Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides shp1 Peptides shp2 Peptides shp3 Peptides shp4 Razor + unique peptides shp1 Razor + unique peptides shp2 Razor + unique peptides shp3 Razor + unique peptides shp4 Unique peptides shp1 Unique peptides shp2 Unique peptides shp3 Unique peptides shp4 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type shp1 Identification type shp2 Identification type shp3 Identification type shp4 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L shp1 Ratio H/L shp2 Ratio H/L shp3 Ratio H/L shp4 Ratio H/L normalized shp1 Ratio H/L normalized shp2 Ratio H/L normalized shp3 Ratio H/L normalized shp4 Ratio H/L variability [%] shp1 Ratio H/L variability [%] shp2 Ratio H/L variability [%] shp3 Ratio H/L variability [%] shp4 Ratio H/L count shp1 Ratio H/L count shp2 Ratio H/L count shp3 Ratio H/L count shp4 Ratio H/L iso-count shp1 Ratio H/L iso-count shp2 Ratio H/L iso-count shp3 Ratio H/L iso-count shp4 Ratio H/L type shp1 Ratio H/L type shp2 Ratio H/L type shp3 Ratio H/L type shp4 Sequence coverage shp1 [%] Sequence coverage shp2 [%] Sequence coverage shp3 [%] Sequence coverage shp4 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity shp1 Intensity L shp1 Intensity H shp1 Intensity shp2 Intensity L shp2 Intensity H shp2 Intensity shp3 Intensity L shp3 Intensity H shp3 Intensity shp4 Intensity L shp4 Intensity H shp4 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions A0A024RBG1;Q9NZJ9 A0A024RBG1;Q9NZJ9 1;1 1;1 1;1 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2 NUDT4 sp|A0A024RBG1|NUD4B_HUMAN Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase NUDT4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDT4B PE=3 SV=1;sp|Q9NZJ9|NUDT4_HUMAN Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDT4 PE=1 SV=2 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 7.7 7.7 7.7 20.434 181 181;180 0 6.8037 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 7.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13746 True 13912 58246 73292 73292 A0AVT1 A0AVT1 5 5 5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 UBA6 sp|A0AVT1|UBA6_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA6 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 4 6.2 6.2 6.2 117.97 1052 1052 0 11.658 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.1609 1.1725 29.531 11 2 Leave out requantified 1.2779 1.0356 0.87047 1.1624 1.3129 1.046 0.96104 1.069 47.711 4.2915 25.535 28.194 2 2 3 4 0 0 1 1 Median Median Median Leave out requantified 2.8 2.1 3 4.3 202310000 97704000 104610000 58092000 26712000 31380000 38790000 19032000 19759000 66974000 33946000 33028000 38454000 18013000 20441000 1 705;3437;9604;12508;17359 True;True;True;True;True 713;3483;9707;12661;17566 3018;3019;14619;14620;40930;53286;53287;73704;73705;73706;73707 3935;18828;51756;67039;67040;92999;93000;93001 3935;18828;51756;67040;93000 A0FGR8 A0FGR8 3 3 3 Extended synaptotagmin-2 ESYT2 sp|A0FGR8|ESYT2_HUMAN Extended synaptotagmin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESYT2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 0 0 3 2 0 0 3 2 0 0 4.2 4.2 4.2 102.36 921 921 0.00057241 4.8491 By MS/MS By MS/MS 0.83067 0.89339 21.128 4 0 Leave out requantified 0.74686 0.92388 NaN NaN 0.83546 0.95535 NaN NaN 1.0389 41.216 NaN NaN 2 2 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.2 2.8 0 0 18782000 9791200 8990300 10622000 5772900 4849300 8159300 4018300 4141000 0 0 0 0 0 0 2 4492;5420;10091 True;True;True 4549;5485;10197 19047;19048;22758;22759;43038 24501;29081;54320 24501;29081;54320 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9 8 11 10 20.7 20.7 20.7 101.58 911 911;1133 0 89.366 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86782 0.82643 16.687 40 18 Leave out requantified 0.76804 0.91334 0.76304 0.95229 0.81178 0.88758 0.82675 0.92346 1.4768 16.866 19.593 17.951 9 8 11 12 6 2 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.7 9.4 16.4 15.1 1000300000 522790000 477490000 234750000 124750000 110000000 237960000 126010000 111950000 297820000 161790000 136030000 229740000 110240000 119500000 4 783;5025;5774;6607;6733;7845;9962;13700;14069;14177;14788;15012;15097;15761;17261 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 793;5088;5839;6679;6805;7927;10068;13864;14241;14349;14967;15196;15285;15954;17466 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1.4151 NaN NaN NaN 43.072 0 1 1 3 0 0 0 1 Median Median Median Plateau 0 1.1 1.1 3.3 36235000 19592000 16644000 0 0 0 4972700 2436400 2536400 8867900 5016900 3851000 22395000 12139000 10256000 5 3665;13721;15418 True;True;True 3712;13886;15609 15629;58139;58140;58141;65406 20147;73161;73162;73163;82505 20147;73162;82505 A5YKK6 A5YKK6 7 7 7 CCR4-NOT transcription complex subunit 1 CNOT1 sp|A5YKK6|CNOT1_HUMAN CCR4-NOT transcription complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 6 2 2 4 6 2 2 4 6 2 2 4 3.2 3.2 3.2 266.94 2376 2376 0 21.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82974 0.82659 38.526 12 9 Median 0.66075 NaN 0.94054 1.1437 0.7178 NaN 0.96928 1.0542 31.671 NaN 16.729 44.865 5 1 2 4 4 1 1 3 Median Median Median Median 2.8 1.1 0.9 1.8 160250000 84330000 75921000 57506000 32837000 24669000 15086000 8846900 6239600 30133000 14846000 15287000 57526000 27799000 29727000 6 2034;3860;5947;8437;9206;12446;14103 True;True;True;True;True;True;True 2066;3909;6013;8528;9304;12598;14275 8731;8732;8733;16420;24961;35672;35673;39278;39279;39280;39281;53054;53055;59857;59858;59859;59860;59861 11225;11226;11227;21154;31866;45189;45190;49699;49700;49701;49702;49703;66756;66757;75353;75354;75355;75356;75357 11225;21154;31866;45189;49699;66756;75354 Q9GZQ8;A6NCE7 Q9GZQ8;A6NCE7 1;1 1;1 1;1 Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B;Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2 MAP1LC3B;MAP1LC3B2 sp|Q9GZQ8|MLP3B_HUMAN Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP1LC3B PE=1 SV=3;sp|A6NCE7|MP3B2_HUMAN Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP1LC3B2 PE=2 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.2 11.2 11.2 14.688 125 125;125 0.0005571 4.4809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9823 1.0841 6.5745 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 11.2 11.2 11.2 11.2 91995000 42019000 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unc-119 homolog B UNC119B sp|A6NIH7|U119B_HUMAN Protein unc-119 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UNC119B PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 8 8 8 28.136 251 251 0.0045226 2.9423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90284 1.0354 21.406 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 8 8 8 0 29590000 19234000 10355000 8486900 5595500 2891400 9988300 6457400 3530900 11115000 7181500 3933100 0 0 0 10 2 True 2 16;17;18 34;35;36 35 A6NKT7;P0DJD0;P0DJD1;Q7Z3J3;Q99666;O14715 A6NKT7;P0DJD0;P0DJD1;Q7Z3J3;Q99666;O14715 4;3;3;3;3;3 1;0;0;1;0;0 1;0;0;1;0;0 RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3;RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1;RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2;RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4;RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6;RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8 RGPD3;RGPD1;RGPD2;RGPD4;RGPD5;RGPD8 sp|A6NKT7|RGPD3_HUMAN RanBP2-like and GRIP 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type II cytoskeletal 2 epidermal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT2 PE=1 SV=2 9 14 10 7 3 11 1 9 1 7 0 6 0 5 0 4 29.8 24.3 19.7 65.865 645 645;639;639;578;578;524;539;594;534 0 66.929 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0.90189 0.81485 87.071 9 7 Median NaN 2.0149 NaN 0.78807 NaN 2.0026 NaN 0.74364 NaN 72.927 NaN 41.62 1 4 0 4 1 3 0 3 Median Median Median Median 4.5 24.7 1.9 16.6 210810000 86009000 124800000 7257500 5323400 1934100 105150000 24573000 80581000 0 0 0 98399000 56112000 42287000 + 20 1295;4938;5252;6083;6135;6140;6141;7610;10578;11872;14048;14875;16250;17661 True;False;False;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;False 1316;4997;5316;6151;6204;6209;6210;7689;10692;12008;14220;15056;16446;17871 5538;5539;5540;20791;20792;22080;22081;22082;22083;22084;22085;25516;25714;25715;25737;25738;25739;32079;32080;32081;45133;50583;59607;63037;68866;74942 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O00154 3 3 3 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase ACOT7 sp|O00154|BACH_HUMAN Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACOT7 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 12.4 12.4 12.4 41.796 380 380 0 9.3771 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0502 1.0833 0.91668 9 3 Leave out requantified 0.96452 0.97501 1.1311 1.2287 1.0122 0.98111 1.2309 1.1061 14.737 6.5075 4.2931 2.7224 3 2 2 2 2 0 0 1 Median Median Median Median 12.4 9.2 9.2 8.4 308420000 146360000 162060000 99137000 49163000 49974000 65109000 29270000 35840000 67733000 33441000 34291000 76445000 34487000 41958000 29 8091;10347;14225 True;True;True 8181;10455;14398 34179;34180;34181;34182;44090;44091;60351;60352;60353 43338;43339;43340;43341;43342;43343;43344;43345;55596;55597;75945;75946;75947 43343;55596;75945 O00159 O00159 10 10 10 Unconventional myosin-Ic MYO1C sp|O00159|MYO1C_HUMAN Unconventional myosin-Ic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO1C PE=1 SV=4 1 10 10 10 7 6 5 2 7 6 5 2 7 6 5 2 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AP3D1 sp|O14617|AP3D1_HUMAN AP-3 complex subunit delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3D1 PE=1 SV=1 1 16 16 16 9 10 10 12 9 10 10 12 9 10 10 12 16.1 16.1 16.1 130.16 1153 1153 0 81.511 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.092 1.0196 24.215 46 22 Leave out requantified 0.91393 0.81703 0.83994 1.1622 0.98517 0.8386 0.92042 1.0344 29.34 28.318 17.66 17.116 9 11 13 13 5 6 8 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.8 10.7 11 12.7 889910000 477380000 412530000 177630000 110660000 66976000 176110000 93692000 82422000 258930000 143040000 115890000 277230000 129990000 147240000 61 833;836;1549;1578;1911;2601;3132;6469;7293;7976;11043;11434;12496;17806;17807;17952 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 843;846;1572;1601;1941;2637;3177;6539;7371;8059;11160;11564;12648;18018;18019;18165 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Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed PRMT5 sp|O14744|ANM5_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT5 PE=1 SV=4 1 10 10 10 10 9 8 8 10 9 8 8 10 9 8 8 16.5 16.5 16.5 72.683 637 637 0 57.656 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0811 1.0466 19.449 41 16 Leave out requantified 1.0789 1.0842 1.0182 1.1238 1.116 1.0824 1.0731 1.025 25.489 16.35 4.5227 31.45 12 11 8 10 6 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.5 15.1 13.5 13.8 2246500000 1484900000 761620000 734830000 500170000 234650000 772860000 562670000 210180000 418130000 238100000 180030000 320720000 183970000 136750000 65 2123;2651;3165;3646;3774;6031;6579;15410;17002;18030 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2155;2687;3210;3693;3823;6098;6650;15601;17206;18244 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requantified Leave out requantified Median 5 7.5 7.5 7.5 302130000 162340000 139790000 51980000 25906000 26074000 91378000 51615000 39763000 86246000 50277000 35969000 72525000 34546000 37979000 66 8037;9637;11090 True;True;True 8122;9740;11207 33925;33926;33927;33928;33929;41041;41042;41043;41044;41045;41046;47229;47230;47231 43026;43027;43028;51889;51890;51891;51892;51893;51894;51895;59457;59458 43026;51894;59457 O14776 O14776 24 24 24 Transcription elongation regulator 1 TCERG1 sp|O14776|TCRG1_HUMAN Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2 1 24 24 24 20 19 17 22 20 19 17 22 20 19 17 22 21.6 21.6 21.6 123.9 1098 1098 0 68.692 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89506 0.93019 41.901 80 18 Leave out requantified 0.79317 0.93994 0.84195 1.12 0.78975 0.9315 0.9058 0.98399 45.371 24.086 19.429 17.578 20 20 18 22 4 5 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.5 18 16 19.9 3524300000 1775200000 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MS/MS By MS/MS 0.90135 0.90716 56.371 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 2.6 1.4 1.4 1.6 16607000 7296600 9310400 0 0 0 7695700 2933300 4762400 0 0 0 8911300 4363200 4548100 68 2547;7887;11683 True;True;True 2583;7970;11818 10896;33295;49742;49743;49744 13993;42251;62603;62604;62605 13993;42251;62604 O14818;Q8TAA3 O14818 8;3 8;3 8;3 Proteasome subunit alpha type-7 PSMA7 sp|O14818|PSA7_HUMAN Proteasome subunit alpha type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMA7 PE=1 SV=1 2 8 8 8 8 7 7 7 8 7 7 7 8 7 7 7 41.5 41.5 41.5 27.887 248 248;256 0 77.367 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82344 0.83183 15.252 38 21 Leave out requantified 0.84853 0.8143 0.76979 0.92204 0.94802 0.79268 0.7735 0.88218 27.513 6.9555 15.136 11.735 10 11 10 7 4 8 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.5 38.3 38.3 38.3 1620200000 887360000 732870000 439960000 244490000 195480000 455280000 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MS/MS By MS/MS 0.92309 0.87468 47.576 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 13.7 13.7 0 13.7 29177000 12098000 17079000 10306000 3100200 7205700 11932000 5616700 6315700 0 0 0 6938800 3381400 3557400 70 17108 True 17312 72670;72671;72672;72673;72674 91734;91735;91736;91737;91738 91734 O14908 O14908 2 2 2 PDZ domain-containing protein GIPC1 GIPC1 sp|O14908|GIPC1_HUMAN PDZ domain-containing protein GIPC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GIPC1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 9.6 9.6 9.6 36.049 333 333 0.00057307 4.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0972 1.1073 26.378 4 2 Median NaN 0.93151 NaN NaN NaN 0.91819 NaN NaN NaN 11.297 NaN NaN 1 2 1 0 0 2 0 0 Median Median Median Median 5.1 9.6 5.1 0 84870000 39017000 45853000 25645000 11828000 13817000 37778000 17593000 20186000 21447000 9596500 11850000 0 0 0 71 10916;14511 True;True 11033;14689 46514;61542;61543;61544 58520;77484;77485;77486 58520;77485 O14929 O14929 9 9 9 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N-terminally processed KIF3B sp|O15066|KIF3B_HUMAN Kinesin-like protein KIF3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF3B PE=1 SV=1 1 2 2 1 0 1 0 2 0 1 0 2 0 0 0 1 3.3 3.3 1.6 85.124 747 747 0.00056497 4.6469 By matching By MS/MS 0.92431 0.85016 15.746 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 1.7 0 3.3 36264000 17718000 18546000 0 0 0 20269000 9465600 10803000 0 0 0 15995000 8252400 7742200 84 12541;14743 True;True 12694;14922 53413;53414;62455;62456 67204;67205;78600 67204;78600 O15067 O15067 21 21 21 Phosphoribosylformylglycinamidine synthase PFAS sp|O15067|PUR4_HUMAN Phosphoribosylformylglycinamidine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFAS PE=1 SV=4 1 21 21 21 19 17 17 13 19 17 17 13 19 17 17 13 24.6 24.6 24.6 144.73 1338 1338 0 171.08 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.019 1.0456 17.567 72 24 Leave out requantified 1.0275 1.0185 0.99893 1.1401 1.0573 0.97593 1.0403 1.0371 20.441 13.716 17.409 9.364 22 19 17 14 8 6 5 5 Leave 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4 4 mRNA cap guanine-N7 methyltransferase RNMT sp|O43148|MCES_HUMAN mRNA cap guanine-N7 methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNMT PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 3 2 4 4 3 2 4 4 3 2 9.9 9.9 9.9 54.843 476 476 0 21.33 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84212 0.88689 40.49 13 6 Leave out requantified 1.082 0.93988 1.2324 1.3342 1.1163 0.95503 1.3117 1.2492 29.367 52.014 51.142 70.399 3 4 3 3 1 2 1 2 Median Median Median Median 9.9 9.9 6.9 4.4 160080000 81133000 78945000 45212000 22057000 23155000 48448000 26357000 22091000 46670000 23966000 22703000 19748000 8751500 10996000 102 2450;10889;11396;14767 True;True;True;True 2486;11006;11523;14946 10469;10470;10471;10472;10473;46433;46434;46435;48551;48552;62561;62562;62563;62564 13486;13487;13488;13489;13490;58436;61032;61033;61034;78753;78754;78755;78756;78757;78758;78759 13488;58436;61032;78756 O43156 O43156 2 2 2 TELO2-interacting protein 1 homolog TTI1 sp|O43156|TTI1_HUMAN TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 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requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 24.1 14.3 20.8 16.3 1066500000 440160000 626380000 333260000 140550000 192710000 204920000 97266000 107660000 410680000 151320000 259370000 117680000 51031000 66645000 138 490;4162;4917;7538;8156;9873;12356;14080 True;True;True;True;True;True;True;True 494;4216;4976;7617;8246;9979;12508;14252 2071;2072;2073;2074;17777;17778;17779;17780;20694;20695;31783;34458;34459;34460;34461;34462;34463;42112;42113;42114;42115;42116;42117;52693;59746;59747 2699;2700;2701;2702;2703;2704;22867;22868;22869;22870;22871;26542;40278;43675;43676;43677;43678;53198;53199;53200;53201;53202;53203;53204;53205;66314;75227;75228;75229 2701;22869;26542;40278;43678;53200;66314;75228 O43815 O43815 2 2 2 Striatin STRN sp|O43815|STRN_HUMAN Striatin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRN PE=1 SV=4 1 2 2 2 0 1 1 2 0 1 1 2 0 1 1 2 4.5 4.5 4.5 86.131 780 780 0 7.6898 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90806 0.86889 28.069 4 4 Median NaN NaN NaN 1.0234 NaN NaN NaN 0.93084 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recognition complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC4 PE=1 SV=2; 2 4 4 4 3 2 1 2 3 2 1 2 3 2 1 2 7.3 7.3 7.3 50.377 436 436;436 0 7.9997 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.0969 1.1308 86.937 7 3 Median 2.6051 0.92395 NaN 0.70032 2.8054 0.92666 NaN 0.63913 121.77 11.951 NaN 80.689 2 2 1 2 1 1 0 1 Median Median Median Median 5.5 3.9 2.1 3.9 72006000 37700000 34305000 17502000 9553000 7948800 16593000 9235300 7357300 10567000 4296900 6269800 27345000 14615000 12730000 + 148 9399;9400;10196;14790 True;True;True;True 9500;9501;10303;14969 40132;40133;40134;40135;40136;43460;62670;62671;62672 50832;50833;50834;54795;78923;78924;78925 50832;50834;54795;78925 O60216 O60216 11 11 11 Double-strand-break repair protein rad21 homolog RAD21 sp|O60216|RAD21_HUMAN Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2 1 11 11 11 9 5 7 9 9 5 7 9 9 5 7 9 22.2 22.2 22.2 71.689 631 631 0 61.355 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85903 0.85941 15.378 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10225;16940;19934;19935;21831;21881;32547;48657;56820;59588;95582 O60231;Q14562 O60231 12;1 11;0 11;0 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 DHX16 sp|O60231|DHX16_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX16 PE=1 SV=2 2 12 11 11 11 8 10 11 10 7 9 10 10 7 9 10 13.7 12.9 12.9 119.26 1041 1041;1220 0 61.008 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88426 0.8911 11.199 35 5 Leave out requantified 0.86689 0.86822 0.88426 1.0417 0.8686 0.87066 0.87405 0.94698 18.096 18.505 15.738 11.043 10 6 9 10 3 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.6 8.2 10.9 12 890330000 463740000 426590000 218270000 117050000 101220000 179610000 92773000 86835000 233410000 126340000 107070000 259040000 127580000 131460000 150 1525;2989;3527;4174;5008;5518;9714;11119;15741;16348;16881;17925 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False 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1.4024 1.2724 1.1633 NaN 57.927 23.703 39.5 NaN 2 2 2 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 12.2 14.1 14.1 7.6 106500000 56432000 50071000 30081000 15457000 14624000 29960000 16511000 13448000 33512000 18021000 15491000 12950000 6442400 6507800 151 582;4011;11596;14710 True;False;False;True 588;4062;11729;14889 2485;2486;2487;2488;17115;17116;17117;17118;49411;49412;62328;62329;62330 3235;3236;3237;3238;3239;3240;22036;22037;22038;22039;22040;22041;22042;22043;22044;62171;78454;78455 3239;22040;62171;78454 O60264 O60264 8 8 5 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 SMARCA5 sp|O60264|SMCA5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCA5 PE=1 SV=1 1 8 8 5 3 3 5 6 3 3 5 6 1 1 3 4 8.7 8.7 5.9 121.9 1052 1052 0 17.344 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95923 1.019 19.252 15 4 Leave out requantified 0.61892 0.87027 1.0002 1.0576 0.62024 0.9286 1.0812 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sp|O60341|KDM1A_HUMAN Lysine-specific histone demethylase 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM1A PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2.7 2.7 2.7 92.902 852 852 0 5.8741 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3007 1.3545 18.125 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 2.7 1.3 1.3 1.3 35567000 17341000 18225000 7271900 4409400 2862500 15398000 7919200 7479300 12896000 5012700 7883600 0 0 0 157 4859;6213 True;True 4918;6282 20456;20457;20458;20459;20460;26061 26244;26245;26246;26247;26248;26249;33303 26246;33303 O60343 O60343 11 11 11 TBC1 domain family member 4 TBC1D4 sp|O60343|TBCD4_HUMAN TBC1 domain family member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBC1D4 PE=1 SV=2 1 11 11 11 7 7 7 5 7 7 7 5 7 7 7 5 10.8 10.8 10.8 146.56 1298 1298 0 37.347 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95653 0.97771 15.373 23 11 Leave out requantified 1.0249 1.0333 0.84272 0.7287 1.0521 1.0118 0.8523 0.68329 13.206 19.57 15.108 31.089 6 6 7 4 3 3 3 2 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Nuclear export mediator factor NEMF OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEMF PE=1 SV=4 1 10 10 10 7 7 5 9 7 7 5 9 7 7 5 9 10.6 10.6 10.6 122.95 1076 1076 0 30.