Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides SHP099_1 Peptides SHP099_3 Peptides SHP099_4 Razor + unique peptides SHP099_1 Razor + unique peptides SHP099_3 Razor + unique peptides SHP099_4 Unique peptides SHP099_1 Unique peptides SHP099_3 Unique peptides SHP099_4 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type SHP099_1 Identification type SHP099_3 Identification type SHP099_4 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L SHP099_1 Ratio H/L SHP099_3 Ratio H/L SHP099_4 Ratio H/L normalized SHP099_1 Ratio H/L normalized SHP099_3 Ratio H/L normalized SHP099_4 Ratio H/L variability [%] SHP099_1 Ratio H/L variability [%] SHP099_3 Ratio H/L variability [%] SHP099_4 Ratio H/L count SHP099_1 Ratio H/L count SHP099_3 Ratio H/L count SHP099_4 Ratio H/L iso-count SHP099_1 Ratio H/L iso-count SHP099_3 Ratio H/L iso-count SHP099_4 Ratio H/L type SHP099_1 Ratio H/L type SHP099_3 Ratio H/L type SHP099_4 Sequence coverage SHP099_1 [%] Sequence coverage SHP099_3 [%] Sequence coverage SHP099_4 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity SHP099_1 Intensity L SHP099_1 Intensity H SHP099_1 Intensity SHP099_3 Intensity L SHP099_3 Intensity H SHP099_3 Intensity SHP099_4 Intensity L SHP099_4 Intensity H SHP099_4 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions P0DPI2;A0A0B4J2D5 P0DPI2;A0A0B4J2D5 8;8 8;8 8;8 sp|P0DPI2|GAL3A_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3A, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATD3A PE=1 SV=1;sp|A0A0B4J2D5|GAL3B_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3B, mitochondr 2 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 40.3 40.3 40.3 28.17 268 268;268 0 28.05 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1344 1.1917 10.69 28 9 Leave out requantified 1.2041 1.0235 1.1758 1.2578 1.1117 1.1495 18.962 6.7432 16.591 9 9 10 3 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.3 40.3 40.3 1782700000 847650000 935030000 521080000 228940000 292140000 625500000 312690000 312810000 636110000 306020000 330080000 0 7643;9575;10835;10836;13378;19211;19682;26911 True;True;True;True;True;True;True;True 7718;9663;10933;10934;13497;19385;19861;27141 25622;25623;25624;25625;25626;25627;32022;32023;32024;36218;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225;36226;45543;45544;45545;64792;64793;64794;66387;66388;66389;90238;90239;90240 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NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 6.6 6.6 3.3 187150000 87846000 99300000 180170000 85882000 94284000 6980100 1964300 5015800 0 0 0 15 13471;24992 False;True 13590;25210 45855;45856;45857;83831;83832;83833 57608;57609;57610;57611;57612;57613;105624;105625;105626 57611;105625 A6NHR9 A6NHR9 41 41 41 Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 SMCHD1 sp|A6NHR9|SMHD1_HUMAN Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMCHD1 PE=1 SV=2 1 41 41 41 37 32 31 37 32 31 37 32 31 25.9 25.9 25.9 226.37 2005 2005 0 165.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9257 0.98833 40.004 108 36 Leave out requantified 0.95642 0.94019 0.9362 0.98268 1.0355 0.93973 54.56 24.528 24.724 43 34 31 19 11 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24 19.6 18.8 4274400000 2184700000 2089700000 1645600000 848350000 797220000 1334100000 668140000 665990000 1294700000 668220000 626470000 16 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A6NKT7;Q7Z3J3 18;17 1;1 1;1 RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3;RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4 RGPD3;RGPD4 sp|A6NKT7|RGPD3_HUMAN RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RGPD3 PE=3 SV=2;sp|Q7Z3J3|RGPD4_HUMAN RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RGPD4 PE=2 SV=3 2 18 1 1 16 17 16 1 1 1 1 1 1 14.3 0.7 0.7 197.48 1758 1758;1758 0.0017705 3.0093 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1306 1.2171 10.471 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 11.2 13.3 12.1 370770000 173950000 196820000 108320000 50105000 58210000 132370000 58948000 73418000 130090000 64892000 65194000 18 1728;7048;7729;9306;9731;12745;12906;15103;15197;16078;16327;19482;22246;22968;23326;23610;23768;28429 False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False 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sapiens OX=9606 GN=MT1X PE=1 SV=1;sp|P04732|MT1E_HUMAN Metallothionein-1E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MT1E PE=1 SV=1;sp|P02795 6 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.7 19.7 19.7 5.9511 61 61;61;61;61;61;62 0 19.102 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0191 1.0105 13.48 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 19.7 19.7 19.7 183460000 95631000 87825000 53660000 28055000 25605000 59467000 30847000 28620000 70329000 36729000 33601000 + 31 21726 True 21916 73005;73006;73007 91625;91626;91627;91628;91629 91629 CON__Q04695;Q04695;CON__Q9QWL7;CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2;CON__P08779;P08779;CON__P19012;CON__A2A4G1;P19012;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8;CON__Q61782;CON__Q8N1A0;CON__Q14525;CON__Q9UE12;CON__Q15323;CON__A2A5Y0;CON__Q9C075;CON__Q99PS0;CON__P35900;CON__Q9D312;CON__Q14532;CON__A2AB72;CON__O76015;CON__Q148H6;CON__O76013;CON__O76014;CON__REFSEQ:XP_986630;CON__Q7Z3Y7;Q8N1A0;Q14525;Q15323;Q9C075;P35900;Q14532;O76014;O76015;Q7Z3Y7;O76013 CON__Q04695;Q04695;CON__Q9QWL7 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Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGPS PE=1 SV=1 1 16 16 16 12 14 15 12 14 15 12 14 15 39.4 39.4 39.4 72.911 658 658 0 110.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0448 1.0301 20.248 41 9 Leave out requantified 1.2339 0.88018 1.0466 1.2949 0.94793 0.98922 23.29 20.728 18.512 11 14 16 1 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.1 32.8 38.1 2094600000 1023900000 1070700000 581510000 255340000 326160000 760420000 386780000 373640000 752680000 381800000 370890000 39 208;2092;7191;7200;7390;7680;8108;9468;9867;10464;13063;18412;19001;21290;24552;28590 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 209;2110;7260;7269;7463;7755;8187;9555;9958;10559;13180;18580;19173;21477;24768;28836 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Interferon-related developmental regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFRD1 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.3 7.3 7.3 50.268 451 451 0 20.208 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83626 0.88405 10.414 6 1 Leave out requantified 0.83995 0.82117 0.90523 0.87899 0.88837 0.87157 9.6015 11.349 7.2055 2 2 2 0 0 1 Median Median Median 7.3 7.3 7.3 131680000 71486000 60196000 43715000 24717000 18998000 44733000 24573000 20160000 43233000 22196000 21038000 61 10058;10642 True;True 10149;10738 33689;33690;33691;35547;35548;35549 42595;42596;44909;44910;44911;44912 42595;44912 O00470;O14770;A6NDR6;A8K0S8;Q99687 O00470;O14770 3;2;1;1;1 3;2;1;1;1 3;2;1;1;1 Homeobox protein Meis1;Homeobox protein Meis2 MEIS1;MEIS2 sp|O00470|MEIS1_HUMAN Homeobox protein Meis1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEIS1 PE=1 SV=1;sp|O14770|MEIS2_HUMAN Homeobox protein Meis2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEIS2 PE=1 SV=2 5 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 7.4 7.4 7.4 43.016 390 390;477;274;358;375 0 6.3877 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92549 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By MS/MS 0.91694 0.92848 15.017 9 5 Leave out requantified 0.81522 1.0806 0.91694 0.87817 1.1932 0.92848 47.956 20.31 23.765 4 2 3 3 1 1 Median Median Median 15.4 7.9 15.4 230990000 123640000 107360000 108520000 56772000 51751000 32014000 14600000 17414000 90454000 52264000 38190000 74 2793;9048;20436;27781 True;True;True;True 2818;9132;20620;28019 9348;9349;30280;30281;30282;30283;68818;68819;68820;93098;93099 12226;12227;38265;38266;38267;38268;86363;86364;86365;86366;117647;117648 12226;38265;86365;117648 O00750 O00750 2 2 2 Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta PIK3C2B sp|O00750|P3C2B_HUMAN Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIK3C2B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1.6 1.6 1.6 184.77 1634 1634 0.00334 2.2566 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92312 0.94953 22.64 4 0 Leave out requantified 0.89183 NaN NaN 0.94953 NaN NaN 22.64 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.6 0.9 0.9 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2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 9.3 9.3 9.3 35.102 312 312 0 21.149 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99034 1.0507 0.82428 5 1 Leave out requantified 1.2746 0.76945 NaN 1.3348 0.82711 NaN 31.005 29.357 NaN 2 2 1 0 0 1 Median Median Median 9.3 9.3 3.8 103170000 51111000 52060000 35295000 16071000 19223000 48603000 26500000 22104000 19273000 8540200 10733000 77 10516;17650 True;True 10612;17800 35166;35167;59747;59748;59749 44441;44442;44443;75130;75131;75132 44441;75130 O14497 O14497 8 8 8 AT-rich interactive domain-containing protein 1A ARID1A sp|O14497|ARI1A_HUMAN AT-rich interactive domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARID1A PE=1 SV=3 1 8 8 8 6 6 5 6 6 5 6 6 5 5 5 5 242.04 2285 2285 0 18.432 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96069 1.0128 34.758 14 8 Leave out requantified 0.82072 0.81441 1.0872 0.8683 0.89324 1.0868 21.321 38.44 36.198 7 4 3 5 2 1 Median Median Median 3.6 3.8 2.3 404670000 208040000 196630000 187050000 103390000 83669000 111380000 56273000 55104000 106240000 48386000 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3 3 3 1 1 1 Median Median Median 31.3 31.3 15.7 670470000 311660000 358810000 170050000 79633000 90421000 167170000 83712000 83462000 333240000 148320000 184920000 79 5333;6172;20629 True;True;True 5385;6230;20813 18135;20885;20886;20887;20888;20889;20890;69425;69426 23064;26578;26579;26580;26581;26582;26583;26584;26585;87150;87151 23064;26585;87150 O14530 O14530 1 1 1 Thioredoxin domain-containing protein 9 TXNDC9 sp|O14530|TXND9_HUMAN Thioredoxin domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNDC9 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4 4 4 26.534 226 226 0.0033434 2.2699 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80 26717 True 26946 89562 113042 113042 O14578 O14578 5 5 5 Citron Rho-interacting kinase CIT sp|O14578|CTRO_HUMAN Citron Rho-interacting kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIT PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 2.8 2.8 2.8 231.43 2027 2027 0 5.4092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89668 0.98931 19.264 11 3 Leave out requantified 0.84108 0.89668 0.84151 0.8852 0.98931 0.84826 45.819 22.709 17.074 4 4 3 2 1 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 2.4 2.2 1.8 233940000 127010000 106930000 82384000 50724000 31660000 97048000 48301000 48746000 54505000 27986000 26520000 81 508;1183;12911;15558;22015 True;True;True;True;True 510;1192;13024;15693;22209 1698;1699;1700;3997;43950;43951;43952;52962;52963;52964;73941 2182;2183;5236;55127;66555;66556;66557;92791 2183;5236;55127;66556;92791 17;18 766;770 O14579 O14579 8 8 8 Coatomer subunit epsilon COPE sp|O14579|COPE_HUMAN Coatomer subunit epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPE PE=1 SV=3 1 8 8 8 6 6 5 6 6 5 6 6 5 46.4 46.4 46.4 34.482 308 308 0 43.787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90576 0.95261 21.675 26 11 Leave out requantified 1.0338 0.89605 1.0225 1.071 0.97506 0.99236 15.405 27.158 8.1804 10 8 8 5 1 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.5 31.2 24.7 1790600000 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SV=1;sp|O14640|DVL1_HUMAN Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL1 PE=1 SV=2 2 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 4.5 4.5 4.5 73.253 670 670;695 0 4.71 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.2 0 2.2 16561000 14785000 1776100 11321000 9545400 1776100 0 0 0 5239700 5239700 0 84 6212;12671 True;True 6271;12781 21041;43170 26790;54139 26790;54139 O14641 O14641 5 5 5 Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2 DVL2 sp|O14641|DVL2_HUMAN Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 13.6 13.6 13.6 78.947 736 736 0 11.722 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98613 1.0178 30.692 9 2 Leave out requantified 0.98613 0.90841 1.0264 1.0397 1.0019 1.0178 31.65 22.917 29.783 3 3 3 0 1 1 Leave out requantified Median Median 13.6 8.7 8.7 379940000 189940000 190000000 116550000 53611000 62936000 112430000 55448000 56985000 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sp|O14727|APAF_HUMAN Apoptotic protease-activating factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APAF1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 141.84 1248 1248 0.0059211 2.043 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73723 0.80935 33.974 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 0.9 0.9 0.9 43186000 25152000 18034000 11401000 5876000 5525300 18019000 11660000 6358600 13766000 7615700 6150400 87 29170 True 29422 97572;97573;97574 123394;123395;123396 123396 O14732 O14732 2 2 2 Inositol monophosphatase 2 IMPA2 sp|O14732|IMPA2_HUMAN Inositol monophosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 7.3 7.3 7.3 31.321 288 288 0 5.6504 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85781 0.84673 29.609 5 3 Median 1.043 NaN 1.0959 1.0671 NaN 1.0886 39.219 NaN 35.535 2 1 2 1 1 1 Median Median Median 7.3 4.2 7.3 310420000 183180000 127240000 103210000 56854000 46357000 86519000 61155000 25364000 120690000 65176000 55516000 88 8195;27597 True;True 8274;27835 27458;27459;27460;92511;92512 34759;34760;34761;116907 34759;116907 O14737 O14737 1 1 1 Programmed cell death protein 5 PDCD5 sp|O14737|PDCD5_HUMAN Programmed cell death protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD5 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.8 8.8 8.8 14.285 125 125 0.0074554 1.8984 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 8.8 8.8 8.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89 17140 True 17284 58069;58070;58071 72978;72979;72980 72980 O14744 O14744 5 5 5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed PRMT5 sp|O14744|ANM5_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT5 PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 5 3 3 5 3 3 5 3 10.4 10.4 10.4 72.683 637 637 0 9.4269 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93 0.98539 27.957 12 2 Leave out requantified 0.9188 0.9171 1.1314 0.9907 1.016 1.124 48.856 23.698 21.731 3 5 4 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 6.8 10.4 6.9 346370000 184090000 162290000 103490000 56082000 47403000 146630000 81802000 64827000 96259000 46202000 50058000 90 117;3365;4940;20224;29042 True;True;True;True;True 118;3395;4988;20408;29294 385;386;387;11365;11366;11367;16833;68171;68172;97183;97184;97185;97186 510;511;14730;14731;14732;14733;14734;21364;85563;122898;122899;122900;122901;122902;122903 510;14730;21364;85563;122899 O14745 O14745 7 7 7 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 SLC9A3R1 sp|O14745|NHRF1_HUMAN Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC9A3R1 PE=1 SV=4 1 7 7 7 7 5 6 7 5 6 7 5 6 27.9 27.9 27.9 38.868 358 358 0 26.072 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96809 0.97753 5.4917 20 7 Leave out requantified 0.90035 1.0139 0.97408 0.97105 1.1102 0.95528 6.3893 18.558 7.7654 8 5 7 4 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.9 21.2 26 577160000 295250000 281910000 270140000 138440000 131700000 103530000 51445000 52083000 203490000 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ribonuclease P protein 3 KIAA0391 sp|O15091|MRPP3_HUMAN Mitochondrial ribonuclease P catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIAA0391 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 10.1 10.1 10.1 67.315 583 583 0 13.341 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85585 0.90421 24.931 11 5 Leave out requantified 0.9278 0.78949 1.0988 0.97174 0.84138 1.0971 14.677 25.94 48.357 3 4 4 1 1 3 Median Leave out requantified Median 5 7.7 8.6 131650000 72277000 59372000 33463000 19199000 14265000 53187000 31280000 21907000 44999000 21799000 23200000 118 5193;7245;15880;22669;23239 True;True;True;True;True 5243;7314;16017;22869;23443 17690;17691;17692;24325;54070;54071;76114;76115;76116;77974;77975 22506;22507;22508;30858;67904;67905;67906;95582;95583;95584;97990;97991 22508;30858;67906;95583;97991 O15111 O15111 2 1 1 Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha CHUK sp|O15111|IKKA_HUMAN Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHUK PE=1 SV=2 1 2 1 1 0 2 0 0 1 0 0 1 0 3 1.9 1.9 84.639 745 745 0.0089571 1.7789 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119 12524;22783 False;True 12633;22983 42642;76475 53444;96014 53444;96014 O15143 O15143 5 5 5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B ARPC1B sp|O15143|ARC1B_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC1B PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 2 4 3 2 4 3 2 20.4 20.4 20.4 40.949 372 372 0 14.73 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94571 1.0024 45.095 11 5 Leave out requantified 0.89199 0.96699 0.94929 0.95792 1.0345 0.97924 115.13 15.305 16.656 5 3 3 3 0 2 Median Leave out requantified Median 15.9 12.1 7.5 787920000 335060000 452870000 441850000 163430000 278430000 130990000 65860000 65133000 215080000 105770000 109310000 120 2130;6011;19535;25682;25970 True;True;True;True;True 2148;6068;19712;25907;26197 7148;7149;7150;7151;7152;20382;65899;86074;86075;86076;87036 9329;9330;9331;9332;9333;9334;25970;25971;82772;108525;108526;108527;108528;108529;108530;109789 9334;25970;82772;108527;109789 O15144 O15144 7 7 7 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 ARPC2 sp|O15144|ARPC2_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC2 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 7 24 24 24 34.333 300 300 0 14.507 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91407 0.99591 36.942 21 3 Leave out requantified 0.76536 0.85591 1.0281 0.80473 0.94801 1.0183 29.814 37.578 36.775 6 8 7 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21 24 24 664280000 338260000 326020000 215120000 118900000 96212000 222820000 112590000 110220000 226350000 106770000 119580000 121 2062;3349;4612;4983;6622;12535;18636 True;True;True;True;True;True;True 2080;3379;4657;5032;6684;12644;18806 6921;6922;6923;11309;11310;11311;11312;15717;15718;15719;16979;16980;16981;22386;22387;22388;42677;42678;42679;62862;62863 9062;9063;14650;14651;14652;14653;14654;20053;20054;20055;21557;21558;21559;28481;28482;28483;28484;53491;53492;53493;53494;53495;53496;79043 9063;14652;20053;21557;28483;53494;79043 O15145 O15145 3 3 3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 ARPC3 sp|O15145|ARPC3_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC3 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 17.4 17.4 17.4 20.546 178 178 0 15.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88533 0.9281 10.119 11 6 Leave out requantified 0.74744 0.80414 0.87155 0.79806 0.86805 0.87782 35.098 55.223 34.571 3 4 4 1 3 2 Median Median Median 11.2 17.4 17.4 569100000 324310000 244790000 82783000 41752000 41031000 238010000 139560000 98452000 248300000 143000000 105310000 122 2628;4691;26357 True;True;True 2652;4737;26584 8829;8830;8831;15975;15976;15977;15978;15979;15980;88348;88349 11571;20342;20343;20344;20345;20346;20347;111490;111491 11571;20347;111490 O15156 O15156 2 2 2 Zinc finger and BTB domain-containing protein 7B ZBTB7B sp|O15156|ZBT7B_HUMAN Zinc finger and BTB domain-containing protein 7B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZBTB7B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 3.5 3.5 3.5 58.026 539 539 0.0033422 2.2644 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0094 1.0828 34.078 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 Median Median Median 3.5 3.5 1.5 45373000 35700000 9673400 17354000 11955000 5398500 20007000 15732000 4274900 8012500 8012500 0 123 8352;20563 True;True 8431;20747 27960;27961;27962;69227;69228 35335;35336;35337;86900;86901 35335;86901 O15160 O15160 8 8 8 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 POLR1C sp|O15160|RPAC1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR1C PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 7 7 8 7 7 8 7 7 33.5 33.5 33.5 39.249 346 346 0 46.612 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93886 1.0243 8.1367 28 9 Leave out requantified 0.91418 0.94387 1.0066 0.94664 1.0437 0.99124 15.235 5.2392 5.5981 11 9 8 6 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.5 30.9 30.9 1246700000 635730000 610960000 454330000 238520000 215810000 392640000 204800000 187850000 399720000 192410000 207310000 124 2765;4656;12834;15359;16165;19401;27195;27935 True;True;True;True;True;True;True;True 2790;4701;12946;15491;16304;19576;27427;28176 9249;9250;9251;15845;15846;15847;15848;43705;43706;43707;43708;43709;43710;52255;52256;52257;52258;55010;55011;55012;55013;65462;65463;65464;91183;91184;91185;93614 12103;12104;12105;12106;12107;20194;20195;54839;54840;54841;54842;54843;65670;65671;65672;65673;65674;69088;69089;69090;69091;82207;82208;115183;115184;115185;118325 12103;20195;54843;65672;69091;82207;115185;118325 O15164 O15164 5 5 4 Transcription intermediary factor 1-alpha TRIM24 sp|O15164|TIF1A_HUMAN Transcription intermediary factor 1-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM24 PE=1 SV=3 1 5 5 4 4 4 5 4 4 5 4 3 4 4.9 4.9 4.1 116.83 1050 1050 0 13.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0738 1.1149 12.114 11 6 Leave out requantified 1.1137 1.0342 1.1471 1.1739 1.1171 1.1181 16.528 83.25 59.297 3 4 4 1 2 3 Median Median Median 4.1 4 4.9 206840000 92381000 114460000 49416000 22089000 27327000 86960000 36748000 50212000 70465000 33543000 36922000 125 1379;2997;3335;4754;12542 True;True;True;True;True 1388;3024;3364;4800;12651 4641;4642;4643;10125;10126;10127;11265;11266;16206;16207;16208;16209;42700;42701 6021;6022;6023;13130;13131;13132;13133;14590;14591;20638;20639;20640;20641;20642;20643;53519;53520 6023;13132;14590;20642;53519 O15173;O00264 O15173;O00264 2;1 2;1 2;1 Membrane-associated progesterone receptor component 2;Membrane-associated progesterone receptor component 1 PGRMC2;PGRMC1 sp|O15173|PGRC2_HUMAN Membrane-associated progesterone receptor component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGRMC2 PE=1 SV=1;sp|O00264|PGRC1_HUMAN Membrane-associated progesterone receptor component 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGRMC1 PE=1 SV=3 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 12.6 12.6 12.6 23.818 223 223;195 0 7.0432 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94159 0.99241 49.672 4 3 Median 0.94159 NaN NaN 0.99241 NaN NaN 0.86444 NaN NaN 2 1 1 1 1 1 Median Median Median 12.6 8.5 4 71051000 30882000 40169000 38493000 18277000 20216000 16314000 4411900 11902000 16244000 8192800 8051100 126 9943;10025 True;True 10034;10116 33321;33322;33587;33588 42147;42148;42467;42468 42147;42467 O15212 O15212 3 3 3 Prefoldin subunit 6 PFDN6 sp|O15212|PFD6_HUMAN Prefoldin subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN6 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 26.4 26.4 26.4 14.582 129 129 0 8.8038 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1207 1.1986 27.421 5 2 Median 0.74721 NaN 1.2663 0.80144 NaN 1.2237 28.242 NaN 2.9263 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 17.1 15.5 15.5 134050000 66834000 67213000 50581000 28896000 21685000 29153000 14486000 14667000 54314000 23453000 30861000 127 5583;7363;16032 True;True;True 5637;7435;16170 18982;24715;24716;54565;54566;54567 24126;31351;31352;68510;68511;68512;68513 24126;31351;68510 O15226 O15226 2 2 2 NF-kappa-B-repressing factor NKRF sp|O15226|NKRF_HUMAN NF-kappa-B-repressing factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NKRF PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 0 0 2 0 0 2 0 2.9 2.9 2.9 77.672 690 690 0 4.7857 By MS/MS 0.79998 0.87206 97.698 2 2 Median NaN 0.79998 NaN NaN 0.87206 NaN NaN 97.698 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 0 2.9 0 54248000 20644000 33604000 0 0 0 54248000 20644000 33604000 0 0 0 128 9131;22005 True;True 9215;22199 30556;73918 38630;92768 38630;92768 O15294 O15294 16 16 16 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit OGT sp|O15294|OGT1_HUMAN UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OGT PE=1 SV=3 1 16 16 16 11 13 13 11 13 13 11 13 13 23.4 23.4 23.4 116.92 1046 1046 0 68.583 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97871 1.0696 5.6931 41 17 Leave out requantified 1.0002 0.96573 1.2595 1.0185 1.0602 1.2285 7.556 8.7464 16.016 11 16 14 3 6 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.4 17.8 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domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASAP2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 4.5 4.5 4.5 111.65 1006 1006 0.0074578 1.8999 By MS/MS By MS/MS 1.0972 1.1182 23.337 3 0 Median NaN NaN 1.0657 NaN NaN 1.07 NaN NaN 6.2342 1 0 2 0 0 0 Median Median Median 2.2 0 4.5 72146000 33004000 39142000 17165000 6201300 10964000 0 0 0 54980000 26802000 28178000 147 1043;25722 True;True 1050;25948 3516;3517;86206 4558;4559;108693 4559;108693 O43156 O43156 7 7 7 TELO2-interacting protein 1 homolog TTI1 sp|O43156|TTI1_HUMAN TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTI1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 6 4 3 6 4 3 6 4 3 8.2 8.2 8.2 122.07 1089 1089 0 70.423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94329 0.94396 41.332 11 4 Leave out requantified 1.1003 0.73623 0.97779 1.1728 0.79625 0.90911 22.171 28.888 32.947 4 4 3 1 2 1 Leave out requantified Median Median 6.9 5 3.2 327640000 167120000 160520000 148470000 67265000 81205000 106840000 62489000 44353000 72332000 37367000 34964000 148 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intracellular-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIBP PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 4 3 2 4 3 2 4 3 15.4 15.4 15.4 41.878 364 364 0 15.644 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1044 1.1709 8.1798 10 5 Leave out requantified 0.74966 1.1044 0.99942 0.80621 1.1709 0.94322 54.639 10.997 20.566 2 4 4 1 1 3 Median Leave out requantified Median 6.3 15.4 12.6 263860000 142750000 121110000 51681000 30268000 21413000 112410000 61243000 51165000 99767000 51237000 48530000 167 21812;22205;27163;29189 True;True;True;True 22003;22402;27395;29441 73298;73299;73300;74539;74540;74541;91068;91069;91070;97633 91998;91999;92000;92001;92002;93561;93562;93563;115043;115044;115045;123471 91998;93563;115043;123471 O43432 O43432 25 20 20 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 EIF4G3 sp|O43432|IF4G3_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4G3 PE=1 SV=2 1 25 20 20 24 23 24 19 18 19 19 18 19 18.1 15 15 176.65 1585 1585 0 79.055 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0604 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Trafficking protein particle complex subunit 3 TRAPPC3 sp|O43617|TPPC3_HUMAN Trafficking protein particle complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 18.3 18.3 18.3 20.274 180 180 0 16.057 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90585 0.95644 10.658 8 4 Leave out requantified 0.87983 1.03 1.0863 0.93599 1.1017 1.0993 3.0574 40.643 64.937 2 3 3 0 1 3 Median Median Median 10 14.4 13.9 822240000 500780000 321460000 263720000 171270000 92454000 313660000 192820000 120840000 244860000 136690000 108160000 177 4962;7299;8887;15574 True;True;True;True 5011;7370;8971;15709 16905;16906;16907;16908;16909;24513;24514;24515;29764;53015 21454;21455;21456;21457;21458;21459;31105;31106;31107;31108;37620;66621 21457;31106;37620;66621 O43633 O43633 5 5 5 Charged multivesicular body protein 2a CHMP2A sp|O43633|CHM2A_HUMAN Charged multivesicular body protein 2a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP2A PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 23.4 23.4 23.4 25.104 222 222 0 25.661 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1451 1.1514 16.786 14 6 Leave out requantified 0.94759 0.98959 1.2421 0.96831 1.084 1.189 19.762 24.474 17.787 5 4 5 2 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 18.9 18.9 19.8 957530000 458590000 498950000 331260000 168060000 163200000 321830000 145740000 176090000 304440000 144790000 159650000 178 425;1703;12984;19825;22969 True;True;True;True;True 427;1718;13099;20005;23173 1425;1426;1427;1428;1429;5709;5710;5711;44195;44196;44197;66876;66877;77111 1832;1833;1834;1835;1836;7435;7436;55426;55427;83930;83931;96793 1832;7436;55427;83930;96793 O43660 O43660 19 19 19 Pleiotropic regulator 1 PLRG1 sp|O43660|PLRG1_HUMAN Pleiotropic regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLRG1 PE=1 SV=1 1 19 19 19 16 15 17 16 15 17 16 15 17 52.9 52.9 52.9 57.193 514 514 0 79.864 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98088 1.0408 13.048 58 22 Leave out requantified 1.0245 0.95711 0.94319 1.0408 1.0427 0.91867 11.393 11.941 17.733 20 18 20 9 7 6 Leave out requantified Leave out 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polyadenylation specificity factor subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDT21 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 7 6 6 7 6 6 7 6 36.6 36.6 36.6 26.227 227 227 0 31.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90902 0.92044 10.421 27 5 Leave out requantified 0.90902 0.71218 0.92897 0.97915 0.79454 0.92044 7.5329 7.7915 10.421 9 9 9 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.1 36.6 29.1 2676200000 1439900000 1236200000 922350000 470690000 451660000 798890000 482540000 316350000 954960000 486720000 468230000 191 1293;10927;15183;16613;16622;24571;25510 True;True;True;True;True;True;True 1302;11026;15314;16756;16765;24787;25733 4355;4356;4357;36537;36538;36539;51644;51645;51646;56414;56440;56441;56442;82463;82464;82465;82466;82467;82468;85494;85495;85496;85497;85498;85499;85500;85501 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By MS/MS By MS/MS 0.60668 0.63974 82.269 6 3 Median 0.35769 0.73155 NaN 0.3753 0.7933 NaN 127.7 78.296 NaN 2 3 1 1 2 0 Median Plateau Median 26.8 38.1 11.3 245440000 134940000 110500000 86031000 42984000 43047000 107320000 65087000 42229000 52093000 26873000 25220000 203 427;8210;8631 True;True;True 429;8289;8711 1433;1434;1435;27504;28896;28897;28898 1839;1840;1841;1842;1843;1844;34814;36491;36492;36493 1839;34814;36492 O60231 O60231 17 17 17 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 DHX16 sp|O60231|DHX16_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX16 PE=1 SV=2 1 17 17 17 13 16 16 13 16 16 13 16 16 23.1 23.1 23.1 119.26 1041 1041 0 61.804 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89096 0.90081 25.479 46 15 Leave out requantified 0.86334 0.84273 0.89922 0.9057 0.91584 0.87893 14.685 29.026 17.532 14 17 15 5 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.4 20.9 21.7 1932300000 1004500000 927860000 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11802;12918;12953;14729;15452;16390;26537;29428;29599;30590;35019;35343;50572;51241;51244;52907;63261;64716;69004;69654;74216;79868;80425;81930;84796;87794;89002;91002;99099;102149;105043;114288;121907 O60266 O60266 1 1 1 Adenylate cyclase type 3 ADCY3 sp|O60266|ADCY3_HUMAN Adenylate cyclase type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADCY3 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.8 0.8 0.8 128.96 1144 1144 0.0095238 1.7463 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 0 0.8 138610000 67132000 71482000 0 0 0 0 0 0 138610000 67132000 71482000 207 17003 True 17147 57642 72434 72434 O60271 O60271 21 21 21 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 SPAG9 sp|O60271|JIP4_HUMAN C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPAG9 PE=1 SV=4 1 21 21 21 14 12 18 14 12 18 14 12 18 23.5 23.5 23.5 146.2 1321 1321 0 74.129 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89045 0.91687 17.582 44 17 Leave out requantified 0.64858 0.82344 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mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 OPA1 sp|O60313|OPA1_HUMAN Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OPA1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 5 3 5 5 3 5 5 3 8 8 8 111.63 960 960 0 12.323 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94386 1.018 16.061 12 6 Leave out requantified 1.0199 1.0088 0.91476 1.0795 1.1026 0.92752 10.481 14.78 8.3133 4 5 3 2 3 1 Median Median Median 5.2 5.8 3 187410000 95282000 92129000 70596000 34548000 36048000 68016000 35569000 32447000 48799000 25165000 23634000 211 1321;7279;7555;18742;20935;24531;28042 True;True;True;True;True;True;True 1330;7350;7629;18913;21120;24747;28285 4449;24449;24450;24451;24452;25335;63213;70383;82324;82325;82326;93976;93977;93978 5780;31020;31021;31022;31023;32157;79488;88365;103675;103676;118816;118817;118818 5780;31023;32157;79488;88365;103676;118817 O60318 O60318 6 6 6 Germinal-center associated nuclear protein MCM3AP sp|O60318|GANP_HUMAN Germinal-center associated nuclear protein OS=Homo sapiens OX=9606 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initiation factor 4E type 2 EIF4E2 sp|O60573|IF4E2_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4E type 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4E2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 2 4 4 2 4 4 2 34.7 34.7 34.7 28.362 245 245 0 13.006 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0241 1.1406 32.149 10 2 Leave out requantified 1.0009 0.89331 1.6355 1.0186 0.96311 1.6133 20.761 10.102 39.652 4 4 2 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 25.7 29.4 13.9 368980000 172320000 196660000 173510000 82306000 91204000 131550000 66162000 65390000 63918000 23851000 40067000 226 2550;5878;7885;25053;27055 True;True;True;True;True 2573;5933;7961;25271;27287 8556;8557;8558;19925;26446;84006;84007;90700;90701;90702;90703 11179;11180;11181;11182;11183;25362;33535;33536;105844;105845;114517;114518;114519;114520;114521 11179;25362;33535;105845;114520 O60610 O60610 45 45 45 Protein diaphanous homolog 1 DIAPH1 sp|O60610|DIAP1_HUMAN Protein diaphanous homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIAPH1 PE=1 SV=2 1 45 45 45 40 41 41 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36 Eukaryotic translation initiation factor 5B EIF5B sp|O60841|IF2P_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5B PE=1 SV=4 1 36 36 36 33 33 34 33 33 34 33 33 34 34.7 34.7 34.7 138.83 1220 1220 0 201.69 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95344 1.0035 17.939 129 30 Leave out requantified 0.95507 0.95076 0.942 1.0162 1.0553 0.91666 23.823 19.254 21.519 43 40 46 8 10 12 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.3 33.9 34 12594000000 6441300000 6152400000 4247800000 2216300000 2031400000 3909400000 1986100000 1923300000 4436600000 2238900000 2197700000 242 599;600;1450;1664;1982;3267;3438;4418;5370;5371;5826;6387;7424;10083;11201;11306;11686;12211;12881;13096;13818;13931;14142;14190;14397;16196;16989;18844;19017;21031;21903;23011;24650;25234;26271;27825 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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O75317;P62068 O75317;P62068 2;1 2;1 2;1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 USP12;USP46 sp|O75317|UBP12_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP12 PE=1 SV=2;sp|P62068|UBP46_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP46 PE=1 SV=1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 5.7 5.7 5.7 42.857 370 370;366 0.0046373 2.1428 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98789 0.98762 36.986 4 1 Median NaN 0.97626 NaN NaN 1.0897 NaN NaN 61.024 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 2.2 5.7 2.2 96610000 56677000 39933000 13586000 7425000 6161000 66463000 39138000 27326000 16561000 10115000 6446500 267 9545;27898 True;True 9633;28138 31918;93495;93496;93497 40373;118185;118186;118187 40373;118186 O75323 O75323 5 5 5 Protein NipSnap homolog 2 GBAS sp|O75323|NIPS2_HUMAN Protein NipSnap homolog 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPSNAP2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 5 18.9 18.9 18.9 33.742 286 286 0 9.621 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96181 1.0006 5.2098 16 5 Leave out requantified 0.89727 0.95378 0.96398 0.93298 1.0666 0.95412 24.058 2.8795 9.4498 5 5 6 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.7 14 18.9 809860000 422660000 387200000 236840000 123990000 112850000 282820000 140800000 142020000 290200000 157870000 132330000 268 11986;16813;21828;22234;28452 True;True;True;True;True 12094;16956;22019;22431;28698 40833;40834;40835;57043;57044;57045;57046;57047;57048;73342;73343;73344;74634;74635;74636;95194;95195 51131;51132;51133;71687;71688;71689;71690;71691;71692;71693;71694;92057;92058;92059;93692;93693;93694;93695;120362;120363 51133;71692;92057;93693;120363 O75330 O75330 2 1 1 Hyaluronan mediated motility receptor HMMR sp|O75330|HMMR_HUMAN Hyaluronan mediated motility receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMMR PE=1 SV=2 1 2 1 1 1 2 0 0 1 0 0 1 0 2.6 1.7 1.7 84.099 724 724 0.0068382 1.9409 By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 1 2.6 0 4549300 4549300 0 0 0 0 4549300 4549300 0 0 0 0 269 6636;16782 True;False 6699;16925 22428;56948;56949 28529;71574 28529;71574 O75340 O75340 8 8 8 Programmed cell death protein 6 PDCD6 sp|O75340|PDCD6_HUMAN Programmed cell death protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD6 PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 5 7 7 5 7 7 5 7 47.1 47.1 47.1 21.868 191 191 0 37.921 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.081 1.0975 11.578 24 5 Leave out requantified 1.269 0.98734 1.0503 1.3236 1.084 1.0104 8.0889 2.573 7.398 9 6 9 2 0 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33 26.7 47.1 3852000000 1860300000 1991700000 1402900000 624620000 778270000 945770000 469430000 476340000 1503300000 766250000 737090000 270 874;4381;4382;17047;19887;22273;22395;28681 True;True;True;True;True;True;True;True 878;4423;4424;17191;20068;22471;22593;28928 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G 1 ATP6V1G1 sp|O75348|VATG1_HUMAN V-type proton ATPase subunit G 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1G1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 28.8 28.8 28.8 13.757 118 118 0 17.672 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92907 1.0148 23.123 7 0 Leave out requantified 0.87519 0.92562 1.2871 0.93834 0.99882 1.2346 0.72595 2.2422 23.522 2 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 21.2 21.2 28.8 282080000 142690000 139390000 79499000 43599000 35899000 83870000 45571000 38298000 118710000 53524000 65188000 272 5490;10541;18439 True;True;True 5544;10637;18608 18686;18687;18688;35233;35234;35235;62229 23774;23775;23776;23777;23778;23779;44530;44531;44532;78226;78227 23777;44531;78227 O75351 O75351 9 9 8 Vacuolar protein sorting-associated protein 4B VPS4B sp|O75351|VPS4B_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS4B PE=1 SV=2 1 9 9 8 7 6 6 7 6 6 6 5 5 28.2 28.2 26.4 49.301 444 444 0 35.694 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0816 1.1316 19.971 20 6 Leave out 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18348;18349;18350;55545;55546;80940;108994;108995;108996;108997;108998;108999 18349;55545;80940;108998 O75400;Q6NWY9 O75400 13;1 13;1 13;1 Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A PRPF40A sp|O75400|PR40A_HUMAN Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF40A PE=1 SV=2 2 13 13 13 11 10 13 11 10 13 11 10 13 15 15 15 108.8 957 957;871 0 75.003 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95044 0.95179 10.799 41 10 Leave out requantified 0.94 0.92516 0.98103 0.99881 1.011 0.95679 11.45 18.156 7.9257 13 12 16 3 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.2 11.4 15 3239000000 1649300000 1589700000 1196800000 604940000 591810000 1007600000 499590000 507970000 1034700000 544720000 489950000 278 573;6917;8789;8982;14372;18109;19801;19845;21076;21852;24782;25761;25767 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 575;6986;8870;9066;14499;18269;19981;20025;21262;22043;24999;25987;25993 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matching 0.96172 1.0018 5.7524 4 1 Median 0.96172 NaN NaN 1.0104 NaN NaN 1.7179 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 8.2 1.8 1.8 313770000 152910000 160860000 108780000 52279000 56500000 103150000 55196000 47952000 101840000 45433000 56407000 279 10537;13256;19414 True;True;True 10633;13373;19589 35225;45107;45108;45109;65500 44519;56647;56648;82249 44519;56647;82249 O75436 O75436 1 1 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 26A VPS26A sp|O75436|VP26A_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS26A PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4 4 4 38.169 327 327 0.0059074 2.0317 By MS/MS By MS/MS 1.127 1.1497 7.3686 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 4 4 42175000 19844000 22332000 0 0 0 19598000 9968600 9629700 22577000 9874900 12702000 280 15169 True 15300 51601;51602 64879;64880 64880 O75439 O75439 1 1 1 Mitochondrial-processing peptidase subunit beta PMPCB sp|O75439|MPPB_HUMAN Mitochondrial-processing peptidase subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PMPCB PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.9 3.9 3.9 54.366 489 489 0.0095178 1.7437 By matching By MS/MS 1.1744 1.2481 25.236 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 3.9 3.9 30742000 14646000 16096000 0 0 0 14577000 6902600 7673900 16165000 7742900 8422100 281 13531 True 13652 46063;46064 57873 57873 O75445 O75445 2 2 2 Usherin USH2A sp|O75445|USH2A_HUMAN Usherin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USH2A PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0.4 0.4 0.4 575.59 5202 5202 0.0062173 2.0124 