Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides GEL1 Peptides GEL2 Peptides GEL3 Razor + unique peptides GEL1 Razor + unique peptides GEL2 Razor + unique peptides GEL3 Unique peptides GEL1 Unique peptides GEL2 Unique peptides GEL3 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type GEL1 Identification type GEL2 Identification type GEL3 Ratio H/L Ratio H/L normalized Ratio H/L variability [%] Ratio H/L count Ratio H/L iso-count Ratio H/L type Ratio H/L GEL1 Ratio H/L GEL2 Ratio H/L GEL3 Ratio H/L normalized GEL1 Ratio H/L normalized GEL2 Ratio H/L normalized GEL3 Ratio H/L variability [%] GEL1 Ratio H/L variability [%] GEL2 Ratio H/L variability [%] GEL3 Ratio H/L count GEL1 Ratio H/L count GEL2 Ratio H/L count GEL3 Ratio H/L iso-count GEL1 Ratio H/L iso-count GEL2 Ratio H/L iso-count GEL3 Ratio H/L type GEL1 Ratio H/L type GEL2 Ratio H/L type GEL3 Sequence coverage GEL1 [%] Sequence coverage GEL2 [%] Sequence coverage GEL3 [%] Intensity Intensity L Intensity H Intensity GEL1 Intensity L GEL1 Intensity H GEL1 Intensity GEL2 Intensity L GEL2 Intensity H GEL2 Intensity GEL3 Intensity L GEL3 Intensity H GEL3 Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions P0DPI2;A0A0B4J2D5 P0DPI2;A0A0B4J2D5 3;3 3;3 3;3 sp|P0DPI2|GAL3A_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3A, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATD3A PE=1 SV=1;sp|A0A0B4J2D5|GAL3B_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 3B, mitochondr 2 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 22.8 22.8 22.8 28.17 268 268;268 0 21.658 By MS/MS By MS/MS By 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2-O-methyltransferase fibrillarin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBLL1 PE=3 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 34.803 334 334 0 4.7537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4478 1.5681 42.901 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 3.3 3.3 3.3 151410000 49459000 101960000 85064000 23901000 61162000 66351000 25557000 40793000 0 0 0 8 15955 True 16297 55662;55663;55664;55665;55666;55667 70408;70409;70410;70411;70412;70413 70413 A6NHR9 A6NHR9 13 13 13 Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 SMCHD1 sp|A6NHR9|SMHD1_HUMAN Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMCHD1 PE=1 SV=2 1 13 13 13 9 10 8 9 10 8 9 10 8 7.8 7.8 7.8 226.37 2005 2005 0 29.198 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91258 1.0126 13.873 27 3 Leave out requantified 0.81173 0.95644 1.072 0.89382 1.0101 1.0916 17.853 14.741 10.165 9 11 7 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 5.5 6 4.1 408120000 206610000 201520000 132390000 70272000 62119000 158750000 82737000 76015000 116980000 53598000 63381000 9 3756;6503;7379;9008;10087;10293;10350;11042;11321;12396;13946;14316;16201 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3834;6626;7522;9190;10286;10494;10551;11254;11537;12666;14243;14619;16544 13261;13262;22412;25924;31852;31853;31854;35593;36362;36363;36525;36526;36527;38755;38756;39671;39672;39673;43423;43424;43425;43426;43427;48798;48799;49985;56488;56489;56490 16995;28481;32894;40429;40430;40431;40432;45155;46081;46289;49016;50155;50156;50157;54737;54738;54739;54740;54741;61515;61516;63071;71455;71456;71457;71458;71459 16995;28481;32894;40432;45155;46081;46289;49016;50157;54738;61516;63071;71457 A6NIH7 A6NIH7 1 1 1 Protein unc-119 homolog B UNC119B sp|A6NIH7|U119B_HUMAN Protein unc-119 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UNC119B PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 8 28.136 251 251 0 4.6062 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78341 0.86743 18.666 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 8 8 8 84978000 48485000 36493000 24866000 15429000 9437300 29780000 17728000 12052000 30332000 15328000 15004000 10 2 True 2 8;9;10 16;17;18;19;20 16 A6NJ78 A6NJ78 1 1 1 Probable methyltransferase-like protein 15 METTL15 sp|A6NJ78|MET15_HUMAN Probable methyltransferase-like protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL15 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 3.2 3.2 3.2 46.121 407 407 0.0022331 2.5806 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0 3.2 0 10175000 4916000 5259400 0 0 0 10175000 4916000 5259400 0 0 0 11 4257 True 4346 14956 19201 19201 A6NKG5 A6NKG5 1 1 1 Retrotransposon-like protein 1 RTL1 sp|A6NKG5|RTL1_HUMAN Retrotransposon-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL1 PE=3 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 155.05 1358 1358 1 -2 By MS/MS By MS/MS 0.94921 0.97404 8.8983 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 1 0 1 344140000 170810000 173340000 169900000 79996000 89905000 0 0 0 174240000 90813000 83430000 + 12 7939 True 8090 27861;27862 35396;35397 35396 0 932 Q9BWD3;A6ZKI3;Q17RB0 Q9BWD3;A6ZKI3;Q17RB0 3;3;2 3;3;2 3;3;2 Protein FAM127B;Protein FAM127A;Protein FAM127C FAM127B;FAM127A;FAM127C sp|Q9BWD3|RTL8A_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 8A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL8A PE=1 SV=3;sp|A6ZKI3|RTL8C_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 8B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL8C PE=1 SV=1;sp|Q17RB0|RTL8B_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 23.9 23.9 23.9 13.188 113 113;113;113 0 6.3736 By MS/MS By matching By MS/MS 1.1199 1.1986 29.857 7 1 Leave out requantified 0.95049 1.1214 0.79108 0.99848 1.2392 0.78211 4.0176 25.148 45.927 2 2 3 0 0 1 Median Median Median 15.9 15.9 23.9 84563000 43666000 40897000 20728000 10193000 10535000 18269000 8764900 9503700 45567000 24709000 20858000 13 4354;5809;13813 True;True;True 4444;5921;14109 15264;15265;20123;20124;20125;48346;48347;48348 19589;19590;25609;25610;60961 19589;25609;60961 P62308;A8MWD9 P62308;A8MWD9 2;2 2;2 2;2 Small nuclear ribonucleoprotein G;Putative small nuclear ribonucleoprotein G-like protein 15 SNRPG;SNRPGP15 sp|P62308|RUXG_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein G OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPG PE=1 SV=1;sp|A8MWD9|RUXGL_HUMAN Putative small nuclear ribonucleoprotein G-like protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPGP15 PE=5 SV=2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 26.3 26.3 26.3 8.496 76 76;76 0 16.912 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88161 0.92368 141.33 6 2 Median 0.9655 0.23607 0.26689 1.0239 0.2569 0.27199 30.2 197.29 188.54 2 2 2 0 1 1 Median Median Median 26.3 26.3 26.3 246240000 151170000 95067000 50113000 24910000 25203000 112950000 74605000 38341000 83177000 51654000 31523000 14 6302;7208 True;True 6424;7349 21788;21789;21790;21791;25297;25298;25299 27707;27708;27709;27710;32139;32140;32141 27710;32140 C4AMC7;Q6VEQ5 C4AMC7;Q6VEQ5 2;2 1;1 1;1 Putative WAS protein family homolog 3;WAS protein family homolog 2 WASH3P;WASH2P sp|C4AMC7|WASH3_HUMAN Putative WAS protein family homolog 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASH3P PE=1 SV=2;sp|Q6VEQ5|WASH2_HUMAN WAS protein family homolog 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASH2P PE=2 SV=2 2 2 1 1 2 1 2 1 0 1 1 0 1 3.9 1.9 1.9 49.994 463 463;465 0.0022512 2.6372 By MS/MS By matching By MS/MS 0.8683 0.90186 27.059 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 3.9 1.9 3.9 23624000 13091000 10533000 11001000 6263700 4736900 0 0 0 12624000 6827500 5796100 15 4607;14849 True;False 4699;15168 16130;16131;16132;51865;51866;51867;51868;51869 20703;20704;20705;65542;65543;65544;65545 20704;65542 CON__P00761 CON__P00761 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4.3 4.3 4.3 24.409 231 231 0.0022665 2.7408 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 4.3 0 0 607260000 515910000 91355000 607260000 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26;26;14;8;4;3;3;3;3;1 24;24;13;7;2;3;3;3;3;1 19;19;12;5;2;3;0;0;0;0 Keratin, type II cytoskeletal 8 KRT8 ;sp|P05787|K2C8_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT8 PE=1 SV=7; 10 26 24 19 24 23 22 22 21 21 17 16 16 44.7 42.7 35.4 53.704 483 483;483;443;499;99;213;600;600;600;470 0 141.42 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87463 0.97441 28.913 78 31 Leave out requantified 0.95306 0.84306 0.85406 1.039 0.9632 0.87772 29.078 34.738 24.725 29 25 24 14 10 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.4 44.7 41.6 7638900000 4410500000 3228500000 2395900000 1395200000 1000700000 2587000000 1487000000 1100100000 2656000000 1528300000 1127700000 + 19 1300;1365;1366;1367;2946;4675;4741;4742;5738;9565;9627;10135;10254;10702;10703;10919;12117;12118;13048;13768;14461;14697;15425;15426;15731;18130 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;True 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41451;41452;41453;41454;41455;44503;54879;54880;54881;54882;54883;76199;76200;76201;76202 41451;44503;54883;76201 O00303 O00303 7 7 7 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F EIF3F sp|O00303|EIF3F_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3F PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 21.6 21.6 21.6 37.563 357 357 0 73.432 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84852 0.91811 15.78 22 5 Leave out requantified 0.8268 0.92382 0.90422 0.84911 0.98978 0.93169 20.965 12.699 12.791 7 8 7 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 21.6 21.6 16.5 1870400000 968920000 901450000 537590000 281700000 255890000 771270000 393010000 378260000 561510000 294210000 267300000 45 3219;5084;7636;9938;9939;15308;17034 True;True;True;True;True;True;True 3289;5182;7781;10134;10135;15638;17386 11313;11314;17706;17707;17708;26809;26810;26811;35121;35122;35123;35124;35125;35126;35127;53393;53394;53395;59397;59398;59399;59400;59401;59402 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WASL sp|O00401|WASL_HUMAN Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASL PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 4.2 4.2 4.2 54.826 505 505 0.0022371 2.5974 By MS/MS By MS/MS By matching 1.4405 1.5769 31.804 4 0 Leave out requantified 1.4317 NaN NaN 1.5476 NaN NaN 11.967 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.2 2.6 1.6 101040000 39082000 61961000 56105000 18965000 37140000 23516000 11165000 12351000 21422000 8951600 12470000 47 5499;17106 True;True 5607;17463 19064;19065;59689;59690 24285;75670 24285;75670 O00410 O00410 40 40 38 Importin-5 IPO5 sp|O00410|IPO5_HUMAN Importin-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IPO5 PE=1 SV=4 1 40 40 38 40 38 38 40 38 38 38 36 37 46.6 46.6 44.8 123.63 1097 1097 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81392 0.88026 29.122 193 51 Leave out requantified 0.82734 0.79134 0.83564 0.88689 0.91034 0.87023 28.22 30.609 46.543 69 64 60 22 18 11 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.6 46.3 45.4 22501000000 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subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIK3C2A PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.6 0.6 0.6 190.68 1686 1686 0.0065161 2.3212 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 0.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52 12028 True 12285 42125 53132 53132 O00469 O00469 4 4 4 Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 PLOD2 sp|O00469|PLOD2_HUMAN Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLOD2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 6.1 6.1 6.1 84.685 737 737 0 14.092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84633 0.91493 14.875 13 7 Leave out requantified 0.77013 0.61525 1.022 0.86381 0.69395 1.0254 16.483 25.144 16.261 4 4 5 1 2 4 Leave out requantified Median Median 6.1 6.1 6.1 167380000 93690000 73692000 45035000 25831000 19204000 56697000 35334000 21363000 65650000 32525000 33125000 53 8218;14021;17989;18359 True;True;True;True 8377;14318;18358;18733 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3291;6017 True;False 3362;6132 11570;20823 14807;26502 14807;26502 O00743 O00743 3 3 3 Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed PPP6C sp|O00743|PPP6_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP6C PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 11.1 11.1 11.1 35.144 305 305 0 6.4361 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.30387 0.3446 91.499 6 3 Median 0.31358 NaN 0.87633 0.35098 NaN 0.89937 23.129 NaN 167.28 3 1 2 1 0 2 Median Median Median 11.1 7.2 7.2 158470000 93117000 65354000 66881000 51453000 15428000 11380000 7932400 3447500 80211000 33732000 46479000 65 1172;17791;18483 True;True;True 1204;18156;18858 4085;4086;4087;62019;64382;64383;64384 5345;5346;5347;78607;81520;81521;81522 5345;78607;81520 O00762 O00762 3 3 3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C UBE2C sp|O00762|UBE2C_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2C PE=1 SV=1 1 3 3 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5376;5377;5378;5379;5380;5381;5382;5383;5384;5385;12715;12716;12717;12718;22029;22030;49695;49696;50753;50754;50755;50756;52388;52389 5380;12716;22029;49696;50753;50756;52388 P47813;O14602 P47813;O14602 4;4 4;4 4;4 Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal EIF1AX;EIF1AY sp|P47813|IF1AX_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1AX PE=1 SV=2;sp|O14602|IF1AY_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1AY PE=1 SV=4 2 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 36.1 36.1 36.1 16.46 144 144;144 0 18.068 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77478 0.90586 13.889 19 13 Leave out requantified 0.99204 1.2296 1.1018 1.0759 1.4164 1.1 37.743 28.632 34.033 7 5 7 5 3 5 Median Median Median 36.1 36.1 36.1 1479200000 749030000 730160000 438430000 224170000 214260000 400950000 219920000 181020000 639810000 304930000 334880000 72 1692;3066;4071;17969 True;True;True;True 1732;3134;4153;18338 5804;5805;5806;5807;5808;10784;10785;10786;10787;10788;10789;14339;14340;14341;14342;14343;62619;62620;62621 7571;7572;7573;7574;7575;13748;13749;13750;13751;13752;13753;13754;13755;13756;18348;18349;18350;18351;18352;79356;79357;79358 7574;13755;18352;79357 O14617 O14617 9 9 9 AP-3 complex subunit delta-1 AP3D1 sp|O14617|AP3D1_HUMAN AP-3 complex subunit delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3D1 PE=1 SV=1 1 9 9 9 6 7 6 6 7 6 6 7 6 10.6 10.6 10.6 130.16 1153 1153 0 44.365 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99278 1.0548 33.498 18 8 Leave out requantified 0.89929 1.0029 0.75355 0.95988 1.125 0.77686 16.468 36.852 90.824 6 6 6 3 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Median 5.6 8.1 6.6 520210000 249500000 270710000 158890000 71828000 87057000 144070000 71460000 72614000 217250000 106210000 111040000 73 809;1569;1931;3771;7125;11478;11712;12208;18393 True;True;True;True;True;True;True;True;True 828;1608;1976;3850;7265;11701;11958;12468;18767 2845;5413;5414;6685;6686;6687;13317;24973;24974;24975;24976;24977;40179;40180;40181;41045;41046;42774;42775;42776;64074 3715;7066;7067;7068;7069;8658;8659;8660;17081;31771;31772;31773;31774;31775;31776;50757;50758;51829;53912;53913;53914;81144 3715;7068;8659;17081;31772;50757;51829;53913;81144 O14618 O14618 3 3 3 Copper chaperone for superoxide dismutase CCS sp|O14618|CCS_HUMAN Copper chaperone for superoxide dismutase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCS PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 12.8 12.8 12.8 29.04 274 274 0 12.299 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61849 0.67172 38.089 6 3 Median 0.77472 0.49181 0.70656 0.8112 0.52472 0.70475 40.136 48.381 36.397 2 2 2 0 2 1 Median Median Median 7.7 12.8 7.7 119530000 69291000 50240000 31480000 17697000 13783000 40219000 25947000 14272000 47832000 25647000 22185000 74 5106;12898;14525 True;True;True 5204;13179;14834 17799;17800;17801;45181;50744;50745;50746 22713;22714;22715;56941;64037;64038;64039 22715;56941;64037 O14641 O14641 2 2 2 Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2 DVL2 sp|O14641|DVL2_HUMAN Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DVL2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 78.947 736 736 0 5.331 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94022 1.0002 24.32 5 2 Median 1.1075 NaN 0.87432 1.1618 NaN 0.8952 21.174 NaN 31.906 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 3 3 3 84855000 44227000 40627000 26793000 12843000 13951000 22667000 10035000 12632000 35394000 21350000 14045000 75 1073;15121 True;True 1098;15444 3728;3729;3730;52722;52723;52724 4889;4890;4891;66612;66613;66614;66615 4889;66612 O14732 O14732 3 3 3 Inositol monophosphatase 2 IMPA2 sp|O14732|IMPA2_HUMAN Inositol monophosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 11.5 11.5 11.5 31.321 288 288 0 19.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93389 1.006 18.408 9 4 Leave out requantified 1.2432 0.95738 1.1818 1.3388 1.0877 1.2102 25.955 20.664 26.53 3 3 3 2 1 1 Median Median Median 11.5 11.5 11.5 785630000 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sp|O14773|TPP1_HUMAN Tripeptidyl-peptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPP1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 6.2 6.2 6.2 61.247 563 563 0 6.0987 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78881 0.91046 24.722 11 5 Leave out requantified 1.0041 0.78881 0.81935 1.048 0.91046 0.84024 23.19 24.482 34.399 3 4 4 1 1 3 Median Leave out requantified Median 6.2 6.2 6.2 391450000 219330000 172110000 110610000 63035000 47574000 139390000 77925000 61464000 141450000 78375000 63074000 78 7964;11350;17520 True;True;True 8116;11566;17882 27938;27939;27940;39754;39755;39756;39757;39758;61124;61125;61126 35476;35477;35478;35479;35480;50243;50244;50245;50246;50247;77504;77505;77506 35476;50246;77506 O14776 O14776 16 16 16 Transcription elongation regulator 1 TCERG1 sp|O14776|TCRG1_HUMAN Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2 1 16 16 16 13 14 14 13 14 14 13 14 14 15 15 15 123.9 1098 1098 0 48.165 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97216 1.0624 18.962 45 16 Leave out requantified 0.86865 0.85739 1.0577 0.92981 0.97889 1.1098 22.015 31.572 17.902 14 15 16 6 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.9 12.8 13.8 1753200000 839630000 913590000 502490000 249050000 253440000 634140000 290300000 343840000 616590000 300280000 316300000 79 716;939;2118;3349;4302;6348;8902;9049;9714;10044;10073;10958;14882;15775;18467;18508 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 734;962;2167;3421;4392;6470;9078;9232;9906;10243;10272;11169;15201;16110;18841;18883 2507;2508;2509;3267;3268;3269;7349;7350;7351;7352;7353;11788;11789;11790;15099;15100;15101;21940;31471;31472;31473;31474;31475;32006;32007;32008;34380;34381;35462;35463;35555;35556;35557;38479;38480;38481;51963;55065;55066;64327;64328;64329;64463;64464;64465 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TNPO2 sp|O14787|TNPO2_HUMAN Transportin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNPO2 PE=1 SV=3 1 8 2 2 8 7 7 2 2 1 2 2 1 8.5 3 3 101.39 897 897 0.00047416 3.2269 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86634 0.94441 21.001 5 0 Leave out requantified 0.66853 1.2256 NaN 0.72528 1.4065 NaN 58.337 2.6546 NaN 2 2 1 0 0 0 Median Median Median 8.5 8.5 6.4 204610000 101660000 102950000 86599000 42609000 43990000 79611000 39838000 39773000 38397000 19213000 19185000 81 1055;2715;5685;9209;10541;12083;13363;14604 False;False;True;False;True;False;False;False 1080;2776;5796;9397;10746;12340;13652;14915 3667;3668;3669;9544;9545;19719;19720;32646;32647;32648;37128;37129;37130;42310;42311;42312;46761;46762;46763;50985;50986;50987;50988;50989;50990 4808;4809;4810;4811;12219;12220;12221;25099;41443;41444;41445;41446;41447;41448;47041;47042;47043;47044;47045;47046;53353;53354;53355;53356;58988;58989;58990;58991;64338;64339;64340;64341;64342;64343;64344 4809;12219;25099;41444;47046;53356;58991;64338 O14818;Q8TAA3 O14818 10;4 10;4 10;4 Proteasome subunit alpha type-7 PSMA7 sp|O14818|PSA7_HUMAN Proteasome subunit alpha type-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMA7 PE=1 SV=1 2 10 10 10 8 9 7 8 9 7 8 9 7 39.5 39.5 39.5 27.887 248 248;256 0 77.639 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78493 0.86801 20.96 29 13 Leave out requantified 0.76099 0.65448 0.99512 0.84949 0.80767 0.99836 27.246 40.999 15.097 9 10 10 4 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 39.5 39.1 39.1 1204800000 702800000 501980000 367630000 227040000 140580000 403360000 233400000 169960000 433790000 242350000 191440000 82 709;710;923;2419;2420;6432;7931;11124;12599;18646 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 726;727;946;2476;2477;6555;8082;11337;12874;19025 2483;2484;2485;2486;3218;3219;3220;8447;8448;22196;22197;22198;27839;27840;27841;39008;39009;39010;39011;39012;39013;39014;44169;44170;44171;44172;44173;44174;64907;64908;64909;64910;64911;64912;64913;64914 3250;3251;3252;3253;4209;4210;4211;10869;10870;28216;35366;35367;35368;35369;35370;35371;49330;49331;49332;49333;49334;49335;49336;49337;55660;55661;55662;55663;55664;55665;55666;55667;55668;82222;82223;82224;82225;82226;82227;82228;82229 3250;3253;4211;10869;10870;28216;35366;49331;55666;82225 O14908 O14908 8 8 8 PDZ domain-containing protein GIPC1 GIPC1 sp|O14908|GIPC1_HUMAN PDZ domain-containing protein GIPC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GIPC1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 7 5 6 7 5 6 7 5 34.5 34.5 34.5 36.049 333 333 0 27.656 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7279 0.76396 41.283 19 11 Leave out requantified 0.80905 0.70093 0.86834 0.83376 0.82812 0.86415 11.697 41.472 36.781 7 7 5 5 3 3 Median Leave out requantified Median 30.6 30.9 22.2 485400000 277370000 208030000 188230000 110200000 78029000 175720000 102420000 73309000 121440000 64747000 56695000 83 2887;5886;6319;7474;8820;12321;13868;14863 True;True;True;True;True;True;True;True 2952;5999;6441;7618;8994;12590;14164;15182 10147;10148;20365;20366;21850;26248;26249;31134;31135;31136;43169;43170;48540;48541;48542;51908;51909;51910;51911 12977;12978;25901;25902;25903;27783;33331;33332;39559;39560;54429;54430;61185;61186;61187;61188;61189;65593;65594;65595;65596 12978;25901;27783;33332;39559;54430;61185;65595 O14920 O14920 3 3 3 Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta IKBKB sp|O14920|IKKB_HUMAN Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IKBKB PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 5 5 5 86.563 756 756 0 7.2266 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2492 1.335 23.326 7 0 Leave out requantified 0.94061 1.2276 1.0069 1.0439 1.413 1.068 30.613 31.118 31.564 3 2 2 0 0 0 Leave out requantified Median Median 5 3.2 3.2 91858000 43652000 48206000 39229000 18202000 21027000 25867000 11988000 13879000 26762000 13461000 13301000 84 799;2569;6377 True;True;True 818;2627;6499 2811;2812;2813;9011;9012;9013;22032 3669;3670;3671;3672;11526;11527;11528;11529;28002 3669;11526;28002 O14929 O14929 11 11 11 Histone acetyltransferase type B catalytic subunit HAT1 sp|O14929|HAT1_HUMAN Histone acetyltransferase type B catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HAT1 PE=1 SV=1 1 11 11 11 11 10 11 11 10 11 11 10 11 38.2 38.2 38.2 49.512 419 419 0 320.