Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides 191220_hirano_23_10 Razor + unique peptides 191220_hirano_23_10 Unique peptides 191220_hirano_23_10 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Sequence coverage 191220_hirano_23_10 [%] Intensity Intensity 191220_hirano_23_10 MS/MS count Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Phospho (ST) site IDs Phospho (STY) site IDs Phospho (ST) site positions Phospho (STY) site positions CON__P00761 CON__P00761 4 4 4 1 4 4 4 4 4 4 25.1 25.1 25.1 24.409 231 231 0 39.427 25.1 231090000 231090000 5 + 0 70;113;126;218 True;True;True;True 71;114;127;219 75;124;125;139;246 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; 8 17 16 13 17 16 13 31.6 31.6 27.2 65.432 639 639;645;629;638;535;606;707;594 0 142.05 31.6 18349000 18349000 16 + 10 14;33;40;54;55;57;60;106;121;151;185;195;209;220;235;239;242 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True 14;34;41;55;56;58;61;107;122;152;186;196;210;221;236;240;243 14;35;42;58;59;61;64;116;133;169;207;208;222;237;248;266;267;271;274 14;35;42;59;60;62;65;117;135;171;209;210;224;239;250;269;270;274;277 14;35;42;59;60;62;65;117;135;171;210;224;239;250;270;274;277 CON__Q2UVX4 CON__Q2UVX4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 187.37 1662 1662 1 -2 1 0 0 0 + + 11 2 True 2 2 2 2 2 921 CON__Q86YZ3 CON__Q86YZ3 5 5 5 1 5 5 5 5 5 5 9.4 9.4 9.4 282.39 2850 2850 0 29.872 9.4 637320 637320 5 + 12 56;61;62;170;241 True;True;True;True;True 57;62;63;171;242 60;65;66;191;273 61;66;67;193;276 61;66;67;193;276 P00360;P00359;P00358 P00360;P00359;P00358 1;1;1 1;1;1 1;1;1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 3;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2 TDH1;TDH3;TDH2 sp|P00360|G3P1_YEAST Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TDH1 PE=1 SV=3;sp|P00359|G3P3_YEAST Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 20 3 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 35.75 332 332;332;332 0 13.606 4.5 3748600 3748600 1 13 196 True 197 223 225 225 P00942 P00942 1 1 1 Triosephosphate isomerase TPI1 sp|P00942|TPIS_YEAST Triosephosphate isomerase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TPI1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 6 6 6 26.795 248 248 0 18.974 6 0 0 1 14 15 True 15 15 15 15 P03881 P03881 1 1 1 Uncharacterized mitochondrial protein RF1 Q0255 sp|P03881|YMRF1_YEAST Uncharacterized mitochondrial protein RF1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=Q0255 PE=4 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 56.412 472 472 0 5.6465 2.3 1378600 1378600 0 15 122 True 123 134 136 136 P0CX40;P0CX39 P0CX40;P0CX39 3;3 3;3 3;3 40S ribosomal protein S8-B;40S ribosomal protein S8-A RPS8B;RPS8A sp|P0CX40|RS8B_YEAST 40S ribosomal protein S8-B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPS8B PE=1 SV=1;sp|P0CX39|RS8A_YEAST 40S ribosomal protein S8-A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPS8 2 3 3 3 3 3 3 17.5 17.5 17.5 22.489 200 200;200 0 34.49 17.5 2704500 2704500 4 16 0;68;160 True;True;True 0;69;161 0;73;179;180 0;74;181;182 0;74;181 P0CX44;P0CX43 P0CX44;P0CX43 1;1 1;1 1;1 60S ribosomal protein L1-B;60S ribosomal protein L1-A RPL1B;RPL1A sp|P0CX44|RL1B_YEAST 60S ribosomal protein L1-B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPL1B PE=1 SV=1;sp|P0CX43|RL1A_YEAST 60S ribosomal protein L1-A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPL1 2 1 1 1 1 1 1 6.5 6.5 6.5 24.485 217 217;217 0 5.6621 6.5 1137900 1137900 1 17 47 True 48 51 52 52 P10592;P10591;P22202;P09435 P10592;P10591 4;4;1;1 4;4;1;1 4;4;1;1 Heat