Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides MTX1 Peptides MTX2 Peptides MTX3 Razor + unique peptides MTX1 Razor + unique peptides MTX2 Razor + unique peptides MTX3 Unique peptides MTX1 Unique peptides MTX2 Unique peptides MTX3 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type MTX1 Identification type MTX2 Identification type MTX3 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L MTX1 Ratio H/L MTX2 Ratio H/L MTX3 Ratio H/L normalized MTX1 Ratio H/L normalized MTX2 Ratio H/L normalized MTX3 Ratio H/L variability [%] MTX1 Ratio H/L variability [%] MTX2 Ratio H/L variability [%] MTX3 Ratio H/L count MTX1 Ratio H/L count MTX2 Ratio H/L count MTX3 Ratio H/L iso-count MTX1 Ratio H/L iso-count MTX2 Ratio H/L iso-count MTX3 Ratio H/L type MTX1 Ratio H/L type MTX2 Ratio H/L type MTX3 Sequence coverage MTX1 [%] Sequence coverage MTX2 [%] Sequence coverage MTX3 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity MTX1 Intensity L MTX1 Intensity H MTX1 Intensity MTX2 Intensity L MTX2 Intensity H MTX2 Intensity MTX3 Intensity L MTX3 Intensity H MTX3 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions A0AVT1 A0AVT1 6 6 6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 UBA6 sp|A0AVT1|UBA6_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA6 PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 1 2 3 1 2 3 1 2 6.2 6.2 6.2 117.97 1052 1052 0 6.6436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85832 0.86529 67.335 5 3 Median 0.83033 NaN NaN 0.86376 NaN NaN 45.555 NaN NaN 3 1 1 1 1 1 Median Median Median 2.9 0.9 2.5 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40;41;42;43;44;3925;3926;3927;4764;4765;4766;14313;14314;14315;14316;14317;28947;28948;28949;39575;39576;39577;39578;39579;39580;39581;39582;48684;48685;48686;48687;48688;48689;49939;49940;49941;49942;59418;68803;68804;68805;68806;68807;69308;69309;69310;69311;69658;69659;69660;69661;69662;69663;71252;71253;71254;71255;71256;71257;71258;71259;71260;71261;71262;75453;75454;75455;75456;75457;75458;75459;75944;75945;75946;75947;75948;75949;75950;75951;75952;75953;75954;87479;87480;91363;91364;91365 41;3926;4764;14314;28947;39575;48689;49942;59418;68806;69309;69658;71257;75459;75949;87479;91363 A3KN83;Q9Y2G9 A3KN83 15;4 15;4 15;4 Protein strawberry notch homolog 1 SBNO1 sp|A3KN83|SBNO1_HUMAN Protein strawberry notch homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SBNO1 PE=1 SV=1 2 15 15 15 8 9 11 8 9 11 8 9 11 14.5 14.5 14.5 154.31 1393 1393;1366 0 39.677 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95492 0.96588 21.608 26 13 Leave out requantified 0.92917 1.0301 0.98826 0.9594 1.0819 1.029 27.78 29.034 7.1079 6 9 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actin-binding repeat-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XIRP2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 0.5 0.5 0.5 382.3 3374 3374 0.00091743 2.9328 By MS/MS By MS/MS 0.76892 0.78451 56.465 4 0 Median NaN NaN 1.0277 NaN NaN 1.0555 NaN NaN 68.96 1 0 3 0 0 0 Median Median Plateau 0.3 0 0.5 378770000 181130000 197640000 7480500 4227100 3253400 0 0 0 371290000 176900000 194390000 7 6713;18629 True;True 6796;18853 21674;21675;60851;60852 28914;28915;80487 28915;80487 A5PKW4 A5PKW4 2 2 2 PH and SEC7 domain-containing protein 1 PSD sp|A5PKW4|PSD1_HUMAN PH and SEC7 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSD PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 1.9 1.9 1.9 109.54 1024 1024 0.0063911 2.1573 By MS/MS By MS/MS 0.88743 0.91237 5.9746 4 0 Leave out requantified 0.90166 0.87342 NaN 0.92555 0.89937 NaN 6.6361 5.3131 NaN 2 2 0 0 0 0 Median Median Median 1.9 1.9 0 709310000 303140000 406170000 373280000 151370000 221920000 336030000 151780000 184250000 0 0 0 8 12561;16552 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type II cytoskeletal 71 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT71 PE=1 SV=3;sp|Q7RTS7|K2C74_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 74 9 3 1 1 3 1 2 1 0 0 1 0 0 5.9 2.3 2.3 55.877 511 511;520;511;523;529;540;523;529;540 0 8.1811 By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 5.9 1.4 3.5 16673000 16673000 0 16673000 16673000 0 0 0 0 0 0 0 + 28 5767;6128;17326 False;True;False 5832;6201;17539 18667;18668;18669;19796;56545;56546 24838;24839;24840;24841;24842;24843;26321;74721 24840;26321;74721 CON__Q3KNV1;P08729;CON__P08729;CON__Q9DCV7 CON__Q3KNV1;P08729;CON__P08729 15;15;14;5 12;12;11;2 10;10;9;2 Keratin, type II cytoskeletal 7 KRT7 ;sp|P08729|K2C7_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT7 PE=1 SV=5; 4 15 12 10 10 6 11 7 5 8 6 4 6 33.9 29.2 24.9 51.385 469 469;469;469;457 0 37.885 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96623 0.98867 19.693 18 5 Leave out requantified 0.9468 0.86889 0.87241 0.99455 0.84863 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form NACA sp|Q13765|NACA_HUMAN Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACA PE=1 SV=1;sp|E9PAV3|NACAM_HUMAN Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACA PE=1 SV=1 2 5 5 4 5 5 5 5 5 5 4 4 4 28.8 28.8 22.8 23.384 215 215;2078 0 101.16 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91431 0.91995 9.62 34 19 Leave out requantified 0.83326 1.0627 0.91431 0.84758 1.0561 0.91995 5.3517 19.115 6.5031 12 10 12 7 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.8 28.8 28.8 7710600000 4488400000 3222200000 2480400000 1493600000 986790000 2613100000 1507600000 1105500000 2617100000 1487300000 1129900000 34 2730;8797;13618;15330;16710 True;True;True;True;True 2764;2765;8899;13782;15523;16921 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16 16 Dynamin-1-like protein DNM1L sp|O00429|DNM1L_HUMAN Dynamin-1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNM1L PE=1 SV=2 1 16 16 16 10 15 13 10 15 13 10 15 13 25.7 25.7 25.7 81.876 736 736 0 56.055 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0906 1.0994 20.858 40 9 Leave out requantified 1.0578 1.1403 1.0355 1.0845 1.123 1.0635 20.762 22.436 27.86 12 14 14 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.9 23.9 20 1161500000 562720000 598740000 406560000 194190000 212370000 362360000 180970000 181390000 392550000 187570000 204980000 53 379;1082;2241;3482;5777;7178;8050;9115;11271;12790;16835;16962;17243;17284;17963;20803 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 381;1094;2270;3528;5842;7267;8143;9222;11405;12935;17046;17174;17455;17496;18181;21045 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1.2739 35.971 NaN 29.288 2 1 3 0 0 1 Median Median Plateau 19.2 8.8 28 75641000 35666000 39975000 27423000 14069000 13354000 10938000 3370900 7567000 37280000 18227000 19053000 75 1721;14028;20003 True;True;True 1742;14202;20239 5768;46102;46103;65385;65386;65387 7778;60834;60835;86728 7778;60834;86728 O14744 O14744 8 8 8 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed PRMT5 sp|O14744|ANM5_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT5 PE=1 SV=4 1 8 8 8 6 5 6 6 5 6 6 5 6 14.4 14.4 14.4 72.683 637 637 0 36.986 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0849 1.086 14.192 14 4 Leave out requantified 1.0622 1.0852 1.078 1.0827 1.0904 1.0787 11.326 7.2717 20.743 4 4 6 2 0 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 10.2 10.4 11.8 356910000 172010000 184890000 112250000 52600000 59650000 100490000 49946000 50541000 144170000 69468000 74702000 76 99;2440;3247;3665;4421;14614;19858;21106 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kinase Chk1 CHEK1 sp|O14757|CHK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase Chk1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHEK1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.9 6.9 6.9 54.433 476 476 0.0071942 2.0841 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95914 1.0103 34.327 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 2.5 4.4 2.5 24865000 14248000 10617000 14763000 7358900 7403700 0 0 0 10102000 6888700 3213600 78 2765;8308 True;True 2800;8404 9070;9071;27006 12062;12063;35859 12062;35859 O14776;Q5VWI1 O14776 34;1 34;1 34;1 Transcription elongation regulator 1 TCERG1 sp|O14776|TCRG1_HUMAN Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2 2 34 34 34 30 26 29 30 26 29 30 26 29 29.4 29.4 29.4 123.9 1098 1098;586 0 105.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92407 0.95331 15.745 103 28 Leave out requantified 0.93916 0.87509 0.95233 0.96638 0.91739 0.98735 14.829 20.263 17.135 38 33 32 10 8 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.5 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10 10 Kinetochore protein NDC80 homolog NDC80 sp|O14777|NDC80_HUMAN Kinetochore protein NDC80 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDC80 PE=1 SV=1 1 10 10 10 5 5 7 5 5 7 5 5 7 15.3 15.3 15.3 73.912 642 642 0 22.268 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90146 0.93368 14.229 15 9 Leave out requantified 1.0454 0.91442 0.83617 1.1034 0.94829 0.87457 24.151 5.1437 44.47 5 4 6 4 1 4 Median Leave out requantified Median 7.5 7.9 11.2 305440000 151600000 153830000 97907000 47351000 50556000 91616000 48968000 42649000 115910000 55284000 60629000 80 1436;2948;2964;3830;4838;8101;8337;11615;13469;19067 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1453;2983;2999;3880;4896;8194;8433;11751;13632;19296 4778;4779;9661;9662;9714;9715;12558;12559;15863;15864;15865;26146;27106;38380;44213;44214;44215;62354 6451;6452;12832;12833;12902;12903;16705;21113;21114;21115;34840;35975;50793;58354;58355;58356;82610 6452;12832;12903;16705;21115;34840;35975;50793;58354;82610 O14802 O14802 4 3 3 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 POLR3A sp|O14802|RPC1_HUMAN DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3A PE=1 SV=2 1 4 3 3 3 1 1 2 1 1 2 1 1 2.9 2.2 2.2 155.64 1390 1390 0.00049213 3.8089 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1296 1.1678 88.066 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 2.2 0.6 0.9 32693000 10598000 22095000 11009000 1554100 9454800 1669700 911760 757990 20014000 8131900 11882000 81 4398;8726;15552;18591 False;True;True;True 4451;8828;15750;18815 14391;28567;28568;50986;60733 19201;37807;37808;67294;80333 19201;37808;67294;80333 O14818;Q8TAA3 O14818;Q8TAA3 9;5 9;5 9;5 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like PSMA7;PSMA8 sp|O14818|PSA7_HUMAN Proteasome subunit alpha type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMA7 PE=1 SV=1;sp|Q8TAA3|PSMA8_HUMAN Proteasome subunit alpha-type 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMA8 PE=2 SV=3 2 9 9 9 8 9 9 8 9 9 8 9 9 46 46 46 27.887 248 248;256 0 105.92 By MS/MS By MS/MS By 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O14828 O14828 1 1 1 Secretory carrier-associated membrane protein 3 SCAMP3 sp|O14828|SCAM3_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP3 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 38.287 347 347 0.0099626 1.9433 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77072 0.77717 7.9833 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 10391000 7332500 3058400 0 0 0 5289600 3381500 1908100 5101300 3951000 1150300 83 4894 True 4953 16045;16046;16047 21361;21362;21363 21362 O14893 O14893 3 3 3 Gem-associated protein 2 GEMIN2 sp|O14893|GEMI2_HUMAN Gem-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GEMIN2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 2 1 1 2 1 1 2 13.6 13.6 13.6 31.585 280 280 0.00052493 4.7026 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9037 0.96727 2.1554 2 1 Median NaN NaN 0.9037 NaN NaN 0.96727 NaN NaN 2.1554 0 0 2 0 0 1 Median Median Median 2.5 2.5 11.1 33879000 16180000 17698000 0 0 0 0 0 0 33879000 16180000 17698000 84 417;16856;19926 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2.0598 2.1797 101.94 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 1.3 0 1.3 44771000 9823700 34947000 9289600 4912000 4377600 0 0 0 35482000 4911700 30570000 95 13177 True 13336 43273;43274 57126;57127 57126 O15020 O15020 6 2 2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 SPTBN2 sp|O15020|SPTN2_HUMAN Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTBN2 PE=1 SV=3 1 6 2 2 6 1 2 2 1 2 2 1 2 2.8 1.4 1.4 271.32 2390 2390 0 6.7796 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1035 1.1078 16.663 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.8 0.8 1.4 55745000 25280000 30465000 20684000 10290000 10394000 17726000 9694700 8030900 17335000 5295300 12040000 96 878;2332;5463;9004;11431;12680 True;False;False;False;False;True 888;2362;5525;9109;11566;12825 2993;2994;7719;17744;29467;37764;41675;41676;41677 4054;4055;10303;23600;39046;50007;55092;55093;55094;55095;55096;55097 4054;10303;23600;39046;50007;55092 O15027 O15027 3 3 3 Protein transport protein Sec16A SEC16A sp|O15027|SC16A_HUMAN Protein transport protein Sec16A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC16A PE=1 SV=4 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1.4 1.4 1.4 251.89 2357 2357 0.00050891 4.2311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1 0.9 1 9031000 3197200 5833900 9031000 3197200 5833900 0 0 0 0 0 0 97 6439;7339;21164 True;True;True 6517;7429;21411 20746;23733;23734;23735;68981;68982 27608;31638;31639;31640;91432;91433 27608;31640;91433 O15042 O15042 16 16 16 U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein U2SURP sp|O15042|SR140_HUMAN U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=U2SURP PE=1 SV=2 1 16 16 16 13 10 14 13 10 14 13 10 14 16.1 16.1 16.1 118.29 1029 1029 0 63.678 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0066 1.0515 13.293 39 7 Leave out requantified 1.0948 0.94857 0.97738 1.1419 0.98521 1.0099 16.592 12.173 16.782 14 10 15 3 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.4 10.7 15.3 1182900000 576750000 606130000 468400000 222340000 246070000 254670000 134330000 120330000 459810000 220080000 239720000 98 2861;4584;5897;6137;6315;10253;10681;12786;13749;13926;16375;16376;17903;18094;21078;21079 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2896;4639;5967;6210;6392;10378;10810;12931;13913;14099;16583;16584;18120;18315;21324;21325 9374;9375;9376;14997;19099;19820;19821;19822;20368;20369;33867;33868;35338;35339;35340;41986;41987;41988;41989;41990;45158;45744;45745;45746;45747;53617;53618;53619;53620;53621;53622;58526;58527;58528;59120;59121;59122;68721;68722;68723;68724 12466;20013;25418;26352;26353;26354;27103;27104;27105;44917;44918;46838;46839;46840;46841;46842;46843;55462;55463;59565;60317;60318;60319;60320;60321;70800;70801;70802;70803;70804;70805;70806;70807;70808;70809;77447;77448;77449;77450;78173;91074;91075 12466;20013;25418;26354;27103;44917;46842;55463;59565;60321;70801;70806;77450;78173;91074;91075 O15047 O15047 7 7 7 Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A SETD1A sp|O15047|SET1A_HUMAN Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETD1A PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 1 5 5 1 5 5 1 5 5.1 5.1 5.1 186.03 1707 1707 0 11.046 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9495 0.93277 15.991 9 3 Leave out requantified 0.93579 NaN 0.87351 0.92483 NaN 0.91387 21.051 NaN 13.783 4 1 4 1 0 2 Leave out requantified Median Median 3.6 0.7 3.6 96065000 51801000 44264000 42538000 22359000 20179000 15009000 8033700 6975400 38517000 21408000 17110000 99 2577;5595;11462;13780;14824;15477;21187 True;True;True;True;True;True;True 2610;5660;11597;13947;15013;15672;21434 8462;18169;37877;37878;37879;45277;45278;48635;50696;50697;69048 11298;24176;50154;59711;59712;64166;66971;91530 11298;24176;50154;59711;64166;66971;91530 O15056 O15056 6 6 6 Synaptojanin-2 SYNJ2 sp|O15056|SYNJ2_HUMAN Synaptojanin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNJ2 PE=1 SV=3 1 6 6 6 3 5 4 3 5 4 3 5 4 6.2 6.2 6.2 165.54 1496 1496 0 14.423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92309 0.93697 40.749 9 4 Leave out requantified 0.88475 0.64324 0.80603 0.89041 0.67097 0.82496 22.542 45.78 2.6706 2 5 2 0 3 1 Median Median Median 2.2 4.3 4.6 153980000 89607000 64369000 35202000 19857000 15346000 83200000 45844000 37356000 35573000 23906000 11666000 100 2536;2929;9662;10984;17380;18482 True;True;True;True;True;True 2568;2964;9780;11116;17593;18706 8345;9596;31737;31738;36303;36304;56732;56733;56734;60360;60361;60362;60363 11142;12749;42158;42159;48089;48090;74952;74953;74954;79826;79827;79828;79829;79830 11142;12749;42158;48090;74954;79830 O15066;O14782 O15066 8;3 8;3 7;3 Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed KIF3B sp|O15066|KIF3B_HUMAN Kinesin-like protein KIF3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF3B PE=1 SV=1 2 8 8 7 5 4 7 5 4 7 4 3 6 10.7 10.7 9 85.124 747 747;793 0 15.198 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83588 0.85202 8.2866 16 3 Leave out requantified 0.84832 0.78597 0.82021 0.86434 0.80111 0.84557 19.054 26.524 5.8467 6 4 6 1 1 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 6.6 5 9.6 206790000 116350000 90444000 85185000 47072000 38113000 55925000 31203000 24722000 65680000 38071000 27609000 101 3085;4597;11239;11777;13654;14501;16849;17178 True;True;True;True;True;True;True;True 3121;4652;11373;11914;13818;14685;17060;17390 10100;15032;15033;15034;37136;37137;37138;38874;44834;44835;47611;55069;55070;55071;56073;56074;56075;56076;56077;56078;56079 13405;20053;20054;20055;49190;51393;59153;62840;72690;72691;72692;74060;74061;74062;74063;74064;74065;74066;74067;74068;74069 13405;20055;49190;51393;59153;62840;72690;74061 O15067 O15067 19 19 19 Phosphoribosylformylglycinamidine synthase PFAS sp|O15067|PUR4_HUMAN Phosphoribosylformylglycinamidine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFAS PE=1 SV=4 1 19 19 19 15 17 18 15 17 18 15 17 18 21.3 21.3 21.3 144.73 1338 1338 0 100.45 By 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN6 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 24.8 24.8 24.8 14.582 129 129 0.00052029 4.5277 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89741 0.92611 15.893 6 0 Leave out requantified 0.89393 1.0435 0.72584 0.93937 1.0866 0.74666 10.329 22.605 4.1807 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 14 14 17.1 153410000 81671000 71744000 48809000 26567000 22242000 55620000 27604000 28016000 48986000 27501000 21485000 106 4153;11655;15492 True;True;True 4206;11791;15688 13625;38513;38514;38515;50763;50764 18167;50945;50946;67049 18167;50945;67049 O15260 O15260 2 2 2 Surfeit locus protein 4 SURF4 sp|O15260|SURF4_HUMAN Surfeit locus protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SURF4 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 8.6 8.6 8.6 30.394 269 269 0 5.2339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1014 1.0996 4.0849 5 1 Leave out requantified NaN 1.001 1.1644 NaN 0.97774 1.1623 NaN 12.337 29.28 1 2 2 0 1 0 Median Median Median 3.7 8.6 8.6 99536000 41492000 58044000 26344000 10903000 15441000 36273000 15899000 20374000 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6 6 6 Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase WBSCR22 sp|O43709|BUD23_HUMAN Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BUD23 PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 5 5 5 5 5 5 5 5 29.2 29.2 29.2 31.88 281 281 0 37.828 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98514 0.989 6.3041 19 11 Leave out requantified 1.1607 0.92345 1.0198 1.1586 0.90905 1.0037 16.204 10.343 22.447 4 7 8 3 3 5 Median Leave out requantified Median 21.4 26.7 26.7 887040000 405890000 481150000 212930000 87559000 125370000 247190000 118090000 129090000 426920000 200230000 226690000 154 598;1775;5341;5609;12994;15543 True;True;True;True;True;True 602;1796;5403;5674;13145;15741 2044;2045;2046;2047;5931;5932;5933;5934;17379;17380;17381;17382;18204;18205;18206;18207;42691;50961;50962;50963;50964;50965 2792;2793;2794;2795;7987;7988;7989;7990;23126;23127;23128;23129;24227;24228;24229;24230;24231;24232;24233;56392;67268;67269;67270;67271;67272;67273;67274 2792;7989;23129;24232;56392;67273 O43719 O43719 6 6 6 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form S1 OPA1 sp|O60313|OPA1_HUMAN Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OPA1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.2 2.2 2.2 111.63 960 960 0.00049505 3.8562 By MS/MS By MS/MS 1.0588 1.0904 34.019 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 0 1 1.1 19813000 8807000 11006000 0 0 0 9157000 4470200 4686800 10656000 4336800 6319300 178 7983;18430 True;True 8075;18652 25791;60161 34409;79558 34409;79558 O60333 O60333 3 1 1 Kinesin-like protein KIF1B KIF1B sp|O60333|KIF1B_HUMAN Kinesin-like protein KIF1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1B PE=1 SV=5 1 3 1 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 2.1 0.7 0.7 204.47 1816 1816 0.00050531 4.1499 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 7517400 2645900 4871600 0 0 0 7517400 2645900 4871600 0 0 0 179 2109;4637;18525 True;False;False 2136;4693;18749 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TBC1 domain family member 4 TBC1D4 sp|O60343|TBCD4_HUMAN TBC1 domain family member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBC1D4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2.3 2.3 2.3 146.56 1298 1298 0 7.4686 By MS/MS By matching By MS/MS 1.0234 1.0802 14.381 4 1 Median 1.0234 NaN NaN 1.0743 NaN NaN 9.5854 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 2.3 1.2 1.2 60452000 30652000 29800000 42264000 21407000 20856000 8853200 3960500 4892600 9335200 5283800 4051400 181 8163;16832 True;True 8256;17043 26335;26336;26337;55025 35068;35069;35070;35071;72637 35069;72637 O60488 O60488 2 2 2 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 ACSL4 sp|O60488|ACSL4_HUMAN Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACSL4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 3.2 3.2 3.2 79.187 711 711 0.00047348 3.3016 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93663 0.99489 12.252 4 0 Leave out requantified NaN NaN 0.88717 NaN NaN 0.9558 NaN NaN 6.5835 1 1 2 0 0 0 Median Median Median 1.8 1.8 3.2 85609000 43730000 41879000 11127000 5956700 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16 10 10 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q SYNCRIP sp|O60506|HNRPQ_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNCRIP PE=1 SV=2 1 16 10 10 12 14 13 7 8 7 7 8 7 28.4 19.1 19.1 69.602 623 623 0 42.342 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98879 0.9997 21.532 30 9 Leave out requantified 0.86832 0.94385 1.0682 0.88432 0.982 1.0401 28.864 11.577 16.73 9 12 9 0 7 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.9 25.5 23.9 1027400000 492990000 534380000 351480000 165020000 186470000 356890000 172450000 184440000 319000000 155530000 163470000 184 274;542;646;3363;3671;4273;6965;8096;10732;11094;11890;12765;13683;15658;17789;20104 False;True;False;True;True;True;False;True;True;False;True;True;True;False;False;True 275;545;652;3407;3719;4326;7050;8189;10863;11227;12029;12910;13847;15857;18006;20340 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1313;1937;3040;3851;5922;5993;8316;11683;12580;12581;12682;16565;23941;24698;26089;26798;26859;28592;28636;29516;31170;35857;38473;38489;41155;41465;49569;50967;54534;55063;55081;55747;61350;69448;72239;73327;76131;81485;82075;84508;85202;85804;86301;87447;87567;87830;88314;89637;89640 O75376 O75376 2 2 2 Nuclear receptor corepressor 1 NCOR1 sp|O75376|NCOR1_HUMAN Nuclear receptor corepressor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCOR1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 0.9 0.9 0.9 270.21 2440 2440 0.0030541 2.4333 By MS/MS By MS/MS 1.0664 1.0663 20.059 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 0.4 0.9 112410000 53555000 58859000 0 0 0 61891000 30879000 31012000 50523000 22676000 27847000 225 7855;9648 True;True 7947;9766 25390;31688;31689 33874;42081;42082 33874;42082 O75390 O75390 9 9 9 Citrate synthase, mitochondrial CS sp|O75390|CISY_HUMAN Citrate synthase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CS PE=1 SV=2 1 9 9 9 8 7 7 8 7 7 8 7 7 19.7 19.7 19.7 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3 3 Sperm-associated antigen 7 SPAG7 sp|O75391|SPAG7_HUMAN Sperm-associated antigen 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPAG7 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 17.2 17.2 17.2 26.034 227 227 0 9.0331 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99004 0.99853 36.673 4 2 Median NaN 1.3758 NaN NaN 1.4013 NaN NaN 31.211 NaN 1 2 1 1 1 0 Median Median Median 11.5 11.5 5.7 139450000 56136000 83310000 5165600 3233400 1932100 75229000 23096000 52134000 59051000 29807000 29244000 227 3501;4237;5611 True;True;True 3547;4290;5676 11467;11468;13902;13903;18212 15234;18520;18521;24237 15234;18521;24237 O75396 O75396 5 5 5 Vesicle-trafficking protein SEC22b SEC22B sp|O75396|SC22B_HUMAN Vesicle-trafficking protein SEC22b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC22B PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 2 1 3 2 1 3 2 1 28.4 28.4 28.4 24.593 215 215 0 18.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86565 0.87126 59.809 7 4 Median 0.86565 0.85901 1.2942 0.87126 0.86851 1.2736 20.004 12.037 137.34 3 2 2 2 0 2 Median Median Median 18.1 12.6 6.5 164360000 83195000 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ATPase-containing subunit A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KATNA1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.4 2.4 2.4 55.964 491 491 0.0083299 1.9789 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.4 0 0 8587700 3700700 4886900 8587700 3700700 4886900 0 0 0 0 0 0 232 16701 True 16912 54626 72094 72094 O75475 O75475 16 16 16 PC4 and SFRS1-interacting protein PSIP1 sp|O75475|PSIP1_HUMAN PC4 and SFRS1-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSIP1 PE=1 SV=1 1 16 16 16 13 14 12 13 14 12 13 14 12 32.3 32.3 32.3 60.103 530 530 0 59.227 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90665 0.97574 20.717 45 13 Leave out requantified 0.91519 0.88755 0.96284 0.95327 0.97495 1.0173 15.507 27.476 24.809 14 16 15 4 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.4 26.4 22.3 1523600000 883140000 640440000 537030000 306150000 230880000 500550000 299390000 201160000 486000000 277590000 208410000 233 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10142;29952;69225;89738;90488 O75521 O75521 1 1 1 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial ECI2 sp|O75521|ECI2_HUMAN Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECI2 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 2.5 2.5 43.585 394 394 0.00091533 2.9178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.5 2.5 2.5 19549000 4144000 15405000 12672000 4144000 8528000 0 0 0 6876600 0 6876600 235 2528 True 2560 8318;8319;8320 11106;11107;11108 11106 O75530 O75530 5 5 5 Polycomb protein EED EED sp|O75530|EED_HUMAN Polycomb protein EED OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EED PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 4 3 3 4 3 3 4 3 12.9 12.9 12.9 50.197 441 441 0 20.653 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.087 1.1166 18.269 7 1 Leave out requantified 1.2341 1.1324 1.078 1.2586 1.1781 1.1006 34.766 22.373 2.0369 2 3 2 1 0 0 Median Leave out requantified Median 7.5 10.9 7.9 120000000 61977000 58028000 27816000 13861000 13955000 58124000 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86;756;841;6718;6902;7148;7419;7865;9467;9935;9973;10848;13420;14178;14571;15236;15824;16789;17421;17788;18360;19869;20143;20641;20904 309;2550;2845;2846;2847;21431;21432;21990;21991;21992;21993;21994;21995;22810;22811;22812;23708;23709;23710;25130;25131;25132;30708;30709;32247;32248;32249;32250;32381;32382;35497;35498;35499;43503;46021;46022;46023;47250;47251;47252;47253;49342;49343;49344;51226;51227;54259;54260;54261;56171;56172;56173;57345;57346;57347;59263;59264;64216;64217;65101;66636;66637;67430;67431 440;3442;3862;28564;29351;29352;29353;29354;29355;29356;29357;29358;29359;29360;30405;30406;30407;30408;30409;30410;30411;31606;31607;31608;31609;31610;31611;33524;33525;33526;40745;40746;40747;42858;42859;42860;42861;43040;47071;57424;60708;60709;60710;62367;62368;62369;62370;65161;65162;65163;67580;67581;71602;71603;71604;74198;74199;74200;75781;75782;75783;78366;78367;78368;85177;85178;86374;88331;88332;88333;89374 440;3442;3862;28564;29352;30411;31611;33524;40746;42860;43040;47071;57424;60708;62367;65162;67580;71603;74198;75781;78368;85178;86374;88331;89374 O75534 O75534 22 22 22 Cold shock domain-containing protein E1 CSDE1 sp|O75534|CSDE1_HUMAN Cold shock domain-containing protein E1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSDE1 PE=1 SV=2 1 22 22 22 18 19 16 18 19 16 18 19 16 30.3 30.3 30.3 88.884 798 798 0 82.751 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92573 0.96294 12.888 57 12 Leave out requantified 0.91355 1.0599 0.94809 0.95132 1.0827 0.968 23.484 15.475 11.65 20 19 18 4 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.2 26.8 22.4 2072700000 1046000000 1026700000 743860000 381660000 362210000 670630000 331520000 339110000 658240000 332860000 325380000 239 1661;2611;3172;3283;3558;3774;4875;4979;5481;6790;6950;7596;9175;9177;11021;13650;13982;15136;17816;18928;19046;20129 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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35 35 35 E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2 MYCBP2 sp|O75592|MYCB2_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYCBP2 PE=1 SV=4 1 35 35 35 21 25 26 21 25 26 21 25 26 9.8 9.8 9.8 513.63 4678 4678 0 172.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91173 0.92442 26.07 71 25 Leave out requantified 0.95238 0.80171 1.0251 0.97238 0.86364 1.0548 31.313 30.084 26.049 20 27 24 6 13 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.4 6.9 7.4 1172000000 580790000 591220000 322770000 160140000 162640000 431810000 216700000 215110000 417430000 203960000 213470000 242 1121;1670;2326;2999;4374;4798;6394;6694;6994;7262;7551;7630;7842;7953;8301;8880;9314;11434;11456;13190;13371;14343;14823;15904;15952;16195;16509;16964;17312;18194;18381;20358;20378;20469;20525 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Ribonuclease P protein subunit p20 POP7 sp|O75817|POP7_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP7 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 10.7 10.7 10.7 15.651 140 140 0 7.5883 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 10.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 251 6710 True 6793 21668 28907 28907 O75821 O75821 9 9 9 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G EIF3G sp|O75821|EIF3G_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3G PE=1 SV=2 1 9 9 9 7 9 9 7 9 9 7 9 9 32.2 32.2 32.2 35.611 320 320 0 49.921 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97065 0.99104 13.915 28 4 Leave out requantified 0.90227 0.97683 0.89468 0.92241 1.0014 0.94085 13.023 15.006 20.12 8 10 10 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.8 32.2 32.2 1875500000 936750000 938740000 590740000 303870000 286870000 632990000 300730000 332260000 651750000 332150000 319600000 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O75874 19 19 18 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic IDH1 sp|O75874|IDHC_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH1 PE=1 SV=2 1 19 19 18 17 16 16 17 16 16 16 15 15 50.7 50.7 48.6 46.659 414 414 0 134.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0638 1.0753 19.012 60 10 Leave out requantified 1.0721 0.9943 0.9633 1.1427 0.99217 0.98312 19.912 13.298 14.456 21 20 19 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.5 43.2 44.2 5379300000 2663900000 2715400000 1995700000 959560000 1036100000 1775000000 899630000 875410000 1608600000 804740000 803830000 256 1582;1927;2274;2741;2885;6090;7451;7692;8090;9150;9569;12670;13619;15858;15912;16230;18547;19063;20182 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1601;1953;2304;2776;2920;6162;7541;7783;8183;9258;9686;12815;13783;16058;16112;16436;18771;19292;20419 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4818;4819;4820;7367;7368;7369;7370;7371;7372;7373;7374;7375;7376;7377;7378;7627;7628;7629;7630;7631;7632;7633;7634;10810;10811;10812;10813;10814;10815;10816;10817;10995;10996;10997;10998;20000;20001;20002;20003;20004;20005;20006;20007;20008;20009;20010;20011;25574;25575;43249;43250;43251;43252;43253;43254;43348;43349;43350;51335;51336;51337;51338;51536;51537;51538;67113;67591;67592;67593;68497;68498;75048;80525;80526;80527;80528;80529;80530;80531;80532;80533;86263;86264 4820;7378;7629;10810;10995;20006;25574;43249;43348;51335;51536;67113;67591;68498;75048;80526;86264 O76031 O76031 3 3 3 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial CLPX sp|O76031|CLPX_HUMAN ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPX PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 6.2 6.2 6.2 69.223 633 633 0 7.2045 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78365 0.82729 13.373 7 2 Leave out requantified 0.88036 0.82377 NaN 0.93886 0.86427 NaN 14.643 21.821 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742;1036;2496;3356;3890;3924;5011;8007;9749;10432;12629;14225;15091;17760;18073;19224;19727;20378;20435;20514;20851 2513;2514;2515;3460;3461;3462;8122;8123;8124;8125;8126;10879;10880;10881;12583;12584;12585;12694;12695;12696;12697;12698;12699;16223;16224;16225;25571;25572;31627;31628;31629;34058;34059;34060;41038;46154;46155;46156;48882;48883;57251;57252;57253;57254;57255;57256;57257;57258;58367;58368;58369;62105;62106;62107;62108;63763;63764;63765;65842;66028;66029;66030;66248;66249;67247;67248;67249 3388;3389;3390;3391;3392;3393;4664;4665;4666;4667;10830;10831;10832;10833;10834;14484;14485;14486;16732;16733;16734;16875;16876;16877;16878;16879;16880;21632;21633;21634;21635;21636;34124;34125;34126;42000;42001;42002;45198;54229;60908;60909;60910;64511;64512;64513;75651;75652;75653;75654;75655;75656;75657;75658;75659;77211;82253;82254;82255;82256;82257;84555;84556;84557;87325;87572;87573;87574;87575;87576;87577;87837;87838;89125;89126;89127 3392;4667;10833;14486;16733;16878;21634;34124;42000;45198;54229;60908;64511;75654;77211;82256;84556;87325;87577;87837;89125 O94763 O94763 3 3 3 Unconventional prefoldin RPB5 interactor 1 URI1 sp|O94763|RMP_HUMAN Unconventional prefoldin RPB5 interactor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=URI1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 10.1 10.1 10.1 59.832 535 535 0 11.646 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.5279 0.55623 61.065 5 5 Median 0.72616 NaN 0.81648 0.71636 NaN 0.82268 89.865 NaN 55.351 2 1 2 2 1 2 Median Median Median 5.6 2.6 7.1 55718000 28241000 27477000 21229000 12106000 9122500 9179600 6500500 2679200 25310000 9634800 15675000 270 4303;14066;18340 True;True;True 4356;14242;18562 14088;46212;59905;59906;59907 18781;60977;79224;79225;79226;79227 18781;60977;79226 O94776 O94776 15 15 15 Metastasis-associated protein MTA2 MTA2 sp|O94776|MTA2_HUMAN Metastasis-associated protein MTA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTA2 PE=1 SV=1 1 15 15 15 13 12 14 13 12 14 13 12 14 29 29 29 75.022 668 668 0 61.233 By 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kinase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK10 PE=1 SV=1 1 4 2 2 3 2 4 1 0 2 1 0 2 4 2 2 112.13 968 968 0.00048709 3.6297 By matching By matching By MS/MS 1.355 1.4064 34.937 3 0 Median NaN NaN 1.1391 NaN NaN 1.1737 NaN NaN 47.15 1 0 2 0 0 0 Median Median Median 3 2.1 4 43899000 22862000 21037000 19606000 9609600 9996100 0 0 0 24293000 13253000 11041000 273 924;2024;8209;10464 True;False;True;False 935;2050;8303;10590 3121;3122;6714;6715;6716;6717;6718;6719;26529;34598;34599;34600 4196;4197;9038;9039;9040;9041;9042;9043;35293;45857;45858;45859 4197;9043;35293;45859 O94806 O94806 1 1 1 Serine/threonine-protein kinase D3 PRKD3 sp|O94806|KPCD3_HUMAN Serine/threonine-protein kinase D3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKD3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2.1 2.1 2.1 100.47 890 890 0.0022302 2.6467 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0 2.1 0 21877000 11949000 9928300 0 0 0 21877000 11949000 9928300 0 0 0 274 12928 True 13077 42457 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4 4 4 Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 PCF11 sp|O94913|PCF11_HUMAN Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCF11 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 1 3 2 1 3 2 1 2.9 2.9 2.9 173.05 1555 1555 0 7.2331 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99714 1.0539 15.422 5 0 Leave out requantified 0.88875 0.96634 NaN 0.94984 1.0179 NaN 16.558 15.633 NaN 2 2 1 0 0 0 Median Median Median 2.3 1.4 0.7 55360000 28318000 27042000 25453000 13117000 12335000 18261000 9197200 9063700 11646000 6003100 5643000 280 1287;13467;14447;16891 True;True;True;True 1302;13630;14631;17102 4301;4302;4303;44211;47464;55179 5793;5794;5795;58352;62658;72822 5793;58352;62658;72822 O94915 O94915 5 5 4 Protein furry homolog-like FRYL sp|O94915|FRYL_HUMAN Protein furry homolog-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FRYL PE=1 SV=2 1 5 5 4 5 3 3 5 3 3 4 2 2 1.5 1.5 1.3 339.59 3013 3013 0 7.0074 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0374 1.0511 29.415 10 2 Leave out requantified 1.0029 1.2635 0.99879 1.0188 1.3097 1.037 35.491 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O95163 14 14 14 Elongator complex protein 1 IKBKAP sp|O95163|ELP1_HUMAN Elongator complex protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP1 PE=1 SV=3 1 14 14 14 11 9 10 11 9 10 11 9 10 14.2 14.2 14.2 150.25 1332 1332 0 65.799 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99591 1.0259 49.702 29 6 Leave out requantified 0.9631 1.0476 1.031 1.0019 1.0623 1.0853 64.415 12.735 23.422 12 8 9 4 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.6 9.6 11 799040000 392510000 406530000 325540000 164150000 161390000 228570000 109100000 119470000 244930000 119270000 125670000 289 1158;1988;2010;2529;9399;9482;9802;13825;15172;17180;18072;19173;19309;20601 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1171;2014;2036;2561;9515;9598;9922;13993;15364;17392;18293;19403;19539;20841 3889;3890;3891;6599;6600;6601;6671;8321;8322;8323;30870;30871;31124;31125;31126;32217;32218;32219;45423;49740;56087;56088;56089;59056;59057;62712;63133;63134;63135;63136;67221 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38008;38009;38010;38011;38012;38013;38014;38015;38016;38017;41509;41510;41511;41512;41513;46202;46203;46204;46205;46206;46207;46208;58444;58445;59308;59309;59310;68388;68389;68390;68391;68392;68393;73834;73835;73836;73837;82443;82444;82445;82446;82447;82448;90477;90478;90479;90480;90481;90482;90483;90484;91597;91598;91599;91600;91601 38015;41509;46206;58445;59308;68388;73835;82448;90477;91598 O95239;Q2VIQ3 O95239 22;10 22;10 21;9 Chromosome-associated kinesin KIF4A KIF4A sp|O95239|KIF4A_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4A PE=1 SV=3 2 22 22 21 16 16 17 16 16 17 15 15 16 20.9 20.9 20 139.88 1232 1232;1234 0 83.381 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90494 0.90909 20.16 42 18 Leave out requantified 0.90128 0.83279 0.93628 0.91058 0.85489 0.90909 17.183 20.57 24.412 14 14 14 7 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.7 15.3 16.1 924020000 500760000 423260000 305860000 167430000 138430000 312150000 170260000 141890000 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O95263 O95263 2 2 2 High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3,5-cyclic phosphodiesterase 8B PDE8B sp|O95263|PDE8B_HUMAN High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3,5-cyclic phosphodiesterase 8B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE8B PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.5 3.5 3.5 98.978 885 885 0.0060189 2.2509 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 1.4 2.1 0 11585000 3047300 8538000 0 0 0 11585000 3047300 8538000 0 0 0 295 298;2473 True;True 299;2504 1022;8146 1412;10858 1412;10858 O95340 O95340 12 11 11 Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2;Sulfate adenylyltransferase;Adenylyl-sulfate kinase PAPSS2 sp|O95340|PAPS2_HUMAN Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPSS2 PE=1 SV=2 1 12 11 11 8 7 8 7 6 7 7 6 7 25.4 23.1 23.1 69.5 614 614 0 31.425 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0801 1.1278 49.492 21 8 Leave out requantified 1.3217 1.0722 1.0712 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126;3377;4343;4398;9063;16034;16523;16822;16888 True;True;True;True;True;True;True;True;True 127;3421;4396;4451;9168;16235;16731;17033;17099 434;435;436;11077;14222;14223;14391;29679;29680;29681;52496;54089;54090;54091;54991;54992;55170;55171 608;609;610;611;14740;18964;18965;19201;39370;39371;69312;71384;72592;72812;72813 611;14740;18964;19201;39371;69312;71384;72592;72812 O95707 O95707 2 2 2 Ribonuclease P protein subunit p29 POP4 