By MS/MS By MS/MS 1.4258 1.4398 62.624 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 0.2 0 0.2 70283000 26491000 43792000 23957000 12479000 11477000 0 0 0 46326000 14011000 32315000 282 2914;23710 True;True 2939;23915 9813;79499 12762;99961 12762;99961 O75446 O75446 3 3 3 Histone deacetylase complex subunit SAP30 SAP30 sp|O75446|SAP30_HUMAN Histone deacetylase 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Ribonuclease P protein subunit p20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP7 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.6 13.6 13.6 15.651 140 140 0.0027797 2.7546 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1658 1.151 13.275 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 13.6 13.6 13.6 42080000 20574000 21506000 16555000 8965300 7589700 15097000 7546800 7549800 10429000 4062300 6366300 314 10479 True 10575 35064;35065;35066 44317;44318;44319 44318 O75818 O75818 3 3 3 Ribonuclease P protein subunit p40 RPP40 sp|O75818|RPP40_HUMAN Ribonuclease P protein subunit p40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPP40 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 13.2 13.2 13.2 41.833 363 363 0 6.5618 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90162 0.95802 48.111 8 5 Median 0.90162 0.7707 1.1367 0.95802 0.83844 1.1302 0.46062 24.605 75.591 2 3 3 1 2 2 Median Median Median 10.7 13.2 7.4 240630000 125860000 114780000 61235000 32504000 28731000 97972000 55417000 42554000 81424000 37934000 43490000 315 4195;19164;28964 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PIAS2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIAS2 PE=1 SV=3;sp|O75925|PIAS1_HUMAN E3 SUMO-protein ligase PIAS1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIAS1 PE=1 SV=2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 68.24 621 621;651 0.0030262 2.3439 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1382 1.1333 4.7 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.4 2.4 2.4 49774000 22049000 27725000 17007000 6200900 10806000 15882000 8329800 7552000 16885000 7518100 9366900 322 17227 True 17371 58321;58322;58323 73317;73318;73319;73320 73317 O75934 O75934 10 10 10 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 BCAS2 sp|O75934|SPF27_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor SPF27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCAS2 PE=1 SV=1 1 10 10 10 9 6 8 9 6 8 9 6 8 52.4 52.4 52.4 26.131 225 225 0 78.493 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97444 0.97253 9.3217 32 10 Leave out requantified 0.90984 0.84563 1.0224 0.96705 0.92489 1.011 12.472 14.937 9.3571 11 9 12 4 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.4 31.1 45.3 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requantified Leave out requantified 24.1 24.9 32.4 2667200000 1411000000 1256200000 1115600000 616470000 499090000 622820000 312520000 310290000 928820000 482040000 446780000 325 5891;7761;15085;16084;17369;20686;20995 True;True;True;True;True;True;True 5946;7836;15216;16222;17515;20870;21180 19970;19971;19972;19973;19974;19975;26007;26008;51332;51333;54750;54751;54752;54753;54754;54755;58789;58790;58791;69604;69605;69606;69607;69608;69609;70567;70568 25425;25426;25427;25428;25429;25430;25431;25432;25433;32998;32999;64525;64526;64527;64528;68744;68745;68746;68747;68748;68749;73923;73924;87385;87386;87387;87388;87389;87390;87391;88604;88605 25430;32998;64527;68746;73923;87386;88605 O75940 O75940 5 5 5 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 SMNDC1 sp|O75940|SPF30_HUMAN Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMNDC1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 34.5 34.5 34.5 26.711 238 238 0 27.196 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94026 0.92999 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affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3,5-cyclic phosphodiesterase 8B PDE8B sp|O95263|PDE8B_HUMAN High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3,5-cyclic phosphodiesterase 8B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE8B PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.8 3.8 3.8 98.978 885 885 0 4.2667 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 1.4 2.5 0 50192000 27952000 22240000 0 0 0 50192000 27952000 22240000 0 0 0 364 25365;26705 True;True 25585;26934 84988;89527 107110;113000 107110;113000 O95295 O95295 2 2 2 SNARE-associated protein Snapin SNAPIN sp|O95295|SNAPN_HUMAN SNARE-associated protein Snapin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAPIN PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 19.1 19.1 19.1 14.874 136 136 0 8.7071 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91307 0.94223 44.084 6 2 Median 1.0124 0.90685 0.9294 1.0316 0.98581 0.90283 67.429 50.11 49.756 2 2 2 1 0 1 Median Median Median 19.1 19.1 19.1 248320000 134650000 113680000 84187000 45819000 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7.5 5.2 5.2 69.5 614 614 0.0030405 2.4056 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0915 1.1092 50.812 6 3 Median NaN 0.81821 1.2207 NaN 0.88243 1.1923 NaN 63.237 32.07 1 3 2 0 2 1 Median Median Median 5.7 7.5 7.5 126640000 68408000 58229000 19484000 9087700 10396000 50359000 27273000 23086000 56794000 32047000 24747000 367 9178;11498;11567;17337 False;True;True;True 9262;11602;11671;17481 30709;30710;30711;30712;38929;38930;39194;39195;39196;58676;58677;58678 38812;38813;38814;38815;48859;48860;49193;49194;49195;73764 38814;48860;49195;73764 O95347 O95347 53 53 53 Structural maintenance of chromosomes protein 2 SMC2 sp|O95347|SMC2_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC2 PE=1 SV=2 1 53 53 53 46 47 49 46 47 49 46 47 49 51.9 51.9 51.9 135.65 1197 1197 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92897 0.96891 20.299 179 44 Leave out requantified 0.91563 0.89406 0.95061 0.97256 0.97903 0.93736 24.099 20.418 16.663 60 58 61 17 14 13 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.4 43.2 45.4 22043000000 11473000000 10571000000 7361900000 3874600000 3487200000 7199500000 3786200000 3413300000 7482100000 3812100000 3670000000 368 1244;1432;1625;1657;2106;2164;2823;3197;3925;4744;4882;4955;5915;6865;7439;7542;7855;8827;10180;11393;12687;12935;12936;13377;13937;15774;16569;16784;16785;17727;17745;19379;20878;20890;20921;21060;21282;22391;22574;23098;23193;23433;23787;24126;24234;24441;24516;24555;25642;25920;27450;28771;29082 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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O95639 1 1 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 CPSF4 sp|O95639|CPSF4_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF4 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 8.2 8.2 8.2 30.255 269 269 0.0071521 1.9249 By MS/MS By MS/MS 0.66983 0.69534 21.555 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 8.2 8.2 44367000 21693000 22675000 0 0 0 18813000 11452000 7361200 25555000 10241000 15313000 386 7999 True 8078 26823;26824 33985;33986 33986 O95671 O95671 4 4 4 N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein ASMTL sp|O95671|ASML_HUMAN Probable bifunctional dTTP/UTP pyrophosphatase/methyltransferase protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASMTL PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 12.2 12.2 12.2 68.856 621 621 0 16.108 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2242 1.2696 13.596 11 2 Leave out requantified 1.2242 1.1963 1.1853 1.2845 1.2696 1.1607 12.677 15.427 9.6924 3 4 4 0 1 1 Leave out requantified Leave out 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Adenylate kinase isoenzyme 1 AK1 sp|P00568|KAD1_HUMAN Adenylate kinase isoenzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK1 PE=1 SV=3 2 8 8 8 6 8 7 6 8 7 6 8 7 48.5 48.5 48.5 21.635 194 194;562 0 23.81 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94302 1.0303 21.125 19 2 Leave out requantified 0.85134 0.94302 1.3509 0.91015 1.0303 1.3036 11.762 14.08 38.36 6 7 6 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.4 48.5 37.1 805860000 400180000 405680000 223180000 118410000 104770000 307150000 160130000 147020000 275530000 121640000 153890000 417 2208;7603;9511;12427;12550;26036;26037;27256 True;True;True;True;True;True;True;True 2228;7677;9599;12536;12659;26263;26264;27491 7416;7417;25480;25481;25482;31799;31800;31801;31802;42321;42322;42323;42723;42724;42725;87245;87246;87247;87248;87249;87250;91397 9676;32342;32343;32344;40226;40227;40228;40229;53013;53014;53542;53543;53544;53545;53546;53547;110055;110056;110057;110058;110059;110060;115443 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15;14;2 Keratin, type II cytoskeletal 1 KRT1 sp|P04264|K2C1_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT1 PE=1 SV=6; 3 21 19 15 18 13 13 16 11 11 13 9 8 44.6 43 39.9 66.038 644 644;644;606 0 173.37 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.401 1.4128 57.013 38 19 Leave out requantified 1.6306 2.8858 0.7838 1.6706 3.2047 0.75651 60.014 31.841 43.014 17 10 11 6 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.2 27.3 29 2278400000 1022100000 1256400000 961740000 460670000 501060000 600600000 159460000 441140000 716110000 401960000 314150000 + 428 1989;8323;8324;9609;10673;12189;14414;16448;18395;19023;19024;20421;22191;22486;22560;22736;22841;22842;24779;24973;28447 True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2007;8402;8403;9697;10770;12298;14541;16591;18563;19195;19196;20605;22388;22685;22759;22936;23041;23042;24996;25191;28693 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8452;8453;8454;8455;8456;8457;8458;8459;8460;8461;16107;16108;16109;16110;16111;16112;16113;21389;21390;21391;21392;44034;44035;44036;44037;44038;44039;44040;44041;44042;44043;61164;61165;61166;61167;61168;61169;61170;61171;61172;61173;61174;61175;62265;62266;62267;62268;62269;62270;62271;62272;62273;62274;62275;62276;62277;64610;64611;64612;64613;64614;64615;64616;64617;64618;64619;64620;64621;64622;84598;87425;87426;87427;87428;87429;104082;104083;104084;104085;104086;104087;104088;104089;104090;104091;104092;117034;117035;117036;117037;117038;117039;117040;117041;117042;117043;117044;117045;117046;117047;117048;117049;117050;117051;117052;117053;123058;123059;123060;123061;123062;123063;123064;123065;123066;123067;123068;123069;123070;123071;123072;123073;123074;123075 8455;8459;16110;21391;44041;44043;61174;62271;64618;84598;87426;104084;117040;123067 44 169 P04818 P04818 2 2 2 Thymidylate synthase TYMS sp|P04818|TYSY_HUMAN Thymidylate synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TYMS PE=1 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2 3 0 1 3 Median Median Plateau 6.8 10.4 10.4 111290000 53752000 57539000 22520000 10464000 12056000 31783000 17485000 14298000 56987000 25803000 31185000 434 6225;12563;16109 True;True;False 6284;12672;16247 21080;21081;21082;21083;42769;42770;54840;54841;54842 26839;26840;26841;26842;26843;26844;53605;53606;68854;68855;68856 26839;53606;68855 Q99878;Q96KK5;Q9BTM1;Q16777;Q93077;Q7L7L0;Q6FI13;P20671;P0C0S8;P04908 Q99878;Q96KK5;Q9BTM1;Q16777;Q93077;Q7L7L0;Q6FI13;P20671;P0C0S8;P04908 3;3;3;3;3;3;3;3;3;3 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Histone H2A type 1-J;Histone H2A type 1-H;Histone H2A.J;Histone H2A type 2-C;Histone H2A type 1-C;Histone H2A type 3;Histone H2A type 2-A;Histone H2A type 1-D;Histone H2A type 1;Histone H2A type 1-B/E HIST1H2AJ;HIST1H2AH;H2AFJ;HIST2H2AC;HIST1H2AC;HIST3H2A;HIST2H2AA3;HIST1H2AD;HIST1H2AG;HIST1H2AB sp|Q99878|H2A1J_HUMAN Histone H2A type 1-J OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AJ PE=1 SV=3;sp|Q96KK5|H2A1H_HUMAN Histone H2A type 1-H OS=Homo sapiens OX=9606 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OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1 2 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 112.26 1020 1020;1023 0.0089457 1.7774 By MS/MS By MS/MS 1.1174 1.1732 4.9034 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 1 1 33220000 16520000 16700000 0 0 0 15673000 8261800 7410800 17547000 8258200 9288800 436 306 True 307 1010;1011 1308;1309 1308 P05091 P05091 2 1 1 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial ALDH2 sp|P05091|ALDH2_HUMAN Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH2 PE=1 SV=2 1 2 1 1 1 1 2 0 0 1 0 0 1 4.1 2.5 2.5 56.381 517 517 0.0068426 1.9522 By matching By matching By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 1.5 1.5 4.1 10065000 3980700 6084600 0 0 0 0 0 0 10065000 3980700 6084600 437 24205;27757 True;False 24416;27995 81174;93024;93025;93026 102160;117559;117560;117561;117562;117563 102160;117559 P05114 P05114 2 2 2 Non-histone chromosomal protein HMG-14 HMGN1 sp|P05114|HMGN1_HUMAN Non-histone chromosomal protein HMG-14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGN1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 24 24 24 10.659 100 100 0 9.2896 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7041 0.76524 9.4155 6 0 Leave out requantified 0.7041 0.65582 0.83388 0.75572 0.73021 0.8153 7.645 16.042 13.87 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 24 24 24 400990000 237190000 163800000 144800000 85342000 59463000 112270000 67409000 44864000 143910000 84437000 59474000 438 5422;24141 True;True 5475;24351 18436;18437;18438;80966;80967;80968 23451;23452;23453;23454;101874;101875 23454;101875 P05161 P05161 3 3 3 Ubiquitin-like protein ISG15 ISG15 sp|P05161|ISG15_HUMAN Ubiquitin-like protein ISG15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ISG15 PE=1 SV=5 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 25.5 25.5 25.5 17.887 165 165 0 20.964 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1091 1.1486 0.53178 8 3 Leave out requantified 0.99121 0.94472 1.2938 1.0189 1.0045 1.2438 7.5023 19.487 11.595 3 2 3 2 0 1 Median Median Median 25.5 13.3 25.5 523890000 248750000 275130000 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2;2;2;1;1;1 2;2;2;1;1;1 Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src;Tyrosine-protein kinase Fyn;Tyrosine-protein kinase Yes;Tyrosine-protein kinase Lck;Tyrosine-protein kinase Lyn;Tyrosine-protein kinase HCK SRC;FYN;YES1;LCK;LYN;HCK sp|P12931|SRC_HUMAN Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRC PE=1 SV=3;sp|P06241|FYN_HUMAN Tyrosine-protein kinase Fyn OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYN PE=1 SV=3;sp|P07947|YES_HUMAN Tyrosine-protein kinase Yes OS=Homo sapiens 6 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 3.4 3.4 3.4 59.834 536 536;537;543;509;512;526 0.0010791 3.2416 By MS/MS 1.3368 1.3258 48.693 2 0 Median NaN NaN 1.3368 NaN NaN 1.3258 NaN NaN 48.693 0 0 2 0 0 0 Median Median Median 0 0 3.4 55238000 27135000 28103000 0 0 0 0 0 0 55238000 27135000 28103000 450 10606;15575 True;True 10702;15710 35455;53016 44792;66622 44792;66622 P06454 P06454 3 3 3 Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 PTMA sp|P06454|PTMA_HUMAN Prothymosin alpha OS=Homo 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mitochondrial FH sp|P07954|FUMH_HUMAN Fumarate hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FH PE=1 SV=3 1 14 14 14 12 14 13 12 14 13 12 14 13 50.4 50.4 50.4 54.636 510 510 0 162.19 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98982 1.036 11.069 60 10 Leave out requantified 1.0996 0.91907 1.023 1.1522 1.0277 0.99452 17.171 10.176 11.012 18 22 20 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.8 50.4 44.7 8113700000 4123600000 3990100000 2159700000 1082600000 1077000000 3240300000 1718700000 1521600000 2713700000 1322300000 1391400000 478 8;977;5703;7303;7953;12243;13106;13621;16402;16447;22216;23203;24477;25784 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 8;982;5757;7374;8032;12352;13223;13742;16544;16590;22413;23407;24692;26010 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DNA excision repair protein ERCC-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERCC1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 11.8 11.8 11.8 32.562 297 297 0 7.8956 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98509 1.03 11.347 7 0 Leave out requantified 1.0335 1.1651 0.98509 1.0795 1.2925 0.94133 6.6452 1.3492 16.241 2 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 7.7 7.7 11.8 186780000 93623000 93154000 49765000 27426000 22340000 57230000 26299000 30931000 79782000 39899000 39883000 479 5966;15111;28612 True;True;True 6022;15242;28858 20223;20224;20225;51418;51419;51420;95724 25759;25760;25761;64649;64650;64651;64652;64653;64654;121019 25760;64651;121019 P08133 P08133 5 5 5 Annexin A6 ANXA6 sp|P08133|ANXA6_HUMAN Annexin A6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA6 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 2 4 4 2 4 4 2 4 8.8 8.8 8.8 75.872 673 673 0 8.4486 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90108 0.95422 26.279 8 3 Leave out requantified 0.5201 NaN 0.61685 0.55678 NaN 0.62013 55.869 NaN 89.488 4 1 3 2 0 1 Median Median Median 7.4 2.7 6.4 185150000 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Mu 1 GSTM4;GSTM2;GSTM1 sp|Q03013|GSTM4_HUMAN Glutathione S-transferase Mu 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSTM4 PE=1 SV=3;sp|P28161|GSTM2_HUMAN Glutathione S-transferase Mu 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSTM2 PE=1 SV=2;sp|P09488|GSTM1_HUMAN Glutathione S-transferase Mu 1 OS=Homo sap 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6 6 6 25.561 218 218;218;218 0 3.8822 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1387 1.0783 22.068 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 6 6 6 57154000 33448000 23706000 15963000 9277900 6684800 17313000 9415500 7897200 23879000 14754000 9124400 505 16095 True 16233 54790;54791;54792 68790;68791;68792;68793 68793 P09493 P09493 5 1 1 Tropomyosin alpha-1 chain TPM1 sp|P09493|TPM1_HUMAN Tropomyosin alpha-1 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPM1 PE=1 SV=2 1 5 1 1 5 4 3 1 1 0 1 1 0 17.6 3.9 3.9 32.708 284 284 0.0043204 2.189 By MS/MS By MS/MS By matching 0.42187 0.46188 29.592 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 17.6 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ribonucleoprotein A1-like 2 HNRNPA1;HNRNPA1L2 sp|P09651|ROA1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1 PE=1 SV=5;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L2 PE=2 SV=2 2 10 9 9 10 10 9 9 9 8 9 9 8 31.5 29 29 38.746 372 372;320 0 90.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84884 0.93039 8.6515 47 5 Leave out requantified 0.73554 0.85021 1.073 0.77285 0.95966 1.0386 15.206 10.897 15.509 16 17 14 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.5 31.5 31.2 11141000000 5985400000 5155300000 3943700000 2342700000 1601000000 3909000000 2063100000 1845800000 3288000000 1579600000 1708400000 511 4966;5459;5465;9452;12234;15162;19404;22011;22012;22299 True;True;False;True;True;True;True;True;True;True 5015;5513;5519;9539;12343;15293;19579;22205;22206;22497 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Ubiquitin-like protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBL4A PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 47.1 47.1 47.1 17.776 157 157 0 20.337 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96799 1.0087 16.199 21 11 Leave out requantified 1.301 0.77793 0.99716 1.3523 0.84105 1.002 11.458 16.707 67.745 7 8 6 4 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Median 47.1 47.1 37.6 1058600000 535580000 523060000 322710000 158340000 164380000 444860000 239850000 205010000 291070000 137400000 153670000 544 5342;8351;14325;16514;17053;27016 True;True;True;True;True;True 5395;8430;14452;16657;17197;27247 18168;18169;18170;18171;18172;27956;27957;27958;27959;48897;48898;48899;56117;56118;56119;57788;57789;57790;90589;90590;90591 23102;23103;23104;23105;23106;35331;35332;35333;35334;61420;61421;61422;70484;70485;70486;70487;72620;72621;72622;72623;72624;114393;114394;114395 23103;35331;61420;70485;72622;114395 P11498 P11498 5 5 5 Pyruvate carboxylase, mitochondrial PC sp|P11498|PYC_HUMAN Pyruvate carboxylase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PC PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 5 3 3 5 3 3 5 3 6.3 6.3 6.3 129.63 1178 1178 0 13.288 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84928 0.92309 34.468 10 7 Leave out requantified 0.82895 0.84928 0.97025 0.86151 0.92309 0.93384 12.379 37.473 25.418 2 5 3 2 3 2 Median Median Median 4.2 6.3 4.2 179710000 105860000 73853000 31285000 17633000 13652000 101950000 64770000 37179000 46480000 23458000 23022000 545 341;429;1178;9942;14721 True;True;True;True;True 342;431;1187;10033;14851 1124;1125;1126;1127;1128;1441;1442;1443;3983;33320;50192;50193;50194 1448;1449;1450;1451;1452;1850;1851;1852;5220;42146;63101;63102;63103;63104 1449;1852;5220;42146;63101 P11532 P11532 5 5 5 Dystrophin DMD sp|P11532|DMD_HUMAN Dystrophin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DMD PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 1.7 1.7 1.7 426.74 3685 3685 0 10.972 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98419 0.97314 50.336 10 4 Leave out requantified 0.85257 0.60681 1.2142 0.90311 0.64799 1.1932 72.986 29.714 38.091 4 3 3 2 1 1 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out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.5 55.8 54.1 45180000000 21782000000 23398000000 14726000000 6734200000 7991700000 15636000000 7926900000 7708900000 14818000000 7120700000 7697700000 547 60;194;2622;3382;4800;5990;6098;6173;7106;7348;9061;9167;9228;9251;9413;9443;10899;12283;13403;13512;13626;13858;13939;14247;14408;14684;15339;15792;17480;18007;18074;20227;20843;23556;23900;23901;24092;24101;24459;25105;25451;27033;27906;28222;29016;29172 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 60;195;2646;3413;4847;6047;6155;6231;7175;7419;9145;9251;9313;9336;9500;9530;10998;12392;13522;13632;13747;13982;14063;14372;14535;14814;15471;15928;17627;18163;18233;20411;21028;23761;24106;24107;24302;24311;24672;25323;25673;25674;27264;28146;28465;29268;29424 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NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 7.6 0 7.6 38287000 24019000 14268000 17500000 10746000 6753600 0 0 0 20787000 13273000 7514400 573 6815 True 6883 22980;22981 29211 29211 P14314 P14314 3 3 3 Glucosidase 2 subunit beta PRKCSH sp|P14314|GLU2B_HUMAN Glucosidase 2 subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKCSH PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.3 8.3 8.3 59.425 528 528 0 7.792 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0815 1.1027 21.863 6 2 Leave out requantified 0.96821 1.1324 1.0419 1.0076 1.2114 1.0174 3.5853 18.663 23.164 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 6.2 4.4 6.2 183450000 82029000 101420000 35888000 18988000 16899000 112740000 46511000 66224000 34826000 16530000 18296000 574 7214;7386;15327 True;True;True 7283;7459;15459 24231;24784;24785;24786;52139;52140 30739;31442;31443;31444;31445;65532 30739;31443;65532 P14324 P14324 3 3 3 Farnesyl pyrophosphate synthase FDPS sp|P14324|FPPS_HUMAN Farnesyl pyrophosphate synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FDPS PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 2 3 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enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDE PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.3 2.3 2.3 117.97 1019 1019 0.0014245 3.1188 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0.8 0 1.5 52978000 31496000 21482000 0 0 0 0 0 0 52978000 31496000 21482000 581 4165;18733 True;True 4203;18904 14222;63186 18165;79459 18165;79459 P14854 P14854 3 3 3 Cytochrome c oxidase subunit 6B1 COX6B1 sp|P14854|CX6B1_HUMAN Cytochrome c oxidase subunit 6B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COX6B1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 47.7 47.7 47.7 10.192 86 86 0 6.5328 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92093 0.90465 1.7096 8 3 Leave out requantified 1.0482 0.78885 1.021 1.0775 0.86246 0.95401 9.4464 18.298 14.203 2 3 3 1 1 1 Median Median Median 26.7 47.7 47.7 227280000 112500000 114780000 60822000 26788000 34034000 77551000 40045000 37507000 88902000 45663000 43240000 582 9583;18658;28117 True;True;True 9671;18828;28360 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protein HMG-I/HMG-Y HMGA1 sp|P17096|HMGA1_HUMAN High mobility group protein HMG-I/HMG-Y OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGA1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 28 28 28 11.676 107 107 0 5.4025 By MS/MS By MS/MS 0.91505 1.0205 10.576 3 3 Median NaN 0.91505 NaN NaN 1.0205 NaN NaN 10.576 NaN 0 3 0 0 3 0 Median Median Median 14 28 0 69199000 39700000 29499000 0 0 0 69199000 39700000 29499000 0 0 0 604 5519;20838 True;True 5573;21023 18764;18765;70099;70100 23870;23871;88006;88007 23871;88006 P17252;P05771 P17252 9;3 9;3 9;3 Protein kinase C alpha type PRKCA sp|P17252|KPCA_HUMAN Protein kinase C alpha type OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKCA PE=1 SV=4 2 9 9 9 6 7 7 6 7 7 6 7 7 19.6 19.6 19.6 76.749 672 672;671 0 26.671 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96075 1.0873 17.116 20 6 Leave out requantified 0.99709 1.0624 1.1169 1.0097 1.1671 1.103 18.444 13.651 21.102 6 7 7 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.5 15.9 15.9 892910000 438650000 454270000 279310000 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polymerases I, II, and III subunit RPABC1 POLR2E sp|P19388|RPAB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2E PE=1 SV=4 1 6 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 31.9 31.9 31.9 24.551 210 210 0 73.312 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96102 1.0188 10.085 21 5 Leave out requantified 0.92839 0.94985 1.0816 0.99119 1.0435 1.0563 7.5499 14.256 5.3678 7 8 6 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.9 31.9 23.8 1388800000 695430000 693400000 443840000 228120000 215710000 558960000 279420000 279540000 386040000 187890000 198150000 633 1350;5687;11024;12630;18333;24567 True;True;True;True;True;True 1359;5741;11123;12739;18500;24783 4546;4547;4548;19308;19309;19310;19311;36871;36872;43032;43033;43034;43035;43036;43037;61886;61887;61888;61889;82448;82449;82450 5900;5901;5902;24562;24563;24564;24565;24566;46604;46605;46606;53942;53943;53944;53945;53946;53947;77778;77779;77780;77781;77782;77783;103857 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Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK2 PE=1 SV=2 1 10 10 10 10 9 8 10 9 8 10 9 8 24.5 24.5 24.5 62.094 551 551 0 35.993 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94628 0.96441 41.364 36 3 Leave out requantified 0.94628 0.91024 0.99577 1.0068 1.0142 0.97132 42.235 19.316 49.466 13 12 11 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.5 17.6 16.2 1749500000 893520000 856020000 580670000 287050000 293620000 645730000 341600000 304140000 523130000 264870000 258270000 635 3612;4109;7922;10736;10822;12359;14073;14680;26827;28867 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3649;4147;7999;10833;10919;12468;14198;14810;27057;29116 12203;12204;12205;14008;14009;14010;14011;14012;14013;26568;26569;26570;35882;35883;35884;36160;36161;42075;42076;42077;47978;47979;47980;47981;47982;47983;50070;89946;89947;89948;96554;96555;96556;96557;96558;96559;96560 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NF-kappa-B p50 subunit NFKB1 sp|P19838|NFKB1_HUMAN Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFKB1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 5 5 5 105.35 968 968 0 7.4847 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0111 1.0948 5.0584 8 0 Leave out requantified 0.87833 1.024 1.3887 0.91422 1.1143 1.3488 14.143 2.4951 4.7802 3 2 3 0 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 5 2.6 5 164470000 73791000 90679000 61984000 30650000 31334000 32237000 15062000 17175000 70249000 28078000 42170000 637 11030;20163;29119 True;True;True 11129;20347;29371 36891;36892;67976;67977;67978;97433;97434;97435 46620;85338;85339;123218 46620;85338;123218 P20042 P20042 18 18 18 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 EIF2S2 sp|P20042|IF2B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S2 PE=1 SV=2 1 18 18 18 17 18 17 17 18 17 17 18 17 58.9 58.9 58.9 38.388 333 333 0 296.64 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93963 0.95872 11.681 84 13 Leave out 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3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSTM3 PE=1 SV=3 1 8 8 8 7 7 7 7 7 7 7 7 7 36.9 36.9 36.9 26.559 225 225 0 22.627 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91863 0.89281 17.89 23 9 Leave out requantified 0.93186 0.82196 0.91863 0.94799 0.90154 0.89281 20.105 14.678 20.157 8 7 8 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.8 31.6 33.8 1064600000 533890000 530730000 364150000 193480000 170670000 332930000 157180000 175750000 367550000 183230000 184310000 649 8761;11830;15809;16087;17855;20200;23219;29061 True;True;True;True;True;True;True;True 8842;11938;15945;16225;18005;20384;23423;29313 29319;29320;29321;40275;40276;53823;53824;53825;53826;53827;54765;54766;54767;60348;60349;60350;60351;60352;60353;68094;68095;68096;77923;97245;97246;97247 37027;37028;37029;50417;50418;50419;50420;67601;67602;67603;67604;67605;68762;68763;68764;68765;68766;68767;75863;75864;75865;75866;75867;75868;85477;85478;85479;97927;122971;122972;122973 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By MS/MS 0.94673 0.9589 9.3067 5 1 Leave out requantified NaN NaN 0.97586 NaN NaN 0.98828 NaN NaN 12.496 1 1 3 0 0 1 Median Median Median 2.1 2.1 4.7 76049000 38147000 37902000 17476000 10082000 7394400 17284000 7672100 9611400 41289000 20393000 20896000 667 10705;17988;19424 True;True;True 10802;18144;19599 35763;60787;65532;65533;65534 45210;76434;82293;82294;82295;82296;82297 45210;76434;82297 P22694 P22694 2 1 1 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta PRKACB sp|P22694|KAPCB_HUMAN cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKACB PE=1 SV=2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 7.4 4.8 4.8 40.622 351 351 0 25.376 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1679 1.0989 4.8365 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.8 7.4 7.4 48056000 21557000 26499000 15600000 7665200 7935300 15117000 6278100 8838500 17339000 7613300 9725300 668 10580;19133 True;False 10676;19305 35368;35369;35370;64541;64542 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Eukaryotic translation initiation factor 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4B PE=1 SV=2 1 14 14 14 14 14 13 14 14 13 14 14 13 23.1 23.1 23.1 69.15 611 611 0 76.034 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90751 0.95043 20.356 54 9 Leave out requantified 0.89443 0.88024 0.96012 0.93316 0.96262 0.94872 15.856 24.154 20.483 18 18 18 5 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.1 23.1 23.1 7152000000 3834300000 3317700000 2605300000 1422700000 1182600000 2223600000 1201400000 1022200000 2323200000 1210200000 1112900000 681 211;1998;4566;5501;10111;22407;22587;22588;23059;25904;26147;26148;26149;27234 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 212;2016;4611;5555;10202;22605;22787;22788;23263;26131;26374;26375;26376;27467 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P27361 6;1;1 3;0;0 3;0;0 Mitogen-activated protein kinase 3 MAPK3 sp|P27361|MK03_HUMAN Mitogen-activated protein kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAPK3 PE=1 SV=4 3 6 3 3 6 6 6 3 3 3 3 3 3 20.8 11.1 11.1 43.135 379 379;587;721 0 12.206 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4042 1.4893 25.296 9 5 Leave out requantified 1.5123 1.4412 1.3445 1.5696 1.5877 1.3394 14.945 31.628 8.2346 3 3 3 2 1 2 Median Median Median 20.8 20.8 20.8 452500000 184960000 267540000 149090000 63771000 85323000 147500000 62275000 85224000 155910000 58912000 96994000 717 1209;4925;11842;13335;24153;28650 True;False;True;False;True;False 1218;4973;11950;13454;24363;28897 4072;4073;4074;16794;16795;16796;16797;16798;40308;40309;40310;45388;45389;45390;81004;81005;81006;95860;95861;95862 5319;5320;5321;5322;21323;21324;21325;21326;21327;50454;50455;50456;56982;56983;56984;101926;101927;101928;101929;121195;121196;121197 5320;21325;50456;56983;101926;121196 P27448 P27448 5 2 1 MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 MARK3 sp|P27448|MARK3_HUMAN MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARK3 PE=1 SV=5 1 5 2 1 4 2 5 1 1 2 1 1 1 7.8 2.4 1.1 84.428 753 753 0 3.8581 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.509 1.5435 96.873 4 3 Median NaN NaN 0.59171 NaN NaN 0.58679 NaN NaN 126.42 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 6.5 2.3 7.8 90894000 60337000 30557000 9727200 3468300 6258900 9317400 2972900 6344500 71850000 53896000 17954000 718 552;8445;14776;15137;25148 False;True;False;False;True 554;8524;14906;15268;25367 1833;1834;28290;28291;28292;50353;50354;51492;51493;51494;84314 2348;35720;35721;35722;63304;64740;64741;64742;64743;106250 2348;35720;63304;64743;106250 P27540 P27540 3 3 3 Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ARNT sp|P27540|ARNT_HUMAN Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARNT PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.3 6.3 6.3 86.636 789 789 0 4.7579 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99107 1.002 10.051 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 1.9 2.8 4.4 31281000 15700000 15581000 0 0 0 15368000 8398300 6970000 15913000 7301700 8611400 719 3117;7059;10717 True;True;True 3144;7128;10814 10504;23720;35802;35803 13620;30127;45257;45258 13620;30127;45257 P27635;Q96L21 P27635 10;4 10;4 10;4 60S ribosomal protein L10 RPL10 sp|P27635|RL10_HUMAN 60S ribosomal protein L10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL10 PE=1 SV=4 2 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 46.7 46.7 46.7 24.604 214 214;214 0 79.429 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0275 1.0727 9.0485 55 5 Leave out requantified 0.99693 1.0085 1.0685 1.0467 1.0927 1.0683 10.535 8.4915 13.808 18 19 18 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.7 46.7 46.7 27149000000 12865000000 14284000000 9410300000 4340900000 5069400000 8626900000 4300900000 4325900000 9111900000 4222900000 4889000000 720 1134;6025;8493;8494;9031;15501;15659;18228;26045;26580 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1143;6082;8572;8573;8574;9115;15636;15794;18392;18393;26272;26807 3847;3848;3849;20427;20428;20429;28462;28463;28464;28465;28466;28467;28468;28469;28470;28471;28472;28473;28474;28475;28476;28477;30215;30216;30217;30218;30219;30220;52745;52746;52747;52748;52749;52750;53290;53291;53292;53293;53294;53295;61547;61548;61549;61550;61551;61552;87271;87272;87273;87274;87275;87276;89111;89112;89113;89114;89115;89116 5036;5037;5038;5039;5040;26015;26016;26017;26018;35941;35942;35943;35944;35945;35946;35947;35948;35949;35950;35951;35952;35953;35954;35955;35956;35957;35958;35959;35960;35961;38172;38173;38174;38175;38176;38177;38178;38179;38180;38181;38182;38183;66284;66285;66286;66287;66288;66289;66290;66291;66292;66969;66970;66971;66972;66973;66974;66975;66976;77337;77338;77339;77340;77341;77342;77343;77344;77345;77346;77347;77348;110088;110089;110090;110091;110092;112480;112481;112482;112483;112484;112485;112486;112487;112488;112489 5036;26017;35952;35960;38179;66292;66970;77345;110091;112486 128;129 102;184 P27694 P27694 23 23 23 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed RPA1 sp|P27694|RFA1_HUMAN Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPA1 PE=1 SV=2 1 23 23 23 19 19 22 19 19 22 19 19 22 40.6 40.6 40.6 68.137 616 616 0 227.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0348 1.1033 21.077 59 7 Leave out requantified 1.0842 0.92177 1.0825 1.123 1.0189 1.0617 23.039 15.461 20.235 21 19 19 5 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.4 34.6 38 5448700000 2637700000 2811000000 2028300000 946220000 1082100000 1731700000 905400000 826330000 1688700000 786040000 902610000 721 99;2178;2298;2709;3941;4631;6824;6825;8056;8279;10961;13793;15218;20855;22198;22490;22806;26526;26636;26809;27976;28008;28009 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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kinase DCK sp|P27707|DCK_HUMAN Deoxycytidine kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCK PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 15 15 15 30.518 260 260 0 7.4996 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85099 0.89188 24.5 8 2 Leave out requantified 0.70454 0.85099 0.79326 0.74955 0.91635 0.75001 18.799 20.672 47.9 3 2 3 1 0 1 Median Median Median 15 9.2 15 162060000 89179000 72878000 62272000 33648000 28624000 41480000 24025000 17455000 58306000 31507000 26798000 723 13282;20487;21758 True;True;True 13399;20671;21948 45188;45189;45190;69002;69003;73090;73091;73092 56743;56744;56745;86623;86624;91722;91723 56744;86624;91722 P27708 P27708 52 52 49 CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase CAD sp|P27708|PYR1_HUMAN CAD protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAD PE=1 SV=3 1 52 52 49 42 42 45 42 42 45 39 39 42 30.8 30.8 29.8 242.98 2225 2225 0 227.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98316 1.0211 12.674 140 48 Leave out requantified 1.005 0.932 0.97405 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Proteasome subunit beta type-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMB6 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.8 8.8 8.8 25.357 239 239 0 3.9571 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.31779 0.34377 52.825 6 3 Median 0.26752 0.38397 0.41333 0.28272 0.41639 0.40582 56.501 55.958 75.855 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 8.8 8.8 8.8 186210000 127830000 58385000 63604000 47060000 16545000 57347000 38198000 19149000 65261000 42569000 22692000 730 14279;21228 True;True 14406;21414 48728;48729;48730;71284;71285;71286 61213;61214;61215;89512;89513;89514 61214;89513 P28074 P28074 3 3 3 Proteasome subunit beta type-5 PSMB5 sp|P28074|PSB5_HUMAN Proteasome subunit beta type-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMB5 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 14.8 14.8 14.8 28.48 263 263 0 6.1188 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0011 1.0438 19.672 7 0 Leave out requantified 0.79659 0.90844 1.0011 0.82575 0.97997 1.0131 33.137 17.675 19.749 2 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 10.3 10.3 14.8 180150000 90116000 90035000 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P28482 12 12 9 Mitogen-activated protein kinase 1 MAPK1 sp|P28482|MK01_HUMAN Mitogen-activated protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAPK1 PE=1 SV=3 1 12 12 9 12 11 9 12 11 9 9 8 6 42.2 42.2 31.9 41.389 360 360 0 49.483 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0973 1.158 19.354 46 19 Leave out requantified 1.0524 1.093 1.2736 1.129 1.219 1.2628 18.094 19.73 21.383 18 14 14 8 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.2 35.6 29.7 1876100000 937300000 938800000 697060000 367870000 329200000 584840000 292640000 292210000 594200000 276800000 317400000 735 1208;4113;4925;6495;7927;10510;11170;13335;19766;25799;28650;29086 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1217;4151;4973;6557;8004;10606;11271;13454;19946;26025;28897;29338 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MS/MS By MS/MS 1.0376 1.0615 51.11 5 3 Median 1.4532 0.99914 NaN 1.5501 1.0759 NaN 53.543 75.579 NaN 2 2 1 1 2 0 Median Median Median 4.2 3.3 3.2 79578000 33112000 46466000 26516000 9454800 17062000 28855000 13553000 15302000 24206000 10104000 14102000 737 1191;3403;6691;10574;13048;25477 True;True;True;True;True;True 1200;3434;6754;10670;13165;25700 4022;11511;11512;11513;22597;35351;44439;85369;85370;85371;85372 5264;14923;14924;14925;28746;44672;55776;107574;107575;107576;107577;107578;107579 5264;14924;28746;44672;55776;107575 P28799 P28799 4 4 4 Granulins;Acrogranin;Paragranulin;Granulin-1;Granulin-2;Granulin-3;Granulin-4;Granulin-5;Granulin-6;Granulin-7 GRN sp|P28799|GRN_HUMAN Progranulin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GRN PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 3 1 2 3 1 2 3 13.3 13.3 13.3 63.544 593 593 0 5.4535 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82251 0.85511 13.714 4 0 Leave out requantified NaN 0.77624 NaN NaN 0.85511 NaN NaN 13.714 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 2.4 5.1 10.6 68582000 32837000 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P30046;A6NHG4 P30046;A6NHG4 2;1 2;1 2;1 D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein DDT;DDTL sp|P30046|DOPD_HUMAN D-dopachrome decarboxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDT PE=1 SV=3;sp|A6NHG4|DDTL_HUMAN D-dopachrome decarboxylase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDTL PE=2 SV=1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 19.5 19.5 19.5 12.712 118 118;134 0 7.4125 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81936 0.86706 17.385 9 3 Leave out requantified 0.65465 0.96096 1.1424 0.69509 1.0567 1.162 17.434 3.5139 24.64 3 3 3 0 2 1 Median Median Median 19.5 19.5 19.5 325770000 162310000 163460000 113280000 54948000 58329000 102900000 54832000 48071000 109590000 52525000 57060000 753 8055;22316 True;True 8134;22514 27006;27007;27008;74884;74885;74886;74887;74888;74889 34215;34216;94015;94016;94017;94018;94019;94020 34216;94018 P30048 P30048 4 4 4 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial PRDX3 sp|P30048|PRDX3_HUMAN Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX3 PE=1 SV=3 1 4 4 4 0 4 2 0 4 2 0 4 2 23 23 23 27.692 256 256 0 6.3515 By MS/MS By MS/MS 0.95032 1.032 75.931 5 2 Leave out requantified NaN 0.95032 1.3061 NaN 1.032 1.2961 NaN 75.931 118.6 0 3 2 0 0 2 Median Leave out requantified Median 0 23 16 131930000 71820000 60110000 0 0 0 87132000 53283000 33849000 44798000 18537000 26261000 754 706;10682;11454;23606 True;True;True;True 708;10779;11558;23811 2311;2312;35675;35676;38719;79164 2960;2961;45088;45089;48621;99526 2960;45089;48621;99526 P30049 P30049 1 1 1 ATP synthase subunit delta, mitochondrial ATP5D sp|P30049|ATPD_HUMAN ATP synthase subunit delta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1D PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.3 8.3 8.3 17.49 168 168 0.0027807 2.7554 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86016 0.87835 21.257 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 8.3 8.3 8.3 65703000 34184000 31519000 31154000 17739000 13415000 0 0 0 34549000 16445000 18104000 755 1842 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13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513;13514;13515;13516;13517;26408;26409;26410;26411;26412;26413;26414;26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;28646;28647;28648;49111;49112;49113;49114;49115;49116;49117;49118;49119;49120;49121;49555;49556;52983;52984;52985;52986;84290;84291;84292;84293;84294;84295;84296;84297 13515;26421;28647;49113;49556;52985;84292 P30084 P30084 5 5 5 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial ECHS1 sp|P30084|ECHM_HUMAN Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECHS1 PE=1 SV=4 1 5 5 5 3 2 4 3 2 4 3 2 4 27.6 27.6 27.6 31.387 290 290 0 21.13 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89973 0.97338 48.94 9 6 Median 1.1732 0.85106 1.2172 1.2356 0.93987 1.1897 31.875 76.159 21.395 3 3 3 1 2 3 Median Median Plateau 15.5 9.3 21.4 396060000 228070000 167990000 100490000 56190000 44296000 124270000 79115000 45151000 171310000 92768000 78542000 757 620;1430;1882;6796;24262 True;True;True;True;True 622;1439;1899;6863;24473 2046;2047;2048;4797;4798;4799;4800;6328;22918;81340 2621;2622;2623;2624;6230;6231;6232;6233;6234;8283;29131;102368 2624;6230;8283;29131;102368 P30085 P30085 3 3 3 UMP-CMP kinase CMPK1 sp|P30085|KCY_HUMAN UMP-CMP kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMPK1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 17.3 17.3 17.3 22.222 196 196 0 6.3184 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80374 0.88909 38.936 7 2 Leave out requantified 0.9696 0.58375 0.80855 1.0296 0.86477 0.80653 40.311 35.52 17.31 2 3 2 1 1 0 Median Plateau Median 11.2 17.3 11.2 128960000 72143000 56815000 37196000 18833000 18363000 47363000 28445000 18918000 44399000 24865000 19534000 758 6744;13548;19391 True;True;True 6807;13669;19566 22750;22751;22752;46116;65434;65435;65436 28930;28931;28932;28933;57941;82170;82171 28930;57941;82170 P30086 P30086 6 6 6 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide PEBP1 sp|P30086|PEBP1_HUMAN Phosphatidylethanolamine-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEBP1 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Hippocalcin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPCAL1 PE=1 SV=3 2 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 6.7 6.7 6.7 22.427 193 193;193 0.0030623 2.5087 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 6.