Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides MTX1 Peptides MTX2 Peptides MTX3 Razor + unique peptides MTX1 Razor + unique peptides MTX2 Razor + unique peptides MTX3 Unique peptides MTX1 Unique peptides MTX2 Unique peptides MTX3 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type MTX1 Identification type MTX2 Identification type MTX3 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L MTX1 Ratio H/L MTX2 Ratio H/L MTX3 Ratio H/L normalized MTX1 Ratio H/L normalized MTX2 Ratio H/L normalized MTX3 Ratio H/L variability [%] MTX1 Ratio H/L variability [%] MTX2 Ratio H/L variability [%] MTX3 Ratio H/L count MTX1 Ratio H/L count MTX2 Ratio H/L count MTX3 Ratio H/L iso-count MTX1 Ratio H/L iso-count MTX2 Ratio H/L iso-count MTX3 Ratio H/L type MTX1 Ratio H/L type MTX2 Ratio H/L type MTX3 Sequence coverage MTX1 [%] Sequence coverage MTX2 [%] Sequence coverage MTX3 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity MTX1 Intensity L MTX1 Intensity H MTX1 Intensity MTX2 Intensity L MTX2 Intensity H MTX2 Intensity MTX3 Intensity L MTX3 Intensity H MTX3 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions P0DPI2;A0A0B4J2D5 P0DPI2;A0A0B4J2D5 4;4 4;4 4;4 sp|P0DPI2|GAL3A_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3A, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATD3A PE=1 SV=1;sp|A0A0B4J2D5|GAL3B_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3B, mitochondr 2 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 25.7 25.7 25.7 28.17 268 268;268 0 26.187 By MS/MS By MS/MS By 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protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMCHD1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 9 7 6 9 7 6 9 7 6 5.6 5.6 5.6 226.37 2005 2005 0 13.054 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1439 1.063 23.244 21 8 Leave out requantified 1.3401 1.0409 1.0289 1.2131 1.0203 0.99998 13.414 24.397 19.161 8 7 6 4 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.6 4.1 3.8 300850000 140840000 160010000 124600000 56808000 67788000 88624000 43491000 45133000 87626000 40540000 47086000 10 3904;7622;9239;10559;11615;12695;14245;14821;16563 True;True;True;True;True;True;True;True;True 4011;7798;9450;10789;11859;12994;14578;15166;16952 13535;13536;26388;26389;32230;32231;32232;36801;36802;36803;40135;40136;40137;43929;43930;43931;49243;49244;51107;56969;56970;56971 17232;17233;33203;33204;40578;40579;46215;46216;50318;50319;50320;54894;54895;61612;61613;63952;71485;71486;71487 17232;33203;40579;46215;50318;54895;61613;63952;71485 A6NIH7 A6NIH7 1 1 1 Protein unc-119 homolog B UNC119B sp|A6NIH7|U119B_HUMAN Protein unc-119 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UNC119B PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 8 28.136 251 251 0 6.7573 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0397 1.0123 27.715 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 8 8 8 70064000 35099000 34965000 26901000 13980000 12920000 16189000 7336000 8853300 26974000 13782000 13191000 11 2 True 2 7;8;9 15;16;17 16 A6NJ78 A6NJ78 1 1 1 Probable methyltransferase-like protein 15 METTL15 sp|A6NJ78|MET15_HUMAN Probable methyltransferase-like protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL15 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.2 3.2 3.2 46.121 407 407 0 3.255 By MS/MS By MS/MS 0.67089 0.61184 11.019 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 3.2 0 3.2 20787000 12895000 7892100 12389000 7432200 4956300 0 0 0 8398400 5462600 2935800 12 4428 True 4546 15326;15327 19491;19492 19491 A6NKF1 A6NKF1 1 1 1 SAC3 domain-containing protein 1 SAC3D1 sp|A6NKF1|SAC31_HUMAN SAC3 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAC3D1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 3.7 3.7 3.7 43.553 404 404 0.009754 1.6022 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 3.7 0 7920900 6904700 1016200 0 0 0 7920900 6904700 1016200 0 0 0 13 2617 True 2694 9063 11552 11552 Q8N7P3;A6NM45 Q8N7P3;A6NM45 1;1 1;1 1;1 Claudin-22;Putative claudin-24 CLDN22;CLDN24 sp|Q8N7P3|CLD22_HUMAN Claudin-22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLDN22 PE=2 SV=3;sp|A6NM45|CLD24_HUMAN Putative claudin-24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLDN24 PE=5 SV=2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.9 5.9 5.9 24.509 220 220;220 0.008507 1.6265 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3615 1.2394 32.152 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.9 5.9 5.9 894050000 439340000 454710000 349020000 140730000 208290000 284840000 136470000 148370000 260200000 162150000 98046000 14 2277 True 2348 7866;7867;7868 10119;10120;10121 10119 Q9BWD3;A6ZKI3;Q17RB0 Q9BWD3;A6ZKI3;Q17RB0 2;2;1 2;2;1 2;2;1 Protein FAM127B;Protein FAM127A;Protein FAM127C FAM127B;FAM127A;FAM127C sp|Q9BWD3|RTL8A_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 8A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL8A PE=1 SV=3;sp|A6ZKI3|RTL8C_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 8B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL8C PE=1 SV=1;sp|Q17RB0|RTL8B_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 3 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 14.2 14.2 14.2 13.188 113 113;113;113 0.00047733 2.6479 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87895 0.84928 2.9595 4 0 Leave out requantified NaN NaN 0.81386 NaN NaN 0.80023 NaN NaN 11.372 1 1 2 0 0 0 Median Median Median 6.2 14.2 14.2 58841000 29006000 29835000 19007000 8707000 10300000 13585000 6794700 6790400 26249000 13504000 12745000 15 4528;6015 True;True 4652;6160 15640;15641;20464;20465;20466 19877;19878;25893;25894;25895;25896 19878;25893 P62308;A8MWD9 P62308;A8MWD9 2;2 2;2 2;2 Small nuclear ribonucleoprotein G;Putative small nuclear ribonucleoprotein G-like protein 15 SNRPG;SNRPGP15 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MS/MS 0.1985 0.15669 20.149 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 7.8 7.8 7.8 1791800000 1501200000 290600000 612320000 528330000 83989000 523420000 438760000 84655000 656070000 534110000 121960000 + 18 1256;12422 True;False 1297;12708 4319;4320;4321;42956;42957;42958 5606;5607;5608;53739 5608;53739 CON__P02533;P02533;CON__P19012;CON__A2A4G1;P19012;CON__Q61782;CON__Q14525;CON__Q9UE12;CON__Q15323;CON__A2A5Y0;CON__Q14532;CON__A2AB72;CON__O76015;CON__O76013;CON__Q7Z3Y9;CON__O76014;CON__REFSEQ:XP_986630;CON__Q99456;CON__Q2M2I5;Q14525;Q15323;Q14532;O76014;O76015;O76013;Q7Z3Y9;Q99456;Q2M2I5 CON__P02533;P02533 16;16;4;4;4;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 8;8;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Keratin, type I cytoskeletal 14 KRT14 ;sp|P02533|K1C14_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT14 PE=1 SV=4 28 16 8 2 4 5 16 0 0 8 0 0 2 39.2 23.7 7 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NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 10.7 10.7 0 38316000 13932000 24384000 35032000 13250000 21782000 3283500 681790 2601700 0 0 0 38 18249 True 18657 62650;62651 78797;78798 78797 G2XKQ0;P63165 G2XKQ0;P63165 2;2 2;2 2;2 Small ubiquitin-related modifier;Small ubiquitin-related modifier 1 SUMO1 sp|G2XKQ0|SUMO5_HUMAN Small ubiquitin-related modifier 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUMO1P1 PE=1 SV=2;sp|P63165|SUMO1_HUMAN Small ubiquitin-related modifier 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUMO1 PE=1 SV=1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 18.8 18.8 18.8 11.526 101 101;101 0 3.2049 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1127 1.0238 15.666 6 0 Leave out requantified 1.2571 0.93881 1.1127 1.0914 0.87456 1.0541 6.6244 5.4391 19.784 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 18.8 18.8 18.8 184360000 92252000 92105000 68883000 32457000 36426000 63767000 34553000 29214000 51707000 25242000 26465000 39 5253;17392 True;True 5384;17788 17968;17969;17970;59793;59794;59795 22778;22779;75173;75174;75175 22779;75175 O00116 O00116 4 4 4 Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal AGPS sp|O00116|ADAS_HUMAN Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGPS PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 1 3 3 1 3 3 1 11.1 11.1 11.1 72.911 658 658 0 8.9431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3729 1.2276 59.572 7 4 Median 1.3729 0.93208 NaN 1.2276 0.9003 NaN 23.204 100.12 NaN 3 3 1 2 1 1 Median Median Median 9 9.1 3.3 124920000 54771000 70145000 53042000 24519000 28524000 54188000 23448000 30739000 17686000 6803900 10882000 40 1443;4617;12402;13876 True;True;True;True 1488;4742;12687;14201 4919;4920;4921;15947;42870;47906;47907 6349;6350;6351;20288;53630;59961;59962;59963 6349;20288;53630;59962 O00139 O00139 6 6 5 Kinesin-like protein KIF2A KIF2A sp|O00139|KIF2A_HUMAN Kinesin-like protein KIF2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF2A PE=1 SV=3 1 6 6 5 4 4 5 4 4 5 4 3 4 9.8 9.8 8.5 79.954 706 706 0 19.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4305 1.3297 0.79949 13 7 Leave out requantified 1.6874 1.1519 1.3883 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10 10 10 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F EIF3F sp|O00303|EIF3F_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3F PE=1 SV=1 1 10 10 10 10 9 9 10 9 9 10 9 9 27.5 27.5 27.5 37.563 357 357 0 64.258 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0862 1.0066 32.742 36 6 Leave out requantified 1.1265 1.0294 1.0728 0.99542 0.94973 1.0009 26.644 40.147 22.613 13 11 12 3 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.5 25.2 25.2 2162700000 1071100000 1091600000 858070000 407180000 450890000 580450000 304850000 275600000 724190000 359030000 365160000 54 5285;7877;10186;10187;12593;15667;16280;17390;17394;18587 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5417;8056;10411;10412;12891;16032;16667;17786;17790;19002 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11913;12014;12887;17709;25130;27276;28550;30193;32400;38984;49606;51423;56640;62339;65136;65705;74680;74763;79154;81424;82012 O00625 O00625 2 2 2 Pirin PIR sp|O00625|PIR_HUMAN Pirin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIR PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 7.6 7.6 7.6 32.113 290 290 0 4.1307 By MS/MS By MS/MS 0.75081 0.7408 20.203 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 3.4 7.6 37753000 22698000 15055000 0 0 0 13791000 8711100 5079500 23962000 13987000 9975700 70 12068;12447 True;True 12345;12734 41694;41695;43060 52222;52223;53872 52223;53872 O00629 O00629 9 9 6 Importin subunit alpha-3 KPNA4 sp|O00629|IMA3_HUMAN Importin subunit alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KPNA4 PE=1 SV=1 1 9 9 6 7 6 7 7 6 7 6 4 4 21.9 21.9 17.5 57.886 521 521 0 55.254 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1558 1.1029 10.766 25 5 Leave out requantified 1.334 1.0924 1.1004 1.1895 1.0564 1.0626 15.585 17.091 21.377 10 6 9 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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73 5330;6241;18519 True;True;True 5462;6391;18931 18208;21218;21219;63479;63480;63481 23063;26834;26835;79784;79785;79786 23063;26834;79785 O14519;O75956 O14519;O75956 2;2 2;2 2;2 Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1;Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2 CDK2AP1;CDK2AP2 sp|O14519|CDKA1_HUMAN Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK2AP1 PE=1 SV=1;sp|O75956|CDKA2_HUMAN Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK2AP2 PE=1 SV=1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 15.7 15.7 15.7 12.365 115 115;126 0 3.4162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0523 0.96215 32.01 4 1 Median NaN 1.4351 NaN NaN 1.344 NaN NaN 34.381 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 8.7 15.7 8.7 100630000 49175000 51451000 27883000 14276000 13606000 46829000 21568000 25262000 25914000 13331000 12583000 74 3421;3858 True;True 3519;3963 11850;13336;13337;13338 15063;16956;16957;16958 15063;16956 O14530 O14530 3 3 3 Thioredoxin domain-containing protein 9 TXNDC9 sp|O14530|TXND9_HUMAN Thioredoxin domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNDC9 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 15.9 15.9 15.9 26.534 226 226 0 6.3419 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.298 1.192 3.7077 7 1 Leave out requantified 1.2675 1.038 1.7997 1.1335 1.0165 1.7592 10.814 120.82 32.509 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 15.9 15.9 15.9 214300000 142070000 72235000 40345000 20524000 19820000 141530000 106800000 34730000 32427000 14742000 17685000 75 4486;11447;11448 True;True;True 4608;11691;11692 15518;15519;15520;39606;39607;39608;39609 19743;19744;19745;19746;49646;49647 19743;49646;49647 O14562 O14562 4 4 4 Ubiquitin domain-containing protein UBFD1 UBFD1 sp|O14562|UBFD1_HUMAN Ubiquitin domain-containing protein UBFD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBFD1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 17.5 17.5 17.5 33.382 309 309 0 22.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1549 1.0966 20.737 8 3 Leave out requantified 1.0734 1.3689 0.88887 0.97501 1.319 0.8704 2.7638 36.784 29.595 2 2 4 0 1 2 Median Median Median 11.7 9.4 12.6 209620000 113950000 95674000 59735000 38034000 21701000 42423000 17023000 25400000 107460000 58891000 48573000 76 6305;7045;8272;15773 True;True;True;True 6456;7210;8463;16141 21481;21482;21483;21484;23978;28619;28620;54254;54255 27153;27154;27155;30328;35967;35968;68046;68047 27153;30328;35968;68047 O14579 O14579 7 7 7 Coatomer subunit epsilon COPE sp|O14579|COPE_HUMAN Coatomer subunit epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPE PE=1 SV=3 1 7 7 7 7 5 6 7 5 6 7 5 6 29.2 29.2 29.2 34.482 308 308 0 27.796 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1093 1.0145 7.1183 21 8 Leave out requantified 1.2038 1.1048 1.0595 1.0599 1.0205 1.0052 10.242 8.051 9.5294 9 5 7 5 0 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.2 26 28.9 572680000 276400000 296280000 287330000 136120000 151210000 110370000 51150000 59223000 174970000 89126000 85847000 77 1236;2970;5115;10998;11508;11765;11766 True;True;True;True;True;True;True 1277;3054;5244;11237;11752;12015;12016 4250;4251;4252;4253;4254;4255;4256;4257;10300;10301;10302;17554;17555;17556;38210;38211;38212;39789;39790;40629;40630;40631;40632 5523;5524;5525;5526;5527;5528;5529;5530;5531;13085;13086;13087;13088;13089;13090;22293;22294;22295;47930;47931;49867;49868;50910;50911;50912;50913 5528;13088;22293;47931;49868;50910;50913 P47813;O14602 P47813;O14602 5;5 5;5 5;5 Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal EIF1AX;EIF1AY sp|P47813|IF1AX_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1AX PE=1 SV=2;sp|O14602|IF1AY_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1AY PE=1 SV=4 2 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 36.1 36.1 36.1 16.46 144 144;144 0 25.946 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88163 0.82868 30.132 18 7 Leave out requantified 1.1423 0.86198 0.80307 1.0181 0.81815 0.75847 29.086 34.987 24.62 5 6 7 1 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.1 36.1 36.1 1252500000 586180000 666340000 433060000 207340000 225720000 395000000 192300000 202700000 424460000 186540000 237920000 78 1761;3212;3443;4237;18354 True;True;True;True;True 1816;3303;3543;4347;18764 6005;6006;6007;6008;6009;11129;11130;11131;11132;11133;11134;11135;11934;14695;14696;14697;14698;14699;62979;62980;62981 7785;7786;7787;7788;7789;7790;14092;14093;14094;14095;14096;14097;14098;14099;14100;14101;15168;18656;18657;18658;18659;18660;79181;79182 7787;14094;15168;18658;79181 O14617 O14617 6 6 6 AP-3 complex subunit delta-1 AP3D1 sp|O14617|AP3D1_HUMAN AP-3 complex subunit delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3D1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 5.9 5.9 5.9 130.16 1153 1153 0 49.622 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0641 1.0428 6.7091 20 4 Leave out requantified 1.1857 1.0099 1.0809 1.1086 0.94973 1.0576 31.854 34.659 13.647 8 7 5 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.9 5.9 5.1 512090000 223380000 288710000 248450000 102250000 146200000 135610000 63519000 72095000 128030000 57608000 70418000 79 1629;2021;7363;9945;11767;12018 True;True;True;True;True;True 1682;2085;7535;10166;12017;12290 5569;5570;5571;5572;5573;6994;6995;6996;25418;25419;25420;25421;34698;34699;34700;40633;40634;40635;41522;41523 7219;7220;7221;7222;7223;7224;7225;7226;7227;7228;9034;9035;9036;9037;9038;32062;32063;32064;32065;43675;50914;50915;50916;51995 7219;9034;32064;43675;50915;51995 O14618 O14618 2 2 2 Copper chaperone for superoxide dismutase CCS sp|O14618|CCS_HUMAN Copper chaperone for superoxide dismutase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCS PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 7.7 7.7 7.7 29.04 274 274 0 7.7001 By MS/MS By MS/MS 1.1022 0.99788 55.447 4 1 Median 0.96691 NaN 1.7591 0.85286 NaN 1.6731 15.725 NaN 66.6 2 0 2 0 0 1 Median Median Median 7.7 0 7.7 97416000 48786000 48631000 53697000 28010000 25687000 0 0 0 43719000 20776000 22944000 80 5305;14850 True;True 5437;15196 18138;18139;51223;51224 22978;22979;64106;64107;64108;64109 22978;64107 O14641;Q92997 O14641;Q92997 2;1 2;1 2;1 Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2;Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-3 DVL2;DVL3 sp|O14641|DVL2_HUMAN Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL2 PE=1 SV=1;sp|Q92997|DVL3_HUMAN Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL3 PE=1 SV=2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.3 3.3 3.3 78.947 736 736;716 0 5.5078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9689 0.87192 9.665 6 1 Leave out requantified 1.0236 1.0109 0.86822 0.90504 0.9321 0.82692 4.3918 9.4189 30.695 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 3.3 3.3 3.3 123770000 59695000 64073000 49054000 22904000 26149000 36775000 18441000 18334000 37939000 18350000 19590000 81 1119;5539 True;True 1153;5676 3863;3864;3865;18852;18853;18854 5018;5019;5020;23875;23876;23877;23878 5018;23876 O14732 O14732 4 4 4 Inositol monophosphatase 2 IMPA2 sp|O14732|IMPA2_HUMAN Inositol monophosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 11.5 11.5 11.5 31.321 288 288 0 14.241 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92908 0.87949 4.8824 9 3 Leave out requantified 1.0625 0.86651 1.1447 0.98414 0.84965 1.1108 16.059 12.055 20.129 3 3 3 1 1 1 Median Median Plateau 11.5 11.5 11.5 734310000 387950000 346350000 271270000 140320000 130950000 208200000 117300000 90891000 254840000 130330000 124510000 82 1103;5139;11177;18050 True;True;True;True 1137;5268;11418;18456 3797;3798;3799;17622;17623;17624;38760;38761;38762;62028 4934;4935;4936;4937;4938;22377;22378;22379;48568;48569;48570;78033 4935;22378;48569;78033 O14744 O14744 2 2 2 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed PRMT5 sp|O14744|ANM5_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT5 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 4.2 4.2 4.2 72.683 637 637 0 5.2604 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0801 0.92465 34.801 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.1 4.2 3.1 61811000 28486000 33325000 20646000 9278500 11368000 18680000 7434700 11245000 22485000 11773000 10712000 83 2217;6028 True;True 2287;6173 7682;7683;7684;20499 9885;9886;9887;9888;25944 9886;25944 O14745 O14745 3 3 3 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 SLC9A3R1 sp|O14745|NHRF1_HUMAN Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC9A3R1 PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14 14 14 38.868 358 358 0 5.5459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4296 1.3038 36.31 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 3.9 2.8 7.3 44183000 16140000 28043000 22872000 10918000 11954000 15147000 5222600 9924700 6164300 0 6164300 84 1289;11459;15413 True;True;True 1331;11703;15772 4426;39642;53024 5743;49683;66435 5743;49683;66435 O14773 O14773 4 4 4 Tripeptidyl-peptidase 1 TPP1 sp|O14773|TPP1_HUMAN Tripeptidyl-peptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPP1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 8.7 8.7 8.7 61.247 563 563 0 11.02 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99662 0.93041 11.021 11 3 Leave out requantified 1.3274 0.88348 0.91011 1.1517 0.83631 0.85764 4.5645 7.0433 13.681 5 3 3 2 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.7 6.2 5 382710000 181840000 200860000 189490000 81498000 107990000 109180000 56177000 53002000 84040000 44169000 39871000 85 8209;9947;11646;17888 True;True;True;True 8396;10168;11890;18293 28384;28385;34702;34703;40228;40229;40230;40231;40232;61498;61499 35697;35698;35699;43677;43678;50417;50418;50419;50420;50421;50422;50423;77385 35698;43678;50417;77385 O14776 O14776 17 17 17 Transcription elongation regulator 1 TCERG1 sp|O14776|TCRG1_HUMAN Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2 1 17 17 17 14 15 14 14 15 14 14 15 14 15.8 15.8 15.8 123.9 1098 1098 0 52.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.081 1.0155 15.998 44 14 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6361;21816;48249 O14787 O14787 7 2 2 Transportin-2 TNPO2 sp|O14787|TNPO2_HUMAN Transportin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNPO2 PE=1 SV=3 1 7 2 2 6 6 7 1 1 2 1 1 2 7.5 3 3 101.39 897 897 0 3.0462 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99341 0.9411 21.332 4 1 Median NaN NaN 0.87987 NaN NaN 0.86016 NaN NaN 33.005 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 5.4 5.4 7.5 171810000 90846000 80963000 63484000 31075000 32409000 49273000 28971000 20302000 59053000 30800000 28252000 88 2834;5899;9448;10812;12391;13700;14925 False;True;False;True;False;False;False 2914;6042;9664;11047;12676;14024;15272 9843;9844;9845;9846;9847;9848;20063;33069;33070;33071;37621;37622;37623;42829;42830;42831;42832;42833;47362;47363;47364;51444;51445;51446;51447;51448;51449 12529;12530;12531;12532;12533;12534;12535;12536;12537;25378;41618;41619;41620;41621;41622;41623;47197;47198;47199;47200;47201;47202;53588;53589;53590;53591;53592;53593;59240;59241;59242;59243;59244;64375;64376;64377;64378;64379;64380;64381 12531;25378;41618;47200;53588;59241;64376 O14818;Q8TAA3 O14818 7;3 7;3 7;3 Proteasome subunit alpha type-7 PSMA7 sp|O14818|PSA7_HUMAN Proteasome subunit alpha type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMA7 PE=1 SV=1 2 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 39.1 39.1 39.1 27.887 248 248;256 0 44.287 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95037 0.91834 19.24 23 7 Leave out requantified 1.2458 0.93751 0.93731 1.1154 0.89967 0.91425 34.542 21.011 8.499 9 6 8 5 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.7 33.5 34.7 836240000 438730000 397510000 386610000 193210000 193400000 203780000 101630000 102150000 245840000 143890000 101950000 89 754;973;6658;8176;11412;12904;19039 True;True;True;True;True;True;True 782;1005;6815;8362;11655;13210;19463 2619;2620;2621;2622;3360;22558;22559;22560;28290;28291;28292;39497;39498;39499;39500;39501;39502;44691;44692;44693;44694;44695;44696;65265;65266 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By MS/MS 1.0259 0.98327 25.411 6 1 Leave out requantified 1.5309 NaN 0.93538 1.478 NaN 0.92198 34.879 NaN 24.169 3 1 2 1 0 0 Median Median Median 4.9 1.2 3.2 72697000 29667000 43029000 42226000 16743000 25482000 9389300 4030900 5358400 21081000 8893100 12188000 92 852;2685;18437 True;True;True 881;2762;18847 2965;2966;2967;9298;9299;63224 3803;3804;3805;11833;79472;79473 3805;11833;79473 O14929 O14929 13 13 13 Histone acetyltransferase type B catalytic subunit HAT1 sp|O14929|HAT1_HUMAN Histone acetyltransferase type B catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HAT1 PE=1 SV=1 1 13 13 13 12 10 11 12 10 11 12 10 11 41.5 41.5 41.5 49.512 419 419 0 203.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1146 1.0428 21.29 43 10 Leave out requantified 1.1925 1.0131 1.1144 1.0581 0.94576 1.0548 25.654 19.45 9.6936 16 13 14 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.5 35.6 34.6 4494200000 2166100000 2328100000 1913400000 880590000 1032800000 1124100000 589960000 534130000 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membrane protein CASK CASK sp|O14936|CSKP_HUMAN Peripheral plasma membrane protein CASK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CASK PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 2 1 4 2 1 4 2 1 5.9 5.9 5.9 105.12 926 926 0 5.859 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3031 1.2066 17.355 5 4 Median 1.3031 1.1095 NaN 1.2066 1.0406 NaN 13.989 26.535 NaN 3 2 0 2 2 0 Median Median Median 4.8 2.3 1.1 51339000 24052000 27288000 32053000 15351000 16702000 19286000 8700500 10586000 0 0 0 94 5812;13193;13842;17241;17301 True;True;True;True;True 5954;13504;14166;17636;17697 19787;45630;47803;59224;59225;59226;59227;59462 25057;57034;59831;74458;74459;74460;74461;74765 25057;57034;59831;74460;74765 P19105;O14950 P19105;O14950 9;9 9;9 4;4 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B MYL12A;MYL12B sp|P19105|ML12A_HUMAN Myosin regulatory light chain 12A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYL12A PE=1 SV=2;sp|O14950|ML12B_HUMAN Myosin regulatory light chain 12B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYL12B PE=1 SV=2 2 9 9 4 9 8 9 9 8 9 4 4 4 62.6 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10207;11946;13312;15627;15768;16437;16475;19191;19874;20277;22899;23093;23096;37967;42766;43621;45156;46872;50534;50569;50572;55415;57932;58027;58374;58420;58466;61264;71088;71293;71296;73649;82188;82253 23 424 O15013 O15013 2 2 2 Rho guanine nucleotide exchange factor 10 ARHGEF10 sp|O15013|ARHGA_HUMAN Rho guanine nucleotide exchange factor 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF10 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.4 3.4 3.4 151.61 1369 1369 0 3.1456 By MS/MS By MS/MS 1.8024 1.6143 48.062 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 Median Median Median 1.8 1.6 0 27685000 10554000 17131000 13622000 4831900 8790200 14063000 5722500 8340700 0 0 0 101 14279;18509 True;True 14613;18921 49359;63444 61739;79745 61739;79745 O15020 O15020 12 7 7 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 SPTBN2 sp|O15020|SPTN2_HUMAN Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTBN2 PE=1 SV=3 1 12 7 7 9 8 8 5 3 4 5 3 4 5.8 4 4 271.32 2390 2390 0 19.661 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0639 0.92316 25.135 9 7 Median 1.4376 1.0808 0.85551 1.3002 0.99162 0.82749 23.712 15.019 2.6043 4 2 3 3 2 2 Median Median Median 4.5 3.9 3.4 158320000 72796000 85524000 95282000 39134000 56148000 29989000 14847000 15142000 33049000 18815000 14234000 102 832;836;2726;2780;3905;4645;7887;10306;10553;11347;12649;14604 True;False;True;False;True;False;False;False;True;True;True;True 861;865;2803;2858;4012;4770;8067;10532;10783;11589;12947;14946 2912;2913;2914;2924;2925;2926;9448;9627;13537;16052;16053;16054;27291;27292;27293;27294;35916;35917;35918;36783;36784;36785;36786;36787;39297;39298;39299;43783;50372 3740;3741;3742;3743;3761;3762;3763;12016;12259;17234;20422;20423;34349;34350;45150;45151;46192;46193;46194;46195;46196;49247;49248;49249;54721;63043 3741;3761;12016;12259;17234;20422;34349;45150;46196;49247;54721;63043 O15027 O15027 2 2 2 Protein transport protein Sec16A SEC16A sp|O15027|SC16A_HUMAN Protein transport protein Sec16A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC16A PE=1 SV=4 1 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26388;26389;26390;26391;26392;50429 26388;50429 O15054 O15054 1 1 1 Lysine-specific demethylase 6B KDM6B sp|O15054|KDM6B_HUMAN Lysine-specific demethylase 6B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM6B PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0.5 0.5 0.5 176.63 1643 1643 0.0060711 1.7381 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 0.5 0 0 48750000 14336000 34414000 48750000 14336000 34414000 0 0 0 0 0 0 105 11874 True 12137 41058 51416 51416 O15143 O15143 5 5 5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B ARPC1B sp|O15143|ARC1B_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC1B PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 17.7 17.7 17.7 40.949 372 372 0 23.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85164 0.79985 5.5242 13 4 Leave out requantified 0.88519 0.8349 0.82964 0.79336 0.79985 0.79871 5.5359 27.75 24.835 4 5 4 1 2 1 Leave out requantified Median Median 15.9 12.9 11 454660000 236820000 217840000 166220000 80891000 85333000 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Median Leave out requantified 23.3 23.3 23.3 245880000 116690000 129190000 84960000 45587000 39372000 58502000 22365000 36137000 102420000 48741000 53682000 110 4608;10576;14007 True;True;True 4733;10806;14335 15915;15916;15917;36868;36869;36870;48423;48424;48425;48426;48427 20237;20238;20239;46294;46295;60594;60595;60596 20239;46294;60596 O15294 O15294 6 6 6 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit OGT sp|O15294|OGT1_HUMAN UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OGT PE=1 SV=3 1 6 6 6 4 4 4 4 4 4 4 4 4 7.2 7.2 7.2 116.92 1046 1046 0 27.996 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1537 1.0815 16.839 11 4 Leave out requantified 1.1631 1.0755 1.2388 1.0301 1.0101 1.1683 16.014 19.5 29.491 4 4 3 2 1 1 Median Leave out requantified Median 4.7 5.4 4.5 264620000 146700000 117920000 110550000 54266000 56280000 97745000 63090000 34655000 56328000 29346000 26982000 111 734;4392;6625;6759;7130;11558 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4-hydroxylase subunit alpha-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P4HA2 PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 5 7 6 5 7 6 5 7 23.2 23.2 23.2 60.901 535 535 0 34.391 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.061 0.99576 9.0344 18 6 Leave out requantified 1.061 0.97917 1.0768 0.98984 0.96076 1.0376 25.102 19.597 5.615 6 5 7 3 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.2 11.6 18.3 447350000 217380000 229970000 157520000 72205000 85313000 116890000 54237000 62648000 172940000 90936000 82007000 120 1241;5951;6610;13126;13342;14133;15311;18668;19088 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1282;6095;6765;13433;13657;14465;15670;19085;19512 4273;20228;20229;20230;22406;22407;22408;45387;46201;46202;46203;48865;48866;48867;52719;63994;65415;65416;65417 5548;25599;25600;28344;28345;28346;28347;28348;28349;56723;57733;57734;57735;57736;61118;61119;66022;80429;82237;82238;82239 5548;25599;28346;56723;57734;61118;66022;80429;82239 O15498 O15498 4 4 4 Synaptobrevin homolog YKT6 YKT6 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protein zw10 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZW10 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.1 3.1 3.1 88.828 779 779 0 4.0902 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.1 0 1 13590000 6028800 7560700 13590000 6028800 7560700 0 0 0 0 0 0 132 926;1137 True;True 958;1174 3208;3926 4147;5100 4147;5100 O43286 O43286 1 1 1 Beta-1,4-galactosyltransferase 5 B4GALT5 sp|O43286|B4GT5_HUMAN Beta-1,4-galactosyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=B4GALT5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 45.118 388 388 0.0004649 2.4303 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1529 1.0594 0.57472 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 34556000 16297000 18258000 19182000 8338700 10843000 15374000 7958400 7415400 0 0 0 133 16875 True 17267 58001;58002;58003;58004;58005 72887;72888;72889;72890;72891 72889 O43290 O43290 1 1 1 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 SART1 sp|O43290|SNUT1_HUMAN U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SART1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 2.5 2.5 90.254 800 800 0 2.9887 By matching By MS/MS By MS/MS 1.2122 1.1198 4.964 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 2.5 2.5 2.5 25087000 12314000 12774000 11266000 5999200 5267200 2949200 0 2949200 10872000 6314300 4557400 134 3239 True 3331 11205;11206;11207 14187;14188 14187 O43294 O43294 1 1 1 Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein TGFB1I1 sp|O43294|TGFI1_HUMAN Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGFB1I1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2 2 2 49.814 461 461 0.00047755 2.6564 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135 2299 True 2371 7930 10195 10195 O43314 O43314 3 3 3 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 PPIP5K2 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358;9370;9371;9372;14545;14546;14547;14661;14662;17660;17661;17662;17663;17664;17665;17666;35438;37444;37445;37446;37447;37448;37449;37450;40495;40496;40497;41241;41242;41243;41244;41245;41246;41247;42608;42609;42610;42611;42612;42613;50475;50476;50477;53923 508;509;11916;11917;11918;11919;18465;18466;18467;18604;18605;22429;22430;22431;22432;22433;22434;44565;46989;46990;46991;46992;46993;46994;46995;50735;50736;50737;50738;50739;50740;51644;51645;51646;51647;51648;51649;51650;53339;53340;53341;53342;53343;53344;63182;63183;67600 508;11918;18465;18604;22434;44565;46989;46995;50736;51648;53343;63182;67600 O43447 O43447 2 2 2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H PPIH sp|O43447|PPIH_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIH PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 14.1 14.1 14.1 19.208 177 177 0.00046083 2.3477 By MS/MS By MS/MS 0.91384 0.89837 71.726 3 3 Median 1.7589 NaN NaN 1.5911 NaN NaN 90.062 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 14.1 7.9 0 71019000 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4111;17273;17274;19320;19321;19322;19323;19324;19325;40439;47626;47627;47628;48522;48523;52226;52227;52228;58158;58159;58160 5346;21931;24462;24463;24464;24465;24466;24467;50666;59600;59601;59602;59603;60715;65417;65418;65419;73088;73089;73090;73091 5346;21931;24464;50666;59603;60715;65417;73089 O43491;Q9Y2J2 O43491 18;1 18;1 18;1 Band 4.1-like protein 2 EPB41L2 sp|O43491|E41L2_HUMAN Band 4.1-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPB41L2 PE=1 SV=1 2 18 18 18 14 14 11 14 14 11 14 14 11 20.4 20.4 20.4 112.59 1005 1005;1087 0 69.496 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95176 0.95518 22.271 39 9 Leave out requantified 1.0409 0.933 0.92072 1.0052 0.90331 0.89627 39.214 9.0598 22.193 13 13 13 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.5 15.6 11.8 749330000 371280000 378050000 222900000 110390000 112510000 246650000 120470000 126170000 279780000 140410000 139360000 146 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AKAP10 sp|O43572|AKA10_HUMAN A-kinase anchor protein 10, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP10 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1.7 1.7 1.7 73.817 662 662 0.0022442 2.0429 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.7 0 0 6322900 2038600 4284300 6322900 2038600 4284300 0 0 0 0 0 0 147 14233 True 14565 49204 61562 61562 O43583 O43583 5 5 5 Density-regulated protein DENR sp|O43583|DENR_HUMAN Density-regulated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DENR PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 26.8 26.8 26.8 22.092 198 198 0 18.413 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0045 0.97906 14.372 17 9 Leave out requantified 1.2148 0.8644 1.0095 1.1025 0.82797 0.97281 35.646 32.018 3.8471 6 5 6 4 2 3 Median Median Leave out requantified 18.2 18.2 22.7 1176400000 656980000 519390000 477880000 256270000 221610000 244300000 145210000 99083000 454200000 255500000 198700000 148 11413;12303;13057;13058;18481 True;True;True;True;True 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TRAPPC3 sp|O43617|TPPC3_HUMAN Trafficking protein particle complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 20.6 20.6 20.6 20.274 180 180 0 10.484 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0324 0.97204 3.3312 11 6 Leave out requantified 1.2032 0.98739 1.0441 1.0446 0.91055 0.99257 32.379 22.327 23.702 4 3 4 3 1 2 Median Median Median 16.1 20.6 20.6 414740000 225540000 189200000 93746000 43950000 49796000 65266000 34158000 31108000 255730000 147430000 108300000 151 3195;4572;10229;13970 True;True;True;True 3286;4697;10454;14297 11073;11074;11075;11076;11077;11078;15788;15789;15790;35679;35680;35681;48268;48269;48270 14034;14035;14036;14037;14038;14039;20068;20069;20070;44860;60404;60405;60406;60407;60408 14034;20069;44860;60406 O43633 O43633 4 4 4 Charged multivesicular body protein 2a CHMP2A sp|O43633|CHM2A_HUMAN Charged multivesicular body protein 2a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP2A PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 16.7 16.7 16.7 25.104 222 222 0 19.182 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630;631;632;2039;2994;2995;2996;4811;4812;4813;4814;4815;4816;4860;4861;4862;6938;6939;15987;15988;15989;16891;16892;21248;21249;21250;23702;23703;23704;25395;25396;25397;25413;25414;30507;30508;30509;38995;40347;40348;40349;40350;41055;41056;41057;45498;46231;46232;46233;46234;47986;47987;47988;47989;47990;47991;47992;52845;52846;52847;52848;52849;55185;55186;55187;55199;55200;55201;59493;59494;59495;60362;60363;60364;60425;60426;60427;60428;60429 827;828;829;830;2601;3842;3843;3844;3845;3846;6206;6207;6208;6209;6210;6211;6212;6213;6214;6280;8954;8955;20344;20345;20346;20347;21466;21467;26872;26873;26874;29998;29999;30000;32037;32038;32039;32057;32058;38419;38420;38421;38422;48872;50561;50562;50563;50564;51412;51413;51414;51415;56870;57774;57775;57776;57777;57778;60061;60062;60063;60064;60065;60066;60067;66203;66204;66205;66206;66207;66208;69238;69239;69240;69255;69256;69257;69258;74801;74802;74803;74804;74805;75924;75925;75926;75927;75928;75929;76021;76022;76023;76024;76025;76026 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5107 1.4412 46.307 14 7 Leave out requantified 1.7534 1.454 1.0335 1.6409 1.3999 1.0087 53.843 15.031 34.003 7 3 4 4 1 2 Leave out requantified Median Median 16.7 5.7 12.3 398780000 192100000 206670000 175490000 79712000 95780000 74124000 31891000 42234000 149160000 80498000 68661000 160 4549;4562;10468;11627;11982;13283;15581 True;True;True;True;True;True;True 4673;4687;10697;11871;12253;13596;15945 15706;15756;15757;15758;36496;36497;36498;36499;40175;40176;41424;41425;45963;45964;45965;45966;53590;53591;53592;53593 19950;20016;20017;20018;20019;20020;20021;45840;45841;45842;45843;50358;50359;51879;51880;57454;57455;57456;57457;67163;67164;67165;67166;67167;67168 19950;20018;45840;50358;51879;57455;67164 Q15438;Q99418;O43739 Q15438;Q99418;O43739 1;1;1 1;1;1 1;1;1 Cytohesin-1;Cytohesin-2;Cytohesin-3 CYTH1;CYTH2;CYTH3 sp|Q15438|CYH1_HUMAN Cytohesin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYTH1 PE=1 SV=1;sp|Q99418|CYH2_HUMAN Cytohesin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYTH2 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True;True;True;True;True;True;True;True;True 92;1680;2679;2702;15581;15704;17940;18845;19464 293;294;5565;9009;9010;9011;9090;52466;52467;52468;52809;52810;60375;60376;63220;63221;65267;65268;65269 418;419;7213;11485;11486;11487;11588;65711;65712;66158;66159;75947;79469;82032;82033;82034;82035;82036;82037 419;7213;11486;11588;65711;66158;75947;79469;82034 O43765 O43765 4 4 4 Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha SGTA sp|O43765|SGTA_HUMAN Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SGTA PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 4 4 2 4 4 2 4 15.3 15.3 15.3 34.063 313 313 0 13.118 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94833 0.89116 7.5843 13 5 Leave out requantified 0.94833 1.2551 1.1004 0.85569 1.2208 1.0001 6.5385 36.398 25.359 5 3 5 2 1 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 15.3 8 15.3 630400000 297080000 333320000 302040000 154960000 147080000 108240000 42572000 65671000 220110000 99546000 120560000 163 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0 7.2705 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98793 0.93351 17.423 5 1 Leave out requantified 0.87555 1.4773 NaN 0.797 1.4194 NaN 4.937 32.018 NaN 2 2 1 0 1 0 Median Median Median 2.8 2.9 3.6 89374000 38230000 51144000 50393000 21068000 29325000 24699000 9987900 14711000 14282000 7173900 7108200 165 7954;13008;14060;14901;17798 True;True;True;True;True 8136;13315;14390;15248;18200 27546;45050;48631;51382;51383;51384;61212;61213 34670;56300;60856;64296;64297;77033;77034;77035 34670;56300;60856;64297;77035 O43809 O43809 3 3 3 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 NUDT21 sp|O43809|CPSF5_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDT21 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 12.8 12.8 12.8 26.227 227 227 0 4.9903 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86575 0.82929 18.23 9 0 Leave out requantified 1.1312 0.86575 0.87897 0.97013 0.82194 0.84351 30.051 33.201 4.7459 3 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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0.95829 NaN 35.226 29.868 NaN 2 4 1 2 2 0 Median Median Median 13.8 11.9 4.2 143260000 62060000 81204000 37171000 9625400 27545000 92151000 44753000 47398000 13942000 7681800 6260300 168 24;2804;4429;6889;7241;7299;15448 True;True;True;True;True;True;True 25;2884;4547;7051;7409;7468;15807 76;9742;15328;23367;23368;24859;25083;53135 117;12409;19493;29567;31327;31560;66579 117;12409;19493;29567;31327;31560;66579 O43847 O43847 3 3 3 Nardilysin NRD1 sp|O43847|NRDC_HUMAN Nardilysin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NRDC PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 2.9 2.9 2.9 131.7 1151 1151 0 4.1947 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0931 1.0564 38.336 6 3 Median NaN 1.0107 0.88362 NaN 0.97238 0.8512 NaN 37.674 44.027 1 3 2 1 1 1 Median Median Median 1 2.9 2.1 93266000 43092000 50174000 24912000 8305400 16606000 37850000 19300000 18550000 30504000 15487000 15017000 169 423;9532;10024 True;True;True 438;9748;10245 1436;1437;1438;33344;34967;34968 1849;1850;1851;41956;44006 1850;41956;44006 O43852 O43852 2 2 2 Calumenin CALU sp|O43852|CALU_HUMAN Calumenin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALU PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 8.3 8.3 8.3 37.106 315 315 0 4.485 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.5417 3.8993 124.99 5 4 Median NaN 4.6458 4.2084 NaN 4.4588 4.1428 NaN 88.237 233.6 1 2 2 1 2 1 Median Median Median 4.1 8.3 8.3 85344000 31389000 53955000 27090000 12668000 14422000 23004000 3811100 19192000 35250000 14910000 20340000 170 7277;15812 True;True 7446;16183 25007;25008;25009;25010;54385;54386 31479;31480;31481;31482;68224;68225 31480;68225 O43865;Q96HN2 O43865 10;4 10;4 10;4 Putative adenosylhomocysteinase 2 AHCYL1 sp|O43865|SAHH2_HUMAN S-adenosylhomocysteine hydrolase-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHCYL1 PE=1 SV=2 2 10 10 10 8 7 10 8 7 10 8 7 10 28.7 28.7 28.7 58.951 530 530;611 0 142.