sp|O95707|RPP29_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10.9 10.9 10.9 25.424 220 220 0.00053305 5.0331 By matching By MS/MS By MS/MS 0.92884 0.95934 0.62356 6 0 Leave out requantified 0.92884 1.0085 0.79879 0.95934 1.0366 0.83198 0.62356 4.2285 3.1284 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 10.9 10.9 10.9 87913000 44290000 43623000 36434000 17705000 18729000 23039000 10781000 12257000 28441000 15804000 12637000 307 3888;11004 True;True 3938;11137 12737;12738;12739;36367;36368;36369 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Phosphoglycerate kinase 1 PGK1 sp|P00558|PGK1_HUMAN Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1 PE=1 SV=3 2 26 26 26 26 26 25 26 26 25 26 26 25 71.2 71.2 71.2 44.614 417 417;417 0 219.3 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95722 1.0104 8.5232 102 12 Leave out requantified 0.89429 0.9476 0.98658 0.94212 0.98419 1.0236 11.551 11.01 10.515 34 35 33 4 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 71.2 71.2 69.1 16138000000 7929400000 8208800000 4818300000 2376100000 2442200000 6160300000 3035400000 3125000000 5159500000 2517900000 2641600000 324 203;214;609;692;958;1055;2415;4865;5793;6026;6736;9496;9695;9696;11133;12476;13880;17252;17760;17761;18922;19624;19630;20030;20546;21089 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 204;215;613;699;970;1067;2445;4924;5858;6097;6819;9612;9814;9815;11266;12618;14053;17464;17977;17978;19147;19856;19857;19863;20266;20785;21335 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1B PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 9.5 9.5 9.5 56.559 529 529 0.00050277 4.1202 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76861 0.76408 35.863 5 4 Median 0.68048 1.2094 NaN 0.68988 1.2697 NaN 14.447 18.953 NaN 2 2 1 2 1 1 Median Median Median 6 6.8 3.4 79165000 45809000 33356000 27974000 17954000 10021000 30477000 16217000 14260000 20714000 11638000 9075500 357 4403;6202;6472 True;True;True 4457;6276;6551 14411;14412;14413;20024;20842 19224;19225;19226;26610;27730 19226;26610;27730 P06703 P06703 3 3 3 Protein S100-A6 S100A6 sp|P06703|S10A6_HUMAN Protein S100-A6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A6 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 24.4 24.4 24.4 10.18 90 90 0 5.92 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83881 0.85035 2.1248 9 0 Leave out requantified 0.77807 0.89289 0.83881 0.78983 0.91103 0.85068 8.9326 5.9004 1.2241 3 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.4 24.4 24.4 3497000000 1819500000 1677400000 1634900000 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P07237 P07237 8 8 8 Protein disulfide-isomerase P4HB sp|P07237|PDIA1_HUMAN Protein disulfide-isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P4HB PE=1 SV=3 1 8 8 8 6 3 5 6 3 5 6 3 5 14.6 14.6 14.6 57.116 508 508 0 14.743 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.027 1.0701 1.5304 12 7 Leave out requantified 1.072 0.94864 1.0019 1.0906 0.99165 1.0586 49.505 5.5261 31.066 5 2 5 4 0 3 Median Median Median 11.4 5.7 9.1 221760000 109680000 112080000 100930000 49362000 51570000 28181000 13936000 14246000 92645000 46383000 46262000 369 2685;5052;9225;12878;13865;17798;18583;20841 True;True;True;True;True;True;True;True 2719;5113;9333;13025;14038;18015;18807;21083 8801;16510;16511;30292;42263;42264;42265;45560;58081;58082;58083;60709;60710;68001 11727;21994;21995;40191;55836;55837;55838;60080;76788;76789;80301;80302;90112 11727;21994;40191;55836;60080;76789;80301;90112 P07305 P07305 3 3 3 Histone H1.0;Histone H1.0, N-terminally processed H1F0 sp|P07305|H10_HUMAN Histone H1.0 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H1F0 PE=1 SV=3 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P07741 P07741 2 2 2 Adenine phosphoribosyltransferase APRT sp|P07741|APT_HUMAN Adenine phosphoribosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APRT PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 12.8 12.8 12.8 19.608 180 180 0.00049826 3.9788 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97689 0.94423 3.9847 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 5.6 12.8 5.6 91272000 49779000 41493000 34579000 19820000 14759000 29133000 16527000 12606000 27560000 13432000 14129000 377 8785;16037 True;True 8887;16238 28736;28737;28738;52505 38030;38031;38032;38033;38034;69320 38031;69320 P07814 P07814 72 72 71 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase EPRS sp|P07814|SYEP_HUMAN Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPRS PE=1 SV=5 1 72 72 71 61 67 68 61 67 68 60 66 67 57 57 57 170.59 1512 1512 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95204 0.98025 12.365 323 71 Leave out requantified 0.98256 0.92565 0.9897 1.0039 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4 Microtubule-associated protein 2 MAP2 sp|P11137|MTAP2_HUMAN Microtubule-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2 PE=1 SV=4 1 4 4 4 1 4 1 1 4 1 1 4 1 2.8 2.8 2.8 199.52 1827 1827 0 8.0305 By MS/MS By MS/MS By matching 1.506 1.4647 46.325 7 2 Leave out requantified NaN 1.506 NaN NaN 1.4647 NaN NaN 47.494 NaN 1 5 1 0 2 0 Median Leave out requantified Median 0.5 2.8 0.5 151700000 68702000 82994000 17276000 8578900 8697500 111670000 50194000 61476000 22749000 9928900 12820000 427 3288;11410;18930;19280 True;True;True;True 3332;11545;19156;19510 10809;37694;37695;37696;61814;61815;63040 14395;14396;49912;49913;81850;81851;83607 14396;49912;81851;83607 P11142 P11142 34 34 22 Heat shock cognate 71 kDa protein HSPA8 sp|P11142|HSP7C_HUMAN Heat shock cognate 71 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA8 PE=1 SV=1 1 34 34 22 32 34 34 32 34 34 21 22 22 61.5 61.5 45.7 70.897 646 646 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98226 1.0214 16.412 158 37 Leave out requantified 0.93712 1.0077 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572;21029;25636;32144;37530;87125 P11177 P11177 11 11 11 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial PDHB sp|P11177|ODPB_HUMAN Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDHB PE=1 SV=3 1 11 11 11 11 10 9 11 10 9 11 10 9 34.5 34.5 34.5 39.233 359 359 0 66.715 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98971 1.0324 16.207 39 18 Leave out requantified 1.0144 0.97757 1.035 1.0502 0.99756 1.0948 23.569 15.355 23.712 14 12 13 5 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.5 34.5 30.1 1349600000 682070000 667570000 412760000 212860000 199910000 432640000 216470000 216160000 504240000 252740000 251500000 431 2323;2324;2550;2751;4434;9222;9347;17909;19176;20108;20295 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2353;2354;2582;2786;4488;9330;9458;18126;19406;20344;20533 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12822;12823;12824;12825;12826;24956;24957;24958;24959;24960;24961;24962;26978;26979;26980;26981;26982;26983;31489;33984;33985;33986;33987;46704;46705;46706;46707;46708;46709;46710;46711;46712;47972;47973;47974;47975;47976;47977;47978;47979;47980;47981;47982;51001;51002;51003;71860;71861;71862;71863;71864;71865;71866;75443;75444;75445;75446;75447;75448;75449;75450;75451;75452;76209;76210;76211;85445;85446;85447;85448;85449;85450 12822;24959;26978;31489;33985;46706;47981;51001;71863;75452;76210;85448 63;64 179;207 P12429 P12429 9 9 9 Annexin A3 ANXA3 sp|P12429|ANXA3_HUMAN Annexin A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA3 PE=1 SV=3 1 9 9 9 8 8 5 8 8 5 8 8 5 28.8 28.8 28.8 36.375 323 323 0 55.357 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95732 0.9801 14.368 23 10 Leave out requantified 0.9891 0.87392 0.95629 1.0401 0.89751 0.9801 8.8025 14.418 11.167 8 10 5 3 6 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26 28.5 18.3 972470000 512970000 459500000 322620000 166050000 156570000 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13.726 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 3.8 3.8 3.8 35146000 19286000 15860000 10344000 3523800 6820600 13150000 8105500 5044800 11651000 7656900 3994500 448 11269 True 11403 37224;37225;37226;37227 49290;49291;49292;49293 49293 P12694 P12694 1 1 1 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial BCKDHA sp|P12694|ODBA_HUMAN 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCKDHA PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 3.1 3.1 3.1 50.47 445 445 0.00048473 3.581 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.1 0 0 7998100 4057300 3940800 7998100 4057300 3940800 0 0 0 0 0 0 449 8960 True 9064 29327 38850 38850 P12955 P12955 1 1 1 Xaa-Pro dipeptidase PEPD sp|P12955|PEPD_HUMAN Xaa-Pro dipeptidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEPD PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.2 2.2 2.2 54.548 493 493 0.0071912 2.0813 By MS/MS By MS/MS 0.79176 0.80703 23.218 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 2.2 2.2 11411000 6457000 4953500 0 0 0 4998600 3070100 1928500 6412000 3386900 3025100 450 8031 True 8124 25926;25927 34579;34580 34579 P12956 P12956 38 38 38 X-ray repair cross-complementing protein 6 XRCC6 sp|P12956|XRCC6_HUMAN X-ray repair cross-complementing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRCC6 PE=1 SV=2 1 38 38 38 35 34 36 35 34 36 35 34 36 59.3 59.3 59.3 69.842 609 609 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98629 1.0219 19.344 176 37 Leave out requantified 0.95297 1.0308 0.99779 0.97063 1.0539 1.0375 24.255 38.078 18.235 59 57 60 14 8 15 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.2 54.5 58.1 46308000000 22467000000 23841000000 14994000000 7495300000 7498900000 16161000000 7761000000 8400000000 15153000000 7211000000 7941900000 451 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99 P14550 P14550 11 11 11 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] AKR1A1 sp|P14550|AK1A1_HUMAN Aldo-keto reductase family 1 member A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1A1 PE=1 SV=3 1 11 11 11 8 11 11 8 11 11 8 11 11 47.4 47.4 47.4 36.573 325 325 0 60.938 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0314 1.0437 16.501 34 17 Leave out requantified 0.97919 0.85848 1.0662 1.009 0.85796 1.0689 22.239 17.252 13.549 8 13 13 4 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.5 47.4 47.4 1318800000 636190000 682640000 341580000 164950000 176630000 510530000 252830000 257690000 466730000 218410000 248320000 466 917;1858;2309;4162;7387;7491;8285;8291;13308;19140;20830 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 927;1880;2339;4215;7477;7581;8380;8386;13469;19370;21072 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MS/MS 0.97379 0.97671 13.95 19 4 Leave out requantified 0.93394 1.0852 0.98187 0.97566 1.1058 1.0054 15.79 24.631 18.941 7 6 6 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.7 10.5 12.8 695770000 402240000 293530000 209340000 102200000 107150000 188320000 89700000 98617000 298100000 210340000 87766000 516 1488;1581;2562;6167;6287;6606;8293;12567;12639;13621;14698;18513 True;True;True;True;True;False;True;True;True;False;True;True 1505;1600;2595;6241;6364;6688;8388;12711;12783;13785;14885;18737 4963;4964;4965;5280;5281;5282;8424;8425;8426;19901;20277;20278;20279;21334;26929;26930;41326;41327;41328;41551;41552;41553;44734;44735;44736;48201;48202;48203;60470;60471 6686;6687;6688;6689;7116;7117;7118;11256;11257;11258;26454;26943;26944;26945;28421;35779;35780;54608;54609;54610;54925;54926;59027;59028;59029;59030;59031;59032;63606;79977;79978 6689;7118;11256;26454;26944;28421;35780;54608;54925;59029;63606;79978 P19387 P19387 5 5 5 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 POLR2C sp|P19387|RPB3_HUMAN DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2C PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 3 3 3 3 3 3 3 3 27.6 27.6 27.6 31.441 275 275 0 14.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.018 0.97955 23.973 9 4 Leave out requantified 0.72522 0.786 0.90551 0.7173 0.80673 0.94575 35.014 65.448 26.565 3 3 3 1 1 2 Median Median Median 12 12 19.3 333820000 221080000 112740000 123240000 82811000 40429000 107110000 69416000 37693000 103470000 68851000 34618000 517 2976;6049;9671;12308;15995 True;True;True;True;True 3011;6120;9789;12449;16196 9766;9767;19575;19576;31765;31766;31767;40507;52367 12974;12975;26046;42194;42195;42196;53521;69147 12974;26046;42194;53521;69147 P19388 P19388 5 5 5 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 POLR2E sp|P19388|RPAB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2E PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 3 4 3 3 4 3 3 4 28.1 28.1 28.1 24.551 210 210 0 92.114 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92222 0.9412 27.546 13 5 Leave out requantified 0.70902 0.9415 0.92222 0.73508 0.98184 0.9412 34.393 19.04 29.83 3 5 5 1 3 1 Median Median Leave out requantified 15.7 19.5 23.8 365550000 188180000 177370000 94490000 49638000 44852000 129690000 67785000 61901000 141380000 70756000 70622000 518 1017;4227;8130;9119;9460 True;True;True;True;True 1029;4280;8223;9226;9576 3438;3439;3440;13867;26233;26234;26235;29910;29911;29912;29913;29914;29915;31057 4641;4642;4643;18476;18477;34949;34950;34951;39663;39664;41254 4643;18476;34950;39663;41254 P19447 P19447 2 2 2 TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit ERCC3 sp|P19447|ERCC3_HUMAN General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERCC3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.5 6.5 6.5 89.277 782 782 0 5.4955 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7912 0.83774 40.309 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 3.1 3.1 3.5 29195000 18663000 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Inosine-5-monophosphate dehydrogenase 1 IMPDH1 sp|P20839|IMDH1_HUMAN Inosine-5-monophosphate dehydrogenase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPDH1 PE=1 SV=2 1 5 3 3 4 2 3 2 0 1 2 0 1 10.3 7.4 7.4 55.405 514 514 0.00053107 4.9854 By MS/MS By matching By MS/MS 1.7382 1.7409 127.94 2 1 Median 1.7382 NaN NaN 1.7409 NaN NaN 127.94 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 6.6 2.9 6.6 16172000 6957600 9214700 16172000 6957600 9214700 0 0 0 0 0 0 530 2718;3704;3889;6001;14867 True;False;False;True;True 2752;3753;3939;6072;15057 8920;12142;12143;12144;12740;12741;12742;19431;48778 11874;16117;16118;16119;16929;16930;16931;16932;16933;25871;64379 11874;16117;16931;25871;64379 P20936 P20936 3 3 3 Ras GTPase-activating protein 1 RASA1 sp|P20936|RASA1_HUMAN Ras GTPase-activating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RASA1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 3.5 3.5 3.5 116.4 1047 1047 0 5.9273 By matching By MS/MS By MS/MS 0.98013 1.0174 1.0571 6 1 Leave out requantified NaN 1.0238 1.0328 NaN 1.065 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Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase PAICS sp|P22234|PUR6_HUMAN Multifunctional protein ADE2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAICS PE=1 SV=3 1 11 11 11 8 7 10 8 7 10 8 7 10 33.2 33.2 33.2 47.079 425 425 0 32.483 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86589 0.90065 18.656 29 13 Leave out requantified 1.0325 0.88797 0.84435 1.0486 0.9498 0.86296 17.913 16.28 16.627 10 8 11 6 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.4 20.7 31.3 1209200000 608760000 600470000 493590000 244290000 249300000 308970000 161190000 147780000 406680000 203280000 203400000 545 222;482;2419;3295;4623;5631;8660;13503;17265;17938;20315 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 223;485;2449;3339;4679;5696;8762;13667;17477;18155;20553 769;770;771;1656;1657;7975;7976;10828;10829;10830;15169;18256;18257;18258;18259;18260;28360;28361;28362;44321;56340;56341;58632;58633;58634;58635;66370;66371;66372 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modifier-activating enzyme 1 UBA1 sp|P22314|UBA1_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1 PE=1 SV=3 1 39 39 39 36 37 35 36 37 35 36 37 35 44.8 44.8 44.8 117.85 1058 1058 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0413 1.0582 14.368 147 25 Leave out requantified 1.0376 1.0277 1.0064 1.0713 1.04 1.0428 14.109 16.443 15.284 51 49 47 10 8 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.3 40.3 43.1 16794000000 8092100000 8702200000 5158300000 2483900000 2674400000 5913700000 2816700000 3097000000 5722300000 2791500000 2930800000 547 189;440;478;1066;1067;1624;1625;2482;3197;5907;7106;7412;7575;9035;9036;9832;10262;10517;10799;11519;12255;12694;13297;13449;13495;13523;13558;13613;14581;14584;14874;14951;15011;15838;16284;16576;19226;20622;20700 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22 23 23 22 23 23 48.2 48.2 48.2 90.069 792 792 0 194.4 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.055 1.103 24.846 89 32 Leave out requantified 1.0594 1.0326 1.0637 1.0973 1.0686 1.1223 22.72 23.586 24.472 29 30 30 13 13 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.7 36.7 38.6 5597500000 2667800000 2929700000 1707600000 841520000 866120000 1953700000 905620000 1048000000 1936200000 920650000 1015600000 561 2188;2456;2581;5161;6641;8419;8670;9051;10341;10691;11983;12531;12726;13969;14037;14081;14082;14388;14703;16686;17076;17754;18325;18663;18756;19197;19665;20074;21005 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2217;2487;2614;5222;6723;8517;8772;9156;10466;10821;12124;12674;12871;14142;14212;14259;14260;14570;14890;16897;17288;17971;18547;18888;18981;19427;19898;20310;21250 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25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZBTB25 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.8 2.8 2.8 48.99 435 435 0.0099297 1.9196 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91231 0.93606 31.958 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 2.8 2.8 2.8 85307000 51317000 33990000 15862000 11170000 4691800 29770000 18551000 11219000 39675000 21596000 18079000 562 12999 True 13150 42706;42707;42708 56411;56412;56413 56413 P24534 P24534 10 8 8 Elongation factor 1-beta EEF1B2 sp|P24534|EF1B_HUMAN Elongation factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1B2 PE=1 SV=3 1 10 8 8 8 10 9 6 8 7 6 8 7 58.2 52.9 52.9 24.763 225 225 0 62.018 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0813 1.1338 30.469 35 9 Leave out requantified 1.0998 1.0437 1.0207 1.1302 1.1026 1.0533 28.465 35.847 18.628 9 13 13 1 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.2 58.2 44 6902900000 3235400000 3667400000 2537900000 1208700000 1329200000 2319600000 1036100000 1283500000 2045300000 990650000 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molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACP1 PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 47.5 47.5 47.5 18.042 158 158 0 41.345 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97533 0.98068 27.886 17 7 Leave out requantified 0.98608 0.95498 0.93178 1.0033 0.97338 0.91116 32.795 50.372 14.061 6 6 5 2 4 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 47.5 32.3 47.5 492180000 250940000 241240000 153170000 69306000 83869000 184950000 98293000 86659000 154050000 83339000 70712000 564 8265;8842;12684;14857;18980 True;True;True;True;True 8360;8945;12829;15047;19207 26800;26801;26802;28936;28937;28938;41686;41687;41688;48744;48745;62032;62033;62034;62035;62036;62037;62038;62039 35608;35609;35610;38324;38325;38326;38327;55106;55107;55108;55109;55110;64318;64319;82159;82160;82161;82162;82163;82164;82165;82166 35609;38326;55110;64318;82160 P24752 P24752 7 7 7 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial ACAT1 sp|P24752|THIL_HUMAN Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial 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N-terminally processed RPA1 sp|P27694|RFA1_HUMAN Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPA1 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 11 12 10 11 12 10 11 12 22.4 22.4 22.4 68.137 616 616 0 48.751 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99031 1.0416 20.438 38 4 Leave out requantified 0.9683 1.0669 0.94786 0.99819 1.1048 0.95822 19.269 18.883 20.89 12 12 14 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.8 19.8 22.4 1056100000 527120000 529020000 365510000 180900000 184610000 323670000 158270000 165400000 366960000 187950000 179010000 593 89;1570;1666;2869;3412;5024;6087;13656;19121;19273;19483;20280 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 90;1587;1686;2904;3456;5085;6159;13820;19351;19503;19714;20518 318;319;320;321;322;323;5227;5228;5229;5580;5581;5582;9396;9397;9398;11176;11177;11178;16441;19674;19675;19676;44839;44840;44841;62550;62551;63021;63022;63023;63024;63729;63730;63731;66257;66258;66259;66260;66261 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out requantified Median 18 18 18 238420000 129490000 108920000 47929000 27725000 20205000 79765000 42153000 37611000 110720000 59612000 51109000 613 2604;6669;14641;16515 True;True;True;True 2638;6751;14827;16723 8541;8542;8543;8544;21536;21537;21538;48009;48010;48011;54070;54071;54072;54073 11395;11396;11397;11398;11399;11400;28710;28711;28712;63355;63356;63357;71360;71361;71362;71363 11396;28710;63357;71361 P30041 P30041 8 8 8 Peroxiredoxin-6 PRDX6 sp|P30041|PRDX6_HUMAN Peroxiredoxin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX6 PE=1 SV=3 1 8 8 8 5 6 5 5 6 5 5 6 5 42 42 42 25.035 224 224 0 43.964 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9364 1.9466 25.835 17 9 Leave out requantified 1.7144 2.4583 1.7505 1.7557 2.4225 1.7688 40.387 50.499 31.527 6 6 5 4 3 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 23.2 30.4 28.6 591550000 194290000 397250000 242210000 88208000 154000000 181710000 49199000 132510000 167630000 56885000 110740000 614 2583;2791;4697;10562;11326;12342;18835;20229 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Bifunctional purine biosynthesis protein PURH OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATIC PE=1 SV=3 1 34 34 34 31 32 33 31 32 33 31 32 33 72.3 72.3 72.3 64.615 592 592 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0266 1.0449 12.486 148 43 Leave out requantified 1.0458 1.0117 1.0104 1.0712 1.0312 1.0339 57.953 12.228 12.645 49 48 51 15 14 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 67.9 67.6 70.9 13771000000 6796600000 6974500000 4266200000 2106200000 2160000000 4501100000 2220300000 2280800000 5003700000 2470000000 2533700000 637 414;547;968;969;1252;1282;2310;2977;3051;3508;3634;3864;5612;8051;8548;10744;12462;13197;13552;13557;13631;13806;15391;16161;16430;17752;17996;18017;18111;18873;20175;20186;20750;21141 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed HNRNPH1 sp|P31943|HNRH1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH1 PE=1 SV=4 1 8 6 3 7 7 7 5 5 5 2 2 2 25.8 19.8 9.6 49.229 449 449 0 149.04 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0478 1.0683 8.6092 26 5 Leave out requantified 1.0823 0.99267 0.96308 1.1009 1.0056 0.97795 7.7509 10.013 6.2785 9 8 9 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.6 22.9 22.9 2246400000 1145600000 1100700000 783780000 414730000 369050000 715270000 363160000 352110000 747320000 367760000 379560000 639 1593;3044;7454;8510;16681;17063;19317;20716 False;True;True;True;True;True;False;True 1612;3080;7544;8611;16892;17275;19547;20956 5317;5318;5319;5320;5321;9964;9965;9966;9967;9968;9969;24099;27800;27801;27802;27803;27804;27805;54563;54564;54565;54566;55716;55717;55718;55719;55720;55721;55722;63164;63165;63166;63167;63168;67588;67589 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Guanylate-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GBP1 PE=1 SV=2 2 6 6 5 4 4 1 4 4 1 4 4 0 9.3 9.3 7.3 67.93 592 592;595 0 12.569 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90572 0.96028 25.971 10 6 Leave out requantified 1.101 0.98407 NaN 1.1517 1.0206 NaN 59.684 9.2669 NaN 5 4 1 3 2 1 Median Median Median 5.7 5.7 2 313610000 149520000 164090000 143380000 68183000 75195000 121510000 61636000 59879000 48713000 19696000 29017000 646 706;3545;4645;11857;12144;13461 True;True;True;True;True;True 713;3593;4701;11994;12285;13624 2428;11606;11607;11608;11609;15225;15226;39109;40001;40002;44196 3279;15406;15407;15408;15409;15410;20321;20322;51669;52877;58333 3279;15406;20321;51669;52877;58333 P32969 P32969 10 10 10 60S ribosomal protein L9 RPL9 sp|P32969|RL9_HUMAN 60S ribosomal protein L9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL9 PE=1 SV=1 1 10 10 10 8 9 10 8 9 10 8 9 10 58.3 58.3 58.3 21.863 192 192 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0564 1.1076 11.983 45 5 Leave out requantified 1.0747 1.0443 1.0156 1.1021 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10960;10961;10962;11243;11244;11245;11246;11247;11248;11249;11250;11251;11252;11253;26263;26264;26265;26266;26267;26268;26269;34227;34228;34229;34673;34674;34675;43787;43788;43789;43790;43791;43792;43793;57114;57115;57116;57117;57118;57119;57120;57121;57122;57123;57124;57125;66662;66663;77095;77096;77097;77098;77099;77100;77101;77102;77103;77104;77105;77106;77371;77372;77373;77374;77375;77376;77377;77378;77379;77380;77381;77382 10962;11253;26265;34228;34674;43787;57119;66663;77101;77379 113 128 P33176;O60282 P33176 57;13 57;13 46;4 Kinesin-1 heavy chain KIF5B sp|P33176|KINH_HUMAN Kinesin-1 heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF5B PE=1 SV=1 2 57 57 46 53 53 53 53 53 53 44 43 42 64.4 64.4 52.6 109.68 963 963;957 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92533 0.95786 21.901 239 57 Leave out requantified 1.0072 0.86138 0.97239 1.029 0.90968 0.98666 14.827 43.623 14.371 76 84 79 15 26 16 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.3 60.7 58.5 20737000000 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Eukaryotic initiation factor 4A-III OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4A3 PE=1 SV=4 1 16 13 13 16 15 15 13 12 13 13 12 13 32.8 27 27 46.871 411 411 0 85.926 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97322 1.0074 15.584 52 18 Leave out requantified 0.98387 0.97095 0.93726 0.99875 1.0136 0.97524 17.436 20.751 13.873 17 19 16 5 8 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.8 32.6 32.8 4036600000 1972500000 2064200000 1312400000 672730000 639650000 1526900000 711450000 815490000 1197300000 588300000 609020000 698 2499;3570;3891;4715;5170;5427;7305;7959;10062;10148;10373;10822;11682;13087;15403;19009 True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;False;True;True;True;True;False 2531;3618;3941;3942;4771;5231;5489;7395;8051;10186;10272;10498;10953;11818;13241;15596;19236 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cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH1 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 3 3 3 36.426 334 334 0.00091449 2.9022 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 3 0 0 27846000 11494000 16353000 27846000 11494000 16353000 0 0 0 0 0 0 711 6887 True 6972 22204 29624 29624 P40926 P40926 4 4 4 Malate dehydrogenase, mitochondrial MDH2 sp|P40926|MDHM_HUMAN Malate dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH2 PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 1 2 2 1 2 2 1 2 18 18 18 35.503 338 338 0 7.3542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92756 0.96337 35.271 4 0 Leave out requantified 0.86398 NaN NaN 0.87276 NaN NaN 48.573 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 10.1 3 11.5 143060000 69276000 73787000 31243000 15368000 15875000 64030000 34713000 29317000 47789000 19195000 28594000 712 9472;12483;16810;17877 True;True;True;True 9588;12625;17021;18094 31083;41029;41030;54956;58433 41293;41294;54217;54218;72544;77318 41293;54218;72544;77318 P40937 P40937 12 12 12 Replication factor C subunit 5 RFC5 sp|P40937|RFC5_HUMAN Replication factor C subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RFC5 PE=1 SV=1 1 12 12 12 11 11 10 11 11 10 11 11 10 42.1 42.1 42.1 38.496 340 340 0 55.278 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96166 0.98757 12.88 36 12 Leave out requantified 0.98333 0.91821 0.93906 1.0178 0.9236 0.94456 16.169 8.6494 12.488 12 11 13 2 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.7 37.9 36.2 1825000000 942760000 882280000 593280000 304400000 288880000 584780000 292740000 292040000 646990000 345620000 301370000 713 1166;5795;5986;7621;9102;12035;12412;12608;12807;18923;20101;21064 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1179;5860;6057;7712;9208;12176;12553;12752;12951;19148;20337;21310 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3920;7221;9539;9540;9541;13110;13111;13112;21582;21583;21584;21775;21776;24404;24405;24667;24668;24669;24770;24771;24772;24773;29386;29387;29388;35350;35351;35352;35353;46375;46376;46377;46378;46379;52526;52527;52528;54893;54894;54895;54952;54953;54954;57268;57269;57270;57271;63397;63398;63399;66138;66139;66140 5274;9668;12672;12673;12674;17451;17452;17453;17454;28776;28777;28778;28779;28780;29060;29061;32533;32534;32904;32905;32906;32907;33053;33054;33055;33056;33057;33058;38939;38940;38941;46859;46860;46861;46862;46863;46864;61226;61227;61228;61229;61230;69352;69353;69354;69355;69356;72455;72456;72457;72458;72538;72539;72540;72541;72542;75672;75673;75674;75675;75676;84071;84072;84073;84074;84075;84076;87702;87703;87704;87705 5274;9668;12673;17451;28779;29061;32534;32904;33055;38940;46864;61228;69352;72457;72539;75675;84071;87703 P43246 P43246 20 20 20 DNA mismatch repair protein Msh2 MSH2 sp|P43246|MSH2_HUMAN DNA mismatch repair protein Msh2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSH2 PE=1 SV=1 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ATP-dependent DNA helicase Q1 RECQL sp|P46063|RECQ1_HUMAN ATP-dependent DNA helicase Q1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RECQL PE=1 SV=3 1 22 22 22 17 20 20 17 20 20 17 20 20 45.8 45.8 45.8 73.457 649 649 0 144.7 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99661 1.021 24.627 75 22 Leave out requantified 0.97937 1.0216 0.93719 1.0091 1.0707 0.97029 14.28 24.389 22.024 25 25 25 10 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.8 39.9 42.7 4503400000 2353700000 2149700000 1458200000 782360000 675870000 1482900000 742000000 740930000 1562300000 829360000 732910000 748 142;249;1237;2781;3378;4012;5530;6362;6516;7729;8663;9037;9641;11346;12739;14290;14395;14591;14771;16614;18772;19452 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 143;250;1252;2816;3422;4064;5593;6440;6598;7821;8765;9142;9759;11481;12884;14471;14577;14776;14959;16823;18997;19683 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1952;2775;2926;5827;6161;9259;11471;11535;12066;12786;13783;18061;19011;19112;20929 6403;6404;6405;6406;8980;8981;9482;18650;19683;19684;30033;30034;30035;37467;37468;37666;37667;37668;39339;39340;41563;41564;41565;44729;44730;44731;58322;58323;58324;58325;58326;58327;61355;61356;61357;61682;61683;61684;67504;67505;67506;67507 8630;8631;8632;8633;8634;8635;11941;11942;12598;24815;26181;26182;39842;39843;39844;39845;39846;49603;49886;49887;49888;49889;49890;51976;51977;54940;59019;59020;59021;59022;59023;59024;77142;77143;77144;77145;77146;77147;77148;81169;81170;81171;81682;81683;81684;81685;81686;81687;81688;89465;89466;89467;89468 8631;11942;12598;24815;26182;39843;49603;49887;51977;54940;59021;77144;81170;81688;89466 REV__O15399;P48995 REV__O15399;P48995 1;1 1;1 1;1 Short transient receptor potential channel 1 TRPC1 sp|O15399|NMDE4_HUMAN Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GRIN2D PE=1 SV=2;sp|P48995|TRPC1_HUMAN Short transient receptor potential channel 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRPC1 PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 143.75 1336 1336;793 0.006402 2.1686 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81897 0.82683 8.8055 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 Median Median Median 0.9 0.9 0.9 592700000 382330000 210370000 239010000 160230000 78783000 131790000 63552000 68237000 221900000 158540000 63353000 780 2993 True 3028 9826;9827;9828;9829 13048;13049;13050;13051;13052;13053 13049 P49005 P49005 8 8 8 DNA polymerase delta subunit 2 POLD2 sp|P49005|DPOD2_HUMAN DNA polymerase delta subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLD2 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 6 7 7 6 7 7 6 7 25.6 25.6 25.6 51.289 469 469 0 39.604 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0662 1.1108 5.2758 20 14 Leave out requantified 1.0662 0.98743 1.1477 1.1209 1.0457 1.1249 29.993 22.764 47.042 7 6 7 5 4 5 Median Median Median 23.2 17.3 22.6 478530000 217640000 260890000 158340000 68006000 90335000 136450000 70110000 66341000 183740000 79524000 104220000 781 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sperm protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NASP PE=1 SV=2 1 7 7 7 7 5 5 7 5 5 7 5 5 12.6 12.6 12.6 85.237 788 788 0 27.701 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90149 0.96319 8.1694 17 5 Leave out requantified 0.88645 1.055 0.87942 0.9335 1.0898 0.91029 8.103 14.609 3.1195 6 5 6 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.6 9.9 9.4 372850000 189260000 183590000 154760000 77233000 77529000 106210000 51305000 54904000 111880000 60723000 51152000 785 3915;5613;7042;10278;12645;12831;16484 True;True;True;True;True;True;True 3966;5678;7128;10403;12789;12976;16692 12846;18219;18220;22731;22732;22733;33956;33957;33958;41572;41573;41574;42123;42124;42125;53989;53990;53991 17089;24250;30292;30293;30294;30295;45074;45075;45076;54947;54948;54949;55639;55640;55641;55642;55643;55644;71272;71273;71274;71275;71276;71277 17089;24250;30292;45075;54949;55644;71275 P49327 P49327 69 69 69 Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase FASN sp|P49327|FAS_HUMAN Fatty acid synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FASN PE=1 SV=3 1 69 69 69 60 61 66 60 61 66 60 61 66 36.4 36.4 36.4 273.42 2511 2511 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0552 1.0763 11.811 251 71 Leave out requantified 1.03 1.1353 1.0143 1.0527 1.1455 1.0306 13.61 12.774 12.942 84 82 85 27 22 22 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.6 33.1 34.8 14816000000 7330000000 7486400000 5026300000 2515600000 2510700000 4756400000 2275100000 2481400000 5033600000 2539300000 2494300000 786 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Median Median 3.5 4.7 3.7 77745000 39438000 38306000 25390000 14516000 10874000 42655000 20237000 22418000 9699500 4685300 5014200 801 1517;7254;8889;15835 True;True;True;True 1534;7344;8993;16035 5061;5062;5063;23467;29103;29104;51897;51898 6824;6825;6826;6827;31269;38549;38550;68516;68517 6826;31269;38550;68516 P49756 P49756 9 9 9 RNA-binding protein 25 RBM25 sp|P49756|RBM25_HUMAN RNA-binding protein 25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM25 PE=1 SV=3 1 9 9 9 8 9 8 8 9 8 8 9 8 14.1 14.1 14.1 100.18 843 843 0 35.697 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86532 0.88819 13.528 25 5 Leave out requantified 0.85999 0.80705 1.0016 0.87777 0.83346 1.0103 16.781 17.248 14.472 8 10 7 2 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13 14.1 13 966710000 521060000 445650000 339470000 182890000 156580000 321310000 176800000 144510000 305930000 161370000 144560000 802 3336;4031;5713;5853;11115;11531;11663;12083;12102 True;True;True;True;True;True;True;True;True 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34994;48068;71282 P49841;P49840 P49841 7;2 7;2 7;2 Glycogen synthase kinase-3 beta GSK3B sp|P49841|GSK3B_HUMAN Glycogen synthase kinase-3 beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSK3B PE=1 SV=2 2 7 7 7 5 6 3 5 6 3 5 6 3 26.7 26.7 26.7 46.744 420 420;483 0 28.811 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86467 0.94348 31.076 14 5 Leave out requantified 0.89146 0.95267 0.87579 0.92566 1.0157 0.91515 38.374 12.077 2.1509 5 6 3 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 19.3 24.3 16 323920000 150700000 173210000 130880000 64034000 66848000 137170000 58926000 78245000 55864000 27743000 28121000 809 2767;5000;9457;15231;18498;20166;20697 True;True;True;True;True;True;True 2802;5061;9573;15423;18722;20402;20937 9079;9080;16360;31052;31053;31054;49903;60418;60419;60420;65909;65910;65911;67527;67528 12076;12077;21813;21814;41249;41250;41251;65924;79903;79904;79905;79906;87398;87399;87400;87401;87402;87403;87404;87405;89490;89491 12077;21813;41249;65924;79905;87399;89491 P49848 P49848 2 2 2 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20083;61292;75331;76128;80717 P50454 P50454 11 11 11 Serpin H1 SERPINH1 sp|P50454|SERPH_HUMAN Serpin H1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERPINH1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 9 10 10 9 10 10 9 10 10 27.8 27.8 27.8 46.44 418 418 0 38.239 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88548 0.94008 28.975 29 9 Leave out requantified 0.92567 0.88548 1.0415 0.95933 0.91616 1.1001 15.057 33.013 28.294 9 10 10 4 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.5 24.6 24.6 1157100000 599580000 557480000 394960000 208070000 186890000 385150000 197430000 187720000 376950000 194080000 182870000 817 1681;1776;1777;2480;3500;8069;8323;10230;11101;12181;17753 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1701;1797;1798;2511;3546;8162;8419;10354;11234;12322;17970 5619;5620;5621;5622;5935;5936;5937;5938;5939;5940;8158;8159;8160;11464;11465;11466;26040;26041;26042;27052;27053;27054;27055;33798;36672;36673;40113;40114;40115;57904;57905;57906 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204 0 8.7891 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87053 0.90014 25.853 10 3 Leave out requantified 0.87501 1.2445 0.71786 0.91487 1.2822 0.74975 12.579 11.004 12.002 3 4 3 0 2 1 Median Median Median 15.2 15.2 15.2 266180000 129560000 136610000 98444000 49111000 49334000 97242000 44350000 52892000 70489000 36104000 34385000 856 383;16293 True;True 385;16501 1305;1306;1307;1308;1309;1310;1311;53328;53329;53330 1767;1768;1769;1770;1771;1772;1773;1774;1775;1776;1777;1778;70440;70441;70442;70443;70444;70445 1768;70445 P52594 P52594 3 3 3 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 AGFG1 sp|P52594|AGFG1_HUMAN Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGFG1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 8.5 8.5 8.5 58.259 562 562 0 29.228 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0863 1.1187 24.636 8 0 Leave out requantified 1.105 1.081 0.90254 1.1455 1.112 0.91048 28.586 18.781 12.65 3 3 2 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.5 8.5 6 207640000 100670000 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C2 AKR1C2 sp|P52895|AK1C2_HUMAN Aldo-keto reductase family 1 member C2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1C2 PE=1 SV=3 1 15 4 4 14 15 14 3 4 3 3 4 3 56 17.3 17.3 36.735 323 323 0 33.193 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85767 0.87192 17.233 20 6 Leave out requantified 0.83424 0.85767 0.81999 0.8395 0.87192 0.82586 23.535 20.964 22.668 6 8 6 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 50.8 56 50.8 6015400000 3536000000 2479400000 2139800000 1217900000 921880000 2000900000 1221000000 779840000 1874800000 1097000000 777730000 866 715;2832;4028;4197;8078;9237;11614;11918;12719;15009;15418;16251;16325;18206;20843 False;False;False;False;False;True;True;False;True;False;False;True;False;False;False 722;2867;4080;4250;8171;9345;11750;12058;12059;12864;15200;15201;15611;16457;16533;18428;21085 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repair protein RAD23 homolog B RAD23B sp|P54727|RD23B_HUMAN UV excision repair protein RAD23 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD23B PE=1 SV=1 1 5 5 3 4 4 3 4 4 3 2 2 1 16.6 16.6 12.5 43.171 409 409 0 19.218 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98456 1.0352 21.75 11 6 Leave out requantified 0.84384 1.1717 0.93135 0.89202 1.2073 1.0158 49.886 73.508 57.138 4 3 4 2 2 2 Median Median Median 14.4 9.5 11.2 481020000 309190000 171830000 181020000 115040000 65980000 132540000 83746000 48797000 167450000 110400000 57051000 888 1727;2302;13985;14494;18081 True;True;True;True;True 1748;2332;14158;14678;18302 5785;5786;7618;7619;7620;45930;47594;47595;47596;59084;59085;59086 7797;7798;10167;10168;10169;60563;62819;62820;62821;62822;78120;78121;78122;78123 7797;10169;60563;62820;78123 P54819 P54819 3 3 3 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed AK2 sp|P54819|KAD2_HUMAN Adenylate kinase 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13.4 13.4 13.4 26.477 239 239 0 7.0826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0208 1.0621 39.398 6 0 Leave out requantified 0.97567 1.2874 0.75161 1.0217 1.3301 0.7803 13.549 6.9032 43.598 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 7.9 7.9 10 169570000 87444000 82131000 65597000 33660000 31937000 53084000 23440000 29644000 50893000 30344000 20549000 889 1770;12665;13719 True;True;True 1791;12810;13883 5918;5919;5920;41638;45061;45062 7971;7972;7973;55047;59448 7972;55047;59448 P54886 P54886 10 10 10 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase;Glutamate 5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase