Protein IDs	Majority protein IDs	Peptide counts (all)	Peptide counts (razor+unique)	Peptide counts (unique)	Protein names	Gene names	Fasta headers	Number of proteins	Peptides	Razor + unique peptides	Unique peptides	Peptides 191224_hirano_26_5re	Razor + unique peptides 191224_hirano_26_5re	Unique peptides 191224_hirano_26_5re	Sequence coverage [%]	Unique + razor sequence coverage [%]	Unique sequence coverage [%]	Mol. weight [kDa]	Sequence length	Sequence lengths	Q-value	Score	Sequence coverage 191224_hirano_26_5re [%]	Intensity	Intensity 191224_hirano_26_5re	iBAQ peptides	iBAQ	iBAQ 191224_hirano_26_5re	MS/MS count	Only identified by site	Reverse	Potential contaminant	id	Peptide IDs	Peptide is razor	Mod. peptide IDs	Evidence IDs	MS/MS IDs	Best MS/MS	Phospho (ST) site IDs	Phospho (STY) site IDs	Phospho (ST) site positions	Phospho (STY) site positions	Taxonomy IDs
CON__A2A5Y0	CON__A2A5Y0	7	3	1				1	7	3	1	7	3	1	15.9	7.5	2.4	47.117	416	416	0	18.357	15.9	29565000	29565000	27	1095000	1095000	5			+	0	61;107;132;198;222;253;255	False;True;False;True;False;False;True	61;107;132;198;222;253;255	73;74;125;155;234;235;264;302;303;307;308	76;77;130;160;244;245;277;278;316;317;318;319;323;324	77;130;160;244;277;316;324					-1
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CON__Q497I4	CON__Q497I4	6	2	0				1	6	2	0	6	2	0	12.5	4.4	0	50.529	455	455	0	14.515	12.5	19807000	19807000	28	707400	707400	3			+	15	132;137;168;192;199;257	False;False;True;False;False;True	132;137;168;192;199;257	155;161;196;227;236;237;238;239;310;311	160;166;203;237;246;247;248;249;326;327	160;166;203;237;247;327					-1
CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__P05787;CON__Q9H552;CON__Q14CN4-1;CON__Q6IME9;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;CON__Q3SY84;CON__P07744;CON__P19013;CON__Q9NSB2;CON__Q6ISB0	CON__Q5XQN5;CON__Q922U2	14;13;5;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1	1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0			;	14	14	1	0	14	1	0	17	1.5	0	62.936	601	601;580;483;499;511;520;457;469;469;523;525;594;600;600	0	6.3729	17	1272200	1272200	31	41038	41038	1			+	16	16;43;69;153;154;171;172;224;226;231;251;264;288;291	True;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False	16;43;69;153;154;171;172;224;226;231;251;264;288;291	20;52;82;179;180;181;204;205;266;268;275;300;319;345;346;347;350	20;54;85;186;187;188;213;214;280;282;289;314;335;364;365;366;369	20;54;85;186;187;213;214;280;282;289;314;335;364;369					-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1
CON__Q61726	CON__Q61726	13	2	1				1	13	2	1	13	2	1	19	3.8	1.9	52.809	479	479	0	13.557	19	121590000	121590000	28	4342400	4342400	5			+	17	4;15;20;21;49;52;67;68;94;212;220;243;289	False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False	4;15;20;21;49;52;67;68;94;212;220;243;289	4;5;17;18;19;24;25;26;58;63;80;81;109;252;261;262;291;292;348	4;5;17;18;19;25;26;27;60;65;83;84;113;264;274;275;305;306;367	4;18;25;27;60;65;83;84;113;264;274;306;367					-1
