Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides csa1 Peptides csa2 Peptides csa3 Razor + unique peptides csa1 Razor + unique peptides csa2 Razor + unique peptides csa3 Unique peptides csa1 Unique peptides csa2 Unique peptides csa3 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type csa1 Identification type csa2 Identification type csa3 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L csa1 Ratio H/L csa2 Ratio H/L csa3 Ratio H/L normalized csa1 Ratio H/L normalized csa2 Ratio H/L normalized csa3 Ratio H/L variability [%] csa1 Ratio H/L variability [%] csa2 Ratio H/L variability [%] csa3 Ratio H/L count csa1 Ratio H/L count csa2 Ratio H/L count csa3 Ratio H/L iso-count csa1 Ratio H/L iso-count csa2 Ratio H/L iso-count csa3 Ratio H/L type csa1 Ratio H/L type csa2 Ratio H/L type csa3 Sequence coverage csa1 [%] Sequence coverage csa2 [%] Sequence coverage csa3 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity csa1 Intensity L csa1 Intensity H csa1 Intensity csa2 Intensity L csa2 Intensity H csa2 Intensity csa3 Intensity L csa3 Intensity H csa3 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions A0A1B0GUS4;P68036 A0A1B0GUS4;P68036 2;2 2;2 2;2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 UBE2L3 sp|A0A1B0GUS4|UB2L5_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2L5 PE=2 SV=1;sp|P68036|UB2L3_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2L3 PE=1 SV=1 2 2 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 20.1 20.1 20.1 17.875 154 154;154 0.0020629 2.2569 By MS/MS By MS/MS 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NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 11.2 11.2 11.2 104940000 46201000 58744000 38832000 15544000 23288000 30689000 13936000 16753000 35424000 16721000 18703000 7 5263 True 5316 16911;16912;16913 21695;21696;21697;21698 21695 A6NDU8 A6NDU8 1 1 1 UPF0600 protein C5orf51 C5orf51 sp|A6NDU8|CE051_HUMAN UPF0600 protein C5orf51 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C5orf51 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.8 4.8 4.8 33.62 294 294 0 24.073 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5516 1.6255 18.063 5 3 Median NaN 1.5884 1.6563 NaN 1.6662 1.8639 NaN 3.4976 27.034 1 2 2 0 1 2 Median Median Median 4.8 4.8 4.8 98232000 34239000 63993000 7651000 3107300 4543700 34424000 12763000 21662000 56157000 18369000 37788000 8 4118 True 4161 13392;13393;13394;13395;13396 17254;17255;17256;17257;17258 17257 A6NGN9 A6NGN9 1 1 1 IgLON family member 5 IGLON5 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN IgLON family member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLON5 PE=2 SV=4 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.1 5.1 5.1 36.794 336 336 0.0015584 2.3372 By MS/MS 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epidermal KRT2 ;;sp|P35908|K22E_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT2 PE=1 SV=2 8 6 3 1 3 3 3 1 2 1 0 1 0 9.5 5.3 1.7 65.432 639 639;645;639;524;539;572;578;578 0 4.9999 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93114 0.95022 57.025 4 2 Median NaN 1.4248 NaN NaN 1.442 NaN NaN 23.795 NaN 1 2 1 0 1 1 Median Median Median 4.4 5 5.3 34296000 18033000 16264000 8426700 5498000 2928700 18416000 7919800 10496000 7453100 4614700 2838400 + 21 1294;4880;5189;5978;7540;14879 True;False;False;True;False;True 1311;4928;5242;6033;7604;15014 4233;4234;15727;16699;16700;16701;16702;16703;16704;19193;24463;48557 5437;5438;20188;21429;21430;21431;21432;21433;21434;21435;24678;31214;61679 5438;20188;21431;24678;31214;61679 CON__Q04695;Q04695;CON__Q9QWL7;CON__Q6IFX2;CON__P19012;CON__A2A4G1;P19012;CON__Q61782 CON__Q04695;Q04695;CON__Q9QWL7 11;11;9;3;2;2;2;1 10;10;8;2;1;1;1;1 6;6;4;1;0;0;0;0 Keratin, type I cytoskeletal 17 KRT17 ;sp|Q04695|K1C17_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT17 PE=1 SV=2; 8 11 10 6 8 7 9 7 6 8 5 2 5 25.7 24.1 14.1 48.105 432 432;432;433;452;456;456;456;93 0 38.65 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3065 1.3539 16.237 20 5 Leave out requantified 1.6501 1.1704 1.1657 1.7387 1.2104 1.276 16.843 30.444 5.403 7 6 7 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.1 16 21.1 391340000 178040000 213300000 155940000 61218000 94718000 101810000 48738000 53074000 133590000 68081000 65508000 + 22 844;1359;1742;1992;4642;9155;12619;15300;15358;15376;16719 True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True 855;1376;1766;2018;4689;9234;12735;15441;15499;15517;16868 2778;4439;4440;5706;6569;6570;6571;15004;15005;15006;30018;30019;30020;41357;49997;49998;50195;50196;50197;50246;50247;54640;54641;54642 3564;5715;5716;7390;8443;8444;19306;19307;19308;19309;19310;38240;52410;63627;63628;63629;63630;63897;63898;63899;63958;69594;69595;69596;69597 3564;5715;7390;8443;19307;38240;52410;63627;63898;63958;69594 CON__Q2YDI2;O43929 CON__Q2YDI2;O43929 1;1 1;1 1;1 Origin recognition complex subunit 4 ORC4 ;sp|O43929|ORC4_HUMAN Origin recognition complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC4 PE=1 SV=2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 50.327 436 436;436 0 3.0947 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0443 1.1064 12.839 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 34088000 17975000 16112000 7559300 4048100 3511200 18363000 9737100 8626300 8165000 4190000 3975000 + 23 9389 True 9470 30826;30827;30828 39284;39285;39286;39287;39288 39285 CON__Q3KNV1;P08729;CON__P08729;CON__Q9DCV7 CON__Q3KNV1;P08729;CON__P08729 11;11;10;4 8;8;7;1 8;8;7;1 Keratin, type II cytoskeletal 7 KRT7 ;sp|P08729|K2C7_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT7 PE=1 SV=5; 4 11 8 8 9 5 4 7 4 4 7 4 4 23.9 19 19 51.385 469 469;469;469;457 0 21.074 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2349 1.274 14.065 13 6 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14339 46452 58941 58941 CON__Q3ZBD7 CON__Q3ZBD7 8 2 2 1 8 2 2 7 6 8 2 1 2 2 1 2 18.3 4.8 4.8 62.87 557 557 0 12.318 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3389 1.4956 9.431 10 2 Leave out requantified 1.3317 1.0462 1.1905 1.4889 1.1234 1.3991 3.3758 26.361 76.166 3 3 4 0 1 1 Median Median Median 17.1 17.1 18.3 640360000 353480000 286870000 91835000 41912000 49923000 225190000 109970000 115220000 323330000 201600000 121730000 + 26 1575;2815;4843;7550;7923;8756;15170;16374 False;False;False;True;False;True;False;False 1594;2847;4891;7614;7990;7991;8833;15309;16520 5132;5133;5134;9220;15613;15614;15615;15616;15617;24492;24493;25762;25763;25764;25765;25766;25767;25768;25769;25770;25771;25772;25773;28617;28618;28619;28620;28621;28622;28623;28624;49500;49501;49502;53451;53452;53453;53454;53455;53456 6621;6622;6623;6624;6625;6626;11817;20058;20059;20060;20061;20062;20063;20064;20065;31250;31251;31252;32935;32936;32937;32938;32939;32940;32941;32942;32943;32944;32945;32946;32947;32948;32949;32950;32951;32952;32953;36530;36531;36532;36533;36534;36535;36536;36537;36538;36539;36540;36541;62959;62960;62961;62962;62963;62964;68119;68120;68121;68122;68123;68124;68125;68126;68127;68128;68129;68130 6622;11817;20062;31252;32949;36537;62962;68129 1 437 Q13765;E9PAV3 Q13765;E9PAV3 5;5 5;5 5;5 Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form NACA sp|Q13765|NACA_HUMAN Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACA PE=1 SV=1;sp|E9PAV3|NACAM_HUMAN Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACA PE=1 SV=1 2 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 29.8 29.8 29.8 23.384 215 215;2078 0 98.376 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95694 1.024 12.438 28 10 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Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGF2BP3 PE=1 SV=2 1 17 17 16 10 12 14 10 12 14 9 11 13 36.1 36.1 33.9 63.704 579 579 0 128.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82112 0.88075 28.146 40 15 Leave out requantified 0.85015 0.82112 0.7504 0.90302 0.86164 0.85845 12.288 11.941 30.955 10 14 16 3 6 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.5 25.9 31.8 1213100000 652670000 560470000 308350000 160240000 148120000 456000000 245610000 210380000 448790000 246830000 201970000 43 339;665;997;2862;5472;6470;7371;7543;8311;8757;10305;11515;12662;14042;15245;15930;16157 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 341;673;1010;2895;5525;6527;7434;7607;8383;8834;10389;11615;12779;14172;15385;16074;16301 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Ubiquitin domain-containing protein UBFD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBFD1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 5.8 5.8 5.8 33.382 309 309 0 4.36 By MS/MS By MS/MS 1.5617 1.6203 37.996 3 3 Median 2.08 NaN NaN 2.1677 NaN NaN 41.159 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 5.8 5.8 0 23449000 8326300 15122000 16701000 5663900 11037000 6748200 2662400 4085800 0 0 0 57 8039 True 8111 26145;26146;26147 33381;33382;33383 33383 O14579 O14579 4 4 4 Coatomer subunit epsilon COPE sp|O14579|COPE_HUMAN Coatomer subunit epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPE PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 16.6 16.6 16.6 34.482 308 308 0 14.501 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89382 0.91689 8.7576 11 2 Leave out requantified 0.97071 0.92348 0.85954 1.0179 0.93368 0.90551 40.51 9.2368 13.367 3 4 4 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 13.6 16.6 16.6 407120000 211120000 196000000 125020000 66405000 58617000 138350000 71878000 66476000 143750000 72835000 70910000 58 1178;2922;10946;11204 True;True;True;True 1194;2955;11038;11299 3876;3877;3878;9540;9541;9542;35929;35930;36743;36744;36745 4958;4959;4960;12237;45524;45525;45526;46551;46552;46553;46554 4960;12237;45525;46552 O14617 O14617 18 18 18 AP-3 complex subunit delta-1 AP3D1 sp|O14617|AP3D1_HUMAN AP-3 complex subunit delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3D1 PE=1 SV=1 1 18 18 18 13 11 15 13 11 15 13 11 15 19.5 19.5 19.5 130.16 1153 1153 0 106.46 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0955 1.1413 24.436 44 20 Leave out requantified 1.1156 1.0573 1.0258 1.1448 1.1061 1.1007 21.665 23.753 25.494 16 13 15 7 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.7 10.7 16.7 1153100000 554930000 598210000 379900000 180250000 199640000 324430000 154760000 169670000 448810000 219920000 228900000 59 825;830;1547;1577;1903;2592;3125;6405;7217;8690;8977;9465;10117;11033;11452;17847;17848;17994 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL3 PE=1 SV=2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3 3 3 78.947 736 736;716 0.00052521 2.4885 By MS/MS By MS/MS By matching 0.78236 0.79194 20.061 4 0 Leave out requantified 0.85997 NaN NaN 0.85497 NaN NaN 30.892 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 3 1.6 1.6 70882000 37253000 33629000 38559000 20079000 18480000 14045000 7382900 6661800 18279000 9791400 8487100 60 5447;6690 True;True 5500;6747 17517;17518;17519;21379 22494;22495;22496;27427 22494;27427 O14732 O14732 3 3 3 Inositol monophosphatase 2 IMPA2 sp|O14732|IMPA2_HUMAN Inositol monophosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 14.2 14.2 14.2 31.321 288 288 0 11.787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1598 1.2294 43.583 6 2 Leave out requantified 1.2205 1.0378 1.0829 1.3009 1.0994 1.2013 35.589 27.774 46.347 2 2 2 0 1 1 Median Median Median 7.3 14.2 7.3 354200000 174620000 179580000 126610000 60853000 65752000 114490000 57363000 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21 Transcription elongation regulator 1 TCERG1 sp|O14776|TCRG1_HUMAN Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2 1 21 21 21 18 16 20 18 16 20 18 16 20 19.1 19.1 19.1 123.9 1098 1098 0 53.958 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91328 0.95683 46.096 61 12 Leave out requantified 0.86832 0.97613 0.9088 0.94373 0.99086 0.96067 48.431 17.874 26.05 20 18 23 4 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 14.8 18 2997800000 1533600000 1464200000 931940000 479470000 452470000 874730000 462540000 412190000 1191100000 591550000 599560000 64 753;945;1440;1526;3313;3510;3574;4458;6514;6515;7783;9638;9936;9962;13619;14528;15420;16660;17504;17917;17947 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 763;957;1459;1545;3351;3549;3613;4504;6571;6572;7850;9719;10019;10045;13745;14662;15561;16809;17659;18076;18107 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initiation factor 3 subunit H EIF3H sp|O15372|EIF3H_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3H PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 6 7 7 6 7 7 6 7 22.4 22.4 22.4 39.93 352 352 0 60.096 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0265 1.1477 8.2068 24 5 Leave out requantified 1.2389 1.0398 1.0072 1.2938 1.0885 1.1254 19.565 15.4 16.231 9 7 8 3 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 16.5 20.5 589510000 296910000 292600000 232420000 119540000 112890000 158810000 79441000 79364000 198290000 97936000 100350000 94 2233;3664;3781;5886;8619;9625;9636;13018 True;True;True;True;True;True;True;True 2260;3703;3821;5940;8695;9706;9717;13137 7279;7280;7281;11939;11940;12277;12278;12279;12280;12281;12282;18889;18890;18891;28131;28132;28133;31551;31552;31553;31586;31587;31588;42597 9390;9391;15381;15382;15831;15832;15833;15834;15835;15836;15837;15838;15839;15840;24282;24283;35933;35934;35935;35936;35937;40156;40157;40197;40198;40199;54012 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2570;3369;6755;24449;37886;52529 O43143;Q14562 O43143 29;1 29;1 28;0 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 DHX15 sp|O43143|DHX15_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX15 PE=1 SV=2 2 29 29 28 27 23 25 27 23 25 26 22 24 36.2 36.2 35.1 90.932 795 795;1220 0 120.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89519 0.93851 17.784 92 35 Leave out requantified 0.90066 0.96343 0.79091 0.92849 0.99647 0.86889 18.743 14.684 21.392 34 28 30 14 10 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.1 28.1 34.2 5125900000 2658700000 2467200000 1963800000 993680000 970160000 1582000000 822230000 759780000 1580000000 842780000 737260000 99 1398;2874;3186;3208;3331;4651;4951;5470;6793;7207;7213;7373;7587;8184;9739;10580;13348;14211;14342;14638;15084;15260;15261;15398;15836;16335;16644;17794;17965 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guanine-N7 methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNMT PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 4 9.9 9.9 9.9 54.843 476 476 0 18.581 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80159 0.86246 16.42 8 3 Leave out requantified 0.80136 0.98397 0.73004 0.86685 1.0394 0.819 53.079 4.1722 20.311 3 2 3 1 1 1 Median Median Median 6.9 4.6 9.9 108540000 54799000 53740000 36855000 17249000 19605000 33000000 17092000 15907000 38685000 20458000 18227000 100 2454;10888;11407;14774 True;True;True;True 2484;10980;11505;14909 8003;8004;35738;35739;35740;37394;48215;48216;48217 10297;10298;45274;45275;47341;61192;61193;61194;61195;61196 10297;45275;47341;61192 O43159 O43159 1 1 1 Ribosomal RNA-processing protein 8 RRP8 sp|O43159|RRP8_HUMAN Ribosomal RNA-processing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP8 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.2 4.2 4.2 50.714 456 456 0 3.4797 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 4.2 4.2 4.2 30947000 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epsilon-1 EEF1E1 sp|O43324|MCA3_HUMAN Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1E1 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 6 5 6 6 5 6 6 5 41.4 41.4 41.4 19.81 174 174 0 28.872 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81534 0.85355 28.088 18 5 Leave out requantified 0.82826 0.93867 0.91963 0.84716 0.91668 0.94619 35.772 26.228 19.513 6 7 5 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.6 35.1 29.9 1648300000 823600000 824730000 509380000 289920000 219460000 555390000 237490000 317900000 583560000 296190000 287370000 109 754;2644;4814;5146;12681;17269;17507 True;True;True;True;True;True;True 764;2674;4862;5199;12798;17421;17662 2486;2487;2488;8652;8653;8654;15519;15520;16570;16571;16572;41544;41545;56402;56403;57132;57133;57134 3228;3229;11081;11082;11083;19945;19946;21268;21269;21270;21271;52641;52642;52643;52644;71836;71837;71838;72724;72725 3228;11082;19945;21270;52644;71837;72724 O43390 O43390 25 17 17 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R HNRNPR sp|O43390|HNRPR_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPR PE=1 SV=1 1 25 17 17 19 21 21 13 14 13 13 14 13 46.6 36 36 70.942 633 633 0 120.11 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91161 1.0357 14.806 50 14 Leave out requantified 0.98093 0.92365 0.88638 1.0375 0.99146 0.97518 18.831 14.468 15.768 16 16 18 3 5 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.5 39.7 34.1 2559100000 1355500000 1203600000 769800000 377590000 392210000 776950000 422600000 354340000 1012300000 555260000 457070000 110 247;596;1071;2716;3230;3527;3647;3857;4313;4461;5918;7116;8492;9329;9673;11885;13521;13829;14633;15246;15371;17062;17221;17439;17772 False;False;True;True;False;True;True;True;True;True;False;True;False;True;False;True;False;True;True;False;True;True;True;True;True 248;602;1085;2748;3266;3566;3686;3897;4359;4507;5972;7174;8566;9409;9754;11990;13647;13957;14768;15386;15512;17214;17373;17594;17930 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554;1601;4575;4790 1792;1793;1794;1795;1796;5153;5154;5155;5156;5157;5158;14684;15304;15305;15306 2329;2330;2331;2332;2333;6641;6642;6643;6644;6645;6646;6647;18895;19695;19696;19697 2333;6641;18895;19695 O43719 O43719 12 12 12 HIV Tat-specific factor 1 HTATSF1 sp|O43719|HTSF1_HUMAN HIV Tat-specific factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HTATSF1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 6 8 9 6 8 9 6 8 9 18.1 18.1 18.1 85.852 755 755 0 48.544 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99424 1.0106 19.227 21 5 Leave out requantified 1.0737 0.98135 0.8493 1.1096 1.0176 0.87812 9.8361 18.847 24.832 5 8 8 1 4 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.9 14.3 13.9 375360000 193110000 182250000 93294000 43464000 49831000 122400000 60484000 61918000 159670000 89161000 70504000 130 2813;4526;5927;6893;7018;8509;11663;12020;12749;13335;14896;15047 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2845;4573;5981;6951;7076;8583;11766;12128;12867;13459;15031;15184 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 225;1562;3560;11768;12047;14516;14797;16086;17685;18263 716;5030;5031;5032;11475;38213;38214;38215;39152;39153;47007;47008;47009;47870;51970;51971;57201;57202;59012;59013;59014 950;6492;14761;48398;48399;48400;48401;48402;48403;49540;49541;59655;59656;60773;66157;66158;72817;75107;75108 950;6492;14761;48398;49540;59655;60773;66157;72817;75108 O43765 O43765 1 1 1 Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha SGTA sp|O43765|SGTA_HUMAN Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SGTA PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.8 3.8 3.8 34.063 313 313 0.0020736 2.3121 By MS/MS By MS/MS 0.94744 1.0197 12.765 3 3 Median NaN 0.95291 NaN NaN 1.0224 NaN NaN 0.37312 NaN 0 2 1 0 2 1 Median Median Median 0 3.8 3.8 146510000 89125000 57382000 0 0 0 84760000 43934000 40826000 61747000 45190000 16557000 132 859 True 870 2812;2813;2814;2815 3609;3610;3611;3612 3611 O43776 O43776 17 17 17 Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic NARS sp|O43776|SYNC_HUMAN Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NARS PE=1 SV=1 1 17 17 17 16 14 15 16 14 15 16 14 15 38.5 38.5 38.5 62.942 548 548 0 131.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85094 0.94188 27.24 63 20 Leave out requantified 0.78853 0.85094 0.91877 0.84373 0.88688 1.0265 41.967 15.091 25.292 22 19 22 6 7 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37 34.3 35.8 3648000000 1861200000 1786800000 1335300000 672060000 663210000 1030600000 534520000 496130000 1282100000 654630000 627490000 133 956;957;958;3043;3987;4354;6949;7098;7586;8591;9464;10354;10785;11678;11961;14372;17791 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 969;970;971;3078;4029;4400;7007;7156;7650;8667;9545;10442;10877;11782;12067;14505;17949 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Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 3 5 6 3 5 6 3 5 18.9 18.9 18.9 71.689 631 631 0 33.537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89438 0.94865 10.746 11 1 Leave out requantified 0.88878 1.2614 0.82106 0.94064 1.2703 0.85288 9.6502 8.3699 12.894 5 2 4 0 0 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 13.8 5.1 11.6 330750000 178530000 152220000 131620000 71485000 60136000 64284000 30665000 33619000 134840000 76383000 58460000 140 3083;3617;3965;6009;8990;10543;11115;17908 True;True;True;True;True;True;True;True 3118;3656;4007;6064;9068;10633;11206;18067 10081;10082;10083;11794;12912;19289;29461;34652;34653;34654;36446;36447;58418;58419 12921;12922;12923;12924;12925;15192;16654;24805;37559;37560;43943;43944;43945;46181;46182;74362 12923;15192;16654;24805;37560;43943;46181;74362 O60231 O60231 11 10 10 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 DHX16 sp|O60231|DHX16_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX16 PE=1 SV=2 1 11 10 10 8 7 10 7 6 9 7 6 9 13.1 12.2 12.2 119.26 1041 1041 0 45.902 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2676 1.3401 9.0543 21 10 Leave out requantified 1.3906 1.2676 1.2048 1.3261 1.3348 1.3882 25.035 17.451 10.569 8 6 7 5 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.6 8.5 13.1 303550000 139150000 164400000 101950000 50367000 51587000 89676000 36060000 53616000 111920000 52722000 59194000 141 1470;1522;3525;4158;5450;9007;14226;15743;16345;16896;17965 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False 1489;1541;3564;4201;5503;9085;14356;15886;16491;17047;18125 4805;4806;4979;4980;4981;11482;13527;13528;13529;17526;29513;29514;46494;46495;46496;51348;51349;51350;53349;53350;53351;55237;55238;55239;58587;58588;58589 6202;6420;6421;6422;14768;17417;17418;17419;22505;37623;37624;58993;58994;65344;65345;65346;65347;67993;67994;67995;70370;70371;70372;70373;70374;70375;74552;74553 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3737;29037;29038;39101;39102;39103;39104;52261 4781;37010;49489;49490;49491;49492;66554 4781;37010;49491;66554 O75400 O75400 9 9 9 Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A PRPF40A sp|O75400|PR40A_HUMAN Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF40A PE=1 SV=2 1 9 9 9 3 6 5 3 6 5 3 6 5 10.7 10.7 10.7 108.8 957 957 0 30.342 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95808 1.0778 22.582 15 4 Leave out requantified 0.85893 0.88019 0.99845 0.9577 0.98088 1.1477 24.642 5.5361 27.981 3 6 6 0 3 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 3.1 7.4 6.3 354340000 181750000 172590000 85220000 44812000 40407000 103430000 47462000 55967000 165690000 89478000 76214000 197 858;5482;8598;9207;11272;12375;15456;16025;17094 True;True;True;True;True;True;True;True;True 869;5535;8674;9286;11368;12490;15597;16169;17246 2808;2809;2810;2811;17637;17638;28064;30181;30182;30183;36973;40623;50491;52223;55900;55901 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peptidase subunit beta PMPCB sp|O75439|MPPB_HUMAN Mitochondrial-processing peptidase subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PMPCB PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 8.2 8.2 8.2 54.366 489 489 0 5.7628 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1042 1.1712 18.759 6 1 Leave out requantified NaN 1.1314 1.1176 NaN 1.1669 1.2181 NaN 23.053 11.646 1 2 3 0 0 1 Median Median Plateau 3.9 8.2 8.2 86962000 39370000 47592000 19157000 7921400 11236000 29684000 12104000 17580000 38121000 19345000 18776000 199 2703;8395;15328 True;True;True 2734;8468;15469 8847;8848;27333;27334;27335;50101;50102 11342;11343;34880;34881;63783;63784 11342;34880;63784 O75475 O75475 10 10 10 PC4 and SFRS1-interacting protein PSIP1 sp|O75475|PSIP1_HUMAN PC4 and SFRS1-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSIP1 PE=1 SV=1 1 10 10 10 6 6 7 6 6 7 6 6 7 23.8 23.8 23.8 60.103 530 530 0 31.051 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88961 1.0264 21.694 21 7 Leave out requantified 0.83463 0.89552 0.92429 0.96911 0.96737 1.0923 21.542 23.656 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Barrier-to-autointegration factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BANF1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 2 3 4 2 3 4 2 56.2 56.2 56.2 10.058 89 89 0 22.136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0766 1.1541 32.153 10 2 Leave out requantified 1.4508 1.0412 0.83045 1.5719 1.1199 0.85033 49.362 35.762 36.711 4 4 2 2 0 0 Median Leave out requantified Median 48.3 56.2 21.3 159250000 75253000 84001000 78915000 33115000 45800000 52580000 28103000 24477000 27759000 14036000 13724000 203 1692;2239;4783;8560 True;True;True;True 1716;2267;4831;8635 5550;5551;5552;7298;7299;7300;15417;15418;15419;27902 7181;7182;9415;9416;19834;19835;19836;19837;19838;35625 7182;9415;19835;35625 O75533 O75533 32 32 32 Splicing factor 3B subunit 1 SF3B1 sp|O75533|SF3B1_HUMAN Splicing factor 3B subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B1 PE=1 SV=3 1 32 32 32 29 25 27 29 25 27 29 25 27 34.4 34.4 34.4 145.83 1304 1304 0 230.68 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98949 1.0245 18.601 97 24 Leave out requantified 1.0806 0.94897 0.92265 1.1114 0.98271 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requantified Leave out requantified 19.7 16 14.4 877590000 491080000 386510000 281870000 159030000 122850000 278200000 150920000 127290000 317520000 181140000 136380000 243 4462;9239;10906;13642;14709;15058;17936;17937 True;True;True;True;True;True;True;True 4508;9318;10998;13768;14844;15195;18096;18097 14464;30294;30295;30296;35789;35790;35791;44544;44545;48000;48001;48002;48003;48004;48005;48006;48007;48008;49139;49140;58505;58506;58507;58508;58509;58510;58511;58512 18638;38590;38591;38592;38593;38594;38595;45329;45330;45331;56476;56477;60939;60940;60941;60942;60943;60944;60945;60946;60947;60948;60949;62469;62470;62471;74457;74458;74459;74460;74461;74462;74463;74464;74465 18638;38595;45330;56476;60943;62470;74460;74465 O95239;Q2VIQ3 O95239;Q2VIQ3 3;2 3;2 3;2 Chromosome-associated kinesin KIF4A;Chromosome-associated kinesin KIF4B KIF4A;KIF4B sp|O95239|KIF4A_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4A PE=1 SV=3;sp|Q2VIQ3|KIF4B_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4B PE=2 SV=2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3.4 3.4 3.4 139.88 1232 1232;1234 0 10.111 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87527 0.93143 22.967 9 2 Leave out requantified 1.1035 0.95209 0.85108 1.0439 1.0351 0.91861 15.219 14.788 32.942 3 3 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified 3.4 3.4 3.4 110650000 54589000 56065000 32424000 15824000 16601000 35379000 18222000 17157000 42850000 20543000 22307000 244 6324;6598;15862 True;True;True 6380;6655;16006 20321;20322;20323;21095;21096;21097;51725;51726;51727 26140;27078;27079;27080;27081;65843;65844;65845;65846 26140;27078;65846 O95260 O95260 2 2 2 Arginyl-tRNA--protein transferase 1 ATE1 sp|O95260|ATE1_HUMAN Arginyl-tRNA--protein transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATE1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.6 5.6 5.6 59.09 518 518 0 6.9206 By MS/MS By MS/MS 1.076 1.1306 24.288 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 2.3 0 3.3 41713000 19052000 22660000 14559000 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MS/MS By MS/MS 0.92663 1.0154 21.16 14 2 Leave out requantified 1.032 1.0541 0.95916 1.0999 1.0678 1.0625 26.026 35.732 16.39 5 5 4 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.6 10.1 7.2 344750000 164730000 180020000 147500000 57540000 89960000 106760000 58935000 47825000 90489000 48252000 42236000 247 313;2375;3698;5982;10829;11924;16867 True;True;True;True;True;True;True 314;2405;3737;6037;10921;12030;17017 977;978;7752;7753;7754;12026;12027;19202;35541;35542;35543;39090;55139;55140;55141 1282;1283;9958;9959;9960;9961;9962;9963;15492;15493;15494;24687;45042;45043;45044;49477;70242;70243;70244;70245 1282;9963;15492;24687;45044;49477;70243 O95347 O95347 46 46 46 Structural maintenance of chromosomes protein 2 SMC2 sp|O95347|SMC2_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC2 PE=1 SV=2 1 46 46 46 38 37 39 38 37 39 38 37 39 38.7 38.7 38.7 135.65 1197 1197 0 222.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88691 0.94626 24.972 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motif-containing protein 16-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM16L PE=2 SV=3 2 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 11.9 11.9 11.9 63.954 564 564;348 0 8.8827 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.228 1.3247 34.274 7 2 Leave out requantified 1.2343 1.0599 1.4002 1.2438 1.1069 1.5431 35.852 41.37 55.861 3 2 2 1 1 0 Median Median Median 9.4 6.4 8.9 102830000 52564000 50264000 49663000 23363000 26301000 26448000 14533000 11915000 26717000 14668000 12049000 250 3665;8367;11105;16635 True;True;True;True 3704;8440;11197;16784 11941;27238;27239;27240;36422;36423;36424;54368 15383;34760;34761;46151;46152;69283 15383;34760;46152;69283 O95372 O95372 1 1 1 Acyl-protein thioesterase 2 LYPLA2 sp|O95372|LYPA2_HUMAN Acyl-protein thioesterase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LYPLA2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 7.8 7.8 7.8 24.737 231 231 0.0030272 2.0554 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 7.