Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides naa50_1 Peptides naa50_2 Peptides naa50_3 Peptides naa50_4 Razor + unique peptides naa50_1 Razor + unique peptides naa50_2 Razor + unique peptides naa50_3 Razor + unique peptides naa50_4 Unique peptides naa50_1 Unique peptides naa50_2 Unique peptides naa50_3 Unique peptides naa50_4 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Fraction average Fraction 1 Fraction 2 Fraction 3 Q-value Score Identification type naa50_1 Identification type naa50_2 Identification type naa50_3 Identification type naa50_4 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L naa50_1 Ratio H/L naa50_2 Ratio H/L naa50_3 Ratio H/L naa50_4 Ratio H/L normalized 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razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Deamidation (NQ) site IDs Oxidation (M) site IDs Deamidation (NQ) site positions Oxidation (M) site positions AT1G01050.2;AT1G01050.1;AT4G01480.2;AT4G01480.1;AT2G46860.1 AT1G01050.2;AT1G01050.1;AT4G01480.2;AT4G01480.1;AT2G46860.1 3;3;3;3;2 1;1;1;1;0 1;1;1;1;0 AT1G01050.2 | Symbols:AtPPa1,PPa1 | pyrophosphorylase 1 | pyrophosphorylase 1 | Chr1:31382-32670 REVERSE LENGTH=212;AT1G01050.1 | Symbols:AtPPa1,PPa1 | pyrophosphorylase 1 | pyrophosphorylase 1 | Chr1:31382-32670 REVERSE LENGTH=212;AT4G01480.2 | Symbo 5 3 1 1 1 3 3 2 0 1 1 0 0 1 1 0 16.5 5.7 5.7 24.484 212 212;212;216;216;216 1.67 1 2 0.00041701 4.1919 By matching By matching By MS/MS By matching 0.38818 0.45691 73.049 3 1 Median NaN NaN 0.2749 NaN NaN NaN 0.32461 NaN NaN NaN 48.347 NaN 0 1 2 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 3.3 16.5 16.5 10.8 445050000 335180000 109870000 0 0 0 92928000 47111000 45818000 352120000 288070000 64052000 0 0 0 0 1714;11058;17042 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glycerol-3-phosphate acyltransferase 4 | Chr1:221950-224255 REVERSE LENGTH=503 1 13 13 4 3 6 5 8 3 6 5 8 1 2 1 2 26.6 26.6 9.9 56.261 503 503 1.91 9 6 7 0 22.865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71745 0.73347 81.002 20 9 Leave out requantified 0.58671 0.4713 1.4825 2.1997 0.51306 0.4748 1.7329 2.6494 46.399 22.746 46.555 67.716 3 5 5 7 0 3 2 4 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 6 12.1 9.5 16.5 1137400000 502080000 635370000 62068000 38409000 23659000 339640000 213140000 126500000 354270000 127870000 226390000 381470000 122660000 258810000 14 6491;7184;8050;12297;12313;18389;19499;27167;28538;31873;33425;36107;38910 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7389;8166;9127;13896;13912;20801;22005;31097;32651;36323;38081;41118;44275 35958;40037;40038;40039;44310;67204;67205;67286;101721;107686;107687;107688;149910;149911;157001;157002;157003;173206;181707;196860;212427;212428 46048;51153;51154;51155;56753;86415;86416;86417;86525;130372;138190;138191;191018;191019;200054;220641;231437;251101;251102;270945 46048;51155;56753;86416;86525;130372;138190;191019;200054;220641;231437;251101;270945 7 17 411 428 AT1G01620.1;AT1G01620.2 AT1G01620.1 8;2 8;2 5;1 AT1G01620.1 | Symbols:TMP-B,PIP1;3,PIP1C | plasma membrane intrinsic protein 1C,PLASMA MEMBRANE INTRINSIC PROTEIN 1;3 | plasma membrane intrinsic protein 1C | Chr1:225986-227176 REVERSE LENGTH=286 2 8 8 5 7 7 7 7 7 7 7 7 5 5 4 4 29.7 29.7 19.9 30.632 286 286;214 2.07 16 21 20 0 47.052 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1776 1.2092 54.223 33 15 Leave out requantified 0.46836 0.41388 2.8921 3.4471 0.42905 0.4003 3.3984 3.9165 3.6291 38.033 33.035 37.029 7 9 8 9 3 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.6 26.6 29.7 29.7 17939000000 4350400000 13588000000 1145700000 532030000 613690000 3510400000 2197000000 1313300000 6483500000 840890000 5642600000 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available | no full name available | SET domain-containing protein | Chr1:316204-318819 FORWARD LENGTH=434;AT1G01920.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | SET domain-containing protein | Chr1:316204- 5 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 4.4 4.4 4.4 49.099 434 434;517;547;572;503 2 1 1 1 0.0024119 2.5759 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3713 1.2605 63.471 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.1 2.1 0 2.3 164720000 103530000 61190000 48644000 14166000 34477000 52859000 26147000 26712000 0 0 0 63214000 63214000 0 22 23988;31499 True;True 26951;35912 130374;130375;171336 166790;166791;218227 166790;218227 27 1 AT1G01930.1 AT1G01930.1 1 1 1 AT1G01930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | zinc finger protein-like protein | Chr1:320041-322809 REVERSE LENGTH=580 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.9 2.9 2.9 65.259 580 580 1.6 3 1 1 0 5.9981 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.33157 0.30933 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ASSOCIATED DEATH1 | GRAM domain family protein | Chr1:395761-399720 FORWARD LENGTH=598;AT1G02120.2 | Symbols:VAD1 | VASCULAR ASSOCIATED DEATH1 | GRAM domain family protein | Chr1:395761-399083 FORWARD LENGTH=473;AT 3 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 9 8 8 8 9 20.7 20.7 20.7 67.701 598 598;473;419 2.02 13 14 14 0 87.097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8564 0.9337 54.575 35 18 Leave out requantified 1.3015 1.6584 0.69858 0.76246 1.1369 1.6346 0.83013 0.86702 65.259 35.174 15.285 13.315 8 8 9 10 4 5 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.9 16.6 16.2 18.1 3006200000 1343700000 1662500000 484950000 159070000 325880000 754660000 259100000 495560000 812720000 491700000 321020000 953860000 433780000 520080000 30 11157;11924;13233;17140;18399;20918;21454;22790;28890;31837 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 12600;13481;14940;19376;20815;23540;24146;25622;33042;36282 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AT1G02170.1 | Symbols:ATMC1,MCP1b,LOL3,AtMCP1b,ATMCPB1,MC1 | metacaspase 1b,LSD ONE LIKE 3,ARABIDOPSIS THALIANA METACASPASE 1B,ARABIDOPSIS THALIANA METACASPASE 1,metacaspase 1 | metacaspase 1 | Chr1:411883-413426 FORWARD LENGTH=367 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 7.4 7.4 7.4 39.792 367 367 2 1 0.00021268 4.4853 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 7.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34 14897 True 16864 82131 105821 105821 AT1G02180.1 AT1G02180.1 1 1 1 AT1G02180.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ferredoxin-like protein | Chr1:413619-414505 REVERSE LENGTH=226 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 6.2 6.2 6.2 24.787 226 226 2 1 1 1 0.0016997 2.8026 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97378 0.92223 102.46 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 6.2 6.2 6.2 24299000 13317000 10982000 0 0 0 15367000 10315000 5052700 0 0 0 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Symbols:GSTF4,ATGSTF4,GST31 | glutathione S-transferase F4,GLUTATH 5 2 2 2 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 13.4 13.4 13.4 25.058 217 217;243;243;245;255 2.5 2 2 0 6.4018 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2446 1.973 24.121 4 1 Linear NaN NaN 1.4029 NaN NaN NaN 1.6084 NaN NaN NaN 27.268 NaN 0 1 2 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 9.7 13.4 3.7 191020000 75964000 115050000 0 0 0 17157000 8312500 8844600 109780000 38983000 70794000 64082000 28668000 35414000 52 9436;23389 True;True 10692;26270 51856;51857;127104;127105 66554;66555;162631;162632 66554;162631 AT1G03000.1 AT1G03000.1 2 2 2 AT1G03000.1 | Symbols:PEX6 | peroxin 6 | peroxin 6 | Chr1:688057-692453 REVERSE LENGTH=941 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.8 2.8 2.8 103.04 941 941 1.5 2 2 0.0039993 2.359 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.96776 0.91884 45.414 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.3 1.3 1.3 1.5 60013000 39781000 20232000 13967000 9197800 4769100 19501000 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Symbols:TRM82,AtTRM82 | tRNA modification 82 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr1:749359-751796 FORWARD LENGTH=427 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 3.5 3.5 3.5 46.443 427 427 2 1 1 0.00097257 3.1932 By MS/MS By MS/MS 0.88829 0.88385 38.298 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 3.5 0 0 3.5 68569000 36397000 32172000 22949000 11901000 11048000 0 0 0 0 0 0 45620000 24496000 21124000 55 20849 True 23466 114285;114286 146480;146481 146481 AT1G03130.1 AT1G03130.1 13 1 1 AT1G03130.1 | Symbols:PSAD-2 | photosystem I subunit D-2 | photosystem I subunit D-2 | Chr1:753528-754142 REVERSE LENGTH=204 1 13 1 1 13 13 13 12 1 1 1 1 1 1 1 1 64.2 5.4 5.4 22.306 204 204 1.88 3 3 2 0.00021106 4.3735 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.987 0.55134 133.08 8 8 Linear 0.31211 0.21828 0.39445 0.76532 0.285 0.20274 0.45353 0.86523 231.96 176.57 74.443 98.812 2 2 2 2 2 2 2 2 Median Median Median Median 64.2 64.2 64.2 64.2 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| Chr1:813975-816623 FORWARD LENGTH=882;AT1G03310.1 | Symbols:ATISA2,BE2,DBE1,ISA2,AtBE2 | debranching en 2 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 3.1 3.1 3.1 98.883 882 882;882 2.33 1 2 0 32.665 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0223 0.93983 35.228 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 1 2 0 2 74949000 36830000 38119000 57241000 29833000 27408000 17708000 6997100 10710000 0 0 0 0 0 0 62 15222;28999 True;True 17227;33164 84080;159290;159291 108414;202890;202891 108414;202891 AT1G03330.1 AT1G03330.1 1 1 1 AT1G03330.1 | Symbols:LSM2 | SM-like 2 | Small nuclear ribonucleoprotein family protein | Chr1:818161-819297 REVERSE LENGTH=93 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14 14 14 10.694 93 93 2 1 3 1 0.00097504 3.2147 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81938 0.81064 19.439 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 14 14 14 14 206580000 98609000 107970000 44534000 23843000 20691000 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oxygenase superfamily protein | Chr1:842895-844158 REVERSE LENGTH=351;AT1G03400.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2-o 2 3 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 10 10 10 39.13 351 351;379 2.2 3 2 5 0 88.169 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65935 0.8094 152.53 9 7 Median NaN 4.3443 0.41589 0.65935 NaN 4.0282 0.52535 0.8094 NaN 49.099 174.84 86.876 1 2 3 3 1 2 2 2 Median Median Median Median 5.7 5.7 10 10 356950000 185810000 171140000 20082000 5259100 14823000 54004000 8878800 45125000 148010000 116310000 31696000 134860000 55362000 79494000 65 13095;14148;15887 True;True;True 14791;15984;17980 71358;71359;71360;71361;77994;77995;87706;87707;87708;87709 91682;91683;91684;91685;91686;100692;100693;112790;112791;112792;112793 91685;100693;112793 AT1G03475.1;AT4G03205.1;AT4G03205.2 AT1G03475.1 16;3;3 16;3;3 16;3;3 AT1G03475.1 | Symbols:HEMF1,ATCPO-I,LIN2 | LESION INITIATION 2 | Coproporphyrinogen III oxidase | Chr1:869302-871175 REVERSE LENGTH=386 3 16 16 16 12 14 13 11 12 14 13 11 12 14 13 11 37.3 37.3 37.3 43.796 386 386;233;240 2.01 22 33 23 0 136.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9188 0.97511 21.776 72 25 Leave out requantified 1.0692 1.319 0.57083 0.88244 1.0098 1.2294 0.6597 0.97087 34.922 30.366 19.102 20.482 15 21 21 15 4 6 8 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29 33.7 32.9 29 17255000000 8607000000 8648300000 3212300000 1466300000 1746000000 5099700000 2117200000 2982500000 5584900000 3446500000 2138400000 3358500000 1577100000 1781400000 66 315;6130;6462;6988;10874;11423;15039;15714;16667;18790;21866;26708;36254;37850;38499;39395 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 352;6960;6961;7357;7951;12280;12901;17027;17785;18846;21241;21242;24583;30599;41295;43104;43819;44832 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1.1553 NaN NaN NaN 3.322 NaN NaN NaN 2 1 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 11 6 4.9 4.9 486680000 245390000 241280000 180700000 74611000 106090000 52415000 21949000 30465000 140010000 79568000 60441000 113550000 69265000 44285000 81 2695;9940 True;True 3094;11248 15323;15324;15325;54415;54416;54417 19838;19839;19840;69788;69789;69790 19839;69789 AT1G04270.2;AT1G04270.1;AT5G43640.1;AT5G09500.1;AT1G33850.1;AT5G09490.1 AT1G04270.2;AT1G04270.1 5;5;2;2;1;1 1;1;0;0;0;0 1;1;0;0;0;0 AT1G04270.2 | Symbols:RPS15 | cytosolic ribosomal protein S15 | cytosolic ribosomal protein S15 | Chr1:1141852-1142960 REVERSE LENGTH=151;AT1G04270.1 | Symbols:RPS15 | cytosolic ribosomal protein S15 | cytosolic ribosomal protein S15 | Chr1:1141852-114 6 5 1 1 5 5 5 5 1 1 1 1 1 1 1 1 45.7 7.9 7.9 17.058 151 151;152;149;150;70;152 2.05 6 7 7 0.00039785 3.4782 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85122 0.90517 45.356 16 3 Median 1.1097 0.94823 0.76682 0.76652 1.0398 0.91332 0.8841 0.83635 22.846 11.431 81.494 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2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr1:1165296-1166538 FORWARD LENGTH=360 1 4 3 3 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 11.4 9.7 9.7 40.796 360 360 1.69 6 5 2 0 6.2697 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75905 0.93814 26.636 7 6 Median 1.1903 NaN 0.73999 NaN 1.1432 NaN 0.85619 NaN 15.205 NaN 24.956 NaN 2 1 3 1 2 1 3 0 Median Median Median Median 8.1 8.1 8.1 9.7 389390000 198020000 191370000 132150000 61475000 70680000 77975000 30104000 47871000 162150000 96834000 65316000 17114000 9609100 7504700 84 9158;16698;18644;24247 True;True;False;True 10362;18880;21082;27360 50450;50451;50452;50453;50454;50455;92049;92050;92051;92052;92053;92054;103110;103111;103112;103113;131983 64814;64815;64816;64817;64818;64819;117978;117979;117980;117981;117982;117983;132171;132172;132173;132174;132175;168658 64816;117983;132173;168658 AT1G04410.1;AT5G56720.1 AT1G04410.1 20;1 20;1 10;0 AT1G04410.1 | Symbols:c-NAD-MDH1 | cytosolic-NAD-dependent malate dehydrogenase 1 | Lactate/malate dehydrogenase family protein | Chr1:1189418-1191267 REVERSE LENGTH=332 2 20 20 10 17 19 20 14 17 19 20 14 8 10 10 7 67.2 67.2 39.5 35.571 332 332;372 2.1 61 89 85 0 233.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89404 0.93126 21.647 153 29 Leave out requantified 0.98629 1.1193 0.73512 0.91428 0.97064 1.1055 0.84672 1.0137 24.75 20.718 21.202 29.329 40 39 45 29 6 10 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 58.4 66.9 67.2 50.3 76695000000 39746000000 36950000000 15106000000 7574300000 7531900000 21623000000 9520000000 12103000000 23984000000 14321000000 9662700000 15982000000 8330400000 7652100000 85 2199;4847;5775;8004;9320;13655;19199;19403;23098;23160;24094;24095;24208;25314;25585;26481;30588;36379;36386;36802 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 4 | Chr1:1321941-1324556 FORWARD LENGTH=443 1 3 1 1 2 2 3 2 0 0 1 0 0 0 1 0 12 5.9 5.9 46.611 443 443 3 1 1 -2 By matching By matching By MS/MS By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 6.1 6.1 12 6.1 22088000 22088000 0 0 0 0 0 0 0 22088000 22088000 0 0 0 0 + 96 4486;26855;32497 False;False;True 5130;5131;30755;37025 24989;24990;24991;24992;24993;24994;24995;24996;24997;24998;24999;25000;25001;25002;25003;148469;148470;148471;148472;148473;148474;148475;148476;148477;176482 32218;32219;32220;32221;32222;32223;32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;189177;189178;189179;189180;189181;189182;189183;189184;189185;189186;189187;189188;189189;224775 32227;189184;224775 103 402 AT1G04750.1;AT1G04750.4;AT1G04750.3;AT1G04750.2;AT2G33120.3;AT3G24890.5;AT3G24890.4;AT3G24890.3;AT3G24890.1;AT3G24890.2;AT4G15780.1;AT2G33110.2;AT2G33110.1 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.6 2.6 0 0 485160000 208220000 276940000 194480000 94154000 100320000 290680000 114070000 176610000 0 0 0 0 0 0 + 98 24555 True 27836 134363;134364 171623;171624 171623 106;107 3;4 AT1G04780.1 AT1G04780.1 2 2 2 AT1G04780.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ankyrin repeat family protein | Chr1:1340891-1342965 REVERSE LENGTH=664 1 2 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 4.7 4.7 4.7 74.359 664 664 2 1 3 1 0 5.1546 By matching By MS/MS By MS/MS 0.97857 1.1556 63.917 5 0 Median NaN NaN 0.55279 0.73202 NaN NaN 0.67399 0.7497 NaN NaN 76.246 72.237 0 1 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 1.8 4.7 4.7 377350000 211780000 165570000 0 0 0 15246000 7208800 8037200 295510000 167830000 127680000 66599000 36741000 29858000 99 8680;9149 True;True 9830;10353 47913;47914;50422;50423;50424 61539;64786;64787 61539;64786 AT1G04800.1 AT1G04800.1 3 3 3 AT1G04800.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycine-rich protein | Chr1:1348635-1349237 REVERSE LENGTH=200 1 3 3 3 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 20 20 20 18.045 200 200 2 2 2 2 0 7.2485 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95638 0.91206 30.342 5 5 Median NaN NaN NaN 1.0921 NaN NaN NaN 1.2554 NaN NaN NaN 22.368 1 1 1 2 1 1 1 2 Median Median Median Median 4 16 4 12 215160000 109980000 105170000 42318000 24181000 18137000 25638000 11903000 13735000 56075000 30470000 25605000 91124000 43429000 47695000 100 13028;13558;15108 True;True;True 14716;15323;17105 70981;70982;74569;74570;74571;83499 91179;91180;96251;96252;96253;107660 91179;96253;107660 AT1G04810.1 AT1G04810.1 12 3 3 AT1G04810.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 26S proteasome regulatory complex%2C non-ATPase subcomplex%2C Rpn2/Psmd1 subunit | Chr1:1350304-1355261 FORWARD LENGTH=1001 1 12 3 3 10 10 10 9 2 2 2 3 2 2 2 3 12.7 4 4 108.86 1001 1001 1.83 5 4 3 0 11.735 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0467 1.0228 91.924 12 12 Median 2.5508 5.6289 1.3721 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Median Median 0 0 4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 108 14094 True 15927 77680;77681;77682 100312;100313;100314 100314 AT1G05010.1 AT1G05010.1 10 10 9 AT1G05010.1 | Symbols:EFE,ACO4,EAT1 | ethylene forming enzyme,ethylene-forming enzyme | ethylene-forming enzyme | Chr1:1431419-1432695 REVERSE LENGTH=323 1 10 10 9 4 8 9 6 4 8 9 6 3 7 8 5 41.5 41.5 39 36.676 323 323 1.93 15 17 12 0 66.517 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91174 0.98558 46.641 43 11 Leave out requantified 1.0795 1.3928 0.51036 0.92751 1.0452 1.2914 0.60136 1.0336 14.222 34.263 38.566 33.159 6 13 15 9 2 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 32.8 36.8 23.2 5102100000 2614200000 2487800000 570580000 230870000 339720000 1378800000 585930000 792890000 2064500000 1267500000 797010000 1088100000 529900000 558230000 109 2522;5264;12174;22923;24235;24676;29036;36306;36917;36974 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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8 8 AT1G05260.1 | Symbols:RCI3,RCI3A | RARE COLD INDUCIBLE GENE 3 | Peroxidase superfamily protein | Chr1:1529827-1531271 FORWARD LENGTH=326 1 9 8 8 7 7 5 5 7 6 4 4 7 6 4 4 36.2 31 31 34.905 326 326 2.03 11 7 12 0 307.96 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86343 0.8857 73.262 27 11 Leave out requantified 0.69727 0.53806 2.744 1.5961 0.6987 0.5075 3.4493 1.8419 70.311 25.612 7.3095 14.025 7 8 7 5 5 2 2 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31 30.7 23.9 23.9 4493600000 1783100000 2710500000 1403200000 576530000 826620000 900210000 544240000 355960000 1530000000 394220000 1135800000 660280000 268110000 392170000 115 4780;12630;13063;13381;13923;17489;19720;32379;32872 True;False;True;True;True;True;True;True;True 5459;14271;14272;14754;15111;15739;19782;22243;36886;37447 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Symbols:no symbol available | no full name available | myosin heavy chain%2C embr 9 5 4 4 4 3 2 3 3 3 2 2 3 3 2 2 9.2 7.9 7.9 76.499 671 671;671;790;790;790;790;790;790;790 2.18 3 3 5 0 12.148 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94274 0.89954 28.208 10 5 Leave out requantified 0.70266 1.0818 0.74752 0.7136 0.64627 0.91321 0.84421 0.78927 24.601 17.711 17.06 35.674 3 3 2 2 1 2 1 1 Median Plateau Median Median 8 6.4 3.3 4.6 324160000 186980000 137180000 96133000 60865000 35268000 91049000 47760000 43289000 52333000 26119000 26214000 84646000 52240000 32406000 116 8554;20212;21719;26212;30643 True;True;True;False;True 9695;22779;24428;30016;34978 47250;47251;47252;111230;111231;111232;111233;111234;118617;144965;144966;167240;167241 60701;60702;142656;142657;142658;142659;142660;151904;184827;184828;184829;213067;213068;213069 60701;142659;151904;184828;213069 AT1G05350.1 AT1G05350.1 7 7 7 AT1G05350.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr1:1560891-1564005 REVERSE LENGTH=431 1 7 7 7 4 4 7 5 4 4 7 5 4 4 7 5 21.3 21.3 21.3 47.02 431 431 1.91 8 8 6 0 37.405 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89253 0.93098 20.28 19 9 Leave out requantified 1.3325 1.2779 0.60769 0.83193 1.2681 1.1823 0.77327 0.95108 18.869 104.45 6.0047 13.661 3 5 6 5 1 3 3 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 11.1 11.1 21.3 16.2 1369400000 796530000 572860000 129060000 50087000 78970000 341390000 197620000 143760000 598660000 379970000 218690000 300290000 168860000 131430000 117 380;1607;2252;9212;9272;29524;30144 True;True;True;True;True;True;True 424;1827;2536;10424;10488;33744;34410 2147;2148;2149;2150;9151;9152;12505;50697;50698;50699;50700;50701;50957;50958;50959;50960;50961;161906;164828;164829;164830;164831 2826;2827;2828;2829;2830;11936;11937;16198;65123;65124;65125;65126;65127;65128;65129;65130;65441;65442;65443;65444;65445;65446;206270;210016;210017;210018;210019 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NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 2.3 2.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 119 2618 True 2996 14787;14788 19180;19181;19182;19183 19181 60;61;62;2638 127 6;8;9;12 10 AT1G05500.1;AT1G05500.2 AT1G05500.1;AT1G05500.2 6;5 6;5 6;5 AT1G05500.1 | Symbols:SYTE,NTMC2T2.1,ATSYTE,NTMC2TYPE2.1,SYT5 | SYNAPTOTAGMIN HOMOLOG E,synaptotagmin 5,ARABIDOPSIS THALIANA SYNAPTOTAGMIN HOMOLOG E | Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein | Chr1:1625098-1628940 FORWARD LENGTH=560; 2 6 6 6 2 3 4 4 2 3 4 4 2 3 4 4 13.8 13.8 13.8 62.928 560 560;416 2.19 3 7 6 0 13.579 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0145 1.2854 10.02 13 2 Leave out requantified NaN 0.73695 1.0448 1.2184 NaN 0.69017 1.2958 1.4093 NaN 13.734 10.776 105.37 1 4 5 3 0 1 0 1 Median Median Leave out requantified Median 6.2 6.6 10.2 8 830790000 425370000 405420000 158500000 77624000 80875000 129160000 71761000 57403000 443420000 234430000 208990000 99705000 41557000 58149000 120 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1,UDP-glucosyltransferase 75B1 | UDP-glucosyltransferase 75B1 | Chr1:1645674-1647233 REVERSE LENGTH=519;AT1G05560.1 | Symbols:UGT1,UGT75B1 | UDP-GLUCOSE TRANSFERASE 1,UDP-glucosyltransferase 7 3 7 7 7 5 7 5 4 5 7 5 4 5 7 5 4 12.9 12.9 12.9 58.584 519 519;469;455 1.74 14 11 6 0 30.504 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0485 1.0501 64.821 30 13 Leave out requantified 1.0407 0.86966 1.5712 1.1028 0.97009 0.79111 1.7986 1.2209 28.689 16.647 42.383 22.794 6 10 7 7 2 6 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.2 12.9 10.2 8.7 3861600000 1929700000 1931900000 1161200000 591460000 569720000 967810000 515080000 452740000 958960000 407710000 551250000 773650000 415440000 358220000 122 2370;4344;5977;6400;19584;27236;31435 True;True;True;True;True;True;True 2672;4953;6781;7291;22099;31172;35844 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Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:180 4 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1.4 1.4 1.4 108.94 982 982;982;982;1003 2 1 0.0020592 2.6922 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 1.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 4363 True 4975 24161 31206 31206 AT1G06000.1 AT1G06000.1 6 6 6 AT1G06000.1 | Symbols:UGT89C1 | | UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | Chr1:1820495-1821802 REVERSE LENGTH=435 1 6 6 6 4 6 4 4 4 6 4 4 4 6 4 4 15.4 15.4 15.4 48.122 435 435 2.14 7 10 11 0 32.532 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94682 0.91779 11.02 28 9 Leave out requantified 1.2607 1.2133 0.65436 0.5407 1.2012 1.0967 0.76807 0.61171 35.594 16.159 22.972 20.04 7 8 7 6 3 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.6 15.4 13.3 13.3 2600100000 1480800000 1119200000 539840000 303630000 236210000 598680000 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contai 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.3 4.3 4.3 24.575 211 211;213 1.75 2 1 1 0.0064011 2.1704 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0625 1.113 30.876 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 4.3 4.3 4.3 4.3 33977000 17481000 16496000 0 0 0 15369000 7627900 7740800 18609000 9853400 8755300 0 0 0 129 27672 True 31670 152467;152468;152469;152470 194296;194297;194298;194299 194298 AT1G06130.2;AT1G06130.1;AT2G43430.3;AT2G43430.2;AT2G31350.2;AT2G31350.1;AT2G43430.1 AT1G06130.2;AT1G06130.1 4;4;1;1;1;1;1 4;4;1;1;1;1;1 4;4;1;1;1;1;1 AT1G06130.2 | Symbols:GLX2-4 | glyoxalase 2-4 | glyoxalase 2-4 | Chr1:1858034-1860640 REVERSE LENGTH=330;AT1G06130.1 | Symbols:GLX2-4 | glyoxalase 2-4 | glyoxalase 2-4 | Chr1:1858034-1860640 REVERSE LENGTH=331 7 4 4 4 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 14.2 14.2 14.2 36.496 330 330;331;286;313;323;324;331 1.79 6 5 3 0 18.953 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86114 0.85008 23.062 11 5 Leave out requantified 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15;15;15 4;4;4 AT1G06220.3 | Symbols:MEE5,CLO,GFA1 | MATERNAL EFFECT EMBRYO ARREST 5,CLOTHO,GAMETOPHYTE FACTOR 1 | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | Chr1:1900524-1904583 FORWARD LENGTH=987;AT1G06220.2 | Symbols:MEE5,CLO,GFA1 | MATERNAL EF 3 15 15 4 12 13 12 11 12 13 12 11 4 4 3 3 20.4 20.4 6.9 110.44 987 987;987;987 1.91 27 18 21 0 113.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1045 1.101 26.061 58 23 Leave out requantified 1.2685 1.1943 0.57671 0.77726 1.1999 1.0716 0.64711 0.91296 25.099 16.713 22.035 23.594 15 17 15 11 5 6 8 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.5 17.5 15.5 14.6 4373400000 2352200000 2021300000 1056200000 507060000 549150000 1129400000 513860000 615570000 1321400000 797390000 524030000 866400000 533880000 332520000 133 2348;4245;13503;14222;14732;16279;19768;27176;28795;29737;31431;31946;31949;35036;36082 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Chr1:2001625-2002596 FORWARD LENGTH=323 1 9 9 9 7 5 6 5 7 5 6 5 7 5 6 5 26.6 26.6 26.6 36.119 323 323 2.12 7 15 11 0 35.036 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7733 0.86849 33.361 20 9 Leave out requantified 0.98652 0.90322 0.84622 0.60948 0.86849 0.83453 1.0055 0.74116 37.238 17.522 11.785 15.181 6 4 4 6 1 3 2 3 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 18.9 19.2 22.3 18.3 1992800000 1113900000 878900000 552390000 320470000 231920000 390500000 201520000 188980000 435630000 242420000 193210000 614270000 349480000 264790000 141 3089;13282;13283;16829;19860;22717;24827;26550;37270 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3538;14995;14996;19021;22396;25546;28269;28270;30421;42451 17437;17438;17439;17440;17441;17442;72340;72341;72342;72343;72344;72345;72346;92738;92739;92740;92741;92742;109378;123761;123762;123763;123764;123765;136724;136725;136726;136727;136728;136729;146922;146923;203340 22542;22543;22544;22545;22546;92931;92932;92933;92934;92935;92936;92937;92938;92939;92940;118881;118882;118883;118884;118885;118886;118887;118888;118889;140290;158435;158436;158437;158438;158439;174577;174578;174579;174580;174581;174582;187201;187202;259177;259178 22545;92931;92932;118889;140290;158439;174577;187202;259177 72 281 AT1G06550.1 AT1G06550.1 6 6 6 AT1G06550.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein | Chr1:2003834-2006564 REVERSE LENGTH=387 1 6 6 6 0 2 3 4 0 2 3 4 0 2 3 4 24.5 24.5 24.5 43.257 387 387 1.64 6 3 2 0 33.964 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2977 1.5709 36.915 6 3 Leave out requantified NaN NaN NaN 0.71636 NaN NaN NaN 0.82986 NaN NaN NaN 41.535 0 1 1 4 0 0 1 2 Median Median Median Median 0 7.2 11.9 19.1 492750000 313800000 178950000 0 0 0 32240000 21124000 11116000 109970000 63178000 46790000 350540000 229500000 121040000 142 2899;9301;23685;32842;38002;38470 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OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 2,PHOTOSYSTEM II SUBUNIT P,photosystem II subunit P-1,OXYGEN EVOLVING COMPLEX SUBUNIT 23 KDA | photosystem II subunit P-1 | Chr1:2047940-2049186 FORWARD LENGTH=263;AT1G06680 3 11 11 11 10 10 11 10 10 10 11 10 10 10 11 10 53.2 53.2 53.2 28.095 263 263;219;125 2.07 68 82 85 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0027 0.90068 18.121 73 16 Leave out requantified 0.97799 0.89822 0.68397 1.2516 0.91163 0.86154 0.78088 1.3796 31.757 9.651 22.41 17.322 19 20 16 18 2 5 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 51 51 53.2 51 79664000000 39769000000 39896000000 17136000000 9252700000 7883200000 23420000000 12825000000 10595000000 14040000000 8205200000 5835000000 25068000000 9485400000 15583000000 145 8600;10928;10929;12163;15958;18955;26837;29706;31798;33374;33375 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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By MS/MS By MS/MS 1.0542 1.0499 32.229 30 13 Leave out requantified 1.5442 1.0542 0.80775 0.86018 1.4739 0.98417 1.0086 1.0067 22.859 17.961 21.704 45.197 7 6 9 8 3 2 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 26.6 16.4 19 19 4404100000 2387700000 2016400000 756660000 344550000 412100000 892130000 496150000 395990000 1544700000 886800000 657880000 1210600000 660170000 550480000 148 4652;19321;22094;22604;29032;32617;33999;34211 False;True;True;True;True;False;True;True 5312;21811;24834;25425;33198;37154;38747;38991;38992 25832;25833;25834;25835;25836;25837;25838;25839;25840;25841;106704;106705;106706;106707;106708;106709;106710;120349;120350;120351;120352;123195;123196;159406;177115;177116;177117;177118;177119;177120;177121;177122;184866;184867;184868;184869;184870;184871;184872;184873;186096;186097;186098;186099;186100;186101;186102;186103;186104;186105;186106;186107;186108;186109 33232;33233;33234;33235;33236;33237;33238;33239;33240;33241;33242;33243;136814;136815;136816;136817;136818;136819;136820;154098;154099;154100;154101;154102;154103;154104;157748;157749;203033;225590;225591;225592;225593;225594;225595;225596;225597;235513;235514;235515;235516;235517;235518;235519;235520;237063;237064;237065;237066;237067;237068;237069;237070;237071;237072;237073;237074;237075;237076;237077;237078 33237;136820;154101;157748;203033;225597;235517;237069 155 68 AT1G06820.2;AT1G06820.3;AT1G06820.1;AT1G06820.4 AT1G06820.2;AT1G06820.3;AT1G06820.1 3;3;3;1 3;3;3;1 3;3;3;1 AT1G06820.2 | Symbols:CCR2,CRTISO | carotenoid isomerase,CAROTENOID AND CHLOROPLAST REGULATION 2 | carotenoid isomerase | Chr1:2093721-2096220 REVERSE LENGTH=521;AT1G06820.3 | Symbols:CCR2,CRTISO | carotenoid isomerase,CAROTENOID AND CHLOROPLAST REGULAT 4 3 3 3 2 3 1 3 2 3 1 3 2 3 1 3 7.7 7.7 7.7 57.722 521 521;586;595;476 2 3 3 3 0 12.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1 1.0998 10.579 7 1 Leave out 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available | no full name available | plant/protein | Chr1:2161225-2163035 REVERSE LENGTH=371 1 8 8 8 4 6 6 6 4 6 6 6 4 6 6 6 31.3 31.3 31.3 40.637 371 371 1.97 12 10 11 0 50.335 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.016 1.0657 9.3062 25 8 Leave out requantified 1.2749 1.652 0.80722 0.64543 1.1974 1.5057 0.97155 0.75011 13.139 16.633 7.854 32.802 6 6 8 5 3 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.5 22.6 21.6 25.9 1878600000 927000000 951570000 320900000 147080000 173820000 452000000 157840000 294160000 745590000 412250000 333340000 360080000 209830000 150250000 156 2460;6611;16719;23598;31381;31489;34427;36977 True;True;True;True;True;True;True;True 2771;7532;7533;18901;26500;35787;35902;39230;42132 13637;36652;36653;36654;36655;36656;36657;92119;128367;128368;128369;128370;170722;170723;170724;170725;170726;171290;171291;171292;171293;171294;187368;201669;201670;201671;201672;201673;201674;201675;201676;201677;201678 17644;46966;46967;46968;46969;46970;46971;46972;118075;164254;164255;164256;164257;164258;217422;217423;217424;217425;217426;218167;218168;218169;218170;218171;238745;257188;257189;257190;257191;257192;257193;257194;257195;257196;257197 17644;46972;118075;164257;217426;218171;238745;257195 79 165 171 57 AT1G07080.1 AT1G07080.1 2 2 2 AT1G07080.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Thioredoxin superfamily protein | Chr1:2170069-2171861 FORWARD LENGTH=265 1 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 8.7 8.7 8.7 29.698 265 265 2.2 2 3 0.00134 2.9809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96472 1.0692 26.059 5 4 Median NaN NaN 1.1733 0.89567 NaN NaN 1.3934 1.0225 NaN NaN 26.882 6.3179 1 0 2 2 1 0 2 1 Median Median Median Median 4.9 0 3.8 8.7 371860000 147220000 224640000 79756000 31344000 48412000 0 0 0 81239000 36698000 44541000 210870000 79180000 131690000 157 36858;38357 True;True 41999;43658 201088;201089;209260;209261;209262 256475;256476;256477;266940;266941;266942 256476;266941 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Chr1:2223889-2225331 FORWARD LENGTH=480 1 6 6 6 5 3 5 5 5 3 5 5 5 3 5 5 17.3 17.3 17.3 52.646 480 480 2.05 7 6 8 0 15.602 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97136 0.9891 73.441 14 11 Median 1.7356 2.3323 1.1684 0.80768 1.549 2.1834 1.4461 0.84239 61.085 37.251 53.758 88.626 5 2 4 3 4 1 3 3 Median Median Linear Median 13.8 6.7 14 14 732850000 345000000 387850000 162450000 69151000 93300000 77564000 21225000 56338000 202720000 104460000 98257000 290120000 150160000 139960000 163 5558;7203;17163;18711;21899;33357 True;True;True;True;True;True 6314;8190;19404;21154;24617;38005 30801;30802;30803;30804;40152;40153;94824;94825;94826;94827;94828;103455;103456;103457;119428;181298;181299;181300;181301;181302;181303 39552;39553;39554;39555;51295;51296;121671;121672;121673;121674;121675;121676;132639;132640;132641;152905;230924;230925;230926;230927;230928;230929;230930;230931 39555;51295;121676;132639;152905;230928 AT1G07250.1 AT1G07250.1 7 7 7 AT1G07250.1 | Symbols:UGT71C4 | UDP-glucosyl transferase 71C4 | UDP-glucosyl transferase 71C4 | Chr1:2225963-2227402 FORWARD LENGTH=479 1 7 7 7 3 5 7 5 3 5 7 5 3 5 7 5 17.1 17.1 17.1 52.843 479 479 1.96 7 10 6 0 14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1563 1.2817 33.519 21 2 Leave out requantified 1.0334 1.0184 1.0369 1.1697 0.95591 0.89789 1.2075 1.3193 56.892 45.449 60.259 44.25 4 5 8 4 1 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.6 11.5 17.1 12.3 1400800000 690830000 709950000 280740000 148830000 131910000 222460000 105750000 116700000 641140000 319440000 321690000 256450000 116810000 139650000 164 2293;4774;11676;11776;14866;21335;29990 True;True;True;True;True;True;True 2579;2580;5452;13189;13315;16829;24010;34247 12710;12711;12712;12713;26520;26521;26522;26523;26524;26525;63744;63745;63746;64366;64367;81973;81974;116702;116703;164225;164226;164227;164228 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available | no full name available | lactoylglutathione lyase family protein / glyoxalase I family protein | Chr1:2535702-2537630 FORWARD LENGTH=185;AT1G08110.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | lac 4 7 7 7 6 4 6 5 6 4 6 5 6 4 6 5 47.6 47.6 47.6 20.848 185 185;185;185;235 2.04 9 9 10 0 40.937 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84689 0.88552 4.6379 24 7 Leave out requantified 0.97835 1.2855 0.70252 0.7356 0.91189 1.1709 0.82323 0.84114 21.394 14.543 5.338 23.607 6 5 8 5 1 0 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.2 22.7 42.2 42.2 2717000000 1300400000 1416600000 443440000 253340000 190100000 523480000 239470000 284000000 1158300000 547170000 611110000 591800000 260400000 331400000 186 9845;9846;10945;13082;15470;32757;34282 True;True;True;True;True;True;True 11146;11147;12359;14778;17513;37311;39070 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| EARLY RESPONSE TO DEHYDRATION 6 | Major facilitator superfamily protein | Chr1:2873604-2876979 FORWARD LENGTH=496;AT1G08930.1 | Symbols:ERD6 | EARLY RESPONSE TO DEHYDRATION 6 | Major facilitator superfamily protein | Chr1:2 2 2 2 2 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 5.6 5.6 5.6 54.354 496 496;496 1.83 3 1 2 0 9.0878 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 2.6 0 5.6 2.6 52390000 29616000 22774000 0 0 0 0 0 0 52390000 29616000 22774000 0 0 0 207 6720;18944 True;True 7650;7651;21407 37551;37552;37553;37554;37555;104903 48129;48130;48131;48132;48133;134528 48132;134528 108 276 AT1G08940.1 AT1G08940.1 2 2 2 AT1G08940.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphoglycerate mutase family protein | Chr1:2877694-2879104 FORWARD LENGTH=281 1 2 2 2 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 12.8 12.8 12.8 32.678 281 281 2.5 1 1 0 24.802 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.1 5.7 0 0 6332200 0 6332200 0 0 0 6332200 0 6332200 0 0 0 0 0 0 208 2238;15737 True;True 2522;17811 12452;86938 16143;111970 16143;111970 AT1G08970.4;AT1G08970.3;AT1G08970.2;AT1G08970.1;AT1G54830.3;AT1G54830.2;AT1G54830.1 AT1G08970.4;AT1G08970.3;AT1G08970.2;AT1G08970.1;AT1G54830.3;AT1G54830.2;AT1G54830.1 2;2;2;2;1;1;1 2;2;2;2;1;1;1 2;2;2;2;1;1;1 AT1G08970.4 | Symbols:NF-YC9,HAP5C | HEME ACTIVATED PROTEIN 5C,nuclear factor Y, subunit C9 | nuclear factor Y%2C subunit C9 | Chr1:2883144-2883839 FORWARD LENGTH=231;AT1G08970.3 | Symbols:NF-YC9,HAP5C | HEME ACTIVATED PROTEIN 5C,nuclear factor Y, su 7 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 10.8 10.8 10.8 25.639 231 231;231;231;231;217;217;217 2 1 1 1 0.000407 3.7913 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4383 1.4325 83.733 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 5.6 5.2 5.2 69608000 29298000 40310000 0 0 0 42923000 11698000 31226000 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out requantified 21.6 26.3 26 22 4805100000 2614100000 2191000000 1014500000 470100000 544430000 928680000 351310000 577370000 1500900000 939530000 561380000 1360900000 853140000 507790000 211 1798;2955;4095;5574;6468;13365;13860;14284;15267;17054;17430;26658;31160;35550;36438;37745;37985;38444;38586;38778 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2047;3393;4681;6332;7364;15091;15665;16182;17283;17284;19276;19717;30547;35542;40499;41513;41514;42982;42983;43246;43247;43760;43916;43917;44129 10172;16863;16864;16865;16866;16867;16868;22955;22956;22957;30883;30884;30885;30886;30887;30888;35881;35882;35883;72976;72977;72978;72979;72980;76498;76499;79045;79046;79047;79048;79049;84389;84390;84391;84392;94071;94072;94073;94074;96300;96301;96302;96303;147495;169603;193701;193702;193703;198684;198685;198686;198687;198688;198689;198690;198691;206044;206045;206046;206047;207261;207262;207263;207264;207265;207266;207267;207268;207269;207270;207271;209839;209840;209841;209842;209843;209844;210592;210593;210594;210595;210596;210597;210598;210599;210600;210601;210602;210603;211642;211643;211644 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sucrose nonfermenting 4 | sucrose nonfermenting-like protein | Chr1:2900149-2904212 REVERSE LENGTH=487 1 6 6 6 4 5 5 4 4 5 5 4 4 5 5 4 12.5 12.5 12.5 53.466 487 487 1.77 12 8 6 0 30.686 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0143 1.0038 5.9426 18 4 Leave out requantified 0.86857 1.0885 0.97606 0.937 0.79951 0.9799 1.1003 1.0067 25.227 8.4493 1.996 7.9041 4 5 4 5 0 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.2 10.3 10.5 8 746250000 376590000 369660000 138840000 76808000 62032000 213320000 105190000 108140000 169970000 85961000 84006000 224120000 108640000 115480000 212 14363;20209;24275;28695;31982;35611 True;True;True;True;True;True 16277;22776;27404;32832;36444;40565 79474;79475;79476;79477;79478;79479;79480;111221;111222;111223;111224;111225;111226;132177;132178;157796;157797;157798;157799;157800;173786;173787;173788;173789;173790;193998 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By MS/MS By MS/MS 1.001 1.0079 19.126 5 4 Median NaN NaN NaN 0.85257 NaN NaN NaN 0.94678 NaN NaN NaN 8.8446 1 1 1 2 0 1 1 2 Median Median Median Median 3.4 5.8 7.2 5.8 2416200000 1161300000 1254900000 542310000 261690000 280620000 417010000 171410000 245600000 211640000 90233000 121410000 1245300000 637980000 607300000 243 360;6533;10435;15586 True;False;False;False 401;7442;11793;17645 2045;2046;2047;2048;2049;2050;2051;36212;36213;36214;36215;56991;56992;56993;56994;56995;56996;86263;86264 2716;2717;2718;2719;2720;2721;2722;46378;46379;46380;46381;73107;73108;73109;73110;111211;111212 2722;46379;73110;111211 AT1G10070.3;AT1G10070.2;AT1G10070.1 AT1G10070.3;AT1G10070.2;AT1G10070.1 4;4;4 4;4;4 4;4;4 AT1G10070.3 | Symbols:BCAT-2,ATBCAT-2,BCAT2 | branched-chain amino acid transferase 2,branched-chain amino acid transaminase 2 | branched-chain amino acid transaminase 2 | Chr1:3288672-3290164 FORWARD LENGTH=318;AT1G10070.2 | Symbols:BCAT-2,ATBCAT-2,BCA 3 4 4 4 2 1 3 3 2 1 3 3 2 1 3 3 15.4 15.4 15.4 34.574 318 318;388;388 2.22 1 5 3 0 8.9777 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99519 1.0517 79.536 9 4 Median 0.51566 NaN 0.87175 1.4789 0.48661 NaN 1.0517 1.5684 99.385 NaN 68.273 15.663 2 1 3 3 1 1 1 1 Median Median Median Median 8.2 3.1 12.6 11 385180000 178920000 206260000 92782000 50730000 42052000 14084000 9831600 4252200 147660000 65883000 81776000 130660000 52472000 78184000 244 29710;31511;32499;38857 True;True;True;True 33944;35925;37027;44216 162848;162849;162850;162851;171379;171380;171381;176491;212083 207503;207504;207505;207506;207507;218279;218280;224786;270521 207506;218279;224786;270521 AT1G10130.1 AT1G10130.1 2 2 2 AT1G10130.1 | Symbols:ECA3,ATECA3 | ARABIDOPSIS THALIANA ER-TYPE CA2+-ATPASE 3,endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3 | endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3 | Chr1:3311139-3321941 FORWARD LENGTH=998 1 2 2 2 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 2.2 2.2 2.2 109.06 998 998 1 2 0.00039896 3.5117 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.5 0 0 0.7 6557900 0 6557900 6557900 0 6557900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 245 4338;34924 True;True 4947;39779 24069;190170 31097;242414 31097;242414 AT1G10200.1;AT1G10200.2 AT1G10200.1;AT1G10200.2 5;3 5;3 5;3 AT1G10200.1 | Symbols:WLIM1,AtWLIM1 | WLIM1 | GATA type zinc finger transcription factor family protein | Chr1:3346677-3347763 REVERSE LENGTH=190;AT1G10200.2 | Symbols:WLIM1,AtWLIM1 | WLIM1 | GATA type zinc finger transcription factor family protein | 2 5 5 5 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 20.5 20.5 20.5 21.04 190 190;148 2.06 4 7 5 0 11.597 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96223 0.93649 20.258 15 5 Leave out requantified 1.3023 1.0338 0.6679 0.96223 1.1956 0.93649 0.7986 1.0809 38.954 22.919 42.566 7.2707 4 4 4 3 2 1 2 0 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 16.8 20.5 16.8 11.6 1815300000 901590000 913680000 330480000 155310000 175170000 542580000 278450000 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AT1G10370.1 | Symbols:ATGSTU17,ERD9,GST30B,GST30,GSTU17 | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 30B,GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 30,GLUTATHIONE S-TRANSFERASE TAU 17,GLUTATHIONE S-TRANSFERASE U17,EARLY-RESPONSIVE TO DEHYDRATION 9 | Glutathione S-transferase family protei 1 7 7 7 7 7 6 6 7 7 6 6 7 7 6 6 33 33 33 25.307 227 227 2.14 14 21 22 0 58.448 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89776 0.87277 18.934 54 13 Leave out requantified 0.8977 0.74807 1.7631 1.0897 0.86961 0.72051 2.0542 1.2365 24.306 30.402 9.8024 12.154 13 14 13 14 2 3 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33 33 29.1 30 10078000000 5049300000 5028400000 2095200000 1217400000 877850000 2605600000 1523900000 1081700000 3412200000 1281700000 2130500000 1964700000 1026400000 938330000 250 1146;3789;12289;18713;31534;37093;37825 True;True;True;True;True;True;True 1290;4336;13888;21156;35952;42253;43069;43070 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Symbols:PP2A-2 | protein phosphatase 2A-2 | protein phosphatase 2A-2 | Chr1:3428705-3430437 REVERSE LENGTH=306 2 9 6 1 5 7 7 8 3 4 4 5 1 1 1 0 33 25.5 5.6 34.934 306 306;306 2.24 3 10 8 0 50.343 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92018 0.89625 16.741 20 6 Leave out requantified 0.90748 1.0324 0.92308 0.77736 0.82838 0.9385 1.0895 0.87165 35.259 20.153 16.407 17.033 5 4 6 5 3 0 3 0 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 21.6 28.1 28.1 27.5 1260300000 671030000 589310000 230990000 109870000 121120000 237280000 130180000 107110000 515670000 272640000 243030000 276410000 158350000 118060000 252 1779;16873;19738;19920;26567;27240;27312;27921;38628 True;True;True;False;True;True;False;True;False 2018;19071;19072;22262;22459;30441;31176;31263;31940;43966 10057;10058;10059;10060;10061;10062;93053;93054;93055;93056;93057;108832;109638;109639;109640;147011;147012;147013;147014;147015;150283;150284;150285;150698;150699;150700;150701;153558;210864;210865;210866;210867 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MS/MS By MS/MS 0.87038 1.0973 60.385 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 2.9 2.9 4.5 4.5 78004000 44864000 33140000 17219000 8816700 8402200 0 0 0 40065000 19742000 20323000 20720000 16306000 4414500 267 31636;32738;34976 True;True;True 36061;37291;39836 171952;177841;177842;177843;177844;177845;190455 219008;226561;226562;226563;226564;226565;242791 219008;226564;242791 AT1G11330.3;AT1G11330.1;AT1G11330.2 AT1G11330.3;AT1G11330.1;AT1G11330.2 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT1G11330.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-locus lectin protein kinase family protein | Chr1:3810372-3813053 FORWARD LENGTH=748;AT1G11330.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-locus lectin protein kinas 3 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 3.7 3.7 3.7 84.049 748 748;840;842 1.83 3 1 2 0 5.8294 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56504 0.73823 82.875 5 1 Median NaN NaN 0.41443 NaN NaN NaN 0.50402 NaN NaN NaN 53.972 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Symbols:PYM | partner of Y14-MAGO | partner of Y14-MAGO | Chr1:3838777-3839978 FORWARD LENGTH=204;AT1G11400.4 | Symbols:PYM | 6 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 8.3 8.3 8.3 22.588 204 204;204;204;204;204;204 2 2 1 2 0.00097809 3.2552 By matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.79561 0.91029 27.111 5 1 Median NaN NaN NaN 0.87839 NaN NaN NaN 0.97266 NaN NaN NaN 9.3727 1 1 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 3.9 3.9 3.9 8.3 191870000 104640000 87229000 35195000 19803000 15392000 47552000 29472000 18079000 31226000 14184000 17043000 77894000 41179000 36714000 271 5956;23215 True;True 6756;26078 33097;126133;126134;126135;126136 42384;161414;161415 42384;161414 AT1G11430.1 AT1G11430.1 5 5 5 AT1G11430.1 | Symbols:RIP9,MORF9 | multiple organellar RNA editing factor 9 | plastid developmental protein DAG | Chr1:3847273-3848938 FORWARD LENGTH=232 1 5 5 5 2 4 3 0 2 4 3 0 2 4 3 0 28.4 28.4 28.4 26.2 232 232 2.08 3 5 4 0 54.767 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67542 0.77102 64.471 10 5 Leave out 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motifs) family protein | Chr1:3914895-3917941 FORWARD LENGTH=405;AT1G11650.1 | Symbols:RBP45B,ATRBP45B | | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr1:3914895-3917301 FORWA 2 7 7 7 4 5 5 6 4 5 5 6 4 5 5 6 20.2 20.2 20.2 44.114 405 405;306 1.97 9 13 8 0 74.15 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66522 0.78624 16.33 23 11 Leave out requantified 4.131 1.2695 0.66522 0.74855 4.0022 1.1778 0.78624 0.86574 68.543 0.09791 7.9298 10.203 4 6 5 8 4 2 1 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.9 13.8 14.3 17 2539000000 890350000 1648600000 522820000 101050000 421770000 598360000 163830000 434530000 724910000 354010000 370910000 692880000 271460000 421420000 275 2570;4276;11883;22509;26459;28569;36275 True;True;True;True;True;True;True 2932;4876;13435;25322;30314;32686;41317 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Symbols:ATSS3,SS3 | starch synthase 3 | starch synthase 3 | Chr1:3951597-3956840 FORWARD LENGTH=1094 2 13 13 13 7 7 8 8 7 7 8 8 7 7 8 8 16.3 16.3 16.3 118.51 1042 1042;1094 1.97 12 12 11 0 76.263 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94361 0.94827 27.495 24 10 Leave out requantified 1.1168 1.1796 0.72712 0.73067 1.0563 1.0469 0.83859 0.80094 18.85 13.365 8.0829 29.039 6 6 6 6 2 2 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 8.6 10 10.6 2864000000 1407600000 1456400000 609530000 279200000 330330000 655560000 315760000 339800000 1028500000 495660000 532880000 570390000 316950000 253440000 277 1834;2871;3575;3890;5450;6554;10161;12677;24154;28349;29409;33838;35406 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2084;3290;4085;4447;4448;6200;7465;11495;14324;27205;32432;33620;38550;40326 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fumarylacetoacetase | Chr1:4072904-4075856 FORWARD LENGTH=421 1 8 8 8 7 6 5 7 7 6 5 7 7 6 5 7 26.6 26.6 26.6 46.095 421 421 2 11 13 11 0 42.82 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0055 1.0426 33.184 29 9 Leave out requantified 1.5288 2.0043 0.52471 0.64252 1.4717 1.8531 0.63611 0.72058 19.373 28.681 33.23 5.456 5 6 9 9 0 0 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.7 21.9 15.9 20.7 2582100000 1303600000 1278500000 422660000 162760000 259900000 494130000 153680000 340450000 803800000 555530000 248270000 861460000 431580000 429880000 288 4568;4929;5600;14422;14575;17473;26909;29125 True;True;True;True;True;True;True;True 5216;5619;6360;16342;16510;19764;30816;33303 25363;25364;25365;25366;25367;25368;25369;27317;27318;31008;31009;31010;31011;31012;31013;31014;31015;31016;79774;79775;79776;80651;80652;80653;80654;80655;96505;96506;96507;96508;96509;148681;148682;148683;159912 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True;True;True;True;True;True 8165;12064;13209;16466;18387;30774 40033;40034;40035;40036;58356;58357;63817;63818;63819;63820;63821;63822;63823;63824;63825;63826;63827;63828;80463;80464;80465;80466;80467;89771;148539;148540;148541;148542 51146;51147;51148;51149;51150;51151;51152;74941;74942;82076;82077;82078;82079;82080;82081;82082;82083;82084;82085;82086;82087;82088;82089;82090;82091;82092;82093;82094;82095;103790;103791;103792;103793;103794;103795;103796;103797;103798;103799;103800;115188;189260;189261;189262 51149;74941;82083;103798;115188;189262 AT1G12470.1 AT1G12470.1 10 10 10 AT1G12470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | zinc ion binding protein | Chr1:4251359-4257201 FORWARD LENGTH=988 1 10 10 10 5 6 9 4 5 6 9 4 5 6 9 4 12.8 12.8 12.8 112.32 988 988 1.96 8 11 7 0 35.772 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0683 1.2105 25.053 25 10 Leave out requantified 0.76654 1.0007 1.171 0.95827 0.7 0.91382 1.2962 1.0854 41.065 30.374 27.312 83.35 6 6 9 4 2 2 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 5.9 8.8 9.9 6 1391300000 737010000 654300000 225940000 118580000 107370000 314680000 159440000 155240000 647560000 376820000 270750000 203130000 82183000 120940000 300 2258;7395;11373;11508;22079;27489;28648;29021;35034;35317 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2543;8405;12847;12997;24819;31455;32780;33187;39898;40230 12544;12545;41218;41219;41220;62017;62018;62019;62020;62944;62945;62946;120284;120285;151572;157567;157568;157569;157570;159371;159372;159373;159374;190719;192409;192410 16247;16248;52766;52767;52768;52769;79738;79739;79740;79741;79742;81025;81026;154011;154012;193177;200745;200746;200747;200748;200749;200750;200751;200752;202991;202992;202993;243115;245312;245313 16247;52766;79742;81025;154012;193177;200750;202991;243115;245312 AT1G12480.1 AT1G12480.1 1 1 1 AT1G12480.1 | Symbols:SLAC1,CDI3,RCD3,OZS1 | CARBON DIOXIDE INSENSITIVE 3,SLOW ANION CHANNEL-ASSOCIATED 1,RADICAL-INDUCED CELL DEATH 3,OZONE-SENSITIVE 1 | C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein | Chr1:4257427-4259249 REVERSE LENGTH=556 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1.8 1.8 1.8 63.234 556 556 2.5 1 1 0.0065649 2.1505 By MS/MS By MS/MS 0.7535 0.8265 1.2654 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 1.8 1.8 203840000 132140000 71700000 0 0 0 0 0 0 129000000 84813000 44188000 74837000 47325000 27512000 301 5084 True 5788 28096;28097 36163;36164;36165 36164 AT1G12520.1;AT1G12520.2;AT1G12520.3 AT1G12520.1;AT1G12520.2;AT1G12520.3 2;2;1 2;2;1 2;2;1 AT1G12520.1 | Symbols:ATCCS,CCS | copper chaperone for SOD1 | copper chaperone for SOD1 | Chr1:4267277-4268900 REVERSE LENGTH=320;AT1G12520.2 | Symbols:ATCCS,CCS | copper chaperone for SOD1 | copper chaperone for SOD1 | Chr1:4267277-4268438 REVERSE LEN 3 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.2 6.2 6.2 33.851 320 320;229;184 1.67 3 2 1 0 5.195 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.48643 0.45922 151.23 6 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THALIANA UDP-GLC 4-EPIMERASE 1,UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 1 | UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 1 | Chr1:4356124-4358120 REVERSE LENGTH=351 1 11 11 9 9 9 11 10 9 9 11 10 8 7 9 8 36.8 36.8 31.3 39.157 351 351 2.08 14 17 18 0 38.608 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0551 1.1634 18.878 44 9 Leave out requantified 0.96122 1.3764 0.94562 0.90102 0.89702 1.268 1.1203 1.0322 21.379 18.063 23.993 19.227 11 10 13 10 2 2 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.6 31.6 36.8 31.9 4604600000 2212400000 2392200000 556270000 268930000 287340000 1045300000 427300000 617960000 1852700000 958510000 894180000 1150400000 557700000 592710000 305 3763;9317;10782;19243;20942;22545;28280;29246;36937;37840;38522 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4304;10536;12181;21728;23567;25359;32357;33434;42087;43094;43845 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2A subunit A3 | Chr1:4563692-4567348 REVERSE LENGTH=587;AT1G13320.1 | Symbols:PP2AA3 | protein phosphatase 2A subunit A3 | protein phosphatase 2A subunit A3 | Chr1 4 16 7 7 14 15 13 13 7 6 6 6 7 6 6 6 34.4 18.1 18.1 65.516 587 587;587;537;412 2.03 13 10 14 0 54.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1361 1.1776 10.693 30 10 Leave out requantified 1.2638 1.0338 0.98332 1.0044 1.1988 0.96856 1.277 1.1389 10.354 24.08 18.841 34.948 9 7 6 8 3 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.5 31.3 27.9 27.9 3355400000 1700000000 1655500000 760770000 377740000 383040000 829590000 391770000 437820000 969090000 501890000 467200000 795990000 428560000 367430000 319 53;3913;4747;6443;7245;7246;9270;9751;10615;21058;21863;21955;28428;29741;30312;38484 False;False;False;False;False;False;False;True;True;False;True;True;False;True;True;True 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6-phosphogluconolactonase 1 | Chr1:4694475-4695600 REVERSE LENGTH=268;AT1G13700.2 | Symbols:PGL1 | 6-phosphogluconolactonase 1 | 6-phosphogluconolactonase 1 | Chr1:4694475-4695600 REVERSE LENGT 3 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 4.5 4.5 4.5 29.887 268 268;268;268 2 1 0.0017091 2.8817 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 4.5 0 33603000 22395000 11209000 0 0 0 0 0 0 33603000 22395000 11209000 0 0 0 325 34005 True 38754 184925 235596 235596 AT1G13730.2;AT1G13730.1 AT1G13730.2;AT1G13730.1 2;2 2;2 2;2 AT1G13730.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein | Chr1:4710519-4712332 FORWARD LENGTH=428;AT1G13730.1 | Symbols:no symb 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 5.1 5.1 5.1 46.803 428 428;428 1.67 3 2 1 0.00058928 3.2834 By matching By MS/MS By matching By MS/MS 0.94942 0.93499 2.4974 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glycoprotein family protein | Chr1:5062168-5064697 REVERSE LENGTH=601;AT1G14710.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hydroxyproline-rich glyco 2 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 2.3 2.3 2.3 66.203 601 601;601 1 1 0.0013443 3.0323 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 2.3 40204000 25939000 14265000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40204000 25939000 14265000 346 23049 True 25897 125278 160361 160361 AT1G14730.1 AT1G14730.1 1 1 1 AT1G14730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family | Chr1:5073244-5074568 FORWARD LENGTH=224 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 5.8 5.8 5.8 24.781 224 224 2.33 1 2 0.0020526 2.666 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 5.8 5.8 0 5.8 15860000 13231000 2628300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15860000 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DYNAMIN-like 1C | Chr1:5107699-5111470 REVERSE LENGTH=614 1 19 14 14 13 14 12 15 8 12 10 11 8 12 10 11 35.8 29.8 29.8 68.722 614 614 2.02 14 14 15 0 42.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93058 0.9879 12.508 43 22 Leave out requantified 1.1185 0.98336 0.74144 1.0463 1.0654 0.92204 0.89742 1.1829 19.931 13.571 18.118 16.593 8 13 10 12 4 7 4 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 29.2 24.9 30.3 3239300000 1684800000 1554500000 441700000 215970000 225730000 898660000 440000000 458670000 859260000 510500000 348760000 1039700000 518340000 521380000 350 4878;8485;10208;10627;14403;14731;14911;18550;21424;24342;24965;29558;29684;30589;30591;31088;31758;32186;37567 True;False;True;True;True;False;True;True;True;False;True;True;False;False;True;True;True;True;True 5566;9623;11550;12001;16321;16683;16879;20982;24109;27520;28460;33779;33918;34919;34921;35464;36199;36671;42782 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PLANT CADMIUM RESISTANCE 1 | Chr1:5132791-5133663 REVERSE LENGTH=151 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 22.5 22.5 22.5 16.503 151 151 1.71 9 4 4 0 38.946 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.26683 0.30858 188.26 5 5 Median NaN NaN 0.15631 NaN NaN NaN 0.17615 NaN NaN NaN 79.284 NaN 1 1 2 1 1 1 2 1 Median Median Median Median 22.5 13.2 22.5 13.2 310740000 163770000 146960000 67281000 272340 67008000 64832000 3498700 61333000 89220000 76439000 12781000 89405000 83565000 5840700 353 13032;27651 True;True 14720;14721;31647;31648;31649 70999;71000;152391;152392;152393;152394;152395;152396;152397;152398;152399;152400;152401;152402;152403;152404;152405 91207;91208;194203;194204;194205;194206;194207;194208;194209;194210;194211;194212;194213;194214;194215;194216;194217;194218;194219;194220 91207;194215 394;395;396 121;140;149 AT1G14900.1 AT1G14900.1 1 1 1 AT1G14900.1 | Symbols:HMGA | high mobility group A | high mobility group A | Chr1:5138665-5139353 REVERSE LENGTH=204 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 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name available | FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase | Chr1:5210403-5212137 REVERSE LENGTH=295;AT1G15140.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase | Ch 3 8 8 8 5 6 8 7 5 6 8 7 5 6 8 7 26.4 26.4 26.4 31.923 295 295;271;271 2.13 10 13 15 0 36.815 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77913 0.88768 32.299 37 13 Leave out requantified 0.68938 1.0391 0.68388 0.83043 0.65397 0.9839 0.81241 0.91078 16.214 22.092 21.375 33.597 6 9 12 10 2 2 7 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 23.7 26.4 26.4 6000400000 3421400000 2579000000 874690000 529600000 345090000 1371100000 648570000 722500000 2339400000 1466500000 872850000 1415200000 776660000 638550000 360 3404;11433;12454;12983;29535;29997;37543;37544 True;True;True;True;True;True;True;True 3887;12911;14074;14666;33755;34254;42754;42755 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full name available | Zinc-binding ribosomal protein family protein | Chr1:5248825-5249381 REVERSE LENGTH=95;AT1G15250.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Zinc-binding ribosomal prote 4 5 5 1 5 5 5 5 5 5 5 5 1 1 1 1 41.1 41.1 8.4 10.816 95 95;95;95;79 2 12 12 12 0 13.994 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97122 1.0081 8.1455 34 4 Leave out requantified 0.98436 0.95993 0.92752 0.99043 0.92349 0.93758 1.1122 1.0705 18.079 11.373 5.9598 12.186 8 8 9 9 0 2 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.1 41.1 41.1 41.1 22996000000 11483000000 11513000000 5194400000 2552500000 2641900000 5276200000 2741200000 2534900000 6675700000 3223500000 3452200000 5849200000 2965300000 2884000000 362 4432;8413;14959;29521;34379 True;True;True;True;True 5061;9536;16935;33740;39173 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methyl-CPG-binding domain 10 | methyl-CPG-binding domain 10 | Chr1:5275895-5277474 REVERSE 2 21 21 19 15 17 18 16 15 17 18 16 14 16 17 14 66.4 66.4 64.3 42.357 384 384;332 1.99 37 48 36 0 196.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.054 1.0626 18.044 99 33 Leave out requantified 0.91913 0.96747 1.3157 1.0696 0.87269 0.93105 1.6039 1.2615 33.821 15.641 26.455 14.486 24 26 28 21 6 4 14 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 58.1 66.1 61.5 54.2 14512000000 7041500000 7470500000 2598800000 1322900000 1275900000 3972300000 1994200000 1978100000 4550200000 2048100000 2502100000 3390700000 1676300000 1714400000 366 1467;1581;3565;7256;7515;8387;8388;8445;8446;9489;9831;9832;14878;18655;19587;19694;19695;19709;24221;27390;29886 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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pyrophosphatase family protein | Chr1:5399115-5402185 FORWARD LENGTH=770;AT1G15690.2 | Symbols:AtVHP1;1,AtAVP1,ATAVP3,AVP-3,AVP1,FUG 2 20 20 20 19 18 17 18 19 18 17 18 19 18 17 18 26 26 26 80.819 770 770;642 1.98 94 87 88 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88811 0.91834 113.06 134 33 Leave out requantified 0.89143 1.2971 0.82925 0.65384 0.84752 1.2599 0.97162 0.69972 121.37 16.314 12.171 15.238 35 33 33 33 10 8 5 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.1 25.1 24.2 25.1 119730000000 63284000000 56449000000 28923000000 15403000000 13520000000 29343000000 12736000000 16607000000 33136000000 18413000000 14723000000 28331000000 16733000000 11599000000 369 94;450;451;1153;1371;8587;9717;16331;18041;19925;23340;23341;24766;25416;25569;27079;31462;32027;35405;38733 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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| Symbols:STR2,ATMST2,RDH2,MST2,ATRDH2,ST2 | ARABIDOPSIS THALIANA MERCAPTOPYRUVATE SULFURTRANSFERASE 2,SULFURTRANSFERASE 2,rhodanese homologue 2,MERCAPTOPYRUVATE SULFURTRANSFERASE 2 | rhodanese homologue 2 | Chr1:5620153-5621981 REVERSE LENGT 6 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 45.5 45.5 45.5 29.451 266 266;290;318;318;318;342 1.93 11 8 9 0 52.949 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82799 0.93249 15.899 26 3 Leave out requantified 1.043 1.2693 0.56685 0.73271 0.9715 1.1659 0.67238 0.88688 21.951 14.6 31.769 19.355 7 7 5 7 2 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.3 38.7 38.7 41.7 2481800000 1328200000 1153600000 617140000 279440000 337700000 559810000 244850000 314960000 725300000 464230000 261070000 579530000 339700000 239830000 387 2736;3029;3140;4509;10812;14058;18577;34390 True;True;True;True;True;True;True;True 3142;3469;3593;5154;12212;15889;21011;39189 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domain-containing protein | Chr1:5837653-5840202 FORWARD LENGTH=849 1 3 3 3 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 4.1 4.1 4.1 96.883 849 849 1.4 3 2 0 6.7758 By matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.69252 0.71118 13.979 4 0 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.2 1.2 2.7 1.4 201100000 103150000 97954000 40046000 19930000 20116000 55450000 22652000 32797000 78791000 41011000 37780000 26815000 19554000 7260500 402 9731;10926;21681 True;True;True 11018;12336;24389 53219;53220;53221;59622;118452 68270;76570;151711;151712 68270;76570;151712 AT1G17100.1 AT1G17100.1 7 7 7 AT1G17100.1 | Symbols:AtHBP1,HBP1 | haem-binding protein 1 | SOUL heme-binding family protein | Chr1:5844766-5845539 FORWARD LENGTH=232 1 7 7 7 5 5 7 5 5 5 7 5 5 5 7 5 45.7 45.7 45.7 25.388 232 232 2.2 9 14 17 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82862 0.9025 20.33 25 5 Leave out requantified 0.98488 1.3291 0.72038 0.49602 0.95652 1.2101 0.88362 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Rossmann-fold superfamily protein | Chr1:6154478-6155440 REVERSE LENGTH=320;AT1G17890.2 | Symbols:GER2 | | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr1:6154478-6155440 REVERSE LENGTH=320;AT1G17 4 3 3 3 1 2 3 1 1 2 3 1 1 2 3 1 10.6 10.6 10.6 35.421 320 320;320;328;323 2.25 2 2 4 0 7.4003 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0122 1.0849 28.431 8 3 Median NaN 1.2586 0.83864 NaN NaN 1.1622 1.0643 NaN NaN 41.589 20.019 NaN 1 3 3 1 0 1 2 0 Median Median Median Median 2.8 6.9 10.6 2.8 640040000 291420000 348620000 103880000 49259000 54618000 196740000 66812000 129930000 226200000 107290000 118910000 113220000 68064000 45160000 424 20278;21986;23770 True;True;True 22852;24716;26694 111629;111630;111631;111632;111633;119831;129235;129236 143146;143147;143148;143149;153407;165367;165368 143146;153407;165368 AT1G17960.2 AT1G17960.2 2 1 1 AT1G17960.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Threonyl-tRNA synthetase | Chr1:6181015-6183737 REVERSE LENGTH=385 1 2 1 1 1 1 2 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RECEPTOR FOR ACTIVATED C KINASE 1 A,Suppressor of Acaulis 53 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr1:6222325-6223901 FORWARD LENGTH=327 1 22 22 17 21 20 22 20 21 20 22 20 16 15 17 15 65.1 65.1 53.5 35.747 327 327 2.14 49 64 76 0 224.39 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92589 0.9742 32.531 144 20 Leave out requantified 1.0821 1.0867 0.80592 0.8161 1.0778 1.0537 0.92138 0.90556 37.176 26.678 20.921 26.132 34 36 37 37 4 3 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 64.2 63.9 65.1 63 70835000000 35156000000 35679000000 13348000000 6064500000 7283100000 18205000000 8227600000 9977000000 21641000000 11561000000 10080000000 17642000000 9302500000 8339100000 429 694;695;915;1585;4083;4893;5409;5410;5741;6961;7117;11958;18471;23794;23807;27316;29726;29727;31204;37684;39333;39494 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Symbols:RBGA1,GR-RBP6 | RNA-binding glycine-rich protein A1,glycine-rich RNA-binding protein 6 | glycine-rich RNA-binding protein 6 | Chr1:6415226-6416283 FORWARD LENGTH=155 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 10.3 10.3 10.3 15.96 155 155 2 1 0.001712 2.9029 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 10.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 440 16799 True 18988 92567 118662 118662 AT1G18640.2;AT1G18640.3 AT1G18640.2;AT1G18640.3 4;3 4;3 4;3 AT1G18640.2 | Symbols:PSP,PSP1 | phosphoserine phosphatase 1,3-phosphoserine phosphatase | 3-phosphoserine phosphatase | Chr1:6416524-6418245 REVERSE LENGTH=295;AT1G18640.3 | Symbols:PSP,PSP1 | phosphoserine phosphatase 1,3-phosphoserine phosphatase | 3 2 4 4 4 2 3 4 3 2 3 4 3 2 3 4 3 15.3 15.3 15.3 32.318 295 295;279 2.23 3 4 6 0 11.23 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.46777 0.54256 24.506 11 6 Leave out requantified 1.0731 2.3049 0.43751 0.55101 1.0087 2.1152 0.54575 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germin-like protein 4 | germin-like protein 4 | Chr1:6554702-6555364 REVERSE LENGTH=220 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 10.5 10.5 10.5 23.213 220 220 2.33 4 2 0 7.0544 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.013 1.1461 113.88 5 5 Median NaN NaN 0.5732 NaN NaN NaN 0.6743 NaN NaN NaN 75.011 NaN 1 1 2 1 1 1 2 1 Median Median Median Median 5.5 5.5 10.5 5.5 313900000 146570000 167330000 42393000 4161800 38231000 57602000 10144000 47458000 157700000 103020000 54683000 56200000 29243000 26958000 448 3046;36191 True;True 3492;41215 17283;197305;197306;197307;197308;197309 22344;251680;251681;251682;251683;251684 22344;251684 230 48 AT1G19000.2;AT1G19000.1;AT5G04760.1;AT1G70000.2;AT1G70000.1;AT3G11280.2;AT3G11280.1;AT5G01200.1;AT5G05790.2;AT5G05790.1;AT5G58900.1;AT2G38090.1;AT1G49010.1;AT5G61620.1;AT5G47390.1;AT3G16350.1 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Chr1:6609545-6610555 REVERSE LENGTH=192 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 14.1 14.1 14.1 21.64 192 192 2.17 2 1 3 0 5.882 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0094 1.1834 109.76 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 6.2 6.2 6.2 14.1 78545000 48200000 30345000 0 0 0 20862000 6150200 14711000 22008000 18001000 4006400 35676000 24049000 11627000 451 6908;11777 True;True 7863;13316 38630;38631;38632;38633;38634;64368 49449;49450;49451;49452;49453;82834 49453;82834 470 187 AT1G19140.1;AT1G19140.2 AT1G19140.1;AT1G19140.2 3;3 3;3 3;3 AT1G19140.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquinone biosynthesis COQ9-like protein | Chr1:6611026-6612414 REVERSE LENGTH=311;AT1G19140.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquinone biosynthesis COQ9-li 2 3 3 3 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 14.5 14.5 14.5 34.341 311 311;312 1.89 4 2 3 0 19.739 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7491 0.72127 52.958 5 3 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subunit A | Chr1:6763976-6764686 FORWARD LENGTH=117;AT1G19530.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | DNA polymerase epsilon catalyt 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.3 10.3 10.3 13.656 117 117;117 2 2 1 2 0.00040984 3.9155 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0789 1.1642 138.88 5 2 Median NaN NaN NaN 1.1922 NaN NaN NaN 1.293 NaN NaN NaN 14.84 1 1 1 2 0 0 0 2 Median Median Median Median 10.3 10.3 10.3 10.3 214370000 98071000 116300000 35844000 31112000 4731800 29010000 11230000 17781000 55721000 9933700 45787000 93791000 45796000 47996000 457 23726 True 26646 129008;129009;129010;129011;129012 165073;165074;165075;165076;165077;165078 165073 AT1G19570.1;AT1G19550.1 AT1G19570.1 10;3 10;3 10;3 AT1G19570.1 | Symbols:ATDHAR1,DHAR1,DHAR5 | DEHYDROASCORBATE REDUCTASE 5,dehydroascorbate reductase | dehydroascorbate reductase | Chr1:6773462-6774413 REVERSE LENGTH=213 2 10 10 10 10 9 10 8 10 9 10 8 10 9 10 8 53.1 53.1 53.1 23.641 213 213;153 2.2 16 21 29 0 154.96 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93815 0.92215 25.894 60 17 Leave out requantified 0.83384 0.92783 0.76676 1.0193 0.79027 0.86967 0.89863 1.1838 24.697 14.903 33.276 13.837 15 15 16 14 3 2 6 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 53.1 47.9 53.1 49.8 15780000000 8799500000 6980600000 2573400000 1436200000 1137200000 3385400000 1771500000 1613900000 4695000000 2838200000 1856800000 5126200000 2753600000 2372700000 458 445;2116;2290;16410;29494;33028;33402;36840;38118;39426 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 502;2391;2576;18559;33710;37612;38055;41980;43389;44866 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AT1G20110.1 5 5 5 AT1G20110.1 | Symbols:FREE1,FYVE1 | FYVE-domain protein 1,FYVE domain protein required for endosomal sorting 1 | RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein | Chr1:6971554-6974578 FORWARD LENGTH=601 1 5 5 5 0 4 3 1 0 4 3 1 0 4 3 1 9.3 9.3 9.3 65.395 601 601 1.75 3 4 1 0 14.663 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76711 0.73807 56.273 5 5 Median NaN 0.76904 NaN NaN NaN 2.4434 NaN NaN NaN 73.186 NaN NaN 0 3 1 1 0 3 1 1 Median Plateau Median Median 0 7.5 5.3 2.2 209780000 103300000 106480000 0 0 0 99531000 36074000 63457000 71192000 44818000 26374000 39056000 22411000 16645000 470 751;10880;16255;20575;33497 True;True;True;True;True 840;12286;18389;23170;38164 4329;4330;4331;59388;89773;113008;182099;182100 5656;5657;5658;76267;115190;144859;231954;231955 5658;76267;115190;144859;231954 AT1G20190.2;AT1G20190.1 AT1G20190.2;AT1G20190.1 4;4 4;4 4;4 AT1G20190.2 | Symbols:EXPA11,ATHEXP ALPHA 1.14,ATEXP11,EXP11,ATEXPA11 | EXPANSIN 11,expansin 11 | expansin 11 | Chr1:6998762-6999449 REVERSE LENGTH=193;AT1G20190.1 | Symbols:EXPA11,ATHEXP ALPHA 1.14,ATEXP11,EXP11,ATEXPA11 | EXPANSIN 11,expansin 11 | e 2 4 4 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 25.4 25.4 25.4 21.011 193 193;252 2.04 7 10 8 0 24.468 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7457 1.6305 26.063 21 6 Leave out requantified 1.5873 0.61847 1.459 2.3976 1.4779 0.56435 1.6947 2.9711 13.893 6.5816 9.835 18.874 2 5 6 8 0 0 2 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 16.1 20.2 25.4 1681400000 658850000 1022600000 92780000 31052000 61727000 412850000 260480000 152370000 339220000 138340000 200870000 836550000 228970000 607580000 471 7149;13325;15707;18093 True;True;True;True 8131;15044;17777;17778;20476 39913;39914;72565;72566;72567;72568;72569;86783;86784;86785;86786;86787;86788;86789;99934;99935;99936;99937;99938;99939;99940;99941;99942;99943;99944 50990;50991;93191;93192;93193;93194;93195;111798;111799;111800;111801;111802;111803;111804;128054;128055;128056;128057;128058;128059;128060;128061;128062;128063;128064 50990;93193;111801;128058 495 70 AT1G20200.1 AT1G20200.1 18 18 8 AT1G20200.1 | Symbols:HAP15,EMB2719 | HAPLESS 15,EMBRYO DEFECTIVE 2719 | PAM domain (PCI/PINT associated module) protein | Chr1:7001409-7004154 REVERSE LENGTH=488 1 18 18 8 16 17 18 16 16 17 18 16 7 7 8 8 42.6 42.6 20.7 55.582 488 488 2 35 36 35 0 224.68 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0645 1.0957 26.725 84 20 Leave out requantified 1.2476 1.195 0.94049 0.76024 1.2055 1.0808 1.1277 0.89894 26.967 25.63 28.71 28.516 22 20 24 18 4 7 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.5 41 42.6 38.9 14959000000 7587100000 7371400000 3015100000 1308100000 1706900000 2938200000 1298300000 1639900000 4877100000 2636100000 2241000000 4128200000 2344600000 1783600000 472 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Thioredoxin superfamily protein | Chr1:7007966-7009318 REVERSE LENGTH=233 1 4 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 22.7 22.7 22.7 26.052 233 233 2.14 7 10 11 0 101.32 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.45239 0.54737 95.891 5 1 Median NaN NaN 0.32245 NaN NaN NaN 0.37464 NaN NaN NaN 53.623 NaN 1 1 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 19.7 19.7 22.7 22.7 262930000 150780000 112150000 47648000 20638000 27009000 51943000 13441000 38502000 110960000 79222000 31741000 52376000 37483000 14893000 474 4787;5273;15278;21294 True;True;True;True 5467;6005;17295;23967;23968 26590;26591;29144;29145;29146;29147;84440;84441;84442;84443;84444;84445;84446;84447;84448;84449;116525;116526;116527;116528;116529;116530;116531;116532;116533;116534;116535;116536 34238;34239;37459;37460;37461;37462;37463;108876;108877;108878;108879;108880;108881;108882;108883;108884;108885;108886;149260;149261;149262;149263;149264;149265;149266;149267;149268;149269;149270;149271;149272;149273 34238;37460;108883;149264 241;242 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methyltransferase 2,COTYLEDON VASCULAR PATTERN 1,FRILL1 | sterol methyltransferase 2 | Chr1:7038968-7040053 REVERSE LENGTH=361 1 9 9 8 4 6 5 6 4 6 5 6 4 5 5 6 29.9 29.9 28 40.45 361 361 2.03 9 10 10 0 26.271 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79146 0.8216 31.558 28 15 Leave out requantified 1.1321 0.71887 0.81469 1.0824 1.0552 0.65572 0.98998 1.2513 31.61 36.07 17.3 13.991 5 7 8 8 3 3 4 5 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.6 19.9 18 20.8 2354800000 1276000000 1078800000 396710000 214820000 181890000 609530000 362450000 247080000 674850000 367800000 307050000 673750000 330920000 342830000 476 3677;4133;5770;11396;17303;19493;19806;31805;36139 True;True;True;True;True;True;True;True;True 4207;4725;6546;12871;19570;19571;21999;22334;36249;41153 20645;20646;20647;20648;23165;23166;31937;31938;31939;31940;62172;95644;95645;95646;95647;95648;95649;95650;95651;95652;95653;95654;95655;107669;109139;109140;172837;197028;197029 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LENGTH=259;AT1G20450.1 | Symbols:LTI45,ERD10,LTI29 | EARLY RESPON 2 9 8 8 7 7 8 7 7 6 7 6 7 6 7 6 42.9 39.4 39.4 29.443 259 259;260 1.89 18 13 13 0 41.692 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0578 0.97799 28.903 36 12 Leave out requantified 1.0578 1.3375 0.47047 1.1846 0.97799 1.2258 0.53002 1.3219 15.123 9.5158 30.835 37.682 10 9 9 8 2 3 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.3 35.1 38.2 32.8 3036100000 1561900000 1474200000 481730000 241280000 240450000 724940000 284530000 440420000 1006200000 631310000 374910000 823180000 404740000 418440000 479 8860;14203;15667;18291;19479;26398;33555;34057;34686 False;True;True;True;True;True;True;True;True 10030;16065;16066;17734;20687;21983;30244;38225;38815;38816;39518 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Symbols:OPCL1 | OPC-8:0 CoA ligase1 | OPC-8:0 CoA ligase1 | Chr1:7104362-7105856 REVERSE LENGTH=468;AT1G20510.2 | Symbols:O 3 10 10 10 4 7 5 5 4 7 5 5 4 7 5 5 26.2 26.2 26.2 59.374 546 546;468;473 1.96 7 11 6 0 49.601 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.7694 2.6237 48.494 16 9 Leave out requantified 2.7651 3.2766 0.28869 0.2854 2.5155 3.0791 0.3432 0.32293 2.8422 44.702 77.946 101.11 3 6 3 4 1 4 2 2 Median Median Median Median 10.3 17.4 12.6 12.3 656830000 330440000 326390000 81653000 20789000 60864000 166530000 37197000 129330000 177830000 134000000 43827000 230820000 138460000 92363000 480 3731;6565;11216;17440;19762;29279;32807;33448;34529;39128 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4269;7477;12670;19728;22289;33469;37369;38107;39337;44529;44530 20947;36331;36332;36333;61280;61281;61282;61283;61284;96353;108931;108932;160604;160605;160606;178207;178208;181823;187850;187851;213648;213649;213650;213651 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family protein | Chr1:7232025-7233367 FORWARD LENGTH=232;AT1G20810.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | FKBP-like pe 2 7 7 7 5 3 5 4 5 3 5 4 5 3 5 4 30.6 30.6 30.6 25.53 232 232;229 1.9 7 9 5 0 17.658 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86691 0.82754 23.475 19 10 Leave out requantified 0.8384 1.4322 0.65465 0.7365 0.78364 1.279 0.75617 0.82271 15.397 29.832 31.997 26.043 6 3 7 3 2 1 5 2 Leave out requantified Median Median Median 30.6 15.9 19.8 19.8 1295600000 777400000 518250000 343400000 216890000 126510000 172480000 84834000 87651000 577700000 357900000 219800000 202070000 117780000 84292000 489 12322;14511;19812;29546;34123;35763;37186 True;True;True;True;True;True;True 13922;16442;22340;33767;38886;40742;42356 67348;80334;109160;109161;109162;109163;161987;161988;185542;185543;185544;185545;185546;185547;185548;185549;194998;194999;202660;202661;202662 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superfamily protein | Chr1:7 5 3 3 3 1 1 3 2 1 1 3 2 1 1 3 2 20 20 20 24.822 225 225;252;265;151;151 2.22 7 2 0 12.348 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97026 0.98054 76.502 8 5 Median NaN NaN 1.0382 0.33185 NaN NaN 1.2323 0.37063 NaN NaN 82.168 105.29 1 1 3 3 0 1 2 2 Median Median Median Median 6.2 6.2 20 13.3 1246500000 725220000 521310000 158430000 86543000 71883000 60274000 23329000 36945000 480030000 262220000 217820000 547800000 353130000 194670000 500 2810;8047;39093 True;True;True 3225;9124;44491 15957;15958;15959;44291;44292;44293;44294;44295;213448 20705;20706;20707;56732;56733;56734;56735;56736;56737;272293 20705;56732;272293 AT1G21380.1 AT1G21380.1 2 2 2 AT1G21380.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Target of Myb protein 1 | Chr1:7485806-7488032 REVERSE LENGTH=506 1 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 4.7 4.7 4.7 55.791 506 506 2 1 2 1 0 5.4636 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.58328 0.63374 22.234 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 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phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 1 | phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 1 | Chr1:7735053-7738309 FORWARD LENGTH=752 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1.9 1.9 1.9 85.944 752 752 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 1.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 516 16517 True 18682 91233 116988 116988 264;2669 531 628;629 633 AT1G22200.2;AT1G22200.1 AT1G22200.2;AT1G22200.1 4;4 4;4 4;4 AT1G22200.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Endoplasmic reticulum vesicle transporter protein | Chr1:7838104-7840602 REVERSE LENGTH=338;AT1G22200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Endoplasmic reticulum v 2 4 4 4 1 4 4 2 1 4 4 2 1 4 4 2 18.9 18.9 18.9 38.334 338 338;386 2.17 2 6 4 0 9.6918 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83368 0.8759 75.452 10 6 Median NaN 1.2457 0.33562 0.40701 NaN 1.1419 0.38434 0.45613 NaN 24.434 52.981 35.588 1 4 3 2 0 3 2 1 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| transmembrane protein | Chr1:8050911-8052618 FORWARD LENGTH=241;AT1G22750.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein | Chr1:8050911-8052618 FORWA 4 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 11.2 11.2 11.2 26.983 241 241;244;247;257 2.22 2 3 4 0 10.959 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98618 1.1342 32.204 9 9 Median NaN 1.3133 0.90236 NaN NaN 1.2121 1.1551 NaN NaN 20.119 33.836 NaN 1 3 4 1 1 3 4 1 Median Median Median Median 7.1 11.2 11.2 7.1 671240000 378200000 293040000 31236000 15617000 15619000 219470000 120060000 99409000 411670000 236840000 174830000 8866700 5688800 3177900 536 3568;23070 True;True 4077;25919 19933;19934;125354;125355;125356;125357;125358;125359;125360 25718;25719;160447;160448;160449;160450;160451;160452;160453 25718;160453 AT4G09800.1;AT1G34030.1;AT1G22780.1 AT4G09800.1;AT1G34030.1;AT1G22780.1 12;12;12 12;12;12 12;12;12 AT4G09800.1 | Symbols:RPS18C | S18 ribosomal protein | S18 ribosomal protein | Chr4:6173818-6174963 FORWARD 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273 369 AT1G23100.1 AT1G23100.1 1 1 1 AT1G23100.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GroES-like family protein | Chr1:8195867-8196336 FORWARD LENGTH=97 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 16.5 16.5 16.5 10.546 97 97 2.5 1 1 0.00058997 3.3089 By MS/MS By MS/MS 0.34467 0.38592 1.9887 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 16.5 16.5 59711000 43930000 15781000 0 0 0 0 0 0 38464000 28081000 10383000 21247000 15849000 5397900 545 8214 True 9308 45100;45101 57765;57766 57766 AT1G23130.1 AT1G23130.1 8 8 8 AT1G23130.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein | Chr1:8200434-8200997 FORWARD LENGTH=160 1 8 8 8 3 8 6 6 3 8 6 6 3 8 6 6 51.2 51.2 51.2 17.859 160 160 1.86 15 12 10 0 30.013 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77696 0.80058 110.73 35 17 Leave out requantified 2.5434 5.0641 0.23443 0.37901 2.2893 4.7005 0.27371 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25087;68111;117228;153184;161490;203876;246657;247545 549;550 152;155 AT1G23180.1;AT1G23180.2 AT1G23180.1;AT1G23180.2 8;5 8;5 8;5 AT1G23180.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:8216125-8219515 FORWARD LENGTH=834;AT1G23180.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:821 2 8 8 8 4 4 6 5 4 4 6 5 4 4 6 5 14.5 14.5 14.5 91.693 834 834;630 2.2 5 6 9 0 30.968 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90492 0.89768 25.349 19 9 Leave out requantified 0.78002 1.078 1.009 0.94787 0.72255 0.99754 1.1223 0.92048 35.018 2.6454 20.693 47.587 4 4 6 5 0 1 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Plateau Median 6.8 6.1 12 8.6 710390000 352900000 357490000 154730000 74938000 79788000 121010000 67555000 53459000 257670000 120010000 137660000 176980000 90393000 86582000 547 135;9906;11122;18402;30424;30425;30926;36019 True;True;True;True;True;True;True;True 149;11212;12564;20818;34736;34737;35289;41023 792;54256;60784;101781;101782;101783;101784;166136;166137;166138;166139;166140;166141;166142;166143;168556;168557;196461;196462;196463 1121;69593;78107;130453;130454;130455;211597;211598;211599;211600;211601;211602;211603;211604;211605;211606;214686;250614;250615;250616 1121;69593;78107;130454;211599;211606;214686;250614 551 458 AT1G23190.1 AT1G23190.1 29 18 18 AT1G23190.1 | Symbols:PGM3 | phosphoglucomutase 3 | Phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein | Chr1:8219946-8224186 FORWARD LENGTH=583 1 29 18 18 24 25 23 22 14 15 15 13 14 15 15 13 66.4 40.5 40.5 63.17 583 583 1.85 44 37 28 0 226.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0511 1.075 12.837 100 32 Leave out requantified 1.1469 1.1953 0.91672 0.82301 1.0708 1.0829 1.0588 0.89784 17.497 18.303 21.544 22.946 23 29 25 23 6 11 5 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56.4 58.7 49.1 45.8 20502000000 11825000000 8677200000 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symbol available | no full name available | Acyl-CoA N-acyltran 3 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 4.1 4.1 4.1 36.019 319 319;319;319 3 1 0.0097324 1.9738 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 4.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 561 12517 True 14143 68453 87996 87996 AT1G24100.1 AT1G24100.1 5 5 5 AT1G24100.1 | Symbols:UGT74B1 | UDP-glucosyl transferase 74B1 | UDP-glucosyl transferase 74B1 | Chr1:8525547-8527010 REVERSE LENGTH=460 1 5 5 5 3 4 5 4 3 4 5 4 3 4 5 4 13.7 13.7 13.7 51.002 460 460 1.87 9 8 6 0 29.729 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9231 0.98424 16.872 20 11 Leave out requantified 1.221 0.95615 0.82615 0.95874 1.1355 0.85585 1.0002 1.1005 68.664 11.091 34.278 18.828 4 6 5 5 3 2 3 3 Median Leave out requantified Median Median 6.7 11.5 13.7 11.5 1858500000 924130000 934410000 335160000 151530000 183630000 550330000 245130000 305200000 493380000 255040000 238330000 479670000 272430000 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| Symbols:ALB4,ARTEMIS | ARABIDOPSIS THALIANA ENVELOPE MEMBR 2 7 7 7 5 3 4 5 5 3 4 5 5 3 4 5 16.8 16.8 16.8 55.187 499 499;462 2.04 8 6 9 0 28.118 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82704 0.80478 81.272 13 11 Median 0.85081 2.2523 0.52195 0.76307 0.80478 2.1344 0.61127 0.80285 74.543 129.6 0.25125 87.303 5 2 2 4 5 2 1 3 Median Median Median Median 12.8 6.6 11.8 13.6 728650000 399170000 329480000 322020000 178010000 144010000 118940000 48344000 70598000 116330000 77714000 38620000 171350000 95101000 76253000 569 775;27924;28785;29187;30194;32274;37180 True;True;True;True;True;True;True 866;31943;32931;33372;34466;36770;42349 4451;4452;4453;4454;4455;4456;4457;153563;158279;158280;158281;158282;158283;158284;158285;160173;160174;165052;175252;175253;175254;202638;202639 5829;5830;5831;5832;5833;5834;5835;195666;201639;201640;201641;201642;201643;201644;201645;204079;204080;210305;223190;223191;223192;258403;258404 5830;195666;201642;204080;210305;223192;258403 288 467 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18129;18130;18131;18132;18133;32178;32179;32180;32181;32182;51521;51522;109359;109360;109361;149444;149445;149446;149447;149448;149449;149450;149451;149452;149453;174194;174195;185512;198505;219894;219895;219896;219897;219898;219899;219900;230336;251344;251345;251346;251347;251348;251349;251350;262154;262155;262156;262157;274533 18130;32182;51521;109359;149453;174194;185512;198505;219900;230336;251344;262157;274533 593 291 AT1G25375.1 AT1G25375.1 1 1 1 AT1G25375.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein | Chr1:8900279-8903220 REVERSE LENGTH=524 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 2.5 2.5 2.5 58.066 524 524 1.67 2 1 0.00040056 3.5789 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.131 6.1293 11.538 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 1 0 1 Median Median Median Median 2.5 2.5 0 2.5 189820000 28516000 161300000 44020000 7902800 36118000 51278000 6931000 44347000 0 0 0 94517000 13682000 80835000 575 22132 True 24878 120557;120558;120559 154376;154377;154378 154378 AT1G25420.3;AT1G25420.2;AT1G25420.4;AT1G25420.1 AT1G25420.3;AT1G25420.2;AT1G25420.4;AT1G25420.1 3;3;3;3 3;3;3;3 3;3;3;3 AT1G25420.3 | Symbols:ISTL2 | IST1-LIKE 2 | Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein | Chr1:8916592-8917980 FORWARD LENGTH=255;AT1G25420.2 | Symbols:ISTL2 | IST1-LIKE 2 | Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein | Chr1:8916592 4 3 3 3 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 13.3 13.3 13.3 27.903 255 255;255;296;323 1.8 2 2 1 0 5.7893 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.2564 1.9869 98.259 3 2 Median NaN NaN 2.217 NaN NaN NaN 2.5944 NaN NaN NaN 137.24 NaN 1 0 2 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 4.7 3.9 9.4 3.9 183620000 53667000 129950000 57853000 14876000 42977000 0 0 0 118510000 31535000 86972000 7256700 7256700 0 576 7393;10251;29495 True;True;True 8403;11599;33711 41213;56048;56049;161750;161751 52761;71879;71880;206077;206078 52761;71880;206077 AT1G25490.1 AT1G25490.1 20 20 14 AT1G25490.1 | Symbols:EER1,ATB BETA BETA,RCN1,REGA | ROOTS CURL IN NPA,ENHANCED ETHYLENE RESPONSE 1 | ARM repeat superfamily protein | Chr1:8951700-8954899 FORWARD LENGTH=588 1 20 20 14 15 18 16 13 15 18 16 13 10 12 12 9 39.8 39.8 32 65.493 588 588 2.01 37 38 38 0 146.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0294 1.0909 12.72 102 21 Leave out requantified 1.154 0.9984 1.0756 0.98891 1.0586 0.897 1.2419 1.1386 27.984 15.927 13.531 21.554 26 26 26 24 6 6 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.6 36.7 33 26.7 17655000000 8833100000 8821600000 3569700000 1714700000 1855000000 3508200000 1773700000 1734600000 6121500000 3062800000 3058700000 4455200000 2281900000 2173300000 577 47;1845;2576;6443;6626;7245;7246;9270;9433;11585;17431;20117;21058;21956;22128;22179;25068;26848;32099;38483 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 54;2096;2941;7337;7548;8236;8237;10486;10689;13080;19718;22666;23692;23693;24681;24874;24926;28597;30748;36577;43803 282;283;284;10353;10354;10355;10356;10357;10358;10359;14494;14495;35755;36696;40353;40354;40355;40356;40357;40358;40359;40360;40361;40362;40363;40364;40365;40366;50942;50943;50944;50945;50946;50947;50948;50949;50950;50951;50952;50953;50954;50955;51837;51838;51839;51840;51841;51842;51843;51844;51845;51846;51847;51848;63273;96304;96305;96306;96307;96308;96309;96310;96311;96312;96313;96314;110724;110725;115192;115193;115194;115195;115196;115197;115198;115199;119700;119701;119702;119703;119704;120540;120541;120542;120543;120544;120545;120546;120547;120548;120733;120734;120735;120736;120737;120738;120739;120740;120741;138327;138328;138329;148437;148438;148439;148440;174408;174409;210039;210040;210041;210042;210043 422;13439;13440;13441;13442;13443;13444;13445;13446;18790;18791;45792;47012;51556;51557;51558;51559;51560;51561;51562;51563;51564;51565;51566;51567;51568;51569;65417;65418;65419;65420;65421;65422;65423;65424;65425;65426;65427;65428;65429;65430;65431;65432;65433;65434;65435;65436;65437;65438;65439;66533;66534;66535;66536;66537;66538;66539;66540;66541;66542;66543;66544;66545;66546;66547;66548;81404;123547;123548;123549;123550;123551;123552;123553;123554;123555;123556;123557;123558;123559;123560;123561;123562;123563;123564;123565;142033;142034;147593;147594;147595;147596;147597;147598;147599;147600;147601;147602;147603;147604;153234;153235;153236;153237;153238;153239;153240;154357;154358;154359;154360;154361;154362;154363;154364;154365;154366;154367;154610;154611;154612;154613;154614;154615;154616;154617;154618;176603;176604;189136;189137;189138;189139;189140;189141;189142;222184;222185;267943;267944;267945;267946;267947 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Di-glucose binding protein with Leucine-rich repeat domain-containing protein | Chr1:8992183-8995430 REVERSE LENGTH=628 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1.8 1.8 1.8 68.971 628 628 3 1 0.0048579 2.2612 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 579 32460 True 36978 176191 224379 224379 AT1G26090.1 AT1G26090.1 9 9 9 AT1G26090.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr1:9020509-9022619 FORWARD LENGTH=455 1 9 9 9 6 8 6 5 6 8 6 5 6 8 6 5 22.6 22.6 22.6 49.908 455 455 1.97 12 7 11 0 56.799 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1239 1.1918 25.415 26 16 Leave out requantified 1.7282 1.7138 0.7904 0.4855 1.5819 1.5379 0.9637 0.54113 77.246 2.4036 9.4026 34.723 8 7 5 6 6 4 2 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 15.6 20.2 16.3 13.2 1360300000 640160000 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Chr1:9024616-9027556 REVERSE LENGTH=611 2 5 5 5 3 5 4 1 3 5 4 1 3 5 4 1 12.7 12.7 12.7 63.66 605 605;611 2.06 6 5 7 0 60.373 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89158 0.87259 41.933 17 6 Leave out requantified 0.87848 1.6573 0.74532 0.54227 0.79788 1.4655 0.89496 0.56554 27.103 46.215 55.288 6.9655 4 5 6 2 2 2 2 0 Median Median Leave out requantified Median 7.8 12.7 9.8 3.6 722180000 392910000 329270000 136640000 65778000 70865000 195990000 82416000 113570000 325840000 202420000 123420000 63711000 42296000 21415000 581 11716;12035;19249;30984;31297 True;True;True;True;True 13246;13600;21735;35352;35692 64004;64005;64006;64007;65732;65733;65734;106364;106365;168807;170299;170300;170301;170302;170303;170304;170305;170306 82330;82331;82332;82333;84553;84554;84555;136363;136364;136365;214972;216872;216873;216874;216875;216876;216877;216878;216879;216880;216881;216882;216883;216884;216885;216886 82332;84553;136364;214972;216885 599 464 AT1G26170.1 AT1G26170.1 3 3 3 AT1G26170.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:9047539-9054438 REVERSE LENGTH=1022 1 3 3 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 3.8 3.8 3.8 113.47 1022 1022 2 5 3 5 0 6.4507 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0503 1.0693 25.197 10 1 Median 1.1168 0.92797 NaN 1.1076 1.0867 0.95825 NaN 1.2183 31.908 2.8638 NaN 27.451 4 2 1 3 1 0 0 0 Median Median Median Median 2.3 0.7 2.3 2.3 26334000000 11576000000 14758000000 5807900000 2521100000 3286700000 6792200000 3071800000 3720400000 5881200000 2535400000 3345900000 7852700000 3447600000 4405100000 582 9437;21631;32687 True;True;True 10693;24333;37230 51858;118183;118184;177475;177476;177477;177478;177479;177480;177481;177482;177483;177484 66556;151343;151344;226035;226036;226037;226038;226039;226040;226041;226042;226043;226044;226045;226046 66556;151343;226042 292 147 AT1G26220.1 AT1G26220.1 2 2 2 AT1G26220.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein | Chr1:9071157-9071750 FORWARD LENGTH=197 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13.7 13.7 13.7 21.851 197 197 2.11 2 4 3 0 9.7301 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79984 0.89836 21.601 8 4 Median NaN 1.1913 0.66466 0.73915 NaN 1.1073 0.78604 0.81479 NaN 6.6009 22.854 18.657 1 2 3 2 0 1 2 1 Median Median Median Median 13.7 13.7 13.7 13.7 388280000 203930000 184350000 40400000 18539000 21861000 109010000 44448000 64565000 158190000 97210000 60977000 80678000 43729000 36949000 583 13533;19523 True;True 15291;22032 74398;74399;74400;74401;74402;107780;107781;107782;107783 96019;96020;96021;96022;96023;96024;138295;138296;138297;138298;138299;138300 96024;138296 AT1G26230.5;AT1G26230.3;AT1G26230.2;AT1G26230.4;AT1G26230.1 AT1G26230.5;AT1G26230.3;AT1G26230.2;AT1G26230.4;AT1G26230.1 5;5;5;5;5 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 AT1G26230.5 | Symbols:Cpn60beta4 | chaperonin-60beta4 | TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | Chr1:9073110-9075272 REVERSE LENGTH=470;AT1G26230.3 | Symbols:Cpn60beta4 | chaperonin-60beta4 | TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | Chr1:9072388-9075023 5 5 3 3 3 3 3 4 1 1 1 2 1 1 1 2 10.6 7.2 7.2 51.114 470 470;551;551;559;611 1.8 2 2 1 0 4.9648 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0.70293 0.74792 38.816 5 2 Median NaN NaN NaN 0.78807 NaN NaN NaN 0.89216 NaN NaN NaN 24.94 1 1 1 2 1 1 0 0 Median Median Median Median 6 6.2 6.2 8.1 231030000 128290000 102740000 15308000 11238000 4070100 50363000 30728000 19635000 56120000 22521000 33598000 109240000 63803000 45436000 584 22026;22106;25751;35000;35788 True;False;True;False;True 24762;24846;29433;39863;40771 119989;120400;120401;120402;120403;120404;120405;120406;120407;120408;120409;120410;120411;120412;142226;190556;190557;190558;190559;190560;190561;190562;190563;195116;195117;195118 153605;154166;154167;154168;154169;154170;154171;154172;154173;154174;154175;154176;154177;154178;181445;242915;242916;242917;242918;242919;242920;242921;242922;242923;242924;248828;248829 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available | no full name available | plant/protein | Chr1:9378635-9380419 FORWARD LENGTH=308 1 8 8 8 6 7 5 5 6 7 5 5 6 7 5 5 30.5 30.5 30.5 35.079 308 308 2.23 7 6 13 0 86.62 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61832 0.65026 90.545 21 5 Leave out requantified 1.5232 6.2448 0.26934 0.16507 1.4344 5.9918 0.32107 0.18983 10.134 16.46 38.254 21.783 7 5 4 5 1 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.8 27.9 16.6 14 2198100000 1387600000 810510000 477410000 197710000 279700000 344270000 71764000 272510000 573870000 477290000 96581000 802580000 640860000 161720000 597 8305;13395;14769;18066;23597;32881;34861;38901 True;True;True;True;True;True;True;True 9406;15127;16724;20447;26499;37456;39705;44266 45576;45577;45578;73166;73167;73168;73169;81533;81534;81535;81536;99781;99782;99783;99784;128362;128363;128364;128365;128366;178663;178664;178665;178666;189804;212393 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| PLASTID ENVELOPE ATPASE 1,autoinhibited Ca2+-ATPase 1 | autoinhibited Ca2+-ATPase 1 | Chr1:9671912-9676010 REVERSE LENGTH=1020;AT1G27770.1 | Symbols:ACA1,PEA1 | PLASTID ENVELOPE ATPASE 1,autoinhibited Ca2+-ATPase 1 | au 4 11 9 9 6 6 6 5 5 4 5 4 5 4 5 4 13.3 11.2 11.2 111.26 1020 1020;1020;957;946 2.22 4 6 8 0 45.069 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6584 0.75103 77.413 15 14 Median 1.0219 1.9664 0.36567 0.48112 0.95964 1.8422 0.42047 0.5376 84.959 31.485 17.516 47.282 4 4 5 2 3 4 5 2 Median Median Median Median 7.5 7.2 7.6 5.8 768880000 459780000 309100000 189650000 85913000 103730000 147080000 43506000 103570000 277290000 209840000 67451000 154870000 120530000 34340000 617 510;1330;1331;7657;17003;24243;24540;24820;25520;25645;32627 True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;False 573;1504;1505;8700;19221;27355;27810;28261;29176;29320;37164 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AT1G27930.1 3 3 3 AT1G27930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | glucuronoxylan 4-O-methyltransferase-like protein (DUF579) | Chr1:9731510-9732379 REVERSE LENGTH=289 1 3 3 3 3 3 1 2 3 3 1 2 3 3 1 2 12.1 12.1 12.1 32.356 289 289 1.78 4 3 2 0 8.7047 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81124 0.85347 52.644 8 2 Leave out requantified 1.1596 1.1516 NaN 0.49866 1.0121 1.022 NaN 0.55804 16.746 50.046 NaN 16.104 2 3 1 2 1 0 0 1 Median Leave out requantified Median Median 12.1 12.1 3.1 6.9 443060000 253010000 190050000 78704000 38268000 40435000 158800000 78871000 79933000 40643000 26366000 14276000 164910000 109510000 55401000 619 75;15443;33566 True;True;True 85;17482;38238 425;426;85418;85419;85420;85421;182439;182440;182441 593;594;110175;110176;110177;110178;110179;110180;110181;110182;232374;232375;232376 594;110179;232375 AT1G27950.1 AT1G27950.1 9 9 9 AT1G27950.1 | Symbols:LTPG1 | glycosylphosphatidylinositol-anchored lipid protein transfer 1 | glycosylphosphatidylinositol-anchored lipid protein transfer 1 | Chr1:9740740-9741991 FORWARD LENGTH=193 1 9 9 9 9 7 9 6 9 7 9 6 9 7 9 6 39.9 39.9 39.9 19.759 193 193 2.15 18 22 28 0 39.077 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69547 0.65264 28.77 56 41 Leave out requantified 0.61903 0.69547 1.3237 0.816 0.58665 0.65264 1.5998 0.86052 26.723 34.107 7.3762 85.973 15 13 15 13 10 9 12 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.9 34.2 39.9 29 25827000000 12181000000 13646000000 5727000000 2957800000 2769200000 4261900000 2174800000 2087100000 8430300000 3578300000 4852000000 7408200000 3470300000 3937800000 620 3444;4174;4175;4176;4340;5861;21613;32554;37155 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3932;4768;4769;4770;4949;6649;24314;37086;42322 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Symbols:NTF2B | nuclear transport factor 2B | nuclear transport factor 2B | Chr1:9746921-9747787 FORWARD LENGTH=126;AT1G27970.2 | Symbols:NTF2B | nuclear transport factor 2B | nuclear transport factor 2B | Chr1:9746921-9748306 FORWARD LEN 2 5 5 5 5 4 5 4 5 4 5 4 5 4 5 4 50 50 50 14.002 126 126;134 2.24 7 11 15 0 48.294 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95555 0.91919 37.285 32 9 Leave out requantified 0.74195 0.81692 1.0555 0.84933 0.70199 0.76584 1.2116 0.97907 54.765 37.942 8.0763 22.853 8 8 8 8 3 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 50 42.1 50 38.9 4777500000 2515400000 2262100000 1114400000 643640000 470810000 875800000 386790000 489010000 1510300000 725170000 785130000 1276900000 759810000 517130000 621 1229;17824;23349;30666;35429 True;True;True;True;True 1385;20172;26228;35001;35002;40353;40354 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carboxypeptidase-like 45 | serine carboxypeptidase-like 45 | Chr1:9804153-9 2 2 2 2 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 5.2 5.2 5.2 51.802 461 461;461 2 1 1 1 0.0016991 2.8023 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.4 0 2.4 2.8 51417000 37806000 13611000 8435900 0 8435900 0 0 0 8133700 8133700 0 34847000 29672000 5174600 625 12559;36451 True;True 14193;41530 68702;198721;198722 88322;253459;253460 88322;253459 AT1G28120.1 AT1G28120.1 3 3 3 AT1G28120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquitin thioesterase otubain-like protein | Chr1:9813219-9815143 REVERSE LENGTH=306 1 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 19 19 19 34.434 306 306 2.1 3 3 4 0 12.434 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1154 1.1339 16.761 6 3 Median NaN 1.2135 0.92538 NaN NaN 1.1419 1.1529 NaN NaN 6.908 25.669 NaN 1 2 2 1 0 1 2 0 Median Median Median Median 19 11.4 11.4 11.4 290920000 155410000 135510000 31982000 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protein 31 | Chr1:9889331-9890843 REVERSE LENGTH=315;AT1G28290.1 | Symbols:AGP31 | arabinogalactan protein 31 | arabinogalactan protein 31 | Chr1:9889331-9890843 REVERSE LENGTH= 2 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 18.7 18.7 18.7 33.932 315 315;359 2.1 17 18 23 0 29.274 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83961 0.87466 4.5429 37 7 Leave out requantified 0.89448 0.69702 0.83892 0.92557 0.85271 0.65837 0.96934 1.0169 39.403 12.038 12.074 12.72 8 8 9 12 2 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.2 18.7 18.7 18.7 19051000000 9818100000 9232500000 4024500000 2141100000 1883400000 4213100000 2386100000 1826900000 5725900000 2841100000 2884800000 5087200000 2449800000 2637400000 629 20921;20922;25413;31328;34234;38145;38146 True;True;True;True;True;True;True 23543;23544;29046;29047;35724;39018;43419;43420 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Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acy 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 4.9 4.9 4.9 34.102 309 309;390 1.67 3 2 1 0 8.9958 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1515 1.1903 111.98 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 4.5 4.9 4.9 4.5 64147000 37405000 26742000 0 0 0 18956000 1442200 17514000 27480000 22976000 4504300 17711000 12987000 4724200 634 4297;18723 True;True 4900;21167 23884;23885;23886;23887;103511;103512 30884;30885;30886;30887;132697;132698 30884;132697 AT1G28600.1;AT1G28600.2 AT1G28600.1;AT1G28600.2 6;3 6;3 6;3 AT1G28600.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | Chr1:10051228-10053073 REVERSE LENGTH=393;AT1G28600.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acy 2 6 6 6 3 6 5 4 3 6 5 4 3 6 5 4 21.6 21.6 21.6 43.61 393 393;221 2.08 6 10 8 0 50.009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | Chr1:10071856-10073371 REVERSE LENGTH=383;AT1G28660.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acy 3 2 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 7.3 7.3 7.3 42.033 383 383;382;384 2 2 1 2 0 23.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.24302 0.29371 44.104 3 3 Median NaN NaN 0.20002 NaN NaN NaN 0.23891 NaN NaN NaN 29.204 NaN 0 0 2 1 0 0 2 1 Median Median Median Median 0 3.9 7.3 7.3 138840000 105230000 33610000 0 0 0 15866000 0 15866000 74783000 65540000 9243600 48192000 39692000 8500100 636 1848;25637 True;True 2101;29310 10373;10374;10375;141724;141725 13459;13460;13461;180835;180836 13461;180836 AT1G28680.2;AT1G28680.1 AT1G28680.2;AT1G28680.1 4;4 4;4 4;4 AT1G28680.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | HXXXD-type acyl-transferase family protein | Chr1:10078222-10079492 FORWARD LENGTH=394;AT1G28680.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | HXXXD-type acyl-transferase 2 4 4 4 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 14.2 14.2 14.2 43.588 394 394;451 2.11 2 4 3 0 11.549 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70006 0.82991 20.558 9 5 Leave out requantified 1.2307 2.1797 0.62262 0.48534 1.1231 2.0461 0.71763 0.54122 27.169 53.876 33.757 5.735 2 2 3 2 1 2 1 1 Median Median Median Median 6.3 7.9 9.1 6.3 332260000 191090000 141180000 43581000 19928000 23654000 88881000 32672000 56209000 124370000 84914000 39459000 75430000 53574000 21856000 637 1318;4807;5145;29134 True;True;True;True 1488;5488;5860;33312 7416;7417;7418;26710;26711;26712;28480;159933;159934 9672;9673;9674;34388;34389;34390;36647;203764;203765 9672;34390;36647;203764 AT1G28690.1 AT1G28690.1 1 1 1 AT1G28690.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr1:10080042-10081604 REVERSE LENGTH=520 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1.5 1.5 1.5 58.137 520 520 2.5 1 1 0.0029542 2.5213 By MS/MS By MS/MS 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.1 0 3.1 0 10970000 0 10970000 0 0 0 0 0 0 10970000 0 10970000 0 0 0 642 13147 True 14847 71614;71615 92043;92044 92044 AT1G29150.2;AT1G29150.1 AT1G29150.2;AT1G29150.1 16;16 16;16 16;16 AT1G29150.2 | Symbols:RPN6,ATS9 | non-ATPase subunit 9,REGULATORY PARTICLE NON-ATPASE 6 | non-ATPase subunit 9 | Chr1:10181240-10182499 FORWARD LENGTH=419;AT1G29150.1 | Symbols:RPN6,ATS9 | non-ATPase subunit 9,REGULATORY PARTICLE NON-ATPASE 6 | non-ATPa 2 16 16 16 13 11 15 13 13 11 15 13 13 11 15 13 48.7 48.7 48.7 46.749 419 419;419 2.05 22 39 26 0 122.92 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92647 0.96773 22.726 79 36 Leave out requantified 1.4215 0.95725 0.78258 0.74404 1.3311 0.90738 0.94427 0.82449 83.225 33.141 30.793 25.22 18 17 23 21 7 10 10 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.2 33.7 46.5 37.5 10502000000 5397800000 5103800000 2161200000 998250000 1162900000 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1921;1922;1923;1924;1925;1926;1927;4244;4245;4246;4247;10610;10611;10612;10613;10614;10615;10616;10617;10618;10619;10620;10621;10622;10623;10624;10625;10626;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;66347;74163;74164;74165;74166;74167;74168;74169;74170;74171;74172;74742;74743;74744;74745;96621;96622;122264;122265;122266;122267;124637;124638;124639;124640;124641;124642;124643;124644;124645;124646;141055;141056;141057;141058;141059;141060;146730;146731;146732;150366;150367;150368;150369;160648;219962;219963;219964;219965;219966;219967;219968;219969;219970;219971;243220;243221;243222 1921;4245;10617;21698;66347;74172;74745;96621;122266;124646;141057;146731;150366;160648;219964;243221 625;626;627;628;629 110;135;256;283;403 AT1G29250.1;AT3G04620.1 AT1G29250.1 8;1 8;1 5;0 AT1G29250.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Alba DNA/RNA-binding protein | Chr1:10223461-10224592 REVERSE LENGTH=130 2 8 8 5 6 7 5 5 6 7 5 5 4 4 2 2 53.8 53.8 48.5 14.574 130 130;164 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degradation factor-like protein (DUF1296) | Chr1:10278080-10283024 REVERSE LENGTH=831;AT1G29350.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA polymer 2 5 5 5 4 5 3 3 4 5 3 3 4 5 3 3 7.1 7.1 7.1 90.887 831 831;831 2.19 5 7 9 0 22.141 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88048 0.89027 44.949 20 11 Leave out requantified 1.1115 1.593 0.36933 0.5579 1.0485 1.4972 0.43386 0.62714 10.376 22.452 20.503 10.05 4 6 6 4 1 4 3 3 Leave out requantified Median Median Median 6.1 7.1 4.8 4.8 1155600000 593330000 562300000 238060000 92240000 145820000 407010000 167110000 239900000 292670000 199880000 92784000 217900000 134100000 83801000 647 5616;7666;19019;22220;29443 True;True;True;True;True 6377;8709;8710;21487;24972;33656 31134;42494;42495;42496;42497;42498;42499;42500;105249;105250;105251;105252;105253;120941;120942;120943;161504;161505;161506;161507;161508 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4984;5601;5988;7854;11193;15445;17691;22225;34000;39116;40056;41820 24179;27254;27255;29073;29074;29075;29076;38596;38597;38598;53959;53960;53961;75242;75243;75244;86416;86417;86418;108647;108648;163096;163097;163098;163099;163100;186797;186798;186799;186800;186801;191476;191477;191478;200160;200161;200162 31224;35056;35057;37370;37371;37372;37373;49412;49413;49414;69199;69200;69201;97145;97146;97147;97148;111379;111380;111381;139352;139353;207836;207837;207838;207839;207840;207841;207842;238024;238025;238026;244083;244084;244085;255328;255329;255330 31224;35057;37373;49413;69200;97147;111379;139353;207840;238026;244084;255328 641;642;643 413;417;721 AT1G29530.1 AT1G29530.1 3 3 3 AT1G29530.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:10325553-10326651 REVERSE LENGTH=236 1 3 3 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 22.5 22.5 22.5 24.886 236 236 1.6 6 2 2 0 20.235 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8604 0.8582 27.168 9 2 Leave out requantified 0.62271 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MS/MS By MS/MS 1.0449 1.0798 23.326 38 8 Leave out requantified 1.1714 1.1977 0.59322 0.93085 1.1372 1.0979 0.72574 1.0513 5.6595 9.2234 13.531 21.122 10 9 9 10 1 1 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.4 44.6 44.6 47.9 8853400000 4614100000 4239300000 2613700000 1188200000 1425600000 1796100000 839020000 957060000 2334600000 1456600000 878010000 2109000000 1130400000 978650000 652 10678;17653;17956;24920;26648;27099;27279;30213;30442;31723;37168;39275 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 12057;19988;19989;20325;28395;30537;31023;31227;34487;34488;34756;36159;36160;36161;42335;44692;44693 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Symbols:PFD6 | prefoldin 6 | prefoldin 6 | Chr1:10507666-10508821 FORWARD LENGTH=129 1 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 24.8 24.8 24.8 14.856 129 129 1.67 4 4 1 0 9.1765 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3534 1.261 42.342 9 1 Leave out requantified 1.308 1.137 0.95584 0.84148 1.2035 1.0151 1.1386 0.96882 6.6025 44.092 75.098 38.788 2 2 2 3 0 1 0 0 Median Median Median Leave out requantified 18.6 18.6 16.3 24.8 613440000 298490000 314950000 83495000 33085000 50410000 99052000 53372000 45679000 208770000 115710000 93062000 222130000 96326000 125800000 663 8959;22812;26899 True;True;True 10136;25644;30804 49427;49428;49429;49430;124170;124171;148630;148631;148632 63495;63496;158953;189375;189376;189377 63495;158953;189375 AT1G30000.1;AT1G30000.2 AT1G30000.1;AT1G30000.2 1;1 1;1 1;1 AT1G30000.1 | Symbols:MNS3 | alpha-mannosidase 3 | alpha-mannosidase 3 | Chr1:10509532-10512320 REVERSE LENGTH=624;AT1G30000.2 | Symbols:MNS3 | alpha-mannosidase 3 | alpha-mannosidase 3 | Chr1:10509532-10512222 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NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 5.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 672 17860 True 20215 98619 126433 126433 AT1G30470.1;AT1G30470.2;AT1G30470.3 AT1G30470.1;AT1G30470.2;AT1G30470.3 6;6;5 6;6;5 6;6;5 AT1G30470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | SIT4 phosphatase-associated family protein | Chr1:10779423-10786415 FORWARD LENGTH=811;AT1G30470.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | SIT4 phosphatase-associated 3 6 6 6 3 4 5 5 3 4 5 5 3 4 5 5 11.2 11.2 11.2 89.887 811 811;805;768 1.86 8 9 5 0 19.75 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92674 0.99644 11.337 22 10 Leave out requantified 0.81131 0.93693 0.94669 0.96604 0.76927 0.87711 1.0508 1.0476 35.694 24.225 20.104 5.9158 4 6 6 6 1 4 2 3 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 6.3 7 9.6 9.6 1548300000 792320000 755950000 369400000 181490000 187910000 322400000 159310000 163090000 459490000 238440000 221050000 396980000 213080000 183900000 673 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 1 2.3 1.4 2.3 106070000 60583000 45490000 18963000 6401500 12561000 24106000 14785000 9321100 55359000 31751000 23608000 7645500 7645500 0 694 6874;19528;25505 True;True;True 7828;22037;29159 38367;107806;107807;140986 49159;138325;138326;179952 49159;138325;179952 AT1G31330.1 AT1G31330.1 7 7 7 AT1G31330.1 | Symbols:PSAF | photosystem I subunit F | photosystem I subunit F | Chr1:11215011-11215939 REVERSE LENGTH=221 1 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 38.9 38.9 38.9 24.173 221 221 2.04 50 55 57 0 208.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0363 1.0645 9.5147 34 5 Leave out requantified 1.0893 0.69238 1.0054 1.5922 1.0661 0.67788 1.1129 1.5698 3.4893 9.6279 21.693 25.838 8 9 8 9 1 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.9 38.9 38.9 38.9 55099000000 25489000000 29610000000 15002000000 6848000000 8154000000 10898000000 6116500000 4781800000 12940000000 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RELATED TO UBIQUITIN 2,ubiquitin 7 | ubiquitin 7 | Chr2:14981044-14981943 FORWARD LENGTH=154;AT1G31340.1 | Symbols:NEDD8,ATRUB1,RUB1 | related to ubiquitin 1,ARABIDOPSIS THALIANA RELATED TO UBIQUITIN 1 | related to ubiq 30 7 2 2 7 6 5 6 2 1 0 1 2 1 0 1 45.5 14.9 14.9 17.15 154 154;156;128;306;457;457;382;381;381;381;322;319;306;306;306;305;128;305;305;305;230;229;229;229;229;229;153;153;631;631 1.5 3 1 0 5.0039 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0.80127 0.82308 19.756 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 45.5 36.4 30.5 36.4 360630000 210940000 149680000 152630000 65436000 87194000 0 0 0 0 0 0 208000000 145510000 62490000 696 8289;8290;8581;9902;17793;32859;32930 False;True;True;False;False;False;False 9389;9390;9724;11207;20141;37432;37433;37509 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Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | Chr1:11254025-11255737 REVERSE LENGTH=570;AT1G31430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopepti 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 2.8 2.8 2.8 63.76 570 570;570 2 2 1 -2 By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 2.8 2.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 698 24581 True 27879 134569;134570 171872 171872 330;331 2;15 AT1G31440.1 AT1G31440.1 4 4 4 AT1G31440.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | SH3 domain-containing protein | Chr1:11256150-11258479 REVERSE LENGTH=439 1 4 4 4 0 2 3 1 0 2 3 1 0 2 3 1 12.3 12.3 12.3 49.258 439 439 2 2 3 2 0 30.737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.49737 0.56498 94.281 4 3 Median NaN NaN 0.40255 NaN NaN NaN 0.45524 NaN NaN NaN 25.973 NaN 0 1 3 0 0 1 2 0 Median Median Median Median 0 6.8 8.7 3.2 132610000 71607000 60999000 0 0 0 42728000 13201000 29527000 89879000 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SUPPRESSOR 1 | DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | Chr1:11479921-11482707 FORWARD LENGTH=537 1 6 6 6 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 11.9 11.9 11.9 59.603 537 537 1.93 5 6 4 0 12.241 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0136 0.97607 66.092 11 8 Median 1.6468 1.0388 0.78303 1.2382 1.5663 0.96697 0.8924 1.3433 121.21 1.3252 12.071 46.332 3 2 3 3 2 2 2 2 Median Median Median Median 8.2 6.3 5.4 5.6 475170000 242440000 232730000 121930000 57442000 64492000 69731000 33051000 36681000 113160000 63532000 49630000 170340000 88415000 81927000 709 5873;7384;8514;20238;20614;29554 True;True;True;True;True;True 6662;8392;9653;22808;23213;33775 32599;32600;32601;41158;41159;41160;41161;41162;47038;111369;113192;162022;162023;162024;162025 41761;41762;41763;52677;52678;52679;52680;52681;52682;60448;142805;145086;206407;206408;206409;206410 41762;52678;60448;142805;145086;206407 AT1G32050.1 AT1G32050.1 1 1 1 AT1G32050.1 | Symbols:SCAMP5,AtSCAMP5 | Secretory carrier membrane protein 5 | SCAMP family protein | Chr1:11528616-11530974 FORWARD LENGTH=264 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 3.8 3.8 3.8 30.06 264 264 2 1 1 0.0074231 2.1055 By MS/MS By MS/MS 0.73115 0.76004 58.133 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 3.8 0 0 3.8 44210000 24322000 19889000 26155000 12012000 14143000 0 0 0 0 0 0 18056000 12310000 5745900 710 19217 True 21701 106238;106239 136216;136217;136218 136217 AT1G32060.1 AT1G32060.1 18 18 18 AT1G32060.1 | Symbols:PRK | phosphoribulokinase | phosphoribulokinase | Chr1:11532668-11534406 FORWARD LENGTH=395 1 18 18 18 18 17 18 17 18 17 18 17 18 17 18 17 65.3 65.3 65.3 44.463 395 395 2.17 77 83 126 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0973 1.092 21.54 145 33 Leave out requantified 1.1907 1.2082 0.6219 1.1591 1.1267 1.1609 0.72553 1.2864 26.875 11.822 18.005 32.049 43 35 35 32 12 7 9 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 65.3 64.8 65.3 64.8 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protein-protein interaction domain protein family | Chr1:11613427-11615748 FORWARD LENGTH=570;AT1G3 6 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.3 3.3 3.3 63.764 570 570;588;588;588;588;589 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 3.3 0 94603000 0 94603000 0 0 0 0 0 0 94603000 0 94603000 0 0 0 + 718 10351 True 11704 56525 72490 72490 703;704 344;345 AT1G32400.3;AT1G32400.2;AT1G32400.1 AT1G32400.3;AT1G32400.2;AT1G32400.1 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT1G32400.3 | Symbols:TOM2A | tobamovirus multiplication 2A | tobamovirus multiplication 2A | Chr1:11689393-11690873 REVERSE LENGTH=280;AT1G32400.2 | Symbols:TOM2A | tobamovirus multiplication 2A | tobamovirus multiplication 2A | Chr1:11689393-11690873 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 17.5 17.5 17.5 31.555 280 280;280;280 2 8 7 8 0 13.285 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1549 1.3398 24.15 22 9 Leave out requantified 1.0691 1.1061 0.94589 1.0804 1.2122 1.0083 1.0839 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available | MATE efflux family protein | Chr1:12005084-12008040 FORWARD LENGTH=404;AT1G33110.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | MATE efflux family protein | Chr1:12005084- 5 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 5 5 5 43.716 404 404;494;490;494;494 1.8 2 2 1 0 6.7937 By MS/MS By matching By matching By MS/MS 1.3156 1.1957 123.74 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 5 3.2 3.2 1.7 251280000 93405000 157870000 51033000 25586000 25447000 49840000 15329000 34511000 70131000 42341000 27791000 80275000 10149000 70126000 732 1347;6100 True;True 1524;6922 7636;7637;7638;33895;33896 10006;10007;43381;43382 10007;43382 AT1G33140.1;AT1G33120.1 AT1G33140.1;AT1G33120.1 14;14 14;14 9;9 AT1G33140.1 | Symbols:PGY2 | PIGGYBACK2 | Ribosomal protein L6 family | Chr1:12023360-12024502 FORWARD LENGTH=194;AT1G33120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L6 family | Chr1:12010986-12012223 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| Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase superfamily protein | Chr1:12068823-12070157 REVERSE LENGTH=287;AT1G33270.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | A 2 4 4 4 0 1 1 4 0 1 1 4 0 1 1 4 11.8 11.8 11.8 31.468 287 287;369 2 2 2 2 0 4.7245 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1537 1.1626 182.13 6 2 Leave out requantified NaN NaN NaN 0.86356 NaN NaN NaN 1.0514 NaN NaN NaN 194.19 0 1 1 4 0 0 1 1 Median Median Median Leave out requantified 0 3.1 3.1 11.8 486610000 145860000 340760000 0 0 0 26381000 7680300 18701000 21271000 12915000 8356100 438960000 125260000 313700000 736 7445;14019;22135;31256 True;True;True;True 8459;15839;24881;35648 41434;77180;120564;120565;120566;170058 53075;99683;154383;154384;216538 53075;99683;154384;216538 AT1G33320.2 AT1G33320.2 1 1 1 AT1G33320.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein | Chr1:12081126-12083462 FORWARD LENGTH=373 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 4.8 4.8 4.8 41.405 373 373 2 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 4.8 4.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 737 19749 True 22274 108870;108871 139624;139625 139624 350 12 AT1G33330.3;AT1G33330.2;AT1G33330.1 AT1G33330.3;AT1G33330.2;AT1G33330.1 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT1G33330.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Class I peptide chain release factor | Chr1:12084968-12086238 FORWARD LENGTH=257;AT1G33330.