ALDH18A1 sp|P54886|P5CS_HUMAN Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH18A1 PE=1 SV=2 1 10 10 10 5 8 9 5 8 9 5 8 9 15.8 15.8 15.8 87.301 795 795 0 26.214 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.009 0.98509 25.739 23 10 Leave out requantified 0.98498 1.0031 1.1175 1.0018 1.0062 1.0741 22.066 17.747 26.782 5 8 10 1 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.7 13.1 13.8 498140000 248770000 249370000 115370000 53733000 61635000 172610000 88052000 84560000 210160000 106980000 103180000 890 2935;5774;10606;12995;13770;14329;14686;19288;20016;20886 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2970;5839;10733;13146;13936;14511;14872;19518;20252;21128 9617;9618;18687;18688;18689;35100;42692;42693;42694;45231;45232;47075;48158;48159;48160;63066;63067;63068;65425;65426;65427;68151;68152;68153 12770;12771;24862;24863;24864;46520;56393;56394;56395;56396;59642;59643;62146;63546;63547;63548;63549;63550;63551;83641;83642;83643;83644;83645;83646;86781;86782;86783;90315;90316;90317 12770;24863;46520;56396;59643;62146;63547;83642;86783;90315 P54920 P54920 1 1 1 Alpha-soluble NSF attachment protein NAPA sp|P54920|SNAA_HUMAN Alpha-soluble NSF attachment protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAPA PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 6.1 6.1 6.1 33.232 295 295 0.0013636 2.8289 By MS/MS By MS/MS 0.71677 0.74692 7.3028 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 6.1 0 6.1 37412000 17363000 20050000 20400000 9943700 10456000 0 0 0 17012000 7419100 9593200 891 11586 True 11722 38293;38294 50679;50680 50680 P55010 P55010 15 15 15 Eukaryotic translation initiation factor 5 EIF5 sp|P55010|IF5_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5 PE=1 SV=2 1 15 15 15 13 15 13 13 15 13 13 15 13 39.9 39.9 39.9 49.222 431 431 0 63.346 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9423 0.99309 19.022 53 13 Leave out requantified 0.80622 1.0375 0.94308 0.82549 1.0595 0.9935 8.876 17.398 10.78 18 19 16 6 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.3 39.9 34.3 3349700000 1718700000 1631000000 1202200000 645310000 556870000 1185000000 589650000 595350000 962530000 483730000 478800000 892 1063;1193;4132;4133;6523;10686;12119;15517;15816;17233;18593;19688;19788;20829;20903 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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non-ATPase regulatory subunit 4 PSMD4 sp|P55036|PSMD4_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD4 PE=1 SV=1 2 6 6 6 3 4 6 3 4 6 3 4 6 23.9 23.9 23.9 40.736 377 377;862 0 18.973 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81869 0.82508 50.212 16 6 Leave out requantified 1.0098 0.98322 0.9171 1.0412 0.99619 0.95302 20.643 106.98 35.822 4 6 6 3 2 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 9.5 16.4 23.9 534660000 288670000 245990000 186830000 101440000 85386000 176170000 94003000 82164000 171670000 93226000 78445000 893 5;12107;12427;13221;13343;19821 True;True;True;True;True;True 5;12248;12568;13381;13504;20057 19;20;39893;39894;39895;39896;39897;40862;40863;43395;43396;43397;43796;43797;43798;64839 38;39;52741;52742;52743;52744;52745;54005;54006;57279;57280;57281;57282;57283;57822;57823;86014 39;52742;54005;57280;57822;86014 P55039 P55039 7 6 6 Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 DRG2 sp|P55039|DRG2_HUMAN Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DRG2 PE=1 SV=1 1 7 6 6 5 5 5 4 4 4 4 4 4 21.7 19.8 19.8 40.746 364 364 0 15.428 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0613 1.0923 16.947 11 5 Leave out requantified 1.0263 1.0665 1.0869 1.0573 1.1119 1.1414 25.614 19.686 7.9772 4 4 3 1 2 2 Leave out requantified Linear Median 15.9 16.8 17 507450000 234240000 273210000 167050000 91077000 75976000 166210000 81082000 85130000 174180000 62080000 112100000 894 6678;7725;8765;15293;16369;18788;20567 True;True;True;False;True;True;True 6760;7817;8867;15485;16577;19013;20806 21560;21561;21562;24984;24985;24986;28673;50083;50084;50085;53594;61360;61361;61362;67119 28743;28744;33334;33335;33336;33337;37947;66184;70770;81174;81175;81176;88956 28744;33334;37947;66184;70770;81174;88956 P55060 P55060 12 12 12 Exportin-2 CSE1L sp|P55060|XPO2_HUMAN Exportin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSE1L PE=1 SV=3 1 12 12 12 12 11 12 12 11 12 12 11 12 14.4 14.4 14.4 110.42 971 971 0 63.726 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95703 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Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXCT1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 2 4 2 2 4 2 2 4 13.5 13.5 13.5 56.157 520 520 0 33.341 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2073 1.2732 106.14 8 8 Median NaN 1.3142 1.1409 NaN 1.348 1.1905 NaN 204.39 78.42 1 2 5 1 2 5 Median Median Median 4 3.7 11 414560000 188530000 226040000 45460000 8766500 36693000 172010000 110540000 61464000 197090000 69216000 127880000 906 602;2671;13522;14668;17061 True;True;True;True;True 606;2705;13686;14854;17273 2059;2060;8752;44395;44396;44397;48097;55712;55713 2809;2810;11661;58579;58580;58581;63477;73580;73581 2809;11661;58579;63477;73581 P55884 P55884 29 29 29 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B EIF3B sp|P55884|EIF3B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3B PE=1 SV=3 1 29 29 29 27 26 27 27 26 27 27 26 27 43.2 43.2 43.2 92.48 814 814 0 173.82 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98542 0.9665 17.761 97 23 Leave out 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2 2 Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A RRP1 sp|P56182|RRP1_HUMAN Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.6 4.6 4.6 52.839 461 461 0 6.4355 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0109 1.0446 21.081 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 2.6 2 2 32335000 16793000 15542000 15519000 8424800 7093700 9066100 4530400 4535700 7749900 3837700 3912200 908 147;345 True;True 148;347 507;508;1187 698;699;1615;1616 699;1616 P56192 P56192 30 30 30 Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic MARS sp|P56192|SYMC_HUMAN Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARS PE=1 SV=2 1 30 30 30 29 29 29 29 29 29 29 29 29 42.1 42.1 42.1 101.11 900 900 0 304.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0347 1.0738 15.061 143 38 Leave out requantified 1.0468 0.97494 1.0528 1.0958 1.0239 1.0845 25.868 14.9 17.649 47 50 46 15 14 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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MS/MS By MS/MS 0.7292 0.74199 17.639 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 7.6 14.4 7.6 23572000 12331000 11241000 12665000 6975100 5689900 0 0 0 10907000 5355700 5551300 918 6617;7595 True;True 6699;7686 21370;21371;24549 28483;28484;32747 28483;32747 P60002 P60002 1 1 1 Transcription elongation factor 1 homolog ELOF1 sp|P60002|ELOF1_HUMAN Transcription elongation factor 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELOF1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.7 21.7 21.7 9.4618 83 83 0 7.4283 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0184 1.0404 19.269 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 21.7 21.7 21.7 99350000 48903000 50447000 26930000 15629000 11300000 37082000 16444000 20638000 35339000 16829000 18509000 919 13218 True 13378 43385;43386;43387 57268;57269;57270;57271;57272 57270 P60174 P60174 9 9 9 Triosephosphate isomerase TPI1 sp|P60174|TPIS_HUMAN Triosephosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPI1 PE=1 SV=3 1 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3 3 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 UBE2M sp|P61081|UBC12_HUMAN NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2M PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 20.2 20.2 20.2 20.9 183 183 0 50.892 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2338 1.2897 45.403 6 3 Median 1.1409 1.5845 1.5216 1.2085 1.6548 1.5685 24.692 81.866 43.178 2 2 2 2 0 1 Median Median Median 14.2 14.8 14.8 267710000 104720000 162990000 74439000 43691000 30748000 87371000 23212000 64159000 105900000 37817000 68087000 934 3734;12602;17438 True;True;True 3783;12746;17651 12230;41421;41422;56910;56911;56912 16233;54720;54721;54722;75195;75196;75197;75198 16233;54721;75197 P61088;Q5JXB2 P61088;Q5JXB2 3;2 3;2 3;2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N;Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like UBE2N;UBE2NL sp|P61088|UBE2N_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2N PE=1 SV=1;sp|Q5JXB2|UE2NL_HUMAN Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2NL PE=1 SV=1 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 18.4 18.4 18.4 17.138 152 152;153 0 8.3727 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.036 1.0829 12.004 9 2 Leave out requantified 1.036 1.2316 0.93308 1.0829 1.2918 0.98011 16.763 18.752 7.3019 3 3 3 1 0 1 Median Leave out requantified Plateau 18.4 18.4 18.4 374300000 188810000 185490000 144470000 72492000 71981000 118040000 56103000 61937000 111790000 60215000 51574000 935 8687;11532;18164 True;True;True 8789;11667;18385 28436;28437;28438;38117;38118;38119;59341;59342;59343 37641;37642;37643;50443;50444;50445;50446;50447;78456;78457;78458 37642;50446;78458 P61106 P61106 4 4 4 Ras-related protein Rab-14 RAB14 sp|P61106|RAB14_HUMAN Ras-related protein Rab-14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB14 PE=1 SV=4 1 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 4 28.4 28.4 28.4 23.897 215 215 0 18.951 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84811 0.88353 8.4983 11 6 Leave out requantified 0.89108 0.95703 0.99338 0.91233 0.98998 1.0452 19.963 24.587 43.067 4 2 5 2 1 3 Median Median Median 24.2 10.2 28.4 451920000 196050000 255870000 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requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.5 43.5 43.5 6671200000 3430800000 3240400000 2386600000 1255900000 1130700000 2104800000 1065000000 1039900000 2179700000 1109900000 1069800000 951 5526;8220;8935;10201;12612;13026;14526;15275;17447 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5589;8315;9039;10325;12756;13177;14710;15467;17660 17953;17954;17955;26582;26583;26584;26585;26586;26587;26588;26589;26590;26591;26592;29242;29243;29244;33696;33697;33698;41456;41457;41458;42780;42781;42782;42783;42784;42785;42786;42787;42788;47673;47674;47675;47676;47677;47678;50026;50027;50028;50029;50030;50031;56933;56934;56935;56936 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345;346;347;878;879;880;2848;2849;6416;6417;6418;9136;9137;9138;9139;9140;9141;9142;9143;9144;10098;10099;10423;10424;10425;10426;10427;16680;16681;16682;16683;26912;26913;26914;26915;37738;37739;43366;44477;44478;44479;50519;50520;50521;55043;55044;55045;55211;55212;56113;56114;56115;56116;62418;62419;62420;62421;64478;64479;66682;66683;66684;67484;67485;67486;68818;68819;68820;68821;68822;68823 488;489;490;491;492;1188;1189;1190;1191;1192;1193;3863;3864;8649;8650;8651;8652;12147;12148;12149;12150;12151;12152;12153;12154;12155;12156;12157;13403;13404;13865;13866;13867;13868;13869;13870;13871;22201;22202;35761;35762;35763;35764;49972;49973;57242;58685;58686;58687;66755;66756;66757;72656;72657;72658;72659;72871;72872;72873;72874;74119;74120;82695;82696;82697;82698;85533;85534;88397;88398;88399;88400;88401;89442;89443;89444;89445;91218;91219;91220;91221 492;1192;3863;8651;12147;12148;13403;13866;22202;35762;49973;57242;58685;66757;72658;72871;74119;74120;82698;85534;88400;89442;91221 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ribonucleoprotein Sm D2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 40.7 40.7 40.7 13.527 118 118 0 22.491 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92154 0.92459 16.223 16 9 Leave out requantified 1.001 0.92154 1.0973 1.0078 0.92459 1.1326 13.531 65.063 41.787 5 7 4 2 5 2 Leave out requantified Median Median 40.7 40.7 40.7 665180000 327790000 337390000 226400000 116910000 109480000 261060000 132510000 128550000 177720000 78368000 99356000 980 4108;6812;8178;13887;15423 True;True;True;True;True 4161;6897;8271;14060;15616 13483;21976;21977;21978;26387;26388;26389;26390;26391;45622;45623;45624;50499;50500;50501;50502 17982;29328;29329;29330;35119;35120;35121;35122;35123;60151;60152;60153;60154;60155;60156;60157;60158;66725;66726;66727;66728;66729;66730;66731 17982;29330;35123;60153;66727 P62318 P62318 2 2 2 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 SNRPD3 sp|P62318|SMD3_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 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12272;27284;31025;49539;59160 P62857 P62857 2 2 2 40S ribosomal protein S28 RPS28 sp|P62857|RS28_HUMAN 40S ribosomal protein S28 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS28 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.4 30.4 30.4 7.8409 69 69 0 13.031 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0082 1.0177 5.4662 9 0 Leave out requantified 0.87625 1.126 1.0697 0.87605 1.1493 1.0805 10.569 8.1856 6.2394 3 3 3 0 0 0 Median Plateau Median 30.4 30.4 30.4 1446200000 706500000 739650000 489430000 242180000 247250000 524410000 252140000 272260000 432330000 212190000 220140000 1000 4327;19045 True;True 4380;19274 14164;14165;14166;14167;14168;14169;62281;62282;62283 18887;18888;18889;18890;18891;18892;18893;18894;18895;18896;18897;18898;82507;82508;82509;82510;82511 18896;82510 P62861 P62861 1 1 1 40S ribosomal protein S30 FAU sp|P62861|RS30_HUMAN 40S ribosomal protein S30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAU PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.9 16.9 16.9 6.6478 59 59 0.00049776 3.9625 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98841 1.0206 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4;3 4;3 Protein SET;Protein SETSIP SET;SETSIP sp|Q01105|SET_HUMAN Protein SET OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SET PE=1 SV=3;sp|P0DME0|SETLP_HUMAN Protein SETSIP OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETSIP PE=1 SV=1 2 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 17.9 17.9 17.9 33.488 290 290;302 0 16.384 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0603 1.0799 27.345 11 4 Leave out requantified 0.85592 0.96985 0.90667 0.87759 0.97721 0.93611 23.46 15.646 41.961 5 2 4 2 0 2 Leave out requantified Median Median 17.9 9.7 14.1 531650000 288600000 243050000 303470000 169260000 134210000 83046000 45213000 37833000 145140000 74129000 71011000 1074 4264;5203;11930;19126 True;True;True;True 4317;5264;12071;19356 13969;13970;13971;13972;16950;16951;16952;39351;62563;62564;62565 18612;18613;18614;18615;18616;18617;22576;22577;22578;51991;82893;82894;82895;82896;82897;82898 18614;22576;51991;82893 Q01130;Q9BRL6 Q01130;Q9BRL6 2;1 2;1 2;1 Serine/arginine-rich splicing factor 2;Serine/arginine-rich splicing factor 8 SRSF2;SRSF8 sp|Q01130|SRSF2_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF2 PE=1 SV=4;sp|Q9BRL6|SRSF8_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF8 PE=1 SV=1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 11.3 11.3 11.3 25.476 221 221;282 0 19.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.055 1.0512 18.163 6 1 Leave out requantified 0.88846 1.1906 0.9733 0.87987 1.1969 0.95828 6.6161 36.516 4.5822 2 2 2 0 0 1 Median Median Median 11.3 11.3 11.3 255080000 128350000 126730000 95928000 49890000 46038000 72943000 34676000 38267000 86210000 43780000 42430000 1075 2294;19223 True;True 2324;19453 7598;7599;7600;62855;62856;62857 10144;10145;10146;10147;10148;83323;83324;83325;83326 10146;83326 Q01469;A8MUU1 Q01469;A8MUU1 2;1 2;1 2;1 Fatty acid-binding protein, epidermal;Putative fatty acid-binding protein 5-like protein 3 FABP5;FABP5P3 sp|Q01469|FABP5_HUMAN Fatty acid-binding protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FABP5 PE=1 SV=3;sp|A8MUU1|FB5L3_HUMAN Putative fatty acid-binding protein 5-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FABP5P3 PE=5 SV=1 2 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 22.2 22.2 22.2 15.164 135 135;101 0.0004948 3.8524 By MS/MS By MS/MS 0.92449 0.93054 41.391 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 22.2 0 15.6 30161000 18405000 11756000 20807000 14341000 6465400 0 0 0 9353700 4063200 5290600 1076 5873;18315 True;True 5943;18537 19030;59828;59829 25329;25330;79134;79135 25329;79135 Q01518 Q01518 13 13 13 Adenylyl cyclase-associated protein 1 CAP1 sp|Q01518|CAP1_HUMAN Adenylyl cyclase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAP1 PE=1 SV=5 1 13 13 13 10 12 8 10 12 8 10 12 8 31.6 31.6 31.6 51.901 475 475 0 31.935 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1534 1.1929 15.072 34 16 Leave out requantified 1.0274 1.3052 0.97623 1.0722 1.346 0.9988 17.409 13.169 6.7232 12 13 9 5 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.3 29.3 21.3 864120000 409420000 454710000 284980000 141000000 143980000 330150000 137260000 192890000 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NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 2.3 2.3 2.3 18889000 10696000 8193600 8006800 2601700 5405100 0 0 0 10883000 8094100 2788500 1089 11079 True 11212 36590;36591;36592 48442;48443;48444 48442 Q02218;Q9ULD0 Q02218 3;1 3;1 3;1 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial OGDH sp|Q02218|ODO1_HUMAN 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OGDH PE=1 SV=3 2 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 4.3 4.3 4.3 115.93 1023 1023;1010 0 6.6675 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0117 1.0732 14.749 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 2.2 2.2 2.2 31507000 17615000 13892000 10563000 4899800 5662800 13026000 7080700 5945400 7918400 5634200 2284200 1090 10261;11159;20264 True;True;True 10386;11293;20502 33892;36887;66209;66210 44943;48841;87786;87787;87788 44943;48841;87786 Q02241 Q02241 3 3 3 Kinesin-like protein KIF23 KIF23 sp|Q02241|KIF23_HUMAN Kinesin-like protein KIF23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF23 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 1 2 1 1 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L18a RPL18A sp|Q02543|RL18A_HUMAN 60S ribosomal protein L18a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL18A PE=1 SV=2 1 9 9 9 9 8 9 9 8 9 9 8 9 48.3 48.3 48.3 20.762 176 176 0 91.211 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91482 0.95009 8.9711 38 8 Leave out requantified 0.92595 0.93322 0.82343 0.95438 0.94908 0.8568 13.743 15.831 13.218 13 12 13 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.3 43.2 48.3 9111300000 4670600000 4440600000 3499100000 1783300000 1715700000 2760200000 1376700000 1383500000 2852000000 1510600000 1341400000 1094 691;2026;3103;6562;8876;9165;13509;16932;19037 True;True;True;True;True;True;True;True;True 698;2052;3140;6644;8979;9273;13673;17143;19266 2379;2380;2381;6723;6724;6725;6726;6727;6728;10189;10190;10191;10192;10193;10194;10195;21178;21179;29053;29054;29055;29056;29057;29058;30077;30078;30079;30080;44346;44347;44348;55302;55303;55304;55305;55306;55307;55308;62255;62256;62257 3221;3222;3223;9047;9048;9049;9050;9051;9052;9053;9054;13559;13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567;28214;28215;38477;38478;38479;38480;38481;38482;38483;38484;38485;38486;38487;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;58515;58516;58517;58518;58519;58520;72986;72987;72988;72989;72990;72991;72992;72993;72994;72995;72996;72997;72998;72999;73000;73001;73002;73003;73004;82464;82465;82466;82467;82468;82469;82470;82471;82472 3222;9050;13565;28214;38479;39906;58516;72994;82468 Q02750 Q02750 5 5 3 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 MAP2K1 sp|Q02750|MP2K1_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K1 PE=1 SV=2 1 5 5 3 4 4 4 4 4 4 3 3 2 18.1 18.1 9.4 43.439 393 393 0 22.923 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87664 0.93202 14.412 14 4 Leave out requantified 0.99241 0.85675 0.81505 1.054 0.91314 0.85857 7.4547 13.687 23.628 5 5 4 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.5 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18378;26711;29575;39896;43479;46525;47414;49869;53171;54884;58082;58270;59038;62674;67701;68913;73805;76249 Q03113 Q03113 2 2 1 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-12 GNA12 sp|Q03113|GNA12_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNA12 PE=1 SV=4 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 0 4.2 4.2 2.1 44.279 381 381 0.0022104 2.5821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0459 1.046 29.887 3 1 Median NaN 1.3268 NaN NaN 1.3169 NaN NaN 32.562 NaN 0 2 1 0 1 0 Median Median Median 2.1 4.2 2.1 127570000 58421000 69144000 0 0 0 71971000 30232000 41740000 55594000 28190000 27405000 1102 2714;13244 True;True 2748;13404 8905;8906;43455;43456 11860;11861;57358;57359;57360;57361 11860;57360 Q03169 Q03169 9 9 9 Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2 TNFAIP2 sp|Q03169|TNAP2_HUMAN Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNFAIP2 PE=2 SV=2 1 9 9 9 4 7 7 4 7 7 4 7 7 14.5 14.5 14.5 72.66 654 654 0 15.864 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0625 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17.564 4 1 Median NaN NaN 1.0516 NaN NaN 1.0418 NaN NaN 15.739 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 6 6.8 7.1 73119000 35215000 37904000 21577000 8940700 12636000 21265000 9736100 11529000 30278000 16538000 13740000 1113 4609;5924;6300;7283;8124;10912;17869;17888 False;True;False;False;False;True;False;False 4664;5994;6377;7373;8217;11043;18086;18105 15075;15076;15077;19181;19182;19183;20322;20323;20324;23560;23561;23562;26218;26219;26220;36093;58416;58472;58473;58474 20111;25518;25519;25520;27014;27015;27016;27017;27018;31406;31407;31408;31409;31410;31411;34934;34935;34936;47824;77299;77383;77384;77385 20111;25518;27015;31406;34936;47824;77299;77383 Q05397 Q05397 3 3 3 Focal adhesion kinase 1 PTK2 sp|Q05397|FAK1_HUMAN Focal adhesion kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTK2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3.4 3.4 3.4 119.23 1052 1052 0 5.3318 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.4 0 0 16606000 8936600 7669300 16606000 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3432;3433;3434;3435;3436;3437;12856;12857;12858;14771;14772;14773;14774;19462;19463;19464;19465;19466;19467;36548;36549;36550;36551;36552;36553;36554;39245;39246;39388;39389;39390;39391;39392;39393;58802;58803;58804 4630;4631;4632;4633;4634;4635;4636;4637;4638;4639;4640;17100;17101;17102;19717;19718;19719;25910;25911;25912;25913;25914;25915;25916;25917;48394;48395;48396;48397;48398;48399;48400;48401;48402;48403;48404;48405;48406;48407;51857;52055;52056;52057;52058;52059;52060;52061;52062;52063;77775;77776;77777;77778;77779;77780 4632;17101;19717;19719;25910;48395;51857;52063;77778 Q05639 Q05639 15 3 3 Elongation factor 1-alpha 2 EEF1A2 sp|Q05639|EF1A2_HUMAN Elongation factor 1-alpha 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A2 PE=1 SV=1 1 15 3 3 14 14 14 3 3 3 3 3 3 37.6 6.7 6.7 50.47 463 463 0 13.384 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72074 0.74014 4.0331 13 7 Leave out requantified 0.93216 0.70897 0.81333 0.92996 0.72268 1.0258 30.084 31.956 24.993 4 6 3 2 4 1 Median Median Plateau 31.3 31.3 37.6 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5774;5775;5776;5777;5778;5779;5780;5781;5782;5783;5784;5785;28982;28983;28984;28985;28986;28987;40590;40591;40592;40593;40594;40595;40596;40597;40598;40599;67530;67531;67532;67533;67534;67535;72479;72480;72481;72482;72483;75170;75171;75172;75173;75174;75175;75176;75177;75178;75179;75180;75181;75182;75183;75184;78602;78603;78604;78605;78606;78607;78608;78617;78618;78619;78620;78621 5784;28987;40590;67533;72483;75174;78603;78621 Q07021 Q07021 4 4 4 Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial C1QBP sp|Q07021|C1QBP_HUMAN Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C1QBP PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 1 3 2 1 3 2 1 3 21.6 21.6 21.6 31.362 282 282 0 15.596 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2512 1.2905 22.374 6 0 Leave out requantified 1.2654 NaN 1.1973 1.316 NaN 1.2343 5.8464 NaN 26.433 2 1 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 12.1 7.1 20.6 189370000 83814000 105560000 81663000 37011000 44652000 32394000 14508000 17886000 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3539;3540;3541;6407;6408;6409;6410;6411;6412;6413;6414;6415;19720;19721;19722;19723;19724;28519;28520;28521;28522;28523;28524;28525;28526;28527;28528;28529;28530;28531;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34593;34594;34595;34596;34597;34598;34599;38301;38302;38303;38304;38305;38306;38307;38308;38309;38749;42215;42216;42217;42218;42219;42220;42221;42222;42223;42224;42225;42226;42227;42228;42229;42230;42231;42232;42233;42234;42235;42236;42237;42238;42868;42869;42870;42871;42872;42873;42874;42875;42876;42877;44092;44093;44094;44095;44096;44097;44098;44099;44100;44101;44102;44103;44104;44105;44106;44107;44108;45238;45239;45240;57399;57400;57401;57402;63739;63740;63741;63742;63743;63744;63745;63746;63747;65472;65473;65474;65475;65476;65477;65478;65479;65480;65481;65515;65516;65517;65518;65519;80606;80607;80608;80609;80610;80611;80612;80613;80614 3539;6408;19721;28529;34531;34596;38308;38749;42221;42235;42871;44094;45239;57401;63745;65481;65515;80613 Q12905 Q12905 6 6 6 Interleukin enhancer-binding factor 2 ILF2 sp|Q12905|ILF2_HUMAN Interleukin enhancer-binding factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILF2 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 4 5 4 4 5 4 4 5 20.8 20.8 20.8 43.062 390 390 0 19.116 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0848 1.1496 11.729 17 2 Leave out requantified 1.0522 1.2019 1.1084 1.1222 1.2814 1.1502 27.469 22.455 14.595 5 6 6 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.9 15.6 18.7 464050000 227200000 236850000 100590000 50795000 49793000 174630000 90000000 84631000 188830000 86408000 102420000 1165 1874;9289;10144;13956;19474;20423 True;True;True;True;True;True 1896;9398;10268;14129;19705;20662 6226;30484;30485;30486;30487;30488;30489;33493;33494;45821;45822;45823;63699;63700;63701;63702;66694 8362;40456;40457;40458;40459;40460;40461;40462;40463;40464;40465;44433;44434;44435;44436;60428;60429;60430;60431;60432;84475;84476;84477;84478;84479;84480;88411 8362;40459;44436;60429;84479;88411 Q12906;Q96SI9 Q12906 12;1 12;1 12;1 Interleukin enhancer-binding factor 3 ILF3 sp|Q12906|ILF3_HUMAN Interleukin enhancer-binding factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILF3 PE=1 SV=3 2 12 12 12 8 7 10 8 7 10 8 7 10 17.8 17.8 17.8 95.337 894 894;672 0 34.904 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0957 1.178 21.56 24 9 Leave out requantified 0.95868 1.0998 1.0961 1.0287 1.1629 1.1657 18.201 19.422 27.759 8 7 9 3 1 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.5 11.1 14.7 574620000 259510000 315100000 241450000 108000000 133450000 145370000 70189000 75179000 187800000 81325000 106470000 1166 1862;2054;4034;8089;8495;10435;11059;11974;16250;19491;19647;20666 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1884;2080;4086;8182;8595;10561;11192;12115;16456;19722;19880;20906 6196;6197;6198;6832;13220;13221;26111;26112;27750;27751;34500;34501;36526;36527;36528;39502;39503;39504;53194;63749;63750;63751;63752;64251;64252;64253;67436 8331;8332;9179;17613;17614;34797;36731;36732;36733;36734;36735;45736;45737;48373;52207;70260;84536;84537;84538;84539;84540;85227;85228;85229;89378 8332;9179;17614;34797;36734;45737;48373;52207;70260;84539;85227;89378 Q12929 Q12929 3 3 3 Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 EPS8 sp|Q12929|EPS8_HUMAN Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS8 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 4.9 4.9 4.9 91.88 822 822 0 9.1435 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99981 1.0176 12.44 6 5 Median 1.0179 0.9875 NaN 1.0176 1.0469 NaN 2.0597 15.957 NaN 2 3 1 1 3 1 Median Median Median 3.6 4.9 3.3 93946000 41872000 52075000 35766000 11428000 24338000 47804000 24939000 22865000 10377000 5505300 4871300 1167 111;1823;3444 True;True;True 112;1845;3489 389;390;391;6092;6093;11272;11273;11274 547;548;549;8188;8189;14991;14992;14993 547;8188;14992 Q12931 Q12931 8 8 8 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial TRAP1 sp|Q12931|TRAP1_HUMAN Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAP1 PE=1 SV=3 1 8 8 8 3 8 6 3 8 6 3 8 6 15.5 15.5 15.5 80.109 704 704 0 42.901 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1238 1.134 36.543 20 4 Leave out requantified 1.1035 1.1681 1.0262 1.1177 1.1473 1.0683 14.283 23.043 42.569 4 9 7 1 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 5.4 15.5 12.4 294960000 138430000 156540000 48914000 22886000 26028000 142220000 66290000 75926000 103830000 49251000 54581000 1168 517;1392;4377;4810;5913;16246;16700;20676 True;True;True;True;True;True;True;True 520;1408;4430;4868;5983;16452;16911;20916 1775;1776;1777;4645;4646;4647;4648;4649;4650;14323;15791;15792;19153;53183;53184;54623;54624;54625;67467;67468 2427;2428;2429;6284;6285;6286;6287;6288;6289;6290;6291;19107;21023;21024;25477;70245;70246;72093;89422;89423 2427;6284;19107;21024;25477;70245;72093;89423 Q12965;O00160 Q12965 31;5 31;5 31;5 Unconventional myosin-Ie MYO1E sp|Q12965|MYO1E_HUMAN Unconventional myosin-Ie OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO1E PE=1 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sapiens OX=9606 GN=PPP1R8 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.1 3.1 3.1 38.478 351 351 0.00047551 3.329 By MS/MS By MS/MS 0.57501 0.59499 21.726 2 2 Median NaN 0.57501 NaN NaN 0.59499 NaN NaN 21.726 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 0 3.1 3.1 27688000 17903000 9785500 0 0 0 27688000 17903000 9785500 0 0 0 1170 13853 True 14026 45526;45527;45528 60032;60033;60034 60034 Q12979 Q12979 5 5 4 Active breakpoint cluster region-related protein ABR sp|Q12979|ABR_HUMAN Active breakpoint cluster region-related protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABR PE=2 SV=2 1 5 5 4 3 1 4 3 1 4 2 0 3 6.8 6.8 5.6 97.597 859 859 0 18.049 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87298 0.90967 49.802 7 1 Leave out requantified 1.4075 NaN 0.80473 1.4816 NaN 0.82833 55.741 NaN 17.302 2 1 4 0 0 1 Median Median Leave out requantified 3.7 1.2 5.2 140060000 63060000 77000000 49912000 17972000 31940000 22659000 12002000 10657000 67488000 33085000 34403000 1171 4305;7706;9468;12768;17095 True;True;True;True;True 4358;7798;9584;12913;17307 14092;14093;24920;31076;41932;55817;55818;55819 18787;18788;33251;41284;55400;73712;73713;73714;73715;73716;73717 18788;33251;41284;55400;73714 Q12986 Q12986 4 4 4 Transcriptional repressor NF-X1 NFX1 sp|Q12986|NFX1_HUMAN Transcriptional repressor NF-X1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFX1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 6.1 6.1 6.1 124.39 1120 1120 0 11.821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0893 1.1013 18.31 15 1 Leave out requantified 0.96465 1.1451 0.9675 1.0479 1.1473 1.0617 12.87 5.7938 35 6 4 5 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.1 2.6 5.2 170130000 86313000 83815000 85053000 44615000 40437000 23544000 11429000 12115000 61532000 30269000 31263000 1172 3583;10671;18485;19307 True;True;True;True 3631;10800;18709;19537 11739;35314;35315;35316;60376;60377;63118;63119;63120;63121;63122;63123;63124;63125;63126 15568;46804;46805;46806;46807;46808;46809;79846;83707;83708;83709;83710;83711 15568;46804;79846;83707 Q12996 Q12996 7 7 7 Cleavage stimulation factor subunit 3 CSTF3 sp|Q12996|CSTF3_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF3 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 4 5 6 4 5 6 4 5 12 12 12 82.921 717 717 0 16.116 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0175 1.0661 4.8358 11 3 Leave out requantified 1.0369 1.0505 0.97861 1.0711 1.0726 1.0024 20.548 0.85963 18.132 5 2 4 1 0 2 Leave out requantified Median Median 10.2 8.2 9.2 178910000 84600000 94310000 72808000 35632000 37177000 43517000 20963000 22553000 62585000 28005000 34580000 1173 808;6226;7975;8890;9135;11081;17542 True;True;True;True;True;True;True 817;6301;8067;8994;9242;11214;17755 2760;20097;20098;25764;29105;29106;29959;29960;29961;36597;36598;36599;57230;57231;57232 3733;26701;26702;26703;34374;38551;38552;39720;39721;39722;39723;39724;39725;48449;48450;48451;75623;75624;75625 3733;26703;34374;38551;39723;48449;75624 Q13017 Q13017 5 5 5 Rho GTPase-activating protein 5 ARHGAP5 sp|Q13017|RHG05_HUMAN Rho GTPase-activating protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP5 PE=1 SV=2 1 5 5 5 1 4 2 1 4 2 1 4 2 4.9 4.9 4.9 172.46 1502 1502 0 8.7931 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95106 0.95222 23.107 7 3 Leave out requantified NaN 0.88157 0.98157 NaN 0.92996 1.0102 NaN 21.366 5.0123 1 4 2 1 1 1 Median Leave out requantified Median 0.9 3.3 2.5 92598000 51538000 41060000 10543000 6134700 4408000 55895000 30083000 25812000 26161000 15321000 10840000 1174 5328;13182;17845;18309;19854 True;True;True;True;True 5390;13341;18062;18531;20090 17340;43282;58328;59810;59811;59812;64935 23070;57135;77149;79107;79108;79109;79110;79111;86158 23070;57135;77149;79109;86158 Q13042 Q13042 2 2 2 Cell division cycle protein 16 homolog CDC16 sp|Q13042|CDC16_HUMAN Cell division cycle protein 16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC16 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 4 4 4 71.655 620 620 0 14.015 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0081 1.019 20.874 5 0 Leave out requantified 0.96383 NaN 0.99417 0.9761 NaN 1.0158 13.885 NaN 21.325 2 1 2 0 0 0 Median Median Median 4 1.6 4 121230000 60254000 60972000 49518000 24068000 25450000 28512000 13839000 14673000 43197000 22347000 20850000 1175 4829;15204 True;True 4887;15396 15837;15838;15839;49820;49821 21075;21076;21077;65825;65826;65827;65828;65829 21077;65826 Q13045 Q13045 31 31 31 Protein flightless-1 homolog FLII sp|Q13045|FLII_HUMAN Protein flightless-1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLII PE=1 SV=2 1 31 31 31 25 27 30 25 27 30 25 27 30 32.8 32.8 32.8 144.75 1269 1269 0 277.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0335 1.0674 21.739 96 30 Leave out requantified 1.0001 1.0041 1.0507 1.0186 1.0098 1.077 9.8768 24.656 18.51 28 32 36 12 7 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.3 27.2 32.1 5060000000 2556500000 2503500000 1491800000 779170000 712670000 1768600000 870320000 898260000 1799600000 907000000 892620000 1176 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Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase COASY sp|Q13057|COASY_HUMAN Bifunctional coenzyme A synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COASY PE=1 SV=4 1 10 10 10 8 8 9 8 8 9 8 8 9 23.8 23.8 23.8 62.328 564 564 0 65.021 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0634 1.0721 33.813 31 9 Leave out requantified 1.0769 1.0607 1.088 1.0855 1.0791 1.1189 6.4821 10.366 44.214 9 10 12 2 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.8 19.1 22.2 1068100000 511510000 556570000 307660000 147360000 160310000 352490000 170200000 182290000 407930000 193960000 213980000 1177 1864;2632;6715;7394;8506;9325;10605;11749;16120;20583 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1886;2666;6798;7484;8606;9434;10732;11886;16323;20823 6202;6203;6204;8619;8620;8621;8622;21678;21679;23901;23902;23903;23904;23905;23906;23907;27782;27783;27784;30595;30596;30597;35098;35099;38790;38791;38792;52795;52796;67166;67167;67168 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subunit alpha-1 PRKAA1 sp|Q13131|AAPK1_HUMAN 5-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKAA1 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1.8 1.8 1.8 64.009 559 559 0.0022533 2.7394 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 1.8 0 1.8 22189000 9713600 12475000 0 0 0 0 0 0 22189000 9713600 12475000 1182 16217 True 16423 53097;53098 70136;70137 70137 Q13136;O75335;O75145;O75334 Q13136 10;1;1;1 10;1;1;1 10;1;1;1 Liprin-alpha-1 PPFIA1 sp|Q13136|LIPA1_HUMAN Liprin-alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPFIA1 PE=1 SV=1 4 10 10 10 9 8 6 9 8 6 9 8 6 13.3 13.3 13.3 135.78 1202 1202;1185;1194;1257 0 52.179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0135 1.0223 11.465 20 10 Leave out requantified 1.0797 0.93641 1.0589 1.1098 0.94174 1.0971 2.5664 17.041 16.368 5 8 7 2 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Median 12.3 10.9 8.7 349730000 184900000 164820000 100620000 56800000 43817000 138850000 72970000 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Serine-protein kinase ATM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATM PE=1 SV=4 1 8 8 8 6 4 6 6 4 6 6 4 6 2.6 2.6 2.6 350.68 3056 3056 0 12.047 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0317 1.0719 21.864 16 6 Leave out requantified 0.93853 0.98282 1.1571 0.96098 1.008 1.1923 12.313 23.652 21.621 6 4 6 3 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 2 1.2 1.8 145310000 80301000 65012000 52709000 27556000 25153000 44936000 24712000 20224000 47668000 28033000 19635000 1199 6111;6727;11576;15189;16260;16503;19593;20283 True;True;True;True;True;True;True;True 6184;6810;11712;15381;16466;16711;19825;20521 19741;19742;19743;21713;21714;38257;38258;38259;49776;53228;53229;53230;54035;64075;66267;66268 26261;26262;28964;28965;50628;50629;65761;70308;70309;70310;70311;70312;70313;71319;84960;87857;87858 26261;28965;50628;65761;70312;71319;84960;87857 Q13325 Q13325 7 7 7 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 IFIT5 sp|Q13325|IFIT5_HUMAN Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFIT5 PE=1 SV=1 1 7 7 7 4 3 4 4 3 4 4 3 4 16.6 16.6 16.6 55.846 482 482 0 12.643 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1704 1.2194 20.319 9 1 Leave out requantified 1.2752 1.06 0.93326 1.3316 1.1 0.91191 12.349 21.884 36.618 3 3 3 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 10.2 7.1 8.5 189900000 94484000 95413000 49079000 23721000 25358000 69885000 35217000 34669000 70933000 35547000 35387000 1200 8758;10721;10844;10935;12122;15953;16050 True;True;True;True;True;True;True 8860;10852;10975;11066;12263;16154;16251 28654;28655;35510;35886;35887;35888;36147;39940;52248;52533;52534 37919;47091;47554;47555;47556;47557;47558;47559;47560;47892;52796;68982;69362;69363 37919;47091;47555;47892;52796;68982;69363 Q13330;Q9BTC8 Q13330 7;1 7;1 7;1 Metastasis-associated protein MTA1 MTA1 sp|Q13330|MTA1_HUMAN Metastasis-associated protein MTA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTA1 PE=1 SV=2 2 7 7 7 4 5 2 4 5 2 4 5 2 11.5 11.5 11.5 80.785 715 715;594 0 14.