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 251 16013 True 16157 52197 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Protein transport protein Sec24A SEC24A sp|O95486|SC24A_HUMAN Protein transport protein Sec24A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC24A PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 119.75 1093 1093 0.0088192 1.8302 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 257 10466 True 10556 34426;34427 43659;43660 43660 O95671 O95671 1 1 1 N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein ASMTL sp|O95671|ASML_HUMAN Probable bifunctional dTTP/UTP pyrophosphatase/methyltransferase protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASMTL PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.7 2.7 2.7 68.856 621 621 0 3.8113 By MS/MS By matching By matching 1.0393 1.0616 3.3219 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.7 2.7 2.7 46287000 22278000 24009000 15267000 7521000 7745600 16599000 8904500 7694800 14421000 5852700 8568500 258 315 True 316 980;981;982 1285;1286 1285 O95747 O95747 12 12 10 Serine/threonine-protein kinase OSR1 OXSR1 sp|O95747|OXSR1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase OSR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXSR1 PE=1 SV=1 1 12 12 10 11 11 12 11 11 12 10 10 10 29 29 25.8 58.022 527 527 0 127.62 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96609 1.0227 15.602 46 13 Leave out requantified 1.1168 0.94375 0.94951 1.1393 0.98407 1.0377 16.36 10.546 14.329 16 15 15 5 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.1 27.1 29 2151700000 1066500000 1085200000 790110000 380070000 410040000 626320000 312330000 314000000 735250000 374130000 361120000 259 1896;2705;2974;4699;4965;8375;9283;9890;10268;13922;14935;16825 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1921;2736;3008;4747;5017;8448;9362;9973;10352;14051;15071;16974 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O95782 29 29 21 AP-2 complex subunit alpha-1 AP2A1 sp|O95782|AP2A1_HUMAN AP-2 complex subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A1 PE=1 SV=3 1 29 29 21 25 24 21 25 24 21 18 17 14 40.2 40.2 30.3 107.54 977 977 0 182.92 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0142 1.0595 19.842 81 33 Leave out requantified 1.0322 1.0005 0.9569 1.0664 1.0092 1.0819 21.986 16.673 20.74 29 26 26 13 11 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34 30.8 29 3176500000 1616000000 1560500000 1298200000 672520000 625700000 909420000 458230000 451190000 968890000 485290000 483590000 261 206;1005;1126;2211;4259;4509;5006;5081;5126;6262;7103;7348;7995;8801;9543;9923;10136;10237;10899;11575;12042;12758;12905;13304;15249;15891;16453;17344;17874 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MAP4K4 sp|O95819|M4K4_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP4K4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.3 2.3 2.3 142.1 1239 1239 0 3.8035 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0.6 0 1.7 6459200 4478800 1980500 0 0 0 0 0 0 6459200 4478800 1980500 264 6697;9524 True;True 6754;9605 21394;31239 27442;39774 27442;39774 O95834 O95834 1 1 1 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 EML2 sp|O95834|EMAL2_HUMAN Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 70.678 649 649 0 2.8233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83222 1.0623 9.9375 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.5 1.5 1.5 36868000 21581000 15287000 11078000 6371300 4706300 14456000 8140900 6314700 11334000 7068400 4266000 265 1227 True 1243 4040;4041;4042 5186;5187;5188 5187 O95861 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Methyl-CpG-binding domain protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MBD3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 8.6 8.6 8.6 32.844 291 291 0 5.1734 By MS/MS By MS/MS 0.99384 1.0757 28.746 2 1 Median NaN NaN 0.99384 NaN NaN 1.0757 NaN NaN 28.746 0 0 2 0 0 1 Median Median Median 0 3.4 8.6 20342000 9325400 11017000 0 0 0 0 0 0 20342000 9325400 11017000 267 484;10693 True;True 488;10784 1577;1578;35136 2055;2056;44550 2056;44550 O96019;O94805 O96019 7;1 7;1 7;1 Actin-like protein 6A ACTL6A sp|O96019|ACL6A_HUMAN Actin-like protein 6A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTL6A PE=1 SV=1 2 7 7 7 5 6 6 5 6 6 5 6 6 21.4 21.4 21.4 47.46 429 429;426 0 19.748 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83568 0.92319 18.695 18 4 Leave out requantified 0.79587 0.87222 0.90824 0.8759 0.94776 1.072 14.532 23.617 21.982 5 6 7 0 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.8 17 18.2 430630000 219390000 211240000 121790000 61997000 59789000 152340000 79261000 73077000 156510000 78132000 78375000 268 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requantified Leave out requantified 40.5 21.7 22.4 2016900000 1170100000 846770000 1062000000 721370000 340670000 629350000 291980000 337370000 325520000 156790000 168730000 + 283 1293;3198;5189;5443;6022;6638;6699;7540;10365;11453;12029;12744;13735;14051;14112;14217;14218;14277;15453;15562;17500 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1310;3234;5242;5496;6077;6695;6756;7604;10455;11553;12139;12862;13861;14181;14242;14347;14348;14407;15594;15705;17655 4231;4232;10446;16699;16700;16701;16702;16703;16704;17508;19325;19326;19327;21224;21401;24463;34096;34097;34098;37523;37524;37525;39484;39485;39486;41751;41752;41753;41754;44838;45905;46123;46124;46125;46126;46127;46128;46469;46470;46471;46472;46652;46653;50481;50482;50483;50820;57117 5435;5436;13401;21429;21430;21431;21432;21433;21434;21435;22481;24849;24850;24851;24852;27220;27455;31214;43249;43250;43251;43252;47511;47512;47513;47514;49967;49968;49969;49970;49971;49972;52906;52907;52908;52909;52910;52911;56856;58286;58526;58527;58528;58529;58530;58531;58532;58533;58534;58535;58536;58537;58961;58962;58963;58964;59184;59185;64241;64242;64243;64244;64245;64683;72707 5435;13401;21431;22481;24849;27220;27455;31214;43249;47511;49968;52909;56856;58286;58527;58961;58964;59185;64242;64683;72707 P04350 P04350 17 3 0 Tubulin beta-4A chain TUBB4A sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV=2 1 17 3 0 16 16 16 2 2 2 0 0 0 54.1 9.7 0 49.585 444 444 0 6.498 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86325 0.87905 18.32 6 0 Leave out requantified 0.90584 0.94666 0.64067 0.91469 0.95798 0.67127 23.94 6.1608 36.905 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 50.2 50.2 50.2 353120000 194210000 158910000 131090000 72528000 58559000 106400000 53521000 52880000 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GSN sp|P06396|GELS_HUMAN Gelsolin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSN PE=1 SV=1; 2 4 4 4 2 3 2 2 3 2 2 3 2 9.1 9.1 9.1 85.696 782 782;781 0 9.1072 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6118 1.8214 48.636 7 6 Median 1.31 1.6118 1.638 1.4205 1.8214 1.8208 78.572 47.904 52.849 2 3 2 2 3 1 Median Median Median 5.5 5.5 3.3 136250000 61764000 74481000 36201000 17983000 18218000 55008000 26514000 28495000 45036000 17267000 27769000 + 302 2950;3712;13164;17013 True;True;True;True 2983;3751;13285;17165 9623;9624;9625;9626;12066;12067;43004;55644 12340;12341;12342;12343;15548;15549;54558;70889 12340;15548;54558;70889 P06454 P06454 3 3 3 Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 PTMA sp|P06454|PTMA_HUMAN Prothymosin alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTMA PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 21.6 21.6 21.6 12.203 111 111 0 46.793 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6063 1.7611 19.022 9 2 Leave out requantified 2.2367 0.313 0.62733 2.5858 0.34873 0.7476 20.684 22.984 40.551 4 2 3 0 1 1 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 462;913;2629;7246;7697;9025;9253;9641;11212;11997;14524;15954;17696 1478;1479;1480;2960;2961;2962;2963;2964;8504;8505;8506;8507;23176;24786;24787;24788;29295;30089;30090;30091;31340;31341;31342;31343;31344;31345;36462;36463;36464;36465;38964;38965;38966;38967;47030;47031;51559;51560;51561;57230;57231;57232 1911;1912;1913;1914;3817;3818;3819;3820;3821;3822;3823;10902;10903;10904;10905;29614;31634;31635;31636;31637;31638;37342;38332;38333;38334;38335;39904;39905;39906;39907;39908;39909;46203;46204;46205;46206;49333;49334;49335;49336;49337;59680;59681;65623;65624;65625;65626;65627;65628;72857;72858 1914;3823;10904;29614;31635;37342;38334;39905;46203;49334;59681;65625;72858 P06576 P06576 4 4 4 ATP synthase subunit beta, mitochondrial ATP5B sp|P06576|ATPB_HUMAN ATP synthase subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1B PE=1 SV=3 1 4 4 4 1 3 0 1 3 0 1 3 0 10.4 10.4 10.4 56.559 529 529 0 13.251 By MS/MS By MS/MS 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4E EIF4E sp|P06730|IF4E_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4E PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 26.7 26.7 26.7 25.097 217 217 0 18.442 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77376 0.83665 20.271 12 5 Leave out requantified 0.92921 0.81329 0.75178 0.97715 0.84886 0.81783 24.222 24.443 13.339 5 4 3 3 2 0 Median Median Leave out requantified 19.8 23.5 17.1 361950000 203650000 158300000 191400000 106420000 84979000 86354000 47588000 38766000 84200000 49642000 34558000 307 2270;7359;8389;15104;17547 True;True;True;True;True 2298;7422;8462;15243;17702 7394;7395;7396;23858;23859;23860;23861;27310;27311;27312;49288;49289;57250 9531;9532;9533;30459;30460;30461;30462;30463;30464;34854;34855;34856;34857;62685;62686;72878 9532;30464;34854;62686;72878 P06733 P06733 32 32 29 Alpha-enolase ENO1 sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2 1 32 32 29 30 31 30 30 31 30 27 28 27 74.9 74.9 62.2 47.168 434 434 0 323.31 By MS/MS By MS/MS 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Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDHB PE=1 SV=3 1 7 7 7 6 6 7 6 6 7 6 6 7 25.1 25.1 25.1 39.233 359 359 0 46.483 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1592 1.2666 25.526 28 11 Leave out requantified 1.3936 1.169 1.0984 1.468 1.2575 1.2175 33.843 30.615 37.433 9 9 10 4 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.1 20.6 25.1 831750000 379490000 452260000 296880000 135540000 161350000 247870000 113080000 134790000 287000000 130880000 156120000 375 2024;2204;2377;8015;15345;16395;17397 True;True;True;True;True;True;True 2050;2231;2407;8084;15486;16541;17552 6677;6678;6679;7179;7180;7181;7182;7756;7757;26046;26047;26048;26049;26050;26051;50158;50159;53526;53527;53528;53529;53530;53531;53532;53533;56828;56829;56830 8583;8584;8585;8586;8587;8588;9250;9251;9252;9253;9254;9255;9965;9966;33249;33250;33251;33252;33253;33254;63854;68211;68212;68213;68214;68215;68216;68217;68218;68219;68220;68221;72375 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sapiens OX=9606 GN=AKR1A1 PE=1 SV=3 1 14 14 14 12 12 10 12 12 10 12 12 10 48.9 48.9 48.9 36.573 325 325 0 56.744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88012 0.95337 17.097 45 13 Leave out requantified 0.91696 0.97088 0.93802 0.94481 0.98019 1.0339 15.463 20.486 16.128 15 15 15 5 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.9 43.4 35.4 2047300000 1112400000 934930000 724020000 395670000 328350000 630420000 340020000 290400000 692890000 376710000 316180000 404 839;2007;2801;5779;6391;7061;7068;7069;11398;11572;12880;13757;16360;17852 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 849;2033;2833;5833;6447;7119;7126;7127;11496;11674;12998;13884;16506;18011 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brain isoform ATP6V1B2 sp|P21281|VATB2_HUMAN V-type proton ATPase subunit B, brain isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1B2 PE=1 SV=3 2 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 5 15.1 15.1 15.1 56.5 511 511;513 0 19.499 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88944 0.94972 26.819 11 2 Leave out requantified 0.94648 0.70391 0.83583 0.97525 0.76246 0.92486 9.6324 30.7 37.674 3 3 5 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 9.2 15.1 179150000 91757000 87396000 54698000 26153000 28546000 48715000 26935000 21779000 75741000 38669000 37071000 470 1635;1640;12764;13903;15948 True;True;True;True;True 1655;1660;12882;14032;16092 5337;5338;5349;5350;5351;41810;41811;45410;45411;45412;51982 6878;6879;6896;6897;52980;52981;52982;57655;57656;57657;57658;57659;66171 6878;6897;52982;57659;66171 P21283 P21283 7 7 7 V-type proton ATPase subunit C 1 ATP6V1C1 sp|P21283|VATC1_HUMAN V-type proton ATPase subunit C 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1C1 PE=1 SV=4 1 7 7 7 5 6 6 5 6 6 5 6 6 20.2 20.2 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Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 28.6 28.6 28.6 31.554 332 332 0 42.093 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83162 0.87957 10.9 19 4 Leave out requantified 0.83162 0.87338 0.70888 0.87957 0.92032 0.81105 10.026 38.722 15.18 7 6 6 0 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.6 28.6 28.6 594890000 317040000 277850000 239000000 134900000 104100000 197980000 97398000 100590000 157910000 84747000 73160000 540 51;331;3340;5820;5880 True;True;True;True;True 52;333;3378;5874;5934 171;172;173;174;175;176;1035;1036;1037;1038;1039;10893;10894;10895;10896;18704;18705;18706;18870;18871;18872 235;236;237;238;239;240;1348;1349;1350;1351;1352;1353;1354;13993;13994;13995;13996;13997;24074;24075;24076;24077;24078;24079;24263;24264;24265 238;1350;13993;24075;24264 P30040 P30040 5 5 5 Endoplasmic reticulum resident protein 29 ERP29 sp|P30040|ERP29_HUMAN Endoplasmic reticulum resident protein 29 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX3 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 24.2 24.2 24.2 27.692 256 256 0 14.508 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.044 1.1367 23.1 8 4 Leave out requantified 0.98883 0.97573 1.2086 1.0911 1.0298 1.355 17.309 37.069 49.921 2 2 4 0 1 3 Median Median Median 19.9 12.1 19.9 140220000 68571000 71648000 36200000 17193000 19007000 31270000 15580000 15690000 72749000 35798000 36951000 546 491;2676;6301;7138 True;True;True;True 495;2706;6357;7198 1599;1600;1601;8753;8754;8755;8756;20244;20245;20246;22998 2082;2083;2084;11206;11207;11208;11209;26033;26034;29412 2082;11208;26033;29412 P30050 P30050 9 9 9 60S ribosomal protein L12 RPL12 sp|P30050|RL12_HUMAN 60S ribosomal protein L12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL12 PE=1 SV=1 1 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 67.9 67.9 67.9 17.818 165 165 0 217.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93643 1.0351 8.9438 48 1 Leave out requantified 0.88781 1.0317 0.9015 0.93119 1.0891 0.98968 12.565 11.593 8.1541 16 16 16 0 1 0 Leave out 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synthase isoform type-2 MAT2A sp|P31153|METK2_HUMAN S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAT2A PE=1 SV=1 2 14 14 14 13 13 13 13 13 13 13 13 13 41 41 41 43.66 395 395;395 0 76.087 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8739 0.949 22.315 48 20 Leave out requantified 0.79868 0.84419 0.96766 0.83989 0.89655 1.056 23.131 25.44 20.599 17 17 14 7 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.7 35.9 35.2 3412000000 1792300000 1619700000 1143900000 592950000 550930000 1156100000 602010000 554110000 1112000000 597310000 514680000 564 171;2912;4129;4130;5515;5705;7078;7409;7805;11729;14976;15218;15696;16036 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 172;2945;4172;4173;5568;5758;7136;7472;7872;11833;15112;15357;15839;16180 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processed HNRNPH1 sp|P31943|HNRH1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH1 PE=1 SV=4 1 12 12 6 11 8 11 11 8 11 5 3 5 40.1 40.1 22 49.229 449 449 0 132.33 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94488 1.0289 21.315 40 1 Leave out requantified 1.0051 0.93867 0.89674 1.0725 0.97875 0.98766 17.543 15.571 20.096 14 12 14 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.6 24.9 35.4 2803000000 1398600000 1404400000 1018600000 494330000 524300000 853740000 435750000 417990000 930660000 468570000 462090000 569 1436;2645;3768;6347;7253;8146;14352;14649;16519;17228;17759;18113 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1455;2675;3808;6403;7315;8218;14485;14784;16665;17380;17917;18274 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7 7 7 Sepiapterin reductase SPR sp|P35270|SPRE_HUMAN Sepiapterin reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPR PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 6 7 6 6 7 6 6 7 37.2 37.2 37.2 28.048 261 261 0 39.584 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0053 0.99661 9.9935 19 5 Leave out requantified 0.95162 1.0111 0.99913 1.0249 1.0008 1.0257 22.539 19.461 10.597 6 6 7 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.3 33.3 37.2 308740000 158790000 149950000 115840000 55820000 60024000 77643000 43045000 34598000 115250000 59928000 55325000 596 2742;4613;10189;10271;12809;16830;17002 True;True;True;True;True;True;True 2774;4660;10273;10355;12927;16980;17154 9008;9009;9010;14910;14911;14912;33455;33456;33457;33741;33742;33743;33744;41940;55021;55022;55023;55609;55610;55611 11561;11562;11563;11564;19186;19187;42464;42465;42466;42467;42829;42830;42831;42832;53146;70082;70083;70084;70847;70848;70849;70850 11563;19186;42466;42831;53146;70083;70847 P35573 P35573 5 5 5 Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase AGL sp|P35573|GDE_HUMAN Glycogen debranching enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGL PE=1 SV=3 1 5 5 5 2 2 4 2 2 4 2 2 4 5.5 5.5 5.5 174.76 1532 1532 0 9.528 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2374 1.2359 55.434 7 7 Median 1.3375 0.85589 1.3892 1.35 0.86862 1.4061 18.394 49.869 82.41 2 2 3 2 2 3 Median Median Median 1.9 1.7 4.4 75072000 33551000 41521000 29952000 11233000 18720000 21987000 10178000 11810000 23132000 12141000 10991000 597 10808;11564;13654;13866;13909 True;True;True;True;True 10900;11666;13780;13995;14038 35483;35484;37891;44580;45308;45309;45425;45426 44968;44969;47964;56520;57525;57526;57669;57670 44969;47964;56520;57526;57670 P35579;REV__Q9UKV3;P12883;P13535;Q9UKX3;P13533;P11055;A7E2Y1 P35579 162;1;1;1;1;1;1;1 162;1;1;1;1;1;1;1 134;1;0;0;0;0;0;0 Myosin-9 MYH9 sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 8 162 162 134 146 154 152 146 154 152 121 126 125 65.4 65.4 55.6 226.53 1960 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P38646 P38646 28 28 28 Stress-70 protein, mitochondrial HSPA9 sp|P38646|GRP75_HUMAN Stress-70 protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA9 PE=1 SV=2 1 28 28 28 19 23 26 19 23 26 19 23 26 47.7 47.7 47.7 73.68 679 679 0 168.04 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.976 1.0497 13.395 82 18 Leave out requantified 1.0055 0.97928 0.96981 1.0718 1.0809 1.1019 13.383 14.399 15.211 23 26 33 5 5 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.9 40.8 44.6 3044400000 1580500000 1463900000 813050000 407160000 405880000 982070000 484610000 497450000 1249300000 688690000 560560000 626 1099;1226;1740;2012;2774;2842;3773;4416;4455;4540;4575;8578;9608;11182;11624;12263;12377;12456;13493;13633;14501;14685;15282;15832;16272;16749;17086;17624 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3B PE=2 SV=2 2 21 21 21 17 21 21 17 21 21 17 21 21 55.3 55.3 55.3 51.109 472 472;472 0 185.61 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90085 0.97276 62.902 84 15 Leave out requantified 0.92001 0.93232 0.89096 0.96795 1.0009 0.96074 69.499 15.792 13.822 28 28 28 7 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.8 55.3 55.3 10053000000 5251800000 4801300000 3223500000 1719400000 1504100000 3244900000 1666000000 1578900000 3584800000 1866500000 1718300000 646 732;2237;4431;6082;6869;7083;7475;8404;8417;9363;9897;10317;10833;11722;12448;12502;13588;13799;13800;16482;17975 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 741;2264;4477;6138;6927;7141;7539;8477;8490;9444;9980;10402;10925;11826;12564;12618;13714;13927;13928;16628;18135 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initiation factor 2D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2D PE=1 SV=3 1 10 10 10 7 7 8 7 7 8 7 7 8 27.7 27.7 27.7 64.706 584 584 0 57.219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94073 0.96834 27.836 21 7 Leave out requantified 0.87307 1.0631 0.83247 0.92057 1.1197 0.92175 21.459 23.839 31.801 6 7 8 2 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.3 19.9 21.9 326210000 189500000 136710000 100270000 59786000 40486000 100510000 57425000 43087000 125420000 72288000 53137000 647 305;1193;1886;6342;6632;7154;9415;10594;14242;14579 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 306;1209;1911;6398;6689;7214;9496;10685;14372;14713 958;959;960;3918;3919;3920;6207;6208;6209;20369;20370;21204;21205;21206;23061;30907;34829;46539;46540;46541;46542;46543;47622;47623;47624 1262;1263;1264;5006;5007;5008;5009;5010;8007;8008;8009;8010;26197;26198;26199;26200;27199;27200;27201;29477;39387;44173;59048;59049;59050;59051;59052;59053;60458;60459;60460;60461;60462 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4063;10812;12260;14271;20700;24888;30090;32302;43443;45130;49270;49712;51461;54701;54703 P43487 P43487 3 3 3 Ran-specific GTPase-activating protein RANBP1 sp|P43487|RANG_HUMAN Ran-specific GTPase-activating protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 26.9 26.9 26.9 23.31 201 201 0 5.9234 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97251 1.0595 11.175 6 1 Leave out requantified NaN 0.82199 0.95327 NaN 0.87976 1.134 NaN 43.273 5.6647 1 3 2 0 1 0 Median Median Median 16.9 10 5.5 143750000 70688000 73065000 26911000 11364000 15546000 77303000 39769000 37535000 39539000 19555000 19984000 670 2988;3585;5217 True;True;True 3023;3624;5270 9784;11676;11677;11678;11679;16778 12552;15029;15030;15031;15032;15033;15034;21538 12552;15030;21538 P43490 P43490 9 9 9 Nicotinamide phosphoribosyltransferase NAMPT sp|P43490|NAMPT_HUMAN Nicotinamide phosphoribosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAMPT PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 6 7 6 6 7 6 6 7 22.4 22.4 22.4 55.52 491 491 0 45.257 By MS/MS 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14161;15253;15257;17343;17980;32959;33147;41288;44226;47262;72136 P43897 P43897 8 8 8 Elongation factor Ts, mitochondrial TSFM sp|P43897|EFTS_HUMAN Elongation factor Ts, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSFM PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 6 7 7 6 7 7 6 7 32.3 32.3 32.3 35.39 325 325 0 99.723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84761 0.95487 19.635 25 10 Leave out requantified 0.8869 0.93323 0.92203 0.92681 1.0068 1.0109 20.803 21.959 10.788 10 6 9 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.5 27.4 29.5 605780000 312700000 293080000 241130000 121980000 119140000 155980000 84213000 71767000 208670000 106510000 102160000 673 878;2840;4950;5959;9714;9781;12388;17756 True;True;True;True;True;True;True;True 890;2872;5002;6014;9796;9863;12503;17914 2889;2890;2891;9300;15973;15974;15975;19126;19127;19128;19129;19130;19131;19132;19133;31857;31858;32089;32090;32091;32092;32093;40662;40663;57902;57903;57904 3720;3721;3722;3723;11944;20517;20518;20519;20520;20521;24588;24589;24590;24591;24592;24593;24594;40532;40860;40861;40862;40863;40864;40865;40866;51519;51520;73699;73700;73701;73702;73703;73704 3722;11944;20521;24588;40532;40864;51519;73703 P45877 P45877 3 3 3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C PPIC sp|P45877|PPIC_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIC PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 14.6 14.6 14.6 22.763 212 212 0 14.372 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74857 0.81767 9.7662 13 5 Leave out requantified 0.74857 0.96623 0.69175 0.76945 1.0239 0.76099 7.8287 20.212 19.266 5 4 4 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 14.6 14.6 9.9 259740000 153060000 106680000 94827000 58320000 36506000 69185000 38576000 30609000 95727000 56165000 39562000 674 8388;15615;15880 True;True;True 8461;15758;16024 27307;27308;27309;50997;50998;51772;51773;51774;51775;51776;51777;51778;51779 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19064;25176;27587;31488;34860;55924;67100 P45985 P45985 1 1 1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 MAP2K4 sp|P45985|MP2K4_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3 3 3 44.287 399 399 0.0030303 2.0604 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 3 8351900 5832100 2519800 0 0 0 0 0 0 8351900 5832100 2519800 676 5784 True 5838 18609 23948 23948 P46060 P46060 8 8 8 Ran GTPase-activating protein 1 RANGAP1 sp|P46060|RAGP1_HUMAN Ran GTPase-activating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANGAP1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 4 4 6 4 4 6 4 4 16 16 16 63.541 587 587 0 35.078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2016 1.264 28.206 12 4 Leave out requantified 1.4503 0.86203 0.85403 1.487 0.88607 0.93246 27.904 38.502 18.284 6 2 4 2 1 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 12.1 8.7 8.9 234060000 108130000 125930000 125720000 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1849;1850;1851;2364;2365;4679;4680;4681;4682;4683;6388;6389;6390;9342;9343;9890;9891;9892;14551;14552;14553;14554;14555;14556;14557;15879;15880;15881;16181;16182;16183;16184;16185;18549;20103;20104;20105;20106;20107;20108;20109;21725;21726;21727;22740;24598;24599;24600;24601;24602;24603;24604;26691;26692;27111;27112;34267;34268;34269;37028;41707;41708;41709;42060;42061;49880;49881;49882;49883;49884;49885;49886;51323;51324;51325;51326;51327;51328;51339;51340;51341;51342;51343;51344;52618;52619;52620;55333;55334;55335;55336;55337;57703;57704;57705;57706;57707 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acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACADVL PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 5 6 5 5 6 5 5 6 12.8 12.8 12.8 70.389 655 655 0 15.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90472 0.95045 14.917 18 2 Leave out requantified 0.92965 0.88523 0.90872 0.94933 0.9058 0.98714 10.37 25.732 12.629 6 6 6 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.6 9.6 11.6 331370000 170290000 161090000 98682000 50126000 48556000 116310000 61350000 54960000 116380000 58810000 57570000 733 573;6090;13664;13792;14243;15643;15711 True;True;True;True;True;True;True 579;6146;13790;13920;14373;15786;15854 1891;1892;1893;19531;44611;44612;44613;44614;45009;45010;46544;46545;46546;46547;46548;46549;51084;51085;51086;51261 2460;2461;2462;2463;25115;56557;56558;56559;57079;59054;59055;59056;59057;59058;59059;59060;59061;59062;65004;65232 2463;25115;56557;57079;59060;65004;65232 P49756 P49756 5 5 5 RNA-binding protein 25 RBM25 sp|P49756|RBM25_HUMAN RNA-binding protein 25 OS=Homo sapiens 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3469;7545;17385;17687;42404;42405;42406;50580;53818;53819;53820;53821 3469;7545;17385;17687;42404;50580;53820 P49840 P49840 3 3 3 Glycogen synthase kinase-3 alpha GSK3A sp|P49840|GSK3A_HUMAN Glycogen synthase kinase-3 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSK3A PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 11.6 11.6 11.6 50.98 483 483 0 4.7009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.51026 0.54542 20.723 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 6.6 5 2.1 16052000 10550000 5502100 0 0 0 7802000 5188200 2613800 8249900 5361700 2888200 738 14447;15762;17279 True;True;True 14581;15905;17432 47235;47236;51412;56436 59962;59963;65433;71878 59962;65433;71878 P49841 P49841 4 4 4 Glycogen synthase kinase-3 beta GSK3B sp|P49841|GSK3B_HUMAN Glycogen synthase kinase-3 beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSK3B PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 2 3 3 2 3 3 2 20 20 20 46.744 420 420 0 17.824 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93198 0.98707 8.7282 7 3 Leave out requantified 1.1245 0.91499 0.8228 1.1009 0.94766 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214;977;2249;3479;3635;4135;4145;4552;7242;7812;8112;8335;8426;11142;12496;14020;15007;15284;15389;15621;16045;16697;16711;16749;17053 681;682;683;3177;7235;7236;7237;7238;11204;11205;11206;11207;11208;11715;11716;11717;11718;11719;13319;13320;13321;13322;13352;14608;14609;14610;14611;14612;14613;14614;14615;14616;14617;23159;23160;23161;23162;23163;23164;25150;25151;26148;26871;26872;27202;27203;36272;36273;36274;40633;40634;40635;40636;40637;40638;45368;45369;45370;48531;48532;48533;48534;48535;49414;49415;49416;49417;49418;49792;49793;49794;49795;49796;50558;50559;50560;51849;54065;54066;54067;54105;54266;54267;55259 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20590;27920;45501;48599;51740;61868 P51149 P51149 3 3 3 Ras-related protein Rab-7a RAB7A sp|P51149|RAB7A_HUMAN Ras-related protein Rab-7a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB7A PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 18.4 18.4 18.4 23.489 207 207 0 8.9475 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7004 0.74301 28.561 6 5 Median 0.82091 NaN 0.55807 0.87051 NaN 0.62057 5.9331 NaN 40.94 2 1 3 1 1 3 Median Median Median 11.6 12.1 12.1 90500000 53129000 37372000 33969000 20292000 13677000 13313000 8964800 4348400 43218000 23871000 19346000 763 2804;3299;12043 True;True;True 2836;3337;12153 9189;10777;10778;10779;39532;39533;39534 11776;13841;13842;13843;13844;50033;50034;50035 11776;13844;50035 P51531 P51531 7 2 2 Probable global transcription activator SNF2L2 SMARCA2 sp|P51531|SMCA2_HUMAN Probable global transcription activator SNF2L2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCA2 PE=1 SV=2 1 7 2 2 4 3 3 1 0 1 1 0 1 5.4 1.5 1.5 181.28 1590 1590 0 7.3248 By MS/MS By matching By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN 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16773;16774;16775;16776;16777;16778;22965;22966;22967;25534;25535;25536;25537;25538;25539;25540;25541;25542;25543;31006;31007;42255;42256;42257;42258;42259;42260;42261;42262;42263;42264;42265;42266;44579;44580;44581;49239;49240;49241;49242;50079;50080;50081;50082;50083;50137;50138;50139;50140;51293;51294;51295;51296;51297;51298;51299;51300;55369;55370;63309;63310;63311;63312;63313;63314 16775;22967;25542;31006;42257;44579;49239;50082;50139;51300;55369;63309 P52294;O15131 P52294 5;2 5;2 3;0 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed KPNA1 sp|P52294|IMA5_HUMAN Importin subunit alpha-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KPNA1 PE=1 SV=3 2 5 5 3 4 3 4 4 3 4 3 1 2 12.1 12.1 7.4 60.221 538 538;536 0 20.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86123 0.91545 11.815 12 5 Leave out requantified 1.3574 2.0281 0.83181 1.4015 2.0867 0.85252 27.552 144.74 158.06 4 4 4 0 3 2 Leave out requantified Median Median 10 8.6 10 295220000 116530000 178690000 107190000 41740000 65448000 80286000 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stimulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1GDS1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 1 3 2 1 3 2 1 3 10 10 10 66.316 607 607 0 7.4506 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91567 0.97456 45.12 7 5 Median 1.2867 NaN 0.88623 1.2954 NaN 0.91029 22.181 NaN 47.654 2 1 4 2 0 3 Median Median Median 4.8 2.8 8.1 85409000 41421000 43988000 27167000 10078000 17090000 12422000 8168200 4254300 45819000 23175000 22643000 781 8090;13566;14720;16249 True;True;True;True 8162;13692;14855;16394 26317;44308;44309;44310;44311;48049;52988 33590;56199;56200;56201;61000;67518 33590;56201;61000;67518 P52564 P52564 7 3 3 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 MAP2K6 sp|P52564|MP2K6_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K6 PE=1 SV=1 1 7 3 3 5 5 2 3 2 1 3 2 1 24 11.7 11.7 37.492 334 334 0 8.1014 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64314 0.71967 47.607 3 3 Median 0.53247 NaN NaN 0.58238 NaN NaN 29.934 NaN NaN 2 0 1 2 0 1 Median Median Median 18.9 18.3 8.4 47133000 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DNA mismatch repair protein Msh6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSH6 PE=1 SV=2 1 33 33 33 28 25 28 28 25 28 28 25 28 32.4 32.4 32.4 152.78 1360 1360 0 243.54 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8881 0.91538 32.537 96 28 Leave out requantified 0.8914 0.8277 0.85089 0.90996 0.88756 0.91154 22.387 36.714 22.878 34 31 31 11 9 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.4 24 27.4 3993300000 2049900000 1943300000 1312300000 677590000 634720000 1387500000 704850000 682610000 1293500000 667510000 625990000 785 545;715;1660;1671;1830;4300;4601;4646;4995;6425;6473;6704;7699;7728;7748;9245;9246;10668;11966;12404;12450;13210;13417;14374;14481;14571;14712;14719;15451;15528;16331;16537;17496 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 550;724;1680;1692;1854;4346;4648;4693;5047;6482;6530;6761;7764;7793;7813;9324;9325;10759;12072;12520;12566;13331;13542;14507;14615;14705;14847;14854;15592;15670;16476;16683;17651 1778;1779;1780;1781;2355;2356;2357;5405;5450;5451;5452;6002;6003;13957;13958;13959;13960;14887;15017;15018;16101;20619;20620;20621;20750;20751;20752;21413;21414;21415;21416;21417;25006;25089;25090;25091;25152;25153;25154;25155;25156;30314;30315;30316;30317;30318;35052;35053;35054;35055;35056;35057;39237;39238;39239;40717;40718;40719;40874;40875;40876;43137;43138;43139;43834;43835;46976;46977;46978;47334;47335;47336;47599;47600;48023;48024;48025;48026;48027;48044;48045;48046;48047;48048;50475;50476;50477;50725;50726;53246;53247;53248;53249;54016;54017;54018;54019;54020;54021;54022;57109 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OX=9606 GN=KIF11 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 1.9 1.9 1.9 119.16 1056 1056 0.002065 2.2842 By MS/MS By MS/MS 0.5534 0.57288 67.692 3 1 Median NaN 0.91234 NaN NaN 0.98299 NaN NaN 76.357 NaN 0 2 1 0 1 0 Median Median Median 0 1.9 0.9 30826000 16086000 14740000 0 0 0 21246000 9303700 11942000 9580400 6782700 2797700 786 11836;13143 True;True 11940;13264 38761;42938;42939 49071;54477 49071;54477 P52735 P52735 6 6 6 Guanine nucleotide exchange factor VAV2 VAV2 sp|P52735|VAV2_HUMAN Guanine nucleotide exchange factor VAV2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAV2 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 4 3 6 4 3 6 4 3 9.9 9.9 9.9 101.29 878 878 0 35.207 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97308 0.99514 70.806 13 10 Median 0.97613 0.97308 0.95781 0.95739 0.9959 1.0033 77.67 13.077 92.873 6 3 4 5 2 3 Median Median Median 9.9 7.3 4.9 164880000 83248000 81629000 65328000 34189000 31139000 33885000 15650000 18235000 65664000 33409000 32255000 787 3890;5488;6187;7678;11629;12169 True;True;True;True;True;True 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Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RARS PE=1 SV=2 1 35 35 35 34 32 33 34 32 33 34 32 33 51.4 51.4 51.4 75.378 660 660 0 275.15 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89284 0.94425 34.543 129 26 Leave out requantified 0.88909 0.96775 0.88391 0.92562 1.0239 0.98704 19.589 17.619 41.907 42 42 45 6 9 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 51.2 51.2 49.8 10572000000 5547500000 5024800000 3768700000 1985900000 1782800000 3380400000 1697800000 1682600000 3423200000 1863800000 1559400000 806 190;1681;2244;2245;3840;4264;4939;5030;5894;5922;5991;5992;7130;7924;7925;8452;9099;9243;9603;10250;10322;10323;10368;10547;11325;11636;12025;13318;13625;14256;14257;14661;16300;16384;16641 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH2 PE=1 SV=1 1 7 2 2 7 6 7 2 2 2 2 2 2 23.2 8.9 8.9 49.263 449 449 0 13.527 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97011 1.0476 36.235 6 1 Leave out requantified 0.93283 0.88147 1.0288 1.0018 0.96802 1.1221 29.921 36.468 39.148 2 2 2 0 1 0 Median Median Median 23.2 21.4 23.2 155900000 75418000 80479000 47726000 25203000 22523000 52546000 23680000 28866000 55625000 26535000 29090000 825 2645;3769;6347;7253;14649;16519;17227 False;True;False;False;False;False;True 2675;3809;6403;7315;14784;16665;17379 8655;8656;8657;12243;12244;12245;20386;20387;23477;23478;23479;23480;23481;23482;47831;47832;47833;47834;47835;47836;53959;53960;53961;53962;53963;56290;56291;56292;56293 11084;11085;15795;15796;15797;15798;15799;26219;26220;29991;29992;29993;29994;29995;29996;29997;29998;29999;30000;30001;30002;60724;60725;60726;60727;60728;60729;60730;60731;60732;60733;60734;60735;68756;68757;68758;68759;68760;68761;68762;68763;68764;71710;71711;71712;71713;71714 11085;15797;26219;30000;60730;68761;71710 P55809 P55809 12 12 12 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OXCT1 sp|P55809|SCOT1_HUMAN Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXCT1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 9 9 10 9 9 10 9 9 10 33.5 33.5 33.5 56.157 520 520 0 101.