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88226 0.853 17.623 28 7 Leave out requantified 0.81998 0.74255 0.72559 0.88396 0.88555 0.71504 0.77304 0.83146 31.39 24.869 28.433 10.827 7 7 5 9 1 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.2 6.9 5 9.7 732590000 468490000 264090000 221250000 148500000 72751000 157620000 104450000 53166000 127860000 85505000 42352000 225860000 130030000 95823000 163 58;2866;3360;4574;4797;7772;9466;10166;10790;16961 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 59;2906;3406;4632;4856;7852;9567;10273;10905;17165 258;259;12227;12228;12229;12230;14301;14302;14303;14304;19367;19368;20237;20238;20239;20240;32780;32781;40402;43355;46015;46016;46017;46018;72034;72035;72036;72037 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442;60590;78095;85417 O75179;Q8IWZ3 O75179;Q8IWZ3 5;4 5;4 5;4 Ankyrin repeat domain-containing protein 17;Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 ANKRD17;ANKHD1 sp|O75179|ANR17_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD17 PE=1 SV=3;sp|Q8IWZ3|ANKH1_HUMAN Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKHD1 PE=1 SV=1 2 5 5 5 2 1 2 4 2 1 2 4 2 1 2 4 2.8 2.8 2.8 274.25 2603 2603;2542 0 14.963 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83126 0.78791 21.909 8 2 Leave out requantified 0.77434 NaN NaN 0.83226 0.75122 NaN NaN 0.72335 20.131 NaN NaN 23.005 2 1 1 4 1 0 0 1 Median Median Median Leave out requantified 1.2 0.5 1.1 2.2 97259000 52201000 45057000 25316000 15349000 9966900 12645000 6275600 6369400 11737000 6248900 5488200 47560000 24327000 23233000 195 5684;10856;14079;15221;15868 True;True;True;True;True 5749;10972;14251;15409;16062 23882;23883;23884;23885;46287;59744;59745;64475;67251 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True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;False;False;True;True;True;True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.1 4.1 1.6 0 48847000 27574000 21274000 20242000 13611000 6631500 15321000 7622000 7698500 13284000 6340900 6943500 0 0 0 205 11067;11664 True;True 11184;11799 47153;47154;47155;49667;49668 59362;59363;62509;62510 59362;62509 O75436 O75436 5 5 5 Vacuolar protein sorting-associated protein 26A VPS26A sp|O75436|VP26A_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS26A PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 5 4 3 5 5 4 3 5 5 4 3 22.3 22.3 22.3 38.169 327 327 0 30.359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0409 1.0364 34.272 20 7 Leave out requantified 1.1714 1.0463 0.91526 1.2996 1.2109 1.0181 0.91941 1.1565 40.785 41.817 35.46 48.112 6 6 5 3 3 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 22.3 22.3 19 14.7 427650000 237880000 189770000 142190000 81454000 60740000 142310000 85688000 56620000 94449000 46018000 48431000 48704000 24725000 23978000 206 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207 5137;15338 True;True 5201;15529 21630;21631;21632;21633;65082;65083;65084 27699;82111;82112;82113 27699;82112 O75475 O75475 13 13 12 PC4 and SFRS1-interacting protein PSIP1 sp|O75475|PSIP1_HUMAN PC4 and SFRS1-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSIP1 PE=1 SV=1 1 13 13 12 10 9 11 11 10 9 11 11 9 9 11 11 30.9 30.9 29.4 60.103 530 530 0 42.106 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90504 0.96488 19.143 44 14 Leave out requantified 0.78548 0.96592 0.87609 1.0483 0.85646 1.0388 0.95911 0.98226 21.488 21.643 17.756 16.767 11 9 12 12 4 3 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.6 23.4 27 27.7 1522400000 862120000 660310000 463370000 313410000 149960000 258240000 124470000 133760000 417030000 228040000 188990000 383800000 196200000 187600000 208 1522;2209;2367;4670;5514;7013;7534;8992;11994;12963;13093;15252;16201 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1545;2242;2403;4728;5579;7086;7613;9089;12135;13121;13252;15442;16396 6518;6519;6520;9385;9386;9387;10111;10112;10113;19707;19708;19709;19710;19711;19712;19713;23141;23142;23143;23144;29094;31769;31770;31771;38295;51136;51137;51138;55134;55135;55136;55137;55138;55139;55596;55597;55598;55599;55600;64661;64662;64663;64664;68633;68634;68635;68636 8410;8411;8412;12114;12115;12116;12117;13028;25311;25312;25313;25314;25315;25316;25317;25318;25319;29571;29572;29573;29574;29575;37091;40263;40264;48526;64259;64260;64261;69406;69407;69408;69409;69410;69411;69994;69995;69996;69997;69998;81532;86634;86635;86636;86637 8412;12117;13028;25316;29571;37091;40263;48526;64259;69406;69998;81532;86635 O75494;Q8WXF0 O75494;Q8WXF0 3;2 3;2 3;2 Serine/arginine-rich splicing factor 10;Serine/arginine-rich splicing factor 12 SRSF10;SRSF12 sp|O75494|SRS10_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF10 PE=1 SV=1;sp|Q8WXF0|SRS12_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF12 PE=2 SV=1 2 3 3 3 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 13 13 13 31.3 262 262;261 0 11.519 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93505 0.9581 11.857 12 1 Leave out requantified 0.80318 1.022 0.98977 1.1968 0.88105 1.0324 1.0198 1.0645 28.391 9.2618 11.954 58.124 3 3 3 3 0 0 0 1 Median Median Plateau Plateau 8.8 8.8 13 8.8 424250000 225980000 198260000 119750000 64769000 54983000 103570000 50981000 52586000 122130000 65166000 56965000 78795000 45066000 33729000 209 2004;5978;12698 True;True;True 2035;6044;12854 8596;8597;8598;8599;8600;8601;8602;8603;8604;8605;25074;25075;25076;25077;54037 11031;11032;11033;11034;11035;11036;11037;11038;11039;11040;11041;11042;32008;32009;32010;32011;67961 11032;32008;67961 O75530 O75530 3 3 3 Polycomb protein EED EED sp|O75530|EED_HUMAN Polycomb protein EED OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EED PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 2 3 1 2 2 3 1 2 2 3 8.4 8.4 8.4 50.197 441 441 0 12.459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1015 1.1025 9.6712 6 3 Median NaN NaN 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Cartilage-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRTAP PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 7.5 7.5 7.5 46.561 401 401 0.00056529 4.675 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0038 0.89437 26.904 5 1 Median NaN NaN 1.2157 NaN NaN NaN 1.2324 NaN NaN NaN 25.865 NaN 1 1 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.7 1.7 3.7 5.5 333140000 164900000 168250000 78896000 41046000 37850000 85067000 44923000 40143000 113750000 52417000 61334000 55429000 26511000 28919000 224 4754;9636;15737 True;True;True 4813;9739;15930 20083;41037;41038;41039;41040;66714 25798;51886;51887;51888;84142 25798;51886;84142 O75792 O75792 2 2 2 Ribonuclease H2 subunit A RNASEH2A sp|O75792|RNH2A_HUMAN Ribonuclease H2 subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNASEH2A PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 2 10 10 10 33.395 299 299 0.0040775 3.1045 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1661 1.1099 18.691 4 1 Median NaN NaN NaN 1.1197 NaN NaN NaN 1.0528 NaN NaN NaN 1.5297 1 1 0 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 4.7 4.7 0 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sapiens OX=9606 GN=EIF3G PE=1 SV=2 1 12 12 12 9 9 10 7 9 9 10 7 9 9 10 7 33.8 33.8 33.8 35.611 320 320 0 91.919 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98717 1.0224 11.156 45 7 Leave out requantified 0.98647 0.9831 0.97413 1.129 1.0256 0.97617 1.0358 1.0647 13.51 8.6082 5.4136 11.249 13 11 12 9 3 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.6 31.2 31.2 28.8 2875300000 1474200000 1401100000 760340000 394910000 365420000 804350000 417920000 386430000 828610000 434010000 394600000 482000000 227330000 254670000 227 233;3006;3466;4002;4031;4032;4033;4751;6249;10483;17230;18095 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 234;3050;3512;4053;4082;4083;4084;4810;6318;10596;17434;18309 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 8.7 6.5 9.4 8.9 20348000 6914200 13434000 0 0 0 0 0 0 5211400 0 5211400 15137000 6914200 8222600 240 1898;3957;4601;6745;6983;6985;6989 True;False;False;False;True;False;True 1928;4007;4659;6817;7056;7058;7062 8198;16841;16842;16843;16844;16845;16846;19465;19466;19467;19468;19469;19470;19471;28048;28980;28985;28986;28987;28988;29005 10533;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;25010;25011;25012;25013;25014;25015;25016;25017;25018;25019;25020;25021;35732;36944;36953;36954;36980 10533;21694;25013;35732;36944;36954;36980 O94822 O94822 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase listerin LTN1 sp|O94822|LTN1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase listerin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LTN1 PE=1 SV=6 1 2 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 1.1 1.1 1.1 200.55 1766 1766 0.0036138 3.3113 By MS/MS 1.0391 0.93755 20.232 2 1 Median NaN NaN NaN 1.0391 NaN NaN NaN 0.93755 NaN NaN NaN 20.232 0 0 0 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 0 0 0 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transport protein Sec31A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC31A PE=1 SV=3 1 16 16 16 12 13 13 10 12 13 13 10 12 13 13 10 16.1 16.1 16.1 133.01 1220 1220 0 56.06 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1014 1.1018 14.807 45 16 Leave out requantified 1.1046 1.0163 0.95001 1.1082 1.0809 1.0647 0.99265 1.0332 21.39 18.438 14.934 25.033 12 13 11 9 4 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.1 12.2 12.8 8.8 1445400000 745640000 699770000 371060000 182430000 188630000 413470000 204670000 208800000 394980000 209200000 185780000 265890000 149340000 116550000 247 1224;1239;1838;3960;4464;4829;5871;6681;7495;7779;9505;11117;12043;13210;17336;17850 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1244;1259;1867;4010;4521;4888;5937;6753;7573;7859;9607;11233;12189;13370;17543;18062 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6;3 6;3 6;3 Chromosome-associated kinesin KIF4A;Chromosome-associated kinesin KIF4B KIF4A;KIF4B sp|O95239|KIF4A_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4A PE=1 SV=3;sp|Q2VIQ3|KIF4B_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4B PE=2 SV=2 2 6 6 6 2 2 2 5 2 2 2 5 2 2 2 5 5.1 5.1 5.1 139.88 1232 1232;1234 0 13.022 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0075 0.96865 14.132 10 1 Leave out requantified 0.87702 0.82877 0.8779 1.0472 0.95471 0.81673 0.92055 0.95464 19.896 14.477 23.17 12.307 2 2 2 4 0 0 0 1 Median Median Median Leave out requantified 1.5 2 2 4.5 110360000 58422000 51940000 18651000 10610000 8041300 22782000 10114000 12668000 20917000 11378000 9539500 48012000 26320000 21692000 254 6078;6673;7337;10912;15860;17863 True;True;True;True;True;True 6146;6745;7415;11029;16054;18075 25501;27795;27796;27797;27798;30871;46507;67227;67228;67229;75802 32576;35426;35427;35428;39169;58512;84771;84772;95561 32576;35427;39169;58512;84772;95561 O95260 O95260 2 2 2 Arginyl-tRNA--protein transferase 1 ATE1 sp|O95260|ATE1_HUMAN Arginyl-tRNA--protein transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATE1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 4.4 4.4 4.4 59.09 518 518 0.0010695 3.7972 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.0033 0.9727 3.8311 6 0 Leave out requantified 0.83606 NaN NaN 1.0528 0.85 NaN NaN 0.94754 22.572 NaN NaN 7.4563 2 1 1 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.4 2.1 4.4 4.4 96681000 50095000 46586000 29752000 16273000 13480000 16811000 9317900 7493100 17607000 9207600 8399800 32510000 15297000 17213000 255 5378;9816 True;True 5443;9922 22588;22589;22590;22591;41866;41867;41868;41869 28857;28858;28859;28860;52929 28860;52929 O95340 O95340 7 7 7 Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2;Sulfate adenylyltransferase;Adenylyl-sulfate kinase PAPSS2 sp|O95340|PAPS2_HUMAN Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPSS2 PE=1 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1.1707 1.2967 1.0404 1.2896 1.2442 1.1281 1.1445 1.2119 3.4834 17.568 7.7384 22.158 2 3 3 3 0 1 0 1 Median Plateau Leave out requantified Plateau 5.6 13.6 11.2 11.2 375380000 177000000 198370000 71243000 32689000 38554000 104970000 45436000 59539000 97574000 45035000 52539000 101590000 53844000 47742000 262 1749;4619;5147;18110 True;True;True;True 1778;4677;5211;18324 7507;19527;19528;19529;19530;21671;21672;21673;76800;76801;76802;76803 9688;25087;25088;25089;25090;25091;25092;27743;27744;27745;27746;96782 9688;25091;27743;96782 O95456 O95456 1 1 1 Proteasome assembly chaperone 1 PSMG1 sp|O95456|PSMG1_HUMAN Proteasome assembly chaperone 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.9 4.9 4.9 32.854 288 288 0.00055617 4.4421 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0944 1.0488 18.232 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.9 4.9 4.9 4.9 93302000 44409000 48893000 20998000 8904100 12094000 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NaN NaN 29.199 NaN NaN NaN 2 0 1 0 2 0 1 0 Median Median Median Median 4 0 2 0 25670000 11389000 14281000 14239000 6444800 7794500 0 0 0 11430000 4943900 6486400 0 0 0 265 2072;14400 True;True 2104;14576 8871;61075;61076;61077 11420;76890;76891;76892 11420;76890 O95602 O95602 2 2 2 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 POLR1A sp|O95602|RPA1_HUMAN DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR1A PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1.7 1.7 1.7 194.81 1720 1720 0 6.6225 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90683 0.78966 37.206 5 4 Median NaN NaN NaN 1.0889 NaN NaN NaN 0.96217 NaN NaN NaN 27.943 1 1 1 2 1 0 1 2 Median Median Median Median 1.7 0.8 0.8 0.8 76490000 36318000 40172000 18524000 9640400 8883300 18709000 10685000 8024600 12359000 5058900 7300500 26898000 10934000 15964000 266 113;7808 True;True 114;7888 482;32918;32919;32920;32921;32922 650;41778;41779;41780;41781;41782 650;41779 O95671 O95671 1 1 1 N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein ASMTL sp|O95671|ASML_HUMAN Probable bifunctional dTTP/UTP pyrophosphatase/methyltransferase protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASMTL PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2.7 2.7 2.7 68.856 621 621 0.00056148 4.5988 By matching By MS/MS By MS/MS 1.26 1.1022 16.238 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 2.7 2.7 2.7 46289000 19015000 27274000 0 0 0 15766000 6246600 9519400 21398000 9717000 11681000 9125600 3051700 6073900 267 320 True 321 1281;1282;1283 1682;1683;1684 1683 O95707 O95707 4 4 4 Ribonuclease P protein subunit p29 POP4 sp|O95707|RPP29_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP4 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 27.3 27.3 27.3 25.424 220 220 0 6.2939 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1532 1.0869 25.112 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 0 0 Median Median Median Median 7.3 8.2 6.4 11.8 34216000 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subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-3;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas GNAI2;GNAT1;GNAI1;GNAT2;GNAO1;GNAI3;GNAT3;GNAL;GNAS sp|P04899|GNAI2_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAI2 PE=1 SV=3;sp|P11488|GNAT1_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAT1 PE=1 SV=5;sp|P63096|GNAI 10 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 6.8 6.8 6.8 40.45 355 355;350;354;354;354;354;354;381;394;1037 0.00055866 4.5163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76064 0.78519 22.685 5 1 Median 0.59457 NaN NaN NaN 0.59861 NaN NaN NaN 30.996 NaN NaN NaN 2 1 1 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 6.8 3.1 3.1 3.1 87263000 49488000 37776000 29792000 18338000 11454000 21264000 11808000 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60 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase EPRS sp|P07814|SYEP_HUMAN Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPRS PE=1 SV=5 1 61 61 60 57 55 55 50 57 55 55 50 56 54 54 49 45.4 45.4 45.4 170.59 1512 1512 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88258 0.90793 19.747 319 66 Leave out requantified 0.82815 0.92721 0.84348 1.0237 0.8617 0.95431 0.89118 0.9531 18.223 19.242 22.717 13.422 82 82 81 74 23 15 14 14 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.7 41.5 41.4 37.3 29158000000 15572000000 13587000000 7385600000 4113900000 3271700000 7997700000 4179600000 3818100000 8374500000 4619900000 3754600000 5400400000 2658200000 2742200000 332 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DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 POLR2C sp|P19387|RPB3_HUMAN DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2C PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 21.8 21.8 21.8 31.441 275 275 0 10.928 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3396 1.4207 32.436 6 3 Median 1.3136 NaN NaN 1.4203 1.429 NaN NaN 1.2816 43.305 NaN NaN 54.797 2 1 1 2 1 1 0 1 Median Median Median Median 13.5 10.5 5.1 8 69758000 29366000 40392000 19742000 7929500 11812000 13792000 2596100 11196000 14230000 5994600 8235500 21994000 12846000 9148400 460 2605;5177;9786;13771 True;True;True;True 2641;5241;9891;13938 11140;21791;41731;41732;41733;41734;58342 14291;27893;52766;52767;52768;52769;52770;52771;73418 14291;27893;52770;73418 P19388 P19388 5 5 5 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 POLR2E sp|P19388|RPAB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2E PE=1 SV=4 1 5 5 5 2 4 4 4 2 4 4 4 2 4 4 4 27.1 27.1 27.1 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1.4287 1.5086 119.32 8 5 Median 1.6632 NaN 1.8302 1.651 1.6303 NaN 2.0394 1.5754 126.33 NaN 233.55 56.452 3 1 2 2 2 0 2 1 Median Median Median Median 11.1 8.6 8.6 6.9 196450000 95868000 100590000 75212000 30278000 44933000 27238000 11311000 15926000 51915000 40041000 11873000 42091000 14237000 27854000 543 2615;3161;6667 True;True;True 2651;3206;6739 11176;11177;11178;11179;11180;13473;13474;13475;13476;13477;13478;13479;13480;27778;27779 14335;14336;14337;14338;14339;14340;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;35408;35409 14336;17300;35409 P28715 P28715 4 4 4 DNA repair protein complementing XP-G cells ERCC5 sp|P28715|ERCC5_HUMAN DNA repair protein complementing XP-G cells OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERCC5 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 2 3 3 2 2 3 3 2 2 3 4.3 4.3 4.3 133.11 1186 1186 0 16.112 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0636 1.0242 22.213 6 5 Median NaN NaN NaN 1.1211 NaN NaN NaN 1.0242 NaN NaN NaN 18.686 1 1 0 4 1 1 0 3 Median Median Median Median 3.5 2.4 2.4 3.2 48748000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 81;283;4026;6763;9723;10541;11182;13018;13386;15547 345;1175;16945;16946;16947;16948;16949;16950;27851;40984;44522;44523;47141;47142;54723;54724;54725;54726;54727;56091;56092;56093;65165;65166;65167;65168 482;1551;21832;21833;21834;21835;21836;21837;21838;21839;35488;51823;56161;56162;59348;59349;68873;68874;68875;68876;68877;68878;70602;70603;70604;82219;82220;82221;82222 482;1551;21835;35488;51823;56162;59349;68876;70604;82219 P29084 P29084 6 6 6 Transcription initiation factor IIE subunit beta GTF2E2 sp|P29084|T2EB_HUMAN Transcription initiation factor IIE subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2E2 PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 5 3 3 4 5 3 3 4 5 3 3 25.1 25.1 25.1 33.043 291 291 0 17.611 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0701 1.0797 61.408 14 2 Leave out requantified 0.71721 0.94384 0.93232 1.1723 0.78303 0.95218 1.0323 1.0895 37.018 72.353 5.0703 12.274 4 5 2 3 1 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Median Leave out requantified 17.9 17.2 11.3 11.3 296060000 157740000 138320000 77744000 49966000 27778000 125770000 61626000 64142000 37306000 19338000 17968000 55243000 26808000 28435000 546 1021;3205;5856;10104;12636;13576 True;True;True;True;True;True 1036;3250;5922;10211;12791;13740 4373;4374;4375;4376;13654;24618;43094;43095;53781;53782;53783;53784;57556;57557;57558 5599;17567;31469;54396;54397;67664;67665;67666;67667;72443;72444;72445 5599;17567;31469;54397;67665;72445 P29144 P29144 12 12 12 Tripeptidyl-peptidase 2 TPP2 sp|P29144|TPP2_HUMAN Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPP2 PE=1 SV=4 1 12 12 12 8 10 9 9 8 10 9 9 8 10 9 9 12.7 12.7 12.7 138.35 1249 1249 0 68.872 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.058 1.0799 29.495 37 18 Leave out requantified 1.0667 1.021 0.96686 1.1852 1.1034 1.0673 1.0354 1.0829 5.6002 14.181 37.463 20.975 8 12 9 8 3 7 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.9 10.1 10.5 8.2 798430000 415360000 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glycosylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPG PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 16.4 16.4 16.4 32.868 298 298 0 8.3893 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98524 0.95123 10.059 6 1 Leave out requantified 0.871 NaN 0.92333 NaN 0.85721 NaN 0.92526 NaN 19.747 NaN 13.973 NaN 2 1 2 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 16.4 6 16.4 6 89845000 50055000 39791000 25171000 14067000 11104000 20326000 12093000 8233500 28568000 16202000 12367000 15779000 7693200 8085900 548 601;8439 True;True 607;8530 2557;2558;35680;35681;35682;35683 3329;3330;3331;3332;3333;45200;45201;45202;45203;45204;45205 3331;45205 P29401 P29401 35 35 35 Transketolase TKT sp|P29401|TKT_HUMAN Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT PE=1 SV=3 1 35 35 35 32 33 33 28 32 33 33 28 32 33 33 28 61 61 61 67.877 623 623 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0847 1.0947 15.104 224 36 Leave out requantified 1.1025 1.098 0.98395 1.2034 1.2063 1.1128 1.0906 1.0926 22.353 15.106 13.942 