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95995 1.0213 19.792 43 11 Leave out requantified 0.97003 0.92801 0.94621 1.0299 1.0366 0.95529 23.676 19.02 20.279 14 14 15 4 5 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.2 32.2 38.2 4432800000 2330700000 2102200000 1252200000 662080000 590150000 1793400000 952620000 840820000 1387200000 715950000 671210000 85 1892;5212;10502;10543;10868;11255;12927;15464;16629;17718;18705 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1936;5312;10703;10704;10748;11079;11471;13208;15796;16978;18081;19084 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Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPDL PE=1 SV=3 1 3 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 8.6 6.7 6.7 46.437 420 420 0 5.9252 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65471 0.69949 47.576 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 5.5 5 5.5 43154000 26075000 17079000 16716000 11003000 5713400 9201300 4398100 4803200 17236000 10673000 6562500 91 5777;5792;11487 True;False;True 5888;5904;11712 19997;19998;20057;20058;20059;40225 25437;25438;25512;25513;25514;25515;50822 25437;25513;50822 O14980 O14980 31 31 31 Exportin-1 XPO1 sp|O14980|XPO1_HUMAN Exportin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO1 PE=1 SV=1 1 31 31 31 27 27 26 27 27 26 27 27 26 33.6 33.6 33.6 123.38 1071 1071 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94254 1.047 24.836 111 29 Leave out requantified 0.97488 0.91383 0.87175 1.0936 1.0586 0.8774 25.981 24.814 29.032 37 39 35 9 12 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.8 28.7 27.8 9755300000 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2/3 complex subunit 3 ARPC3 sp|O15145|ARPC3_HUMAN Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARPC3 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10.1 10.1 10.1 20.546 178 178 0 3.9239 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79217 0.86654 6.7026 6 0 Leave out requantified 0.71528 0.78934 0.87285 0.76725 0.89747 0.91918 23.912 11.663 2.2569 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 10.1 10.1 10.1 207340000 112180000 95162000 68982000 39167000 29815000 68778000 37329000 31449000 69581000 35683000 33898000 99 1709;16804 True;True 1752;17155 5888;5889;5890;58589;58590;58591 7715;7716;7717;7718;7719;74260;74261;74262 7717;74260 O15160 O15160 4 4 4 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 POLR1C sp|O15160|RPAC1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR1C PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 16.5 16.5 16.5 39.249 346 346 0 23.492 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77638 0.81568 60.929 9 0 Leave out requantified 0.86356 0.74803 0.76041 0.90443 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synthase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPSS1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 7 6 7 7 6 7 7 6 7 16.3 16.3 16.3 70.832 624 624 0 45.024 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87605 0.98097 10.193 21 7 Leave out requantified 0.88535 0.83595 0.93176 0.94993 0.98149 0.97287 15.862 12.22 12.548 8 6 7 3 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.3 11.5 11.9 871820000 475500000 396320000 328440000 172010000 156430000 327910000 180420000 147490000 215480000 123070000 92408000 122 1681;2416;2669;4087;5832;12167;12168;15327;17402 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1721;2473;2729;4169;5944;12426;12427;15657;17761 5766;5767;5768;5769;8441;8442;9409;9410;9411;14392;20185;20186;42621;42622;42623;42624;42625;53450;53451;53452;60725 7526;7527;7528;7529;10860;10861;12059;18431;25677;25678;25679;25680;53735;53736;53737;53738;53739;53740;53741;67552;67553;67554;67555;67556;67557;76999 7526;10861;12059;18431;25678;53737;53741;67557;76999 15 548 O43264 O43264 2 2 2 Centromere/kinetochore protein zw10 homolog ZW10 sp|O43264|ZW10_HUMAN Centromere/kinetochore protein zw10 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZW10 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.6 3.6 3.6 88.828 779 779 0.0065104 2.3185 By MS/MS By MS/MS 0.74811 0.75809 39.471 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 1 0 2.6 59063000 31880000 27183000 39496000 19895000 19602000 0 0 0 19567000 11985000 7581600 123 870;18596 True;True 893;18975 3048;64748 3994;82008 3994;82008 O43286 O43286 1 1 1 Beta-1,4-galactosyltransferase 5 B4GALT5 sp|O43286|B4GT5_HUMAN Beta-1,4-galactosyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=B4GALT5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.1 2.1 2.1 45.118 388 388 0.00047619 3.2688 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0358 1.0423 11.664 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 2.1 2.1 2.1 58603000 27683000 30920000 17909000 7941300 9967900 23292000 11501000 11791000 17401000 8240000 9161400 124 16506 True 16854 57529;57530;57531;57532;57533;57534 72835;72836;72837;72838;72839;72840 72837 O43293 O43293 1 1 1 Death-associated protein kinase 3 DAPK3 sp|O43293|DAPK3_HUMAN Death-associated protein kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DAPK3 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 2 2 2 52.535 454 454 0.0018382 2.8613 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 2 2 0 6202300 2050300 4152000 0 0 0 6202300 2050300 4152000 0 0 0 125 9964 True 10161 35217;35218 44664;44665 44664 O43314 O43314 3 3 3 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 PPIP5K2 sp|O43314|VIP2_HUMAN Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIP5K2 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2.3 2.3 2.3 140.41 1243 1243 0 4.6549 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9588 2.0724 57.656 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 0 Median Median Median 0.9 1.4 0.8 78214000 27762000 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17 13 12 13 9 33.2 33.2 26.9 70.942 633 633 0 120.22 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94603 1.0214 19.671 56 18 Leave out requantified 1.0099 0.7356 1.0768 1.0463 0.82027 1.0775 20.98 26.31 10.553 19 21 16 5 7 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 33.2 33.2 24.3 2956900000 1557000000 1399900000 913660000 475010000 438650000 1119600000 635050000 484550000 923610000 446910000 476700000 128 546;2668;3448;3629;4144;5778;6984;9389;10535;12126;13859;14985;15572;15711;15799;17758;18319 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 559;2728;3520;3703;4233;5889;7119;9579;10739;12384;14155;15306;15904;16046;16134;18121;18692 1862;1863;1864;9403;9404;9405;9406;9407;9408;12120;12121;12122;12123;12124;12768;12769;14597;14598;19999;20000;20001;20002;20003;20004;20005;24333;24334;24335;24336;24337;24338;33279;33280;33281;33282;33283;33284;33285;37113;37114;42470;42471;42472;42473;42474;48507;48508;48509;48510;52275;52276;52277;54273;54274;54275;54830;54831;55144;55145;55146;61911;61912;61913;63795;63796 2428;2429;2430;2431;2432;2433;12049;12050;12051;12052;12053;12054;12055;12056;12057;12058;15517;15518;15519;15520;15521;15522;15523;15524;16345;16346;18720;18721;25439;25440;25441;25442;25443;25444;25445;25446;30886;30887;30888;30889;30890;30891;42245;42246;42247;42248;42249;42250;47023;47024;53553;53554;53555;53556;53557;53558;61146;61147;61148;61149;66066;66067;66068;66069;66070;68643;68644;68645;68646;68647;68648;69354;69355;69727;69728;69729;69730;69731;69732;78500;78501;78502;78503;80800;80801 2431;12053;15522;16346;18721;25446;30890;42249;47024;53558;61148;66069;68643;69355;69728;78502;80801 O43395 O43395 3 3 3 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 PRPF3 sp|O43395|PRPF3_HUMAN U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF3 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 5.6 5.6 5.6 77.528 683 683 0 6.3155 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1142 1.1617 13.012 4 0 Leave out requantified NaN NaN 1.1264 NaN NaN 1.1324 NaN NaN 31.914 1 1 2 0 0 0 Median Median Median 2.3 3.2 5.6 62229000 44624000 17605000 9739800 5048300 4691500 15771000 12496000 3275100 36718000 27080000 9638300 129 3784;5408;12702 True;True;True 3864;5514;12979 13371;13372;18747;18748;44514;44515 17145;23892;23893;56121 17145;23893;56121 O43396 O43396 6 6 6 Thioredoxin-like protein 1 TXNL1 sp|O43396|TXNL1_HUMAN Thioredoxin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNL1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 3 5 3 3 5 3 3 5 3 31.5 31.5 31.5 32.251 289 289 0 37.156 By MS/MS By MS/MS By matching 0.79317 0.88383 19.493 11 3 Leave out requantified 0.7199 0.6164 1.4221 0.76587 0.70422 1.4494 22.314 19.042 6.9416 3 5 3 1 2 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 15.2 29.1 13.5 223360000 122190000 101180000 59591000 36087000 23504000 129240000 72112000 57125000 34536000 13988000 20547000 130 480;5232;7414;7543;12881;16948 True;True;True;True;True;True 490;5332;7557;7687;13161;17300 1640;18191;26038;26039;26040;26492;26493;45115;45116;59092;59093 2131;23167;33054;33055;33056;33057;33648;56865;74887;74888;74889;74890 2131;23167;33055;33648;56865;74889 O43399 O43399 5 5 5 Tumor protein D54 TPD52L2 sp|O43399|TPD54_HUMAN Tumor protein D54 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPD52L2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 40.8 40.8 40.8 22.237 206 206 0 41.71 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3915 1.4081 31.551 14 10 Leave out requantified 0.92162 0.81116 1.3915 0.96078 0.94008 1.4081 36.927 22.391 34.276 4 5 5 3 4 3 Median Median Median 31.6 40.8 40.8 593840000 288350000 305490000 192430000 94922000 97504000 194210000 98865000 95342000 207210000 94563000 112650000 131 6182;9860;15987;16041;16090 True;True;True;True;True 6298;10054;16329;16383;16432 21399;21400;34865;34866;34867;55793;55794;55795;55963;55964;55965;55966;56125;56126;56127;56128;56129 27228;27229;44232;44233;44234;70571;70572;70573;70768;70769;70770;70771;70966;70967;70968;70969;70970;70971 27228;44234;70573;70768;70968 O43427 O43427 1 1 1 Acidic fibroblast growth factor intracellular-binding protein FIBP sp|O43427|FIBP_HUMAN Acidic fibroblast growth factor intracellular-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIBP PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 2.5 2.5 41.878 364 364 0.0022411 2.6054 By MS/MS By MS/MS By matching 0.92766 0.94458 18.089 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 2.5 2.5 2.5 30691000 16308000 14383000 8556700 5515000 3041700 11739000 5744600 5994400 10396000 5048200 5347300 132 2539 True 2597 8926;8927;8928 11426;11427 11426 O43432 O43432 12 6 6 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 EIF4G3 sp|O43432|IF4G3_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 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151 5995 True 6110 20747;20748;20749 26406;26407 26406 O43747 O43747 10 10 10 AP-1 complex subunit gamma-1 AP1G1 sp|O43747|AP1G1_HUMAN AP-1 complex subunit gamma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP1G1 PE=1 SV=5 1 10 10 10 7 8 5 7 8 5 7 8 5 13.9 13.9 13.9 91.35 822 822 0 22.945 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86635 0.99203 29.047 18 5 Leave out requantified 0.88388 0.77927 1.0092 0.95851 0.97398 1.0428 34.291 33.187 12.936 6 7 5 2 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.2 9.6 6 357020000 192830000 164180000 118090000 63968000 54121000 128080000 71394000 56688000 110840000 57468000 53375000 152 1566;2477;2505;3977;9152;11236;14892;15009;15492;18647 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1605;2535;2563;4059;9337;11450;15212;15330;15824;19026 5407;8676;8677;8678;8778;14060;14061;32391;32392;39375;39376;39377;51999;52000;52001;52343;53987;64915;64916;64917 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2811;2812;2813;3866;3867;3868;3869;44273;44274;44275;44276;44277;70652;70653;70654;70655;70656 2812;3869;44277;70655 O43776 O43776 13 13 13 Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic NARS sp|O43776|SYNC_HUMAN Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NARS PE=1 SV=1 1 13 13 13 11 11 11 11 11 11 11 11 11 29.6 29.6 29.6 62.942 548 548 0 87.35 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73119 0.87158 48.146 35 6 Leave out requantified 0.76736 0.89183 1.044 0.87482 1.0399 1.0827 47.108 55.412 52.191 13 11 11 2 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.6 26.1 26.3 2268800000 1129800000 1139000000 677980000 362330000 315650000 763620000 387970000 375660000 827180000 379460000 447720000 154 952;3555;4187;7527;7572;8331;8610;10547;11038;11909;12209;14720;17174 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 977;3628;4276;7671;7716;8496;8781;10752;11250;12166;12469;15036;17531 3311;3312;3313;3314;12493;12494;14721;14722;14723;26441;26442;26443;26591;26592;29248;29249;30281;30282;30283;30284;30285;30286;30287;30288;37148;38746;38747;38748;41762;41763;41764;42777;42778;51428;51429;51430;59959;59960;59961 4333;4334;4335;4336;4337;16007;18887;18888;18889;33589;33776;33777;37102;37103;38489;38490;38491;38492;38493;38494;38495;38496;38497;38498;38499;38500;47069;49007;49008;49009;52714;52715;53915;53916;64945;64946;64947;64948;64949;76023;76024;76025;76026;76027;76028 4333;16007;18887;33589;33776;37103;38491;47069;49009;52715;53916;64949;76026 O43795 O43795 4 4 4 Unconventional myosin-Ib MYO1B sp|O43795|MYO1B_HUMAN Unconventional myosin-Ib OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO1B PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 5.4 5.4 5.4 131.98 1136 1136 0 12.117 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81432 0.8721 34.299 9 2 Leave out requantified 0.73574 0.64585 0.92419 0.79829 0.73784 0.95273 24.306 52.212 18.684 3 3 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified 5.4 4.5 5.4 146370000 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MS/MS 0.90081 0.91217 34.346 8 2 Median 0.89255 1.0092 0.65862 0.95627 1.1948 0.65747 36.834 29.571 39.628 3 3 2 1 1 0 Median Median Median 7.8 17.1 4.4 129260000 77018000 52240000 48476000 27436000 21040000 54975000 32946000 22029000 25807000 16636000 9171000 158 22;2685;4258;6669;7059 True;True;True;True;True 23;2746;4347;6796;7196 83;9450;14957;22984;22985;22986;24644;24645;24646 112;12111;19202;29267;29268;31221 112;12111;19202;29268;31221 O43852 O43852 1 1 1 Calumenin CALU sp|O43852|CALU_HUMAN Calumenin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALU PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.1 4.1 4.1 37.106 315 315 0 4.3224 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.2071 6.1185 135.72 2 2 Median NaN 5.2071 NaN NaN 6.1185 NaN NaN 135.72 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 4.1 4.1 4.1 57766000 21309000 36456000 9957300 0 9957300 26811000 9418500 17393000 20997000 11891000 9106500 159 7036 True 7173 24573;24574;24575;24576;24577 31141;31142;31143;31144;31145 31141 O43865;Q96HN2 O43865 8;2 8;2 8;2 Putative adenosylhomocysteinase 2 AHCYL1 sp|O43865|SAHH2_HUMAN S-adenosylhomocysteine hydrolase-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHCYL1 PE=1 SV=2 2 8 8 8 6 7 7 6 7 7 6 7 7 24 24 24 58.951 530 530;611 0 110.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76513 0.7704 15.816 28 6 Leave out requantified 0.72879 0.73179 1.2562 0.79186 0.84242 1.2445 19.929 8.6525 30.469 9 10 9 2 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 17.7 20.9 20.8 1900100000 1041700000 858380000 613980000 355810000 258170000 647040000 392770000 254270000 639030000 293100000 345940000 160 3630;6056;8955;9409;12403;12948;13442;17896 True;True;True;True;True;True;True;True 3704;6172;9132;9599;12673;13230;13731;18263 12770;20971;20972;20973;20974;20975;20976;31653;31654;31655;31656;31657;31658;33340;33341;33342;33343;33344;33345;43453;43454;43455;45348;47023;47024;47025;62364;62365;62366 16347;26681;26682;26683;26684;26685;26686;26687;26688;40166;40167;40168;40169;40170;40171;40172;40173;40174;42318;42319;42320;42321;54778;54779;54780;54781;54782;57155;59317;59318;59319;79035;79036;79037;79038;79039 16347;26685;40166;42320;54782;57155;59319;79036 O43929;CON__Q2YDI2 O43929;CON__Q2YDI2 4;2 4;2 4;2 Origin recognition complex subunit 4 ORC4 sp|O43929|ORC4_HUMAN Origin recognition complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC4 PE=1 SV=2; 2 4 4 4 3 1 2 3 1 2 3 1 2 10.1 10.1 10.1 50.377 436 436;436 0 11.963 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0326 1.1391 48.682 6 1 Leave out requantified 1.1008 NaN 0.95135 1.1473 NaN 0.94348 36.579 NaN 37.949 3 1 2 1 0 0 Median Median Median 7.8 1.8 4.1 118800000 60743000 58061000 57501000 30046000 27455000 26718000 12394000 14324000 34585000 18303000 16282000 + 161 405;9450;13507;15142 True;True;True;True 414;9641;13797;15466 1390;33494;47243;52797;52798;52799 1826;42539;59600;66711;66712;66713;66714;66715 1826;42539;59600;66715 O60216;Q9H4I0 O60216 8;1 8;1 8;1 Double-strand-break repair protein rad21 homolog RAD21 sp|O60216|RAD21_HUMAN Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2 2 8 8 8 5 5 5 5 5 5 5 5 5 22.3 22.3 22.3 71.689 631 631;556 0 20.529 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.199 1.363 27.056 14 4 Leave out requantified 0.99635 1.2253 1.382 1.1007 1.4933 1.5205 33.417 36.201 15.889 4 5 5 0 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.4 14.9 16.3 401670000 251960000 149700000 80721000 39429000 41292000 101430000 54167000 47268000 219510000 158370000 61144000 162 592;1267;1872;3751;8051;11381;16119;18461 True;True;True;True;True;True;True;True 605;1299;1916;3829;8209;11597;16461;18835 2068;2069;2070;4412;6468;13232;13233;13234;28261;28262;28263;39844;56229;56230;64312 2714;2715;2716;2717;5742;8411;16955;16956;35868;35869;35870;35871;35872;35873;50344;71099;81442 2717;5742;8411;16956;35869;50344;71099;81442 O60231 O60231 4 4 4 Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 DHX16 sp|O60231|DHX16_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX16 PE=1 SV=2 1 4 4 4 0 2 4 0 2 4 0 2 4 4.4 4.4 4.4 119.26 1041 1041 0 7.8609 By MS/MS By MS/MS 0.85377 0.94196 15.766 4 1 Median NaN 0.84783 0.9857 NaN 0.94196 1.0152 NaN 2.786 26.112 0 2 2 0 0 1 Median Median Median 0 2.7 4.4 83604000 47143000 36461000 0 0 0 38532000 22796000 15736000 45072000 24347000 20725000 163 70;1541;1542;10242 True;True;True;True 71;1579;1580;10443 224;225;5350;5351;36199;36200 293;294;6981;6982;45883;45884 294;6981;6982;45884 O60232 O60232 2 2 2 Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 SSSCA1 sp|O60232|SSA27_HUMAN Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSSCA1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 26.6 26.6 26.6 21.474 199 199 0 3.8979 By MS/MS By MS/MS 0.93236 1.0292 10.829 4 0 Leave out requantified NaN 0.75241 1.1553 NaN 0.86315 1.2272 NaN 11.843 9.8151 0 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3 3 V-type proton ATPase subunit G 1 ATP6V1G1 sp|O75348|VATG1_HUMAN V-type proton ATPase subunit G 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1G1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 23.7 23.7 23.7 13.757 118 118 0 18.328 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93247 1.0079 10.239 12 0 Leave out requantified 0.90509 0.83076 1.0618 0.98949 0.99279 1.0632 7.3443 22.469 14.13 4 4 4 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.7 23.7 23.7 525210000 272550000 252660000 160060000 81857000 78204000 182960000 98676000 84287000 182180000 92015000 90168000 214 3352;6450;12648 True;True;True 3424;6573;12924 11801;11802;11803;22240;22241;22242;22243;22244;22245;44327;44328;44329 15102;15103;15104;15105;15106;15107;28262;28263;28264;28265;28266;28267;28268;28269;55876;55877 15106;28266;55876 O75351;Q6PIW4 O75351 7;1 7;1 6;0 Vacuolar protein sorting-associated protein 4B VPS4B sp|O75351|VPS4B_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS4B PE=1 SV=2 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O75569 1 1 1 Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A PRKRA sp|O75569|PRKRA_HUMAN Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKRA PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.8 4.8 4.8 34.404 313 313 0 6.0378 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.074 1.2266 24.107 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 4.8 4.8 4.8 25108000 12170000 12938000 9768800 4970900 4797900 15339000 7198900 8140200 0 0 0 227 17820 True 18186 62120;62121;62122 78730;78731;78732 78732 O75592 O75592 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2 MYCBP2 sp|O75592|MYCB2_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYCBP2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 0.7 0.7 0.7 513.63 4678 4678 0 3.8517 By matching By MS/MS By MS/MS 0.8689 0.99659 7.185 6 0 Leave out requantified 0.92541 0.86629 0.88342 1.0111 0.99659 0.95112 16.839 7.185 10.192 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 0.7 0.7 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O75832 O75832 5 5 5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 PSMD10 sp|O75832|PSD10_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD10 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 5 3 4 5 3 4 5 30.5 30.5 30.5 24.428 226 226 0 26.852 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.117 1.181 16.997 15 4 Leave out requantified 1.0077 0.91411 1.2566 1.1071 1.0859 1.3522 15.517 27.116 14.206 4 5 6 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.6 26.1 30.5 537950000 285050000 252900000 126360000 59648000 66715000 179450000 103360000 76094000 232130000 122040000 110100000 239 1404;2299;4324;5885;10501 True;True;True;True;True 1438;2354;4414;5998;10702 4852;4853;4854;4855;4856;4857;8046;15177;15178;15179;20362;20363;20364;37000;37001 6314;6315;6316;6317;6318;6319;6320;6321;10365;19489;19490;19491;19492;25895;25896;25897;25898;25899;25900;46883;46884;46885;46886 6321;10365;19490;25895;46884 22 143 O75874 O75874 3 3 2 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic IDH1 sp|O75874|IDHC_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH1 PE=1 SV=2 1 3 3 2 3 2 3 3 2 3 2 2 2 11.1 11.1 8.9 46.659 414 414 0 14.766 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0176 1.1424 4.6534 8 2 Leave out requantified 0.99045 0.94376 1.0718 1.1719 1.0903 1.0836 6.9958 11.246 23.873 3 2 3 1 0 1 Plateau Median Plateau 11.1 8.9 11.1 250110000 124680000 125430000 84395000 43159000 41235000 69479000 33770000 35709000 96240000 47753000 48486000 240 1436;12060;16274 True;True;True 1472;12317;16619 4987;4988;4989;42229;42230;56732;56733;56734 6517;6518;6519;53257;53258;71775;71776;71777;71778;71779 6519;53258;71778 O75934 O75934 5 5 5 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 BCAS2 sp|O75934|SPF27_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor SPF27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BCAS2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 1 3 4 1 3 4 1 3 4 33.3 33.3 33.3 26.131 225 225 0 32.003 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5408 1.5826 36.545 8 2 Leave out requantified NaN 0.50564 1.3171 NaN 0.57624 1.2999 NaN 103.52 14.692 1 3 4 0 1 1 Median Median Leave out requantified 5.8 21.3 28 215970000 130390000 85580000 20707000 10044000 10663000 111420000 81217000 30198000 83848000 39129000 44719000 241 3086;7485;11902;15701;18256 True;True;True;True;True 3154;7629;12158;16036;18629 10837;26280;41739;41740;54780;54781;54782;63568 13813;33376;52688;69292;69293;69294;69295;69296;80522 13813;33376;52688;69294;80522 O75935 O75935 4 4 4 Dynactin subunit 3 DCTN3 sp|O75935|DCTN3_HUMAN Dynactin subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 25.3 25.3 25.3 21.119 186 186 0 19.806 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97156 1.071 7.7421 12 0 Leave out requantified 0.98202 0.98929 0.93955 1.071 1.1589 0.96822 7.7421 8.1281 13.289 4 4 4 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.3 25.3 25.3 357590000 181300000 176290000 112390000 55393000 56993000 129530000 66328000 63199000 115670000 59574000 56099000 242 921;7279;9327;17626 True;True;True;True 944;7421;9515;17988 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1813;1814;15161;15800;15801;15802;15803;15804;15805;15806;15807;21013;21014;21015;21016;46266;46267;58008;58009;58010;58011;58012;58785;58786;58787;58788;58789;58790;58791 1813;15161;15805;21016;46267;58009;58786 O75940 O75940 3 3 3 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 SMNDC1 sp|O75940|SPF30_HUMAN Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMNDC1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 1 2 3 1 2 3 1 2 10.1 10.1 10.1 26.711 238 238 0 7.4391 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7149 0.77536 46.207 5 0 Leave out requantified 0.71288 NaN 0.75294 0.75874 NaN 0.79722 57.302 NaN 35.979 2 1 2 0 0 0 Median Median Median 10.1 5 5.9 71565000 37043000 34523000 27418000 12526000 14892000 16603000 8687600 7915700 27544000 15829000 11715000 244 2627;3889;7790 True;True;True 2685;3971;7938 9212;13754;13755;27367;27368;27369 11783;17608;34772;34773;34774 11783;17608;34773 O75962 O75962 5 5 5 Triple functional domain protein TRIO sp|O75962|TRIO_HUMAN Triple functional domain protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIO PE=1 SV=2 1 5 5 5 1 3 3 1 3 3 1 3 3 3.6 3.6 3.6 346.9 3097 3097 0 6.8817 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89204 0.96956 26.158 6 2 Leave out requantified NaN 1.1418 0.84419 NaN 1.258 0.86156 NaN 10.671 11.877 1 2 3 0 0 2 Median Median Median 0.8 1.6 2.8 44568000 26842000 17725000 9256300 5084200 4172000 12939000 7343700 5595800 22372000 14414000 7957400 245 2178;9058;12024;13429;16489 True;True;True;True;True 2228;9241;12281;13718;16837 7550;32037;32038;32039;42117;46974;57478 9767;40666;53123;59254;72774 9767;40666;53123;59254;72774 O76003 O76003 10 10 10 Glutaredoxin-3 GLRX3 sp|O76003|GLRX3_HUMAN Glutaredoxin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLRX3 PE=1 SV=2 1 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 32.2 32.2 32.2 37.432 335 335 0 85.591 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97194 1.1349 21.984 42 9 Leave out requantified 1.0473 0.9605 1.0414 1.1528 1.1125 1.0733 17.468 15.917 26.876 14 13 15 3 3 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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cleavage complex 2 protein Pcf11 PCF11 sp|O94913|PCF11_HUMAN Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCF11 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 173.05 1555 1555 0.00048591 3.5315 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88546 0.96216 16.828 4 0 Leave out requantified 0.88546 NaN NaN 0.96216 NaN NaN 16.828 NaN NaN 2 1 1 0 0 0 Median Median Median 1 0.5 0.5 1348900000 712140000 636770000 421740000 218330000 203410000 501540000 306270000 195270000 425630000 187540000 238090000 259 3859;13083 True;True 3940;13366 13654;45830;45831;45832 17494;57792;57793;57794;57795;57796;57797 17494;57797 O94915 O94915 2 2 2 Protein furry homolog-like FRYL sp|O94915|FRYL_HUMAN Protein furry homolog-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FRYL PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 339.59 3013 3013 0 14.811 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1294 1.1593 24.787 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 0.6 0.4 0.6 39317000 17590000 21727000 14070000 5418800 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10216;10217;10218;23595;23596;23597;28616;28617;28618;28619;28620;28621;28622;43585;43586;49091;72688;72689;72690;72691;72692;72693;82297;82298;82299 10217;23595;28617;43585;49091;72691;82297 O94952 O94952 1 1 1 F-box only protein 21 FBXO21 sp|O94952|FBX21_HUMAN F-box only protein 21 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBXO21 PE=2 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 72.269 628 628 0 12.842 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0504 1.1377 6.6237 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 67508000 31865000 35643000 20974000 9049000 11925000 24636000 12407000 12229000 21898000 10409000 11489000 262 18160 True 18530 63213;63214;63215 80075;80076;80077;80078 80077 O94966 O94966 4 4 4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19 USP19 sp|O94966|UBP19_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP19 PE=1 SV=2 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 7 7 7 145.65 1318 1318 0 17.178 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2 1.3204 5.8232 11 7 Leave out requantified 1.1354 1.2 1.147 1.1835 1.3204 1.1776 37.544 12.031 20.047 3 4 4 3 1 3 Median Leave out requantified Median 4.9 7 7 224680000 112050000 112630000 53193000 26536000 26658000 82042000 36105000 45937000 89447000 49410000 40036000 263 4175;8150;14020;18648 True;True;True;True 4264;8309;14317;19027 14683;14684;14685;28609;28610;49023;49024;49025;64918;64919;64920 18837;18838;18839;18840;36315;61808;61809;61810;82236;82237;82238 18837;36315;61810;82238 O94967 O94967 1 1 1 WD repeat-containing protein 47 WDR47 sp|O94967|WDR47_HUMAN WD repeat-containing protein 47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR47 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.4 1.4 1.4 101.95 919 919 0 4.8592 By MS/MS By MS/MS 0.27144 0.30932 9.8629 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.4 1.4 0 37617000 29626000 7990700 17008000 12469000 4538800 20609000 17157000 3451800 0 0 0 264 165 True 167 541;542 710;711 710 O94973 O94973 8 4 4 AP-2 complex subunit alpha-2 AP2A2 sp|O94973|AP2A2_HUMAN AP-2 complex subunit alpha-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A2 PE=1 SV=2 1 8 4 4 5 5 5 2 1 3 2 1 3 11.7 5.4 5.4 103.96 939 939 0 12.33 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92303 0.9396 41.083 6 3 Median 0.92609 NaN 0.83228 1.002 NaN 0.86967 22.354 NaN 51.176 2 1 3 0 1 2 Median Median Median 7.9 8.1 8.4 133030000 70336000 62690000 48875000 23870000 25005000 25688000 12353000 13335000 58463000 34114000 24350000 265 7269;10031;11026;15577;16292;16896;17408;18423 False;False;True;True;True;False;True;False 7410;10230;11237;15910;16637;17248;17767;18797 25523;35423;35424;38700;54296;56791;56792;56793;58915;58916;58917;58918;58919;60741;64193;64194;64195 32391;44927;44928;44929;48946;48947;68675;71858;71859;74668;74669;74670;74671;74672;74673;77023;81299;81300;81301 32391;44927;48947;68675;71858;74668;77023;81300 O94979 O94979 23 23 23 Protein transport protein Sec31A SEC31A sp|O94979|SC31A_HUMAN Protein transport protein