Raw file Scan number Scan index Sequence Length Missed cleavages Modifications Modified sequence Deamidation (NQ) Probabilities Oxidation (M) Probabilities Deamidation (NQ) Score Diffs Oxidation (M) Score Diffs Acetyl (Protein N-term) Deamidation (NQ) Oxidation (M) Proteins Charge Fragmentation Mass analyzer Type Scan event number Isotope index m/z Mass Mass error [ppm] Mass error [Da] Simple mass error [ppm] Retention time PEP Score Delta score Score diff Localization prob Combinatorics PIF Fraction of total spectrum Base peak fraction Precursor Full ScanNumber Precursor Intensity Precursor Apex Fraction Precursor Apex Offset Precursor Apex Offset Time Matches Intensities Mass Deviations [Da] Mass Deviations [ppm] Masses Number of Matches Intensity coverage Peak coverage Neutral loss level ETD identification type Reverse All scores All sequences All modified sequences id Protein group IDs Peptide ID Mod. peptide ID Evidence ID Deamidation (NQ) site IDs Oxidation (M) site IDs 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IITHPNFNGNTLDNDIM(63.3)LIK 0 0 1 CON__P00761 3 CID ITMS MULTI-MSMS 3 0 767.06322 2298.1678 -0.72934 -0.00055945 -438.36937 40.996 0.013322 63.302 27.973 63.302 1 1 0 0 0 14764 8207604.34375 0.480808200850686 -3 0.1195068359375 y2;y3;y4;y7;y8;y9;y10;y12;y13;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y13(2+);b7;b11;b12;b13;b7-H2O;b11-H2O;b10(2+);b11(2+);b19(2+) 290.8;139.2;436.3;1360.5;4786.6;985.3;498.3;111.2;171;365.2;1638.3;1523.1;6401;967.1;947.7;88.9;117.1;1197.9;498.3;434.2;1848.1;7171.5 -0.0151984993905785;0.1658808618688;0.0562605589187797;0.0552267568000389;-0.0368487658874983;0.0242659957625619;0.110884899550001;0.162336617225037;0.0941800800501369;-0.0527712492875025;0.0410753119812171;0.0275658910500169;-0.0322795391749651;-0.0789854699186208;0.0110091807750905;-0.0249219560123493;0.163153888487614;-0.0734979101248427;0.0724659788500048;-0.0646842063312079;-0.00880151224998826;0.0174250058003054 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IITHPNFNGNTLDNDIM(1)LIK IITHPNFNGNTLDNDIM(60.56)LIK 0 0 1 CON__P00761 3 CID ITMS MULTI-MSMS 3 0 767.06322 2298.1678 -0.16619 -0.00012747 2.0684435 47.503 0.014303 60.564 21.327 60.564 1 1 0 0 0 17988 1638866.390625 0.686766576358932 1 -0.0280227661132813 y2;y3;y4;y7;y8;y9;y10;y9(2+);y10(2+);y11(2+);b2;b11;b13;b16;b11-H2O;b7(2+);b8(2+);b11(2+);b13(2+);b15(2+);b17(2+);b18(2+);b19(2+) 39;126.2;90;424.3;1037.7;368;188.2;135.6;516.7;181.5;53.4;140.4;19.8;40.4;188.2;55.5;69.2;755.4;439.1;247.1;369.1;276.4;2879 -0.0241401497812035;0.000872316946924911;0.0512556761062797;-0.119822071324961;0.0091717419250017;-0.0367691604874381;0.00993275111250114;-0.122778573506253;0.0340562690124671;0.0625390355812669;0.1453446129469;-0.0920181629749095;-0.0559623224498864;-0.0759780581622636;-0.0284861695874952;0.000614004200087948;0.060102630143831;-0.00788598490623826;-0.0183614826124767;-0.104458957856195;0.0492667871187678;0.0623070781000479;0.0494074276753054 