17.546 59 57 59 49 10 10 11 5 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P30041 P30041 15 15 15 Peroxiredoxin-6 PRDX6 sp|P30041|PRDX6_HUMAN Peroxiredoxin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX6 PE=1 SV=3 1 15 15 15 14 14 13 14 14 14 13 14 14 14 13 14 58.5 58.5 58.5 25.035 224 224 0 148.63 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.9932 2.8638 36.6 87 40 Leave out requantified 2.5007 3.0604 2.9132 3.0425 2.6428 3.0937 3.1301 2.7703 50.103 19.71 57.523 32.652 23 23 21 20 9 11 11 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 55.4 54 50.4 53.1 8902900000 2134000000 6768900000 2333200000 529530000 1803600000 2428100000 575710000 1852400000 2465200000 594060000 1871100000 1676500000 434680000 1241800000 553 2244;2258;2259;2409;2410;4038;4039;6485;9252;10482;10714;11703;16129;17306;17324 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2278;2294;2295;2445;2446;4089;4090;4091;6556;9350;10595;10829;11838;16324;17512;17531 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MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.84237 0.81958 78.964 4 2 Median NaN NaN NaN 0.44827 NaN NaN NaN 0.41032 NaN NaN NaN 104.06 1 0 1 2 0 0 1 1 Median Median Median Median 10.1 3.4 24.2 13.5 67511000 39151000 28360000 15363000 8440500 6922400 0 0 0 20469000 10206000 10264000 31679000 20505000 11174000 565 824;6712;15033;16609 False;True;True;True 834;6784;15218;16809 3491;27934;63734;70524;70525;70526 4526;35591;80342;89079;89080;89081 4526;35591;80342;89080 P30419 P30419 13 13 10 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 NMT1 sp|P30419|NMT1_HUMAN Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NMT1 PE=1 SV=2 1 13 13 10 10 10 12 11 10 10 12 11 8 8 9 9 28 28 21.6 56.806 496 496 0 291.11 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90191 0.91266 11.928 60 12 Leave out requantified 0.8779 0.90041 0.8405 1.151 0.90208 0.91159 0.88967 1.0451 14.859 14.004 11.078 18.723 15 14 16 15 3 2 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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P30626 P30626 4 4 4 Sorcin SRI sp|P30626|SORCN_HUMAN Sorcin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRI PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 21.2 21.2 21.2 21.676 198 198 0 53.179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3391 1.4529 46.417 12 7 Leave out requantified 1.5926 1.4121 1.2738 1.3194 1.6993 1.486 1.4498 1.2232 2.2371 8.2228 34.424 65.415 2 3 3 4 1 2 1 3 Median Median Median Median 11.6 15.7 17.2 17.2 470870000 210840000 260040000 82646000 37530000 45116000 122110000 51307000 70798000 116920000 53282000 63637000 149200000 68716000 80486000 569 2762;10386;10742;13901 True;True;True;True 2800;10498;10857;14072 11829;11830;11831;11832;44304;45834;45835;58940;58941;58942;58943;58944 15196;15197;15198;15199;55866;57761;57762;74234;74235;74236;74237;74238;74239;74240 15198;55866;57762;74239 P30740 P30740 9 9 9 Leukocyte elastase inhibitor SERPINB1 sp|P30740|ILEU_HUMAN Leukocyte elastase inhibitor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERPINB1 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 7 8 8 7 7 8 8 7 7 8 8 29.3 29.3 29.3 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18535;18536;18537;18538;18539;26713;26714;26715;26716;26717;26718;26719;29150;34851;34852;34853;34854;43646;43647;53006;53007;53008;53009;53010;53011;80892;85476;85477;85478;85479;85480;85481;85482;85483;85484;85485;85486;85587;85588;85589;85590;85591;85592;85593;85594;85595;85596;85597;85598;85599 18537;26714;29150;34853;43646;53007;80892;85485;85592 P30837;P00352;P47895;O94788 P30837 6;1;1;1 6;1;1;1 5;0;0;0 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial ALDH1B1 sp|P30837|AL1B1_HUMAN Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1B1 PE=1 SV=3 4 6 6 5 4 5 4 2 4 5 4 2 4 4 3 1 15.7 15.7 14.1 57.206 517 517;501;512;518 0 17.494 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95392 1.0089 8.2274 15 3 Leave out requantified 0.99654 0.93468 0.91043 1.1633 1.0508 0.94946 1.0051 1.0937 10.507 18.761 12.962 4.8269 4 5 4 2 1 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 11.2 12.8 9.1 3.5 250750000 118680000 132060000 66846000 28813000 38033000 78747000 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Median Median Median Median 3.3 3.3 3.3 3.3 115270000 46350000 68922000 22857000 11669000 11188000 31420000 11778000 19641000 34897000 15205000 19691000 26099000 7697800 18401000 637 9642 True 9745 41061;41062;41063;41064 51910;51911;51912;51913 51912 P38606 P38606 18 18 18 V-type proton ATPase catalytic subunit A ATP6V1A sp|P38606|VATA_HUMAN V-type proton ATPase catalytic subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1A PE=1 SV=2 1 18 18 18 16 16 15 11 16 16 15 11 16 16 15 11 37.1 37.1 37.1 68.303 617 617 0 143.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.06 1.0469 18.873 71 25 Leave out requantified 1.0865 0.97848 0.91666 1.1367 1.1246 1.0143 0.92808 1.0129 19.783 20.544 23.421 30.844 16 19 21 15 2 6 10 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.2 36 33.4 22.9 1820100000 885160000 934970000 476230000 226410000 249820000 533610000 257830000 275780000 547770000 276840000 270930000 262530000 124090000 138440000 638 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15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 USP8 sp|P40818|UBP8_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP8 PE=1 SV=1 1 15 15 15 9 12 9 9 9 12 9 9 9 12 9 9 17.8 17.8 17.8 127.52 1118 1118 0 47.988 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81197 0.81954 18.356 42 7 Leave out requantified 0.72599 0.81567 0.79213 1.0157 0.782 0.80051 0.86655 0.9064 23.665 13.659 22.329 27.077 9 13 10 10 1 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.4 14.7 11.9 11.2 682920000 377960000 304960000 149940000 96403000 53542000 207360000 111940000 95420000 195560000 107430000 88137000 130050000 62197000 67857000 652 4341;4968;5241;5636;5959;6727;7901;8847;11250;11627;11939;13423;13659;14661;14864 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4398;5028;5305;5701;6025;6799;7984;8941;11372;11761;12076;13587;13823;14840;15045 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dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH2 PE=1 SV=3 1 11 11 11 10 7 9 8 10 7 9 8 10 7 9 8 40.2 40.2 40.2 35.503 338 338 0 40.817 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.056 1.1002 13.879 35 13 Leave out requantified 1.0323 1.0766 0.96462 1.2495 1.0122 1.0894 1.0647 1.1005 14.967 57.75 16.321 5.8311 10 8 9 8 3 3 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37 26.6 32.2 29.6 1142900000 550540000 592330000 313190000 153180000 160010000 323290000 151050000 172240000 324990000 160500000 164490000 181400000 85806000 95591000 654 1145;3805;5783;7006;7658;8173;10821;11287;15331;16204;16978 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1165;3854;5848;7079;7737;8263;10937;11410;15522;16399;17182 4914;4915;4916;4917;4918;16194;16195;16196;24313;24314;24315;24316;24317;29074;29075;29076;32291;32292;34519;34520;34521;34522;46139;46140;46141;46142;48085;48086;48087;48088;65043;65044;68642;72153;72154;72155;72156 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTOR PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1.5 1.5 1.5 288.89 2549 2549 0 6.9482 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3982 1.3485 21.522 6 2 Leave out requantified NaN NaN 1.5107 1.4375 NaN NaN 1.6357 1.3485 NaN NaN 110.53 21.522 1 1 2 2 0 1 1 0 Median Median Median Median 0.6 0.5 1.1 1.1 99514000 39466000 60049000 11019000 5424500 5594700 16261000 7064400 9196900 41757000 14436000 27321000 30477000 12541000 17937000 668 2067;6606;9607 True;True;True 2099;6678;9710 8853;8854;27558;27559;27560;40939 11393;11394;35160;51765 11394;35160;51765 P42677 P42677 4 4 2 40S ribosomal protein S27 RPS27 sp|P42677|RS27_HUMAN 40S ribosomal protein S27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27 PE=1 SV=3 1 4 4 2 4 4 3 3 4 4 3 3 2 2 2 2 39.3 39.3 14.3 9.461 84 84 0 14.968 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97074 0.93317 20.268 25 4 Leave out requantified 0.95189 0.98276 0.8948 1.0703 0.97321 0.9789 0.93545 0.96164 22.786 19.519 25.374 5.5176 7 6 5 7 1 0 0 3 Leave out 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16.147 5 1 Median NaN 1.082 NaN NaN NaN 1.0837 NaN NaN NaN 18.187 NaN NaN 1 2 1 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 16.9 16.9 16.9 16.9 90978000 45585000 45393000 11546000 4229200 7316700 44382000 23060000 21323000 27389000 16119000 11270000 7660700 2177000 5483700 678 3000 True 3044 12801;12802;12803;12804;12805 16456;16457;16458;16459;16460;16461;16462 16461 P43490 P43490 9 9 9 Nicotinamide phosphoribosyltransferase NAMPT sp|P43490|NAMPT_HUMAN Nicotinamide phosphoribosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAMPT PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 4 7 6 7 4 7 6 7 4 7 6 20.8 20.8 20.8 55.52 491 491 0 38.568 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9239 0.94515 17.482 23 11 Leave out requantified 0.91029 0.71279 0.92598 0.94968 0.96677 0.71616 0.94161 0.83987 25.148 15.63 23.894 18.31 7 4 6 6 4 1 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.1 6.9 15.7 12.6 472530000 250040000 222480000 134480000 72290000 62194000 86823000 44820000 42002000 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSFM PE=1 SV=2 1 7 7 7 6 7 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 29.5 29.5 29.5 35.39 325 325 0 82.459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96311 0.94473 14.703 28 10 Leave out requantified 0.82193 0.9235 0.8873 0.95433 0.81781 0.93405 0.92811 0.89111 21.025 13.839 12.969 14.45 7 9 6 6 2 5 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.1 29.5 27.1 27.1 601880000 312590000 289280000 145830000 76103000 69728000 202230000 107500000 94730000 138160000 72677000 65486000 115650000 56311000 59340000 681 883;5006;6019;9740;9813;12361;17715 True;True;True;True;True;True;True 895;5069;6086;9844;9918;12513;17926 3759;3760;3761;3762;21108;21109;21110;21111;25264;25265;25266;25267;41525;41842;41843;41844;41845;41846;41847;52708;52709;52710;52711;75161;75162;75163;75164;75165 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3 4 2 3 3 4 15.3 13.2 13.2 42.777 372 372 0 45.52 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86753 0.83932 2.8032 14 8 Leave out requantified 0.73645 0.92671 0.87264 0.99228 0.7269 0.8948 0.88956 0.87107 12.37 17.522 9.0198 3.5713 3 5 3 3 2 4 1 1 Median Median Median Median 7.8 11.3 11.3 15.3 201740000 104650000 97091000 41394000 23645000 17749000 70925000 34808000 36117000 50645000 25879000 24766000 38778000 20319000 18459000 759 6753;9180;10326;12042;13242 True;False;True;True;True 6825;9278;10433;12188;13402 28077;28078;28079;28080;39158;39159;39160;39161;44007;44008;44009;44010;51368;51369;51370;51371;51372;51373;56152 35767;35768;35769;35770;49560;49561;49562;49563;49564;49565;55491;55492;55493;55494;55495;64570;64571;64572;64573;64574;64575;70679 35770;49563;55492;64574;70679 P50851 P50851 1 1 1 Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein LRBA sp|P50851|LRBA_HUMAN Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRBA PE=1 SV=4 1 1 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P51610 P51610 7 7 7 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 HCFC1 sp|P51610|HCFC1_HUMAN Host cell factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HCFC1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 6 5 5 5 6 5 5 5 6 5 5 5.2 5.2 5.2 208.73 2035 2035 0 18.535 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97506 1.0152 6.0026 18 3 Leave out requantified 0.98349 1.025 0.95223 1.0724 1.0319 1.0391 1.0563 1.0051 10.781 5.4895 3.9157 9.3964 4 5 5 4 0 1 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 3.1 4.6 3.1 3.9 346700000 175740000 170960000 80589000 40321000 40267000 100940000 49920000 51023000 96637000 53551000 43087000 68531000 31947000 36584000 774 6578;7461;14399;15661;16124;17650;18018 True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By matching By matching 1.1572 1.2125 17.733 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 14.7 14.7 14.7 14.7 117870000 56329000 61536000 31107000 15288000 15819000 33007000 14474000 18533000 34021000 17764000 16257000 19731000 8803400 10928000 777 7048 True 7121 29230;29231;29232;29233 37261;37262 37262 P51812 P51812 11 4 4 Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 RPS6KA3 sp|P51812|KS6A3_HUMAN Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS6KA3 PE=1 SV=1 1 11 4 4 6 6 8 6 2 1 3 1 2 1 3 1 15.9 6.4 6.4 83.735 740 740 0 10.253 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 0.78982 0.83613 76.861 7 3 Median 0.30187 NaN 1.0022 NaN 0.31853 NaN 1.0863 NaN 136.48 NaN 19.769 NaN 2 1 3 1 1 0 2 0 Median Median Plateau Median 8.2 8 11.9 8.5 338300000 260150000 78146000 225110000 197710000 27400000 17253000 9854200 7399000 83485000 43783000 39702000 12445000 8800900 3644300 778 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Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 HNRNPA3 sp|P51991|ROA3_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA3 PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 8 7 6 7 8 7 6 7 8 7 6 30.4 30.4 30.4 39.594 378 378 0 51.815 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1765 1.1386 25.423 37 13 Leave out requantified 1.0642 1.1988 1.0508 1.197 1.1745 1.1945 1.2327 1.1059 21.947 25.539 14.696 24.332 9 10 9 9 3 2 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.8 30.4 27.5 22 1718800000 861860000 856900000 414940000 213570000 201380000 519530000 252910000 266620000 492240000 253180000 239060000 292040000 142210000 149830000 780 3497;5975;7632;7685;9645;14548;17487;17769 True;True;True;True;True;True;True;True 3544;6041;7711;7764;9748;14726;17695;17980 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5 Rho GDP-dissociation inhibitor 1 ARHGDIA sp|P52565|GDIR1_HUMAN Rho GDP-dissociation inhibitor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGDIA PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 26 26 26 23.207 204 204 0 115.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0282 1.0782 7.2107 35 5 Leave out requantified 1.0671 1.1679 1.0037 1.0676 1.1454 1.182 1.092 0.97756 9.9081 12.895 4.7824 6.5635 9 9 9 8 0 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26 26 26 26 4255400000 2085400000 2170000000 1185100000 566670000 618440000 1177000000 564780000 612240000 1110400000 577570000 532880000 782820000 376420000 406400000 788 347;7521;14013;14014;17802 True;True;True;True;True 349;7600;14185;14186;18014 1389;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396;1397;31709;31710;31711;31712;31713;31714;31715;59436;59437;59438;59439;59440;59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;59448;59449;59450;59451;75532;75533;75534;75535 1807;1808;1809;1810;1811;1812;1813;1814;1815;1816;1817;1818;1819;1820;1821;1822;40201;40202;40203;40204;40205;40206;40207;40208;40209;40210;74857;74858;74859;74860;74861;74862;74863;74864;74865;74866;74867;74868;74869;74870;74871;74872;74873;74874;74875;74876;74877;74878;74879;74880;74881;74882;74883;95223;95224;95225;95226 1812;40205;74859;74879;95226 P52594 P52594 1 1 1 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 AGFG1 sp|P52594|AGFG1_HUMAN Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGFG1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 2.5 2.5 2.5 58.259 562 562 0.002103 3.5767 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.1503 2.2947 64.236 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 1 0 1 Median Median Median Median 2.5 2.5 0 2.5 65595000 32553000 33042000 17456000 6064200 11392000 24533000 13384000 11149000 0 0 0 23606000 13105000 10501000 789 14181 True 14353 60207;60208;60209 75772;75773;75774 75773 P52597 P52597 10 8 8 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed HNRNPF sp|P52597|HNRPF_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPF PE=1 SV=3 1 10 8 8 10 9 10 10 8 7 8 8 8 7 8 8 35.9 29.4 29.4 45.671 415 415 0 101.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1594 1.1323 16.333 42 16 Leave out requantified 1.1585 1.2025 1.0612 1.2596 1.1614 1.2086 1.1161 1.1159 15.748 10.018 24.859 12.189 11 9 11 11 4 2 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.9 34 35.9 35.9 1358900000 632160000 726720000 319790000 150230000 169560000 300490000 126950000 173540000 436350000 218610000 217750000 302250000 136380000 165870000 790 1430;5352;6411;7301;8359;13077;15083;16525;17202;17719 False;True;True;True;True;True;True;False;True;True 1453;5416;6480;7379;8449;13236;15269;16722;17406;17930 6141;6142;6143;6144;6145;6146;6147;22459;22460;22461;22462;26843;26844;26845;26846;30682;30683;30684;30685;30686;30687;30688;30689;30690;35336;35337;35338;35339;35340;35341;35342;55525;55526;55527;55528;55529;55530;63924;63925;63926;70111;70112;70113;70114;70115;70116;73051;73052;73053;73054;73055;75175;75176;75177;75178 7938;7939;7940;7941;7942;7943;7944;7945;7946;28690;28691;28692;28693;28694;28695;28696;34334;34335;38944;38945;38946;38947;38948;38949;38950;38951;38952;38953;38954;38955;38956;38957;44747;44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754;44755;69886;69887;69888;69889;69890;80595;80596;80597;88533;88534;88535;88536;88537;88538;88539;88540;88541;88542;92215;92216;92217;92218;92219;92220;94765;94766;94767;94768 7940;28691;34335;38949;44749;69888;80596;88538;92220;94765 P52701 P52701 30 30 30 DNA mismatch repair protein Msh6 MSH6 sp|P52701|MSH6_HUMAN DNA mismatch repair protein Msh6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSH6 PE=1 SV=2 1 30 30 30 25 27 26 24 25 27 26 24 25 27 26 24 28.2 28.2 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RNA polymerase II transcriptional coactivator p15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUB1 PE=1 SV=3 1 10 10 10 9 7 10 7 9 7 10 7 9 7 10 7 60.6 60.6 60.6 14.395 127 127 0 79.378 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91449 0.9184 20.596 51 12 Leave out requantified 0.96934 0.98546 0.8067 1.0732 1.019 0.99847 0.86953 0.95666 19.254 15.533 19.043 19.662 15 11 14 11 4 1 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 60.6 45.7 60.6 59.8 11195000000 5603000000 5592100000 3057600000 1542500000 1515000000 2827500000 1409500000 1417900000 3662400000 1832600000 1829800000 1647500000 818260000 829270000 810 2131;4259;4427;4899;4900;6264;6265;8734;13153;13154 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2163;2164;4314;4484;4958;4959;6333;6334;8828;13312;13313 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Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 DRG2 sp|P55039|DRG2_HUMAN Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DRG2 PE=1 SV=1 1 10 9 9 10 10 8 10 9 9 7 9 9 9 7 9 34.6 32.7 32.7 40.746 364 364 0 63.893 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9104 0.94372 31.701 41 9 Leave out requantified 0.87555 0.89871 0.86745 1.1306 0.93861 0.90311 0.95358 1.027 47.74 33.884 39.634 27.073 11 11 7 12 1 4 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.6 34.6 27.7 34.6 1138400000 618970000 519400000 312750000 174670000 138080000 298350000 162310000 136040000 257880000 153170000 104720000 269400000 128830000 140570000 820 1258;3427;5740;6660;7545;10989;13189;14885;16086;16478 True;True;True;True;True;True;False;True;True;True 1278;3473;5805;6732;7624;11106;13348;15066;16281;16675 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Median 13.7 13.7 13.7 0 282360000 136370000 145990000 118970000 45876000 73094000 111230000 51705000 59530000 52159000 38791000 13368000 0 0 0 824 2882;2963;3151 True;True;True 2922;3005;3196 12303;12304;12305;12306;12600;12601;12602;13430;13431 15834;15835;15836;15837;15838;15839;16185;16186;16187;17249;17250 15839;16187;17250 P55209 P55209 10 10 8 Nucleosome assembly protein 1-like 1 NAP1L1 sp|P55209|NP1L1_HUMAN Nucleosome assembly protein 1-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAP1L1 PE=1 SV=1 1 10 10 8 7 10 9 7 7 10 9 7 6 8 7 5 39.1 39.1 36.3 45.374 391 391 0 116.43 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1613 1.1799 75.503 45 13 Leave out requantified 1.3464 1.1341 0.96956 1.5051 1.3961 1.0965 1.0683 1.3364 101.84 83.589 67.987 53.796 10 15 12 8 2 6 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.6 39.1 32.7 17.6 3073600000 1459600000 1614000000 810020000 369290000 440730000 889560000 426320000 463230000 871500000 421680000 449820000 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Adenosine kinase ADK sp|P55263|ADK_HUMAN Adenosine kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADK PE=1 SV=2 1 10 10 10 8 7 7 6 8 7 7 6 8 7 7 6 36.5 36.5 36.5 40.545 362 362 0 63.496 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0707 1.0903 7.5829 27 4 Leave out requantified 0.95541 1.0408 1.0702 1.1461 1.0147 1.044 1.1435 1.0194 10.926 6.7123 13.188 23.657 6 8 7 6 0 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.4 24.3 21.8 18 804920000 391280000 413640000 208850000 93957000 114890000 223180000 109750000 113430000 223560000 116500000 107060000 149330000 71067000 78262000 826 45;563;2140;3906;4102;4103;4419;8449;8545;14162 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 46;568;2173;3955;4156;4157;4476;8540;8637;14334 206;2404;2405;2406;2407;9138;16589;17538;17539;17540;17541;17542;17543;17544;18727;18728;18729;18730;35715;35716;35717;35718;36138;36139;36140;36141;36142;36143;60132;60133 292;293;3124;3125;3126;11782;21354;22574;22575;22576;22577;22578;22579;22580;22581;22582;22583;24084;24085;24086;45244;45245;45246;45247;45796;45797;45798;45799;45800;45801;45802;75698;75699 293;3125;11782;21354;22578;22582;24085;45245;45799;75698 P55265 P55265 5 5 5 Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase ADAR sp|P55265|DSRAD_HUMAN Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAR PE=1 SV=4 1 5 5 5 1 2 2 4 1 2 2 4 1 2 2 4 4.3 4.3 4.3 136.06 1226 1226 0 7.8401 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0526 0.99943 68.992 6 3 Median NaN NaN NaN 1.2304 NaN NaN NaN 1.0896 NaN NaN NaN 67.961 0 1 1 4 0 1 0 2 Median Median Median Median 0.6 2 1.7 3.4 113600000 58592000 55009000 2440800 2440800 0 6727900 4945000 1783000 35285000 14452000 20832000 69148000 36754000 32394000 827 2408;5958;10899;11785;12510 True;True;True;True;True 2444;6024;11016;11920;12663 10298;24999;25000;25001;46462;50162;50163;50164;50165;53292 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transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXCT1 PE=1 SV=1 1 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 24 24 24 56.157 520 520 0 70.125 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99399 0.99493 10.349 43 20 Leave out requantified 0.92764 1.0299 0.98105 1.1419 0.96826 1.0335 1.0385 1.0441 10.534 17.879 7.3641 15.349 11 10 10 12 4 4 4 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.8 22.5 22.5 22.5 2105600000 1008400000 1097200000 603910000 297680000 306230000 543770000 259810000 283960000 552060000 269030000 283030000 405860000 181830000 224030000 832 551;1944;2301;5665;6435;6472;11515;11725;12666 True;True;True;True;True;True;True;True;True 556;1975;2337;5730;6504;6542;11648;11860;12821 2354;2355;2356;8358;9826;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;23806;23807;23808;23809;26946;26947;26948;26949;27087;27088;27089;27090;27091;27092;49041;49042;49043;49044;49045;49915;49916;49917;49918;53889;53890;53891;53892;53893;53894;53895;53896;53897 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Selenocysteine-specific elongation factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEFSEC PE=1 SV=4 1 8 8 8 5 4 6 6 5 4 6 6 5 4 6 6 19.1 19.1 19.1 65.304 596 596 0 23.415 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93682 0.86496 26.719 21 6 Leave out requantified 0.85131 0.85267 0.8531 1.1073 0.85758 0.83171 0.86335 0.97981 35.234 11.71 36.904 32.289 5 4 6 6 1 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.9 9.7 14.4 13.8 373380000 168270000 205110000 96214000 40437000 55777000 56739000 29217000 27522000 129610000 54837000 74776000 90815000 43784000 47032000 842 2704;5141;6443;9208;9354;9764;12320;16530 True;True;True;True;True;True;True;True 2741;5205;6512;9306;9455;9869;12472;16727 11583;11584;21644;21645;26980;26981;39286;39287;39288;39289;39986;39987;39988;39989;41649;41650;52550;52551;70133;70134;70135;70136 14879;14880;27711;27712;34492;34493;49705;49706;49707;49708;49709;50643;52655;66120;88564;88565;88566;88567 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P62306 P62306 1 1 1 Small nuclear ribonucleoprotein F SNRPF sp|P62306|RUXF_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPF PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 15.1 15.1 15.1 9.7251 86 86 0 15.359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 15.1 15.1 15.1 0 7601000 2167100 5433900 7601000 2167100 5433900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 903 6885 True 6958 28594;28595;28596 36454;36455;36456 36455 P62314 P62314 3 3 3 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 SNRPD1 sp|P62314|SMD1_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 3 1 37 37 37 13.281 119 119 0 5.807 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0001 1.046 32.057 6 3 Median NaN 1.0791 0.96404 NaN NaN 1.094 0.99926 NaN NaN 38.301 38.965 NaN 1 2 2 1 1 2 0 0 Median Median Median Median 9.2 9.2 37 10.9 255700000 132200000 123490000 42092000 18870000 23222000 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P67775;P62714 P67775;P62714 6;5 6;5 6;5 Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform PPP2CA;PPP2CB sp|P67775|PP2AA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2CA PE=1 SV=1;sp|P62714|PP2AB_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform OS=Homo sapiens OX=9606 G 2 6 6 6 6 6 6 3 6 6 6 3 6 6 6 3 26.9 26.9 26.9 35.594 309 309;309 0 48.787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.135 1.0868 69.627 26 8 Leave out requantified 1.1162 1.1151 1.0447 1.2777 1.1825 1.0771 1.0616 1.1332 13.346 78.761 15.579 34.324 7 9 7 3 3 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 26.9 26.9 26.9 10.4 876290000 384600000 491690000 248850000 107350000 141490000 278560000 118600000 159960000 251580000 112950000 138630000 97298000 45694000 51604000 950 1774;4073;4541;10571;14381;18009 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 6.4 6.4 3.5 17227000 7976700 9250200 0 0 0 6258400 3983600 2274800 0 0 0 10969000 3993100 6975400 966 7574;12238 True;True 7653;12387 31926;31927;52147 40446;40447;65619 40446;65619 P78346 P78346 4 4 4 Ribonuclease P protein subunit p30 RPP30 sp|P78346|RPP30_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPP30 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 2 22.4 22.4 22.4 29.321 268 268 0 15.617 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9932 0.95549 12.563 14 0 Leave out requantified 1 1.0852 0.87396 1.1645 0.97813 1.0634 0.89336 1.0297 12.306 13.342 7.4039 7.6829 4 4 4 2 0 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 14.9 14.9 16.8 9.3 378150000 192290000 185860000 112400000 60499000 51900000 114050000 58507000 55548000 99382000 49160000 50222000 52313000 24124000 28189000 967 6617;10813;12277;13411 True;True;True;True 6689;10929;12427;13574 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Median Median Median 2.8 7.3 6.2 9.7 97588000 50543000 47045000 16834000 8836900 7997100 28332000 16061000 12272000 19063000 10232000 8831000 33359000 15413000 17945000 969 36;525;7096;7807;12364;13535 True;True;False;True;False;True 37;530;7169;7887;12516;13699 169;170;171;2229;2230;2231;29550;29551;29552;32917;52717;52718;52719;57419 236;237;2906;2907;2908;37594;37595;37596;41777;66340;66341;66342;72251 237;2907;37596;41777;66341;72251 P78371 P78371 30 30 30 T-complex protein 1 subunit beta CCT2 sp|P78371|TCPB_HUMAN T-complex protein 1 subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCT2 PE=1 SV=4 1 30 30 30 29 28 28 24 29 28 28 24 29 28 28 24 68.2 68.2 68.2 57.488 535 535 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2376 1.2529 14.575 163 29 Leave out requantified 1.2969 1.2082 1.1957 1.2378 1.348 1.2273 1.2563 1.1381 17.88 11.794 16.912 18.997 42 41 44 36 7 5 8 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 66.2 66.2 64.9 54 16177000000 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1 BASP1 sp|P80723|BASP1_HUMAN Brain acid soluble protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BASP1 PE=1 SV=2 1 15 15 15 14 14 12 12 14 14 12 12 14 14 12 12 85.5 85.5 85.5 22.693 227 227 0 195.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.59769 0.6289 19.868 73 9 Leave out requantified 0.7632 0.59493 0.50961 0.55214 0.87333 0.62216 0.59244 0.55232 9.4474 20.729 24.298 17.633 18 18 17 20 3 1 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 85 85.5 85 85 2727700000 1655300000 1072300000 737170000 406300000 330870000 855390000 546760000 308630000 630070000 398680000 231380000 505030000 303590000 201450000 974 41;353;403;404;1155;1241;1242;4005;4513;4651;7010;8558;8754;9054;13601 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 42;355;406;407;1175;1261;1262;4056;4570;4709;7083;8650;8848;9151;13765 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PFKP sp|Q01813|PFKAP_HUMAN ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFKP PE=1 SV=2 1 34 34 31 30 31 32 26 30 31 32 26 28 29 29 24 51.1 51.1 46.4 85.595 784 784 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91199 0.9196 13.458 189 61 Leave out requantified 0.87487 0.94894 0.85665 1.0747 0.90911 0.93316 0.91925 0.97194 14.791 12.517 17.791 17.498 47 50 50 42 12 16 16 17 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 44.6 49.4 46.8 38.3 20885000000 10707000000 10178000000 5127000000 2709700000 2417300000 5918300000 3020300000 2898100000 6400400000 3363300000 3037200000 3439700000 1614000000 1825700000 1005 24;690;1080;2681;3901;4261;4852;5244;5559;6148;6276;7813;8675;8694;8955;9226;10415;10473;10492;11254;11304;11690;11755;12273;12274;12285;13117;13306;13775;15180;15580;16466;17207;17847 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Q0VDF9 Q0VDF9 6 6 6 Heat shock 70 kDa protein 14 HSPA14 sp|Q0VDF9|HSP7E_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA14 PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 3 3 5 4 3 3 5 4 3 3 5 22.4 22.4 22.4 54.794 509 509 0 49.651 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0877 1.0781 50.405 15 8 Leave out requantified 0.92088 0.82237 1.2217 1.2215 0.92911 0.83368 1.2614 1.1252 18.868 43.868 30.599 37.297 4 3 4 4 3 1 2 2 Median Median Median Median 14.5 9 10.6 19.4 221990000 108400000 113580000 52007000 28748000 23259000 49575000 27278000 22297000 63996000 27437000 36559000 56410000 24941000 31469000 1055 626;2299;4592;6384;7305;17231 True;True;True;True;True;True 632;2335;4650;6453;7383;17435 2668;2669;2670;2671;9815;9816;9817;9818;9819;9820;19438;26751;30701;30702;30703;73157;73158;73159 3472;3473;3474;3475;3476;3477;3478;12674;12675;12676;12677;12678;12679;24977;34228;38969;38970;38971;38972;92340;92341 3476;12678;24977;34228;38969;92340 Q0ZGT2 Q0ZGT2 2 2 2 Nexilin NEXN sp|Q0ZGT2|NEXN_HUMAN 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11 WASH complex subunit strumpellin KIAA0196 sp|Q12768|WASC5_HUMAN WASH complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASHC5 PE=1 SV=1 1 11 11 11 7 7 7 9 7 7 7 9 7 7 7 9 11.7 11.7 11.7 134.28 1159 1159 0 26.903 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89175 0.84946 19.16 29 5 Leave out requantified 0.84146 0.77421 0.86018 1.134 0.91398 0.78531 0.89416 1.0688 23.443 40.191 29.78 15.607 7 7 6 9 2 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 6.6 6.6 9.4 366170000 196460000 169710000 89256000 48592000 40664000 88100000 49521000 38579000 79390000 43404000 35986000 109420000 54940000 54479000 1061 931;2852;4110;9360;10697;12713;13591;15820;16046;16517;16963 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 943;2891;4164;9461;10812;12869;13755;16014;16241;16714;17167 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17934;19970;34915;34916;34917;34918;34919;38852;43431;43432;43433;43434;43435;43436;43437;43438;47282;62565;62566;62567;62568;62569;94984;94985;94986;95610;95611;95612;95613;95614;95615;95616;95617;95618;95619 17934;19970;34917;38852;43437;47282;62565;94985;95615 Q12802 Q12802 2 2 2 A-kinase anchor protein 13 AKAP13 sp|Q12802|AKP13_HUMAN A-kinase anchor protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP13 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 0 2 0 2 0 2 0 2 0 2 1.3 1.3 1.3 307.55 2813 2813 0.0026028 3.4121 By MS/MS By MS/MS 0.97928 0.9384 10.978 3 1 Median NaN 0.93467 NaN NaN NaN 0.9479 NaN NaN NaN 15.503 NaN NaN 0 2 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 1.3 0 1.3 35119000 13819000 21300000 0 0 0 27098000 10023000 17075000 0 0 0 8021400 3796100 4225300 1065 4198;10335 True;True 4253;10443 17912;17913;44047;44048 23041;55541;55542 23041;55541 Q12824 Q12824 3 3 3 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 SMARCB1 sp|Q12824|SNF5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCB1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 15.6 15.6 15.6 44.141 385 385 0 32.164 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86423 0.83986 17.964 8 4 Median 0.7267 0.86491 0.74046 1.0836 0.71073 0.83986 0.74637 0.96354 3.2929 11.037 31.962 0.3515 2 2 2 2 1 1 1 1 Median Median Median Median 10.6 15.6 10.6 10.6 231310000 110310000 121010000 50023000 24830000 25193000 52584000 24393000 28190000 66396000 36665000 29732000 62312000 24419000 37893000 1066 1624;13010;15158 True;True;True 1648;13168;15346 6935;6936;6937;6938;55299;64231;64232;64233;64234 8911;8912;8913;8914;69601;80980;80981;80982;80983 8911;69601;80983 Q12874 Q12874 9 9 9 Splicing factor 3A subunit 3 SF3A3 sp|Q12874|SF3A3_HUMAN Splicing factor 3A subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3A3 PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 4 5 7 6 4 5 7 6 4 5 7 21.8 21.8 21.8 58.848 501 501 0 27.975 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0289 1.0794 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sapiens OX=9606 GN=TP53BP1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 3 2 0 2 3 2 0 2 3 2 0 3.2 3.2 3.2 213.57 1972 1972 0 13.324 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3315 1.4143 43.105 4 2 Median NaN 2.038 NaN NaN NaN 2.0694 NaN NaN NaN 63.898 NaN NaN 1 2 1 0 0 2 0 0 Median Median Median Median 1.9 2.1 1.9 0 53278000 23117000 30161000 13336000 8406600 4929500 23949000 9306200 14643000 15993000 5403800 10589000 0 0 0 1068 5850;8751;10148;16629 True;True;True;True 5916;8845;10255;16829 24600;37178;37179;43283;70619;70620;70621 31438;47134;47135;54605;89185;89186;89187 31438;47134;54605;89187 Q12894 Q12894 2 2 2 Interferon-related developmental regulator 2 IFRD2 sp|Q12894|IFRD2_HUMAN Interferon-related developmental regulator 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFRD2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 5.1 5.1 5.1 54.813 506 506 0 8.6889 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95564 0.94776 14.658 6 5 Median NaN 0.95442 0.87617 NaN NaN 0.93164 0.89152 NaN NaN 26.62 12.269 NaN 1 2 2 1 1 2 2 0 Median Median Median Median 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enhancer-binding factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILF2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 13.1 13.1 13.1 43.062 390 390 0 12.078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2008 1.2601 11.254 17 2 Leave out requantified 1.79 1.1522 1.1316 1.1918 1.9904 1.2591 1.2948 1.0874 47.739 11.219 3.8499 18.917 4 5 4 4 1 1 0 0 Linear Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.8 13.1 10.8 10.8 351820000 159870000 191950000 95968000 43665000 52302000 98016000 43886000 54130000 97206000 45265000 51941000 60629000 27052000 33577000 1071 1667;8014;16668;17470 True;True;True;True 1691;8099;16868;17677 7114;33848;33849;33850;33851;33852;33853;33854;33855;70790;70791;70792;70793;74134;74135;74136;74137 9151;42941;42942;42943;42944;42945;42946;89383;89384;89385;93471;93472;93473;93474;93475;93476;93477 9151;42942;89384;93473 Q12906 Q12906 10 10 9 Interleukin enhancer-binding factor 3 ILF3 sp|Q12906|ILF3_HUMAN Interleukin enhancer-binding factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 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2188;2189;2190;2191;2192;2193;2194;2195;13073;13074;13075;13076;13077;13078;13079;13080;13081;13082;13083;13084;13085;13086;14480;14481;14482;19300;19301;19302;19303;21930;21931;21932;21933;23870;23871;23872;23873;23874;23875;23876;23877;38857;44704;45107;45108;45109;45110;45111;45112;65041;65042;65626;66537;66538;66539;66540;67674;67675;75509;75510;75511;75512;80440;80441;80442;80443;80444;87638;87639;87640;87641;87642;87643;90333;90334;90335;90336;91976;91977;91978;92047;93902;93903 2194;13083;14481;19302;21931;23870;38857;44704;45112;65041;65626;66538;67675;75510;80441;87643;90334;91977;91978;92047;93903 Q12972 Q12972 6 6 6 Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1;Activator of RNA decay PPP1R8 sp|Q12972|PP1R8_HUMAN Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R8 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 6 4 3 4 6 4 3 4 6 4 3 28.8 28.8 28.8 38.478 351 351 0 31.981 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97051 1.0154 3.7047 18 11 Leave out requantified 0.92494 0.99986 0.852 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ACACA sp|Q13085|ACACA_HUMAN Acetyl-CoA carboxylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACACA PE=1 SV=2 2 15 15 15 12 10 13 12 12 10 13 12 12 10 13 12 9.8 9.8 9.8 265.55 2346 2346;2458 0 52.129 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1251 1.0952 19.788 47 15 Leave out requantified 1.3029 1.0858 1.0504 1.1666 1.3793 1.0821 1.0764 1.0556 9.1765 19.137 19.988 18.024 12 10 13 12 6 0 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 5.8 8 7 758830000 373440000 385390000 202120000 95866000 106250000 190130000 96111000 94019000 224780000 113130000 111660000 141800000 68334000 73466000 1082 2173;3056;3369;6772;7734;7810;7857;8004;8395;10200;12901;13199;14269;15875;17099 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2206;3100;3415;6844;7813;7890;7940;8089;8486;10307;13057;13358;14442;16069;17303 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3 3 Serine/threonine-protein kinase ATR ATR sp|Q13535|ATR_HUMAN Serine/threonine-protein kinase ATR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATR PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1.6 1.6 1.6 301.36 2644 2644 0 6.3572 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8531 0.81097 30.75 6 2 Leave out requantified 0.76172 0.61542 NaN 1.2315 0.82597 0.61815 NaN 1.1415 50.382 5.2443 NaN 4.7093 2 2 0 2 2 0 0 0 Median Median Median Median 0.5 1.2 0 1.1 64544000 35403000 29141000 22743000 11060000 11682000 23511000 15240000 8270900 0 0 0 18291000 9103000 9187600 1118 1482;4120;15513 True;True;True 1505;4174;15705 6351;6352;6353;17607;17608;65792 8185;8186;8187;8188;22661;82977 8187;22661;82977 Q13547 Q13547 8 8 7 Histone deacetylase 1 HDAC1 sp|Q13547|HDAC1_HUMAN Histone deacetylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDAC1 PE=1 SV=1 1 8 8 7 8 6 7 4 8 6 7 4 7 5 6 3 22.6 22.6 20.1 55.102 482 482 0 62.157 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93321 0.93273 15.432 30 4 Leave out requantified 0.97462 0.92126 0.83797 0.98527 0.95201 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protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta CAMK2D;CAMK2A;CAMK2G;CAMK2B sp|Q13557|KCC2D_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK2D PE=1 SV=3;sp|Q9UQM7|KCC2A_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK2A PE 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 5 5 56.369 499 499;478;558;666 0 7.6729 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0113 1.118 14.548 8 1 Leave out requantified 1.135 0.97287 1.1239 0.66248 1.2662 1.0244 1.2634 0.64257 3.0482 18.647 15.363 12.113 2 2 2 2 0 0 0 1 Median Median Median Median 5 5 5 5 82742000 39540000 43202000 23218000 10230000 12989000 20868000 10312000 10555000 26616000 11823000 14793000 12040000 7175800 4864300 1120 2610;5536 True;True 2646;5601 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EKC/KEOPS complex subunit LAGE3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAGE3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 27.3 27.3 27.3 14.804 143 143 0 13.457 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81681 0.81052 40.863 8 3 Leave out requantified 0.99797 1.0241 0.78177 1.0989 0.9778 0.98626 0.78129 0.98325 24.719 5.6739 35.668 53.997 2 2 2 2 1 1 0 1 Median Median Median Median 27.3 27.3 27.3 27.3 78545000 43195000 35350000 19836000 12583000 7252700 20853000 8676300 12177000 23968000 14196000 9772500 13888000 7740200 6148100 1165 1994;6152 True;True 2025;6221 8553;8554;8555;8556;25778;25779;25780;25781;25782 10979;10980;10981;10982;32952;32953;32954;32955;32956 10980;32955 Q14667 Q14667 2 2 2 Protein KIAA0100 KIAA0100 sp|Q14667|K0100_HUMAN Protein KIAA0100 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIAA0100 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 1.6 1.6 1.6 253.7 2235 2235 0.0005531 4.263 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0711 1.0529 81.548 4 1 Median 2.3066 NaN NaN NaN 2.3898 NaN NaN NaN 113.65 NaN NaN NaN 2 1 1 0 1 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3502 1.3297 43.422 6 4 Median 1.6194 1.1489 NaN NaN 1.6344 1.1179 NaN NaN 33.801 29.164 NaN NaN 2 2 1 1 2 1 1 0 Median Median Median Median 6.9 6.9 2.4 2.4 109610000 48638000 60971000 38620000 13789000 24830000 42290000 22876000 19414000 11182000 2923900 8258500 17518000 9048700 8469200 1253 3706;10522;15054 True;True;True 3753;10635;15239 15768;15769;15770;44915;44916;44917;63799 20315;20316;20317;56611;56612;56613;80414 20315;56612;80414 Q16555;Q14194 Q16555 21;2 21;2 18;1 Dihydropyrimidinase-related protein 2 DPYSL2 sp|Q16555|DPYL2_HUMAN Dihydropyrimidinase-related protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPYSL2 PE=1 SV=1 2 21 21 18 20 18 20 15 20 18 20 15 17 16 17 13 51.2 51.2 43.7 62.293 572 572;572 0 160.