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0058 0.99264 16.129 10 2 Leave out requantified 0.78637 0.96846 1.0135 1.2608 0.94771 1.0462 42.102 15.839 30.975 4 4 2 2 0 0 Linear Leave out requantified Median 5.9 8.3 3.1 170480000 88798000 81686000 78098000 43948000 34149000 63992000 30877000 33115000 28394000 13972000 14422000 1201 896;2207;2818;10748;17240;18815;21018 True;True;True;True;True;True;True 906;2236;2853;10879;17452;19040;21264 3041;3042;7326;9245;9246;35578;35579;35580;56264;61446;68541 4103;9808;12303;12304;47162;47163;74334;81324;90838 4103;9808;12304;47163;74334;81324;90838 Q13347 Q13347 13 13 13 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I EIF3I sp|Q13347|EIF3I_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3I PE=1 SV=1 1 13 13 13 13 12 13 13 12 13 13 12 13 56.3 56.3 56.3 36.501 325 325 0 101.02 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9836 1.0184 17.805 53 14 Leave out requantified 0.93581 0.92189 0.95589 0.96347 0.95358 0.97649 23.341 21.143 21.877 18 16 19 5 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56.3 45.8 56.3 4481500000 2220400000 2261100000 1510400000 737090000 773340000 1458400000 757960000 700400000 1512700000 725350000 787340000 1202 3158;3258;4320;7183;8537;9711;11007;12710;13025;14722;16088;17309;17614 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3199;3300;4373;7272;8639;9830;11140;12855;13176;14909;16291;17522;17830 10412;10413;10414;10415;10416;10698;10699;10700;10701;14138;14139;14140;23197;23198;23199;23200;23201;23202;23203;23204;23205;27912;27913;27914;27915;27916;27917;27918;27919;31922;31923;31924;31925;31926;36379;36380;36381;41753;41754;41755;42777;42778;42779;48286;48287;48288;52700;52701;52702;56500;56501;56502;57492;57493 13853;13854;13855;13856;13857;14230;14231;14232;14233;14234;14235;18852;18853;18854;18855;18856;18857;30914;30915;30916;30917;30918;30919;30920;30921;30922;30923;30924;30925;36922;36923;36924;36925;36926;36927;36928;36929;36930;36931;42421;42422;42423;42424;42425;42426;42427;42428;42429;42430;48201;48202;48203;55182;55183;55184;55185;56495;56496;56497;56498;63710;69629;69630;69631;69632;69633;69634;74670;74671;74672;74673;74674;74675;74676;75985;75986;75987;75988;75989;75990 13857;14234;18856;30923;36929;42429;48203;55182;56496;63710;69632;74674;75990 Q13356 Q13356 2 2 2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2 PPIL2 sp|Q13356|PPIL2_HUMAN RING-type E3 ubiquitin-protein ligase PPIL2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIL2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.6 4.6 4.6 58.823 520 520 0 6.9501 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94305 1.0132 9.7253 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 1.9 2.7 2.7 20500000 11459000 9041700 9957700 4732600 5225100 4923900 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6 Origin recognition complex subunit 2 ORC2 sp|Q13416|ORC2_HUMAN Origin recognition complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC2 PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 6 3 5 6 3 5 6 3 10.9 10.9 10.9 65.971 577 577 0 12.342 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.042 1.0938 5.2103 9 1 Leave out requantified 1.1632 1.0986 1.0139 1.1947 1.1134 1.0795 12.773 5.5119 1.8693 3 4 2 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 9.2 10.9 6.6 592620000 268100000 324520000 304020000 139590000 164420000 258210000 114550000 143650000 30393000 13949000 16444000 1208 1397;13425;14894;18342;20050;20290 True;True;True;True;True;True 1413;13587;15084;18564;20286;20528 4663;4664;44068;44069;44070;48863;48864;48865;59911;59912;59913;65536;66292;66293 6311;6312;58158;58159;58160;58161;58162;64489;64490;64491;79233;79234;79235;86935;87895 6312;58160;64491;79235;86935;87895 Q13418 Q13418 16 16 16 Integrin-linked protein kinase ILK sp|Q13418|ILK_HUMAN Integrin-linked protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILK PE=1 SV=2 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12 12 12 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein PDAP1 sp|Q13442|HAP28_HUMAN 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDAP1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 10 11 11 10 11 11 10 11 11 53 53 53 20.63 181 181 0 230.62 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89291 0.97084 9.9128 50 8 Leave out requantified 0.82039 0.94168 0.93231 0.87704 0.99569 1.0262 11.696 10.376 7.7066 16 16 18 1 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 52.5 53 52.5 5911900000 3059200000 2852700000 2248000000 1215000000 1033000000 1863900000 919260000 944690000 1799900000 924940000 874950000 1213 839;1445;2420;4109;7977;10064;10339;10402;13160;15382;16389;20150 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 849;1462;2450;4162;8069;10188;10464;10527;13318;15575;16597;20386 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cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIN1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 12.3 12.3 12.3 18.243 163 163 0.00047778 3.4013 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 12.3 10696000 3063800 7632100 0 0 0 0 0 0 10696000 3063800 7632100 1220 16081 True 16284 52676 69600 69600 Q13535 Q13535 7 7 7 Serine/threonine-protein kinase ATR ATR sp|Q13535|ATR_HUMAN Serine/threonine-protein kinase ATR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATR PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 6 4 4 6 4 4 6 4 3.5 3.5 3.5 301.36 2644 2644 0 14.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84289 0.87681 11.103 14 6 Leave out requantified 0.78356 0.98502 0.95232 0.82393 1.0228 1.0123 12.765 15.976 38.992 4 6 4 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 1.9 2.9 2.2 198830000 97969000 100860000 54521000 29166000 25356000 77899000 37466000 40433000 66413000 31337000 35075000 1221 798;1303;6936;10499;11552;11873;17999 True;True;True;True;True;True;True 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initiation factor 3 subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3A PE=1 SV=1 1 65 65 65 58 63 61 58 63 61 58 63 61 43.4 43.4 43.4 166.57 1382 1382 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0054 1.0378 15.346 257 49 Leave out requantified 1.0364 0.97082 1.0301 1.0566 0.98048 1.0523 16.757 17.941 13.382 82 88 87 18 14 17 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.4 41.5 41.6 31532000000 15940000000 15592000000 10385000000 5104300000 5280900000 10809000000 5605400000 5203500000 10338000000 5230400000 5107800000 1248 380;825;963;1222;1713;2720;3126;3371;4003;4201;4211;4641;4753;5103;5198;5797;6288;6614;7353;7354;7581;8175;8284;8971;9010;9159;9302;9724;10046;10223;10272;10311;10629;10862;10973;11119;11120;11131;11571;11726;11790;12529;12751;12985;13307;13483;13579;13809;13977;14394;15014;15201;15279;15387;15389;15460;15496;15503;15734;16128;16401;17945;18089;19602;20068 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5808;38799;38800;39041;39042;39043;43276;52525;55008;55134;61348;61349;68262;68263;68264;68265;68266;68267;68268 7833;51294;51295;51587;51588;51589;51590;57129;69351;72613;72772;81164;81165;90462;90463;90464;90465;90466;90467;90468;90469;90470;90471 7833;51294;51589;57129;69351;72613;72772;81165;90466 Q14197 Q14197 2 2 2 Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial ICT1 sp|Q14197|ICT1_HUMAN Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPL58 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 10.2 10.2 10.2 23.63 206 206 0.00049188 3.8029 By MS/MS By MS/MS 0.78054 0.79111 11.661 4 3 Median 0.81181 0.78054 NaN 0.81311 0.79111 NaN 16.987 10.575 NaN 2 2 0 2 1 0 Median Median Median 4.9 10.2 0 176020000 97221000 78800000 52536000 25242000 27294000 123480000 71979000 51506000 0 0 0 1255 3142;14287 True;True 3183;14468 10350;46949;46950;46951 13775;61978;61979;61980 13775;61979 Q14203 Q14203 9 9 9 Dynactin subunit 1 DCTN1 sp|Q14203|DCTN1_HUMAN Dynactin subunit 1 OS=Homo sapiens 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18885;35510;50255;80195;80196;87682 Q14919 Q14919 2 2 2 Dr1-associated corepressor DRAP1 sp|Q14919|NC2A_HUMAN Dr1-associated corepressor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DRAP1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10.2 10.2 10.2 22.35 205 205 0 5.234 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9108 0.91718 30.846 6 2 Leave out requantified 0.9827 0.90175 0.79741 1.0068 0.89945 0.80847 17.66 28.086 14.178 2 2 2 0 1 1 Median Median Median 10.2 10.2 10.2 265380000 141290000 124090000 91523000 41484000 50039000 80159000 46536000 33624000 93701000 53270000 40431000 1288 9372;18723 True;True 9488;18948 30788;30789;30790;61147;61148;61149 40879;40880;40881;80887;80888;80889;80890;80891;80892 40880;80889 Q14966 Q14966 2 2 2 Zinc finger protein 638 ZNF638 sp|Q14966|ZN638_HUMAN Zinc finger protein 638 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF638 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 220.62 1978 1978 0.00047664 3.3718 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98368 1.0498 22.007 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 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By MS/MS 1.0099 1.0371 4.4429 4 1 Median NaN NaN 1.0369 NaN NaN 1.062 NaN NaN 4.8749 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 1 1 1.9 203580000 94998000 108590000 64692000 31420000 33271000 70264000 32126000 38138000 68628000 31452000 37176000 1315 5319;17315 True;True 5380;17528 17304;56518;56519;56520 23018;74696 23018;74696 Q15059 Q15059 14 10 9 Bromodomain-containing protein 3 BRD3 sp|Q15059|BRD3_HUMAN Bromodomain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRD3 PE=1 SV=1 1 14 10 9 11 11 10 7 8 7 6 7 7 24.8 19.6 18.3 79.541 726 726 0 28.162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87045 0.88809 8.8393 16 6 Leave out requantified 1.0746 0.82768 0.85097 1.0462 0.85245 0.88275 8.0892 9.494 11.07 5 7 4 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.4 19 17.4 395360000 195840000 199520000 126020000 64182000 61841000 183330000 87577000 95749000 86013000 44084000 41930000 1316 2931;3416;5704;8428;9875;10487;11880;11956;12124;13113;18192;18820;20239;20990 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out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.6 36.6 31 4222600000 2150700000 2071900000 1281900000 661910000 619940000 1423600000 706680000 716940000 1517200000 782150000 735030000 1356 660;2153;4756;8484;8779;9852;9953;12351;14211;15370;20254;20265;20266;20428;20759 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 666;2182;4813;8584;8881;9972;10076;12492;14392;15563;20492;20503;20504;20667;21001 2253;2254;2255;7185;7186;7187;15615;15616;15617;15618;15619;27684;27685;27686;27687;27688;27689;28710;28711;28712;32378;32379;32380;32776;32777;40641;40642;40643;46706;46707;46708;46709;46710;46711;50336;50337;50338;50339;66177;66178;66179;66180;66181;66182;66211;66212;66213;66214;66215;66216;66217;66218;66219;66714;66715;66716;67719;67720 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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform PPP2R5E sp|Q16537|2A5E_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R5E PE=1 SV=1 1 6 5 5 3 5 6 3 5 5 3 5 5 15.8 13.3 13.3 54.699 467 467 0 74.371 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98317 1.01 20.456 14 7 Leave out requantified 1.1368 1.0527 0.98178 1.196 1.0521 0.992 19.989 24.851 33.11 3 6 5 1 3 3 Median Leave out requantified Median 7.5 13.3 15.8 464150000 218470000 245680000 107030000 52773000 54260000 194750000 87463000 107290000 162370000 78239000 84133000 1380 2257;3619;6135;6739;17090;19594 False;True;True;True;True;True 2287;3667;6208;6822;17302;19826 7477;11860;11861;11862;11863;11864;19812;19813;19814;19815;19816;21747;21748;55806;55807;55808;64076;64077;64078 10000;10001;15738;15739;15740;15741;15742;26342;26343;26344;26345;26346;26347;29021;29022;73699;73700;73701;84961;84962;84963;84964;84965 10001;15739;26343;29022;73701;84961 Q16539 Q16539 5 5 5 Mitogen-activated protein kinase 14 MAPK14 sp|Q16539|MK14_HUMAN Mitogen-activated protein kinase 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAPK14 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 17.5 17.5 17.5 41.293 360 360 0 14.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0483 1.1086 14.534 12 1 Leave out requantified 0.96656 0.99702 1.1907 1.0094 1.0307 1.2481 13.436 21.794 3.3415 4 4 4 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.3 17.5 14.4 369080000 185430000 183640000 120750000 60219000 60536000 139040000 70706000 68337000 109280000 54510000 54768000 1381 2988;3012;8213;14246;18000 True;True;True;True;True 3023;3047;8308;14427;18218 9810;9811;9812;9882;9883;9884;26557;26558;46813;46814;58822;58823;58824 13027;13028;13029;13030;13031;13032;13033;13119;13120;13121;35332;61779;61780;77800;77801;77802 13027;13119;35332;61780;77800 Q16540 Q16540 1 1 1 39S ribosomal protein L23, mitochondrial MRPL23 sp|Q16540|RM23_HUMAN 39S ribosomal 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7;2 7;2 7;2 Gamma-interferon-inducible protein 16 IFI16 sp|Q16666|IF16_HUMAN Gamma-interferon-inducible protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFI16 PE=1 SV=3 2 7 7 7 6 6 5 6 6 5 6 6 5 11.1 11.1 11.1 88.255 785 785;492 0 37.119 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0172 1.0723 21.686 15 5 Leave out requantified 1.1102 0.81153 0.9584 1.1608 0.88589 1.0013 32.77 34.836 11.057 5 4 6 1 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.9 9.9 8.2 224180000 108990000 115190000 81173000 40345000 40829000 58272000 29261000 29012000 84734000 39387000 45347000 1392 5491;6886;7386;8887;9409;16500;17565 True;True;True;True;True;True;True 5553;6971;7476;8991;9525;16708;17778 17818;17819;17820;22201;22202;22203;23879;23880;23881;29098;29099;30892;54026;54027;54028;57308;57309;57310;57311 23701;23702;23703;29621;29622;29623;31844;31845;31846;38542;38543;38544;41029;71310;75720;75721;75722;75723;75724 23702;29621;31845;38543;41029;71310;75721 Q16696 Q16696 1 1 1 Cytochrome P450 2A13 CYP2A13 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MS/MS By MS/MS 0.89307 0.91645 15.858 23 8 Leave out requantified 0.88286 0.81818 1.0693 0.90481 0.82201 1.0921 15.666 23.212 9.4223 7 8 8 3 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.6 17.4 11.6 700730000 347140000 353590000 226860000 111640000 115210000 261670000 133810000 127860000 212210000 101680000 110520000 1397 6149;11885;12723;19101;19756;20234;20327;20439 True;True;True;True;True;True;True;True 6222;12023;12868;19330;19991;20471;20565;20678 19855;19856;19857;39186;39187;39188;41796;41797;41798;62431;62432;62433;64602;64603;64604;64605;66126;66402;66403;66744;66745;66746;66747 26394;26395;26396;26397;26398;26399;51775;51776;51777;55237;55238;82709;82710;82711;82712;82713;82714;85688;85689;85690;85691;87692;88041;88042;88476;88477;88478;88479;88480;88481 26397;51775;55237;82710;85690;87692;88042;88480 Q17RN3 Q17RN3 1 1 1 Protein FAM98C FAM98C sp|Q17RN3|FA98C_HUMAN Protein FAM98C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM98C PE=2 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 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domain-containing protein 1B CC2D1B sp|Q5T0F9|C2D1B_HUMAN Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CC2D1B PE=1 SV=1 1 7 7 7 3 5 3 3 5 3 3 5 3 9.4 9.4 9.4 94.223 858 858 0 9.5971 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0133 1.0002 47.92 12 5 Leave out requantified 0.57328 0.99597 1.0991 0.56531 0.98643 1.0632 38.716 37.439 11.899 3 6 3 1 2 2 Median Leave out requantified Median 3.4 7.5 4.8 242450000 122270000 120170000 64358000 37356000 27002000 123330000 58928000 64402000 54757000 25988000 28770000 1444 5172;5876;5951;10933;13055;14128;19869 True;True;True;True;True;True;True 5233;5946;6021;11064;13208;14307;20105 16854;19036;19037;19261;36143;36144;42883;46438;46439;46440;64974;64975 22434;25340;25341;25629;47888;47889;56636;61309;61310;86206;86207 22434;25340;25629;47889;56636;61310;86207 Q9Y6H1;Q5T1J5 Q9Y6H1;Q5T1J5 1;1 1;1 1;1 Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2;Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial CHCHD2;CHCHD2P9 sp|Q9Y6H1|CHCH2_HUMAN Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHCHD2 PE=1 SV=1;sp|Q5T1J5|CHCH9_HUMAN Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial OS=Homo s 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.6 8.6 8.6 15.512 151 151;151 0 23.446 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82887 0.86022 22.468 6 0 Median 0.76251 1.0848 0.88171 0.80879 1.1366 0.91312 1.3232 33.632 14.207 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 8.6 8.6 8.6 128590000 69724000 58870000 48614000 27618000 20996000 36112000 17962000 18151000 43867000 24144000 19723000 1445 14582 True 14767 47825;47826;47827;47828;47829;47830 63102;63103;63104;63105;63106;63107;63108;63109;63110;63111;63112;63113 63105 Q5T280 Q5T280 3 3 3 Putative methyltransferase C9orf114 C9orf114 sp|Q5T280|CI114_HUMAN Putative methyltransferase C9orf114 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPOUT1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 10.4 10.4 10.4 42.008 376 376 0 14.146 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0741 1.089 50.324 7 3 Leave out requantified 1.2861 0.93983 1.0068 1.3185 0.91389 1.0083 27.037 3.6156 51.169 2 2 3 0 2 1 Median Median Median 6.6 6.6 10.4 75951000 35430000 40521000 23942000 10883000 13060000 19380000 9013200 10367000 32629000 15535000 17095000 1446 7763;9310;15495 True;True;True 7855;9419;15691 25092;25093;25094;25095;30559;30560;30561;50778 33470;33471;33472;33473;33474;33475;40540;40541;40542;67064 33472;40540;67064 Q5T3I0 Q5T3I0 3 3 3 G patch domain-containing protein 4 GPATCH4 sp|Q5T3I0|GPTC4_HUMAN G patch domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH4 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 1 1 3 1 1 3 1 9.4 9.4 9.4 50.381 446 446 0 8.7641 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84364 0.89789 17.267 11 2 Median 0.97918 0.71399 0.79596 1.0107 0.74396 0.8522 7.7427 13.483 17.509 3 5 3 0 2 0 Median Median Median 3.6 9.4 3.6 99548000 54881000 44668000 34608000 17264000 17344000 42322000 24797000 17526000 22618000 12820000 9797800 1447 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31.178 NaN 8.8689 2 1 3 1 0 0 Median Median Median 1.7 0.8 2.1 64099000 34429000 29670000 27135000 13263000 13872000 11609000 6817000 4791700 25355000 14349000 11006000 1457 12716;15908;15992;16655;16800 True;True;True;True;True 12861;16108;16193;16866;17011 41770;52110;52111;52349;52350;52351;52352;52353;54491;54935 55206;55207;68801;68802;69125;69126;69127;69128;69129;69130;69131;71916;72513;72514 55207;68801;69128;71916;72513 Q5VIR6 Q5VIR6 1 1 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog VPS53 sp|Q5VIR6|VPS53_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS53 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1.1 1.1 1.1 79.652 699 699 0.0063884 2.1564 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.1 0 0 11773000 4861700 6911400 11773000 4861700 6911400 0 0 0 0 0 0 1458 14326 True 14508 47068 62133 62133 Q9ULQ0;Q5VSL9 Q9ULQ0;Q5VSL9 2;2 2;2 2;2 Striatin-interacting protein 2;Striatin-interacting protein 1 STRIP2;STRIP1 sp|Q9ULQ0|STRP2_HUMAN Striatin-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRIP2 PE=1 SV=2;sp|Q5VSL9|STRP1_HUMAN Striatin-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRIP1 PE=1 SV=1 2 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.2 2.2 2.2 95.358 834 834;837 0.0022341 2.6511 By MS/MS By MS/MS 0.87867 0.92075 17.453 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 1.2 0 1 31081000 13863000 17218000 23798000 9926800 13871000 0 0 0 7283400 3936500 3347000 1459 9261;18155 True;True 9369;18376 30405;59317 40348;78425 40348;78425 Q5VT25 Q5VT25 6 5 5 Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha CDC42BPA sp|Q5VT25|MRCKA_HUMAN Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC42BPA PE=1 SV=1 1 6 5 5 4 2 3 3 2 2 3 2 2 3.9 3.3 3.3 197.3 1732 1732 0 7.0645 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83014 0.86943 35.108 2 1 Median 0.83014 NaN NaN 0.86943 NaN NaN 35.108 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.3 1.3 2.1 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Muscleblind-like protein 2;Muscleblind-like protein 1;Muscleblind-like protein 3 MBNL2;MBNL1;MBNL3 sp|Q5VZF2|MBNL2_HUMAN Muscleblind-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MBNL2 PE=1 SV=2;sp|Q9NR56|MBNL1_HUMAN Muscleblind-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MBNL1 PE=1 SV=2;sp|Q9NUK0|MBNL3_HUMAN Muscleblind-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 6.4 6.4 6.4 40.517 373 373;388;354 0.0005144 4.3898 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0731 1.1175 75.814 6 2 Leave out requantified 1.1235 1.2692 1.8567 1.1703 1.3279 2.0338 6.5376 28.382 100.37 2 2 2 0 2 0 Median Median Median 4.3 4.3 4.6 193080000 88063000 105020000 68081000 33326000 34755000 64072000 29806000 34267000 60929000 24932000 35997000 1470 13871;19343;20471 True;True;True 14044;19573;20710 45573;45574;63265;63266;63267;66830 60096;60097;83898;83899;83900;88588 60096;83900;88588 Q5VZK9 Q5VZK9 11 11 11 Leucine-rich repeat-containing protein 16A LRRC16A sp|Q5VZK9|CARL1_HUMAN F-actin-uncapping protein 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By MS/MS By MS/MS 0.97887 1.0166 7.1013 12 4 Leave out requantified 0.88554 1.0161 0.98219 0.91232 1.0749 1.0269 13.506 8.7482 4.1692 4 4 4 1 2 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 14.6 14.6 14.6 240790000 114590000 126200000 86153000 46144000 40009000 72174000 34237000 37936000 82459000 34210000 48249000 1490 5398;8456;17578;20774 True;True;True;True 5460;8556;17791;21016 17551;17552;17553;17554;27584;27585;27586;27587;57361;57362;57363;67764;67765;67766 23332;23333;23334;23335;36548;36549;36550;36551;36552;75799;89811;89812;89813 23332;36552;75799;89812 Q6L8Q7 Q6L8Q7 2 2 2 2,5-phosphodiesterase 12 PDE12 sp|Q6L8Q7|PDE12_HUMAN 2,5-phosphodiesterase 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE12 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 5.3 5.3 5.3 67.351 609 609 0 6.5219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1661 1.159 11.933 5 2 Median 1.2096 NaN 1.1039 1.2491 NaN 1.0901 10.586 NaN 7.8456 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 5.3 3.3 5.3 68583000 29421000 39162000 27404000 11707000 15696000 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10082;10083;10084;10495;12333;13669;13670;18572;18573;18574;18575;24186;43846;43847;43848;49375;49376;49377;56253;56254;64339;66836 13387;13388;13389;13959;16383;18219;18220;18221;18222;24722;24723;32241;57887;57888;57889;65200;65201;65202;65203;65204;65205;74320;74321;85338;88598 13388;13959;16383;18219;24723;32241;57888;65200;74320;85338;88598 Q6NS38 Q6NS38 1 1 1 Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 2 ALKBH2 sp|Q6NS38|ALKB2_HUMAN DNA oxidative demethylase ALKBH2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALKBH2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 5.4 5.4 5.4 29.322 261 261 0.0013612 2.8219 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 5.4 0 14535000 10932000 3603400 0 0 0 14535000 10932000 3603400 0 0 0 1493 392 True 394 1339 1813 1813 Q6NT04 Q6NT04 2 2 2 Tigger transposable element-derived protein 7 TIGD7 sp|Q6NT04|TIGD7_HUMAN Tigger transposable element-derived protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGD7 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 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13.9 13.9 16.22 158 158;158 0.00051308 4.3679 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3268 1.3217 0.59607 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 13.9 13.9 13.9 67542000 32064000 35478000 25315000 12531000 12784000 19823000 8852900 10970000 22404000 10679000 11724000 1498 10600 True 10727 35081;35082;35083 46491;46492;46493;46494 46494 Q6NZI2 Q6NZI2 5 5 5 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 18.7 18.7 18.7 43.476 390 390 0 44.107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95821 0.97933 12.16 14 2 Leave out requantified 0.98369 0.93857 0.95951 1.0346 0.93408 0.99484 13.372 20.477 2.0883 4 4 6 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.1 18.7 18.7 291950000 148940000 143010000 105280000 52692000 52589000 75335000 39149000 36185000 111330000 57101000 54233000 1499 1591;9073;14295;16054;19863 True;True;True;True;True 1610;9178;14476;16255;20099 5310;5311;29718;29719;29720;29721;29722;29723;29724;29725;46971;46972;46973;46974;52543;52544;52545;52546;64958;64959;64960 7153;7154;39407;39408;39409;39410;39411;39412;39413;39414;39415;39416;39417;62004;62005;62006;62007;62008;62009;69372;69373;69374;69375;69376;69377;69378;86186;86187;86188;86189;86190;86191;86192;86193 7153;39414;62009;69372;86186 Q6P158 Q6P158 8 8 8 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 DHX57 sp|Q6P158|DHX57_HUMAN Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX57 PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 4 6 6 4 6 6 4 6 6.6 6.6 6.6 155.6 1386 1386 0 18.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0783 1.0564 33.189 13 9 Leave out requantified 1.0199 1.2166 0.72759 1.0402 1.1921 0.73106 44.3 91.617 66.057 5 3 5 4 2 3 Median Median Median 4.5 3.5 5 173000000 84864000 88139000 67004000 32390000 34614000 34316000 17958000 16358000 71683000 34515000 37168000 1500 1965;2386;3061;5400;6489;12496;14207;18800 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 35;3058;4429;5096;8432;8880;8894;13758;15216;15899;16259;16758;17705;18426;18694 123;124;125;9911;9912;9913;14320;14321;14322;16475;27105;28708;28709;28764;28765;28766;44642;44643;44644;44645;49282;49283;51460;51461;51462;52554;52555;54160;54161;54162;54163;54164;57081;57082;57083;57084;59490;60317;60318;60319 202;203;204;205;206;13162;13163;13164;13165;13166;13167;19104;19105;19106;21951;35974;37989;38070;38071;38072;38073;58894;58895;58896;58897;65077;65078;67892;67893;67894;67895;69386;71470;71471;71472;71473;71474;71475;75401;75402;75403;75404;75405;78647;79761;79762;79763 202;13163;19106;21951;35974;37989;38070;58895;65078;67893;69386;71472;75401;78647;79762 Q6P1L8 Q6P1L8 2 2 2 39S ribosomal protein L14, mitochondrial MRPL14 sp|Q6P1L8|RM14_HUMAN 39S ribosomal protein L14, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPL14 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 15.9 15.9 15.9 15.947 145 145 0.00051653 4.4448 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98056 0.97505 30.805 4 1 Median NaN 0.87232 NaN NaN 0.87796 NaN NaN 34.187 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 9.7 15.9 6.2 84597000 39701000 44895000 29754000 12396000 17358000 36880000 18027000 18853000 17962000 9278400 8683900 1502 19493;20211 True;True 19724;20448 63759;63760;66063;66064 84551;84552;87620;87621;87622 84551;87621 Q6P1N0 Q6P1N0 8 8 8 Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A CC2D1A sp|Q6P1N0|C2D1A_HUMAN Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CC2D1A PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11.7 11.7 11.7 104.06 951 951 0 35.485 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8279 0.83362 7.015 17 10 Leave out requantified 0.96679 0.77831 0.74565 0.95795 0.80155 0.74609 25.292 23.873 12.048 6 5 6 4 3 3 Median Median Leave out requantified 9.5 9.3 8 532290000 290290000 242000000 200080000 102820000 97261000 136130000 83047000 53079000 196090000 104430000 91656000 1503 1475;5819;7381;7588;9534;13816;14882;17986 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Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED27 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.2 3.2 3.2 35.431 311 311 0.0018051 2.7625 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 3.2 3.2 0 13215000 6685300 6529200 0 0 0 13215000 6685300 6529200 0 0 0 1506 15695 True 15894 51450;51451 67877;67878;67879 67879 Q6P2E9 Q6P2E9 13 13 13 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 EDC4 sp|Q6P2E9|EDC4_HUMAN Enhancer of mRNA-decapping protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EDC4 PE=1 SV=1 1 13 13 13 9 12 8 9 12 8 9 12 8 14.6 14.6 14.6 151.66 1401 1401 0 49.235 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.097 1.132 33.301 29 10 Leave out requantified 0.89095 1.2346 1.1407 0.92003 1.2483 1.191 19.063 38.922 17.377 11 11 7 6 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.5 13.9 10 595390000 303370000 292020000 200620000 106770000 93857000 248800000 125130000 123670000 145970000 71471000 74496000 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homolog CWC27 sp|Q6UX04|CWC27_HUMAN Spliceosome-associated protein CWC27 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CWC27 PE=1 SV=1 1 7 7 7 4 5 6 4 5 6 4 5 6 22.9 22.9 22.9 53.846 472 472 0 86.727 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0993 1.1361 37.889 21 8 Leave out requantified 1.3424 0.9004 1.02 1.423 0.89032 1.0596 31.621 41.933 30.167 5 8 8 2 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.4 18.4 22.9 713850000 366050000 347810000 123830000 66513000 57317000 315170000 159660000 155510000 274860000 139880000 134980000 1525 4066;13531;15743;15892;20109;20277;20278 True;True;True;True;True;True;True 4119;13695;15942;16092;20345;20515;20516 13341;13342;13343;13344;13345;13346;13347;44421;44422;44423;51591;51592;52064;52065;52066;65744;65745;65746;66250;66251;66252 17779;17780;17781;17782;17783;17784;17785;17786;58611;58612;58613;58614;58615;68072;68073;68732;68733;68734;68735;68736;68737;87201;87202;87203;87204;87839;87840;87841 17779;58612;68072;68735;87204;87839;87840 Q6VY07 Q6VY07 9 9 9 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 PACS1 sp|Q6VY07|PACS1_HUMAN Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACS1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 7 5 5 7 5 5 7 5 5 12.9 12.9 12.9 104.9 963 963 0 22.853 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0019 0.97658 31.173 17 8 Leave out requantified 0.89421 0.83706 1.0648 0.90046 0.87002 1.1185 27.924 67.917 18.788 6 6 5 2 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.9 6.6 7.7 334640000 173090000 161550000 117990000 59151000 58835000 143140000 76303000 66839000 73508000 37634000 35874000 1526 3514;6153;9861;11510;15955;16719;16875;17500;19994 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3561;6226;9981;11645;16156;16930;17086;17713;20230 11514;11515;11516;19867;19868;19869;19870;32405;38037;52256;54693;54694;55133;57118;57119;57120;65361;65362 15290;15291;15292;26411;26412;26413;26414;26415;43067;50348;68993;72197;72771;75460;75461;75462;75463;75464;86709;86710 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protein 5B DENND5B sp|Q6ZUT9|DEN5B_HUMAN DENN domain-containing protein 5B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DENND5B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 2 145.02 1274 1274 0.0022252 2.626 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94929 0.96093 31.85 3 1 Median 0.75196 NaN NaN 0.76918 NaN NaN 31.477 NaN NaN 2 0 1 1 0 0 Median Median Median 2 0.7 0.7 31042000 17834000 13207000 22938000 14052000 8886100 0 0 0 8103700 3782300 4321400 1533 3746;12543 True;True 3795;12687 12270;12271;12272;41229 16299;16300;16301;54484 16299;54484 Q70E73 Q70E73 4 4 4 Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 RAPH1 sp|Q70E73|RAPH1_HUMAN Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAPH1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 3 1 2 3 1 2 3 1 7 7 7 135.25 1250 1250 0 15.175 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0809 1.0934 7.9284 5 1 Leave out requantified 0.86853 1.0227 NaN 0.91666 1.0407 NaN 36.49 14.917 NaN 2 2 1 1 0 0 Median Median Median 3.1 5.8 1.9 105910000 51378000 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45694;45695;54380;54381;64082;71309 45694;54380;64082;71309 Q7Z7A4 Q7Z7A4 1 1 1 PX domain-containing protein kinase-like protein PXK sp|Q7Z7A4|PXK_HUMAN PX domain-containing protein kinase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PXK PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.1 2.1 2.1 64.949 578 578 0.0030594 2.4524 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.1 0 0 12708000 7456300 5251600 12708000 7456300 5251600 0 0 0 0 0 0 1570 6667 True 6749 21533 28706 28706 Q7Z7K6 Q7Z7K6 1 1 1 Centromere protein V CENPV sp|Q7Z7K6|CENPV_HUMAN Centromere protein V OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CENPV PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.7 4.7 4.7 29.946 275 275 0.0022351 2.6522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88111 0.97153 8.6182 6 0 Median 0.84097 0.90909 0.88521 0.90597 1.0238 0.97674 11.129 8.6574 4.5212 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 4.7 4.7 4.7 70252000 38623000 31629000 24668000 12368000 12300000 22365000 13358000 9007400 23219000 12897000 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 2.4 0 5894200 453770 5440400 0 0 0 5894200 453770 5440400 0 0 0 + 1573 2867 True 2902 9393 12490 12490 259 817 Q86TG7 Q86TG7 5 5 5 Retrotransposon-derived protein PEG10 PEG10 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN Retrotransposon-derived protein PEG10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEG10 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 8.3 8.3 8.3 80.172 708 708 0 43.685 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9728 1.0029 5.5076 18 6 Leave out requantified 0.94427 0.96559 1.0125 0.97445 0.99987 1.0449 4.836 5.8084 2.3788 6 6 6 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.8 8.3 6.8 476080000 237100000 238980000 174320000 92036000 82289000 154400000 74488000 79917000 147350000 70574000 76777000 1574 2497;5219;8527;12448;15142 True;True;True;True;True 2529;5280;8629;12589;15334 8219;16994;16995;16996;27875;27876;27877;27878;27879;27880;40917;40918;40919;49653;49654;49655;49656;49657;49658 10967;22634;22635;22636;22637;22638;22639;22640;36883;36884;36885;36886;36887;36888;54067;54068;65582;65583;65584;65585;65586;65587;65588;65589 10967;22634;36883;54068;65588 Q86TU7 Q86TU7 9 9 9 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 SETD3 sp|Q86TU7|SETD3_HUMAN Actin-histidine N-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETD3 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 8 6 7 8 6 7 8 6 18 18 18 67.256 594 594 0 34.067 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95582 0.96545 32.089 25 13 Leave out requantified 1.0228 0.94891 1.0609 1.073 0.97958 1.0494 45.98 34.975 21.696 8 9 8 5 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.5 15.3 12.8 488330000 236660000 251670000 156650000 78904000 77745000 196530000 90161000 106370000 135150000 67596000 67557000 1575 3382;4573;14073;15002;15358;15950;16152;20652;20930 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3426;4627;14249;15193;15551;16151;16357;20892;21173 11090;11091;14961;14962;46232;49181;49182;49183;49184;50298;50299;52234;52235;52236;52237;52238;52889;52890;52891;52892;67393;67394;67395;67396;67397;68282;68283 14756;19965;60999;64924;64925;64926;64927;64928;64929;66449;68970;68971;68972;68973;68974;69866;69867;69868;69869;69870;89325;89326;89327;89328;89329;89330;90485;90486 14756;19965;60999;64927;66449;68973;69866;89326;90486 Q86U86 Q86U86 8 8 8 Protein polybromo-1 PBRM1 sp|Q86U86|PB1_HUMAN Protein polybromo-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PBRM1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 4 5 6 4 5 6 4 5 6 6.9 6.9 6.9 192.95 1689 1689 0 17.092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92239 0.91974 12.21 13 4 Leave out requantified 0.78394 0.81113 0.94412 0.83897 0.83224 0.93874 39.021 17.452 13.477 3 4 6 1 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 2.8 4 5.4 200100000 110240000 89864000 43731000 24128000 19603000 59865000 33667000 26198000 96506000 52443000 44063000 1576 2553;2598;3614;8570;13878;18709;19970;20966 True;True;True;True;True;True;True;True 2585;2632;3662;8672;14051;18934;20206;21209 8398;8530;8531;11840;11841;11842;28061;28062;45591;61108;61109;65278;65279;65280;68387 11211;11212;11382;15707;37105;37106;60116;80840;80841;86607;86608;86609;86610;86611;86612;90614 11211;11382;15707;37106;60116;80840;86609;90614 Q86UE4 Q86UE4 1 1 1 Protein LYRIC MTDH sp|Q86UE4|LYRIC_HUMAN Protein LYRIC OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTDH PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.2 2.2 2.2 63.836 582 582 0.0026374 2.5102 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 2.2 2.2 12247000 7154800 5092400 0 0 0 0 0 0 12247000 7154800 5092400 1577 17914 True 18131 58549;58550 77469;77470 77469 Q86UK7 Q86UK7 9 9 9 Zinc finger protein 598 ZNF598 sp|Q86UK7|ZN598_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase ZNF598 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF598 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 5 6 7 5 6 7 5 6 10.8 10.8 10.8 98.636 904 904 0 24.556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.111 1.1055 26.721 15 5 Leave out requantified 1.0983 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4503;4504;4505;4506;18937;18938;18939;18940;18941;18942;18943;19177;19178;30807;30808;30809;30810;38427;38428;38429;41698;41699;41700;41701;41702;48553;48554;48555;48556;48557;48558;52350;53334;57916;57917;57918;62185;63967;63968;63969;63970;63971;63972;64671;64672;79383;79384;79385;79386;80424;80425;88289;88290;88291;89460;89916;89917;89918 4505;18938;19178;30810;38428;41699;48554;52350;53334;57917;62185;63969;64672;79384;80424;88291;89460;89917 Q86UX6 Q86UX6 1 1 1 Serine/threonine-protein kinase 32C STK32C sp|Q86UX6|ST32C_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 32C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK32C PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.5 2.5 2.5 54.994 486 486 0.00048008 3.4559 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.5 0 0 5887700 2834800 3052900 5887700 2834800 3052900 0 0 0 0 0 0 1580 2275 True 2305 7535;7536 10067;10068 10067 Q86V21 Q86V21 3 3 3 Acetoacetyl-CoA synthetase AACS sp|Q86V21|AACS_HUMAN Acetoacetyl-CoA synthetase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AACS PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 1 2 0 1 2 0 1 2 5.4 5.4 5.4 75.143 672 672 0.00092678 3.0409 By MS/MS By MS/MS 1.1251 1.1691 95.6 3 1 Median NaN NaN 2.339 NaN NaN 2.4214 NaN NaN 102.97 0 1 2 0 0 1 Median Median Median 0 1.5 3.9 30967000 12044000 18923000 0 0 0 13034000 6987300 6046700 17933000 5057100 12876000 1581 1722;2794;20353 True;True;True 1743;2829;20592 5769;9166;9167;66488 7779;12182;12183;88157 7779;12182;88157 Q86V48 Q86V48 5 5 5 Leucine zipper protein 1 LUZP1 sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 2 4 4 2 4 4 2 4 7 7 7 120.27 1076 1076 0 11.84 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84725 0.89635 23.767 9 3 Leave out requantified 0.79754 0.92152 1.0338 0.82945 0.97142 1.0522 32.126 11.375 26.715 3 2 4 1 1 1 Median Median Leave out requantified 5.3 2.4 5.8 131670000 68997000 62672000 38059000 19299000 18761000 33643000 17638000 16005000 59966000 32060000 27906000 1582 1489;4663;9353;11546;18377 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Q86W42 7 7 7 THO complex subunit 6 homolog THOC6 sp|Q86W42|THOC6_HUMAN THO complex subunit 6 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THOC6 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 4 5 5 4 5 5 4 5 28.4 28.4 28.4 37.535 341 341 0 18.173 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96927 0.9686 9.9742 12 6 Leave out requantified 0.96927 0.97932 1.1611 0.95758 1.0385 1.1815 12.318 15.875 64.972 4 3 5 1 1 4 Leave out requantified Median Median 18.5 14.4 21.4 180060000 80939000 99122000 65399000 32705000 32694000 42565000 17871000 24694000 72097000 30363000 41734000 1587 1432;1796;1857;5604;8353;16730;19679 True;True;True;True;True;True;True 1449;1818;1879;5669;8449;16941;19912 4769;6014;6015;6016;6186;18190;18191;18192;18193;27179;27180;27181;54725;64363;64364 6440;8092;8093;8318;24203;24204;24205;24206;24207;36053;36054;36055;72238;85369;85370 6440;8092;8318;24204;36054;72238;85370 Q86W56 Q86W56 2 2 2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase PARG sp|Q86W56|PARG_HUMAN Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARG PE=1 SV=1 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 294;2098;5155;5838;6292;6675;9328;9424;11113;14149;17566;17726;18989 1004;1005;1006;6898;6899;6900;16614;16615;16616;18684;18685;18686;20066;20067;21300;30279;30280;30570;30571;36294;36295;36296;36297;36298;45892;45893;45894;56636;56637;56638;57151;57152;57153;61279;61280 1386;1387;1388;9257;9258;9259;22117;22118;22119;24859;24860;24861;26664;28381;40176;40177;40178;40552;40553;48081;48082;48083;48084;60518;60519;74833;74834;74835;74836;75510;75511;75512;75513;75514;81069;81070;81071 1387;9259;22119;24860;26664;28381;40178;40553;48081;60519;74835;75511;81070 Q86XP3 Q86XP3 27 27 27 ATP-dependent RNA helicase DDX42 DDX42 sp|Q86XP3|DDX42_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX42 PE=1 SV=1 1 27 27 27 26 25 25 26 25 25 26 25 25 40 40 40 102.97 938 938 0 156.