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Class I peptide chain release fact 3 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 14.4 14.4 14.4 27.646 257 257;257;257 2.29 2 1 4 0 12.404 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91134 0.92717 79.256 7 7 Median 0.83793 0.86256 NaN NaN 0.79062 0.79824 NaN NaN 45.022 21.175 NaN NaN 3 2 1 1 3 2 1 1 Median Median Median Median 14.4 14.4 9.3 5.1 201340000 92308000 109030000 59826000 32977000 26849000 50891000 29962000 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AT1G33520.1 AT1G33520.1 1 1 1 AT1G33520.1 | Symbols:MOS2 | modifier of snc1, 2 | D111/G-patch domain-containing protein | Chr1:12157488-12158876 REVERSE LENGTH=462 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.9 3.9 3.9 51.027 462 462 1.75 2 1 1 0 7.6737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64276 0.62137 58.119 4 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 1 0 Median Median Median Median 3.9 3.9 3.9 3.9 52509000 35863000 16646000 13210000 8529300 4681100 10742000 8396700 2345600 11982000 9936200 2046300 16574000 9000900 7573200 741 37067 True 42226 202091;202092;202093;202094 257724;257725;257726;257727;257728 257727 AT1G33590.1;AT1G33590.3;AT1G33590.2;AT1G33612.1 AT1G33590.1;AT1G33590.3;AT1G33590.2 21;21;21;1 21;21;21;1 20;20;20;1 AT1G33590.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Leucine-rich repeat (LRR) family protein | Chr1:12177788-12179221 FORWARD LENGTH=477;AT1G33590.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Leucine-rich repeat (LRR) fami 4 21 21 20 18 19 20 20 18 19 20 20 17 18 19 19 59.5 59.5 55.1 51.741 477 477;512;514;455 2.11 48 53 67 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98841 1.0288 33.373 96 29 Leave out requantified 1.5367 2.004 0.48495 0.55401 1.4443 1.8882 0.57168 0.59241 33.668 23.489 55.477 25.936 26 23 24 23 10 5 5 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 52.8 57 57 57 37158000000 19476000000 17683000000 8223400000 3134100000 5089300000 8933200000 2752500000 6180700000 11627000000 8039800000 3586900000 8375000000 5549100000 2825900000 742 2085;6307;11491;11758;11918;13567;14890;15833;16759;19062;21228;22352;22990;22991;23268;25324;33217;36587;36834;38119;39492 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2359;7195;12978;13296;13475;15332;15333;16856;16857;17918;18945;21534;23891;23892;25143;25836;25837;25838;26136;28904;37824;41695;41974;43390;44939 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4;4 AT1G33960.1 | Symbols:AIG1 | AVRRPT2-INDUCED GENE 1 | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr1:12346555-12348184 FORWARD LENGTH=353;AT1G33960.2 | Symbols:AIG1 | AVRRPT2-INDUCED GENE 1 | P-loop containing nucleoside 2 4 4 4 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 11.6 11.6 11.6 40.07 353 353;377 1.62 5 1 2 0 6.1323 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4368 1.6945 148.85 7 6 Median 5.9933 2.669 0.67731 NaN 5.3666 2.3909 0.75906 NaN 22.89 134.65 113.57 NaN 2 2 2 1 1 2 2 1 Median Median Median Median 4.8 2.5 5.9 5.9 222900000 108440000 114450000 62160000 8786600 53373000 56693000 10963000 45730000 62336000 49566000 12770000 41707000 39127000 2580100 749 2903;16260;26214;30865 True;True;True;True 3333;3334;18395;30018;35222 16467;16468;16469;16470;16471;89839;144968;168332 21376;21377;21378;21379;21380;115276;184831;214405 21379;115276;184831;214405 728;729 301;317 AT1G33990.1;AT4G09900.1 AT1G33990.1;AT4G09900.1 1;1 1;1 1;1 AT1G33990.1 | Symbols:MES14,ATMES14 | 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Leave out requantified Median Leave out requantified 2.6 6.8 7.2 7.2 1140400000 606880000 533510000 118020000 39189000 78832000 300960000 127550000 173410000 370000000 233850000 136160000 351410000 206300000 145120000 752 7637;11141;12375;29007;33905;37157 True;True;True;True;True;True 8680;12583;13979;33172;38636;42324 42390;42391;42392;60902;60903;60904;67649;67650;67651;159327;184280;184281;184282;184283;202518;202519 54324;54325;78335;78336;78337;87022;87023;87024;202939;234680;234681;234682;234683;234684;234685;258267;258268 54324;78335;87023;202939;234684;258267 730 13 AT1G34160.1 AT1G34160.1 1 1 1 AT1G34160.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr1:12441393-12443225 FORWARD LENGTH=581 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.9 1.9 1.9 65.452 581 581 2 2 3 2 0.006392 2.159 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.11912 0.12 4.607 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 1.9 1.9 1.9 1.9 714360000 235770000 478590000 182290000 76184000 106100000 199580000 90294000 109290000 152650000 0 152650000 179840000 69288000 110560000 753 26684 True 30574 147597;147598;147599;147600;147601;147602;147603 188099;188100;188101;188102;188103;188104;188105 188101 AT1G34220.2;AT1G34220.1 AT1G34220.2;AT1G34220.1 4;4 4;4 4;4 AT1G34220.2 | Symbols:ISTL1 | IST1-LIKE 1 | Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein | Chr1:12463102-12465911 REVERSE LENGTH=619;AT1G34220.1 | Symbols:ISTL1 | IST1-LIKE 1 | Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein | Chr1:12463 2 4 4 4 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 7.9 7.9 7.9 68.958 619 619;649 2 4 4 4 0 12.749 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98107 0.9781 14.129 9 3 Leave out requantified 1.3131 1.2748 0.97048 0.7574 1.2118 1.2065 1.144 0.85594 36.718 23.258 24.91 39.476 2 2 3 2 1 1 1 0 Median Median Median Median 3.7 6 6 6 631490000 328760000 302730000 129860000 59526000 70336000 178080000 91347000 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3003 | 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase family protein | Chr1:12588027-12590084 REVERSE LENGTH=465 1 17 15 15 16 16 14 14 14 14 12 12 14 14 12 12 51 45.6 45.6 48.306 465 465 2 36 44 36 0 87.626 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1331 1.2773 57.978 111 28 Leave out requantified 0.71194 0.61718 1.755 1.6927 0.66704 0.59304 2.0668 1.877 38.449 19.193 16.53 23.209 28 30 26 27 7 11 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49 47.7 44.1 44.1 17628000000 8151500000 9476900000 3313300000 2000300000 1313000000 4174500000 2533700000 1640900000 5308500000 1855100000 3453400000 4831900000 1762400000 3069600000 756 2817;3332;3616;8607;10436;10777;15315;15945;18232;25927;26152;27466;28887;34417;34881;35077;35539 True;True;True;False;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3233;3810;4132;9752;9753;9754;11794;11795;12174;12175;17341;17342;18047;20626;29663;29938;29939;31430;33038;39219;39726;39945;39946;40487 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368 99 AT1G35470.1;AT1G35470.2 AT1G35470.1;AT1G35470.2 1;1 1;1 1;1 AT1G35470.1 | Symbols:RanBPM | Ran-binding protein in the microtubule-organizing centre | SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein | Chr1:13051636-13054922 REVERSE LENGTH=465;AT1G35470.2 | Symbols:RanBPM | Ran-binding protein in the micr 2 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 4.1 4.1 4.1 52.093 465 465;467 2 1 1 1 0.00097542 3.2197 By matching By MS/MS By MS/MS 0.76369 0.8631 8.2109 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 4.1 4.1 4.1 146280000 85264000 61019000 0 0 0 36464000 22102000 14362000 40257000 25712000 14545000 69562000 37450000 32112000 761 9300 True 10519 51102;51103;51104 65619;65620 65619 AT1G35580.2;AT1G35580.1;AT1G35580.3;AT4G09510.1;AT4G09510.2;AT1G22650.2;AT1G22650.1;AT4G34860.3;AT4G34860.2;AT4G34860.1 AT1G35580.2;AT1G35580.1;AT1G35580.3 11;11;9;5;4;2;2;2;2;2 11;11;9;5;4;2;2;2;2;2 11;11;9;5;4;2;2;2;2;2 AT1G35580.2 | Symbols:CINV1,A/N-InvG | cytosolic invertase 1,alkaline/neutral invertase G | cytosolic invertase 1 | Chr1:13122460-13124808 REVERSE LENGTH=551;AT1G35580.1 | Symbols:CINV1,A/N-InvG | cytosolic invertase 1,alkaline/neutral invertase G | cyt 10 11 11 11 6 5 8 7 6 5 8 7 6 5 8 7 24.9 24.9 24.9 62.834 551 551;551;460;558;461;468;534;571;571;571 1.87 10 15 6 0 58.288 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98211 1.1147 18.191 28 9 Leave out requantified 1.2367 0.98727 0.91506 1.0559 1.1324 0.913 1.1147 1.1952 16.47 20.756 7.9815 25.851 7 6 8 7 3 0 5 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.7 9.1 19.2 12.3 2219300000 1159400000 1059900000 376410000 183580000 192830000 488160000 269880000 218280000 745190000 401480000 343710000 609540000 304490000 305040000 762 3674;4837;5213;11446;14610;18429;21109;24194;30303;31177;33161 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4204;5521;5939;12925;16551;20847;23752;27269;34598;34599;35560;37762 20628;20629;20630;20631;26807;26808;26809;26810;28879;62464;80839;80840;101929;101930;101931;115513;131630;165587;165588;169667;169668;169669;169670;169671;169672;169673;180083;180084;180085;180086;180087 26654;26655;26656;26657;34494;34495;34496;34497;34498;37142;37143;80348;104267;104268;130622;130623;130624;130625;130626;148056;168243;210904;210905;216023;216024;216025;216026;216027;216028;216029;216030;229424;229425;229426;229427;229428 26654;34496;37143;80348;104267;130625;148056;168243;210904;216030;229424 369 745 138 45 AT1G35620.1 AT1G35620.1 10 10 10 AT1G35620.1 | Symbols:ATPDIL5-2,PDI8,PDIL5-2,ATPDI8 | ARABIDOPSIS THALIANA PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE 8,PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE 8,PDI-like 5-2 | PDI-like 5-2 | Chr1:13156504-13158280 FORWARD LENGTH=440 1 10 10 10 4 6 8 6 4 6 8 6 4 6 8 6 29.5 29.5 29.5 49.85 440 440 2.08 6 12 8 0 94.78 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97207 0.87952 24.72 22 9 Leave out 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AT1G35670.1 | Symbols:ATCDPK2,ATCPK11,CDPK2,CPK11 | calcium-dependent protein kinase 2 | calcium-dependent protein kinase 2 | Chr1:13205456-13208058 FORWARD LENGTH=495 1 10 2 2 6 5 9 7 0 2 1 1 0 2 1 1 20.4 4.2 4.2 55.915 495 495 1.75 2 1 1 0.0022359 2.6432 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3306 1.6304 21.397 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 13.1 10.9 18.8 14.1 280150000 136990000 143150000 0 0 0 62591000 30788000 31803000 137410000 64198000 73212000 80145000 42007000 38138000 764 5890;7800;8559;21248;22920;22921;24248;24373;27094;35487 True;False;False;False;False;False;True;False;False;False 6683;8856;9701;23913;25757;25758;27361;27565;31017;31018;40421;40422 32692;32693;32694;43126;43127;43128;47288;47289;47290;116277;116278;116279;116280;116281;116282;124599;124600;124601;124602;124603;124604;124605;131984;133229;133230;149490;149491;193301;193302;193303;193304 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Symbols:ANNAT1,ATOXY5,OXY5,ANN1,AtANN1 | annexin 1 | annexin 1 | Chr1:13225304-13226939 FORWARD LENGTH=317 1 21 21 21 17 20 21 19 17 20 21 19 17 20 21 19 62.8 62.8 62.8 36.203 317 317 2.05 47 53 54 0 188.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0947 1.1293 18.871 133 40 Leave out requantified 1.4905 1.6441 0.40741 0.81355 1.3983 1.5066 0.48795 0.88382 18.522 12.581 28.594 16.719 31 34 32 36 10 11 10 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59 62.5 62.8 61.8 30280000000 16391000000 13889000000 5241100000 2181400000 3059700000 7553600000 2865000000 4688600000 10214000000 7382600000 2831400000 7271100000 3961700000 3309400000 766 1762;2928;4665;4666;5720;9265;16132;24530;26225;26838;29897;29898;29900;32620;32968;33803;35695;36870;38076;38426;39129 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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L-Aspartase-like family protein | Chr1 2 8 3 3 5 6 6 7 1 2 2 3 1 2 2 3 16.5 6.6 6.6 58.815 527 527;519 2 2 4 2 0 8.8989 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3649 1.2852 70.389 4 3 Median NaN 2.3278 NaN NaN NaN 2.23 NaN NaN NaN 45.954 NaN NaN 1 2 1 0 0 2 1 0 Median Median Median Median 8.5 12.7 12.7 14.8 6648900000 3251900000 3397000000 6514800000 3189300000 3325400000 102850000 37797000 65049000 22429000 15892000 6536400 8904600 8904600 0 769 1313;2587;3742;3854;5087;6033;36532;38674 False;True;False;True;True;False;False;False 1480;1481;2960;4281;4410;5794;5795;6850;41631;44014 7386;7387;7388;7389;7390;7391;7392;7393;7394;7395;7396;14587;20986;20987;20988;20989;20990;20991;20992;20993;21643;21644;21645;21646;28114;28115;28116;33553;33554;33555;33556;33557;199192;199193;199194;199195;211112 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14;14;14;1;1;1;1 AT1G48410.1 | Symbols:ICU9,AGO1,AtAGO1 | ARGONAUTE 1 | Stabilizer of iron transporter SufD / Polynucleotidyl transferase | Chr1:17886285-17891892 REVERSE LENGTH=1048;AT1G48410.3 | Symbols:ICU9,AGO1,AtAGO1 | ARGONAUTE 1 | Stabilizer of iron transporter S 7 14 14 14 7 8 8 12 7 8 8 12 7 8 8 12 13.9 13.9 13.9 116.19 1048 1048;1050;1050;988;988;988;988 2.1 10 16 14 0 32.971 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8954 0.9855 22.559 32 12 Leave out requantified 0.85518 0.833 0.90554 0.92912 0.80647 0.79673 1.0779 1.0402 18.745 27.688 15.89 9.6577 7 7 7 11 2 3 1 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.3 7.4 8.2 11.6 3039500000 1591100000 1448400000 717740000 349720000 368020000 499220000 259630000 239590000 686550000 357200000 329340000 1136000000 624550000 511430000 829 6258;9284;10487;17428;18046;26396;26986;27307;27697;27978;29218;29391;30251;32031 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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THALIANA 1-AMINOCYCLOPROPANE-1-CARBOXYLIC ACID DEAMINASE 1,D-cysteine desulfhydrase | D-cysteine desulfhydrase | Chr1:17896767-17898803 REVERSE LENG 3 11 11 11 6 8 10 8 6 8 10 8 6 8 10 8 36.2 36.2 36.2 43.9 401 401;401;401 2 18 17 18 0 111.63 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7074 1.6235 62.968 44 24 Leave out requantified 1.4874 2.2099 0.40293 0.56273 1.3932 2.0637 0.47068 0.64678 26.619 32.678 11.135 74.747 9 12 14 9 5 4 8 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 20.9 26.2 33.9 26.2 4615800000 2478400000 2137300000 649350000 268010000 381340000 1143200000 366590000 776630000 1751500000 1179700000 571870000 1071700000 664160000 407510000 830 480;5670;7991;8574;15415;21831;23533;24136;28130;34674;38000 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 542;6435;9062;9717;17449;17450;24546;26431;27176;32181;32182;39503;43264 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ARABIDOPSIS RAB GTPASE HOMOLOG 7,RAB GTPase homolog G3E,ARABIDOPSIS RAB GTPASE HOMOLOG G3E | RAB GTPase homolog G3E | Chr1:18234842-18236968 FORWARD LENGTH=206;AT1G49300.1 | Symbols:ATRABG3E,ATRAB7,RABG3 2 10 3 3 8 8 7 6 2 3 2 2 2 3 2 2 52.9 23.3 23.3 22.98 206 206;206 1.75 8 4 4 0 25.837 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97529 0.93002 6.4931 13 2 Leave out requantified 0.93055 1.2409 0.96047 0.81182 0.86273 1.1641 1.1078 0.88269 1.3222 16.602 4.6871 14.208 4 4 2 3 0 1 0 1 Leave out requantified Median Median Plateau 40.8 43.7 34.5 34 1699500000 850290000 849240000 380580000 179650000 200940000 464290000 200920000 263370000 328840000 164920000 163920000 525820000 304810000 221020000 848 3440;10388;11855;12421;14301;16523;21022;29264;33719;33720 False;False;False;True;True;False;False;True;False;False 3928;11745;13402;14033;16202;18689;23655;33452;33453;38419;38420;38421;38422 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LENGTH=838;AT1G49540.2 | Symbols:AtELP2,ELP2 | elongator protein 2,Elongator subunit 2 | elongator protein 2 | Chr1:18333 2 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1.2 1.2 1.2 92.68 838 838;840 2.5 1 1 0.0038272 2.3799 By MS/MS By MS/MS 0.92902 1.0118 16.759 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 1.2 1.2 0 85662000 43489000 42174000 0 0 0 26255000 12299000 13956000 59407000 31189000 28218000 0 0 0 855 35219 True 40108 191713;191714 244370;244371 244371 AT1G49600.1;AT1G49600.3;AT1G49600.2;AT1G47490.2;AT1G47500.2;AT1G47490.1;AT1G47500.1 AT1G49600.1;AT1G49600.3;AT1G49600.2;AT1G47490.2;AT1G47500.2;AT1G47490.1;AT1G47500.1 3;3;3;2;2;2;2 3;3;3;2;2;2;2 1;1;1;1;1;1;1 AT1G49600.1 | Symbols:RBP47A,ATRBP47A | RNA-binding protein 47A | RNA-binding protein 47A | Chr1:18357236-18360150 REVERSE LENGTH=445;AT1G49600.3 | Symbols:RBP47A,ATRBP47A | RNA-binding protein 47A | RNA-binding protein 47A | Chr1:18357827-18360150 REV 7 3 3 1 1 1 2 1 1 1 2 1 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Median Median Median Median 0 5.3 12 10.6 101970000 47986000 53979000 0 0 0 0 0 0 68566000 30913000 37653000 33399000 17073000 16326000 880 8518;27943;29616 True;True;True 9657;31963;33845 47052;47053;153672;153673;162398 60462;60463;195836;195837;206899 60463;195837;206899 AT1G50840.1;AT1G50840.2 AT1G50840.1;AT1G50840.2 2;2 2;2 2;2 AT1G50840.1 | Symbols:PolIA,POLGAMMA2 | polymerase gamma 2,polymerase I A | polymerase gamma 2 | Chr1:18839277-18844313 FORWARD LENGTH=1050;AT1G50840.2 | Symbols:PolIA,POLGAMMA2 | polymerase gamma 2,polymerase I A | polymerase gamma 2 | Chr1:18839277-1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 3 3 3 117.23 1050 1050;1051 2.17 1 3 2 0.0013431 3.0051 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86789 0.84962 22.68 6 1 Leave out requantified NaN 0.70621 1.0974 NaN NaN 0.65514 1.2861 NaN NaN 59.44 7.7897 NaN 1 2 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.5 3 1.5 1.5 577900000 306680000 271220000 97940000 46295000 51646000 209710000 118330000 91378000 133600000 61233000 72368000 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10555;10556;10557;10558;10559;10560;10561;10562;10563;10564;10565;10566;10567;10568;10569;10570;10571;10572;10573;10574;10575;10576;10577;10578;10579;10580;10581;10582;10583;10584;112305;112306;139505;139506;139507;139508;139509;139510;139511;139512;139513;139514;139515;139516;139517;153456;153457;153458;153459;153460;153461;153462;153463;153464;153465;153466;153467;153468;153469;153470;153471;153472;153473;176645;176646;176647;176648;224702;224703;224704;224705;228601;228602;228603;228604;228605 10582;112306;139510;153468;176648;224702;228605 419 874 106 110 AT1G51100.1 AT1G51100.1 6 6 6 AT1G51100.1 | Symbols:CRR41 | CHLORORESPIRATORY REDUCTION 41 | potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel protein | Chr1:18934342-18934977 FORWARD LENGTH=211 1 6 6 6 2 4 6 3 2 4 6 3 2 4 6 3 28.9 28.9 28.9 24.161 211 211 2.11 4 8 6 0 25.835 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.47564 0.52814 42.05 17 4 Leave out requantified 0.71747 1.1034 0.45123 0.74696 0.63917 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0.83089 NaN NaN NaN 0.77027 NaN NaN NaN 40.018 NaN NaN NaN 2 1 1 1 1 0 1 0 Median Median Median Median 7.7 7.7 7.7 7.7 430950000 229050000 201900000 145700000 85874000 59827000 54756000 22841000 31915000 93057000 41801000 51256000 137430000 78531000 58901000 888 28947 True 33103 159056;159057;159058;159059;159060 202603;202604;202605;202606;202607;202608;202609;202610 202610 AT1G51390.1 AT1G51390.1 2 1 1 AT1G51390.1 | Symbols:NFU5,ATNFU1 | NFU domain protein 5 | NFU domain protein 5 | Chr1:19050427-19051753 FORWARD LENGTH=275 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.9 9.1 9.1 29.971 275 275 2.4 1 1 3 0 6.3743 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0075 1.0318 66.974 4 3 Median 0.98822 NaN NaN NaN 0.91057 NaN NaN NaN 59.123 NaN NaN NaN 2 1 1 0 1 1 1 0 Median Median Median Median 9.1 14.9 9.1 9.1 111490000 66318000 45175000 47125000 20562000 26563000 17313000 3006600 14306000 21430000 17125000 4305500 25625000 25625000 0 889 17902;24628 True;False 20264;27950 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35,THIOGLUCOSIDE GLUCOHYDROLASE 5 | beta glucosidase 35 | Chr1:19087424-19090248 FORWARD LENGTH=511 1 11 3 3 8 9 9 7 2 2 2 2 2 2 2 2 27 6.1 6.1 57.468 511 511 2.09 3 4 4 0 16.068 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3998 1.5702 2.133 11 2 Leave out requantified 1.7504 1.8367 1.3573 0.49142 1.7171 1.6838 1.6525 0.55125 21.528 19.686 5.0909 12.447 3 3 2 3 0 2 0 0 Median Median Median Median 20.5 22.1 22.9 21.1 913570000 418830000 494740000 148010000 57336000 90675000 180620000 56718000 123910000 378550000 159210000 219350000 206380000 145570000 60813000 892 2309;4470;17846;18287;23255;24599;27276;30749;30750;37162;37905 False;False;False;False;False;False;False;True;True;False;True 2601;5112;20199;20683;26122;27905;27906;31223;35095;35096;42329;43160 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NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.1 1.1 1.1 1.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 897 24175 True 27240 131546;131547;131548;131549 168153;168154 168154 AT1G51630.1 AT1G51630.1 2 2 2 AT1G51630.1 | Symbols:MSR2,AtMSR2 | Mannan Synthesis Related 2 | O-fucosyltransferase family protein | Chr1:19142141-19144082 REVERSE LENGTH=423 1 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 4.7 4.7 4.7 47.142 423 423 1.67 1 2 0.00040992 3.9165 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0782 1.1643 13.471 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 2.6 2.1 2.6 83614000 33207000 50406000 0 0 0 26206000 10533000 15673000 0 0 0 57407000 22674000 34733000 898 10921;37221 True;True 12330;42396 59598;203074;203075 76543;258869;258870 76543;258870 AT1G51650.1 AT1G51650.1 2 2 2 AT1G51650.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP synthase epsilon chain | Chr1:19152680-19153641 FORWARD 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phospholipase D alpha 2 | Chr1:19583940-19586551 REVERSE LENGTH=810;AT1G52570.2 | Symbols:PLDALPHA2 | phospholipase D alpha 2 | phospholipase D alpha 2 | Chr1:19583940-19586551 REVERSE LENGTH= 3 7 2 2 4 4 5 6 1 0 1 1 1 0 1 1 11.6 4.9 4.9 91.597 810 810;810;810 3 3 0 9.4302 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.9086 1.7657 67.303 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 1 0 1 1 Median Median Median Median 6 5.6 7.3 9.9 182210000 98604000 83608000 92533000 27875000 64658000 0 0 0 49477000 35550000 13928000 40201000 35179000 5022000 922 5323;11671;18405;27138;29559;29670;38385 False;False;True;False;True;False;False 6061;6062;13183;20821;31066;33780;33903;43690 29405;29406;29407;29408;29409;29410;29411;29412;29413;29414;29415;29416;29417;29418;29419;29420;29421;29422;63726;63727;63728;63729;101798;101799;149742;162041;162689;162690;162691;162692;162693;162694;162695;162696;162697;209487;209488;209489 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679;123654;217083;233760 901 88 AT1G52690.2;AT1G52690.1 AT1G52690.2;AT1G52690.1 1;1 1;1 1;1 AT1G52690.2 | Symbols:LEA7 | LATE EMBRYOGENESIS ABUNDANT 7 | Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein | Chr1:19619842-19620589 FORWARD LENGTH=169;AT1G52690.1 | Symbols:LEA7 | LATE EMBRYOGENESIS ABUNDANT 7 | Late embryogenesis abundant pr 2 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 6.5 6.5 6.5 18.1 169 169;169 1 1 0.0013349 2.9301 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 6.5 0 0 11803000 7201500 4601000 0 0 0 11803000 7201500 4601000 0 0 0 0 0 0 925 33756 True 38462 183428 233621 233621 AT1G52730.2;AT1G52730.1;AT1G52730.3;AT1G15470.2;AT1G15470.1 AT1G52730.2;AT1G52730.1;AT1G52730.3 7;7;5;1;1 7;7;5;1;1 3;3;1;0;0 AT1G52730.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr1:19642866-19644978 FORWARD LENGTH=343;AT1G52730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transducin/WD40 repeat- 5 7 7 3 4 5 2 5 4 5 2 5 1 2 1 3 27.7 27.7 12.8 37.754 343 343;343;265;282;333 1.65 8 7 2 0 34.382 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71961 0.72039 35.474 12 8 Leave out requantified 0.89836 1.0769 NaN 0.48293 0.80177 0.98845 NaN 0.53084 133.73 35.182 NaN 35.232 3 4 1 4 3 2 1 2 Median Median Median Median 16.9 19 8.5 19.2 611340000 331320000 280030000 343400000 166370000 177030000 110610000 55197000 55409000 23994000 21220000 2773900 133340000 88529000 44812000 926 12078;12296;18498;30053;30575;31669;38793 True;True;True;True;True;True;True 13647;13895;20921;34313;34905;36098;36099;44146 65960;65961;65962;65963;65964;67202;67203;102352;164484;164485;166878;172084;172085;211727;211728;211729;211730 84849;84850;84851;84852;84853;86413;86414;131171;209577;212565;219191;219192;270079;270080;270081;270082 84851;86413;131171;209577;212565;219191;270081 902 226 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AT1G52780.1 AT1G52780.1 7 7 7 AT1G52780.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PII%2C uridylyltransferase (DUF2921) | Chr1:19658846-19662025 FORWARD LENGTH=1059 1 7 7 7 5 3 4 4 5 3 4 4 5 3 4 4 7.5 7.5 7.5 119.96 1059 1059 1.89 9 3 7 0 26.677 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.1882 2.8843 17.856 19 10 Leave out requantified 2.8604 2.976 0.20628 0.32002 2.6769 2.7696 0.23946 0.35096 12.313 22.2 24.054 32.568 7 4 4 4 3 0 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Median Median 5.8 2.9 4.7 4.7 891840000 535450000 356390000 214620000 52910000 161710000 100740000 23982000 76758000 242790000 199280000 43509000 333690000 259280000 74411000 929 341;14625;17005;23892;30697;33935;35774 True;True;True;True;True;True;True 379;16566;19223;26830;35041;38676;40756 1923;1924;1925;1926;80903;80904;93833;93834;129867;167526;167527;167528;167529;167530;184500;184501;195075;195076;195077 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LENGTH=615;AT4G01595.1 | Symbols:no symbol available | no full name avail 7 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 2.6 2.6 1.1 69.351 615 615;140;468;589;589;589;606 1.86 2 4 1 0.00041009 3.9242 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0354 1.2156 20.407 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.1 2.6 2.6 2.6 189670000 94652000 95018000 35333000 19068000 16265000 52527000 27332000 25195000 48824000 21860000 26964000 52986000 26392000 26594000 943 701;25532 True;True 788;29188 4115;4116;4117;4118;141089;141090;141091 5402;5403;5404;5405;180072;180073;180074 5402;180074 447 162 AT1G53520.1 AT1G53520.1 4 4 4 AT1G53520.1 | Symbols:FAP3,AtFAP3 | fatty-acid-binding protein 3 | Chalcone-flavanone isomerase family protein | Chr1:19976485-19977915 REVERSE LENGTH=287 1 4 4 4 1 2 2 4 1 2 2 4 1 2 2 4 16 16 16 30.729 287 287 2 3 6 3 0 11.026 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83976 0.8066 87.963 9 6 Median NaN 0.45932 NaN 2.1268 NaN 0.42136 NaN 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AT1G53590.1 3 3 3 AT1G53590.1 | Symbols:NTMC2T6.1,NTMC2TYPE6.1 | | Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein | Chr1:19996556-20000127 FORWARD LENGTH=751 1 3 3 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 7.1 7.1 7.1 84.9 751 751 2.17 2 1 3 0 6.4308 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.138 1.2067 65.904 6 3 Median NaN NaN NaN 1.1059 NaN NaN NaN 1.032 NaN NaN NaN 97.787 1 1 1 3 1 0 0 2 Median Median Median Median 1.6 1.6 1.6 7.1 86074000 27929000 58145000 8805200 2404200 6400900 12736000 5301500 7434500 13200000 5899700 7300000 51333000 14323000 37009000 946 7785;17366;22418 True;True;True 8841;19646;25222 43063;96026;96027;96028;96029;122215 55171;123207;123208;123209;156551 55171;123208;156551 AT1G53645.1 AT1G53645.1 2 2 2 AT1G53645.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hydroxyproline-rich glycoprotein family protein | Chr1:20026434-20028587 REVERSE LENGTH=523 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 3.8 3.8 3.8 56.918 523 523 1.83 3 1 2 0.00021304 4.5202 By MS/MS By 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Symbols:PME1,ATPME1 | pectin methylesterase 1 | pectin methylesterase 1 | Chr1:20101533-20103458 FORWARD LENGTH=586 1 3 3 3 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 6.1 6.1 6.1 64.148 586 586 1.75 4 2 2 0 5.0875 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3271 1.2919 96.34 6 6 Median NaN 0.42291 NaN 2.6085 NaN 0.39965 NaN 2.7612 NaN 9.307 NaN 23.037 1 2 1 2 1 2 1 2 Median Median Median Median 1.9 4.4 1.7 3.6 175830000 89632000 86200000 13097000 7239300 5858200 63510000 45484000 18026000 20099000 6962000 13137000 79127000 29947000 49179000 953 26326;27598;34828 True;True;True 30161;31589;39671 145541;145542;145543;145544;145545;152153;189646;189647 185513;185514;185515;185516;185517;193904;241767;241768 185517;193904;241767 AT1G53850.2;AT1G53850.1 AT1G53850.2;AT1G53850.1 9;9 9;9 1;1 AT1G53850.2 | Symbols:ATPAE1,PAE1 | 20S proteasome alpha subunit E1,ARABIDOPSIS 20S PROTEASOME ALPHA SUBUNIT E1 | 20S proteasome alpha subunit E1 | Chr1:20104131-20105792 REVERSE LENGTH=237;AT1G53850.1 | Symbols:ATPAE1,PAE1 | 20S 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| no full name available | Rubredoxin-like superfamily protein | Chr1:20357084-20357671 REVERSE LENGTH=195 1 9 9 9 9 8 9 9 9 8 9 9 9 8 9 9 50.8 50.8 50.8 21.874 195 195 1.94 22 27 18 0 177.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1117 1.0275 26.287 56 17 Leave out requantified 0.84856 1.0954 1.2617 1.0921 0.78796 0.99913 1.4509 1.2259 31.538 14.303 17.698 19.823 12 14 14 16 1 5 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 50.8 50.8 50.8 50.8 11212000000 5479700000 5731900000 2551600000 1446300000 1105300000 2502700000 1259500000 1243200000 2997700000 1297400000 1700300000 3159500000 1476400000 1683100000 970 4417;4839;4840;4841;10228;10229;10732;24770;38341 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5044;5523;5524;5525;11575;11576;12120;28175;28176;43641 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MS/MS By MS/MS 1.1759 1.0918 13.086 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 1 0 Median Median Median Median 5.2 5.2 5.2 0 134980000 53680000 81303000 31579000 9437600 22141000 41651000 11883000 29768000 61753000 32359000 29394000 0 0 0 975 12914 True 14591 70423;70424;70425 90453;90454;90455 90453 AT1G54780.1 AT1G54780.1 11 11 11 AT1G54780.1 | Symbols:TLP18.3,AtTLP18.3 | thylakoid lumen protein 18.3 | thylakoid lumen 18.3 kDa protein | Chr1:20439533-20440953 FORWARD LENGTH=285 1 11 11 11 10 10 11 10 10 10 11 10 10 10 11 10 44.2 44.2 44.2 31.138 285 285 2.06 36 43 43 0 111.17 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9995 1.0351 14.02 92 15 Leave out requantified 1.061 1.1488 0.88187 0.99209 0.99481 1.0915 0.99646 1.0947 23.42 9.3865 18.3 22.37 27 20 22 23 4 1 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.9 43.9 44.2 43.9 70102000000 34940000000 35161000000 17126000000 8026800000 9098900000 16246000000 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5,6-fructa 3 3 1 0 2 2 2 2 0 0 1 1 0 0 0 0 6.2 2.2 0 67.067 594 594;554;579 2.5 1 1 1 -2 By matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.62775 0.66256 97.268 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 4 4 4 4 26604000 17165000 9439100 0 0 0 0 0 0 14060000 11930000 2130600 12544000 5235400 7308500 + 982 747;26582;39488 True;False;False 836;30457;44932;44933 4310;4311;147071;147072;215596;215597;215598;215599;215600;215601 5634;5635;187399;187400;187401;275143;275144;275145;275146;275147;275148;275149;275150;275151;275152 5635;187401;275148 959;960;961 51;58;479 AT1G55120.2 AT1G55120.2 3 1 1 AT1G55120.2 | Symbols:FRUCT5,AtcwINV3,ATFRUCT5 | beta-fructofuranosidase 5,6-fructan exohydrolase | beta-fructofuranosidase 5 | Chr1:20566983-20569165 FORWARD LENGTH=555 1 3 1 1 1 2 2 3 0 1 0 1 0 1 0 1 7.6 3.2 3.2 62.697 555 555 1.5 1 1 1 -2 By matching By MS/MS By matching By matching 1.036 1.0141 17.944 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 2 5.2 4.3 7.6 34419000 15469000 18950000 0 0 0 24338000 11745000 12594000 0 0 0 10081000 3724000 6356600 + 983 747;17843;39488 False;True;False 836;20194;44932;44933 4310;4311;98521;98522;215596;215597;215598;215599;215600;215601 5634;5635;126310;275143;275144;275145;275146;275147;275148;275149;275150;275151;275152 5635;126310;275148 961 440 AT1G55150.1;AT1G55150.2 AT1G55150.1;AT1G55150.2 8;7 8;7 5;4 AT1G55150.1 | Symbols:AtRH20,RH20 | RNA helicase 20 | DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | Chr1:20574634-20577141 FORWARD LENGTH=501;AT1G55150.2 | Symbols:AtRH20,RH20 | RNA helicase 20 | DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | Chr1:20574749-20 2 8 8 5 2 6 1 3 2 6 1 3 1 3 0 2 19.4 19.4 12.4 55.575 501 501;526 1.67 7 2 3 0 13.615 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0104 0.95863 78.414 9 7 Median NaN 1.4098 NaN 0.56049 NaN 1.2881 NaN 0.65429 NaN 106.28 NaN 37.972 1 4 1 3 1 4 0 2 Median Median Median Median 5 14.4 2.4 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Di 3 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 29.4 29.4 29.4 20.618 187 187;187;125 2.08 8 7 10 0 32.438 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98096 1.0363 73.427 18 7 Leave out requantified 3.5264 5.3739 0.23828 0.19255 3.4951 5.0019 0.28306 0.20853 10.941 30.704 19.635 79.842 5 4 5 4 1 2 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified Median 25.7 22.5 25.7 22.5 7008700000 3663300000 3345400000 1629400000 330150000 1299300000 1655500000 290890000 1364600000 1960300000 1626900000 333420000 1763500000 1415400000 348110000 986 8865;9050;9395;25309;26302 True;True;True;True;True 10035;10236;10637;10638;28885;28886;30136 48903;48904;49922;49923;51622;51623;51624;51625;51626;51627;51628;139552;139553;139554;139555;139556;139557;139558;145444;145445;145446;145447;145448;145449;145450 62807;64149;64150;66266;66267;66268;66269;66270;66271;66272;178145;178146;178147;178148;178149;178150;178151;185413;185414;185415;185416;185417;185418;185419;185420;185421 62807;64150;66269;178146;185419 463 962;963;964 173 115;117;146 AT1G55260.2;AT1G55260.1 AT1G55260.2;AT1G55260.1 4;4 4;4 4;4 AT1G55260.2 | Symbols:LTPG6 | glycosylphosphatidylinositol-anchored lipid protein transfer 6 | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr1:20614663-20616158 FORWARD LENGTH=224;AT1G55260.1 | Symbols:LT 2 4 4 4 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 15.6 15.6 15.6 25.034 224 224;227 2 7 8 7 0 10.874 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99587 1.0415 2.4936 20 6 Leave out requantified 1.1784 0.95304 1.1858 0.9515 1.0659 0.84322 1.3906 1.0956 5.7864 70.757 59.792 7.5684 6 5 4 5 1 2 2 1 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 12.5 10.7 7.6 12.5 3230000000 1632500000 1597500000 749560000 351670000 397890000 744440000 382010000 362430000 730320000 386300000 344020000 1005700000 512540000 493140000 987 4489;4801;5692;8035 True;True;True;True 5134;5482;6459;9111 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S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr1:20705274-20706825 REVERSE LENGTH=311;AT1G55450.2 | Symbols:no symbol available | no full name available 2 11 11 9 7 6 6 7 7 6 6 7 6 5 5 6 46 46 41.5 34.475 311 311;320 2.03 9 13 10 0 60.924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.3442 2.214 109.1 29 17 Leave out requantified 3.6514 3.6655 0.19162 0.27759 3.2693 3.4559 0.22934 0.30636 42.261 143.22 143.6 55.817 9 6 6 8 3 5 3 6 Leave out requantified Median Leave out requantified Median 29.3 24.8 24.8 32.5 4472300000 2577000000 1895300000 1185600000 339080000 846500000 1366600000 797840000 568750000 1012200000 756150000 256010000 907960000 683940000 224030000 990 1576;10891;10912;15140;19994;23471;28562;31652;33143;33500;37066 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1792;12297;12320;17140;22536;26358;32679;36077;36078;37741;37742;38167;38168;42225 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dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr1:20903163-20905420 FORWARD LENGTH=370;AT1G55900.1 | Symbols:TIM50,EMB1860 | embryo defective 1860 | Haloacid dehalogenase- 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.2 2.2 2.2 41.89 370 370;376 1.75 2 1 1 0.0081014 2.0744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2364 1.2861 20.625 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 2.2 2.2 2.2 2.2 271070000 123020000 148050000 0 0 0 74948000 26662000 48286000 72825000 33974000 38851000 123300000 62385000 60913000 1002 8772 True 9935 48515;48516;48517;48518 62356;62357;62358;62359 62358 AT1G55910.1 AT1G55910.1 1 1 1 AT1G55910.1 | Symbols:ZIP11 | zinc transporter 11 precursor | zinc transporter 11 precursor | Chr1:20906161-20907225 FORWARD LENGTH=326 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 35.461 326 326 1.6 3 1 1 0 5.7328 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77371 0.82092 100.48 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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Symbols:no symbol available | no full name available | Leucine-rich repeat t 4 2 1 1 2 0 2 2 1 0 1 1 1 0 1 1 1.9 1.1 1.1 113.75 1033 1033;833;884;1032 2 1 1 1 0.0013433 3.0136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.9 0 1.9 1.9 28791000 10682000 18108000 28791000 10682000 18108000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1008 3198;28534 False;True 3659;32647 17941;17942;17943;156987;156988;156989 23174;23175;23176;200040;200041;200042 23175;200040 AT1G56190.2;AT1G56190.1 AT1G56190.2;AT1G56190.1 28;28 12;12 12;12 AT1G56190.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphoglycerate kinase family protein | Chr1:21028622-21030454 FORWARD LENGTH=405;AT1G56190.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphoglycerate kinase family p 2 28 12 12 27 27 25 26 12 11 11 11 12 11 11 11 78.5 37.3 37.3 42.615 405 405;478 2.02 40 40 43 0 150.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96967 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MS/MS By MS/MS 1.3474 1.2699 55.34 3 1 Median NaN 1.4002 NaN NaN NaN 1.2865 NaN NaN NaN 1.838 NaN NaN 0 2 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 16.8 9.5 4.2 130910000 63986000 66924000 0 0 0 97108000 40109000 56998000 33802000 23877000 9925400 0 0 0 1021 9768;10663;33347 True;True;True 11061;12041;37991 53405;53406;53407;58218;181198;181199 68505;68506;68507;74751;230778 68506;74751;230778 AT1G57590.1 AT1G57590.1 4 4 4 AT1G57590.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pectinacetylesterase family protein | Chr1:21327458-21329707 REVERSE LENGTH=444 1 4 4 4 2 1 4 3 2 1 4 3 2 1 4 3 11 11 11 49.914 444 444 1.92 4 5 3 0 10.758 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79379 0.80935 130.54 12 12 Median 2.4074 NaN 0.32374 0.20198 2.2416 NaN 0.3904 0.24777 29.8 NaN 121.32 188.13 3 1 5 3 3 1 5 3 Plateau Median Median Median 5.6 3.2 11 7.9 665590000 249010000 416580000 109430000 35208000 74219000 60878000 12399000 48479000 284250000 112630000 171630000 211030000 88779000 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| Symbols:PUP18,ATPUP18 | purine permease 18 | purine permease 18 | Chr1:21441700-21442872 REVERSE LENGTH=390 2 4 4 4 3 4 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 12.8 12.8 12.8 44.181 390 390;394 1.57 9 2 3 0 25.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93359 0.97174 1.8373 10 4 Leave out requantified 1.022 2.0121 0.79708 0.28007 0.94828 1.8686 0.92671 0.29296 19.175 161.2 13.841 138.05 3 3 2 2 1 2 0 1 Median Median Median Median 7.9 12.8 4.6 9.5 534450000 247670000 286780000 184700000 82380000 102320000 128440000 37162000 91280000 117130000 60247000 56880000 104180000 67881000 36298000 1027 7781;24214;24771;27868 True;True;True;True 8837;27305;27306;28177;31878 43042;43043;43044;43045;131759;131760;131761;131762;131763;131764;136242;136243;153276;153277 55149;55150;55151;55152;55153;168396;168397;168398;168399;168400;168401;173993;173994;195265;195266 55153;168396;173994;195265 1026;1027 1;3 AT1G58025.6;AT1G58025.1;AT1G58025.5;AT1G58025.4;AT1G58025.3;AT1G58025.2 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 0.8 0 0.8 8465000 4547300 3917700 0 0 0 8465000 4547300 3917700 0 0 0 0 0 0 1029 1188 True 1338 6620;6621 8628;8629 8628 AT1G58080.1 AT1G58080.1 3 2 2 AT1G58080.1 | Symbols:ATATP-PRT1,ATP-PRT1,HISN1A | ATP phosphoribosyl transferase 1 | ATP phosphoribosyl transferase 1 | Chr1:21504562-21507429 REVERSE LENGTH=411 1 3 2 2 2 1 2 1 1 0 2 0 1 0 2 0 9.5 7.8 7.8 44.556 411 411 2.67 1 2 0 32.789 By MS/MS By matching By MS/MS By matching 0.85794 0.99961 71.106 3 2 Median NaN NaN 1.1071 NaN NaN NaN 1.2898 NaN NaN NaN 36.05 NaN 1 0 2 0 0 0 2 0 Median Median Median Median 4.1 1.7 7.8 1.7 193580000 112590000 80986000 60386000 46575000 13811000 0 0 0 133190000 66019000 67175000 0 0 0 1030 169;4828;23951 True;False;True 186;5512;26899 925;26779;26780;26781;26782;130162;130163 1269;34465;34466;34467;34468;166535;166536 1269;34465;166535 AT1G58270.1 AT1G58270.1 9 9 9 AT1G58270.1 | Symbols:ZW9 | | TRAF-like family protein | Chr1:21612394-21614089 REVERSE LENGTH=396 1 9 9 9 8 9 9 8 8 9 9 8 8 9 9 8 22 22 22 45.035 396 396 1.99 25 26 24 0 70.508 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1541 1.1412 17.058 57 7 Leave out requantified 1.2086 1.117 1.1919 1.1276 1.1301 1.0647 1.3931 1.2302 27.33 4.0248 16.698 24.087 14 15 14 14 2 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.4 22 22 19.4 21471000000 10398000000 11073000000 3623700000 1612100000 2011600000 5161300000 2609800000 2551500000 5961000000 2801500000 3159500000 6724900000 3375000000 3349900000 1031 6281;11478;11603;11852;20856;31046;33628;35638;39152 True;True;True;True;True;True;True;True;True 7165;12963;13099;13398;13399;23473;35420;38313;38314;40593;40594;44554 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44814;44815;44816;44817;44818;44819;44820;44821;80606;80607;80608;80609;80610;80611;80612;80613;80614;80615;80616;80617;80618;80619;80620;80621;81533;81534;81535;81536;81537;81538;81539;81540;81541;83350;83351;83352;83353;83354;83355;83356;83357;83358;83359;83360;83361;83362;83363;146507;146508;146509;146510;146511;215231;215232;215233;215234;215235;215236;215237;215238;215239;215240;215241;215242;215243;215244;215245;215246;215247;215248;232869;232870;232871;232872;247613;247614;247615;247616;247617;247618;247619;247620;247621;247622;247623;247624;247625;272746;272747;272748;272749;272750;272751;272752;272753;272754;272755;272756;272757;272758;272759 44819;80621;81536;83356;146509;215244;232872;247617;272751 501;502 1028 95;326 107 AT1G58290.1;AT2G31250.1 AT1G58290.1 8;2 8;2 5;1 AT1G58290.1 | Symbols:HEMA1,GluTR,AtHEMA1 | glutamyl-tRNA reductase,Arabidopsis thaliana hemA 1 | Glutamyl-tRNA reductase family protein | Chr1:21624028-21626051 REVERSE LENGTH=543 2 8 8 5 3 6 6 6 3 6 6 6 2 4 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17829;17830;17831;46378;46379;46380;46381;60369;60370;60371;60372;60373;60374;60375;60376;73107;73108;73109;73110;111211;111212;157712;157713;186388;186389;186390;186391;186392;186393;186394;186395;262924 17831;46379;60372;73110;111211;157712;186388;262924 AT1G58360.1 AT1G58360.1 2 2 2 AT1G58360.1 | Symbols:NAT2,AtAAP1,AAP1 | amino acid permease 1,NEUTRAL AMINO ACID TRANSPORTER 2 | amino acid permease 1 | Chr1:21676623-21680313 FORWARD LENGTH=485 1 2 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 5.4 5.4 5.4 52.895 485 485 2.5 1 1 0 10.371 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.9 0 3.5 0 13665000 4531800 9133300 13665000 4531800 9133300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1033 26661;33734 True;True 30550;38438 147506;183353 187983;233525 187983;233525 1029 228 AT1G59359.1;AT1G58983.1;AT1G58684.1;AT1G58380.1;AT3G57490.1 AT1G59359.1;AT1G58983.1;AT1G58684.1;AT1G58380.1;AT3G57490.1 17;17;17;17;10 5;5;5;5;0 5;5;5;5;0 AT1G59359.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S5 family protein | Chr1:21842537-21843733 REVERSE LENGTH=284;AT1G58983.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S5 family protein 5 17 5 5 17 16 17 17 5 5 5 5 5 5 5 5 55.6 18.7 18.7 30.771 284 284;284;284;284;276 2.08 15 15 19 0 62.431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0855 1.1257 10.06 48 12 Leave out requantified 1.1226 1.2235 0.83549 0.97941 1.0652 1.2117 0.96484 1.114 8.3229 14.461 25.057 29.227 10 12 13 13 3 1 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 55.6 55.3 55.6 55.6 27380000000 13060000000 14320000000 5312600000 2235900000 3076700000 6086600000 2741200000 3345400000 8895900000 4488800000 4407100000 7084700000 3594100000 3490500000 1034 1239;3394;4296;10177;10580;10581;12487;14730;16898;19825;20801;23164;30585;33042;34352;35810;36255 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Median Median 13.8 7.1 19 7.1 138990000 83653000 55340000 39426000 9741600 29684000 0 0 0 79567000 56738000 22829000 20000000 17173000 2826600 1039 20576;38079;38985 True;True;True 23171;43347;44355 113009;207722;207723;212784;212785;212786;212787 144860;264999;265000;271398;271399;271400;271401 144860;265000;271399 AT1G59760.1 AT1G59760.1 2 2 2 AT1G59760.1 | Symbols:AtMTR4,MTR4 | homolog of yeast MTR4 | RNA helicase%2C ATP-dependent%2C SK12/DOB1 protein | Chr1:21984571-21990110 REVERSE LENGTH=988 1 2 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 2 2 2 111.89 988 988 2 1 1 1 0.0081029 2.0756 By MS/MS By MS/MS 1.2953 1.476 87.491 2 0 Median NaN NaN 1.2953 NaN NaN NaN 1.476 NaN NaN NaN 87.491 NaN 0 0 2 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.3 0 0.7 0 108300000 34530000 73773000 0 0 0 0 0 0 108300000 34530000 73773000 0 0 0 1040 8776;31419 True;True 9939;35828 48531;48532;170940 62375;217702 62375;217702 AT1G59820.1 AT1G59820.1 2 2 2 AT1G59820.1 | Symbols:ALA3 | aminophospholipid ATPase 3 | aminophospholipid ATPase 3 | Chr1:22011599-22020023 FORWARD LENGTH=1213 1 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 2.1 2.1 2.1 137.75 1213 1213 2 1 1 1 0.00021327 4.5352 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79856 0.75903 92.561 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 1.3 0.7 0 1.3 48976000 32986000 15990000 0 0 0 36225000 28583000 7642000 0 0 0 12751000 4402800 8348100 1041 711;39075 True;True 798;44472 4147;4148;213342 5433;5434;272141 5433;272141 AT1G59830.1;AT1G59830.2 AT1G59830.1;AT1G59830.2 9;6 1;1 1;1 AT1G59830.1 | Symbols:PP2A-1 | protein phosphatase 2A-1 | protein phosphatase 2A-2 | Chr1:22020708-22022293 REVERSE LENGTH=306;AT1G59830.2 | Symbols:PP2A-1 | protein phosphatase 2A-1 | protein phosphatase 2A-2 | Chr1:22020929-22022293 REVERSE LENGTH=26 2 9 1 1 4 7 6 8 0 1 0 0 0 1 0 0 33 5.6 5.6 34.96 306 306;262 2 1 1 -2 By matching By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 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complex C | Chr1:22026569-22028174 FORWARD LENGTH=297;AT1G59840.2 | Symbols:CCB4 | cofactor assembly of complex C | cofactor assembly of complex C | Chr1:22026569-220281 3 4 4 4 4 1 1 2 4 1 1 2 4 1 1 2 23.2 23.2 23.2 32.222 297 297;297;283 2.25 2 2 4 0 40.217 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63116 0.5564 121.31 7 4 Median 0.56389 NaN NaN 0.83549 0.50884 NaN NaN 0.92019 154.21 NaN NaN 9.4776 3 1 1 2 2 0 0 2 Median Median Median Median 23.2 5.7 5.7 11.1 278020000 177750000 100270000 131800000 106140000 25664000 36879000 24159000 12719000 29730000 12013000 17717000 79610000 35444000 44166000 1043 2995;13177;34199;37374 True;True;True;True 3436;14878;38977;42564 17044;71753;71754;186015;186016;186017;186018;204039 22032;92206;92207;236942;236943;236944;236945;260126 22032;92207;236942;260126 1035 150 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symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr1:22071410-22073067 REVERSE LENGTH=326 1 6 6 6 4 2 3 0 4 2 3 0 4 2 3 0 24.5 24.5 24.5 36.73 326 326 2.33 1 4 4 0 17.825 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7477 1.6496 93.276 6 6 Median 2.1949 NaN 0.27203 NaN 2.1712 NaN 0.31871 NaN 17.175 NaN 5.5008 NaN 3 1 2 0 3 1 2 0 Plateau Median Median Median 16.9 10.4 11 0 244560000 125040000 119530000 85686000 21107000 64579000 38597000 5358000 33239000 120280000 98571000 21707000 0 0 0 1046 16706;18042;23792;26470;30201;39171 True;True;True;True;True;True 18888;20421;26721;30326;34473;44573 92077;92078;99659;129408;146343;165073;165074;213829;213830 118010;118011;127715;165600;186452;210329;210330;272835;272836 118011;127715;165600;186452;210330;272835 AT1G59990.1;AT1G59990.2 AT1G59990.1;AT1G59990.2 6;5 6;5 6;5 AT1G59990.1 | Symbols:HS3,EMB3108,RH22 | EMBRYO DEFECTIVE 3108,HEAVY SEED 3,RNA helicase 22 | DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | Chr1:22090369-22092885 REVERSE LENGTH=581;AT1G59990.2 | Symbols:HS3,EMB3108,RH22 | EMBRYO DEFECTIVE 3108,HEAVY SEED 2 6 6 6 4 2 4 2 4 2 4 2 4 2 4 2 13.3 13.3 13.3 64.747 581 581;567 1.92 5 4 4 0 24.288 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0448 1.1574 30.718 12 3 Leave out requantified 0.7502 0.8311 1.0591 1.1548 0.66887 0.78996 1.2528 1.3424 5.5449 26.299 35.776 2.278 4 2 4 2 2 1 0 0 Median Median Leave out requantified Median 8.6 4.6 9.3 4.6 537400000 293010000 244390000 194890000 115340000 79554000 75008000 47280000 27728000 178610000 91620000 86989000 88893000 38778000 50115000 1047 835;1459;6060;6930;24338;33286 True;True;True;True;True;True 936;1656;6880;7885;27516;37919 4746;4747;4748;4749;4750;8325;8326;8327;8328;33695;38734;133015;180833 6181;6182;6183;6184;6185;6186;10896;10897;10898;10899;10900;10901;43140;43141;49570;170014;230332;230333 6186;10897;43140;49570;170014;230333 1061 428 AT1G60000.1 AT1G60000.1 2 2 2 AT1G60000.1 | Symbols:no symbol available | no full name 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AT1G60170.1 | Symbols:emb1220,PRP31 | embryo defective 1220 | pre-mRNA processing ribonucleoprotein binding region-containing protein | Chr1:22193008-22195177 FORWARD LENGTH=485 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.2 6.2 6.2 52.644 485 485 2 2 2 0 5.3511 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87752 0.90974 52.773 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 1 0 Median Median Median Median 2.3 2.3 3.9 2.3 219770000 127770000 91996000 49397000 24662000 24735000 61036000 28115000 32921000 39565000 34353000 5211700 69770000 40642000 29128000 1052 15054;24343 True;True 17046;27521 83143;83144;83145;133023 107161;107162;107163;170022 107163;170022 AT1G60200.4;AT1G60200.3;AT1G60200.2;AT1G60200.1 AT1G60200.4;AT1G60200.3;AT1G60200.2;AT1G60200.1 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT1G60200.4 | Symbols:RBM25 | RNA-binding protein 25 | splicing factor PWI domain-containing protein / RNA recognition motif (RRM)-containing protein | Chr1:22200882-22203717 REVERSE LENGTH=750;AT1G60200.3 | Symbols:RBM25 | RNA-binding protein 25 | spli 4 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 2.1 2.1 2.1 85.987 750 750;750;750;899 2 1 1 0 6.3234 By MS/MS By MS/MS 1.5227 1.54 27.275 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 0 2.1 0 2.1 30674000 13656000 17018000 0 0 0 15121000 6540600 8579900 0 0 0 15553000 7115200 8438000 1053 28366 True 32451 155968;155969 198797;198798 198797 AT1G60420.1 AT1G60420.1 10 10 10 AT1G60420.1 | Symbols:AtNRX1,NRX1 | nucleoredoxin 1 | DC1 domain-containing protein | Chr1:22261978-22264243 FORWARD LENGTH=578 1 10 10 10 4 8 9 7 4 8 9 7 4 8 9 7 20.8 20.8 20.8 65.169 578 578 2.14 8 15 13 0 33.566 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76982 0.81364 75.668 35 19 Leave out requantified 1.8039 1.9325 0.39489 0.49065 1.6818 1.7729 0.47903 0.56528 17.048 20.845 42.015 43.941 5 10 11 9 2 6 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 17.5 17.8 13.8 2391200000 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Chr1:22305988-22308092 REVERSE LENGTH=337 1 5 5 5 4 4 5 5 4 4 5 5 4 4 5 5 16.6 16.6 16.6 37.056 337 337 2.05 5 10 6 0 14.707 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85998 0.79074 21.044 17 7 Leave out requantified 0.96665 0.67491 1.4903 1.0116 0.84036 0.6317 1.6496 1.1185 15.539 8.2347 45.873 31.631 4 5 4 4 2 0 3 2 Linear Leave out requantified Median Median 14.2 14.2 16.6 16.6 883460000 464350000 419110000 171150000 93211000 77940000 277590000 156430000 121160000 220380000 100930000 119450000 214340000 113780000 100560000 1055 1092;2051;12379;33520;35491 True;True;True;True;True 1225;2323;13984;38190;40426;40427 6039;6040;6041;6042;11464;11465;67675;67676;67677;67678;182248;182249;182250;182251;193309;193310;193311;193312;193313;193314;193315 7884;7885;7886;7887;7888;14871;14872;87058;87059;87060;87061;232138;232139;232140;232141;232142;246486;246487;246488;246489;246490;246491;246492;246493;246494 7887;14871;87058;232142;246489 1063 223 AT1G60660.1 AT1G60660.1 2 2 2 AT1G60660.1 | Symbols:B5 #5,CB5LP,ATCB5LP | ARABIDOPSIS CYTOCHROME B5-LIKE PROTEIN,cytochrome B5-like protein | cytochrome B5-like protein | Chr1:22342589-22342954 REVERSE LENGTH=121 1 2 2 2 2 2 0 0 2 2 0 0 2 2 0 0 17.4 17.4 17.4 13.709 121 121 2.25 1 1 2 0.00021022 4.3062 By MS/MS By MS/MS 1.1991 1.1403 26.406 4 1 Median 1.1991 1.1227 NaN NaN 1.1403 1.0477 NaN NaN 20.278 40.112 NaN NaN 2 2 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 17.4 17.4 0 0 149860000 77894000 71970000 65824000 33438000 32386000 84041000 44456000 39585000 0 0 0 0 0 0 1056 29028;30997 True;True 33194;35367 159391;159392;168846;168847 203017;203018;215014;215015 203017;215014 AT1G60710.1;AT1G60730.2 AT1G60710.1 14;1 14;1 6;0 AT1G60710.1 | Symbols:ATB2 | | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr1:22355073-22356627 REVERSE LENGTH=345 2 14 14 6 7 6 12 8 7 6 12 8 3 2 5 3 39.7 39.7 19.7 37.924 345 345;183 2.1 12 12 16 0 38.556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66668 0.76486 25.919 36 12 Leave out requantified 1.0842 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548;549;550;551;552;553;5844;49156;49157;64171;78565;89722;89723;89724;89725;89726;89727;91342;91343;162087;162088;162089;162090;162091;162092;162093;162094;163603;163604;163605;175128;241328;241329;254758;254759;269818;269819;269820;269821;269822;269823 553;5844;49156;64171;78565;89724;91343;162089;163605;175128;241329;254758;254759;269820 AT1G60730.1;AT1G60730.3 AT1G60730.1;AT1G60730.3 7;6 3;2 2;1 AT1G60730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr1:22358327-22360082 REVERSE LENGTH=345;AT1G60730.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidored 2 7 3 2 4 2 6 4 1 0 3 1 1 0 2 1 21.7 9.6 6.7 37.857 345 345;365 2.4 1 1 3 0 6.2203 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.23804 0.28361 75.08 2 2 Median NaN NaN 0.23804 NaN NaN NaN 0.28361 NaN NaN NaN 75.08 NaN 0 0 2 0 0 0 2 0 Median Median Median Median 13.6 6.1 19.7 11.6 80473000 68826000 11647000 0 0 0 0 0 0 62152000 50506000 11647000 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49938;49939;69857;69858;69859;69860;69861;98561;98562;211505;211506;211507;211508;211509;211510 64171;89722;89723;89724;89725;89726;89727;126366;269818;269819;269820;269821;269822;269823 64171;89724;126366;269820 2703 274 AT1G60770.1 AT1G60770.1 2 2 2 AT1G60770.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr1:22366959-22368648 REVERSE LENGTH=491 1 2 2 2 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 6.1 6.1 6.1 55.905 491 491 2.43 1 2 4 0 6.1724 By matching By MS/MS By MS/MS 0.78713 0.92375 40.712 5 0 Median NaN NaN 0.78713 NaN NaN NaN 0.92375 NaN NaN NaN 4.603 NaN 1 1 3 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.9 6.1 6.1 0 268760000 107790000 160970000 123950000 37085000 86861000 22674000 7656300 15017000 122140000 63048000 59091000 0 0 0 1060 25392;34194 True;True 29013;38972 140056;140057;185997;185998;185999;186000;186001 178737;178738;236926;236927;236928 178738;236928 508 438 AT1G60780.1;AT1G10730.1 AT1G60780.1 6;2 6;2 6;2 AT1G60780.1 | Symbols:AP1M2,HAP13 | adaptor protein-1 mu-adaptin 2,HAPLESS 13 | Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein | Chr1:22369289-22371885 REVERSE LENGTH=428 2 6 6 6 5 5 4 4 5 5 4 4 5 5 4 4 15.9 15.9 15.9 49.032 428 428;428 1.83 11 6 7 0 15.586 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2058 1.264 15.383 21 15 Leave out requantified 1.7703 1.2058 0.95312 1.2688 1.755 1.1183 1.1583 1.4529 40.016 98.275 88.971 86.87 5 6 4 6 4 4 2 5 Median Median Median Median 14 13.6 11.7 11.7 2015500000 686170000 1329300000 427410000 97218000 330190000 666040000 287290000 378750000 261460000 113620000 147840000 660590000 188040000 472550000 1061 888;12849;28810;33715;34375;38792 True;True;True;True;True;True 995;14515;32956;38415;39169;44144;44145 4989;4990;4991;4992;70112;70113;70114;158375;183241;183242;183243;183244;183245;183246;187095;187096;187097;211720;211721;211722;211723;211724;211725;211726 6504;6505;6506;6507;90059;90060;90061;201767;233393;233394;233395;233396;233397;233398;238402;238403;238404;270072;270073;270074;270075;270076;270077;270078 6506;90061;201767;233397;238404;270077 1064;1065 209;419 AT1G60990.3;AT1G60990.2;AT1G60990.1 AT1G60990.3;AT1G60990.2;AT1G60990.1 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT1G60990.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glycine cleavage T-protein family | Chr1:22462771-22465416 REVERSE LENGTH=432;AT1G60990.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glycine cleavage T-protein family | 3 3 3 3 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 7.4 7.4 7.4 47.008 432 432;432;432 2 1 1 1 0 4.8338 By MS/MS By MS/MS 0.27573 0.3153 16.757 2 2 Median NaN NaN 0.27573 NaN NaN NaN 0.3153 NaN NaN NaN 16.757 NaN 0 0 2 0 0 0 2 0 Median Median Median Median 0 2.5 4.9 0 75495000 58656000 16839000 0 0 0 0 0 0 75495000 58656000 16839000 0 0 0 1062 27211;27814;32704 True;True;True 31147;31823;37253 150149;153080;177665 191309;195021;226325 191309;195021;226325 1066 172 AT1G61010.5;AT1G61010.4;AT1G61010.3;AT1G61010.2;AT1G61010.1 AT1G61010.5;AT1G61010.4;AT1G61010.3;AT1G61010.2;AT1G61010.1 4;4;4;4;4 4;4;4;4;4 4;4;4;4;4 AT1G61010.5 | Symbols:CPSF73-I | cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I | cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I | Chr1:22474954-22477660 REVERSE LENGTH=693;AT1G61010.4 | Symbols:CPSF73-I | cleavage and polyadenylation specif 5 4 4 4 1 2 1 3 1 2 1 3 1 2 1 3 6.3 6.3 6.3 77.364 693 693;693;693;693;693 2 1 5 1 0 7.2291 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98325 1.0162 27.732 5 4 Median NaN NaN NaN 0.74333 NaN NaN NaN 0.85227 NaN NaN NaN 44.466 1 1 1 2 0 1 1 2 Median Median Median Median 1.2 3 1.2 4.5 125520000 64950000 60574000 28439000 12108000 16331000 12747000 5399600 7347400 30485000 18547000 11938000 53853000 28895000 24958000 1063 18146;22103;22238;26124 True;True;True;True 20531;24843;24991;29906 100152;120381;120382;120383;120384;121036;144434 128326;154141;154142;154143;154144;154972;184183 128326;154142;154972;184183 AT1G61150.7;AT1G61150.3;AT1G61150.5;AT1G61150.9;AT1G61150.8;AT1G61150.6;AT1G61150.4;AT1G61150.2;AT1G61150.11;AT1G61150.10;AT1G61150.1 AT1G61150.7;AT1G61150.3;AT1G61150.5;AT1G61150.9;AT1G61150.8;AT1G61150.6;AT1G61150.4;AT1G61150.2;AT1G61150.11;AT1G61150.10;AT1G61150.1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT1G61150.7 | Symbols:no symbol available | no full name available | LisH and RanBPM domains containing protein | Chr1:22543304-22544355 FORWARD LENGTH=193;AT1G61150.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | LisH and RanBPM domains cont 11 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 11.9 11.9 11.9 21.831 193 193;193;220;226;226;226;226;226;243;243;243 3 1 0 5.5916 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 11.9 0 25646000 15723000 9923500 0 0 0 0 0 0 25646000 15723000 9923500 0 0 0 1064 36471 True 41554 198811 253575 253575 AT1G61210.1;AT1G61210.2;AT1G61210.3 AT1G61210.1;AT1G61210.2;AT1G61210.3 2;2;1 2;2;1 2;2;1 AT1G61210.1 | Symbols:DWA3 | DWD hypersensitive to ABA 3 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr1:22564785-22571555 FORWARD LENGTH=1181;AT1G61210.2 | Symbols:DWA3 | DWD hypersensitive to ABA 3 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily pr 3 2 2 2 1 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 0 2.3 2.3 2.3 129.17 1181 1181;1179;1077 1 3 0.001341 2.9887 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0.9 2.3 0 0 13039000 0 13039000 13039000 0 13039000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1065 33741;37428 True;True 38446;42622 183373;204347;204348 233547;260558;260559 233547;260559 509;2704 1067;1068 750;751 745;747 AT1G61250.2;AT1G61250.1;AT1G11180.3;AT1G11180.1;AT1G11180.2 AT1G61250.2;AT1G61250.1 3;3;1;1;1 3;3;1;1;1 3;3;1;1;1 AT1G61250.2 | Symbols:AtSCAMP1,SC3,SCAMP1 | secretory carrier 3,Secretory carrier membrane protein 1 | secretory carrier 3 | Chr1:22586035-22588519 FORWARD LENGTH=274;AT1G61250.1 | Symbols:AtSCAMP1,SC3,SCAMP1 | secretory carrier 3,Secretory carrier memb 5 3 3 3 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 12.4 12.4 12.4 30.942 274 274;289;284;291;297 1.67 5 6 1 0 44.161 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82553 0.86901 39.631 12 1 Leave out requantified 1.2868 1.7801 0.69943 0.56334 1.2123 1.607 0.79155 0.62642 37.521 13.84 15.176 6.5044 2 4 4 2 0 1 0 0 Median Median Leave out requantified Median 9.5 12.4 12.4 9.9 3556200000 1755300000 1800900000 653090000 258530000 394560000 952350000 331830000 620520000 1479700000 857490000 622170000 471080000 307470000 163610000 1066 1499;34040;38373 True;True;True 1705;38795;43676 8554;8555;8556;8557;185128;185129;185130;209372;209373;209374;209375;209376 11156;11157;11158;235868;235869;235870;235871;267090;267091;267092;267093;267094;267095 11158;235869;267093 AT1G61330.1 AT1G61330.1 1 1 1 AT1G61330.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | FBD%2C F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein | Chr1:22622975-22624527 FORWARD LENGTH=447 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.2 2.2 2.2 51.878 447 447 2 2 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.2 2.2 2.2 2.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 1067 24663 True 28009 135457;135458;135459;135460;135461 172995;172996;172997;172998 172997 510;2705 1069 6;8 1 AT1G61520.2;AT1G61520.3;AT1G61520.1 AT1G61520.2;AT1G61520.3;AT1G61520.1 6;6;6 6;6;6 6;6;6 AT1G61520.2 | Symbols:LHCA3 | photosystem I light harvesting complex gene 3 | PSI type III chlorophyll a/b-binding protein | Chr1:22700493-22701149 FORWARD LENGTH=218;AT1G61520.3 | Symbols:LHCA3 | photosystem I light harvesting complex gene 3 | PSI type 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 33.9 33.9 33.9 23.746 218 218;273;273 2.06 54 57 65 0 215.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0958 1.1628 9.8126 111 35 Leave out requantified 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L3 B | Chr1:22720833-22722402 REVERSE LENGTH=390 1 13 7 7 9 8 9 10 3 2 3 4 3 2 3 4 30 19 19 44.546 390 390 2.14 3 6 5 0 11.142 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95433 0.98794 33.58 7 4 Leave out requantified 1.6886 NaN NaN 0.62842 1.6473 NaN NaN 0.71218 45.75 NaN NaN 37.23 3 1 1 2 1 1 0 2 Median Median Median Median 19.5 16.9 19.7 21.3 297880000 136210000 161670000 104190000 46497000 57693000 25302000 7211600 18091000 31536000 18729000 12807000 136850000 63773000 73080000 1070 1572;5013;7803;11305;11859;12628;13771;15432;19775;23344;35479;35927;37047 True;False;True;True;True;False;False;False;True;True;True;False;False 1787;5712;5713;8860;12765;13406;14269;15563;17468;22302;26223;40412;40413;40922;42206 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AT1G62390.1 | Symbols:Phox2,CLMP1 | Phox2,CLUMPED CHLOROPLASTS 1 | Octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein / tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein | Chr1:23084632-23086887 REVERSE LENGTH=751 1 19 19 19 13 15 15 10 13 15 15 10 13 15 15 10 33.7 33.7 33.7 82.707 751 751 2 22 24 22 0 129.63 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92144 0.94804 12.664 49 14 Leave out requantified 0.94915 1.0538 0.78109 0.8632 0.85906 0.99212 0.90747 0.99841 23.267 10.729 15.691 25.257 12 15 13 9 5 3 5 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.6 25.8 25.7 17 4858400000 2489200000 2369200000 1087000000 554170000 532840000 1458900000 686040000 772880000 1435400000 799460000 635900000 877130000 449510000 427620000 1081 1110;2969;7232;10437;10838;12283;16455;17717;20084;20110;21249;24063;25421;29329;30681;31877;35028;35138;38806 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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AT1G62500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr1:23132181-23133074 FORWARD LENGTH=297 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.4 3.4 3.4 29.68 297 297 2 2 1 2 0.0020611 2.6973 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77539 0.68773 69.341 5 0 Median 0.4224 NaN NaN NaN 0.39318 NaN NaN NaN 52.87 NaN NaN NaN 2 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.4 3.4 3.4 3.4 543980000 262320000 281660000 149410000 88875000 60538000 100460000 54686000 45777000 165340000 58217000 107120000 128770000 60543000 68227000 1084 27610 True 31602 152204;152205;152206;152207;152208 193963;193964;193965;193966;193967;193968;193969 193967 AT1G63390.1;AT1G62600.2;AT1G62600.1 AT1G63390.1;AT1G62600.2;AT1G62600.1 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT1G63390.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | flavin containing monooxygenase FMO GS-OX-like protein | Chr1:23506461-23506967 REVERSE LENGTH=168;AT1G62600.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Flavin-binding m 3 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 11.3 11.3 11.3 18.768 168 168;394;452 2 1 4 1 0.00097523 3.2194 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 11.378 13.375 179.2 5 4 Median NaN NaN 2.0609 NaN NaN NaN 2.3734 NaN NaN NaN 244.52 NaN 1 1 2 1 1 1 1 1 Median Median Median Median 4.8 4.8 11.3 4.8 607230000 86843000 520390000 91809000 994960 90814000 152530000 1823100 150710000 263800000 80718000 183080000 99097000 3307100 95790000 1085 2833;34617 True;True 3249;39446 16040;16041;16042;16043;16044;188617 20804;20805;20806;20807;20808;240460 20806;240460 AT1G62630.1;AT1G63360.2;AT1G63360.1 AT1G62630.1 5;2;2 5;2;2 5;2;2 AT1G62630.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family | Chr1:23185912-23188593 FORWARD LENGTH=893 3 5 5 5 1 3 3 2 1 3 3 2 1 3 3 2 6 6 6 101.9 893 893;849;884 2.11 3 2 4 0 14.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.60629 0.64913 54.145 9 4 Leave out 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LENGTH=571 1 18 18 13 7 13 13 3 7 13 13 3 5 11 9 3 36.8 36.8 29.1 64.519 571 571 1.86 18 13 12 0 107.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72248 0.8036 56.082 31 18 Leave out requantified 0.97754 1.8873 0.3199 0.56591 0.94433 1.7345 0.37632 0.68054 14.737 21.113 38.416 40.057 5 13 10 3 2 9 6 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Plateau 15.4 27.7 29.8 6.3 1715900000 959810000 756070000 160760000 80929000 79829000 641400000 239480000 401920000 776220000 537860000 238360000 137490000 101530000 35964000 1089 447;3043;4514;7145;8817;9004;9005;9067;10520;13889;16144;21046;26086;26761;27960;28206;34069;38335 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 504;3488;3489;5159;8126;9983;10187;10188;10189;10256;11883;15701;18264;23679;29863;30657;31982;32267;38829;43633 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 1 0 Median Median Median Median 1.4 1.4 1.4 0 65144000 37715000 27428000 17814000 8752500 9061600 29551000 18335000 11217000 17778000 10628000 7150100 0 0 0 1095 23780 True 26706 129294;129295;129296 165447;165448;165449 165448 AT1G63000.1 AT1G63000.1 12 10 10 AT1G63000.1 | Symbols:NRS/ER,UER1 | UDP-4-KETO-6-DEOXY-D-GLUCOSE-3,5-EPIMERASE-4-REDUCTASE 1,nucleotide-rhamnose synthase/epimerase-reductase | nucleotide-rhamnose synthase/epimerase-reductase | Chr1:23342510-23343859 FORWARD LENGTH=301 1 12 10 10 8 10 11 8 6 8 9 6 6 8 9 6 42.9 35.5 35.5 33.597 301 301 1.97 10 13 9 0 35.762 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83801 0.82823 32.211 27 10 Leave out requantified 1.1223 0.97917 0.48152 0.99065 0.96818 0.92696 0.57328 1.1147 23.084 22.345 12.662 10.241 5 6 11 5 0 2 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.6 34.6 36.5 25.2 3269300000 1777500000 1491800000 448010000 217260000 230750000 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18806;51077;55428;85559;143763;152389;171996;187591;211347;222958;231144;238909 530 1102;1103 6 150;168 AT1G63010.2;AT1G63010.7;AT1G63010.6;AT1G63010.4;AT1G63010.3;AT1G63010.1;AT1G63010.5 AT1G63010.2;AT1G63010.7;AT1G63010.6;AT1G63010.4;AT1G63010.3;AT1G63010.1;AT1G63010.5 3;3;3;3;3;3;3 3;3;3;3;3;3;3 3;3;3;3;3;3;3 AT1G63010.2 | Symbols:VPT1,PHT5;1 | Vacuolar Phosphate Transporter 1 | Major Facilitator Superfamily with SPX (SYG1/Pho81/XPR1) domain-containing protein | Chr1:23347972-23351026 REVERSE LENGTH=697;AT1G63010.7 | Symbols:VPT1,PHT5;1 | Vacuolar Phosphate 7 3 3 3 2 3 1 2 2 3 1 2 2 3 1 2 4.4 4.4 4.4 78.05 697 697;699;699;699;699;699;708 2.07 5 4 6 0 7.4763 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6123 1.4727 67.247 7 4 Leave out requantified 0.79298 1.9067 NaN 0.81629 0.72276 1.759 NaN 0.92307 33.09 25.119 NaN 69.853 2 2 1 2 1 0 1 2 Median Median Median Median 2.4 4.4 1 2.4 392080000 206320000 185760000 78415000 47147000 31268000 106990000 36727000 70263000 79499000 48536000 30963000 127170000 73909000 53263000 1097 5932;9796;12159 True;True;True 6727;11094;13742 32953;32954;32955;32956;32957;32958;32959;32960;32961;32962;32963;53587;66413;66414;66415 42208;42209;42210;42211;42212;42213;42214;42215;42216;42217;42218;68746;85436;85437;85438 42216;68746;85437 AT1G63110.2;AT1G63110.3;AT1G63110.1 AT1G63110.2;AT1G63110.3;AT1G63110.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT1G63110.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | GPI transamidase subunit PIG-U | Chr1:23405155-23407757 FORWARD LENGTH=397;AT1G63110.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | GPI transamidase subunit PIG-U | Chr1:2 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.5 3.5 3.5 44.772 397 397;407;469 1.8 2 2 1 0.00040217 3.6352 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.60791 0.68749 97.912 5 5 Median NaN NaN 0.29765 NaN NaN NaN 0.34037 NaN NaN NaN 5.0034 NaN 1 1 2 1 1 1 2 1 Median Median Median Median 3.5 3.5 3.5 3.5 274410000 165130000 109280000 59889000 27204000 32685000 22322000 4453200 17868000 131440000 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Symbols:UGE3 | UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 3 | UDP-D-glucose/U 2 6 4 4 1 3 6 2 0 1 4 0 0 1 4 0 19.4 14 14 38.91 351 351;304 2.2 1 2 2 0 9.5806 By matching By MS/MS By MS/MS By matching 1.5849 1.9929 61.111 3 2 Median NaN NaN 1.2267 NaN NaN NaN 1.4981 NaN NaN NaN 40.359 NaN 0 1 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 3.1 8.3 19.4 5.4 124520000 51213000 73309000 0 0 0 24665000 2431500 22234000 99856000 48781000 51075000 0 0 0 1100 1277;3764;10782;20694;20942;37144 True;True;False;True;False;True 1440;4305;12181;23298;23567;42311 7201;21102;21103;58959;58960;58961;58962;113532;114672;114673;114674;202468 9423;27254;27255;75726;75727;75728;75729;75730;75731;75732;145516;146959;146960;146961;258200 9423;27254;75732;145516;146959;258200 AT1G63210.1 AT1G63210.1 3 1 1 AT1G63210.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transcription elongation factor Spt6 | Chr1:23443688-23447354 FORWARD LENGTH=1197 1 3 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 1.2 1.2 138.13 1197 1197 2.22 2 3 4 0.00021349 4.5479 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0367 1.076 31.659 9 3 Median 1.1439 0.81005 1.21 1.2872 1.076 0.78495 1.4345 1.4011 19.266 8.1871 6.4239 27.247 3 2 2 2 1 1 1 0 Plateau Median Median Median 1.9 1.2 1.8 1.2 3769300000 1733700000 2035600000 670070000 316110000 353960000 893480000 495380000 398100000 1303000000 567450000 735510000 902750000 354760000 547990000 1101 22187;33564;38238 False;True;False 24934;38234;43527 120764;182423;182424;182425;182426;182427;182428;182429;182430;182431;208651 154648;232353;232354;232355;232356;232357;232358;232359;232360;232361;232362;232363;232364;232365;266165 154648;232354;266165 AT1G63270.1 AT1G63270.1 1 1 1 AT1G63270.1 | Symbols:NAP10,ATNAP10,AtCCMA,ABCI1 | non-intrinsic ABC protein 10,ATP-binding cassette I1,cytochrome c maturation a | non-intrinsic ABC protein 10 | Chr1:23469664-23470353 REVERSE LENGTH=229 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 25.975 229 229 2.43 1 2 4 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:23486580-23487044 REVERSE LENGTH=154 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9.1 9.1 9.1 17.201 154 154 1.75 2 1 1 0.00020868 4.2009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 9.1 9.1 9.1 9.1 32418000 16377000 16041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32418000 16377000 16041000 1104 1446 True 1640 8246;8247;8248;8249 10798;10799;10800;10801 10800 AT1G63460.1 AT1G63460.1 1 1 1 AT1G63460.1 | Symbols:ATGPX8,GPX8 | glutathione peroxidase 8 | glutathione peroxidase 8 | Chr1:23535118-23536326 FORWARD LENGTH=167 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 7.2 7.2 7.2 19.067 167 167 3 1 0.0018779 2.7227 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 7.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1105 11630 True 13127 63525 81720;81721 81720 531;2710;2711 140;142;145 AT1G63470.1 AT1G63470.1 1 1 1 AT1G63470.1 | Symbols:AHL5 | AT-hook motif nuclear localized protein 5 | AT hook motif DNA-binding family protein | Chr1:23536831-23538863 REVERSE LENGTH=378 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3.2 3.2 3.2 39.643 378 378 2 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 3.2 0 3.2 12589000 7034400 5554300 0 0 0 12589000 7034400 5554300 0 0 0 0 0 0 + 1106 6613 True 7535 36659;36660 46974;46975 46974 1105 140 AT1G63500.1 AT1G63500.1 10 6 5 AT1G63500.1 | Symbols:BSK7 | brassinosteroid-signaling kinase 7 | kinase with tetratricopeptide repeat domain-containing protein | Chr1:23556015-23558403 FORWARD LENGTH=487 1 10 6 5 7 8 7 9 5 6 4 6 4 5 4 5 24.2 16.2 13.3 54.798 487 487 2.15 7 15 12 0 24.459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0515 1.0927 32.779 30 18 Leave out requantified 1.1029 1.2506 0.79293 0.78755 1.0224 1.1825 0.97355 0.934 14.208 92.894 20.74 152.85 8 7 6 9 5 4 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 17.2 19.7 17.5 21.1 4782800000 3995500000 787330000 1300600000 1071900000 228670000 489390000 326520000 162870000 337990000 176290000 161700000 2654900000 2420800000 234090000 1107 2471;4365;22262;23999;25001;27067;30237;31746;32097;36064 False;False;True;True;True;False;True;False;True;True 2782;4977;25015;25016;26969;26970;28506;30986;34513;34514;36185;36575;41072 13693;13694;13695;13696;13697;13698;13699;24164;121130;121131;121132;121133;130426;130427;130428;130429;130430;130431;130432;130433;130434;130435;137843;137844;137845;137846;137847;137848;149369;149370;149371;149372;165222;165223;165224;165225;165226;165227;165228;172484;174404;174405;196677;196678;196679;196680;196681 17712;17713;17714;17715;17716;17717;17718;17719;17720;17721;31209;155089;155090;155091;155092;166853;166854;166855;166856;166857;166858;166859;166860;166861;166862;175986;175987;175988;175989;175990;175991;175992;175993;175994;175995;190279;190280;190281;190282;190283;190284;190285;190286;210496;210497;210498;210499;210500;210501;219686;222180;222181;250885;250886;250887;250888;250889;250890;250891;250892 17713;31209;155091;166860;175989;190281;210498;219686;222181;250888 1106;1107;1108 115;135;310 AT1G63610.1;AT1G63610.2;AT1G63610.3 AT1G63610.1;AT1G63610.2 8;4;2 8;4;2 8;4;2 AT1G63610.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:23583675-23585599 REVERSE LENGTH=340;AT1G63610.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:23584118-23585599 REV 3 8 8 8 4 7 6 7 4 7 6 7 4 7 6 7 32.1 32.1 32.1 37.955 340 340;257;185 1.9 11 11 8 0 61.155 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90536 0.84184 22.744 27 14 Leave out 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101;103;286 AT1G63660.1;AT1G63660.2 AT1G63660.1;AT1G63660.2 19;15 19;15 19;15 AT1G63660.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)%2C putative / glutamine amidotransferase | Chr1:23604127-23607080 REVERSE LENGTH=534;AT1G63660.2 | Symbols:no symbol available | no full name avail 2 19 19 19 16 15 15 9 16 15 15 9 16 15 15 9 41.6 41.6 41.6 59.314 534 534;434 2.27 14 18 31 0 131.33 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85796 0.83184 30.008 59 20 Leave out requantified 0.82726 0.90312 0.98606 0.93768 0.74958 0.83496 1.2015 1.0841 38.269 28.473 20.559 24.285 18 15 17 9 6 4 7 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.6 28.7 34.5 19.7 7415900000 3723600000 3692300000 1994500000 1075100000 919330000 2080600000 1011300000 1069300000 2372600000 1158100000 1214500000 968270000 479140000 489130000 1109 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Median 11.6 11.6 11.6 11.6 354090000 165570000 188520000 80723000 40762000 39961000 87804000 42504000 45299000 79450000 35990000 43461000 106110000 46312000 59797000 1121 30605 True 34938 167074;167075;167076;167077 212847;212848;212849;212850;212851;212852;212853;212854;212855;212856;212857 212856 AT1G64400.1 AT1G64400.1 7 5 5 AT1G64400.1 | Symbols:LACS3 | long-chain acyl-CoA synthetase 3 | AMP-dependent synthetase and ligase family protein | Chr1:23915802-23919681 REVERSE LENGTH=665 1 7 5 5 5 3 7 4 3 1 5 2 3 1 5 2 11.4 8 8 74.75 665 665 2.17 3 4 5 0 15.475 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.50245 0.56111 123.83 7 6 Median 1.3225 NaN 0.15276 NaN 1.2658 NaN 0.1715 NaN 50.718 NaN 84.033 NaN 2 1 3 1 1 1 3 1 Median Median Median Median 8.7 4.5 11.4 7.1 145020000 96964000 48059000 44570000 23208000 21363000 15607000 1654300 13953000 50796000 46655000 4140800 34049000 25447000 8602800 1122 7098;20963;23285;27198;33027;38798;38799 False;True;True;True;False;True;True 8076;23590;26154;31134;37611;44152;44153 39636;39637;39638;39639;39640;114778;114779;114780;126487;126488;150092;150093;150094;179365;179366;179367;179368;179369;211761;211762;211763;211764 50645;50646;50647;50648;50649;50650;147087;147088;147089;161828;161829;191237;191238;191239;228476;228477;228478;228479;228480;270118;270119;270120;270121;270122 50649;147087;161829;191237;228477;270118;270120 AT1G64430.1;AT1G64430.2;AT1G64430.3 AT1G64430.1;AT1G64430.2;AT1G64430.3 6;6;5 6;6;5 6;6;5 AT1G64430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr1:23933541-23936336 FORWARD LENGTH=559;AT1G64430.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopeptide re 3 6 6 6 3 5 2 3 3 5 2 3 3 5 2 3 12 12 12 61.621 559 559;559;483 1.75 10 5 5 0 20.354 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0923 1.0725 16.96 10 7 Median 1.0932 1.1496 NaN 1.092 0.95989 1.0523 NaN 1.1729 16.289 14.613 NaN 10.649 3 2 1 4 3 1 0 3 Median Median Median Median 7 10 2.7 5.4 581600000 285670000 295920000 52036000 29399000 22637000 172560000 84847000 87711000 129530000 59088000 70440000 227480000 112340000 115140000 1123 5587;10723;17780;34051;35426;37129 True;True;True;True;True;True 6345;12111;20125;38808;40350;42293 30942;30943;30944;58626;58627;58628;58629;58630;58631;58632;58633;58634;58635;98184;185187;185188;185189;192956;202415;202416 39725;39726;39727;75296;75297;75298;75299;75300;75301;75302;75303;75304;75305;125882;235941;235942;235943;246033;258135;258136 39727;75304;125882;235942;246033;258135 AT1G64500.1 AT1G64500.1 4 4 4 AT1G64500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glutaredoxin family protein | Chr1:23953270-23954376 FORWARD LENGTH=368 1 4 4 4 1 3 3 2 1 3 3 2 1 3 3 2 13.9 13.9 13.9 41.016 368 368 1.67 4 4 1 0 10.804 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1263 1.1536 42.38 7 0 Leave out requantified NaN 0.93904 1.0683 1.2587 NaN 0.82549 1.1643 1.4545 NaN 0.34338 41.955 9.6013 1 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.5 10.6 9.5 6.2 390240000 185790000 204450000 25528000 13277000 12251000 112910000 59634000 53277000 126230000 55380000 70850000 125570000 57498000 68071000 1124 7032;23193;29532;38879 True;True;True;True 8001;26055;33752;44241 39286;39287;39288;39289;126006;126007;126008;161926;212201 50221;50222;50223;50224;50225;161257;161258;161259;206291;270667 50222;161259;206291;270667 540 1139 294 138 AT1G64510.1;AT1G64510.2 AT1G64510.1;AT1G64510.2 2;2 2;2 2;2 AT1G64510.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein | Chr1:23954993-23956205 REVERSE LENGTH=207;AT1G64510.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13 13 13 22.761 207 207;231 2.19 5 11 10 0 9.1722 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81634 0.91871 12.467 24 5 Leave out requantified 0.79436 1.0238 0.7685 0.87702 0.76185 0.93686 0.92652 1.0164 50.955 23.437 12.79 27.627 5 6 8 5 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 13 13 13 13 3748900000 1869000000 1879900000 868580000 415700000 452880000 925100000 382730000 542370000 1214900000 671320000 543560000 740340000 399200000 341140000 1125 15187;28061 True;True 17190;32097;32098;32099 83889;83890;83891;83892;83893;154278;154279;154280;154281;154282;154283;154284;154285;154286;154287;154288;154289;154290;154291;154292;154293;154294;154295;154296;154297;154298 108141;108142;108143;108144;108145;108146;196596;196597;196598;196599;196600;196601;196602;196603;196604;196605;196606;196607;196608;196609;196610;196611;196612;196613;196614;196615;196616;196617;196618;196619;196620;196621 108143;196615 1140;1141 106;113 AT1G64520.1;AT5G42040.1 AT1G64520.1 14;2 14;2 14;2 AT1G64520.1 | Symbols:RPN12a | regulatory particle non-ATPase 12A | regulatory particle non-ATPase 12A | Chr1:23956459-23958120 FORWARD LENGTH=267 2 14 14 14 8 13 13 8 8 13 13 8 8 13 13 8 65.5 65.5 65.5 30.706 267 267;233 1.98 18 21 17 0 82.36 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0458 1.0888 46.89 46 24 Leave out requantified 1.5213 1.8742 0.54624 0.83191 1.4451 1.6963 0.64819 0.91847 19.326 13.086 23.312 25.033 6 16 16 8 5 8 8 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.7 60.7 59.2 39.3 5089500000 2541900000 2547600000 376630000 155630000 221000000 1396500000 501380000 895170000 2444900000 1468400000 976460000 871440000 416450000 454980000 1126 4061;5100;5683;7199;8260;8703;12095;15613;17742;18819;24108;27811;32195;32836 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4641;5812;6449;8185;9357;9854;13666;17674;17675;20082;21275;27136;31819;31820;36680;37405 22753;22754;22755;22756;22757;28215;28216;28217;31490;31491;31492;31493;40124;40125;40126;40127;40128;40129;45321;45322;48021;48022;48023;66044;66045;66046;66047;86358;86359;97968;97969;97970;97971;97972;97973;97974;104183;104184;104185;104186;104187;131228;131229;131230;131231;153069;153070;153071;174857;174858;174859;174860;178427;178428;178429;178430 29494;29495;29496;29497;29498;29499;36315;36316;36317;36318;40386;40387;40388;51262;51263;51264;51265;51266;51267;58047;58048;61672;61673;61674;84959;84960;84961;84962;84963;84964;111319;111320;125633;125634;125635;125636;125637;133617;133618;133619;133620;133621;167814;167815;167816;167817;195006;195007;195008;222733;222734;222735;222736;227318;227319;227320;227321 29495;36317;40386;51264;58047;61673;84964;111320;125637;133620;167816;195007;222735;227321 1142;1143 153;176 AT1G64550.1 AT1G64550.1 9 9 9 AT1G64550.1 | Symbols:AtABCF3,AtGCN20,SCORD5,GCN3,ATGCN3,GCN20,ABCF3 | general control non-repressible 20,susceptible to coronatine-deficient Pst DC3000 5,general control non-repressible 3,ATP-binding cassette F3 | general control non-repressible 3 | Chr 1 9 9 9 4 3 5 5 4 3 5 5 4 3 5 5 16.4 16.4 16.4 79.643 715 715 1.95 8 6 7 0 65.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74417 0.86538 16.941 14 6 Leave out requantified 0.84599 1.087 0.79087 0.6852 0.80152 1.037 0.9207 0.77296 1.591 10.964 26.418 22.329 2 2 4 6 0 1 2 3 Median Median Median Leave out requantified 6.9 5.3 9.8 10.2 1028000000 530120000 497910000 93155000 49900000 43256000 111760000 45443000 66315000 269490000 142370000 127130000 553620000 292410000 261210000 1127 3488;6794;8102;9243;20427;21636;29508;32329;33835 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3986;7745;9183;10456;23005;24338;33725;36832;38547 19437;37997;44557;44558;50826;112296;118209;118210;118211;118212;118213;118214;118215;118216;161823;161824;175490;175491;175492;183851;183852 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Chr1:24036071-24036768 FORWARD LENGTH=204;AT1G64680.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | beta-carotene isomerase D27 | Chr1:2403607 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.9 3.9 3.9 23.173 204 204;250 1.88 3 3 2 0.0055456 2.2137 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0368 1.0924 27.39 8 1 Median 0.92523 0.99952 1.0393 1.3903 0.85984 0.90786 1.2716 1.5765 11.815 11.103 6.4205 2.9204 2 2 2 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 3.9 3.9 3.9 3.9 1044400000 456150000 588220000 266260000 121000000 145260000 235430000 105220000 130220000 243520000 106410000 137110000 299160000 123530000 175640000 1130 36788 True 41926 200726;200727;200728;200729;200730;200731;200732;200733 256001;256002;256003;256004;256005;256006;256007;256008;256009;256010 256010 AT1G64710.1;AT1G64710.3;AT1G64710.2 AT1G64710.1;AT1G64710.3;AT1G64710.2 5;4;4 5;4;4 5;4;4 AT1G64710.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein | 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| alpha-1 tubulin | alpha-1 tubulin | Chr1:24050114-24052296 FORWARD LENGTH=450 1 10 4 4 8 8 10 8 2 2 4 2 2 2 4 2 26.7 11.6 11.6 49.8 450 450 1.85 5 5 3 0 22.458 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6629 1.6994 43.228 11 5 Leave out requantified 1.4078 2.2144 0.68867 NaN 1.2514 2.1148 0.84438 NaN 43.281 115.81 41.675 NaN 2 3 5 1 0 2 3 0 Median Median Median Median 20.7 19.3 26.7 19.3 977780000 537730000 440050000 71715000 33417000 38298000 283440000 138650000 144790000 521870000 316160000 205710000 100750000 49505000 51245000 1132 3654;3749;4284;6979;7683;7744;8770;27397;32824;39004 False;True;True;True;False;False;True;False;False;False 4178;4179;4180;4181;4288;4884;7942;8731;8732;8797;9933;31356;37392;44374;44375;44376 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subfamily A, polypeptide 5 | cytochrome P450%2C family 89%2C subfamily A%2C polypeptide 5 | Chr1:24127587-24129119 FORWARD LENGTH=510;AT2G12190.1 | Symbols:no symbol available | no full name 4 6 5 5 2 4 4 4 1 4 4 4 1 4 4 4 13.5 11.2 11.2 59.115 510 510;512;511;511 1.85 5 5 3 0 13.121 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95126 0.91109 28.479 9 1 Leave out requantified NaN 1.2805 0.76645 0.70665 NaN 1.1395 0.92918 0.75452 NaN 19.6 40.244 38.235 0 3 2 4 0 0 0 1 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 5.7 7.8 7.8 7.8 339440000 175380000 164060000 0 0 0 90926000 38692000 52235000 109050000 49285000 59766000 139460000 87400000 52058000 1140 9638;10390;11663;11712;21234;31595 True;False;True;True;True;True 10916;11747;13170;13242;23898;36016 52680;52681;52682;56744;63678;63679;63680;63990;63991;63992;116198;116199;116200;171763 67571;67572;72770;81930;81931;81932;82311;82312;82313;148881;148882;218765 67571;72770;81931;82311;148882;218765 AT1G64970.1 AT1G64970.1 8 8 8 AT1G64970.1 | Symbols:TMT1,G-TMT,VTE4 | gamma-tocopherol methyltransferase,VITAMIN E DEFICIENT 4 | gamma-tocopherol methyltransferase | Chr1:24134337-24135993 REVERSE LENGTH=348 1 8 8 8 5 3 5 1 5 3 5 1 5 3 5 1 33.6 33.6 33.6 38.075 348 348 2.2 3 6 6 0 86.339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.57107 0.62625 65.116 9 7 Median 0.81601 NaN 0.36408 NaN 0.75151 NaN 0.43064 NaN 79.84 NaN 42.836 NaN 4 1 3 1 3 1 2 1 Median Median Median Median 23 14.1 19.8 3.7 663520000 370640000 292880000 194720000 92242000 102470000 93191000 31093000 62098000 242980000 172480000 70506000 132630000 74832000 57799000 1141 2610;4157;10662;11177;24375;25843;32473;37330 True;True;True;True;True;True;True;True 2987;4749;4750;12040;12623;27568;29540;36995;42518 14746;23264;23265;58217;61074;133242;142700;142701;142702;176291;203864;203865;203866;203867;203868 19125;30143;30144;74750;78553;170301;182011;182012;182013;224508;259918;259919;259920;259921;259922 19125;30143;74750;78553;170301;182012;224508;259918 545 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| Chr1:24415172-24417466 REVERSE LENGTH=330 2 6 6 6 3 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 21.2 21.2 21.2 37.498 330 330;334 2 5 6 5 0 13.273 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0163 1.0196 23.422 16 6 Leave out requantified 1.4886 0.91259 0.95826 1.3758 1.3802 0.83988 1.1534 1.5732 40.248 83.345 25.334 51.033 3 5 4 4 1 2 1 2 Median Median Leave out requantified Median 12.7 8.2 12.1 10.3 1005300000 462000000 543260000 251950000 108300000 143650000 226330000 114750000 111570000 275090000 123250000 151830000 251900000 115690000 136210000 1155 5686;9655;11722;13830;18356;28827 True;True;True;True;True;True 6452;10937;13252;15625;20761;32974 31504;31505;31506;31507;31508;52841;64023;64024;64025;76265;76266;76267;76268;76269;101474;158460 40400;40401;40402;40403;40404;67815;82350;82351;82352;82353;82354;98521;98522;98523;98524;98525;98526;98527;98528;130034;201879 40400;67815;82353;98525;130034;201879 AT1G65690.1 AT1G65690.1 1 1 1 AT1G65690.1 | Symbols:NHL6 | NDR1/HIN1-like 6 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | Chr1:24431642-24432898 REVERSE LENGTH=252 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3.6 3.6 3.6 28.574 252 252 2 1 1 0.0018762 2.7165 By MS/MS By MS/MS 0.62684 0.60084 111.21 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 3.6 0 3.6 38929000 18440000 20489000 0 0 0 23149000 6723200 16426000 0 0 0 15779000 11717000 4062500 1156 33903 True 38634 184274;184275 234673;234674;234675 234673 AT1G65820.1;AT1G65820.3;AT1G65820.2 AT1G65820.1;AT1G65820.3;AT1G65820.2 6;6;4 6;6;4 6;6;4 AT1G65820.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | microsomal glutathione s-transferase | Chr1:24485213-24486682 FORWARD LENGTH=146;AT1G65820.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | microsomal glutathione s-transfera 3 6 6 6 5 5 5 6 5 5 5 6 5 5 5 6 30.8 30.8 30.8 16.586 146 146;194;162 2.06 11 11 13 0 29.626 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.182 1.1098 59.597 35 22 Leave out requantified 1.6234 2.3745 0.61123 0.53952 1.5086 2.0768 0.70419 0.63735 39.335 22.633 19.682 47.713 10 7 8 10 7 3 4 8 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 28.8 28.8 28.8 30.8 6322200000 3230300000 3091800000 1568300000 647580000 920740000 996750000 333890000 662860000 1620400000 931330000 689070000 2136700000 1317500000 819160000 1157 218;15418;15419;20960;39077;39078 True;True;True;True;True;True 243;17453;17454;17455;23587;44474;44475 1216;1217;1218;1219;85297;85298;85299;85300;85301;85302;85303;85304;85305;85306;85307;85308;85309;114763;114764;114765;114766;114767;213344;213345;213346;213347;213348;213349;213350;213351;213352;213353;213354;213355;213356 1635;1636;1637;1638;110019;110020;110021;110022;110023;110024;110025;110026;110027;110028;110029;110030;147065;147066;147067;147068;147069;147070;147071;272143;272144;272145;272146;272147;272148;272149;272150;272151;272152;272153;272154;272155;272156 1635;110021;110027;147066;272151;272156 1170 116 AT1G65860.1 AT1G65860.1 3 3 3 AT1G65860.1 | Symbols:FMO GS-OX1 | flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 1 | flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 1 | Chr1:24499210-24502678 REVERSE LENGTH=459 1 3 3 3 0 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 8.1 8.1 8.1 52.309 459 459 1.67 1 2 0.00021418 4.5903 By MS/MS By MS/MS 0.9863 1.0186 176.21 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 5.7 0 2.4 55472000 23255000 32217000 0 0 0 13791000 10509000 3282400 0 0 0 41681000 12746000 28935000 1158 10326;21654;37658 True;True;True 11677;24360;42880 56418;118311;205580 72345;151515;262150 72345;151515;262150 AT1G65930.1 AT1G65930.1 28 28 22 AT1G65930.1 | Symbols:cICDH | cytosolic NADP+-dependent isocitrate dehydrogenase | cytosolic NADP+-dependent isocitrate dehydrogenase | Chr1:24539088-24541861 FORWARD LENGTH=410 1 28 28 22 25 26 25 25 25 26 25 25 20 20 19 19 61.5 61.5 49.3 45.746 410 410 2.05 87 101 101 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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available | no full name available | kinase-like protein | Chr1:24973201-24974684 REVERSE LENGTH=332;AT1G66940.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | kinase-like protein | Chr1:24973201-24974684 REVER 4 2 2 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 6.6 6.6 6.6 36.658 332 332;361;309;309 2.17 2 1 3 0.00021044 4.3285 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.60762 0.59704 31.864 6 4 Median 0.52401 NaN NaN 0.7658 0.48879 NaN NaN 0.82671 32.591 NaN NaN 23.555 2 0 1 3 1 0 0 3 Median Median Median Median 6.6 0 3.6 6.6 458180000 245720000 212460000 120560000 61156000 59406000 0 0 0 77411000 40954000 36458000 260210000 143610000 116600000 1181 9861;16500 True;True 11163;18658 53848;53849;91138;91139;91140;91141 69051;69052;116870;116871;116872;116873 69051;116870 AT1G66970.1;AT1G66970.2;AT1G66970.3;AT1G66980.4;AT1G66980.1;AT1G66980.3;AT1G66980.2 AT1G66970.1;AT1G66970.2;AT1G66970.3 17;16;15;3;3;3;2 17;16;15;3;3;3;2 16;15;14;2;2;2;1 AT1G66970.1 | Symbols:SVL2,GDPDL1 | SHV3-like 2,Glycerophosphodiester 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2254;2255;2256;2257;2258;2259;2260;2261;2262;2263;2264;2265;2266;2267;8214;8215;8216;8217;8218;8219;8220;8221;8222;8223;8224;8225;8226;8227;67150;67151;67152;67153;87067;87068;87069;87070;87071;87072;87073;87074;101772;101773;101774;101775;101776;101777;101778;101779;101780;101781;103636;103637;103638;103639;127933;127934;127935;127936;127937;127938;127939;127940;217847;217848;217849;217850;217851;217852;217853;217854;217855;217856;217857;232755;232756;232757;232758;232759;232760;232761;236264;236265;236266;236267;266907;266908;266909;266910;266911 2265;8227;67153;87068;101777;103639;127936;217850;232759;236266;266911 1211;1212;1213 112;223;242 AT1G67300.5;AT1G67300.4;AT1G67300.7;AT1G67300.6;AT1G67300.3;AT1G67300.1;AT1G67300.2 AT1G67300.5;AT1G67300.4;AT1G67300.7;AT1G67300.6;AT1G67300.3;AT1G67300.1;AT1G67300.2 1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1 AT1G67300.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | Major facilitator superfamily protein | Chr1:25194011-25196751 REVERSE LENGTH=429;AT1G67300.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | Major facilitator superfamily pro 7 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.3 3.3 3.3 45.713 429 429;429;449;449;493;493;494 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 3.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 1189 24491 True 27737 133925 171101 171101 2721 5 AT1G67325.1;AT1G67325.2 AT1G67325.1;AT1G67325.2 1;1 1;1 1;1 AT1G67325.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ran BP2/NZF zinc finger-like superfamily protein | Chr1:25209825-25212412 REVERSE LENGTH=287;AT1G67325.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ran BP2/NZF zinc finge 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.8 3.8 3.8 31.105 287 287;288 2 1 2 1 0.0017007 2.814 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0192 1.1482 9.7523 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 3.8 3.8 3.8 3.8 81146000 43851000 37294000 0 0 0 24423000 9159800 15263000 32267000 19709000 12559000 24456000 14983000 9472600 1190 27536 True 31519 151815;151816;151817;151818 193480;193481;193482;193483 193483 AT1G67350.2;AT1G67350.1 AT1G67350.2;AT1G67350.1 2;2 2;2 2;2 AT1G67350.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | NADH-ubiquinone oxidoreductase | Chr1:25235826-25236122 FORWARD LENGTH=98;AT1G67350.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NADH-ubiquinone oxidoreductase | Chr1:25 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 19.4 19.4 19.4 11.791 98 98;98 2 4 2 4 0 4.8274 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.31 2.1196 85.818 7 4 Median 1.9179 2.3275 1.0198 NaN 1.7769 2.1304 1.2042 NaN 98.948 0.72012 146.11 NaN 3 2 2 0 2 1 1 0 Median Median Median Median 19.4 8.2 8.2 8.2 407590000 170420000 237170000 218680000 90153000 128530000 63439000 19420000 44020000 125470000 60851000 64618000 0 0 0 1191 22318;37861 True;True 25085;25086;43116 121471;121472;121473;121474;121475;121476;121477;121478;206753;206754 155537;155538;155539;155540;155541;155542;155543;263729;263730 155541;263729 1214 16 AT1G67360.2;AT1G67360.1 AT1G67360.2;AT1G67360.1 6;6 6;6 6;6 AT1G67360.2 | Symbols:LDAP1,SRP1 | LD-associated protein 1,small rubber particle protein | Rubber elongation factor protein (REF) | Chr1:25237072-25237913 REVERSE LENGTH=240;AT1G67360.1 | Symbols:LDAP1,SRP1 | LD-associated protein 1,small rubber particl 2 6 6 6 5 3 4 3 5 3 4 3 5 3 4 3 29.6 29.6 29.6 26.425 240 240;240 2.2 5 6 9 0 18.755 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.5809 3.2618 166.15 18 9 Median 4.5355 5.9406 0.1208 0.139 4.1879 5.4472 0.14652 0.15529 28.311 27.906 44.782 16.264 6 5 4 3 2 3 2 2 Leave out requantified Median Median Median 25 17.1 21.2 17.1 1238700000 512960000 725730000 399520000 74554000 324960000 418800000 61475000 357330000 268770000 239720000 29053000 151600000 137210000 14385000 1192 150;10794;11117;11419;35051;37503 True;True;True;True;True;True 165;12193;12558;12897;39916;42705 859;860;59001;59002;60761;62327;62328;62329;62330;62331;62332;62333;190775;190776;190777;190778;190779;190780;204710;204711 1193;1194;75775;75776;78076;80159;80160;80161;80162;80163;80164;80165;243170;243171;243172;243173;243174;243175;243176;243177;261009;261010 1193;75776;78076;80165;243172;261010 AT1G67430.1;AT1G67430.2 AT1G67430.1;AT1G67430.2 12;8 12;8 1;1 AT1G67430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L22p/L17e family protein | Chr1:25262209-25263627 FORWARD LENGTH=175;AT1G67430.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L22p/L17e 2 12 12 1 12 11 12 11 12 11 12 11 1 1 1 1 59.4 59.4 5.7 19.854 175 175;131 2.09 36 36 47 0 67.703 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97522 1.0359 17.533 79 36 Leave out requantified 1.0866 0.94786 0.89498 0.84515 1.0088 0.91241 1.0622 0.95904 32.327 20.629 26.804 23.504 22 18 18 21 11 10 7 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.4 59.4 59.4 55.4 35340000000 19297000000 16043000000 8446400000 4442300000 4004100000 6738100000 3492900000 3245300000 10538000000 6104000000 4433700000 9617700000 5257600000 4360100000 1193 7935;9551;9934;13872;17646;17647;18878;24900;26755;28494;38856;39256 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 9001;10824;11241;15681;19979;19980;19981;21335;28372;28373;30651;32599;44215;44668;44669 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Chr1:25431705-25432972 REVERSE LENGTH=372 1 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 6.2 6.2 6.2 40.461 372 372 1.75 2 1 1 0 5.961 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2934 1.3027 10.146 4 3 Median NaN NaN NaN 1.2513 NaN NaN NaN 1.3944 NaN NaN NaN 14.045 1 0 1 2 1 0 1 1 Median Median Median Median 3 0 3 6.2 200330000 97367000 102970000 57220000 25266000 31955000 0 0 0 61420000 27440000 33980000 81693000 44662000 37031000 1200 14787;33275 True;True 16742;37901 81585;180754;180755;180756 105142;230250;230251;230252 105142;230252 1219 154 AT1G67930.1 AT1G67930.1 4 4 4 AT1G67930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Golgi transport complex protein-like protein | Chr1:25474218-25477332 REVERSE LENGTH=832 1 4 4 4 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 6.2 6.2 6.2 91.65 832 832 2 3 4 3 0 19.813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85909 0.79974 61.158 8 4 Median 1.5558 1.6476 0.55447 NaN 1.3998 1.5352 0.66972 NaN 80.17 94.498 15.703 NaN 2 2 3 1 1 0 2 1 Median Median Median Median 2.5 4.8 6.2 1.1 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transporter family | Chr1:25521325-25523824 FORWARD LENGTH=432;AT1G68100.1 | Symbols:IAR1 | IAA-ALANINE RESISTANT 1 | ZIP metal ion transporter family | Chr1:25521325-25524032 FORWARD 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.9 4.9 4.9 46.896 432 432;469 1.67 5 2 2 0 13.405 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5203 1.4347 54.058 9 5 Median 1.6946 1.8271 0.48088 0.70732 1.5942 1.6607 0.5597 0.78439 22.137 20.686 18.774 27.871 3 2 2 2 2 1 1 1 Median Median Median Median 4.9 4.9 4.9 4.9 441570000 219240000 222330000 139820000 46786000 93039000 82597000 24857000 57740000 119540000 85869000 33673000 99605000 61725000 37880000 1206 28767;33634 True;True 32911;38321 158184;158185;158186;158187;158188;182849;182850;182851;182852 201509;201510;201511;201512;201513;201514;232901;232902;232903;232904;232905;232906;232907 201512;232901 AT1G68230.1;AT1G68230.2 AT1G68230.1;AT1G68230.2 1;1 1;1 1;1 AT1G68230.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Reticulon family protein | Chr1:25572185-25572921 FORWARD LENGTH=162;AT1G68230.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Reticulon family protein | Chr1:25572185-2557 2 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 6.8 6.8 6.8 19.04 162 162;215 1.5 1 1 0.0081 2.0743 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 6.8 0 6.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1207 3748 True 4287 21007;21008 27123;27124 27124 AT1G68300.1 AT1G68300.1 2 2 2 AT1G68300.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein | Chr1:25598518-25599261 REVERSE LENGTH=160 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 11.2 11.2 11.2 17.332 160 160 2 2 2 2 0 4.8197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84473 0.91739 36.259 6 1 Leave out requantified NaN 1.3572 0.65307 NaN NaN 1.2535 0.75521 NaN NaN 47.136 8.7471 NaN 1 2 2 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 5.6 11.2 11.2 5.6 244310000 138280000 106020000 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GRAVITY 1 | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein | Chr1:25632046-25634527 REVERSE LENGTH=410 1 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 7.3 7.3 7.3 45.483 410 410 1.91 5 2 4 0 6.0039 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1009 1.1527 0.99287 10 3 Leave out requantified 1.0863 1.1769 0.81368 1.304 1.0403 1.0944 1.0152 1.5807 40.692 65.825 9.408 17.005 2 3 2 3 1 1 1 0 Median Median Median Plateau 7.3 5.6 5.6 5.6 385860000 184670000 201190000 88888000 43348000 45541000 100340000 41188000 59153000 83728000 46363000 37365000 112910000 53775000 59132000 1210 6722;11815;24963 True;True;True 7653;13355;28458 37559;37560;37561;37562;37563;64567;137587;137588;137589;137590;137591 48137;48138;48139;83100;175662;175663;175664;175665;175666 48138;83100;175666 AT1G68530.1;AT1G68530.2;AT1G25450.1;AT4G34510.1 AT1G68530.1;AT1G68530.2;AT1G25450.1 4;3;2;1 4;3;2;1 3;2;2;0 AT1G68530.1 | Symbols:G2,KCS6,CER6,POP1,AtCUT1,CUT1 | CUTICULAR 1,ECERIFERUM 6,3-ketoacyl-CoA synthase 6,POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 1 | 3-ketoacyl-CoA synthase 6 | Chr1:25712881-25714733 REVERSE LENGTH=497;AT1G68530.2 | Symbols:G2,KCS6,CER6,POP1,AtCU 4 4 4 3 1 1 3 2 1 1 3 2 1 1 2 2 8.9 8.9 6.6 56.395 497 497;377;492;487 2.14 2 2 3 0 8.6728 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67205 0.75922 96.179 5 2 Median NaN NaN 0.32884 NaN NaN NaN 0.40794 NaN NaN NaN 77.979 NaN 1 1 2 1 1 0 1 0 Median Median Median Median 1.4 1.8 7.4 5.2 230060000 148160000 81895000 19869000 4258800 15610000 44091000 17447000 26643000 101050000 78305000 22745000 65050000 48153000 16897000 1211 5942;31420;32887;37955 True;True;True;True 6739;35829;37462;43214 33033;170941;178695;178696;207150;207151;207152 42315;217703;227640;227641;264258;264259;264260 42315;217703;227640;264259 AT1G68560.1;AT3G45940.1 AT1G68560.1 27;4 27;4 27;4 AT1G68560.1 | Symbols:XYL1,GH31,TRG1,ATXYL1,AXY3 | altered xyloglucan 3,ALPHA-XYLOSIDASE 1,alpha-xylosidase 1,thermoinhibition resistant germination 1 | alpha-xylosidase 1 | Chr1:25734435-25737897 REVERSE LENGTH=915 2 27 27 27 21 22 22 22 21 22 22 22 21 22 22 22 35.8 35.8 35.8 102.4 915 915;868 1.97 63 68 57 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1137 1.1102 33.764 131 34 Leave out requantified 1.0729 0.61334 1.0953 1.5979 0.99355 0.57605 1.2885 1.6894 11.355 39.781 21.495 21.18 26 35 34 36 7 9 11 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 29.1 30.6 30.4 29648000000 14110000000 15539000000 4802100000 2343500000 2458600000 8070600000 4479500000 3591100000 8481300000 3813500000 4667800000 8294500000 3473200000 4821300000 1212 2477;5196;5425;6424;7543;9665;10518;12473;12826;13895;14005;18548;21838;23684;23882;26852;26993;27073;32331;32693;33933;34214;34215;37035;37853;37888;37934 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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little nuclei3 | Chr1:25834932-25839157 REVERSE LENGTH=1085 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2.2 2.2 2.2 127.2 1085 1085 2.14 2 2 3 0.00039456 3.3493 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0.6 2.2 0.6 2.2 97531000 72923000 24608000 11766000 11766000 0 17611000 0 17611000 18915000 18915000 0 49239000 42242000 6997400 1217 11634;21699 True;True 13131;24407 63537;63538;63539;63540;63541;118516;118517 81740;81741;81742;81743;81744;151774;151775 81744;151774 AT1G68830.1 AT1G68830.1 8 8 8 AT1G68830.1 | Symbols:STN7 | STT7 homolog STN7 | Serine/Threonine kinase domain protein | Chr1:25872654-25875473 REVERSE LENGTH=562 1 8 8 8 4 7 7 6 4 7 7 6 4 7 7 6 15.1 15.1 15.1 63.251 562 562 2.03 10 13 11 0 82.134 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0928 1.1881 23.164 33 12 Leave out requantified 1.3076 0.72742 0.84865 1.4148 1.2089 0.73358 1.0595 1.6524 31.045 22.489 10.835 20.244 6 9 9 9 2 3 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full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr1:25933023-25934882 FORWARD LENGTH=619 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 2.7 2.7 2.7 69.849 619 619 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 1.3057 1.348 44.774 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.7 0 2.7 60890000 24556000 36334000 0 0 0 28404000 12477000 15927000 0 0 0 32486000 12079000 20407000 + 1219 15641 True 17705 86467;86468 111430;111431 111430 1235 428 AT1G69200.1 AT1G69200.1 14 14 14 AT1G69200.1 | Symbols:FLN2 | fructokinase-like 2 | fructokinase-like protein | Chr1:26016024-26018365 FORWARD LENGTH=614 1 14 14 14 10 9 9 7 10 9 9 7 10 9 9 7 32.4 32.4 32.4 68.979 614 614 2.11 14 19 20 0 126.11 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0388 0.92001 44.151 33 16 Leave out requantified 0.88486 0.78593 1.4806 1.6029 0.85261 0.7256 1.788 1.8133 23.079 5.4175 27.952 53.497 8 9 10 6 2 5 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 23.8 19.5 21.8 17.9 2780800000 1330800000 1450000000 759250000 407820000 351440000 707040000 393500000 313540000 873560000 341180000 532390000 440940000 188280000 252660000 1220 8;9;6154;12191;19284;21051;21903;22945;24529;26983;28924;31130;33707;36072 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 8;9;7001;13775;21771;23684;24621;25783;25784;27795;30895;33077;35511;38404;38405;41080 43;44;45;46;47;48;49;50;51;52;53;54;34235;34236;66567;66568;66569;106528;115162;119443;119444;124721;124722;124723;124724;124725;124726;124727;124728;124729;134201;134202;148969;148970;148971;148972;158910;158911;169446;169447;169448;183188;183189;183190;183191;183192;183193;183194;183195;183196;183197;183198;196720 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plasmodesmata callose-binding protein 4 | Chr1:26050492-26051843 REVERSE LENGTH=222;AT1G69295.2 | Symbols:PDCB4 | plasmodesmata callose-binding protein 4 | plasmodesmata callose-bin 3 3 3 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 22.5 22.5 22.5 22.076 222 222;218;197 2.14 5 2 7 0 14.311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90024 0.99827 26.155 8 1 Leave out requantified 1.1198 1.2929 0.75061 0.80782 1.0666 1.234 0.91444 0.93122 52.715 15.724 3.447 35.989 2 2 2 2 1 0 0 0 Median Median Median Median 9.9 22.5 9.9 22.5 1361100000 763820000 597250000 285020000 142150000 142870000 319640000 151950000 167690000 333310000 202720000 130590000 423110000 267010000 156110000 1222 1657;8357;25419 True;True;True 1885;9471;29055 9437;9438;45930;45931;45932;45933;140309;140310;140311;140312;140313;140314;140315;140316 12308;12309;12310;58907;58908;58909;58910;58911;58912;179052;179053;179054;179055;179056;179057;179058 12310;58910;179058 587 42 AT1G69340.2;AT1G69340.1 AT1G69340.2;AT1G69340.1 6;6 6;6 6;6 AT1G69340.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | appr-1-p processing enzyme family protein | Chr1:26066298-26069644 FORWARD LENGTH=562;AT1G69340.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | appr-1-p processing enzyme fa 2 6 6 6 3 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 13 13 13 63.304 562 562;562 2.15 3 5 5 0 15.021 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92847 0.93155 25.125 9 5 Leave out requantified NaN 1.0235 0.65086 0.77149 NaN 0.96183 0.76527 0.88136 NaN 35.529 18.348 3.8854 1 2 4 2 0 1 3 1 Median Median Median Median 6.4 5 8.7 6.4 322350000 170250000 152100000 47289000 19877000 27412000 75406000 35526000 39880000 143980000 81979000 62003000 55675000 32868000 22807000 1223 2707;12209;22149;22514;30902;31919 True;True;True;True;True;True 3108;13794;24895;25327;35263;36372 15400;66651;120625;120626;122693;168476;168477;168478;173414;173415;173416;173417;173418 19949;85713;154468;154469;157143;214598;214599;214600;220893;220894;220895;220896;220897 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Chr1:26855489-26858806 FORWARD LENGTH=651;AT1G71240.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | chromosome-partiti 3 3 3 3 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 4.6 4.6 4.6 73.211 651 651;823;824 2.33 1 2 0.00039833 3.4894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4154 1.696 58.829 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 1.5 1.7 1.4 0 131770000 59886000 71884000 36882000 20374000 16508000 26432000 9690400 16742000 68456000 29821000 38634000 0 0 0 1266 1621;11330;13682 True;True;True 1843;12794;15462 9225;61780;75346 12043;79456;97289 12043;79456;97289 AT1G71260.1 AT1G71260.1 1 1 1 AT1G71260.1 | Symbols:WHY2,ATWHY2 | WHIRLY 2 | WHIRLY 2 | Chr1:26861849-26863391 REVERSE LENGTH=238 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 7.1 7.1 7.1 26.295 238 238 1 1 0.0018783 2.7301 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 7.1 24794000 18216000 6577500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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Symbols:RAD52-1,RAD52-1B.2,RAD52-1A,ODB1,RAD52-1B.1 | radiation sensitive 51-1,Organellar DNA-Binding protein 1 | cobalt ion binding protein | Chr1:26878717-26879844 REVERSE LENGTH=176;AT1G71310.1 | Symbols:RAD52-1,RAD52-1B.2,RAD52-1A,ODB1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.8 10.8 10.8 19.484 176 176;176 1.6 3 1 1 0.0011653 3.1604 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79311 0.85094 60.829 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 4.5 4.5 4.5 10.8 210970000 109790000 101180000 60372000 22538000 37835000 49394000 16030000 33363000 69833000 48881000 20952000 31373000 22339000 9033300 1269 9894;15449 True;True 11199;17489 53975;85444;85445;85446;85447 69215;110212;110213;110214 69215;110214 AT1G71410.2;AT1G71410.1;AT1G22870.4;AT1G22870.1 AT1G71410.2;AT1G71410.1;AT1G22870.4;AT1G22870.1 2;2;1;1 2;2;1;1 2;2;1;1 AT1G71410.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:26913070-26917515 REVERSE LENGTH=909;AT1G71410.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr1:2 4 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.1 2.1 2.1 98.763 909 909;909;817;913 2 1 1 1 0 5.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95523 1.03 117.97 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 0 1.2 0.9 1.2 167720000 109960000 57769000 0 0 0 40103000 19804000 20298000 69196000 61665000 7531100 58425000 28486000 29939000 1270 101;32458 True;True 114;36975 559;560;176184 765;766;224374 765;224374 AT1G71440.1 AT1G71440.1 1 1 1 AT1G71440.1 | Symbols:PFI,TFC E | PFIFFERLING,TUBULIN-FOLDING COFACTOR E | tubulin folding cofactor E / Pfifferling (PFI) | Chr1:26921271-26924373 REVERSE LENGTH=531 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 2.4 2.4 2.4 58.241 531 531 1.5 1 1 0.0051981 2.2297 By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 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THALIANA GERMIN-LIKE PROTEIN 1,GERMIN-LIKE PROTEIN 1,germin-like protein 1 | germin-like protein 1 | Chr1:27339302-27339928 REVERSE LENGTH=208 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 12.5 12.5 12.5 21.559 208 208 2.17 11 11 18 0 18.827 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92598 0.97496 38.488 39 7 Leave out requantified 1.0507 1.5501 0.57374 0.71207 0.99132 1.5235 0.66052 0.84621 62.107 17.712 72.781 46.737 11 9 10 9 3 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.5 12.5 12.5 12.5 61276000000 31091000000 30184000000 18738000000 8475300000 10263000000 12399000000 4298500000 8100500000 14407000000 8921600000 5485100000 15732000000 9396000000 6336000000 1298 1034;1035;15204;21769;28116 True;True;True;True;True 1155;1156;17207;24481;32166 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Symbols:ATKTI1,KTI1 | kunitz trypsin inhibitor 1,ARABIDOPSIS THALIANA KUNITZ TRYPSIN INHIBITOR 1 | kunitz trypsin inhibitor 1 | Chr1:27547410-27548057 REVERSE LENGTH=215 1 8 8 8 5 7 7 7 5 7 7 7 5 7 7 7 43.7 43.7 43.7 23.793 215 215 2.08 12 12 15 0 97.067 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90481 0.98965 37.156 38 8 Leave out requantified 1.6443 3.5772 0.61701 0.22856 1.5112 3.4538 0.74563 0.25343 38.908 27.427 34.538 39.115 8 10 10 10 3 1 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.3 37.2 37.2 43.3 7036800000 3489500000 3547400000 816690000 312810000 503880000 2534000000 563030000 1971000000 2086100000 1273600000 812430000 1600100000 1340000000 260080000 1314 4439;13287;13384;19608;20186;28066;29261;35376 True;True;True;True;True;True;True;True 5072;15000;15115;22123;22742;22743;32104;33449;40295 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symbol available | no full name available | Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein | Chr1:27591486-27594148 REVERSE LENGTH=342;AT1G73390.7 | Symbols:no symbol available | no full name available | Endosomal targe 7 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.5 8.5 8.5 38.019 342 342;419;419;419;419;419;419 2.22 2 3 4 0 7.0269 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1329 1.2402 45.796 8 2 Leave out requantified 1.5253 1.2274 1.2254 0.86831 1.4243 1.1292 1.5042 0.92851 71.673 32.536 18.498 17.421 2 2 2 2 0 1 1 0 Median Median Median Median 8.5 8.5 8.5 8.5 416100000 167540000 248560000 122660000 40586000 82074000 105040000 46212000 58826000 110560000 45631000 64926000 77848000 35114000 42733000 1316 17716;30099 True;True 20055;34364 97840;97841;97842;97843;164656;164657;164658;164659;164660 125395;125396;125397;125398;125399;125400;209804;209805;209806;209807;209808;209809 125399;209806 AT1G73430.2;AT1G73430.1 AT1G73430.2;AT1G73430.1 4;4 4;4 4;4 AT1G73430.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | sec34-like family protein | Chr1:27604096-27610829 FORWARD LENGTH=784;AT1G73430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | sec34-like family protein | Chr1:27604096-27 2 4 4 4 3 1 1 3 3 1 1 3 3 1 1 3 8.2 8.2 8.2 88.608 784 784;784 2 3 2 3 0 9.3764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93617 1.001 2.7786 7 2 Leave out requantified 1.9742 NaN NaN 0.71459 1.8314 NaN NaN 0.83714 38.887 NaN NaN 52.261 2 1 1 3 1 0 0 1 Median Median Median Median 7.1 2.9 2.9 5.4 268930000 127920000 141010000 71272000 20801000 50472000 38493000 16906000 21587000 66976000 35196000 31780000 92185000 55014000 37171000 1317 20709;32786;34360;34588 True;True;True;True 23314;37346;39154;39406 113615;113616;113617;113618;178089;186985;188320;188321 145611;145612;145613;145614;145615;145616;145617;145618;145619;145620;226859;238243;239974;239975 145616;226859;238243;239975 AT1G73530.1 AT1G73530.1 1 1 1 AT1G73530.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr1:27643801-27645386 REVERSE LENGTH=181 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5 5 5 20.063 181 181 1.6 3 1 1 0.0094307 2.0107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89477 0.78984 27.432 4 4 Median NaN 0.89477 NaN NaN NaN 0.78984 NaN NaN NaN 4.6004 NaN NaN 1 2 1 0 1 2 1 0 Median Median Median Median 5 5 5 5 170940000 97115000 73829000 45308000 19328000 25980000 72222000 39965000 32257000 53414000 37822000 15592000 0 0 0 1318 38465 True 43783;43784 209951;209952;209953;209954;209955 267815;267816;267817;267818;267819 267817 1308 132 AT1G73600.1;AT1G73600.2 AT1G73600.1;AT1G73600.2 7;7 5;5 5;5 AT1G73600.1 | Symbols:NMT,NMT3 | | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr1:27670825-27673400 FORWARD LENGTH=490;AT1G73600.2 | Symbols:NMT,NMT3 | | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily 2 7 5 5 5 4 2 4 3 2 0 2 3 2 0 2 17.3 14.1 14.1 56.367 490 490;504 2.1 4 1 5 0 17.585 By MS/MS By MS/MS By 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(DUF1295) | Chr1:27688449-27689606 REVERSE LENGTH=208;AT1G73650.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | 3-oxo-5-alpha-steroid 4 7 5 5 5 5 5 4 5 5 5 4 5 5 5 4 5 23.1 23.1 23.1 23.73 208 208;290;219;291;302;291;305 2.12 7 7 10 0 18.119 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91854 0.9583 12.57 23 0 Leave out requantified 1.0123 1.8823 0.71793 0.43646 0.96839 1.8482 0.86233 0.48814 13.037 14.369 16.839 21.821 6 6 6 5 0 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.1 23.1 19.7 23.1 6649300000 3561400000 3088000000 1739500000 845880000 893580000 1267800000 441700000 826070000 1993000000 1152500000 840430000 1649100000 1121200000 527910000 1321 15364;25828;33962;34088;37851 True;True;True;True;True 17395;29524;38704;38849;43105 85057;85058;85059;85060;142633;142634;142635;184640;184641;184642;184643;184644;184645;184646;184647;185332;185333;185334;185335;206715;206716;206717;206718;206719 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chloroplast accumulation response 1 | J-domain protein required for chloroplast accumulation response 1 | Chr1:28191108-28193769 REVERSE LENGTH=651 1 4 4 4 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 8.8 8.8 8.8 71.601 651 651 2.22 2 3 4 0 15.8 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68511 0.69379 49.166 6 4 Median NaN NaN 0.94539 0.78249 NaN NaN 1.0848 0.82072 NaN NaN 47.672 48.726 1 1 2 2 1 1 1 1 Median Median Median Median 3.2 2.5 4 4 181900000 99607000 82294000 27525000 17054000 10471000 19253000 10911000 8342000 91071000 49793000 41278000 44052000 21850000 22203000 1360 2775;7493;10125;12570 True;True;True;True 3183;8520;11455;14205 15801;41701;55327;55328;68749;68750;68751;68752;68753 20517;53428;70943;70944;88382;88383;88384;88385 20517;53428;70944;88383 AT1G75170.3;AT1G75170.2;AT1G75170.1 AT1G75170.3;AT1G75170.2;AT1G75170.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT1G75170.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein | Chr1:28214744-28215686 FORWARD LENGTH=213;AT1G75170.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec14p-like ph 3 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 5.6 5.6 5.6 24.435 213 213;296;296 2 1 1 0.00040461 3.7193 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 5.6 0 0 0 210170000 102970000 107200000 210170000 102970000 107200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1361 2285 True 2571 12671;12672 16417;16418 16418 AT1G75200.1 AT1G75200.1 2 2 2 AT1G75200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | flavodoxin family protein / radical SAM domain-containing protein | Chr1:28220849-28223597 REVERSE LENGTH=647 1 2 2 2 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 3.6 3.6 3.6 72.079 647 647 1.25 3 1 0 6.7186 By MS/MS By MS/MS 2.4973 2.257 88.093 3 2 Median 1.5772 NaN NaN NaN 1.4322 NaN NaN NaN 64.321 NaN NaN NaN 2 0 1 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 3.6 0 1.9 0 61591000 23179000 38412000 53120000 21486000 31633000 0 0 0 8471300 1692200 6779000 0 0 0 1362 4075;15327 True;True 4656;17354 22814;84837;84838;84839 29570;109453;109454;109455 29570;109453 AT1G75210.3;AT1G75210.2;AT1G75210.1 AT1G75210.3;AT1G75210.2;AT1G75210.1 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT1G75210.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | HAD-superfamily hydrolase%2C subfamily IG%2C 5-nucleotidase | Chr1:28225027-28228751 FORWARD LENGTH=539;AT1G75210.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | HAD-superf 3 2 2 2 2 2 0 0 2 2 0 0 2 2 0 0 5 5 5 62.534 539 539;539;642 2.25 1 1 2 0 6.0142 By MS/MS By MS/MS 0.92308 0.87506 30.482 3 3 Median NaN 1.0189 NaN NaN NaN 0.9504 NaN NaN NaN 11.679 NaN NaN 1 2 0 0 1 2 0 0 Median Median Median Median 5 5 0 0 108490000 79762000 28732000 75419000 65117000 10303000 33076000 14646000 18430000 0 0 0 0 0 0 1363 10619;29018 True;True 11992;33184 57946;57947;159365;159366 74393;74394;202983;202984 74394;202983 AT1G75220.1 AT1G75220.1 4 4 3 AT1G75220.1 | Symbols:ERDL6,AtERDL6 | ERD6-like 6 | Major facilitator superfamily protein | Chr1:28229412-28232606 REVERSE LENGTH=487 1 4 4 3 3 1 3 2 3 1 3 2 2 1 3 2 9 9 7.2 52.901 487 487 2 3 4 3 0 16.736 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78977 0.80097 49.538 7 3 Median 0.66218 NaN NaN NaN 0.62047 NaN NaN NaN 55.642 NaN NaN NaN 4 1 1 1 3 0 0 0 Median Median Median Median 7 2.1 7.2 4.1 1684300000 834450000 849880000 418470000 244300000 174170000 214370000 123840000 90533000 522830000 180280000 342550000 528650000 286020000 242630000 1364 6766;24328;29182;32995 True;True;True;True 7708;27496;33366;37577 37822;37823;132876;132877;160158;160159;179228;179229;179230;179231 48507;48508;169852;169853;204067;204068;228316;228317;228318;228319;228320;228321;228322 48507;169853;204067;228321 474;1348;1349 143;230;232 AT1G75270.1 AT1G75270.1 4 4 4 AT1G75270.1 | Symbols:DHAR2 | dehydroascorbate reductase 2 | dehydroascorbate reductase 2 | Chr1:28250255-28251237 REVERSE LENGTH=213 1 4 4 4 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 3 24.4 24.4 24.4 23.407 213 213 1.93 5 6 4 0 21.981 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77202 0.80052 78.75 12 4 Leave out requantified NaN 1.1916 0.48044 0.52617 NaN 1.1016 0.56117 0.57154 NaN 63.816 22.322 20.867 1 4 4 3 0 1 2 1 Median Leave out requantified Median Median 11.7 24.4 19.7 16.4 991150000 520290000 470860000 15584000 4868300 10716000 186380000 53696000 132680000 658310000 380930000 277390000 130870000 80802000 50070000 1365 2432;8785;32675;34715 True;True;True;True 2740;9949;37215;39548 13497;13498;13499;13500;48563;48564;48565;177394;177395;177396;177397;177398;189154;189155;189156 17465;17466;17467;17468;17469;62417;62418;62419;225940;225941;225942;225943;241154;241155;241156 17465;62419;225941;241155 AT1G75280.1;AT1G75300.1;AT1G75290.1;AT1G75290.2 AT1G75280.1 10;3;2;2 10;3;2;2 10;3;2;2 AT1G75280.