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0719 1.0667 14.34 86 23 Leave out requantified 1.0674 0.9725 0.99724 1.1719 1.0688 1.0003 1.0408 1.0667 19.74 11.425 24.07 11.276 24 23 23 16 7 7 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.7 43.4 49.3 37.1 2710800000 1347000000 1363800000 776310000 372410000 403900000 823040000 426260000 396780000 778540000 389540000 389000000 332890000 158780000 174110000 1254 1127;2369;2780;6254;6460;6746;6860;7466;7930;8460;8464;8967;11160;11452;11493;12704;12988;14518;15267;15963;16408 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1147;2405;2818;6323;6529;6818;6932;7544;8013;8551;8555;9064;11278;11582;11624;12860;13146;14696;15458;16158;16605 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 3.5 3.5 3.5 3.5 820190000 384090000 436100000 207230000 100250000 106970000 233070000 101040000 132020000 235980000 117810000 118170000 143930000 64988000 78938000 1265 15397 True 15588 65324;65325;65326;65327 82416;82417;82418;82419;82420;82421;82422;82423 82419 Q16881;Q9NNW7 Q16881 11;1 11;1 11;1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic TXNRD1 sp|Q16881|TRXR1_HUMAN Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNRD1 PE=1 SV=3 2 11 11 11 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 10 10 24.3 24.3 24.3 70.905 649 649;524 0 74.807 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1557 1.1066 23.384 38 15 Leave out requantified 1.25 0.91151 1.0542 1.3717 1.2453 0.92363 1.0656 1.2336 21.567 29.03 20.033 26.579 9 8 11 10 3 3 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.2 18.2 22.8 20.5 1086700000 482790000 603930000 294070000 120190000 173880000 259660000 123020000 136640000 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out requantified Leave out requantified Median Median 5.2 8.4 1.7 5.7 161520000 93792000 67725000 57701000 36469000 21233000 61580000 34345000 27235000 9402600 3979700 5422900 32832000 18998000 13834000 1279 385;3972;3992;4499;4547;7090;13431 True;True;True;True;True;True;True 388;4022;4043;4556;4604;7163;13595 1592;1593;1594;16931;16932;17020;17021;19075;19076;19256;19257;19258;29511;29512;29513;57026 2072;2073;2074;21816;21817;21818;21819;21928;21929;24535;24536;24748;24749;24750;37556;37557;71766;71767 2074;21817;21929;24536;24750;37557;71767 Q3LXA3 Q3LXA3 7 7 7 Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) DAK sp|Q3LXA3|TKFC_HUMAN Triokinase/FMN cyclase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKFC PE=1 SV=2 1 7 7 7 3 6 3 4 3 6 3 4 3 6 3 4 16 16 16 58.946 575 575 0 29.489 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9453 0.93245 32.952 17 5 Leave out requantified 1.0778 0.93232 3.4637 0.81539 1.0563 0.93601 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8713;25156;25157;25158;25159;25160;25161;25162;25163;38321;38322;38848;38849;38850;38851;47283;47284;47285;47286;47287;47288;47289;47290;47291;47292;47293;80514;80515;80516;80517;80518;80519;92772;92773;92774;94984;94985;94986 8713;25157;38322;38848;47292;80519;92773;94985 Q6IBW4 Q6IBW4 2 2 2 Condensin-2 complex subunit H2 NCAPH2 sp|Q6IBW4|CNDH2_HUMAN Condensin-2 complex subunit H2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCAPH2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 3.1 3.1 3.1 68.226 605 605 0 6.2193 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98662 0.93054 24.25 10 6 Leave out requantified 0.61501 1.1375 0.77948 0.82286 0.58966 1.0854 0.78391 0.73393 113.11 2.4813 60.088 90.033 2 2 3 3 2 0 2 2 Median Median Median Median 1.5 3.1 3.1 3.1 123740000 61991000 61748000 20604000 11206000 9397600 27746000 13264000 14482000 38204000 20764000 17439000 37186000 16756000 20430000 1346 4926;5612 True;True 4985;5677 20731;20732;20733;20734;20735;20736;20737;23565;23566;23567 26585;26586;26587;26588;26589;26590;26591;26592;30118;30119;30120 26585;30120 Q6IQ21 Q6IQ21 1 1 1 Zinc finger protein 770 ZNF770 sp|Q6IQ21|ZN770_HUMAN Zinc finger protein 770 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF770 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 80.006 691 691 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.064838 0.071692 18.691 4 4 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 1 1 Median Median Median Median 2 2 2 2 44512000 42194000 2318600 10661000 9805400 855180 7277900 6595600 682330 17090000 16567000 523340 9483700 9225900 257780 + 1347 9066 True 9163 38616;38617;38618;38619 48923;48924;48925;48926 48926 176 415 Q6L8Q7 Q6L8Q7 5 5 5 2,5-phosphodiesterase 12 PDE12 sp|Q6L8Q7|PDE12_HUMAN 2,5-phosphodiesterase 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE12 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 3 3 4 3 3 3 4 3 3 3 11.2 11.2 11.2 67.351 609 609 0 11.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92917 0.93059 10.472 14 7 Leave out requantified 0.87189 0.99021 0.83735 0.92972 0.8916 0.97128 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out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 7.3 10.4 7.3 4.9 200240000 98820000 101420000 43118000 19398000 23720000 60507000 31350000 29158000 62297000 31405000 30893000 34318000 16668000 17650000 1349 4811;6171;7441;9244 True;True;True;True 4870;6240;7519;9342 20285;20286;25859;25860;25861;31379;31380;31381;31382;39449;39450;39451 26036;33040;39804;39805;39806;39807;39808;49905;49906;49907 26036;33040;39805;49907 Q6NXR4 Q6NXR4 4 4 4 TELO2-interacting protein 2 TTI2 sp|Q6NXR4|TTI2_HUMAN TELO2-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTI2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 4 2 2 2 4 2 2 2 4 2 12.2 12.2 12.2 56.914 508 508 0 12.073 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92611 1.0259 99.549 10 3 Leave out requantified 1.1239 0.53878 0.88795 0.64105 1.2081 0.57037 0.9903 0.63231 35.629 88.028 92.274 106.49 2 2 4 2 0 1 1 1 Median Median Leave out requantified Median 6.7 7.5 12.2 7.5 226610000 147850000 78753000 45142000 26221000 18920000 46633000 30561000 16072000 102050000 72156000 29898000 32778000 18916000 13863000 1350 2577;9948;16814;17572 True;True;True;True 2613;10054;17016;17780 11023;11024;42419;71426;71427;71428;74548;74549;74550;74551 14158;14159;53590;90194;90195;90196;90197;93978;93979;93980;93981;93982;93983 14159;53590;90197;93979 Q6NYC1 Q6NYC1 7 7 7 Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6 JMJD6 sp|Q6NYC1|JMJD6_HUMAN Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JMJD6 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 6 5 3 6 6 5 3 6 6 5 3 18.4 18.4 18.4 46.461 403 403 0 25.934 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95342 0.93476 20.465 20 7 Leave out requantified 0.76341 0.95224 1.0209 1.1436 0.78879 0.93325 1.1069 1.0463 27.589 15.783 31.01 9.9507 5 7 6 2 1 3 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 15.9 18.4 15.9 10.2 416470000 213810000 202650000 103190000 53279000 49915000 148420000 75756000 72665000 125490000 65375000 60116000 39360000 19403000 19957000 1351 227;1766;2139;5076;5077;17447;17476 True;True;True;True;True;True;True 228;1795;2172;5139;5140;17654;17683 981;982;983;7557;7558;7559;7560;9133;9134;9135;9136;9137;21351;21352;21353;21354;21355;21356;21357;74068;74161;74162;74163 1270;1271;1272;9743;9744;9745;11775;11776;11777;11778;11779;11780;11781;27353;27354;27355;27356;27357;27358;27359;27360;93408;93509;93510;93511;93512;93513 1271;9743;11778;27353;27356;93408;93509 Q6P582;Q6NZ67 Q6P582;Q6NZ67 1;1 1;1 1;1 Mitotic-spindle organizing protein 2A;Mitotic-spindle organizing protein 2B MZT2A;MZT2B sp|Q6P582|MZT2A_HUMAN Mitotic-spindle organizing protein 2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MZT2A PE=1 SV=2;sp|Q6NZ67|MZT2B_HUMAN Mitotic-spindle organizing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MZT2B PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.9 13.9 13.9 16.22 158 158;158 0 4.9966 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.98902 0.97582 10.163 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 13.9 13.9 13.9 13.9 56370000 30494000 25876000 20400000 12048000 8352200 10273000 5233200 5040300 14978000 8444900 6533500 10718000 4767900 5950200 1352 9284 True 9382 39627;39628;39629;39630 50158;50159;50160;50161 50158 Q6NZI2 Q6NZI2 4 4 4 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 18.7 18.7 18.7 43.476 390 390 0 49.338 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61147 0.67384 39.937 6 1 Leave out requantified NaN 0.76543 0.58456 NaN NaN 0.80552 0.61961 NaN NaN 24.285 11.866 NaN 1 2 2 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 3.3 7.7 9.7 4.6 103000000 57057000 45948000 16251000 10800000 5451200 26201000 14026000 12175000 35860000 21442000 14417000 24693000 10789000 13905000 1353 1429;7817;12365;16909 True;True;True;True 1452;7898;12517;17112 6140;32958;52720;71809;71810;71811 7936;7937;41818;66343;90692;90693 7937;41818;66343;90692 Q6P158 Q6P158 2 2 2 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 DHX57 sp|Q6P158|DHX57_HUMAN Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX57 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 1 0 2 2 1 0 2 2 1 0 2.2 2.2 2.2 155.6 1386 1386 0.0045068 2.8987 By MS/MS By MS/MS By matching 1.062 1.1532 17.467 5 0 Leave out requantified 1.0417 1.0846 NaN NaN 1.1851 1.1655 NaN NaN 24.335 15.963 NaN NaN 2 2 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.2 2.2 1.3 0 55768000 25112000 30655000 25081000 11570000 13511000 22044000 9629400 12415000 8642000 3913300 4728700 0 0 0 1354 9503;13417 True;True 9605;13581 40546;40547;40548;56958;56959 51313;51314;71690;71691;71692 51313;71692 Q6P1J9 Q6P1J9 11 11 11 Parafibromin CDC73 sp|Q6P1J9|CDC73_HUMAN Parafibromin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC73 PE=1 SV=1 1 11 11 11 7 9 10 6 7 9 10 6 7 9 10 6 21.8 21.8 21.8 60.576 531 531 0 25.573 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93703 0.96674 12.302 30 11 Leave out requantified 0.88497 1.1402 0.93837 1.0008 0.91396 1.1833 0.9482 0.90295 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Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTHFD1L PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 6 4 5 6 6 4 5 6 6 4 5 8.6 8.6 8.6 105.79 978 978 0 24.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0055 0.9807 8.4802 23 9 Leave out requantified 0.91509 1.1227 0.89538 1.0749 0.93758 1.13 0.97574 1.0074 21.252 10.079 12.858 8.4978 6 7 5 5 2 3 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.5 7.5 4.6 6.4 334010000 173860000 160150000 93913000 47804000 46109000 109070000 55564000 53501000 78666000 45937000 32729000 52363000 24552000 27811000 1366 368;2207;4772;5801;7971;10619;18090 True;True;True;True;True;True;True 371;2240;4831;5866;8054;10734;18304 1514;9380;9381;9382;9383;20141;20142;20143;20144;24390;24391;24392;33675;33676;33677;33678;45314;45315;45316;45317;45318;45319;45320;76715;76716;76717 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14855;14856;14857;14858;14859;14860;17102;17103;17104;17105;17106;17107;45654;45655;45656;45657;45658;45659;45660;45661;57508;57509;57510;57511;57512;57513;57514;57995;57996;57997 19131;19132;19133;19134;19135;19136;22026;22027;22028;57535;57536;57537;57538;57539;57540;57541;57542;72372;72373;72374;72375;72376;72377;72978;72979;72980 19132;22026;22028;57535;72374;72979 Q6VY07 Q6VY07 5 5 5 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 PACS1 sp|Q6VY07|PACS1_HUMAN Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACS1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 2 3 2 4 2 3 2 4 2 3 2 6.6 6.6 6.6 104.9 963 963 0 9.2041 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78296 0.79676 1.865 6 1 Leave out requantified 0.73689 NaN NaN 0.9289 0.79332 NaN NaN 0.86256 1.2528 NaN NaN 4.8645 2 1 1 2 1 0 0 0 Median Median Median Median 5.2 2.3 4.4 2.9 78603000 46245000 32358000 22176000 13908000 8267500 12857000 6469300 6388000 19466000 13333000 6132700 24104000 12534000 11570000 1368 3032;5267;8538;13741;14499 True;True;True;True;True 3076;5331;8629;13907;14677 12932;22142;22143;22144;22145;36093;36094;36095;58227;61502;61503 16636;28328;28329;28330;28331;28332;45725;73259;77439;77440 16636;28329;45725;73259;77440 Q6WCQ1 Q6WCQ1 4 4 4 Myosin phosphatase Rho-interacting protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 3 7.7 7.7 7.7 116.53 1025 1025 0 17.265 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1025 1.1358 2.0595 10 3 Leave out requantified 0.86125 4.3546 0.75396 1.4476 0.93862 1.2461 0.82855 1.3874 20.551 78.98 13.245 13.854 2 3 2 3 1 1 0 1 Median Plateau Median Median 4.2 7.7 6 6 162700000 67933000 94768000 24349000 13407000 10942000 60661000 19800000 40861000 32172000 17408000 14764000 45518000 17317000 28201000 1369 367;7348;10065;16144 True;True;True;True 370;7426;10171;16339 1513;30912;30913;30914;42929;42930;42931;42932;68403;68404;68405;68406 1981;39209;39210;39211;54194;86331;86332;86333;86334;86335;86336;86337;86338 1981;39210;54194;86335 Q6XZF7 Q6XZF7 3 3 3 Dynamin-binding protein DNMBP sp|Q6XZF7|DNMBP_HUMAN Dynamin-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNMBP PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2.8 2.8 2.8 177.35 1577 1577 0 7.5262 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90615 0.88087 7.548 14 1 Leave out requantified 1.0231 0.95748 0.7948 1.0287 1.085 0.92916 0.83325 0.94308 12.114 7.1722 12.788 8.1748 3 3 4 4 0 0 0 1 Plateau Median Leave out requantified Median 2.1 2.1 2.1 2.8 165540000 85947000 79595000 36964000 20155000 16809000 38672000 19319000 19353000 54334000 28144000 26190000 35571000 18329000 17243000 1370 3933;13933;14083 True;True;True 3982;14104;14255 16705;16706;16707;16708;59094;59095;59096;59097;59098;59099;59100;59101;59102;59753 21507;74441;74442;74443;74444;74445;74446;74447;74448;74449;75233 21507;74445;75233 Q6Y7W6 Q6Y7W6 2 2 2 PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2 GIGYF2 sp|Q6Y7W6|GGYF2_HUMAN GRB10-interacting GYF protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GIGYF2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1.8 1.8 1.8 150.07 1299 1299 0 4.9808 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75226 0.77406 29.247 7 1 Leave out requantified 0.75226 0.65031 0.53364 NaN 0.81954 0.66838 0.591 NaN 37.323 26.846 2.6 NaN 2 2 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.8 1.8 1.8 0.9 60007000 35049000 24958000 17376000 9890200 7486200 18821000 11846000 6974900 17291000 10179000 7111500 6518600 3132900 3385700 1371 1000;15104 True;True 1015;15292 4284;4285;4286;64010;64011;64012;64013 5484;80708;80709;80710;80711 5484;80710 Q6YN16 Q6YN16 1 1 1 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 HSDL2 sp|Q6YN16|HSDL2_HUMAN Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSDL2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 4.3 4.3 4.3 45.394 418 418 0 4.9088 By MS/MS By MS/MS 1.4643 1.5057 17.537 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 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alpha-1A chain;Tubulin alpha-3E chain TUBA1A;TUBA3E sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN Tubulin alpha-1A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1A PE=1 SV=1;sp|P0DPH8|TBA3D_HUMAN Tubulin alpha-3D chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA3D PE=1 SV=1;sp|P0DPH7|TBA3C_HUMAN Tubulin alpha-3C chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA3C 4 26 2 0 25 24 25 23 2 2 2 1 0 0 0 0 69.2 3.1 0 50.135 451 451;450;450;450 0 12.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1309 1.252 32.845 12 1 Leave out requantified 0.85889 1.0231 0.92601 1.1394 0.93381 1.0333 1.0129 1.0461 53.628 52.802 27.569 3.7399 3 4 3 2 0 1 0 0 Median Median Median Median 69.2 69.2 60.8 60.5 1354200000 687590000 666580000 351080000 191510000 159570000 343460000 163780000 179680000 382610000 198830000 183780000 277020000 133480000 143550000 1376 507;508;1513;1552;1677;3119;3179;3411;3417;3480;3481;3904;4979;4985;6192;7755;9390;10765;10766;11869;12825;12826;13448;15317;15353;16470 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translation initiation factor 3 subunit M OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3M PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 9 8 9 7 9 8 9 7 9 8 9 27.8 27.8 27.8 42.502 374 374 0 44.375 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0708 0.99327 19.412 35 5 Leave out requantified 1.0976 1.0984 1.1027 1.1109 1.1071 1.0477 1.1872 0.99728 20.356 19.588 16.781 21.419 7 10 8 10 0 3 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.9 27.8 23 27.8 1263900000 611040000 652850000 302840000 140280000 162550000 382340000 184460000 197880000 283940000 145520000 138420000 294770000 140770000 154000000 1385 2205;3714;10309;10338;10339;12159;16033;16926;17494 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2238;3761;10416;10446;10447;12306;16228;17130;17702 9373;9374;9375;9376;15799;15800;15801;43940;43941;43942;43943;43944;43945;43946;43947;43948;44057;44058;44059;44060;44061;44062;44063;44064;51831;51832;51833;51834;67933;67934;67935;67936;71879;71880;74229;74230;74231;74232 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Median 0 5.1 5.1 5.1 25267000 10438000 14829000 0 0 0 7742100 2941100 4801000 10573000 3989600 6583300 6952000 3506900 3445200 1392 4047 True 4100 17253;17254;17255 22196 22196 Q7LBC6;Q9Y4C1 Q7LBC6 11;1 11;1 11;1 Lysine-specific demethylase 3B KDM3B sp|Q7LBC6|KDM3B_HUMAN Lysine-specific demethylase 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM3B PE=1 SV=2 2 11 11 11 5 6 7 9 5 6 7 9 5 6 7 9 8.2 8.2 8.2 191.58 1761 1761;1321 0 35.433 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77841 0.78551 31.102 26 5 Leave out requantified 0.698 0.86716 0.78915 0.86807 0.76869 0.90638 0.85145 0.81467 17.347 14.422 29.838 45.699 5 6 6 9 1 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.4 5.2 6 6.7 331290000 188250000 143030000 65167000 37466000 27700000 80651000 45216000 35435000 67658000 38115000 29543000 117810000 67455000 50355000 1393 4412;5219;5960;6112;8252;9671;13087;13695;15291;16047;16110 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4469;5283;6026;6181;8342;9774;13246;13859;15482;16242;16305 18705;21951;25003;25628;25629;25630;25631;34851;34852;41191;41192;41193;41194;55572;58034;58035;58036;58037;64897;64898;64899;67991;67992;68257;68258;68259;68260 24049;28079;31919;32753;32754;32755;32756;44136;44137;52064;52065;69942;73022;73023;73024;73025;73026;73027;73028;73029;73030;73031;73032;81858;81859;81860;85779;86143;86144;86145;86146 24049;28079;31919;32755;44136;52065;69942;73030;81860;85779;86143 Q7LBR1 Q7LBR1 4 4 4 Charged multivesicular body protein 1b CHMP1B sp|Q7LBR1|CHM1B_HUMAN Charged multivesicular body protein 1b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP1B PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 1 4 4 4 1 4 4 4 1 15.1 15.1 15.1 22.109 199 199 0 5.8568 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 0.93445 0.95428 17.153 13 2 Leave out requantified 0.78232 1.0191 0.89202 NaN 0.7828 1.0037 0.9183 NaN 21.696 18.815 8.669 NaN 4 4 4 1 1 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 15.1 15.1 15.1 3.5 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Q7Z2W4 3 3 3 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 ZC3HAV1 sp|Q7Z2W4|ZCCHV_HUMAN Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HAV1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1 4.9 4.9 4.9 101.43 902 902 0 20.136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0805 1.0832 15.761 2 2 Median 1.0805 NaN NaN NaN 1.0832 NaN NaN NaN 15.761 NaN NaN NaN 2 0 0 0 2 0 0 0 Median Median Median Median 3.4 0 3.1 1.4 23101000 10040000 13060000 23101000 10040000 13060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1396 1352;14561;16190 True;True;True 1373;14739;16385 5786;5787;61738;61739;68592 7485;7486;77743;77744;86570 7486;77744;86570 Q7Z2Z2 Q7Z2Z2 4 4 4 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 EFTUD1 sp|Q7Z2Z2|EFL1_HUMAN Elongation factor-like GTPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFL1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 6.4 6.4 6.4 125.43 1120 1120 0 19.278 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1583 1.1513 30.566 11 1 Leave out requantified 1.1058 0.88539 1.1583 1.6465 1.2074 0.85925 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retardation-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUFIP2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 4 10.4 10.4 10.4 76.12 695 695 0 19.268 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71224 0.69857 6.5664 12 6 Leave out requantified 0.77916 0.72096 0.72926 0.88982 0.77153 0.71051 0.82284 0.77844 19.194 19.535 29.304 26.927 3 2 3 4 2 0 1 3 Median Median Median Median 3.6 3.6 5.2 8.8 149430000 83475000 65958000 33873000 19222000 14651000 27938000 16158000 11780000 34270000 20861000 13410000 53353000 27234000 26118000 1400 5784;8088;11967;12640;13900 True;True;True;True;True 5849;8177;12106;12795;14071 24318;34165;34166;34167;34168;51022;51023;51024;51025;51026;51027;53791;58939 31093;43319;43320;43321;43322;64113;64114;64115;64116;64117;64118;64119;64120;67673;74233 31093;43322;64113;67673;74233 Q7Z443 Q7Z443 1 1 1 Polycystic kidney disease protein 1-like 3 PKD1L3 sp|Q7Z443|PK1L3_HUMAN Polycystic kidney disease protein 1-like 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKD1L3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 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domain-containing family protein 1 YTHDF3;YTHDF1 sp|Q7Z739|YTHD3_HUMAN YTH domain-containing family protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDF3 PE=1 SV=1;sp|Q9BYJ9|YTHD1_HUMAN YTH domain-containing family protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDF1 PE=1 SV=1 2 4 4 1 4 4 4 3 4 4 4 3 1 1 1 1 6.5 6.5 2.2 63.86 585 585;559 0 10.093 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97526 0.93677 14.862 15 1 Leave out requantified 0.9731 0.97055 0.82675 0.95918 0.9901 0.98519 0.81747 0.88211 20.165 11.929 10.409 7.2042 4 4 4 3 0 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.5 6.5 6.5 5.3 424100000 231580000 192520000 108030000 58740000 49293000 110220000 57838000 52383000 115930000 65000000 50927000 89921000 50000000 39921000 1410 2192;3022;9553;14858 True;True;True;True 2225;3066;9655;15038 9330;9331;9332;12890;12891;12892;12893;40726;40727;40728;40729;40730;62962;62963;62964;62965 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factor 5, axonemal DNAAF5 sp|Q86Y56|DAAF5_HUMAN Dynein assembly factor 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAAF5 PE=1 SV=4 1 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11.2 11.2 11.2 93.52 855 855 0 21.927 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0945 1.0705 35.007 23 7 Leave out requantified 1.0963 1.2245 0.86555 1.0807 1.0697 1.1767 0.9064 0.98755 51.198 52.817 23.303 14.979 6 5 6 6 2 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.6 7.6 7.4 7.5 450480000 282140000 168340000 125690000 82144000 43545000 113790000 75735000 38052000 136620000 90500000 