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98813 0.99363 15.247 95 21 Leave out requantified 1.0036 0.92813 0.99623 1.0233 0.94131 0.99776 21.667 14.697 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assembly factor 5, axonemal DNAAF5 sp|Q86Y56|DAAF5_HUMAN Dynein assembly factor 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAAF5 PE=1 SV=4 1 11 11 11 6 9 10 6 9 10 6 9 10 15 15 15 93.52 855 855 0 34.655 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0928 1.1057 19.993 22 2 Leave out requantified 0.98028 1.1433 1.0656 1.0208 1.151 1.0409 23.435 19.76 21.025 5 8 9 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.8 12.5 13.8 495660000 244220000 251440000 114290000 59737000 54557000 173850000 84768000 89083000 207510000 99712000 107800000 1595 228;795;883;1587;2081;2182;10726;11743;11754;15565;17320 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 229;804;893;1606;2107;2211;10857;11880;11891;15763;17533 786;787;788;789;790;2712;2713;3006;3007;3008;5302;5303;5304;6928;7254;7255;35521;38779;38780;38781;38805;38806;38807;51028;51029;51030;56529 1071;1072;1073;1074;1075;3663;3664;3665;4065;4066;4067;4068;4069;7142;7143;7144;7145;7146;9297;9712;9713;47100;51270;51271;51272;51273;51303;67343;74706 1074;3665;4068;7142;9297;9713;47100;51271;51303;67343;74706 Q86Y79 Q86Y79 1 1 1 Probable peptidyl-tRNA hydrolase PTRH1 sp|Q86Y79|PTH_HUMAN Probable peptidyl-tRNA hydrolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTRH1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.7 4.7 4.7 22.936 214 214 0.00047893 3.4248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0852 1.0901 128.68 4 1 Median NaN NaN 3.9492 NaN NaN 3.9832 NaN NaN 178.63 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 4.7 4.7 4.7 58101000 19149000 38951000 9451000 5276700 4174300 12078000 6461700 5616000 36572000 7410900 29161000 1596 1585 True 1604 5295;5296;5297;5298 7134;7135;7136;7137;7138 7135 Q86YP4 Q86YP4 7 6 6 Transcriptional repressor p66-alpha GATAD2A sp|Q86YP4|P66A_HUMAN Transcriptional repressor p66-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD2A PE=1 SV=1 1 7 6 6 6 4 4 5 3 3 5 3 3 19.3 17.5 17.5 68.062 633 633 0 14.859 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0528 1.0916 27.795 10 7 Median 1.0392 0.85873 1.1658 1.0639 0.88777 1.1681 27.28 32.858 32.618 5 2 3 4 0 3 Median Median Median 17.1 8.2 8.2 115410000 54648000 60765000 54950000 26328000 28622000 24938000 13346000 11592000 35524000 14974000 20550000 1597 1089;3939;7421;7918;7930;11787;20144 False;True;True;True;True;True;True 1101;3990;7511;8010;8022;11924;20380 3663;3664;3665;12911;24000;24001;25579;25614;38902;38903;38904;65847;65848;65849;65850 4933;4934;4935;4936;4937;4938;17168;17169;31995;31996;34136;34184;51429;51430;51431;51432;87331;87332;87333;87334;87335 4938;17168;31996;34136;34184;51430;87333 Q8IUD2;O15083 Q8IUD2 10;1 10;1 10;1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 ERC1 sp|Q8IUD2|RB6I2_HUMAN ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERC1 PE=1 SV=1 2 10 10 10 6 8 5 6 8 5 6 8 5 11 11 11 128.08 1116 1116;957 0 40.623 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87813 0.93703 43.699 18 5 Leave out requantified 0.87827 0.87538 0.7276 0.949 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NaN 83.288 65.193 0 2 2 0 1 1 Median Median Median 0 6.5 6.5 64743000 20936000 43807000 0 0 0 33083000 9204600 23879000 31660000 11731000 19929000 1599 851;2451 True;True 861;2482 2902;2903;8072;8073 3928;3929;10763;10764 3928;10764 Q8IV48 Q8IV48 4 4 4 3-5 exoribonuclease 1 ERI1 sp|Q8IV48|ERI1_HUMAN 3-5 exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 12.3 12.3 12.3 40.063 349 349 0 37.775 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8492 0.86567 6.2366 13 3 Leave out requantified 0.85139 0.85318 0.87269 0.87828 0.86104 0.89356 7.5162 8.7806 19.687 5 4 4 2 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.3 12.3 12.3 443640000 233330000 210310000 176240000 93368000 82868000 137600000 70518000 67079000 129810000 69443000 60366000 1600 319;6080;6173;13072 True;True;True;True 321;6152;6247;13225 1094;1095;1096;19655;19656;19657;19658;19914;19915;19916;42926;42927;42928 1505;1506;1507;1508;1509;1510;26146;26147;26148;26149;26150;26151;26470;26471;26472;56685;56686;56687;56688;56689;56690 1506;26151;26471;56688 Q8IVF2 Q8IVF2 14 12 12 Protein AHNAK2 AHNAK2 sp|Q8IVF2|AHNK2_HUMAN Protein AHNAK2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHNAK2 PE=1 SV=2 1 14 12 12 12 10 9 10 8 8 10 8 8 12.7 12 12 616.62 5795 5795 0 33.759 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0598 1.0975 17.87 19 2 Leave out requantified 1.0598 1.0296 0.99383 1.0975 1.067 1.0436 15.377 23.078 11.211 6 6 7 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.4 10.3 9.8 665000000 330090000 334900000 190140000 90573000 99564000 170880000 86862000 84020000 303980000 152660000 151320000 1601 7598;7648;10884;10885;10886;11606;12202;13124;13191;16228;17767;17982;18445;19011 False;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7689;7739;11015;11016;11017;11742;12343;13280;13350;16434;17984;18200;18667;19238 24559;24560;24561;24738;24739;36003;36004;36005;36006;36007;36008;36009;38341;38342;38343;40183;43091;43092;43093;43300;53126;53127;53128;57941;58759;58760;60203;60204;62164;62165;62166 32759;32760;32761;32762;32763;33003;33004;33005;47706;47707;47708;47709;47710;47711;47712;47713;50746;53110;56898;56899;56900;57156;70167;76590;77723;77724;79618;79619;82343;82344;82345 32759;33005;47708;47711;47713;50746;53110;56898;57156;70167;76590;77724;79619;82345 Q8IVS2 Q8IVS2 2 2 2 Malonyl-CoA-acyl carrier protein transacylase, mitochondrial MCAT sp|Q8IVS2|FABD_HUMAN Malonyl-CoA-acyl carrier protein transacylase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCAT PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 5.9 5.9 5.9 42.961 390 390 0.0005277 4.8716 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 3.6 2.3 0 57619000 40097000 17523000 0 0 0 57619000 40097000 17523000 0 0 0 1602 6256;11878 True;True 6333;12016 20190;39170 26833;51756 26833;51756 Q8IWS0 Q8IWS0 10 10 10 PHD finger protein 6 PHF6 sp|Q8IWS0|PHF6_HUMAN PHD finger protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF6 PE=1 SV=1 1 10 10 10 9 10 10 9 10 10 9 10 10 36.7 36.7 36.7 41.29 365 365 0 138.88 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95941 0.98567 7.5507 49 7 Leave out requantified 1.0147 0.89281 0.96532 1.0305 0.91206 1.0037 7.4965 20.516 12.027 16 16 17 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.8 36.7 36.7 2465700000 1305600000 1160000000 897170000 477630000 419530000 784180000 423690000 360480000 784320000 404290000 380030000 1603 385;1999;2218;2850;7327;11860;17120;18604;18702;18703 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 387;2025;2247;2885;7417;11997;17332;18828;18927;18928 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FTSJ3 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA processing protein FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 PE=1 SV=2 1 15 15 15 10 11 11 10 11 11 10 11 11 26.8 26.8 26.8 96.557 847 847 0 123.65 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.048 1.0937 17.294 46 26 Leave out requantified 1.1114 0.8852 1.0793 1.1835 0.95177 1.0992 12.164 13.689 13.549 14 16 16 7 9 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.4 21.1 22.3 1240900000 606830000 634080000 382240000 173720000 208510000 468430000 242780000 225650000 390240000 190330000 199910000 1611 144;357;399;1367;1468;7868;9211;10452;12461;15036;15090;15776;17576;18649;21124 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 145;359;402;1383;1485;7960;9319;10578;12603;15228;15282;15976;17789;18874;21370 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By MS/MS By MS/MS 0.94308 0.97215 10.984 29 6 Leave out requantified 0.99344 0.88557 0.95747 1.0137 0.90442 1.0222 13.674 11.539 7.2626 10 10 9 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.3 7.3 8.5 1542400000 778060000 764340000 530010000 251860000 278150000 536720000 284260000 252460000 475670000 241940000 233730000 1612 1671;5130;9989;12800;17234;19460;19796;19853 True;True;True;True;True;True;True;True 1691;5191;10113;12945;17446;19691;20032;20089 5593;16718;16719;16720;32902;32903;32904;32905;32906;32907;32908;42030;42031;42032;56245;56246;63638;63639;63640;63641;63642;63643;64741;64742;64743;64744;64745;64929;64930;64931;64932;64933;64934 7538;22240;22241;22242;22243;22244;22245;43698;43699;43700;43701;43702;43703;43704;43705;55512;55513;55514;55515;55516;55517;74307;84395;84396;84397;84398;84399;84400;84401;84402;85869;85870;85871;85872;85873;86148;86149;86150;86151;86152;86153;86154;86155;86156;86157 7538;22241;43703;55515;74307;84395;85873;86155 Q8IYI6 Q8IYI6 2 2 2 Exocyst complex component 8 EXOC8 sp|Q8IYI6|EXOC8_HUMAN Exocyst complex component 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC8 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 2.5 2.5 2.5 81.798 725 725 0.0026432 2.5361 By MS/MS By MS/MS 0.91068 0.91291 10.685 3 1 Median NaN NaN 0.80822 NaN NaN 0.84895 NaN NaN 10.273 0 1 2 0 1 0 Median Median Median 0 1.1 2.5 36584000 16638000 19946000 0 0 0 13762000 5937400 7824900 22821000 10700000 12121000 1613 5864;11729 True;True 5934;11865 19007;38733;38734 25297;51210;51211 25297;51210 Q8IYL3 Q8IYL3 1 1 1 UPF0688 protein C1orf174 C1orf174 sp|Q8IYL3|CA174_HUMAN UPF0688 protein C1orf174 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C1orf174 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.8 5.8 5.8 25.977 243 243 0.0026467 2.5472 By MS/MS By matching By matching 1.0322 1.0798 8.8155 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.8 5.8 5.8 29387000 14724000 14663000 9876900 5532100 4344800 10024000 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MS/MS By MS/MS 1.4834 1.5143 9.116 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 1.7 1.7 18743000 10059000 8683600 0 0 0 8072200 3641400 4430800 10671000 6417800 4252700 1621 2779 True 2814 9120;9121 12132;12133 12133 Q8N0X7 Q8N0X7 6 6 6 Spartin SPG20 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN Spartin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPART PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 5 5 4 5 5 4 5 5 11.6 11.6 11.6 72.832 666 666 0 18.197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88258 0.94728 25.224 13 1 Leave out requantified 0.88979 1.3001 0.86073 0.93375 1.3471 0.90755 25.349 27.181 14.272 4 5 4 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.3 10.5 9.8 285100000 142670000 142430000 101540000 51939000 49602000 98460000 45854000 52605000 85100000 44872000 40227000 1622 524;5077;7345;9505;18326;20051 True;True;True;True;True;True 527;5138;7435;9621;18548;20287 1794;16576;16577;23749;23750;31204;31205;31206;59861;59862;59863;65537;65538;65539 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protein GPD1L sp|Q8N335|GPD1L_HUMAN Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPD1L PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5.4 5.4 5.4 38.418 351 351 0 5.4904 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0462 1.0977 27.876 6 0 Leave out requantified 1.045 1.0462 1.031 1.1138 1.0796 1.0884 25.805 25.534 37.857 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 5.4 5.4 5.4 213810000 103900000 109910000 79622000 39204000 40418000 62519000 31097000 31423000 71671000 33599000 38072000 1632 5789;7218 True;True 5854;7307 18727;18728;18729;23353;23354;23355 24916;24917;24918;24919;31117;31118;31119;31120 24916;31117 Q8N392 Q8N392 4 4 4 Rho GTPase-activating protein 18 ARHGAP18 sp|Q8N392|RHG18_HUMAN Rho GTPase-activating protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP18 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 7.1 7.1 7.1 74.976 663 663 0 10.442 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0506 1.0772 50.116 6 3 Median 1.0048 NaN 1.2792 1.0284 NaN 1.3458 72.591 NaN 28.376 3 1 2 2 0 1 Median Median Median 5.1 3.8 5.7 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25342;68353;68354;82463 25342;68354;82463 Q8N543 Q8N543 2 2 2 Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1 OGFOD1 sp|Q8N543|OGFD1_HUMAN Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OGFOD1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.4 4.4 4.4 63.245 542 542 0.00053362 5.0556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0722 1.0957 18.701 6 0 Leave out requantified 1.0636 1.0349 1.1278 1.0745 1.0538 1.1254 21.458 13.18 17.054 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 4.4 4.4 4.4 77425000 35947000 41478000 24968000 10688000 14280000 25249000 12707000 12542000 27208000 12552000 14655000 1638 9238;20654 True;True 9346;20894 30341;30342;30343;67401;67402;67403 40268;89337;89338;89339 40268;89338 Q8N567 Q8N567 1 1 1 Zinc finger CCHC domain-containing protein 9 ZCCHC9 sp|Q8N567|ZCHC9_HUMAN Zinc finger CCHC domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZCCHC9 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4.4 4.4 4.4 30.477 271 271 0.00093897 3.1737 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 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Deubiquitinase OTUD6B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OTUD6B PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 5 5 5 5 5 5 5 5 24.9 24.9 24.9 33.812 293 293 0 14.491 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92612 0.92156 42.76 15 2 Leave out requantified 0.97471 0.88431 0.84748 0.99996 0.89212 0.85311 7.1106 11.229 50.113 5 6 4 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.1 18.1 16.7 622540000 321750000 300790000 201820000 93191000 108630000 223900000 122750000 101150000 196830000 105820000 91010000 1646 724;2392;8172;8591;10579;12634;14730 True;True;True;True;True;True;True 731;2422;8265;8693;10706;12778;14917 2471;2472;7902;26372;26373;28128;28129;28130;28131;28132;28133;34995;34996;34997;41540;48316;48317;48318;48319 3329;3330;10563;35107;35108;37186;37187;37188;37189;37190;37191;37192;37193;37194;37195;46386;46387;54915;63754;63755;63756;63757 3329;10563;35107;37192;46387;54915;63757 Q8N6R0 Q8N6R0 11 11 11 Methyltransferase-like protein 13 METTL13 sp|Q8N6R0|EFNMT_HUMAN eEF1A lysine and N-terminal methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1AKNMT PE=1 SV=1 1 11 11 11 7 9 9 7 9 9 7 9 9 24 24 24 78.767 699 699 0 43.154 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92701 0.94005 30.286 29 13 Leave out requantified 0.90379 0.90095 1.0412 0.93378 0.93576 1.091 14.505 33.841 22.808 9 10 10 6 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.9 20 20.3 776590000 400290000 376300000 229830000 117150000 112680000 273680000 142620000 131060000 273070000 140510000 132560000 1647 1731;3178;3443;6365;7897;8084;8829;10633;15133;18624;21133 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1752;3219;3488;6443;7989;8177;8932;10760;15325;18848;21379 5799;5800;10471;11270;11271;20537;25525;25526;25527;26092;26093;26094;26095;28899;28900;28901;35184;35185;35186;35187;35188;35189;35190;35191;49623;49624;49625;60834;60835;60836;68878;68879 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3130;3131;3132;3133;3134;3135;3136;18846;18847;18848;18849;18850;18851;26152;26153;26154;26155;26156;34880;37925;37926;37927;37928;37929;37930;37931;37932;45381;50716;50717;50718;50719;50720;50721;65243;65244;65245;65246;65247;65248;65249;65250;70509;70510;70511;70512;70513;70514;70515;76122;76123;76124;87336;87337;87338;87339;87340;87341;87342;87343;89096;89097;89098;89099;89100;89101;89102;89687;89688 3134;18851;26152;34880;37927;45381;50718;65244;65249;70509;76123;87341;89097;89687 Q8N8S7 Q8N8S7 5 5 5 Protein enabled homolog ENAH sp|Q8N8S7|ENAH_HUMAN Protein enabled homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENAH PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 9 9 9 66.509 591 591 0 18.007 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84934 0.89751 7.3781 20 12 Leave out requantified 0.84934 0.84313 0.89245 0.89751 0.90992 1.025 6.5595 32.568 28.472 8 6 6 5 4 3 Leave out requantified Median Median 9 5.4 5.4 395610000 184960000 210650000 203600000 85003000 118600000 73925000 37992000 35933000 118080000 61965000 56119000 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-regulatory protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JMY PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.3 3.3 3.3 111.44 988 988 0.00049975 4.0214 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.9 0 1.4 14405000 10178000 4226700 14405000 10178000 4226700 0 0 0 0 0 0 1653 5276;15710 True;True 5337;15909 17186;51487 22875;67923 22875;67923 Q8N9N2 Q8N9N2 1 1 1 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 ASCC1 sp|Q8N9N2|ASCC1_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4 4 4 45.509 400 400 0.0067912 2.1042 By MS/MS By MS/MS 0.97896 1.0373 2.6925 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 4 4 22402000 11521000 10880000 0 0 0 9655400 5400900 4254500 12746000 6120600 6625800 1654 2186 True 2215 7268;7269 9732;9733 9733 Q8N9N5 Q8N9N5 2 2 2 Protein BANP BANP sp|Q8N9N5|BANP_HUMAN Protein BANP OS=Homo sapiens OX=9606 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4032;4033;4034;9450;9451;9452;9453;19227;19228;19229;19230;19895;19896;19897;19898;19899;19900;19901;19902;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482;33763;33764;33765;33766;34509;34510;34511;34512;35485;36417;39864;39865;39866;39867;73765;83503;84563 4033;9450;19230;19895;19900;28479;33764;34510;35485;36417;39865;73765;83503;84563 Q8NBJ5 Q8NBJ5 1 1 1 Procollagen galactosyltransferase 1 COLGALT1 sp|Q8NBJ5|GT251_HUMAN Procollagen galactosyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COLGALT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.4 2.4 2.4 71.635 622 622 0.0030581 2.4474 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.4 0 0 12218000 6449600 5768100 12218000 6449600 5768100 0 0 0 0 0 0 1660 13303 True 13464 43641 57598 57598 Q8NBJ7 Q8NBJ7 4 4 4 Sulfatase-modifying factor 2 SUMF2 sp|Q8NBJ7|SUMF2_HUMAN Inactive C-alpha-formylglycine-generating enzyme 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUMF2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 17.3 17.3 17.3 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True 11766 38429;38430;38431;38432 50849;50850;50851;50852 50850 Q8NC51 Q8NC51 15 15 15 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein SERBP1 sp|Q8NC51|PAIRB_HUMAN Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERBP1 PE=1 SV=2 1 15 15 15 15 13 13 15 13 13 15 13 13 38.2 38.2 38.2 44.965 408 408 0 181.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91588 0.94877 19.174 69 15 Leave out requantified 0.84231 1.0219 0.99227 0.86938 1.0689 1.0389 15.644 13.261 17.858 26 21 22 8 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.2 35.8 35.8 3989900000 2088800000 1901100000 1480700000 848050000 632690000 1123900000 577500000 546370000 1385300000 663200000 722070000 1663 2498;3813;4217;4218;5036;5836;5884;7146;10270;15437;15540;15635;15891;16350;16900 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2530;3863;4270;4271;5097;5904;5954;7235;10395;15631;15738;15833;16091;16558;17111 8220;12491;12492;12493;13841;13842;13843;13844;13845;13846;13847;13848;13849;16476;16477;16478;18902;18903;18904;18905;18906;18907;19061;19062;19063;19064;19065;23089;23090;23091;23092;33927;33928;33929;50554;50555;50556;50557;50558;50559;50952;50953;50954;50955;50956;50957;51245;51246;51247;51248;51249;51250;52055;52056;52057;52058;52059;52060;52061;52062;52063;53525;53526;55205;55206;55207;55208;55209;55210 10968;16599;16600;18448;18449;18450;18451;18452;18453;18454;18455;18456;21952;21953;21954;21955;21956;25153;25154;25155;25156;25157;25158;25159;25160;25161;25162;25163;25364;25365;25366;25367;25368;25369;30791;30792;30793;45032;45033;45034;45035;45036;66804;66805;66806;66807;66808;67257;67258;67259;67260;67261;67262;67263;67264;67265;67598;67599;67600;67601;67602;67603;67604;67605;67606;67607;67608;68718;68719;68720;68721;68722;68723;68724;68725;68726;68727;68728;68729;68730;68731;70682;70683;72863;72864;72865;72866;72867;72868;72869;72870 10968;16600;18451;18455;21955;25161;25366;30792;45035;66805;67259;67606;68720;70682;72869 Q8NCA5 Q8NCA5 4 4 4 Protein FAM98A FAM98A sp|Q8NCA5|FA98A_HUMAN Protein FAM98A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM98A PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 11.8 11.8 11.8 55.4 519 519 0 24.492 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96276 0.98292 13.356 10 5 Leave out requantified 0.89314 1.0242 0.9478 0.90528 1.0289 0.96811 35.285 8.6159 40.056 5 3 2 4 1 0 Median Plateau Median 11.8 8.9 8.9 287060000 150580000 136480000 136250000 77690000 58557000 83749000 42326000 41423000 67065000 30561000 36504000 1664 7140;8788;9905;18471 True;True;True;True 7229;8890;10026;18695 23064;23065;23066;23067;28743;28744;28745;28746;28747;32581;60320;60321;60322 30759;30760;30761;30762;38041;38042;38043;38044;38045;43297;79764;79765;79766;79767;79768 30761;38045;43297;79764 Q8NCE0 Q8NCE0 2 2 2 tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2 TSEN2 sp|Q8NCE0|SEN2_HUMAN tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSEN2 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damage-inducible proteins-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GADD45GIP1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 25.384 222 222 0.0022523 2.7394 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.1589 0.16309 118.4 5 5 Median 0.42897 NaN 0.4509 0.44644 NaN 0.47487 142.42 NaN 157.83 2 1 2 2 1 2 Median Median Median 4.5 4.5 4.5 74518000 46417000 28102000 30416000 16084000 14332000 12480000 11707000 773310 31622000 18626000 12997000 1680 6321 True 6398 20391;20392;20393;20394;20395;20396 27138;27139;27140;27141;27142;27143 27140 Q8TAQ2 Q8TAQ2 28 28 21 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 SMARCC2 sp|Q8TAQ2|SMRC2_HUMAN SWI/SNF complex subunit SMARCC2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCC2 PE=1 SV=1 1 28 28 21 21 23 22 21 23 22 15 18 17 28.9 28.9 23 132.88 1214 1214 0 120.29 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0221 1.0444 13.847 77 32 Leave out requantified 0.99496 0.93676 1.0496 1.0349 0.98979 1.054 11.891 19.815 13.387 25 26 26 10 12 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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transmission fidelity protein 18 homolog CHTF18 sp|Q8WVB6|CTF18_HUMAN Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHTF18 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 4 4 6 4 4 6 4 4 10.9 10.9 10.9 107.38 975 975 0 24.755 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84951 0.90906 18.574 15 8 Leave out requantified 0.80999 0.79859 0.86826 0.84338 0.84846 0.90906 17.666 37.12 22.677 6 4 5 4 2 2 Median Median Leave out requantified 10.9 5.8 6.7 165330000 89734000 75599000 63500000 30806000 32694000 52481000 27786000 24695000 49352000 31141000 18211000 1706 308;6748;9680;10049;19271;19584 True;True;True;True;True;True 309;6831;9798;10173;19501;19816 1048;1049;1050;21771;21772;21773;21774;31810;31811;33144;33145;33146;63014;64050;64051;64052 1443;1444;29056;29057;29058;29059;42253;42254;43985;83565;84931;84932;84933 1443;29058;42253;43985;83565;84931 Q8WVJ2 Q8WVJ2 1 1 1 NudC domain-containing protein 2 NUDCD2 sp|Q8WVJ2|NUDC2_HUMAN NudC domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD2 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51772;63823 Q8WVV9 Q8WVV9 8 7 7 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like HNRNPLL sp|Q8WVV9|HNRLL_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPLL PE=1 SV=1 1 8 7 7 5 6 7 4 5 6 4 5 6 20.3 19 19 60.082 542 542 0 19.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0752 1.0794 25.587 14 3 Leave out requantified 1.0951 1.0752 0.92289 1.156 1.0794 0.96778 49.244 27.975 29.709 4 5 5 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.5 15.5 17.3 226420000 109270000 117150000 72854000 34770000 38085000 81700000 41177000 40523000 71861000 33321000 38540000 1709 1831;7350;8182;9710;11997;14338;14680;16051 True;True;True;True;False;True;True;True 1853;7440;8275;9829;12138;14520;14866;16252 6115;23769;26404;31919;31920;31921;39572;39573;39574;47103;47104;47105;48143;48144;48145;52535;52536;52537 8223;31695;35138;42418;42419;42420;52286;52287;52288;62179;62180;62181;62182;63529;63530;69364;69365;69366 8223;31695;35138;42419;52286;62180;63529;69366 Q8WVY7 Q8WVY7 7 7 7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 UBLCP1 sp|Q8WVY7|UBCP1_HUMAN Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBLCP1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 6 7 5 6 7 5 6 7 21.4 21.4 21.4 36.804 318 318 0 18.961 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94779 0.9652 17.443 18 2 Leave out requantified 1.0056 0.90784 0.90083 1.0261 0.92264 0.93055 9.7306 11.114 25.773 5 6 7 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.2 18.6 21.4 1270600000 608880000 661710000 409200000 195070000 214140000 385600000 191820000 193780000 475790000 221990000 253800000 1710 4791;6381;7415;9365;10711;14110;18108 True;True;True;True;True;True;True 4849;6459;7505;9479;10842;14289;18329 15737;15738;15739;20581;20582;20583;23980;23981;23982;23983;30748;30749;30750;35480;35481;35482;46383;46384;46385;59167 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chromatin subfamily D member 2 SMARCD2 sp|Q92925|SMRD2_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCD2 PE=1 SV=3 2 6 5 5 3 4 5 3 3 4 3 3 4 13.2 10 10 58.92 531 531;483 0 12.401 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89596 0.89816 14.507 11 3 Leave out requantified 1.0087 0.87651 0.94447 1.0669 0.921 0.97626 26.586 13.672 25.058 4 2 5 1 0 2 Median Median Median 8.3 10.9 11.7 174780000 88277000 86500000 49784000 25794000 23990000 26879000 10406000 16474000 98114000 52078000 46036000 1756 389;4942;9132;9133;12908;15592 True;False;True;True;True;True 391;5001;9239;9240;13057;15790 1326;1327;1328;1329;1330;1331;1332;16188;16189;29950;29951;29952;29953;29954;29955;42387;51112;51113 1796;1797;1798;1799;1800;1801;1802;1803;1804;1805;21553;39708;39709;39710;39711;39712;39713;56019;67436 1799;21553;39712;39713;56019;67436 Q92945 Q92945 9 7 7 Far upstream element-binding protein 2 KHSRP sp|Q92945|FUBP2_HUMAN Far upstream element-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHSRP PE=1 SV=4 1 9 7 7 8 7 8 6 6 6 6 6 6 19.4 16.5 16.5 73.114 711 711 0 40.303 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97404 1.0052 14.38 18 4 Leave out requantified 0.96509 0.89684 0.94563 0.99991 0.91026 0.98198 13.557 20.172 22.275 6 6 6 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.3 13.2 15.2 510540000 247180000 263360000 188420000 86460000 101960000 158790000 77971000 80824000 163320000 82744000 80580000 1757 634;1853;7087;8957;9096;13007;14809;17236;19929 False;False;True;True;True;True;True;True;True 640;1875;7175;9061;9202;13158;14998;17448;20165 2175;2176;2177;6174;6175;22885;29315;29316;29317;29819;29820;29821;42725;42726;42727;48584;48585;48586;56250;56251;56252;65151;65152;65153;65154;65155 2951;2952;2953;2954;8305;8306;30499;38827;38828;38829;38830;39549;39550;39551;39552;56433;56434;56435;64094;64095;64096;64097;64098;74313;74314;74315;74316;74317;74318;74319;86440;86441;86442;86443;86444;86445 2952;8306;30499;38829;39549;56433;64095;74317;86441 Q92947 Q92947 1 1 1 Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial GCDH sp|Q92947|GCDH_HUMAN Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GCDH PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 48.127 438 438 0.0083264 1.977 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62429 0.65118 17.312 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.3 2.3 2.3 22399000 10408000 11991000 0 0 0 11898000 5541900 6356400 10501000 4866300 5634800 1758 152 True 153 517;518;519 709;710;711;712 710 Q92973;O14787 Q92973 9;2 9;2 9;2 Transportin-1 TNPO1 sp|Q92973|TNPO1_HUMAN Transportin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNPO1 PE=1 SV=2 2 9 9 9 7 6 8 7 6 8 7 6 8 14.8 14.8 14.8 102.35 898 898;897 0 64.551 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9118 0.95867 18.353 21 5 Leave out requantified 0.9409 1.0846 0.76056 0.98441 1.083 0.77269 11.354 8.6985 20.953 7 6 8 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.5 9.4 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26.72 244 244 0 28.816 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1287 1.1578 18.881 19 12 Leave out requantified 1.3114 1.1981 1.1068 1.34 1.2568 1.0985 42.876 21.512 17.232 6 7 6 5 4 3 Median Leave out requantified Leave out requantified 32.4 42.2 30.7 688440000 256080000 432360000 265980000 101970000 164010000 231560000 77156000 154400000 190900000 76959000 113940000 1761 3233;4944;13276;14186;18693;19292;20071 True;True;True;True;True;True;True 3275;5003;13436;14366;18918;19522;20307 10640;10641;10642;16193;16194;43549;43550;43551;43552;46633;46634;46635;46636;46637;61049;61050;61051;63074;63075;63076;65605;65606 14158;14159;14160;21557;21558;21559;57482;57483;57484;57485;57486;57487;61559;61560;61561;61562;61563;61564;61565;61566;80740;80741;80742;83652;83653;83654;87010;87011 14158;21557;57482;61561;80741;83653;87011 Q92989 Q92989 1 1 1 Polyribonucleotide 5-hydroxyl-kinase Clp1 CLP1 sp|Q92989|CLP1_HUMAN Polyribonucleotide 5-hydroxyl-kinase Clp1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLP1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 5.4 5.4 5.4 47.645 425 425 0.0039079 2.3571 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 5.4 0 11717000 7562700 4154800 0 0 0 11717000 7562700 4154800 0 0 0 1762 19213 True 19443 62828 83293;83294 83293 Q93008 Q93008 2 2 2 Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X USP9X sp|Q93008|USP9X_HUMAN Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP9X PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 1.2 1.2 1.2 292.28 2570 2570 0 5.9435 By MS/MS 1.1578 1.2001 53.502 2 0 Median 1.1578 NaN NaN 1.2001 NaN NaN 53.502 NaN NaN 2 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.2 0 0 19621000 9303000 10318000 19621000 9303000 10318000 0 0 0 0 0 0 1763 2461;4731 True;True 2492;4787 8113;15526 10818;20684 10818;20684 Q93009 Q93009 23 23 23 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 USP7 sp|Q93009|UBP7_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP7 PE=1 SV=2 1 23 23 23 19 19 21 19 19 21 19 19 21 26.9 26.9 26.9 128.3 1102 1102 0 103.73 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9218 0.95541 30.046 67 25 Leave out requantified 1.0132 0.88445 0.93604 1.0277 0.94446 0.98935 25.994 37.084 35.664 23 21 23 9 8 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.7 22.9 24.2 2461100000 1270100000 1190900000 823320000 425090000 398230000 766840000 395560000 371280000 870910000 449490000 421420000 1764 1846;2452;3020;3023;4091;4114;5826;6243;6584;7860;8460;8811;9077;9471;9519;11608;11992;12328;12329;13109;16521;17896;19004 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1868;2483;3056;3059;4144;4167;5893;6319;6666;7952;8560;8913;9183;9587;9635;11744;12133;12469;12470;13265;16729;18113;19231 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2951;2952;2953;2954;8305;8306;9604;9605;9606;21865;21866;21867;21868;34117;38831;38832;38833;41348;41349;41350;41351;41386;41387;41388;41389;41390;50630;50631;50632;57425;67326;67327;67328;67329;67330;67331;67332;67333;67334;68107;68108;68109;68110 2952;8306;9606;21865;34117;38831;41348;41390;50632;57425;67326;68110 Q96AG4 Q96AG4 2 2 2 Leucine-rich repeat-containing protein 59 LRRC59 sp|Q96AG4|LRC59_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 59 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC59 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 9.4 9.4 9.4 34.93 307 307 0 5.8071 By MS/MS By MS/MS 0.91462 0.9558 54.304 3 2 Median 1.1161 NaN NaN 1.1826 NaN NaN 74.803 NaN NaN 2 1 0 2 0 0 Median Median Median 9.4 4.2 0 66196000 27374000 38822000 48119000 18581000 29538000 18077000 8793300 9284000 0 0 0 1777 12539;12636 True;True 12682;12780 41211;41544;41545 54462;54917;54918 54462;54918 Q96AX1 Q96AX1 3 3 3 Vacuolar protein sorting-associated protein 33A VPS33A sp|Q96AX1|VP33A_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS33A PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 2 3 0 2 3 0 2 3 5.7 5.7 5.7 67.61 596 596 0 7.5074 By MS/MS By MS/MS 1.2595 1.3123 29.688 3 0 Median NaN NaN 1.2847 NaN NaN 1.3159 NaN NaN 41.985 0 1 2 0 0 0 Median Median Median 0 4.5 5.7 410550000 182670000 227880000 0 0 0 29543000 9868300 19675000 381010000 172800000 208210000 1778 2963;3994;16234 True;True;True 2998;4046;16440 9712;9713;13093;13094;53146 12900;12901;17426;17427;17428;70194 12900;17426;70194 Q96B26 Q96B26 3 3 3 Exosome complex component RRP43 EXOSC8 sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN Exosome complex component RRP43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC8 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 14.1 14.1 14.1 30.039 276 276 0 6.5526 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82113 0.84672 23.917 6 2 Leave out requantified 0.74267 0.92481 0.88707 0.77119 0.93874 0.90754 10.702 15.025 14.108 2 2 2 0 1 1 Median Median Median 7.2 7.2 14.1 123560000 70066000 53493000 49219000 29847000 19372000 37735000 20274000 17460000 36605000 19945000 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12827;12828;12829;12830;12831;22246;45982;45993;45994;45995;45996 12827;22246;45982;45993 Q96E11 Q96E11 7 7 7 Ribosome-recycling factor, mitochondrial MRRF sp|Q96E11|RRFM_HUMAN Ribosome-recycling factor, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRRF PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 7 26.7 26.7 26.7 29.277 262 262 0 40.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93275 0.96201 20.159 19 5 Leave out requantified 0.87904 0.90394 0.91352 0.91519 0.92422 0.95752 23.575 21.815 15.495 6 6 7 2 0 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.7 26.7 26.7 742780000 386330000 356450000 227990000 120550000 107440000 221890000 120900000 100990000 292900000 144880000 148020000 1797 3516;5278;8671;10545;14744;16329;17192 True;True;True;True;True;True;True 3563;5339;8773;10671;14931;16537;17404 11520;11521;17191;17192;17193;28386;28387;28388;34845;34846;34847;48362;48363;48364;53458;53459;53460;56123;56124;56125 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1 0 1 1 0 1 Median Median Median 2.9 2.9 2.9 23901000 13296000 10606000 7360600 3489800 3870800 5188400 5188400 0 11352000 4617400 6735100 1799 1001;2770 True;True 1013;2805 3378;3379;3380;9086 4551;4552;4553;12085 4553;12085 Q96EK5 Q96EK5 3 3 3 KIF1-binding protein KIAA1279 sp|Q96EK5|KBP_HUMAN KIF1-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1BP PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 7.4 7.4 7.4 71.813 621 621 0 8.3399 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0685 1.0871 9.8497 4 1 Median 1.0785 NaN NaN 1.0871 NaN NaN 1.5602 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 7.4 5.3 5.3 69169000 33968000 35201000 32721000 16560000 16162000 15998000 6998600 8999500 20449000 10410000 10040000 1800 4757;5540;9545 True;True;True 4814;5603;9661 15620;17992;17993;17994;17995;17996;17997;31324;31325;31326 20793;23950;23951;23952;23953;23954;23955;41591 20793;23951;41591 Q96EK7 Q96EK7 8 8 8 Constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor gamma FAM120B sp|Q96EK7|F120B_HUMAN Constitutive 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DNAJA3 sp|Q96EY1|DNJA3_HUMAN DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJA3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.7 6.7 6.7 52.488 480 480 0 7.5203 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91472 0.92556 38.167 5 3 Median NaN NaN 1.2852 NaN NaN 1.3147 NaN NaN 47.87 1 1 3 0 0 3 Median Median Median 3.3 3.3 6.7 66701000 33988000 32713000 10570000 6470300 4099600 15843000 8219400 7623700 40288000 19298000 20990000 1804 6425;19735 True;True 6503;19969 20700;20701;64530;64531;64532;64533 27549;27550;85588;85589;85590;85591;85592;85593 27550;85592 Q96EY4 Q96EY4 5 5 5 Translation machinery-associated protein 16 TMA16 sp|Q96EY4|TMA16_HUMAN Translation machinery-associated protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMA16 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 2 4 4 2 4 4 2 4 28.1 28.1 28.1 23.864 203 203 0 8.7358 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97615 1.0012 30.099 11 4 Leave out requantified 1.0649 0.84563 1.0729 1.0926 0.84143 1.0791 34.22 4.7799 20.956 4 2 5 0 1 3 Leave out requantified Median 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0.71338 0.70176 41.791 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 6.2 3.5 6.2 29915000 19127000 10787000 12270000 10184000 2086100 9545800 3120400 6425300 8098700 5822900 2275800 1824 5938;15949 True;True 6008;16150 19222;19223;19224;52232;52233 25576;25577;25578;68968;68969 25576;68968 Q96II8 Q96II8 2 2 2 Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 3 LRCH3 sp|Q96II8|LRCH3_HUMAN Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRCH3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2.6 2.6 2.6 86.082 777 777 0.00091116 2.8544 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95226 1.024 20.044 3 1 Median NaN 1.0435 NaN NaN 1.0751 NaN NaN 28.066 NaN 0 2 1 0 1 0 Median Median Median 1 2.6 1.5 23050000 11744000 11306000 0 0 0 13802000 6206000 7595600 9248600 5538400 3710200 1825 2382;6608 True;True 2412;6690 7866;7867;21337;21338 10510;10511;28424 10511;28424 Q96IJ6 Q96IJ6 5 5 5 Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha GMPPA sp|Q96IJ6|GMPPA_HUMAN Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GMPPA PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 16.2 16.2 16.2 46.291 420 420 0 14.004 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1807 1.1953 18.773 12 3 Leave out requantified 1.0979 0.81667 1.16 1.1352 0.83402 1.1586 24.211 22.249 24.606 4 3 5 0 1 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 13.6 11.9 13.6 179350000 85129000 94224000 68098000 31964000 36134000 43620000 21122000 22498000 67636000 32043000 35592000 1826 1752;11742;18813;19057;20924 True;True;True;True;True 1773;11879;19038;19286;21167 5871;5872;5873;38778;61441;61442;61443;62313;62314;62315;62316;62317;68260;68261 7913;7914;7915;51269;81318;81319;81320;81321;81322;82554;82555;82556;82557;82558;82559;90459;90460;90461 7914;51269;81318;82554;90460 Q96IU4 Q96IU4 2 2 2 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B ABHD14B sp|Q96IU4|ABHEB_HUMAN Protein ABHD14B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABHD14B PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 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10367;12669;12670;73842 Q96J01 Q96J01 4 4 4 THO complex subunit 3 THOC3 sp|Q96J01|THOC3_HUMAN THO complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THOC3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 4 2 4 4 2 4 4 18.8 18.8 18.8 38.771 351 351 0 16.099 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1161 1.1301 15.088 10 1 Leave out requantified 1.0928 1.1445 1.0885 1.1701 1.1545 1.1063 49.95 14.546 14.959 2 4 4 1 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 10 18.8 18.8 290100000 138520000 151580000 43235000 20251000 22984000 111320000 52506000 58812000 135540000 65760000 69784000 1829 7184;13032;17411;21179 True;True;True;True 7273;13184;17624;21426 23206;23207;23208;42808;42809;56810;56811;56812;69023;69024 30926;30927;30928;30929;56539;56540;75047;91500 30926;56540;75047;91500 Q96JC1 Q96JC1 3 3 3 Vam6/Vps39-like protein VPS39 sp|Q96JC1|VPS39_HUMAN Vam6/Vps39-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS39 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.1 4.1 4.1 101.81 886 886 0 6.6337 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1657 1.2072 15.28 4 1 Median NaN NaN 1.0499 NaN NaN 1.0984 NaN NaN 24.682 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 3 3 2.5 37663000 17210000 20453000 10022000 4259900 5762500 10560000 4700900 5858900 17081000 8249400 8831800 1830 8919;13752;14828 True;True;True 9023;13916;15018 29184;29185;45165;48649;48650;48651 38647;38648;59570;64185;64186;64187 38648;59570;64185 Q96JG6 Q96JG6 2 2 2 Coiled-coil domain-containing protein 132 CCDC132 sp|Q96JG6|VPS50_HUMAN Syndetin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS50 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2.2 2.2 2.2 111.17 964 964 0 12.284 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95743 0.97263 47.917 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.2 2.2 2.2 41405000 22849000 18556000 13430000 7814200 5615400 12373000 4767600 7605700 15602000 10267000 5335200 1831 3718;14875 True;True 3767;15065 12184;12185;12186;12187;12188;12189;48806;48807;48808 16165;16166;16167;16168;16169;16170;64420 16166;64420 Q96JJ3;Q92556 Q96JJ3 11;2 11;2 11;2 Engulfment and cell motility protein 2 ELMO2 sp|Q96JJ3|ELMO2_HUMAN Engulfment and cell motility protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELMO2 PE=1 SV=2 2 11 11 11 3 7 8 3 7 8 3 7 8 19 19 19 82.614 720 720;727 0 35.755 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0867 1.0603 15.774 12 5 Leave out requantified 1.1205 0.78157 1.2073 1.1134 0.80368 1.2457 6.9216 35.276 14.457 2 5 5 0 3 2 Median Median Leave out requantified 4 13.1 15.1 199760000 98975000 100780000 27230000 14285000 12945000 83269000 46785000 36484000 89259000 37905000 51355000 1832 1569;2752;3154;5129;8608;9506;12870;13194;15804;19588;20542 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1586;2787;3195;5190;8710;9622;13016;13353;16004;19820;20781 5226;9021;10396;16715;16716;16717;28192;31207;31208;42244;42245;43308;43309;51796;64062;64063;67039;67040 7041;11991;13829;22236;22237;22238;22239;37290;41440;55814;55815;55816;57165;57166;68382;84942;84943;88856;88857 7041;11991;13829;22237;37290;41440;55815;57165;68382;84943;88856 Q96JM3 Q96JM3 6 6 6 Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1 CHAMP1 sp|Q96JM3|CHAP1_HUMAN Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHAMP1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 5 3 5 5 3 5 5 3 7.9 7.9 7.9 89.098 812 812 0 14.9 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93501 0.97467 11.622 12 0 Leave out requantified 0.93772 0.8343 1.007 0.98458 0.8972 1.0529 12.668 24.422 18.46 5 4 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.8 6.8 4.3 243800000 118520000 125280000 90279000 42509000 47769000 86970000 45310000 41660000 66555000 30705000 35850000 1833 527;1628;16283;16759;16924;17491 True;True;True;True;True;True 530;1647;16491;16970;17135;17704 1804;1805;5443;5444;5445;53298;53299;54805;55277;55278;55279;57079;57080 2460;2461;2462;2463;7339;7340;70396;70397;70398;72323;72324;72949;72950;72951;72952;72953;75400 2460;7339;70396;72324;72953;75400 Q96JP5 Q96JP5 3 3 3 E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91 ZFP91 sp|Q96JP5|ZFP91_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91 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4890;4891;4892;4893;11088;11089;37515;37516;37517;37518;41491;41492;41493;41494;54146;54147;54148;74411;74412 4891;11089;37517;41492;54148;74412 Q96P47 Q96P47 4 4 2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 AGAP3 sp|Q96P47|AGAP3_HUMAN Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGAP3 PE=1 SV=2 1 4 4 2 2 3 4 2 3 4 0 1 2 6.3 6.3 3.5 95.043 875 875 0 17.401 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7502 0.762 38.149 8 6 Median 0.79391 0.82918 0.95856 0.80936 0.84425 0.97618 34.924 17.338 64.53 2 3 3 2 2 2 Median Median Plateau 2.7 4.1 6.3 139980000 76617000 63365000 37666000 20192000 17474000 54793000 29868000 24925000 47523000 26557000 20966000 1849 1640;11043;19188;20937 True;True;True;True 1659;11176;19418;21180 5484;5485;36483;62749;62750;62751;68304;68305;68306;68307 7390;7391;48322;83178;83179;83180;90515;90516;90517;90518 7390;48322;83178;90515 Q96P70 Q96P70 2 2 2 Importin-9 IPO9 sp|Q96P70|IPO9_HUMAN Importin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IPO9 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2.6 2.6 2.6 115.96 1041 1041 0.00048031 3.4564 By MS/MS By matching By MS/MS 1.0032 0.84751 20.399 4 1 Linear NaN NaN 0.69678 NaN NaN 0.72644 NaN NaN 3.8091 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 0.7 0.7 2.6 22196000 11543000 10653000 6220500 2979000 3241500 6381700 3102700 3279000 9594100 5461800 4132300 1850 5623;19656 True;True 5688;19889 18246;64277;64278;64279 24290;85259 24290;85259 Q96PK6 Q96PK6 6 6 6 RNA-binding protein 14 RBM14 sp|Q96PK6|RBM14_HUMAN RNA-binding protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM14 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 4 5 6 4 5 6 4 5 10.8 10.8 10.8 69.491 669 669 0 14.996 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73343 0.7449 21.205 15 6 Leave out requantified 0.81036 0.84998 0.66104 0.80071 0.8687 0.67225 8.0264 30.013 19.197 6 4 5 3 2 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 10.8 6.6 9 259560000 145170000 114390000 103020000 54610000 48410000 76230000 44138000 32092000 80313000 46423000 33890000 1851 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41534;41535;41536;41537;41538;68689;68690;68691;68692 41534;68692 Q96QR8 Q96QR8 1 1 1 Transcriptional activator protein Pur-beta PURB sp|Q96QR8|PURB_HUMAN Transcriptional activator protein Pur-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PURB PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 4.2 4.2 4.2 33.24 312 312 0.00049603 3.9097 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 4.2 0 4.