Sec31A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC31A PE=1 SV=3 1 23 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0.77768 NaN 41.61 22.432 NaN 2 2 0 2 2 0 Median Median Median 4.7 5.8 3.8 87068000 47612000 39457000 43855000 18977000 24879000 36833000 22255000 14578000 6379800 6379800 0 291 14597;14753;17230 True;True;True 14908;15070;17589 50962;51543;51544;51545;60154;60155 64307;65118;65119;65120;76268;76269 64307;65119;76268 O95551 O95551 1 1 1 Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 TDP2 sp|O95551|TYDP2_HUMAN Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDP2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.3 3.3 3.3 40.929 362 362 0.00047214 3.1771 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 3.3 0 3.3 7998600 4852200 3146400 0 0 0 0 0 0 7998600 4852200 3146400 292 3088 True 3156 10841;10842 13817;13818 13818 O95602 O95602 5 5 5 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 POLR1A sp|O95602|RPA1_HUMAN DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR1A PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 2 4 4 2 4 4 2 4.8 4.8 4.8 194.81 1720 1720 0 26.051 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75283 0.79669 16.419 8 1 Leave out requantified 0.77456 0.75283 0.784 0.81972 0.79669 0.78619 22.718 23.747 25.592 2 4 2 0 1 0 Median Leave out requantified Median 3.9 4 2.4 106650000 58110000 48536000 28605000 17166000 11438000 42032000 22007000 20025000 36009000 18936000 17073000 293 98;9012;11053;14808;14862 True;True;True;True;True 100;9194;11265;15125;15181 317;31865;38787;38788;38789;51735;51736;51905;51906;51907 428;40444;49050;65371;65372;65586;65587;65588;65589;65590;65591;65592 428;40444;49050;65372;65587 O95671 O95671 4 4 4 N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein ASMTL sp|O95671|ASML_HUMAN Probable bifunctional dTTP/UTP pyrophosphatase/methyltransferase protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASMTL PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 11.1 11.1 11.1 68.856 621 621 0 15.436 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99054 1.0302 13.069 8 4 Leave out requantified 0.87001 0.72991 0.79218 1.0225 0.81874 0.82887 14.585 38.795 24.653 3 2 3 1 1 2 Median Median Median 7.4 6.4 9.2 243330000 136270000 107060000 68159000 34671000 33489000 90878000 54925000 35953000 84295000 46675000 37620000 294 296;8528;16485;16800 True;True;True;True 299;8697;16833;17151 974;975;976;29924;29925;57464;57465;58576 1270;1271;1272;1273;1274;37983;37984;72750;72751;74240 1272;37984;72750;74240 O95716 O95716 1 1 1 Ras-related protein Rab-3D RAB3D sp|O95716|RAB3D_HUMAN Ras-related protein Rab-3D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB3D PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 5 5 5 24.267 219 219 0.0022573 2.677 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 5 5 30892000 30892000 0 0 0 0 21897000 21897000 0 8995300 8995300 0 295 10352 True 10553 36534;36535 46297;46298 46298 O95747 O95747 12 12 11 Serine/threonine-protein kinase OSR1 OXSR1 sp|O95747|OXSR1_HUMAN Serine/threonine-protein kinase OSR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXSR1 PE=1 SV=1 1 12 12 11 10 9 12 10 9 12 9 8 11 30.6 30.6 28.7 58.022 527 527 0 101.99 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1242 1.1919 19.163 36 17 Leave out requantified 0.99324 1.1134 1.0097 1.0802 1.2031 1.036 15.201 26.556 29.145 11 11 14 5 4 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.9 25.2 30.6 1748500000 919600000 828900000 482530000 251830000 230700000 541990000 282430000 259560000 723980000 385340000 338640000 296 1922;2662;4543;4807;8404;9345;9997;10453;12104;14249;15273;17336 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1967;2721;4635;4902;8570;9533;10195;10654;12361;14552;15602;17695 6657;6658;6659;9350;9351;9352;9353;9354;9355;9356;15945;15946;16816;16817;29495;33126;33127;33128;35324;35325;35326;36853;36854;36855;42384;42385;49785;49786;49787;49788;49789;49790;53264;53265;53266;53267;53268;53269;60506;60507;60508 8628;8629;8630;11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;20478;20479;21546;21547;37409;42050;42051;42052;42053;42054;44795;44796;44797;46714;46715;46716;53438;53439;62811;62812;62813;62814;62815;62816;67328;67329;67330;67331;67332;67333;67334;67335;67336;76704;76705;76706 8628;11975;20479;21546;37409;42052;44796;46714;53438;62815;67335;76706 O95757 O95757 9 6 6 Heat shock 70 kDa protein 4L HSPA4L sp|O95757|HS74L_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 4L OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA4L PE=1 SV=3 1 9 6 6 5 6 5 2 4 4 2 4 4 16.3 11.9 11.9 94.511 839 839 0 27.742 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0144 1.0859 43.039 13 7 Median 1.9239 0.73278 1.1282 2.0185 0.81445 1.1478 54.293 45.132 21.079 3 5 5 1 3 3 Plateau Median Median 8 10.5 10.1 249010000 120390000 128630000 71362000 28095000 43267000 100970000 54984000 45991000 76678000 37307000 39370000 297 1811;2406;3301;4185;5615;11542;13061;13186;17189 True;False;True;True;False;False;True;True;True 1855;2463;3372;4274;5725;11773;13344;13473;17547 6207;6208;6209;6210;6211;6212;8420;8421;11611;11612;14717;19476;19477;19478;19479;40423;45749;46198;60024;60025 8123;8124;8125;10837;10838;14860;14861;18884;24810;24811;24812;24813;24814;51057;57695;58272;76113;76114 8124;10837;14861;18884;24814;51057;57695;58272;76113 O95782 O95782 21 21 17 AP-2 complex subunit alpha-1 AP2A1 sp|O95782|AP2A1_HUMAN AP-2 complex subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A1 PE=1 SV=3 1 21 21 17 18 17 18 18 17 18 15 13 16 28 28 22 107.54 977 977 0 155.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88758 0.97723 21.372 56 15 Leave out requantified 0.8861 0.86816 1.0267 0.95556 1.0092 1.0702 22.584 21.489 25.702 18 18 20 4 4 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24 24.1 25.1 2096500000 1082900000 1013600000 655250000 344740000 310510000 775830000 406820000 369010000 665450000 331340000 334110000 298 998;1119;1464;2190;4850;4933;4974;6334;6967;7269;7989;8725;10031;10299;10411;11159;15575;16174;16293;16896;18423 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35720;35721;35722;35891;35892;35893;35894;46463;46464;46465;46466;46467;46468;46469;46470;46471;52004;52005;52006;52007;52008;52009;52010;52011;52012;52013;63706;63707;63708;72352;72353;72354;74852;74853;74854;81205;81206;81207;81208;81209 35720;35894;46463;52012;63708;72354;74853;81208 27 38 P00492 P00492 3 3 3 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase HPRT1 sp|P00492|HPRT_HUMAN Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPRT1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 16.5 16.5 16.5 24.579 218 218 0 8.8385 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79305 0.88602 27.114 6 4 Median 0.68322 0.91075 NaN 0.73493 1.0304 NaN 12.13 11.16 NaN 2 3 1 1 2 1 Median Median Median 16.5 16.5 5 125460000 73965000 51495000 46129000 27541000 18588000 68634000 39026000 29609000 10697000 7397800 3299100 311 15179;16828;17032 True;True;True 15504;17179;17384 52915;52916;58651;58652;58653;59392;59393 66855;66856;74334;74335;74336;75271 66856;74336;75271 P00558;P07205 P00558 16;3 16;3 16;3 Phosphoglycerate kinase 1 PGK1 sp|P00558|PGK1_HUMAN Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1 PE=1 SV=3 2 16 16 16 15 15 16 15 15 16 15 15 16 51.3 51.3 51.3 44.614 417 417;417 0 184.43 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80763 0.90412 24.089 59 21 Leave out requantified 0.79734 0.79508 0.9352 0.88887 0.91444 0.95912 32.778 26.881 30.4 18 19 22 6 5 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 49.4 48.9 51.3 3849400000 2157400000 1692000000 1051400000 566010000 485400000 1323600000 801560000 522040000 1474400000 789860000 684580000 312 176;864;947;2101;3997;4760;4941;5625;8340;9789;11055;15550;17340;17347;17689;18108 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 178;887;970;2149;4079;4853;5037;5735;8506;9981;11267;15882;17699;17706;18052;18478 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kinase isoenzyme 1 AK1 sp|P00568|KAD1_HUMAN Adenylate kinase isoenzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK1 PE=1 SV=3 1 12 12 12 9 11 11 9 11 11 9 11 11 44.8 44.8 44.8 21.635 194 194 0 68.633 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1248 1.2415 24.898 41 6 Leave out requantified 1.0086 0.88459 1.8099 1.0862 0.97974 1.8746 23.398 24.306 26.047 14 14 13 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.7 44.8 39.2 2278800000 1093300000 1185400000 728850000 365950000 362900000 858870000 474700000 384170000 691040000 252700000 438350000 313 1452;4578;4579;5759;5760;7701;9149;13625;16621;16622;17464;18347 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1488;4670;4671;5870;5871;7848;9334;13916;16969;16970;17826;18720 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2;2;2;2;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1 HLA class I histocompatibility antigen, A-74 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-31 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-29 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-32 alpha chain HLA-A sp|P30459|1A74_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, A-74 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-A PE=1 SV=1;sp|P30457|1A66_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-A PE=1 SV=1;sp|P30453|1A34 16 3 3 2 1 3 1 1 3 1 1 2 1 10.1 10.1 6.3 40.89 365 365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365 0 6.8423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67638 0.67912 33.972 5 3 Median NaN 0.67638 NaN NaN 0.71265 NaN NaN 45.45 NaN 1 3 1 0 2 1 Median Median Median 4.4 10.1 4.4 90865000 55938000 34927000 7795700 4737800 3057900 75743000 46940000 28803000 7326500 4259800 3066600 314 4944;15587;16661 True;True;True 5040;15920;17010 17271;54363;54364;54365;58072 22111;68771;68772;68773;73557 22111;68772;73557 P02511 P02511 3 3 3 Alpha-crystallin B chain CRYAB sp|P02511|CRYAB_HUMAN Alpha-crystallin B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRYAB PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 17.1 17.1 17.1 20.159 175 175 0 5.107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79994 0.90494 17.247 9 3 Leave out requantified 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97634 1.0594 21.246 9 1 Leave out requantified 0.95056 0.87947 1.175 1.0151 1.0251 1.2165 18.603 16.805 36.811 3 4 2 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.7 12.3 8.7 193250000 100070000 93184000 56557000 30665000 25892000 83787000 44325000 39462000 52910000 25080000 27830000 322 464;4732;6179;17349 True;True;True;True 474;4825;6295;17708 1588;16555;16556;16557;21386;21387;21388;60554;60555;60556 2067;2068;21219;21220;21221;21222;21223;27212;27213;27214;27215;76767;76768;76769;76770 2068;21221;27212;76768 P04183 P04183 3 3 3 Thymidine kinase, cytosolic TK1 sp|P04183|KITH_HUMAN Thymidine kinase, cytosolic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TK1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 15.8 15.8 15.8 25.468 234 234 0 9.2997 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61724 0.68936 13.451 14 4 Leave out requantified 0.61724 0.63534 0.63402 0.68936 0.72325 0.66237 13.36 21.995 7.114 5 4 5 2 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.8 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P05198 22 22 22 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 EIF2S1 sp|P05198|IF2A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S1 PE=1 SV=3 1 22 22 22 20 21 21 20 21 21 20 21 21 66.3 66.3 66.3 36.112 315 315 0 225.87 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93619 1.0087 34.916 80 28 Leave out requantified 0.96986 0.83306 1.0288 1.0522 0.95546 1.0487 22.498 24.017 62.074 25 27 28 9 10 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 60.3 66.3 66.3 5915100000 3042200000 2872800000 1948400000 1013500000 934860000 1954100000 1063500000 890530000 2012600000 965160000 1047400000 332 531;4126;4127;4547;5509;6659;6760;6805;6806;6807;7182;8055;9620;9621;11083;11928;13740;15300;15407;17709;17940;18671 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 542;4215;4216;4639;5617;6786;6892;6938;6939;6940;7322;8213;9812;9813;11295;12185;14034;15630;15737;18072;18308;19050 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P05423 1 1 1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 POLR3D sp|P05423|RPC4_HUMAN DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3D PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4.5 4.5 4.5 44.395 398 398 0.0022282 2.5729 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 4.5 0 0 9590000 5734300 3855700 9590000 5734300 3855700 0 0 0 0 0 0 336 9258 True 9446 32809 41642 41642 P05455 P05455 2 2 2 Lupus La protein SSB sp|P05455|LA_HUMAN Lupus La protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSB PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 4.4 4.4 4.4 46.836 408 408 0 4.0768 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0031 1.0281 64.635 4 1 Median NaN NaN 1.8741 NaN NaN 1.8918 NaN NaN 86.357 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 1.7 4.4 4.4 31024000 11988000 19036000 5360600 2717400 2643100 7647600 4535600 3112000 18016000 4734900 13281000 337 3499;7692 True;True 3572;7839 12296;12297;12298;27030;27031 15747;15748;34363;34364 15748;34364 P05556 P05556 2 2 2 Integrin beta-1 ITGB1 sp|P05556|ITB1_HUMAN Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 4.9 4.9 4.9 88.414 798 798 0 10.033 By matching By MS/MS 1.508 1.5658 2.5258 3 1 Plateau NaN NaN 1.4912 NaN NaN 1.5656 NaN NaN 3.1034 1 0 2 0 0 1 Median Median Median 2.6 0 4.9 37017000 16313000 20704000 11650000 4376300 7273800 0 0 0 25367000 11937000 13430000 338 10922;12534 True;True 11133;12808 38368;38369;43949 48566;55416 48566;55416 P05783;CON__P05784;CON__H-INV:HIT000015463;CON__Q92764;CON__Q497I4;Q92764 P05783 18;4;2;2;2;2 17;3;2;1;1;1 16;2;2;1;1;1 Keratin, type I cytoskeletal 18 KRT18 sp|P05783|K1C18_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT18 PE=1 SV=2 6 18 17 16 17 17 16 16 16 15 15 15 14 45.6 44 41.9 48.057 430 430;423;295;425;455;455 0 136.46 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86031 0.93371 43.885 58 16 Leave out requantified 0.84768 0.91078 0.93885 0.94091 1.012 0.94001 9.3387 45.474 17.379 20 20 18 5 3 8 Leave out 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alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 PTMA sp|P06454|PTMA_HUMAN Prothymosin alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTMA PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 12.6 12.6 12.6 12.203 111 111 0 19.251 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3566 1.4535 7.9119 7 0 Leave out requantified 1.7206 NaN 1.322 1.8744 NaN 1.3319 10.396 NaN 5.3355 3 1 3 0 0 0 Median Median Median 12.6 11.7 12.6 248840000 109030000 139800000 101750000 38773000 62976000 19094000 8308900 10785000 127990000 61952000 66041000 342 45;46 True;True 46;47 156;157;158;159;160;161;162 209;210;211;212;213;214;215;216;217;218;219 214;216 P06493 P06493 12 12 10 Cyclin-dependent kinase 1 CDK1 sp|P06493|CDK1_HUMAN Cyclin-dependent kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK1 PE=1 SV=3 1 12 12 10 10 10 11 10 10 11 8 8 9 47.5 47.5 41.1 34.095 297 297 0 43.564 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89604 1.0055 18.493 35 13 Leave out requantified 0.85626 0.84274 0.97912 0.92515 0.96055 0.99551 18.585 22.835 16.246 11 11 13 5 3 5 Leave out 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ATP5B sp|P06576|ATPB_HUMAN ATP synthase subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1B PE=1 SV=3 1 13 13 13 12 13 13 12 13 13 12 13 13 38.2 38.2 38.2 56.559 529 529 0 167.57 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85822 0.90398 17.5 54 14 Leave out requantified 0.81634 0.7832 0.94849 0.85915 0.85676 0.95037 18.154 17.712 15.548 17 20 17 4 7 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.3 38.2 38.2 5043400000 2822400000 2221000000 1536000000 872270000 663720000 1937200000 1113400000 823800000 1570200000 836660000 733510000 344 599;3533;5123;5384;8001;8023;8103;11207;15607;16327;16526;17217;17848 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 612;3606;5221;5489;8154;8180;8262;11420;15940;16673;16874;17576;18214 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Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DLAT PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 3 3 2 3 3 2 3 6.2 6.2 6.2 68.996 647 647 0 6.1339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0312 1.1073 5.4107 6 2 Leave out requantified 1.3966 1.7919 0.94034 1.5729 1.9751 0.98091 53.257 43.922 9.9438 2 2 2 1 1 0 Median Median Median 3.9 3.6 4.8 82992000 40955000 42037000 37299000 18528000 18771000 17943000 7920000 10023000 27749000 14507000 13242000 408 2316;5965;6657;16860 True;True;True;True 2371;6079;6784;17211 8102;20637;20638;20639;22948;22949;58774;58775 10448;26262;26263;26264;26265;29224;74491;74492 10448;26264;29224;74492 P10599 P10599 5 5 5 Thioredoxin TXN sp|P10599|THIO_HUMAN Thioredoxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXN PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 27.6 27.6 27.6 11.737 105 105 0 11.993 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5497 1.7331 32.448 14 7 Leave out requantified 1.7281 1.0676 1.5529 1.9617 1.2511 1.6251 21.291 39.052 57.25 4 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regulatory subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKAR2A PE=1 SV=2 2 11 11 11 9 8 8 9 8 8 9 8 8 33.4 33.4 33.4 45.518 404 404;418 0 91.856 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82186 0.90757 37.86 30 6 Leave out requantified 0.92624 0.80298 0.90497 0.98318 0.90075 0.92391 45.531 15.296 20.401 10 11 9 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.2 25 26 959900000 541190000 418710000 278540000 150790000 127750000 300130000 176090000 124040000 381220000 214300000 166920000 443 134;1147;2244;6431;6624;10306;10736;11482;12088;12142;13349 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 136;1178;2299;6554;6749;10507;10945;11705;12345;12400;13638 434;435;4000;7828;7829;22193;22194;22195;22826;36396;36397;37761;37762;37763;40192;40193;40194;40195;40196;40197;42328;42329;42523;42524;42525;42526;42527;42528;46722;46723;46724;46725 571;572;5228;10113;10114;10115;10116;28213;28214;28215;29060;46128;47834;50772;50773;50774;50775;50776;50777;50778;50779;50780;50781;50782;50783;53372;53373;53627;53628;53629;53630;53631;53632;58933;58934;58935;58936 571;5228;10114;28215;29060;46128;47834;50776;53373;53628;58933 P13984 P13984 4 4 4 General transcription factor IIF subunit 2 GTF2F2 sp|P13984|T2FB_HUMAN General transcription factor IIF subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2F2 PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 4 2 2 4 2 2 4 2 25.7 25.7 25.7 28.38 249 249 0 13.201 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83029 0.94857 12.488 8 3 Leave out requantified 0.73758 0.771 0.98981 0.8175 0.90161 1.0254 5.4969 38.525 15.84 2 4 2 1 2 0 Median Median Median 19.3 25.7 19.3 484610000 269760000 214860000 136900000 84022000 52881000 187030000 102990000 84041000 160680000 82745000 77934000 444 5740;10981;15448;17943 True;True;True;True 5851;11192;15779;18311 19893;38556;53838;53839;53840;62537;62538;62539 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27 Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic DARS sp|P14868|SYDC_HUMAN Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DARS PE=1 SV=2 1 27 27 27 26 26 26 26 26 26 26 26 26 56.7 56.7 56.7 57.136 501 501 0 180.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91599 1.0089 18.823 106 28 Leave out requantified 0.92413 0.90425 0.94439 0.98338 1.0059 0.97147 21.454 17.318 19.35 35 35 36 10 9 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 54.9 55.3 55.3 10164000000 5201800000 4962500000 3169900000 1620700000 1549200000 3482800000 1812100000 1670700000 3511500000 1769000000 1742600000 453 886;1701;3156;3689;3690;4326;4693;4694;4861;5043;5248;5705;5834;7631;7647;8510;9643;10664;12290;12816;13155;13289;13421;16169;16851;17789;18328 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.4496 4.0536 94.315 3 3 Median NaN 1.7801 NaN NaN 2.0611 NaN NaN 95.653 NaN 0 2 1 0 2 1 Median Median Median 2.9 6.6 3.7 107580000 32533000 75051000 0 0 0 60017000 24104000 35914000 47567000 8429500 39138000 466 1157;2823 True;True 1188;2886 4034;4035;9905;9906 5274;5275;12652;12653 5275;12652 P16401 P16401 8 8 8 Histone H1.5 HIST1H1B sp|P16401|H15_HUMAN Histone H1.5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H1B PE=1 SV=3 1 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 23.9 23.9 23.9 22.58 226 226 0 49.562 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96824 1.1015 14.871 33 3 Leave out requantified 0.89128 0.91852 1.1236 0.99373 1.0507 1.184 8.221 16.771 15.586 11 11 11 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.9 23.9 23.9 5510300000 2832800000 2677500000 1734600000 883860000 850740000 1872800000 1001800000 871020000 1902900000 947210000 955690000 467 768;769;1458;8541;8565;12007;12008;14077 True;True;True;True;True;True;True;True 787;788;1495;8710;8734;12264;12265;14375 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22.3 22.3 1216900000 557940000 658940000 371840000 147170000 224670000 413270000 218760000 194510000 431780000 192010000 239770000 488 2726;2917;9845;14678;17904;17928 True;True;True;True;True;True 2787;2983;10039;14993;18271;18296 9583;9584;9585;10244;10245;10246;10247;10248;10249;34819;34820;51288;51289;51290;51291;51292;51293;62390;62391;62392;62393;62394;62485;62486;62487 12271;12272;12273;13096;13097;13098;13099;13100;13101;44179;44180;64765;64766;64767;64768;64769;79071;79072;79073;79074;79075;79189;79190;79191;79192;79193 12272;13098;44180;64768;79073;79189 P18858 P18858 20 20 20 DNA ligase 1 LIG1 sp|P18858|DNLI1_HUMAN DNA ligase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LIG1 PE=1 SV=1 1 20 20 20 17 17 16 17 17 16 17 17 16 26 26 26 101.73 919 919 0 76.828 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86688 0.97251 26.001 57 18 Leave out requantified 0.87624 0.92237 0.97253 0.94896 1.073 1.0001 19.856 24.765 30.952 19 19 19 4 6 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 24.5 23 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1259;1260;1261;1262;1263;1264;1692;1693;1694;1695;1696;5668;5669;5670;5671;5672;7789;15163;15164;15165;15166;15624;15625;15626;15627;20452;20453;20454;20455;20456;20457;20458;20459;20460;20461;20462;20463;20826;26541;26542;34539;34540;34541;34542;34543;34544;44361;44362;44363;44364;44365;44366;44367;44368;52048;52049;52050;52051;54547;54548;54549;54550;54551;54552;56361;59106;59107;59108;59109;68124;68125;68126;68127;69180;78000;78001 1264;1692;1696;5671;7789;15164;15624;20456;20463;20826;26541;34543;44363;52050;54551;56361;59108;68125;69180;78000 P18887 P18887 3 3 3 DNA repair protein XRCC1 XRCC1 sp|P18887|XRCC1_HUMAN DNA repair protein XRCC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRCC1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 5.8 5.8 5.8 69.476 633 633 0 6.4179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98759 1.0821 12.04 10 2 Leave out requantified 1.5207 0.98126 1.0129 1.7018 1.1275 1.0845 47.627 15.263 11.992 3 3 4 2 0 0 Plateau Median Leave out requantified 3.5 3.5 5.8 298730000 149670000 149060000 89534000 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873;1062;1063;4608;5023;5903;6076;6334;6335;8841;9785;12160;15718;15866;16244;16913;16914;18163;18322 2981;2982;2983;3601;3602;3603;3604;3605;3606;15849;15850;15851;17219;17220;17221;17222;17223;20051;20052;20053;20054;20055;20056;20630;20631;20632;21503;21504;21505;21506;21507;21508;21509;21510;30503;30504;30505;30506;30507;30508;33998;33999;41742;41743;53659;53660;53661;53662;53663;53664;54133;55500;55501;55502;57739;57740;57741;57742;57743;62038;62039;62577;62578;62579 3900;3901;3902;3903;3904;3905;4721;4722;4723;4724;4725;4726;4727;4728;4729;4730;4731;4732;20346;22048;22049;22050;22051;22052;22053;25506;25507;25508;25509;25510;25511;26255;26256;26257;27345;27346;27347;27348;27349;27350;27351;27352;27353;38769;38770;38771;38772;38773;38774;38775;38776;38777;43157;43158;52690;52691;67827;67828;67829;67830;67831;68450;70204;70205;70206;73116;73117;73118;73119;73120;78629;79313;79314;79315 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1.2923 1.1794 199.94 97.481 164.45 3 3 4 1 2 3 Median Median Median 18 13.7 12.6 159360000 73275000 86086000 45640000 24535000 21106000 34487000 12938000 21549000 79233000 35802000 43432000 499 2985;3203;5502;7033;7034;9972;15983;17276 True;True;True;True;True;True;True;True 3052;3273;5610;7170;7171;10169;16325;17635 10501;11263;19077;19078;19079;24567;24568;24569;24570;35240;55783;60298;60299;60300;60301 13404;14392;24298;24299;24300;24301;31135;31136;31137;31138;44692;70552;76447;76448;76449;76450 13404;14392;24301;31136;31138;44692;70552;76447 P19971 P19971 3 3 3 Thymidine phosphorylase TYMP sp|P19971|TYPH_HUMAN Thymidine phosphorylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TYMP PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 8.1 8.1 8.1 49.955 482 482 0 6.6819 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82594 0.8774 10.034 7 1 Leave out requantified 0.81123 0.73953 1.0402 0.82802 0.8173 1.0647 22.173 12.595 17.33 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 5.2 8.1 5.2 79398000 42867000 36531000 21559000 10658000 10901000 34529000 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Inosine-5-monophosphate dehydrogenase 1 IMPDH1 sp|P20839|IMDH1_HUMAN Inosine-5-monophosphate dehydrogenase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPDH1 PE=1 SV=2 1 15 12 12 11 13 12 8 10 9 8 10 9 39.3 36 36 55.405 514 514 0 141.9 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83313 0.92535 9.8132 29 10 Leave out requantified 0.87626 0.8515 0.71373 0.95599 0.95033 0.75547 13.596 9.7948 13.782 9 11 9 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 30 35.6 28.6 1311600000 742150000 569440000 396630000 218700000 177940000 493260000 282500000 210760000 421700000 240960000 180740000 506 2310;3064;3206;4917;6086;6890;7306;7484;8665;12182;12392;13002;13603;15936;18290 True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True 2365;3132;3276;5013;6202;7024;7449;7628;8836;12441;12662;13285;13894;16278;18663 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Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCMT1 PE=1 SV=4 1 7 7 7 7 7 6 7 7 6 7 7 6 53.3 53.3 53.3 24.636 227 227 0 94.983 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92551 1.0244 20.454 33 12 Leave out requantified 0.92551 0.82666 1.1327 1.0007 0.93774 1.1949 21.076 8.8963 18.81 12 12 9 5 5 