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 832 13608 True 13729 46314 58216 58216 P37802 P37802 7 7 7 Transgelin-2 TAGLN2 sp|P37802|TAGL2_HUMAN Transgelin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAGLN2 PE=1 SV=3 1 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 43.2 43.2 43.2 22.391 199 199 0 106.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92571 0.94695 11.511 32 8 Leave out requantified 0.71421 0.92559 1.0725 0.75338 0.99291 1.0601 10.51 13.287 6.3278 11 10 11 2 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.2 43.2 43.2 4026600000 2112100000 1914500000 1455600000 825510000 630050000 1267100000 669350000 597730000 1304000000 617240000 686750000 833 3355;6843;13121;18834;20740;24807;28560 True;True;True;True;True;True;True 3385;6912;13238;19006;20924;25024;28806 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transfer flavoprotein subunit beta ETFB sp|P38117|ETFB_HUMAN Electron transfer flavoprotein subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ETFB PE=1 SV=3 1 12 12 12 11 11 10 11 11 10 11 11 10 47.1 47.1 47.1 27.843 255 255 0 47.011 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89781 0.94842 10.871 39 16 Leave out requantified 1.0678 0.88802 0.94433 1.1035 0.96082 0.91543 12.417 9.7312 16.114 13 14 12 7 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 43.5 43.5 42.4 3707500000 1891500000 1816000000 1199900000 583020000 616850000 1345200000 722220000 623020000 1162400000 586270000 576100000 836 6054;6290;7533;11649;12235;15788;16580;17212;23912;24434;26112;28364 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6111;6351;7607;11755;12344;15924;16723;17356;24118;24646;26339;28609 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Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein EIF2S3;EIF2S3L sp|P41091|IF2G_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3 PE=1 SV=3;sp|Q2VIR3|IF2GL_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3B PE=2 SV=2 2 23 23 23 22 20 22 22 20 22 22 20 22 54.4 54.4 54.4 51.109 472 472;472 0 220.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91452 0.97661 15.422 105 11 Leave out requantified 0.93616 0.9292 0.97086 0.98669 1.0158 0.96359 12.326 16.801 16.84 36 34 35 4 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.4 51.1 52.5 35673000000 18031000000 17642000000 12334000000 6307100000 6027000000 12058000000 6070300000 5987600000 11281000000 5653600000 5627200000 863 787;1072;3560;9698;10923;11326;12070;13537;13558;14637;15438;15615;16358;17341;18772;19926;20013;21428;21741;22069;22070;26524;28887 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requantified 12.6 14.6 16.2 513670000 265850000 247820000 150960000 80608000 70349000 178070000 94875000 83193000 184640000 90363000 94281000 942 3977;12665;15645;16459;17557;24509 True;True;True;True;True;True 4015;12775;15780;16602;17704;24725 13548;13549;13550;43159;43160;53245;53246;53247;53248;55949;55950;59417;59418;59419;82254;82255;82256 17385;17386;17387;17388;54124;66916;66917;66918;66919;70264;70265;70266;74700;103587;103588;103589;103590 17385;54124;66917;70265;74700;103589 P48739 P48739 5 5 5 Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform PITPNB sp|P48739|PIPNB_HUMAN Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PITPNB PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 3 4 3 3 4 3 3 4 21.8 21.8 21.8 31.54 271 271 0 12.927 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1031 1.1934 17.233 7 2 Leave out requantified 1.2135 0.79877 1.4977 1.2524 0.87596 1.4723 2.4452 31.54 1.678 2 3 2 0 1 1 Median Median Median 13.7 12.5 17.3 248710000 109430000 139280000 69629000 30307000 39321000 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True 4157 14050;14051;14052;14053;14054;14055 17948;17949;17950;17951;17952;17953 17949 P49005 P49005 13 13 13 DNA polymerase delta subunit 2 POLD2 sp|P49005|DPOD2_HUMAN DNA polymerase delta subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLD2 PE=1 SV=1 1 13 13 13 11 10 11 11 10 11 11 10 11 42.6 42.6 42.6 51.289 469 469 0 50.355 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.02 1.064 19.403 34 6 Leave out requantified 0.8477 1.0643 1.197 0.8967 1.1867 1.1714 19.808 18.941 19.436 11 10 13 2 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.7 33 33.9 2143100000 1020200000 1122900000 647290000 325960000 321330000 783360000 367080000 416280000 712480000 327210000 385270000 945 1660;1959;7613;8347;8442;10334;11338;14567;17615;21308;24088;25111;28649 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1673;1977;7687;8426;8521;10428;11441;14696;17764;21495;24298;25329;28896 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93;94 136;137 137 P49207 P49207 4 4 4 60S ribosomal protein L34 RPL34 sp|P49207|RL34_HUMAN 60S ribosomal protein L34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL34 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 28.2 28.2 28.2 13.293 117 117 0 10.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80812 0.86481 11.855 12 1 Leave out requantified 0.80897 0.78054 0.89806 0.85297 0.87311 0.87639 8.6875 24.105 9.9732 3 4 5 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 28.2 28.2 5465600000 2920500000 2545100000 1507500000 836170000 671360000 1924100000 1037700000 886360000 2034000000 1046600000 987390000 947 682;2609;13577;17225 True;True;True;True 684;2632;13698;17369 2249;2250;2251;8732;8733;8734;46211;46212;46213;46214;58317;58318 2876;2877;2878;2879;2880;11400;11401;11402;11403;11404;11405;58085;58086;58087;58088;58089;58090;73312;73313;73314 2879;11405;58086;73314 P49321 P49321 4 4 4 Nuclear autoantigenic sperm protein NASP sp|P49321|NASP_HUMAN Nuclear autoantigenic sperm protein OS=Homo sapiens 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OX=9606 GN=FASN PE=1 SV=3 1 94 94 94 89 91 90 89 91 90 89 91 90 51.7 51.7 51.7 273.42 2511 2511 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0186 1.0854 13.561 434 79 Leave out requantified 0.97781 0.96743 1.1917 1.0169 1.0682 1.1622 27.278 14.863 15.069 148 144 142 30 25 24 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 47.6 49.7 49.3 91556000000 44700000000 46856000000 27787000000 14158000000 13629000000 32141000000 16220000000 15921000000 31627000000 14322000000 17305000000 949 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Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH7A1 PE=1 SV=5 1 23 23 23 19 23 20 19 23 20 19 23 20 49.5 49.5 49.5 58.486 539 539 0 166.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0121 1.1105 16.048 81 20 Leave out requantified 0.97625 1.0005 1.24 1.0521 1.0876 1.2324 16.279 18.512 19.064 27 26 28 7 4 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.6 49.5 44.2 5805000000 2759600000 3045500000 1701700000 856810000 844920000 2097500000 1043900000 1053600000 2005800000 858830000 1146900000 953 4183;5627;5867;8290;9101;9434;10544;13204;13578;15165;16610;18103;18728;19918;19919;19945;19946;20253;21204;23455;26516;26890;27307 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4222;5681;5922;8369;9185;9521;10640;13321;13699;15296;16753;18263;18899;20099;20100;20126;20127;20437;21390;23660;26743;27120;27544 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Serine--tRNA ligase, cytoplasmic SARS sp|P49591|SYSC_HUMAN Serine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SARS PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 12.3 12.3 12.3 58.777 514 514 0 16.329 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85922 0.91378 13.954 12 1 Leave out requantified 0.84459 0.85922 1.0775 0.88792 0.91378 1.0546 6.3918 16.139 9.6107 4 4 4 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.5 12.3 9.5 511710000 267510000 244200000 169470000 98006000 71462000 177410000 94839000 82568000 164840000 74667000 90169000 959 6713;8284;14701;26870;28767 True;True;True;True;True 6776;8363;14831;27100;29014 22656;22657;22658;27745;27746;27747;50137;90099;90100;90101;96247;96248;96249 28815;28816;28817;28818;28819;28820;35085;35086;35087;63039;113737;113738;113739;113740;113741;113742;121648;121649;121650 28816;35087;63039;113739;121648 P49642 P49642 11 11 11 DNA primase small subunit PRIM1 sp|P49642|PRI1_HUMAN DNA primase small subunit OS=Homo sapiens OX=9606 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requantified 22.2 28.7 20.7 929060000 433870000 495190000 300120000 138680000 161440000 346340000 160690000 185660000 282600000 134510000 148090000 1032 284;5110;8664;9150;10691;13037;17871;21278 True;True;True;True;True;True;True;True 285;5159;8745;9234;10788;13154;18023;21465 942;943;17400;17401;17402;29014;30614;30615;35713;35714;35715;44396;44397;44398;60410;60411;60412;60413;71435;71436;71437 1229;1230;22111;22112;22113;36654;38696;38697;45132;55717;55718;55719;55720;75959;75960;75961;75962;75963;89718;89719 1230;22112;36654;38697;45132;55720;75959;89718 P52565 P52565 3 3 3 Rho GDP-dissociation inhibitor 1 ARHGDIA sp|P52565|GDIR1_HUMAN Rho GDP-dissociation inhibitor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGDIA PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 15.7 15.7 15.7 23.207 204 204 0 18.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81106 0.89388 2.7712 12 1 Leave out requantified 0.64784 0.8434 0.98576 0.68485 0.94805 0.98541 11.354 4.6756 21.004 4 4 4 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified 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exchange factor VAV2 VAV2 sp|P52735|VAV2_HUMAN Guanine nucleotide exchange factor VAV2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAV2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3.2 3.2 3.2 101.29 878 878 0 5.6459 By MS/MS By matching By matching 1.2633 1.2074 6.7593 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.2 2.2 2.2 79607000 37468000 42138000 26832000 14224000 12608000 24518000 10976000 13542000 28257000 12269000 15988000 1039 6111;9863 True;True 6169;9953 20715;33020;33021;33022 26358;41766;41767 26358;41766 P52789;Q2TB90;P52790 P52789 13;1;1 13;1;1 10;0;0 Hexokinase-2 HK2 sp|P52789|HXK2_HUMAN Hexokinase-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HK2 PE=1 SV=2 3 13 13 10 8 10 5 8 10 5 6 8 4 18.3 18.3 15.5 102.38 917 917;917;923 0 35.679 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93379 0.92798 41.271 22 12 Leave out requantified 0.93379 0.82134 1.1082 0.9681 0.91023 1.0993 26.52 56.067 11.73 8 9 5 4 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.9 13.2 6.9 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RNA-specific adenosine deaminase ADAR sp|P55265|DSRAD_HUMAN Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAR PE=1 SV=4 1 22 22 22 18 17 16 18 17 16 18 17 16 22.6 22.6 22.6 136.06 1226 1226 0 187.74 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9317 0.96903 19.335 59 21 Leave out requantified 0.88126 0.9407 1.0688 0.92578 1.0694 1.0367 19.942 25.353 16.937 22 19 18 8 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.8 16.6 16 3156200000 1615600000 1540600000 1100800000 564700000 536090000 1045800000 543730000 502040000 1009700000 507160000 502500000 1088 2763;3643;4298;4602;8459;8650;9427;11544;11808;12710;17442;18040;18928;20731;22301;23092;23720;23880;24830;25621;26994;28799 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2788;3680;4340;4647;8538;8731;9514;11648;11916;12820;17589;18197;19100;20915;22499;23296;23925;24086;25048;25845;27225;29047 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RNA processing protein 1 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 4 5 3 4 5 3 4 5 18.4 18.4 18.4 52.839 461 461 0 9.5275 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8435 0.86825 35.877 10 5 Leave out requantified 0.56188 0.68345 0.72565 0.59093 0.74554 0.73401 19.575 51.378 41.547 2 4 4 1 2 2 Median Median Median 7.6 9.5 16.3 385620000 256610000 129010000 93585000 65498000 28087000 148180000 96776000 51405000 143850000 94332000 49518000 1096 92;558;4633;18483;21953;26444 True;True;True;True;True;True 92;560;4678;18653;22145;26671 306;307;308;1852;15777;62386;62387;73759;73760;88645;88646;88647 408;409;410;2377;20118;78433;78434;92579;92580;92581;111879;111880;111881 408;2377;20118;78433;92580;111880 P56192 P56192 24 24 24 Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic MARS sp|P56192|SYMC_HUMAN Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARS PE=1 SV=2 1 24 24 24 20 17 24 20 17 24 20 17 24 34.9 34.9 34.9 101.11 900 900 0 156.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92758 0.97333 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MS/MS 1.1006 1.1768 4.1479 8 2 Leave out requantified 0.96019 0.98704 1.2552 0.98622 1.0765 1.1979 12.839 8.4488 0.29509 4 2 2 2 0 0 Median Median Median 15.8 10.1 10.1 324110000 154490000 169610000 152000000 70333000 81664000 86035000 42433000 43602000 86077000 41728000 44349000 1157 981;6580 True;True 986;6642 3277;3278;3279;3280;3281;3282;3283;22269 4238;4239;4240;4241;4242;4243;4244;4245;4246;28326 4239;28326 P61978 P61978 22 22 22 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K HNRNPK sp|P61978|HNRPK_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPK PE=1 SV=1 1 22 22 22 21 22 22 21 22 22 21 22 22 57.5 57.5 57.5 50.976 463 463 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0581 1.1268 10.105 108 17 Leave out requantified 0.95112 1.014 1.2531 0.99779 1.1289 1.2334 12.711 12.454 14.864 36 34 38 7 4 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 53.8 57.5 57.5 66450000000 31955000000 34495000000 20991000000 10802000000 10189000000 22187000000 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MRPS11 sp|P82912|RT11_HUMAN 28S ribosomal protein S11, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS11 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.2 23.2 23.2 20.616 194 194 0 13.818 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78149 0.81278 29.934 6 1 Leave out requantified 0.85489 0.63226 0.81004 0.88483 0.67916 0.75517 17.923 28.557 52.14 2 2 2 0 0 1 Median Median Median 23.2 23.2 23.2 116270000 61452000 54818000 36820000 18560000 18260000 37201000 21172000 16029000 42249000 21719000 20530000 1264 2061;10712 True;True 2079;10809 6918;6919;6920;35783;35784;35785 9059;9060;9061;45231;45232;45233 9060;45233 P82914 P82914 2 2 2 28S ribosomal protein S15, mitochondrial MRPS15 sp|P82914|RT15_HUMAN 28S ribosomal protein S15, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS15 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 6.2 6.2 6.2 29.842 257 257 0.005923 2.0451 By MS/MS 2.3325 2.4461 102.55 2 1 Median 2.3325 NaN NaN 2.4461 NaN NaN 102.55 NaN NaN 2 0 0 1 0 0 Median Median Median 6.2 0 0 633030000 336900000 296120000 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neutral amino acids transporter small subunit 1 SLC7A5 sp|Q01650|LAT1_HUMAN Large neutral amino acids transporter small subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A5 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.5 7.5 7.5 55.01 507 507 0 9.4569 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1054 1.0898 27.732 6 2 Leave out requantified 1.1697 0.98502 1.1054 1.2262 1.078 1.0898 44.632 17.752 27.732 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 7.5 7.5 7.5 153090000 74923000 78168000 39490000 19935000 19555000 55035000 27309000 27726000 58566000 27679000 30888000 1301 21603;22189 True;True 21793;22386 72581;72582;72583;74494;74495;74496 91124;91125;91126;93513 91124;93513 Q01658 Q01658 2 2 2 Protein Dr1 DR1 sp|Q01658|NC2B_HUMAN Protein Dr1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DR1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 11.9 11.9 11.9 19.443 176 176 0 6.6848 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91702 0.9807 32.459 4 4 Median NaN 0.66141 NaN NaN 0.73844 NaN NaN 40.455 NaN 1 2 1 1 2 1 Median Median Median 7.4 11.9 7.4 216240000 111970000 104270000 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protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSBP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 21.6 21.6 21.6 17.259 148 148 0 19.763 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8889 0.9317 11.202 10 7 Median 0.8334 0.89245 0.95893 0.8664 0.98823 0.89479 9.2795 11.715 1.4016 3 4 3 2 3 2 Median Median Plateau 16.2 21.6 16.2 245910000 113470000 132440000 72141000 37344000 34797000 99300000 43836000 55464000 74465000 32290000 42175000 1334 4785;13358;22170 True;True;True 4831;13477;22367 16299;45471;45472;45473;74429;74430;74431;74432;74433;74434 20755;57089;57090;57091;57092;57093;93437;93438;93439;93440;93441;93442 20755;57093;93441 Q04917 Q04917 8 5 5 14-3-3 protein eta YWHAH sp|Q04917|1433F_HUMAN 14-3-3 protein eta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAH PE=1 SV=4 1 8 5 5 8 7 6 5 4 4 5 4 4 37.4 27.6 27.6 28.218 246 246 0 67.354 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89268 0.95685 25.51 18 10 Leave out requantified 0.76164 1.0292 1.0722 0.81307 1.1364 1.0571 26.926 28.842 39.907 6 6 6 3 3 4 Leave out requantified Median 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 8.6 8.6 8.6 167410000 95548000 71861000 53306000 32178000 21128000 56792000 30223000 26569000 57311000 33147000 24164000 1336 11670 True 11776 39653;39654;39655 49729;49730;49731 49729 Q05048 Q05048 6 6 6 Cleavage stimulation factor subunit 1 CSTF1 sp|Q05048|CSTF1_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 5 6 5 5 6 5 5 6 23.4 23.4 23.4 48.357 431 431 0 23.826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87633 0.90024 21.599 19 6 Leave out requantified 0.89799 1.1752 1.1234 0.95415 1.2595 1.0885 24.4 21.137 26.184 7 5 7 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.2 17.4 23.4 586010000 330460000 255550000 212310000 128500000 83805000 136290000 77606000 58680000 237420000 124360000 113060000 1337 896;2856;19135;22454;24916;28669 True;True;True;True;True;True 900;2881;19307;22653;25134;28916 2990;2991;9570;9571;9572;64545;64546;64547;75367;75368;75369;83589;83590;83591;83592;83593;95913;95914;95915 3865;3866;12505;12506;12507;12508;12509;12510;12511;81073;81074;81075;94641;94642;94643;94644;105336;105337;105338;105339;105340;105341;105342;121259;121260;121261;121262 3866;12508;81073;94641;105340;121261 Q05193 Q05193 21 14 11 Dynamin-1 DNM1 sp|Q05193|DYN1_HUMAN Dynamin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNM1 PE=1 SV=2 1 21 14 11 14 17 15 8 11 9 7 9 7 32.1 24.7 21.1 97.407 864 864 0 45.832 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0774 1.0896 39.302 30 10 Leave out requantified 1.2948 0.98055 1.1524 1.3458 1.0646 1.1257 46.259 15.137 51.746 9 12 9 3 5 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.3 26 22.6 1633500000 544380000 1089100000 333860000 123490000 210370000 744370000 244940000 499430000 555230000 175960000 379270000 1338 4720;6823;8049;8560;9872;10324;10966;11015;11317;12178;14711;14958;18831;19225;21520;23420;24383;24539;24566;27060;27427 True;True;True;False;False;True;True;False;True;True;False;True;True;True;True;False;True;False;False;True;True 4766;6892;8128;8640;9963;10418;11065;11114;11419;12287;14841;15089;19003;19399;21710;23625;24595;24755;24782;27292;27664 16074;23016;26981;26982;26983;28684;28685;28686;33063;33064;33065;33066;34537;34538;36666;36667;36668;36845;36846;36847;38089;41479;41480;41481;41482;50163;50164;50165;50938;63483;64850;64851;64852;64853;72307;78580;78581;78582;81735;81736;81737;81738;82355;82356;82357;82447;90717;90718;90719;91962;91963;91964 20464;29258;34187;34188;34189;34190;34191;34192;36234;36235;36236;36237;36238;36239;41816;41817;41818;41819;41820;43648;43649;46346;46570;46571;46572;46573;46574;46575;47963;51967;51968;51969;51970;51971;63072;63073;63074;63075;63076;63077;64040;79826;81434;81435;81436;81437;90797;98773;98774;98775;102824;102825;102826;102827;102828;102829;103735;103736;103856;114542;114543;114544;114545;116174;116175;116176;116177 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requantified 0.80637 0.67893 1.2588 0.88108 0.71831 1.236 53.83 42.861 15.746 3 5 4 1 4 1 Median Median Leave out requantified 9.1 9.1 6.7 466610000 297660000 168950000 137410000 98198000 39207000 171060000 111790000 59274000 158140000 87672000 70467000 1340 1936;2840;5395;16150;19121;19685;24775 True;True;True;True;True;True;True 1953;2865;5448;16289;19293;19864;24992 6517;6518;9506;9507;18343;18344;18345;54966;64500;64501;66393;83114;83115;83116 8519;8520;12411;12412;23327;23328;23329;23330;23331;23332;69038;81026;81027;83362;104702 8519;12411;23327;69038;81026;83362;104702 Q05519 Q05519 9 9 9 Serine/arginine-rich splicing factor 11 SRSF11 sp|Q05519|SRS11_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF11 PE=1 SV=1 1 9 9 9 9 6 8 9 6 8 9 6 8 24.2 24.2 24.2 53.542 484 484 0 32.397 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81635 0.85013 17.2 30 2 Leave out requantified 0.79319 0.80067 1.0727 0.8146 0.87112 1.0318 21.678 18.572 14.355 10 9 11 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.2 16.7 21.1 3259800000 1722100000 1537700000 1171300000 644290000 527010000 979910000 529390000 450510000 1108500000 548410000 560130000 1341 1349;4953;5257;6063;8165;15202;16425;16479;24717 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1358;5002;5309;6120;8244;15333;16567;16622;24934 4540;4541;4542;4543;4544;4545;16877;16878;17921;20546;20547;20548;27363;27364;27365;27366;27367;27368;51704;51705;51706;51707;55835;55836;56013;56014;56015;56016;56017;56018;82921;82922;82923 5892;5893;5894;5895;5896;5897;5898;5899;21417;21418;22797;26149;26150;26151;26152;26153;34660;34661;34662;34663;34664;34665;65007;65008;65009;65010;65011;65012;65013;70129;70130;70350;70351;70352;70353;70354;70355;70356;70357;70358;104472;104473;104474;104475;104476;104477 5899;21417;22797;26151;34663;65008;70130;70354;104473 Q05639 Q05639 20 4 4 Elongation factor 1-alpha 2 EEF1A2 sp|Q05639|EF1A2_HUMAN Elongation factor 1-alpha 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A2 PE=1 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MS/MS By MS/MS 1.1372 1.116 12.33 7 4 Median 1.0419 NaN 1.2319 1.0947 NaN 1.2118 12.429 NaN 10.289 2 1 4 1 1 2 Median Median Median 7 5.5 11.6 276350000 135290000 141060000 85228000 42904000 42324000 43693000 24106000 19586000 147430000 68277000 79153000 1344 14135;15970;20286;27018 True;True;True;True 14260;16108;20470;27249 48210;48211;48212;54342;54343;68347;68348;90598;90599 60574;60575;60576;68250;68251;85792;85793;114406;114407 60575;68251;85792;114407 Q05D32 Q05D32 4 4 4 CTD small phosphatase-like protein 2 CTDSPL2 sp|Q05D32|CTSL2_HUMAN CTD small phosphatase-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTDSPL2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 10.3 10.3 10.3 52.998 466 466 0 19.528 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81452 0.89351 48.318 13 10 Median 0.84329 0.81452 0.97707 0.89535 0.89351 0.95462 44.76 56.887 54.333 4 5 4 3 4 3 Median Median Median 7.7 10.3 10.3 341600000 182810000 158800000 115040000 64292000 50743000 129580000 66494000 63089000 96986000 52022000 44963000 1345 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Q07812 5 5 5 Apoptosis regulator BAX BAX sp|Q07812|BAX_HUMAN Apoptosis regulator BAX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAX PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 35.9 35.9 35.9 21.184 192 192 0 22.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98994 1.0549 11.285 14 4 Leave out requantified 1.0724 0.91285 1.1177 1.0953 0.98701 1.0862 1.4381 10.967 11.626 4 6 4 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.5 35.9 35.9 1001500000 421000000 580470000 251490000 98117000 153380000 446810000 196600000 250210000 303170000 126280000 176890000 1361 9620;12356;18041;18082;24342 True;True;True;True;True 9708;12465;18198;18241;24554 32156;32157;32158;42059;42060;42061;60972;60973;60974;60975;61109;61110;61111;81606;81607;81608 40691;40692;40693;40694;40695;40696;52694;52695;52696;76649;76650;76651;76652;76812;76813;76814;102672;102673 40694;52696;76651;76814;102672 Q07864 Q07864 14 14 14 DNA polymerase epsilon catalytic subunit A POLE sp|Q07864|DPOE1_HUMAN DNA polymerase epsilon catalytic 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protein 1 TP53BP1 sp|Q12888|TP53B_HUMAN TP53-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TP53BP1 PE=1 SV=2 1 15 15 15 9 12 13 9 12 13 9 12 13 11.6 11.6 11.6 213.57 1972 1972 0 57.042 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95457 0.9955 18.546 38 15 Leave out requantified 1.0366 0.91915 1.0338 1.0797 0.99643 1.0048 18.88 23.629 16.759 9 15 14 4 5 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 7.5 9.3 10.3 754060000 407230000 346830000 154650000 78998000 75650000 308350000 168870000 139480000 291060000 159360000 131700000 1399 41;7115;7186;10377;10913;16004;17599;19625;19765;21900;22988;24962;25254;25311;26745 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 41;7184;7255;10471;11012;16142;17747;19804;19945;22092;23192;25180;25473;25531;26974 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12832;18066;18067;18068;18069;18070;18071;26194;26195;26196;26197;26952;26953;29510;29511;29512;29513;29514;29515;46311;49455;49456;49457;49570;49571;57206;57207;57208;57638;57639;57640;57641;57642;57643;79716;82413;84252;84253;84254;84255;85791;89591;92769;92770;92771;92772;95332;95333;95334;101889;101890;101891;111443;114812;114813;114814;114815;114816;114817;114818;117275;117276;117277;117278;120563;120564;120565;120566 12832;18069;26194;26953;29511;46311;49456;49570;57208;57643;79716;82413;84255;85791;89591;92771;95334;101891;111443;114816;117278;120564 Q12979;P11274 Q12979 6;1 6;1 6;1 Active breakpoint cluster region-related protein ABR sp|Q12979|ABR_HUMAN Active breakpoint cluster region-related protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABR PE=2 SV=2 2 6 6 6 3 5 3 3 5 3 3 5 3 7.7 7.7 7.7 97.597 859 859;1271 0 14.771 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80378 0.87557 14.407 8 4 Leave out requantified 0.86658 0.8838 0.78563 0.91747 0.98594 0.75631 15.72 47.224 35.115 3 3 2 1 2 1 Plateau Median Median 4.2 5.7 3.3 194080000 101270000 92812000 70563000 38099000 32463000 68302000 33566000 34736000 55213000 29601000 25612000 1408 5798;9788;10469;17746;19975;23514 True;True;True;True;True;True 5852;9877;10565;17896;20156;23719 19672;19673;32771;32772;32773;35029;60015;67381;78866;78867;78868 24998;24999;41445;41446;41447;44270;75452;84558;99139;99140;99141;99142;99143;99144 24998;41446;44270;75452;84558;99144 Q12982 Q12982 2 2 1 BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2 BNIP2 sp|Q12982|BNIP2_HUMAN BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BNIP2 PE=1 SV=1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 7.6 7.6 3.8 36.017 314 314 0 18.54 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0216 1.044 6.5536 6 2 Leave out requantified 1.1259 0.77052 1.0212 1.1862 0.85471 1.0014 11.503 34.329 0.65703 2 2 2 0 1 1 Median Median Median 7.6 7.6 7.6 202770000 98592000 104180000 56189000 23819000 32370000 75497000 38807000 36690000 71083000 35965000 35117000 1409 10594;22658 True;True 10690;22858 35416;35417;35418;76083;76084;76085 44754;44755;44756;95550;95551;95552;95553 44755;95552 Q12986 Q12986 2 2 2 Transcriptional repressor NF-X1 NFX1 sp|Q12986|NFX1_HUMAN Transcriptional repressor NF-X1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFX1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2.9 2.9 2.9 124.39 1120 1120 0 3.7338 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9313 2.0359 9.5761 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 1.2 2.9 1.2 35545000 13601000 21945000 0 0 0 21178000 8075700 13102000 14368000 5524900 8842800 1410 1966;23452 True;True 1984;23657 6613;78681;78682;78683 8646;98912;98913;98914 8646;98913 Q12996 Q12996 16 16 16 Cleavage stimulation factor subunit 3 CSTF3 sp|Q12996|CSTF3_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF3 PE=1 SV=1 1 16 16 16 13 14 15 13 14 15 13 14 15 26.5 26.5 26.5 82.921 717 717 0 49.755 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.049 1.0788 21.052 44 5 Leave out requantified 1.0747 0.94995 1.049 1.1161 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4726;4727;4728;4729;21578;21579;35815;35816;35817;35818;35819;38679;38821;38822;45727;45728;45729;45730;52369;52370;52371;52372;54018;54019;54020;54021;54022;54023;60289;60290;60291;60292;60293;60294;60295;63817;65069;65070;65071;65072;74179;74180;74181;75845;75846;75847;101808;101809;101810;114234;114235;114236;114237;114238;114239;120336;120337;120338;120339;120340 4727;21578;35819;38679;38821;45727;52370;54019;60292;63817;65070;74180;75847;101810;114234;120339 Q13011 Q13011 1 1 1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial ECH1 sp|Q13011|ECH1_HUMAN Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECH1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 4.3 4.3 4.3 35.816 328 328 0.001422 3.0838 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 4.3 4.3 0 13108000 6584700 6523600 13108000 6584700 6523600 0 0 0 0 0 0 1412 18253 True 18418 61644;61645 77465;77466 77466 Q13017 Q13017 5 5 5 Rho GTPase-activating protein 5 ARHGAP5 sp|Q13017|RHG05_HUMAN Rho GTPase-activating protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP5 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 1 4 4 1 4 4 1 4.5 4.5 4.5 172.46 1502 1502 0 8.8072 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90784 0.98307 38.474 7 1 Leave out requantified 0.66444 0.90224 NaN 0.69528 1.005 NaN 18.977 38.229 NaN 3 3 1 1 0 0 Median Leave out requantified Median 3.5 3.4 0.7 96311000 53322000 42989000 51890000 30814000 21076000 34532000 16991000 17541000 9889500 5517900 4371600 1413 7308;8185;16752;25175;26296 True;True;True;True;True 7379;8264;16895;25394;26523 24541;24542;27426;27427;27428;56876;84386;84387;88131 31138;31139;31140;34731;71473;106342;111213 31139;34731;71473;106342;111213 Q13042 Q13042 7 7 7 Cell division cycle protein 16 homolog CDC16 sp|Q13042|CDC16_HUMAN Cell division cycle protein 16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC16 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 3 6 5 3 6 5 3 6 17.7 17.7 17.7 71.655 620 620 0 18.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9134 0.9314 14.968 13 5 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Q13064 1 1 1 Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3 MKRN3 sp|Q13064|MKRN3_HUMAN Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKRN3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.2 2.2 2.2 55.644 507 507 0.0089801 1.7949 By MS/MS By matching 1.1058 1.1577 23.537 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 2.2 2.2 33931000 16069000 17862000 0 0 0 17436000 8326100 9110200 16495000 7742600 8752100 1418 21687 True 21877 72896;72897 91491 91491 Q13085;O00763 Q13085 71;11 71;11 71;11 Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase ACACA sp|Q13085|ACACA_HUMAN Acetyl-CoA carboxylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACACA PE=1 SV=2 2 71 71 71 62 66 63 62 66 63 62 66 63 39.8 39.8 39.8 265.55 2346 2346;2458 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0368 1.0442 23.635 242 74 Leave out requantified 1.0782 0.8938 1.0696 1.1339 1.0013 1.0327 27.909 33.109 27.141 78 83 81 24 28 22 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP15 PE=1 SV=3 2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 108.56 963 963;981 0.0030161 2.3074 By MS/MS By MS/MS 2.1552 2.3985 52.046 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1 1 0 39265000 13106000 26159000 25095000 9246100 15849000 14170000 3860400 10310000 0 0 0 1421 23513 True 23718 78864;78865 99137;99138 99137 Q13111 Q13111 3 3 3 Chromatin assembly factor 1 subunit A CHAF1A sp|Q13111|CAF1A_HUMAN Chromatin assembly factor 1 subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHAF1A PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 4.4 4.4 4.4 106.91 956 956 0 6.8569 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99343 1.0076 7.8259 7 0 Leave out requantified 1.0287 NaN 0.9761 1.0616 NaN 0.97 16.739 NaN 5.2179 3 1 3 0 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 4.4 2.2 4.4 183990000 91048000 92945000 82596000 41230000 41366000 24598000 14130000 10467000 76800000 35687000 41112000 1422 10097;15692;23079 True;True;True 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methyltransferase TARBP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TARBP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 1.7 1.7 1.7 181.67 1621 1621 0 4.5409 By MS/MS By MS/MS 1.1973 1.3128 29.355 2 2 Median NaN 1.1973 NaN NaN 1.3128 NaN NaN 29.355 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 0 1.7 0.9 35546000 17436000 18111000 0 0 0 35546000 17436000 18111000 0 0 0 1449 1374;10582 True;True 1383;10678 4625;4626;4627;35373 6007;6008;6009;44697;44698 6007;44698 Q13409 Q13409 12 12 12 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 DYNC1I2 sp|Q13409|DC1I2_HUMAN Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNC1I2 PE=1 SV=3 1 12 12 12 9 10 12 9 10 12 9 10 12 29.2 29.2 29.2 71.456 638 638 0 72.769 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91569 0.9652 10.079 40 8 Leave out requantified 0.89167 0.82384 0.98575 0.95388 0.90045 0.9684 8.9054 11.307 9.7493 12 14 14 4 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.8 25.5 29.2 2909700000 1511900000 1397800000 890690000 474270000 416420000 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subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 12 12 12 65.971 577 577 0 23.616 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90577 0.90811 75.958 12 9 Median 1.0696 0.81779 0.90367 1.1258 0.89179 0.88708 81.375 88.441 79.433 4 4 4 3 3 3 Median Median Median 9.9 10.4 9.9 599680000 343070000 256620000 235480000 122510000 112970000 173690000 106290000 67403000 190520000 114270000 76245000 1451 5115;18695;21922;23663;25227 True;True;True;True;True 5164;18865;22114;23868;25446 17413;63045;63046;63047;73660;73661;79342;79343;79344;84545;84546;84547 22125;79273;79274;79275;92451;92452;99766;99767;99768;106536;106537;106538 22125;79275;92451;99767;106537 Q13418 Q13418 17 17 17 Integrin-linked protein kinase ILK sp|Q13418|ILK_HUMAN Integrin-linked protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILK PE=1 SV=2 1 17 17 17 15 13 14 15 13 14 15 13 14 44.2 44.2 44.2 51.419 452 452 0 57.636 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0212 1.0406 19.739 55 16 Leave out requantified 1.0326 0.89593 1.0497 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10020;10021;10022;10023;10024;10025;10026;10027;10028;10029;10030;10036;10037;10038;10039;10040;10041;10042;10043;10044;10045;10046;10047;10048;25436;57122;57123;57124;57125;57126;57127;57128;57129;57130;57131;60341;60342;64506;64507;82950;82951;82952;83816;83817;83818;89246;89247;89248;93624;93625;93626;93627;107330;109139;109140;109141;109142 10029;10043;25436;57128;60342;64507;82950;83817;89247;93626;107330;109141 257 35 Q13496 Q13496 6 6 6 Myotubularin MTM1 sp|Q13496|MTM1_HUMAN Myotubularin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTM1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 3 5 4 3 5 4 3 5 10.8 10.8 10.8 69.931 603 603 0 9.9141 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0771 1.1352 15.642 10 6 Leave out requantified 1.2686 1.1285 1.028 1.3357 1.268 1.0163 66.053 49.616 13.542 4 3 3 3 1 2 Median Plateau Median 7.1 6 8.8 126850000 60316000 66539000 51093000 23616000 27477000 44992000 22290000 22701000 30770000 14410000 16360000 1462 3064;4290;9404;13107;17531;20971 True;True;True;True;True;True 3091;4332;9491;13224;17678;21156 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Q14232 Q14232 9 9 9 Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha EIF2B1 sp|Q14232|EI2BA_HUMAN Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2B1 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 8 8 7 8 8 7 8 8 30.2 30.2 30.2 33.712 305 305 0 58.282 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99032 1.0756 25.472 28 11 Leave out requantified 0.9644 0.98613 1.153 1.0179 1.0843 1.1301 22.774 20.266 26.369 8 10 10 3 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.6 26.9 29.5 1346700000 661810000 684920000 330930000 173620000 157310000 483110000 247900000 235210000 532690000 240290000 292400000 1516 1942;6494;8265;8759;11840;12438;15200;15201;24778 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1960;6556;8344;8840;11948;12547;15331;15332;24995 6543;6544;6545;6546;6547;6548;21988;21989;27680;27681;27682;29307;29308;29309;29310;29311;29312;40304;42356;42357;42358;51699;51700;51701;51702;51703;83123;83124;83125 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6985;6986;32088;86918;101765 6985;32088;86918;101765 Q15172 Q15172 3 2 2 Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform PPP2R5A sp|Q15172|2A5A_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R5A PE=1 SV=1 1 3 2 2 2 2 3 1 2 2 1 2 2 6.4 4.7 4.7 56.193 486 486 0 6.5482 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0621 1.1063 0.30361 5 1 Leave out requantified NaN 0.76075 1.2035 NaN 0.82749 1.1904 NaN 41.367 10.672 1 2 2 0 1 0 Median Median Median 4.3 4.7 6.4 74284000 37231000 37053000 15709000 7027900 8681500 26505000 15051000 11454000 32069000 15152000 16918000 1597 10860;15098;20404 True;True;False 10958;15229;20588 36303;36304;36305;51372;51373;68708;68709 45883;45884;64577;64578;86230 45884;64577;86230 Q15181 Q15181 2 2 2 Inorganic pyrophosphatase PPA1 sp|Q15181|IPYR_HUMAN Inorganic pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPA1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.9 6.9 6.9 32.66 289 289 0 4.267 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1478 1.1409 31.638 4 3 Median NaN NaN 0.89756 NaN NaN 0.87203 NaN NaN 2.1508 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 3.1 3.1 6.9 81035000 33394000 47641000 28062000 11913000 16149000 31953000 9365500 22588000 21020000 12115000 8904700 1598 183;4818 True;True 184;4865 612;613;614;16433 802;803;804;20893 803;20893 Q15185 Q15185 3 3 3 Prostaglandin E synthase 3 PTGES3 sp|Q15185|TEBP_HUMAN Prostaglandin E synthase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTGES3 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 23.8 23.8 23.8 18.697 160 160 0 23.851 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0056 1.0852 187.49 13 9 Median 0.94796 1.0229 1.4978 1.048 1.1478 1.4939 190.24 212.28 217.16 5 4 4 4 3 2 Median Median Median 23.8 18.8 18.8 862130000 424810000 437310000 349210000 177790000 171430000 245440000 118950000 126490000 267480000 128080000 139400000 1599 4872;11430;17289 True;True;True 4920;11534;17433 16632;38595;38596;38597;38598;38599;38600;38601;38602;38603;58520;58521;58522;58523;58524;58525 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186;1346;2567;6323;7851;7907;8218;9169;11254;11255;18111;18112;18222;21655;21656;24861;26483 618;619;620;4502;4503;4504;8540;8541;8542;21206;21207;21208;26064;26065;26066;26067;26068;26069;26276;26277;26278;26279;26280;26281;27280;27281;27282;27283;27284;27285;27286;30386;30387;30388;30389;37341;37342;37343;37344;37345;37346;37347;37348;37349;37350;37351;37352;37353;37354;60687;60688;60689;60690;60691;60692;60693;60694;60695;60696;61044;61045;61046;72107;72108;72109;72110;72111;72112;72113;82710;82711;82712;82713;88004;88005;88006 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3;2 3;2 3;2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 UBE2V2;UBE2V1 sp|Q15819|UB2V2_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2V2 PE=1 SV=4;sp|Q13404|UB2V1_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2V1 PE=1 SV=2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 16.6 16.6 16.6 16.363 145 145;147 0 6.1191 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3447 1.4297 25.592 10 3 Leave out requantified 1.0842 1.5525 1.6449 1.1366 1.7134 1.6213 93.472 68.437 64.513 3 3 4 1 1 1 Median Median Median 16.6 16.6 16.6 715210000 278510000 436690000 207720000 90085000 117630000 220120000 86478000 133640000 287370000 101950000 185420000 1651 15934;22439;27949 True;True;True 16072;22638;28190 54241;54242;54243;75313;75314;75315;93660;93661;93662;93663 68126;68127;68128;94564;94565;94566;94567;118391;118392 68127;94565;118392 Q15833 Q15833 5 5 5 Syntaxin-binding protein 2 STXBP2 sp|Q15833|STXB2_HUMAN Syntaxin-binding protein 2 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Q16186 4 4 4 Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 ADRM1 sp|Q16186|ADRM1_HUMAN Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADRM1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 11.1 11.1 11.1 42.153 407 407 0 93.