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NmrA-like negative transcriptional regulator family protein | Chr1:28252030-28253355 FORWARD LENGTH=310 4 10 10 10 6 7 8 7 6 7 8 7 6 7 8 7 33.2 33.2 33.2 33.736 310 310;322;318;345 2 12 15 12 0 47.449 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79111 0.80854 27.751 38 13 Leave out requantified 0.94885 1.1157 0.64401 0.53947 0.90309 1.0446 0.82085 0.61096 29.735 24.062 49.345 28.547 8 10 10 10 2 3 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 23.9 27.1 26.5 8467100000 4837800000 3629300000 1763800000 700530000 1063300000 1655500000 782890000 872590000 2857000000 1882200000 974880000 2190800000 1472200000 718620000 1366 3797;5862;7567;7828;11583;11632;17513;32670;33636;37146 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4344;6650;8605;8886;13078;13129;19807;37210;38323;42313 21297;21298;21299;21300;21301;21302;21303;21304;21305;21306;32545;32546;32547;42090;43251;43252;63262;63263;63264;63265;63266;63267;63268;63530;63531;63532;96708;177381;177382;177383;177384;177385;177386;182857;182858;182859;182860;202472;202473 27528;27529;27530;27531;27532;27533;27534;27535;27536;27537;27538;27539;27540;27541;27542;27543;41684;41685;41686;41687;41688;53921;55405;55406;81390;81391;81392;81393;81394;81395;81396;81397;81398;81730;81731;81732;124072;225923;225924;225925;225926;225927;225928;225929;225930;225931;225932;232912;232913;232914;232915;232916;232917;232918;232919;258204;258205;258206;258207 27535;41688;53921;55405;81392;81730;124072;225927;232917;258205 AT1G75330.1 AT1G75330.1 7 7 7 AT1G75330.1 | Symbols:OTC | ornithine carbamoyltransferase | ornithine carbamoyltransferase | Chr1:28266457-28268383 REVERSE LENGTH=375 1 7 7 7 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 20.8 20.8 20.8 41.002 375 375 2.02 18 24 19 0 136.23 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97162 1.0006 27.704 52 19 Leave out requantified 1.1427 1.5515 0.68729 0.79004 1.0647 1.4157 0.8117 0.9062 38.269 26.298 5.9768 25.84 14 10 13 15 5 3 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.7 18.7 20.8 18.7 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8601;8602;8603;8604;8605;8606;8607;8608;8609;8610;8611;8612;8613;8614;8615;8616;36547;36548;36549;36550;36551;36552;36553;36554;107954;107955;107956;107957;107958;107959;107960;110128;110129;110130;110131;110132;110133;110134;110135;110136;110137;110138;110139;110140;110141;110142;110143;110144;110145;110146;117523;117524;201143;201144;201145;201146;201147;201148;201149;201150;201151;201152;201153;201154;201155;271794;271795;271796;271797;271798;271799;271800 8609;36551;107957;110129;117524;201152;271797 653 1350;1351 344 172;321 AT1G75350.1 AT1G75350.1 7 7 7 AT1G75350.1 | Symbols:emb2184 | embryo defective 2184 | Ribosomal protein L31 | Chr1:28272163-28272687 FORWARD LENGTH=144 1 7 7 7 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 54.9 54.9 54.9 16.033 144 144 2.03 32 27 35 0 70.842 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97303 1.0314 19.377 75 7 Leave out requantified 1.0753 0.93994 1.0088 1.0743 1.0341 0.90624 1.2455 1.1632 36.369 10.869 27.263 26.828 19 19 18 19 0 2 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.4 42.4 54.9 42.4 22022000000 10646000000 11377000000 3712500000 1821700000 1890800000 6643700000 3150900000 3492800000 7620800000 3807000000 3813800000 4045200000 1865900000 2179300000 1368 9084;10601;10656;12919;12920;28444;37702 True;True;True;True;True;True;True 10278;11971;12031;12032;14596;14597;14598;14599;32544;32545;42933;42934 50077;50078;50079;50080;50081;50082;50083;50084;50085;50086;50087;50088;57847;58151;58152;58153;58154;58155;58156;58157;58158;58159;58160;58161;58162;58163;58164;58165;58166;58167;58168;58169;58170;58171;58172;58173;70440;70441;70442;70443;70444;70445;70446;70447;70448;70449;70450;70451;70452;70453;70454;70455;70456;70457;70458;70459;70460;70461;70462;70463;70464;156490;156491;156492;156493;156494;156495;156496;156497;156498;156499;156500;156501;156502;156503;156504;205813;205814;205815;205816;205817;205818;205819;205820;205821;205822;205823;205824;205825;205826;205827;205828;205829;205830 64336;64337;64338;64339;64340;64341;64342;64343;64344;64345;64346;64347;64348;64349;64350;64351;64352;64353;64354;64355;64356;64357;64358;64359;74267;74657;74658;74659;74660;74661;74662;74663;74664;74665;74666;74667;74668;74669;74670;74671;74672;74673;74674;74675;74676;74677;74678;74679;74680;74681;74682;74683;74684;74685;74686;74687;74688;74689;74690;74691;74692;74693;74694;90471;90472;90473;90474;90475;90476;90477;90478;90479;90480;90481;90482;90483;90484;90485;90486;90487;90488;90489;90490;90491;90492;90493;90494;90495;90496;90497;90498;90499;90500;90501;90502;90503;90504;90505;90506;199443;199444;199445;199446;199447;199448;199449;199450;199451;199452;199453;199454;199455;199456;199457;262527;262528;262529;262530;262531;262532;262533;262534;262535;262536;262537;262538;262539;262540;262541;262542;262543;262544;262545;262546;262547;262548;262549;262550 64358;74267;74687;90473;90502;199454;262542 654 1352;1353;1354;1355 66 71;100;120;131 AT1G75380.4;AT1G75380.3;AT1G75380.2;AT1G75380.1 AT1G75380.4;AT1G75380.3;AT1G75380.2;AT1G75380.1 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT1G75380.4 | Symbols:ATBBD1,BBD1 | bifunctional nuclease in basal defense response 1 | bifunctional nuclease in basal defense response 1 | Chr1:28281789-28283631 REVERSE LENGTH=325;AT1G75380.3 | Symbols:ATBBD1,BBD1 | bifunctional nuclease in basal defe 4 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 8.6 8.6 8.6 36.173 325 325;325;325;325 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 8.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 1369 18044 True 20423 99662 127718 127718 655 277 AT1G75460.1;AT1G19740.1 AT1G75460.1;AT1G19740.1 2;1 2;1 2;1 AT1G75460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP-dependent protease La (LON) domain protein | Chr1:28327986-28328822 FORWARD LENGTH=278;AT1G19740.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP-dependent protease L 2 2 2 2 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 9.7 9.7 9.7 31.335 278 278;278 2.25 1 1 2 0.0041644 2.317 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.1463 2.4073 75.496 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 0 5 9.7 5 165010000 75832000 89183000 0 0 0 60343000 25446000 34897000 22973000 17537000 5435700 81699000 32848000 48851000 1370 9667;26358 True;True 10951;30197 52905;52906;52907;145689 67890;67891;67892;185680 67890;185680 AT1G75500.2;AT1G75500.1 AT1G75500.2;AT1G75500.1 2;2 2;2 2;2 AT1G75500.2 | Symbols:WAT1,UMAMIT5 | Usually multiple acids move in and out Transporters 5,Walls Are Thin 1 | Walls Are Thin 1 | Chr1:28338282-28340091 REVERSE LENGTH=389;AT1G75500.1 | Symbols:WAT1,UMAMIT5 | Usually multiple acids move in and out Transp 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.2 7.2 7.2 42.57 389 389;389 2.08 3 5 4 0 12.04 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92423 0.89722 15.142 9 4 Leave out requantified 1.4874 0.82124 0.70208 1.1046 1.373 0.74464 0.81337 1.2384 41.345 7.9942 1.266 36.003 3 2 2 2 2 0 1 1 Median Median Median Median 7.2 7.2 7.2 7.2 471200000 224010000 247190000 128080000 43982000 84097000 140370000 74532000 65837000 51758000 31105000 20653000 150990000 74391000 76602000 1371 215;30891 True;True 239;35251 1182;1183;1184;1185;1186;1187;1188;1189;168433;168434;168435;168436 1591;1592;1593;1594;1595;1596;1597;1598;1599;1600;214544;214545;214546;214547;214548;214549;214550 1599;214550 AT1G75660.1;AT5G42540.1;AT5G42540.2 AT1G75660.1 5;1;1 5;1;1 5;1;1 AT1G75660.1 | Symbols:AtXRN3,XRN3 | 5-3 EXORIBONUCLEASE 3,5-3 exoribonuclease 3 | 5-3 exoribonuclease 3 | Chr1:28408289-28414825 FORWARD LENGTH=1020 3 5 5 5 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 6.4 6.4 6.4 116.82 1020 1020;1012;1023 2.08 4 4 5 0 10.833 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93862 0.92016 27.386 13 4 Leave out requantified 0.93862 1.4662 0.84247 0.79794 0.87722 1.3045 1.0087 0.88589 29.304 11.48 62.405 37.25 5 2 2 4 2 0 1 1 Median Median Median Median 4.5 3 2.6 3.7 461660000 218630000 243030000 171850000 75530000 96318000 88905000 31625000 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protein SMD3 | Chr1:28625957-28627080 FORWARD LENGTH=128 1 3 1 1 3 2 2 3 1 1 1 1 1 1 1 1 20.3 7 7 13.812 128 128 2.25 1 1 2 0.0022351 2.6393 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85192 0.97422 37.596 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 20.3 12.5 12.5 20.3 177990000 100870000 77124000 34377000 22128000 12248000 35729000 11408000 24321000 68676000 47162000 21514000 39209000 20169000 19040000 1392 11637;29958;36991 True;False;False 13134;34210;42147 63552;63553;63554;63555;164095;164096;164097;164098;164099;164100;164101;164102;201736;201737 81760;81761;81762;81763;81764;81765;81766;209102;209103;209104;209105;209106;209107;209108;209109;209110;209111;257265;257266;257267 81760;209111;257266 AT1G76390.2;AT1G76390.1 AT1G76390.2;AT1G76390.1 1;1 1;1 1;1 AT1G76390.2 | Symbols:AtPUB43,PUB43 | plant U-box 43 | ARM repeat superfamily protein | Chr1:28655914-28658531 FORWARD LENGTH=811;AT1G76390.1 | Symbols:AtPUB43,PUB43 | plant U-box 43 | ARM repeat superfamily protein | Chr1:28655914-28658531 FORWARD LEN 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 2.3 2.3 2.3 89.108 811 811;811 3 1 0 8.7511 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 2.3 0 25362000 15486000 9875300 0 0 0 0 0 0 25362000 15486000 9875300 0 0 0 1393 21417 True 24101 117129 150039 150039 AT1G76400.1;AT1G76400.2 AT1G76400.1;AT1G76400.2 9;7 9;7 9;7 AT1G76400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribophorin I | Chr1:28658713-28661672 REVERSE LENGTH=614;AT1G76400.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribophorin I | Chr1:28658956-28661672 REVERSE LENGTH=560 2 9 9 9 2 7 5 6 2 7 5 6 2 7 5 6 18.6 18.6 18.6 68.641 614 614;560 1.8 9 6 5 0 33.984 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89087 0.93315 42.779 19 9 Leave out requantified 1.0735 1.4651 0.50421 0.62509 0.99568 1.3171 0.63576 0.71942 73.776 27.542 29.053 22.918 2 6 5 6 2 2 2 3 Median 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family protein | Chr1:28715384-28717289 FORWARD LENGTH=390 5 4 4 4 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 14.1 14.1 14.1 42.631 390 390;390;336;415;415 2 2 3 2 0 15.413 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.1505 1.2826 63.641 5 2 Median NaN NaN 0.88583 NaN NaN NaN 0.97046 NaN NaN NaN 39.436 NaN 1 1 2 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 5.6 3.1 6.2 8.5 417520000 99478000 318050000 34670000 15006000 19663000 28768000 8631700 20136000 87610000 40367000 47242000 266480000 35473000 231000000 1397 13369;20030;21535;36301 True;True;True;True 15095;22573;24232;41348 72992;72993;72994;110237;110238;117737;198018 93902;141412;141413;150785;252610 93902;141412;150785;252610 AT1G76550.1 AT1G76550.1 9 5 5 AT1G76550.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphofructokinase family protein | Chr1:28722900-28726929 REVERSE LENGTH=617 1 9 5 5 4 8 7 4 1 4 4 1 1 4 4 1 19.4 10.5 10.5 67.558 617 617 2 3 4 3 0 12.911 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79418 0.85479 26.706 9 2 Leave out 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Symbols:ADH1,ATADH,ADH,ATADH1 | ARABIDOPSIS THALIANA ALCOHOL DEHYDROGENASE,ALCOHOL DEHYDROGENASE,alcohol dehydrogenase 1 | alcohol dehydrogenase 1 | Chr1:28975509-28977216 FORWARD LENGTH=379 1 8 8 8 3 8 6 6 3 8 6 6 3 8 6 6 22.4 22.4 22.4 41.178 379 379 1.83 9 10 5 0 36.101 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79863 0.86786 40.933 18 4 Leave out requantified 2.8286 2.4928 0.5457 0.37212 2.6399 2.2405 0.63416 0.41373 41.346 5.9864 19.684 14.092 2 6 5 5 0 2 1 1 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.9 22.4 14.2 14.2 1272300000 648170000 624130000 116110000 30283000 85826000 412090000 121280000 290810000 405040000 259170000 145870000 339060000 237430000 101630000 1411 422;1107;8067;14623;14934;17641;31295;32076 True;True;True;True;True;True;True;True 476;1241;9144;16564;16905;19974;35690;36547 2415;6145;6146;6147;44370;44371;44372;80890;80891;80892;80893;80894;82311;82312;82313;97461;97462;97463;97464;170291;174216;174217;174218;174219 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AT1G78140.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr1:29401937-29403878 REVERSE LENGTH=355 1 5 5 5 3 4 5 4 3 4 5 4 3 4 5 4 19.2 19.2 19.2 39.387 355 355 2.26 3 8 8 0 19.443 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0088 1.1229 19.296 15 7 Leave out requantified 1.0767 1.2082 1.1118 0.94495 0.69397 1.128 1.3693 1.0908 21.935 10.762 11.676 70.25 3 4 4 4 2 2 1 2 Plateau Median Leave out requantified Median 12.4 15.5 19.2 16.6 1204300000 588000000 616320000 243710000 126700000 117010000 261450000 111390000 150050000 407100000 210100000 197000000 292060000 139810000 152250000 1432 506;26859;27543;31744;39216 True;True;True;True;True 569;30759;31528;36183;44624 2902;2903;148486;148487;148488;151847;151848;151849;151850;151851;151852;172478;172479;172480;172481;172482;214118;214119;214120 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superfamily protein | Chr1:29457457-29458909 REVERSE LENGTH=343;AT1G78290.2 | Symbols:SNRK2-8,S 2 2 1 1 0 2 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 7.3 5 5 38.249 343 343;343 1 1 0 4.7173 By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 7.3 2.3 2.3 15540000 0 15540000 0 0 0 15540000 0 15540000 0 0 0 0 0 0 1436 16352;33984 False;True 18497;38730 90374;90375;90376;184750 115918;115919;115920;115921;235329 115920;235329 AT1G78300.1 AT1G78300.1 17 11 11 AT1G78300.1 | Symbols:GRF2,14-3-3OMEGA,GF14 OMEGA | general regulatory factor 2,14-3-3 PROTEIN G-BOX FACTOR14 OMEGA | general regulatory factor 2 | Chr1:29461883-29463052 FORWARD LENGTH=259 1 17 11 11 15 16 15 15 9 10 9 10 9 10 9 10 68.7 47.9 47.9 29.161 259 259 1.98 31 27 29 0 141.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0173 1.075 15.994 79 18 Leave out requantified 1.1123 0.92273 0.87154 1.1949 1.0334 0.83803 1.0356 1.3817 46.496 9.9804 12.453 45.799 21 21 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Chr1:30044794-30045851 FORWARD LENGTH=313;AT1G79870.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | D-isomer s 2 9 9 9 8 7 6 5 8 7 6 5 8 7 6 5 29.1 29.1 29.1 34.161 313 313;294 2.05 13 15 15 0 30.178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97371 0.98121 12.348 38 18 Leave out requantified 1.0589 0.95276 0.79725 0.75306 0.9951 0.87884 1.0101 0.80018 4.1778 17.341 4.5313 25.502 10 8 11 9 5 2 7 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.9 23.6 18.5 14.4 6409000000 3193100000 3216000000 1190500000 506810000 683680000 1134400000 553200000 581190000 2486600000 1284100000 1202500000 1597600000 848970000 748590000 1478 783;12312;14444;24956;27125;27964;30055;31496;32782 True;True;True;True;True;True;True;True;True 877;13911;16365;28445;28446;31051;31986;31987;34315;35909;37341 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Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:30157057-30157473 REVERSE LENGTH=138 1 2 2 2 0 0 2 2 0 0 2 2 0 0 2 2 18.1 18.1 18.1 15.106 138 138 2 4 0 6.0244 By MS/MS By MS/MS 1.7895 1.7078 15.164 3 3 Plateau NaN NaN 1.6674 NaN NaN NaN 1.9441 NaN NaN NaN 18.327 NaN 0 0 2 1 0 0 2 1 Median Median Median Median 0 0 18.1 18.1 81957000 17051000 64905000 0 0 0 0 0 0 40957000 6501600 34455000 41000000 10549000 30450000 1486 18990;21395 True;True 21457;24075 105115;105116;116971;116972 134803;134804;149845;149846 134804;149845 AT1G80210.2;AT1G80210.1 AT1G80210.2;AT1G80210.1 1;1 1;1 1;1 AT1G80210.2 | Symbols:BRCC36A,AtBRCC36A | BRCA1/BRCA2-containing complex 36 homolog A | Mov34/MPN/PAD-1 family protein | Chr1:30163546-30165628 REVERSE LENGTH=371;AT1G80210.1 | Symbols:BRCC36A,AtBRCC36A | BRCA1/BRCA2-containing complex 36 homolog A | Mo 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 4.9 4.9 4.9 40.734 371 371;406 2.5 1 1 0 7.8836 By MS/MS By MS/MS 0.60703 0.60217 7.9717 2 2 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1 | choice-of-anchor C domain protein%2C putative (Protein of unknown function%2C DUF642) | Chr1:30171520-30172799 REVERSE LENGTH=370 1 4 4 4 0 3 2 2 0 3 2 2 0 3 2 2 11.1 11.1 11.1 40.226 370 370 1.86 2 4 1 0 8.2628 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.0717 3.2669 230.84 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 8.9 6.2 6.2 211460000 139280000 72178000 0 0 0 91949000 88010000 3939000 63884000 25330000 38554000 55629000 25943000 29686000 1489 1678;11919;21224;25359 True;True;True;True 1909;13476;23886;28953 9549;9550;65152;116130;139854;139855;139856 12465;12466;83817;148799;178510;178511;178512 12465;83817;148799;178511 727;728 199;201 AT1G80270.5;AT1G80270.4;AT1G80270.3;AT1G80270.2;AT1G80270.1 AT1G80270.5;AT1G80270.4;AT1G80270.3;AT1G80270.2;AT1G80270.1 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 AT1G80270.5 | Symbols:PPR596 | PENTATRICOPEPTIDE REPEAT 596 | PENTATRICOPEPTIDE REPEAT 596 | Chr1:30181265-30183331 FORWARD LENGTH=596;AT1G80270.4 | Symbols:PPR596 | PENTATRICOPEPTIDE REPEAT 596 | PENTATRICOPEPTIDE REPEAT 596 | Chr1:30181265-30183331 F 5 3 3 3 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 6 6 6 67.281 596 596;596;596;596;596 2.67 1 2 0 8.7152 By MS/MS By MS/MS 0.2621 0.27593 127.28 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 2.2 0 3.9 0 93050000 74376000 18674000 27267000 15116000 12151000 0 0 0 65784000 59260000 6523400 0 0 0 1490 2352;33079;38094 True;True;True 2652;37665;43362 13034;179617;207786 16866;228787;265075 16866;228787;265075 AT1G80300.1 AT1G80300.1 14 14 6 AT1G80300.1 | Symbols:ATNTT1,NTT1 | nucleotide transporter 1 | nucleotide transporter 1 | Chr1:30191954-30194280 FORWARD LENGTH=624 1 14 14 6 11 12 11 11 11 12 11 11 4 6 5 4 26.1 26.1 14.1 68.134 624 624 1.96 25 26 22 0 114.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0494 0.96986 37.528 53 24 Leave out requantified 1.105 1.1554 0.94101 0.69537 1.0323 1.0528 1.1109 0.79292 22.516 32.664 45.147 36.081 12 13 16 12 4 5 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1467;1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;5808;5809;5810;5811;5812;5813;5814;5815;5816;5817;5818;5819;5820;5821;5822;5823;49743;49744;49745;49746;49747;49748;49749;65964;65965;65966;65967;65968;65969;65970;65971;65972;65973;81818;105352;105353;105354;105355;105356;118185;125810;125811;125812;125813;125814;125815;125816;125817;125818;125819;125820;125821;125822;125823;125824;125825;125826;125827;125828;125829;155061;155062;155063;202076;202077;202078;202079;202080;208856;208857;208858;269369;273365;273366;273367;273368;273369;273370;273371;273372;274982;274983;274984;274985 1471;5818;49744;65964;81818;105354;118185;125828;155061;202077;208856;269369;273371;274983 729 402 605 502 AT1G80310.1 AT1G80310.1 5 5 5 AT1G80310.1 | Symbols:MOT2 | molybdate transporter 2 | sulfate transmembrane transporter | Chr1:30194951-30196345 FORWARD LENGTH=464 1 5 5 5 3 2 1 2 3 2 1 2 3 2 1 2 17 17 17 49.55 464 464 1.67 5 2 2 0 58.702 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.37595 0.39145 10.362 8 4 Leave out requantified 3.0988 2.5536 0.33893 0.43098 2.9146 2.2836 0.37301 0.4495 18.035 22.016 17.187 29.917 2 2 2 2 2 1 0 1 Median Median Median Median 9.7 7.1 4.1 7.1 282680000 106070000 176610000 114650000 27637000 87011000 94340000 23639000 70702000 31216000 23333000 7882600 42479000 31466000 11013000 1492 210;7321;11754;24249;30774 True;True;True;True;True 234;8320;13289;27362;35120 1146;1147;1148;40808;40809;64196;131985;167873;167874 1525;52181;52182;82587;168660;213830;213831 1525;52182;82587;168660;213831 AT1G80360.4;AT1G80360.3;AT1G80360.2;AT1G80360.1 AT1G80360.4;AT1G80360.3;AT1G80360.2;AT1G80360.1 8;8;8;8 8;8;8;8 8;8;8;8 AT1G80360.4 | Symbols:VAS1,ISS1 | ndole Severe Sensitive1,reversal of sav3 phenotype 1 | Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein | Chr1:30208736-30210643 REVERSE LENGTH=394;AT1G80360.3 | Symbols:VAS1,ISS1 | ndole Severe Sens 4 8 8 8 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 24.4 24.4 24.4 43.761 394 394;394;394;394 2.05 13 14 15 0 22.892 By MS/MS By MS/MS 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SNARE-like superfamily protein | Chr1:30271195-30272431 FORWARD LENGTH=135;AT1G80500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | SNARE-like superfamily protein | Chr1:3 2 3 3 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 26.7 26.7 26.7 15.264 135 135;135 1.87 7 3 5 0 8.1311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74137 0.87364 15.181 15 7 Leave out requantified 1.0441 1.201 0.73218 0.68793 0.98314 1.0853 0.86911 0.76825 22.159 37.873 0.73543 25.707 4 5 2 4 4 2 0 1 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 26.7 26.7 20 26.7 850150000 455970000 394180000 195170000 105420000 89756000 293390000 135740000 157640000 144120000 82827000 61297000 217470000 131980000 85481000 1499 17399;18191;25098 True;True;True 19683;20583;28634 96168;96169;96170;96171;100412;100413;100414;138471;138472;138473;138474;138475;138476;138477;138478 123383;123384;123385;123386;123387;123388;123389;128657;128658;176777;176778;176779;176780;176781;176782;176783;176784;176785;176786 123387;128658;176783 AT1G80560.1 AT1G80560.1 13 13 8 AT1G80560.1 | Symbols:ATIMD2,IMD2 | isopropylmalate dehydrogenase 2,ARABIDOPSIS ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2 | isopropylmalate dehydrogenase 2 | Chr1:30287833-30290126 FORWARD LENGTH=405 1 13 13 8 8 10 10 10 8 10 10 10 5 6 6 5 49.1 49.1 32.1 43.37 405 405 1.99 22 24 21 0 140.81 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83295 0.89999 31.802 60 15 Leave out requantified 1.1075 1.1653 0.58626 0.78163 1.005 1.0955 0.69258 0.84213 23.16 24.476 25.669 26.392 12 15 19 14 3 2 6 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.9 39.5 40 38.8 7963100000 4274600000 3688600000 1383100000 692830000 690250000 1665200000 705610000 959630000 3197500000 1952900000 1244600000 1717400000 923240000 794110000 1500 2689;9285;9367;9394;9741;10154;26498;31400;32505;33316;34523;37056;39334 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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128010;220621 1490 103 AT1G80890.1 AT1G80890.1 1 1 1 AT1G80890.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GAG1At protein | Chr1:30397211-30397875 FORWARD LENGTH=80 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 10 10 10 8.8089 80 80 2.5 1 1 0.0063909 2.1554 By MS/MS By MS/MS 2.1618 2.0691 8.4383 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 10 10 0 0 48950000 15207000 33743000 27102000 7797100 19305000 21848000 7409900 14438000 0 0 0 0 0 0 1506 29512 True 33729 161838;161839 206191;206192 206191 AT1G80910.1 AT1G80910.1 1 1 1 AT1G80910.1 | Symbols:CCZ1b | CALCIUM CAFFEINE ZINC SENSITIVITY 1b | vacuolar fusion CCZ1-like protein (DUF1712) | Chr1:30401143-30403466 FORWARD LENGTH=497 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1.4 1.4 1.4 55.428 497 497 2 1 1 0.0050333 2.2532 By MS/MS By MS/MS 1.3393 1.6305 88.747 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 1.4 1.4 145720000 34495000 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requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.5 43.5 43 43.5 29686000000 15660000000 14026000000 6393500000 2504400000 3889100000 7358900000 2602800000 4756100000 9906000000 6634900000 3271100000 6027900000 3918300000 2109600000 1510 1905;2708;3217;4689;7288;13624;14103;20268;29550;32462;34278;34303;38148;39187;39188 False;False;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2166;3109;3110;3680;3681;5360;8283;15392;15393;15937;22839;33771;36980;39065;39091;43422;43423;44593;44594 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Median Median 0 1.3 1.3 0 121110000 60653000 60452000 0 0 0 49940000 15495000 34445000 71166000 45159000 26007000 0 0 0 1533 13169 True 14869 71706;71707 92149;92150 92150 AT2G02040.1;AT5G01180.3;AT5G01180.2;AT5G01180.1;AT1G62200.1;AT1G62200.2;AT1G62200.3 AT2G02040.1 8;1;1;1;1;1;1 8;1;1;1;1;1;1 8;1;1;1;1;1;1 AT2G02040.1 | Symbols:AtNPF8.3,PTR2,NTR1,ATPTR2-B,ATPTR2,PTR2-B,NPF8.3 | ARABIDOPSIS THALIANA PEPTIDE TRANSPORTER 2,peptide transporter 2,NRT1/ PTR family 8.3,NITRATE TRANSPORTER 1 | peptide transporter 2 | Chr2:487542-489707 FORWARD LENGTH=585 7 8 8 8 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 17.9 17.9 17.9 64.421 585 585;570;570;570;590;619;633 2.05 12 12 14 0 65.112 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97296 0.94474 10.651 25 7 Leave out requantified 1.2714 2.1161 0.47983 0.3129 1.1729 2.0199 0.55537 0.3505 19.439 8.0494 25.391 51.117 7 6 5 7 2 1 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 12.8 12.8 12.1 1679000000 941290000 737710000 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| NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit | Chr2:490024-490335 FORWARD LENGTH=103 1 5 5 5 5 4 4 4 5 4 4 4 5 4 4 4 49.5 49.5 49.5 11.74 103 103 1.95 7 7 6 0 15.035 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72078 0.79241 30.984 20 10 Leave out requantified 0.72078 2.2951 0.48778 0.62886 0.68532 2.2499 0.563 0.79241 30.135 44.122 41.075 29.924 6 4 5 5 3 2 3 2 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 49.5 37.9 40.8 40.8 1097200000 518020000 579170000 265610000 127570000 138040000 152570000 52846000 99721000 239510000 162390000 77123000 439500000 175210000 264280000 1535 4239;17894;22710;24366;26721 True;True;True;True;True 4836;4837;20256;25539;27554;27555;30614 23620;23621;98835;98836;98837;98838;123729;123730;123731;123732;133176;133177;133178;133179;133180;133181;147756;147757;147758;147759 30561;30562;126699;126700;126701;126702;158398;170215;170216;170217;170218;170219;170220;188273;188274;188275;188276 30562;126699;158398;170215;188273 1504;1505;1506 10;17;67 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5;5;5;3;2;2 AT2G04690.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pyridoxamine 5-phosphate oxidase family protein | Chr2:1644628-1646035 FORWARD LENGTH=203;AT2G04690.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pyridoxamine 5-phosphat 6 5 5 5 2 3 5 2 2 3 5 2 2 3 5 2 24.6 24.6 24.6 22.821 203 203;203;210;230;110;110 2.21 2 7 5 0 16.337 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2734 1.2697 31.069 9 5 Leave out requantified 1.2455 2.221 0.52355 NaN 1.1352 2.0277 0.65427 NaN 0.54639 12.311 66.675 NaN 2 2 4 1 1 0 3 1 Median Median Median Median 11.3 11.8 24.6 7.9 792230000 422600000 369630000 90510000 37330000 53180000 206430000 48832000 157600000 452690000 305270000 147430000 42598000 31175000 11422000 1574 6290;12529;15660;22056;22057 True;True;True;True;True 7175;14159;17727;24795;24796 35027;68535;86564;86565;86566;86567;120133;120134;120135;120136;120137;120138;120139;120140 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requantified NaN 0.84573 1.2226 1.1693 NaN 0.81461 1.5316 1.2794 NaN 1.2314 107.63 35.728 1 2 3 2 0 0 1 0 Median Median Median Median 6.3 13.4 6.3 6.3 4837200000 2336800000 2500500000 1056500000 577810000 478680000 1427200000 788770000 638440000 1379300000 546490000 832840000 974220000 423710000 550500000 1576 12033;16510;37006 True;True;True 13598;18675;42163 65719;65720;65721;65722;65723;91211;91212;91213;91214;91215;201801 84539;84540;84541;84542;84543;84544;116966;116967;116968;116969;257353 84541;116969;257353 AT2G04842.2;AT2G04842.1 AT2G04842.2;AT2G04842.1 16;16 16;16 16;16 AT2G04842.2 | Symbols:EMB2761 | EMBRYO DEFECTIVE 2761 | threonyl-tRNA synthetase%2C putative / threonine-tRNA ligase | Chr2:1698466-1701271 REVERSE LENGTH=650;AT2G04842.1 | Symbols:EMB2761 | EMBRYO DEFECTIVE 2761 | threonyl-tRNA synthetase%2C putative / 2 16 16 16 13 16 11 12 13 16 11 12 13 16 11 12 25.8 25.8 25.8 74.784 650 650;650 1.95 25 15 22 0 121.17 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96237 1.023 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Phospholipase A2 family protein | Chr2:2842322-2843212 REVERSE LENGTH=148;AT2G06925.1 | Symbols:PLA2-ALPHA,ATSPLA2-ALPHA | PHOSPHOLIPASE A2-ALPHA | Phospholipase A2 family protein 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.1 8.1 8.1 16.266 148 148;148 1.75 2 1 1 0.00041719 4.1987 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2846 1.4304 29.596 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 8.1 8.1 8.1 8.1 163140000 79446000 83690000 23428000 11109000 12318000 35791000 16247000 19543000 51954000 26244000 25709000 51964000 25845000 26119000 1597 25951 True 29697 143522;143523;143524;143525 182991;182992;182993;182994 182992 AT2G06990.1 AT2G06990.1 6 6 6 AT2G06990.1 | Symbols:SOP3,HEN2 | SUPPRESSOR OF PAS2 3,hua enhancer 2 | RNA helicase%2C ATP-dependent%2C SK12/DOB1 protein | Chr2:2895135-2900909 FORWARD LENGTH=995 1 6 6 6 2 3 5 3 2 3 5 3 2 3 5 3 7.1 7.1 7.1 111.89 995 995 2 4 5 4 0 13.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61018 0.64358 31.643 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Symbols:ATP6,ATP6-1 | ATPASE SUBUNIT 6,ATPase subunit 6-1 | ATPase subunit 6-1 | ChrM:111750-112907 FORWARD LE 4 2 2 2 0 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 0 5.2 5.2 5.2 39.739 349 349;385;385;385 1.67 1 2 0.0013377 2.9583 By MS/MS By MS/MS 1.3775 1.2609 72.09 3 2 Median NaN 1.471 NaN NaN NaN 1.3428 NaN NaN NaN 8.901 NaN NaN 0 2 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 5.2 3.2 0 141750000 74856000 66892000 0 0 0 113380000 55626000 57755000 28366000 19230000 9136300 0 0 0 1608 2386;9645 True;True 2692;10926 13202;52797;52798 17090;67761;67762 17090;67762 AT2G09990.1 AT2G09990.1 12 12 1 AT2G09990.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein | Chr2:3781442-3781882 FORWARD LENGTH=146 1 12 12 1 12 12 12 12 12 12 12 12 1 1 1 1 69.9 69.9 6.8 16.631 146 146 2.16 33 52 55 0 87.001 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91929 0.98584 16.534 86 29 Leave out requantified 0.95792 0.95195 0.95541 0.87772 0.91003 0.94981 1.08 0.97048 23.28 44.669 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| Triphosphate Tunnel Metalloenzyme 3 | adenylate cyclase | Chr2:4802999-4803631 FOR 2 5 5 5 5 2 1 2 5 2 1 2 5 2 1 2 31.4 31.4 31.4 24.162 210 210;173 2.25 4 1 7 0 31.347 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79089 0.79132 28.303 12 10 Median 0.74734 1.0795 NaN 0.78246 0.69019 0.97084 NaN 0.79009 31.807 40.912 NaN 9.9773 6 2 1 3 5 1 1 3 Median Median Median Median 31.4 10.5 3.8 10.5 634330000 357200000 277130000 284690000 160530000 124150000 118230000 62413000 55817000 71645000 41178000 30468000 159770000 93072000 66694000 1611 7678;20850;26319;33265;35017 True;True;True;True;True 8726;23467;30154;37884;39880 42571;42572;42573;42574;114287;145520;145521;180661;190634;190635;190636;190637 54557;54558;54559;54560;146482;185491;185492;230123;243010;243011;243012;243013 54557;146482;185492;230123;243010 AT2G12400.1 AT2G12400.1 1 1 1 AT2G12400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | plasma membrane fusion protein | Chr2:5005144-5008140 REVERSE LENGTH=541 1 1 1 1 0 1 1 1 0 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Symbols:BP80-2;2,ATVSR3,VSR3,VSR2;2,UXS2 | vaculolar sorting receptor 3,VACUOLAR SORTING RECEPTOR 3,binding protein of 80 kDa 2;2,VACUOLAR SORTING RECEPTOR 2;2 | vaculolar sorting receptor 3 | Chr2:6308895-6312303 FORWARD LENGTH=628;AT2G147 2 20 20 1 16 17 18 14 16 17 18 14 0 1 1 1 41.4 41.4 1.3 69.743 628 628;628 2.02 28 35 30 0 88.057 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99515 1.1342 31.001 75 22 Leave out requantified 1.5816 1.3141 0.49762 0.60376 1.497 1.2388 0.58763 0.67433 23.214 22.687 20.842 23.252 17 21 23 14 2 7 9 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.8 33.8 36.6 25.6 5976000000 3244800000 2731200000 1165000000 454840000 710120000 1596100000 647750000 948340000 1678400000 1147200000 531210000 1536500000 995020000 541530000 1623 533;1267;4210;4211;4378;5290;5428;7640;8140;12694;12736;12854;14966;18613;26233;28081;30680;35183;38279;38280 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| no full name available | RING/U-box superfamily protein | Chr2:6367238-6370610 FORWARD LENGTH=343;AT2G14835.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RING/U-box superfamily protein | Chr2:636 2 5 5 5 2 3 1 4 2 3 1 4 2 3 1 4 21.9 21.9 21.9 37.437 343 343;343 2.1 3 3 4 0 33.202 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95999 0.98397 26.363 6 2 Leave out requantified 0.78404 0.93764 NaN NaN 0.76449 0.87665 NaN NaN 9.3296 42.697 NaN NaN 2 2 1 1 1 1 0 0 Median Median Median Median 7.6 12.8 5.5 19.8 182210000 90025000 92190000 39972000 20902000 19070000 66973000 29063000 37910000 40489000 21983000 18506000 34780000 18077000 16703000 1624 2846;4183;23825;27568;34394 True;True;True;True;True 3262;4777;26757;31559;39194 16088;16089;16090;16091;23386;23387;129589;129590;151970;187226 20861;20862;20863;20864;20865;20866;20867;20868;30286;30287;165870;165871;193648;238577 20862;30286;165871;193648;238577 AT2G14880.1;AT2G14880.3;AT2G14880.2 AT2G14880.1 7;2;2 7;2;2 3;2;2 AT2G14880.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | SWIB/MDM2 domain superfamily protein | Chr2:6393686-6394841 REVERSE LENGTH=141 3 7 7 3 6 5 6 5 6 5 6 5 3 2 2 2 35.5 35.5 17 15.902 141 141;105;105 1.97 10 10 9 0 106 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89617 0.94174 16.458 27 7 Leave out requantified 0.7106 0.93879 0.93587 1.0045 0.63482 0.88961 1.0749 1.1155 20.7 16.248 11.039 8.2993 6 7 7 7 0 1 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.8 34 34.8 29.8 4383000000 2378500000 2004500000 853370000 513440000 339930000 990110000 488370000 501740000 1341400000 731370000 610060000 1198100000 645320000 552800000 1625 3942;3943;8464;8465;8648;21512;35394 True;True;True;True;True;True;True 4507;4508;9597;9598;9795;24209;40313 22074;22075;22076;22077;22078;22079;46626;46627;46628;46629;46630;46631;46632;46633;47766;47767;47768;47769;117624;117625;117626;117627;192776;192777;192778;192779;192780;192781;192782 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194;194 2 1 1 1 0 10.625 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6444 1.5532 35.131 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 10.3 10.3 0 10.3 114970000 56635000 58339000 31449000 15084000 16365000 66188000 28301000 37887000 0 0 0 17336000 13250000 4086500 1627 36968 True 42122 201642;201643;201644 257153;257154;257155;257156;257157;257158 257158 AT2G15290.1 AT2G15290.1 2 2 2 AT2G15290.1 | Symbols:AtTic21,CIA5,PIC1,TIC21 | PERMEASE IN CHLOROPLASTS 1,CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 5,translocon at inner membrane of chloroplasts 21,TRANSLOCON AT INNER MEMBRANE OF CHLOROPLASTS 21 | translocon at inner membrane of chloroplasts 21 | 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 7.1 7.1 7.1 31.276 296 296 1.68 9 7 3 0 6.079 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80633 0.77255 30.035 6 2 Median 0.90176 0.87638 0.4779 NaN 0.86725 0.80376 0.55337 NaN 12.476 12.871 43.312 NaN 2 2 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 7.1 7.1 7.1 4.7 2402800000 1437300000 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Symbols:no symbol available | no full name available | BAT2 domain protein | Chr2:6905712-6909282 REVERSE LENGTH=512;AT2G15860.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | BAT2 domain protein | Chr2:6905712-6909282 REVERSE L 4 3 3 3 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 6.8 6.8 6.8 55.574 512 512;524;453;462 1.67 3 2 1 0 6.438 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84472 0.85885 10.183 6 4 Median NaN 0.97551 0.8409 NaN NaN 0.85494 0.92007 NaN NaN 1.085 10.177 NaN 1 2 2 1 1 1 2 0 Median Median Median Median 1.8 4.5 4.1 1.8 409050000 216220000 192830000 62002000 32180000 29822000 160980000 80825000 80158000 105590000 59432000 46162000 80469000 43783000 36685000 1638 7387;20779;28755 True;True;True 8395;23394;32898 41175;113947;158126;158127;158128;158129 52697;146027;201428;201429;201430;201431;201432 52697;146027;201429 AT2G16005.1 AT2G16005.1 4 4 4 AT2G16005.1 | Symbols:ROSY1 | InteractoR Of SYnaptotagmin1 | MD-2-related lipid recognition domain-containing protein | Chr2:6959347-6960135 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Median 2.6 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1642 30748;35321 True;True 35094;40234 167788;192438 213738;245354 213738;245354 2759 214 AT2G16430.2;AT2G16430.1 AT2G16430.2;AT2G16430.1 12;9 12;9 12;9 AT2G16430.2 | Symbols:ATPAP10,PAP10 | purple acid phosphatase 10 | purple acid phosphatase 10 | Chr2:7120502-7122772 REVERSE LENGTH=468;AT2G16430.1 | Symbols:ATPAP10,PAP10 | purple acid phosphatase 10 | purple acid phosphatase 10 | Chr2:7120502-7122020 2 12 12 12 10 9 11 9 10 9 11 9 10 9 11 9 34.4 34.4 34.4 54.218 468 468;348 2.12 17 18 24 0 83.016 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0229 1.0374 18.835 48 14 Leave out requantified 1.1546 1.9946 0.75325 0.681 1.0613 1.8851 0.91266 0.76555 11.559 18.782 41.688 23.518 14 11 14 9 6 2 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.4 25.9 32.9 25.2 5072700000 2475900000 2596800000 1611800000 771880000 839880000 1076100000 356220000 719920000 1476600000 790000000 686610000 908160000 557790000 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27745;27746;27747;27748;27749;45535;45536;45537;45538;45539;53676;53677;53678;53679;53680;53681;53682;53683;86481;86482;86483;86484;86485;86486;86487;86488;173413;173414;179074;179075;179076;179077;179078;179079;179080;179081;179082;179083;179084;179085;179086;179087;179088;181281;214384;214385;214386;214387;214388;214389;214390;254483;254484;254485;254486;257127;257128;257129;257130;274333;274334;274335;274336;274337;275877;275878;275879;275880;275881;275882;275883;275884;275885 27748;45535;53678;86487;173414;179080;181281;214388;254485;257129;274335;275884 795 1611 374 404 AT2G16460.1;AT2G16460.2 AT2G16460.1;AT2G16460.2 3;2 3;2 3;2 AT2G16460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | coiled-coil 90B-like protein (DUF1640) | Chr2:7133704-7135483 REVERSE LENGTH=230;AT2G16460.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | coiled-coil 90B-like protein (DUF1 2 3 3 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 17 17 17 25.789 230 230;173 2.5 1 2 5 0 11.058 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76105 0.8292 20.325 6 6 Median 1.0227 NaN 0.65411 0.66557 0.97046 NaN 0.78856 0.73516 22.661 NaN 7.523 25.717 2 0 2 2 2 0 2 2 Median Median Median Median 12.6 7.8 12.6 12.2 262320000 151300000 111020000 43552000 21477000 22075000 0 0 0 121340000 69811000 51532000 97421000 60007000 37414000 1644 1164;17890;29887 True;True;True 1308;20252;34136 6440;6441;98822;98823;98824;98825;98826;163769 8409;8410;126685;126686;126687;126688;126689;126690;208694 8410;126687;208694 AT2G16595.1 AT2G16595.1 1 1 1 AT2G16595.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Translocon-associated protein (TRAP)%2C alpha subunit | Chr2:7198363-7200086 FORWARD LENGTH=251 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.2 5.2 5.2 27.407 251 251 1.6 3 1 1 0.00040866 3.8734 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6681 1.5171 102.36 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 5.2 5.2 5.2 5.2 114780000 56652000 58127000 32625000 11587000 21038000 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11423;11424;11425;11426;11427;11428;11429;11430;11431;11432;62208;62209;62210;62211;62212;62213;62214;62215;62216;62217;62218;62219;62220;62221;62222;62223;62224;62225;62226;62227;62228;62229;62230;62231;62232;62233;62234;62235;62236;62237;63620;63621;63622;63623;63624;63625;63626;63627;63628;63629;63630;63631;63632;63633;63634;63635;63636;63637;63638;63639;63640;63641;63642;63643;63644;63645;63646;63647;63648;63649;63650;63651;88380;88381;88382;88924;101475;101476;101477;101478;101479;101480;101481;101482;101483;101484;101485;101486;101487;101488;101489;101490;101491;101492;101493;149814;149815;149816;149817;149818;149819;149820;149821;183180;183181;183182;183183;183184;183185;183186;183187;183775;183776;183777;183778;183779;183780;183781;183782;183783;205970;205971;205972;205973;205974;205975;205976;205977;205978;205979 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available | no full name available | Major facilitator superfamily protein | Chr2:7220301-7221592 REVERSE LENGTH=390;AT2G16660.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Major facilitator superfamily prote 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 42.544 390 390;546 1.83 2 3 1 0.0004056 3.7498 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.4436 0.51434 194.01 5 5 Median NaN NaN 0.30694 NaN NaN NaN 0.3552 NaN NaN NaN 52.353 NaN 1 1 2 1 1 1 2 1 Median Median Median Median 3.3 3.3 3.3 3.3 134890000 97861000 37030000 18800000 9365500 9434300 24435000 4116600 20318000 40466000 35024000 5441300 51190000 49355000 1835500 1648 30081 True 34345 164575;164576;164577;164578;164579;164580 209684;209685;209686;209687;209688;209689;209690 209689 AT2G16780.1 AT2G16780.1 3 3 3 AT2G16780.1 | Symbols:NFC02,MSI2,MSI02,NFC2 | MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1 2,NUCLEOSOME/CHROMATIN ASSEMBLY FACTOR GROUP C 2 | Transducin family protein / WD-40 repeat family protein | Chr2:7281615-7283583 REVERSE 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Median Median Median 2.2 1.9 0 0 74984000 32956000 42028000 74984000 32956000 42028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1650 21345;26687 True;True 24020;30577 116736;147607 149518;188109 149518;188109 AT2G16860.2;AT2G16860.1 AT2G16860.2;AT2G16860.1 2;2 2;2 2;2 AT2G16860.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | GCIP-interacting family protein | Chr2:7304139-7305959 REVERSE LENGTH=298;AT2G16860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GCIP-interacting family protein | Chr2:7 2 2 2 2 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 6.4 6.4 6.4 35.17 298 298;298 1 2 0.0004 3.5648 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 3.4 3 0 0 50900000 28863000 22038000 0 0 0 50900000 28863000 22038000 0 0 0 0 0 0 1651 7553;30416 True;True 8590;34727 42013;166098 53823;211531 53823;211531 AT2G16940.1;AT2G16940.3;AT2G16940.2;AT2G16940.5;AT2G16940.4 AT2G16940.1;AT2G16940.3;AT2G16940.2;AT2G16940.5;AT2G16940.4 2;2;2;1;1 2;2;2;1;1 2;2;2;1;1 AT2G16940.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Splicing factor%2C CC1-like protein | Chr2:7342869-7347052 REVERSE LENGTH=561;AT2G16940.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Splicing factor%2C CC1-like protein | 5 2 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 5.5 5.5 5.5 63.098 561 561;599;610;420;420 1.67 2 4 0 6.7805 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61442 0.73356 50.432 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 0 2.1 5.5 5.5 94479000 52290000 42190000 0 0 0 33506000 13900000 19606000 32242000 19627000 12615000 28732000 18763000 9969100 1652 10983;34070 True;True 12407;38830 60004;60005;60006;60007;185265;185266 77039;77040;77041;77042;77043;236020;236021 77041;236020 799 24 AT2G16950.2;AT2G16950.1 AT2G16950.2;AT2G16950.1 21;21 21;21 21;21 AT2G16950.2 | Symbols:ATTRN1,TRN1 | transportin 1,TRANSPORTIN 1 | transportin 1 | Chr2:7353939-7360637 FORWARD LENGTH=891;AT2G16950.1 | Symbols:ATTRN1,TRN1 | transportin 1,TRANSPORTIN 1 | transportin 1 | Chr2:7353939-7360637 FORWARD LENGTH=895 2 21 21 21 16 11 16 10 16 11 16 10 16 11 16 10 30.6 30.6 30.6 99.108 891 891;895 2.02 24 30 26 0 158.54 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96467 0.98374 17.833 67 22 Leave out requantified 1.1282 1.0374 0.87241 0.78105 1.042 0.94946 1.0108 0.88714 20.679 19.255 28.556 20.141 18 15 20 14 8 4 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.6 16.5 24.6 12.9 5927900000 3069200000 2858700000 1378500000 642390000 736150000 1204000000 584800000 619170000 1983900000 1048100000 935870000 1361500000 793950000 567540000 1653 392;2438;4871;4879;5922;7916;9487;12615;15439;18465;21873;21898;25844;26698;27024;27688;28857;28952;36525;37587;38897 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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2904;2905;17489;17490;17491;17492;17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;34852;34853;34854;34855;34856;34857;34858;34859;34897;42138;42139;55931;55932;55933;55934;55935;55936;55937;55938;55939;55940;55941;55942;66786;88639;88640;88641;88642;110147;110148;110149;110150;130935;130936;130937;130938;130939;130940;130941;130942;152732;152733;152734;152904;182014;182015;182016;182017;188158;188159;188160;188161;188162;188163;189980;189981;194376;202027;202028;202029;202640;254013;254014;254015;261672;270883;270884;270885;270886;270887;270888;270889;270890;270891;270892;270893;270894 2905;17494;34856;34897;42138;55937;66786;88642;110147;130936;152734;152904;182016;188158;189981;194376;202029;202640;254013;261672;270887 800 1616;1617 861 87;566 AT2G17120.1 AT2G17120.1 9 9 9 AT2G17120.1 | Symbols:LYM2,LYP1,CL-1 | lysM domain GPI-anchored protein 2 precursor,LysM-containing receptor protein 1,CEBiP-like 1 | lysm domain GPI-anchored protein 2 precursor | Chr2:7459156-7460648 FORWARD LENGTH=350 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Chr2:7478272-7481361 REVERSE LENGTH=538 1 6 1 1 3 3 4 4 1 1 0 1 1 1 0 1 13.4 2.8 2.8 57.285 538 538 1.5 3 1 0 7.2093 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.3466 1.2549 27.356 4 2 Median 1.5241 NaN NaN NaN 1.4772 NaN NaN NaN 15.013 NaN NaN NaN 2 1 0 1 2 0 0 0 Median Median Median Median 8.4 7.4 8.7 10.2 78709000 31733000 46976000 36505000 14229000 22276000 22612000 8113000 14499000 0 0 0 19592000 9390800 10201000 1656 2250;9087;9390;26036;27843;30282 False;True;False;False;False;False 2534;10281;10631;29805;31852;34571 12499;12500;12501;12502;50099;50100;50101;50102;51605;51606;143994;143995;143996;153180;165432 16191;16192;16193;16194;16195;64373;64374;64375;64376;64377;64378;66246;66247;183602;183603;183604;195151;210749 16192;64376;66247;183602;195151;210749 802 1618;1619;1620;1621;1622 522 188;190;195;414;415 AT2G17200.1 AT2G17200.1 10 10 5 AT2G17200.1 | Symbols:DSK2,DSK2b | | ubiquitin family protein | Chr2:7482133-7485090 REVERSE LENGTH=551 1 10 10 5 4 5 7 6 4 5 7 6 2 3 3 3 26.1 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Symbols:no symbol available | no full name available | pantothenate kinase | Chr2:7541615-7544089 REVERSE LENGTH=367 3 9 9 7 3 3 8 3 3 3 8 3 2 2 6 1 29.7 29.7 24.8 40.857 367 367;361;348 2.17 3 9 6 0 49.373 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85281 0.91399 14.699 15 5 Leave out requantified 1.1402 1.1642 0.65195 0.9183 1.0995 1.0806 0.77224 1.048 31.751 19.54 15.188 20.189 3 3 6 3 0 1 2 2 Leave out requantified Plateau Leave out requantified Median 10.1 12 24.3 8.4 1402600000 778420000 624150000 199690000 94323000 105370000 203980000 91520000 112460000 767580000 471870000 295720000 231320000 120700000 110610000 1663 541;1007;3507;5017;13569;15843;22044;23827;38187 True;True;True;True;True;True;True;True;True 607;1125;4009;5717;15335;17928;24783;26759;43466 3130;3131;3132;3133;5565;5566;5567;19575;27772;74634;74635;87416;120049;120050;120051;120052;129596;208330 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Symbols:NFD4,NFD04,HMGB4 | NUCLEOSOME/CHROMATIN ASSEMBLY FACTOR D4,h 3 4 4 3 4 4 4 4 4 4 4 4 3 3 3 3 28.4 28.4 23.1 14.975 134 134;138;138 1.93 9 14 7 0 12.927 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1268 1.1453 25.244 20 4 Leave out requantified 1.4437 1.3862 0.83765 0.77275 1.3629 1.3116 0.94308 0.87512 78.039 20.473 16.2 45.163 4 5 4 7 1 1 1 1 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 28.4 28.4 28.4 28.4 7475700000 3885900000 3589900000 1271600000 632210000 639410000 1967000000 911830000 1055200000 1782100000 969020000 813100000 2455000000 1372800000 1082200000 1669 2569;8115;26521;31369 True;True;True;True 2931;9196;9197;30386;35773 14454;14455;14456;14457;14458;14459;14460;14461;44609;44610;44611;44612;44613;44614;146712;146713;146714;146715;146716;170657;170658;170659;170660;170661;170662;170663;170664;170665;170666;170667 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Median Median Median Median 6.5 18 21.3 11.5 126210000 96203000 30007000 0 0 0 24107000 4521200 19586000 76646000 71090000 5555300 25457000 20591000 4865400 1684 232;10859;24331;29297;33008 True;False;False;True;True 257;258;12263;12264;27500;27501;33488;37590 1295;1296;1297;59270;59271;59272;59273;59274;59275;59276;59277;59278;59279;132884;132885;132886;132887;132888;132889;132890;132891;132892;132893;132894;132895;132896;132897;160700;160701;160702;179265 1749;1750;1751;76115;76116;76117;76118;76119;76120;76121;76122;76123;76124;76125;76126;76127;76128;169861;169862;169863;169864;169865;169866;169867;169868;169869;169870;169871;169872;169873;169874;204744;204745;204746;228359 1751;76126;169871;204745;228359 670;808 1643 123;264 315 AT2G18180.5;AT2G18180.4;AT2G18180.3;AT2G18180.2;AT2G18180.1 AT2G18180.5;AT2G18180.4;AT2G18180.3;AT2G18180.2;AT2G18180.1 1;1;1;1;1 1;1;1;1;1 1;1;1;1;1 AT2G18180.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein | Chr2:7911005-7913229 REVERSE LENGTH=447;AT2G18180.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec14p-like phos 5 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 3.8 3.8 3.8 50.402 447 447;474;487;545;558 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 3.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 1685 21254 True 23919 116304 149011 149011 2763 1644 62 61 AT2G18193.1 AT2G18193.1 3 2 2 AT2G18193.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr2:7917621-7919184 REVERSE LENGTH=495 1 3 2 2 2 0 2 1 2 0 1 1 2 0 1 1 6.1 3.6 3.6 56.469 495 495 2.5 1 3 0.0009739 3.2063 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7188 1.6074 70.738 2 1 Median 1.7188 NaN NaN NaN 1.6074 NaN NaN NaN 70.738 NaN NaN NaN 2 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 3.6 0 4 1.6 67140000 43380000 23760000 53309000 29549000 23760000 0 0 0 0 0 0 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0.75732 0.81854 87.601 14 12 Median 1.1091 2.5579 0.37502 0.35356 1.0401 2.3089 0.45271 0.5118 5.7278 52.52 77.551 14.37 2 4 5 3 2 4 4 2 Median Median Median Plateau 8.7 15.1 16.1 16.1 2603900000 1502800000 1101000000 371250000 198420000 172830000 704350000 224820000 479520000 1216600000 847320000 369230000 311700000 232230000 79463000 1688 930;1714;11058;17040 True;True;True;True 1040;1947;12487;19261 5216;9703;9704;9705;9706;60478;60479;60480;60481;60482;60483;94023;94024;94025 6830;12656;12657;12658;12659;77711;77712;77713;77714;77715;77716;120583;120584;120585 6830;12657;77711;120585 0;1 132;134 AT2G18245.1 AT2G18245.1 1 1 1 AT2G18245.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr2:7937353-7939382 FORWARD LENGTH=398 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 3.8 3.8 3.8 44.847 398 398 1 3 0.001159 3.092 By MS/MS By MS/MS 0.79158 0.71986 36.877 3 3 Median 0.66428 NaN NaN NaN 0.60082 NaN NaN NaN 25.563 NaN NaN NaN 2 1 0 0 2 1 0 0 Median Median Median Median 3.8 3.8 0 0 48980000 24499000 24481000 27515000 15801000 11714000 21465000 8697900 12768000 0 0 0 0 0 0 1689 12648 True 14292 69132;69133;69134 88843;88844;88845 88845 AT2G18330.1;AT4G36580.1 AT2G18330.1;AT4G36580.1 2;1 1;0 1;0 AT2G18330.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | AAA-type ATPase family protein | Chr2:7965829-7968915 FORWARD LENGTH=636;AT4G36580.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | AAA-type ATPase family protein | Chr4:172 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 1.9 1.9 71.194 636 636;632 1.75 2 1 1 0.00041537 4.1398 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.58 0.65827 30.454 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 1.9 1.9 3.1 3.1 216620000 119310000 97306000 77168000 47239000 29928000 49100000 19561000 29539000 52083000 27625000 24458000 38269000 24888000 13381000 1690 2480;16318 False;True 2796;18460 13768;13769;90209;90210;90211;90212 17827;17828;115728;115729;115730;115731 17827;115729 AT2G18370.1 AT2G18370.1 1 1 1 AT2G18370.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr2:7980687-7981475 FORWARD LENGTH=116 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.2 11.2 11.2 11.789 116 116 2.3 2 3 5 0 6.8703 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89132 0.8253 115.73 7 7 Median 1.2094 2.3883 NaN NaN 1.1521 2.1978 NaN NaN 85.759 138.52 NaN NaN 4 2 0 1 4 2 0 1 Median Median Median Median 11.2 11.2 11.2 11.2 352590000 164870000 187730000 178200000 82321000 95883000 114450000 31458000 82995000 0 0 0 59937000 51087000 8849500 1691 29825 True 34065 163420;163421;163422;163423;163424;163425;163426;163427;163428;163429 208241;208242;208243;208244;208245;208246;208247;208248;208249;208250 208250 AT2G18510.1 AT2G18510.1 2 2 2 AT2G18510.1 | Symbols:emb2444 | embryo defective 2444 | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr2:8031554-8033517 REVERSE LENGTH=363 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 5.8 5.8 5.8 39.888 363 363 1.83 2 3 1 0 6.3962 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80998 0.8575 44.121 6 2 Median NaN 1.474 0.55755 NaN NaN 1.3752 0.64055 NaN NaN 2.9099 53.085 NaN 1 2 2 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 3 5.8 5.8 3 703950000 387810000 316130000 43600000 24638000 18963000 253640000 104080000 149560000 357130000 228050000 129070000 49578000 31037000 18541000 1692 21828;28859 True;True 24542;33007 119084;119085;119086;119087;158594;158595 152452;152453;152454;152455;152456;152457;152458;202048;202049 152456;202049 AT2G18630.2;AT2G18630.1 AT2G18630.2;AT2G18630.1 1;1 1;1 1;1 AT2G18630.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putative (DUF677) | Chr2:8081154-8082323 FORWARD LENGTH=389;AT2G18630.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putat 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.6 3.6 3.6 44.513 389 389;393 2 1 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AT2G18770.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr2:8134984-8136360 FORWARD LENGTH=260;AT2G18770.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 4 4 4 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 23.1 23.1 23.1 28.973 260 260;270 2.17 3 4 5 0 19.746 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99213 1.0255 41.145 12 5 Leave out requantified 1.3415 1.7619 0.79069 0.64409 1.082 1.6547 0.94235 0.70111 12.913 29.96 35.249 27.058 3 3 4 2 3 1 0 1 Plateau Plateau Leave out requantified Median 11.9 15 20 11.9 721530000 376880000 344650000 221920000 105170000 116750000 119440000 57708000 61731000 297790000 165180000 132610000 82382000 48822000 33560000 1701 353;24100;30438;37222 True;True;True;True 393;27126;34751;42397 1991;1992;1993;1994;1995;131204;166192;166193;166194;166195;166196;203076 2638;2639;2640;2641;2642;167787;211659;211660;211661;211662;258871 2640;167787;211662;258871 AT2G18790.1;AT2G18790.2 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AT2G20810.1 AT2G20810.1 1 1 1 AT2G20810.1 | Symbols:GAUT10,LGT4 | galacturonosyltransferase 10 | galacturonosyltransferase 10 | Chr2:8957927-8959610 FORWARD LENGTH=536 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 61.811 536 536 2.25 1 1 2 0.00040659 3.7787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89298 0.91842 29.563 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 2.1 2.1 2.1 2.1 100430000 51539000 48891000 41986000 17925000 24062000 11312000 5758600 5553800 29396000 20446000 8950500 17735000 7410100 10325000 1752 12352 True 13953 67484;67485;67486;67487 86806;86807;86808;86809;86810;86811 86811 AT2G20820.1 AT2G20820.1 1 1 1 AT2G20820.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr2:8964450-8965166 FORWARD LENGTH=93 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.6 8.6 8.6 10.052 93 93 1.75 2 1 1 0.0065603 2.143 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.112 1.1421 20.342 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 8.6 8.6 8.6 8.6 1174200000 596230000 578010000 294370000 142710000 151670000 257330000 106760000 150570000 304180000 183870000 120310000 318360000 162900000 155460000 1753 10073 True 11397 55061;55062;55063;55064 70581;70582;70583;70584;70585 70583 AT2G20830.4;AT2G20830.1;AT2G20830.5;AT2G20830.3;AT2G20830.6;AT2G20830.2 AT2G20830.4;AT2G20830.1;AT2G20830.5;AT2G20830.3;AT2G20830.6;AT2G20830.2 1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 AT2G20830.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | folic acid binding / transferase | Chr2:8968370-8969798 REVERSE LENGTH=297;AT2G20830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | folic acid binding / transferase | Chr2 6 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 4.7 4.7 4.7 32.136 297 297;297;302;341;371;431 1.67 2 1 0 12.509 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 4.7 4.7 0 0 12500000 4873600 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9;1 9;1 AT2G20890.1 | Symbols:THF1,PSB29 | THYLAKOID FORMATION1,photosystem II reaction center PSB29 protein | photosystem II reaction center PSB29 protein | Chr2:8987783-8989185 FORWARD LENGTH=300 2 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 27.3 27.3 27.3 33.795 300 300;277 1.97 33 31 30 0 58.228 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0159 1.0026 15.749 88 30 Leave out requantified 1.041 1.0109 1.0423 1.0367 0.96801 0.97147 1.2168 1.1368 30.095 16.126 14.35 22.017 20 23 22 23 5 9 9 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.3 27.3 27.3 27.3 62388000000 29030000000 33358000000 15468000000 7025600000 8442300000 15941000000 8085900000 7854900000 16622000000 7395100000 9227000000 14357000000 6523100000 7834000000 1756 2619;4085;8206;8258;20356;20357;21938;30709;31397 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2997;4671;9299;9355;22931;22932;24661;35053;35804 14789;14790;14791;14792;14793;14794;14795;14796;22884;22885;22886;22887;22888;22889;22890;22891;22892;22893;22894;22895;22896;22897;22898;22899;22900;22901;22902;22903;22904;22905;45040;45041;45042;45043;45303;45304;45305;45306;45307;45308;45309;45310;45311;45312;112013;112014;112015;112016;112017;112018;112019;112020;112021;112022;112023;119637;119638;119639;119640;119641;119642;119643;119644;119645;119646;119647;119648;119649;119650;167571;167572;167573;167574;167575;167576;167577;167578;167579;167580;167581;167582;167583;167584;167585;167586;170816;170817;170818;170819;170820;170821;170822;170823;170824 19184;19185;19186;19187;19188;19189;19190;19191;19192;19193;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;29672;29673;29674;29675;29676;29677;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;29686;29687;29688;29689;29690;29691;29692;29693;57680;57681;57682;57683;57684;57685;57686;57687;58014;58015;58016;58017;58018;58019;58020;58021;58022;58023;58024;58025;58026;58027;143678;143679;143680;143681;143682;143683;143684;143685;143686;143687;143688;143689;153167;153168;153169;153170;153171;153172;153173;153174;153175;153176;153177;153178;153179;213447;213448;213449;213450;213451;213452;213453;213454;213455;213456;213457;213458;213459;213460;213461;213462;213463;213464;213465;213466;213467;213468;213469;213470;213471;217537;217538;217539;217540;217541;217542;217543;217544;217545 19184;29673;57687;58025;143683;143689;153174;213450;217540 AT2G20900.3;AT2G20900.2;AT2G20900.4;AT2G20900.1 AT2G20900.3;AT2G20900.2;AT2G20900.4;AT2G20900.1 3;3;3;3 3;3;3;3 3;3;3;3 AT2G20900.3 | Symbols:ATDGK5,DGK5 | diacylglycerol kinase 5 | diacylglycerol kinase 5 | Chr2:8989794-8992798 REVERSE LENGTH=491;AT2G20900.2 | Symbols:ATDGK5,DGK5 | diacylglycerol kinase 5 | diacylglycerol kinase 5 | Chr2:8989794-8992798 REVERSE LENGTH= 4 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 6.1 6.1 6.1 55.267 491 491;491;509;509 2 3 3 3 0 7.8439 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66983 0.70557 75.478 5 0 Median NaN NaN NaN 0.42655 NaN NaN NaN 0.45252 NaN NaN NaN 62.815 1 1 1 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.7 4.7 4.7 3.9 154820000 110390000 44432000 29791000 15927000 13864000 18274000 9818900 8455000 69807000 58928000 10879000 36951000 25717000 11234000 1757 25467;26150;31964 True;True;True 29117;29936;36425 140759;144568;144569;144570;173697;173698;173699;173700;173701 179678;184342;184343;184344;221283;221284 179678;184344;221283 AT2G20920.1 AT2G20920.1 4 4 4 AT2G20920.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | chaperone (DUF3353) | Chr2:8998728-8999789 FORWARD LENGTH=287 1 4 4 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symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C puta 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 17.1 17.1 17.1 14.142 129 129;129 1.75 4 2 2 0 11.028 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82071 0.85417 9.4771 8 0 Leave out requantified 0.948 1.4028 0.70693 0.62333 0.90493 1.2528 0.80626 0.70799 14.913 15.149 4.041 14.096 2 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 17.1 17.1 17.1 17.1 672620000 364250000 308380000 135640000 69980000 65658000 206120000 85387000 120740000 161050000 94884000 66170000 169800000 113990000 55809000 1759 9501;20677 True;True 10770;23280 52140;52141;52142;52143;113466;113467;113468;113469 66885;66886;66887;66888;66889;66890;66891;66892;145429;145430;145431;145432 66885;145431 AT2G20990.1;AT2G20990.2;AT2G20990.3;AT2G21010.1;AT1G20080.5;AT1G20080.4;AT1G20080.3;AT1G20080.2;AT1G20080.1;AT2G34240.1 AT2G20990.1;AT2G20990.2;AT2G20990.3 25;25;23;5;1;1;1;1;1;1 25;25;23;5;1;1;1;1;1;1 25;25;23;5;1;1;1;1;1;1 AT2G20990.1 | Symbols:ATSYTA,SYT1,NTMC2TYPE1.1,NTMC2T1.1,SYTA | SYNAPTOTAGMIN 1,synaptotagmin A,ARABIDOPSIS THALIANA SYNAPTOTAGMIN A | synaptotagmin A | Chr2:9014827-9017829 FORWARD LENGTH=541;AT2G20990.2 | Symbols:ATSYTA,SYT1,NTMC2TYPE1.1,NTMC2T1.1,SYT 10 25 25 25 20 19 21 22 20 19 21 22 20 19 21 22 47.5 47.5 47.5 61.743 541 541;565;579;256;537;537;537;537;537;687 2.07 43 54 53 0 160.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0208 1.0467 20.71 129 56 Leave out requantified 1.0109 0.9078 1.0331 1.3278 0.96868 0.82963 1.2591 1.5783 31.002 28.595 37.139 25.83 35 34 28 32 17 15 10 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.1 39.4 42.9 45.5 20089000000 10301000000 9787700000 4712300000 2455300000 2257000000 4584700000 2512300000 2072300000 5960500000 2980200000 2980300000 4831000000 2352900000 2478100000 1760 1221;2763;5944;6410;9099;9408;10032;10033;11273;11502;12238;12239;13042;21140;21383;22915;24516;25461;25808;29534;32964;32965;33235;37756;38822 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14798;14799;14800;14801;14802;14803;14804;14805;14806;14807;14808;14809;14810;14811;14812;14813;14814;76502;76503;76504;76505;76506;76507;76508;76509;76510;76511;101994;101995;101996;114184;114185;114186;114187;114188;114189;114190;114191;114192;114193;114194;114195;114196;114197;119963;119964;119965;119966;119967;119968;119969;119970;119971;130060;130061;130062;130063;130064;130065;130066;222474;222475;222476;222477;248744;248745;248746;248747 14803;76507;101995;114196;119970;130060;222476;248745 835 1706;1707 79 23;69 AT2G21150.1 AT2G21150.1 2 2 2 AT2G21150.1 | Symbols:XCT | XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER | XAP5 family protein | Chr2:9065397-9067921 FORWARD LENGTH=337 1 2 2 2 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 6.8 6.8 6.8 39.239 337 337 1.5 1 1 0 5.516 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 3.6 3.3 0 26166000 19269000 6897300 0 0 0 0 0 0 26166000 19269000 6897300 0 0 0 1763 3892;22775 True;True 4451;25607 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Symbols:FBA1,AtFBA1 | fructose-bisphosphate aldolase 1 | fructose-bisphosphate aldolase 1 | 3 21 8 8 19 18 18 19 8 7 7 7 8 7 7 7 56.6 30.1 30.1 42.93 399 399;389;311 2.14 44 54 67 0 182.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0885 1.0756 21.688 52 12 Leave out requantified 1.2208 1.1998 0.57419 0.75414 1.1224 1.1415 0.64481 0.83969 25.014 15.525 13.428 21.576 14 14 15 9 4 0 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.1 53.4 54.4 55.9 63571000000 33421000000 30150000000 10070000000 4589000000 5480800000 18641000000 8300500000 10340000000 22024000000 13791000000 8233200000 12836000000 6740200000 6095900000 1769 314;343;1905;2354;2708;3496;7288;8348;14163;19419;20269;24759;31797;32691;34276;34295;34332;34888;38150;39317;39318 True;True;False;False;False;True;False;False;True;False;True;False;False;True;False;False;False;True;True;False;False 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22054;150274;151445;238418;246968 AT2G22475.1;AT2G22475.2 AT2G22475.1;AT2G22475.2 3;2 3;2 3;2 AT2G22475.1 | Symbols:GEM | GL2-EXPRESSION MODULATOR | GRAM domain family protein | Chr2:9541523-9544778 FORWARD LENGTH=299;AT2G22475.2 | Symbols:GEM | GL2-EXPRESSION MODULATOR | GRAM domain family protein | Chr2:9541523-9544242 FORWARD LENGTH=248 2 3 3 3 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 13.4 13.4 13.4 32.215 299 299;248 1.89 3 4 2 0 19.092 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74057 0.75313 50.683 7 3 Median NaN NaN 0.37922 0.86261 NaN NaN 0.41856 0.97747 NaN NaN 69.052 31.914 1 1 3 2 0 0 2 1 Median Median Median Median 5 5 13.4 5 864360000 481390000 382960000 149330000 83161000 66166000 199850000 114140000 85709000 243600000 151690000 91908000 271590000 132410000 139180000 1795 382;3863;30449 True;True;True 426;4420;34768 2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;21671;166286 2832;2833;2834;2835;2836;28113;211773 2832;28113;211773 AT2G22480.1 AT2G22480.1 14 13 13 AT2G22480.1 | Symbols:PFK5 | phosphofructokinase 5 | phosphofructokinase 5 | Chr2:9545670-9548414 FORWARD LENGTH=537 1 14 13 13 8 10 9 8 7 9 8 7 7 9 8 7 35.9 34.3 34.3 58.614 537 537 1.97 12 14 11 0 56.219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89788 0.96088 39.832 34 9 Leave out requantified 2.2087 1.8237 0.50979 0.56174 2.0448 1.6763 0.59803 0.62555 16.105 17.805 13.541 10.667 6 11 9 8 1 4 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.8 23.1 21.6 18.4 1939300000 1026100000 913230000 266370000 89101000 177270000 693530000 274480000 419050000 542150000 369810000 172340000 437250000 292680000 144570000 1796 1793;4725;8750;11923;13151;13379;25598;30565;32402;32708;33635;34731;38442;38728 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False 2040;5401;9909;13480;14851;15108;15109;29267;34892;36911;37257;38322;39566;43758;44074;44075 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THALIANA NICOTINAMIDASE 1 | nicotinamidase 1 | Chr2:9589604-9590846 REVERSE LENGTH=244 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 5.3 5.3 5.3 27.023 244 244 2 1 1 1 0.0017071 2.8577 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98991 1.057 22.667 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.3 5.3 5.3 89427000 35169000 54258000 0 0 0 33572000 10489000 23083000 0 0 0 55855000 24680000 31175000 1797 12622 True 14263 68994;68995;68996 88682;88683;88684 88683 AT2G22610.2;AT2G22610.1;AT2G22610.3 AT2G22610.2;AT2G22610.1;AT2G22610.3 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT2G22610.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Di-glucose binding protein with Kinesin motor domain-containing protein | Chr2:9599550-9604626 FORWARD LENGTH=1062;AT2G22610.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 3 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0.9 0.9 0.9 120.51 1062 1062;1083;1084 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 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Symbols:NAPRT2 | nicotinate phosphoribosyltransferase 2 | nicotinate phosphoribosyltransferase 2 | Chr2:9971819-9974792 FORWARD LENGTH=544;AT2G23420.1 | Symbols:NAPRT2 | nicotinate phosphoribosyltransferase 2 | nicotinate phosphoribosyltra 2 9 9 4 7 5 4 3 7 5 4 3 3 1 1 1 20.2 20.2 12.1 60.982 544 544;557 2 8 7 8 0 62.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0626 1.048 11.123 20 11 Leave out requantified 1.2008 1.245 0.8239 0.82077 1.131 1.1443 0.91265 0.89948 26.115 49.891 58.635 50.887 9 3 5 3 5 1 4 1 Leave out requantified Plateau Median Median 15.4 10.3 9.4 9.2 1467200000 796820000 670410000 452260000 235860000 216410000 264030000 140060000 123970000 472990000 250520000 222470000 277950000 170390000 107560000 1814 2922;10346;13851;15931;22462;24833;28123;29348;38315 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3355;11698;15654;18032;25273;28281;32174;33552;43608 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Cytosol aminopeptidase family protein | Chr2:10287017-10289450 REVERSE LENGTH=520;AT2G24200.2 | Symbols:LAP1,atLAP1 | leucyl aminopeptidase 1 | Cytosol aminopeptidase family protein | Chr2:1 3 19 19 12 16 17 18 19 16 17 18 19 9 11 12 12 46.7 46.7 30 54.509 520 520;520;484 1.97 56 76 51 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72358 0.78332 35.002 126 42 Leave out requantified 1.5042 1.7891 0.43405 0.5381 1.4273 1.68 0.49187 0.5965 21.506 14.397 17.968 32.549 26 32 33 35 7 15 9 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.5 42.7 45.2 46.7 28357000000 15644000000 12713000000 5311400000 2203400000 3108000000 6062800000 2143300000 3919500000 10508000000 7196600000 3311400000 6474800000 4100900000 2373900000 1828 1358;1586;3237;3669;3670;8563;9103;10289;10853;10987;12746;14123;23287;24607;29459;32590;32737;34676;38166 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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1,ADP-ribosylation factor 3 | ADP-ribosylation factor 3 | Chr2:10562822-10564961 FORWARD LENGTH=182;AT2G24765.2 | Symbols:ARF3,ARL1,ATARL1 | ARF-LIKE 1,ADP-ribosylation factor 3 | ADP-ribosylation factor 2 5 5 5 2 5 4 2 2 5 4 2 2 5 4 2 37.9 37.9 37.9 20.242 182 182;135 2.06 5 7 6 0 52.942 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78449 0.83591 29.371 13 9 Leave out requantified NaN 1.348 0.55968 0.40703 NaN 1.1967 0.68294 0.43669 NaN 32.421 64.232 94.888 1 5 5 2 1 3 3 2 Median Median Median Median 13.7 37.9 30.8 11 686070000 383790000 302280000 14770000 8561700 6208100 219750000 101180000 118580000 402940000 246230000 156710000 48609000 27822000 20787000 1837 7858;12901;17515;24290;26902 True;True;True;True;True 8917;14577;19809;27426;30807 43380;43381;70360;70361;70362;96713;96714;96715;132250;132251;132252;132253;132254;132255;132256;132257;148636;148637 55567;55568;90368;90369;90370;90371;124078;124079;124080;168956;168957;168958;168959;168960;168961;168962;168963;189381;189382 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nodulin-like protein 14 | early nodulin-like protein 14 | Chr2:10662308-10662930 FORWARD LENGTH=182 1 6 6 6 3 5 6 6 3 5 6 6 3 5 6 6 33.5 33.5 33.5 19.482 182 182 2.08 8 8 10 0 14.029 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3691 1.6373 21.265 15 3 Leave out requantified NaN 0.78272 1.3206 1.8183 NaN 0.71849 1.5493 2.0283 NaN 22.447 21.214 13.105 1 3 5 6 0 0 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.9 25.3 33.5 33.5 2256100000 931500000 1324600000 107160000 55433000 51731000 458160000 256950000 201210000 840040000 333260000 506780000 850770000 285850000 564910000 1841 6652;17740;23052;29402;35355;38461 True;True;True;True;True;True 7576;20080;25900;33611;40272;43779 36860;36861;36862;36863;97962;97963;97964;125286;125287;125288;161317;161318;161319;161320;161321;161322;161323;192594;192595;192596;209932;209933;209934;209935;209936;209937 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9724 0.88034 25.366 17 11 Leave out requantified 1.4272 0.77585 0.87518 1.5162 1.3561 0.70012 0.97563 1.6541 164.35 18.205 55.445 19.866 3 5 6 3 2 2 6 1 Median Leave out requantified Median Median 10.4 15.1 15.5 10.5 1248800000 424940000 823880000 227880000 41134000 186750000 546000000 158740000 387260000 260250000 134770000 125470000 214690000 90297000 124390000 1865 13565;17436;25735;29700;30347;31622;33804 True;True;True;True;True;True;True 15330;19723;29416;33934;34648;36046;38513 74607;74608;74609;74610;96343;96344;96345;142160;142161;162807;162808;165745;165746;171894;171895;171896;171897;183650;183651;183652;183653;183654 96317;96318;96319;96320;96321;123606;123607;123608;181373;181374;207449;207450;211088;211089;218933;218934;218935;218936;218937;233886;233887;233888;233889;233890;233891 96317;123607;181374;207449;211088;218934;233888 1831 188 AT2G26300.2;AT2G26300.1 AT2G26300.2;AT2G26300.1 4;4 4;4 4;4 AT2G26300.2 | Symbols:GP ALPHA 1,ATGPA1,GPA1 | ARABIDOPSIS THALIANA G PROTEIN ALPHA SUBUNIT 1,G protein alpha subunit 1,G PROTEIN ALPHA SUBUNIT 1 | G protein alpha subunit 1 | Chr2:11198087-11200822 FORWARD LENGTH=383;AT2G26300.1 | Symbols:GP ALPHA 1,AT 2 4 4 4 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 11.7 11.7 11.7 44.545 383 383;383 1.78 4 3 2 0 9.7741 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82998 0.85415 8.7956 8 3 Leave out requantified 1.017 0.95604 NaN 0.55433 0.95073 0.87007 NaN 0.60581 46.302 13.687 NaN 12.868 2 3 1 2 1 1 1 0 Median Median Median Median 6.3 8.4 6.3 6.3 596760000 305040000 291720000 99615000 43919000 55697000 317410000 162390000 155010000 67615000 34741000 32874000 112130000 63985000 48141000 1866 8005;21992;22093;22897 True;True;True;True 9077;24723;24833;25734 44108;44109;44110;44111;119853;119854;119855;120348;124502 56510;56511;56512;56513;56514;56515;153435;153436;154097;159370 56512;153435;154097;159370 AT2G26340.1;AT2G26340.2 AT2G26340.1;AT2G26340.2 5;4 5;4 5;4 AT2G26340.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr2:11215254-11216480 FORWARD LENGTH=253;AT2G26340.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr2:11215254-11216991 FOR 2 5 5 5 3 2 5 3 3 2 5 3 3 2 5 3 30 30 30 27.824 253 253;264 1.91 8 8 6 0 66.542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77427 0.80552 31.499 21 9 Leave out requantified 0.92208 1.1577 0.59161 0.89494 0.84628 1.0445 0.6544 1.0323 12.87 24.201 33.05 38.176 7 3 7 4 3 0 5 1 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 16.6 11.5 30 15.4 1371800000 753660000 618120000 436020000 223950000 212080000 220490000 91230000 129270000 486340000 306900000 179440000 228920000 131590000 97336000 1867 2104;3638;6555;28500;30654 True;True;True;True;True 2379;4159;7466;32605;34989 11770;11771;11772;11773;11774;11775;11776;20396;20397;20398;36292;36293;36294;156761;156762;156763;156764;156765;156766;156767;156768;167304 15247;15248;15249;15250;15251;15252;15253;26355;26356;26357;46465;46466;46467;199774;199775;199776;199777;199778;199779;199780;199781;199782;199783;199784;199785;199786;199787;213141 15248;26356;46466;199785;213141 AT2G26440.1 AT2G26440.1 2 1 1 AT2G26440.1 | Symbols:PME12 | pectin methylesterase 12 | Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily | Chr2:11247407-11249407 FORWARD LENGTH=547 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 0 1 1 1 0 4.4 3.1 3.1 60.416 547 547 2.67 1 2 0.0095735 1.9845 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 3.7233 3.4156 199.65 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 4.4 4.4 4.4 1.3 156110000 68855000 87259000 47255000 8380300 38874000 52057000 6554700 45503000 56802000 53920000 2882000 0 0 0 1868 15950;18094 False;True 18052;20477 88075;88076;88077;88078;99945;99946;99947 113215;113216;128065;128066;128067 113216;128067 AT2G26500.3;AT2G26500.2;AT2G26500.1 AT2G26500.3;AT2G26500.2;AT2G26500.1 1;1;1 1;1;1 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Symbols:WEB1 | WEAK CHLOROPLAST MOVEMENT UNDER BLUE LI 6 11 11 11 8 6 7 9 8 6 7 9 8 6 7 9 13.6 13.6 13.6 89.293 807 807;807;751;752;753;779 2.06 11 8 13 0 37.011 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96041 1.0825 16.122 25 13 Leave out requantified 1.2554 0.96633 0.73626 0.83972 1.2194 0.93841 0.88901 0.97013 19.581 17.074 67.697 19.988 9 4 5 7 5 2 3 3 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 10.5 7.9 8.2 11.3 3977000000 2176200000 1800800000 1223700000 583140000 640600000 750750000 364110000 386640000 925550000 524850000 400700000 1077000000 704080000 372890000 1873 1553;2110;2942;9837;13956;16808;20161;22469;27467;28908;34056 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1765;2385;3376;11138;15776;18998;22713;25280;31431;33060;38814 8860;8861;11788;11789;16771;16772;53721;53722;76944;76945;76946;76947;92609;92610;92611;92612;92613;110916;110917;110918;110919;122450;151484;151485;151486;151487;158851;158852;185199;185200;185201;185202 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no full name available | ARM repeat superfamily protein | Chr2: 2 12 12 12 7 6 9 8 7 6 9 8 7 6 9 8 8 8 8 199.7 1812 1812;1826 2.3 6 11 16 0 43.546 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83716 0.873 22.135 24 13 Leave out requantified 1.4044 1.2 0.57907 0.68446 1.3887 1.121 0.71668 0.7502 56.274 51.534 10.809 6.5961 6 4 7 7 4 2 3 4 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 4.7 4.2 5.7 4.7 1048200000 593530000 454700000 271220000 122740000 148480000 163160000 76684000 86478000 339090000 211180000 127920000 274760000 182930000 91827000 1878 4667;6578;7885;8535;12476;13439;21991;23237;24465;30209;31198;33381 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5330;7492;8945;9674;14099;15178;24722;26104;27694;34483;35583;38032 25975;25976;36415;36416;43494;43495;43496;47152;47153;68225;68226;68227;68228;73478;119849;119850;119851;119852;126252;133787;133788;165110;165111;165112;169758;169759;169760;169761;169762;181465;181466;181467;181468 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G32,pleiotropic drug resistance 4,PLEIOTROPIC DRUG RESISTANCE 4 | pleiotropic drug resistance 4 | Chr2:11481623-11487874 FORWARD LENGTH=1420 1 3 1 1 2 2 3 3 0 0 1 1 0 0 1 1 2.1 0.9 0.9 161.26 1420 1420 2 2 0.0094356 2.0119 By matching By matching By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 1.2 1.2 2.1 2.1 58054000 29161000 28892000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58054000 29161000 28892000 1883 32;8721;33917 False;True;False 35;36;9874;38648;38649 149;150;151;152;153;154;155;156;157;158;159;160;48127;48128;184339;184340;184341;184342;184343;184344;184345;184346;184347;184348;184349;184350 209;210;211;212;213;214;215;216;61826;61827;234755;234756;234757;234758;234759;234760;234761;234762;234763;234764;234765;234766;234767;234768;234769;234770;234771 216;61826;234769 1036;1049 873;1009 AT2G26930.1 AT2G26930.1 8 8 8 AT2G26930.1 | Symbols:CMK,PDE277,CMEK,ISPE,CDPMEK,ATCDPMEK | PIGMENT DEFECTIVE 277,4-(cytidine 5-phospho)-2-C-methyl-D-erithritol kinase,4-(cytidine 5′-diphospho)-2-C-methyl-d-erythritol kinase | 4-(cytidine 5-phospho)-2-C-methyl-D-erithritol kina 1 8 8 8 4 5 5 6 4 5 5 6 4 5 5 6 24.3 24.3 24.3 42.042 383 383 2.23 4 9 9 0 47.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0035 1.0321 31.082 22 4 Leave out requantified 0.82731 0.90645 0.98807 1.1391 0.76775 0.83235 1.0933 1.2494 18.842 11.947 11.355 16.557 5 5 6 6 0 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.1 18.3 18.3 18 1327100000 664670000 662420000 318630000 159110000 159510000 238370000 120970000 117400000 295000000 143380000 151620000 475100000 241210000 233890000 1884 7297;7485;9546;12927;16823;19605;23135;27919 True;True;True;True;True;True;True;True 8292;8511;10818;14607;19015;22120;25992;31938 40675;41669;41670;41671;41672;52314;52315;52316;52317;52318;70497;70498;70499;92713;92714;92715;92716;92717;108188;108189;125754;153550 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Chr5:7214740-7215950 REVERSE LENGTH=149;AT3G56800.1 | Symbols:ACAM-3,CAM3 | C 8 11 11 2 10 11 7 9 10 11 7 9 2 2 1 1 56.4 56.4 11.6 20.576 181 181;149;149;149;149;149;214;161 2.08 26 27 33 0 217.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80374 0.81064 28.138 54 12 Leave out requantified 0.74414 1.4432 0.48261 0.99075 0.69411 1.3576 0.5629 1.0969 25.745 39.126 18.483 15.279 14 15 11 14 4 4 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56.4 56.4 47 51.9 19752000000 10528000000 9223600000 4265700000 2442700000 1823000000 5660300000 2073700000 3586700000 6218300000 4115500000 2102800000 3607400000 1896300000 1711100000 1887 712;5243;6693;7315;7357;9075;16073;24424;24425;30951;35205 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 799;5973;7623;8313;8361;10264;10265;18190;27634;27635;27636;35319;40092;40093 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Symbols:AGO4,OCP11 | OVEREXPRESSOR OF CATIONIC PEROXIDASE 11,ARGONAUTE 4 | Argonaute family protein | Chr2:11536795-11541503 REVERSE LENGTH=924;AT2G27040.2 | Symbols:AGO4,OCP11 | OVEREXPRESSOR OF CATIONIC PEROXIDASE 11,ARGONAUTE 4 | Argona 3 11 11 11 4 8 8 6 4 8 8 6 4 8 8 6 16.1 16.1 16.1 102.84 924 924;924;896 2 10 13 10 0 65.901 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65127 0.74855 40.177 24 12 Leave out requantified 0.57816 0.71078 0.55165 0.73645 0.52611 0.65132 0.64418 0.80725 54.25 44.817 32.471 27.685 4 8 6 6 3 6 1 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 5 13.2 9.8 7.5 1137600000 679870000 457740000 134390000 78856000 55531000 346390000 194900000 151490000 322470000 203790000 118680000 334360000 202320000 132040000 1888 961;10932;11092;13560;14559;17724;28581;33029;35975;36972;36984 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1074;12346;12526;15325;16493;20063;32702;37613;40973;42126;42139 5333;59715;60641;74580;74581;74582;80585;80586;80587;80588;97865;157234;157235;157236;157237;157238;179379;179380;179381;179382;179383;196229;196230;196231;196232;201652;201653;201654;201655;201656;201657;201702;201703 6980;76705;77915;96283;96284;96285;103944;103945;103946;103947;125422;200319;200320;200321;200322;200323;228499;228500;250302;250303;250304;250305;250306;250307;257167;257168;257169;257170;257171;257172;257230 6980;76705;77915;96285;103945;125422;200319;228499;250305;257170;257230 AT2G27100.1 AT2G27100.1 7 7 7 AT2G27100.1 | Symbols:SE | SERRATE | C2H2 zinc-finger protein SERRATE (SE) | Chr2:11572587-11576357 FORWARD LENGTH=720 1 7 7 7 3 4 7 4 3 4 7 4 3 4 7 4 13.2 13.2 13.2 81.097 720 720 2.09 6 8 8 0 53.075 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78312 0.75332 88.99 15 11 Median 1.0562 1.3094 0.54154 0.42241 1.016 1.2396 0.60782 0.48948 119.55 81.179 30.214 106.2 3 4 4 4 2 2 3 4 Median Median Median Median 5.7 7.1 13.2 6.7 877730000 482520000 395210000 143540000 66223000 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Median 0 0 2.9 4 126940000 98524000 28412000 0 0 0 0 0 0 16380000 14265000 2115200 110560000 84259000 26297000 1891 1687;5592;15564;35404 True;True;True;False 1919;6350;17621;40324 9604;30964;30965;86179;192817 12542;39757;39758;111112;245831 12542;39758;111112;245831 AT2G27170.2;AT2G27170.1;AT2G27170.4;AT2G27170.3 AT2G27170.2;AT2G27170.1;AT2G27170.4;AT2G27170.3 7;7;6;6 7;7;6;6 7;7;6;6 AT2G27170.2 | Symbols:TTN7,SMC3 | TITAN7,STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOMES 3 | Structural maintenance of chromosomes (SMC) family protein | Chr2:11609319-11617064 REVERSE LENGTH=1204;AT2G27170.1 | Symbols:TTN7,SMC3 | TITAN7,STRUCTURAL MAINTENANCE OF 4 7 7 7 5 3 3 2 5 3 3 2 5 3 3 2 5.2 5.2 5.2 139.37 1204 1204;1204;1071;1071 1.69 7 3 3 0 12.32 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95298 0.92821 17.427 10 3 Leave out requantified 1.1003 1.0931 0.77845 4.5984 1.0499 0.95235 0.85551 4.9388 213.84 15.343 33.042 279.96 3 2 3 2 1 0 1 1 Median Median Plateau Median 3.9 2.6 2.2 1.5 996070000 370170000 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protein 1 | nitrilase-like protein 1 | Chr2:11737666-11738914 REVERSE LENGTH=220;AT2G27450.1 | Symbols:CPA,ATNLP1,NLP1 | nitrilase-like protein 1 | nitrilase-like protein 1 | Chr2:11737666-11739577 3 3 3 3 1 1 3 2 1 1 3 2 1 1 3 2 14.5 14.5 14.5 24.458 220 220;299;326 1.9 5 1 4 0 7.9148 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0678 1.247 47.463 8 6 Median NaN NaN 0.59771 1.1632 NaN NaN 0.6986 1.2909 NaN NaN 37.119 9.359 1 1 4 2 1 0 3 2 Median Median Median Median 4.1 4.1 14.5 9.5 642780000 343160000 299620000 39499000 11707000 27792000 57496000 21721000 35774000 401160000 248260000 152910000 144620000 61472000 83151000 1899 12341;29502;36175 True;True;True 13941;33719;41193 67414;161784;161785;161786;161787;197197;197198;197199;197200;197201 86703;206113;206114;206115;206116;251544;251545;251546;251547;251548 86703;206115;251544 1847 216 AT2G27460.1 AT2G27460.1 1 1 1 AT2G27460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | sec23/sec24 transport family protein | Chr2:11740670-11744867 FORWARD LENGTH=745 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 2.1 2.1 2.1 82.584 745 745 2 1 0.0032925 2.4329 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 2.1 0 6125900 6125900 0 0 0 0 0 0 0 6125900 6125900 0 0 0 0 1900 28394 True 32488 156228 199124 199124 1848;1849 238;243 AT2G27490.4;AT2G27490.3;AT2G27490.2;AT2G27490.1 AT2G27490.4;AT2G27490.3;AT2G27490.2;AT2G27490.1 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT2G27490.4 | Symbols:ATCOAE | | dephospho-CoA kinase family | Chr2:11748087-11749009 REVERSE LENGTH=232;AT2G27490.3 | Symbols:ATCOAE | | dephospho-CoA kinase family | Chr2:11748087-11749009 REVERSE LENGTH=232;AT2G27490.2 | Symbols:ATCOAE | | depho 4 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 8.6 8.6 8.6 25.747 232 232;232;232;232 2 1 1 1 0.00039393 3.3331 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.40926 0.38958 0.59869 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 8.6 8.6 0 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glutathione S-transferase tau 4 | Chr2:12626689-12627600 REVERSE LENGTH=224 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 6.2 6.2 6.2 25.839 224 224 1.5 1 1 0.00040024 3.5741 By MS/MS By MS/MS 1.0435 1.0569 115.11 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 6.2 6.2 0 103270000 61102000 42168000 0 0 0 31050000 5812300 25238000 72220000 55290000 16930000 0 0 0 1942 15268 True 17285 84393;84394 108822;108823 108823 AT2G29470.1 AT2G29470.1 1 1 1 AT2G29470.1 | Symbols:ATGSTU3,GSTU3,GST21 | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 21,glutathione S-transferase tau 3 | glutathione S-transferase tau 3 | Chr2:12628666-12629490 REVERSE LENGTH=225 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 5.3 5.3 5.3 25.94 225 225 1.5 1 1 0 5.6291 By MS/MS By MS/MS 0.5634 0.61169 436.39 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 5.3 5.3 0 74546000 41990000 32556000 0 0 0 34868000 2975100 31893000 39678000 39015000 663270 0 0 0 1943 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TRANSLOCASE OF THE INNER MEMBRANE 10 | Tim10/DDP family zinc finger protein | Chr2:12641026-12642243 REVERSE LENGTH=83;AT2G29530.2 | Symbols:TIM10,AtTIM10 | TRANSLOCASE OF THE INNER MEMBRANE 10 | Tim10/DDP family zi 3 5 5 5 5 2 1 1 5 2 1 1 5 2 1 1 57.8 57.8 57.8 9.3387 83 83;83;107 1.67 7 2 3 0 15.093 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0233 0.93696 36.026 10 1 Leave out requantified 1.0233 1.8006 0.52614 NaN 0.93696 1.6587 0.59492 NaN 32.846 13.628 28.407 NaN 6 2 2 0 0 0 1 0 Leave out requantified Median Median Median 57.8 33.7 16.9 16.9 489120000 235900000 253220000 384420000 188250000 196170000 67138000 23767000 43371000 37561000 23884000 13677000 0 0 0 1945 3218;7335;9596;20255;38808 True;True;True;True;True 3682;8336;8337;10873;10874;22826;44164 18071;40883;40884;40885;40886;40887;40888;52522;52523;52524;111445;211810 23303;52295;52296;52297;52298;52299;52300;52301;67341;67342;142913;270179 23303;52296;67341;142913;270179 1875;1876;1877 17;22;52 AT2G29550.1 AT2G29550.1 18 3 2 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THALIANA PROLIFERATING CELL NUCLEAR ANTIGEN 2,proliferating cell nuclear antigen 2 | proliferating cell nuclear antigen 2 | Chr2:12650139-12651598 REVERSE LENGTH=264 1 5 5 1 0 2 3 3 0 2 3 3 0 0 1 0 20.1 20.1 7.2 29.222 264 264 2.11 2 4 3 0 24.627 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.146 1.0695 58.793 7 4 Median NaN 1.5287 0.71758 1.4662 NaN 1.3906 0.80599 1.6085 NaN 37.124 46.08 35.026 0 2 3 2 0 1 2 1 Median Median Plateau Median 0 7.2 13.3 9.8 274590000 138140000 136450000 0 0 0 101350000 44015000 57332000 90336000 51735000 38601000 82908000 42387000 40520000 1948 580;4163;16176;28892;34501 True;True;True;True;True 647;4756;18299;33044;39308 3374;23280;23281;89396;158753;158754;158755;158756;187727 4423;30160;30161;114742;202225;202226;239179 4423;30160;114742;202226;239179 AT2G29630.3;AT2G29630.2;AT2G29630.1;AT2G29630.4 AT2G29630.3;AT2G29630.2;AT2G29630.1;AT2G29630.4 9;9;9;6 9;9;9;6 9;9;9;6 AT2G29630.3 | Symbols:THIC,PY | PYRIMIDINE REQUIRING,thiaminC | thiaminC | Chr2:12667395-12669569 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5;15;127;155;542;580;738;892 AT2G32810.2;AT2G32810.1 AT2G32810.2;AT2G32810.1 15;15 14;14 14;14 AT2G32810.2 | Symbols:BGAL9 | beta galactosidase 9,beta-galactosidase 9 | beta galactosidase 9 | Chr2:13919741-13925325 REVERSE LENGTH=859;AT2G32810.1 | Symbols:BGAL9 | beta galactosidase 9,beta-galactosidase 9 | beta galactosidase 9 | Chr2:13919410-13 2 15 14 14 9 6 11 11 8 5 10 11 8 5 10 11 17.6 17.6 17.6 96.513 859 859;887 2.07 11 19 14 0 36.737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.867 1.025 43.748 37 17 Leave out requantified 1.4469 1.2656 0.72502 0.55794 1.3083 1.1694 0.83014 0.61644 26.096 151.43 44.041 27.483 7 4 13 13 2 2 7 6 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 10.4 6.8 13.4 13.3 2909800000 1681300000 1228600000 484670000 207930000 276750000 398030000 204710000 193320000 1063400000 613620000 449760000 963740000 655000000 308740000 2020 2232;3494;4483;5583;14643;16046;18587;20377;25311;26933;28817;32104;32106;34348;34743 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| Protein kinase superfamily protein | Chr2:13935448-13937977 REVERSE LENGTH=650;AT2G32850.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein kinase superfamily protein | 2 5 5 5 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 2 8.6 8.6 8.6 72.442 650 650;670 1.7 6 1 3 0 24.986 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6848 0.63804 54.655 7 4 Median 1.2746 NaN 0.56505 0.46553 1.1944 NaN 0.64931 0.50707 88.669 NaN 43 8.7232 2 1 2 2 1 1 1 1 Median Median Median Median 5.7 6 2.6 4 151860000 80190000 71666000 38572000 14168000 24403000 18642000 7644600 10998000 50851000 30471000 20380000 43791000 27906000 15885000 2021 54;872;10799;11442;36479 True;True;True;True;True 62;978;12198;12921;41563 318;319;320;4949;59011;59012;59013;62446;198831;198832 463;464;465;466;6453;75785;75786;75787;75788;80328;253594;253595 464;6453;75786;80328;253595 1956 192 AT2G32880.1;AT2G32870.1 AT2G32880.1;AT2G32870.1 1;1 1;1 1;1 AT2G32880.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | TRAF-like family protein | Chr2:13948953-13950505 REVERSE LENGTH=318;AT2G32870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | TRAF-like family protein | Chr2:13944968-1394 2 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.8 2.8 2.8 36.728 318 318;416 2 1 1 1 0.00039968 3.5565 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 2.8 2.8 2.8 32392000 6696800 25695000 0 0 0 5469800 5469800 0 11920000 1227000 10693000 15002000 0 15002000 2022 11578 True 13073 63247;63248;63249 81375;81376;81377 81377 AT2G32920.1 AT2G32920.1 8 8 8 AT2G32920.1 | Symbols:PDIL2-3,PDI9,ATPDIL2-3,ATPDI9 | ARABIDOPSIS THALIANA PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE 9,PDI-like 2-3,PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE 9 | PDI-like 2-3 | Chr2:13962502-13965406 REVERSE LENGTH=440 1 8 8 8 7 7 8 7 7 7 8 7 7 7 8 7 24.3 24.3 24.3 47.754 440 440 2.11 13 16 18 0 84.864 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9305 0.99118 13.937 35 9 Leave out requantified 1.8141 1.4013 0.51749 0.67846 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AT2G33470.2;AT2G33470.1 7;7 7;7 7;7 AT2G33470.2 | Symbols:GLTP1,ATGLTP1 | glycolipid transfer protein 1,ARABIDOPSIS GLYCOLIPID TRANSFER PROTEIN 1 | glycolipid transfer protein 1 | Chr2:14176599-14177950 REVERSE LENGTH=202;AT2G33470.1 | Symbols:GLTP1,ATGLTP1 | glycolipid transfer protein 1 2 7 7 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 45 45 45 22.74 202 202;202 2.05 9 17 11 0 25.243 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0054 1.0678 25.924 25 6 Leave out requantified 1.5377 1.1179 0.87621 0.75587 1.4136 1.0293 1.0725 0.88679 24.074 11.174 27.81 12.228 5 7 7 6 0 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.1 39.6 35.1 45 1596700000 780480000 816260000 333690000 131090000 202600000 396830000 177580000 219240000 519450000 277240000 242210000 346780000 194570000 152210000 2035 2494;11458;11661;25866;28687;28752;32798 True;True;True;True;True;True;True 2816;12938;12939;12940;13166;13167;13168;29566;29567;32824;32894;32895;37359 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1 | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr2:14224622-14226365 FORWARD LENGTH=321 1 12 12 8 9 9 8 7 9 9 8 7 6 7 5 5 29 29 18.7 35.875 321 321 2.16 12 13 19 0 42.137 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.238 1.1798 18.485 34 16 Leave out requantified 1.3503 1.5058 0.80164 0.57641 1.2397 1.3353 0.89565 0.66584 18.224 17.648 11.681 47.02 8 9 9 8 1 4 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 25.9 22.7 18.4 20.6 2476300000 1257500000 1218800000 569740000 213020000 356730000 595290000 241010000 354280000 819670000 485580000 334090000 491580000 317920000 173660000 2037 511;1010;6835;7155;19713;26179;26180;29217;32294;33617;38717;38719 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 574;1128;7786;8137;22235;29976;29977;33403;36793;38297;44062;44065 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Symbols:UREG,PSKF109 | urease accessory protein G | urease accessory protein G | Chr2:14530900-14532411 REVERSE LENGTH=275;AT2G34470.2 | Symbols:UREG,PSKF109 | urease accessory protein G | urease accessory protein G | Chr2:14530900-145324 2 6 6 6 4 3 5 1 4 3 5 1 4 3 5 1 24 24 24 30.082 275 275;276 2.43 2 4 8 0 18.719 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6654 1.5272 90.268 9 6 Median 1.8479 2.8676 0.37735 NaN 1.7765 2.6252 0.46102 NaN 21.376 27.3 69.044 NaN 2 3 3 1 1 2 3 0 Median Median Median Median 18.2 14.5 21.1 5.1 742180000 388280000 353910000 81065000 26541000 54524000 162060000 43296000 118760000 435710000 274310000 161400000 63353000 44127000 19226000 2054 1226;3733;5752;7717;19003;39236 True;True;True;True;True;True 1382;4271;6527;8767;21470;44646 6853;6854;6855;20953;20954;20955;31836;42752;105177;105178;105179;214222;214223;214224 8951;8952;8953;27052;27053;27054;40807;54787;134889;134890;134891;273346;273347;273348 8952;27054;40807;54787;134891;273347 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19812;33056;37516;41074;43313 96719;96720;96721;158831;178949;178950;178951;178952;178953;196687;196688;196689;207528 124084;124085;124086;202320;227970;227971;227972;227973;227974;227975;250899;264735 124086;202320;227971;250899;264735 AT2G34585.1 AT2G34585.1 1 1 1 AT2G34585.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein | Chr2:14568227-14568472 REVERSE LENGTH=81 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.7 24.7 24.7 8.5705 81 81 1.75 2 1 1 0 61.836 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0823 1.0891 8.8241 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 24.7 24.7 24.7 24.7 454420000 236920000 217510000 153420000 77082000 76336000 90957000 40170000 50787000 122130000 64905000 57227000 87918000 54759000 33160000 2058 30078 True 34342 164565;164566;164567;164568 209668;209669;209670;209671;209672;209673;209674;209675 209669 AT2G34590.1 AT2G34590.1 7 7 1 AT2G34590.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transketolase family protein | Chr2:14568956-14570844 REVERSE LENGTH=406 1 7 7 1 4 7 6 4 4 7 6 4 1 1 1 1 22.4 22.4 3.7 44.015 406 406 2.07 9 10 11 0 23.365 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7595 0.7332 14.77 22 11 Leave out requantified 0.66522 0.69774 1.0037 1.4876 0.63944 0.64534 1.1442 1.7283 26.859 30.19 67.079 42.44 3 8 6 5 0 4 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 12.6 22.4 16.7 12.6 2018000000 1013300000 1004700000 129830000 80697000 49135000 682760000 376650000 306100000 813100000 378700000 434400000 392350000 177300000 215060000 2059 15430;20836;27402;28973;30013;36134;38707 True;True;True;True;True;True;True 17466;23453;31361;33138;34272;34273;41148;44049;44050 85333;85334;85335;85336;85337;85338;85339;85340;114225;151164;151165;151166;151167;159188;159189;159190;159191;159192;164321;164322;164323;164324;164325;164326;197011;197012;197013;197014;211266;211267 110054;110055;110056;110057;110058;110059;110060;110061;110062;110063;110064;110065;146390;192621;192622;192623;192624;202770;202771;202772;202773;202774;202775;202776;209366;209367;209368;209369;209370;209371;209372;209373;251333;251334;251335;251336;269530;269531 110060;146390;192621;202774;209371;251336;269530 951 663 330 299 AT2G34630.1;AT2G34630.2 AT2G34630.1;AT2G34630.2 2;1 2;1 2;1 AT2G34630.1 | Symbols:GPS1,GPPS | geranyl diphosphate synthase 1,GERANYLPYROPHOSPHATE SYNTHASE | geranyl diphosphate synthase 1 | Chr2:14579726-14581632 FORWARD LENGTH=321;AT2G34630.2 | Symbols:GPS1,GPPS | geranyl diphosphate synthase 1,GERANYLPYROPHOSP 2 2 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 5 5 5 35.046 321 321;422 2.25 1 1 2 0.00020881 4.2153 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3378 1.209 21.765 3 0 Median 1.2722 NaN NaN NaN 1.1596 NaN NaN NaN 5.9109 NaN NaN NaN 2 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5 2.5 2.5 0 48487000 20336000 28151000 31401000 13595000 17806000 17086000 6741200 10345000 0 0 0 0 0 0 2060 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6;6;6 1;1;1 1;1;1 AT2G34660.3 | Symbols:EST4,ATMRP2,MRP2,AtABCC2,ABCC2 | ATP-binding cassette C2,multidrug resistance-associated protein 2,Arabidopsis thaliana ATP-binding cassette C2 | multidrug resistance-associated protein 2 | Chr2:14604848-14612387 FORWARD LENGTH=1336 3 6 1 1 2 3 4 4 1 0 1 1 1 0 1 1 4.5 1 1 149.01 1336 1336;1623;1623 2.33 2 1 0.00039683 3.4376 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.2 1.6 3.2 2.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2062 4858;10935;11193;16904;24811;25415 False;False;False;False;True;False 5542;12349;12642;19105;28248;29049 26907;59722;59723;59724;61152;61153;61154;93237;93238;136651;136652;136653;140267 34630;76712;76713;76714;76715;78653;78654;78655;78656;78657;78658;119570;119571;119572;174495;174496;174497;178995 34630;76713;78655;119570;174496;178995 AT2G34680.1;AT2G34680.2 AT2G34680.1;AT2G34680.2 4;4 4;4 4;4 AT2G34680.1 | Symbols:AIR9 | AUXIN-INDUCED IN ROOT CULTURES 9 | Outer arm dynein light chain 1 protein | Chr2:14616947-14628300 REVERSE LENGTH=1708;AT2G34680.2 | Symbols:AIR9 | AUXIN-INDUCED IN ROOT CULTURES 9 | Outer arm dynein light chain 1 protein | 2 4 4 4 0 2 0 2 0 2 0 2 0 2 0 2 3.9 3.9 3.9 186.86 1708 1708;1768 1.75 2 1 1 0 8.5734 By MS/MS By MS/MS 1.1553 1.2712 64.591 3 3 Median NaN NaN NaN 1.8363 NaN NaN NaN 1.8802 NaN NaN NaN 55.353 0 1 0 2 0 1 0 2 Median Median Median Median 0 1.8 0 2.1 38762000 14324000 24437000 0 0 0 15111000 8573200 6538200 0 0 0 23650000 5751200 17899000 2063 29362;30163;34347;37004 True;True;True;True 33566;34431;39139;42161 161109;164927;186906;201798 205294;205295;210149;238149;257349 205294;210149;238149;257349 AT2G34690.1 AT2G34690.1 1 1 1 AT2G34690.1 | Symbols:ACD11 | ACCELERATED CELL DEATH 11 | Glycolipid transfer protein (GLTP) family protein | Chr2:14630425-14631779 FORWARD LENGTH=206 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 4.9 4.9 4.9 22.68 206 206 3 1 0.00058916 3.2791 By MS/MS 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0.0038265 2.377 By MS/MS By matching By matching 0.8418 0.7666 34.332 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 0 156170000 85996000 70175000 36655000 19633000 17022000 40437000 16565000 23871000 79079000 49797000 29282000 0 0 0 2066 26922 True 30829 148740;148741;148742 189521 189521 AT2G34790.1 AT2G34790.1 3 1 1 AT2G34790.1 | Symbols:EDA28,MEE23,AtBBE-like 15 | Berberine Bridge Enzyme-Like 15,EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 28,MATERNAL EFFECT EMBRYO ARREST 23 | FAD-binding Berberine family protein | Chr2:14673998-14677237 REVERSE LENGTH=532 1 3 1 1 3 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 6.4 2.6 2.6 59.646 532 532 1.33 2 1 0.00039825 3.4873 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0759 0.9788 92.775 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 1 0 Median Median Median Median 6.4 2.6 2.6 0 52496000 31115000 21381000 12806000 5265000 7541100 15972000 5838300 10133000 23718000 20012000 3706200 0 0 0 2067 5791;9418;33004 True;False;False 6569;10672;37586 32197;32198;32199;51758;179258 41267;41268;41269;66434;228350 41269;66434;228350 AT2G34810.1 AT2G34810.1 5 4 4 AT2G34810.1 | Symbols:AtBBE16 | | FAD-binding Berberine family protein | Chr2:14685292-14686914 FORWARD LENGTH=540 1 5 4 4 2 2 2 4 2 1 1 3 2 1 1 3 8.1 6.9 6.9 61.306 540 540 2.12 2 3 3 0 7.488 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72437 0.79971 64.772 8 5 Leave out requantified 2.1287 NaN 0.61889 0.52634 2.0017 NaN 0.75271 0.56094 6.4429 NaN 20.285 21.692 2 1 2 3 1 1 2 1 Median Median Median Median 3.5 3.3 3.3 6.7 447590000 239900000 207680000 88401000 30334000 58067000 68503000 25085000 43418000 142760000 93561000 49196000 147930000 90924000 57002000 2068 2789;7352;7475;33649;37022 True;False;True;True;True 3202;8356;8494;38336;42181 15883;40963;40964;40965;41590;182894;182895;182896;182897;182898;201881 20623;52413;52414;52415;52416;53273;232963;232964;232965;232966;232967;232968;257452 20623;52414;53273;232964;257452 2001 468 AT2G34860.2;AT2G34860.1 AT2G34860.2;AT2G34860.1 4;4 4;4 4;4 AT2G34860.2 | Symbols:PSA2,EDA3 | embryo sac development arrest 3 | DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein | Chr2:14708380-14709804 FORWARD LENGTH=186;AT2G34860.1 | Symbols:PSA2,EDA3 | embryo sac development arrest 3 | DnaJ/Hsp40 cysteine-r 2 4 4 4 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 3 26.3 26.3 26.3 19.942 186 186;186 1.8 14 8 8 0 58.322 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92331 0.9671 25.638 20 10 Leave out requantified 1.4684 0.9257 0.67367 1.0201 1.3482 0.8587 0.8853 1.1005 90.114 14.356 22.724 42.405 4 6 6 4 2 3 3 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 18.3 26.3 26.3 18.3 725880000 394120000 331760000 106580000 42846000 63736000 254350000 146360000 107990000 222850000 136150000 86699000 142100000 68760000 73340000 2069 1923;7094;23442;25045 True;True;True;True 2184;8072;26324;28565;28566 10815;10816;10817;10818;10819;10820;10821;39618;39619;39620;39621;39622;39623;39624;127469;127470;127471;127472;138173;138174;138175;138176;138177;138178;138179;138180;138181;138182;138183;138184 14051;14052;14053;14054;14055;14056;14057;14058;14059;14060;14061;50627;50628;50629;50630;50631;50632;50633;163111;163112;163113;163114;176395;176396;176397;176398;176399;176400;176401;176402;176403;176404;176405;176406;176407;176408;176409 14057;50629;163112;176406 2002 115 AT2G34970.1;AT4G18300.1 AT2G34970.1 4;1 4;1 4;1 AT2G34970.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Trimeric LpxA-like enzyme | Chr2:14746340-14748532 FORWARD LENGTH=730 2 4 4 4 3 4 2 1 3 4 2 1 3 4 2 1 6.2 6.2 6.2 81.863 730 730;709 1.6 5 4 1 0 14.138 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93039 0.93006 5.8648 10 5 Leave out requantified 0.96397 0.92115 1.0001 NaN 0.8676 0.85744 1.1788 NaN 10.182 56.098 47.697 NaN 3 4 2 1 1 2 1 1 Median Median Median Median 4.1 6.2 2.1 1.1 443920000 232400000 211520000 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MS/MS By MS/MS 0.94927 0.98534 20.574 19 6 Leave out requantified 0.9355 0.96849 1.1121 0.70163 0.92559 0.91161 1.3431 0.81516 21.644 30.157 13.381 23.36 5 5 4 5 1 3 0 2 Leave out requantified Median Leave out requantified Median 13.7 16.2 18.7 16.6 1155000000 594170000 560790000 256820000 132920000 123900000 298660000 134580000 164080000 296690000 143590000 153100000 302800000 183090000 119710000 2084 11401;20820;31600;32555;34701;35954;36148;37983 True;True;False;True;False;True;False;True 12876;23436;36021;37087;39533;39534;40952;41163;43244 62190;62191;62192;62193;62194;62195;62196;62197;62198;114148;171776;171777;171778;171779;176752;176753;189091;189092;189093;196107;196108;196109;196110;196111;196112;196113;196114;196115;197068;197069;197070;197071;207258;207259 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Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase family protein | Chr2:15053952-15055776 FORWARD LENGTH=422;AT2G35840.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sucrose-6F-phospha 8 14 14 14 9 14 11 11 9 14 11 11 9 14 11 11 38.6 38.6 38.6 47.855 422 422;422;422;422;423;424;424;424 2.01 25 27 26 0 87.339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85472 0.88151 13.845 66 13 Leave out requantified 1.1354 1.3458 0.68756 0.60167 1.0742 1.2421 0.83774 0.6839 15.38 8.2641 9.4348 16.915 13 21 17 15 4 5 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28 38.6 31.8 33.9 7727700000 4004100000 3723600000 1203300000 582650000 620660000 2395300000 1004800000 1390500000 2548900000 1445400000 1103500000 1580300000 971280000 609000000 2092 3302;4162;7020;8232;12996;14539;17198;22651;26937;28179;35107;37663;37859;37925 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Uncharacterized protein family (UPF0497) | Chr2:15159744-15160669 REVERSE LENGTH=206 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 7.3 7.3 7.3 21.969 206 206 1.5 1 1 0.00021473 4.6583 By MS/MS By MS/MS 0.8246 0.83208 79.413 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.3 0 7.3 0 113480000 57206000 56274000 52052000 33902000 18150000 0 0 0 61428000 23304000 38125000 0 0 0 2099 9905 True 11211 54254;54255 69590;69591;69592 69590 AT2G36130.1 AT2G36130.1 3 3 3 AT2G36130.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | Chr2:15166863-15168259 FORWARD LENGTH=164 1 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 22 22 22 18.232 164 164 2 6 4 6 0 7.9418 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90733 1.0058 3.1741 16 5 Leave out requantified 0.94364 1.3768 0.78771 0.81741 0.90906 1.3162 0.95082 0.99148 30.535 25.473 18.037 20.929 4 4 4 4 2 1 1 1 Median Median Leave out requantified Leave out 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cassette subfamily B1 | Chr2:15502162-15507050 FORWARD LENGTH=1286 1 3 1 1 2 2 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 2.1 0.7 0.7 140.57 1286 1286 2 1 1 0.0031279 2.4818 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 1.4956 1.3766 55.592 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 1.4 1.4 1.4 0.7 238290000 104920000 133370000 136550000 67494000 69051000 101740000 37422000 64322000 0 0 0 0 0 0 2124 14074;15275;31327 True;False;False 15905;17292;35723 77578;77579;84417;84418;84419;84420;84421;84422;170448 100181;100182;108852;108853;108854;108855;217084 100182;108852;217084 AT2G36950.1 AT2G36950.1 2 2 2 AT2G36950.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Heavy metal transport/detoxification superfamily protein | Chr2:15515216-15516754 FORWARD LENGTH=386 1 2 2 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 4.9 4.9 4.9 40.357 386 386 2 1 1 0.0045143 2.2935 By MS/MS 1.2205 1.039 3.3488 2 0 Median 1.2205 NaN NaN NaN 1.039 NaN NaN NaN 3.3488 NaN NaN NaN 2 0 0 0 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MS/MS By MS/MS 0.99117 1.0008 14.885 33 17 Leave out requantified 1.7411 1.8692 0.68724 0.5735 1.575 1.7149 0.82022 0.65688 24.254 6.3589 30.164 17.348 8 9 8 8 5 5 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 29.1 18.6 29.4 2032600000 1046800000 985740000 394450000 135900000 258550000 496170000 144850000 351320000 691530000 478800000 212730000 450410000 287260000 163150000 2129 4415;5306;7669;14022;23908;25724;27675;28573 True;True;True;True;True;True;True;True 5042;6043;6044;8716;15842;26849;29404;31675;32692 24495;29336;29337;29338;29339;29340;29341;42525;42526;42527;42528;77188;77189;129947;129948;129949;129950;129951;129952;129953;142094;142095;142096;142097;142098;142099;142100;142101;142102;152493;152494;152495;152496;157203;157204;157205;157206 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| actin 3 | actin 3 | Chr3:19915924-19917371 FORWARD LENGTH=377;AT2G37620.4 | Symbols:ACT1,AAc1 | ARABIDOPSIS ACTIN 1,actin 1 | actin 6 17 4 3 14 14 15 16 2 3 4 3 2 2 3 2 53.8 13.8 11.1 41.797 377 377;377;377;377;377;377 1.85 10 10 6 0 17.654 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91199 0.95393 9.0879 21 10 Leave out requantified 1.1845 0.8476 0.7249 1.3489 1.1014 0.79722 0.87702 1.5752 80.993 8.7775 3.5597 16.465 4 5 5 7 4 1 2 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.8 41.6 45.9 49.6 2974600000 1430700000 1543900000 188760000 79235000 109530000 725610000 385010000 340610000 863950000 454950000 409000000 1196300000 511550000 684740000 2144 628;1061;1329;3751;4202;4795;4796;6030;6110;8751;15518;16017;26606;33873;34619;37278;37279 False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;True;False;True;False;True;False;False 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putative (DUF3411) | Chr2:15856 5 4 4 3 1 2 1 3 1 2 1 3 0 2 1 3 8.8 8.8 7.2 46.629 432 432;432;347;347;433 2 2 4 2 0 6.9152 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.6414 1.4655 67.566 7 2 Leave out requantified NaN 1.0002 NaN 3.0119 NaN 0.92726 NaN 3.4133 NaN 11.937 NaN 66.783 1 2 1 3 0 1 0 1 Median Median Median Plateau 1.6 5.1 2.8 7.2 471270000 192650000 278620000 29794000 10819000 18975000 102690000 47629000 55063000 47764000 19647000 28117000 291020000 114560000 176470000 2151 8060;24446;28872;37340 True;True;True;True 9137;27666;27667;33023;42528 44348;133675;133676;133677;158660;158661;158662;203923 56796;170797;170798;170799;202122;202123;260000 56796;170797;202123;260000 2080 210 AT2G37870.1 AT2G37870.1 1 1 1 AT2G37870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr2:15859280-15859723 FORWARD LENGTH=115 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.3 11.3 11.3 11.985 115 115 2 1 2 1 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protein | Chr2:15891900-15892136 REVERSE LE 2 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 15.4 15.4 15.4 8.8576 78 78;78 1.5 1 1 0.00040967 3.9146 By MS/MS By MS/MS 0.89653 0.94121 8.0787 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 15.4 0 15.4 140000000 79894000 60103000 0 0 0 61696000 33823000 27872000 0 0 0 78302000 46071000 32231000 2154 15404 True 17438 85241;85242 109940;109941;109942 109942 AT2G37990.1 AT2G37990.1 6 6 6 AT2G37990.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ribosome biogenesis regulatory protein (RRS1) family protein | Chr2:15900713-15903028 FORWARD LENGTH=318 1 6 6 6 3 5 2 2 3 5 2 2 3 5 2 2 22.3 22.3 22.3 35.53 318 318 1.75 6 3 3 0 14.905 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69745 0.70928 65.213 9 5 Median 0.66334 0.73874 NaN 0.55462 0.64824 0.67184 NaN 0.64033 39.917 95.249 NaN 57.411 2 4 1 2 1 3 0 1 Median Median Median Median 11.6 18.9 10.1 8.8 464330000 247610000 216720000 130760000 70011000 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proteins 14C | Chr2:16132178-16134229 FORWARD LENGTH=335 1 10 10 10 8 7 8 8 8 7 8 8 8 7 8 8 28.4 28.4 28.4 36.701 335 335 1.87 18 17 12 0 69.546 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80326 0.93882 24.63 29 4 Leave out requantified 1.2138 1.2987 0.74661 0.6951 1.1373 1.1952 0.89776 0.82795 30.442 31.458 12.016 27.708 8 6 9 6 2 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.4 23.9 26 26 3663400000 1932900000 1730500000 1132200000 509550000 622670000 564270000 257550000 306720000 1376400000 804010000 572370000 590580000 361820000 228760000 2175 109;110;1928;8771;8829;10090;14505;24643;28685;37568 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 122;123;2189;9934;9997;11417;16435;27971;27972;27973;32822;42783 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Symbols:no symbol available | no full name available | AMMECR1 family | Chr2:16184517-16186764 REVERSE LENGTH=214;AT2G38710.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | AMMECR1 family | Chr2:16184517-16186764 REVERSE LENGTH= 4 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 4.2 4.2 4.2 24.244 214 214;214;214;214 2 1 1 0.0050278 2.2409 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 4.2 4.2 0 0 49258000 16309000 32950000 49258000 16309000 32950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2180 12647 True 14291 69130;69131 88841;88842 88842 AT2G38740.1 AT2G38740.1 2 2 2 AT2G38740.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr2:16194639-16195995 REVERSE LENGTH=244 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 7 7 7 26.732 244 244 2.22 2 3 4 0.00041229 3.9899 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.40705 0.46307 72.352 5 5 Median NaN NaN 0.23346 NaN NaN NaN 0.28989 NaN NaN NaN 34.378 NaN 1 1 2 1 1 1 2 1 Median Median Median Median 3.7 3.7 7 3.7 283930000 203460000 80476000 20788000 9503100 11285000 30240000 11097000 19143000 196040000 158820000 37220000 36865000 24037000 12828000 2181 467;17249 True;True 527;19508 2681;95371;95372;95373;95374;95375;95376;95377;95378 3516;122420;122421;122422;122423;122424;122425;122426;122427 3516;122424 AT2G38750.2;AT2G38750.1 AT2G38750.2;AT2G38750.1 3;3 3;3 3;3 AT2G38750.2 | Symbols:AtANN4,ANNAT4 | annexin 4 | annexin 4 | Chr2:16196582-16198273 REVERSE LENGTH=302;AT2G38750.1 | Symbols:AtANN4,ANNAT4 | annexin 4 | annexin 4 | Chr2:16196582-16198431 REVERSE LENGTH=319 2 3 3 3 2 1 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 12.9 12.9 12.9 34.494 302 302;319 2.3 2 3 5 0 20.453 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.0556 2.3441 91.498 10 1 Leave out requantified 0.89996 NaN 1.8861 2.4438 0.87479 NaN 2.3184 2.7692 112.12 NaN 4.6842 40.387 3 1 2 4 1 0 0 0 Median Median Median Leave out requantified 9.9 3 9.9 12.9 925290000 388410000 536880000 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hydrolases superfamily protein | Chr2:16203185-16210253 REVERSE LENGTH=1509 1 14 14 14 13 11 12 11 13 11 12 11 13 11 12 11 11 11 11 173.02 1509 1509 2 21 23 21 0 67.479 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85927 0.88092 29.474 47 24 Leave out requantified 1.3496 1.1964 0.74292 0.647 1.1951 1.0884 0.83355 0.72574 23.274 30.906 39.525 12.426 14 10 13 10 8 5 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.2 8.4 9.5 8.3 2284000000 1159400000 1124600000 665840000 273760000 392080000 389910000 160650000 229260000 711720000 410810000 300900000 516580000 314190000 202390000 2184 5101;5142;5838;6043;8796;10849;17952;21202;21245;22543;22670;23157;24034;34091 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5813;5814;5857;6621;6861;9960;12251;20320;20321;23858;23910;25357;25497;26017;27024;38852 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Symbols:no symbol available | no full name available | Guanylate-binding family protein | Ch 2 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 2.7 2.7 2.7 51.708 444 444;602 1 1 0.0050324 2.2527 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 2.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2187 25289 True 28858 139453 178017 178017 AT2G38860.2;AT2G38860.1;AT2G38860.3 AT2G38860.2;AT2G38860.1 10;10;4 10;10;4 9;9;3 AT2G38860.2 | Symbols:DJ1E,YLS5,DJ-1e | | Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein | Chr2:16233629-16235207 REVERSE LENGTH=398;AT2G38860.1 | Symbols:DJ1E,YLS5,DJ-1e | | Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein | 3 10 10 9 9 8 5 4 9 8 5 4 9 7 5 3 24.6 24.6 22.1 42.729 398 398;389;279 1.94 12 10 10 0 19.218 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95479 1.0829 58.062 30 18 Leave out requantified 3.071 2.7675 0.25802 0.2253 2.8391 2.5095 0.31797 0.25714 18.981 78.362 6.9627 14.331 10 10 6 4 4 9 3 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6;4 6;4 6;4 AT2G39010.1 | Symbols:PIP2E,PIP2;6 | plasma membrane intrinsic protein 2E,PLASMA MEMBRANE INTRINSIC PROTEIN 2;6 | plasma membrane intrinsic protein 2E | Chr2:16291564-16293746 FORWARD LENGTH=289;AT2G39010.2 | Symbols:PIP2E,PIP2;6 | plasma membrane intri 2 6 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 18 18 18 31.05 289 289;223 2.14 14 26 23 0 48.988 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.8626 2.2391 32.964 31 5 Leave out requantified 0.81595 0.34219 2.1823 3.7029 0.76438 0.32047 2.5807 4.1057 24.461 48.7 9.2619 38.307 7 8 8 8 3 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18 18 18 18 6127000000 2377900000 3749100000 639210000 347780000 291430000 1409900000 1000200000 409620000 1737600000 550270000 1187300000 2340400000 479620000 1860800000 2189 7178;29114;30655;32890;32891;35290 True;True;True;True;True;True 8160;33290;33291;33292;34990;37465;37466;40200 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Symbols:JAL22 | jacalin-related lectin 22 | jacalin-related lectin 22 | Chr2:16414262-16416323 REVERSE LENGTH= 7 13 13 12 1 9 6 9 1 9 6 9 1 8 5 9 38.6 38.6 37.1 50.462 458 458;458;458;428;459;459;507 1.82 11 11 6 0 51.298 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.2726 3.6883 118.51 23 12 Leave out requantified NaN 0.309 3.4435 4.3522 NaN 0.27737 4.2011 4.9686 NaN 33.818 38.601 39.186 1 8 5 9 1 5 1 5 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 2.2 29.3 19.4 31.2 1956800000 863500000 1093300000 61396000 36567000 24829000 717550000 584350000 133200000 554230000 120530000 433700000 623640000 122050000 501600000 2197 7682;11033;11936;12173;17510;19333;19656;20432;23540;30512;31410;37668;37801 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 8730;12460;13493;13757;19803;21823;22176;23011;26439;34834;35818;42892;43041 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P-glycoprotein 6,ATP-binding cassette B6 | P-glycoprotein 6 | Chr2:16478249-16483469 REVERSE LENGTH=1227;AT2G39480.1 | Symbols:ABCB6,PGP6 | P-glycoprotein 6,ATP-binding cassette B6 | P-glycoprotein 6 | Chr2:16478249-1 3 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2.4 2.4 2.4 136.14 1227 1227;1407;1408 2.14 1 4 2 0 8.5682 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3996 1.4099 30.741 7 6 Median NaN NaN NaN 1.1942 NaN NaN NaN 1.2324 NaN NaN NaN 43.068 1 1 1 4 1 0 1 4 Median Median Median Median 1.4 1.4 1.4 2.4 460100000 197010000 263090000 23037000 5777500 17260000 27183000 7396500 19786000 40971000 23157000 17814000 368910000 160680000 208230000 2202 4751;12328 True;True 5428;13928 26430;67360;67361;67362;67363;67364;67365 34034;86642;86643;86644;86645;86646;86647;86648 34034;86647 AT2G39670.1;AT2G39670.2 AT2G39670.1;AT2G39670.2 2;2 2;2 2;2 AT2G39670.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Radical SAM superfamily protein | Chr2:16534303-16536986 FORWARD LENGTH=428;AT2G39670.2 | 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23130;41378;87353;87354;87355;87356;87357;87358;87359;87360;87361;87362;87363;88685;190773;221694;221695;221696;221697;228966 23130;41378;87363;88685;190773;221696;228966 2148;2149;2150;2151;2152 171;358;527;533;535 AT2G39960.1 AT2G39960.1 3 3 3 AT2G39960.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25) | Chr2:16681666-16683491 REVERSE LENGTH=192 1 3 3 3 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 16.1 16.1 16.1 21.642 192 192 1.82 7 6 4 0 6.5154 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1857 1.0901 158.11 16 15 Median 3.4773 0.43307 0.57686 0.92975 3.1676 0.40368 0.6535 0.99214 151.88 98.702 206.1 186.18 4 4 4 4 4 3 4 4 Median Median Median Median 8.3 11.5 3.6 3.6 554670000 271500000 283170000 92799000 23199000 69599000 182560000 90461000 92099000 131910000 83093000 48813000 147410000 74749000 72663000 2215 6869;11892;26595 True;True;True 7822;13444;30472 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7293;11831;16754;23709 35597;35598;35599;35600;35601;35602;35603;35604;57133;57134;57135;57136;57137;81630;81631;81632;81633;115308 45608;45609;45610;45611;45612;45613;45614;45615;45616;73254;73255;73256;73257;73258;105191;105192;105193;105194;147770 45609;73254;105192;147770 AT2G39990.1 AT2G39990.1 6 6 6 AT2G39990.1 | Symbols:EIF2,AteIF3f,eIF3F | Arabidopsis thaliana eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F,eukaryotic translation initiation factor 2,eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F | eukaryotic translation initiation factor 1 6 6 6 1 5 6 3 1 5 6 3 1 5 6 3 24.9 24.9 24.9 31.862 293 293 2.31 1 9 6 0 53.031 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77218 0.93669 14.795 15 8 Leave out requantified NaN 0.94232 0.65682 1.2943 NaN 0.92363 0.78197 1.3838 NaN 61.652 13.446 26.34 1 5 7 2 1 3 3 1 Median Median Leave out requantified Median 3.8 22.2 24.9 9.9 1385500000 769950000 615510000 43501000 16753000 26747000 324460000 157680000 166770000 857720000 519440000 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available | Ribosomal protein S26e family pro 2 5 3 3 5 5 5 5 3 3 3 3 3 3 3 3 35.1 16.8 16.8 14.729 131 131;133 2.11 4 9 6 0 7.9194 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1006 1.1293 16.111 14 3 Leave out requantified 1.5795 1.0361 0.76426 1.1658 1.1332 0.97924 0.90954 1.3244 17.574 14.733 25.64 2.38 3 3 4 4 1 0 2 0 Plateau Median Median Leave out requantified 35.1 35.1 35.1 35.1 1455600000 734520000 721060000 366250000 181390000 184860000 299950000 131180000 168770000 446500000 253790000 192710000 342870000 168160000 174720000 2225 7005;7789;13501;18838;25597 False;True;True;True;False 7970;7971;8845;15251;21295;29266 39104;39105;39106;39107;39108;39109;39110;39111;39112;39113;39114;39115;39116;43077;43078;43079;43080;43081;43082;43083;43084;43085;43086;73886;73887;73888;73889;73890;104288;104289;104290;104291;141500;141501;141502;141503;141504;141505;141506;141507;141508;141509;141510 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708;709;710;711;712;713;43675;43676;43677;43678;43679;43680;43681;43682;43683;43684;56800;56801;56802;56803;58825;58826;58827;58828;86856;86857;86858;86859;86860;100281;100282;100283;100284;108705;108706;122833;127381;127382;180545;180546;201296;201297;201298;201299;201300;207188;207850;207851;207852;207853 1006;1007;1008;1009;1010;1011;1012;1013;55958;55959;55960;55961;55962;55963;55964;55965;55966;55967;55968;55969;55970;55971;72855;72856;72857;72858;75557;75558;75559;75560;75561;111878;111879;111880;111881;111882;128501;128502;128503;128504;139432;139433;157308;162996;162997;229977;229978;256752;256753;256754;256755;256756;256757;264314;265163;265164;265165;265166;265167;265168 1008;55971;72856;75558;111880;128502;139432;157308;162997;229977;256756;264314;265168 1030 362 AT2G40730.1 AT2G40730.1 2 2 2 AT2G40730.1 | Symbols:CTEXP | cytoplasmic tRNA export protein | kinase family with ARM repeat domain-containing protein | Chr2:16990083-16996072 REVERSE LENGTH=798 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 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autoinhibited Ca(2+)-ATPase, isoform 4 | autoinhibited Ca(2+)-ATPase%2C isoform 4 | Chr2:17332256-17337179 REVERSE LENGTH=1030;AT2G41560.4 | Symbols:ACA4 | autoinhibited Ca(2+)-ATPase, isoform 4 | autoinhibited Ca(2+)-AT 4 23 23 14 18 18 20 17 18 18 20 17 11 10 11 9 25.4 25.4 16 112.75 1030 1030;928;928;928 2.05 35 38 41 0 149.8 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94953 1.0061 39.355 91 33 Leave out requantified 0.88503 1.2555 1.1847 0.68614 0.80891 1.1426 1.3732 0.78322 21.558 37.786 25.342 35.959 21 23 26 21 5 9 12 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.8 20.9 22.1 18.3 10884000000 5453500000 5430300000 2204500000 1132700000 1071700000 2658400000 1163200000 1495200000 3324100000 1631800000 1692200000 2696900000 1525800000 1171100000 2245 1335;5093;5695;7611;7660;8873;9419;12552;13438;15822;18187;20038;22319;23201;24047;24540;24818;30816;31101;32628;32952;34525;39305 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Symbols:VLN2,ATVLN2 | villin 2 | villin 2 | Chr2:17410962-17416878 REVERSE LENGTH=976 2 18 15 15 10 12 11 14 8 10 9 11 8 10 9 11 24.5 20.9 20.9 107.84 976 976;976 2.08 15 17 19 0 64.354 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.844 0.89948 29.183 41 13 Leave out requantified 0.97935 0.81788 0.82266 1.5818 0.92347 0.74894 0.99275 1.8401 30.666 18.389 17.249 23.519 8 12 10 11 3 3 1 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.4 17.2 16 20.4 3260700000 1665600000 1595200000 547290000 288960000 258330000 861700000 473240000 388450000 988560000 570330000 418230000 863160000 333020000 530130000 2250 375;1887;2151;6774;9573;13343;16637;18576;20860;22388;28488;30357;30921;34487;34606;35777;35986;38724 True;True;True;False;True;False;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 417;2145;2430;7717;10848;15067;18813;21009;21010;23477;25185;32592;34658;35284;39294;39432;40759;40989;44070 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domain-containing protein | Chr2:17491352-17493502 FORWARD LENGTH=716 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1.7 1.7 1.7 77.991 716 716 2.5 1 1 0.0099044 1.9716 By MS/MS By MS/MS 0.87722 0.9538 15.254 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 1.7 1.7 98293000 59952000 38341000 0 0 0 0 0 0 65773000 41752000 24022000 32519000 18200000 14319000 2255 10578 True 11943 57699;57700 74034;74035 74034 AT2G41950.1 AT2G41950.1 1 1 1 AT2G41950.