shock protein SSA2;Heat shock protein SSA1 SSA2;SSA1 sp|P10592|HSP72_YEAST Heat shock protein SSA2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SSA2 PE=1 SV=3;sp|P10591|HSP71_YEAST Heat shock protein SSA1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SSA1 PE=1 4 4 4 4 4 4 4 6.1 6.1 6.1 69.469 639 639;642;642;649 0 35.412 6.1 1242700 1242700 6 18 45;125;156;203 True;True;True;True 46;126;157;204 47;48;49;138;174;231 48;49;50;140;176;233 49;140;176;233 P14736 P14736 1 1 1 DNA repair protein RAD4 RAD4 sp|P14736|RAD4_YEAST DNA repair protein RAD4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RAD4 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1.1 1.1 1.1 87.173 754 754 0 6.0138 1.1 16663000 16663000 1 19 87 True 88 94 95 95 P16140 P16140 1 1 1 V-type proton ATPase subunit B VMA2 sp|P16140|VATB_YEAST V-type proton ATPase subunit B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=VMA2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 57.749 517 517 0 5.7515 2.1 533620 533620 1 20 213 True 214 241 243 243 P17214 P17214 1 1 1 Telomere elongation protein EST1 EST1 sp|P17214|EST1_YEAST Telomere elongation protein EST1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=EST1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1.6 1.6 1.6 81.799 699 699 1 -2 1.6 0 0 0 + 21 143 True 144 158 160 160 3 569 P21242 P21242 4 4 4 Probable proteasome subunit alpha type-7 PRE10 sp|P21242|PSA7_YEAST Probable proteasome subunit alpha type-7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE10 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 4 4 16 16 16 31.536 288 288 0 27.65 16 7538200 7538200 5 22 52;71;130;145 True;True;True;True 53;72;131;146 56;76;143;144;161 57;77;145;146;163 57;77;146;163 P21243 P21243 12 12 12 Proteasome subunit alpha type-1 SCL1 sp|P21243|PSA1_YEAST Proteasome subunit alpha type-1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SCL1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 12 12 12 46.8 46.8 46.8 28.001 252 252 0 138.86 46.8 76693000 76693000 14 23 10;20;28;43;63;67;135;141;167;186;198;202 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 10;21;29;44;64;68;136;142;168;187;199;203 10;21;30;45;67;68;72;149;156;188;209;210;226;230 10;21;30;46;68;69;73;151;158;190;211;212;228;232 10;21;30;46;69;73;151;158;190;212;228;232 P22203 P22203 1 1 1 V-type proton ATPase subunit E VMA4 sp|P22203|VATE_YEAST V-type proton ATPase subunit E OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=VMA4 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 3.9 3.9 3.9 26.471 233 233 0 6.8157 3.9 581890 581890 1 24 3 True 3 3 3 3 P33442;P23248 P33442;P23248 1;1 1;1 1;1 40S ribosomal protein S1-A;40S ribosomal protein S1-B RPS1A;RPS1B sp|P33442|RS3A1_YEAST 40S ribosomal protein S1-A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPS1A PE=1 SV=2;sp|P23248|RS3A2_YEAST 40S ribosomal protein S1-B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RP 2 1 1 1 1 1 1 3.9 3.9 3.9 28.743 255 255;255 0 6.1663 3.9 35834 35834 1 25 64 True 65 69 70 70 P23615 P23615 1 1 1 Transcription elongation factor SPT6 SPT6 sp|P23615|SPT6_YEAST Transcription elongation factor SPT6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SPT6 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0.7 0.7 0.7 168.29 1451 1451 0 6.1981 0.7 148180 148180 0 26 164 True 165 184 186 186 P23638 P23638 11 11 11 Proteasome subunit alpha type-3 PRE9 sp|P23638|PSA3_YEAST Proteasome subunit alpha type-3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE9 PE=1 SV=1 1 11 11 11 11 11 11 37.2 37.2 37.2 28.714 258 258 0 114.22 37.2 74263000 