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86475 0.94604 36.545 39 8 Leave out requantified 1.0331 0.90144 0.7861 1.0676 0.95577 0.88499 23.657 15.734 36.403 13 14 12 5 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.6 22.9 28.1 1820600000 907450000 913170000 555860000 250200000 305660000 710890000 356880000 354010000 553870000 300360000 253510000 826 553;1932;2302;5599;6374;6376;6407;11541;11753;12674;13266;14648 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 558;1958;2330;5652;6430;6432;6463;11642;11857;12791;13388;14783 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factor 6 EIF6 sp|P56537|IF6_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 22.9 22.9 22.9 26.599 245 245 0 44.868 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82219 0.86767 18.51 12 3 Leave out requantified 0.95952 0.74316 0.7708 0.99244 0.75873 0.84395 19.33 4.6874 22.888 4 5 3 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 22.9 22.9 18.8 305470000 155040000 150430000 112920000 55002000 57921000 126670000 66517000 60153000 65877000 33518000 32359000 830 1331;7044;10370;12182 True;True;True;True 1348;7102;10460;12294 4357;4358;4359;22593;22594;22595;34113;34114;34115;34116;39974;39975 5607;5608;5609;5610;28951;28952;28953;43274;43275;43276;43277;43278;50632;50633;50634 5608;28952;43275;50633 P56545 P56545 1 1 1 C-terminal-binding protein 2 CTBP2 sp|P56545|CTBP2_HUMAN C-terminal-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTBP2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.3 4.3 4.3 48.944 445 445 0 46.347 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0049 1.1116 5.2876 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 4.3 4.3 4.3 147260000 74645000 72613000 47259000 23331000 23928000 44365000 22322000 22043000 55634000 28991000 26643000 831 2529 True 2559 8254;8255;8256 10593;10594;10595;10596 10594 P57076 P57076 2 2 2 UPF0769 protein C21orf59 C21orf59 sp|P57076|CF298_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 298 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP298 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 5.9 5.9 5.9 33.224 290 290 0 3.8491 By MS/MS By MS/MS 0.84959 0.90435 21.543 4 2 Median 0.92583 0.83828 NaN 0.9444 0.90435 NaN 29.914 21.88 NaN 2 2 0 1 1 0 Median Median Median 5.9 5.9 0 56652000 28298000 28354000 24873000 12610000 12263000 31779000 15688000 16090000 0 0 0 832 4356;6556 True;True 4402;6613 14111;14112;20998;20999 18168;18169;26969;26970 18169;26970 P57081 P57081 2 2 2 tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4 WDR4 sp|P57081|WDR4_HUMAN tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.5 7.5 7.5 45.489 412 412 0 9.1243 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2611 1.2362 16.166 9 4 Median 1.0387 1.3899 1.2846 1.121 1.365 1.3315 11.602 20.077 13.757 3 3 3 1 2 1 Plateau Median Median 7.5 7.5 7.5 107630000 48986000 58647000 34316000 17086000 17230000 35359000 15469000 19889000 37959000 16431000 21528000 833 8279;11445 True;True 8351;11545 26933;26934;26935;26936;26937;26938;37507;37508;37509 34357;34358;34359;34360;34361;47489;47490;47491 34357;47489 P57678 P57678 7 7 7 Gem-associated protein 4 GEMIN4 sp|P57678|GEMI4_HUMAN Gem-associated protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GEMIN4 PE=1 SV=2 1 7 7 7 4 6 6 4 6 6 4 6 6 6.7 6.7 6.7 120.04 1058 1058 0 12.099 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89371 0.93353 16.681 15 1 Leave out requantified 0.83436 0.90658 0.7995 0.84932 0.94216 0.90767 21.317 17.836 26.764 4 5 6 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified 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Triosephosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPI1 PE=1 SV=3 1 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 66.8 66.8 66.8 30.791 286 286 0 150.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.011 1.0923 14.113 64 19 Leave out requantified 1.1 0.90938 1.011 1.169 0.97485 1.1153 12.198 12.083 17.022 22 22 20 7 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 66.8 66.8 66.8 6362900000 3148300000 3214700000 2021600000 980230000 1041400000 2227100000 1161100000 1066000000 2114200000 1006900000 1107300000 839 3288;4035;5014;7273;7396;7810;8995;13105;14951;16074;16541;17003;17254;17331;17356 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3326;4077;5066;7336;7459;7877;9073;13226;15087;16218;16687;17155;17406;17485;17511 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D3;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 UBE2D3;UBE2D2 sp|P61077|UB2D3_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2D3 PE=1 SV=1;sp|P62837|UB2D2_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2D2 PE=1 SV=1 4 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 24.5 24.5 24.5 16.687 147 147;147;147;147 0 11.524 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.084 1.1445 23.109 6 1 Leave out requantified 1.5432 1.1703 0.96428 1.5638 1.2242 1.0395 41.778 32.626 17.679 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 19.7 24.5 19.7 256870000 124390000 132480000 94024000 41366000 52657000 79949000 40342000 39607000 82897000 42683000 40214000 854 4197;8466;14505 True;True;True 4240;8539;14639 13643;27576;27577;27578;47405;47406;47407 17579;35187;35188;35189;35190;60176;60177;60178;60179;60180;60181 17579;35188;60178 P61081 P61081 6 6 6 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 UBE2M sp|P61081|UBC12_HUMAN NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2M PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 35.5 35.5 35.5 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2023;2024;2025;2026;2027;2028;2029;2030;2031;2032;2033;2034;2035;23653;23654;23655;23656;23657;29600;29601;29602;29603;29604;29605;29710;29711;29712;29713;29714;29891;29892;29893;29894;29895;29896;32954;32955;32956;38449;38450;38451;38452;38453;38454;42916;42917;42918;48891;48892;48893;48894;48895;48896;48897;48898;48899;50928;50929;50930;50931;50932;50933;52495;52496;52497;55679;55680;55681;56765;56766;56767 2628;2629;2630;2631;2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2642;2643;2644;30183;30184;30185;30186;30187;37719;37720;37721;37722;37723;37724;37725;37726;37865;37866;37867;37868;37869;38069;38070;38071;38072;38073;38074;38075;38076;38077;38078;38079;38080;41887;41888;41889;48689;48690;48691;48692;48693;48694;48695;48696;48697;48698;48699;54451;54452;54453;54454;54455;54456;62121;62122;62123;62124;62125;62126;62127;62128;62129;62130;62131;62132;62133;64815;64816;64817;64818;64819;64820;66843;66844;66845;66846;66847;70926;72294;72295;72296;72297;72298;72299 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Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed PPIA sp|P62937|PPIA_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA PE=1 SV=2 8 14 14 14 12 13 13 12 13 13 12 13 13 75.8 75.8 75.8 18.012 165 165;164;164;164;164;164;164;164 0 128.29 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.15502 0.16417 33.018 86 39 Leave out requantified 0.15526 0.15439 0.15464 0.16488 0.16125 0.17469 31.866 25.097 35.746 30 27 29 10 14 15 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 70.9 74.5 71.5 43234000000 37107000000 6126900000 14415000000 12290000000 2125000000 14962000000 12830000000 2131800000 13857000000 11987000000 1870000000 930 1018;3745;4952;7252;7776;8308;8786;11525;14048;15119;16663;16981;17137;17138 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1031;3784;3785;5004;7314;7842;7843;8380;8863;11625;14178;15258;16812;17133;17289;17290 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23632;40041;57138;72158 P63167;Q96FJ2 P63167;Q96FJ2 4;2 4;2 4;2 Dynein light chain 1, cytoplasmic;Dynein light chain 2, cytoplasmic DYNLL1;DYNLL2 sp|P63167|DYL1_HUMAN Dynein light chain 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLL1 PE=1 SV=1;sp|Q96FJ2|DYL2_HUMAN Dynein light chain 2, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLL2 PE=1 SV=1 2 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 57.3 57.3 57.3 10.366 89 89;89 0 71.656 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72981 0.76014 21.967 21 15 Leave out requantified 0.79922 0.89841 0.92715 0.85832 0.93978 1.0327 100.53 110.92 80.886 9 6 6 7 4 4 Median Median Median 57.3 49.4 49.4 1718300000 896520000 821830000 669330000 357250000 312080000 534090000 278010000 256080000 514930000 261260000 253670000 938 2340;11573;11741;17988 True;True;True;True 2368;11675;11845;18148 7644;37911;37912;37913;37914;37915;37916;37917;37918;37919;38459;38460;38461;38462;38463;38464;38465;38466;58654;58655;58656 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factor 5A-1-like;Eukaryotic translation initiation factor 5A-2 EIF5A;EIF5AL1;EIF5A2 sp|P63241|IF5A1_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5A-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5A PE=1 SV=2;sp|Q6IS14|IF5AL_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5AL1 PE=2 SV=2;sp|Q9GZV4|IF5A2_HUMAN Eukar 3 13 13 13 11 12 13 11 12 13 11 12 13 71.4 71.4 71.4 16.832 154 154;154;153 0 166.88 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87868 0.94439 19.585 61 13 Leave out requantified 0.91032 0.79897 0.86066 1.0123 0.86982 0.96927 22.767 21.156 23.388 18 21 22 3 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 55.8 55.8 71.4 13816000000 7324700000 6491100000 4371000000 2181400000 2189600000 4987300000 2703500000 2283800000 4457500000 2439800000 2017700000 941 3465;3466;8377;9138;9139;10448;11668;11771;13403;16525;16526;17676;17699 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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14483;14484;14485;14486;14487;14488;14489;14490;14491;14492;14493;34809;34810;34811;38130;38131;38132;38133;38134;38135;38136;38137;38138;38139;38140;38141;38142;38143;38144;38145;38146;38147;38148;38149;38150;38151;38152;38153;38154;38155;38156;38157;38158;38159;38160;43589;43590;43591;43592;43593;43594;43595;43596;43597;48407;48408;48409;48410;48814;48815;48816;55573;55574;68781;68782;68783;68784;68785;68786;68787;68788;68789;68790;68791;68792;68793;68794;68795;68796;73385;73481;73482;73483;73484;73485;73486;73487;73488;73489 14486;14492;34811;38149;38155;43594;48407;48815;55574;68789;68795;73385;73486 143;144 79;141 P63244 P63244 18 18 18 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed GNB2L1 sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 1 18 18 18 16 17 17 16 17 17 16 17 17 62.1 62.1 62.1 35.076 317 317 0 199.11 By MS/MS By MS/MS By 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sapiens OX=9606 GN=CSNK2B PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 23.7 23.7 23.7 24.942 215 215 0 15.597 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88948 0.92141 15.029 11 0 Leave out requantified 0.85123 0.86953 0.79852 0.89368 0.86915 0.84563 14.127 15.612 27.716 4 3 4 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.7 13 23.7 389700000 214780000 174920000 144650000 80069000 64577000 92573000 52350000 40223000 152480000 82362000 70119000 947 6128;13415;17450;18024 True;True;True;True 6184;13540;17605;18185 19681;19682;19683;43830;43831;43832;56993;56994;58764;58765;58766 25301;25302;25303;25304;55613;55614;55615;72581;72582;74792;74793;74794;74795;74796 25302;55614;72581;74796 P67936;P07951 P67936 5;1 5;1 4;1 Tropomyosin alpha-4 chain TPM4 sp|P67936|TPM4_HUMAN Tropomyosin alpha-4 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPM4 PE=1 SV=3 2 5 5 4 0 4 1 0 4 1 0 4 0 21 21 17.7 28.521 248 248;284 0 9.3779 By MS/MS By MS/MS 0.15723 0.16662 73.72 3 1 Median NaN 0.18871 NaN NaN 0.20383 NaN 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Q0VDF9 Q0VDF9 9 9 9 Heat shock 70 kDa protein 14 HSPA14 sp|Q0VDF9|HSP7E_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA14 PE=1 SV=1 1 9 9 9 5 6 5 5 6 5 5 6 5 24.6 24.6 24.6 54.794 509 509 0 25.227 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0481 1.0644 29.143 14 4 Leave out requantified 1.1489 0.99214 1.0999 1.1665 1.0122 1.1308 21.687 34.839 25.744 4 4 6 2 0 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 14.3 15.5 14.3 280940000 139940000 141010000 89274000 44510000 44764000 88553000 48898000 39655000 103110000 46528000 56587000 1043 625;2300;4879;4975;6806;7230;17258;17357;17707 True;True;True;True;True;True;True;True;True 631;2328;4927;5027;6864;7292;17410;17512;17865 2047;2048;2049;7498;7499;7500;7501;7502;15726;16045;21750;23384;23385;56376;56705;57766;57767;57768 2660;2661;2662;2663;2664;9657;9658;9659;9660;9661;9662;9663;9664;20187;20600;27907;29875;29876;29877;71814;72220;73511;73512;73513 2661;9660;20187;20600;27907;29876;71814;72220;73513 Q10567 Q10567 19 5 5 AP-1 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beta-like protein 3 TBL3 sp|Q12788|TBL3_HUMAN Transducin beta-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBL3 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 5 5 5 89.034 808 808 0 27.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0051 1.0267 6.5127 8 2 Leave out requantified 1.0966 1.055 1.0223 1.0801 1.0895 1.0746 15.05 18.455 41.431 3 2 3 1 0 1 Median Median Median 5 5 5 695760000 341160000 354600000 237700000 112690000 125020000 224910000 108450000 116460000 233140000 120020000 113120000 1048 3145;7416;16965 True;True;True 3181;7479;17117 10277;10278;10279;10280;10281;24062;24063;24064;55474;55475;55476 13163;13164;13165;13166;13167;30717;70656;70657 13165;30717;70656 Q12789 Q12789 3 3 3 General transcription factor 3C polypeptide 1 GTF3C1 sp|Q12789|TF3C1_HUMAN General transcription factor 3C polypeptide 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF3C1 PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2.3 2.3 2.3 238.87 2109 2109 0 3.8988 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96752 0.97241 31.902 3 2 Median NaN 0.74778 NaN NaN 0.7411 NaN NaN 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54.722 499 499 0.0088235 1.8377 By MS/MS 0.84287 0.94003 28.648 2 0 Median 0.84287 NaN NaN 0.94003 NaN NaN 28.648 NaN NaN 2 0 0 0 0 0 Median Median Median 5 0 0 9940700 5492100 4448600 9940700 5492100 4448600 0 0 0 0 0 0 1053 4338;17100 True;True 4384;17252 14059;55916 18116;71217 18116;71217 Q12840 Q12840 11 1 1 Kinesin heavy chain isoform 5A KIF5A sp|Q12840|KIF5A_HUMAN Kinesin heavy chain isoform 5A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF5A PE=1 SV=2 1 11 1 1 11 10 7 1 0 0 1 0 0 11.4 0.7 0.7 117.38 1032 1032 1 -2 By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 11.4 10.8 8.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 1054 852;4192;4711;7267;7959;8202;11070;15180;15579;17196;18023 True;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False 863;4235;4759;7329;7330;8027;8274;11162;15319;15722;17348;18184 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10304 33564;33565 42609;42610 42610 Q12904 Q12904 14 14 14 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 AIMP1 sp|Q12904|AIMP1_HUMAN Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIMP1 PE=1 SV=2 1 14 14 14 13 13 14 13 13 14 13 13 14 64.1 64.1 64.1 34.352 312 312 0 172.63 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86509 0.94085 8.3189 67 3 Leave out requantified 0.82452 0.87637 0.88559 0.89303 0.94591 0.97765 11.742 11.833 9.6998 23 22 22 0 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.9 59.9 64.1 6515300000 3543800000 2971500000 2526000000 1408900000 1117100000 1858500000 988320000 870200000 2130800000 1146600000 984170000 1058 1282;5623;6857;7539;7625;8300;8443;8733;8993;12550;12734;13062;13069;15966 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1299;5676;6915;7603;7689;8372;8516;8810;9071;12666;12852;13182;13189;16110 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1693;1694;1695;1696;1697;1698;7599;7600;7601;9979;9980;9981;9982;9983;9984;9985;9986;9987;9988;9989;11028;11029;11030;14722;14723;16687;16688;16689;18105;18106;18107;18108;18109;18110;29866;34441;34442;34747;34748;34749;50520;50521;51670;51671;51672;52521;58666;58667;58668;62477;62478;62479;62480;62481;68057;68058;68059;68060;68061;68062;70193;70194;70195;70196;71517;71518 1695;7601;9989;11028;14722;16689;18107;29866;34442;34749;50520;51670;52521;58667;62479;68057;70193;71517;71518 Q12972 Q12972 6 6 6 Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1;Activator of RNA decay PPP1R8 sp|Q12972|PP1R8_HUMAN Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R8 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 28.8 28.8 28.8 38.478 351 351 0 46.865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97329 0.98507 6.1346 19 10 Leave out requantified 0.90891 1.0305 0.97329 0.92946 1.0771 1.0501 5.9531 10.129 10.65 5 7 7 2 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.8 25.6 28.8 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Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECH1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 10 9 9 10 9 9 10 9 9 47 47 47 35.816 328 328 0 81.826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92802 0.94982 39.198 33 12 Leave out requantified 0.91433 0.92708 0.88355 0.96103 0.94034 0.93874 40.276 16.787 22.208 12 11 10 3 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 44.2 34.5 38.4 1288300000 660970000 627340000 426910000 220380000 206530000 490760000 248710000 242050000 370650000 191880000 178760000 1066 1637;4287;10799;11223;11367;14423;14801;16402;16580;17666;18014 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1657;4333;10891;11318;11464;14556;14936;16548;16726;17823;18175 5342;5343;5344;13918;13919;13920;35455;35456;35457;36805;37277;37278;37279;37280;47153;47154;47155;48302;53554;53555;53556;54147;54148;54149;54150;54151;54152;57621;57622;57623;58734;58735;58736 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4;1;1 4;1;1 3;0;0 Liprin-alpha-1 PPFIA1 sp|Q13136|LIPA1_HUMAN Liprin-alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPFIA1 PE=1 SV=1 3 4 4 3 4 2 3 4 2 3 3 1 2 5.9 5.9 4.9 135.78 1202 1202;1194;1257 0 15.979 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1901 1.2128 32.617 8 3 Leave out requantified 0.81814 1.5095 1.0466 0.86835 1.5125 1.1374 79.748 31.226 45.066 3 2 3 2 0 1 Median Median Median 5.9 3.1 4.9 84092000 36955000 47137000 31403000 14543000 16859000 19106000 8514500 10592000 33583000 13897000 19686000 1073 4605;10183;12214;15520 True;True;True;True 4652;10267;12326;15662 14892;33433;33434;33435;40081;40082;40083;40084;50696;50697 19156;42435;50778;50779;50780;50781;50782;64523;64524 19156;42435;50781;64524 Q13144 Q13144 3 3 3 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon EIF2B5 sp|Q13144|EI2BE_HUMAN Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2B5 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 6.1 6.1 6.1 80.379 721 721 0 5.3476 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1051 1.0996 18.777 5 0 Leave out requantified 1.1051 NaN NaN 1.0996 NaN NaN 16.698 NaN NaN 3 1 1 0 0 0 Leave out requantified Median Median 6.1 1.4 1.4 108620000 50318000 58297000 53077000 23901000 29176000 29236000 13390000 15846000 26303000 13027000 13276000 1074 5624;6934;17665 True;True;True 5677;6992;17822 18100;22153;57618;57619;57620 23296;28434;73349;73350;73351;73352;73353;73354 23296;28434;73354 Q13148 Q13148 7 7 7 TAR DNA-binding protein 43 TARDBP sp|Q13148|TADBP_HUMAN TAR DNA-binding protein 43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TARDBP PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 17.6 17.6 17.6 44.739 414 414 0 36.808 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3231 1.3763 27.182 18 4 Leave out requantified 1.2962 1.4597 1.2157 1.2896 1.5365 1.3557 16.991 16.156 47.06 6 6 6 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.6 17.4 17.6 359250000 166460000 192790000 116050000 50035000 66017000 115430000 50952000 64475000 127770000 65475000 62294000 1075 1927;5037;6198;8904;11149;13117;15712 True;True;True;True;True;True;True 1953;5090;6254;8981;11242;13238;15855 6346;6347;6348;16247;16248;16249;16250;19928;19929;19930;29136;29137;36573;42876;42877;42878;51262;51263;51264 8173;8174;20870;20871;20872;20873;20874;25658;25659;25660;37124;46343;54397;54398;65233;65234;65235;65236;65237 8173;20873;25658;37124;46343;54398;65233 Q13151 Q13151 8 8 8 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 HNRNPA0 sp|Q13151|ROA0_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA0 PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 33.1 33.1 33.1 30.84 305 305 0 66.193 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79745 0.86967 14.919 27 7 Leave out requantified 0.91348 0.79745 0.78361 0.94118 0.86967 0.85284 18.129 11.885 13.609 8 10 9 1 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.2 25.6 25.9 1467200000 780450000 686740000 488250000 262080000 226170000 484930000 257330000 227600000 494010000 261040000 232970000 1076 2848;3448;5086;5800;5942;9618;9668;13863 True;True;True;True;True;True;True;True 2880;3486;5139;5854;5997;9699;9749;13992 9319;11222;11223;11224;16389;18653;18654;18655;18656;18657;19065;19066;19067;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31687;31688;31689;31690;31691;31692;45302 11965;14425;14426;14427;14428;21046;24006;24007;24008;24009;24010;24011;24012;24516;24517;24518;24519;40104;40105;40106;40107;40108;40109;40110;40111;40112;40311;40312;40313;57518 11965;14427;21046;24007;24516;40105;40311;57518 Q13155 Q13155 11 11 11 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 AIMP2 sp|Q13155|AIMP2_HUMAN Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIMP2 PE=1 SV=2 1 11 11 11 9 8 9 9 8 9 9 8 9 45 45 45 35.348 320 320 0 204.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99219 1.0501 14.035 37 11 Leave out requantified 0.9756 0.99981 0.97906 1.0021 1.0794 1.0335 14.159 3.7288 19.292 13 12 12 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.6 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Q13442 15 15 15 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein PDAP1 sp|Q13442|HAP28_HUMAN 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDAP1 PE=1 SV=1 1 15 15 15 9 13 11 9 13 11 9 13 11 54.1 54.1 54.1 20.63 181 181 0 92.077 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9221 1.0032 17.392 48 4 Leave out requantified 0.94147 0.89659 0.77354 1.0616 0.98612 0.87307 10.443 19.709 20.499 15 18 15 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.1 44.2 43.6 4134400000 2164800000 1969600000 1362800000 705040000 657720000 1557000000 807840000 749130000 1214700000 651950000 562740000 1095 760;1298;2102;2103;3528;3529;3704;3705;6814;8719;9122;11433;13276;14119;17265 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 770;1315;2128;2129;3567;3568;3743;3744;6872;8795;9200;11533;13398;14249;17417 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8356;12486 26949;26950;26951;40607;40608;40609 34377;34378;34379;51449;51450 34377;51449 Q13501 Q13501 2 2 2 Sequestosome-1 SQSTM1 sp|Q13501|SQSTM_HUMAN Sequestosome-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SQSTM1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 3 3 3 47.687 440 440 0 3.3105 By MS/MS 0.9111 0.86708 15.385 2 1 Median 0.9111 NaN NaN 0.86708 NaN NaN 15.385 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 3 0 0 13127000 6466100 6660800 13127000 6466100 6660800 0 0 0 0 0 0 1099 2337;13301 True;True 2365;13423 7632;7633;43418 9827;9828;55105 9827;55105 Q13509 Q13509 15 5 3 Tubulin beta-3 chain TUBB3 sp|Q13509|TBB3_HUMAN Tubulin beta-3 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB3 PE=1 SV=2 1 15 5 3 13 12 14 3 2 4 1 0 2 38 15.1 10.4 50.432 450 450 0 50.008 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.129 1.1732 15.128 9 2 Leave out requantified 1.0532 1.2346 0.98419 1.0441 1.2841 1.0569 9.127 0.62461 15.35 3 2 4 2 0 0 Median Median Leave out requantified 29.3 27.6 36.2 399590000 183900000 215690000 146330000 64943000 81384000 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3028;3029;3030;3031;3032;3033;3034;3035;3036;3037;3038;3039;3040;3041;3042;3043;3044;3045;3046;3047;3048;3049;3050;3051;3052;3053;4350;4351;4352;4353;4354;4355;4356;4357;4358;4359;4360;4361;4362;4363;4364;19343;19344;19345;19346;19347;21986;21987;21988;21989;21990;23012;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249;25250;25251;25252;25253;25254;25255;25256;25257;25258;25259;25260;25261;25262;25263;25264;25265;25266;25267;25268;25269;25270;25271;25272;25273;25274;25275;25276;33992;33993;33994;33995;33996;33997;33998;34362;36797;36798;36799;36800;36801;36802;36803;36804;36805;38963;38964;38965;38966;38967;38968;38969;38970;38971;38972;38973;38974;49952;49953;49954;49955;49956;49957;49958;49959;49960;49961;49962;49963;49964;49965;49966;50727;50728;50729;50730;50731;50732;50733;50734;50735;50736;50737;50738;50739;50740;50741;50742;50743;71287;71288;74487;74488;74489;74490;74491;74492 3051;4356;19347;21987;23012;25254;25260;33994;34362;36801;38972;49963;50739;71288;74487 14;16;17;27 73;293;299;300 Q13526 Q13526 2 2 2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 PIN1 sp|Q13526|PIN1_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIN1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 23.9 23.9 23.9 18.243 163 163 0 28.246 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0051 1.0666 5.5027 7 1 Leave out requantified 0.84893 1.0129 1.09 0.89552 1.0666 1.1954 1.3768 5.5027 16.718 2 2 3 0 0 1 Median Median Median 12.3 23.9 23.9 152090000 74588000 77503000 40183000 22969000 17214000 51654000 25183000 26471000 60254000 26436000 33818000 1101 13848;15192 True;True 13977;15331 45235;45236;45237;45238;45239;49568;49569 57434;57435;57436;57437;57438;57439;63034;63035 57438;63034 Q13535 Q13535 1 1 1 Serine/threonine-protein kinase ATR ATR sp|Q13535|ATR_HUMAN Serine/threonine-protein kinase ATR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATR PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.5 0.5 0.5 301.36 2644 2644 0.0059701 1.9184 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 0.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1102 1478 True 1497 4835 6239 6239 Q13547 Q13547 9 9 6 Histone deacetylase 1 HDAC1 sp|Q13547|HDAC1_HUMAN Histone deacetylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDAC1 PE=1 SV=1 1 9 9 6 6 6 8 6 6 8 4 4 6 26.1 26.1 18.3 55.102 482 482 0 54.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86794 0.92724 26.599 23 7 Leave out requantified 0.84133 0.95938 0.84067 0.88635 1.0066 0.92634 34.481 30.98 17.319 7 7 9 2 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 19.5 23.2 773670000 420400000 353260000 257010000 149690000 107320000 208750000 115110000 93641000 307900000 155600000 152300000 1103 1113;2268;9830;11483;14032;15045;16920;17766;17809 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1129;2296;9913;11583;14162;15182;17071;17924;17967 3643;3644;7388;7389;7390;32263;32264;32265;37620;37621;45846;45847;45848;45849;45850;45851;49106;55320;55321;57929;58073;58074;58075 4674;4675;9526;9527;9528;41054;41055;41056;41057;41058;41059;47620;58209;58210;58211;58212;58213;58214;58215;58216;62433;70464;70465;73735;73925;73926 4674;9528;41057;47620;58213;62433;70465;73735;73926 Q13557;Q9UQM7;Q13555;Q13554 Q13557;Q9UQM7;Q13555;Q13554 3;2;2;2 3;2;2;2 3;2;2;2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta CAMK2D;CAMK2A;CAMK2G;CAMK2B sp|Q13557|KCC2D_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK2D PE=1 SV=3;sp|Q9UQM7|KCC2A_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK2A PE 4 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 8.8 8.8 8.8 56.369 499 499;478;558;666 0 12.333 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84664 0.91235 36.27 7 2 Leave out requantified 1.0697 0.88452 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1;1 1;1 Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2;Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 IDI2;IDI1 sp|Q9BXS1|IDI2_HUMAN Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDI2 PE=1 SV=1;sp|Q13907|IDI1_HUMAN Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDI1 PE=1 SV=2 2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4.4 4.4 4.4 26.752 227 227;227 0.002045 2.1704 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 4.4 0 0 21746000 11867000 9878100 21746000 11867000 9878100 0 0 0 0 0 0 1122 11641 True 11743 38142 48304 48304 Q13946 Q13946 1 1 1 High affinity cAMP-specific 3,5-cyclic phosphodiesterase 7A PDE7A sp|Q13946|PDE7A_HUMAN High affinity cAMP-specific 3,5-cyclic phosphodiesterase 7A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE7A PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 55.504 482 482 0.0054863 1.9262 By MS/MS By matching By matching 1.1417 1.1806 10.455 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median 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A EIF3A sp|Q14152|EIF3A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3A PE=1 SV=1 1 61 61 61 54 55 51 54 55 51 54 55 51 44 44 44 166.57 1382 1382 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88599 0.94703 27.255 229 47 Leave out requantified 0.89255 0.94774 0.85325 0.93156 0.97378 0.92611 20.881 28.582 16.567 72 81 76 15 17 15 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.3 41.5 38.5 16786000000 8718400000 8067700000 5484300000 2869000000 2615300000 5585600000 2878200000 2707500000 5716100000 2971200000 2744900000 1128 748;879;1116;1117;2351;2719;2725;2905;3414;3577;3958;4071;4412;5315;5613;6270;6403;6477;6974;7060;7650;7818;7962;7963;8707;8843;8922;8988;9299;9476;9565;9697;10078;10204;10858;10981;11057;11570;11719;11797;11999;12127;12233;12464;12982;13132;13278;13281;13327;13341;13342;13343;13381;13575;14130;14888;15379;15500;16285;16806;17188 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 5.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1134 14547 True 14681 47526 60330 60330 Q14203 Q14203 12 12 12 Dynactin subunit 1 DCTN1 sp|Q14203|DCTN1_HUMAN Dynactin subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN1 PE=1 SV=3 1 12 12 12 6 8 8 6 8 8 6 8 8 13.4 13.4 13.4 141.69 1278 1278 0 31.484 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99114 1.0186 35.025 21 16 Leave out requantified 1.1484 1.0626 0.8056 1.1565 1.0886 0.87759 26.457 41.05 28.247 6 7 8 5 5 6 Median Median Median 7.8 8.5 9.8 397400000 189290000 208110000 141280000 63412000 77871000 120400000 60422000 59980000 135710000 65453000 70259000 1135 767;1356;2565;2680;4219;4977;7828;9295;10947;11415;15756;16203 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 777;1373;2595;2710;4262;5029;7895;9374;11039;11513;15899;16347 2534;4433;4434;8383;8384;8385;8769;13710;16049;16050;25429;25430;30495;30496;30497;35931;35932;35933;37420;37421;51379;51380;52804;52805 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DNA replication licensing factor MCM6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCM6 PE=1 SV=1 1 26 26 26 23 25 23 23 25 23 23 25 23 34.5 34.5 34.5 92.888 821 821 0 243.