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 53.3 53.3 45.8 4232700000 2459000000 1773700000 1450800000 837820000 612960000 1554300000 962210000 592040000 1227600000 658980000 568660000 517 10025;11513;11565;14185;15356;17033;17593 True;True;True;True;True;True;True 10223;10224;11740;11741;11798;14485;15686;17385;17955 35402;35403;35404;35405;35406;35407;35408;40318;40319;40320;40321;40322;40323;40533;40534;49565;49566;49567;49568;49569;49570;49571;49572;49573;53540;53541;53542;59394;59395;59396;61367;61368;61369 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.3798 6.0017 60.742 8 8 Median 5.6563 7.2841 4.4938 5.7802 8.443 4.5568 67.913 42.947 66.395 3 2 3 3 2 3 Median Median Median 33.5 25.3 33.5 179260000 22359000 156900000 55534000 6627800 48906000 61284000 7245500 54039000 62443000 8485500 53958000 539 747;6896;11270;14749;16682 True;True;True;True;True 766;7030;11486;15066;17031 2621;2622;2623;23937;23938;39512;39513;51532;58133;58134;58135 3420;3421;3422;30440;30441;49975;49976;65105;73643;73644;73645 3421;30440;49976;65105;73645 P24752 P24752 6 6 6 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial ACAT1 sp|P24752|THIL_HUMAN Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACAT1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 5 6 3 5 6 3 5 6 17.1 17.1 17.1 45.199 427 427 0 15.926 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90336 1.0148 34.343 13 2 Leave out requantified 1.0224 0.6844 1.2077 1.1348 0.80281 1.2871 36.563 37.101 28.886 3 5 5 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.1 15 17.1 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geranylgeranyltransferase component A 2 CHML sp|P26374|RAE2_HUMAN Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHML PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 0 2 1 0 2 1 0 7.6 7.6 7.6 74.071 656 656 0 8.6469 By MS/MS By MS/MS 0.74795 0.86463 9.2193 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 4.6 3 0 38773000 21630000 17143000 23892000 12482000 11410000 14882000 9148800 5732900 0 0 0 556 1600;9748;13990 True;True;True 1639;9940;14287 5512;34485;48924 7212;43741;61670 7212;43741;61670 P26447 P26447 3 3 3 Protein S100-A4 S100A4 sp|P26447|S10A4_HUMAN Protein S100-A4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 24.8 24.8 24.8 11.728 101 101 0 8.5873 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.7512 1.8197 10.135 9 2 Leave out requantified 1.8623 1.5629 2.8722 2.0319 1.7028 3.05 15.475 8.1575 26.418 3 3 3 1 0 1 Median Leave out requantified Plateau 24.8 24.8 24.8 645920000 222010000 423910000 192290000 72476000 119820000 215050000 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16930;16931;16932;16933;19989;19990;26598;26599;47237;50175;50176;57866;57867;61171;69190;69191;69192;69736 16930;19990;26598;47237;50175;57867;61171;69192;69736 P29083 P29083 6 6 6 General transcription factor IIE subunit 1 GTF2E1 sp|P29083|T2EA_HUMAN General transcription factor IIE subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2E1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 3 4 5 3 4 5 3 4 5 31 31 31 49.452 439 439 0 26.831 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7401 0.81137 32.051 17 7 Leave out requantified 0.70565 0.90284 0.54262 0.78787 0.9449 0.5644 20.032 18.784 46.154 6 4 7 2 1 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.2 18.7 25.7 416150000 230020000 186130000 137050000 77579000 59469000 107140000 60007000 47134000 171960000 92433000 79531000 578 1960;2287;4387;4406;5174;6368 True;True;True;True;True;True 2006;2342;4478;4497;5274;6490 6774;6775;6776;8002;8003;8004;8005;8006;8007;8008;8009;15378;15445;15446;18021;22001;22002 8771;8772;8773;10325;10326;10327;10328;10329;10330;10331;10332;10333;19732;19831;22979;27968;27969 8773;10330;19732;19831;22979;27969 P29084 P29084 6 6 6 Transcription initiation factor IIE subunit beta GTF2E2 sp|P29084|T2EB_HUMAN Transcription initiation factor IIE subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2E2 PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 6 4 3 6 4 3 6 4 31.3 31.3 31.3 33.043 291 291 0 32.672 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91927 1.0449 23.38 11 2 Leave out requantified 0.7141 0.95424 1.0415 0.79524 1.0886 1.0562 30.659 9.6215 15.932 3 4 4 0 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.2 31.3 22.7 422420000 213650000 208760000 121570000 57918000 63649000 144390000 71356000 73035000 156460000 84380000 72076000 579 5681;6153;7889;12847;13942;15152 True;True;True;True;True;True 5792;6269;8037;13126;14239;15476 19707;19708;19709;21295;21296;27707;44975;44976;44977;48787;48788;48789;52830 25087;27103;27104;35198;56707;56708;56709;61505;66756 25087;27104;35198;56708;61505;66756 P29144 P29144 3 3 3 Tripeptidyl-peptidase 2 TPP2 sp|P29144|TPP2_HUMAN Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPP2 PE=1 SV=4 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 3.8 3.8 3.8 138.35 1249 1249 0 5.1408 By MS/MS By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 2.4 1 2.4 18870000 12295000 6574800 3922400 3922400 0 0 0 0 14947000 8372500 6574800 580 181;9021;18545 True;True;True 183;9203;18923 595;596;597;31894;64581 778;779;780;40487;81773 778;40487;81773 P29218 P29218 5 5 5 Inositol monophosphatase 1 IMPA1 sp|P29218|IMPA1_HUMAN Inositol monophosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IMPA1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 2 2 5 2 2 5 2 2 20.6 20.6 20.6 30.188 277 277 0 18.621 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61217 0.66744 34.971 10 7 Median 0.55752 0.57213 0.9741 0.62899 0.63824 1.0097 34.378 21.988 3.6694 5 3 2 3 3 1 Median Median Median 20.6 7.9 7.9 385880000 235940000 149930000 196750000 127160000 69593000 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P29401 P29401 32 32 32 Transketolase TKT sp|P29401|TKT_HUMAN Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT PE=1 SV=3 1 32 32 32 29 31 31 29 31 31 29 31 31 62.6 62.6 62.6 67.877 623 623 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90994 0.97532 25.803 166 44 Leave out requantified 0.93524 0.71097 1.221 1.0483 0.81922 1.2501 31.678 21.493 21.407 52 59 55 14 17 13 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 52.5 56.8 62.6 54357000000 27639000000 26718000000 14727000000 7478100000 7248400000 20387000000 11617000000 8769700000 19244000000 8543800000 10700000000 583 1555;1697;1761;2045;4394;6043;6044;7106;7674;7844;7988;8283;8793;8808;8901;9467;9880;10020;10711;11368;11484;11666;12272;12441;12442;12633;14206;14389;15138;16153;17215;17216 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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986;5427;6803;10387;15916;17220;17221;17862 3350;3351;18497;23005;23006;23007;23008;23009;23010;36011;36012;36013;54349;58806;58807;58808;58809;58810;58811;58812;61067;61068;61069;61070 4374;4375;23564;29295;29296;29297;29298;29299;29300;29301;29302;45650;45651;45652;45653;45654;68752;74531;74532;74533;74534;74535;74536;74537;77440;77441;77442;77443 4375;23564;29298;45653;68752;74533;74536;77443 P30046;A6NHG4 P30046;A6NHG4 4;3 4;3 4;3 D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein DDT;DDTL sp|P30046|DOPD_HUMAN D-dopachrome decarboxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDT PE=1 SV=3;sp|A6NHG4|DDTL_HUMAN D-dopachrome decarboxylase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDTL PE=2 SV=1 2 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 39 39 39 12.712 118 118;134 0 15.323 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.50965 0.58136 29.021 10 5 Leave out requantified 0.4674 0.46969 1.089 0.52872 0.54488 1.1513 11.813 7.0364 11.954 4 3 3 2 1 2 Median Median Median 39 32.2 28.8 441050000 269590000 171460000 156450000 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sp|P30050|RL12_HUMAN 60S ribosomal protein L12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL12 PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 58.8 58.8 58.8 17.818 165 165 0 116.05 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99863 1.053 21.995 42 14 Leave out requantified 1.0368 0.89365 1.0993 1.091 1.035 1.1099 13.104 37.255 14.092 14 16 12 5 7 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 58.8 58.8 58.8 6315900000 3406600000 2909300000 1890300000 1009400000 880890000 2456700000 1371600000 1085100000 1968800000 1025600000 943270000 593 1961;3676;3677;4043;7079;7130;7623;12668 True;True;True;True;True;True;True;True 2007;3751;3752;4125;7216;7270;7768;12944 6777;6778;6779;6780;6781;6782;6783;12920;12921;12922;12923;12924;12925;12926;12927;12928;12929;12930;12931;12932;12933;12934;14247;14248;14249;24720;24721;24722;24723;24724;24725;24989;24990;24991;24992;24993;24994;26763;26764;26765;44393;44394;44395;44396;44397;44398 8774;8775;8776;8777;8778;8779;8780;8781;8782;8783;8784;8785;16550;16551;16552;16553;16554;16555;16556;16557;16558;16559;16560;16561;16562;16563;16564;16565;16566;18220;18221;18222;31308;31309;31310;31311;31312;31313;31314;31315;31316;31317;31318;31319;31789;31790;31791;31792;31793;31794;31795;31796;31797;31798;31799;33995;33996;33997;33998;33999;34000;55946;55947;55948;55949;55950;55951 8778;16559;16561;18221;31311;31792;33997;55948 P30084 P30084 2 2 2 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial ECHS1 sp|P30084|ECHM_HUMAN Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECHS1 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 11 11 11 31.387 290 290 0 15.13 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98336 1.0334 10.937 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 11 6.2 6.2 80016000 43790000 36226000 20412000 10351000 10060000 31221000 18683000 12539000 28383000 14756000 13627000 594 953;4115 True;True 978;4203 3315;3316;3317;14495 4338;4339;4340;18577 4339;18577 P30085 P30085 7 7 7 UMP-CMP kinase CMPK1 sp|P30085|KCY_HUMAN UMP-CMP kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMPK1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 7 5 5 7 5 5 7 5 36.7 36.7 36.7 22.222 196 196 0 31.179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94457 1.097 29.085 17 5 Leave out requantified 0.94457 0.73944 1.6328 1.0166 0.80682 1.6116 17.447 24.003 26.279 6 6 5 3 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.5 36.7 23.5 468590000 228760000 239830000 126590000 66618000 59972000 198530000 110450000 88082000 143470000 51689000 91779000 595 4091;5063;8437;8977;12350;18345;18346 True;True;True;True;True;True;True 4173;5161;8605;9158;12619;18718;18719 14402;14403;14404;17643;17644;17645;29611;31747;43255;43256;43257;43258;63888;63889;63890;63891;63892;63893;63894 18446;18447;18448;18449;18450;18451;22532;22533;22534;22535;22536;22537;37555;40280;54537;54538;54539;54540;54541;80923;80924;80925;80926;80927;80928 18449;22533;37555;40280;54540;80926;80928 P30101 P30101 6 6 6 Protein disulfide-isomerase A3 PDIA3 sp|P30101|PDIA3_HUMAN Protein disulfide-isomerase A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDIA3 PE=1 SV=4 1 6 6 6 4 6 5 4 6 5 4 6 5 14.5 14.5 14.5 56.782 505 505 0 12.216 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5449 1.6431 14.076 15 7 Leave out requantified 1.107 0.86331 1.5704 1.2469 1.0199 1.6637 33.754 21.407 25.978 4 6 5 2 3 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 7.9 14.5 12.9 306890000 157880000 149020000 60656000 31182000 29473000 137330000 82362000 54963000 108910000 44332000 64582000 596 5100;6061;9084;10939;16269;18343 True;True;True;True;True;True 5198;6177;9268;11150;16614;18716 17766;17767;17768;20988;20989;20990;32139;32140;38428;38429;38430;56718;63883;63884;63885 22679;22680;22681;26705;26706;26707;26708;26709;40786;48622;48623;48624;71753;80919;80920;80921 22681;26705;40786;48623;71753;80919 P30153;P30154 P30153 23;4 23;4 23;4 Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform PPP2R1A sp|P30153|2AAA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R1A PE=1 SV=4 2 23 23 23 22 23 22 22 23 22 22 23 22 50.3 50.3 50.3 65.308 589 589;601 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92819 1.0121 24.414 103 16 Leave out requantified 0.93745 0.84152 0.99535 1.0264 0.96365 1.0326 30.391 22.409 75.505 33 37 33 3 8 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 48.9 50.3 49.1 13598000000 7291500000 6306600000 4138500000 2152100000 1986300000 5142400000 2849400000 2293100000 4317100000 2289900000 2027200000 597 698;1577;2738;3415;4078;4179;4632;7042;7622;10580;10996;11091;11382;11930;12127;13131;13885;14042;15363;15364;17182;17239;18523 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 714;1616;2801;3487;4160;4268;4724;7179;7767;10786;11207;11304;11598;12187;12385;13414;14181;14340;15693;15694;17539;17540;17598;18900 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P30260 3 3 3 Cell division cycle protein 27 homolog CDC27 sp|P30260|CDC27_HUMAN Cell division cycle protein 27 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC27 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 3.8 3.8 3.8 91.866 824 824 0 6.6587 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.29378 0.3183 90.437 3 3 Median 0.56347 NaN NaN 0.62538 NaN NaN 95.509 NaN NaN 2 1 0 2 1 0 Median Median Median 2.9 1.1 2.7 44719000 33399000 11320000 25104000 15927000 9177300 9147000 7004100 2142800 10468000 10468000 0 598 818;2937;9248 True;True;True 837;3003;9436 2876;10328;10329;32781;32782;32783 3764;13210;13211;41607;41608;41609 3764;13210;41609 P30419;O60551 P30419 8;2 8;2 8;2 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 NMT1 sp|P30419|NMT1_HUMAN Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NMT1 PE=1 SV=2 2 8 8 8 7 6 8 7 6 8 7 6 8 21.6 21.6 21.6 56.806 496 496;498 0 78.181 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97051 1.0658 7.3225 30 8 Leave out requantified 0.95307 0.93461 1.0176 1.0424 1.0765 1.079 7.428 17.344 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4604;4605;4606;37079;37080;47090;48745;48746;48747;56830;56831;56832;56833;56834;56835;56836;62788;62789;62790;62791;62792;62793 4604;37080;47090;48746;56834;62790 P30837;P00352;P47895;P05091 P30837 9;1;1;1 9;1;1;1 8;0;0;0 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial ALDH1B1 sp|P30837|AL1B1_HUMAN Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1B1 PE=1 SV=3 4 9 9 8 6 6 9 6 6 9 5 5 8 22.2 22.2 20.7 57.206 517 517;501;512;517 0 44.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99504 1.0456 11.322 21 5 Leave out requantified 0.83759 0.87189 1.0373 0.90391 0.99092 1.0456 10.219 20.31 20.987 5 7 9 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.5 14.9 22.2 559610000 271680000 287930000 127460000 58730000 68729000 187990000 93896000 94099000 244160000 119050000 125100000 605 3374;8773;9138;9316;15489;15504;16921;17285;17776 True;True;True;True;True;True;True;True;True 3446;8946;9322;9504;15821;15836;17273;17644;18140 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Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UQCRC1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 3 1 3 3 1 3 3 1 17.7 17.7 17.7 52.645 480 480 0 10.231 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56571 0.58273 51.822 7 4 Median 0.97061 0.35917 NaN 1.0481 0.41952 NaN 30.519 21.691 NaN 3 3 1 2 2 0 Plateau Median Median 12.9 13.8 4.2 141700000 83550000 58150000 63523000 34054000 29469000 52262000 37178000 15083000 25915000 12317000 13598000 614 1558;11773;11853;18397 True;True;True;True 1597;12024;12108;18771 5387;41271;41272;41273;41574;64085;64086 7033;52104;52105;52488;81156;81157 7033;52104;52488;81157 P31939 P31939 30 30 30 Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase ATIC sp|P31939|PUR9_HUMAN Bifunctional purine biosynthesis protein PURH OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATIC PE=1 SV=3 1 30 30 30 27 27 25 27 27 25 27 27 25 62 62 62 64.615 592 592 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74829 0.78602 53.204 107 41 Leave out 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P31943 P31943 8 8 3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed HNRNPH1 sp|P31943|HNRH1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH1 PE=1 SV=4 1 8 8 3 6 8 6 6 8 6 2 3 2 26.5 26.5 11.4 49.229 449 449 0 112.89 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1434 1.1734 14.042 34 8 Leave out requantified 1.3391 0.82445 1.3157 1.4348 0.93139 1.352 13.302 12.59 10.252 11 13 10 4 4 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20 26.5 20 2795700000 1386400000 1409300000 732660000 343440000 389220000 1121700000 634600000 487080000 941340000 408360000 532980000 616 1449;3552;6196;7170;14702;15001;16969;17764 True;True;True;True;True;True;True;True 1485;3625;6312;7310;15018;15322;17321;18127 5028;5029;5030;12485;12486;12487;21440;25148;25149;25150;25151;25152;25153;25154;25155;25156;25157;51371;51372;51373;52317;52318;52319;52320;52321;52322;52323;59165;59166;59167;59168;59169;59170;61927 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2392;6997;8079;9448;13976;16137 8172;8173;23752;27833;27834;32817;32818;32819;47884;47885;55153 10531;10532;30206;35360;41650;60431;60432;69737 10532;30206;35360;41650;60431;69737 P37235;P84074;P61601 P37235;P84074;P61601 2;1;1 2;1;1 2;1;1 Hippocalcin-like protein 1;Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin;Neurocalcin-delta HPCAL1;HPCA;NCALD sp|P37235|HPCL1_HUMAN Hippocalcin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPCAL1 PE=1 SV=3;sp|P84074|HPCA_HUMAN Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPCA PE=1 SV=2;sp|P61601|NCALD_HUMAN Neurocalcin-delta OS=Homo 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.3 9.3 9.3 22.313 193 193;193;193 0 6.718 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1251 1.1692 26.456 6 4 Median 1.0889 0.93626 1.4771 1.1381 0.99237 1.4921 35.874 8.9434 20.248 2 2 2 1 1 2 Median Median Median 9.3 9.3 9.3 106790000 45914000 60879000 35703000 16449000 19253000 43553000 20865000 22688000 27538000 8600100 18938000 668 10887;10948 True;True 11098;11159 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68229 0.76665 55.345 10 6 Median 0.62614 0.50103 0.95943 0.68274 0.58032 1.0252 72.293 45.277 23.856 4 4 2 3 2 1 Median Median Median 36.4 36.4 25 307220000 188760000 118450000 115010000 72652000 42362000 132300000 87297000 45005000 59902000 28816000 31086000 670 3576;4270;15714;16278 True;True;True;True 3649;4359;16049;16623 12573;12574;12575;14990;14991;54841;54842;54843;56741;56742 16109;19246;19247;69369;69370;69371;71786;71787 16109;19247;69370;71787 P38117 P38117 14 14 14 Electron transfer flavoprotein subunit beta ETFB sp|P38117|ETFB_HUMAN Electron transfer flavoprotein subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ETFB PE=1 SV=3 1 14 14 14 13 13 12 13 13 12 13 13 12 56.5 56.5 56.5 27.843 255 255 0 62.942 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92361 1.0659 24.111 43 15 Leave out requantified 0.88203 0.92074 0.87163 0.96327 1.032 0.89038 27.589 20.72 27.932 14 16 13 5 6 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 56.1 56.1 52.9 2356300000 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translation initiation factor 2D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2D PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 7.4 7.4 7.4 64.706 584 584 0 11.347 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0255 1.0632 3.2311 7 1 Leave out requantified 1.1388 0.82703 1.0255 1.2677 0.9547 1.0632 14.585 22.793 3.2311 2 3 2 0 1 0 Median Median Median 5 7.4 5 144920000 74660000 70262000 44226000 22408000 21818000 54986000 28650000 26336000 45711000 23602000 22108000 696 5108;10813;14600 True;True;True 5206;11024;14911 17804;38023;38024;38025;50972;50973;50974 22718;48144;48145;64320;64321;64322;64323;64324;64325 22718;48145;64325 P41223 P41223 2 2 2 Protein BUD31 homolog BUD31 sp|P41223|BUD31_HUMAN Protein BUD31 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BUD31 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 19.4 19.4 19.4 17 144 144 0.00047037 3.1408 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 5.6 13.9 67347000 42028000 25319000 0 0 0 0 0 0 67347000 42028000 25319000 697 8557;18373 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P41240 3 3 3 Tyrosine-protein kinase CSK CSK sp|P41240|CSK_HUMAN Tyrosine-protein kinase CSK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSK PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 8 8 8 50.704 450 450 0 6.7538 By MS/MS By matching By MS/MS 0.98789 1.0669 9.7067 5 2 Median 1.0513 NaN NaN 0.97768 NaN NaN 11.121 NaN NaN 3 1 1 2 0 0 Plateau Median Median 8 3.1 3.1 152580000 72128000 80455000 62344000 27771000 34573000 45069000 22418000 22651000 45171000 21940000 23231000 699 3237;6501;17437 True;True;True 3307;6624;17796 11372;11373;11374;22407;60842 14546;28474;77147 14546;28474;77147 P41250 P41250 11 11 11 Glycine--tRNA ligase GARS sp|P41250|GARS_HUMAN Glycine--tRNA ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GARS PE=1 SV=3 1 11 11 11 9 10 10 9 10 10 9 10 10 19.2 19.2 19.2 83.165 739 739 0 86.907 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.376 1.4299 37.441 31 1 Leave out requantified 1.3373 1.3209 1.4744 1.4145 1.5101 1.5349 40.685 35.389 38.486 10 10 11 1 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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reductase family 1 member C3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1C3 PE=1 SV=4;sp|P17516|AK1C4_HUMAN Aldo-keto reductase family 1 member C4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1C4 PE=1 SV=3 2 8 8 2 8 6 5 8 6 5 2 1 1 32.2 32.2 13 36.853 323 323;323 0 27.141 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.33222 0.35667 12.444 18 9 Leave out requantified 0.33222 0.28216 0.51496 0.35667 0.30712 0.51679 12.444 20.149 22.784 8 6 4 5 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.2 20.1 17.6 638820000 476220000 162590000 237150000 175390000 61752000 268410000 208230000 60173000 133270000 92597000 40668000 708 3298;6725;6926;9290;12178;13042;15980;18144 True;True;True;True;True;True;True;True 3369;6857;7061;9478;12437;13325;16322;18514 11602;11603;23231;23232;23233;24072;32925;32926;32927;42654;42655;42656;45680;45681;45682;45683;45684;45685;55767;55768;55769;63157 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sp|P46087|NOP2_HUMAN Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP2 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 6 5 5 6 5 5 6 5 13.2 13.2 13.2 89.301 812 812 0 37.651 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76961 0.87803 19.215 14 6 Leave out requantified 0.7579 0.69413 0.79536 0.85164 0.78835 0.87803 9.9623 23.868 29.919 4 5 5 1 3 2 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.9 9.6 8.9 291610000 171220000 120390000 78960000 46043000 32917000 115860000 69944000 45912000 96789000 55232000 41558000 732 5528;6685;7860;9906;11240;12471;13267;17313 True;True;True;True;True;True;True;True 5636;6816;8008;10102;11454;12743;13554;17672 19166;19167;23070;23071;23072;27610;35013;39384;39385;43686;43687;43688;46455;46456;60434;60435;60436 24408;24409;29376;29377;29378;29379;29380;35086;44408;49800;49801;55098;55099;55100;58602;58603;76613;76614;76615;76616 24408;29376;35086;44408;49801;55098;58603;76613 P46100 P46100 4 4 4 Transcriptional regulator ATRX ATRX sp|P46100|ATRX_HUMAN Transcriptional regulator ATRX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATRX PE=1 SV=5 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 2.2 2.2 2.2 282.58 2492 2492 0 9.179 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93484 1.0081 23.308 10 2 Leave out requantified 0.93484 1.0193 1.0508 1.0081 1.1471 1.0794 26.072 21.806 22.771 3 3 4 0 1 1 Leave out requantified Median Leave out requantified 1.7 1.8 2.2 119740000 58850000 60888000 35565000 16509000 19056000 33419000 16932000 16487000 50753000 25409000 25345000 733 9045;12678;15442;17860 True;True;True;True 9228;12954;15773;18227 31998;31999;32000;44435;44436;44437;53821;53822;62249;62250 40624;40625;40626;56015;56016;56017;56018;56019;56020;68040;68041;78897;78898 40626;56020;68041;78897 P46199 P46199 2 2 2 Translation initiation factor IF-2, mitochondrial MTIF2 sp|P46199|IF2M_HUMAN Translation initiation factor IF-2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTIF2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 3.3 3.3 3.3 81.316 727 727 0 4.0369 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78377 0.86351 24.837 8 0 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specificity mitogen-activated protein kinase kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K3 PE=1 SV=2 1 4 1 1 2 3 4 1 1 1 1 1 1 12.4 3.2 3.2 39.318 347 347 0.0065274 2.3227 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.6564 2.9778 42.144 3 3 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 5.5 7.8 12.4 22582000 7891100 14691000 6242900 1896800 4346100 9172500 3155400 6017100 7166800 2838900 4327900 737 2989;5612;8067;11406 True;False;False;False 3056;5722;8225;11625 10512;10513;10514;19466;19467;28310;28311;28312;39934 13415;13416;13417;24798;24799;35931;35932;35933;50456 13415;24799;35931;50456 P46736 P46736 2 2 2 Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 BRCC3 sp|P46736|BRCC3_HUMAN Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRCC3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 10.8 10.8 10.8 36.072 316 316 0 4.8156 By MS/MS By MS/MS 0.65621 0.73856 1.6422 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 4.7 10.8 0 27188000 19274000 7914200 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semialdehyde dehydrogenase ALDH7A1 sp|P49419|AL7A1_HUMAN Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH7A1 PE=1 SV=5 1 20 20 20 19 18 19 19 18 19 19 18 19 46.6 46.6 46.6 58.486 539 539 0 287.61 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80867 0.89913 25.363 71 18 Leave out requantified 0.80845 0.80867 0.91661 0.88022 0.91443 0.93496 15.353 20.362 28.371 25 22 24 7 7 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 46.2 46 46.6 5623200000 3043800000 2579400000 1716600000 935920000 780650000 1967500000 1078000000 889520000 1939100000 1029900000 909220000 775 2616;3764;3919;5018;5579;5763;6452;8169;8460;9696;11533;12676;12677;12691;12853;12917;14988;16922;17228;17229 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2674;3842;4001;5116;5689;5874;6575;8328;8628;9888;11764;12952;12953;12968;13132;13198;15309;17274;17587;17588 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16 Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic CARS sp|P49589|SYCC_HUMAN Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CARS PE=1 SV=3 1 16 16 16 13 14 10 13 14 10 13 14 10 22.1 22.1 22.1 85.472 748 748 0 63.739 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90998 0.96783 14.144 46 11 Leave out requantified 0.9181 0.87952 1.0176 0.97219 0.98053 1.0437 21.599 10.917 