46125000 74377000 33763000 40614000 1427 213;723;813;1918;3782;4173;9372;10236;13409 True;True;True;True;True;True;True;True;True 214;732;823;1949;3831;4228;9473;10343;13572 915;916;3092;3093;3094;3095;3461;3462;3463;3464;8263;8264;8265;16091;16092;17822;17823;17824;40039;43638;43639;43640;43641;56920 1190;1191;4019;4020;4021;4495;4496;4497;10611;10612;10613;20756;20757;22917;50706;55042;71644 1190;4020;4496;10611;20757;22917;50706;55042;71644 Q86YR7 Q86YR7 1 1 1 Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2 MCF2L2 sp|Q86YR7|MF2L2_HUMAN Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCF2L2 PE=2 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 126.99 1114 1114 0.0095877 2.3953 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.1377 1.2061 14.422 7 1 Median 1.273 1.1109 1.1163 NaN 1.3269 1.154 1.1987 NaN 13.494 21.218 10.201 NaN 2 2 2 1 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.4 1.4 1.4 1.4 688210000 320460000 367750000 231930000 96446000 135490000 192550000 93417000 99135000 232300000 114660000 117650000 31417000 15940000 15477000 1428 13974 True 14145 59281;59282;59283;59284;59285;59286;59287 74676;74677;74678;74679;74680;74681 74677 Q8IUD2 Q8IUD2 2 2 2 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 ERC1 sp|Q8IUD2|RB6I2_HUMAN ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 2.1 2.1 2.1 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RNA helicase DHX40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX40 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.7 1.7 1.7 88.559 779 779 0.0045386 2.9638 By matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.99848 1.0181 13.181 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 1.7 1.7 1.7 1.7 50786000 25412000 25373000 12400000 5860700 6538800 11166000 4957600 6207900 17330000 9516900 7813600 9890400 5077200 4813100 1438 9775 True 9880 41698;41699;41700;41701 52730;52731 52730 Q8IXB1 Q8IXB1 4 4 4 DnaJ homolog subfamily C member 10 DNAJC10 sp|Q8IXB1|DJC10_HUMAN DnaJ homolog subfamily C member 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJC10 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 1 3 3 3 1 3 3 3 1 3 3 5 5 5 91.079 793 793 0 8.5907 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1764 1.1696 19.642 8 1 Leave out requantified 0.95244 NaN 1.1218 1.2103 0.98468 NaN 1.1529 1.0926 21.781 NaN 24.517 17.292 2 1 3 2 0 0 1 0 Median Median Plateau Median 3.7 1.1 3.8 3.7 101180000 48198000 52983000 21121000 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Adenylosuccinate synthetase isozyme 1 ADSSL1 sp|Q8N142|PURA1_HUMAN Adenylosuccinate synthetase isozyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADSSL1 PE=1 SV=1 1 7 6 6 6 5 6 6 5 4 5 5 5 4 5 5 19 17.5 17.5 50.208 457 457 0 15.283 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85627 0.82925 20.403 23 12 Leave out requantified 1.0032 0.76605 0.87616 0.99821 1.055 0.73207 0.9576 0.88983 21.834 23.442 17.561 28.708 8 4 6 5 6 1 3 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.2 12.3 15.5 16.2 340820000 171180000 169640000 107850000 53151000 54700000 69607000 39020000 30587000 108630000 55106000 53526000 54729000 23906000 30823000 1449 1363;1891;4538;4860;9398;10622;17280 True;True;False;True;True;True;True 1384;1921;4595;4919;9499;10737;17485 5825;5826;8182;8183;19225;19226;19227;19228;20461;20462;20463;20464;40126;40127;40128;40129;40130;40131;45327;45328;45329;45330;73380;73381;73382;73383;73384 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1487;1488;1489;1490;1491;1492;1493;17045;17046;17047;20380;20381;20382;20383;20384;20385;20386;20387;22835;22836;22837;22838;22839;22840;22841;22842;22999;23192;23193;23194;23195;23196;23197;23198;23199;23200;23201;23202;23203;23204;23205;28571;28572;28573;53065;53066;53067;53068;53069;62024;62025;62026;62027;62028;62029;62030;62031;62032;62033;62034;62035;62036;62037;62038;68939;68940;68941;68942;68943;68944;68945;68946;70064;70065;70066;71000;71001;71002;71003;71004;71005;71006;71007;71008;74735;74736;74737;74738;74739;74740;74741;79407;79408;79409;79410;79411;79412;79413;79414;82473;82474;82475;82476;82477;82478;82479;82480;82481;82482;82483;82484;82485;82486;82487;82488;82489;92616;92617;92618;92619;92620;92621;92622 1492;17046;20385;22841;22999;23195;28571;53068;62025;68939;68942;70065;71003;74741;79414;82485;92617 Q8N335 Q8N335 4 4 4 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein GPD1L sp|Q8N335|GPD1L_HUMAN Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein OS=Homo sapiens 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 1.8 0 2 1.8 8164800 7458900 705880 3486300 3486300 0 0 0 0 0 0 0 4678500 3972600 705880 1455 2113;4595 True;True 2145;4653 9027;9028;19453 11631;11632;24997 11632;24997 Q8N3C0 Q8N3C0 9 9 9 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 ASCC3 sp|Q8N3C0|ASCC3_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC3 PE=1 SV=3 1 9 9 9 3 2 6 8 3 2 6 8 3 2 6 8 5.6 5.6 5.6 251.46 2202 2202 0 22.305 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74905 0.78057 47.56 15 5 Leave out requantified 0.65364 NaN 0.67073 0.88471 0.68218 NaN 0.70386 0.8297 25.679 NaN 38.779 47.362 2 1 6 6 1 0 2 2 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 1.6 1 3.7 5 258820000 110350000 148480000 26129000 15207000 10922000 23126000 9255900 13870000 71325000 41878000 29446000 138240000 44008000 94237000 1456 605;1093;5287;5289;7961;10184;11280;12497;17947 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5;2 5;2 5;2 Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B ANP32B sp|Q92688|AN32B_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32B PE=1 SV=1 2 5 5 5 2 4 3 4 2 4 3 4 2 4 3 4 24.3 24.3 24.3 28.787 251 251;249 0 60.274 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5908 1.5699 28.18 17 4 Leave out requantified 1.857 1.4527 1.3099 1.7328 1.7938 1.4125 1.4072 1.59 32.556 27.769 33.751 32.861 3 5 4 5 0 0 1 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Median 10.8 21.1 15.9 19.1 248820000 112220000 136600000 54832000 24328000 30503000 71764000 34941000 36824000 70058000 31441000 38617000 52170000 21513000 30657000 1545 4251;7656;10249;10501;14102 True;True;True;True;True 4306;7735;10356;10614;14274 18131;32283;32284;32285;32286;43687;43688;44830;44831;59849;59850;59851;59852;59853;59854;59855;59856 23308;40923;40924;40925;55090;56521;75346;75347;75348;75349;75350;75351;75352 23308;40923;55090;56521;75350 Q92747 Q92747 2 2 2 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1 Median Median Median Median 14.3 14.3 20.1 14.3 218910000 117260000 101650000 52531000 26806000 25725000 66410000 39350000 27061000 65586000 35464000 30122000 34381000 15638000 18743000 1562 10002;10857;15997;16504 True;True;True;True 10108;10973;16192;16701 42626;46288;46289;46290;46291;67756;67757;67758;67759;70010;70011;70012;70013 53861;58274;58275;85457;85458;85459;85460;88402;88403;88404 53861;58275;85459;88402 Q93008 Q93008 4 4 3 Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X USP9X sp|Q93008|USP9X_HUMAN Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP9X PE=1 SV=3 1 4 4 3 2 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 2 2.4 2.4 2.1 292.28 2570 2570 0 13.344 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 1.1681 1.1277 35.239 6 3 Median 1.4094 NaN NaN 0.78773 1.3749 NaN NaN 0.71967 17.47 NaN NaN 22.353 2 1 1 2 1 0 1 1 Median Median Median Median 0.8 0.5 0.5 1.6 67314000 30552000 36761000 25849000 11407000 14442000 16426000 7445300 8981100 6948600 2515500 4433100 18090000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 550;2165;2659;2677;2679;3558;3582;5026;5085;5419;6856;7904;8308;10228;10816;14387;16635;16992;17843 2324;2325;9100;9101;9102;11228;11229;11294;11295;11301;14961;14962;14963;14964;15058;20909;20910;20911;20912;21168;21169;21170;21171;21172;21173;21174;21175;22468;22469;22470;28187;28188;32993;32994;34719;34720;43154;43155;43156;43157;45650;45651;45652;45653;60323;69692;69693;69694;71318;74813 3021;3022;3023;11732;11733;11734;14399;14400;14489;14497;19265;19266;19267;19268;19269;19270;19271;19386;26800;26801;27141;27142;28700;35912;35913;41865;43976;54461;54462;54463;54464;57534;75911;87987;90059;94320;94321 3023;11732;14400;14489;14497;19267;19386;26800;27141;28700;35912;41865;43976;54462;57534;75911;87987;90059;94320 Q93096;Q12974 Q93096;Q12974 2;1 2;1 2;1 Protein tyrosine phosphatase type IVA 1;Protein tyrosine phosphatase type IVA 2 PTP4A1;PTP4A2 sp|Q93096|TP4A1_HUMAN Protein tyrosine phosphatase type IVA 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTP4A1 PE=1 SV=2;sp|Q12974|TP4A2_HUMAN Protein tyrosine phosphatase type IVA 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTP4A2 PE=1 SV=1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 15.6 15.6 15.6 19.815 173 173;167 0.0036232 3.3257 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0801 1.1076 31.817 4 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 1 1 Median Median Median Median 8.1 8.1 7.5 15.6 96236000 48890000 47347000 29756000 15467000 14289000 30374000 15883000 14490000 10142000 7134700 3007100 25965000 10405000 15561000 1565 5270;16159 True;True 5334;16354 22154;22155;22156;68456;68457 28347;28348;28349;86392;86393 28349;86393 Q969G3 Q969G3 5 5 4 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 SMARCE1 sp|Q969G3|SMCE1_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCE1 PE=1 SV=2 1 5 5 4 1 3 1 3 1 3 1 3 1 2 1 3 14.8 14.8 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receptor gamma FAM120B sp|Q96EK7|F120B_HUMAN Constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM120B PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 2.6 2.6 2.6 103.78 910 910 0.0036082 3.2939 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0962 0.82844 14.468 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 1 0 Median Median Median Median 2.6 1.3 2.6 0 15569000 7247100 8322200 4938900 2665700 2273300 5871200 1918400 3952900 4759100 2663000 2096100 0 0 0 1595 12576;13193 True;True 12729;13352 53528;53529;53530;55960;55961;55962 67347;67348;67349;70431;70432;70433 67347;70432 Q96EM0 Q96EM0 1 1 1 Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase L3HYPDH sp|Q96EM0|T3HPD_HUMAN Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=L3HYPDH PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 4 4 4 38.137 354 354 0 5.1166 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 4 0 0 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26185;29563;69576 Q96F86 Q96F86 5 5 5 Enhancer of mRNA-decapping protein 3 EDC3 sp|Q96F86|EDC3_HUMAN Enhancer of mRNA-decapping protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EDC3 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 4 5 4 3 4 5 4 3 4 5 9.8 9.8 9.8 56.077 508 508 0 8.9918 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83461 0.84642 42.203 15 4 Leave out requantified 0.80539 0.76137 0.78003 0.90551 0.85384 0.77263 0.87043 0.83907 42.057 220.16 42.618 45.052 3 3 4 5 0 1 1 2 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 8.1 6.5 8.1 9.8 229050000 136990000 92062000 55654000 33325000 22329000 39470000 24312000 15158000 62454000 39215000 23239000 71470000 40134000 31336000 1600 5590;6250;7226;8960;15660 True;True;True;True;True 5655;6319;7301;9056;15853 23477;23478;23479;26235;30267;30268;30269;30270;38131;38132;38133;38134;66426;66427;66428;66429 29995;29996;33553;38396;38397;38398;38399;48278;48279;83794;83795;83796 29995;33553;38397;48278;83795 Q96FQ6 Q96FQ6 6 6 6 Protein S100-A16 S100A16 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protein 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HAV1L PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.7 6.7 6.7 32.962 300 300 0 5.8555 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81563 0.78955 42.333 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 1 0 1 0 0 Median Median Median Median 6.7 6.7 6.7 6.7 28020000 13638000 14382000 0 0 0 11803000 8988700 2814600 6089100 0 6089100 10127000 4649100 5478000 1608 11314 True 11438 48198;48199;48200;48201;48202 60596;60597;60598;60599;60600;60601 60600 Q96HA7 Q96HA7 2 2 2 Tonsoku-like protein TONSL sp|Q96HA7|TONSL_HUMAN Tonsoku-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TONSL PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 1.5 1.5 1.5 150.93 1378 1378 0.0021153 3.6648 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90474 0.96655 14.627 4 1 Median NaN NaN 0.90474 NaN NaN NaN 0.96655 NaN NaN NaN 10.432 NaN 1 1 2 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 1.5 0.7 1.5 0 34838000 18779000 16059000 8481800 4837500 3644300 8722500 4332800 4389700 17634000 9608600 8025400 0 0 0 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ubiquitin-protein ligase ZFP91 ZFP91 sp|Q96JP5|ZFP91_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZFP91 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.4 4.4 4.4 63.444 570 570 0 11.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1574 1.1068 5.9211 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.4 4.4 4.4 4.4 69836000 32835000 37000000 17253000 7754400 9499100 17865000 8832900 9031800 17019000 8504800 8513900 17699000 7743200 9955700 1621 134 True 135 568;569;570;571 754;755;756;757;758;759;760;761;762;763 758 Q96K17 Q96K17 3 3 3 Transcription factor BTF3 homolog 4 BTF3L4 sp|Q96K17|BT3L4_HUMAN Transcription factor BTF3 homolog 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BTF3L4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 36.7 36.7 36.7 17.27 158 158 0 45.084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83692 0.85673 54.885 16 9 Leave out requantified 0.86303 0.77688 0.88922 0.9196 0.98952 0.84624 0.99078 0.92854 43.678 33.727 44.492 77.234 4 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N-terminal kinase-like protein SCYL1 sp|Q96KG9|SCYL1_HUMAN N-terminal kinase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCYL1 PE=1 SV=1 1 7 7 7 2 3 4 7 2 3 4 7 2 3 4 7 9.3 9.3 9.3 89.63 808 808 0 34.68 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8154 0.82207 44.028 17 6 Leave out requantified 0.55107 0.9241 0.70702 0.94407 0.59391 0.97312 0.75475 0.86511 35.867 71.461 65.276 9.9984 2 3 4 8 0 1 1 4 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 2.6 5 6.2 9.3 286070000 138030000 148050000 33380000 20099000 13281000 60256000 22510000 37747000 72383000 37457000 34925000 120060000 57960000 62096000 1625 5312;6247;7850;8017;8732;9583;14300 True;True;True;True;True;True;True 5376;6316;7933;8102;8826;9686;14475 22294;22295;26218;26219;26220;33119;33120;33121;33122;33860;33861;33862;33863;33864;37081;40846;40847;60669 28507;28508;33525;33526;33527;42015;42016;42017;42951;42952;47025;51679;51680;76337 28508;33525;42017;42951;47025;51680;76337 Q96KP1 Q96KP1 4 4 4 Exocyst complex component 2 EXOC2 sp|Q96KP1|EXOC2_HUMAN Exocyst complex component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 3 2 6.1 6.1 6.1 104.07 924 924 0 27.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0756 1.1472 0.55282 12 5 Leave out requantified 1.1034 1.3672 0.866 1.158 1.2144 1.3628 0.95493 1.0758 57.395 18.557 24.039 6.4361 4 3 3 2 2 1 1 1 Median Median Median Median 6.1 4.9 4.9 3.1 244390000 127210000 117180000 87009000 47786000 39222000 55430000 26153000 29277000 71040000 37126000 33914000 30910000 16148000 14762000 1626 6109;8390;11644;12395 True;True;True;True 6178;8481;11778;12547 25622;25623;25624;25625;35493;35494;35495;35496;49599;52841;52842;52843 32747;32748;32749;32750;44974;62417;66490;66491;66492 32747;44974;62417;66492 Q96L92 Q96L92 1 1 1 Sorting nexin-27 SNX27 sp|Q96L92|SNX27_HUMAN Sorting nexin-27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNX27 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.8 1.8 1.8 61.264 541 541 0.0010817 3.9375 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2818 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E2;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3 UBE2E2;UBE2E1;UBE2E3 sp|Q96LR5|UB2E2_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2E2 PE=1 SV=1;sp|P51965|UB2E1_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2E1 PE=1 SV=1;sp|Q969T4|UB2E3_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 3 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 16.9 16.9 16.9 22.255 201 201;193;207 0 8.7624 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 1.0445 1.0572 40.193 12 1 Leave out requantified 0.71714 1.2922 1.2707 2.088 0.71535 1.2922 1.4004 1.9238 39.385 24.536 47.157 45.011 3 3 3 3 0 1 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 13.9 12.9 12.9 11.4 203200000 104460000 98744000 62455000 37454000 25001000 45634000 23472000 22162000 60634000 29871000 30763000 34482000 13663000 20819000 1629 2806;4579;4580;5841 True;True;True;True 2844;4637;4638;5907 11999;12000;12001;19388;19389;19390;19391;19392;19393;19394;24562;24563 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of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1A PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 1 2 2 3 1 2 2 3 1 2 2 18.3 18.3 18.3 35.719 312 312 0 19.974 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98757 0.92499 6.5211 7 0 Leave out requantified 0.96589 NaN 0.77471 1.0391 1.0076 NaN 0.81516 0.93556 6.7758 NaN 16.909 0.6417 2 1 2 2 0 0 0 0 Median Median Median Median 13.1 5.8 9.3 10.9 201060000 107720000 93338000 54920000 30482000 24438000 36579000 19388000 17192000 61589000 34751000 26838000 47969000 23098000 24871000 1631 985;2189;7457;14820 True;True;True;True 1000;2222;7535;14999 4230;4231;4232;4233;9323;9324;31466;62785 5422;5423;5424;5425;5426;12040;39918;79064 5425;12040;39918;79064 Q96P47;Q9UPQ3 Q96P47;Q9UPQ3 2;1 2;1 2;1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3;Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 AGAP3;AGAP1 sp|Q96P47|AGAP3_HUMAN Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 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OX=9606 GN=PUS7 PE=1 SV=2 1 11 11 11 7 11 9 1 7 11 9 1 7 11 9 1 22.1 22.1 22.1 75.035 661 661 0 93.088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0517 1.1381 44.857 27 7 Leave out requantified 1.0759 0.8942 1.0279 NaN 1.1381 0.87423 1.1174 NaN 18.801 54.55 14.173 NaN 8 10 9 0 3 3 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 15.6 22.1 19.5 1.7 639970000 313050000 326920000 194110000 103350000 90761000 226680000 108600000 118070000 219190000 101100000 118090000 0 0 0 1635 743;3011;4297;5619;5733;5734;6624;7123;9494;11831;17999 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 753;3055;4354;5684;5798;5799;6696;7196;9596;11966;18213 3178;3179;3180;12850;12851;12852;12853;12854;12855;18314;18315;23599;23600;23601;24107;24108;24109;24110;27629;27630;27631;29707;29708;40509;40510;40511;50375;76341;76342;76343 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1447;9956;10752;12039;14423;18186 6118;6119;6120;6121;42007;42008;42009;45404;45405;45406;45407;45408;50703;50704;60460;60461;60462;60463;76237 7912;7913;7914;7915;53079;53080;53081;53082;57238;57239;57240;57241;63760;63761;76072;76073;96099 7914;53081;57238;63760;76072;96099 Q96QK1 Q96QK1 11 11 11 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 VPS35 sp|Q96QK1|VPS35_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS35 PE=1 SV=2 1 11 11 11 10 11 11 8 10 11 11 8 10 11 11 8 18 18 18 91.706 796 796 0 68.541 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1463 1.1555 21.471 44 16 Leave out requantified 1.035 1.1529 1.113 1.0648 1.0938 1.1425 1.1129 0.94194 21.006 22.521 15.155 8.5541 11 11 11 11 4 3 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.6 18 18 13.7 1228500000 586140000 642370000 330780000 160100000 170680000 338910000 158890000 180020000 380870000 188020000 192850000 177960000 79130000 98826000 1637 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5583;5584;5585;5586;5587;6410;6411;6412;6413;6414;6415;8733;8734;8735;10542;18184;18185;18186;18187;18188;18189;18190;19959;19960;19961;19962;19963;19964;19965;19966;19967;19968;19969;25624;25625;25626;25627;29355;29356;29357;29358;31257;31258;31259;31260;40031;40032;40033;40034;40035;40036;40037;50467;50468;50469;54690;54691;54692;54693;54694;54695;54696;55293;55294;55295;55296;55297;55298;55299;55300;55301;55302;55303;55304;55305;56114;56115;56116;56117;56118;56119;56120;62348;62349;62350;62351;75387;75388;81106;81107;81108;83799;83800;83801;83802;83803;83804;84918;86452;86453;88740;88741;90700;90701;90702;90703 5586;6413;8734;10542;18189;19961;19966;25625;29355;31257;40033;50469;54693;55293;56115;62348;75387;81107;83801;84918;86452;88740;90703 Q9BPX5 Q9BPX5 1 1 1 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein ARPC5L sp|Q9BPX5|ARP5L_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC5L PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.8 7.8 7.8 16.941 153 153 0.0035824 3.1855 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2002 1.13 28.525 4 0 Linear NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.8 7.8 7.8 7.8 79313000 38689000 40624000 22702000 11399000 11303000 24328000 11372000 12956000 21172000 9564100 11608000 11111000 6354300 4756900 1685 812 True 822 3457;3458;3459;3460 4488;4489;4490;4491;4492;4493;4494 4491 Q9BPZ3 Q9BPZ3 3 3 3 Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2 PAIP2 sp|Q9BPZ3|PAIP2_HUMAN Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAIP2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 0 3 2 2 0 3 2 2 0 22.8 22.8 22.8 14.984 127 127 0 12.785 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8523 0.8899 21.432 7 3 Leave out requantified 0.7441 0.71576 0.90612 NaN 0.71308 0.74373 0.94093 NaN 25.249 3.9449 13.547 NaN 3 2 2 0 2 0 1 0 Median Median Median Median 22.8 11.8 16.5 0 233450000 131980000 101470000 101190000 58469000 42725000 90680000 50913000 39767000 41572000 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33833;39207;70174;86511 Q9BSH4 Q9BSH4 5 5 5 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 TACO1 sp|Q9BSH4|TACO1_HUMAN Translational activator of cytochrome c oxidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACO1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 23.9 23.9 23.9 32.477 297 297 0 27.