CON__Q6NT21;CON__P78385;CON__O43790;CON__Q14533	CON__Q6NT21;CON__P78385;CON__O43790;CON__Q14533	17;16;14;14	4;3;4;4	1;0;1;1			;;;	4	17	4	1	17	4	1	20.3	5.7	1.4	54.195	493	493;493;486;505	0	31.412	20.3	97166000	97166000	31	3134400	3134400	5			+	18	4;20;21;49;52;67;68;94;122;130;151;212;213;218;243;254;289	False;True;True;False;False;False;False;False;False;False;True;True;False;False;False;False;False	4;20;21;49;52;67;68;94;122;130;151;212;213;218;243;254;289	4;5;24;25;26;58;63;80;81;109;141;152;153;177;252;253;254;259;291;292;304;305;306;348	4;5;25;26;27;60;65;83;84;113;146;157;158;184;264;265;266;267;272;305;306;320;321;322;367	4;25;27;60;65;83;84;113;146;157;184;264;265;272;306;321;367					-1;-1;-1;-1
CON__Q86YZ3	CON__Q86YZ3	6	6	6				1	6	6	6	6	6	6	10.1	10.1	10.1	282.39	2850	2850	0	41.062	10.1	4609800	4609800	85	54233	54233	9			+	19	90;91;96;97;202;296	True;True;True;True;True;True	90;91;96;97;202;296	104;105;106;112;113;114;242;358	108;109;110;116;117;118;119;252;378	109;110;118;119;252;378					-1
CON__Q92764	CON__Q92764	6	1	1				1	6	1	1	6	1	1	13.9	2.1	2.1	47.596	425	425	0	6.0787	13.9	9675900	9675900	27	358370	358370	1			+	20	132;159;168;199;222;257	False;True;False;False;False;False	132;159;168;199;222;257	155;186;196;236;237;238;239;264;310;311	160;193;203;246;247;248;249;277;278;326;327	160;193;203;247;277;327					-1
CON__Q9NSB4	CON__Q9NSB4	3	1	1				1	3	1	1	3	1	1	5.5	1.9	1.9	56.682	513	513	0	8.1991	5.5	125690000	125690000	32	3927900	3927900	1			+	21	15;67;134	False;False;True	15;67;134	17;18;19;80;157	17;18;19;83;162	18;83;162					-1
CON__REFSEQ:XP_986630	CON__REFSEQ:XP_986630	7	2	2				1	7	2	2	7	2	2	14.3	4.8	4.8	53.728	476	476	0	13.12	14.3	3701200	3701200	30	123370	123370	2			+	22	61;107;132;195;196;198;253	False;False;False;True;True;False;False	61;107;132;195;196;198;253	73;74;125;155;230;231;234;235;302;303	76;77;130;160;240;241;244;245;316;317;318;319	77;130;160;240;241;244;316					-1
O13563	O13563	2	2	2	26S proteasome regulatory subunit RPN13	RPN13	sp|O13563|RPN13_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN13 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN13 PE=1 SV=1	1	2	2	2	2	2	2	15.4	15.4	15.4	17.902	156	156	0	16.344	15.4	7059100	7059100	10	705910	705910	2				23	102;178	True;True	102;178	119;211	124;221	124;221					559292
P00358;P00359;P00360	P00358;P00359;P00360	2;2;1	2;2;1	2;2;1	Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 3;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1	TDH2;TDH3;TDH1	sp|P00358|G3P2_YEAST Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TDH2 PE=1 SV=3;sp|P00359|G3P3_YEAST Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 20	3	2	2	2	2	2	2	7.2	7.2	7.2	35.846	332	332;332;332	0	20.569	7.2	2640900	2640900	20	132050	132050	2				24	62;248	True;True	62;248	75;297	78;311	78;311					559292;559292;559292
P03874	P03874	2	2	2	Cytochrome B pre-mRNA-processing protein 2	CBP2	sp|P03874|CBP2_YEAST Cytochrome B pre-mRNA-processing protein 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=CBP2 PE=1 SV=2	1	2	2	2	2	2	2	3.2	3.2	3.2	73.86	630	630	0	11.05	3.2	1986000	1986000	32	62061	62061	1				25	33;207	True;True	33;207	39;247	40;258	40;258					559292
P04840	P04840	1	1	1	Mitochondrial outer membrane protein porin 1	POR1	sp|P04840|VDAC1_YEAST Mitochondrial outer membrane protein porin 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=POR1 PE=1 SV=4	1	1	1	1	1	1	1	3.5	3.5	3.5	30.428	283	283	1	-2	3.5	0	0	16	0	0	0	+			26	237	True	237	284	298	298	0		7		559292