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94099 0.9 11.751 36 14 Leave out requantified 0.99579 0.97984 0.97553 0.87828 0.92455 0.92135 9.442 20.412 13.244 11 12 13 3 7 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.4 20.2 28.7 2026400000 1060100000 966240000 680890000 340530000 340370000 493940000 250990000 242950000 851530000 468610000 382920000 171 3776;6272;9184;9665;12706;13275;13774;13836;15169;18276 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3880;6422;9393;9883;13005;13588;14098;14160;15526;18684 13068;21346;21347;21348;21349;21350;21351;32018;32019;32020;32021;32022;32023;32024;33802;33803;33804;33805;33806;33807;33808;33809;43970;43971;43972;45936;45937;47587;47588;47589;47788;47789;52303;52304;52305;62734;62735;62736 16614;26988;26989;26990;26991;26992;26993;26994;26995;26996;40291;40292;40293;40294;40295;40296;40297;40298;40299;40300;40301;40302;40303;40304;42535;42536;42537;42538;42539;42540;42541;42542;42543;54951;54952;54953;54954;54955;54956;57419;59545;59546;59547;59814;59815;65511;65512;78894;78895;78896 16614;26993;40302;42539;54953;57419;59547;59814;65511;78895 O43929 O43929 2 2 2 Origin recognition complex subunit 4 ORC4 sp|O43929|ORC4_HUMAN Origin recognition complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 5.5 5.5 5.5 50.377 436 436 0 5.8544 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94321 0.91308 39.548 4 3 Median NaN NaN 1.2776 NaN NaN 1.2704 NaN NaN 32.178 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 1.8 1.8 5.5 73931000 38747000 35184000 19578000 11628000 7950100 18575000 11573000 7002500 35777000 15546000 20232000 172 432;15488 True;True 448;15848 1461;53270;53271;53272;53273 1875;66756;66757;66758;66759 1875;66756 O60216;Q9H4I0 O60216 6;1 6;1 6;1 Double-strand-break repair protein rad21 homolog RAD21 sp|O60216|RAD21_HUMAN Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2 2 6 6 6 4 4 3 4 4 3 4 4 3 17.1 17.1 17.1 71.689 631 631;556 0 15.227 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0525 0.98342 22.452 10 3 Leave out requantified 1.1276 1.2297 0.98241 1.0364 1.1944 0.93313 31.449 44.076 22.094 4 3 3 1 1 1 Leave out requantified Median Median 13.6 12.4 10 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True;True;True;True;False 72;1658;5678;10736;19329 225;5507;18860;36625;36626;36627;64834;64835;64836 312;7130;23887;46006;46007;46008;46009;81472 312;7130;23887;46006;81472 O60232 O60232 3 3 3 Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 SSSCA1 sp|O60232|SSA27_HUMAN Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSSCA1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 30.2 30.2 30.2 21.474 199 199 0 14.127 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1998 1.1498 28.154 8 2 Leave out requantified 1.0944 1.5479 0.97612 0.99327 1.4421 0.94227 55.34 3.8766 27.371 3 2 3 1 1 0 Plateau Median Median 30.2 21.6 21.6 250710000 114970000 135740000 110460000 51213000 59251000 38361000 10039000 28322000 101890000 53722000 48164000 175 3744;11887;14911 True;True;True 3847;12150;15258 12969;12970;12971;12972;41101;51409;51410;51411 16499;16500;16501;16502;16503;16504;51462;64326;64327;64328;64329;64330;64331 16499;51462;64327 Q14558;O60256 Q14558;O60256 1;1 1;1 1;1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1;Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 PRPSAP1;PRPSAP2 sp|Q14558|KPRA_HUMAN Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPSAP1 PE=1 SV=2;sp|O60256|KPRB_HUMAN Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPSAP2 PE=1 SV=1 2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.9 3.9 3.9 39.393 356 356;369 0.00046253 2.3657 By MS/MS By MS/MS 0.79873 0.74415 21.208 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 3.9 0 3.9 59623000 32710000 26913000 31760000 18555000 13206000 0 0 0 27863000 14155000 13707000 176 3934 True 4042 13657;13658 17388;17389;17390;17391 17388 O60264 O60264 9 9 6 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 SMARCA5 sp|O60264|SMCA5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCA5 PE=1 SV=1 1 9 9 6 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OX=9606 GN=SPAG9 PE=1 SV=4 1 17 17 17 15 13 15 15 13 15 15 13 15 16.8 16.8 16.8 146.2 1321 1321 0 63.749 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1137 1.0082 24.5 39 14 Leave out requantified 1.031 1.102 0.9949 0.94707 1.0411 0.96491 23.858 17.093 29.527 15 10 14 5 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.6 13.1 15.4 1043500000 495870000 547640000 412990000 195200000 217790000 262450000 122180000 140270000 368080000 178500000 189580000 178 424;581;768;4580;4683;5147;5428;7161;9998;10191;12527;12528;12864;15296;16998;17141;18912 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 439;603;797;4705;4809;5277;5561;7327;10219;10416;12817;12818;13170;15655;17391;17534;19333 1439;1973;1974;1975;2678;2679;2680;2681;2682;15817;15818;15819;16181;16182;16183;16184;17653;17654;18499;18500;18501;18502;24505;24506;24507;34886;34887;34888;35559;35560;35561;43380;43381;44558;44559;52679;52680;52681;58410;58411;58412;58413;58880;58881;58882;64847;64848;64849;64850;64851 1852;2515;2516;2517;3437;3438;3439;3440;20106;20107;20108;20573;20574;20575;20576;22420;22421;23418;23419;23420;23421;30942;30943;30944;43905;43906;44718;44719;54256;54257;55691;55692;65972;65973;73394;73395;73396;73397;73398;74008;81491;81492;81493 1852;2515;3437;20108;20575;22420;23418;30942;43905;44718;54256;54257;55692;65973;73396;74008;81491 O60333 O60333 6 6 3 Kinesin-like protein KIF1B KIF1B sp|O60333|KIF1B_HUMAN Kinesin-like protein KIF1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1B PE=1 SV=5 1 6 6 3 6 4 3 6 4 3 3 3 3 3.9 3.9 2.1 204.47 1816 1816 0 12.532 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0289 0.94597 17.516 13 6 Leave out requantified 1.0289 1.235 0.94589 0.94597 1.2115 0.91428 25.027 37.234 84.113 5 4 4 2 2 2 Leave out requantified Median Median 3.9 2.8 2.1 380870000 191440000 189430000 170420000 82052000 88373000 106540000 50893000 55642000 103910000 58494000 45412000 179 1965;4104;7913;14945;16376;16621 True;True;True;True;True;True 2028;4214;8094;15292;16764;17012 6803;6804;6805;6806;6807;14271;14272;14273;27405;51520;56373;56374;56375;57162;57163 8787;8788;8789;8790;8791;18140;18141;18142;18143;18144;34493;64471;70723;71735;71736 8788;18140;34493;64471;70723;71736 O60341 O60341 5 5 5 Lysine-specific histone demethylase 1A KDM1A sp|O60341|KDM1A_HUMAN Lysine-specific histone demethylase 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM1A PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 5 4 3 5 4 3 5 4 5.8 5.8 5.8 92.902 852 852 0 7.3811 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99084 0.94558 12.56 9 1 Leave out requantified 1.0771 1.1099 0.88467 0.9395 1.0311 0.85949 1.6676 5.3393 36.885 3 3 3 0 1 0 Leave out requantified Plateau Leave out requantified 4.6 5.8 5.8 153290000 71523000 81768000 57948000 29170000 28778000 45540000 18413000 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5170;5171;5172;24946;25662;25663;28088;28089;28090;44246;51519;52214;54925;54926;54927;54928 6692;6693;6694;6695;31417;32351;32352;35344;35345;35346;55329;64470;65398;65399;68919;68920;68921 6693;31417;32351;35345;55329;64470;65399;68920 O60361 O60361 5 1 1 Putative nucleoside diphosphate kinase NME2P1 sp|O60361|NDK8_HUMAN Putative nucleoside diphosphate kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NME2P1 PE=5 SV=1 1 5 1 1 4 4 5 1 1 1 1 1 1 40.9 7.3 7.3 15.529 137 137 0.0022523 2.0785 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79224 0.77528 54.159 5 3 Median 0.63643 0.76055 NaN 0.58772 0.74708 NaN 99.462 5.2398 NaN 2 2 1 1 1 1 Median Median Median 34.3 34.3 40.9 150940000 86400000 64542000 71605000 43926000 27679000 56147000 30301000 25846000 23190000 12173000 11017000 182 2922;5218;5855;12359;17813 False;True;False;False;False 3006;5349;5997;12644;18215;18216 10156;10157;10158;10159;10160;17873;17874;17875;17876;17877;19927;42724;42725;42726;42727;42728;42729;61249;61250;61251;61252;61253 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requantified Leave out requantified 16.5 23.6 16.7 645490000 309000000 336500000 187180000 84156000 103030000 237900000 119030000 118870000 220410000 105810000 114600000 184 1055;1868;2074;3547;7661;9261;12261;16716 True;True;True;True;True;True;True;True 1089;1931;2139;3647;7838;9472;12546;17107 3630;3631;3632;6412;7156;7157;7158;7159;12282;12283;12284;26534;26535;26536;32311;32312;32313;42395;42396;57473;57474;57475;57476 4695;4696;4697;4698;4699;8338;9239;9240;9241;9242;15622;15623;15624;15625;33392;33393;33394;33395;40684;40685;40686;40687;53076;53077;72147;72148;72149;72150 4696;8338;9240;15624;33393;40684;53077;72147 O60488 O60488 1 1 1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 ACSL4 sp|O60488|ACSL4_HUMAN Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACSL4 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.8 1.8 1.8 79.187 711 711 0.0077486 1.6756 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0385 0.96874 7.8814 6 3 Median 1.1105 0.95209 1.0888 0.98114 0.93907 1.052 0.30593 2.5102 13.153 2 2 2 1 0 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complex subunit 4 DKC1 sp|O60832|DKC1_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DKC1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 4 3 4 4 3 4 4 3 4 11.1 11.1 11.1 57.673 514 514 0 13.927 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1158 1.0519 25.093 12 7 Leave out requantified 0.99843 1.1983 1.2198 0.89689 1.0985 1.1853 36.545 85.91 38.673 4 3 5 2 2 3 Median Median Median 9.5 7.4 7.6 208430000 103210000 105220000 83893000 39557000 44337000 54031000 30544000 23487000 70502000 33106000 37396000 207 556;557;1243;4790;10184;18346 True;True;True;True;True;True 574;575;1284;4916;10409;18756 1878;1879;1880;4275;16499;35526;35527;35528;35529;62961;62962;62963 2404;2405;2406;5550;20969;44672;44673;44674;44675;79165 2404;2406;5550;20969;44672;79165 O60841 O60841 33 33 33 Eukaryotic translation initiation factor 5B EIF5B sp|O60841|IF2P_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5B PE=1 SV=4 1 33 33 33 30 27 28 30 27 28 30 27 28 29.3 29.3 29.3 138.83 1220 1220 0 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differentiation-related factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EDF1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 35.1 35.1 35.1 16.368 148 148 0 13.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0426 0.99308 16.538 20 3 Leave out requantified 1.1397 0.79851 1.0299 1.0303 0.76617 0.99054 19.991 18.204 4.8766 7 7 6 1 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.1 29.7 29.7 1116400000 565910000 550520000 354940000 160480000 194470000 448300000 256520000 191780000 313180000 148910000 164270000 209 724;8280;9746;9747;12953 True;True;True;True;True 751;8471;9966;9967;13260 2511;2512;2513;28651;28652;28653;28654;28655;28656;28657;34102;34103;34104;34105;34106;34107;34108;34109;34110;44854 3211;3212;3213;36011;36012;36013;36014;36015;36016;36017;36018;36019;36020;36021;42943;42944;42945;42946;42947;42948;42949;42950;42951;42952;42953;56066 3213;36015;42945;42953;56066 O60879 O60879 4 4 4 Protein diaphanous homolog 2 DIAPH2 sp|O60879|DIAP2_HUMAN Protein diaphanous homolog 2 OS=Homo sapiens 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3 254.41 2243 2243 0 14.251 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.021 0.93812 13.367 8 4 Leave out requantified 1.4477 0.9196 1.5309 1.2532 0.85482 1.4459 43.395 21.295 6.8172 3 2 3 2 0 2 Median Median Median 1.8 1.8 1.6 73310000 31722000 41588000 31828000 13031000 18797000 17131000 8240600 8890500 24350000 10450000 13900000 224 693;2976;8616;14339;17140 True;True;True;True;True 717;3060;8816;14673;17533 2377;2378;2379;10316;10317;10318;29834;49539;58879 3047;3048;3049;3050;13109;13110;13111;13112;37523;61978;74007 3047;13109;37523;61978;74007 O75179 O75179 3 2 2 Ankyrin repeat domain-containing protein 17 ANKRD17 sp|O75179|ANR17_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD17 PE=1 SV=3 1 3 2 2 3 3 2 2 2 1 2 2 1 1.5 1.1 1.1 274.25 2603 2603 0 8.6304 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3812 1.3257 18.489 5 2 Median 1.4993 1.1836 NaN 1.3526 1.1111 NaN 16.529 24.973 NaN 2 2 1 1 0 1 Median Median Median 1.5 1.5 1 58652000 24504000 34148000 27228000 10291000 16937000 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sp|O75312|ZPR1_HUMAN Zinc finger protein ZPR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZPR1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 7.4 7.4 7.4 50.925 459 459 0 17.42 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1891 1.0691 13.865 12 6 Leave out requantified 1.0144 1.3023 0.9372 0.86969 1.1596 0.89084 21.392 18.686 27.135 5 3 4 3 1 2 Median Median Median 7.4 7.2 7.4 201520000 98522000 103000000 94732000 46461000 48271000 40584000 18547000 22037000 66206000 33514000 32691000 227 739;740;5591;5775 True;True;True;True 766;767;5728;5916 2562;2563;2564;2565;2566;2567;19000;19001;19002;19645;19646;19647 3273;3274;3275;3276;3277;3278;3279;24063;24064;24065;24871;24872 3274;3278;24064;24871 O75340 O75340 6 6 6 Programmed cell death protein 6 PDCD6 sp|O75340|PDCD6_HUMAN Programmed cell death protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD6 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 31.9 31.9 31.9 21.868 191 191 0 52.821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94399 0.8805 10.819 25 5 Leave out requantified 0.96328 0.98982 0.92905 0.82931 0.91285 0.87093 10.733 27.353 11.347 10 8 7 3 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.9 31.9 31.9 1885000000 953400000 931590000 879940000 439680000 440260000 531600000 278360000 253240000 473450000 235360000 238090000 228 605;11194;14646;14647;16775;18781 True;True;True;True;True;True 627;11435;14988;14989;17167;19200 2065;2066;2067;38811;38812;38813;38814;38815;38816;38817;50485;50486;50487;50488;50489;50490;50491;57674;57675;57676;57677;57678;57679;64415;64416;64417 2634;2635;2636;2637;48644;48645;48646;48647;48648;48649;48650;48651;48652;48653;48654;48655;48656;63194;63195;63196;63197;63198;63199;63200;63201;63202;63203;63204;72419;72420;72421;72422;72423;72424;72425;72426;72427;80961;80962;80963;80964;80965 2634;48647;63195;63203;72422;80962 O75348 O75348 2 2 2 V-type proton ATPase subunit G 1 ATP6V1G1 sp|O75348|VATG1_HUMAN V-type proton ATPase subunit G 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1G1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 21.2 21.2 21.2 13.757 118 118 0 15.585 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81184 0.73201 43.681 8 1 Leave out requantified 1.0313 0.88712 1.1788 0.93558 0.86024 1.1543 33.68 22.142 19.433 3 2 3 0 0 1 Median Median Median 21.2 11.9 21.2 347500000 173230000 174270000 147770000 75521000 72253000 66641000 35704000 30937000 133080000 62004000 71080000 229 3494;6674 True;True 3594;6831 12117;12118;12119;22605;22606;22607;22608;22609;22610 15412;15413;15414;15415;28570;28571;28572;28573;28574;28575;28576;28577;28578 15415;28572 O75351;Q6PIW4 O75351 7;1 7;1 5;0 Vacuolar protein sorting-associated protein 4B VPS4B sp|O75351|VPS4B_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS4B PE=1 SV=2 2 7 7 5 5 4 4 5 4 4 3 3 2 22.5 22.5 18.2 49.301 444 444;674 0 18.153 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94803 0.86004 17.941 12 6 Leave out requantified 1.1535 1.042 0.76952 1.0276 1.0178 0.72951 19.735 11.651 13.273 4 3 5 1 1 4 Leave out requantified Median Median 15.8 14.4 10.8 476890000 238480000 238420000 195790000 87682000 108110000 139200000 70211000 68991000 141900000 80584000 61315000 230 4314;6217;10179;10537;11090;14930;18457 True;True;True;True;True;True;True 4432;6367;10404;10767;11331;15277;18868 14969;14970;21147;21148;21149;35510;36708;38493;51460;51461;51462;51463;63277;63278 19014;19015;19016;19017;26754;26755;26756;44654;46094;48252;64392;64393;64394;64395;79536;79537 19014;26754;44654;46094;48252;64393;79536 O75369 O75369 121 112 109 Filamin-B FLNB sp|O75369|FLNB_HUMAN Filamin-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNB PE=1 SV=2 1 121 112 109 116 116 120 107 108 111 105 105 108 56.5 54.2 53 278.16 2602 2602 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9624 0.90624 11.604 512 104 Leave out requantified 0.95398 1.0525 0.94247 0.85488 1.0076 0.90416 13.857 17.019 13.148 176 158 178 40 30 34 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56 54.8 56.5 53086000000 26629000000 26457000000 19820000000 10018000000 9801900000 12970000000 6324800000 6644700000 20297000000 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123 homolog CDC123 sp|O75794|CD123_HUMAN Cell division cycle protein 123 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC123 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 17.6 17.6 17.6 39.134 336 336 0 17.599 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1307 1.074 17.212 9 2 Leave out requantified 1.0515 1.1307 1.3407 0.94894 1.074 1.3104 17.28 106.38 122.05 3 3 3 0 1 1 Leave out requantified Plateau Median 13.7 10.4 10.1 307830000 213190000 94642000 61002000 29582000 31421000 112630000 80726000 31904000 134200000 102880000 31318000 251 2331;3208;3219;15452;16229 True;True;True;True;True 2405;3299;3311;15811;16614 8074;8075;11119;11150;11151;53149;53150;53151;55900;55901 10379;10380;14083;14122;66599;66600;66601;66602;66603;70143 10379;14083;14122;66603;70143 O75818 O75818 2 2 2 Ribonuclease P protein subunit p40 RPP40 sp|O75818|RPP40_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPP40 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 6.9 6.9 6.9 41.833 363 363 0.00047962 2.7032 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 2.5 4.4 0 5773900 3537200 2236700 0 0 0 5773900 3537200 2236700 0 0 0 252 18047;18959 True;True 18453;19382 62022;64992 78027;81689 78027;81689 O75821 O75821 13 13 13 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G EIF3G sp|O75821|EIF3G_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3G PE=1 SV=2 1 13 13 13 12 13 13 12 13 13 12 13 13 37.2 37.2 37.2 35.611 320 320 0 90.456 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1546 1.0719 15.228 49 19 Leave out requantified 1.2204 1.308 0.98668 1.1044 1.2501 0.94165 12.504 24.273 14.991 15 15 19 7 6 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.2 37.2 37.2 4225300000 2092200000 2133100000 1557700000 843020000 714660000 1147300000 506600000 640660000 1520300000 742560000 777780000 253 1994;3026;3455;3456;3925;3969;3970;4711;6230;16736;16737;18174;19071 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2058;3113;3555;3556;4033;4077;4078;4837;6380;17128;17129;18581;19495 6901;6902;6903;6904;6905;10511;10512;10513;11970;11971;11972;11973;11974;11975;11976;13616;13617;13618;13619;13620;13799;13800;13801;13802;13803;13804;13805;13806;13807;16283;16284;16285;21188;21189;21190;57553;57554;57555;57556;57557;57558;57559;57560;57561;62390;62391;62392;62393;65361;65362;65363 8914;8915;8916;8917;8918;8919;8920;8921;13362;13363;13364;15209;15210;15211;15212;15213;15214;15215;15216;15217;15218;17334;17335;17336;17337;17338;17339;17577;17578;17579;17580;17581;17582;17583;17584;17585;17586;17587;17588;20703;20704;20705;26806;26807;26808;26809;26810;72253;72254;72255;72256;72257;72258;72259;72260;72261;78474;78475;78476;78477;78478;78479;82166;82167;82168;82169;82170;82171 8920;13362;15214;15216;17335;17578;17584;20705;26809;72254;72256;78474;82169 O75822 O75822 12 12 12 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J EIF3J sp|O75822|EIF3J_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3J PE=1 SV=2 1 12 12 12 11 11 12 11 11 12 11 11 12 38 38 38 29.062 258 258 0 34.617 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1021 1.0437 15.254 42 6 Leave out requantified 1.1075 1.0949 1.1021 1.0011 1.0324 1.0528 14.068 24.883 15.073 14 14 14 3 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.2 30.2 38 3212800000 1566300000 1646500000 1185600000 569490000 616120000 926500000 450360000 476150000 1100700000 546410000 554240000 254 2213;3069;4590;6943;8572;8964;9156;9291;9804;11018;14014;17765 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2283;3156;4715;7107;8772;9171;9365;9503;10025;11257;14342;18167 7661;7662;7663;10651;10652;10653;10654;10655;10656;15858;23605;23606;23607;29693;29694;29695;31161;31162;31163;31932;31933;31934;31935;31936;31937;32427;32428;32429;34277;34278;34279;38266;38267;38268;48452;48453;48454;48455;48456;48457;61114;61115;61116 9856;9857;9858;9859;9860;9861;13551;13552;13553;13554;13555;13556;20161;29866;29867;29868;29869;29870;37336;37337;37338;39245;40197;40198;40199;40200;40201;40202;40831;40832;40833;40834;43162;43163;43164;43165;43166;43167;47991;47992;47993;47994;47995;47996;60632;60633;60634;60635;60636;60637;60638;76915;76916;76917;76918;76919;76920 9861;13553;20161;29866;37337;39245;40201;40832;43162;47992;60632;76915 O75832 O75832 4 4 4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 PSMD10 sp|O75832|PSD10_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD10 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 27.4 27.4 27.4 24.428 226 226 0 22.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0513 0.97867 16.876 13 5 Leave out requantified 1.0671 1.1623 0.91688 0.94798 1.0949 0.85719 17.981 3.572 21.834 6 4 3 4 1 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 27.4 27.4 23 492790000 234350000 258440000 255190000 116810000 138390000 104500000 49763000 54733000 133100000 67780000 65323000 255 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factor SPF27 BCAS2 sp|O75934|SPF27_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor SPF27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCAS2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 11.6 11.6 11.6 26.131 225 225 0 20.072 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0729 0.925 24.689 5 4 Median 1.1947 0.7426 NaN 1.064 0.70824 NaN 19.8 7.2807 NaN 2 2 1 2 2 0 Median Median Median 5.8 11.6 5.8 97493000 51317000 46175000 44376000 20818000 23558000 34872000 20483000 14389000 18244000 10016000 8228100 257 3231;16047 True;True 3323;16423 11180;55274;55275;55276;55277;55278 14159;69365;69366;69367;69368;69369 14159;69366 O75935 O75935 4 4 4 Dynactin subunit 3 DCTN3 sp|O75935|DCTN3_HUMAN Dynactin subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 25.3 25.3 25.3 21.119 186 186 0 19.505 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0876 0.99456 15.827 8 1 Leave out requantified 1.1431 1.0331 0.99843 0.99456 0.98537 0.98845 15.827 6.1931 29.643 4 2 2 1 0 0 Leave out requantified Median Median 25.3 16.7 16.7 222720000 104030000 118690000 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18354;18355;18356;18357;18358;18359;18360;35342;35343;37503;37504;37505;37506;37507;37508;42550;42551;42552;42553;42554;42555;46997;46998;46999;47644;47645;47646;71959;78450;78451;78452;78453 18357;35342;37507;42551;46999;47645;71959;78452 O95340 O95340 2 2 2 Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2;Sulfate adenylyltransferase;Adenylyl-sulfate kinase PAPSS2 sp|O95340|PAPS2_HUMAN Bifunctional 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPSS2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.6 4.6 4.6 69.5 614 614 0 4.8163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1018 1.0562 36.959 6 4 Median 0.99004 1.1018 1.048 0.87796 1.0562 1.008 52.574 0.17296 60.797 2 2 2 2 1 1 Median Median Median 4.6 4.6 4.6 55691000 25052000 30639000 20492000 9004800 11487000 15119000 7088700 8030700 20079000 8958300 11121000 292 8812;17748 True;True 9018;18150 30587;30588;30589;61059;61060;61061 38544;38545;38546;76844;76845;76846 38544;76845 O95347 O95347 43 43 43 Structural 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14;435 O95376 O95376 4 4 4 E3 ubiquitin-protein ligase ARIH2 ARIH2 sp|O95376|ARI2_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase ARIH2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARIH2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 12.2 12.2 12.2 57.818 493 493 0 9.1814 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97402 0.93225 13.108 10 1 Leave out requantified 1.0987 0.97402 0.97001 0.97781 0.89533 0.93225 16.779 25.151 18.074 3 3 4 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.9 8.9 12.2 173790000 87804000 85985000 68548000 34311000 34237000 41295000 21667000 19628000 63945000 31826000 32120000 298 1795;15931;16353;18793 True;True;True;True 1854;16306;16741;19212 6146;6147;6148;54818;54819;54820;56311;64455;64456;64457 7992;68789;70662;81013;81014;81015;81016;81017;81018 7992;68789;70662;81014 O95379 O95379 3 3 3 Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 TNFAIP8 sp|O95379|TFIP8_HUMAN Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNFAIP8 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 17.7 17.7 17.7 23.003 198 198 0 13.186 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0256 0.93036 3.0718 8 4 Leave out requantified 0.62399 1.3318 1.0569 0.55668 1.2686 1.0337 75.703 80.926 123.37 2 2 4 1 1 2 Median Median Median 7.6 7.6 17.7 168830000 80061000 88769000 51331000 25579000 25751000 27196000 11342000 15854000 90303000 43139000 47164000 299 9638;12435;14613 True;True;True 9856;12721;14955 33726;33727;33728;43006;43007;43008;43009;43010;50399 42447;53797;53798;53799;53800;53801;63085 42447;53800;63085 O95394 O95394 4 4 4 Phosphoacetylglucosamine mutase PGM3 sp|O95394|AGM1_HUMAN Phosphoacetylglucosamine mutase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGM3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 7.2 7.2 7.2 59.851 542 542 0 7.6773 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78522 0.73409 12.324 10 1 Leave out requantified 0.97583 0.73733 0.75066 0.86939 0.69239 0.68811 22.133 19.924 13.614 3 3 4 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.9 5.9 7.2 253600000 145680000 107910000 74257000 40651000 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213;2242;2328;4717;5261;6376;9918;16509;19514 679;680;7537;7538;7809;7810;7811;7812;7813;7814;15860;15861;15862;17598;17599;17600;21175;21176;21177;33936;55589;65421 890;9700;9701;10059;10060;10061;10062;10063;20163;20164;20165;20166;20167;22344;22345;22346;22347;22348;26785;26786;26787;26788;26789;26790;42738;69757;82245 890;9700;10062;20164;22344;26788;42738;69757;82245 O95453 O95453 3 3 3 Poly(A)-specific ribonuclease PARN PARN sp|O95453|PARN_HUMAN Poly(A)-specific ribonuclease PARN OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARN PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 5.8 5.8 5.8 73.45 639 639 0.00047214 2.5676 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2105 1.1777 78.725 7 0 Leave out requantified 1.2182 0.89165 1.2105 1.1233 0.87414 1.1865 11.399 16.943 74.559 2 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 3.1 3.1 5.8 95742000 39062000 56680000 25944000 11050000 14894000 24789000 13661000 11128000 45009000 14351000 30658000 302 6202;10239;17802 True;True;True 6352;10465;18204 21103;21104;21105;35714;35715;35716;61227 26706;44906;44907;44908;44909;77052 26706;44909;77052 O95456 O95456 6 6 6 Proteasome assembly chaperone 1 PSMG1 sp|O95456|PSMG1_HUMAN Proteasome assembly chaperone 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 5 4 5 5 4 5 5 4 20.8 20.8 20.8 32.854 288 288 0 24.812 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2122 1.0828 25.084 21 8 Leave out requantified 1.2694 0.97527 1.1908 1.1015 0.9316 1.1353 25.257 10.784 32.095 7 7 7 2 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16 15.6 10.8 1213900000 576370000 637520000 477970000 217280000 260690000 348360000 170310000 178050000 387560000 188780000 198770000 303 593;594;12386;12387;16474;16497 True;True;True;True;True;True 615;616;12671;12672;16862;16885 2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024;42803;42804;42805;42806;42807;42808;42809;42810;42811;42812;42813;56674;56753 2567;2568;2569;2570;2571;2572;2573;2574;2575;2576;2577;2578;2579;53561;53562;53563;53564;53565;53566;53567;53568;53569;53570;53571;71094;71189 2572;2575;53561;53570;71094;71189 O95466 O95466 2 2 2 Formin-like protein 1 FMNL1 sp|O95466|FMNL1_HUMAN Formin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMNL1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2.1 2.1 2.1 121.85 1100 1100 0 6.5185 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0182 0.9792 39.516 5 0 Leave out requantified 1.1657 1.049 NaN 1.0778 1.0017 NaN 16.471 45.771 NaN 2 2 1 0 0 0 Median Median Median 2.1 2.1 1.1 62172000 32974000 29198000 29265000 14824000 14441000 21565000 11785000 9780500 11342000 6365300 4976500 304 11149;15129 True;True 11390;15485 38690;38691;52194;52195;52196 48484;65365;65366;65367;65368;65369;65370 48484;65367 O95486 O95486 4 4 4 Protein transport protein Sec24A SEC24A sp|O95486|SC24A_HUMAN Protein transport protein Sec24A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC24A PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4.3 4.3 4.3 119.75 1093 1093 0 17.813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1019 1.0324 25.505 14 2 Leave out requantified 1.0381 1.1423 0.92161 0.92872 1.0634 0.875 25.885 31.179 25.949 5 5 4 2 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 4.3 4.3 3.4 212180000 98976000 113200000 74116000 35724000 38392000 70595000 32381000 38214000 67465000 30871000 36594000 305 14455;14993;16790;17047 True;True;True;True 14792;15346;17182;17440 49878;49879;49880;51709;51710;51711;57721;57722;57723;57724;57725;57726;58568;58569;58570 62381;62382;62383;62384;64736;64737;64738;72484;72485;72486;73591;73592;73593;73594;73595 62383;64738;72484;73591 O95544 O95544 3 3 3 NAD kinase NADK sp|O95544|NADK_HUMAN NAD kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NADK PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 8.5 8.5 8.5 49.228 446 446 0 8.7616 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78975 0.74545 24.386 5 3 Median 0.74898 NaN 0.67618 0.66212 NaN 0.65282 16.764 NaN 23.085 2 1 2 1 1 1 Median Median Median 8.5 2 4.7 95010000 49424000 45585000 38655000 18387000 20268000 12616000 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Serine/threonine-protein kinase OSR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXSR1 PE=1 SV=1 1 13 13 12 11 10 9 11 10 9 10 9 8 30.2 30.2 28.3 58.022 527 527 0 92.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0882 1.0324 89.705 38 20 Leave out requantified 1.2213 0.88279 1.0854 1.0671 0.83056 1.0337 94.977 57.969 83.496 15 13 10 7 8 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.6 23.3 21.4 1696700000 814040000 882630000 754400000 356310000 398090000 507290000 250850000 256440000 434990000 206880000 228110000 313 2012;2785;3009;4725;8629;9591;10251;10718;12411;14573;15629;17693;17694 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2076;2863;3095;4851;8829;9807;10477;10949;12696;14915;15994;18094;18095 6961;6962;6963;9642;9643;9644;9645;9646;9647;10450;16317;16318;29875;29876;29877;33558;33559;33560;33561;35750;35751;37341;37342;42911;42912;42913;42914;42915;42916;50266;50267;50268;50269;50270;50271;53760;53761;53762;53763;60874;60875 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O95816 5 5 5 BAG family molecular chaperone regulator 2 BAG2 sp|O95816|BAG2_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 2 4 4 2 4 4 2 4 24.6 24.6 24.6 23.772 211 211 0 12.409 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.209 1.0976 15.441 8 2 Leave out requantified 1.4491 1.0223 1.2712 1.4224 0.95048 1.2242 42.141 18.13 62.511 3 2 3 1 0 1 Median Median Median 20.4 10 18 167070000 69120000 97948000 68673000 26022000 42651000 33055000 14972000 18082000 65342000 28126000 37215000 317 3247;5230;5449;7929;10541 True;True;True;True;True 3339;5361;5582;8110;10771 11236;11237;11238;17906;18561;27452;27453;36735;36736;36737 14232;14233;22707;23491;34558;34559;46124;46125;46126;46127;46128;46129 14233;22707;23491;34559;46124 O95819;Q8N4C8;Q9UKE5 O95819;Q8N4C8;Q9UKE5 2;1;1 2;1;1 2;1;1 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase MAP4K4;MINK1;TNIK sp|O95819|M4K4_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP4K4 PE=1 SV=2;sp|Q8N4C8|MINK1_HUMAN Misshapen-like kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MINK1 PE=1 SV=2;sp|Q9UKE5|TNIK_HUMAN TRAF2 and NCK-interacting 3 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 1.7 1.7 1.7 142.1 1239 1239;1332;1360 0.0035794 2.0189 By MS/MS By MS/MS 1.2894 1.2421 151.72 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.7 0.9 0 10714000 2815600 7898400 7091100 649680 6441400 3622900 2165900 1457000 0 0 0 318 8150;13603 True;True 8334;13925 28209;28210;47056 35497;35498;58850 35498;58850 O95861 O95861 8 8 8 3(2),5-bisphosphate nucleotidase 1 BPNT1 sp|O95861|BPNT1_HUMAN 3(2),5-bisphosphate nucleotidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BPNT1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 7 6 7 7 6 7 7 6 31.8 31.8 31.8 33.392 308 308 0 58.54 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98408 0.96038 16.677 24 3 Leave out requantified 1.0235 0.92272 1.0986 0.90457 0.85711 1.0305 17.097 15.285 14.066 8 9 7 1 2 0 Leave out 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6.1299 By MS/MS By MS/MS 0.92212 0.90385 34.403 3 2 Median NaN NaN 0.73891 NaN NaN 0.71895 NaN NaN 32.368 1 0 2 0 0 2 Median Median Median 2 0 5.5 60006000 32656000 27349000 15431000 6735800 8695400 0 0 0 44574000 25920000 18654000 322 2689;16142 True;True 2766;16520 9308;55618;55619 11842;69799;69800 11842;69800 O96019;O94805 O96019 3;1 3;1 3;1 Actin-like protein 6A ACTL6A sp|O96019|ACL6A_HUMAN Actin-like protein 6A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTL6A PE=1 SV=1 2 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 7.9 7.9 7.9 47.46 429 429;426 0 5.2772 By MS/MS By MS/MS By matching 1.2807 1.2136 27.035 5 0 Leave out requantified 1.6155 1.1378 NaN 1.4776 1.0808 NaN 31.999 10.636 NaN 2 2 1 0 0 0 Median Median Median 7.9 5.6 3.3 45083000 19207000 25876000 18376000 7852100 10524000 18668000 7436700 11231000 8039300 3917900 4121400 323 612;4328;10392 True;True;True 634;4446;10620 2090;2091;15000;36206;36207;36208 2672;19058;45485;45486;45487 2672;19058;45485 P00338 P00338 8 8 8 L-lactate dehydrogenase A chain LDHA 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28580;28581;28582;28690;28691;37127;37128;37129;37130;41664;41665;41666;41667;50956;50957;57635;57636;59454;59455;59456;59457;64464;64465 35922;35923;35924;36064;36065;46614;46615;46616;46617;46618;46619;52184;52185;52186;52187;63769;63770;72370;72371;74756;74757;74758;74759;81024;81025 35923;36064;46618;52186;63770;72371;74757;81024;81025 38 38 P00390 P00390 2 2 2 Glutathione reductase, mitochondrial GSR sp|P00390|GSHR_HUMAN Glutathione reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSR PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.8 4.8 4.8 56.256 522 522 0 2.9486 By matching By MS/MS By matching 1.0113 0.94515 1.6949 7 0 Leave out requantified 1.2644 0.97513 1.0507 1.1171 0.9442 1.0134 20.102 5.3913 11.55 2 3 2 0 0 0 Median Plateau Median 4.8 4.8 4.8 278300000 135520000 142780000 102880000 46100000 56781000 106370000 54957000 51417000 69045000 34462000 34583000 326 989;10074 True;True 1021;10297 3411;3412;3413;35151;35152;35153;35154 4413;4414;44233 4414;44233 P00441 P00441 2 2 2 Superoxide dismutase [Cu-Zn] SOD1 sp|P00441|SODC_HUMAN Superoxide dismutase [Cu-Zn] OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOD1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 29.9 29.9 29.9 15.936 154 154 0 19.095 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4688 1.348 74.369 3 3 Median 1.6937 NaN NaN 1.607 NaN NaN 24.86 NaN NaN 2 0 1 2 0 1 Median Median Median 23.4 29.9 23.4 68010000 27733000 40277000 30432000 6810900 23621000 26061000 11451000 14610000 11516000 9470700 2045700 327 7435;9463 True;True 7608;9679 25698;25699;25700;25701;33121 32387;32388;32389;32390;32391;41689 32389;41689 P00492 P00492 4 4 4 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase HPRT1 sp|P00492|HPRT_HUMAN Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPRT1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 22.5 22.5 22.5 24.579 218 218 0 11.639 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75141 0.69684 15.583 8 6 Median 0.86477 0.66153 0.73813 0.77224 0.62054 0.72216 11.477 9.1724 11.355 3 3 2 2 2 2 Median Median Median 16.5 16.5 16.5 137300000 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out requantified Leave out requantified 39.2 46.4 46.4 2698200000 1257500000 1440800000 1113700000 524120000 589620000 509230000 226460000 282770000 1075300000 506900000 568360000 330 4763;4764;5967;5968;6627;7945;9391;13949;16992;16993;17833;18732 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4889;4890;6111;6112;6783;6784;8126;9604;14275;17384;17385;18238;19150 16408;16409;16410;16411;16412;16413;16414;16415;16416;20275;20276;20277;20278;20279;20280;20281;20282;20283;22456;22457;22458;22459;27504;27505;27506;32820;32821;32822;32823;32824;48192;48193;48194;48195;58392;58393;58394;58395;58396;61332;64229;64230;64231;64232;64233;64234 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MS/MS By MS/MS 1.0189 0.96429 6.1091 12 2 Leave out requantified 1.1274 0.82896 0.92087 1.0335 0.80947 0.88632 2.1891 22.891 11.995 4 4 4 0 2 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 12.8 12.3 12.8 316940000 159800000 157140000 121800000 56971000 64825000 91524000 51213000 40311000 103620000 51616000 52005000 339 4915;6402;7349;17708;18455 True;True;True;True;True 5041;6553;7521;18109;18866 16915;16916;16917;16918;21773;21774;21775;25376;60919;60920;60921;60922;63273;63274 21487;21488;21489;21490;21491;27540;27541;27542;27543;27544;32012;76648;76649;76650;79532 21487;27543;32012;76650;79532 P04183 P04183 4 4 4 Thymidine kinase, cytosolic TK1 sp|P04183|KITH_HUMAN Thymidine kinase, cytosolic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TK1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 23.1 23.1 23.1 25.468 234 234 0 15.013 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0417 1.0036 27.963 15 4 Leave out requantified 1.105 0.95461 1.0157 0.99688 0.91046 0.99153 14.109 31.448 7.9847 4 6 5 2 1 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 17.5 23.1 17.1 432690000 210140000 222550000 162160000 77406000 84758000 151970000 74999000 76967000 118560000 57732000 60828000 340 1421;4300;6620;16680 True;True;True;True 1466;4418;6776;17071 4850;4851;4852;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;14931;22438;22439;57359;57360;57361;57362 6266;6267;6268;6269;6270;6271;18967;18968;18969;18970;18971;18972;18973;18974;18975;18976;18977;28391;28392;71989;71990;71991;71992;71993;71994 6267;18975;28391;71991 P04264;CON__P04264 P04264;CON__P04264 31;30 31;30 18;17 Keratin, type II cytoskeletal 1 KRT1 sp|P04264|K2C1_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT1 PE=1 SV=6; 2 31 31 18 9 29 28 9 29 28 3 18 16 54.7 54.7 39.9 66.038 644 644;644 0 285.71 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98103 0.9219 34.134 96 32 Leave out requantified 0.62593 0.92758 1.0907 0.55236 0.86996 1.0712 39.244 47.353 24.142 9 41 46 2 15 15 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.3 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Hete 5 12 12 12 10 8 10 10 8 10 10 8 10 32.7 32.7 32.7 33.67 306 306;293;293;293;293 0 53.219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97733 0.88872 20.514 38 11 Leave out requantified 1.148 0.87291 0.97311 1.0411 0.84835 0.92617 24.221 16.511 12.915 15 11 12 5 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.4 23.2 29.4 2275500000 1113900000 1161600000 1147200000 557200000 590010000 479860000 245740000 234110000 648430000 310920000 337510000 382 9300;10381;10382;11820;12122;12994;13323;13324;14302;17057;17193;17918 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 9512;10608;10609;12077;12404;13301;13637;13638;14636;17450;17587;18323 32462;36155;36156;36157;36158;36159;36160;36161;36162;36163;36164;36165;36166;36167;36168;36169;40840;40841;40842;40843;40844;40845;40846;41894;45003;45004;45005;46125;46126;46127;46128;46129;46130;46131;46132;46133;46134;49414;58598;58599;58600;59085;59086;59087;61602;61603 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4283;4284;4285;15854;15855;15856;15857;27033;27034;33689;33690;33691;33692;58842;58843 5558;5559;5560;5561;20157;20158;20159;20160;34023;34024;42412;42413;73954;73955 5560;20160;34023;42412;73954 P08397 P08397 5 5 5 Porphobilinogen deaminase HMBS sp|P08397|HEM3_HUMAN Porphobilinogen deaminase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMBS PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 19.1 19.1 19.1 39.33 361 361 0 9.7135 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97305 0.90412 1.9752 15 8 Leave out requantified 1.0022 0.93777 1.3496 0.90343 0.9051 1.3568 119.18 4.7562 46.993 7 4 4 5 1 2 Median Leave out requantified Median 19.1 14.4 14.4 338740000 141330000 197410000 179230000 69410000 109820000 72768000 33294000 39474000 86743000 38623000 48120000 393 771;4336;7212;8402;8902 True;True;True;True;True 800;4454;7378;8594;9108 2692;2693;2694;2695;2696;15016;15017;15018;24699;29078;29079;29080;30906;30907;30908;30909;30910 3455;3456;3457;3458;3459;3460;19077;19078;19079;31156;36552;36553;38930;38931;38932;38933;38934 3459;19078;31156;36553;38930 P08559;P29803 P08559 7;2 7;2 7;2 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial PDHA1 sp|P08559|ODPA_HUMAN Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDHA1 PE=1 SV=3 2 7 7 7 5 5 3 5 5 3 5 5 3 21 21 21 43.295 390 390;388 0 27.22 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1461 1.0212 10.742 15 7 Leave out requantified 1.1685 1.0835 1.016 1.0104 1.0004 0.95775 2.6202 25.098 4.3731 5 6 4 2 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 15.4 10.5 8.2 569300000 276860000 292450000 190660000 85843000 104810000 227270000 117570000 109700000 151370000 73442000 77932000 394 20;3516;5982;9798;14747;16443;17005 True;True;True;True;True;True;True 21;3616;6126;10019;15092;16831;17398 64;12195;12196;20324;34259;34260;34261;34262;50852;50853;50854;56577;56578;56579;58426 101;15519;15520;25714;25715;43143;43144;43145;43146;63652;70972;70973;70974;70975;70976;70977;73416 101;15520;25714;43145;63652;70974;73416 P08621 P08621 5 5 5 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa SNRNP70 sp|P08621|RU17_HUMAN U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRNP70 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 11 11 11 51.556 437 437 0 20.103 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0092 0.97885 18.972 13 4 Leave out requantified 1.0312 1.168 1.0092 0.90709 1.132 0.97885 14.383 34 21.492 4 4 5 1 2 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 11 8.5 11 534990000 290440000 244550000 198810000 105410000 93402000 151040000 82299000 68738000 185140000 102730000 82414000 395 6072;6960;13583;14082;17901 True;True;True;True;True 6219;7124;13904;14412;18306 20645;20646;20647;23665;23666;46983;46984;46985;48708;48709;48710;61550;61551;61552 26138;26139;26140;26141;29949;29950;58769;58770;58771;60944;60945;77450;77451;77452;77453;77454 26141;29950;58771;60944;77450 P08651 P08651 1 1 1 Nuclear factor 1 C-type NFIC sp|P08651|NFIC_HUMAN Nuclear factor 1 C-type OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFIC PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2 2 2 55.674 508 508 0.0022401 2.0259 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0 2 0 15090000 8460100 6629600 0 0 0 15090000 8460100 6629600 0 0 0 396 3437 True 3537 11911 15137 15137 P08670 P08670 11 8 8 Vimentin VIM sp|P08670|VIME_HUMAN Vimentin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VIM PE=1 SV=4 1 11 8 8 7 8 8 5 5 6 5 5 6 22.5 19.1 19.1 53.651 466 466 0 16.114 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2725 1.145 14.473 16 7 Leave out requantified 1.1214 1.3946 1.0181 0.98965 1.3222 0.96523 15.001 24.585 26.552 5 5 6 1 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 16.3 11.8 18 403260000 185410000 217850000 171310000 80885000 90425000 93672000 37541000 56132000 138280000 66988000 71294000 397 4618;4889;5246;8158;9141;10520;13049;13651;13772;13819;14085 True;True;False;True;False;False;True;True;True;True;True 4743;5015;5377;8343;9350;10750;13356;13974;14096;14143;14415 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recognition particle 19 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRP19 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.1 11.1 11.1 16.156 144 144 0 4.8548 By matching By MS/MS By MS/MS 0.93015 0.89581 9.7342 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 11.1 11.1 11.1 75551000 37265000 38286000 26800000 12680000 14119000 24385000 11860000 12525000 24367000 12725000 11642000 403 15883 True 16257 54628;54629;54630 68544;68545 68544 P09211 P09211 7 7 7 Glutathione S-transferase P GSTP1 sp|P09211|GSTP1_HUMAN Glutathione S-transferase P OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSTP1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 5 6 5 5 6 5 5 6 41.9 41.9 41.9 23.356 210 210 0 226.99 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1099 1.0135 17.302 25 11 Leave out requantified 1.2684 1.0301 0.89981 1.1268 0.98002 0.8601 18.988 18.733 7.7613 9 7 9 3 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.3 29.5 34.3 2091200000 1072800000 1018300000 1200800000 607550000 593230000 427960000 220640000 207330000 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CBS PE=1 SV=2 2 17 17 17 16 14 15 16 14 15 16 14 15 39.4 39.4 39.4 60.586 551 551;551 0 57.197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88538 0.83716 20.875 54 7 Leave out requantified 0.9648 0.83677 0.90575 0.8497 0.80428 0.87935 21.652 23.559 16.456 19 16 19 1 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.3 27 35.8 1806300000 927370000 878970000 691820000 339090000 352730000 452420000 239860000 212570000 662100000 348420000 313680000 420 132;927;1832;1902;2087;3323;4362;4974;6018;8179;10403;11891;12028;12173;12909;16746;17972 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 136;959;1892;1965;2152;3418;4480;5102;6163;8365;10631;12155;12302;12455;13215;17138;18377 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acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DLAT PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 3 1 1 3 1 1 3 1 3.9 3.9 3.9 68.996 647 647 0 3.1225 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4398 1.3622 22.037 4 0 Leave out requantified NaN 1.247 NaN NaN 1.2014 NaN NaN 39.793 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 1.2 3.9 1.2 52813000 24068000 28745000 14646000 6877500 7768800 25785000 11944000 13841000 12382000 5246700 7135400 424 2437;6177;17230 True;True;True 2513;6325;17625 8432;21001;21002;21003;59192 10813;26579;26580;26581;74413 10813;26580;74413 P10599 P10599 5 5 5 Thioredoxin TXN sp|P10599|THIO_HUMAN Thioredoxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXN PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 27.6 27.6 27.6 11.737 105 105 0 9.6018 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0997 1.023 33.911 14 2 Leave out requantified 1.2577 1.0121 0.65813 1.0998 0.97273 0.63272 18.411 35.744 51.63 4 5 5 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.6 27.6 27.6 706810000 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I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed PRKAR1A sp|P10644|KAP0_HUMAN cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKAR1A PE=1 SV=1 2 13 13 13 13 12 13 13 12 13 13 12 13 31.5 31.5 31.5 42.981 381 381;381 0 93.205 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0748 1.0411 19.42 37 7 Leave out requantified 0.98919 1.1444 1.0528 0.89682 1.0977 1.0229 9.4872 20.331 20.37 11 12 14 2 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.5 31.2 31.5 2392200000 1185700000 1206500000 873620000 451290000 422330000 697500000 351980000 345520000 821090000 382400000 438690000 427 3418;7291;11406;12114;12835;13277;14094;14375;15738;16275;17627;17628;18068 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3516;7460;11649;12394;13139;13590;14425;14711;16105;16662;18028;18029;18474 11843;11844;11845;25053;25054;25055;25056;25057;39475;39476;39477;39478;39479;39480;41861;41862;41863;44445;44446;44447;44448;45941;45942;45943;48738;48739;49642;49643;49644;54140;54141;54142;56055;56056;56057;60657;60658;60659;60660;60661;60662;62081;62082;62083 15056;15057;15058;31528;31529;31530;31531;31532;49481;49482;49483;49484;49485;49486;49487;49488;49489;49490;49491;52413;52414;52415;52416;55566;55567;55568;57423;57424;57425;57426;57427;57428;60973;60974;62091;62092;62093;62094;67889;67890;67891;67892;70351;70352;76307;76308;76309;76310;76311;78097;78098;78099;78100;78101;78102 15057;31529;49490;52414;55567;57427;60974;62092;67890;70352;76307;76310;78098 P10809 P10809 49 49 49 60 kDa heat shock protein, mitochondrial HSPD1 sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2 1 49 49 49 48 47 45 48 47 45 48 47 45 72.4 72.4 72.4 61.054 573 573 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0524 0.99417 17.697 304 114 Leave out 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666;667;668;669;670;671;672;673;674;8080;27545;27546;27547;27548;27549;27550;29295;29296;29297;29298;29299;29300;43487;43488;43489;43490;43491;43492;43493;43494;43495;43496;47053;47054;47055;47056;47057;47058;47059;47060;56773;61771;61772;61773;61774;69373;69374;69375;69376;69377;69378;69379;76947;76948;76949;76950;76951;76952;76953;78985;78986;78987;78988;78989;79139;79140 668;8080;27549;29296;43490;47053;56773;61772;69377;76953;78988;78989;79139 P13861;P31323 P13861 11;1 11;1 11;1 cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit PRKAR2A sp|P13861|KAP2_HUMAN cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKAR2A PE=1 SV=2 2 11 11 11 9 10 10 9 10 10 9 10 10 37.9 37.9 37.9 45.518 404 404;418 0 90.233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1413 0.98825 33.484 28 5 Leave out requantified 1.301 0.9218 1.0988 1.1242 0.86077 1.0841 32.41 21.554 42.177 9 9 10 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.9 32.9 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True;True;True;True;True;True;True;True;True 3489;4387;4626;5288;12530;13155;13335;18076;19451 11744;11745;14825;14826;15571;15572;17695;17696;17697;42347;42348;42349;42350;44514;44515;45101;45102;60821;65210;65211;65212 14934;14935;18839;18840;19801;19802;22467;53027;53028;53029;55643;55644;55645;56359;76516;81953;81954;81955;81956 14935;18840;19801;22467;53029;55644;56359;76516;81956 P14866 P14866 15 15 15 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L HNRNPL sp|P14866|HNRPL_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPL PE=1 SV=2 1 15 15 15 13 13 14 13 13 14 13 13 14 41.8 41.8 41.8 64.132 589 589 0 112.