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2821 1.3052 22.296 12 5 Leave out requantified 0.9021 0.9635 1.3513 0.9615 1.0659 1.3401 13.201 31.899 24.327 4 4 4 3 2 0 Median Median Leave out requantified 11.1 11.1 11.1 729540000 372510000 357030000 206190000 109760000 96429000 261490000 144260000 117230000 261870000 118500000 143370000 1658 15142;23191;25250;25251 True;True;True;True 15273;23395;25469;25470 51506;51507;51508;77848;77849;77850;84632;84633;84634;84635;84636;84637 64758;64759;64760;64761;97836;97837;97838;97839;106639;106640;106641;106642;106643;106644;106645;106646;106647 64759;97836;106639;106643 Q16204 Q16204 11 11 11 Coiled-coil domain-containing protein 6 CCDC6 sp|Q16204|CCDC6_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC6 PE=1 SV=2 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RBBP7 RBBP7 sp|Q16576|RBBP7_HUMAN Histone-binding protein RBBP7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBBP7 PE=1 SV=1 1 13 6 6 12 13 13 6 6 6 6 6 6 43.1 30.6 30.6 47.82 425 425 0 57.107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9182 0.98459 7.4747 35 3 Leave out requantified 1.0047 0.9372 1.014 1.0498 1.0322 0.97852 27.121 7.1676 9.3595 12 11 12 2 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 40.9 43.1 43.1 3381700000 1686400000 1695300000 1197800000 593310000 604490000 958430000 503120000 455310000 1225500000 589960000 635510000 1670 4950;5974;6757;11528;12365;13021;16397;16567;21459;25091;25481;26583;26703 True;True;True;True;True;False;False;False;False;False;False;True;False 4998;6030;6820;11632;12474;13138;16539;16710;21647;25309;25704;26810;26932 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Q16630 Q16630 9 9 9 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 CPSF6 sp|Q16630|CPSF6_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF6 PE=1 SV=2 1 9 9 9 9 7 8 9 7 8 9 7 8 22.1 22.1 22.1 59.209 551 551 0 55.678 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91767 0.94551 15.083 29 8 Leave out requantified 0.90389 0.84043 1.0074 0.94261 0.93935 0.98335 10.119 35.306 10.255 10 9 10 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.1 16.9 19.2 3773700000 2020900000 1752800000 1301000000 697910000 603130000 1151800000 635880000 515950000 1320800000 687130000 633700000 1672 4987;6477;8995;9299;9455;10391;20189;25068;27002 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5036;6539;9079;9385;9542;10485;20373;25286;27233 16991;21937;21938;21939;21940;30107;30108;31090;31091;31092;31093;31593;31594;31595;34756;34757;34758;68062;68063;68064;84053;84054;84055;84056;84057;84058;90542;90543;90544;90545;90546;90547 21571;27928;27929;27930;27931;38055;38056;39307;39308;39309;39310;39963;39964;39965;39966;43906;43907;43908;43909;43910;43911;43912;85438;85439;85440;105903;105904;105905;105906;105907;105908;105909;105910;105911;105912;105913;114322;114323;114324;114325;114326;114327;114328;114329;114330;114331;114332 21571;27928;38055;39309;39964;43911;85439;105910;114323 Q16637 Q16637 4 4 4 Survival motor neuron protein SMN1 sp|Q16637|SMN_HUMAN Survival motor neuron protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMN1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 20.1 20.1 20.1 31.848 294 294 0 56.044 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92736 0.97382 9.4139 18 12 Leave out requantified 0.99633 0.88134 0.96999 1.0555 0.9608 0.95028 15.5 17.784 14.905 6 7 5 5 4 3 Median Median Median 13.9 20.1 20.1 874870000 457270000 417600000 253060000 121840000 131220000 336150000 186080000 150060000 285660000 149350000 136320000 1673 7311;10718;19542;21681 True;True;True;True 7382;10815;19720;21871 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PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 13.1 13.1 13.1 36.067 335 335 0 12.287 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79577 0.85028 25.855 6 3 Median 0.79785 0.90339 NaN 0.83644 0.98332 NaN 33.8 18.238 NaN 3 2 1 2 0 1 Median Median Median 13.1 10.4 3.9 118240000 62496000 55746000 60607000 32094000 28513000 43722000 22295000 21427000 13913000 8106300 5806900 1677 2177;25843;26562 True;True;True 2195;26069;26789 7308;7309;7310;86605;86606;89043 9529;9530;9531;109219;109220;112394 9529;109219;112394 Q16719 Q16719 9 9 9 Kynureninase KYNU sp|Q16719|KYNU_HUMAN Kynureninase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KYNU PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 9 9 6 9 9 6 9 9 25.2 25.2 25.2 52.351 465 465 0 22.212 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75067 0.7971 13.39 24 11 Leave out requantified 0.72557 0.74224 0.86838 0.76203 0.81828 0.8667 9.3493 4.0479 20.744 6 9 9 2 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.1 25.2 25.2 1198700000 700550000 498160000 292190000 161670000 130520000 441080000 270850000 170240000 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5183;12727;32480;68776;69627 Q16836 Q16836 4 4 4 Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial HADH sp|Q16836|HCDH_HUMAN Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADH PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 16.9 16.9 16.9 34.293 314 314 0 10.446 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0273 1.0663 31.43 11 1 Leave out requantified 0.92896 0.99495 1.1967 0.97165 1.0988 1.1577 24.528 28.538 30.496 4 3 4 0 1 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 16.9 8.6 16.9 368410000 189450000 178960000 126160000 66059000 60099000 106310000 60211000 46097000 135940000 63180000 72761000 1681 757;4733;7768;24269 True;True;True;True 760;4779;7844;24480 2480;2481;2482;16124;16125;16126;26033;26034;81357;81358;81359 3209;3210;3211;20533;20534;20535;20536;20537;33037;33038;102385;102386;102387 3209;20535;33038;102386 Q16851 Q16851 6 6 6 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UGP2 sp|Q16851|UGPA_HUMAN UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UGP2 PE=1 SV=5 1 6 6 6 4 5 4 4 5 4 4 5 4 15.4 15.4 15.4 56.94 508 508 0 12.456 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.097 1.2048 20.824 10 1 Leave out requantified 0.88534 1.097 1.2585 0.93283 1.2257 1.2637 28.883 20.421 7.5649 3 4 3 1 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 9.1 11.4 8.7 284810000 130820000 153990000 66588000 34060000 32528000 104830000 51682000 53153000 113390000 45078000 68312000 1682 5765;7207;13194;17454;18756;24668 True;True;True;True;True;True 5819;7276;13311;17601;18928;24885 19570;19571;19572;24205;24206;24207;44906;59077;59078;59079;63255;63256;82781 24892;24893;24894;30710;30711;30712;56396;74263;74264;74265;79539;79540;104286 24893;30712;56396;74265;79540;104286 Q16881;Q9NNW7 Q16881 13;1 13;1 13;1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic TXNRD1 sp|Q16881|TRXR1_HUMAN Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNRD1 PE=1 SV=3 2 13 13 13 13 9 11 13 9 11 13 9 11 35.1 35.1 35.1 70.905 649 649;524 0 97.809 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83675 0.84332 24.865 38 16 Leave out requantified 0.78772 0.86643 1.0284 0.842 0.93331 0.99127 24.22 20.172 41.523 14 10 14 5 4 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.1 24 31.1 2940500000 1576100000 1364400000 1109400000 644450000 464920000 799200000 420220000 378980000 1031900000 511420000 520490000 1683 2714;8353;9469;13111;16392;18094;20500;26292;27249;27856;27907;28047;28183 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2739;8432;9556;13228;16533;18254;20684;26519;27484;28096;28147;28290;28426 9087;9088;27963;27964;27965;31635;31636;44615;44616;44617;44618;55745;55746;55747;61149;69048;69049;69050;69051;88112;88113;88114;91374;91375;91376;91377;91378;91379;93352;93353;93354;93521;93522;93523;93988;93989;94403;94404 11902;35338;35339;35340;35341;35342;40009;40010;56000;56001;56002;56003;56004;70021;70022;70023;70024;70025;70026;76856;86679;86680;111189;111190;111191;115418;115419;115420;117996;118218;118219;118220;118829;118830;119337;119338;119339 11902;35339;40010;56000;70023;76856;86680;111189;115420;117996;118219;118830;119338 Q1ED39 Q1ED39 8 8 8 Lysine-rich nucleolar protein 1 KNOP1 sp|Q1ED39|KNOP1_HUMAN Lysine-rich nucleolar protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KNOP1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 4 8 4 4 8 4 4 8 4 22.3 22.3 22.3 51.588 458 458 0 20.901 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92309 1.0101 27.2 22 5 Leave out requantified 1.1197 0.90447 1.0029 1.1629 1.01 0.98404 32.637 31.539 8.4386 7 10 5 2 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.5 22.3 12.4 709420000 371230000 338190000 147120000 72145000 74971000 402390000 211060000 191330000 159910000 88021000 71891000 1684 46;1471;3418;4821;10916;12485;23575;26186 True;True;True;True;True;True;True;True 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domain-containing protein 1 MAP7D1 sp|Q3KQU3|MA7D1_HUMAN MAP7 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP7D1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.7 1.7 1.7 92.819 841 841 0.003055 2.48 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 0 1.7 16335000 10823000 5511700 0 0 0 0 0 0 16335000 10823000 5511700 1698 532 True 534 1763 2266 2266 Q3LXA3 Q3LXA3 14 14 14 Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) DAK sp|Q3LXA3|TKFC_HUMAN Triokinase/FMN cyclase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKFC PE=1 SV=2 1 14 14 14 10 12 11 10 12 11 10 12 11 38.8 38.8 38.8 58.946 575 575 0 40.793 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89849 0.93114 17.941 36 4 Leave out requantified 1.1389 0.82197 0.93309 1.1852 0.9064 0.88749 14.292 21.381 19.827 10 14 12 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.7 32.3 28.2 1549700000 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1,4,5-trisphosphate receptor-interacting protein-like 2 ITPRIPL2 sp|Q3MIP1|IPIL2_HUMAN Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor-interacting protein-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITPRIPL2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.5 1.5 1.5 58.446 535 535 0.0058958 2.0171 By MS/MS By MS/MS 1.1048 1.19 19.977 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.5 1.5 0 86148000 22151000 63998000 56506000 13812000 42694000 29642000 8339100 21303000 0 0 0 1700 9160 True 9244 30642;30643 38731;38732 38732 Q3V6T2 Q3V6T2 2 2 2 Girdin CCDC88A sp|Q3V6T2|GRDN_HUMAN Girdin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC88A PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1.5 1.5 1.5 216.04 1871 1871 0 8.5438 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0416 1.0265 19.303 5 3 Median 0.98976 0.89191 NaN 1.029 0.978 NaN 11.235 36.525 NaN 2 2 1 2 1 0 Median Median Median 1.5 1.5 0.6 73420000 37160000 36260000 30033000 14740000 15292000 32219000 17164000 15056000 11168000 5256400 5912000 1701 12789;25463 True;True 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chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB8 PE=1 SV=2 1 10 2 2 10 10 10 2 2 2 2 2 2 24.5 7.4 7.4 49.775 444 444 0 120.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0078 1.0686 0.057228 13 5 Leave out requantified 0.87549 1.0175 1.1516 0.95271 1.1458 1.1529 8.1817 14.923 4.9064 5 5 3 2 3 0 Median Median Median 24.5 24.5 24.5 5351500000 2622500000 2729100000 1737600000 893700000 843930000 1246800000 590410000 656410000 2367100000 1138300000 1228700000 1703 2467;5102;8561;13214;13750;13963;14539;15467;19265;23979 False;True;False;False;True;False;False;False;False;False 2489;2490;5151;8641;13331;13874;14087;14667;14668;15601;15602;19439;19440;24188 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oxidase assembly factor 6 homolog COA6 sp|Q5JTJ3|COA6_HUMAN Cytochrome c oxidase assembly factor 6 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COA6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 20.8 20.8 20.8 14.116 125 125 0 13.584 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.138 1.1493 3.4904 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 10.4 20.8 10.4 54068000 22378000 31691000 20333000 9164300 11169000 15482000 6500700 8981700 18252000 6712500 11540000 1731 2872;23284 True;True 2897;23488 9629;78125;78126;78127 12569;98170;98171;98172 12569;98170 Q5JUR7 Q5JUR7 3 3 3 Testis-expressed sequence 30 protein TEX30 sp|Q5JUR7|TEX30_HUMAN Testis-expressed protein 30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TEX30 PE=2 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 17.2 17.2 17.2 25.585 227 227 0 8.7029 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0711 1.1371 11.513 11 4 Leave out requantified 0.91374 1.0711 0.92461 0.96218 1.1584 0.89654 7.7316 7.9233 18.047 4 3 4 2 0 2 Median Leave out requantified Median 17.2 17.2 17.2 410670000 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requantified Median 8.3 8.4 5 338940000 167560000 171380000 126390000 62977000 63412000 131030000 64018000 67016000 81517000 40569000 40948000 1744 7638;11703;12185;22183;24592 True;True;True;True;True 7713;11810;12294;22380;24808 25608;25609;39774;39775;41506;41507;41508;41509;74472;74473;82533;82534 32492;32493;49883;52003;52004;52005;52006;52007;93491;93492;103973 32492;49883;52006;93492;103973 Q9Y6H1;Q5T1J5 Q9Y6H1;Q5T1J5 2;2 2;2 2;2 Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2;Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial CHCHD2;CHCHD2P9 sp|Q9Y6H1|CHCH2_HUMAN Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHCHD2 PE=1 SV=1;sp|Q5T1J5|CHCH9_HUMAN Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial OS=Homo s 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 27.2 27.2 27.2 15.512 151 151;151 0 12.368 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91205 0.91276 19.395 6 1 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0 4.7711 By MS/MS By MS/MS 1.1541 1.2029 3.1327 6 2 Leave out requantified 1.2265 NaN 1.0556 1.3314 NaN 0.99415 42.005 NaN 24.221 2 0 4 0 0 2 Median Median Median 4.8 0 6.6 108510000 52011000 56501000 34203000 18024000 16179000 0 0 0 74309000 33986000 40323000 1747 6013;12573;23845 True;True;True 6070;12682;24051 20385;20386;42811;42812;79941;79942 25974;53659;100533;100534 25974;53659;100533 Q5T200 Q5T200 3 3 3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 13 ZC3H13 sp|Q5T200|ZC3HD_HUMAN Zinc finger CCCH domain-containing protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3H13 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 2.2 2.2 2.2 196.63 1668 1668 0 8.9611 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.819 1.9302 50.037 3 3 Plateau 1.211 NaN NaN 1.2475 NaN NaN 61.722 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 2.2 1.4 0.7 93230000 35504000 57726000 47181000 20707000 26474000 46049000 14797000 31252000 0 0 0 1748 1862;2088;24270 True;True;True 1879;2106;24481 6256;7024;7025;81360;81361;81362 8158;9188;9189;102388;102389;102390 8158;9189;102388 Q5T280 Q5T280 3 3 3 Putative methyltransferase C9orf114 C9orf114 sp|Q5T280|CI114_HUMAN Putative methyltransferase C9orf114 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPOUT1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 0 2 3 0 2 3 0 2 9.8 9.8 9.8 42.008 376 376 0 13.031 By MS/MS By MS/MS 1.0072 1.0326 24.15 5 3 Median 0.77918 NaN 1.2063 0.82164 NaN 1.1859 20.08 NaN 19.58 3 0 2 2 0 1 Median Median Median 9.8 0 7.2 157500000 79993000 77504000 88635000 48412000 40223000 0 0 0 68863000 31582000 37281000 1749 10553;13877;21451 True;True;True 10649;14001;21639 35273;35274;47289;72058;72059 44581;44582;44583;59470;90501;90502 44581;59470;90502 Q5T3I0 Q5T3I0 5 5 5 G patch domain-containing protein 4 GPATCH4 sp|Q5T3I0|GPTC4_HUMAN G patch domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH4 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 16.6 16.6 16.6 50.381 446 446 0 15.883 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97402 1.0562 20.641 12 2 Leave out requantified 0.81446 1.113 0.75336 0.85966 1.1946 0.75197 33.467 5.5993 29.699 4 5 3 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Q5VT52 Q5VT52 12 12 12 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 RPRD2 sp|Q5VT52|RPRD2_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD2 PE=1 SV=1 1 12 12 12 7 7 7 7 7 7 7 7 7 12.1 12.1 12.1 156.02 1461 1461 0 54.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0185 1.0447 22.438 20 5 Leave out requantified 1.0127 0.90261 1.062 1.0622 0.99964 1.0485 10.493 32.208 23.109 6 7 7 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 6.9 7.4 7.7 603070000 307830000 295240000 199920000 93178000 106740000 200810000 110370000 90442000 202340000 104280000 98059000 1765 2063;2141;12641;13347;14880;16503;19170;19567;19737;21716;23105;26248 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2081;2159;12750;13466;15011;16646;19343;19746;19917;21906;23309;26475 6924;6925;7181;7182;43072;45429;45430;50696;56089;56090;64655;66000;66001;66002;66594;66595;72972;72973;72974;77568;77569;87981 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45824;80171;85695;97851;108692 Q5VTR2 Q5VTR2 28 26 26 E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A RNF20 sp|Q5VTR2|BRE1A_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF20 PE=1 SV=2 1 28 26 26 22 23 20 20 21 18 20 21 18 35.3 32.4 32.4 113.66 975 975 0 94.406 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92541 0.94119 16.766 65 27 Leave out requantified 0.87755 0.94482 0.99896 0.94119 1.0479 0.97824 17.068 28.25 17.203 22 23 20 8 12 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.9 30.7 24.8 2774900000 1487100000 1287800000 880700000 495630000 385060000 1028100000 529100000 498960000 866150000 462390000 403750000 1767 242;526;1586;1621;2373;2512;2757;2950;5581;6005;10722;11361;11406;12165;12703;15329;15452;16081;16797;17014;19920;19987;22249;24230;24961;25113;25190;28416 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True 243;528;1596;1631;2395;2535;2782;2976;5635;6062;10819;11464;11509;12273;12813;15461;15586;16219;16940;17158;20101;20168;22446;24441;25179;25331;25409;28661 796;797;798;1751;1752;5327;5328;5439;7977;7978;7979;7980;7981;8425;8426;8427;9228;9229;9928;9929;9930;9931;9932;9933;9934;9935;18975;20364;20365;20366;20367;35819;35820;38283;38284;38495;38496;38497;38498;38499;38500;38501;38502;38503;38504;41430;43274;52147;52148;52149;52569;52570;52571;52572;52573;54742;54743;54744;56990;57671;57672;57673;67206;67207;67208;67209;67413;67414;67415;74680;74681;74682;81249;81250;81251;81252;81253;81254;83731;83732;83733;84204;84424;84425;84426;95088;95089 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Q96DC8;Q6BEB4 1;1 1;1 1;1 Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial;Transcription factor Sp5 ECHDC3;SP5 sp|Q96DC8|ECHD3_HUMAN Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECHDC3 PE=1 SV=2;sp|Q6BEB4|SP5_HUMAN Transcription factor Sp5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SP5 PE=2 SV=1 2 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.3 2.3 2.3 32.633 303 303;398 0 4.3217 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 2.3 2.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1793 235 True 236 776;777 1005;1006 1006 Q6DD87 Q6DD87 5 5 5 Zinc finger protein 787 ZNF787 sp|Q6DD87|ZN787_HUMAN Zinc finger protein 787 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF787 PE=1 SV=4 1 5 5 5 5 2 3 5 2 3 5 2 3 24.1 24.1 24.1 40.428 382 382 0 11.783 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90472 0.91792 10.084 14 2 Leave out requantified 0.90472 0.88429 0.84809 0.91792 0.98462 0.84923 11.682 17.96 54.224 6 3 5 0 0 2 Leave out requantified Plateau Median 24.1 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3957;3958;3959;13302;13303;13304;15297;15298;30120;76859;76860;76861;76862;76863 5187;5188;5189;17105;17106;19525;19526;38064;38065;96482;96483;96484;96485;96486 5188;17105;19526;38064;96482 Q6DKI1 Q6DKI1 4 4 4 60S ribosomal protein L7-like 1 RPL7L1 sp|Q6DKI1|RL7L_HUMAN 60S ribosomal protein L7-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL7L1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 19.2 19.2 19.2 29.669 255 255 0 11.768 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84713 0.94979 11.875 10 4 Leave out requantified 0.81688 0.90522 1.0317 0.86882 1.0336 1.033 111.82 87.43 84.971 4 3 3 2 1 1 Median Median Median 19.2 13.7 13.7 779110000 458820000 320290000 402490000 273960000 128540000 193510000 92565000 100940000 183100000 92297000 90807000 1796 12314;13496;13930;24573 True;True;True;True 12423;13616;14054;24789 41934;41935;41936;45944;47484;47485;47486;47487;47488;82470;82471;82472 52535;52536;52537;52538;52539;52540;57740;59700;59701;59702;59703;59704;103880;103881 52538;57740;59700;103881 Q6DRA6;Q6DN03 Q6DRA6;Q6DN03 3;3 1;1 1;1 Putative histone H2B type 2-D;Putative histone H2B type 2-C HIST2H2BD;HIST2H2BC sp|Q6DRA6|H2B2D_HUMAN Putative histone H2B type 2-D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST2H2BD PE=5 SV=3;sp|Q6DN03|H2B2C_HUMAN Putative histone H2B type 2-C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST2H2BC PE=5 SV=3 2 3 1 1 3 2 2 1 0 0 1 0 0 15.2 9.1 9.1 18.018 164 164;193 1 -2 By MS/MS By matching By matching NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 15.2 6.1 6.1 25137000 20257000 4879900 25137000 20257000 4879900 0 0 0 0 0 0 + 1797 1636;7292;13803 True;False;False 1647;7363;13927 5482;24491;24492;24493;24494;47030;47031;47032;47033;47034;47035 7162;31076;31077;31078;31079;31080;31081;59130;59131;59132;59133;59134;59135;59136;59137;59138 7162;31078;59133 272 63 Q6FI81 Q6FI81 6 6 6 Anamorsin CIAPIN1 sp|Q6FI81|CPIN1_HUMAN Anamorsin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAPIN1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 6 6 4 6 6 4 6 6 22.4 22.4 22.4 33.582 312 312 0 10.358 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1483 1.2289 13.342 21 5 Leave out requantified 1.0124 1.0575 1.3654 1.038 1.1744 1.3328 12.907 20.993 13.254 5 8 8 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.7 22.4 22.4 1215700000 688870000 526840000 247930000 119930000 128000000 509270000 317660000 191610000 458520000 251280000 207240000 1798 6949;6980;12909;14111;16738;23365 True;True;True;True;True;True 7018;7049;13022;14236;16881;23569 23378;23379;23380;23462;23463;23464;23465;23466;23467;43945;43946;48124;48125;56821;56822;56823;56824;56825;56826;78399;78400;78401;78402;78403 29711;29712;29713;29714;29715;29716;29812;29813;29814;29815;29816;29817;29818;55124;55125;60464;71399;71400;71401;71402;71403;71404;98536;98537;98538;98539 29716;29816;55125;60464;71399;98539 Q6GMV3 Q6GMV3 1 1 1 Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 PTRHD1 sp|Q6GMV3|PTRD1_HUMAN Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTRHD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 10 10 10 15.805 140 140 0.0043189 2.1889 By MS/MS 1.0976 1.1977 34.51 2 2 Median NaN 1.0976 NaN NaN 1.1977 NaN NaN 34.51 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 0 10 0 50751000 20876000 29875000 0 0 0 50751000 20876000 29875000 0 0 0 1799 3704 True 3741 12576;12577 16238;16239 16239 Q6GQQ9;Q8TE49 Q6GQQ9 3;1 3;1 3;1 OTU domain-containing protein 7B OTUD7B sp|Q6GQQ9|OTU7B_HUMAN OTU domain-containing protein 7B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OTUD7B PE=1 SV=1 2 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 5 5 5 92.525 843 843;926 0 5.404 By matching By MS/MS By MS/MS 0.94613 0.97142 19.804 7 2 Leave out requantified NaN 0.94751 1.1863 NaN 1.072 1.1648 NaN 44.682 51.18 1 3 3 0 1 1 Median Median Median 1.4 5 5 132110000 67432000 64683000 20747000 11064000 9682500 58516000 30844000 27672000 52852000 25524000 27328000 1800 8219;10595;16179 True;True;True 8298;10691;16318 27522;27523;35419;35420;55066;55067;55068 34834;34835;44757;69151 34834;44757;69151 Q6GYQ0 Q6GYQ0 5 5 5 Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 RALGAPA1 sp|Q6GYQ0|RGPA1_HUMAN Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RALGAPA1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2.8 2.8 2.8 229.83 2036 2036 0 6.4351 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70325 0.76054 17.706 3 2 Median NaN 0.71348 NaN NaN 0.76788 NaN NaN 1.3585 NaN 0 2 1 0 1 1 Median Median Median 1.4 1.1 1 66499000 33723000 32776000 18984000 9556000 9427600 31824000 15072000 16752000 15691000 9095300 6596100 1801 9537;12933;19246;19844;25497 True;True;True;True;True 9625;13046;19420;20024;25720 31897;44016;64918;66929;85450;85451 40341;55195;81512;83994;107698;107699 40341;55195;81512;83994;107698 Q6I9Y2 Q6I9Y2 3 3 3 THO complex subunit 7 homolog THOC7 sp|Q6I9Y2|THOC7_HUMAN THO complex subunit 7 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THOC7 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 16.7 16.7 16.7 23.743 204 204 0 15.417 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1101 1.1402 15.952 4 1 Median 1.1014 NaN NaN 1.2122 NaN NaN 19.517 NaN NaN 3 0 1 1 0 0 Plateau Median Median 16.7 5.9 9.8 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16094;16095;29553;29554;35404;35405;35406;53197;54125;99220;99221;99222;99223;99224;99225;109541;109542 16095;29554;35404;53197;54125;99224;109542 Q6IAA8 Q6IAA8 2 2 2 Ragulator complex protein LAMTOR1 LAMTOR1 sp|Q6IAA8|LTOR1_HUMAN Ragulator complex protein LAMTOR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMTOR1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 23 23 23 17.745 161 161 0 8.7947 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3262 1.3465 14.749 4 1 Median 1.2617 NaN NaN 1.3127 NaN NaN 23.707 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 23 14.9 14.9 107770000 49008000 58763000 72879000 36545000 36334000 16112000 5864500 10248000 18780000 6598400 12182000 1804 23962;24051 True;True 24171;24260 80358;80359;80360;80653 101056;101057;101058;101461 101056;101461 Q6IBS0 Q6IBS0 4 4 3 Twinfilin-2 TWF2 sp|Q6IBS0|TWF2_HUMAN Twinfilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TWF2 PE=1 SV=2 1 4 4 3 4 3 3 4 3 3 3 2 2 14.3 14.3 12.3 39.548 349 349 0 10.737 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96468 1.0073 31.666 9 2 Leave out requantified 0.91736 0.77943 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True;True 8972;24350 29765;29766;29767;29768;29769;29770;80963;80964;80965 37621;37622;37623;37624;37625;37626;101871;101872;101873 37622;101871 Q6ICB0 Q6ICB0 3 3 3 Desumoylating isopeptidase 1 DESI1 sp|Q6ICB0|DESI1_HUMAN Desumoylating isopeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DESI1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 24.4 24.4 24.4 18.262 168 168 0 15.426 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2652 1.3463 12.354 6 4 Median 1.2496 NaN 1.3608 1.3377 NaN 1.3459 11.417 NaN 16.409 2 1 3 1 0 3 Median Median Median 9.5 4.8 24.4 273460000 116950000 156520000 105640000 44029000 61612000 34034000 16979000 17055000 133790000 55938000 77849000 1807 9319;17149;17789 True;True;True 9405;17293;17939 31152;58088;58089;58090;60149;60150 39377;72998;72999;73000;73001;73002;75614;75615 39377;73002;75615 Q6IN85;Q5MIZ7 Q6IN85;Q5MIZ7 3;2 3;2 3;2 Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A;Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B SMEK1;SMEK2 sp|Q6IN85|P4R3A_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3A PE=1 SV=1;sp|Q5MIZ7|P4R3B_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3B PE=1 SV=2 2 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4.3 4.3 4.3 95.367 833 833;849 0 5.545 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97259 1.043 14.931 6 5 Median 1.1171 0.92733 1.1566 1.1645 1.0238 1.1295 16.35 3.3801 25.592 2 2 2 2 1 2 Median Median Median 2.9 2.9 2.9 116470000 60039000 56431000 39618000 17341000 22276000 36787000 19642000 17145000 40065000 23056000 17009000 1808 577;10711;14411 True;True;True 579;10808;14538 1906;1907;1908;35782;49155;49156 2440;2441;2442;45230;61758;61759 2441;45230;61759 Q6KC79 Q6KC79 19 19 19 Nipped-B-like protein NIPBL sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL PE=1 SV=2 1 19 19 19 11 16 12 11 16 12 11 16 12 8.3 8.3 8.3 316.05 2804 2804 0 56.572 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9195 0.94661 22.573 39 11 Leave out requantified 1.0302 0.85831 0.89015 1.0773 0.95063 0.86982 10.973 27.97 26.334 9 16 14 3 5 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.3 7 5.7 1646500000 841420000 805060000 460860000 215300000 245560000 588750000 328990000 259760000 596870000 297130000 299740000 1809 303;400;2559;3071;4756;8879;11596;12869;16132;17198;17545;19197;19242;21116;21907;23147;23951;26759;28449 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 304;401;2582;3098;4802;8963;11702;12982;16270;17342;17692;19371;19416;21302;22099;23351;24160;26988;28695 1002;1003;1004;1326;1327;1328;8583;10345;16213;29737;39378;39379;39380;39381;39382;39383;39384;43816;43817;43818;43819;43820;54902;54903;54904;58235;58236;59381;64749;64904;64905;70931;70932;70933;73606;73607;73608;77691;77692;77693;77694;80325;89708;95185;95186;95187 1300;1301;1302;1708;1709;11222;13414;20647;37584;49412;49413;49414;49415;49416;49417;49418;54966;54967;54968;68944;68945;68946;68947;68948;68949;68950;73207;73208;73209;74653;81325;81494;81495;89068;89069;89070;92386;92387;92388;97626;97627;101022;113225;120354;120355;120356 1301;1708;11222;13414;20647;37584;49416;54966;68947;73209;74653;81325;81494;89070;92386;97626;101022;113225;120355 Q6N069 Q6N069 5 2 2 N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit NAA16 sp|Q6N069|NAA16_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA16 PE=1 SV=2 1 5 2 2 3 4 4 2 2 2 2 2 2 6.1 3 3 101.46 864 864 0 3.8543 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0587 1.0926 25.023 6 5 Median 0.90262 0.92109 1.1682 0.9797 1.0362 1.143 34.639 32.125 25.599 2 2 2 2 1 2 Median Median Median 4.3 5.3 5.1 106170000 54967000 51207000 37867000 20250000 17618000 36999000 20710000 16290000 31307000 14008000 17300000 1810 5597;7789;8381;20880;23708 False;False;False;True;True 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By MS/MS 0.95087 0.94326 17.53 2 0 Median NaN NaN 0.95087 NaN NaN 0.94326 NaN NaN 17.53 0 0 2 0 0 0 Median Median Median 0 0 2.2 690340000 344820000 345520000 0 0 0 0 0 0 690340000 344820000 345520000 1814 16994 True 17138 57615;57616 72406;72407;72408 72407 Q6NXR4 Q6NXR4 4 4 4 TELO2-interacting protein 2 TTI2 sp|Q6NXR4|TTI2_HUMAN TELO2-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTI2 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 11.6 11.6 11.6 56.914 508 508 0 12.744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94515 0.97453 7.5718 14 0 Leave out requantified 1.0713 0.92721 0.88715 1.112 0.99254 0.8751 14.61 5.9762 14.522 4 5 5 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.7 11.6 11.6 525180000 262560000 262620000 135400000 64420000 70978000 207060000 104470000 102600000 182720000 93672000 89051000 1815 205;4063;9215;28304 True;True;True;True 206;4101;9300;28547 685;686;687;13851;13852;13853;30840;30841;94754;94755;94756;94757;94758;94759 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1346;12153;14858;34273;93801;123517 Q6NZI2 Q6NZI2 12 12 12 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 33.6 33.6 33.6 43.476 390 390 0 149.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9057 0.94085 5.7438 47 4 Leave out requantified 0.91255 0.83679 0.94633 0.94062 0.92741 0.91736 12.636 13.77 58.307 16 15 16 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.6 31.8 31.8 6367400000 3187600000 3179900000 2183700000 1093900000 1089700000 2262200000 1174600000 1087600000 1921600000 919020000 1002600000 1817 2203;2204;5940;7159;12553;14010;15067;19828;21846;22135;27226;27406 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2223;2224;5995;7228;12662;14134;15198;20008;22037;22330;27459;27643 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helicase DHX57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX57 PE=1 SV=2 1 6 5 5 3 4 5 3 4 4 3 4 4 5.5 4.7 4.7 155.6 1386 1386 0 11.906 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98672 0.98562 10.319 9 5 Leave out requantified NaN 0.86361 1.0578 NaN 0.94183 1.0322 NaN 31.883 19.771 1 4 4 0 2 3 Median Median Median 3.2 3.9 4.8 147770000 76250000 71523000 18503000 10056000 8446900 66550000 33408000 33142000 62720000 32786000 29935000 1818 1889;2732;4201;7360;16340;19702 True;True;True;True;False;True 1906;2757;4240;7431;16479;19882 6346;6347;6348;9150;14342;14343;14344;24701;24702;24703;55582;66461 8298;8299;8300;11987;18318;18319;18320;31334;31335;69823;83446 8300;11987;18320;31334;69823;83446 Q6P1J9 Q6P1J9 16 16 16 Parafibromin CDC73 sp|Q6P1J9|CDC73_HUMAN Parafibromin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC73 PE=1 SV=1 1 16 16 16 13 14 13 13 14 13 13 14 13 30.7 30.7 30.7 60.576 531 531 0 51.052 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96389 1.0058 19.349 46 25 Leave out requantified 0.96389 0.96744 1.1015 0.99701 1.0686 1.0949 16.408 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34764;67999 Q6P1K8;Q13888 Q6P1K8;Q13888 2;1 2;1 2;1 General transcription factor IIH subunit 2-like protein;General transcription factor IIH subunit 2 GTF2H2C;GTF2H2 sp|Q6P1K8|T2H2L_HUMAN General transcription factor IIH subunit 2-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2H2C PE=1 SV=1;sp|Q13888|TF2H2_HUMAN General transcription factor IIH subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2H2 PE=1 SV=1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 8.6 8.6 8.6 44.452 395 395;395 0.0010741 3.203 By matching By MS/MS By MS/MS 0.99206 1.0979 9.9514 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.3 2.3 8.6 116890000 58134000 58759000 35181000 18034000 17147000 38071000 19010000 19061000 43641000 21090000 22551000 1821 2230;5293 True;True 2250;5345 7495;7496;7497;18028 9778;9779;22926 9779;22926 Q6P1L8 Q6P1L8 3 3 3 39S ribosomal protein L14, mitochondrial MRPL14 sp|Q6P1L8|RM14_HUMAN 39S ribosomal protein L14, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPL14 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 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5;7143;7381;10179;14726;17367;21399;21950;22789 19;20;21;23768;23769;24544;33782;33783;33784;49786;49787;49788;58312;58313;58314;71222;71223;73099;75843 30;31;32;30186;30187;31142;42703;62592;73307;89441;89442;91735;95254 31;30186;31142;42703;62592;73307;89441;91735;95254 Q6P2Q9 Q6P2Q9 87 87 87 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 PRPF8 sp|Q6P2Q9|PRP8_HUMAN Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF8 PE=1 SV=2 1 87 87 87 81 80 77 81 80 77 81 80 77 45.6 45.6 45.6 273.6 2335 2335 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89003 0.94365 18.614 299 70 Leave out requantified 0.90544 0.87894 0.9494 0.95476 0.95543 0.9188 18.006 20.597 20.234 99 101 99 20 21 29 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 42.8 43.6 41.1 28829000000 14964000000 13865000000 9508700000 4905600000 4603100000 9908700000 5251200000 4657500000 9411700000 4807300000 4604400000 1827 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sp|Q6UVJ0|SAS6_HUMAN Spindle assembly abnormal protein 6 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SASS6 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 74.396 657 657 0 7.3104 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0236 1.0015 21.276 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 2.4 2.4 2.4 55485000 28330000 27156000 16608000 6580100 10027000 19398000 11740000 7658600 19479000 10010000 9469500 1849 1462 True 1471 4908;4909;4910 6368;6369;6370 6368 Q6UWE0 Q6UWE0 5 5 5 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 LRSAM1 sp|Q6UWE0|LRSM1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRSAM1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 5 2 2 5 2 2 5 2 8 8 8 83.593 723 723 0 6.0624 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99782 1.0519 3.1592 9 2 Leave out requantified 0.92232 0.97118 1.201 0.96148 1.0506 1.1883 12.901 9.7015 0.51309 2 5 2 0 2 0 Median Leave out requantified Median 3.5 8 3.6 231580000 110150000 121440000 55032000 29369000 25663000 111510000 54008000 57500000 65044000 26768000 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8632;87078 Q6ZUT9 Q6ZUT9 2 2 2 DENN domain-containing protein 5B DENND5B sp|Q6ZUT9|DEN5B_HUMAN DENN domain-containing protein 5B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DENND5B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1.3 1.3 1.3 145.02 1274 1274 0.0030354 2.3913 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1318 1.2308 32.695 6 0 Leave out requantified 1.205 1.2204 0.96051 1.2857 1.3428 0.94684 38.869 20.378 15.964 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 1.3 1.3 1.3 146900000 70559000 76341000 52631000 24596000 28035000 46034000 22679000 23355000 48236000 23285000 24951000 1865 15446;23645 True;True 15580;23850 52542;52543;52544;79291;79292;79293 66026;66027;66028;99692;99693;99694;99695;99696;99697 66028;99692 Q6ZVM7 Q6ZVM7 3 3 3 TOM1-like protein 2 TOM1L2 sp|Q6ZVM7|TM1L2_HUMAN TOM1-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1L2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 7.5 7.5 7.5 55.556 507 507 0.0014276 3.1424 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69109 0.76563 33.002 9 2 Leave out requantified 0.685 0.69109 0.84979 0.71989 0.76563 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transcription factor IIH subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2H5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.5 15.5 15.5 8.0533 71 71 0.0027884 2.8073 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6769 1.7952 56.343 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 1 0 Median Median Median 15.5 15.5 15.5 43948000 19407000 24541000 27954000 11767000 16187000 15994000 7639900 8353700 0 0 0 1868 10869 True 10967 36332;36333;36334 45917;45918;45919;45920 45918 Q709C8 Q709C8 13 13 13 Vacuolar protein sorting-associated protein 13C VPS13C sp|Q709C8|VP13C_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 13C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS13C PE=1 SV=1 1 13 13 13 9 8 7 9 8 7 9 8 7 4.7 4.7 4.7 422.39 3753 3753 0 27.666 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85516 0.91699 19.395 22 9 Leave out requantified 1.1164 0.69096 0.76466 1.1837 0.76549 0.74584 22.376 7.8075 25.375 8 7 7 3 1 5 Leave out requantified Leave out requantified Median 3.2 2.9 2.5 483390000 257590000 225800000 170880000 82451000 88427000 157420000 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SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRGAP1 PE=1 SV=1 2 7 7 7 4 5 7 4 5 7 4 5 7 8.3 8.3 8.3 124.26 1085 1085;1099 0 14.776 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93864 0.99843 14.128 17 8 Leave out requantified 0.93249 0.97504 1.0305 0.9828 1.0868 1.0115 47.268 14.912 27.813 4 7 6 2 4 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 4.8 6.1 8.3 280290000 133620000 146660000 81516000 32419000 49097000 99149000 51026000 48123000 99621000 50179000 49442000 1921 404;2886;7727;8239;9402;16126;25736 True;True;True;True;True;True;True 406;2911;7802;8318;9489;16264;25962 1351;1352;9712;9713;9714;9715;25882;27588;27589;27590;27591;27592;27593;31421;31422;31423;54887;54888;54889;86242 1741;12656;12657;12658;12659;32844;34908;34909;34910;34911;34912;34913;39722;39723;39724;68930;68931;108748 1741;12658;32844;34913;39722;68931;108748 Q7Z6E9 Q7Z6E9 4 4 4 E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6 RBBP6 sp|Q7Z6E9|RBBP6_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6 OS=Homo sapiens 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ribosomal protein L55, mitochondrial MRPL55 sp|Q7Z7F7|RM55_HUMAN 39S ribosomal protein L55, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPL55 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 25.8 25.8 25.8 15.128 128 128 0 7.7973 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0038 1.0695 18.56 7 1 Leave out requantified 1.1084 0.98478 0.91334 1.1679 1.0551 0.87958 21.945 13.147 33.813 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 13.3 25.8 13.3 153950000 71680000 82268000 45585000 20550000 25035000 65744000 29390000 36354000 42619000 21739000 20879000 1926 17750;18154;19993 True;True;True 17900;18315;20174 60023;60024;60025;61321;67431;67432;67433 75461;75462;75463;75464;75465;75466;77049;84626;84627 75464;77049;84626 Q7Z7K0 Q7Z7K0 2 2 2 COX assembly mitochondrial protein homolog CMC1 sp|Q7Z7K0|COXM1_HUMAN COX assembly mitochondrial protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 25.5 25.5 25.5 12.49 106 106 0 13.159 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8496 0.91347 29.123 5 4 Median NaN 0.62106 0.9462 NaN 0.68046 0.94996 NaN 42.452 5.5385 1 2 2 1 1 2 Median Median Median 9.4 25.5 16 110780000 64324000 46456000 38427000 21608000 