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | DNA-directed RNA polymerase subunit beta | Chr2:17513137-17514029 FORWARD LENGTH=266 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.4 3.4 3.4 30.021 266 266 2 1 2 1 0.0094505 2.0197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.1833 1.1049 31.162 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.4 3.4 3.4 3.4 179130000 84113000 95021000 27609000 13575000 14034000 55609000 30255000 25353000 47707000 24965000 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requantified 21.7 32.8 35.5 18.1 6391800000 3514100000 2877700000 1528100000 657260000 870830000 1391800000 472700000 919060000 2467400000 1710100000 757260000 1004500000 673990000 330520000 2258 4607;6699;6734;9820;16681;21740;23374;28437 True;True;True;True;True;True;True;True 5257;7629;7668;11119;18862;24451;24452;26254;32536 25510;25511;25512;25513;25514;25515;25516;25517;25518;37465;37466;37467;37643;53667;53668;53669;53670;53671;91972;91973;91974;91975;118688;118689;118690;127023;127024;127025;156459;156460;156461;156462;156463;156464 32833;32834;32835;32836;32837;32838;32839;32840;32841;32842;32843;48015;48016;48017;48018;48258;68843;68844;68845;68846;68847;68848;68849;68850;68851;117875;117876;117877;117878;117879;117880;151983;151984;151985;162529;162530;199409;199410;199411;199412;199413;199414 32836;48015;48258;68851;117876;151985;162529;199413 2185 206 AT2G42210.5;AT2G42210.4;AT2G42210.3;AT2G42210.1;AT2G42210.2 AT2G42210.5;AT2G42210.4;AT2G42210.3;AT2G42210.1;AT2G42210.2 4;4;4;4;3 4;4;4;4;3 4;4;4;4;3 AT2G42210.5 | Symbols:OEP16-3,ATOEP16-3 | | Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein | Chr2:17590642-17591591 FORWARD LENGTH=159;AT2G42210.4 | Symbols:OEP16-3,ATOEP16-3 | | Mitochondrial import inner mem 5 4 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 22.6 22.6 22.6 16.999 159 159;159;159;159;173 1.96 9 11 8 0 11.248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0399 1.0661 9.6506 24 5 Leave out requantified 1.248 1.472 0.79257 0.89133 1.191 1.4459 0.90381 0.99902 5.0579 9.5109 9.9682 9.0359 6 6 7 5 1 2 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.6 18.2 22.6 22.6 6551200000 3140900000 3410300000 1374400000 615170000 759260000 1271300000 507760000 763570000 1847100000 904820000 942260000 2058300000 1113200000 945170000 2259 10604;24101;26414;38858 True;True;True;True 11974;27127;30263;44217;44218 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available | carboxyl-terminal peptidase (DUF23 2 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.2 9.2 9.2 46.527 415 415;445 1.75 5 5 2 0 35.441 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.2123 2.4426 109.66 8 7 Median 2.6754 3.9846 0.40349 2.2123 2.4758 3.6243 0.46022 2.4426 82.045 20.193 161.19 12.798 2 2 2 2 1 2 2 2 Median Median Median Median 4.8 7.2 7.2 7.2 497250000 222190000 275070000 139460000 56154000 83302000 142580000 34013000 108570000 115100000 83065000 32030000 100120000 48955000 51164000 2314 10641;26039;26524 True;True;True 12015;29808;29809;30389 58073;144001;144002;144003;144004;146720;146721;146722;146723;146724;146725;146726 74559;183609;183610;183611;183612;186931;186932;186933;186934;186935;186936;186937 74559;183611;186936 1068 378 AT2G44230.1 AT2G44230.1 3 3 3 AT2G44230.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein (DUF946) | Chr2:18286537-18288247 FORWARD LENGTH=542 1 3 3 3 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 2 8.1 8.1 8.1 59.894 542 542 1.33 2 1 0 11.33 By 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1965 1.2017 38.048 8 5 Median NaN 1.0001 1.6938 1.4038 NaN 0.90853 1.9669 1.573 NaN 19.684 16.033 34.581 1 3 2 2 1 2 1 1 Median Median Median Median 5.6 8.9 8.9 8.9 687180000 289540000 397630000 61872000 21548000 40324000 196520000 89941000 106580000 206090000 87703000 118390000 222690000 90350000 132340000 2331 28471;34184 True;True 32574;38962 156623;156624;156625;156626;156627;185955;185956;185957;185958 199589;199590;199591;199592;199593;236883;236884;236885;236886;236887 199593;236886 AT2G44920.2;AT2G44920.1 AT2G44920.2;AT2G44920.1 9;6 9;6 9;6 AT2G44920.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr2:18524419-18526502 FORWARD LENGTH=224;AT2G44920.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopepti 2 9 9 9 8 9 7 7 8 9 7 7 8 9 7 7 50.4 50.4 50.4 23.778 224 224;210 1.91 19 23 14 0 99.818 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79253 0.84197 10.799 34 14 Leave out 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protein / WD-40 repeat family protein | Chr2:19115570-19124831 REVERSE LENGTH=2270;AT2G46560.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | transducin fam 3 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0.7 0.7 0.7 248.44 2270 2270;2505;2513 2.33 1 2 0 9.3139 By MS/MS By MS/MS 0.83526 0.84477 30.941 2 2 Median NaN NaN NaN 0.83526 NaN NaN NaN 0.84477 NaN NaN NaN 30.941 0 0 0 2 0 0 0 2 Median Median Median Median 0 0.7 0 0.7 25937000 13820000 12116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25937000 13820000 12116000 2367 465 True 525 2672;2673;2674 3506;3507;3508 3508 AT2G46650.1 AT2G46650.1 1 1 1 AT2G46650.1 | Symbols:CYTB5-C,ATCB5-C,B5 #1,CB5-C | ARABIDOPSIS CYTOCHROME B5 ISOFORM C,cytochrome B5 isoform C | cytochrome B5 isoform C | Chr2:19151807-19152394 FORWARD LENGTH=132 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 8.3 8.3 8.3 14.873 132 132 1.67 1 2 0.0025945 2.5601 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.55157 0.57361 81.102 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 0 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THALIANA CATION DIFFUSION FACILITATOR 1,OVERLY ZINC SENSITIVE 1 | zinc transporter | 5 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.3 3.3 3.3 43.827 398 398;398;398;398;398 2 1 0.0095936 2.0006 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 3.3 0 83049000 18306000 64742000 0 0 0 0 0 0 83049000 18306000 64742000 0 0 0 2370 34762 True 39599 189356 241408 241408 AT2G46820.2;AT2G46820.1 AT2G46820.2;AT2G46820.1 3;3 3;3 3;3 AT2G46820.2 | Symbols:PTAC8,PSI-P,PSAP,CURT1B,TMP14 | CURVATURE THYLAKOID 1B,PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 8,THYLAKOID MEMBRANE PHOSPHOPROTEIN OF 14 KDA,photosystem I P subunit | photosystem I P subunit | Chr2:19243729-19244870 FORWARD LENGTH=174;AT2G 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 23.6 23.6 23.6 18.482 174 174;174 1.97 12 10 11 0 100.9 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2067 1.2829 12.362 32 14 Leave out requantified 1.1365 0.73924 1.2486 1.4517 1.0689 0.69322 1.4001 1.5741 13.902 7.7854 77.875 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Symbols:no symbol available | no full name available | transcription factor-like protein | Chr2:19269678-19271987 FORWARD LENGTH=627 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 71.421 627 627 2 2 1 2 0.0039891 2.3246 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0446 1.0671 21.111 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 1.4 1.4 1.4 1.4 104970000 55660000 49307000 20884000 9908000 10976000 20123000 7837400 12286000 40650000 25224000 15426000 23310000 12691000 10619000 2372 17745 True 20085 97985;97986;97987;97988;97989 125654;125655;125656;125657;125658;125659;125660 125660 AT2G46910.1 AT2G46910.1 6 6 6 AT2G46910.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein | Chr2:19272427-19273856 FORWARD LENGTH=284 1 6 6 6 5 2 5 4 5 2 5 4 5 2 5 4 24.6 24.6 24.6 31.58 284 284 2.26 6 5 12 0 15.344 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81719 0.8869 26.321 21 9 Leave out 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superfamily protein | Chr2:19333116-19334759 REVERSE 6 6 2 2 4 4 4 4 1 0 1 1 1 0 1 1 21.1 9.3 9.3 39.931 365 365;365;397;247;266;322 2.67 1 2 0 19.323 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.90635 0.8931 15.321 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 14 11.8 14 13.7 70640000 38755000 31885000 33308000 16210000 17097000 0 0 0 37332000 22545000 14788000 0 0 0 2376 7558;13910;14612;16175;22764;22916 True;False;False;False;True;False 8595;15725;16553;18298;25596;25753 42041;76747;76748;76749;76750;76751;76752;76753;76754;80848;80849;80850;89392;89393;89394;89395;123974;123975;124575;124576 53856;99140;99141;99142;99143;99144;99145;99146;99147;99148;99149;104277;104278;104279;104280;114737;114738;114739;114740;114741;158689;158690;159456 53856;99148;104279;114741;158690;159456 AT3G62250.1;AT2G47110.2;AT2G47110.1;AT1G23410.1 AT3G62250.1;AT2G47110.2;AT2G47110.1;AT1G23410.1 8;8;8;6 8;8;8;6 3;3;3;1 AT3G62250.1 | Symbols:UBQ5 | ubiquitin 5 | ubiquitin 5 | Chr3:23037138-23037611 FORWARD LENGTH=157;AT2G47110.2 | Symbols:UBI6,UBQ6 | UBIQUITIN EXTENSION PROTEIN 6,ubiquitin 6 | ubiquitin 6 | Chr2:19344701-19345174 FORWARD LENGTH=157;AT2G47110.1 | Symb 4 8 8 3 8 8 8 8 8 8 8 8 3 3 3 3 52.9 52.9 22.9 17.797 157 157;157;157;156 2.07 42 60 53 0 155.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0681 1.08 23.668 96 42 Leave out requantified 1.2644 1.2906 0.78338 0.86792 1.1773 1.2177 0.86772 0.91392 35.913 20.944 17.517 38.012 28 20 25 23 10 10 10 12 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 52.9 52.9 52.9 52.9 74036000000 37379000000 36657000000 21900000000 11123000000 10777000000 15729000000 7759500000 7969800000 18063000000 8739900000 9323300000 18343000000 9756600000 8586500000 2377 4289;7667;8289;9902;17793;20330;32859;32930 True;True;True;True;True;True;True;True 4890;8711;8712;8713;8714;9389;11207;20141;22904;37432;37433;37509 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13551;13552;13553;13554;13555;13556;13557;13558;13559;13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567;13568;13569;13570;13571;13572;13573;13574;13575;13576;13577;13578;13579;13580;25668;25669;25670;25671;25672;25673;25674;25675;25676;25677;25678;25679;25680;25681;42647;42648;42649;42650;42651;42652;42653;42654;42655;42656;42657;42658;42659;42660;101245;101246;101247;101248;101249;101250;101251;101252;101253;101254;101255;101256;101257;101258;101259;101260;101261;101262;101263;101264;101265;101266;101267;101268;101269;101270;101271;101272;101273;101274;101275;101276;101277;101278;101279;101280;101281;101282;101283;101284;101285;101286;101287;101288;101289;101290;101291;101292;101293;101294;101295;101296;101297;101298;101299;101300;101301;101302;101303;101304;101305;101306;151485;151486;151487;151488;151489;151490;151491;151492;151493;151494;151495;151496;151497;151498;151499;151500;151501;151502;151503;151504;151505;151506;151507;151508;151509;151510;151511;151512;189558;189559;189560;189561;189562;247056;247057;247058;247059;247060;247061;250010;250011;250012;250013;250014;250460;250461;250462;250463;250464;250465;250466;250467;250468;250469;250470;250471;250900;250901;250902;250903;250904;250905;250906;250907;250908 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Median Median 16.3 12.5 12.5 12.5 2711200000 1580600000 1130600000 931850000 655260000 276590000 445240000 219930000 225310000 709360000 368530000 340830000 624740000 336870000 287870000 2395 11503;17299;33508 True;True;True 12992;19565;19566;38177 62816;95624;95625;95626;95627;95628;95629;95630;95631;182142;182143;182144;182145;182146;182147;182148;182149;182150;182151;182152 80845;122723;122724;122725;122726;122727;122728;122729;122730;122731;231997;231998;231999;232000;232001;232002;232003;232004;232005;232006;232007 80845;122729;232001 2308 164 AT2G47910.2;AT2G47910.1 AT2G47910.2;AT2G47910.1 3;3 3;3 3;3 AT2G47910.2 | Symbols:CRR6 | chlororespiratory reduction 6 | chlororespiratory reduction 6 | Chr2:19614963-19615559 FORWARD LENGTH=198;AT2G47910.1 | Symbols:CRR6 | chlororespiratory reduction 6 | chlororespiratory reduction 6 | Chr2:19614741-19615559 F 2 3 3 3 3 1 2 2 3 1 2 2 3 1 2 2 16.7 16.7 16.7 22.837 198 198;246 2.09 3 4 4 0 18.561 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64915 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93325 0.93078 36.449 63 10 Leave out requantified 0.97557 0.89194 0.98775 1.284 0.91948 0.82359 1.1497 1.4815 37.489 36.863 20.623 36.139 17 17 17 12 2 2 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 21.6 26.1 16.2 9284600000 4818500000 4466100000 1788200000 923610000 864570000 2650100000 1432300000 1217800000 2768600000 1465900000 1302700000 2077700000 996700000 1081000000 2397 6393;7159;7544;8223;10653;16992;18885;20775;22248;22677;28309;35122;37704;39326 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7284;8141;8580;9319;12028;19207;21342;23389;25001;25504;32387;39999;42936;44759 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| Symbols:no symbol available | no full name available | Nuclear pore localization protein NPL4 | Chr2:19629525-19630589 FORWARD LENGTH=354;AT2G47970.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Nuclear pore localization protei 3 6 6 6 4 6 6 5 4 6 6 5 4 6 6 5 23.2 23.2 23.2 39.787 354 354;413;413 2.04 8 10 9 0 23.294 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82261 0.89877 17.197 24 4 Leave out requantified 1.222 1.4169 0.64268 0.74237 1.1329 1.3046 0.79364 0.77889 25.89 9.5414 14.448 21.024 5 5 9 5 0 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15 23.2 23.2 19.5 1870400000 994290000 876060000 255640000 126560000 129080000 401690000 162990000 238700000 770270000 456530000 313730000 442770000 248210000 194550000 2399 4552;10461;27013;29664;33060;37051 True;True;True;True;True;True 5198;11823;30926;33897;37646;42210 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ATP synthase E chain | Chr3:45177-45522 REVERSE LENGTH=48;AT3G01130.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP synthase E chain | Chr3:45177-45522 REVERSE LENGTH=4 8 2 2 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 0 2 66.7 66.7 66.7 5.1292 48 48;48;49;50;53;53;63;63 2 2 3 2 0 8.2925 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0673 0.94874 45.23 7 3 Leave out requantified 1.0745 1.5209 NaN 0.42445 0.96902 1.4194 NaN 0.4681 42.239 64.867 NaN 6.9817 2 3 0 2 1 1 0 1 Median Median Median Median 66.7 66.7 0 66.7 401980000 241020000 160970000 110740000 65606000 45131000 94985000 38181000 56804000 0 0 0 196260000 137230000 59031000 2408 2822;3036 True;True 3238;3480 16003;16004;16005;17255;17256;17257;17258 20766;20767;20768;22318;22319;22320 20766;22320 AT3G01180.1 AT3G01180.1 6 6 6 AT3G01180.1 | Symbols:AtSS2,SS2 | starch synthase 2 | starch synthase 2 | Chr3:62456-65678 REVERSE LENGTH=792 1 6 6 6 5 4 3 5 5 4 3 5 5 4 3 5 10.4 10.4 10.4 87.592 792 792 2.29 4 4 9 0 20.051 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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membrane ATPase 10 | vacuolar membrane ATPase 10 | Chr3:150265-150922 R 4 9 9 9 8 8 8 7 8 8 8 7 8 8 8 7 70 70 70 12.397 110 110;110;110;110 2 22 24 22 0 27.593 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85562 0.90541 25.832 65 18 Leave out requantified 0.83183 1.6917 0.7905 0.55616 0.78065 1.521 0.98501 0.6484 21.078 25.98 17.914 36.566 17 15 19 14 5 3 7 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.1 67.3 70 49.1 13357000000 6780100000 6576900000 3980100000 1727000000 2253000000 2636600000 1000600000 1636000000 3439500000 1838300000 1601200000 3300900000 2214200000 1086700000 2416 2998;7066;7809;14576;17983;19272;20681;20800;28221 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3439;8041;8042;8867;16511;20353;21759;23284;23415;32283 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11.954 3 1 Median NaN NaN 0.98286 NaN NaN NaN 1.2133 NaN NaN NaN 3.8254 NaN 0 0 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 4 4 6 4.9 231920000 141220000 90699000 18949000 18949000 0 29219000 18419000 10800000 122090000 74124000 47964000 61664000 29730000 31934000 2425 5656;15604;17922;24468 True;True;True;False 6420;17664;20286;27698;27699;27700 31339;31340;31341;31342;31343;86328;86329;86330;98968;98969;133793;133794;133795;133796;133797;133798;133799;133800;133801;133802;133803;133804;133805;133806;133807 40204;40205;40206;40207;40208;111279;111280;111281;126869;126870;170936;170937;170938;170939;170940;170941;170942;170943;170944;170945;170946;170947;170948;170949;170950;170951;170952;170953;170954;170955;170956;170957 40206;111281;126869;170941 2192;2193 316;319 AT3G01590.2;AT3G01590.1 AT3G01590.2;AT3G01590.1 2;2 2;2 2;2 AT3G01590.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Galactose mutarotase-like superfamily protein | Chr3:226647-228346 FORWARD LENGTH=306;AT3G01590.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Galactose mutarotase-like sup 2 2 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 8.2 8.2 8.2 34.738 306 306;306 1.5 1 1 0 5.8501 By MS/MS 0.95623 1.0558 115.37 2 2 Median NaN NaN NaN 0.95623 NaN NaN NaN 1.0558 NaN NaN NaN 115.37 0 0 0 2 0 0 0 2 Median Median Median Median 0 0 0 8.2 54842000 30997000 23845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54842000 30997000 23845000 2426 13320;17109 True;True 15039;19336 72547;94399 93174;121107 93174;121107 AT3G01640.1;AT3G01640.2 AT3G01640.1;AT3G01640.2 3;3 3;3 3;3 AT3G01640.1 | Symbols:GLCAK,ATGLCAK | glucuronokinase G,ARABIDOPSIS THALIANA GLUCURONOKINASE | glucuronokinase G | Chr3:239418-241198 FORWARD LENGTH=362;AT3G01640.2 | Symbols:GLCAK,ATGLCAK | glucuronokinase G,ARABIDOPSIS THALIANA GLUCURONOKINASE | glucu 2 3 3 3 1 1 3 3 1 1 3 3 1 1 3 3 12.4 12.4 12.4 40.075 362 362;378 1.9 3 5 2 0 12.232 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.9168 3.237 106.33 3 3 Plateau NaN NaN NaN 1.0621 NaN NaN NaN 1.1598 NaN NaN NaN 124.86 0 0 1 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protein | Chr3:279171-282353 FORWARD LENGTH=848 2 14 14 14 8 9 11 8 8 9 11 8 8 9 11 8 14 14 14 130.91 1176 1176;848 1.88 22 14 16 0 63.044 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98539 1.0326 38.975 43 27 Leave out requantified 1.1968 0.98131 0.9263 0.81976 1.1498 0.92722 1.0524 0.90144 93.091 17.585 41.662 28.236 13 12 11 7 10 8 5 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.4 9.1 11.7 8.4 1467000000 734600000 732380000 350160000 168230000 181920000 355180000 170410000 184760000 424790000 217760000 207030000 336860000 178190000 158670000 2431 3240;3583;5631;5991;13008;17201;17728;18018;20990;21711;23383;25418;28548;30223 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3704;4095;6392;6797;14693;19454;20068;20393;23622;24420;26264;29054;32665;34498 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pyrophosphate:dimethylallyl pyrophosphate isomerase 2 | Chr3:602578-604648 REVERSE LENGTH=284;AT3 2 6 4 4 5 4 5 4 3 2 4 3 3 2 4 3 22.2 15.5 15.5 32.607 284 284;237 2 5 6 5 0 16.774 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90652 0.914 25.741 13 5 Leave out requantified 1.1532 1.0445 0.6624 0.71088 1.0384 0.9892 0.77296 0.78764 70.205 15.73 42.104 52.523 4 2 4 3 3 0 2 0 Median Median Median Leave out requantified 19 14.1 18.7 14.1 1719400000 971180000 748190000 427580000 216540000 211040000 398140000 193640000 204500000 484140000 306110000 178030000 409510000 254890000 154620000 2460 1211;4611;9764;18615;23738;36773 False;True;True;True;False;True 1364;5262;11054;21052;26659;26660;41908 6789;6790;25546;25547;25548;25549;53368;53369;53370;53371;102960;102961;102962;102963;129076;129077;129078;129079;129080;129081;129082;200621;200622;200623;200624 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available | no full name available | O-Glycosyl hydrolases family 17 protein | Chr3:1036879-1039263 REVERSE LENGTH=491 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.7 4.7 4.7 54.059 491 491 1.75 2 1 1 0 8.3946 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0229 1.3733 36.412 4 0 Linear NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.7 4.7 4.7 4.7 230450000 106210000 124240000 52037000 21921000 30116000 59734000 23456000 36278000 78712000 33471000 45241000 39965000 27363000 12602000 2490 3595 True 4108 20068;20069;20070;20071 25880;25881;25882;25883;25884;25885 25884 AT3G04080.1 AT3G04080.1 2 2 2 AT3G04080.1 | Symbols:ATAPY1,APY1 | apyrase 1 | apyrase 1 | Chr3:1068068-1070917 REVERSE LENGTH=471 1 2 2 2 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 7.9 7.9 7.9 51.193 471 471 1.33 2 1 0.0013482 3.0697 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0137 0.94329 17.819 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 3 3 4.9 0 32919000 13313000 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glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase C subunit 1 | Chr3:1081077-1083131 FORWARD LENGTH=338 1 26 26 3 26 26 26 24 26 26 26 24 3 3 3 3 79.9 79.9 10.4 36.914 338 338 2.02 152 172 164 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0777 1.0677 14.607 276 71 Leave out requantified 1.2152 1.1031 0.9894 0.9291 1.1443 1.0568 1.1867 1.0313 27.753 19.924 16.477 30.069 69 71 70 66 15 22 20 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 79.9 79.9 79.9 77.8 463210000000 225890000000 237320000000 96867000000 42787000000 54080000000 109930000000 52154000000 57775000000 144410000000 72898000000 71515000000 112000000000 58050000000 53951000000 2493 355;413;414;1367;1368;1748;4704;4948;11183;13634;16891;18663;19871;23261;23708;26031;26032;28701;30879;33088;34039;36220;36683;37314;37461;38382 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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symbol available | no full name available | Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | Chr3:1303884-1305692 REVERSE LENGTH=602;AT3G04760.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopeptide 2 6 6 6 2 1 6 2 2 1 6 2 2 1 6 2 11.8 11.8 11.8 67.694 602 602;572 2.23 2 6 5 0 26.196 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94935 0.93451 82.157 9 7 Median 0.94935 NaN 1.0482 NaN 0.93451 NaN 1.1907 NaN 80.562 NaN 101.19 NaN 3 0 5 1 1 0 5 1 Median Median Median Median 3 1.3 11.8 4 546160000 331490000 214680000 194950000 128010000 66935000 0 0 0 268270000 155390000 112870000 82951000 48081000 34870000 2510 705;13780;14128;16385;16581;25840 True;True;True;True;True;True 792;15572;15964;18533;18752;29537 4129;4130;4131;75969;75970;75971;75972;77839;90591;91533;142681;142682;142683 5417;5418;5419;98117;98118;98119;98120;100502;116200;117325;181990;181991;181992 5419;98117;100502;116200;117325;181990 AT3G04780.1 AT3G04780.1 1 1 1 AT3G04780.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PITH domain protein (DUF1000) | Chr3:1311447-1313013 REVERSE LENGTH=176 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 5.7 5.7 5.7 19.67 176 176 2 1 1 1 0 4.7336 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4481 1.2591 139.29 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 5.7 5.7 5.7 207160000 122200000 84965000 0 0 0 83176000 35227000 47950000 68758000 36632000 32126000 55230000 50340000 4889700 2511 28377 True 32467 156098;156099;156100 198960;198961;198962;198963 198962 AT3G04790.1 AT3G04790.1 14 14 14 AT3G04790.1 | Symbols:EMB3119 | EMBRYO DEFECTIVE 3119 | Ribose 5-phosphate isomerase%2C type A protein | Chr3:1313365-1314195 FORWARD LENGTH=276 1 14 14 14 13 12 12 11 13 12 12 11 13 12 12 11 55.8 55.8 55.8 29.305 276 276 1.94 54 40 46 0 276.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86588 0.84934 18.516 114 49 Leave out requantified 1.1138 1.2356 0.61387 0.68421 1.0766 1.1524 0.7376 0.75626 17.747 10.32 10.319 21.362 31 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Median Median 12.1 16.2 12.1 12.1 128890000 61237000 67657000 41084000 14442000 26642000 27316000 10815000 16501000 36424000 20090000 16334000 24069000 15890000 8179900 2521 19583;36933 False;True 22098;42083 108069;201459;201460;201461;201462;201463 138644;256940;256941;256942;256943;256944;256945;256946 138644;256942 AT3G05020.1 AT3G05020.1 1 1 1 AT3G05020.1 | Symbols:ACP,ACP1 | acyl carrier protein 1,ACYL CARRIER PROTEIN | acyl carrier protein 1 | Chr3:1391863-1392878 REVERSE LENGTH=137 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 13.1 13.1 13.1 15.055 137 137 1.5 1 1 0 5.3917 By MS/MS By matching 0.94187 0.88168 113.05 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 13.1 0 13.1 19484000 12669000 6814400 0 0 0 13843000 10764000 3079500 0 0 0 5640300 1905300 3734900 2522 16330 True 18472 90248;90249 115770;115771 115771 AT3G05040.1;AT3G05040.2 AT3G05040.1;AT3G05040.2 3;3 3;3 3;3 AT3G05040.1 | Symbols:HST1,HST | HASTY,HASTY 1 | ARM repeat superfamily protein | Chr3:1401479-1408095 REVERSE LENGTH=1202;AT3G05040.2 | Symbols:HST1,HST | HASTY,HASTY 1 | ARM repeat superfamily protein | Chr3:1401479-1408095 REVERSE LENGTH=1203 2 3 3 3 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 3.9 3.9 3.9 133.13 1202 1202;1203 1.83 4 6 2 0 19.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0031 1.0989 41.844 8 5 Median 2.0533 1.1929 0.95514 0.7698 1.8561 1.1192 1.0758 0.79358 27.759 43.635 2.8293 46.214 2 2 2 2 1 1 2 1 Median Median Median Median 1.8 1.8 3.9 1.8 136810000 76729000 60077000 24894000 10543000 14351000 33342000 16211000 17131000 38646000 22687000 15959000 39923000 27287000 12636000 2523 269;416;8378 True;True;True 301;467;9499 1472;1473;1474;1475;1476;2360;2361;46154;46155;46156;46157;46158 1979;1980;1981;1982;1983;1984;3095;3096;59211;59212;59213;59214;59215 1980;3095;59215 2435;2436 794;796 AT3G05060.1 AT3G05060.1 19 19 16 AT3G05060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NOP56-like pre RNA processing ribonucleoprotein | 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12;12;1;1;1;1;1;1 12;12;1;1;1;1;1;1 AT3G05420.1 | Symbols:ACBP4,AtACBP4 | acyl-CoA binding protein 4 | acyl-CoA binding protein 4 | Chr3:1561880-1567047 FORWARD LENGTH=668;AT3G05420.2 | Symbols:ACBP4,AtACBP4 | acyl-CoA binding protein 4 | acyl-CoA binding protein 4 | Chr3:1561880-1567047 8 12 12 12 4 7 9 3 4 7 9 3 4 7 9 3 18.9 18.9 18.9 73.074 668 668;669;242;648;654;668;776;780 1.93 10 12 8 0 32.159 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86029 0.79566 52.064 25 15 Leave out requantified 0.95268 1.6305 0.36243 0.70883 0.86835 1.4672 0.41649 0.80296 23.811 24.014 24.059 48.506 4 5 11 5 1 2 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 6.3 11.4 14.2 4.6 1305400000 797090000 508320000 165840000 82541000 83302000 223600000 91883000 131720000 593190000 418570000 174620000 322780000 204100000 118680000 2530 352;3534;5503;6304;8779;9000;17317;22210;22816;28930;33227;38432 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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| Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr3:1623816-1624704 REVERSE LENGTH=243;AT3G05600.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfami 2 4 3 3 1 3 2 4 0 2 1 3 0 2 1 3 18.1 15.2 15.2 27.286 243 243;331 1.67 2 4 0 5.7791 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4922 1.809 86.499 6 3 Median NaN 0.4322 NaN 1.9901 NaN 0.40285 NaN 2.2355 NaN 18.931 NaN 20.698 0 2 1 3 0 0 1 2 Median Median Median Median 2.9 13.6 6.6 18.1 267850000 115270000 152580000 0 0 0 76963000 53400000 23563000 45109000 17389000 27720000 145780000 44478000 101300000 2538 3637;3745;11810;33043 False;True;True;True 4158;4284;13349;37628 20392;20393;20394;20395;21000;64532;64533;179450;179451;179452 26350;26351;26352;26353;26354;27112;83045;83046;83047;228594;228595;228596 26350;27112;83045;228596 AT3G05625.2;AT3G05625.1 AT3G05625.2;AT3G05625.1 6;6 6;6 6;6 AT3G05625.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:1632408-1633422 FORWARD LENGTH=192;AT3G05625.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide 2 6 6 6 5 3 2 2 5 3 2 2 5 3 2 2 31.2 31.2 31.2 21.848 192 192;257 1.85 6 3 4 0 10.813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93247 0.91587 16.485 10 6 Leave out requantified 1.0029 1.3774 0.76107 0.80532 0.88582 1.3336 0.89872 0.92197 8.7614 33.844 32.523 15.545 3 3 2 2 1 3 1 1 Plateau Median Median Median 27.6 14.1 10.4 10.4 511260000 247820000 263430000 99881000 52135000 47745000 267250000 114230000 153020000 77246000 45766000 31479000 66884000 35690000 31194000 2539 1738;7631;10942;14102;24685;27122 True;True;True;True;True;True 1973;8674;12356;15936;28041;31048 9834;9835;9836;9837;9838;42358;59739;77705;135621;149598;149599;149600;149601 12830;12831;12832;12833;12834;12835;12836;54272;76730;76731;100341;173196;190595;190596;190597;190598 12831;54272;76731;100341;173196;190595 1145;2844 2449 5;8 1 AT3G05727.1 AT3G05727.1 2 2 2 AT3G05727.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S locus-related glycoprotein 1 (SLR1) binding pollen coat protein family | Chr3:1693616-1693934 FORWARD LENGTH=80 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 23.8 23.8 23.8 9.1484 80 80 2.06 6 3 7 0 4.9156 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93885 0.87744 60.822 9 5 Median 0.82799 NaN 0.55385 2.243 0.79127 NaN 0.6646 2.5084 14.542 NaN 18.277 4.7269 2 1 3 3 1 0 2 2 Median Median Median Median 23.8 13.8 13.8 13.8 308260000 145640000 162620000 49215000 27177000 22038000 32341000 16341000 16000000 101960000 68989000 32967000 124750000 33132000 91618000 2540 10284;12875 True;True 11633;14547 56190;56191;56192;56193;56194;56195;56196;56197;56198;56199;56200;56201;56202;56203;56204;70249 72054;72055;72056;72057;72058;72059;72060;72061;72062;72063;72064;72065;72066;72067;72068;90230 72056;90230 AT3G05730.1 AT3G05730.1 1 1 1 AT3G05730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | defensin-like protein | Chr3:1696070-1696490 FORWARD LENGTH=86 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 17.4 17.4 17.4 9.9741 86 86 2 1 2 1 0 5.7903 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2497 1.3069 73.672 4 1 Median NaN 1.152 NaN NaN NaN 1.0684 NaN NaN NaN 48.3 NaN NaN 0 2 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 17.4 17.4 17.4 173900000 72184000 101710000 0 0 0 60804000 29019000 31785000 56632000 27676000 28957000 56463000 15490000 40973000 2541 4804 True 5485 26695;26696;26697;26698 34366;34367;34368;34369;34370;34371;34372;34373 34366 AT3G61160.5;AT5G26751.1;AT3G05840.2;AT3G05840.1;AT5G14640.2;AT5G14640.1;AT3G61160.4;AT3G61160.1;AT3G61160.2;AT4G00720.1 AT3G61160.5;AT5G26751.1;AT3G05840.2;AT3G05840.1;AT5G14640.2;AT5G14640.1;AT3G61160.4;AT3G61160.1;AT3G61160.2;AT4G00720.1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT3G61160.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein kinase superfamily protein | Chr3:22636209-22638299 FORWARD LENGTH=384;AT5G26751.1 | Symbols:ATSK11,ASKalpha,SK 11 | Arabidopsis GSK alpha,ARABIDOPSIS THALIANA SHAGGY-RELATED K 10 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 44.109 384 384;405;409;409;410;410;421;431;438;472 2.25 1 1 2 0.0031336 2.4996 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77427 0.81361 10.019 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.3 2.3 2.3 2.3 162670000 92234000 70437000 39304000 19834000 19470000 45096000 23579000 21517000 40825000 24858000 15967000 37446000 23962000 13484000 2542 22189 True 24936 120772;120773;120774;120775 154660;154661;154662;154663;154664;154665;154666 154665 AT3G05850.1 AT3G05850.1 1 1 1 AT3G05850.1 | Symbols:MUG7 | MUSTANG 7 | MuDR family transposase | Chr3:1743537-1745943 REVERSE LENGTH=777 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 2.2 2.2 2.2 87.636 777 777 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.2 0 2.2 0 0 0 0 0 0 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chromatin remodeling 12 | SNF2/Brahma-type chromatin-remodeling protein CHR12 | Chr3:1802435-1807284 REVERSE LENGTH=1102 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1.2 1.2 1.2 126.73 1102 1102 1 1 0.0086161 2.0569 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2547 15036 True 17024 82999 106977 106977 AT3G06035.1 AT3G06035.1 1 1 1 AT3G06035.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored | Chr3:1823172-1824110 REVERSE LENGTH=200 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 8 8 8 22.053 200 200 1.5 2 2 0 14.172 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 8 8 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2548 25202 True 28757 138992;138993;138994;138995 177435;177436;177437;177438 177438 AT3G06050.1;AT3G06050.2 AT3G06050.1 9;3 9;3 9;3 AT3G06050.1 | Symbols:PRXIIF,ATPRXIIF | peroxiredoxin IIF,PEROXIREDOXIN IIF | peroxiredoxin IIF | Chr3:1826311-1827809 REVERSE LENGTH=201 2 9 9 9 9 8 8 9 9 8 8 9 9 8 8 9 48.8 48.8 48.8 21.445 201 201;184 1.96 17 17 15 0 64.215 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83657 0.87769 32.985 46 7 Leave out requantified 1.2755 2.0257 0.55607 0.45406 1.1863 1.9623 0.64597 0.51155 31.869 12.065 27.676 5.1586 12 10 12 12 1 1 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.8 44.3 44.3 48.8 13716000000 7431300000 6284600000 2478200000 1138100000 1340100000 3318800000 1127700000 2191100000 4559200000 3011800000 1547400000 3359600000 2153700000 1205900000 2549 3865;4632;5999;11995;20064;29960;31631;37110;38041 True;True;True;True;True;True;True;True;True 4422;5289;6807;13559;22608;34212;36056;42272;43307 21676;21677;21678;21679;21680;21681;25688;25689;25690;25691;33348;33349;33350;33351;33352;65534;65535;65536;65537;110409;110410;110411;110412;110413;110414;110415;110416;164105;164106;164107;164108;164109;164110;171925;171926;171927;171928;171929;171930;171931;171932;202297;202298;202299;202300;202301;202302;207505;207506 28117;28118;28119;28120;28121;28122;28123;28124;28125;28126;28127;33051;33052;33053;33054;33055;33056;42695;42696;42697;42698;42699;42700;42701;84318;84319;84320;84321;84322;84323;141629;141630;141631;141632;141633;141634;141635;141636;141637;141638;141639;141640;141641;141642;209114;209115;209116;218976;218977;218978;218979;218980;218981;218982;218983;218984;218985;218986;257993;257994;257995;257996;257997;264704;264705 28124;33054;42701;84319;141636;209116;218985;257997;264705 AT3G06110.1;AT3G06110.3;AT3G06110.2 AT3G06110.1;AT3G06110.3;AT3G06110.2 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G06110.1 | Symbols:MKP2,DSPTP1B,ATMKP2 | DUAL-SPECIFICITY PROTEIN PHOSPHATASE 1B,MAPK phosphatase 2,ARABIDOPSIS MAPK PHOSPHATASE 2 | MAPK phosphatase 2 | Chr3:1843517-1844577 FORWARD LENGTH=157;AT3G06110.3 | Symbols:MKP2,DSPTP1B,ATMKP2 | DUAL-SPECIFI 3 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 8.9 8.9 8.9 17.315 157 157;167;167 2 1 1 1 0.0013438 3.0155 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 8.9 8.9 8.9 0 25842000 12565000 13277000 25842000 12565000 13277000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2550 37312 True 42496 203709;203710;203711 259709;259710;259711 259711 AT3G06300.1 AT3G06300.1 1 1 1 AT3G06300.1 | Symbols:AT-P4H-2,P4H2 | prolyl 4-hydroxylase 2,P4H isoform 2 | P4H isoform 2 | Chr3:1907744-1909675 FORWARD LENGTH=299 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 5.7 5.7 5.7 33.019 299 299 1.83 2 3 1 0 31.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.7 5.7 5.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2551 28541 True 32655;32656 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1770;2396;3449;5880;6700;8257;12614;18469;20220;24767;30736;34828;35188;40822 8868;11852;17106;17107;17108;17109;28596;28597;28598;28599;32769;32770;32771;32772;32773;32774;32775;32776;40496;40497;40498;40499;61037;61038;61039;61040;90241;90242;90243;90244;90245;98639;98640;98641;98642;98643;98644;120008;120009;148379;166551;166552;166553;166554;166555;166556;168178;168179;168180;168181;195456;195457;195458 11562;15342;22113;22114;22115;22116;36799;36800;41949;41950;41951;41952;41953;41954;41955;41956;41957;41958;51742;51743;51744;51745;78514;78515;78516;78517;115765;115766;115767;126458;126459;126460;126461;126462;126463;126464;126465;153638;153639;189060;212142;212143;212144;212145;212146;212147;214213;214214;214215;214216;214217;249297;249298;249299;249300 11562;15342;22114;36800;41955;51742;78517;115766;126461;153638;189060;212143;214215;249297 2456 271 AT3G06390.1 AT3G06390.1 3 3 3 AT3G06390.1 | Symbols:CASPL1D2 | CASP-like protein 1D2 | Uncharacterized protein family (UPF0497) | Chr3:1938913-1939707 REVERSE LENGTH=199 1 3 3 3 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 21.6 21.6 21.6 21.156 199 199 1.5 3 3 0 22.024 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.749 2.0444 114.96 5 2 Median NaN NaN 2.1082 NaN NaN NaN 2.4322 NaN NaN NaN 27.582 NaN 1 1 3 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 6 17.1 21.6 0 288930000 122270000 166670000 29235000 24706000 4529000 82225000 51016000 31209000 177470000 46544000 130930000 0 0 0 2553 3284;14264;28981 True;True;True 3757;16156;33146 18413;18414;18415;78951;159214;159215 23753;23754;23755;101866;101867;202798;202799 23755;101866;202799 AT3G06400.1;AT3G06400.2;AT3G06400.3;AT5G18620.1;AT5G18620.2 AT3G06400.1;AT3G06400.2;AT3G06400.3;AT5G18620.1;AT5G18620.2 11;11;11;7;7 11;11;11;7;7 11;11;11;7;7 AT3G06400.1 | Symbols:CHR11 | chromatin-remodeling protein 11 | chromatin-remodeling protein 11 | Chr3:1941066-1946700 FORWARD LENGTH=1055;AT3G06400.2 | Symbols:CHR11 | chromatin-remodeling protein 11 | chromatin-remodeling protein 11 | Chr3:1941066-19 5 11 11 11 5 4 6 5 5 4 6 5 5 4 6 5 12.6 12.6 12.6 122.43 1055 1055;1056;1057;1069;1072 1.8 8 8 4 0 47.693 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61517 0.67473 24.526 19 10 Leave out requantified 1.1796 1.2149 0.44233 0.76393 1.0535 1.1273 0.50181 0.85721 26.792 47.648 28.851 47.41 5 3 6 5 3 2 3 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 6.4 4 7.7 5 1012100000 583000000 429140000 225960000 105980000 119980000 146900000 62012000 84883000 389370000 260560000 128810000 249910000 154450000 95462000 2554 4727;6627;10763;11527;12884;18104;26650;26792;29549;34154;38914 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5403;7549;12155;13017;14558;20487;30539;30690;33770;38930;44280 26289;36697;58843;58844;63008;70293;70294;70295;70296;99976;99977;147455;148152;148153;148154;148155;162007;185785;185786;212445 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Symbols:SFR2,ATSFR2 | SENSITIVE TO FREEZING 2 | Glycosyl hydrolase superfamily protein | Chr3:2 2 21 21 21 16 15 19 17 16 15 19 17 16 15 19 17 35.2 35.2 35.2 70.778 622 622;656 2.11 29 40 41 0 77.368 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0313 1.168 40.817 96 24 Leave out requantified 1.5285 1.7304 0.62314 0.56074 1.4015 1.6267 0.73815 0.61645 17.043 16.783 25.467 25.071 23 24 24 25 6 5 5 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.1 23.6 32.6 27.5 20446000000 10336000000 10110000000 4468700000 1810700000 2658100000 3971500000 1552200000 2419200000 6617400000 3649900000 2967400000 5388100000 3322900000 2065200000 2557 4060;6715;7607;10062;10063;10322;11172;11196;12311;15370;17567;20322;20480;23514;24351;24866;27803;29854;33092;34053;36609 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Symbols:BCE2,DIN3,LTA1 | DARK INDUCIBLE 3 | 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase family protein | Chr3:2158212-2160465 REVERSE LENGTH=483;AT3G06850.1 | Symbols:BCE2,DIN3,LTA1 | DARK INDUCIBLE 3 | 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferas 2 8 8 8 2 4 7 3 2 4 7 3 2 4 7 3 24.2 24.2 24.2 52.706 483 483;483 2.21 5 5 9 0 80.822 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0653 1.0824 13.554 18 4 Leave out requantified 0.77733 0.99921 1.124 1.5167 0.77486 0.92836 1.3346 1.7349 17.176 6.8927 14.569 19.631 2 4 8 4 0 1 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Linear 6.4 14.3 22.4 9.1 2331600000 1069100000 1262500000 705970000 281710000 424250000 187570000 81783000 105780000 1189000000 588000000 600970000 249060000 117610000 131450000 2567 13191;16012;20321;22451;22720;34582;35973;36138 True;True;True;True;True;True;True;True 14895;18118;22895;25260;25549;39399;40971;41152 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| UDP-glucosyl transferase 80A2,sterol glucosyltransferase | UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | Chr3:2218120-2221245 REVERSE LENGTH=555;AT3G07020.2 | Symbols:UGT80A2,SGT | UDP-glucosyl transferase 80A2,sterol 3 6 6 6 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 15.7 15.7 15.7 61.06 555 555;637;637 2.12 5 4 7 0 17.406 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.093 1.1027 19.261 15 9 Leave out requantified 1.418 1.1028 0.66884 0.98071 1.3496 1.0365 0.80657 1.0495 24.232 24.146 61.411 37.633 3 3 4 5 1 1 3 4 Median Median Median Median 8.8 6.8 10.6 9.9 622980000 291270000 331720000 118620000 51503000 67114000 145780000 68351000 77432000 167280000 83054000 84225000 191300000 88357000 102940000 2573 558;3974;12848;13122;27549;30754 True;True;True;True;True;True 624;4542;14514;14818;31536;35100 3229;22236;22237;22238;22239;22240;70111;71484;71485;71486;71487;151876;167804;167805;167806;167807 4243;28845;28846;28847;28848;28849;28850;28851;90058;91839;91840;91841;91842;193542;213751;213752 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45285;45286;45287;45288;63254;63255;63256;63257;126991;126992;129301;129302;129303;129304;134197;134198;134199;142333;151639;151640;151641;151642;151643;157251;157252;157253;169471;169472;169473;169474;170118;170119;170120;170121;170122;182376;187265;187266;187267;187268;193853;193854;193855;193856;202287;202288;202289;202290;214611;214612;214613;214821;214822;214823;214824 57995;57996;57997;57998;81382;81383;81384;81385;162495;162496;165454;165455;165456;165457;171436;171437;171438;181579;193263;193264;193265;193266;193267;200336;200337;200338;215781;215782;215783;215784;216611;216612;216613;216614;216615;216616;232301;238619;238620;238621;238622;238623;238624;247173;247174;247175;247176;257980;257981;257982;257983;273827;273828;273829;274158;274159;274160;274161;274162 57996;81384;162495;165457;171437;181579;193263;200337;215784;216613;232301;238621;247176;257981;273828;274160 1157;2847 2476;2477;2478 968;970 500;775;972 AT3G07110.1;AT3G07110.2 AT3G07110.1;AT3G07110.2 11;11 11;11 6;6 AT3G07110.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L13 family protein | Chr3:2252092-2253332 FORWARD LENGTH=206;AT3G07110.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L13 family protein 2 11 11 6 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 5 5 48.5 48.5 25.2 23.466 206 206;207 2.05 32 37 37 0 53.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98635 0.97722 9.0855 75 12 Leave out requantified 1.0542 0.96747 0.94965 0.91365 0.98912 0.92012 1.1045 1.0374 26.134 8.6113 5.3164 16.209 19 20 16 20 3 4 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.1 45.1 45.1 42.7 24905000000 12924000000 11981000000 4723000000 2238800000 2484200000 5996400000 3048400000 2948100000 6232800000 3251000000 2981800000 7952600000 4385600000 3567000000 2577 2877;4214;5926;12516;20297;21275;21276;23108;24830;35222;36923 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Symbols:no symbol available | no full name available | Sterile alpha motif ( 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 11.4 11.4 11.4 20.735 185 185;203 1.71 3 3 1 0 6.9788 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95033 1.0323 25.408 6 4 Median NaN 1.2583 0.79616 NaN NaN 1.1838 0.91982 NaN NaN 38.889 22.392 NaN 1 2 2 1 1 1 2 0 Median Median Median Median 6.5 11.4 11.4 6.5 277800000 138600000 139200000 22829000 9639300 13190000 105560000 54392000 51166000 121360000 58615000 62741000 28058000 15953000 12105000 2579 6380;31366 True;True 7271;35770 35496;35497;35498;35499;170651;170652;170653 45471;45472;45473;45474;217342;217343;217344 45473;217344 2480 81 AT3G07180.2;AT3G07180.3;AT3G07180.1 AT3G07180.2;AT3G07180.3;AT3G07180.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G07180.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | GPI transamidase component PIG-S-like protein | Chr3:2282455-2285475 REVERSE LENGTH=454;AT3G07180.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | GPI transamidase component 3 1 1 1 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wound-responsive protein-like protein | Chr3:2299920-2300183 FORWARD LENGTH=46 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 45.7 45.7 45.7 5.3049 46 46 1.67 4 4 1 0 7.3061 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71338 0.69892 29.652 6 1 Leave out requantified 0.4893 0.91209 NaN NaN 0.45181 0.83211 NaN NaN 89.736 54.321 NaN NaN 2 2 1 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 21.7 45.7 45.7 45.7 1221600000 686040000 535540000 402910000 238750000 164170000 320850000 129770000 191090000 189470000 103150000 86320000 308350000 214370000 93971000 2582 3066;24420 True;True 3513;3514;27630 17358;17359;17360;17361;17362;133520;133521;133522;133523 22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447;22448;170619;170620;170621;170622;170623 22448;170622 2481;2482 1;44 AT3G07300.1;AT3G07300.2;AT3G07300.3 AT3G07300.1;AT3G07300.2;AT3G07300.3 4;4;4 4;4;4 4;4;4 AT3G07300.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein | Chr3:2324967-2327380 REVERSE 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O-Glycosyl hydrolases family 17 protein | Chr3:2332324-2333925 REVERSE LENGTH=460 1 6 6 6 3 5 2 2 3 5 2 2 3 5 2 2 16.3 16.3 16.3 50.603 460 460 1.75 6 3 3 0 11.428 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4347 1.2413 25.243 11 3 Leave out requantified 1.6787 1.3449 0.71581 NaN 1.5073 1.1882 0.8539 NaN 23.067 23.921 1.2288 NaN 3 5 2 1 1 1 0 1 Median Leave out requantified Median Median 7.8 14.6 4.8 6.1 484410000 243160000 241250000 71200000 26771000 44429000 221640000 101240000 120400000 124610000 71852000 52762000 66954000 43298000 23656000 2584 4217;9824;19962;35537;36218;38917 True;True;True;True;True;True 4813;11124;22501;40485;41254;44283 23531;53682;53683;53684;109865;109866;193640;193641;197506;197507;197508;212456 30451;68864;68865;68866;68867;140965;140966;140967;246916;246917;246918;246919;251930;251931;270982 30451;68865;140967;246917;251931;270982 AT3G07390.1;AT3G07390.2 AT3G07390.1;AT3G07390.2 4;2 4;2 4;2 AT3G07390.1 | Symbols:AIR12 | Auxin-Induced in Root cultures 12 | auxin-induced in root cultures-like protein | Chr3:2365452-2366273 FORWARD LENGTH=273;AT3G07390.2 | Symbols:AIR12 | Auxin-Induced in Root cultures 12 | auxin-induced in root cultures-like 2 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 13.9 13.9 13.9 27.926 273 273;164 2.08 10 13 13 0 13.403 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1012 1.0674 36.732 34 6 Leave out requantified 1.8648 2.109 0.39947 0.47008 1.7876 2.0117 0.47097 0.54242 23.31 18.618 12.589 13.8 9 8 8 9 1 0 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.9 13.9 13.9 13.9 13080000000 6391100000 6689000000 4024200000 1245300000 2778900000 2899900000 893610000 2006300000 2696900000 1956400000 740430000 3459000000 2295700000 1163300000 2585 16231;20096;23985;29302 True;True;True;True 18359;22642;26946;26947;33494 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2;2;2 2;2;2 AT3G07470.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putative (Protein of unknown function%2C DUF538) | Chr3:2387568-2388343 REVERSE LENGTH=157;AT3G07470.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 3 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 14 14 14 17.386 157 157;160;169 2 3 5 3 0 5.5314 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5554 1.4644 38.457 9 5 Median 1.0661 1.7737 1.0829 1.0958 0.98297 1.6964 1.3231 1.2505 48.312 12.125 57.137 50.132 2 3 2 2 1 2 1 1 Median Median Median Median 7.6 7.6 14 7.6 341010000 160860000 180150000 62111000 29176000 32935000 104450000 42864000 61587000 95963000 51086000 44877000 78483000 37730000 40752000 2588 8157;12008 True;True 9242;13572 44779;65593;65594;65595;65596;65597;65598;65599;65600;65601;65602 57341;84399;84400;84401;84402;84403;84404;84405;84406;84407;84408;84409;84410 57341;84403 AT3G07480.1 AT3G07480.1 2 2 2 AT3G07480.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein | Chr3:2389026-2389505 FORWARD LENGTH=159 1 2 2 2 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 11.9 11.9 11.9 17.602 159 159 1.4 3 2 0.00021209 4.4506 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.49182 0.52703 8.5665 5 1 Leave out requantified NaN 1.0672 0.39315 NaN NaN 0.97047 0.46049 NaN NaN 72.031 10.52 NaN 1 2 2 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 5.7 11.9 11.9 0 540300000 321530000 218770000 93974000 51731000 42243000 214590000 110060000 104520000 231740000 159740000 72003000 0 0 0 2589 22861;34322 True;True 25696;39111 124345;124346;186779;186780;186781 159171;159172;238005;238006;238007 159172;238006 AT3G07520.1 AT3G07520.1 1 1 1 AT3G07520.1 | Symbols:GLR1.4,ATGLR1.4 | glutamate receptor 1.4 | glutamate receptor 1.4 | Chr3:2395121-2398291 REVERSE LENGTH=861 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 2.1 2.1 2.1 97.759 861 861 2.67 1 2 1 -2 By matching By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.1 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with DOMON related domain-containing protein | Chr3:2418205-2420206 REVERSE LENGTH=369 1 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 10.3 10.3 10.3 40.444 369 369 1.75 1 3 0 29.359 By matching By MS/MS By MS/MS 0.82222 0.72673 14.707 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.4 4.9 5.4 17355000 9418000 7936900 0 0 0 9312400 4811000 4501300 0 0 0 8042500 4607000 3435600 2592 12264;27745 True;True 13860;31749 67015;67016;152793;152794 86156;86157;194671 86156;194671 AT3G07630.3;AT3G07630.2;AT3G07630.1 AT3G07630.3;AT3G07630.2;AT3G07630.1 7;7;7 7;7;7 6;6;6 AT3G07630.3 | Symbols:AtADT2,ADT2 | arogenate dehydratase 2,Arabidopsis thaliana arogenate dehydratase 2 | arogenate dehydratase 2 | Chr3:2435457-2437530 FORWARD LENGTH=381;AT3G07630.2 | Symbols:AtADT2,ADT2 | arogenate dehydratase 2,Arabidopsis thaliana 3 7 7 6 6 3 4 3 6 3 4 3 6 3 4 2 24.7 24.7 22.8 42.115 381 381;381;381 1.88 7 5 5 0 49.506 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0242 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MS/MS By MS/MS 1.0141 1.0896 11.744 29 7 Leave out requantified 1.0249 1.3215 0.93817 0.81032 0.9761 1.2044 1.1718 0.92139 7.2164 16.83 29.56 28.643 5 7 8 9 0 0 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.1 30.8 34.1 30.8 3855000000 1890500000 1964500000 565610000 283510000 282090000 878580000 388310000 490270000 1487100000 743290000 743850000 923670000 475410000 448260000 2621 12066;21342;22277;29829;36387;36886;37342 True;True;True;True;True;True;True 13635;24017;25032;34071;41440;42028;42530 65897;65898;65899;65900;65901;65902;116724;116725;116726;121176;121177;121178;121179;163455;198421;198422;198423;198424;198425;198426;198427;198428;201228;201229;201230;203925;203926;203927;203928;203929 84775;84776;84777;84778;84779;84780;84781;149508;155141;155142;155143;155144;155145;155146;155147;155148;208282;253121;253122;253123;253124;253125;253126;253127;253128;253129;253130;256670;256671;256672;260002;260003;260004;260005;260006;260007;260008 84780;149508;155143;208282;253130;256672;260008 2517 118 AT3G08930.1 AT3G08930.1 4 2 2 AT3G08930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | LMBR1-like membrane protein | Chr3:2713562-2717058 FORWARD LENGTH=509 1 4 2 2 1 3 4 3 1 1 2 2 1 1 2 2 6.1 4.5 4.5 56.544 509 509 2.3 2 3 5 0 7.5395 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2856 1.4216 27.446 6 3 Median NaN NaN 1.0825 1.6089 NaN NaN 1.3296 1.8998 NaN NaN 21.061 6.5689 1 1 2 2 0 1 0 2 Median Median Median Median 2 3.5 6.1 5.9 300420000 124660000 175760000 28792000 14212000 14579000 59749000 21251000 38497000 125000000 61179000 63823000 86879000 28016000 58863000 2622 78;7562;7563;26853 True;False;False;True 89;8599;8600;30753 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AT3G09200.1;AT3G09200.2;AT2G40010.1 12;10;6 12;10;6 4;4;0 AT3G09200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L10 family protein | Chr3:2823364-2825020 REVERSE LENGTH=320;AT3G09200.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L10 family protein 3 12 12 4 11 11 12 11 11 11 12 11 3 4 4 4 51.2 51.2 15.6 34.133 320 320;287;317 2.1 36 45 49 0 269.87 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0277 1.0517 13.31 104 21 Leave out requantified 1.0604 1.24 0.64377 0.79365 1.0179 1.1748 0.7325 0.91266 13.992 13.695 19.783 26.186 28 28 25 23 7 5 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 50.6 50 51.2 42.5 50394000000 26090000000 24304000000 10253000000 5096700000 5156600000 11312000000 4813200000 6498600000 17448000000 10115000000 7333400000 11381000000 6065300000 5315800000 2632 10403;10556;10726;12772;12831;15049;19101;20402;24942;35452;35501;35890 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 11760;11920;12114;14427;14495;14496;17040;21578;22980;28422;28423;40382;40439;40881 56807;56808;56809;56810;56811;56812;56813;56814;56815;57540;57541;57542;57543;57544;57545;57546;57547;57548;57549;57550;57551;58652;58653;58654;58655;58656;58657;58658;58659;58660;58661;58662;58663;58664;58665;58666;58667;69726;69727;69728;69729;69730;69731;70016;70017;70018;70019;70020;70021;70022;70023;70024;70025;70026;70027;70028;70029;70030;83084;83085;83086;83087;83088;83089;83090;83091;83092;83093;83094;83095;83096;105677;105678;105679;105680;105681;105682;112218;112219;112220;112221;137366;137367;137368;137369;137370;137371;137372;137373;137374;137375;137376;137377;137378;137379;137380;137381;193105;193106;193107;193108;193109;193110;193111;193112;193113;193114;193115;193116;193117;193118;193119;193120;193121;193122;193123;193380;193381;193382;193383;193384;193385;193386;193387;193388;193389;193390;195761;195762;195763 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True;True 16252;24229 79373;79374;117731 102397;102398;150776 102397;150776 AT3G10050.1 AT3G10050.1 4 4 4 AT3G10050.1 | Symbols:OMR1 | L-O-methylthreonine resistant 1 | L-O-methylthreonine resistant 1 | Chr3:3099164-3101741 REVERSE LENGTH=592 1 4 4 4 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 10.1 10.1 10.1 64.634 592 592 2.5 2 2 0 10.143 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92984 0.86578 77.58 4 2 Median 0.92984 NaN NaN NaN 0.85236 NaN NaN NaN 10.899 NaN NaN NaN 2 0 1 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 5.2 0 1.7 3.2 138100000 57172000 80930000 53568000 34724000 18844000 0 0 0 59166000 8849600 50316000 25367000 13598000 11770000 2656 7757;15177;25538;34156 True;True;True;True 8810;17180;29194;38932 42944;83855;141112;185792 55022;108105;180103;236675 55022;108105;180103;236675 AT3G10060.1 AT3G10060.1 8 8 8 AT3G10060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | Chr3:3102291-3103801 FORWARD LENGTH=230 1 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 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THALIANA DHFS-FPGS HOMOLOG C,folylpolyglutamate synthetase 2 | DHFS-FPGS homolog C | Chr3:3139588-3143949 REVERSE LENGTH=625 1 4 4 4 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 6.4 6.4 6.4 68.92 625 625 2.2 1 6 3 0 9.1868 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9557 0.93407 14.484 6 2 Leave out requantified NaN 1.2257 1.2823 NaN NaN 1.1419 1.468 NaN NaN 42.894 3.5604 NaN 1 2 2 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 3.2 4.8 3.2 2.7 130180000 63784000 66396000 18742000 8151200 10591000 35355000 16825000 18531000 49958000 25846000 24113000 26125000 12962000 13163000 2660 6053;9968;15739;35797 True;True;True;True 6871;11278;17813;40781 33657;33658;33659;54528;54529;54530;86943;86944;86945;195234 43095;43096;43097;69924;69925;69926;111975;111976;111977;248996 43097;69926;111977;248996 AT3G10230.2;AT3G10230.1 AT3G10230.2;AT3G10230.1 3;3 3;3 3;3 AT3G10230.2 | Symbols:AtLCY,LYC | lycopene cyclase | lycopene cyclase | Chr3:3164340-3165449 REVERSE LENGTH=369;AT3G10230.1 | Symbols:AtLCY,LYC | lycopene cyclase | lycopene cyclase | Chr3:3164340-3165845 REVERSE LENGTH=501 2 3 3 3 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 8.7 8.7 8.7 41.779 369 369;501 2.29 1 3 3 0.00020916 4.2446 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93198 0.9504 28.747 6 4 Median 0.96634 0.78971 NaN NaN 0.9504 0.71191 NaN NaN 15.599 10.231 NaN NaN 2 2 1 1 0 2 1 1 Median Median Median Median 6 6 3 5.7 199240000 106080000 93162000 59307000 29117000 30190000 72313000 41215000 31098000 36792000 19707000 17085000 30833000 16044000 14789000 2661 16748;24400;38887 True;True;True 18932;27601;44250 92241;92242;133389;212296;212297;212298;212299 118225;118226;170477;270778;270779;270780;270781 118225;170477;270778 AT3G10260.1;AT3G10260.2;AT3G10260.3 AT3G10260.1;AT3G10260.2;AT3G10260.3 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT3G10260.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Reticulon family protein | Chr3:3171413-3172508 REVERSE LENGTH=247;AT3G10260.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Reticulon family protein | Chr3:3171413-3172508 3 3 3 3 2 1 1 3 2 1 1 3 2 1 1 3 13.8 13.8 13.8 27.912 247 247;247;267 2.12 3 1 4 0 8.8615 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.0251 1.1022 39.307 8 4 Median 1.285 NaN NaN 0.87839 1.213 NaN NaN 1.0485 9.8308 NaN NaN 45.907 3 1 1 3 2 0 0 2 Median Median Median Plateau 9.3 3.2 3.2 13.8 457300000 239420000 217880000 132470000 62438000 70036000 67290000 28931000 38359000 81797000 45338000 36459000 175740000 102720000 73027000 2662 13997;15755;28364 True;True;True 15817;17829;32449 77080;87031;87032;87033;155962;155963;155964;155965 99547;112073;112074;112075;198788;198789;198790;198791;198792;198793 99547;112075;198791 AT3G10270.1;AT3G10270.2 AT3G10270.1;AT3G10270.2 9;9 9;9 4;4 AT3G10270.1 | Symbols:GYRB1 | DNA GYRASE B1 | DNA gyrase subunit B | Chr3:3173805-3179726 REVERSE LENGTH=730;AT3G10270.2 | Symbols:GYRB1 | DNA GYRASE B1 | DNA gyrase subunit B | Chr3:3173805-3179756 REVERSE LENGTH=740 2 9 9 4 6 7 9 7 6 7 9 7 2 3 4 3 16.2 16.2 7.8 81.047 730 730;740 2 12 12 12 0 35.369 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81126 0.85346 32.096 33 11 Leave out requantified 0.87424 0.92879 0.93187 0.74284 0.81983 0.87941 1.1164 0.81728 18.363 66.446 38.972 43.134 7 7 10 9 2 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.9 12.9 16.2 12.9 2634000000 1361200000 1272800000 412590000 230710000 181880000 539170000 226010000 313170000 795170000 423650000 371520000 887110000 480830000 406280000 2663 8336;8917;15017;18090;19998;25172;30908;32702;33131 True;True;True;True;True;True;True;True;True 9440;10090;17004;20473;22540;28725;35269;37251;37729 45771;45772;45773;45774;45775;49233;49234;49235;49236;49237;49238;49239;82908;99916;99917;99918;99919;110062;110063;110064;110065;138849;168495;168496;168497;168498;177657;177658;177659;177660;177661;177662;179941;179942;179943;179944 58686;58687;58688;58689;58690;58691;58692;63258;63259;63260;63261;63262;63263;63264;63265;106862;128029;128030;128031;128032;128033;128034;141204;141205;141206;141207;177270;214618;214619;214620;214621;214622;214623;214624;226317;226318;226319;226320;226321;226322;229227;229228;229229 58688;63263;106862;128030;141205;177270;214618;226317;229228 AT3G10300.3;AT3G10300.6;AT3G10300.1;AT3G10300.2;AT3G10300.5;AT3G10300.4 AT3G10300.3;AT3G10300.6;AT3G10300.1;AT3G10300.2;AT3G10300.5;AT3G10300.4 2;2;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 AT3G10300.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Calcium-binding EF-hand family protein | Chr3:3186436-3188071 FORWARD LENGTH=335;AT3G10300.6 | Symbols:no symbol available | no full name available | Calcium-binding EF-hand family pro 6 2 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 7.2 2.7 2.7 35.302 335 335;377;232;324;325;334 2.5 1 1 0.0063932 2.1596 By matching By MS/MS By MS/MS 0.81949 0.92662 34.657 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 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available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr3:3208310-3210678 FORWARD LENGTH=411;AT3G10350.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 11 11 10 8 6 10 9 8 6 10 9 8 6 9 8 32.1 32.1 29 44.753 411 411;433 2.08 17 25 22 0 103.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74496 0.83878 11.615 42 23 Leave out requantified 0.7524 1.1835 0.74779 0.62795 0.67893 1.1071 0.90314 0.72565 21.769 44.336 8.9373 19.692 9 8 13 12 4 6 6 7 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 25.3 18 30.4 26.5 3248800000 1727400000 1521400000 767410000 404280000 363130000 361750000 119750000 242000000 1333500000 759500000 573970000 786200000 443880000 342320000 2666 9916;11513;14412;18313;21116;21685;22212;28509;31436;33640;35773 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 11222;13002;16330;20710;23761;24393;24964;32615;32616;35845;38327;40754;40755 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84958 0.96905 22.978 6 2 Median NaN 0.8176 0.84064 NaN NaN 0.75145 1.0066 NaN NaN 5.374 13.065 NaN 1 2 2 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 2.8 5.7 5.7 8.5 253660000 136580000 117070000 32705000 14542000 18163000 80272000 42006000 38266000 100320000 61695000 38620000 40365000 18339000 22025000 2682 5080;11911;12588 True;True;True 5784;13466;14224 28078;28079;28080;28081;65087;68847;68848;68849 36139;36140;36141;36142;36143;36144;36145;83737;88511;88512;88513 36143;83737;88511 1216 58 AT3G10980.1 AT3G10980.1 2 2 2 AT3G10980.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PLAC8 family protein | Chr3:3438810-3440501 FORWARD LENGTH=563 1 2 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 5 5 5 63.233 563 563 2.67 1 2 0 4.8186 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.5 0 2.5 0 3017500 3017500 0 0 0 0 0 0 0 3017500 3017500 0 0 0 0 2683 7195;31577 True;True 8180;35996 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Median 7.7 8.1 6 7.9 4678400000 4477300000 201130000 1592700000 1544400000 48261000 1733000000 1680700000 52255000 751590000 710100000 41496000 601150000 542040000 59116000 2685 15170;24209;27410;30527;31035;35552 True;False;True;True;True;True 17173;27298;31370;34852;35409;40501 83822;83823;83824;83825;131746;151194;151195;166644;166645;166646;166647;166648;169002;193708;193709;193710 108070;108071;108072;108073;168383;192653;192654;212272;212273;212274;212275;215194;247003;247004;247005 108073;168383;192654;212275;215194;247003 2589 492 AT3G11130.1 AT3G11130.1 63 12 12 AT3G11130.1 | Symbols:AtCHC1,CHC1 | clathrin heavy chain 1 | Clathrin%2C heavy chain | Chr3:3482575-3491667 REVERSE LENGTH=1705 1 63 12 12 55 52 57 54 12 11 12 10 12 11 12 10 41.3 7.2 7.2 193.24 1705 1705 2.04 22 26 25 0 107.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86705 0.95374 17.476 68 10 Leave out requantified 1.139 1.2082 0.66775 0.71686 1.0881 1.1636 0.78378 0.8338 63.065 13.959 11.248 24.743 17 16 18 17 3 2 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.1 34.3 38.1 34.9 11772000000 6196900000 5575400000 3086400000 1377300000 1709100000 2451700000 1123700000 1328100000 3658000000 2158900000 1499200000 2576200000 1537100000 1039200000 2686 37;591;1167;1417;3008;3079;3704;5725;5923;6314;7257;7556;8342;9798;9836;10183;10517;11721;11806;13786;14321;14333;14545;15684;16138;16139;17096;18010;20338;21112;21384;22482;22779;23760;23761;23829;24080;25262;25775;26712;27420;27730;28189;29158;29514;30041;30042;30476;30598;31904;34043;34616;34639;34932;35016;36324;36325;36530;36617;37253;38732;38736;38807 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2738 | GTP-binding family protein | Chr3:3847851-3851980 FORWARD LENGTH=663;AT3G12080.2 | Symbols:EngA-1,emb2738 | embryo defective 2738 | GTP-binding family protein | Chr3:3847851-3851677 FORWARD 2 5 5 5 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 8.1 8.1 8.1 73.125 663 663;587 2.11 3 2 4 0 17.098 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94969 0.97304 33.535 8 2 Leave out requantified 0.74423 0.77656 1.2294 0.8892 0.71543 0.7024 1.4186 0.98226 40.329 3.7727 1.4191 3.7657 2 2 2 2 0 1 0 1 Median Median Median Median 3.3 5.3 2.7 2.3 553190000 287970000 265220000 119250000 67187000 52059000 145550000 74089000 71466000 193030000 94821000 98212000 95360000 51875000 43485000 2715 7127;21004;31072;32025;32879 True;True;True;True;True 8107;23637;35449;36490;37454 39806;114970;114971;114972;169167;173978;173979;173980;178661 50859;50860;147323;147324;215413;221609;221610;221611;221612;221613;227594 50860;147324;215413;221611;227594 2614 443 AT3G12110.1;AT2G42170.4;AT2G42170.2;AT2G42170.3;AT2G42170.1 AT3G12110.1 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35963;271036 AT3G12130.1 AT3G12130.1 2 2 2 AT3G12130.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | KH domain-containing protein / zinc finger (CCCH type) family protein | Chr3:3864486-3866406 REVERSE LENGTH=248 1 2 2 2 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 12.5 12.5 12.5 25.952 248 248 1.5 1 1 0.00020969 4.276 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 6.5 0 6 16832000 16832000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16832000 16832000 0 2718 14654;29812 True;True 16598;34052 81027;163325 104485;208125 104485;208125 1227 2617 17 28 AT3G12140.1;AT3G12140.2;AT3G12140.3 AT3G12140.1;AT3G12140.2;AT3G12140.3 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G12140.1 | Symbols:EML1,AtEML1 | EMSY-like 1 | Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein | Chr3:3868947-3870964 REVERSE LENGTH=327;AT3G12140.2 | Symbols:EML1,AtEML1 | EMSY-like 1 | Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like doma 3 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 5.5 5.5 5.5 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TGACG motif-binding factor 6 | TGACG motif-binding factor 6 | Chr3:3906636-3908583 FORWARD LENGTH=303;AT3G12250.3 | Symbols:BZIP45,TGA6 | TGACG motif-binding factor 6 | TGACG motif-binding factor 6 | Chr3:3906573-390 15 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 7.3 7.3 7.3 33.963 303 303;324;330;330;330;330;330;330;330;330;330;355;310;330;330 1.67 1 2 0.00059067 3.3206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76975 0.90744 24.035 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 4 3.3 3.3 161400000 83008000 78391000 0 0 0 0 0 0 73867000 40136000 33732000 87531000 42872000 44660000 2721 21851;23331 True;True 24568;26207 119197;126779;126780 152596;162205;162206 152596;162206 2619 182 AT3G12260.1 AT3G12260.1 6 6 6 AT3G12260.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | LYR family of Fe/S cluster biogenesis protein | Chr3:3909252-3910337 REVERSE LENGTH=133 1 6 6 6 4 4 5 6 4 4 5 6 4 4 5 6 39.8 39.8 39.8 15.082 133 133 2.21 5 9 10 0 23.806 By 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Symbols:ATRBR1,RBR1,RB1,RB,RBR | RETINOBLASTOMA-RELATED,RETINOBLASTOMA 1,RETINOBLASTOMA-RELATED PROTEIN 1,retinoblastoma-related 1 | retinoblastoma-related 1 | Chr3:3913671-3918433 REVERSE LENGTH=1012;AT3G12280.1 | Symbols:ATRBR1,RBR1,RB1, 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1.8 1.8 1.8 112.09 1012 1012;1013 2.4 1 1 3 0.0013372 2.9491 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91004 0.94803 37.91 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 0.8 0.8 0.8 42338000 25563000 16775000 9251200 4626500 4624700 6816500 3665300 3151200 17232000 11175000 6057900 9037900 6096900 2940900 2723 22417;32562 True;True 25221;37094 122211;122212;122213;122214;176785 156544;156545;156546;156547;156548;156549;156550;225149 156550;225149 AT3G12290.1 AT3G12290.1 12 12 12 AT3G12290.1 | Symbols:MTHFD1 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | Amino acid dehydrogenase family protein | Chr3:3919591-3921326 FORWARD 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Chr3:3944078-3945796 REVERSE LENGTH=396;AT3G12400.1 | Symbols:ELC,ATELC,Vps23A | Vacuolar protein sorting 23A | Ubiquitin-conjugating 3 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 3 3 3 44.48 396 396;398;440 1.33 2 1 0.0029548 2.5241 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97822 0.88451 83.828 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 3 3 3 0 88928000 56997000 31930000 17508000 7764800 9743500 36912000 21284000 15629000 34507000 27949000 6558200 0 0 0 2727 14500 True 16430 80300;80301;80302 103604;103605;103606 103606 AT3G12480.1 AT3G12480.1 3 3 3 AT3G12480.1 | Symbols:NF-YC11 | nuclear factor Y, subunit C11 | nuclear factor Y%2C subunit C11 | Chr3:3958065-3960278 FORWARD LENGTH=293 1 3 3 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 8.9 8.9 8.9 32.291 293 293 1.86 3 2 2 0.00040494 3.7329 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81137 0.86357 81.369 7 1 Leave out requantified 1.0418 NaN 0.75316 0.35679 0.98434 NaN 0.83243 0.38916 6.5333 NaN 6.7823 85.79 2 1 2 2 1 0 0 0 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Leave out requantified Leave out requantified 51.3 51.3 51.3 51.3 6831200000 3129200000 3702000000 1955000000 1049800000 905200000 1877800000 665820000 1212000000 1547800000 740560000 807250000 1450500000 673010000 777520000 2729 2441;9221;9424;10373;10728;10729;16045 True;True;True;True;True;True;True 2749;10433;10680;11729;12116;12117;18160 13532;13533;13534;13535;13536;50737;50738;50739;50740;51785;51786;51787;51788;51789;51790;56623;56624;56625;56626;56627;56628;56629;58669;58670;58671;58672;58673;58674;58675;58676;58677;88610;88611;88612;88613;88614 17508;17509;17510;17511;17512;65172;65173;65174;65175;65176;65177;66471;66472;66473;66474;66475;66476;66477;66478;66479;72607;72608;72609;72610;72611;72612;72613;75350;75351;75352;75353;75354;75355;75356;75357;75358;113850;113851;113852;113853;113854 17508;65172;66477;72613;75352;75355;113850 AT3G12500.1 AT3G12500.1 10 10 9 AT3G12500.1 | Symbols:HCHIB,PR-3,B-CHI,ATHCHIB,PR3,CHI-B | PATHOGENESIS-RELATED 3,basic chitinase | basic chitinase | Chr3:3962501-3963984 REVERSE LENGTH=335 1 10 10 9 5 8 7 7 5 8 7 7 5 8 7 7 51.6 51.6 47.8 36.183 335 335 1.98 15 17 14 0 300.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0776 1.1127 91.206 36 15 Leave out requantified 7.8951 4.0279 0.29261 0.24988 7.1403 3.8478 0.34218 0.27201 27.292 17.038 22.628 12.63 5 9 11 11 4 0 5 6 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26 41.2 33.1 35.5 5695400000 3099200000 2596100000 548320000 48838000 499480000 1635900000 321240000 1314700000 1699100000 1287800000 411380000 1812000000 1441400000 370550000 2730 1722;13198;14475;22564;24613;25056;26744;27003;29165;38306 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1956;14902;14903;16402;25378;28581;30638;30916;33346;43599 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defective 2742 | CTP synthase family protein | Chr3:4020351-4024086 REVERSE LENGTH=591 1 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 3.6 3.6 3.6 64.303 591 591 2 1 1 1 0 5.2299 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7068 0.71936 0.70255 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.2 2.4 0 2.4 143350000 80352000 63002000 0 0 0 71548000 33265000 38284000 0 0 0 71806000 47088000 24718000 2735 473;12426 True;True 535;14040 2766;67939;67940 3618;87374;87375;87376 3618;87376 AT3G12700.1;AT3G12700.3;AT3G12700.2 AT3G12700.1 6;2;2 6;2;2 6;2;2 AT3G12700.1 | Symbols:NANA | NANA | Eukaryotic aspartyl protease family protein | Chr3:4037136-4039043 FORWARD LENGTH=461 3 6 6 6 1 3 4 2 1 3 4 2 1 3 4 2 14.3 14.3 14.3 50.567 461 461;238;263 2 4 5 4 0 15.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0335 1.1486 47.581 7 4 Median NaN NaN 0.51152 1.2231 NaN NaN 0.61295 1.442 NaN NaN 43.79 34.072 1 1 3 2 0 0 3 1 Median Median Median Median 2 5.9 10.4 4.8 367760000 166810000 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2737 25987;31009;31781 True;True;True 29750;35381;36223 143795;143796;168901;168902;168903;168904;172693;172694;172695 183360;183361;215073;215074;215075;215076;215077;219957;219958;219959 183361;215074;219958 AT3G12760.1 AT3G12760.1 1 1 1 AT3G12760.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | defective in cullin neddylation protein | Chr3:4054963-4056826 FORWARD LENGTH=250 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 6.8 6.8 6.8 29.01 250 250 2 1 0 7.5264 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 6.8 0 30963000 26816000 4146300 0 0 0 0 0 0 30963000 26816000 4146300 0 0 0 2738 26964 True 30873 148882 189673 189673 AT3G12780.1 AT3G12780.1 36 36 20 AT3G12780.1 | Symbols:PGK1 | phosphoglycerate kinase 1 | phosphoglycerate kinase 1 | Chr3:4061127-4063140 REVERSE LENGTH=481 1 36 36 20 35 35 32 33 35 35 32 33 19 19 19 19 79.4 79.4 49.1 50.111 481 481 2.1 200 247 270 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By 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available | Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein | Chr3:4184777-4186795 FORWARD LENGTH=403;AT3G13062.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Poly 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 45.31 403 403;440 1.67 3 2 1 0.0098855 1.9519 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5975 1.4762 219.09 6 6 Median NaN 1.7539 1.4767 NaN NaN 1.5968 1.775 NaN NaN 268.57 278.14 NaN 1 2 2 1 1 2 2 1 Median Median Median Median 2 2 2 2 267060000 156580000 110480000 40932000 4502500 36430000 69158000 37873000 31285000 96360000 58662000 37698000 60610000 55538000 5071200 2744 26690 True 30580 147617;147618;147619;147620;147621;147622 188115;188116;188117;188118;188119;188120 188120 AT3G13080.2;AT3G13080.5;AT3G13080.1;AT3G13080.4;AT3G13080.3;AT3G13100.2;AT3G13090.1;AT1G04120.3;AT3G13100.1;AT1G04120.2;AT1G04120.1;AT3G60970.1;AT3G60160.3;AT3G60160.1 AT3G13080.2;AT3G13080.5;AT3G13080.1;AT3G13080.4;AT3G13080.3 11;11;11;8;8;2;2;2;2;2;2;1;1;1 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4723;5056;15440;18588;31215;31460;32537;34578;35279;37551;39537 23154;23155;23156;24561;75221;75222;90830;150481;151584;156465;156466;165443;168520;179108;189098 30012;30013;30014;31723;97124;97125;116482;191745;193193;199415;199416;210760;214649;228169;228170;241085 30014;31723;97125;116482;191745;193193;199416;210760;214649;228170;241085 2638 296 AT3G13110.1;AT1G55920.1 AT3G13110.1 3;1 3;1 3;1 AT3G13110.1 | Symbols:SAT-M,SAT-A,SAT3,SERAT2;2,ATSERAT2;2,SAT-1 | SERINE ACETYLTRANSFERASE-MITOCHONDRIAL,serine acetyltransferase 2;2,SERINE ACETYLTRANSFERASE A,SERINE ACETYLTRANSFERASE-1,SERINE ACETYLTRANSFERASE 3 | serine acetyltransferase 2%3B2 | Chr 2 3 3 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 7.4 7.4 7.4 42.72 391 391;314 2 2 3 2 0 8.7856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54892 0.62005 49.747 6 0 Leave out requantified NaN NaN 0.53547 0.54892 NaN NaN 0.59955 0.62005 NaN NaN 22.526 49.747 1 1 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 7.4 255460000 151290000 104160000 24428000 9861800 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available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:4227975-4229630 REVERSE LENGTH=551 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 3.1 3.1 3.1 60.629 551 551 1.5 2 2 0 11.471 By MS/MS By MS/MS 0.80115 0.7914 53.27 3 3 Median NaN 1.1887 NaN NaN NaN 1.1125 NaN NaN NaN 48.157 NaN NaN 0 2 1 0 0 2 1 0 Median Median Median Median 0 3.1 3.1 0 63757000 30935000 32821000 0 0 0 43831000 15516000 28315000 19926000 15420000 4506000 0 0 0 2748 3273 True 3744 18378;18379;18380;18381 23710;23711;23712;23713 23711 AT3G13160.1 AT3G13160.1 8 8 8 AT3G13160.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:4229994-4231178 REVERSE LENGTH=394 1 8 8 8 2 4 7 4 2 4 7 4 2 4 7 4 25.9 25.9 25.9 44.927 394 394 2.08 8 7 10 0 80.992 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86265 1.0223 30.553 17 11 Leave out requantified 1.4172 1.5608 0.6647 0.73896 1.3731 1.4656 0.81046 0.83167 60.375 28.718 24.026 41.936 2 3 8 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Symbols:ATBFRUCT1,CWI1,AtCWI1,ATCWINV1 | ARABIDOPSIS THALIANA CELL WALL INVERTASE 1 | Glycosyl hydrolases family 32 protein | Chr3:4533084-4535831 REVERSE LENGTH=584;AT3G13790.2 | Symbols:ATBFRUCT1,CWI1,AtCWI1,ATCWINV1 | ARABIDOPSIS THALIA 6 18 18 16 12 14 14 14 12 14 14 14 10 12 13 13 33.6 33.6 29.5 66.28 584 584;581;514;514;514;572 1.93 24 29 19 0 119.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1235 1.1641 38.418 52 14 Leave out requantified 2.1899 1.804 0.71089 0.52682 2.1072 1.718 0.84604 0.60151 20.932 15.247 25.042 21.305 11 12 14 15 3 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.2 30.5 27.7 26.9 7018000000 3541000000 3477000000 1287300000 414220000 873120000 1607200000 520160000 1087100000 2149000000 1270200000 878740000 1974500000 1336400000 638110000 2768 748;2222;5713;6321;11221;12222;13831;15662;17990;26166;26582;29371;30474;30560;30561;32399;32530;39488 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By MS/MS By MS/MS 0.85351 0.97046 184.75 10 7 Median 0.39366 0.4753 2.9352 0.85452 0.36851 0.42888 3.3736 0.97505 216.3 162.77 176.88 214.42 2 3 2 3 2 2 1 2 Median Median Median Median 6.8 15.3 6.8 6.8 2741400000 1622900000 1118500000 380400000 304310000 76092000 666890000 567160000 99728000 680190000 200020000 480170000 1013900000 551430000 462490000 2811 3320;5783;12434;33981 True;True;True;True 3796;6561;14051;38727 18567;32169;32170;32171;32172;32173;32174;68008;68009;68010;68011;184744 23921;41238;41239;41240;41241;41242;41243;41244;87461;87462;87463;87464;235324 23921;41242;87461;235324 AT3G15352.1;AT3G15352.2;AT3G15352.3;AT3G15352.4 AT3G15352.1;AT3G15352.2;AT3G15352.3;AT3G15352.4 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT3G15352.1 | Symbols:ATCOX17,COX17 | cytochrome c oxidase 17,ARABIDOPSIS THALIANA CYTOCHROME C OXIDASE 17 | cytochrome c oxidase 17 | Chr3:5180266-5180490 FORWARD LENGTH=74;AT3G15352.2 | Symbols:ATCOX17,COX17 | cytochrome c oxidase 17,ARABIDOPSIS THALI 4 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 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11481;11482;11483;11484;35904;35905;35906;35907;35908;35909;35910;35911;35912;35913;35914;35915;35916;35917;35918;35919;35920;35921;49849;49850;49851;49852;49853;49854;49855;49856;49857;82266;82267;82268;111540;111541;111542;111543;111544;185590;185591;185592;185593;185594;185595;185596;185597;185598;185599;185600;185601;185602;185603;185604;185605;185606;185607;185608;185609;185610;204291;204292;204293;204294;251706;251707;251708;251709;251710;251711;251712;251713;251714;251715;251716;251717;251718;251719;251720;251721;251722;251723;251724;251725;251726;251727 11482;35917;49853;82267;111543;185609;204293;251709 1281;1282;2868 2707;2708;2709 216;245;246 55;247;255 AT3G15360.1 AT3G15360.1 6 6 6 AT3G15360.1 | Symbols:ATM4,TRX-M4,ATHM4 | ARABIDOPSIS THIOREDOXIN M-TYPE 4,thioredoxin M-type 4 | thioredoxin M-type 4 | Chr3:5188448-5189457 FORWARD LENGTH=193 1 6 6 6 6 6 5 5 6 6 5 5 6 6 5 5 32.6 32.6 32.6 21.172 193 193 2.11 13 14 18 0 17.737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88672 0.91747 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Median Median 0 2.4 2.4 2.4 154890000 87337000 67548000 0 0 0 59615000 36598000 23017000 52027000 29047000 22980000 43243000 21693000 21550000 2815 23062 True 25910 125321;125322;125323 160408;160409;160410 160410 AT3G15450.1;AT3G15450.3;AT3G15450.2 AT3G15450.1;AT3G15450.3;AT3G15450.2 4;2;2 4;2;2 4;2;2 AT3G15450.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs | Chr3:5213050-5213998 FORWARD LENGTH=253;AT3G15450.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | aluminum induced protei 3 4 4 4 2 1 3 3 2 1 3 3 2 1 3 3 22.5 22.5 22.5 27.7 253 253;186;208 2.3 1 5 4 0 11.021 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3335 1.4921 130.08 6 2 Median NaN NaN 3.2193 1.3335 NaN NaN 3.7526 1.4921 NaN NaN 42.211 65.717 1 1 2 2 1 0 0 1 Median Median Median Median 14.6 7.5 17.4 15 459660000 190150000 269510000 71386000 57886000 13500000 95824000 63798000 32026000 223960000 41954000 182010000 68486000 26508000 41978000 2816 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requantified Leave out requantified 29.4 31.3 27.7 30.5 12473000000 6780900000 5692000000 2483900000 1415300000 1068600000 2585400000 1250100000 1335300000 4161300000 2441800000 1719500000 3242300000 1673700000 1568500000 2817 645;646;1797;5559;5716;13341;14695;15050;17147;17276;17277;19557;21469;22497;23040;23730;34559 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 725;726;2045;2046;6315;6486;15065;16644;17041;19385;19540;19541;22067;22068;24162;25309;25888;26650;39370 3717;3718;3719;3720;3721;10167;10168;10169;10170;10171;30805;30806;30807;30808;30809;30810;30811;30812;31661;31662;72861;72862;72863;81234;81235;81236;81237;81238;83097;83098;83099;94750;94751;94752;94753;94754;95522;95523;95524;95525;95526;95527;95528;95529;95530;107900;107901;107902;107903;107904;107905;107906;107907;107908;117371;117372;117373;117374;117375;117376;122626;122627;122628;122629;125241;125242;125243;125244;129028;129029;129030;129031;129032;129033;129034;129035;129036;129037;129038;188036 4879;4880;4881;4882;4883;4884;4885;4886;4887;13230;13231;13232;13233;13234;39556;39557;39558;39559;39560;39561;39562;39563;39564;40567;40568;93732;93733;93734;104750;104751;104752;104753;104754;104755;107099;107100;107101;107102;121573;121574;121575;121576;121577;121578;121579;122609;122610;122611;122612;122613;122614;122615;122616;122617;122618;138438;138439;138440;138441;138442;138443;138444;138445;138446;138447;138448;138449;150323;150324;150325;150326;150327;157057;157058;157059;157060;157061;160315;160316;160317;160318;165095;165096;165097;165098;165099;165100;165101;165102;165103;165104;165105;165106;165107;165108;165109;239577 4882;4887;13234;39563;40567;93734;104750;107100;121578;122613;122618;138448;150327;157061;160318;165108;239577 2712;2713 141;166 AT3G15610.1 AT3G15610.1 7 3 3 AT3G15610.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr3:5291076-5292796 REVERSE LENGTH=341 1 7 3 3 5 4 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 25.2 10.3 10.3 37.355 341 341 2 2 2 0 5.5713 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 16.7 13.8 8.5 6.5 31053000 21284000 9769300 0 0 0 0 0 0 31053000 21284000 9769300 0 0 0 2818 490;12296;18497;20880;30575;31669;38793 True;False;True;True;False;False;False 553;13895;20920;23497;34905;36098;36099;44146 2839;2840;67202;67203;102351;114380;166878;172084;172085;211727;211728;211729;211730 3709;3710;86413;86414;131170;146591;212565;219191;219192;270079;270080;270081;270082 3710;86413;131170;146591;212565;219191;270081 902 226 AT3G15660.2;AT3G15660.1 AT3G15660.2;AT3G15660.1 5;5 5;5 5;5 AT3G15660.2 | Symbols:GRXS15,ATGRX4,GRX4 | glutaredoxin S15,A. THALIANA GLUTAREDOXIN 4,glutaredoxin 4 | glutaredoxin 4 | Chr3:5308134-5309383 REVERSE LENGTH=169;AT3G15660.1 | Symbols:GRXS15,ATGRX4,GRX4 | glutaredoxin S15,A. THALIANA GLUTAREDOXIN 4,gluta 2 5 5 5 3 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 32.5 32.5 32.5 18.734 169 169;169 1.75 4 7 1 0 14.37 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0783 1.1011 120.86 10 9 Median 1.6229 1.9105 0.64623 0.55019 1.5466 1.7769 0.77413 0.62352 208.86 22.062 57.641 34.805 3 2 3 2 3 2 2 2 Median Median Median Median 20.1 16.6 27.2 20.1 915590000 453710000 461880000 247480000 83320000 164160000 171760000 56771000 114990000 234440000 135910000 98536000 261900000 177710000 84194000 2819 6230;15256;21729;25534;36270 True;True;True;True;True 7102;17272;24439;29190;41312 34735;34736;84322;84323;84324;84325;118649;118650;118651;141094;197885;197886 44492;44493;108733;108734;108735;108736;151946;151947;151948;180077;252462;252463 44492;108734;151947;180077;252462 2714;2715 79;82 AT3G15670.1 AT3G15670.1 1 1 1 AT3G15670.1 | Symbols:LEA76 | Late Embryogenesis Accumulating 76 | Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein | Chr3:5310141-5310901 REVERSE LENGTH=225 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 4.9 4.9 4.9 24.186 225 225 2 1 0 6.4229 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 4.9 0 7319800 0 7319800 0 0 0 0 0 0 7319800 0 7319800 0 0 0 2820 33765 True 38471 183469 233672 233672 AT3G15690.2 AT3G15690.2 2 2 2 AT3G15690.2 | Symbols:BLP2 | BCCP-Like Protein 2 | Single hybrid motif superfamily protein | Chr3:5317108-5319435 FORWARD LENGTH=263 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 9.9 9.9 9.9 28.169 263 263 1.83 2 3 1 0 16.636 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.151 1.0938 48.425 5 2 Median NaN 1.0554 NaN NaN NaN 1.0066 NaN NaN NaN 11.748 NaN NaN 1 2 1 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 9.9 9.9 8.7 9.9 259710000 123100000 136610000 57057000 36427000 20630000 133260000 54401000 78859000 44332000 18234000 26099000 25062000 14037000 11024000 2821 7718;17450 True;True 8768;19739 42753;42754;42755;96379;96380;96381 54788;54789;54790;123644;123645;123646;123647 54790;123644 AT3G15710.1 AT3G15710.1 2 2 2 AT3G15710.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein | Chr3:5323564-5324785 REVERSE LENGTH=180 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 10 10 10 19.846 180 180 2.17 1 3 2 0 4.7312 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.56222 0.64637 94.975 5 1 Median NaN NaN NaN 0.31487 NaN NaN NaN 0.36559 NaN NaN NaN 80.592 1 1 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 3.9 3.9 10 10 349810000 211890000 137920000 53422000 17745000 35677000 56396000 22012000 34383000 65790000 48371000 17420000 174210000 123770000 50440000 2822 12745;13104 True;True 14397;14800 69585;69586;69587;69588;71405;71406 89383;89384;91732;91733 89383;91733 AT3G15730.1 AT3G15730.1 28 28 23 AT3G15730.1 | Symbols:PLD,PLDALPHA1 | phospholipase D alpha 1 | phospholipase D alpha 1 | Chr3:5330835-5333474 FORWARD LENGTH=810 1 28 28 23 23 23 23 24 23 23 23 24 20 19 19 19 42.2 42.2 35.6 91.847 810 810 2.05 60 67 69 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0403 1.0689 25.766 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AT3G16230.13;AT3G16230.9;AT3G16230.7;AT3G16230.6;AT3G16230.4;AT3G16230.8;AT3G16230.5;AT3G16230.11;AT3G16230.3;AT3G16230.12;AT3G16230.2;AT3G16230.10;AT3G16230.1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT3G16230.13 | Symbols:no symbol available | no full name available | Putative eukaryotic LigT | Chr3:5501489-5503303 FORWARD LENGTH=325;AT3G16230.9 | Symbols:no symbol available | no full name available | Putative eukaryotic LigT | Chr3:5500563-550275 13 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.3 4.3 4.3 36.457 325 325;372;372;372;372;379;379;379;409;409;449;449;449 1.8 2 2 1 0.0039913 2.3358 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73541 0.74955 56.238 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 4.3 4.3 4.3 4.3 224760000 115930000 108830000 39583000 25628000 13955000 41244000 18174000 23070000 82833000 28215000 54618000 61098000 43914000 17184000 2839 36398 True 41451 198466;198467;198468;198469;198470 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11239;11240;11241;11242;11243;11244;11245;11246;11247;11248;11249;11250;11251;11252;11253;11254;11255;11256;11257;11258;11259;11260;11261;11262;11263;11264;11265;11266;11267 11258 AT3G16250.1 AT3G16250.1 2 2 2 AT3G16250.1 | Symbols:NDF4,PnsB3 | Photosynthetic NDH subcomplex B 3,NDH-dependent cyclic electron flow 1 | NDH-dependent cyclic electron flow 1 | Chr3:5507091-5508320 REVERSE LENGTH=204 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 18.1 18.1 18.1 22.418 204 204 1.67 2 4 0 5.5086 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62273 0.72145 29.437 6 5 Median NaN NaN 0.57473 NaN NaN NaN 0.69951 NaN NaN NaN 10.041 NaN 1 1 3 1 1 1 3 0 Median Median Median Median 5.9 12.3 18.1 12.3 261800000 141920000 119870000 43421000 25929000 17492000 34741000 9676000 25065000 141560000 85669000 55889000 42075000 20650000 21425000 2841 19989;25576 True;True 22530;29242 110032;110033;110034;110035;141389;141390 141170;141171;141172;141173;141174;180449;180450 141171;180449 AT3G16270.3;AT3G16270.2;AT3G16270.1 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end (MPPN) family protein | Chr3:5526593-5528106 REVERSE LENGTH=329 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.8 5.8 5.8 35.43 329 329 1.75 2 1 1 0 30.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87086 0.87081 2.5996 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 5.8 5.8 5.8 5.8 55695000 34252000 21443000 0 0 0 17048000 9520300 7527800 21970000 15523000 6446400 16677000 9208800 7468500 2844 28662 True 32798 157638;157639;157640;157641 200819;200820;200821;200822 200819 AT3G16370.1 AT3G16370.1 11 11 11 AT3G16370.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | Chr3:5556928-5558351 FORWARD LENGTH=353 1 11 11 11 7 9 8 8 7 9 8 8 7 9 8 8 37.4 37.4 37.4 38.199 353 353 1.92 14 15 11 0 81.724 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0389 1.1283 37.103 34 9 Leave out requantified 1.1268 0.85395 0.87535 1.4873 1.03 0.7789 1.084 1.6748 16.632 27.728 32.567 21.76 6 10 10 8 2 3 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.6 27.8 27.8 29.7 4278100000 1969400000 2308700000 848880000 383840000 465040000 1229300000 568950000 660340000 1068800000 604910000 463920000 1131100000 411740000 719370000 2845 244;771;12624;16982;20300;22483;22484;25783;29291;33022;39107 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 272;862;14265;19194;22874;25294;25295;29468;33482;37605;44507 1344;1345;1346;4436;68999;69000;69001;69002;69003;69004;69005;93695;93696;93697;111738;111739;111740;111741;111742;111743;122535;122536;122537;122538;122539;122540;122541;142340;160674;160675;160676;160677;179327;179328;179329;179330;213536;213537;213538;213539 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Symbols:ATKINESIN-13A,KINESIN-13A | | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr3:5662660-5667261 REVERSE LENGTH=794;AT3G16630.1 | Symbols:ATKINESIN-13A,KINESIN-13A | | P-loop containing nucleoside tri 2 3 2 2 1 2 2 3 1 1 2 2 1 1 2 2 4.4 2.8 2.8 89.081 794 794;794 2 3 1 3 0.00041597 4.164 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5821 1.6138 56.962 5 3 Median NaN NaN NaN 2.3092 NaN NaN NaN 2.4104 NaN NaN NaN 56.739 1 1 1 2 0 0 1 2 Median Median Median Median 1.3 2.9 2.8 4.4 103260000 43525000 59739000 18742000 9269800 9472200 19549000 10678000 8870500 22519000 10030000 12489000 42454000 13547000 28907000 2859 2070;3340;25946 True;False;True 2344;3819;29692 11587;11588;11589;18682;18683;143505;143506;143507;143508 15032;15033;15034;24084;24085;182971;182972;182973;182974 15032;24084;182972 AT3G16640.1 AT3G16640.1 11 11 11 AT3G16640.1 | Symbols:AtTCTP2,TCTP | translationally controlled tumor protein | translationally controlled tumor protein | 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Chr3:5676904-5677788 FORWARD LENGTH=180;AT3G16660.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pollen Ole e 1 allerg 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.8 12.8 12.8 17.857 180 180;211 2.33 1 2 3 0 74.809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.27962 0.34714 45.978 5 5 Median NaN NaN 0.27962 NaN NaN NaN 0.34714 NaN NaN NaN 4.8142 NaN 1 0 3 1 1 0 3 1 Median Median Median Median 12.8 12.8 12.8 12.8 856580000 646840000 209730000 196900000 108810000 88089000 20347000 0 20347000 503510000 417780000 85726000 135830000 120260000 15572000 2861 37650 True 42872 205556;205557;205558;205559;205560;205561 262121;262122;262123;262124;262125;262126 262123 AT3G16670.1 AT3G16670.1 1 1 1 AT3G16670.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein | Chr3:5681500-5682111 FORWARD LENGTH=154 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 15.875 154 154 2.14 2 2 3 0.0022321 2.6181 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86763 0.85856 169.08 7 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THALIANA HEAT STABLE PROTEIN 1 | heat 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 11.9 11.9 11.9 12.184 109 109;109 2 1 0.0013392 2.9769 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 11.9 0 116670000 57887000 58778000 0 0 0 0 0 0 116670000 57887000 58778000 0 0 0 2875 36359 True 41409 198271 252920 252920 AT3G17240.1;AT3G17240.3;AT3G17240.2 AT3G17240.1;AT3G17240.3 23;23;2 13;13;1 13;13;1 AT3G17240.1 | Symbols:mtLPD2 | lipoamide dehydrogenase 2 | lipoamide dehydrogenase 2 | Chr3:5890278-5892166 REVERSE LENGTH=507;AT3G17240.3 | Symbols:mtLPD2 | lipoamide dehydrogenase 2 | lipoamide dehydrogenase 2 | Chr3:5890278-5892166 REVERSE LENGTH=50 3 23 13 13 19 21 19 18 10 12 9 9 10 12 9 9 46.5 27.6 27.6 53.985 507 507;507;127 2.05 26 28 30 0 160.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7492 0.77771 42.739 71 29 Leave out requantified 1.2674 1.8231 0.44542 0.38925 1.2034 1.7222 0.51354 0.43562 38.526 10.977 15.237 40.122 21 16 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Symbols:PYD1 | pyrimidine 1 | pyrimidine 1 | Chr3:6094279-6096289 FORWARD LENGTH=426 1 11 11 11 5 6 10 7 5 6 10 7 5 6 10 7 35.4 35.4 35.4 46.846 426 426 2.19 5 15 11 0 34.311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.42276 0.47915 43.989 27 13 Leave out requantified 1.685 1.8062 0.3209 0.47757 1.5292 1.7572 0.39376 0.53993 34.147 54.605 17.935 30.539 5 4 11 7 3 2 6 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 17.6 17.6 32.6 23.7 2424100000 1549200000 874910000 273880000 102330000 171540000 294690000 124830000 169860000 1405100000 1034200000 370830000 450490000 287820000 162680000 2885 3597;17376;24612;24733;28699;28885;32141;32950;33168;34206;35134 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4110;19658;27926;28115;28116;32836;33036;36623;37530;37770;38986;40013 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40252;40253;40254;40255;40256;40257;40258;40259;40260;40261;40262;40263;40264;40265;40266;60239;60240;60241;60242;60243;60244;102330;102331;118550;118551;118552;118553;120494;135033;135034;135035;135036;135037;135038;135039;135040;135041;135042;135043;135044;176697;176698;176699;176700;176701;176702;176703;176704;188140;188141;188142;209552;209553;209554;209555;209556;229280;229281;229282;229283;229284;229285;229286;229287;229288;229289;229290;229291;229292;229293;229294;229295;229296;264509;264510;264511 40253;60244;102330;102331;118550;120494;135034;176702;176704;188141;209552;229288;229294;264510 1305 2756;2757 244 31;91 AT3G17840.1 AT3G17840.1 8 8 7 AT3G17840.1 | Symbols:RLK902 | receptor-like kinase 902 | receptor-like kinase 902 | Chr3:6106092-6108430 FORWARD LENGTH=647 1 8 8 7 4 4 5 3 4 4 5 3 3 4 4 3 13.3 13.3 11.9 70.405 647 647 2.06 5 5 6 0 14.233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0429 1.0956 17.697 13 4 Leave out requantified 0.968 1.0888 0.92142 0.96558 0.96376 1.0354 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838;838 2 2 0.00039976 3.5628 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 3.1 1.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2889 12719;24988 True;True 14369;28486 69469;137739 89256;175861 89256;175861 1306 536 AT3G17910.1 AT3G17910.1 2 2 2 AT3G17910.1 | Symbols:SURF1,EMB3121 | EMBRYO DEFECTIVE 3121,SURFEIT 1 | Surfeit locus 1 cytochrome c oxidase biogenesis protein | Chr3:6133581-6136053 FORWARD LENGTH=354 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 4.8 4.8 4.8 39.921 354 354 2.2 1 2 2 0.0018804 2.7512 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1159 1.1775 30.423 4 4 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 1 1 Median Median Median Median 2.3 4.8 2.5 2.3 91154000 43423000 47731000 18610000 7015700 11594000 21879000 6085300 15794000 31249000 17677000 13573000 19415000 12645000 6770200 2890 22406;33019 True;True 25209;37602 122162;122163;179310;179311;179312 156481;156482;228412;228413;228414 156481;228412 AT3G17930.1 AT3G17930.1 3 3 3 AT3G17930.1 | Symbols:DAC | Defective Accumulation of Cytochrome b6/f complex | transmembrane protein | Chr3:6142307-6143246 REVERSE LENGTH=190 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 17.4 17.4 17.4 20.913 190 190 1.81 9 7 5 0 10.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0584 1.1754 6.15 18 8 Leave out requantified 0.90998 1.0068 1.1035 0.95729 0.83078 0.94835 1.2604 1.0705 45.861 97.732 20.536 3.2695 6 4 4 4 5 2 1 0 Median Median Median Leave out requantified 17.4 17.4 17.4 17.4 2907200000 1765800000 1141400000 890560000 530170000 360390000 965770000 698320000 267450000 501540000 246790000 254750000 549360000 290560000 258800000 2891 7146;9404;37002 True;True;True 8127;8128;10651;10652;42159 39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;51673;51674;51675;51676;51677;51678;201793;201794;201795;201796 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Symbols:TOC64-III,atToc64-III | translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-III | translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-III | Chr3:6148030-6151794 FORWARD LENGTH=589;AT3G17970.2 | Symbols:TOC64-III,atToc64-III | trans 2 11 11 11 7 9 7 6 7 9 7 6 7 9 7 6 24.1 24.1 24.1 64.025 589 589;560 2.13 11 11 16 0 37.446 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0591 1.0249 20.264 35 14 Leave out requantified 1.0746 1.0727 0.84016 0.92172 1.0283 0.98067 0.98501 1.1117 12.75 20.162 13.058 19.999 10 9 10 6 5 2 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.9 20.5 16.3 15.1 2252500000 1198600000 1054000000 666350000 310650000 355710000 591650000 309100000 282550000 664090000 400890000 263210000 330420000 177940000 152490000 2893 4870;7709;8761;15962;16116;22335;22902;32660;34263;34563;38217 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5557;8759;9924;18065;18236;25122;25739;37200;39047;39374;43501 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Symbols:HAL3,ATHAL3A,HAL3A,ATHAL3 | HAL3-like protein A,HALOTOLERANCE DETERMINANT 3,ARABIDOPSIS THALIANA HAL3-LIKE PROTEIN A | HAL3-like protein A | Chr3:6167883-6168629 REVERSE LENGTH=209 2 3 3 3 0 3 0 0 0 3 0 0 0 3 0 0 16.3 16.3 16.3 23.355 209 209;201 2 3 0 4.809 By MS/MS 0.5119 0.47101 18.928 2 1 Median NaN 0.5119 NaN NaN NaN 0.47101 NaN NaN NaN 18.928 NaN NaN 0 2 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 16.3 0 0 104190000 70943000 33251000 0 0 0 104190000 70943000 33251000 0 0 0 0 0 0 2895 16830;21040;30909 True;True;True 19022;23673;35270 92743;115117;168499 118890;147493;214625 118890;147493;214625 AT3G18035.1;AT3G18035.2 AT3G18035.1 13;4 13;4 13;4 AT3G18035.1 | Symbols:HON4 | | winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | Chr3:6169384-6171558 REVERSE LENGTH=480 2 13 13 13 10 10 10 9 10 10 10 9 10 10 10 9 32.1 32.1 32.1 51.524 480 480;387 2.02 15 14 16 0 126.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1362 1.1903 21.095 39 17 Leave out requantified 1.1322 1.0877 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DNA-BINDING TRANSCRIPTION FACTOR 2 | Chr3:6311002-6313181 REVERSE LENGTH=346;AT3G18380.1 | Symbols:DTF2,SHH2 | DNA-BINDING TRANSCRIPTION FACTOR 2,SAWADE 3 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 3.8 3.8 3.8 38.391 346 346;348;349 2.5 1 1 0.0025964 2.5673 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 3.8 3.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2908 29423 True 33635 161406;161407 205668;205669 205668 AT3G18420.1 AT3G18420.1 5 5 5 AT3G18420.1 | Symbols:SG1 | SLOW GREEN 1 | Protein prenylyltransferase superfamily protein | Chr3:6324771-6325721 REVERSE LENGTH=316 1 5 5 5 3 4 3 2 3 4 3 2 3 4 3 2 22.2 22.2 22.2 35.63 316 316 1.86 5 6 3 0 14.231 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97569 1.0081 1.9938 14 10 Leave out requantified 1.1314 1.7885 0.3099 1.1549 1.058 1.7178 0.35453 1.2848 51.367 55.083 45.018 36.29 3 6 3 2 1 5 3 1 Median Median Median Median 14.2 19 11.7 11.7 641820000 308790000 333020000 130830000 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1 Median Median Median Median 12 12 5.1 12 338170000 188030000 150140000 69601000 31281000 38320000 104050000 58221000 45833000 96252000 59160000 37092000 68266000 39369000 28897000 2910 5202;9693 True;True 5927;10980 28834;28835;28836;53035;53036;53037;53038 37090;37091;37092;68040;68041;68042;68043 37092;68042 AT3G18460.1 AT3G18460.1 1 1 1 AT3G18460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PLAC8 family protein | Chr3:6333048-6333948 REVERSE LENGTH=184 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 13 13 13 20.15 184 184 1 1 0.009429 2.0106 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2911 24339 True 27517 133016 170015 170015 1317;2872;2873;2874 7;9;12;19 AT3G18480.1 AT3G18480.1 4 4 4 AT3G18480.1 | Symbols:AtCASP,CASP | CCAAT-displacement protein alternatively spliced product | CCAAT-displacement protein alternatively spliced product | Chr3:6336924-6341596 FORWARD LENGTH=689 1 4 4 4 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 6.8 6.8 6.8 79.683 689 689 1.43 5 1 1 0 9.551 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77125 0.79962 42.005 6 3 Median 0.92365 NaN NaN 0.68627 0.84914 NaN NaN 0.81028 59.954 NaN NaN 56.177 2 1 1 2 1 0 0 2 Median Median Median Median 2.8 2.6 1.5 4.4 277220000 153660000 123560000 75493000 36930000 38563000 55892000 27043000 28849000 52565000 33358000 19206000 93272000 56327000 36946000 2912 6660;16202;23841;27389 True;True;True;True 7584;18328;26775;31348 36900;89526;89527;89528;89529;129647;151122 47257;114899;114900;114901;114902;114903;165939;192554 47257;114903;165939;192554 AT3G18490.1 AT3G18490.1 9 9 9 AT3G18490.1 | Symbols:ASPG1 | ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1 | Eukaryotic aspartyl protease family protein | Chr3:6349090-6350592 REVERSE LENGTH=500 1 9 9 9 6 8 8 8 6 8 8 8 6 8 8 8 22.6 22.6 22.6 53.233 500 500 1.94 16 21 13 0 311.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.35535 0.37396 95.469 29 14 Leave out requantified 2.0304 3.5801 0.21877 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polyol/monosaccharide transporter 5 | Chr3:6489000-6491209 REVERSE LENGTH=539 1 3 3 3 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 6.9 6.9 6.9 58.102 539 539 1.71 3 3 1 0 6.4576 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78888 0.80464 7.2192 6 2 Leave out requantified 2.4249 NaN 0.23655 NaN 2.2338 NaN 0.26945 NaN 55.006 NaN 59.128 NaN 2 1 2 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 3.5 4.8 3.5 2 553730000 312050000 241670000 147160000 47173000 99992000 120850000 28458000 92392000 185590000 151240000 34343000 100120000 85179000 14946000 2923 15552;32487;33660 True;True;True 17605;37012;38354 86066;176422;176423;176424;182959;182960;182961 110977;224706;224707;224708;233048;233049 110977;224707;233048 AT3G18860.2;AT3G18860.1 AT3G18860.2;AT3G18860.1 11;11 11;11 11;11 AT3G18860.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | transducin family protein / WD-40 repeat family protein | Chr3:6501774-6508352 FORWARD LENGTH=760;AT3G18860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transducin family 2 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1118 1.1554 24.075 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.1 1.9 1.1 1.1 179170000 92235000 86933000 47178000 22817000 24361000 36065000 15561000 20504000 51186000 27313000 23873000 44739000 26544000 18195000 2943 2168;9967 True;True 2448;11277 12061;54524;54525;54526;54527 15621;69916;69917;69918;69919;69920;69921;69922;69923 15621;69917 AT3G19760.1;AT1G51380.2;AT1G51380.4;AT1G51380.3 AT3G19760.1 17;1;1;1 15;1;1;1 14;0;0;0 AT3G19760.1 | Symbols:EIF4A-III,RH2 | eukaryotic initiation factor 4A-III | eukaryotic initiation factor 4A-III | Chr3:6863790-6866242 FORWARD LENGTH=408 4 17 15 14 13 14 15 12 11 12 13 10 10 11 12 9 44.6 42.2 39.2 45.844 408 408;279;299;306 2.21 14 20 27 0 59.024 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80132 0.83262 31.761 52 14 Leave out requantified 1.1259 1.3906 0.619 0.67118 1.0476 1.2993 0.70625 0.71599 28.66 26.484 31.013 27.343 12 14 16 10 3 3 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.9 36.8 40.9 28.2 6771400000 3562200000 3209100000 1450700000 663060000 787680000 1555400000 604090000 951350000 2469900000 1535400000 934460000 1295300000 759650000 535640000 2944 3848;4644;5011;6915;8939;10384;11681;13113;15363;19063;19776;22054;27052;28136;33731;36133;38935 True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True 4403;5304;5710;7870;10115;11741;13198;14809;17394;21535;22303;24793;30971;32188;38435;41147;44303 21603;21604;21605;21606;21607;25785;25786;25787;25788;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;38662;38663;38664;38665;49336;49337;49338;49339;56700;56701;56702;56703;56704;56705;63781;71443;71444;71445;71446;71447;85047;85048;85049;85050;85051;85052;85053;85054;85055;85056;105495;105496;105497;105498;105499;108978;108979;108980;108981;108982;108983;120125;120126;120127;120128;149286;154766;154767;154768;154769;154770;154771;154772;154773;154774;154775;154776;183347;197009;197010;212523;212524;212525 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domain-containing protein | Chr3:6866916-6869114 FORWARD LENGTH=520 2 3 3 3 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 9 9 9 57.897 520 520;384 2.14 1 4 2 0 13.996 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.41326 0.48339 135.37 7 7 Median 0.48406 0.53292 0.17941 NaN 0.45443 0.49329 0.20508 NaN 214.43 192.46 121.26 NaN 2 2 2 1 2 2 2 1 Median Median Median Median 6.9 6.9 4.8 2.1 360200000 265760000 94439000 78557000 57233000 21324000 106800000 77191000 29606000 141350000 110530000 30823000 33497000 20811000 12686000 2945 1583;29690;35192 True;True;True 1803;33924;40079 9048;9049;162776;162777;191562;191563;191564 11814;11815;207410;207411;244193;244194;244195 11814;207411;244195 AT3G19820.3;AT3G19820.2;AT3G19820.1 AT3G19820.3;AT3G19820.2;AT3G19820.1 22;22;22 22;22;22 22;22;22 AT3G19820.3 | Symbols:DWF1,DIM,DIM1,CBB1,EVE1 | ENHANCED VERY-LOW-FLUENCE RESPONSES 1,DIMINUTIA,DIMINUTO 1,CABBAGE 1,DWARF 1 | cell elongation protein / DWARF1 / DIMINUTO (DIM) | Chr3:6879835-6881616 REVERSE LENGTH=561;AT3G19820.2 | Symbols:DWF1,DIM,DIM 3 22 22 22 20 19 20 20 20 19 20 20 20 19 20 20 44.7 44.7 44.7 65.393 561 561;561;561 2.08 42 57 54 0 133.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0319 1.1523 32.733 134 48 Leave out requantified 0.70484 0.53664 1.3035 1.7104 0.67014 0.51223 1.5663 1.9386 25.152 9.2674 27.984 20.539 32 34 34 34 13 12 11 12 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.9 38.7 43.5 43.1 26344000000 12770000000 13573000000 4588800000 2656300000 1932500000 6595300000 4220900000 2374400000 8223500000 3481700000 4741800000 6936100000 2411500000 4524600000 2946 1720;3515;4375;5328;7341;9363;12776;12886;14571;14587;15713;17686;21555;23392;24282;25537;28716;29791;35119;35349;37966;38909 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1954;4017;4987;6067;8345;10588;10589;14431;14560;16506;16523;17784;20025;24254;26273;27411;27412;27413;29193;32855;32856;34029;39995;39996;40264;43227;44274 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AT3G19900.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr3:6922852-6924557 REVERSE LENGTH=222 1 2 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 12.2 12.2 12.2 25.339 222 222 2.5 1 1 0.0052037 2.234 By MS/MS By MS/MS 0.70681 0.76276 88.33 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 6.8 0 5.4 0 209210000 123800000 85408000 132380000 93956000 38428000 0 0 0 76828000 29848000 46980000 0 0 0 2948 25768;29168 True;True 29453;33349 142302;160075 181545;203941 181545;203941 AT3G19930.2;AT3G19930.1 AT3G19930.2;AT3G19930.1 6;6 6;6 6;6 AT3G19930.2 | Symbols:ATSTP4,STP4 | SUGAR TRANSPORTER 4,sugar transporter 4 | sugar transporter 4 | Chr3:6935048-6936841 FORWARD LENGTH=514;AT3G19930.1 | Symbols:ATSTP4,STP4 | SUGAR TRANSPORTER 4,sugar transporter 4 | sugar transporter 4 | Chr3:6935048 2 6 6 6 3 5 6 5 3 5 6 5 3 5 6 5 14 14 14 57.095 514 514;514 1.92 9 9 7 0 133.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63739 0.71992 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protein | Chr3:6938211-6939975 FORWARD LENGTH=514 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 2.9 2.9 2.9 56.2 514 514 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 2.9 35469000 29558000 5910700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35469000 29558000 5910700 + 2950 23979 True 26937 130276 166671 166671 2826 1 AT3G19990.1;AT3G19990.2 AT3G19990.1;AT3G19990.2 4;4 4;4 4;4 AT3G19990.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | E3 ubiquitin-protein ligase | Chr3:6965671-6967102 FORWARD LENGTH=425;AT3G19990.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | E3 ubiquitin-protein ligase | Chr3:6965596-6 2 4 4 4 1 3 3 4 1 3 3 4 1 3 3 4 9.9 9.9 9.9 48.415 425 425;450 2.18 3 3 5 0 8.1934 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77669 0.93895 60.931 8 1 Leave out requantified NaN 1.6649 0.66508 0.59153 NaN 1.5341 0.78636 0.72045 NaN 29.725 2.6676 37.46 1 3 2 2 1 0 0 0 Median Leave out requantified Median Median 2.6 6.8 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13 AT3G20630.1 | Symbols:TTN6,UBP14,ATUBP14,PER1,DA3 | ubiquitin-specific protease 14,TITAN6,phosphate deficiency root hair defective1 | ubiquitin-specific protease 14 | Chr3:7203001-7208340 REVERSE LENGTH=797 1 13 13 13 8 9 12 7 8 9 12 7 8 9 12 7 15.4 15.4 15.4 88.373 797 797 1.92 13 16 10 0 41.766 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89961 0.94471 28.358 36 8 Leave out requantified 1.4126 1.4234 0.6529 0.57005 1.3327 1.2989 0.74076 0.5622 21.741 19.799 22.58 40.603 8 8 12 8 1 1 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.4 11.4 14.4 9 3087000000 1453000000 1633900000 522990000 215510000 307480000 610750000 256200000 354550000 1434100000 628640000 805490000 519080000 352690000 166390000 2967 3207;4759;8962;9685;9945;13887;14234;17281;21164;27626;30773;32586;38546 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3668;5436;10139;10971;11253;15698;16113;16114;19545;23818;31619;35119;37121;43870 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plant/protein (DUF1995) | Chr3:7230147-7231163 REVERSE LENGTH=338 1 8 8 8 6 3 4 4 6 3 4 4 6 3 4 4 31.7 31.7 31.7 37.436 338 338 1.9 9 5 7 0 28.126 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87492 0.88736 46.247 16 6 Leave out requantified 0.96159 1.0006 1.0605 0.93074 0.87441 0.93168 1.2597 1.0111 54.591 18.544 34.088 28.478 4 3 4 5 2 0 1 3 Median Plateau Median Median 22.2 11.2 15.7 18.6 2185000000 1221900000 963100000 1042700000 654460000 388280000 455970000 241650000 214320000 563180000 266410000 296770000 123080000 59341000 63736000 2970 7813;11601;21987;28768;30648;31932;32000;38006 True;True;True;True;True;True;True;True 8871;13097;24717;32912;34983;36388;36463;43270 43196;63361;119832;119833;119834;119835;119836;119837;119838;119839;158189;167265;167266;167267;173529;173856;173857;207339;207340;207341;207342 55333;81504;153408;153409;153410;153411;153412;153413;153414;153415;153416;153417;153418;153419;153420;201515;213096;213097;221063;221470;221471;264486;264487;264488;264489 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AT3G20970.1 | Symbols:NFU4,ATNFU2 | NFU domain protein 4,ARABIDOPSIS THALIANA NFU DOMAIN PROTEIN 2 | NFU domain protein 4 | Chr3:7348277-7350069 FORWARD LENGTH=283 2 3 3 2 1 2 1 0 1 2 1 0 1 1 1 0 20.1 20.1 14.5 30.504 283 283;222 2 2 1 2 0 19.863 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6625 0.80277 25.952 3 3 Median NaN NaN 0.65767 NaN NaN NaN 0.79374 NaN NaN NaN 1.5995 NaN 0 1 2 0 0 1 2 0 Median Median Median Median 5.7 14.5 8.8 0 120330000 61408000 58925000 0 0 0 25049000 8092400 16957000 95284000 53315000 41969000 0 0 0 2975 6682;17900;24628 True;True;True 7609;20262;27950 36991;98859;98860;98861;135034 47375;126728;126729;126730;126731;172456 47375;126729;172456 875 231 AT3G21055.1;AT3G21055.2 AT3G21055.1;AT3G21055.2 2;2 2;2 2;2 AT3G21055.1 | Symbols:PSBTN | photosystem II subunit T | photosystem II subunit T | Chr3:7376761-7377072 REVERSE LENGTH=103;AT3G21055.2 | Symbols:PSBTN | photosystem II subunit T | photosystem II subunit T | Chr3:7376761-7377192 REVERSE LENGTH=143 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 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LENGTH=1086 1 3 1 1 2 3 3 2 0 1 1 1 0 1 1 1 4.1 1 1 118.77 1086 1086 1.67 1 2 0.0020511 2.6625 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.5508 0.52727 37.494 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 3.1 4.1 4.1 2.6 53262000 43706000 9555100 0 0 0 13388000 8602600 4785900 19431000 17706000 1724100 20443000 17397000 3045200 2980 9876;22859;24819 False;False;True 11180;25694;28260 53920;53921;53922;124336;124337;124338;124339;124340;124341;136701;136702;136703 69141;69142;69143;159161;159162;159163;159164;159165;159166;159167;174549;174550;174551 69142;159167;174550 2863 486 AT3G21190.1 AT3G21190.1 1 1 1 AT3G21190.1 | Symbols:AtMSR1,MSR1 | Mannan Synthesis Related 1 | O-fucosyltransferase family protein | Chr3:7432579-7434543 REVERSE LENGTH=422 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 46.798 422 422 1.6 3 1 1 0.000214 4.5826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0423 0.96655 14.255 5 2 Median 1.1613 NaN NaN NaN 1.0624 NaN NaN NaN 13.367 NaN NaN NaN 2 1 1 1 2 0 0 0 Median Median Median Median 3.3 3.3 3.3 3.3 166300000 82052000 84250000 49074000 22417000 26657000 34095000 19161000 14934000 41058000 21305000 19753000 42074000 19169000 22905000 2981 2913 True 3345 16521;16522;16523;16524;16525 21440;21441;21442;21443;21444;21445;21446 21442 AT3G21215.3;AT3G21215.4;AT3G21215.2;AT3G21215.1 AT3G21215.3;AT3G21215.4;AT3G21215.2;AT3G21215.1 2;2;2;2 2;2;2;2 2;2;2;2 AT3G21215.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr3:7443036-7445231 REVERSE LENGTH=317;AT3G21215.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RNP 4 2 2 2 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 6.3 6.3 6.3 34.831 317 317;339;339;339 2.75 1 3 0.00040692 3.7861 By matching By MS/MS By MS/MS 0.90029 0.954 63.683 4 2 Median NaN NaN 0.52076 NaN NaN NaN 0.60791 NaN NaN NaN 17.124 NaN 1 1 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 2.2 2.2 6.3 0 238640000 109990000 128640000 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3 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 17.6 17.6 17.6 21.07 188 188 2 1 2 1 0 6.1783 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.53926 0.59383 63.983 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 10.1 0 7.4 7.4 131800000 92562000 39238000 45961000 21900000 24060000 0 0 0 35051000 24013000 11038000 50789000 46649000 4139500 2985 16531;18177;38383 True;True;True 18698;20566;43688 91296;100349;100350;209482 117054;128582;128583;267251 117054;128583;267251 2864;2865 73;77 AT3G21520.1 AT3G21520.1 2 2 2 AT3G21520.1 | Symbols:AtDMP1,DMP1 | Arabidopsis thaliana DUF679 domain membrane protein 1,DUF679 domain membrane protein 1 | transmembrane protein%2C putative (DUF679 domain membrane protein 1) | Chr3:7582000-7582623 FORWARD LENGTH=207 1 2 2 2 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 12.1 12.1 12.1 22.057 207 207 1.5 1 1 0.00021119 4.3771 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 12.1 0 0 57876000 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1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 7.6 0 146160000 60442000 85719000 0 0 0 0 0 0 146160000 60442000 85719000 0 0 0 2988 14175 True 16018 78184 100919 100919 AT3G21630.1 AT3G21630.1 1 1 1 AT3G21630.1 | Symbols:AtLYK1,LYK1,AtCERK1,LYSM RLK1,CERK1 | chitin elicitor receptor kinase 1,LysM-containing receptor-like kinase 1,LYSM DOMAIN RECEPTOR-LIKE KINASE 1 | chitin elicitor receptor kinase 1 | Chr3:7615543-7618530 REVERSE LENGTH=617 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1.8 1.8 1.8 67.314 617 617 2 2 0.0022297 2.6049 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 1.8 1.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2989 30863 True 35220 168326;168327 214398;214399 214398 AT3G21670.1 AT3G21670.1 2 2 2 AT3G21670.1 | Symbols:AtNPF6.4,NPF6.4 | NRT1/ PTR family 6.4 | Major facilitator superfamily protein | Chr3:7626942-7628954 REVERSE LENGTH=590 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2.9 2.9 2.9 65.245 590 590 1.86 3 2 2 0.00021372 4.5668 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86002 0.91496 0.92546 7 0 Leave out requantified NaN 0.80675 0.99949 0.97346 NaN 0.74269 1.1528 1.1021 NaN 4.1293 37.124 27.249 1 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.7 2.9 2.9 2.9 454470000 221680000 232790000 56574000 24044000 32530000 131580000 75327000 56249000 129770000 55972000 73797000 136550000 66334000 70214000 2990 5353;35393 True;True 6094;40312 29512;29513;29514;29515;192773;192774;192775 37936;37937;37938;37939;37940;37941;245778 37938;245778 AT3G21720.1 AT3G21720.1 3 3 3 AT3G21720.1 | Symbols:ICL | isocitrate lyase | isocitrate lyase | Chr3:7652789-7655873 REVERSE LENGTH=576 1 3 3 3 0 0 3 0 0 0 3 0 0 0 3 0 8.9 8.9 8.9 64.244 576 576 2.33 2 1 0 13.015 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 8.9 0 57039000 2309200 54729000 0 0 0 0 0 0 57039000 2309200 54729000 0 0 0 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TRANSAMINASE,POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 2,HEXENAL RESPONSE1 | Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein | Chr3:7835286-7838863 FORWARD LENGTH=504;AT3G22200.2 | Sy 2 18 18 18 14 18 17 18 14 18 17 18 14 18 17 18 55.2 55.2 55.2 55.187 504 504;513 2.05 43 64 51 0 291.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0444 1.1649 9.1917 117 30 Leave out requantified 1.322 1.152 0.98104 0.80602 1.2338 1.096 1.1861 0.90537 22.453 9.5165 8.6232 22.498 25 32 30 30 10 7 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.5 55.2 50.8 55.2 23379000000 11450000000 11929000000 4504400000 1835900000 2668500000 5206600000 2435300000 2771400000 6880900000 3458400000 3422500000 6787300000 3720900000 3066400000 2999 1083;1126;2396;8371;11275;13475;14954;21289;25572;25706;28901;28902;30535;33902;34535;36146;38851;39055 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Median Median 0.9 0.9 3.6 0 48750000 30676000 18074000 7062000 2276900 4785100 6157200 1484000 4673100 35531000 26915000 8615500 0 0 0 3002 4892;11511 True;True 5580;13000 27160;27161;27162;27163;27164;62950 34952;34953;34954;34955;34956;81030 34955;81030 AT3G22320.1 AT3G22320.1 3 3 3 AT3G22320.1 | Symbols:ATRPABC24.3,NRPD5,NRPB5,RPB5A | RNA POLYMERASE II FIFTH LARGEST SUBUNIT, A | Eukaryotic rpb5 RNA polymerase subunit family protein | Chr3:7891045-7892094 REVERSE LENGTH=205 1 3 3 3 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 19 19 19 24.301 205 205 1.83 3 1 2 0 9.296 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2623 1.1489 40.18 5 1 Leave out requantified 1.6202 NaN NaN NaN 1.5264 NaN NaN NaN 55.017 NaN NaN NaN 3 1 0 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 19 3.4 3.4 3.4 95801000 44630000 51171000 58733000 24760000 33973000 22726000 11645000 11081000 0 0 0 14341000 8224100 6116700 3003 7760;8507;25116 True;True;True 8813;9646;28655 42947;42948;42949;42950;47010;138534 55025;55026;55027;55028;55029;60415;176847 55028;60415;176847 AT3G22330.1;AT3G22310.2;AT3G22310.1 AT3G22330.1 9;3;3 9;3;3 9;3;3 AT3G22330.1 | Symbols:PMH2,ATRH53 | putative mitochondrial RNA helicase 2 | putative mitochondrial RNA helicase 2 | Chr3:7892641-7895145 FORWARD LENGTH=616 3 9 9 9 6 5 4 6 6 5 4 6 6 5 4 6 17.5 17.5 17.5 65.359 616 616;595;610 2.15 6 10 10 0 29.