16.978 18 16 12 7 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 19.4 18.9 13.9 1712600000 905080000 807540000 573870000 296740000 277130000 643750000 351280000 292470000 495000000 257060000 237940000 780 791;979;980;981;1196;2720;4232;4796;5473;8138;11229;13183;14758;15189;17597;17668 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 810;1004;1005;1006;1228;2781;4321;4891;5580;8297;11443;13470;15075;15515;17959;18031 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sp|P49840|GSK3A_HUMAN Glycogen synthase kinase-3 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSK3A PE=1 SV=2 1 6 6 4 6 5 4 6 5 4 4 4 3 18.2 18.2 14.9 50.98 483 483 0 26.258 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82833 0.93421 23.56 15 4 Leave out requantified 0.70326 0.86219 0.92769 0.74114 0.96838 0.94677 22.564 3.625 18.309 6 5 4 2 2 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.2 16.4 14.3 434960000 225000000 209970000 159620000 81068000 78548000 139650000 71369000 68282000 135700000 72558000 63137000 790 8857;10972;14797;16161;17277;17814 True;True;True;True;True;True 9032;11183;15114;16503;17636;18180 31289;38527;38528;38529;51699;51700;56361;56362;56363;60302;60303;60304;62093;62094;62095 39745;48733;48734;48735;65329;65330;71292;71293;71294;71295;71296;71297;76451;76452;78691;78692 39745;48735;65330;71294;76451;78692 P49841 P49841 5 3 3 Glycogen synthase kinase-3 beta GSK3B sp|P49841|GSK3B_HUMAN Glycogen synthase kinase-3 beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSK3B PE=1 SV=2 1 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IDH3A sp|P50213|IDH3A_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH3A PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 8 7 8 8 7 8 8 7 23.2 23.2 23.2 39.591 366 366 0 50.088 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84353 0.889 22.763 24 8 Leave out requantified 0.55293 0.91539 0.95792 0.57203 1.0404 0.97306 32.035 19.939 20.792 8 9 7 3 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 23.2 23.2 23.2 1460100000 767500000 692580000 455820000 253490000 202330000 522270000 263420000 258850000 481990000 250590000 231390000 796 1928;1929;4176;4482;7252;12554;16030;18100 True;True;True;True;True;True;True;True 1973;1974;4265;4573;7393;12829;16372;18470 6677;6678;6679;6680;6681;14686;14687;14688;15721;15722;15723;25474;25475;25476;44020;44021;44022;44023;55927;55928;55929;63007;63008;63009 8650;8651;8652;8653;18841;18842;18843;18844;18845;20190;32332;32333;32334;55490;55491;55492;55493;70728;70729;70730;79814;79815 8650;8652;18843;20190;32333;55490;70730;79815 P50395;P31150 P50395 5;1 5;1 5;1 Rab GDP dissociation inhibitor beta GDI2 sp|P50395|GDIB_HUMAN Rab GDP dissociation inhibitor beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GDI2 PE=1 SV=2 2 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 14.2 14.2 14.2 50.663 445 445;447 0 43.912 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1545 1.2924 35.548 11 3 Leave out requantified 1.1599 0.61864 2.0041 1.2989 0.68577 2.0927 36.026 3.2742 23.028 3 4 4 1 1 1 Plateau Leave out requantified Leave out requantified 9.4 11.7 11.9 399580000 193790000 205790000 95620000 44071000 51549000 158340000 102150000 56191000 145620000 47574000 98048000 797 5462;6434;15335;16408;17004 True;True;True;True;True 5568;6557;15665;16756;17356 18936;18937;18938;22201;53471;53472;53473;57204;57205;57206;59306 24124;24125;24126;24127;24128;24129;28221;67579;67580;67581;72387;72388;72389;72390;72391;72392;75157 24127;28221;67580;72387;75157 P50454 P50454 8 8 8 Serpin H1 SERPINH1 sp|P50454|SERPH_HUMAN Serpin H1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERPINH1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 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P51553 5 5 5 Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial IDH3G sp|P51553|IDH3G_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH3G PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 1 1 4 1 1 4 1 1 28.2 28.2 28.2 42.794 393 393 0 21.71 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7876 0.81249 23.841 5 4 Median 0.866 NaN NaN 0.96925 NaN NaN 26.376 NaN NaN 3 1 1 3 1 0 Median Median Median 23.2 5.1 5.9 128240000 61509000 66730000 74802000 32679000 42123000 7231800 4474900 2756900 46205000 24355000 21850000 821 4177;6781;7180;8567;16132 True;True;True;True;True 4266;6913;7320;8736;16474 14689;14690;23415;25189;30077;56273 18846;18847;18848;29836;32031;38190;71161 18848;29836;32031;38190;71161 P51570 P51570 4 4 4 Galactokinase GALK1 sp|P51570|GALK1_HUMAN Galactokinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GALK1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 13.3 13.3 13.3 42.272 392 392 0 15.279 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5148 1.6514 27.701 8 7 Median 1.5503 1.5103 1.4213 1.6514 1.7128 1.4241 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2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 HSD17B4 sp|P51659|DHB4_HUMAN Peroxisomal multifunctional enzyme type 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSD17B4 PE=1 SV=3 1 10 10 10 7 8 7 7 8 7 7 8 7 19.3 19.3 19.3 79.685 736 736 0 36.485 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87491 0.98142 24.81 26 9 Leave out requantified 0.96616 0.72072 0.93455 1.048 0.77419 1.0022 25.402 20.06 9.128 9 9 8 2 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.2 17.3 13.7 458650000 256340000 202310000 162920000 90322000 72597000 135890000 79826000 56065000 159840000 86193000 73648000 826 1520;1521;5569;6483;7417;7427;9853;14690;16564;17288 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1558;1559;5677;6606;7560;7570;10047;15005;16912;17647 5274;5275;5276;5277;5278;19317;22357;22358;22359;22360;22361;26055;26056;26057;26089;34841;34842;51326;51327;51328;57734;57735;57736;57737;57738;60338;60339;60340 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Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2E1 PE=1 SV=1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 13.5 9.3 9.3 21.404 193 193 0 4.4431 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1053 1.2432 20.38 6 6 Median 0.91381 1.1151 NaN 1.006 1.2743 NaN 36.625 5.4885 NaN 2 3 1 2 3 1 Median Median Median 13.5 13.5 13.5 152160000 84637000 67522000 54100000 33706000 20394000 83974000 45476000 38497000 14086000 5455300 8630800 831 3810;5669 True;False 3890;5779 13478;13479;13480;13481;13482;13483;19659;19660;19661 17277;17278;17279;17280;17281;17282;25028;25029;25030 17280;25028 P51991 P51991 6 6 6 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 HNRNPA3 sp|P51991|ROA3_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA3 PE=1 SV=2 1 6 6 6 4 4 5 4 4 5 4 4 5 25.9 25.9 25.9 39.594 378 378 0 18.316 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.75004 0.84558 22.303 20 5 Leave out requantified 0.79263 0.8418 0.95539 0.86802 0.97846 1.0206 61.091 30.85 56.992 6 6 8 1 1 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.4 18.5 21.7 772770000 465550000 307220000 243930000 157340000 86591000 200620000 104850000 95772000 328220000 203370000 124850000 832 3337;5772;7562;9693;13622;18330 True;True;True;True;True;True 3409;5883;7706;9885;13913;18703 11749;11750;11751;11752;11753;11754;11755;11756;19984;19985;19986;19987;26559;34304;34305;34306;47651;47652;63844;63845 15046;15047;15048;15049;15050;15051;15052;25427;25428;25429;25430;33737;43513;43514;43515;43516;60122;60123;80880;80881 15048;25430;33737;43515;60122;80881 P52209 P52209 4 4 4 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating PGD sp|P52209|6PGD_HUMAN 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGD PE=1 SV=3 1 4 4 4 0 3 3 0 3 3 0 3 3 11 11 11 53.139 483 483 0 25.063 By MS/MS By MS/MS 0.73336 0.77818 29.955 6 3 Median NaN 0.59028 1.0861 NaN 0.62843 1.0725 NaN 1.9147 9.754 0 3 3 0 2 1 Median Median Median 0 8.7 8.1 147860000 74538000 73321000 0 0 0 60745000 40144000 20600000 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17190;17191;17192;17193;17194;24120;24121;24122;24123;26471;26472;26473;26474;26475;26476;26477;26478;26479;26480;26481;26482;33134;33135;46093;46094;46095;46096;46097;46098;46099;46100;46101;46102;48612;48613;48614;53487;53488;53489;53490;53491;54347;54348;54349;54350;54351;54352;54381;54382;54383;54384;54385;54386;55486;55487;60235;68620;68621;68622;68623;68624;68625 17191;24121;26472;33134;46095;48612;53491;54347;54381;55486;60235;68623 P52294;O15131 P52294 6;2 4;0 4;0 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed KPNA1 sp|P52294|IMA5_HUMAN Importin subunit alpha-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KPNA1 PE=1 SV=3 2 6 4 4 3 5 5 2 3 3 2 3 3 10 5.4 5.4 60.221 538 538;536 0 6.4978 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86182 0.94101 18.901 8 0 Leave out requantified 0.82943 0.77033 0.96417 0.88306 0.91448 0.9683 34.674 33.584 16.074 2 3 3 0 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 5.4 10 8 339720000 176200000 163510000 53784000 25806000 27978000 86921000 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stimulator 1 RAP1GDS1 sp|P52306|GDS1_HUMAN Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1GDS1 PE=1 SV=3 1 10 10 10 8 10 8 8 10 8 8 10 8 19.4 19.4 19.4 66.316 607 607 0 70.858 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88587 0.94453 6.3458 29 13 Leave out requantified 0.9143 0.86733 1.0365 0.96787 0.94453 1.0647 10.439 12.158 12.779 9 10 10 4 4 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.7 19.4 16 1087800000 645560000 442220000 394210000 244890000 149320000 402020000 257450000 144570000 291550000 143210000 148340000 838 880;4572;11172;11589;11612;12122;13913;15065;15702;16529 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 903;4664;11385;11824;11848;12380;14209;15387;16037;16877 3082;3083;3084;3085;3086;3087;3088;3089;16022;16023;39165;40614;40615;40616;40706;40707;40708;40709;42459;42460;42461;48701;48702;48703;52534;52535;52536;54783;54784;54785;57594;57595;57596 4046;4047;4048;4049;4050;4051;4052;20575;20576;49508;51275;51276;51277;51400;51401;51402;51403;53539;53540;53541;61399;61400;61401;66387;66388;66389;69297;72905;72906 4048;20576;49508;51275;51402;53539;61401;66389;69297;72905 P52434 P52434 2 2 2 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 POLR2H sp|P52434|RPAB3_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2H PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 21.3 21.3 21.3 17.143 150 150 0 4.3048 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9949 1.0555 9.7219 6 5 Median 0.95239 1.0304 1.0323 0.99669 1.1264 1.0325 5.857 6.9509 15.21 2 2 2 2 2 1 Median Median Median 10.7 10.7 21.3 137870000 70319000 67550000 50234000 26057000 24177000 51825000 25913000 25912000 35809000 18348000 17461000 839 10766;18001 True;True 10976;18370 37866;37867;37868;37869;37870;62718 47951;47952;47953;47954;47955;79479 47952;79479 P52564 P52564 6 6 3 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 MAP2K6 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requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.5 24.1 22.5 715700000 347660000 368040000 254330000 124030000 130300000 230750000 111450000 119300000 230620000 112180000 118440000 854 7139;10178;13045;13058;14230;14484;15358 True;True;True;True;True;True;True 7279;10378;13328;13341;14531;14792;15688 25019;25020;25021;25022;25023;25024;35970;35971;35972;45691;45692;45693;45741;45742;45743;45744;49729;50594;50595;53545;53546;53547 31827;31828;31829;31830;31831;45601;45602;45603;45604;57596;57597;57598;57599;57600;57686;57687;57688;57689;62734;63838;63839;67667;67668;67669 31827;45601;57600;57689;62734;63839;67668 P53384 P53384 2 2 2 Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1 NUBP1 sp|P53384|NUBP1_HUMAN Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUBP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 8.1 8.1 8.1 34.534 320 320 0 4.8552 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63976 0.70313 50.74 6 0 Median 0.63976 0.59514 0.58284 0.70313 0.68737 0.61311 48.695 65.767 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4.7121 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1322 1.1658 78.617 3 2 Median NaN 2.0666 NaN NaN 2.2076 NaN NaN 90.296 NaN 0 2 1 0 2 0 Median Median Median 5 12.5 5 66973000 26536000 40437000 7082500 0 7082500 22103000 5955100 16148000 37787000 20581000 17206000 888 6569;6854 True;True 6693;6988 22632;23716;23717;23718;23719;23720;23721;23722 28781;30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176 28781;30170 P55327 P55327 2 2 2 Tumor protein D52 TPD52 sp|P55327|TPD52_HUMAN Tumor protein D52 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPD52 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13.4 13.4 13.4 24.327 224 224 0 11.284 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92279 1.0185 9.0694 4 1 Median NaN 0.89637 NaN NaN 0.98668 NaN NaN 11.331 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 13.4 13.4 13.4 110820000 64247000 46569000 34425000 19092000 15333000 33009000 19539000 13470000 43383000 25616000 17767000 889 3822;16110 True;True 3903;16452 13537;13538;13539;56200;56201;56202 17346;17347;17348;71062;71063;71064;71065;71066;71067 17347;71067 P55735 P55735 3 3 3 Protein SEC13 homolog SEC13 sp|P55735|SEC13_HUMAN Protein SEC13 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC13 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 15.8 15.8 15.8 35.54 322 322 0 6.3081 By matching By MS/MS By MS/MS 0.6386 0.66573 133.53 7 2 Leave out requantified NaN 1.7565 0.64493 NaN 2.0193 0.63865 NaN 144.75 13.675 1 3 3 0 1 1 Median Plateau Median 7.1 15.8 15.8 332670000 191470000 141200000 34495000 22481000 12014000 105240000 45406000 59832000 192940000 123580000 69355000 890 2939;4745;16830 True;True;True 3005;4838;17181 10333;10334;10335;16598;16599;58660;58661 13218;21269;21270;74346;74347 13218;21269;74346 P55769 P55769 5 5 5 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed NHP2L1 sp|P55769|NH2L1_HUMAN NHP2-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNU13 PE=1 SV=3 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 28.1 28.1 28.1 14.173 128 128 0 30.233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91559 0.99973 13.662 29 14 Leave out requantified 0.93139 0.83228 0.78046 0.97282 0.96894 0.85083 10.399 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P55809 P55809 3 3 3 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OXCT1 sp|P55809|SCOT1_HUMAN Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXCT1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 7.3 7.3 7.3 56.157 520 520 0 16.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96981 1.017 28.024 9 6 Median 0.90615 1.0373 1.0162 1.0031 1.1957 1.0498 24.147 6.8109 35.005 3 2 4 3 1 2 Median Median Median 7.3 4.6 7.3 204480000 110040000 94433000 64704000 33653000 31051000 63970000 33891000 30079000 75804000 42501000 33304000 893 2271;6260;11793 True;True;True 2326;6376;12046 7941;7942;7943;7944;21651;21652;21653;41355;41356 10256;10257;10258;27532;27533;27534;52198;52199;52200 10256;27534;52200 P55884 P55884 28 28 28 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B EIF3B sp|P55884|EIF3B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3B PE=1 SV=3 1 28 28 28 28 24 26 28 24 26 28 24 26 37.7 37.7 37.7 92.48 814 814 0 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protein 3;Vesicle-associated membrane protein 2 VAMP3;VAMP2 sp|Q15836|VAMP3_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP3 PE=1 SV=3;sp|P63027|VAMP2_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP2 PE=1 SV=3 2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 17 17 17 11.309 100 100;116 0.0094624 2.2368 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 17 0 0 11328000 6150400 5177800 11328000 6150400 5177800 0 0 0 0 0 0 1002 199 True 201 657 854 854 P63092;Q5JWF2 P63092;Q5JWF2 4;4 4;4 3;3 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas GNAS sp|P63092|GNAS2_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAS PE=1 SV=1;sp|Q5JWF2|GNAS1_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAS P 2 4 4 3 3 3 3 3 3 3 2 2 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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform PPP2R2A sp|P63151|2ABA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2R2A PE=1 SV=1 4 6 6 6 3 6 4 3 6 4 3 6 4 20.1 20.1 20.1 51.691 447 447;447;443;453 0 58.595 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64 0.69617 28.375 13 4 Leave out requantified 0.90633 0.53742 1.3289 0.95981 0.61842 1.3458 20.898 19.209 43.791 3 6 4 0 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.7 20.1 16.8 583100000 292810000 290290000 78093000 43530000 34563000 309780000 170620000 139160000 195230000 78663000 116560000 1006 2410;2458;5595;9666;14483;17559 True;True;True;True;True;True 2467;2516;5705;9858;14791;17921 8426;8427;8598;8599;8600;19409;19410;34221;34222;50593;61234;61235;61236 10843;11059;11060;24726;24727;24728;43421;43422;63837;77658;77659;77660 10843;11059;24726;43421;63837;77659 P63167;Q96FJ2 P63167 5;1 5;1 5;1 Dynein light chain 1, cytoplasmic DYNLL1 sp|P63167|DYL1_HUMAN Dynein light chain 1, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLL1 PE=1 SV=1 2 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 51.7 51.7 51.7 10.366 89 89;89 0 55.953 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0673 1.1902 19.765 12 5 Leave out requantified 1.1582 0.90021 0.90408 1.2594 1.0349 0.97758 60.311 106.64 117.86 4 5 3 2 2 1 Median Median Median 51.7 39.3 39.3 444610000 212190000 232420000 124120000 56087000 68038000 203840000 114200000 89636000 116650000 41907000 74742000 1007 2300;2301;11822;11978;18533 True;True;True;True;True 2355;2356;12077;12235;18910 8047;8048;8049;8050;41451;41452;41453;41454;41455;41456;41976;64544;64545;64546 10366;10367;10368;10369;52315;52316;52317;52318;52319;52320;52321;52322;52323;52324;52952;81719;81720 10366;10368;52320;52952;81720 P63172 P63172 1 1 1 Dynein light chain Tctex-type 1 DYNLT1 sp|P63172|DYLT1_HUMAN Dynein light chain Tctex-type 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNLT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 14.2 14.2 14.2 12.452 113 113 0.00047847 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GN=EIF5A PE=1 SV=2;sp|Q9GZV4|IF5A2_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 5A-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF5A2 PE=1 SV=3;sp|Q6IS14|IF5AL_HUMAN Eukaryotic 3 11 11 11 10 11 11 10 11 11 10 11 11 51.3 51.3 51.3 16.832 154 154;153;154 0 172.9 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.255 1.3327 25.432 76 21 Leave out requantified 1.255 1.0062 1.4039 1.3783 1.1685 1.4996 27.074 29.845 21.257 23 26 27 9 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 51.3 51.3 51.3 16727000000 7672700000 9054700000 4917200000 2265800000 2651400000 5876100000 2871600000 3004500000 5934100000 2535300000 3398800000 1012 3313;3314;8406;9187;9188;10642;11897;13724;16975;18242;18243 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3384;3385;8572;8573;9373;9374;9375;10850;12153;14018;17327;18614;18615;18616 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63463 0.70477 17.225 3 3 Median NaN 0.59221 NaN NaN 0.69383 NaN NaN 24.326 NaN 0 2 1 0 2 1 Median Median Median 5 10.3 10.3 75725000 42862000 32863000 0 0 0 43807000 25261000 18546000 31918000 17601000 14317000 1039 10896;12742 True;True 11107;13019 38279;38280;44624;44625;44626 48447;48448;56254;56255;56256 48447;56254 P82979 P82979 6 6 6 SAP domain-containing ribonucleoprotein SARNP sp|P82979|SARNP_HUMAN SAP domain-containing ribonucleoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SARNP PE=1 SV=3 1 6 6 6 4 5 6 4 5 6 4 5 6 34.3 34.3 34.3 23.671 210 210 0 54.226 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89697 0.95484 13.951 15 3 Leave out requantified 0.89528 0.91996 0.97257 0.96169 1.0351 0.97984 31.55 11.162 14.452 4 5 6 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.2 29.5 34.3 593540000 310940000 282610000 136240000 68135000 68103000 200860000 103220000 97642000 256440000 139580000 116860000 1040 4892;4893;4895;5205;6226;8362 True;True;True;True;True;True 4988;4989;4991;5305;6342;8528 17102;17103;17104;17105;17106;17113;17114;17115;18111;21533;21534;21535;29366;29367;29368 21899;21900;21901;21902;21903;21904;21905;21906;21913;21914;21915;23084;27390;27391;37256;37257;37258 21900;21906;21913;23084;27391;37258 P83436 P83436 3 3 3 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7 COG7 sp|P83436|COG7_HUMAN Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG7 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 5.7 5.7 5.7 86.343 770 770 0 15.736 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8914 0.95037 16.418 9 2 Leave out requantified 0.87594 0.81843 0.88002 0.96878 0.89582 0.89619 26.84 11.272 53.722 2 3 4 0 0 2 Median Leave out requantified Median 3.5 5.7 5.7 199510000 107760000 91751000 51368000 28527000 22842000 70192000 36079000 34113000 77947000 43150000 34797000 1041 6139;10251;14437 True;True;True 6255;10452;14745 21252;21253;36221;36222;36223;36224;50438;50439;50440 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878;2659;2701;3848;3854;5003;7286;7561;9196;12365;14216;14883;16172;17237;18826;19568;19574;20206;22950;28022;28062;28073;31922;34151;36608;37510;37814;38420;38728;41627;42096;42898;43115;44488;46358;46925;47644;53810;54064;54307;54354;59041;60692;60706;66646;69999;71125;73536;74592;74906;75546;77155;78351;79767;79780;80539;80937;81044 Q00613 Q00613 3 3 3 Heat shock factor protein 1 HSF1 sp|Q00613|HSF1_HUMAN Heat shock factor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSF1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 9.8 9.8 9.8 57.26 529 529 0 31.309 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81105 0.8317 20.61 6 3 Median 0.79896 0.83259 0.83915 0.81521 0.87816 0.83071 23.158 28.012 27.258 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 8.1 8.1 9.8 120380000 59322000 61056000 37602000 18324000 19278000 42605000 21562000 21043000 40171000 19436000 20735000 1057 4312;10474;16715 True;True;True 4402;10675;17065 15137;15138;15139;15140;15141;15142;36918;58261;58262;58263 19448;19449;19450;19451;19452;19453;46783;73819;73820 19453;46783;73820 Q00653 Q00653 2 2 2 Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit;Nuclear factor NF-kappa-B p52 subunit NFKB2 sp|Q00653|NFKB2_HUMAN Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NFKB2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 3.3 3.3 3.3 96.748 900 900 0 7.2941 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.5133 1.7429 23.323 3 2 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 1 Median Median Median 2 2 3.3 36162000 15590000 20573000 12490000 6104600 6385800 10999000 4481700 6516900 12673000 5003100 7669900 1058 14866;18305 True;True 15185;18678 51921;63742;63743;63744 65610;80730;80731;80732;80733 65610;80733 Q00688 Q00688 7 7 7 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 FKBP3 sp|Q00688|FKBP3_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FKBP3 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 7 7 5 7 7 5 7 7 30.4 30.4 30.4 25.177 224 224 0 51.908 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81229 0.87225 37.144 27 14 Leave out requantified 0.90402 0.72955 0.81229 0.99501 0.86196 0.85891 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domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBXN1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 2 5 5 2 5 5 2 5 5 24.9 24.9 24.9 33.325 297 297 0 24.345 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91416 0.96629 31.243 15 5 Leave out requantified 1.0902 0.80112 1.0918 1.1615 0.90651 1.1361 18.967 29.491 31.46 2 6 7 0 2 3 Median Leave out requantified Leave out requantified 12.1 24.9 24.9 288890000 173060000 115840000 21662000 10924000 10738000 137040000 93618000 43421000 130190000 68514000 61677000 1085 4198;4199;9195;10739;18323 True;True;True;True;True 4287;4288;9382;10948;18696 14755;14756;14757;14758;14759;32598;32599;37769;37770;37771;63810;63811;63812;63813;63814 18931;18932;41393;41394;47841;47842;47843;80826;80827;80828;80829;80830;80831 18931;18932;41394;47842;80826 Q04637;REV__Q8NEG2 Q04637 50;1 50;1 44;1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 EIF4G1 sp|Q04637|IF4G1_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4G1 PE=1 SV=4 2 50 50 44 41 45 42 41 45 42 35 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OX=9606 GN=PLP2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.6 8.6 8.6 16.691 152 152 0 5.6097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0679 1.0985 39.805 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 8.6 8.6 8.6 82137000 41788000 40349000 27619000 12935000 14684000 25877000 15159000 10718000 28641000 13693000 14948000 1091 7160 True 7300 25123;25124;25125 31953;31954;31955 31953 Q05048 Q05048 6 6 6 Cleavage stimulation factor subunit 1 CSTF1 sp|Q05048|CSTF1_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 4 4 6 4 4 6 4 4 20.4 20.4 20.4 48.357 431 431 0 21.248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0109 1.0586 24.093 13 2 Leave out requantified 1.0479 0.92911 1.0818 1.1054 1.0266 1.07 25.029 23.4 20.407 5 4 4 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.4 15.8 15.8 473310000 224830000 248490000 163620000 71341000 92279000 159620000 80900000 78723000 150070000 72585000 77484000 1092 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True 16825 57437;57438;57439 72717 72717 Q06323 Q06323 15 15 15 Proteasome activator complex subunit 1 PSME1 sp|Q06323|PSME1_HUMAN Proteasome activator complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSME1 PE=1 SV=1 1 15 15 15 14 13 14 14 13 14 14 13 14 59.4 59.4 59.4 28.723 249 249 0 88.346 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0245 1.0949 38.873 54 14 Leave out requantified 1.0122 1.012 1.1575 1.0772 1.1218 1.1763 26.93 25.824 38.695 19 17 18 6 4 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 59.4 50.6 50.6 5021000000 2582700000 2438300000 1766500000 908690000 857850000 1812700000 959340000 853350000 1441800000 714690000 727070000 1104 1170;1171;5699;8208;8457;8705;9560;10551;11868;13148;15429;15430;16698;16810;18292 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1202;1203;5810;8367;8625;8876;9752;10756;12123;13431;15760;15761;17047;17161;18665 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Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP3CA PE=1 SV=1 3 10 10 10 9 9 7 9 9 7 9 9 7 24 24 24 58.687 521 521;524;512 0 34.132 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90706 0.99325 25.588 26 7 Leave out requantified 0.96834 0.85134 0.86956 1.0509 0.97742 0.9151 28.922 28.484 30.218 10 9 7 2 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.5 21.9 15.4 1974300000 