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1857 7079 True 7167 22856;22857 30453;30454 30453 Q96R06 Q96R06 4 4 4 Sperm-associated antigen 5 SPAG5 sp|Q96R06|SPAG5_HUMAN Sperm-associated antigen 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPAG5 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 4 1 2 4 1 2 4 4.3 4.3 4.3 134.42 1193 1193 0 16.715 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9836 1.0308 11.472 6 1 Leave out requantified NaN 0.95411 0.90372 NaN 1.0031 0.9469 NaN 3.8495 10.927 1 2 3 0 1 0 Median Median Leave out requantified 1.1 2.2 4.3 99973000 51689000 48284000 27826000 15340000 12486000 30809000 15549000 15260000 41338000 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2.6704 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 2.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1860 11291 True 11426 37314 49406 49406 Q96RP9 Q96RP9 12 12 12 Elongation factor G, mitochondrial GFM1 sp|Q96RP9|EFGM_HUMAN Elongation factor G, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GFM1 PE=1 SV=2 1 12 12 12 7 9 9 7 9 9 7 9 9 22.4 22.4 22.4 83.471 751 751 0 47.532 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1146 1.1887 25.645 30 7 Leave out requantified 0.98008 1.0395 1.1393 1.0154 1.0667 1.2416 17.031 26.867 24.652 9 11 10 4 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.9 16.5 17.6 690300000 326040000 364260000 189950000 85592000 104350000 272850000 133330000 139520000 227510000 107120000 120390000 1861 2678;3203;5404;6528;10881;14504;16055;19385;20359;20868;20997;21045 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2712;3244;5466;6610;11012;14688;16256;19615;20598;21110;21242;21291 8774;10533;10534;10535;10536;17569;17570;21055;21056;35996;35997;35998;35999;36000;47618;52547;52548;63388;63389;63390;63391;63392;66506;68103;68104;68105;68485;68486;68618;68619;68620;68621;68622 11688;14013;14014;14015;14016;14017;23357;23358;28033;28034;47698;47699;47700;47701;47702;47703;62845;69379;69380;84057;84058;84059;84060;84061;84062;84063;88178;90258;90259;90260;90261;90262;90750;90943;90944;90945;90946;90947;90948;90949;90950 11688;14017;23358;28033;47699;62845;69380;84061;88178;90262;90750;90947 Q96RS0 Q96RS0 3 3 3 Trimethylguanosine synthase TGS1 sp|Q96RS0|TGS1_HUMAN Trimethylguanosine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGS1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 5 5 5 96.619 853 853 0.00051046 4.2884 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76606 0.76067 37.851 7 2 Leave out requantified 0.77181 0.80461 1.0333 0.76699 0.82512 1.0293 40.091 21.426 39.687 2 2 3 1 0 1 Median Median Median 3.9 5 5 59510000 26198000 33312000 13070000 4826800 8243000 20052000 10189000 9863100 26388000 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Structural maintenance of chromosomes protein 6 SMC6 sp|Q96SB8|SMC6_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC6 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0.9 0.9 0.9 126.32 1091 1091 0.0060267 2.2547 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0.9 0 0.9 5429600 2303500 3126100 0 0 0 0 0 0 5429600 2303500 3126100 1866 17050 True 17262 55672;55673 73514;73515 73515 Q96SN8 Q96SN8 2 2 2 CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 CDK5RAP2 sp|Q96SN8|CK5P2_HUMAN CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK5RAP2 PE=1 SV=5 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1.5 1.5 1.5 215.04 1893 1893 0.00049358 3.8419 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99731 1.04 9.2619 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1 1.5 1 170220000 85603000 84616000 51417000 25791000 25626000 61710000 30843000 30868000 57091000 28969000 28122000 1867 3643;17860 True;True 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chaperone regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG1 PE=1 SV=4 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 13.6 13.6 13.6 38.778 345 345 0 17.062 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9469 0.98495 7.3263 11 1 Leave out requantified 0.84919 1.0045 0.94208 0.90669 1.0493 0.9725 7.7362 8.0768 20.428 4 3 4 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.6 10.7 13.6 282910000 141520000 141400000 85898000 42833000 43065000 92052000 47850000 44202000 104960000 50834000 54129000 1907 4928;8590;9224;14048 True;True;True;True 4987;8692;9332;14224 16145;16146;16147;28125;28126;28127;30288;30289;30290;30291;46152;46153 21502;21503;21504;21505;37180;37181;37182;37183;37184;37185;40188;40189;40190;60906;60907 21504;37182;40188;60907 Q99961;Q99962 Q99961 7;1 7;1 7;1 Endophilin-A2 SH3GL1 sp|Q99961|SH3G1_HUMAN Endophilin-A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GL1 PE=1 SV=1 2 7 7 7 6 5 5 6 5 5 6 5 5 25.5 25.5 25.5 41.489 368 368;352 0 41.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0388 1.0784 11.202 22 11 Leave out 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coiled-coil WAC sp|Q9BTA9|WAC_HUMAN WW domain-containing adapter protein with coiled-coil OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WAC PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 14.1 14.1 14.1 70.723 647 647 0 18.359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0569 1.1002 13.879 13 8 Leave out requantified 1.0571 0.96254 0.9453 1.1079 1.0024 0.98258 22.904 17.657 23.849 4 4 5 3 1 4 Median Leave out requantified Median 5.9 11.1 8.8 177950000 95717000 82234000 51782000 27873000 23909000 47540000 23940000 23601000 78629000 43904000 34724000 1935 2619;14640;17045;18338 True;True;True;True 2653;14826;17257;18560 8584;47999;48000;48001;48002;48003;48004;48005;48006;48007;48008;55654;59901;59902;59903 11452;63343;63344;63345;63346;63347;63348;63349;63350;63351;63352;63353;63354;73495;79218;79219;79220;79221;79222 11452;63354;73495;79218 Q9BTC0 Q9BTC0 16 16 16 Death-inducer obliterator 1 DIDO1 sp|Q9BTC0|DIDO1_HUMAN Death-inducer obliterator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIDO1 PE=1 SV=5 1 16 16 16 9 11 9 9 11 9 9 11 9 11.3 11.3 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2345;4199;4536;8511;13661;16195;20393;32939;38632;48598;62081;62673;64153;69818;75000;88715 Q9BTE3 Q9BTE3 6 6 6 Mini-chromosome maintenance complex-binding protein MCMBP sp|Q9BTE3|MCMBP_HUMAN Mini-chromosome maintenance complex-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCMBP PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 12.5 12.5 12.5 72.979 642 642 0 20.044 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0785 1.0979 22.335 14 5 Leave out requantified 1.2172 0.88038 1.0679 1.2534 0.87972 1.0979 30.788 15.408 19.584 5 4 5 2 2 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 12.5 10.3 10.3 219370000 105170000 114190000 78270000 35191000 43078000 66371000 34065000 32306000 74725000 35918000 38807000 1937 1711;2082;2364;3972;12166;17279 True;True;True;True;True;True 1732;2108;2394;4023;12307;17491 5730;5731;5732;6929;6930;6931;7811;7812;7813;13013;13014;13015;40075;40076;40077;56383 7731;7732;7733;7734;9298;9299;9300;9301;10429;10430;10431;17302;17303;17304;17305;52981;52982;52983;52984;74502 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Q9BUL8 4 4 4 Programmed cell death protein 10 PDCD10 sp|Q9BUL8|PDC10_HUMAN Programmed cell death protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD10 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 26.4 26.4 26.4 24.701 212 212 0 22.169 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99916 1.0342 12.845 8 3 Leave out requantified 1.2093 0.94174 0.90968 1.3193 0.96115 0.94262 12.634 33.146 18.202 3 2 3 1 1 1 Plateau Median Median 20.8 17.5 23.1 326190000 164870000 161320000 128950000 60370000 68578000 66625000 30127000 36497000 130610000 74372000 56242000 1949 5068;11384;12801;16048 True;True;True;True 5129;11519;12946;16249 16552;37627;37628;37629;42033;42034;42035;52530 22040;22041;49829;49830;49831;49832;55518;55519;55520;55521;55522;55523;55524;55525;55526;69358 22040;49832;55526;69358 Q9BUP3 Q9BUP3 5 5 5 Oxidoreductase HTATIP2 HTATIP2 sp|Q9BUP3|HTAI2_HUMAN Oxidoreductase HTATIP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HTATIP2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 5 3 3 5 3 3 5 3 28.5 28.5 28.5 27.049 242 242 0 14.758 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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requantified Leave out requantified 29.5 26.1 30.2 3122900000 1607600000 1515300000 946710000 486370000 460340000 1036900000 539790000 497110000 1139300000 581430000 557890000 1951 1406;2235;2754;2782;3433;4069;4235;4705;6728;6997;8459;8767;8814;9227;10139;12947;12981;12996;13031;13040;13587;14320;16160;19178 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1423;2264;2789;2817;3477;4122;4288;4761;6811;7083;8559;8869;8916;9335;10263;13098;13132;13147;13183;13193;13751;14502;16365;19408 4689;4690;4691;7407;7408;7409;9024;9025;9128;11239;11240;11241;13354;13355;13356;13898;13899;13900;15432;15433;15434;21715;22581;22582;22583;27593;27594;27595;27596;27597;28675;28832;28833;28834;28835;28836;28837;30295;30296;30297;30298;30299;30300;30301;33483;42525;42526;42527;42625;42695;42696;42697;42698;42699;42807;42838;42839;42840;44617;44618;44619;47050;47051;47052;47053;47054;47055;52907;52908;52909;62722;62723 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MS/MS By MS/MS 1.0715 1.1186 2.4231 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 7.7 7.7 7.7 73668000 33404000 40264000 25877000 10974000 14903000 25026000 12790000 12236000 22765000 9640000 13125000 1954 9464 True 9580 31064;31065;31066 41264;41265;41266;41267;41268;41269 41266 Q9BV86 Q9BV86 6 6 6 N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1;N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1, N-terminally processed NTMT1 sp|Q9BV86|NTM1A_HUMAN N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NTMT1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 5 5 4 5 5 4 5 5 4 29.1 29.1 29.1 25.387 223 223 0 50.799 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0584 1.0656 24.229 19 4 Leave out requantified 1.0618 1.1851 1.033 1.0862 1.1702 1.0415 29.253 16.541 14.118 6 8 5 1 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 28.7 24.7 706360000 357040000 349320000 155840000 75715000 80120000 286260000 156960000 129300000 264260000 124370000 139900000 1955 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True;True;True;True 12854;13450;18849;20717 41752;43595;60837;60838;60839;66848 55181;57555;80471;80472;80473;88614 55181;57555;80471;88614 Q9BVC5 Q9BVC5 2 2 2 Ashwin C2orf49 sp|Q9BVC5|ASHWN_HUMAN Ashwin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C2orf49 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 11.2 11.2 11.2 25.858 232 232 0 7.3128 By MS/MS By MS/MS 1.3548 1.3811 19.144 3 2 Median 1.4093 NaN NaN 1.3943 NaN NaN 1.346 NaN NaN 2 0 1 1 0 1 Median Median Median 11.2 0 7.3 75651000 31919000 43732000 48847000 21792000 27055000 0 0 0 26804000 10126000 16677000 1957 3410;13576 True;True 3454;13740 11172;11173;44571 14864;14865;58802 14865;58802 Q9BVI4 Q9BVI4 2 2 2 Nucleolar complex protein 4 homolog NOC4L sp|Q9BVI4|NOC4L_HUMAN Nucleolar complex protein 4 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOC4L PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 5 5 5 58.467 516 516 0 7.1557 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4513 1.5144 53.038 5 2 Median 1.938 1.4059 NaN 2.0193 1.4585 NaN 40.695 68.728 NaN 2 2 1 1 1 0 Median Median Median 5 5 2.5 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Q9BXP5 Q9BXP5 26 26 26 Serrate RNA effector molecule homolog SRRT sp|Q9BXP5|SRRT_HUMAN Serrate RNA effector molecule homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRT PE=1 SV=1 1 26 26 26 21 25 23 21 25 23 21 25 23 31.5 31.5 31.5 100.67 876 876 0 125.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98737 0.99573 28.237 79 19 Leave out requantified 0.90006 0.93298 0.93212 0.91243 0.98613 0.96653 18.193 28.102 21.502 24 28 27 5 6 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.1 30.6 27.9 4239700000 2126200000 2113500000 1451400000 731500000 719900000 1423400000 712070000 711300000 1365000000 682640000 682350000 1973 405;565;2001;3976;4407;4499;5296;5476;6549;8092;9232;9233;9572;9770;9941;11244;11385;12497;12906;13033;13627;15096;15097;17454;18290;20779 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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7.6 48.586 423 423 0.00052138 4.5534 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8338 0.8638 32.761 5 3 Median NaN 1.13 0.9363 NaN 1.1538 0.96058 NaN 57.932 15.019 1 2 2 1 0 2 Median Median Median 4.7 7.6 7.6 62677000 30111000 32566000 16823000 7829700 8993600 27198000 10562000 16636000 18656000 11719000 6937100 1974 9304;17039 True;True 9413;17251 30540;30541;55636;55637;55638 40523;40524;73467;73468;73469 40524;73468 Q9BXS6 Q9BXS6 4 4 4 Nucleolar and spindle-associated protein 1 NUSAP1 sp|Q9BXS6|NUSAP_HUMAN Nucleolar and spindle-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUSAP1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 2 3 3 2 3 3 2 10.4 10.4 10.4 49.451 441 441 0 9.3564 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81134 0.85352 24.371 9 3 Leave out requantified 0.80821 0.84341 0.93489 0.83609 0.84667 0.96478 24.166 7.223 28.714 3 3 3 0 1 2 Leave out requantified Plateau Median 7.5 8.4 5.4 166660000 93276000 73386000 57306000 32295000 25011000 55878000 29384000 26494000 53477000 31596000 21881000 1975 12410;12536;18969;21073 True;True;True;True 12551;12679;19196;21319 40816;40817;40818;40819;41204;41205;41206;61994;68702 53947;53948;53949;53950;53951;53952;54453;54454;54455;54456;54457;82112;91051 53947;54454;82112;91051 Q9BXW7 Q9BXW7 1 1 1 Cat eye syndrome critical region protein 5 CECR5 sp|Q9BXW7|HDHD5_HUMAN Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDHD5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.5 3.5 3.5 46.321 423 423 0.0079465 2.0032 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 3.5 3.5 0 6016300 1794500 4221800 6016300 1794500 4221800 0 0 0 0 0 0 1976 1611 True 1630 5390;5391 7267;7268 7267 Q9BXW9 Q9BXW9 16 16 16 Fanconi anemia group D2 protein FANCD2 sp|Q9BXW9|FACD2_HUMAN Fanconi anemia group D2 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCD2 PE=1 SV=2 1 16 16 16 11 12 14 11 12 14 11 12 14 13.4 13.4 13.4 164.13 1451 1451 0 47.097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93999 1.0312 12.11 38 12 Leave out 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24724;28043;54663;63876 Q9BZK3 Q9BZK3 2 1 1 Putative nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein NACAP1 sp|Q9BZK3|NACP4_HUMAN Putative nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACA4P PE=5 SV=1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 13.1 7 7 23.306 213 213 0.00052301 4.5894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81483 0.85502 52.582 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 13.1 13.1 13.1 15417000 9447900 5968900 0 0 0 8587400 4340400 4247000 6829300 5107400 1721900 1995 8796;13618 True;False 8898;13782 28772;28773;28774;44718;44719;44720;44721;44722;44723;44724;44725;44726;44727;44728 38079;38080;38081;38082;59008;59009;59010;59011;59012;59013;59014;59015;59016;59017;59018 38080;59013 Q9BZK7;O60907;Q9BQ87 Q9BZK7 7;3;2 7;3;2 7;3;2 F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1 TBL1XR1 sp|Q9BZK7|TBL1R_HUMAN F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBL1XR1 PE=1 SV=1 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By MS/MS By MS/MS 1.0612 1.07 12.772 4 1 Median NaN NaN 1.1238 NaN NaN 1.1513 NaN NaN 6.3153 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 1.7 3.5 3.2 24134000 11882000 12251000 6904400 3510500 3393800 5438100 2725800 2712300 11791000 5645700 6145400 1997 7582;16809;17342 True;True;True 7673;17020;17555 24498;24499;24500;54955;56600 32676;32677;32678;32679;72543;74785 32676;72543;74785 Q9BZV1 Q9BZV1 2 2 2 UBX domain-containing protein 6 UBXN6 sp|Q9BZV1|UBXN6_HUMAN UBX domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBXN6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 7.3 7.3 7.3 49.753 441 441 0 7.6856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.907 0.96688 21.933 4 3 Median 0.81226 NaN NaN 0.85774 NaN NaN 30.256 NaN NaN 2 1 1 1 1 1 Median Median Median 7.3 4.5 4.5 133470000 76354000 57115000 54852000 30361000 24491000 46646000 28451000 18195000 31971000 17543000 14428000 1998 77;4669 True;True 78;4725 287;288;289;15296 420;421;422;20399 421;20399 Q9BZX2 Q9BZX2 4 4 4 Uridine-cytidine kinase 2 UCK2 sp|Q9BZX2|UCK2_HUMAN Uridine-cytidine kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UCK2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 21.1 21.1 21.1 29.299 261 261 0 37.693 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0095 1.0226 10.535 13 6 Leave out requantified 0.97428 1.0639 1.0552 0.99993 1.0644 1.0747 7.9692 16.538 6.6377 4 5 4 1 3 2 Leave out requantified Median Median 21.1 21.1 21.1 672610000 329070000 343540000 185970000 89724000 96242000 298020000 147900000 150130000 188620000 91447000 97178000 1999 7694;9791;11089;18627 True;True;True;True 7785;9911;11222;18851 24877;24878;24879;32182;32183;32184;36621;36622;36623;36624;36625;60845;60846;60847 33196;33197;33198;33199;33200;33201;42765;42766;42767;48480;48481;48482;48483;48484;48485;80480;80481;80482;80483;80484 33197;42766;48483;80484 Q9BZZ5 Q9BZZ5 3 3 3 Apoptosis inhibitor 5 API5 sp|Q9BZZ5|API5_HUMAN Apoptosis inhibitor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=API5 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 1 2 3 1 2 3 1 6.3 6.3 6.3 59.004 524 524 0 6.7376 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97235 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10612;36619;36620;52435;61220;61221 14121;48479;69239;80987;80988 14121;48479;69239;80988 Q9C0C9 Q9C0C9 3 3 3 E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O UBE2O sp|Q9C0C9|UBE2O_HUMAN (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2O PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 3.1 3.1 3.1 141.29 1292 1292 0 8.0274 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98485 0.99386 13.932 5 2 Median NaN 0.8671 1.029 NaN 0.88549 1.0774 NaN 16.327 1.2078 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 0.8 3.1 1.5 47052000 25197000 21855000 13376000 7387100 5989200 18493000 10314000 8178200 15183000 7495200 7688000 2002 7457;12862;19949 True;True;True 7547;13008;20185 24105;24106;24107;42222;42223;65212 32137;32138;32139;32140;32141;55788;55789;86507 32137;55788;86507 Q9C0D5 Q9C0D5 5 5 5 Protein TANC1 TANC1 sp|Q9C0D5|TANC1_HUMAN Protein TANC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANC1 PE=1 SV=3 1 5 5 5 2 1 4 2 1 4 2 1 4 5.1 5.1 5.1 202.22 1861 1861 0 9.8542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81337 0.81389 29.252 8 4 Median 0.95611 NaN 0.82063 0.94816 NaN 0.81306 21.449 NaN 34.949 2 1 5 0 1 3 Median Median Median 1.5 0.8 4.4 78554000 42292000 36262000 29377000 12614000 16764000 7271000 4262700 3008300 41905000 25416000 16490000 2003 3817;8412;14689;18398;20300 True;True;True;True;True 3867;8510;14875;18620;20538 12503;27402;48167;48168;60065;66322;66323;66324;66325;66326 16610;36310;63561;63562;79433;87933;87934;87935;87936 16610;36310;63561;79433;87936 Q9C0F1 Q9C0F1 3 3 3 Centrosomal protein of 44 kDa CEP44 sp|Q9C0F1|CEP44_HUMAN Centrosomal protein of 44 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP44 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 13.1 13.1 13.1 44.139 390 390 0 12.317 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84675 0.84359 19.906 7 2 Leave out requantified 0.96928 NaN 0.84675 1.0558 NaN 0.84365 19.344 NaN 18.448 3 1 3 2 0 0 Plateau Median Leave out requantified 6.7 3.8 13.1 97786000 52838000 44948000 40990000 17911000 23078000 11061000 7669100 3391500 45736000 27257000 18478000 2004 3285;11739;15987 True;True;True 3329;11876;16188 10802;10803;38768;38769;38770;38771;52339 14385;14386;51255;51256;51257;69114 14385;51257;69114 Q9C0G6 Q9C0G6 1 1 1 Dynein heavy chain 6, axonemal DNAH6 sp|Q9C0G6|DYH6_HUMAN Dynein heavy chain 6, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH6 PE=2 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.2 0.2 0.2 475.98 4158 4158 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0745 1.1119 20.385 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.2 0.2 0.2 180480000 84416000 96059000 61309000 29682000 31627000 60207000 28006000 32201000 58958000 26727000 32231000 + 2005 12759 True 12904 41905;41906;41907 55364;55365;55366 55364 267 2492 Q9C0H9 Q9C0H9 2 2 2 SRC kinase signaling inhibitor 1 SRCIN1 sp|Q9C0H9|SRCN1_HUMAN SRC kinase signaling inhibitor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRCIN1 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1.5 1.5 1.5 127.1 1183 1183 0.0071821 2.0754 By MS/MS By matching By MS/MS 0.93753 0.99448 10.7 5 1 Leave out requantified 0.93753 NaN 0.75648 0.99448 NaN 0.79156 10.7 NaN 27.703 2 1 2 0 0 1 Median Median Median 1.5 0.8 1.5 137120000 75861000 61259000 58097000 29114000 28983000 27902000 16429000 11473000 51122000 30317000 20804000 2006 2300;12193 True;True 2330;12334 7614;7615;40145;40146;40147 10163;10164;53066;53067 10164;53067 Q9GZL7 Q9GZL7 5 5 5 Ribosome biogenesis protein WDR12 WDR12 sp|Q9GZL7|WDR12_HUMAN Ribosome biogenesis protein WDR12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR12 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 5 3 3 5 3 3 5 3 16.3 16.3 16.3 47.707 423 423 0 10.536 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93844 0.9676 13.7 11 1 Leave out requantified 0.90801 0.93844 1.1302 0.94735 0.9676 1.1691 17.832 18.403 12.095 3 5 3 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 11.8 16.3 11.1 291270000 147280000 143990000 68155000 36476000 31679000 158170000 81483000 76689000 64939000 29319000 35621000 2007 1308;9824;9825;20338;20510 True;True;True;True;True 1323;9944;9945;20576;20749 4394;32284;32285;32286;32287;32288;66442;66443;66939;66940;66941 5930;42913;42914;42915;42916;42917;42918;42919;42920;88098;88099;88100;88729;88730;88731 5930;42913;42917;88099;88731 Q9H1A7;Q9GZM3;P52435 Q9H1A7;Q9GZM3;P52435 3;3;2 3;3;2 3;3;2 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a POLR2J3;POLR2J2;POLR2J sp|Q9H1A7|RPB1C_HUMAN DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2J3 PE=3 SV=1;sp|Q9GZM3|RPB1B_HUMAN DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2J2 PE=1 SV=2;sp|P52435|RPB11_HUMAN DNA- 3 3 3 3 2 1 0 2 1 0 2 1 0 23.5 23.5 23.5 13.092 115 115;115;117 0.00048614 3.6088 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 17.4 6.1 0 19859000 14681000 5177500 0 0 0 19859000 14681000 5177500 0 0 0 2008 3255;4025;17448 True;True;True 3297;4077;17661 10692;13193;56937 14223;17581;75229 14223;17581;75229 Q9GZR2 Q9GZR2 6 6 6 RNA 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24592;42814;50998;70131;71541;75289;85801;88101 Q9GZT3 Q9GZT3 1 1 1 SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial SLIRP sp|Q9GZT3|SLIRP_HUMAN SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLIRP PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.8 12.8 12.8 12.349 109 109 0.00048852 3.6847 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69613 0.72195 1.044 4 4 Median NaN NaN 0.67432 NaN NaN 0.72032 NaN NaN 1.1693 1 1 2 1 1 2 Median Median Median 12.8 12.8 12.8 26607000 17368000 9238500 7849000 5778100 2070900 7472700 5219800 2252900 11285000 6370300 4914600 2013 13339 True 13500 43781;43782;43783;43784;43785 57805;57806;57807;57808;57809 57809 Q9GZT9 Q9GZT9 5 5 5 Egl nine homolog 1 EGLN1 sp|Q9GZT9|EGLN1_HUMAN Egl nine homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EGLN1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 5 3 2 5 3 2 5 3 16.2 16.2 16.2 46.02 426 426 0 19.539 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98247 1.0032 5.285 11 6 Leave out requantified 0.95466 0.92377 0.64081 0.97995 0.95827 0.66947 13.436 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MS/MS 0.90074 0.90977 17.1 28 10 Leave out requantified 0.95691 0.87848 0.89062 0.98102 0.87144 0.92886 6.1308 15.708 10.554 8 11 9 2 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.9 35.9 29.6 761780000 396290000 365490000 237050000 120260000 116800000 258310000 138040000 120270000 266410000 137990000 128420000 2020 1025;1543;2701;3349;3787;10137;10824;12159;12373;13869;14325;14627;14921;15960;17161;18016;18097;18986;20682 True;True;False;True;False;True;True;True;True;False;False;True;True;True;True;False;True;True;False 1037;1560;2735;3393;3836;10261;10955;12300;12514;14042;14507;14813;15111;16161;17373;18234;18318;19213;20922 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Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILKAP PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 7.7 7.7 7.7 42.906 392 392 0.0005184 4.4803 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88393 0.86836 4.301 7 2 Leave out requantified NaN 0.93608 0.77324 NaN 0.92945 0.7863 NaN 23.22 10.657 1 2 4 0 0 2 Median Median Median 2.6 5.6 7.7 106290000 57511000 48781000 6958900 3648000 3310900 28927000 16025000 12902000 70406000 37838000 32568000 2021 4475;5728;6837 True;True;True 4529;5793;6922 14645;14646;14647;14648;14649;18543;18544;22056 19561;19562;19563;19564;19565;19566;24685;29445 19563;24685;29445 Q9H0D6 Q9H0D6 4 4 4 5-3 exoribonuclease 2 XRN2 sp|Q9H0D6|XRN2_HUMAN 5-3 exoribonuclease 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRN2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 2 3 3 2 3 3 2 4.8 4.8 4.8 108.58 950 950 0 14.146 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9623 0.95609 2.2127 9 4 Leave out requantified 0.91474 0.95578 0.91123 0.93316 0.94125 0.92137 48.793 4.7154 5.0519 4 3 2 3 1 0 Median Median Median 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sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSRP1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 2 4 1 2 4 1 2 4 8.8 8.8 8.8 66.389 558 558 0 6.8647 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91344 0.98573 39.072 7 4 Median NaN 0.68812 1.0585 NaN 0.73883 1.0911 NaN 33.66 43.883 1 2 4 0 1 3 Median Median Median 2.7 4.5 8.8 205340000 108940000 96395000 41601000 23464000 18137000 65128000 37149000 27979000 98606000 48326000 50279000 2024 8349;13862;13962;19372 True;True;True;True 8445;14035;14135;19602 27168;45555;45836;45837;45838;63347;63348 36042;60076;60446;60447;60448;60449;60450;60451;84012;84013 36042;60076;60447;84013 Q9H0H5 Q9H0H5 3 3 3 Rac GTPase-activating protein 1 RACGAP1 sp|Q9H0H5|RGAP1_HUMAN Rac GTPase-activating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACGAP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 0 3 2 0 3 2 0 6.5 6.5 6.5 71.026 632 632 0 20.654 By MS/MS By MS/MS 0.81707 0.89451 7.9026 5 1 Leave out requantified 0.81707 1.0828 NaN 0.89451 1.1163 NaN 9.0242 21.415 NaN 3 2 0 0 1 0 Leave out requantified Median Median 6.5 4.4 0 78878000 38087000 40791000 49686000 25212000 24474000 29192000 12875000 16317000 0 0 0 2025 16249;18588;18904 True;True;True 16455;18812;19129 53192;53193;60725;61725;61726 70258;70259;80326;81738 70258;80326;81738 Q9H0P0 Q9H0P0 3 3 3 Cytosolic 5-nucleotidase 3A NT5C3A sp|Q9H0P0|5NT3A_HUMAN Cytosolic 5-nucleotidase 3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NT5C3A PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10.1 10.1 10.1 37.948 336 336 0 6.2961 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0037 1.0608 22.796 5 0 Leave out requantified 1.1499 NaN 0.84297 1.1885 NaN 0.89394 27.966 NaN 24.209 2 1 2 0 0 0 Median Median Median 5.4 7.4 7.4 76170000 37043000 39127000 33734000 15958000 17775000 16077000 7527300 8549800 26359000 13557000 12802000 2026 3204;4448;6911 True;True;True 3245;4502;6996 10537;10538;14558;14559;22298;22299 14018;14019;14020;19442;29752 14020;19442;29752 Q9H0S4 Q9H0S4 9 9 9 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 DDX47 sp|Q9H0S4|DDX47_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX47 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 6 8 7 6 8 7 6 8 24.8 24.8 24.8 50.646 455 455 0 28.282 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97913 0.993 34.087 33 13 Leave out requantified 0.96447 0.89135 0.8943 0.98571 0.94393 0.93419 59.386 38.638 18.433 11 11 11 3 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.5 15.8 22.4 892950000 447460000 445490000 315450000 141360000 174090000 264860000 144970000 119890000 312640000 161130000 151510000 2027 2753;9491;10190;10255;10995;11342;12237;16264;16885 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2788;9607;10314;10380;11128;11477;12378;16470;17096 9022;9023;31159;31160;31161;31162;31163;31164;33658;33659;33871;33872;36341;36342;36343;37482;37483;37484;37485;37486;37487;37488;40299;40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;53236;55162;55163 11992;11993;41391;41392;41393;41394;41395;44638;44639;44640;44920;48149;48150;48151;49618;49619;49620;49621;49622;49623;49624;49625;53260;53261;53262;53263;53264;53265;53266;53267;70322;72807 11992;41393;44639;44920;48151;49624;53260;70322;72807 Q9H0U4;Q92928 Q9H0U4;Q92928 6;3 4;2 2;1 Ras-related protein Rab-1B;Putative Ras-related protein Rab-1C RAB1B;RAB1C sp|Q9H0U4|RAB1B_HUMAN Ras-related protein Rab-1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB1B PE=1 SV=1;sp|Q92928|RAB1C_HUMAN Putative Ras-related protein Rab-1C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB1C PE=5 SV=2 2 6 4 2 4 5 6 2 3 4 1 1 2 36.8 27.9 15.9 22.171 201 201;201 0 62.883 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.128 1.1703 17.371 12 0 Leave out requantified 1.063 1.0033 1.1411 1.0431 1.0273 1.1912 19.37 26.327 16.349 3 4 5 0 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 24.4 28.4 36.8 365540000 176030000 189520000 67300000 29444000 37856000 158460000 80728000 77730000 139790000 65856000 73930000 2028 4233;11708;12969;13359;17852;20580 True;False;True;True;False;True 4286;11844;13120;13520;18069;20820 13890;13891;13892;13893;13894;13895;38671;38672;38673;38674;38675;38676;42589;42590;42591;43845;58352;58353;58354;67161;67162 18504;18505;18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;51123;51124;51125;51126;51127;51128;51129;51130;56265;57886;77187;77188;77189;89020;89021 18505;51125;56265;57886;77189;89020 Q9H0U9 Q9H0U9 1 1 1 Testis-specific Y-encoded-like protein 1 TSPYL1 sp|Q9H0U9|TSYL1_HUMAN Testis-specific Y-encoded-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSPYL1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.9 3.9 3.9 49.192 437 437 0.00047416 3.3031 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 3.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2029 15712 True 15911 51489 67925 67925 Q9H1A4 Q9H1A4 5 5 5 Anaphase-promoting complex subunit 1 ANAPC1 sp|Q9H1A4|APC1_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 3 4 5 3 4 5 3 2.8 2.8 2.8 216.5 1944 1944 0 12.554 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89489 0.8854 7.8891 10 5 Leave out requantified 1.2553 0.78258 1.1562 1.2844 0.79277 1.1436 33.908 51.582 38.929 2 5 3 1 3 1 Median Median Median 2.3 2.8 1.9 188580000 91976000 96604000 43343000 19655000 23688000 88107000 42707000 45400000 57130000 29613000 27517000 2030 1900;3060;11791;18133;19828 True;True;True;True;True 1925;3096;11928;18354;20064 6334;6335;10022;10023;38913;38914;38915;59250;59251;64864;64865;64866;64867 8536;8537;13321;51443;51444;78353;78354;86049;86050;86051;86052;86053 8536;13321;51443;78353;86049 Q9H1E3 Q9H1E3 2 2 2 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 NUCKS1 sp|Q9H1E3|NUCKS_HUMAN Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUCKS1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.9 9.9 9.9 27.296 243 243 0.00050916 4.236 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76765 0.81574 2.418 7 2 Leave out requantified 0.58093 1.1517 0.80227 0.61433 1.222 0.82981 14.478 7.4167 27.998 2 2 3 0 0 2 Median Median Median 9.9 9.9 9.9 197170000 107080000 90096000 83895000 52591000 31303000 50830000 21824000 29006000 62448000 32661000 29786000 2031 1669;14050 True;True 1689;14226 5589;5590;5591;46157;46158;46159;46160 7535;7536;60911;60912;60913;60914;60915 7535;60914 Q9H1I8 Q9H1I8 7 7 7 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 ASCC2 sp|Q9H1I8|ASCC2_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC2 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 3 6 5 3 6 5 3 6 12.5 12.5 12.5 86.359 757 757 0 24.431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95215 1.0138 52.274 14 9 Leave out requantified 0.95215 1.0271 0.89857 1.0138 1.0297 0.92124 31.01 60.35 41.553 4 3 7 1 3 5 Leave out requantified Median Median 9.2 6.6 11.2 345420000 183860000 161560000 175050000 92066000 82979000 48242000 24793000 23449000 122130000 67001000 55129000 2032 3182;4419;12505;15549;17174;18392;20710 True;True;True;True;True;True;True 3223;4473;12648;15747;17386;18614;20950 10478;14457;14458;14459;14460;41105;50978;50979;56062;56063;56064;60046;60047;67574;67575 13935;19290;19291;19292;19293;19294;54330;67286;67287;74049;74050;74051;79409;79410;89571;89572 13935;19294;54330;67287;74049;79409;89572 Q9H223 Q9H223 20 19 16 EH domain-containing protein 4 EHD4 sp|Q9H223|EHD4_HUMAN EH domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHD4 PE=1 SV=1 1 20 19 16 17 18 16 16 17 15 14 14 13 44.7 43.3 38.1 61.174 541 541 0 122.