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89978 0.92162 31.992 22 4 Leave out requantified 1.1887 1.6956 0.48479 0.41023 1.1064 1.5902 0.56946 0.45846 23.807 30.586 23.465 19.429 6 6 4 6 1 1 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.3 9.6 7.8 11 1410900000 754650000 656270000 221880000 91745000 130130000 461940000 169370000 292570000 372270000 254560000 117700000 354830000 238960000 115870000 3004 3151;4323;12041;14667;24417;29312;30823;32935;38926 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3604;4930;13606;16614;27626;33505;35178;37514;44294 17723;17724;17725;17726;23989;65757;81106;133494;133495;133496;160820;160821;160822;160823;168113;168114;178932;178933;178934;178935;178936;178937;178938;178939;178940;212496 22922;22923;31008;84579;104582;170592;204897;204898;204899;204900;204901;214132;214133;214134;227944;227945;227946;227947;227948;227949;227950;227951;227952;227953;227954;271037 22922;31008;84579;104582;170592;204900;214134;227954;271037 2881 486 AT3G22370.1 AT3G22370.1 9 9 4 AT3G22370.1 | Symbols:ATAOX1A,AOX1A,HSR3,AtHSR3 | hyper-sensitivity-related 3,alternative oxidase 1A | alternative oxidase 1A | Chr3:7906890-7908416 FORWARD LENGTH=354 1 9 9 4 5 3 4 3 5 3 4 3 2 2 3 1 28.5 28.5 16.1 39.979 354 354 2.08 7 8 9 0 28.577 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.8297 1.6619 37.367 17 13 Leave out requantified 1.3558 2.1235 0.31427 0.42595 1.2696 1.93 0.40076 0.48979 37.671 49.059 57.495 40.978 6 5 3 3 4 3 3 3 Median Median Median Median 16.4 10.7 13 8.8 1008900000 497100000 511750000 385020000 148390000 236630000 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1 0 6.2232 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54413 0.58431 99.137 3 2 Median NaN NaN 0.30276 NaN NaN NaN 0.33948 NaN NaN NaN 133.01 NaN 0 0 2 1 0 0 2 0 Median Median Median Median 0 0.6 1.9 0.6 49253000 32613000 16639000 0 0 0 0 0 0 30835000 23251000 7583500 18418000 9362200 9055800 3006 6577;26932;30694 True;True;True 7491;30839;35038 36413;36414;148777;167516;167517 46632;46633;189556;213386;213387;213388 46632;189556;213387 AT3G22425.2;AT4G14910.1 AT3G22425.2;AT4G14910.1 2;1 2;1 2;1 AT3G22425.2 | Symbols:HISN5A,IGPD | imidazoleglycerol-phosphate dehydratase | imidazoleglycerol-phosphate dehydratase | Chr3:7951110-7952853 FORWARD LENGTH=270;AT4G14910.1 | Symbols:HISN5B | HISTIDINE BIOSYNTHESIS 5B | HISTIDINE BIOSYNTHESIS 5B | Chr4: 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 5.9 5.9 5.9 29.225 270 270;272 1.88 3 3 2 0.00041667 4.1899 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2162 1.149 44.892 6 1 Leave out requantified NaN 1.5822 0.89328 NaN NaN 1.407 1.0056 NaN NaN 6.2685 86.246 NaN 1 2 2 1 0 0 0 1 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protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr3:8006711-8007397 REVERSE LENGTH=170 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.5 6.5 6.5 17.305 170 170 2 2 3 2 0.00021133 4.3838 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.2216 1.25 28.382 6 0 Median 1.47 NaN NaN 0.67331 1.335 NaN NaN 0.76288 1.7882 NaN NaN 5.2903 2 1 1 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 6.5 6.5 6.5 6.5 821430000 389210000 432220000 165530000 62540000 102990000 221800000 97988000 123820000 221000000 106270000 114730000 213100000 122410000 90682000 3011 524 True 588 2986;2987;2988;2989;2990;2991;2992 3914;3915;3916;3917;3918;3919;3920 3915 AT3G22630.1 AT3G22630.1 9 4 4 AT3G22630.1 | Symbols:PBD1,PRCGB | 20S proteasome beta subunit D1 | 20S proteasome beta subunit D1 | Chr3:8009709-8010774 REVERSE LENGTH=204 1 9 4 4 8 8 8 8 3 3 3 3 3 3 3 3 44.6 20.1 20.1 22.54 204 204 2 5 5 5 0 7.9852 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83526 0.8969 21.684 10 2 Leave out requantified 1.3015 1.2743 0.64425 0.66865 1.1817 1.1627 0.80576 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Symbols:NET1A | Networked 1A | Kinase interacting (KIP1-like) family protein | Chr3:8052446-8057888 REVERSE LENGTH=1728;AT3G22790.2 | Symbols:NET1A | Networked 1A | Kinase interacting (KIP1-like) family protein | Chr3:8052446-8057888 REVE 3 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0.9 0.9 0.9 198.85 1728 1728;1728;1728 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3014 2659 True 3047 15082 19567 19567 2878;2879;2880 2884;2885 668;670;677 672;676 AT3G22845.1;AT3G22845.2 AT3G22845.1 3;1 3;1 3;1 AT3G22845.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | emp24/gp25L/p24 family/GOLD family protein | Chr3:8087373-8088550 FORWARD LENGTH=214 2 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 14.5 14.5 14.5 24.281 214 214;181 2.15 6 5 9 0 17.665 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2637 1.1631 17.383 16 6 Leave out requantified 1.4664 1.3345 0.69241 0.53433 1.3806 1.2467 0.81713 0.60186 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Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr3:8458052-8459608 REVERSE LENGTH=239;AT3G23570.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfami 3 5 5 5 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 3 31.4 31.4 31.4 26.53 239 239;239;239 2.12 5 4 7 0 15.462 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9565 0.95162 7.3825 13 5 Leave out requantified 1.4046 1.5662 0.38605 0.68766 1.3194 1.4223 0.45624 0.64202 62.084 13.343 113.19 11.295 2 3 5 3 1 0 3 1 Median Leave out requantified Median Plateau 18.8 21.8 28.5 14.6 608510000 365470000 243040000 52600000 18719000 33881000 144710000 59945000 84762000 289740000 212870000 76876000 121460000 73939000 47521000 3030 13041;21227;29336;37225;39045 True;True;True;True;True 14730;23890;33538;42403;44431 71040;71041;71042;71043;71044;71045;116146;116147;116148;116149;160993;203098;203099;213148;213149;213150 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available | no full name available | Ribosomal RNA processing Brix domain protein | Chr3:8480147-8481873 FORWARD LENGTH=314 1 4 4 4 3 4 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 10.8 10.8 10.8 35.727 314 314 1.93 6 3 5 0 8.1123 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72755 0.79952 12.924 11 2 Leave out requantified 0.69443 0.89193 0.67927 0.76224 0.62573 0.83241 0.83446 0.86648 52.312 26.705 11.749 43.078 3 3 2 3 1 0 0 1 Median Leave out requantified Median Median 8.3 10.8 5.1 8.3 479550000 262110000 217440000 139480000 88384000 51097000 124850000 64862000 59986000 96983000 58096000 38887000 118240000 50770000 67471000 3032 10355;10695;26435;33067 True;True;True;True 11708;12078;30288;37653 56538;56539;56540;56541;58456;146133;146134;146135;146136;146137;179560;179561;179562;179563 72507;75071;186210;186211;186212;186213;186214;228719;228720;228721;228722;228723;228724;228725 72507;75071;186212;228723 AT3G23640.1;AT3G23640.2;AT3G23640.3 AT3G23640.1;AT3G23640.2;AT3G23640.3 6;6;6 6;6;6 6;6;6 AT3G23640.1 | Symbols:HGL1 | heteroglycan glucosidase 1 | heteroglycan glucosidase 1 | Chr3:8502355-8509358 FORWARD LENGTH=991;AT3G23640.2 | Symbols:HGL1 | heteroglycan glucosidase 1 | heteroglycan glucosidase 1 | Chr3:8502355-8509358 FORWARD LENGTH=99 3 6 6 6 3 4 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 6.7 6.7 6.7 110.88 991 991;991;1060 1.83 4 6 2 0 23.975 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.848 13.648 129.79 7 6 Median 5.1812 1.8024 NaN NaN 4.7314 1.7122 NaN NaN 174.71 136.79 NaN NaN 2 3 1 1 2 2 1 1 Median Median Median Median 3.3 4.2 2.8 3.5 1268200000 116020000 1152200000 221630000 16711000 204920000 325260000 40281000 284980000 425690000 38005000 387690000 295640000 21020000 274620000 3033 10451;13996;28395;31333;31448;34494 True;True;True;True;True;True 11813;15816;32489;35729;35857;39301 57079;57080;57081;77076;77077;77078;77079;156229;156230;170478;171081;187683 73205;73206;73207;99543;99544;99545;99546;199125;199126;217121;217872;239123 73205;99545;199125;217121;217872;239123 AT3G23660.1;AT3G23660.2 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symbol available | no full name available | Peroxisomal memb 2 2 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 10.8 10.8 10.8 25.518 222 222;235 2 1 3 1 0.009434 2.0109 By matching By MS/MS By MS/MS 0.48408 0.582 59.693 5 2 Median NaN NaN 0.70364 0.38552 NaN NaN 0.85664 0.44977 NaN NaN 54.665 24.881 0 1 2 2 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 4.1 10.8 10.8 466330000 240120000 226200000 0 0 0 101680000 26353000 75330000 197710000 102690000 95025000 166930000 111080000 55850000 3054 21784;23234 True;True 24496;26101 118868;118869;118870;126241;126242 152189;161535;161536 152189;161535 AT3G24590.1;AT3G24590.2 AT3G24590.1;AT3G24590.2 6;6 6;6 6;6 AT3G24590.1 | Symbols:PLSP1 | plastidic type i signal peptidase 1 | plastidic type i signal peptidase 1 | Chr3:8970694-8972020 FORWARD LENGTH=291;AT3G24590.2 | Symbols:PLSP1 | plastidic type i signal peptidase 1 | plastidic type i signal peptidase 1 | 2 6 6 6 5 4 4 5 5 4 4 5 5 4 4 5 33.3 33.3 33.3 32.554 291 291;310 2.16 7 7 11 0 30.65 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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B%2C polypeptide 3 | Chr3:9596208-9597828 REVERSE LENGTH=501 1 3 2 1 3 1 0 1 2 0 0 1 1 0 0 1 6 4.4 3 57.663 501 501 2.67 1 2 0.00021482 4.6644 By MS/MS By matching By MS/MS 1.2493 1.242 25.397 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 6 1.6 0 3 46471000 14078000 32394000 30024000 2896100 27128000 0 0 0 0 0 0 16447000 11182000 5265900 3087 7255;23273;26037 False;True;True 8246;26142;29806 40428;40429;126435;143997;143998 51662;51663;161758;183605;183606 51663;161758;183606 AT3G26280.1;AT3G26280.2;AT1G13080.2;AT1G13080.1 AT3G26280.1;AT3G26280.2 3;3;1;1 2;2;1;1 1;1;0;0 AT3G26280.1 | Symbols:CYP71B4 | cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 4 | cytochrome P450%2C family 71%2C subfamily B%2C polypeptide 4 | Chr3:9630358-9631970 REVERSE LENGTH=504;AT3G26280.2 | Symbols:CYP71B4 | cytochrome P450, family 71 4 3 2 1 2 0 2 0 1 0 1 0 1 0 0 0 6.7 4.6 3 57.789 504 504;521;384;502 1.5 1 1 0.00097428 3.2095 By MS/MS By MS/MS 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Median Median 6.8 3.4 8.8 6.8 499460000 211840000 287620000 60406000 34369000 26037000 48523000 15920000 32603000 287620000 88201000 199420000 102910000 73353000 29558000 3093 592;7243;9908;19797;36529 True;True;True;True;False 661;8234;11214;22325;41628 3430;40338;40339;40340;54263;109087;109088;109089;199178;199179;199180;199181 4485;51538;51539;69601;139891;139892;139893;254031;254032;254033;254034;254035;254036 4485;51538;69601;139893;254035 AT3G26420.1 AT3G26420.1 4 4 4 AT3G26420.1 | Symbols:RZ-1A,ATRZ-1A,RBGB2 | RNA-binding glycine-rich protein B2,RZ-1A | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain-containing protein | Chr3:9671953-9673055 FORWARD LENGTH=245 1 4 4 4 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 17.6 17.6 17.6 26.923 245 245 2 5 4 5 0 15.044 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85173 0.8923 5.7798 9 1 Leave out requantified 0.98037 1.6118 0.50586 0.73997 0.91806 1.4383 0.61417 0.86726 28.828 4.6538 21.254 17.268 2 2 3 2 0 0 1 0 Median Median 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155989;155990;155991;155992;186173;186174 198821;198822;198823;198824;237180;237181 198822;237180 AT3G27050.1 AT3G27050.1 2 2 2 AT3G27050.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | plant/protein | Chr3:9978286-9979636 REVERSE LENGTH=182 1 2 2 2 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 13.2 13.2 13.2 20.611 182 182 2.67 1 2 0.00039534 3.3866 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 13.2 0 6 0 31150000 23935000 7214700 31150000 23935000 7214700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3110 10904;18946 True;True 12312;21409 59523;59524;104905 76454;76455;134530 76454;134530 AT3G27080.1 AT3G27080.1 4 4 4 AT3G27080.1 | Symbols:TOM20-3 | translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 | translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 | Chr3:9985212-9986560 REVERSE LENGTH=202 1 4 4 4 1 4 2 2 1 4 2 2 1 4 2 2 18.8 18.8 18.8 22.565 202 202 1.67 5 2 2 0 6.4864 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8827 0.96521 24.396 8 0 Leave 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Symbols:no symbol available | no full name available | Sucrase/ferredoxin-like family p 2 8 8 8 4 5 7 4 4 5 7 4 4 5 7 4 31.2 31.2 31.2 37.147 340 340;379 1.87 6 14 3 0 59.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68323 0.72022 73.842 14 7 Leave out requantified 1.316 1.746 0.45142 1.7786 1.2242 1.644 0.54637 2.0102 7.7068 67.729 55.769 58.198 2 4 5 3 0 3 3 1 Median Median Median Plateau 12.6 17.6 28.5 20 1063700000 528630000 535030000 159770000 63323000 96446000 251800000 72375000 179430000 435460000 253650000 181810000 216630000 139280000 77344000 3123 1817;4299;10997;12921;13171;18617;28963;35151 True;True;True;True;True;True;True;True 2066;4902;12421;14600;14871;21054;33121;33122;40031 10238;10239;10240;10241;10242;10243;23889;60072;60073;60074;60075;70465;71721;71722;102966;102967;159125;159126;159127;159128;191300;191301;191302 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PROTEIN L12 | ribosomal protein L12-A | Chr3:10318576- 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 32.1 32.1 32.1 19.682 187 187;191;191 2.03 17 28 19 0 35.888 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93652 0.89962 8.8316 58 22 Leave out requantified 1.0878 1.0576 0.54413 0.8939 1.0049 1.0135 0.61962 0.96651 51.856 19.836 26.187 29.508 12 16 15 15 5 7 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.1 32.1 32.1 32.1 43384000000 23023000000 20361000000 8497500000 4633500000 3864100000 11212000000 5035600000 6176200000 15576000000 9100800000 6475700000 8098600000 4253000000 3845500000 3130 2420;8294;8295;9089;16946;17506;19730;32988 True;True;True;True;True;True;True;True 2727;9395;9396;10283;19155;19799;22253;37570 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NADPH:quinone oxidoreductase | NADPH:quinone oxidoreductase | Chr3:10350807-10351938 REVERSE LENGTH=196 1 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 29.1 29.1 29.1 21.556 196 196 2.04 8 7 9 0 100.32 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.55116 0.67559 27.284 23 4 Leave out requantified 1.6063 2.2528 0.54096 0.45908 1.5253 2.141 0.66413 0.51227 19.494 39.564 17.03 20.288 5 5 7 6 1 2 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.5 29.1 29.1 29.1 6283300000 3614900000 2668400000 1509600000 594590000 915040000 620860000 197590000 423270000 2349700000 1508100000 841610000 1803100000 1314700000 488480000 3131 10771;17305;24155;34434 True;True;True;True 12164;19573;27206;27207;39237 58877;58878;58879;58880;95665;95666;95667;95668;95669;95670;131423;131424;131425;131426;131427;131428;131429;131430;131431;131432;131433;187383;187384;187385 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(TPR)-like superfamily protein | Chr3:10380809-10382593 REVERSE LENGTH=594;AT3G27960.3 | Symbols:KLCR2 | kinesin light chain-related 2 | Tetratricopeptide repeat (TPR 3 2 2 2 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3.5 3.5 3.5 64.801 594 594;663;663 2 1 1 0.0018801 2.7512 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 1.7 0 1.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3134 6902;9336 True;True 7857;10555 38604;51291 49421;65865 49421;65865 AT3G28200.1 AT3G28200.1 8 8 8 AT3G28200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr3:10518082-10519032 FORWARD LENGTH=316 1 8 8 8 5 5 6 6 5 5 6 6 5 5 6 6 27.2 27.2 27.2 35.302 316 316 2.1 7 13 10 0 32.724 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0315 1.0748 16.954 24 6 Leave out requantified 1.041 0.68322 1.1078 1.4147 1.0025 0.62031 1.2903 1.6797 17.267 19.326 13.802 29.224 6 7 5 6 3 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave 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Symbols:AT14A | | transmembrane protein%2C putative (DUF677) | Chr3:10566106-10567263 FORWARD LENGTH=385;AT3G28290.1 | Symbols:AT14A | | transmembrane protein%2C putative (DUF677) | Chr3:10547873-10549030 FORWARD LENGTH=385 2 11 11 11 4 11 8 9 4 11 8 9 4 11 8 9 32.2 32.2 32.2 42.954 385 385;385 1.76 18 16 8 0 236.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0516 1.0072 42.085 38 8 Leave out requantified 1.201 1.0319 0.73623 1.2107 1.147 0.93417 0.89922 1.4168 27.905 41.756 41.918 19.771 4 13 8 13 1 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.7 32.2 24.7 27.8 4606200000 2252600000 2353600000 237920000 124670000 113250000 1303100000 625690000 677400000 823760000 438550000 385210000 2241400000 1063700000 1177700000 3138 4105;8884;9619;24376;25496;29083;30220;32580;32966;33736;38794 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4692;10056;10897;27569;27570;29149;33256;34495;37113;37546;38440;44147 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THALIANA PECTIN METHYLESTERASE 31,pectin methylesterase 31 | pectin methylesterase 31 | Chr3:11073804-11075335 FORWARD LENGTH=317 1 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 6.6 6.6 6.6 35.52 317 317 2 1 1 1 0.00040241 3.6396 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 3.2 3.5 0 3.5 12538000 9424500 3113600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12538000 9424500 3113600 3152 4253;30628 True;True 4851;34961 23678;23679;167160 30621;30622;212957 30622;212957 AT3G29160.1;AT3G29160.2;AT3G29160.3 AT3G29160.1;AT3G29160.2;AT3G29160.3 5;5;4 5;5;4 4;4;3 AT3G29160.1 | Symbols:SNRK1.2,ATKIN11,AKIN11,KIN11 | SNF1 kinase homolog 11,SNF1-RELATED PROTEIN KINASE 1.2 | SNF1 kinase homolog 11 | Chr3:11128893-11131510 REVERSE LENGTH=512;AT3G29160.2 | Symbols:SNRK1.2,ATKIN11,AKIN11,KIN11 | SNF1 kinase homolog 11, 3 5 5 4 1 2 5 2 1 2 5 2 1 2 4 2 11.1 11.1 7.8 58.689 512 512;512;359 2.33 1 6 5 0 8.3631 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 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LENGTH=317;AT3G29240.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PPR containing protein (DUF179) | Chr3 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 5.4 5.4 5.4 34.551 317 317;317 3 1 0.0060595 2.1936 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 5.4 0 5408100 1506000 3902100 0 0 0 0 0 0 5408100 1506000 3902100 0 0 0 3155 20917 True 23539 114560 146803 146803 AT3G29250.2;AT3G29250.3;AT3G29250.1 AT3G29250.2;AT3G29250.3;AT3G29250.1 4;4;4 1;1;1 1;1;1 AT3G29250.2 | Symbols:AtSDR4,SDR4 | short-chain dehydrogenase reductase 4 | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr3:11193767-11194840 REVERSE LENGTH=260;AT3G29250.3 | Symbols:AtSDR4,SDR4 | short-chain dehydrogenase reductase 4 | NAD(P)-b 3 4 1 1 1 1 3 2 0 0 1 0 0 0 1 0 17.7 5.4 5.4 27.026 260 260;296;298 2 1 0.00039793 3.4803 By matching By matching By MS/MS By matching NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 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histidine-containing phosphotransmitter 2 | Chr3:11264682-11265408 REVERSE LENGTH=114;AT3G29350.1 | Symbols:AHP2 | histidine-containing phosphotransmitter 2 | histidine-containing 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 27.2 27.2 27.2 12.689 114 114;156 1.86 3 2 2 0 10.637 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 27.2 8.8 8.8 8.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3160 2087;24059 True;True 2361;27061;27062 11680;130841;130842;130843;130844;130845;130846 15154;167357;167358;167359;167360;167361;167362 15154;167362 3041 1 AT3G29360.2;AT3G29360.1;AT1G26570.1;AT3G01010.1 AT3G29360.2;AT3G29360.1 16;16;5;1 16;16;5;1 6;6;1;0 AT3G29360.2 | Symbols:UGD2 | UDP-glucose dehydrogenase 2 | UDP-glucose 6-dehydrogenase family protein | Chr3:11267375-11268817 REVERSE LENGTH=480;AT3G29360.1 | Symbols:UGD2 | UDP-glucose dehydrogenase 2 | UDP-glucose 6-dehydrogenase family protein | Ch 4 16 16 6 11 13 16 13 11 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available | no full name available | Cofactor-independent phosphoglycerate mutase | Chr4:6024970-6026751 REVERSE LENGTH=492;AT3G30841.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Cofactor-independent phospho 3 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.4 2.4 2.4 53.124 492 492;495;495 2 1 1 1 0.00021053 4.3354 By matching By MS/MS By matching 0.88713 0.99387 40.669 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.4 2.4 2.4 236190000 127270000 108920000 0 0 0 71981000 28572000 43409000 60477000 39653000 20824000 103730000 59049000 44686000 3166 28681 True 32817 157695;157696;157697 200885 200885 AT3G31910.1 AT3G31910.1 1 1 1 AT3G31910.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ulp1 protease family protein (DUF1985) | Chr3:12907877-12909614 REVERSE LENGTH=399 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.8 3.8 3.8 46.118 399 399 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 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LENGTH=249;AT3G32930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 6%2C7-dimethyl-8-ribityllumaz 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 10.8 10.8 10.8 27.432 249 249;249 2.08 4 3 5 0 9.4974 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95082 0.87861 9.9717 10 3 Leave out requantified NaN 0.99596 0.59959 1.6748 NaN 0.91301 0.74358 1.9474 NaN 30.419 11.041 62.453 1 3 2 4 0 1 0 2 Median Median Median Linear 5.6 10.8 10.8 10.8 346030000 181680000 164350000 27668000 13106000 14562000 102580000 49835000 52742000 100170000 69065000 31109000 115610000 49673000 65939000 3169 1622;9725 True;True 1844;11012 9226;9227;9228;53185;53186;53187;53188;53189;53190;53191;53192;53193 12044;68231;68232;68233;68234;68235;68236;68237;68238;68239;68240;68241 12044;68236 AT3G32980.1 AT3G32980.1 13 12 6 AT3G32980.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr3:13526404-13529949 REVERSE LENGTH=352 1 13 12 6 12 13 13 10 11 12 12 9 6 6 6 4 41.5 38.9 22.2 38.847 352 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Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family | Chr3:16091973-16096041 REVERSE LENGTH=1191;AT3G44480.4 | Symbols:cog1,RPP1 | recognition of peronospora parasitica 1 | Di 9 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 135.73 1191 1191;1194;1194;1214;1214;1214;1240;1240;1240 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 1 77569000 47382000 30187000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77569000 47382000 30187000 + 3193 32423 True 36934 175962 224072 224072 3081 118 AT3G44555.1 AT3G44555.1 1 1 1 AT3G44555.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr3:16145285-16145608 FORWARD LENGTH=107 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 9.3 9.3 9.3 12.35 107 107 2 1 1 0.0045151 2.295 By MS/MS By MS/MS 1.0303 0.96217 1.9005 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 9.3 9.3 0 0 161150000 79601000 81544000 92450000 46142000 46308000 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Symbols:no symbol available | no full name available | protein-tyrosine phosphatase | Chr3:16193 2 4 4 4 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 26.8 26.8 26.8 26.95 239 239;262 2.28 4 5 9 0 13.149 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84355 0.91513 12.525 18 2 Leave out requantified 1.1272 1.5263 0.55074 0.87132 1.0265 1.3497 0.65525 0.94701 15.708 17.412 22.133 25.759 5 3 6 4 2 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.4 18.4 26.8 18.4 1376900000 769490000 607440000 282820000 137210000 145610000 261000000 109800000 151200000 551060000 364170000 186890000 282040000 158310000 123730000 3197 11708;12224;30445;35979 True;True;True;True 13237;13238;13816;34761;40979 63972;63973;63974;63975;63976;63977;66779;66780;66781;66782;66783;66784;66785;166235;166236;166237;166238;196245 82286;82287;82288;82289;82290;82291;82292;82293;82294;85869;85870;85871;85872;85873;85874;85875;85876;85877;85878;85879;211707;211708;250324 82293;85877;211707;250324 3082 125 AT3G44750.2;AT3G44750.1 AT3G44750.2;AT3G44750.1 6;6 6;6 6;6 AT3G44750.2 | Symbols:HDA3,HDT1,ATHD2A,HD2A | histone deacetylase 3,HISTONE DEACETYLASE 2A | histone deacetylase 3 | Chr3:16298045-16299585 FORWARD LENGTH=242;AT3G44750.1 | Symbols:HDA3,HDT1,ATHD2A,HD2A | histone deacetylase 3,HISTONE DEACETYLASE 2A | h 2 6 6 6 5 6 4 3 5 6 4 3 5 6 4 3 31.4 31.4 31.4 25.985 242 242;245 1.78 8 6 4 0 17.539 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84735 0.8322 15.313 17 2 Leave out requantified 0.79908 1.0108 0.46884 1.0253 0.72806 0.92486 0.54585 1.1147 9.6918 22.934 32.5 13.752 4 6 4 3 1 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 27.3 31.4 15.3 14 1159800000 647320000 512460000 282990000 178420000 104570000 419360000 195050000 224310000 271190000 180600000 90590000 186240000 93256000 92984000 3198 18979;24176;28511;29361;32428;34727 True;True;True;True;True;True 21444;27241;32618;33565;36944;39562 105054;105055;105056;131550;131551;131552;156828;156829;156830;156831;161107;161108;176020;176021;176022;189219;189220;189221 134737;134738;134739;134740;168155;168156;168157;199856;199857;199858;199859;199860;199861;205292;205293;224139;224140;241241 134738;168156;199856;205292;224139;241241 3083 1 AT3G44860.1;AT3G44870.1 AT3G44860.1;AT3G44870.1 8;5 8;5 8;5 AT3G44860.1 | Symbols:FAMT | farnesoic acid carboxyl-O-methyltransferase | farnesoic acid carboxyl-O-methyltransferase | Chr3:16379689-16380939 FORWARD LENGTH=348;AT3G44870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methioni 2 8 8 8 3 2 4 4 3 2 4 4 3 2 4 4 26.4 26.4 26.4 38.515 348 348;379 2.18 4 6 7 0 46.162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4092 1.6944 156.26 11 11 Median 5.1699 NaN 0.24272 0.26648 4.9794 NaN 0.29332 0.30413 16.488 NaN 25.402 132.69 4 1 3 3 4 1 3 3 Median Median Median Median 9.2 5.5 14.4 17 760420000 486960000 273460000 172970000 36660000 136310000 43970000 5062300 38908000 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deaminase family protein | Chr3:17462094-17464655 FORWARD LENGTH=596;AT3G47390.1 | Symbols:PHS1,PyrR | pyrimidine reductase,PHOTOSENSITIVE 1 | cytidine/de 2 5 5 5 2 1 3 2 2 1 3 2 2 1 3 2 11.6 11.6 11.6 65.118 596 596;599 1.5 4 4 0 11.176 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.9079 1.8238 7.1462 5 1 Leave out requantified 1.3015 NaN 1.3453 NaN 1.2103 NaN 1.5479 NaN 50.842 NaN 54.504 NaN 2 1 2 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 3.5 1.2 5.5 6 258090000 88688000 169400000 72605000 29366000 43240000 71822000 23434000 48388000 113660000 35889000 77772000 0 0 0 3239 82;4053;12189;13392;18361 True;True;True;True;True 95;4633;13773;15124;20769 462;22714;22715;22716;66563;73156;73157;101522 632;29438;85617;94134;94135;130101 632;29438;85617;94134;130101 3136 45 AT3G47430.1 AT3G47430.1 3 3 3 AT3G47430.1 | Symbols:PEX11B | peroxin 11B | peroxin 11B | Chr3:17480798-17481692 FORWARD LENGTH=227 1 3 3 3 2 2 1 3 2 2 1 3 2 2 1 3 12.8 12.8 12.8 25.598 227 227 2.12 2 3 3 0.00041169 3.9798 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0954 1.1101 8.394 8 3 Leave out requantified 1.0792 0.81873 NaN 1.1224 1.0388 0.74662 NaN 1.3454 1.0003 4.5733 NaN 64.523 2 2 1 3 0 1 0 2 Median Median Median Plateau 9.7 9.7 3.1 12.8 798670000 419960000 378700000 143740000 76700000 67037000 141220000 66867000 74357000 153790000 55179000 98611000 359920000 221220000 138700000 3240 22721;23744;32442 True;True;True 25550;26667;36959 123780;123781;123782;129107;129108;129109;129110;176119 158454;158455;158456;165199;165200;165201;165202;165203;165204;165205;165206;224283 158455;165201;224283 AT3G47450.2;AT3G47450.1 AT3G47450.2;AT3G47450.1 2;2 2;2 2;2 AT3G47450.2 | Symbols:NOS1,RIF1,SVR10,ATNOA1,ATNOS1,NOA1 | NITRIC OXIDE SYNTHASE 1,SUPPRESSOR OF VARIEGATION 10,RESISTANT TO INHIBITION WITH FOSMIDOMYCIN 1,NO ASSOCIATED 1 | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr3 2 2 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 4.8 4.8 4.8 61.957 561 561;561 1.5 4 1 1 0 14.189 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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Median 2 0 3.1 3.1 76416000 66388000 10027000 12797000 2769500 10027000 0 0 0 26266000 26266000 0 37353000 37353000 0 3264 8726;31907 True;True 9880;36359 48156;48157;173356 61860;61861;220825 61860;220825 AT3G48410.1;AT3G48410.2 AT3G48410.1;AT3G48410.2 2;2 2;2 2;2 AT3G48410.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr3:17925786-17928100 REVERSE LENGTH=385;AT3G48410.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | alpha/beta-Hydrolases superfa 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7 7 7 43.447 385 385;427 2 1 2 1 0.0017004 2.8124 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.7125 1.9603 27.62 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.4 3.4 3.6 3.6 70251000 30760000 39491000 0 0 0 0 0 0 41993000 17284000 24709000 28258000 13476000 14782000 3265 18326;30058 True;True 20725;34318 101239;101240;164493;164494 129715;209587;209588 129715;209587 AT3G48420.1 AT3G48420.1 11 11 11 AT3G48420.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr3:17929743-17931551 FORWARD LENGTH=319 1 11 11 11 10 10 11 10 10 10 11 10 10 10 11 10 42.3 42.3 42.3 34.245 319 319 1.98 29 35 27 0 143.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89055 0.90717 20.765 67 31 Leave out requantified 0.74223 1.2815 0.71281 0.86169 0.69651 1.265 0.85969 0.9309 15.21 16.83 19.875 24.319 16 17 21 13 7 8 10 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.2 39.2 42.3 34.2 27979000000 17639000000 10340000000 7203300000 5016600000 2186700000 7868400000 4738700000 3129600000 8043900000 4812800000 3231100000 4863700000 3070900000 1792700000 3266 178;4523;8073;16692;17955;19201;23469;24710;29489;32268;34705 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 198;199;5168;9151;18874;20324;21684;26355;26356;28085;28086;33705;36762;39538 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1362;1363;1364;1365;1366;1367;1368;1369;1370;1371;1372;1373;1374;32394;32395;32396;32397;32398;32399;56847;56848;56849;56850;56851;56852;56853;56854;117935;117936;127017;127018;127019;127020;127021;127022;127023;127024;136113;136114;136115;136116;136117;136118;136119;136120;136121;136122;136123;136124;136125;136126;136127;136128;136129;136130;136131;163305;163306;163307;163308;163309;163310;163311;163312;163313;163314;163315;163316;163317;163318;163319;163320;163321;163322;163323;163324;163325;163326;163327;163328;173388;173389;173390;173391;173392;173393;173394;173395;173396;173397;173398;173399;206045;206046;206047;206048;223157;223158;241086;241087;241088;241089;241090;241091;241092;241093;241094 1371;32394;56850;117935;127023;136114;163315;173391;206047;223158;241090 1484 3152;3153 190 166;271 AT3G48460.1 AT3G48460.1 1 1 1 AT3G48460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | Chr3:17949496-17951082 FORWARD LENGTH=381 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 42.235 381 381 2 1 3 1 0.0013423 3.0014 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.50507 0.54145 83.002 4 4 Median NaN NaN 0.94001 NaN NaN NaN 1.094 NaN NaN NaN 53.26 NaN 1 1 2 0 1 1 2 0 Median Median Median Median 2.6 2.6 2.6 2.6 99200000 68295000 30905000 21123000 18932000 2191100 23452000 19061000 4391200 54624000 30302000 24322000 0 0 0 3267 38864 True 44224 212118;212119;212120;212121;212122 270564;270565;270566;270567;270568 270565 AT3G48500.1;AT3G48500.2 AT3G48500.1;AT3G48500.2 8;8 8;8 8;8 AT3G48500.1 | Symbols:PTAC10,TAC10,PDE312 | PIGMENT DEFECTIVE 312,PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 10 | Nucleic acid-binding%2C OB-fold-like protein | Chr3:17962209-17965408 FORWARD LENGTH=668;AT3G48500.2 | Symbols:PTAC10,TAC10,PDE312 | PIGMENT DEFECTIV 2 8 8 8 5 4 5 5 5 4 5 5 5 4 5 5 16.9 16.9 16.9 78.813 668 668;697 1.91 8 8 6 0 70.738 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75724 0.68656 27.157 13 7 Leave out requantified 0.70667 0.86282 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AT3G48560.1 | Symbols:CSR1,IMR1,TZP5,ALS,AHAS | ACETOLACTATE SYNTHASE,TRIAZOLOPYRIMIDINE RESISTANT 5,IMIDAZOLE RESISTANT 1,ACETOHYDROXY ACID SYNTHASE,chlorsulfuron/imidazolinone resistant 1 | chlorsulfuron/imidazolinone resistant 1 | Chr3:18001530-180035 1 4 4 4 3 3 3 1 3 3 3 1 3 3 3 1 6 6 6 72.584 670 670 2.1 3 3 4 0 6.325 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92301 0.9306 24.186 10 1 Leave out requantified 0.80342 0.82678 0.93872 NaN 0.77439 0.78589 1.1296 NaN 29.397 33.7 18.554 NaN 3 3 3 1 0 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Median Median 3.6 3.6 4.6 1.2 885890000 437460000 448420000 208570000 97647000 110930000 316620000 147540000 169080000 317690000 172570000 145120000 43002000 19712000 23290000 3270 5608;20479;27329;35966 True;True;True;True 6368;23066;31281;40964 31056;112557;112558;112559;150760;150761;150762;150763;196194;196195 39880;144325;144326;192066;192067;192068;192069;192070;192071;250265;250266 39880;144325;192069;250266 AT3G48680.1 AT3G48680.1 6 6 2 AT3G48680.1 | Symbols:AtCAL2,GAMMA CAL2 | gamma carbonic anhydrase-like 2 | gamma carbonic anhydrase-like 2 | Chr3:18035107-18036773 FORWARD LENGTH=256 1 6 6 2 2 3 5 5 2 3 5 5 0 1 2 2 32 32 8.6 27.956 256 256 2 7 7 7 0 53.61 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63131 0.67025 43.594 16 3 Leave out requantified 1.3016 1.3936 0.41084 0.58721 1.2124 1.2936 0.4757 0.63309 9.7186 24.438 23.407 12.64 2 3 5 6 0 0 1 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 9 19.5 27.7 27.3 2786800000 1522100000 1264800000 448040000 206660000 241390000 589520000 220110000 369420000 851750000 567300000 284450000 897510000 527990000 369520000 3271 18201;27269;28606;29635;30724;33207 True;True;True;True;True;True 20593;31214;32732;32733;33866;35070;37811 100456;150479;150480;157365;157366;157367;157368;162485;162486;162487;162488;167650;167651;180326;180327;180328;180329;180330;180331;180332;180333 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HXXXD-type acyl-transferase family protein | Chr3:18046527-18049295 FORWARD LENGTH=430 1 2 1 1 1 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 5.3 2.6 2.6 48.004 430 430 2 1 1 1 0.0095869 1.9897 By matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.49294 0.60713 41.461 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.8 5.3 5.3 5.3 78878000 53719000 25159000 0 0 0 24329000 16046000 8283000 42578000 29558000 13020000 11971000 8115200 3856000 3274 14053;29145 False;True 15884;33325 77486;77487;77488;77489;77490;159991;159992;159993 100071;100072;100073;100074;100075;203843;203844 100075;203844 AT3G48730.1 AT3G48730.1 15 15 5 AT3G48730.1 | Symbols:GSAM,GSA2 | glutamate-l-semialdehyde aminomutase,glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase 2 | glutamate-1-semialdehyde 2%2C1-aminomutase 2 | Chr3:18049697-18051550 FORWARD LENGTH=472 1 15 15 5 11 15 13 13 11 15 13 13 3 5 3 5 50.2 50.2 15.9 50.141 472 472 1.94 57 67 47 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99844 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protein | Chr3:18141017-18142189 REVERSE LENGTH=160 1 9 9 5 8 8 9 9 8 8 9 9 4 4 5 5 43.8 43.8 22.5 17.957 160 160 2.07 23 24 28 0 28.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9606 1.0215 12.264 67 20 Leave out requantified 1.1083 1.0378 0.81159 0.93047 1.0511 1.0017 0.99443 1.0872 26.112 11.7 16.345 35.075 18 16 16 17 4 5 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.5 42.5 43.8 43.8 55497000000 27102000000 28395000000 9290200000 4445200000 4845000000 14518000000 6710700000 7807200000 13731000000 6921300000 6809600000 17958000000 9024500000 8933100000 3281 4409;7185;7398;7399;8204;17267;25514;35754;35880 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5036;8167;8408;8409;9297;19530;29170;40730;40871 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ARABIDOPSIS THALIANA PEROXIDASE CB,PEROXIDASE 34,peroxidase CB | peroxidase CB | Chr3:18207819-18210041 FORWARD LENGTH=353 1 12 7 5 9 11 10 9 6 7 5 5 4 5 3 3 44.5 30 20.4 38.832 353 353 1.98 35 33 33 0 265.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.8762 4.4511 171.04 13 8 Median 8.1415 4.8762 0.29902 0.12872 7.7175 4.4511 0.36288 0.15206 26.442 76.36 107.77 65.539 4 5 2 2 3 4 0 1 Median Median Median Median 30 43.6 34.8 28.3 4740300000 1715200000 3025100000 1137500000 118970000 1018500000 1942000000 175670000 1766300000 837990000 669460000 168520000 822780000 751090000 71688000 3287 4041;4590;10020;13138;23895;24333;26113;26466;28457;32259;33495;34192 True;False;True;False;False;True;True;True;True;False;False;True 4617;4618;4619;4620;5239;5240;11334;11335;14837;26833;27504;27505;27506;27507;29892;29893;30321;32559;36750;36751;38162;38970 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Symbols:SR34a,SRp34a,At-SR34a | Serine/Arginine-Rich Protein Splicing Factor 34a,SER/ARG-rich protein 34A | SER/ARG-rich protein 34A | Chr3:18332668-18334617 FORWARD LENGTH=297;AT3G49430.7 | Symbols:SR34a,SRp34a,At-SR34a | Serine/Arginine- 7 7 7 6 5 4 7 2 5 4 7 2 4 4 6 2 23.9 23.9 21.2 33.462 297 297;300;300;300;300;300;300 2.27 6 7 13 0 56.552 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7506 0.86643 12.394 22 18 Leave out requantified 0.7506 0.88934 0.89801 1.1628 0.73231 0.81508 1.0444 1.2543 25.795 34.456 39.678 30.224 5 4 10 3 4 4 8 2 Median Median Median Median 19.2 14.8 23.9 9.1 1363500000 678860000 684630000 248440000 147580000 100860000 179300000 82559000 96739000 866750000 419530000 447220000 69006000 29197000 39809000 3291 4582;5419;6464;8467;18260;18651;19241 True;True;True;True;True;True;True 5231;6168;7359;7360;9600;20654;21089;21726 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Leave out requantified Median 4.2 5.4 6.4 7.7 1447400000 659380000 788060000 297000000 126640000 170360000 268200000 120290000 147910000 394010000 215580000 178430000 488230000 196860000 291360000 3306 106;10611;12401;14146;14424;17467;22065;22873;23133;23363;23933;27574;29566;29867;34904 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 119;11982;14007;15982;16344;19758;24805;25708;25990;26243;26880;31565;33788;34113;39754 626;627;628;57910;67797;77982;79780;96466;96467;96468;96469;96470;96471;120224;120225;124386;124387;125750;126987;126988;130108;130109;151984;151985;151986;151987;162073;162074;162075;162076;163669;163670;163671;163672;190048 901;902;903;74354;87218;100681;102889;123759;123760;123761;123762;123763;123764;123765;123766;153932;153933;159220;159221;160950;162492;166472;166473;193667;193668;193669;206470;206471;206472;206473;206474;206475;206476;208577;208578;208579;208580;242269 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8;8 AT3G50950.2 | Symbols:ZAR1 | HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 | HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 | Chr3:18936127-18938685 FORWARD LENGTH=852;AT3G50950.1 | Symbols:ZAR1 | HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 | HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 | Chr3:18936127-18938685 FORWARD L 2 8 8 8 2 4 7 3 2 4 7 3 2 4 7 3 12.7 12.7 12.7 97.039 852 852;852 1.88 5 8 3 0 42.81 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61737 0.73353 112 10 7 Median NaN 3.01 0.24998 0.28993 NaN 2.9101 0.29593 0.33471 NaN 9.9921 76.512 37.129 1 3 4 2 0 1 4 2 Median Median Median Median 3.3 7.2 10.8 4.1 270020000 158120000 111900000 31335000 9947500 21388000 75962000 19899000 56063000 118250000 90718000 27528000 44472000 37556000 6916400 3311 6070;12814;14054;14574;15849;16386;28524;30716 True;True;True;True;True;True;True;True 6891;14472;15885;16509;17934;18534;32634;35060 33748;69921;69922;69923;77491;77492;77493;80650;87433;87434;87435;90592;90593;156918;167608;167609 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flavanone 3-hydroxylase | Chr3:19025409-19026658 FORWARD LENGTH=358;AT3G51240.2 | Symbols:F3H,F3H,TT6 | TRANSPARENT TESTA 6,flavanone 3-hydroxylase | flavanone 3-hydroxy 2 3 3 3 0 2 2 1 0 2 2 1 0 2 2 1 12.8 12.8 12.8 40.275 358 358;274 2 1 3 1 0 7.7823 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.5996 2.4543 101.66 3 2 Median NaN 2.6069 NaN NaN NaN 2.4647 NaN NaN NaN 0.59568 NaN NaN 0 2 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 10.6 10.6 2.2 136400000 79395000 57008000 0 0 0 62471000 15677000 46794000 53006000 42792000 10214000 20926000 20926000 0 3319 18450;24885;34739 True;True;True 20871;28353;39575 102082;137059;137060;189262;189263 130827;174998;174999;241293;241294 130827;174998;241294 AT3G51250.2;AT3G51250.1 AT3G51250.2;AT3G51250.1 1;1 1;1 1;1 AT3G51250.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Senescence/dehydration-associated protein-like protein | Chr3:19028227-19029637 FORWARD LENGTH=378;AT3G51250.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Senescence/dehyd 2 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16262;16263;16264;16265;16266;16267;16268;16269;16270;16271;16272;16273;16274;16275;16276;16277;68209;68210;68211;68212;68213;68214;68215;68216;68217;68218;101593;105927;105928;105929;105930;105931;105932;105933;105934;105935;125215;125216;125217;125218;125219;125220;125221;125222;125223;125224;125225;125226;125227;125228;125229;125230;125231;125232;130502;130503;130504;135870;135871;135872;161873;161874;161875;161876;161877;161878;161879;192482;269533;269534;269535;269536;269537;269538 16268;68212;101593;105930;125225;130503;135872;161875;192482;269534 AT3G51310.1 AT3G51310.1 8 8 7 AT3G51310.1 | Symbols:VPS35C | VPS35 homolog C | VPS35 homolog C | Chr3:19044634-19049321 REVERSE LENGTH=790 1 8 8 7 3 5 3 4 3 5 3 4 3 4 3 3 11.4 11.4 10.4 89.404 790 790 2.13 4 5 6 0 31.557 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0343 1.1671 68.714 10 6 Leave out requantified 1.3152 1.9232 0.34208 0.86666 1.2246 1.756 0.40672 0.94961 92.157 73.552 19.197 34.855 2 2 2 4 2 0 2 2 Median Median Median Median 6.1 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By MS/MS 1.9896 1.8214 102.22 9 6 Median 2.7372 2.1523 NaN 0.25282 2.402 1.9191 NaN 0.27611 36.294 7.3918 NaN 38.853 4 2 0 3 3 1 0 2 Median Median Median Median 5.5 3.8 3.8 7.5 325690000 154100000 171590000 136950000 51295000 85657000 99266000 38323000 60943000 0 0 0 89475000 64482000 24993000 3323 4458;7222;10277;33893 True;True;True;True 5098;8211;11626;38618 24879;40259;40260;40261;40262;56166;184154;184155;184156;184157;184158 32085;51443;51444;51445;51446;72021;234503;234504;234505;234506;234507 32085;51443;72021;234504 AT3G51420.1 AT3G51420.1 8 8 6 AT3G51420.1 | Symbols:SSL4,ATSSL4 | STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 4,strictosidine synthase-like 4 | strictosidine synthase-like 4 | Chr3:19084082-19085451 FORWARD LENGTH=370 1 8 8 6 7 3 5 6 7 3 5 6 5 3 4 4 25.1 25.1 18.9 41.595 370 370 2.2 8 12 15 0 47.637 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83554 0.87413 13.578 31 12 Leave out requantified 0.86741 1.0236 0.8518 0.74295 0.84444 0.94946 1.0567 0.87511 27.168 15.475 20.599 31.404 9 6 9 7 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phosphotriesterase superfamily protein | Chr3:19091013-19092393 FORWARD LENGTH=371 1 2 1 1 2 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 5.1 3.2 3.2 41.124 371 371 1 2 0.0094422 2.0173 By MS/MS By MS/MS By matching 0.79798 0.72285 26.716 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 5.1 3.2 0 1.9 55080000 30366000 24714000 20180000 12121000 8059400 34900000 18245000 16655000 0 0 0 0 0 0 3326 32269;39538 True;False 36763;44995 175223;175224;215966;215967 223159;223160;275626;275627 223159;275627 AT3G51460.1 AT3G51460.1 5 5 3 AT3G51460.1 | Symbols:RHD4 | ROOT HAIR DEFECTIVE 4 | Phosphoinositide phosphatase family protein | Chr3:19093007-19097142 FORWARD LENGTH=597 1 5 5 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 1 2 8.9 8.9 5.4 68.237 597 597 2.38 2 4 7 0 12.623 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1291 1.0852 10.477 11 4 Leave out requantified 1.1598 0.88819 1.0022 1.1534 1.1261 0.82086 1.1695 1.3779 16.149 33.869 22.493 16.126 3 4 2 2 1 2 0 1 Median Median Median Median 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(TPR)-containing protein | Chr3:19333232-19341295 FORWARD LENGTH=1403;AT3G52140.2 | Symbols:FMT,NOXY38,FRIENDLY | FRIENDLY MITOCH 4 31 31 31 26 24 21 20 26 24 21 20 26 24 21 20 25.2 25.2 25.2 153.26 1403 1403;1407;1419;1396 1.94 57 33 49 0 291.05 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92262 0.94817 25.936 109 35 Leave out requantified 0.98573 0.91326 0.94296 0.82259 0.90272 0.84092 1.084 0.91252 39.788 23.087 25.396 23.795 31 30 24 24 11 9 5 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.9 19.6 17.4 16 7575800000 3851100000 3724700000 2131900000 1076800000 1055100000 1883100000 892420000 990720000 1902400000 978980000 923410000 1658400000 902880000 755490000 3345 332;601;611;1984;4697;6061;8123;8498;9237;10170;13725;14531;16006;19976;21580;23909;27330;27571;28804;29281;32475;32888;33296;34325;35350;36770;37011;37281;38297;38344;38942 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Symbols:ATOEP7,OEP7 | OUTER ENVELOPE MEMBRANE PROTEIN 7,outer envelope membrane protein 7 | outer envelope membrane protein 7 | Chr3:19429775-19429969 FORWARD LENGTH=64 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 31.2 31.2 31.2 6.7636 64 64 1.25 3 1 0 8.696 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2849 1.2984 21.602 4 2 Median 1.3489 NaN NaN NaN 1.2195 NaN NaN NaN 32.522 NaN NaN NaN 2 1 1 0 2 0 0 0 Median Median Median Median 31.2 31.2 31.2 0 438990000 183810000 255170000 180180000 71972000 108210000 142690000 53723000 88967000 116120000 58118000 58002000 0 0 0 3354 28746 True 32888 158081;158082;158083;158084 201372;201373;201374;201375;201376 201376 AT3G52430.1 AT3G52430.1 1 1 1 AT3G52430.1 | Symbols:ATPAD4,PAD4 | ARABIDOPSIS PHYTOALEXIN DEFICIENT 4,PHYTOALEXIN DEFICIENT 4 | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr3:19431566-19434292 FORWARD LENGTH=541 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 2.4 2.4 2.4 60.984 541 541 1.5 1 1 0.0027706 2.5254 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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5454;5455;5456;5457;5458;5459;5460;5461;5462;5463;5464;5465;5466;5467;5468;5469;5470;5471;5472;5473;5474;5475;5476;5477;5478;5479;5480;5481;5482;5483;5484;5485;5486;5487;5488;5489;5490;5491;5492;5493;5494;5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;5502;5503;5504;5505;35855;35856;35857;35858;35859;35860;35861;35862;35863;35864;35865;35866;35867;35868;35869;35870;35871;35872;35873;35874;35875;35876;35877;35878;35879;35880;64196;64197;64198;64199;64200;64201;64202;64203;117307;117308;117309;117310;117311;117312;117313;117314;117315;117316;117317;117318;231532;231533;231534;231535;231536;231537;243531;243532;243533;243534;243535;243536;243537;243538;243539;243540;249351;249352;249353;249354;249355;249356;249357 5491;35879;64200;117312;117317;231535;243533;249352 2022 74 AT3G52700.2 AT3G52700.2 1 1 1 AT3G52700.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr3:19532610-19533093 REVERSE LENGTH=135 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 5.2 5.2 5.2 15.301 135 135 2 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 5.2 5.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3361 24456 True 27682 133731;133732 170859;170860 170860 3232 1 AT3G52730.1;AT3G52730.2 AT3G52730.1 3;1 3;1 3;1 AT3G52730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquinol-cytochrome C reductase UQCRX/QCR9-like family protein | Chr3:19543146-19544167 REVERSE LENGTH=72 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 31.9 31.9 31.9 8.4485 72 72;79 2 9 9 9 0 47.982 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94025 1.0376 20.736 24 11 Leave out requantified 1.2471 1.4626 0.72675 0.70669 1.193 1.351 0.91309 0.80353 18.573 27.639 21.336 9.258 5 7 6 6 3 4 2 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 31.9 31.9 31.9 31.9 4830200000 2285500000 2544600000 1045800000 444910000 600860000 1242100000 483620000 758530000 1300400000 680510000 619930000 1241800000 676490000 565330000 3362 12455;28318;38405 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requantified 1.181 0.95359 0.62032 0.93441 1.0608 0.90283 0.70719 1.0116 37.115 18.667 24.944 26.444 3 3 2 4 1 2 1 3 Median Median Median Median 23.7 20.3 29.1 20 488350000 250790000 237560000 96248000 46026000 50222000 79456000 39094000 40362000 132730000 79425000 53303000 179920000 86245000 93676000 3363 1781;2339;6250;13931;18893;35707 False;True;False;True;True;False 2020;2635;7130;15749;15750;21350;40672 10064;12950;12951;12952;34842;34843;34844;76857;76858;76859;76860;76861;76862;76863;76864;76865;76866;104553;104554;104555;104556;194524;194525;194526;194527;194528;194529;194530;194531 13112;16757;16758;16759;44633;44634;44635;99284;99285;99286;99287;99288;99289;99290;99291;99292;99293;99294;99295;99296;134068;134069;134070;134071;134072;134073;134074;134075;248040;248041;248042;248043;248044;248045;248046;248047;248048;248049;248050;248051;248052;248053;248054 13112;16759;44635;99296;134073;248047 2024;2025;3233 184;323;331 AT3G52840.1;AT3G52840.2 AT3G52840.1;AT3G52840.2 15;15 11;11 11;11 AT3G52840.1 | Symbols:BGAL2 | beta-galactosidase 2 | beta-galactosidase 2 | Chr3:19581244-19586097 FORWARD LENGTH=727;AT3G52840.2 | Symbols:BGAL2 | beta-galactosidase 2 | beta-galactosidase 2 | Chr3:19581082-19586097 FORWARD LENGTH=781 2 15 11 11 10 11 11 10 6 8 8 7 6 8 8 7 29.8 23.8 23.8 82.014 727 727;781 1.95 13 14 11 0 213.45 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1045 1.0957 34.897 30 9 Leave out requantified 0.90121 0.77027 1.3483 1.6149 0.83468 0.74075 1.4705 1.8585 16.272 17.763 12.562 32.262 7 8 10 5 3 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.8 23.8 21 21.2 1932000000 866750000 1065300000 541130000 310670000 230460000 362820000 165810000 197020000 758030000 274360000 483670000 270060000 115920000 154140000 3364 4398;5329;12009;13139;14273;15244;19595;20379;20380;20913;23248;26945;30821;32104;33639 True;True;True;False;True;False;False;True;True;True;True;True;True;False;True 5017;6068;13573;14838;16167;16168;17259;17260;22110;22955;22956;23535;26115;30853;35176;36582;38326 24391;24392;29438;65603;65604;65605;65606;65607;65608;65609;71572;71573;71574;78987;78988;78989;78990;78991;78992;84275;84276;84277;84278;84279;84280;84281;84282;84283;84284;84285;84286;108138;108139;108140;108141;112124;112125;112126;112127;112128;112129;112130;112131;112132;112133;114548;114549;126281;148819;148820;148821;168103;168104;174420;174421;174422;182865;182866;182867;182868 31515;31516;37848;84411;84412;84413;84414;84415;84416;84417;84418;91973;91974;91975;101907;101908;101909;101910;101911;101912;101913;101914;101915;108680;108681;108682;108683;108684;108685;108686;108687;108688;108689;108690;108691;138724;138725;138726;138727;143811;143812;143813;143814;143815;143816;143817;143818;143819;143820;143821;146789;146790;161575;189606;189607;189608;189609;214121;214122;222195;232923;232924;232925;232926;232927;232928 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available | no full name available | 2%2C3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase | Chr3:19822813-19823298 FORWARD LENGTH=135;AT3G53470.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2%2C3-bis 2 5 5 5 2 1 3 3 2 1 3 3 2 1 3 3 28.9 28.9 28.9 15.375 135 135;136 2.08 3 5 4 0 19.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97245 1.0894 97.172 8 2 Leave out requantified 3.177 NaN 0.9535 0.77053 2.9096 NaN 1.1083 0.93724 122.51 NaN 10.928 13.856 2 1 2 3 0 1 0 1 Median Median Median Median 17 7.4 23.7 23 1492200000 725740000 766480000 300220000 104630000 195590000 144080000 54684000 89397000 506960000 272460000 234500000 540960000 293970000 247000000 3382 3280;28879;28880;29934;39483 True;True;True;True;True 3751;33030;33031;34186;44927 18402;158696;158697;158698;158699;163991;163992;163993;163994;163995;163996;215576 23742;202164;202165;202166;208979;208980;208981;208982;208983;208984;208985;275111 23742;202164;202166;208982;275111 AT3G53480.1 AT3G53480.1 4 2 2 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UDP-glucuronic acid decarboxylase 1 | Chr3:19841635-19844057 FORWARD LENGTH=433;AT3G53520.1 | Symbols:ATUXS1,UXS1 | UDP-glucuronic acid decarboxylase 1 | UDP-glucuronic acid decar 4 9 7 7 6 8 5 5 5 6 3 3 5 6 3 3 25.2 21.5 21.5 48.402 433 433;435;458;354 1.94 7 4 6 0 17.418 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.079 0.98998 24.63 15 5 Leave out requantified 1.4328 1.1387 0.44004 0.64442 1.3329 1.0693 0.55636 0.69995 33.449 9.6206 22.61 19.083 4 5 3 3 0 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Median Median 16.4 21.9 13.9 14.5 749460000 395230000 354230000 184840000 85206000 99631000 226230000 105380000 120850000 146700000 98086000 48615000 191690000 106560000 85128000 3384 10145;11563;12714;16762;17414;18456;28614;31167;37584 True;True;True;False;True;True;False;True;True 11478;13057;14364;18949;19700;20877;32742;35549;42801 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2325;37058 11476;11477;176644 14889;14890;224994 14889;224994 AT3G53580.1 AT3G53580.1 8 8 8 AT3G53580.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | diaminopimelate epimerase family protein | Chr3:19864784-19866907 FORWARD LENGTH=362 1 8 8 8 7 8 7 6 7 8 7 6 7 8 7 6 18.8 18.8 18.8 38.984 362 362 1.97 12 13 11 0 20.642 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86594 0.90209 18.259 30 14 Leave out requantified 0.87042 0.95327 0.90113 0.79708 0.78697 0.906 1.0757 0.92074 49.056 27.37 31.342 19.14 7 8 8 7 4 3 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.3 18.8 18.8 15.7 7461800000 4240400000 3221300000 2131900000 1276100000 855860000 1435800000 844700000 591150000 2191300000 1348900000 842360000 1702700000 770760000 931970000 3387 2887;10000;11292;11954;11955;18176;33376;34826 True;True;True;True;True;True;True;True 3309;11312;12751;13514;13515;20565;38027;39669 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protein | Chr3:20001588-20005063 FORWARD LENGTH=545;AT3G54010.1 | Symbols:DEI1,PAS1 | PASTICCINO 1 | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase fami 2 2 2 2 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 6.6 6.6 6.6 62.12 545 545;635 2 2 0.0013397 2.9789 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 6.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3400 29590;32722 True;True 33813;37272 162186;177739 206627;226422 206627;226422 1545 486 AT3G54050.2;AT3G54050.1 AT3G54050.2;AT3G54050.1 17;17 17;17 17;17 AT3G54050.2 | Symbols:HCEF1,cfbp1 | high cyclic electron flow 1 | high cyclic electron flow 1 | Chr3:20016951-20018527 FORWARD LENGTH=417;AT3G54050.1 | Symbols:HCEF1,cfbp1 | high cyclic electron flow 1 | high cyclic electron flow 1 | Chr3:20016951-2001 2 17 17 17 15 17 17 17 15 17 17 17 15 17 17 17 39.1 39.1 39.1 45.161 417 417;417 2.07 55 71 69 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0365 1.0779 23.04 144 33 Leave out requantified 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carrot EP3-3 chitinase | Chr3:20145935-20147034 FORWARD LENGTH=273 1 3 3 3 2 2 3 1 2 2 3 1 2 2 3 1 17.2 17.2 17.2 29.436 273 273 1.75 4 2 2 0 53.335 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 12.8 12.8 17.2 7 144780000 69696000 75087000 6044300 0 6044300 16470000 0 16470000 122270000 69696000 52573000 0 0 0 3414 1790;7130;12458 True;True;True 2033;8110;14078 10103;10104;10105;10106;39824;39825;39826;68137 13158;13159;13160;13161;50878;50879;50880;87621 13159;50880;87621 1551 236 AT3G54440.1;AT3G54440.2;AT3G54440.3 AT3G54440.1;AT3G54440.2;AT3G54440.3 18;18;18 18;18;18 18;18;18 AT3G54440.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycoside hydrolase family 2 protein | Chr3:20148494-20157019 REVERSE LENGTH=1107;AT3G54440.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycoside hydrolase family 2 prot 3 18 18 18 10 12 13 15 10 12 13 15 10 12 13 15 17.4 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290;562;564 AT3G54470.1 AT3G54470.1 14 14 14 AT3G54470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | uridine 5-monophosphate synthase / UMP synthase (PYRE-F) (UMPS) | Chr3:20168285-20170245 REVERSE LENGTH=476 1 14 14 14 10 11 12 13 10 11 12 13 10 11 12 13 33 33 33 51.85 476 476 2.15 15 22 24 0 87.248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0558 1.1319 21.983 53 12 Leave out requantified 0.99133 0.78911 1.3151 1.2403 0.94103 0.73235 1.5406 1.4151 18.426 14.892 16.352 16.322 12 13 14 14 2 3 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.1 26.5 28.6 30.5 6275900000 3249900000 3026000000 943450000 462810000 480640000 1096000000 639690000 456310000 2260600000 1133900000 1126600000 1975900000 1013500000 962390000 3416 976;1669;6403;9475;11540;13225;14677;19294;20882;28466;29345;35466;36753;37038 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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superfamily protein | Chr3:20211048-20212876 FORWARD LENGTH=399 1 5 4 4 1 4 2 5 1 3 2 4 1 3 2 4 13 10.5 10.5 43.142 399 399 1.82 4 5 2 0 10.021 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2752 1.2341 38.357 5 1 Median NaN NaN NaN 1.4722 NaN NaN NaN 1.7194 NaN NaN NaN 17.542 1 1 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 2.8 10.5 5.8 13 432700000 197650000 235050000 81370000 34323000 47047000 92383000 47763000 44620000 97079000 50651000 46427000 161870000 64916000 96953000 3418 4172;12040;30472;34540;34815 True;False;True;True;True 4766;13605;34793;39349;39658 23328;23329;23330;23331;65755;65756;166374;187925;187926;187927;187928;189599;189600 30218;30219;30220;30221;84577;84578;211901;239437;239438;239439;239440;241708;241709 30220;84578;211901;239439;241709 AT3G54610.1 AT3G54610.1 1 1 1 AT3G54610.1 | Symbols:HAG01,HAT1,HAC3,HAG1,BGT,GCN5 | BIG TOP,General Control Nonderepressible 5,HISTONE ACETYLTRANSFERASE 1,histone acetyltransferase of the GNAT family 1 | histone acetyltransferase of the GNAT family 1 | Chr3:20213593-20217375 FORWARD 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1.8 1.8 1.8 63.123 568 568 1.33 2 1 0.0094521 2.0198 By MS/MS By MS/MS By matching 1.088 1.0973 6.3135 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 0 197460000 83472000 113990000 56810000 21755000 35055000 66106000 27451000 38655000 74543000 34265000 40278000 0 0 0 3419 36707 True 41831 200205;200206;200207 255378;255379 255379 AT3G54640.1 AT3G54640.1 4 4 4 AT3G54640.1 | Symbols:TRP3,TSA1 | TRYPTOPHAN-REQUIRING 3,tryptophan synthase alpha chain | tryptophan synthase alpha chain | Chr3:20223331-20225303 REVERSE LENGTH=312 1 4 4 4 1 3 2 0 1 3 2 0 1 3 2 0 26.6 26.6 26.6 33.199 312 312 1.89 2 6 1 0 45.695 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7242 1.5796 18.556 7 4 Leave out requantified NaN 1.7242 0.45341 NaN NaN 1.5796 0.50975 NaN NaN 18.556 33.434 NaN 0 4 3 0 0 1 3 0 Median Leave out requantified Median Median 6.7 19.6 13.8 0 450070000 288750000 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harvesting complex gene 1 | chlorophyll a-b bin 4 10 10 10 8 8 10 9 8 8 10 9 8 8 10 9 46.5 46.5 46.5 23.262 213 213;241;164;207 2.24 23 30 47 0 46.692 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1608 1.1738 47.691 95 19 Leave out requantified 1.0748 0.74215 0.8831 1.8226 0.96273 0.70309 1.08 1.9694 36.973 7.9261 48.435 25.784 27 21 21 26 9 2 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39 39 46.5 46.5 101000000000 38587000000 62413000000 23691000000 9100500000 14590000000 24145000000 11392000000 12753000000 24462000000 9846500000 14615000000 28703000000 8248400000 20454000000 3428 9763;12247;19214;19936;26668;30262;30263;37832;38819;39095 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 11053;13842;21697;22475;30558;34542;34543;43077;43078;44177;44493 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lambda 2 | glutathione transferase lambda 2 | Chr3:20398718-20400305 REVERSE LENGTH=292 1 8 8 8 5 5 7 6 5 5 7 6 5 5 7 6 38.7 38.7 38.7 33.057 292 292 1.94 10 14 8 0 114.1 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72619 0.73496 23.815 30 8 Leave out requantified 0.86921 1.6992 0.42386 0.57412 0.82597 1.5353 0.48701 0.64252 11.964 41.366 28.608 1.322 6 7 9 8 1 1 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.3 24.7 35.6 25 4197700000 2162700000 2035000000 902330000 349960000 552370000 734770000 266640000 468130000 1584500000 1085400000 499090000 976030000 460620000 515410000 3433 16566;16632;26910;28001;31223;36083;36600;38729 True;True;True;True;True;True;True;True 18736;18807;30817;32030;35609;41092;41709;44076 91454;91455;91759;91760;91761;91762;148684;148685;148686;154043;154044;169902;196768;196769;196770;196771;196772;196773;196774;196775;199550;199551;199552;199553;199554;199555;211391;211392;211393;211394;211395;211396 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full name available | Membrane fusion protein Use1 | Chr3:20620 5 5 5 5 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 2 1 31.2 31.2 31.2 26.836 240 240;240;236;242;244 1.33 7 1 1 0 10.202 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3142 1.2514 42.754 4 2 Median 1.4707 NaN NaN NaN 1.3655 NaN NaN NaN 49.607 NaN NaN NaN 2 1 0 1 1 1 0 0 Median Median Median Median 10.8 15 16.2 9.2 179620000 124630000 54987000 36139000 15959000 20180000 10795000 3654600 7140200 50157000 50157000 0 82527000 54861000 27667000 3447 9653;16315;17301;22192;30597 True;True;True;True;True 10934;18457;19568;24941;34929 52833;90199;95640;95641;120799;120800;120801;167037;167038 67807;115719;122742;122743;154698;154699;154700;212802;212803;212804 67807;115719;122742;154699;212803 AT3G55610.1;AT3G55610.2 AT3G55610.1;AT3G55610.2 25;21 13;11 13;11 AT3G55610.1 | Symbols:P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthase 2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthase 2 | Chr3:20624278-20628989 REVERSE LENGTH=726;AT3G55610.2 | Symbols:P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthase 2 | delta 1-pyrrolin 2 25 13 13 19 21 21 21 9 9 9 9 9 9 9 9 39.3 20.9 20.9 78.87 726 726;622 2.05 16 20 19 0 127.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0866 1.0492 31.685 45 14 Leave out requantified 0.98139 0.91522 1.5147 1.0421 0.90071 0.8402 1.7992 1.1677 22.668 11.194 14.325 21.351 10 10 14 11 1 4 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.4 34.8 33.2 34.6 3395400000 1686500000 1708900000 722790000 389640000 333150000 848860000 505520000 343340000 1073500000 415870000 657670000 750180000 375460000 374730000 3448 455;965;5981;6125;7894;11187;14514;15314;15952;17768;19745;20458;20608;21528;22415;22655;27273;27347;27909;29390;30325;33601;35509;35771;35809 True;True;True;False;False;True;False;True;True;False;True;False;False;True;True;False;True;True;False;False;False;True;False;True;False 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Symbols:no symbol available | no full name available | Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | Chr3:20743529-20745049 REVERSE LENGTH=228 1 2 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 8.8 5.7 5.7 24.506 228 228 2 2 1 2 0.0015232 2.9173 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8475 0.80089 20.795 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 8.8 8.8 8.8 8.8 101900000 57365000 44537000 20132000 11080000 9052700 22516000 13161000 9355500 22077000 12859000 9218100 37176000 20265000 16911000 3455 10626;19111 False;True 12000;21588 58006;58007;58008;58009;58010;58011;58012;105734;105735;105736;105737;105738 74476;74477;74478;74479;74480;74481;74482;135575;135576;135577;135578;135579;135580;135581 74481;135576 AT3G56010.1 AT3G56010.1 2 2 2 AT3G56010.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein | Chr3:20788758-20789656 FORWARD LENGTH=201 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 10.9 10.9 10.9 21.921 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LENGTH=209;AT3G56110.3 | Symbols:PRA1.B1 | prenylated RAB acceptor 1.B1 | prenylated RAB acceptor 1.B1 | Chr3:20822228-20822857 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.4 12.4 12.4 22.618 209 209;209;209;209 1.75 2 1 1 0 6.1985 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 12.4 12.4 12.4 12.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3459 3509 True 4011 19584;19585;19586;19587 25283;25284;25285;25286 25284 AT3G56120.1 AT3G56120.1 2 2 2 AT3G56120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr3:20823243-20826357 FORWARD LENGTH=468 1 2 2 2 0 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 6.2 6.2 6.2 52.914 468 468 1.75 2 1 1 0 10.571 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 6.2 3.2 3 13247000 6616000 6630600 0 0 0 13247000 6616000 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Symbols:no symbol available | no full name available | potassium transporter | Chr3:20878743-20879541 REVERSE LENGTH=173 1 2 2 2 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 0 0 12.7 12.7 12.7 19.922 173 173 2.33 1 2 0.00041485 4.1116 By MS/MS By MS/MS 2.2276 2.0393 182.04 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 12.7 5.8 0 0 21917000 8905000 13012000 10815000 7316800 3498600 11102000 1588200 9513700 0 0 0 0 0 0 3467 24739;28929 True;True 28126;28127;33083 136001;136002;158993 173684;173685;202536 173685;202536 3329 92 AT3G56310.1;AT3G56310.2 AT3G56310.1;AT3G56310.2 8;7 8;7 8;7 AT3G56310.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Melibiase family protein | Chr3:20882886-20885745 FORWARD LENGTH=437;AT3G56310.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Melibiase family protein | Chr3:20882886-2088 2 8 8 8 4 6 4 7 4 6 4 7 4 6 4 7 21.7 21.7 21.7 48.362 437 437;413 2.09 7 7 9 0 56.263 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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N2%2CN2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase | Chr3:20890250-20891933 FORWARD LENGTH=433 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 4.4 4.4 4.4 48.472 433 433 1.67 1 2 0.0031216 2.4684 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 4.4 4.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3469 25710 True 29390 142045;142046;142047 181238;181239;181240 181240 1574 55 AT3G56340.1 AT3G56340.1 5 5 3 AT3G56340.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S26e family protein | Chr3:20892309-20893343 REVERSE LENGTH=130 1 5 5 3 5 4 4 4 5 4 4 4 3 2 2 2 35.4 35.4 16.9 14.628 130 130 2.02 12 15 13 0 70.154 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1039 1.1193 8.498 24 4 Leave out requantified 1.1392 1.0798 0.99448 0.94248 1.0348 1.0003 1.1274 1.0718 26.407 16.043 5.1803 13.822 5 6 7 6 0 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.4 30 30 30 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AT3G56460.1 AT3G56460.1 9 9 9 AT3G56460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein | Chr3:20933029-20934425 REVERSE LENGTH=348 1 9 9 9 9 7 6 7 9 7 6 7 9 7 6 7 36.8 36.8 36.8 37.265 348 348 2.17 14 11 22 0 70.154 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95395 0.97051 24.643 42 20 Leave out requantified 1.24 1.289 0.78715 0.68662 1.1695 1.1235 0.9001 0.74918 26.184 17.668 18.17 21.339 17 9 7 9 10 4 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.8 34.2 28.4 30.7 3741700000 1881100000 1860600000 1293700000 568460000 725260000 728920000 314260000 414660000 768750000 437740000 331000000 950320000 560650000 389670000 3471 15121;17009;19302;21090;24149;30273;34786;36430;39139 True;True;True;True;True;True;True;True;True 17119;19227;21792;23732;27198;27199;34560;39627;41500;44541 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11 11 AT3G56650.1 | Symbols:PPD6 | PsbP-domain protein 6 | thylakoid lumenal protein (Mog1/PsbP/DUF1795-like photosystem II reaction center PsbP family protein) | Chr3:20984807-20985913 FORWARD LENGTH=262 1 11 11 11 10 10 9 11 10 10 9 11 10 10 9 11 53.1 53.1 53.1 28.63 262 262 2.03 24 35 27 0 204.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78951 0.84772 16.222 65 13 Leave out requantified 0.86418 1.2752 0.60617 0.73405 0.81639 1.2192 0.69588 0.82279 24.895 15.122 19.763 30.333 14 16 15 20 2 4 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.6 48.9 46.6 53.1 15361000000 8167600000 7193300000 2956000000 1632200000 1323800000 3947700000 1655400000 2292200000 4669700000 2847900000 1821800000 3787500000 2032100000 1755300000 3473 1436;1974;4160;16270;16831;23308;28038;32983;35616;36810;39435 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1629;2238;4753;18407;19023;26180;26181;32071;37565;40570;41948;44877 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1 | Transmembrane proteins 14C | Chr3:21193960-21195547 FORWARD LENGTH=226 1 4 4 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 30.1 30.1 30.1 24.347 226 226 1.85 10 11 6 0 54.956 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77557 0.86701 23.827 24 1 Leave out requantified 1.395 1.9532 0.54876 0.67664 1.2814 1.8531 0.6453 0.74126 30.205 54.584 68.335 46.994 5 5 5 9 0 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.1 30.1 18.6 30.1 3780500000 2084000000 1696500000 816890000 375090000 441800000 924840000 383170000 541670000 898420000 622340000 276080000 1140400000 703390000 436980000 3488 9802;21800;31388;33708 True;True;True;True 11101;24513;35795;38406 53616;53617;53618;53619;53620;53621;53622;53623;118945;118946;118947;118948;118949;118950;118951;118952;170772;170773;170774;170775;183199;183200;183201;183202;183203;183204;183205 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Symbols:VLN3,ATVLN3 | villin 3 | villin 3 | Chr3:21243615-21249809 REVERSE LENGTH=965;AT3G57410.7 | Symbols:VLN3,ATVLN3 | villin 3 | vill 10 25 23 21 14 16 21 18 13 14 19 16 12 13 18 14 36 33.5 31.2 106.35 965 965;965;965;965;965;965;965;965;821;727 1.97 24 31 22 0 227.42 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81956 0.9089 21.853 58 23 Leave out requantified 0.64054 1.1126 0.83706 0.86553 0.59894 1.0293 0.96864 0.92643 21.644 10.535 19.719 28.739 12 14 18 14 3 7 9 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.5 24.2 31.1 26.6 4230800000 2324600000 1906200000 648080000 389150000 258930000 899990000 442870000 457120000 1560800000 876480000 684310000 1122000000 616100000 505890000 3493 55;1201;3600;6774;8409;13343;14826;16638;18576;19482;19763;23918;26243;26867;27806;28934;29379;30287;31862;34068;34488;35776;35987;37198;38766 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Symbols:NRPA1 | nuclear RNA polymerase A1 | nuclear RNA polymerase A1 | Chr3:21353746-21362814 FORWARD LENGTH 4 5 5 5 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 3.9 3.9 3.9 186.04 1657 1657;1670;1376;1391 2 2 3 2 0 13.36 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.43952 0.50416 63.257 3 2 Median NaN NaN 0.33884 NaN NaN NaN 0.38588 NaN NaN NaN 37.813 NaN 0 1 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 1.4 1.6 1.4 0.9 91104000 55393000 35711000 8020700 0 8020700 19153000 9270900 9881700 63931000 46122000 17809000 0 0 0 3500 805;1545;8340;17527;19162 True;True;True;True;True 902;1757;9444;19821;21640 4598;4599;8820;45790;45791;96766;105935 6007;6008;11499;58711;58712;124140;135833 6007;11499;58712;124140;135833 AT3G57790.2;AT3G57790.1 AT3G57790.2;AT3G57790.1 1;1 1;1 1;1 AT3G57790.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pectin lyase-like superfamily protein | Chr3:21405387-21407088 REVERSE LENGTH=490;AT3G57790.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pectin lyase-like superfamily 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Symbols:no symbol available | no full name available | Integrin-linked protein kinase fa 6 2 2 2 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 4.9 4.9 4.9 41.388 369 369;432;432;471;534;534 2 2 2 2 0 4.9083 By MS/MS By matching By MS/MS 1.1063 1.0974 28.59 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.9 2.7 4.9 0 26871000 11357000 15514000 0 0 0 7473400 2876900 4596500 19398000 8480500 10917000 0 0 0 3517 5006;32148 True;True 5705;36631 27728;27729;27730;174612;174613;174614 35722;35723;35724;222439;222440 35724;222440 AT3G58830.2;AT3G58830.1;AT3G58830.3 AT3G58830.2;AT3G58830.1;AT3G58830.3 2;2;1 2;2;1 2;2;1 AT3G58830.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | haloacid dehalogenase (HAD) superfamily protein | Chr3:21755172-21756652 REVERSE LENGTH=348;AT3G58830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | haloacid dehalogenase ( 3 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 5.2 5.2 5.2 39.093 348 348;343;332 2.29 1 3 3 0.0017097 2.8906 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Median Median 3.4 0 5.8 2.5 202220000 75868000 126350000 100310000 36058000 64249000 0 0 0 101910000 39810000 62104000 0 0 0 3561 6422;14356 True;True 7314;16270 35670;35671;79442;79443 45695;45696;102487;102488 45696;102488 AT3G61130.1 AT3G61130.1 2 2 2 AT3G61130.1 | Symbols:GAUT1,LGT1 | galacturonosyltransferase 1 | galacturonosyltransferase 1 | Chr3:22622399-22625514 FORWARD LENGTH=673 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 3.3 3.3 3.3 77.372 673 673 1.8 2 2 1 0.00040469 3.721 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6908 0.69299 46.699 4 3 Median 0.51419 NaN NaN NaN 0.4646 NaN NaN NaN 28.282 NaN NaN NaN 2 1 0 1 2 0 0 1 Median Median Median Median 3.3 1.3 1.3 1.9 170050000 107660000 62393000 92761000 65315000 27446000 15077000 9148800 5927700 0 0 0 62214000 33195000 29019000 3562 31398;36081 True;True 35805;41089 170825;170826;170827;196757;196758 217546;217547;217548;250976;250977 217547;250976 AT3G61140.1 AT3G61140.1 7 7 7 AT3G61140.1 | Symbols:FUS6,ATFUS6,EMB78,ATSK31,AtCSN1,COP11,CSN1,SK31 | ARABIDOPSIS THALIANA FUSCA 6,EMBRYO DEFECTIVE 78,CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 11,COP9 SIGNALOSOME SUBUNIT 1,FUSCA 6,SHAGGY-LIKE KINASE 31 | COP9 signalosome complex subunit 1 | Chr3 1 7 7 7 4 4 5 2 4 4 5 2 4 4 5 2 16.1 16.1 16.1 50.578 441 441 2.35 2 7 8 0 16.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1011 1.1428 36.619 13 5 Leave out requantified 1.1767 1.3799 1.208 1.0045 1.0928 1.2864 1.4252 1.1259 13.452 32.02 71.35 31.088 3 3 5 2 2 1 2 0 Median Median Leave out requantified Median 10.2 10 11.3 4.1 1078600000 546480000 532140000 295030000 128780000 166250000 227140000 123670000 103470000 464440000 253330000 211110000 92011000 40700000 51311000 3563 8978;20761;25259;33822;35635;36261;38244 True;True;True;True;True;True;True 10157;10158;23374;28823;38533;40590;41302;43534 49539;49540;49541;113892;139284;139285;139286;139287;139288;139289;183761;194162;194163;194164;197823;208684;208685 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1 | NAD(P)-binding Rossman 3 11 10 10 8 10 10 6 7 9 9 5 7 9 9 5 34.5 31.8 31.8 32.803 296 296;303;327 1.95 13 17 11 0 31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82345 0.88611 17.316 35 13 Leave out requantified 1.0424 1.2367 0.67341 0.65552 0.95423 1.1199 0.76812 0.76842 34.156 30.489 21.262 23.361 6 11 11 7 3 5 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27 34.1 30.1 19.9 3764200000 2044900000 1719300000 540700000 238370000 302320000 1175000000 552470000 622520000 1339700000 841410000 498290000 708790000 412610000 296170000 3565 3173;11679;13600;13649;13882;13883;16502;18372;24045;36468;38273 True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True 3627;13195;15368;15423;15692;15693;18660;20781;27041;27042;41551;43564 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Symbols:no symbol available | no full name available | DEA(D/H)-box RNA helicase fami 2 8 2 2 6 7 6 8 2 2 2 2 2 2 2 2 17.7 4.8 4.8 56.774 498 498;498 1.88 3 3 2 0 8.5146 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85531 0.898 5.8883 8 0 Leave out requantified 0.93603 1.0453 0.78156 0.65884 0.8503 0.94159 0.93378 0.74474 17.341 10.487 3.3707 18.472 2 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 15.5 15.7 15.7 17.7 749790000 396980000 352800000 188480000 92236000 96245000 148890000 69262000 79624000 212320000 118830000 93493000 200090000 116650000 83441000 3566 13048;14265;14266;25867;27661;32483;33676;35546 False;False;False;False;True;True;False;False 14737;16157;16158;29568;31659;37007;38371;40494 71076;71077;71078;71079;78952;78953;78954;78955;78956;78957;142847;142848;142849;142850;142851;142852;152430;152431;152432;152433;176348;176349;176350;176351;183018;183019;183020;183021;193692 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ARABIDOPSIS THALIANA GAMMA-TUBULIN COMPLEX PROTEIN 2,GAMMA-TUBULIN 2,gamma-tubulin complex protein 2 | gamma-tubulin complex protein 2 | Chr5:1679340-1681719 FORWARD LENGTH=474;AT3G61650.1 | Symbols:TUBG1 | ga 2 2 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 4.9 4.9 4.9 53.277 474 474;474 1.5 1 1 0.00040306 3.663 By MS/MS 1.8658 2.1158 46.456 2 1 Median NaN NaN NaN 1.8658 NaN NaN NaN 2.1158 NaN NaN NaN 46.456 0 0 0 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 4.9 71931000 28741000 43190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71931000 28741000 43190000 3574 6897;26737 True;True 7852;30630 38591;147896 49405;188472 49405;188472 AT3G61760.1;AT3G61760.2;AT3G61760.3 AT3G61760.1;AT3G61760.2;AT3G61760.3 6;6;5 2;2;2 2;2;2 AT3G61760.1 | Symbols:ADL1B,DL1B | DYNAMIN-like 1B | DYNAMIN-like 1B | Chr3:22860546-22864092 REVERSE LENGTH=610;AT3G61760.2 | Symbols:ADL1B,DL1B | DYNAMIN-like 1B | DYNAMIN-like 1B | Chr3:22860753-22864092 REVERSE LENGTH=574;AT3G61760.3 | Symbols:ADL 3 6 2 2 4 2 2 5 0 0 0 2 0 0 0 2 12.6 7.7 7.7 68.083 610 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available | no full name available | RING/U-box superfamily protein | Chr3:23033592-23036653 REVERSE LENGTH=812 6 5 5 5 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 3 9.1 9.1 9.1 90.223 812 812;722;739;743;759;766 1.92 5 4 4 0 25.918 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75608 0.84504 49.532 10 9 Median NaN 1.1508 0.52476 0.89815 NaN 1.0907 0.59959 0.96425 NaN 45.735 29.865 39.12 1 4 2 3 1 3 2 3 Median Median Median Median 4.3 7 5.9 6.4 307910000 171910000 136000000 24985000 16227000 8758800 139210000 60259000 78947000 58114000 38624000 19490000 85607000 56803000 28804000 3586 2949;6566;10185;30725;33501 True;True;True;True;True 3386;7478;11522;35071;38169 16829;16830;16831;16832;36334;55638;167652;167653;167654;167655;167656;182115;182116 21784;21785;21786;21787;46511;71334;213547;213548;213549;213550;213551;231968;231969 21787;46511;71334;213548;231968 AT3G62310.3;AT3G62310.2;AT3G62310.1 AT3G62310.3;AT3G62310.2;AT3G62310.1 11;11;11 4;4;4 4;4;4 AT3G62310.3 | Symbols:no symbol available | no full name 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available | Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein | Chr3:23146931-23147735 FORWARD LENGTH=213 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 9.9 9.9 9.9 23.581 213 213 2.29 2 1 4 0 7.3771 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3132 1.2181 47.861 3 3 Median 0.86065 NaN NaN NaN 0.81619 NaN NaN NaN 59.266 NaN NaN NaN 2 1 0 0 2 1 0 0 Median Median Median Median 9.9 5.6 9.9 4.2 368970000 181850000 187120000 81779000 39406000 42374000 256260000 118880000 137380000 23561000 23561000 0 7365500 0 7365500 3596 9492;15955 True;True 10760;18057 52086;52087;52088;88112;88113;88114;88115 66822;66823;66824;113250;113251;113252;113253 66824;113251 AT3G62600.1 AT3G62600.1 4 4 4 AT3G62600.1 | Symbols:ERDJ3B,ATERDJ3B | | DNAJ heat shock family protein | Chr3:23151038-23153346 REVERSE LENGTH=346 1 4 4 4 1 4 3 1 1 4 3 1 1 4 3 1 13 13 13 39.199 346 346 2.17 3 4 5 0 13.428 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7182 1.7146 131.55 9 6 Median NaN 3.0547 0.16917 NaN NaN 2.6844 0.20463 NaN NaN 9.3452 123.95 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Median 11.8 0 0 11.8 11153000 6874000 4278800 5898200 1619400 4278800 0 0 0 0 0 0 5254600 5254600 0 3598 37425 True 42619 204330;204331 260534;260535 260535 3433 100 AT3G62700.1;AT1G71330.1;AT3G21250.6;AT3G21250.3;AT3G21250.1;AT3G21250.5;AT3G21250.2;AT3G21250.4 AT3G62700.1 21;1;1;1;1;1;1;1 21;1;1;1;1;1;1;1 16;0;0;0;0;0;0;0 AT3G62700.1 | Symbols:MRP10,ABCC14,ATMRP10 | ATP-binding cassette C14,multidrug resistance-associated protein 10 | multidrug resistance-associated protein 10 | Chr3:23190428-23195727 REVERSE LENGTH=1539 8 21 21 16 15 11 15 8 15 11 15 8 13 7 11 5 15.1 15.1 11.7 172.14 1539 1539;324;1048;1048;1453;1459;1464;1470 2.08 17 20 22 0 84.009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94443 0.95929 38.716 42 18 Leave out requantified 1.2804 1.5427 0.58571 0.56492 1.1946 1.527 0.69369 0.65117 29.552 16.493 27.595 29.434 11 11 11 9 4 6 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.2 8.4 11.5 6.8 8450200000 6109000000 2341200000 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glucosidase 8 | beta glucosidase 8 | Chr3:23214884-23216900 FORWARD LENGTH=412;AT3G62750.4 | Symbols:B 11 4 1 1 3 2 3 4 1 0 1 1 1 0 1 1 9.2 2.4 2.4 46.682 412 412;412;461;497;523;369;369;436;424;500;502 2.33 1 2 1 -2 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.44056 0.48736 18.709 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 1 0 1 1 Median Median Median Median 7.5 5.1 7.5 9.2 44024000 33200000 10824000 12215000 7947800 4267600 0 0 0 13932000 11075000 2857500 17876000 14178000 3698600 + 3600 4855;8054;15654;22632 False;False;True;False 5539;9131;17720;25455 26899;26900;26901;26902;44320;86527;86528;86529;123311;123312;123313;123314 34620;34621;34622;34623;34624;34625;56763;111504;111505;111506;111507;157858;157859;157860;157861;157862 34624;56763;111507;157860 3434 312 AT3G62770.3;AT3G62770.1 AT3G62770.3;AT3G62770.1 1;1 1;1 1;1 AT3G62770.3 | Symbols:ATG18a,AtATG18a,PEUP2 | autophagy 18a,PEROXISOME UNUSUAL POSITIONING 2 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr3:23219091-23221110 REVERSE LENGTH=396;AT3G62770.1 | Symbols:ATG18a,AtATG18a,PEUP2 | autophagy 18a,PEROXI 2 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 4.5 4.5 4.5 43.48 396 396;425 1.5 2 2 0 5.7028 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56338 0.67747 22.286 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 4.5 4.5 4.5 105090000 63904000 41183000 0 0 0 34410000 16160000 18250000 38831000 22951000 15881000 31846000 24793000 7052500 3601 16275 True 18412 89909;89910;89911;89912 115359;115360;115361;115362;115363;115364 115359 AT3G62790.1;AT2G47690.1 AT3G62790.1;AT2G47690.1 2;1 2;1 2;1 AT3G62790.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NADH-ubiquinone oxidoreductase-like protein | Chr3:23223321-23224221 REVERSE LENGTH=83;AT2G47690.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NADH-ubiquinone oxidoreducta 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 20.5 20.5 20.5 9.893 83 83;118 2 4 3 4 0 4.8089 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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0.60592 NaN 41.058 NaN 34.125 1 2 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 5.2 14.9 5.2 11.3 437460000 251840000 185610000 65796000 37807000 27989000 175500000 103850000 71649000 75734000 31209000 44525000 120430000 78980000 41451000 3603 9928;16254;33099 True;True;True 11235;18388;37688 54344;54345;89772;179750;179751;179752;179753 69702;69703;115189;228976;228977;228978 69703;115189;228977 AT3G62830.1;AT3G62830.2;AT2G47650.2 AT3G62830.1;AT3G62830.2;AT2G47650.2 5;5;3 3;3;1 2;2;0 AT3G62830.1 | Symbols:UXS2,ATUXS2,AUD1 | UDP-GLUCURONIC ACID DECARBOXYLASE 2 | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr3:23232539-23235353 FORWARD LENGTH=445;AT3G62830.2 | Symbols:UXS2,ATUXS2,AUD1 | UDP-GLUCURONIC ACID DECARBOXYLASE 2 | NA 3 5 3 2 2 5 5 5 1 3 3 3 1 2 2 2 13.3 9.7 7.9 49.971 445 445;445;449 1.7 4 5 1 0 11.509 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62749 0.71122 26.704 10 1 Leave out requantified NaN 1.1691 0.47701 0.78035 NaN 1.0513 0.53386 0.91024 NaN 43.51 20.407 18.218 1 3 3 3 1 0 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.3 13.3 13.3 13.3 905870000 510240000 395640000 126980000 49040000 77943000 232150000 109800000 122360000 256210000 179100000 77104000 290530000 172300000 118230000 3604 8402;9136;16762;28614;37553 True;True;False;False;True 9525;10338;18949;32742;42764 46300;46301;46302;46303;50354;50355;50356;92337;92338;92339;157397;157398;157399;157400;157401;157402;157403;157404;157405;157406;157407;157408;157409;157410;205042;205043;205044 59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;64691;64692;118363;118364;200512;200513;200514;200515;200516;200517;200518;200519;200520;200521;200522;200523;200524;200525;200526;200527;200528;200529;200530;261483;261484;261485;261486;261487 59441;64691;118363;200515;261485 AT3G62870.1 AT3G62870.1 15 3 3 AT3G62870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein | Chr3:23242862-23244273 REVERSE LENGTH=256 1 15 3 3 14 14 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19260;19261;19262;19263;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270;19271;19272;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281;19282;19283;19284;19285;19286;19287;19288;19289;19290;19291;19292;19293;19294;19295;19296;19297;19298;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972;20973;20974;20975;20976;20977;20978;20979;20980;20981;20982;20983;20984;20985;20986;20987;20988;20989;20990;20991;20992;20993;20994;137359;137360;137361;137362;137363;137364;137365;137366;137367;137368;137369;137370;137371;137372;137373;137374;137375;137376;137377;137378;137379;137380;137381;137382;137383;137384;137385;137386;137387;137388;137389;137390;137391;137392;137393;137394;137395;137396;137397;137398;137399;137400;137401;137402;137403;137404;137405;137406;137407;137408;147780;147781;147782;147783;147784;147785;147786;147787;147788;147789;147790;147791;147792;152410;152411;152412;152413;152414;152415;152416;152417;152418;152419;152420;152421;152422;152423;152424;152425;152426;152427;152428;152429;152430;152431;152432;152433;152434;168717;168718;168719;168720;168721;168722;168723;168724;168725;168726;168727;168728;168729;168730;168731;177145;177146;177147;177148;177149;177150;177151;177152;177153;177154;177155;177156;177157;177158;177159;177160;177161;177162;177163;177164;177165;177166;177167;177168;177169;177170;177171;177172;177173;181044;181045;181046;181047;181048;181049;181050;181051;181052;181053;181054;181055;181056;181057;181058;181059;181060;181061;181062;181063;181064;181065;181066;181067;181068;181069;181070;190202;190203;190204;190205;190206;190207;190208;190209;190210;190211;190212;190213;190214;190215;190216;190217;190218;190219;190220;190221;190222;190223;190224;190225;190226;190227;190228;190229;190230;190231;190232;190233;190234;190235;190236;190237;190238;190239;190240;190241;190242;219852;219853;219854;219855;219856;219857;219858;219859;219860;219861;228167;228168;258350;258351;258352;258353;258354;258355;258356;258357;258358;264060;264061;264062;268922;268923;268924;268925;268926;268927;268928;268929;268930;268931;268932;268933;268934;268935;268936;268937;268938;268939;268940;268941;268942;268943;268944;268945;268946;268947;268948;268949;268950;268951;268952;268953;268954;268955;268956;268957;268958;268959;268960;268961;268962;268963;268964 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DNA-binding storekeeper protein-related transcriptional regulator | Chr4:104092-105129 REVERSE LENGTH=345 4 5 5 5 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 3 4 18.8 18.8 18.8 38.186 345 345;319;323;352 1.75 6 3 3 0 34.431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85835 0.92776 28.408 7 2 Leave out requantified 0.852 NaN 0.83888 0.75015 0.7611 NaN 0.972 0.86237 13.582 NaN 21.82 40.36 2 1 2 2 0 0 0 2 Median Median Median Median 9.9 12.8 12.2 16.5 886060000 483710000 402350000 221170000 117530000 103650000 178990000 81734000 97254000 258060000 149700000 108360000 227830000 134750000 93087000 3631 8185;10432;18722;29392;29685 True;True;True;True;True 9272;11790;21166;33600;33919 44898;44899;44900;44901;56982;56983;103510;161260;161261;161262;161263;162766 57475;57476;57477;57478;57479;73097;73098;132696;205483;205484;205485;205486;205487;205488;207400 57477;73097;132696;205483;207400 AT4G00270.1;AT5G14280.1;AT2G25650.1 AT4G00270.1 4;1;1 4;1;1 4;1;1 AT4G00270.1 | Symbols:GeBP | | DNA-binding storekeeper protein-related transcriptional regulator | Chr4:117477-118468 REVERSE LENGTH=302 3 4 4 4 4 1 3 3 4 1 3 3 4 1 3 3 12.9 12.9 12.9 34.058 302 302;301;386 1.88 7 5 5 0 11.033 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82275 0.90403 35.806 16 7 Leave out requantified 1.7651 1.4399 0.6786 0.62245 1.6652 1.3153 0.82193 0.72663 30.97 56.534 15.264 29.97 5 2 5 4 2 1 3 1 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 12.9 3.6 10.3 10.3 1281400000 719580000 561830000 214260000 87034000 127220000 43880000 18920000 24960000 518630000 323710000 194920000 504650000 289920000 214730000 3632 387;2041;17650;18489 True;True;True;True 431;432;2312;19985;20912 2175;2176;2177;2178;2179;2180;2181;11433;97513;97514;97515;97516;97517;102299;102300;102301;102302 2853;2854;2855;2856;2857;2858;2859;14835;125008;125009;125010;131111;131112;131113;131114;131115 2854;14835;125008;131114 3464 46 AT4G00290.1;AT4G00234.1 AT4G00290.1 7;1 7;1 7;1 AT4G00290.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mechanosensitive ion channel protein | Chr4:123097-125300 REVERSE LENGTH=497 2 7 7 7 2 5 3 3 2 5 3 3 2 5 3 3 19.1 19.1 19.1 53.884 497 497;263 1.71 6 6 2 0 28.1 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69086 0.8446 34.943 10 5 Leave out requantified 1.4147 1.1009 0.69086 0.33584 1.3294 0.98238 0.8446 0.40957 8.2058 62.201 20.193 57.528 2 3 3 2 1 3 0 1 Median Median Median Median 5.4 13.5 9.7 9.3 544940000 292990000 251950000 40736000 11468000 29268000 146320000 54583000 91732000 184080000 112540000 71540000 173800000 114400000 59408000 3633 1922;7922;11284;15761;17726;22161;24319 True;True;True;True;True;True;True 2183;8985;12743;17835;20065;24908;27481 10814;43689;43690;61565;87041;87042;87043;97867;97868;120676;120677;120678;120679;132806 14050;55976;55977;79175;112081;112082;112083;125424;125425;154534;154535;154536;154537;169759 14050;55977;79175;112083;125424;154534;169759 3465;3466 183;413 AT4G00370.1 AT4G00370.1 2 2 2 AT4G00370.1 | Symbols:PHT4;4,AtPHT4;4,ANTR2 | anion 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intrinsic protein 1%3B4 | Chr4:186143-187531 REVERSE LENGTH=287;AT4G00430.2 | Symbols:PIP1E,T 2 8 5 5 6 6 6 7 4 4 3 4 4 4 3 4 30 20.2 20.2 30.692 287 287;219 1.92 9 10 7 0 56.515 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89164 0.8715 27.455 22 4 Leave out requantified 0.67598 0.63271 1.7979 1.6121 0.64125 0.58362 2.0555 1.7986 18.378 7.5476 36.49 36.078 6 5 4 7 1 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Median Leave out requantified 26.8 26.8 23 30 5352400000 2381800000 2970500000 1075300000 595020000 480270000 1089000000 646990000 441960000 1578800000 585230000 993540000 1609400000 554580000 1054800000 3636 7176;13146;24188;27593;27594;27595;29937;35342 True;True;False;True;True;True;False;False 8158;14846;27260;31584;31585;31586;34189;40256;40257 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MS/MS 0.80054 0.84312 36.191 23 12 Leave out requantified 0.848 1.6954 0.53155 0.75573 0.77542 1.7013 0.65951 0.86163 69.823 15.936 35.598 35.724 3 7 7 6 1 4 4 3 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 9.1 18 15.6 17.4 1556400000 860240000 696120000 171650000 106090000 65559000 360020000 133050000 226970000 609340000 355930000 253410000 415340000 265160000 150180000 3645 10230;20705;20934;25571;30961;35648;38477;38478 True;True;True;True;True;True;True;True 11577;23309;23557;29237;35329;40605;43797;43798 55946;113601;113602;113603;113604;113605;114623;114624;114625;114626;141358;168713;168714;168715;168716;168717;168718;194229;194230;194231;194232;194233;210016;210017;210018;210019;210020;210021 71749;145594;145595;145596;145597;145598;146887;146888;146889;180412;214869;214870;214871;214872;214873;247686;247687;247688;247689;247690;247691;267917;267918;267919;267920;267921;267922 71749;145597;146889;180412;214872;247690;267917;267921 1643 357 AT4G00860.1 AT4G00860.1 4 4 4 AT4G00860.1 | Symbols:ATOZI1,AT0ZI1 | Arabidopsis thaliana ozone-induced protein 1 | monopolar spindle protein (DUF1138) | Chr4:359548-359868 REVERSE LENGTH=80 1 4 4 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 51.2 51.2 51.2 8.6058 80 80 2.14 5 9 8 0 21.782 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61674 0.67443 44.973 15 3 Leave out requantified 0.90475 2.5583 0.40835 0.38873 0.88208 2.2576 0.48628 0.43517 20.418 12.541 26.951 24.676 4 3 4 4 0 1 1 1 Leave out requantified Median Median Leave out requantified 51.2 51.2 51.2 51.2 1511500000 846360000 665190000 397870000 193860000 204010000 359910000 97476000 262440000 360610000 264930000 95670000 393170000 290090000 103080000 3646 10483;20923;34547;35789 True;True;True;True 11846;23545;23546;39357;39358;40772 57192;57193;57194;57195;114580;114581;114582;114583;114584;114585;114586;187987;187988;187989;187990;187991;187992;187993;195119;195120;195121;195122 73333;73334;73335;73336;73337;146833;146834;146835;146836;146837;146838;146839;239519;239520;239521;239522;239523;239524;239525;248830;248831;248832;248833;248834;248835;248836;248837 73333;146834;239521;248833 1644 3474 41 65 AT4G00900.2;AT4G00900.1 AT4G00900.2;AT4G00900.1 5;5 4;4 4;4 AT4G00900.2 | Symbols:ECA2,ATECA2 | ER-type Ca2+-ATPase 2,ARABIDOPSIS THALIANA ER-TYPE CA2+-ATPASE 2 | ER-type Ca2+-ATPase 2 | Chr4:382690-386226 REVERSE LENGTH=1054;AT4G00900.1 | Symbols:ECA2,ATECA2 | ER-type Ca2+-ATPase 2,ARABIDOPSIS THALIANA ER-TYPE 2 5 4 4 4 2 4 3 3 1 4 3 3 1 4 3 6.8 5.1 5.1 115.83 1054 1054;1054 1.86 5 6 3 0 32.142 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76461 0.88323 39.829 11 6 Median 0.99068 NaN 0.97228 0.74923 0.87185 NaN 1.1718 0.88323 44.674 NaN 36.333 9.7219 3 1 3 4 2 0 2 2 Plateau Median Median Median 5.7 2.8 5.1 3.7 598680000 360530000 238160000 173170000 117290000 55879000 69191000 41316000 27875000 156380000 79895000 76480000 199950000 122020000 77924000 3647 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AT4G01370.1 | Symbols:MPK4,ATMPK4,MAPK4 | MAP kinase 4 | MAP kinase 4 | Chr4:567219-568889 FORWARD LENGTH=376 5 9 9 6 4 5 7 4 4 5 7 4 3 3 5 3 32.4 32.4 22.9 42.851 376 376;346;369;275;275 2.1 11 5 14 0 117.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.41115 0.48515 62.421 23 11 Leave out requantified 1.5336 1.6426 0.32576 0.43536 1.49 1.5333 0.39431 0.4924 31.642 33.734 15.055 17.795 6 4 9 4 3 1 5 2 Median Median Leave out requantified Median 17.3 20.5 26.3 16.5 2654200000 1629700000 1024500000 417840000 177490000 240350000 631140000 260450000 370690000 1234100000 941900000 292240000 371110000 249840000 121270000 3659 5903;12613;15900;16910;21080;21662;24536;28378;30415 True;True;True;True;True;True;True;True;True 6696;14253;17995;19111;23720;24368;27805;32468;34726 32751;32752;32753;32754;32755;32756;32757;32758;32759;32760;32761;32762;32763;68950;68951;68952;68953;87805;87806;93260;115350;118343;134233;134234;156101;156102;156103;156104;166096;166097 41927;41928;41929;41930;41931;41932;41933;41934;41935;41936;41937;41938;41939;41940;41941;41942;41943;88632;88633;88634;88635;88636;88637;112908;112909;119598;147824;151552;171478;171479;198964;198965;198966;198967;198968;211529;211530 41935;88635;112908;119598;147824;151552;171479;198968;211530 AT4G01395.1 AT4G01395.1 6 6 6 AT4G01395.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | conserved oligomeric Golgi complex subunit 4 | Chr4:573098-575648 REVERSE LENGTH=738 1 6 6 6 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 8.5 8.5 8.5 82.977 738 738 1.8 7 4 4 0 12.084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84016 0.82507 32.152 15 6 Leave out requantified 0.7377 1.0573 0.6117 0.55496 0.68154 0.91322 0.74543 0.66543 21.883 25.53 25.543 49.237 4 3 3 5 3 0 0 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 5.3 4.9 5 5.1 719670000 441570000 278100000 135580000 82772000 52805000 136440000 72734000 63711000 144670000 95830000 48845000 302970000 190240000 112740000 3660 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| Symbols:AtcathB3 | | Cysteine proteinases superfamily protein | Chr4:694857-696937 FORWARD LENGTH=359;AT4G01610.1 | Symbols:AtcathB3 | | Cysteine proteinases superfamily protein | Chr4:694857-696937 FORWARD LENGTH=359 2 6 6 6 5 5 6 5 5 5 6 5 5 5 6 5 18.4 18.4 18.4 39.344 359 359;359 2.09 10 11 13 0 60.361 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0671 1.1129 25.793 32 16 Leave out requantified 1.5854 2.3075 0.44499 0.38411 1.4892 2.1677 0.52402 0.43535 45.083 33.565 18.813 25.178 7 8 10 7 3 4 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 14.8 14.8 18.4 14.8 2952300000 1620200000 1332100000 558190000 233800000 324380000 659270000 215500000 443770000 1049500000 702960000 346550000 685320000 467920000 217400000 3662 14998;15385;15805;16141;28194;30412 True;True;True;True;True;True 16983;17418;17886;18261;32254;34722;34723 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MS/MS By MS/MS 0.8233 0.71461 54.532 7 3 Median 1.0624 1.4166 0.35871 NaN 0.95598 1.2772 0.40603 NaN 41.154 10.204 34.223 NaN 2 2 2 1 2 0 0 1 Median Median Median Median 7.6 7.6 7.6 7.6 102570000 59949000 42623000 20655000 9071100 11584000 21072000 7908700 13163000 57350000 40692000 16659000 3495200 2277600 1217600 3663 22894 True 25730 124478;124479;124480;124481;124482;124483;124484 159337;159338;159339;159340;159341;159342;159343;159344 159342 AT4G01660.1 AT4G01660.1 3 3 3 AT4G01660.1 | Symbols:ATATH10,ATABC1,ABC1 | ABC transporter 1 | ABC transporter 1 | Chr4:708652-711095 FORWARD LENGTH=623 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 8 68.627 623 623 2.25 3 1 0 7.672 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96764 1.067 24.4 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 2.2 4 1.8 1.8 59147000 30023000 29124000 22034000 12642000 9391600 17939000 7573100 10366000 0 0 0 19174000 9807600 9366300 3664 8792;17496;29770 True;True;True 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requantified 0.58397 0.81553 0.70277 0.96793 0.565 0.74273 0.7819 1.1268 51.219 26.202 49.14 78.685 3 4 3 4 1 3 0 0 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 14.7 20.1 22.3 15.2 1928700000 1041800000 886920000 442950000 265550000 177410000 499040000 273380000 225660000 400430000 191060000 209370000 586320000 311840000 274480000 3672 1137;17018;24442;25838;26231 True;True;True;True;True 1276;19236;27661;29535;30041;30042 6297;6298;6299;6300;6301;93894;93895;133665;142665;142666;142667;142668;142669;142670;145077;145078;145079;145080 8228;8229;8230;8231;8232;8233;8234;8235;120418;170788;181967;181968;181969;181970;181971;181972;181973;184962;184963;184964;184965 8233;120418;170788;181968;184964 1657 3493 209 85 AT4G01897.1 AT4G01897.1 2 2 2 AT4G01897.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | dihydroorotate dehydrogenase | Chr4:820487-821466 REVERSE LENGTH=122 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.4 16.4 16.4 14.158 122 122 1.67 3 2 1 0.00039448 3.3472 By 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.1 1.1 2.2 1.1 372750000 164850000 207900000 65384000 34190000 31195000 76035000 47434000 28600000 132240000 37362000 94878000 99093000 45863000 53230000 3676 20676;34459 True;False 23279;39263 113458;113459;113460;113461;113462;113463;113464;113465;187525;187526 145421;145422;145423;145424;145425;145426;145427;145428;238938;238939 145424;238938 AT4G02030.1;AT4G02030.2 AT4G02030.1;AT4G02030.2 10;10 10;10 10;10 AT4G02030.1 | Symbols:UNH,VPS51 | UNHINGED,vacuolar protein sorting 51 | Vps51/Vps67 family (components of vesicular transport) protein | Chr4:892262-897175 FORWARD LENGTH=780;AT4G02030.2 | Symbols:UNH,VPS51 | UNHINGED,vacuolar protein sorting 51 | Vps5 2 10 10 10 1 8 6 4 1 8 6 4 1 8 6 4 13.1 13.1 13.1 88.515 780 780;805 1.9 6 10 4 0 18.25 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69332 0.8452 49.815 13 5 Leave out requantified NaN 1.5601 0.69133 0.6716 NaN 1.4644 0.7881 0.75259 NaN 52.525 25.62 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protein | Chr4:940873-943636 FORWARD LENGTH=484;AT4G02120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | CTP synthase family protein | Chr4:940873-9440 5 4 4 3 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 9.7 9.7 8.3 52.814 484 484;556;578;466;517 2.27 2 4 5 0 15.744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2481 1.2532 38.926 9 0 Leave out requantified 1.445 1.8448 NaN 1.0437 1.2835 1.6996 NaN 1.1542 47.64 1.8541 NaN 8.1319 4 2 1 2 0 0 0 0 Leave out requantified Median Median Median 7.4 4.5 4.5 4.5 313330000 141960000 171360000 133540000 59378000 74163000 63740000 23475000 40264000 48559000 28777000 19782000 67490000 30335000 37155000 3679 18973;23864;27456;31250 True;True;True;True 21437;26800;31420;35641 105040;129739;129740;129741;129742;129743;129744;151431;170036;170037;170038 134719;166034;166035;166036;166037;166038;166039;166040;192977;216517 134719;166035;192977;216517 AT4G02230.1 AT4G02230.1 5 2 2 AT4G02230.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L19e 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Symbols:RBP-DR1,BRN1,AtRBP-DR1,AtBRN1 | Bruno-like 1 5 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 4.8 4.8 4.8 48.46 439 439;440;441;429;438 2.33 1 2 3 0.00097771 3.2479 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0036 1.033 27.99 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 4.8 242980000 132010000 110960000 52163000 29495000 22668000 52710000 28954000 23755000 71801000 34516000 37285000 66303000 39046000 27257000 3706 9606;38158 True;True 10884;43434 52562;52563;208213;208214;208215;208216 67390;67391;265598;265599;265600;265601;265602;265603;265604;265605 67391;265602 1669 167 AT4G03190.1 AT4G03190.1 1 1 1 AT4G03190.1 | Symbols:AFB1,ATGRH1,GRH1 | AUXIN SIGNALING F BOX PROTEIN 1,GRR1-like protein 1 | GRR1-like protein 1 | Chr4:1405108-1407057 REVERSE LENGTH=585 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.7 2.7 2.7 65.648 585 585 2 3 0 4.9471 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1769 1.2312 48.459 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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AT4G04200.1 1 1 1 AT4G04200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25) | Chr4:2027165-2028866 FORWARD LENGTH=190 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.4 7.4 7.4 21.228 190 190 2.33 1 2 3 0.00058951 3.2863 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.43365 0.4077 81.87 4 4 Median NaN 0.80799 NaN NaN NaN 0.75427 NaN NaN NaN 89.67 NaN NaN 1 2 0 1 1 2 0 1 Median Median Median Median 7.4 7.4 7.4 7.4 148850000 116150000 32703000 15692000 12263000 3429400 65427000 37977000 27450000 41138000 41138000 0 26592000 24769000 1823100 3716 15856 True 17942 87475;87476;87477;87478;87479;87480 112529;112530;112531;112532;112533;112534 112531 AT4G04210.1;AT4G22150.1 AT4G04210.1;AT4G22150.1 2;1 2;1 2;1 AT4G04210.1 | Symbols:PUX4 | plant UBX domain containing protein 4 | plant UBX domain containing protein 4 | Chr4:2030391-2031670 FORWARD LENGTH=303;AT4G22150.1 | Symbols:PUX3 | plant UBX domain-containing protein 3 | UBA/UBX domain protein | Chr4:1173 2 2 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 7.3 7.3 7.3 32.896 303 303;302 2.25 1 1 2 0.0017068 2.8566 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66814 0.59311 61.044 3 0 Median 0.81278 NaN NaN NaN 0.76308 NaN NaN NaN 35.635 NaN NaN NaN 2 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.3 5 0 5 121550000 70780000 50767000 92481000 49692000 42789000 0 0 0 0 0 0 29065000 21087000 7977800 3717 19240;29199 True;True 21725;33384 106331;106332;106333;160221 136325;136326;136327;204143 136326;204143 AT4G04320.2;AT4G04320.1 AT4G04320.2;AT4G04320.1 8;8 8;8 8;8 AT4G04320.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | malonyl-CoA decarboxylase family protein | Chr4:2113565-2116525 FORWARD LENGTH=517;AT4G04320.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | malonyl-CoA decarboxylase family 2 8 8 8 6 6 5 5 6 6 5 5 6 6 5 5 17.8 17.8 17.8 58.323 517 517;518 2.14 7 10 11 0 50.215 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0977 1.2336 41.49 27 8 Leave out requantified 1.2353 1.3998 1.0041 0.56706 1.1169 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AT4G04340.3;AT4G04340.2;AT4G04340.1 AT4G04340.3;AT4G04340.2;AT4G04340.1 7;7;7 7;7;7 7;7;7 AT4G04340.3 | Symbols:osca1 | reduced hyperosmolality, induced Ca2+ increase 1 (osca1) | ERD (early-responsive to dehydration stress) family protein | Chr4:2123235-2126624 FORWARD LENGTH=772;AT4G04340.2 | Symbols:osca1 | reduced hyperosmolality, indu 3 7 7 7 1 6 2 5 1 6 2 5 1 6 2 5 9.3 9.3 9.3 87.606 772 772;772;772 1.93 4 8 3 0 11.078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5733 1.6597 49.942 11 4 Leave out requantified NaN 0.52693 1.5215 1.7725 NaN 0.48657 1.8419 2.0396 NaN 101.49 4.6879 16.632 1 4 2 4 0 2 0 2 Median Median Median Median 1.6 7.9 2.5 6.5 787630000 284040000 503590000 20777000 12042000 8735600 418750000 145980000 272770000 136500000 52197000 84306000 211600000 73819000 137780000 3719 10991;12218;20762;22698;30959;34798;37816 True;True;True;True;True;True;True 12415;13807;23375;25527;35327;39639;43057 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19741;28559;38030;38031;38032;38033;43944;43945;43946;43947;43948;43949;45189;45190;45191;45192;45193;65453;102679;148433;148434;148435;148436;148437;148438;153013;153014;153015;153016;183524;185834;185835;185836;185837;185838;185839;185840;204465;204466;204467;204468;204469;204470;204471;204472;231343;247881;247882;247883;247884;247885;262944;262945;262946;262947;262948;262949;262950;262951;270426 19741;28559;38031;43944;45192;65453;102679;148437;153014;183524;185837;204470;231343;247885;262944;270426 1678;2928 909;911 AT4G04460.2;AT4G04460.1 AT4G04460.2;AT4G04460.1 3;3 3;3 3;3 AT4G04460.2 | Symbols:AtPaspA3,PaspA3 | putative aspartic proteinase A3 | Saposin-like aspartyl protease family protein | Chr4:2225232-2227746 FORWARD LENGTH=504;AT4G04460.1 | Symbols:AtPaspA3,PaspA3 | putative aspartic proteinase A3 | Saposin-like aspa 2 3 3 3 1 3 2 2 1 3 2 2 1 3 2 2 7.5 7.5 7.5 55.101 504 504;508 2 3 3 3 0 19.3 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0362 0.99802 75.947 7 1 Leave out 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protein | Chr4:2517882-2519924 REVERSE LENGTH=488 2 5 5 5 2 4 5 4 2 4 5 4 2 4 5 4 12.5 12.5 12.5 53.115 488 488;160 1.95 6 8 5 0 48.254 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66608 0.70207 16.184 12 7 Leave out requantified NaN 1.2848 0.43465 0.53101 NaN 1.2041 0.51986 0.59652 NaN 16.311 28.58 15.984 1 3 5 3 0 2 3 2 Median Median Median Median 5.5 9.2 12.5 9.2 754810000 461900000 292910000 39026000 18002000 21024000 196860000 83853000 113000000 347530000 247430000 100090000 171400000 112610000 58792000 3732 2974;13303;13713;19862;34048 True;True;True;True;True 3412;15018;15496;22398;38804 16956;16957;16958;72448;72449;75492;75493;75494;75495;75496;75497;75498;109381;109382;109383;185169;185170;185171;185172 21937;21938;21939;93056;93057;97481;97482;97483;97484;97485;97486;97487;140293;140294;140295;235916;235917;235918;235919;235920;235921 21939;93057;97483;140293;235921 AT4G05020.1;AT4G05020.2;AT4G21490.2;AT4G21490.1 AT4G05020.1;AT4G05020.2 9;9;1;1 9;9;1;1 9;9;1;1 AT4G05020.1 | Symbols:NDB2 | NAD(P)H dehydrogenase B2 | NAD(P)H dehydrogenase B2 | Chr4:2572752-2576222 FORWARD LENGTH=582;AT4G05020.2 | Symbols:NDB2 | NAD(P)H dehydrogenase B2 | NAD(P)H dehydrogenase B2 | Chr4:2572752-2576222 FORWARD LENGTH=619 4 9 9 9 5 6 8 7 5 6 8 7 5 6 8 7 21.1 21.1 21.1 65.058 582 582;619;579;580 1.98 13 16 12 0 75.371 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.52864 0.59174 45.192 34 18 Leave out requantified 3.2835 2.6293 0.39843 0.35798 3.044 2.3334 0.48246 0.39086 118.08 81.859 28.611 75.057 7 7 12 8 6 3 3 6 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 11 13.6 18.6 15.8 2047600000 1187900000 859730000 526320000 247690000 278620000 395490000 175960000 219530000 776440000 501650000 274790000 349380000 262590000 86790000 3733 8130;11573;13514;18106;18155;25807;26439;35059;37481 True;True;True;True;True;True;True;True;True 9214;13068;15271;20489;20541;29499;30292;39924;42681 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1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 AT4G05590.3 | Symbols:NRGA1 | Negative Regulator of Guard Cell ABA Signaling 1 | pyruvate carrier-like protein | Chr4:2907176-2908041 FORWARD LENGTH=81;AT4G05590.1 | Symbols:NRGA1 | Negative Regulator of Guard Cell ABA Signaling 1 | pyruvate carrier-lik 6 2 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 27.2 14.8 14.8 9.0604 81 81;108;109;109;146;91 2.25 2 2 4 0 6.6818 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87782 0.97051 27.279 7 7 Median NaN 1.2373 0.57196 0.86221 NaN 1.1588 0.70572 0.97977 NaN 8.1109 42.519 1.3427 1 2 2 2 1 2 2 2 Median Median Median Median 27.2 27.2 27.2 27.2 1345000000 716410000 628640000 246280000 131050000 115230000 362390000 179220000 183180000 403430000 225940000 177490000 332950000 180200000 152750000 3743 22656;32761 True;False 25481;37316 123443;123444;123445;123446;123447;123448;123449;123450;177968;177969;177970;177971;177972;177973 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23.88 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73993 0.7481 48.842 17 14 Median 0.82045 0.99769 0.43572 NaN 0.75949 0.89995 0.52139 NaN 47.044 39.581 50.354 NaN 5 5 6 1 3 5 5 1 Median Median Median Median 26.1 26.1 27 19 950490000 608300000 342190000 176930000 112120000 64814000 290230000 162040000 128190000 413020000 283340000 129680000 70307000 50803000 19504000 3787 5479;5480;16412;26494;30537 False;True;True;True;True 6230;6231;6232;18561;30354;34864 30368;30369;30370;30371;30372;30373;30374;30375;30376;30377;30378;30379;30380;30381;30382;30383;30384;30385;90704;90705;90706;90707;90708;90709;90710;146531;146532;146533;146534;146535;166699;166700;166701;166702;166703;166704;166705;166706 39007;39008;39009;39010;39011;39012;39013;39014;39015;39016;39017;39018;39019;39020;39021;39022;39023;39024;116315;116316;116317;116318;116319;116320;116321;116322;186696;186697;186698;186699;186700;212335;212336;212337;212338;212339;212340;212341;212342 39018;39024;116320;186700;212336 3187;3560 125;181 AT4G10710.2;AT4G10710.1;AT4G10710.3;AT4G10670.1 AT4G10710.2;AT4G10710.1;AT4G10710.3 13;13;9;1 13;13;9;1 13;13;9;1 AT4G10710.2 | Symbols:SPT16 | global transcription factor C | global transcription factor C | Chr4:6602226-6605450 REVERSE LENGTH=1074;AT4G10710.1 | Symbols:SPT16 | global transcription factor C | global transcription factor C | Chr4:6602226-6605450 RE 4 13 13 13 4 9 7 7 4 9 7 7 4 9 7 7 13.8 13.8 13.8 120.58 1074 1074;1074;767;343 1.96 9 11 8 0 27.745 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76047 0.83873 54.924 22 11 Leave out requantified 0.58138 1.2217 0.50639 0.61922 0.54499 1.1443 0.56549 0.71331 41.84 42.612 24.661 83.88 2 7 7 6 1 3 4 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 3.8 10.1 6.5 6.5 922420000 486990000 435430000 54012000 34515000 19497000 297300000 133330000 163960000 311030000 184690000 126330000 260090000 134460000 125630000 3788 1434;3171;3472;10842;15574;28564;28636;34201;34290;34364;34943;39073;39277 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Plateau Plateau Median 0 8.4 8.4 5.9 740630000 429440000 311190000 0 0 0 224960000 104410000 120550000 280750000 199050000 81705000 234920000 125980000 108930000 3789 2300;24882;31506 True;True;True 2587;28350;35919 12736;12737;12738;12739;137052;137053;171362;171363;171364;171365 16490;16491;16492;16493;174989;174990;218260;218261;218262 16492;174990;218260 AT4G10790.1 AT4G10790.1 5 5 5 AT4G10790.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | UBX domain-containing protein | Chr4:6640752-6643035 REVERSE LENGTH=480 1 5 5 5 3 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 12.9 12.9 12.9 52.802 480 480 2 4 7 4 0 19.737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97042 1.1656 31.242 14 6 Leave out requantified 1.5059 3.3031 2.8687 0.68503 1.4776 3.4358 3.1508 0.77578 66.514 61.102 84.328 33.699 3 4 3 4 1 2 1 2 Median Linear Plateau Median 8.8 8.8 11 8.8 2402800000 673600000 1729200000 309950000 107150000 202790000 681900000 188060000 493850000 1157700000 220420000 937240000 253270000 157980000 95299000 3790 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AT4G11220.1 3 2 2 AT4G11220.1 | Symbols:BTI2,RTNLB2 | VIRB2-interacting protein 2,Reticulan like protein B2 | VIRB2-interacting protein 2 | Chr4:6838176-6839578 REVERSE LENGTH=271 1 3 2 2 3 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 15.1 10 10 30.28 271 271 2 3 2 3 0 5.5174 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.108 1.1698 17.299 8 2 Leave out requantified 1.0702 0.8386 0.77133 NaN 1.0443 0.7804 0.89462 NaN 35.613 67.413 19.385 NaN 3 2 2 1 1 1 0 0 Median Median Median Median 15.1 15.1 10 12.2 1579800000 839580000 740180000 453470000 189860000 263610000 271120000 137180000 133930000 682000000 424770000 257240000 173160000 87763000 85399000 3799 17703;28048;36084 True;True;False 20042;32084;41093;41094 97775;97776;97777;97778;154217;154218;154219;154220;196776;196777;196778 125327;125328;125329;125330;125331;196531;196532;196533;250995;250996;250997 125328;196532;250996 3567 90 AT4G11250.1 AT4G11250.1 1 1 1 AT4G11250.1 | Symbols:AGL52 | AGAMOUS-like 52 | AGAMOUS-like 52 | Chr4:6849578-6850567 FORWARD LENGTH=329 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 5.5 5.5 5.5 37.834 329 329 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3800 24440 True 27658 133653 170777 170777 1722;2935 3;11 AT4G11260.1 AT4G11260.1 6 6 6 AT4G11260.1 | Symbols:EDM1,RPR1,ATSGT1B,SGT1B,ETA3 | ENHANCED DOWNY MILDEW 1,ENHANCER OF TIR1-1 AUXIN RESISTANCE 3 | phosphatase-like protein | Chr4:6851515-6853719 REVERSE LENGTH=358 1 6 6 6 4 4 4 5 4 4 4 5 4 4 4 5 20.1 20.1 20.1 39.762 358 358 1.9 7 8 5 0 36.091 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90533 1.0633 1.73 10 6 Leave out requantified NaN 1.4319 0.8658 0.67367 NaN 1.3343 1.0764 0.7213 NaN 15.166 33.808 106.28 1 2 3 4 1 1 1 3 Median Median Plateau Median 13.7 15.1 13.7 15.9 570750000 260760000 309990000 18884000 5212000 13672000 127290000 52192000 75095000 101990000 62645000 39350000 322580000 140710000 181870000 3801 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symbol available | no full name available | Adaptin family protein | Chr4:6920608-6925444 FORWARD LENGTH=894;AT4G11380.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Adaptin family protein | Chr4:6920608-6925444 FOR 2 16 1 1 11 15 13 10 0 1 0 0 0 1 0 0 23.2 4 4 99.371 894 894;916 1 1 0.0053715 2.2212 By matching By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 13.4 22 18 12.6 12719000 0 12719000 0 0 0 12719000 0 12719000 0 0 0 0 0 0 3804 4355;4852;6591;7040;7339;13115;18120;18982;19681;22228;22716;24003;25477;25565;30676;32180 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True 4966;5536;7508;8009;8342;14811;20504;21448;22202;24981;25545;26975;26976;29130;29228;35017;36664 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Symbols:no symbol available | no full name available | Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein | Chr4:7090456-7093208 FORWARD LENGTH=443 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 5.9 5.9 5.9 47.42 443 443 2 2 3 2 0 7.5449 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96669 1.0065 82.26 6 5 Median NaN NaN 0.39436 1.4248 NaN NaN 0.44456 1.6073 NaN NaN 37.525 51.186 1 1 2 2 0 1 2 2 Median Median Median Median 2 2 5.9 2 114610000 65400000 49211000 12376000 7438300 4937700 17502000 4664100 12838000 42624000 33361000 9262400 42109000 19937000 22172000 3809 11420;26563 True;True 12898;30437 62334;62335;62336;62337;62338;62339;147000 80166;80167;80168;80169;80170;80171;80172;187309 80166;187309 AT4G11820.3;AT4G11820.1;AT4G11820.2 AT4G11820.3;AT4G11820.1;AT4G11820.2 8;8;8 8;8;8 8;8;8 AT4G11820.3 | Symbols:MVA1,FKP1,HMGS | FLAKY POLLEN 1,HYDROXYMETHYLGLUTARYL-COA SYNTHASE | hydroxymethylglutaryl-CoA synthase / HMG-CoA synthase / 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase | Chr4:7109124-7111213 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57274;57275;57276;57277;57278;57279;57280;58213;58214;58215;58216;58217;58218;58219;58220;58221;58222;111788;116805;156310;175862;175863;175864;175865;224050;224051;224052;224053;224054;224055;224056;255891 57278;58218;111788;116805;156310;175862;224056;255891 3574;3575 42;331 AT4G11850.1;AT4G11830.1;AT4G11830.2;AT4G11840.2;AT4G11840.1;AT4G11830.4;AT4G11830.3;AT4G00240.3;AT4G00240.2;AT4G00240.1;AT2G42010.1;AT2G42010.2 AT4G11850.1 10;3;3;2;2;1;1;1;1;1;1;1 10;3;3;2;2;1;1;1;1;1;1;1 10;3;3;2;2;1;1;1;1;1;1;1 AT4G11850.1 | Symbols:PLDGAMMA1,MEE54 | maternal effect embryo arrest 54,phospholipase D gamma 1 | phospholipase D gamma 1 | Chr4:7129352-7132937 REVERSE LENGTH=858 12 10 10 10 5 4 8 2 5 4 8 2 5 4 8 2 16.7 16.7 16.7 95.587 858 858;824;856;836;866;635;636;775;892;927;1083;1108 2 8 8 8 0 28.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1741 1.0429 55.422 19 13 Leave out requantified 1.1029 1.5229 0.45537 0.29193 0.99913 1.439 0.51646 0.32996 93.493 57.657 49.712 29.898 6 5 6 2 5 3 4 1 Median Median Median Median 8.6 6.8 13.2 2.4 1319600000 821740000 497860000 317050000 180030000 137030000 424700000 213460000 211230000 497160000 367930000 129230000 80695000 60320000 20374000 3811 10382;16435;16608;17535;19520;28043;33307;33541;34122;37001 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 11739;18584;18781;19831;22029;32078;37944;38211;38885;42158 56685;56686;56687;90807;90808;90809;91660;96833;96834;107774;154196;154197;180958;182352;185537;185538;185539;185540;185541;201788;201789;201790;201791;201792 72686;72687;72688;72689;116459;116460;116461;117485;124227;124228;138289;196502;196503;230482;232274;236360;236361;236362;236363;236364;257339;257340;257341;257342;257343 72688;116461;117485;124227;138289;196503;230482;232274;236364;257339 AT4G11860.1 AT4G11860.1 3 3 3 AT4G11860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | FAM63A-like protein (DUF544) | Chr4:7134237-7138361 REVERSE LENGTH=682 1 3 3 3 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 6.5 6.5 6.5 74.427 682 682 1.71 4 1 2 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3 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 8.4 8.4 8.4 34.253 309 309 1.83 2 3 1 0 5.2122 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.40092 0.43711 46.707 5 0 Leave out requantified NaN NaN 0.40092 NaN NaN NaN 0.43711 NaN NaN NaN 31.254 NaN 1 1 3 0 0 0 0 0 Median Median Leave out requantified Median 2.9 2.9 8.4 2.9 259110000 147520000 111590000 51799000 27585000 24214000 55613000 18696000 36917000 151700000 101240000 50460000 0 0 0 3814 4627;8343;10234 True;True;True 5280;9447;11581 25649;45799;55952;55953;55954;55955 33003;58723;71754;71755;71756;71757 33003;58723;71755 AT4G12060.1 AT4G12060.1 8 8 8 AT4G12060.1 | Symbols:ClpT2 | | Double Clp-N motif protein | Chr4:7228269-7229898 REVERSE LENGTH=241 1 8 8 8 7 7 6 6 7 7 6 6 7 7 6 6 40.2 40.2 40.2 26.56 241 241 2.12 15 22 22 0 60.503 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98101 1.041 26.167 58 13 Leave out requantified 1.2163 1.2631 0.8609 0.84774 1.1365 1.2116 0.96361 0.93944 35.566 8.0213 29.731 32.173 15 15 15 13 6 2 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.3 30.7 27.8 27.8 16283000000 8330600000 7952100000 3226800000 1597500000 1629300000 4420900000 2138200000 2282700000 4885000000 2627400000 2257700000 3750000000 1967500000 1782500000 3815 689;2075;9007;17278;29056;29766;36822;39106 True;True;True;True;True;True;True;True 774;775;2349;10191;19542;33226;33227;34004;41960;44506 4018;4019;4020;4021;4022;4023;4024;4025;4026;4027;4028;4029;4030;4031;4032;4033;11599;11600;11601;11602;11603;11604;11605;11606;11607;11608;11609;11610;49674;49675;49676;49677;95531;95532;95533;95534;159524;159525;159526;159527;159528;159529;159530;159531;159532;159533;159534;163114;163115;163116;163117;163118;163119;163120;163121;163122;200863;213534;213535 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MS/MS By MS/MS 2.0795 1.9689 19.698 21 13 Leave out requantified 2.0795 5.0339 0.077763 0.17197 1.9689 4.3948 0.09436 0.19171 19.698 82.697 83.384 5.9153 10 6 3 2 4 5 2 2 Leave out requantified Median Plateau Median 14.4 12.8 7.6 9.9 3245200000 1905600000 1339500000 1167400000 423830000 743530000 483140000 69046000 414100000 716800000 655970000 60834000 877850000 756770000 121080000 3816 1804;13190;14495;15975;21868;23053;27008;28269;35448;35459;35549 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2053;14894;16424;18078;24585;25901;30921;32342;40377;40391;40498 10188;10189;10190;10191;71831;71832;80241;80242;80243;80244;80245;80246;80247;88203;119275;119276;125289;125290;125291;125292;125293;125294;125295;149073;155441;155442;155443;155444;155445;193072;193073;193074;193149;193700 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NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 35.9 30.6 36.4 35.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3841 4214;9145;12400;21275;21276;23108;24787;35220;36923 False;True;False;False;False;False;False;True;False 4810;10347;14006;23944;23945;25961;25962;28204;28205;40109;42072 23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;23524;23525;23526;23527;50405;67791;67792;67793;67794;67795;67796;116406;116407;116408;116409;116410;116411;116412;116413;116414;116415;116416;116417;116418;116419;116420;116421;116422;125612;125613;125614;125615;125616;125617;125618;125619;125620;125621;125622;125623;125624;125625;125626;125627;125628;125629;125630;125631;136368;136369;136370;136371;136372;136373;136374;136375;136376;136377;136378;136379;136380;136381;136382;136383;136384;136385;136386;136387;136388;136389;136390;136391;136392;136393;191715;191716;201410;201411;201412;201413;201414;201415;201416;201417 30434;30435;30436;30437;30438;30439;30440;30441;30442;30443;30444;30445;30446;30447;64766;87209;87210;87211;87212;87213;87214;87215;87216;87217;149127;149128;149129;149130;149131;149132;149133;149134;149135;149136;149137;149138;149139;149140;149141;149142;149143;149144;149145;149146;149147;149148;160768;160769;160770;160771;160772;160773;160774;160775;160776;160777;160778;160779;160780;160781;160782;160783;160784;160785;160786;160787;160788;160789;160790;160791;160792;160793;160794;160795;160796;160797;160798;160799;174157;174158;174159;174160;174161;174162;174163;174164;174165;174166;174167;174168;174169;174170;174171;174172;174173;174174;174175;174176;174177;174178;174179;174180;174181;174182;174183;174184;174185;174186;174187;174188;174189;174190;174191;174192;244372;244373;256890;256891;256892;256893;256894;256895 30440;64766;87217;149130;149132;160786;174189;244372;256893 1159 2935 153 123 AT4G13180.1 AT4G13180.1 3 2 2 AT4G13180.