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1544 1.1124 28.664 50 11 Leave out requantified 1.3019 1.0942 1.0387 1.1638 1.0388 0.99695 27.403 37.364 19.918 17 15 18 3 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.4 37.2 39.6 2653200000 1293900000 1359300000 1106100000 532710000 573370000 586710000 275720000 310980000 960380000 485460000 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Nucleolin NCL sp|P19338|NUCL_HUMAN Nucleolin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCL PE=1 SV=3 1 18 18 18 16 15 16 16 15 16 16 15 16 25.4 25.4 25.4 76.613 710 710 0 88.553 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0624 0.98539 17.989 56 13 Leave out requantified 1.1254 1.2561 1.0627 1.0114 1.2098 1.0051 17.867 40.408 28.631 19 18 19 4 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.4 20.1 21.1 4264200000 1918500000 2345700000 1554100000 702080000 852030000 1262800000 544940000 717820000 1447300000 671490000 775800000 513 906;1087;1088;3349;4691;5121;5993;6174;6442;6443;8892;9854;12222;15747;15891;16265;16931;18337 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 936;1121;1122;3444;4817;5250;6138;6322;6593;6594;9098;10075;12506;16115;16265;16652;17323;18747 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37204;75439 P19388 P19388 3 3 3 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 POLR2E sp|P19388|RPAB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2E PE=1 SV=4 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 15.7 15.7 15.7 24.551 210 210 0 8.514 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9481 0.87896 14.538 12 1 Leave out requantified 1.0819 0.8928 0.93762 0.95501 0.84157 0.89472 23.212 14.299 15.15 4 4 4 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 11.4 11.4 15.7 360100000 175460000 184640000 156920000 73100000 83822000 91339000 45039000 46300000 111830000 57321000 54513000 516 962;7995;8346 True;True;True 994;8178;8538 3328;3329;3330;3331;3332;3333;27664;27665;27666;27667;27668;27669;28873 4310;4311;4312;4313;4314;34813;34814;34815;34816;34817;36292 4313;34814;36292 P19525 P19525 7 7 7 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase EIF2AK2 sp|P19525|E2AK2_HUMAN Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase 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subunit 2, mitochondrial UQCRC2 sp|P22695|QCR2_HUMAN Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UQCRC2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 6.6 6.6 6.6 48.442 453 453 0 17.602 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90655 0.89066 32.405 6 3 Median 1.187 0.68948 0.97455 1.1547 0.66979 0.94698 25.07 28.664 27.594 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 6.6 6.6 6.6 66861000 32981000 33880000 26534000 11316000 15218000 18396000 10337000 8058900 21932000 11328000 10603000 546 11679;15964 True;True 11923;16339 40324;40325;40326;54970;54971;54972 50536;50537;68981;68982;68983;68984 50536;68981 P23193 P23193 7 7 7 Transcription elongation factor A protein 1 TCEA1 sp|P23193|TCEA1_HUMAN Transcription elongation factor A protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCEA1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 26.6 26.6 26.6 33.969 301 301 0 17.302 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93226 0.89882 16.576 24 4 Leave out requantified 1.0878 0.8304 0.92152 0.97976 0.80572 0.90017 7.7619 22.723 19.172 8 7 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Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B PPIB sp|P23284|PPIB_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIB PE=1 SV=2 1 12 12 12 12 11 12 12 11 12 12 11 12 45.4 45.4 45.4 23.742 216 216 0 55.37 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99367 0.93907 16.347 57 14 Leave out requantified 1.096 0.80286 1.0537 0.9655 0.78689 0.98241 18.755 14.271 14.718 18 19 20 2 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.4 45.4 45.4 5532100000 2725400000 2806700000 2153000000 1006600000 1146400000 1621500000 871190000 750270000 1757600000 847650000 910000000 550 2303;2578;3113;5409;7463;7811;14709;15656;16636;17383;17406;17407 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2375;2376;2655;3201;5542;7637;7988;15053;16021;17027;17779;17803;17804 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DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 POLR2A sp|P24928|RPB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2A PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 3.2 3.2 3.2 217.17 1970 1970 0 10.793 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1482 1.1265 36.744 7 4 Median 1.1353 1.5864 0.72871 1.0992 1.5368 0.72085 3.4705 27.761 35.407 2 2 3 2 0 2 Median Median Median 1.4 3.2 2.3 94723000 44427000 50296000 26264000 12176000 14088000 32144000 11405000 20740000 36315000 20846000 15469000 562 8289;16679;19005 True;True;True 8480;17070;19429 28685;28686;57358;65144;65145;65146;65147;65148 36059;71988;81871;81872;81873;81874;81875 36059;71988;81874 P24941;Q00526 P24941 11;3 9;1 9;1 Cyclin-dependent kinase 2 CDK2 sp|P24941|CDK2_HUMAN Cyclin-dependent kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK2 PE=1 SV=2 2 11 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 47.3 40.9 40.9 33.929 298 298;305 0 34.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1664 1.0874 22.02 26 6 Leave out requantified 1.2215 0.92655 1.1559 1.0813 0.89085 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geranylgeranyltransferase component A 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHML PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 10.2 10.2 10.2 74.071 656 656 0 11.688 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9257 0.90822 12.547 8 3 Leave out requantified 0.94994 1.4182 0.81015 0.79212 1.3861 0.79698 18.725 14.89 2.7336 3 2 3 2 0 1 Plateau Median Median 8.5 5.6 7.3 75726000 41615000 34111000 39633000 22445000 17187000 11376000 4815100 6560900 24718000 14355000 10363000 576 1659;10003;14299;15673 True;True;True;True 1712;10224;14633;16038 5680;34899;49407;49408;49409;53924;53925;53926 7373;43918;61794;61795;67601;67602;67603 7373;43918;61795;67603 P26447 P26447 1 1 1 Protein S100-A4 S100A4 sp|P26447|S10A4_HUMAN Protein S100-A4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.9 7.9 7.9 11.728 101 101 0.00047438 2.5892 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0705 0.99999 27.055 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 7.9 7.9 7.9 203360000 109400000 93958000 64172000 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25361;27419;56946;61603;66812 P29144 P29144 4 4 4 Tripeptidyl-peptidase 2 TPP2 sp|P29144|TPP2_HUMAN Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPP2 PE=1 SV=4 1 4 4 4 1 2 2 1 2 2 1 2 2 3.4 3.4 3.4 138.35 1249 1249 0 4.7116 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64029 0.61912 28.36 4 2 Median NaN NaN 0.68749 NaN NaN 0.6665 NaN NaN 11.383 1 1 2 1 1 0 Median Median Median 0.7 1.4 2.2 31301000 17441000 13860000 5526900 3729400 1797500 8128200 4886300 3241900 17646000 8824900 8821100 602 3131;7061;9255;10190 True;True;True;True 3219;7226;9466;10415 10856;24048;32281;35557;35558 13774;30404;40640;44716;44717 13774;30404;40640;44717 P29218 P29218 4 4 4 Inositol monophosphatase 1 IMPA1 sp|P29218|IMPA1_HUMAN Inositol monophosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 19.5 19.5 19.5 30.188 277 277 0 14.795 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76956 0.68218 14.022 12 5 Leave out requantified 0.75934 0.63696 0.75795 0.65318 0.60181 0.72933 9.014 25.858 23.752 3 4 5 0 2 3 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isozyme 2 ADSS sp|P30520|PURA2_HUMAN Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADSS PE=1 SV=3 1 6 6 6 5 4 1 5 4 1 5 4 1 18 18 18 50.097 456 456 0 26.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1066 1.0089 43.496 10 7 Median 1.2255 1.1315 NaN 1.0648 1.0644 NaN 46.887 49.068 NaN 6 3 1 5 2 0 Median Median Median 16 10.5 3.1 214940000 85951000 128990000 139880000 55798000 84081000 63194000 24405000 38789000 11864000 5748200 6115400 623 5146;6198;11703;16206;17269;18226 True;True;True;True;True;True 5276;6348;11949;16591;17665;18634 17651;17652;21091;40407;40408;55846;59342;62574;62575;62576;62577 22418;22419;26689;50627;70081;74607;78711;78712;78713;78714;78715 22418;26689;50627;70081;74607;78712 P30533 P30533 8 8 8 Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein LRPAP1 sp|P30533|AMRP_HUMAN Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRPAP1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 4 7 6 4 7 6 4 7 24.4 24.4 24.4 41.465 357 357 0 18.098 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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P30837;P00352;P05091;O94788 P30837 10;1;1;1 10;1;1;1 9;0;0;0 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial ALDH1B1 sp|P30837|AL1B1_HUMAN Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1B1 PE=1 SV=3 4 10 10 9 7 9 4 7 9 4 6 8 3 24 24 22.4 57.206 517 517;501;517;518 0 33.235 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1412 1.0426 26.386 19 9 Leave out requantified 1.1483 0.98233 1.2642 1.0299 0.95585 1.2262 10.073 30.591 22.74 7 9 3 4 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Plateau 16.8 24 11.6 469140000 218610000 250530000 193660000 80579000 113080000 205590000 100790000 104810000 69892000 37248000 32644000 628 3510;7526;8996;9325;9379;9561;15844;15858;16857;18155 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3610;7701;9203;9538;9592;9777;16215;16231;17249;18561 12175;26039;26040;31299;31300;32571;32572;32775;32776;33436;33437;33438;54495;54548;57948;57949;57950;62340;62341;62342;62343 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P31943 7 7 2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed HNRNPH1 sp|P31943|HNRH1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH1 PE=1 SV=4 1 7 7 2 7 6 7 7 6 7 2 2 2 21.8 21.8 6.7 49.229 449 449 0 150.36 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.112 1.0273 10.648 32 8 Leave out requantified 0.9422 1.5943 1.119 0.83444 1.4812 1.0519 7.6377 35.064 8.9955 11 10 11 5 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.8 20 21.8 2476300000 1192900000 1283500000 970260000 516390000 453870000 599770000 232710000 367060000 906320000 443760000 462560000 638 1514;3699;6420;7406;15029;15334;17326 True;True;True;True;True;True;True 1562;3801;6571;7578;15384;15693;17722 5186;5187;5188;5189;5190;5191;12789;12790;12791;21822;21823;25591;25592;25593;25594;25595;25596;51848;51849;51850;52781;52782;52783;52784;52785;52786;52787;59557;59558;59559;59560;59561;59562 6710;6711;6712;6713;6714;6715;16259;16260;16261;16262;16263;16264;27603;27604;32272;32273;32274;32275;32276;32277;64902;64903;64904;66119;66120;66121;66122;66123;66124;66125;66126;66127;66128;66129;66130;74881;74882;74883;74884;74885;74886;74887;74888 6711;16264;27603;32273;64902;66126;74882 P31946 P31946 10 7 6 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed YWHAB sp|P31946|1433B_HUMAN 14-3-3 protein beta/alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAB PE=1 SV=3 1 10 7 6 10 10 10 7 7 7 6 6 6 48.4 37.4 30.9 28.082 246 246 0 272.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1475 1.0663 19.344 38 17 Leave out requantified 0.97775 2.2988 1.1022 0.88323 2.1415 1.0392 21.259 63.265 20.871 13 11 14 3 8 6 Leave out requantified Median Leave out requantified 48.4 48.4 48.4 6997500000 3200600000 3796900000 2973600000 1514300000 1459300000 1428300000 442910000 985420000 2595600000 1243400000 1352200000 639 1719;3002;4281;9501;12507;13754;13755;15590;18848;18880 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Stress-induced-phosphoprotein 1 STIP1 sp|P31948|STIP1_HUMAN Stress-induced-phosphoprotein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STIP1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 11 8 6 11 8 6 11 8 6 24.9 24.9 24.9 62.639 543 543 0 72.635 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1085 1.0491 19.878 27 8 Leave out requantified 0.92773 1.1896 1.1329 0.83219 1.1551 1.0882 17.686 11.062 24.126 12 9 6 5 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.6 14.7 11.2 793990000 389580000 404410000 442170000 239630000 202540000 189390000 78356000 111040000 162420000 71595000 90829000 641 862;1064;2278;3670;4074;4607;5908;7858;9630;10790;16635;16779 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 891;1098;2349;3771;4184;4732;6051;8036;9848;11022;17026;17171 3003;3004;3005;3657;7869;12691;12692;12693;14180;14181;15914;20094;20095;27185;27186;33708;37541;37542;37543;57202;57203;57204;57687;57688;57689;57690;57691;57692 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Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP8 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 2 3 3 2 3 3 2 4.4 4.4 4.4 127.52 1118 1118 0 9.0555 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54442 0.53025 24.585 7 2 Leave out requantified 0.57427 0.65447 0.47795 0.52171 0.63613 0.46612 77.344 13.871 42.816 3 2 2 2 0 0 Median Median Median 3.5 2.9 2 64949000 40822000 24127000 28944000 17657000 11287000 20031000 12490000 7541800 15974000 10676000 5298300 713 4315;5234;9067;12515 True;True;True;True 4433;5365;9275;12804 14971;14972;14973;17913;31590;31591;31592;43332 19018;19019;19020;19021;22716;39784;39785;39786;54179 19020;22716;39785;54179 P40925 P40925 3 3 3 Malate dehydrogenase, cytoplasmic MDH1 sp|P40925|MDHC_HUMAN Malate dehydrogenase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH1 PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 2 2 11.7 11.7 11.7 36.426 334 334 0 7.5657 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89372 0.83745 30.82 4 1 Median NaN 0.90424 0.7859 NaN 0.84341 0.74132 NaN 27.596 43.837 0 2 2 0 0 1 Median Median 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subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3B PE=2 SV=2 2 20 20 20 17 19 19 17 19 19 17 19 19 49.4 49.4 49.4 51.109 472 472;472 0 193.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1126 1.0315 6.1726 83 14 Leave out requantified 1.1722 1.0983 1.0301 1.0335 1.0425 0.9919 11.912 9.9551 12.017 27 29 27 6 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.2 47.9 46.8 8642500000 4043100000 4599400000 2965400000 1338200000 1627200000 2803700000 1321600000 1482100000 2873400000 1383300000 1490000000 719 741;2324;5216;6930;7169;7652;8652;8663;9685;10783;11370;12262;12989;13042;13965;14231;14412;14413;17290;18921 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 768;2397;5347;7094;7335;7829;8854;8865;9904;11015;11612;12547;13296;13349;14292;14563;14749;14750;17686;19342 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initiation factor 2D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2D PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 4 4 3 4 4 3 4 11.5 11.5 11.5 64.706 584 584 0 17.593 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99609 0.91496 13.504 11 6 Leave out requantified 1.2793 1.1221 0.91388 1.162 1.0066 0.90184 30.023 52.178 13.586 4 3 4 2 2 2 Median Median Median 9.1 6.2 8.6 172960000 86769000 86190000 63931000 32356000 31575000 43033000 22196000 20838000 65995000 32218000 33777000 720 1996;5308;9199;11093;14921 True;True;True;True;True 2060;5440;9410;11334;15268 6909;6910;18144;18145;32091;32092;32093;38500;51433;51434;51435 8926;8927;22984;22985;40401;40402;40403;40404;40405;48263;64358;64359;64360;64361;64362 8926;22984;40403;48263;64358 P41227;Q9BSU3 P41227 8;2 8;2 8;2 N-alpha-acetyltransferase 10 NAA10 sp|P41227|NAA10_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA10 PE=1 SV=1 2 8 8 8 7 7 8 7 7 8 7 7 8 45.5 45.5 45.5 26.458 235 235;229 0 68.119 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95486 0.8721 13.397 24 8 Leave out requantified 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11959;11960;11961;11962;11963;11964;11965;11966;11967;11968;11969;11970;11971;11972;11973;11974;11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;11982;11983;11984;11985;11986;11987;11988;11989;49155;49156;49157;49158;49159;49160;50037;50038;50039 11966;11977;11988;49156;50037 P42695 P42695 1 1 1 Condensin-2 complex subunit D3 NCAPD3 sp|P42695|CNDD3_HUMAN Condensin-2 complex subunit D3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCAPD3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.3 1.3 1.3 168.89 1498 1498 0 3.0785 By MS/MS By MS/MS 1.0486 0.97068 9.5851 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 1.3 1.3 34898000 17390000 17508000 0 0 0 16721000 8112700 8608800 18176000 9277100 8899400 735 1388 True 1433 4748;4749 6131;6132 6131 P42704 P42704 40 40 40 Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial LRPPRC sp|P42704|LPPRC_HUMAN Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRPPRC PE=1 SV=3 1 40 40 40 35 34 34 35 34 34 35 34 34 33.4 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428;532;1148;2130;2197;2206;2551;5668;5962;6020;6021;6044;6181;6653;8547;8889;9228;9596;9901;10434;10678;10870;11236;11699;11702;12346;12784;12905;13163;14174;14561;14643;15613;15817;15931;17074;17104;17105;17601;17765 1402;1721;1722;1723;3839;3840;3841;7136;7137;7138;7382;7383;7384;7415;8569;8570;8571;18837;18838;18839;19812;19813;19814;19997;19998;19999;20070;20071;20072;20531;20532;22062;28896;28897;28898;30070;30071;30072;31388;31389;31390;32789;32790;32791;33889;33890;33891;35620;35621;35622;36436;36437;36438;36439;37075;38207;38208;38209;39626;39627;39628;39629;39630;39639;39640;39641;41696;41697;41698;43255;43256;43257;43258;43647;43648;43649;43650;43651;44538;44539;44540;44541;44542;44543;47829;47830;47831;49193;49194;49195;49436;49437;49438;49439;49440;52563;53172;53173;53174;53175;53548;53549;53550;53551;53552;53553;57368;57369;57370;57462;57463;57464;57465;57466;57467;59115;59116;59117;59720;59721;59722 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28.673 By MS/MS By MS/MS 1.1741 1.0586 36.997 3 0 Median NaN NaN 1.3962 NaN NaN 1.3413 NaN NaN 48.622 0 1 2 0 0 0 Median Median Median 0 7.7 18.6 29019000 12735000 16284000 0 0 0 6514200 3135500 3378700 22505000 9599500 12905000 739 969;3630 True;True 1001;3731 3354;12562;12563 4337;4338;15962 4337;15962 P43034 P43034 2 2 2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha PAFAH1B1 sp|P43034|LIS1_HUMAN Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAFAH1B1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 6.3 6.3 6.3 46.637 410 410 0.00045683 2.2307 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 6.3 0 0 25178000 14111000 11067000 25178000 14111000 11067000 0 0 0 0 0 0 740 4817;10833 True;True 4943;11069 16596;37681 21091;47276 21091;47276 P43243 P43243 12 12 12 Matrin-3 MATR3 sp|P43243|MATR3_HUMAN Matrin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MATR3 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 22.1 22.1 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSFM PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 18.2 18.2 18.2 35.39 325 325 0 42.152 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1061 0.97596 15.673 14 2 Leave out requantified 1.2149 1.1269 0.92978 1.079 1.0138 0.91238 20.992 17.264 19.695 5 4 5 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.2 15.7 18.2 339350000 165500000 173850000 133350000 58944000 74404000 101890000 50547000 51347000 104110000 56007000 48100000 746 4985;6019;12929;16326;18691 True;True;True;True;True 5114;6164;13235;16714;19109 17156;17157;17158;20479;20480;20481;20482;44779;44780;56210;56211;56212;64077;64078;64079 21790;21791;21792;21793;25914;25915;25916;25917;25918;55972;55973;70533;70534;80522;80523;80524;80525;80526 21790;25914;55972;70534;80522 P45973 P45973 2 2 2 Chromobox protein homolog 5 CBX5 sp|P45973|CBX5_HUMAN Chromobox protein homolog 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CBX5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 12.6 12.6 12.6 22.225 191 191 0 4.3566 By MS/MS By MS/MS By matching 0.86759 0.81629 42.823 5 1 Leave out requantified 0.64652 1.8045 NaN 0.56858 1.741 NaN 8.32 62.823 NaN 2 2 1 0 1 0 Median Median Median 12.6 12.6 6.8 65259000 30560000 34700000 24434000 13724000 10709000 29420000 10891000 18529000 11406000 5944100 5461500 747 15012;18449 True;True 15366;18860 51788;51789;63257;63258;63259 64837;64838;79516;79517 64837;79516 P45974 P45974 28 28 26 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 USP5 sp|P45974|UBP5_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5 PE=1 SV=2 1 28 28 26 28 28 27 28 28 27 26 26 25 42.7 42.7 41.4 95.785 858 858 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1356 1.0534 7.3525 123 13 Leave out requantified 1.2011 1.1258 1.0842 1.0659 1.0671 1.0332 11.832 12.183 16.383 43 40 40 6 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.7 42.7 42.7 9460700000 4484400000 4976300000 3824700000 1800500000 2024200000 2508600000 1181900000 1326800000 3127400000 1502100000 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P48735 P48735 4 4 3 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial IDH2 sp|P48735|IDHP_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH2 PE=1 SV=2 1 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 2 2 10.2 10.2 8.2 50.909 452 452 0 5.869 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0002 0.94947 54.322 9 2 Leave out requantified 1.0293 0.98717 1.0153 0.94357 0.98623 0.96667 108.89 65.215 23.505 3 3 3 1 0 1 Median Leave out requantified Median 8.2 7.7 7.3 89515000 40796000 48719000 33402000 10236000 23166000 32817000 19536000 13280000 23296000 11024000 12273000 783 10276;11530;12368;16982 True;True;True;True 10502;11774;12653;17374 35819;35820;35821;39858;39859;39860;42749;42750;58363;58364 45030;45031;45032;49952;53492;53493;73337;73338 45031;49952;53492;73337 P48739 P48739 9 9 9 Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform PITPNB sp|P48739|PIPNB_HUMAN Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PITPNB PE=1 SV=2 1 9 9 9 9 9 8 9 9 8 9 9 8 38.4 38.4 38.4 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NT5C2 sp|P49902|5NTC_HUMAN Cytosolic purine 5-nucleotidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NT5C2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 4.8 4.8 4.8 64.969 561 561 0.005298 1.8962 By MS/MS By MS/MS 0.59954 0.57713 69.66 2 2 Median NaN NaN 0.59954 NaN NaN 0.57713 NaN NaN 69.66 0 0 2 0 0 2 Median Median Median 3 0 4.8 64283000 42956000 21327000 11965000 11965000 0 0 0 0 52318000 30991000 21327000 813 7208;17199 True;True 7374;17594 24689;24690;59104 31146;31147;74287 31146;74287 P49903 P49903 4 4 4 Selenide, water dikinase 1 SEPHS1 sp|P49903|SPS1_HUMAN Selenide, water dikinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPHS1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 0 2 3 0 2 3 0 2 13.5 13.5 13.5 42.91 392 392 0 34.651 By MS/MS By MS/MS 1.1717 1.0344 33.402 5 3 Median 1.1717 NaN 1.1652 1.0162 NaN 1.1212 46.489 NaN 11.396 3 0 2 2 0 1 Median Median Median 13.5 0 3.8 169380000 74310000 95072000 120650000 49686000 70965000 0 0 0 48730000 24624000 24106000 814 4493;4494;10542;12263 True;True;True;True 4615;4616;10772;12548 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17204;17205;23300;23301;23302;39775;39776;39777;42379;42380;42381;44947;44948;44949;44950;44951;44952;53734;53735;53736;53737;53738 21844;29481;29482;29483;49851;49852;49853;49854;49855;49856;53059;53060;53061;53062;56174;56175;56176;56177;56178;56179;56180;56181;56182;56183;67363;67364;67365;67366;67367;67368;67369;67370;67371 21844;29482;49856;53059;56181;67367 P51149 P51149 5 5 5 Ras-related protein Rab-7a RAB7A sp|P51149|RAB7A_HUMAN Ras-related protein Rab-7a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB7A PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 30 30 30 23.489 207 207 0 32.891 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0428 0.99771 15.873 16 2 Leave out requantified 1.0743 1.1877 1.0912 0.95485 1.0959 1.0485 15.768 27.474 14.35 5 5 6 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30 30 30 604650000 285270000 319380000 214220000 98955000 115270000 176940000 83552000 93384000 213490000 102760000 110730000 837 1528;3318;12603;16110;17400 True;True;True;True;True 1577;3413;12901;16487;17797 5240;5241;5242;11488;11489;11490;11491;43634;43635;43636;55513;55514;55515;59829;59830;59831 6786;6787;6788;6789;14599;14600;14601;14602;14603;14604;54528;54529;69657;69658;69659;69660;69661;75219 6788;14599;54529;69661;75219 P51151;Q9NP90 P51151 3;1 3;1 3;1 Ras-related protein Rab-9A RAB9A sp|P51151|RAB9A_HUMAN Ras-related protein Rab-9A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB9A PE=1 SV=1 2 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 19.9 19.9 19.9 22.837 201 201;201 0 3.9219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3239 1.1553 45.93 4 3 Median 1.3239 1.0498 NaN 1.1553 0.99776 NaN 13.656 76.989 NaN 2 2 0 1 2 0 Median Median Median 12.9 12.4 5.5 65511000 31094000 34417000 28040000 13447000 14592000 37472000 17647000 19825000 0 0 0 838 2176;14267;17415 True;True;True 2244;14601;17812 7541;49325;59907;59908;59909 9704;61707;75373;75374;75375 9704;61707;75373 P51153 P51153 2 1 1 Ras-related protein Rab-13 RAB13 sp|P51153|RAB13_HUMAN Ras-related protein Rab-13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB13 PE=1 SV=1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 11.3 5.9 5.9 22.774 203 203 0 4.1537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3349 1.3158 26.995 5 2 Median NaN 1.207 1.6178 NaN 1.1751 1.5784 NaN 14.914 25.735 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 11.3 11.3 11.3 158130000 64032000 94095000 56264000 20129000 36135000 50656000 23372000 27284000 51207000 20532000 30675000 839 10610;14649 False;True 10840;14991 36976;36977;36978;36979;36980;36981;50497;50498;50499;50500;50501 46432;46433;46434;46435;46436;46437;63210;63211;63212;63213;63214;63215;63216 46436;63211 P51398 P51398 1 1 1 28S ribosomal protein S29, mitochondrial DAP3 sp|P51398|RT29_HUMAN 28S ribosomal protein S29, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DAP3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.8 2.8 2.8 45.566 398 398 0.009721 1.5803 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.8 0 0 7421300 1768900 5652400 7421300 1768900 5652400 0 0 0 0 0 0 840 12174 True 12456 42078 52699 52699 P51452 P51452 2 2 2 Dual specificity protein phosphatase 3 DUSP3 sp|P51452|DUS3_HUMAN Dual specificity protein phosphatase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUSP3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 14.6 14.6 14.6 20.478 185 185 0 7.9604 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.21 1.1753 9.1378 6 0 Leave out requantified 1.0074 1.6471 1.21 0.87193 1.567 1.1753 1.3552 27.84 9.1378 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 14.6 14.6 14.6 157630000 70927000 86705000 66267000 32229000 34038000 33123000 13404000 19719000 58242000 25294000 32948000 841 8728;10092 True;True 8930;10315 30216;30217;30218;35235;35236;35237 38007;38008;38009;38010;38011;38012;44333;44334;44335 38008;44335 P51532;P51531 P51532 7;3 7;3 7;3 Transcription activator BRG1 SMARCA4 sp|P51532|SMCA4_HUMAN Transcription activator BRG1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCA4 PE=1 SV=2 2 7 7 7 5 4 4 5 4 4 5 4 4 5.4 5.4 5.4 184.64 1647 1647;1590 0 30.878 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96827 0.89454 14.617 10 6 Leave out requantified 0.99202 1.0086 0.84117 0.89791 0.95579 0.79922 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delta SSR4 sp|P51571|SSRD_HUMAN Translocon-associated protein subunit delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSR4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 11 11 11 18.998 173 173 0.0022482 2.0529 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 845 17968 True 18373 61783 77740 77740 252 64 P51580 P51580 2 2 2 Thiopurine S-methyltransferase TPMT sp|P51580|TPMT_HUMAN Thiopurine S-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPMT PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 8.2 8.2 8.2 28.18 245 245 0.0035651 1.9793 By MS/MS By matching By matching 0.74184 0.71547 23.572 4 1 Median 0.90386 NaN NaN 0.84281 NaN NaN 37.395 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 8.2 4.9 4.9 53755000 28314000 25441000 28077000 14429000 13648000 8851500 4145900 4705700 16826000 9739100 7087100 846 5777;17184 True;True 5918;17578 19652;19653;19654;59060 24878;74232 24878;74232 P51610 P51610 8 8 8 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 HCFC1 sp|P51610|HCFC1_HUMAN Host cell factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HCFC1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 8 8 5 8 8 5 8 8 5 4.9 4.9 4.9 208.73 2035 2035 0 29.034 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99969 0.96565 17.941 25 6 Leave out requantified 1.2431 0.83269 0.99969 1.0988 0.80628 0.96565 18.544 27.849 24.035 8 9 8 1 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.9 4.9 3.4 512010000 243100000 268910000 207180000 96552000 110620000 161530000 77593000 83938000 143300000 68956000 74346000 847 5784;6557;6566;7567;14844;15077;16922;17828 True;True;True;True;True;True;True;True 5926;6712;6721;7743;15190;15433;17314;18233 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2210;8297;11738;11740;14356;25965;28188;28196;33181;39098;55155;61618 P51965 P51965 1 1 1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 UBE2E1 sp|P51965|UB2E1_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2E1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9.3 9.3 9.3 21.404 193 193 0 8.7845 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2271 0.92129 12.483 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 9.3 9.3 9.3 69360000 36963000 32398000 22732000 10850000 11882000 20558000 12406000 8152000 26071000 13707000 12364000 854 3965 True 4073 13779;13780;13781;13782;13783;13784;13785 17548;17549;17550;17551;17552;17553;17554;17555 17551 P51991 P51991 5 5 5 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 HNRNPA3 sp|P51991|ROA3_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA3 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 2 4 3 2 4 3 2 19.8 19.8 19.8 39.594 378 378 0 13.962 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6647 1.5202 68.422 10 7 Leave out requantified 1.6647 1.2541 1.154 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DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 POLR2H sp|P52434|RPAB3_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2H PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 21.3 21.3 21.3 17.143 150 150 0.00045935 2.3025 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0348 0.96504 19.87 5 3 Median NaN 0.91673 1.137 NaN 0.85172 1.0661 NaN 17.666 13.637 1 2 2 1 1 1 Median Median Median 10.7 21.3 21.3 97342000 49329000 48013000 13628000 7168300 6459800 35360000 17664000 17697000 48354000 24497000 23857000 860 11043;18383 True;True 11283;18793 38360;38361;63069;63070;63071 48093;48094;79301;79302 48094;79301 P52564;P46734 P52564 5;2 5;2 5;2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 MAP2K6 sp|P52564|MP2K6_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K6 PE=1 SV=1 2 5 5 5 4 3 4 4 3 4 4 3 4 17.4 17.4 17.4 37.492 334 334;347 0 12.282 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89405 0.85919 29.783 11 7 Leave out requantified 1.1282 0.97298 0.98839 1.0192 0.90866 0.96174 24.688 19.928 20.141 4 3 4 3 2 2 Median Median Median 13.2 11.4 13.8 325360000 161230000 164140000 148170000 68169000 80004000 72588000 40030000 32558000 104600000 53028000 51575000 861 213;3124;3284;5821;8301 True;True;True;True;True 217;3212;3377;5963;8492 691;10836;10837;10838;11360;11361;19815;19816;28724;28725;28726 904;13751;13752;13753;14407;14408;14409;25088;25089;36105;36106;36107;36108;36109 904;13751;14409;25088;36107 P52565 P52565 4 4 4 Rho GDP-dissociation inhibitor 1 ARHGDIA sp|P52565|GDIR1_HUMAN Rho GDP-dissociation inhibitor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGDIA PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 22.5 22.5 22.5 23.207 204 204 0 64.251 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95174 0.92297 19.43 16 5 Leave out requantified 0.68916 1.1259 0.98271 0.60932 1.0829 0.9529 3.0166 21.56 9.6588 6 5 5 2 3 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 22.5 15.2 15.7 1316700000 687830000 628880000 435100000 270410000 164690000 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1847;2822;3574;6823;13291;14690;14867;15200;15277 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1909;2902;3674;6982;13604;15034;15213;15557;15636 6349;6350;6351;9814;9815;12384;12385;12386;12387;23130;23131;23132;45991;45992;45993;50630;51272;51273;51274;52393;52629;52630 8257;12494;12495;15755;15756;15757;29273;29274;29275;57490;57491;57492;57493;63379;64172;64173;64174;64175;64176;64177;65619;65911;65912 8257;12494;15755;29273;57490;63379;64177;65619;65911 P52597 P52597 6 4 4 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed HNRNPF sp|P52597|HNRPF_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPF PE=1 SV=3 1 6 4 4 6 6 6 4 4 4 4 4 4 20.2 13.7 13.7 45.671 415 415 0 50.828 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0152 0.92893 12.186 13 5 Leave out requantified 1.0713 1.3485 0.90682 0.95461 1.2994 0.88724 13.697 31.143 24.667 5 4 4 2 2 1 Median Median Leave out requantified 20.2 20.2 20.2 415660000 193360000 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requantified 12.1 9.3 8.5 1268700000 620900000 647760000 470850000 214930000 255910000 388310000 191000000 197300000 409510000 214970000 194550000 865 713;4662;6055;6501;7948;9553;9554;11187;12519;12990;15391;16258;17136 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 740;4787;6202;6656;8129;9769;9770;11428;12808;13297;15750;16644;17529 2478;2479;16102;16103;16104;20599;22069;22070;22071;27511;27512;27513;33411;33412;33413;33414;33415;33416;38792;43338;43339;43340;44988;44989;44990;52961;52962;52963;52964;52965;52966;56005;56006;56007;58865;58866;58867 3174;3175;20486;20487;20488;26088;27909;27910;27911;27912;27913;34632;34633;34634;42050;42051;42052;42053;48615;54185;54186;54187;56227;56228;56229;56230;66359;66360;66361;66362;66363;66364;66365;70283;70284;70285;70286;70287;73989;73990;73991 3174;20488;26088;27913;34632;42052;42053;48615;54187;56229;66360;70285;73989 P52732 P52732 7 7 7 Kinesin-like protein KIF11 KIF11 sp|P52732|KIF11_HUMAN Kinesin-like protein KIF11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF11 PE=1 SV=2 1 7 7 7 6 5 2 6 5 2 6 5 2 8.4 8.4 8.4 119.16 1056 1056 0 20.223 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0907 0.97506 17.233 12 4 Leave out requantified 1.1358 1.1402 1.0536 0.97838 1.0862 1.0501 18.49 11.413 25.165 6 4 2 3 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 7.5 5.4 2.2 234620000 104210000 130410000 129990000 56384000 73603000 66153000 28404000 37748000 38484000 19425000 19059000 866 1842;4937;10863;11418;12371;13015;16401 True;True;True;True;True;True;True 1904;5063;11099;11661;12656;13322;16789 6336;16988;16989;37780;37781;39523;39524;39525;42759;42760;45065;56449;56450;56451 8242;21575;21576;21577;47404;47405;49551;53502;53503;56320;70816;70817;70818;70819;70820 8242;21576;47405;49551;53503;56320;70818 P52789;Q2TB90;P52790 P52789 11;1;1 11;1;1 10;0;0 Hexokinase-2 HK2 sp|P52789|HXK2_HUMAN Hexokinase-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HK2 PE=1 SV=2 3 11 11 10 11 9 10 11 9 10 10 8 9 13.1 13.1 12.3 102.38 917 917;917;923 0 30.575 By MS/MS 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SUCLG1 sp|P53597|SUCA_HUMAN Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLG1 PE=1 SV=4 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 11.6 11.6 11.6 36.249 346 346 0 11.387 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2271 1.1495 13.859 8 2 Leave out requantified 1.3796 1.0517 0.94598 1.259 0.99693 0.93023 32.28 5.496 13.223 4 2 2 1 0 1 Leave out requantified Median Median 11.6 7.2 7.2 221090000 107000000 114090000 121740000 55735000 66003000 47415000 23764000 23650000 51935000 27503000 24432000 879 6107;10258;11472 True;True;True 6254;10484;11716 20760;35768;35769;35770;35771;39666;39667;39668 26280;44956;44957;44958;44959;49710;49711 26280;44957;49710 P53618 P53618 26 26 26 Coatomer subunit beta COPB1 sp|P53618|COPB_HUMAN Coatomer subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPB1 PE=1 SV=3 1 26 26 26 25 20 20 25 20 20 25 20 20 31.6 31.6 31.6 107.14 953 953 0 195.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0838 1.0246 19.215 74 17 Leave out requantified 1.3651 1.0228 1.0664 1.2031 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RARS PE=1 SV=2 1 35 35 35 29 32 30 29 32 30 29 32 30 52.4 52.4 52.4 75.378 660 660 0 247.43 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0421 0.99331 13.861 128 36 Leave out requantified 1.1246 1.0223 1.0303 1.0311 0.98579 0.96555 16.337 16.281 13.927 43 46 39 9 18 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.9 47.7 45.8 7883500000 3844900000 4038600000 2849800000 1357100000 1492700000 2426000000 1206000000 1219900000 2607700000 1281800000 1326000000 888 179;1782;2334;3756;4266;4977;5069;5962;5983;6041;7245;7246;8160;8696;8697;9289;9385;9552;10212;10692;10788;10831;11035;11898;11946;12189;12583;13926;14265;14933;14934;15344;17110;17190;17462 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 183;1840;2408;3859;4381;5105;5198;6106;6127;6186;7413;7414;8345;8898;8899;9501;9598;9768;10437;10923;11020;11067;11275;12162;12215;12471;12878;14252;14599;15280;15281;15703;17503;17584;17860 581;582;583;584;585;586;6103;6104;8079;13003;13004;13005;14810;17128;17129;17130;17404;17405;17406;17407;20261;20262;20263;20325;20326;20327;20328;20329;20330;20546;20547;20548;20549;24864;24865;24866;24867;24868;24869;24870;24871;24872;24873;24874;24875;28241;28242;28243;28244;28245;28246;28247;28248;28249;30108;30109;30110;30111;32415;32416;32417;32418;32419;32420;32793;33408;33409;33410;35634;35635;35636;37250;37251;37252;37533;37534;37535;37536;37672;37673;37674;38320;38321;38322;38323;38324;38325;38326;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41316;41317;41318;41319;41320;41321;41322;42121;42122;42123;42124;43557;43558;43559;48100;48101;48102;49316;49317;49318;49319;49320;49321;51473;51474;51475;51476;51477;51478;51479;51480;51481;51482;52807;52808;58784;58785;58786;59078;60070;60071;60072;60073;60074 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1.0996 1.0753 2.915 12.285 12.426 3 2 2 1 0 0 Median Median Median 3.1 1.9 1.9 78007000 35230000 42777000 35574000 15677000 19897000 18012000 7773200 10239000 24421000 11780000 12641000 890 13393;18034 True;True 13708;18439 46349;46350;46351;46352;46353;46354;61979 57935;57936;57937;57938;57939;57940;77980 57936;77980 P54577 P54577 38 38 38 Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed YARS sp|P54577|SYYC_HUMAN Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YARS PE=1 SV=4 1 38 38 38 34 33 34 34 33 34 34 33 34 68.8 68.8 68.8 59.143 528 528 0 320.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1036 1.0058 44.441 153 46 Leave out requantified 1.099 1.0559 1.1357 0.99721 0.99588 1.0742 19.894 19.332 45.645 53 50 50 19 16 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 65.2 65.5 66.7 14650000000 7184700000 7465200000 5922000000 2902200000 3019900000 3688900000 1830200000 1858700000 5039000000 2452400000 2586600000 891 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Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed AK2 sp|P54819|KAD2_HUMAN Adenylate kinase 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK2 PE=1 SV=2 1 14 14 14 13 13 14 13 13 14 13 13 14 64.4 64.4 64.4 26.477 239 239 0 120.22 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97488 0.94078 8.5306 60 11 Leave out requantified 0.97759 0.99565 0.96773 0.88825 0.94128 0.93262 10.802 11.585 9.7757 18 21 21 3 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 60.3 60.3 64.4 7077700000 3501100000 3576600000 2528400000 1204400000 1323900000 2235700000 1150300000 1085400000 2313700000 1146400000 1167300000 896 1156;1157;1252;1663;3918;9498;9754;10993;11553;12316;12462;12931;12932;15540 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1196;1197;1293;1716;4026;9714;9974;11232;11797;12601;12750;13237;13238;15903 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5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase ALDH18A1 sp|P54886|P5CS_HUMAN Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH18A1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 8 10 8 8 10 8 8 10 8 18.5 18.5 18.5 87.301 795 795 0 30.192 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0507 0.96691 12.503 26 3 Leave out requantified 1.2285 0.96177 1.1268 1.0987 0.89788 1.0942 12.556 11.478 14.791 9 10 7 1 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.3 17.4 11.9 836010000 403670000 432340000 334860000 152530000 182330000 322600000 162000000 160600000 178550000 89150000 89404000 897 2635;3409;4250;6234;6283;6598;8149;10890;11825;18051;18840 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2712;3507;4360;6384;6433;6753;8333;11126;12083;18457;19259 9130;11811;11812;14750;14751;14752;21198;21199;21382;21383;21384;21385;21386;21387;22368;22369;22370;28207;28208;37870;40862;40863;40864;62029;62030;62031;64616;64617;64618 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Microfibrillar-associated protein 1 MFAP1 sp|P55081|MFAP1_HUMAN Microfibrillar-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MFAP1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.6 4.6 4.6 51.958 439 439 0.0004787 2.6807 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0911 1.0198 4.5946 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.6 4.6 4.6 25526000 13646000 11880000 9845200 5506600 4338600 7061900 3716700 3345100 8619400 4422700 4196600 904 783 True 812 2727;2728;2729 3492;3493;3494;3495;3496;3497 3497 P55084 P55084 3 3 3 Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase HADHB sp|P55084|ECHB_HUMAN Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 13.3 13.3 13.3 51.294 474 474 0 28.854 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1606 1.096 122.2 6 4 Median 0.55287 1.9161 1.2075 0.5213 1.844 1.1605 128.42 202.1 31.425 2 2 2 1 2 1 Median Median Median 7.8 2.1 11.2 113560000 54701000 58864000 40763000 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P55735 3 3 3 Protein SEC13 homolog SEC13 sp|P55735|SEC13_HUMAN Protein SEC13 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC13 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 15.8 15.8 15.8 35.54 322 322 0 11.363 By MS/MS By matching By MS/MS 1.023 0.8892 32.403 7 4 Median 0.89798 NaN 0.97563 0.79829 NaN 0.92717 18.528 NaN 11.346 4 1 2 3 0 1 Median Median Median 15.8 7.1 10.6 465940000 253110000 212830000 251290000 138590000 112700000 24662000 7694800 16967000 189990000 106830000 83157000 910 3067;4927;17197 True;True;True 3154;5053;17592 10646;10647;10648;10649;16954;16955;59101 13547;13548;13549;21532;21533;74284 13549;21533;74284 P55769 P55769 6 6 6 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed NHP2L1 sp|P55769|NH2L1_HUMAN NHP2-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNU13 PE=1 SV=3 1 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 40.6 40.6 40.6 14.173 128 128 0 33.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0977 1.0526 14.017 27 7 Leave out requantified 1.2033 1.0373 1.0055 1.087 1.0007 0.95342 21.107 9.5883 14.347 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Myc-associated zinc finger protein MAZ sp|P56270|MAZ_HUMAN Myc-associated zinc finger protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAZ PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 48.607 477 477 0.00047015 2.5265 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1025 1.0176 29.584 6 3 Median 1.4187 1.2636 NaN 1.2894 1.199 NaN 35.602 9.6702 NaN 2 3 1 1 2 0 Median Plateau Median 3.1 3.1 3.1 91077000 38915000 52162000 35878000 15491000 20386000 35015000 15111000 19904000 20185000 8312500 11872000 918 17339 True 17735 59615;59616;59617;59618;59619;59620 74957;74958;74959;74960;74961;74962 74957 P56537 P56537 3 3 3 Eukaryotic translation initiation factor 6 EIF6 sp|P56537|IF6_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF6 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 18.8 18.8 18.8 26.599 245 245 0 30.384 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76024 0.73438 12.968 6 0 Leave out requantified NaN 0.66016 0.86829 NaN 0.62366 0.84637 NaN 1.0992 15.362 1 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 18.8 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[ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 NDUFA6 sp|P56556|NDUA6_HUMAN NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDUFA6 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.2 6.2 6.2 15.136 128 128 0.0052794 1.8791 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92541 0.89931 15.02 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.2 6.2 6.2 38770000 18330000 20440000 15916000 7660900 8254600 12263000 5542700 6720800 10591000 5126800 5464600 921 18227 True 18635 62578;62579;62580 78716;78717;78718;78719;78720 78718 P57076 P57076 1 1 1 UPF0769 protein C21orf59 C21orf59 sp|P57076|CF298_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 298 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP298 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.9 5.9 5.9 33.224 290 290 0 11.556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2102 1.0751 8.9915 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.9 5.9 5.9 124320000 60817000 63506000 48609000 24196000 24413000 38501000 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P60174 12 12 12 Triosephosphate isomerase TPI1 sp|P60174|TPIS_HUMAN Triosephosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPI1 PE=1 SV=3 1 12 12 12 9 12 9 9 12 9 9 12 9 58.7 58.7 58.7 30.791 286 286 0 83.329 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1382 1.1113 16.795 36 10 Leave out requantified 1.8795 1.1382 0.63709 1.6166 1.1113 0.62369 20.862 14.15 19.096 11 14 11 2 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.5 58.7 45.5 2133900000 999420000 1134500000 770380000 258420000 511960000 758640000 368630000 390020000 604910000 372370000 232530000 930 3992;7431;7571;8018;9277;15043;15648;16869;17347;18172;18245;18269 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4101;7604;7747;8202;9489;15398;16013;17261;17743;18579;18653;18677 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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform PPP2R2A sp|P63151|2ABA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R2A PE=1 SV=1 3 6 6 5 4 1 5 4 1 5 3 1 4 21.7 21.7 18.6 51.691 447 447;447;453 0 50.23 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0302 0.94879 10.004 10 6 Leave out requantified 0.90462 NaN 1.0009 0.80672 NaN 0.97958 30.328 NaN 69.61 4 1 5 3 0 3 Median Median Median 17.4 7.4 18.3 477530000 269180000 208350000 195020000 127280000 67741000 42075000 21209000 20866000 240430000 120680000 119740000 1028 2535;2582;5805;9928;14425;17927 True;True;True;True;True;True 2612;2659;5947;10149;14762;18332 8761;8927;19750;19751;19752;34654;49802;49803;61631;61632 11199;11397;25014;25015;25016;25017;43620;62300;77561;77562;77563 11199;11397;25016;43620;62300;77562 P63167;Q96FJ2 P63167 4;1 4;1 4;1 Dynein light chain 1, cytoplasmic DYNLL1 sp|P63167|DYL1_HUMAN Dynein light chain 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLL1 PE=1 SV=1 2 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 51.7 51.7 51.7 10.366 89 89;89 0 19.799 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78281 0.75514 3.2944 10 5 Leave out requantified 2.0433 0.47993 0.72669 1.9296 0.47304 0.69395 150.93 70.446 12.565 3 4 3 2 2 1 Median Median Median 39.3 51.7 39.3 312850000 183370000 129490000 101680000 46114000 55570000 81193000 51666000 29526000 129970000 85585000 44389000 1029 2423;12131;12291;18920 True;True;True;True 2498;12413;12576;19341 8370;8371;8372;8373;41920;41921;41922;41923;42491;64872;64873;64874 10737;10738;10739;10740;52494;52495;52496;52497;52498;52499;52500;52501;53186;81518;81519;81520 10739;52499;53186;81520 P63173 P63173 3 3 3 60S ribosomal protein L38 RPL38 sp|P63173|RL38_HUMAN 60S ribosomal protein L38 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL38 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 32.9 32.9 32.9 8.2178 70 70 0 9.3469 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82124 0.78225 59.418 10 7 Median 0.70417 0.55875 0.95133 0.63028 0.54005 0.9187 80.516 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15223;15224;15225;15226;15227;15228;15229;15230;15231;15232;15233;15234;15235;15236;15237;15238;15239;15240;15241;15242;15243;15244;15245;15246;15247;15248;15249;37583;37584;37585;37586;37587;37588;37589;37590;41498;41499;41500;41501;41502;41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524;41525;41526;41527;41528;41529;41530;47612;52880;52881;52882;52883;52884;52885;52886;60749;60750;60751;60752;60753;74919;74920;74921;74922;74923;74924;74925;74926;74927;74928;80214;80215;80216;80217;80218;80219;80220;80221;80222;80223;80224;80225;80226 15226;15235;37590;41506;41524;47612;52885;60750;74926;80218;80225 312;313 43;79 P63244 P63244 6 6 6 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed GNB2L1 sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 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Median Median 13.6 6.8 9.4 404270000 200230000 204040000 173680000 90624000 83058000 95019000 43760000 51258000 135570000 65842000 69724000 1036 4015;11038;13460 True;True;True 4124;11278;13775 13961;13962;38340;38341;46580;46581;46582 17774;17775;48072;58242 17774;48072;58242 P67809;Q9Y2T7 P67809 11;2 11;2 9;0 Nuclease-sensitive element-binding protein 1 YBX1 sp|P67809|YBOX1_HUMAN Nuclease-sensitive element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YBX1 PE=1 SV=3 2 11 11 9 11 10 10 11 10 10 9 9 9 48.5 48.5 43.8 35.924 324 324;364 0 173.