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0336 1.1003 19.92 92 36 Leave out requantified 1.1441 1.0302 0.95561 1.2374 1.0837 1.044 18.813 19.19 16.318 29 33 30 10 15 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.2 33.6 30.5 3734200000 1892200000 1842000000 1159700000 575840000 583820000 1371900000 741140000 630810000 1202600000 575240000 627390000 1152 326;327;1719;2155;2246;2863;3070;3864;3865;4194;4465;5762;7270;8125;8255;9082;9627;10801;11257;12010;12958;14145;15804;16377;17935;18093 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 328;329;1743;2182;2274;2896;3105;3904;3905;4237;4511;5816;7333;8197;8327;9160;9708;10893;11353;12118;13077;14275;15947;16523;18095;18254 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RNA processing protein 1 homolog B RRP1B sp|Q14684|RRP1B_HUMAN Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP1B PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 4 4 3 4 4 3 4 8.4 8.4 8.4 84.427 758 758 0 13.692 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85822 0.91364 23.663 10 3 Leave out requantified 0.84624 0.89444 1.034 0.89932 0.91782 1.1593 7.2753 20.07 22.151 4 3 3 1 1 1 Leave out requantified Median Median 6.6 4.5 6.9 227450000 104080000 123370000 103460000 42856000 60605000 46989000 25377000 21612000 77002000 35847000 41154000 1159 4126;4572;4695;5074;14600 True;True;True;True;True 4169;4619;4743;5127;14734 13425;13426;13427;14807;14808;15180;16358;16359;16360;47684;47685 17294;17295;17296;19049;19050;19051;19547;21012;21013;60538;60539 17294;19051;19547;21013;60538 Q14690 Q14690 3 3 3 Protein RRP5 homolog PDCD11 sp|Q14690|RRP5_HUMAN Protein RRP5 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD11 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 3 1.8 1.8 1.8 208.7 1871 1871 0 4.2092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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6444;16090;18124;19582;19583;21071;23854;29196;30518;32681;33488;36598;41294;43605;43613;44351;45348;47205;47868;53259;53566;55289;55395;56724;59886;66815;71957;74270;74888 Q15050 Q15050 3 3 3 Ribosome biogenesis regulatory protein homolog RRS1 sp|Q15050|RRS1_HUMAN Ribosome biogenesis regulatory protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRS1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 11.2 11.2 11.2 41.193 365 365 0 3.9088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0085 1.1199 14.569 5 0 Leave out requantified 1.1699 0.79994 NaN 1.1837 0.82832 NaN 7.8327 8.0547 NaN 2 2 1 0 0 0 Median Median Median 8.8 7.1 4.7 67577000 35393000 32184000 32058000 16132000 15926000 23781000 12794000 10987000 11738000 6467300 5270700 1186 1697;3522;11421 True;True;True 1721;3561;11519 5566;11476;37436;37437;37438 7198;14762;14763;47390 7198;14762;47390 Q15054 Q15054 7 7 7 DNA polymerase delta subunit 3 POLD3 sp|Q15054|DPOD3_HUMAN DNA polymerase delta subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLD3 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 7 6 5 7 6 5 7 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GN=EIF4H PE=1 SV=5 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 9.3 9.3 9.3 27.385 248 248 0 17.602 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67539 0.73305 38.13 4 2 Median NaN 0.48236 NaN NaN 0.50644 NaN NaN 40.777 NaN 1 2 1 1 1 0 Median Median Median 5.6 9.3 5.6 56841000 31776000 25066000 16753000 8594800 8158600 27853000 17984000 9868600 12235000 5196900 7038300 1188 3597;5921 True;True 3636;5975 11720;18987;18988;18989 15096;24411;24412;24413 15096;24411 Q15057;Q96P50 Q15057 4;1 4;1 4;1 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 ACAP2 sp|Q15057|ACAP2_HUMAN Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAP2 PE=1 SV=3 2 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4 5.8 5.8 5.8 88.028 778 778;834 0 18.543 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84072 0.83572 14.357 9 3 Leave out requantified 0.98017 0.84675 0.63574 0.96652 0.83708 0.6282 10.475 7.3863 22.577 2 2 5 0 0 3 Median Median Median 2.8 2.3 5.8 48374000000 20319000000 28055000000 45768000 26838000 18930000 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By MS/MS By MS/MS 1.3708 1.4337 41.955 23 2 Leave out requantified 2.3055 1.0911 0.92689 2.3606 1.1165 0.96311 34.031 31.845 24.801 11 5 7 2 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.8 13.9 22.3 494340000 216310000 278040000 224940000 80751000 144190000 112840000 56206000 56634000 156570000 79350000 77216000 1192 828;2257;5895;6635;6687;11911;12154;12224;15188;16433 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 838;2285;5949;6692;6744;12017;12266;12337;15327;16579 2717;2718;7360;18909;18910;18911;21213;21214;21369;21370;21371;21372;39040;39896;39897;39898;39899;40119;40120;40121;49555;49556;49557;53650 3504;9492;24307;24308;24309;24310;24311;27208;27414;27415;27416;27417;49424;50532;50533;50830;63020;63021;68360 3504;9492;24311;27208;27417;49424;50532;50830;63021;68360 Q15102 Q15102 4 4 4 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma PAFAH1B3 sp|Q15102|PA1B3_HUMAN Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAFAH1B3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 19.9 19.9 19.9 25.734 231 231 0 9.3705 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1826 1.2047 31.723 12 2 Leave out requantified 1.1724 1.1826 1.2054 1.1694 1.2047 1.246 23.068 31.772 27.761 3 4 5 0 1 1 Plateau Leave out requantified Leave out requantified 11.3 16.5 19.9 269940000 140710000 129240000 68946000 32793000 36152000 74575000 34005000 40571000 126420000 73909000 52515000 1193 6560;9537;10051;17415 True;True;True;True 6617;9618;10134;17570 21006;31275;31276;33009;33010;33011;33012;33013;33014;56882;56883;56884 26978;39811;41946;41947;41948;41949;41950;41951;72441;72442;72443;72444 26978;39811;41946;72444 Q15126 Q15126 5 5 5 Phosphomevalonate kinase PMVK sp|Q15126|PMVK_HUMAN Phosphomevalonate kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PMVK PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 31.8 31.8 31.8 21.995 192 192 0 26.701 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97308 0.99835 6.0579 19 5 Leave out requantified 1.0683 1.0409 0.80461 1.0778 1.0286 0.83549 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56.193 486 486 0 15.629 By MS/MS By MS/MS 0.72398 0.77767 48.681 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 5.8 0 2.1 39716000 26958000 12758000 15214000 10369000 4845200 0 0 0 24502000 16589000 7912600 1196 5546;6833;9591 True;True;True 5599;6891;9672 17846;21833;31425 22957;28012;39986 22957;28012;39986 Q15181 Q15181 12 12 12 Inorganic pyrophosphatase PPA1 sp|Q15181|IPYR_HUMAN Inorganic pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPA1 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 11 10 10 11 10 10 11 10 62.6 62.6 62.6 32.66 289 289 0 162.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99195 1.0792 21.455 43 13 Leave out requantified 0.77932 0.97228 1.0168 0.84099 1.0554 1.123 28.081 13.294 18.752 14 15 14 5 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 55.4 57.1 53.6 2142200000 1030800000 1111400000 674810000 326570000 348240000 791880000 372010000 419870000 675470000 332210000 343260000 1197 1726;2471;6189;6601;6929;7251;10020;11191;16546;16770;17864;18103 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1750;2501;6245;6658;6987;7313;10103;11286;16692;16919;18023;18264 5654;8055;8056;8057;19890;19891;19892;19893;19894;21104;21105;21106;22133;22134;22135;22136;23467;23468;23469;23470;23471;23472;23473;32891;32892;36709;36710;36711;54046;54047;54048;54049;54050;54051;54807;54808;54809;54810;54811;54812;54813;58280;58281;59015;59016;59017 7325;10358;10359;10360;10361;10362;10363;25604;25605;25606;25607;25608;27086;27087;27088;28411;28412;28413;28414;28415;29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986;29987;41812;41813;46512;46513;68860;68861;68862;68863;68864;68865;68866;68867;69804;69805;69806;69807;69808;69809;69810;69811;69812;69813;74196;74197;75109;75110;75111;75112;75113 7325;10358;25605;27086;28413;29975;41812;46512;68863;69807;74196;75113 Q15185 Q15185 4 4 4 Prostaglandin E synthase 3 PTGES3 sp|Q15185|TEBP_HUMAN Prostaglandin E synthase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTGES3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 28.1 28.1 28.1 18.697 160 160 0 10.371 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87109 0.86898 75.318 7 4 Median 0.87109 0.70307 1.1086 0.86898 0.74099 1.2129 77.213 51.169 126.2 3 2 2 2 1 1 Median Median Median 28.1 23.1 9.4 218000000 121010000 96988000 84889000 45298000 39591000 66834000 42775000 24059000 66273000 32934000 33339000 1198 3117;7129;10794;14001 True;True;True;True 3153;7189;10886;14130 10190;10191;10192;22965;22966;35438;35439;45733;45734;45735 13059;13060;13061;29377;29378;44919;44920;58056;58057 13060;29378;44919;58057 Q15208 Q15208 1 1 1 Serine/threonine-protein kinase 38 STK38 sp|Q15208|STK38_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 38 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK38 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 6.9 6.9 6.9 54.19 465 465 0.0074294 1.8971 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 6.9 0 6.9 20446000 11053000 9393100 8209800 3073500 5136300 0 0 0 12236000 7979200 4256800 1199 13965 True 14094 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4657;24026;27745;55897;60133;65302 Q16204 Q16204 1 1 1 Coiled-coil domain-containing protein 6 CCDC6 sp|Q16204|CCDC6_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC6 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1.9 1.9 1.9 53.29 474 474 0.0010482 2.4394 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 1.9 0 10333000 5052800 5280700 0 0 0 10333000 5052800 5280700 0 0 0 1241 146 True 147 457 601 601 Q16222 Q16222 6 6 6 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylgalactosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase UAP1 sp|Q16222|UAP1_HUMAN UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UAP1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 5 5 4 5 5 4 5 5 4 14.9 14.9 14.9 58.768 522 522 0 22.599 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99937 1.1024 10.944 12 1 Leave out requantified 1.2942 0.90052 0.91464 1.3964 0.9597 1.0176 19.676 14.683 15.464 3 5 4 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified 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16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFI16 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 3.7 3.7 3.7 88.255 785 785 0 9.1688 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.53113 0.56649 24.447 2 1 Median NaN NaN 0.53113 NaN NaN 0.56649 NaN NaN 24.447 0 0 2 0 0 1 Median Median Median 2 2 3.7 17832000 12279000 5553600 0 0 0 0 0 0 17832000 12279000 5553600 1255 4648;15065 True;True 4695;15202 15021;15022;15023;49151 19326;19327;19328;19329;62483 19326;62483 Q16719 Q16719 11 11 11 Kynureninase KYNU sp|Q16719|KYNU_HUMAN Kynureninase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KYNU PE=1 SV=1 1 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 28.4 28.4 28.4 52.351 465 465 0 64.385 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94954 1.0281 13.965 33 10 Leave out requantified 1.0156 0.91257 1.0641 1.0566 0.97856 1.1254 16.771 20.364 19.064 12 10 11 5 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.8 26.7 25.6 984130000 493140000 491000000 350860000 180160000 170700000 287610000 143460000 144150000 345660000 169520000 176140000 1256 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dehydrogenase, mitochondrial HADH sp|Q16836|HCDH_HUMAN Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADH PE=1 SV=3 1 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 7 38.9 38.9 38.9 34.293 314 314 0 75.361 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94504 1.0459 19.835 29 8 Leave out requantified 1.0625 0.9371 0.93768 1.1023 1.0012 1.0288 29.317 10.215 9.8733 8 10 11 1 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.3 38.9 38.9 1144900000 605300000 539590000 347310000 179030000 168280000 351930000 185350000 166570000 445650000 240920000 204730000 1259 3006;4863;5145;5740;9689;15135;15511 True;True;True;True;True;True;True 3041;4911;5198;5794;9770;15274;15653 9839;9840;9841;15673;15674;15675;16566;16567;16568;16569;18479;18480;18481;18482;18483;18484;31762;31763;31764;31765;31766;31767;49390;49391;49392;50664;50665;50666;50667;50668 12627;12628;12629;12630;12631;20119;20120;20121;21263;21264;21265;21266;21267;23803;23804;23805;23806;23807;23808;40407;40408;40409;40410;40411;40412;40413;40414;40415;40416;62814;62815;62816;62817;62818;62819;64480;64481;64482;64483;64484;64485 12628;20119;21267;23808;40415;62815;64481 Q16851 Q16851 3 3 3 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UGP2 sp|Q16851|UGPA_HUMAN UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UGP2 PE=1 SV=5 1 3 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 9.3 9.3 9.3 56.94 508 508 0 26.125 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98632 1.1147 46.105 5 2 Median 1.2949 NaN NaN 1.3754 NaN NaN 64.532 NaN NaN 3 1 1 2 0 0 Median Median Median 9.3 3.5 3.5 131540000 66914000 64630000 66108000 35255000 30853000 31535000 15876000 15659000 33901000 15783000 18118000 1260 3651;11715;15401 True;True;True 3690;11819;15542 11905;38371;38372;38373;50317 15337;48596;48597;48598;64035 15337;48597;64035 Q16878 Q16878 1 1 1 Cysteine dioxygenase type 1 CDO1 sp|Q16878|CDO1_HUMAN Cysteine dioxygenase type 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDO1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.5 3.5 3.5 22.972 200 200 0.0020387 2.1477 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.076 1.1232 7.7443 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.5 3.5 3.5 662720000 325480000 337230000 222070000 106030000 116040000 214090000 101990000 112110000 226560000 117470000 109090000 1261 15388 True 15529 50282;50283;50284 63999;64000;64001;64002;64003;64004 64000 Q16881;Q9NNW7 Q16881 9;1 9;1 9;1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic TXNRD1 sp|Q16881|TRXR1_HUMAN Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNRD1 PE=1 SV=3 2 9 9 9 9 8 9 9 8 9 9 8 9 19.7 19.7 19.7 70.905 649 649;524 0 50.128 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0324 1.1076 11.671 30 6 Leave out requantified 1.1441 0.91095 1.0018 1.1892 0.97818 1.1065 9.2903 13.456 17.445 10 10 10 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.7 17.4 19.7 930440000 440270000 490170000 311800000 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MS/MS 0.70535 0.76634 26.771 28 10 Leave out requantified 0.65678 0.72927 0.75356 0.67774 0.79074 0.83216 37.695 17.182 30.889 9 8 11 3 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.3 17 16.5 707270000 422800000 284470000 206440000 119090000 87343000 214850000 131000000 83856000 285980000 172700000 113270000 1265 52;938;1733;2636;3572;6287;10525;10979;13846;17266;17990 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 53;950;1757;2666;3611;6343;10615;11071;13975;17418;18150 177;178;179;180;3082;3083;5668;5669;5670;8625;8626;8627;8628;11628;20205;20206;34605;34606;34607;36055;36056;36057;45230;45231;45232;56395;56396;58660;58661 241;242;243;244;245;246;3967;3968;7334;7335;7336;7337;7338;11051;11052;11053;11054;14961;25979;25980;43880;43881;43882;43883;43884;43885;43886;45706;57427;57428;57429;57430;57431;71831;74640;74641 244;3968;7334;11051;14961;25980;43885;45706;57431;71831;74641 Q27J81 Q27J81 3 3 3 Inverted formin-2 INF2 sp|Q27J81|INF2_HUMAN Inverted formin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=INF2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 5 5 5 135.62 1249 1249 0 15.316 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2854 1.2184 19.654 5 3 Median 1.0538 NaN 1.1158 1.0885 NaN 1.225 15.944 NaN 30.209 2 1 2 1 0 2 Median Median Median 3.9 4.2 5 49541000 28797000 20744000 28279000 13207000 15073000 9409200 7813500 1595600 11853000 7777000 4075900 1266 6684;11701;14800 True;True;True 6741;11805;14935 21362;21363;21364;38330;38331;48299;48300;48301 27403;27404;27405;27406;27407;48550;48551;61321;61322;61323 27405;48551;61321 Q29RF7 Q29RF7 22 22 20 Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A PDS5A sp|Q29RF7|PDS5A_HUMAN Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDS5A PE=1 SV=1 1 22 22 20 19 14 16 19 14 16 17 13 15 22.6 22.6 21 150.83 1337 1337 0 180.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90171 0.97581 16.887 55 20 Leave out requantified 0.9103 0.98743 0.83078 0.95424 1.0334 0.88654 19.321 17.014 17.545 23 17 15 9 5 6 Leave out 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710;711;712;713;714;8700;9941;10560;10561;10562;10563;11290;11291;16377;16378;16379;16380;16381;18478;19669;19670;19671;20195;21828;21829;21830;21831;30537;30538;30539;30540;30541;45891;45892;46440;53962;56122;56123;56124;56125;57567;57568;57569;57947;57948;57949;57950;57951;57952;59916;60760;60761;60808;60809;60810;62194;62195;62196;66209;66210;66211;66212;66213;66214;66215 712;8700;9941;10562;11290;16381;18478;19669;20195;21829;30539;45891;46440;53962;56123;57567;57948;59916;60760;60808;62196;66215 Q2M389 Q2M389 5 5 5 WASH complex subunit 7 KIAA1033 sp|Q2M389|WASC4_HUMAN WASH complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASHC4 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 5.5 5.5 5.5 136.4 1173 1173 0 27.709 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0442 1.1153 11.436 16 4 Leave out requantified 1.0161 1.1972 1.0037 1.0648 1.2678 1.1051 11.697 5.5905 11.754 5 6 5 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.7 5.5 5.5 240240000 117110000 123120000 82347000 40101000 42246000 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sp|Q2TAY7|SMU1_HUMAN WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 7 4 5 7 4 5 7 4 5 15.4 15.4 15.4 57.543 513 513 0 27.825 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89232 0.92529 12.272 13 7 Leave out requantified 1.0852 0.92966 1.5922 1.1112 0.95406 1.7557 120.6 16.603 111.63 6 2 5 4 0 3 Median Median Median 15.4 8.2 10.7 426570000 151420000 275160000 185970000 68919000 117050000 57301000 30894000 26406000 183300000 51604000 131700000 1270 2957;2980;3064;3392;10315;15797;17834 True;True;True;True;True;True;True 2990;3014;3099;3430;10400;15940;17993 9650;9752;9753;9754;9755;9756;10031;10032;11047;33879;33880;33881;33882;51513;51514;51515;58161;58162;58163 12371;12507;12508;12509;12510;12511;12862;12863;14200;42990;42991;42992;42993;65566;65567;65568;74035;74036;74037;74038;74039 12371;12509;12863;14200;42993;65566;74035 Q32MZ4;Q9Y608 Q32MZ4;Q9Y608 2;1 2;1 2;1 Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1;Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2 LRRFIP1;LRRFIP2 sp|Q32MZ4|LRRF1_HUMAN Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRFIP1 PE=1 SV=2;sp|Q9Y608|LRRF2_HUMAN Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRFIP2 PE=1 SV=1 2 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.5 3.5 3.5 89.252 808 808;721 0 3.4043 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 1.5 2 10531000 10531000 0 0 0 0 6200800 6200800 0 4329900 4329900 0 1271 1111;7321 True;True 1127;7384 3641;23740 4672;30298 4672;30298 Q32P28 Q32P28 2 2 2 Prolyl 3-hydroxylase 1 LEPRE1 sp|Q32P28|P3H1_HUMAN Prolyl 3-hydroxylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P3H1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 3.4 3.4 3.4 83.393 736 736 0 3.3954 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 3.4 1.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1272 10823;15957 True;True 10915;16101 35521;52015;52016 45013;66216;66217 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MS/MS 0.96275 0.9575 71.361 6 5 Median 1.1703 0.68827 1.4742 1.2576 0.70373 1.4688 36.463 41.46 128.05 2 2 2 1 2 2 Median Median Median 5.6 4.5 4.9 78735000 44790000 33944000 24930000 13068000 11862000 36011000 23560000 12451000 17794000 8163000 9630600 1279 834;2691;2706;5357 True;True;True;True 844;2722;2737;5410 2734;2735;2736;2737;8814;8863;17235 3523;3524;3525;3526;11303;11360;22120 3525;11303;11360;22120 Q4G0J3 Q4G0J3 8 8 8 La-related protein 7 LARP7 sp|Q4G0J3|LARP7_HUMAN La-related protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LARP7 PE=1 SV=1 1 8 8 8 5 5 6 5 5 6 5 5 6 16.5 16.5 16.5 66.898 582 582 0 43.369 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88954 0.95034 36.025 16 7 Leave out requantified 0.8627 0.78927 1.1361 0.86974 0.83875 1.3095 9.0869 27.736 23.574 5 5 6 2 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.8 9.8 13.2 268980000 145590000 123390000 102750000 61330000 41418000 77741000 38567000 39174000 88487000 45692000 42795000 1280 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MS/MS By matching 1.1046 1.1578 18.503 4 0 Leave out requantified 1.1858 NaN NaN 1.2359 NaN NaN 27.14 NaN NaN 3 0 1 0 0 0 Median Median Median 6.3 0 2.7 27301000 12982000 14319000 18547000 8884400 9662300 0 0 0 8754700 4097500 4657200 1304 11660;12769 True;True 11763;12887 38202;38203;41819;41820 48384;48385;52989 48385;52989 Q5T4B2 Q5T4B2 1 1 1 Probable inactive glycosyltransferase 25 family member 3 CERCAM sp|Q5T4B2|GT253_HUMAN Inactive glycosyltransferase 25 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CERCAM PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.3 1.3 1.3 67.591 595 595 0.0088106 1.8261 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0764 1.0795 5.7453 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.3 1.3 1.3 99284000 46320000 52965000 35184000 15881000 19303000 29180000 13408000 15773000 34921000 17031000 17889000 1305 10059 True 10142 33030;33031;33032 41966;41967;41968 41968 Q5T4S7 Q5T4S7 3 3 3 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 UBR4 sp|Q5T4S7|UBR4_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBR4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1.3 1.3 1.3 573.83 5183 5183 0 7.1818 By matching By MS/MS By MS/MS 1.211 1.2298 73.336 4 1 Median NaN 2.1046 NaN NaN 2.1616 NaN NaN 97.372 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 0.6 0.8 1.1 64935000 30003000 34932000 18112000 8250000 9861800 22110000 8815700 13295000 24713000 12937000 11775000 1306 15497;15750;16948 True;True;True 15639;15893;17100 50614;51363;51364;51365;55414 64415;65362;70578 64415;65362;70578 Q5T5C0 Q5T5C0 2 2 2 Syntaxin-binding protein 5 STXBP5 sp|Q5T5C0|STXB5_HUMAN Syntaxin-binding protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STXBP5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 2.3 2.3 2.3 127.57 1151 1151 0 5.2751 By MS/MS By MS/MS 0.9135 0.90701 2.6016 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.3 1 0 65941000 39768000 26173000 5686000 3011600 2674400 60255000 36757000 23499000 0 0 0 1307 7860;10249 True;True 7927;10333 25539;33651 32649;42716 32649;42716 Q5T5Y3 Q5T5Y3 1 1 1 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1 CAMSAP1 sp|Q5T5Y3|CAMP1_HUMAN Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMSAP1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0.7 0.7 0.7 177.97 1602 1602 0 3.7517 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 0.7 0 0 8009500 5054900 2954500 8009500 5054900 2954500 0 0 0 0 0 0 1308 4688 True 4736 15154 19509 19509 Q5T6V5 Q5T6V5 2 2 2 UPF0553 protein C9orf64 C9orf64 sp|Q5T6V5|QSPP_HUMAN Queuosine salvage protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C9orf64 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.9 5.9 5.9 39.028 341 341 0 4.8159 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4952 1.5234 76.493 5 4 Median 1.4952 NaN NaN 1.5234 NaN NaN 97.934 NaN NaN 3 1 1 2 1 1 Median Median Median 5.9 2.9 2.9 88092000 43930000 44161000 54899000 28856000 26043000 15098000 6578400 8519300 18095000 8496200 9598900 1309 2091;3074 True;True 2117;3109 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HS3ST6;HS3ST3B1;HS3ST3A1;ARHGAP40 sp|Q96QI5|HS3S6_HUMAN Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HS3ST6 PE=1 SV=2;sp|Q9Y662|HS3SB_HUMAN Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 3B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HS3ST3B1 PE=1 SV=1;sp|Q9Y663|HS3SA_HU 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 37.186 342 342;390;406;622 0.0059672 1.9179 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0843 1.1102 10.423 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2 2 2 55362000 25467000 29895000 20020000 9871400 10148000 17855000 7785700 10070000 17487000 7809500 9677600 1314 926 True 938 3045;3046;3047 3917;3918 3917 Q5TZA2 Q5TZA2 1 1 1 Rootletin CROCC sp|Q5TZA2|CROCC_HUMAN Rootletin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CROCC PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.4 0.4 0.4 228.52 2017 2017 0.0010417 2.3668 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93763 0.962 5.2383 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.4 0.4 0.4 1745800000 906640000 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Q69YN2 Q69YN2 3 3 3 CWF19-like protein 1 CWF19L1 sp|Q69YN2|C19L1_HUMAN CWF19-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CWF19L1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 10 10 10 60.618 538 538 0 10.686 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90483 0.9828 101.74 6 3 Median NaN 0.34102 0.8092 NaN 0.36735 0.88524 NaN 155.48 94.609 1 2 3 0 1 2 Median Median Median 2.6 7.1 10 160230000 108260000 51969000 20434000 11032000 9401800 70147000 51965000 18182000 69647000 45262000 24385000 1331 1770;2000;12467 True;True;True 1794;2026;12583 5793;6595;6596;40935;40936;40937 7495;8471;8472;51869;51870 7495;8472;51870 Q69YQ0 Q69YQ0 2 1 1 Cytospin-A SPECC1L sp|Q69YQ0|CYTSA_HUMAN Cytospin-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPECC1L PE=1 SV=2 1 2 1 1 1 1 2 1 0 1 1 0 1 1.9 1.3 1.3 124.6 1117 1117 0.0010422 2.3674 By MS/MS By matching By matching 0.62621 0.74026 15.486 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 1.3 0.6 1.9 18246000 11399000 6847100 8270900 5219200 3051700 0 0 0 9975400 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NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 6.1 6.1 6.1 41708000 24455000 17253000 13852000 5580800 8271500 13457000 8948000 4509400 14399000 9926500 4472300 1334 2466;6327 True;True 2496;6383 8038;8039;8040;20332;20333;20334 10334;10335;10336;26148;26149 10335;26149 Q6DKI1 Q6DKI1 1 1 1 60S ribosomal protein L7-like 1 RPL7L1 sp|Q6DKI1|RL7L_HUMAN 60S ribosomal protein L7-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL7L1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.3 6.3 6.3 29.669 255 255 0 4.0781 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9863 1.1089 23.072 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.3 6.3 6.3 72746000 40953000 31793000 24480000 13082000 11399000 23005000 14095000 8909500 25261000 13775000 11485000 1335 15337 True 15478 50135;50136;50137 63825;63826;63827 63827 Q6FI81 Q6FI81 2 2 2 Anamorsin CIAPIN1 sp|Q6FI81|CPIN1_HUMAN Anamorsin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAPIN1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 7.4 7.4 7.4 33.582 312 312 0 3.3382 By matching By MS/MS By MS/MS 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out requantified Leave out requantified 7.7 11 11 268350000 135410000 132940000 80628000 38644000 41984000 81369000 43623000 37746000 106350000 53142000 53212000 1342 1549;1867;9811;10710;17470 True;True;True;True;True 1568;1891;9894;10801;17625 5048;5049;5050;6129;6130;32195;32196;35191;35192;35193;57047;57048;57049 6522;6523;6524;7894;7895;40978;40979;44615;44616;72646;72647;72648 6524;7894;40979;44615;72648 Q6NVY1 Q6NVY1 3 3 3 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial HIBCH sp|Q6NVY1|HIBCH_HUMAN 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIBCH PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 8.8 8.8 8.8 43.482 386 386 0 6.5006 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.192 1.3186 50.727 7 2 Median NaN 1.2035 1.446 NaN 1.2475 1.6042 NaN 54.016 49.165 1 2 4 0 0 2 Median Median Median 1.8 5.7 8.8 141200000 62073000 79122000 18690000 12047000 6642600 43773000 18630000 25144000 78733000 31397000 47336000 1343 4311;7375;9241 True;True;True 4357;7438;9320 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MS/MS By matching 0.79645 0.84584 1.3675 6 1 Leave out requantified 0.63892 0.86848 0.75593 0.6366 0.88389 0.8187 19.117 4.8553 9.2011 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 18.4 18.4 18.4 64131000 33223000 30908000 20817000 10902000 9915100 21617000 10802000 10815000 21697000 11520000 10177000 1346 7999;9281 True;True 8067;9360 25998;25999;26000;30434;30435;30436 33193;38785;38786 33193;38785 Q6NZI2 Q6NZI2 5 5 5 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 16.9 16.9 16.9 43.476 390 390 0 18.887 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81306 0.88297 13.722 10 2 Leave out requantified 0.88917 0.72857 0.80856 0.9038 0.82953 1.1664 7.1618 18.766 17.226 4 3 3 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Plateau 14.6 14.6 10.5 166910000 88143000 78762000 66165000 34035000 32129000 52048000 28771000 23277000 48693000 25337000 23356000 1347 1435;3766;8854;16924;17025 True;True;True;True;True 1454;3806;8931;17075;17177 4687;4688;12235;12236;12237;28974;28975;28976;55330;55331;55332;55682 6049;6050;6051;15786;36948;36949;70476;70477;70478;70927 6050;15786;36949;70477;70927 Q6P158 Q6P158 1 1 1 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 DHX57 sp|Q6P158|DHX57_HUMAN Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX57 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.7 1.7 1.7 155.6 1386 1386 0.0020587 2.2453 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 1.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1348 1230 True 1246 4051 5197 5197 Q6P1J9 Q6P1J9 15 15 15 Parafibromin CDC73 sp|Q6P1J9|CDC73_HUMAN Parafibromin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC73 PE=1 SV=1 1 15 15 15 9 8 12 9 8 12 9 8 12 28.8 28.8 28.8 60.576 531 531 0 37.248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99717 1.0441 41.108 29 10 Leave out requantified 0.9789 0.97247 0.99947 1.0254 0.98245 1.0853 18.087 23.924 40.503 10 8 11 5 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.3 15.8 24.1 1028400000 370040000 658310000 247660000 121620000 126040000 377240000 111420000 265820000 403450000 137000000 266460000 1349 32;1156;2631;3724;6898;7108;7494;9418;10344;11810;13555;13832;14241;14815;15816 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 33;1172;2661;3763;6956;7166;7558;9499;10432;11914;13681;13960;14371;14950;15960 109;110;3790;3791;3792;8611;8612;8613;12108;22033;22034;22869;24315;24316;24317;30912;33998;38682;38683;38684;38685;38686;38687;44279;45132;45133;45134;46537;46538;48347;48348;51583;51584;51585 151;152;4845;4846;4847;11036;11037;11038;11039;15609;28280;28281;28282;29273;31021;39393;43135;48973;48974;48975;48976;48977;48978;56170;56171;57222;57223;57224;57225;59045;59046;59047;61375;61376;61377;65657;65658;65659 152;4845;11038;15609;28282;29273;31021;39393;43135;48978;56170;57225;59047;61376;65658 Q6P1N0 Q6P1N0 2 2 2 Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A CC2D1A 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EDC4 sp|Q6P2E9|EDC4_HUMAN Enhancer of mRNA-decapping protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EDC4 PE=1 SV=1 1 7 7 7 3 3 6 3 3 6 3 3 6 7.6 7.6 7.6 151.66 1401 1401 0 19.224 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80058 0.8324 16.755 13 2 Leave out requantified 0.81511 0.97382 0.65924 0.8324 1.0608 0.72259 3.9383 20.181 19.467 4 3 6 0 1 1 Leave out requantified Plateau Leave out requantified 2.8 3.9 5.6 208450000 117980000 90470000 56155000 31019000 25137000 50364000 26101000 24263000 101930000 60862000 41070000 1352 798;3275;4547;6112;6393;9798;10770 True;True;True;True;True;True;True 808;3313;4594;6168;6449;9881;10861 2629;10682;10683;10684;14735;14736;14737;19592;20541;32147;32148;32149;35369 3393;3394;13707;13708;13709;13710;18956;18957;18958;25182;26403;40924;44840 3393;13710;18958;25182;26403;40924;44840 Q6P2Q9 Q6P2Q9 46 46 46 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 PRPF8 sp|Q6P2Q9|PRP8_HUMAN Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF8 PE=1 SV=2 1 46 46 46 33 36 36 33 36 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I;POTE ankyrin domain family member J POTEE;POTEI;POTEJ sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN POTE ankyrin domain family member E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POTEE PE=2 SV=3;sp|P0CG38|POTEI_HUMAN POTE ankyrin domain family member I OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POTEI PE=3 SV=1;sp|P0CG39|POTEJ_HUMAN POTE ankyrin domain family membe 4 11 1 1 11 8 9 1 0 0 1 0 0 10.7 1.7 1.7 121.36 1075 1075;1075;1038;375 1 -2 By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 10.7 8.7 8.9 16799000 10373000 6425500 16799000 10373000 6425500 0 0 0 0 0 0 + 1360 543;1548;2387;3981;8445;9348;12582;12583;13340;14845;16113 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True 548;1567;2417;4023;8518;9428;9429;12698;12699;13464;14980;16257 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protein 1 PACS1 sp|Q6VY07|PACS1_HUMAN Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACS1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 3 2 2 3 2 2 3 2 7.1 7.1 7.1 104.9 963 963 0 11.286 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0497 1.1791 26.089 7 4 Leave out requantified NaN 0.89034 1.306 NaN 0.89375 1.4383 NaN 49.893 28.098 1 4 2 0 3 1 Median Median Median 2.8 4.3 2.7 72655000 34190000 38466000 15181000 6395200 8786300 37544000 18476000 19068000 19930000 9318700 10611000 1364 3020;5201;5999;13760;15015 True;True;True;True;True 3055;5254;6054;13887;15152 9886;16740;16741;16742;16743;19261;44910;49017 12680;21483;21484;21485;21486;21487;24766;24767;56947;62301 12680;21484;24767;56947;62301 Q6WCQ1 Q6WCQ1 4 4 4 Myosin phosphatase Rho-interacting protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 7.6 7.6 7.6 116.53 1025 1025 0 13.206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91096 0.9087 16.574 9 3 Leave out requantified 0.89554 0.82676 0.85861 0.92327 0.84592 0.96247 53.348 40.736 12.036 4 3 2 2 1 0 Median Median Median 7.6 5.9 6 149700000 78150000 71554000 72527000 35652000 36875000 47714000 26591000 21123000 29462000 15907000 13555000 1365 7276;10041;13225;16151 True;True;True;True 7339;10124;13347;16295 23565;23566;32972;32973;32974;43184;43185;52637;52638;52639;52640;52641 30088;30089;41907;41908;41909;54797;54798;67051;67052;67053;67054;67055;67056;67057;67058;67059 30088;41908;54797;67055 Q6XZF7 Q6XZF7 4 4 4 Dynamin-binding protein DNMBP sp|Q6XZF7|DNMBP_HUMAN Dynamin-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNMBP PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 3 2 2 3 2 2 3 4.2 4.2 4.2 177.35 1577 1577 0 14.075 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8681 0.93727 6.8241 11 1 Leave out requantified 0.94319 0.9545 1.0118 0.97123 0.95032 1.0053 5.0334 5.7107 24.464 4 3 4 0 0 1 Leave out requantified Median Linear 2.1 2.2 3.6 96374000 50047000 46327000 45403000 23245000 22158000 21011000 10584000 10427000 29960000 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MS/MS By MS/MS 1.0027 1.0709 5.6431 12 3 Leave out requantified 1.0512 0.96516 0.82121 1.1252 1.029 0.91264 105.3 75.524 38.81 4 4 4 1 1 1 Median Median Median 72.7 72.5 72.3 1110600000 577320000 533260000 452530000 225380000 227150000 299850000 151890000 147970000 358190000 200050000 158140000 1373 506;507;1511;1551;1672;3111;3172;3404;3410;3471;3473;3887;4921;4926;6124;7689;9381;9382;9896;10757;10758;11895;12837;12838;13408;13472;15312;15341;16460 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;True;False;True;False 510;511;512;1530;1570;1693;1694;3147;3208;3442;3448;3509;3510;3512;3927;4971;4976;4977;6180;7754;9462;9463;9979;10848;10849;12000;12955;12956;13533;13598;15453;15482;16606 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Transcription elongation factor SPT6 SUPT6H sp|Q7KZ85|SPT6H_HUMAN Transcription elongation factor SPT6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUPT6H PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2.8 2.8 2.8 199.07 1726 1726 0 29.