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_IITHPNFNGNTLDNDIM(ox)LIK_;_EIKIM(ox)SQFDLFKLN(de)GSAGQR_;_Q(de)WITFQ(de)HFSFLKRM(ox)LWL_ 629 1 268 273 1045 0;1;2;3 20190510_RS_XS_21 19838 17433 IITHPNFNGNTLDNDIMLIK 20 0 Oxidation (M) _IITHPNFNGNTLDNDIM(ox)LIK_ IITHPNFNGNTLDNDIM(1)LIK IITHPNFNGNTLDNDIM(82.01)LIK 0 0 1 CON__P00761 3 CID ITMS MULTI-MSMS 15 1 767.06322 2298.1678 0.078737 6.0396E-05 1.0241333 51.331 0.0070507 82.007 47.285 82.007 1 1 0 0 0 19823 762786.90625 0.113171746490983 -17 0.496475219726563 y2;y3;y4;y7;y8;y9;y10;y4-NH3;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y18(2+);b2;b11;b11-H2O;b11(2+);b12(2+);b15(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b19(2+) 59.6;142.7;98.1;441.2;1216.4;331.9;146.7;67.7;167.4;733.5;621.7;321.2;28.7;157.9;146.7;588.9;241.6;353.7;192;459.5;1046.9;3625.3 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_IITHPNFNGN(de)TLDNDIM(ox)LIK_ IITHPN(0.138)FN(0.138)GN(0.705)TLDN(0.019)DIMLIK IITHPNFNGNTLDNDIM(1)LIK IITHPN(-7.1)FN(-7.1)GN(7.1)TLDN(-15.61)DIMLIK IITHPNFNGNTLDNDIM(84.89)LIK 0 1 1 CON__P00761 3 CID ITMS MULTI-MSMS 3 1 767.39122 2299.1518 0.13615 0.00010448 1.2778823 44.555 0.0070964 84.895 49.023 84.895 1 4 0 0 0 18137 1904834.125 0.0121793057502091 28 -0.811790466308594 y2;y3;y4;y6;y7;y8;y9;y10;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);b2;b4;b11;b12;b13;b11-H2O;b11-NH3;b8(2+);b11(2+);b12(2+);b15(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b19(2+) 295.4;289.7;719;1117.8;1650.7;5530.3;1297.8;436.6;180.8;439.1;965.6;1626.5;56;439.7;558.6;70.3;83.7;400.7;334.8;151.4;2173.2;1034.7;633.2;493;675.1;1296.4;7937.7 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_IITHPNFNGNTLDNDIM(ox)LIKLSSPATLNSR_;_TVSKQQYKGMAIFTPVICGVGGN(de)LVAIQ(de)TSR_;_LVLYDFQ(de)N(de)AQ(de)KIQIPN(de)YSLN(de)LQSLKELK_ 670 1 269 277 1116 0;1;2;3 20190510_RS_XS_21 16886 14710 IITHPNFNGNTLDNDIMLIKLSSPATLNSR 30 1 Oxidation (M) _IITHPNFNGNTLDNDIM(ox)LIKLSSPATLNSR_ IITHPNFNGNTLDNDIM(1)LIKLSSPATLNSR IITHPNFNGNTLDNDIM(52.74)LIKLSSPATLNSR 0 0 1 CON__P00761 4 CID ITMS MULTI-MSMS 14 2 832.18568 3324.7136 2.0418 0.0016992 302.48301 45.296 0.0032053 52.739 35.663 52.739 1 1 0 0 0 16872 2186500.90234375 0.0574426825362082 -7 0.218296051025391 y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y6-NH3;y7(2+);y8(2+);y11(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);y20(2+);b7;b11;b12;b14;b15;b16;b10(2+);b11(2+);b12(2+);b13(2+);b19(2+);b20(2+);b21(2+);b22(2+);b23(2+);b25(2+);b26(2+) 171;268.1;696.5;656.2;6100.3;1889.3;787.7;477.4;929.4;339.3;407.6;434.2;697.7;2673.6;1292;790;2208.6;451.4;162.5;21.2;32.8;9.4;170;1659;535.7;457.6;2324;595;463.6;551.3;1097.2;61;26.1 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_IITHPNFNGNTLDNDIM(ox)LIKLSSPATLNSR_ IITHPNFNGNTLDNDIM(1)LIKLSSPATLNSR IITHPNFNGNTLDNDIM(46.15)LIKLSSPATLNSR 0 0 1 CON__P00761 4 CID ITMS MULTI-MSMS 1 2 832.18568 3324.7136 2.0418 0.0016992 1.945847 45.357 0.0080109 46.145 25.757 46.145 1 1 0 0 0 16910 14607423.1640625 