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98595 1.0077 32.74 58 20 Leave out requantified 0.99535 0.95571 0.99057 1.0073 0.99012 1.0211 47.696 27.137 38.074 20 18 20 8 3 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36 40.9 35.7 2326700000 1185200000 1141600000 852670000 411510000 441160000 730500000 382700000 347800000 743570000 390950000 352620000 2033 314;601;1211;2807;2879;4308;5002;5710;5981;6225;9089;10391;10458;10764;11008;11351;12058;16309;20363;20900 True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 315;605;1226;2842;2914;4361;5063;5775;6052;6300;9195;10516;10584;10895;11141;11486;12199;16517;20602;21142 1064;1065;1066;2056;2057;2058;4064;4065;4066;4067;9210;9211;9212;9213;9438;9439;9440;9441;14101;14102;14103;16364;16365;16366;16367;16368;16369;16370;18481;19373;19374;19375;20093;20094;20095;20096;29797;29798;29799;29800;29801;29802;34349;34350;34351;34580;34581;35627;35628;35629;36382;36383;36384;37516;37517;37518;39753;39754;39755;53384;53385;53386;53387;53388;53389;66514;68190 1463;1464;1465;1466;1467;1468;2808;5464;5465;5466;5467;5468;5469;12251;12252;12253;12254;12551;12552;12553;12554;18796;18797;18798;18799;18800;21818;21819;21820;21821;21822;21823;21824;24586;25787;25788;25789;26697;26698;26699;26700;39518;39519;39520;39521;39522;39523;39524;39525;39526;45555;45835;45836;45837;45838;47220;47221;47222;48204;48205;48206;49667;49668;49669;52544;70522;70523;70524;70525;70526;70527;70528;88183;90363;90364 1464;2808;5465;12253;12552;18799;21823;24586;25788;26700;39524;45555;45835;47221;48206;49668;52544;70522;88183;90364 Q9H267 Q9H267 5 5 5 Vacuolar protein sorting-associated protein 33B VPS33B sp|Q9H267|VP33B_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 33B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS33B PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 5 4 3 5 4 3 5 11.2 11.2 11.2 70.584 617 617 0 23.964 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94715 1.0071 4.2267 13 7 Leave out requantified 0.97379 1.469 0.9432 1.0377 1.4893 0.99099 50.919 36.977 59.366 3 4 6 1 2 4 Median Linear Median 9.2 6.2 11.2 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isomerase-like 3 PPIL3 sp|Q9H2H8|PPIL3_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIL3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 11.8 11.8 11.8 18.154 161 161 0.00093633 3.1426 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 11.8 0 21961000 14423000 7537900 0 0 0 21961000 14423000 7537900 0 0 0 2036 19353 True 19583 63297 83941 83941 Q9H2K8 Q9H2K8 5 4 4 Serine/threonine-protein kinase TAO3 TAOK3 sp|Q9H2K8|TAOK3_HUMAN Serine/threonine-protein kinase TAO3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAOK3 PE=1 SV=2 1 5 4 4 5 3 2 4 2 1 4 2 1 6.3 4.9 4.9 105.4 898 898 0 7.942 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0485 1.062 39.322 10 5 Leave out requantified 0.9597 0.73147 0.74926 0.95983 0.75912 0.76896 37.881 47.478 34.561 5 2 3 2 1 2 Leave out requantified Median Median 6.3 3.9 2.8 69756000 39601000 30155000 40467000 24576000 15890000 10323000 5789000 4534100 18966000 9235200 9730700 2037 641;3104;10728;13571;14709 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out requantified Median Median 13.2 15.3 13.2 221520000 115980000 105550000 97531000 49522000 48008000 70307000 38173000 32134000 53686000 28281000 25406000 2040 8126;11323;16582;17098 True;True;True;True 8219;11458;16790;17310 26224;37430;37431;37432;54262;54263;55826;55827;55828;55829;55830 34940;49561;49562;49563;49564;49565;71605;71606;73724;73725;73726;73727;73728 34940;49565;71605;73726 Q9H3H1 Q9H3H1 3 3 3 tRNA dimethylallyltransferase, mitochondrial TRIT1 sp|Q9H3H1|MOD5_HUMAN tRNA dimethylallyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIT1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 1 2 0 1 2 0 1 2 6.9 6.9 6.9 52.725 467 467 0.00091659 2.9224 By MS/MS By MS/MS 1.7519 1.8115 9.1922 3 2 Median NaN NaN 1.6272 NaN NaN 1.6783 NaN NaN 10.797 0 1 2 0 1 1 Median Median Median 0 2.4 4.5 38318000 15817000 22500000 0 0 0 14593000 5835800 8757000 23725000 9981600 13743000 2041 4263;12378;13130 True;True;True 4316;12519;13286 13968;40724;43110 18611;53819;56916 18611;53819;56916 Q9H3K6 Q9H3K6 1 1 1 BolA-like protein 2 BOLA2 sp|Q9H3K6|BOLA2_HUMAN BolA-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BOLA2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.6 18.6 18.6 10.116 86 86 0.00092635 3.0318 By MS/MS By MS/MS By matching 1.1496 1.1271 9.4646 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 18.6 18.6 18.6 77726000 35442000 42284000 25810000 12088000 13722000 25942000 12170000 13772000 25973000 11184000 14789000 2042 2922 True 2957 9575;9576;9577 12722;12723 12722 Q9H3P2 Q9H3P2 14 14 14 Negative elongation factor A NELFA sp|Q9H3P2|NELFA_HUMAN Negative elongation factor A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NELFA PE=1 SV=3 1 14 14 14 12 13 10 12 13 10 12 13 10 35.4 35.4 35.4 57.276 528 528 0 70.138 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9367 0.97701 22.251 40 12 Leave out requantified 0.98627 0.92403 1.0265 1.0186 0.96954 1.0549 21.338 16.529 15.638 14 14 12 4 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.3 33.7 26.1 1577400000 783240000 794170000 596260000 269390000 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matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 SMARCAD1 sp|Q9H4L7|SMRCD_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCAD1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2.3 2.3 2.3 117.4 1026 1026 0.00052411 4.6565 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84092 0.86249 45.804 4 0 Leave out requantified 0.80311 NaN NaN 0.81614 NaN NaN 77.492 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.3 1.1 1.3 52332000 28852000 23480000 24979000 13782000 11197000 9586800 4602900 4983900 17766000 10467000 7298800 2053 11440;19256 True;True 11575;19486 37801;37802;62968;62969 50047;50048;50049;83493;83494 50047;83494 Q9H4M9 Q9H4M9 16 14 11 EH domain-containing protein 1 EHD1 sp|Q9H4M9|EHD1_HUMAN EH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHD1 PE=1 SV=2 1 16 14 11 11 14 13 9 12 11 9 9 9 40.1 36.7 30 60.626 534 534 0 114.13 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0321 0.99984 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N-methyltransferase SMYD3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMYD3 PE=1 SV=4 1 7 7 7 6 7 6 6 7 6 6 7 6 19.6 19.6 19.6 49.097 428 428 0 17.108 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99034 1.0638 11.509 22 6 Leave out requantified 1.069 1.0281 0.98047 1.0408 1.0835 0.94821 10.529 6.8884 18.889 7 9 6 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.2 19.6 15.2 889210000 444440000 444770000 319030000 169920000 149110000 309820000 148850000 160970000 260360000 125670000 134690000 2067 1835;2162;3331;8893;10497;11863;12783 True;True;True;True;True;True;True 1857;2191;3375;8997;10623;12000;12928 6121;6122;6123;7206;10947;10948;10949;29113;29114;29115;34702;34703;34704;39120;39121;39122;39123;41976;41977;41978;41979;41980 8230;8231;8232;8233;8234;8235;9645;14589;14590;14591;14592;38559;38560;38561;38562;38563;38564;45983;45984;51682;51683;51684;51685;55452;55453;55454;55455 8234;9645;14589;38560;45983;51683;55454 Q9H7D0 Q9H7D0 20 20 18 Dedicator of cytokinesis protein 5 DOCK5 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4289;4767;4768;4831;4832;9420;9421;9422;12666;12667;12668;36347;36348;36349;38628;38629;38630;38879;38880;38881;41208;41209;41210;45655;45656;53795;53796;53797 5771;6438;6439;6509;12525;12526;12527;16837;16838;16839;16840;16841;48157;48158;48159;48160;48161;51075;51076;51077;51078;51079;51398;51399;51400;54459;54460;54461;60197;60198;60199;60200;71026;71027;71028 5771;6438;6509;12526;16838;48158;51079;51399;54460;60199;71026 Q9H8Y8 Q9H8Y8 1 1 1 Golgi reassembly-stacking protein 2 GORASP2 sp|Q9H8Y8|GORS2_HUMAN Golgi reassembly-stacking protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GORASP2 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.7 2.7 2.7 47.145 452 452 0.00048123 3.4959 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2831 1.2877 15.02 4 4 Median 1.2831 NaN NaN 1.2877 NaN NaN 13.022 NaN NaN 2 1 1 2 1 1 Median Median Median 2.7 2.7 2.7 38213000 15227000 22986000 21514000 9632000 11882000 6701000 1977300 4723600 9998100 3617700 6380500 2075 12799 True 12944 42026;42027;42028;42029 55506;55507;55508;55509;55510;55511 55506 Q9H939 Q9H939 1 1 1 Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 PSTPIP2 sp|Q9H939|PPIP2_HUMAN Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSTPIP2 PE=1 SV=4 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.3 3.3 3.3 38.858 334 334 0.0059932 2.221 By MS/MS By MS/MS 2.3631 2.4636 31.397 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 3.3 3.3 75287000 19651000 55636000 0 0 0 36988000 10921000 26067000 38299000 8730400 29568000 2076 2844 True 2879 9319;9320;9321 12405;12406;12407 12405 Q9H993 Q9H993 4 4 4 Protein-glutamate O-methyltransferase ARMT1 sp|Q9H993|ARMT1_HUMAN Protein-glutamate O-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARMT1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 11.3 11.3 11.3 51.172 441 441 0 8.5981 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.046 1.1577 8.7973 11 3 Leave out requantified 0.93322 1.0561 1.088 1.0194 1.152 1.165 11.579 9.0085 10.425 3 4 4 0 2 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 9.1 9.3 11.3 196510000 93596000 102910000 59283000 26424000 32860000 69717000 33379000 36338000 67510000 33793000 33717000 2077 3337;13470;17849;20735 True;True;True;True 3381;13633;18066;20975 10971;10972;44216;44217;44218;58343;58344;58345;67645;67646;67647 14613;58357;58358;58359;77166;77167;77168;77169;77170;77171;89667;89668;89669 14613;58358;77169;89669 Q9H9A5 Q9H9A5 3 3 3 CCR4-NOT transcription complex subunit 10 CNOT10 sp|Q9H9A5|CNO10_HUMAN CCR4-NOT transcription complex subunit 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT10 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 5.4 5.4 5.4 82.309 744 744 0 9.4255 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1513 1.1916 26.522 9 4 Median 1.15 1.3668 0.96867 1.1801 1.4326 1.0073 24.29 26.648 23.766 4 3 2 2 1 1 Median Median Median 5.4 3.9 3.5 106190000 52409000 53784000 43426000 21979000 21448000 35368000 15773000 19595000 27398000 14657000 12741000 2078 8200;12772;13335 True;True;True 8294;12917;13496 26483;26484;26485;26486;26487;41937;41938;43768;43769 35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;55405;55406;57785;57786 35244;55405;57786 Q9H9A6 Q9H9A6 13 13 13 Leucine-rich repeat-containing protein 40 LRRC40 sp|Q9H9A6|LRC40_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC40 PE=1 SV=1 1 13 13 13 6 10 9 6 10 9 6 10 9 28.1 28.1 28.1 68.249 602 602 0 73.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97109 0.93257 16.154 25 10 Leave out requantified 0.89551 1.0049 1.0281 0.90223 1.0207 1.0237 11.991 20.658 14.708 6 10 9 2 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.6 21.1 18.8 721680000 365180000 356500000 145230000 76950000 68278000 328530000 156700000 171830000 247920000 131530000 116390000 2079 2398;6105;6176;7854;9158;10774;11744;11959;12243;12463;13065;14365;17219 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2428;6178;6250;7946;9266;10905;11881;12100;12384;12605;13218;14547;17431 7914;19728;19729;19730;19923;19924;25387;25388;25389;30053;35660;35661;38782;38783;39455;39456;39457;39458;40320;40321;40972;40973;40974;42913;47191;47192;56205;56206;56207 10580;26243;26244;26245;26246;26247;26248;26480;33871;33872;33873;39869;39870;47253;47254;51274;51275;52145;52146;52147;52148;53287;54140;54141;54142;54143;54144;54145;56669;62293;62294;74240;74241;74242;74243;74244;74245 10580;26248;26480;33872;39869;47254;51275;52145;53287;54143;56669;62294;74241 Q9H9C1 Q9H9C1 3 3 3 Spermatogenesis-defective protein 39 homolog VIPAS39 sp|Q9H9C1|SPE39_HUMAN Spermatogenesis-defective protein 39 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VIPAS39 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 6.5 6.5 6.5 57.005 493 493 0 12.284 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89726 0.89568 5.1455 9 5 Leave out requantified 0.91415 1.171 0.84046 0.92015 1.1718 0.8417 13.466 23.733 18.501 3 2 4 2 1 2 Median Median Median 5.1 4.5 6.5 102810000 50600000 52209000 34405000 16225000 18180000 23541000 12138000 11403000 44862000 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16450;16451;17468;17469;17470;17471;17472;22996;22997;25851;31077;31937;31938;31939;50919;50920;52261;52262;52263;52347;52348;55938;55939;56201;56202;56203;61137;61138;61139;68664;68665;68666 21922;21923;23230;23231;23232;23233;23234;23235;30658;30659;34474;41285;42446;42447;67220;67221;69001;69002;69003;69004;69005;69006;69007;69123;69124;73880;73881;74235;74236;74237;74238;80876;80877;80878;80879;91004 21923;23230;30658;34474;41285;42446;67221;69002;69123;73880;74235;80876;91004 Q9HAU5 Q9HAU5 9 9 9 Regulator of nonsense transcripts 2 UPF2 sp|Q9HAU5|RENT2_HUMAN Regulator of nonsense transcripts 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UPF2 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 8 6 7 8 6 7 8 6 8.5 8.5 8.5 147.81 1272 1272 0 31.657 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90913 0.94254 14.844 21 4 Leave out requantified 0.93764 0.88152 0.90895 0.96581 0.90721 0.93754 16.494 12.422 12.103 7 8 6 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.8 7.5 5.7 497290000 264950000 232340000 168540000 87086000 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8 8 Pleckstrin homology domain-containing family A member 2 PLEKHA2 sp|Q9HB19|PKHA2_HUMAN Pleckstrin homology domain-containing family A member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEKHA2 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 7 5 5 7 5 5 7 5 20.9 20.9 20.9 47.254 425 425 0 22.229 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86208 0.92601 14.091 14 3 Leave out requantified 0.85838 0.87745 0.8271 0.89943 0.88458 0.87889 19.295 14.601 19.103 4 6 4 1 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.7 17.4 13.9 509320000 307170000 202150000 170820000 111660000 59156000 241400000 144630000 96777000 97098000 50884000 46214000 2089 3187;3667;4538;7092;8682;16355;16868;20699 True;True;True;True;True;True;True;True 3228;3715;4592;7180;8784;16563;17079;20939 10492;12005;12006;12007;14853;14854;22905;22906;22907;28425;53545;53546;53547;55118;55119;55120;67533 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CACYBP sp|Q9HB71|CYBP_HUMAN Calcyclin-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACYBP PE=1 SV=2 1 12 12 12 12 9 8 12 9 8 12 9 8 61.8 61.8 61.8 26.21 228 228 0 54.764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99477 1.0159 14.687 31 7 Leave out requantified 0.91014 1.0828 0.98078 0.93351 1.1199 1.0086 10.261 21.201 9.766 11 10 10 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 61.8 57.5 47.4 1469600000 756460000 713150000 532700000 292990000 239710000 488650000 235290000 253360000 448260000 228180000 220080000 2091 426;2342;4672;9625;9834;9835;9849;9883;16006;17305;17523;20411 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 429;2372;4728;9743;9954;9955;9969;10004;16207;17517;17736;20650 1462;1463;1464;1465;1466;7742;7743;7744;15306;15307;15308;31612;31613;31614;32314;32315;32316;32317;32318;32319;32320;32371;32372;32501;52402;52403;52404;56478;56479;56480;56481;57179;57180;57181;66656 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5;1;0 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 CHD8 sp|Q9HCK8|CHD8_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD8 PE=1 SV=5 3 6 6 5 5 5 5 5 5 5 4 4 4 2.7 2.7 2.4 290.52 2581 2581;2897;2715 0 11.118 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8494 0.88617 21.351 15 1 Leave out requantified 0.99172 0.96019 0.87796 1.011 0.99941 0.90476 32.282 18.75 21.474 5 5 5 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 2.3 2.3 2.2 172950000 88012000 84934000 56255000 27920000 28335000 62663000 33043000 29620000 54028000 27048000 26980000 2097 2246;9794;14546;14976;16489;20259 True;True;True;True;True;True 2275;9914;14730;15167;16697;20497 7439;7440;7441;32191;32192;32193;47724;49108;49109;54000;54001;54002;66195;66196;66197 9954;42780;62973;64838;71286;87771;87772 9954;42780;62973;64838;71286;87771 Q9HCS7 Q9HCS7 2 2 2 Pre-mRNA-splicing factor SYF1 XAB2 sp|Q9HCS7|SYF1_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor SYF1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XAB2 PE=1 SV=2 1 2 2 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sp|Q9HD67|MYO10_HUMAN Unconventional myosin-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO10 PE=1 SV=3 1 3 3 3 0 3 0 0 3 0 0 3 0 1.8 1.8 1.8 237.34 2058 2058 0 5.2234 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 1.8 0 10824000 5242100 5581700 0 0 0 10824000 5242100 5581700 0 0 0 2100 2199;5023;17528 True;True;True 2228;5084;17741 7307;16440;57191 9786;21912;75575 9786;21912;75575 Q9NNW5 Q9NNW5 8 8 8 WD repeat-containing protein 6 WDR6 sp|Q9NNW5|WDR6_HUMAN WD repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR6 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 7 6 7 7 6 7 7 6 11.5 11.5 11.5 121.72 1121 1121 0 36.113 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97229 1.0307 10.495 30 16 Leave out requantified 1.0074 0.94524 0.95475 1.0464 1 1.0037 8.7207 12.545 18.178 12 10 8 8 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.3 10.7 9.5 485070000 227200000 257870000 188740000 85071000 103670000 156130000 77250000 78878000 140210000 64882000 75325000 2101 564;1653;2655;7413;9307;14383;19332;20281 True;True;True;True;True;True;True;True 568;1672;2689;7503;9416;14565;19562;20519 1925;1926;1927;1928;5536;5537;5538;8707;23975;23976;23977;23978;30547;30548;30549;30550;30551;30552;30553;47238;63215;63216;63217;63218;63219;63220;63221;66262;66263;66264 2623;2624;2625;2626;2627;2628;2629;2630;7469;7470;11612;31967;31968;31969;31970;31971;40530;40531;40532;40533;40534;40535;40536;62354;83833;83834;83835;83836;83837;87850;87851;87852;87853;87854 2626;7470;11612;31970;40535;62354;83835;87850 Q9NP64 Q9NP64 2 2 2 Nucleolar protein of 40 kDa ZCCHC17 sp|Q9NP64|NO40_HUMAN Nucleolar protein of 40 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZCCHC17 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 11.2 11.2 11.2 27.569 241 241 0.00050352 4.1272 By MS/MS By MS/MS By matching 1.0887 1.1789 8.0423 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 11.2 11.2 5.4 66952000 29642000 37310000 27174000 12018000 15156000 20113000 8236000 11877000 19665000 9388000 10277000 2102 2916;18961 True;True 2951;19188 9552;9553;61974;61975;61976 12686;12687;82086 12686;82086 Q9NP79 Q9NP79 3 3 3 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog VTA1 sp|Q9NP79|VTA1_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VTA1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 17.6 17.6 17.6 33.879 307 307 0 26.036 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97434 1.0115 26.002 8 6 Median NaN 1.0173 1.0002 NaN 1.0593 1.0355 NaN 33.238 19.849 1 4 3 0 4 2 Median Median Median 6.5 9.8 17.6 178610000 85326000 93288000 35844000 17735000 18109000 79119000 37142000 41977000 63651000 30449000 33202000 2103 12934;14845;20554 True;True;True 13084;15035;20793 42479;42480;42481;48712;67071;67072;67073;67074 56141;56142;56143;64284;88892;88893;88894;88895;88896;88897;88898 56141;64284;88895 Q9NP92 Q9NP92 2 2 2 28S ribosomal protein S30, mitochondrial MRPS30 sp|Q9NP92|RT30_HUMAN 39S ribosomal protein S30, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS30 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 4.3 4.3 4.3 50.364 439 439 0.0013562 2.7825 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 2.7 0 1.6 21515000 8126300 13388000 0 0 0 0 0 0 21515000 8126300 13388000 2104 6875;21038 True;True 6960;21284 22169;68599 29585;90922 29585;90922 Q9NPA8 Q9NPA8 2 2 2 Transcription and mRNA export factor ENY2 ENY2 sp|Q9NPA8|ENY2_HUMAN Transcription and mRNA export factor ENY2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENY2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 24.8 24.8 24.8 11.528 101 101 0.00093941 3.1819 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92892 0.98994 24.21 5 2 Median 1.0751 0.89645 NaN 1.137 0.91696 NaN 19.582 36.819 NaN 2 2 1 1 0 1 Median Median Median 24.8 24.8 7.9 134240000 64701000 69542000 48768000 24430000 24337000 61205000 27638000 33566000 24270000 12632000 11638000 2105 1161;7379 True;True 1174;7469 3896;3897;3898;3899;23857;23858 5243;5244;5245;5246;5247;31814 5245;31814 Q9NPD3 Q9NPD3 2 2 2 Exosome complex component RRP41 EXOSC4 sp|Q9NPD3|EXOS4_HUMAN Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 9 9 9 26.383 245 245 0 5.8056 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0728 1.0721 9.6617 4 0 Leave out requantified NaN 1.0833 NaN NaN 1.0837 NaN NaN 8.1419 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 5.7 9 5.7 59622000 30537000 29085000 16318000 9261200 7056900 25562000 11962000 13600000 17742000 9313900 8428000 2106 3932;15217 True;True 3983;15409 12895;49852;49853;49854 17143;65862;65863;65864;65865;65866;65867 17143;65864 Q9NPD8 Q9NPD8 2 2 2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T UBE2T sp|Q9NPD8|UBE2T_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2T PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 14.2 14.2 14.2 22.521 197 197 0 5.8436 By MS/MS 0.7927 0.81074 57.586 2 2 Median NaN NaN 0.7927 NaN NaN 0.81074 NaN NaN 57.586 0 0 2 0 0 2 Median Median Median 0 0 14.2 50210000 25826000 24384000 0 0 0 0 0 0 50210000 25826000 24384000 2107 1383;6206 True;True 1399;6280 4618;20031 6248;26619 6248;26619 Q9NPF4 Q9NPF4 2 2 2 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OSGEP sp|Q9NPF4|OSGEP_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEP PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 7.8 7.8 7.8 36.426 335 335 0 6.8654 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4934 1.5877 20.198 4 4 Linear NaN NaN 0.95396 NaN NaN 0.98395 NaN NaN 0.89155 1 1 2 1 1 2 Median Median Median 2.7 2.7 7.8 34219000 18162000 16057000 10092000 4998200 5093600 9004700 4202300 4802400 15122000 8961000 6161100 2108 12582;18717 True;True 12726;18942 41363;41364;41365;61133 54651;54652;54653;80873 54652;80873 Q9NPI6 Q9NPI6 1 1 1 mRNA-decapping enzyme 1A DCP1A sp|Q9NPI6|DCP1A_HUMAN mRNA-decapping enzyme 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCP1A PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 63.278 582 582 0.002635 2.5005 By matching By MS/MS By MS/MS 0.46978 0.38125 28.54 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 40846000 29046000 11800000 9601400 7338600 2262800 13511000 9243300 4268100 17733000 12464000 5269000 2109 16843 True 17054 55053;55054;55055 72671;72672 72671 Q9NPJ6 Q9NPJ6 2 2 2 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 MED4 sp|Q9NPJ6|MED4_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED4 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.9 5.9 5.9 29.745 270 270 0.0026408 2.5283 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.3 0 2.6 16822000 16822000 0 0 0 0 0 0 0 16822000 16822000 0 2110 3360;10544 True;True 3404;10670 11033;34844 14684;46178 14684;46178 Q9NQ29 Q9NQ29 8 3 3 Putative RNA-binding protein Luc7-like 1 LUC7L sp|Q9NQ29|LUC7L_HUMAN Putative RNA-binding protein Luc7-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUC7L PE=1 SV=1 1 8 3 3 8 7 7 3 2 2 3 2 2 23.5 10.8 10.8 43.727 371 371 0 17.272 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0598 1.0396 16.458 7 0 Leave out 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Q9NQ55 Q9NQ55 4 4 4 Suppressor of SWI4 1 homolog PPAN sp|Q9NQ55|SSF1_HUMAN Suppressor of SWI4 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPAN PE=2 SV=1 1 4 4 4 2 3 2 2 3 2 2 3 2 9.3 9.3 9.3 53.193 473 473 0 5.278 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90565 0.96363 49.298 5 2 Median NaN 0.81831 NaN NaN 0.85206 NaN NaN 68.38 NaN 1 3 1 0 2 0 Median Median Median 3.2 7.6 3.2 68512000 32971000 35541000 19177000 8828300 10349000 32711000 15252000 17459000 16624000 8890600 7733100 2112 11858;13226;17551;17623 True;True;True;True 11995;13386;17764;17839 39110;43407;43408;43409;57267;57525;57526 51670;57297;57298;57299;75671;76031;76032 51670;57298;75671;76031 Q9NQ88 Q9NQ88 1 1 1 Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR TIGAR sp|Q9NQ88|TIGAR_HUMAN Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGAR PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.3 6.3 6.3 30.062 270 270 0 9.9668 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1414 1.1629 18.722 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 Median Median Median 6.3 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32895;32896;32897;32898;32899;32900;34471;36447;36448;36449;36450;36451;36452;36453;36454;44816;44817;44818;44819;44820;65128;65129;91148;91149;91150;91151;91152;91153;91154;91155;91156;91157;91158;91159;91160 32896;34471;36449;44816;65129;91152 Q9NQG5 Q9NQG5 4 3 3 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B RPRD1B sp|Q9NQG5|RPR1B_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1 1 4 3 3 2 3 2 2 2 1 2 2 1 17.8 13.2 13.2 36.899 326 326 0 7.8569 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87422 0.90933 39.042 5 1 Leave out requantified 0.63621 1.0498 NaN 0.66238 1.0667 NaN 44.812 14.005 NaN 2 2 1 0 1 0 Median Median Median 8.6 12.9 9.2 100860000 57508000 43355000 32222000 22167000 10055000 37982000 19021000 18961000 30659000 16320000 14339000 2116 4253;8652;12464;17258 True;True;False;True 4306;8754;12606;17470 13942;13943;28337;40975;40976;40977;56323;56324 18577;18578;37514;54146;54147;54148;74413;74414;74415 18577;37514;54148;74414 Q9NQT5 Q9NQT5 5 5 5 Exosome complex component RRP40 EXOSC3 sp|Q9NQT5|EXOS3_HUMAN Exosome complex component RRP40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC3 PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 29.1 29.1 29.1 29.572 275 275 0 31.654 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95527 0.97349 25.714 24 8 Leave out requantified 1.176 0.95527 0.89326 1.2081 0.97349 0.95955 7.2026 14.632 22.703 8 7 9 3 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 21.8 29.1 477190000 238380000 238810000 175320000 88470000 86849000 140980000 65699000 75285000 160890000 84214000 76675000 2117 3130;6775;8316;11541;19001 True;True;True;True;True 3168;6860;8412;11676;19228 10308;10309;10310;21849;21850;21851;21852;21853;27033;27034;27035;38148;38149;38150;38151;38152;62127;62128;62129;62130;62131;62132;62133;62134 13719;29157;29158;29159;35893;35894;35895;50478;50479;50480;50481;50482;82289;82290;82291;82292;82293;82294;82295;82296;82297;82298;82299 13719;29157;35894;50480;82289 Q9NQT8;Q9H1H9 Q9NQT8 3;1 3;1 3;1 Kinesin-like protein KIF13B KIF13B sp|Q9NQT8|KI13B_HUMAN Kinesin-like protein KIF13B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF13B PE=1 SV=2 2 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 1.8 1.8 1.8 202.79 1826 1826;1805 0.00091324 2.8899 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8833 0.88067 2.067 5 0 Leave out requantified NaN 0.93597 0.89184 NaN 0.93087 0.88831 NaN 8.2142 3.2877 1 2 2 0 0 0 Median Median Median 0.4 1.8 1 158970000 84225000 74747000 16497000 9090700 7406200 74376000 37801000 36575000 68099000 37334000 30765000 2118 12356;13411;18524 True;True;True 12497;13573;18748 40653;40654;44025;44026;44027;60502 53728;53729;58111;80022 53729;58111;80022 Q9NQW6 Q9NQW6 18 18 18 Actin-binding protein anillin ANLN sp|Q9NQW6|ANLN_HUMAN Anillin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANLN PE=1 SV=2 1 18 18 18 15 16 14 15 16 14 15 16 14 16.2 16.2 16.2 124.2 1124 1124 0 45.024 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96847 1.005 23.09 46 13 Leave out requantified 0.87981 0.95886 0.96758 0.91523 0.98406 1.0317 44.378 13.102 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True;True;True;True;True;True 1959;4029;7256;7896;8948;19525 6430;6431;6432;6433;6434;13033;13034;13035;23150;25235;28944;28945;28946;28947;28948;63083;63084 8675;8676;8677;8678;8679;17331;17332;17333;30857;33678;38334;38335;83660 8675;17331;30857;33678;38335;83660 Q9NQY0 Q9NQY0 2 2 2 Bridging integrator 3 BIN3 sp|Q9NQY0|BIN3_HUMAN Bridging integrator 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BIN3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 7.5 7.5 7.5 29.665 253 253 0.0022492 2.7205 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 3.2 4.3 0 7515900 5684800 1831100 0 0 0 7515900 5684800 1831100 0 0 0 2121 1435;5139 True;True 1452;5200 4777;16745 6450;22279 6450;22279 Q9NQZ2 Q9NQZ2 1 1 1 Something about silencing protein 10 UTP3 sp|Q9NQZ2|SAS10_HUMAN Something about silencing protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UTP3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 4.6 4.6 4.6 54.557 479 479 0.0095515 1.9485 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN 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NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 7.4 0 7.4 24060000 8931700 15128000 10217000 3467800 6749200 0 0 0 13843000 5463900 8379200 2167 19301 True 19531 63101;63102 83682;83683;83684 83683 Q9NVS2 Q9NVS2 1 1 1 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial MRPS18A sp|Q9NVS2|RT18A_HUMAN 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS18A PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.6 4.6 4.6 22.184 196 196 0.0026385 2.5117 By MS/MS By MS/MS By matching 1.0282 1.0711 6.9267 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.6 4.6 4.6 38137000 18467000 19670000 11041000 5021600 6019400 13637000 6616000 7021000 13459000 6829600 6629900 2168 5642 True 5707 18284;18285;18286 24332;24333 24332 Q9NVU0 Q9NVU0 2 2 2 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5 POLR3E sp|Q9NVU0|RPC5_HUMAN DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3E PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3 3 3 79.897 708 708 0.00092807 3.0548 By 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Gem-associated protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GEMIN8 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 11.6 11.6 11.6 28.636 242 242 0 5.4453 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0906 1.0829 6.7221 6 0 Leave out requantified 1.0936 1.0064 1.1019 1.1085 0.99255 1.0829 3.4458 19.651 6.7221 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 11.6 11.6 11.6 164900000 85984000 78916000 52726000 26234000 26492000 59980000 32446000 27534000 52194000 27304000 24890000 2179 10807;17157 True;True 10938;17369 35762;35763;35764;56007;56008;56009 47385;47386;47387;73969;73970;73971;73972;73973;73974 47386;73969 Q9NX24 Q9NX24 4 4 4 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 NHP2 sp|Q9NX24|NHP2_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NHP2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 37.9 37.9 37.9 17.201 153 153 0 18.908 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82772 0.85142 17.766 12 2 Leave out requantified 1.0231 0.82772 0.79529 1.0284 0.85142 0.82247 33.731 13.056 20.668 4 4 4 2 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 37.9 25.5 25.5 407180000 220870000 186310000 141740000 78968000 62770000 135800000 76250000 59549000 129640000 65650000 63989000 2180 9157;13785;17496;18711 True;True;True;True 9265;13952;17709;18936 30052;45294;45295;45296;45297;45298;45299;45300;57099;57100;57101;61113;61114;61115;61116;61117 39868;59728;59729;59730;59731;59732;59733;59734;59735;59736;59737;75427;75428;80847;80848;80849;80850;80851;80852;80853 39868;59736;75428;80848 Q9NX46 Q9NX46 2 2 2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 ADPRHL2 sp|Q9NX46|ARHL2_HUMAN ADP-ribose glycohydrolase ARH3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADPRHL2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.3 8.3 8.3 38.946 363 363 0 5.5738 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.038 1.0367 12.455 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 4.4 3.9 3.9 21610000 11413000 10197000 0 0 0 11034000 4200400 6833600 10576000 7212800 3363400 2181 8545;17535 True;True 8647;17748 27949;57211;57212;57213 36961;75600;75601;75602 36961;75600 Q9NX55 Q9NX55 1 1 1 Huntingtin-interacting protein K HYPK sp|Q9NX55|HYPK_HUMAN Huntingtin-interacting protein K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HYPK PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 13.2 13.2 13.2 14.665 129 129 0 18.522 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 13.2 0 0 13873000 7870700 6002700 13873000 7870700 6002700 0 0 0 0 0 0 2182 4598 True 4653 15035 20056;20057 20057 Q9NX58 Q9NX58 14 14 14 Cell growth-regulating nucleolar protein LYAR sp|Q9NX58|LYAR_HUMAN Cell growth-regulating nucleolar protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LYAR PE=1 SV=2 1 14 14 14 11 12 13 11 12 13 11 12 13 41.2 41.2 41.2 43.614 379 379 0 108.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9897 1.0444 17.342 50 9 Leave out requantified 1.1284 0.9172 1.052 1.1778 0.94794 1.0808 17.59 21.058 18.692 16 17 17 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.7 35.1 40.9 2658000000 1373100000 1284900000 840150000 410340000 429810000 998080000 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10503;10504;10505;10506;10507;10508;11370;11371;11372;21062;21063;21064;21065;21066;21067;21068;21069;21070;21071;22292;22293;22294;22295;22296;22297;22298;22299;22300;22301;22302;22303;33180;33181;43996;52389;52390;52391;52392;52393;52394;52395;52396;57934;57935;57936;57937;57938;57939;62201;62202;62203;68754;68755;68756;83066;83067;83068;83069;83070;83071;83072;84351;84352;84353;84354;84355;84356;84357;84570;84571;84572;84573;84574;84575;84576;84577;84578;84579;84580;84581;84582;84583;84584 10508;11371;21064;22303;33181;43996;52393;57934;62203;68756;83071;84351;84357;84574 Q9NXV6 Q9NXV6 12 12 12 CDKN2A-interacting protein CDKN2AIP sp|Q9NXV6|CARF_HUMAN CDKN2A-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDKN2AIP PE=1 SV=3 1 12 12 12 11 9 9 11 9 9 11 9 9 25.5 25.5 25.5 61.124 580 580 0 62.448 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97674 1.0058 25.311 33 12 Leave out requantified 1.0639 0.86222 0.90376 1.0351 0.84745 0.93097 28.193 23.365 16.642 12 10 11 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.8 18.8 19.7 519410000 284920000 234490000 226610000 122550000 104060000 150310000 80888000 69426000 142480000 81475000 61005000 2184 7284;9321;16937;16989;17001;17002;17007;17026;17116;17260;18408;20095 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7374;9430;17148;17201;17213;17214;17219;17238;17328;17472;18630;20331 23563;23564;23565;30588;30589;30590;55320;55321;55476;55477;55509;55510;55511;55512;55513;55514;55515;55523;55524;55525;55579;55580;55581;55582;55583;55584;55875;55876;55877;56327;60099;60100;65698;65699 31412;31413;31414;40582;73021;73022;73023;73243;73244;73245;73290;73291;73292;73293;73294;73295;73296;73297;73298;73299;73307;73308;73309;73310;73311;73378;73379;73380;73381;73382;73383;73779;73780;73781;74420;79484;79485;87130;87131 31412;40582;73022;73243;73293;73298;73308;73379;73781;74420;79485;87131 Q9NXX6 Q9NXX6 1 1 1 Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A NSMCE4A sp|Q9NXX6|NSE4A_HUMAN Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSMCE4A PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.6 3.6 3.6 44.301 385 385 0.00049092 3.7843 By MS/MS By MS/MS 0.57048 0.58806 7.5833 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 3.6 0 3.6 20496000 12028000 8468100 10770000 5916200 4853400 0 0 0 9726200 6111500 3614700 2185 17652 True 17868 57609;57610 76129;76130 76129 Q9NY12 Q9NY12 3 3 3 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 GAR1 sp|Q9NY12|GAR1_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAR1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 0 2 1 0 2 1 0 2 20.7 20.7 20.7 22.348 217 217 0 7.2906 By MS/MS By MS/MS 1.1064 1.1728 52.423 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 9.2 0 11.5 64746000 23818000 40928000 10573000 4105300 6467200 0 0 0 54173000 19712000 34461000 2186 2227;2595;20253 True;True;True 2256;2629;20491 7380;8522;66176 9878;9879;11373;87746 9879;11373;87746 Q9NY93 Q9NY93 2 2 2 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 DDX56 sp|Q9NY93|DDX56_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX56 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.5 5.5 5.5 61.589 547 547 0.00047281 3.2772 By MS/MS By matching By MS/MS 0.90224 0.95236 26.314 4 1 Median 0.74055 NaN NaN 0.75741 NaN NaN 33.334 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 5.5 2.9 2.9 66313000 33667000 32646000 28616000 16038000 12579000 17552000 8380400 9171900 20144000 9248400 10895000 2187 1771;18803 True;True 1792;19028 5921;5922;5923;61406 7974;7975;81236 7974;81236 Q9NYF8 Q9NYF8 8 8 8 Bcl-2-associated transcription factor 1 BCLAF1 sp|Q9NYF8|BCLF1_HUMAN Bcl-2-associated transcription factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCLAF1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 7 1 5 7 1 5 7 1 9.9 9.9 9.9 106.12 920 920 0 15.495 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79351 0.80233 23.334 11 4 Leave out requantified 0.82819 0.85385 NaN 0.84488 0.89213 NaN 40.393 26.576 NaN 4 6 1 2 2 0 Median Leave out requantified Median 7.3 8.9 1.5 258030000 135670000 122360000 120410000 66757000 53655000 121320000 62069000 59252000 16300000 6849000 9451300 2188 3467;5394;6252;15634;16803;16926;17196;17831 True;True;True;True;True;True;True;True 3512;5456;6329;15832;17014;17137;17408;18048 11359;17540;17541;20177;51244;54940;54941;55283;55284;55285;56136;58278;58279 15101;23316;23317;23318;26809;67596;67597;72519;72520;72959;72960;72961;72962;72963;74154;77080;77081 15101;23317;26809;67597;72520;72962;74154;77080 Q9NYL2 Q9NYL2 4 4 4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase MLT ZAK sp|Q9NYL2|M3K20_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K20 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 6.6 6.6 6.6 91.154 800 800 0 11.406 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0304 1.0383 8.4447 9 0 Leave out requantified 1.0304 1.1603 1.0036 1.0383 1.2052 1.0024 12.762 13.03 8.9734 3 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.8 4.8 6.6 175390000 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1882;1883;1884;9813;9814;9815;9816;9817;23522;23523;45842;45843;45844;45845;80755 1882;9814;23522;45842;80755 Q9NZI8 Q9NZI8 5 3 3 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 IGF2BP1 sp|Q9NZI8|IF2B1_HUMAN Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGF2BP1 PE=1 SV=2 1 5 3 3 4 5 4 2 3 2 2 3 2 11.4 7.5 7.5 63.48 577 577 0 8.7621 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88307 0.90722 19.733 5 2 Median 1.1987 0.79018 NaN 1.2103 0.83206 NaN 0.56066 8.4717 NaN 2 2 1 1 1 0 Median Median Median 9 11.4 9 66813000 35398000 31415000 25236000 11781000 13455000 30141000 16588000 13553000 11435000 7028100 4407200 2192 809;3321;9184;11847;13253 True;True;False;True;False 818;3365;9292;11984;13413 2761;2762;2763;10911;10912;10913;30141;30142;30143;39080;43481;43482;43483;43484;43485;43486 3734;3735;3736;3737;14532;14533;14534;39992;51629;57388;57389;57390;57391;57392;57393;57394;57395;57396;57397;57398 3736;14534;39992;51629;57398 Q9NZJ0 Q9NZJ0 5 5 5 Denticleless protein homolog DTL sp|Q9NZJ0|DTL_HUMAN Denticleless protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTL PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 8.2 8.2 8.2 79.467 730 730 0 8.4918 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81096 0.84326 9.6214 10 1 Leave out requantified 0.76811 0.85441 0.87348 0.80738 0.88112 0.92465 20.422 12.481 16.619 4 3 3 1 0 0 Median Median Median 6.7 4.7 4.9 181890000 95097000 86797000 70011000 39312000 30699000 57636000 28914000 28722000 54247000 26871000 27376000 2193 590;7850;8657;12682;15311 True;True;True;True;True 594;7942;8759;12827;15504 2015;2016;25373;28350;28351;28352;41681;41682;50142;50143;50144;50145;50146;50147 2741;2742;33849;37531;37532;37533;55101;55102;66250;66251;66252;66253;66254;66255 2741;33849;37533;55101;66250 Q9NZJ4 Q9NZJ4 3 3 3 Sacsin SACS sp|Q9NZJ4|SACS_HUMAN Sacsin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SACS PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 0.6 0.6 0.6 521.12 4579 4579 0 5.2306 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1205 1.1009 56.337 7 1 Leave out requantified 1.0266 1.2601 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7950;85524 Q9NZM1 Q9NZM1 8 8 8 Myoferlin MYOF sp|Q9NZM1|MYOF_HUMAN Myoferlin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYOF PE=1 SV=1 1 8 8 8 3 3 4 3 3 4 3 3 4 5.1 5.1 5.1 234.71 2061 2061 0 26.194 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78708 0.79563 47.42 6 5 Median 0.67377 NaN 0.84552 0.67966 NaN 0.87254 34.356 NaN 74.967 3 1 2 3 0 2 Median Median Median 1.7 1.8 2.6 80082000 41090000 38993000 35282000 20178000 15104000 18768000 6570600 12197000 26033000 14341000 11691000 2196 3303;3713;4869;7670;15781;16244;16504;21134 True;True;True;True;True;True;True;True 3347;3762;4928;7761;15981;16450;16712;21380 10857;12169;15972;15973;24813;51714;53180;54036;68880;68881 14459;16147;21262;21263;33122;68257;70242;71320;91295;91296 14459;16147;21263;33122;68257;70242;71320;91295 Q9NZM5 Q9NZM5 2 2 2 Glioma tumor suppressor candidate region gene 2 protein GLTSCR2 sp|Q9NZM5|NOP53_HUMAN Ribosome biogenesis protein NOP53 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP53 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.9 6.9 6.9 54.389 478 478 0.00049407 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17291;26091;27439;59796;75934 Q9P021 Q9P021 2 2 2 Cysteine-rich PDZ-binding protein CRIPT sp|Q9P021|CRIPT_HUMAN Cysteine-rich PDZ-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRIPT PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 27.7 27.7 27.7 11.216 101 101 0.00048309 3.5313 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62455 0.61648 24.84 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 27.7 16.8 10.9 24408000 16075000 8332900 6533300 4264700 2268500 4857100 2898100 1959000 13017000 8911900 4105400 2203 11255;17024 True;True 11389;17236 37173;37174;55573;55574;55575 49230;49231;73372;73373;73374 49231;73373 Q9P086 Q9P086 1 1 1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 MED11 sp|Q9P086|MED11_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED11 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.2 16.2 16.2 13.129 117 117 0.0067969 2.1074 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.8134 1.7773 13.435 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPACT PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.4 3.4 3.4 36.476 320 320 0.0022442 2.6861 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2293 1.2063 19.498 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 3.4 3.4 3.4 17158000 8158900 8999300 5623500 2546200 3077200 6507800 2726200 3781600 5026900 2886500 2140500 2221 14264 True 14445 46872;46873;46874 61873;61874;61875 61873 Q9UBB4 Q9UBB4 14 14 14 Ataxin-10 ATXN10 sp|Q9UBB4|ATX10_HUMAN Ataxin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATXN10 PE=1 SV=1 1 14 14 14 12 14 13 12 14 13 12 14 13 36.4 36.4 36.4 53.488 475 475 0 87.645 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93677 0.95251 13.149 42 10 Leave out requantified 1.0307 0.99221 0.80863 1.0619 1.0057 0.83327 15.454 9.5669 17.024 13 15 14 2 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.7 36.4 33.9 1218700000 610710000 608020000 394250000 190310000 203940000 427230000 206300000 220940000 397250000 214110000 183140000 2222 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Neurochondrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCDN PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1.6 1.6 1.6 78.863 729 729 0.00091158 2.8563 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.6 0 0 11882000 5723300 6158900 11882000 5723300 6158900 0 0 0 0 0 0 2223 12103 True 12244 39882 52729 52729 Q9UBB9 Q9UBB9 4 4 4 Tuftelin-interacting protein 11 TFIP11 sp|Q9UBB9|TFP11_HUMAN Tuftelin-interacting protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFIP11 PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 4 2 1 4 2 1 4 2 6.7 6.7 6.7 96.819 837 837 0 8.9178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77615 0.77397 46.081 6 2 Leave out requantified NaN 0.77615 1.3153 NaN 0.77397 1.3058 NaN 42.203 12.249 1 3 2 0 0 2 Median Leave out requantified Median 1.7 6.7 4.4 105320000 56900000 48424000 11275000 5943000 5331500 54769000 33089000 21681000 39280000 17868000 21412000 2224 376;2571;10946;16485 True;True;True;True 378;2604;11077;16693 1284;1285;1286;8445;36183;53992;53993 1739;1740;1741;11281;47936;47937;71278;71279 1740;11281;47936;71278 Q9UBD5 Q9UBD5 10 10 9 Origin recognition complex subunit 3 ORC3 sp|Q9UBD5|ORC3_HUMAN Origin recognition complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC3 PE=1 SV=1 1 10 10 9 7 8 8 7 8 8 6 8 7 16 16 15 82.253 711 711 0 29.76 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93866 0.97903 40.02 23 3 Leave out requantified 1.1599 0.89962 0.93214 1.2042 0.92759 0.96048 28.462 44.09 19.375 8 8 7 3 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.1 13.9 12.2 652270000 337320000 314950000 267380000 141690000 125690000 207190000 102270000 104930000 177690000 93361000 84328000 2225 1819;3133;5095;9392;12128;12844;15256;16333;17273;17501 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1841;3171;5156;9508;12269;12990;15448;16541;17485;17714 6083;10321;16617;30852;30853;30854;30855;39955;39956;42167;42168;42169;49971;49972;49973;53471;53472;53473;53474;56370;56371;56372;56373;57121;57122;57123 8176;13734;22120;40972;40973;40974;40975;40976;52814;52815;55708;55709;55710;66015;70626;70627;74489;74490;75465;75466 8176;13734;22120;40976;52814;55709;66015;70627;74490;75465 Q9UBK8 Q9UBK8 4 4 4 Methionine synthase reductase MTRR sp|Q9UBK8|MTRR_HUMAN Methionine synthase reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTRR PE=1 SV=4 1 4 4 4 2 4 4 2 4 4 2 4 4 8 8 8 77.673 698 698 0 20.187 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75993 0.79739 21.695 11 7 Leave out requantified 1.176 0.9247 0.97947 1.2198 0.90041 0.98815 38.462 33.807 40.525 2 5 4 1 4 2 Median Median Median 3.9 8 8 302700000 157860000 144850000 56585000 29218000 27368000 134320000 68558000 65761000 111800000 60081000 51719000 2226 1811;2354;7688;21186 True;True;True;True 1833;2384;7779;21433 6057;6058;7776;7777;7778;7779;7780;24864;24865;69045;69046;69047 8145;8146;10381;10382;10383;10384;33182;33183;91526;91527;91528;91529 8145;10384;33182;91528 Q9UBL3 Q9UBL3 1 1 1 Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 ASH2L sp|Q9UBL3|ASH2L_HUMAN Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASH2L PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.6 1.6 1.6 68.722 628 628 0.0079665 2.0279 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0823 1.1963 46.791 4 3 Median NaN NaN 1.1918 NaN NaN 1.3251 NaN NaN 68.864 1 1 2 0 1 2 Median Median Median 1.6 1.6 1.6 34989000 16530000 18459000 12688000 6500800 6187400 7590300 3115000 4475300 14711000 6914600 7796300 2227 2846 True 2881 9325;9326;9327;9328 12409;12410;12411;12412;12413 12411 Q9UL62;Q9UBN4 Q9UL62;Q9UBN4 1;1 1;1 1;1 Short transient receptor potential channel 5;Short transient receptor potential channel 4 TRPC5;TRPC4 sp|Q9UL62|TRPC5_HUMAN Short transient receptor potential channel 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRPC5 PE=1 SV=1;sp|Q9UBN4|TRPC4_HUMAN Short transient receptor potential channel 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRPC4 PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.7 0.7 0.7 111.41 973 973;977 0.0063748 2.1171 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98623 1.0135 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MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.8 2.