74263000 11 27 50;69;88;91;104;109;211;212;216;219;230 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 51;70;89;92;105;110;212;213;217;220;231 54;74;95;99;114;120;239;240;244;247;259 55;75;96;100;115;121;241;242;246;249;261 55;75;96;100;115;121;241;242;246;249;261 P23639 P23639 11 11 11 Proteasome subunit alpha type-2 PRE8 sp|P23639|PSA2_YEAST Proteasome subunit alpha type-2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE8 PE=1 SV=1 1 11 11 11 11 11 11 34.4 34.4 34.4 27.162 250 250 0 131.91 34.4 69335000 69335000 10 28 19;79;86;99;102;115;128;129;175;192;244 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 20;80;87;100;103;116;129;130;176;193;245 20;85;93;108;111;127;141;142;196;219;276 20;86;94;109;112;129;143;144;198;221;279 20;86;94;109;112;129;143;144;198;221;279 P23724 P23724 4 4 4 Proteasome subunit beta type-6 PRE7 sp|P23724|PSB6_YEAST Proteasome subunit beta type-6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE7 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 17.4 17.4 17.4 26.871 241 241 0 33.179 17.4 8632600 8632600 4 29 29;51;149;243 True;True;True;True 30;52;150;244 31;55;166;275 31;56;168;278 31;56;168;278 P25043 P25043 1 1 1 Proteasome subunit beta type-2 PUP1 sp|P25043|PSB2_YEAST Proteasome subunit beta type-2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUP1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 3.8 3.8 3.8 28.268 261 261 0 5.7489 3.8 1572200 1572200 1 30 194 True 195 221 223 223 P30656 P30656 4 4 4 Proteasome subunit beta type-5 PRE2 sp|P30656|PSB5_YEAST Proteasome subunit beta type-5 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE2 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 4 4 13.2 13.2 13.2 31.636 287 287 0 54.676 13.2 10319000 10319000 4 31 18;34;78;90 True;True;True;True 18;19;35;79;91 18;19;36;84;97;98 18;19;36;85;98;99 18;36;85;99 4;14 103;105 P30657 P30657 9 9 9 Proteasome subunit beta type-7 PRE4 sp|P30657|PSB7_YEAST Proteasome subunit beta type-7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE4 PE=1 SV=1 1 9 9 9 9 9 9 38 38 38 29.443 266 266 0 59.832 38 201320000 201320000 12 32 58;100;119;146;153;159;214;231;234 True;True;True;True;True;True;True;True;True 59;101;120;147;154;160;215;232;235 62;109;131;162;171;178;242;260;261;264;265 63;110;133;164;173;180;244;262;263;266;267;268 63;110;133;164;173;180;244;263;268 P32496 P32496 3 3 3 26S proteasome regulatory subunit RPN12 RPN12 sp|P32496|RPN12_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN12 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN12 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 3 13.1 13.1 13.1 31.919 274 274 0 19.463 13.1 1174700 1174700 3 33 152;158;162 True;True;True 153;159;163 170;177;182 172;179;184 172;179;184 P32855 P32855 1 1 1 Exocyst complex component SEC8 SEC8 sp|P32855|SEC8_YEAST Exocyst complex component SEC8 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SEC8 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.22 1065 1065 0 5.7673 1 0 0 0 34 166 True 167 187 189 189 5 1011 P33297 P33297 2 2 2 26S protease regulatory subunit 6A RPT5 sp|P33297|PRS6A_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 6A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT5 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 7.8 7.8 7.8 48.255 434 434 0 12.878 7.8 69789 69789 2 35 31;36 True;True 32;37 33;38 33;38 33;38 P33298 P33298 12 12 12 26S protease regulatory subunit 6B homolog RPT3 sp|P33298|PRS6B_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT3 PE=1 SV=2 1 12 12 12 12 12 12 26.2 26.2 26.2 47.893 428 428 0 93.558 26.2 38031000 