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94485 1.0246 12.149 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 1.4 2.8 47844000 21674000 26170000 11078000 5702100 5375500 14312000 7295300 7016500 22455000 8676500 13778000 1375 13980;17111 True;True 14109;17263 45667;45668;55950;55951;55952 57978;57979;57980;71270;71271;71272;71273;71274;71275 57978;71275 Q7KZF4 Q7KZF4 38 38 38 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 SND1 sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SND1 PE=1 SV=1 1 38 38 38 31 34 32 31 34 32 31 34 32 49.1 49.1 49.1 102 910 910 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87643 0.9331 17.516 115 22 Leave out requantified 0.88895 0.91029 0.81281 0.91741 0.95803 0.90641 16.948 14.643 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1;1 1;1 1;1 Serine/threonine-protein kinase TAO3;Serine/threonine-protein kinase TAO1 TAOK3;TAOK1 sp|Q9H2K8|TAOK3_HUMAN Serine/threonine-protein kinase TAO3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAOK3 PE=1 SV=2;sp|Q7L7X3|TAOK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase TAO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAOK1 PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 105.4 898 898;1001 0.00053533 2.7121 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.57549 0.59434 16.246 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 29535000 20480000 9054600 9407400 6793700 2613800 11274000 7826400 3447400 8853400 5860000 2993400 1385 589 True 595 1930;1931;1932;1933 2502;2503;2504;2505 2505 Q7LBC6 Q7LBC6 8 8 8 Lysine-specific demethylase 3B KDM3B sp|Q7LBC6|KDM3B_HUMAN Lysine-specific demethylase 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM3B PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 3 4 7 3 4 7 3 4 6.6 6.6 6.6 191.58 1761 1761 0 19.365 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76461 0.80961 22.521 11 5 Leave out requantified 0.83601 NaN 0.62859 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augmin-like complex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HAUS6 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 2.1 2.1 2.1 108.62 955 955 0 3.7757 By MS/MS By MS/MS 0.58975 0.60868 29.55 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 0 Median Median Median 1.4 2.1 0 39813000 27459000 12354000 10581000 5437900 5143600 29232000 22021000 7210400 0 0 0 1396 1586;5237 True;True 1605;5290 5166;5167;16846 6656;6657;6658;21617 6657;21617 Q7Z4Q2 Q7Z4Q2 4 4 4 HEAT repeat-containing protein 3 HEATR3 sp|Q7Z4Q2|HEAT3_HUMAN HEAT repeat-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR3 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 1 3 3 1 3 3 1 3 7.6 7.6 7.6 74.582 680 680 0 11.778 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8569 0.90913 19.731 6 3 Median 0.92706 NaN 0.90413 0.92824 NaN 0.96534 22.836 NaN 6.0782 3 1 2 2 0 1 Plateau Median Median 5.4 1.6 5.7 100720000 52821000 47898000 55737000 30246000 25491000 4771200 2739500 2031700 40211000 19836000 20375000 1397 2413;6475;7268;9778 True;True;True;True 2443;6532;7331;9860 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sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1 PE=1 SV=3 1 8 8 8 4 5 4 4 5 4 4 5 4 2.5 2.5 2.5 481.89 4374 4374 0 13.723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.158 1.2006 12.571 12 1 Leave out requantified 1.4845 1.2463 1.0625 1.4529 1.2335 1.0934 32.527 9.3439 10.757 3 5 4 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 1.2 1.6 1.4 142240000 69740000 72502000 61144000 31601000 29544000 43863000 19951000 23912000 37235000 18189000 19046000 1401 2266;2855;5834;9145;10145;10270;13939;16817 True;True;True;True;True;True;True;True 2294;2888;5888;9224;10229;10354;14068;16966 7385;9347;18743;18744;29988;33322;33323;33738;33739;33740;45518;54968;54969 9524;12000;24124;38205;42316;42827;42828;57790;70008 9524;12000;24124;38205;42316;42827;57790;70008 Q7Z739;Q9BYJ9 Q7Z739;Q9BYJ9 5;4 5;4 2;2 YTH domain-containing family protein 3;YTH domain-containing family protein 1 YTHDF3;YTHDF1 sp|Q7Z739|YTHD3_HUMAN YTH domain-containing family protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDF3 PE=1 SV=1;sp|Q9BYJ9|YTHD1_HUMAN YTH domain-containing family protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDF1 PE=1 SV=1 2 5 5 2 5 4 4 5 4 4 2 1 2 8.9 8.9 4.6 63.86 585 585;559 0 10.764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97712 1.0309 11.483 15 2 Leave out requantified 0.98808 0.94766 0.98994 1.0472 0.97344 1.0802 8.6937 9.5874 19.737 6 4 5 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.9 6.5 7.7 397360000 220540000 176820000 146890000 78822000 68068000 140770000 82605000 58170000 109690000 59110000 50584000 1402 2188;3009;7265;9540;14864 True;True;True;True;True 2215;3044;7327;9621;14999 7134;7135;9850;9851;9852;23517;23518;31280;31281;31282;31283;31284;31285;48503;48504;48505 9199;9200;12639;12640;12641;12642;12643;30040;39815;39816;39817;39818;39819;61612;61613;61614 9200;12642;30040;39815;61614 Q7Z7A4 Q7Z7A4 1 1 1 PX domain-containing protein kinase-like protein PXK sp|Q7Z7A4|PXK_HUMAN PX domain-containing protein 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hydrolase 48 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP48 PE=1 SV=1 1 13 13 13 9 8 11 9 8 11 9 8 11 17 17 17 119.03 1035 1035 0 85.088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85866 0.93394 18.291 30 10 Leave out requantified 0.85532 1.085 0.89428 0.88677 1.119 0.99171 13.841 1.8467 23.369 10 8 12 1 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.4 10.5 14.3 828110000 421440000 406670000 313590000 165170000 148410000 218860000 104780000 114070000 295660000 151490000 144180000 1409 893;3692;5292;7568;7971;9637;9681;10624;12125;15746;17480;17728;17823 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 905;3731;5345;7632;8039;9718;9762;10715;12236;15889;17635;17886;17982 2937;2938;2939;2940;12008;12009;12010;12011;12012;12013;17013;24552;25912;25913;25914;31589;31590;31591;31736;31737;31738;34935;39795;39796;51355;51356;51357;57071;57072;57824;58125;58126 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Q86XI2 5 5 5 Condensin-2 complex subunit G2 NCAPG2 sp|Q86XI2|CNDG2_HUMAN Condensin-2 complex subunit G2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCAPG2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 4.9 4.9 4.9 130.96 1143 1143 0 6.0574 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98097 1.0027 26.32 11 5 Leave out requantified 1.017 0.77478 0.79685 1.0638 0.78197 0.83244 132.54 30.224 33.476 5 3 3 3 1 1 Median Median Median 4.9 3.3 3.3 157960000 85136000 72819000 72510000 38625000 33885000 43465000 23564000 19901000 41981000 22947000 19034000 1418 1832;4886;7974;9567;10698 True;True;True;True;True 1856;4934;8042;9648;10789 6009;15738;25917;25918;25919;31360;31361;31362;35152;35153;35154 7763;20202;33111;33112;33113;39922;44566;44567 7763;20202;33113;39922;44567 Q86XP3 Q86XP3 14 14 14 ATP-dependent RNA helicase DDX42 DDX42 sp|Q86XP3|DDX42_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX42 PE=1 SV=1 1 14 14 14 11 12 12 11 12 12 11 12 12 20.8 20.8 20.8 102.97 938 938 0 50.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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9895;9896;10061;10062;10189;10190;10191;10192;16933;16934;17085;17086;17087;17088;18589;18590;18591;25592;25593;25914;25915;26593;26594;32070;32071;32072;32073;32074;32075;32076;35458;57780;57781;66023;66024;66025;66026;72335;72336;72337 9896;10061;10191;16934;17086;18590;25592;25914;26594;32074;35458;57781;66026;72336 Q86Y56 Q86Y56 8 8 8 Dynein assembly factor 5, axonemal DNAAF5 sp|Q86Y56|DAAF5_HUMAN Dynein assembly factor 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAAF5 PE=1 SV=4 1 8 8 8 7 5 5 7 5 5 7 5 5 10.9 10.9 10.9 93.52 855 855 0 29.638 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0088 1.0788 12.636 16 3 Leave out requantified 1.1639 1.2434 0.9756 1.2275 1.26 1.0647 21.857 20.743 9.5265 7 4 5 2 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.5 6.3 6.4 284530000 159740000 124790000 149480000 92465000 57013000 61031000 29093000 31938000 74020000 38177000 35843000 1420 204;725;808;1910;3772;4157;10217;13518 True;True;True;True;True;True;True;True 205;734;818;1936;3812;4200;10301;13644 655;656;2387;2388;2389;2665;2666;2667;6292;12250;12251;13525;13526;33554;33555;33556;44158 873;874;3092;3093;3094;3447;8109;15804;15805;17416;42596;42597;42598;56020 873;3093;3447;8109;15805;17416;42598;56020 Q8WXI9;Q86YP4 Q8WXI9;Q86YP4 1;1 1;1 1;1 Transcriptional repressor p66-beta;Transcriptional repressor p66-alpha GATAD2B;GATAD2A sp|Q8WXI9|P66B_HUMAN Transcriptional repressor p66-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD2B PE=1 SV=1;sp|Q86YP4|P66A_HUMAN Transcriptional repressor p66-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD2A PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.9 1.9 1.9 65.26 593 593;633 0 5.5365 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.094 0.85059 17.147 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.9 1.9 1.9 41692000 19479000 22213000 13788000 6203000 7584700 15313000 7234800 8078200 12591000 6041300 6549800 1421 992 True 1005 3258;3259;3260 4173;4174;4175;4176;4177;4178 4175 Q86YR7 Q86YR7 1 1 1 Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2 MCF2L2 sp|Q86YR7|MF2L2_HUMAN Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCF2L2 PE=2 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 126.99 1114 1114 0.0020534 2.2121 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4448 1.5703 13.363 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 362310000 148170000 214140000 192820000 75695000 117130000 82525000 38646000 43879000 86959000 33826000 53133000 1422 13991 True 14120 45706;45707;45708 58022;58023;58024 58024 Q8IUD2;O15083 Q8IUD2 3;1 3;1 3;1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 ERC1 sp|Q8IUD2|RB6I2_HUMAN ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERC1 PE=1 SV=1 2 3 3 3 1 2 0 1 2 0 1 2 0 2.9 2.9 2.9 128.08 1116 1116;957 0 4.619 By MS/MS By MS/MS 0.61934 0.65252 76.902 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 0 Median Median Median 1.1 1.8 0 40198000 25453000 14745000 29532000 17168000 12365000 10666000 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NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.5 2.5 5.2 47896000 23541000 24356000 20840000 9469900 11370000 14343000 8210400 6132700 12713000 5860400 6852400 1425 2942;7800 True;True 2975;7867 9603;25341;25342;25343 12318;32390;32391;32392;32393 12318;32391 Q8IV48 Q8IV48 4 4 4 3-5 exoribonuclease 1 ERI1 sp|Q8IV48|ERI1_HUMAN 3-5 exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4 10.6 10.6 10.6 40.063 349 349 0 4.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0249 1.1081 40.615 8 1 Leave out requantified 0.86569 0.8877 1.0115 0.92709 0.93503 1.1334 23.075 24.016 39.454 2 2 4 0 0 1 Median Median Leave out requantified 4.9 4.9 10.6 260000000 131380000 128620000 73973000 42238000 31736000 70380000 33297000 37083000 115640000 55845000 59797000 1426 297;9034;11343;16558 True;True;True;True 298;9112;11440;16704 932;933;934;29584;37201;54083;54084;54085 1232;1233;1234;37703;47113;68906 1232;37703;47113;68906 Q8IWA0 Q8IWA0 1 1 1 WD repeat-containing protein 75 WDR75 sp|Q8IWA0|WDR75_HUMAN WD repeat-containing protein 75 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR75 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.6 1.6 1.6 94.498 830 830 0.0020523 2.2008 By MS/MS By matching By matching 0.77401 0.85656 5.1346 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.6 1.6 1.6 63321000 35315000 28006000 19799000 10930000 8869500 21176000 11538000 9638000 22346000 12847000 9499000 1427 13986 True 14115 45688;45689;45690 58001 58001 172 341 Q8IWS0 Q8IWS0 12 12 12 PHD finger protein 6 PHF6 sp|Q8IWS0|PHF6_HUMAN PHD finger protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF6 PE=1 SV=1 1 12 12 12 11 10 10 11 10 10 11 10 10 40.5 40.5 40.5 41.29 365 365 0 84.449 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85772 0.90512 16.335 44 7 Leave out requantified 0.81562 0.89405 0.82838 0.8321 0.90512 0.88366 24.874 11.852 15.473 15 14 15 4 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.5 32.6 32.6 1228000000 657360000 570590000 408090000 208720000 199370000 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CHERP sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHERP PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 4.4 4.4 4.4 103.7 916 916 0 5.8027 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72884 0.76391 26.031 7 2 Leave out requantified 0.76373 0.68996 0.80235 0.78758 0.71544 0.86395 30.345 23.938 33.683 2 2 3 0 1 1 Median Median Median 2.8 2.8 4.4 106360000 61621000 44742000 33082000 17447000 15635000 28116000 15248000 12867000 45165000 28926000 16240000 1429 4125;6824;12567 True;True;True 4168;6882;12683 13422;13423;13424;21810;41218;41219;41220 17292;17293;27987;52225;52226;52227 17292;27987;52225 Q8IWZ3 Q8IWZ3 5 2 2 Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 ANKHD1 sp|Q8IWZ3|ANKH1_HUMAN Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKHD1 PE=1 SV=1 1 5 2 2 2 3 3 0 1 1 0 1 1 3.1 1.1 1.1 269.45 2542 2542 0 6.8021 By matching By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 1.3 1.8 2 3806900 1904500 1902500 0 0 0 0 0 0 3806900 1904500 1902500 1430 394;5620;10859;14086;15215 True;False;False;True;False 397;5673;10951;14216;15354 1277;1278;18080;18081;35630;46039;49642;49643;49644;49645 1652;1653;23260;23261;45140;58430;63124;63125;63126;63127 1652;23261;45140;58430;63124 Q8IX12 Q8IX12 13 13 13 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 CCAR1 sp|Q8IX12|CCAR1_HUMAN Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCAR1 PE=1 SV=2 1 13 13 13 6 9 10 6 9 10 6 9 10 11.6 11.6 11.6 132.82 1150 1150 0 36.028 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68605 0.80881 35.817 27 8 Leave out requantified 0.67461 0.69931 0.75269 0.76291 0.76487 0.89409 11.648 50.123 21.984 6 10 11 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.3 8.5 9 433280000 257570000 175720000 109450000 60369000 49083000 142190000 86350000 55838000 181640000 110850000 70794000 1431 575;2790;3243;3579;5787;8420;8583;8612;8892;11682;13578;16284;16928 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 581;2822;3279;3618;5841;8493;8659;8688;8969;11786;13704;16429;17079 1897;9155;10585;10586;10587;11649;11650;18612;27409;27410;27411;28005;28006;28007;28008;28009;28010;28115;28116;29094;38277;38278;44351;44352;44353;53107;55344;55345 2467;11733;13581;13582;14988;14989;23951;34977;34978;34979;35780;35781;35782;35915;37072;48490;56253;56254;56255;67680;70489;70490 2467;11733;13581;14989;23951;34979;35780;35915;37072;48490;56253;67680;70490 Q8IX18 Q8IX18 1 1 1 Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40 DHX40 sp|Q8IX18|DHX40_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX40 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.7 1.7 1.7 88.559 779 779 0 4.0047 By matching By MS/MS By MS/MS 1.4272 1.5799 8.5884 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.7 1.7 1.7 42303000 18688000 23615000 10442000 4028000 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NaN 0.99933 NaN NaN 16.519 1 1 3 0 0 0 Median Median Median 2.2 2.2 4.9 86048000 40840000 45207000 30413000 13097000 17316000 22955000 11261000 11694000 32679000 16482000 16197000 1434 5663;15742 True;True 5716;15885 18224;18225;18226;51346;51347 23466;65342;65343 23466;65342 Q8IY67 Q8IY67 2 2 2 Ribonucleoprotein PTB-binding 1 RAVER1 sp|Q8IY67|RAVR1_HUMAN Ribonucleoprotein PTB-binding 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAVER1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 5.6 5.6 5.6 63.876 606 606 0 6.7709 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7636 1.7081 24.757 4 1 Linear 1.358 NaN NaN 1.3616 NaN NaN 41.3 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 5.6 2.1 5.6 38242000 16906000 21336000 19947000 9120000 10827000 9047500 3913800 5133700 9248200 3872200 5375900 1435 6349;13837 True;True 6405;13965 20390;20391;45155;45156;45157 26223;26224;57258;57259;57260 26224;57259 Q8IY81 Q8IY81 7 7 7 pre-rRNA processing protein FTSJ3 FTSJ3 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA processing protein FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 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protein C12orf29 C12orf29 sp|Q8N999|CL029_HUMAN Uncharacterized protein C12orf29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C12orf29 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 37.49 325 325 0 3.2164 By MS/MS By matching By MS/MS 0.93113 1.0477 10.19 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.1 3.1 3.1 563850000 287100000 276750000 189630000 91438000 98193000 186900000 97404000 89499000 187310000 98253000 89058000 1463 16707 True 16856 54599;54600;54601 69553;69554 69553 Q8N9T8 Q8N9T8 3 3 3 Protein KRI1 homolog KRI1 sp|Q8N9T8|KRI1_HUMAN Protein KRI1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRI1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.5 7.5 7.5 82.597 703 703 0 6.3071 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83303 0.86854 24.399 7 4 Median 0.82382 0.78001 1.0307 0.85757 0.81431 1.0867 1.7971 14.18 39.821 2 2 3 1 1 2 Median Median Median 5.5 5.4 4.1 75037000 42549000 32488000 28480000 13680000 14801000 15281000 9231300 6049300 31276000 19638000 11638000 1464 3507;10545;15965 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subunit methyltransferase NEP1 EMG1 sp|Q92979|NEP1_HUMAN Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMG1 PE=1 SV=4 1 4 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 18.9 18.9 18.9 26.72 244 244 0 12.191 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87578 0.8885 25.399 8 4 Leave out requantified 1.0027 0.87534 0.93734 1.053 0.90289 0.98442 18.791 22.81 39.897 4 2 2 2 1 1 Median Median Median 18.9 8.6 8.6 159000000 78104000 80897000 84340000 39396000 44944000 36553000 19796000 16757000 38108000 18912000 19197000 1552 10860;12311;15997;16498 True;True;True;True 10952;12425;16141;16644 35631;35632;35633;40424;52136;52137;52138;53886 45141;45142;45143;51225;66376;66377;66378;68664;68665 45143;51225;66376;68665 Q93008;O00507 Q93008;O00507 6;3 6;3 6;3 Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y USP9X;USP9Y sp|Q93008|USP9X_HUMAN Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP9X PE=1 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MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 5.6 0 18029000 13393000 4636100 0 0 0 18029000 13393000 4636100 0 0 0 1555 847 True 858 2786 3577 3577 Q969G3 Q969G3 5 5 5 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 SMARCE1 sp|Q969G3|SMCE1_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCE1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 2 4 3 2 4 3 2 19.5 19.5 19.5 46.649 411 411 0 13.206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71502 0.78634 32.845 6 3 Median 0.61862 0.79621 0.74815 0.63574 0.81228 0.80381 36.065 10.591 56.687 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 17 10.7 8.3 84363000 42848000 41514000 32223000 14203000 18020000 23326000 12161000 11165000 28813000 16484000 12329000 1556 2683;3952;9727;9945;14497 True;True;True;True;True 2713;3993;9809;10028;14631 8774;12877;31913;32645;32646;32647;47383;47384;47385 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2091;2466;4519;5185;5231;5933;6272;7346;11961;13982;14633;14839;15654 6794;7951;7952;7953;7954;14498;16533;16534;16535;16536;16664;18868;18869;19990;23582;23583;23584;23585;23586;38842;38843;38844;45254;47388;47389;47390;47987;47988;47989;47990;50669;50670 8737;10218;10219;10220;10221;18675;21225;21226;21227;21228;21390;24261;24262;25739;30105;30106;30107;30108;30109;49157;49158;49159;57453;57454;60155;60156;60157;60158;60159;60160;60921;60922;60923;60924;60925;60926;64486 8737;10218;18675;21226;21390;24262;25739;30105;49157;57453;60157;60922;64486 Q96AC1 Q96AC1 16 16 15 Fermitin family homolog 2 FERMT2 sp|Q96AC1|FERM2_HUMAN Fermitin family homolog 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FERMT2 PE=1 SV=1 1 16 16 15 11 15 8 11 15 8 10 14 8 29.3 29.3 28.2 77.86 680 680 0 96.863 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92158 0.99641 28.545 38 8 Leave out requantified 1.1929 0.89078 0.79052 1.2547 0.96199 0.9154 34.333 26.898 17.583 12 16 10 3 5 0 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domain-containing protein 124 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC124 PE=1 SV=1 1 11 11 11 8 10 11 8 10 11 8 10 11 45.3 45.3 45.3 25.835 223 223 0 43.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87999 0.93218 24.257 34 6 Leave out requantified 0.83586 0.92272 0.8927 0.89581 0.94442 0.96482 10.521 25.524 37.455 11 10 13 3 0 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.3 41.7 45.3 1535500000 818560000 716980000 465820000 255970000 209850000 440280000 215280000 224990000 629440000 347310000 282130000 1571 71;1234;2105;3345;10026;10095;13942;13943;14384;15295;15296 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 72;1250;2131;3383;10109;10179;14071;14072;14517;15436;15437 230;231;4062;4063;4064;6900;6901;10914;32917;32918;32919;32920;33143;33144;33145;45525;45526;45527;45528;45529;45530;45531;45532;45533;45534;47010;47011;47012;49982;49983;49984;49985;49986;49987;49988 301;302;303;5215;5216;5217;8885;14021;14022;41840;41841;41842;41843;42109;42110;42111;57797;57798;57799;57800;57801;57802;57803;57804;59657;59658;63609;63610;63611;63612;63613;63614;63615;63616 303;5217;8885;14021;41840;42110;57798;57803;59658;63610;63616 Q96CW1 Q96CW1 9 9 9 AP-2 complex subunit mu AP2M1 sp|Q96CW1|AP2M1_HUMAN AP-2 complex subunit mu OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2M1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 8 9 8 8 9 8 8 9 8 23.9 23.9 23.9 49.654 435 435 0 41.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95723 0.98727 14.778 29 3 Leave out requantified 0.91203 0.89106 0.95447 0.94482 0.93583 0.99629 23.825 12.412 19.63 10 10 9 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 23.9 19.3 1565700000 792840000 772860000 522950000 274200000 248750000 523200000 257630000 265580000 519550000 261020000 258530000 1572 2381;5902;10439;13100;14036;14336;14855;15144;17482 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2411;5956;10529;13221;14166;14469;14990;15283;17637 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protein 1 REPS1 sp|Q96D71|REPS1_HUMAN RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=REPS1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.4 1.4 1.4 86.661 796 796 0.0074221 1.8875 By MS/MS By MS/MS 0.48785 0.53257 18.706 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 1.4 1.4 33159000 22697000 10462000 0 0 0 15734000 10285000 5448400 17425000 12412000 5013700 1576 14883 True 15018 48566;48567 61687;61688 61688 Q96DB5 Q96DB5 2 2 2 Regulator of microtubule dynamics protein 1 RMDN1 sp|Q96DB5|RMD1_HUMAN Regulator of microtubule dynamics protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RMDN1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 7.6 7.6 7.6 35.808 314 314 0 9.2072 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61015 0.67257 35.198 3 0 Median NaN 0.81275 NaN NaN 0.8304 NaN NaN 46.707 NaN 0 2 1 0 0 0 Median Median Median 3.5 7.6 3.5 27263000 15258000 12005000 0 0 0 18333000 9514900 8817700 8930400 5742900 3187500 1577 408;11316 True;True 411;11413 1319;1320;1321;37119 1707;1708;1709;1710;46998;46999 1707;46998 Q96DG6 Q96DG6 8 8 8 Carboxymethylenebutenolidase homolog CMBL sp|Q96DG6|CMBL_HUMAN Carboxymethylenebutenolidase homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMBL PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 8 7 8 8 7 8 8 7 24.5 24.5 24.5 28.048 245 245 0 24.524 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99415 1.1157 8.0262 29 12 Leave out requantified 1.0016 1.0359 0.96549 1.103 1.1167 1.1015 17.803 10.325 8.5475 10 9 10 3 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.5 24.5 23.3 972090000 429230000 542860000 345120000 163330000 181790000 315910000 133740000 182170000 311060000 132160000 178900000 1578 2903;3139;3419;3920;4741;7481;9005;11937 True;True;True;True;True;True;True;True 2936;3175;3457;3960;4789;7545;9083;12043 9488;9489;9490;10268;10269;10270;11128;11129;11130;11131;11132;12744;12745;12746;15301;15302;15303;24267;24268;29507;29508;29509;29510;29511;39135;39136;39137;39138;39139;39140 12172;12173;12174;12175;13154;13155;13156;14314;14315;14316;14317;14318;14319;14320;14321;16413;16414;16415;19693;19694;30961;37616;37617;37618;37619;37620;37621;49523;49524;49525;49526;49527;49528 12175;13154;14317;16413;19694;30961;37617;49524 Q96DH6 Q96DH6 2 2 2 RNA-binding protein Musashi homolog 2 MSI2 sp|Q96DH6|MSI2H_HUMAN RNA-binding protein Musashi homolog 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSI2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 9.1 9.1 9.1 35.196 328 328 0 17.437 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5954 1.6713 42.962 5 4 Median 1.7953 NaN 1.6245 1.8733 NaN 1.8378 16.133 NaN 31.014 2 1 2 2 0 2 Median Median Median 4.6 4.6 9.1 48514000 21455000 27059000 17367000 7682200 9685100 11602000 5834500 5767500 19544000 7938000 11606000 1579 5939;5941 True;True 5994;5996 19054;19055;19061;19062;19063;19064 24500;24501;24502;24503;24512;24513;24514;24515 24503;24512 Q96DI7 Q96DI7 5 5 5 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein SNRNP40 sp|Q96DI7|SNR40_HUMAN U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRNP40 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 3 5 2 3 5 2 3 5 21.3 21.3 21.3 39.31 357 357 0 7.4092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78002 0.8335 48.001 8 1 Leave out requantified 0.80355 1.1094 0.76221 0.82559 1.1426 0.82815 17.668 37.406 55.613 2 3 3 0 1 0 Median Median Leave out requantified 5.9 14.8 21.3 176810000 93817000 82990000 54923000 31339000 23584000 52638000 26616000 26021000 69246000 35861000 33385000 1580 6518;7603;10457;15863;17435 True;True;True;True;True 6575;7667;10547;16007;17590 20879;20880;24672;24673;34403;34404;51728;56939;56940;56941 26826;26827;31487;43627;65847;72512;72513;72514;72515;72516 26827;31487;43627;65847;72513 Q96E11 Q96E11 4 4 4 Ribosome-recycling factor, mitochondrial MRRF sp|Q96E11|RRFM_HUMAN Ribosome-recycling factor, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRRF PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 4 4 1 4 4 1 4 4 19.5 19.5 19.5 29.277 262 262 0 25.046 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0307 1.1049 12.897 9 4 Leave out requantified NaN 1.1431 1.0501 NaN 1.1762 1.0854 NaN 18.419 37.016 1 4 4 1 0 3 Median Leave out requantified Median 6.1 19.5 19.5 203630000 93233000 110400000 18051000 8372700 9678500 102440000 48232000 54211000 83138000 36628000 46510000 1581 4476;7404;12746;14060 True;True;True;True 4522;7467;12864;14190 14503;14504;14505;24027;24028;41761;41762;41763;45949;45950 18681;18682;18683;30673;30674;52918;52919;52920;58339;58340 18683;30673;52919;58339 Q96EK4 Q96EK4 1 1 1 THAP domain-containing protein 11 THAP11 sp|Q96EK4|THA11_HUMAN THAP domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THAP11 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.9 2.9 2.9 34.455 314 314 0.0059642 1.9168 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 2.9 0 2.9 7513800 4784500 2729300 2495800 2495800 0 0 0 0 5018000 2288700 2729300 1582 2395 True 2425 7814;7815;7816 10046;10047;10048 10046 Q96EK5 Q96EK5 2 2 2 KIF1-binding protein KIAA1279 sp|Q96EK5|KBP_HUMAN KIF1-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1BP PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 5 5 5 71.813 621 621 0 5.3089 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.9246 7.2946 106.83 3 3 Median NaN 3.0966 NaN NaN 3.1174 NaN NaN 120.23 NaN 0 2 1 0 2 1 Median Median Median 1.9 5 3.1 154500000 20390000 134110000 0 0 0 77621000 11895000 65726000 76876000 8495100 68381000 1583 1604;4687 True;True 1624;4735 5231;5232;15152;15153 6736;6737;19507;19508 6736;19508 Q96EM0 Q96EM0 1 1 1 Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase L3HYPDH sp|Q96EM0|T3HPD_HUMAN Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=L3HYPDH PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4 4 4 38.137 354 354 0 5.3591 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1584 2701 True 2732 8841;8842 11336;11337 11337 Q96EY4 Q96EY4 1 1 1 Translation machinery-associated protein 16 TMA16 sp|Q96EY4|TMA16_HUMAN Translation machinery-associated protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 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True;True;True;True;True 1213;2686;5574;7210;15803 3932;8687;8688;17766;17767;23048;23049;23050;51135;51136;51137 5024;11124;22848;29464;29465;29466;65069;65070 5024;11124;22848;29465;65069 Q96FQ6 Q96FQ6 6 6 6 Protein S100-A16 S100A16 sp|Q96FQ6|S10AG_HUMAN Protein S100-A16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A16 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 6 64.1 64.1 64.1 11.801 103 103 0 32.106 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.806 0.83892 16.843 25 7 Leave out requantified 0.78278 0.89189 0.92769 0.79921 0.92805 0.9891 18.452 16.592 15.35 8 6 11 1 1 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 63.1 64.1 64.1 1557100000 821770000 735340000 535510000 280620000 254890000 426120000 226220000 199890000 595480000 314930000 280560000 1587 1568;4163;4164;8199;9898;9939 True;True;True;True;True;True 1587;4206;4207;8271;9981;10022 5112;5113;5114;13542;13543;13544;13545;13546;13547;13548;13549;13550;26649;26650;26651;26652;32491;32492;32493;32494;32495;32627;32628;32629;32630;32631;32632 6595;6596;6597;6598;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448;17449;17450;17451;33999;34000;34001;34002;41328;41329;41330;41331;41332;41333;41334;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512 6596;17448;17450;34001;41333;41507 Q96FW1 Q96FW1 8 8 8 Ubiquitin thioesterase OTUB1 OTUB1 sp|Q96FW1|OTUB1_HUMAN Ubiquitin thioesterase OTUB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OTUB1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 7 6 7 7 6 7 7 6 39.9 39.9 39.9 31.284 271 271 0 75.363 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1966 1.2132 27.702 25 3 Leave out requantified 1.2805 1.1123 1.0166 1.3253 1.1874 1.0592 29.514 9.1388 17.219 10 7 8 2 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.2 30.3 26.6 657610000 303540000 354070000 274230000 117710000 156520000 170360000 77916000 92446000 213020000 107910000 105110000 1588 457;3609;4794;4986;8154;9533;12558;15700 True;True;True;True;True;True;True;True 460;3648;4842;5038;8226;9614;12674;15843 1471;1472;1473;1474;1475;1476;11760;11761;11762;11763;11764;11765;15448;15449;15450;16073;26521;26522;26523;26524;26525;31263;31264;31265;41196;51237;51238;51239 1903;1904;1905;1906;1907;1908;1909;15149;15150;15151;15152;15153;15154;15155;15156;19871;19872;19873;19874;19875;20638;33844;33845;33846;33847;33848;33849;33850;39798;39799;39800;52195;65199;65200;65201;65202 1904;15153;19871;20638;33848;39798;52195;65200 Q96G03 Q96G03 2 2 2 Phosphoglucomutase-2 PGM2 sp|Q96G03|PGM2_HUMAN Phosphoglucomutase-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGM2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 4.1 4.1 4.1 68.283 612 612 0 3.5439 By MS/MS By MS/MS 1.0858 1.2138 67.898 2 2 Median 1.0858 NaN NaN 1.2138 NaN NaN 67.898 NaN NaN 2 0 0 2 0 0 Median Median Median 2.3 1.8 0 37231000 19956000 17275000 37231000 19956000 17275000 0 0 0 0 0 0 1589 2699;8396 True;True 2730;8469 8837;8838;27336 11332;11333;34882 11332;34882 Q96GA3 Q96GA3 4 4 4 Protein LTV1 homolog LTV1 sp|Q96GA3|LTV1_HUMAN Protein LTV1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LTV1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 8.8 8.8 8.8 54.854 475 475 0 6.2283 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85509 0.88732 23.449 9 4 Leave out requantified 0.92861 0.94404 0.74753 0.9691 0.98675 0.8192 12.468 5.6541 37.142 2 3 4 0 2 2 Median Plateau Median 4.2 7.4 5.7 180570000 93783000 86790000 41084000 21727000 19357000 51086000 27153000 23932000 88403000 44902000 43501000 1590 10549;14491;15204;16815 True;True;True;True 10639;14625;15343;16964 34676;34677;34678;34679;47369;49604;49605;49606;54964 43970;43971;43972;43973;43974;60126;63085;63086;70003 43971;60126;63085;70003 Q96GM8 Q96GM8 10 10 10 Target of EGR1 protein 1 TOE1 sp|Q96GM8|TOE1_HUMAN Target of EGR1 protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOE1 PE=1 SV=1 1 10 10 10 7 8 6 7 8 6 7 8 6 28.6 28.6 28.6 56.547 510 510 0 24.263 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88143 0.89741 22.449 21 8 Leave out requantified 1.0013 0.74735 0.77594 1.0515 0.79251 0.835 17.433 25.493 18.451 6 7 8 0 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Median 21.8 22.5 19.4 451160000 244370000 206800000 132440000 65966000 66479000 149750000 84470000 65280000 168970000 93931000 75038000 1591 36;936;1475;5749;6435;13183;14009;14197;14706;15428 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 37;948;1494;5803;6492;13304;14138;14327;14841;15569 119;120;3076;3077;4823;4824;4825;4826;18504;20647;20648;43063;43064;45756;45757;45758;46408;46409;47994;47995;47996;50394;50395;50396 167;168;3960;3961;3962;3963;6227;6228;6229;6230;6231;23834;26529;54638;58079;58080;58081;58878;58879;60932;60933;60934;60935;64119;64120;64121;64122;64123;64124 168;3961;6228;23834;26529;54638;58081;58878;60932;64120 Q96GQ7 Q96GQ7 5 5 5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27 DDX27 sp|Q96GQ7|DDX27_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX27 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 2 1 4 2 1 4 2 1 6 6 6 89.834 796 796 0 7.3166 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3394 1.39 50.487 5 5 Median 1.5709 0.87931 NaN 1.6222 0.90311 NaN 21.844 45.736 NaN 2 2 1 2 2 1 Median Median Median 4.9 2.3 1.3 70212000 31951000 38262000 28028000 10873000 17155000 34899000 19135000 15764000 7285800 1943000 5342800 1592 164;200;2343;3390;7952 True;True;True;True;True 165;201;2371;3428;8020 510;641;642;7649;11040;25850;25851 655;854;855;9845;14193;33036;33037 655;855;9845;14193;33036 Q96GY0 Q96GY0 2 2 2 Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A ZC2HC1A sp|Q96GY0|ZC21A_HUMAN Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC2HC1A PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.8 5.8 5.8 35.092 325 325 0 3.7932 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.4 0 2.