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1188 1.0382 11.427 51 10 Leave out requantified 1.1885 1.125 1.0369 1.0687 1.0903 1.0146 13.099 19.01 9.2676 18 16 17 1 7 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.5 43.8 43.8 2317500000 1088400000 1229200000 1131400000 507350000 624090000 505360000 241210000 264160000 680750000 339840000 340910000 1037 38;3441;3442;5737;12235;12248;12901;13559;14063;15436;15437 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 39;3541;3542;5878;12520;12533;13207;13880;14393;15795;15796 123;124;125;126;127;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926;11927;11928;11929;11930;11931;11932;11933;19501;19502;19503;19504;19505;19506;19507;42305;42358;42359;42360;42361;42362;42363;44682;44683;44684;44685;44686;44687;46913;46914;46915;48635;48636;48637;48638;53091;53092;53093;53094;53095;53096;53097 178;179;180;181;182;183;15149;15150;15151;15152;15153;15154;15155;15156;15157;15158;15159;15160;15161;15162;15163;15164;15165;15166;15167;24689;24690;24691;24692;24693;24694;24695;24696;24697;52976;53038;53039;53040;53041;53042;53043;53044;55843;55844;55845;55846;55847;55848;55849;55850;58693;58694;58695;58696;58697;58698;60860;60861;60862;60863;60864;66519;66520;66521;66522;66523;66524;66525;66526 178;15154;15164;24695;52976;53038;55843;58693;60860;66520;66524 P67870 P67870 3 3 3 Casein kinase II subunit beta CSNK2B sp|P67870|CSK2B_HUMAN Casein kinase II subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSNK2B PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 13 13 13 24.942 215 215 0 11.291 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1274 1.0212 3.0851 11 2 Leave out requantified 1.2561 1.0437 1.028 1.1039 0.98944 0.96589 8.4433 9.8382 9.0768 4 3 4 0 1 1 Leave out requantified Plateau Leave out requantified 13 13 13 532890000 250010000 282880000 207170000 86221000 120940000 117990000 65889000 52098000 207740000 97900000 109840000 1038 6172;14045;18963 True;True;True 6320;14375;19386 20986;20987;20988;48569;48570;48571;48572;48573;48574;48575;65006;65007;65008 26564;26565;26566;26567;26568;60774;60775;60776;60777;60778;60779;60780;81708;81709;81710;81711;81712;81713 26566;60780;81713 P67936 P67936 11 11 3 Tropomyosin alpha-4 chain TPM4 sp|P67936|TPM4_HUMAN Tropomyosin alpha-4 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPM4 PE=1 SV=3 1 11 11 3 5 10 5 5 10 5 2 2 2 38.7 38.7 11.3 28.521 248 248 0 22.198 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0783 1.0111 29.221 24 8 Leave out requantified 1.2574 0.98378 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cardiac muscle 1;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, aortic smooth muscle ACTA1;ACTC1;ACTG2;ACTA2 sp|P68133|ACTS_HUMAN Actin, alpha skeletal muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTA1 PE=1 SV=1;sp|P68032|ACTC_HUMAN Actin, alpha cardiac muscle 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTC1 PE=1 SV=1;sp|P63267|ACTH_HUMAN Actin, gamma-enteric smooth muscle OS=Homo sapie 4 19 4 4 18 18 18 3 3 3 3 3 3 43.2 18 18 42.051 377 377;377;376;377 0 30.25 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0403 1.0045 23.044 20 2 Leave out requantified 1.1858 1.0412 0.94347 1.0745 1.0066 0.90041 22.07 0.30296 8.1264 7 7 6 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.1 43.2 43.2 7247800000 3624000000 3623800000 3150000000 1500000000 1650000000 1844100000 931240000 912840000 2253700000 1192700000 1061000000 1040 526;1631;2770;3006;3007;3864;7335;7336;7337;7923;7924;8048;8690;9672;9712;15533;16905;18932;18933 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phosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSPH PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 13.8 13.8 13.8 25.007 225 225 0 6.2476 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81016 0.73641 29.241 12 0 Leave out requantified 0.79028 0.99528 0.81016 0.69454 0.92509 0.73641 41.594 20.218 19.27 4 4 4 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.8 13.8 13.8 1025300000 481340000 543940000 397130000 183470000 213660000 277040000 126200000 150840000 351110000 171670000 179440000 1049 9545;10199;12100 True;True;True 9761;10424;12378 33382;33383;33384;35584;35585;35586;41818;41819;41820;41821;41822;41823 42009;42010;42011;42012;44750;44751;44752;44753;44754;52359;52360;52361;52362;52363;52364;52365 42012;44752;52359 P78344 P78344 20 20 20 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 EIF4G2 sp|P78344|IF4G2_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4G2 PE=1 SV=1 1 20 20 20 16 18 18 16 18 18 16 18 18 23.3 23.3 23.3 102.36 907 907 0 101.93 By 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.8 3.8 3.8 31.546 286 286 0 3.5213 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1779 1.1261 48.366 4 1 Median 0.78608 NaN NaN 0.7225 NaN NaN 66.868 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 3.8 3.8 3.8 80305000 40928000 39378000 35099000 19242000 15857000 19401000 8443200 10958000 25805000 13243000 12562000 1058 6159 True 6306 20926;20927;20928;20929 26482;26483;26484;26485;26486;26487;26488 26482 P80723 P80723 17 17 17 Brain acid soluble protein 1 BASP1 sp|P80723|BASP1_HUMAN Brain acid soluble protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BASP1 PE=1 SV=2 1 17 17 17 16 17 15 16 17 15 16 17 15 92.5 92.5 92.5 22.693 227 227 0 162.23 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9264 0.88468 13.105 90 8 Leave out requantified 1.1653 0.79629 0.90365 1.0578 0.76546 0.86362 10.44 17.55 14.563 31 30 29 4 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 92.5 92.5 92.5 6993600000 3590500000 3403100000 2450100000 1126100000 1324000000 2246100000 1248100000 998000000 2297400000 1216200000 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sp|P82970|HMGN5_HUMAN High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGN5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 14.2 14.2 14.2 31.524 282 282 0.000481 2.7374 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71283 0.66423 18.172 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 5.3 8.9 14.2 120040000 66703000 53335000 49037000 27541000 21496000 35489000 18990000 16499000 35512000 20173000 15340000 1060 8544;11181 True;True 8742;11422 29584;29585;38770;38771 37200;48580;48581 37200;48581 P82979 P82979 6 6 6 SAP domain-containing ribonucleoprotein SARNP sp|P82979|SARNP_HUMAN SAP domain-containing ribonucleoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SARNP PE=1 SV=3 1 6 6 6 3 4 6 3 4 6 3 4 6 34.3 34.3 34.3 23.671 210 210 0 56.315 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93039 0.8747 19.625 15 5 Leave out requantified 1.0961 0.77406 1.187 0.96679 0.76077 1.116 10.617 20.669 8.546 3 5 7 0 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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Median Median 2.6 4.8 7 137100000 90161000 46941000 16869000 8923300 7946000 103680000 71611000 32066000 16555000 9626100 6928700 1072 7427;9862;11872 True;True;True 7600;10083;12135 25670;34451;34452;41054 32359;43372;43373;43374;51411 32359;43373;51411 Q00341 Q00341 40 40 40 Vigilin HDLBP sp|Q00341|VIGLN_HUMAN Vigilin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDLBP PE=1 SV=2 1 40 40 40 35 35 31 35 35 31 35 35 31 39 39 39 141.45 1268 1268 0 210.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1496 1.04 61.376 121 43 Leave out requantified 1.2091 1.0292 1.0718 1.0968 0.9873 1.0067 23.641 22.67 69.158 43 42 36 13 17 13 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.6 34.8 33.5 5556900000 2706800000 2850100000 2387700000 1101100000 1286600000 1737000000 902080000 834930000 1432200000 703620000 728550000 1073 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19 19 Tight junction protein ZO-1 TJP1 sp|Q07157|ZO1_HUMAN Tight junction protein ZO-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TJP1 PE=1 SV=3 1 19 19 19 15 13 17 15 13 17 15 13 17 16.6 16.6 16.6 195.46 1748 1748 0 63.098 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1061 1.0626 15.622 50 17 Leave out requantified 1.0624 1.4433 1.1079 0.97354 1.3626 1.0585 15.711 24.469 17.75 17 14 19 5 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.8 9.7 15.5 1140700000 525150000 615540000 438340000 202530000 235810000 275250000 124390000 150860000 427100000 198230000 228870000 1136 728;1537;2378;3299;3657;3862;5271;6098;6309;7051;8470;9522;11169;15187;15217;16639;16640;16743;18958 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 755;1586;2453;3393;3758;3967;5403;6245;6460;7216;8662;9738;11410;15544;15575;17030;17031;17135;19381 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1.1505 1.0014 16.658 7 3 Leave out requantified 1.1173 NaN 0.97435 1.0075 NaN 0.9219 13.327 NaN 33.855 4 1 2 2 0 1 Median Median Median 2.8 1 3.5 115070000 53844000 61226000 66840000 29382000 37457000 10373000 4672200 5700500 37858000 19790000 18068000 1159 2203;15198;15615;16837 True;True;True;True 2272;15555;15980;17229 7623;52387;52388;52389;53715;53716;53717;57879 9806;65610;65611;65612;67337;67338;67339;72724 9806;65610;67339;72724 Q12769 Q12769 7 7 7 Nuclear pore complex protein Nup160 NUP160 sp|Q12769|NU160_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup160 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP160 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 5 5 5 5 5 5 5 5 6.3 6.3 6.3 162.12 1436 1436 0 25.007 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.173 1.1597 31.728 15 2 Leave out requantified 1.152 1.1584 1.1639 1.0338 1.1036 1.1265 77.301 15.448 14.57 6 4 5 2 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.8 4.7 4.9 409820000 187050000 222770000 170990000 80079000 90914000 123740000 55654000 68089000 115090000 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14433;15364;15365;15366;15367;15368;15369;15674;15675;15676;15677;15678;32002;32003;32004;32005;32006;32007;32008;32009;32010;36025;36026;36027;36028;36029;36030;36031;39448;39449;39450;39451;39452;39453;45148;45149;46043;53047;81268;81269;81270;81271;81272;81273;81274;81275;81276;81277;81278 14433;15364;15367;15676;32007;36025;39452;45149;46043;53047;81270 Q12797 Q12797 3 3 3 Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase ASPH sp|Q12797|ASPH_HUMAN Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPH PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 0 2 1 0 2 1 0 2 5.1 5.1 5.1 85.862 758 758 0 3.6687 By MS/MS By MS/MS 4.1791 4.0935 185.99 2 2 Median NaN NaN 4.1791 NaN NaN 4.0935 NaN NaN 185.99 0 0 2 0 0 2 Median Median Median 1.1 0 4.1 60313000 12659000 47653000 0 0 0 0 0 0 60313000 12659000 47653000 1163 363;1277;5757 True;True;True 372;1318;5898 1231;4378;19583 1593;5684;24800 1593;5684;24800 Q12824 Q12824 2 2 2 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 SMARCB1 sp|Q12824|SNF5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCB1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 7.5 7.5 7.5 44.141 385 385 0 8.6956 By MS/MS By MS/MS 0.82395 0.79111 25.23 2 1 Median NaN NaN 0.82395 NaN NaN 0.79111 NaN NaN 25.23 0 0 2 0 0 1 Median Median Median 3.4 0 7.5 50331000 26622000 23709000 0 0 0 0 0 0 50331000 26622000 23709000 1164 1407;1707 True;True 1452;1762 4799;5827;5828 6191;7553;7554 6191;7553 Q12857;O00712 Q12857;O00712 2;1 2;1 2;1 Nuclear factor 1 A-type;Nuclear factor 1 B-type NFIA;NFIB sp|Q12857|NFIA_HUMAN Nuclear factor 1 A-type OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFIA PE=1 SV=2;sp|O00712|NFIB_HUMAN Nuclear factor 1 B-type OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFIB PE=1 SV=2 2 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 6.1 6.1 6.1 55.944 509 509;420 0.0013643 2.1745 By MS/MS 1.4244 1.3462 67.675 2 1 Median 1.4244 NaN NaN 1.3462 NaN NaN 67.675 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 6.1 0 0 29111000 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receptor-associated factor 2 TRAF2 sp|Q12933|TRAF2_HUMAN TNF receptor-associated factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAF2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6 6 6 55.859 501 501 0 3.7775 By MS/MS By MS/MS By matching 1.4893 1.3816 18.107 4 2 Median 1.3111 NaN NaN 1.1675 NaN NaN 21.046 NaN NaN 2 1 1 1 1 0 Median Median Median 3.6 2.4 2 44366000 21558000 22807000 24044000 11211000 12833000 7430700 5160100 2270600 12891000 5187700 7703600 1173 760;1984;16895 True;True;True 789;2048;17287 2646;6873;58056;58057 3389;8871;72945 3389;8871;72945 Q12959 Q12959 5 5 5 Disks large homolog 1 DLG1 sp|Q12959|DLG1_HUMAN Disks large homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DLG1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 5 4 2 5 4 2 5 4 7.3 7.3 7.3 100.45 904 904 0 14.723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8796 0.83671 27.518 10 2 Leave out requantified 1.092 0.88202 0.8564 0.99809 0.86559 0.83671 41.824 6.8138 42.122 2 4 4 0 1 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 3.3 7.3 6.4 164790000 70954000 93838000 46538000 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42480;74826 Q12996 Q12996 4 4 4 Cleavage stimulation factor subunit 3 CSTF3 sp|Q12996|CSTF3_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 2 2 4 2 2 4 2 7.3 7.3 7.3 82.921 717 717 0 21.819 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1609 1.0735 22.802 6 2 Leave out requantified 1.7272 0.97492 NaN 1.5558 0.94308 NaN 26.572 18.372 NaN 2 3 1 1 1 0 Median Median Median 3.5 7.3 3.3 323900000 160170000 163730000 59757000 23006000 36751000 171450000 87651000 83803000 92691000 49511000 43180000 1177 5224;5348;9993;17767 True;True;True;True 5355;5480;10214;18169 17890;18265;18266;18267;34875;34876;61121;61122 22690;23131;23132;23133;43891;76926;76927;76928 22690;23132;43891;76927 Q13042 Q13042 1 1 1 Cell division cycle protein 16 homolog CDC16 sp|Q13042|CDC16_HUMAN Cell division cycle protein 16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC16 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.4 2.4 2.4 71.655 620 620 0.00046168 2.3588 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN 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Q13155 Q13155 7 7 7 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 AIMP2 sp|Q13155|AIMP2_HUMAN Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIMP2 PE=1 SV=2 1 7 7 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 28.4 28.4 28.4 35.348 320 320 0 97.858 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1654 1.0906 19.184 25 6 Leave out requantified 1.2916 1.1654 1.0382 1.1322 1.0928 0.99318 29.429 9.6454 12.331 9 9 7 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.4 28.4 24.4 1619600000 784980000 834590000 656360000 309490000 346870000 532530000 264750000 267780000 430680000 210740000 219940000 1191 5502;13027;14226;15478;15539;17119;17753 True;True;True;True;True;True;True 5636;13334;14558;15838;15902;17512;18155 18735;18736;18737;45098;45099;45100;49185;49186;49187;53234;53235;53236;53450;53451;53452;53453;53454;58815;58816;58817;61076;61077;61078;61079;61080;61081;61082;61083;61084 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2-like UBAP2L sp|Q14157|UBP2L_HUMAN Ubiquitin-associated protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBAP2L PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 7.8 7.8 7.8 114.53 1087 1087 0 17.243 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.19 1.1419 27.251 16 4 Leave out requantified 1.19 1.5892 1.1768 1.1075 1.5346 1.1419 25.368 24.301 33.572 7 4 5 4 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.8 6.3 6.3 319530000 147210000 172330000 162380000 78155000 84226000 61969000 25094000 36875000 95184000 43956000 51228000 1248 2389;5990;6118;7641;12941;15055 True;True;True;True;True;True 2464;6135;6265;7818;13247;15410 8254;8255;8256;8257;20369;20370;20371;20793;20794;20795;26463;26464;26465;44810;51927;51928;51929 10604;10605;10606;10607;10608;25775;26325;26326;26327;33297;33298;33299;56008;65006;65007 10605;25775;26325;33299;56008;65007 Q14160;Q9BTT6 Q14160 8;1 8;1 8;1 Protein scribble homolog SCRIB sp|Q14160|SCRIB_HUMAN Protein scribble homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCRIB PE=1 SV=4 2 8 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4 4 Neutral alpha-glucosidase AB GANAB sp|Q14697|GANAB_HUMAN Neutral alpha-glucosidase AB OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GANAB PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 5 5 5 106.87 944 944 0 7.9924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90693 0.90204 9.1512 8 1 Leave out requantified 1.0049 1.0204 0.90287 0.86368 0.96448 0.90204 14.467 30.314 9.1512 3 2 3 1 0 0 Median Median Leave out requantified 4 4 5 146150000 71712000 74436000 53658000 24092000 29566000 35886000 18572000 17314000 56605000 29048000 27556000 1283 6122;15665;18091;18138 True;True;True;True 6269;16030;18497;18544 20805;20806;20807;53903;53904;53905;62138;62139;62140;62287 26338;26339;26340;67580;67581;78162;78163;78164;78165;78166;78167;78168;78365 26340;67580;78163;78365 Q14738 Q14738 7 7 4 Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform PPP2R5D sp|Q14738|2A5D_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R5D PE=1 SV=1 1 7 7 4 5 3 5 5 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Median Median 2.7 2.7 8 55273000 31704000 23569000 15671000 7690300 7981200 14162000 6572000 7590000 25440000 17442000 7997300 1288 13678;18789 True;True 14002;19208 47296;64441;64442;64443 59154;80994;80995;80996;80997 59154;80997 Q14914 Q14914 12 12 12 Prostaglandin reductase 1 PTGR1 sp|Q14914|PTGR1_HUMAN Prostaglandin reductase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTGR1 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 10 11 10 10 11 10 10 11 45.3 45.3 45.3 35.869 329 329 0 100.22 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.3731 0.36344 28.753 39 23 Leave out requantified 0.38251 0.21603 0.35511 0.35312 0.20946 0.35699 27.886 38.193 11.238 12 13 14 7 8 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.9 42.9 45 2130700000 1494100000 636570000 691520000 534380000 157150000 750850000 472560000 278290000 688290000 487150000 201140000 1289 1452;3616;6061;6807;7103;8970;10363;15585;15906;16646;16647;18248 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SART3 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 7 6 7 7 6 7 7 6 12 12 12 109.93 963 963 0 42.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0806 1.0168 10.652 24 10 Leave out requantified 1.1294 1.2173 0.99988 1.0157 1.2121 0.97938 14.253 24.12 7.1848 8 9 7 2 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.3 11.9 9.8 572090000 264650000 307440000 213860000 97080000 116780000 164420000 74567000 89850000 193810000 93005000 100800000 1303 579;1043;3245;5729;5730;11171;14117;18800 True;True;True;True;True;True;True;True 601;1077;3337;5870;5871;11412;14449;19219 1967;1968;1969;1970;1971;3584;3585;11226;11227;11228;11229;11230;19480;19481;19482;19483;38748;38749;48816;48817;48818;64473;64474;64475 2509;2510;2511;2512;2513;4621;4622;14218;14219;14220;14221;14222;24662;24663;48556;48557;48558;61061;61062;61063;61064;61065;61066;81032;81033;81034;81035;81036 2509;4622;14221;24662;24663;48556;61063;81036 Q15021 Q15021 20 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coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAP2 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 6.2 6.2 6.2 88.028 778 778 0 14.224 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0566 0.9688 18.671 10 2 Leave out requantified 1.0679 0.83663 1.0521 0.96585 0.82675 0.9807 22.51 13.937 18.352 4 3 3 1 1 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 4.9 3.5 3.2 1292800000 633100000 659710000 857200000 423460000 433740000 35042000 17374000 17669000 400570000 192270000 208300000 1313 1392;4939;14940;15268;15269 True;True;True;True;True 1437;5065;15287;15627;15628 4761;4762;16996;51499;52603;52604;52605;52606;52607;52608 6148;6149;21584;64435;65881;65882;65883;65884;65885 6148;21584;64435;65881;65885 Q15059 Q15059 3 1 1 Bromodomain-containing protein 3 BRD3 sp|Q15059|BRD3_HUMAN Bromodomain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRD3 PE=1 SV=1 1 3 1 1 2 3 3 0 1 1 0 1 1 4.7 1.7 1.7 79.541 726 726 0 4.9056 By matching By MS/MS By MS/MS 1.7721 1.7219 9.5885 2 2 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548;549;550;2250;2251;2252;4257;4258;4259;4260;4261;4262;7657;7658;7659;7660;7661;7662;17321;17322;17323;17324;17325;17326;21348;21349;21501;21502;21503;21504;21505;22225;22226;22227;22228;22229;22230;22231;29095;29096;43950;43951;43952;43953;43954;43955;50826;50827;50828;50829;50830;50831;50832;50833;50834;50835;50836;50837;50838;50839;50840;50841;50842;50843;51084;51085;60723;60724;60725;60726;60727;60728;60729;60730;60731;60732;60733;60734;60735;60736;60737;60738;60739;60740;60741;60742;60743;60744;60745;60746;60747;69586;69587;69588;69589;73901;73902 549;2252;4258;4261;7658;17322;21349;21503;22226;29096;43950;50827;50836;51085;60725;60738;69588;69589;73901 375 326 Q15257 Q15257 7 7 7 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator PPP2R4 sp|Q15257|PTPA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTPA PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 4 6 4 4 6 4 4 6 22.3 22.3 22.3 40.667 358 358 0 16.003 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75139 0.67872 23.876 15 4 Leave out requantified 0.866 0.56725 0.72604 0.74777 0.52815 0.69591 23.87 29.635 20.805 5 4 6 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.2 12.8 19.3 339960000 200060000 139900000 108270000 61901000 46373000 69462000 40497000 28965000 162220000 97661000 64562000 1324 320;547;5108;8854;11428;17884;18438 True;True;True;True;True;True;True 327;564;5237;9060;11672;18289;18848 1048;1049;1050;1051;1825;1826;17523;17524;17525;30735;39557;61485;61486;63225;63226 1351;1352;2340;2341;22246;22247;22248;38711;49598;77368;79474;79475;79476 1352;2340;22248;38711;49598;77368;79475 Q15269 Q15269 1 1 1 Periodic tryptophan protein 2 homolog PWP2 sp|Q15269|PWP2_HUMAN Periodic tryptophan protein 2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PWP2 PE=2 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2.7 2.7 2.7 102.45 919 919 0.00046447 2.42 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0 2.7 0 22155000 11780000 10375000 0 0 0 22155000 11780000 10375000 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MS/MS By MS/MS 1.0474 1.0063 7.7749 20 7 Leave out requantified 1.0695 1.0992 1.0572 0.93057 1.0227 1.0071 6.599 10.322 16.87 7 7 6 3 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49 49 40.7 2571500000 1327500000 1244000000 1057900000 496070000 561830000 649430000 356520000 292910000 864190000 474930000 389260000 1363 8293;10513;10952;14678;18283;18513;18931 True;True;True;True;True;True;True 8484;10743;11190;15022;18691;18925;19353 28695;28696;28697;28698;28699;36642;36643;36644;38057;38058;38059;50588;50589;50590;62758;62759;62760;63457;63458;63459;64906;64907;64908 36067;36068;36069;36070;36071;36072;46019;46020;46021;47748;47749;47750;63320;63321;63322;63323;63324;63325;78921;78922;78923;79762;79763;81563;81564;81565;81566;81567 36072;46020;47748;63320;78921;79762;81567 Q15833 Q15833 5 5 5 Syntaxin-binding protein 2 STXBP2 sp|Q15833|STXB2_HUMAN Syntaxin-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STXBP2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 12.3 12.3 12.3 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Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 CPSF6 sp|Q16630|CPSF6_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF6 PE=1 SV=2 1 9 9 9 6 6 9 6 6 9 6 6 9 16.9 16.9 16.9 59.209 551 551 0 26.324 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2551 1.1814 13.125 22 5 Leave out requantified 1.3203 1.2522 1.109 1.2181 1.2038 1.0151 9.0871 15.512 21.841 6 7 9 1 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.2 14 16.9 824180000 382790000 441390000 224950000 99114000 125830000 244180000 112710000 131470000 355060000 170970000 184090000 1381 745;4081;5906;5977;6570;6571;13916;16369;17655 True;True;True;True;True;True;True;True;True 772;4191;6049;6121;6725;6726;14241;16757;18056 2584;2585;14198;20087;20088;20089;20090;20310;20311;20312;22282;22283;22284;48051;48052;48053;56355;56356;56357;56358;56359;60750;60751;60752;60753 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enzyme E2 S OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2S PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 36.5 36.5 36.5 23.845 222 222 0 23.292 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1471 1.0562 1.9818 9 5 Leave out requantified 1.4597 1.0747 0.71572 1.2983 1.0101 0.71031 35.162 33.473 4.5168 4 3 2 2 2 1 Linear Plateau Median 32.4 24.3 23 173990000 90126000 83865000 85924000 40799000 45126000 59823000 32745000 27079000 28243000 16582000 11661000 1387 833;1941;3183;4787;10607 True;True;True;True;True 862;2004;3272;4913;10837 2915;2916;2917;6711;11036;16494;16495;16496;36969;36970 3744;3745;3746;3747;3748;3749;8676;13990;20963;20964;20965;46426;46427 3745;8676;13990;20963;46427 Q16774 Q16774 1 1 1 Guanylate kinase GUK1 sp|Q16774|KGUA_HUMAN Guanylate kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GUK1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 11.2 11.2 11.2 21.725 197 197 0 5.7039 By MS/MS By MS/MS 1.4785 1.317 37.522 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 11.2 11.2 0 55601000 23216000 32386000 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13401;21436;22567;25179;68263 Q16851 Q16851 15 15 15 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UGP2 sp|Q16851|UGPA_HUMAN UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UGP2 PE=1 SV=5 1 15 15 15 13 11 13 13 11 13 13 11 13 35.4 35.4 35.4 56.94 508 508 0 154.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0397 0.94603 22.024 50 13 Leave out requantified 1.0072 1.0958 1.0802 0.88715 1.0703 1.035 16.896 42.982 25.352 18 13 19 4 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.1 28.5 28.7 2881800000 1354100000 1527700000 1162500000 557370000 605160000 517300000 253700000 263600000 1202000000 543050000 658960000 1390 3587;4511;5656;6126;6418;6840;8225;8226;8399;10847;11451;12255;14420;16099;16798 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3687;4634;5796;6273;6569;6999;8412;8413;8591;11083;11695;12540;14757;16476;17190 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 534;886;1564;2039;3971;5674;8034;9613;10884;13331;14938;15847;18438;18569 1727;1728;1729;2983;2984;2985;2986;2987;5195;5196;5197;5198;5199;6833;6834;6835;13388;13389;18849;27181;32858;37119;37120;37121;37122;37123;45089;45090;45091;50353;53266;53267;53268;53269;61976;61977;61978;62363;62364 2221;3828;3829;3830;3831;3832;6720;6721;6722;6723;6724;6725;8816;8817;8818;8819;8820;17048;17049;23872;34207;41355;46606;46607;46608;46609;56349;63014;66751;66752;66753;66754;66755;77977;77978;77979;78444;78445 2221;3831;6720;8817;17049;23872;34207;41355;46607;56349;63014;66755;77977;78444 Q29RF7 Q29RF7 18 18 17 Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A PDS5A sp|Q29RF7|PDS5A_HUMAN Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDS5A PE=1 SV=1 1 18 18 17 15 12 11 15 12 11 15 12 10 19.1 19.1 18.5 150.83 1337 1337 0 146.09 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0592 0.98389 12.598 40 11 Leave out 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Q2TAY7 6 6 6 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed SMU1 sp|Q2TAY7|SMU1_HUMAN WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 6 4 6 6 4 6 6 4 14.2 14.2 14.2 57.543 513 513 0 23.03 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90636 0.87824 9.5865 19 8 Leave out requantified 0.90674 0.78971 0.88558 0.78572 0.75845 0.85477 15.673 41.004 1.9998 8 6 5 5 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.2 14.2 9.7 380360000 183810000 196540000 143480000 63799000 79685000 140220000 64495000 75728000 96648000 55520000 41128000 1398 84;3018;3093;10781;16558;18764 True;True;True;True;True;True 87;3104;3181;11013;16947;19183 278;279;280;10476;10477;10478;10479;10747;10748;37520;37521;37522;56954;56955;56956;64352;64353;64354;64355;64356;64357 397;398;399;13315;13316;13317;13318;13662;13663;47079;47080;47081;71465;71466;71467;71468;71469;80883;80884;80885;80886;80887;80888 397;13315;13662;47080;71466;80886 Q32MZ4 Q32MZ4 4 4 4 Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1 LRRFIP1 sp|Q32MZ4|LRRF1_HUMAN Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRFIP1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 7.4 7.4 7.4 89.252 808 808 0 7.6737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0194 0.9775 17.276 12 5 Leave out requantified 1.0095 1.0194 0.9781 0.89588 0.9775 0.98763 38.021 25.917 19.769 3 5 4 1 3 1 Median Median Leave out requantified 5.1 7.4 7.4 124610000 61652000 62958000 31003000 16248000 14755000 48275000 22934000 25342000 45332000 22471000 22861000 1399 540;1841;4233;7625 True;True;True;True 557;1903;4343;7801 1807;1808;1809;6333;6334;6335;14682;14683;14684;26395;26396;26397 2322;2323;2324;8241;18637;18638;18639;18640;33211 2322;8241;18640;33211 Q32P28 Q32P28 8 8 8 Prolyl 3-hydroxylase 1 LEPRE1 sp|Q32P28|P3H1_HUMAN Prolyl 3-hydroxylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P3H1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 13.2 13.2 13.2 83.393 736 736 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258;35985;35986;35987;35988;35989;35990;50724;50725;50726;53357;53358;53359;53360;53361;66319;66320;66321;66322;66323;66324;66325;66326;66327 258;35990;50724;53358;66324 Q52LW3 Q52LW3 1 1 1 Rho GTPase-activating protein 29 ARHGAP29 sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN Rho GTPase-activating protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP29 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.06 1261 1261 0.00047916 2.6918 By MS/MS By matching By MS/MS 0.97425 0.96031 32.933 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 1 1 1 27959000 13477000 14482000 8475300 2971800 5503400 9064200 5430400 3633900 10420000 5074900 5344800 1411 3851 True 3956 13318;13319;13320 16933;16934;16935 16933 Q53EL6 Q53EL6 14 14 14 Programmed cell death protein 4 PDCD4 sp|Q53EL6|PDCD4_HUMAN Programmed cell death protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD4 PE=1 SV=2 1 14 14 14 12 13 12 12 13 12 12 13 12 37.7 37.7 37.7 51.735 469 469 0 189.3 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1668 1.0514 10.109 54 12 Leave out 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19556;21214;30307;54522;55372;55781;66626 Q53H96 Q53H96 2 2 2 Pyrroline-5-carboxylate reductase 3 PYCRL sp|Q53H96|P5CR3_HUMAN Pyrroline-5-carboxylate reductase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYCR3 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 8.8 8.8 8.8 28.663 274 274 0 4.1085 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1154 1.0013 40.208 4 2 Median 1.1154 NaN NaN 1.0013 NaN NaN 39.576 NaN NaN 2 1 1 1 0 1 Median Median Median 8.8 4.7 4 36887000 17280000 19608000 20423000 9702500 10721000 9168100 4154800 5013300 7295900 3422300 3873600 1415 152;7477 True;True 156;7651 480;481;25902;25903 638;639;640;32601;32602 638;32602 Q53LP3 Q53LP3 2 2 2 Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC SOWAHC sp|Q53LP3|SWAHC_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOWAHC PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 5.5 5.5 5.5 55.671 525 525 0 2.9726 By MS/MS By MS/MS By matching 1.0005 0.93192 28.571 5 0 Leave out requantified 1.1839 0.94769 NaN 1.0446 0.89571 NaN 33.505 34.175 NaN 2 2 1 0 0 0 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90-beta 4 HSP90AB4P sp|Q58FF6|H90B4_HUMAN Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AB4P PE=5 SV=1 1 7 1 1 7 6 6 1 1 1 1 1 1 10.1 2.2 2.2 58.264 505 505 0 17.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0866 0.96074 12.693 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 10.1 9.7 9.7 523390000 257070000 266320000 206520000 103750000 102770000 139200000 74685000 64511000 177670000 78639000 99034000 1419 3470;3660;3661;8427;14851;17412;18653 False;False;False;False;True;False;False 3570;3761;3762;8619;15197;17809;19070 12036;12037;12038;12654;12655;12656;12657;12658;12659;12660;12661;12662;29161;29162;51225;51226;51227;59871;59872;59873;59874;59875;59876;59877;59878;59879;59880;59881;59882;59883;59884;59885;59886;59887;59888;59889;59890;63926;63927;63928 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Q5T4S7 39 39 39 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 UBR4 sp|Q5T4S7|UBR4_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBR4 PE=1 SV=1 1 39 39 39 32 28 20 32 28 20 32 28 20 11.5 11.5 11.5 573.83 5183 5183 0 242.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0595 0.98048 22.831 77 25 Leave out requantified 1.0987 1.0529 1.0998 1.0102 0.99338 1.0568 23.058 26.406 32.165 31 27 19 10 7 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.6 8.3 5.9 1739300000 825890000 913370000 748680000 351010000 397670000 596040000 294570000 301470000 394540000 180310000 214230000 1441 346;1341;1484;1690;1708;1776;2851;3887;4055;4117;4166;4477;6265;7095;7170;7287;8596;10705;10950;10992;11962;12057;12063;12711;12911;13801;14670;14937;15033;16178;16230;16504;16506;16536;16579;16631;17530;17837;17965 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20733;53349;56332 Q6AI08 Q6AI08 1 1 1 HEAT repeat-containing protein 6 HEATR6 sp|Q6AI08|HEAT6_HUMAN HEAT repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR6 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.2 2.2 2.2 128.78 1181 1181 0.0035556 1.9537 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.2 0 0 25708000 16443000 9265100 25708000 16443000 9265100 0 0 0 0 0 0 1471 9036 True 9244 31453 39604;39605 39605 Q96DC8;Q6BEB4 Q96DC8;Q6BEB4 1;1 1;1 1;1 Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial;Transcription factor Sp5 ECHDC3;SP5 sp|Q96DC8|ECHD3_HUMAN Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECHDC3 PE=1 SV=2;sp|Q6BEB4|SP5_HUMAN Transcription factor Sp5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SP5 PE=2 SV=1 2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.3 2.3 2.3 32.633 303 303;398 0.0060764 1.7401 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.3 0 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NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.3 6.3 6.3 69541000 37396000 32145000 25896000 12929000 12967000 20584000 11612000 8972300 23060000 12855000 10205000 1474 16024 True 16400 55193;55194;55195 69246;69247;69248 69246 Q6FI81 Q6FI81 8 8 8 Anamorsin CIAPIN1 sp|Q6FI81|CPIN1_HUMAN Anamorsin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAPIN1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 8 7 7 8 7 7 8 7 36.5 36.5 36.5 33.582 312 312 0 38.98 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0911 0.97946 6.0213 31 9 Leave out requantified 1.1845 1.0782 0.94681 1.0821 0.96427 0.90854 10.072 11.716 15.187 9 12 10 2 5 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33 36.5 32.7 1243000000 607240000 635720000 471520000 223410000 248110000 306630000 154170000 152460000 464810000 229660000 235150000 1475 3736;4183;4371;6462;12203;14144;15270;17683 True;True;True;True;True;True;True;True 3839;4293;4489;6613;12487;14476;15629;18084 12941;12942;12943;12944;12945;14516;14517;14518;14519;14520;15137;15138;21930;21931;21932;21933;21934;21935;42191;42192;42193;42194;48903;48904;48905;52609;52610;52611;52612;52613;60842;60843 16469;16470;16471;16472;16473;18430;18431;18432;18433;18434;18435;18436;18437;19245;19246;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;52840;52841;52842;52843;52844;61170;61171;61172;65886;65887;65888;65889;65890;65891;76544;76545 16470;18435;19245;27736;52840;61170;65891;76545 Q6IA86 Q6IA86 6 6 6 Elongator complex protein 2 ELP2 sp|Q6IA86|ELP2_HUMAN Elongator complex protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP2 PE=1 SV=2 1 6 6 6 3 3 4 3 3 4 3 3 4 11.4 11.4 11.4 92.499 826 826 0 17.249 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92843 0.86413 47.011 7 2 Leave out requantified NaN 0.70512 1.2943 NaN 0.66531 1.2374 NaN 61.098 22.342 1 3 3 0 0 2 Median Leave out requantified Plateau 7 4.7 4.2 107720000 53716000 54006000 29592000 14974000 14617000 35668000 16349000 19319000 42462000 22392000 20070000 1476 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5698;12321;15908;15909;15910;15911;15912;15913;24938;24939;24940;24941;24942;24943;24944;25365;25366;25367;25368;31325;31326;33995;33996;33997;33998;33999;36579;36580;36581;54244;54245;54246;62688;62689 7402;15673;20231;20232;20233;20234;20235;31409;31410;31411;31412;31413;31414;31415;31997;31998;31999;32000;32001;39454;39455;42808;42809;42810;42811;42812;45939;45940;45941;45942;45943;45944;68038;68039;68040;78839;78840 7402;15673;20232;20235;31410;31997;39454;42808;42810;45940;68040;78840 Q6IN85 Q6IN85 3 3 3 Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A SMEK1 sp|Q6IN85|P4R3A_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3A PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3.8 3.8 3.8 95.367 833 833 0 6.9206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95829 0.9333 4.2272 9 1 Leave out requantified 1.0147 1.146 0.99116 0.92577 1.0786 0.99748 15.378 30.291 4.0342 3 3 3 1 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 3.8 3.8 3.8 140900000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1491 1.0921 17.024 6 2 Median 1.1021 1.1186 1.2214 0.98327 1.0942 1.1838 23.747 11.219 20.302 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 4.1 4.1 4.1 203890000 101840000 102050000 69098000 36974000 32124000 70831000 32656000 38175000 63966000 32214000 31752000 1480 18534 True 18946 63526;63527;63528;63529;63530;63531 79836;79837;79838;79839;79840;79841;79842;79843 79842 Q6NZI2 Q6NZI2 5 5 5 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 21.5 21.5 21.5 43.476 390 390 0 40.188 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0692 0.95273 29.643 16 5 Leave out requantified 1.0541 1.0692 1.1045 0.89834 0.95273 1.1012 21.207 38.468 44.585 6 5 5 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 21.5 16.9 16.9 365940000 177310000 188630000 175600000 87950000 87647000 97552000 44528000 53024000 92791000 44834000 47957000 1481 1513;7946;9122;12930;17810 True;True;True;True;True 1561;8127;9331;13236;18212 5183;5184;5185;27507;31801;31802;31803;31804;31805;31806;44781;44782;44783;61241;61242;61243 6707;6708;6709;34628;40041;40042;40043;40044;55974;55975;55976;55977;77065;77066;77067 6708;34628;40044;55975;77066 Q6P158 Q6P158 1 1 1 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 DHX57 sp|Q6P158|DHX57_HUMAN Putative ATP-dependent RNA helicase DHX57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX57 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.9 0.9 0.9 155.6 1386 1386 0.0097128 1.5797 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 0.9 2887300 2887300 0 0 0 0 0 0 0 2887300 2887300 0 1482 2747 True 2824 9504 12089 12089 Q6P1J9 Q6P1J9 6 6 6 Parafibromin CDC73 sp|Q6P1J9|CDC73_HUMAN Parafibromin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC73 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 6 4 5 6 4 5 6 4 11.1 11.1 11.1 60.576 531 531 0 11.696 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0909 1.0004 17.616 11 2 Leave out requantified 1.0938 1.171 0.88857 0.9801 1.0871 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Q6P1N0 Q6P1N0 3 3 3 Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A CC2D1A sp|Q6P1N0|C2D1A_HUMAN Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CC2D1A PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 5 5 5 104.06 951 951 0 5.6877 By MS/MS 0.87598 0.85112 38.125 3 2 Median NaN NaN 0.87598 NaN NaN 0.85112 NaN NaN 38.125 0 0 3 0 0 2 Median Median Median 0 0 5 31309000 20018000 11291000 0 0 0 0 0 0 31309000 20018000 11291000 1485 6544;14408;18467 True;True;True 6699;14745;18879 22202;49757;63321 28084;28085;62240;79589 28084;62240;79589 Q6P1Q9;Q96IZ6 Q6P1Q9;Q96IZ6 2;1 2;1 2;1 Methyltransferase-like protein 2B;Methyltransferase-like protein 2A METTL2B;METTL2A sp|Q6P1Q9|MET2B_HUMAN Methyltransferase-like protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL2B PE=1 SV=3;sp|Q96IZ6|MET2A_HUMAN Methyltransferase-like protein 2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL2A PE=1 SV=5 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 6.9 6.9 6.9 43.426 378 378;378 0 6.2504 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2265 1.1203 17.963 3 0 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32 33 27 22 22 22 273.6 2335 2335 0 173.03 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0882 1.0153 31.249 102 41 Leave out requantified 1.1428 1.0296 1.1541 1.0237 0.97744 1.1004 24.986 29.632 18.857 35 36 31 18 13 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17 18.5 15.4 3125800000 1440800000 1685000000 1200800000 535210000 665600000 976280000 474390000 501890000 948690000 431220000 517460000 1488 167;861;1007;1416;1634;1913;2675;3134;3412;3523;4065;4427;4703;5066;6264;6490;6849;6991;7645;8240;9985;10332;10591;10881;11580;12518;13592;14903;15116;15582;15726;15753;16018;16317;16539;18646;18776;18884;19107 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 171;890;1041;1461;1687;1976;2752;3222;3510;3623;4175;4545;4829;5195;6414;6642;7008;7155;7822;8427;10206;10558;10821;11117;11824;12807;13913;15250;15472;15946;16093;16121;16394;16705;16927;19063;19195;19304;19533 536;537;538;3000;3001;3002;3477;3478;4826;4827;4828;5595;5596;5597;6560;9264;10861;10862;10863;10864;11820;11821;11822;11823;11824;11825;12216;14153;14154;15323;15324;15325;16250;16251;17391;17392;17393;17394;17395;21311;21312;21313;22031;22032;22033;23203;23204;23205;23767;23768;23769;26474;28490;34843;34844;34845;36001;36002;36003;36917;36918;36919;37841;37842;40030;40031;40032;40033;40034;40035;43337;47017;47018;47019;51388;51389;52152;52153;53594;53595;53596;54097;54098;54195;54196;54197;55171;55172;56185;56186;56897;56898;56899;63910;63911;63912;64391;64392;64393;64394;64395;64396;64761;64762;64763;65491 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sp|Q6P3X3|TTC27_HUMAN Tetratricopeptide repeat protein 27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC27 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 3.8 3.8 3.8 96.631 843 843 0 5.0288 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3225 1.2658 27.188 5 2 Median 1.7521 NaN 1.4876 1.5286 NaN 1.4314 40.849 NaN 32.415 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 3.8 2.6 3.8 64279000 23665000 40613000 27512000 8820400 18691000 12520000 5514900 7005300 24247000 9330100 14917000 1489 3617;12110 True;True 3718;12390 12513;12514;12515;41853;41854 15914;15915;15916;52403;52404 15914;52403 Q6P6C2 Q6P6C2 2 2 2 RNA demethylase ALKBH5 ALKBH5 sp|Q6P6C2|ALKB5_HUMAN RNA demethylase ALKBH5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALKBH5 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 13.5 13.5 13.5 44.255 394 394 0 11.119 By MS/MS By MS/MS 1.0481 0.97763 2.2687 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 7.4 0 6.1 39056000 17915000 21141000 18184000 7897000 10287000 0 0 0 20872000 10018000 10854000 1490 3229;6763 True;True 3321;6921 11176;22895 14154;28953 14154;28953 Q6P996;Q6P474 Q6P996 12;2 12;2 12;2 Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1 PDXDC1 sp|Q6P996|PDXD1_HUMAN Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDXDC1 PE=1 SV=2 2 12 12 12 9 7 6 9 7 6 9 7 6 22.1 22.1 22.1 86.706 788 788;469 0 34.962 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83423 0.80112 19.227 26 15 Leave out requantified 1.0569 0.83423 0.69583 0.96956 0.80112 0.67219 79.885 33.384 2.9721 10 8 8 8 2 5 Median Leave out requantified Leave out requantified 13.3 15.5 9.3 640200000 339450000 300750000 274110000 135120000 138990000 215830000 118810000 97014000 150260000 85514000 64750000 1491 1688;5041;6235;6675;6917;7041;8939;9146;10269;10836;11269;15836 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1742;5170;6385;6832;7081;7206;9145;9355;10495;11072;11510;16207 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1839;4861;11854;16721;18338 