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92036 0.93005 12.821 16 5 Leave out requantified 0.857 1.0245 0.89748 1.1409 0.89176 1.004 0.97729 1.0381 26.43 28.351 10.559 25.132 4 4 4 4 1 2 0 2 Leave out requantified Median Leave out requantified Median 17.8 17.8 20.2 20.2 495060000 259420000 235640000 108640000 57531000 51106000 99721000 55390000 44331000 151630000 79382000 72249000 135070000 67113000 67959000 1706 872;5159;6568;14047;14658 True;True;True;True;True 883;5223;6639;14219;14837 3700;3701;3702;3703;21720;21721;21722;21723;27435;27436;59605;59606;62128;62129;62130;62131 4762;4763;4764;4765;27807;27808;27809;27810;27811;27812;35009;35010;75088;75089;78206 4763;27808;35010;75088;78206 Q9BSJ2 Q9BSJ2 5 5 5 Gamma-tubulin complex component 2 TUBGCP2 sp|Q9BSJ2|GCP2_HUMAN Gamma-tubulin complex component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 4 4 4 2 4 4 4 2 4 4 4 7.4 7.4 7.4 102.53 902 902 0 13.323 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9918 0.95751 27.17 14 1 Leave out requantified 0.79155 0.87386 0.97356 1.1564 0.82042 0.82914 1.0238 1.0346 23.789 16.881 19.801 24.915 2 4 4 4 0 0 1 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 3.3 6.1 6.1 6.2 203430000 97108000 106330000 35095000 17649000 17445000 55200000 25642000 29558000 60294000 28008000 32286000 52845000 25808000 27036000 1707 152;3408;3826;6227;8309 True;True;True;True;True 153;3454;3875;6296;8399 645;14504;14505;14506;14507;16294;16295;16296;26124;26125;26126;26127;35118;35119 847;18674;18675;18676;21016;33394;33395;44453;44454;44455 847;18674;21016;33395;44453 Q9BSJ8 Q9BSJ8 2 2 2 Extended synaptotagmin-1 ESYT1 sp|Q9BSJ8|ESYT1_HUMAN Extended synaptotagmin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 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4;1 DCN1-like protein 5 DCUN1D5 sp|Q9BTE7|DCNL5_HUMAN DCN1-like protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCUN1D5 PE=1 SV=1 2 4 4 4 1 1 3 2 1 1 3 2 1 1 3 2 16 16 16 27.508 237 237;292 0 15.032 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78755 0.76146 24.081 6 3 Median NaN NaN 0.61183 0.96767 NaN NaN 0.63249 0.8839 NaN NaN 17.727 12.57 1 1 2 2 0 0 2 1 Median Median Median Median 5.1 5.1 13.1 8 58130000 31122000 27008000 7197000 4138100 3058900 8885000 4704400 4180600 14874000 8774100 6099900 27174000 13505000 13669000 1713 6491;14298;14476;17583 True;True;True;True 6562;14473;14654;17791 27149;27150;27151;27152;27153;60661;61420;74590 34678;34679;34680;34681;34682;34683;34684;76329;77328;94042 34678;76329;77328;94042 Q9BTT0 Q9BTT0 1 1 1 Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E ANP32E sp|Q9BTT0|AN32E_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32E PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 4.5 4.5 4.5 30.692 268 268 0 5.2727 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Median Median 4.7 2.2 2.2 0 49111000 27473000 21638000 24054000 11464000 12590000 12735000 7892700 4842100 12322000 8116000 4206100 0 0 0 1722 1582;2202;15241 True;True;True 1605;2235;15431 6759;9366;9367;64582 8711;12088;12089;81428 8711;12089;81428 Q9BV57 Q9BV57 1 1 1 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase ADI1 sp|Q9BV57|MTND_HUMAN 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADI1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 7.8 7.8 7.8 21.498 179 179 0.0040796 3.1127 By MS/MS By MS/MS 0.96248 1.0826 26.098 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 7.8 7.8 0 0 46770000 26076000 20694000 19721000 10037000 9684000 27049000 16038000 11010000 0 0 0 0 0 0 1723 9355 True 9456 39990;39991 50644;50645 50645 Q9BV68 Q9BV68 1 1 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 RNF126 sp|Q9BV68|RN126_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF126 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 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MS/MS 0.77275 0.82198 17.25 7 0 Leave out requantified 0.80122 0.80437 0.91528 NaN 0.85312 0.82064 0.997 NaN 35.259 4.2667 10.048 NaN 2 2 2 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 9.9 9.9 9.9 5.4 109740000 57476000 52267000 27916000 16221000 11695000 32606000 18531000 14076000 30324000 14777000 15547000 18897000 7947900 10949000 1728 4267;4834 True;True 4322;4893 18201;18202;18203;20369;20370;20371;20372 23435;23436;26125;26126;26127;26128;26129 23436;26129 Q9BVP2 Q9BVP2 13 13 13 Guanine nucleotide-binding protein-like 3 GNL3 sp|Q9BVP2|GNL3_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein-like 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNL3 PE=1 SV=2 1 13 13 13 10 10 11 11 10 10 11 11 10 10 11 11 29.5 29.5 29.5 61.992 549 549 0 64.292 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9196 0.99643 10.879 49 11 Leave out requantified 0.9045 0.9376 0.93189 1.0918 0.95833 0.93359 1.0523 1.0092 12.491 14.605 12.038 14.241 10 13 13 13 1 4 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0888 1.0118 20.4 18 10 Leave out requantified 1.2437 1.4694 1.1133 1.0709 1.2358 1.4113 1.1461 0.95702 54.442 55.368 105.61 23.852 5 6 5 2 3 4 3 0 Median Median Median Median 19.6 25.7 19.6 14.6 597410000 284580000 312830000 180330000 78795000 101530000 154380000 66441000 87938000 208940000 117060000 91879000 53766000 22289000 31477000 1732 1487;3963;7127;8061;15330;16945 True;True;True;True;True;True 1510;4013;7200;8146;15521;17149 6373;6374;6375;6376;16894;16895;16896;29720;29721;29722;34014;34015;34016;34017;34018;65042;71959;71960;71961;71962 8213;8214;21767;21768;21769;37793;37794;37795;43120;43121;43122;43123;43124;43125;82054;90854;90855;90856;90857 8213;21767;37795;43122;82054;90854 Q9BWF3 Q9BWF3 1 1 1 RNA-binding protein 4 RBM4 sp|Q9BWF3|RBM4_HUMAN RNA-binding protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 7.7 7.7 7.7 40.313 364 364 0 6.7561 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5214 1.3525 16.924 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 1 0 1 Median Median Median Median 7.7 7.7 0 7.7 37892000 10817000 27075000 13640000 4224500 9415700 12835000 2907100 9927500 0 0 0 11418000 3685800 7731700 1733 1413 True 1435 6044;6045;6046 7802;7803;7804 7802 Q9BWJ5 Q9BWJ5 2 2 2 Splicing factor 3B subunit 5 SF3B5 sp|Q9BWJ5|SF3B5_HUMAN Splicing factor 3B subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 27.9 27.9 27.9 10.135 86 86 0 5.3461 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4678 1.5483 67.033 5 2 Median NaN 2.0291 1.3693 NaN NaN 2.0766 1.5173 NaN NaN 116.72 56.71 NaN 1 2 2 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 15.1 27.9 15.1 0 98175000 40259000 57916000 19025000 9559100 9465400 37947000 12971000 24976000 41204000 17730000 23474000 0 0 0 1734 17788;18049 True;True 18000;18263 75494;76544;76545;76546;76547;76548 95179;96476;96477;96478;96479;96480 95179;96479 Q9BXB5;Q9BXB4 Q9BXB5 5;1 5;1 5;1 Oxysterol-binding protein-related protein 10 OSBPL10 sp|Q9BXB5|OSB10_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL10 PE=1 SV=2 2 5 5 5 4 4 5 3 4 4 5 3 4 4 5 3 8.5 8.5 8.5 83.969 764 764;747 0 16.184 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81734 0.7239 25.64 12 4 Leave out requantified 0.8498 0.90868 0.89137 0.81734 0.90569 0.89517 0.96758 0.7239 26.335 24.371 11.634 24.161 3 3 3 3 2 1 1 0 Median Median Median Leave out requantified 7.1 7.1 8.5 5.8 223670000 117240000 106430000 53236000 28061000 25175000 71307000 34898000 36410000 72021000 39966000 32055000 27105000 14315000 12790000 1735 1477;4298;13993;14579;17333 True;True;True;True;True 1500;4355;14164;14757;17540 6331;6332;6333;6334;18316;59359;59360;59361;59362;61800;61801;61802;61803;73600;73601;73602 8166;8167;8168;8169;23572;74763;77804;77805;77806;77807;77808;92879;92880;92881 8167;23572;74763;77808;92881 Q9BXJ9 Q9BXJ9 35 35 30 N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit NAA15 sp|Q9BXJ9|NAA15_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA15 PE=1 SV=1 1 35 35 30 29 29 29 25 29 29 29 25 25 25 26 23 41.5 41.5 36 101.27 866 866 0 178.8 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92946 0.94842 18.992 138 42 Leave out requantified 0.85809 0.94964 0.92238 1.0892 0.91798 0.9712 0.95333 0.98755 18.243 52.98 25.532 20.559 35 35 36 32 13 8 13 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.6 32.2 34.5 29.6 7355800000 3700500000 3655300000 1671200000 895880000 775310000 2053900000 1025100000 1028800000 2002900000 1048100000 954790000 1627800000 731360000 896460000 1736 674;928;2111;2682;2688;3222;3256;3321;3817;4913;5280;6437;8404;8512;8634;8825;9475;9635;9670;9672;9844;9845;10494;11525;11724;11961;12054;12714;13367;14869;15682;16081;16342;17451;17512 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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domain-interacting nucleolar phosphoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIFK PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 3 5 3 4 3 5 3 4 3 5 23.5 23.5 23.5 34.222 293 293 0 40.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84831 0.85961 36.635 17 5 Leave out requantified 0.87443 0.79379 1.0809 1.0809 0.84275 0.8768 1.089 0.98206 17.89 12.43 50.166 33.549 3 4 3 7 1 1 0 3 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.3 17.4 11.3 23.5 252250000 134960000 117290000 38817000 22268000 16549000 68587000 38447000 30140000 52993000 27947000 25046000 91856000 46300000 45556000 1745 3164;3553;6204;14497;15869 True;True;True;True;True 3209;3600;6273;14675;16063 13484;13485;13486;13487;15134;15135;15136;15137;15138;26024;26025;26026;26027;61498;61499;61500;67252 17308;17309;17310;17311;17312;19497;19498;19499;33257;33258;33259;77434;77435;77436;77437;84797 17310;19498;33258;77436;84797 Q9BYT8 Q9BYT8 1 1 1 Neurolysin, mitochondrial NLN sp|Q9BYT8|NEUL_HUMAN Neurolysin, mitochondrial OS=Homo 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regulatory protein 1 NSRP1 sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSRP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 5 5 5 66.389 558 558 0.00056022 4.5649 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93735 0.97335 8.5734 7 2 Leave out requantified NaN 1.0823 0.71166 1.0527 NaN 1.1943 0.80904 1.0603 NaN 3.8216 6.6185 3.5234 1 2 2 2 1 1 0 0 Median Median Median Median 2.7 5 5 5 121380000 61741000 59638000 18310000 10955000 7354900 30919000 15100000 15818000 38293000 21405000 16888000 33857000 14281000 19576000 1771 6297;12091 True;True 6366;12237 26409;26410;26411;51551;51552;51553;51554;51555 33803;64810;64811;64812;64813;64814;64815 33803;64813 Q9H0P0 Q9H0P0 2 2 2 Cytosolic 5-nucleotidase 3A NT5C3A sp|Q9H0P0|5NT3A_HUMAN Cytosolic 5-nucleotidase 3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NT5C3A PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 7.4 7.4 7.4 37.948 336 336 0.00055279 4.2592 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 7.4 0 0 7275000 3252100 4022900 0 0 0 7275000 3252100 4022900 0 0 0 0 0 0 1772 2801;5929 True;True 2839;5995 11988;11989;24897 15392;15393;31804 15392;31804 Q9H0S4 Q9H0S4 3 3 3 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 DDX47 sp|Q9H0S4|DDX47_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX47 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 1 3 1 2 1 3 1 2 1 3 9.9 9.9 9.9 50.646 455 455 0 9.8739 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1693 1.1177 39.112 7 1 Leave out requantified NaN 1.3292 NaN 1.2 NaN 1.3351 NaN 1.0496 NaN 36.737 NaN 18.21 1 2 1 3 0 0 0 1 Median Median Median Median 4 5.9 4 9.9 125210000 60691000 64522000 17070000 10169000 6900500 40420000 18549000 21870000 21208000 11185000 10023000 46517000 20788000 25729000 1773 9895;14510;15186 True;True;True 10001;14688;15374 42209;42210;61538;61539;61540;61541;64344 53317;53318;77478;77479;77480;77481;77482;77483;81128 53317;77479;81128 Q9H0U9 Q9H0U9 1 1 1 Testis-specific Y-encoded-like protein 1 TSPYL1 sp|Q9H0U9|TSYL1_HUMAN Testis-specific Y-encoded-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSPYL1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 3.9 3.9 3.9 49.192 437 437 0.006846 2.5776 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 3.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1774 13538 True 13702 57425 72259 72259 Q9H1E3 Q9H1E3 2 2 2 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 NUCKS1 sp|Q9H1E3|NUCKS_HUMAN Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUCKS1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.9 9.9 9.9 27.296 243 243 0 6.9598 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91488 0.91331 15.103 8 1 Leave out requantified 1.0255 0.81543 0.90342 0.93094 1.1296 0.83596 1.0069 0.8949 4.6849 4.3516 7.0756 12.222 2 2 2 2 0 0 1 0 Median Median Median Median 9.9 9.9 9.9 9.9 351290000 187400000 163890000 113910000 58541000 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Median Median 6.7 4.1 4.1 2.6 97824000 49816000 48008000 46800000 23674000 23126000 15425000 6379200 9045700 16075000 7417900 8656800 19524000 12345000 7179400 1789 5114;16624 True;True 5178;16824 21541;21542;21543;70600;70601 27584;27585;27586;27587;27588;27589;89168;89169 27585;89168 Q9H4A3;Q96J92 Q9H4A3 18;2 18;2 14;0 Serine/threonine-protein kinase WNK1 WNK1 sp|Q9H4A3|WNK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase WNK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WNK1 PE=1 SV=2 2 18 18 14 9 12 12 12 9 12 12 12 7 9 9 9 8.5 8.5 7 250.79 2382 2382;1243 0 85.133 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88538 0.88846 18.224 46 19 Leave out requantified 0.80143 0.93658 0.86646 1.0175 0.82126 0.94753 0.9105 0.93098 10.096 31.236 13.208 27.324 9 12 14 11 3 6 6 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.1 5.9 5.2 5.8 1300400000 781350000 519030000 252670000 136230000 116440000 407380000 273860000 133530000 385780000 230960000 154820000 254560000 140310000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0382 1.0183 13.473 30 4 Leave out requantified 1.1077 1.0819 1.0452 1.0812 1.0783 1.066 1.0682 1.0051 28.965 9.1708 16.267 5.906 8 7 8 7 1 1 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.3 13.6 12.8 13.6 1049800000 500320000 549430000 253310000 118750000 134560000 269620000 123270000 146360000 305460000 153860000 151600000 221370000 104450000 116920000 1813 5233;6777;7883;9935;10429;10804;12432;14780;15475 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5297;6849;7966;10041;10542;10920;12584;14959;15666 21988;21989;21990;21991;28162;28163;28164;28165;33270;33271;33272;42367;42368;42369;42370;44524;46070;46071;46072;46073;53003;53004;53005;53006;62624;62625;62626;62627;65635;65636;65637 28128;28129;28130;28131;28132;35883;35884;35885;35886;35887;42218;42219;42220;42221;42222;53524;53525;53526;56163;58024;58025;58026;58027;66690;66691;66692;66693;66694;66695;78845;78846;78847;78848;78849;78850;82770;82771 28130;35887;42219;53526;56163;58025;66690;78849;82770 Q9H9C1 Q9H9C1 2 2 2 Spermatogenesis-defective protein 39 homolog VIPAS39 sp|Q9H9C1|SPE39_HUMAN Spermatogenesis-defective protein 39 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VIPAS39 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 0 5.3 5.3 5.3 57.005 493 493 0.00054975 4.1856 By MS/MS By matching 0.71 0.73914 9.2197 3 1 Median NaN 0.70103 NaN NaN NaN 0.68723 NaN NaN NaN 11.604 NaN NaN 0 2 1 0 0 1 0 0 Median Median Median Median 0 5.3 1.4 0 38241000 21434000 16806000 0 0 0 26305000 14799000 11506000 11936000 6635500 5300500 0 0 0 1814 10195;15703 True;True 10302;15896 43458;43459;66585 54794;83985 54794;83985 Q9H9Q2 Q9H9Q2 2 2 2 COP9 signalosome complex subunit 7b COPS7B sp|Q9H9Q2|CSN7B_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 7b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS7B PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 0 2 1 0 0 2 1 0 0 8.3 8.3 8.3 29.622 264 264 0 5.8984 By MS/MS By MS/MS 1.2609 1.2134 19.177 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 0 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2397;2453;4803;7998;9636;11010;12990;15040 10082;10083;10084;10350;10351;10352;20035;20036;33417;33418;33419;33420;40665;46448;46449;54609;54610;62973;62974 12991;12992;12993;12994;13330;13331;13332;25737;25738;42412;42413;51456;58447;58448;58449;68717;79322;79323 12992;13330;25738;42413;51456;58447;68717;79323 Q9H9Y6 Q9H9Y6 3 3 3 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 POLR1B sp|Q9H9Y6|RPA2_HUMAN DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR1B PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 3.4 3.4 3.4 128.23 1135 1135 0 5.3208 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2727 1.2447 17.864 7 4 Median NaN 1.4095 1.0697 1.45 NaN 1.3503 1.1176 1.3372 NaN 17.937 22.885 24.771 1 2 2 2 0 2 1 1 Median Median Median Median 0.9 1.9 2.4 2.4 46245000 18669000 27577000 7562000 2895400 4666600 15991000 6542200 9448600 14155000 6155900 7999000 8537500 3075000 5462400 1817 3350;8263;15778 True;True;True 3396;8353;15971 14249;14250;14251;14252;14253;34888;34889;66880 18324;18325;18326;18327;18328;18329;44178;84355 18326;44178;84355 Q9HAU5 Q9HAU5 4 4 4 Regulator of nonsense transcripts 2 UPF2 sp|Q9HAU5|RENT2_HUMAN Regulator of nonsense transcripts 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UPF2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 2 3 3.9 3.9 3.9 147.81 1272 1272 0 15.2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84765 0.87762 6.4506 10 2 Leave out requantified 0.80106 0.90391 0.73351 1.0249 0.87929 0.90982 0.80704 0.95208 13.716 18.72 14.197 7.8792 2 3 2 3 0 1 0 1 Median Plateau Median Median 2.2 3.1 2.2 3 137980000 73226000 64750000 25843000 14278000 11565000 34305000 16560000 17745000 36351000 21742000 14609000 41476000 20645000 20831000 1818 509;10089;11738;12992 True;True;True;True 514;10195;11873;13150 2153;2154;2155;2156;43030;43031;43032;43033;49968;55239 2805;2806;2807;2808;54308;54309;54310;54311;54312;54313;62871;69527 2805;54310;62871;69527 Q9HAV4 Q9HAV4 8 8 8 Exportin-5 XPO5 sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN Exportin-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO5 PE=1 SV=1 1 8 8 8 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protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACYBP PE=1 SV=2 1 15 15 15 12 14 15 12 12 14 15 12 12 14 15 12 58.3 58.3 58.3 26.21 228 228 0 70.191 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94017 0.96427 24.371 65 13 Leave out requantified 0.91692 0.9074 0.85414 1.0693 1.0074 0.9177 0.91825 1.0511 27.355 21.779 25.934 32.767 16 17 18 14 3 5 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.4 58.3 58.3 57.5 3570200000 1790800000 1779300000 795800000 398440000 397350000 1012800000 507790000 505010000 1147400000 609620000 537800000 614170000 274990000 339180000 1824 2048;3984;4013;4014;8314;8315;8511;8527;8822;13781;14059;14859;15031;17083;17459 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2080;4035;4064;4065;8404;8405;8602;8618;8916;13948;14231;15039;15216;17287;17666 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Beta-parvin PARVB sp|Q9HBI1|PARVB_HUMAN Beta-parvin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARVB PE=1 SV=1 1 5 3 3 3 1 4 4 3 0 3 2 3 0 3 2 16.2 10.7 10.7 41.714 364 364 0 5.6624 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.96562 1.0185 22.09 8 3 Leave out requantified 1.0129 NaN 0.96562 1.2985 0.99071 NaN 1.0344 1.1906 51.158 NaN 43.426 67.276 3 0 3 2 1 0 1 1 Median Median Median Median 10.7 1.9 12.6 12.1 92594000 46672000 45923000 31497000 15896000 15601000 0 0 0 33737000 19198000 14540000 27360000 11578000 15782000 1825 2013;4801;9760;10459;10650 False;True;False;True;True 2045;4860;9865;10572;10765 8643;20256;20257;20258;41634;41635;41636;44649;44650;44651;45446;45447 11086;26008;26009;26010;52640;52641;52642;52643;52644;56295;56296;57286 11086;26008;52642;56296;57286 Q9HBL8 Q9HBL8 4 4 4 NmrA-like family domain-containing protein 1 NMRAL1 sp|Q9HBL8|NMRL1_HUMAN NmrA-like family domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NMRAL1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 4 2 2 2 4 2 2 2 4 2 15.7 15.7 15.7 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Median Median 7.1 0 5.4 5.4 33729000 16808000 16921000 13910000 6884400 7025500 0 0 0 10620000 5634600 4985200 9199200 4289200 4910000 1827 4638;13996;14640 True;True;True 4696;14167;14819 19596;59368;62044;62045 25175;74769;78096 25175;74769;78096 Q9HC35 Q9HC35 21 21 21 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 EML4 sp|Q9HC35|EMAL4_HUMAN Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML4 PE=1 SV=3 1 21 21 21 13 14 15 15 13 14 15 15 13 14 15 15 30.2 30.2 30.2 108.91 981 981 0 103.55 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90483 0.94704 14.096 70 22 Leave out requantified 0.83541 0.98287 0.8707 1.1466 0.87654 0.99169 0.89595 1.0902 11.646 14.775 11.84 14.233 17 16 20 17 5 3 9 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.7 21.2 22.7 20.5 1813600000 942850000 870760000 482010000 255180000 226830000 405990000 209200000 196780000 530150000 287660000 242490000 395470000 190810000 204660000 1828 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583;584;585;1574;6624;6625;7564;7565;7566;8056;8057;8058;8059;14478;14479;16962;16963;16964;16965;19690;19691;19692;19693;19694;19695;19696;21222;21223;21224;25223;36500;36501;39440;41923;41924;46564;46565;46566;46567;46568;48496;48497;48498;48499;48500;49836;49837;49838;57689;57690;57691;57692;57693;57694;57695;58438;58439;58440;58441;58442;58443;84564;91508;91509;91510;91511;91512;91513;91514;91515;96231;96232;96233 585;1574;6625;7565;8056;14478;16964;19690;21223;25223;36500;39440;41924;46568;48497;49837;57692;58442;84564;91513;96231 Q9HC38 Q9HC38 8 8 8 Glyoxalase domain-containing protein 4 GLOD4 sp|Q9HC38|GLOD4_HUMAN Glyoxalase domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLOD4 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 6 28.4 28.4 28.4 34.793 313 313 0 27.