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1593 15138;17185 True;True 15277;17337 49400;56159 62828;71533 62828;71533 Q96H79 Q96H79 1 1 1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like ZC3HAV1L sp|Q96H79|ZCCHL_HUMAN Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HAV1L PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.7 6.7 6.7 32.962 300 300 0 13.901 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87218 0.93118 33.683 4 4 Median NaN 0.76615 NaN NaN 0.799 NaN NaN 43.916 NaN 1 2 1 1 2 1 Median Median Median 6.7 6.7 6.7 42760000 22289000 20471000 8317000 2539300 5777700 21678000 11247000 10431000 12765000 8502700 4262500 1594 11312 True 11409 37106;37107;37108;37109 46980;46981;46982;46983 46983 Q96HC4 Q96HC4 6 6 6 PDZ and LIM domain protein 5 PDLIM5 sp|Q96HC4|PDLI5_HUMAN PDZ and LIM domain protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM5 PE=1 SV=5 1 6 6 6 6 4 5 6 4 5 6 4 5 13.6 13.6 13.6 63.944 596 596 0 34.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75899 0.85954 11.066 13 6 Leave out requantified 0.83584 0.83299 0.6761 0.93164 0.86232 0.80552 14.422 13.162 11.514 5 3 5 2 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 13.6 9.1 11.7 368870000 213410000 155470000 138890000 77173000 61719000 79115000 45089000 34026000 150870000 91144000 59724000 1595 1308;4771;5674;6497;7856;13004 True;True;True;True;True;True 1325;4819;5727;6554;7923;13123 4291;4292;4293;4294;15380;15381;15382;15383;15384;18267;18268;20821;20822;20823;25524;25525;42558;42559;42560 5526;5527;5528;19781;19782;19783;19784;19785;23531;23532;26746;26747;26748;32627;32628;53963;53964;53965;53966 5527;19785;23532;26746;32628;53966 Q96HE7 Q96HE7 5 5 5 ERO1-like protein alpha ERO1L sp|Q96HE7|ERO1A_HUMAN ERO1-like protein alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERO1A PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 0 2 3 0 2 3 0 2 14.1 14.1 14.1 54.392 468 468 0 12.403 By MS/MS By MS/MS 1.0417 1.0862 58.748 4 3 Median 0.76295 NaN 1.0417 0.79622 NaN 1.0862 96.565 NaN 8.0518 2 0 2 2 0 1 Median Median Median 7.5 0 6.6 46903000 24291000 22612000 24898000 14934000 9964300 0 0 0 22005000 9357500 12648000 1596 8447;9694;11329;11955;18043 True;True;True;True;True 8520;9775;11426;12061;18204 27498;31782;37164;39191;58824 35096;35097;40432;47066;49581;74868 35097;40432;47066;49581;74868 Q96I25 Q96I25 4 4 4 Splicing factor 45 RBM17 sp|Q96I25|SPF45_HUMAN Splicing factor 45 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM17 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 4 14.7 14.7 14.7 44.961 401 401 0 15.623 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72963 0.75869 3.9376 9 3 Leave out requantified 0.77054 0.80816 0.74135 0.78137 0.86403 0.79582 4.9806 23.967 9.3535 3 2 4 0 0 3 Leave out requantified Median Median 9.2 5.2 14.7 134410000 75125000 59283000 43050000 24297000 18753000 30214000 15904000 14310000 61144000 34924000 26220000 1597 1950;10255;12035;13124 True;True;True;True 1976;10339;12145;13245 6422;6423;33668;33669;33670;39507;42890;42891;42892;42893 8273;8274;8275;42737;42738;49999;54420;54421;54422;54423;54424;54425 8275;42738;49999;54421 Q96I99 Q96I99 4 4 4 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial SUCLG2 sp|Q96I99|SUCB2_HUMAN Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLG2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 12.3 12.3 12.3 46.51 432 432 0 10.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85873 0.91361 14.344 10 5 Leave out requantified 0.86123 0.87083 0.7379 0.91545 0.93076 0.80871 21.698 20.206 38.449 3 3 4 1 2 2 Median Median Median 9.5 9.5 12.3 202740000 107930000 94809000 70833000 37146000 33687000 62596000 33416000 29180000 69309000 37367000 31942000 1598 4387;7943;9510;13753 True;True;True;True 4433;8011;9591;13880 14203;14204;14205;25824;25825;25826;25827;31198;31199;31200;44887 18304;18305;18306;33006;33007;33008;33009;39732;39733;56918 18304;33007;39733;56918 Q96IJ6 Q96IJ6 1 1 1 Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha GMPPA sp|Q96IJ6|GMPPA_HUMAN Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GMPPA PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 46.291 420 420 0.0088496 1.8539 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.236 1.2374 13.413 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.3 3.3 3.3 31100000 15418000 15682000 9391200 4068900 5322300 12065000 6887900 5177200 9643700 4460700 5183000 1599 16297 True 16442 53138;53139;53140 67709;67710;67711;67712 67709 Q96IU4 Q96IU4 3 3 3 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B ABHD14B sp|Q96IU4|ABHEB_HUMAN Protein ABHD14B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABHD14B PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 21.4 21.4 21.4 22.345 210 210 0 5.274 By MS/MS 1.1849 1.3222 21.238 3 2 Median NaN NaN 1.1849 NaN NaN 1.3222 NaN NaN 21.238 0 0 3 0 0 2 Median Median Median 0 0 21.4 52300000 21522000 30777000 0 0 0 0 0 0 52300000 21522000 30777000 1600 1503;3324;15599 True;True;True 1522;3362;15742 4899;4900;10852;50939 6314;6315;13939;64828 6315;13939;64828 Q96IZ0 Q96IZ0 7 7 7 PRKC apoptosis WT1 regulator protein PAWR sp|Q96IZ0|PAWR_HUMAN PRKC apoptosis WT1 regulator protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAWR PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 4 5 7 4 5 7 4 5 37.9 37.9 37.9 36.567 340 340 0 68.438 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83535 0.88087 4.1453 19 12 Leave out requantified 1.0287 0.77002 0.82339 1.023 0.80352 0.90626 16.71 77.325 35.552 7 6 6 4 4 4 Leave out requantified Median Median 37.9 16.5 24.1 306520000 168420000 138100000 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6159;15643;18284 19572;19573;50631;50632;59070;59071 25158;25159;64438;75186;75187;75188 25159;64438;75187 Q96JC1 Q96JC1 1 1 1 Vam6/Vps39-like protein VPS39 sp|Q96JC1|VPS39_HUMAN Vam6/Vps39-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS39 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1.5 1.5 1.5 101.81 886 886 0.0030288 2.0588 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 1.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1603 12828 True 12946 42002 53223 53223 Q96JG6 Q96JG6 4 4 4 Coiled-coil domain-containing protein 132 CCDC132 sp|Q96JG6|VPS50_HUMAN Syndetin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS50 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 4.7 4.7 4.7 111.17 964 964 0 17.422 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0296 1.1274 25.349 9 6 Median 1.1996 0.81314 0.98564 1.238 0.84276 1.0951 3.9624 20.121 31.88 3 2 4 2 1 3 Median Median Median 3.4 2.2 3.4 73168000 40331000 32838000 22300000 12478000 9821300 15346000 8298100 7047900 35523000 19555000 15968000 1604 3206;10347;12866;14337 True;True;True;True 3242;10435;12984;14470 10473;10474;10475;10476;10477;34010;42129;42130;42131;46848 13434;13435;13436;13437;13438;13439;43150;53398;53399;53400;59446 13435;43150;53399;59446 Q96JJ3;Q92556 Q96JJ3 7;1 7;1 7;1 Engulfment and cell motility protein 2 ELMO2 sp|Q96JJ3|ELMO2_HUMAN Engulfment and cell motility protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELMO2 PE=1 SV=2 2 7 7 7 1 2 5 1 2 5 1 2 5 12.6 12.6 12.6 82.614 720 720;727 0 21.17 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0758 1.0932 10.529 6 2 Leave out requantified NaN 0.93742 1.0633 NaN 0.96267 1.0932 NaN 1.4241 21.925 1 2 3 0 1 1 Median Median Median 3.2 3.8 8.9 89648000 48836000 40812000 19386000 7672000 11714000 35755000 19564000 16192000 34507000 21601000 12907000 1605 978;2378;10076;13640;14255;15687;16788 True;True;True;True;True;True;True 991;2408;10160;13766;14385;15830;16937 3225;7758;33087;33088;44540;46585;51206;54874;54875 4134;9967;42044;42045;56471;59103;65163;65164;69883;69884;69885 4134;9967;42044;56471;59103;65164;69884 Q96JM3 Q96JM3 2 2 2 Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1 CHAMP1 sp|Q96JM3|CHAP1_HUMAN Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHAMP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.1 3.1 3.1 89.098 812 812 0 5.314 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.227 1.2845 43.992 6 0 Leave out requantified 0.9805 0.95389 1.325 1.0184 1.0016 1.4281 11.166 79.168 35.971 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 3.1 3.1 3.1 100580000 48964000 51618000 35559000 19360000 16199000 34187000 15702000 18485000 30836000 13902000 16934000 1606 477;14535 True;True 480;14669 1553;1554;1555;47498;47499;47500 2020;2021;2022;2023;2024;60292;60293 2022;60293 Q96JP5 Q96JP5 1 1 1 E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91 ZFP91 sp|Q96JP5|ZFP91_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZFP91 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.4 4.4 4.4 63.444 570 570 0 9.4822 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0687 1.0971 46.82 4 1 Median NaN 1.7847 NaN NaN 1.7956 NaN NaN 51.805 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 4.4 4.4 4.4 66031000 27865000 38166000 17462000 9322100 8140100 28834000 9475300 19358000 19735000 9067100 10668000 1607 131 True 132 412;413;414;415 536;537;538;539;540;541;542;543 538 Q96K17 Q96K17 4 4 4 Transcription factor BTF3 homolog 4 BTF3L4 sp|Q96K17|BT3L4_HUMAN Transcription factor BTF3 homolog 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BTF3L4 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 36.7 36.7 36.7 17.27 158 158 0 77.464 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2118 1.3408 5.2647 17 13 Leave out requantified 1.0338 1.0434 0.89806 1.1901 1.135 1.0564 7.3674 21.098 22.363 5 6 6 4 4 5 Median Median Median 19 36.7 36.7 485500000 246550000 238950000 166060000 79444000 86615000 164630000 75948000 88678000 154810000 91153000 63661000 1608 1170;1171;9315;9316 True;True;True;True 1186;1187;9395;9396 3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;30576;30577;30578;30579;30580 4888;4889;4890;4891;4892;4893;4894;4895;4896;4897;4898;4899;4900;4901;38975;38976;38977;38978;38979 4890;4899;38975;38979 Q96KB5 Q96KB5 4 4 4 Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase PBK sp|Q96KB5|TOPK_HUMAN Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PBK PE=1 SV=3 1 4 4 4 1 4 3 1 4 3 1 4 3 14.9 14.9 14.9 36.085 322 322 0 5.6645 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0713 1.1234 10.843 8 5 Median NaN 1.1097 1.0472 NaN 1.1569 1.092 NaN 10.364 15.422 1 4 3 1 2 2 Median Median Median 4 14.9 12.1 172260000 85365000 86896000 22705000 13244000 9461300 91810000 42355000 49455000 57746000 29766000 27980000 1609 1382;2885;8071;14213 True;True;True;True 1399;2918;8143;14343 4502;4503;4504;4505;9444;9445;26251;26252;46462 5796;5797;5798;5799;12118;12119;33512;58951 5797;12118;33512;58951 Q96KG9 Q96KG9 7 7 7 N-terminal kinase-like protein SCYL1 sp|Q96KG9|SCYL1_HUMAN N-terminal kinase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCYL1 PE=1 SV=1 1 7 7 7 4 4 3 4 4 3 4 4 3 8.8 8.8 8.8 89.63 808 808 0 14.987 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87525 0.94665 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cytokinesis protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK7 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 0.9 0.9 0.9 242.56 2140 2140 0 3.652 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2379 1.2937 2.3603 4 0 Leave out requantified NaN 1.214 NaN NaN 1.2517 NaN NaN 7.0236 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 0.4 0.9 0.4 414200000 192150000 222050000 148550000 67296000 81257000 135120000 64937000 70181000 130530000 59922000 70609000 1615 4481;11907 True;True 4527;12013 14520;14521;14522;39033 18696;18697;18698;18699;49417 18699;49417 Q96NC0 Q96NC0 2 2 2 Zinc finger matrin-type protein 2 ZMAT2 sp|Q96NC0|ZMAT2_HUMAN Zinc finger matrin-type protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZMAT2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 5 5 5 23.612 199 199 0 3.278 By MS/MS By MS/MS 0.75515 0.92201 44.506 3 0 Median NaN NaN 0.96662 NaN NaN 1.17 NaN NaN 33.681 1 0 2 0 0 0 Median Median Median 4.5 0 5 27173000 14769000 12405000 7705500 4671500 3034000 0 0 0 19468000 10097000 9370700 1616 2272;2273 True;True 2300;2301 7398;7399;7400 9535;9536 9535;9536 Q96NW4 Q96NW4 1 1 1 Ankyrin repeat domain-containing protein 27 ANKRD27 sp|Q96NW4|ANR27_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD27 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.4 1.4 1.4 116.98 1050 1050 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 0 1.4 12865000 5881300 6983700 0 0 0 0 0 0 12865000 5881300 6983700 + 1617 7983 True 8051 25950 33148 33148 183 614 Q96P11;Q63ZY6 Q96P11 3;1 3;1 3;1 Probable 28S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase NSUN5 sp|Q96P11|NSUN5_HUMAN Probable 28S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSUN5 PE=1 SV=2 2 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 9.3 9.3 9.3 46.691 429 429;315 0 4.986 By matching By MS/MS By MS/MS 1.079 1.1032 10.113 7 1 Leave out requantified 1.106 0.93264 1.1038 1.1032 0.93013 1.1941 10.113 10.458 13.032 2 2 3 0 0 1 Median Median Median 6.1 9.3 9.3 62163000 31069000 31094000 19238000 9187800 10050000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 755;3034;4320;5111;5604;5725;5726;6606;7103;8282;9561;11959;18200 2458;2459;2460;9817;9818;9819;9820;13874;13875;13876;16317;17861;17862;17863;18262;18263;18264;18265;18266;20975;20976;20977;22596;22597;22598;22599;22600;26688;26689;26690;31109;31110;38838;58812;58813;58814 3191;3192;3193;3194;12603;12604;12605;12606;12607;17886;17887;20954;22978;22979;23525;23526;23527;23528;23529;23530;26943;26944;26945;26946;28954;28955;28956;28957;34048;34049;34050;34051;39622;39623;49150;74856 3191;12603;17886;20954;22978;23525;23528;26946;28956;34048;39622;49150;74856 Q96Q11 Q96Q11 6 6 6 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial TRNT1 sp|Q96Q11|TRNT1_HUMAN CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRNT1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 4 4 4 4 4 4 4 4 19.4 19.4 19.4 50.127 434 434 0 10.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95973 0.9925 13.528 12 5 Leave out requantified 0.93099 0.95973 1.0013 0.92451 0.9925 1.077 11.8 13.588 25.801 3 5 4 0 3 2 Leave out requantified Median Median 12.4 10.1 13.8 262650000 130940000 131720000 74068000 35171000 38897000 88344000 44769000 43575000 100240000 50996000 49245000 1623 1431;8366;9822;10617;14259;18016 True;True;True;True;True;True 1450;8439;9905;10708;14389;18177 4675;4676;27237;32234;32235;32236;32237;34913;34914;34915;46595;46596;46597;58739 6037;6038;34759;41017;41018;41019;41020;41021;44276;44277;44278;59111;74762;74763 6037;34759;41017;44277;59111;74762 Q96QK1 Q96QK1 15 15 15 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 VPS35 sp|Q96QK1|VPS35_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS35 PE=1 SV=2 1 15 15 15 13 11 8 13 11 8 13 11 8 23.7 23.7 23.7 91.706 796 796 0 76.672 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0417 1.0958 15.842 34 12 Leave out requantified 1.1515 0.94619 0.94982 1.1692 0.99892 1.0396 18.657 22.038 15.688 15 11 8 7 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.9 17.8 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GFM1 sp|Q96RP9|EFGM_HUMAN Elongation factor G, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GFM1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 4 5 5 4 5 5 4 5 10.5 10.5 10.5 83.471 751 751 0 22.615 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80196 0.85858 20.396 13 5 Leave out requantified 0.79768 0.77567 0.82552 0.85858 0.84805 0.90469 32.433 27.113 26.079 5 4 4 1 2 2 Leave out requantified Median Median 8 6.8 7.7 263030000 142770000 120270000 101850000 54201000 47652000 79102000 44066000 35036000 82078000 44501000 37577000 1625 756;4805;8106;13830;14862;17885;18020 True;True;True;True;True;True;True 766;4853;8178;13958;14997;18044;18181 2493;15490;15491;15492;26358;45126;45127;45128;48501;58357;58358;58745;58746;58747 3235;19915;33641;57216;57217;57218;61610;74291;74292;74768;74769;74770;74771;74772 3235;19915;33641;57217;61610;74292;74768 Q96RS6 Q96RS6 1 1 1 NudC domain-containing protein 1 NUDCD1 sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.9 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2027;2028;2029;2030;13300;13301;21635;21636;21637;21638;21639 2027;13300;21636 Q96S55 Q96S55 2 2 2 ATPase WRNIP1 WRNIP1 sp|Q96S55|WRIP1_HUMAN ATPase WRNIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WRNIP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 3.6 3.6 3.6 72.132 665 665 0 5.7283 By MS/MS By MS/MS 0.97672 0.95541 57.205 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.5 3.6 0 23212000 13773000 9439300 8256500 2648800 5607700 14955000 11124000 3831600 0 0 0 1628 1527;15327 True;True 1546;15468 4992;50098;50099;50100 6437;63780;63781;63782 6437;63781 Q96SB4 Q96SB4 11 11 9 SRSF protein kinase 1 SRPK1 sp|Q96SB4|SRPK1_HUMAN SRSF protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRPK1 PE=1 SV=2 1 11 11 9 7 8 7 7 8 7 6 7 6 22 22 19.5 74.324 655 655 0 48.334 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96562 1.0546 24.329 23 15 Leave out requantified 0.83587 1.0336 0.92681 0.88656 1.1079 0.93761 31.318 4.172 107.1 7 10 6 3 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Median 12.8 16.5 16.2 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Median 1.1 6 5 108720000 55207000 53515000 19241000 9669100 9571600 43824000 20485000 23339000 45657000 25053000 20605000 1630 2267;2563;4566;11377 True;True;True;True 2295;2593;4613;11474 7386;7387;8381;14792;14793;37302;37303;37304 9525;10752;19027;19028;47238;47239;47240;47241;47242 9525;10752;19027;47241 Q96ST3 Q96ST3 3 3 3 Paired amphipathic helix protein Sin3a SIN3A sp|Q96ST3|SIN3A_HUMAN Paired amphipathic helix protein Sin3a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIN3A PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 0 2 1 0 2 1 0 2 3.7 3.7 3.7 145.17 1273 1273 0 8.0004 By MS/MS By MS/MS 0.81541 0.88068 48.396 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 1.1 0 2.6 22302000 15610000 6692100 5830000 3374300 2455700 0 0 0 16472000 12236000 4236400 1631 33;10035;12562 True;True;True 34;10118;12678 111;32947;41208 153;41877;52211 153;41877;52211 Q96SU4 Q96SU4 6 6 6 Oxysterol-binding protein-related protein 9 OSBPL9 sp|Q96SU4|OSBL9_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 9 OS=Homo 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NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 3 3 3 20035000 12240000 7794800 11053000 6228200 4825200 0 0 0 8981500 6011900 2969600 1633 393 True 396 1274;1275;1276 1648;1649;1650;1651 1648 Q96T37 Q96T37 1 1 1 Putative RNA-binding protein 15 RBM15 sp|Q96T37|RBM15_HUMAN RNA-binding protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM15 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1.4 1.4 1.4 107.19 977 977 0.007909 1.8836 By MS/MS By matching 0.82117 0.86809 21.318 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 0 1.4 11623000 5595600 6027100 5944800 3062900 2881900 0 0 0 5677900 2532600 3145300 1634 13627 True 13753 44506;44507 56439;56440 56439 Q96T58 Q96T58 2 2 2 Msx2-interacting protein SPEN sp|Q96T58|MINT_HUMAN Msx2-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEN PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 0.4 0.4 0.4 402.24 3664 3664 0.0020693 2.2918 By matching By MS/MS By MS/MS 0.92702 0.95446 1.3972 5 0 Leave out requantified NaN 0.9862 0.97338 NaN 1.0008 1.0151 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cofactor B TBCB sp|Q99426|TBCB_HUMAN Tubulin-folding cofactor B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCB PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 1 2 1 1 2 1 1 11.5 11.5 11.5 27.325 244 244 0 4.415 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90681 0.9566 39.806 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 7.8 3.7 3.7 80739000 51295000 29444000 39898000 29449000 10449000 18506000 10360000 8145900 22335000 11486000 10849000 1640 1210;9718;14262 True;True;True 1226;9800;14392 3970;31875;31876;46609 5075;40556;40557;40558;59124 5075;40557;59124 Q99439 Q99439 7 7 6 Calponin-2 CNN2 sp|Q99439|CNN2_HUMAN Calponin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNN2 PE=1 SV=4 1 7 7 6 6 5 6 6 5 6 5 4 5 27.2 27.2 23.6 33.697 309 309 0 29.143 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9676 1.0243 33.335 17 3 Leave out requantified 1.1636 0.85189 0.79026 1.2078 0.90486 0.86596 24.3 39.877 20.406 6 5 6 1 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.6 19.1 22.7 768040000 411000000 357040000 255370000 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5-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC5L PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 9 11 10 9 11 10 9 11 19.1 19.1 19.1 92.25 802 802 0 99.784 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85421 0.90174 26.948 33 9 Leave out requantified 0.83362 0.91019 1.024 0.89297 0.93224 1.1593 20.937 26.414 41.227 10 9 14 1 1 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 15.2 17.1 973550000 503210000 470350000 313560000 172160000 141410000 288410000 150290000 138120000 371580000 180760000 190820000 1643 2762;2763;3850;4460;6043;7960;9761;10942;13009;14882;15283;17618 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2794;2795;3890;4506;6099;8028;9843;11034;13128;15017;15424;17773 9077;9078;9079;9080;12498;14457;14458;14459;14460;19391;19392;19393;19394;25880;25881;32026;32027;32028;35911;35912;35913;35914;35915;35916;42573;42574;42575;48563;48564;48565;49931;49932;49933;57467;57468 11638;11639;11640;16100;18632;18633;18634;18635;24942;24943;24944;24945;24946;24947;33070;33071;33072;40772;40773;40774;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508;53984;53985;53986;53987;61685;61686;63540;73146;73147 11638;11640;16100;18634;24947;33070;40772;45503;53986;61686;63540;73147 Q99460 Q99460 12 12 12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 PSMD1 sp|Q99460|PSMD1_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD1 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 8 7 10 8 7 10 8 7 18.4 18.4 18.4 105.84 953 953 0 84.911 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92406 0.98482 18.948 27 15 Leave out requantified 1.179 0.94171 0.915 1.2351 0.99105 1.0264 40.777 32.246 17.449 9 10 8 7 6 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 15.5 12.2 11.1 708400000 398870000 309530000 223370000 97475000 125900000 195830000 95898000 99934000 289190000 205490000 83699000 1644 2901;3013;7512;9504;11287;11609;12412;12470;12471;12513;15612;15899 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3-kinase regulatory subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIK3R4 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 153.1 1358 1358 0.0092638 1.7912 By MS/MS By MS/MS 0.73378 0.78191 16.768 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 1 0 1 18131000 9399000 8731700 8610700 4249900 4360800 0 0 0 9520000 5149100 4370900 1649 6621 True 6678 21164;21165 27151;27152;27153;27154 27151 Q99575 Q99575 13 13 13 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 POP1 sp|Q99575|POP1_HUMAN Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP1 PE=1 SV=2 1 13 13 13 9 8 9 9 8 9 9 8 9 18.4 18.4 18.4 114.71 1024 1024 0 39.815 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74269 0.79883 18.821 22 5 Leave out requantified 0.73031 0.83981 0.73576 0.78858 0.86913 0.79714 21.861 14.056 21.521 9 5 8 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.8 11.2 13 489080000 256720000 232360000 200180000 109590000 90596000 122500000 58777000 63718000 166400000 88356000 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requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.9 15.6 15.8 352360000 183580000 168780000 159570000 81451000 78116000 71858000 37743000 34115000 120930000 64383000 56550000 1687 1802;3305;5578;6755;9112;11229;11346;17095 True;True;True;True;True;True;True;True 1826;3343;5631;6812;9190;11325;11443;17247 5882;5883;5884;10791;17949;17950;17951;17952;17953;21572;21573;21574;21575;29851;29852;36831;36832;36833;37208;55902;55903;55904 7604;7605;7606;13861;23098;23099;23100;23101;23102;27689;27690;27691;27692;27693;27694;38034;46653;46654;47121;71204;71205;71206;71207 7606;13861;23099;27689;38034;46654;47121;71205 Q9BRX5 Q9BRX5 2 2 2 DNA replication complex GINS protein PSF3 GINS3 sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 10.6 10.6 10.6 24.534 216 216 0 4.8453 By MS/MS By matching By MS/MS 0.93098 0.97681 24.981 5 2 Median 1.2103 NaN 0.8571 1.29 NaN 0.93178 13.996 NaN 6.6745 2 1 2 1 0 1 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11070;11071;11072;12390;12391;12392;24983;26839;26840;26841;26842;44296;44297 14238;14239;14240;14241;14242;15986;15987;31924;31925;34241;34242;34243;34244;56186 14240;15986;31925;34242;56186 Q9BSJ8 Q9BSJ8 1 1 1 Extended synaptotagmin-1 ESYT1 sp|Q9BSJ8|ESYT1_HUMAN Extended synaptotagmin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESYT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 122.85 1104 1104 0 6.8227 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1655 1.1544 12.346 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 72310000 33328000 38982000 28753000 12200000 16553000 16314000 8292000 8022400 27242000 12836000 14406000 1693 10304 True 10388 33843;33844;33845 42942;42943;42944 42942 Q9BT78 Q9BT78 4 4 4 COP9 signalosome complex subunit 4 COPS4 sp|Q9BT78|CSN4_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS4 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 2 3 2 2 3 2 2 15.8 15.8 15.8 46.268 406 406 0 14.997 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0193 1.0694 23.615 7 0 Leave out 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53189;53190;61898;61899;61900;61901 53189;61901 Q9BTD8 Q9BTD8 1 1 1 RNA-binding protein 42 RBM42 sp|Q9BTD8|RBM42_HUMAN RNA-binding protein 42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM42 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 50.413 480 480 0 3.2414 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.8585 1.9624 27.76 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 2.3 2.3 2.3 17083000 6043900 11039000 5861600 1967500 3894100 6030700 2150400 3880300 5190600 1926000 3264600 1696 4101 True 4144 13349;13350;13351 17201;17202;17203 17203 Q9BTE3 Q9BTE3 5 5 5 Mini-chromosome maintenance complex-binding protein MCMBP sp|Q9BTE3|MCMBP_HUMAN Mini-chromosome maintenance complex-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCMBP PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 9.7 9.7 9.7 72.979 642 642 0 9.5619 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8447 0.89597 12.595 10 2 Leave out requantified 0.95379 1.167 0.76997 0.95179 1.1695 0.8047 11.072 40.92 11.031 3 3 4 0 2 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 6.1 8.1 7.9 182590000 100270000 82320000 45706000 21622000 24084000 72185000 43028000 29156000 64704000 35623000 29080000 1697 1531;2058;3394;7787;10586 True;True;True;True;True 1550;2084;3432;7854;10677 4998;4999;6765;6766;6767;11054;11055;11056;25291;34810;34811 6445;8701;8702;14220;14221;32319;44148;44149 6445;8701;14220;32319;44148 Q9BTE6 Q9BTE6 14 14 14 Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 AARSD1 sp|Q9BTE6|AASD1_HUMAN Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AARSD1 PE=1 SV=2 1 14 14 14 12 11 12 12 11 12 12 11 12 54.6 54.6 54.6 45.479 412 412 0 158.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78634 0.83251 16.044 41 10 Leave out requantified 0.77082 0.85133 0.79611 0.81159 0.86261 0.83579 20.967 18.774 19.831 14 13 14 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.6 38.3 44.7 1391900000 772010000 619930000 514600000 291850000 222750000 378890000 202100000 176790000 498450000 278070000 220380000 1698 1026;1755;3668;4206;4712;6346;6741;12046;12193;13334;13399;13535;16061;17374 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1039;1779;3707;4249;4760;6402;6798;12156;12305;13458;13524;13661;16205;17529 3360;3361;3362;5742;5743;5744;11945;11946;11947;13664;13665;13666;13667;13668;15226;20381;20382;20383;20384;20385;21531;21532;21533;39540;39541;40011;40012;40013;43573;43781;44214;44215;44216;44217;52350;52351;52352;56756;56757;56758;56759;56760;56761 4298;4299;4300;4301;4302;4303;7434;7435;15389;15390;15391;15392;15393;15394;17604;17605;17606;17607;17608;17609;19595;26214;26215;26216;26217;26218;27635;27636;27637;50039;50680;50681;50682;55321;55557;56092;56093;56094;56095;56096;56097;66658;72282;72283;72284;72285;72286;72287;72288 4298;7434;15394;17606;19595;26215;27637;50039;50680;55321;55557;56097;66658;72282 Q9BTE7 Q9BTE7 3 3 3 DCN1-like protein 5 DCUN1D5 sp|Q9BTE7|DCNL5_HUMAN DCN1-like protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCUN1D5 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 12.2 12.2 12.2 27.508 237 237 0 11.562 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74091 0.75748 3.4854 7 1 Leave out requantified 0.80013 0.81902 0.69441 0.77638 0.82103 0.7236 38.723 31.374 2.9863 3 2 2 1 0 0 Median Median Median 12.2 8.9 8.9 94485000 57576000 36909000 63764000 40435000 23329000 14348000 7601900 6746000 16372000 9538900 6833600 1699 6426;14110;14303 True;True;True 6483;14240;14434 20622;20623;20624;46119;46748;46749;46750 26500;26501;26502;26503;26504;58521;59308;59309;59310;59311;59312;59313 26502;58521;59309 Q9BTV5 Q9BTV5 1 1 1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 FSD1 sp|Q9BTV5|FSD1_HUMAN Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.2 2.2 2.2 55.819 496 496 0.0030227 2.0442 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 2.2 12358000 5067800 7290200 0 0 0 0 0 0 12358000 5067800 7290200 1700 9357 True 9438 30736 39162 39162 Q9BTW9 Q9BTW9 8 8 8 Tubulin-specific chaperone D TBCD sp|Q9BTW9|TBCD_HUMAN Tubulin-specific chaperone D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCD PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 7 7 6 7 7 6 7 7 8.4 8.4 8.4 132.6 1192 1192 0 25.411 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0608 1.0606 25.697 17 6 Leave out requantified 1.4623 1.1219 1.0139 1.4254 1.1344 1.062 38.43 20.259 35.697 4 7 6 2 2 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 5.7 7.3 7.3 344580000 170370000 174200000 74057000 34628000 39429000 143310000 68818000 74495000 127200000 66925000 60280000 1701 148;1627;5612;6333;9379;9645;10896;16566 True;True;True;True;True;True;True;True 149;1647;5665;6389;9460;9726;10988;16712 461;462;463;464;465;5315;5316;5317;18053;18054;20347;20348;20349;30799;30800;31619;31620;35758;35759;35760;54106;54107;54108 606;607;608;609;610;6846;6847;6848;23221;23222;23223;26173;26174;39250;39251;40232;45291;45292;45293;68932;68933;68934;68935 609;6848;23221;26173;39250;40232;45291;68932 Q9BUB5 Q9BUB5 1 1 1 MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1 MKNK1 sp|Q9BUB5|MKNK1_HUMAN MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKNK1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.6 2.6 2.6 51.342 465 465 0.0083744 1.8663 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 2.