38031000 13 36 4;5;38;41;94;118;137;174;176;197;227;245 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4;5;39;42;95;119;138;175;177;198;228;246 4;5;40;43;102;130;152;195;197;224;225;255;277 4;5;40;43;103;132;154;197;199;226;227;257;280 4;5;40;43;103;132;154;197;199;227;257;280 P33299 P33299 2 2 2 26S protease regulatory subunit 7 homolog RPT1 sp|P33299|PRS7_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 4.7 4.7 4.7 51.982 467 467 0 31.298 4.7 5048600 5048600 3 37 42;223 True;True 43;224 44;251 44;45;253 44;253 P38624 P38624 1 1 1 Proteasome subunit beta type-1 PRE3 sp|P38624|PSB1_YEAST Proteasome subunit beta type-1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 5.1 5.1 5.1 23.547 215 215 0 6.211 5.1 357900 357900 1 38 139 True 140 154 156 156 P38764 P38764 3 3 3 26S proteasome regulatory subunit RPN1 RPN1 sp|P38764|RPN1_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 3 4.1 4.1 4.1 109.49 993 993 0 43.626 4.1 1411800 1411800 3 39 97;168;222 True;True;True 98;169;223 105;106;189;250 106;107;191;252 107;191;252 P38769 P38769 1 1 1 Uncharacterized protein YHR035W YHR035W sp|P38769|YHJ5_YEAST Uncharacterized protein YHR035W OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YHR035W PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1.7 1.7 1.7 72.306 630 630 1 -2 1.7 0 0 0 + 40 80 True 81 86 87 87 15 349 P38886 P38886 4 4 4 26S proteasome regulatory subunit RPN10 RPN10 sp|P38886|RPN10_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN10 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN10 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 4 4 21.6 21.6 21.6 29.747 268 268 0 64.143 21.6 111910000 111910000 6 41 76;116;157;225 True;True;True;True 77;117;158;226 81;82;128;175;176;253 82;83;130;177;178;255 83;130;178;255 P38994 P38994 1 1 1 Probable phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase MSS4 MSS4 sp|P38994|MSS4_YEAST Probable phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase MSS4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MSS4 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 89.319 779 779 1 -2 1.4 0 0 0 + 42 161 True 162 181 183 183 6;7 140;142 P40302 P40302 7 7 7 Proteasome subunit alpha type-6 PRE5 sp|P40302|PSA6_YEAST Proteasome subunit alpha type-6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE5 PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 7 7 35 35 35 25.604 234 234 0 83.028 35 47009000 47009000 8 43 9;66;112;140;154;163;189 True;True;True;True;True;True;True 9;67;113;141;155;164;190 9;71;123;155;172;183;213;214 9;72;124;157;174;185;215;216 9;72;124;157;174;185;215 P40303 P40303 2 2 2 Proteasome subunit alpha type-4 PRE6 sp|P40303|PSA4_YEAST Proteasome subunit alpha type-4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 9.8 9.8 9.8 28.439 254 254 0 16.975 9.8 991070 991070 2 44 127;188 True;True 128;189 140;212 142;214 142;214 P40327 P40327 5 5 5 26S protease regulatory subunit 4 homolog RPT2 sp|P40327|PRS4_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT2 PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 5 5 14.2 14.2 14.2 48.828 437 437 0 38.499 14.2 11067000 11067000 5 45 21;77;85;95;217 True;True;True;True;True 22;78;86;96;218 22;83;92;103;245 22;84;93;104;247 22;84;93;104;247 P40555 P40555 2 2 2 Probable 26S proteasome regulatory subunit p27 NAS2 sp|P40555|PSMD9_YEAST Probable 26S proteasome regulatory subunit p27 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NAS2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 9.5 9.5 9.5 24.846 220 220 0 12.001 9.5 2063000 2063000 3 46 142;144 True;True 143;145 