6100;6101;6102;16342;40123;56238;56239;56240;61647 7933;7934;7935;20779;50304;70577;70578;70579;77575 7934;20779;50304;70578;77575 Q6PGP7 Q6PGP7 7 7 7 Tetratricopeptide repeat protein 37 TTC37 sp|Q6PGP7|TTC37_HUMAN Tetratricopeptide repeat protein 37 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC37 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 2 6 5 2 6 5 2 6 4.9 4.9 4.9 175.48 1564 1564 0 9.3517 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0992 1.0127 24.855 12 3 Leave out requantified 1.1801 0.60485 0.95318 1.068 0.58192 0.9162 22.46 54.116 18.16 5 2 5 1 1 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 3.4 1.5 4.2 203040000 96118000 106930000 96554000 41496000 55059000 25682000 14398000 11284000 80807000 40225000 40583000 1493 905;3408;5022;10479;11196;14544;17897 True;True;True;True;True;True;True 935;3506;5151;10709;11437;14884;18302 3134;3135;11808;11809;11810;17261;36541;36542;38821;38822;38823;50184;61540 4041;15021;15022;15023;21916;45893;48662;48663;48664;48665;62798;77436 4041;15021;21916;45893;48662;62798;77436 Q6PI48 Q6PI48 4 4 4 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial DARS2 sp|Q6PI48|SYDM_HUMAN Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DARS2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 7.1 7.1 7.1 73.562 645 645 0 5.4399 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1439 1.1135 28.619 5 2 Median 1.2017 NaN 1.1843 1.1108 NaN 1.1583 54.184 NaN 5.5779 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 6 4 6 128070000 57602000 70464000 47278000 18309000 28968000 27983000 13697000 14286000 52806000 25596000 27210000 1494 650;3110;3576;12767 True;True;True;True 673;3198;3676;13069 2249;2250;10788;12389;12390;44199;44200;44201 2896;2897;13702;15759;15760;15761;55271;55272;55273 2896;13702;15759;55272 Q6PID6 Q6PID6 2 2 2 Tetratricopeptide repeat protein 33 TTC33 sp|Q6PID6|TTC33_HUMAN Tetratricopeptide repeat protein 33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC33 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 9.2 9.2 9.2 29.411 262 262 0 6.7595 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1111 1.051 61.052 4 3 Median 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2254;7238;10962;17297;37857;42621;56654;56662;66938;72988 274 927 Q6UB35 Q6UB35 16 16 16 Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial MTHFD1L sp|Q6UB35|C1TM_HUMAN Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTHFD1L PE=1 SV=1 1 16 16 16 14 10 9 14 10 9 14 10 9 18.4 18.4 18.4 105.79 978 978 0 48.434 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0256 0.97823 43.052 32 16 Leave out requantified 0.88477 0.91165 1.0234 0.81094 0.87898 0.97326 22.765 19.366 53.256 15 9 8 11 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 13.5 11.1 702880000 335810000 367070000 362120000 166760000 195360000 180370000 95302000 85069000 160390000 73753000 86638000 1500 348;1643;2291;2442;3798;4740;5845;8558;9045;10090;11099;13561;15942;17695;17696;19065 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 357;1696;2362;2518;3902;4866;5987;8757;9253;10313;11340;13882;16317;18096;18097;19489 1178;5627;5628;5629;7902;7903;7904;8444;8445;8446;13135;16353;16354;16355;19889;19890;19891;29628;31498;35230;35231;35232;38521;38522;38523;46919;46920;46921;54871;60876;60877;65340;65341;65342 1530;7309;7310;7311;10157;10158;10159;10825;10826;10827;16700;20793;20794;20795;25173;25174;25175;37248;39662;44328;44329;44330;48291;48292;48293;48294;58704;58705;68858;76588;76589;82142;82143;82144 1530;7310;10158;10825;16700;20794;25173;37248;39662;44330;48294;58704;68858;76588;76589;82144 Q6UWE0 Q6UWE0 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 LRSAM1 sp|Q6UWE0|LRSM1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRSAM1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.3 3.3 3.3 83.593 723 723 0 6.3935 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2643 1.202 7.2689 5 0 Leave out requantified NaN 1.0702 1.4272 NaN 0.99757 1.3594 NaN 1.1829 24.676 1 2 2 0 0 0 Median Median Median 3.3 3.3 3.3 78016000 31190000 46826000 14685000 5963300 8721400 35037000 14615000 20422000 28294000 10612000 17682000 1501 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NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.6 8.9 8.9 102310000 56830000 45483000 7839600 0 7839600 38668000 22298000 16370000 55805000 34532000 21274000 1503 18217;18883 True;True 18625;19303 62542;62543;64758;64759;64760 78669;78670;81385;81386;81387 78669;81385 Q6VY07 Q6VY07 3 3 3 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 PACS1 sp|Q6VY07|PACS1_HUMAN Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACS1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 0 1 3 0 1 3 0 3.8 3.8 3.8 104.9 963 963 0 6.2876 By MS/MS By MS/MS 0.61926 0.59612 54.712 5 4 Median NaN 0.78164 NaN NaN 0.72964 NaN NaN 59.135 NaN 1 4 0 1 3 0 Median Median Median 1.3 3.8 0 40614000 23239000 17374000 6080600 4470600 1610000 34533000 18769000 15764000 0 0 0 1504 5266;8724;15172 True;True;True 5397;8926;15529 17995;17996;17997;30203;52315 22804;22805;22806;37990;65527 22806;37990;65527 Q6WCQ1 Q6WCQ1 8 8 8 Myosin phosphatase Rho-interacting protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 8 8 8 6 7 5 6 7 5 6 7 5 12.3 12.3 12.3 116.53 1025 1025 0 43.452 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0497 1.0088 16.642 20 12 Leave out requantified 1.0489 0.94051 0.92035 0.89688 0.92001 0.87134 15.891 16.717 27.573 7 7 6 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 9.9 11.3 7.8 482590000 239330000 243260000 192570000 95588000 96983000 138650000 66690000 71963000 151360000 77048000 74314000 1505 3377;4346;7436;9372;10447;13855;15135;16944 True;True;True;True;True;True;True;True 3474;4464;7609;9585;10676;14179;15491;17336 11687;15054;15055;15056;25702;25703;25704;25705;32756;32757;36430;36431;36432;47841;47842;47843;47844;47845;52212;58239;58240;58241 14855;19130;19131;19132;32392;32393;32394;32395;41236;45760;45761;45762;59876;59877;59878;59879;59880;59881;65396;73203;73204;73205;73206;73207;73208 14855;19130;32392;41236;45761;59880;65396;73204 Q6WKZ4 Q6WKZ4 1 1 1 Rab11 family-interacting protein 1 RAB11FIP1 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Leave out requantified 2.9 7.6 11.3 140330000 75335000 64995000 31271000 16028000 15242000 31791000 14016000 17776000 77268000 45291000 31977000 1516 999;4828;6285;18478 True;True;True;True 1031;4954;6435;18890 3440;3441;3442;16624;21390;21391;63348 4449;4450;4451;4452;4453;21121;27052;79622 4450;21121;27052;79622 Q71RC2 Q71RC2 2 2 2 La-related protein 4 LARP4 sp|Q71RC2|LARP4_HUMAN La-related protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LARP4 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 4.7 4.7 4.7 80.595 724 724 0.0022462 2.0479 By MS/MS By MS/MS 1.0313 0.96095 35.014 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 3 0 1.7 23947000 9945600 14001000 8250200 2719300 5530900 0 0 0 15696000 7226300 8470100 1517 3844;15228 True;True 3949;15586 13303;52482 16915;65732 16915;65732 Q71UM5 Q71UM5 4 2 2 40S ribosomal protein S27-like RPS27L sp|Q71UM5|RS27L_HUMAN 40S ribosomal protein S27-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27L PE=1 SV=3 1 4 2 2 4 4 4 2 2 2 2 2 2 40.5 15.5 15.5 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protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SND1 PE=1 SV=1 1 41 41 41 36 35 36 36 35 36 36 35 36 52.7 52.7 52.7 102 910 910 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0232 0.97092 15.329 140 39 Leave out requantified 1.0746 1.0175 1.029 0.95248 0.97242 0.99025 18.34 15.917 16.601 47 46 47 9 15 15 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.7 48.4 49.1 14282000000 6902800000 7379300000 5272900000 2596100000 2676700000 3810700000 1833500000 1977300000 5198500000 2473200000 2725300000 1520 211;2512;3031;3032;3033;3222;3223;3257;3671;4660;4688;4738;4844;5609;5902;6325;7100;9392;10140;10887;11198;12081;12220;13139;13266;13907;14206;14313;14879;15238;15661;16004;16826;17456;17704;17705;17823;17900;18348;18349;19023 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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retardation-interacting protein 2 NUFIP2 sp|Q7Z417|NUFP2_HUMAN Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUFIP2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 1 1 4 1 1 4 1 1 7.6 7.6 7.6 76.12 695 695 0 11.061 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98663 0.91464 29.827 5 5 Median 1.2058 NaN NaN 1.0666 NaN NaN 15 NaN NaN 3 1 1 3 1 1 Median Median Median 7.6 1.9 1.9 47243000 23549000 23694000 26997000 11168000 15829000 8532900 4337000 4195900 11713000 8043300 3669800 1539 5735;5828;8265;12549 True;True;True;True 5876;5970;8455;12840 19499;19832;28589;43445;43446;43447 24687;25106;35935;54322;54323;54324 24687;25106;35935;54323 Q7Z460 Q7Z460 9 9 7 CLIP-associating protein 1 CLASP1 sp|Q7Z460|CLAP1_HUMAN CLIP-associating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLASP1 PE=1 SV=1 1 9 9 7 6 6 6 6 6 6 5 4 4 9.8 9.8 7.9 169.45 1538 1538 0 33.676 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1722 1.0972 41.051 18 4 Leave out requantified 1.1062 1.1192 1.1802 0.96494 1.0586 1.1766 45.487 28.256 64.268 6 6 6 1 0 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MS/MS By MS/MS 1.034 0.99176 28.076 5 2 Median NaN 0.69427 NaN NaN 0.65861 NaN NaN 29.031 NaN 1 3 1 0 2 0 Median Median Median 1.6 3.5 1.6 114570000 62803000 51767000 17947000 7595500 10352000 82404000 49346000 33058000 14219000 5862000 8356500 1543 549;10124 True;True 566;10348 1830;1831;1832;35336;35337 2344;2345;2346;44447;44448 2344;44448 Q7Z4S6;O75037;Q2M1P5;Q86VH2 Q7Z4S6;O75037 6;3;1;1 6;3;1;1 6;3;1;1 Kinesin-like protein KIF21A;Kinesin-like protein KIF21B KIF21A;KIF21B sp|Q7Z4S6|KI21A_HUMAN Kinesin-like protein KIF21A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF21A PE=1 SV=2;sp|O75037|KI21B_HUMAN Kinesin-like protein KIF21B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF21B PE=1 SV=2 4 6 6 6 5 4 6 5 4 6 5 4 6 5.3 5.3 5.3 187.18 1674 1674;1637;1343;1401 0 19.336 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.213 1.1501 34.256 16 3 Leave out requantified 1.3876 1.0994 1.1778 1.2486 1.0082 1.1628 38.088 15.619 28.555 5 4 7 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.6 2.9 5.3 216340000 104350000 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requantified 14.5 15.5 13.6 6125400000 2926000000 3199500000 2380400000 1092200000 1288100000 1988200000 991340000 996900000 1756800000 842400000 914430000 1549 101;391;591;645;827;1278;4538;4870;5304;5433;5619;6434;6466;6510;6511;6703;7005;7021;7441;7533;8047;8835;9960;10135;10575;10722;10760;11054;11379;12088;12437;13623;13624;13706;13833;14084;14141;14230;14662;14880;14981;15210;15219;15328;15691;16379;16407;16600;16692;16974;17561;17564;17686;17910;18037;18071 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1738 1.0881 32.46 5 3 Median 1.1331 1.6684 NaN 1.0371 1.6227 NaN 6.7975 43.578 NaN 2 2 1 1 1 1 Median Median Median 8.8 11.6 5.9 150000000 84382000 65616000 64938000 35559000 29379000 59472000 33166000 26305000 25588000 15656000 9932000 1554 1364;9401;14298 True;True;True 1409;9614;14632 4675;4676;32859;49404;49405;49406 6031;41356;61791;61792;61793 6031;41356;61792 Q86U90 Q86U90 2 2 2 YrdC domain-containing protein, mitochondrial YRDC sp|Q86U90|YRDC_HUMAN YrdC domain-containing protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YRDC PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 11.8 11.8 11.8 29.328 279 279 0 3.4904 By MS/MS By MS/MS By matching 1.5097 1.3708 25.527 4 1 Median 1.5544 NaN NaN 1.4188 NaN NaN 21.777 NaN NaN 2 1 1 0 1 0 Median Median Median 11.8 4.7 7.2 53285000 21493000 31791000 33064000 10838000 22226000 7537100 3234800 4302300 12683000 7420500 5262900 1555 5086;10137 True;True 5215;10362 17465;17466;35375;35376 22189;44503;44504 22189;44503 Q86UE4 Q86UE4 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VPS36 sp|Q86VN1|VPS36_HUMAN Vacuolar protein-sorting-associated protein 36 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS36 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 6 6 6 43.816 386 386 0 11.465 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0799 1.0418 16.28 5 3 Median 1.4635 NaN 1.0748 1.3037 NaN 1.0304 16.211 NaN 1.562 2 1 2 1 1 1 Median Median Median 6 2.6 6 87658000 37567000 50091000 39535000 15152000 24383000 16418000 7997600 8420300 31706000 14417000 17289000 1561 6722;13331 True;True 6879;13645 22768;22769;22770;46154;46155 28781;28782;28783;57680;57681 28781;57680 Q86VP6;O75155 Q86VP6 45;5 45;5 45;5 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 CAND1 sp|Q86VP6|CAND1_HUMAN Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAND1 PE=1 SV=2 2 45 45 45 43 41 38 43 41 38 43 41 38 38 38 38 136.37 1230 1230;1236 0 293.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0625 0.98446 42.741 172 47 Leave out requantified 1.1199 0.93777 1.0797 0.99288 0.89986 1.0276 38.373 27.021 24.229 58 57 57 12 19 16 Leave out 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MS/MS By MS/MS 0.98062 0.90993 4.3855 6 2 Leave out requantified 1.249 0.80748 NaN 1.1407 0.7587 NaN 15.032 16.169 NaN 2 3 1 0 1 1 Median Median Median 6.6 9.6 3.4 69067000 29553000 39514000 27865000 11907000 15959000 29722000 13641000 16081000 11480000 4005200 7474400 1568 13398;13701;15105 True;True;True 13713;14025;15461 46366;46367;46368;47365;47366;52121 57957;57958;57959;57960;59245;59246;59247;65271 57960;59246;65271 Q86WR0 Q86WR0 1 1 1 Coiled-coil domain-containing protein 25 CCDC25 sp|Q86WR0|CCD25_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC25 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 5.3 5.3 5.3 24.479 208 208 0.00045662 2.2251 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 5.3 0 0 24427000 11083000 13344000 24427000 11083000 13344000 0 0 0 0 0 0 1569 4734 True 4860 16341 20778 20778 Q86X55 Q86X55 9 9 9 Histone-arginine methyltransferase CARM1 CARM1 sp|Q86X55|CARM1_HUMAN Histone-arginine methyltransferase CARM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CARM1 PE=1 SV=3 1 9 9 9 8 8 7 8 8 7 8 8 7 19.2 19.2 19.2 65.853 608 608 0 24.969 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2552 1.1078 19.211 25 10 Leave out requantified 1.2922 1.0871 1.2176 1.1213 1.0398 1.1686 21.852 14.796 17.713 8 9 8 2 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 17.6 11.2 725490000 320130000 405360000 291760000 120810000 170950000 214200000 97309000 116890000 219530000 102010000 117520000 1570 709;1932;5728;10745;11882;13716;15261;18850;19037 True;True;True;True;True;True;True;True;True 735;1995;5869;10976;12145;14040;15620;19269;19461 2450;2451;2452;6661;6662;19477;19478;19479;37416;37417;37418;41082;41083;41084;41085;41086;41087;47421;52585;52586;52587;64646;64647;64648;65259;65260;65261 3130;8628;8629;8630;24659;24660;24661;46956;46957;46958;51443;51444;51445;51446;51447;51448;59324;65854;65855;81253;81254;81255;82021;82022;82023 3130;8629;24660;46956;51446;59324;65855;81253;82021 Q86XI2 Q86XI2 2 2 2 Condensin-2 complex subunit G2 NCAPG2 sp|Q86XI2|CNDG2_HUMAN Condensin-2 complex subunit G2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCAPG2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1.7 1.7 1.7 130.96 1143 1143 0.00047348 2.5846 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0672 1.005 13.382 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 0.9 1.7 0.9 61864000 20415000 41449000 20790000 6321200 14469000 25312000 6007300 19304000 15762000 8086500 7675900 1571 7598;9890 True;True 7774;10111 26313;26314;34541;34542 33113;33114;43482;43483 33113;43483 Q86XP3 Q86XP3 15 15 15 ATP-dependent RNA helicase DDX42 DDX42 sp|Q86XP3|DDX42_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX42 PE=1 SV=1 1 15 15 15 11 13 11 11 13 11 11 13 11 18.8 18.8 18.8 102.97 938 938 0 54.871 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.204 1.1258 16.456 40 14 Leave out requantified 1.2378 1.0546 1.1649 1.1259 0.98063 1.1186 25.253 24.508 25.537 13 14 13 3 5 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.2 15.7 14.1 1402600000 715090000 687490000 514190000 249950000 264250000 461860000 241200000 220660000 426520000 223950000 202570000 1572 2475;2507;2809;2986;4003;4004;4044;4463;6239;6334;7931;12310;12454;16676;18115 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2552;2584;2889;3071;4112;4113;4154;4582;4583;6389;6485;8112;12595;12742;17067;18521 8572;8573;8663;8664;9755;9756;9757;10351;10352;10353;13925;13926;13927;13928;13929;13930;14072;15434;15435;15436;15437;15438;21213;21214;21215;21569;27461;27462;27463;42552;43093;43094;43095;43096;43097;43098;43099;43100;57349;57350;57351;62214 10980;10981;11088;11089;12423;13149;13150;17730;17731;17732;17733;17734;17895;19643;19644;19645;26831;27267;27268;34572;34573;34574;53262;53908;53909;53910;53911;53912;53913;53914;53915;53916;53917;53918;71977;71978;71979;71980;78267 10980;11089;12423;13149;17730;17734;17895;19645;26831;27268;34572;53262;53910;71978;78267 392 671 Q86Y56 Q86Y56 3 3 3 Dynein assembly factor 5, axonemal DNAAF5 sp|Q86Y56|DAAF5_HUMAN Dynein assembly factor 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAAF5 PE=1 SV=4 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.7 3.7 3.7 93.52 855 855 0 6.4445 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1092 1.046 13.585 6 1 Leave out requantified 1.3219 1.0445 1.1233 1.1583 0.97886 1.1076 0.84134 25.099 0.78939 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 2.5 2.3 2.3 87144000 38898000 48246000 28465000 11634000 16831000 25972000 11869000 14103000 32707000 15395000 17312000 1573 196;729;9913 True;True;True 200;756;10134 633;2522;2523;34609;34610;34611 831;3225;43569;43570 831;3225;43570 Q86YP4 Q86YP4 2 1 1 Transcriptional repressor p66-alpha GATAD2A sp|Q86YP4|P66A_HUMAN Transcriptional repressor p66-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD2A PE=1 SV=1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 3.6 1.9 1.9 68.062 633 633 0 3.222 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3089 1.2515 18.559 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 3.6 3.6 35963000 17404000 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234;13684;13685;13686;14884;14885;14886;34543;34544;34545;39062;48113;48114;48722;51390;53102;54621;55566 325;17432;17433;17434;17435;17436;17437;18916;18917;18918;18919;43484;43485;43486;48955;60213;60214;60957;64304;66530;68533;69729 325;17432;18916;43484;48955;60213;60957;64304;66530;68533;69729 Q8IUR0 Q8IUR0 1 1 1 Trafficking protein particle complex subunit 5 TRAPPC5 sp|Q8IUR0|TPPC5_HUMAN Trafficking protein particle complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 6.9 6.9 6.9 20.783 188 188 0.00045893 2.2976 By MS/MS By MS/MS 1.9291 1.8628 78.767 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 1 Median Median Median 6.9 0 6.9 29138000 8588100 20550000 24367000 7454200 16912000 0 0 0 4771500 1133900 3637500 1579 3258 True 3350 11276;11277 14292;14293 14292 Q8IV38 Q8IV38 1 1 1 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 ANKMY2 sp|Q8IV38|ANKY2_HUMAN Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 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8 8 Protein NOXP20 FAM114A1 sp|Q8IWE2|NXP20_HUMAN Protein NOXP20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM114A1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 8 6 5 8 6 5 8 6 22.2 22.2 22.2 60.741 563 563 0 90.054 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0698 1.0146 3.7118 20 6 Leave out requantified 1.1334 0.93305 1.0698 1.0272 0.88809 1.0593 1.3658 5.2017 5.8451 5 7 8 0 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.5 22.2 17.6 838430000 403410000 435010000 322670000 136270000 186400000 276840000 146400000 130430000 238920000 120740000 118180000 1585 4042;5583;6494;15465;16296;16727;16850;17983 True;True;True;True;True;True;True;True 4152;5720;6647;15824;16684;17119;17242;18388 14068;14069;14070;18977;18978;22047;22048;22049;53193;53194;53195;53196;56120;56121;56122;57522;57923;57924;57925;57926;57927;57928;57929;61827 17888;17889;17890;17891;17892;17893;24037;24038;27883;27884;27885;27886;27887;66650;66651;66652;66653;70427;70428;70429;72208;72781;72782;72783;72784;72785;72786;72787;72788;72789;72790;77793 17889;24037;27884;66650;70428;72208;72781;77793 Q8IWJ2 Q8IWJ2 1 1 1 GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2 GCC2 sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GCC2 PE=1 SV=4 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.6 0.6 0.6 195.91 1684 1684 0.0085361 1.6451 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 0.6 43916000 10267000 33649000 0 0 0 0 0 0 43916000 10267000 33649000 1586 2679 True 2756 9277 11813 11813 Q8IWS0 Q8IWS0 8 8 8 PHD finger protein 6 PHF6 sp|Q8IWS0|PHF6_HUMAN PHD finger protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF6 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 6 7 7 6 7 7 6 7 26.8 26.8 26.8 41.29 365 365 0 25.555 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97047 0.9333 9.5201 22 3 Leave out requantified 1.1066 0.98902 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Median Median Median 2.4 2.4 2.4 135760000 70010000 65746000 54422000 27053000 27369000 37286000 21192000 16094000 44048000 21764000 22283000 1592 1625 True 1678 5555;5556;5557 7197;7198;7199;7200 7197 Q8IY67 Q8IY67 8 8 8 Ribonucleoprotein PTB-binding 1 RAVER1 sp|Q8IY67|RAVR1_HUMAN Ribonucleoprotein PTB-binding 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAVER1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 8 5 7 8 5 7 8 5 21.1 21.1 21.1 63.876 606 606 0 51.997 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0152 0.93977 23.586 19 2 Leave out requantified 1.1579 0.95531 0.92067 1.0217 0.9003 0.86438 21.284 16.416 11.603 7 7 5 0 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.5 21.1 10.7 647710000 295940000 351770000 287290000 122240000 165050000 219810000 106180000 113630000 140610000 67512000 73093000 1593 1052;1204;5978;6421;14470;14471;14978;18595 True;True;True;True;True;True;True;True 1086;1245;6122;6572;14807;14808;15328;19010 3618;3619;3620;4142;20313;20314;21824;21825;21826;49916;49917;49918;49919;49920;49921;51663;51664;63718;63719;63720 4679;4680;4681;4682;4683;4684;5383;25701;25702;27605;27606;27607;27608;27609;62420;62421;62422;62423;62424;62425;62426;62427;64675;64676;80091;80092 4679;5383;25701;27606;62424;62425;64676;80092 Q8IY81 Q8IY81 5 5 5 pre-rRNA processing protein FTSJ3 FTSJ3 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA processing protein FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 3 3 2 3 3 2 3 3 9.7 9.7 9.7 96.557 847 847 0 12.096 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0464 1.0221 9.7021 6 2 Leave out requantified 1.3985 NaN 1.0964 1.2298 NaN 1.0393 8.9894 NaN 17.168 2 1 3 1 0 1 Median Median Plateau 5.4 6.5 5.8 120040000 56917000 63123000 49461000 20597000 28863000 11668000 5160600 6507200 58912000 31159000 27753000 1594 116;1404;2669;8098;11330 True;True;True;True;True 120;1449;2746;8282;11572 379;4790;4791;4792;9248;28043;39257;39258 534;6182;6183;11781;35305;49203;49204;49205 534;6183;11781;35305;49204 Q8IYB3 Q8IYB3 5 5 5 Serine/arginine repetitive matrix protein 1 SRRM1 sp|Q8IYB3|SRRM1_HUMAN Serine/arginine repetitive matrix protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRM1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 9.4 9.4 9.4 102.33 904 904 0 28.983 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0327 0.96638 9.7315 19 1 Leave out requantified 1.0571 1.0616 0.92615 0.95857 1.0361 0.88996 16.137 7.7402 14.635 6 7 6 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.6 9.4 5.6 787520000 363870000 423650000 258080000 112900000 145180000 285520000 133330000 152190000 243910000 117630000 126280000 1595 1573;4894;8869;17484;17911 True;True;True;True;True 1625;5020;9075;17882;18316 5387;16836;16837;16838;30796;30797;30798;30799;30800;30801;60146;60147;60148;60149;60150;60151;61586;61587;61588 6970;21392;38792;38793;38794;38795;38796;38797;38798;38799;38800;75648;75649;75650;75651;75652;75653;75654;75655;75656;75657;77505;77506;77507;77508 6970;21392;38794;75652;77506 Q8IYB5 Q8IYB5 2 2 2 Stromal membrane-associated protein 1 SMAP1 sp|Q8IYB5|SMAP1_HUMAN Stromal membrane-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMAP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 5.8 5.8 5.8 50.386 467 467 0.00046533 2.4443 By MS/MS By MS/MS 0.83679 0.79508 2.1301 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 3.2 5.8 18515000 9576100 8938600 0 0 0 8054700 4162300 3892400 10460000 5413800 5046200 1596 3901;10776 True;True 4008;11008 13522;13523;37511 17213;17214;47070 17214;47070 Q8IYI6 Q8IYI6 5 5 5 Exocyst complex component 8 EXOC8 sp|Q8IYI6|EXOC8_HUMAN Exocyst complex component 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC8 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 7.3 7.3 7.3 81.798 725 725 0 10.393 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1855 1.0166 41.238 10 3 Leave out requantified 1.1855 1.0518 0.91353 1.0166 0.99556 0.87412 42.622 44.279 25.904 4 3 3 1 1 1 Leave out requantified Median Median 7.3 5.1 5.1 174510000 82953000 91555000 78770000 37194000 41576000 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3 Median 1.4619 NaN 1.8038 1.2666 NaN 1.7451 97.422 NaN 2.9912 2 1 2 2 0 1 Median Median Median 4.8 4.8 4.8 85119000 28325000 56794000 25979000 10787000 15193000 29140000 8495900 20644000 30000000 9042100 20958000 1616 7031 True 7196 23923;23924;23925;23926;23927;23928 30262;30263;30264;30265;30266;30267 30262 Q8N6T3 Q8N6T3 2 2 2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 ARFGAP1 sp|Q8N6T3|ARFG1_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.4 8.4 8.4 44.667 406 406 0 7.197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90364 0.8661 9.0834 6 0 Leave out requantified 1.2041 0.92678 0.77517 1.1385 0.90526 0.76651 29.587 18.394 8.1911 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 8.4 8.4 8.4 145700000 72675000 73028000 55367000 25052000 30315000 41783000 17825000 23958000 48553000 29798000 18755000 1617 1405;7758 True;True 1450;7935 4793;4794;4795;26854;26855;26856 6184;6185;6186;6187;6188;6189;33801 6185;33801 Q8N7H5 Q8N7H5 4 4 4 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog PAF1 sp|Q8N7H5|PAF1_HUMAN RNA polymerase II-associated factor 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAF1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 9.8 9.8 9.8 59.975 531 531 0 11.239 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3341 1.2669 0.32067 12 8 Leave out requantified 1.0107 1.3458 1.9217 0.9558 1.2822 1.8723 24.475 14.602 38.004 4 4 4 3 2 3 Median Median Median 7.7 7.3 7.3 196430000 70896000 125530000 54186000 24585000 29600000 64884000 24817000 40067000 77360000 21494000 55866000 1618 610;3613;18177;18713 True;True;True;True 632;3714;18584;19131 2086;2087;2088;12506;62399;62400;62401;62402;64164;64165;64166;64167 2668;2669;2670;15908;78484;78485;78486;78487;80653;80654;80655;80656 2670;15908;78486;80656 Q8N8S7 Q8N8S7 7 7 7 Protein enabled homolog ENAH sp|Q8N8S7|ENAH_HUMAN Protein enabled homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENAH PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 5 7 5 5 7 5 5 7 17.1 17.1 17.1 66.509 591 591 0 50.2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1204 1.0755 19.467 20 1 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domain-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MLKL PE=1 SV=1 1 5 5 5 1 3 4 1 3 4 1 3 4 10.4 10.4 10.4 54.478 471 471 0 11.658 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7348 1.6851 124.18 7 7 Median NaN 0.93253 0.88844 NaN 0.87742 0.87065 NaN 219.44 103.5 1 2 4 1 2 4 Median Median Median 1.7 6.6 8.5 111420000 60089000 51331000 16774000 5023200 11750000 40853000 24955000 15898000 53794000 30111000 23683000 1622 5326;8887;13579;14080;17624 True;True;True;True;True 5458;9093;13900;14410;18025 18194;18195;18196;30861;46972;46973;48701;60650 23046;23047;23048;38877;58756;58757;60931;76296 23047;38877;58757;60931;76296 Q8NB37 Q8NB37 1 1 1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 PDDC1 sp|Q8NB37|GALD1_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 10.9 10.9 10.9 23.297 220 220 0.0081405 1.6584 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 10.9 0 0 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True;True;True;True;True;True;True 859;3685;7679;10179;16469;17381;17382 2906;2907;2908;12426;25976;25977;25978;34743;34744;34745;55457;55458;55459;58382;58383;58384;58385;58386;58387 3732;3733;3734;15808;32696;32697;32698;43716;43717;43718;69594;69595;69596;69597;73359;73360;73361;73362;73363;73364;73365 3733;15808;32698;43717;69595;73359;73364 Q8NBT2 Q8NBT2 3 3 3 Kinetochore protein Spc24 SPC24 sp|Q8NBT2|SPC24_HUMAN Kinetochore protein Spc24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPC24 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 29.9 29.9 29.9 22.478 197 197 0 15.781 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1478 1.065 13.773 9 5 Leave out requantified 1.221 1.1478 1.0637 1.1157 1.065 1.0137 66.098 5.781 39.467 4 3 2 3 1 1 Median Median Median 29.9 15.7 15.7 245500000 115060000 130440000 112600000 50826000 61772000 65236000 28593000 36643000 67664000 35642000 32022000 1628 4436;6200;10546 True;True;True 4554;6350;10776 15346;21093;21094;21095;21096;36747;36748;36749;36750 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168;2084;2697;2829;2830;2911;2912;3764;3923;4486;4824;5199;5457;5701;5847;6870;7200;7217;9019;9533;9756;9771;10698;11292;12675;12719;12990;14017;15227;15729;15806;15835;16686;16765;16864;18782;19030;19031 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Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog CHTF18 sp|Q8WVB6|CTF18_HUMAN Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHTF18 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 6.5 6.5 6.5 107.38 975 975 0 8.6384 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80751 0.75786 24.757 10 5 Leave out requantified 1.0639 1.2907 0.74479 0.94767 1.2356 0.72824 64.673 56.776 32.669 5 3 2 4 1 0 Median Median Median 6.5 5.6 3.5 79211000 35378000 43832000 35475000 13223000 22252000 26455000 12077000 14378000 17281000 10079000 7202200 1664 3788;5844;8948;12488 True;True;True;True 3892;5986;9154;12776 13107;19886;19887;19888;31073;31074;31075;43222;43223;43224 16665;25169;25170;25171;25172;39143;39144;39145;39146;39147;54056;54057;54058 16665;25171;39146;54057 Q8WVC0 Q8WVC0 1 1 1 RNA polymerase-associated protein LEO1 LEO1 sp|Q8WVC0|LEO1_HUMAN RNA polymerase-associated protein LEO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LEO1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.8 1.8 1.8 75.403 666 666 0.00047103 2.5388 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Probable tRNA pseudouridine synthase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRUB1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.4 3.4 3.4 37.252 349 349 0 3.2653 By MS/MS By MS/MS 1.0778 0.96837 7.9787 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 3.4 3.4 0 21794000 10412000 11383000 12908000 5561600 7346200 8886400 4850000 4036300 0 0 0 1672 7837 True 8014 27119;27120 34132;34133 34132 Q8WWI1 Q8WWI1 5 5 5 LIM domain only protein 7 LMO7 sp|Q8WWI1|LMO7_HUMAN LIM domain only protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LMO7 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 3.8 3.8 3.8 192.69 1683 1683 0 19.543 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2086 1.0956 18.575 15 1 Leave out requantified 1.2782 1.2019 1.0738 1.1106 1.1631 1.0458 37.003 14.579 20.507 5 5 5 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 3 1.9 2.7 224510000 101930000 122580000 90739000 39804000 50935000 59432000 29099000 30334000 74334000 33026000 41308000 1673 2063;10971;10972;14991;16531 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Q92665 Q92665 1 1 1 28S ribosomal protein S31, mitochondrial MRPS31 sp|Q92665|RT31_HUMAN 28S ribosomal protein S31, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS31 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.8 3.8 3.8 45.318 395 395 0.00045872 2.2857 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.9125 5.3387 3.0133 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 3.8 3.8 3.8 105500000 16024000 89471000 37263000 6675700 30587000 26495000 3038800 23457000 41737000 6309800 35427000 1704 14365 True 14700 49615;49616;49617 62064;62065;62066 62066 Q92667 Q92667 2 2 2 A-kinase anchor protein 1, mitochondrial AKAP1 sp|Q92667|AKAP1_HUMAN A-kinase anchor protein 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 4 4 4 97.34 903 903 0 3.9633 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85131 0.78942 31.816 5 2 Median 0.74235 NaN NaN 0.68212 NaN NaN 28.466 NaN NaN 3 1 1 2 0 0 Median Median Median 4 1.7 1.7 55963000 32307000 23656000 42132000 25053000 17079000 6918400 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nucleotide exchange factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF1 PE=1 SV=2 1 13 13 13 11 10 9 11 10 9 11 10 9 15.2 15.2 15.2 102.43 912 912 0 44.965 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1512 1.1272 28.443 35 24 Leave out requantified 1.2691 0.98703 1.2493 1.1262 0.93747 1.2045 32.645 21.742 18.193 12 13 10 8 9 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.9 13.7 11.2 848750000 393370000 455380000 312430000 145980000 166450000 259890000 131580000 128320000 276430000 115820000 160610000 1714 258;402;403;452;2810;4938;5657;7228;10636;13105;13676;13698;16251 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 263;413;414;468;2890;5064;5797;7394;10866;13412;14000;14022;16637 857;858;859;860;1348;1349;1350;1351;1541;1542;1543;9758;9759;9760;16990;16991;16992;16993;16994;16995;19234;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;24792;37061;37062;45320;45321;45322;47291;47292;47293;47358;55983;55984;55985 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out requantified Median Median 19.1 9.6 17.2 566550000 277810000 288740000 278080000 136630000 141460000 98305000 47729000 50576000 190160000 93449000 96709000 1735 2420;3622;4925;6382;11146;14467;16919 True;True;True;True;True;True;True 2495;3723;5051;6533;11387;14804;17311 8362;8363;8364;12535;12536;12537;16947;21719;38685;38686;49909;49910;49911;58146;58147;58148 10728;10729;10730;15936;15937;15938;21522;27478;48479;48480;48481;62413;62414;62415;73080;73081 10729;15937;21522;27478;48479;62413;73080 Q969U7 Q969U7 6 6 6 Proteasome assembly chaperone 2 PSMG2 sp|Q969U7|PSMG2_HUMAN Proteasome assembly chaperone 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG2 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 6 23.1 23.1 23.1 29.396 264 264 0 28.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1515 1.0802 18.075 16 3 Leave out requantified 1.2564 1.0979 1.1515 1.0806 1.0072 1.0802 24.845 12.71 14.715 5 5 6 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.7 19.7 23.1 707170000 331370000 375800000 278900000 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Q96BW1 1 1 1 Uracil phosphoribosyltransferase homolog UPRT sp|Q96BW1|UPP_HUMAN Uracil phosphoribosyltransferase homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UPRT PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.3 2.3 2.3 33.786 309 309 0.0056968 1.8288 By MS/MS By MS/MS 1.6924 1.5898 116.4 3 2 Median 1.3731 NaN NaN 1.1852 NaN NaN 162.85 NaN NaN 2 0 1 2 0 0 Median Median Median 2.3 0 2.3 88804000 39930000 48874000 55865000 23870000 31995000 0 0 0 32938000 16060000 16879000 1749 4187 True 4297 14528;14529;14530 18444;18445;18446;18447 18444 Q96C01 Q96C01 1 1 1 Protein FAM136A FAM136A sp|Q96C01|F136A_HUMAN Protein FAM136A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM136A PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 10.1 10.1 10.1 15.641 138 138 0.0057043 1.8359 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 10.1 0 0 4123600 2429800 1693800 4123600 2429800 1693800 0 0 0 0 0 0 1750 2016 True 2080 6979 9008 9008 Q96C19;Q9BUP0 Q96C19;Q9BUP0 4;2 4;2 4;2 EF-hand domain-containing 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MS/MS By MS/MS 1.6958 1.588 35.094 6 4 Median 1.6601 2.0576 1.5042 1.4728 1.9945 1.5003 8.4981 30.087 63.444 2 2 2 1 2 1 Median Median Median 7.2 7.2 7.2 120220000 48268000 71948000 46309000 17242000 29066000 32112000 12420000 19693000 41796000 18606000 23189000 1752 4185;11900 True;True 4295;12165 14522;14523;14524;41149;41150;41151 18439;18440;18441;51519;51520;51521 18440;51521 Q96C86 Q96C86 6 6 6 m7GpppX diphosphatase DCPS sp|Q96C86|DCPS_HUMAN m7GpppX diphosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCPS PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 6 25.8 25.8 25.8 38.608 337 337 0 47.224 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96518 0.89533 8.3656 14 3 Leave out requantified 1.0468 0.99734 0.82782 0.92121 0.97935 0.80554 4.2166 14.04 7.3617 5 3 6 2 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.2 20.2 25.8 849480000 435200000 414280000 311300000 155980000 155320000 178660000 91423000 87237000 359520000 187800000 171720000 1753 2777;4018;8636;12369;16616;17839 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domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ISOC1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 4.7 4.7 4.7 32.236 298 298 0 4.225 By MS/MS By MS/MS 0.98032 0.93203 1.0362 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 4.7 0 4.7 17330000 8050700 9279800 7108800 3307200 3801600 0 0 0 10222000 4743500 5478200 1755 8139 True 8323 28173;28174 35451;35452 35452 Q96CP2 Q96CP2 2 2 2 FLYWCH family member 2 FLYWCH2 sp|Q96CP2|FWCH2_HUMAN FLYWCH family member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLYWCH2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 9.3 9.3 9.3 14.563 140 140 0 5.1527 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2407 0.87741 24.24 4 3 Linear 0.93879 NaN NaN 0.87741 NaN NaN 0.39818 NaN NaN 2 1 1 2 1 0 Median Median Median 9.3 9.3 9.3 56434000 26829000 29605000 29235000 13712000 15523000 10066000 5314200 4751700 17133000 7803100 9329800 1756 656;657 True;True 679;680 2262;2263;2264;2265 2911;2912;2913;2914 2911;2912 Q96CT7 Q96CT7 5 5 5 Coiled-coil domain-containing protein 124 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NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.9 0 0 21512000 12720000 8792400 21512000 12720000 8792400 0 0 0 0 0 0 1758 307 True 313 994 1288 1288 Q96CW1 Q96CW1 9 9 9 AP-2 complex subunit mu AP2M1 sp|Q96CW1|AP2M1_HUMAN AP-2 complex subunit mu OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2M1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 7 8 9 7 8 9 7 8 9 22.1 22.1 22.1 49.654 435 435 0 23.512 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0796 1.0146 8.8289 22 2 Leave out requantified 1.3034 1.0848 1.0197 1.1555 1.0146 0.95016 11.94 11.818 10.429 6 8 8 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.2 20.5 22.1 926870000 438180000 488700000 306870000 134650000 172210000 287570000 141480000 146090000 332440000 162040000 170390000 1759 2461;10904;12178;13684;14523;15010;15547;15828;18397 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2538;11141;12460;14008;14863;15364;15910;16199;18807 8517;8518;8519;37908;37909;37910;42093;42094;42095;47312;47313;47314;47315;50116;51784;51785;51786;53473;53474;54436;54437;54438;63113;63114;63115 10906;10907;10908;10909;10910;10911;47565;47566;47567;47568;47569;52719;59175;59176;59177;59178;59179;59180;62724;64835;67005;67006;68289;79353;79354;79355;79356 10907;47565;52719;59177;62724;64835;67006;68289;79356 Q96CW5 Q96CW5 1 1 1 Gamma-tubulin complex component 3 TUBGCP3 sp|Q96CW5|GCP3_HUMAN Gamma-tubulin complex component 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.8 0.8 0.8 103.57 907 907 0.0077419 1.6736 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.765 0.71379 21.177 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 0.8 0.8 0.8 591260000 345330000 245940000 212110000 129400000 82712000 168360000 97894000 70462000 210800000 118030000 92762000 1760 984 True 1016 3391;3392;3393 4384;4385;4386 4386 Q96CX2;Q68DU8;Q6ZWB6 Q96CX2 15;1;1 15;1;1 15;1;1 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 KCTD12 sp|Q96CX2|KCD12_HUMAN BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KCTD12 PE=1 SV=1 3 15 15 15 13 15 14 13 15 14 13 15 14 44.3 44.3 44.3 35.7 325 325;428;473 0 100.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0657 0.96946 10.199 52 11 Leave out requantified 0.98465 1.084 1.0657 0.85979 1.0107 1.0084 6.1324 17.226 15.586 18 16 18 8 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.2 44.3 40.3 3930000000 1945200000 1984800000 1552000000 770110000 781860000 1019400000 502690000 516760000 1358600000 672410000 686200000 1761 2058;2751;3281;3282;4694;4695;5028;5378;10029;11784;14017;14581;15092;15093;18770 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2123;2828;3374;3375;4820;4821;5157;5511;10250;12036;14345;14923;15448;15449;19189 7123;9515;9516;9517;9518;9519;9520;9521;11351;11352;11353;11354;11355;11356;16218;16219;16220;16221;16222;16223;16224;16225;16226;17278;17279;17280;18360;18361;34976;34977;34978;34979;34980;34981;34982;40703;40704;40705;48464;48465;48466;50296;50297;50298;52064;52065;52066;52067;52068;52069;52070;52071;52072;64370;64371;64372 9198;12106;12107;12108;12109;12110;12111;12112;12113;12114;14393;14394;14395;14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402;20620;20621;20622;20623;20624;20625;20626;20627;21938;21939;21940;23258;23259;44014;44015;44016;44017;44018;44019;44020;44021;44022;51003;51004;51005;51006;60644;60645;60646;60647;60648;62941;62942;62943;62944;62945;65176;65177;65178;65179;65180;65181;65182;65183;65184;65185;65186;65187;65188;80901;80902;80903 9198;12109;14393;14400;20622;20627;21939;23258;44016;51005;60647;62945;65180;65188;80902 Q96D46 Q96D46 7 7 7 60S ribosomal export protein NMD3 NMD3 sp|Q96D46|NMD3_HUMAN 60S ribosomal export protein NMD3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NMD3 PE=1 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By MS/MS By MS/MS 1.1181 1.0607 13.475 10 3 Leave out requantified 1.1868 0.98344 1.1432 1.038 0.92202 1.1394 11.322 17.572 5.8394 4 4 2 2 1 0 Median Leave out requantified Median 13.4 10.9 7.3 156330000 83465000 72860000 75447000 41116000 34331000 62047000 32665000 29383000 18831000 9684100 9146600 1763 6577;7783;13961;16633;18352 True;True;True;True;True 6732;7960;14287;17024;18762 22300;22301;22302;22303;26936;26937;48228;48229;57198;57199;62975;62976 28210;28211;28212;28213;28214;33895;33896;60357;60358;71774;71775;79178 28210;33895;60357;71774;79178 Q96DT5 Q96DT5 2 2 2 Dynein heavy chain 11, axonemal DNAH11 sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN Dynein heavy chain 11, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH11 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 0.4 0.4 0.4 520.36 4516 4516 0.00045746 2.2598 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85953 0.7642 35.38 5 2 Median 0.71573 NaN 0.82685 0.65295 NaN 0.79829 22.249 NaN 36.682 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 0.4 0.2 0.4 121750000 60739000 61008000 56777000 30322000 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sp|Q96EE3|SEH1_HUMAN Nucleoporin SEH1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEH1L PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 18.1 18.1 18.1 39.648 360 360 0 14.677 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1244 1.043 10.98 13 1 Leave out requantified 1.127 1.042 1.0461 1.0246 0.99371 1.0158 11.191 17.2 18.559 5 4 4 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.1 13.3 13.3 273970000 132100000 141870000 111220000 54669000 56550000 74900000 36720000 38179000 87852000 40713000 47139000 1766 629;11693;14429;15575;16538 True;True;True;True;True 651;11938;14766;15939;16926 2172;2173;2174;40367;40368;40369;49809;49810;49811;53570;56894;56895;56896 2791;50579;50580;50581;62307;62308;62309;62310;62311;62312;67136;71389;71390;71391 2791;50580;62312;67136;71391 Q96EH3 Q96EH3 1 1 1 Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1 MALSU1 sp|Q96EH3|MASU1_HUMAN Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MALSU1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9 9 9 26.17 234 234 0 4.5898 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0335 0.95058 11.822 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 9 9 9 47259000 23481000 23778000 15640000 7048500 8591500 15414000 7550800 7863500 16205000 8881900 7323000 1767 344 True 353 1165;1166;1167 1517;1518;1519;1520 1519 Q96EI5 Q96EI5 1 1 1 Transcription elongation factor A protein-like 4 TCEAL4 sp|Q96EI5|TCAL4_HUMAN Transcription elongation factor A protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCEAL4 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9.8 9.8 9.8 24.647 215 215 0.008144 1.6589 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77928 0.70675 14.025 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 9.8 9.8 9.8 45366000 27711000 17655000 13441000 8461100 4980000 13783000 8405800 5376800 18142000 10844000 7298100 1768 3652 True 3753 12631;12632;12633 16053;16054;16055 16054 Q96EK5 Q96EK5 10 10 10 KIF1-binding protein KIAA1279 sp|Q96EK5|KBP_HUMAN KIF1-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1BP PE=1 SV=1 1 10 10 10 7 7 7 7 7 7 7 7 7 23.3 23.3 23.3 71.813 621 621 0 60.178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0229 0.946 17.116 21 10 Leave out requantified 1.178 0.89467 0.98957 1.0626 0.86239 0.94535 21.749 4.8245 17.554 7 7 7 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.3 19.3 12.6 716230000 332500000 383730000 283040000 132920000 150120000 229080000 102420000 126660000 204100000 97154000 106950000 1769 970;978;1692;4043;4706;5291;8856;11153;17117;18114 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1002;1010;1746;4153;4832;5423;9062;11394;17510;18520 3355;3356;3357;3373;5775;5776;5777;5778;5779;14071;16259;16260;16261;18076;18077;18078;18079;30740;30741;30742;38699;58808;58809;58810;62213 4339;4340;4341;4362;7492;7493;7494;7495;7496;7497;17894;20669;20670;20671;20672;20673;20674;22903;22904;22905;22906;22907;22908;38718;38719;48492;73908;73909;73910;73911;73912;78266 4339;4362;7493;17894;20672;22903;38718;48492;73908;78266 Q96EK7 Q96EK7 3 3 3 Constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor gamma FAM120B sp|Q96EK7|F120B_HUMAN Constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM120B PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 4 4 4 103.78 910 910 0 6.9231 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1806 1.0599 20.25 6 2 Leave out requantified 1.0877 0.9498 NaN 0.94833 0.88811 NaN 19.398 40.744 NaN 3 2 1 0 1 1 Leave out requantified Median Median 4 2.6 1.3 51576000 26929000 24647000 26909000 13260000 13650000 14798000 7933100 6865000 9868600 5735900 4132700 1770 13107;13108;13109 True;True;True 13414;13415;13416 45327;45328;45329;45330;45331;45332;45333 56634;56635;56636;56637;56638;56639 56634;56635;56639 Q96EK9 Q96EK9 2 2 2 Protein KTI12 homolog KTI12 sp|Q96EK9|KTI12_HUMAN Protein KTI12 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KTI12 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 11.3 11.3 11.3 38.615 354 354 0 4.7243 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4126 1.3726 15.708 3 1 Median NaN NaN 1.2733 NaN NaN 1.2268 NaN NaN 15.877 1 0 2 0 0 1 Median Median Median 6.2 5.1 11.3 39018000 21085000 17933000 14418000 4996800 9421600 0 0 0 24599000 16088000 8511600 1771 4045;14217 True;True 4155;14549 14073;14074;49162;49163 17896;17897;61502;61503;61504 17896;61504 Q96EN8 Q96EN8 6 6 6 Molybdenum cofactor sulfurase MOCOS sp|Q96EN8|MOCOS_HUMAN Molybdenum cofactor sulfurase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOCOS PE=1 SV=2 1 6 6 6 2 5 3 2 5 3 2 5 3 8.3 8.3 8.3 98.119 888 888 0 13.497 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1283 1.0659 65.521 9 8 Median 0.45473 1.129 1.4782 0.40105 1.0807 1.3924 52.162 34.99 61.371 2 4 3 1 4 3 Median Median Median 2.9 7 4.3 103030000 47284000 55746000 23159000 16143000 7016000 40532000 14809000 25723000 39339000 16332000 23006000 1772 4352;4987;9650;11338;14931;15870 True;True;True;True;True;True 4470;5116;9868;11580;15278;16244 15071;15072;15073;17161;33757;39276;51464;51465;51466;54590 19148;19149;19150;21797;42483;49222;64396;64397;64398;68494 19148;21797;42483;49222;64396;68494 Q96ER3 Q96ER3 2 2 2 Protein SAAL1 SAAL1 sp|Q96ER3|SAAL1_HUMAN Protein SAAL1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAAL1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.4 4.4 4.4 53.557 474 474 0 5.6184 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1679 1.0632 6.273 8 4 Leave out requantified 1.4227 1.124 1.2582 1.2864 1.0421 1.2606 25.928 9.1037 28.751 3 2 3 2 0 2 Plateau Median Median 4.4 4.4 4.4 161800000 82031000 79765000 72260000 34339000 37921000 26964000 14990000 11974000 62572000 32701000 29871000 1773 17041;17727 True;True 17434;18129 58547;58548;58549;60986;60987;60988;60989;60990 73563;73564;76748;76749;76750;76751;76752;76753 73563;76750 Q96EY8 Q96EY8 1 1 1 Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial MMAB sp|Q96EY8|MMAB_HUMAN Corrinoid adenosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MMAB PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.4 6.4 6.4 27.388 250 250 0 3.8232 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2208 1.0534 1.453 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.4 6.4 6.4 96996000 46086000 50910000 41646000 19740000 21906000 27430000 13425000 14005000 27919000 12920000 14999000 1774 6575 True 6730 22294;22295;22296 28201;28202;28203;28204;28205;28206 28205 Q96EZ8 Q96EZ8 2 2 2 Microspherule protein 1 MCRS1 sp|Q96EZ8|MCRS1_HUMAN Microspherule protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCRS1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.9 6.9 6.9 51.803 462 462 0.0097375 1.589 By matching By matching By MS/MS 1.2666 1.1779 147.71 4 1 Median NaN NaN 4.6109 NaN NaN 4.3654 NaN NaN 206.6 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 3.9 3.9 6.9 71360000 30082000 41277000 22202000 12305000 9896900 14112000 5045800 9066500 35046000 12732000 22314000 1775 2993;5623 True;True 3078;5762 10369;10370;10371;19101 13171;24189 13171;24189 400 14 Q96F86 Q96F86 6 6 6 Enhancer of mRNA-decapping protein 3 EDC3 sp|Q96F86|EDC3_HUMAN Enhancer of mRNA-decapping protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EDC3 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 2 4 5 2 4 5 2 4 15.6 15.6 15.6 56.077 508 508 0 10.471 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99158 0.89179 28.29 8 3 Leave out requantified 0.90312 1.1368 1.1835 0.89173 1.0856 1.1188 4.7244 2.5081 49.142 3 2 3 1 1 1 Plateau Median Median 12.2 3.5 8.7 137320000 68832000 68486000 64578000 31352000 33226000 25309000 12731000 12578000 47431000 24749000 22682000 1776 1257;5636;8016;15107;16406;18501 True;True;True;True;True;True 1298;5776;8200;15463;16794;18913 4322;19153;19154;19155;27752;27753;52126;56468;56469;56470;56471;63418;63419 5609;24250;24251;24252;34935;34936;65277;70842;70843;70844;79705;79706 5609;24252;34935;65277;70842;79705 Q96FQ6 Q96FQ6 4 4 4 Protein S100-A16 S100A16 sp|Q96FQ6|S10AG_HUMAN Protein S100-A16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A16 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 28.2 28.2 28.2 11.801 103 103 0 8.5615 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99039 0.94802 4.8816 9 3 Leave out requantified 0.84194 0.98914 1.3339 0.72622 0.91585 1.283 32.64 16.157 30.558 3 3 3 1 1 1 Median Plateau Median 27.2 27.2 28.2 180230000 94256000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 452;453;3650;4953;5149;6072;8586;10077;10981;13405;16836 1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;1477;1478;1479;1480;1481;12294;12295;12296;12297;12298;12299;16621;16622;16623;17252;17253;17254;17255;17256;17257;20155;20156;20157;20158;29043;29044;29045;29046;29047;29048;29049;34436;34437;34438;37433;37434;37435;45303;45304;45305;56598;56599;56600;56601;56602;56603 1886;1887;1888;1889;1890;1891;1892;1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;1900;1901;1902;1903;15643;15644;15645;15646;15647;15648;15649;21116;21117;21118;21119;21120;21905;21906;21907;21908;21909;21910;21911;25499;25500;25501;25502;25503;25504;25505;36499;36500;36501;36502;36503;36504;36505;36506;36507;36508;36509;36510;43355;43356;43357;43358;46977;46978;56606;56607;56608;56609;56610;70994;70995;70996 1891;1898;15643;21120;21911;25503;36502;43357;46977;56607;70994 Q96GA3 Q96GA3 3 3 3 Protein LTV1 homolog LTV1 sp|Q96GA3|LTV1_HUMAN Protein LTV1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 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8197700 4081700 4116000 6478100 2441200 4036900 10680000 4523600 6156000 1780 15650 True 16015 53844;53845;53846 67499;67500;67501 67499 Q96GM8 Q96GM8 6 6 6 Target of EGR1 protein 1 TOE1 sp|Q96GM8|TOE1_HUMAN Target of EGR1 protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOE1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 5 4 5 5 4 5 5 4 18.6 18.6 18.6 56.547 510 510 0 25.