P0CH09;P0CH08;P05759;P0CG63	P0CH09;P0CH08;P05759;P0CG63	1;1;1;1	1;1;1;1	1;1;1;1	Ubiquitin-60S ribosomal protein L40;Ubiquitin;60S ribosomal protein L40;Ubiquitin-40S ribosomal protein S31;Ubiquitin;40S ribosomal protein S31;Polyubiquitin;Ubiquitin	RPL40B;RPL40A;RPS31;UBI4	sp|P0CH09|RL40B_YEAST Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPL40B PE=1 SV=1;sp|P0CH08|RL40A_YEAST Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S28	4	1	1	1	1	1	1	7	7	7	14.554	128	128;128;152;381	0	7.2297	7	2081100	2081100	6	346850	346850	1				27	261	True	261	315	331	331					559292;559292;559292;559292
P06780	P06780	1	1	1	GTP-binding protein RHO1	RHO1	sp|P06780|RHO1_YEAST GTP-binding protein RHO1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RHO1 PE=1 SV=3	1	1	1	1	1	1	1	4.8	4.8	4.8	23.152	209	209	0	6.5144	4.8	1119300	1119300	10	111930	111930	1				28	165	True	165	192	199	199					559292
P07807	P07807	1	1	1	Dihydrofolate reductase	DFR1	sp|P07807|DYR_YEAST Dihydrofolate reductase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=DFR1 PE=1 SV=2	1	1	1	1	1	1	1	4.7	4.7	4.7	24.261	211	211	1	-2	4.7	0	0	12	0	0	0	+			29	161	True	161	188	195	195		0		80	559292
P08425	P08425	1	1	1	Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial	MSF1	sp|P08425|SYFM_YEAST Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MSF1 PE=1 SV=3	1	1	1	1	1	1	1	2.1	2.1	2.1	54.828	469	469	1	-2	2.1	0	0	25	0	0	0	+			30	189	True	189	223	233	233		13		319	559292
P09457	P09457	2	2	2	ATP synthase subunit 5, mitochondrial	ATP5	sp|P09457|ATPO_YEAST ATP synthase subunit 5, mitochondrial OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=ATP5 PE=1 SV=1	1	2	2	2	2	2	2	11.8	11.8	11.8	22.814	212	212	0	15.368	11.8	148970	148970	12	12414	12414	2				31	180;181	True;True	180;181	213;214	223;224	223;224					559292
P10592;P10591	P10592;P10591	2;2	2;2	2;2	Heat shock protein SSA2;Heat shock protein SSA1	SSA2;SSA1	sp|P10592|HSP72_YEAST Heat shock protein SSA2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SSA2 PE=1 SV=3;sp|P10591|HSP71_YEAST Heat shock protein SSA1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SSA1 PE=1	2	2	2	2	2	2	2	3.4	3.4	3.4	69.469	639	639;642	0	14.103	3.4	272830	272830	36	7578.5	7578.5	2				32	75;177	True;True	75;177	89;210	92;220	92;220					559292;559292
P11433	P11433	1	1	1	Cell division control protein 24	CDC24	sp|P11433|CDC24_YEAST Cell division control protein 24 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=CDC24 PE=1 SV=2	1	1	1	1	1	1	1	1.2	1.2	1.2	96.938	854	854	1	-2	1.2	0	0	48	0	0	0	+			33	39	True	39	47	48	48		7		106	559292
P15992	P15992	1	1	1	Heat shock protein 26	HSP26	sp|P15992|HSP26_YEAST Heat shock protein 26 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=HSP26 PE=1 SV=3	1	1	1	1	1	1	1	4.2	4.2	4.2	23.879	214	214	0	6.2049	4.2	0	0	12	0	0	1				34	216	True	216	257	270	270					559292
P16451	P16451	1	1	1	Pyruvate dehydrogenase complex protein X component, mitochondrial	PDX1	sp|P16451|ODPX_YEAST Pyruvate dehydrogenase complex protein X component, mitochondrial OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PDX1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	2.7	2.7	2.7	45.361	410	410	0	6.8232	2.7	408560	408560	24	17023	17023	1				35	150	True	150	176	183	183					559292