16818000 56434000 34558000 21876000 15920000 8158000 7762000 1927 3041;5335 True;True 3068;5387 10262;10263;18141;18142;18143 13313;13314;23070;23071;23072;23073 13313;23070 Q7Z7K6 Q7Z7K6 3 3 3 Centromere protein V CENPV sp|Q7Z7K6|CENPV_HUMAN Centromere protein V OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CENPV PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13.5 13.5 13.5 29.946 275 275 0 5.3766 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.257 1.2574 20.304 7 0 Leave out requantified 0.94417 1.2168 1.487 1.0397 1.3256 1.4215 8.6966 16.122 8.6934 3 2 2 0 0 0 Median Median Median 9.8 8.7 8.7 185000000 88447000 96558000 88054000 44388000 43666000 48734000 24507000 24227000 48217000 19552000 28665000 1928 2804;9019;23108 True;True;True 2829;9103;23312 9378;9379;30181;30182;30183;77574;77575 12270;12271;38133;97474;97475 12271;38133;97475 Q86SE9 Q86SE9 1 1 1 Polycomb group RING finger protein 5 PCGF5 sp|Q86SE9|PCGF5_HUMAN Polycomb group RING finger protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCGF5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.2 6.2 6.2 29.714 256 256 0.0083574 1.8313 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0354 1.1636 28.105 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 6.2 6.2 6.2 39231000 19813000 19418000 13330000 6895700 6433800 12713000 6076100 6637300 13188000 6841000 6347000 1929 26042 True 26269 87261;87262;87263 110076;110077;110078 110077 Q86SQ0 Q86SQ0 1 1 1 Pleckstrin homology-like domain family B member 2 PHLDB2 sp|Q86SQ0|PHLB2_HUMAN Pleckstrin homology-like domain family B member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHLDB2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 142.16 1253 1253 0.0062152 2.01 By matching By MS/MS By matching 0.88518 0.88734 16.663 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.9 0.9 0.9 45065000 27156000 17909000 14145000 7639200 6506300 12985000 8594500 4390900 17934000 10923000 7011600 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1642;7100;8986;11731;16499;21017;22780;29230 True;True;True;True;True;True;True;True 1655;7169;9070;11838;16642;21203;22980;29483 5514;5515;23874;23875;23876;23877;23878;23879;23880;23881;30082;30083;39871;39872;56079;56080;56081;70630;70631;70632;70633;70634;70635;70636;76462;76463;76464;76465;76466;97769;97770;97771 7202;7203;30319;30320;30321;30322;30323;30324;30325;30326;30327;30328;30329;30330;38025;38026;49976;49977;70434;70435;70436;70437;70438;70439;88687;88688;88689;88690;88691;88692;88693;88694;88695;88696;88697;96000;96001;96002;96003;96004;96005;123652 7202;30322;38026;49977;70437;88688;96004;123652 Q86TN4 Q86TN4 1 1 1 tRNA 2-phosphotransferase 1 TRPT1 sp|Q86TN4|TRPT1_HUMAN tRNA 2-phosphotransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRPT1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.6 3.6 3.6 27.742 253 253 0.0089686 1.7873 By MS/MS By MS/MS By matching 1.219 1.1999 7.3233 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 3.6 3.6 36393000 16068000 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Kelch repeat and BTB domain-containing protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KBTBD7 PE=1 SV=1 2 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.6 1.6 1.6 76.137 674 674;684 0 4.304 By MS/MS By MS/MS 0.68501 0.69646 10.303 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 1.6 1.6 45067000 26662000 18405000 0 0 0 20964000 14064000 6899300 24103000 12598000 11506000 1951 19669 True 19848 66338;66339 83303;83304 83303 Q86VM9 Q86VM9 3 3 3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 18 ZC3H18 sp|Q86VM9|ZCH18_HUMAN Zinc finger CCCH domain-containing protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3H18 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 5.4 5.4 5.4 106.38 953 953 0.0031153 2.6786 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88834 0.91125 18.059 6 5 Median NaN 0.82824 1.1043 NaN 0.89292 1.0741 NaN 20.17 22.769 1 2 3 0 2 3 Median Median Plateau 4 2.7 5.4 142800000 78438000 64358000 31824000 16199000 15625000 46614000 25517000 21097000 64358000 36722000 27635000 1952 14066;23372;27546 True;True;True 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4463;4464;4465;10962;10963;10964;13882;13883;57167;57168;57169;72346;72347;72348;72349;72350;77887;77888;77889;79113;79114;79115;79116;79117;79118;79119;79120 5798;5799;5800;14181;14182;14183;14184;14185;17753;17754;71835;71836;71837;90841;90842;90843;90844;90845;90846;90847;90848;97881;97882;97883;97884;97885;97886;99466;99467;99468;99469;99470;99471;99472;99473;99474 5799;14184;17754;71837;90845;97881;99473 Q86WB0 Q86WB0 10 10 10 Nuclear-interacting partner of ALK ZC3HC1 sp|Q86WB0|NIPA_HUMAN Nuclear-interacting partner of ALK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HC1 PE=1 SV=1 1 10 10 10 7 9 10 7 9 10 7 9 10 26.7 26.7 26.7 55.261 502 502 0 55.184 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93935 0.9658 8.0259 31 8 Leave out requantified 0.93469 0.8782 1.0894 0.98377 0.97553 1.0802 16.168 8.4306 10.639 8 11 12 0 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.5 25.1 26.7 1036800000 527730000 509080000 250210000 125980000 124230000 361410000 192840000 168570000 425190000 208910000 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OX=9606 GN=CARM1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 3 4 5 3 4 5 3 4 5 13.2 13.2 13.2 65.853 608 608 0 22.671 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1411 1.1415 43.937 12 4 Leave out requantified 1.1865 0.72905 1.1015 1.2001 0.81422 1.0906 26.633 24.283 37.873 3 4 5 0 2 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 3.9 7.4 9.4 538540000 281350000 257180000 125370000 60884000 64488000 156060000 89519000 66542000 257110000 130950000 126150000 1966 764;1696;2888;8998;13569;16295;23349 True;True;True;True;True;True;True 767;1710;2913;9082;13690;16434;23553 2506;5679;9718;9719;30113;30114;46189;46190;46191;55439;55440;78348 3243;7396;12662;12663;38059;58046;58047;58048;69648;69649;98470 3243;7396;12662;38059;58046;69649;98470 Q86X83 Q86X83 2 2 2 COMM domain-containing protein 2 COMMD2 sp|Q86X83|COMD2_HUMAN COMM domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COMMD2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 8.5 8.5 8.5 22.745 199 199 0.0052858 2.0968 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0294 1.1206 7.7888 3 0 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371;2924;7028;7916;8534;15183;19587;24094;26062;27975 1237;1238;1239;1240;9762;9763;9764;23405;23406;23407;26310;26311;26312;28330;28331;51232;65495;65496;65497;80095;80096;80097;86589;92973;92974;92975 1595;1596;1597;1598;1599;12710;12711;12712;29746;29747;33372;33373;33374;35770;64405;64406;82246;100728;109200;117497;117498;117499;117500 1599;12712;29747;33374;35770;64405;82246;100728;109200;117498 Q86XL3 Q86XL3 5 5 5 Ankyrin repeat and LEM domain-containing protein 2 ANKLE2 sp|Q86XL3|ANKL2_HUMAN Ankyrin repeat and LEM domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKLE2 PE=1 SV=4 1 5 5 5 2 2 5 2 2 5 2 2 5 7.2 7.2 7.2 104.11 938 938 0 11.084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9115 1.0081 12.148 8 1 Leave out requantified 0.94291 0.9902 1.1017 0.99472 1.0895 1.0682 11.189 10.982 13.313 2 2 4 0 0 1 Median Median Leave out requantified 2.9 2.9 7.2 103050000 55195000 47857000 29998000 16916000 13083000 24269000 11175000 13094000 48785000 27105000 21680000 1970 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factor 2-binding protein 1 IRF2BP1 sp|Q8IU81|I2BP1_HUMAN Interferon regulatory factor 2-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IRF2BP1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 5 6 8 5 6 8 5 6 19.9 19.9 19.9 61.687 584 584 0 20.514 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89247 0.90171 26.139 19 10 Leave out requantified 1.3253 0.91049 0.89247 1.3574 0.99234 0.84064 47.673 15.734 34.928 7 5 7 4 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.9 11 15.8 471250000 250460000 220790000 172100000 88440000 83655000 146690000 83236000 63449000 152470000 78784000 73689000 1978 785;1891;9179;11789;12197;16646;18552;20560 True;True;True;True;True;True;True;True 788;1908;9263;11896;12306;16789;18722;20744 2581;2582;6355;6356;6357;30713;30714;30715;40117;40118;40119;40120;41531;56522;56523;62598;62599;62600;69220;69221;69222 3341;3342;8312;8313;8314;38816;38817;38818;38819;38820;50228;50229;50230;50231;52029;71015;71016;78708;78709;78710;78711;86893;86894;86895 3341;8314;38816;50228;52029;71016;78711;86895 Q8IU85 Q8IU85 4 4 4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D CAMK1D sp|Q8IU85|KCC1D_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK1D PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 16.6 16.6 16.6 42.913 385 385 0 14.649 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92545 0.9801 1.0447 11 6 Leave out requantified 0.86445 0.91648 0.91349 0.87601 0.99906 0.91387 113.65 1.665 21.254 5 2 4 3 1 2 Median Median Median 16.6 9.1 12.2 567340000 199530000 367810000 369010000 92236000 276780000 57384000 29945000 27439000 140950000 77354000 63591000 1979 4104;7252;15487;21222 True;True;True;True 4142;7321;15622;21408 13993;24341;24342;52689;52690;52691;52692;52693;71262;71263;71264 17882;30876;66220;66221;66222;66223;66224;89484;89485;89486 17882;30876;66222;89485 Q8IUD2;O15083 Q8IUD2 16;1 16;1 16;1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 ERC1 sp|Q8IUD2|RB6I2_HUMAN ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 OS=Homo sapiens 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315;316;14235;14236;14237;17962;17963;17964;18497;18498;21301;21302;21303;21304;21305;21306;22960;22961;22962;26851;26852;26853;35938;35939;35940;35941;35942;35943;41366;41367;51242;51243;51244;58196;58197;58198;67616;67617;67618;76402;76403;76404;76405;81643;81644;81645;81646;82870;82871;82872;84225 415;416;18179;18180;18181;22852;22853;23532;23533;27095;27096;27097;27098;27099;27100;27101;27102;29182;29183;29184;34028;34029;45433;45434;45435;45436;45437;51809;51810;64418;64419;64420;64421;64422;64423;73149;73150;73151;73152;73153;84877;84878;84879;95933;95934;95935;95936;95937;102710;102711;102712;102713;104409;104410;104411;106133 415;18180;22852;23532;27099;29184;34029;45435;51809;64419;73152;84877;95935;102711;104409;106133 Q8IUF8 Q8IUF8 3 3 3 Bifunctional lysine-specific demethylase and histidyl-hydroxylase MINA MINA sp|Q8IUF8|RIOX2_HUMAN Ribosomal oxygenase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RIOX2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 8.6 8.6 8.6 52.8 465 465 0 4.8185 By MS/MS By matching By MS/MS 0.86995 0.89009 6.5395 6 2 Leave out requantified 0.81097 NaN 1.0758 0.83269 NaN 1.0692 7.5764 NaN 56.333 2 1 3 0 0 2 Median Median Median 6.5 4.3 8.6 148940000 73962000 74979000 60763000 32167000 28596000 27224000 11729000 15495000 60955000 30066000 30889000 1981 3698;8566;17726 True;True;True 3735;8646;17876 12545;12546;12547;28697;59954;59955 16201;16202;36257;75378 16201;36257;75378 Q8IUR0 Q8IUR0 3 3 3 Trafficking protein particle complex subunit 5 TRAPPC5 sp|Q8IUR0|TPPC5_HUMAN Trafficking protein particle complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC5 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 18.1 18.1 18.1 20.783 188 188 0 5.6503 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98715 1.0582 5.795 14 6 Leave out requantified 1.0434 0.8889 1.0474 1.1124 0.97362 1.0405 10.78 17.654 10.402 5 5 4 2 3 1 Median Median Median 18.1 18.1 18.1 427790000 203390000 224400000 150830000 70988000 79846000 147930000 79192000 68743000 129020000 53214000 75807000 1982 5073;6941;26943 True;True;True 5122;7010;27173 17284;17285;17286;17287;17288;17289;23351;23352;23353;23354;23355;90341;90342;90343 21963;21964;21965;21966;21967;21968;29685;29686;29687;29688;29689;114058;114059;114060;114061;114062;114063 21965;29686;114062 Q8IV38 Q8IV38 2 2 2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 ANKMY2 sp|Q8IV38|ANKY2_HUMAN Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKMY2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 7.5 7.5 7.5 49.298 441 441 0.0030344 2.3899 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 2.5 5 14806000 8621300 6184500 0 0 0 6184500 0 6184500 8621300 8621300 0 1983 14786;18481 True;True 14916;18651 50386;62378 63350;78420 63350;78420 Q8IV48 Q8IV48 4 4 4 3-5 exoribonuclease 1 ERI1 sp|Q8IV48|ERI1_HUMAN 3-5 exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 11.7 11.7 11.7 40.063 349 349 0 37.507 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9856 1.0041 32.851 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36031;86885;113130 Q8IVT2 Q8IVT2 3 3 3 Mitotic interactor and substrate of PLK1 MISP sp|Q8IVT2|MISP_HUMAN Mitotic interactor and substrate of PLK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MISP PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 1 2 1 1 2 1 1 5.4 5.4 5.4 75.356 679 679 0 10.631 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78873 0.77446 114.12 4 4 Median 0.82732 NaN NaN 0.85 NaN NaN 139.55 NaN NaN 3 0 1 3 0 1 Median Median Median 4.3 1.2 1.2 76442000 50367000 26075000 58741000 39286000 19455000 0 0 0 17701000 11082000 6619400 1991 2152;3900;11447 True;True;True 2170;3938;11551 7212;7213;13278;13279;38695;38696 9413;9414;17076;17077;48595;48596 9414;17077;48595 Q8IVV2 Q8IVV2 1 1 1 Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 LOXHD1 sp|Q8IVV2|LOXH1_HUMAN Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LOXHD1 PE=2 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.4 0.4 0.4 235.67 2067 2067 0.008983 1.797 By matching By MS/MS By MS/MS 0.81029 0.83438 16.443 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 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division cycle and apoptosis regulator protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCAR1 PE=1 SV=2 1 21 21 21 17 19 17 17 19 17 17 19 17 22.8 22.8 22.8 132.82 1150 1150 0 94.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92882 0.98446 28.174 59 17 Leave out requantified 0.91243 0.89568 0.96848 0.98511 1.0018 0.90646 10.509 23.559 31.041 20 20 19 6 6 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 20.5 20.3 4196700000 2197000000 1999700000 1499900000 770630000 729310000 1399800000 761020000 638770000 1297000000 665390000 631610000 2001 4224;5069;6182;8708;9906;16115;16867;17255;19249;21725;22041;22713;22714;22792;24561;25152;26219;27175;27230;28658;29104 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4263;5118;6240;8789;9997;16253;17010;17399;19423;21915;22235;22913;22914;22992;24777;25371;26446;27407;27463;28905;29356 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ATP-dependent RNA helicase DHX40 DHX40 sp|Q8IX18|DHX40_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX40 PE=1 SV=2 1 7 7 7 7 2 5 7 2 5 7 2 5 10.1 10.1 10.1 88.559 779 779 0 19.648 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96228 0.949 34.092 12 6 Leave out requantified 0.92421 0.79835 0.6882 0.96551 0.86418 0.69165 34.373 53.585 79.717 6 2 4 3 1 2 Leave out requantified Median Median 10.1 2.7 7.3 223650000 120150000 103500000 113520000 57026000 56490000 36547000 20327000 16220000 73582000 42797000 30785000 2002 2866;4380;8754;15349;15816;20727;25280 True;True;True;True;True;True;True 2891;4422;8835;15481;15952;20911;25499 9615;9616;9617;14957;14958;29291;29292;52230;53849;69737;69738;69739;84726;84727;84728 12555;12556;12557;19110;19111;36993;36994;65639;67623;87542;87543;87544;106756;106757 12557;19110;36993;65639;67623;87542;106756 Q8IX90 Q8IX90 1 1 1 Spindle and kinetochore-associated protein 3 SKA3 sp|Q8IX90|SKA3_HUMAN Spindle and kinetochore-associated protein 3 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0097 1 29.968 7 1 Median 1.0716 0.93069 1.0107 1.0985 1 1.0044 17.011 47.047 3.5236 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 1.7 3.6 1.7 1983400000 1006800000 976590000 582830000 295850000 286980000 586160000 302450000 283710000 814410000 408520000 405890000 2008 4614;5615 True;True 4659;5669 15724;19093;19094;19095;19096;19097;19098 20060;24276;24277;24278;24279 20060;24278 Q8IY18 Q8IY18 2 2 2 Structural maintenance of chromosomes protein 5 SMC5 sp|Q8IY18|SMC5_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC5 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2.1 2.1 2.1 128.81 1101 1101 0.0043175 2.1831 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0638 1.0975 22.683 4 0 Leave out requantified NaN NaN 1.0638 NaN NaN 1.0203 NaN NaN 32.999 1 1 2 0 0 0 Median Median Median 0.9 0.9 2.1 65546000 31573000 33973000 13399000 6592400 6807000 14329000 7346200 6982500 37818000 17635000 20184000 2009 17269;17611 True;True 17413;17760 58459;59615;59616;59617 73491;74975;74976 73491;74976 Q8IY37 Q8IY37 12 12 12 Probable ATP-dependent RNA helicase DHX37 DHX37 sp|Q8IY37|DHX37_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX37 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX37 PE=1 SV=1 1 12 12 12 8 8 7 8 8 7 8 8 7 12.4 12.4 12.4 129.54 1157 1157 0 24.595 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7904 0.82459 62.212 22 7 Leave out requantified 0.89013 0.64451 0.87768 0.90216 0.70102 0.85169 33.981 56.504 47.563 8 7 7 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.6 8.2 6.3 535980000 275160000 260820000 220560000 106320000 114230000 149630000 94496000 55138000 165790000 74338000 91449000 2010 6226;6431;8373;17078;20196;21544;21748;25066;26196;27522;27842;28453 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6285;6493;8452;17222;20380;21734;21938;25284;26423;27759;28081;28699 21084;21085;21805;21806;28031;28032;28033;57862;68086;68087;68088;72387;72388;73067;73068;73069;84049;87829;87830;92268;92269;93304;95196 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1511;1763;2787;9544;10013;10210;11099;16809;21545;22014;22346;23089;25138;27827 5042;5043;5044;5045;5848;9240;9241;9242;31599;31600;31601;33248;33869;33870;33871;36792;36793;36794;56589;56590;71700;71701;73329;73330;73331;74336;74337;74338;74339;74340;74341;76834;76835;76836;76837;76838;76839;83606;83607;83608;92490 6559;6560;6561;6562;6563;6564;6565;6566;7614;12090;12091;12092;12093;12094;39969;39970;42056;42809;42810;42811;42812;42813;42814;46496;46497;46498;46499;46500;46501;71102;71103;71104;71105;90059;90060;90061;92045;92046;93283;93284;93285;93286;93287;93288;93289;96448;96449;96450;96451;105356;105357;116881 6564;7614;12094;39970;42056;42813;46499;71104;90061;92046;93286;96451;105357;116881 Q8IY81 Q8IY81 22 22 22 pre-rRNA processing protein FTSJ3 FTSJ3 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA processing protein FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 PE=1 SV=2 1 22 22 22 18 18 19 18 18 19 18 18 19 35.2 35.2 35.2 96.557 847 847 0 108.53 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97585 1.0309 20.618 58 18 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587;588;589;1515;1516;1517;1679;6319;6320;6321;6322;6323;6324;6801;6802;6803;8245;8246;32588;32589;35727;35728;35729;35730;35731;37472;37473;37474;40035;43467;43468;46543;46544;46545;48822;48823;48824;58493;58494;58495;70107;70108;70109;70367;70368;70369;73194;73195;73196;73197;73198;81026;81027;81028;84914;84915;84916;97279;97280;97281 773;774;775;776;1954;1955;1956;2159;8271;8272;8273;8274;8275;8276;8277;8278;8904;8905;8906;8907;10793;10794;41227;41228;45151;45152;45153;45154;45155;45156;45157;45158;47261;47262;47263;50148;54531;54532;54533;58496;58497;58498;61337;73537;73538;73539;73540;88016;88017;88018;88019;88347;88348;88349;88350;88351;88352;88353;91861;91862;91863;91864;91865;91866;101953;101954;101955;107011;107012;107013;107014;107015;107016;123017;123018 775;1954;2159;8271;8277;8906;10794;41227;45158;47261;47263;50148;54533;58498;61337;73537;88018;88350;91864;101953;107011;123017 Q8IYB3 Q8IYB3 11 11 11 Serine/arginine repetitive matrix protein 1 SRRM1 sp|Q8IYB3|SRRM1_HUMAN Serine/arginine repetitive matrix protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRM1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 10 11 11 10 11 11 10 11 11 15.9 15.9 15.9 102.33 904 904 0 50.744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0139 1.0543 6.5905 55 19 Leave out requantified 1.0421 0.93171 1.0714 1.0845 0.99691 1.0116 9.8057 10.477 14.889 19 18 18 8 5 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.7 15.9 15.9 7745800000 4132000000 3613800000 2795300000 1516000000 1279300000 2600400000 1418500000 1181900000 2350100000 1197500000 1152600000 2013 2308;6976;7786;11621;13805;14224;17794;21062;26781;27303;27390 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2329;7045;7862;11727;13929;14349;17944;17945;21248;27011;27540;27627 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Stromal membrane-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMAP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 5.4 5.4 5.4 50.386 467 467 0 9.9407 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1901 1.25 57.349 4 1 Median NaN 0.68974 NaN NaN 0.74936 NaN NaN 82.769 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 2.6 5.4 2.6 201130000 103060000 98072000 40553000 17723000 22830000 106600000 63508000 43091000 53981000 21831000 32151000 2014 16345;21531 True;True 16484;21721 55595;55596;55597;72342 69834;69835;69836;69837;69838;69839;90834 69839;90834 Q8IYB8 Q8IYB8 6 6 6 ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial SUPV3L1 sp|Q8IYB8|SUV3_HUMAN ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUPV3L1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 3 3 3 3 3 3 3 3 10.7 10.7 10.7 87.99 786 786 0 11.185 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.101 1.1361 26.126 11 4 Leave out requantified 0.88482 1.0807 1.2307 0.94447 1.2091 1.1942 42.109 26.597 26.529 3 4 4 0 3 1 Median Median Median 4.8 5.2 4.6 858970000 431690000 427280000 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carboxyl-terminal domain of ezrin SCYL3 sp|Q8IZE3|PACE1_HUMAN Protein-associating with the carboxyl-terminal domain of ezrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCYL3 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1.3 1.3 1.3 82.857 742 742 0.0043146 2.1783 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 1.3 0 6440400 2974700 3465700 0 0 0 6440400 2974700 3465700 0 0 0 2019 22108 True 22303 74215 93133 93133 Q8IZL8 Q8IZL8 3 3 3 Proline-, glutamic acid- and leucine-rich protein 1 PELP1 sp|Q8IZL8|PELP1_HUMAN Proline-, glutamic acid- and leucine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PELP1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 4 4 4 119.7 1130 1130 0 7.1365 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0893 1.1618 18.062 6 1 Leave out requantified 1.0776 0.85995 1.2613 1.1224 0.96511 1.2554 37.02 6.7539 8.5209 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 2.6 4 2.6 185870000 86022000 99850000 56163000 23633000 32530000 67906000 34577000 33329000 61803000 27813000 33990000 2020 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5849;5850;5851;5852;5853;5854;53372;53373;53374;60352;60353;60354;76418;76419;76420;76421;76422;76423;76424;76425;109054;109055;109056;109057;109058;109059;109060;109061;109062;109063;109064;109065;109066;109067 5852;53372;60353;76423;109054;109065 Q8IZQ5 Q8IZQ5 1 1 1 Selenoprotein H SELH sp|Q8IZQ5|SELH_HUMAN Selenoprotein H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SELENOH PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.4 7.4 7.4 13.453 122 122 0.0027933 2.8175 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77153 0.80161 14.107 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 7.4 7.4 7.4 142970000 84626000 58348000 50360000 26570000 23790000 48562000 32800000 15761000 44052000 25255000 18797000 2022 14836 True 14966 50552;50553;50554 63558;63559;63560 63558 Q8N0X7 Q8N0X7 11 11 11 Spartin SPG20 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN Spartin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPART PE=1 SV=1 1 11 11 11 11 10 8 11 10 8 11 10 8 23.4 23.4 23.4 72.832 666 666 0 74.52 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0418 1.0855 25.099 34 11 Leave 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2026;2870;12515;20625;28404;29516;42149;56337;101126;106423;117136 Q8N122 Q8N122 5 5 5 Regulatory-associated protein of mTOR RPTOR sp|Q8N122|RPTOR_HUMAN Regulatory-associated protein of mTOR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPTOR PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 5.4 5.4 5.4 149.04 1335 1335 0 17.39 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8533 0.96131 20.129 11 5 Leave out requantified 0.85831 0.8533 1.1266 0.90257 0.96131 1.1147 21.51 17.626 14.229 3 5 3 2 2 1 Median Leave out requantified Median 4.4 5.4 4.4 243680000 119020000 124670000 70462000 31848000 38615000 103070000 57444000 45629000 70149000 29727000 40422000 2024 1284;10341;22662;23808;27449 True;True;True;True;True 1293;10435;22862;24013;27686 4326;4327;4328;34605;34606;34607;76094;79830;79831;79832;92046;92047;92048 5632;5633;5634;43726;43727;43728;95560;100400;100401;100402;116291;116292 5634;43727;95560;100400;116292 Q8N163 Q8N163 24 24 24 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 CCAR2 sp|Q8N163|CCAR2_HUMAN Cell cycle and apoptosis 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requantified Leave out requantified Median 14.3 12.3 12.3 324310000 177750000 146560000 107660000 59456000 48202000 96247000 55344000 40903000 120410000 62952000 57454000 2047 647;4910;12261;27609;29135 True;True;True;True;True 649;4958;12370;27847;29387 2140;16755;16756;16757;41764;41765;41766;41767;92549;92550;92551;97479;97480 2737;21280;21281;21282;21283;52325;52326;52327;52328;52329;116947;116948;123277;123278 2737;21281;52326;116947;123278 Q8N726 Q8N726 1 1 1 Tumor suppressor ARF CDKN2A sp|Q8N726|ARF_HUMAN Tumor suppressor ARF OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDKN2A PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.1 12.1 12.1 13.903 132 132 0.0027778 2.7355 By MS/MS By matching By MS/MS 0.83263 0.85231 10.896 4 2 Linear 0.68437 NaN NaN 0.71499 NaN NaN 1.2317 NaN NaN 2 1 1 2 0 0 Median Median Median 12.1 12.1 12.1 146910000 80108000 66807000 52943000 30720000 22222000 44506000 23907000 20599000 49466000 25480000 23986000 2048 2975 True 3002 10038;10039;10040;10041 13030;13031;13032 13032 Q8N7H5 Q8N7H5 11 11 11 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog PAF1 sp|Q8N7H5|PAF1_HUMAN RNA polymerase II-associated factor 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAF1 PE=1 SV=2 1 11 11 11 10 10 6 10 10 6 10 10 6 23.9 23.9 23.9 59.975 531 531 0 53.506 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0583 1.1378 24.922 32 19 Leave out requantified 1.1064 0.98871 1.1228 1.1507 1.0861 1.1144 13.082 31.406 24.087 12 12 8 7 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.5 22.2 14.5 954310000 512920000 441400000 352130000 178490000 173640000 334040000 186960000 147080000 268140000 147470000 120670000 2049 880;4652;5817;8272;10994;12069;18521;20898;20899;27792;28385 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 884;4697;5872;8351;11093;12177;18691;21083;21084;28030;28630 2940;2941;2942;15834;19732;19733;19734;27708;27709;27710;36768;36769;41098;41099;41100;41101;41102;41103;62496;70274;70275;70276;70277;70278;70279;93130;93131;93132;94991;94992;94993;94994;94995;94996;94997 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C12orf29 C12orf29 sp|Q8N999|CL029_HUMAN Uncharacterized protein C12orf29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C12orf29 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 37.49 325 325 0.0068538 1.9716 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9486 1.0161 9.0183 6 0 Median 0.95537 0.937 0.9977 1.0113 1.0421 0.98368 15.588 7.5592 8.5565 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 3.1 3.1 3.1 752450000 394150000 358300000 235250000 126580000 108670000 253130000 133230000 119900000 264070000 134340000 129730000 2051 26843 True 27073 90010;90011;90012;90013;90014;90015 113624;113625;113626;113627;113628 113626 Q8N9N2 Q8N9N2 2 2 2 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 ASCC1 sp|Q8N9N2|ASCC1_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6.2 6.2 6.2 45.509 400 400 0.00072674 3.4507 By MS/MS By MS/MS By matching 0.94558 1.0236 11.084 4 1 Median 0.87326 NaN NaN 0.91917 NaN NaN 13.253 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 6.2 4 4 80211000 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33002;50554;85670;110024 Q8NBT2 Q8NBT2 5 5 5 Kinetochore protein Spc24 SPC24 sp|Q8NBT2|SPC24_HUMAN Kinetochore protein Spc24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPC24 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 48.2 48.2 48.2 22.478 197 197 0 26.782 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94991 1.0123 23.038 17 8 Leave out requantified 0.94991 0.93039 0.92495 1.0123 1.0185 0.89312 21.23 9.6926 16.46 6 5 6 2 2 4 Leave out requantified Median Median 48.2 35.5 35.5 959590000 494080000 465510000 312560000 175590000 136970000 309040000 150660000 158380000 337990000 167830000 170160000 2062 7101;7472;9812;12240;15988 True;True;True;True;True 7170;7545;9902;12349;16126 23882;23883;23884;23885;25058;32848;32849;32850;32851;32852;32853;41689;41690;41691;54413;54414;54415 30331;30332;30333;30334;31798;41540;41541;41542;41543;41544;41545;41546;41547;41548;41549;41550;52233;52234;52235;52236;68327;68328;68329;68330;68331;68332 30331;31798;41545;52233;68332 Q8NC51 Q8NC51 15 15 15 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding 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Protein SMG8 SMG8 sp|Q8ND04|SMG8_HUMAN Protein SMG8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMG8 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5.5 5.5 5.5 109.68 991 991 0 5.3765 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95897 0.94647 18.99 5 2 Leave out requantified 1.1624 NaN 1.0687 1.2282 NaN 1.0249 47.639 NaN 11.257 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 3.2 3.5 3.6 305760000 140110000 165660000 222880000 106950000 115920000 27290000 12567000 14722000 55598000 20588000 35010000 2067 8743;11580;16831;24110 True;True;True;True 8824;11684;16974;24320 29255;39256;57100;80874;80875;80876;80877 36947;49261;71755;101766;101767;101768;101769 36947;49261;71755;101769 Q8ND24 Q8ND24 1 1 1 RING finger protein 214 RNF214 sp|Q8ND24|RN214_HUMAN RING finger protein 214 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF214 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2 2 2 77.667 703 703 0.0059036 2.023 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2068 23865 True 24071 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Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 PIK3C3 sp|Q8NEB9|PK3C3_HUMAN Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIK3C3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 6.2 6.2 6.2 101.55 887 887 0 9.702 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85983 0.91794 11.886 10 1 Leave out requantified 0.77536 0.84509 1.0005 0.82313 0.93094 0.99501 25.861 14.102 4.0185 3 4 3 1 0 0 Median Leave out requantified Median 2.6 5.3 5.3 186550000 102100000 84449000 99947000 59404000 40543000 48148000 25116000 23032000 38453000 17579000 20874000 2072 18284;22238;28071;29211 True;True;True;True 18450;22435;28314;29463 61744;61745;61746;74645;74646;74647;74648;74649;74650;94060;94061;97692 77590;77591;77592;93708;93709;93710;93711;93712;93713;118935;118936;123540 77592;93708;118935;123540 Q8NEC7 Q8NEC7 3 3 3 Glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein GSTCD sp|Q8NEC7|GSTCD_HUMAN Glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein OS=Homo sapiens 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Q8WVM0 2 2 2 Dimethyladenosine transferase 1, mitochondrial TFB1M sp|Q8WVM0|TFB1M_HUMAN Dimethyladenosine transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFB1M PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6.4 6.4 6.4 39.542 346 346 0.0092181 1.754 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0045 1.0553 4.4727 4 0 Leave out requantified 1.0045 NaN NaN 1.0553 NaN NaN 4.4727 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.4 2.9 2.9 59884000 31235000 28649000 27831000 15269000 12562000 15540000 7807700 7732500 16513000 8158400 8355000 2131 13519;17216 True;True 13639;17360 46022;46023;46024;58298 57830;57831;57832;73295 57831;73295 Q8WVM8 Q8WVM8 4 4 4 Sec1 family domain-containing protein 1 SCFD1 sp|Q8WVM8|SCFD1_HUMAN Sec1 family domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCFD1 PE=1 SV=4 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 7.6 7.6 7.6 72.379 642 642 0 9.0628 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94254 0.96376 15.608 8 1 Leave out requantified 0.91591 0.87012 1.1487 0.96376 0.95625 1.1852 21.218 25.488 62.695 3 2 3 0 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4732;13434;16558;19889;20313;24037;24133;27685 True;True;False;True;True;True;True;True 4778;13553;16701;20070;20497;24246;24343;27923 16122;16123;45731;45732;45733;56244;56245;67103;67104;67105;68426;68427;68428;80620;80621;80622;80942;92806;92807;92808 20531;20532;57431;57432;57433;57434;57435;57436;70643;70644;84218;84219;84220;84221;84222;85885;85886;101418;101419;101420;101421;101422;101844;117273;117274 20532;57431;70644;84218;85885;101419;101844;117273 Q8WVY7 Q8WVY7 2 2 2 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 UBLCP1 sp|Q8WVY7|UBCP1_HUMAN Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBLCP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 7.5 7.5 7.5 36.804 318 318 0.0010764 3.2272 By MS/MS By matching By MS/MS 0.93823 1.0143 5.2369 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.1 3.1 7.5 84469000 44352000 40118000 25544000 13740000 11804000 33192000 17621000 15570000 25734000 12990000 12744000 2134 10059;14626 True;True 10150;14756 33692;49912;49913;49914 42597;62763 42597;62763 Q8WW01 Q8WW01 1 1 1 tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15 TSEN15 sp|Q8WW01|SEN15_HUMAN tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSEN15 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.5 10.5 10.5 18.641 171 171 0 7.9324 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93805 0.96475 6.1607 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 10.5 10.5 10.5 52997000 26099000 26898000 16448000 8010500 8437200 18615000 7842100 10773000 17933000 10246000 7687400 2135 9269 True 9355 30999;31000;31001 39171;39172;39173;39174;39175;39176 39176 Q8WW12 Q8WW12 2 2 2 PEST proteolytic signal-containing nuclear protein PCNP sp|Q8WW12|PCNP_HUMAN PEST proteolytic signal-containing nuclear protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCNP PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 17.4 17.4 17.4 18.925 178 178 0.0010776 3.2314 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94791 1.0253 0.21857 4 0 Leave out requantified NaN 0.83303 NaN NaN 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2145;10491;10492;10493;10494;10495;23898;23899;23900;30520;30521;30522;45200;45201;62546;62547;62548;62549;63691;63692;63693;63694;63695;65353;65354;65355;65356;70101;70102;70103;71920;72335;72336;72337;72384;72385;72386;72432;72433;72434;72921;72922;72923;76913;76914;76915;78960;78961;80931;80932;80933;84085;84086;84884;84885;84886 2744;13600;13601;13602;13603;13604;13605;13606;13607;13608;30350;30351;30352;30353;30354;30355;38575;38576;38577;56755;78635;78636;78637;78638;80072;80073;80074;80075;80076;82072;82073;82074;82075;82076;88008;88009;88010;90338;90826;90827;90828;90829;90830;90898;90957;90958;90959;91520;91521;96544;96545;96546;99258;99259;101833;101834;101835;105942;105943;106971;106972 2744;13605;30353;38577;56755;78636;80074;82076;88010;90338;90826;90898;90959;91521;96544;99258;101834;105942;106972 Q8WWM7 Q8WWM7 8 8 8 Ataxin-2-like protein ATXN2L sp|Q8WWM7|ATX2L_HUMAN Ataxin-2-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATXN2L PE=1 SV=2 1 8 8 8 7 5 6 7 5 6 7 5 6 10.5 10.5 10.5 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Q92625 3 3 3 Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A ANKS1A sp|Q92625|ANS1A_HUMAN Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKS1A PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 2 2 3.6 3.6 3.6 123.11 1134 1134 0 4.6862 By matching By MS/MS By MS/MS 0.8443 0.86759 9.2466 4 1 Median NaN NaN 0.84369 NaN NaN 0.8268 NaN NaN 10.778 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 1.9 2.9 2.6 45572000 24578000 20993000 9727100 5404000 4323000 17704000 10179000 7524600 18141000 8995000 9145600 2182 4915;22008;22313 True;True;True 4963;22202;22511 16771;73925;74875;74876;74877 21296;92775;94003;94004 21296;92775;94003 Q92626 Q92626 2 2 2 Peroxidasin homolog PXDN sp|Q92626|PXDN_HUMAN Peroxidasin homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PXDN PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1.9 1.9 1.9 165.27 1479 1479 0.00036496 3.5195 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93169 0.99236 31.386 4 1 Median NaN 0.93696 NaN NaN 1.0083 NaN NaN 20.634 NaN 1 2 1 1 0 0 Median Median Median 1.1 1.9 1.1 94440000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93841 0.94881 16.588 7 1 Leave out requantified 1.1797 0.75283 NaN 1.2781 0.81176 NaN 2.1759 13.146 NaN 2 4 1 0 1 0 Median Leave out requantified Median 4.5 7.2 2.9 125010000 61146000 63860000 34471000 16516000 17955000 62465000 32737000 29728000 28070000 11894000 16176000 2185 13638;14198;19499;24213;26008 True;True;True;True;True 13759;14323;19675;24424;26235 46414;46415;46416;48414;48415;65778;81194;81195;87158 58343;58344;58345;60834;82607;82608;102183;102184;109956 58343;60834;82607;102184;109956 Q92688;P39687 Q92688 5;1 5;1 5;1 Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B ANP32B sp|Q92688|AN32B_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32B PE=1 SV=1 2 5 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 22.3 22.3 22.3 28.787 251 251;249 0 156.09 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86477 0.87915 26.589 13 1 Leave out requantified 0.57453 0.73795 0.91591 0.5883 0.80141 0.89166 30.396 26.008 21.555 4 4 5 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.3 22.3 19.1 893600000 491390000 402210000 295550000 171260000 124280000 314360000 175430000 138930000 283700000 144700000 139000000 2186 6702;12280;14000;16656;22562 True;True;True;True;True 6765;12389;14124;16799;22761 22622;22623;22624;41824;41825;41826;41827;47728;47729;56558;56559;56560;75748;75749;75750 28775;28776;28777;28778;28779;52400;52401;52402;52403;59966;59967;71058;71059;71060;71061;71062;95136;95137;95138;95139 28777;52401;59967;71061;95137 Q92747 Q92747 6 6 6 Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A ARPC1A sp|Q92747|ARC1A_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC1A PE=2 SV=2 1 6 6 6 4 3 6 4 3 6 4 3 6 26.2 26.2 26.2 41.569 370 370 0 8.9758 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83117 0.83444 18.218 12 3 Leave out requantified 0.8536 0.70022 0.94562 0.89703 0.76813 0.93569 80.678 15.864 40.221 4 3 5 2 0 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 18.1 12.7 26.2 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MS/MS 1.0281 1.0833 6.469 10 5 Leave out requantified 0.95329 1.0339 1.1504 1.0233 1.1468 1.1278 10.447 38.446 14.566 4 3 3 1 2 2 Leave out requantified Median Median 14.6 14.6 8.8 417270000 184660000 232610000 161980000 74244000 87738000 156180000 69180000 87000000 99105000 41236000 57869000 2224 5551;14835;22297 True;True;True 5605;14965;22495 18872;18873;18874;50547;50548;50549;50550;50551;74822;74823 24002;24003;24004;24005;63554;63555;63556;63557;93935 24005;63555;93935 Q969H6 Q969H6 1 1 1 Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 POP5 sp|Q969H6|POP5_HUMAN Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POP5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 7.4 7.4 7.4 18.819 163 163 0.0010811 3.2748 By MS/MS By MS/MS 1.0422 1.0318 3.8678 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 7.4 0 7.4 83656000 36494000 47162000 34610000 16530000 18081000 0 0 0 49046000 19965000 29081000 2225 28775 True 29022 96273;96274 121680;121681 121680 Q969M3 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13 13 11 Far upstream element-binding protein 1 FUBP1 sp|Q96AE4|FUBP1_HUMAN Far upstream element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FUBP1 PE=1 SV=3 1 13 13 11 10 10 11 10 10 11 9 9 9 24.2 24.2 22 67.56 644 644 0 33.