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0208 0.95132 0.21904 13 8 Leave out requantified 0.76484 1.0441 1.1523 0.69646 0.97699 1.1171 21.5 13.665 14.155 5 4 4 3 2 3 Median Median Median 17.1 15.7 13.7 308010000 160030000 147970000 136690000 77299000 59392000 83181000 36840000 46340000 88136000 45895000 42241000 1781 983;1559;13768;14875;15623;16133 True;True;True;True;True;True 1015;1610;14092;15221;15988;16510 3390;5340;5341;5342;47574;47575;47576;51291;51292;53747;53748;53749;53750;55590;55591 4383;6907;6908;6909;6910;6911;59527;59528;59529;59530;59531;59532;64195;64196;67384;67385;67386;67387;69758;69759 4383;6907;59527;64195;67385;69759 Q96GQ7 Q96GQ7 1 1 1 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27 DDX27 sp|Q96GQ7|DDX27_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX27 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1.5 1.5 1.5 89.834 796 796 0.0056818 1.7908 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.5 0 0 16561000 5297400 11263000 16561000 5297400 11263000 0 0 0 0 0 0 1782 120 True 124 389 544 544 Q96GS4 Q96GS4 1 1 1 Uncharacterized protein C17orf59 C17orf59 sp|Q96GS4|BORC6_HUMAN BLOC-1-related complex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BORCS6 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2.8 2.8 2.8 37.226 357 357 0.0097005 1.5736 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 2.8 0 162150000 133040000 29110000 0 0 0 162150000 133040000 29110000 0 0 0 1783 16129 True 16506 55582 69748 69748 Q96H20 Q96H20 1 1 1 Vacuolar-sorting protein SNF8 SNF8 sp|Q96H20|SNF8_HUMAN Vacuolar-sorting protein SNF8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNF8 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 5.4 5.4 5.4 28.864 258 258 0 12.182 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 5.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1784 6841 True 7000 23180 29331 29331 Q96H79 Q96H79 1 1 1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like ZC3HAV1L sp|Q96H79|ZCCHL_HUMAN Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HAV1L PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.7 6.7 6.7 32.962 300 300 0 4.7998 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.074 0.97308 59.874 5 4 Median 0.94177 NaN 1.3467 0.85073 NaN 1.3192 19.003 NaN 109.5 2 1 2 2 0 2 Median Median Median 6.7 6.7 6.7 105450000 52490000 52956000 53663000 25675000 27988000 23283000 12722000 10561000 28500000 14092000 14407000 1785 11880 True 12143 41076;41077;41078;41079;41080 51436;51437;51438;51439;51440;51441 51436 Q96HC4 Q96HC4 13 13 13 PDZ and LIM domain protein 5 PDLIM5 sp|Q96HC4|PDLI5_HUMAN PDZ and LIM domain protein 5 OS=Homo sapiens 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5324;6118;6119;6120;21021;21022;21023;21024;21877;21878;21879;21880;21881;28119;28120;28121;28122;28123;28124;28125;35221;38267;38268;38269;38270;55331;55332;55333;55334;55335;58714;58715;58716;58717;58718;58719;58720;65197;65198;66858;66859;66860;66861;66862;66863;70708;70709;70710;70711;70712;70713 5324;6120;21022;21878;28124;35221;38268;55331;58716;58720;65198;66861;70709 Q96HE7 Q96HE7 1 1 1 ERO1-like protein alpha ERO1L sp|Q96HE7|ERO1A_HUMAN ERO1-like protein alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERO1A PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 3 54.392 468 468 0 3.5421 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63339 0.61799 54.802 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 3 3 3 33122000 20314000 12808000 9107400 6818900 2288500 7105800 3056200 4049700 16909000 10439000 6470000 1787 10032 True 10253 34987;34988;34989;34990 44027;44028;44029;44030;44031 44027 Q96HR8 Q96HR8 1 1 1 H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1 NAF1 sp|Q96HR8|NAF1_HUMAN H/ACA 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hydrolase 47 USP47 sp|Q96K76|UBP47_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP47 PE=1 SV=3 1 13 13 13 8 9 7 8 9 7 8 9 7 12.6 12.6 12.6 157.31 1375 1375 0 90.99 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1471 1.0243 27.245 21 12 Leave out requantified 1.1577 1.0303 1.2027 1.0152 1.0243 1.1833 16.487 52.754 28.056 8 7 6 4 5 3 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.5 9.5 8.1 486840000 229360000 257470000 175480000 74244000 101240000 122230000 53546000 68680000 189130000 101570000 87553000 1800 679;5251;5274;9730;9731;10013;11205;12299;13724;15418;15532;17806;18362 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 702;5382;5406;9949;9950;10234;11446;12584;14048;15777;15895;18208;18772 2328;17959;17960;17961;18023;18024;18025;34053;34054;34055;34928;38852;38853;42515;42516;42517;47441;53040;53041;53042;53420;53421;53422;61234;63008;63009 2988;22769;22770;22771;22838;22839;22840;42875;42876;43956;48701;48702;53219;53220;53221;59348;66458;66459;66460;66461;66462;66463;66934;66935;66936;77059;79218;79219 2988;22769;22838;42875;42876;43956;48701;53220;59348;66463;66935;77059;79219 Q96KB5 Q96KB5 5 5 5 Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase PBK sp|Q96KB5|TOPK_HUMAN Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PBK PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 18.3 18.3 18.3 36.085 322 322 0 14.648 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1413 1.0586 13.279 10 2 Leave out requantified 1.0765 1.1696 1.2564 0.91955 1.1058 1.1419 8.513 5.5457 13.977 5 2 3 2 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 18.3 10.6 9.9 347340000 170120000 177220000 159050000 75690000 83361000 58797000 31658000 27139000 129490000 62770000 66719000 1801 1456;2926;8302;14843;14891 True;True;True;True;True 1501;3010;8493;15189;15238 4951;4952;4953;10174;28727;28728;28729;51191;51192;51193;51356;51357 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Exocyst complex component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 2.9 2.9 2.9 104.07 924 924 0 13.83 By MS/MS By MS/MS 1.4081 1.2722 51.689 3 3 Median NaN NaN 1.9229 NaN NaN 1.9467 NaN NaN 64.319 1 0 2 1 0 2 Median Median Median 2.1 0 2.9 56922000 26116000 30807000 27015000 13829000 13186000 0 0 0 29907000 12286000 17620000 1803 6095;7289 True;True 6242;7458 20719;20720;25050 26227;26228;31525 26228;31525 Q96KR1 Q96KR1 3 3 3 Zinc finger RNA-binding protein ZFR sp|Q96KR1|ZFR_HUMAN Zinc finger RNA-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZFR PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 4.2 4.2 4.2 117.01 1074 1074 0 8.6483 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81826 0.74689 49.79 6 2 Leave out requantified 1.2154 0.78318 NaN 1.044 0.74258 NaN 38.045 53.028 NaN 3 2 1 1 0 1 Plateau Median Median 4.2 2.5 2.5 78934000 43562000 35371000 48773000 26247000 22526000 18008000 9964200 8043500 12153000 7351500 4801900 1804 744;3619;15318 True;True;True 771;3720;15677 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1 1 Zinc finger protein 512 ZNF512 sp|Q96ME7|ZN512_HUMAN Zinc finger protein 512 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF512 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 64.681 567 567 1 -2 By matching By MS/MS By MS/MS 1.2248 1.0711 8.7168 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 791690000 371670000 420020000 303420000 143700000 159720000 200970000 95141000 105830000 287300000 132830000 154470000 + 1811 15402 True 15761 52993;52994;52995 66400;66401 66401 401;402 78;80 Q96MU7 Q96MU7 1 1 1 YTH domain-containing protein 1 YTHDC1 sp|Q96MU7|YTDC1_HUMAN YTH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YTHDC1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 84.699 727 727 0.00091199 2.2034 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0591 0.96562 16.659 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 1.5 1.5 1.5 24470000 11853000 12617000 9574700 4516400 5058200 6534400 3121700 3412700 8360800 4214700 4146100 1812 15025 True 15380 51836;51837;51838 64887;64888;64889 64887 Q96N67 Q96N67 4 4 4 Dedicator of cytokinesis protein 7 DOCK7 sp|Q96N67|DOCK7_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK7 PE=1 SV=4 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 2.3 2.3 2.3 242.56 2140 2140 0 4.2502 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.027 0.95927 15.957 10 2 Leave out requantified 1.0597 0.81034 1.027 0.95927 0.76128 0.96529 33.814 33.866 41.557 3 3 4 1 0 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 1.5 1.5 2.3 408160000 199930000 208240000 147240000 70478000 76765000 120220000 61044000 59175000 140700000 68403000 72296000 1813 4500;10706;16268;17651 True;True;True;True 4623;10937;16655;18052 15564;15565;15566;37293;37294;37295;56035;60732;60733;60734 19793;19794;46814;70326;76391;76392;76393 19793;46814;70326;76393 Q96NU1 Q96NU1 1 1 1 Sterile alpha motif domain-containing protein 11 SAMD11 sp|Q96NU1|SAM11_HUMAN Sterile alpha motif domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMD11 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 2.5 2.5 72.707 681 681 0 3.1004 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0493 0.99866 5.2345 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.5 2.5 2.5 29169000 14388000 14781000 9325000 4638200 4686800 8991900 4288400 4703500 10852000 5461400 5390400 1814 6595 True 6750 22359;22360;22361 28282;28283;28284;28285;28286 28284 Q96P16 Q96P16 3 3 3 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A RPRD1A sp|Q96P16|RPR1A_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1A PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 1 2 3 1 2 3 1 17.3 17.3 17.3 35.719 312 312 0 23.474 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69905 0.61085 48.129 6 2 Leave out requantified 0.69905 1.0053 NaN 0.61085 0.96958 NaN 48.129 11.719 NaN 2 3 1 0 2 0 Median Median Median 9.3 17.3 5.8 263290000 142440000 120840000 96099000 49568000 46531000 122970000 70506000 52459000 44223000 22372000 21852000 1815 1025;2272;7562 True;True;True 1059;2343;7738 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out requantified Leave out requantified 17.8 15.8 18.4 4149200000 1880800000 2268400000 1737300000 739320000 998010000 1145700000 551400000 594300000 1266200000 590130000 676050000 1817 700;1617;1713;3347;4061;4132;4214;4780;5469;5920;10684;11567;13209;13337;13871;17502;17733;17758;18100;18999 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 725;1670;1768;3442;4171;4242;4324;4906;5603;6063;10915;11811;13520;13652;14196;17901;18135;18160;18506;19423 2412;2413;2414;5538;5539;5844;5845;5846;11584;11585;11586;11587;11588;11589;14141;14142;14360;14361;14362;14615;14616;14617;16460;16461;16462;16463;16464;16465;18633;18634;18635;18636;18637;18638;18639;20129;20130;37219;37220;37221;37222;37223;37224;37225;37226;37227;37228;39984;39985;45683;45684;45685;45686;45687;45688;46181;46182;46183;47896;60230;60231;60232;60233;60234;60235;60236;60237;60238;60239;61006;61007;61008;61009;61010;61011;61092;62169;62170;65127 3084;3085;3086;7177;7178;7179;7571;14722;14723;14724;14725;14726;14727;14728;14729;17976;17977;18251;18252;18253;18547;18548;18549;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929;23594;23595;23596;23597;23598;23599;23600;23601;23602;23603;25469;25470;46717;46718;46719;46720;46721;46722;46723;46724;46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731;46732;50129;50130;57095;57096;57097;57098;57703;57704;57705;59945;75754;75755;75756;75757;75758;75759;75760;75761;75762;75763;75764;75765;76772;76773;76774;76775;76776;76884;78208;78209;78210;81850 3084;7177;7571;14724;17976;18251;18548;20923;23600;25469;46721;50130;57097;57704;59945;75756;76775;76884;78208;81850 Q96PK6 Q96PK6 1 1 1 RNA-binding protein 14 RBM14 sp|Q96PK6|RBM14_HUMAN RNA-binding protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM14 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2.1 2.1 2.1 69.491 669 669 0 4.3594 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 2.1 0 19802000 10257000 9545300 0 0 0 19802000 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26121;26122;26123;26124 26121 Q96QU8 Q96QU8 4 4 4 Exportin-6 XPO6 sp|Q96QU8|XPO6_HUMAN Exportin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4.3 4.3 4.3 128.88 1125 1125 0 7.4193 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2931 1.2296 11.589 9 4 Leave out requantified 1.3175 1.0357 1.4889 1.1444 0.95343 1.4275 60.858 5.3544 32.695 5 2 2 4 0 0 Median Median Median 4.3 1.9 1.9 181020000 80154000 100860000 100450000 43995000 56458000 39683000 19366000 20317000 40880000 16792000 24089000 1822 366;919;12492;16596 True;True;True;True 375;951;12780;16986 1236;3181;43241;43242;43243;43244;57090;57091;57092 1599;4106;54077;54078;54079;54080;54081;71644;71645;71646;71647;71648;71649 1599;4106;54078;71647 Q96R06 Q96R06 2 2 2 Sperm-associated antigen 5 SPAG5 sp|Q96R06|SPAG5_HUMAN Sperm-associated antigen 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPAG5 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 1.8 1.8 1.8 134.42 1193 1193 0.00047985 2.7046 By MS/MS By MS/MS 1.2475 1.1218 30.408 2 1 Median 1.2475 NaN NaN 1.1218 NaN NaN 30.408 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.8 0 1.1 23619000 10853000 12766000 23619000 10853000 12766000 0 0 0 0 0 0 1823 10985;15157 True;True 11224;15514 38169;38170;52276 47879;47880;65477 47879;65477 Q96RE7 Q96RE7 1 1 1 Nucleus accumbens-associated protein 1 NACC1 sp|Q96RE7|NACC1_HUMAN Nucleus accumbens-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NACC1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.4 3.4 3.4 57.258 527 527 0 3.7988 By MS/MS By MS/MS By matching 1.1809 1.05 17.032 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.4 3.4 3.4 41200000 20100000 21100000 18136000 10207000 7929300 13223000 5363600 7859600 9840500 4529500 5311000 1824 17517 True 17917 60297;60298;60299 75842;75843;75844;75845;75846 75842 Q96RP9 Q96RP9 6 6 6 Elongation factor G, mitochondrial GFM1 sp|Q96RP9|EFGM_HUMAN Elongation factor G, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GFM1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 4 4 6 4 4 6 4 4 11.3 11.3 11.3 83.471 751 751 0 44.802 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10474;20162;35668;51755 Q96SU4 Q96SU4 5 5 5 Oxysterol-binding protein-related protein 9 OSBPL9 sp|Q96SU4|OSBL9_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL9 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 9.1 9.1 9.1 83.184 736 736 0 19.541 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.115 1.0432 4.1135 13 4 Leave out requantified 1.2286 0.98696 1.0169 1.1018 0.93772 0.99245 39.873 22.505 6.7407 5 4 4 2 1 1 Median Median Median 7.6 6.1 4.6 559300000 280530000 278770000 230110000 105250000 124860000 178390000 103010000 75379000 150800000 72269000 78535000 1835 7411;9094;18282;18443;18576 True;True;True;True;True 7583;9303;18690;18853;18991 25611;31689;31690;31691;31692;31693;31694;62755;62756;62757;63239;63670;63671;63672;63673 32294;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915;78917;78918;78919;78920;79494;80032;80033;80034;80035 32294;39909;78917;79494;80035 Q96SW2 Q96SW2 1 1 1 Protein cereblon CRBN sp|Q96SW2|CRBN_HUMAN Protein cereblon OS=Homo sapiens 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sp|Q99436|PSB7_HUMAN Proteasome subunit beta type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMB7 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.2 3.2 3.2 29.965 277 277 0.0018141 2.1545 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.2 0 3.2 22061000 10953000 11108000 22061000 10953000 11108000 0 0 0 0 0 0 1844 6832 True 6991 23158;23159 29306;29307;29308 29307 Q99439 Q99439 8 8 7 Calponin-2 CNN2 sp|Q99439|CNN2_HUMAN Calponin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNN2 PE=1 SV=4 1 8 8 7 8 7 7 8 7 7 7 6 6 30.7 30.7 27.2 33.697 309 309 0 136.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98016 0.94204 18.123 30 9 Leave out requantified 1.1978 1.0342 0.96323 1.0773 1.0007 0.93368 19.626 12.187 18.975 10 10 10 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.7 27.2 27.2 3110600000 1542200000 1568500000 1222800000 590930000 631900000 912400000 463000000 449400000 975400000 488230000 487170000 1845 583;1805;2394;6435;6591;11096;16764;18622 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Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAT1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 6 7 5 6 7 5 6 7 27 27 27 41.92 393 393 0 45.178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0533 1.0173 20.751 24 10 Leave out requantified 1.0221 1.0533 1.0779 0.91727 1.0378 1.0479 16.206 2.911 27.873 6 10 8 2 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.8 20.1 27 1079400000 511040000 568340000 383590000 178020000 205570000 335180000 156510000 178670000 360610000 176510000 184100000 1851 1959;1960;4309;4649;4650;6867;17689 True;True;True;True;True;True;True 2022;2023;4427;4774;4775;7027;7028;18090 6767;6768;6769;6770;6771;6772;6773;6774;6775;14953;14954;16067;16068;16069;16070;23283;23284;23285;23286;23287;23288;23289;60862;60863;60864 8741;8742;8743;8744;8745;8746;8747;8748;8749;8750;8751;8752;19002;20440;20441;20442;20443;29461;29462;29463;29464;29465;29466;29467;29468;76569;76570;76571;76572;76573;76574 8746;8752;19002;20440;20443;29467;76570 Q99543 Q99543 6 6 6 DnaJ homolog subfamily C member 2;DnaJ homolog subfamily C member 2, N-terminally processed DNAJC2 sp|Q99543|DNJC2_HUMAN DnaJ homolog subfamily C member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJC2 PE=1 SV=4 1 6 6 6 4 4 3 4 4 3 4 4 3 13 13 13 71.996 621 621 0 13.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0321 0.98925 46.238 11 6 Leave out requantified 1.0207 1.0193 1.0113 0.92227 0.9861 0.97621 28.182 48.403 6.1659 4 4 3 3 2 1 Median Median Median 8.4 8.7 6.6 199670000 96172000 103490000 73834000 30816000 43018000 62824000 29169000 33655000 63008000 36188000 26821000 1852 70;467;2836;9735;13231;18418 True;True;True;True;True;True 71;483;2916;9954;13543;18828 223;224;1573;9852;9853;9854;34068;34069;34070;45773;45774;63175 310;311;2024;12541;12542;12543;42898;42899;57204;57205;79413 310;2024;12543;42898;57204;79413 Q99547 Q99547 2 2 2 M-phase phosphoprotein 6 MPHOSPH6 sp|Q99547|MPH6_HUMAN M-phase phosphoprotein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPHOSPH6 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 14.4 14.4 14.4 19.024 160 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ribonucleoprotein A/B HNRNPAB sp|Q99729|ROAA_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPAB PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.9 6.9 6.9 36.224 332 332 0 3.6803 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1446 1.0926 35.061 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 2.4 2.4 4.5 29579000 15457000 14121000 12753000 5946700 6805800 4339500 1948900 2390600 12487000 7561800 4925000 1867 5991;6038 True;True 6136;6183 20372;20373;20536 25776;25777;25994 25777;25994 Q99733 Q99733 11 9 9 Nucleosome assembly protein 1-like 4 NAP1L4 sp|Q99733|NP1L4_HUMAN Nucleosome assembly protein 1-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAP1L4 PE=1 SV=1 1 11 9 9 11 8 11 9 6 9 9 6 9 38.7 35.7 35.7 42.823 375 375 0 206.1 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98973 0.92017 50.394 38 21 Leave out requantified 0.96481 1.6485 1.0572 0.86418 1.5712 1.0287 70.908 48.037 11.194 14 11 13 8 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.7 23.2 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3088;4007;6804;8015;8991;16297;16564;26045;27044;32792;32797;34982;35973;41349;45973;51732;52970;57724;58847;59663;64017;65259;66369;67495;68407;70288;70418;74965;77485;77662;77672;81500 404;405;406;407 227;382;394;414 Q99836 Q99836 2 2 2 Myeloid differentiation primary response protein MyD88 MYD88 sp|Q99836|MYD88_HUMAN Myeloid differentiation primary response protein MyD88 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYD88 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 11.5 11.5 11.5 33.233 296 296 0 8.3008 By MS/MS 1.3511 1.241 1.3577 2 1 Median 1.3511 NaN NaN 1.241 NaN NaN 1.3577 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 11.5 0 0 34745000 14782000 19963000 34745000 14782000 19963000 0 0 0 0 0 0 1873 5188;13625 True;True 5318;13947 17781;47117 22562;58929 22562;58929 Q99848 Q99848 3 3 3 Probable rRNA-processing protein EBP2 EBNA1BP2 sp|Q99848|EBP2_HUMAN Probable rRNA-processing protein EBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EBNA1BP2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 11.4 11.4 11.4 34.852 306 306 0 4.5546 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0001 0.89812 15.568 4 1 Median 1.1456 NaN NaN 1.0048 NaN NaN 16.09 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 8.2 6.5 3.3 102330000 48915000 53412000 46866000 21134000 25732000 27091000 13687000 13404000 28370000 14094000 14276000 1874 1607;4569;6400 True;True;True 1659;4694;6551 5508;5509;5510;15781;21770 7131;7132;20058;27536 7132;20058;27536 Q99871 Q99871 1 1 1 HAUS augmin-like complex subunit 7 HAUS7 sp|Q99871|HAUS7_HUMAN HAUS augmin-like complex subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HAUS7 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4.3 4.3 4.3 40.778 368 368 0.0097252 1.5844 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 4.3 3539200 1386900 2152200 0 0 0 0 0 0 3539200 1386900 2152200 1875 6052 True 6199 20593;20594 26084;26085 26085 Q99873 Q99873 7 7 7 Protein arginine N-methyltransferase 1 PRMT1 sp|Q99873|ANM1_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 3 5 5 3 5 5 3 5 26.7 26.7 26.7 42.461 371 371 0 20.626 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2613 1.1694 5.5346 13 7 Leave out requantified 1.1314 1.5579 1.0411 1.1103 1.5039 0.99533 20.17 46.575 56.66 5 3 5 2 2 3 Leave out requantified Plateau Median 18.9 11.1 18.9 329490000 154910000 174580000 139750000 64481000 75271000 69250000 34439000 34811000 120490000 55988000 64497000 1876 1183;2591;3063;6621;7910;9384;13758 True;True;True;True;True;True;True 1224;2668;3150;6777;8091;9597;14082 4077;4078;8954;8955;10636;10637;10638;22440;22441;22442;27400;32792;47534 5296;5297;11425;13531;13532;13533;13534;13535;13536;28393;28394;28395;34488;41269;59472 5296;11425;13533;28395;34488;41269;59472 Q99933 Q99933 5 5 5 BAG family molecular chaperone regulator 1 BAG1 sp|Q99933|BAG1_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG1 PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 2 2 3 2 2 3 2 2 13.3 13.3 13.3 38.778 345 345 0 22.536 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1168 1.0622 30.234 8 3 Leave out requantified 1.073 2.2581 1.0645 0.95427 2.178 1.0405 27 52.155 6.1315 4 2 2 1 1 1 Leave out requantified Median Median 10.7 7 10.7 275130000 135540000 139590000 133930000 67448000 66482000 44492000 16252000 28239000 96710000 51841000 44869000 1877 2744;4224;7487;7488;8117 True;True;True;True;True 2821;4334;7661;7662;8301 9496;14655;14656;25929;25930;28094;28095;28096 12078;18598;18599;18600;32633;32634;32635;35351;35352;35353 12078;18598;32634;32635;35353 Q99961;Q99962 Q99961 14;3 14;3 14;3 Endophilin-A2 SH3GL1 sp|Q99961|SH3G1_HUMAN Endophilin-A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GL1 PE=1 SV=1 2 14 14 14 13 10 12 13 10 12 13 10 12 38.9 38.9 38.9 41.489 368 368;352 0 86.222 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1398 1.0457 70.716 39 11 Leave out requantified 1.2924 1.1485 0.96622 1.1498 1.0594 0.90897 15.176 23.543 75.681 14 11 14 4 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 36.7 33.2 35.3 2193900000 1072800000 1121200000 867360000 414080000 453280000 639590000 303380000 336210000 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VRK1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 7.6 7.6 7.6 45.476 396 396 0 5.6382 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6053 1.5061 78.632 6 3 Median 2.0308 1.751 1.5526 1.7903 1.6924 1.5061 113.53 103.44 83.76 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 7.6 7.6 5.6 160640000 61292000 99351000 54470000 14805000 39666000 50953000 24134000 26818000 55221000 22354000 32867000 1879 2479;10498;18600 True;True;True 2556;10728;19015 8581;8582;8583;36599;36600;36601;63731;63732 10990;10991;10992;45975;80101;80102 10990;45975;80102 Q9BPU6 Q9BPU6 1 1 1 Dihydropyrimidinase-related protein 5 DPYSL5 sp|Q9BPU6|DPYL5_HUMAN Dihydropyrimidinase-related protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPYSL5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.2 1.2 1.2 61.421 564 564 0.0077253 1.6657 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0538 0.99596 177.67 12 5 Median 1.0158 1.0002 1.1096 0.89576 0.9291 1.0604 236.79 165.69 174.04 4 4 4 1 2 2 Median Median Median 1.2 1.2 1.2 1573100000 801130000 771990000 532710000 275380000 257330000 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sp|Q9BRT6|LLPH_HUMAN Protein LLP homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LLPH PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 12.4 12.4 12.4 15.225 129 129 0 4.0721 By MS/MS By MS/MS 1.2616 1.0976 33.743 3 1 Median 0.93775 NaN NaN 0.84589 NaN NaN 36.843 NaN NaN 2 0 1 1 0 0 Median Median Median 12.4 0 12.4 67794000 32708000 35086000 49645000 23619000 26026000 0 0 0 18149000 9089000 9060100 1902 16166 True 16545 55700;55701;55702 69889;69890 69889 Q9BRT9 Q9BRT9 4 4 4 DNA replication complex GINS protein SLD5;DNA replication complex GINS protein SLD5, N-terminally processed GINS4 sp|Q9BRT9|SLD5_HUMAN DNA replication complex GINS protein SLD5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS4 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 23.3 23.3 23.3 26.047 223 223 0 21.598 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0119 0.93437 17.097 12 4 Leave out requantified 1.0122 1.2543 0.94074 0.91056 1.1645 0.88347 17.449 27.849 7.0965 4 3 5 0 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 23.3 19.7 23.3 414470000 182180000 232290000 158180000 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226;4024;11508;19370;19371;23106;23107;23108;24519;24520;24521;61842;61843;61844 313;5224;14628;24523;24524;29243;29244;29245;30956;30957;30958;77815;77816;77817 313;5224;14628;24523;29243;30958;77815 Q9BRX5 Q9BRX5 4 4 4 DNA replication complex GINS protein PSF3 GINS3 sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4 25 25 25 24.534 216 216 0 39.42 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89326 0.85377 1.8136 8 1 Leave out requantified 0.85529 0.80103 0.9995 0.78547 0.77097 0.98163 6.2361 14.427 6.2543 2 2 4 0 0 1 Median Median Leave out requantified 11.1 13.4 25 130680000 67516000 63160000 34146000 19426000 14720000 32663000 16972000 15691000 63868000 31119000 32749000 1905 6605;9853;14168;16657 True;True;True;True 6760;10074;14500;17048 22389;34431;34432;48986;48987;48988;57285;57286 28317;43350;43351;43352;61272;61273;61274;61275;71896;71897;71898;71899 28317;43352;61272;71898 Q9BS26 Q9BS26 2 2 2 Endoplasmic reticulum resident protein 44 ERP44 sp|Q9BS26|ERP44_HUMAN Endoplasmic reticulum resident protein 44 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERP44 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 8.6 8.6 8.6 46.971 406 406 0 8.4236 By MS/MS By matching By MS/MS 1.0513 0.94735 25.417 7 0 Leave out requantified 1.1227 1.5229 0.91696 0.995 1.4245 0.87499 32.357 9.1568 24.251 2 2 3 0 0 0 Median Median Plateau 8.6 3 8.6 116240000 56039000 60206000 44820000 21846000 22974000 13632000 5616400 8015400 57793000 28576000 29216000 1906 16897;16988 True;True 17289;17380 58061;58062;58377;58378;58379;58380;58381 72950;73354;73355;73356;73357;73358 72950;73355 Q9BSC4 Q9BSC4 1 1 1 Nucleolar protein 10 NOL10 sp|Q9BSC4|NOL10_HUMAN Nucleolar protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOL10 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.5 1.5 1.5 80.301 688 688 0.0097087 1.575 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1907 10231 True 10456 35685;35686;35687 44867;44868;44869 44867 Q9BSD7 Q9BSD7 5 5 5 Cancer-related nucleoside-triphosphatase NTPCR sp|Q9BSD7|NTPCR_HUMAN Cancer-related nucleoside-triphosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NTPCR PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 2 4 4 2 4 4 2 35.8 35.8 35.8 20.713 190 190 0 16.389 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99264 0.93127 0.053332 12 5 Leave out requantified 1.1605 0.86062 0.95452 1.0304 0.79772 0.93092 25.368 16.162 43.487 4 5 3 2 2 1 Median Median Median 29.5 29.5 12.1 192260000 97416000 94846000 85246000 41064000 44182000 79340000 42607000 36733000 27675000 13745000 13931000 1908 6306;7434;7826;13743;15235 True;True;True;True;True 6457;7607;8003;14067;15593 21485;21486;21487;21488;21489;25697;27076;27077;47491;47492;52500;52501 27156;27157;27158;27159;27160;27161;32386;34075;59417;59418;65754;65755 27157;32386;34075;59418;65754 Q9BSH4 Q9BSH4 2 2 2 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 TACO1 sp|Q9BSH4|TACO1_HUMAN Translational activator of cytochrome c oxidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACO1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 14.8 14.8 14.8 32.477 297 297 0 14.639 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79068 0.74994 35.739 5 1 Leave out requantified NaN 0.60928 0.92875 NaN 0.58883 0.89629 NaN 6.6886 55.798 1 2 2 0 1 0 Median Median Median 14.8 14.8 14.8 126760000 69380000 57382000 23810000 12160000 11649000 41178000 28191000 12987000 61774000 29029000 32745000 1909 907;6560 True;True 937;6715 3139;3140;3141;22249;22250;22251 4048;4049;28144;28145;28146;28147;28148 4048;28145 Q9BSJ2 Q9BSJ2 2 2 2 Gamma-tubulin complex component 2 TUBGCP2 sp|Q9BSJ2|GCP2_HUMAN Gamma-tubulin complex component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2.7 2.7 2.7 102.53 902 902 0.00046751 2.4728 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4468 1.5906 45.914 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 2.7 1.8 1.8 42794000 19996000 22798000 18431000 5950100 12481000 11052000 6319800 4731900 13310000 7726100 5584300 1910 1791;11318 True;True 1850;11559 6135;39215;39216;39217 7978;49147;49148 7978;49148 Q9BT73 Q9BT73 4 4 4 Proteasome assembly chaperone 3 PSMG3 sp|Q9BT73|PSMG3_HUMAN Proteasome assembly chaperone 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 50 50 50 13.104 122 122 0 22.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84989 0.81771 41.995 7 4 Median 1.1046 0.81069 1.3308 0.99438 0.7658 1.2895 46.722 31.571 27.153 2 3 2 1 2 1 Median Median Median 42.6 39.3 39.3 249420000 130250000 119170000 86499000 44072000 42427000 80824000 49953000 30871000 82095000 36228000 45867000 1911 1661;11806;12558;17674 True;True;True;True 1714;12061;12850;18075 5684;5685;5686;40777;40778;40779;43480;60818;60819;60820 7380;7381;7382;51088;51089;51090;51091;54359;76515 7382;51088;54359;76515 Q9BT78 Q9BT78 16 16 16 COP9 signalosome complex subunit 4 COPS4 sp|Q9BT78|CSN4_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS4 PE=1 SV=1 1 16 16 16 14 14 16 14 14 16 14 14 16 51.5 51.5 51.5 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2545;2546;2547;2548;2549;2550;2551;4910;4911;4912;5348;5349;5350;5351;5621;5622;5623;5624;5625;5626;13453;13454;13455;40211;40212;41331;41332;41903;41904;41905;45120;45121;45122;45123;45124;45125;45126;45127;45667;45668;45669;45670;46466;46467;46468;46469;47863;47864;47865;55262;55263;55264;55265;55266;55267;59998;59999;60000;60001;60002;60003;64855;64856;64857 3249;3250;3251;3252;3253;3254;3255;3256;3257;3258;6339;6340;6341;6915;6916;6917;6918;6919;6920;7299;7300;7301;7302;7303;7304;7305;7306;7307;7308;17134;17135;17136;17137;50398;51763;52472;52473;52474;52475;56391;56392;56393;56394;56395;56396;56397;57077;57078;57079;57080;58091;58092;58093;58094;59902;59903;59904;69346;69347;69348;69349;69350;69351;69352;75477;75478;75479;75480;75481;75482;75483;75484;75485;81496;81497;81498 3256;6339;6918;7299;17136;50398;51763;52474;56396;56397;57080;58094;59903;69346;75478;81497 Q9BTA9 Q9BTA9 1 1 1 WW domain-containing adapter protein with coiled-coil WAC sp|Q9BTA9|WAC_HUMAN WW domain-containing adapter protein with coiled-coil OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WAC PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.9 2.9 2.9 70.723 647 647 0 8.3928 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0533 1.0084 22.991 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.9 2.9 2.9 88592000 37243000 51350000 29808000 10900000 18908000 32885000 14085000 18800000 25899000 12258000 13641000 1913 15325 True 15684 52753;52754;52755 66072;66073;66074;66075;66076;66077 66073 Q9BTC0 Q9BTC0 4 4 4 Death-inducer obliterator 1 DIDO1 sp|Q9BTC0|DIDO1_HUMAN Death-inducer obliterator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIDO1 PE=1 SV=5 1 4 4 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.3 3.3 3.3 243.87 2240 2240 0 6.1715 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0291 1.0147 12.045 6 4 Median 0.94844 1.091 1.0002 0.92979 1.0366 0.98951 19.005 9.6481 12.333 2 2 2 2 1 1 Median Median Median 1.3 1.8 1.5 90434000 41416000 49018000 27271000 12698000 14573000 35193000 15980000 19213000 27970000 12739000 15231000 1914 12944;13052;15628;18496 True;True;True;True 13250;13359;15993;18908 44816;44817;44818;44819;45179;53759;63403 56014;56015;56016;56017;56018;56456;67395;79688 56014;56456;67395;79688 Q9BTD8 Q9BTD8 2 2 2 RNA-binding protein 42 RBM42 sp|Q9BTD8|RBM42_HUMAN RNA-binding protein 42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM42 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.4 5.4 5.4 50.413 480 480 0 3.7966 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7917 0.78113 39.203 4 2 Median 0.93048 NaN NaN 0.8793 NaN NaN 62.693 NaN NaN 2 1 1 1 1 0 Median Median Median 5.4 3.1 2.3 36469000 21493000 14977000 19500000 12713000 6787000 10709000 5085100 5624200 6260000 3694500 2565400 1915 4071;6979 True;True 4181;7143 14173;14174;23734;23735 18018;30045;30046 18018;30045 Q9BTE3 Q9BTE3 12 12 12 Mini-chromosome maintenance complex-binding protein MCMBP sp|Q9BTE3|MCMBP_HUMAN Mini-chromosome maintenance complex-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCMBP PE=1 SV=2 1 12 12 12 12 9 11 12 9 11 12 9 11 26.5 26.5 26.5 72.979 642 642 0 66.427 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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7151;8695;9673;13515;15048;24084;40408;48129;48242;55150;56020;66928 Q9BTE6 Q9BTE6 2 2 2 Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 AARSD1 sp|Q9BTE6|AASD1_HUMAN Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AARSD1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.6 5.6 5.6 45.479 412 412 0 2.9205 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97139 0.92038 30.165 4 1 Median 0.98745 NaN NaN 0.9099 NaN NaN 50.524 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 5.6 2.7 2.7 52141000 26477000 25665000 26316000 12041000 14275000 11422000 5458400 5963500 14403000 8977600 5425800 1917 1857;6417 True;True 1919;6568 6373;21814;21815;21816 8285;27591;27592;27593;27594;27595;27596 8285;27592 Q9BTT0 Q9BTT0 1 1 1 Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E ANP32E sp|Q9BTT0|AN32E_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32E PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 4.5 4.5 4.5 30.692 268 268 0 5.513 By MS/MS By MS/MS 16.285 15.575 40.73 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 4.5 4.5 0 12977000 699770 12277000 8461100 314550 8146600 4515600 385210 4130400 0 0 0 1918 2767 True 2844 9565;9566 12166;12167 12166 Q9BTV5 Q9BTV5 1 1 1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 FSD1 sp|Q9BTV5|FSD1_HUMAN Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.2 2.2 2.2 55.819 496 496 0.0053168 1.9158 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.2 0 0 12367000 4749000 7618300 12367000 4749000 7618300 0 0 0 0 0 0 1919 9677 True 9896 33882 42671;42672 42671 Q9BTW9 Q9BTW9 16 16 16 Tubulin-specific chaperone D TBCD sp|Q9BTW9|TBCD_HUMAN Tubulin-specific chaperone D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCD PE=1 SV=2 1 16 16 16 14 11 12 14 11 12 14 11 12 18 18 18 132.6 1192 1192 0 51.745 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96107 0.89273 13.124 43 15 Leave out requantified 0.96901 0.94965 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601;4225;7616;7617;7618;7619;7620;7621;7622;27537;27538;27539;33120;33121;35818;36780;36781;41643;41644;41645;41646;41647;42749;42750;43829;43830;43831;43832;43833;43834;49609;49610;49611;49612;57282;57283;57284;65472;69624;69625;75128;75129;75130;75131;75132;75133;78253 601;4225;7619;27538;33121;35818;36780;41646;42749;43830;49612;57282;65472;69624;75130;78253 Q9BTY7 Q9BTY7 4 4 4 Protein HGH1 homolog HGH1 sp|Q9BTY7|HGH1_HUMAN Protein HGH1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HGH1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 10.3 10.3 10.3 42.129 390 390 0 6.7764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92633 0.84563 7.2297 11 5 Leave out requantified 0.99488 0.90772 1.1273 0.87036 0.85375 1.0618 10.882 6.7191 24.963 4 3 4 2 0 3 Median Leave out requantified Median 10.3 7.9 10.3 279660000 149710000 129950000 124550000 72150000 52397000 53251000 27200000 26051000 101860000 50355000 51502000 1921 261;457;850;10660 True;True;True;True 266;473;879;10891 863;864;1552;1553;1554;1555;1556;2958;2959;2960;2961;37142;37143;37144;37145 1137;1138;2001;2002;2003;2004;2005;2006;3797;3798;3799;3800;3801;46631;46632;46633 1138;2001;3801;46631 Q9BU89 Q9BU89 2 2 2 Deoxyhypusine hydroxylase DOHH sp|Q9BU89|DOHH_HUMAN Deoxyhypusine hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOHH PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 10.9 10.9 10.9 32.904 302 302 0 10.203 By MS/MS By MS/MS 2.116 2.0545 70.307 3 2 Median 2.0542 NaN NaN 1.8819 NaN NaN 99.171 NaN NaN 2 0 1 1 0 1 Median Median Median 10.9 0 6.6 56156000 16808000 39348000 38851000 12791000 26059000 0 0 0 17305000 4016700 13288000 1922 3337;7046 True;True 3432;7211 11544;23979;23980 14668;30329;30330 14668;30330 Q9BUF5 Q9BUF5 14 3 3 Tubulin beta-6 chain TUBB6 sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN Tubulin beta-6 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB6 PE=1 SV=1 1 14 3 3 14 14 13 3 3 2 3 3 2 33.2 12.6 12.6 49.857 446 446 0 30.554 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0907 1.0748 28.487 8 1 Leave out requantified 1.2023 0.98214 0.93058 1.0748 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17063;17064;17065;17066;17067;20496;20497;20498;20499;23379;23380;23381;23382;23383;23384;23385;24442;24443;26529;26530;26531;26532;36174;36175;36176;36177;36178;36179;36592;36593;36594;36595;36596;36597;39820;39821;39822;42398;42399;42400;42401;42402;42403;42404;42405;42406;42407;42408;42409;42410;42411;54449;54450;54451;54452;54453;54454;54455;54456;54457;54458;54459;54460;54461;54462;54463;54464;54465;54466;54467;55092;55093;55094;55095;55096;55097;55098;55099;55100;55101;55102;55103;81401;81402;81403;81404;81405;81406 17066;20498;23379;23381;24443;26531;26532;36174;36595;39822;42406;54463;55099;81401 46;48;49 257;299;300 Q9BUI4 Q9BUI4 2 2 2 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3 POLR3C sp|Q9BUI4|RPC3_HUMAN DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3C PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 4.7 4.7 4.7 60.611 534 534 0 3.