P21243	P21243	5	5	5	Proteasome subunit alpha type-1	SCL1	sp|P21243|PSA1_YEAST Proteasome subunit alpha type-1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SCL1 PE=1 SV=1	1	5	5	5	5	5	5	20.6	20.6	20.6	28.001	252	252	0	35.699	20.6	4725200	4725200	19	248700	248700	4				36	1;25;100;164;250	True;True;True;True;True	1;25;100;164;250	1;31;117;191;299	1;32;122;198;313	1;32;122;198;313					559292
P22141	P22141	7	7	7	Proteasome subunit beta type-4	PRE1	sp|P22141|PSB4_YEAST Proteasome subunit beta type-4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE1 PE=1 SV=2	1	7	7	7	7	7	7	40.9	40.9	40.9	22.516	198	198	0	53.881	40.9	921270000	921270000	9	102360000	102360000	14				37	51;87;138;170;205;215;277	True;True;True;True;True;True;True	51;87;138;170;205;215;277	61;62;101;162;200;201;202;203;245;256;333;334	63;64;105;167;209;210;211;212;255;256;269;350;351;352;353	63;105;167;210;256;269;352					559292
P23638	P23638	4	4	4	Proteasome subunit alpha type-3	PRE9	sp|P23638|PSA3_YEAST Proteasome subunit alpha type-3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE9 PE=1 SV=1	1	4	4	4	4	4	4	15.1	15.1	15.1	28.714	258	258	0	49.566	15.1	2440300	2440300	14	174310	174310	5				38	128;265;267;282	True;True;True;True	128;265;267;282	149;320;322;339	154;336;337;339;358	154;337;339;358					559292
P25043	P25043	4	4	4	Proteasome subunit beta type-2	PUP1	sp|P25043|PSB2_YEAST Proteasome subunit beta type-2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUP1 PE=1 SV=1	1	4	4	4	4	4	4	15.7	15.7	15.7	28.268	261	261	0	26.883	15.7	13385000	13385000	10	1338500	1338500	5				39	77;188;245;283	True;True;True;True	77;188;245;283	91;221;222;294;340	94;231;232;308;359	94;232;308;359					559292
P25332	P25332	1	1	1	Probable ribokinase	RBK1	sp|P25332|RBSK_YEAST Ribokinase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RBK1 PE=1 SV=2	1	1	1	1	1	1	1	3	3	3	36.924	333	333	1	-2	3	0	0	14	0	0	0	+			40	108	True	108	126	131	131	1		121		559292
P25451	P25451	4	4	4	Proteasome subunit beta type-3	PUP3	sp|P25451|PSB3_YEAST Proteasome subunit beta type-3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUP3 PE=1 SV=1	1	4	4	4	4	4	4	18	18	18	22.605	205	205	0	29.948	18	171430000	171430000	8	21429000	21429000	5				41	72;113;143;144	True;True;True;True	72;113;143;144	85;131;167;168;169	88;136;173;174;175	88;136;173;175					559292
P48164;P26786	P48164;P26786	2;2	2;2	2;2	40S ribosomal protein S7-B;40S ribosomal protein S7-A	RPS7B;RPS7A	sp|P48164|RS7B_YEAST 40S ribosomal protein S7-B OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPS7B PE=1 SV=1;sp|P26786|RS7A_YEAST 40S ribosomal protein S7-A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPS7	2	2	2	2	2	2	2	9.5	9.5	9.5	21.634	190	190;190	0	16.405	9.5	1804000	1804000	12	150330	150330	2				42	46;139	True;True	46;139	55;163	57;168	57;168					559292;559292
P30656	P30656	4	4	4	Proteasome subunit beta type-5	PRE2	sp|P30656|PSB5_YEAST Proteasome subunit beta type-5 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE2 PE=1 SV=3	1	4	4	4	4	4	4	16	16	16	31.636	287	287	0	42.565	16	87006000	87006000	15	5800400	5800400	4				43	24;109;115;228	True;True;True;True	24;109;115;228	30;127;133;270	31;132;138;284	31;132;138;284					559292