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92015 1.0038 25.202 35 13 Leave out requantified 0.76676 0.97862 1.1459 0.80497 1.0698 1.1143 25.219 20.368 19.487 12 11 12 4 3 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.3 20.2 20.3 1146700000 644280000 502440000 366280000 204470000 161810000 360530000 214920000 145610000 419910000 224890000 195020000 2236 824;2567;3007;6810;11922;12380;12383;13154;13160;18487;21510;21754;24385 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 828;2590;3034;6878;12030;12489;12492;13271;13277;18657;21700;21944;24597 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requantified Leave out requantified 35.2 35.2 35.2 10669000000 5506500000 5162800000 3700900000 1900900000 1800000000 3439600000 1808600000 1631000000 3528800000 1797000000 1731800000 2237 2240;3934;4374;6299;16921;17392;17548;17617;25841 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2260;3972;4416;6360;17065;17538;17695;17766;26067 7522;7523;7524;13393;13394;13395;13396;13397;13398;13399;13400;13401;14940;14941;14942;21355;21356;21357;57387;57388;57389;58859;58860;58861;58862;58863;58864;58865;58866;59386;59387;59388;59389;59390;59391;59632;59633;59634;59635;59636;59637;86600;86601;86602;86603 9811;9812;9813;17220;17221;17222;17223;17224;17225;17226;17227;17228;19086;19087;19088;19089;19090;27169;27170;27171;27172;27173;72116;72117;74001;74002;74003;74004;74005;74006;74007;74008;74009;74658;74659;74660;74661;74662;74663;74664;74665;74992;74993;74994;74995;74996;74997;109212;109213;109214;109215;109216;109217 9813;17220;19089;27171;72117;74005;74663;74992;109213 Q96AX1 Q96AX1 4 4 4 Vacuolar protein sorting-associated protein 33A VPS33A sp|Q96AX1|VP33A_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS33A PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 6.4 6.4 6.4 67.61 596 596 0 9.7555 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3156 1.416 84.697 9 5 Leave out requantified 2.4673 0.85947 0.52449 2.5776 0.95094 0.5281 84.161 83.438 75.677 2 3 4 0 2 3 Median Median Median 5.2 5.2 6.4 720310000 370720000 349590000 27201000 6679900 20522000 37729000 24326000 13402000 655380000 339710000 315670000 2238 812;3500;4078;22357 True;True;True;True 815;3533;4116;22555 2669;2670;2671;11836;11837;11838;13891;13892;13893;75036;75037 3446;3447;3448;15331;15332;15333;15334;17763;17764;17765;94206;94207 3446;15332;17764;94206 Q96AY3 Q96AY3 15 15 15 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP10 FKBP10 sp|Q96AY3|FKB10_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FKBP10 PE=1 SV=1 1 15 15 15 13 14 15 13 14 15 13 14 15 32 32 32 64.244 582 582 0 69.628 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3124;3125;9263;9264;9265;14412;14413;14414;14415;14416;19341;19342;19343;19344;23297;23298;23299;23300;23301;23302;32336;32337;32338;42767;42768;42769;43201;43202;43203;43204;43205;53647;53648;53649;53650;53651;53652;70075;70076;70077;70078;70079;78476;82973;82974;82975;86995;86996;86997;86998;86999;87000;87001;87002;103678;103679;103680;103681;112796;112797;112798;112799;112800;112801 3124;9264;14414;19341;23298;32337;42769;43204;53649;70076;78476;82975;87001;103681;112801 Q96B26 Q96B26 3 3 3 Exosome complex component RRP43 EXOSC8 sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN Exosome complex component RRP43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC8 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 15.6 15.6 15.6 30.039 276 276 0 13.258 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72652 0.75455 13.006 9 3 Leave out requantified 0.68982 0.72652 0.75544 0.7265 0.80718 0.76787 11.014 11.942 25.336 4 2 3 2 0 1 Median Median Plateau 15.6 8.7 15.6 300020000 173200000 126820000 124860000 72065000 52793000 77814000 49351000 28463000 97348000 51781000 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118;119;120;121;122;123;4222;20619;20620;20621;20622;20623;20624;28195;30761;49836;50339;50340;73239;73240;85929;85930;85931;119203;119204;119205;119206 119;4222;20623;28195;30761;49836;50340;73239;85929;119205 Q96BR5 Q96BR5 4 4 4 Cytochrome c oxidase assembly factor 7 COA7 sp|Q96BR5|COA7_HUMAN Cytochrome c oxidase assembly factor 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COA7 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 16.5 16.5 16.5 25.709 231 231 0 10.183 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98185 1.0197 15.746 9 0 Leave out requantified 1.06 0.79553 1.0694 1.1166 0.8823 1.0197 10.843 15.678 4.3918 3 4 2 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 13 16.5 13 458390000 238020000 220360000 120530000 59301000 61231000 232820000 125920000 106900000 105030000 52801000 52230000 2246 3401;8498;9647;15280 True;True;True;True 3432;8578;9735;15411 11504;11505;11506;28486;28487;28488;32231;51949;51950;51951 14917;14918;35972;35973;35974;40796;65274 14918;35974;40796;65274 Q96C01 Q96C01 3 3 3 Protein FAM136A FAM136A sp|Q96C01|F136A_HUMAN Protein FAM136A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM136A PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 30.4 30.4 30.4 15.641 138 138 0 7.7532 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7733 0.80005 9.8031 7 3 Leave out requantified 0.69327 0.55495 1.2339 0.7168 0.59164 1.23 62.193 41.34 25.676 3 2 2 1 1 1 Median Median Median 30.4 23.2 20.3 106660000 53366000 53289000 47904000 23651000 24254000 19426000 11270000 8155300 39325000 18445000 20880000 2247 2817;3033;27457 True;True;True 2842;3060;27694 9427;9428;9429;10236;10237;92066;92067 12325;12326;12327;13275;116315;116316 12326;13275;116316 Q96C19;Q9BUP0 Q96C19 3;1 3;1 3;1 EF-hand domain-containing protein D2 EFHD2 sp|Q96C19|EFHD2_HUMAN EF-hand domain-containing protein D2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFHD2 PE=1 SV=1 2 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 15.4 15.4 15.4 26.697 240 240;239 0 8.142 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 11.2 10.4 5 12789000 5949000 6840300 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ribonucleoprotein 40 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRNP40 PE=1 SV=1 1 15 15 15 13 14 15 13 14 15 13 14 15 66.9 66.9 66.9 39.31 357 357 0 161.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90209 0.94368 7.5281 49 18 Leave out requantified 0.90606 0.84308 0.94668 0.9691 0.93649 0.92074 13.345 8.067 10.577 14 18 17 3 9 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 52.4 59.1 66.9 4039400000 2076700000 1962700000 1357900000 690760000 667120000 1258700000 653160000 605520000 1422800000 732750000 690050000 2262 3066;3081;8183;8913;9713;9748;9754;10400;11160;12304;13875;16617;21423;25488;28062 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3093;3108;8262;8997;9802;9837;9843;10494;11261;12413;13999;16760;21610;25711;28305 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7188;11955;14429;20424;22491;23641;25293 True;True;True;True;True;True;True 7257;12063;14556;20608;22690;23846;25512 24146;24147;24148;40730;40731;40732;49211;49212;49213;68773;68774;68775;68776;68777;68778;75483;75484;75485;75486;75487;75488;79278;79279;79280;84770 30648;30649;30650;30651;30652;30653;51000;51001;51002;51003;51004;51005;61829;61830;61831;61832;61833;61834;86307;86308;86309;86310;86311;86312;94793;94794;94795;94796;94797;94798;94799;94800;99673;99674;99675;106809 30649;51002;61829;86312;94797;99674;106809 Q96EB1 Q96EB1 3 3 3 Elongator complex protein 4 ELP4 sp|Q96EB1|ELP4_HUMAN Elongator complex protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP4 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 9.2 9.2 9.2 46.587 424 424 0 6.5114 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94229 0.9313 40.052 8 1 Leave out requantified 0.94229 0.87632 0.80529 0.96184 0.9313 0.7731 31.902 34.59 25.313 3 3 2 1 0 0 Median Leave out requantified Median 9.2 9.2 5 159410000 85246000 74164000 55497000 31106000 24391000 65535000 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109758;110967 Q96EY8 Q96EY8 2 2 2 Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial MMAB sp|Q96EY8|MMAB_HUMAN Corrinoid adenosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MMAB PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 10.4 10.4 10.4 27.388 250 250 0 4.4509 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3297 1.4765 15.443 5 3 Median NaN 1.3407 1.2851 NaN 1.4791 1.2384 NaN 0.24842 24.967 1 2 2 1 1 1 Median Median Median 4 10.4 10.4 141270000 56809000 84458000 18167000 7681300 10485000 61682000 22558000 39124000 61417000 26569000 34849000 2280 9547;10397 True;True 9635;10491 31920;31921;31922;34774;34775 40375;40376;40377;43941;43942 40377;43942 Q96F07 Q96F07 17 2 2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 CYFIP2 sp|Q96F07|CYFP2_HUMAN Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYFIP2 PE=1 SV=2 1 17 2 2 16 13 14 2 2 2 2 2 2 14.9 1.9 1.9 148.4 1278 1278 0 7.1404 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89314 0.95483 23.311 6 1 Leave out requantified 0.81148 0.93039 0.53181 0.85757 1.028 0.5289 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MS/MS By MS/MS 1.0792 1.1301 20.533 38 9 Leave out requantified 1.0803 0.97101 1.1425 1.1604 1.0716 1.1201 22.076 21.647 24.423 13 13 12 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.8 45.8 52 4011100000 2054800000 1956200000 1188100000 606890000 581190000 1569000000 848480000 720480000 1254000000 599460000 654570000 2287 653;5706;7705;8032;9356;13185;14981;16302;20106;25202;28103 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 655;5760;7780;8111;9443;13302;15112;16441;20290;25421;28346 2153;2154;2155;2156;2157;19374;19375;19376;25816;25817;25818;26926;26927;26928;31258;31259;31260;31261;31262;44875;44876;44877;44878;51007;51008;51009;55463;55464;67809;84462;84463;84464;84465;84466;84467;94165;94166;94167 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SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCD1 PE=1 SV=2 1 11 10 8 8 8 11 7 7 10 7 7 8 30.7 27.4 21.7 58.232 515 515 0 28.017 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90045 0.92575 19.475 26 6 Leave out requantified 1.0928 0.81139 0.95778 1.0873 0.89157 0.93848 29.709 19.826 15.148 8 8 10 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.2 20.2 30.7 1072900000 517450000 555480000 338040000 150050000 187990000 320220000 155310000 164910000 414660000 212090000 202570000 2292 6711;8689;12463;14175;14691;15443;15924;21775;22839;23977;28814 False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6774;8770;12572;14300;14821;15577;16062;21965;23039;24186;29062 22646;22647;22648;22649;22650;29089;42433;42434;42435;48338;48339;48340;48341;48342;50109;50110;50111;52533;54212;54213;54214;73152;73153;73154;76677;80409;80410;80411;96394;96395;96396 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1399;2300;2507;21360;22607;22905;24140;24938 4679;4680;4681;7646;7647;7648;8345;8346;8347;71108;71109;71110;75208;75209;75210;76226;76227;76228;80271;80272;80273;82930;82931;82932 6066;6067;6068;6069;9978;9979;9980;9981;9982;10918;10919;10920;89300;89301;89302;94425;94426;94427;95715;95716;95717;100952;100953;100954;100955;100956;104485;104486;104487;104488 6069;9979;10919;89302;94426;95717;100953;104485 Q96GN5 Q96GN5 4 4 4 Cell division cycle-associated 7-like protein CDCA7L sp|Q96GN5|CDA7L_HUMAN Cell division cycle-associated 7-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDCA7L PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 3 2 2 3 2 2 3 2 9 9 9 52.206 454 454 0 9.5174 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98236 1.0483 22.038 6 0 Leave out requantified NaN 0.98236 0.9196 NaN 1.0483 0.91565 NaN 28.458 37.794 1 3 2 0 0 0 Median Leave out requantified Median 5.1 6.6 4.6 90244000 50991000 39253000 21728000 13415000 8313000 43138000 23006000 20131000 25378000 14570000 10809000 2294 2673;7787;7813;9778 True;True;True;True 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33313;33314;45563;45564 33313;45564 Q96H79 Q96H79 9 9 9 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like ZC3HAV1L sp|Q96H79|ZCCHL_HUMAN Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3HAV1L PE=1 SV=2 1 9 9 9 7 8 8 7 8 8 7 8 8 50 50 50 32.962 300 300 0 23.334 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1303 1.1934 18.051 22 4 Leave out requantified 1.2309 0.8557 1.2801 1.2949 0.93405 1.2651 26.378 26.593 9.5893 7 7 8 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35 42.7 46.3 757710000 382420000 375290000 216170000 108010000 108150000 277330000 152040000 125280000 264210000 122360000 141850000 2297 3341;9313;9320;12844;16205;18177;20283;22315;27859 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3370;9399;9406;12956;16344;18339;20467;22513;28099 11275;11276;11277;11278;31132;31133;31134;31153;31154;31155;43739;43740;43741;55150;61384;61385;61386;68340;68341;74882;74883;93362;93363;93364 14603;14604;14605;14606;14607;39354;39355;39356;39378;39379;39380;39381;54872;54873;54874;69263;77128;77129;77130;77131;77132;77133;85782;85783;94013;94014;118009 14606;39354;39381;54873;69263;77130;85783;94014;118009 Q96HA7 Q96HA7 5 5 5 Tonsoku-like protein TONSL sp|Q96HA7|TONSL_HUMAN Tonsoku-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TONSL PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4.8 4.8 4.8 150.93 1378 1378 0 7.4991 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98936 1.0365 4.4377 9 2 Leave out requantified 1.0141 0.87916 1.3419 1.0768 0.93274 1.3291 3.3833 13.795 11.196 3 3 3 0 1 1 Leave out requantified Median Plateau 4 3 3.1 121610000 64866000 56739000 40036000 23158000 16878000 43408000 24570000 18837000 38162000 17138000 21024000 2298 327;3237;16909;16925;20668 True;True;True;True;True 328;3264;17053;17069;20852 1078;1079;10929;57344;57345;57346;57399;57400;69546;69547;69548 1384;14131;72056;72057;72058;72059;72060;72132;72133;87304;87305;87306 1384;14131;72056;72132;87305 Q96HC4 Q96HC4 6 6 6 PDZ and LIM domain protein 5 PDLIM5 sp|Q96HC4|PDLI5_HUMAN PDZ and LIM domain protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM5 PE=1 SV=5 1 6 6 6 4 4 5 4 4 5 4 4 5 16.6 16.6 16.6 63.944 596 596 0 16.037 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0927 1.1393 26.079 10 1 Leave out requantified 1.1693 1.0294 1.1955 1.2244 1.1393 1.192 41.715 24.352 9.6062 4 4 2 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 11.4 11.4 11.2 421470000 186310000 235150000 156370000 74248000 82117000 169610000 72426000 97185000 95489000 39637000 55852000 2299 9082;10346;12730;13330;20850;29068 True;True;True;True;True;True 9166;10440;12841;13449;21035;29320 30378;34621;34622;34623;43368;43369;43370;45370;45371;70132;97265;97266;97267 38391;43742;43743;43744;43745;43746;43747;54404;54405;56959;56960;88049;122999;123000 38391;43744;54404;56960;88049;123000 Q96HR8 Q96HR8 1 1 1 H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1 NAF1 sp|Q96HR8|NAF1_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1 OS=Homo sapiens 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Leave out requantified Leave out requantified 15.7 18.9 11 366240000 187380000 178860000 97645000 51639000 46005000 187180000 97113000 90063000 81420000 38626000 42794000 2303 3597;12083;13153;13161;18486;22427 True;True;True;True;True;True 3634;12191;13270;13278;18656;22626 12150;12151;12152;41143;41144;41145;44763;44764;44765;44788;44789;44790;62394;75278;75279 15714;51506;51507;51508;56192;56193;56194;56195;56223;56224;56225;56226;56227;56228;78443;94514;94515 15714;51506;56193;56228;78443;94515 Q96I25 Q96I25 6 6 6 Splicing factor 45 RBM17 sp|Q96I25|SPF45_HUMAN Splicing factor 45 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM17 PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 6 17.2 17.2 17.2 44.961 401 401 0 15.009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88477 0.94218 10.152 17 3 Leave out requantified 0.87615 0.98328 0.93263 0.93842 1.0896 0.94218 7.833 9.7147 26.375 5 6 6 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14 17.2 17.2 669470000 344290000 325170000 203550000 108350000 95204000 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[GDP-forming] subunit beta, mitochondrial SUCLG2 sp|Q96I99|SUCB2_HUMAN Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLG2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 12.5 12.5 12.5 46.51 432 432 0 20.525 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.034 1.0472 19.323 17 6 Leave out requantified 1.3499 0.79119 1.0836 1.3529 0.87651 1.0511 26.017 20.663 19.398 6 6 5 3 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.5 12.5 12.5 532380000 280840000 251540000 167560000 80795000 86760000 202270000 115600000 86669000 162550000 84437000 78113000 2306 5260;7025;14942;17822;21982 True;True;True;True;True 5312;7094;15073;17972;22176 17930;17931;17932;23607;23608;23609;50882;50883;50884;60251;60252;60253;60254;73843;73844;73845;73846 22807;22808;22809;22810;22811;22812;29994;29995;29996;63964;63965;63966;75749;75750;75751;75752;92679;92680;92681;92682;92683;92684 22807;29994;63964;75749;92682 Q96IJ6 Q96IJ6 5 5 5 Mannose-1-phosphate 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Q96IY1 2 2 2 Kinetochore-associated protein NSL1 homolog NSL1 sp|Q96IY1|NSL1_HUMAN Kinetochore-associated protein NSL1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSL1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.1 7.1 7.1 32.162 281 281 0 5.5768 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0557 1.0794 48.999 6 0 Leave out requantified 1.1505 0.90948 1.1532 1.1967 0.97186 1.0797 34.417 34.155 59.413 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 7.1 7.1 7.1 125020000 62160000 62857000 45005000 22975000 22030000 41175000 20394000 20781000 38837000 18791000 20046000 2309 12486;18359 True;True 12595;18526 42516;42517;42518;61972;61973;61974 53279;53280;53281;77883;77884 53281;77884 Q96IZ0 Q96IZ0 7 7 7 PRKC apoptosis WT1 regulator protein PAWR sp|Q96IZ0|PAWR_HUMAN PRKC apoptosis WT1 regulator protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAWR PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 5 4 6 5 4 6 5 4 22.9 22.9 22.9 36.567 340 340 0 40.515 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.004 1.0729 3.4753 11 5 Leave out requantified 0.88473 1.03 1.2217 0.90089 1.1429 0.66601 43.023 78.272 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2479;4711;4975;5254;5368;6490;7216;7267;8166;9647;11135;12152;17179;17361;19670;20604;21385;21386;23278;26936;27228 8242;8243;8244;15879;15880;15881;16801;16802;16803;17730;17731;17732;18089;21796;21797;21798;24032;24180;24181;27121;27122;27123;31952;31953;31954;36908;36909;41020;41021;41022;41023;57728;58299;58300;58301;65767;68755;68756;71183;71184;71185;77472;77473;89534;90525;90526;90527;90528;90529 10791;10792;20226;20227;20228;20229;21329;21330;21331;22551;23001;27767;27768;30507;30682;30683;34351;34352;34353;40412;40413;40414;46643;46644;51364;51365;51366;51367;51368;72536;73296;73297;82594;86286;86287;89391;89392;89393;97326;97327;113008;114298;114299;114300;114301;114302 10791;20227;21329;22551;23001;27767;30507;30682;34352;40414;46644;51364;72536;73297;82594;86287;89391;89393;97327;113008;114298 Q96NC0 Q96NC0 3 3 3 Zinc finger matrin-type protein 2 ZMAT2 sp|Q96NC0|ZMAT2_HUMAN Zinc finger matrin-type protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZMAT2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 20.6 20.6 20.6 23.612 199 199 0 15.28 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87266 0.95589 10.46 13 2 Leave out requantified 0.92197 0.87176 0.94538 0.98672 0.96027 0.92703 29.613 0.43402 20.971 4 5 4 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.6 20.6 20.6 403560000 218930000 184630000 146620000 78979000 67638000 139820000 74569000 65254000 117120000 65384000 51738000 2336 4608;20453;25424 True;True;True 4653;20637;25646 15706;15707;15708;68873;68874;68875;68876;85196;85197;85198;85199;85200;85201 20037;20038;20039;20040;20041;20042;86445;86446;86447;86448;107371;107372;107373;107374;107375;107376;107377;107378;107379 20039;86448;107373 Q96NW4 Q96NW4 2 2 2 Ankyrin repeat domain-containing protein 27 ANKRD27 sp|Q96NW4|ANR27_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD27 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2.2 2.2 2.2 116.98 1050 1050 0.0003686 3.6875 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.214 1.223 33.142 6 0 Leave out requantified 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35 VPS35 sp|Q96QK1|VPS35_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS35 PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 4 8 6 4 8 6 4 8 13.6 13.6 13.6 91.706 796 796 0 29.499 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.047 1.0934 17.226 15 3 Leave out requantified 1.1271 0.94693 0.99238 1.1844 1.0345 0.98631 7.755 20.218 26.693 5 3 7 1 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.3 6.9 13.6 570330000 284220000 286110000 213780000 111010000 102770000 97540000 46257000 51283000 259010000 126950000 132060000 2352 272;12310;13103;13212;16501;18943;21898;26926 True;True;True;True;True;True;True;True 273;12419;13220;13329;16644;19115;22090;27156 899;900;41920;44593;44594;44960;44961;44962;56085;56086;63887;63888;63889;63890;73565;73566;73567;90297;90298 1173;52512;55968;56468;56469;56470;56471;56472;56473;70443;70444;80314;80315;80316;80317;92331;92332;92333;92334;92335;92336;114000;114001 1173;52512;55968;56473;70444;80314;92334;114000 Q96QR8 Q96QR8 1 1 1 Transcriptional activator protein Pur-beta PURB sp|Q96QR8|PURB_HUMAN Transcriptional activator protein Pur-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PURB PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.2 4.2 4.2 33.24 312 312 0 5.7463 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90457 0.91887 25.398 6 6 Median 0.7255 0.96708 1.0263 0.76552 1.0527 1.0109 23.165 36.989 10.843 2 2 2 2 2 2 Median Median Median 4.2 4.2 4.2 110080000 57760000 52319000 33083000 20236000 12847000 39467000 19100000 20367000 37529000 18424000 19105000 2353 9605 True 9693 32101;32102;32103;32104;32105;32106 40612;40613;40614;40615;40616;40617 40615 Q96QU8 Q96QU8 9 9 9 Exportin-6 XPO6 sp|Q96QU8|XPO6_HUMAN Exportin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO6 PE=1 SV=1 1 9 9 9 5 6 7 5 6 7 5 6 7 9.7 9.7 9.7 128.88 1125 1125 0 25.564 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94879 1.0069 33.529 17 9 Leave out requantified 1.104 0.86808 1.2392 1.1276 0.94413 1.1753 22.622 45.384 37.028 5 6 6 3 4 2 Median Median Leave out requantified 5.8 6.7 7.4 717560000 356390000 361170000 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Sin3a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIN3A PE=1 SV=2 1 19 19 19 16 15 16 16 15 16 16 15 16 21.1 21.1 21.1 145.17 1273 1273 0 76.726 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97683 0.99944 20.187 52 11 Leave out requantified 0.86891 1.0182 1.0083 0.91229 1.0651 0.95853 28.036 19.943 24.074 17 17 18 2 2 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 16.4 15.6 2472000000 1212000000 1260100000 793190000 402550000 390640000 795470000 411980000 383490000 883360000 397440000 485910000 2370 678;6001;7282;7565;11259;14057;14729;15505;16010;20111;20387;21610;22555;22675;22686;22702;23058;25195;28865 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 680;6058;7353;7639;11360;14181;14859;15640;16148;20295;20571;21800;22754;22875;22886;22902;23262;25414;29114 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Oxysterol-binding protein-related protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL9 PE=1 SV=2 1 15 14 14 14 14 13 13 13 12 13 13 12 25.5 24.6 24.6 83.184 736 736 0 74.349 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0194 1.1032 22.037 39 11 Leave out requantified 0.97708 1.0029 1.0391 1.0463 1.0934 1.0353 16.761 22.311 30.119 14 14 11 4 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.5 23.4 23.4 2744100000 1323000000 1421200000 845170000 413880000 431290000 976010000 473580000 502430000 922950000 435490000 487460000 2371 4904;7419;11104;11693;11694;13367;13984;15152;15379;15566;22061;22416;23649;27946;28362 True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True 4952;7492;11204;11800;11801;13486;14108;15283;15511;15701;22255;22614;23854;28187;28607 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCB PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 16.4 16.4 16.4 27.325 244 244 0 12.389 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0357 1.0814 11.383 4 3 Median NaN 0.99065 NaN NaN 1.0814 NaN NaN 2.3624 NaN 1 2 1 0 2 1 Median Median Median 4.5 11.9 4.5 115190000 53007000 62183000 33203000 10268000 22935000 44308000 21789000 22519000 37679000 20950000 16729000 2381 1851;14751;29083 True;True;True 1868;14881;29335 6212;6213;50294;97310 8096;8097;63230;123055;123056 8096;63230;123056 Q99436 Q99436 2 2 2 Proteasome subunit beta type-7 PSMB7 sp|Q99436|PSB7_HUMAN Proteasome subunit beta type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMB7 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 6.9 6.9 6.9 29.965 277 277 0 5.1187 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67982 0.70061 50.273 5 2 Median NaN 0.44046 0.44798 NaN 0.491 0.44781 NaN 68.168 63.297 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 3.2 6.9 6.9 302650000 222170000 80476000 39797000 23602000 16196000 127420000 95137000 32284000 135430000 103430000 31997000 2382 2202;10773 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Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2;Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 MAP3K2;MAP3K3 sp|Q9Y2U5|M3K2_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K2 PE=1 SV=2;sp|Q99759|M3K3_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K3 PE=1 SV=2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 69.74 619 619;626 0 4.5078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68596 0.68191 13.711 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 53590000 31736000 21855000 18709000 10027000 8681800 17270000 9146100 8123900 17612000 12563000 5049100 2413 21246 True 21432 71339;71340;71341 89588;89589;89590 89588 Q99798 Q99798 1 1 1 Aconitate hydratase, mitochondrial ACO2 sp|Q99798|ACON_HUMAN Aconitate hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACO2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 2.1 2.1 2.1 85.424 780 780 0.0098101 1.7123 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0 2.1 0 10739000 8277000 2461800 0 0 0 10739000 8277000 2461800 0 0 0 2414 3833 True 3871 13046 16786 16786 Q99816 Q99816 10 10 10 Tumor susceptibility gene 101 protein TSG101 sp|Q99816|TS101_HUMAN Tumor susceptibility gene 101 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSG101 PE=1 SV=2 1 10 10 10 7 7 8 7 7 8 7 7 8 26.2 26.2 26.2 43.944 390 390 0 29.006 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0246 1.0768 14.63 19 3 Leave out requantified 1.0834 0.96646 1.0295 1.1355 1.0743 0.98559 15.917 14.395 26.224 7 6 6 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.4 18.7 21 1024300000 512950000 511400000 375630000 185720000 189910000 316420000 169430000 146990000 332300000 157790000 174510000 2415 2084;3657;4114;7430;10846;13644;13943;14754;14755;14901 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2102;3694;4152;7503;10944;13765;14067;14884;14885;15032 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T-complex protein 1 subunit eta CCT7 sp|Q99832|TCPH_HUMAN T-complex protein 1 subunit eta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCT7 PE=1 SV=2 1 26 26 26 24 23 26 24 23 26 24 23 26 56.9 56.9 56.9 59.366 543 543 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0686 1.0995 13.433 107 18 Leave out requantified 1.0774 0.89551 1.1419 1.1427 0.98847 1.1426 10.513 9.4229 14.887 34 35 38 5 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 53.4 53.2 56.9 29134000000 14136000000 14998000000 8811000000 4267800000 4543300000 10209000000 5186400000 5022500000 10114000000 4681900000 5431900000 2417 1256;2241;2665;3026;4287;5953;6044;9574;11896;12686;15909;16628;18707;20486;20925;21221;22638;23112;23975;24320;24897;24948;27369;27370;27479;28880 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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2252;4231;6749;6819;11952;12885;19684 7504;14313;22581;22582;22583;22584;22785;22786;22787;40314;40315;40316;43523;43524;43525;43526;65807;65808;65809 9791;18282;28729;28730;28976;28977;50460;50461;50462;50463;54612;54613;54614;54615;82649;82650 9791;18282;28730;28976;50461;54613;82649 Q99958 Q99958 1 1 1 Forkhead box protein C2 FOXC2 sp|Q99958|FOXC2_HUMAN Forkhead box protein C2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FOXC2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.8 2.8 2.8 53.719 501 501 0.0055976 2.056 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86385 0.92359 9.3508 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.8 2.8 2.8 27790000 15388000 12402000 10642000 5462800 5178700 8316300 5321200 2995100 8832300 4604400 4227800 2423 23769 True 23974 79703;79704;79705 100226;100227;100228 100226 Q99961;Q99962 Q99961 9;2 9;2 9;2 Endophilin-A2 SH3GL1 sp|Q99961|SH3G1_HUMAN Endophilin-A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GL1 PE=1 SV=1 2 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 29.9 29.9 29.9 41.489 368 368;352 0 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11078;11079;11080;11081;11082;11083;20062;20063;20064;27861;27862;27863;27864;27865;27866;27867;73699;73700;73701;81999;82000;82001;82002;82003;82004;82005;82006;84446;84447;84448;84449;84450;84451;87721;87722;87723;87724;87725;87726;87727;87728;87729;87730;87731;96498;96499;96500;96501;96502;96503;96504;103662;103663;103664;103665;103666 11079;20062;27866;73701;81999;84447;87729;96501;103662 Q99986 Q99986 9 9 9 Serine/threonine-protein kinase VRK1 VRK1 sp|Q99986|VRK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase VRK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VRK1 PE=1 SV=1 1 9 9 9 7 6 8 7 6 8 7 6 8 33.8 33.8 33.8 45.476 396 396 0 33.386 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94514 1.0055 32.194 24 9 Leave out requantified 0.93551 0.87887 0.91238 0.96147 0.95693 0.90115 80.061 14.935 17.779 9 7 8 3 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28 24.5 28.5 1364100000 675800000 688280000 537790000 281430000 256360000 265020000 128650000 136380000 561270000 265730000 295540000 2425 2105;2808;3811;6068;11360;15911;19325;26286;29181 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2123;2833;3849;6125;11463;16048;19500;26513;29433 7077;9387;9388;12965;12966;12967;12968;12969;20566;20567;20568;38280;38281;38282;54165;54166;65214;65215;65216;65217;88089;97605;97606;97607 9249;12280;12281;16695;16696;16697;16698;16699;16700;26171;26172;26173;26174;48160;48161;48162;48163;48164;68034;68035;81896;81897;81898;81899;81900;81901;111156;123431;123432;123433 9249;12280;16697;26173;48163;68034;81899;111156;123432 Q9BPU6 Q9BPU6 1 1 1 Dihydropyrimidinase-related protein 5 DPYSL5 sp|Q9BPU6|DPYL5_HUMAN Dihydropyrimidinase-related protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPYSL5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.2 1.2 1.2 61.421 564 564 0.0024518 2.8601 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0934 1.1807 187.39 6 6 Median 1.1786 1.0934 1.171 1.211 1.1807 1.2005 247.67 232.64 245.17 2 2 2 2 2 2 Median Median Median 1.2 1.2 1.2 5970200000 2937200000 3033000000 1977400000 927620000 1049800000 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requantified Median Median 4.5 3.7 0.9 82053000 35657000 46396000 36283000 16754000 19529000 32279000 15201000 17078000 13491000 3700900 9789600 2444 12;257;6300;10130;27460 True;True;True;True;True 12;258;6361;10221;27697 40;41;848;849;850;21358;33911;92072;92073 72;1109;1110;27174;42869;116322;116323 72;1110;27174;42869;116322 Q9BR61 Q9BR61 2 2 2 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6 ACBD6 sp|Q9BR61|ACBD6_HUMAN Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 8.5 8.5 8.5 31.15 282 282 0 4.5695 By MS/MS By MS/MS 1.178 1.2112 27.333 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 3.5 8.5 25068000 7854800 17213000 0 0 0 9038700 3457300 5581400 16029000 4397500 11632000 2445 4466;6717 True;True 4511;6780 15243;22672;22673 19451;28838;28839 19451;28839 Q9BR76 Q9BR76 4 4 4 Coronin-1B CORO1B sp|Q9BR76|COR1B_HUMAN Coronin-1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CORO1B PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 14.5 14.5 14.5 54.234 489 489 0 6.9626 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.413 1.5327 29.337 8 1 Leave out requantified 1.0072 1.4011 1.3473 1.0388 1.5327 1.2931 50.67 29.337 20.592 2 3 3 0 0 1 Median Leave out requantified Median 11.9 11.9 12.5 280840000 137420000 143410000 79381000 47578000 31802000 115670000 53407000 62261000 85788000 36439000 49350000 2446 3190;19681;26492;27841 True;True;True;True 3217;19860;26719;28080 10759;10760;66384;66385;66386;88823;88824;88825;93303 13908;13909;83350;83351;83352;83353;83354;83355;112095;117926 13908;83353;112095;117926 Q9BRA0 Q9BRA0 1 1 1 N-alpha-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit NAA38 sp|Q9BRA0|LSMD1_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA38 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 15.2 15.2 15.2 13.514 125 125 0.0068515 1.9709 By MS/MS By MS/MS 1.1756 1.1683 17.916 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 15.2 0 15.2 33806000 15633000 18174000 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYM1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 4 3 4 4 3 4 4 3 51.5 51.5 51.5 22.655 204 204 0 20.576 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88024 0.93576 13.736 14 4 Leave out requantified 0.8365 0.88024 0.93795 0.89987 1.0049 0.9242 15.732 17.119 4.1289 5 5 4 1 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.9 37.7 22.5 485850000 253680000 232170000 179650000 91256000 88397000 179230000 99524000 79703000 126970000 62895000 64070000 2452 192;5979;13116;22506;27633;28629 True;True;True;True;True;True 193;6035;13233;22705;27871;28876 640;641;642;643;644;645;20272;44635;44636;44637;75549;92640;92641;95791 827;828;829;830;831;832;833;834;835;25814;56022;56023;56024;94878;117064;117065;121106;121107 831;25814;56022;94878;117064;121107 Q9BRS2 Q9BRS2 3 3 3 Serine/threonine-protein kinase RIO1 RIOK1 sp|Q9BRS2|RIOK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase RIO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RIOK1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 6.2 6.2 6.2 65.582 568 568 0 7.8999 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89815 0.9213 9.1968 6 1 Leave out requantified NaN 1.2635 0.87119 NaN 1.3322 0.87646 NaN 109.02 16.253 1 3 2 0 1 0 Median Median Median 2.6 6.2 4.4 334510000 89175000 245330000 23193000 12050000 11143000 249900000 46199000 203700000 61418000 30925000 30493000 2453 2294;5233;16563 True;True;True 2315;5284;16706 7704;17824;17825;17826;56259;56260 10059;22668;22669;22670;22671;22672;22673;70664 10059;22672;70664 Q9BRT2 Q9BRT2 1 1 1 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2 UQCC2 sp|Q9BRT2|UQCC2_HUMAN Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UQCC2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 10.3 10.3 10.3 14.875 126 126 0 4.2501 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 10.3 0 10.3 10449000 3478200 6970700 10449000 3478200 6970700 0 0 0 0 0 0 2454 4748 True 4794 16188;16189 20614;20615 20615 Q9BRT6 Q9BRT6 1 1 1 Protein LLP homolog LLPH 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requantified Leave out requantified 9 9 6.7 547550000 269940000 277610000 218520000 111350000 107170000 194920000 95532000 99388000 134120000 63059000 71057000 2474 6466;10090;11005;12259 True;True;True;True 6528;10181;11104;12368 21909;21910;33787;33788;33789;36809;36810;36811;41755;41756;41757;41758;41759;41760;41761 27901;27902;42706;42707;42708;42709;42710;46521;46522;52316;52317;52318;52319;52320;52321;52322 27902;42709;46522;52320 Q9BTE1 Q9BTE1 1 1 1 Dynactin subunit 5 DCTN5 sp|Q9BTE1|DCTN5_HUMAN Dynactin subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 6 6 6 20.126 182 182 0.00072516 3.4121 By MS/MS By MS/MS 0.58129 0.63944 20.237 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 6 6 0 28788000 17388000 11400000 12693000 6982700 5710100 16095000 10406000 5689800 0 0 0 2475 22044 True 22238 74020;74021 92901;92902 92902 Q9BTE6 Q9BTE6 5 5 5 Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 AARSD1 sp|Q9BTE6|AASD1_HUMAN Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AARSD1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 2 5 3 2 5 3 2 5 18 18 18 45.479 412 412 0 11.872 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91515 0.92255 63.275 11 6 Leave out requantified 0.84167 1.2033 1.0154 0.87793 1.3019 0.99755 60.64 5.9289 40.625 3 2 6 1 1 4 Median Median Median 12.6 6.8 18 237410000 123860000 113550000 71101000 42247000 28854000 41818000 17279000 24539000 124490000 64334000 60156000 2476 1533;2768;6670;9415;9615 True;True;True;True;True 1542;2793;6733;9502;9703 5132;5133;9256;9257;22529;22530;31458;31459;31460;32139;32140 6687;6688;12112;28661;28662;39779;39780;39781;40668;40669 6687;12112;28661;39781;40669 Q9BTE7 Q9BTE7 4 4 3 DCN1-like protein 5 DCUN1D5 sp|Q9BTE7|DCNL5_HUMAN DCN1-like protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCUN1D5 PE=1 SV=1 1 4 4 3 4 4 4 4 4 4 3 3 3 16.5 16.5 13.5 27.508 237 237 0 12.238 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84095 0.84001 13.996 12 0 Leave out requantified 0.81492 0.83886 0.97342 0.85244 0.92575 0.9457 9.2113 13.989 18.768 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subunit 10 MED10 sp|Q9BTT4|MED10_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED10 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 24.4 24.4 24.4 15.688 135 135 0 4.8466 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4482 1.5259 51.234 5 3 Median 0.99893 1.0458 NaN 1.055 1.1404 NaN 52.183 77.302 NaN 2 2 1 1 1 1 Median Median Median 24.4 24.4 9.6 78139000 36384000 41755000 30147000 14471000 15676000 29834000 15754000 14080000 18159000 6160100 11999000 2479 16476;20564 True;True 16619;20748 55995;55996;55997;69229;69230 70321;70322;86902;86903 70322;86903 Q9BTV5 Q9BTV5 1 1 1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 FSD1 sp|Q9BTV5|FSD1_HUMAN Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 55.819 496 496 0.0003663 3.5714 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90635 0.91978 29.945 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 23423000 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207;1150;1335;2550;2594;7002;10175;12095;14414;15329;15508;17591;17969;20555;24887;26883;27921 688;689;690;3878;4466;4467;4468;4469;8483;8484;8485;8486;8620;8621;8622;23329;33773;33774;33775;40836;40837;40838;48758;48759;48760;48761;48762;48763;51695;52314;52315;52316;59039;59040;60242;60243;60244;68606;68607;68608;68609;68610;82784;89374;89375;92802;92803;92804 885;886;887;888;889;5097;5801;5802;5803;5804;11085;11086;11087;11088;11089;11090;11091;11092;11268;11269;11270;29665;42694;42695;51134;61253;61254;61255;61256;61257;61258;61259;61260;61261;61262;64992;64993;65733;65734;65735;74225;74226;75737;75738;75739;75740;86106;86107;86108;104289;104290;112811;112812;112813;117270;117271 886;5097;5802;11092;11269;29665;42694;51134;61255;64992;65733;74226;75739;86106;104290;112811;117270 Q9BTX7 Q9BTX7 2 2 2 Alpha-tocopherol transfer protein-like TTPAL sp|Q9BTX7|TTPAL_HUMAN Alpha-tocopherol transfer protein-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTPAL PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 9.4 9.4 9.4 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382;1196;1588;6387;6546;6987;11852;15821;16319 1275;1276;4010;4011;4012;5298;5299;5300;21451;21452;21453;21964;21965;21966;23288;39947;53400;53401;53402;55069;55070;55071 1647;1648;5247;5248;5249;5250;6923;6924;6925;27306;27307;27308;27959;29614;50058;67105;67106;67107;67108;67109;69152;69153;69154 1648;5247;6923;27307;27959;29614;50058;67108;69152 Q9BTZ2;Q6PKH6;P0CG22 Q9BTZ2;Q6PKH6;P0CG22 4;2;2 4;2;2 4;2;2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4;Dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2;Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1 DHRS4;DHRS4L2;DHRS4L1 sp|Q9BTZ2|DHRS4_HUMAN Dehydrogenase/reductase SDR family member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHRS4 PE=1 SV=3;sp|Q6PKH6|DR4L2_HUMAN Dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHRS4L2 PE=2 SV=1;sp|P0CG22|DR4L1_HUMAN Putativ 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 18.7 18.7 18.7 29.537 278 278;230;281 0 11.244 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81753 0.91405 55.797 12 3 Leave out requantified 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Q9BV20 Q9BV20 3 3 3 Methylthioribose-1-phosphate isomerase MRI1 sp|Q9BV20|MTNA_HUMAN Methylthioribose-1-phosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRI1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 14.9 14.9 14.9 39.149 369 369 0 7.9762 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99864 1.0714 21.714 9 4 Leave out requantified 0.99864 0.97305 1.48 1.0533 1.0714 1.4726 17.964 110.01 10.951 3 3 3 1 2 1 Median Median Plateau 14.9 14.9 14.9 508810000 156470000 352350000 107830000 51367000 56464000 295510000 55454000 240060000 105470000 49644000 55823000 2495 6118;26630;27832 True;True;True 6176;26857;28071 20725;20726;20727;89296;89297;89298;93276;93277;93278 26368;26369;26370;26371;26372;26373;112717;112718;112719;117890;117891;117892 26369;112718;117890 Q9BV38 Q9BV38 4 4 4 WD repeat-containing protein 18 WDR18 sp|Q9BV38|WDR18_HUMAN WD repeat-containing protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR18 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 1 3 3 1 3 3 1 3 13.2 13.2 13.2 47.405 432 432 0 9.3002 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0668 1.1231 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2475;3529;5530;19164 8231;8232;8233;11823;18635;18636;18637;64055 10768;10769;10770;10771;10772;15319;23705;23706;23707;23708;23709;80499 10770;15319;23705;80499 Q9BV68 Q9BV68 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 RNF126 sp|Q9BV68|RN126_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF126 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 12.2 12.2 12.2 33.861 311 311 0 12.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1485 1.2049 22.86 6 3 Median 1.3224 1.1485 1.1188 1.3842 1.2593 1.0789 35.159 14.008 23.393 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 12.2 12.2 12.2 287210000 148490000 138720000 91186000 47360000 43826000 95852000 47086000 48766000 100170000 54042000 46130000 2498 2743;13118 True;True 2768;13235 9192;9193;9194;44639;44640;44641 12041;56026;56027;56028 12041;56028 Q9BV86 Q9BV86 9 9 9 N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1;N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1, N-terminally processed NTMT1 sp|Q9BV86|NTM1A_HUMAN N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens 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19043;19044;19045;19046;19047;19048;19049;19050;19051;31867;31868;31869;31870;31871;31872;44799;53391;53392;53393;53394;53395;53396;68878;68879;68880;68881;68882;68883;85127;86248;103010;103011;103012;103013;103014;108734;108735;108736;108737 19048;31871;44799;53393;68882;85127;86248;103012;108736 Q9BVA0 Q9BVA0 2 2 2 Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 KATNB1 sp|Q9BVA0|KTNB1_HUMAN Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KATNB1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 4.6 4.6 4.6 72.333 655 655 0 4.6764 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77364 0.77475 34.165 5 4 Median NaN NaN 0.77364 NaN NaN 0.77475 NaN NaN 43.015 1 1 3 1 1 2 Median Median Median 2 2 4.6 67660000 40440000 27220000 10461000 6373300 4087400 12472000 8127000 4345200 44727000 25939000 18788000 2500 13095;28484 True;True 13212;28730 44573;95300;95301;95302;95303;95304 55949;120492;120493;120494;120495;120496 55949;120493 Q9BVC3 Q9BVC3 2 2 2 Sister chromatid cohesion protein DCC1 DSCC1 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Protein MAK16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAK16 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.7 3.7 3.7 35.368 300 300 0.0031088 2.6639 By MS/MS By MS/MS 1.0603 1.1311 20.056 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 0 24480000 12632000 11847000 11774000 4824200 6950300 12705000 7808100 4897200 0 0 0 2528 18780 True 18952 63317;63318 79620;79621 79620 Q9BY32 Q9BY32 3 3 3 Inosine triphosphate pyrophosphatase ITPA sp|Q9BY32|ITPA_HUMAN Inosine triphosphate pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITPA PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 21.6 21.6 21.6 21.445 194 194 0 10.