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr4:7657373-7658164 REVERSE LENGTH=263 1 3 2 2 2 3 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 17.1 14.1 14.1 27.656 263 263 1.86 3 2 2 0 28.001 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7438 0.79638 110.28 6 2 Median NaN 0.27678 0.44821 NaN NaN 0.26029 0.52137 NaN NaN 151.28 112.68 NaN 1 2 2 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 11.8 17.1 17.1 14.1 719500000 424980000 294520000 96232000 37469000 58762000 269560000 167480000 102080000 184240000 124660000 59580000 169470000 95373000 74097000 3842 444;752;35571 False;True;True 501;841;40522 2564;2565;2566;4332;4333;4334;4335;193808;193809;193810 3345;3346;5659;5660;5661;5662;5663;5664;5665;5666;247125;247126;247127 3346;5666;247125 2413 180 AT4G13200.1 AT4G13200.1 7 7 7 AT4G13200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr4:7668292-7669166 REVERSE LENGTH=185 1 7 7 7 3 3 4 6 3 3 4 6 3 3 4 6 44.3 44.3 44.3 20.429 185 185 2.2 5 6 9 0 21.476 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6762 1.7334 90.006 17 8 Leave out requantified 0.93587 1.9414 0.42771 0.5341 0.87452 1.7334 0.52279 0.63699 52.471 46.67 28.125 81.252 3 3 4 7 1 0 3 4 Median Leave out requantified Median Median 21.6 20 29.2 36.8 1557900000 883810000 674130000 210610000 114320000 96283000 253900000 85145000 168760000 569590000 381170000 188430000 523830000 303170000 220660000 3843 2008;10042;10043;16673;26021;27980;31485 True;True;True;True;True;True;True 2277;11359;11360;11361;18852;29788;32006;35898 11258;11259;54864;54865;54866;54867;54868;54869;54870;54871;54872;91949;143909;153950;153951;153952;171278;171279;171280;171281 14629;70325;70326;70327;70328;70329;70330;70331;70332;70333;70334;70335;70336;117851;183488;196197;196198;196199;218153;218154;218155;218156 14629;70325;70330;117851;183488;196198;218156 3602 135 AT4G13220.1 AT4G13220.1 1 1 1 AT4G13220.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein | Chr4:7674431-7675275 REVERSE LENGTH=176 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 9.1 9.1 9.1 19.186 176 176 1.33 2 1 0 8.8618 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74395 0.67333 9.3998 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 9.1 9.1 9.1 0 78229000 39817000 38412000 31378000 16088000 15290000 46851000 23729000 23122000 0 0 0 0 0 0 3844 5298 True 6035 29292;29293;29294 37647;37648;37649 37649 AT4G13340.1 AT4G13340.1 8 8 4 AT4G13340.1 | Symbols:LRX3 | leucine-rich repeat/extensin 3 | Leucine-rich repeat (LRR) family protein | Chr4:7758610-7760892 FORWARD LENGTH=760 1 8 8 4 5 7 7 6 5 7 7 6 2 4 3 2 13.2 13.2 7.8 82.245 760 760 2.21 11 15 21 0 36.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85547 0.96037 19.174 44 20 Leave out requantified 1.0159 1.5089 0.59995 0.78895 0.96529 1.4579 0.70541 0.90615 4.7634 21.285 8.6749 23.326 12 10 12 10 7 6 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.5 11.8 10.4 8.7 6853800000 3828000000 3025800000 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AT4G13345.7;AT4G13345.3 1;1 1;1 1;1 AT4G13345.7 | Symbols:MEE55 | maternal effect embryo arrest 55 | Serinc-domain containing serine and sphingolipid biosynthesis protein | Chr4:7767292-7768829 FORWARD LENGTH=302;AT4G13345.3 | Symbols:MEE55 | maternal effect embryo arrest 55 | Serinc-doma 2 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2.3 2.3 2.3 34.475 302 302;302 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.3 0 0 0 979670000 442380000 537290000 979670000 442380000 537290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3846 25502 True 29155 140950 179912 179912 3604 297 AT4G13350.2;AT4G13350.1 AT4G13350.2;AT4G13350.1 1;1 1;1 1;1 AT4G13350.2 | Symbols:NIG | NSP (nuclear shuttle protein)-interacting GTPase | NSP (nuclear shuttle protein)-interacting GTPase | Chr4:7770170-7773321 REVERSE LENGTH=602;AT4G13350.1 | Symbols:NIG | NSP (nuclear shuttle protein)-interacting GTPase | NSP 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1.7 1.7 1.7 65.026 602 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requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.8 32.3 36.6 29 5783200000 2783700000 2999400000 1096800000 419440000 677400000 1211600000 461460000 750150000 2040400000 1035600000 1004800000 1434300000 867240000 567090000 3848 1091;2301;3820;4498;10009;12530;15077;17918;29142;30038;38547;39166;39266 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1224;2588;2589;4370;5143;11322;14160;17071;20281;33322;34298;43871;44568;44683 6037;6038;12740;12741;12742;12743;12744;12745;12746;12747;21455;21456;21457;21458;21459;21460;21461;21462;21463;25033;25034;25035;25036;54713;54714;54715;54716;54717;68536;68537;68538;68539;68540;68541;83270;83271;83272;83273;83274;83275;83276;98942;98943;98944;98945;159980;159981;159982;159983;164422;164423;164424;210324;210325;210326;213812;213813;214413;214414;214415;214416;214417;214418;214419;214420;214421;214422 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Symbols:PDS3,PDE226,PDS | PHYTOENE DESATURASE,PIGMENT DEFECTIVE 226,p 3 16 16 16 12 13 12 13 12 13 12 13 12 13 12 13 33.2 33.2 33.2 62.963 566 566;566;566 2.09 22 20 28 0 78.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92376 0.90854 42.144 53 18 Leave out requantified 0.78103 0.76943 1.2789 1.5874 0.73326 0.72837 1.4472 1.8094 39.312 27.103 24.812 30.209 15 13 12 13 4 4 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.6 27.6 23.9 26 4906800000 2554500000 2352300000 1130000000 638360000 491680000 1393000000 807820000 585150000 1190200000 564600000 625570000 1193600000 543720000 649920000 3873 10603;10762;16626;19364;20394;20977;22096;23977;26405;29950;30286;30496;32124;37078;37444;38837 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 11973;12153;12154;18799;21854;22972;23609;24836;26934;26935;30254;34202;34576;34818;36605;36606;42237;42640;44195;44196 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symbol available | no full name available | adenylyl cyclase | Chr4:8919245-8921382 REVERSE LENGTH=329;AT4G15640.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | adenylyl cyclase | Chr4:8919245-8921852 REVERSE LENGTH= 2 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 5.2 5.2 5.2 37.148 329 329;390 3 1 0.00039463 3.3504 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.2 0 0 0 20536000 10005000 10530000 20536000 10005000 10530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3903 29027 True 33193 159390 203016 203016 AT4G15760.1;AT4G15760.2 AT4G15760.1;AT4G15760.2 2;2 2;2 2;2 AT4G15760.1 | Symbols:MO1 | monooxygenase 1 | monooxygenase 1 | Chr4:8972785-8974548 REVERSE LENGTH=422;AT4G15760.2 | Symbols:MO1 | monooxygenase 1 | monooxygenase 1 | Chr4:8972785-8974548 REVERSE LENGTH=434 2 2 2 2 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 5.7 5.7 5.7 46.905 422 422;434 2 2 2 2 0 5.5265 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1537 1.0855 31.907 5 1 Leave out requantified NaN 0.8379 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88202;88203;88204;88205;88206;88207;88208;88209;88210;88211;88212;88398;88399;88400;88401;88402;88403;88404;88405;88406;88954;88955;88956;88957;88958;88959;185933;185934;185935;185936;185937;185938;185939;185940;185941;185942;185943;185944;185945;185946;270060;270061;270062;270063;270064;270065;270066;270067;270068;270069;270070 88211;88405;88958;185936;270062 1299 94 AT4G15802.1 AT4G15802.1 1 1 1 AT4G15802.1 | Symbols:AtHSBP,HSBP | Arabidopsis thaliana heat shock factor binding protein,heat shock factor binding protein | heat shock factor binding protein | Chr4:8986864-8988339 REVERSE LENGTH=86 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.3 16.3 16.3 9.3472 86 86 1.6 3 1 1 0 5.5017 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0922 1.0099 45.872 5 3 Median NaN 1.5903 NaN NaN NaN 1.3935 NaN NaN NaN 11.497 NaN NaN 1 2 1 1 1 2 0 0 Median Median Median Median 16.3 16.3 16.3 16.3 472540000 247920000 224630000 69877000 32347000 37530000 204830000 74626000 130200000 106250000 75625000 30629000 91583000 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available | no full name available | Dynein light chain type 1 family 2 2 2 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 29.9 29.9 29.9 10.703 97 97;123 2.25 1 1 2 0.0004008 3.5854 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 14.4 15.5 29.9 47998000 23892000 24106000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47998000 23892000 24106000 3910 30923;31520 True;True 35286;35934 168551;168552;171413;171414 214681;214682;218312;218313 214682;218312 1760 11 AT4G15940.1;AT3G16700.2;AT3G16700.1;AT3G16700.4;AT3G16700.3 AT4G15940.1;AT3G16700.2;AT3G16700.1 4;2;2;1;1 4;2;2;1;1 4;2;2;1;1 AT4G15940.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family | Chr4:9038361-9040163 FORWARD LENGTH=222;AT3G16700.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Fumarylacetoacetate (FAA) hydr 5 4 4 4 2 2 4 3 2 2 4 3 2 2 4 3 16.2 16.2 16.2 24.154 222 222;170;224;131;131 1.92 4 6 3 0 10.495 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68577 0.76433 84.092 7 4 Median NaN NaN 0.95489 0.39599 NaN NaN 1.0695 0.44832 NaN NaN 101.85 33.89 1 1 3 2 1 0 2 1 Median Median Plateau Median 9.5 6.3 16.2 9.9 810800000 420910000 389890000 64549000 30905000 33644000 125310000 43204000 82111000 482690000 263660000 219020000 138250000 83137000 55112000 3911 3544;9068;9215;14553 True;True;True;True 4052;10257;10427;16487 19782;19783;19784;19785;50004;50005;50006;50007;50709;50710;50711;80568;80569 25516;25517;25518;25519;64249;64250;64251;64252;65140;65141;103928;103929 25516;64250;65141;103928 AT4G16060.1 AT4G16060.1 5 5 5 AT4G16060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr4:9094424-9096147 FORWARD LENGTH=289 1 5 5 5 2 2 5 3 2 2 5 3 2 2 5 3 19 19 19 32.725 289 289 2 5 7 5 0 8.7809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54912 0.62901 36.271 15 4 Leave out requantified 0.63706 1.7348 0.77353 0.53159 0.58017 1.6301 0.8675 0.60037 45.98 65.235 58.541 27.507 4 3 4 4 2 1 1 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available | Papain family cysteine protease | Chr4:9171512-9172877 FORWARD LENGTH=373 2 5 4 4 3 3 2 3 2 2 1 2 2 2 1 2 20.4 18.2 18.2 41.263 373 373;361 1.88 4 1 3 0 10.272 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7922 0.90963 9.4507 7 2 Leave out requantified 1.667 2.5383 NaN 0.56007 1.5727 2.3797 NaN 0.65835 47.434 18.878 NaN 55.173 2 2 1 2 1 1 0 0 Median Median Median Median 10.2 10.7 4.6 8.6 1920700000 1009800000 910960000 323250000 136140000 187110000 554320000 179170000 375140000 465730000 287910000 177820000 577440000 406560000 170880000 3919 1353;8883;9630;22617;26147 True;False;True;True;True 1530;10055;10908;25440;29933 7662;49020;49021;49022;49023;49024;49025;49026;49027;52633;52634;52635;52636;52637;123258;144564 10050;62966;62967;62968;62969;62970;62971;62972;62973;62974;62975;67471;67472;67473;67474;67475;67476;67477;157819;184338 10050;62967;67471;157819;184338 AT4G16210.1 AT4G16210.1 5 5 5 AT4G16210.1 | Symbols:ECHIA,E-COAH-2 | ENOYL-COA HYDRATASE 2,enoyl-CoA 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| Cystatin/monellin superfamily protein | Chr4:9301530-9301883 REV 2 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 35.9 35.9 35.9 12.556 117 117;117 1.91 9 7 7 0 13.556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91477 0.98312 7.7536 23 1 Leave out requantified 0.90727 1.5436 0.97502 0.80137 0.83502 1.4618 1.1225 0.89472 25.657 31.083 10.723 24.256 5 6 6 6 0 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.9 35.9 35.9 35.9 5917200000 2984500000 2932700000 1202800000 606440000 596340000 1475100000 621680000 853390000 1583800000 832080000 751700000 1655600000 924330000 731260000 3930 26528;26602;37357;38199 True;True;True;True 30393;30480;42547;43481 146748;146749;146750;146751;147152;147153;147154;147155;147156;147157;147158;203989;203990;203991;203992;208408;208409;208410;208411;208412;208413;208414;208415 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symbol available | no full name available | heat shock protein 70 (Hsp 70) family protein | Chr4:9377225-9381232 FORWARD LENGTH=867;AT4G16660.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | heat shock protein 70 (Hsp 2 17 17 17 8 9 15 11 8 9 15 11 8 9 15 11 25.4 25.4 25.4 96.724 867 867;891 2.2 11 19 21 0 92.468 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.40613 0.47943 42.817 36 22 Leave out requantified 2.5349 1.8682 0.37087 0.44178 2.346 1.7777 0.42935 0.51189 43.125 53.087 21.167 32.111 7 8 11 10 6 7 6 3 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 11.8 12 23.5 16 2502900000 1376600000 1126300000 312340000 97742000 214590000 418480000 121780000 296700000 1001700000 618180000 383560000 770350000 538870000 231480000 3932 5117;6165;8673;8820;8855;16407;17239;21183;22006;22805;23496;25965;30193;30452;34103;34213;37860 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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AT4G16680.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | Chr4:9388071-9390461 REVERSE LENGTH=796 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1.1 1.1 1.1 90.731 796 796 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 1.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3933 11367 True 12841 61991 79709 79709 2947 3691 638 642 AT4G16690.1 AT4G16690.1 4 4 4 AT4G16690.1 | Symbols:MES16,ATMES16 | methyl esterase 16,ARABIDOPSIS THALIANA METHYL ESTERASE 16 | methyl esterase 16 | Chr4:9392405-9393424 REVERSE LENGTH=262 1 4 4 4 2 3 4 3 2 3 4 3 2 3 4 3 21 21 21 29.014 262 262 2.23 3 4 6 0 23.815 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0002 1.0247 31.564 12 6 Leave out requantified 0.97397 2.615 0.401 0.39996 0.91792 2.2785 0.48675 0.50782 0.28381 66.101 26.986 124.38 2 3 4 3 0 2 2 2 Median Median Median Median 11.5 13.7 21 13.7 628550000 401270000 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Chr4:9539010-9544340 REVERSE LENGTH=1449;AT4G16950.3 | Symbols:RPP5 | RECOGNITION OF PERONOSPORA PARASITICA 5 | Disease resist 29 4 4 4 4 3 3 1 4 3 3 1 4 3 3 1 2.9 2.9 2.9 164.46 1449 1449;1440;1404;1374;1359;1350;1322;1437;1428;1370;1370;1364;1364;1361;985;1319;1307;1304;1213;1147;1058;1322;1001;1244;1244;1244;1234;1157;1147 2.17 5 9 9 0 13.297 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98376 1.0105 22.694 23 7 Leave out requantified 1.1329 1.0141 1.5576 0.96806 1.1236 1.0296 1.8054 1.0399 27.736 47.647 79.003 31.374 7 5 8 3 4 1 1 1 Median Median Median Median 2.9 2.1 2.1 0.6 6795000000 2881600000 3913500000 1827700000 797970000 1029800000 1368600000 722300000 646330000 2553800000 845890000 1707900000 1044900000 515430000 529490000 3940 8691;9159;23799;31285 True;True;True;True 9842;10363;26728;35680 47953;47954;47955;47956;47957;47958;47959;47960;47961;47962;47963;47964;47965;47966;47967;47968;50456;50457;50458;129428;170244;170245;170246 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LEPTOSPHAERIA MACULANS 3 | disease resistance protein 19 13 13 13 4 8 8 7 4 8 8 7 4 8 8 7 19.2 19.2 19.2 91.661 801 801;801;796;796;795;795;801;671;737;671;670;643;643;643;643;638;637;513;513 2.12 7 15 11 0 33.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93403 0.99367 38.042 26 9 Leave out requantified 1.2538 1.0849 0.89006 0.60488 1.2314 1.0107 1.0926 0.66456 13.583 19.422 49.602 35.719 4 8 8 6 0 4 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.1 11.7 11.4 10 5530600000 2647400000 2883200000 1467700000 630130000 837580000 1242800000 544600000 698180000 1624400000 860290000 764120000 1195700000 612400000 583300000 3941 2007;11358;16583;18168;20557;26250;28832;29561;31021;32608;37721;37773;39419 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2276;12829;18754;20556;23149;23150;30066;32979;33782;35393;37145;42956;43011;44859 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beta-amylase | Chr4:9605266-9607250 REVERSE LENGTH=548 1 17 17 17 10 13 13 11 10 13 13 11 10 13 13 11 38.1 38.1 38.1 61.352 548 548 1.97 24 25 22 0 123.1 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0102 1.021 10.006 60 29 Leave out requantified 1.0107 1.0767 0.7926 0.91139 0.96263 1.0205 0.91717 1.0643 20.632 9.3453 21.956 13.824 14 16 16 14 5 10 8 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23 29.4 30.3 24.8 6976100000 3781100000 3195000000 1809700000 915680000 894030000 1300000000 680620000 619350000 2212500000 1289900000 922600000 1654000000 894930000 759050000 3944 2553;5261;5381;7792;11080;13585;20903;21934;24438;25423;25819;26044;26123;32457;33396;38377;39114 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2902;5992;6125;8848;12512;15351;23523;24656;27655;29059;29515;29815;29904;29905;36974;38048;43682;44514 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Symbols:FPS2 | farnesyl diphosphate synthase 2 | farnesyl diphosphate synthase 2 | Chr4:9648743-96506 3 7 4 4 5 6 6 7 3 3 3 4 3 3 3 4 19.3 12.6 12.6 39.825 342 342;305;247 2.18 5 4 8 0 14.194 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2359 1.3237 54.991 16 4 Leave out requantified 1.4494 0.5938 1.4494 1.2588 1.3662 0.53216 1.6164 1.4435 10.027 19.72 23.095 33.389 4 3 4 5 0 0 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Linear Median 14 17 17 19.3 1433100000 691060000 742040000 367620000 167640000 199980000 221670000 130150000 91518000 434340000 203510000 230830000 409470000 189770000 219700000 3948 991;1815;16962;21450;24470;28711;31164 True;False;False;True;False;True;True 1109;2064;19171;24141;27702;27703;32850;35546 5496;5497;5498;5499;10230;10231;10232;10233;10234;93580;93581;93582;93583;117297;117298;117299;133809;133810;133811;133812;133813;133814;157910;157911;157912;157913;157914;157915;169614;169615;169616;169617 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4 3 7 2 10.6 10.6 10.6 97.453 862 862;862 1.82 7 6 4 0 46.605 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1859 1.0677 29.882 13 6 Leave out requantified 1.254 1.3994 0.6446 0.49346 1.1576 1.252 0.73858 0.57663 29.483 32.47 72.837 12.268 4 3 4 2 1 1 4 0 Leave out requantified Median Median Median 6 4.8 9.3 3.2 752880000 380870000 372010000 214470000 93049000 121420000 192550000 82690000 109860000 243050000 135980000 107070000 102800000 69155000 33650000 3965 6354;9642;22390;23002;23926;25606;28193;36154 True;True;True;True;True;True;True;True 7245;10920;25188;25850;26873;29278;32253;41170 35350;52721;52722;52723;52724;122059;122060;122061;125112;130084;130085;130086;130087;130088;141574;155040;197084 45275;67638;67639;67640;67641;67642;67643;156373;156374;156375;160164;166442;166443;166444;166445;166446;166447;166448;180674;197622;251419 45275;67642;156375;160164;166442;180674;197622;251419 AT4G17830.1;AT4G17830.2 AT4G17830.1;AT4G17830.2 10;10 10;10 10;10 AT4G17830.1 | Symbols:AtNAOD | N2-acetylornithine deacetylase | Peptidase M20/M25/M40 family protein | Chr4:9915916-9918049 FORWARD LENGTH=440;AT4G17830.2 | Symbols:AtNAOD | N2-acetylornithine deacetylase | Peptidase M20/M25/M40 family protein | Chr4:9 2 10 10 10 5 9 9 8 5 9 9 8 5 9 9 8 29.5 29.5 29.5 48.217 440 440;445 1.87 13 17 8 0 51.367 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67156 0.74579 70.046 30 14 Leave out requantified 1.6661 2.0372 0.4055 0.46229 1.5091 1.8958 0.48747 0.52533 22.47 17.116 18.256 29.696 6 8 10 6 3 3 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 15.2 27.5 27.5 23.4 3934100000 2307300000 1626700000 560730000 273030000 287700000 763370000 229740000 533630000 1905800000 1312900000 592910000 704150000 491670000 212480000 3966 1788;2228;12241;14316;15038;17166;21243;22695;23320;39438 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2030;2031;2512;13835;16218;17026;19407;23908;25523;25524;26195;44880 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NaN NaN NaN 1.2343 NaN 0 1 2 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 8.4 13.6 0 136690000 65743000 70949000 0 0 0 41899000 15697000 26202000 94792000 50045000 44747000 0 0 0 3967 6932;20315 True;True 7887;22889 38740;38741;111805 49576;49577;143407 49577;143407 3721 178 AT4G18030.1 AT4G18030.1 14 14 14 AT4G18030.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr4:10012850-10015267 REVERSE LENGTH=621 1 14 14 14 6 6 9 10 6 6 9 10 6 6 9 10 25 25 25 70.337 621 621 2.05 13 10 15 0 47.661 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8541 0.92022 20.483 23 9 Leave out requantified 1.1703 1.1663 0.46997 0.69517 1.1064 1.1277 0.52233 0.8001 23.546 11.921 38.001 29.004 4 6 6 7 2 2 3 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.2 11.8 16.4 16.3 1863000000 803890000 1059100000 240420000 93210000 147210000 293690000 144030000 149670000 646290000 292240000 354050000 682580000 274410000 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4E,ARABIDOPSIS THALIANA EUKARYOTIC TRANSLATION INITATION FACTOR 4E1,eukaryotic translation Initiation Factor 4E1,CUCUMOVIRUS MULTIPLICATION 1 | eukaryotic transla 1 5 5 5 4 5 3 2 4 5 3 2 4 5 3 2 32.3 32.3 32.3 26.519 235 235 1.79 6 5 3 0 20.592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7745 0.7942 45.937 14 5 Leave out requantified 1.4005 1.3738 0.47707 0.48011 1.3096 1.2048 0.54597 0.52781 18.366 21.13 15.598 6.5487 4 5 3 2 2 2 1 0 Median Leave out requantified Median Median 27.7 32.3 20 8.5 1126800000 632770000 494060000 249000000 115620000 133380000 349360000 147460000 201890000 321260000 232620000 88633000 207220000 137070000 70151000 3969 3698;20138;24987;31606;38693 True;True;True;True;True 4229;22690;28485;36027;44034 20790;20791;20792;20793;110835;137735;137736;137737;137738;171795;171796;211208;211209;211210 26852;26853;26854;26855;142169;175854;175855;175856;175857;175858;175859;175860;218800;218801;269453;269454;269455 26855;142169;175858;218801;269455 AT4G18060.1 AT4G18060.1 3 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LENGTH=228;AT4G 7 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 5.3 5.3 5.3 24.003 228 228;228;228;228;262;262;262 1 2 0.0040007 2.3632 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.3 5.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3971 27865 True 31875 153272;153273 195260;195261 195261 AT4G18100.1 AT4G18100.1 8 8 3 AT4G18100.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L32e | Chr4:10035715-10036475 REVERSE LENGTH=133 1 8 8 3 7 8 8 7 7 8 8 7 2 3 3 2 54.1 54.1 30.8 15.503 133 133 2.13 32 37 47 0 59.534 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.055 1.0375 30.787 85 23 Leave out requantified 1.0205 1.0752 0.96332 0.86043 0.95997 1.075 1.1085 0.94811 33.706 22.882 10.155 16.886 23 20 20 22 6 3 8 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.4 54.1 54.1 41.4 31677000000 16684000000 14993000000 7851500000 3955000000 3896500000 7252000000 3665200000 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termination factor | Chr4:10303543-10304479 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.2 4.2 4.2 21.176 189 189;214;220;245 2 1 2 1 0.0075931 2.0966 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73114 0.74763 131.47 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 4.2 4.2 4.2 4.2 37616000 20806000 16810000 0 0 0 10775000 8759500 2015100 26841000 12047000 14794000 0 0 0 3981 1753 True 1989 9906;9907;9908;9909 12924;12925;12926;12927 12926 AT4G18760.1 AT4G18760.1 4 4 4 AT4G18760.1 | Symbols:RLP51,AtRLP51,SNC2 | suppressor of npr1-1, constitutive 2,receptor like protein 51 | receptor like protein 51 | Chr4:10308163-10309458 REVERSE LENGTH=431 1 4 4 4 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 4 2 12.3 12.3 12.3 46.07 431 431 2 3 5 3 0 20.257 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71874 0.6601 53.475 8 2 Leave out requantified 0.48118 0.74921 1.3076 1.9524 0.44243 0.68076 1.6602 2.211 23.332 4.3586 3.3449 5.3234 2 2 2 2 0 0 1 1 Median Median Median Median 6.7 8.1 12.3 5.8 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Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 (eIF-3) | Chr4:11216997-11218772 FORWARD LENGTH=591;AT4G20980.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Eukaryotic 4 9 3 3 5 6 6 5 1 2 3 2 1 2 3 2 20.3 6.3 6.3 66.724 591 591;591;591;591 2 2 5 2 0 9.2219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65522 0.72285 63.217 8 6 Median NaN 1.2248 0.57403 0.91375 NaN 1.1706 0.67402 1.0248 NaN 58.282 36.51 77.326 1 2 3 2 1 1 3 1 Median Median Median Median 12.7 13 13 11.7 923170000 603920000 319250000 22350000 17969000 4381000 248180000 144820000 103360000 368310000 256490000 111820000 284330000 184650000 99682000 4020 3581;4225;25851;29153;29725;31077;37218;38062;39232 False;True;True;False;False;False;True;False;False 4092;4093;4821;29548;33333;33961;35454;42392;43328;44642 19990;19991;19992;19993;19994;19995;19996;23557;23558;23559;23560;142734;142735;160016;160017;160018;160019;162920;162921;169194;203041;203042;203043;207664;207665;207666;214210 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Chr4:11477988-11479375 FORWARD LENGTH=262;AT4G21585.2 | Symbols:ENDO4 | endonuclease 4 | endonuclease 4 | Chr4:11477988-11479375 FORWARD LENGTH=262;AT4G21585.4 | Symbols:ENDO4 | endonucle 6 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 5.7 5.7 5.7 30.129 262 262;262;299;299;325;327 2 1 0.0013495 3.0753 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 5.7 24302000 19602000 4699300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24302000 19602000 4699300 4032 16207 True 18333 89539 114912 114912 AT4G21620.2;AT4G21620.1 AT4G21620.2;AT4G21620.1 1;1 1;1 1;1 AT4G21620.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycine-rich protein | Chr4:11491519-11491914 FORWARD LENGTH=98;AT4G21620.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycine-rich protein | Chr4:11491519-11491914 FORW 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.3 16.3 16.3 10.048 98 98;131 1.6 3 1 1 0 26.54 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.2324 1.1413 18.859 5 0 Median 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Symbols:EMB1989,NRPB2,RPB2 | EMBRYO DEFECTIVE 1989 | DNA-directed RNA polymerase family protein | Chr4:11535684-11542200 REVERSE LENGTH=1188 1 9 9 9 5 6 7 6 5 6 7 6 5 6 7 6 9 9 9 135.02 1188 1188 2 8 8 8 0 34.092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86585 0.90297 37.846 20 4 Leave out requantified 1.522 1.2576 0.67775 0.6011 1.4052 1.1673 0.77642 0.67611 29.634 8.894 25.319 14.647 5 5 6 4 2 0 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.1 5.9 7.4 6.1 1585400000 680970000 904430000 264820000 123830000 140990000 349900000 142900000 206990000 636850000 221340000 415520000 333840000 192900000 140930000 4037 1526;8201;13413;17954;19012;26407;31105;32254;33936 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1737;9294;15146;20323;21480;30256;35484;36744;38677 8723;8724;8725;8726;45015;45016;45017;45018;73255;99101;99102;99103;99104;105219;145989;169321;169322;175147;175148;175149;184502;184503;184504;184505 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Symbols:AtACER,ATCES1 | CERAMIDASE | Alkaline phytoceramidase (aPHC) | Chr4:11798483-11799549 FORWARD LENGTH=255 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.2 8.2 8.2 29.744 255 255 2.11 3 2 4 0 6.3972 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0875 1.1155 42.543 7 0 Leave out requantified 1.3252 1.4204 0.54207 NaN 1.2888 1.3027 0.66056 NaN 22.117 36.784 3.8491 NaN 2 2 2 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 8.2 8.2 8.2 8.2 552950000 282130000 270820000 89411000 39835000 49576000 149650000 55886000 93767000 190250000 123940000 66308000 123640000 62469000 61166000 4047 38515;39537 True;True 43837;44994 210201;210202;210203;210204;215961;215962;215963;215964;215965 268155;268156;268157;268158;268159;268160;275622;275623;275624;275625 268158;275625 AT5G20160.1;AT4G22380.1;AT5G20160.2;AT5G20160.3 AT5G20160.1;AT4G22380.1;AT5G20160.2 3;3;3;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT5G20160.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein | Chr5:6804075-6805102 REVERSE LENGTH=128;AT4G22380.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein 4 3 1 1 3 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 19.5 6.2 6.2 13.897 128 128;128;160;109 1.71 4 1 2 0.0020515 2.6625 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85104 0.79217 52.474 6 2 Median 0.61799 1.2874 NaN NaN 0.58239 1.1778 NaN NaN 2.7116 15.296 NaN NaN 2 2 1 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 19.5 19.5 19.5 19.5 1325500000 740000000 585550000 437870000 267310000 170560000 389900000 170420000 219480000 319720000 237290000 82429000 178060000 64977000 113080000 4048 26517;30642;32525 False;False;True 30382;34977;37053;37054 146692;146693;146694;146695;146696;146697;146698;167235;167236;167237;167238;167239;176621;176622;176623;176624;176625;176626;176627 186902;186903;186904;186905;186906;186907;186908;186909;213060;213061;213062;213063;213064;213065;213066;224964;224965;224966;224967;224968;224969;224970 186906;213061;224965 AT4G22400.1 AT4G22400.1 1 1 1 AT4G22400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr4:11816829-11817812 FORWARD LENGTH=327 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 6.1 6.1 6.1 37.98 327 327 3 1 0.002233 2.6257 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 6.1 0 0 0 38766000 19030000 19736000 38766000 19030000 19736000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4049 22741 True 25570 123849 158546 158546 AT4G22485.1 AT4G22485.1 5 5 5 AT4G22485.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr4:11844506-11846476 REVERSE LENGTH=656 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 8.2 8.2 8.2 68.199 656 656 2 17 18 17 0 57.752 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8652 0.9178 10.134 40 7 Leave out requantified 0.9178 1.0887 0.71833 1.0058 0.87424 1.0445 0.82203 1.0881 15.576 11.287 6.6921 106.95 9 10 11 10 1 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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pyrimidin 4 | Chr4:12019315-12021200 FORWARD LENGTH=377;AT4G22930.1 | Symbols:DHOASE,PYR4 | DIHYDROOROTASE,pyrimidin 4 | pyrimidin 4 | Chr4:12019315-12021200 FORWARD LENGTH=377 2 8 8 8 3 4 4 3 3 4 4 3 3 4 4 3 32.1 32.1 32.1 41.949 377 377;377 2.06 4 8 5 0 75.909 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78874 0.76149 39.455 15 13 Median 0.78904 1.2321 0.55018 0.57618 0.76149 1.1552 0.66339 0.66811 9.3597 33.638 39.365 21.061 3 5 3 4 3 5 2 3 Plateau Median Median Median 13.5 19.4 18 12.2 1451600000 837970000 613630000 249730000 130770000 118970000 310100000 146330000 163770000 420240000 238730000 181510000 471540000 322150000 149390000 4062 2334;4360;5245;11077;20619;23901;24948;33142 True;True;True;True;True;True;True;True 2629;4971;5975;12509;23218;26840;28434;37740 12909;24148;29022;60589;113215;129910;129911;129912;129913;129914;129915;129916;137447;137448;137449;137450;179972 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protein kinase) 7 | Chr4:12125731-12128301 FORWARD LENGTH=659 1 3 1 1 1 2 1 2 0 0 0 1 0 0 0 1 5.5 2.1 2.1 73.924 659 659 3 1 0.00040185 3.6262 By matching By matching By matching By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 2 3.3 2 4.1 12751000 5935500 6815800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12751000 5935500 6815800 4064 1814;3197;27112 True;False;False 2063;3657;3658;31036 10229;17935;17936;17937;17938;17939;17940;149542 13300;23168;23169;23170;23171;23172;23173;190513 13300;23169;190513 3818 473 AT4G23160.1;AT4G23140.1;AT4G23140.2;AT4G23160.3;AT4G23160.2 AT4G23160.1;AT4G23140.1;AT4G23140.2;AT4G23160.3;AT4G23160.2 4;3;3;3;3 3;3;3;2;2 3;3;3;2;2 AT4G23160.1 | Symbols:CRK8 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 | cysteine-rich RECEPTOR-like kinase | Chr4:12131325-12134086 FORWARD LENGTH=682;AT4G23140.1 | Symbols:CRK6 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 6 | cysteine-r 5 4 3 3 1 3 2 2 1 2 2 2 1 2 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(RECEPTOR-like protein kinase) 11,RECEPTOR LIKE PROTEIN KINASE 3 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 11 | Chr4:12141197-12143476 REVERSE LENGTH=589;AT4G23190.3 | Symbols:CRK11,AT-RLK 3 2 1 1 1 1 1 2 0 0 0 1 0 0 0 1 4.6 2.4 2.4 65.535 589 589;589;667 3 1 1 -2 By matching By matching By matching By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 2.2 2.2 2.2 4.6 236630000 20241000 216390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 236630000 20241000 216390000 + 4068 3197;23675 False;True 3657;3658;26590 17935;17936;17937;17938;17939;17940;128775 23168;23169;23170;23171;23172;23173;164769 23169;164769 3818 409 AT4G23200.2;AT4G23200.1 AT4G23200.2;AT4G23200.1 1;1 1;1 1;1 AT4G23200.2 | Symbols:CRK12 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 12 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 12 | Chr4:12146023-12147934 REVERSE LENGTH=502;AT4G23200.1 | Symbols:CRK12 | cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein ki 2 1 1 1 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Median Median Median 7.4 5.8 7.4 3.8 126610000 74362000 52251000 21600000 3418600 18181000 15828000 1193100 14635000 68490000 49054000 19435000 20696000 20696000 0 4070 3197;16729;24365;27791 False;True;True;True 3657;3658;18911;27552;27553;31799 17935;17936;17937;17938;17939;17940;92154;92155;92156;92157;133174;133175;153018;153019;153020 23168;23169;23170;23171;23172;23173;118116;118117;118118;118119;170213;170214;194951;194952;194953 23169;118119;170214;194952 1833 3818;3819 219 161;473 AT4G23250.1;AT4G23250.3;AT4G23250.2 AT4G23250.1;AT4G23250.3;AT4G23250.2 5;5;5 4;4;4 3;3;3 AT4G23250.1 | Symbols:DUF26-21,RKC1,EMB1290,CRK17 | EMBRYO DEFECTIVE 1290,CYSTEINE-RICH RLK (RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE) 17,RECEPTOR-LIKE KINASE THALIANACOL-0GENOMICLIBRARY(CLONTECH).THEPOSITIVEPHAGECLONES C-X8-C-X2-C CLASS 1 | cysteine-rich receptor-li 3 5 4 3 2 2 5 4 1 1 4 3 1 1 3 2 8 6.1 4.7 76.353 686 686;721;1001 2.22 1 5 3 0 14.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.5791 0.69767 109.95 8 8 Median NaN NaN 0.5791 0.33875 NaN NaN 0.69767 0.37436 NaN NaN 118.91 112.72 1 0 4 3 1 0 4 3 Median Median Median Median 3.9 3.9 8 6.6 367400000 173850000 193550000 36332000 9668000 26664000 0 0 0 208520000 97984000 110540000 122550000 66199000 56349000 4071 3197;4823;22292;32716;32825 False;True;True;True;True 3657;3658;5506;25048;37266;37393 17935;17936;17937;17938;17939;17940;26763;26764;121257;121258;177698;177699;177700;177701;178369 23168;23169;23170;23171;23172;23173;34448;34449;155239;155240;226370;226371;226372;226373;227243 23169;34449;155239;226372;227243 3818 496 AT4G23400.1 AT4G23400.1 7 6 6 AT4G23400.1 | Symbols:PIP1D,PIP1;5 | plasma membrane intrinsic protein 1;5 | plasma membrane intrinsic protein 1%3B5 | Chr4:12220792-12222155 FORWARD LENGTH=287 1 7 6 6 6 5 7 5 5 4 6 4 5 4 6 4 27.9 24.4 24.4 30.646 287 287 2.19 6 14 12 0 32.727 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87269 0.96085 82.742 19 8 Leave out requantified 0.4299 0.56631 1.06 0.83006 0.41036 0.51953 1.2422 0.94057 38.396 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| Symbols:no symbol available | no full name available | PLAC8 family protein | Chr4:12249289-12251079 FOR 4 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 9 9 9 26.082 233 233;255;177;199 1.8 2 2 1 0 6.3049 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9056 1.7501 32.269 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 5.6 9 5.6 5.6 73627000 29341000 44286000 5717800 1824000 3893800 56721000 16329000 40392000 11188000 11188000 0 0 0 0 4075 2465;39375 True;True 2776;44808 13673;215062;215063;215064;215065 17691;274470;274471;274472;274473 17691;274470 3821;3822 57;67 AT4G23500.1 AT4G23500.1 3 3 3 AT4G23500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pectin lyase-like superfamily protein | Chr4:12264640-12267074 FORWARD LENGTH=495 1 3 3 3 3 3 1 1 3 3 1 1 3 3 1 1 7.9 7.9 7.9 54.69 495 495 1.88 4 1 3 0 8.0468 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.52399 0.54295 64.489 7 4 Median 0.91398 0.25162 NaN NaN 0.86225 0.23831 NaN NaN 79.814 24.068 NaN NaN 3 2 1 1 1 2 0 1 Plateau Median Median Median 7.9 7.9 3 3.2 541120000 336040000 205080000 188330000 114860000 73472000 140520000 107830000 32685000 176000000 91516000 84480000 36284000 21838000 14446000 4076 4773;10637;16568 True;True;True 5451;12011;18739 26518;26519;58053;58054;58055;91470;91471;91472 34128;34129;74532;74533;117254;117255;117256 34129;74533;117255 AT4G23570.1;AT4G23570.2;AT4G23570.3 AT4G23570.1;AT4G23570.2;AT4G23570.3 4;4;3 4;4;3 4;4;3 AT4G23570.1 | Symbols:SGT1A | | phosphatase-like protein | Chr4:12300015-12302493 FORWARD LENGTH=350;AT4G23570.2 | Symbols:SGT1A | | phosphatase-like protein | Chr4:12300015-12302493 FORWARD LENGTH=350;AT4G23570.3 | Symbols:SGT1A | | phosphatase-li 3 4 4 4 2 2 4 3 2 2 4 3 2 2 4 3 13.4 13.4 13.4 39.224 350 350;350;351 1.82 4 5 2 0 9.7675 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62693 0.69868 94.3 9 5 Median 1.2063 1.8231 0.62693 0.36636 1.1097 1.6791 0.69868 0.38418 26.749 5.9319 117.26 10.67 2 2 3 2 0 1 3 1 Median Median Plateau Median 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Calcium dependent protein kinase 3,calcium-dependent protein kinase 6 | calcium-dependent protein kinase 6 | Chr4:12324967-12327415 REVERSE LENGTH=529 3 17 17 17 11 12 16 15 11 12 16 15 11 12 16 15 36.3 36.3 36.3 59.336 529 529;523;528 2.07 24 28 30 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83175 0.90357 25.328 71 20 Leave out requantified 1.2503 1.2361 0.72385 0.66767 1.2007 1.1822 0.85046 0.75014 33.938 28.235 32.546 22.84 18 14 19 20 5 1 9 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.8 28.9 35.9 32.5 12907000000 6924000000 5983300000 2643900000 1080500000 1563400000 2345500000 1036200000 1309300000 4102100000 2457800000 1644200000 3815700000 2349400000 1466300000 4082 16;3348;5019;5893;6066;6067;7716;8629;11411;14570;14827;17673;17936;19033;23169;29877;35603 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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AMP-dependent synthetase and ligase family protein | Chr4:12403720-12408263 REVERSE LENGTH=666 2 26 26 24 25 22 24 23 25 22 24 23 23 20 22 21 39.5 39.5 36 74.507 666 666;666 2.03 55 57 60 0 91.309 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96901 1.0115 27.553 135 49 Leave out requantified 1.2798 1.6148 0.62538 0.59699 1.2013 1.4869 0.76271 0.65009 22.043 17.267 22.838 33.225 35 33 33 34 11 10 11 17 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.8 32.9 36.9 34.2 19626000000 9552100000 10074000000 4196500000 1769200000 2427400000 4520400000 1680200000 2840100000 5890900000 3161500000 2729500000 5017900000 2941300000 2076700000 4090 1726;1934;5274;5937;7098;8084;8396;8768;11325;14618;19052;19154;19362;19623;20835;27159;28055;28473;28682;31466;32007;33027;34275;37817;38741;39547 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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cellulose synthase like G3,AR 5 4 4 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.4 8.4 8.4 60.812 537 537;751;530;722;760 2.12 2 3 3 0 21.033 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.7486 2.6633 98.048 4 4 Median NaN 3.8288 NaN NaN NaN 3.7164 NaN NaN NaN 35.896 NaN NaN 1 2 0 1 1 2 0 1 Median Median Median Median 5 3.5 3.5 5 60577000 22009000 38568000 18029000 4196200 13832000 26619000 6989400 19630000 0 0 0 15929000 10823000 5105900 4094 25102;29993;32570;35063 True;True;True;True 28640;34250;37103;39928 138500;164232;164233;164234;164235;176827;176828;190816 176809;209249;209250;209251;209252;225210;225211;243219 176809;209251;225211;243219 AT4G24040.1 AT4G24040.1 2 2 2 AT4G24040.1 | Symbols:TRE1,ATTRE1 | trehalase 1 | trehalase 1 | Chr4:12488242-12491060 FORWARD LENGTH=626 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2.7 2.7 2.7 71.354 626 626 2.5 1 1 4 0.0041621 2.3123 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2728 1.1968 62.965 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 1.1 1.1 2.7 1.1 62878000 37157000 25720000 13185000 3949300 9235700 12424000 3973800 8449900 37269000 29234000 8034700 0 0 0 4095 1193;1805 True;True 1343;2054 6650;10192;10193;10194;10195;10196 8671;13256;13257;13258;13259;13260 8671;13257 AT4G24090.1 AT4G24090.1 5 5 5 AT4G24090.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | homer protein | Chr4:12512742-12514467 FORWARD LENGTH=308 1 5 5 5 3 4 5 4 3 4 5 4 3 4 5 4 21.8 21.8 21.8 33.64 308 308 1.81 6 7 3 0 32.892 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90127 0.88697 27.214 15 8 Leave out requantified 0.78886 0.50604 1.1309 1.1592 0.72802 0.46294 1.3258 1.2719 8.7073 13.84 31.99 26.959 3 4 5 3 0 3 3 2 Leave out requantified Median Median Median 13 16.9 21.8 16.9 785660000 412340000 373320000 141310000 71950000 69363000 214010000 144850000 69159000 319690000 148630000 171060000 110640000 46909000 63735000 4096 121;13990;22168;30157;30994 True;True;True;True;True 134;15810;24915;34423;35362 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| Symbols:RGTA1,ATRGTA1 | RAB geranylgeranyl transferase alpha subunit 1 | RAB geranylgeranyl transferase alpha subunit 1 | Chr4:12655330-12658103 REVERSE LENGTH=678;AT4G24490.1 | Symbols:RGTA1,ATRGTA1 | RAB geranylgeranyl transferase alpha 2 3 3 3 2 1 3 1 2 1 3 1 2 1 3 1 4.9 4.9 4.9 76.908 678 678;678 1.71 3 3 1 0 5.6928 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.267 1.4494 10.323 3 2 Median NaN NaN 1.2289 NaN NaN NaN 1.415 NaN NaN NaN 3.4038 NaN 0 1 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 2.9 1.5 4.9 1.5 129430000 57083000 72342000 0 0 0 56362000 24159000 32203000 73063000 32924000 40139000 0 0 0 4107 7483;14268;39470 True;True;True 8508;16160;44913 41661;41662;78959;215513;215514;215515;215516 53370;53371;101873;275040;275041;275042;275043 53370;101873;275043 3857 449 AT4G24510.1 AT4G24510.1 7 7 7 AT4G24510.1 | Symbols:VC-2,VC2,CER2 | ECERIFERUM 2 | HXXXD-type acyl-transferase family protein | Chr4:12660929-12662537 FORWARD LENGTH=421 1 7 7 7 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 17.6 17.6 17.6 47.237 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Chr4:12663065-12667066 REVERSE LENGTH=688;AT4G24520.1 | Symbols:ATR1,AR1 | ARABIDOPSIS CYTOCHROME REDUCTASE,P450 reductase 1 | P450 reductase 1 | Ch 2 9 8 8 4 6 6 4 3 5 5 4 3 5 5 4 13.8 12.8 12.8 76.324 688 688;692 2.05 5 8 6 0 34.057 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.8993 1.8003 62.797 19 12 Leave out requantified 2.4423 1.3944 0.49019 0.66022 2.2001 1.2977 0.57683 0.64564 62.039 40.711 67.72 11.121 3 7 5 4 1 6 3 2 Median Median Median Linear 7.7 10.3 9 7 776190000 412590000 363600000 114030000 47632000 66401000 277070000 125960000 151110000 227740000 145200000 82536000 157350000 93790000 63557000 4109 333;2374;9829;28060;33059;36935;37600;37904;39552 True;True;True;False;True;True;True;True;True 371;2677;11129;32096;37645;42085;42821;43159;45013 1881;1882;1883;13145;53695;53696;53697;154275;154276;154277;179526;179527;179528;179529;179530;201480;201481;205272;205273;206933;206934;216093 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PROTOCHLOROPHYLLIDE-DEPENDENT TRANSLOCON COMPONENT, 52 KDA,ACD1-like,TRANSLOCON AT THE INNER ENVELOPE MEMBRANE OF CHLOROPLASTS, 55 KDA - IV | ACD1-like protein | Chr4:13081021-13083153 REVERSE LENGTH=536;A 2 11 11 11 9 8 9 9 9 8 9 9 9 8 9 9 26.5 26.5 26.5 61.263 536 536;559 2.24 10 18 22 0 39.606 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9704 1.0462 9.0632 45 8 Leave out requantified 0.84776 1.0888 0.90001 0.92318 0.80499 1.0561 1.0701 1.081 21.091 13.271 15.934 16.587 13 10 12 10 2 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.5 19.4 21.1 21.1 4619400000 2312900000 2306500000 1064800000 503950000 560860000 980150000 459210000 520940000 1349800000 704730000 645050000 1224700000 645050000 579610000 4140 8270;10868;14423;21597;21696;22662;25523;28624;31047;36415;39502 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 9368;12274;16343;24298;24404;25487;29179;32754;35421;41476;44952 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.6 0 2.4 1.6 56521000 34014000 22507000 0 0 0 0 0 0 24752000 14515000 10237000 31769000 19499000 12270000 4142 2417;2721 True;True 2724;3125 13417;15533;15534;15535 17351;20167;20168;20169 17351;20168 AT4G25740.2;AT4G25740.1 AT4G25740.2;AT4G25740.1 7;7 3;3 3;3 AT4G25740.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA binding Plectin/S10 domain-containing protein | Chr4:13107488-13108751 REVERSE LENGTH=149;AT4G25740.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA binding Plectin/S 2 7 3 3 7 7 7 7 3 3 3 3 3 3 3 3 45.6 21.5 21.5 16.368 149 149;177 1.9 11 10 8 0 17.445 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0078 1.0649 18.958 27 5 Leave out requantified 1.0017 0.87379 1.1746 1.0619 0.92133 0.82557 1.4161 1.173 5.6426 28.036 15.284 1.5679 5 7 7 8 1 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.6 45.6 45.6 45.6 5142700000 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ARABIDOPSIS 2 16 16 13 13 12 13 11 13 12 13 11 11 9 10 8 50.5 50.5 43.5 42.997 372 372;359 2.17 14 31 26 0 102.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94015 0.98544 9.4306 66 30 Leave out requantified 0.87233 0.93254 0.97444 0.94292 0.77357 0.9208 1.125 1.0983 32.964 11.897 19.703 44.94 17 15 20 14 10 5 10 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.5 34.1 39.2 37.4 14019000000 7355200000 6663700000 2287100000 1312500000 974600000 3473000000 1752700000 1720300000 5239800000 2530600000 2709200000 3019000000 1759400000 1259600000 4152 1416;2538;5609;15264;19208;20692;22755;25947;25948;26346;28802;30334;30644;31700;38438;39176 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1601;2880;2881;6369;17280;21691;23295;25586;29693;29694;30183;32948;34634;34979;36131;36132;43754;44579 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10629;10630;10631;10632;10633;10634;10635;10636;10637;10638;10639;10640;18316;18317;18318;18319;18320;18321;18322;39881;39882;39883;39884;39885;39886;39887;39888;39889;39890;108805;108806;108807;108808;108809;108810;108811;108812;136153;145495;145496;145497;145498;145499;158635;182975;182976;182977;182978;182979;182980;182981;182982;182983;182984;182985;182986;185612;201752;201753;201754;201755;201756;201757;211043;211044;213070;213071;219366;219367;219368;219369;219370;219371;219372;219373;219374;267649;272866;272867;272868;272869;272870;272871;272872;272873;272874 10633;18319;39890;108806;136153;145498;158635;182976;182980;185612;201756;211043;213071;219371;267649;272867 1864 3903;3904 99 193;205 AT4G26160.1 AT4G26160.1 2 2 2 AT4G26160.1 | Symbols:ACHT1 | atypical CYS HIS rich thioredoxin 1 | atypical CYS HIS rich thioredoxin 1 | Chr4:13255296-13256632 FORWARD LENGTH=221 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 10.9 10.9 10.9 24.352 221 221 2 3 2 3 0 7.1843 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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| Chr4:13452257-13453579 FORWARD LENGTH=210 1 3 3 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 22.9 22.9 22.9 21.811 210 210 1.94 6 5 5 0 12.705 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1167 1.1068 16.114 14 5 Leave out requantified 1.065 1.1071 0.89355 1.0872 0.94784 1.0768 1.0887 1.203 48.804 17.325 6.2062 31.996 4 5 2 3 2 2 0 1 Median Leave out requantified Median Median 11.9 22.9 11.9 11.9 1543300000 734150000 809180000 361210000 178340000 182860000 422770000 187740000 235020000 344020000 165750000 178270000 415330000 202310000 213020000 4164 2454;10652;14699 True;True;True 2765;12027;16648 13608;13609;13610;13611;13612;58133;81248;81249;81250;81251;81252;81253;81254;81255;81256;81257 17600;17601;17602;74634;104770;104771;104772;104773;104774;104775;104776;104777;104778 17602;74634;104770 3914 61 AT4G26690.1 AT4G26690.1 15 14 14 AT4G26690.1 | Symbols:GPDL2,MRH5,SHV3,GDPDL3 | Glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDPD) like 3,MUTANT ROOT HAIR 5,GLYCEROPHOSPHODIESTERASE-LIKE 2,SHAVEN 3 | PLC-like phosphodiesterase family protein | Chr4:13456793-13459890 REVERSE LENGTH=759 1 15 14 14 15 15 15 15 14 14 14 14 14 14 14 14 25.4 24.1 24.1 82.561 759 759 2.11 27 33 38 0 202.08 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.081 1.1356 17.638 86 22 Leave out requantified 1.178 1.3748 0.98492 0.84154 1.1364 1.2565 1.2078 0.95562 17.641 25.289 31.689 31.503 21 22 22 21 7 5 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.4 25.4 25.4 25.4 16619000000 8653300000 7966200000 3609900000 1757900000 1852000000 3194600000 1393900000 1800600000 5879300000 3318700000 2560600000 3935700000 2182800000 1752900000 4165 4657;5235;5550;5886;7939;10621;19600;21014;23153;25374;27904;30578;31706;32365;34132 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True 5317;5318;5965;6306;6679;9005;11994;22115;23647;26013;28982;28983;31921;34908;36139;36871;38897 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Symbols:HTA2 | histone H2A 2 | histone H2A 2 | Chr4:13637515-13638325 REVERSE LENGTH=131 2 6 2 2 4 5 4 6 1 1 1 2 1 1 1 2 48.9 13.7 13.7 13.833 131 131;131 2.2 1 2 2 0.0020568 2.6865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83338 0.90332 22.149 5 1 Median NaN NaN NaN 0.83843 NaN NaN NaN 0.92659 NaN NaN NaN 34.965 1 1 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 35.9 41.2 35.9 48.9 2702200000 1455800000 1246400000 545760000 287600000 258160000 690210000 360840000 329380000 707210000 369820000 337400000 759010000 437590000 321420000 4181 1408;1481;15799;22001;25073;27415 False;True;False;False;False;True 1592;1685;17880;24732;24733;24734;24735;28604;31375 8041;8042;8043;8044;8045;8046;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;8055;8056;8057;8058;8059;8060;8061;8464;87255;87256;119875;119876;119877;119878;119879;119880;119881;119882;119883;119884;119885;119886;138363;138364;138365;138366;151213;151214;151215;151216 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reaction center PSB28 protein | photosyste 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 12.6 12.6 12.6 20.192 183 183;198 1.92 4 6 3 0 6.3162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 6 6 12.6 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4218 12217;39202 True;True 13806;44608;44609 66728;213999;214000;214001;214002;214003;214004;214005;214006;214007;214008;214009;214010 85803;273050;273051;273052;273053;273054;273055;273056;273057;273058;273059;273060;273061;273062;273063;273064 85803;273052 1903;1904 143;175 AT4G28706.1;AT4G28706.3;AT4G28706.2;AT4G28706.4 AT4G28706.1;AT4G28706.3;AT4G28706.2;AT4G28706.4 8;8;8;8 8;8;8;8 8;8;8;8 AT4G28706.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | pfkB-like carbohydrate kinase family protein | Chr4:14167805-14170619 FORWARD LENGTH=401;AT4G28706.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | pfkB-like carbohydrate kin 4 8 8 8 2 5 6 3 2 5 6 3 2 5 6 3 25.7 25.7 25.7 43.079 401 401;403;404;440 2 5 8 5 0 34.302 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97949 1.0302 31.79 16 6 Leave out requantified 1.1277 1.2933 0.62269 0.87824 1.0632 1.1767 0.74196 1.0294 4.9342 22.337 33.218 9.603 2 6 5 3 0 3 3 0 Median Leave out requantified Median Plateau 8 19 21.4 14.7 1016900000 580280000 436650000 116420000 59097000 57321000 383050000 207300000 175750000 358890000 229330000 129560000 158570000 84549000 74019000 4219 3161;6637;8366;18806;20944;21339;31998;36751 True;True;True;True;True;True;True;True 3614;7560;9482;21262;23569;24014;36460;36461;41882 17762;36800;36801;36802;36803;46003;104112;114678;116711;173850;173851;173852;200446;200447;200448;200449;200450;200451 22965;47136;47137;47138;47139;47140;47141;47142;47143;47144;58986;133519;146965;149497;221464;221465;221466;255650;255651;255652;255653;255654;255655;255656;255657 22965;47140;58986;133519;146965;149497;221466;255655 3957;3958 162;172 AT4G28710.1 AT4G28710.1 2 1 1 AT4G28710.1 | Symbols:XIH,ATXIH | MYOSIN XI H | Myosin family protein with Dil domain-containing protein | Chr4:14172280-14181771 FORWARD LENGTH=1516 1 2 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1.9 1 1 172.15 1516 1516 3 1 1 -2 By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0.9 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 4220 6870;34696 False;True 7823;7824;39528 38343;38344;189055 49130;49131;241016 49131;241016 1905;2968;2969 3959 770;772;778 66 AT4G28730.1;AT4G28730.2 AT4G28730.1;AT4G28730.2 3;2 3;2 3;2 AT4G28730.1 | Symbols:GrxC5 | glutaredoxin C5 | Glutaredoxin family protein | Chr4:14199174-14200712 FORWARD LENGTH=174;AT4G28730.2 | Symbols:GrxC5 | glutaredoxin C5 | Glutaredoxin family protein | Chr4:14199174-14200324 FORWARD LENGTH=142 2 3 3 3 1 3 0 0 1 3 0 0 1 3 0 0 25.3 25.3 25.3 18.813 174 174;142 1.5 2 2 0 5 By MS/MS By MS/MS 1.2532 1.147 58.822 4 2 Median NaN 1.2327 NaN NaN NaN 1.0787 NaN NaN NaN 72.015 NaN NaN 1 3 0 0 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767;768;769;770;771;772;773;774;775;776;777;778;779;780;781;782;783;784;785;786;787;788;789;790;791;792;793;794;795;796;797;798;799;46539;46540;46541;46542;46543;46544;46545;46546;46547;46548;46549;46550;46551;46552;46553;46554;46555;46556;46557;46558;46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567;46568;46569;46570;46571;46572;46573;46574;46575;46576;46577;46578;46579;46580;46581;46582;46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590;46591;46592;46593;46594;46595;46596;46597;46598;46599;46600;46601;46602;46603;46604;46605;46606;46607;46608;46609;46610;46611;46612;186405;186406;186407;186408;186409;186410;186411;186412;186413;186414;186415;186416;186417;186418;186419;186420;186421;186422;186423;186424;186425;186426;186427;186428;186429;186430;186431;186432;186433;186434;186435;186436;186437;186438;186439;186440;186441;186442;186443;186444;186445;186446;186447;186448;186449;186450;186451;254340;254341;254342;254343;254344;254345;254346;254347;254348;254349;254350;254351;254352;254353;254354;254355;254356;254357;254358;254359;254360;254361 795;46553;46605;186414;254343 826;1906;1907;1908 99;124;131;132 AT4G28770.1;AT4G28770.2 AT4G28770.1;AT4G28770.2 4;4 4;4 4;4 AT4G28770.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetraspanin family protein | Chr4:14212177-14213518 REVERSE LENGTH=281;AT4G28770.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetraspanin family protein | Chr4:14212177- 2 4 4 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 23.1 23.1 23.1 30.976 281 281;325 1.85 9 5 6 0 31.504 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0783 1.06 34.149 17 9 Leave out requantified 1.3435 1.1953 0.88983 0.80118 1.2383 1.1112 1.0015 0.86817 21.095 12.151 22.168 23.937 4 5 4 4 3 3 1 2 Median Median Median Median 15.3 15.3 15.3 23.1 924780000 500980000 423800000 224270000 100500000 123770000 199720000 99841000 99879000 272430000 148520000 123910000 228360000 152110000 76245000 4224 5985;6207;27705;38615 True;True;True;True 6790;7070;31706;31707;43949 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2.1 58.686 533 533 1 1 0.0031227 2.4703 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4250 8747 True 9906 48274 62019 62019 AT4G29810.1;AT4G29810.2;AT4G29810.3 AT4G29810.1;AT4G29810.2;AT4G29810.3 6;5;4 6;5;4 5;5;4 AT4G29810.1 | Symbols:ATMKK2,MKK2,MK1 | MAP kinase kinase 2,MAP KINASE KINASE 1 | MAP kinase kinase 2 | Chr4:14593299-14595241 REVERSE LENGTH=363;AT4G29810.2 | Symbols:ATMKK2,MKK2,MK1 | MAP kinase kinase 2,MAP KINASE KINASE 1 | MAP kinase kinase 2 | Ch 3 6 6 5 3 6 4 2 3 6 4 2 2 5 3 1 20.1 20.1 17.6 39.848 363 363;372;338 2.28 3 7 8 0 14.162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0899 1.1795 61.842 16 7 Leave out requantified 1.3868 1.5425 0.74508 0.37845 1.2318 1.4858 0.93635 0.44673 43.499 0.7214 61.509 67.282 3 7 4 2 1 4 1 1 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 10.5 20.1 13.2 5.8 1415800000 836510000 579300000 184200000 90679000 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Symbols:ATACA10,ACA10,CIF1 | autoinhibited Ca(2+)-ATPase 10,COM 2 13 12 12 11 5 8 8 10 4 7 7 10 4 7 7 12.3 10.8 10.8 116.86 1069 1069;1069 2.16 9 9 14 0 72.102 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72518 0.87329 24.811 26 11 Leave out requantified 0.84521 1.4614 0.73756 0.48396 0.78018 1.3123 0.87226 0.56736 50.369 71.623 17.467 15.081 9 3 7 7 3 2 2 4 Leave out requantified Plateau Leave out requantified Leave out requantified 11.1 5.8 9.1 8.6 1506500000 828340000 678110000 420460000 229670000 190790000 195660000 109940000 85725000 507310000 282060000 225250000 383020000 206680000 176340000 4254 1769;14089;19470;21604;22859;24124;26284;27748;27749;28389;28390;29003;32386 True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True 2008;15922;21973;24305;25694;27160;30114;31752;31753;32483;32484;33168;36895 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Symbols:ATDGK7,DGK7 | diacylglycerol kinase 7 | diacylglycerol kinase 7 | Chr4:14839068-14840941 REVERSE LENGTH=374;AT4G30340.1 | Symbols:ATDGK7,DGK7 | diacylglycerol kinase 7 | diacylglycerol kinase 7 | Chr4:14838465-14840941 REVERSE LEN 2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 3.7 3.7 3.7 41.192 374 374;492 2.25 1 1 2 0 7.3818 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91779 0.84254 31.659 2 2 Median 0.91779 NaN NaN NaN 0.84254 NaN NaN NaN 31.659 NaN NaN NaN 2 0 0 0 2 0 0 0 Median Median Median Median 3.7 3.7 3.7 0 37259000 17636000 19622000 37259000 17636000 19622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4268 31452 True 35862 171121;171122;171123;171124 217947;217948;217949;217950 217949 AT4G30440.1 AT4G30440.1 2 2 2 AT4G30440.1 | Symbols:GAE1 | UDP-D-glucuronate 4-epimerase 1 | UDP-D-glucuronate 4-epimerase 1 | Chr4:14881976-14883265 REVERSE LENGTH=429 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 7.5 7.5 7.5 47.458 429 429 2.6 2 3 0 6.0417 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89025 0.84184 44.387 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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amidotransferase-like superfamily protein | Chr4:14925618-14926713 FORWARD LENGTH=249 1 3 2 2 2 2 3 2 2 1 2 1 2 1 2 1 14.1 10.4 10.4 28.224 249 249 1.83 2 3 1 0 12.924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.60438 0.56448 38.032 6 2 Leave out requantified 0.60438 NaN 0.45568 NaN 0.56448 NaN 0.50478 NaN 38.032 NaN 60.175 NaN 2 1 2 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 10.4 10 14.1 10 265420000 155190000 110240000 103350000 62988000 40366000 60814000 18229000 42585000 81333000 60596000 20737000 19924000 13373000 6551200 4272 8654;15445;31233 False;True;True 9801;17484;35622 47788;47789;47790;85429;85430;85431;85432;169967;169968 61368;110191;110192;110193;110194;110195;110196;216419;216420 61368;110191;216420 4013 229 AT4G30570.1 AT4G30570.1 1 1 1 AT4G30570.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein | Chr4:14930706-14931951 REVERSE LENGTH=331 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 5.7 5.7 5.7 36.573 331 331 3 1 1 -2 By MS/MS 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2339 1.697 42.107 4 2 Linear NaN 1.7123 NaN 0.92828 NaN 1.6086 NaN 0.98943 NaN 33.684 NaN 42.693 0 2 0 2 0 1 0 1 Median Median Median Median 20 19.4 13.9 19.4 233100000 93632000 139460000 0 0 0 139920000 42752000 97172000 0 0 0 93172000 50880000 42292000 4277 2960;23034;32078;37164 False;True;True;False 3398;25882;36549;42331 16888;125219;125220;174221;174222;174223;174224;174225;202539;202540;202541;202542;202543;202544;202545;202546 21854;160285;221933;221934;221935;221936;221937;258288;258289;258290;258291;258292;258293;258294;258295;258296;258297;258298 21854;160285;221937;258295 1770;4015 86;133 AT4G30650.1 AT4G30650.1 1 1 1 AT4G30650.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Low temperature and salt responsive protein family | Chr4:14954403-14954698 FORWARD LENGTH=73 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.8 17.8 17.8 7.9055 73 73 1.75 2 1 1 0.00021436 4.6088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1452 1.1198 26.394 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 17.8 17.8 17.8 17.8 429160000 194980000 234170000 94932000 28862000 66070000 135430000 64605000 70826000 66831000 39556000 27275000 131960000 61959000 70005000 4278 8406 True 9529 46323;46324;46325;46326 59468;59469;59470;59471;59472;59473;59474;59475;59476;59477 59472 AT4G30690.1;AT4G30690.2 AT4G30690.1;AT4G30690.2 7;6 4;4 4;4 AT4G30690.1 | Symbols:AtINFC-4,AtIF3- 4 | Initiation factor 3-4 | Translation initiation factor 3 protein | Chr4:14960742-14962328 FORWARD LENGTH=281;AT4G30690.2 | Symbols:AtINFC-4,AtIF3- 4 | Initiation factor 3-4 | Translation initiation factor 3 prote 2 7 4 4 5 7 6 7 3 4 3 4 3 4 3 4 26.3 15.7 15.7 31.823 281 281;253 1.83 9 9 5 0 13.638 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84608 0.78534 42.901 22 6 Leave out requantified 0.76168 0.81927 1.1647 1.0763 0.70453 0.73163 1.3592 1.2121 39.04 52.95 23.537 40.344 4 6 5 7 1 0 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Median 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available | no full name available | DNA topoisomerase%2C type IA%2C c 3 3 3 3 0 0 3 1 0 0 3 1 0 0 3 1 3.5 3.5 3.5 136.65 1239 1239;1280;1284 2.5 2 2 0 7.6656 By MS/MS By MS/MS 0.48018 0.51462 124.26 3 2 Median NaN NaN 0.75882 NaN NaN NaN 0.85123 NaN NaN NaN 170.85 NaN 0 0 2 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 3.5 1 74446000 51594000 22852000 0 0 0 0 0 0 46378000 29473000 16904000 28068000 22121000 5947300 4297 5246;26998;39102 True;True;True 5976;30910;44501 29023;149028;149029;213513 37306;189855;189856;272415 37306;189855;272415 AT4G31300.3;AT4G31300.1;AT4G31300.2 AT4G31300.3;AT4G31300.1;AT4G31300.2 9;9;9 9;9;9 9;9;9 AT4G31300.3 | Symbols:PBA1 | | N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein | Chr4:15188927-15190935 FORWARD LENGTH=233;AT4G31300.1 | Symbols:PBA1 | | N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily p 3 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 36.1 36.1 36.1 25.151 233 233;233;234 2.07 12 16 15 0 121.68 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77251 0.83613 6.3535 29 8 Leave out requantified 0.99311 1.4681 0.63591 0.64791 0.93311 1.3582 0.73753 0.76249 7.7261 16.849 5.3253 24.13 8 7 6 8 3 3 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.9 30 27 27 4373800000 2260100000 2113700000 952980000 470320000 482660000 1039600000 409590000 630030000 1275800000 747370000 528400000 1105400000 632770000 472640000 4298 3910;6223;7811;18179;24458;25298;29421;33798;34117 True;True;True;True;True;True;True;True;True 4470;7094;8869;20568;27685;28869;33633;38506;38507;38879;38880 21891;21892;21893;21894;34707;43190;100353;100354;100355;100356;133749;139495;161399;161400;161401;161402;161403;161404;183581;183582;183583;183584;183585;183586;183587;183588;183589;183590;183591;183592;183593;183594;185490;185491;185492;185493;185494;185495;185496;185497;185498;185499;185500 28428;28429;28430;28431;44458;55327;128586;128587;128588;170880;178069;205657;205658;205659;205660;205661;205662;205663;205664;205665;205666;233803;233804;233805;233806;233807;233808;233809;233810;233811;233812;233813;233814;233815;233816;233817;233818;236299;236300;236301;236302;236303;236304;236305;236306;236307;236308;236309;236310;236311 28429;44458;55327;128586;170880;178069;205657;233818;236304 1936 4025 192 36 AT4G31310.1;AT4G31310.2 AT4G31310.1;AT4G31310.2 2;2 2;2 2;2 AT4G31310.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | AIG2-like (avirulence induced gene) family protein | Chr4:15191325-15192337 FORWARD LENGTH=172;AT4G31310.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | AIG2-like (avirulenc 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 11.6 11.6 11.6 20.122 172 172;174 1.8 2 2 1 0.00041314 4.0335 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77719 0.88965 14.263 4 3 Median NaN NaN 0.68602 NaN NaN NaN 0.76831 NaN NaN NaN 11.068 NaN 0 1 2 1 0 1 2 0 Median Median Median Median 4.7 4.7 11.6 4.7 208180000 105620000 102560000 0 0 0 40310000 19437000 20873000 124410000 59829000 64586000 43457000 26354000 17103000 4299 13711;34077 True;True 15494;38838 75487;75488;75489;75490;185302 97476;97477;97478;97479;236066 97478;236066 4026 93 AT4G31340.2;AT4G31340.1 AT4G31340.2;AT4G31340.1 4;4 4;4 4;4 AT4G31340.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | myosin heavy chain-like protein | Chr4:15205662-15208895 FORWARD LENGTH=420;AT4G31340.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | myosin heavy chain-like protein | Chr4 2 4 4 4 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 13.6 13.6 13.6 47.739 420 420;437 2 4 2 4 0 23.15 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89661 0.91913 21.648 8 1 Leave out requantified NaN 0.9948 0.42136 0.78171 NaN 0.91774 0.49868 0.90091 NaN 23.913 9.6416 3.0472 1 3 2 2 0 0 1 0 Median Leave out requantified Median Median 8.6 10.2 8.1 11.4 1106700000 687130000 419550000 179450000 92962000 86487000 415530000 249100000 166440000 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| no full name available | Ribosomal L28 family | Chr4:15259773-15260847 REVERSE LENGTH=212 1 2 2 2 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 8 8 8 24.065 212 212 1.5 2 2 0.0031204 2.4654 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2078 1.2271 49.587 4 1 Median NaN NaN 0.75311 NaN NaN NaN 0.84397 NaN NaN NaN 21.512 NaN 1 1 2 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 3.3 3.3 8 0 437090000 182480000 254600000 121760000 43351000 78406000 160810000 48827000 111980000 154520000 90304000 64216000 0 0 0 4303 546;1349 True;True 612;1526 3149;3150;3151;7640 4131;4132;10009 4132;10009 AT4G31480.9;AT4G31480.8;AT4G31480.7;AT4G31480.5;AT4G31480.4;AT4G31480.2;AT4G31480.1;AT4G31480.6;AT4G31480.3 AT4G31480.9;AT4G31480.8;AT4G31480.7;AT4G31480.5;AT4G31480.4;AT4G31480.2;AT4G31480.1;AT4G31480.6;AT4G31480.3 25;25;25;25;25;25;25;25;25 1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT4G31480.9 | Symbols:no symbol available | no full name available | Coatomer%2C beta subunit | Chr4:15264145-15267384 FORWARD LENGTH=948;AT4G31480.8 | Symbols:no symbol 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nodulin-like protein 15 | Chr4:15401798-15402426 FORWARD LENGTH=177 1 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 7 8 8 8 7 41.2 41.2 41.2 18.961 177 177 2.07 14 22 18 0 36.146 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9106 0.96926 42.979 47 19 Leave out requantified 0.66606 0.64347 1.1889 1.901 0.62911 0.62814 1.3577 2.2552 29.245 11.903 28.245 21.165 13 13 11 10 6 7 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.2 41.2 41.2 38.4 7246200000 3657600000 3588600000 1646800000 1030600000 616230000 1882500000 1089300000 793300000 1899000000 909510000 989480000 1817800000 628210000 1189600000 4312 3317;6657;17739;20548;23753;35354;35899;38399 True;True;True;True;True;True;True;True 3791;7581;20079;23140;26677;40271;40890;43705 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Symbols:no symbol available | no full name available | copper ion binding protein | Chr4:15728376-15729897 REVERSE LENGTH=315 1 3 3 3 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 13 13 13 34.779 315 315 1.5 4 1 1 0 40.901 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7957 0.71709 19.109 5 2 Median NaN 0.71516 NaN NaN NaN 0.71641 NaN NaN NaN 4.9374 NaN NaN 1 3 1 0 0 2 0 0 Median Plateau Median Median 3.5 6 3.5 7 442550000 194190000 248360000 103070000 40966000 62105000 182540000 84715000 97829000 156930000 68507000 88426000 0 0 0 4331 10202;26638;30420 True;True;True 11544;30527;34731 55772;55773;55774;147387;147388;166112 71507;71508;71509;187828;187829;211552 71507;187829;211552 AT4G32640.2;AT4G32640.1 AT4G32640.2;AT4G32640.1 10;10 10;10 7;7 AT4G32640.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec23/Sec24 protein transport family protein | Chr4:15742661-15750424 FORWARD LENGTH=1080;AT4G32640.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sec23/Sec24 protein trans 2 10 10 7 3 8 6 6 3 8 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protein | Chr4:15908785-15910141 REVERSE LENGTH=264 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 3 3 3 29.423 264 264 2.33 2 1 0.00041093 3.9493 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 3 3 0 23123000 10409000 12714000 0 0 0 23123000 10409000 12714000 0 0 0 0 0 0 4341 684 True 767 3969;3970;3971 5222;5223;5224 5222 AT4G33010.1;AT4G33010.2 AT4G33010.1;AT4G33010.2 42;35 42;35 23;20 AT4G33010.1 | Symbols:GLDP1,AtGLDP1 | glycine decarboxylase P-protein 1 | glycine decarboxylase P-protein 1 | Chr4:15926852-15931150 REVERSE LENGTH=1037;AT4G33010.2 | Symbols:GLDP1,AtGLDP1 | glycine decarboxylase P-protein 1 | glycine decarboxylase P-pr 2 42 42 23 41 41 40 41 41 41 40 41 22 23 22 23 57.1 57.1 33.8 112.92 1037 1037;976 2.09 166 183 219 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9584 0.99915 16.856 380 79 Leave out requantified 0.98001 1.0933 0.89459 0.82346 0.93717 1.0501 1.0166 0.90289 32.414 19.443 21.453 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THALIANA PECTIN METHYLESTERASE 44 | pectin methylesterase 44 | Chr4:16024445-16026130 FORWARD LENGTH=404;AT4G33220.1 | Symbols:ATPME44,PME44 | pectin methylesterase 44,A. THALIANA PECTIN 3 7 6 6 5 5 5 7 4 4 4 6 4 4 4 6 18.1 16.3 16.3 45.342 404 404;525;527 2.05 6 7 7 0 17.874 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93985 0.93931 25.713 16 5 Leave out requantified 0.977 1.2844 0.65368 0.72734 0.94168 1.1581 0.77336 0.82484 27.905 22.222 60.323 13.707 4 3 4 5 1 0 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Median Leave out requantified 11.9 12.6 13.1 18.1 1185300000 642690000 542600000 287850000 116680000 171160000 231720000 100320000 131400000 307310000 215980000 91336000 358410000 209710000 148700000 4346 5637;9150;14182;15509;15950;26343;28760 True;True;True;True;False;True;True 6398;10354;16025;17558;18052;30179;32903 31224;31225;31226;31227;31228;50425;50426;50427;50428;78205;78206;78207;78208;85803;88075;88076;88077;88078;145611;145612;145613;158158;158159;158160 40070;40071;40072;40073;40074;64788;64789;64790;64791;100946;100947;100948;100949;110626;113215;113216;185587;185588;185589;201479;201480;201481 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8;6 8;6 AT4G33350.1 | Symbols:AtTic22-IV,Tic22-IV | translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 22-IV | Tic22-like family protein | Chr4:16064638-16066715 REVERSE LENGTH=268;AT4G33350.2 | Symbols:AtTic22-IV,Tic22-IV | translocon at the inner envel 2 8 8 8 7 5 6 6 7 5 6 6 7 5 6 6 37.7 37.7 37.7 30.105 268 268;242 2.09 12 15 16 0 45.053 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3384 1.3155 31.106 35 17 Leave out requantified 1.2544 0.96471 1.2985 0.92626 1.1621 0.87844 1.5129 0.97017 30.482 11.307 36.402 26.41 12 7 9 7 6 3 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 33.2 24.6 28.4 26.9 4742400000 2211300000 2531000000 1439900000 588040000 851870000 930940000 431330000 499610000 1554800000 765720000 789050000 816770000 426260000 390520000 4349 11577;12816;25323;26941;29454;31663;37526;38308 True;True;True;True;True;True;True;True 13072;14474;14475;28903;30849;33667;36092;42736;43601 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superfamily protein | 3 7 7 7 4 5 3 1 4 5 3 1 4 5 3 1 29.1 29.1 29.1 37.86 344 344;327;305 2.18 5 4 8 0 23.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1887 1.1109 45.784 16 8 Leave out requantified 1.5867 1.2287 0.84638 0.63474 1.4878 1.1724 1.014 0.72683 163.95 17.632 7.1067 28.098 5 5 3 3 2 2 2 2 Median Leave out requantified Median Median 21.2 18 12.8 3.8 732120000 420080000 312040000 238850000 160170000 78677000 166830000 65544000 101280000 199210000 118750000 80458000 127240000 75615000 51623000 4350 8302;15964;17522;23520;23990;29974;33650 True;True;True;True;True;True;True 9403;18067;19816;26417;26954;34228;38337 45561;88167;88168;96734;96735;96736;96737;96738;96739;96740;96741;127952;130381;164169;182899;182900;182901 58401;113312;113313;124102;124103;124104;124105;124106;124107;163695;166798;209177;232969;232970 58401;113313;124104;163695;166798;209177;232969 4091;4092 162;332 AT4G33400.1 AT4G33400.1 2 2 2 AT4G33400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Vacuolar import/degradation%2C Vid27-related protein | Chr4:16078189-16080410 REVERSE LENGTH=645 1 2 2 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 5 5 5 71.628 645 645 1.6 2 3 0.00020921 4.2515 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0101 1.1744 44.924 5 4 Median NaN NaN NaN 2.0946 NaN NaN NaN 2.4398 NaN NaN NaN 37.599 0 1 1 3 0 0 1 3 Median Median Median Plateau 0 1.9 1.9 5 155390000 66398000 88995000 0 0 0 24242000 14007000 10235000 24089000 11215000 12874000 107060000 41177000 65886000 4351 15101;31825 True;True 17098;36270 83458;83459;83460;83461;172999 107599;107600;107601;107602;107603;220380 107602;220380 AT4G33410.1 AT4G33410.1 1 1 1 AT4G33410.1 | Symbols:SPPL1,ATSPPL1 | SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 1 | SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 1 | Chr4:16081640-16083119 FORWARD LENGTH=372 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 2.4 2.4 2.4 41.001 372 372 1 1 0.0029526 2.5176 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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MS/MS By MS/MS 1.5784 1.4301 74.484 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 1.9 3.1 1.9 1.9 63467000 32618000 30849000 16996000 9164500 7831600 28893000 10182000 18712000 17577000 13272000 4305300 0 0 0 4356 4139;34082 True;True 4731;38843 23200;23201;23202;185312 30071;30072;30073;236076 30073;236076 AT4G33480.1 AT4G33480.1 1 1 1 AT4G33480.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | BTB/POZ domain protein TNFAIP protein | Chr4:16105804-16108497 REVERSE LENGTH=336 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 5.4 5.4 5.4 36.627 336 336 3 2 0 11.966 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4357 18197 True 20589 100437;100438 128682;128683 128682 AT4G33500.1 AT4G33500.1 12 12 12 AT4G33500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein phosphatase 2C family protein | 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9133;9134;32251;32252;32253;48189;78132;78133;114887;114888;118849;118850;118851;118852;121677;121678;121679;121680;126910;164872;164873;164874;164875;213773;213774;213775;213776;213777;213778;219612;270459 9133;32253;48189;78132;114887;118852;121679;126910;164875;213773;219612;270459 1961 246 AT4G33510.1;AT4G33510.2 AT4G33510.1;AT4G33510.2 18;13 18;13 13;9 AT4G33510.1 | Symbols:DAHP2,AtDAHP2,DHS2 | 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase,3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE-7-PHOSPHATE 2 | 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase | Chr4:16116496-16118549 FORWARD LENGTH=507;AT4G33510.2 2 18 18 13 13 14 13 13 13 14 13 13 9 10 10 10 38.3 38.3 29.2 56.148 507 507;347 2.12 28 30 40 0 93.094 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0005 1.008 36.64 74 19 Leave out requantified 1.1062 0.78149 1.0535 1.0393 1.0543 0.72188 1.2827 1.195 23.326 25.423 35.941 49.069 18 22 20 14 5 5 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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AT4G33520.3;AT4G33520.2 1;1 1;1 1;1 AT4G33520.3 | Symbols:HMA6,AtHMAC6,PAA1,PCH1 | HEAVY METAL ATPASE 6,Arabidopsis thaliana heavy metal ATPase 6,plastid chaperon 1,P-type ATP-ase 1 | P-type ATP-ase 1 | Chr4:16118993-16125849 FORWARD LENGTH=949;AT4G33520.2 | Symbols:HMA6,AtHMAC6,PAA1,PCH1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.8 1.8 1.8 100.09 949 949;949 1.75 2 1 1 0 35.061 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74974 0.75599 20.099 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 1.8 195890000 111760000 84129000 36247000 15028000 21219000 47342000 23877000 23465000 51959000 30896000 21063000 60343000 41960000 18383000 4360 31190 True 35575 169737;169738;169739;169740 216115;216116;216117;216118;216119;216120;216121 216117 AT4G33530.1;AT4G33530.2;AT5G09400.1 AT4G33530.1;AT4G33530.2;AT5G09400.1 3;2;2 3;2;2 3;2;2 AT4G33530.1 | Symbols:KUP5 | K+ uptake permease 5 | K+ uptake permease 5 | Chr4:16126503-16130353 REVERSE 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THALIANA BETA CARBONIC ANHYDRASE 5,beta carbonic anhydrase 5 | beta carbonic anhydrase 5 | Chr4:16139406-16141363 FORWARD LENGTH=301;AT4G33580.1 | Symbols:ATBCA5,BCA5 | A. 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methyltransferases superfamily protein | Chr4:16310844-16311973 FORWARD LENGTH=259;AT4G34050.3 | Symbols:CCoAOMT1 | caffeoyl coenzyme A O-meth 3 6 6 6 2 3 5 3 2 3 5 3 2 3 5 3 30.9 30.9 30.9 29.155 259 259;286;148 2 4 9 4 0 28.001 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.57482 0.61863 42.028 17 6 Leave out requantified 1.3334 1.8513 0.35848 0.56099 1.2159 1.6981 0.4288 0.61855 8.9241 45.786 24.758 46.992 3 3 7 4 0 1 3 2 Median Median Leave out requantified Median 10.8 14.3 27.4 13.5 2663100000 1710000000 953140000 403230000 151050000 252180000 449450000 259470000 189980000 1195200000 923380000 271810000 615230000 376050000 239170000 4371 1985;3572;8369;9544;16613;30046 True;True;True;True;True;True 2250;4082;9485;10816;18786;34306 11148;11149;19955;46009;46010;46011;46012;46013;46014;52305;52306;52307;52308;52309;52310;91672;164457 14490;14491;25742;58996;58997;58998;58999;59000;59001;59002;67093;67094;67095;67096;67097;117499;209546 14491;25742;58999;67097;117499;209546 4106 245 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Symbols:CDCP1,CBSX2,LEJ1 | CBS domain containing protein 2,LOSS OF THE TIMING OF ET AND JA BIOSYNTHESIS 1,CYSTATHIONE [BETA]-SYNTHASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 | Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein | Chr4:16341194-16342893 FO 1 5 5 5 5 4 5 3 5 4 5 3 5 4 5 3 31.5 31.5 31.5 25.955 238 238 1.86 11 10 7 0 73.418 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68344 0.72893 61.856 16 10 Leave out requantified 1.392 1.4736 0.43418 0.62795 1.3046 1.3945 0.48222 0.70603 51.536 24.905 24.743 17.918 4 5 5 2 2 4 3 1 Median Median Median Median 31.5 25.6 31.5 18.9 2381700000 1330800000 1050900000 502830000 235770000 267060000 541480000 191340000 350140000 929130000 658550000 270580000 408280000 245170000 163100000 4374 6633;25337;27556;30668;37399 True;True;True;True;True 7556;28922;28923;31544;35005;42590 36772;36773;36774;36775;36776;36777;139701;139702;139703;139704;139705;139706;139707;139708;139709;151905;151906;151907;151908;151909;167366;167367;167368;167369;167370;204199;204200;204201 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family protein 3 4 4 4 2 4 4 3 2 4 4 3 2 4 4 3 23.3 23.3 23.3 24.289 215 215;215;215 2.1 5 8 7 0 24.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.134 1.0478 19.962 18 5 Leave out requantified 0.81785 1.3659 1.2064 0.80196 0.72487 1.2913 1.4314 0.91755 26.434 70.967 10.302 49.365 3 6 6 3 0 3 1 1 Median Median Leave out requantified Median 16.3 23.3 23.3 11.2 1480100000 674130000 805950000 211210000 101780000 109440000 394750000 188270000 206480000 731790000 317120000 414670000 142320000 66970000 75350000 4393 6827;9244;11318;35610 True;True;True;True 7778;10457;10458;12780;12781;40564 38133;38134;38135;38136;50827;50828;50829;50830;50831;61711;61712;61713;61714;61715;61716;61717;193994;193995;193996;193997 48884;48885;48886;48887;65286;65287;65288;65289;65290;79366;79367;79368;79369;79370;79371;79372;79373;79374;79375;247365;247366;247367;247368;247369 48885;65290;79371;247369 4133;4134 74;166 AT4G34740.1;AT2G16570.1 AT4G34740.1 12;4 12;4 12;4 AT4G34740.1 | Symbols:DOV1,ASE2,ATPURF2,ATASE2,CIA1 | CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 1,DIFFERENTIAL DEVELOPMENT OF VASCULAR ASSOCIATED CELLS,GLN phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase 2 | GLN phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase 2 | Chr4:16 2 12 12 12 9 10 12 11 9 10 12 11 9 10 12 11 27.5 27.5 27.5 61.03 561 561;566 2.18 14 22 25 0 74.954 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93225 0.9974 12.701 52 26 Leave out requantified 0.82808 1.1043 0.96377 0.84441 0.76832 1.0152 1.1444 0.95736 5.6185 9.2207 12.38 19.973 11 12 17 12 6 6 8 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.3 23.5 27.5 26 10251000000 5476200000 4775100000 2238400000 1278300000 960100000 1940300000 944410000 995840000 3359200000 1810200000 1549000000 2713500000 1443300000 1270200000 4394 1509;10473;10474;11228;14557;16314;18249;20555;22703;32412;36276;39271 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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protein | Chr4:16599976-16605994 REVERSE LENGTH=1089 1 12 12 12 7 8 5 5 7 8 5 5 7 8 5 5 13.6 13.6 13.6 119.77 1089 1089 2.07 9 8 11 0 65.865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91178 0.92132 33.591 23 6 Leave out requantified 0.76047 0.7578 1.1767 1.0004 0.72797 0.69791 1.3422 1.1577 24.091 19.126 23.708 12.203 6 8 5 4 4 2 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.2 7.3 6.6 4.9 1327500000 695640000 631900000 287820000 164800000 123030000 344340000 196650000 147700000 454650000 225420000 229230000 240720000 108790000 131940000 4396 494;10017;17200;17719;18553;18742;20574;23658;30479;30980;32707;35478 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 557;11331;19453;20058;20985;21187;23169;26570;34801;35348;37256;40411 2847;2848;2849;54756;95168;97851;97852;97853;97854;97855;102687;102688;102689;103623;103624;113007;128710;128711;166408;166409;166410;166411;168795;168796;177672;193264;193265;193266 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ARABIDOPSIS THALIANA CYCLOPHILIN 1,rotamase cyclophilin 5 | rotamase cyclophilin 5 | Chr4:16614451-16614969 FORWARD LENGTH=172 1 12 12 8 12 12 12 12 12 12 12 12 8 8 8 8 79.7 79.7 66.3 18.378 172 172 2.15 35 44 55 0 164.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9343 0.98065 7.5816 79 34 Leave out requantified 1.1344 1.1352 0.78102 0.80664 1.0955 1.1312 0.90995 0.8873 28.447 14.705 29.323 17.157 22 18 19 20 12 8 8 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 79.7 79.7 79.7 79.7 87085000000 40406000000 46679000000 19927000000 8534200000 11393000000 19425000000 8089800000 11335000000 22783000000 11776000000 11007000000 24950000000 12006000000 12944000000 4398 2038;11403;11404;16013;16098;16633;21187;25394;33826;35239;35758;37610 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2308;12878;12879;12880;12881;18119;18218;18808;18809;23842;29016;29017;38537;40136;40137;40735;40736;42831 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THALIANA XANTHINE DEHYDROGENAS 4 6 6 6 4 5 5 6 4 5 5 6 4 5 5 6 4.3 4.3 4.3 149.19 1361 1361;1163;1269;1353 2.05 6 8 7 0 19.207 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0221 1.0455 22.985 18 5 Leave out requantified 1.5032 1.412 0.82832 0.62064 1.4704 1.2405 1.0531 0.71361 56.903 15.961 21.26 47.483 4 3 5 6 1 0 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 2.8 3.5 3.4 4.3 766400000 400500000 365900000 160940000 65288000 95650000 102590000 37431000 65158000 283240000 164310000 118930000 219630000 133470000 86160000 4399 5931;9093;11854;33930;38418;39299 True;True;True;True;True;True 6726;10287;13401;38670;43726;44721 32950;32951;32952;50121;50122;50123;50124;64783;64784;184459;184460;184461;184462;184463;209660;209661;209662;214614;214615;214616;214617 42204;42205;42206;42207;64403;64404;64405;83367;83368;234910;234911;234912;234913;234914;234915;267455;267456;267457;267458;273830;273831;273832;273833;273834;273835;273836;273837 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Symbols:NRPB1,RNA_POL_II_LS,RPB1,RNA_POL_II_LSRNA_POL_II_LS | RNA POLYMERASE II LARGE SUBUNIT,RNA polymerase II large subunit | RNA polymerase II large subunit | Chr4:16961115-16967892 REVERSE LENGTH=1839;AT4G35800.1 | Symbols:NRPB1,RNA_PO 2 8 8 8 3 5 4 1 3 5 4 1 3 5 4 1 5.1 5.1 5.1 204.62 1839 1839;1839 1.86 5 6 3 0 15.259 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0272 0.92494 2.1019 10 4 Leave out requantified 1.109 1.2143 0.59077 NaN 1.0274 1.096 0.6767 NaN 62.88 106.2 8.4177 NaN 3 4 2 1 1 2 0 1 Median Median Median Median 2.5 3.8 2.3 0.4 372280000 206920000 165370000 91055000 37552000 53503000 163480000 97137000 66344000 91229000 59094000 32135000 26517000 13133000 13384000 4424 4488;4955;8310;17611;22289;29837;31766;39191 True;True;True;True;True;True;True;True 5133;5647;9412;19939;25045;34080;36207;44597 25009;27417;45608;97266;97267;97268;121247;121248;121249;163500;172605;213960;213961;213962 32240;35264;58467;124723;155232;155233;155234;208345;219849;273008;273009;273010 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D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase | FAD-linked oxidases family protein | 2 10 10 10 5 5 6 4 5 5 6 4 5 5 6 4 17.4 17.4 17.4 61.445 559 559;559 2.22 5 8 10 0 39.279 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95205 1.03 74.549 18 8 Leave out requantified 1.1889 2.5815 0.40401 0.38127 1.1406 2.2955 0.51686 0.44025 65.141 18.334 34.907 35.701 3 5 6 4 1 1 3 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 9.8 9.7 10.9 6.8 877840000 495060000 382780000 95857000 49176000 46681000 181980000 53055000 128920000 422590000 275680000 146910000 177410000 117150000 60259000 4438 6244;13106;14755;18793;20618;22016;26065;26370;36228;36938 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7123;14802;16710;21246;23217;24752;29841;30212;41266;42088 34818;34819;34820;71411;81489;81490;81491;81492;81493;103983;113211;113212;113213;113214;119961;119962;144159;144160;145765;145766;197621;197622;201487 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Symbols:LCB1,ATLCB1,EMB2779,FBR11 | long-chain base1,EMBRYO DEFECTIVE 2779,FUMONISIN B1 RESISTANT 11 | long-chain base1 | Chr4:17218598-17221124 FORWARD LENGTH=482;AT4G36480.2 | Symbols:LCB1,ATLCB1,EMB2779,FBR11 | long-chain base1,EMBRYO D 3 5 5 5 4 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 12.9 12.9 12.9 53.14 482 482;482;342 2.29 4 4 9 0 14.397 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90299 0.90796 22.853 15 4 Leave out requantified 1.5445 1.4017 0.54357 0.65584 1.475 1.2661 0.65981 0.73507 30.561 16.626 13.133 5.6609 4 3 4 4 1 1 1 1 Leave out requantified Plateau Leave out requantified Leave out requantified 11 7.3 11 9.1 587420000 343310000 244110000 138550000 66151000 72402000 133060000 64269000 68795000 188170000 132490000 55676000 127640000 80399000 47237000 4441 2241;7075;9856;23943;37475 True;True;True;True;True 2525;8052;11158;26891;42675 12458;12459;12460;12461;39564;39565;53828;53829;53830;53831;53832;130139;130140;130141;130142;130143;204586 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Symbols:AtGBF1,GBF1 | G-box binding factor 1 | G-box binding factor 1 | Chr4:17309850-17311752 REVERSE LENGTH=313;AT4G36730.1 | Symbols:AtGBF1,GBF1 | G-box binding factor 1 | G-box binding factor 1 | Chr4:17309850-17311752 REVERSE LENGTH= 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 3.8 3.8 3.8 33.675 313 313;315 2 1 0.0024137 2.5876 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 3.8 0 27861000 15261000 12601000 0 0 0 0 0 0 27861000 15261000 12601000 0 0 0 4448 28971 True 33135 159170 202739 202739 AT4G36750.1 AT4G36750.1 8 8 8 AT4G36750.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Quinone reductase family protein | Chr4:17324642-17326215 FORWARD LENGTH=273 1 8 8 8 7 4 7 6 7 4 7 6 7 4 7 6 38.5 38.5 38.5 28.754 273 273 2.06 9 11 11 0 93.392 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77899 0.77116 33.077 29 8 Leave out requantified 0.91427 1.234 0.79143 0.55916 0.84758 1.1299 0.92245 0.65895 25.312 27.742 27.816 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Median 2.3 3.4 5.7 5.4 307730000 197730000 110010000 0 0 0 102450000 69839000 32613000 113650000 72194000 41458000 91631000 55695000 35936000 4458 1843;19383;35710 True;True;True 2094;21874;40675 10346;10347;10348;106994;194541;194542 13432;13433;13434;137190;248070;248071 13432;137190;248071 AT4G37070.3;AT4G37070.1;AT4G37070.2;AT4G37070.4;AT4G37060.1;AT4G37060.2 AT4G37070.3;AT4G37070.1;AT4G37070.2;AT4G37070.4 9;9;9;8;2;2 9;9;9;8;2;2 9;9;9;8;2;2 AT4G37070.3 | Symbols:PLA IVA,PLP1,AtPLAIVA | phospholipase A IVA | Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase superfamily protein | Chr4:17465167-17467058 REVERSE LENGTH=383;AT4G37070.1 | Symbols:PLA IVA,PLP1,AtPLAIVA | phospholipase A IVA | Acy 6 9 9 9 4 6 8 3 4 6 8 3 4 6 8 3 34.7 34.7 34.7 42.13 383 383;383;414;372;414;445 1.74 12 10 5 0 68.485 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.4232 2.6372 51.057 22 12 Leave out requantified 2.3867 0.49583 2.8983 1.5155 2.2742 0.45436 3.4678 1.8599 16.116 36.026 43.971 19.281 4 7 8 3 2 5 4 1 Median Median Leave out requantified Median 17.5 22.5 32.9 9.9 1981000000 774210000 1206800000 199180000 60423000 138760000 503920000 351630000 152290000 847820000 208810000 639010000 430090000 153350000 276740000 4459 2360;16403;16771;21364;21795;27465;30387;32234;36444 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2661;18551;18552;18959;24040;24508;31429;34695;36723;41521 13086;13087;90664;90665;90666;90667;90668;90669;90670;90671;92438;92439;116823;116824;116825;116826;116827;118930;151474;151475;165912;165913;165914;175032;198700;198701;198702 16953;16954;116281;116282;116283;116284;116285;116286;116287;116288;118503;118504;149655;149656;149657;149658;149659;149660;149661;152271;193060;211275;211276;211277;211278;222939;253439;253440;253441 16954;116288;118504;149660;152271;193060;211275;222939;253440 4192;4193;4194 335;359;361 AT4G37150.1 AT4G37150.1 2 2 2 AT4G37150.1 | Symbols:MES9,ATMES9 | methyl esterase 9,ARABIDOPSIS THALIANA METHYL ESTERASE 9 | methyl esterase 9 | 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Symbols:CYP81H1 | cytochrome P450, family 81, subfamily H, polypeptide 1 | cytochrome P450%2C family 81%2C subfamily H%2C polypeptide 1 | Chr4:17556152-17558833 REVERSE LENGTH=518 1 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 4.2 4.2 4.2 58.227 518 518 2 1 1 1 0.00040708 3.792 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 1.7 2.5 2.5 16699000 11025000 5674500 0 0 0 0 0 0 16699000 11025000 5674500 0 0 0 4466 11059;27546 True;True 12488;31531;31532 60484;151862;151863 77717;193527;193528 77717;193528 4196 339 AT4G37510.1 AT4G37510.1 4 4 4 AT4G37510.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribonuclease III family protein | Chr4:17626259-17628854 REVERSE LENGTH=537 1 4 4 4 4 2 0 1 4 2 0 1 4 2 0 1 9.5 9.5 9.5 62.431 537 537 2.12 3 1 4 0 38.592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16.807 15.591 209.55 6 6 Median 8.0718 NaN NaN NaN 7.7905 NaN NaN NaN 252.21 NaN NaN NaN 4 1 0 1 4 1 0 1 Median Median Median Median 9.5 5.8 0 3.7 2096700000 127850000 1968900000 1097500000 91484000 1006000000 274850000 17896000 256960000 0 0 0 724360000 18474000 705880000 4467 14305;15830;26768;29167 True;True;True;True 16206;17915;30665;33348 79177;79178;87377;148013;148014;148015;148016;160074 102138;102139;112431;188600;188601;188602;188603;203940 102138;112431;188600;203940 AT4G37520.1;AT4G37520.2 AT4G37520.1;AT4G37520.2 11;10 11;10 8;7 AT4G37520.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr4:17631704-17633060 FORWARD LENGTH=329;AT4G37520.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr4:1 2 11 11 8 6 9 6 7 6 9 6 7 6 8 4 4 41 41 32.8 36.076 329 329;326 1.82 13 13 7 0 62.597 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3621 1.4129 66.232 26 12 Leave out requantified 1.9608 4.3171 0.45799 0.64195 1.7353 4.0142 0.53424 0.72069 29.307 33.691 61.474 46.169 7 7 5 7 3 3 2 4 Leave out requantified Leave out 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full name available | transmembrane protein | Chr4:17785692-17787290 FORWARD LENGTH=532;AT4G37820.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein | Chr4:17785692-17787290 F 2 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 3.2 3.2 3.2 59.134 532 532;532 1 2 0 14.548 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.2 3.2 0 0 11985000 0 11985000 11985000 0 11985000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4475 37301 True 42484 203548;203549 259478;259479 259479 AT4G37830.1 AT4G37830.1 2 2 2 AT4G37830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | cytochrome c oxidase-like protein | Chr4:17787672-17788762 REVERSE LENGTH=102 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 14.7 14.7 14.7 11.235 102 102 2 2 2 2 0 6.7586 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.48805 0.52727 73.334 6 1 Median NaN 1.0502 NaN 0.2992 NaN 1.0215 NaN 0.35283 NaN 107.01 NaN 39.26 1 2 1 2 0 1 0 0 Median Median Median Median 12.7 14.7 12.7 14.7 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| subunit NDH-M of NAD(P)H:plastoquinone dehydrogenase complex | Chr4:17830748-17831485 REVERSE LENGTH=217 1 2 2 2 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 18.4 18.4 18.4 24.795 217 217 2 1 3 1 0 10.875 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 9.2 18.4 9.2 19830000 13649000 6181200 0 0 0 0 0 0 19830000 13649000 6181200 0 0 0 4481 18507;36746 True;True 20931;41876;41877 102397;200423;200424;200425;200426 131235;255618;255619;255620;255621;255622;255623 131235;255618 2986 212 AT4G37930.1 AT4G37930.1 26 26 17 AT4G37930.1 | Symbols:STM,SHMT1,SHM1 | SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 1,serine transhydroxymethyltransferase 1,SERINE TRANSHYDROXYMETHYLTRANSFERASE | serine transhydroxymethyltransferase 1 | Chr4:17831891-17834742 REVERSE LENGTH=517 1 26 26 17 24 25 25 24 24 25 25 24 16 17 16 16 66.5 66.5 42.4 57.4 517 517 2.03 129 134 140 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95934 0.94036 12.473 275 58 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Symbols:ATFP6,FP6,HIPP26 | HEAVY METAL ASSOCIATED IS 5 4 4 4 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 25.5 25.5 25.5 17.023 153 153;153;121;147;147 1.86 5 6 3 0 8.2848 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94053 1.0345 5.8931 8 4 Leave out requantified 0.7681 0.74149 NaN 1.2672 0.7234 0.67533 NaN 1.4262 69.645 29.527 NaN 39.507 3 2 1 2 2 1 0 1 Median Median Median Median 20.3 20.3 12.4 20.3 282420000 150020000 132390000 79594000 42447000 37147000 80886000 47053000 33834000 28210000 16226000 11984000 93727000 44299000 49429000 4499 24062;27468;28299;37242 True;True;True;True 27066;31432;32376;42420 130878;130879;130880;151488;151489;155612;155613;155614;155615;155616;203174;203175;203176;203177 167403;167404;193073;193074;198370;198371;198372;198373;198374;198375;258980;258981;258982;258983 167403;193074;198372;258982 AT4G38590.1;AT4G38590.2 AT4G38590.1;AT4G38590.2 1;1 1;1 1;1 AT4G38590.1 | Symbols:BGAL14 | beta-galactosidase 14 | beta-galactosidase 14 | Chr4:18036395-18039990 FORWARD 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AT4G38760.1 AT4G38760.1 1 1 1 AT4G38760.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | nucleoporin (DUF3414) | Chr4:18085033-18096166 REVERSE LENGTH=1965 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.8 0.8 0.8 219.49 1965 1965 2 1 0.0039862 2.3213 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4507 17047 True 19268 94040 120599 120599 AT4G38770.1 AT4G38770.1 1 1 1 AT4G38770.1 | Symbols:PRP4,ATPRP4 | ARABIDOPSIS THALIANA PROLINE-RICH PROTEIN 4,proline-rich protein 4 | proline-rich protein 4 | Chr4:18097009-18098448 REVERSE LENGTH=448 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1.6 1.6 1.6 49.136 448 448 1.75 2 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0087 0.96195 59.826 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.6 1.6 0 1.6 365050000 175480000 189560000 107890000 58979000 48907000 108110000 57342000 50766000 0 0 0 149050000 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full name available | Tautomerase/MIF superfamily protein | 4 4 4 4 1 4 3 3 1 4 3 3 1 4 3 3 47.8 47.8 47.8 12.111 115 115;116;122;122 1.73 4 6 1 0 46.506 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.59194 0.65334 44.54 11 2 Leave out requantified NaN 0.9852 0.5612 0.59194 NaN 0.88877 0.65334 0.63003 NaN 10.003 50.978 48.108 1 4 3 3 1 1 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27 47.8 37.4 37.4 686340000 380470000 305870000 31495000 9041500 22453000 218050000 118890000 99160000 277700000 158710000 118980000 159100000 93828000 65271000 4559 14704;14873;14874;22857 True;True;True;True 16653;16836;16837;25692 81274;81275;81276;82007;82008;82009;82010;82011;82012;82013;124331 104802;104803;105667;105668;105669;105670;105671;105672;105673;105674;105675;105676;159153 104802;105668;105675;159153 4291 49 AT5G01750.2;AT5G01750.1 AT5G01750.2;AT5G01750.1 7;4 7;4 7;4 AT5G01750.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | LURP-one-like protein (DUF567) | Chr5:290034-291109 FORWARD LENGTH=217;AT5G01750.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | LURP-one-like protein (DUF567) | Chr5:29003 2 7 7 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 34.1 34.1 34.1 24.295 217 217;174 2.05 13 13 15 0 23.264 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2168 1.2593 9.485 40 26 Leave out requantified 1.3108 0.9419 0.94264 1.3507 1.284 0.86608 1.0983 1.5149 18.692 25.022 9.8228 24.329 11 10 7 12 8 6 4 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.6 33.6 33.6 34.1 5691700000 2728600000 2963200000 1288000000 574390000 713570000 1085500000 585280000 500270000 1630400000 829180000 801260000 1687800000 739730000 948060000 4560 5939;16039;19094;28611;35884;36143;38282 True;True;True;True;True;True;True 6734;18154;21570;32738;32739;40875;41157;43573 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287;2495;12439;15380;15948;21108;21421;25271;28660 True;True;True;True;True;True;True;True;True 320;2817;14056;17413;18050;23751;24105;28839;32796 1548;1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556;1557;1558;1559;1560;1561;13895;68023;68024;85141;85142;85143;88067;88068;88069;88070;88071;88072;115510;115511;115512;117137;117138;117139;117140;117141;139379;139380;139381;139382;139383;139384;139385;157631;157632;157633;157634;157635 2073;2074;2075;2076;2077;2078;2079;2080;2081;2082;2083;2084;2085;17964;87477;87478;109833;109834;109835;113206;113207;113208;113209;113210;113211;113212;148054;148055;150047;150048;150049;150050;150051;177926;177927;177928;177929;177930;177931;177932;200811;200812;200813;200814;200815;200816 2075;17964;87477;109834;113208;148054;150048;177930;200811 AT5G02100.2;AT5G02100.3;AT5G02100.1 AT5G02100.2;AT5G02100.3;AT5G02100.1 3;3;3 1;1;1 1;1;1 AT5G02100.2 | Symbols:ORP3A,UNE18 | OSBP(OXYSTEROL BINDING PROTEIN)-RELATED PROTEIN 3A,UNFERTILIZED EMBRYO SAC 18 | Oxysterol-binding family protein | Chr5:413639-415444 FORWARD LENGTH=322;AT5G02100.3 | Symbols:ORP3A,UNE18 | OSBP(OXYSTEROL BINDING PROTE 3 3 1 1 2 1 2 2 1 0 0 0 1 0 0 0 12.7 4.7 4.7 36.187 322 322;426;453 1 1 0.00039659 3.4266 By MS/MS By matching By matching By matching NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 8.7 4 8.1 8.1 30006000 16245000 13761000 30006000 16245000 13761000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4564 5407;11528;38472 False;False;True 6155;13018;43792 29885;29886;29887;29888;29889;29890;29891;29892;29893;29894;63009;63010;210005 38386;38387;38388;38389;38390;38391;38392;38393;38394;38395;81106;81107;267905 38389;81107;267905 AT5G02120.1 AT5G02120.1 2 2 2 AT5G02120.1 | Symbols:PDE335,OHP | one helix protein,PIGMENT DEFECTIVE 335 | one helix protein | Chr5:419144-419633 FORWARD LENGTH=110 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 27.3 27.3 27.3 12.01 110 110 2.14 2 2 3 0 13.566 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76548 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AT5G02450.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L36e family protein | Chr5:533501-534394 FORWARD LENGTH=108 1 5 5 2 5 5 5 5 5 5 5 5 2 2 2 2 36.1 36.1 18.5 12.189 108 108 2.09 14 20 19 0 18.46 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1177 1.1583 20.257 33 8 Leave out requantified 1.1623 1.1656 1.2296 1.0554 1.0644 1.1499 1.3755 1.1274 2.4435 13.958 21.983 11.45 8 9 8 8 1 3 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.1 36.1 36.1 36.1 26060000000 13191000000 12868000000 4693600000 2143900000 2549700000 6553100000 3447000000 3106100000 7468400000 4113600000 3354800000 7344400000 3486600000 3857800000 4573 7925;9666;10162;10163;34691 True;True;True;True;True 8989;8990;10949;10950;11496;11497;39523 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LENGTH=653;AT1G56410.1 | Symbols:HSP70T-1,ERD2 | HEAT SHOCK PROTEIN 70T-1,EARLY-RESPONSIVE TO DEHYDRATION 2 | heat shock protein 70 ( 2 31 9 8 28 29 30 27 6 7 8 6 5 6 8 6 48.9 15.2 13.6 71.386 653 653;617 2.08 11 11 14 0 34.805 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.33975 0.36612 84.126 23 17 Leave out requantified 1.5556 6.0063 0.2172 0.19865 1.4594 5.362 0.26744 0.24197 26.908 84.356 65.543 46.245 7 7 5 4 5 6 3 3 Median Median Median Median 46.1 45.8 47.3 40.6 2580400000 1411900000 1168500000 694520000 265620000 428890000 646120000 108090000 538030000 916180000 775950000 140230000 323620000 262250000 61364000 4574 3330;4377;4617;6226;8523;9010;10949;12902;17117;17118;18147;18725;21500;23021;24431;24803;24807;24856;24945;25017;25640;26178;26383;26384;26892;29653;32896;33943;35068;36784;36785 False;False;True;False;True;True;True;False;False;False;False;False;False;True;True;False;False;True;False;False;True;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False 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name available | Ribosomal protein S24e family protein | Chr5:616517-618267 FORWARD LENGTH=228;AT5G02740.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S24e family protein 2 3 3 3 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 16.2 16.2 16.2 25.224 228 228;185 2 3 3 3 0 9.6081 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0712 1.104 5.5797 9 3 Leave out requantified 1.3419 1.302 0.80131 0.68933 1.3104 1.1918 0.93875 0.72994 1.194 16.402 15.545 56.582 2 2 3 2 1 0 1 1 Median Median Median Median 11 11 16.2 11 822860000 399970000 422890000 136340000 56815000 79524000 187670000 78643000 109030000 306220000 174030000 132180000 192630000 90478000 102160000 4581 3016;18158;37271 True;True;True 3456;20544;42452 17132;100195;100196;100197;100198;203341;203342;203343;203344 22140;128374;128375;128376;128377;128378;128379;128380;259179;259180;259181;259182 22140;128377;259182 AT5G02770.1 AT5G02770.1 6 6 6 AT5G02770.1 | Symbols:MOS11 | modifier of snc1, 11 | Protein MODIFIER OF SNC1 11 | 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glutathione transferase lambda 1 | Chr5:630957-632485 FORWARD LENGTH=235;AT5G02780.3 | Symbols:GSTL1 | glutathione transferase lambda 1 | glutathione transferase lambda 1 | Chr5:630957-63 3 2 2 2 0 0 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 12.3 12.3 12.3 27.009 235 235;237;237 2.25 3 1 0 19.1 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 12.3 7.7 47266000 43615000 3650300 0 0 0 0 0 0 47266000 43615000 3650300 0 0 0 4583 32128;39391 True;True 36610;44827;44828 174529;215145;215146;215147 222331;274568;274569;274570 222331;274569 2052 105 AT5G02790.1 AT5G02790.1 14 14 14 AT5G02790.1 | Symbols:GSTL3 | Glutathione transferase L3 | Glutathione S-transferase family protein | Chr5:632877-634858 FORWARD LENGTH=235 1 14 14 14 11 11 12 11 11 11 12 11 11 11 12 11 63.8 63.8 63.8 27.09 235 235 2.1 16 22 22 0 78.273 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82095 0.85954 37.83 54 21 Leave out requantified 1.2849 1.9633 0.40451 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Chr5:797155-798997 FORWARD LENGTH=292;AT5G03300.2 | Symbols:ADK2 | aden 3 18 6 6 17 16 17 16 5 5 6 6 5 5 6 6 63.8 29.3 29.3 37.846 345 345;292;292 2.15 11 19 18 0 53.085 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0185 1.1157 4.8734 29 12 Leave out requantified 1.305 1.0319 1.1586 0.89806 1.2159 0.96952 1.4025 0.97881 42.119 65.45 6.6228 30.21 6 8 6 9 2 4 2 4 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 60.6 61.2 63.2 59.4 2475300000 1112800000 1362500000 366030000 160000000 206030000 649800000 286260000 363540000 753130000 361090000 392040000 706300000 305410000 400890000 4593 1275;4735;11586;11748;15873;19490;19937;22444;23473;28295;29244;29579;29988;33986;33987;35307;35564;39117 False;True;True;False;True;False;False;False;True;False;False;True;False;False;False;False;True;False 1438;5411;5412;13081;13082;13282;13283;17964;17965;21995;22476;25252;25253;26361;26362;26363;32372;33432;33801;34244;34245;38733;38734;40220;40515;44517 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Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein | Chr5:922378-924616 REVERSE LENGTH=435 1 19 18 18 16 16 18 18 15 15 17 17 15 15 17 17 54.5 52.9 52.9 47.479 435 435 1.91 60 49 46 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0391 1.0128 36.322 115 44 Leave out requantified 1.404 1.8908 0.43281 0.47551 1.2999 1.735 0.51463 0.5401 14.336 12.261 23.625 19.762 28 29 31 27 4 11 15 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.4 47.4 52.9 52.9 13481000000 7547700000 5933500000 2898900000 1269600000 1629300000 3037300000 1093800000 1943600000 4524100000 3166000000 1358100000 3020900000 2018300000 1002600000 4606 107;2973;3467;6412;8330;8981;9694;11234;15044;15469;19867;21019;22893;27082;28376;33233;33722;37396;39174 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True 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Median Median 5.3 5.3 5.3 5.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4626 38481 True 43801 210031;210032;210033;210034;210035 267934;267935;267936;267937;267938;267939;267940 267934 2082 138 AT5G04550.2;AT5G04550.1 AT5G04550.2;AT5G04550.1 1;1 1;1 1;1 AT5G04550.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | type-1 restriction enzyme mjaxp r protein (DUF668) | Chr5:1303757-1305556 REVERSE LENGTH=599;AT5G04550.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | type-1 restriction enz 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 67.263 599 599;599 1.75 2 1 1 0 5.5447 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0979 1.2668 35.463 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 1 0 1 0 Median Median Median Median 2.3 2.3 2.3 2.3 68853000 32595000 36258000 19509000 4486200 15023000 0 0 0 24460000 15909000 8551800 24884000 12200000 12684000 4627 30349 True 34650 165754;165755;165756;165757 211097;211098;211099;211100;211101 211097 AT5G04590.1 AT5G04590.1 23 23 23 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ATPase 1 | Chr5:1445509-1449568 FORWARD LENGTH=1158 3 3 3 3 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2.4 2.4 2.4 130.33 1158 1158;1107;1139 1.4 3 2 0 6.3815 By matching By MS/MS By matching By MS/MS 0.97584 0.96766 66.447 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0.7 0.7 0.7 1.7 349000000 207930000 141070000 80856000 35575000 45282000 72035000 22903000 49131000 80100000 52771000 27329000 116010000 96681000 19327000 4637 1386;2310;32624 True;True;True 1567;2602;37161 7863;12789;177154;177155;177156 10321;16549;225635 10321;16549;225635 AT5G04990.1 AT5G04990.1 4 4 4 AT5G04990.1 | Symbols:SUN1,ATSUN1 | SAD1/UNC-84 domain protein 1,ARABIDOPSIS SAD1/UNC-84 DOMAIN PROTEIN 1 | SAD1/UNC-84 domain protein 1 | Chr5:1471698-1473770 REVERSE LENGTH=471 1 4 4 4 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 13 13 13 51.501 471 471 2.5 1 1 4 0 44.627 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.26279 0.3031 123.21 5 4 Median NaN NaN 0.13023 NaN NaN NaN 0.15203 NaN NaN NaN 97.574 NaN 1 1 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acid binding R3H protein | Chr5:1505461-1506940 REVERSE LENGTH=324 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 4 4 4 36.549 324 324 1.5 2 2 0 6.932 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97833 0.87898 67.111 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 4 4 4 0 59932000 32398000 27533000 22033000 10404000 11630000 17622000 7696100 9926400 20276000 14299000 5977300 0 0 0 4641 12465 True 14086 68167;68168;68169;68170 87660;87661;87662;87663 87660 AT5G05170.1;AT5G17420.1 AT5G05170.1 6;1 6;1 5;0 AT5G05170.1 | Symbols:CEV1,IXR1,ELI1,ATH-B,CESA3,MRE1,ATCESA3 | ISOXABEN RESISTANT 1,ECTOPIC LIGNIFICATION 1,CONSTITUTIVE EXPRESSION OF VSP 1,multiple response expansion 1,CELLULOSE SYNTHASE 3 | Cellulose synthase family protein | Chr5:1530401-1535090 R 2 6 6 5 3 3 1 3 3 3 1 3 3 2 1 3 7.2 7.2 6 119.68 1065 1065;1026 1.7 5 3 2 0 14.892 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67803 0.73 80.243 7 3 Median 0.31061 0.54946 NaN 0.76222 0.28586 0.50493 NaN 0.8459 155.4 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requantified Leave out requantified Leave out requantified 23 23.5 22.2 19.8 4756700000 2492500000 2264100000 1793900000 896160000 897720000 757390000 278100000 479290000 1324500000 729980000 594520000 880900000 588290000 292610000 4643 2824;7521;7522;8002;8132;14809;15003;16710;16856;21244;22800;23871;33728;38865 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3240;8554;8555;9074;9216;16766;16990;18892;19052;23909;25632;26807;38432;44225;44226 16009;16010;16011;41854;41855;41856;41857;41858;44073;44074;44075;44076;44680;44681;44682;44683;81701;81702;81703;82845;82846;82847;92085;92914;92915;92916;116268;116269;116270;116271;124115;129778;129779;129780;129781;129782;183338;183339;183340;183341;183342;212123;212124;212125;212126;212127;212128 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Median Median Median 5 0 2.6 2.6 51437000 38110000 13327000 21559000 12950000 8609500 0 0 0 12633000 9604900 3028100 17245000 15555000 1689300 4644 12358;13781 True;True 13962;15573 67549;75973;75974;75975;75976;75977 86894;98121;98122;98123;98124;98125 86894;98125 AT5G05270.2;AT5G05270.1 AT5G05270.2;AT5G05270.1 3;3 3;3 3;3 AT5G05270.2 | Symbols:CHIL,AtCHIL | chalcone isomerase like | Chalcone-flavanone isomerase family protein | Chr5:1563543-1564827 FORWARD LENGTH=209;AT5G05270.1 | Symbols:CHIL,AtCHIL | chalcone isomerase like | Chalcone-flavanone isomerase family protein 2 3 3 3 1 3 1 2 1 3 1 2 1 3 1 2 19.1 19.1 19.1 23.331 209 209;209 1.75 3 4 1 0 14.565 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2588 1.2085 76.854 8 5 Median NaN 1.4839 NaN 0.35797 NaN 1.3884 NaN 0.3734 NaN 18.476 NaN 47.766 1 4 1 2 1 3 0 1 Median Median Median Median 6.2 19.1 6.2 15.3 295260000 147440000 147820000 14965000 4351000 10614000 176960000 78171000 98791000 49560000 29519000 20041000 53772000 35401000 18370000 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1 | Chr5:1677331-1678942 REVERSE LENGTH=241;AT3G11200.1 | Symbols:AL2 | alfin-like 2 | alfin-like 2 3 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 5.8 5.8 5.8 27.223 241 241;241;246 1.88 2 5 1 0.0025883 2.5319 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3044 1.5704 48.665 8 5 Median NaN 1.593 1.3044 1.4835 NaN 1.4357 1.5704 1.7192 NaN 53.49 5.3826 52.922 1 2 2 3 1 2 0 2 Median Median Median Median 2.9 5.8 5.8 5.8 696190000 320290000 375890000 72004000 49011000 22993000 183070000 74825000 108250000 189160000 66910000 122250000 251950000 129550000 122400000 4652 29584;34059 True;True 33807;38818 162168;162169;162170;185219;185220;185221;185222;185223 206601;206602;206603;235973;235974;235975;235976;235977;235978 206601;235976 AT5G05670.2;AT5G05670.1 AT5G05670.2;AT5G05670.1 2;2 2;2 2;2 AT5G05670.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | signal recognition particle binding protein | Chr5:1695916-1697534 REVERSE LENGTH=260;AT5G05670.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | signal recognition particle b 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 12.7 12.7 12.7 29.075 260 260;260 2.25 2 2 4 0 12.187 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86239 0.92469 28.582 8 3 Median 0.91639 1.1352 0.66281 0.90468 0.84669 1.0538 0.81689 1.0313 43.267 5.8133 4.8617 52.444 2 2 2 2 1 1 0 1 Median Median Median Median 12.7 12.7 6.5 12.7 560310000 304710000 255600000 77447000 40949000 36498000 99406000 39920000 59486000 279830000 164350000 115480000 103630000 59486000 44140000 4653 354;17264 True;True 394;19526 1996;1997;1998;1999;2000;95463;95464;95465 2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649;2650;122529;122530;122531 2648;122531 AT5G05730.1;AT5G05730.2;AT3G55870.2;AT3G55870.1;AT3G55870.3 AT5G05730.1;AT5G05730.2 6;6;1;1;1 6;6;1;1;1 6;6;1;1;1 AT5G05730.1 | Symbols:TRP5,JDL1,WEI2,ASA1,AMT1 | anthranilate synthase alpha subunit 1,JASMONATE-INDUCED DEFECTIVE LATERAL ROOT 1,A-METHYL TRYPTOPHAN RESISTANT 1,WEAK ETHYLENE INSENSITIVE 2,TRYPTOPHAN BIOSYNTHESIS 5 | anthranilate synthase alpha subunit 1 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Symbols:ATHMOV34,RPN8A,AE3 | ASYMMETRIC LEAVES ENHANCER 3,RP non-ATPase subunit 8A | RP non-ATPase subunit 8A | Chr5:1735862-1738176 FORWARD LENGTH=308;AT5G05780.2 | Symbols:ATHMOV34,RPN8A,AE3 | ASYMMETRIC LEAVES ENHANCER 3,RP non-ATPase s 2 10 10 3 7 7 7 6 7 7 7 6 2 2 3 2 31.5 31.5 11.4 34.728 308 308;305 1.92 13 13 10 0 45.249 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0074 1.027 16.046 32 9 Leave out requantified 1.097 1.2234 0.75544 0.82605 1.0215 1.1167 0.8546 0.93708 17.855 14.077 13.844 33.758 7 9 8 8 3 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.4 24.7 23.7 22.4 6407900000 3137600000 3270300000 1380500000 567720000 812800000 1818800000 785230000 1033500000 1763300000 1016300000 747040000 1445400000 768390000 676960000 4656 826;4145;4146;6783;8512;9059;22124;31712;33586;37431 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 926;4737;4738;7727;9651;10245;24869;36145;38259;42625 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deoxyhypusine synthase | Chr5:1777781-1779699 REVERSE LENGTH=368 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 5.7 5.7 5.7 41.063 368 368 1.5 1 1 0.00040282 3.6514 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.7 0 5.7 17936000 17936000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17936000 17936000 0 4660 20002 True 22544 110089;110090 141236;141237 141236 AT5G05980.2;AT5G05980.1 AT5G05980.2;AT5G05980.1 8;7 8;7 7;6 AT5G05980.2 | Symbols:ATDFB,FPGS1,DFB | DHFS-FPGS homolog B,folylpolyglutamate synthetase 1 | DHFS-FPGS homolog B | Chr5:1799738-1804177 REVERSE LENGTH=513;AT5G05980.1 | Symbols:ATDFB,FPGS1,DFB | DHFS-FPGS homolog B,folylpolyglutamate synthetase 1 | DHF 2 8 8 7 4 4 6 5 4 4 6 5 4 4 6 4 18.7 18.7 16.2 56.637 513 513;571 2.08 7 8 9 0 27.333 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86405 0.93395 42.723 16 10 Leave out requantified 1.2731 0.81163 0.42836 0.76396 1.1039 0.73825 0.50835 0.8156 27.169 10.34 48.59 95.643 3 3 6 4 1 3 4 2 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AT5G06160.1 6 6 6 AT5G06160.1 | Symbols:ATO | ATROPOS | splicing factor-like protein | Chr5:1862623-1866298 REVERSE LENGTH=504 1 6 6 6 5 4 3 4 5 4 3 4 5 4 3 4 13.1 13.1 13.1 58.971 504 504 2 6 8 6 0 15.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84055 0.80575 37.73 10 5 Leave out requantified 1.0976 NaN 0.69685 0.58463 0.9458 NaN 0.81179 0.65778 26.516 NaN 21.304 47.677 3 1 2 4 1 0 1 3 Median Median Median Median 10.7 9.1 7.3 9.7 1395800000 844130000 551630000 728000000 434400000 293600000 62673000 29435000 33238000 302600000 188520000 114080000 302480000 191780000 110710000 4667 7454;21739;23446;23740;25269;31050 True;True;True;True;True;True 8469;24450;26330;26663;28836;35424 41478;41479;41480;41481;118684;118685;118686;118687;127500;127501;127502;127503;127504;127505;127506;127507;129098;139375;169062;169063 53133;53134;53135;53136;53137;151978;151979;151980;151981;151982;163154;163155;163156;163157;163158;163159;163160;163161;165190;177922;215271;215272 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Symbols:2-Cys Prx B,2CPB | 2-cysteine peroxiredoxin B,2-CYS PEROXIREDOXIN B | 2 9 4 4 7 8 9 8 2 3 4 3 2 3 4 3 44.3 23.1 23.1 29.78 273 273;245 2.09 9 11 12 0 136.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85877 0.93821 3.0547 32 18 Leave out requantified 0.57044 0.90645 0.79382 1.1365 0.54952 0.8942 0.94633 1.2603 60.89 60.194 2.4443 23.32 7 8 9 8 3 5 4 6 Median Median Leave out requantified Median 36.6 41.8 44.3 41.8 17676000000 9376700000 8299500000 3216700000 1775300000 1441400000 3251100000 1759700000 1491400000 7693600000 4273100000 3420500000 3514700000 1568500000 1946200000 4669 2754;2860;8436;13917;22951;29127;29320;31383;33158 False;False;False;False;True;True;True;False;True 3162;3277;9563;9564;15732;25791;33305;33517;35789;35790;37759 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protein | Chr5:1967869-1968489 REVERSE LENGTH=206 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 12.1 12.1 12.1 23.215 206 206 2 3 3 0 7.1676 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0301 0.98711 58.665 6 3 Median 1.1553 NaN NaN NaN 1.1334 NaN NaN NaN 37.947 NaN NaN NaN 3 1 1 1 1 1 1 0 Median Median Median Median 12.1 4.9 7.3 4.9 243110000 125330000 117780000 144140000 66624000 77518000 37883000 13848000 24034000 17426000 13967000 3458200 43657000 30890000 12767000 4672 24712;36396 True;True 28088;41449 135797;135798;135799;135800;198454;198455 173401;173402;173403;173404;173405;253158;253159;253160 173403;253159 AT5G06460.1 AT5G06460.1 14 9 9 AT5G06460.1 | Symbols:ATUBA2,UBA 2 | ubiquitin activating enzyme 2,ARABIDOPSIS THALIANA UBIQUITIN ACTIVATING ENZYME 2 | ubiquitin activating enzyme 2 | Chr5:1970239-1974382 FORWARD LENGTH=1077 1 14 9 9 7 9 11 11 3 4 7 7 3 4 7 7 14.6 9.7 9.7 119.62 1077 1077 2.09 6 9 8 0 46.936 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99216 1.0302 16.39 20 9 Leave out requantified 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AT5G06680.1 2 2 2 AT5G06680.1 | Symbols:ATGCP3,GCP3,ATSPC98,SPC98 | GAMMA TUBULIN COMPLEX PROTEIN 3,spindle pole body component 98,ARABIDOPSIS THALIANA GAMMA TUBULIN COMPLEX PROTEIN 3,SPINDLE POLE BODY COMPONENT 98 | spindle pole body component 98 | Chr5:2056741-2059369 F 1 2 2 2 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 3.1 3.1 3.1 94.646 838 838 2 1 1 0.0015247 2.9226 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 1.8 1.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4678 11735;30030 True;True 13267;34290 64082;164394 82425;209460 82425;209460 AT5G06690.1;AT5G06690.4;AT5G06690.2 AT5G06690.1;AT5G06690.4;AT5G06690.2 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT5G06690.1 | Symbols:WCRKC1 | WCRKC thioredoxin 1 | WCRKC thioredoxin 1 | Chr5:2060651-2061956 REVERSE LENGTH=210;AT5G06690.4 | Symbols:WCRKC1 | WCRKC thioredoxin 1 | WCRKC thioredoxin 1 | Chr5:2060733-2061956 REVERSE LENGTH=213;AT5G06690.2 | Symbols 3 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 7.1 7.1 7.1 24.516 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31115;31116;31117;31118;31119;31120;122573;122574;122575;122576;122577;122578;143849;143850;143851;143852;143853;143854;143855;143856;158932;158933;158934;158935;158936;158937;158938;158939;158940;158941;158942;158943;160120;160121;160122;161676;161677;161678;161679;161680;209121;209122;209123;209124;209125;235399;235400;235401;235402 31119;122578;143854;158933;160120;161677;209121;235402 AT5G06870.1 AT5G06870.1 8 8 8 AT5G06870.1 | Symbols:PGIP2,ATPGIP2 | ARABIDOPSIS POLYGALACTURONASE INHIBITING PROTEIN 2,polygalacturonase inhibiting protein 2 | polygalacturonase inhibiting protein 2 | Chr5:2133941-2135016 FORWARD LENGTH=330 1 8 8 8 6 7 5 5 6 7 5 5 6 7 5 5 30.9 30.9 30.9 37.067 330 330 2.1 9 9 12 0 25.908 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1404 1.188 51.249 26 7 Leave out requantified 1.9583 1.8332 0.72429 0.74264 1.8937 1.7084 0.86898 0.83645 77.472 8.5465 20.973 20.842 6 7 6 7 2 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.4 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Chr5:2180669-2182284 REVERSE LENGTH=235 1 4 4 4 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 20.4 20.4 20.4 24.395 235 235 1.93 11 10 9 0 120.58 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93191 0.9701 12.018 26 12 Leave out requantified 0.8505 1.0861 0.77032 1.0184 0.82143 1.0424 0.86889 1.1469 17.764 14.06 14.627 14.076 6 7 8 5 4 3 4 1 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 17 17 20.4 17 10540000000 5310900000 5228600000 1316200000 707810000 608390000 2431700000 1213900000 1217800000 4512700000 2261300000 2251400000 2278900000 1127900000 1151000000 4686 3242;3690;15403;37426 True;True;True;True 3706;4220;17437;42620 18194;18195;18196;18197;18198;18199;18200;20737;20738;20739;20740;20741;20742;20743;20744;20745;20746;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754;85237;85238;85239;85240;204332 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glucuronidase 2 | glucuronidase 2 | Chr5:2504168-2506567 FORWARD LENGTH=543 1 5 5 5 4 4 2 3 4 4 2 3 4 4 2 3 13.8 13.8 13.8 60.25 543 543 2.07 5 4 6 0 12.256 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4964 1.3696 54.7 14 9 Leave out requantified 1.7229 2.0086 0.48732 0.25624 1.6325 1.8187 0.57855 0.30551 47.854 83.13 49.942 76.053 5 5 2 2 1 5 1 2 Leave out requantified Median Median Median 10.7 10.7 5 7.6 908920000 491600000 417310000 200030000 72174000 127860000 421570000 196210000 225370000 138440000 103420000 35017000 148870000 119800000 29072000 4697 3160;14941;15198;16876;30015 True;True;True;True;True 3613;16914;17201;19075;34275 17757;17758;17759;17760;17761;82337;83936;83937;83938;83939;93065;164328;164329;164330;164331 22959;22960;22961;22962;22963;22964;106060;108200;108201;108202;108203;119313;209375;209376;209377;209378;209379 22964;106060;108203;119313;209376 AT5G07860.1;AT5G07870.1 AT5G07860.1;AT5G07870.1 2;1 2;1 2;1 AT5G07860.1 | Symbols:no symbol available | no full name 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subunit) 2 | Chr5:2709974-2710528 REVERSE LENGTH=184;AT5G08410.2 | Symbols:FTRA2 | ferredoxin/thioredoxi 2 5 5 5 4 5 4 5 4 5 4 5 4 5 4 5 31 31 31 20.146 184 184;204 2.05 7 6 8 0 56.342 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9515 1.0497 12.666 21 8 Leave out requantified 0.62836 0.88868 1.1157 1.0232 0.59124 0.81715 1.3648 1.145 32.799 18.958 16.485 9.1709 6 5 4 6 4 1 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.4 31 27.2 31 2400300000 1374400000 1025800000 752810000 473100000 279710000 533870000 316550000 217320000 467950000 209390000 258560000 645630000 375390000 270240000 4716 7237;11105;17915;19151;28335 True;True;True;True;True 8228;12545;20278;21628;32418 40318;40319;40320;60717;60718;60719;60720;98931;98932;98933;98934;98935;98936;98937;105876;105877;105878;155830;155831;155832;155833 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Symbols:HDC1,RXT3-like | Histone Deacetylation Complex 1,RXT3-like | zinc finger C 3 4 4 4 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 3 2 6.4 6.4 6.4 104.15 918 918;918;918 1.88 6 6 4 0 18.057 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1637 1.073 41.133 13 10 Median 1.2882 1.7053 0.53779 0.5551 1.1632 1.5366 0.65022 0.60287 19.777 26.197 51.381 46.034 4 3 3 3 4 2 2 2 Median Median Median Median 6.4 5.2 5.2 3.5 474220000 254650000 219570000 118410000 54651000 63762000 109830000 54056000 55776000 133910000 81869000 52036000 112070000 64079000 47993000 4718 9043;14350;34491;36242 True;True;True;True 10229;16262;39298;41281 49895;49896;49897;49898;49899;49900;79402;79403;79404;79405;79406;79407;187677;187678;187679;197706 64117;64118;64119;64120;64121;64122;64123;102433;102434;102435;102436;102437;102438;102439;102440;239117;239118;239119;252235 64122;102437;239119;252235 AT5G08490.5;AT5G08490.7;AT5G08490.6;AT5G08490.2;AT5G08490.4;AT5G08490.8;AT5G08490.3;AT5G08490.1 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 3.