1036600000 937700000 659180000 342570000 316610000 706740000 387560000 319180000 608420000 306520000 301910000 1117 2053;4515;5005;5006;6229;7761;8364;9546;9680;18260 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2099;4607;5102;5103;6345;7909;8530;9738;9872;18633 7100;7101;7102;7103;15843;15844;15845;15846;15847;15848;17466;17467;17468;21543;21544;21545;27254;27255;27256;29373;29374;29375;33844;34262;34263;34264;63579;63580;63581 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328;329;330;331;332;333;334;335;336;337;338;339 808;820;887;1096;1197;1418;2253;2581;2965;3032;3160;4958 Q0PNE2 Q0PNE2 1 1 1 Elongator complex protein 6 ELP6 sp|Q0PNE2|ELP6_HUMAN Elongator complex protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP6 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5.6 5.6 5.6 29.793 266 266 0 4.069 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98783 1.0337 10.879 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 5.6 5.6 5.6 45858000 26477000 19381000 13285000 8125700 5159100 15837000 8898300 6938300 16737000 9453000 7283800 1131 3205 True 3275 11267;11268;11269 14399;14400;14401;14402;14403 14401 Q0VDF9 Q0VDF9 2 2 2 Heat shock 70 kDa protein 14 HSPA14 sp|Q0VDF9|HSP7E_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA14 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 4.1 4.1 4.1 54.794 509 509 0 6.2092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.47549 0.52361 75.277 5 4 Median 0.63625 NaN 0.67819 0.67731 NaN 0.70355 84.398 NaN 122.14 2 1 2 1 1 2 Median Median Median 4.1 1.8 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MS/MS By MS/MS 0.28117 0.3077 45.806 6 5 Median 0.33222 0.20253 0.3793 0.34761 0.22591 0.3801 28.833 55.28 59.226 2 2 2 2 2 1 Median Median Median 3.4 5.5 3.4 115490000 94382000 21111000 30928000 23219000 7708600 53182000 46935000 6247100 31383000 24228000 7154900 1134 11774;18498 True;True 12025;18873 41274;41275;41276;41277;41278;41279;64436 52106;52107;52108;52109;52110;52111;81579 52109;81579 Q12768 Q12768 4 4 4 WASH complex subunit strumpellin KIAA0196 sp|Q12768|WASC5_HUMAN WASH complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASHC5 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 2 3 3 2 3 3 2 5.1 5.1 5.1 134.28 1159 1159 0 11.551 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82989 0.8654 25.71 9 5 Leave out requantified 0.81638 0.94785 0.89857 0.88488 1.0042 0.92564 23.659 29.697 9.518 4 3 2 2 2 1 Median Median Median 3.5 3.5 2.7 194970000 96099000 98873000 92062000 46842000 45220000 69958000 31036000 38922000 32952000 18222000 14730000 1135 918;14869;15260;16471 True;True;True;True 941;15188;15589;16819 3209;51924;51925;51926;51927;53223;53224;53225;57419;57420;57421 4202;65613;65614;65615;67275;67276;67277;72700;72701;72702 4202;65613;67277;72702 Q12769 Q12769 5 5 5 Nuclear pore complex protein Nup160 NUP160 sp|Q12769|NU160_HUMAN Nuclear pore complex protein Nup160 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP160 PE=1 SV=3 1 5 5 5 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4.7 4.7 4.7 162.12 1436 1436 0 26.358 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8094 0.84944 25.754 9 2 Leave out requantified 0.90549 0.7012 0.8094 0.96796 0.80882 0.84944 66.587 12.995 24.113 3 3 3 1 1 0 Median Median Leave out requantified 3.5 3.3 4 322620000 184210000 138410000 96055000 59680000 36375000 118600000 61337000 57265000 107960000 63191000 44773000 1136 823;7855;9112;12911;14146 True;True;True;True;True 843;8003;9296;13192;14444 2894;2895;2896;27600;32243;32244;32245;45213;45214;49410;49411 3788;3789;3790;3791;3792;3793;3794;3795;35077;40930;40931;40932;56979;56980;62289;62290 3791;35077;40930;56980;62289 Q12788 Q12788 2 2 2 Transducin beta-like protein 3 TBL3 sp|Q12788|TBL3_HUMAN Transducin beta-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBL3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3.2 3.2 3.2 89.034 808 808 0 4.0173 By MS/MS By matching By MS/MS 1.2029 1.2165 12.756 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.2 1.6 1.6 54214000 24773000 29441000 19735000 10642000 9092100 16734000 7616800 9116900 17746000 6514000 11232000 1137 3026;9421 True;True 3093;9612 10648;33417;33418;33419 13581;42437 13581;42437 Q12792 Q12792 10 10 10 Twinfilin-1 TWF1 sp|Q12792|TWF1_HUMAN Twinfilin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TWF1 PE=1 SV=3 1 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 34.6 34.6 34.6 40.282 350 350 0 172.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86634 0.86975 15.755 47 16 Leave out requantified 0.82991 0.84761 0.91482 0.91187 0.95659 0.94177 20.15 11.273 14.926 15 14 18 3 6 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 34.6 34.6 34.6 2938100000 1564700000 1373400000 1051000000 570410000 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Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPH PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 3 3 3 85.862 758 758 0 3.8332 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.61 21.238 164.64 4 3 Median NaN NaN 4.0519 NaN NaN 4.2131 NaN NaN 224.46 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 1.3 1.3 3 230100000 24279000 205820000 67335000 5324500 62011000 91725000 6500800 85225000 71037000 12454000 58583000 1139 1218;6149 True;True 1250;6265 4251;4252;4253;21279 5545;5546;5547;27085 5547;27085 Q12824 Q12824 2 2 2 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 SMARCB1 sp|Q12824|SNF5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCB1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 7.5 7.5 7.5 44.141 385 385 0 7.0577 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83992 0.9175 19.966 5 2 Median 0.74977 NaN 0.91124 0.81822 NaN 0.95652 34.822 NaN 5.8903 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 7.5 3.4 7.5 148270000 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19339;23025;23681;23682;30575;30576;30577;30578;45974;61362;61363;61364;61365;61366;61367;62006;62007;70622;70623;79917;79918 19339;23025;23682;30578;45974;61367;62006;70622;79918 Q12874 Q12874 14 14 14 Splicing factor 3A subunit 3 SF3A3 sp|Q12874|SF3A3_HUMAN Splicing factor 3A subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3A3 PE=1 SV=1 1 14 14 14 14 13 14 14 13 14 14 13 14 27.9 27.9 27.9 58.848 501 501 0 121.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90646 1.0341 20.115 62 15 Leave out requantified 0.93515 0.9595 0.88301 1.0215 1.0596 0.9183 18.84 19.263 25.823 22 20 20 5 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.9 26.5 27.9 5103500000 2472000000 2631500000 1663500000 786620000 876920000 1748200000 840620000 907560000 1691800000 844800000 846980000 1142 1310;2667;4168;8111;8112;8759;13890;14490;16415;17157;18119;18120;18428;18516 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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shock protein 75 kDa, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAP1 PE=1 SV=3 1 21 21 21 18 18 20 18 18 20 18 18 20 39.6 39.6 39.6 80.109 704 704 0 240.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93166 1.0261 18.568 72 19 Leave out requantified 0.92083 0.94885 0.91197 0.96069 1.0942 0.91639 17.975 20.504 17.197 25 23 24 7 6 6 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 32.1 32.2 38.5 5617400000 3004800000 2612600000 1857200000 997340000 859910000 1840700000 992940000 847760000 1919400000 1014500000 904940000 1147 424;1264;1437;3506;3507;3938;4640;4836;6589;6957;6961;10061;10213;10566;13834;13956;14310;14643;14718;15329;18268 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 433;1296;1473;3579;3580;4020;4732;4932;6713;7092;7096;10260;10414;10772;14130;14253;14613;14954;15034;15659;18641 1461;1462;1463;1464;1465;4398;4399;4400;4401;4402;4403;4990;4991;4992;12320;12321;12322;12323;12324;12325;12326;12327;12328;13922;13923;13924;16238;16239;16240;16241;16242;16243;16914;22716;22717;22718;24195;24196;24197;24198;24199;24219;24220;24221;24222;24223;24224;35517;35518;35519;35520;35521;35522;36097;36098;36099;37205;37206;48418;48826;48827;48828;49970;51142;51143;51144;51419;51420;51421;51422;53457;53458;53459;63610;63611;63612 1926;1927;1928;1929;1930;5726;5727;5728;5729;5730;5731;6520;6521;6522;15779;15780;15781;15782;15783;15784;15785;15786;15787;15788;15789;15790;15791;15792;15793;15794;17828;17829;17830;17831;17832;17833;20836;20837;20838;20839;20840;20841;20842;20843;20844;21652;28911;28912;28913;30742;30743;30744;30745;30746;30771;30772;30773;30774;30775;30776;45061;45062;45063;45064;45065;45066;45067;45760;45761;45762;45763;45764;47132;47133;61043;61541;61542;61543;63055;64550;64934;64935;64936;64937;67562;67563;67564;67565;80576;80577;80578 1929;5731;6520;15781;15794;17828;20843;21652;28912;30744;30775;45063;45762;47133;61043;61541;63055;64550;64934;67562;80577 Q12933 Q12933 2 2 2 TNF receptor-associated factor 2 TRAF2 sp|Q12933|TRAF2_HUMAN TNF receptor-associated factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAF2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 0 0 2 0 0 2 0 4.4 4.4 4.4 55.859 501 501 0 4.0645 By MS/MS 1.6783 1.8953 52.612 2 1 Median NaN 1.6783 NaN NaN 1.8953 NaN NaN 52.612 NaN 0 2 0 0 1 0 Median Median Median 0 4.4 0 63879000 29107000 34772000 0 0 0 63879000 29107000 34772000 0 0 0 1148 2484;9482 True;True 2542;9673 8701;33628 11171;42704 11171;42704 Q12959 Q12959 5 5 5 Disks large homolog 1 DLG1 sp|Q12959|DLG1_HUMAN Disks large homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DLG1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 2 4 3 2 4 3 2 4 7.9 7.9 7.9 100.45 904 904 0 19.423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2372 1.2851 30.413 9 3 Leave out requantified 0.99585 1.4287 1.2372 1.0056 1.5639 1.2851 40.942 54.069 48.699 3 2 4 1 0 2 Median Median Median 4.3 3 6.5 189850000 85093000 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372;2397;2654;3425;8482;8555;14806;17729 1240;1241;1242;1243;8185;8186;8187;8188;8189;8190;9124;9125;11804;11805;11806;29211;29212;29445;29446;50639;50640;50641;60626;60627 1628;1629;1630;1631;10547;10548;10549;10550;10551;10552;10553;10554;11668;11669;15108;15109;15110;15111;15112;15113;37058;37059;37346;63897;63898;63899;63900;63901;63902;76868;76869 1631;10554;11668;15109;37059;37346;63897;76869 Q12972 Q12972 6 6 6 Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1;Activator of RNA decay PPP1R8 sp|Q12972|PP1R8_HUMAN Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R8 PE=1 SV=2 1 6 6 6 1 4 2 1 4 2 1 4 2 32.8 32.8 32.8 38.478 351 351 0 13.321 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81714 0.88439 38.154 6 3 Median NaN 0.66754 NaN NaN 0.79206 NaN NaN 41.135 NaN 1 4 1 0 3 0 Median Median Median 4.6 21.9 10.5 104360000 62905000 41455000 12158000 7233500 4924600 82992000 52221000 30771000 9210500 3450600 5759900 1151 3783;6174;8293;9603;13806;17762 True;True;True;True;True;True 3863;6290;8458;9795;14101;18125 13369;13370;21374;29141;34024;48324;61923 17144;27197;36978;43185;60936;78511 17144;27197;36978;43185;60936;78511 Q12996 Q12996 3 3 3 Cleavage stimulation factor subunit 3 CSTF3 sp|Q12996|CSTF3_HUMAN Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF3 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 5 5 5 82.921 717 717 0 8.2575 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88227 0.97292 21.14 5 1 Leave out requantified 1.5093 0.91792 NaN 1.6564 1.0311 NaN 0.11721 8.2188 NaN 2 2 1 1 0 0 Median Median Median 3.5 3.2 1.8 265900000 133720000 132180000 62759000 25824000 36936000 177950000 92441000 85507000 25192000 15453000 9738900 1152 5146;9737;17405 True;True;True 5245;9929;17764 17925;17926;34455;34456;60734 22861;22862;43708;43709;77014 22862;43708;77014 Q13042 Q13042 1 1 1 Cell division cycle protein 16 homolog CDC16 sp|Q13042|CDC16_HUMAN Cell division cycle protein 16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC16 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 2.4 2.4 2.4 71.655 620 620 0 5.3723 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 2.4 0 2.4 8356800 3674200 4682600 8356800 3674200 4682600 0 0 0 0 0 0 1153 13380 True 13669 46825;46826 59072;59073 59073 Q13043;Q13188 Q13043;Q13188 2;1 2;1 2;1 Serine/threonine-protein kinase 4;Serine/threonine-protein kinase 4 37kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 4 18kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 3;Serine/threonine-protein kinase 3 36kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 3 20kDa subunit STK4;STK3 sp|Q13043|STK4_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK4 PE=1 SV=2;sp|Q13188|STK3_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK3 PE=1 SV=2 2 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 5.3 5.3 5.3 55.63 487 487;491 0.00048685 3.559 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 3.3 2.1 12205000 6493500 5711700 0 0 0 12205000 6493500 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factor eIF-2B subunit epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2B5 PE=1 SV=3 1 6 6 6 6 3 4 6 3 4 6 3 4 10.7 10.7 10.7 80.379 721 721 0 28.135 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77562 0.81258 5.3591 12 5 Leave out requantified 0.5691 0.77873 0.77562 0.60958 0.90568 0.81258 33.496 20.105 5.3591 6 3 3 4 1 0 Median Plateau Leave out requantified 10.7 6.5 7.6 385790000 226430000 159360000 151740000 95783000 55961000 112910000 63059000 49847000 121140000 67586000 53556000 1163 1813;6770;7768;16447;16844;18206 True;True;True;True;True;True 1857;6902;7916;16795;17195;18578 6216;6217;6218;6219;6220;23383;23384;23385;27279;27280;57328;57329;57330;58712;63373 8129;8130;8131;8132;8133;29801;29802;34667;34668;72595;72596;74406;80282 8129;29801;34667;72595;74406;80282 Q13148 Q13148 8 8 8 TAR DNA-binding protein 43 TARDBP sp|Q13148|TADBP_HUMAN TAR DNA-binding protein 43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TARDBP PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 8 7 8 8 7 8 8 7 18.1 18.1 18.1 44.739 414 414 0 67.671 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 HNRNPA0 sp|Q13151|ROA0_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA0 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 9.5 9.5 9.5 30.84 305 305 0 26.807 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0534 1.1642 19.627 8 3 Median 1.1356 0.89506 1.5188 1.2208 0.97253 1.4988 17.323 8.9848 0.92845 3 3 2 1 2 0 Median Median Median 9.5 9.5 5.2 242650000 116980000 125670000 78956000 42871000 36085000 96263000 48709000 47555000 67433000 25402000 42031000 1165 3303;9691 True;True 3374;9883 11619;11620;34291;34292;34293;34294;34295;34296;34297 14871;14872;43499;43500;43501;43502;43503;43504 14872;43504 Q13155 Q13155 8 8 8 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 AIMP2 sp|Q13155|AIMP2_HUMAN Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIMP2 PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 8 7 6 8 7 6 8 7 29.7 29.7 29.7 35.348 320 320 0 109.89 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.891 0.9443 29.233 24 9 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800;3004;17279 2762;2763;2764;10330;10331;10332;59009;59010;59011 3612;3613;3614;13212;13213;13214;13215;13216;13217;74783 3613;13214;74783 Q13371 Q13371 1 1 1 Phosducin-like protein PDCL sp|Q13371|PHLP_HUMAN Phosducin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCL PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 8.6 8.6 8.6 34.281 301 301 0.00048567 3.5212 By MS/MS By MS/MS 0.84847 0.92386 30.168 3 3 Median 0.74511 NaN NaN 0.83848 NaN NaN 13.713 NaN NaN 2 0 1 2 0 1 Median Median Median 8.6 0 8.6 31380000 17054000 14326000 24475000 12079000 12395000 0 0 0 6905700 4974900 1930900 1182 1734 True 1777 5962;5963;5964 7810;7811;7812 7811 Q13404 Q13404 7 3 3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 UBE2V1 sp|Q13404|UB2V1_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2V1 PE=1 SV=2 1 7 3 3 6 5 6 3 2 2 3 2 2 55.8 23.1 23.1 16.495 147 147 0 6.4478 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70116 0.76707 1.915 7 1 Leave out requantified 0.70822 0.57396 1.1267 0.77752 0.63651 1.1582 42.824 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requantified Leave out requantified 14.3 14.3 9.1 403810000 218820000 184990000 147710000 82627000 65080000 136960000 76325000 60635000 119140000 59864000 59274000 1184 3251;3252;4451;15147;15739 True;True;True;True;True 3322;3323;4542;15471;16074 11432;11433;11434;11435;11436;11437;15617;15618;52809;52810;52811;54939;54940;54941 14628;14629;14630;14631;14632;14633;14634;14635;14636;20068;20069;20070;20071;20072;66725;66726;66727;66728;66729;66730;69489 14631;14636;20072;66728;69489 Q13415 Q13415 1 1 1 Origin recognition complex subunit 1 ORC1 sp|Q13415|ORC1_HUMAN Origin recognition complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.2 1.2 1.2 97.349 861 861 1 -2 By matching By MS/MS By matching 1.1666 1.3748 7.4659 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.2 1.2 1.2 36445000 17700000 18745000 10751000 4884600 5866800 13928000 6971600 6956000 11766000 5844200 5922300 + 1185 14967 True 15288 52228;52229;52230 66005 66005 343 388 Q13416 Q13416 3 3 3 Origin recognition complex subunit 2 ORC2 sp|Q13416|ORC2_HUMAN Origin recognition complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 4.5 4.5 4.5 65.971 577 577 0 5.0167 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98419 1.0216 22.234 4 1 Median NaN 0.90444 NaN NaN 1.0124 NaN NaN 38.055 NaN 1 2 1 0 1 0 Median Median Median 2.8 3.3 1.6 39247000 20017000 19230000 6985200 3605900 3379300 25218000 12942000 12276000 7043400 3468500 3574900 1186 749;3016;17710 True;True;True 768;3083;18073 2627;2628;2629;10604;61746 3425;3426;3427;13521;78296 3427;13521;78296 Q13418 Q13418 14 14 14 Integrin-linked protein kinase ILK sp|Q13418|ILK_HUMAN Integrin-linked protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILK PE=1 SV=2 1 14 14 14 11 14 14 11 14 14 11 14 14 31.6 31.6 31.6 51.419 452 452 0 52.372 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92052 0.96088 18.469 43 12 Leave out requantified 0.87387 0.84637 0.86683 0.94396 0.97626 0.86335 19.118 26.286 12.023 13 13 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3043;3044;3045;3046;3047;3048;3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055;3056;3057;3058;3059;3060;3061;3062;3063;3064;3065;3066;3067;3068;3069;3070;3071;3072;3073;4685;4686;4687;4688;4689;4690;4691;4692;4693;4694;4695;4696;20227;23109;23110;23111;23112;23113;23114;23115;24176;24177;24178;26213;26214;26215;26216;26217;26218;26219;26220;26221;26222;26223;26224;26225;26226;26227;26228;26229;26230;26231;26232;26233;26234;26235;26236;36568;36569;36570;39701;39702;39703;42191;42192;42193;42194;42195;42196;42197;42198;42199;42200;42201;42202;42203;54216;54217;54218;54219;54220;54221;54222;54223;54224;54225;54226;54227;54228;54229;54230;54231;54232;54233;54234;54235;54236;54237;54921;54922;54923;54924;54925;54926;54927;54928;54929;54930;54931;81598;81599;81600;81601 3065;4685;20227;23109;23114;24176;26215;26229;36568;39702;42191;54235;54925;81601 36;37;38;50 73;257;299;300 Q13510 Q13510 1 1 1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta ASAH1 sp|Q13510|ASAH1_HUMAN Acid ceramidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASAH1 PE=1 SV=5 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.8 2.8 2.8 44.659 395 395 0 10.713 By MS/MS By MS/MS 1.3278 1.4562 27.229 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 2.8 2.8 61609000 26710000 34899000 0 0 0 32679000 14946000 17733000 28930000 11764000 17166000 1200 4329 True 4419 15189;15190 19504;19505 19505 Q13547 Q13547 8 8 7 Histone deacetylase 1 HDAC1 sp|Q13547|HDAC1_HUMAN Histone deacetylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDAC1 PE=1 SV=1 1 8 8 7 8 7 7 8 7 7 7 6 6 25.7 25.7 23.2 55.102 482 482 0 38.72 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86364 0.91165 25.781 30 14 Leave out requantified 0.85044 0.70494 0.94748 0.93139 0.81591 0.98762 27.215 16.498 18.084 11 9 10 4 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.7 23.9 25.7 1174000000 605990000 567980000 404370000 219350000 185020000 342600000 176920000 165680000 427010000 209720000 217290000 1201 2248;4597;8223;9925;11605;14358;18353;18689 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sapiens OX=9606 GN=CAMK2D PE=1 SV=3;sp|Q9UQM7|KCC2A_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAMK2A PE 4 4 4 4 2 4 2 2 4 2 2 4 2 12 12 12 56.369 499 499;478;558;666 0 21.084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85401 0.98123 33.656 10 7 Median 0.82296 0.81101 1.1456 0.95485 0.93764 1.1645 6.5998 33.056 57.574 3 4 3 2 3 2 Median Median Median 5.6 12 5.6 163580000 93947000 69634000 49368000 30022000 19346000 56924000 31103000 25821000 57290000 32822000 24468000 1202 479;2571;4380;5364 True;True;True;True 489;2629;4470;5469 1639;9016;9017;9018;9019;9020;9021;15348;15349;15350;18605 2130;11532;11533;11534;11535;11536;11537;19695;23715 2130;11536;19695;23715 Q13561 Q13561 15 15 15 Dynactin subunit 2 DCTN2 sp|Q13561|DCTN2_HUMAN Dynactin subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN2 PE=1 SV=4 1 15 15 15 13 10 13 13 10 13 13 10 13 48.1 48.1 48.1 44.23 401 401 0 169.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91845 0.96211 22.712 47 12 Leave out requantified 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subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTN1 PE=1 SV=3 1 26 26 26 19 20 23 19 20 23 19 20 23 26.5 26.5 26.5 141.69 1278 1278 0 130.47 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95786 1.0136 23.296 63 23 Leave out requantified 1.0105 0.96016 0.88661 1.0985 1.0553 0.92782 25.61 17.858 17.726 18 22 23 4 9 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.8 20.6 23.3 2239400000 1212800000 1026600000 630330000 339930000 290400000 774670000 402960000 371710000 834400000 469910000 364490000 1235 344;370;433;1364;2531;2645;4063;4235;4815;5387;7801;9362;9927;11216;12210;12353;13136;13292;13328;13360;13804;14599;14767;16628;16706;16938 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 349;375;442;1398;2589;2703;4145;4324;4911;5492;7949;9550;10123;11430;12470;12622;13419;13580;13617;13649;14099;14910;15084;16977;17055;17290 1168;1169;1170;1250;1251;1252;1487;4718;8889;8890;8891;8892;9271;9272;9273;9274;9275;9276;14313;14314;14315;14878;14879;14880;14881;14882;16851;16852;16853;18670;27400;27401;27402;33188;33189;33190;35084;35085;35086;39309;39310;42779;42780;43270;43271;46031;46032;46033;46034;46534;46535;46536;46655;46656;46754;46755;46756;48320;50966;50967;50968;50969;50970;50971;51586;51587;51588;57941;57942;57943;58232;58233;59067 1532;1533;1534;1640;1641;1642;1952;6149;11391;11392;11393;11394;11856;11857;11858;11859;11860;11861;18310;18311;18312;18313;18314;19085;19086;19087;19088;19089;19090;21580;21581;23796;34819;34820;34821;42132;42133;42134;42135;42136;42137;42138;42139;44498;44499;44500;44501;44502;49698;49699;53917;53918;54553;54554;58066;58067;58068;58700;58701;58853;58854;58979;58980;58981;58982;58983;60933;64314;64315;64316;64317;64318;64319;65163;65164;65165;73375;73376;73377;73378;73379;73781;74855 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610;2063;2064;2065;10938;10939;10940;10941;10942;10943;10944;10945;11474;11475;11476;11477;18049;18050;20651;23312;25352;25353;28938;28939;28940;28941;28942;28943;28944;28945;30790;30791;30792;30793;30794;30795;33355;34322;34323;40701;40702;40703;40704;40705;40706;40707;44162;44163;44164;44738;44739;44740;44741;44742;44743;45640;47135;47136;47137;47138;49586;49587;49588;49589;49590;51576;52982;54178;57028;57029;57030;57031;59536;59537;59538;62487;62488;62489;62805;62806;62807;62808;62809;62810;67260;67261;71720;75659;79174;79175;79176;80535 610;2065;10941;11475;18049;20651;23312;25352;28945;30793;33355;34323;40702;44163;44742;45640;47136;49586;51576;52982;54178;57031;59537;62489;62806;67260;71720;75659;79175;80535 Q14690 Q14690 4 4 4 Protein RRP5 homolog PDCD11 sp|Q14690|RRP5_HUMAN Protein RRP5 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD11 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 2 2 3 2 2 3 2 2 2 2 2 208.7 1871 1871 0 7.0012 By MS/MS By matching By MS/MS 1.0933 1.1411 13.804 6 1 Leave out requantified 0.51668 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CHD4 sp|Q14839|CHD4_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD4 PE=1 SV=2 1 23 23 18 21 16 17 21 16 17 16 15 13 17.1 17.1 14 218 1912 1912 0 102.75 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83984 0.90053 21.224 72 18 Leave out requantified 0.91879 0.72833 0.86322 0.99783 0.848 0.89761 20.406 27.19 27.355 25 22 25 5 5 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.3 11.9 12.9 2234400000 1179400000 1055100000 775260000 392860000 382400000 671760000 373080000 298670000 787410000 413410000 374000000 1267 169;431;1148;1955;3668;4297;4345;4714;4914;4936;5352;5519;5868;6290;6917;10221;10272;11724;13035;14979;14980;15402;18125 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 171;440;1179;2001;3743;4387;4435;4807;5010;5032;5457;5627;5981;6412;7052;10422;10473;11971;13318;15300;15301;15732;18495 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pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPA1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 5 26.6 26.6 26.6 32.66 289 289 0 54.609 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9125 1.9914 15.587 9 5 Leave out requantified 1.453 0.9457 2.5046 1.5782 1.0901 2.5446 17.303 94.533 48.762 2 4 3 1 3 1 Median Median Median 16.3 16.3 26.6 322740000 114970000 207760000 66878000 18475000 48403000 126010000 65317000 60690000 129850000 31181000 98671000 1298 2428;6027;10155;16996;17266 True;True;True;True;True 2485;6142;10355;17348;17625 8473;8474;8475;8476;8477;20849;20850;20851;35870;59275;59276;59277;60267 10909;10910;10911;10912;10913;26536;26537;26538;45477;75120;75121;75122;75123;75124;75125;76409 10910;26538;45477;75123;76409 Q15185 Q15185 3 3 3 Prostaglandin E synthase 3 PTGES3 sp|Q15185|TEBP_HUMAN Prostaglandin E synthase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTGES3 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 20 20 20 18.697 160 160 0 7.8564 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92009 0.96521 48.01 9 4 Leave out requantified 3.855 0.61453 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99094 1.0264 14.342 4 1 Median NaN NaN 1.1236 NaN NaN 1.1573 NaN NaN 2.9877 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 1.1 1.1 4.2 52005000 23675000 28330000 7591800 4162100 3429700 8104800 3930600 4174100 36309000 15583000 20726000 1306 1204;6178;16280 True;True;True 1236;6294;16625 4206;4207;4208;21385;56744 5481;5482;27211;71789 5481;27211;71789 Q15345 Q15345 1 1 1 Leucine-rich repeat-containing protein 41 LRRC41 sp|Q15345|LRC41_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC41 