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.039 1.1119 17.921 31 2 Leave out requantified 1.0988 1.1634 1.0018 1.1125 1.1592 1.1753 1.1119 1.0357 16.05 13.248 26.457 20.042 8 8 8 7 1 0 0 1 Leave out requantified Leave out 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCCC2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 3.6 3.6 3.6 61.332 563 563 0.0010852 3.9656 By matching By MS/MS 1.3053 1.2338 21.421 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 0 0 3.6 3.6 28424000 13327000 15097000 0 0 0 0 0 0 13775000 6896000 6878800 14649000 6430600 8218300 1830 166 True 167 697;698 902 902 Q9HCK8;Q8TD26;Q3L8U1;Q9P2D1 Q9HCK8 3;1;1;1 3;1;1;1 3;1;1;1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 CHD8 sp|Q9HCK8|CHD8_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD8 PE=1 SV=5 4 3 3 3 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1.6 1.6 1.6 290.52 2581 2581;2715;2897;2997 0.00055402 4.3378 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.76252 0.86036 32.879 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 0 1 Median Median Median Median 0.3 0.3 0.9 1.3 20104000 13300000 6804900 2532700 1423700 1108900 3147800 1633200 1514700 3906100 3906100 0 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matching By MS/MS By MS/MS 1.3331 1.4088 36.534 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 16.8 16.8 16.8 16.8 49466000 22105000 27361000 14524000 6083700 8440600 9577500 4966200 4611300 14615000 7331000 7283500 10749000 3723500 7025900 1837 6353 True 6422 26618;26619;26620;26621 34050;34051;34052 34051 Q9NPD3 Q9NPD3 5 5 5 Exosome complex component RRP41 EXOSC4 sp|Q9NPD3|EXOS4_HUMAN Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 4 3 1 4 4 3 1 4 4 3 1 20.8 20.8 20.8 26.383 245 245 0 9.0266 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 0.82421 0.8069 12.451 12 2 Leave out requantified 0.75625 0.86599 0.82831 NaN 0.75948 0.8388 0.83383 NaN 15.011 17.731 8.6157 NaN 4 4 3 1 1 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median 17.6 15.1 11.8 3.7 309280000 164980000 144300000 92037000 50586000 41451000 108900000 55174000 53729000 99247000 55114000 44133000 9093600 4105300 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5356;5357;5358;5359;17626;17627;22349;22350;22351;31561;54240;54241;54242 6908;6909;6910;6911;6912;6913;6914;22679;22680;28567;28568;28569;28570;40020;68232;68233;68234 6912;22680;28569;40020;68233 Q9NPF4 Q9NPF4 2 2 2 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OSGEP sp|Q9NPF4|OSGEP_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEP PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 9.9 9.9 9.9 36.426 335 335 0 10.669 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98472 0.97346 26.031 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 1 0 Median Median Median Median 0 9.9 5.1 5.1 23688000 11435000 12253000 0 0 0 12080000 6794500 5285900 11608000 4640300 6967400 0 0 0 1840 8310;16021 True;True 8400;16216 35120;67882;67883;67884;67885;67886 44456;85640;85641;85642;85643;85644 44456;85642 Q9NPI6 Q9NPI6 2 2 2 mRNA-decapping enzyme 1A DCP1A sp|Q9NPI6|DCP1A_HUMAN mRNA-decapping enzyme 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCP1A PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 0 1 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312;408;3255;9184;9863;12166;16164;16165;16519 False;True;True;False;True;False;False;False;False 313;411;3300;9282;9969;12313;16359;16360;16716 1258;1259;1260;1687;1688;1689;1690;1691;13855;39177;39178;39179;42071;42072;51854;51855;51856;51857;51858;68487;68488;68489;68490;68491;68492;68493;68494;70065;70066;70067;70068;70069;70070;70071;70072 1661;1662;1663;2196;2197;2198;2199;2200;2201;2202;17818;49586;49587;53147;53148;65222;65223;65224;65225;65226;65227;65228;65229;65230;86442;86443;86444;86445;86446;86447;86448;88460;88461;88462;88463;88464;88465;88466;88467;88468;88469;88470 1661;2197;17818;49586;53147;65223;86442;86444;88465 Q9NQ88 Q9NQ88 3 3 3 Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR TIGAR sp|Q9NQ88|TIGAR_HUMAN Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGAR PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 17 17 17 30.062 270 270 0 36.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99902 1.0483 8.7066 20 5 Leave out requantified 0.98174 0.99038 0.92824 1.1317 1.0467 1.0363 1.0187 1.0268 27.948 14.297 21.641 9.1327 6 5 5 4 3 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17 17 17 17 394650000 200600000 194040000 120900000 58593000 62304000 99369000 50212000 49156000 111930000 63541000 48394000 62446000 28256000 34190000 1843 3520;7853;14133 True;True;True 3567;7936;14305 15014;15015;15016;15017;15018;15019;15020;15021;33132;33133;33134;33135;33136;33137;33138;33139;33140;59979;59980;59981;59982 19332;19333;19334;19335;19336;19337;19338;19339;19340;19341;19342;42029;42030;42031;42032;42033;42034;42035;42036;42037;42038;75502;75503;75504;75505;75506;75507 19334;42031;75504 Q9NQC3 Q9NQC3 7 7 7 Reticulon-4 RTN4 sp|Q9NQC3|RTN4_HUMAN Reticulon-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTN4 PE=1 SV=2 1 7 7 7 4 3 5 4 4 3 5 4 4 3 5 4 10.7 10.7 10.7 129.93 1192 1192 0 77.731 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0025 1.012 41.557 21 7 Leave out requantified 1.0506 0.73414 1.0448 0.76545 1.1155 0.73576 1.1222 0.71024 22.915 65.846 15.738 39.504 4 4 8 5 1 1 4 1 Median Median Leave out requantified Leave out requantified 5.9 5.2 8.9 4.8 824890000 478700000 346190000 193200000 107170000 86027000 178510000 100870000 77638000 276590000 164570000 112020000 176600000 106090000 70504000 1844 1681;4380;6577;7269;8958;13593;18021 True;True;True;True;True;True;True 1708;4437;6648;7345;9054;13757;18235 7221;7222;18601;27462;30459;30460;30461;30462;30463;38122;38123;38124;38125;38126;57632;76434;76435;76436;76437;76438;76439;76440;76441 9319;9320;9321;9322;9323;23930;35041;38625;38626;38627;38628;38629;48262;48263;48264;48265;48266;48267;48268;48269;72535;96343;96344;96345;96346;96347;96348;96349 9321;23930;35041;38628;48263;72535;96347 Q9NQG5 Q9NQG5 4 4 4 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B RPRD1B sp|Q9NQG5|RPR1B_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 17.2 17.2 17.2 36.899 326 326 0 14.36 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3094 1.2962 49.168 8 2 Leave out requantified 1.4124 1.1147 1.1092 NaN 1.4308 1.1253 1.1705 NaN 19.945 38.995 40.226 NaN 2 3 2 1 0 1 1 0 Median Median Median Median 9.5 12.3 9.5 9.5 185430000 99504000 85921000 26432000 11651000 14782000 116870000 67999000 48871000 32827000 16282000 16546000 9295400 3572900 5722500 1845 986;3632;7456;8347 True;True;True;True 1001;3679;7534;8437 4234;15483;15484;15485;15486;31461;31462;31463;31464;31465;35287 5427;19947;19948;19949;19950;19951;19952;39913;39914;39915;39916;39917;44682 5427;19950;39914;44682 Q9NQR4 Q9NQR4 2 2 2 Omega-amidase NIT2 NIT2 sp|Q9NQR4|NIT2_HUMAN Omega-amidase NIT2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIT2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 0 2 1 2 0 2 1 2 0 10.9 10.9 10.9 30.608 276 276 0.0021108 3.6321 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6246 1.6631 42.375 5 2 Median 1.662 NaN 0.81747 NaN 1.7262 NaN 0.89368 NaN 5.2653 NaN 45.83 NaN 2 1 2 0 1 1 0 0 Median Median Median Median 10.9 5.4 10.9 0 91562000 42066000 49496000 39124000 15937000 23187000 17438000 5651200 11787000 35000000 20478000 14522000 0 0 0 1846 611;8475 True;True 617;8566 2597;2598;35820;35821;35822 3374;3375;3376;3377;45384;45385;45386 3376;45384 Q9NQT4 Q9NQT4 2 2 2 Exosome complex component RRP46 EXOSC5 sp|Q9NQT4|EXOS5_HUMAN Exosome complex component RRP46 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 0 2 2 2 0 2 2 2 0 14.5 14.5 14.5 25.249 235 235 0 12.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69425 0.72793 35.002 5 3 Median 0.85998 NaN 0.71131 NaN 0.88408 NaN 0.73144 NaN 63.451 NaN 0.68103 NaN 2 1 2 0 2 1 0 0 Median Median Median Median 14.5 14.5 14.5 0 44762000 23774000 20988000 16044000 7159000 8884800 7367200 5377600 1989700 21351000 11238000 10113000 0 0 0 1847 1452;6462 True;True 1475;6531 6233;6234;6235;27057;27058;27059 8053;8054;8055;34581;34582;34583 8055;34583 Q9NQT5 Q9NQT5 3 3 3 Exosome complex component RRP40 EXOSC3 sp|Q9NQT5|EXOS3_HUMAN Exosome complex component RRP40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC3 PE=1 SV=3 1 3 3 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Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.8 31.4 31.1 30.2 9203900000 4895400000 4308500000 2296600000 1239900000 1056700000 2564400000 1341000000 1223300000 2745400000 1472700000 1272600000 1597500000 841740000 755770000 1867 1104;2428;2990;3008;3085;3328;3913;3973;4077;4078;4775;5170;5460;5532;5556;6663;7247;7409;7410;7667;9565;9725;9868;10034;10367;10770;10843;11203;11460;11586;11929;12229;12569;12791;12938;13457;13922;14122;14266;14334;14345;14717;15107;15122;16614;17370 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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protein 1 PAK1IP1 sp|Q9NWT1|PK1IP_HUMAN p21-activated protein kinase-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAK1IP1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.3 4.3 4.3 43.963 392 392 0.0054591 2.7508 By matching By matching By matching By MS/MS 0.96712 0.96565 13.856 4 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 4.3 4.3 4.3 4.3 37236000 18319000 18916000 10453000 4801700 5650900 7326300 3582500 3743900 11526000 5517000 6009400 7930500 4418300 3512200 1895 5314 True 5378 22300;22301;22302;22303 28516 28516 Q9NWX6 Q9NWX6 2 2 2 Probable tRNA(His) guanylyltransferase THG1L sp|Q9NWX6|THG1_HUMAN Probable tRNA(His) guanylyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THG1L PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 0 2 1 1 0 2 1 1 0 9.1 9.1 9.1 34.83 298 298 0 11.407 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0921 1.1067 8.7614 4 1 Median 1.0614 NaN NaN NaN 1.0902 NaN NaN NaN 4.0264 NaN NaN NaN 2 1 1 0 1 0 0 0 Median Median Median Median 9.1 3.4 3.4 0 32510000 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Q9UBK8 4 4 4 Methionine synthase reductase MTRR sp|Q9UBK8|MTRR_HUMAN Methionine synthase reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTRR PE=1 SV=4 1 4 4 4 3 2 4 3 3 2 4 3 3 2 4 3 8.7 8.7 8.7 77.673 698 698 0 15.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0969 1.1064 11.396 12 5 Leave out requantified 1.1535 1.1559 0.99234 1.0898 1.3143 1.152 1.0152 0.94821 20.914 0.81934 17.225 27.175 3 2 4 3 0 0 3 2 Leave out requantified Median Median Median 7 3.9 8.7 7 276480000 134510000 141970000 65130000 30982000 34149000 60722000 26048000 34674000 89213000 46980000 42232000 61414000 30502000 30912000 1935 1047;2059;12931;18096 True;True;True;True 1063;2091;13089;18310 4510;4511;8827;8828;8829;55012;55013;55014;76736;76737;76738;76739 5804;5805;11360;11361;11362;69259;69260;69261;96702;96703;96704;96705;96706;96707 5804;11362;69261;96703 Q9UBP6 Q9UBP6 7 7 7 tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase METTL1 sp|Q9UBP6|TRMB_HUMAN tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL1 PE=1 SV=1 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9815;22073;60237;62972;65980;68892;78328 Q9UGJ1 Q9UGJ1 3 3 3 Gamma-tubulin complex component 4 TUBGCP4 sp|Q9UGJ1|GCP4_HUMAN Gamma-tubulin complex component 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 7 7 7 76.088 667 667 0 5.0604 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.64406 0.60232 47.455 5 1 Leave out requantified NaN NaN NaN 0.50596 NaN NaN NaN 0.44342 NaN NaN NaN 108.11 1 1 1 2 1 0 0 0 Median Median Median Median 2.1 3.3 1.6 4.9 53948000 32704000 21244000 7441500 4787200 2654300 10032000 6509600 3522200 12654000 7249000 5405300 23820000 14158000 9662100 1952 448;13868;16306 True;True;True 451;14037;16502 1851;58833;58834;69107;69108 2399;74110;87258;87259;87260 2399;74110;87258 Q9UH62 Q9UH62 2 2 2 Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 ARMCX3 sp|Q9UH62|ARMX3_HUMAN Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARMCX3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 6.3 6.3 6.3 42.5 379 379 0 5.4612 By MS/MS By MS/MS By 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BAZ1B BAZ1B sp|Q9UIG0|BAZ1B_HUMAN Tyrosine-protein kinase BAZ1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAZ1B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 0 1 2 1 0 1 2 1 0 1 1.1 1.1 1.1 170.9 1483 1483 0.0035787 3.1743 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82469 0.86921 6.5315 4 1 Median 0.74803 NaN NaN NaN 0.81467 NaN NaN NaN 6.5667 NaN NaN NaN 2 1 0 1 1 0 0 0 Median Median Median Median 1.1 0.5 0 0.5 561130000 297360000 263760000 210310000 116220000 94089000 181780000 99710000 82072000 0 0 0 169040000 81438000 87604000 1967 6243;15060 True;True 6312;15245 26199;26200;26201;63819 33491;33492;33493;33494;33495;80434 33493;80434 Q9UIJ7 Q9UIJ7 4 4 4 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial AK3 sp|Q9UIJ7|KAD3_HUMAN GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK3 PE=1 SV=4 1 4 4 4 4 2 2 3 4 2 2 3 4 2 2 3 21.1 21.1 21.1 25.565 227 227 0 12.86 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.80294 0.87584 49.72 11 3 Leave out requantified 0.81471 0.81719 0.5523 0.79134 0.93595 0.83444 0.61198 0.81959 68.695 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True;True 2704;14388 11395;60324;60325;60326;60327 14612;75912;75913;75914;75915 14612;75914 Q9UKV3 Q9UKV3 8 8 8 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus ACIN1 sp|Q9UKV3|ACINU_HUMAN Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACIN1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 6 4 5 5 6 4 5 5 6 4 5 8.3 8.3 8.3 151.86 1341 1341 0 21.831 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98646 0.98004 31.234 18 2 Leave out requantified 0.8801 0.97638 1.0014 1.1707 0.85752 0.98999 1.1001 1.0403 27.243 4.7575 18.101 43.538 4 6 3 5 0 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.4 6.2 5.4 5.7 304660000 144850000 159820000 61712000 31994000 29718000 96260000 47026000 49234000 61241000 29792000 31449000 85451000 36037000 49414000 1978 2567;5235;6401;6926;8591;10086;15770;16669 True;True;True;True;True;True;True;True 2603;5299;6470;6999;8684;10192;15963;16869 10987;10988;21996;21997;21998;21999;26810;26811;26812;28748;36372;36373;36374;36375;43016;43017;43018;66843;66844;70794 14110;14111;28137;28138;28139;28140;28141;28142;28143;34300;36660;46121;46122;54292;54293;84306;89386 14110;28138;34300;36660;46121;54293;84306;89386 Q9UKX7 Q9UKX7 2 2 2 Nuclear pore complex protein Nup50 NUP50 sp|Q9UKX7|NUP50_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup50 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP50 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 6.2 6.2 6.2 50.144 468 468 0 6.7777 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76615 0.70611 34.383 6 1 Median NaN NaN 0.75142 0.63956 NaN NaN 0.80086 0.58223 NaN NaN 38.858 43.602 1 1 2 2 0 0 1 0 Median Median Median Median 3 3 6.2 6.2 108030000 58496000 49532000 24192000 13619000 10574000 22373000 12942000 9431000 36640000 18899000 17741000 24822000 13037000 11786000 1979 7355;17836 True;True 7433;18048 30965;30966;75707;75708;75709;75710 39261;39262;95444;95445;95446 39262;95444 Q9UKZ1 Q9UKZ1 1 1 1 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 CNOT11 sp|Q9UKZ1|CNO11_HUMAN CCR4-NOT transcription complex subunit 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT11 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 55.215 510 510 0 5.3172 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89451 0.99824 30.783 6 5 Median 1.004 NaN 0.81936 NaN 1.096 NaN 0.8978 NaN 35.518 NaN 37.305 NaN 2 1 2 1 2 1 2 0 Median Median Median Median 2.4 2.4 2.4 2.4 63514000 33560000 29954000 19101000 10502000 8599300 11928000 7925300 4003100 18721000 8506500 10215000 13763000 6625800 7137000 1980 15417 True 15608 65400;65401;65402;65403;65404;65405 82499;82500;82501;82502;82503;82504 82503 Q9UL46 Q9UL46 2 2 2 Proteasome activator complex subunit 2 PSME2 sp|Q9UL46|PSME2_HUMAN Proteasome activator complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSME2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 2 0 9.2 9.2 9.2 27.401 239 239 0 7.0743 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 Median Median Median Median 0 3.8 9.2 0 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Protein SGT1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUGT1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 1 1 2 3 1 1 2 3 1 1 8.5 8.5 8.5 41.024 365 365 0.0010782 3.8604 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 1.2754 1.3543 6.1795 6 0 Leave out requantified 1.4105 1.3472 NaN NaN 1.5299 1.3985 NaN NaN 8.7457 0.68341 NaN NaN 2 2 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median 6 8.5 4.1 4.1 263040000 118070000 144970000 110820000 49300000 61523000 133950000 59369000 74584000 12202000 6532000 5669800 6062100 2869800 3192300 2031 4217;9395;9542 True;True;True 4272;9496;9644 17990;17991;40118;40687;40688;40689;40690 23142;23143;50816;51485;51486 23143;50816;51486 Q9Y314 Q9Y314 5 5 5 Nitric oxide synthase-interacting protein NOSIP sp|Q9Y314|NOSIP_HUMAN Nitric oxide synthase-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOSIP PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 4 4 3 4 4 4 3 4 4 4 25.9 25.9 25.9 33.172 301 301 0 22.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92276 0.95379 10.363 19 3 Leave out requantified 0.73361 0.9223 0.81425 1.1081 0.77686 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protein SBDS OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SBDS PE=1 SV=4 1 17 17 17 12 15 15 12 12 15 15 12 12 15 15 12 54.8 54.8 54.8 28.763 250 250 0 145.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8872 0.91148 37.055 63 14 Leave out requantified 0.91808 0.89246 1.0102 1.0213 0.98167 0.90423 1.0879 0.9434 40.228 22.254 18.143 34.458 14 18 16 15 1 6 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 44.4 45.6 51.6 48.8 6006000000 3029600000 2976400000 1390800000 766510000 624270000 1783800000 895350000 888400000 1668600000 834140000 834430000 1162900000 533630000 629300000 2037 1969;2340;3075;3464;3862;3863;5185;5186;5967;5968;6729;7333;8631;10826;12986;13299;16569 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2000;2376;3119;3510;3911;3912;5249;5250;6033;6034;6801;7411;8725;10942;13144;13461;16766 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protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLIC4 PE=1 SV=4 1 7 7 7 6 5 5 4 6 5 5 4 6 5 5 4 39.5 39.5 39.5 28.772 253 253 0 53.374 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1293 1.2434 9.0772 26 8 Leave out requantified 1.1514 1.3727 1.1872 1.2302 1.2406 1.301 1.2726 1.0968 5.7006 7.9574 19.657 25.91 7 7 7 5 2 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.5 28.9 34.4 28.9 612410000 295240000 317170000 163340000 78073000 85267000 181300000 81464000 99837000 199980000 104110000 95879000 67785000 31601000 36184000 2080 2159;3524;4726;5240;7257;9379;12180 True;True;True;True;True;True;True 2192;3571;4785;5304;7333;9480;12327 9195;9196;9197;9198;9199;15033;19962;22026;22027;22028;22029;22030;22031;22032;30403;30404;40062;40063;40064;40065;51905;51906;51907;51908;51909;51910 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11101;11102;34027;34028;34029 11102;34027 Q9Y6D9 Q9Y6D9 2 2 2 Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 MAD1L1 sp|Q9Y6D9|MD1L1_HUMAN Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAD1L1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 1 0 2 0 1 0 2 0 1 0 2.9 2.9 2.9 83.066 718 718 0.0040712 3.0807 By MS/MS By MS/MS 1.4273 1.5429 46.63 3 0 Median 1.0894 NaN NaN NaN 1.1099 NaN NaN NaN 60.211 NaN NaN NaN 2 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median 2.9 0 1.4 0 856450000 352660000 503790000 387620000 159720000 227890000 0 0 0 468830000 192940000 275900000 0 0 0 2083 8177;10058 True;True 8267;10164 34549;42892;42893 43771;54150;54151 43771;54150 Q9Y6E0 Q9Y6E0 9 5 5 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit STK24 sp|Q9Y6E0|STK24_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK24 PE=1 SV=1 1 9 5 5 7 7 5 8 5 4 3 4 5 4 3 4 25.3 15.3 15.3 49.307 443 443 0 28.822 By MS/MS 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leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 BZW2 sp|Q9Y6E2|BZW2_HUMAN Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BZW2 PE=1 SV=1 1 20 20 19 16 16 17 16 16 16 17 16 15 15 16 15 45.8 45.8 44.2 48.162 419 419 0 115.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89947 0.92099 12.502 85 20 Leave out requantified 0.85472 0.92536 0.93019 1.0396 0.90785 0.92809 0.97856 0.98195 15.516 50.405 15.035 13.237 22 20 23 20 4 3 9 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.1 38.9 40.1 36.5 6643600000 3524600000 3119000000 1600100000 840050000 760090000 1483000000 769160000 713850000 2226100000 1260200000 965860000 1334400000 655170000 679190000 2085 308;454;455;496;2053;3009;3575;4219;7279;8486;8643;10123;10744;11469;13106;14739;17038;17061;17578;17708 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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