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2230 5806;16869 True;True 5872;17080 18782;55121 24987;72756 24987;72756 Q9UBP9 Q9UBP9 1 1 1 PTB domain-containing engulfment adapter protein 1 GULP1 sp|Q9UBP9|GULP1_HUMAN PTB domain-containing engulfment adapter protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GULP1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.6 3.6 3.6 34.49 304 304 0.007176 2.0732 By MS/MS By MS/MS 0.48109 0.51342 13.81 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 3.6 3.6 50836000 35224000 15612000 0 0 0 21467000 15034000 6432200 29370000 20190000 9180100 2231 6146 True 6219 19846;19847 26386;26387 26386 Q9UBQ5 Q9UBQ5 3 3 3 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K EIF3K sp|Q9UBQ5|EIF3K_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3K PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 17.9 17.9 17.9 25.059 218 218 0 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6182;9798;14516;67909;76185 Q9UBW8 Q9UBW8 1 1 1 COP9 signalosome complex subunit 7a COPS7A sp|Q9UBW8|CSN7A_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 7a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS7A PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 8 30.276 275 275 0.00051361 4.3731 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2968 1.2645 34.186 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 8 8 8 46576000 26741000 19835000 16785000 11974000 4810700 15975000 8152300 7822200 13817000 6615200 7202300 2239 20159 True 20395 65889;65890;65891;65892 87378;87379;87380;87381 87381 Q9UDY2 Q9UDY2 10 10 10 Tight junction protein ZO-2 TJP2 sp|Q9UDY2|ZO2_HUMAN Tight junction protein ZO-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TJP2 PE=1 SV=2 1 10 10 10 8 8 7 8 8 7 8 8 7 11.8 11.8 11.8 133.96 1190 1190 0 26.526 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88241 0.93828 11.055 21 3 Leave out requantified 0.917 0.75017 1.0086 0.97905 0.77548 1.0621 18.757 11.895 10.126 7 7 7 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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MS/MS 1.0464 1.122 1.8625 17 6 Leave out requantified 1.0926 1.0008 1.0361 1.1414 1.031 1.1083 5.3006 12.177 59.238 6 5 6 2 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Median 24.1 21.7 19.6 588870000 319370000 269500000 216800000 117660000 99140000 172030000 92682000 79349000 200030000 109020000 91008000 2257 4717;5835;8407;12386;15577;18339 True;True;True;True;True;True 4773;5903;8505;12527;15775;18561 15475;15476;18898;18899;18900;18901;27389;40746;40747;40748;40749;40750;40751;51062;51063;51064;59904 20622;20623;25148;25149;25150;25151;25152;36296;53844;53845;53846;53847;53848;53849;53850;53851;53852;53853;53854;53855;67384;67385;67386;67387;79223 20622;25151;36296;53846;67387;79223 Q9UHD8 Q9UHD8 22 22 22 Septin-9 SEPT9 sp|Q9UHD8|SEPT9_HUMAN Septin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT9 PE=1 SV=2 1 22 22 22 17 18 20 17 18 20 17 18 20 42 42 42 65.401 586 586 0 227.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94073 0.97689 49.621 73 7 Leave out requantified 0.93685 0.93054 0.97028 0.95568 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10424;10425;10426;10427;10428 10424 Q9UHV9 Q9UHV9 3 3 3 Prefoldin subunit 2 PFDN2 sp|Q9UHV9|PFD2_HUMAN Prefoldin subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 21.4 21.4 21.4 16.648 154 154 0 6.9969 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.045 1.0886 51.45 7 1 Leave out requantified 0.9271 1.045 1.2777 0.99316 1.0886 1.3575 0.61632 64.113 53.613 2 3 2 1 0 0 Median Leave out requantified Median 14.3 21.4 14.9 200570000 76281000 124290000 38476000 20066000 18410000 84290000 34204000 50086000 77808000 22011000 55797000 2264 5564;9066;11882 True;True;True 5629;9171;12020 18076;18077;29688;29689;29690;39179;39180 24063;24064;39378;39379;39380;51769;51770 24064;39380;51770 Q9UHX1 Q9UHX1 16 16 16 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 PUF60 sp|Q9UHX1|PUF60_HUMAN Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUF60 PE=1 SV=1 1 16 16 16 16 12 13 16 12 13 16 12 13 35.1 35.1 35.1 59.875 559 559 0 179.03 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96046 0.99443 14.368 53 11 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2026;2027;3198;3199;3200;3201;3202;3203;3204;3205;3206;3207;3208;4941;4942;4943;6866;6867;6868;6869;6870;20188;20189;20190;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;28544;28545;28546;28547;28548;28549;28550;42708;49088;49089;49090;49091;49092;49093;49094;52421;52422;52423;66892;66893;86525;86526;86527;86528;86529;86530;86531;86900;86901;88030 2027;3207;4943;6868;20188;21272;28544;42708;49093;52422;66893;86527;86901;88030 Q9UI12 Q9UI12 1 1 1 V-type proton ATPase subunit H ATP6V1H sp|Q9UI12|VATH_HUMAN V-type proton ATPase subunit H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1H PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.7 2.7 2.7 55.882 483 483 0.0004914 3.8011 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2267 14912 True 15102 48919 64568 64568 Q9UI30 Q9UI30 6 6 6 Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein TRMT112 sp|Q9UI30|TR112_HUMAN Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRMT112 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 4 5 5 4 5 5 4 5 59.2 59.2 59.2 14.199 125 125 0 48.588 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96412 0.95248 7.2545 19 3 Leave out requantified 0.97047 0.90312 0.99518 0.98059 0.90758 0.98024 4.8504 5.2586 11.194 7 6 6 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48 42.4 53.6 2464900000 1238400000 1226500000 1849900000 933340000 916590000 317500000 160330000 157170000 297510000 144740000 152770000 2268 7266;7668;8693;11830;12109;19128 True;True;True;True;True;True 7356;7759;8795;11967;12250;19358 23506;23507;23508;23509;23510;24804;24805;24806;28461;28462;28463;28464;28465;28466;39030;39031;39032;39033;39034;39035;39900;62569 31330;31331;31332;31333;31334;31335;33108;33109;33110;33111;33112;33113;37676;37677;37678;37679;37680;37681;37682;37683;37684;51579;51580;51581;51582;51583;52748;82902;82903 31334;33113;37681;51580;52748;82902 Q9UID3 Q9UID3 3 3 3 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog VPS51 sp|Q9UID3|VPS51_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS51 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 5.4 5.4 5.4 86.041 782 782 0 6.813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80834 0.81522 19.067 8 6 Median 0.76513 0.73725 0.8865 0.78103 0.74516 0.87768 18.954 30.605 14.681 4 2 2 3 2 1 Median Median Median 5.4 3.5 3.5 105840000 59417000 46418000 56284000 32237000 24048000 22076000 13149000 8926800 27475000 14032000 13444000 2269 796;1349;10574 True;True;True 805;1365;10701 2714;2715;2716;2717;2718;4504;4505;34978;34979 3666;3667;3668;3669;3670;6074;6075;46368;46369 3666;6075;46368 Q9UIG0 Q9UIG0 5 5 5 Tyrosine-protein kinase BAZ1B BAZ1B sp|Q9UIG0|BAZ1B_HUMAN Tyrosine-protein kinase BAZ1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAZ1B PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3.6 3.6 3.6 170.9 1483 1483 0 8.4694 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82102 0.88649 19.708 5 1 Leave out requantified 0.73311 1.0113 NaN 0.7836 1.0528 NaN 2.2601 19.903 NaN 2 2 1 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8346;49362;52208;61312;64422;90198 Q9UJX3 Q9UJX3 9 9 9 Anaphase-promoting complex subunit 7 ANAPC7 sp|Q9UJX3|APC7_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC7 PE=1 SV=4 1 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17.7 17.7 17.7 66.855 599 599 0 44.751 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95572 0.98085 17.614 28 10 Leave out requantified 0.9235 0.92312 0.99204 0.96358 0.95715 1.013 17.758 19.991 48.595 9 10 9 2 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.7 17.7 16 926360000 500130000 426230000 318970000 176730000 142240000 373510000 194950000 178560000 233880000 128450000 105430000 2273 1135;2320;3885;5900;14423;19902;19981;20641;21043 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1147;2350;3935;5970;14605;20138;20217;20881;21289 3800;3801;7689;12730;12731;12732;19104;19105;19106;19107;19108;19109;19110;47366;47367;47368;65082;65083;65084;65314;65315;65316;67358;67359;67360;68614;68615;68616 5096;5097;10275;16917;16918;16919;25426;25427;25428;25429;25430;62523;62524;62525;86350;86351;86352;86650;86651;86652;86653;86654;86655;86656;89280;90939;90940;90941 5097;10275;16917;25429;62524;86351;86655;89280;90941 Q9UJX4 Q9UJX4 4 4 4 Anaphase-promoting complex subunit 5 ANAPC5 sp|Q9UJX4|APC5_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC5 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 2 1 2 2 1 2 2 6 6 6 85.076 755 755 0 7.6018 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87792 0.88249 61.077 3 3 Median NaN 1.1292 NaN NaN 1.1783 NaN NaN 83.089 NaN 0 2 1 0 2 1 Median Median Median 1.7 2.6 3.2 23330000 13193000 10137000 0 0 0 12578000 6650900 5926900 10752000 6542400 4210000 2274 2165;3362;18549;20537 True;True;True;True 2194;3406;18773;20776 7213;7214;11036;60596;67024;67025 9655;9656;14688;80141;88834;88835 9656;14688;80141;88834 Q9UK59 Q9UK59 2 2 2 Lariat debranching enzyme DBR1 sp|Q9UK59|DBR1_HUMAN Lariat debranching enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBR1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 4.4 4.4 4.4 61.554 544 544 0.00047574 3.343 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.262 1.2549 10.474 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.4 4.4 1.8 30291000 16505000 13786000 14284000 9514800 4769300 8502800 3773300 4729500 7504600 3217300 4287200 2275 7182;12299 True;True 7271;12440 23195;23196;40479;40480;40481 30912;30913;53488;53489 30912;53489 Q9UKD2 Q9UKD2 14 14 14 mRNA turnover protein 4 homolog MRTO4 sp|Q9UKD2|MRT4_HUMAN mRNA turnover protein 4 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRTO4 PE=1 SV=2 1 14 14 14 11 13 13 11 13 13 11 13 13 59 59 59 27.56 239 239 0 84.541 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99203 1.0141 18.02 42 2 Leave out requantified 1.0113 0.91865 0.99602 1.0747 0.93525 1.0244 15.251 18.439 20.762 13 15 14 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.2 54.4 54.8 4077200000 1920900000 2156300000 1301900000 612540000 689350000 1487400000 717320000 770090000 1287900000 591090000 696860000 2276 75;4328;6944;8077;11029;14847;14848;14990;14991;16769;17934;20879;20968;21122 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 76;4381;7029;8170;11162;15037;15038;15181;15182;16980;18151;21121;21211;21368 280;281;14170;14171;14172;22402;26064;26065;26066;26067;26068;26069;36440;36441;36442;48715;48716;48717;48718;48719;48720;49147;49148;49149;49150;49151;49152;49153;49154;49155;54828;54829;54830;58623;58624;58625;68135;68390;68391;68392;68849;68850;68851 411;412;413;18899;18900;18901;18902;18903;18904;29876;34744;34745;34746;34747;34748;34749;34750;34751;34752;34753;34754;48270;48271;48272;48273;64286;64287;64288;64289;64290;64291;64292;64293;64294;64882;64883;64884;64885;64886;64887;64888;64889;64890;64891;64892;64893;64894;72348;72349;72350;72351;72352;72353;72354;72355;77563;77564;77565;90302;90617;90618;90619;90620;91258;91259;91260;91261 413;18900;29876;34748;48271;64289;64294;64885;64893;72348;77564;90302;90619;91258 Q9UKI8 Q9UKI8 5 5 2 Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1 TLK1 sp|Q9UKI8|TLK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TLK1 PE=1 SV=2 1 5 5 2 3 2 4 3 2 4 1 1 2 8.4 8.4 3.5 86.699 766 766 0 9.0182 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97928 1.0393 9.958 12 3 Leave out requantified 1.1416 0.7731 0.90163 1.2205 0.87555 0.98778 14.362 20.393 28.874 4 3 5 1 0 2 Median Median Median 4.7 3.7 7.3 119350000 58909000 60440000 54877000 25570000 29307000 20391000 11645000 8746300 44080000 21694000 22386000 2277 7075;10246;10437;15482;20905 True;True;True;True;True 7163;10370;10563;15678;21147 22845;33842;34508;50724;50725;50726;50727;50728;50729;68201;68202;68203 30438;44871;45744;67005;67006;67007;67008;67009;67010;67011;67012;67013;67014;67015;90379 30438;44871;45744;67005;90379 Q9UKJ3;Q7Z570;A4D1E1 Q9UKJ3 9;1;1 9;1;1 9;1;1 G patch domain-containing protein 8 GPATCH8 sp|Q9UKJ3|GPTC8_HUMAN G patch domain-containing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH8 PE=1 SV=2 3 9 9 9 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True;True;True;True;True;True;True 318;1183;1459;3000;9077;10799;12433 1083;1084;1085;3927;3928;3929;3930;4793;4794;4795;9716;9717;9718;9719;9720;9721;29368;29369;35311;35312;35313;40461;40462;40463 1494;1495;1496;1497;1498;5281;5282;5283;5284;6467;6468;6469;6470;12904;12905;12906;12907;12908;12909;12910;12911;38907;38908;46803;53463;53464;53465;53466 1496;5281;6470;12906;38907;46803;53466 Q9UKV3 Q9UKV3 11 11 11 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus ACIN1 sp|Q9UKV3|ACINU_HUMAN Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACIN1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 8 5 8 8 5 8 8 5 8 10 10 10 151.86 1341 1341 0 31.596 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9108 0.95499 20.608 19 5 Leave out requantified 0.9325 0.92712 0.88338 0.95704 0.97619 0.92633 15.257 5.2724 21.547 6 5 8 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.7 5.7 7.8 538390000 283750000 254640000 181070000 91711000 89354000 133170000 72272000 60901000 224150000 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12630 12630 Q9UKX7 Q9UKX7 1 1 1 Nuclear pore complex protein Nup50 NUP50 sp|Q9UKX7|NUP50_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup50 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP50 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 50.144 468 468 0.00092166 2.9882 By MS/MS By matching By matching 1.0716 1.0954 18.207 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 32026000 16812000 15214000 11252000 5538700 5713400 9796400 4931100 4865300 10977000 6341800 4635700 2284 18346 True 18568 59922;59923;59924 79248 79248 Q9UKZ1 Q9UKZ1 3 3 3 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 CNOT11 sp|Q9UKZ1|CNO11_HUMAN CCR4-NOT transcription complex subunit 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT11 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10.6 10.6 10.6 55.215 510 510 0 6.7567 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0625 1.1156 21.106 6 0 Leave out requantified 0.86008 1.0512 1.1067 0.90449 1.1362 1.1821 16.355 0.8736 8.1867 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 6.7 6.3 6.3 107010000 50405000 56607000 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with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 ASAP1 sp|Q9ULH1|ASAP1_HUMAN Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASAP1 PE=1 SV=4 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.7 3.7 3.7 125.5 1129 1129 0 6.746 By MS/MS By MS/MS 1.2388 1.3256 18.257 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 1.9 1.8 18492000 8968800 9522800 0 0 0 8459200 2679300 5780000 10032000 6289600 3742800 2287 838;16347 True;True 848;16555 2868;53517 3888;70674 3888;70674 Q9ULH7 Q9ULH7 2 2 2 MKL/myocardin-like protein 2 MKL2 sp|Q9ULH7|MRTFB_HUMAN Myocardin-related transcription factor B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRTFB PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 118.13 1088 1088 0 5.0641 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90639 0.93496 33.843 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 0.9 2.2 2.2 41737000 24632000 17105000 12889000 8898100 3990600 13506000 8873300 4632400 15342000 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NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 4.3 4.3 4.3 9426500 3324800 6101800 3460500 891900 2568600 2802500 1008000 1794500 3163500 1424800 1738600 2316 2519;19188;20937 True;False;False 2551;19418;21180 8291;8292;8293;62749;62750;62751;68304;68305;68306;68307 11070;11071;11072;83178;83179;83180;90515;90516;90517;90518 11070;83178;90515 Q9UPT5 Q9UPT5 13 13 13 Exocyst complex component 7 EXOC7 sp|Q9UPT5|EXOC7_HUMAN Exocyst complex component 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC7 PE=1 SV=3 1 13 13 13 12 9 8 12 9 8 12 9 8 23.3 23.3 23.3 83.381 735 735 0 50.723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0134 1.0885 14.602 28 9 Leave out requantified 0.96275 1.0183 0.98001 1.0359 1.0645 1.0115 16.074 17.083 15.532 11 8 9 5 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.7 16.1 15.4 641860000 319210000 322650000 262130000 134490000 127640000 193570000 96307000 97262000 186160000 88416000 97749000 2317 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NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 6.5 6.5 13.5 75720000 44371000 31348000 22487000 10115000 12372000 29665000 20739000 8925900 23568000 13517000 10051000 2329 4948;11713 True;True 5007;11849 16203;38689;38690;38691 21570;51149;51150;51151 21570;51151 Q9Y262 Q9Y262 16 16 16 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L EIF3L sp|Q9Y262|EIF3L_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3L PE=1 SV=1 1 16 16 16 13 11 11 13 11 11 13 11 11 28.7 28.7 28.7 66.726 564 564 0 49.153 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97646 0.98724 10.44 38 10 Leave out requantified 1.0145 0.89298 1.0167 1.05 0.91894 1.0195 12.447 17.399 12.716 13 12 13 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.8 19.3 24.3 1079600000 533160000 546460000 373140000 183140000 190000000 364480000 187630000 176840000 342000000 162380000 179620000 2330 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PLAA sp|Q9Y263|PLAP_HUMAN Phospholipase A-2-activating protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLAA PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 6 4 5 6 4 5 6 4 12.7 12.7 12.7 87.156 795 795 0 15.612 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9461 0.9715 48.509 13 7 Leave out requantified 1.3124 0.9461 0.82527 1.2879 0.9715 0.85966 75.557 44.914 48.513 3 5 5 2 1 4 Median Leave out requantified Median 10.6 9.8 8.6 455920000 278700000 177220000 125570000 75040000 50529000 197500000 114330000 83164000 132860000 89328000 43528000 2331 3962;4914;6048;8944;13421;17717;21184 True;True;True;True;True;True;True 4013;4973;6119;9048;13583;17934;21431 12985;12986;16101;19574;29263;29264;29265;29266;29267;44053;44054;44055;57799;57800;57801;69040;69041 17271;17272;21440;26045;38760;38761;38762;38763;38764;58142;76385;76386;76387;76388;91521;91522 17272;21440;26045;38760;58142;76385;91522 Q9Y265 Q9Y265 14 14 14 RuvB-like 1 RUVBL1 sp|Q9Y265|RUVB1_HUMAN RuvB-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUVBL1 PE=1 SV=1 1 14 14 14 11 12 11 11 12 11 11 12 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1 Protein canopy homolog 2 CNPY2 sp|Q9Y2B0|CNPY2_HUMAN Protein canopy homolog 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNPY2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.8 8.8 8.8 20.652 182 182 0.0013587 2.7905 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0885 1.0616 12.513 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 8.8 8.8 8.8 32649000 16062000 16587000 17324000 8865600 8458500 15325000 7196000 8128600 0 0 0 2338 9405 True 9521 30884;30885;30886 41017;41018;41019;41020;41021 41018 Q9Y2D4;Q8TAG9 Q9Y2D4 3;1 3;1 3;1 Exocyst complex component 6B EXOC6B sp|Q9Y2D4|EXC6B_HUMAN Exocyst complex component 6B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC6B PE=1 SV=3 2 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 3.6 3.6 3.6 94.2 811 811;804 0 5.9293 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89898 0.87488 17.805 7 2 Leave out requantified 1.1225 0.89898 0.97417 1.1462 0.87488 0.99006 31.484 13.344 25.438 2 3 2 1 1 0 Median Median Median 2.6 3.6 2.6 159000000 85210000 73785000 31925000 17559000 14366000 89080000 47582000 41498000 37991000 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S17, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS17 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 29.2 29.2 29.2 14.502 130 130 0 7.5441 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1313 1.1921 15.819 5 1 Leave out requantified 1.0655 1.049 NaN 1.1294 1.0893 NaN 8.1763 28.581 NaN 2 2 1 1 0 0 Median Median Median 29.2 29.2 6.9 108990000 53012000 55980000 32789000 14122000 18667000 50184000 26760000 23425000 26018000 12131000 13887000 2344 12617;19356 True;True 12761;19586 41473;41474;41475;63307;63308 54802;54803;54804;54805;54806;83960;83961 54802;83961 Q9Y2R9 Q9Y2R9 2 2 2 28S ribosomal protein S7, mitochondrial MRPS7 sp|Q9Y2R9|RT07_HUMAN 28S ribosomal protein S7, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS7 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 9.9 9.9 9.9 28.134 242 242 0 5.7849 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89286 0.91906 64.069 3 1 Median NaN NaN 0.62255 NaN NaN 0.65508 NaN NaN 86.287 0 1 2 0 0 1 Median Median Median 5.4 5.4 9.9 109150000 64407000 44745000 0 0 0 47644000 26988000 20655000 61508000 37419000 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16814;49002 Q9Y305 Q9Y305 3 3 3 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial ACOT9 sp|Q9Y305|ACOT9_HUMAN Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACOT9 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 8.7 8.7 8.7 49.901 439 439 0 8.769 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0897 1.1081 1.5797 6 2 Leave out requantified NaN 1.1355 1.1824 NaN 1.1293 1.1838 NaN 20.728 22.2 1 3 2 0 1 1 Median Median Median 1.8 8.7 6.4 151540000 66923000 84613000 24315000 10473000 13842000 73216000 33471000 39745000 54005000 22979000 31026000 2355 5591;7585;16410 True;True;True 5656;7676;16618 18158;18159;18160;24509;24510;53749 24171;32694;32695;32696;70975 24171;32696;70975 Q9Y314 Q9Y314 10 10 10 Nitric oxide synthase-interacting protein NOSIP sp|Q9Y314|NOSIP_HUMAN Nitric oxide synthase-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOSIP PE=1 SV=1 1 10 10 10 8 8 9 8 8 9 8 8 9 54.5 54.5 54.5 33.172 301 301 0 86.975 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1294 1.1314 13.918 29 6 Leave out requantified 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Endophilin-B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GLB1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 14.2 14.2 14.2 40.796 365 365 0 19.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2868 1.2643 39.66 7 4 Median 1.0705 1.2868 1.0759 1.0773 1.2643 1.0797 51.848 41.985 56.651 2 3 2 1 2 1 Median Median Median 6.6 10.7 10.1 160660000 78476000 82182000 51219000 27161000 24059000 62635000 28938000 33697000 46803000 22377000 24426000 2357 4807;10433;15214;17583 True;True;True;True 4865;10559;15406;17797 15784;34494;34495;34496;49847;57389;57390;57391 21010;45730;65857;75843;75844;75845 21010;45730;65857;75845 Q9Y383 Q9Y383 15 15 10 Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 LUC7L2 sp|Q9Y383|LC7L2_HUMAN Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUC7L2 PE=1 SV=2 1 15 15 10 14 15 15 14 15 15 9 10 10 37.2 37.2 25.3 46.513 392 392 0 148.4 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97591 0.99678 7.1808 71 6 Leave out requantified 0.99895 0.93373 1.008 1.0265 0.95941 1.0189 7.2264 7.1787 13.179 23 24 24 2 2 2 Leave out 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1548;1549;1550;1551;5399;5400;5401;5402;5403;5404;5405;5406;5407;5408;14318;14319;14320;14321;14322;16423;16424;16425;16426;27271;27272;27273;27274;27275;27276;27277;27278;45968;45969;45970;45971;45972;49439;49440;49441;49442;49443;49444;49445;55790;55791;55792;55793;55794;55795;60876;60877;60878;60879;60880;60881;60882;60883;60884;60885;60886;60887;60888;60889;60890;70016;70017;70018;70019;70020;70021;70022;70023;70024;70025;70026;70027;70028;70029;70030;70031;81590;81591;81592;81593;81594;81595;81596;81597;81598;81599;81600;81601;81602;81603;81604;81605;81606;81607;82721;82722;82723;82724;82725;82726;82727;82728;82729;82730;82731;82732;82733;82734;82735;82736;82737;82738;82739;82740;82741;82742;83712;83713;83714;83715;83716;83717;83718;83719;83720;83721;85573;85574;85575;85576 1549;5400;14321;16425;27278;45970;49440;55791;60878;70022;81591;81606;82730;83714;85574 268 177 Q9Y3A4;Q9NSQ0 Q9Y3A4;Q9NSQ0 2;1 2;1 2;1 Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A;Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B RRP7A;RRP7BP sp|Q9Y3A4|RRP7A_HUMAN Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP7A PE=1 SV=2;sp|Q9NSQ0|RRP7B_HUMAN Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP7BP PE=5 SV=1 2 2 2 2 0 2 0 0 2 0 0 2 0 11.1 11.1 11.1 32.334 280 280;103 0.00047304 3.2808 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 11.1 0 6588400 4412000 2176400 0 0 0 6588400 4412000 2176400 0 0 0 2359 843;20450 True;True 853;20689 2882;66775 3901;88518 3901;88518 Q9Y3A5 Q9Y3A5 12 12 12 Ribosome maturation protein SBDS SBDS sp|Q9Y3A5|SBDS_HUMAN Ribosome maturation protein SBDS OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SBDS PE=1 SV=4 1 12 12 12 10 9 9 10 9 9 10 9 9 51.6 51.6 51.6 28.763 250 250 0 42.085 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91321 0.96094 17.982 30 13 Leave out requantified 0.83769 1.1986 0.8984 0.87964 1.2336 0.94778 12.897 20.734 19.139 11 10 9 6 5 2 Leave out 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Q9Y3C1 Q9Y3C1 3 3 3 Nucleolar protein 16 NOP16 sp|Q9Y3C1|NOP16_HUMAN Nucleolar protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP16 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 14.6 14.6 14.6 21.188 178 178 0 7.1619 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76744 0.79047 78.344 8 8 Median 0.84399 0.69783 0.75745 0.87139 0.71707 0.78709 105.04 90.546 33.546 3 3 2 3 3 2 Median Median Median 14.6 8.4 10.7 408020000 131330000 276680000 185180000 51482000 133700000 163330000 51217000 112120000 59504000 28635000 30869000 2364 2968;14267;20967 True;True;True 3003;14448;21210 9729;9730;46882;46883;46884;46885;46886;46887;68388;68389 12924;12925;61882;61883;61884;61885;61886;61887;90615;90616 12924;61886;90615 Q9Y3C6 Q9Y3C6 4 4 4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 PPIL1 sp|Q9Y3C6|PPIL1_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIL1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 28.9 28.9 28.9 18.237 166 166 0 12.624 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1033 1.1182 21.033 8 4 Leave out requantified 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Q9Y3D6 Q9Y3D6 1 1 1 Mitochondrial fission 1 protein FIS1 sp|Q9Y3D6|FIS1_HUMAN Mitochondrial fission 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIS1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 7.2 7.2 7.2 16.937 152 152 0 6.5198 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 7.2 0 0 7581800 3710400 3871300 7581800 3710400 3871300 0 0 0 0 0 0 2367 7300 True 7390 23616 31483;31484 31484 Q9Y3D9 Q9Y3D9 2 2 2 28S ribosomal protein S23, mitochondrial MRPS23 sp|Q9Y3D9|RT23_HUMAN 28S ribosomal protein S23, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS23 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 13.7 13.7 13.7 21.77 190 190 0 5.65 By MS/MS By matching By MS/MS 0.84347 0.89177 15.93 4 1 Median 0.97945 NaN NaN 1.0248 NaN NaN 20.759 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 13.7 8.4 13.7 84593000 41264000 43330000 52932000 23780000 29152000 16061000 8409100 7651800 15600000 9074300 6525600 2368 494;5592 True;True 497;5657 1693;1694;18161;18162;18163 2333;2334;24172;24173 2333;24173 Q9Y3E1 Q9Y3E1 3 3 3 Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 HDGFRP3 sp|Q9Y3E1|HDGR3_HUMAN Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDGFL3 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 19.2 19.2 19.2 22.619 203 203 0 5.639 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80049 0.86543 27.68 8 1 Leave out requantified 0.8839 0.73729 0.95492 0.94626 0.77407 0.99811 24.45 15.778 19.391 3 2 3 0 0 1 Leave out requantified Median Median 19.2 11.3 19.2 140200000 70588000 69610000 55667000 27625000 28042000 34051000 18890000 15162000 50480000 24074000 26406000 2369 580;7010;8721 True;True;True 584;7096;8823 1982;1983;1984;22622;22623;28554;28555;28556 2707;2708;2709;30141;30142;37796 2709;30141;37796 Q9Y3F4 Q9Y3F4 11 11 11 Serine-threonine kinase receptor-associated protein STRAP sp|Q9Y3F4|STRAP_HUMAN Serine-threonine kinase receptor-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRAP PE=1 SV=1 1 11 11 11 9 9 10 9 9 10 9 9 10 42.6 42.6 42.6 38.438 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19430;19431;19432;19433;19434;19435;19436;19437;19438;19439;19440;19441;22435;22436;22437;22438;22439;22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447;30542;30543;30544;30545;30546;31885;31886;31887;31888;31889;31890;31891;31892;32327;32328;32329;32330;32331;33362;34468;34469;34470;37524;37525;37526;37527;37528;37529;45870;45871;51757;51758;51759;51760;51761;51762;53426;53427;54879;54880;54881;54882;54883;56680;56681;56682;56683;56684;59346;59347;59348;59349;59350;59351;59352;61681;61682;61683;61684;61685;61686;61687;61688;61689;63635;63636;63637;63638;63639;63640;63641;63642;63643;63644;73171;73172;73173;74606;74607;74608;74609;74610;74611;74612;74613;74614;74615;74616;78519;78520;78521;78522;78523;78524;78525;78526;78527;82703;82704;82705;82706;82707;82708;83157;83158;83159;83160;83161;83162;83163;83164;83165;83166;83167;83168 19430;22437;30543;31887;32330;33362;34470;37524;45870;51758;53427;54882;56683;59352;61683;63640;73171;74607;78519;78526;82706;83164 Q9Y3S2 Q9Y3S2 5 5 5 Zinc finger protein 330 ZNF330 sp|Q9Y3S2|ZN330_HUMAN Zinc finger protein 330 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF330 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 20 20 20 36.201 320 320 0 22.136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1106 1.1565 11.172 14 1 Leave out requantified 1.0986 0.96835 1.1039 1.1565 1.0313 1.0871 13.686 22.052 13.338 4 5 5 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.1 17.2 17.2 287200000 150290000 136910000 113040000 59983000 53060000 92999000 47386000 45613000 81155000 42919000 38236000 2372 218;492;2084;12037;18683 True;True;True;True;True 219;495;2110;12178;18908 757;758;759;760;761;762;1689;1690;1691;6933;6934;39690;61022;61023 1031;1032;1033;1034;1035;1036;1037;1038;2326;2327;2328;2329;2330;2331;9303;9304;9305;9306;9307;9308;52454;80706;80707;80708 1034;2328;9305;52454;80707 Q9Y3T9 Q9Y3T9 7 7 7 Nucleolar complex protein 2 homolog NOC2L sp|Q9Y3T9|NOC2L_HUMAN Nucleolar complex protein 2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOC2L PE=1 SV=4 1 7 7 7 4 5 7 4 5 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Leave out requantified 9.2 7.4 6.6 598550000 368530000 230020000 212290000 125740000 86545000 191090000 119120000 71971000 195170000 123670000 71501000 2394 175;1278;4160;13448;13455;14165;17267;17275 True;True;True;True;True;True;True;True 176;1293;4213;13611;13618;14345;17479;17487 586;4268;4269;4270;4271;13642;13643;13644;13645;44150;44151;44152;44176;44177;44178;44179;44180;44181;44182;46554;46555;46556;56344;56375;56376 806;5750;5751;5752;5753;5754;18188;18189;18190;18191;58272;58273;58274;58275;58276;58312;58313;58314;58315;58316;58317;58318;58319;61446;61447;61448;74440;74492 806;5753;18191;58273;58316;61447;74440;74492 Q9Y5J1 Q9Y5J1 3 3 3 U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog UTP18 sp|Q9Y5J1|UTP18_HUMAN U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UTP18 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 7.7 7.7 7.7 62.003 556 556 0 6.1718 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.881 0.90981 7.7777 9 1 Leave out requantified 1.1522 0.94544 0.81702 1.225 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4467;6345;7427;10942;14153;15286;20740 14439;14440;20219;20220;23729;35774;35775;35776;45912;45913;45914;45915;49500;66917;66918 19264;19265;26871;26872;26873;31635;47397;47398;47399;47400;47401;47402;60545;60546;60547;60548;65371;88704;88705 19265;26873;31635;47398;60546;65371;88705 Q9Y5L4 Q9Y5L4 3 3 3 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13 TIMM13 sp|Q9Y5L4|TIM13_HUMAN Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIMM13 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 42.1 42.1 42.1 10.5 95 95 0 8.9999 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96005 1.0393 9.3924 11 3 Leave out requantified 0.92558 1.1371 0.93959 0.92019 1.1547 0.93153 8.0493 42.143 60.908 3 3 5 0 1 2 Leave out requantified Median Median 42.1 42.1 42.1 241240000 125150000 116090000 77642000 38941000 38701000 64749000 33715000 31034000 98848000 52490000 46359000 2397 2034;10786;19925 True;True;True 2060;10917;20161 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By MS/MS By MS/MS 1.0536 1.0757 24.011 21 4 Leave out requantified 1.1571 1.0401 0.99192 1.1823 1.058 0.98453 21.115 26.135 24.368 7 8 6 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.2 24.9 19.7 565810000 253110000 312700000 210540000 76880000 133660000 207820000 106530000 101290000 147440000 69692000 77749000 2411 947;2444;3988;4819;6000;6720;7992;9100;15341 True;True;True;True;True;True;True;True;True 958;2474;4040;4877;6071;6803;8084;9206;15534 3205;3206;3207;8048;8049;8050;13077;15813;19429;19430;21696;21697;21698;25817;25818;25819;29835;29836;29837;50243;50244 4312;4313;4314;10739;10740;17402;21046;25869;25870;28944;28945;28946;34443;34444;34445;39566;39567;39568;39569;39570;39571;66376;66377 4313;10740;17402;21046;25870;28944;34445;39567;66376 Q9Y618 Q9Y618 9 9 9 Nuclear receptor corepressor 2 NCOR2 sp|Q9Y618|NCOR2_HUMAN Nuclear receptor corepressor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCOR2 PE=1 SV=3 1 9 9 9 4 6 3 4 6 3 4 6 3 5.6 5.6 5.6 273.65 2514 2514 0 20.257 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0143 1.0146 46.104 11 3 Leave out requantified 1.0226 1.0757 0.91998 1.0576 1.1128 0.92496 17.243 29.325 55.883 3 5 3 1 2 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 3 3.4 1.6 284780000 140630000 144150000 110400000 61736000 48664000 114310000 50192000 64121000 60063000 28698000 31366000 2412 804;4150;7857;8134;15177;15869;16117;16892;16997 True;True;True;True;True;True;True;True;True 813;4203;7949;8227;15369;16069;16320;17103;17209 2749;13615;25392;25393;25394;26246;49749;51988;52787;55180;55181;55182;55499 3721;18158;33876;33877;33878;34961;65727;68617;69737;72823;72824;72825;72826;72827;73280 3721;18158;33877;34961;65727;68617;69737;72827;73280 Q9Y657;Q5JUX0 Q9Y657 4;1 4;1 4;1 Spindlin-1 SPIN1 sp|Q9Y657|SPIN1_HUMAN Spindlin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPIN1 PE=1 SV=3 2 4 4 4 3 1 2 3 1 2 3 1 2 22.9 22.9 22.9 29.6 262 262;258 0.0005102 4.284 By MS/MS By matching By MS/MS 1.2011 1.2631 30.336 5 1 Leave out requantified 0.95222 NaN NaN 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2684;2685;2686;4094;9982;9983;9984;9985;9986;31917;31918;31919;31920;31921;31922;40315;48441;67961;67962;67963;67964;71426;71427;71428;71429;71430;73198;73199;73200;73201;74256;76017;77706;77707;77708;77709;77710;83154;86208;86209;86210;88031;88032 2685;4094;9982;31920;40315;48441;67964;71427;73199;74256;76017;77708;83154;86208;88031 Q9Y697 Q9Y697 1 1 1 Cysteine desulfurase, mitochondrial NFS1 sp|Q9Y697|NFS1_HUMAN Cysteine desulfurase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFS1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 50.195 457 457 0.003913 2.3748 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2373 1.2669 7.3252 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 17388000 8778200 8609500 0 0 0 8963900 4138600 4825300 8423800 4639600 3784200 2416 19015 True 19242 62183;62184;62185 82369;82370;82371 82370 Q9Y6A4 Q9Y6A4 3 3 3 Cilia- and flagella-associated protein 20 CFAP20 sp|Q9Y6A4|CFA20_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 20 OS=Homo sapiens 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True;True;True;True;True;True 773;9594;12415;12673;14582;15519 2612;31109;31110;40414;41185;41186;41187;47292;47293;47294;50195 3525;41321;41322;53413;54434;54435;54436;54437;54438;62417;62418;62419;62420;62421;66310 3525;41321;53413;54437;62417;66310 Q9Y6E0 Q9Y6E0 9 4 3 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit STK24 sp|Q9Y6E0|STK24_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK24 PE=1 SV=1 1 9 4 3 7 5 5 2 2 2 2 1 2 23.5 12 9.9 49.307 443 443 0 14.547 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1589 1.1888 11.375 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 18.1 12.6 13.8 46752000 22269000 24483000 15079000 7636400 7442900 21430000 10116000 11315000 10243000 4517300 5725800 2420 4301;7371;7776;10362;10462;13714;13875;16785;19557 True;False;False;False;False;True;True;True;False 4354;7461;7868;10487;10588;13878;14048;16996;19789 14084;23837;23838;23839;25146;34245;34589;34590;34591;34592;34593;45044;45045;45582;54886;54887;63967;63968;63969 18775;31792;31793;31794;31795;31796;33547;45423;45847;45848;45849;45850;45851;59432;59433;60107;72448;72449;84827;84828;84829;84830 18775;31793;33547;45423;45850;59433;60107;72449;84828 Q9Y6E2 Q9Y6E2 15 14 14 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 BZW2 sp|Q9Y6E2|BZW2_HUMAN Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BZW2 PE=1 SV=1 1 15 14 14 15 14 13 14 13 12 14 13 12 35.8 34.1 34.1 48.162 419 419 0 110.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91526 0.96473 36.366 53 6 Leave out requantified 0.87271 0.96216 0.92853 0.91564 1.049 0.96677 12.953 38.642 17.923 18 18 17 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.8 33.9 31.5 3599000000 1816900000 1782200000 1407000000 703910000 703060000 1142600000 578940000 563660000 1049500000 534020000 515440000 2421 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1538;1539;1540;2505;2506;2507;10364;10365;10366;15175;15176;15177;15178;15179;15180;15181;15182;18261;18262;18263;18264;18265;18266;19045;19046;19047;26271;36530;42829;42830;42831;42832;42833;42834;43625;43626;43627;43628;43629;43630;43631;43632;43633;43634;43635;43636;50760;50761;50762;50763;50764;50765;57300;57301;57302;57303;57304;57305;57306;57307;57308;86399;86400;86401;86402;86403;86404;86502;86503;89545;89546 1539;2506;10365;15179;18265;19047;26271;36530;42832;43635;50761;57302;86402;86502;89545 Q9Y6G9 Q9Y6G9 8 8 7 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 DYNC1LI1 sp|Q9Y6G9|DC1L1_HUMAN Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNC1LI1 PE=1 SV=3 1 8 8 7 6 8 4 6 8 4 5 7 4 20.7 20.7 18.2 56.578 523 523 0 24.311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92894 0.96166 33.113 21 9 Leave out requantified 0.96842 1.1353 0.91834 1.0072 1.1888 0.94837 20.668 25.83 14.29 7 9 5 2 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Median 14.5 20.7 10.9 696220000 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