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.5 2.5 2.5 88.649 812 812 0.00048403 3.4865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0492 1.1073 54.405 4 3 Median 1.0492 NaN NaN 1.1073 NaN NaN 6.8238 NaN NaN 2 1 1 2 0 1 Median Median Median 2.5 2.5 2.5 28872000 15530000 13342000 12784000 7010100 5774100 8951200 3952500 4998700 7136800 4567200 2569600 1307 13783 True 14078 48248;48249;48250;48251;48252 60853;60854;60855;60856;60857;60858 60857 Q15365;P57723 Q15365 12;1 12;1 9;0 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ubiquitin receptor ADRM1 ADRM1 sp|Q16186|ADRM1_HUMAN Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADRM1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 10.8 10.8 10.8 42.153 407 407 0 106.75 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87538 0.9306 3.7278 11 3 Leave out requantified 0.93407 0.80937 0.89648 0.99343 0.87463 0.90639 11.617 6.4847 4.7346 4 4 3 1 1 1 Median Median Median 8.6 10.8 8.6 740950000 398260000 342690000 239890000 129160000 110730000 259350000 143430000 115910000 241710000 125670000 116050000 1345 9684;14836;16120 True;True;True 9876;15155;16462 34276;51827;51828;51829;51830;51831;51832;56231;56232;56233;56234;56235;56236 43485;65498;65499;65500;65501;65502;65503;65504;65505;65506;71100;71101;71102;71103;71104;71105 43485;65498;71101 Q16204 Q16204 6 6 6 Coiled-coil domain-containing protein 6 CCDC6 sp|Q16204|CCDC6_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC6 PE=1 SV=2 1 6 6 6 2 3 5 2 3 5 2 3 5 15 15 15 53.29 474 474 0 16.283 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83056 0.96152 10.824 11 4 Leave out requantified 0.94982 0.8376 0.82733 1.0181 0.95521 0.86655 32.558 0.93174 14.957 3 2 6 1 1 2 Median Median Leave out requantified 3.8 7.4 13.1 227140000 119380000 107760000 56526000 29272000 27254000 42573000 23570000 19003000 128040000 66539000 61501000 1346 350;3761;5071;8886;9348;11397 True;True;True;True;True;True 355;3839;5169;9061;9536;11615 1187;1188;13279;17667;31406;31407;31408;31409;33134;33135;33136;39896 1558;1559;17025;17026;22562;39885;39886;39887;39888;39889;42061;42062;42063;42064;42065;50408 1559;17025;22562;39885;42063;50408 Q16222 Q16222 1 1 1 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylgalactosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase UAP1 sp|Q16222|UAP1_HUMAN UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UAP1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.3 2.3 2.3 58.768 522 522 0.0065076 2.3158 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 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54468;54469;54471;54472;54473;79505;79506 54469;54471;79505;79506 Q16630 Q16630 7 7 7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 CPSF6 sp|Q16630|CPSF6_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF6 PE=1 SV=2 1 7 7 7 6 6 7 6 6 7 6 6 7 15.2 15.2 15.2 59.209 551 551 0 31.565 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94522 1.0519 18.721 26 6 Leave out requantified 1.0353 0.92959 1.0581 1.1327 1.076 1.0613 43.01 14.739 16.498 8 9 9 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.3 15.2 15.2 960000000 486040000 473970000 296300000 141790000 154510000 307480000 151130000 156350000 356220000 193120000 163110000 1359 5694;5773;5774;6349;13588;16009;17302 True;True;True;True;True;True;True 5805;5884;5885;6471;13878;16351;17661 19749;19750;19751;19752;19988;19989;19990;19991;19992;21941;21942;47505;47506;47507;47508;47509;47510;47511;55855;55856;55857;55858;55859;55860;60396;60397;60398;60399;60400 25134;25135;25136;25137;25138;25431;25432;25433;27879;27880;59933;59934;59935;59936;59937;59938;59939;70635;70636;70637;70638;70639;70640;76560;76561;76562;76563;76564;76565;76566;76567 25138;25432;25433;27879;59937;70635;76562 Q16643 Q16643 9 9 9 Drebrin DBN1 sp|Q16643|DREB_HUMAN Drebrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBN1 PE=1 SV=4 1 9 9 9 8 7 6 8 7 6 8 7 6 15.9 15.9 15.9 71.428 649 649 0 26.943 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2445 1.3541 10.766 21 4 Leave out requantified 1.3328 0.95767 1.3283 1.4424 1.1155 1.3915 20.841 4.5948 10.388 8 7 6 3 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.6 13.6 12.3 768200000 328910000 439290000 212060000 84412000 127650000 305850000 143660000 162180000 250290000 100840000 149460000 1360 2858;4219;9066;9216;10111;13298;13299;14071;18669 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2922;4308;9249;9404;10311;13586;13587;14369;19048 10022;10023;10024;14820;32067;32068;32069;32675;32676;32677;35690;35691;35692;46563;46564;46565;46566;46567;46568;49191;64993 12793;19000;40698;40699;40700;41478;41479;41480;41481;45277;58733;58734;58735;58736;58737;58738;58739;58740;62005;82337 12793;19000;40700;41478;45277;58734;58739;62005;82337 Q16666 Q16666 3 3 3 Gamma-interferon-inducible protein 16 IFI16 sp|Q16666|IF16_HUMAN Gamma-interferon-inducible protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFI16 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 1 2 2 1 2 2 1 6.6 6.6 6.6 88.255 785 785 0 13.185 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86762 0.9609 26.012 4 2 Median NaN 0.84795 NaN NaN 1.0085 NaN NaN 43.709 NaN 1 2 1 1 1 0 Median Median Median 4.5 4.6 2.2 66442000 34105000 32337000 15371000 5249000 10122000 25067000 15725000 9342400 26004000 13131000 12873000 1361 4491;7530;10175 True;True;True 4582;7674;10375 15749;26448;26449;35959;35960;35961 20223;33594;33595;45588;45589;45590 20223;33595;45589 Q16698 Q16698 2 2 2 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial DECR1 sp|Q16698|DECR_HUMAN 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DECR1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 10.4 10.4 10.4 36.067 335 335 0 7.7603 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.52764 0.53161 55.564 4 2 Median NaN 0.39977 NaN NaN 0.43647 NaN NaN 90.652 NaN 1 2 1 1 1 0 Median Median Median 3.9 10.4 6.6 56405000 41115000 15290000 6009000 4563000 1446000 30620000 24338000 6282800 19776000 12215000 7560800 1362 1418;16494 True;True 1452;16842 4896;4897;57489;57490 6372;6373;72784;72785 6373;72784 Q16718 Q16718 1 1 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 NDUFA5 sp|Q16718|NDUA5_HUMAN NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDUFA5 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 8.6 8.6 8.6 13.459 116 116 0.0094461 2.2156 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 8.6 0 0 4603500 4603500 0 4603500 4603500 0 0 0 0 0 0 0 1363 7869 True 8017 27641 35116 35116 Q16719 Q16719 3 3 3 Kynureninase KYNU sp|Q16719|KYNU_HUMAN Kynureninase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KYNU PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 8 8 8 52.351 465 465 0 11.585 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0997 1.1722 6.8028 8 1 Leave out requantified 1.2999 1.3309 0.93433 1.4529 1.5073 0.96622 35.125 54.405 20.527 4 2 2 1 0 0 Median Median Median 8 5.4 3.2 109040000 51412000 57629000 44256000 20159000 24097000 21754000 9128100 12626000 43030000 22124000 20906000 1364 5381;7238;16514 True;True;True 5486;7379;16862 18647;18648;18649;18650;18651;18652;25426;25427;57554 23762;23763;23764;23765;23766;23767;23768;23769;23770;23771;23772;32284;72859 23768;32284;72859 Q16740 Q16740 1 1 1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial CLPP sp|Q16740|CLPP_HUMAN ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPP PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.3 12.3 12.3 30.18 277 277 0 7.3399 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70789 0.73375 32.194 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 12.3 12.3 12.3 107460000 56377000 51080000 32573000 16473000 16100000 37102000 20964000 16137000 37783000 18940000 18842000 1365 17416 True 17775 60769;60770;60771 77061;77062;77063;77064;77065 77063 Q16762 Q16762 2 2 2 Thiosulfate sulfurtransferase TST sp|Q16762|THTR_HUMAN Thiosulfate sulfurtransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TST PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 14.1 14.1 14.1 33.429 297 297 0 5.3352 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 8.1 0 6.1 43907000 6434900 37472000 16683000 0 16683000 0 0 0 27224000 6434900 20790000 1366 3496;5606 True;True 3569;5716 12288;19452 15734;24782 15734;24782 Q16763 Q16763 5 5 5 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S UBE2S sp|Q16763|UBE2S_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2S PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 3 2 4 3 2 4 3 2 35.1 35.1 35.1 23.845 222 222 0 23.423 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 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acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog IAH1 sp|Q2TAA2|IAH1_HUMAN Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IAH1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 10.1 10.1 10.1 27.598 248 248 0.00047081 3.1649 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 3.2 6.9 25639000 11281000 14358000 0 0 0 0 0 0 25639000 11281000 14358000 1377 2928;15073 True;True 2994;15395 10299;52558 13171;66412 13171;66412 Q2TAL8 Q2TAL8 1 1 1 Glutamine-rich protein 1 QRICH1 sp|Q2TAL8|QRIC1_HUMAN Glutamine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QRICH1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 86.435 776 776 0.0044033 2.4511 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.12888 0.14315 229.05 4 4 Median NaN NaN 1.3062 NaN NaN 1.3538 NaN NaN 321.92 1 1 2 1 1 2 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 45190000 32202000 12988000 12808000 10731000 2076800 11232000 10298000 934090 21150000 11173000 9977000 1378 11826 True 12081 41466;41467;41468;41469 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2181;7907;7908;11872;11873;11874;11875;11876;11877;11878;11879;11880;11881;11882;11883;11884;11885;11886;11887;11888;11889;11890;11891;11892;11893;11894;11895;11896;11897;11898;11899;11900;11901;11902;11903;11904;11905;11906;11907;11908;11909;11910;11911;11912;11913;11914;11915;11916;11917;11918;11919;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926;11927;31417;31418;31419;31420;31421;31422;31423;31424;31425;31426;31427;31428;31429;31430;31431;31432;31433;31434;31435;31436;31437;31438;31439;31440;31441;31442;31443;31444;31445;31446;31447;31448;31449;31450;31451;31452;31453;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461;31462;31463;31464;31465;31466;31467;31468;31469;31470;31471;31472;31473;31474;31475;31476;31477;31478;31479;31480;31481;31482;31483;31484;31485;31486;31487;31488;31489;31490;31491;31492;31493;31494;31495;31496;31497;31498;31499;31500;31501;31502;31503;31504;31505;31506;31507;31508;31509;31510;31511;31512;31513;31514;31515;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31523;31524;31525;31526;31527;31528;31529;31530;31531;31532;31533;31534;31535;31536;31537;31538;31539;31540;31541;31542;31543;31544;31545;31546;31547;31548;31549;31550;31551;31552;31553;31554;31555;31556;31557;31558;31559;31560;31561;31562;31563;31564;31565;31566;31567;31568;31569;31570;31571;31572;31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;31593;31594;31595;31596;31597;31598;31599;31600;31601;31602;31603;31604;31605;31606;31607;31608;31609;31610;31611;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;31620;31621;31622;31623;31624;31625;31626;31627;31628;31629;31630;31631;31632;31633;31634;31635;31636;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645;31646;31647;31648;31649;31650;31651;34301;34302;34303;34304;34305;34306;34307;34308;34309;34310;34311;34312;34858;38334;42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;66875;66876;66877;66878;66879;66880;66881;66882;66883;66884;66885;66886;66887;66888;66889;66890;66891;66892;66893;66894;66895;66896;66897;66898;66899;66900;66901;66902;66903;66904;66905;66906;66907;66908;72945;72946;72947;72948;72949 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1 Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 HSP90AB4P sp|Q58FF6|H90B4_HUMAN Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AB4P PE=5 SV=1 1 6 1 1 6 6 6 1 1 1 1 1 1 9.7 2.2 2.2 58.264 505 505 0 18.63 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.40929 0.44858 30.981 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 9.7 9.7 9.7 625800000 437540000 188260000 191340000 137590000 53745000 245560000 185850000 59714000 188910000 114110000 74801000 1400 3327;3515;3516;14526;17055;18264 False;False;False;True;False;False 3399;3588;3589;14835;17410;18637 11709;11710;11711;12350;12351;12352;12353;12354;12355;12356;12357;12358;50747;50748;50749;59490;59491;59492;59493;59494;59495;59496;59497;59498;59499;59500;59501;59502;59503;59504;59505;59506;59507;63588;63589;63590 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Q5GLZ8 5 5 5 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 HERC4 sp|Q5GLZ8|HERC4_HUMAN Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HERC4 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 6.1 6.1 6.1 118.56 1057 1057 0 19.943 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87825 0.94801 10.206 8 2 Leave out requantified 0.82734 0.88546 0.85475 0.882 1.0378 0.88663 13.62 22.907 16.66 3 3 2 1 1 0 Median Median Median 5.4 5 5.4 280380000 167880000 112490000 84463000 47030000 37433000 105150000 65184000 39965000 90764000 55668000 35096000 1405 3982;4074;7566;10050;12887 True;True;True;True;True 4064;4156;7710;10249;13167 14072;14348;14349;14350;26570;26571;26572;35473;35474;35475;45135;45136 18012;18357;18358;18359;33750;44999;45000;45001;45002;56889;56890 18012;18358;33750;45002;56889 Q5H9R7 Q5H9R7 5 5 5 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 PPP6R3 sp|Q5H9R7|PP6R3_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP6R3 PE=1 SV=2 1 5 5 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50664;50665;50666 63930;63931;63932 63931 Q5JS54 Q5JS54 1 1 1 Proteasome assembly chaperone 4 PSMG4 sp|Q5JS54|PSMG4_HUMAN Proteasome assembly chaperone 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG4 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 20.3 20.3 20.3 13.775 123 123 0 6.3031 By MS/MS By MS/MS 0.47908 0.51741 21.795 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 20.3 20.3 0 47333000 33022000 14311000 19874000 13109000 6764200 27459000 19912000 7547100 0 0 0 1408 18232 True 18604 63460;63461 80388;80389 80389 Q5JSL3 Q5JSL3 1 1 1 Dedicator of cytokinesis protein 11 DOCK11 sp|Q5JSL3|DOC11_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK11 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.5 0.5 0.5 237.67 2073 2073 0.0077586 2.2723 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54009 0.60341 29.432 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 0.5 0.5 0.5 24160000 15731000 8429100 7881000 4522100 3358900 7388500 4782000 2606500 8890600 6426900 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Exosome complex component MTR3 EXOSC6 sp|Q5RKV6|EXOS6_HUMAN Exosome complex component MTR3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC6 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 3 4 5 3 4 5 3 4 28.7 28.7 28.7 28.235 272 272 0 21.586 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83721 0.88381 27.923 12 2 Leave out requantified 0.84085 0.746 1.1137 0.88101 0.84109 1.1326 27.781 12.019 25.513 5 3 4 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 28.7 20.2 23.2 383190000 195910000 187290000 144760000 78623000 66142000 91516000 47867000 43649000 146910000 69417000 77497000 1415 528;3823;5869;8183;11347 True;True;True;True;True 539;3904;5982;8342;11563 1790;1791;13540;20313;20314;20315;28726;28727;28728;39746;39747;39748 2332;2333;17349;25845;36469;36470;36471;36472;50232;50233;50234 2332;17349;25845;36470;50234 Q5SNV9 Q5SNV9 2 2 2 Uncharacterized protein C1orf167 C1orf167 sp|Q5SNV9|CA167_HUMAN Uncharacterized protein C1orf167 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C1orf167 PE=2 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1.9 1.9 1.9 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Q6DKJ4 2 2 2 Nucleoredoxin NXN sp|Q6DKJ4|NXN_HUMAN Nucleoredoxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NXN PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 9.2 9.2 9.2 48.392 435 435 0 6.1477 By MS/MS By MS/MS 1.8701 1.8669 7.4957 3 3 Median NaN NaN 1.7979 NaN NaN 1.871 NaN NaN 10.599 1 0 2 1 0 2 Median Median Median 5.5 0 9.2 31988000 9805200 22183000 8144600 1672300 6472300 0 0 0 23844000 8132900 15711000 1456 8267;10882 True;True 8432;11093 29059;38242;38243 36877;48408;48409 36877;48408 Q6FI81 Q6FI81 9 9 9 Anamorsin CIAPIN1 sp|Q6FI81|CPIN1_HUMAN Anamorsin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAPIN1 PE=1 SV=2 1 9 9 9 8 9 6 8 9 6 8 9 6 47.4 47.4 47.4 33.582 312 312 0 41.099 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87052 0.91951 47.155 33 12 Leave out requantified 0.88352 0.85705 1.0535 0.91225 0.97575 1.0535 57.349 51.033 42.689 12 12 9 5 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 44.9 47.4 28.5 1383000000 718230000 664800000 459380000 235220000 224160000 514730000 288430000 226300000 408920000 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48.491 25.547 4 5 3 3 2 2 Median Leave out requantified Median 4.6 5.6 2.8 169960000 94910000 75051000 59425000 34115000 25310000 76236000 41615000 34621000 34300000 19180000 15120000 1458 2280;5073;5230;15043;17385;18282 True;True;True;True;True;True 2335;5171;5330;15365;17744;18655 7974;7975;7976;17671;17672;17673;18181;18182;52454;60673;63663;63664 10292;10293;10294;22566;22567;22568;23155;23156;66281;76931;80641;80642 10294;22568;23156;66281;76931;80641 Q6IBS0 Q6IBS0 8 8 8 Twinfilin-2 TWF2 sp|Q6IBS0|TWF2_HUMAN Twinfilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TWF2 PE=1 SV=2 1 8 8 8 5 7 5 5 7 5 5 7 5 34.1 34.1 34.1 39.548 349 349 0 38.666 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80438 0.84672 17.33 17 10 Leave out requantified 0.66389 0.60536 1.6715 0.7094 0.67315 1.6943 53.09 20.37 96.004 5 7 5 3 4 3 Median Leave out requantified Median 23.5 32.7 22.3 462050000 271500000 190540000 105260000 67073000 38190000 204890000 147680000 57212000 151890000 56751000 95143000 1459 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0.6629 NaN NaN 31.096 NaN 1 2 0 0 1 0 Median Median Median 1.5 3.4 0 42817000 30771000 12046000 4266400 2567100 1699200 38550000 28204000 10347000 0 0 0 1462 9164;18008 True;True 9349;18377 32423;32424;62736 41172;79501 41172;79501 Q8TCE6;Q6NSW5 Q8TCE6;Q6NSW5 1;1 1;1 1;1 Protein FAM45A;Protein FAM45B FAM45A;FAM45B sp|Q8TCE6|FA45A_HUMAN Protein FAM45A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM45A PE=2 SV=1;sp|Q6NSW5|FA45B_HUMAN Putative protein FAM45B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM45BP PE=5 SV=1 2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 5.3 5.3 5.3 40.513 357 357;357 0.000481 3.399 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 5.3 0 0 31946000 15838000 16107000 31946000 15838000 16107000 0 0 0 0 0 0 1463 3650 True 3724 12832 16422 16422 Q6NXR4 Q6NXR4 3 3 3 TELO2-interacting protein 2 TTI2 sp|Q6NXR4|TTI2_HUMAN TELO2-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTI2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 10.2 10.2 10.2 56.914 508 508 0 18.897 By MS/MS By MS/MS 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POTE ankyrin domain family member E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POTEE PE=2 SV=3 1 10 1 0 9 9 10 0 0 1 0 0 0 10 1.7 0 121.36 1075 1075 0.0030932 2.48 By matching By matching By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 8.4 8.4 10 16489000 16489000 0 0 0 0 0 0 0 16489000 16489000 0 1483 493;1571;2348;3767;8467;9414;12786;12787;15182;16538 False;False;False;False;False;False;False;False;False;True 503;1610;2404;3845;3846;8635;9604;9605;13063;13064;15508;16886 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Median Median Median 2.6 2.6 2.6 56866000 6572300 50294000 21994000 3830900 18163000 11651000 0 11651000 23221000 2741500 20480000 1487 18499 True 18874 64437;64438;64439;64440;64441 81580;81581;81582;81583;81584 81582 Q6VY07 Q6VY07 3 3 3 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 PACS1 sp|Q6VY07|PACS1_HUMAN Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACS1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 4.4 4.4 4.4 104.9 963 963 0 10.822 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8675 0.92632 26.697 6 3 Median 0.96573 NaN 0.72137 0.99885 NaN 0.75047 32.14 NaN 19.111 3 1 2 1 1 1 Median Median Median 4.4 1.6 4.4 110140000 55910000 54230000 48431000 23600000 24831000 25988000 10087000 15900000 35721000 22222000 13498000 1488 5065;8504;14065 True;True;True 5163;8672;14363 17648;17649;17650;29832;29833;29834;49167;49168 22540;22541;22542;37850;37851;37852;61971;61972;61973 22540;37852;61971 Q6WCQ1 Q6WCQ1 10 10 10 Myosin phosphatase Rho-interacting protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 10 10 10 7 8 9 7 8 9 7 8 9 15.8 15.8 15.8 116.53 1025 1025 0 51.915 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90216 0.96281 15.881 19 5 Leave out requantified 0.84188 0.86912 0.97805 0.94969 0.99115 0.98624 24.271 21.101 12.185 5 7 7 2 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.5 11.6 14.6 584380000 309830000 274550000 154520000 86903000 67618000 191530000 103970000 87560000 238340000 118960000 119380000 1489 3231;3899;4172;7197;9130;10189;13527;16578;16895;18062 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3301;3981;4261;7337;9314;10389;13817;16926;17247;18431 11349;11350;11351;13792;13793;14676;14677;14678;25237;25238;25239;32312;32313;36017;47294;47295;47296;57781;57782;57783;58913;58914;62891;62892 14516;14517;14518;17651;17652;18830;18831;18832;32079;32080;32081;41028;41029;45657;59661;59662;59663;59664;73177;73178;73179;73180;73181;73182;74665;74666;74667;79676 14516;17652;18830;32081;41029;45657;59662;73178;74666;79676 Q6XZF7 Q6XZF7 5 5 5 Dynamin-binding protein DNMBP sp|Q6XZF7|DNMBP_HUMAN Dynamin-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNMBP PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 5 4 4 4 177.35 1577 1577 0 13.414 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92769 1.0474 36.757 14 3 Leave out requantified 1.0048 0.77593 0.92769 1.0901 0.86651 0.98087 33.852 33.452 34.318 4 5 5 0 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 3.3 4 4 216060000 113440000 102620000 62269000 30935000 31334000 83460000 43494000 39966000 70332000 39011000 31321000 1490 5220;5788;10067;14438;15861 True;True;True;True;True 5320;5900;10266;14746;16201 18153;18154;18155;20043;20044;20045;35539;35540;50441;50442;50443;55346;55347;55348 23129;23130;23131;23132;25497;45088;45089;63632;63633;70002;70003;70004 23129;25497;45088;63632;70002 Q6Y7W6 Q6Y7W6 1 1 1 PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2 GIGYF2 sp|Q6Y7W6|GGYF2_HUMAN GRB10-interacting GYF protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GIGYF2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.7 2.7 2.7 150.07 1299 1299 0 8.1843 By MS/MS By MS/MS 0.99478 1.0466 15.131 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 2.7 2.7 51272000 32917000 18355000 0 0 0 25311000 19079000 6231600 25961000 13838000 12123000 1491 16945 True 17297 59081;59082 74867;74868;74869;74870;74871 74868 Q6YN16 Q6YN16 5 5 5 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 HSDL2 sp|Q6YN16|HSDL2_HUMAN Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSDL2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 14.8 14.8 14.8 45.394 418 418 0 82.915 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69869 0.77553 44.327 18 4 Leave out requantified 0.6741 0.84584 0.71937 0.75452 1.0112 0.76615 14.234 27.244 38.097 5 7 6 1 3 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.5 12.7 14.8 747990000 454890000 293100000 210500000 132530000 77973000 278220000 161010000 117220000 259260000 161350000 97905000 1492 965;2155;2849;9133;10311 True;True;True;True;True 990;2205;2913;9317;10512 3362;7484;7485;9998;9999;32320;32321;32322;32323;32324;32325;36412;36413;36414;36415;36416;36417;36418 4388;9689;9690;12761;41036;41037;41038;41039;41040;41041;46140;46141;46142;46143;46144;46145;46146;46147;46148;46149;46150;46151 4388;9689;12761;41037;46146 Q6ZNJ1 Q6ZNJ1 3 3 3 Neurobeachin-like protein 2 NBEAL2 sp|Q6ZNJ1|NBEL2_HUMAN Neurobeachin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NBEAL2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 302.51 2754 2754 0 5.7525 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0347 1.1238 41.278 6 3 Median 1.2408 1.0111 1.4207 1.2935 1.1238 1.4261 51.993 29.993 65.899 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 0.8 1.4 0.8 268080000 134520000 133550000 78000000 39732000 38268000 105450000 51766000 53684000 84625000 43025000 41600000 1493 3118;9495;9508 True;True;True 3186;9686;9699 10944;33670;33671;33709;33710;33711 13954;42755;42756;42806 13954;42756;42806 Q6ZS17 Q6ZS17 1 1 1 Protein FAM65A FAM65A sp|Q6ZS17|RIPR1_HUMAN Rho family-interacting cell polarization regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RIPOR1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 1 1 132.31 1223 1223 0.00093677 3.1019 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 1 9786400 5869500 3916900 0 0 0 0 0 0 9786400 5869500 3916900 1494 12213 True 12474 42785 53923 53923 Q6ZS81 Q6ZS81 1 1 1 WD repeat- and FYVE domain-containing protein 4 WDFY4 sp|Q6ZS81|WDFY4_HUMAN WD repeat- and FYVE domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDFY4 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.4 0.4 0.4 353.61 3184 3184 1 -2 By MS/MS By matching By matching 0.71612 0.76973 17.382 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.4 0.4 0.4 97289000 54868000 42421000 30633000 17097000 13536000 31508000 17410000 14098000 35148000 20360000 14788000 + 1495 14992 True 15313 52294;52295;52296 66088 66088 370 1681 Q709C8 Q709C8 2 2 2 Vacuolar protein sorting-associated protein 13C VPS13C sp|Q709C8|VP13C_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 13C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS13C PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 0.7 0.7 0.7 422.39 3753 3753 0.0018315 2.8336 By MS/MS By MS/MS 1.6641 1.7056 40.803 4 2 Linear 0.88461 NaN 1.1228 0.92211 NaN 1.1194 43.66 NaN 52.082 2 0 2 2 0 0 Median Median Median 0.7 0 0.7 30827000 14161000 16666000 14233000 6172800 8060300 0 0 0 16594000 7988200 8605400 1496 187;3199 True;True 189;3269 617;618;11252;11253 808;809;14376;14377 808;14377 Q70E73 Q70E73 1 1 1 Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 RAPH1 sp|Q70E73|RAPH1_HUMAN Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAPH1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.6 2.6 2.6 135.25 1250 1250 0.0061002 2.329 By MS/MS By MS/MS 0.94246 0.97453 0.57538 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 2.6 2.6 47672000 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Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 SND1 sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SND1 PE=1 SV=1 1 35 35 35 33 30 31 33 30 31 33 30 31 47.9 47.9 47.9 102 910 910 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83059 0.89703 20.469 126 43 Leave out requantified 0.83059 0.73717 0.97216 0.89821 0.84342 0.97744 26.168 23.356 19.218 43 40 43 13 14 16 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 47.8 40.8 43 12981000000 6928300000 6052900000 4135500000 2226200000 1909200000 4292600000 2445800000 1846800000 4553100000 2256200000 2296900000 1503 203;2389;2390;2901;2902;2903;3077;3078;3112;3526;4487;4513;4553;5404;5689;6110;6874;9151;9896;11776;11901;12812;13578;13904;14006;14553;14906;15304;16461;17096;17346;17455;17531;17963;18629 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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2 RSRC2 sp|Q7L4I2|RSRC2_HUMAN Arginine/serine-rich coiled-coil protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RSRC2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.3 5.3 5.3 50.559 434 434 0 23.061 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 3.7 0 1.