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1702 3028 True 3063 9908 12710 12710 Q9BUF5 Q9BUF5 13 4 4 Tubulin beta-6 chain TUBB6 sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN Tubulin beta-6 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB6 PE=1 SV=1 1 13 4 4 12 12 13 3 3 4 3 3 4 36.3 15.9 15.9 49.857 446 446 0 103.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81087 0.8536 17.965 15 6 Leave out requantified 0.99904 0.81791 0.69455 1.0135 0.8775 0.74916 2.5392 6.4537 15.302 5 3 7 2 1 3 Leave out requantified Median Leave out requantified 33 33 36.3 1028700000 582890000 445820000 349930000 189580000 160350000 238640000 136390000 102250000 440140000 256920000 183220000 1703 122;3940;4653;5323;5559;6121;8085;8172;8819;9314;12028;12209;17944 True;True;False;False;True;False;True;False;False;False;False;False;False 123;3981;4700;5376;5612;6177;8157;8244;8896;9394;12137;12138;12321;18104 384;385;12821;12822;12823;12824;12825;12826;12827;12828;15034;15035;15036;15037;17134;17135;17136;17880;17881;17882;19634;19635;19636;26297;26298;26299;26580;26581;26582;28844;28845;28846;28847;28848;28849;30570;30571;30572;30573;30574;30575;39472;39473;39474;39475;39476;39477;39478;39479;39480;39481;39482;39483;40052;40053;40054;40055;40056;40057;40058;40059;58531;58532;58533;58534 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Median Median 9.9 9.9 5.4 81459000 43391000 38068000 27845000 16409000 11436000 30412000 15263000 15149000 23202000 11720000 11483000 1711 4242;4774 True;True 4285;4822 13783;13784;15389;15390;15391 17775;19792;19793;19794 17775;19792 Q9BVP2 Q9BVP2 14 14 14 Guanine nucleotide-binding protein-like 3 GNL3 sp|Q9BVP2|GNL3_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein-like 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNL3 PE=1 SV=2 1 14 14 14 11 14 13 11 14 13 11 14 13 31.3 31.3 31.3 61.992 549 549 0 68.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86939 0.93946 11.758 44 12 Leave out requantified 0.857 0.9287 0.87281 0.94966 0.95385 0.94002 13.872 10.707 14.64 14 16 14 4 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26 31.3 29.5 1642400000 884070000 758320000 522900000 285940000 236960000 598460000 317270000 281200000 521020000 280860000 240160000 1712 1881;4179;6034;7738;8573;8852;10137;10939;13782;13861;14319;14379;16503;16559 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 4 4 4 37289000 17642000 19646000 17911000 8682200 9228800 0 0 0 19378000 8960100 10418000 1715 3504 True 3543 11414;11415;11416;11417 14682;14683;14684;14685;14686 14682 Q9BWD1 Q9BWD1 5 5 5 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic ACAT2 sp|Q9BWD1|THIC_HUMAN Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAT2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 19.6 19.6 19.6 41.35 397 397 0 40.013 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1259 1.2056 119.39 11 5 Leave out requantified 1.1259 1.0771 1.2699 1.2056 1.0531 1.308 117.12 76.918 20.418 5 3 3 2 2 1 Leave out requantified Median Median 17.1 14.4 14.4 386290000 194040000 192250000 124840000 53042000 71801000 129110000 77545000 51568000 132330000 63449000 68880000 1716 1483;3942;7051;8004;16959 True;True;True;True;True 1502;3983;7109;8072;17111 4847;4848;4849;12847;12848;22611;22612;22613;26012;55451;55452;55453 6250;6251;16572;16573;28971;28972;28973;33202;70623;70624;70625;70626;70627;70628 6251;16572;28973;33202;70627 Q9BWJ5 Q9BWJ5 3 3 3 Splicing factor 3B subunit 5 SF3B5 sp|Q9BWJ5|SF3B5_HUMAN Splicing factor 3B subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B5 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 45.3 45.3 45.3 10.135 86 86 0 5.8295 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0633 1.1605 5.7358 6 1 Leave out requantified 0.94819 1.1579 1.1639 1.0173 1.2245 1.2765 2.5659 1.4548 19.204 2 2 2 0 1 0 Median Median Median 27.9 15.1 45.3 133220000 67784000 65440000 50703000 27184000 23520000 35944000 16345000 19600000 46576000 24256000 22321000 1717 11348;17833;18082 True;True;True 11445;17992;18243 37210;58159;58160;58947;58948;58949;58950 47123;74034;75020;75021;75022;75023;75024;75025 47123;74034;75025 Q9BXB5;Q9BXB4 Q9BXB5 6;1 6;1 6;1 Oxysterol-binding protein-related protein 10 OSBPL10 sp|Q9BXB5|OSB10_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL10 PE=1 SV=2 2 6 6 6 4 5 6 4 5 6 4 5 6 10.6 10.6 10.6 83.969 764 764;747 0 21.867 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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2222;2223;2224;2225;2226;2227;3021;3022;3023;3024;3025;3026;4065;4066;8733;8757;8758;8759;8760;8761;8762;10603;10604;10802;10803;10804;10805;10806;10807;10808;12364;12365;12366;15644;16763;16764;16765;18845;18846;18847;20484;23845;23846;23847;27186;31051;31052;31053;31495;31496;31497;31604;31605;31608;31609;31610;32210;32211;32212;32213;32214;32215;32216;32217;34447;34448;34449;37851;38498;38499;39304;39305;39306;39663;39664;39665;41696;41697;41698;43750;43751;43752;48539;48540;48541;51201;52423;52424;52425;52426;52427;52428;53338;53339;53340;57096;57097;57098;57287;57288;57289;57290 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Serrate RNA effector molecule homolog SRRT sp|Q9BXP5|SRRT_HUMAN Serrate RNA effector molecule homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRT PE=1 SV=1 1 22 22 22 19 16 17 19 16 17 19 16 17 26.4 26.4 26.4 100.67 876 876 0 105.55 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92579 0.9576 18.109 52 9 Leave out requantified 0.90343 0.93967 0.97812 0.96318 0.96061 1.0723 16.247 18.219 20.614 19 17 16 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.1 19.5 21.6 1983300000 998620000 984680000 683190000 356440000 326750000 651670000 323200000 328470000 648450000 318980000 329460000 1720 363;518;519;2534;3398;3639;4489;4637;5552;5553;7891;7892;7893;8209;8386;8572;9786;10831;11190;15673;16095;16096 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 366;523;524;2564;3436;3678;4535;4684;5605;5606;7958;7959;7960;8281;8459;8648;9869;10923;11285;15816;16239;16240 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32868;75179;75180 32868;75179 Q9GZR7 Q9GZR7 7 7 7 ATP-dependent RNA helicase DDX24 DDX24 sp|Q9GZR7|DDX24_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX24 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 3 4 5 3 4 5 3 4 9.5 9.5 9.5 96.331 859 859 0 16.272 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8087 0.88202 28.962 11 6 Leave out requantified 0.98258 1.3225 0.7054 1.0679 1.347 0.77545 78.675 59.455 49.672 4 3 4 2 2 2 Median Median Median 7.6 3.5 5.1 196950000 91981000 104970000 93351000 33771000 59579000 40395000 22670000 17725000 63208000 35540000 27668000 1743 6294;8559;9401;11692;12274;12954;15982 True;True;True;True;True;True;True 6350;8634;9482;11796;12388;13073;16126 20220;20221;27901;30857;38306;38307;38308;38309;40272;40273;40274;42411;52096 25997;35624;39316;48518;48519;48520;48521;51026;51027;53774;66322 25997;35624;39316;48518;51026;53774;66322 Q9GZS1 Q9GZS1 3 3 3 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 POLR1E sp|Q9GZS1|RPA49_HUMAN DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 OS=Homo 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31219;31236;31237;31238;31239;31240;31241;31242;36062;36063;36064;36065;38987;38988;38989;38990;38991;38992;38993;43477;43478;43479;43480;43481;43482;47083;47084;49551;49552;55368 31219;31237;36063;38988;43478;43481;47083;49552;55368 Q9GZZ9 Q9GZZ9 1 1 1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 UBA5 sp|Q9GZZ9|UBA5_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 5.9 5.9 5.9 44.863 404 404 0 13.141 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 5.9 12578000 4140200 8438200 0 0 0 0 0 0 12578000 4140200 8438200 1748 8969 True 9047 29382 37459 37459 Q9H078 Q9H078 2 2 2 Caseinolytic peptidase B protein homolog CLPB sp|Q9H078|CLPB_HUMAN Caseinolytic peptidase B protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPB PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.7 5.7 5.7 78.728 707 707 0 7.9415 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1301 1.1503 28.909 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 3 2.7 2.7 69715000 29001000 40714000 15023000 5942000 9080800 29514000 10390000 19124000 25178000 12669000 12509000 1749 5110;17377 True;True 5163;17532 16475;16476;56768 21154;21155;21156;21157;21158;72300 21157;72300 Q9H0A0 Q9H0A0 14 14 14 N-acetyltransferase 10 NAT10 sp|Q9H0A0|NAT10_HUMAN RNA cytidine acetyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAT10 PE=1 SV=2 1 14 14 14 9 12 9 9 12 9 9 12 9 16.1 16.1 16.1 115.73 1025 1025 0 79.858 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79381 0.8239 22.152 32 11 Leave out requantified 0.80757 0.79381 0.76932 0.82598 0.8239 0.80536 23.668 24.254 19.618 10 13 9 1 7 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.3 14.2 10.3 843900000 448450000 395450000 253550000 130570000 122990000 317970000 168780000 149190000 272380000 149110000 123270000 1750 550;670;4488;5123;7401;7916;8567;13061;13147;14730;15495;15496;16757;17641 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 555;678;4534;5176;7464;7983;8642;13181;13268;14865;15637;15638;16906;17796 1797;2205;2206;2207;14547;16508;16509;24020;25744;25745;27940;42716;42717;42718;42948;42949;42950;42951;48077;48078;48079;50607;50608;50609;50610;50611;50612;50613;54765;54766;54767;54768;57548 2334;2862;2863;2864;2865;2866;2867;18727;21198;21199;30666;32918;32919;32920;35676;54166;54167;54168;54169;54170;54171;54487;54488;54489;54490;54491;54492;61036;64409;64410;64411;64412;64413;64414;69761;69762;73259 2334;2863;18727;21199;30666;32919;35676;54167;54489;61036;64411;64413;69762;73259 Q9H0B6;Q9NSK0 Q9H0B6 8;1 6;1 6;1 Kinesin light chain 2 KLC2 sp|Q9H0B6|KLC2_HUMAN Kinesin light chain 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KLC2 PE=1 SV=1 2 8 6 6 6 5 6 4 4 4 4 4 4 16.9 14 14 68.934 622 622;619 0 26.212 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71679 0.75882 16.299 11 4 Leave out requantified 0.70425 0.77558 0.77112 0.72044 0.80345 0.80457 16.433 50.932 8.2342 4 4 3 0 2 2 Leave out requantified Median Median 11.6 10.5 11.6 194060000 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Median 9.7 12.8 10.5 268000000 135930000 132070000 83193000 45885000 37308000 87392000 43504000 43888000 97410000 46536000 50874000 1752 1775;1835;1893;3818;4842;5118;5811 True;True;True;True;True;True;True 1799;1859;1918;3858;4890;5171;5865 5807;5808;6016;6238;6239;12404;12405;15610;15611;15612;16495;16496;18680 7517;7770;8044;8045;16001;20055;20056;20057;21187;21188;24044 7517;7770;8044;16001;20055;21188;24044 Q9H0D6 Q9H0D6 4 4 4 5-3 exoribonuclease 2 XRN2 sp|Q9H0D6|XRN2_HUMAN 5-3 exoribonuclease 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRN2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 5.4 5.4 5.4 108.58 950 950 0 5.498 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94146 0.96413 1.8133 8 1 Leave out requantified 1.0278 0.93131 0.871 1.0195 0.9638 0.86288 7.554 0.46767 9.2166 4 2 2 1 0 0 Leave out requantified Median Median 5.4 2.2 2 107240000 49702000 57534000 57923000 23320000 34603000 25996000 13335000 12661000 23317000 13047000 10269000 1753 6855;12000;12194;18000 True;True;True;True 6913;12108;12306;18161 21895;21896;21897;39356;40014;40015;58702;58703 28099;49789;50683;50684;74713 28099;49789;50684;74713 Q9H0G5 Q9H0G5 3 3 3 Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 NSRP1 sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSRP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 0 3 1 0 3 1 0 3 5.9 5.9 5.9 66.389 558 558 0 5.2705 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.7 0 5.9 28612000 17124000 11488000 28612000 17124000 11488000 0 0 0 0 0 0 1754 1801;12114;16568 True;True;True 1825;12225;16714 5881;39764;39765;54112 7603;50342;50343;68939 7603;50343;68939 Q9H0L4 Q9H0L4 1 1 1 Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant CSTF2T sp|Q9H0L4|CSTFT_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF2T PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.6 2.6 2.6 64.436 616 616 0.0035088 2.001 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.6 0 0 25543000 14721000 10821000 25543000 14721000 10821000 0 0 0 0 0 0 1755 11465 True 11565 37562 47558 47558 Q9H0S4 Q9H0S4 5 5 5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 DDX47 sp|Q9H0S4|DDX47_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX47 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 2 3 4 2 3 4 2 3 14.9 14.9 14.9 50.646 455 455 0 16.735 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71668 0.76624 55.943 10 4 Leave out requantified 1.2624 0.80064 0.78491 1.311 0.80421 0.79953 42.886 55.571 21.759 4 3 3 2 1 1 Median Median Median 12.5 6.4 9.9 193430000 109830000 83603000 81143000 43805000 37338000 59290000 35665000 23625000 53001000 30362000 22639000 1756 2379;9860;14005;14511;15181 True;True;True;True;True 2409;9943;14134;14645;15320 7759;32381;32382;45746;45747;47420;47421;47422;49540;49541 9968;41198;41199;58069;58070;60193;60194;60195;63007;63008 9968;41199;58070;60195;63007 Q9H0U4;Q92928 Q9H0U4;Q92928 8;4 1;1 1;1 Ras-related protein Rab-1B;Putative Ras-related protein Rab-1C RAB1B;RAB1C sp|Q9H0U4|RAB1B_HUMAN Ras-related protein Rab-1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB1B PE=1 SV=1;sp|Q92928|RAB1C_HUMAN Putative Ras-related protein Rab-1C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB1C PE=5 SV=2 2 8 1 1 6 7 7 1 1 0 1 1 0 46.8 8.5 8.5 22.171 201 201;201 0.0005305 2.5957 By MS/MS By MS/MS By matching NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 39.3 42.8 38.3 17487000 8886500 8600700 0 0 0 17487000 8886500 8600700 0 0 0 1757 3604;4847;10188;11618;13255;15303;15353;17651 False;False;False;True;False;False;False;False 3643;4895;10272;11720;13377;15444;15494;17808 11743;11744;11745;11746;11747;11748;15624;15625;15626;15627;33451;33452;33453;33454;38081;38082;43267;43268;50006;50007;50181;50182;57584;57585;57586 15124;15125;15126;15127;15128;15129;15130;15131;15132;15133;20072;20073;20074;20075;20076;42458;42459;42460;42461;42462;42463;48226;48227;54914;54915;63637;63638;63883;73312;73313;73314 15132;20076;42460;48226;54914;63638;63883;73313 Q9H0W9 Q9H0W9 1 1 1 Ester hydrolase C11orf54 C11orf54 sp|Q9H0W9|CK054_HUMAN Ester hydrolase C11orf54 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C11orf54 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 6.7 6.7 6.7 35.117 315 315 0 5.2561 By MS/MS By MS/MS 0.96213 1.036 20.051 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 6.7 6.7 27666000 13396000 14270000 0 0 0 13064000 4160500 8903600 14602000 9235200 5366800 1758 13940 True 14069 45519;45520 57791;57792 57792 Q9H1E3 Q9H1E3 4 4 4 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 NUCKS1 sp|Q9H1E3|NUCKS_HUMAN Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUCKS1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 18.1 18.1 18.1 27.296 243 243 0 15.601 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68965 0.7493 1.6582 9 1 Leave out requantified 0.98335 0.67361 0.66143 1.0549 0.69517 0.75872 20.287 4.5864 7.7822 3 3 3 0 0 1 Leave out requantified Leave out 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4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHD4 PE=1 SV=1 1 11 10 9 11 10 9 10 9 8 9 9 7 24 22.6 20.9 61.174 541 541 0 78.872 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89019 0.92555 17.835 28 9 Leave out requantified 0.90759 0.96921 0.79823 0.9242 0.98797 0.87188 31.659 15.97 12.365 10 10 8 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24 22.4 19 678360000 352320000 326040000 243820000 135840000 107980000 238130000 116650000 121480000 196410000 99837000 96574000 1761 289;552;1101;2435;4278;7763;9171;9599;9871;14040;16835 True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True 290;557;1117;2465;4324;7829;9250;9680;9954;14170;16985 912;913;914;1806;1807;1808;1809;3619;3620;3621;3622;3623;7948;7949;7950;13887;13888;13889;25211;25212;30080;30081;30082;30083;31452;31453;31454;32410;32411;45867;45868;45869;45870;55039;55040;55041 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78;79;80;2104;2105;2106;39715;39716;39717;39718;39719;39720;41824;41825;41826;42175;42176;42177 113;114;115;2735;2736;2737;50275;50276;50277;50278;50279;50280;50281;52995;52996;52997;53459;53460;53461 115;2736;50280;52995;52997;53460 Q9H7Z7 Q9H7Z7 3 3 3 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form PTGES2 sp|Q9H7Z7|PGES2_HUMAN Prostaglandin E synthase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTGES2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8.5 8.5 8.5 41.943 377 377 0 5.8721 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94588 0.99354 16.772 10 1 Leave out requantified 1.2208 0.90632 0.94588 1.2121 0.8893 0.99354 50.324 5.6619 10.819 4 3 3 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.5 8.5 8.5 156300000 77640000 78660000 58947000 27462000 31485000 49277000 25250000 24027000 48075000 24928000 23148000 1789 737;3469;15635 True;True;True 746;3507;15778 2429;2430;2431;11287;11288;11289;51053;51054;51055;51056 3145;3146;3147;3148;3149;14502;64958;64959 3149;14502;64958 Q9H814 Q9H814 1 1 1 Phosphorylated adapter RNA export protein PHAX sp|Q9H814|PHAX_HUMAN Phosphorylated adapter RNA export protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHAX PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.8 2.8 2.8 44.402 394 394 0.0088063 1.8221 By MS/MS By MS/MS 1.1941 1.3061 16.156 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 0 2.8 2.8 29619000 14220000 15400000 0 0 0 15189000 7839900 7348700 14431000 6379800 8051000 1790 12258 True 12372 40224;40225 50970;50971;50972 50970 Q9H832 Q9H832 4 4 4 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z UBE2Z sp|Q9H832|UBE2Z_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2Z PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 10.7 10.7 10.7 38.21 354 354 0 4.3896 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0224 1.0215 27.043 9 2 Leave out requantified 1.5186 1.0224 0.94741 1.4641 1.0215 0.99361 36.216 54.559 26.916 3 3 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified 7.9 7.6 7.6 138770000 65394000 73375000 36009000 14224000 21784000 50651000 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6 4 2 6 11.8 11.8 11.8 80.926 726 726 0 17.906 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96492 0.99162 6.7837 11 2 Leave out requantified 0.97708 0.88765 0.93685 1.0137 0.90291 1.0122 6.039 12.466 8.7228 5 2 4 2 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.5 5.2 11.8 186550000 83958000 102590000 78554000 32471000 46083000 35042000 15166000 19876000 72954000 36322000 36632000 1793 2497;6061;8809;9162;9587;10179 True;True;True;True;True;True 2527;6117;8886;9241;9668;10263 8137;19445;28810;28811;30042;30043;30044;31416;31417;31418;33419;33420;33421 10457;25013;36761;36762;36763;38270;38271;38272;38273;39976;39977;39978;39979;39980;42415;42416;42417;42418 10457;25013;36762;38272;39978;42415 Q9H939 Q9H939 1 1 1 Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 PSTPIP2 sp|Q9H939|PPIP2_HUMAN Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSTPIP2 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.6 3.6 3.6 38.858 334 334 0 3.8916 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9115 0.88477 8.5297 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 3.6 3.6 11695000 6290500 5404600 6142300 3239100 2903200 0 0 0 5552800 3051400 2501400 1794 196 True 197 632;633;634;635 843;844;845;846;847 846 Q9H993 Q9H993 3 3 3 Protein-glutamate O-methyltransferase ARMT1 sp|Q9H993|ARMT1_HUMAN Protein-glutamate O-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARMT1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 7.9 7.9 7.9 51.172 441 441 0 6.7987 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.035 1.0479 6.3777 10 2 Leave out requantified 0.97601 1.077 1.0451 1.0565 1.0479 1.131 4.8683 10.808 15.292 3 3 4 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 7.9 7.9 7.9 205230000 104560000 100660000 66975000 40033000 26942000 47693000 20228000 27465000 90560000 44302000 46258000 1795 2876;15298;17776 True;True;True 2909;15439;17934 9415;9416;9417;49990;49991;49992;49993;57963;57964;57965 12092;12093;12094;12095;63618;63619;63620;63621;63622;63623;73782;73783 12095;63619;73782 Q9H9A6 Q9H9A6 9 9 9 Leucine-rich repeat-containing protein 40 LRRC40 sp|Q9H9A6|LRC40_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC40 PE=1 SV=1 1 9 9 9 8 5 8 8 5 8 8 5 8 18.9 18.9 18.9 68.249 602 602 0 45.445 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1872 1.1589 6.2912 20 3 Leave out requantified 1.1966 1.2079 1.0327 1.1728 1.25 1.1612 10.898 8.7463 21.306 8 5 7 1 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.1 9.8 17.3 322000000 163640000 158360000 129470000 61687000 67784000 71122000 34762000 36361000 121410000 67191000 54214000 1796 4111;5166;6701;7816;10793;11990;12449;14792;15460 True;True;True;True;True;True;True;True;True 4154;5219;6758;7883;10885;12098;12565;14927;15601 13373;13374;13375;16627;16628;21405;21406;21407;21408;25392;25393;35435;35436;35437;39320;40871;40872;40873;48272;48273;48274;50499 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPL44 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 12 12 12 37.535 332 332 0 7.5163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0521 1.092 20.32 6 6 Median NaN 1.0073 1.191 NaN 1.0462 1.2808 NaN 14.11 36.042 1 3 2 1 3 2 Median Median Median 3.9 12 12 68320000 34313000 34008000 9319200 4448400 4870800 35204000 18216000 16989000 23797000 11648000 12148000 1798 2205;7772;12002 True;True;True 2232;7838;12110 7183;7184;25234;25235;25236;25237;39358;39359 9256;9257;32249;32250;32251;32252;49791;49792 9256;32251;49792 Q9H9L3 Q9H9L3 2 2 2 Interferon-stimulated 20 kDa exonuclease-like 2 ISG20L2 sp|Q9H9L3|I20L2_HUMAN Interferon-stimulated 20 kDa exonuclease-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ISG20L2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 5.9 5.9 5.9 39.153 353 353 0.0030257 2.0551 By MS/MS By MS/MS 0.83315 0.89086 27.803 3 0 Median NaN 0.75787 NaN NaN 0.82003 NaN NaN 38.733 NaN 0 2 1 0 0 0 Median Median Median 0 5.9 4 412330000 218250000 194080000 0 0 0 409140000 216540000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8724 0.87858 16.195 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 5.4 5.4 5.4 26949000 12716000 14233000 7291700 4067500 3224300 8766600 3290200 5476400 10891000 5358000 5532600 1811 14639 True 14774 47798;47799;47800 60680;60681;60682;60683 60680 Q9HC35 Q9HC35 22 22 22 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 EML4 sp|Q9HC35|EMAL4_HUMAN Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML4 PE=1 SV=3 1 22 22 22 17 12 18 17 12 18 17 12 18 32.3 32.3 32.3 108.91 981 981 0 88.493 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94972 0.98751 23.144 55 12 Leave out requantified 0.96152 0.95206 0.89326 1.0309 0.97662 0.97123 16.184 30.031 25.053 22 12 21 5 1 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.1 17.5 26.2 1810200000 923400000 886770000 689520000 368860000 320660000 422130000 214430000 207700000 698530000 340110000 358420000 1812 98;1199;1380;1453;1813;2626;3087;3581;3870;6607;6821;7314;7766;8614;8959;9226;10716;10890;15824;16550;17084;18036 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 99;1215;1397;1472;1837;2656;3122;3620;3910;6664;6879;7377;7832;8690;9037;9305;10807;10982;15968;16696;17236;18197 312;313;314;3936;3937;4497;4498;4748;4749;5930;8602;10096;11660;11661;11662;11663;12546;12547;21117;21118;21800;23713;23714;23715;25218;25219;28120;28121;29345;29346;29347;29348;29349;30257;30258;30259;30260;35209;35210;35211;35212;35743;35744;35745;35746;35747;51603;54064;55874;55875;55876;58802;58803;58804;58805;58806;58807 416;417;418;419;5031;5032;5788;5789;5790;6133;6134;6135;7676;11027;12938;12939;15006;15007;15008;15009;15010;15011;16156;16157;16158;27095;27974;30268;30269;32233;32234;35922;37423;37424;38547;38548;38549;38550;44642;44643;44644;44645;44646;44647;45277;45278;45279;45280;45281;65682;65683;68885;71168;71169;71170;71171;71172;74851;74852;74853 419;5031;5788;6134;7676;11027;12939;15006;16158;27095;27974;30268;32233;35922;37423;38548;44645;45278;65682;68885;71168;74853 Q9HC38 Q9HC38 6 6 6 Glyoxalase domain-containing protein 4 GLOD4 sp|Q9HC38|GLOD4_HUMAN Glyoxalase domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLOD4 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 20.4 20.4 20.4 34.793 313 313 0 22.015 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2036 1.2689 14.423 20 5 Leave out requantified 1.1678 1.1772 1.1944 1.2348 1.256 1.3331 9.4518 15.239 17.847 8 6 6 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.4 17.3 20.4 884510000 397480000 487030000 325770000 147630000 178140000 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export factor ENY2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENY2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 24.8 24.8 24.8 11.528 101 101 0 2.9666 By MS/MS By MS/MS 1.1178 1.1935 40.8 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 24.8 0 16.8 32470000 16341000 16129000 22802000 10630000 12172000 0 0 0 9667900 5711100 3956700 1818 1056;6293 True;True 1070;6349 3478;20218;20219 4469;25995;25996 4469;25995 Q9NPD3 Q9NPD3 4 4 4 Exosome complex component RRP41 EXOSC4 sp|Q9NPD3|EXOS4_HUMAN Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 17.6 17.6 17.6 26.383 245 245 0 6.5056 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80307 0.84843 11.402 11 2 Leave out requantified 0.94881 0.80307 0.74795 0.98098 0.8209 0.79729 9.475 18.595 6.7234 4 3 4 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.6 11.8 17.6 267800000 145530000 122260000 101550000 51867000 49682000 68934000 38089000 30845000 97314000 55576000 41738000 1819 811;9818;13142;13581 True;True;True;True 821;9901;13263;13707 2672;2673;2674;32222;32223;32224;42936;42937;44359;44360;44361 3452;3453;3454;3455;41003;54475;54476;56262 3454;41003;54476;56262 Q9NPD8 Q9NPD8 6 6 6 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T UBE2T sp|Q9NPD8|UBE2T_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2T PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 3 5 4 3 5 4 3 5 44.7 44.7 44.7 22.521 197 197 0 20.231 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1102 1.1411 9.9357 11 4 Leave out requantified 1.1171 1.1565 1.1961 1.3104 1.2379 1.3768 24.664 5.8917 19.885 3 3 5 1 0 3 Median Leave out requantified Median 23.9 18.3 35 401590000 201310000 200280000 96944000 52942000 44002000 135040000 67526000 67511000 169600000 80840000 88764000 1820 1239;4109;5255;7419;12766;17980 True;True;True;True;True;True 1255;4152;5308;7482;12884;18140 4081;4082;4083;13371;16896;16897;24071;24072;41813;58636;58637;58638 5238;5239;5240;5241;5242;5243;17228;21679;21680;30722;30723;52984;74615 5238;17228;21679;30723;52984;74615 Q9NPF4 Q9NPF4 1 1 1 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OSGEP sp|Q9NPF4|OSGEP_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEP PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 5.1 5.1 5.1 36.426 335 335 0 4.0422 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 5.1 0 0 16238000 10139000 6099000 16238000 10139000 6099000 0 0 0 0 0 0 1821 16024 True 16168 52222 66507 66507 Q9NPI6 Q9NPI6 1 1 1 mRNA-decapping enzyme 1A DCP1A sp|Q9NPI6|DCP1A_HUMAN mRNA-decapping enzyme 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCP1A PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.6 2.6 2.6 63.278 582 582 0.00053079 2.6004 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.6 0 0 15228000 7583800 7644400 15228000 7583800 7644400 0 0 0 0 0 0 1822 10836 True 10928 35566 45071;45072 45072 Q9NQ29 Q9NQ29 8 3 3 Putative RNA-binding protein Luc7-like 1 LUC7L sp|Q9NQ29|LUC7L_HUMAN Putative RNA-binding protein Luc7-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUC7L PE=1 SV=1 1 8 3 3 7 8 6 2 3 2 2 3 2 21.3 8.6 8.6 43.727 371 371 0 23.568 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0162 1.0065 14.858 6 4 Median 1.0661 0.95438 0.83099 1.0753 0.95589 0.86697 1.9476 3.4245 24.963 2 2 2 2 1 1 Median Median Median 19.1 21.3 19.1 70681000 35436000 35245000 18252000 7889800 10363000 29721000 13771000 15950000 22708000 13775000 8932700 1823 307;406;9834;11157;12187;16172;16173;16513 False;True;True;True;False;False;False;False 308;409;9917;11250;12299;16316;16317;16659 964;965;966;1312;1313;1314;1315;1316;1317;32280;32281;32282;36591;39987;39988;39989;52706;52707;52708;52709;52710;52711;53924;53925;53926;53927;53928;53929 1270;1271;1272;1699;1700;1701;1702;1703;1704;41082;41083;41084;41085;41086;46365;50652;50653;50654;50655;50656;50657;67148;67149;67150;67151;67152;68706;68707;68708;68709;68710;68711;68712 1270;1700;41082;46365;50657;67148;67150;68712 Q9NQ55 Q9NQ55 5 5 5 Suppressor of SWI4 1 homolog PPAN sp|Q9NQ55|SSF1_HUMAN Suppressor of SWI4 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPAN PE=2 SV=1 1 5 5 5 3 2 4 3 2 4 3 2 4 9.9 9.9 9.9 53.193 473 473 0 14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88026 0.9054 10.761 9 2 Leave out requantified 0.95954 0.81186 0.82255 0.98573 0.81706 0.87856 8.4907 12.555 19.244 3 2 4 0 0 2 Leave out requantified Median Median 5.3 3.6 8 347200000 172520000 174680000 50720000 25481000 25238000 20370000 11333000 9036600 276110000 135710000 140410000 1824 11488;12433;15056;16921;17055 True;True;True;True;True 11588;12549;15193;17072;17207 37640;37641;37642;40804;40805;40806;49135;55322;55778;55779 47640;51699;51700;51701;51702;62464;70466;71058 47640;51702;62464;70466;71058 Q9NQ88 Q9NQ88 5 5 5 Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR TIGAR sp|Q9NQ88|TIGAR_HUMAN Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGAR PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 5 4 3 5 4 3 5 25.2 25.2 25.2 30.062 270 270 0 68.838 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3064 1.3194 19.399 15 5 Leave out requantified 1.3918 1.091 0.95289 1.3816 1.1606 1.0342 30.085 23.678 19.053 5 4 6 1 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 20.4 17 25.2 329790000 166040000 163750000 116840000 56017000 60820000 89680000 43284000 46396000 123280000 66741000 56535000 1825 3517;7785;12367;13156;14147 True;True;True;True;True 3556;7852;12482;13277;14277 11460;11461;11462;11463;11464;25283;25284;25285;25286;25287;40596;42979;42980;46230;46231;46232;46233 14744;14745;14746;14747;14748;14749;32311;32312;32313;32314;32315;32316;51434;54528;54529;58661;58662;58663;58664;58665 14749;32313;51434;54528;58664 Q9NQC3 Q9NQC3 5 5 5 Reticulon-4 RTN4 sp|Q9NQC3|RTN4_HUMAN Reticulon-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTN4 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 7.6 7.6 7.6 129.93 1192 1192 0 34.465 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0734 1.1628 33.92 18 8 Leave out requantified 0.81107 1.1819 0.94388 0.86162 1.2315 1.0473 39.533 55.974 28.788 5 6 7 1 4 3 Leave out requantified Median Leave out requantified 6.5 7.6 7.6 704970000 400970000 304000000 190760000 113690000 77062000 198200000 98601000 99597000 316010000 188670000 127340000 1826 1676;6508;7193;8932;18057 True;True;True;True;True 1699;6565;7253;9010;18218 5494;5495;5496;20854;20855;23195;23196;23197;23198;23199;29240;29241;29242;29243;29244;58866;58867;58868;58869;58870;58871 7109;7110;7111;7112;7113;26790;26791;29630;29631;29632;29633;29634;37256;37257;37258;37259;37260;37261;37262;37263;37264;74928;74929;74930;74931;74932;74933 7113;26791;29630;37257;74930 Q9NQG5 Q9NQG5 2 2 2 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B RPRD1B sp|Q9NQG5|RPR1B_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 9.5 9.5 9.5 36.899 326 326 0 7.4103 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0619 1.182 20.191 5 2 Median NaN 1.1586 0.97272 NaN 1.1897 1.0519 NaN 33.204 16.492 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 4.6 9.5 9.5 88417000 42371000 46047000 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235 0 10.273 By MS/MS By MS/MS 0.75195 0.77329 7.4105 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 10.2 0 4.3 20133000 11366000 8767800 9608100 4725400 4882700 0 0 0 10525000 6640200 3885000 1829 1452;6399 True;True 1471;6455 4747;20559 6132;26426 6132;26426 Q9NQT5 Q9NQT5 3 3 3 Exosome complex component RRP40 EXOSC3 sp|Q9NQT5|EXOS3_HUMAN Exosome complex component RRP40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC3 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 14.5 14.5 14.5 29.572 275 275 0 10.419 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1034 1.1757 15.354 4 2 Median NaN NaN 1.2267 NaN NaN 1.3431 NaN NaN 7.2553 1 1 2 0 0 2 Median Median Median 9.1 4 9.5 52985000 27167000 25818000 16996000 8520500 8475100 11443000 6654000 4789300 24546000 11992000 12553000 1830 1124;2730;5756 True;True;True 1140;2762;5810 3683;8974;18522;18523;18524 4714;11517;23851;23852;23853 4714;11517;23852 Q9NQW6 Q9NQW6 8 8 8 Actin-binding protein anillin ANLN sp|Q9NQW6|ANLN_HUMAN Anillin OS=Homo sapiens OX=9606 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6862;33697;33698;41355;41356 8826;8827;42765;42766;52408;52409 8827;42765;52408 Q9NR56;Q9NUK0;Q5VZF2 Q9NR56;Q9NUK0;Q5VZF2 2;1;1 2;1;1 2;1;1 Muscleblind-like protein 1;Muscleblind-like protein 3;Muscleblind-like protein 2 MBNL1;MBNL3;MBNL2 sp|Q9NR56|MBNL1_HUMAN Muscleblind-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MBNL1 PE=1 SV=2;sp|Q9NUK0|MBNL3_HUMAN Muscleblind-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MBNL3 PE=1 SV=2;sp|Q5VZF2|MBNL2_HUMAN Muscleblind-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 3 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 4.6 4.6 4.6 41.817 388 388;354;373 0.0059761 1.921 By MS/MS By MS/MS 1.401 1.5018 12.251 4 0 Leave out requantified NaN 1.2778 1.536 NaN 1.3365 1.6876 NaN 9.0778 15.424 0 2 2 0 0 0 Median Median Median 0 4.6 4.6 54808000 22745000 32063000 0 0 0 27474000 12134000 15340000 27334000 10611000 16722000 1839 6706;12045 True;True 6763;12155 21424;21425;39538;39539 27480;50037;50038 27480;50037 Q9NRN7 Q9NRN7 1 1 1 L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase AASDHPPT sp|Q9NRN7|ADPPT_HUMAN L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AASDHPPT PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 4.9 4.9 4.9 35.776 309 309 0 3.3874 By MS/MS By MS/MS 0.88447 0.90515 17.501 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 4.9 4.9 0 25109000 12635000 12474000 14370000 7190300 7179900 10739000 5444900 5293800 0 0 0 1840 7195 True 7255 23201;23202 29636;29637 29636 Q9NRV9 Q9NRV9 2 2 2 Heme-binding protein 1 HEBP1 sp|Q9NRV9|HEBP1_HUMAN Heme-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEBP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 13.8 13.8 13.8 21.097 189 189 0 4.2536 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0166 1.0776 6.0714 5 2 Median 1.0477 NaN 0.99228 1.0924 NaN 1.0687 5.6415 NaN 10.523 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 13.8 8.5 13.8 229480000 111520000 117960000 88207000 41382000 46825000 65354000 34196000 31158000 75922000 35942000 39981000 1841 104;4892 True;True 105;4940 330;331;15756;15757;15758 438;439;20226;20227;20228;20229;20230;20231 438;20227 Q9NRW7 Q9NRW7 2 2 2 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 VPS45 sp|Q9NRW7|VPS45_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 45 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS45 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 4.6 4.6 4.6 65.076 570 570 0 5.193 By matching By MS/MS By MS/MS 1.016 1.0126 8.4897 5 0 Leave out requantified NaN 1.0502 0.93778 NaN 1.0176 0.9392 NaN 29.064 2.1486 1 2 2 0 0 0 Median Median Median 2.1 4.6 4.6 45596000 22359000 23237000 8399800 3313600 5086200 18213000 8690000 9523300 18983000 10355000 8627700 1842 13816;15115 True;True 13944;15254 45087;45088;49322;49323;49324 57172;57173;62728;62729;62730 57173;62728 Q9NRX1 Q9NRX1 3 3 3 RNA-binding protein PNO1 PNO1 sp|Q9NRX1|PNO1_HUMAN RNA-binding protein PNO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PNO1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 16.3 16.3 16.3 27.924 252 252 0 11.