0.383759078528557 -5 0.171562194824219 y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y7(2+);y8(2+);y11(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);b4;b7;b11;b12;b13;b11(2+);b12(2+);b13(2+);b16(2+);b18(2+);b19(2+);b20(2+);b21(2+);b22(2+);b23(2+) 898.9;1462.1;3352.7;3032.1;21635.6;6379.2;2656.7;3466.9;1168.8;2226.9;1912.1;8984.6;3232.8;354.1;8980.8;1328;307.5;82.9;4151;1782.3;1739.8;1305.8;2623.4;8353.3;1626.3;954.6;1961.4;3356.3 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MIEDTMTLLSLLGRIMR 17 1 Acetyl (Protein N-term),2 Oxidation (M) _(ac)MIEDTM(ox)TLLSLLGRIM(ox)R_ M(0.204)IEDTM(0.796)TLLSLLGRIM(1)R M(-5.9)IEDTM(5.9)TLLSLLGRIM(59.19)R 1 0 2 sp|Q5SGD2-4|PPM1L_HUMAN;sp|Q5SGD2|PPM1L_HUMAN 3 CID ITMS MULTI-MSMS 4 0 689.69308 2066.0574 -0.26504 -0.0001828 -524.58997 39.975 0.014493 59.68 32.843 59.193 1 3 0 0 0 13556 671197.05078125 0.409845880020089 1 -0.0163536071777344 y9;y10;y11;y9-H2O;y11-H2O;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y13(2+);b6;b7;b8;b9;b11;b7-H2O;b11-H2O;b6(2+);b7(2+) 93.4;151.7;146.6;66.6;56.7;423.7;1166.5;1417.1;558.5;3620.4;1410.7;563.8;138.7;20.3;373;146.6;469.4;112.3 0.336250531562882;0.0602070900879426;0.0818845876253818;0.0886252983877966;0.207306229450296;0.0971785381439076;0.122242754906438;0.0660649021126574;-0.48437622715619;-0.140055023649779;-0.13937361986234;-0.0763057332122798;-0.201226127812333;-0.211110300012251;0.433069506337688;-0.0787306503748368;-0.0939161339936163;0.467917487821978 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_(ac)M(ox)IEDTMTLLSLLGRIM(ox)R_ M(0.5)IEDTM(0.5)TLLSLLGRIM(1)R M(0)IEDTM(0)TLLSLLGRIM(62.69)R 1 0 2 sp|Q5SGD2-4|PPM1L_HUMAN;sp|Q5SGD2|PPM1L_HUMAN 3 CID ITMS MULTI-MSMS 5 1 689.69308 2066.0574 1.7859 0.0012317 3.372131 39.964 0.01434 65.704 35.553 62.687 1 3 0 0 0 15315 1472271.8828125 0.736144059119839 1 -0.0144309997558594 y6;y9;y10;y11;y11-H2O;y11-NH3;y9(2+);y10(2+);y11(2+);b6;b7;b8;b6-H2O;b8-H2O;b6(2+);b7(2+) 442.6;395.9;290;477.9;99.8;97.1;856.6;1727.9;3623.6;7901.6;2314.1;1055.1;442.6;292.7;1001.1;456.9 -0.112013749293624;0.0571977971878823;0.203273496337943;0.167944157937882;0.0462954872627961;0.217322790812887;0.151194651425158;0.0662124814689378;0.0970707614876574;-0.136026703337393;-0.16738875658109;-0.0883296589935298;-0.272628987293615;-0.180864560137252;-0.0468580285249232;-0.0900659106155217 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tr|B7Z957|B7Z957_HUMAN;sp|O00154-2|BACH_HUMAN;tr|K7EKP8|K7EKP8_HUMAN;sp|O00154-3|BACH_HUMAN;sp|O00154-6|BACH_HUMAN;sp|O00154-4|BACH_HUMAN;sp|O00154-5|BACH_HUMAN;sp|O00154-7|BACH_HUMAN;sp|O00154|BACH_HUMAN 3 CID ITMS MULTI-MSMS 5 1 797.03762 2388.091 -1.4246 -0.0011354 0.096568052 35.301 0.010965 66.809 37.674 66.809 1 1 0 0 0 12887 1843444.640625 0.829474509544864 1 -0.0344963073730469 y10;y6(2+);y10(2+);y13(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y20(2+);b4;b13;b15;b4-H2O;b13-H2O;b15-H2O;b13-NH3;b18(2+) 188.6;194.6;749.6;2206.6;225.3;1630.2;404.3;491.2;159.9;228;40.2;33.3;206.2;58.5;95.4;60.5;481.2 -0.0249323337875467;-0.451097173846904;-0.0193259804688068;-0.0964371303000462;0.492105855362524;0.486907541381242;0.161409259500033;-0.0513029814624133;0.0711075880876706;0.0198482309813244;0.117452441262458;0.149035902362584;-0.0306944826623976;0.00984185652487213;0.133466333249999;-0.0400781055500374;0.468897478106328 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MIHMSMQ(1)MGN(1)EPPISLR M(0.954)IHM(0.539)SM(0.121)QM(0.386)GNEPPISLR MIHMSMQ(42.08)MGN(42.08)EPPISLR M(14.12)IHM(1.71)SM(-7.33)QM(-1.71)GNEPPISLR 0 2 2 tr|B4DM61|B4DM61_HUMAN;sp|Q92621|NU205_HUMAN 2 CID ITMS MULTI-MSMS 11 0 1003.4461 2004.8777 3.3194 0.0033308 4.5501069 39.56 0.014615 42.083 9.5165 42.083 1 6 0 0 0 15092 2108065.5 0.994744926547088 1 -0.0376510620117188 y2;y8;y16;y16-NH3;b4;b9;b10;b12;b14;b14-H2O;b9-NH3 23.6;165.9;6.2;12.5;21.5;71.5;62.6;30.1;48.1;12.8;60.3 0.000959276634432626;0.471101094837422;0.0976487721000012;0.381036194037506;0.0480160980314395;-0.119961198149895;-0.0410162130247045;-0.379619225762326;0.00720860663773237;0.0877083734626467;0.18344575503761 3.32848642650799;508.735807393686;52.534590178012;206.922721759505;88.0749688228493;-111.021927239847;-34.3098095749524;-266.980251244288;4.41798579957184;54.3570923895896;172.54308362887 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(M),Deamidation (NQ) _M(ox)M(ox)MAGSVRN(de)GK_ MMMAGSVRN(1)GK M(0.96)M(0.96)M(0.08)AGSVRNGK MMMAGSVRN(66.07)GK M(13.59)M(13.59)M(-13.59)AGSVRNGK 0 1 2 sp|P49768-3|PSN1_HUMAN;sp|P49768-5|PSN1_HUMAN 2 CID ITMS MULTI-MSMS 4 0 607.76995 1213.5253 -2.778 -0.0016884 -2.8852477 13.792 0.01451 66.073 35.906 66.073 1 3 0 0 0 4261 3515092.65625 0.750524399086541 1 -0.0476665496826172 y2;y3;y2-NH3;a2;b2;b4;b8;b9;b8-H2O;b9-H2O;b8-NH3;b9-NH3 147.6;958.4;49.2;279.8;108.4;311.8;182.8;73.5;2240.8;691.1;78.2;24.1 0.0542508043562293;0.031206043387499;0.154715863012484;-0.0448914567124916;-0.0379834264093688;-0.0353972394406696;-0.0523398784373512;-0.0604310261248884;-0.0509416741123232;-0.0489620210186104;-0.0888987455623464;-0.00494887762488361 265.831045733135;97.7847363457978;827.565541007503;-168.052199748725;-128.706742092535;-71.1944391942517;-58.3869552366857;-59.7459749255769;-57.9924503051833;-49.2851328333705;-101.08550944859;-4.97682732187705 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Unknown 150.142199937969;60.4336443040746;49.5004684804406 QISNLQQSISDAEQR;NPDVQGALWQIFLGR;LQQALGQLQAACEKR _QISNLQQSISDAEQR_;_N(de)PDVQ(de)GALWQ(de)IFLGR_;_LQ(de)Q(de)ALGQ(de)LQAACEKR_ 1262 92;519 579 603 2345 20190510_RS_XS_19 5363 4086 QKPSQDW 7 1 2 Deamidation (NQ) _Q(de)KPSQ(de)DW_ Q(1)KPSQ(1)DW Q(44.61)KPSQ(44.61)DW 0 2 0 tr|B7ZL41|B7ZL41_HUMAN;sp|Q9H221-2|ABCG8_HUMAN;tr|Q14CR0|Q14CR0_HUMAN;sp|Q9H221|ABCG8_HUMAN 2 CID ITMS MULTI-SECPEP 2 0 445.69816 889.38176 -0.6135 -0.00027344 91.169986 16.848 0.012812 44.611 9.7867 44.611 1 1 0 0 0 5361 5910864.06640625 0.624462314224053 7 -0.194498062133789 y1;y2;y2-H2O;b5;b6;b6-H2O;b5-NH3 