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0314 1.1073 22.887 11 2 Leave out requantified 1.0675 0.96117 1.1296 1.1486 1.0792 1.1322 22.332 16.189 32.176 4 3 4 0 0 2 Leave out requantified Median Median 17 17 21.6 396760000 196500000 200260000 138100000 71011000 67084000 102680000 54073000 48603000 155990000 71414000 84577000 2529 12057;13511;15797 True;True;True 12165;13631;15933 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331;332;333;334;335;336;11782;14386;14387;14388;14389;14390;34797;72579;72580;72581;94067;94068;94069;94070;94071;94072;102806 336;11782;14387;34797;72580;94067;102806 Q9BY43 Q9BY43 2 2 2 Charged multivesicular body protein 4a CHMP4A sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN Charged multivesicular body protein 4a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4A PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 10.4 10.4 10.4 25.098 222 222 0 3.7772 By MS/MS By MS/MS 1.299 1.4686 54.157 3 1 Median 1.282 NaN NaN 1.3575 NaN NaN 76.32 NaN NaN 2 1 0 1 0 0 Median Median Median 10.4 10.4 0 36319000 15233000 21085000 22641000 9340000 13301000 13677000 5893000 7784300 0 0 0 2531 5149;13186 True;True 5199;13303 17551;17552;44879;44880 22325;22326;56362 22326;56362 Q9BY44 Q9BY44 21 21 21 Eukaryotic translation initiation factor 2A;Eukaryotic translation initiation factor 2A, N-terminally processed EIF2A sp|Q9BY44|EIF2A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2A PE=1 SV=3 1 21 21 21 21 18 19 21 18 19 21 18 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9795;10282;11859;16025;38456;42678;44594;55572;58151;67135;75521;77882;83063;83067;83373;92023;97002;104012;109783;115620;117645 Q9BY77 Q9BY77 5 5 5 Polymerase delta-interacting protein 3 POLDIP3 sp|Q9BY77|PDIP3_HUMAN Polymerase delta-interacting protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLDIP3 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 15.2 15.2 15.2 46.089 421 421 0 13.793 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99491 1.0052 11.092 10 2 Leave out requantified 0.99491 0.88638 1.0096 1.0505 0.9896 1.0052 3.8692 19.918 32.037 4 3 3 1 1 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 11.4 11.9 8.1 321600000 161440000 160150000 130450000 66187000 64259000 88369000 46472000 41897000 102780000 48784000 53997000 2533 6599;17488;23294;24590;26498 True;True;True;True;True 6661;17635;23498;24806;26725 22321;59199;59200;59201;78160;82527;82528;82529;88846;88847;88848 28392;74408;74409;98211;103965;103966;112137;112138;112139 28392;74408;98211;103966;112137 Q9BYG3 Q9BYG3 8 8 8 MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein NIFK sp|Q9BYG3|MK67I_HUMAN MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIFK PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 6 7 7 6 7 7 6 7 36.9 36.9 36.9 34.222 293 293 0 38.752 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.015 1.0336 31.727 23 3 Leave out requantified 1.015 0.91926 1.1281 1.0336 0.99445 1.0853 41.097 36.093 28.793 7 8 8 1 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.7 27 33.1 800010000 380150000 419860000 221450000 103470000 117980000 227510000 110450000 117060000 351050000 166230000 184820000 2534 4939;5571;10979;13466;14152;15919;23210;25501 True;True;True;True;True;True;True;True 4987;5625;11078;13585;14277;16056;23414;25724 16830;16831;16832;18933;18934;18935;18936;18937;18938;36717;36718;36719;45839;45840;45841;45842;48265;48266;48267;54191;77900;85460;85461;85462 21359;21360;21361;21362;21363;24073;24074;24075;24076;24077;24078;24079;24080;46401;46402;46403;46404;57587;57588;57589;57590;57591;57592;57593;60651;60652;60653;68062;97903;107718;107719;107720 21363;24074;46401;57588;60653;68062;97903;107718 Q9BYI3 Q9BYI3 3 3 3 Hyccin FAM126A sp|Q9BYI3|HYCCI_HUMAN Hyccin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM126A PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 0 2 1 0 2 1 0 2 7.3 7.3 7.3 57.625 521 521 0 8.5238 By MS/MS By MS/MS 1.6026 1.5712 25.072 3 3 Plateau NaN NaN 1.4178 NaN NaN 1.3954 NaN NaN 21.425 1 0 2 1 0 2 Median Median Median 2.3 0 5 48904000 21884000 27020000 19257000 10793000 8463200 0 0 0 29648000 11091000 18557000 2535 2853;10936;24827 True;True;True 2878;11035;25045 9558;36575;83284 12489;46231;104933 12489;46231;104933 Q9BYV8 Q9BYV8 2 2 2 Centrosomal protein of 41 kDa CEP41 sp|Q9BYV8|CEP41_HUMAN Centrosomal protein of 41 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP41 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.4 9.4 9.4 41.368 373 373 0 4.6743 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.263 1.2196 16.864 7 4 Median 1.5568 1.1254 1.3485 1.6411 1.2229 1.2844 26.341 15.019 7.3231 3 2 2 3 1 0 Plateau Median Median 9.4 9.4 9.4 85509000 36936000 48573000 29075000 12138000 16937000 25724000 11707000 14017000 30711000 13092000 17619000 2536 12248;14862 True;True 12357;14993 41716;41717;41718;50637;50638;50639;50640 52271;52272;63660;63661;63662;63663 52272;63663 Q9BYW2 Q9BYW2 2 2 2 Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 SETD2 sp|Q9BYW2|SETD2_HUMAN Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETD2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 287.59 2564 2564 0 3.9123 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80369 0.85609 15.081 3 3 Plateau 0.70946 NaN NaN 0.74372 NaN NaN 17.318 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 1 0.5 0.5 32341000 21101000 11240000 20338000 13148000 7189600 12003000 7952700 4050100 0 0 0 2537 1888;23867 True;True 1905;24073 6343;6344;6345;80015 8295;8296;8297;100622 8297;100622 Q9BYX2 Q9BYX2 5 5 5 TBC1 domain family member 2A TBC1D2 sp|Q9BYX2|TBD2A_HUMAN TBC1 domain family member 2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBC1D2 PE=1 SV=3 1 5 5 5 3 3 4 3 3 4 3 3 4 6.5 6.5 6.5 105.41 928 928 0 6.4527 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78515 0.82641 82.683 10 5 Median 0.87914 0.97037 0.85708 0.90675 1.0501 0.82966 29.073 84.426 113.48 3 3 4 2 1 2 Plateau Median Median 4 4.3 5.2 549150000 301670000 247480000 133230000 69469000 63764000 175740000 90336000 85408000 240170000 141860000 98311000 2538 7083;11228;20356;22302;26180 True;True;True;True;True 7152;11329;20540;22500;26407 23807;23808;23809;37696;68559;74839;74840;87780;87781;87782 30241;30242;30243;47503;86043;93952;110782 30242;47503;86043;93952;110782 Q9BZ29 Q9BZ29 6 5 5 Dedicator of cytokinesis protein 9 DOCK9 sp|Q9BZ29|DOCK9_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK9 PE=1 SV=2 1 6 5 5 4 4 5 3 3 4 3 3 4 4 3.5 3.5 236.44 2069 2069 0 8.1616 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0075 1.0305 4.1343 9 2 Leave out requantified 0.93894 0.82904 1.0922 0.98923 0.89859 1.0748 5.7842 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Leave out requantified 3.2 2.6 4.1 215230000 110660000 104570000 85711000 42051000 43660000 64297000 33935000 30363000 65222000 34671000 30551000 2555 69;4053;5995;10583;19250;23304;27304 True;True;True;True;True;True;True 69;4091;6052;10679;19424;23508;27541 232;233;234;13822;20328;35374;64928;78198;78199;91573;91574;91575 323;324;325;17683;25895;44699;81526;98278;98279;98280;115668;115669 324;17683;25895;44699;81526;98280;115668 Q9C0C9 Q9C0C9 22 22 22 E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O UBE2O sp|Q9C0C9|UBE2O_HUMAN (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2O PE=1 SV=3 1 22 22 22 15 15 18 15 15 18 15 15 18 24.5 24.5 24.5 141.29 1292 1292 0 65.082 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.047 1.047 25.44 48 15 Leave out requantified 1.0564 0.88208 1.1055 1.0707 0.974 1.0985 30.524 17.603 13.366 17 14 17 6 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18 17.1 21.4 1504900000 746320000 758570000 482530000 245560000 236970000 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20345;22278;23257;27532;27533;27534;30691;30692;30693;40370;40371;40372;55308;55309;55310 25917;28335;29568;34843;34844;38789;38790;38791;50527;50528;50529;69490 25917;28335;29568;34844;38791;50529;69490 Q9H081 Q9H081 3 3 3 Protein MIS12 homolog MIS12 sp|Q9H081|MIS12_HUMAN Protein MIS12 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS12 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 0 3 1 0 3 1 0 3 19.5 19.5 19.5 24.14 205 205 0 9.4789 By MS/MS By MS/MS 0.98551 0.94692 22.485 4 3 Median NaN NaN 1.1477 NaN NaN 1.1134 NaN NaN 21.537 1 0 3 1 0 2 Median Median Median 5.4 0 19.5 136490000 69943000 66548000 31029000 17963000 13066000 0 0 0 105460000 51980000 53482000 2575 7223;7399;14673 True;True;True 7292;7472;14803 24252;24253;24821;50052 30766;30767;31485;62942 30767;31485;62942 Q9H089 Q9H089 4 4 4 Large subunit GTPase 1 homolog LSG1 sp|Q9H089|LSG1_HUMAN Large subunit GTPase 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LSG1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 2 1 4 2 1 4 2 1 4.9 4.9 4.9 75.225 658 658 0 7.8254 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95426 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Q9H0E3 Q9H0E3 2 2 2 Histone deacetylase complex subunit SAP130 SAP130 sp|Q9H0E3|SP130_HUMAN Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2.4 2.4 2.4 110.32 1048 1048 0 6.0787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87684 0.86344 50.817 5 5 Median 1.1872 1.1781 NaN 1.2149 1.3218 NaN 65.94 68.794 NaN 2 2 1 2 2 1 Median Median Median 2.4 2.4 1.3 159400000 76478000 82921000 65118000 31443000 33675000 60020000 28153000 31867000 34260000 16881000 17379000 2582 17327;29157 True;True 17471;29409 58645;58646;97539;97540;97541 73720;73721;123355;123356;123357 73721;123357 Q9H0F6 Q9H0F6 1 1 1 Sharpin SHARPIN sp|Q9H0F6|SHRPN_HUMAN Sharpin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHARPIN PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.6 3.6 3.6 39.949 387 387 0.0089744 1.7916 By matching By matching By MS/MS 0.75698 0.77119 7.8336 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 3.6 3.6 29078000 15384000 13694000 10923000 5556600 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sp|Q9H0L4|CSTFT_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF2T PE=1 SV=1 1 4 2 2 3 2 3 2 1 1 2 1 1 7.8 3.2 3.2 64.436 616 616 0.0010749 3.2105 By MS/MS By matching By MS/MS 1.073 1.1606 32.947 4 0 Leave out requantified 1.073 NaN NaN 1.1606 NaN NaN 32.947 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 6 4.4 6.2 136120000 65538000 70586000 107300000 51189000 56113000 14473000 8324800 6148200 14348000 6023800 8324300 2586 1628;10079;12496;23627 True;False;True;False 1639;10170;12605;23832 5461;33756;42544;42545;42546;79228;79229;79230 7137;42671;53309;99608;99609;99610 7137;42671;53309;99610 Q9H0S4 Q9H0S4 14 14 14 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 DDX47 sp|Q9H0S4|DDX47_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX47 PE=1 SV=1 1 14 14 14 12 14 11 12 14 11 12 14 11 40.2 40.2 40.2 50.646 455 455 0 90.096 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94223 0.94477 51.083 46 10 Leave out requantified 0.92589 0.92428 0.90524 0.98622 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21137;25894;57907;57908;57909;107567;107568 21137;25894;57909;107568 Q9H1I8 Q9H1I8 6 6 6 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 ASCC2 sp|Q9H1I8|ASCC2_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC2 PE=1 SV=3 1 6 6 6 6 3 3 6 3 3 6 3 3 12.9 12.9 12.9 86.359 757 757 0 14.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95735 0.96863 51.595 12 0 Leave out requantified 0.9535 0.71602 0.93174 1.0001 0.79226 0.92932 59.813 31.888 41.935 6 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.9 8.2 7.7 373570000 178790000 194790000 221260000 95158000 126110000 49558000 25668000 23889000 102750000 57959000 44793000 2593 2215;5937;7899;11523;23624;25288 True;True;True;True;True;True 2235;5992;7975;11627;23829;25507 7440;7441;20128;20129;20130;26494;26495;39005;39006;79223;79224;84759 9702;9703;25641;25642;25643;25644;25645;25646;33601;48942;99604;106793 9703;25641;33601;48942;99604;106793 Q9H1K0 Q9H1K0 3 3 3 Rabenosyn-5 RBSN 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3378;3379;3380;3381;26778;51687;68189;68190;105816;105817;105818 3378;26778;51687;68189;105816 Q9H3S7 Q9H3S7 8 8 8 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 PTPN23 sp|Q9H3S7|PTN23_HUMAN Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTPN23 PE=1 SV=1 1 8 8 8 5 4 5 5 4 5 5 4 5 6.7 6.7 6.7 178.97 1636 1636 0 13.708 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97619 1.045 17.243 12 5 Leave out requantified 0.90956 1.0235 1.2308 0.96501 1.124 1.2161 58.206 20.713 19.85 4 4 4 2 2 1 Median Median Leave out requantified 4.7 3 3.5 314490000 157570000 156920000 104680000 60488000 44192000 114210000 56420000 57788000 95599000 40657000 54942000 2616 150;1271;2654;3488;10485;17562;27399;28100 True;True;True;True;True;True;True;True 151;1280;2679;3521;10581;17709;27636;28343 495;496;497;4280;4281;4282;4283;8915;8916;11794;35087;35088;59434;91886;94158 653;654;655;656;657;5576;5577;5578;5579;5580;5581;11694;15287;44347;44348;74722;116065;119038 655;5577;11694;15287;44347;74722;116065;119038 Q9H3U1 Q9H3U1 30 30 30 Protein unc-45 homolog A UNC45A sp|Q9H3U1|UN45A_HUMAN Protein unc-45 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UNC45A PE=1 SV=1 1 30 30 30 26 27 23 26 27 23 26 27 23 42.3 42.3 42.3 103.08 944 944 0 158.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0157 1.0571 31.054 86 27 Leave out requantified 1.0356 0.90144 1.1005 1.0933 1.0099 1.0633 37.376 31.111 31.625 28 32 26 7 12 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.7 36.1 31.5 5962900000 2899600000 3063300000 1670600000 846120000 824460000 2399800000 1200100000 1199700000 1892500000 853380000 1039100000 2617 220;1065;1303;1343;2125;2386;2485;2775;4340;4432;5548;5808;7594;9145;12792;14747;14868;15823;16322;17305;18932;20159;22664;23656;23754;24217;24901;26297;26408;28204 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 221;1072;1312;1352;2143;2408;2508;2800;4382;4476;5602;5862;7668;9229;12903;14877;14999;15959;16461;17449;19104;20343;22864;23861;23959;24428;25119;26524;26635;28447 728;729;730;3592;3593;3594;3595;3596;3597;4385;4386;4387;4520;4521;4522;4523;4524;7135;7136;7137;8028;8348;8349;8350;9278;9279;14820;14821;14822;15142;15143;18864;19701;19702;25460;25461;25462;30599;30600;30601;43585;50283;50284;50285;50286;50650;50651;50652;50653;50654;50655;53877;53878;53879;53880;55522;55523;55524;55525;58573;58574;58575;58576;63842;63843;63844;67964;67965;67966;76098;79320;79321;79651;79652;79653;81208;81209;81210;83547;83548;83549;83550;88132;88133;88134;88135;88136;88137;88138;88524;88525;88526;94464;94465 944;945;946;947;948;949;4659;4660;4661;4662;4663;4664;5709;5710;5711;5866;5867;5868;5869;5870;9314;9315;9316;9317;10507;10921;10922;10923;12141;12142;18938;18939;18940;18941;18942;18943;19330;19331;23993;25042;25043;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32325;38680;38681;54697;63215;63216;63217;63218;63677;63678;63679;63680;63681;63682;67661;67662;67663;67664;67665;67666;69754;69755;69756;69757;73624;73625;73626;73627;73628;80259;80260;80261;80262;80263;80264;85317;85318;85319;85320;85321;85322;95567;99737;100148;100149;100150;102200;102201;102202;105288;105289;105290;111214;111215;111216;111217;111218;111219;111220;111221;111720;119405;119406 947;4662;5711;5868;9316;10507;10921;12142;18941;19330;23993;25043;32323;38680;54697;63215;63681;67663;69756;73626;80264;85318;95567;99737;100150;102200;105289;111218;111720;119405 Q9H410 Q9H410 5 5 5 Kinetochore-associated protein DSN1 homolog DSN1 sp|Q9H410|DSN1_HUMAN Kinetochore-associated protein DSN1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSN1 PE=1 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Median 6.2 6.2 6.2 59831000 33991000 25841000 18478000 10770000 7707900 20558000 12437000 8121400 20795000 10784000 10011000 2619 5179 True 5229 17652;17653;17654 22452;22453;22454;22455;22456 22454 Q9H479 Q9H479 4 4 4 Fructosamine-3-kinase FN3K sp|Q9H479|FN3K_HUMAN Fructosamine-3-kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FN3K PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 16.8 16.8 16.8 35.171 309 309 0 8.6048 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91124 0.93685 13.694 9 4 Leave out requantified 0.96921 0.67362 0.89293 1.0321 0.75099 0.87657 16.169 58.86 12.318 3 2 4 1 1 2 Median Median Median 12.9 8.4 12.9 299700000 170320000 129380000 93425000 49350000 44074000 88677000 56377000 32299000 117590000 64589000 53005000 2620 2597;15305;20742;21416 True;True;True;True 2620;15437;20926;21603 8696;8697;52046;52047;52048;69785;69786;69787;71919 11355;11356;65408;65409;65410;65411;87606;87607;87608;90337 11355;65409;87607;90337 Q9H488 Q9H488 4 4 4 GDP-fucose protein O-fucosyltransferase 1 POFUT1 sp|Q9H488|OFUT1_HUMAN GDP-fucose protein O-fucosyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POFUT1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 3 2 4 3 2 4 3 18 18 18 43.955 388 388 0 9.8623 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93226 0.9967 18.456 7 2 Leave out requantified NaN 0.8102 1.071 NaN 0.88905 1.0616 NaN 30.327 41.868 1 4 2 0 2 0 Median Median Median 6.7 18 11.6 163990000 75019000 88971000 44806000 16646000 28160000 70410000 34405000 36005000 48774000 23968000 24806000 2621 3653;6017;8133;28872 True;True;True;True 3690;6074;8212;29121 12400;12401;20394;27266;27267;27268;96578;96579;96580 16028;25985;34544;34545;34546;122071;122072;122073 16028;25985;34546;122072 Q9H4A3;Q9BYP7;Q96J92 Q9H4A3 26;5;4 26;5;4 22;2;2 Serine/threonine-protein kinase WNK1 WNK1 sp|Q9H4A3|WNK1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase WNK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WNK1 PE=1 SV=2 3 26 26 22 20 22 18 20 22 18 19 18 15 14.2 14.2 12.5 250.79 2382 2382;1800;1243 0 128.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0162 1.0771 26.165 62 16 Leave out requantified 1.0668 1.0039 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9048;9049;9050;11494;14155;14156;16637;16638;16639;20114;20115;20714;20855;24133;24134;24135;27753;27754;28958;28959;28960;28961;28962;28963;33446;33447;33923;42078;42079;46658;51870;70063;70064;70065;70531;70532;70533;70534;70535;70536;70537;77839;77840;77841;79289;79290;86692;86693;86694;87993;87994;87995;91897;91898;91899;93170;93171;93172;93453;93454;93455;95976;95977;95978 11848;11849;11850;11851;11852;14904;18079;18080;21146;21147;21148;21149;21150;21151;25623;25624;26357;26534;30637;35092;35093;36574;36575;36576;36577;36578;36579;42298;42883;52720;52721;58649;65191;87966;87967;87968;87969;88554;88555;88556;88557;88558;88559;88560;88561;88562;88563;97824;97825;97826;97827;97828;97829;99690;99691;109321;109322;109323;111041;111042;111043;116079;116080;117741;117742;117743;117744;118131;118132;118133;121330;121331;121332;121333 11851;14904;18079;21146;25623;26357;26534;30637;35092;36575;36577;42298;42883;52720;58649;65191;87969;88562;97824;99690;109323;111043;116080;117744;118133;121330 Q9H4A6;Q9H4A5 Q9H4A6 4;1 4;1 4;1 Golgi phosphoprotein 3 GOLPH3 sp|Q9H4A6|GOLP3_HUMAN Golgi phosphoprotein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLPH3 PE=1 SV=1 2 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 21.1 21.1 21.1 33.81 298 298;285 0 24.459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0639 1.1191 8.7072 10 3 Leave out requantified 1.0229 0.99282 1.3653 1.0944 1.1055 1.3148 5.6415 19.779 11.049 3 3 4 1 0 2 Median Median Median 15.8 9.4 14.8 587840000 281700000 306140000 230290000 121800000 108490000 183340000 90563000 92779000 174210000 69334000 104880000 2623 5977;20603;20774;21780 True;True;True;True 6033;20787;20959;21971 20269;69357;69358;69359;69887;73170;73171;73172;73173;73174 25811;87063;87064;87065;87732;91826;91827;91828;91829;91830 25811;87065;87732;91827 Q9H4B0 Q9H4B0 1 1 1 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondrial OSGEPL1 sp|Q9H4B0|OSGP2_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEPL1 PE=2 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.4 3.4 3.4 45.122 414 414 0.0030938 2.6068 By MS/MS By matching By MS/MS 0.87479 0.88425 9.2098 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.4 3.4 3.4 75287000 41375000 33912000 20020000 10238000 9782100 28994000 17560000 11433000 26273000 13577000 12696000 2624 24364 True 24576 81675;81676;81677 102754;102755 102754 Q9H4E7 Q9H4E7 1 1 1 Differentially expressed in FDCP 6 homolog DEF6 sp|Q9H4E7|DEFI6_HUMAN Differentially expressed in FDCP 6 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DEF6 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.3 1.3 1.3 73.91 631 631 0 3.7593 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2102 1.183 30.628 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.3 1.3 1.3 193220000 94439000 98778000 63920000 32968000 30952000 65661000 30610000 35050000 63637000 30861000 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16576;16577;16578;16929;17036;17037;17038;30028;30029;30030;30031;30032;30033;30434;31816;31817;31818;31819;31820;31821;34270;34271;34272;35161;35162;35163;35164;35165;39240;39241;39242;39243;39244;39245;39246;39247;39248;39249;39250;39251;39252;44995;44996;44997;44998;44999;58052;58053;58054;58055;59560;59561;66602;66603;66604;67173;93039;93040;93041;93042;93043;93044;97685;97686;97687 21071;21072;21073;21074;21075;21484;21617;21618;21619;21620;37955;37956;37957;37958;37959;37960;38458;40246;40247;40248;40249;40250;40251;43316;43317;43318;43319;44436;44437;44438;44439;44440;49245;49246;49247;49248;49249;49250;49251;49252;49253;49254;49255;49256;49257;56520;56521;56522;56523;56524;72955;72956;72957;72958;72959;72960;74911;83606;83607;83608;84313;117577;117578;117579;117580;117581;117582;117583;117584;123534;123535 21071;21484;21618;37955;38458;40247;43319;44437;49250;49257;56521;72959;74911;83608;84313;117580;123534 Q9H4L4 Q9H4L4 2 2 2 Sentrin-specific protease 3 SENP3 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8814;14379;29777;93718;97822 Q9H6T3 Q9H6T3 17 17 17 RNA polymerase II-associated protein 3 RPAP3 sp|Q9H6T3|RPAP3_HUMAN RNA polymerase II-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPAP3 PE=1 SV=2 1 17 17 17 12 11 13 12 11 13 12 11 13 34.4 34.4 34.4 75.718 665 665 0 91.774 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0965 1.135 33.341 33 8 Leave out requantified 1.1228 0.93989 1.0468 1.1859 1.0387 1.0267 31.102 34.926 27.399 10 12 11 3 4 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.8 21.2 23.5 1322100000 659170000 662930000 367240000 182160000 185080000 434200000 225440000 208750000 520670000 251570000 269100000 2643 972;3336;6275;7849;9768;10211;12161;12815;13341;18313;19058;19988;20028;23354;23778;26908;28400 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 977;3365;6336;7925;9857;10302;12269;12926;13460;18479;19230;20169;20211;23558;23983;27138;28645 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383 0 10.041 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7426 0.74729 32.159 10 0 Leave out requantified 0.72122 0.76988 0.88136 0.74655 0.83947 0.8648 19.749 54.626 21.686 3 4 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Plateau 14.6 14.6 11.5 527380000 274840000 252540000 178170000 90653000 87520000 171680000 91382000 80303000 177530000 92810000 84717000 2646 4731;25689;27913 True;True;True 4777;25914;28153 16119;16120;16121;86090;86091;93535;93536;93537;93538;93539 20530;108541;118237;118238;118239;118240;118241 20530;108541;118237 Q9H773 Q9H773 3 3 3 dCTP pyrophosphatase 1 DCTPP1 sp|Q9H773|DCTP1_HUMAN dCTP pyrophosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTPP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 16.5 16.5 16.5 18.681 170 170 0 4.5359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7159 1.7538 7.0215 7 1 Leave out requantified 1.4491 1.6593 2.0127 1.5058 1.8431 1.957 19.56 9.9301 22.524 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 11.2 16.5 11.2 218690000 74701000 143990000 69011000 26127000 42884000 84349000 25694000 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kinase 1 PEAK1 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN Inactive tyrosine-protein kinase PEAK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEAK1 PE=1 SV=4 1 3 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.9 1.9 1.9 193.1 1746 1746 0 4.9716 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88151 0.88139 116.97 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 0.7 0.6 0.6 102940000 49447000 53490000 32407000 24703000 7703200 53637000 16379000 37258000 16893000 8364400 8529000 2649 7580;15738;19582 True;True;True 7654;15874;19761 25408;53587;66050 32250;67336;82957 32250;67336;82957 Q9H7B2 Q9H7B2 2 2 2 Ribosome production factor 2 homolog RPF2 sp|Q9H7B2|RPF2_HUMAN Ribosome production factor 2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPF2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 6.9 6.9 6.9 35.582 306 306 0.0031002 2.64 By MS/MS By MS/MS 0.79618 0.79757 24.738 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 6.9 0 6.9 35632000 21837000 13795000 21023000 13178000 7844900 0 0 0 14609000 8658800 5949900 2650 18987;22695 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11101;11102;11103;11104;11105;13243;13244;19719;19720;19721;52390;52391;52392;52393;52394;61604;61605;69892;69893;69894;69895;69896;70786;70787 11102;13244;19720;52391;61605;69892;70787 Q9H7D0;Q92608 Q9H7D0 19;1 19;1 19;1 Dedicator of cytokinesis protein 5 DOCK5 sp|Q9H7D0|DOCK5_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK5 PE=1 SV=3 2 19 19 19 17 17 15 17 17 15 17 17 15 11.7 11.7 11.7 215.31 1870 1870;1830 0 46.311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95684 0.97015 20.082 45 12 Leave out requantified 0.92905 0.89066 0.95992 0.94928 0.96472 0.96902 28.037 18.119 28.911 17 15 13 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.5 9.9 8.4 1421800000 793460000 628300000 523320000 279510000 243810000 505060000 294520000 210540000 393390000 219440000 173950000 2652 4588;6313;8260;8956;9799;13325;14756;15536;16172;16405;18039;18456;19236;20587;22408;23738;24178;28804;28811 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Q9H7D7 2 2 2 WD repeat-containing protein 26 WDR26 sp|Q9H7D7|WDR26_HUMAN WD repeat-containing protein 26 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR26 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 4.8 4.8 4.8 72.123 661 661 0.0030571 2.495 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92528 0.97468 64.346 7 5 Median 0.66642 0.92528 NaN 0.72378 0.97468 NaN 76.787 69.903 NaN 3 3 1 2 2 1 Median Median Median 4.8 4.8 2 127420000 65115000 62303000 57788000 29744000 28044000 53506000 29763000 23742000 16123000 5606800 10516000 2653 18405;21966 True;True 18573;22158 62112;62113;62114;62115;73792;73793;73794 78085;78086;78087;92616;92617;92618 78086;92617 Q9H7E2 Q9H7E2 1 1 1 Tudor domain-containing protein 3 TDRD3 sp|Q9H7E2|TDRD3_HUMAN Tudor domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 2.9 2.9 2.9 73.184 651 651 0.0010768 3.2291 By MS/MS By MS/MS 0.53267 0.58534 26.708 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 2.9 2.9 0 50470000 31104000 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5819;6293;6294;6295;17192;83983;83984 7569;8220;8221;21837;105824 7569;8221;21837;105824 Q9H7Z3 Q9H7Z3 4 4 4 Protein NRDE2 homolog NRDE2 sp|Q9H7Z3|NRDE2_HUMAN Protein NRDE2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NRDE2 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 0 3 2 0 3 2 0 5.4 5.4 5.4 132.67 1164 1164 0.0024665 2.9247 By MS/MS By MS/MS 0.98418 1.0222 26.445 5 3 Median 0.8604 1.3115 NaN 0.93943 1.4368 NaN 11.221 13.927 NaN 3 2 0 1 2 0 Median Median Median 4.2 2.7 0 191700000 89056000 102640000 182250000 84560000 97687000 9453700 4495800 4957900 0 0 0 2658 7166;14192;15599;24197 True;True;True;True 7235;14317;15734;24408 24091;24092;48393;53100;81143 30578;30579;60802;66734;102114 30579;60802;66734;102114 Q9H7Z6 Q9H7Z6 4 3 3 Histone acetyltransferase KAT8 KAT8 sp|Q9H7Z6|KAT8_HUMAN Histone acetyltransferase KAT8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KAT8 PE=1 SV=2 1 4 3 3 4 2 4 3 1 3 3 1 3 10.3 7.9 7.9 52.402 458 458 0 10.781 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68958 0.69622 18.228 7 5 Median 0.69655 NaN 0.70243 0.73517 NaN 0.67703 21.516 NaN 3.954 4 1 2 3 1 1 Median Median Median 10.3 4.8 10.3 116510000 77086000 39422000 68950000 42224000 26726000 18782000 13718000 5063400 28776000 21144000 7632800 2659 13611;22950;25695;28823 False;True;True;True 13732;23154;25921;29071 46321;46322;46323;46324;77046;77047;86108;86109;86110;96426;96427;96428 58224;58225;58226;58227;96699;96700;108567;108568;108569;121861;121862;121863 58226;96700;108569;121861 Q9H832 Q9H832 11 11 11 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z UBE2Z sp|Q9H832|UBE2Z_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2Z PE=1 SV=2 1 11 11 11 9 9 11 9 9 11 9 9 11 32.2 32.2 32.2 38.21 354 354 0 44.459 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1084 1.0774 11.169 34 12 Leave out requantified 1.2958 0.92281 1.1084 1.3475 1.0136 1.0774 15.329 8.719 15.118 11 11 12 4 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.4 25.1 32.2 3843300000 1992700000 1850600000 1286100000 668260000 617820000 1192100000 620070000 571990000 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5 5 5 Histone-lysine N-methyltransferase EHMT1 EHMT1 sp|Q9H9B1|EHMT1_HUMAN Histone-lysine N-methyltransferase EHMT1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHMT1 PE=1 SV=4 1 5 5 5 5 3 4 5 3 4 5 3 4 5.9 5.9 5.9 141.46 1298 1298 0 8.7114 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8898 0.90846 22.318 11 3 Leave out requantified 0.8898 0.93096 0.85485 0.90846 1.0037 0.8372 23.639 20.556 25.492 4 3 4 1 1 1 Leave out requantified Plateau Leave out requantified 5.9 3 4.7 205990000 112250000 93744000 80168000 41662000 38505000 57307000 34370000 22937000 68518000 36216000 32302000 2677 411;1470;1790;6195;13958 True;True;True;True;True 413;1479;1807;6254;14082 1370;4934;4935;4936;6009;6010;6011;20975;20976;47579;47580;47581 1766;6402;6403;6404;6405;7827;7828;26696;26697;59807;59808;59809 1766;6403;7827;26696;59808 Q9H9C1 Q9H9C1 3 3 3 Spermatogenesis-defective protein 39 homolog VIPAS39 sp|Q9H9C1|SPE39_HUMAN Spermatogenesis-defective protein 39 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VIPAS39 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 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domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NMRAL1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 6.4 6.4 6.4 33.344 299 299 0.00036657 3.5787 By MS/MS By MS/MS 1.0122 1.1062 55.181 3 3 Median 0.72147 NaN NaN 0.7718 NaN NaN 72.292 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 6.4 4 0 45918000 23379000 22539000 24690000 12673000 12017000 21227000 10705000 10522000 0 0 0 2698 1540;3986 True;True 1549;4024 5154;5155;5156;13582 6711;6712;6713;17427 6713;17427 Q9HBM1 Q9HBM1 3 3 3 Kinetochore protein Spc25 SPC25 sp|Q9HBM1|SPC25_HUMAN Kinetochore protein Spc25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPC25 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 22.3 22.3 22.3 26.152 224 224 0 14.303 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95996 0.98583 1.0568 9 3 Leave out requantified 1.0478 0.91724 1.0431 1.0625 1 1.0039 15.053 5.245 6.8512 4 3 2 3 0 0 Median Leave out requantified Median 22.3 22.3 15.2 305120000 151930000 153190000 126640000 61063000 65575000 102120000 51804000 50319000 76356000 39061000 37295000 2699 4964;19334;23461 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receptor coactivator 5 NCOA5 sp|Q9HCD5|NCOA5_HUMAN Nuclear receptor coactivator 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCOA5 PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 3 2 2 3 2 2 3 2 7.8 7.8 7.8 65.536 579 579 0 4.4744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72415 0.75439 11.993 7 2 Leave out requantified 0.90298 0.62261 0.74619 0.95782 0.69359 0.72832 21.772 17.7 9.5887 2 3 2 1 1 0 Median Median Median 3.6 6.2 3.5 288380000 165940000 122440000 79300000 38586000 40715000 153670000 96178000 57489000 55412000 31172000 24240000 2702 7883;20828;21319;28829 True;True;True;True 7959;21013;21506;29077 26442;70066;70067;70068;71573;71574;96438 33532;87970;89905;89906;121873 33532;87970;89905;121873 Q9HCD6 Q9HCD6 7 7 7 Protein TANC2 TANC2 sp|Q9HCD6|TANC2_HUMAN Protein TANC2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANC2 PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4.4 4.4 4.4 219.65 1990 1990 0 10.601 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77782 0.83316 22.073 9 3 Leave out requantified 0.91732 0.59076 0.76927 0.97393 0.64398 0.76076 16.15 31.718 14.73 3 3 3 1 1 1 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30488000 2704 7113;17913;20490;21473 True;True;True;True 7182;18066;20674;21662 23920;23921;60530;60531;60532;69008;72135;72136;72137 30382;30383;76113;76114;76115;86632;90587;90588;90589 30382;76114;86632;90588 Q9HCK8;Q8TD26 Q9HCK8 9;2 9;2 8;1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 CHD8 sp|Q9HCK8|CHD8_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD8 PE=1 SV=5 2 9 9 8 6 7 5 6 7 5 5 6 4 4.8 4.8 4.5 290.52 2581 2581;2715 0 17.207 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92625 1.0071 33.567 12 2 Leave out requantified 1.1031 0.93378 1.0797 1.1635 1.0171 1.0809 15.216 36.173 22.739 4 5 3 2 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 2.7 4 2.3 262590000 132700000 129890000 93138000 48835000 44303000 109380000 52470000 56910000 60067000 31393000 28673000 2705 388;11206;13551;20134;22696;25453;27067;27113;27950 True;True;True;True;True;True;True;True;True 389;11307;13672;20318;22896;25676;27299;27345;28191 1292;1293;1294;37577;37578;37579;37580;37581;46124;67881;76195;76196;76197;85295;85296;90743;90744;90745;90909;93664 1667;1668;1669;47377;47378;47379;47380;47381;57953;85223;95676;95677;95678;95679;95680;107494;107495;114583;114584;114585;114831;118393 1668;47379;57953;85223;95676;107494;114584;114831;118393 Q9HCN4 Q9HCN4 3 3 3 GPN-loop GTPase 1 GPN1 sp|Q9HCN4|GPN1_HUMAN GPN-loop GTPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPN1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 13.1 13.1 13.1 41.74 374 374 0 4.6531 By matching By MS/MS By MS/MS 0.97563 1.0307 10.922 7 2 Leave out requantified 1.0049 0.94205 1.2621 1.0358 1.0165 1.2352 17.609 5.5067 89.921 2 2 3 0 0 2 Median Median Median 9.1 9.1 13.1 324960000 165630000 159330000 98444000 54373000 44071000 108170000 56384000 51782000 118350000 54877000 63473000 2706 10734;11564;22909 True;True;True 10831;11668;23113 35876;35877;35878;39188;76918;76919;76920 45351;45352;49188;96548 45351;49188;96548 Q9HCS7 Q9HCS7 5 5 5 Pre-mRNA-splicing factor SYF1 XAB2 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MS/MS By MS/MS 0.88713 0.90513 58.854 20 5 Leave out requantified 0.99068 0.7252 0.91596 1.0326 0.80391 0.92054 8.2091 53.647 62.855 6 7 7 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.2 21.9 21.2 856390000 437830000 418560000 247640000 116700000 130940000 309480000 164460000 145030000 299270000 156680000 142590000 2708 2520;5308;11307;14838;17677;17737;18453;21971 True;True;True;True;True;True;True;True 2543;5360;11409;14968;17827;17887;18622;22163 8456;8457;8458;18068;18069;38045;38046;38047;38048;38049;38050;50556;50557;50558;59816;59987;59988;59989;62273;62274;73805;73806;73807 11050;11051;11052;11053;11054;22974;22975;47919;47920;47921;47922;47923;47924;63562;63563;63564;75202;75417;75418;75419;75420;75421;78282;78283;92629;92630;92631;92632;92633;92634 11053;22974;47924;63563;75202;75418;78283;92632 Q9HDC5 Q9HDC5 3 3 3 Junctophilin-1 JPH1 sp|Q9HDC5|JPH1_HUMAN Junctophilin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JPH1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 6.4 6.4 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Dynein light chain roadblock-type 1 DYNLRB1 sp|Q9NP97|DLRB1_HUMAN Dynein light chain roadblock-type 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLRB1 PE=1 SV=3 2 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 51 51 51 10.921 96 96;96 0 18.609 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88459 0.9418 19.455 10 8 Median 0.97051 1.1396 0.79498 1.0297 1.1921 0.80925 15.768 20.783 18.903 4 3 3 4 2 2 Median Plateau Median 51 29.2 29.2 470660000 246700000 223960000 181270000 92480000 88790000 153200000 80177000 73027000 136190000 74042000 62147000 2716 3744;10902;23515 True;True;True 3781;11001;23720 12714;12715;12716;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;78869 16403;16404;16405;46054;46055;46056;46057;46058;46059;46060;46061;46062;99145 16404;46057;99145 Q9NPA3 Q9NPA3 2 2 2 Mid1-interacting protein 1 MID1IP1 sp|Q9NPA3|M1IP1_HUMAN Mid1-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MID1IP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 23.5 23.5 23.5 20.201 183 183 0.0043218 2.1896 By MS/MS By matching 1.1902 1.291 45.573 3 1 Median 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Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 16.7 16.7 16.7 26.383 245 245 0 9.9026 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9098 0.94117 8.9396 8 3 Leave out requantified 0.9789 0.91728 0.86878 0.99631 1.0018 0.83461 4.8053 3.1099 3.9122 3 3 2 2 1 0 Median Median Median 16.7 16.7 12.7 350860000 176880000 173980000 159970000 85656000 74310000 134590000 62891000 71701000 56305000 28336000 27970000 2719 1577;21103;26883 True;True;True 1587;21289;27113 5295;5296;5297;70886;70887;70888;70889;90139;90140 6919;6920;6921;6922;89017;89018;89019;89020;113797 6920;89018;113797 Q9NPD8 Q9NPD8 8 8 8 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T UBE2T sp|Q9NPD8|UBE2T_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2T PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 7 7 8 7 7 8 7 7 49.2 49.2 49.2 22.521 197 197 0 50.629 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97632 1.0464 6.2 25 4 Leave out requantified 0.94836 0.95237 1.1651 0.96893 1.0295 1.1104 16.569 8.4662 15.655 9 9 7 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.2 44.7 44.7 1367100000 655640000 711460000 486780000 245520000 241260000 457580000 225660000 231920000 422740000 184460000 238280000 2720 335;1908;2124;6480;8437;11980;15066;20451 True;True;True;True;True;True;True;True 336;1925;2142;6542;8516;12088;15197;20635 1103;1104;1105;6433;6434;6435;6436;7134;21950;21951;21952;21953;21954;28260;28261;28262;40808;40809;40810;40811;51276;51277;51278;68869;68870;68871 1417;1418;1419;1420;1421;1422;8404;8405;8406;8407;8408;8409;9313;27947;27948;27949;27950;27951;27952;35690;35691;51100;51101;51102;51103;51104;51105;64459;64460;64461;64462;86438;86439;86440;86441;86442 1417;8406;9313;27952;35690;51101;64461;86438 Q9NPE3 Q9NPE3 2 2 2 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 NOP10 sp|Q9NPE3|NOP10_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP10 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 43.8 43.8 43.8 7.7059 64 64 0 6.1304 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86394 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PPAN sp|Q9NQ55|SSF1_HUMAN Suppressor of SWI4 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPAN PE=2 SV=1 1 9 9 9 9 8 5 9 8 5 9 8 5 30.4 30.4 30.4 53.193 473 473 0 31.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91668 0.98017 21.382 22 5 Leave out requantified 0.8863 0.83985 0.89149 0.94211 0.91778 0.87706 24.13 25.03 15.52 8 9 5 1 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.4 26.8 11.6 1351600000 733940000 617670000 484560000 262150000 222410000 605050000 328270000 276780000 262000000 143520000 118480000 2730 2905;3338;16357;16615;16761;24131;24220;26480;27220 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2930;3367;16496;16758;16904;24341;24431;26707;27453 9779;9780;11269;11270;55629;56418;56419;56420;56899;56900;80935;80936;80937;81217;81218;81219;81220;88773;88774;88775;91255;91256;91257 12726;14594;14595;69874;70871;70872;70873;71508;101837;101838;101839;101840;101841;102208;102209;102210;102211;112039;115263;115264;115265 12726;14594;69874;70873;71508;101841;102209;112039;115263 Q9NQ88 Q9NQ88 1 1 1 Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR TIGAR sp|Q9NQ88|TIGAR_HUMAN Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGAR PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 6.3 6.3 6.3 30.062 270 270 0.0030896 2.5988 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 6.