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4720 3212 True 3673 17992 23234 23234 AT5G08530.1 AT5G08530.1 16 16 16 AT5G08530.1 | Symbols:CI51,NDUFV1 | 51 kDa subunit of complex I | 51 kDa subunit of complex I | Chr5:2759848-2761726 REVERSE LENGTH=486 1 16 16 16 14 10 12 13 14 10 12 13 14 10 12 13 37.9 37.9 37.9 53.449 486 486 2.04 27 33 31 0 75.008 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98037 1.0007 20.377 84 18 Leave out requantified 1.2232 1.2223 0.5984 0.75016 1.1604 1.1776 0.71726 0.87246 29.403 11.307 17.587 21.801 22 18 21 23 5 3 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.2 28.2 31.7 34 10924000000 5456200000 5467500000 2220900000 956560000 1264300000 2299300000 1016900000 1282500000 3247500000 1701700000 1545700000 3156100000 1781000000 1375000000 4721 3894;7625;8410;9153;13016;13211;13455;14918;14919;15692;16791;20671;25470;31147;32895;36857 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peroxisomal NAD-malate dehydrogenase 2 | Chr5:2993645-2995169 REVERSE LENGTH=333;AT5G09660.1 | Symbols:PMDH2 | peroxisomal NAD-malate dehydrogenase 2 | peroxisomal NAD-malate dehydro 5 18 18 17 15 16 16 17 15 16 16 17 14 15 15 16 62.5 62.5 58.9 34.975 333 333;354;353;342;363 1.99 79 85 77 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.145 1.1665 9.5016 144 33 Leave out requantified 1.2785 0.85186 1.2839 1.0602 1.2181 0.80169 1.4731 1.1521 25.629 26.055 10.198 9.3762 33 36 36 39 3 9 8 13 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 61.9 60.1 62.2 62.5 186070000000 88829000000 97244000000 33789000000 14010000000 19780000000 42858000000 23495000000 19363000000 53683000000 23118000000 30566000000 55743000000 28207000000 27536000000 4738 1256;1506;1909;2717;4181;4182;5005;10620;12691;13361;17590;17845;19320;22027;27374;32480;32951;34568 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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SUBUNIT 5A | 26S proteasome regulatory subunit%2C putative (RPN5) | Chr5:3089462-3092434 REVERSE LENGTH=442;AT5G09900.2 | Symbols:EMB2107,MSA,RPN5A 3 20 20 12 19 16 18 17 19 16 18 17 11 9 10 9 50.5 50.5 32.8 50.837 442 442;442;462 2.04 41 48 46 0 145.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.097 1.1124 14.977 114 33 Leave out requantified 1.2244 1.1773 0.85249 0.75942 1.1583 1.0795 1.0094 0.8577 10.989 14.342 28.761 20.961 29 27 32 26 9 6 12 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 47.3 44.1 44.6 42.1 18221000000 9155200000 9065900000 3922200000 1853800000 2068500000 3587100000 1623400000 1963800000 6467200000 3263700000 3203500000 4244500000 2414400000 1830200000 4743 1898;6558;8213;10065;15880;16213;17062;17216;18606;20074;20635;21885;22122;28016;30280;33128;35195;35196;38802;39551 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 2.3 2.3 2.3 5.8 38533000 23626000 14907000 0 0 0 16063000 5171000 10892000 10097000 10097000 0 12373000 8357700 4015100 4747 9682;27867;31082 True;True;True 10968;31877 52980;52981;52982;52983;52984;52985;153275 67978;67979;67980;67981;67982;67983;195264 67983;195264 AT5G10160.1 AT5G10160.1 6 6 5 AT5G10160.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Thioesterase superfamily protein | Chr5:3185819-3187159 FORWARD LENGTH=219 1 6 6 5 3 3 6 6 3 3 6 6 2 3 5 5 35.2 35.2 29.7 24.123 219 219 1.92 8 11 6 0 21.214 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3119 1.6142 23.485 22 11 Leave out requantified 2.6753 0.95254 1.3119 1.7873 2.6377 0.8718 1.6142 2.1504 45.715 47.611 26.789 16.369 3 5 6 8 1 3 2 5 Plateau Median Leave out requantified Median 16.4 14.6 35.2 35.2 5170100000 1474700000 3695500000 1059300000 255660000 803600000 1347700000 365640000 982040000 1126100000 448380000 677730000 1637100000 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 1 1 Median Median Median Median 5.5 10.2 10.4 4.3 271870000 218340000 53537000 48908000 39683000 9225200 35480000 18042000 17439000 154520000 140710000 13816000 32965000 19907000 13058000 4749 3291;3592;8068;9628;10150;21374;27327;31277 False;True;False;False;False;True;False;False 3765;4104;9145;10906;11483;24051;31279;35671 18436;18437;18438;18439;20041;20042;20043;20044;20045;44373;44374;44375;44376;44377;44378;52629;55479;116874;150757;170218 23774;23775;23776;23777;25849;25850;25851;25852;25853;56821;56822;56823;56824;56825;56826;67467;71134;149721;192063;216769 23774;25849;56825;67467;71134;149721;192063;216769 3131;3132 323;326 AT5G10270.1;AT5G64960.1;AT5G64960.2;AT1G67580.2;AT1G67580.1 AT5G10270.1;AT5G64960.1;AT5G64960.2 3;3;2;1;1 2;2;1;1;1 2;2;1;1;1 AT5G10270.1 | Symbols:CDKC;1 | cyclin-dependent kinase C;1 | cyclin-dependent kinase C%3B1 | Chr5:3221715-3224674 REVERSE LENGTH=505;AT5G64960.1 | Symbols:CDKC2,CDKC;2 | cyclin 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19842;19843;19844;19845;19846;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;19859;19860;19861;19862;19863;19864;19865;19866;19867;19868;19869;19870;19871;19872;19873;19874;82487;82488;82489;82490;82491;82492;82493;82494;82495;82496;82497;82498;82499;82500;82501;82502;82503;82504;82505;82506;82507;82508;82509;82510;82511;82512;88846;88847;88848;88849;88850;88851;88852;88853;88854;88855;88856;88857;88858;88859;88860;88861;88862;88863;88864;88865;88866;108892;108893;108894;108895;108896;108897;108898;108899;108900;108901;108902;108903;108904;108905;108906;108907;108908;108909;108910;108911;108912;108913;108914;108915;108916;108917;108918;108919;124325;124326;124327;135355;135356;135357;135358;135359;135360;135361;135362;136526;136527;136528;136529;136530;136531;136532;136533;136534;136535;136536;136537;136538;136539;136540;136541;136542;136543;136544;136545;136546;136547;136548;136549;136550;136551;136552;136553;136554;136555;136556;136691;136692;136693;136694;136695;136696;136697;136698;136699;145672;145673;145674;145675;145676;145677;160594;160595;160596;160597;160598;160599;160600;160601;160602;160603;160604;160605;160606;160607;160608;160609;160610;160611;160612;160613;160614;160615;160616;160617;160618;160619;160620;160621;160622;160623;160624;160625;160626;160627;160628;160629;160630;160631;160632;160633;160634;160635;160636;160637;160638;160639;160640;160706;160707;160708;160709;160710;165057;165058;165059;165060;165061;165062;165063;165064;165065;165066;165067;165068;165069;165070;165071;165072;170753;170754;170755;170756;170757;170758;170759;191259;191260 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kinesin like protein for actin based chloroplast movement 1 | Chr5:3290121-3297248 REVERSE LENGTH=1274;AT5G10470.1 | Symbols:KCA1 2 34 34 27 26 22 24 21 26 22 24 21 21 15 20 17 31.2 31.2 26.2 141.12 1274 1274;1273 1.97 41 39 37 0 208.8 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9328 0.97197 27.178 106 41 Leave out requantified 0.81253 1.0022 1.1859 0.98011 0.77976 0.9107 1.4103 1.0713 19.941 20.458 23.205 19.951 33 27 25 21 12 13 7 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.9 19.9 23.2 19.1 9086700000 4562200000 4524500000 2059700000 1058000000 1001700000 1997600000 1043200000 954440000 3001600000 1440700000 1560900000 2027700000 1020200000 1007500000 4756 2263;3219;3706;4279;5456;6086;6525;6649;8468;9661;9706;12906;13902;19248;20279;20961;22748;26138;26400;26801;26939;27678;28434;28616;29055;29445;30255;31008;32492;34911;35921;36986;38009;38852 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NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 3.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 4760 23396 True 26277 127126 162658 162658 2113 4490 229 245 AT5G10730.1 AT5G10730.1 5 5 5 AT5G10730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr5:3390822-3392947 REVERSE LENGTH=287 1 5 5 5 2 2 4 3 2 2 4 3 2 2 4 3 24.7 24.7 24.7 31.044 287 287 2.29 3 4 7 0 16.423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4243 1.4725 33.758 14 3 Leave out requantified 1.6719 1.3705 0.72594 0.54664 1.6587 1.2132 0.85919 0.6023 35.045 23.17 164.76 48.845 3 3 5 3 0 0 2 1 Plateau Median Leave out requantified Median 8.7 6.6 21.6 15.3 1078900000 579930000 498940000 162870000 66581000 96292000 157500000 68379000 89118000 376410000 226490000 149920000 382090000 218470000 163620000 4761 394;14109;17722;30930;37245 True;True;True;True;True 441;15943;20061;35293;42423 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SYNTHASE 1 | sucrose phosphate synthase 2F | Chr5:3536426-3540901 FORWARD LENGTH=1047 1 7 3 3 5 4 5 5 2 2 1 1 2 2 1 1 6.6 3.3 3.3 116.96 1047 1047 2.5 1 2 5 0.00041135 3.9597 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3741 1.2836 44.898 8 1 Leave out requantified 1.2818 2.5605 NaN NaN 1.2013 2.333 NaN NaN 9.3706 14.907 NaN NaN 4 2 1 1 0 0 0 1 Leave out requantified Median Median Median 4.1 4 3.9 4.2 709370000 306370000 403000000 188890000 81109000 107780000 239680000 59020000 180660000 83252000 49156000 34096000 197550000 117080000 80471000 4770 2203;6473;12949;20770;22500;31883;39486 False;False;False;True;True;True;False 2486;7369;14631;23384;25312;36333;44930 12246;12247;12248;12249;12250;12251;35892;35893;35894;35895;70605;70606;113912;113913;113914;113915;122639;122640;122641;173248;215587;215588;215589;215590;215591;215592;215593;215594 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Symbols:no symbol available | no full name available 3 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2.4 2.4 2.4 80.918 708 708;696;626 2.2 1 2 2 0.0040015 2.3638 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82192 0.86321 7.9798 5 1 Leave out requantified NaN NaN NaN 1.0427 NaN NaN NaN 1.1713 NaN NaN NaN 51.138 1 1 1 2 1 0 0 0 Median Median Median Median 1 1 1 2.4 422160000 197250000 224910000 48562000 17342000 31220000 104660000 50413000 54250000 86405000 51954000 34451000 182530000 77541000 104990000 4820 19603;21050 True;True 22118;23683 108178;108179;108180;108181;115161 138767;138768;138769;138770;147557 138768;147557 AT5G13200.1;AT5G13200.2 AT5G13200.1;AT5G13200.2 7;6 7;6 7;6 AT5G13200.1 | Symbols:GER5 | GEm-Related 5 | GRAM domain family protein | Chr5:4207081-4208079 FORWARD LENGTH=272;AT5G13200.2 | Symbols:GER5 | GEm-Related 5 | GRAM domain family protein | Chr5:4207081-4207812 FORWARD LENGTH=213 2 7 7 7 3 4 3 2 3 4 3 2 3 4 3 2 28.3 28.3 28.3 30.07 272 272;213 1.75 6 3 3 0 14.318 By MS/MS By MS/MS 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no full name available | Ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit | Chr5:4305414-4307399 REVERSE LENGTH=272;AT5G13440.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ubiquinol-cytochrome 2 8 8 8 6 5 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 27.2 27.2 27.2 29.607 272 272;274 2.17 12 16 20 0 117.73 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0121 1.0046 31.998 34 11 Leave out requantified 1.0035 1.4973 0.66013 0.78253 1.0077 1.3949 0.79383 0.88588 38.475 11.561 22.728 39.3 8 9 8 9 3 3 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.3 21.3 20.6 20.6 4009700000 2094100000 1915600000 613900000 310610000 303280000 1040200000 406280000 633900000 1202300000 744850000 457460000 1153300000 632320000 520970000 4829 14409;18466;19037;20214;20215;21686;28288;39108 True;True;True;True;True;True;True;True 16327;20887;21507;22781;22782;22783;22784;24394;32365;44508 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no full name available | hypothetical protein | Chr5:4552169-4552901 REVERSE LENGTH=76 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 27.6 27.6 27.6 8.4378 76 76 2.17 4 2 6 0.0016978 2.7847 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.4377 0.42052 103.68 11 10 Median 0.48579 0.33899 0.58218 0.46471 0.45476 0.31419 0.6832 0.54372 103.06 19.134 236.5 79.47 3 2 2 4 3 2 2 3 Median Median Median Median 17.1 17.1 27.6 27.6 351490000 205420000 146070000 95706000 52453000 43253000 64160000 47730000 16430000 58700000 29200000 29500000 132920000 76032000 56890000 4854 136;16107 True;True 150;18227 793;794;88963;88964;88965;88966;88967;88968;88969;88970;88971;88972 1122;1123;114242;114243;114244;114245;114246;114247;114248;114249;114250;114251 1122;114251 AT5G14120.1;AT3G01930.3;AT3G01930.2;AT3G01930.1;AT5G50630.1;AT5G50520.1 AT5G14120.1;AT3G01930.3;AT3G01930.2 4;2;2;1;1;1 4;2;2;1;1;1 4;2;2;1;1;1 AT5G14120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Major facilitator superfamily protein | Chr5:4556308-4558447 FORWARD LENGTH=579;AT3G01930.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Major facilitator superfamily prote 6 4 4 4 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 9.3 9.3 9.3 63.148 579 579;436;584;471;540;540 2.13 5 3 7 0 10.37 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99666 1.0412 11.192 13 3 Leave out requantified 0.47645 1.1182 1.1508 0.86314 0.44697 1.0844 1.4314 0.96196 59.43 37.099 18.24 4.3196 4 3 3 3 0 2 1 0 Median Median Median Median 5.2 2.8 6.9 2.8 1331200000 739250000 592000000 421540000 263990000 157550000 275040000 137950000 137080000 290370000 129030000 161340000 344290000 208270000 136020000 4855 14523;26749;28148;30922 True;True;True;True 16455;30643;32203;35285 80398;80399;80400;80401;80402;147948;154854;168543;168544;168545;168546;168547;168548;168549;168550 103717;103718;103719;188525;197382;214673;214674;214675;214676;214677;214678;214679;214680 103719;188525;197382;214676 AT5G14170.1 AT5G14170.1 5 5 5 AT5G14170.1 | Symbols:BAF60,SWP73B,CHC1 | SWP73B | SWIB/MDM2 domain superfamily protein | Chr5:4568696-4570444 REVERSE LENGTH=534 1 5 5 5 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 3 4 12 12 12 59.27 534 534 2 4 6 4 0 19.776 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1583 1.0632 101.63 14 5 Leave out requantified 1.2334 1.1926 0.68756 0.84343 1.1508 1.0817 0.80649 0.93571 17.3 3.4825 26.394 112.34 2 3 5 4 0 0 5 0 Median Leave out requantified Median Leave out requantified 5.6 9.2 8.1 10.5 742540000 362670000 379870000 41013000 18813000 22199000 95854000 44922000 50932000 364990000 212090000 152890000 240680000 86841000 153840000 4856 12067;17311;19353;23903;37265 True;True;True;True;True 13636;19579;21843;26842;42446 65903;95688;95689;95690;95691;95692;106876;106877;106878;106879;129919;129920;129921;203304 84782;122799;122800;122801;122802;122803;122804;122805;122806;137042;137043;137044;137045;137046;166244;166245;166246;166247;259138 84782;122800;137046;166247;259138 4595 380 AT5G14200.1;AT5G14200.3;AT5G14200.2 AT5G14200.1;AT5G14200.3;AT5G14200.2 12;10;8 6;6;5 6;6;5 AT5G14200.1 | Symbols:ATIMD1,IMD1 | isopropylmalate dehydrogenase 1,ARABIDOPSIS ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 1 | isopropylmalate dehydrogenase 1 | Chr5:4576220-4578111 FORWARD LENGTH=409;AT5G14200.3 | Symbols:ATIMD1,IMD1 | isopropylmalate dehydrogenase 3 12 6 6 7 8 8 7 2 3 3 1 2 3 3 1 39.6 24.2 24.2 44.161 409 409;388;300 2.09 3 4 4 0 20.942 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63649 0.58221 27.56 7 2 Leave out requantified 0.68094 0.72133 0.812 NaN 0.64795 0.6775 0.96743 NaN 51.794 27.462 45.426 NaN 2 3 2 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 24.7 23 24 18.3 589920000 193280000 396640000 58865000 35785000 23080000 170100000 97007000 73091000 360960000 60485000 300470000 0 0 0 4857 1471;2689;2727;9285;9367;9397;22884;28199;32506;34523;39052;39265 True;False;False;False;False;True;True;True;False;False;True;True 1670;3086;3087;3132;10501;10594;10595;10641;25720;32260;37034;39331;44441;44682 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protein | Chr5:4596223-4597568 REVERSE LENGTH=256 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 5.5 5.5 5.5 28.749 256 256 2 2 0.0063943 2.1607 By MS/MS By MS/MS 7.7607 8.9051 124.17 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 5.5 5.5 782510000 34517000 747990000 0 0 0 0 0 0 730690000 20848000 709840000 51826000 13669000 38157000 4859 38662 True 44002 211072;211073 269287;269288 269288 AT5G14250.1;AT5G14250.2 AT5G14250.1;AT5G14250.2 6;5 6;5 6;5 AT5G14250.1 | Symbols:COP13,FUS11,CSN3 | FUSCA 11,COP9 SIGNALOSOME SUBUNIT 3,CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 13 | Proteasome component (PCI) domain protein | Chr5:4597970-4600561 FORWARD LENGTH=429;AT5G14250.2 | Symbols:COP13,FUS11,CSN3 | FUSCA 11,COP9 SI 2 6 6 6 5 6 4 4 5 6 4 4 5 6 4 4 16.8 16.8 16.8 47.74 429 429;356 1.88 10 8 7 0 24.681 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0517 1.0509 34.715 21 10 Leave out requantified 1.2532 1.8299 0.83571 0.85277 1.1661 1.7522 0.99615 0.94692 30.242 51.91 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Symbols:no symbol available | no full name available | Rubisco methyltransferase family 4 11 11 11 11 10 11 10 11 10 11 10 11 10 11 10 28.8 28.8 28.8 57.585 514 514;514;514;429 2.05 26 27 30 0 117.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1484 1.2136 25.981 79 23 Leave out requantified 0.98452 0.80672 1.208 1.255 0.92215 0.74882 1.4259 1.4344 33.495 22.618 26.58 20.75 23 16 21 19 9 3 7 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.8 26.7 28.8 26.1 8774200000 4297300000 4476900000 2282700000 1166500000 1116200000 1442500000 828570000 613970000 2884900000 1340500000 1544400000 2164100000 961740000 1202400000 4861 1293;2549;3811;7609;7693;10681;22095;23092;35824;35825;36095 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1458;2897;2898;4359;4360;8647;8648;8742;12060;24835;25945;40812;40813;41105 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AT5G14350.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr5:4627140-4628703 REVERSE LENGTH=241 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 3.7 3.7 3.7 26.948 241 241 2 1 0.0055436 2.2135 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 3.7 0 0 54788000 29588000 25199000 0 0 0 54788000 29588000 25199000 0 0 0 0 0 0 4864 22434 True 25241 122302 156662 156662 AT5G14430.2;AT5G14430.1 AT5G14430.2;AT5G14430.1 3;3 2;2 2;2 AT5G14430.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr5:4653092-4655741 FORWARD LENGTH=612;AT5G14430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 3 2 2 2 1 2 3 1 0 1 2 1 0 1 2 4.7 3.1 3.1 69.889 612 612;612 2 1 2 1 0.00020907 4.2293 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.60401 0.66955 36.05 4 3 Median NaN NaN NaN 0.57712 NaN NaN NaN 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.39729 0.44816 35.538 9 9 Median 0.57815 0.61016 0.37738 0.52613 0.52994 0.56946 0.44816 0.56107 46.693 59.557 32.725 41.02 2 2 3 2 2 2 3 2 Median Median Median Median 19.7 6.7 19.7 6.7 1600200000 982660000 617500000 212190000 150650000 61533000 516830000 301360000 215470000 542220000 341300000 200920000 328920000 189350000 139570000 4878 2341;27874 True;True 2637;31884 12965;12966;12967;12968;12969;12970;12971;153297;153298;153299 16776;16777;16778;16779;16780;16781;16782;195295;195296;195297 16776;195296 AT5G14920.1 AT5G14920.1 4 4 4 AT5G14920.1 | Symbols:GASA14 | A-stimulated in Arabidopsis 14 | Gibberellin-regulated family protein | Chr5:4826598-4827761 FORWARD LENGTH=275 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 13.5 13.5 13.5 29.138 275 275 1.9 21 23 15 0 11.716 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89018 0.91142 19.739 45 14 Leave out requantified 0.65381 1.0757 0.90048 0.97721 0.60429 1.0172 1.0407 1.0785 19.933 14.825 30.272 33.294 11 10 13 11 4 3 4 3 Leave 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protein homolog 4 | Chr5:4945017-4946025 FORWARD LENGTH=106 2 4 4 4 3 4 3 1 3 4 3 1 3 4 3 1 36.1 36.1 36.1 9.4099 83 83;106 1.86 9 7 6 0 12.581 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1027 1.0747 6.9564 21 4 Leave out requantified 0.7735 0.3608 2.4243 2.0294 0.68662 0.34772 2.8424 2.3553 36.788 8.9746 14.8 14.278 5 7 6 3 1 2 1 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 21.7 36.1 26.5 12 2835900000 1359100000 1476900000 367680000 181020000 186670000 979100000 714780000 264320000 1004200000 286830000 717320000 485000000 176430000 308570000 4885 514;4343;33514;33515 True;True;True;True 577;4952;38184;38185 2942;2943;24095;24096;182194;182195;182196;182197;182198;182199;182200;182201;182202;182203;182204;182205;182206;182207;182208;182209;182210;182211 3865;3866;31126;31127;232069;232070;232071;232072;232073;232074;232075;232076;232077;232078;232079;232080;232081;232082;232083;232084;232085 3865;31127;232069;232077 AT5G15270.3;AT5G15270.2;AT5G15270.1 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pescadillo ortholog | 3 2 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 6 6 6 47.337 433 433;433;402 1.5 3 1 0.00021286 4.4987 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3577 1.3245 19.732 4 0 Leave out requantified 1.3577 NaN NaN NaN 1.2578 NaN NaN NaN 27.037 NaN NaN NaN 2 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 6 2.8 0 2.8 178840000 68677000 110160000 85143000 32445000 52698000 44350000 14539000 29811000 0 0 0 49342000 21693000 27650000 4893 10864;12978 True;True 12270;14661 59307;59308;59309;70734 76160;76161;76162;90845 76162;90845 AT5G15610.2;AT5G15610.1 AT5G15610.2;AT5G15610.1 8;8 6;6 6;6 AT5G15610.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Proteasome component (PCI) domain protein | Chr5:5079579-5081929 FORWARD LENGTH=413;AT5G15610.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Proteasome component (PCI) doma 2 8 6 6 7 5 4 6 5 4 3 4 5 4 3 4 24 20.6 20.6 46.418 413 413;442 2.11 7 3 9 0 26.694 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82584 0.80362 10.323 14 7 Leave out requantified 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Chr5:5087822-5089677 FORWARD LENGTH=316;AT5G15640.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mitochondrial substrate ca 2 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 12.7 12.7 12.7 34.014 316 316;323 2.27 3 2 6 0 20.848 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99903 0.97737 39.559 8 5 Median 1.2087 NaN 0.79303 0.56877 1.1542 NaN 0.89369 0.64349 34.601 NaN 41.968 33.338 3 1 2 2 2 1 0 2 Median Median Median Median 12.7 9.2 7.6 9.2 185140000 92369000 92768000 68461000 26408000 42053000 25128000 10378000 14750000 49184000 25817000 23367000 42363000 29765000 12599000 4895 11530;13094;17075 True;True;True 13020;14790;19297 63012;63013;63014;63015;71353;71354;71355;71356;71357;94176;94177 81109;81110;81111;81112;91677;91678;91679;91680;91681;120775 81111;91678;120775 AT5G15650.1 AT5G15650.1 25 25 11 AT5G15650.1 | Symbols:MUR5,ATRGP2,RGP2 | MURUS 5,REVERSIBLY GLYCOSYLATED POLYPEPTIDE 2,reversibly glycosylated polypeptide 2 | reversibly glycosylated polypeptide 2 | Chr5:5092203-5094093 FORWARD LENGTH=360 1 25 25 11 18 20 21 21 18 20 21 21 7 8 9 9 83.3 83.3 43.9 40.89 360 360 2.11 37 57 53 0 257.1 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0016 1.0207 46.716 138 51 Leave out requantified 1.5667 1.7532 0.50046 0.54454 1.4904 1.782 0.56818 0.6014 18.755 22.937 55.791 84.429 30 37 36 35 7 17 13 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 68.1 73.6 75 73.9 38363000000 21071000000 17292000000 7486400000 2959400000 4527000000 8579900000 3371200000 5208700000 13713000000 9232700000 4480700000 8583700000 5507600000 3076100000 4896 3049;3201;3852;4254;5007;5876;7616;8189;8442;8864;13591;14983;17015;19991;23112;25688;25769;32576;35110;35111;35626;38329;38742;38743;39378 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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17290;17291;17292;17953;17954;17955;17956;17957;17958;17959;21630;21631;21632;21633;21634;21635;21636;21637;21638;23680;23681;23682;23683;23684;23685;23686;23687;23688;23689;23690;23691;23692;23693;23694;27731;32610;32611;32612;32613;32614;32615;32616;42292;42293;42294;42295;42296;42297;42298;44922;44923;44924;46520;46521;46522;46523;46524;46525;48902;74753;74754;74755;74756;74757;74758;82667;82668;82669;82670;82671;82672;82673;82674;82675;82676;93880;93881;93882;93883;93884;93885;93886;93887;110043;125644;125645;141960;141961;141962;141963;142303;142304;142305;142306;142307;142308;142309;176852;176853;176854;176855;176856;176857;176858;176859;191080;191081;191082;191083;191084;191085;191086;194110;194111;194112;194113;194114;194115;194116;209128;209129;209130;209131;209132;209133;211485;211486;211487;211488;211489;211490;211491;211492;211493;211494;215070;215071;215072;215073;215074;215075;215076;215077;215078;215079;215080;215081 22351;22352;22353;23186;23187;23188;23189;23190;23191;23192;23193;23194;23195;28061;28062;28063;28064;28065;28066;28067;28068;28069;28070;28071;28072;28073;28074;28075;28076;28077;28078;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;30636;30637;30638;30639;30640;35725;41773;41774;41775;41776;41777;41778;41779;54183;54184;54185;54186;54187;54188;54189;54190;54191;57500;57501;57502;59755;59756;59757;59758;59759;59760;59761;62806;96513;96514;96515;96516;96517;96518;96519;96520;96521;96522;106572;106573;106574;106575;106576;106577;106578;120398;120399;120400;120401;120402;120403;120404;120405;120406;120407;120408;120409;120410;141186;141187;160813;181142;181143;181144;181145;181546;181547;181548;181549;181550;181551;181552;181553;181554;181555;225239;225240;225241;225242;225243;225244;225245;225246;225247;225248;225249;225250;225251;225252;225253;243542;243543;243544;243545;243546;243547;243548;247522;247523;247524;247525;247526;247527;247528;247529;247530;266770;266771;266772;266773;266774;266775;266776;266777;269794;269795;269796;269797;269798;269799;269800;269801;269802;269803;269804;269805;269806;274478;274479;274480;274481;274482;274483;274484;274485;274486;274487;274488;274489;274490;274491;274492 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LENGTH=427 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2.8 2.8 2.8 47.581 427 427 3 1 0.0097408 1.9816 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4898 32452 True 36969 176162 224345 224345 AT5G15870.1 AT5G15870.1 2 2 2 AT5G15870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | glycosyl hydrolase family 81 protein | Chr5:5182641-5184878 REVERSE LENGTH=745 1 2 2 2 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 2.3 2.3 2.3 82.872 745 745 2.67 1 2 0.0011574 3.0794 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.2 0 1.2 1.1 29871000 20226000 9644100 0 0 0 0 0 0 29871000 20226000 9644100 0 0 0 4899 6508;6650 True;True 7412;7574 36054;36055;36855 46156;46157;47198 46156;47198 AT5G15910.1;AT5G15910.2 AT5G15910.1;AT5G15910.2 8;7 8;7 8;7 AT5G15910.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr5:5193207-5195202 FORWARD LENGTH=269;AT5G15910.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann- 2 8 8 8 7 8 7 5 7 8 7 5 7 8 7 5 36.4 36.4 36.4 28.826 269 269;228 2.03 12 11 13 0 27.129 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93071 0.99256 61.485 22 14 Leave out requantified 1.1563 1.0713 0.75496 0.84714 1.0938 0.99256 0.92514 0.9776 25.393 31.215 34.717 71.117 6 5 7 4 4 4 5 1 Median Median Median Leave out requantified 33.5 36.4 33.1 23.4 4333400000 2613200000 1720200000 1318900000 728530000 590370000 910700000 541840000 368870000 1132800000 728710000 404090000 971020000 614100000 356920000 4900 27;429;3364;17514;17618;17765;22581;31347 True;True;True;True;True;True;True;True 30;483;3846;19808;19948;20107;25396;25397;35749 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Median 7.1 7.1 7.1 7.1 1314700000 690400000 624280000 534290000 286660000 247630000 42801000 21058000 21743000 390630000 190370000 200260000 346960000 192320000 154640000 4904 2234;11255 True;True 2518;12712 12433;12434;12435;12436;12437;12438;12439;12440;12441;61429;61430;61431;61432;61433;61434 16116;16117;16118;16119;16120;16121;16122;16123;16124;16125;16126;16127;16128;78984;78985;78986;78987;78988;78989;78990;78991;78992;78993 16119;78990 AT5G16050.2;AT5G16050.1 AT5G16050.2;AT5G16050.1 20;20 20;20 8;8 AT5G16050.2 | Symbols:GRF5,GF14 UPSILON | general regulatory factor 5 | general regulatory factor 5 | Chr5:5244008-5245402 REVERSE LENGTH=268;AT5G16050.1 | Symbols:GRF5,GF14 UPSILON | general regulatory factor 5 | general regulatory factor 5 | Chr5:524 2 20 20 8 16 18 18 17 16 18 18 17 5 7 7 6 70.5 70.5 36.2 30.182 268 268;268 2.01 69 76 72 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93018 0.99439 14.224 182 74 Leave out requantified 1.319 1.15 0.72675 0.88682 1.2204 1.0961 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28859;28860;28861;28862;28863;28864;28865;28866;28867;40652;40653;40654;40655;40656;40657;40658;40659;40660;40661;40662;40663;40664;40665;40666;40667;40668;43457;43458;43459;43460;43461;43462;43463;43464;43465;43466;43467;43468;49521;49522;49523;49524;50539;50540;50541;50542;50543;146435;146436;146437;146438;146439;146440;146441;146442;146443;146444;146445;146446;146447;146448;146449;146450;146451;168922;168923;168924;168925;168926;168927;168928;168929;168930;168931;168932;168933;168934;175084;175085;175086;175087;175088;175089;175090;175091;175092;175093;175094;175095;175096;175097;175098;175099;175100;229781;229782;229783;229784;229785;229786;229787;229788;229789;229790;229791;229792;229793;229794;229795;229796;229797;229798;229799;229800;229801;229802;229803;229804;229805 28862;40659;43462;43468;49524;50543;146439;168923;175091;229786 2146;2147 4634;4635;4636 13;34 1;52;126 AT5G16150.3;AT5G16150.2;AT5G16150.1 AT5G16150.3;AT5G16150.2;AT5G16150.1 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT5G16150.3 | Symbols:GLT1,PGLCT | GLUCOSE TRANSPORTER 1,plastidic GLC translocator | plastidic GLC translocator | Chr5:5272904-5275678 FORWARD LENGTH=546;AT5G16150.2 | Symbols:GLT1,PGLCT | GLUCOSE TRANSPORTER 1,plastidic GLC translocator | plastidic GL 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 6.6 6.6 6.6 56.969 546 546;546;546 1.8 7 4 4 0 34.764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3893 1.3613 31.373 12 7 Leave out requantified 1.4668 0.99095 0.67717 1.3893 1.3613 0.87138 0.80308 1.6005 31.373 37.737 52.249 41.043 4 3 2 3 1 3 1 2 Leave out requantified Median Median Median 6.6 6.6 6.6 6.6 1234900000 580130000 654760000 313750000 134110000 179640000 204610000 99916000 104700000 232920000 129470000 103450000 483610000 216640000 266970000 4909 2873;29901;37982 True;True;True 3293;34150;43243 16235;16236;16237;16238;16239;163840;163841;163842;163843;163844;207253;207254;207255;207256;207257 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NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 2.2 2.2 2.2 74904000 41475000 33429000 0 0 0 20537000 6815900 13721000 22900000 17239000 5661300 31467000 17421000 14047000 4911 28175 True 32232 154950;154951;154952 197499;197500;197501;197502;197503 197502 AT5G16280.2;AT5G16280.1 AT5G16280.2;AT5G16280.1 7;7 7;7 7;7 AT5G16280.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr5:5323377-5331345 REVERSE LENGTH=1271;AT5G16280.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptid 2 7 7 7 4 3 5 2 4 3 5 2 4 3 5 2 5.2 5.2 5.2 143.48 1271 1271;1272 2.21 3 5 6 0 11.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79329 0.94455 18.359 10 4 Leave out requantified 1.2548 0.87983 0.73012 0.54402 1.1578 0.81103 0.90983 0.59966 24.303 25.756 14.606 25.658 2 2 4 2 1 0 1 2 Median Median Leave out requantified Median 3.1 2.2 4.1 1.6 347600000 190570000 157020000 51282000 23494000 27788000 87444000 43431000 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requantified 9.6 13.8 8.8 7.5 613470000 279760000 333710000 120270000 66504000 53763000 218810000 120370000 98432000 166520000 47298000 119230000 107870000 45584000 62290000 4913 1872;6939;9791;9880;11872;24752;36269 True;True;True;True;True;True;True 2126;7896;11086;11184;13420;28146;41311 10476;10477;10478;38773;38774;38775;38776;53510;53511;53931;53932;64850;64851;64852;64853;136089;136090;197883;197884 13589;13590;13591;13592;49611;49612;49613;68629;69159;69160;83451;83452;83453;83454;173798;173799;252460;252461 13589;49612;68629;69160;83452;173798;252460 AT5G16300.3;AT5G16300.4;AT5G16300.1;AT5G16300.2 AT5G16300.3;AT5G16300.4;AT5G16300.1;AT5G16300.2 5;5;5;4 5;5;5;4 5;5;5;4 AT5G16300.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Vps51/Vps67 family (components of vesicular transport) protein | Chr5:5338119-5342068 FORWARD LENGTH=1029;AT5G16300.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | Vps51/Vps 4 5 5 5 4 5 3 2 4 5 3 2 4 5 3 2 5 5 5 114.86 1029 1029;1035;1068;1034 1.87 6 5 4 0 10.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76361 0.88687 56.909 9 4 Median 0.76361 1.6889 0.43215 NaN 0.75199 1.5289 0.51432 NaN 71.738 59.713 38.141 NaN 3 2 3 1 2 1 1 0 Median Median Median Median 4.1 5 3.3 1.8 391080000 228770000 162310000 149570000 85339000 64228000 71305000 34135000 37170000 130180000 86752000 43426000 40029000 22544000 17485000 4914 7536;10050;10715;21718;36942 True;True;True;True;True 8571;11372;12103;24427;42092 41899;41900;41901;54931;58592;58593;58594;118612;118613;118614;118615;118616;201498;201499;201500 53673;53674;53675;70413;75253;75254;75255;151901;151902;151903;256990;256991;256992 53674;70413;75253;151902;256992 4637 640 AT5G16330.1 AT5G16330.1 1 1 1 AT5G16330.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NC domain-containing protein-like protein | Chr5:5346163-5346977 REVERSE LENGTH=242 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 26.497 242 242 2 1 2 1 0.0016946 2.7687 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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17.2 21.3 13.7 13.7 2918600000 1025000000 1893700000 338550000 144030000 194520000 559450000 223190000 336260000 1125800000 411720000 714100000 894830000 246040000 648790000 4919 1211;14976;16551;18614;20879;22766;23738 True;True;True;True;True;True;True 1364;16956;18720;21051;23496;25598;26659;26660 6789;6790;82630;82631;91376;91377;91378;91379;102959;114379;123979;123980;123981;123982;129076;129077;129078;129079;129080;129081;129082 8864;8865;106508;106509;117139;117140;117141;117142;117143;117144;117145;131944;146590;158693;158694;158695;158696;158697;158698;158699;158700;158701;165156;165157;165158;165159;165160;165161;165162;165163;165164;165165;165166 8865;106508;117140;131944;146590;158700;165166 2376 268 AT5G16450.2;AT5G16450.1 AT5G16450.2;AT5G16450.1 4;4 2;2 2;2 AT5G16450.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribonuclease E inhibitor RraA/Dimethylmenaquinone methyltransferase | Chr5:5374357-5375342 FORWARD LENGTH=166;AT5G16450.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribon 2 4 2 2 3 2 3 3 1 1 1 2 1 1 1 2 28.3 16.9 16.9 17.82 166 166;166 2 2 2 2 0 15.508 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.58473 0.60289 68.242 4 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 1 1 Median Median Median Median 18.1 11.4 18.1 23.5 151580000 97747000 53829000 33645000 15882000 17763000 26725000 13272000 13452000 51126000 38834000 12292000 40081000 29759000 10321000 4920 1234;2025;27249;36389 True;False;False;True 1391;2295;31186;41442 6896;11326;11327;11328;150336;150337;150338;150339;150340;198430;198431;198432;198433;198434 9018;14705;14706;14707;191571;191572;191573;253132;253133;253134;253135;253136 9018;14707;191571;253136 AT5G16470.1;AT5G16470.2;AT3G02790.1 AT5G16470.1;AT5G16470.2 3;3;1 3;3;1 3;3;1 AT5G16470.1 | Symbols:MBS2 | METHYLENE BLUE SENSITIVITY 2 | zinc finger (C2H2 type) family protein | Chr5:5379516-5379830 FORWARD LENGTH=104;AT5G16470.2 | Symbols:MBS2 | METHYLENE BLUE SENSITIVITY 2 | zinc finger (C2H2 type) family protein | Chr5:53795 3 3 3 3 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 31.7 31.7 31.7 11.239 104 104;104;105 2.19 5 3 8 0 6.5463 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6254 1.8328 130.19 14 14 Median 1.9537 2.6457 1.1912 2.23 1.8017 2.4382 1.5632 2.475 147.11 157.91 144.69 26.322 4 3 5 2 4 3 5 2 Median Median Median Median 23.1 23.1 24 15.4 557430000 281200000 276230000 125890000 59940000 65954000 97744000 37275000 60469000 256310000 148440000 107870000 77485000 35541000 41944000 4921 552;25743;33280 True;True;True 618;29425;37909 3181;3182;142192;142193;142194;142195;142196;142197;142198;142199;142200;142201;142202;142203;142204;180790 4169;4170;181407;181408;181409;181410;181411;181412;181413;181414;181415;181416;181417;181418;181419;181420;181421;230287 4169;181409;230287 AT5G16510.2;AT5G16510.1 AT5G16510.2;AT5G16510.1 7;7 7;7 7;7 AT5G16510.2 | Symbols:RGP5 | reversibly glycosylated polypeptide 5,reversibly glycosylated protein 5 | Alpha-1%2C4-glucan-protein synthase family protein | Chr5:5393296-5394342 FORWARD LENGTH=348;AT5G16510.1 | Symbols:RGP5 | reversibly glycosylated poly 2 7 7 7 4 5 6 3 4 5 6 3 4 5 6 3 23.6 23.6 23.6 38.585 348 348;348 2.14 8 9 12 0 52.525 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87344 0.89703 54.932 25 15 Leave out requantified 1.6901 1.3768 0.39106 0.52345 1.5509 1.3093 0.46419 1.3476 111.43 41.948 37.583 88.62 5 7 9 4 3 4 7 1 Median Leave out requantified Median Linear 14.9 20.4 20.7 12.9 1523100000 991580000 531570000 206650000 102280000 104360000 324970000 139830000 185140000 835000000 654600000 180400000 156540000 94871000 61668000 4922 9316;9654;15801;26304;31528;31529;35002 True;True;True;True;True;True;True 10535;10935;10936;17882;30138;35946;35947;39865 51173;51174;51175;51176;51177;51178;51179;51180;51181;52834;52835;52836;52837;52838;52839;52840;87273;145461;145462;145463;145464;145465;145466;171461;171462;171463;171464;190565;190566 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hydroxyproline-rich glycoprotein family protein | Chr5:5450808-5454256 FORWARD LENGTH=447 1 14 14 14 11 13 10 14 11 13 10 14 11 13 10 14 44.7 44.7 44.7 48.903 447 447 1.99 24 28 23 0 105.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93114 1.0982 28.927 68 21 Leave out requantified 0.74459 0.75201 1.0911 1.2774 0.6485 0.69002 1.268 1.3374 19.754 30.646 10.283 26.165 13 17 16 22 5 4 4 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.6 38.3 30.2 44.7 5397000000 2744000000 2653000000 876360000 527260000 349090000 1210400000 659060000 551340000 1700500000 789880000 910600000 1609800000 767810000 841990000 4926 5506;9851;13370;17546;18023;20896;24547;24835;25240;26597;27637;35165;38219;39159 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6259;11152;15096;19848;19849;20398;23516;27820;27821;28284;28285;28799;30474;31630;40049;43504;44561 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| Symbols:GSTF12,GST26,TT19,ATGSTF12 | glutathione S-transferase phi 12,GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 26,ARABIDOPSIS THALIANA GLUTATHIONE S-TRANSFERASE PHI 12,TRANSPARENT TESTA 19 | glutathione S-transferase phi 12 | Chr5:5658528-5659322 FORWARD 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.6 5.6 5.6 24.58 214 214 1.8 2 2 1 0.0018793 2.7407 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2075 1.1437 190.67 5 5 Median NaN 5.2643 NaN NaN NaN 4.8634 NaN NaN NaN 204.7 NaN NaN 1 2 1 1 1 2 1 1 Median Median Median Median 5.6 5.6 5.6 5.6 252980000 133520000 119460000 22952000 3892900 19059000 91192000 9397100 81795000 86714000 76246000 10468000 52126000 43983000 8142700 4945 23865 True 26801 129745;129746;129747;129748;129749 166041;166042;166043;166044;166045 166042 AT5G17230.4;AT5G17230.2;AT5G17230.1;AT5G17230.3 AT5G17230.4;AT5G17230.2;AT5G17230.1;AT5G17230.3 3;3;3;3 3;3;3;3 3;3;3;3 AT5G17230.4 | Symbols:PSY | PHYTOENE SYNTHASE | PHYTOENE SYNTHASE | Chr5:5659839-5662087 REVERSE LENGTH=422;AT5G17230.2 | Symbols:PSY | PHYTOENE SYNTHASE | PHYTOENE SYNTHASE | Chr5:5659839-5662087 REVERSE LENGTH=422;AT5G17230.1 | Symbols:PSY | PHYTOEN 4 3 3 3 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 9.7 9.7 9.7 47.486 422 422;422;422;437 2 2 4 2 0 9.2644 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1061 1.0365 81.512 7 7 Median NaN 2.605 0.8282 2.2027 NaN 2.3976 0.89465 2.4531 NaN 118.61 7.3161 91.57 0 2 3 2 0 2 3 2 Median Median Plateau Median 2.4 7.6 7.3 4.5 1059000000 211460000 847530000 0 0 0 489930000 63886000 426050000 133670000 64041000 69629000 435390000 83531000 351850000 4946 16161;31041;37754 True;True;True 18284;35415;42992 89286;89287;89288;169023;169024;206086;206087;206088 114609;114610;114611;215219;215220;262889;262890;262891 114610;215219;262891 AT5G17270.2;AT5G17270.1 AT5G17270.2;AT5G17270.1 1;1 1;1 1;1 AT5G17270.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein prenylyltransferase superfamily protein | Chr5:5681235-5685597 FORWARD LENGTH=661;AT5G17270.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein prenylyltransfera 2 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 4.5 4.5 4.5 74.463 661 661;899 1.5 1 1 0 14.314 By MS/MS By MS/MS 0.8495 0.85376 15.502 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.5 0 4.5 0 55541000 28938000 26603000 27014000 10521000 16492000 0 0 0 28527000 18417000 10110000 0 0 0 4947 31025 True 35397 168959;168960 215131;215132;215133;215134;215135;215136 215133 AT5G17310.2;AT5G17310.3;AT5G17310.5;AT5G17310.1;AT5G17310.6;AT5G17310.4 AT5G17310.2;AT5G17310.3;AT5G17310.5;AT5G17310.1;AT5G17310.6;AT5G17310.4 23;18;18;18;17;17 23;18;18;18;17;17 10;7;7;7;6;6 AT5G17310.2 | Symbols:AtUGP2,UGP2 | UDP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE 2,UDP-glucose pyrophosphorylase 2 | UDP-glucose pyrophosphorylase 2 | Chr5:5696955-5700845 REVERSE LENGTH=470;AT5G17310.3 | Symbols:AtUGP2,UGP2 | UDP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE 2,UDP-gluco 6 23 23 10 20 22 21 19 20 22 21 19 7 9 8 7 54.9 54.9 24.3 51.919 470 470;385;390;390;336;336 1.96 66 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COBALAMIN-INDEPENDENT METHIONINE SYNTHASE,methionine synthesis 1 | Cobalamin-independent synthase family protein | Chr5:5935771-5939195 FORWARD LENGTH=765;AT5G17920.2 | Symbols:ATCIMS,ATMETS,ATMS1 | COBALAMIN- 3 42 42 19 34 38 39 35 34 38 39 35 16 18 18 17 61.4 61.4 31.4 84.356 765 765;765;894 2.05 136 148 159 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9981 1.0244 32.897 257 61 Leave out requantified 0.81131 0.62306 1.2654 1.3202 0.75572 0.58658 1.4357 1.4341 26.427 22.841 21.82 22.468 57 66 70 64 14 18 18 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 53.1 55 56.3 49.9 324680000000 162220000000 162460000000 70030000000 38108000000 31922000000 80365000000 49527000000 30838000000 95385000000 41078000000 54307000000 78905000000 33510000000 45395000000 4960 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Median Median 1.6 1.6 1.6 1.6 77654000 41830000 35824000 18773000 9499300 9273300 16428000 7898300 8530100 30860000 17121000 13739000 11593000 7311500 4281200 4971 4604 True 5254 25501;25502;25503;25504;25505 32822;32823;32824;32825;32826;32827;32828 32825 AT5G18420.4;AT5G18420.3;AT5G18420.1;AT5G18420.2 AT5G18420.4;AT5G18420.3;AT5G18420.1;AT5G18420.2 5;5;5;5 5;5;5;5 5;5;5;5 AT5G18420.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | CCR4-NOT transcription complex subunit | Chr5:6106282-6109337 REVERSE LENGTH=349;AT5G18420.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | CCR4-NOT transcription complex sub 4 5 5 5 3 4 5 3 3 4 5 3 3 4 5 3 18.3 18.3 18.3 39.407 349 349;439;441;442 2.2 3 6 6 0 24.233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.372 1.2589 30.265 14 4 Leave out requantified 1.372 1.4959 0.38178 0.90767 1.2589 1.4211 0.45016 1.156 66.462 43.206 81.697 17.409 3 4 4 3 0 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Median Plateau 9.7 13.2 18.3 10.6 813520000 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-2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.16352 0.15829 12.301 4 4 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 1 1 Median Median Median Median 2.9 2.9 2.9 2.9 559370000 473210000 86166000 103320000 86291000 17025000 139700000 115580000 24117000 176320000 151370000 24945000 140040000 119960000 20079000 + 4981 23781 True 26707 129297;129298;129299;129300 165450;165451;165452;165453 165451 4700 19 AT5G18760.2;AT5G18760.1 AT5G18760.2;AT5G18760.1 1;1 1;1 1;1 AT5G18760.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | RING/U-box superfamily protein | Chr5:6259040-6260828 REVERSE LENGTH=348;AT5G18760.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RING/U-box superfamily protein | Chr5:625 2 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 4.6 4.6 4.6 38.658 348 348;411 1 1 0.00021061 4.3447 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 4.6 0 0 40159000 30437000 9722500 0 0 0 40159000 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Symbols:no symbol available | no full name available | Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein | Chr5:6581854-6583137 REVERSE LENGTH=224 2 9 7 7 9 8 9 9 7 6 7 7 7 6 7 7 50 42.9 42.9 24.201 224 224;228 2.15 17 23 27 0 137.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84027 0.88345 20.309 53 17 Leave out requantified 0.87853 0.87771 0.74431 1.0202 0.8363 0.83877 0.86303 1.185 28.405 16.034 16.227 3.597 15 12 14 12 5 2 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 50 42.4 50 50 15237000000 8217200000 7020000000 2856900000 1587500000 1269400000 4748300000 2492100000 2256200000 4613500000 2619300000 1994200000 3018600000 1518300000 1500300000 4999 3935;15141;19265;23648;31092;31416;34361;37695;38131 True;True;False;False;True;True;True;True;True 4499;17141;17142;21752;26560;35469;35470;35825;39155;42924;42925;43403 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ASPARTATE AMINOTRANSFERASE 2,aspartate aminotransferase 2 | aspartate aminotransferase 2 | Chr5:6598201-6601597 FORWARD LENGTH=405 3 22 22 18 20 19 20 17 20 19 20 17 16 15 16 13 62 62 53.1 44.266 405 405;403;405 2.06 40 45 48 0 281.84 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1726 1.1515 49.636 109 32 Leave out requantified 1.4572 2.0844 0.56048 0.42034 1.4025 1.9305 0.65306 0.4652 38.162 25.912 26.514 14.446 32 26 28 23 8 7 7 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 57.3 57.8 59.5 47.7 19923000000 10714000000 9209100000 4503700000 1813900000 2689800000 4263600000 1418100000 2845500000 7220400000 4622600000 2597800000 3935300000 2859400000 1075900000 5000 999;2759;8069;9689;10553;15011;17998;18639;21547;24128;27258;27647;30037;30789;32461;32683;35277;35335;35341;35889;37220;39516 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1117;3167;9146;9147;10975;10976;11917;16998;20368;21077;24246;27165;27166;31198;31199;31643;34297;35138;35139;36979;37224;40184;40249;40255;40880;42395;44968 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AT5G19860.1 AT5G19860.1 2 2 2 AT5G19860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putative (Protein of unknown function%2C DUF538) | Chr5:6714533-6715837 REVERSE LENGTH=181 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 4.4 4.4 4.4 20.443 181 181 2.18 2 5 4 0.00097466 3.2137 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0974 1.0947 14.987 11 1 Leave out requantified 1.0974 1.9081 0.90632 0.94605 1.0947 1.7957 1.1266 1.0074 14.987 0.64546 13.923 53.806 2 2 3 4 0 0 1 0 Median Median Plateau Median 4.4 4.4 4.4 4.4 416790000 197870000 218920000 71316000 35653000 35662000 77430000 25385000 52045000 162280000 79960000 82324000 105760000 56874000 48884000 5009 19246;20495 True;True 21732;23084 106349;106350;106351;106352;106353;106354;106355;106356;106357;112616;112617 136347;136348;136349;136350;136351;136352;136353;136354;136355;136356;144395;144396 136352;144396 AT5G19890.1 AT5G19890.1 3 3 3 AT5G19890.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr5:6724372-6725877 REVERSE LENGTH=328 1 3 3 3 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 13.1 13.1 13.1 35.023 328 328 1.67 1 2 0 24.039 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 3.7 9.5 0 98595000 71365000 27229000 0 0 0 0 0 0 98595000 71365000 27229000 0 0 0 5010 440;13053;31294 True;True;True 496;14742;35689 2543;71094;170290 3316;91325;216862 3316;91325;216862 AT5G19940.2;AT5G19940.1 AT5G19940.2;AT5G19940.1 6;6 6;6 6;6 AT5G19940.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein | Chr5:6739693-6740747 FORWARD LENGTH=235;AT5G19940.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Plastid-l 2 6 6 6 6 6 3 4 6 6 3 4 6 6 3 4 31.5 31.5 31.5 26.001 235 235;239 2.03 11 13 12 0 59.116 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86011 0.84306 57.601 34 16 Leave out requantified 0.88713 0.55489 1.4936 1.9191 0.82926 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6.7 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71552 0.83079 4.9249 10 2 Leave out requantified 0.90448 NaN 0.77611 0.58278 0.85146 NaN 0.86023 0.64739 0.2195 NaN 29.348 33.628 2 1 3 4 0 0 0 2 Median Median Plateau Median 7.3 10.9 18.2 18.2 3954400000 2049600000 1904800000 315440000 158240000 157200000 746730000 309930000 436790000 1345800000 725160000 620650000 1546400000 856310000 690120000 5018 2924;11796 True;True 3357;13335 16680;16681;16682;16683;16684;16685;16686;64458;64459;64460 21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611;82960;82961;82962 21608;82960 AT5G20140.1;AT5G20140.2 AT5G20140.1;AT5G20140.2 7;7 7;7 7;7 AT5G20140.1 | Symbols:HBP5,AtHBP5 | haem-binding protein 5 | SOUL heme-binding family protein | Chr5:6799047-6800892 REVERSE LENGTH=378;AT5G20140.2 | Symbols:HBP5,AtHBP5 | haem-binding protein 5 | SOUL heme-binding family protein | Chr5:6799066-6800892 2 7 7 7 6 5 5 5 6 5 5 5 6 5 5 5 23.5 23.5 23.5 43.159 378 378;395 2.3 6 7 14 0 78.721 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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Symbols:Phox3 | Phox3 | Octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein / tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein | Chr5:6882121-6884630 REVERSE LENGTH=719;AT5G20360.5 | Symbols:Phox3 | Phox3 | Octicosapeptide/Phox/Bem 11 3 2 2 2 1 1 1 2 1 0 0 2 1 0 0 4 3.1 3.1 81.748 719 719;719;749;749;799;809;809;745;745;745;745 1 3 0.0070834 2.1264 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 0.86389 0.79191 14.399 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.1 1.4 1 1 111070000 61828000 49240000 43240000 25437000 17803000 67828000 36391000 31436000 0 0 0 0 0 0 5027 4532;5860;35160 False;True;True 5177;6648;40042 25192;25193;32534;191419;191420 32455;32456;41672;244003;244004 32456;41672;244003 AT5G20400.1 AT5G20400.1 2 2 2 AT5G20400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr5:6894871-6896185 FORWARD LENGTH=348 1 2 2 2 0 1 2 0 0 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AT5G20500.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glutaredoxin family protein | Chr5:6938652-6939665 FORWARD LENGTH=135 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 20 20 20 14.827 135 135 2.17 4 2 6 0 19.863 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.494 1.365 81.333 5 3 Median 1.6312 NaN NaN NaN 1.517 NaN NaN NaN 93.777 NaN NaN NaN 4 1 0 0 3 0 0 0 Median Median Median Median 20 20 14.1 14.1 292640000 116420000 176220000 176400000 65402000 111000000 106230000 41015000 65216000 0 0 0 10004000 10004000 0 5030 15848;22025 True;True 17933;24761 87423;87424;87425;87426;87427;87428;87429;87430;87431;87432;119987;119988 112477;112478;112479;112480;112481;112482;112483;112484;112485;112486;153602;153603;153604 112481;153604 AT5G20520.1 AT5G20520.1 2 2 2 AT5G20520.1 | Symbols:WAV2 | WAVY GROWTH 2 | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | Chr5:6943536-6946315 REVERSE LENGTH=308 1 2 2 2 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 7.8 7.8 7.8 34.341 308 308 2 1 1 0.0004051 3.7363 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 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| ARABIDOPSIS THALIANA GERMIN 3,germin 3,GERMIN-LIKE PROTEIN 3 | germin 3 | Chr5:6975315-6975950 REVERSE LENGTH=211 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 29.4 29.4 29.4 21.836 211 211 2.05 40 40 46 0 173.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77949 0.82171 31.761 10 0 Leave out requantified 0.59534 0.73175 1.1149 1.2542 0.56563 0.72236 1.3421 1.2801 58.946 35.051 20.126 43.407 2 2 3 3 0 0 0 0 Median Median Median Plateau 29.4 29.4 29.4 29.4 23875000000 11380000000 12495000000 4943400000 2471900000 2471500000 6101800000 3126600000 2975100000 6062000000 2841100000 3220800000 6767400000 2940200000 3827200000 5034 468;12827;14490;15205;21770 True;True;True;True;True 528;529;14486;14487;14488;14489;14490;16418;16419;17208;24482 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LENGTH=573 1 5 4 4 4 4 3 2 3 3 2 1 3 3 2 1 10.5 9.1 9.1 64.265 573 573 2.08 4 3 5 0 13.806 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91307 0.81508 49.752 5 1 Leave out requantified 0.91307 2.4999 NaN NaN 0.81508 2.0918 NaN NaN 49.752 45.115 NaN NaN 2 2 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 8 8.2 5.6 3.7 295930000 143240000 152690000 116410000 55823000 60586000 90768000 26099000 64669000 88755000 61317000 27438000 0 0 0 5049 9434;11443;24200;26402;37937 True;False;True;True;True 10690;12922;27279;30251;43193 51849;51850;51851;62447;62448;62449;62450;62451;131667;145971;145972;207061;207062;207063;207064;207065;207066 66549;66550;66551;80329;80330;80331;80332;80333;80334;168282;186019;186020;264151;264152;264153;264154;264155;264156 66549;80332;168282;186019;264154 2193 190 AT5G21105.1;AT5G21105.3;AT5G21105.2 AT5G21105.1;AT5G21105.3;AT5G21105.2 9;9;6 9;9;6 8;8;5 AT5G21105.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Plant L-ascorbate oxidase | Chr5:7172727-7177409 FORWARD 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requantified 9.3 13.2 14.6 18.5 1291200000 667970000 623260000 201600000 93512000 108080000 348090000 162370000 185720000 445600000 256770000 188830000 295940000 155320000 140620000 5052 2064;4173;5899;12407;16582;17031;33044 True;True;True;True;True;True;True 2337;4767;6692;14014;18753;19250;37629 11533;11534;11535;23332;32736;32737;32738;32739;32740;32741;32742;67822;67823;67824;67825;91534;91535;91536;91537;93966;179453;179454;179455 14962;14963;14964;14965;14966;30222;41913;41914;41915;41916;41917;41918;87245;87246;117326;117327;120510;228597;228598;228599 14962;30222;41914;87246;117326;120510;228597 AT5G21430.1;AT5G21430.2 AT5G21430.1;AT5G21430.2 7;6 7;6 7;6 AT5G21430.1 | Symbols:CRRL,NdhU | NADH dehydrogenase-like complex U,CHLORORESPIRATORY REDUCTION L | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein | Chr5:7222294-7223400 FORWARD LENGTH=218;AT5G21430.2 | Symbols:CRRL,NdhU | NADH dehydrogenase-like complex U,C 2 7 7 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 7 44.5 44.5 44.5 24.437 218 218;217 1.98 15 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| Symbols:no symbol available | no full name available | Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein | Chr5:7287878-7289357 REVERSE LENGTH=395;AT5G22020.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Calcium-dependen 3 2 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 4.6 2 2 44.527 395 395;395;395 1 1 0.0020507 2.6567 By MS/MS By matching NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 2 0 2.5 0 108150000 86747000 21403000 108150000 86747000 21403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5057 6594;14528 True;False 7511;16460 36566;80422 46865;103741 46865;103741 AT5G22060.1 AT5G22060.1 13 2 2 AT5G22060.1 | Symbols:ATJ2,J2 | DNAJ homologue 2,ARABIDOPSIS THALIANA DNAJ HOMOLOGUE 2 | DNAJ homologue 2 | Chr5:7303798-7305668 REVERSE LENGTH=419 1 13 2 2 10 9 9 10 1 0 2 2 1 0 2 2 26.3 5.3 5.3 46.438 419 419 2.43 1 2 4 0.0031296 2.486 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.57101 0.5544 62.585 6 5 Median 1.1546 NaN NaN 0.37664 1.0756 NaN NaN 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NF-kappa-B inhibitor-like protein | Ch 2 3 3 3 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 10.8 10.8 10.8 36.265 323 323;340 1.5 3 3 0 18.528 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69326 0.73385 54.007 6 3 Median NaN 0.55888 1.0282 NaN NaN 0.50621 1.2033 NaN NaN 7.1481 43.413 NaN 1 2 2 1 1 2 0 0 Median Median Median Median 5 8 7.7 2.8 378470000 201940000 176530000 49826000 29206000 20621000 109140000 70113000 39023000 151190000 79398000 71791000 68317000 23222000 45095000 5061 7608;9815;28852 True;True;True 8646;11114;32999 42264;42265;53652;53653;53654;158557 54148;68827;68828;68829;68830;201999 54148;68828;201999 AT5G22360.1 AT5G22360.1 2 2 2 AT5G22360.1 | Symbols:ATVAMP714,VAMP714 | vesicle-associated membrane protein 714 | vesicle-associated membrane protein 714 | Chr5:7404379-7405654 REVERSE LENGTH=221 1 2 2 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 10.4 10.4 10.4 25.316 221 221 1.75 2 1 1 0 5.4669 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89547 1.0141 20.106 4 1 Median NaN NaN NaN 0.7592 NaN NaN NaN 0.84079 NaN NaN NaN 22.18 0 1 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1.0024 NaN NaN NaN 0.92973 NaN NaN NaN 24.032 NaN NaN 0 2 1 0 0 2 0 0 Median Median Median Median 3.3 5.4 5.4 5.4 85753000 33666000 52087000 19007000 0 19007000 46100000 21743000 24357000 20646000 11923000 8722600 0 0 0 5089 31767;38735 True;True 36208;44082 172606;211440;211441;211442;211443 219850;269735;269736;269737;269738;269739 219850;269738 AT5G23540.1;AT5G23540.2 AT5G23540.1;AT5G23540.2 10;8 10;8 10;8 AT5G23540.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mov34/MPN/PAD-1 family protein | Chr5:7937772-7939339 FORWARD LENGTH=308;AT5G23540.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mov34/MPN/PAD-1 family protein | Chr5:793 2 10 10 10 7 7 9 6 7 7 9 6 7 7 9 6 45.1 45.1 45.1 34.353 308 308;259 2.04 16 15 18 0 84.384 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85267 0.94584 21.21 48 14 Leave out requantified 1.1533 1.412 0.52013 0.59308 1.1288 1.2942 0.61047 0.66945 17.101 9.5971 24.273 16.679 12 12 14 10 5 4 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.3 33.1 40.6 20.1 7061500000 3958100000 3103400000 1568100000 759460000 808670000 1438900000 612640000 826230000 2616700000 1684600000 932140000 1437800000 901400000 536350000 5090 1522;3649;3889;16725;20154;24504;29655;33317;37445;38064 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1733;4172;4446;18907;22706;27755;27756;33888;37957;37958;42641;43330 8706;8707;20458;20459;20460;20461;20462;20463;20464;20465;21786;21787;21788;21789;92133;92134;110897;133998;133999;134000;134001;134002;134003;134004;162615;162616;181023;181024;181025;181026;181027;181028;181029;181030;181031;181032;181033;181034;181035;181036;204437;204438;204439;204440;207668;207669;207670;207671;207672 11342;11343;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26424;26425;26426;26427;26428;26429;26430;26431;28266;28267;28268;28269;28270;28271;28272;28273;118088;142243;171188;171189;171190;171191;171192;171193;171194;171195;207174;207175;230558;230559;230560;230561;230562;230563;230564;230565;230566;230567;230568;230569;230570;230571;230572;230573;230574;230575;230576;230577;260671;260672;260673;260674;260675;264938;264939;264940;264941;264942 11343;26427;28266;118088;142243;171192;207174;230571;260671;264940 4825;4826;4827;4828;4829 50;53;56;215;247 AT5G23575.1 AT5G23575.1 4 4 4 AT5G23575.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Transmembrane CLPTM1 family protein | Chr5:7946563-7950041 FORWARD LENGTH=593 1 4 4 4 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 10.3 10.3 10.3 68.608 593 593 2 2 2 2 0 9.4211 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2374 1.0398 42.43 5 3 Median 1.3607 NaN NaN NaN 1.1982 NaN NaN NaN 20.055 NaN NaN NaN 2 1 1 1 1 1 0 1 Median Median Median Median 6.9 4.2 2.5 5.9 201790000 92988000 108800000 87995000 37812000 50183000 50766000 14784000 35982000 48105000 29691000 18414000 14927000 10701000 4225400 5091 2816;29287;36475;36476 True;True;True;True 3232;33478;41559;41560 15979;15980;160654;198820;198821;198822 20738;20739;204690;253583;253584;253585 20739;204690;253584;253585 AT5G23580.1 AT5G23580.1 4 2 2 AT5G23580.1 | Symbols:ATCDPK9,CPK12,CDPK9,ATCPK12 | calmodulin-like domain protein kinase 9,ARABIDOPSIS THALIANA CALMODULIN-LIKE DOMAIN PROTEIN KINASE 9,CALCIUM-DEPENDENT PROTEIN KINASE 12 | calmodulin-like domain protein kinase 9 | Chr5:7950388-7952433 1 4 2 2 3 2 4 3 1 1 2 1 1 1 2 1 6.9 4.1 4.1 55.379 490 490 2.5 4 4 0.0046881 2.2778 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.0867 1.0636 15.489 7 0 Median 1.464 0.98453 NaN NaN 1.3885 0.9978 NaN NaN 15.388 0 NaN NaN 3 2 1 1 0 0 0 0 Plateau Median Median Median 4.5 3.7 6.9 4.5 22534000000 11869000000 10665000000 6646200000 2658700000 3987500000 11220000000 6696600000 4523500000 4602100000 2484600000 2117500000 65485000 29419000 36067000 5092 19987;21864;22920;22921 True;True;False;False 22528;24581;25757;25758 110024;110025;110026;110027;110028;110029;110030;119258;124599;124600;124601;124602;124603;124604;124605 141167;141168;152676;159486;159487;159488;159489;159490;159491 141168;152676;159486;159491 AT5G23630.1 AT5G23630.1 11 11 11 AT5G23630.1 | Symbols:MIA,PDR2 | phosphate deficiency response 2,MALE GAMETOGENESIS IMPAIRED ANTHERS | phosphate deficiency response 2 | Chr5:7960756-7967644 REVERSE LENGTH=1179 1 11 11 11 4 5 5 4 4 5 5 4 4 5 5 4 10.3 10.3 10.3 131.11 1179 1179 1.94 8 3 7 0 22.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.59137 0.66225 46.443 12 5 Leave out requantified 1.6904 1.212 0.46925 0.67819 1.6512 1.0644 0.54086 0.76528 46.629 42.163 5.1099 20.45 3 3 4 2 1 2 1 1 Median Median Leave out requantified Median 3.6 5.1 5 3.3 457760000 238780000 218980000 97629000 41886000 55743000 114500000 44946000 69557000 168240000 102580000 65658000 77392000 49371000 28021000 5093 3927;9098;10452;13575;15166;17442;17542;22024;23475;32863;36546 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4490;10293;11814;15341;17169;19730;19840;24760;26365;37437;41648 21999;50148;57082;74673;83807;96355;96852;119986;127670;127671;178593;178594;178595;178596;199268;199269;199270;199271 28560;64431;73208;96410;108050;123619;124248;153601;163368;163369;227524;227525;227526;254149;254150;254151;254152;254153;254154;254155 28560;64431;73208;96410;108050;123619;124248;153601;163368;227524;254151 2212 4830 866 519 AT5G23680.1 AT5G23680.1 1 1 1 AT5G23680.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein | Chr5:7985573-7986460 REVERSE LENGTH=295 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 6.1 6.1 6.1 32.552 295 295 1.33 2 1 0 15.228 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0655 1.0417 29.262 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 6.1 6.1 6.1 0 79172000 34763000 44408000 19721000 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hypothetical protein | Chr5:8188622-8189087 FORWARD 2 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 42.7 42.7 42.7 7.7558 75 75;75 2.05 8 4 9 0 19.172 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9708 0.95087 91.203 19 14 Median 0.47062 1.2848 0.66936 0.8656 0.45237 1.2351 0.78599 1.0075 124.94 94.338 84.541 56.881 5 5 5 4 4 3 4 3 Median Median Median Median 41.3 41.3 41.3 42.7 3072100000 1641100000 1431000000 661990000 310180000 351810000 790100000 314890000 475210000 1005900000 650740000 355130000 614180000 365320000 248860000 5108 15984;19457;26536 True;True;True 18088;21960;30403 88253;88254;88255;88256;88257;88258;88259;88260;88261;88262;88263;88264;88265;88266;107413;146805;146806;146807;146808;146809;146810 113419;113420;113421;113422;113423;113424;113425;113426;113427;113428;113429;113430;113431;113432;113433;137708;187045;187046;187047;187048;187049;187050;187051;187052;187053;187054 113432;137708;187053 AT5G24300.2;AT5G24300.1 AT5G24300.2;AT5G24300.1 11;11 11;11 11;11 AT5G24300.2 | Symbols:SS1,ATSS1 | STARCH SYNTHASE 1,starch synthase 1 | Glycogen/starch synthases%2C ADP-glucose type | Chr5:8266934-8270860 FORWARD LENGTH=652;AT5G24300.1 | Symbols:SS1,ATSS1 | STARCH SYNTHASE 1,starch synthase 1 | Glycogen/starch synth 2 11 11 11 8 9 8 9 8 9 8 9 8 9 8 9 24.2 24.2 24.2 72.098 652 652;652 1.95 14 14 12 0 56.149 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9702 0.99457 10.302 37 17 Leave out requantified 0.96483 0.86941 0.73127 1.1025 0.90519 0.79488 0.85679 1.2825 16.545 13.254 6.8674 17.001 8 11 10 8 2 6 7 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.6 18.6 16.6 20.6 2389100000 1207700000 1181400000 517910000 233890000 284010000 600060000 313080000 286980000 699890000 402430000 297470000 571220000 258270000 312950000 5109 1055;5387;6795;10992;12457;12494;18081;30261;32547;32654;37233 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1178;6132;7746;12416;14077;14119;20463;34541;37077;37193;42411 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47169;123531;124033;170762 AT5G24490.1 AT5G24490.1 7 7 7 AT5G24490.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 30S ribosomal protein | Chr5:8365690-8367178 FORWARD LENGTH=308 1 7 7 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 7 17.2 17.2 17.2 34.856 308 308 1.92 22 20 17 0 27.066 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.304 1.492 21.16 39 19 Leave out requantified 0.50301 0.61745 1.6961 1.3541 0.46396 0.56217 2.0639 1.5746 73.358 13.962 22.595 20.834 7 10 10 12 4 6 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.2 17.2 15.3 17.2 12803000000 6383300000 6419200000 986570000 648640000 337930000 3337000000 2172300000 1164700000 4911900000 2020500000 2891300000 3567100000 1541900000 2025200000 5114 940;4235;8279;18859;25713;25714;35118 True;True;True;True;True;True;True 1050;4832;9378;21316;29393;29394;39993;39994 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Symbols:AtDMR6,DMR6 | DOWNY MILDEW RESISTANT 6 | 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr5:8378964-8383154 FORWARD LENGTH=341 1 3 3 3 0 1 2 2 0 1 2 2 0 1 2 2 9.4 9.4 9.4 39.363 341 341 1.83 1 5 0 10.572 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.20493 0.23832 166.15 6 5 Median NaN NaN 0.27127 0.098279 NaN NaN 0.31307 0.10244 NaN NaN 40.377 35.932 0 1 3 2 0 1 2 2 Median Median Median Median 0 2.6 5.3 6.7 186990000 121160000 65832000 0 0 0 40331000 3331400 37000000 99051000 73091000 25960000 47610000 44737000 2872700 5115 3941;5201;25693 True;True;True 4506;5926;29371 22070;22071;22072;22073;28833;141975 28646;28647;28648;28649;37089;181161 28648;37089;181161 AT5G24580.5;AT5G24580.3;AT5G24580.2;AT5G24580.4;AT5G24580.1 AT5G24580.5;AT5G24580.3;AT5G24580.2;AT5G24580.4;AT5G24580.1 1;1;1;1;1 1;1;1;1;1 1;1;1;1;1 AT5G24580.5 | Symbols:no symbol available | no full name available | Heavy metal transport/detoxification superfamily protein | Chr5:8410394-8411527 REVERSE 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protein 2 | vegetative storage protein 2 | Chr5:8500977-8501844 REVERSE LENGTH=208;AT5G24770.1 | Symbols:ATVSP2,VSP2 | vegetative storage protein 2 | vegetative storage protein 2 | Chr5:8500713-850 2 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 5.3 5.3 5.3 23.441 208 208;265 3 1 0.0048587 2.2633 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 5.3 96242000 50868000 45374000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96242000 50868000 45374000 5120 7230 True 8220 40299 51497 51497 AT5G24840.1 AT5G24840.1 1 1 1 AT5G24840.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | tRNA (guanine-N-7) methyltransferase | Chr5:8533897-8534652 REVERSE LENGTH=251 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 5.6 5.6 5.6 28.818 251 251 1 3 0.0060703 2.2025 By MS/MS By MS/MS 1.6581 1.5288 3.0446 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 5.6 5.6 0 0 84576000 29746000 54829000 47413000 17648000 29765000 37163000 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Endomembrane protein 70 protein family | Chr5:8648374-8651015 REVERSE LENGTH=651 2 13 13 6 10 12 10 12 10 12 10 12 4 6 5 6 21.7 21.7 12.1 74.119 644 644;651 2 20 18 20 0 98.682 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96409 0.9858 20.67 50 18 Leave out requantified 1.3523 0.9692 0.66902 0.87094 1.2808 0.88582 0.81104 0.97407 31.946 20.364 30.121 22.38 11 16 10 13 4 8 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.3 21.3 19.1 20.5 3426700000 1828600000 1598100000 794850000 349610000 445230000 940620000 506430000 434190000 792940000 493640000 299300000 898270000 478900000 419370000 5125 7520;12821;15705;16484;16636;18273;19166;19519;23355;23553;23766;36516;39044 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 8553;14480;17775;18640;18812;20668;21644;22028;26234;26453;26690;41607;41608;44430 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Symbols:CIPK25,SnRK3.25 | CBL-interacting protein kinase 25,SNF1-RELATED PROTEIN KINASE 3.25 | CBL-interacting protein kinase 25 | Chr5:8657740-8659206 REVERSE LENGTH=488 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.6 1.6 1.6 55.562 488 488 2.11 3 2 4 0.0086207 2.0612 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2603 1.4247 24.415 9 1 Median 1.6185 1.0028 1.2555 1.3749 1.6175 0.96112 1.4671 1.4723 19.552 29.184 4.1479 16.026 3 2 2 2 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.6 1.6 1.6 1.6 3858700000 1799200000 2059500000 770800000 327930000 442870000 969540000 552690000 416860000 1198400000 582460000 615950000 919940000 336080000 583860000 5126 22288 True 25044 121238;121239;121240;121241;121242;121243;121244;121245;121246 155219;155220;155221;155222;155223;155224;155225;155226;155227;155228;155229;155230;155231 155221 AT5G25120.1;AT5G25180.1 AT5G25120.1 5;1 4;0 3;0 AT5G25120.1 | Symbols:CYP71B11 | ytochrome p450, family 71, subfamily B, polypeptide 11 | cytochrome p450%2C family 71%2C subfamily B%2C 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 10.8 11.8 11 8.9 73456000 32046000 41410000 0 0 0 73456000 32046000 41410000 0 0 0 0 0 0 + 5129 4245;14222;14732;16279;19768;23300;28795;29737;31431;31946;31949;36082 False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False 4843;16094;16095;16684;18416;22295;26169;32941;33974;35840;36403;36406;41090;41091 23646;78630;78631;78632;78633;78634;78635;78636;81397;81398;81399;81400;89946;89947;89948;89949;108952;108953;108954;126561;158318;158319;158320;158321;158322;162969;162970;162971;171010;171011;171012;173579;173580;173581;173582;173583;173598;173599;196759;196760;196761;196762;196763;196764;196765;196766;196767 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(Protein of unknown function%2C DUF642) | Chr5:8863430-8865394 FORWARD LENGTH=369 1 13 13 7 8 12 11 13 8 12 11 13 3 6 5 7 37.4 37.4 19 39.978 369 369 1.98 31 31 29 0 185.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1649 1.1399 34.651 71 20 Leave out requantified 0.87527 0.48756 1.4952 1.9416 0.84952 0.47833 1.6466 2.2102 16.915 34.304 50.237 29.977 18 18 16 19 4 5 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.2 37.4 34.4 37.4 34496000000 16861000000 17635000000 5304800000 2749300000 2555500000 8660300000 5851700000 2808600000 11259000000 5375000000 5884400000 9271600000 2885300000 6386300000 5133 1677;5332;5333;9729;12127;14242;14790;14924;21223;27121;28634;34406;39392 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1908;6071;6072;11016;13702;16126;16745;16746;16895;23885;31046;31047;32765;39206;44829 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Median Median 0 6.1 0 2.9 205320000 126730000 78595000 0 0 0 135170000 79735000 55433000 0 0 0 70156000 46994000 23162000 5167 31249;31440 True;True 35640;35849 170035;171042;171043 216516;217825;217826;217827 216516;217827 AT5G27470.1 AT5G27470.1 21 21 21 AT5G27470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | seryl-tRNA synthetase / serine-tRNA ligase | Chr5:9695087-9697154 FORWARD LENGTH=451 1 21 21 21 17 18 17 17 17 18 17 17 17 18 17 17 51.4 51.4 51.4 51.628 451 451 2.13 29 34 43 0 250.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96202 1.0072 17.002 96 19 Leave out requantified 0.98511 1.0314 0.94381 0.86553 0.93597 0.98609 1.1878 1.0015 30.146 25.994 18.082 33.959 25 23 24 24 7 4 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.2 45.7 39.7 40.8 16372000000 8144500000 8227700000 3449300000 1745600000 1703700000 3043700000 1489500000 1554200000 5000800000 2489800000 2511000000 4878300000 2419600000 2458700000 5168 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Ribosomal protein S21e | Chr5:9807541-9808048 REVERSE LENGTH=82 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 31.7 31.7 18.3 9.1131 82 82 1.79 7 3 4 0 99.766 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0804 1.1838 13.147 5 1 Median NaN 1.1804 NaN NaN NaN 1.0711 NaN NaN NaN 23.904 NaN NaN 1 2 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 31.7 31.7 31.7 31.7 2134300000 1035700000 1098600000 451950000 222850000 229110000 630350000 312430000 317930000 506440000 259510000 246930000 545550000 240930000 304620000 5175 2912;24636 True;True 3344;27960;27961 16516;16517;16518;16519;16520;135077;135078;135079;135080;135081;135082;135083;135084;135085 21434;21435;21436;21437;21438;21439;172510;172511;172512;172513;172514;172515;172516;172517;172518 21436;172511 4899 1 AT5G27720.1 AT5G27720.1 3 3 3 AT5G27720.1 | Symbols:LSM4,emb1644 | SM-like protein 4,embryo defective 1644 | Small nuclear ribonucleoprotein family protein | Chr5:9815904-9817304 FORWARD LENGTH=129 1 3 3 3 1 2 3 1 1 2 3 1 1 2 3 1 21.7 21.7 21.7 14.323 129 129 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Median 23.2 13.5 23.2 7.6 583280000 259260000 324020000 148800000 82109000 66694000 197150000 82670000 114480000 162600000 57414000 105180000 74727000 37066000 37661000 5183 11626;18618;39300 True;True;True 13123;21055;44722 63503;63504;63505;63506;102968;102969;214618;214619;214620;214621;214622;214623;214624 81692;81693;81694;81695;131955;131956;273838;273839;273840;273841;273842;273843 81692;131956;273841 2239 166 AT5G28060.1 AT5G28060.1 5 5 3 AT5G28060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S24e family protein | Chr5:10069791-10070792 REVERSE LENGTH=133 1 5 5 3 4 3 3 4 4 3 3 4 2 2 2 3 35.3 35.3 21.8 15.419 133 133 2.06 10 12 12 0 128.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0365 1.0446 11.859 17 3 Leave out requantified 1.1948 1.09 0.77796 0.98919 1.1357 0.99458 0.90836 1.0961 6.1319 15.208 31.967 19.88 5 4 4 4 0 1 1 1 Leave out requantified Median Median Median 31.6 26.3 26.3 30.1 4592800000 2210700000 2382200000 1433200000 609510000 823650000 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protein | Chr5:10477810-10479114 FORWARD LENGTH=434 2 7 7 7 5 4 6 4 5 4 6 4 5 4 6 4 23 23 23 48.236 434 434;269 2.34 7 9 19 0 79.772 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81867 0.80078 16.186 34 9 Leave out requantified 0.83487 0.95655 0.54667 1.0234 0.78159 0.87811 0.65335 1.1935 48.119 11.007 11.751 16.203 10 7 8 9 3 0 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.5 11.8 17.3 11.8 4633500000 2754400000 1879100000 1094200000 630590000 463600000 1112200000 552580000 559640000 1742200000 1193400000 548800000 684920000 377830000 307090000 5185 11144;21907;22133;33913;34416;35877;38123 True;True;True;True;True;True;True 12586;24625;24626;24879;38644;39218;40868;43395 60913;119456;119457;120560;184316;184317;184318;184319;184320;184321;184322;184323;184324;184325;184326;187304;187305;187306;187307;187308;187309;187310;195692;195693;195694;195695;195696;195697;195698;195699;207924;207925;207926;207927;207928 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AT5G33320.1 | Symbols:NOX1,ARAPPT,CUE1,PPT | PHOSPHOENOLPYRUVATE/PHOSPHATE TRANSLOCATOR,Nitrous Oxide Overexpressor 1,CAB UNDEREXPRESSED 1,ARABIDOPSIS THALIANA PHOSPHATE/PHOSPHOENOLPYRUVATE TRANSLOCATOR | Glucose-6-phosphate/phosphate translocator-like pr 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5.9 5.9 5.9 44.224 408 408 2 6 13 6 0 17.001 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0555 1.1494 30.982 22 7 Leave out requantified 1.4232 1.0274 0.88353 0.79871 1.3625 0.96542 1.0448 0.91676 38.983 36.583 11.201 31.737 4 6 6 6 0 2 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 5.9 5.9 5.9 5.9 3604600000 1827700000 1776900000 717000000 323160000 393840000 976640000 475960000 500680000 882610000 481230000 401390000 1028400000 547320000 481030000 5195 12077;37040 True;True 13646;42199 65940;65941;65942;65943;65944;65945;65946;65947;65948;65949;65950;65951;65952;65953;65954;65955;65956;65957;65958;65959;201969;201970;201971;201972;201973 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| Symbols:no symbol available | no full name available | ENHANCED DISEASE RESISTANCE protein (DUF1336) | Chr5:13424538-13432699 FORWARD LENGTH=778;AT5G35180.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ENHANCED DISEASE RESISTAN 5 6 6 6 3 3 5 4 3 3 5 4 3 3 5 4 10.8 10.8 10.8 86.998 778 778;778;782;811;593 2.19 3 7 6 0 16.102 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97417 0.96423 15.409 13 5 Leave out requantified 1.2627 0.96267 0.78633 1.2913 1.1558 0.85068 0.96865 1.4425 24.688 1.4922 44.727 51.69 3 3 4 3 1 1 2 1 Median Plateau Median Median 4.4 5 9.6 5.5 657090000 306450000 350640000 106730000 40738000 65990000 135750000 71463000 64287000 245700000 124720000 120980000 168910000 69523000 99384000 5201 2774;12133;15181;18981;38093;38469 True;True;True;True;True;True 3182;13709;17184;21447;43361;43789 15800;66232;66233;66234;83866;83867;105064;105065;105066;105067;207785;209995;209996;209997;209998;209999 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Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr5:14481229-14483730 REVERSE LENGTH=362;AT5G36790.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid 7 19 19 18 17 18 17 15 17 18 17 15 16 17 16 14 56.4 56.4 53 39.761 362 362;362;362;362;362;362;332 2.12 40 57 59 0 304.84 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83783 0.8287 22.068 127 37 Leave out requantified 0.92772 1.4067 0.5372 0.70151 0.88867 1.332 0.6278 0.76515 21.391 26.575 20.001 33.178 34 31 35 27 11 8 11 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56.4 50.8 50.8 50.8 57171000000 32340000000 24830000000 12747000000 6648500000 6098600000 10812000000 4510200000 6302200000 22901000000 15000000000 7901000000 10710000000 6181900000 4528400000 5223 4776;8997;8998;9499;9567;9568;12758;17851;17889;17924;19887;20579;21470;23528;26672;30634;30635;33108;37808 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available | no full name available | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein | Chr5:14817035-14818330 REVERSE LENGTH=431;AT5G37380.8 | Symbols:no symbol available | no full name available | Chaperone DnaJ-domain superfa 9 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 2.1 2.1 2.1 48.253 431 431;431;431;431;431;431;431;431;431 2.2 1 2 2 0.003117 2.4578 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.14597 0.1772 269.01 5 5 Median NaN NaN 0.082217 0.05142 NaN NaN 0.098435 0.058283 NaN NaN 139.87 157.25 1 0 2 2 1 0 2 2 Median Median Median Median 2.1 0 2.1 2.1 4973000000 3854000000 1119000000 929160000 52236000 876930000 0 0 0 2613000000 2465600000 147330000 1430900000 1336100000 94784000 5227 29601 True 33827 162263;162264;162265;162266;162267 206724;206725;206726;206727;206728;206729 206725 AT5G37475.3;AT5G37475.2;AT5G37475.1 AT5G37475.3;AT5G37475.2;AT5G37475.1 6;6;6 6;6;6 6;6;6 AT5G37475.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Translation initiation factor eIF3 subunit | Chr5:14866328-14867749 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Symbols:no symbol available | no full name available | HXXXD-type acyl-transferase family protein | Chr5:15641681-15643072 FORWARD LENGTH=463 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 4.3 4.3 4.3 51.484 463 463 1.57 14 5 4 0.00021066 4.3522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0608 1.047 87.746 19 4 Median 1.2113 0.79484 1.7484 0.82007 1.0798 0.78619 1.7695 0.7735 94.752 81.591 109.83 61.394 6 5 4 4 1 1 0 2 Median Median Median Median 2.8 2.8 2.8 4.3 141530000 67175000 74351000 47586000 21639000 25948000 29716000 15746000 13970000 28832000 11133000 17699000 35392000 18658000 16734000 5250 10413;39339 True;True 11771;44772 56857;56858;56859;56860;56861;56862;56863;56864;56865;56866;56867;56868;56869;56870;56871;56872;56873;56874;56875;56876;56877;56878;214904 72924;72925;72926;72927;72928;72929;72930;72931;72932;72933;72934;72935;72936;72937;72938;72939;72940;274270 72938;274270 AT5G39110.1 AT5G39110.1 2 1 1 AT5G39110.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RmlC-like cupins 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3 | Chr5:15748941-15750248 FORWARD LENGTH=155 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 6.5 6.5 6.5 17.479 155 155 2 1 0 5.5354 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 6.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5254 24132 True 27171 131319 167911 167911 AT5G39410.1 AT5G39410.1 11 11 11 AT5G39410.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Saccharopine dehydrogenase | Chr5:15768415-15770274 REVERSE LENGTH=454 1 11 11 11 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 34.6 34.6 34.6 49.68 454 454 2.16 13 16 21 0 95.627 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98548 1.0303 10.707 44 18 Leave out requantified 1.1234 1.1405 0.7521 0.76941 1.0844 1.1201 0.90778 0.89666 12.503 12.289 16.497 18.472 11 10 13 10 3 4 7 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.1 27.3 29.7 27.3 4112500000 2081000000 2031500000 1024900000 421810000 603130000 682980000 295420000 387560000 1270900000 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TRANSPORT V-SNARE 11,SHOOT GRAVITROPSIM 4,IMPAIRED TONOPLAST TRAFFIC 3 | Vesicle transport v-SNARE family protein | Chr5:15822035-15823591 FORWARD LENGTH=221 3 7 7 6 3 6 5 6 3 6 5 6 3 6 4 5 34.4 34.4 31.2 24.951 221 221;195;221 1.93 10 10 8 0 28.492 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92775 0.98036 22.796 20 11 Leave out requantified 0.88276 1.1012 1.0751 0.93077 0.83667 1.0299 1.221 1.0964 30.285 15.241 38.316 48.806 5 5 5 5 3 2 2 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 15.4 31.2 23.5 29 1652600000 714940000 937670000 291210000 127920000 163280000 393430000 158000000 235430000 540000000 260230000 279770000 427970000 168790000 259190000 5257 1559;4457;5009;19402;28050;28797;29370 True;True;True;True;True;True;True 1772;5097;5708;21894;32086;32943;33575 8877;8878;8879;8880;8881;24877;24878;27735;27736;107076;107077;154223;154224;154225;154226;154227;154228;154229;154230;154231;158331;158332;158333;161144;161145;161146;161147;161148 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protein | Chr5:15851483-15853768 FORWARD LENGTH=542 1 8 8 8 8 7 8 7 8 7 8 7 8 7 8 7 19.6 19.6 19.6 59.908 542 542 1.91 15 20 11 0 111.71 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85998 0.85467 35.967 42 23 Leave out requantified 0.80645 0.6743 1.7988 1.5078 0.70803 0.62835 1.9762 1.6407 13.892 19.106 34.409 22.128 10 9 12 11 5 2 9 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.6 17.7 19.6 17.5 2938600000 1287800000 1650800000 510510000 272440000 238070000 544780000 286800000 257970000 1036900000 399940000 637000000 846390000 328640000 517740000 5259 8591;20690;22758;23470;27710;31126;32456;33670 True;True;True;True;True;True;True;True 9736;23293;25590;26357;31713;35506;36973;38365 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 8.7 0 0 22851000 11004000 11847000 0 0 0 22851000 11004000 11847000 0 0 0 0 0 0 5260 9839 True 11140 53725 68912 68912 AT5G39730.1 AT5G39730.1 3 3 3 AT5G39730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | AIG2-like (avirulence induced gene) family protein | Chr5:15901740-15902624 FORWARD LENGTH=172 1 3 3 3 1 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 2 20.9 20.9 20.9 20.017 172 172 2.11 2 4 3 0 5.722 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66719 0.77358 4.899 9 3 Leave out requantified NaN 1.2733 0.68995 0.48632 NaN 1.1621 0.80015 0.55223 NaN 16.307 6.8852 39.688 1 2 4 2 0 1 1 1 Median Median Median Median 11.6 15.7 20.9 15.7 751030000 428400000 322630000 29305000 17278000 12027000 165810000 72841000 92966000 385110000 226860000 158250000 170800000 111420000 59382000 5261 14644;35174;35318 True;True;True 16586;40059;40231 80988;80989;80990;80991;80992;191493;192411;192412;192413 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LENGTH=427;AT5G41170.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopepti 3 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 6.3 6.3 6.3 48.226 427 427;497;527 2.25 1 4 3 0.0020561 2.6821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64581 0.73016 14.856 8 0 Leave out requantified 1.2079 NaN 0.70541 0.77343 1.141 NaN 0.79751 0.81104 9.0537 NaN 11.159 0 2 1 3 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.1 2.1 6.3 2.1 2834100000 1605400000 1228700000 351990000 160810000 191180000 370040000 200840000 169210000 1360400000 803170000 557280000 751610000 440550000 311060000 5291 2297;26670 True;True 2584;30560 12722;12723;12724;12725;12726;12727;12728;147553 16480;16481;16482;16483;188047 16481;188047 4983;4984 346;351 AT5G41190.1 AT5G41190.1 2 2 2 AT5G41190.1 | Symbols:NOB1,AtNOB1 | | RNA-binding NOB1-like protein | Chr5:16487628-16490012 REVERSE LENGTH=602 1 2 2 2 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 3.5 3.5 3.5 66.724 602 602 1.5 1 1 0.0022338 2.6312 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 1.2 2.3 0 56445000 33212000 23233000 0 0 0 0 0 0 56445000 33212000 23233000 0 0 0 5292 3408;7773 True;True 3891;8827 18991;43003 24500;55097 24500;55097 AT5G41210.1;AT5G41220.1;AT5G41220.3;AT5G41220.2;AT5G41240.1 AT5G41210.1 8;2;1;1;1 8;2;1;1;1 8;2;1;1;1 AT5G41210.1 | Symbols:ATGSTT1,GST10,GSTT1 | glutathione S-transferase THETA 1 | glutathione S-transferase THETA 1 | Chr5:16492550-16493884 REVERSE LENGTH=245 5 8 8 8 8 7 5 7 8 7 5 7 8 7 5 7 31.4 31.4 31.4 27.653 245 245;590;532;540;591 1.94 13 9 11 0 44.204 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8783 1.0126 29.872 32 8 Leave out requantified 1.2362 1.4086 0.63058 0.58088 1.0945 1.3625 0.75031 0.65829 39.44 17.486 32.852 29.262 9 9 6 8 3 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.4 25.3 21.6 25.3 3639200000 1775000000 1864200000 879670000 355790000 523890000 934120000 384760000 549360000 862290000 449880000 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17712;17713;17714;17715;17716;17717;17718;17719;17720;17721;31209;153679;153680;153681;153682;153683;153684;166849;166850;166851;166852;175982;175983;175984;175985;190279;190280;190281;190282;190283;190284;190285;190286;201236;201237;201238;210455;210456;211485;211486;219686;250880;250881;250882;250883;250884 17713;31209;153680;166851;175982;190281;201238;210456;211485;219686;250881 4985;4986 115;310 AT5G41480.1 AT5G41480.1 3 3 3 AT5G41480.1 | Symbols:EMB9,ATDFA,DFA,GLA1 | GLOBULAR ARREST1,EMBRYO DEFECTIVE 9,DHFS-FPGS HOMOLOG A,A. THALIANA DHFS-FPGS HOMOLOG A | Folylpolyglutamate synthetase family protein | Chr5:16595967-16598523 FORWARD LENGTH=530 1 3 3 3 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 6.4 6.4 6.4 56.903 530 530 2.57 3 4 0 7.6343 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73494 0.82592 51.447 4 4 Median NaN NaN NaN 0.92701 NaN NaN NaN 0.97421 NaN NaN NaN 21.218 1 0 1 2 1 0 1 2 Median Median Median Median 1.9 1.9 3.8 4.5 123790000 74224000 49562000 21785000 17421000 4363600 0 0 0 70457000 38578000 31879000 31544000 18225000 13319000 5295 5207;12475;17906 True;True;True 5933;14098;20268 28862;28863;28864;68223;68224;98888;98889 37124;37125;37126;87722;87723;126765;126766 37124;87723;126766 2288 31 AT5G41520.1;AT5G41520.2 AT5G41520.1 7;3 7;3 7;3 AT5G41520.1 | Symbols:RPS10B | ribosomal protein S10e B | RNA binding Plectin/S10 domain-containing protein | Chr5:16609377-16610583 REVERSE LENGTH=180 2 7 7 7 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 35.6 35.6 35.6 19.733 180 180;134 2.07 21 24 26 0 59.819 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87506 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alpha subunit F1 | Chr5:17159270-17160975 REVERSE LENGTH=278 1 18 18 7 12 15 14 12 12 15 14 12 5 5 5 4 75.2 75.2 33.8 30.476 278 278 2 30 33 30 0 170.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98381 0.99471 16.303 86 20 Leave out requantified 1.105 1.4089 0.57374 0.72636 1.0644 1.3347 0.72205 0.7838 18.622 23.831 20.68 19.212 20 22 24 20 4 4 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.7 64.4 66.5 49.6 22657000000 11869000000 10789000000 2456400000 1196200000 1260100000 3706600000 1562300000 2144300000 13434000000 7343900000 6090000000 3060500000 1766300000 1294200000 5326 2987;3002;4640;10037;11006;11007;13300;21001;23752;26181;27188;29005;29530;30898;34822;35641;35642;36597 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3427;3442;5300;11354;12430;12431;15013;15014;23633;23634;26676;29978;31122;33170;33750;35259;39665;40597;40598;41706 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Symbols:TT3,M318,DFR | dihydroflavonol 4-reductase | dihydroflavonol 4-reductase | Chr5:17164296-17165864 REVERSE LENGTH=382 1 5 5 5 0 3 2 3 0 3 2 3 0 3 2 3 17 17 17 42.774 382 382 2 4 1 4 0 17.354 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7809 1.5824 60.556 5 4 Median NaN 5.2332 NaN NaN NaN 4.7525 NaN NaN NaN 59.198 NaN NaN 0 3 1 1 0 2 1 1 Median Plateau Median Median 0 11 6 10.7 317920000 177570000 140350000 0 0 0 110170000 31969000 78202000 59425000 39515000 19910000 148320000 106080000 42240000 5327 13123;32320;33106;38716;39091 True;True;True;True;True 14819;36821;37695;44061;44489 71488;71489;175442;179801;179802;211329;213440;213441;213442 91843;91844;223425;229056;229057;269610;272284;272285;272286 91844;223425;229057;269610;272284 AT5G42820.2;AT5G42820.1 AT5G42820.2;AT5G42820.1 4;4 4;4 2;2 AT5G42820.2 | Symbols:ATU2AF35B,U2AF35B | | Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein | Chr5:17170445-17171296 REVERSE LENGTH=283;AT5G42820.1 | Symbols:ATU2AF35B,U2AF35B | | Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein | Chr5:17170445-1717 2 4 4 2 1 2 3 3 1 2 3 3 0 0 1 1 16.3 16.3 8.5 33.232 283 283;283 2.45 2 2 7 0 8.8351 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79644 0.88891 21.792 9 4 Leave out requantified NaN 1.0492 0.59913 1.4109 NaN 0.94803 0.76197 1.6328 NaN 17.291 89.557 32.157 1 2 3 3 0 1 1 2 Median Median Median Plateau 3.5 7.8 13.1 11 681000000 282820000 398190000 18324000 7123500 11201000 151150000 70366000 80785000 297070000 99551000 197520000 214460000 105780000 108680000 5328 920;7827;13458;28059 True;True;True;True 1030;8885;15201;32095 5167;5168;5169;43249;43250;73607;73608;73609;73610;154273;154274 6767;6768;6769;55403;55404;94809;94810;94811;196591;196592 6769;55404;94811;196591 AT5G42830.1 AT5G42830.1 3 3 3 AT5G42830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | HXXXD-type acyl-transferase family protein | Chr5:17176384-17177906 FORWARD LENGTH=450 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.4 10.4 10.4 50.523 450 450 1.75 2 1 1 0 8.2431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78045 0.81304 269.66 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 4.9 3.3 3.3 2.2 104060000 82249000 21808000 6195000 0 6195000 13592000 1923700 11668000 29711000 29711000 0 54559000 50614000 3944600 5329 1319;23118;38769 True;True;True 1489;25973;44117 7419;7420;125684;211597 9675;9676;160868;269925 9675;160868;269925 AT5G42850.2;AT5G42850.1 AT5G42850.2;AT5G42850.1 3;3 3;3 3;3 AT5G42850.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Thioredoxin superfamily protein | Chr5:17182072-17182568 REVERSE LENGTH=134;AT5G42850.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Thioredoxin superfamily protein | Chr5 2 3 3 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 20.1 20.1 20.1 15.206 134 134;134 2 3 2 3 0 10.803 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66614 0.68077 18.174 8 4 Leave out requantified 0.69688 NaN 0.73147 0.31572 0.65893 NaN 0.84135 0.358 13.562 NaN 11.776 17.761 2 1 2 3 1 0 1 2 Median Median Median Median 20.1 12.7 20.1 12.7 868460000 556450000 312000000 222990000 133430000 89554000 97681000 40527000 57154000 275330000 164170000 111150000 272460000 218320000 54141000 5330 19765;32993;34805 True;True;True 22292;37575;39648 108940;108941;108942;108943;108944;179221;179222;189557 139712;139713;139714;139715;139716;139717;139718;228306;228307;241653 139714;228307;241653 AT5G42890.1 AT5G42890.1 4 4 4 AT5G42890.1 | Symbols:SCP2,ATSCP2 | STEROL CARRIER PROTEIN 2,sterol carrier protein 2 | sterol carrier protein 2 | Chr5:17194458-17195910 REVERSE LENGTH=123 1 4 4 4 2 4 2 2 2 4 2 2 2 4 2 2 27.6 27.6 27.6 13.568 123 123 1.91 4 4 3 0 5.4532 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1432 1.0164 55.21 9 8 Median 1.1568 1.2973 0.39573 0.55911 1.0492 1.8563 0.42984 0.60628 4.4904 25.508 50.29 27.989 2 3 2 2 2 2 2 2 Median Plateau Median Median 13.8 27.6 14.6 13.8 273870000 145000000 128870000 47232000 25071000 22161000 114500000 47853000 66645000 36265000 26403000 9862100 75876000 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SIGNALOSOME SUBUNIT 4,FUSCA 4,EMBRYO DEFECTIVE 134,CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 8,FUSCA 8 | Proteasome component (PCI) domain protein | Chr5:17237470-172 1 3 3 3 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 8.8 8.8 8.8 44.957 397 397 2.4 1 1 3 0 7.7606 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.52527 0.632 84.897 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 3 2.5 5.8 2.5 319580000 229920000 89660000 143510000 128220000 15288000 59396000 20367000 39029000 79115000 56549000 22567000 37557000 24781000 12776000 5335 10796;37574;39534 True;True;True 12195;42790;44990 59007;205161;215940;215941;215942 75781;261624;275597;275598 75781;261624;275598 AT5G42980.1 AT5G42980.1 10 10 10 AT5G42980.1 | Symbols:ATH3,TRX3,TRXH3,ATTRX3,ATTRXH3 | THIOREDOXIN H3,thioredoxin 3,thioredoxin H-type 3 | thioredoxin 3 | Chr5:17242772-17243718 FORWARD LENGTH=118 1 10 10 10 9 10 10 10 9 10 10 10 9 10 10 10 72 72 72 13.109 118 118 1.97 37 39 34 0 144.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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LENGTH=178;AT5G43430.3 | Symbols:ETFBETA | electron transfer flavoprotein beta | electron transfer flavoprotein be 4 3 3 3 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 27.5 27.5 27.5 19.134 178 178;219;251;282 2.38 1 3 4 0 19.319 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.39827 0.48853 40.44 8 4 Leave out requantified 1.436 NaN 0.51684 NaN 1.3084 NaN 0.58563 NaN 21.244 NaN 25.59 NaN 2 1 4 1 1 1 2 0 Median Median Median Median 8.4 8.4 27.5 8.4 422170000 261350000 160820000 60378000 23937000 36441000 54138000 22705000 31433000 265700000 189720000 75987000 41953000 24996000 16957000 5345 10294;13609;29834 True;True;True 11643;15377;34077 56243;74833;163482;163483;163484;163485;163486;163487 72107;96613;208318;208319;208320;208321;208322;208323 72107;96613;208322 AT5G43440.1;AT5G43440.2 AT5G43440.1;AT5G43440.2 4;2 3;1 3;1 AT5G43440.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr5:17455356-17456608 REVERSE LENGTH=365;AT5G43440.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 4 3 3 1 2 4 2 1 2 3 2 1 2 3 2 17 14.2 14.2 40.859 365 365;290 2 2 4 2 0 22.412 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78022 0.88894 55.877 7 3 Median NaN NaN 0.37083 0.58238 NaN NaN 0.40933 0.6717 NaN NaN 64.414 39.63 1 1 3 2 0 0 2 1 Median Median Median Median 6.3 11.5 17 9 399520000 198870000 200650000 42924000 19609000 23315000 45939000 18389000 27550000 173520000 84988000 88529000 137140000 75881000 61260000 5346 5644;6498;9157;11266 True;True;True;False 6407;7397;10361;12724 31268;31269;35989;35990;35991;35992;50448;50449;61488 40128;40129;46083;46084;46085;46086;46087;46088;46089;64812;64813;79077 40128;46087;64813;79077 AT5G43450.2;AT5G43450.1 AT5G43450.2;AT5G43450.1 3;3 3;3 3;3 AT5G43450.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr5:17457623-17458714 REVERSE LENGTH=287;AT5G43450.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2 3 3 3 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 14.6 14.6 14.6 32.277 287 287;362 2.71 2 5 0 6.4058 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0904 1.0049 123.1 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 7 7 3.8 7.7 195640000 108680000 86956000 64219000 33372000 30847000 60607000 16232000 44374000 63358000 51623000 11735000 7452400 7452400 0 5347 6497;11268;26183 True;True;True 7396;12726;29980 35988;61497;61498;144788;144789;144790;144791 46082;79087;79088;184611;184612;184613;184614;184615 46082;79087;184614 AT5G43470.4;AT5G43470.3;AT5G43470.2;AT5G43470.1;AT5G35450.2;AT5G35450.1;AT1G10920.5;AT1G10920.3;AT1G10920.4;AT1G10920.2;AT1G10920.1;AT1G59620.2;AT1G59620.1 AT5G43470.4;AT5G43470.3;AT5G43470.2;AT5G43470.1 23;23;23;23;2;2;1;1;1;1;1;1;1 23;23;23;23;2;2;1;1;1;1;1;1;1 11;11;11;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0 AT5G43470.4 | Symbols:HRT,RPP8,RCY1 | RECOGNITION OF PERONOSPORA PARASITICA 8,RESISTANT TO CMV(Y) 1,HYPERSENSITIVE RESPONSE TO TCV | Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family | Chr5:17463130-17466658 REVERSE LENGTH=908;AT5G43470.3 | Symbols:H 13 23 23 11 16 18 11 12 16 18 11 12 8 8 4 4 29.2 29.2 16.6 104.68 908 908;908;908;908;901;901;557;557;727;727;727;740;895 2.12 20 20 28 0 84.902 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87782 0.92861 19.99 53 18 Leave out requantified 1.2303 1.5971 0.70393 0.60126 1.2137 1.4956 0.81547 0.69187 17.076 15.387 20.819 20.365 14 16 12 11 5 8 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.9 24.6 14.5 16.9 5335100000 2754700000 2580400000 985940000 459570000 526370000 1462700000 579190000 883530000 1322800000 827750000 495060000 1563600000 888150000 675470000 5348 785;4384;9200;9411;16038;17438;17460;18840;20463;22709;23639;23797;25187;25875;27886;30133;33201;34650;34651;35210;35981;36754;38960 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 879;4999;10411;10661;10662;18153;19725;19726;19750;21297;23046;25538;26550;26726;28741;29577;31899;34399;37805;39479;39480;40098;40981;41885;44330 4495;4496;24267;24268;50650;51715;51716;51717;51718;51719;88561;88562;88563;88564;88565;88566;96349;96350;96351;96427;96428;96429;104293;104294;112458;123724;123725;123726;123727;123728;128603;128604;128605;128606;129423;129424;129425;129426;138929;138930;138931;138932;138933;138934;138935;138936;142888;153370;153371;153372;164796;164797;164798;164799;180302;188812;188813;188814;188815;188816;191674;196248;196249;200458;200459;200460;200461;212664 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AT5G43600.1 6 6 6 AT5G43600.1 | Symbols:UAH,ATAAH-2 | ureidoglycolate amidohydrolase,ARABIDOPSIS THALIANA ALLANTOATE AMIDOHYDROLASE 2 | ureidoglycolate amidohydrolase | Chr5:17512651-17515280 FORWARD LENGTH=476 1 6 6 6 3 4 4 2 3 4 4 2 3 4 4 2 18.1 18.1 18.1 51.486 476 476 2.14 3 6 5 0 33.297 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.59665 0.53714 53.622 13 8 Leave out requantified 0.73023 1.6267 0.31456 NaN 0.67699 1.4947 0.4056 NaN 57.741 71.53 41.516 NaN 3 4 5 1 2 2 3 1 Median Median Median Median 11.6 11.3 11.1 4 662110000 426040000 236080000 139510000 91807000 47701000 215340000 101830000 113500000 226940000 176930000 50005000 80328000 55463000 24865000 5351 8910;18367;25057;36296;37857;38349 True;True;True;True;True;True 10083;20776;28582;41341;43111;43650 49155;49156;101545;101546;101547;101548;138276;138277;197997;206738;209227;209228;209229;209230 63147;63148;130127;130128;130129;130130;130131;176545;176546;252587;263715;266897;266898;266899;266900;266901;266902 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AT5G43830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs | Chr5:17622593-17624239 REVERSE LENGTH=251 1 9 9 9 4 7 7 8 4 7 7 8 4 7 7 8 39 39 39 27.509 251 251 1.83 13 16 7 0 31.36 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89325 0.99615 26.61 32 5 Leave out requantified 1.2497 1.0759 0.71736 0.89325 1.1402 0.99012 0.83119 0.99615 14.833 18.247 22.716 57.395 5 9 11 7 0 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.1 30.7 29.9 34.7 3625600000 1925300000 1700300000 641220000 290040000 351180000 833850000 380580000 453270000 1385900000 858680000 527190000 764630000 395960000 368670000 5355 10650;18161;24455;25195;27680;31694;34017;34939;34941 True;True;True;True;True;True;True;True;True 12025;20547;27681;28750;31680;36125;38766;39796;39798 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1732;1733;1734;1735;1736;1737;1738;1739;1740;1741;1742;1743;1744;1745;1746;1747;3155;3156;3157;3158;3159;3160;3161;3162;3163;3164;3165;3166;3167;3168;3169;3170;3171;7955;7956;7957;7958;7959;7960;7961;7962;7963;7964;7965;7966;25336;25337;25338;25339;25340;25341;32294;32295;32296;61332;61333;61334;61335;61336;78950;78951;78952;78953;78954;105810;105811;105812;105813;105814;105815;105816;105817;105818;116836;116837;116838;116839;116840;116841;116842;116843;116844;116845;120961;120962;120963;120964;120965;124208;124209;124210;124211;124212;124213;124214;124215;124216;124217;124218;124219;124220;124221;124222;134444;134445;134446;134447;134448;134449;134450;134451;134452;134453;134454;199966;199967;199968;199969;199970;199971;199972;199973;199974;199975;199976;199977;199978;199979;199980;199981;199982;199983;199984;199985;199986;199987;199988;199989;199990;199991;199992;199993;199994;199995;232672;232673;232674;232675;232676;232677;232678;232679;232680;232681;232682;232683;232684;232685;241443;241444;241445;241446;241447;241448;241449;241450;241451;241452;241453;241454;241455;241456;241457;241833;241834;241835;241836;241837;241838;241839;241840;241841;241842;241843;241844;241845;241846;243580;243581;243582;243583;243584;243585;243586;243587;243588;243589;243590;243591;243592;243593;243594;243595;243596 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AT5G44650.1 | Symbols:AtCEST,CEST,Y3IP1 | Ycf3-interacting protein 1,Arabidopsis thaliana chloroplast protein-enhancing stress tolerance,chloroplast protein-enhancing stress tolerance | death domain associated protein | Chr5:18013396-18015292 FORWARD LEN 1 7 7 7 6 7 7 5 6 7 7 5 6 7 7 5 32.9 32.9 32.9 31.816 280 280 1.95 14 16 12 0 66.375 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0511 1.0582 13.958 38 6 Leave out requantified 1.0454 1.1048 0.93024 0.97627 0.96951 1.0474 1.0624 1.0807 22.324 14.863 20.276 8.2248 11 8 12 7 1 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.6 32.9 32.9 20.4 6336700000 3093500000 3243200000 1661700000 784590000 877140000 1222700000 558490000 664210000 2072300000 1034600000 1037700000 1379900000 715770000 664120000 5373 6142;12853;22014;23280;27565;31145;36693 True;True;True;True;True;True;True 6983;6984;14521;24750;26149;31556;35526;41815 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cofactor sulfur 2 4 4 4 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 14 14 14 34.798 308 308;230 1.57 4 2 1 0 8.0859 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.60962 0.73748 49.422 7 3 Leave out requantified 1.9763 1.5865 NaN 0.64402 1.8519 1.4593 NaN 0.74843 46.423 5.3651 NaN 2.0849 2 2 1 2 2 1 0 0 Median Median Median Median 6.2 7.8 4.5 7.8 330140000 159330000 170810000 54649000 21821000 32828000 111950000 43729000 68220000 56181000 39565000 16616000 107360000 54218000 53143000 5374 17600;17867;28731;35121 True;True;True;True 19928;20224;32873;39998 97231;97232;98653;157993;191150;191151;191152 124690;124691;126473;201278;243630;243631;243632 124691;126473;201278;243632 5055 256 AT5G44730.2;AT5G44730.1 AT5G44730.2;AT5G44730.1 5;5 5;5 5;5 AT5G44730.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr5:18045588-18046519 REVERSE LENGTH=255;AT5G44730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Haloacid 2 5 5 5 2 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 4 27.8 27.8 27.8 28.809 255 255;255 2.08 4 3 5 0 13.347 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3924 1.5175 26.824 10 4 Leave out requantified 1.8026 NaN 0.97614 0.88155 1.7605 NaN 1.173 1.0038 13.684 NaN 69.607 38.129 2 1 3 4 1 0 1 2 Median Median Median Median 15.7 12.2 20.8 22.7 449840000 229630000 220200000 60184000 22615000 37569000 50584000 20665000 29919000 118790000 62720000 56070000 220280000 123630000 96645000 5375 1432;18586;20351;39082;39141 True;True;True;True;True 1625;21022;22926;44479;44543 8201;8202;8203;8204;102858;102859;102860;102861;111990;213375;213711;213712 10752;10753;10754;131822;131823;131824;131825;143651;272180;272696;272697 10753;131822;143651;272180;272696 5056 202 AT5G44790.1 AT5G44790.1 1 1 1 AT5G44790.1 | Symbols:HMA7,RAN1 | RESPONSIVE-TO-ANTAGONIST 1 | copper-exporting ATPase / responsive-to-antagonist 1 / copper-transporting ATPase (RAN1) | Chr5:18075846-18079817 REVERSE LENGTH=1001 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 2.1 2.1 2.1 107.39 1001 1001 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protein | Chr5:18151665-18153164 FORWARD LENGTH=438 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.5 2.5 2.5 50.376 438 438 1.67 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.5 2.5 2.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5379 27490 True 31456 151573;151574;151575 193178;193179;193180 193178 3052 5058 378 381 AT5G45130.1;AT5G45130.2 AT5G45130.1;AT5G45130.2 3;2 1;1 1;1 AT5G45130.1 | Symbols:RAB5A,RABF2A,ATRAB-F2A,ATRABF2A,RAB-F2A,RHA1,ATRAB5A | ARABIDOPSIS RAB HOMOLOG F2A,RAB homolog 1,RAB HOMOLOG F2A | Ras small GTP-binding family protein | Chr5:18244495-18246060 FORWARD LENGTH=200;AT5G45130.2 | Symbols:RAB5A,RABF2A, 2 3 1 1 3 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 15 4 4 21.653 200 200;208 2.14 1 4 2 0.0055407 2.2098 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0849 1.2754 130.47 4 4 Median NaN NaN 0.70402 NaN NaN NaN 0.81246 NaN NaN NaN 58.755 NaN 0 1 2 1 0 1 2 1 Median Median Median Median 15 15 15 15 174460000 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protein | Chr5:18405668-18406597 REVERSE LENGTH=309;AT5G45420.2 | Symbols:maMYB | membrane anchored MYB | Duplicated homeodomain-like superfamily protein | Ch 3 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 6.1 6.1 6.1 34.362 309 309;309;309 1 1 0 10.264 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 6.1 0 0 32630000 9950000 22680000 0 0 0 32630000 9950000 22680000 0 0 0 0 0 0 5385 23456 True 26340 127540 163198 163198 AT5G45470.1;AT5G45460.1 AT5G45470.1 3;1 3;1 2;1 AT5G45470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putative (DUF594) | Chr5:18422164-18424764 REVERSE LENGTH=866 2 3 3 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 2 2.4 2.4 1.6 100.19 866 866;703 1.67 2 1 0.0051999 2.2311 By MS/MS By MS/MS 0.41867 0.50917 38.375 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 0.8 1.6 93356000 64905000 28451000 0 0 0 0 0 0 46346000 32686000 13660000 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Leave out requantified Leave out requantified 27.2 29.8 24.9 22.3 2551300000 1234600000 1316600000 434380000 197200000 237180000 624650000 266610000 358030000 1114400000 577520000 536920000 377800000 193300000 184500000 5390 254;6376;18110;23000;26330;32818;35574;35586;36088 True;False;True;False;True;True;True;False;False 282;7267;20493;25847;25848;30165;37386;40525;40538;41098 1391;1392;1393;1394;1395;1396;1397;1398;1399;35477;35478;35479;35480;100001;100002;100003;100004;100005;100006;100007;125103;125104;125105;125106;125107;125108;125109;125110;145562;145563;178335;178336;193813;193814;193815;193816;193857;193858;193859;193860;193861;196786;196787;196788;196789;196790;196791;196792;196793 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26;27;28;29;30;31;32;33;14262;14263;20609;20610;20611;20612;20613;20614;20615;20616;20617;20618;20619;20620;20621;20622;154278;154279;154280;154281;154282;154283;154284;154285;154286;154287;154288;154289;154290;154291;154292;154293;154294;154295;154296;154297;154298;154299;154300;154301;154302;154303;154304;154305;154306;154307;154308;154309;154310;154311;154312;154313;154314;154315;154316;154317;154318;154319;154320;154321;154322;154323;154324;154325;154326;154327;154328;154329;154330;154331;154332;154333;154334;154335;154336;154337;154338;154339;154340;154341;197162;197163;197164;197165;197166;197167;197168;197169;197170;197171;197172;197173;197174;197175;197176;197177;197178;197179;197180;197181;197182 26;14262;20615;154322;197176 2328;2329 168;296 AT5G46180.1 AT5G46180.1 7 7 7 AT5G46180.1 | Symbols:DELTA-OAT | ornithine-delta-aminotransferase | ornithine-delta-aminotransferase | Chr5:18718766-18721271 REVERSE LENGTH=475 1 7 7 7 4 6 5 3 4 6 5 3 4 6 5 3 17.9 17.9 17.9 52.177 475 475 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SYRINGAE 6 | disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family | Chr5:18842701-18846809 FORWARD LENGTH=1127 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 2 2 2 128.27 1127 1127 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5405 2170 True 2450 12063;12064 15623;15624 15623 3054;3055 235;237 AT5G46570.1 AT5G46570.1 2 2 2 AT5G46570.1 | Symbols:BSK2 | brassinosteroid-signaling kinase 2 | BR-signaling kinase 2 | Chr5:18894687-18897198 FORWARD LENGTH=489 1 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 5.1 5.1 5.1 54.972 489 489 1.83 2 3 1 0 8.0899 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0045 1.1931 41.675 6 0 Leave out requantified NaN 0.68627 1.0424 1.2267 NaN 0.64604 1.2627 1.423 NaN 21.071 49.699 16.757 0 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.1 5.1 5.1 238050000 133570000 104480000 0 0 0 65932000 41303000 24628000 87837000 49835000 38002000 84279000 42431000 41848000 5406 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protein-2 mu-adaptin | Clathrin adaptor complexes mediu 2 5 5 5 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 4 2 12.8 12.8 12.8 49.322 438 438;441 2.25 2 5 5 0 11.645 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2394 1.0858 50.32 9 6 Leave out requantified 1.4007 1.7153 0.79018 NaN 1.2978 1.5217 0.92514 NaN 4.2251 47.727 43.935 NaN 2 2 4 1 2 0 4 0 Median Median Median Median 5 8.9 10.7 3.9 503910000 239280000 264630000 81826000 34511000 47315000 165290000 55610000 109680000 202150000 115580000 86572000 54646000 33582000 21064000 5408 1485;4258;31684;32725;33322 True;True;True;True;True 1689;4857;36115;37276;37964 8471;8472;23708;23709;172162;172163;172164;177777;177778;181057;181058;181059 11059;11060;30657;30658;219276;219277;219278;226486;226487;230602;230603;230604;230605 11060;30657;219277;226486;230603 5084 216 AT5G46680.1 AT5G46680.1 1 1 1 AT5G46680.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | Chr5:18941118-18942524 FORWARD LENGTH=468 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 2.6 2.6 2.6 52.506 468 468 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5409 29337 True 33539 160994 205141 205141 2332 172 AT5G46700.1 AT5G46700.1 1 1 1 AT5G46700.1 | Symbols:TET1,TRN2 | TORNADO 2,TETRASPANIN 1 | Tetraspanin family protein | Chr5:18951035-18952439 FORWARD LENGTH=269 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 5.6 5.6 5.6 30.287 269 269 2 1 1 1 0 7.9474 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.6 0 5.6 5.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5410 32001 True 36464;36465 173858;173859;173860 221472;221473;221474 221472 2333;3056 148;149 AT5G46750.1 AT5G46750.1 8 8 6 AT5G46750.1 | Symbols:AGD9 | ARF-GAP domain 9 | ARF-GAP domain 9 | Chr5:18969950-18971817 REVERSE LENGTH=402 1 8 8 6 6 4 5 6 6 4 5 6 4 3 3 4 29.9 29.9 24.6 43.55 402 402 2 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DE SOUFFLE | Mitochondrial substrate carrier family protein | Chr5:18988779-18989810 REVERSE LENGTH=300;AT5G46800.2 | Symbols:BOU | A BOUT DE SOUFFLE | Mitochondrial substrate carrier family protein | Chr5:18988779-18 3 12 12 12 11 11 11 12 11 11 11 12 11 11 11 12 50.3 50.3 50.3 31.022 300 300;300;300 2.06 33 44 40 0 205.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95731 0.96819 12.783 109 24 Leave out requantified 1.0438 0.99246 1.118 0.80683 0.94682 0.91052 1.3036 0.89135 39.8 13.171 22.134 20.116 30 27 27 25 7 10 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 47.7 47.7 47.7 50.3 25857000000 13745000000 12112000000 6255400000 3315800000 2939600000 5496600000 3088700000 2407900000 6965100000 3404400000 3560600000 7140300000 3936100000 3204200000 5413 5769;10375;13921;14596;22657;22803;27876;31503;31525;38600;39314;39324 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Syntaxin/t-SNARE family protein | Chr5:1901234 7 9 9 9 6 6 6 9 6 6 6 9 6 6 6 9 42.2 42.2 42.2 29.481 268 268;255;262;739;818;845;923 2.03 11 8 12 0 71.588 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0046 1.0608 24.752 21 1 Leave out requantified 0.66654 0.78264 1.2564 1.2662 0.63843 0.72599 1.4724 1.4107 24.972 22.356 20.685 15.362 5 4 5 7 1 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.5 29.5 30.2 42.2 3628800000 1809900000 1818800000 623680000 362970000 260720000 637130000 363290000 273840000 1116700000 516960000 599760000 1251300000 566740000 684520000 5415 2952;5176;9631;10112;21346;21733;23625;29179;30665 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3389;5899;10909;11441;24021;24443;26533;33363;35000 16844;16845;16846;16847;28689;28690;28691;28692;28693;28694;52638;52639;52640;52641;55286;55287;55288;55289;116737;116738;116739;116740;116741;118661;128533;128534;160143;160144;160145;160146;167354 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BETA-AMYLASE 1 | RNA helicase | Chr5:19072009-19078856 FORWARD LENGTH=1254 1 7 7 7 6 4 5 2 6 4 5 2 6 4 5 2 8.5 8.5 8.5 136.87 1254 1254 1.89 8 5 6 0 67.939 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0536 1.0526 16.448 16 5 Leave out requantified 1.1967 1.0215 0.93115 NaN 1.1103 0.92399 1.0501 NaN 10.357 16.593 32.423 NaN 5 5 5 1 2 2 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 7.2 4.5 6 3.4 1032800000 560620000 472190000 378310000 189580000 188720000 287160000 152120000 135040000 255450000 148180000 107270000 111890000 70730000 41164000 5418 8597;17920;27299;28013;29476;33354;38402 True;True;True;True;True;True;True 9742;20284;31250;32045;33692;38002;43708 47483;98953;98954;98955;150655;150656;150657;154090;154091;154092;161662;161663;181281;181282;181283;181284;209557;209558;209559 60980;126850;191951;196369;196370;196371;205978;205979;230897;230898;230899;230900;230901;230902;230903;230904;267341;267342;267343;267344 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available | Ribosomal protein L19 family protein | Chr5:19164432-19166064 REVERSE LENGTH=229 1 7 3 3 7 6 7 6 3 2 3 2 3 2 3 2 33.2 21.8 21.8 25.468 229 229 2.16 7 7 11 0 40.012 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98211 0.9105 44.259 22 5 Leave out requantified 0.67008 0.63547 1.343 1.7686 0.65669 0.61911 1.6279 1.8819 64.841 30.328 40.992 53.939 5 4 8 5 0 0 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Linear 33.2 16.2 33.2 16.2 9353200000 4449400000 4903800000 1990800000 1258200000 732620000 1622700000 872660000 750050000 2371800000 893670000 1478100000 3367900000 1424900000 1943000000 5425 881;20854;20855;21084;21085;27533;32504 True;False;False;True;True;False;False 987;23471;23472;23724;23725;23726;23727;31516;37032 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available | no full name available | NADH dehydrogenase ubiquinone 1 beta subcomplex subunit | Chr5:19292869-19294666 REVERSE LENGTH=125 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 7.2 7.2 7.2 13.211 125 125 1.33 2 1 0.0016936 2.7662 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89967 0.79993 19.637 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 7.2 7.2 7.2 0 189760000 118460000 71300000 56527000 32716000 23811000 74685000 43148000 31537000 58552000 42600000 15952000 0 0 0 5435 1420 True 1607 8125;8126;8127 10660;10661;10662 10661 5096 33 AT5G47650.5;AT5G47650.3;AT5G47650.1;AT5G47650.4;AT5G47650.2 AT5G47650.5;AT5G47650.3;AT5G47650.1;AT5G47650.4;AT5G47650.2 4;4;4;4;4 4;4;4;4;4 4;4;4;4;4 AT5G47650.5 | Symbols:ATNUDT2,NUDT2,ATNUDX2 | nudix hydrolase homolog 2,ARABIDOPSIS THALIANA NUDIX HYDROLASE HOMOLOG 2 | nudix hydrolase homolog 2 | Chr5:19310391-19312084 REVERSE LENGTH=278;AT5G47650.3 | Symbols:ATNUDT2,NUDT2,ATNUDX2 | nudix hydrolase 5 4 4 4 0 3 3 3 0 3 3 3 0 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Symbols:PDS5A,PDS5,AtPD 4 26 26 26 14 17 14 19 14 17 14 19 14 17 14 19 18 18 18 181.21 1605 1605;1606;1607;1510 1.87 28 31 18 0 102.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0245 1.0439 21.912 65 28 Leave out requantified 1.2778 1.3751 0.75792 0.71554 1.177 1.2204 0.91857 0.80513 34.83 20.662 13.845 25.969 12 16 18 19 5 4 7 12 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.3 12.4 10.4 14.2 4465800000 2242900000 2222900000 830460000 344590000 485870000 1104500000 486590000 617860000 1340000000 756870000 583110000 1190900000 654870000 536070000 5437 792;1197;1511;2934;4971;7283;10270;11983;17492;17858;18086;20506;21812;21813;22263;23611;23987;26462;27071;27704;27860;30158;30176;34949;35657;38263 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 887;1347;1720;3367;5665;8278;11618;13546;19785;20212;20213;20469;23095;24525;24526;25017;26517;26950;30317;30991;31705;31870;34424;34445;39806;40616;43553 4543;4544;4545;4546;4547;4548;6664;6665;6666;6667;8652;8653;8654;8655;8656;16722;27562;27563;27564;40603;40604;40605;40606;40607;40608;56134;65490;65491;96600;96601;96602;96603;96604;96605;98611;98612;98613;98614;98615;99900;99901;99902;112661;112662;112663;119005;119006;121134;128448;128449;130373;146262;149385;149386;152607;152608;152609;152610;153259;153260;153261;153262;153263;164886;164887;164888;164974;164975;164976;164977;190282;190283;190284;194265;208790;208791;208792 5948;5949;5950;5951;5952;8684;8685;11277;11278;11279;11280;11281;11282;11283;11284;21656;21657;35493;35494;35495;51879;51880;51881;51882;51883;51884;51885;51886;51887;51888;71981;84262;84263;123919;123920;123921;123922;123923;123924;123925;123926;126423;126424;126425;126426;126427;126428;126429;128007;128008;128009;144451;144452;144453;152362;152363;155093;164358;164359;164360;166788;166789;186362;190304;190305;194448;194449;194450;194451;195245;195246;195247;195248;195249;210099;210100;210101;210209;210210;210211;210212;242565;242566;242567;247737;266347;266348;266349 5949;8684;11281;21656;35495;51888;71981;84263;123920;126424;128008;144452;152362;152363;155093;164360;166788;186362;190304;194450;195248;210101;210212;242565;247737;266349 5097;5098;5099 98;235;500 AT5G47700.2;AT5G47700.1 AT5G47700.2;AT5G47700.1 2;2 2;2 2;2 AT5G47700.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 60S acidic ribosomal protein family | Chr5:19328019-19328724 REVERSE LENGTH=113;AT5G47700.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 60S acidic ribosomal protein family 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 49.6 49.6 49.6 11.247 113 113;113 2 6 4 6 0 13.148 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2088 1.1274 69.367 13 5 Median 1.2088 1.5408 1.1594 0.70964 1.1274 1.4746 1.3278 0.80057 37.861 87.991 92.305 68.698 3 3 4 3 0 1 3 1 Median Median Median Median 35.4 35.4 49.6 35.4 848470000 479600000 368880000 208700000 117210000 91492000 140830000 54574000 86252000 246470000 145660000 100810000 252480000 162160000 90326000 5438 181;26538 True;True 202;30405;30406 1023;146814;146815;146816;146817;146818;146819;146820;146821;146822;146823;146824;146825;146826;146827;146828 1380;187059;187060;187061;187062;187063;187064;187065;187066;187067;187068;187069;187070;187071;187072;187073;187074 1380;187062 5100;5101 45;61 AT5G47720.3;AT5G47720.1;AT5G47720.5;AT5G47720.4;AT5G47720.2 AT5G47720.3;AT5G47720.1;AT5G47720.5;AT5G47720.4;AT5G47720.2 2;2;2;2;2 2;2;2;2;2 2;2;2;2;2 AT5G47720.3 | Symbols:AACT1 | acetoacetyl-CoA thiolase 1 | Thiolase family protein | Chr5:19331762-19334009 FORWARD LENGTH=405;AT5G47720.1 | Symbols:AACT1 | acetoacetyl-CoA thiolase 1 | Thiolase family protein | Chr5:19331762-19334009 FORWARD LENGTH=40 5 2 2 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 2 8.6 8.6 8.6 42.241 405 405;405;412;415;415 2.33 1 2 0 5.9322 By MS/MS By MS/MS 1.1939 1.1906 73.744 3 2 Median NaN NaN NaN 1.2301 NaN NaN NaN 1.2943 NaN NaN NaN 11.81 0 1 0 2 0 1 0 1 Median Median Median Median 0 5.4 0 8.6 70339000 38321000 32018000 0 0 0 26741000 18030000 8710500 0 0 0 43599000 20291000 23308000 5439 7937;15412 True;True 9003;17446 43762;85275;85276 56056;109991;109992;109993 56056;109993 AT5G47760.1;AT5G47760.2 AT5G47760.1;AT5G47760.2 4;3 3;2 3;2 AT5G47760.1 | Symbols:ATPGLP2,ATPK5,PGLP2 | 2-phosphoglycolate phosphatase 2 | 2-phosphoglycolate phosphatase 2 | Chr5:19343121-19344979 REVERSE LENGTH=301;AT5G47760.2 | Symbols:ATPGLP2,ATPK5,PGLP2 | 2-phosphoglycolate phosphatase 2 | 2-phosphoglycolate 2 4 3 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burst oxidase homologue D | respiratory burst oxidase homologue D | Chr5:19397585-19401768 FORWARD LENGTH=921 1 4 4 4 0 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 4.9 4.9 4.9 103.91 921 921 2 2 2 2 0 33.949 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68862 0.69012 120.25 4 2 Median NaN 2.1163 NaN NaN NaN 1.9796 NaN NaN NaN 5.413 NaN NaN 0 2 1 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 1.7 2.2 2.7 112990000 71679000 41311000 0 0 0 44131000 16096000 28036000 24397000 18855000 5541800 44461000 36728000 7733300 5447 632;5059;12523;22438 True;True;True;True 708;5763;14151;25245 3657;27973;68502;122317;122318;122319 4802;36007;88059;156678;156679;156680;156681 4802;36007;88059;156681 AT5G47930.1 AT5G47930.1 4 3 3 AT5G47930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Zinc-binding ribosomal protein family protein | Chr5:19406423-19407329 REVERSE LENGTH=84 1 4 3 3 4 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 46.4 31 31 9.49 84 84 2.25 4 7 9 0 10.562 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0061 1.0241 2.5306 19 3 Leave out requantified 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Aldolase-type TIM barrel family protein | Chr5:19549930-19552046 FORWARD LENGTH=379;AT5G48220.