P32496	P32496	3	3	3	26S proteasome regulatory subunit RPN12	RPN12	sp|P32496|RPN12_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN12 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN12 PE=1 SV=3	1	3	3	3	3	3	3	9.9	9.9	9.9	31.919	274	274	0	18.81	9.9	6157300	6157300	16	384830	384830	4				44	13;73;185	True;True;True	13;73;185	15;86;87;218	15;89;90;228	15;89;228					559292
P32784	P32784	1	1	1	Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1	SCT1	sp|P32784|GPT1_YEAST Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SCT1 PE=1 SV=3	1	1	1	1	1	1	1	1.3	1.3	1.3	85.693	759	759	1	-2	1.3	0	0	39	0	0	0	+			45	40	True	40	48	49	49		1		645	559292
P32795	P32795	1	1	1	Mitochondrial inner membrane i-AAA protease supercomplex subunit YME1	YME1	sp|P32795|YME1_YEAST Mitochondrial inner membrane i-AAA protease supercomplex subunit YME1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YME1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	2	2	2	81.771	747	747	1	-2	2	0	0	38	0	0	0	+			46	32	True	32	38	39	39	8		743		559292
P33297	P33297	3	3	3	26S protease regulatory subunit 6A	RPT5	sp|P33297|PRS6A_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 6A OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT5 PE=1 SV=3	1	3	3	3	3	3	3	11.1	11.1	11.1	48.255	434	434	0	24.895	11.1	1031500	1031500	25	41258	41258	5				47	41;55;93	True;True;True	41;55;93	49;66;108	50;51;68;69;112	51;69;112					559292
P33298	P33298	3	3	3	26S protease regulatory subunit 6B homolog	RPT3	sp|P33298|PRS6B_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT3 PE=1 SV=2	1	3	3	3	3	3	3	4.7	4.7	4.7	47.893	428	428	0	20.277	4.7	2309300	2309300	23	100400	100400	3				48	146;208;211	True;True;True	146;208;211	171;248;251	177;259;263	177;259;263					559292
P33299	P33299	3	3	3	26S protease regulatory subunit 7 homolog	RPT1	sp|P33299|PRS7_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT1 PE=1 SV=1	1	3	3	3	3	3	3	7.1	7.1	7.1	51.982	467	467	0	24	7.1	5686800	5686800	26	218720	218720	2				49	70;270;272	True;True;True	70;270;272	83;326;328	86;343;345	86;343;345					559292
P38624	P38624	11	11	11	Proteasome subunit beta type-1	PRE3	sp|P38624|PSB1_YEAST Proteasome subunit beta type-1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE3 PE=1 SV=2	1	11	11	11	11	11	11	48.4	48.4	48.4	23.547	215	215	0	111.15	48.4	1000300000	1000300000	13	76948000	76948000	16				50	31;36;37;59;82;99;147;162;169;266;284	True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True	31;36;37;59;82;99;147;162;169;266;284	37;42;43;44;45;71;96;116;172;173;189;197;198;199;321;341	38;43;44;45;46;74;99;100;121;178;179;196;204;205;206;207;208;338;360	38;43;46;74;99;121;178;196;204;338;360					559292
P38764	P38764	3	3	3	26S proteasome regulatory subunit RPN1	RPN1	sp|P38764|RPN1_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN1 PE=1 SV=3	1	3	3	3	3	3	3	3.7	3.7	3.7	109.49	993	993	0	44.711	3.7	5547600	5547600	49	113220	113220	4				51	121;200;249	True;True;True	121;200;249	139;140;240;298	144;145;250;312	145;250;312					559292