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2731 12624 True 12733 43004 53908 53908 Q9NQA3 Q9NQA3 5 1 1 WAS protein family homolog 6 WASH6P sp|Q9NQA3|WASH6_HUMAN WAS protein family homolog 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASH6P PE=1 SV=3 1 5 1 1 5 3 4 1 1 1 1 1 1 15.4 3.8 3.8 47.989 447 447 0 4.0654 By matching By MS/MS By MS/MS 0.97377 0.97273 23.508 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 15.4 8.7 11.4 33924000 19584000 14340000 10813000 6541000 4272200 10159000 7073300 3085700 12952000 5969700 6981900 2732 16809;19981;23215;24482;29132 False;True;False;False;False 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34706;34707;34708;34709;36279;36280;36281;39229;39230;39231;39232;39233;39234;39235;39236;39237;39238;39239;47943;70120;70121;70122;97136;97137;97138;97139;97140;97141;97142 43840;43841;43842;43843;45855;45856;49234;49235;49236;49237;49238;49239;49240;49241;49242;49243;49244;60213;88032;88033;88034;88035;122836;122837;122838;122839;122840;122841 43843;45855;49240;60213;88032;122836 Q9NQG5 Q9NQG5 7 6 6 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B RPRD1B sp|Q9NQG5|RPR1B_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1 1 7 6 6 7 7 7 6 6 6 6 6 6 30.4 25.8 25.8 36.899 326 326 0 49.145 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0572 1.1191 25.51 27 7 Leave out requantified 0.81321 1.0786 1.2367 0.86184 1.1659 1.1955 14.316 9.1675 51.68 9 7 11 3 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.4 30.4 30.4 1475200000 753140000 722020000 536940000 286990000 249950000 380860000 199680000 181190000 557360000 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Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BIRC6 PE=1 SV=2 1 10 10 10 5 8 6 5 8 6 5 8 6 4.1 4.1 4.1 530.25 4857 4857 0 24.364 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94775 0.91009 32.929 16 7 Leave out requantified 0.99724 0.97416 1.0979 1.0603 1.0379 1.063 47.389 30.952 17.138 4 7 5 1 5 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 1.3 3.5 2.6 326860000 163320000 163540000 68648000 40554000 28093000 145850000 69919000 75935000 112360000 52851000 59507000 2741 659;2502;9371;12732;15912;16973;22954;24026;24430;24746 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 661;2525;9458;12843;16049;17117;23158;24235;24642;24963 2174;2175;8393;8394;31319;31320;43378;43379;54167;54168;54169;54170;57559;77060;77061;77062;80584;80585;80586;81910;83003 2786;2787;10971;39587;39588;54418;68036;68037;68038;68039;72345;96718;96719;96720;101380;101381;101382;101383;103091;104574 2787;10971;39587;54418;68036;72345;96720;101381;103091;104574 Q9NR12 Q9NR12 7 7 7 PDZ and LIM domain protein 7 PDLIM7 sp|Q9NR12|PDLI7_HUMAN PDZ and LIM domain protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM7 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 7 6 6 7 6 6 7 6 19.7 19.7 19.7 49.844 457 457 0 29.887 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94072 0.9803 17.61 22 10 Leave out requantified 0.92793 0.95915 1.1314 0.95352 1.0529 1.0965 10.922 16.374 19.41 7 8 7 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.8 19.7 15.1 1155800000 575980000 579820000 410360000 209740000 200620000 393300000 195610000 197690000 352140000 170630000 181520000 2742 731;2010;9054;11657;13396;26895;28835 True;True;True;True;True;True;True 734;2028;9138;11763;13515;27125;29083 2399;2400;2401;6750;6751;6752;30295;30296;30297;39606;39607;45598;45599;45600;90180;90181;90182;90183;90184;90185;96455;96456 3085;3086;3087;3088;3089;3090;8845;38282;38283;38284;38285;38286;49664;49665;57248;57249;57250;113854;113855;113856;113857;113858;113859;121902 3085;8845;38284;49665;57248;113855;121902 Q9NR28 Q9NR28 5 5 5 Diablo homolog, mitochondrial DIABLO sp|Q9NR28|DBLOH_HUMAN Diablo homolog, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIABLO PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 5 18 18 18 27.131 239 239 0 14.195 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1847 1.2053 22.551 17 6 Leave out requantified 1.311 1.0207 1.2525 1.349 1.1111 1.214 12.597 23.445 20.633 7 6 4 4 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.6 14.6 18 779590000 349830000 429750000 267670000 117730000 149940000 276830000 130550000 146270000 235090000 101550000 133540000 2743 579;580;14333;21344;21986 True;True;True;True;True 581;582;14460;21531;22180 1910;1911;1912;1913;1914;1915;1916;48915;48916;48917;71642;73856;73857;73858;73859;73860;73861;73862 2444;2445;2446;2447;2448;2449;2450;2451;61439;61440;61441;61442;89990;92693;92694;92695;92696;92697;92698;92699 2446;2450;61440;89990;92696 Q9NR30 Q9NR30 36 36 34 Nucleolar RNA helicase 2 DDX21 sp|Q9NR30|DDX21_HUMAN Nucleolar RNA helicase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX21 PE=1 SV=5 1 36 36 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Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDS5B PE=1 SV=1 1 34 29 29 33 31 30 28 27 25 28 27 25 27.7 24.5 24.5 164.67 1447 1447 0 226.88 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89977 0.951 56.907 98 37 Leave out requantified 0.97443 0.86725 0.89658 1.0054 0.95861 0.87621 69.778 15.777 20.235 35 33 30 12 14 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.8 25.7 24.4 5735200000 2904500000 2830700000 2153000000 1047100000 1106000000 1865400000 968090000 897320000 1716700000 889360000 827370000 2768 806;1431;3813;4123;4140;4239;4577;7405;7838;8501;8800;9751;10534;11132;11916;12137;13610;15378;16050;16308;16310;17687;17785;18754;20543;21659;22084;22236;22343;22828;25413;25807;27448;28336 True;False;True;True;False;False;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KBTBD4 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.1 2.1 2.1 58.143 518 518 0.0089772 1.7926 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 2.1 0 2.1 29147000 15009000 14138000 0 0 0 0 0 0 29147000 15009000 14138000 2807 15670 True 15806 53333;53334 67025;67026 67026 Q9NVZ3 Q9NVZ3 2 2 2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 NECAP2 sp|Q9NVZ3|NECP2_HUMAN Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NECAP2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.5 9.5 9.5 28.338 263 263 0 6.0026 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4106 1.4034 27.694 6 2 Leave out requantified 1.0884 1.1665 1.4106 1.1194 1.2907 1.4034 18.057 1.6722 27.694 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 9.5 9.5 9.5 192660000 88373000 104290000 57116000 26072000 31044000 65820000 31243000 34577000 69726000 31059000 38668000 2808 666;9186 True;True 668;9270 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RNA-binding protein 28 RBM28 sp|Q9NW13|RBM28_HUMAN RNA-binding protein 28 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM28 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 6 5 5 6 5 5 6 5 11.7 11.7 11.7 85.737 759 759 0 20.066 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99348 1.0351 7.9011 15 6 Leave out requantified 0.82897 0.99348 0.97916 0.8695 1.0763 0.9576 19.304 20.584 11.645 4 6 5 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.2 10.5 9 339080000 181180000 157910000 99147000 55806000 43341000 136280000 70705000 65576000 103660000 54667000 48989000 2810 2902;4742;6194;10501;20933;21997;27754 True;True;True;True;True;True;True 2927;4788;6253;10597;21118;22191;27992 9772;9773;16155;20974;35127;35128;35129;70378;70379;70380;73892;73893;73894;93014;93015;93016;93017 12719;12720;20564;26695;44401;88362;92737;92738;92739;92740;92741;117547;117548;117549;117550 12719;20564;26695;44401;88362;92737;117548 Q9NW64 Q9NW64 1 1 1 Pre-mRNA-splicing factor RBM22 RBM22 sp|Q9NW64|RBM22_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor RBM22 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CTTNBP2 N-terminal-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTTNBP2NL PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 4.2 4.2 4.2 70.157 639 639 0 7.8988 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84098 1.3701 62.671 4 2 Linear NaN NaN 0.61178 NaN NaN 0.58262 NaN NaN 90.211 1 1 2 1 0 1 Median Median Median 1.3 4.2 2.7 75864000 43757000 32107000 10918000 8984000 1934500 33662000 18105000 15557000 31284000 16667000 14616000 2876 4258;10141;26690 True;True;True 4298;10232;26919 14534;14535;14536;33933;89489;89490 18577;18578;18579;42895;112962;112963 18577;42895;112963 Q9P2E9 Q9P2E9 25 25 25 Ribosome-binding protein 1 RRBP1 sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1 PE=1 SV=5 1 25 25 25 21 21 19 21 21 19 21 21 19 24.5 24.5 24.5 152.45 1410 1410 0 111.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88392 0.94233 24.546 60 16 Leave out requantified 0.75024 0.87212 1.0648 0.7929 0.97879 1.0339 19.625 22.859 26.33 21 19 20 3 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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4 4 4 4 5.8 4.7 4.7 118.72 1060 1060 0 57.264 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76268 0.84145 26.475 15 5 Leave out requantified 0.75079 0.782 0.83051 0.79222 0.87053 0.82613 12.369 27.596 19.039 4 5 6 1 0 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 5.8 5.8 5.8 802790000 448430000 354360000 248300000 123800000 124500000 286490000 180330000 106160000 268000000 144300000 123700000 2881 632;1077;5566;17170;18187 True;False;True;True;True 634;1084;5620;17314;18349 2089;2090;2091;2092;2093;3635;3636;3637;3638;18918;18919;18920;18921;58145;58146;58147;61411;61412;61413;61414 2673;2674;2675;2676;2677;4716;4717;4718;4719;24052;24053;24054;24055;24056;24057;24058;73074;73075;73076;77167;77168;77169;77170;77171;77172 2674;4716;24058;73075;77171 Q9P2R3 Q9P2R3 15 15 15 Rabankyrin-5 ANKFY1 sp|Q9P2R3|ANFY1_HUMAN Rabankyrin-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKFY1 PE=1 SV=2 1 15 15 15 9 13 11 9 13 11 9 13 11 19 19 19 128.4 1169 1169 0 55.246 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98926 0.99431 8.5227 37 15 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sp|Q9UBB9|TFP11_HUMAN Tuftelin-interacting protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFIP11 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 8.2 8.2 8.2 96.819 837 837 0 5.8013 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0129 1.1004 19.393 9 7 Median 0.91235 0.938 1.39 0.96605 1.0269 1.3505 14.063 10.64 13.019 4 2 3 3 1 3 Median Median Median 8.2 4.4 6.8 226150000 106080000 120070000 102360000 48938000 53419000 56259000 30242000 26017000 67533000 26902000 40631000 2888 4333;11524;22684;22877 True;True;True;True 4375;11628;22884;23079 14805;39007;39008;76166;76167;76168;76803;76804;76805 18918;48943;48944;95638;95639;95640;96418;96419;96420 18918;48944;95639;96419 Q9UBC2 Q9UBC2 8 8 8 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 EPS15L1 sp|Q9UBC2|EP15R_HUMAN Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS15L1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 5 7 6 5 7 6 5 7 6 12.2 12.2 12.2 94.254 864 864 0 24.425 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88866 0.94547 4.1241 17 8 Leave out requantified 0.67367 0.79719 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requantified 1.0414 0.86213 1.0856 1.1344 0.97016 1.0501 12.192 15.893 9.8692 18 17 17 5 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 45.7 45.7 45.7 7611300000 3758000000 3853300000 2399800000 1166500000 1233300000 2646900000 1363700000 1283200000 2564600000 1227800000 1336800000 2891 1943;4437;5181;5483;10173;14078;14765;17664;19111;26142;26250;27040;27657;27658;27896 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1961;4481;5231;5537;10264;14203;14895;17814;19283;26369;26477;27271;27895;27896;28136 6549;6550;6551;15154;15155;15156;15157;15158;17658;17659;17660;17661;18653;18654;18655;34038;34039;34040;34041;47994;47995;47996;50323;50324;50325;59785;59786;59787;64466;64467;64468;64469;64470;64471;87613;87614;87615;87986;87987;87988;90659;90660;90661;92704;92705;92706;92707;92708;92709;92710;93491;93492;93493 8567;8568;8569;19346;19347;19348;19349;19350;19351;19352;19353;22463;22464;22465;22466;22467;22468;23729;23730;23731;23732;23733;23734;43028;43029;43030;43031;60284;60285;60286;63266;63267;75175;75176;80989;80990;80991;80992;80993;80994;110551;110552;110553;110554;110555;110556;110557;111031;111032;111033;111034;111035;114469;114470;114471;114472;114473;114474;114475;117143;117144;117145;117146;117147;117148;117149;117150;117151;117152;117153;118181;118182;118183 8569;19351;22468;23729;43029;60284;63266;75175;80994;110555;111033;114473;117146;117149;118182 Q9UBF8 Q9UBF8 9 9 9 Phosphatidylinositol 4-kinase beta PI4KB sp|Q9UBF8|PI4KB_HUMAN Phosphatidylinositol 4-kinase beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KB PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 6 7 6 6 7 6 6 7 14.1 14.1 14.1 91.378 816 816 0 18.713 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96855 1.0208 49.434 20 7 Leave out requantified 0.91193 1.155 0.96855 0.94691 1.2636 0.93765 33.997 51.854 61.025 7 7 6 3 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.2 9.6 11 447880000 230380000 217500000 135100000 72015000 63086000 168810000 77412000 91393000 143970000 80955000 63020000 2892 5514;6616;6981;16045;17073;18204;20674;27386;28068 True;True;True;True;True;True;True;True;True 5568;6678;7050;16183;17217;18366;20858;27623;28311 18755;22371;22372;22373;23468;23469;23470;23471;54622;54623;57844;57845;61463;61464;69569;69570;91841;91842;91843;94054;94055 23862;28461;28462;28463;29819;29820;29821;29822;68579;68580;72689;72690;77231;77232;87339;87340;116016;118927 23862;28461;29822;68580;72689;77231;87339;116016;118927 Q9UBI1 Q9UBI1 5 5 5 COMM domain-containing protein 3 COMMD3 sp|Q9UBI1|COMD3_HUMAN COMM domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COMMD3 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 35.4 35.4 35.4 22.151 195 195 0 20.382 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0558 1.1206 48.436 9 4 Leave out requantified 1.0898 0.87169 0.83657 1.1478 0.96095 0.82778 57.431 42.866 10.514 2 4 3 0 3 1 Median Median Median 23.1 29.7 29.2 418640000 232230000 186410000 123990000 68020000 55967000 146600000 83241000 63355000 148060000 80973000 67084000 2893 82;12192;19487;22068;23511 True;True;True;True;True 82;12301;19663;22262;23716 278;279;280;41524;41525;65738;65739;65740;74094;78859;78860 380;381;52022;52023;82557;82558;82559;92999;99132;99133 380;52022;82557;92999;99133 Q9UBI6 Q9UBI6 1 1 1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 GNG12 sp|Q9UBI6|GBG12_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNG12 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 15.3 15.3 15.3 8.0061 72 72 0.0030211 2.3288 By MS/MS By MS/MS 0.70085 0.69455 14.396 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 15.3 15.3 49114000 28445000 20669000 0 0 0 22229000 13341000 8888000 26885000 15104000 11781000 2894 23964 True 24173 80366;80367 101066;101067 101066 Q9UBK8 Q9UBK8 2 2 2 Methionine synthase reductase MTRR sp|Q9UBK8|MTRR_HUMAN Methionine synthase reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTRR PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.9 3.9 3.9 77.673 698 698 0 5.4779 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8428 0.85687 3.5348 5 2 Median 0.79888 NaN 0.86796 0.8492 NaN 0.85041 5.4852 NaN 4.3959 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 3.9 3.9 3.9 163410000 91971000 71437000 68888000 38857000 30031000 24785000 14819000 9965400 69735000 38295000 31440000 2895 3260;29158 True;True 3287;29410 11006;11007;11008;97542;97543;97544;97545;97546 14240;14241;14242;14243;14244;14245;123358;123359;123360;123361;123362 14244;123361 Q9UBL3 Q9UBL3 4 4 4 Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 ASH2L sp|Q9UBL3|ASH2L_HUMAN Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASH2L PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 7 7 7 68.722 628 628 0 7.2683 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82943 1.4439 80.683 4 2 Linear 0.41392 NaN NaN 0.44183 NaN NaN 119.48 NaN NaN 2 1 1 1 1 0 Median Median Median 5.7 4 5.3 71433000 38058000 33375000 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sorting-associated protein 29 VPS29 sp|Q9UBQ0|VPS29_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS29 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 21.4 21.4 21.4 20.505 182 182 0 9.4851 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80504 0.82838 27.121 6 3 Median 0.72558 0.81211 NaN 0.77166 0.88847 NaN 35.766 19.883 NaN 3 2 1 2 1 0 Median Median Median 21.4 21.4 7.1 73011000 44680000 28331000 44597000 28250000 16347000 20470000 11956000 8514400 7943500 4474600 3468900 2900 9205;13159;17534 True;True;True 9290;13276;17681 30811;30812;30813;44783;44784;59354;59355;59356 38932;38933;38934;56218;56219;74618;74619;74620;74621 38933;56218;74620 Q9UBQ5 Q9UBQ5 7 7 7 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K EIF3K sp|Q9UBQ5|EIF3K_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3K PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 48.2 48.2 48.2 25.059 218 218 0 71.442 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0131 1.0419 8.1216 34 9 Leave out requantified 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8338;8339;8340;8341;8342;8343;8344;8345;8346;12298;12299;12300;26072;39423;64858;64859;64860;64861;64862;70609;70610;70611;70612;70613;72280;72281;72282;72283;72284;72285;76343;76344;76345;82760;82761;82762;82763;82764;94021;94022;94023;100373;106178;106179;106180;106181;118488;118489;122498;122499 8345;12299;26072;39423;64858;70609;72281;76344;82764;94021;100373;106178;118488;122498 Q9UHP3 Q9UHP3 2 2 2 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 USP25 sp|Q9UHP3|UBP25_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP25 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 2.7 2.7 2.7 122.22 1055 1055 0.0068449 1.9585 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 1.2 2.7 0 25091000 13131000 11959000 0 0 0 25091000 13131000 11959000 0 0 0 2937 7344;22930 True;True 7415;23134 24642;24643;76977 31269;31270;31271;96621 31270;96621 Q9UHR4 Q9UHR4 6 6 6 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2-like protein 1 BAIAP2L1 sp|Q9UHR4|BI2L1_HUMAN Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAIAP2L1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 2 4 4 2 4 4 2 4 4 12.9 12.9 12.9 56.882 511 511 0 16.343 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95359 0.95965 15.535 9 3 Leave out requantified 0.89669 0.87335 0.99291 0.96285 0.95476 0.96456 17.307 27.223 15.407 2 3 4 1 1 1 Median Median Leave out requantified 6.7 10 9.4 409690000 218030000 191660000 103080000 55263000 47813000 117190000 64378000 52811000 189430000 98389000 91037000 2938 2651;6116;7863;12369;17275;28241 True;True;True;True;True;True 2676;6174;7939;12478;17419;28484 8908;8909;20722;26379;42119;42120;42121;58475;58476;94570 11684;11685;26365;33448;52781;52782;52783;52784;52785;73514;119539 11685;26365;33448;52784;73514;119539 Q9UHR5 Q9UHR5 4 4 4 SAP30-binding protein SAP30BP sp|Q9UHR5|S30BP_HUMAN SAP30-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP30BP PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 20.1 20.1 20.1 33.87 308 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5128;5129;5130;5131;5132;5133;8652;8653;8654;8655;8656;8657;8658;16351;16352;16353;16354;16355;16356;16357;16358;23872;26863;33721;33722;46502;52589;52590;52591;52592;52593;58441;58442;58443;58444;58445;58446;58447;58448;58449;58450;58451;58452;59076;59077;59078;59079;59080;59081;60654;60655;60656;60657;61039;61040;65712;65713;65714;65715;65716;65717;65718;65719;85555;85556;85557;85558;85559;85560;94143;94144;94145;94146;94147;94148;99581;99582;99583;99584;99585;99586;112280;112281;112282;112283;112284;112285;112286;112287;112956;112957;112958;112959;117975;117976;117977;117978;117979;119169;119170;119171;119172;119173;119174;119175;119397;119398;119399;119400;119401;119916;119917 5133;8656;16352;23872;26863;33721;46502;52590;58444;59076;60657;61039;65719;85556;94148;99584;112281;112958;117976;119174;119401;119917 Q9UHY1 Q9UHY1 1 1 1 Nuclear receptor-binding protein NRBP1 sp|Q9UHY1|NRBP_HUMAN Nuclear receptor-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NRBP1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 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ATP-dependent RNA helicase DDX41 DDX41 sp|Q9UJV9|DDX41_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX41 PE=1 SV=2 1 10 10 10 7 5 8 7 5 8 7 5 8 22.3 22.3 22.3 69.837 622 622 0 23.136 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0028 1.0931 22.332 19 8 Leave out requantified 0.89844 1.0309 0.80124 0.96442 1.1311 0.81519 30.133 12.197 18.274 7 5 7 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.1 12.7 16.9 395780000 201200000 194590000 146110000 69062000 77047000 106240000 52075000 54165000 143440000 80060000 63376000 2959 738;2660;4859;5935;9200;9813;10824;18516;21118;21665 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 741;2685;4906;5990;9285;9903;10921;18686;21304;21855 2415;8937;8938;8939;16579;16580;16581;20121;30794;30795;32854;32855;32856;36165;36166;62478;70937;72823;72824;72825 3107;11718;11719;11720;21076;21077;21078;25630;38906;41551;45726;78554;89074;91407 3107;11720;21076;25630;38906;41551;45726;78554;89074;91407 Q9UJX2 Q9UJX2 6 6 6 Cell division cycle protein 23 homolog CDC23 sp|Q9UJX2|CDC23_HUMAN Cell division cycle protein 23 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC23 PE=1 SV=3 1 6 6 6 5 6 5 5 6 5 5 6 5 11.6 11.6 11.6 68.833 597 597 0 16.336 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98726 1.0185 12.519 16 1 Leave out requantified 1.008 0.91819 0.98726 1.0971 1.0104 0.94498 29.578 12.346 11.971 5 6 5 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.7 11.6 8.7 572510000 287900000 284610000 165500000 83375000 82121000 222900000 113790000 109110000 184120000 90736000 93379000 2960 1511;2678;13942;15464;19597;20619 True;True;True;True;True;True 1520;2703;14066;15598;19776;20803 5066;5067;5068;8989;8990;8991;47524;47525;47526;52608;66096;66097;66098;69395;69396;69397 6596;6597;11781;59742;66111;83018;83019;83020;83021;87114;87115;87116;87117;87118 6596;11781;59742;66111;83018;87115 Q9UJX3 Q9UJX3 11 11 11 Anaphase-promoting complex subunit 7 ANAPC7 sp|Q9UJX3|APC7_HUMAN Anaphase-promoting complex 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protein 3 PACSIN3 sp|Q9UKS6|PACN3_HUMAN Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACSIN3 PE=1 SV=2 1 13 13 13 11 12 12 11 12 12 11 12 12 43.6 43.6 43.6 48.486 424 424 0 120.84 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0224 1.0277 12.696 53 17 Leave out requantified 0.96748 1.0119 0.9942 1.0026 1.1012 0.95621 15.104 9.2813 13.63 16 18 19 6 4 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.9 38.2 40.3 3769200000 1851100000 1918100000 1192600000 575280000 617330000 1268200000 626990000 641220000 1308400000 648850000 659520000 2979 403;1593;1991;2588;4080;4309;10406;12413;14571;17023;18388;23483;28856 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 405;1603;2009;2611;4118;4351;10500;12522;14700;17167;18556;23688;29105 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99386 1.0762 10.608 22 13 Leave out requantified 1.2056 0.79328 0.92225 1.2426 0.87674 0.91273 17.96 16.598 42.056 7 6 9 3 2 8 Leave out requantified Leave out requantified Median 16.9 15.1 16.9 814080000 415840000 398230000 259870000 118290000 141590000 251870000 137450000 114420000 302330000 160100000 142230000 2984 8051;9671;17648;21018;23048;23049;24683 True;True;True;True;True;True;True 8130;9760;17798;21204;23252;23253;24900 26987;26988;26989;26990;26991;26992;26993;32310;32311;32312;59742;59743;59744;70637;70638;77376;77377;77378;77379;82818;82819;82820 34196;34197;34198;34199;34200;34201;34202;40898;40899;40900;75124;75125;75126;88698;88699;97178;97179;97180;97181;97182;97183;104331;104332;104333;104334;104335;104336 34197;40898;75125;88698;97178;97182;104336 Q9UL15 Q9UL15 3 3 3 BAG family molecular chaperone regulator 5 BAG5 sp|Q9UL15|BAG5_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG5 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 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Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASAP1 PE=1 SV=4 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 7 7 7 125.5 1129 1129 0 14.133 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80457 0.84322 0.42928 11 7 Leave out requantified 0.80614 0.74498 0.85378 0.87544 0.8275 0.84066 52.34 33.23 55.065 4 4 3 3 2 2 Median Median Median 5.8 5.7 4.4 252820000 136940000 115880000 72287000 36467000 35819000 115200000 64982000 50214000 65335000 35490000 29845000 2988 1111;9418;19610;22510;23339 True;True;True;True;True 1120;9505;19789;22709;23543 3761;3762;3763;31465;66141;75562;75563;75564;78310;78311;78312 4912;4913;4914;39785;83073;94898;98433;98434;98435 4913;39785;83073;94898;98433 Q9ULK4 Q9ULK4 2 2 2 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 MED23 sp|Q9ULK4|MED23_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED23 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1.9 1.9 1.9 156.47 1368 1368 0.001083 3.2874 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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Q9UPQ3;Q8TF27;A6NIR3 Q9UPQ3 3;1;1 3;1;1 3;1;1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 AGAP1 sp|Q9UPQ3|AGAP1_HUMAN Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGAP1 PE=1 SV=4 3 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 5.4 5.4 5.4 94.469 857 857;550;686 0 7.9954 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87818 0.90396 25.722 4 1 Median 0.88623 NaN NaN 0.92038 NaN NaN 36.602 NaN NaN 2 1 1 1 0 0 Median Median Median 3.7 1.5 3.2 62336000 33124000 29212000 43294000 23087000 20207000 9298600 4508100 4790400 9743300 5528800 4214500 3024 3475;15170;17382 True;True;True 3508;15301;17528 11755;11756;11757;51603;58831 15246;15247;15248;64881;73971 15246;64881;73971 Q9UPT5 Q9UPT5 12 12 12 Exocyst complex component 7 EXOC7 sp|Q9UPT5|EXOC7_HUMAN Exocyst complex component 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC7 PE=1 SV=3 1 12 12 12 9 11 12 9 11 12 9 11 12 21.5 21.5 21.5 83.381 735 735 0 51.757 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92168 0.98146 24.168 35 15 Leave out 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Exosome complex exonuclease RRP44 DIS3 sp|Q9Y2L1|RRP44_HUMAN Exosome complex exonuclease RRP44 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIS3 PE=1 SV=2 1 15 15 15 11 12 14 11 12 14 11 12 14 23.2 23.2 23.2 109 958 958 0 56.986 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0442 1.1131 18.709 38 9 Leave out requantified 0.9743 1.0059 1.0421 1.0116 1.1201 1.0487 20.032 34.971 9.7174 11 12 15 1 2 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.2 18.6 22 1175700000 602400000 573330000 339480000 173370000 166120000 354530000 181900000 172630000 481710000 247130000 234580000 3052 961;2155;3948;7442;7443;10778;11237;11373;12060;12547;14306;18400;18583;22810;23221 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 966;2173;3986;7515;7516;10875;11338;11476;12168;12656;14433;18568;18753;23010;23425 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2736;2737;2738;2739;2740;2741;11903;11904;11905;15657;15658;15659;15660;15661;28251;28252;28253;34148;34149;37986;37987;37988;37989;37990;37991;60731;60732;60733;63152;63153;63154;63155;63156;63157;63158 3534;3535;3536;3537;3538;3539;15412;19973;19974;19975;19976;19977;19978;19979;19980;35681;43173;47845;47846;47847;47848;47849;47850;76362;76363;76364;79411;79412;79413;79414;79415;79416;79417;79418;79419;79420;79421 3538;15412;19980;35681;43173;47850;76363;79415 Q9Y2R4 Q9Y2R4 3 3 3 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52 DDX52 sp|Q9Y2R4|DDX52_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX52 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 6.7 6.7 6.7 67.497 599 599 0 8.8731 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94963 0.99189 32.086 7 5 Median 0.94963 NaN NaN 0.99189 NaN NaN 31.942 NaN NaN 5 1 1 4 1 0 Median Median Median 6.7 4.3 2 243850000 126940000 116910000 180180000 92613000 87569000 20120000 10194000 9926700 43546000 24129000 19417000 3055 1085;4490;6519 True;True;True 1092;4535;6581 3655;15313;15314;22077;22078;22079;22080;22081 4742;19543;19544;28101;28102;28103;28104;28105 4742;19544;28102 Q9Y2R5 Q9Y2R5 1 1 1 28S ribosomal protein S17, mitochondrial MRPS17 sp|Q9Y2R5|RT17_HUMAN 28S ribosomal protein S17, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS17 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 22.3 22.3 22.3 14.502 130 130 0.0033478 2.2885 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 22.3 22.3 0 15896000 8877900 7018400 15896000 8877900 7018400 0 0 0 0 0 0 3056 26635 True 26862 89314;89315 112739;112740 112739 Q9Y2R9 Q9Y2R9 4 4 4 28S ribosomal protein S7, mitochondrial MRPS7 sp|Q9Y2R9|RT07_HUMAN 28S ribosomal protein S7, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS7 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 19.4 19.4 19.4 28.134 242 242 0 9.2703 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2757 1.2796 86.361 8 5 Median 2.0705 1.0503 1.2854 2.1948 1.1457 1.2381 71.644 108.62 92.021 2 3 3 1 2 2 Median Median 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complex component CSL4 EXOSC1 sp|Q9Y3B2|EXOS1_HUMAN Exosome complex component CSL4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 20 20 20 21.452 195 195 0 12.946 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9678 1.0434 33.351 9 0 Leave out requantified 0.9678 0.9595 1.1115 0.98128 1.0434 1.0617 43.197 30.961 23.701 3 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 20 20 381690000 201270000 180420000 127030000 69492000 57542000 127910000 67577000 60329000 126750000 64206000 62544000 3080 14579;22129;26582 True;True;True 14708;22324;26809 49725;49726;49727;74265;74266;74267;89122;89123;89124 62505;62506;62507;62508;62509;62510;93194;93195;93196;112496;112497;112498 62505;93195;112497 Q9Y3B4 Q9Y3B4 4 4 4 Splicing factor 3B subunit 6 SF3B6 sp|Q9Y3B4|SF3B6_HUMAN Splicing factor 3B subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 39.2 39.2 39.2 14.585 125 125 0 28.022 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92773 0.90767 12.45 16 3 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NOP16 sp|Q9Y3C1|NOP16_HUMAN Nucleolar protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP16 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 4 4 2 4 4 2 4 4 34.8 34.8 34.8 21.188 178 178 0 12.339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93733 0.92789 15.122 12 5 Leave out requantified 1.2045 0.86744 0.93733 1.2678 0.96557 0.92789 7.7923 62.114 6.4661 2 5 5 0 4 1 Median Median Leave out requantified 12.4 25.3 26.4 406230000 189380000 216860000 98601000 37450000 61151000 149500000 82963000 66542000 158130000 68963000 89165000 3084 1630;8961;14140;19792;28871 True;True;True;True;True 1641;9045;14265;19972;29120 5465;5466;5467;5468;5469;30010;48229;66767;66768;66769;96573;96574;96575;96576;96577 7141;7142;7143;7144;7145;37934;60594;83787;83788;83789;122065;122066;122067;122068;122069;122070 7142;37934;60594;83787;122069 Q9Y3C4 Q9Y3C4 2 2 2 EKC/KEOPS complex subunit TPRKB TPRKB sp|Q9Y3C4|TPRKB_HUMAN EKC/KEOPS complex subunit TPRKB OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPRKB PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 14.9 14.9 14.9 19.661 175 175 0 5.4669 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78764 0.85012 16.552 4 1 Median NaN NaN 0.83458 NaN NaN 0.83126 NaN NaN 28.255 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 4 4 14.9 181980000 98133000 83847000 45900000 24966000 20934000 27905000 16535000 11369000 108180000 56632000 51544000 3085 20405;27767 True;True 20589;28005 68710;93056;93057;93058 86231;117599;117600;117601 86231;117599 Q9Y3C6 Q9Y3C6 2 2 2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 PPIL1 sp|Q9Y3C6|PPIL1_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIL1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 14.5 14.5 14.5 18.237 166 166 0.0031013 2.6408 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 14.5 0 0 29577000 16641000 12937000 29577000 16641000 12937000 0 0 0 0 0 0 3086 3529;26009 True;True 3563;26236 11926;87159 15436;109957 15436;109957 Q9Y3C7 Q9Y3C7 2 2 2 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31 MED31 sp|Q9Y3C7|MED31_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED31 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 12.2 12.2 12.2 15.805 131 131 0.00072807 3.4931 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86228 0.92531 16.373 4 3 Median NaN NaN 0.86165 NaN NaN 0.86872 NaN NaN 27.417 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 5.3 5.3 12.2 64362000 32538000 31824000 17591000 7958600 9632200 15312000 6889000 8422700 31460000 17691000 13769000 3087 725;6707 True;True 728;6770 2379;2380;2381;2382;22636 3055;3056;3057;3058;3059;28789 3057;28789 Q9Y3C8 Q9Y3C8 1 1 1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 UFC1 sp|Q9Y3C8|UFC1_HUMAN Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UFC1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.4 5.4 5.4 19.458 167 167 0.0062193 2.0124 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6251 1.9575 30.737 4 4 Linear NaN NaN 1.3479 NaN NaN 1.3495 NaN NaN 44.286 1 1 2 1 1 2 Median Median Median 5.4 5.4 5.4 31691000 10346000 21345000 6383900 1722300 4661600 8814900 2477900 6336900 16492000 6145600 10346000 3088 3160 True 3187 10655;10656;10657;10658 13786;13787;13788;13789 13787 Q9Y3D0 Q9Y3D0 3 3 3 Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 FAM96B sp|Q9Y3D0|CIA2B_HUMAN Cytosolic iron-sulfur assembly component 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAO2B PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 30.7 30.7 30.7 17.663 163 163 0 17.135 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1418 1.1982 14.378 9 0 Leave out requantified 1.1418 1.0262 1.2335 1.2197 1.096 1.1982 9.9958 11.113 14.378 3 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30.7 30.7 30.7 522700000 262410000 260280000 160080000 79093000 80986000 189490000 99010000 90483000 173120000 84311000 88812000 3089 6088;22178;22420 True;True;True 6145;22375;22618 20625;20626;20627;74459;74460;74461;75247;75248;75249 26237;93472;93473;93474;93475;93476;93477;93478;94472;94473;94474;94475;94476 26237;93473;94476 Q9Y3D6 Q9Y3D6 3 3 3 Mitochondrial fission 1 protein FIS1 sp|Q9Y3D6|FIS1_HUMAN Mitochondrial fission 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIS1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 23.7 23.7 23.7 16.937 152 152 0 37.183 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0332 1.0604 7.0637 7 1 Leave out requantified 1.0635 0.8804 1.0772 1.1409 0.97119 1.0673 2.7248 12.662 7.9865 3 2 2 1 0 0 Median Median Median 23.7 15.8 15.8 367210000 182880000 184320000 120540000 56979000 63565000 125520000 66379000 59138000 121150000 59525000 61620000 3090 9894;10094;23531 True;True;True 9985;10185;23736 33143;33144;33145;33798;33799;33800;78908 41917;41918;41919;41920;41921;42720;42721;42722;42723;42724;42725;99196 41917;42721;99196 Q9Y3D8 Q9Y3D8 4 4 4 Adenylate kinase isoenzyme 6 AK6 sp|Q9Y3D8|KAD6_HUMAN Adenylate kinase isoenzyme 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 33.7 33.7 33.7 20.061 172 172 0 14.813 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71611 0.7342 16.142 13 7 Leave out requantified 0.6375 0.88941 0.96977 0.65146 0.96602 0.96897 29.781 24.729 40.963 5 3 5 2 2 3 Leave out requantified Median Median 33.7 24.4 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receptor-associated protein STRAP sp|Q9Y3F4|STRAP_HUMAN Serine-threonine kinase receptor-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRAP PE=1 SV=1 1 14 14 14 14 14 12 14 14 12 14 14 12 51.4 51.4 51.4 38.438 350 350 0 86.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85861 0.89921 18.811 48 19 Leave out requantified 0.82391 0.81113 1.0323 0.86955 0.89665 1.0094 18.222 19.313 24.842 17 16 15 7 7 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 51.4 51.4 43.1 3805900000 2000000000 1805900000 1315700000 700070000 615670000 1310900000 722770000 588150000 1179300000 577150000 602130000 3094 219;1588;3134;5751;8722;9729;13615;17657;20219;20395;22332;25494;28058;28433 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 220;1598;3161;5805;8803;9818;13736;17807;20403;20579;22530;25717;28301;28678 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20 21 58.2 58.2 58.2 55.21 505 505 0 277.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89371 0.93356 33.515 90 16 Leave out requantified 0.89557 0.87087 0.92412 0.94643 0.96417 0.90087 24.6 35.917 27.218 30 29 31 6 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.3 55 54.3 15505000000 8161100000 7343600000 5104800000 2674100000 2430700000 4953300000 2705700000 2247600000 5446600000 2781300000 2665200000 3095 5971;7038;9562;9624;10031;10123;10207;10508;10853;11935;14321;16385;17007;17539;18216;19048;19718;20368;23346;23809;24996;24997;26401 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6027;7107;9650;9712;10122;10214;10298;10604;10951;12043;14448;16526;17151;17686;18380;19220;19898;20552;23550;24014;25214;25215;26628 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFS1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 7.4 7.4 7.4 50.195 457 457 0 9.6589 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1103 1.0838 31.583 8 0 Leave out requantified 1.0667 1.175 1.0191 1.0805 1.2744 0.9978 18.51 47.209 11.689 3 3 2 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 7.4 7.4 4.8 221340000 109390000 111960000 84018000 38214000 45804000 81273000 42143000 39130000 56054000 29030000 27024000 3158 12054;20982;26182 True;True;True 12162;21167;26409 41046;41047;41048;70526;70527;87786;87787;87788 51396;88549;110786;110787;110788;110789;110790 51396;88549;110786 Q9Y6A4 Q9Y6A4 2 2 2 Cilia- and flagella-associated protein 20 CFAP20 sp|Q9Y6A4|CFA20_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP20 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 11.9 11.9 11.9 22.774 193 193 0 7.5959 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0065 1.0307 7.1901 5 3 Median 0.92033 NaN 1.0539 0.98198 NaN 1.0442 6.8442 NaN 6.4499 2 1 2 2 0 1 Median Median 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protein MAD1 MAD1L1 sp|Q9Y6D9|MD1L1_HUMAN Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAD1L1 PE=1 SV=2 1 17 17 17 13 15 12 13 15 12 13 15 12 28.1 28.1 28.1 83.066 718 718 0 45.442 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1125 1.173 33.315 41 11 Leave out requantified 1.0803 1.1549 1.2007 1.0924 1.2931 1.2011 23.78 26.16 35.326 13 14 14 3 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.6 24.2 22.1 1303100000 616810000 686310000 397690000 189770000 207920000 445950000 211210000 234740000 459490000 215840000 243650000 3163 383;1023;1478;5398;5455;6233;7388;8907;9697;13146;16997;17126;20091;21193;21265;26606;26981 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 384;1029;1487;5451;5509;6292;7461;8991;9786;13263;17141;17270;20274;21379;21451;26833;27212 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2-5-oligoadenylate synthase 3 OAS3 sp|Q9Y6K5|OAS3_HUMAN 2-5-oligoadenylate synthase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OAS3 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 4.6 4.6 4.6 121.17 1087 1087 0 11.664 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0382 1.0977 4.3233 7 0 Leave out requantified 1.2644 0.9404 1.078 1.3761 1.063 1.0717 21.56 16.402 5.7928 2 3 2 0 0 0 Median Leave out requantified Median 3.3 4.6 3.3 256600000 123750000 132850000 75967000 35086000 40881000 95648000 48153000 47495000 84983000 40508000 44475000 3167 5021;16301;19112;25565 True;True;True;True 5070;16440;19284;25788 17090;17091;55460;55461;55462;64472;64473;85679;85680;85681 21694;21695;21696;69672;69673;69674;69675;69676;80995;80996;108010;108011 21696;69676;80996;108010 Q9Y6M4;P78368;Q9HCP0 Q9Y6M4;P78368;Q9HCP0 4;3;2 4;3;2 4;3;2 Casein kinase I isoform gamma-3;Casein kinase I isoform gamma-2;Casein kinase I isoform gamma-1 CSNK1G3;CSNK1G2;CSNK1G1 sp|Q9Y6M4|KC1G3_HUMAN Casein kinase I isoform gamma-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSNK1G3 PE=1 SV=2;sp|P78368|KC1G2_HUMAN Casein kinase I isoform gamma-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSNK1G2 PE=1 SV=1;sp|Q9HCP0|KC1G1_HUMAN Casein kinase I isoform gamma-1 OS=H 3 4 4 4 1 3 2 1 3 2 1 3 2 10.5 10.5 10.5 51.388 447 447;415;422 0 5.718 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70248 0.71966 38.354 4 2 Median NaN NaN 0.81635 NaN NaN 0.76688 NaN NaN 50.757 1 1 2 0 1 1 Median Median Median 2.5 7.6 6 60055000 34908000 25147000 12615000 7258600 5356100 15166000 9365900 5799600 32275000 18283000 13991000 3168 10609;14658;19247;25171 True;True;True;True 10705;14788;19421;25390 35462;50017;64919;64920;84374;84375 44798;62907;81513;81514;106325;106326 44798;62907;81514;106325 Q9Y6M7 Q9Y6M7 1 1 1 Sodium bicarbonate cotransporter 3 SLC4A7 sp|Q9Y6M7|S4A7_HUMAN Sodium bicarbonate cotransporter 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC4A7 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.4 1.4 1.4 136.04 1214 1214 0 4.1915 By matching By MS/MS 0.73653 0.7682 7.2525 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 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family member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASF2 PE=1 SV=3 1 7 7 7 4 5 4 4 5 4 4 5 4 19.3 19.3 19.3 54.283 498 498 0 40.672 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88506 0.88859 41.127 12 5 Leave out requantified 0.86631 0.93138 0.88506 0.90225 1.0134 0.84022 52.517 23.313 21.555 3 5 4 1 3 1 Median Median Leave out requantified 10.8 12.4 10.8 706520000 353820000 352700000 181110000 92786000 88325000 319510000 157800000 161710000 205900000 103240000 102660000 3172 5536;19496;20569;21123;21824;21954;28315 True;True;True;True;True;True;True 5590;19672;20753;21309;22015;22146;28558 18824;18825;18826;18827;65771;69243;69244;70952;73332;73333;73761;73762;94784;94785 23951;23952;23953;23954;23955;82600;86919;86920;89092;92047;92048;92582;92583;119807;119808 23951;82600;86919;89092;92048;92582;119808 Q9Y6X3 Q9Y6X3 2 2 2 MAU2 chromatid cohesion factor homolog MAU2 sp|Q9Y6X3|SCC4_HUMAN MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAU2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3.3 3.3 3.3 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