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0534 1.1228 30.776 8 0 Leave out requantified 1.3601 1.12 0.9907 1.3825 1.1637 1.0833 40.07 36.781 17.833 2 3 3 0 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 11.9 16.3 16.3 117780000 51373000 66409000 35669000 16288000 19381000 40548000 14813000 25735000 41565000 20273000 21293000 1843 7613;12392;16521 True;True;True 7677;12507;16667 24697;24698;24699;40671;40672;40673;53967;53968 31513;31514;31515;51528;51529;51530;51531;51532;51533;68768;68769 31513;51533;68769 Q9NRY4 Q9NRY4 7 7 7 Rho GTPase-activating protein 35 ARHGAP35 sp|Q9NRY4|RHG35_HUMAN Rho GTPase-activating protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP35 PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 2 5 4 2 5 4 2 5 5.5 5.5 5.5 170.51 1499 1499 0 12.593 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84145 0.89006 9.626 8 2 Leave out requantified 1.362 0.89369 0.75816 1.4216 0.93314 0.8315 104.96 29.862 31.464 3 2 3 1 0 1 Median Median Median 3 1.2 3.7 83710000 41957000 41753000 28642000 11777000 16864000 22864000 11429000 11435000 32204000 18750000 13454000 1844 3494;7781;9520;10513;11699;11987;13063 True;True;True;True;True;True;True 3533;7848;9601;10603;11803;12095;13183 11380;25274;25275;25276;31230;31231;31232;34575;38325;39310;42725 14634;32300;32301;39763;39764;39765;39766;43845;48543;49725;54184 14634;32300;39766;43845;48543;49725;54184 Q9NRZ9 Q9NRZ9 2 2 2 Lymphoid-specific helicase HELLS sp|Q9NRZ9|HELLS_HUMAN Lymphoid-specific helicase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HELLS PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2.5 2.5 2.5 97.073 838 838 0.0020608 2.2498 By MS/MS By MS/MS 1.1941 1.2382 28.757 3 1 Median 1.2073 NaN NaN 1.2579 NaN NaN 2.2328 NaN NaN 2 1 0 1 0 0 Median Median Median 2.5 1 0 25147000 12475000 12671000 19269000 9438200 9831100 5877300 3037200 2840100 0 0 0 1845 4990;16620 True;True 5042;16769 16084;16085;54319 20651;69223 20651;69223 Q9NSD9 Q9NSD9 14 14 14 Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit FARSB sp|Q9NSD9|SYFB_HUMAN Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FARSB PE=1 SV=3 1 14 14 14 11 12 12 11 12 12 11 12 12 25.1 25.1 25.1 66.115 589 589 0 55.25 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92773 1.0151 12.281 35 10 Leave out requantified 1.0036 0.93455 0.92935 1.0623 1.0059 1.0377 10.238 12.176 17.365 11 12 12 6 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.9 21.2 21.7 1798000000 866520000 931490000 507670000 235570000 272090000 631220000 308160000 323060000 659120000 322790000 336330000 1846 74;1325;2615;2888;2944;4598;9606;9802;9903;11811;12084;15818;16022;17690 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 75;1342;2645;2921;2977;4645;9687;9885;9986;11915;12195;15962;16166;17847 239;240;241;4342;4343;8565;8566;8567;9450;9451;9607;14880;14881;14882;31479;31480;31481;32165;32166;32511;32512;32513;38688;38689;38690;39678;39679;39680;39681;51589;51590;51591;52217;52218;52219;52220;57702 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0239 1.0978 8.8528 6 3 Median NaN 1.0538 1.0361 NaN 1.088 1.111 NaN 8.5225 0.42682 1 3 2 1 1 1 Median Median Median 10.4 19.1 15.2 92722000 46802000 45920000 15614000 8939600 6674500 42593000 19562000 23032000 34515000 18301000 16214000 1848 5341;5821;16529 True;True;True 5394;5875;16675 17183;17184;17185;18707;18708;18709;53993 22063;22064;22065;24080;24081;24082;24083;24084;68803 22064;24082;68803 Q9NTI5 Q9NTI5 13 11 11 Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B PDS5B sp|Q9NTI5|PDS5B_HUMAN Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDS5B PE=1 SV=1 1 13 11 11 8 7 6 6 6 5 6 6 5 11.1 9.7 9.7 164.67 1447 1447 0 19.188 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.029 1.0697 51.77 15 3 Leave out requantified 1.0182 1.0142 1.008 1.0873 1.043 1.0905 79.319 26.101 38.224 6 6 3 3 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.3 5.4 5.4 234800000 109760000 125040000 129560000 61272000 68287000 72211000 32460000 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3 3 3 Protein SDA1 homolog SDAD1 sp|Q9NVU7|SDA1_HUMAN Protein SDA1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDAD1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.4 4.4 4.4 79.87 687 687 0 4.6147 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77531 0.85242 27.391 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 1.6 1.5 1.3 45734000 24796000 20938000 10456000 5371400 5085100 18876000 10392000 8484500 16401000 9032600 7368800 1872 6239;15584;16887 True;True;True 6295;15727;17038 20054;50899;55212 25804;64783;70340 25804;64783;70340 Q9NW13 Q9NW13 5 5 5 RNA-binding protein 28 RBM28 sp|Q9NW13|RBM28_HUMAN RNA-binding protein 28 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM28 PE=1 SV=3 1 5 5 5 2 2 3 2 2 3 2 2 3 7.8 7.8 7.8 85.737 759 759 0 14.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77845 0.9063 28.987 7 2 Leave out requantified 0.65027 1.005 0.68643 0.66289 1.0836 0.83833 25.72 14.245 26.24 2 2 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified 3.3 3.2 4.9 46596000 28034000 18561000 14275000 8361200 5913800 11871000 6990000 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MS/MS 0.99545 1.0793 7.2884 11 5 Leave out requantified 0.9968 0.94322 0.97857 1.0746 1.0253 1.0493 57.73 9.1249 14.712 4 5 2 2 2 1 Median Leave out requantified Median 6.7 10.4 3.2 274570000 144340000 130230000 112960000 63732000 49226000 92316000 42710000 49606000 69296000 37894000 31403000 1875 3957;5556;5845;9967;11001;13447;14232;15944 True;True;True;True;True;True;True;True 3998;5609;5899;10050;11093;13573;14362;16088 12888;17874;18774;32722;32723;36128;36129;43942;46510;46511;46512;51975 16625;22997;24160;41628;41629;45801;55764;59009;66164 16625;22997;24160;41629;45801;55764;59009;66164 Q9NWB6 Q9NWB6 3 3 3 Arginine and glutamate-rich protein 1 ARGLU1 sp|Q9NWB6|ARGL1_HUMAN Arginine and glutamate-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARGLU1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 8.8 8.8 8.8 33.216 273 273 0 3.2149 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99275 1.0069 31.068 5 0 Leave out requantified 0.90669 NaN 0.9804 0.89414 NaN 1.0673 37.721 NaN 8.5524 3 0 2 0 0 0 Leave out requantified 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5504;5591;5871;6580;9370;9757;16744 17527;17528;17820;18695;18696;18697;20891;20892;20893;30477;30478;31720;54250;54251 22506;22920;24062;24063;26840;26841;26842;38841;38842;40345;69141;69142;69143;69144 22506;22920;24063;26841;38841;40345;69144 Q9NY93 Q9NY93 1 1 1 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 DDX56 sp|Q9NY93|DDX56_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX56 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.6 2.6 2.6 61.589 547 547 0.0010438 2.3819 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.6 0 2.6 3463700 3463700 0 0 0 0 0 0 0 3463700 3463700 0 1888 16104 True 16248 52480;52481 66828;66829 66829 Q9NYB9 Q9NYB9 4 2 2 Abl interactor 2 ABI2 sp|Q9NYB9|ABI2_HUMAN Abl interactor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABI2 PE=1 SV=1 1 4 2 2 1 2 4 0 0 2 0 0 2 11.1 6.2 6.2 55.663 513 513 0.0005291 2.5677 By matching By matching By MS/MS 1.2475 1.3584 46.81 2 1 Median NaN NaN 1.2475 NaN NaN 1.3584 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matching By MS/MS By MS/MS 0.8179 0.9236 51.311 6 3 Median NaN 0.93937 1.2221 NaN 1.0746 1.4046 NaN 28.438 94.939 1 3 2 0 2 1 Median Median Median 3.1 8.5 8.5 121010000 61333000 59682000 17188000 9987400 7201000 57167000 31199000 25968000 46659000 20146000 26513000 1891 12783;17855 True;True 12901;18014 41859;41860;41861;58245;58246;58247 53042;53043;74151;74152;74153 53042;74152 Q9NYU2 Q9NYU2 2 2 2 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 UGGT1 sp|Q9NYU2|UGGG1_HUMAN UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UGGT1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 1.6 1.6 1.6 177.19 1555 1555 0 5.927 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.6 0 0 9339000 3581500 5757500 9339000 3581500 5757500 0 0 0 0 0 0 1892 3927;7857 True;True 3967;7924 12767;25526 16440;32629 16440;32629 Q9NZB2 Q9NZB2 6 6 6 Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 FAM120A sp|Q9NZB2|F120A_HUMAN Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM120A PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 2 3 5 2 3 5 2 3 8.5 8.5 8.5 121.89 1118 1118 0 17.533 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1816 1.2661 19.148 7 1 Leave out requantified 1.5808 1.1264 1.1722 1.6455 1.1932 1.2795 43.851 20.454 26.873 2 2 3 1 0 0 Median Median Leave out requantified 6.7 3 4.2 100540000 47751000 52793000 22227000 6520800 15706000 34135000 17988000 16147000 44182000 23242000 20940000 1893 358;4001;11848;12103;13134;14457 True;True;True;True;True;True 361;4043;11952;12214;13255;14591 1156;13020;38812;39736;39737;42913;42914;42915;47262;47263 1512;1513;16781;49126;50303;50304;54448;54449;54450;59994;59995 1513;16781;49126;50303;54450;59994 Q9NZI8;Q9Y6M1 Q9NZI8 6;1 5;0 5;0 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 IGF2BP1 sp|Q9NZI8|IF2B1_HUMAN Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGF2BP1 PE=1 SV=2 2 6 5 5 5 5 4 4 4 3 4 4 3 13.3 11.1 11.1 63.48 577 577;599 0 15.011 By MS/MS By MS/MS 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Disco-interacting protein 2 homolog B DIP2B sp|Q9P265|DIP2B_HUMAN Disco-interacting protein 2 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIP2B PE=1 SV=3 2 5 5 5 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4.4 4.4 4.4 171.49 1576 1576;1571 0 11.821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79811 0.84276 72.451 8 3 Leave out requantified 1.2218 1.0028 0.48065 1.2708 1.0582 0.51079 36.767 31.451 70.067 4 2 2 3 0 0 Median Median Median 3.6 1.9 2.2 106240000 54339000 51898000 45331000 19878000 25452000 34808000 17332000 17475000 26099000 17129000 8970400 1906 1242;3140;8158;13634;14029 True;True;True;True;True 1258;3176;8230;13760;14159 4087;10271;26531;26532;44523;45835;45836;45837;45838 5247;13157;33857;56456;58197;58198;58199;58200 5247;13157;33857;56456;58200 Q9P287 Q9P287 3 3 3 BRCA2 and CDKN1A-interacting protein BCCIP sp|Q9P287|BCCIP_HUMAN BRCA2 and CDKN1A-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCCIP PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 3 7.6 7.6 7.6 35.979 314 314 0 3.9286 By matching By matching By MS/MS 0.96946 1.072 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Median Median 6.2 6.2 6.2 27905000 13485000 14420000 9027700 2784800 6242900 10956000 5613000 5343400 7920400 5086700 2833700 1916 12180 True 12292 39967;39968;39969 50625;50626;50627 50625 Q9UBK8 Q9UBK8 5 5 5 Methionine synthase reductase MTRR sp|Q9UBK8|MTRR_HUMAN Methionine synthase reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTRR PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 9.9 9.9 9.9 77.673 698 698 0 18.681 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89713 0.93913 0.99946 11 7 Leave out requantified 0.91121 1.1718 0.8868 0.9224 1.2472 0.93959 6.0296 53.171 67.174 3 4 4 2 3 2 Median Median Median 6.4 7.3 7.3 243460000 126960000 116500000 70179000 38000000 32178000 93647000 48561000 45085000 79630000 40397000 39232000 1917 1046;2048;3080;6551;18131 True;True;True;True;True 1060;2074;3115;6608;18292 3449;3450;3451;6746;6747;10072;10073;20979;59096;59097;59098 4435;4436;4437;4438;8677;8678;12909;12910;26949;75221;75222;75223;75224;75225 4437;8678;12909;26949;75222 Q9UBP6 Q9UBP6 6 6 6 tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase METTL1 sp|Q9UBP6|TRMB_HUMAN tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 4 4 5 4 4 5 4 4 26.8 26.8 26.8 31.471 276 276 0 8.4906 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1983 1.2473 43.463 13 1 Leave out requantified 1.0409 1.0476 0.86092 1.0805 1.0858 0.96029 46.67 45.153 38.131 5 4 4 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.4 19.9 19.9 264770000 122430000 142340000 67077000 28826000 38251000 95322000 42986000 52336000 102370000 50616000 51755000 1918 11212;11754;12271;13362;17017;17018 True;True;True;True;True;True 11307;11858;12385;13486;17169;17170 36770;36771;36772;38501;38502;38503;40266;40267;40268;43648;55659;55660;55661 46582;46583;48755;51022;55397;70902;70903 46583;48755;51022;55397;70902;70903 Q9UBQ0 Q9UBQ0 5 5 5 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 VPS29 sp|Q9UBQ0|VPS29_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS29 PE=1 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(adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6 TRMT6 sp|Q9UJA5|TRM6_HUMAN tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRMT6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6.6 6.6 6.6 55.799 497 497 0 6.7033 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80863 0.81291 40.991 4 0 Leave out requantified 0.7672 NaN NaN 0.78186 NaN NaN 35.484 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.6 3.4 3.4 73525000 36350000 37175000 26664000 14458000 12206000 22757000 10124000 12633000 24104000 11768000 12336000 1949 5837;14327 True;True 5891;14460 18752;46821;46822;46823 24135;59410;59411;59412;59413 24135;59411 Q9UJU6 Q9UJU6 2 2 2 Drebrin-like protein DBNL sp|Q9UJU6|DBNL_HUMAN Drebrin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBNL PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 7.4 7.4 7.4 48.207 430 430 0.0020725 2.3102 By MS/MS By MS/MS 0.59894 0.61796 37.077 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 4.7 2.8 7573300 4411800 3161500 0 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polypeptide 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF3C4 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 4 4 4 4 4 4 4 4 11.1 11.1 11.1 91.981 822 822 0 22.533 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1416 1.1909 11.479 11 3 Leave out requantified 1.1939 1.2576 0.96129 1.1909 1.2851 1.0207 9.5147 22.264 18.06 4 4 3 1 2 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.2 6.6 6.8 164870000 78470000 86401000 53376000 22887000 30489000 50479000 22153000 28326000 61016000 33430000 27586000 1954 4250;7934;11202;12852;13188;13962 True;True;True;True;True;True 4293;8002;11297;12970;13309;14091 13803;25800;36740;42084;42085;42086;43076;43077;43078;45604;45605;45606 17800;32978;46548;53341;53342;53343;54650;54651;54652;57901 17800;32978;46548;53343;54650;57901 Q9UKS6 Q9UKS6 6 6 6 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 PACSIN3 sp|Q9UKS6|PACN3_HUMAN Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACSIN3 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 4 4 6 4 4 6 4 4 17.9 17.9 17.9 48.486 424 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sapiens OX=9606 GN=PSME2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 13 13 13 27.401 239 239 0.007913 1.8854 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 0 13 9189100 4048900 5140200 0 0 0 0 0 0 9189100 4048900 5140200 1959 2149;7811 True;True 2176;7878 7022;25383 9038;32450 9038;32450 Q9ULC4 Q9ULC4 8 8 8 Malignant T-cell-amplified sequence 1 MCTS1 sp|Q9ULC4|MCTS1_HUMAN Malignant T-cell-amplified sequence 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCTS1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 5 7 6 5 7 6 5 7 58 58 58 20.555 181 181 0 52.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8855 0.91672 21.991 22 6 Leave out requantified 1.0893 1.0358 0.79182 1.1396 1.0836 0.88918 10.314 27.112 21.5 7 6 9 2 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.9 32 51.4 874330000 441060000 433270000 325180000 164930000 160250000 187840000 87899000 99939000 361310000 188230000 173080000 1960 3754;4346;5530;11077;11447;12124;12673;17995 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non-ATPase regulatory subunit 13 PSMD13 sp|Q9UNM6|PSD13_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD13 PE=1 SV=2 1 12 12 12 9 8 11 9 8 11 9 8 11 39.1 39.1 39.1 42.945 376 376 0 44.775 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9879 1.0006 16.054 26 5 Leave out requantified 1.1055 0.97953 0.81228 1.18 1.0602 0.90874 19.18 17.624 15.678 9 8 9 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.7 25.8 35.9 916430000 477300000 439130000 370930000 179990000 190940000 250020000 132630000 117390000 295480000 164680000 130800000 1973 1021;2657;2877;4581;5571;6645;8347;11044;12917;12947;14296;14959 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1034;2687;2910;4628;5624;6702;8420;11136;13035;13066;14427;15095 3342;3343;3344;8689;8690;8691;9418;14831;14832;14833;17927;17928;17929;21248;21249;27183;27184;27185;36257;36258;42299;42300;42301;42387;42388;46724;46725;46726;46727;48833 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Q9Y3C1 Q9Y3C1 3 3 3 Nucleolar protein 16 NOP16 sp|Q9Y3C1|NOP16_HUMAN Nucleolar protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP16 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 16.9 16.9 16.9 21.188 178 178 0 8.7888 By matching By MS/MS By MS/MS 1.1837 1.2844 37.859 6 1 Leave out requantified 1.2598 0.82734 1.0613 1.2904 0.86491 1.1753 62.292 33.805 25.311 2 2 2 0 1 0 Median Median Median 10.7 12.4 10.7 150410000 78698000 71711000 43139000 25377000 17762000 52512000 25597000 26915000 54758000 27724000 27034000 2015 1081;12366;17967 True;True;True 1095;12481;18127 3549;3550;3551;40594;40595;58596 4557;4558;51433;74562 4558;51433;74562 Q9Y3C4 Q9Y3C4 3 3 3 EKC/KEOPS complex subunit TPRKB TPRKB sp|Q9Y3C4|TPRKB_HUMAN EKC/KEOPS complex subunit TPRKB OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPRKB PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 28 28 28 19.661 175 175 0 13.129 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91434 0.98349 13.597 7 3 Leave out requantified 1.0718 0.97299 0.91434 1.1246 0.99418 0.98349 30.833 13.349 13.597 3 2 2 2 1 0 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Cytosolic iron-sulfur assembly component 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAO2B PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 13.5 13.5 13.5 17.663 163 163 0 8.0601 By MS/MS By MS/MS 0.78386 0.79966 2.7354 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 13.5 13.5 31545000 17773000 13772000 0 0 0 14644000 8608500 6035700 16900000 9164500 7735800 2018 13854 True 13983 45255;45256 57455;57456 57455 Q9Y3D6 Q9Y3D6 1 1 1 Mitochondrial fission 1 protein FIS1 sp|Q9Y3D6|FIS1_HUMAN Mitochondrial fission 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIS1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.2 7.2 7.2 16.937 152 152 0 5.4959 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64348 0.66476 26.435 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 7.2 7.2 7.2 21184000 13048000 8135600 4343400 1929200 2414200 9809700 6146200 3663400 7030900 4973000 2057900 2019 6214 True 6270 19984;19985;19986 25729;25730;25731 25730 Q9Y3D8 Q9Y3D8 3 3 3 Adenylate kinase isoenzyme 6 AK6 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requantified Leave out requantified 43.7 45.4 38.3 2160100000 1096100000 1064000000 816140000 412340000 403790000 769260000 394730000 374530000 574710000 289010000 285700000 2021 157;1954;3642;3923;5432;5711;6101;8454;11017;12629;12722;13801;15867;17432;17695 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 158;1980;3681;3963;5485;5764;6157;8527;11109;12745;12840;13929;16011;17587;17852 487;488;489;6440;6441;6442;6443;6444;11863;11864;11865;12753;12754;12755;12756;12757;12758;17474;17475;17476;17477;18393;19562;19563;27525;27526;27527;36176;36177;36178;36179;36180;41388;41389;41693;45037;45038;45039;45040;45041;51736;56933;57715;57716;57717;57718;57719 631;632;633;634;635;636;8296;8297;8298;8299;8300;8301;8302;15279;15280;15281;16422;16423;16424;16425;16426;16427;16428;22434;22435;22436;22437;22438;22439;22440;23688;25149;25150;35128;35129;35130;35131;45853;45854;45855;45856;45857;52444;52445;52827;57116;57117;57118;57119;57120;57121;57122;65856;72501;73449;73450;73451;73452;73453;73454;73455 634;8297;15281;16422;22439;23688;25149;35129;45856;52444;52827;57119;65856;72501;73450 Q9Y3I0 Q9Y3I0 21 21 21 tRNA-splicing ligase RtcB homolog RTCB sp|Q9Y3I0|RTCB_HUMAN tRNA-splicing ligase RtcB homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTCB PE=1 SV=1 1 21 21 21 18 19 19 18 19 19 18 19 19 46.3 46.3 46.3 55.21 505 505 0 168.98 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88766 0.95987 12.237 76 20 Leave out requantified 0.90793 0.85988 0.89185 0.96087 0.93474 0.97166 10.461 10.723 20.391 24 27 25 6 8 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.6 46.1 40.6 5601700000 2940000000 2661700000 1933100000 1017900000 915170000 1866700000 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15896;15897;15898;15899;15900;15901;15902;15903;15904;15905;15906;15907;15908;18352;24722;24882;24883;24884;24885;24886;24887;26038;26039;26040;26041;26042;26043;26044;26045;26046;26047;26048;26049;26050;28000;28001;28002;30630;30631;38351;43057;43058;43059;45563;45564;45565;45566;45567;45568;47110;47111;47112;49340;49341;49342;49343;51301;51302;51303;51304;51305;51306;51307;51308;51309;51310;51311;51312;51313;51314;51315;52774;52775;52776;52777;52778;52779;52780;52781;52782;52783;52784;52785;55586;55587;61597;61598;61599;61600;61601;61602;64754;64755;64756;64757;64758;64759;64760;64761;64762;64763;64764;67828;67829;67830;67831;67832;67833;67834;67835;67836;67837;67838;67839;68232;68233;68234;68235;68236;68237;68238;68239;68240 15906;18352;24722;24883;26044;28001;30631;38351;43058;45563;47110;49343;51304;51314;52775;55586;61600;64755;64761;67835;68236 Q9Y3S2 Q9Y3S2 4 4 4 Zinc finger protein 330 ZNF330 sp|Q9Y3S2|ZN330_HUMAN Zinc finger protein 330 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF330 PE=1 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ADP-ribose glycohydrolase OARD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OARD1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 16.4 16.4 16.4 17.025 152 152 0.0010411 2.3589 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96281 1.0194 6.0148 5 1 Leave out requantified NaN 0.96281 1.0636 NaN 1.0194 1.1702 NaN 6.0148 23.895 1 2 2 0 0 1 Median Median Median 8.6 16.4 16.4 69560000 35484000 34076000 14817000 7352400 7464900 31324000 15450000 15874000 23418000 12682000 10737000 2035 1347;15029 True;True 1364;15166 4406;4407;49065;49066;49067 5676;5677;62361;62362;62363 5677;62363 Q9Y570 Q9Y570 6 6 6 Protein phosphatase methylesterase 1 PPME1 sp|Q9Y570|PPME1_HUMAN Protein phosphatase methylesterase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPME1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 21.5 21.5 21.5 42.315 386 386 0 18.499 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0379 1.0585 11.78 16 2 Leave out requantified 1.0069 1.0379 0.99235 1.0585 1.0491 1.1043 24.037 7.7763 18.092 6 5 5 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.5 15.5 19.2 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YTH domain-containing family protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDF2 PE=1 SV=2 1 4 1 1 3 4 3 0 1 1 0 1 1 5.9 1.6 1.6 62.333 579 579 0 3.5424 By matching By MS/MS By MS/MS 0.57005 0.64272 29.093 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.3 5.9 4.7 35524000 20945000 14579000 0 0 0 16344000 10257000 6086800 19180000 10688000 8492300 2038 2188;3009;12526;14864 False;False;True;False 2215;3044;12642;14999 7134;7135;9850;9851;9852;41108;41109;48503;48504;48505 9199;9200;12639;12640;12641;12642;12643;52080;52081;61612;61613;61614 9200;12642;52081;61614 Q9Y5B9 Q9Y5B9 3 3 3 FACT complex subunit SPT16 SUPT16H sp|Q9Y5B9|SP16H_HUMAN FACT complex subunit SPT16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUPT16H PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 3.1 3.1 3.1 119.91 1047 1047 0 7.2088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72385 0.76133 33.814 6 2 Leave out requantified 0.64448 0.78026 0.67609 0.66997 0.80593 0.73595 39.417 29.39 20.455 2 2 2 0 0 2 Median Median Median 2.4 3.1 2.4 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carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UCHL5 PE=1 SV=3 1 8 8 8 6 7 8 6 7 8 6 7 8 33.4 33.4 33.4 37.606 329 329 0 44.161 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2447 1.3278 14.698 17 6 Leave out requantified 1.34 1.2206 1.1134 1.4145 1.2909 1.2226 12.825 26.289 15.374 5 6 6 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.8 30.1 33.4 462110000 200420000 261690000 133140000 51885000 81253000 155530000 70744000 84782000 173440000 77790000 95652000 2041 3755;5685;6257;9431;12130;13044;15390;17583 True;True;True;True;True;True;True;True 3795;5738;6313;9512;12241;13163;15531;17738 12204;12205;18301;18302;18303;20113;30954;30955;30956;39811;39812;39813;42671;42672;42673;50288;50289;50290;57360;57361;57362 15752;15753;15754;23574;25866;39435;39436;39437;50406;50407;50408;54108;54109;54110;64008;64009;64010;64011;64012;73009;73010;73011 15754;23574;25866;39435;50408;54110;64010;73009 Q9Y5K6 Q9Y5K6 7 7 7 CD2-associated protein CD2AP 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11088;11089;11090;13428;13429;16314;16315;16316;16326;16327;16328;16687;16688;16689;18384;18385;21801;21802;21803;25231;25232;25233;34406;34407;43247;43248;43249 14264;14265;14266;17297;17298;20949;20950;20951;20952;20953;20966;20967;20968;21415;21416;21417;21418;21419;23679;23680;27975;27976;27977;27978;27979;32246;32247;32248;43629;43630;54883;54884;54885;54886;54887;54888;54889 14264;17298;20949;20966;21415;23679;27977;32246;43630;54887 Q9Y618 Q9Y618 3 3 3 Nuclear receptor corepressor 2 NCOR2 sp|Q9Y618|NCOR2_HUMAN Nuclear receptor corepressor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCOR2 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 0 1 2 0 1 2 0 1 1.6 1.6 1.6 273.65 2514 2514 0 6.444 By MS/MS By MS/MS 1.0435 1.0639 22.405 3 1 Plateau 0.99635 NaN NaN 1.0228 NaN NaN 19.53 NaN NaN 2 0 1 0 0 1 Median Median Median 1.1 0 0.4 37216000 19660000 17556000 30082000 15337000 14745000 0 0 0 7134000 4323200 2810800 2057 13881;14515;14589 True;True;True 14010;14649;14723 45343;47434;47650 57570;60207;60495 57570;60207;60495 Q9Y678 Q9Y678 18 18 15 Coatomer subunit gamma-1 COPG1 sp|Q9Y678|COPG1_HUMAN Coatomer subunit gamma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPG1 PE=1 SV=1 1 18 18 15 17 13 14 17 13 14 14 10 12 23.9 23.9 20.1 97.717 874 874 0 93.553 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0859 1.1282 25.364 52 13 Leave out requantified 1.4866 0.98126 0.97283 1.5498 0.98935 1.0987 22.082 21.968 17.261 20 14 18 5 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.9 16.7 17.7 1217500000 609150000 608310000 510110000 245780000 264330000 372070000 191380000 180690000 335280000 171990000 163290000 2058 750;816;1956;2949;4284;5196;6311;7912;12539;12816;13570;13959;14795;15107;15228;16399;17360;17425 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 760;826;1982;2982;4330;5249;6367;7979;12655;12934;13696;14088;14930;15246;15368;16545;17515;17580 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MS/MS By MS/MS 1.1076 1.2653 24.922 21 5 Leave out requantified 1.2758 0.9731 1.1063 1.3397 1.0393 1.2643 14.491 24.472 26.562 8 6 7 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.8 25.3 34 548230000 260020000 288210000 224090000 104780000 119310000 149510000 70413000 79097000 174630000 84822000 89808000 2059 2158;3520;4668;5174;6878;9370;12202;15037 True;True;True;True;True;True;True;True 2185;3559;4716;5227;6936;9451;12314;15174 7044;7045;7046;11472;11473;11474;15095;16654;16655;16656;16657;21977;30774;30775;40035;40036;40037;40038;40039;40040;40041;49087 9068;9069;9070;9071;9072;9073;9074;14759;14760;19426;21380;21381;21382;21383;21384;21385;28204;39215;39216;39217;50708;50709;50710;50711;50712;50713;50714;50715;62405 9068;14760;19426;21382;28204;39216;50711;62405 Q9Y6A4 Q9Y6A4 5 5 5 Cilia- and flagella-associated protein 20 CFAP20 sp|Q9Y6A4|CFA20_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP20 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 3 4 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