P38886	P38886	3	3	3	26S proteasome regulatory subunit RPN10	RPN10	sp|P38886|RPN10_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN10 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN10 PE=1 SV=3	1	3	3	3	3	3	3	16	16	16	29.747	268	268	0	20.443	16	8415000	8415000	9	935000	935000	4				52	106;179;275	True;True;True	106;179;275	123;124;212;331	128;129;222;348	128;222;348					559292
P39717	P39717	1	1	1	Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2	GPB2	sp|P39717|GPB2_YEAST Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=GPB2 PE=1 SV=4	1	1	1	1	1	1	1	1.6	1.6	1.6	98.655	880	880	1	-2	1.6	0	0	41	0	0	0	+			53	104	True	104	121	126	126		8		150	559292
P40302	P40302	9	9	9	Proteasome subunit alpha type-6	PRE5	sp|P40302|PSA6_YEAST Proteasome subunit alpha type-6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PRE5 PE=1 SV=1	1	9	9	9	9	9	9	37.2	37.2	37.2	25.604	234	234	0	90.83	37.2	257230000	257230000	17	15131000	15131000	10				54	10;42;140;163;175;187;214;235;236	True;True;True;True;True;True;True;True;True	10;42;140;163;175;187;214;235;236	12;50;51;164;190;208;220;255;281;282;283	12;52;53;169;197;218;230;268;295;296;297	12;53;169;197;218;230;268;295;296					559292
P40327	P40327	2	2	2	26S protease regulatory subunit 4 homolog	RPT2	sp|P40327|PRS4_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT2 PE=1 SV=3	1	2	2	2	2	2	2	5	5	5	48.828	437	437	0	11.629	5	887010	887010	24	36959	36959	2				55	27;101	True;True	27;101	33;118	34;123	34;123					559292
P41805	P41805	2	2	2	60S ribosomal protein L10	RPL10	sp|P41805|RL10_YEAST 60S ribosomal protein L10 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPL10 PE=1 SV=1	1	2	2	2	2	2	2	10	10	10	25.361	221	221	0	16.006	10	3260300	3260300	11	296390	296390	3				56	50;119	True;True	50;119	59;60;137	61;62;142	62;142					559292
P41895	P41895	1	1	1	Transcription initiation factor IIF subunit alpha	TFG1	sp|P41895|T2FA_YEAST Transcription initiation factor IIF subunit alpha OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TFG1 PE=1 SV=2	1	1	1	1	1	1	1	1.1	1.1	1.1	82.193	735	735	0	6.3741	1.1	0	0	33	0	0	1				57	131	True	131	154	159	159					559292
P47116	P47116	1	1	1	Serine/threonine-protein kinase PTK2/STK2	PTK2	sp|P47116|PTK2_YEAST Serine/threonine-protein kinase PTK2/STK2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PTK2 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1.5	1.5	1.5	91.399	818	818	1	-2	1.5	0	0	41	0	0	0	+			58	65	True	65	78	81	81	2	2;9	17	17;18	559292
P50086	P50086	13	13	13	Probable 26S proteasome regulatory subunit p28	NAS6	sp|P50086|PSD10_YEAST Probable 26S proteasome regulatory subunit p28 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=NAS6 PE=1 SV=1	1	13	13	13	13	13	13	36.4	36.4	36.4	25.616	228	228	0	86.478	36.4	807110000	807110000	13	62085000	62085000	18				59	0;5;6;34;78;117;184;186;221;233;278;279;295	True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True	0;5;6;34;78;117;184;186;221;233;278;279;295	0;6;7;8;40;92;135;217;219;263;277;278;335;336;354;355;356;357	0;6;7;8;41;95;140;227;229;276;291;292;354;355;373;374;375;376;377	0;6;7;41;95;140;227;229;276;292;354;355;374					559292
P53141	P53141	1	1	1	Myosin light chain 1	MLC1	sp|P53141|MLC1_YEAST Myosin light chain 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MLC1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	8.1	8.1	8.1	16.444	149	149	1	-2	8.1	0	0	12	0	0	0	+			60	60	True	60	72	75	75	3		102		559292