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3018 1.2756 108 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 1.7 4.7 3 41415000 14267000 27149000 19816000 8275100 11541000 11528000 4305000 7223000 10072000 1686500 8385000 1924 9481;9661 True;True 9697;9879 33168;33169;33790;33791 41738;41739;42524;42525 41738;42524 Q9BUK6;REV__P04114 Q9BUK6 3;1 3;1 3;1 Protein misato homolog 1 MSTO1 sp|Q9BUK6|MSTO1_HUMAN Protein misato homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSTO1 PE=1 SV=1 2 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 6.3 6.3 6.3 61.835 570 570;4563 0 3.8186 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90922 0.86285 48.915 5 1 Median NaN 1.3555 0.64288 NaN 1.2982 0.61516 NaN 57.775 7.3453 1 2 2 0 0 1 Median Median Median 1.2 6.3 2.5 154490000 66872000 87613000 11003000 5555600 5447400 79082000 27166000 51916000 64401000 34151000 30250000 1925 3506;6749;10275 True;True;True 3606;6906;10501 12156;12157;22844;35816;35817;35818 15470;15471;28876;45024;45025;45026;45027;45028;45029 15470;28876;45027 Q9BUL8 Q9BUL8 7 7 7 Programmed cell death protein 10 PDCD10 sp|Q9BUL8|PDC10_HUMAN Programmed cell death protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD10 PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 5 7 7 5 7 7 5 7 38.2 38.2 38.2 24.701 212 212 0 50.979 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96075 0.87708 33.126 21 14 Leave out requantified 1.0376 0.90435 1.1713 0.93154 0.88818 1.1432 33.378 47.881 71.001 8 5 8 4 3 7 Leave out requantified Median Median 38.2 32.5 38.2 762900000 349560000 413340000 343200000 153940000 189260000 164320000 76584000 87737000 255380000 119040000 136340000 1926 361;4335;10261;11660;14457;15430;17876 True;True;True;True;True;True;True 370;4453;10487;11904;14794;15789;18281 1223;1224;1225;1226;1227;15013;15014;15015;35779;35780;35781;40269;40270;40271;49885;49886;49887;53076;53077;53078;61460;61461;61462;61463;61464 1583;1584;1585;1586;1587;1588;19073;19074;19075;19076;44968;44969;44970;44971;50460;50461;50462;50463;50464;50465;62388;62389;62390;66500;66501;66502;66503;77343;77344;77345;77346;77347 1585;19073;44968;50460;62389;66500;77343 Q9BUP3 Q9BUP3 2 2 2 Oxidoreductase HTATIP2 HTATIP2 sp|Q9BUP3|HTAI2_HUMAN Oxidoreductase 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1193;9897 3984;3985;33883 5176;42673 5176;42673 Q9BVJ7 Q9BVJ7 1 1 1 Dual specificity protein phosphatase 23 DUSP23 sp|Q9BVJ7|DUS23_HUMAN Dual specificity protein phosphatase 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUSP23 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 7.3 7.3 7.3 16.588 150 150 0 3.869 By MS/MS By MS/MS 0.1178 0.11059 12.035 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 7.3 7.3 33445000 29267000 4178200 0 0 0 14658000 13091000 1567100 18787000 16175000 2611200 1932 5658 True 5798 19242;19243 24368;24369 24369 Q9BVL2 Q9BVL2 3 3 3 Nucleoporin p58/p45 NUPL1 sp|Q9BVL2|NUP58_HUMAN Nucleoporin p58/p45 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP58 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6 6 6 60.896 599 599 0 4.1222 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94969 0.90701 0.54746 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 4.7 3.3 1.3 67856000 34091000 33766000 41433000 20114000 21318000 26424000 13976000 12447000 0 0 0 1933 963;7736;13812 True;True;True 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requantified Leave out requantified 31.3 32.6 35.3 2271000000 1035600000 1235300000 804870000 357200000 447670000 744470000 333680000 410800000 721630000 344750000 376880000 1935 1987;1988;2455;4172;6084;8815;9118;10567;11502;11604;13101;14503;14504;14989;15054;17306;17366;17367 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2051;2052;2532;4282;6231;9021;9327;10797;11746;11848;13408;14842;14843;15342;15409;17702;17762;17763 6882;6883;6884;6885;6886;8501;8502;8503;14491;14492;14493;20687;20688;20689;30601;30602;30603;30604;30605;31790;31791;31792;31793;31794;36828;36829;36830;39764;39765;39766;40103;45310;45311;50057;50058;50059;50060;50061;51699;51700;51701;51924;51925;51926;59476;59477;59478;59711;59712;59713;59714;59715;59716;59717 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Q9BW27 Q9BW27 4 4 4 Nuclear pore complex protein Nup85 NUP85 sp|Q9BW27|NUP85_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup85 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP85 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 10.1 10.1 10.1 75.019 656 656 0 8.4562 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1967 1.1293 10.965 9 1 Leave out requantified 1.1587 0.98415 1.2205 1.032 0.91181 1.147 15.782 20.419 47.973 3 3 3 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Median 7.3 7.3 6.1 181260000 83736000 97529000 73803000 33514000 40290000 58579000 29171000 29409000 48882000 21052000 27830000 1937 3252;14069;18077;18872 True;True;True;True 3344;14399;18483;19292 11257;11258;11259;48662;48663;62107;62108;62109;64720 14259;14260;14261;14262;60895;78131;78132;78133;81343 14259;60895;78132;81343 Q9BW71 Q9BW71 3 3 3 HIRA-interacting protein 3 HIRIP3 sp|Q9BW71|HIRP3_HUMAN HIRA-interacting protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIRIP3 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 5.9 5.9 5.9 61.956 556 556 0 7.6962 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0195 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acetyltransferase, cytosolic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAT2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 1 4 1 1 4 1 1 4 21.9 21.9 21.9 41.35 397 397 0 23.375 By MS/MS By matching By MS/MS 1.2787 1.1021 37.439 5 2 Median NaN NaN 1.3634 NaN NaN 1.3241 NaN NaN 40.319 1 1 3 0 0 2 Median Median Plateau 5 5 21.9 134790000 63536000 71256000 29834000 15017000 14816000 20505000 6944100 13561000 84454000 41575000 42879000 1940 7823;8235;8671;17855 True;True;True;True 8000;8422;8873;18260 27069;28477;30031;61401;61402;61403 34069;35799;37776;77271;77272 34069;35799;37776;77271 Q9BWF3 Q9BWF3 2 2 2 RNA-binding protein 4 RBM4 sp|Q9BWF3|RBM4_HUMAN RNA-binding protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM4 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 12.1 12.1 12.1 40.313 364 364 0 5.0388 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 7.7 0 4.4 17663000 8588700 9074100 17663000 8588700 9074100 0 0 0 0 0 0 1941 1493;16827 True;True 1540;17219 5093;57854 6574;72691 6574;72691 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6902;6903;6904;6905;6906;18848;18849;18850;31418;31419;31420;64986;64987;64988;64989;64990;64991;64992;64993;64994;65875;65876;65877;65878;65879;65880;75065;78915;78916 6906;18850;31420;64991;65880;75065;78916 Q9BXJ9 Q9BXJ9 26 26 24 N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit NAA15 sp|Q9BXJ9|NAA15_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA15 PE=1 SV=1 1 26 26 24 22 22 22 22 22 22 20 20 21 28.6 28.6 26.2 101.27 866 866 0 78.556 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0127 0.95894 14.917 77 16 Leave out requantified 1.0598 0.91897 1.065 0.91999 0.88627 1.0212 16.804 19.52 19 25 26 26 3 4 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.2 26.4 24.2 3180900000 1542900000 1638000000 1146200000 545280000 600870000 889890000 453270000 436620000 1144800000 544320000 600520000 1945 668;966;2755;3233;3328;4895;8702;8795;8836;9787;9976;10160;10938;12300;12301;12542;12543;13263;13884;14273;15565;15566;17147;18404;18468;18469 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1532;1533;1534;1535;1536;9369;9370;15051;15052;15053;15054;15055;15739;15740;15741;15742;15743;15744;17380;17381;17382;17383;17384;17385;19831;19832;19833;19834;19835;24391;24392;24393;24394;24395;24396;24397;24398;24399;35394;35395;35396;35397;35398;35399;35400;35401;35402;35403;35404;35405;35406;35407;35408;35409;35410;35411;35412;35413;35414;35415;35416;35417;35418;35419;35420;37626;37627;37628;37629;37630;37631;44481;48505;48506;48507;48508;48509;48510;49327;49328;49329;49330;50875;50876;50877;50878;50879;50880;53513;53514;53515;53516;53517;68293;70877;72922;72923;72924;72925;72926;72927 1533;9369;15052;15742;17382;19831;24391;24396;35394;35403;35413;37626;44481;48508;49328;50880;53515;68293;70877;72927 Q9BXR0 Q9BXR0 1 1 1 Queuine tRNA-ribosyltransferase QTRT1 sp|Q9BXR0|TGT_HUMAN Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QTRT1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.2 3.2 3.2 44.047 403 403 0 3.7982 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 3.2 7646900 3338100 4308800 0 0 0 0 0 0 7646900 3338100 4308800 1948 6266 True 6416 21319 26949 26949 Q9BXS5;Q9Y6Q5 Q9BXS5 7;1 7;1 7;1 AP-1 complex subunit mu-1 AP1M1 sp|Q9BXS5|AP1M1_HUMAN AP-1 complex subunit mu-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP1M1 PE=1 SV=3 2 7 7 7 6 5 6 6 5 6 6 5 6 20.3 20.3 20.3 48.586 423 423;423 0 15.624 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0947 1.0198 13.5 14 5 Leave out requantified 1.2388 1.125 1.0205 1.0917 1.0288 0.97931 22.812 5.8501 16.245 4 4 6 0 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 18.4 15.6 17 484900000 200440000 284460000 157730000 56544000 101190000 126430000 52665000 73770000 200740000 91232000 109500000 1949 618;3653;5003;8198;14358;15316;17205 True;True;True;True;True;True;True 640;3754;5132;8384;14693;15675;17600 2116;2117;2118;2119;12634;12635;12636;17202;17203;28355;28356;49601;52730;52731;52732;52733;59112;59113;59114 2712;2713;2714;2715;2716;16056;16057;16058;21843;35669;35670;62055;66039;66040;66041;66042;66043;66044;74297;74298;74299;74300 2712;16056;21843;35669;62055;66040;74298 Q9BXS6 Q9BXS6 3 3 3 Nucleolar and spindle-associated protein 1 NUSAP1 sp|Q9BXS6|NUSAP_HUMAN Nucleolar and spindle-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUSAP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 8.6 8.6 8.6 49.451 441 441 0 5.5179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75449 0.71506 69.812 5 3 Median NaN NaN 2.0151 NaN NaN 1.9112 NaN NaN 98.305 1 1 3 0 1 2 Median Median Plateau 2.9 5.7 8.6 82357000 54938000 27419000 11054000 7130100 3924000 7832700 4951500 2881200 63470000 42857000 20613000 1950 11399;14964;17048 True;True;True 11641;15311;17441 39454;51598;51599;58571;58572;58573;58574 49454;64575;64576;73596;73597;73598 49454;64576;73596 Q9BXV9 Q9BXV9 1 1 1 Uncharacterized protein C14orf142 C14orf142 sp|Q9BXV9|GON7_HUMAN EKC/KEOPS complex subunit GON7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GON7 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 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By MS/MS By MS/MS 0.87747 0.85315 14.593 5 1 Leave out requantified NaN NaN 0.78237 NaN NaN 0.76951 NaN NaN 18.457 1 1 3 0 0 1 Median Median Median 0.9 0.9 3.1 40887000 21863000 19024000 6726600 3605300 3121300 4734900 2631500 2103500 29425000 15626000 13799000 1953 2360;14386;16522 True;True;True 2435;14722;16910 8153;8154;8155;49681;56840 10470;10471;10472;10473;62141;71320 10471;62141;71320 Q9BXY0 Q9BXY0 1 1 1 Protein MAK16 homolog MAK16 sp|Q9BXY0|MAK16_HUMAN Protein MAK16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAK16 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 6 6 6 35.368 300 300 0.00048077 2.7321 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 6 0 40245000 21573000 18671000 0 0 0 40245000 21573000 18671000 0 0 0 1954 944 True 976 3270 4233 4233 Q9BY32 Q9BY32 3 3 3 Inosine triphosphate pyrophosphatase ITPA sp|Q9BY32|ITPA_HUMAN Inosine triphosphate pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITPA PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 21.6 21.6 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dpy-30 homolog DPY30 sp|Q9C005|DPY30_HUMAN Protein dpy-30 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPY30 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.1 11.1 11.1 11.25 99 99 0 2.9677 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95638 0.89356 12.584 6 0 Median 1.0655 0.94198 1.0202 0.98341 0.89178 0.9916 18.89 2.561 17.004 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 11.1 11.1 11.1 102990000 49689000 53305000 39818000 19165000 20653000 28838000 13044000 15794000 34338000 17480000 16857000 1969 13322 True 13636 46119;46120;46121;46122;46123;46124 57644;57645;57646;57647 57645 Q9C0B1 Q9C0B1 11 11 11 Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO FTO sp|Q9C0B1|FTO_HUMAN Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTO PE=1 SV=3 1 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 31.9 31.9 31.9 58.281 505 505 0 49.96 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0834 0.98812 12.813 28 11 Leave out requantified 1.1514 1.0239 1.0564 1.0207 0.96851 1.0232 11.264 10.154 16.333 9 10 9 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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protein 5 COMMD5 sp|Q9GZQ3|COMD5_HUMAN COMM domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COMMD5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.4 5.4 5.4 24.67 224 224 0 3.72 By MS/MS By matching By MS/MS 1.1689 1.0098 7.5259 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.4 5.4 5.4 64303000 30633000 33670000 24913000 11953000 12960000 20241000 10185000 10056000 19149000 8495500 10653000 1977 5676 True 5816 19292;19293;19294 24431;24432;24433 24432 Q9GZR7 Q9GZR7 3 3 3 ATP-dependent RNA helicase DDX24 DDX24 sp|Q9GZR7|DDX24_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX24 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 1 2 3 1 2 3 1 5.4 5.4 5.4 96.331 859 859 0 6.9708 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1099 1.0753 7.9895 3 0 Median NaN 1.1208 NaN NaN 1.078 NaN NaN 0.35587 NaN 1 2 0 0 0 0 Median Median Median 3.6 5.4 1.4 58812000 17973000 40839000 24650000 7100000 17550000 27161000 10873000 16288000 7000400 0 7000400 1978 1276;2567;12240 True;True;True 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Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAIP1 PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 16.5 16.5 16.5 53.524 479 479 0 33.73 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0989 0.98332 19.418 24 4 Leave out requantified 1.1463 1.0486 1.0872 1.0118 0.96581 1.0166 9.6812 22.781 8.3677 8 7 9 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.5 15 16.5 1303000000 596120000 706920000 551260000 234840000 316430000 330960000 159730000 171230000 420820000 201560000 219260000 1987 243;4129;4943;6303;7724;11336;18949 True;True;True;True;True;True;True 247;4239;5069;6454;7901;11578;19372 789;790;791;14349;14350;14351;14352;14353;17005;17006;21475;21476;21477;21478;21479;26731;26732;26733;39270;39271;39272;64970;64971;64972 1033;1034;1035;1036;1037;1038;18234;18235;18236;18237;18238;18239;18240;21599;27145;27146;27147;27148;27149;27150;27151;33638;33639;33640;33641;49215;49216;49217;81661;81662 1038;18235;21599;27149;33641;49217;81661 Q9H089 Q9H089 3 3 3 Large subunit GTPase 1 homolog LSG1 sp|Q9H089|LSG1_HUMAN Large subunit GTPase 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LSG1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 4.3 4.3 4.3 75.225 658 658 0 6.6708 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3229 1.2903 12.38 7 1 Leave out requantified 1.1647 NaN 1.3878 1.048 NaN 1.3236 18.046 NaN 41.693 3 1 3 0 0 1 Leave out requantified Median Plateau 4.3 4.3 4.3 278960000 127880000 151080000 92625000 38491000 54134000 85122000 35311000 49812000 101210000 54078000 47133000 1988 6020;6021;13087 True;True;True 6165;6166;13394 20483;20484;20485;20486;20487;45278;45279;45280 25919;25920;25921;25922;25923;25924;25925;25926;25927;56576;56577 25919;25922;56577 Q9H0A0 Q9H0A0 5 5 5 N-acetyltransferase 10 NAT10 sp|Q9H0A0|NAT10_HUMAN RNA cytidine acetyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAT10 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 3 4 3 3 4 3 3 4 6.6 6.6 6.6 115.73 1025 1025 0 13.218 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0648 1.0201 13.462 12 7 Leave out requantified 1.7355 1.0901 1.0907 1.5521 1.0393 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kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILKAP PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 8 7 6 8 7 6 8 7 19.4 19.4 19.4 42.906 392 392 0 25.097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1805 1.0971 12.744 25 7 Leave out requantified 1.2452 0.96478 1.0845 1.0777 0.95115 1.0271 14.467 17.219 11.273 6 11 8 0 5 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.1 19.4 17.3 952280000 459210000 493070000 253290000 114160000 139130000 400190000 200000000 200190000 298790000 145040000 153760000 1992 1879;2007;3742;4881;5161;5903;7399;14636 True;True;True;True;True;True;True;True 1942;2071;3845;5007;5291;6046;7571;14978 6441;6442;6443;6945;6946;12958;12959;12960;12961;12962;12963;16793;16794;16795;16796;16797;17702;17703;17704;20076;20077;20078;20079;25571;25572;25573;50461;50462 8372;8373;8374;8375;8963;8964;8965;16485;16486;16487;16488;16489;16490;16491;21341;21342;21343;21344;21345;21346;22472;22473;22474;25396;25397;25398;25399;25400;25401;32248;32249;32250;63169;63170 8373;8963;16489;21342;22473;25397;32248;63169 Q9H0D6 Q9H0D6 5 5 5 5-3 exoribonuclease 2 XRN2 sp|Q9H0D6|XRN2_HUMAN 5-3 exoribonuclease 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRN2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 7.5 7.5 7.5 108.58 950 950 0 12.553 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0724 0.92818 32.823 10 3 Leave out requantified 0.95588 0.65099 1.0902 0.83272 0.61275 1.0456 25.639 24.143 76.898 4 3 3 1 1 1 Leave out requantified Median Median 5.5 5.9 4.2 160750000 108130000 52619000 77832000 47785000 30047000 52418000 37886000 14532000 30496000 22457000 8039500 1993 2896;6914;12557;12731;18585 True;True;True;True;True 2980;7078;12849;13030;19000 10057;23484;23485;23486;43477;43478;43479;44052;44053;63697;63698 12794;29716;29717;29718;29719;54356;54357;54358;55064;55065;80066 12794;29717;54358;55064;80066 Q9H0G5 Q9H0G5 2 2 2 Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 NSRP1 sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSRP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 5 5 66.389 558 558 0 6.2887 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1103 1.0785 24.43 5 2 Median 1.1223 NaN 1.2394 1.0226 NaN 1.1958 34.003 NaN 14.595 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 5 5 5 75116000 34048000 41068000 35738000 16487000 19251000 7773600 4038900 3734700 31605000 13522000 18082000 1994 6288;12655 True;True 6438;12953 21404;21405;21406;43803;43804;43805 27065;54741;54742;54743 27065;54741 Q9H0L4 Q9H0L4 2 1 1 Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant CSTF2T sp|Q9H0L4|CSTFT_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF2T PE=1 SV=1 1 2 1 1 2 1 0 1 1 0 1 1 0 4.1 1.8 1.8 64.436 616 616 0 3.2528 By MS/MS By MS/MS 1.4672 1.3031 8.581 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 0 Median Median Median 4.1 1.8 0 26162000 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Ras-related protein Rab-1C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB1C PE=5 SV=2 2 8 2 2 8 8 8 2 2 2 2 2 2 50.2 15.9 15.9 22.171 201 201;201 0 34.169 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0307 0.95641 8.9599 9 2 Leave out requantified 1.111 0.85251 1.0858 0.98138 0.80086 1.0533 8.0391 41.978 15.475 3 3 3 0 2 0 Median Median Median 50.2 50.2 50.2 643040000 324150000 318890000 265190000 125260000 139930000 191460000 102830000 88639000 186380000 96059000 90325000 1997 3546;4886;10610;11798;12176;13840;15985;16040 False;False;False;True;True;False;False;False 3646;5012;10840;12052;12458;14164;16360;16416 12275;12276;12277;12278;12279;12280;12281;16810;16811;16812;16813;36976;36977;36978;36979;36980;36981;40759;40760;40761;42081;42082;42083;42084;42085;42086;47797;47798;47799;55044;55045;55046;55246;55247;55248 15610;15611;15612;15613;15614;15615;15616;15617;15618;15619;15620;15621;21357;21358;21359;21360;21361;46432;46433;46434;46435;46436;46437;51071;51072;51073;52702;52703;52704;52705;52706;52707;52708;52709;52710;59826;59827;59828;69065;69066;69067;69068;69069;69320;69321;69322;69323;69324;69325 15620;21357;46436;51072;52707;59826;69066;69325 Q9H1A4 Q9H1A4 2 2 2 Anaphase-promoting complex subunit 1 ANAPC1 sp|Q9H1A4|APC1_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 1.6 1.6 1.6 216.5 1944 1944 0.0056943 1.8279 By MS/MS By matching 0.8244 0.78274 17.082 3 1 Median 0.89802 NaN NaN 0.80878 NaN NaN 24.01 NaN NaN 2 1 0 1 0 0 Median Median Median 1.6 0.5 0 33063000 17438000 15625000 25245000 13350000 11895000 7817900 4087800 3730100 0 0 0 1998 5492;10697 True;True 5626;10928 18708;37263;37264 23693;46772 23693;46772 Q9H1E3 Q9H1E3 1 1 1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 NUCKS1 sp|Q9H1E3|NUCKS_HUMAN Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUCKS1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 27.296 243 243 0.0056868 1.795 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94801 0.88907 20.425 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 246210000 118970000 127240000 82285000 34635000 47650000 78723000 41033000 37690000 85203000 43301000 41903000 1999 1570 True 1622 5376;5377;5378 6958;6959;6960;6961 6959 Q9H1H9;Q9NQT8 Q9H1H9;Q9NQT8 2;1 2;1 2;1 Kinesin-like protein KIF13A;Kinesin-like protein KIF13B KIF13A;KIF13B sp|Q9H1H9|KI13A_HUMAN Kinesin-like protein KIF13A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF13A PE=1 SV=2;sp|Q9NQT8|KI13B_HUMAN Kinesin-like protein KIF13B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF13B PE=1 SV=2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1.6 1.6 1.6 202.31 1805 1805;1826 0 3.7359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2438 1.1265 11.959 4 1 Median 1.267 NaN NaN 1.1265 NaN NaN 5.5492 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 1.6 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MS/MS By matching By MS/MS 0.81901 0.79851 27.913 4 2 Median 0.6473 NaN NaN 0.59565 NaN NaN 30.962 NaN NaN 2 1 1 1 0 1 Median Median Median 11.6 4.7 6.9 39414000 20910000 18504000 22697000 12510000 10187000 8963300 4434000 4529300 7753800 3966800 3786900 2002 8722;9992 True;True 8924;10213 30197;30198;34873;34874 37983;43889;43890 37983;43889 Q9H201 Q9H201 2 1 1 Epsin-3 EPN3 sp|Q9H201|EPN3_HUMAN Epsin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPN3 PE=2 SV=1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 3.5 1.6 1.6 68.221 632 632 0 5.1709 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2663 1.1442 15.861 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.5 3.5 3.5 35336000 17078000 18258000 10810000 4701900 6108000 12157000 6804300 5352600 12369000 5572100 6797200 2003 1074;12400 True;False 1108;12685 3686;3687;3688;42863;42864;42865 4770;4771;4772;4773;4774;4775;53623;53624;53625 4775;53625 Q9H211 Q9H211 1 1 1 DNA replication factor Cdt1 CDT1 sp|Q9H211|CDT1_HUMAN DNA replication factor Cdt1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDT1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.5 3.5 3.5 60.39 546 546 0 3.2224 By matching By MS/MS 0.6792 0.66151 37.298 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 3.5 3.5 39732000 25457000 14275000 0 0 0 16672000 10159000 6513200 23060000 15299000 7761400 2004 450 True 466 1533;1534 1977 1977 410 321 Q9H223 Q9H223 9 8 7 EH domain-containing protein 4 EHD4 sp|Q9H223|EHD4_HUMAN EH domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHD4 PE=1 SV=1 1 9 8 7 7 8 6 7 7 6 6 6 5 17.7 16.3 14.8 61.174 541 541 0 48.486 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1752 1.0137 14.921 19 12 Leave out requantified 1.2343 0.84105 0.89148 1.1105 0.78839 0.83073 8.1277 75.242 40.816 7 7 5 3 6 3 Leave out requantified Median Median 14.2 15.5 12 666650000 340670000 325980000 299670000 150470000 149200000 204040000 100830000 103220000 162940000 89370000 73566000 2005 274;533;2514;4279;5095;9924;10228;10945;14694 True;True;True;False;True;True;True;True;True 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kinase SLK sp|Q9H2G2|SLK_HUMAN STE20-like serine/threonine-protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLK PE=1 SV=1 2 16 16 16 12 12 12 12 12 12 12 12 12 15.8 15.8 15.8 142.69 1235 1235;968 0 51.712 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1225 1.0289 30.85 33 8 Leave out requantified 1.1355 1.0196 1.0512 1.0155 0.97982 1.0407 25.345 38.223 33.549 10 11 12 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.4 13.4 13.2 890950000 421970000 468980000 295070000 143920000 151150000 253560000 120490000 133070000 342320000 157560000 184760000 2007 409;410;571;936;1461;1885;2750;4796;8316;8317;8672;9158;9474;13735;13845;18190 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 420;421;592;968;1506;1948;2827;4922;8507;8508;8874;9367;9690;14059;14169;18598 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MS/MS By MS/MS 0.94728 0.92172 45.137 7 4 Median NaN 1.1235 0.73709 NaN 1.049 0.72016 NaN 18.289 47.061 1 2 4 1 0 3 Median Median Median 4.5 8.2 12.7 199950000 131990000 67963000 63926000 50069000 13858000 36293000 15272000 21021000 99735000 66651000 33085000 2013 1729;13795;16587 True;True;True 1784;14119;16977 5904;5905;47658;47659;47660;57059;57060 7655;59642;59643;59644;71607;71608 7655;59644;71608 Q9H3K6 Q9H3K6 2 2 2 BolA-like protein 2 BOLA2 sp|Q9H3K6|BOLA2_HUMAN BolA-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BOLA2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 40.7 40.7 40.7 10.116 86 86 0 8.3298 By MS/MS By MS/MS 0.87867 0.87121 22.248 4 2 Median 0.95673 NaN 0.87867 0.8333 NaN 0.87121 38.276 NaN 0.25904 2 0 2 0 0 2 Median Median Median 40.7 0 22.1 195080000 92704000 102380000 106210000 50985000 55229000 0 0 0 88866000 41719000 47148000 2014 2626;11517 True;True 2703;11761 9091;39814;39815;39816 11589;49888;49889;49890 11589;49889 Q9H3P2 Q9H3P2 4 4 4 Negative elongation factor A NELFA 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MS/MS By MS/MS 0.90497 0.84177 15.377 57 16 Leave out requantified 1.0437 0.92574 0.91468 0.896 0.87746 0.89579 21.41 9.8767 23.161 19 19 19 6 6 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.6 18.8 19.7 1933700000 952100000 981610000 776490000 380800000 395700000 540600000 261250000 279360000 616620000 310060000 306560000 2019 149;737;956;1098;1411;1684;1685;2829;3678;4758;5818;9739;9794;10481;10765;11344;12353;13117;15013;16262;17135 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 153;764;988;1132;1456;1738;1739;2909;3780;4884;5960;9958;10015;10711;10996;11586;12638;13424;15367;16648;17528 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True 277;2592;3846;4350;4395;7390;8041;9404;9698;10146;10726;10890;15089 887;888;8694;12964;12965;12966;12967;12968;14705;14706;14707;14847;14848;14849;24767;24768;24769;24770;24771;24772;27199;32071;32072;32073;33170;33171;33172;34647;34648;34649;36590;36591;36592;37139;37140;37141;50843;50844;50845 1165;1166;11126;16492;16493;16494;16495;16496;16497;16498;18665;18666;18667;18861;18862;18863;31224;31225;31226;31227;31228;31229;34231;40370;40371;40372;41740;41741;41742;43615;43616;43617;45963;45964;45965;46629;46630;63644;63645;63646 1165;11126;16496;18666;18861;31228;34231;40370;41740;43617;45964;46630;63645 Q9H501 Q9H501 1 1 1 ESF1 homolog ESF1 sp|Q9H501|ESF1_HUMAN ESF1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESF1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.8 1.8 1.8 98.795 851 851 0.00045809 2.267 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 1.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2030 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78820;78821;78822;78823 78820 Q9H6Z4 Q9H6Z4 4 4 4 Ran-binding protein 3 RANBP3 sp|Q9H6Z4|RANB3_HUMAN Ran-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 3 2 2 3 2 2 3 8.8 8.8 8.8 60.209 567 567 0 8.6975 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3403 1.2855 63.042 7 2 Median 0.6827 2.2194 1.399 0.61766 2.1064 1.3338 49.139 69.839 26.933 2 2 3 1 0 1 Median Median Median 4.6 4.8 6.3 140500000 69640000 70860000 52315000 32290000 20025000 26955000 8678000 18277000 61230000 28672000 32558000 2037 8537;10008;10830;17202 True;True;True;True 8735;10229;11066;17597 29562;29563;29564;34913;37670;37671;59109 37168;37169;37170;37171;37172;43937;47258;47259;74294 37171;43937;47259;74294 Q9H773 Q9H773 5 5 5 dCTP pyrophosphatase 1 DCTPP1 sp|Q9H773|DCTP1_HUMAN dCTP pyrophosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTPP1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 5 22.9 22.9 22.9 18.681 170 170 0 22.567 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89833 0.84321 8.6514 12 4 Leave out requantified 0.97427 0.98455 0.79958 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190450000 104400000 86053000 111770000 55405000 56367000 124090000 56415000 67677000 2039 9330;12389;15179;16846;16847;18421 True;True;True;True;True;True 9543;12674;15536;17238;17239;18831 32591;42816;52333;52334;52335;57909;57910;57911;57912;57913;57914;57915;63181;63182 41027;53575;65546;65547;65548;72764;72765;72766;72767;72768;72769;79420 41027;53575;65548;72764;72767;79420 Q9H7B2 Q9H7B2 1 1 1 Ribosome production factor 2 homolog RPF2 sp|Q9H7B2|RPF2_HUMAN Ribosome production factor 2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPF2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 35.582 306 306 0.0018083 2.1015 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3961 1.2419 25.943 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 15994000 6431600 9562000 5392300 2391600 3000700 3513600 1309500 2204100 7087700 2730400 4357200 2040 14869 True 15215 51278;51279;51280 64183;64184;64185 64183 Q9H7B4 Q9H7B4 1 1 1 Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3 SMYD3 sp|Q9H7B4|SMYD3_HUMAN Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMYD3 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.6 2.6 2.6 49.097 428 428 0 3.3308 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 2.6 0 0 7545600 3544900 4000700 7545600 3544900 4000700 0 0 0 0 0 0 2041 2910 True 2994 10120 12865 12865 Q9H7D0 Q9H7D0 5 5 5 Dedicator of cytokinesis protein 5 DOCK5 sp|Q9H7D0|DOCK5_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK5 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 3.1 3.1 3.1 215.31 1870 1870 0 6.5346 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.174 1.1354 30.651 11 3 Leave out requantified 1.2823 1.274 1.1018 1.1635 1.2346 1.1008 44.52 34.402 14.149 4 4 3 3 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 2.5 2.5 1.9 136530000 60539000 75989000 51074000 23074000 28001000 49252000 19438000 29813000 36201000 18026000 18175000 2042 691;5178;5704;10656;11327 True;True;True;True;True 715;5308;5845;10887;11569 2370;2371;2372;17754;19401;19402;19403;37131;37132;37133;39250 3045;22529;24560;24561;46620;46621;46622;49198 3045;22529;24560;46622;49198 Q9H832 Q9H832 7 7 7 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z UBE2Z sp|Q9H832|UBE2Z_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2Z PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 6 5 5 6 5 5 6 5 20.3 20.3 20.3 38.21 354 354 0 19.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0921 0.99871 17.603 18 7 Leave out requantified 1.2186 1.1551 1.0174 1.0768 1.0708 0.95592 23.494 20.537 6.2231 5 7 6 1 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.6 15.8 14.1 812130000 383760000 428370000 267630000 121130000 146500000 303340000 140060000 163280000 241160000 122570000 118590000 2043 5393;10181;10820;12899;14437;15626;16932 True;True;True;True;True;True;True 5526;10406;11055;13205;14774;15991;17324 18405;18406;18407;35512;37642;37643;37644;44676;44677;44678;49833;49834;49835;53755;58197;58198;58199;58200 23318;23319;23320;44656;47224;47225;47226;47227;47228;47229;55831;55832;55833;55834;55835;55836;62332;62333;62334;67391;73144;73145;73146;73147 23319;44656;47225;55834;62334;67391;73145 Q9H845 Q9H845 2 2 2 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial ACAD9 sp|Q9H845|ACAD9_HUMAN Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAD9 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.7 3.7 3.7 68.76 621 621 0 2.9851 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0452 1.0224 0.87865 6 0 Leave out requantified 1.1662 0.82392 1.0906 1.0731 0.78882 1.0782 5.9674 17.171 8.3969 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 77668000 40439000 37229000 26492000 12116000 14376000 21924000 13028000 8895100 29252000 15294000 13958000 2044 1770;6730 True;True 1828;6887 6062;6063;6064;22787;22788;22789 7884;28802;28803 7884;28803 Q9H8Y8 Q9H8Y8 4 4 4 Golgi reassembly-stacking protein 2 GORASP2 sp|Q9H8Y8|GORS2_HUMAN Golgi reassembly-stacking protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GORASP2 PE=1 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23.222 212 212 0 6.2119 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94497 0.94313 18.613 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 6.6 6.6 6.6 50855000 23993000 26862000 21451000 8696000 12755000 15904000 7816000 8087900 13500000 7480700 6019200 2048 6927 True 7091 23530;23531;23532 29770;29771;29772 29772 Q9H9A6 Q9H9A6 13 13 13 Leucine-rich repeat-containing protein 40 LRRC40 sp|Q9H9A6|LRC40_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC40 PE=1 SV=1 1 13 13 13 12 10 6 12 10 6 12 10 6 30.6 30.6 30.6 68.249 602 602 0 43.285 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0893 0.9616 14.691 27 8 Leave out requantified 1.2637 1.0148 1.0893 1.1356 0.94128 1.0558 24.18 16.733 23.226 11 10 6 4 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 21.4 13.5 2512500000 1152800000 1359700000 1038500000 461830000 576680000 762020000 353910000 408110000 712010000 337090000 374920000 2049 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Median Median 1.8 0 1.8 18515000 9940300 8575100 12519000 5255200 7264200 0 0 0 5996000 4685100 1310900 2050 9996 True 10217 34881;34882 43898;43899 43898 Q9H9Q2 Q9H9Q2 7 7 7 COP9 signalosome complex subunit 7b COPS7B sp|Q9H9Q2|CSN7B_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 7b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS7B PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 6 4 5 6 4 5 6 4 26.5 26.5 26.5 29.622 264 264 0 98.714 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1101 0.99642 43.937 21 8 Leave out requantified 1.2414 0.96263 1.2308 1.0921 0.89754 1.184 10.132 44.516 37.289 8 7 6 3 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 22.7 23.9 20.1 888410000 415940000 472470000 403000000 178400000 224600000 203850000 103630000 100220000 281560000 133900000 147660000 2051 1494;1495;2500;4514;7268;16430;16431 True;True;True;True;True;True;True 1541;1542;2577;4637;7436;16818;16819 5094;5095;5096;5097;5098;5099;5100;5101;5102;8643;15596;15597;15598;24975;56536;56537;56538;56539;56540;56541;56542;56543 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNB4 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.5 3.5 3.5 37.567 340 340 0.002687 2.0242 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 3.5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2057 15863 True 16237 54567 68466 68466 Q9HAV4 Q9HAV4 15 15 15 Exportin-5 XPO5 sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN Exportin-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO5 PE=1 SV=1 1 15 15 15 14 11 11 14 11 11 14 11 11 15.8 15.8 15.8 136.31 1204 1204 0 74.985 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2369 1.1044 22.175 32 11 Leave out requantified 1.2668 1.0022 1.2285 1.127 0.95283 1.1499 25.266 23.617 31.003 12 11 9 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.6 13.1 11.3 1175800000 565070000 610710000 519750000 231220000 288530000 373690000 200990000 172700000 282340000 132850000 149490000 2058 1673;1674;1728;2869;8675;9999;10200;10483;10644;12526;14225;14856;15684;16076;16481 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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9746;9747;10345;10346;10347;23078;23079;23080;39269;50916;50917;50918 12414;12415;13141;13142;13143;29203;29204;29205;29206;49214;63731;63732;63733 12414;13143;29205;49214;63733 Q9HD26 Q9HD26 4 4 4 Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein GOPC sp|Q9HD26|GOPC_HUMAN Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOPC PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 1 3 4 1 3 4 1 11.3 11.3 11.3 50.519 462 462 0 9.9573 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94477 0.9065 17.481 7 2 Leave out requantified 1.1455 1.0525 NaN 1.0332 1.0258 NaN 55.249 38.647 NaN 3 3 1 1 1 0 Plateau Plateau Median 6.1 11.3 2.2 131310000 69692000 61616000 64231000 33574000 30657000 48124000 27107000 21016000 18953000 9011000 9942300 2069 3373;9783;11632;14368 True;True;True;True 3470;10003;11876;14703 11676;11677;34208;34209;40190;49623;49624;49625 14840;14841;43075;43076;50373;62073;62074;62075;62076 14840;43075;50373;62073 Q9NP61 Q9NP61 3 3 3 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 ARFGAP3 sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 5.6 5.6 5.6 56.928 516 516 0 5.0008 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94338 0.86675 6.3651 7 0 Leave out requantified 0.93836 0.94338 1.2207 0.82184 0.91457 1.1899 4.7608 7.594 8.8014 3 2 2 0 0 0 Leave out requantified Median Median 5.6 3.5 3.5 120530000 56198000 64332000 54713000 26414000 28299000 35386000 16717000 18669000 30430000 13067000 17364000 2070 1536;9558;16964 True;True;True 1585;9774;17356 5265;5266;5267;33430;58299;58300;58301 6814;6815;6816;6817;42067;73271 6814;42067;73271 Q9NP73 Q9NP73 1 1 1 Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13 ALG13 sp|Q9NP73|ALG13_HUMAN Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALG13 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.7 1.7 1.7 126.05 1137 1137 0.00048216 2.7531 By MS/MS By MS/MS 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ENY2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENY2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 16.8 16.8 16.8 11.528 101 101 0 3.0741 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 16.8 0 0 37342000 22928000 14414000 37342000 22928000 14414000 0 0 0 0 0 0 2073 6356 True 6507 21635 27349 27349 Q9NPD3 Q9NPD3 2 2 2 Exosome complex component RRP41 EXOSC4 sp|Q9NPD3|EXOS4_HUMAN Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 9 9 9 26.383 245 245 0 4.3798 By MS/MS By MS/MS 0.85528 0.75001 11.607 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 Median Median Median 4.1 4.9 0 74591000 36386000 38205000 56970000 28089000 28881000 17620000 8296700 9323700 0 0 0 2074 841;17578 True;True 870;17979 2939;60502 3779;76120 3779;76120 Q9NPD8 Q9NPD8 7 7 7 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T UBE2T sp|Q9NPD8|UBE2T_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2T PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 5 4 7 5 4 7 5 4 45.7 45.7 45.7 22.521 197 197 0 55.508 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1428 1.0589 14.052 18 9 Leave out requantified 1.2063 1.081 1.17 1.0751 1.0338 1.1051 15.526 18.827 11.854 7 6 5 3 4 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 45.7 24.9 27.4 873220000 403520000 469700000 409340000 187900000 221440000 154650000 72686000 81960000 309240000 142940000 166300000 2075 219;1313;4086;5331;7592;8779;13297 True;True;True;True;True;True;True 223;1356;4196;5463;7768;8983;13610 710;711;4507;4508;4509;4510;4511;4512;14210;18209;18210;26293;26294;26295;30426;30427;46007;46008;46009 928;929;5839;5840;5841;5842;5843;5844;18058;23064;23065;33095;33096;38324;57514;57515;57516 929;5840;18058;23065;33095;38324;57515 Q9NPF4 Q9NPF4 5 5 5 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OSGEP sp|Q9NPF4|OSGEP_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEP PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 17.9 17.9 17.9 36.426 335 335 0 18.099 By 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4568;32963;41615;51685;66839 Q9NQP4 Q9NQP4 1 1 1 Prefoldin subunit 4 PFDN4 sp|Q9NQP4|PFD4_HUMAN Prefoldin subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 11.2 11.2 11.2 15.314 134 134 0 8.1141 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 11.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2084 5 True 5 14 25 25 Q9NQT4 Q9NQT4 4 4 4 Exosome complex component RRP46 EXOSC5 sp|Q9NQT4|EXOS5_HUMAN Exosome complex component RRP46 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC5 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 33.6 33.6 33.6 25.249 235 235 0 33.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1406 1.1407 35.929 9 2 Leave out requantified 1.2301 0.99605 1.1406 1.2058 0.95943 1.1407 43.25 42.903 20.607 3 3 3 0 1 1 Leave out requantified Median Median 18.3 23.4 18.3 199340000 93724000 105620000 78161000 32706000 45455000 50996000 30955000 20042000 70188000 30064000 40124000 2085 1535;6479;7072;7854 True;True;True;True 1584;6630;7237;8032 5262;5263;5264;21997;21998;24083;27171;27172;27173 6810;6811;6812;6813;27814;27815;30441;34200 6813;27814;30441;34200 Q9NQT5 Q9NQT5 3 3 3 Exosome complex component RRP40 EXOSC3 sp|Q9NQT5|EXOS3_HUMAN Exosome complex component RRP40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC3 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 13.1 13.1 13.1 29.572 275 275 0 7.2924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80615 0.75052 31.647 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 13.1 5.8 11.3 30465000 12080000 18384000 16128000 5796100 10332000 0 0 0 14337000 6284400 8052600 2086 5860;7185;19072 True;True;True 6002;7351;19496 19934;24604;24605;65364;65365 25222;31048;31049;31050;31051;82172;82173 25222;31048;82173 Q9NQW6 Q9NQW6 2 2 2 Actin-binding protein anillin ANLN sp|Q9NQW6|ANLN_HUMAN Anillin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANLN PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1.8 1.8 1.8 124.2 1124 1124 0 3.7855 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95687 0.92867 26.734 4 2 Median NaN 1.0887 NaN NaN 1.0364 NaN NaN 16.706 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301;302;1468;2864;3096;5285;7082;11519;12298;16534 950;951;952;953;4856;4857;4858;4859;9648;9649;9650;10451;10452;10453;17686;17687;17688;23498;23499;23500;39085;39086;39087;41541;41542;55668;55669;55670 1240;1241;6273;6274;6275;6276;6277;6278;6279;12281;12282;13283;13284;13285;13286;13287;13288;22451;22452;22453;22454;29730;29731;29732;29733;29734;48993;48994;48995;48996;52019;52020;69850;69851;69852;69853;69854;69855 1240;1241;6273;12281;13284;22454;29730;48993;52020;69851 Q9NQZ2 Q9NQZ2 1 1 1 Something about silencing protein 10 UTP3 sp|Q9NQZ2|SAS10_HUMAN Something about silencing protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UTP3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.5 2.5 2.5 54.557 479 479 0 3.7258 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 2.5 0 2.5 18233000 1041000 17192000 10081000 0 10081000 0 0 0 8151300 1041000 7110300 2089 14125 True 14457 48842;48843 61093;61094 61093 Q9NR09 Q9NR09 2 2 2 Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 BIRC6 sp|Q9NR09|BIRC6_HUMAN Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BIRC6 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 0.4 0.4 0.4 530.25 4857 4857 0 10.553 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1583 1.0921 36.647 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 0.2 0.4 0.4 50081000 15314000 34767000 18673000 9452800 9219800 5911600 0 5911600 25496000 5861300 19635000 2090 10925;15018 True;True 11162;15372 37971;37972;51806;51807;51808;51809 47634;47635;64849;64850;64851;64852 47635;64851 Q9NR12 Q9NR12 5 5 5 PDZ and LIM domain protein 7 PDLIM7 sp|Q9NR12|PDLI7_HUMAN PDZ and LIM domain protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM7 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 3 4 5 3 4 5 3 16.4 16.4 16.4 49.844 457 457 0 12.234 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2316 1.1623 22.653 12 5 Leave out requantified 1.2403 1.3149 0.87227 1.0936 1.2629 0.82237 4.4595 32.054 61.081 4 5 3 2 2 1 Median Leave out requantified Median 14 16.4 9.4 380630000 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Nucleolar RNA helicase 2 DDX21 sp|Q9NR30|DDX21_HUMAN Nucleolar RNA helicase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX21 PE=1 SV=5 2 28 28 28 25 24 22 25 24 22 25 24 22 42 42 42 87.343 783 783;737 0 242.03 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0557 0.99552 16.489 96 27 Leave out requantified 1.1079 1.0205 1.0389 0.97787 0.98492 1.0192 19.614 21.251 19.564 33 33 30 9 13 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.3 36.5 31.2 6398300000 3201500000 3196800000 2333200000 1073900000 1259300000 1806500000 961720000 844800000 2258600000 1165900000 1092700000 2093 165;3099;3372;3607;3933;3982;4409;5807;6333;7882;8751;8826;9050;9055;10146;10404;10494;12244;13025;14250;14276;15399;15400;15607;15848;16005;18153;18489 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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26985;26986;40530;40531;40532;59563;59564 33964;33965;50778;50779;50780;74889;74890 33965;50779;74889 Q9NRY4 Q9NRY4 7 7 7 Rho GTPase-activating protein 35 ARHGAP35 sp|Q9NRY4|RHG35_HUMAN Rho GTPase-activating protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP35 PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 5 4 4 5 4 4 5 4 4.9 4.9 4.9 170.51 1499 1499 0 10.279 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4144 1.3929 71.492 14 7 Leave out requantified 1.6316 1.0217 1.4144 1.4798 0.99428 1.3929 72.549 64.679 47.146 5 5 4 3 3 1 Median Median Leave out requantified 2.7 3.5 2.7 139810000 55722000 84087000 59273000 23065000 36208000 46200000 20515000 25685000 34335000 12142000 22194000 2103 4517;4577;5589;7986;9842;10545;14796 True;True;True;True;True;True;True 4640;4702;5726;8169;10063;10775;15141 15605;15606;15810;18996;27638;27639;27640;34390;34391;34392;36745;36746;51029;51030 19839;19840;20093;24059;34782;34783;34784;43301;43302;43303;46140;46141;63861 19839;20093;24059;34782;43301;46141;63861 Q9NRY5 Q9NRY5 2 2 2 Protein FAM114A2 FAM114A2 sp|Q9NRY5|F1142_HUMAN Protein FAM114A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM114A2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 8.1 8.1 8.1 55.468 505 505 0 5.8974 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0563 1.0073 17.257 8 0 Leave out requantified 1.1768 0.81139 0.97059 1.1019 0.78594 0.94033 14.629 3.8764 6.4886 3 2 3 0 0 0 Median Median Median 8.1 3 8.1 124400000 59881000 64514000 51634000 22179000 29456000 32896000 17572000 15324000 39865000 20130000 19734000 2104 9294;14939 True;True 9506;15286 32435;32436;32437;32438;32439;32440;51497;51498 40841;40842;40843;40844;40845;40846;64433;64434 40843;64433 Q9NRZ9 Q9NRZ9 3 3 3 Lymphoid-specific helicase HELLS sp|Q9NRZ9|HELLS_HUMAN Lymphoid-specific helicase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HELLS PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 3.9 3.9 3.9 97.073 838 838 0 4.8865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0357 0.99185 13.29 7 1 Leave out requantified 0.97859 1.011 1.0236 0.85694 0.93345 0.99185 3.5573 32.683 13.29 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 2.7 3.9 2.7 143780000 73807000 69968000 51032000 27244000 23789000 50293000 27334000 22959000 42450000 19229000 23221000 2105 10311;11569;11759 True;True;True 10537;11813;12009 35936;35937;35938;39989;39990;39991;40616 45180;50136;50895 45180;50136;50895 Q9NS87 Q9NS87 7 7 7 Kinesin-like protein KIF15 KIF15 sp|Q9NS87|KIF15_HUMAN Kinesin-like protein KIF15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF15 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 4 7 6 4 7 6 4 7 6.2 6.2 6.2 160.16 1388 1388 0 16.605 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0153 0.96951 51.252 17 5 Leave out requantified 1.0244 1.2352 1.0764 0.95523 1.1735 1.0285 19.339 81.023 66.63 6 4 7 1 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 5.2 3.7 6.2 262070000 102210000 159860000 101160000 40697000 60466000 53218000 17955000 35263000 107690000 43553000 64133000 2106 1293;3335;10547;11243;13368;16496;16709 True;True;True;True;True;True;True 1335;3430;10777;11484;13683;16884;17100 4437;4438;11539;11540;36751;36752;36753;38964;46273;46274;46275;56750;56751;56752;57448;57449;57450 5754;5755;5756;14662;14663;46147;46148;46149;48833;57821;57822;57823;71188;72117;72118;72119 5754;14662;46147;48833;57823;71188;72119 Q9NSC5 Q9NSC5 1 1 1 Homer protein homolog 3 HOMER3 sp|Q9NSC5|HOME3_HUMAN Homer protein homolog 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HOMER3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 3.3 3.3 3.3 39.836 361 361 0.0052701 1.8479 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 3.3 0 0 4977200 2241800 2735400 4977200 2241800 2735400 0 0 0 0 0 0 2107 15161 True 15518 52284 65492 65492 Q9NSD9 Q9NSD9 18 18 18 Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit FARSB sp|Q9NSD9|SYFB_HUMAN Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FARSB PE=1 SV=3 1 18 18 18 18 18 16 18 18 16 18 18 16 32.6 32.6 32.6 66.115 589 589 0 96.187 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1362 1.0631 48.663 65 24 Leave out requantified 1.0732 1.1817 1.1685 0.9673 1.0981 1.1134 51.294 16 12.729 23 22 20 7 9 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.6 32.6 27.7 3914200000 1803700000 2110600000 1605700000 769950000 835790000 1184400000 512320000 672090000 1124100000 521430000 602680000 2108 69;1403;1796;2710;2934;4620;4864;7666;9932;9933;10148;10266;12352;12629;14599;15583;16581;16804 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 70;1448;1855;2787;3018;4745;4990;7843;10153;10154;10373;10492;12637;12927;14941;15947;16971;17196 221;222;4787;4788;4789;6149;6150;6151;6152;9388;9389;9390;10193;10194;10195;10196;10197;10198;15955;15956;15957;16724;16725;16726;16727;26553;26554;34665;34666;34667;34668;34669;34670;35406;35407;35408;35790;35791;35792;42697;42698;42699;42700;42701;42702;43723;43724;43725;50362;50363;50364;53597;53598;53599;57040;57041;57042;57043;57772;57773;57774;57775;57776;57777;57778;57779 308;309;6177;6178;6179;6180;6181;7993;7994;7995;7996;11939;11940;11941;11942;11943;11944;12957;12958;12959;12960;12961;12962;20302;20303;20304;20305;20306;20307;21250;21251;21252;21253;33414;43631;43632;43633;43634;43635;43636;43637;43638;43639;43640;43641;43642;44533;44534;44983;44984;44985;44986;44987;53441;53442;53443;53444;53445;53446;53447;54648;54649;63025;63026;63027;63028;63029;63030;67175;67176;67177;71577;71578;71579;71580;71581;71582;71583;72591;72592;72593;72594;72595;72596;72597;72598;72599 308;6181;7996;11940;12958;20307;21250;33414;43634;43642;44533;44983;53444;54648;63029;67177;71583;72596 Q9NSV4 Q9NSV4 5 5 5 Protein diaphanous homolog 3 DIAPH3 sp|Q9NSV4|DIAP3_HUMAN Protein diaphanous homolog 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIAPH3 PE=1 SV=4 1 5 5 5 1 2 3 1 2 3 1 2 3 5.1 5.1 5.1 136.92 1193 1193 0 3.4006 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96006 0.89001 64.041 6 5 Median NaN 1.8965 0.53085 NaN 1.8422 0.52226 NaN 66.057 26.524 1 2 3 0 2 3 Median Median Median 0.7 2.5 3.2 85735000 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1938 6428 8353 8353 415 671 Q9NVI1 Q9NVI1 12 12 12 Fanconi anemia group I protein FANCI sp|Q9NVI1|FANCI_HUMAN Fanconi anemia group I protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCI PE=1 SV=4 1 12 12 12 8 8 11 8 8 11 8 8 11 10.4 10.4 10.4 149.32 1328 1328 0 29.37 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1908 1.1535 12.611 29 10 Leave out requantified 1.2909 1.0777 1.1006 1.1553 1.0535 1.0719 27.758 17.792 15.464 9 9 11 4 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.8 7.7 9.9 860940000 412090000 448850000 332260000 154600000 177660000 215540000 112130000 103420000 313130000 145360000 167770000 2130 871;1949;4317;4597;5306;6903;7786;8213;14874;15577;15990;18582 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 900;2012;4435;4722;5438;7065;7963;8400;15220;15941;16366;18997 3032;3033;3034;6730;6731;6732;6733;6734;14977;15881;15882;15883;18140;18141;23421;23422;23423;23424;23425;23426;26950;28402;28403;28404;51289;51290;53572;53573;55071;55072;55073;63686;63687 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Histone chaperone ASF1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASF1B PE=1 SV=1 1 3 3 2 3 3 3 3 3 3 2 2 2 18.3 18.3 14.4 22.433 202 202 0 20.