327.5;2005.4;925.7;2414.3;1784.9;1256.7;1302.7 -0.00691083500626632;-0.0339533987093432;0.059516338818753;0.00720329016257892;-0.0318937168999582;-0.0214012742936802;0.0106224503813337 -33.6942859140339;-106.05199104749;197.038726995215;12.6093668925479;-46.469872931045;-32.0229749246028;19.1659665886986 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_SLSFEM(ox)QQDELIEKPMSPMQ(de)YAR_ SLSFEMQ(0.001)Q(0.001)DELIEKPMSPMQ(0.998)YAR SLSFEM(0.999)QQDELIEKPM(0.001)SPM(0.001)QYAR SLSFEMQ(-32.02)Q(-32.39)DELIEKPMSPMQ(32.02)YAR SLSFEM(34.32)QQDELIEKPM(-34.32)SPM(-34.32)QYAR 0 1 1 tr|Q6MZF3|Q6MZF3_HUMAN;tr|B3KMY8|B3KMY8_HUMAN;tr|B3KM71|B3KM71_HUMAN;sp|Q9Y6Y0|NS1BP_HUMAN 3 CID ITMS MULTI-MSMS 2 1 925.76066 2774.2601 -0.46427 -0.0004298 0.26380749 47.403 0.014582 40.779 10.78 34.321 0.99883 9 0 0 0 18468 22605956.484375 1 0 0 y8;y9;y12;y13;y13-H2O;y12-NH3;y13-NH3;y6(2+);y8(2+);y13(2+);y16(2+);y17(2+);b7;b10;b11;b15;b15-NH3;b8(2+);b10(2+);b15(2+);b21(2+) 3653.4;1477;172.8;431.9;221.9;731.4;1232.3;131;191.3;1705.9;717.9;932.2;2203.1;3534.2;584.2;67.5;197.7;1999.2;329.8;2189.1;953.6 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tr|Q6MZF3|Q6MZF3_HUMAN;tr|B3KMY8|B3KMY8_HUMAN;tr|B3KM71|B3KM71_HUMAN;sp|Q9Y6Y0|NS1BP_HUMAN 3 CID ITMS MULTI-MSMS 2 1 925.76066 2774.2601 -1.9106 -0.0017687 0.26380749 47.407 0.014435 41.798 11.264 38.178 0.99937 9 0 0 0 17049 15794617.640625 0.960124758946046 -1 0.0155220031738281 y8;y9;y12;y13;y12-NH3;y13-NH3;y6(2+);y9(2+);y13(2+);b7;b10;b11;b15;b15-NH3;b8(2+);b9(2+);b11(2+);b15(2+);b21(2+) 2186.9;834.3;188.9;259.6;712.4;257;112.7;211.2;1232.9;1616.6;2488.2;313.2;98;137.9;1409.5;211.2;541.4;1101.4;571.8 -0.00828607864991682;0.0544875389753088;0.05113204733766;0.16717844961272;0.112473570837665;-0.082393112824775;0.444195717175035;-0.0521258097123791;0.0146566573250766;-0.0016795279748294;-0.115509247749969;-0.084545853287409;-0.0340388601123323;0.153279225887673;-0.0369435367061328;0.430568506637542;-0.026122486312488;0.0140846235563004;-0.436072357199691 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Oxidation (M) _SLVALLVETQM(ox)K_ SLVALLVETQM(1)K SLVALLVETQM(215.87)K 0 0 1 tr|A0A024RB22|A0A024RB22_HUMAN;sp|Q8TAQ2|SMRC2_HUMAN;sp|Q8TAQ2-2|SMRC2_HUMAN;sp|Q8TAQ2-3|SMRC2_HUMAN;tr|Q59G16|Q59G16_HUMAN;tr|F8VXC8|F8VXC8_HUMAN;tr|B4DF22|B4DF22_HUMAN;tr|Q58EY4|Q58EY4_HUMAN;sp|Q92922|SMRC1_HUMAN;tr|B4DYQ1|B4DYQ1_HUMAN;tr|B4DYF9|B4DYF9_HUMAN 2 CID ITMS MULTI-MSMS 8 0 674.38125 1346.7479 -0.3743 -0.00025242 2.7541022 45.373 7.0318E-69 215.87 135.19 215.87 1 1 0 0 0 18551 3711427.46875 0.63860162159148 -1 0.0333900451660156 y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y6-H2O;y3-NH3;y4-NH3;b2;b3;b4;b5;b6;b7;b8;b9;b10;b11;b3-H2O;b4-H2O;b5-H2O;b6-H2O;b8-H2O;b9-H2O;b10-H2O;b11-H2O 294.9;1219.5;3880.4;3774.2;5165.6;3616.1;1010.8;1068.9;188.6;425.8;542.6;252;11.1;276.2;413.1;1417.1;2977.8;1893;3126.7;2179;481.7;871.9;88.6;269.7;1006.3;1712.4;766.1;758.2;237.1;109.4 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