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Aldolase-type TIM barrel family 4 15 15 15 15 12 13 12 15 12 13 12 15 12 13 12 46.2 46.2 46.2 41.968 379 379;364;316;316 2.01 29 27 30 0 190.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97562 1.0343 30.25 70 31 Leave out requantified 1.123 1.1109 0.71889 0.86132 1.0751 1.0652 0.90782 0.99116 35.709 13.583 18.775 14.282 24 16 16 14 12 7 8 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.2 37.2 38.5 39.1 7282000000 3700200000 3581800000 1902500000 942370000 960150000 1855800000 838090000 1017700000 1939700000 1105500000 834190000 1584000000 814220000 769830000 5453 2071;3837;5120;7714;12418;13199;13200;14883;19513;22749;25536;29350;32574;35930;36894 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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153369;200482 AT5G48375.1 AT5G48375.1 3 1 1 AT5G48375.1 | Symbols:TGG3,BGLU39 | thioglucoside glucosidase 3,BETA GLUCOSIDASE 39 | thioglucoside glucosidase 3 | Chr5:19601303-19603883 REVERSE LENGTH=439 1 3 1 1 3 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 7.1 1.6 1.6 50.757 439 439 2.25 1 1 2 1 -2 By MS/MS By matching By matching By MS/MS 1.0662 1.1245 37.835 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.1 7.1 7.1 7.1 390680000 194270000 196410000 119240000 44404000 74833000 66001000 29536000 36465000 63942000 39616000 24327000 141500000 80717000 60782000 + 5458 8046;11931;14037 False;True;False 9122;9123;13488;15865 44282;44283;44284;44285;44286;44287;44288;44289;44290;65209;65210;65211;65212;77383;77384;77385;77386 56716;56717;56718;56719;56720;56721;56722;56723;56724;56725;56726;56727;56728;56729;56730;56731;83886;83887;83888;83889;99960;99961;99962;99963 56724;83889;99962 5124 273 AT5G48380.1 AT5G48380.1 6 6 6 AT5G48380.1 | Symbols:BIR1 | BAK1-interacting receptor-like kinase 1 | BAK1-interacting receptor-like kinase 1 | Chr5:19604584-19606532 REVERSE LENGTH=620 1 6 6 6 2 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 3 9 9 9 69.141 620 620 1.67 6 4 2 0 10.268 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75055 0.81164 6.7436 12 7 Leave out requantified 1.2765 1.2611 0.73646 0.39267 1.1623 1.1744 0.85128 0.45698 36.755 15.501 74.334 41.872 2 2 3 5 2 0 2 3 Median Median Median Median 2.6 3.2 4.7 4.4 1303400000 714250000 589180000 291310000 140840000 150470000 256390000 123360000 133020000 337420000 178300000 159120000 418310000 271740000 146570000 5459 3371;6191;14327;20354;30715;36884 True;True;True;True;True;True 3853;7053;16230;22929;35059;42026 18829;18830;34532;79284;112011;167604;167605;167606;167607;201224;201225;201226 24285;24286;44220;102291;143676;213492;213493;213494;213495;256666;256667;256668 24285;44220;102291;143676;213495;256668 AT5G48430.1 AT5G48430.1 6 6 6 AT5G48430.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Eukaryotic aspartyl protease family protein | Chr5:19627892-19629112 REVERSE LENGTH=406 1 6 6 6 4 1 3 3 4 1 3 3 4 1 3 3 17.5 17.5 17.5 44.445 406 406 2.27 4 7 0 13.552 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76944 0.74161 11.589 10 6 Leave out requantified 0.70098 NaN 0.75536 0.38942 0.67806 NaN 0.89998 0.47196 33.315 NaN 14.968 30.136 4 0 3 3 2 0 2 2 Median Median Median Median 12.6 2 9.4 9.4 627740000 408230000 219510000 206070000 131860000 74212000 0 0 0 169590000 94429000 75156000 252080000 181940000 70139000 5460 2450;10669;12073;17345;19331;35260 True;True;True;True;True;True 2761;12047;13642;19621;21821;40162 13586;58235;58236;58237;65925;65926;95901;95902;95903;106755;191994 17573;74773;74774;74775;84806;84807;123063;123064;123065;136867;244738 17573;74774;84806;123063;136867;244738 AT5G48440.1;AT5G48440.2;AT5G48440.3 AT5G48440.1;AT5G48440.2;AT5G48440.3 3;3;2 3;3;2 3;3;2 AT5G48440.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | FAD-dependent oxidoreductase family protein | 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PSII ACCUMULATION protein (DUF1995) | Chr5:19780010-19781977 REVERSE LENGTH=316;AT5G48790.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | LOW PSII ACCUMULATION protein ( 3 8 8 8 6 4 6 6 6 4 6 6 6 4 6 6 23.4 23.4 23.4 35.86 316 316;248;248 2.19 7 7 12 0 15.637 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6313 0.69427 30.013 25 14 Leave out requantified 1.092 2.425 0.66212 0.54717 1.0405 2.2313 0.82065 0.61583 92.153 58.728 39.373 23.29 8 5 5 7 6 4 1 3 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 19.6 13.9 20.3 15.8 4308700000 1488800000 2819900000 2141800000 416790000 1725000000 778340000 229600000 548750000 527570000 328700000 198880000 861000000 513730000 347270000 5467 7593;7620;7621;16723;21534;24251;34085;38718 True;True;True;True;True;True;True;True 8631;8663;8664;18905;24231;27365;27366;38846;44063;44064 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Leave out requantified 60 60 60 60 13839000000 7570600000 6268700000 3120000000 1236000000 1884000000 3133900000 1120700000 2013100000 3462300000 2490700000 971610000 4123100000 2723100000 1400000000 5468 2545;4739;4835;11461;12230;35306 True;True;True;True;True;True 2892;2893;5416;5519;12944;13822;40219 14258;14259;14260;14261;14262;14263;14264;14265;14266;14267;14268;14269;14270;14271;14272;14273;14274;14275;14276;26365;26366;26367;26368;26369;26370;26371;26372;26799;26800;26801;26802;26803;62543;62544;62545;62546;62547;62548;62549;62550;62551;62552;62553;66808;66809;66810;66811;66812;66813;66814;66815;66816;66817;192340;192341;192342;192343;192344;192345;192346;192347;192348 18457;18458;18459;18460;18461;18462;18463;18464;18465;18466;18467;18468;18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;18479;18480;18481;18482;18483;33949;33950;33951;33952;33953;33954;33955;33956;33957;33958;33959;33960;33961;33962;34486;34487;34488;34489;34490;80461;80462;80463;80464;80465;80466;80467;80468;80469;80470;80471;80472;80473;80474;80475;80476;80477;80478;85915;85916;85917;85918;85919;85920;85921;85922;85923;85924;85925;245211;245212;245213;245214;245215;245216;245217;245218;245219;245220;245221;245222;245223;245224;245225;245226;245227;245228;245229 18469;33958;34488;80467;85920;245214 5127 71 AT5G48840.1 AT5G48840.1 2 2 2 AT5G48840.1 | Symbols:PANC,PTS,ATPTS | homolog of bacterial PANC,ARABIDOPSIS THALIANA PANTOTHENATE SYNTHETASE,PANTOTHENATE SYNTHETASE | pantoate-beta-alanine ligase | Chr5:19803823-19805041 REVERSE LENGTH=310 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 10 10 10 34.137 310 310 2.25 2 2 4 0 8.4605 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99079 0.99268 32.563 8 4 Leave out requantified 1.5308 0.80259 0.77708 0.79629 1.4359 0.75724 0.92293 0.86813 19.645 21.762 10.858 13.603 2 2 2 2 0 1 2 1 Median Median Median Median 10 4.5 4.5 4.5 272950000 150960000 121980000 40015000 21537000 18478000 35117000 19255000 15862000 141860000 80046000 61813000 55954000 30126000 25828000 5469 20964;37562 True;True 23591;42776 114781;114782;114783;114784;114785;114786;114787;205095 147090;147091;147092;147093;147094;147095;147096;147097;147098;147099;261549 147099;261549 AT5G48870.1 AT5G48870.1 1 1 1 AT5G48870.1 | Symbols:AtSAD1,LSM5,AtLSM5,SAD1 | SUPERSENSITIVE TO ABA AND DROUGHT 1,SM-like 5 | Small nuclear ribonucleoprotein family protein | Chr5:19813407-19814362 FORWARD LENGTH=88 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 17 17 17 9.658 88 88 1.33 2 1 0 14.325 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 17 17 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5470 2682 True 3078 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5130;5131;5499;5500;7680;14494;20664;24413;33235;41679 24989;24990;24991;24992;24993;24994;24995;24996;24997;24998;24999;25000;25001;25002;25003;26749;26750;37724;37725;37726;37727;37728;37729;70013;70014;70015;100891;118545;118546;159563;199392 32218;32219;32220;32221;32222;32223;32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;34432;34433;48352;48353;48354;48355;48356;48357;48358;89920;89921;129252;151819;151820;203252;254326 32227;34432;48354;89921;129252;151820;203252;254326 2355 103;5128 343 154;368 AT5G48900.1 AT5G48900.1 4 3 2 AT5G48900.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pectin lyase-like superfamily protein | Chr5:19825240-19828909 FORWARD LENGTH=417 1 4 3 2 2 4 4 4 2 3 3 3 1 2 2 2 10.6 8.4 5 46.727 417 417 2.27 3 5 7 0 22.725 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9289 2.2245 108.43 6 4 Median NaN NaN 2.0609 3.0538 NaN NaN 2.3866 3.5048 NaN NaN 48.286 25.959 1 1 2 2 1 1 1 1 Median Median Median Median 8.4 10.6 10.6 10.6 261900000 93199000 168700000 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Symbols:OVA2 | ovule abortion 2 | tRNA synthetase class I (I%2C L%2C M and V) family pr 3 26 26 26 23 20 21 22 23 20 21 22 23 20 21 22 28.5 28.5 28.5 143.39 1279 1279;1093;955 2.1 31 38 42 0 126.02 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99393 1.05 46.215 99 28 Leave out requantified 0.93692 0.81969 1.1463 1.1808 0.89455 0.74059 1.3571 1.3399 44.915 24.225 29.19 20.093 28 24 24 23 8 7 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.6 19.8 21.7 23.5 9726900000 4900300000 4826600000 2926200000 1544400000 1381800000 1899000000 1059300000 839680000 2659400000 1272700000 1386800000 2242300000 1023900000 1218400000 5475 2856;3385;4262;4699;4827;8333;9377;21947;22832;23563;23929;25150;25577;27879;29739;29968;31868;31951;32418;32904;34296;36271;36814;37752;38622;39327 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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70414;85911;113999;125315;140479;159016;164833;196995;249932;263864 2367;2368;2369 5150 131;132;518 360 AT5G49980.1 AT5G49980.1 4 4 4 AT5G49980.1 | Symbols:AFB5 | auxin F-box protein 5 | auxin F-box protein 5 | Chr5:20334420-20336531 REVERSE LENGTH=619 1 4 4 4 4 2 3 3 4 2 3 3 4 2 3 3 8.1 8.1 8.1 69.316 619 619 2.23 4 2 7 0 39.68 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.042 1.0387 10.985 11 4 Leave out requantified 1.1201 0.943 1.1605 0.8482 1.0445 0.86975 1.3642 0.95628 101.76 34.515 117.52 8.1517 4 2 3 2 2 1 1 0 Median Median Plateau Median 8.1 5.3 6.6 6.6 655790000 363390000 292400000 155840000 74908000 80936000 106430000 56199000 50230000 170380000 91361000 79019000 223140000 140920000 82212000 5493 7782;12251;16067;20337 True;True;True;True 8838;13846;18183;22912 43046;43047;43048;43049;66936;88721;88722;88723;88724;111916;111917;111918;111919 55154;55155;55156;55157;55158;86071;113962;113963;113964;113965;143556;143557;143558;143559;143560;143561;143562 55157;86071;113963;143562 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154620 AT5G50100.1 AT5G50100.1 1 1 1 AT5G50100.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC | Chr5:20371916-20373172 FORWARD LENGTH=214 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9.3 9.3 9.3 24.43 214 214 1.86 3 2 2 0 34.037 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.016 0.96415 21.379 7 2 Median NaN 0.92072 1.016 0.82116 NaN 0.82435 1.1703 0.9585 NaN 18.837 4.6607 33.602 1 2 2 2 0 0 1 1 Median Median Median Median 9.3 9.3 9.3 9.3 302650000 158590000 144060000 36894000 12368000 24525000 77756000 41253000 36502000 100100000 58211000 41885000 87906000 46754000 41152000 5496 12136 True 13713 66268;66269;66270;66271;66272;66273;66274 85254;85255;85256;85257;85258;85259;85260;85261;85262;85263 85260 AT5G50200.3;AT5G50200.2;AT5G50200.1 AT5G50200.3;AT5G50200.2;AT5G50200.1 4;4;4 4;4;4 4;4;4 AT5G50200.3 | Symbols:WR3,NRT3.1,ATNRT3.1 | WOUND-RESPONSIVE 3,NITRATE TRANSPORTER 3.1 | nitrate transmembrane transporter | Chr5:20436308-20437535 FORWARD LENGTH=210;AT5G50200.2 | Symbols:WR3,NRT3.1,ATNRT3.1 | WOUND-RESPONSIVE 3,NITRATE TRANSPORTER 3.1 3 4 4 4 3 3 1 2 3 3 1 2 3 3 1 2 25.2 25.2 25.2 23.403 210 210;210;210 2.18 3 3 5 0 21.723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9295 1.8325 108.8 3 1 Median 1.6543 NaN NaN NaN 1.5749 NaN NaN NaN 21.431 NaN NaN NaN 2 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 19.5 19.5 10.5 11 281620000 95817000 185800000 175680000 71802000 103880000 91606000 9683400 81923000 0 0 0 14331000 14331000 0 5497 4046;12499;17036;33337 True;True;True;True 4626;14124;19257;37980 22698;22699;22700;68364;68365;68366;68367;68368;94009;94010;181148 29417;29418;29419;87895;87896;87897;87898;87899;120569;120570;120571;230725 29419;87895;120570;230725 AT5G50210.1 AT5G50210.1 10 10 10 AT5G50210.1 | Symbols:QS,OLD5,SUFE3 | SULFUR E 3,quinolinate synthase,ONSET OF LEAF DEATH 5 | quinolinate synthase | Chr5:20442803-20445706 FORWARD LENGTH=718 1 10 10 10 4 8 7 6 4 8 7 6 4 8 7 6 16.2 16.2 16.2 78.933 718 718 1.92 8 12 6 0 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purple acid phosphatase 27 | Chr5:20523575-20525915 REVERSE LENGTH=539 1 2 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3 1.3 1.3 61.098 539 539 1.67 1 2 1 -2 By MS/MS By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 1.3 1.7 1.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5503 24506;26236 True;False 27758;30048 134006;134007;134008;145106 171197;171198;171199;185004 171198;185004 3061 363 5 151 AT5G50640.1;AT5G50530.1;AT5G63490.2;AT5G63490.1 AT5G50640.1;AT5G50530.1 6;6;1;1 6;6;1;1 6;6;1;1 AT5G50640.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | CBS/octicosapeptide/phox/Bemp1 domain protein | Chr5:20605218-20608264 REVERSE LENGTH=548;AT5G50530.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | CBS / octicosapeptide/Pho 4 6 6 6 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 13.3 13.3 13.3 59.812 548 548;548;543;543 2 3 5 3 0 24.673 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2195 1.1688 35.657 10 2 Leave out requantified NaN 1.1681 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ubiquitin-conjugating enzyme 27 | ubiquitin-conjugating enzyme 27 | Chr5:20699626- 2 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 8.3 8.3 8.3 21.254 192 192;203 2 1 1 0 10.789 By MS/MS By MS/MS 0.32849 0.32592 81.613 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 0 8.3 0 8.3 197450000 146400000 51048000 0 0 0 148990000 120510000 28481000 0 0 0 48464000 25897000 22567000 5508 28418 True 32513 156342;156343 199261;199262 199262 AT5G50920.1;AT3G45450.1 AT5G50920.1 49;2 49;2 24;0 AT5G50920.1 | Symbols:DCA1,CLPC,ATHSP93-V,CLPC1,HSP93-V | HEAT SHOCK PROTEIN 93-V,CLPC homologue 1,DE-REGULATED CAO ACCUMULATION 1 | CLPC homologue 1 | Chr5:20715710-20719800 REVERSE LENGTH=929 2 49 49 24 46 44 48 46 46 44 48 46 22 19 23 21 56.1 56.1 27 103.45 929 929;341 2.05 171 200 200 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95701 0.97292 23.638 446 118 Leave out requantified 1.018 1.0715 0.8759 0.87261 0.9562 0.98921 1.0058 0.96862 28.813 15.868 17.599 26.536 121 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Symbols:PABN1,ATPABN1 | polyadenylate-binding protein 1,POLYADENYLATE-BINDING PROTEIN 1 | polyadenylate-binding protein 1 | Chr5:20779760-20781241 FORWARD LENGTH=227;AT5G51120.2 | Symbols:PABN1,ATPABN1 | polyadenylate-binding protein 1,POL 3 3 3 3 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 27.8 27.8 27.8 25.671 227 227;265;142 2.08 4 3 5 0 45.902 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89269 1.0023 21.972 12 4 Leave out requantified 1.1009 1.6121 0.7275 0.70646 1.0597 1.5008 0.87011 0.79213 89.114 42.893 45.314 45.228 3 2 4 3 0 1 2 1 Median Median Median Median 22.5 15.4 27.8 15.4 844200000 474860000 369330000 239420000 138350000 101080000 84435000 30902000 53533000 240980000 135000000 105980000 279360000 170620000 108740000 5516 6138;17223;29743 True;True;True 6972;6973;19478;33981 34094;34095;34096;34097;34098;34099;34100;95250;95251;95252;163005;163006 43612;43613;43614;43615;43616;43617;43618;43619;43620;122246;122247;122248;207714;207715;207716 43619;122248;207714 5170 82 AT5G51200.1;AT5G51200.3;AT5G51200.2 AT5G51200.1;AT5G51200.3;AT5G51200.2 8;8;8 8;8;8 8;8;8 AT5G51200.1 | Symbols:EMB3142 | EMBRYO DEFECTIVE 3142 | nuclear pore complex protein (DUF3414) | Chr5:20804926-20819408 FORWARD LENGTH=1839;AT5G51200.3 | Symbols:EMB3142 | EMBRYO DEFECTIVE 3142 | nuclear pore complex protein (DUF3414) | Chr5:20804926-2 3 8 8 8 8 3 6 5 8 3 6 5 8 3 6 5 4.6 4.6 4.6 206.85 1839 1839;1857;1863 2.04 7 11 8 0 13.971 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1141 1.085 20.676 16 10 Leave out requantified 1.0939 1.7979 0.66211 0.78932 1.0764 1.729 0.79752 0.88382 59.716 46.256 22.052 62.3 6 3 3 4 5 1 2 2 Median Median Median Median 4.6 2 3.5 2.9 726550000 409020000 317520000 223100000 114010000 109090000 138030000 59924000 78101000 221630000 144540000 77089000 143790000 90540000 53246000 5517 5688;7065;16357;20930;22822;22892;23546;37367 True;True;True;True;True;True;True;True 6455;8040;18502;23553;25655;25728;26445;26446;42557 31534;31535;31536;31537;39508;39509;39510;39511;39512;39513;39514;90390;90391;90392;90393;114610;114611;124196;124197;124466;124467;124468;124469;128060;128061;204015 40430;40431;40432;40433;50503;50504;50505;50506;50507;50508;50509;115937;115938;115939;115940;115941;146872;146873;158980;158981;159323;159324;159325;159326;163842;163843;260107 40430;50503;115937;146872;158981;159325;163842;260107 2375 5171 559 857 AT5G51220.2;AT5G51220.1 AT5G51220.2;AT5G51220.1 1;1 1;1 1;1 AT5G51220.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquinol-cytochrome C chaperone family protein | Chr5:20821405-20822614 REVERSE LENGTH=220;AT5G51220.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ubiquinol-cytochrome C 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.7 7.7 7.7 25.459 220 220;281 2 2 1 2 0 6.4265 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.5484 0.62665 49.135 5 2 Median NaN NaN NaN 0.39401 NaN NaN NaN 0.44566 NaN NaN NaN 48.202 1 1 1 2 0 0 0 2 Median Median Median Median 7.7 7.7 7.7 7.7 292570000 178140000 114430000 68487000 34437000 34050000 60386000 27505000 32881000 60483000 40931000 19553000 103220000 75269000 27949000 5518 26458 True 30313 146250;146251;146252;146253;146254 186348;186349;186350;186351;186352;186353;186354 186351 AT5G51400.1 AT5G51400.1 1 1 1 AT5G51400.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | PLAC8 family protein | Chr5:20878784-20880036 REVERSE LENGTH=241 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 5.4 5.4 5.4 27.016 241 241 2 2 0.00098058 3.272 By MS/MS By MS/MS 0.95749 1.1582 7.3385 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 5.4 5.4 80382000 38915000 41467000 0 0 0 0 0 0 40072000 23677000 16395000 40310000 15238000 25072000 5519 37726 True 42961 205954;205955 262724;262725 262724 AT5G51430.1 AT5G51430.1 5 5 5 AT5G51430.1 | Symbols:EYE | EMBRYO YELLOW | conserved oligomeric Golgi complex component-related / COG complex component-like protein | Chr5:20887044-20890795 REVERSE LENGTH=836 1 5 5 5 3 4 3 4 3 4 3 4 3 4 3 4 9.2 9.2 9.2 92.258 836 836 1.93 6 3 5 0 49.678 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89814 0.88669 22.487 13 4 Leave out requantified 1.1444 1.2057 0.59917 0.70752 1.0384 1.1051 0.66978 0.80841 8.8274 13.835 6.6864 9.7587 3 4 3 3 1 1 1 1 Median Leave out requantified Plateau Plateau 5.4 7.7 6.1 6.9 504200000 284050000 220150000 88627000 42848000 45779000 152670000 74240000 78425000 104030000 65908000 38120000 158880000 101050000 57822000 5520 22424;28833;28987;34428;37292 True;True;True;True;True 25229;32980;33152;39231;42474 122231;122232;158501;158502;158503;158504;159245;159246;187369;187370;203484;203485;203486;203487 156568;156569;201931;201932;201933;201934;201935;201936;201937;202842;202843;238746;238747;238748;259380;259381;259382 156568;201935;202843;238748;259380 5172 603 AT5G51545.1 AT5G51545.1 4 4 4 AT5G51545.1 | Symbols:LPA2 | low psii accumulation2 | low psii accumulation2 | Chr5:20936434-20937243 FORWARD LENGTH=185 1 4 4 4 3 2 3 1 3 2 3 1 3 2 3 1 17.3 17.3 17.3 20.213 185 185 2.15 6 5 9 0 28.272 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0461 1.2352 92.336 3 1 Plateau 0.36037 NaN NaN NaN 0.33778 NaN NaN NaN 61.128 NaN NaN NaN 2 0 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 16.2 11.9 16.2 10.8 166420000 95798000 70620000 60726000 44170000 16556000 0 0 0 105690000 51629000 54064000 0 0 0 5521 19359;26262;26263;29799 True;True;True;True 21849;30080;30081;30082;34037 106899;106900;106901;145202;145203;145204;145205;145206;145207;145208;145209;145210;145211;145212;145213;145214;145215;145216;145217;163256 137070;137071;185117;185118;185119;185120;185121;185122;185123;185124;185125;185126;185127;185128;185129;185130;185131;185132;185133;185134;185135;185136;185137;185138;185139;208037 137071;185126;185139;208037 2376 49 AT5G51550.1 AT5G51550.1 3 3 3 AT5G51550.1 | Symbols:EXL3 | EXORDIUM like 3 | EXORDIUM like 3 | Chr5:20939793-20940806 REVERSE LENGTH=337 1 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 12.8 12.8 12.8 36.848 337 337 2.33 2 6 7 0 18.431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.45743 0.48965 57.304 14 4 Leave out requantified 0.99154 2.1519 0.38416 0.28465 0.94322 1.9661 0.45965 0.31613 40.781 16.957 34.307 43.858 4 2 4 4 1 0 3 0 Median Median Median Leave out requantified 9.2 9.2 9.2 12.8 1817300000 1123500000 693850000 467240000 222700000 244540000 250820000 77656000 173160000 382550000 271950000 110600000 716730000 551190000 165550000 5522 8087;20398;23012 True;True;True 9167;22976;25860 44471;112199;112200;112201;112202;112203;112204;125140;125141;125142;125143;125144;125145;125146;125147 56941;143888;143889;143890;143891;143892;143893;143894;143895;143896;160204;160205;160206;160207;160208;160209;160210 56941;143891;160209 AT5G51570.1 AT5G51570.1 6 6 6 AT5G51570.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | SPFH/Band 7/PHB domain-containing membrane-associated protein family | Chr5:20949511-20951234 FORWARD LENGTH=292 1 6 6 6 6 6 3 5 6 6 3 5 6 6 3 5 24 24 24 32.378 292 292 1.88 11 5 8 0 17.461 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4999 1.4249 40.978 20 4 Leave out requantified 1.4999 2.2754 0.27678 0.55725 1.4249 2.1183 0.35838 0.60395 34.739 36.614 73.21 61.039 7 6 3 4 2 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24 24 12.7 18.8 1028600000 505550000 523020000 293110000 122900000 170210000 317200000 87373000 229820000 169400000 117670000 51729000 248870000 177610000 71259000 5523 2449;2555;3031;5615;9466;31487 True;True;True;True;True;True 2760;2905;3472;6376;10728;35900 13584;13585;14309;14310;14311;14312;17211;17212;17213;17214;17215;17216;17217;31130;31131;31132;31133;51981;51982;51983;51984;171285;171286;171287 17571;17572;18520;18521;18522;18523;22254;22255;22256;22257;22258;22259;22260;22261;39974;39975;66698;66699;66700;218161;218162;218163;218164 17571;18520;22260;39974;66699;218164 5173;5174;5175 113;114;163 AT5G51660.4;AT5G51660.2;AT5G51660.3;AT5G51660.1 AT5G51660.4;AT5G51660.2;AT5G51660.3;AT5G51660.1 4;4;4;4 4;4;4;4 4;4;4;4 AT5G51660.4 | Symbols:ATCPSF160,CPSF160 | cleavage and polyadenylation specificity factor 160 | cleavage and polyadenylation specificity factor 160 | Chr5:20980250-20988114 FORWARD LENGTH=1239;AT5G51660.2 | Symbols:ATCPSF160,CPSF160 | cleavage and polya 4 4 4 4 2 3 4 4 2 3 4 4 2 3 4 4 4.4 4.4 4.4 135.29 1239 1239;1311;1317;1442 2 6 4 6 0 33.618 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0227 1.0789 12.652 9 1 Leave out requantified 1.4164 1.0899 0.82128 1.0456 1.311 0.98048 1.0189 1.1062 7.2922 14.842 6.7661 17.445 2 2 2 3 1 0 0 0 Median Median Median Leave out requantified 1.9 2.7 4.4 4.4 285880000 149720000 136150000 62319000 28324000 33995000 63620000 32740000 30879000 72138000 37550000 34588000 87799000 51108000 36691000 5524 978;2893;3503;8415 True;True;True;True 1095;3320;4002;9538 5445;5446;16385;16386;16387;16388;19551;19552;19553;19554;19555;19556;19557;46355;46356;46357 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binding protein | Chr5:21009645-21010227 FORWARD LENGTH=108 1 5 5 5 5 4 4 3 5 4 4 3 5 4 4 3 50 50 50 11.626 108 108 1.92 10 7 8 0 16.023 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1075 1.2219 8.3981 20 7 Leave out requantified 0.28506 1.2505 1.1519 1.1075 0.26434 1.109 1.2919 1.2825 39.303 18.514 57.038 31.454 7 5 4 4 4 2 1 0 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 50 45.4 45.4 34.3 3123000000 1651100000 1471900000 926100000 707160000 218940000 828350000 335710000 492640000 814070000 332150000 481910000 554490000 276060000 278430000 5526 909;2634;19426;29448;37329 True;True;True;True;True 1019;3013;21928;33661;42517 5114;5115;5116;5117;5118;5119;5120;5121;14880;14881;14882;107261;161520;161521;161522;161523;161524;203856;203857;203858;203859;203860;203861;203862;203863 6693;6694;6695;6696;6697;6698;6699;6700;19300;19301;19302;137523;205809;205810;205811;205812;205813;205814;205815;205816;205817;259907;259908;259909;259910;259911;259912;259913;259914;259915;259916;259917 6694;19302;137523;205809;259913 2377 96 AT5G51740.2;AT5G51740.1;AT5G51740.3 AT5G51740.2;AT5G51740.1;AT5G51740.3 3;3;2 3;3;2 3;3;2 AT5G51740.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peptidase family M48 family protein | Chr5:21016981-21018987 FORWARD LENGTH=485;AT5G51740.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peptidase family M48 family protein 3 3 3 3 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 0 10.1 10.1 10.1 54.639 485 485;442;403 2.5 3 3 0 5.9705 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5459 1.4477 32.615 5 3 Median 1.5184 1.6654 NaN NaN 1.4619 1.5381 NaN NaN 22.956 8.5633 NaN NaN 2 2 1 0 1 2 0 0 Median Median Median Median 6 6 6.6 0 195290000 85660000 109630000 75804000 29546000 46258000 62916000 25282000 37634000 56569000 30832000 25737000 0 0 0 5527 21145;22010;37688 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7 7 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 5 28.2 28.2 28.2 32.038 298 298 2.08 8 7 10 0 25.016 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0613 0.9786 23.579 25 4 Leave out requantified 0.98603 1.3648 0.81714 0.8067 0.93697 1.2321 0.95592 0.95527 18.153 50.535 19.426 36.827 7 6 7 5 1 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.8 19.1 24.8 19.8 2779300000 1432200000 1347100000 793630000 385280000 408350000 658760000 293170000 365590000 842480000 484320000 358160000 484430000 269400000 215030000 5534 469;7786;14631;15644;17247;31610;35582 True;True;True;True;True;True;True 530;8842;16572;17708;19506;36031;40533;40534 2743;2744;2745;2746;2747;2748;43064;43065;80935;80936;80937;86475;86476;86477;86478;95367;95368;95369;171810;171811;171812;171813;193843;193844;193845 3592;3593;3594;3595;3596;55172;104384;104385;104386;104387;104388;104389;111438;111439;111440;111441;111442;111443;111444;111445;122416;122417;122418;218818;218819;218820;218821;247166;247167 3594;55172;104388;111445;122416;218819;247166 5188 241 AT5G52110.2;AT5G52110.1 AT5G52110.2;AT5G52110.1 2;2 2;2 2;2 AT5G52110.2 | Symbols:HCF208,CCB2 | COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C,HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE 208 | chaperone (DUF2930) | Chr5:21172159-21173953 REVERSE LENGTH=275;AT5G52110.1 | Symbols:HCF208,CCB2 | COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C,HIGH CHLOROPHYLL FL 2 2 2 2 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 9.5 9.5 9.5 30.607 275 275;275 2.33 1 2 0.0004128 4.0157 By MS/MS By MS/MS 1.0303 1.0508 40.457 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 1 0 0 1 Median Median Median Median 9.5 0 0 5.5 131450000 72749000 58699000 70014000 44336000 25678000 0 0 0 0 0 0 61434000 28413000 33021000 5535 12046;19767 True;True 13611;22294 65768;65769;108951 84595;84596;139726 84595;139726 AT5G52190.1 AT5G52190.1 1 1 1 AT5G52190.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Sugar isomerase (SIS) family protein | Chr5:21201817-21202443 REVERSE LENGTH=208 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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AT5G52310.1;AT5G52300.2;AT5G52300.1 AT5G52310.1 12;1;1 12;1;1 12;1;1 AT5G52310.1 | Symbols:COR78,LTI140,RD29A,LTI78 | RESPONSIVE TO DESICCATION 29A,LOW-TEMPERATURE-INDUCED 78,COLD REGULATED 78 | low-temperature-responsive protein 78 (LTI78) / desiccation-responsive protein 29A (RD29A) | Chr5:21240929-21243326 FORWARD LENG 3 12 12 12 3 8 7 8 3 8 7 8 3 8 7 8 23.5 23.5 23.5 77.855 710 710;618;619 1.77 13 12 6 0 29.065 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1979 1.1999 47.555 29 11 Leave out requantified 1.3599 1.4904 0.46791 1.1979 1.2794 1.378 0.52262 1.3032 21.915 36.177 46.591 51.676 4 9 6 10 2 4 1 4 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.2 18.7 13.1 18.9 1304000000 674000000 630020000 166860000 75181000 91674000 419740000 176860000 242880000 257610000 183860000 73757000 459810000 238090000 221720000 5538 349;6349;8015;10058;11768;22573;23325;23357;29496;32321;32322;33866 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 388;7239;9087;11382;13307;25387;26200;26236;33712;36822;36823;36824;38587 1972;35304;44161;54985;54986;54987;64332;64333;122953;122954;122955;122956;126728;126729;126730;126731;126939;126940;161752;175443;175444;175445;175446;175447;175448;175449;175450;175451;184037;184038;184039 2612;45215;56579;70481;70482;70483;70484;70485;82797;82798;157456;157457;157458;162143;162144;162145;162146;162147;162428;162429;206079;223426;223427;223428;223429;223430;223431;223432;223433;223434;223435;234370;234371;234372 2612;45215;56579;70485;82798;157458;162147;162428;206079;223427;223435;234371 5189 333 AT5G52410.3 AT5G52410.3 1 1 1 AT5G52410.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | oxidoreductase/transition metal ion-binding protein | Chr5:21275981-21279293 FORWARD LENGTH=752 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 2 2 84.141 752 752 1 1 0.0039956 2.3454 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2 0 0 0 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AT5G53580.1 AT5G53580.1 7 7 7 AT5G53580.1 | Symbols:AtPLR1,PLR1 | pyridoxal reductase 1 | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr5:21765215-21766919 REVERSE LENGTH=365 1 7 7 7 6 3 5 4 6 3 5 4 6 3 5 4 21.4 21.4 21.4 40.576 365 365 2.12 7 8 10 0 24.162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83819 0.75815 15.975 19 7 Leave out requantified 0.80572 0.87198 0.85969 0.91895 0.7483 0.76814 0.99711 1.0527 6.4352 28.933 17.225 16.21 8 3 4 4 2 1 2 2 Leave out requantified Median Median Median 17.5 8.8 15.1 11.2 1072500000 588720000 483770000 353300000 195960000 157340000 166230000 92798000 73428000 319300000 177370000 141930000 233670000 122600000 111070000 5567 3782;15060;16050;23304;23345;27541;29552 True;True;True;True;True;True;True 4328;17053;18166;26175;26224;31526;33773 21225;21226;21227;21228;21229;21230;83187;83188;83189;83190;83191;88646;88647;126578;126870;126871;151833;151834;151835;151836;151837;151838;162015;162016;162017 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protein FTSZ 1-1,ARABIDOPSIS THALIANA HOMOLOG OF BACTERIAL CYTOKINESIS Z-RING PROTEIN FTSZ 1-1 | homolog of bacterial cytokinesis Z-ring protein FTSZ 1 7 7 7 2 7 5 3 2 7 5 3 2 7 5 3 20.3 20.3 20.3 45.564 433 433 1.91 7 10 5 0 39.186 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0996 1.0791 15.924 21 14 Leave out requantified 0.95744 1.6904 0.682 1.1267 0.85867 1.5809 0.78482 1.2995 11.141 29.984 19.549 35.828 2 9 7 3 2 6 4 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 6 20.3 11.8 12.2 2428000000 1065300000 1362800000 147160000 72460000 74697000 968190000 365140000 603050000 939600000 475560000 464050000 373100000 152100000 221000000 5607 5646;13946;26438;27771;30123;33105;35706 True;True;True;True;True;True;True 6409;15766;30291;31777;34389;37694;40671 31282;31283;76917;76918;146144;146145;146146;146147;152901;152902;164764;164765;179799;179800;194516;194517;194518;194519;194520;194521;194522;194523 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available | no full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RN 2 2 2 2 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 5.6 5.6 5.6 64.024 585 585;710 1.33 2 1 0 6.9551 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0482 0.93161 46.893 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 2.1 2.1 3.6 0 77544000 37141000 40403000 30051000 10841000 19210000 29971000 12239000 17732000 17522000 14061000 3461400 0 0 0 5612 33584;36873 True;True 38257;42015 182514;182515;201166 232466;232467;256583 232467;256583 AT5G55710.1 AT5G55710.1 1 1 1 AT5G55710.1 | Symbols:Tic20-V,AtTic20-V | translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 20-V | TIC 20-v-like protein | Chr5:22554995-22555624 REVERSE LENGTH=209 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 9.1 9.1 9.1 23.651 209 209 2.5 1 1 0.0011614 3.1243 By MS/MS By MS/MS 0.77654 0.73209 11.832 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 9.1 9.1 0 0 50743000 26707000 24036000 27530000 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AT5G55850.3 AT5G55850.3 1 1 1 AT5G55850.3 | Symbols:NOI | | RPM1-interacting protein 4 (RIN4) family protein | Chr5:22603617-22604850 FORWARD LENGTH=79 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.2 15.2 15.2 8.3433 79 79 2.14 1 4 2 0.00040064 3.5839 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0.63987 0.66223 30.068 7 0 Median 0.59974 NaN 0.90329 0.58071 0.54279 NaN 1.0258 0.64253 10.524 NaN 9.6293 4.2703 2 1 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 15.2 15.2 15.2 15.2 825920000 469880000 356040000 193600000 121550000 72043000 160280000 70851000 89430000 193170000 108910000 84262000 278870000 168560000 110310000 5615 29304 True 33496 160760;160761;160762;160763;160764;160765;160766 204822;204823;204824;204825;204826 204825 AT5G55920.1;AT4G26600.3;AT4G26600.1;AT4G26600.5;AT4G26600.8;AT4G26600.4;AT4G26600.2;AT4G26600.7;AT4G26600.6 AT5G55920.1;AT4G26600.3;AT4G26600.1;AT4G26600.5;AT4G26600.8;AT4G26600.4;AT4G26600.2;AT4G26600.7;AT4G26600.6 4;3;3;3;2;2;2;2;2 4;3;3;3;2;2;2;2;2 4;3;3;3;2;2;2;2;2 AT5G55920.1 | Symbols:OLI2,NOP2A | OLIGOCELLULA 2 | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr5:22645742-22649383 REVERSE LENGTH=682;AT4G26600.3 | Symbols:NOP2B | | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase 9 4 4 4 3 1 2 0 3 1 2 0 3 1 2 0 6.6 6.6 6.6 76.775 682 682;652;671;702;510;541;541;551;582 2.33 1 2 3 0 10.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.55278 0.61461 25.215 3 2 Median 0.5554 NaN NaN NaN 0.50208 NaN NaN NaN 31.607 NaN NaN NaN 2 0 1 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 5.3 2.1 3.4 0 134480000 91650000 42827000 98154000 67158000 30995000 0 0 0 36323000 24491000 11832000 0 0 0 5616 15238;24353;25188;36141 True;True;True;True 17253;27535;28742;41155 84220;133104;133105;133106;138937;197031 108589;170117;170118;170119;177374;251356 108589;170118;177374;251356 AT5G55940.1 AT5G55940.1 3 3 3 AT5G55940.1 | Symbols:emb2731 | embryo defective 2731 | Uncharacterized protein family (UPF0172) | Chr5:22656256-22657894 REVERSE LENGTH=208 1 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 18.3 18.3 18.3 22.979 208 208 2.08 4 4 5 0 10.775 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80764 0.82466 53.947 10 2 Median 1.3238 1.4468 0.42478 0.5112 1.2613 1.2835 0.4953 0.57853 32.422 19.648 23.207 22.456 2 3 3 2 0 1 1 0 Median Median Median Median 10.6 10.6 10.6 18.3 504800000 288400000 216400000 91244000 37576000 53668000 125240000 54743000 70501000 185850000 134560000 51290000 102460000 61518000 40941000 5617 7110;9581;38533 True;True;True 8090;10856;43856 39704;39705;39706;39707;52436;210267;210268;210269;210270;210271;210272;210273;210274 50729;50730;50731;50732;67228;268247;268248;268249;268250;268251;268252;268253;268254;268255;268256;268257;268258;268259 50732;67228;268257 AT5G55960.1 AT5G55960.1 3 3 3 AT5G55960.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein C9orf5 protein | Chr5:22662726-22664762 FORWARD LENGTH=648 1 3 3 3 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 4.5 4.5 4.5 71.637 648 648 1.8 2 2 1 0 5.4896 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95602 1.1081 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TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | Chr5:22874058-22876966 FORWARD LENGTH=597;AT5G56500.1 | Symbols:Cpn60beta3 | chaperonin-60beta3 | TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | Chr5:22874058-2287 2 31 13 13 23 26 28 22 6 8 10 5 6 8 10 5 55.3 26 26 63.324 597 597;597 1.94 13 9 11 0 55.992 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91713 0.92922 12.046 30 19 Leave out requantified 1.2685 1.7356 0.43161 0.47857 1.1444 1.5934 0.48586 0.51333 121.7 31.912 25.638 197.81 6 8 11 5 4 4 8 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 38.4 43.9 51.4 38.9 2308900000 943500000 1365400000 314410000 80020000 234390000 577790000 156240000 421550000 969730000 524930000 444790000 446940000 182310000 264630000 5632 438;2406;4180;5546;6788;6789;10244;15358;15475;15764;18362;19080;20021;20955;22653;22851;22977;22978;24041;24921;25750;26558;28374;30731;33304;35000;35333;35468;36307;37255;38409 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symbol available | no full name available | CwfJ- 3 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 5 5 5 45.694 404 404;503;596 2.08 4 3 5 0.0004012 3.5994 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.53417 0.60162 104.25 11 5 Median 1.0979 0.79917 0.21537 0.40298 1.0999 0.76777 0.26477 0.43095 151.96 33.668 116.07 105.95 3 2 2 4 2 0 1 2 Median Median Median Median 5 2 5 5 730410000 554470000 175930000 254840000 166020000 88828000 34914000 19188000 15726000 290920000 255830000 35091000 149730000 113440000 36288000 5642 10324;22151 True;True 11675;24897 56407;56408;56409;56410;56411;56412;56413;56414;56415;120631;120632;120633 72333;72334;72335;72336;72337;72338;72339;72340;72341;72342;154477;154478;154479 72335;154478 AT5G56950.1 AT5G56950.1 7 4 4 AT5G56950.1 | Symbols:NFA3,NAP1;3,NFA03 | NUCLEOSOME/CHROMATIN ASSEMBLY FACTOR GROUP A 03,NUCLEOSOME/CHROMATIN ASSEMBLY FACTOR GROUP A3,nucleosome assembly protein 1;3 | nucleosome assembly protein 1%3B3 | Chr5:23032618-23035299 FORWARD LENGTH=374 1 7 4 4 5 7 6 5 2 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Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | Chr5:23271518-23272900 REVERSE LENGTH=240 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.2 6.2 6.2 26.779 240 240 2 1 2 1 0 5.1206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66649 0.68278 17.973 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 6.2 6.2 6.2 6.2 314270000 195060000 119220000 47757000 31756000 16000000 65278000 27476000 37802000 129800000 96318000 33479000 71439000 39505000 31934000 5654 36356 True 41406 198257;198258;198259;198260 252900;252901;252902;252903;252904 252902 AT5G57460.1 AT5G57460.1 4 4 4 AT5G57460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | muniscin carboxy-terminal mu-like domain protein | Chr5:23275321-23277261 FORWARD LENGTH=646 1 4 4 4 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 5.9 5.9 5.9 70.511 646 646 1.62 6 6 1 0 8.6204 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96767 0.99745 0.94551 11 3 Leave out requantified 1.1472 1.1998 0.84868 0.48412 1.0646 1.1146 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evolutionarily conserved C-terminal region 10 | Chr5:23546434-23549363 FORWARD LENGTH=527;AT5G58190.2 | Symbols:ECT10 | evolutionarily conserved C-terminal region 10 | evoluti 2 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 2.7 2.7 2.7 58.341 527 527;528 1.33 2 1 0.0052027 2.2334 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 2.7 2.7 0 2.7 116930000 13767000 103160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116930000 13767000 103160000 5672 1308 True 1475 7369;7370;7371 9616;9617;9618 9616 AT5G58220.1;AT5G58220.2 AT5G58220.1;AT5G58220.2 4;3 4;3 1;0 AT5G58220.1 | Symbols:ALNS,TTL | transthyretin-like protein,allantoin synthase | transthyretin-like protein | Chr5:23554546-23555861 REVERSE LENGTH=324;AT5G58220.2 | Symbols:ALNS,TTL | transthyretin-like protein,allantoin synthase | transthyretin-like p 2 4 4 1 2 3 4 4 2 3 4 4 1 1 1 1 17.6 17.6 5.9 35.564 324 324;286 2.13 3 7 5 0 61.198 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84881 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By MS/MS By MS/MS 1.3914 1.2737 44.175 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 1 0 1 Median Median Median Median 3.5 3.5 6.4 3.5 85976000 40457000 45519000 27334000 9769500 17565000 32790000 12806000 19985000 0 0 0 25852000 17882000 7970000 5675 25226;36756 True;True 28783;41887 139104;200467;200468;200469;200470 177562;255673;255674;255675;255676;255677 177562;255676 AT5G58240.2;AT5G58240.3;AT5G58240.1 AT5G58240.2;AT5G58240.3;AT5G58240.1 3;2;2 3;2;2 3;2;2 AT5G58240.2 | Symbols:FHIT | FRAGILE HISTIDINE TRIAD | FRAGILE HISTIDINE TRIAD | Chr5:23558349-23559171 REVERSE LENGTH=160;AT5G58240.3 | Symbols:FHIT | FRAGILE HISTIDINE TRIAD | FRAGILE HISTIDINE TRIAD | Chr5:23558349-23558909 REVERSE LENGTH=128;AT5G58 3 3 3 3 2 0 1 3 2 0 1 3 2 0 1 3 23.1 23.1 23.1 18.128 160 160;128;180 2.17 2 1 3 0 8.9616 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63551 0.64464 46.083 6 3 Median 0.80589 NaN NaN 0.79157 0.75461 NaN NaN 0.84982 84.989 NaN NaN 27.414 2 0 1 3 1 0 0 2 Median Median Median 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11955;86225;99304;100916;187892;247287 AT5G58270.1 AT5G58270.1 15 15 15 AT5G58270.1 | Symbols:STA1,ATATM3,ATM3,ABCB25 | ABC transporter of the mitochondrion 3,STARIK 1,ATP-binding cassette B25,ARABIDOPSIS THALIANA ABC TRANSPORTER OF THE MITOCHONDRION 3 | ABC transporter of the mitochondrion 3 | Chr5:23562168-23567040 FORWARD 1 15 15 15 11 5 9 6 11 5 9 6 11 5 9 6 25.3 25.3 25.3 80.419 728 728 2.16 12 17 20 0 49.385 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95167 1.0621 10.322 42 17 Leave out requantified 0.97398 1.2465 0.96263 0.82613 0.92274 1.1658 1.0805 0.96506 16.024 2.5036 34.17 14.614 12 9 11 10 7 4 5 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 9.5 18.8 10.7 2059500000 1061700000 997760000 552850000 305640000 247210000 488650000 209490000 279160000 597330000 327790000 269530000 420690000 218820000 201870000 5679 203;10016;11053;17286;19137;19905;21015;22875;28696;30450;31360;33965;37371;38520;38521 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Symbols:TCU2 | TRANSCURVATA 2 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | C 2 6 6 6 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 5.4 5.4 5.4 114.18 1002 1002;1065 2.08 4 4 5 0 11.315 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98649 1.0672 44.226 6 3 Median NaN NaN 1.4129 0.85191 NaN NaN 1.7073 0.91799 NaN NaN 50.644 24.529 1 1 2 2 1 0 1 1 Median Median Median Median 2.4 2.5 3.4 3 224880000 114290000 110590000 23106000 9042700 14063000 48724000 31035000 17688000 96377000 46652000 49725000 56677000 27559000 29118000 5688 2613;22091;23731;27666;31650;35653 True;True;True;True;True;True 2990;24831;26651;31664;36075;40611 14756;120343;120344;129039;129040;129041;152445;152446;172013;172014;172015;194245;194246 19137;154092;154093;165110;165111;194269;194270;219105;219106;219107;247713;247714 19137;154093;165110;194269;219106;247713 AT5G58470.2;AT5G58470.1 AT5G58470.2;AT5G58470.1 2;2 2;2 2;2 AT5G58470.2 | Symbols:TAF15b | TBP-associated factor 15B | TBP-associated factor 15B | Chr5:23638566-23640854 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AT5G59010.1;AT5G59010.2;AT3G54030.1 6;4;3 2;1;0 2;1;0 AT5G59010.1 | Symbols:BSK5 | brassinosteroid-signaling kinase 5 | kinase with tetratricopeptide repeat domain-containing protein | Chr5:23820578-23823099 REVERSE LENGTH=489;AT5G59010.2 | Symbols:BSK5 | brassinosteroid-signaling kinase 5 | kinase with te 3 6 2 2 3 4 4 5 1 1 1 2 1 1 1 2 13.9 5.9 5.9 54.854 489 489;359;490 2 2 1 2 0.00040584 3.7543 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 4.1405 5.0515 103.84 4 0 Linear NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 5.7 7.2 8.8 10.8 133450000 55187000 78262000 20819000 14219000 6600600 19265000 13275000 5990500 34332000 14764000 19568000 59032000 12929000 46103000 5696 393;2471;4364;27067;30233;31746 True;False;False;False;True;False 440;2782;4976;30986;34509;36185 2217;13693;13694;13695;13696;13697;13698;13699;24162;24163;149369;149370;149371;149372;165204;165205;165206;165207;172484 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2 0 1 1 1 0 1 1 1 2.7 1.8 1.8 79.597 741 741;976;977 2 1 1 1 1 -2 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0.9 2.7 2.7 2.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5698 30235;37476 True;False 34511;42676 165215;165216;165217;204587;204588;204589;204590 210491;210492;210493;260860;260861;260862;260863;260864 210491;260862 2430 5336 453 448 AT5G59110.1 AT5G59110.1 1 1 1 AT5G59110.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | subtilisin-like serine protease-like protein | Chr5:23863530-23864048 REVERSE LENGTH=172 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 6.4 6.4 6.4 18.534 172 172 1 1 0.0092885 2.0291 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 6.4 0 0 26942000 12921000 14021000 0 0 0 26942000 12921000 14021000 0 0 0 0 0 0 5699 29011 True 33176 159341 202952 202952 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PROTEIN 7,ubiquitin carrier protein 7 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 | Chr5:23919868-23921193 REVERSE LENGTH=166 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 6 6 6 18.722 166 166 2 1 1 1 0.00040858 3.8721 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85925 0.79144 205.61 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 6 0 6 6 208050000 137710000 70337000 53783000 33406000 20377000 0 0 0 85077000 40251000 44825000 69189000 64054000 5135400 5706 3225 True 3689 18097;18098;18099 23341;23342;23343 23341 AT5G59320.1 AT5G59320.1 3 3 3 AT5G59320.1 | Symbols:LTP3 | lipid transfer protein 3 | lipid transfer protein 3 | Chr5:23929051-23929492 FORWARD LENGTH=115 1 3 3 3 1 3 2 1 1 3 2 1 1 3 2 1 26.1 26.1 26.1 11.694 115 115 1.88 3 3 2 0 17.989 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.399 1.2744 189.98 7 5 Median NaN 1.6691 0.35978 NaN NaN 1.6193 0.41937 NaN NaN 95.246 61.437 NaN 1 3 2 1 1 3 1 0 Median Median Median Median 13.9 26.1 20 13.9 915050000 464530000 450510000 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intrinsic protein 2%3B4 | Chr5:24375673-24376939 REVERSE LENGTH=291 1 3 2 2 2 2 3 2 1 1 2 1 1 1 2 1 12.4 9.3 9.3 30.952 291 291 2.2 1 2 2 0 28.542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.666 1.9067 116.03 5 4 Median NaN NaN 3.2381 NaN NaN NaN 3.6306 NaN NaN NaN 36.815 NaN 1 1 2 1 1 0 2 1 Median Median Median Median 7.9 7.9 12.4 7.9 362680000 164060000 198620000 14598000 11154000 3443600 49624000 32860000 16764000 261340000 103260000 158080000 37117000 16793000 20324000 5731 1190;5800;38594 False;True;True 1340;6579;43926 6630;6631;6632;6633;6634;6635;6636;6637;6638;32244;210636;210637;210638;210639 8643;8644;8645;8646;8647;8648;8649;8650;8651;8652;8653;8654;8655;8656;8657;41323;268718;268719;268720;268721 8656;41323;268721 AT5G60670.1 AT5G60670.1 9 2 2 AT5G60670.1 | Symbols:RPL12C | Ribosomal Protein Like 12C | Ribosomal protein L11 family protein | Chr5:24381066-24381566 REVERSE LENGTH=166 1 9 2 2 8 8 9 7 1 2 2 1 1 2 2 1 53 13.9 13.9 17.843 166 166 1.43 4 3 0 10.182 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2372 1.3648 23.277 7 2 Leave out requantified 0.84674 1.4433 1.1977 NaN 0.74873 1.3328 1.3357 NaN 19.302 30.393 9.756 NaN 2 2 2 1 2 0 0 0 Median Median Median Median 48.8 51.8 53 42.2 1285800000 629140000 656680000 163860000 95377000 68486000 383170000 167090000 216080000 470130000 216480000 253650000 268660000 150190000 118470000 5732 2243;2244;5989;8657;8658;9256;16919;37115;37244 False;False;True;False;False;True;False;False;False 2527;2528;6795;9804;9805;10471;19121;42278;42422 12469;12470;12471;12472;12473;12474;12475;12476;12477;33300;33301;33302;33303;47797;47798;47799;47800;47801;47802;47803;47804;47805;47806;47807;47808;47809;47810;47811;47812;47813;47814;47815;47816;47817;47818;47819;47820;50888;50889;50890;93319;93320;93321;93322;93323;93324;93325;93326;202330;202331;202332;202333;202334;202335;202336;202337;202338;202339;202340;202341;202342;202343;202344;202345;202346;202347;202348;202349;202350;203179;203180;203181;203182;203183;203184;203185;203186;203187;203188;203189;203190 16157;16158;16159;16160;16161;16162;42639;42640;42641;42642;42643;61376;61377;61378;61379;61380;61381;61382;61383;61384;61385;61386;61387;61388;61389;61390;61391;61392;61393;61394;61395;61396;61397;61398;61399;61400;61401;61402;61403;61404;61405;61406;61407;61408;61409;61410;61411;61412;61413;65349;65350;65351;119681;119682;119683;119684;119685;119686;119687;119688;119689;119690;119691;119692;119693;119694;119695;119696;119697;258023;258024;258025;258026;258027;258028;258029;258030;258031;258032;258033;258034;258035;258036;258037;258038;258039;258040;258041;258042;258043;258044;258045;258046;258047;258048;258049;258050;258051;258052;258053;258054;258055;258056;258057;258058;258059;258060;258061;258985;258986;258987;258988;258989;258990;258991;258992;258993;258994;258995;258996 16157;16162;42642;61387;61404;65351;119682;258045;258993 AT5G60790.1 AT5G60790.1 14 14 14 AT5G60790.1 | Symbols:GCN1,ATGCN1,ABCF1 | GENERAL CONTROL NON-REPRESSIBLE 1,ATP-binding cassette F1,ARABIDOPSIS THALIANA GENERAL CONTROL NON-REPRESSIBLE 1 | ABC transporter family protein | Chr5:24453760-24455767 REVERSE LENGTH=595 1 14 14 14 14 10 9 6 14 10 9 6 14 10 9 6 27.7 27.7 27.7 66.885 595 595 2.02 19 15 20 0 299.99 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3185 1.2056 35.81 49 18 Leave out requantified 1.571 1.7038 0.46776 0.58111 1.3973 1.5697 0.55403 0.71451 22.128 19.587 21.34 18.808 16 14 9 10 6 6 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.7 20 17.6 10.4 4235900000 1989100000 2246800000 1094300000 443530000 650780000 1079900000 414960000 664970000 1065900000 620340000 445580000 995680000 510240000 485450000 5733 124;6658;8122;10241;20430;21578;22354;22796;25846;28337;28943;32018;37884;39557 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 138;7582;9205;11588;23008;23009;24279;25148;25628;29543;32420;33098;33099;36483;43139;45019 753;754;755;36891;36892;36893;36894;36895;44645;44646;44647;44648;55977;112306;112307;112308;112309;112310;112311;112312;112313;112314;112315;117939;117940;121918;124102;124103;142723;142724;155837;155838;155839;159041;159042;159043;159044;159045;159046;159047;173940;173941;173942;173943;173944;173945;173946;173947;173948;206821;216124;216125;216126;216127 1071;1072;47246;47247;47248;47249;47250;47251;47252;57179;57180;57181;57182;57183;71789;144013;144014;144015;144016;144017;144018;144019;144020;144021;151055;151056;156199;158852;158853;182037;182038;198649;198650;198651;202585;202586;202587;202588;202589;202590;202591;202592;202593;202594;221556;221557;221558;221559;221560;221561;221562;221563;221564;221565;221566;221567;263815;275822;275823;275824;275825;275826;275827;275828 1072;47252;57183;71789;144013;151056;156199;158852;182038;198651;202594;221563;263815;275827 2440 5357;5358;5359;5360 37 183;309;426;436 AT5G60860.1 AT5G60860.1 7 1 1 AT5G60860.1 | Symbols:AtRABA1f,RABA1f | RAB GTPase homolog A1F | RAB GTPase homolog A1F | Chr5:24484750-24485565 FORWARD LENGTH=217 1 7 1 1 6 5 6 4 1 1 1 0 1 1 1 0 33.6 6 6 24.276 217 217 1.33 2 1 0.00039573 3.3973 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.0075 0.91708 32.05 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 1 0 Median Median Median Median 27.6 24 28.6 18 128470000 67587000 60883000 27650000 12440000 15211000 61002000 30179000 30823000 39818000 24969000 14849000 0 0 0 5734 578;1871;2058;12600;25180;31192;37480 False;False;True;False;False;False;False 645;2125;2331;14236;28733;35577;42680 3369;3370;3371;3372;10471;10472;10473;10474;10475;11502;11503;11504;68904;138883;138884;169743;169744;169745;169746;204600;204601;204602;204603;204604 4418;4419;4420;4421;13581;13582;13583;13584;13585;13586;13587;13588;14925;14926;14927;88580;177316;177317;216124;216125;216126;216127;260875;260876;260877;260878 4421;13586;14926;88580;177317;216125;260876 AT5G60960.1 AT5G60960.1 2 2 2 AT5G60960.1 | Symbols:PNM1 | PPR protein localized to the nucleus and mitochondria 1 | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr5:24528423-24529988 REVERSE LENGTH=521 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 4.4 4.4 4.4 59.143 521 521 1.8 2 2 1 0 14.234 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79238 0.88936 34.956 5 1 Median NaN NaN 0.57323 NaN NaN NaN 0.66727 NaN NaN NaN 40.632 NaN 1 1 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 3.1 3.1 4.4 3.1 155130000 78909000 76219000 34343000 15299000 19045000 30666000 13144000 17522000 57768000 34371000 23397000 32350000 16094000 16256000 5735 9289;22760 True;True 10505;25592 51025;51026;51027;51028;123959 65525;65526;65527;65528;65529;65530;65531;158669 65529;158669 AT5G60980.4;AT5G60980.1;AT5G60980.3;AT5G60980.2 AT5G60980.4;AT5G60980.1;AT5G60980.3;AT5G60980.2 10;10;10;10 10;10;10;10 10;10;10;10 AT5G60980.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein | Chr5:24543988-24546027 FORWARD LENGTH=459;AT5G60980.1 | Symbols:no sy 4 10 10 10 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 30.9 30.9 30.9 49.415 459 459;459;460;460 2.14 6 12 10 0 41.016 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1182 1.1565 33.572 25 15 Leave out requantified 1.5683 1.171 0.4046 0.49923 1.4688 1.0574 0.50434 0.56601 12.052 21.199 40.097 29.317 7 6 5 7 4 3 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Median Median 16.1 17.6 14.8 20 2776600000 1569800000 1206800000 702050000 344310000 357740000 708520000 292430000 416090000 686380000 447380000 238990000 679630000 485640000 193990000 5736 2976;7004;11971;12371;15675;23262;25821;27690;30958;38412 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3414;7969;13534;13975;17742;26130;29517;31690;35326;43719 16960;16961;39100;39101;39102;39103;65435;67627;86635;86636;86637;86638;126351;126352;126353;126354;142596;142597;142598;142599;142600;142601;152544;168702;168703;168704;209635;209636 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D-ribulose-5-phosphate-3-epimerase,EMBRYO DEFECTIVE 2728 | D-ribulose-5-phosphate-3-epimerase | Chr5:24684085-24685836 REVERSE LENGTH=281;AT5G61410.1 | Symbols:EMB2728,RPE | D-ribulose-5-phosphate-3-epimerase,EMBRYO D 2 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 31.3 31.3 31.3 30.008 281 281;281 2.01 22 26 23 0 114.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78662 0.84003 21.736 51 13 Leave out requantified 0.74476 1.4103 0.65976 0.86425 0.68218 1.3134 0.76296 0.95023 14.368 13.147 22.195 11.456 12 14 13 12 2 6 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.8 31.3 31.3 31.3 39058000000 20936000000 18122000000 7197500000 3886400000 3311100000 8117600000 3511000000 4606600000 14062000000 8052300000 6010000000 9681200000 5486500000 4194700000 5743 1249;7121;15243;28242;28689;35645 True;True;True;True;True;True 1408;8101;17258;32312;32826;40601;40602 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40322;46828;129487;157252;210015 2446;2447 271;273 AT5G61970.1 AT5G61970.1 10 10 10 AT5G61970.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | signal recognition particle-related / SRP-like protein | Chr5:24888920-24893079 FORWARD LENGTH=605 1 10 10 10 5 5 8 3 5 5 8 3 5 5 8 3 20.7 20.7 20.7 68.832 605 605 2 8 6 8 0 42.286 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76714 0.82311 31.055 16 4 Leave out requantified 0.83456 0.88389 0.70371 0.72854 0.7625 0.8411 0.80885 0.84134 39.325 38.204 9.7865 51.109 3 4 6 3 0 0 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Plateau 11.4 10.2 17.5 5.1 1186300000 627360000 558940000 237270000 122260000 115000000 213850000 114130000 99711000 412180000 233990000 178190000 323010000 156970000 166040000 5755 3755;9241;11922;16550;19375;20601;23832;24700;28722;38903 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4294;10454;13479;18719;21866;23199;26765;28063;28064;32863;44268 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Symbols:no symbol available | no full name available | Pectin lyase-like superfamily protein | Chr5:25341106-25343113 REVERSE LENGTH=432 1 4 2 2 3 3 2 2 2 1 0 0 2 1 0 0 8.3 4.6 4.6 47.894 432 432 1.67 2 1 0.00041365 4.0625 By MS/MS By matching By matching By matching 1.3541 1.2157 67.18 3 1 Median 1.7484 NaN NaN NaN 1.6236 NaN NaN NaN 92.022 NaN NaN NaN 2 1 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 6.2 6 3.7 3.7 251940000 92514000 159430000 181420000 64192000 117230000 70526000 28322000 42204000 0 0 0 0 0 0 5789 6158;7911;11456;19996 False;False;True;True 7011;7012;8972;12936;22538 34297;34298;34299;34300;34301;34302;34303;43624;43625;43626;62517;62518;110060 43872;43873;43874;43875;43876;43877;43878;43879;43880;43881;43882;55900;55901;55902;80428;141202 43880;55902;80428;141202 3870 157 AT5G63190.2;AT5G63190.1 AT5G63190.2;AT5G63190.1 13;13 11;11 11;11 AT5G63190.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | MA3 domain-containing protein | Chr5:25346145-25348563 FORWARD 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nucleoside diphosphate kinase 2 | Chr5:25372122-25373838 REVERSE 1 8 8 8 6 8 8 8 6 8 8 8 6 8 8 8 29.9 29.9 29.9 25.55 231 231 2.21 14 22 27 0 24.943 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0788 1.12 16.133 40 11 Leave out requantified 0.92308 1.2084 0.83014 1.0595 0.90471 1.1796 0.98325 1.2629 41.03 9.0859 13.662 25.186 7 11 13 9 1 4 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26 29.9 29.9 29.9 15503000000 7911200000 7592000000 2177100000 1075800000 1101300000 4552700000 2242600000 2310100000 5012000000 2568500000 2443500000 3761400000 2024200000 1737100000 5791 8622;8915;12761;14153;25599;25600;32115;37864 True;True;True;True;True;True;True;True 9769;10088;14415;15990;29268;29269;29270;29271;36594;43119 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out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.1 22.7 18 14.2 10474000000 5154700000 5319400000 2258900000 1148800000 1110100000 2813100000 1513200000 1299900000 2714600000 1240600000 1474100000 2687600000 1252200000 1435400000 5794 15;247;1140;2787;2835;5920;7446;7734;8447;9484;12935;16182;16416;18682;19408;22971;24226;25319;29138;32986;34363;34473;35009;35760;37356 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 15;275;1280;3200;3251;6714;8460;8785;9576;10750;14615;18305;18306;18565;21123;21905;25816;27322;28899;33316;33317;33318;37568;39157;39279;39872;40738;42546 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LIFE 5,RADIAL SWELLING 3 | Glycosyl hydrolases family 31 protein | Chr5:25545056-25548922 FORWARD LENGTH=921;AT5G63840.2 | Symbols:PSL5,RSW3 | PRIORITY IN SWEET LIFE 5,RADIAL SWELLING 3 | Glycosyl hydr 2 13 13 13 6 8 10 9 6 8 10 9 6 8 10 9 15.6 15.6 15.6 104.27 921 921;948 1.93 13 18 10 0 35.736 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75401 0.80595 40 32 12 Leave out requantified 1.6892 1.2865 0.3916 0.55046 1.6447 1.1517 0.46515 0.64952 35.511 16.085 29.189 26.723 6 8 10 8 2 4 5 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.7 10.2 12.1 11 1582200000 940640000 641570000 220630000 87627000 133000000 333630000 154050000 179580000 608290000 420410000 187870000 419670000 278550000 141120000 5803 1699;4661;4935;7571;9925;11864;14440;15224;21772;24060;24822;28458;38014 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1931;5323;5625;8609;11231;13411;16361;17229;24484;27063;28264;32560;43278 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Symbols:VPS20.1 | | SNF7 family protein | Chr5:25563890-25565258 FORWARD LENGTH=243 2 3 2 2 2 2 2 1 1 1 1 0 1 1 1 0 16.9 13.7 13.7 24.794 219 219;243 1.33 2 1 0 5.9991 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.3037 1.3543 19.67 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 11 9.1 11 3.2 39387000 14980000 24407000 20116000 6792000 13324000 0 0 0 19270000 8188000 11082000 0 0 0 5805 4113;33496;33525 True;True;False 4704;38163;38195 23068;182097;182098;182271;182272;182273;182274 29897;231952;231953;232168;232169;232170;232171;232172;232173;232174 29897;231952;232168 AT5G63890.1;AT5G63890.2 AT5G63890.1;AT5G63890.2 8;8 8;8 8;8 AT5G63890.1 | Symbols:HISN8,ATHDH,HDH | histidinol dehydrogenase,HISTIDINE BIOSYNTHESIS 8 | histidinol dehydrogenase | Chr5:25565600-25567879 REVERSE LENGTH=452;AT5G63890.2 | Symbols:HISN8,ATHDH,HDH | histidinol dehydrogenase,HISTIDINE BIOSYNTHESIS 8 | 2 8 8 8 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 7 20.8 20.8 20.8 48.956 452 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family 2 3 3 3 0 2 2 1 0 2 2 1 0 2 2 1 12.3 12.3 12.3 38.384 357 357;298 1.8 2 2 1 0 5.0416 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2231 1.2644 62.26 5 4 Median NaN 1.4922 1.0764 NaN NaN 1.4011 1.2417 NaN NaN 34.714 118.91 NaN 0 2 2 1 0 1 2 1 Median Median Median Median 0 9.2 8.7 3.1 257320000 94476000 162840000 0 0 0 46095000 14545000 31551000 145620000 58115000 87503000 65606000 21817000 43789000 5809 9239;35179;37073 True;True;True 10452;40064;42232 50808;50809;191507;191508;202120 65258;65259;244127;244128;257763 65258;244128;257763 AT5G64030.1;AT2G34300.3;AT2G34300.2;AT2G34300.1;AT3G51070.2;AT3G51070.1 AT5G64030.1 4;1;1;1;1;1 3;0;0;0;1;1 3;0;0;0;1;1 AT5G64030.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr5:25624965-25628257 FORWARD LENGTH=829 6 4 3 3 1 2 4 2 1 1 3 1 1 1 3 1 6.8 5.7 5.7 93.048 829 829;770;770;770;832;895 2 2 2 2 0 12.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 2.3 2.9 6.8 2.9 68722000 42991000 25731000 16342000 0 16342000 0 0 0 52380000 42991000 9389000 0 0 0 5810 2773;27841;31668;36697 True;True;True;False 3181;31850;36097;41820 15797;15798;15799;153176;153177;172083;200160;200161;200162 20513;20514;20515;195147;195148;219190;255328;255329;255330 20514;195147;219190;255328 AT5G64040.1;AT5G64040.2 AT5G64040.1 8;3 8;3 8;3 AT5G64040.1 | Symbols:PSAN | | photosystem I reaction center subunit PSI-N%2C chloroplast%2C putative / PSI-N%2C putative (PSAN) | Chr5:25628724-25629409 REVERSE LENGTH=171 2 8 8 8 7 7 8 8 7 7 8 8 7 7 8 8 34.5 34.5 34.5 18.429 171 171;181 2 21 22 21 0 38.891 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89227 0.93078 33.877 61 17 Leave out requantified 0.87381 0.86351 0.74129 1.3001 0.90626 0.84201 0.84592 1.3592 59.058 4.7387 18.074 12.919 18 12 15 16 7 1 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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8963;8964;8965;8966;8967;8968;8969;8970;8971;8972;30863;30864;30865;30866;30867;30868;30869;30870;30871;30872;30873;30874;30875;82739;82740;82741;82742;82743;82744;82745;82746;82747;82748;82749;82750;82751;82752;82753;82754;82755;82756;82757;82758;82759;82760;82761;82762;82763;82764;82765;82766;82767;82768;82769;82770;82771;82772;82773;82774;82775;82776;82777;82778;82779;82780;82781;82782;82783;82784;82785;82786;82787;82788;82789;140122;140123;140124;140125;140126;140127;140128;140129;140130;140131;140132;140133;140134;140135;140136;140137;140138;140139;140140;140141;140142;143398;143399;143400;143401;143402;143403;143404;143405;254587;254588;254589;254590;254591;254592;254593;254594;254595;254596;254597;254598;254599;254600;254601;254602;254603;254604;254605;254606 8969;30874;82755;140131;140138;143405;254592;254604 AT5G64050.1 AT5G64050.1 12 12 12 AT5G64050.1 | Symbols:ATERS,OVA3,ERS | glutamate tRNA synthetase,OVULE ABORTION 3 | glutamate tRNA synthetase | Chr5:25630196-25633099 REVERSE LENGTH=570 1 12 12 12 8 8 10 9 8 8 10 9 8 8 10 9 25.1 25.1 25.1 63.465 570 570 2.14 11 16 17 0 50.39 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1794 1.2208 22.324 38 13 Leave out requantified 0.92795 0.94039 1.3292 1.3401 0.83523 0.86733 1.5486 1.5459 23.828 18.917 16.383 6.3757 9 9 12 8 4 3 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17 15.1 20.2 18.6 4548600000 2135700000 2412900000 716060000 316150000 399910000 1289900000 695480000 594410000 1736200000 760550000 975650000 806420000 363530000 442890000 5812 854;1475;4249;5299;10697;15010;15730;16575;21964;27462;36161;37845 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 958;1677;1678;4847;6036;12081;16997;17802;18746;24693;31426;41177;43099 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Median Median 0 3.8 0 3.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5814 9439 True 10695 51860;51861;51862 66558;66559;66560 66558 2467 338 AT5G64100.1 AT5G64100.1 12 12 11 AT5G64100.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peroxidase superfamily protein | Chr5:25650824-25652062 REVERSE LENGTH=331 1 12 12 11 6 11 10 10 6 11 10 10 6 10 9 9 32 32 29.3 35.678 331 331 2.11 13 15 18 0 34.912 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91877 0.91095 22.872 40 13 Leave out requantified 0.91277 0.97435 1.3776 0.66989 0.88487 0.8963 1.7359 0.75711 12.496 35.051 27.421 15.649 6 11 13 10 2 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.8 32 26 28.7 5865700000 2781100000 3084500000 596750000 272330000 324420000 1529300000 709460000 819840000 2256100000 941180000 1314900000 1483500000 858170000 625350000 5815 10892;11235;13054;18019;26451;27340;29660;32604;34189;35078;35079;37887 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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AT5G64160.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | plant/protein | Chr5:25670941-25672318 FORWARD LENGTH=227 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 7.5 7.5 7.5 24.954 227 227 1.33 2 1 0.0025892 2.5325 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85511 0.85774 75.957 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 7.5 7.5 7.5 0 49906000 25540000 24365000 0 0 0 22335000 6522400 15813000 27570000 19018000 8552500 0 0 0 5820 18040 True 20419 99644;99645;99646 127695;127696;127697 127695 AT5G64220.2;AT5G64220.1 AT5G64220.2;AT5G64220.1 1;1 1;1 1;1 AT5G64220.2 | Symbols:CAMTA2 | calmodulin-binding transcription activator 2 | Calmodulin-binding transcription activator protein with CG-1 and Ankyrin domain | Chr5:25686434-25691903 FORWARD LENGTH=1050;AT5G64220.1 | Symbols:CAMTA2 | calmodulin-binding 2 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 2.2 2.2 2.2 117.26 1050 1050;1050 2 1 1 1 0.0043368 2.3006 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81287 0.9269 6.6888 3 0 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2 AT5G64350.1 | Symbols:FKBP12,ATFKBP12,FKP12 | ARABIDOPSIS THALIANA FK506-BINDING PROTEIN 12,FK506-binding protein 12 | FK506-binding protein 12 | Chr5:25734810-25735990 REVERSE LENGTH=112 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 25.9 25.9 25.9 11.987 112 112 2.22 2 3 4 0 10.32 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86371 0.90995 32.556 8 7 Median 0.87102 0.86106 NaN 0.84196 0.82854 0.77859 NaN 0.95716 39.186 20.104 NaN 5.2073 3 2 1 2 2 2 1 2 Median Median Median Median 25.9 11.6 14.3 25.9 768910000 422860000 346050000 249260000 155450000 93805000 281990000 153520000 128470000 65777000 26287000 39490000 171890000 87601000 84290000 5828 4993;15378 True;True 5691;17409;17410 27692;27693;27694;27695;85124;85125;85126;85127;85128 35681;35682;35683;35684;35685;109812;109813;109814;109815;109816 35683;109813 5429 70 AT5G64370.1 AT5G64370.1 5 5 5 AT5G64370.1 | Symbols:PYD3,BETA-UP | PYRIMIDINE 3,beta-ureidopropionase | beta-ureidopropionase | Chr5:25739264-25741031 FORWARD LENGTH=408 1 5 5 5 3 2 2 2 3 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MS/MS By MS/MS 1.0191 1.1218 15.746 37 13 Leave out requantified 0.93361 1.2733 1.1699 1.1988 0.88969 1.1822 1.4348 1.3713 20.628 31.276 12.837 29.959 8 8 12 9 1 2 7 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 20 23 23 3086100000 1498700000 1587400000 594010000 301080000 292930000 653910000 322450000 331460000 1200600000 557990000 642630000 637550000 317220000 320330000 5830 14588;16311;23499;23779;25472;33116;38491 True;True;True;True;True;True;True 16524;18453;26394;26705;29123;37706;43811 80725;80726;80727;80728;90180;90181;90182;90183;90184;90185;127844;127845;127846;127847;127848;127849;129285;129286;129287;129288;129289;129290;129291;129292;129293;140803;140804;140805;140806;140807;140808;140809;140810;179840;179841;210077;210078;210079;210080 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available | no full name available | thionin-like protein | Chr5:25913487-25913879 FORWARD LENGTH=130;AT5G64816.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | thionin-like protein | Chr5:25913487-25913879 FOR 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.7 7.7 7.7 14.441 130 130;130;130;130 1.75 3 4 1 0.0015238 2.9184 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1415 1.1816 9.7615 7 6 Median NaN 1.2424 0.98783 NaN NaN 1.1107 1.1885 NaN NaN 8.7432 6.4968 NaN 1 2 3 1 1 2 2 1 Median Median Median Median 7.7 7.7 7.7 7.7 490660000 245490000 245180000 56560000 27986000 28574000 125660000 57917000 67747000 218310000 118090000 100230000 90125000 41497000 48628000 5842 30772 True 35118 167863;167864;167865;167866;167867;167868;167869;167870 213821;213822;213823;213824;213825;213826;213827;213828 213825 AT5G64840.1;AT5G09930.1 AT5G64840.1 9;2 9;2 9;2 AT5G64840.1 | Symbols:ATGCN5,ABCF5,GCN5 | ATP-binding cassette F5,General Control Nonderepressible 5,general control non-repressible 5 | general control non-repressible 5 | Chr5:25916956-25919693 REVERSE LENGTH=692 2 9 9 9 4 4 6 3 4 4 6 3 4 4 6 3 18.4 18.4 18.4 78 692 692;678 2.17 4 7 7 0 28.217 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1079 1.1289 38.908 14 4 Leave out requantified 0.63564 0.90219 1.3244 2.7249 0.61983 0.79862 1.6317 3.0192 41.436 21.036 58.564 140.54 3 4 5 2 1 1 1 1 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 6.8 6.8 13.3 5.3 993590000 361430000 632160000 128390000 71607000 56787000 300800000 77215000 223590000 340140000 159860000 180280000 224250000 52745000 171510000 5843 1057;1158;2876;11687;17175;21567;21870;32388;35676 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1180;1302;3296;13208;19416;24267;24587;36897;40638 5806;6418;6419;6420;16252;63816;94865;94866;94867;94868;117879;117880;119292;119293;119294;175817;175818;194379 7562;8384;8385;8386;21107;82075;121715;121716;121717;121718;150972;150973;152726;152727;152728;223889;223890;247869 7562;8385;21107;82075;121715;150973;152726;223890;247869 2478 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available | Ribosomal L29 family protein | Chr5:26061301-26062506 FORWARD LENGTH=173 1 6 6 6 6 5 5 5 6 5 5 5 6 5 5 5 22 22 22 19.377 173 173 1.96 20 18 18 0 52.763 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1101 1.1519 13.384 52 13 Leave out requantified 0.95668 0.81499 1.3568 1.2163 0.89853 0.78803 1.6671 1.2925 17.309 16.548 15.57 7.5016 16 11 11 14 4 2 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22 20.8 20.8 20.8 22007000000 10386000000 11620000000 6213000000 3136500000 3076500000 3940800000 2098500000 1842300000 4634000000 1880400000 2753600000 7218900000 3270900000 3948000000 5851 12937;19348;22679;29816;33855;33856 True;True;True;True;True;True 14617;14618;21838;25507;34056;38573;38574 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thimet metalloendopeptidase 1,organellar oligopeptidase | Zincin-like metalloproteases family protein | Chr5:26221951-26225784 FORWARD LENGTH=791;AT5G65620.2 | Symbols:OOP,TOP1 | thimet metalloendopeptidase 1,organellar 2 28 28 15 23 21 21 19 23 21 21 19 13 12 11 10 43 43 23 88.756 791 791;805 2.05 50 65 59 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93148 0.97488 37.892 140 48 Leave out requantified 1.23 1.2451 0.62908 0.73779 1.1555 1.171 0.74041 0.84488 36.435 21.92 29.266 31.245 38 34 35 33 13 15 11 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36 32 33.4 27.7 22302000000 11189000000 11113000000 4294300000 1841200000 2453100000 5967500000 2451500000 3516000000 6502400000 3802600000 2699800000 5537900000 3093500000 2444400000 5857 128;197;3249;6603;6742;7860;8578;9849;10718;11903;14649;16118;16119;21252;22028;23387;23482;23510;24507;26130;26337;26873;28520;31427;33606;36417;38353;39453 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NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 7.2 0 2.5 56548000 30777000 25770000 0 0 0 13506000 0 13506000 0 0 0 43041000 30777000 12264000 5866 15193;18366 True;True 17196;20775 83910;83911;101544 108163;108164;130126 108163;130126 AT5G65940.2;AT5G65940.3;AT5G65940.4;AT5G65940.1;AT2G30650.2;AT2G30650.1;AT2G30660.2;AT2G30660.1 AT5G65940.2;AT5G65940.3;AT5G65940.4;AT5G65940.1;AT2G30650.2;AT2G30650.1 4;4;4;4;2;2;1;1 4;4;4;4;2;2;1;1 4;4;4;4;2;2;1;1 AT5G65940.2 | Symbols:CHY1 | beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 | beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 | Chr5:26377132-26379161 REVERSE LENGTH=328;AT5G65940.3 | Symbols:CHY1 | beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 | beta-hydroxyisobutyryl-CoA hyd 8 4 4 4 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 18.6 18.6 18.6 36.112 328 328;342;378;378;328;378;346;378 2.09 4 2 5 0 8.9687 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56218 0.59552 49.098 9 5 Leave out requantified 0.71786 0.94834 0.57446 0.59354 0.67951 0.88968 0.67389 0.67518 67.757 9.051 72.22 31.344 2 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protein 16 | sulfurtransferase protein 16 | Chr5:26410871-26411139 FOR 2 3 3 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 38.3 38.3 38.3 12.676 120 120;65 2 5 4 5 0 9.9441 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.233 1.2432 112.82 14 11 Median 0.51065 0.36916 3.5694 1.55 0.48076 0.33063 4.7197 1.9086 38.22 87.287 16.013 55.868 2 4 3 5 2 3 3 3 Median Median Plateau Median 26.7 38.3 29.2 38.3 1622300000 618200000 1004100000 137440000 83755000 53690000 317240000 212910000 104330000 598440000 121820000 476630000 569160000 199710000 369450000 5871 3552;5663;33415 True;True;True 4061;6427;38070;38071 19824;19825;19826;19827;19828;19829;31402;31403;31404;181677;181678;181679;181680;181681 25564;25565;25566;25567;25568;25569;25570;25571;40285;40286;40287;231413;231414;231415;231416;231417;231418 25567;40286;231416 5463 49 AT5G66060.1 AT5G66060.1 2 2 2 AT5G66060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | Chr5:26419481-26421118 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1,ferredoxin-NADP(+)-oxidoreductase 1 | ferredoxin-NADP[+]-oxidoreductase 1 | Chr5:26451203-26453012 REVERSE LENGTH=360;AT5G66190.2 | Symbols:LFNR1,ATLFNR1,FNR1 | l 2 24 24 22 22 24 24 24 22 24 24 24 20 22 22 22 61.7 61.7 58.6 40.326 360 360;262 2.08 93 91 116 0 260.58 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87558 0.88247 24.889 230 68 Leave out requantified 1.0171 1.4479 0.52019 0.7837 0.97282 1.3707 0.62983 0.84647 27.547 12.022 17.699 35.329 63 56 56 55 20 16 15 17 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 61.4 61.7 61.7 61.7 115940000000 62146000000 53799000000 27301000000 14023000000 13279000000 30753000000 13094000000 17659000000 32343000000 20391000000 11952000000 25547000000 14639000000 10908000000 5876 3013;5296;5297;6243;6294;8382;8383;8867;13537;15099;18130;18792;19573;20478;23787;23919;23973;23974;24271;26949;28226;28279;28990;34205 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domain containing protein 105,Arabidopsis NAC domain containing protein 105,VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN 3 | NAC domain containing protein 105 | Chr5:26480005-26481247 REVERSE LENGTH=292 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 5.5 5.5 5.5 34.32 292 292 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 5.5 0 0 328060000 163920000 164130000 0 0 0 328060000 163920000 164130000 0 0 0 0 0 0 + 5878 38848 True 44207 212007 270427 270427 5469 288 AT5G66390.1 AT5G66390.1 3 3 3 AT5G66390.1 | Symbols:PRX72 | PEROXIDASE 72 | Peroxidase superfamily protein | Chr5:26516063-26517329 REVERSE LENGTH=336 1 3 3 3 0 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 0 14.9 14.9 14.9 37.426 336 336 1.67 1 2 0 14.405 By MS/MS By MS/MS 0.58079 0.5374 44.658 3 3 Median NaN 0.50586 NaN NaN NaN 0.47676 NaN NaN NaN 16.93 NaN NaN 0 2 1 0 0 2 1 0 Median Median Median Median 0 11.6 3.3 0 102240000 66669000 35569000 0 0 0 66228000 47092000 19136000 36009000 19577000 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8436;8437;8438;8439;8440;8441;8442;32646;32647;32648;70987;70988;70989;70990;76775;76776;76777;76778;83354;83355;83356;83357;83358;83359;83360;83361;91427;91428;91429;91430;158334;158335;158336;158337;158338;161237;161238;161927;161928;161929;161930;161931;161932;161933;168373;178817;178818;180217;180218;180219;180220;180221;192711;192712;192713;192714;197946;197947;197948;197949;197950;197951;197952;197953;198281;198282;198283 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223;1269;4340;4590;4653;14351;16636;16637;18134;19891;19892;35347;37245;38200;39305;43183 1114;1115;1116;1117;1118;1119;1120;1121;6267;6268;6269;6270;6271;6272;21283;22489;22490;22491;22492;22805;22806;22807;69374;69375;81207;81208;81209;88457;97099;97100;97101;97102;97103;168791;168792;168793;168794;177629;182285;182286;182287;182288;182289;182290;182291;182292;187708;187709;187710;187711;187712;187713;187714;187715;187716;187717;207029;207030;207031 1487;1488;1489;1490;1491;1492;1493;1494;1495;1496;1497;1498;8184;8185;8186;8187;8188;8189;8190;8191;27503;29161;29162;29163;29164;29561;29562;29563;89115;89116;104719;104720;104721;113657;124544;124545;124546;124547;124548;214954;214955;214956;214957;226278;232185;232186;232187;232188;232189;232190;232191;232192;232193;232194;232195;232196;232197;232198;232199;239159;239160;239161;239162;239163;239164;239165;239166;239167;239168;239169;264104;264105 1491;8186;27503;29164;29563;89115;104721;113657;124547;214954;226278;232196;239168;264104 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| NADH:ubiquinone oxidoreductase Fe-S protein4,FROSTBITE1 | NADH-ubiquinone oxidoreductase-like protein | Chr5:26958073-26959356 FORWARD LENGTH=154 1 4 4 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 22.7 22.7 22.7 17.134 154 154 2 2 5 2 0.00021501 4.6817 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67989 0.70282 79.676 6 5 Median NaN 1.5438 0.30839 NaN NaN 1.4596 0.35027 NaN NaN 31.95 101.61 NaN 1 2 2 1 1 2 1 1 Median Median Median Median 10.4 10.4 9.7 11.7 783470000 398190000 385280000 151680000 80484000 71198000 214350000 74563000 139790000 241290000 143410000 97883000 176150000 99742000 76410000 5907 17612;31739;36914;37952 True;True;True;True 19940;36178;42061;43211 97269;172463;172464;172465;172466;201353;207132;207133;207134 124724;219660;219661;219662;219663;256826;264229;264230;264231 124724;219662;256826;264229 AT5G67630.1;AT3G49830.1 AT5G67630.1 11;1 11;1 11;1 AT5G67630.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | 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chloroplast ribosomal protein S15 | chloroplast ribosomal protein S15 | ChrC:123296-123562 REVERSE LENGTH=88 1 7 7 7 5 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 67 67 67 10.718 88 88 2.16 12 14 19 0 44.258 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90225 0.89111 35.175 45 20 Leave out requantified 0.71546 0.72492 1.2014 1.0563 0.69648 0.70812 1.3893 1.1828 43.316 18.365 22.992 33.594 11 12 10 12 5 5 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.1 67 59.1 59.1 22059000000 11308000000 10751000000 5460600000 3070400000 2390200000 5070000000 2845300000 2224800000 5984800000 2593200000 3391500000 5543400000 2799500000 2744000000 5965 9102;14868;18818;21861;23346;25601;25602 True;True;True;True;True;True;True 10299;16831;21274;24578;26225;29272;29273 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26 213.69 1786 1786;343 2.05 47 48 54 0 166.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0762 1.1031 31.192 128 55 Leave out requantified 1.0352 0.95523 1.2319 1.207 0.95667 0.88347 1.4196 1.3769 27.704 23.439 51.622 29.432 35 33 28 32 16 13 10 16 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19 19.7 16 16.5 13836000000 7246300000 6590000000 3130700000 1683700000 1447000000 3528000000 1940600000 1587400000 3732800000 1860900000 1871800000 3444900000 1761000000 1683800000 5966 4485;6232;6551;9723;10768;11002;11506;11645;12362;13107;13637;16459;17655;18182;18519;18801;19530;20647;21633;21768;22447;22958;24439;24502;25103;25268;25491;25579;25966;26012;26140;26359;26580;27557;29156;29927;32130;32384;32421;32750;34196;37631;37995;39259 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5129;7104;7105;7461;11010;12161;12426;12995;13142;13966;14803;15410;18610;19991;20573;20943;21254;22039;23248;24335;24480;25256;25799;27656;27657;27753;28641;28835;29144;29245;29717;29779;29925;30198;30455;31545;33337;34178;36612;36893;36931;37303;38974;42852;43259;44673 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2225;2226;2227;2228;2229;2230;2231;2232;2233;2234;2235;2236;2237;2238;20520;20521;20522;20523;20524;20525;39026;39027;39028;39029;39030;50667;50668;50669;50670;50671;50672;50673;50674;50675;50676;50677;50678;50679;104971;104972;104973;104974;104975;104976;104977;104978;104979;116361;116362;116363;116364;116365;121923;121924;121925;121926;121927;121928;121929;121930;121931;121932;121933;153105;153106;153107;154241;154242;154243;154244;154245;154246;154247;154248;163231;163232;163233;163234;163235;163236;163237;163238;163239;163240;163241;163242;163243;163244;163245;163246;163247;163248;163249;163250;163251;163252;163253;163254;163255;163256;163257;163258;163259;163260;163261;163262;163263;164120;164121;164122;164123;164124;164125;238389;238390;238391;238392;238393;238394;238395;238396;238397;238398 2230;20522;39029;50678;104979;116362;121933;153106;154248;163246;164121;238398 2606;3133 5603;5604;5605;5606;5607;5608 33;244 32;192;223;282;286;369 nad9arabC;ATMG00070.1 nad9arabC;ATMG00070.1 8;5 8;5 8;5 nad9arabC |;ATMG00070.1 | Symbols:NAD9 | NADH dehydrogenase subunit 9 | NADH dehydrogenase subunit 9 | ChrM:23663-24235 REVERSE LENGTH=190 2 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 8 6 38.9 38.9 38.9 22.881 190 190;190 1.98 16 15 15 0 25.215 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87663 0.98985 35.589 45 6 Leave out requantified 1.157 1.4337 0.72319 0.73082 1.0983 1.2917 0.86548 0.82621 28.27 19.356 28.579 13.281 11 10 11 13 0 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.6 32.6 38.9 32.6 12186000000 6351600000 5834400000 3036800000 1437900000 1598900000 3002500000 1319300000 1683200000 3214600000 1860600000 1354000000 2932100000 1733800000 1198300000 5990 5169;17481;17482;36801;37569;38331;38486;39286 True;True;True;True;True;True;True;True 5891;19773;19774;41939;42784;42785;43629;43806;44707 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FORWARD LENGTH=672;AT1G03910.2 | Symbols:CTN | CACTIN | cactus-binding carboxy-terminal%2C cactin | Chr1:996432-1000231 FORWARD LENGTH=716 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 78.285 672 672;716 1.62 7 4 2 0.0069088 2.136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86864 0.91382 60.857 12 7 Median 0.83861 2.5137 1.0788 NaN 0.76532 2.5988 1.3058 NaN 27.14 73.414 26.025 NaN 4 4 3 1 2 2 2 1 Median Linear Median Median 0 0 0 0 26553000000 10651000000 15902000000 13323000000 6201700000 7121500000 5528200000 1607100000 3921100000 7611100000 2816700000 4794400000 90451000 25106000 65345000 + 5991 36988 True 42144 201717;201718;201719;201720;201721;201722;201723;201724;201725;201726;201727;201728;201729 257245;257246;257247;257248;257249;257250;257251;257252;257253;257254;257255;257256;257257;257258 257247 REV__AT1G04635.1 REV__AT1G04635.1 1 1 1 AT1G04635.1 | Symbols:EMB1687,AtPOP5,POP5 | A. thaliana homolog of yeast POP5,EMBRYO DEFECTIVE 1687 | ribonuclease P family protein / Rpp14 family protein 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THALIAN 2 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 29.122 263 263;264 1 1 0.00041728 4.2006 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5993 1861 True 2114 10421 13511 13511 2607 180 REV__AT1G08510.1 REV__AT1G08510.1 1 1 1 AT1G08510.1 | Symbols:FATB | fatty acyl-ACP thioesterases B | fatty acyl-ACP thioesterases B | Chr1:2691546-2693409 REVERSE LENGTH=412 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 45.687 412 412 3 3 1 -2 By MS/MS By MS/MS 1.0771 1.0615 33.093 3 0 Median 1.0771 NaN NaN NaN 1.0615 NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 2 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 5873000000 3322300000 2550700000 3319100000 1640500000 1678600000 0 0 0 2553900000 1681800000 872090000 0 0 0 + + 5994 16885 True 19084 93099;93100;93101 119355;119356;119357;119358 119355 5610 291 REV__AT1G09210.1 REV__AT1G09210.1 1 1 1 AT1G09210.1 | Symbols:AtCRT1b,CRT1b | calreticulin 1b | calreticulin 1b | Chr1:2973217-2976655 REVERSE LENGTH=424 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 48.156 424 424 2.25 1 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 5995 5561 True 6317 30823;30824;30825;30826 39579;39580;39581;39582 39579 2608;2609 268;271 REV__AT1G09730.1 REV__AT1G09730.1 1 1 1 AT1G09730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Cysteine proteinases superfamily protein | Chr1:3148017-3154236 REVERSE LENGTH=963 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 109.64 963 963 1.75 2 1 1 0.0050369 2.2592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 16046000 2227000 13820000 16046000 2227000 13820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 5996 5774 True 6552 32124;32125;32126;32127 41179;41180;41181;41182 41181 5611 715 REV__AT1G10150.1 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Chr1:5508563-5511609 FORWARD LENGTH=345 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 39.171 345 345 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6001 15022 True 17010 82924 106882 106882 2611 264 REV__AT1G16410.1;REV__AT1G16410.2 REV__AT1G16410.1;REV__AT1G16410.2 2;1 2;1 2;1 AT1G16410.1 | Symbols:CYP79F1,BUS1,SPS1 | SUPERSHOOT 1,BUSHY 1,cytochrome p450 79f1 | cytochrome p450 79f1 | Chr1:5608862-5611118 FORWARD LENGTH=538;AT1G16410.2 | Symbols:CYP79F1,BUS1,SPS1 | SUPERSHOOT 1,BUSHY 1,cytochrome p450 79f1 | cytochrome p450 79 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 0 0 0 61.695 538 538;423 2.29 1 3 3 0.0031371 2.5155 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 19304000 14481000 4823400 0 0 0 0 0 0 19304000 14481000 4823400 0 0 0 + 6002 15678;35126 True;True 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2613 55 REV__AT1G19460.1 REV__AT1G19460.1 1 1 1 AT1G19460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein | Chr1:6738484-6739734 FORWARD LENGTH=416 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 47.185 416 416 2.25 1 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6004 26043 True 29814 144015;144016;144017;144018 183625;183626;183627;183628 183627 2614 148 REV__AT1G20220.1 REV__AT1G20220.1 2 2 2 AT1G20220.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Alba DNA/RNA-binding protein | Chr1:7005090-7007285 REVERSE LENGTH=315 1 2 2 2 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 33.763 315 315 2 2 0.0060736 2.2068 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 34226000000 13866000000 20361000000 0 0 0 34213000000 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2;2;2 2;2;2 AT1G24190.2 | Symbols:ATSIN3,SNL3,SIN3 | SIN3-like 3,ARABIDOPSIS THALIANA SIN3 HOMOLOG | SIN3-like 3 | Chr1:8563858-8569927 REVERSE LENGTH=1326;AT1G24190.1 | Symbols:ATSIN3,SNL3,SIN3 | SIN3-like 3,ARABIDOPSIS THALIANA SIN3 HOMOLOG | SIN3-like 3 | Chr1: 3 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 0 0 0 150.82 1326 1326;1330;1338 1.64 5 5 1 0.0029553 2.5249 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91974 0.88997 27.016 8 0 Median 1.1976 1.3598 0.63357 NaN 1.0863 1.2543 0.72711 NaN 0 0 0.16154 NaN 2 2 3 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 1761000000 858390000 902580000 398430000 182320000 216110000 598190000 233050000 365150000 483790000 284410000 199370000 280560000 158610000 121950000 + 6007 4845;25926 True;True 5529;29662 26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;26850;143351;143352;143353 34550;34551;34552;34553;34554;34555;34556;34557;182789 34555;182789 REV__AT1G24220.2;REV__AT1G24220.1 REV__AT1G24220.2;REV__AT1G24220.1 2;2 2;2 2;2 AT1G24220.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | paired amphipathic helix repeat-containing protein | Chr1:8578658-8582413 REVERSE LENGTH=744;AT1G24220.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | paired amphipathic hel 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 0 0 0 85.704 744 744;744 2.08 3 5 4 0.0022371 2.6552 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2154 1.2746 183.65 6 2 Median NaN NaN 1.0572 6.3171 NaN NaN 1.2575 6.9853 NaN NaN 0 283.69 1 1 2 2 1 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 360130000 185830000 174290000 61604000 36188000 25416000 80236000 36049000 44187000 128430000 63703000 64723000 89860000 49894000 39966000 + 6008 2195;2819 True;True 2477;3235 12182;12183;12184;12185;15987;15988;15989;15990;15991;15992;15993;15994 15765;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754 15765;20752 REV__AT1G24230.1 REV__AT1G24230.1 1 1 1 AT1G24230.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Paired amphipathic helix (PAH2) superfamily protein | Chr1:8584039-8585135 REVERSE LENGTH=245 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 27.792 245 245 1.5 2 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80665 0.73052 68.282 3 1 Median NaN 0.80665 NaN NaN NaN 0.73052 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 2 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 191960000 81625000 110330000 0 0 0 110560000 52539000 58016000 81403000 29086000 52317000 0 0 0 + + 6009 24030 True 27017 130650;130651;130652;130653 167133;167134;167135 167135 5615 118 REV__AT1G32030.1 REV__AT1G32030.1 1 1 1 AT1G32030.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | plant-specific B3-DNA-binding domain protein (DUF313) | Chr1:11514594-11515595 FORWARD LENGTH=333 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 37.696 333 333 2.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 192790000 192790000 0 92359000 92359000 0 0 0 0 100430000 100430000 0 0 0 0 + + 6010 25552 True 29209 141194;141195 180207;180208 180207 5616 109 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REV__AT1G53510.1 1 1 1 AT1G53510.1 | Symbols:MPK18,ATMPK18 | mitogen-activated protein kinase 18,ARABIDOPSIS THALIANA MAP KINASE 18 | mitogen-activated protein kinase 18 | Chr1:19970961-19974158 REVERSE LENGTH=615 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 69.351 615 615 1.67 1 2 0.0072579 2.1239 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97926 1.0676 33.001 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 438530000 233000000 205530000 0 0 0 143740000 91052000 52690000 159940000 72767000 87173000 134850000 69182000 65666000 + 6012 24680 True 28033 135557;135558;135559 173101;173102;173103;173104;173105 173105 5617 283 REV__AT1G53935.1 REV__AT1G53935.1 1 1 1 AT1G53935.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr1:20142065-20142604 REVERSE LENGTH=165 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 18.554 165 165 2.14 2 2 3 0.0040036 2.3689 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0083 1.0265 23.955 7 0 Median NaN 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REV__AT1G60980.1 1 1 1 AT1G60980.1 | Symbols:GA20OX4,ATGA20OX4 | gibberellin 20-oxidase 4 | gibberellin 20-oxidase 4 | Chr1:22452573-22454140 FORWARD LENGTH=376 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 43.133 376 376 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 0.89965 0.9271 5.864 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 175640000 86978000 88657000 0 0 0 114130000 50142000 63989000 61504000 36836000 24668000 0 0 0 + + 6015 8621 True 9768 47617;47618 61149;61150 61150 5618;5619 170;175 REV__AT1G63770.7;REV__AT1G63770.4;REV__AT1G63770.1;REV__AT1G63770.2;REV__AT1G63770.6;REV__AT1G63770.5;REV__AT1G63770.3 REV__AT1G63770.7;REV__AT1G63770.4;REV__AT1G63770.1;REV__AT1G63770.2;REV__AT1G63770.6;REV__AT1G63770.5;REV__AT1G63770.3 1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1 AT1G63770.7 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peptidase M1 family protein | Chr1:23657791-23663476 REVERSE LENGTH=883;AT1G63770.4 | Symbols:no symbol available | no full name available | Peptidase M1 family protein | Chr1:2365779 7 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 0 0 99.157 883 883;895;918;945;975;975;987 2.33 1 4 4 0.0045159 2.2979 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96027 1.079 26.421 9 1 Median 0.8812 NaN 1.0437 1.4458 0.82791 NaN 1.1676 1.483 11.662 NaN 11.152 6.9924 4 0 2 3 0 0 1 0 Median Median Median Plateau 0 0 0 0 14586000000 6828700000 7757400000 4355600000 2306100000 2049500000 0 0 0 4721400000 2320200000 2401200000 5509200000 2202400000 3306800000 + 6016 2405 True 2712 13345;13346;13347;13348;13349;13350;13351;13352;13353 17272;17273;17274;17275;17276 17272 5620 653 REV__AT1G63900.2;REV__AT1G63900.1 REV__AT1G63900.2;REV__AT1G63900.1 1;1 1;1 1;1 AT1G63900.2 | Symbols:SP1,DAL1 | SUPPRESSOR OF PPI1 locus 1,DIAP1-like protein 1 | E3 Ubiquitin ligase family protein | Chr1:23717056-23718742 FORWARD LENGTH=277;AT1G63900.1 | Symbols:SP1,DAL1 | SUPPRESSOR OF PPI1 locus 1,DIAP1-like protein 1 | E3 Ubiqu 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 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13 | myosin heavy chain-like protein | Chr2:6279594-6 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 51.47 454 454;491;573;573;596;629;629;652 2.17 2 1 3 0.0081072 2.0814 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7651 0.90147 55.853 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 861720000 483830000 377890000 0 0 0 281410000 188190000 93218000 292240000 146500000 145740000 288070000 149140000 138930000 + 6031 21778 True 24490 118844;118845;118846;118847;118848;118849 152158;152159;152160;152161;152162;152163;152164 152162 REV__AT2G18876.2;REV__AT2G18876.1 REV__AT2G18876.2;REV__AT2G18876.1 1;1 1;1 1;1 AT2G18876.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Afadin/alpha-actinin-binding protein | Chr2:8170594-8172287 FORWARD LENGTH=284;AT2G18876.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Afadin/alpha-actinin-binding protein 2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 32.369 284 284;382 1.33 2 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 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Chr2:18026397-18030989 REVERSE LENGTH=858;AT2G43410.1 | Symbols:FPA | | RNA binding protein | Chr2:18 6 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 83.788 762 762;858;858;901;901;901 2 1 2 1 1 -2 By MS/MS By matching By matching 1.0541 1.0335 14.67 4 0 Median NaN 1.077 NaN NaN NaN 1.0335 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 2 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 393600000 210730000 182870000 0 0 0 107530000 51299000 56226000 177550000 107210000 70342000 108520000 52222000 56300000 + + 6041 15590 True 17649 86270;86271;86272;86273 111218 111218 5626 420 REV__AT2G44530.2;REV__AT2G44530.1 REV__AT2G44530.2;REV__AT2G44530.1 1;1 1;1 1;1 AT2G44530.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphoribosyltransferase family protein | Chr2:18383732-18385974 FORWARD LENGTH=393;AT2G44530.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phosphoribosyltransferase fami 2 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 42.496 393 393;394 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 2285800000 739270000 1546500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2285800000 739270000 1546500000 + + 6042 30073 True 34337 164548 209647 209647 5627 393 REV__AT2G45900.3;REV__AT2G45900.2;REV__AT2G45900.1 REV__AT2G45900.3;REV__AT2G45900.2;REV__AT2G45900.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT2G45900.3 | Symbols:TRM13 | TON1 Recruiting Motif 13 | Phosphatidylinositol N-acetyglucosaminlytransferase subunit P-like protein | Chr2:18886069-18888674 REVERSE LENGTH=720;AT2G45900.2 | Symbols:TRM13 | TON1 Recruiting Motif 13 | Phosphatidylinositol 3 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 81.664 720 720;720;720 2 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 44122000 6954900 37168000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44122000 6954900 37168000 + + 6043 15553 True 17606 86067;86068 110978;110979 110979 5628 394 REV__AT2G47030.1 REV__AT2G47030.1 1 1 1 AT2G47030.1 | Symbols:VGDH1 | | Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily | Chr2:19324415-19326268 REVERSE LENGTH=588 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 64.137 588 588 1.33 2 1 0.0094538 2.0198 By MS/MS By matching 2.3564 2.2556 72.446 3 0 Median NaN 2.3564 NaN NaN NaN 2.2556 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 2 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 975680000 403750000 571930000 0 0 0 633340000 184040000 449300000 342340000 219710000 122630000 0 0 0 + 6044 18003 True 20378 99436;99437;99438 127421 127421 REV__AT3G01860.2;REV__AT3G01860.1 REV__AT3G01860.2;REV__AT3G01860.1 1;1 1;1 1;1 AT3G01860.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr3:303767-304329 FORWARD LENGTH=159;AT3G01860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr3:302869-304329 FORWARD LEN 2 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 18.341 159 159;223 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6045 27905 True 31922 153476;153477 195559;195560 195560 3134 5629;5630 2 11;12 REV__AT3G02170.3;REV__AT3G02170.2;REV__AT3G02170.1;REV__AT5G15580.1 REV__AT3G02170.3;REV__AT3G02170.2;REV__AT3G02170.1;REV__AT5G15580.1 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT3G02170.3 | Symbols:TRM1,LNG2 | LONGIFOLIA2,TON1 Recruiting Motif 1 | longifolia2 | Chr3:397263-399393 REVERSE LENGTH=634;AT3G02170.2 | Symbols:TRM1,LNG2 | LONGIFOLIA2,TON1 Recruiting Motif 1 | longifolia2 | Chr3:397042-399393 REVERSE LENGTH=677;AT3G 4 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 70.546 634 634;677;905;927 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 225380000 101130000 124250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 225380000 101130000 124250000 + + 6046 32279 True 36775 175266 223205 223205 5631 257 REV__AT3G02555.1;REV__AT3G02555.2;REV__AT5G16110.1 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REV__AT3G02930.2;REV__AT3G02930.3;REV__AT3G02930.1 REV__AT3G02930.2;REV__AT3G02930.3;REV__AT3G02930.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G02930.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | weak chloroplast movement under blue light protein (DUF827) | Chr3:655158-658319 FORWARD LENGTH=804;AT3G02930.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | weak chloroplas 3 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 91.617 804 804;806;806 1.25 3 1 0.0024155 2.6027 By matching By MS/MS By matching 1.0516 0.99711 8.0104 4 0 Median NaN 1.0516 NaN NaN NaN 0.99711 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 1 2 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 1175400000 584380000 591060000 146920000 71242000 75680000 622350000 292230000 330120000 406170000 220910000 185260000 0 0 0 + 6048 30593 True 34923 166964;166965;166966;166967 212686;212687;212688 212687 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325;325;325;325;325;325;325;325;325;460 3 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6050 31153 True 35535 169564 215890 215890 2619 319 REV__AT3G12050.1;REV__AT3G12050.2 REV__AT3G12050.1;REV__AT3G12050.2 2;1 2;1 2;1 AT3G12050.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Aha1 domain-containing protein | Chr3:3839289-3841303 FORWARD LENGTH=360;AT3G12050.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Aha1 domain-containing protein | Chr3:383 2 2 2 2 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 40.184 360 360;321 1.67 1 2 0.0034754 2.4304 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81673 0.88193 13.906 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 6963500000 3843600000 3119900000 0 0 0 2634300000 1278200000 1356200000 4329100000 2565400000 1763700000 0 0 0 + 6051 15249;19890 True;True 17265;22428 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Median Median Plateau 0 0 0 0 781810000 384790000 397020000 182880000 84653000 98232000 184730000 107500000 77228000 183570000 90169000 93399000 230630000 102460000 128160000 + 6053 5028 True 5728 27809;27810;27811;27812;27813;27814;27815;27816;27817 35818;35819;35820;35821;35822;35823 35818 REV__AT3G18380.3;REV__AT3G18380.1;REV__AT3G18380.2 REV__AT3G18380.3;REV__AT3G18380.1;REV__AT3G18380.2 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G18380.3 | Symbols:DTF2,SHH2 | DNA-BINDING TRANSCRIPTION FACTOR 2,SAWADEE homeodomain homolog 2 | DNA-BINDING TRANSCRIPTION FACTOR 2 | Chr3:6311002-6313181 REVERSE LENGTH=346;AT3G18380.1 | Symbols:DTF2,SHH2 | DNA-BINDING TRANSCRIPTION FACTOR 2,SAWADE 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 38.391 346 346;348;349 1.88 28 20 20 0.009602 2.0097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96834 0.96836 31.427 64 9 Median 0.96288 0.96834 1.2766 0.75601 0.89568 0.91196 1.405 0.84433 16.259 28.032 19.229 31.781 16 18 15 15 2 3 1 3 Median Median Median Median 0 0 0 0 26893000000 13243000000 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210829;210830;210831;210832;210833;210834;210835;210836;210837;210838;210839;210840;210841;210842;210843;210844;210845;210846;210847;210848;210849;210850;210851;210852;210853;210854;210855;210856;210857;210858;210859;210860;210861;210862;210863;210864;210865;210866;210867;210868;210869;210870;210871;210872;210873;210874;210875;210876;210877;210878;210879;210880 210879 REV__AT3G21865.1 REV__AT3G21865.1 1 1 1 AT3G21865.1 | Symbols:PEX22 | peroxin 22 | peroxin 22 | Chr3:7701308-7703218 REVERSE LENGTH=283 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 31.398 283 283 1.8 2 2 1 0.0067376 2.143 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0208 1.0669 36.655 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 939970000 592010000 347950000 30895000 19610000 11285000 218830000 218830000 0 525270000 188610000 336670000 164960000 164960000 0 + 6055 27951 True 31972 153727;153728;153729;153730;153731 195905;195906;195907;195908;195909 195907 REV__AT3G25250.1 REV__AT3G25250.1 1 1 1 AT3G25250.1 | Symbols:OXI1,AGC2,AtOXI1,AGC2-1 | AGC2 kinase 1,oxidative signal-inducible1 | AGC (cAMP-dependent%2C cGMP-dependent and protein kinase C) kinase family protein | Chr3:9195566-9196949 FORWARD LENGTH=421 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 47.559 421 421 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6056 25979 True 29739 143736;143737 183269;183270 183270 2621;2622;3135 34;35;41 REV__AT3G26560.1 REV__AT3G26560.1 1 1 1 AT3G26560.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATP-dependent RNA helicase | Chr3:9750122-9753719 REVERSE LENGTH=1168 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 134.16 1168 1168 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 4.0046 4.2249 10.334 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 3188900000 753930000 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Median Median 0 0 0 0 175680000 108360000 67322000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 175680000 108360000 67322000 + + 6059 11939 True 13496 65240 83932 83932 5635 182 REV__AT3G43160.1 REV__AT3G43160.1 1 1 1 AT3G43160.1 | Symbols:MEE38 | maternal effect embryo arrest 38 | maternal effect embryo arrest 38 | Chr3:15166561-15168225 FORWARD LENGTH=295 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 33.357 295 295 1.5 5 2 1 0.0064114 2.1809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88759 0.9078 13.687 8 1 Median 0.98439 0.88759 0.65186 NaN 0.9078 0.92495 0.72166 NaN 0 8.0533 0 NaN 2 3 2 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 65077000000 28406000000 36671000000 11772000000 5324100000 6447600000 21838000000 8755500000 13082000000 22901000000 10402000000 12499000000 8565700000 3924200000 4641600000 + 6060 15035 True 17023 82991;82992;82993;82994;82995;82996;82997;82998 106959;106960;106961;106962;106963;106964;106965;106966;106967;106968;106969;106970;106971;106972;106973;106974;106975;106976 106960 REV__AT3G44716.2 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protein | Chr3:19469652-19470623 REVERSE LENGTH=214;AT3G52510.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | F-box associate 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 24.694 214 214;216 2.25 1 1 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6064 7201 True 8188 40145;40146;40147;40148 51288;51289;51290;51291 51288 2624 94 REV__AT3G53790.1 REV__AT3G53790.1 1 1 1 AT3G53790.1 | Symbols:TRFL4 | TRF-like 4 | TRF-like 4 | Chr3:19928478-19930267 FORWARD LENGTH=400 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 44.998 400 400 1.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 0.69375 0.69897 26.718 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 294780000 174910000 119870000 0 0 0 138010000 70574000 67441000 156770000 104340000 52432000 0 0 0 + + 6065 17883 True 20242 98752;98753 126593;126594 126593 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 9720900000 3598400000 6122600000 0 0 0 0 0 0 4596900000 1603200000 2993700000 5124100000 1995200000 3128900000 + + 6068 9391 True 10632 51607;51608 66248;66249 66248 5639 745 REV__AT3G62030.3;REV__AT3G62030.1;REV__AT3G62030.2 REV__AT3G62030.3;REV__AT3G62030.1;REV__AT3G62030.2 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT3G62030.3 | Symbols:ROC4,CYP20-3 | rotamase CYP 4,cyclophilin 20-3 | rotamase CYP 4 | Chr3:22973708-22975139 FORWARD LENGTH=259;AT3G62030.1 | Symbols:ROC4,CYP20-3 | rotamase CYP 4,cyclophilin 20-3 | rotamase CYP 4 | Chr3:22973708-22975139 FORWARD LEN 3 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 28.079 259 259;260;313 1.8 2 2 1 0.0082746 2.0721 By MS/MS By matching By MS/MS 0.8153 0.98677 20.155 5 0 Median NaN 1.1142 NaN 0.6762 NaN 1.1312 NaN 0.7589 NaN 0 NaN 0 0 2 1 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 2228400000 1123900000 1104600000 0 0 0 941940000 414100000 527840000 421120000 238470000 182650000 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1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 89.046 793 793 2 1 1 0.0062344 2.1861 By MS/MS By MS/MS 3.2265 3.4126 38.283 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 974460000 243180000 731280000 0 0 0 308840000 93392000 215450000 665620000 149790000 515840000 0 0 0 + 6073 23017 True 25865 125158;125159 160218;160219 160219 REV__AT4G21710.1 REV__AT4G21710.1 1 1 1 AT4G21710.1 | Symbols:EMB1989,NRPB2,RPB2 | EMBRYO DEFECTIVE 1989 | DNA-directed RNA polymerase family protein | Chr4:11535684-11542200 REVERSE LENGTH=1188 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 135.02 1188 1188 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 65609000 34964000 30645000 0 0 0 0 0 0 65609000 34964000 30645000 0 0 0 + + 6074 24600 True 27907 134652 171961 171961 5644;5645;5646 14;19;21 REV__AT4G24800.4;REV__AT4G24800.3;REV__AT4G24800.2;REV__AT4G24800.1 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LENGTH=371;AT4G31350.4 | Symbols:no symbol available | no full name availa 4 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 43.212 371 371;376;376;376 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6077 20519 True 23108 112734 144550 144550 2625 19 REV__AT4G32250.3;REV__AT4G32250.2;REV__AT4G32250.1 REV__AT4G32250.3;REV__AT4G32250.2;REV__AT4G32250.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT4G32250.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein kinase superfamily protein | Chr4:15570285-15572528 REVERSE LENGTH=611;AT4G32250.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Protein kinase superfamily protein | 3 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 68.157 611 611;611;611 1.67 2 4 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 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AT4G36120.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | filament-like protein (DUF869) | Chr4:17093213-17096573 REVERSE LENGTH=996;AT4G36120.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | filament-like protein (DUF869) | Chr4:1 2 3 3 3 1 1 3 0 1 1 3 0 1 1 3 0 0 0 0 111.88 996 996;996 2.5 3 3 0.00098078 3.2727 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63441 0.59489 85.472 5 1 Median 0.63441 NaN 0.41456 NaN 0.59489 NaN 0.48042 NaN 0 NaN 167.67 NaN 2 1 2 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 126590000 75867000 50719000 29585000 16651000 12934000 17133000 10617000 6516700 79867000 48598000 31269000 0 0 0 + 6080 1056;7014;7817 True;True;True 1179;7980;8875 5802;5803;5804;5805;39178;43214 7560;7561;50106;55359 7560;50106;55359 REV__AT5G08030.1;REV__AT5G08030.2 REV__AT5G08030.1;REV__AT5G08030.2 1;1 1;1 1;1 AT5G08030.1 | Symbols:AtGDPD6,GDPD6 | glycerophosphodiester phosphodiesterase 6 | PLC-like phosphodiesterases superfamily protein | Chr5:2575152-2576770 REVERSE 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NaN 0 NaN 0 NaN 2 1 2 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 995760000 563720000 432040000 281320000 164800000 116520000 172150000 97145000 75002000 338810000 202790000 136030000 203480000 98988000 104490000 + 6082 28918 True 33071 158890;158891;158892;158893;158894;158895 202398;202399;202400;202401;202402 202401 5648 125 REV__AT5G13600.1 REV__AT5G13600.1 1 1 1 AT5G13600.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Phototropic-responsive NPH3 family protein | Chr5:4380432-4382497 FORWARD LENGTH=591 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 66.499 591 591 2 1 2 1 1 -2 By MS/MS By matching By matching 1.5651 1.6092 5.8241 4 0 Median NaN 1.7903 NaN NaN NaN 1.6313 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 2 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 348190000 139120000 209070000 0 0 0 201240000 73926000 127320000 96346000 46630000 49716000 50604000 18567000 32037000 + + 6083 30098 True 34363 164652;164653;164654;164655 209803 209803 5649;5650 211;212 REV__AT5G16260.1 REV__AT5G16260.1 2 2 2 AT5G16260.1 | Symbols:ELF9 | EARLY FLOWERING 9 | RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr5:5311363-5315496 FORWARD LENGTH=519 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 0 0 0 57.893 519 519 1.92 4 6 3 0.0046898 2.2806 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.036 15.734 305.71 6 6 Median NaN 0.1246 NaN NaN NaN 0.12343 NaN NaN NaN 344.05 NaN NaN 1 3 1 1 1 3 1 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 1206600000 823870000 382720000 96539000 44298000 52241000 768930000 594600000 174330000 184480000 75369000 109110000 156650000 109610000 47038000 + 6084 26683;37564 True;True 30573;42778 147586;147587;147588;147589;147590;147591;147592;147593;147594;147595;147596;205103;205104 188088;188089;188090;188091;188092;188093;188094;188095;188096;188097;188098;261558;261559 188096;261558 REV__AT5G16310.1 REV__AT5G16310.1 1 1 1 AT5G16310.1 | Symbols:UCH1 | | Peptidase C12%2C ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1 | Chr5:5342579-5344153 REVERSE LENGTH=334 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 38.539 334 334 2 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 205750000 162210000 43547000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 205750000 162210000 43547000 + + 6085 8980 True 10160 49543 63646 63646 5651 102 REV__AT5G20200.1 REV__AT5G20200.1 3 3 3 AT5G20200.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | nucleoporin-like protein | Chr5:6816776-6821620 FORWARD LENGTH=762 1 3 3 3 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 0 0 0 81.684 762 762 2.1 2 5 3 0.00021515 4.7023 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95455 0.95707 53.513 8 0 Median 0.77552 0.59743 1.566 1.2618 0.73231 0.55484 1.8904 1.409 0 9.3321 19.035 16.845 2 2 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 2815500000 1252600000 1563000000 578030000 349640000 228400000 498650000 308560000 190090000 1093900000 322280000 771610000 644950000 272080000 372880000 + 6086 625;9206;30277 True;True;True 698;10418;34566 3610;50676;50677;50678;50679;50680;50681;50682;50683;165417 4737;65100;65101;65102;65103;65104;65105;65106;65107;210735 4737;65102;210735 REV__AT5G22140.2;REV__AT5G22140.1 REV__AT5G22140.2;REV__AT5G22140.1 1;1 1;1 1;1 AT5G22140.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein | Chr5:7340284-7341398 REVERSE LENGTH=311;AT5G22140.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | FAD/NAD(P)-binding oxido 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 33.959 311 311;365 2.26 2 10 7 0.0043415 2.3108 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0164 1.0299 24.661 19 2 Median 1.0076 1.0225 0.76816 1.5979 0.97243 1.0208 0.91727 1.7013 19.803 5.538 12.736 15.792 3 5 7 4 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 15838000000 7494900000 8343200000 1688100000 775060000 913040000 2441700000 1210900000 1230700000 6636100000 3704600000 2931500000 5072200000 1804400000 3267800000 + 6087 17528 True 19822;19823 96767;96768;96769;96770;96771;96772;96773;96774;96775;96776;96777;96778;96779;96780;96781;96782;96783;96784;96785 124141;124142;124143;124144;124145;124146;124147;124148;124149;124150;124151;124152;124153;124154 124146 5652 112 REV__AT5G23110.1 REV__AT5G23110.1 2 2 2 AT5G23110.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Zinc finger%2C C3HC4 type (RING finger) family protein | Chr5:7758307-7775509 FORWARD LENGTH=4706 1 2 2 2 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 527.25 4706 4706 2.5 1 1 0.0079323 2.0832 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 62679000 30173000 32506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62679000 30173000 32506000 + 6088 23393;33772 True;True 26274;38478 127123;183484 162654;233691 162654;233691 REV__AT5G24120.3;REV__AT5G24120.2;REV__AT5G24120.1 REV__AT5G24120.3;REV__AT5G24120.2;REV__AT5G24120.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT5G24120.3 | Symbols:SIGE,ATSIG5,SIG5 | SIGMA FACTOR 5,sigma factor E | sigma factor E | Chr5:8157794-8159746 REVERSE LENGTH=517;AT5G24120.2 | Symbols:SIGE,ATSIG5,SIG5 | SIGMA FACTOR 5,sigma factor E | sigma factor E | Chr5:8157794-8159746 REVERSE LEN 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 58.813 517 517;517;517 1.75 4 2 2 1 -2 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6089 18289 True 20685 101013;101014;101015;101016;101017;101018;101019;101020 129420;129421;129422;129423;129424;129425 129423 2628 5653 255 254 REV__AT5G35770.1 REV__AT5G35770.1 1 1 1 AT5G35770.1 | Symbols:SAP | STERILE APETALA | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein | Chr5:13936457-13940786 REVERSE LENGTH=446 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 49.306 446 446 2.62 1 1 6 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6090 22445 True 25254 122346;122347;122348;122349;122350;122351;122352;122353 156711;156712;156713;156714;156715;156716 156712 2629 280 REV__AT5G41650.1 REV__AT5G41650.1 1 1 1 AT5G41650.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein | Chr5:16654956-16655578 FORWARD LENGTH=117 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 12.861 117 117 2 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS 1.1072 1.107 15.188 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 251030000 126200000 124830000 0 0 0 125590000 57082000 68506000 0 0 0 125440000 69121000 56322000 + + 6091 140 True 155 807;808 1137;1138 1138 5654 8 REV__AT5G41820.2;REV__AT5G41820.1 REV__AT5G41820.2;REV__AT5G41820.1 1;1 1;1 1;1 AT5G41820.2 | Symbols:ATRGTA2,RGTA2 | RAB geranylgeranyl transferase alpha subunit 2 | RAB geranylgeranyl transferase alpha subunit 2 | Chr5:16740804-16743433 FORWARD LENGTH=687;AT5G41820.1 | Symbols:ATRGTA2,RGTA2 | RAB geranylgeranyl transferase alpha 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 79.14 687 687;687 2 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS 0.69259 0.79081 7.46 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 699710000 474290000 225420000 0 0 0 0 0 0 352300000 264350000 87947000 347410000 209940000 137470000 + + 6092 24823 True 28265 136712;136713 174564;174565 174565 5655 440 REV__AT5G44020.1 REV__AT5G44020.1 1 1 1 AT5G44020.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | HAD superfamily%2C subfamily IIIB acid phosphatase | Chr5:17712433-17714046 FORWARD LENGTH=272 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 31.056 272 272 2.5 1 1 1 -2 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 52354000 32773000 19581000 52354000 32773000 19581000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6093 23607 True 26510 128426;128427 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Putative methyltransferase family protein | Chr5:20110961-20111785 REVERSE LENGTH=274 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 30.493 274 274 1.47 11 4 2 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2415 1.1249 43.581 17 0 Median 2.6936 1.2164 0.70545 1.589 2.3662 1.1041 0.80032 1.7353 36.655 12.677 7.5265 19.475 6 5 4 2 0 0 0 0 Plateau Median Median Median 0 0 0 0 1613900000 754080000 859830000 481220000 150080000 331140000 567630000 295380000 272250000 387940000 237580000 150360000 177120000 71042000 106080000 + + 6095 5969 True 6769;6770 33137;33138;33139;33140;33141;33142;33143;33144;33145;33146;33147;33148;33149;33150;33151;33152;33153 42429;42430;42431;42432;42433;42434;42435;42436 42429 5657 274 REV__AT5G50280.1 REV__AT5G50280.1 2 2 2 AT5G50280.1 | Symbols:EMB1006 | embryo defective 1006 | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr5:20459238-20461504 FORWARD LENGTH=723 1 2 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 0 0 0 82.172 723 723 2.5 1 1 4 0.0057194 2.2094 By MS/MS By MS/MS By matching 1.1504 1.2464 12.315 5 0 Median 1.1504 1.3612 NaN NaN 1.0512 1.2675 NaN NaN 0 2.3663 NaN NaN 2 2 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 223320000 105510000 117820000 84635000 39123000 45512000 72354000 34923000 37431000 66334000 31461000 34873000 0 0 0 + 6096 24666;24944 True;True 28012;28425 135466;135467;135468;135469;135470;137384 173002;173003;175414 173002;175414 2630 543 REV__AT5G51730.1 REV__AT5G51730.1 2 2 2 AT5G51730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr5:21011418-21013365 FORWARD LENGTH=317 1 2 2 2 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 34.972 317 317 1.67 1 2 0.0053754 2.2258 By MS/MS By MS/MS 1.0648 1.141 1.4804 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 1711400000 773590000 937850000 0 0 0 1475400000 641500000 833920000 236010000 132090000 103930000 0 0 0 + 6097 2367;30164 True;True 2669;34432 13127;164928;164929 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NaN 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 83400000 33822000 49578000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83400000 33822000 49578000 + + 6100 25199 True 28754 138986 177432 177432 5659 176 REV__AT5G65530.1 REV__AT5G65530.1 1 1 1 AT5G65530.1 | Symbols:AtRLCK VI_A3 | Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase AtRLCK VI_A3 | Protein kinase superfamily protein | Chr5:26190844-26192826 REVERSE LENGTH=456 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 51.55 456 456 1 1 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6101 14009 True 15829 77137 99627 99627 3138 5660 47 52 REV__AT5G66650.1 REV__AT5G66650.1 1 1 1 AT5G66650.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | calcium uniporter (DUF607) | Chr5:26603204-26604257 REVERSE LENGTH=321 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 36.765 321 321 1.43 5 1 1 1 -2 By matching By MS/MS By matching By matching 2.3846 2.3439 62.263 7 0 Linear NaN 1.9141 0.51335 NaN NaN 1.9592 0.57608 NaN NaN 2.7391 4.0284 NaN 1 3 2 1 0 0 0 0 Median Plateau Median Median 0 0 0 0 37367000000 14019000000 23348000000 4900900000 2151500000 2749400000 28482000000 9312900000 19169000000 2885400000 1829700000 1055700000 1098700000 725080000 373630000 + + 6102 31490 True 35903 171295;171296;171297;171298;171299;171300;171301 218172;218173 218172 5661;5662 205;210 REV__ATCG01280.1;REV__ATCG00860.1 REV__ATCG01280.1;REV__ATCG00860.1 2;2 2;2 2;2 ATCG01280.1 | Symbols:YCF2.2 | | Chloroplast Ycf2%3BATPase%2C AAA type%2C core | ChrC:145291-152175 REVERSE LENGTH=2294;ATCG00860.1 | Symbols:YCF2.1 | | Chloroplast Ycf2%3BATPase%2C AAA type%2C core | ChrC:86474-93358 FORWARD LENGTH=2294 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 0 0 0 269.56 2294 2294;2294 2 2 1 2 0.0032961 2.4429 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7603 0.82724 56.502 5 1 Median NaN NaN NaN 0.45798 NaN NaN NaN 0.52031 NaN NaN NaN 65.573 1 1 1 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 0 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NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 378280000 166600000 211680000 0 0 0 378280000 166600000 211680000 0 0 0 0 0 0 + + + 6105 11111 True 12551 60737 78044 78044 5665 330 REV__CON__Q6IFU5 REV__CON__Q6IFU5 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 48.139 431 431 1.33 2 1 0.0087827 2.0455 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 6106 17859 True 20214 98616;98617;98618 126430;126431;126432 126430 2632 291