157;159;160 159;161;162 159;161 P40896 P40896 1 1 1 Uncharacterized protein YJL213W sp|P40896|YJV3_YEAST Uncharacterized protein YJL213W OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YJL213W PE=3 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 35.905 331 331 0 5.8341 3.3 0 0 0 47 136 True 137 150;151 152;153 152 8 6 P43588 P43588 4 4 4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 RPN11 sp|P43588|RPN11_YEAST Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN11 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 15.4 15.4 15.4 34.398 306 306 0 26.579 15.4 11451000 11451000 4 48 12;22;117;181 True;True;True;True 12;23;118;182 12;23;129;202 12;23;131;204 12;23;131;204 P43603 P43603 1 1 1 LAS seventeen-binding protein 3 LSB3 sp|P43603|LSB3_YEAST LAS seventeen-binding protein 3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=LSB3 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 49.343 459 459 0 5.658 2.6 246690 246690 0 49 173 True 174 194 196 196 P47170 P47170 1 1 1 Vacuolar membrane-associated protein IML1 IML1 sp|P47170|IML1_YEAST Vacuolar membrane-associated protein IML1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=IML1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 181.95 1584 1584 0 5.7533 0.9 0 0 0 50 96 True 97 104 105 105 16;17;18;19 606;607;608;612 P49017 P49017 1 1 1 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial COQ5 sp|P49017|COQ5_YEAST 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=COQ5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 3.6 3.6 3.6 34.684 307 307 0 5.9624 3.6 321320 321320 1 51 25 True 26 26 26 26 P50086 P50086 4 4 4 Probable 26S proteasome regulatory subunit p28 NAS6 sp|P50086|PSD10_YEAST Probable 26S proteasome regulatory subunit p28 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NAS6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 16.7 16.7 16.7 25.616 228 228 0 29.045 16.7 7036600 7036600 4 52 1;7;177;240 True;True;True;True 1;7;178;241 1;7;198;272 1;7;200;275 1;7;200;275 P51402 P51402 1 1 1 60S ribosomal protein L37-B RPL37B sp|P51402|RL37B_YEAST 60S ribosomal protein L37-B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPL37B PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 10.2 10.2 10.2 9.8682 88 88 0 6.4939 10.2 27386 27386 0 53 147 True 148 163 165 165 P53549 P53549 1 1 1 26S protease subunit RPT4 RPT4 sp|P53549|PRS10_YEAST 26S proteasome subunit RPT4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT4 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 49.408 437 437 0 6.3338 2.1 0 0 1 54 48 True 49 52 53 53 P53883 P53883 1 1 1 Nucleolar protein 13 NOP13 sp|P53883|NOP13_YEAST Nucleolar protein 13 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NOP13 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 3 3 3 45.609 403 403 0 5.6412 3 0 0 0 55 204 True 205 232 234 234 9 378 P69771 P69771 1 1 1 Vacuolar protein-sorting-associated protein 46 DID2 sp|P69771|DID2_YEAST Vacuolar protein-sorting-associated protein 46 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=DID2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 5.4 5.4 5.4 23.091 204 204 0 5.6351 5.4 142160 142160 0 56 16 True 16 16 16 16 Q01939 Q01939 3 3 3 26S protease regulatory subunit 8 homolog RPT6 sp|Q01939|PRS8_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT6 PE=1 SV=4 1 3 3 3 3 3 3 7.9 7.9 7.9 45.271 405 405 0 27.213 7.9 8632100 8632100 3 57 155;221;229 True;True;True 156;222;230 173;249;258 175;251;260 175;251;260 Q04062 Q04062 2 2 2 26S proteasome regulatory subunit RPN9 RPN9 sp|Q04062|RPN9_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN9 