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1029 1.0675 18.608 12 0 Leave out requantified 1.1996 1.0529 0.99285 1.0896 1.0247 0.99425 32.091 34.979 14.509 5 3 4 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.3 18.3 18.3 582240000 259000000 323240000 259170000 109840000 149330000 150430000 70942000 79490000 172650000 78222000 94423000 2136 4339;12364;17313 True;True;True 4457;12649;17709 15025;15026;15027;15028;15029;15030;42740;42741;42742;59499;59500;59501;59502;59503 19091;19092;19093;19094;19095;19096;19097;19098;19099;19100;19101;53485;74809;74810;74811;74812;74813;74814;74815 19093;53485;74812 REV__Q6NXN4;REV__Q6NUT2;Q9NW61 REV__Q6NXN4;REV__Q6NUT2;Q9NW61 1;1;1 1;1;1 1;1;1 Pleckstrin homology domain-containing family J member 1 PLEKHJ1 sp|Q6NXN4|D19P1_HUMAN Putative C-mannosyltransferase DPY19L2P1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPY19L2P1 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24436;25335;35044;45278;50153;60930;62987;64324;70358;72151 Q9NWH9 Q9NWH9 1 1 1 SAFB-like transcription modulator SLTM sp|Q9NWH9|SLTM_HUMAN SAFB-like transcription modulator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLTM PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1.2 1.2 1.2 117.15 1034 1034 0.0035698 1.9929 By MS/MS By MS/MS 1.2318 1.1521 1.9678 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 1.2 0 1.2 70375000 29831000 40544000 43198000 17021000 26177000 0 0 0 27177000 12810000 14367000 2140 15776 True 16144 54265;54266 68065;68066;68067 68065 Q9NWS0 Q9NWS0 3 3 3 PIH1 domain-containing protein 1 PIH1D1 sp|Q9NWS0|PIHD1_HUMAN PIH1 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIH1D1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 17.2 17.2 17.2 32.363 290 290 0 30.251 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1287 1.0366 58.954 7 5 Median 1.1287 1.4745 1.062 1.0366 1.4173 1.0476 75.813 86.128 27.598 3 2 2 3 1 1 Median Median Median 17.2 11.7 11.7 87652000 36985000 50666000 40349000 14437000 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9724;19279;19280;19281;47615;47616;47617;47618;47619;47620;47621;47622;56122;56123;56124;56125;56126;61950;61951;61952;75604;75605;75606;75607;75608;75609;75610 9724;19279;47615;47621;56123;56126;61951;75604;75606 Q9NX70 Q9NX70 1 1 1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29 MED29 sp|Q9NX70|MED29_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED29 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7 7 7 21.073 200 200 0.00047037 2.528 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0724 1.0398 12.265 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 7 7 7 41849000 21420000 20428000 15570000 8204300 7365500 10658000 5091500 5566900 15621000 8124600 7495900 2148 9531 True 9747 33341;33342;33343 41953;41954;41955 41955 Q9NX74 Q9NX74 3 3 3 tRNA-dihydrouridine(20) synthase [NAD(P)+]-like DUS2 sp|Q9NX74|DUS2L_HUMAN tRNA-dihydrouridine(20) synthase [NAD(P)+]-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUS2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.1 8.1 8.1 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(guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase TRMT1 sp|Q9NXH9|TRM1_HUMAN tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRMT1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.6 5.6 5.6 72.233 659 659 0 33.73 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62056 0.56808 29.441 4 4 Median 0.55034 NaN NaN 0.48119 NaN NaN 14.21 NaN NaN 2 1 1 2 1 1 Median Median Median 5.6 2 2 60712000 42132000 18579000 37685000 27864000 9821700 8338300 5579300 2759100 14688000 8689400 5998500 2151 4759;15574 True;True 4885;15938 16399;16400;16401;16402;16403;53569 20844;20845;20846;20847;20848;20849;67135 20848;67135 Q9NXR7 Q9NXR7 1 1 1 BRCA1-A complex subunit BRE BRE sp|Q9NXR7|BABA2_HUMAN BRISC and BRCA1-A complex member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 43.551 383 383 0 9.8548 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93338 0.87562 22.112 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 44745000 21872000 22873000 14904000 7302000 7601900 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26878;26879;55088;55089;55090;55091;65937;65938;65939;65940;65941;65942;65943;65944;65945;65946;66298;66299;66300;66301;66302;66776;71306;71307;71308;71309;71310 26878;55091;65937;65939;65944;66299;66301;66776;71306 Q9NY12 Q9NY12 1 1 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 GAR1 sp|Q9NY12|GAR1_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAR1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 8.3 8.3 8.3 22.348 217 217 0 5.5759 By MS/MS By MS/MS 1.2465 1.2141 21.739 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 8.3 8.3 110610000 49061000 61549000 0 0 0 48148000 23150000 24998000 62463000 25911000 36552000 2154 18277 True 18685 62737;62738 78897;78898;78899 78898 Q9NY74 Q9NY74 1 1 1 Ewings tumor-associated antigen 1 ETAA1 sp|Q9NY74|ETAA1_HUMAN Ewings tumor-associated antigen 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ETAA1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0.9 0.9 0.9 103.44 926 926 0.0056893 1.806 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0.9 0.9 8684700 8684700 0 0 0 0 4056300 4056300 0 4628400 4628400 0 2155 1903 True 1966 6528;6529 8474;8475 8475 Q9NY93 Q9NY93 1 1 1 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 DDX56 sp|Q9NY93|DDX56_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX56 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 61.589 547 547 0 5.2734 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97875 0.90006 20.5 4 2 Median 0.88987 NaN NaN 0.79028 NaN NaN 16.077 NaN NaN 2 1 1 2 0 0 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 63620000 33812000 29809000 34285000 19444000 14841000 13630000 5694100 7935700 15706000 8673700 7031900 2156 16899 True 17291 58067;58068;58069;58070 72958;72959;72960;72961;72962;72963 72958 Q9NYB9 Q9NYB9 2 2 2 Abl interactor 2 ABI2 sp|Q9NYB9|ABI2_HUMAN Abl interactor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABI2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 6.4 6.4 6.4 55.663 513 513 0 9.6813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0812 1.0489 15.028 7 1 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35632;35633;35634;35635;53538;53539;53540;53541;53542;57639;57640;57641;57642;58840;58841;58842;64803;64804;64805;69421;69422;69423;69424;69425;69426;80987;80988;80989;80990;80991;80992 35634;53539;57641;58840;64803;69422;80988 Q9NYU2 Q9NYU2 8 8 8 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 UGGT1 sp|Q9NYU2|UGGG1_HUMAN UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UGGT1 PE=1 SV=3 1 8 8 8 8 3 4 8 3 4 8 3 4 7.3 7.3 7.3 177.19 1555 1555 0 23.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.749 0.6894 21.284 12 5 Leave out requantified 0.81051 0.69907 1.1494 0.74239 0.65518 1.1179 23.382 26.561 22.259 7 3 2 3 1 1 Leave out requantified Median Median 7.3 2.4 4.4 228600000 113200000 115400000 153950000 74773000 79178000 35686000 20174000 15512000 38962000 18255000 20707000 2161 2665;4406;5572;6657;7748;8656;10083;15572 True;True;True;True;True;True;True;True 2742;4524;5709;6814;7925;8858;10306;15936 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Q9NZD2 Q9NZD2 1 1 1 Glycolipid transfer protein GLTP sp|Q9NZD2|GLTP_HUMAN Glycolipid transfer protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLTP PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.7 5.7 5.7 23.85 209 209 0 3.6773 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98246 0.95074 10.213 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.7 5.7 5.7 41020000 22228000 18791000 14068000 7910000 6157600 12720000 6219900 6500200 14232000 8098500 6133400 2164 6631 True 6788 22469;22470;22471 28424;28425;28426 28426 Q9NZI8 Q9NZI8 7 6 6 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 IGF2BP1 sp|Q9NZI8|IF2B1_HUMAN Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGF2BP1 PE=1 SV=2 1 7 6 6 6 5 3 5 4 3 5 4 3 14.6 12.3 12.3 63.48 577 577 0 27.864 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1443 1.0537 14.784 9 4 Leave out requantified 1.4193 1.4346 1.0878 1.2194 1.4086 1.0537 16.203 15.899 28.345 3 3 3 2 1 1 Median Plateau Median 12.3 11.8 7.3 241480000 113870000 127610000 100300000 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3 3 3 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial SUCLA2 sp|Q9P2R7|SUCB1_HUMAN Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLA2 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 6.5 6.5 6.5 50.317 463 463 0 3.4667 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97783 0.93409 17.426 7 1 Leave out requantified 1.0239 0.85887 0.92492 0.93776 0.79418 0.89917 16.871 17.771 12.037 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 3.9 6.5 3.9 164240000 83860000 80384000 53497000 24136000 29361000 70692000 39661000 31031000 40055000 20063000 19992000 2184 1710;4377;8068 True;True;True 1765;4495;8252 5835;5836;5837;15159;15160;15161;27938 7560;7561;7562;7563;19272;19273;35158 7563;19272;35158 Q9UBB4 Q9UBB4 21 21 21 Ataxin-10 ATXN10 sp|Q9UBB4|ATX10_HUMAN Ataxin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATXN10 PE=1 SV=1 1 21 21 21 19 19 19 19 19 19 19 19 19 50.5 50.5 50.5 53.488 475 475 0 260.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0971 1.0355 26.887 89 34 Leave out requantified 1.2025 1.0025 1.1456 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98662 0.89852 10.592 5 1 Leave out requantified 1.0067 NaN 0.95071 0.91865 NaN 0.93738 7.4588 NaN 16.58 2 1 2 0 0 1 Median Median Median 4.2 1.7 3.8 51917000 27166000 24751000 21391000 10490000 10901000 12326000 6805400 5520200 18200000 9870600 8329100 2188 1704;11711;15526 True;True;True 1759;11958;15888 5817;40438;53399;53400;53401 7544;50665;66906 7544;50665;66906 Q9UBE0 Q9UBE0 13 13 13 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed SAE1 sp|Q9UBE0|SAE1_HUMAN SUMO-activating enzyme subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAE1 PE=1 SV=1 1 13 13 13 12 10 10 12 10 10 12 10 10 36.7 36.7 36.7 38.449 346 346 0 90.562 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9329 0.9148 20.368 44 19 Leave out requantified 0.88277 0.96418 0.92264 0.79848 0.94265 0.89744 26.771 12.623 17.022 16 14 14 7 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.4 30.9 31.8 2380200000 1219400000 1160800000 951110000 505580000 445530000 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subunit 2 UBA2 sp|Q9UBT2|SAE2_HUMAN SUMO-activating enzyme subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA2 PE=1 SV=2 1 25 25 25 19 20 21 19 20 21 19 20 21 46.6 46.6 46.6 71.223 640 640 0 268.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0139 0.98484 16.772 71 22 Leave out requantified 0.99866 1.0659 0.94893 0.90347 1.0348 0.89994 15.979 15.446 19.071 22 25 24 5 8 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.3 34.2 38.8 4632500000 2312800000 2319600000 1581700000 826060000 755610000 1578500000 705250000 873260000 1472300000 781520000 690770000 2194 267;1181;2899;3966;4565;4913;4914;6800;6801;6928;8963;9084;9236;9692;11202;11705;11706;13133;15342;15842;17329;17794;18203;18833;18857 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 272;1221;1222;2983;4074;4690;5039;5040;6958;6959;7092;9170;9293;9447;9911;11443;11951;11952;13441;15701;16213;17725;18196;18611;19252;19276 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requantified Median 4.6 10.6 4.9 328520000 163960000 164560000 92365000 45241000 47124000 160740000 79109000 81631000 75417000 39614000 35803000 2213 73;1306;10894;12748;13399;15630;18296 True;True;True;True;True;True;True 74;1349;11131;13047;13714;15995;18705 227;228;4485;4486;4487;37884;37885;44120;44121;44122;46369;53764;53765;53766;62806 314;315;5813;5814;5815;5816;47532;47533;55167;55168;55169;57961;67404;67405;67406;78979 314;5813;47532;55168;57961;67406;78979 Q9UHR6 Q9UHR6 1 1 1 Zinc finger HIT domain-containing protein 2 ZNHIT2 sp|Q9UHR6|ZNHI2_HUMAN Zinc finger HIT domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 3 42.883 403 403 0 5.4972 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4683 1.2736 47.763 5 2 Median 0.91701 1.2661 NaN 0.81525 1.2111 NaN 63.087 43.764 NaN 2 2 1 1 1 0 Median Median Median 3 3 3 53402000 24200000 29202000 22604000 9043400 13560000 19370000 10046000 9324000 11428000 5110100 6318200 2214 2169 True 2236 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VPS51 sp|Q9UID3|VPS51_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS51 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 4.2 4.2 4.2 86.041 782 782 0 5.8162 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86687 0.7984 19.795 4 1 Median 0.79437 NaN NaN 0.6855 NaN NaN 29.791 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 4.2 1.5 1.5 93264000 45192000 48072000 48873000 20921000 27952000 20685000 10550000 10135000 23707000 13722000 9984900 2226 730;18566 True;True 757;18980 2524;2525;2526;63639 3226;3227;3228;3229;3230;79993 3230;79993 Q9UIG0 Q9UIG0 3 3 3 Tyrosine-protein kinase BAZ1B BAZ1B sp|Q9UIG0|BAZ1B_HUMAN Tyrosine-protein kinase BAZ1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAZ1B PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 3 2.2 2.2 2.2 170.9 1483 1483 0 3.7876 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1482 1.1387 17.874 4 1 Median NaN NaN 1.1937 NaN NaN 1.1884 NaN NaN 8.9869 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 0.9 0.9 2.2 38398000 15841000 22557000 8096300 4620700 3475600 8807300 4084000 4723400 21494000 7136500 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Q9UJU6 Q9UJU6 2 2 2 Drebrin-like protein DBNL sp|Q9UJU6|DBNL_HUMAN Drebrin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBNL PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 4.9 4.9 4.9 48.207 430 430 0.00046425 2.4166 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0805 1.0066 2.4275 5 0 Leave out requantified 1.0762 NaN 1.0895 0.96291 NaN 1.058 6.6357 NaN 1.0105 2 1 2 0 0 0 Median Median Median 4.9 2.8 4.9 35262000 16099000 19163000 15683000 7217400 8465200 6377500 3100300 3277300 13202000 5781800 7420600 2230 16308;18950 True;True 16696;19373 56152;56153;64973;64974;64975 70461;81663;81664;81665;81666 70461;81664 Q9UJX5 Q9UJX5 2 2 2 Anaphase-promoting complex subunit 4 ANAPC4 sp|Q9UJX5|APC4_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.3 3.3 3.3 92.115 808 808 0 16.658 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 1.4 0 2 19847000 13109000 6737600 5615800 4152800 1463000 0 0 0 14231000 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sorting-associated protein 28 homolog VPS28 sp|Q9UK41|VPS28_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS28 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.3 11.3 11.3 25.425 221 221 0 7.7173 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2232 1.1097 30.181 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 6.8 4.5 4.5 43232000 18279000 24953000 15412000 5746800 9665300 15009000 6552900 8455800 12811000 5979600 6831500 2233 1122;13813 True;True 1156;14137 3872;3873;47716 5030;5031;59717 5030;59717 Q9UK59 Q9UK59 4 4 4 Lariat debranching enzyme DBR1 sp|Q9UK59|DBR1_HUMAN Lariat debranching enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBR1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 3 1 2 3 1 2 3 11.8 11.8 11.8 61.554 544 544 0 4.4148 By matching By MS/MS By MS/MS 1.102 1.093 18.301 6 2 Leave out requantified NaN 2.0334 1.102 NaN 1.9456 1.093 NaN 5.3285 26.814 1 2 3 0 2 0 Median Median Leave out requantified 2.6 5 8.8 95983000 45479000 50504000 12353000 5035700 7317500 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transfer protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PITPNC1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.1 5.1 5.1 38.387 332 332 0.00047059 2.5341 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81539 0.76528 35.532 4 4 Median 0.73492 NaN NaN 0.65744 NaN NaN 17.602 NaN NaN 2 1 1 2 1 1 Median Median Median 5.1 5.1 5.1 62537000 31320000 31216000 38122000 21046000 17076000 13219000 6757400 6461800 11195000 3516900 7678300 2236 18631 True 19048 63838;63839;63840;63841;63842;63843 80227;80228;80229;80230;80231;80232 80227 Q9UKG1 Q9UKG1 11 11 11 DCC-interacting protein 13-alpha APPL1 sp|Q9UKG1|DP13A_HUMAN DCC-interacting protein 13-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APPL1 PE=1 SV=1 1 11 11 11 7 11 7 7 11 7 7 11 7 28.1 28.1 28.1 79.663 709 709 0 62.537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1566 1.0632 30.937 29 8 Leave out requantified 1.1931 0.8867 1.5088 1.03 0.8258 1.3931 22.183 60.433 36.416 9 13 7 1 6 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.5 28.1 14.5 902570000 412770000 489790000 371350000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3935;8352;8376;10932;11470;13716;14094;15071;16921;17682 13261;28264;28329;28330;28331;37273;37274;37275;38922;38923;38924;46373;46374;46375;47579;47580;47581;50779;50780;50781;50782;56880;56881;59396;59397 16857;35557;35638;35639;46783;46784;46785;46786;48782;48783;57967;57968;57969;59535;59536;59537;59538;59539;63568;63569;63570;63571;63572;63573;71372;71373;74685;74686;74687 16857;35557;35639;46783;48782;57968;59535;63572;71372;74686 Q9UKS6 Q9UKS6 5 5 5 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 PACSIN3 sp|Q9UKS6|PACN3_HUMAN Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACSIN3 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 3 4 5 3 4 5 3 4 15.6 15.6 15.6 48.486 424 424 0 33.769 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0465 0.95826 17.473 14 8 Leave out requantified 1.0465 0.96126 1.0806 0.92608 0.88532 1.0241 16.988 12.757 18.782 5 4 5 1 3 4 Leave out requantified Median Median 15.6 10.1 12.7 378730000 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Q9UKV8 1 1 1 Protein argonaute-2 AGO2 sp|Q9UKV8|AGO2_HUMAN Protein argonaute-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGO2 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.3 1.3 1.3 97.207 859 859 0.0060949 1.778 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1199 1.0628 19.729 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.3 1.3 1.3 40682000 20613000 20069000 15421000 7897200 7524000 8343300 4691800 3651500 16918000 8024000 8893600 2242 14198 True 14530 49100;49101;49102 61427;61428;61429;61430;61431 61427 Q9UKX7 Q9UKX7 5 5 5 Nuclear pore complex protein Nup50 NUP50 sp|Q9UKX7|NUP50_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup50 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP50 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 9.8 9.8 9.8 50.144 468 468 0 14.092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0813 1.0147 39.796 14 4 Leave out requantified 1.0226 1.0398 1.1342 1.0025 0.98051 1.1278 38.079 23.014 14.057 5 4 5 0 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 9.8 7.5 9.8 236700000 115380000 121320000 97768000 51049000 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molecular chaperone regulator 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 8.7 8.7 8.7 51.199 447 447 0 4.525 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90081 0.84548 20.575 4 0 Leave out requantified 1.0366 0.78281 NaN 0.92692 0.7712 NaN 18.406 22.744 NaN 2 2 0 0 0 0 Median Median Median 8.7 8.7 4.5 64538000 34863000 29675000 33252000 17411000 15841000 31286000 17452000 13834000 0 0 0 2245 13382;15427 True;True 13697;15786 46310;46311;46312;53067;53068 57875;57876;66494 57876;66494 Q9UL25 Q9UL25 3 3 3 Ras-related protein Rab-21 RAB21 sp|Q9UL25|RAB21_HUMAN Ras-related protein Rab-21 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB21 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 17.3 17.3 17.3 24.347 225 225 0 10.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87208 0.82292 23.133 4 1 Median NaN 1.0345 NaN NaN 0.98522 NaN NaN 23.552 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 12.9 9.8 5.3 50713000 33918000 16795000 21315000 17173000 4142200 15106000 8169300 6936900 14292000 8576000 5715600 2246 5122;6184;7448 True;True;True 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5255;5256;5257;5258;5259;5260;5261;5262;5263;5264;5265;5266;9850;9851;9852;9853;9854;9855;17140;17141;17142;17143;17144;17145;23309;23310;23311;23312;23313;23314;30522;30523;30524;30525;30526;30527;30528;30529;38406;38407;38408;38409;38410;38411;38412;38413;38414;38415;41601;64711;64712;64713;80998;80999;82115;82116;82117 5257;9853;17144;23310;30524;38415;41601;64711;80998;82115 Q9UNZ2 Q9UNZ2 3 3 3 NSFL1 cofactor p47 NSFL1C sp|Q9UNZ2|NSF1C_HUMAN NSFL1 cofactor p47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSFL1C PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 14.1 14.1 14.1 40.572 370 370 0 8.8084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0778 1.0165 30.631 5 1 Leave out requantified 0.89126 NaN 1.3975 0.81272 NaN 1.3577 10.107 NaN 9.2884 3 0 2 1 0 0 Median Median Median 14.1 3.2 14.1 90907000 41797000 49110000 55897000 26833000 29065000 0 0 0 35010000 14965000 20045000 2270 2672;3357;10136 True;True;True 2749;3452;10361 9258;9259;11614;11615;11616;11617;35373;35374 11793;11794;14762;14763;14764;14765;44502 11793;14762;44502 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MS/MS By MS/MS 1.153 1.0353 15.986 49 14 Leave out requantified 1.181 1.0261 1.0945 1.0196 0.94288 1.0339 11.771 18.374 25.361 16 17 16 5 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.7 13.6 15.5 1502000000 766580000 735460000 548230000 266810000 281420000 472300000 229120000 243180000 481510000 270650000 210860000 2275 1479;1831;3013;3554;4539;5574;5575;6624;6679;6721;9662;10455;14664;15110;15494;18441 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1524;1891;3099;3654;4663;5711;5712;6780;6836;6878;9880;10684;15006;15466;15854;18851 5033;5034;5035;5036;6282;6283;6284;6285;6286;6287;10459;10460;10461;12310;12311;15674;15675;18951;18952;18953;18954;18955;22449;22450;22451;22630;22631;22632;22764;22765;22766;22767;33792;33793;33794;33795;36453;36454;36455;50537;50538;50539;50540;50541;50542;52133;52134;53289;53290;53291;63231 6505;6506;6507;6508;6509;8159;8160;8161;8162;8163;8164;8165;8166;8167;13295;13296;13297;15660;19913;19914;24010;24011;24012;28403;28404;28405;28406;28407;28606;28607;28775;28776;28777;28778;28779;28780;42526;42527;42528;45789;63263;63264;63265;63266;63267;63268;65286;65287;66772;66773;66774;79484 6509;8162;13296;15660;19913;24011;24012;28404;28606;28775;42526;45789;63267;65286;66772;79484 Q9UPT5 Q9UPT5 4 4 4 Exocyst complex component 7 EXOC7 sp|Q9UPT5|EXOC7_HUMAN Exocyst complex component 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC7 PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 3 1 2 3 1 2 3 1 6.5 6.5 6.5 83.381 735 735 0 5.0309 By MS/MS By MS/MS By matching 1.1376 1.0805 9.5903 6 1 Leave out requantified 1.1583 1.072 NaN 1.036 1.0528 NaN 9.6215 20.494 NaN 2 3 1 0 1 0 Median Median Median 3.5 5.4 1.1 109490000 53514000 55972000 47202000 24030000 23173000 39494000 18777000 20717000 22789000 10707000 12082000 2276 9808;13733;14364;18132 True;True;True;True 10029;14057;14699;18538 34291;47460;47461;49614;62273;62274 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2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase;UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (hydrolyzing);N-acetylmannosamine kinase GNE sp|Q9Y223|GLCNE_HUMAN Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNE PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2.8 2.8 2.8 79.274 722 722 0.00046664 2.4646 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0636 0.99954 29.495 5 1 Leave out requantified 1.1223 NaN 1.008 1.0261 NaN 0.9737 44.127 NaN 14.863 2 1 2 0 1 0 Median Median Median 2.8 1.5 2.8 69495000 31496000 37999000 28865000 11971000 16894000 9304900 4419700 4885200 31325000 15105000 16220000 2283 6185;8159 True;True 6333;8344 21038;21039;28238;28239;28240 26616;35530;35531 26616;35530 Q9Y224 Q9Y224 12 12 12 UPF0568 protein C14orf166 C14orf166 sp|Q9Y224|RTRAF_HUMAN RNA transcription, translation and transport factor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTRAF PE=1 SV=1 1 12 12 12 12 9 10 12 9 10 12 9 10 54.9 54.9 54.9 28.068 244 244 0 43.926 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0772 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Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIN4 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 17.6 17.6 17.6 13.81 131 131 0 4.9203 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92451 0.88059 14.444 6 2 Leave out requantified 1.5277 0.87836 0.97623 1.3892 0.82505 0.95112 50.029 59.908 25.34 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 17.6 17.6 17.6 77448000 36130000 41319000 31771000 12073000 19699000 18086000 9934200 8151300 27591000 14123000 13469000 2286 5120;5375 True;True 5249;5508 17571;17572;17573;18355;18356;18357 22312;22313;22314;22315;23253;23254;23255 22312;23253 Q9Y248 Q9Y248 2 2 2 DNA replication complex GINS protein PSF2 GINS2 sp|Q9Y248|PSF2_HUMAN DNA replication complex GINS protein PSF2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 14.1 14.1 14.1 21.427 185 185 0 6.1187 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98212 0.94953 35.406 5 3 Median 0.73739 NaN 0.92684 0.67476 NaN 0.88807 55.243 NaN 9.4633 2 1 2 2 0 1 Median Median Median 14.1 6.5 14.1 132760000 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subunit 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC8 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 1.7 1.7 1.7 161 1435 1435 0.00046104 2.3524 By MS/MS 0.66188 0.63658 111.45 2 2 Median 0.66188 NaN NaN 0.63658 NaN NaN 111.45 NaN NaN 2 0 0 2 0 0 Median Median Median 1.7 0 0 19607000 12318000 7289500 19607000 12318000 7289500 0 0 0 0 0 0 2297 4030;9237 True;True 4140;9448 14034;32226 17852;40576 17852;40576 Q9Y2P8 Q9Y2P8 1 1 1 RNA 3-terminal phosphate cyclase-like protein RCL1 sp|Q9Y2P8|RCL1_HUMAN RNA 3-terminal phosphate cyclase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RCL1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4 4 4 40.842 373 373 0 5.9705 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99205 0.91999 27.402 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4 4 4 27940000 14707000 13233000 8713700 4845900 3867800 9416100 3279400 6136700 9810300 6582100 3228200 2298 6932 True 7096 23558;23559;23560 29803;29804;29805;29806 29803 Q9Y2Q3 Q9Y2Q3 6 6 6 Glutathione S-transferase kappa 1 GSTK1 sp|Q9Y2Q3|GSTK1_HUMAN Glutathione S-transferase kappa 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSTK1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 5 6 5 5 6 5 5 6 5 32.7 32.7 32.7 25.497 226 226 0 57.403 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3458 1.2347 8.5912 18 14 Leave out requantified 1.2552 1.0808 1.8848 1.1619 1.0512 1.8537 51.401 106.22 115.78 7 7 4 5 6 3 Median Median Linear 27.9 32.7 27.9 423610000 215870000 207740000 177930000 79351000 98578000 154580000 86990000 67586000 91101000 49526000 41575000 2299 2300;2960;5327;7145;11756;12242 True;True;True;True;True;True 2372;3044;5459;7311;12006;12527 7931;7932;7933;10271;10272;10273;10274;18197;18198;18199;18200;18201;24447;24448;24449;40608;40609;40610;42329;42330;42331;42332;42333;42334 10196;10197;10198;10199;13044;13045;13046;13047;23049;23050;23051;23052;23053;23054;30871;30872;30873;50888;50889;50890;53006;53007;53008;53009;53010;53011 10198;13044;23051;30873;50889;53006 Q9Y2S6 Q9Y2S6 2 2 2 Translation machinery-associated protein 7 TMA7 sp|Q9Y2S6|TMA7_HUMAN Translation machinery-associated protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMA7 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 29.7 29.7 29.7 7.0662 64 64 0 3.7479 By MS/MS By MS/MS 1.3592 1.3193 84.761 3 3 Plateau NaN NaN 1.3592 NaN NaN 1.3193 NaN NaN 96.806 0 1 2 0 1 2 Median Median Median 0 14.1 29.7 125790000 77104000 48687000 0 0 0 45246000 30825000 14421000 80545000 46279000 34266000 2300 4254;6564 True;True 4365;6719 14763;22267;22268 18753;28169;28170 18753;28169 Q9Y2T2 Q9Y2T2 2 2 2 AP-3 complex subunit mu-1 AP3M1 sp|Q9Y2T2|AP3M1_HUMAN AP-3 complex subunit mu-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3M1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 8.4 8.4 8.4 46.939 418 418 0 8.6893 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0477 0.9995 8.2409 5 2 Median NaN 0.99732 1.0155 NaN 0.93622 0.96583 NaN 13.945 4.845 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 2.9 8.4 8.4 131860000 65461000 66397000 26409000 12783000 13626000 42221000 22012000 20209000 63229000 30666000 32563000 2301 6467;10466 True;True 6618;10695 21957;21958;36490;36491;36492 27768;27769;45834;45835;45836 27768;45834 Q9Y2V7 Q9Y2V7 3 3 3 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6 COG6 sp|Q9Y2V7|COG6_HUMAN Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG6 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 2 2 5.3 5.3 5.3 73.278 657 657 0 3.5199 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6033 1.4712 6.2243 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 2.4 3.8 4 72510000 25923000 46587000 30150000 11632000 18519000 22793000 7379700 15413000 19567000 6911400 12656000 2302 1359;4433;4720 True;True;True 1404;4551;4846 4659;15339;16306;16307;16308 6014;19511;20735;20736;20737 6014;19511;20735 Q9Y2W1 Q9Y2W1 5 5 5 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 THRAP3 sp|Q9Y2W1|TR150_HUMAN Thyroid hormone receptor-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THRAP3 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5.8 5.8 5.8 108.66 955 955 0 23.776 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0526 0.91195 19.159 12 3 Leave out requantified 1.0526 1.1348 0.82858 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out requantified 14.2 17.6 11.5 661460000 315340000 346120000 258350000 107620000 150730000 241650000 119050000 122600000 161450000 88657000 72790000 2304 215;216;1328;1496;1705;2799;4331;5652;9120;9121;11611;14549 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 219;220;1371;1543;1760;2879;4449;5792;9329;9330;11855;14889 695;696;697;698;699;700;701;702;4557;4558;5103;5104;5105;5818;5819;5820;5821;9730;15006;19214;19215;31798;31799;31800;40124;40125;40126;40127;50197;50198;50199 908;909;910;911;912;913;914;915;916;917;5899;5900;6591;6592;6593;6594;7545;7546;7547;7548;7549;12394;19065;24331;24332;24333;40038;40039;40040;50305;50306;50307;50308;50309;50310;62811;62812;62813 908;914;5899;6592;7546;12394;19065;24331;40038;40040;50306;62813 Q9Y2X3 Q9Y2X3 4 4 4 Nucleolar protein 58 NOP58 sp|Q9Y2X3|NOP58_HUMAN Nucleolar protein 58 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP58 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 10.4 10.4 10.4 59.578 529 529 0 6.8924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0848 1.0477 33.495 10 4 Leave out requantified 1.4748 1.2561 1.033 1.3559 1.2046 0.99131 15.623 59.692 28.197 3 4 3 2 2 0 Median Median Leave out requantified 7.8 10.4 7.8 157920000 73270000 84651000 54911000 22325000 32587000 61208000 27512000 33696000 41802000 23434000 18368000 2305 3306;9008;11207;16774 True;True;True;True 3401;9215;11448;17166 11449;11450;11451;31341;31342;38857;38858;57670;57671;57672;57673 14546;14547;14548;39470;48707;48708;72413;72414;72415;72416;72417;72418 14546;39470;48707;72414 Q9Y2Y0 Q9Y2Y0 2 2 2 ADP-ribosylation factor-like protein 2-binding protein ARL2BP sp|Q9Y2Y0|AR2BP_HUMAN ADP-ribosylation factor-like protein 2-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARL2BP PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 16.6 16.6 16.6 18.822 163 163 0 6.1247 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0975 1.0729 37.092 3 1 Median NaN 1.5029 NaN NaN 1.4188 NaN NaN 39.521 NaN 1 2 0 0 1 0 Median Median Median 7.4 16.6 7.4 105700000 48871000 56831000 11341000 4866300 6475000 94360000 44004000 50356000 0 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5984;5985;5986;14548;17333;17334;17335;17336;32749;34347;34348;34423;34424;34425;34856;34857;34858;34859;34860;34861;34862;42312;44620;45465;45466;45467;51061;51062 7758;7759;7760;18468;22002;22003;22004;22005;22006;22007;22008;41229;43249;43250;43339;43340;43341;43342;43343;43344;43872;43873;43874;43875;43876;43877;43878;52984;52985;55765;56820;56821;63893;63894 7758;18468;22003;41229;43249;43341;43872;52984;55765;56821;63894 Q9Y2Z4 Q9Y2Z4 2 2 2 Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial YARS2 sp|Q9Y2Z4|SYYM_HUMAN Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YARS2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 6.3 6.3 6.3 53.198 477 477 0 2.8581 By MS/MS By MS/MS 0.85424 0.78819 38.775 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 6.3 0 4.4 55267000 30717000 24551000 38302000 21569000 16734000 0 0 0 16965000 9148100 7817100 2308 7722;11334 True;True 7899;11576 26727;39267;39268 33633;49213 33633;49213 Q9Y305 Q9Y305 3 3 3 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial ACOT9 sp|Q9Y305|ACOT9_HUMAN Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACOT9 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 11.2 11.2 11.2 49.901 439 439 0 5.1356 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0789 0.98741 6.5912 8 1 Leave out requantified 1.1672 1.1007 0.80914 1.0293 1.0228 0.77496 2.634 14.995 4.8071 2 4 2 0 1 0 Median Median Median 5.5 11.2 5.5 129130000 63906000 65220000 40824000 20009000 20815000 59632000 30298000 29334000 28670000 13599000 15071000 2309 2950;14805;16576 True;True;True 3034;15150;16966 10242;51056;51057;51058;51059;57027;57028;57029 13011;63890;63891;71560;71561;71562 13011;63890;71560 Q9Y312 Q9Y312 1 1 1 Protein AAR2 homolog AAR2 sp|Q9Y312|AAR2_HUMAN Protein AAR2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AAR2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 3.9 3.9 3.9 43.472 384 384 0 2.9068 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 3.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2310 13221 True 13533 45743 57168 57168 Q9Y314 Q9Y314 6 6 6 Nitric oxide synthase-interacting protein NOSIP sp|Q9Y314|NOSIP_HUMAN Nitric oxide synthase-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOSIP PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 35.9 35.9 35.9 33.172 301 301 0 34.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0221 0.92437 8.2938 17 2 Leave out requantified 1.0221 0.92269 0.98729 0.92917 0.88291 0.96201 9.5704 16.033 5.9767 6 6 5 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.9 35.9 29.9 417980000 207230000 210760000 157160000 80534000 76626000 130930000 63221000 67707000 129900000 63470000 66426000 2311 1057;2983;3008;6120;12016;17712 True;True;True;True;True;True 1091;3068;3094;6267;12288;18113 3636;3637;3638;10342;10343;10344;10447;10448;10449;20799;20800;20801;41517;41518;60932;60933;60934 4703;4704;4705;4706;4707;4708;13137;13138;13139;13140;13277;13278;13279;13280;13281;26331;51989;51990;51991;76667;76668;76669;76670;76671;76672 4707;13139;13280;26331;51991;76668 Q9Y371 Q9Y371 4 3 3 Endophilin-B1 SH3GLB1 sp|Q9Y371|SHLB1_HUMAN Endophilin-B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GLB1 PE=1 SV=1 1 4 3 3 2 4 3 1 3 2 1 3 2 12.1 9.9 9.9 40.796 365 365 0 11.214 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0845 1.0412 27.668 6 4 Median NaN 0.89864 1.0845 NaN 0.85538 1.0412 NaN 30.11 4.9081 1 3 2 1 1 2 Median Median Median 5.5 12.1 9 108170000 52682000 55484000 19846000 8033900 11812000 59760000 31528000 28232000 28560000 13120000 15440000 2312 1693;6310;7691;13725 False;True;True;True 1747;6461;7868;14049 5780;5781;5782;21501;21502;21503;26649;47442;47443 7498;27171;27172;27173;33539;33540;59349;59350 7498;27173;33540;59349 Q9Y376 Q9Y376 10 10 8 Calcium-binding protein 39 CAB39 sp|Q9Y376|CAB39_HUMAN Calcium-binding protein 39 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAB39 PE=1 SV=1 1 10 10 8 7 9 10 7 9 10 6 8 8 26.7 26.7 21.1 39.869 341 341 0 25.656 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8109 0.77177 19.035 30 12 Leave out requantified 0.95995 0.63242 0.94675 0.86187 0.60961 0.9027 12.13 9.4037 22.159 8 11 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OX=9606 GN=LUC7L2 PE=1 SV=2 1 14 14 11 14 14 14 14 14 14 11 11 11 37.5 37.5 29.8 46.513 392 392 0 109.58 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0609 0.99582 10.567 56 6 Leave out requantified 1.1712 1.1016 0.98232 1.0352 1.0437 0.95551 15.152 14.823 18.456 18 18 20 0 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.5 37.5 37.5 4096700000 1951000000 2145700000 1459300000 672150000 787110000 1245700000 596490000 649240000 1391700000 682370000 709330000 2314 303;1141;3268;3921;5460;5479;9511;10177;11725;12727;14593;17133;17134;17318 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 309;1178;3360;4029;5594;5613;9727;10402;11973;13026;14935;17526;17527;17714 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protein SBDS SBDS sp|Q9Y3A5|SBDS_HUMAN Ribosome maturation protein SBDS OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SBDS PE=1 SV=4 1 11 11 11 10 7 10 10 7 10 10 7 10 44.4 44.4 44.4 28.763 250 250 0 76.914 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0235 0.93657 20.017 33 15 Leave out requantified 1.0076 1.0299 1.1498 0.91998 0.97812 1.0774 19.219 18.336 19.466 13 8 12 7 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 44.4 36.8 40.4 1740800000 839760000 901010000 712140000 365910000 346230000 359040000 163690000 195360000 669580000 310160000 359420000 2315 2427;3094;3454;3763;5162;6712;7416;8832;11362;13570;17382 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2502;3182;3554;3867;5292;6869;7588;9038;11604;13891;17778 8381;8382;10749;10750;11969;13030;13031;13032;13033;13034;17705;22743;22744;22745;25620;25621;25622;25623;25624;25625;30659;30660;30661;30662;30663;39337;39338;39339;46944;46945;46946;59762;59763;59764 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ribosomal protein L36 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL36 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 20 20 20 12.254 105 105 0 12.375 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80746 0.76388 23.621 5 5 Median 0.97145 0.91905 NaN 0.84659 0.86863 NaN 36.512 18.173 NaN 2 2 1 2 2 1 Median Median Median 20 10.5 10.5 145510000 72977000 72536000 100140000 49395000 50744000 29900000 14596000 15303000 15474000 8986000 6488200 2330 3527;4661 True;True 3627;4786 12225;12226;12227;12228;16100;16101 15549;15550;15551;15552;20484;20485 15552;20485 Q9Y3Z3 Q9Y3Z3 6 6 6 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 SAMHD1 sp|Q9Y3Z3|SAMH1_HUMAN Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMHD1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 3 5 4 3 5 4 3 5 12.6 12.6 12.6 72.2 626 626 0 14.741 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.161 1.0282 30.541 10 1 Leave out requantified 1.1448 0.89439 1.161 1.0234 0.84124 1.1017 5.1672 32.525 38.079 3 3 4 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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STK24 sp|Q9Y6E0|STK24_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK24 PE=1 SV=1 1 11 5 5 11 11 10 5 5 5 5 5 5 25.3 15.1 15.1 49.307 443 443 0 28.383 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.18 1.1127 18.933 15 0 Leave out requantified 1.2126 1.0277 1.18 1.1131 0.97708 1.1127 6.4246 15.827 27.45 5 5 5 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.3 25.3 23.5 561430000 264180000 297250000 220470000 97034000 123440000 165960000 80484000 85475000 175000000 86664000 88337000 2368 118;268;5960;6348;6689;9346;9471;9472;12609;15103;16541 True;True;True;False;False;False;False;False;True;True;False 122;273;6104;6499;6846;9559;9687;9688;12907;15459;16929 383;384;385;877;878;879;20254;20255;20256;21616;21617;21618;21619;21620;22664;22665;32647;32648;32649;32650;32651;32652;33141;33142;33143;33144;33145;33146;43653;43654;43655;52106;52107;52108;56902;56903;56904 537;538;539;540;1153;1154;1155;25630;25631;25632;27328;27329;27330;27331;27332;27333;27334;27335;28651;28652;41087;41088;41089;41090;41091;41092;41710;41711;41712;41713;41714;41715;41716;41717;41718;41719;54548;54549;54550;54551;54552;54553;65243;65244;65245;65246;65247;65248;71395;71396;71397;71398;71399 539;1153;25632;27334;28651;41091;41713;41717;54549;65248;71395 Q9Y6E2 Q9Y6E2 15 14 14 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 BZW2 sp|Q9Y6E2|BZW2_HUMAN Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BZW2 PE=1 SV=1 1 15 14 14 14 11 11 13 10 10 13 10 10 37.7 36 36 48.162 419 419 0 89.277 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1256 1.0131 57.166 41 13 Leave out requantified 1.1505 0.99394 1.0858 1.0248 0.91777 1.027 59.055 14.896 21.561 16 11 14 5 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.8 26.3 26.3 2412100000 1192200000 1219900000 914950000 447420000 467530000 617580000 315480000 302100000 879580000 429260000 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coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial CHCHD2;CHCHD2P9 sp|Q9Y6H1|CHCH2_HUMAN Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHCHD2 PE=1 SV=1;sp|Q5T1J5|CHCH9_HUMAN Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial OS=Homo s 2 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 33.8 33.8 33.8 15.512 151 151;151 0 19.807 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0569 0.95019 4.9841 8 0 Leave out requantified 1.0569 1.1944 0.90288 0.95019 1.1255 0.87367 5.0765 6.8202 10.902 3 2 3 0 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 33.8 27.2 33.8 383560000 207330000 176230000 159640000 81946000 77691000 71979000 33294000 38685000 151940000 92086000 59858000 2371 126;9642;13137 True;True;True 130;9860;13445 402;403;404;33736;33737;45413;45414;45415 555;556;557;558;559;560;561;42455;56754;56755;56756;56757;56758;56759 557;42455;56758 Q9Y6I3 Q9Y6I3 4 4 3 Epsin-1 EPN1 sp|Q9Y6I3|EPN1_HUMAN 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Influenza virus NS1A-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IVNS1ABP PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.6 1.6 1.6 71.729 642 642 0.0081266 1.655 By MS/MS By matching By MS/MS 1.1286 1.0818 23.168 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 1.6 1.6 1.6 83393000 39399000 43994000 29333000 14162000 15171000 24891000 10740000 14150000 29169000 14497000 14673000 2377 12187 True 12469 42117;42118;42119 52740;52741;52742 52741 Q9Y6Y8 Q9Y6Y8 12 12 12 SEC23-interacting protein SEC23IP sp|Q9Y6Y8|S23IP_HUMAN SEC23-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC23IP PE=1 SV=1 1 12 12 12 12 8 7 12 8 7 12 8 7 15.1 15.1 15.1 111.08 1000 1000 0 59.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0595 0.97534 18.788 29 11 Leave out requantified 0.97551 1.2069 0.97109 0.89391 1.1655 0.91252 16.726 26.637 20.1 12 8 9 4 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.1 11.7 9.4 768900000 388710000 380190000 368570000 196920000 171650000 190780000 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