P53549	P53549	4	4	4	26S protease subunit RPT4	RPT4	sp|P53549|PRS10_YEAST 26S proteasome subunit RPT4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT4 PE=1 SV=4	1	4	4	4	4	4	4	7.3	7.3	7.3	49.408	437	437	0	28.572	7.3	2541400	2541400	21	121020	121020	3				61	123;126;209;252	True;True;True;True	123;126;209;252	142;146;249;301	147;151;260;315	147;151;260;315					559292
P53893	P53893	1	1	1	Ribosome assembly protein 1	RIA1	sp|P53893|RIA1_YEAST Ribosome assembly protein 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RIA1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	0.8	0.8	0.8	124.46	1110	1110	1	-2	0.8	0	0	53	0	0	0	+			62	53	True	53	64	66	66		3		425	559292
P80667	P80667	1	1	1	Peroxisomal membrane protein PAS20	PEX13	sp|P80667|PEX13_YEAST Peroxisomal membrane protein PAS20 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PEX13 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	2.1	2.1	2.1	42.706	386	386	1	-2	2.1	0	0	15	0	0	0	+			63	120	True	120	138	143	143		10		215	559292
Q01939	Q01939	5	5	5	26S protease regulatory subunit 8 homolog	RPT6	sp|Q01939|PRS8_YEAST 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPT6 PE=1 SV=4	1	5	5	5	5	5	5	13.3	13.3	13.3	45.271	405	405	0	36.628	13.3	7302500	7302500	24	304270	304270	6				64	66;148;176;271;280	True;True;True;True;True	66;148;176;271;280	79;174;209;327;337	82;180;181;219;344;356	82;181;219;344;356					559292
Q03661	Q03661	2	2	2	Silent chromatin protein ESC1	ESC1	sp|Q03661|ESC1_YEAST Silent chromatin protein ESC1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=ESC1 PE=1 SV=1	1	2	2	2	2	2	2	1.4	1.4	1.4	187.14	1658	1658	0	12.41	1.4	1736800	1736800	71	24462	24462	2				65	30;244	True;True	30;244	36;293	37;307	37;307					559292
Q04213	Q04213	1	1	1	ISWI one complex protein 4	IOC4	sp|Q04213|IOC4_YEAST ISWI one complex protein 4 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=IOC4 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	2.1	2.1	2.1	55.426	475	475	1	-2	2.1	0	0	19	0	0	0	+			66	223	True	223	265	279	279	4		219		559292
Q04500	Q04500	1	1	1	U3 small nucleolar RNA-associated protein 14	UTP14	sp|Q04500|UTP14_YEAST U3 small nucleolar RNA-associated protein 14 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=UTP14 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1.2	1.2	1.2	103.02	899	899	1	-2	1.2	0	0	38	0	0	0	+			67	145	True	145	170	176	176		4;11		208;210	559292
Q06103	Q06103	2	2	2	26S proteasome regulatory subunit RPN7	RPN7	sp|Q06103|RPN7_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN7 PE=1 SV=3	1	2	2	2	2	2	2	4.9	4.9	4.9	48.958	429	429	0	22.801	4.9	4193800	4193800	22	190630	190630	2				68	9;239	True;True	9;239	11;286	11;300	11;300					559292
Q06436	Q06436	1	1	1	RING-finger protein MAG2	MAG2	sp|Q06436|MAG2_YEAST RING-finger protein MAG2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MAG2 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1.2	1.2	1.2	76.316	670	670	1	-2	1.2	0	0	32	0	0	0	+			69	116	True	116	134	139	139	5		548		559292