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN9 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 4.6 4.6 4.6 45.782 393 393 0 14.962 4.6 1325000 1325000 2 58 81;131 True;True 82;132 87;145 88;147 88;147 Q04119 Q04119 1 1 1 Endopolyphosphatase PPN1 sp|Q04119|PPN1_YEAST Endopolyphosphatase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PPN1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 78.343 674 674 0 5.9048 1.5 767360 767360 1 59 134 True 135 148 150 150 Q04839 Q04839 1 1 1 mRNA transport factor GFD1 GFD1 sp|Q04839|GFD1_YEAST mRNA transport factor GFD1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=GFD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 21.571 188 188 0 5.8201 3.7 91133000 91133000 1 60 73 True 74 78 79 79 Q06103 Q06103 2 2 2 26S proteasome regulatory subunit RPN7 RPN7 sp|Q06103|RPN7_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN7 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 3.7 3.7 3.7 48.958 429 429 0 13.327 3.7 437830 437830 2 61 72;178 True;True 73;179 77;199 78;201 78;201 Q06385 Q06385 1 1 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 74 VPS74 sp|Q06385|VPS74_YEAST Vacuolar protein sorting-associated protein 74 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=VPS74 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 4.1 4.1 4.1 39.286 345 345 0 5.7401 4.1 0 0 0 62 200 True 201 228 230 230 20 136 Q06488 Q06488 1 1 1 Chromatin structure-remodeling complex subunit RSC2 RSC2 sp|Q06488|RSC2_YEAST Chromatin structure-remodeling complex subunit RSC2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RSC2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1.1 1.1 1.1 102.3 889 889 1 -2 1.1 0 0 0 + 63 26 True 27 27 27 27 10 481 Q07454 Q07454 1 1 1 UPF0592 protein YDL073W YDL073W sp|Q07454|YD073_YEAST UPF0592 protein YDL073W OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YDL073W PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1.1 1.1 1.1 113.89 984 984 1 -2 1.1 0 0 0 + 64 46 True 47 50 51 51 11;12 632;633 Q08208 Q08208 1 1 1 Nucleolar protein 12 NOP12 sp|Q08208|NOP12_YEAST Nucleolar protein 12 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NOP12 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 51.941 459 459 0 5.6885 2.4 0 0 0 65 93 True 94 101 102 102 21 380 Q12250 Q12250 4 4 4 26S proteasome regulatory subunit RPN5 RPN5 sp|Q12250|RPN5_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN5 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN5 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 4 4 8.5 8.5 8.5 51.768 445 445 0 29.855 8.5 4490400 4490400 3 66 53;83;98;111 True;True;True;True 54;84;99;112 57;90;107;122 58;91;108;123 58;91;108;123 Q12252 Q12252 1 1 1 Phosphate metabolism protein 7 PHM7 sp|Q12252|PHM7_YEAST Phosphate metabolism protein 7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PHM7 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.54 991 991 0 5.7086 1 1064900 1064900 1 67 27 True 28 28;29 28;29 29 Q12377 Q12377 1 1 1 26S proteasome regulatory subunit RPN6 RPN6 sp|Q12377|RPN6_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN6 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 49.773 434 434 0 18.894 3.7 238730 238730 1 68 30 True 31 32 32 32 Q3E7X8 Q3E7X8 1 1 1 Y element ATP-dependent helicase YEL077C YEL077C sp|Q3E7X8|YE077_YEAST Y element ATP-dependent helicase YEL077C OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YEL077C PE=2 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 143.09 1277 1277 0 5.7 0.9 0 0 0 69 108 True 109 118;119 119;120 120 13;22 507;509