Q08723	Q08723	2	2	2	26S proteasome regulatory subunit RPN8	RPN8	sp|Q08723|RPN8_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN8 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN8 PE=1 SV=3	1	2	2	2	2	2	2	5.6	5.6	5.6	38.312	338	338	0	12.442	5.6	1563700	1563700	19	82298	82298	2				70	38;110	True;True	38;110	46;128	47;133	47;133					559292
Q08760	Q08760	1	1	1	Bud site selection protein RAX1	RAX1	sp|Q08760|RAX1_YEAST Bud site selection protein RAX1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RAX1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	2.8	2.8	2.8	50.16	435	435	1	-2	2.8	0	0	20	0	0	0	+			71	234	True	234	279;280	293;294	293		12		282	559292
Q12175	Q12175	1	1	1	MutS protein homolog 5	MSH5	sp|Q12175|MSH5_YEAST MutS protein homolog 5 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MSH5 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	0.8	0.8	0.8	102.21	901	901	1	-2	0.8	0	0	42	0	0	0	+			72	268	True	268	323	340	340		5		363	559292
Q12250	Q12250	2	2	2	26S proteasome regulatory subunit RPN5	RPN5	sp|Q12250|RPN5_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN5 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN5 PE=1 SV=3	1	2	2	2	2	2	2	4.7	4.7	4.7	51.768	445	445	0	12.781	4.7	1890900	1890900	25	75635	75635	2				73	80;124	True;True	80;124	94;143	97;148	97;148					559292
Q12272	Q12272	1	1	1	tRNA 2-phosphotransferase	TPT1	sp|Q12272|TPT1_YEAST tRNA 2-phosphotransferase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=TPT1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	3	3	3	26.196	230	230	1	-2	3	0	0	10	0	0	0	+			74	57	True	57	68	71	71	6		46		559292
Q12276	Q12276	1	1	1	HMG2-induced ER-remodeling protein 1	HER1	sp|Q12276|HER1_YEAST HMG2-induced ER-remodeling protein 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=HER1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	139.46	1246	1246	1	-2	1	0	0	70	0	0	0	+			75	210	True	210	250	261;262	262		6		788	559292
Q12335	Q12335	1	1	1	Protoplast secreted protein 2	PST2	sp|Q12335|PST2_YEAST Protoplast secreted protein 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PST2 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	7.6	7.6	7.6	20.965	198	198	0	6.6964	7.6	684380	684380	9	76042	76042	1				76	238	True	238	285	299	299					559292
Q12377	Q12377	2	2	2	26S proteasome regulatory subunit RPN6	RPN6	sp|Q12377|RPN6_YEAST 26S proteasome regulatory subunit RPN6 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RPN6 PE=1 SV=3	1	2	2	2	2	2	2	4.8	4.8	4.8	49.773	434	434	0	12.795	4.8	367110	367110	21	17481	17481	2				77	26;103	True;True	26;103	32;120	33;125	33;125					559292
Q12447	Q12447	4	4	4	Polyamine N-acetyltransferase 1	PAA1	sp|Q12447|PAA1_YEAST Polyamine N-acetyltransferase 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PAA1 PE=1 SV=1	1	4	4	4	4	4	4	18.3	18.3	18.3	21.947	191	191	0	27.739	18.3	6580100	6580100	12	548350	548350	5				78	18;56;155;183	True;True;True;True	18;56;155;183	22;67;182;216	22;23;70;189;226	22;70;189;226					559292
Q12532	Q12532	1	1	1	Ribosome quality control complex subunit 2	RQC2	sp|Q12532|RQC2_YEAST Ribosome quality control complex subunit 2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RQC2 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1.3	1.3	1.3	119.07	1038	1038	1	-2	1.3	0	0	47	0	0	0	+			79	258	True	258	312	328	328	7		346		559292