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1509 13238;14010 True;True 13525;14307 46365;48985 58493;61745 58493;61745 Q7L576;Q96F07 Q7L576;Q96F07 14;7 14;7 14;7 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 CYFIP1;CYFIP2 sp|Q7L576|CYFP1_HUMAN Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYFIP1 PE=1 SV=1;sp|Q96F07|CYFP2_HUMAN Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYFIP2 PE=1 SV=2 2 14 14 14 12 10 10 12 10 10 12 10 10 12.6 12.6 12.6 145.18 1253 1253;1278 0 55.914 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81024 0.90244 11.784 37 10 Leave out requantified 0.84047 0.78409 0.95441 0.93252 0.90594 0.9486 14.173 9.0533 12.237 14 12 11 4 3 3 Leave out 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demethylase 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDM3B PE=1 SV=2 1 5 5 5 5 4 4 5 4 4 5 4 4 4.4 4.4 4.4 191.58 1761 1761 0 23.163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79941 0.89803 15.351 13 4 Leave out requantified 0.78124 0.79097 0.83825 0.88041 0.92671 0.88193 9.0276 13.068 33.665 5 4 4 2 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.4 3.7 3.7 323520000 174470000 149050000 116300000 63232000 53066000 103210000 50182000 53027000 104010000 61054000 42953000 1515 7018;14026;15116;15618;16543 True;True;True;True;True 7155;14323;15439;15952;16891 24503;24504;24505;24506;24507;24508;24509;49037;49038;49039;52712;54483;54484;54485;54486;57643;57644;57645 31072;31073;31074;31075;31076;31077;31078;61825;61826;61827;66605;68921;68922;68923;68924;68925;68926;72993;72994 31074;61825;66605;68922;72993 Q7LBR1 Q7LBR1 2 2 2 Charged multivesicular body protein 1b CHMP1B sp|Q7LBR1|CHM1B_HUMAN Charged multivesicular body protein 1b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP1B PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 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1549 13069;13364;14784 True;True;True 13352;13653;15101 45777;45778;45779;45780;46764;46765;46766;51656;51657 57727;57728;57729;57730;57731;57732;58992;58993;58994;65268;65269 57730;58993;65268 Q86WR0 Q86WR0 2 2 2 Coiled-coil domain-containing protein 25 CCDC25 sp|Q86WR0|CCD25_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC25 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 11.1 11.1 11.1 24.479 208 208 0.00093284 3.0705 By MS/MS By MS/MS 0.69439 0.77793 28.638 3 1 Median NaN 0.64174 NaN NaN 0.7555 NaN NaN 4.1364 NaN 1 2 0 0 1 0 Median Median Median 5.3 11.1 0 32601000 19271000 13330000 9303000 3835900 5467100 23298000 15435000 7862700 0 0 0 1550 5210;9929 True;True 5310;10125 18124;18125;35088 23102;44504 23102;44504 Q86X55 Q86X55 7 7 7 Histone-arginine methyltransferase CARM1 CARM1 sp|Q86X55|CARM1_HUMAN Histone-arginine methyltransferase CARM1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CARM1 PE=1 SV=3 1 7 7 7 5 6 7 5 6 7 5 6 7 16.1 16.1 16.1 65.853 608 608 0 21.149 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98993 1.0387 21.907 21 11 Leave out requantified 0.98993 0.83357 0.82237 1.0387 0.95216 0.83833 32.706 22.88 73.096 6 6 9 3 3 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 9.5 14.8 16.1 650770000 351170000 299600000 175840000 91995000 83845000 198740000 107970000 90776000 276180000 151200000 124980000 1551 10479;11582;13228;13379;14925;18460;18644 True;True;True;True;True;True;True 10680;11816;13515;13668;15246;18834;19023 36932;36933;36934;36935;40591;40592;40593;40594;46335;46336;46337;46821;46822;46823;46824;52108;64310;64311;64901;64902;64903 46801;46802;46803;46804;51254;51255;51256;51257;58464;59068;59069;59070;59071;65848;81440;81441;82211;82212;82213;82214;82215 46802;51257;58464;59068;65848;81440;82212 Q86X83 Q86X83 1 1 1 COMM domain-containing protein 2 COMMD2 sp|Q86X83|COMD2_HUMAN COMM domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COMMD2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 9.5 9.5 9.5 22.745 199 199 0.0098628 2.186 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 9.5 0 0 40062000 19958000 20104000 40062000 19958000 20104000 0 0 0 0 0 0 1552 15670 True 16005 54657 69133 69133 Q86XA9 Q86XA9 2 2 2 HEAT repeat-containing protein 5A HEATR5A sp|Q86XA9|HTR5A_HUMAN HEAT repeat-containing protein 5A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR5A PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.4 1.4 1.4 222 2040 2040 0.00048239 3.4475 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 Median Median Median 0.6 0.8 0 18299000 12304000 5995300 3440500 3440500 0 14859000 8863300 5995300 0 0 0 1553 1488;14147 True;True 1525;14445 5170;49412 6748;62291 6748;62291 Q86XI2 Q86XI2 2 2 2 Condensin-2 complex subunit G2 NCAPG2 sp|Q86XI2|CNDG2_HUMAN Condensin-2 complex subunit G2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCAPG2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.7 1.7 1.7 130.96 1143 1143 0 4.6076 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0138 1.0106 29.214 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 0.9 0.8 0.9 39230000 19596000 19634000 16043000 8196000 7847200 6734800 2778900 3955900 16452000 8621300 7831100 1554 9632;16490 True;True 9824;16838 34122;34123;57479 43304;43305;43306;43307;72775 43304;72775 Q86XP3 Q86XP3 13 13 13 ATP-dependent RNA helicase DDX42 DDX42 sp|Q86XP3|DDX42_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX42 PE=1 SV=1 1 13 13 13 9 11 11 9 11 11 9 11 11 17 17 17 102.97 938 938 0 51.554 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96502 1.0092 24.648 38 19 Leave out requantified 0.93189 0.98718 0.86745 0.97335 1.1271 0.89842 19.914 9.4541 24.497 11 13 14 5 7 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 11.8 13.5 15 1550900000 792250000 758680000 463970000 230310000 233650000 484370000 240540000 243820000 602590000 321400000 281200000 1555 2356;2383;3846;3847;3888;4290;6025;6121;7687;11999;12151;16312;17738 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2412;2440;3927;3928;3970;4380;6140;6237;7834;12256;12410;16658;18101 8247;8248;8249;8334;8335;8336;8337;8338;13617;13618;13619;13620;13621;13753;15056;15057;15058;20839;20840;20841;20842;20843;20844;20845;21186;21187;21188;27010;27011;27012;42042;42563;42564;42565;42566;56869;56870;61841;61842;61843 10632;10633;10634;10735;10736;10737;10738;10739;17448;17449;17450;17451;17452;17453;17607;19340;19341;19342;26523;26524;26525;26526;26527;26528;26529;26530;26531;26532;26955;26956;26957;26958;34337;34338;53028;53663;53664;53665;53666;53667;53668;71957;71958;78416;78417;78418 10634;10736;17451;17453;17607;19340;26528;26958;34337;53028;53664;71958;78416 Q86Y56 Q86Y56 2 2 2 Dynein assembly factor 5, axonemal DNAAF5 sp|Q86Y56|DAAF5_HUMAN Dynein assembly factor 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAAF5 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2.7 2.7 2.7 93.52 855 855 0 7.3928 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0372 1.0951 22.395 5 3 Median NaN 0.93987 1.1311 NaN 1.0218 1.1295 NaN 41.493 4.3719 1 2 2 0 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sp|Q8IV38|ANKY2_HUMAN Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKMY2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.9 2.9 2.9 49.298 441 441 0 8.3151 By matching By MS/MS By MS/MS 0.89344 1.0029 2.2731 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.9 2.9 2.9 49911000 26303000 23608000 14580000 9071300 5508800 17552000 9265800 8286500 17779000 7965600 9813000 1562 6620 True 6745 22815;22816;22817 29051;29052 29051 Q8IV48 Q8IV48 3 3 3 3-5 exoribonuclease 1 ERI1 sp|Q8IV48|ERI1_HUMAN 3-5 exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 9.2 9.2 9.2 40.063 349 349 0 9.9172 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88766 0.97938 28.092 6 3 Median 0.96928 0.94441 0.83409 1.0592 1.1056 0.88516 39.422 31.675 28.84 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 6.6 6.6 9.2 140450000 75575000 64879000 44445000 22922000 21523000 53804000 28907000 24897000 42205000 23746000 18459000 1563 267;4991;17010 True;True;True 269;5088;17362 886;17420;17421;17422;59325;59326;59327 1172;22286;22287;22288;75185 1172;22287;75185 Q8IVD9 Q8IVD9 2 2 2 NudC domain-containing protein 3 NUDCD3 sp|Q8IVD9|NUDC3_HUMAN NudC domain-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD3 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.1 6.1 6.1 40.822 361 361 0 3.9291 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4415 1.5358 51.709 4 2 Median NaN NaN 1.2129 NaN NaN 1.213 NaN NaN 46.875 1 1 2 1 0 1 Median Median Median 1.9 1.9 6.1 87655000 40623000 47032000 29137000 16762000 12375000 23624000 8819800 14804000 34895000 15041000 19854000 1564 4182;8129 True;True 4271;8288 14709;28531;28532;28533 18872;36213;36214;36215 18872;36214 Q8IVF2 Q8IVF2 9 9 9 Protein AHNAK2 AHNAK2 sp|Q8IVF2|AHNK2_HUMAN Protein AHNAK2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHNAK2 PE=1 SV=2 1 9 9 9 5 7 7 5 7 7 5 7 7 7.9 7.9 7.9 616.62 5795 5795 0 22.911 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89529 1.0094 28.029 21 8 Leave out requantified 0.97795 0.79986 0.79029 1.0912 0.92264 0.83743 6.2579 34.141 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domain-containing family M member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEKHM2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 1 112.78 1019 1019 0.0064963 2.2951 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 1 0 0 11855000 5951200 5904000 11855000 5951200 5904000 0 0 0 0 0 0 1569 14983 True 15304 52271 66062 66062 Q8IWJ2 Q8IWJ2 2 2 2 GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2 GCC2 sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GCC2 PE=1 SV=4 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1.4 1.4 1.4 195.91 1684 1684 0 5.9998 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87273 1.0098 54.575 4 2 Median 1.3314 NaN NaN 1.4795 NaN NaN 71.837 NaN NaN 2 1 1 1 0 1 Median Median Median 1.4 0.8 0.8 70221000 32320000 37902000 44133000 17205000 26928000 13422000 7734600 5686900 12667000 7379400 5287200 1570 2563;13284 True;True 2621;13571 8992;46506;46507;46508 11503;58672;58673;58674 11503;58673 Q8IWS0 Q8IWS0 4 4 4 PHD finger protein 6 PHF6 sp|Q8IWS0|PHF6_HUMAN PHD finger protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 15.1 15.1 15.1 41.29 365 365 0 18.234 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0448 1.1402 19.178 11 1 Leave out requantified 0.9718 0.87403 1.1734 1.103 0.92489 1.2598 18.384 35.123 4.6155 3 4 4 0 1 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 15.1 10.7 10.7 230810000 121980000 108830000 75015000 41788000 33226000 74865000 40357000 34508000 80926000 39832000 41095000 1571 316;1963;2431;15045 True;True;True;True 319;2009;2488;15367 1051;1052;1053;6786;8489;8490;8491;52458;52459;52460;52461;52462 1375;1376;1377;8788;10928;10929;66285;66286;66287;66288;66289;66290;66291 1377;8788;10928;66286 Q8IWV8 Q8IWV8 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase UBR2 UBR2 sp|Q8IWV8|UBR2_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase UBR2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBR2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 1.9 1.9 1.9 200.54 1755 1755 0.00228 2.777 By MS/MS By MS/MS 0.68214 0.76028 22.186 3 3 Median NaN 0.79831 NaN NaN 0.8955 NaN NaN 23.151 NaN 1 2 0 1 2 0 Median Median Median 0.7 1.9 0 25281000 14923000 10357000 7503400 4151000 3352400 17777000 10772000 7005000 0 0 0 1572 9606;12405 True;True 9798;12675 34034;34035;43459 43193;43194;54788 43193;54788 Q8IWX8 Q8IWX8 2 2 2 Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein CHERP sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHERP PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1.6 1.6 1.6 103.7 916 916 0.00047348 3.2055 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 1 0 0 Median Median Median 0.9 0 0.8 5842700 1191200 4651500 5842700 1191200 4651500 0 0 0 0 0 0 1573 3946;10424 True;True 4028;10625 13955;36760 17871;46589 17871;46589 Q8IWZ3 Q8IWZ3 7 7 3 Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 ANKHD1 sp|Q8IWZ3|ANKH1_HUMAN Ankyrin repeat and KH domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKHD1 PE=1 SV=1 1 7 7 3 4 3 4 4 3 4 2 1 2 4.8 4.8 2.6 269.45 2542 2542 0 34.233 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97831 1.0746 45.579 7 5 Median 0.97831 0.92952 1.5007 1.0746 1.0099 1.5532 23.401 28.998 89.596 3 2 2 1 2 2 Median Median Median 3.1 1.7 2.3 165190000 110290000 54904000 65452000 40394000 25058000 57179000 38708000 18471000 42559000 31184000 11375000 1574 2878;5529;9519;9685;11111;14433;16238 True;True;True;True;True;True;True 2943;5637;9710;9877;11324;14741;16582 10125;19168;33751;33752;33753;33754;33755;33756;34277;38967;50428;50429;56610;56611 12947;24410;42853;42854;42855;42856;42857;42858;43486;49275;63618;63619;71621;71622 12947;24410;42857;43486;49275;63619;71622 Q8IX04 Q8IX04 3 3 3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3 UEVLD sp|Q8IX04|UEVLD_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UEVLD PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 1 2 1 1 2 1 1 2 6.8 6.8 6.8 52.263 471 471 0 6.2709 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95816 1.0113 34.611 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 0 0 0 Median Median Median 2.3 2.3 4.5 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Q8IYB3 7 7 7 Serine/arginine repetitive matrix protein 1 SRRM1 sp|Q8IYB3|SRRM1_HUMAN Serine/arginine repetitive matrix protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRM1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 5 7 5 5 7 5 5 7 11.3 11.3 11.3 102.33 904 904 0 44.396 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.003 1.1014 11.894 24 7 Leave out requantified 1.0131 0.79479 1.0406 1.114 0.9723 1.1341 11.206 23.442 12.369 8 8 8 3 3 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.2 10.2 11.3 1102500000 571430000 531090000 320920000 164340000 156580000 422060000 228970000 193090000 359540000 178120000 181420000 1581 1506;4711;8651;8652;9128;17123;17542 True;True;True;True;True;True;True 1544;4804;8822;8823;9312;17480;17904 5227;5228;5229;16477;30432;30433;30434;30435;30436;30437;30438;32306;32307;32308;59745;59746;59747;59748;59749;59750;59751;61189;61190;61191;61192;61193 6819;6820;6821;21122;38673;38674;38675;38676;38677;38678;38679;38680;38681;38682;38683;38684;38685;38686;41021;75734;75735;75736;75737;75738;75739;75740;75741;75742;75743;75744;75745;77606;77607;77608;77609;77610;77611 6820;21122;38673;38686;41021;75739;77609 Q8IYB5 Q8IYB5 2 2 2 Stromal membrane-associated protein 1 SMAP1 sp|Q8IYB5|SMAP1_HUMAN Stromal membrane-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMAP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5.8 5.8 5.8 50.386 467 467 0 6.0968 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63803 0.7226 21.978 9 8 Median 0.58372 0.75481 0.72838 0.63456 0.83827 0.74571 24.982 20.999 16.122 4 2 3 4 1 3 Median Median Median 5.8 5.8 5.8 199850000 120660000 79186000 85820000 50981000 34839000 61859000 39169000 22690000 52170000 30513000 21657000 1582 3754;10507 True;True 3832;10709 13250;13251;13252;13253;13254;37027;37028;37029;37030 16978;16979;16980;16981;16982;46920;46921;46922;46923;46924 16980;46920 Q8IYI6 Q8IYI6 6 6 6 Exocyst complex component 8 EXOC8 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Tetratricopeptide repeat protein 39C TTC39C sp|Q8N584|TT39C_HUMAN Tetratricopeptide repeat protein 39C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC39C PE=2 SV=2 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 9.3 9.3 9.3 65.869 583 583 0 10.25 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80034 0.89623 28.334 8 0 Leave out requantified 1.0484 0.78356 1.0284 1.1234 0.87921 1.0645 36.735 2.7109 38.784 3 2 3 0 0 0 Leave out requantified Median Leave out requantified 9.3 4.5 9.3 139110000 79750000 59357000 51124000 32469000 18655000 36696000 20068000 16629000 51287000 27214000 24073000 1599 11030;11723;18465 True;True;True 11241;11970;18839 38713;38714;41079;41080;41081;64321;64322;64323 48964;51869;51870;51871;81451;81452;81453 48964;51869;81452 Q8N668 Q8N668 1 1 1 COMM domain-containing protein 1 COMMD1 sp|Q8N668|COMD1_HUMAN COMM domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COMMD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.4 7.4 7.4 21.178 190 190 0 5.4133 By MS/MS By MS/MS By matching 0.86822 0.93094 15.178 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 7.4 7.4 7.4 31640000 17424000 14216000 14749000 8321100 6427900 0 0 0 16891000 9102800 7787900 1600 12840 True 13117 44933;44934;44935 56646;56647;56648 56648 Q8N684 Q8N684 6 6 6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 CPSF7 sp|Q8N684|CPSF7_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF7 PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 15.9 15.9 15.9 52.049 471 471 0 23.712 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0738 1.111 8.6973 19 11 Leave out requantified 1.0951 0.93101 1.0357 1.1545 1.0305 1.0526 10.496 9.6888 16.483 7 6 6 3 4 4 Leave out requantified Median Median 15.9 15.9 14.2 374460000 192120000 182350000 131830000 69942000 61887000 112470000 59754000 52713000 130170000 62421000 67747000 1601 1482;2829;10261;13191;14951;15206 True;True;True;True;True;True 1519;2892;10462;13478;15272;15533 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By MS/MS 1.1265 1.1519 50.905 6 5 Median NaN 0.94434 1.8014 NaN 1.0335 1.8043 NaN 53.907 73.219 1 3 2 1 3 1 Median Median Median 4.8 9.2 9.2 184520000 81752000 102770000 12883000 4002600 8880400 106710000 52136000 54573000 64932000 25613000 39319000 1603 6808;7247 True;True 6941;7388 23526;23527;23528;25460;25461;25462 29958;29959;29960;32319;32320;32321;32322 29960;32321 Q8N7H5 Q8N7H5 3 3 3 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog PAF1 sp|Q8N7H5|PAF1_HUMAN RNA polymerase II-associated factor 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAF1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 7.3 7.3 7.3 59.975 531 531 0 9.1754 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0301 1.2855 66.036 9 3 Leave out requantified 1.0128 1.0274 0.8647 1.1472 1.2149 0.88113 16.565 7.9914 63.436 4 2 3 2 0 1 Median Median Median 7.3 7.3 7.3 142950000 69583000 73372000 77504000 35528000 41977000 21604000 8942500 12661000 43846000 25113000 18733000 1604 571;17796;18327 True;True;True 584;18161;18700 1973;1974;1975;62033;62034;62035;63828;63829;63830;63831;63832 2579;2580;78624;78625;78626;78627;80855;80856;80857;80858;80859 2579;78625;80858 Q8N8S7 Q8N8S7 6 6 6 Protein enabled homolog ENAH sp|Q8N8S7|ENAH_HUMAN Protein enabled homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENAH PE=1 SV=2 1 6 6 6 5 5 4 5 5 4 5 5 4 13.9 13.9 13.9 66.509 591 591 0 33.176 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0042 1.0435 30.418 19 3 Leave out requantified 1.2308 0.84251 0.85816 1.3348 0.94033 0.91543 41.545 34.692 14.98 7 6 6 1 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13 11.8 11 737370000 404920000 332450000 241530000 129660000 111870000 251430000 147320000 104110000 244410000 127930000 116480000 1605 161;4284;6536;10101;10102;13201 True;True;True;True;True;True 163;4373;6660;10300;10301;13488 531;15038;15039;15040;15041;15042;22516;22517;22518;22519;22520;22521;35656;35657;35658;35659;46257;46258;46259 695;19315;19316;19317;19318;28623;28624;28625;28626;28627;28628;28629;28630;28631;28632;28633;28634;28635;45237;45238;45239;45240;45241;45242;45243;58350;58351;58352;58353;58354 695;19317;28626;45240;45243;58352 Q8N999 Q8N999 1 1 1 Uncharacterized protein C12orf29 C12orf29 sp|Q8N999|CL029_HUMAN Uncharacterized protein C12orf29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C12orf29 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 37.49 325 325 0 6.2404 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92288 1.0234 17.679 8 0 Median 0.92288 0.72406 1.0547 1.0076 0.84608 1.1047 2.5378 20.046 8.3831 2 3 3 0 0 0 Median Median Median 3.1 3.1 3.1 1331300000 582560000 748730000 367770000 132180000 235590000 565470000 321320000 244160000 398050000 129060000 268990000 1606 17188 True 17546 60014;60015;60016;60017;60018;60019;60020;60021;60022;60023 76101;76102;76103;76104;76105;76106;76107;76108;76109;76110;76111;76112 76109 Q8NAV1 Q8NAV1 1 1 1 Pre-mRNA-splicing factor 38A PRPF38A sp|Q8NAV1|PR38A_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor 38A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF38A PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 3.2 3.2 3.2 37.476 312 312 0.00047259 3.1993 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 1 0 Median Median Median 0 3.2 0 14518000 6226800 8291100 0 0 0 14518000 6226800 8291100 0 0 0 1607 18443 True 18817 64253 81368 81368 Q8NB16 Q8NB16 3 3 3 Mixed lineage kinase domain-like protein MLKL sp|Q8NB16|MLKL_HUMAN Mixed lineage kinase domain-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MLKL PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 1 3 0 1 3 0 1 3 8.3 8.3 8.3 54.478 471 471 0 6.2316 By MS/MS By MS/MS 0.99195 1.04 77.518 4 4 Median NaN NaN 0.70119 NaN NaN 0.76643 NaN NaN 75.876 0 1 3 0 1 3 Median Median Median 0 1.7 8.3 79401000 46361000 33040000 0 0 0 21036000 8964600 12071000 58366000 37396000 20969000 1608 5127;13243;17269 True;True;True 5225;13530;17628 17863;17864;46374;60279 22791;22792;58501;76422 22792;58501;76422 Q8NB37 Q8NB37 1 1 1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 PDDC1 sp|Q8NB37|GALD1_HUMAN Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATD1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 23.297 220 220 0.0030987 2.4919 By MS/MS By MS/MS By matching 1.4088 1.6024 13.023 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.5 4.5 4.5 32097000 13284000 18813000 10950000 5108100 5841600 12169000 4855900 7313200 8977900 3319600 5658300 1609 10666 True 10874 37540;37541;37542 47558;47559 47558 Q8NB90 Q8NB90 10 9 9 Spermatogenesis-associated protein 5 SPATA5 sp|Q8NB90|AFG2H_HUMAN ATPase family protein 2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPATA5 PE=1 SV=3 1 10 9 9 8 8 7 7 7 6 7 7 6 16.2 14.9 14.9 97.903 893 893 0 36.127 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86396 0.91309 9.0104 21 9 Leave out requantified 0.84993 0.99761 0.89834 0.92538 1.0578 0.9053 21.569 15.798 6.8452 7 7 7 2 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.5 12.5 11.9 478820000 248120000 230700000 153160000 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0 5.3252 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91781 1.0158 4.553 4 0 Leave out requantified NaN 0.832 NaN NaN 0.95504 NaN NaN 4.1663 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 4.1 8.3 4.1 58111000 30215000 27895000 15623000 7678000 7944700 25406000 14450000 10957000 17082000 8087800 8994000 1637 1724;12846 True;True 1767;13125 5934;44972;44973;44974 7778;56702;56703;56704;56705;56706 7778;56703 Q8TC07 Q8TC07 2 2 2 TBC1 domain family member 15 TBC1D15 sp|Q8TC07|TBC15_HUMAN TBC1 domain family member 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBC1D15 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2.5 2.5 2.5 79.49 691 691 0 5.2497 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.53237 0.58094 37.286 5 2 Median 0.80297 NaN 0.50848 0.87568 NaN 0.51781 50.693 NaN 7.4973 2 1 2 0 1 1 Median Median Median 2.5 1.2 2.5 76843000 48351000 28492000 31841000 18750000 13091000 10017000 6916600 3100700 34985000 22684000 12300000 1638 10325;15831 True;True 10526;16166 36455;36456;36457;55229;55230 46200;46201;46202;69829 46200;69829 Q8TCG1 Q8TCG1 3 3 3 Protein CIP2A KIAA1524 sp|Q8TCG1|CIP2A_HUMAN Protein CIP2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIP2A PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 3.4 3.4 3.4 102.18 905 905 0 5.6035 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87529 0.94142 2.7381 6 1 Leave out requantified 1.0425 NaN 0.86085 1.0938 NaN 0.87941 8.6896 NaN 11.428 2 1 3 0 0 1 Median Median Plateau 2.3 1.3 3.4 67016000 34295000 32721000 25982000 12732000 13249000 11067000 5746700 5320500 29967000 15817000 14151000 1639 8971;13245;14284 True;True;True 9151;13532;14587 31727;46378;46379;49897;49898;49899 40257;58508;58509;58510;62966 40257;58509;62966 Q8TCS8 Q8TCS8 5 5 5 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial PNPT1 sp|Q8TCS8|PNPT1_HUMAN Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PNPT1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 6 6 6 85.95 783 783 0 11.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92088 0.95905 23.229 10 2 Leave out requantified 0.88147 0.94515 0.92088 0.95905 1.0738 0.94787 48.889 13.01 26.321 3 3 4 1 0 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 4.7 4.7 4.9 235830000 121690000 114140000 69036000 32998000 36038000 75422000 40055000 35368000 91374000 48640000 42734000 1640 1072;1528;3912;6039;9747 True;True;True;True;True 1097;1566;3994;6154;9939 3725;3726;3727;5301;5302;13836;13837;13838;13839;20894;34482;34483;34484 4884;4885;4886;4887;4888;6917;6918;17705;17706;17707;17708;17709;26590;43738;43739;43740 4885;6918;17705;26590;43740 Q8TD19 Q8TD19 3 3 3 Serine/threonine-protein kinase Nek9 NEK9 sp|Q8TD19|NEK9_HUMAN Serine/threonine-protein kinase Nek9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEK9 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 4.6 4.6 4.6 107.17 979 979 0 8.1523 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99839 1.0347 27.397 7 3 Leave out requantified 1.0294 1.1193 0.99839 1.1501 1.2842 1.0347 29.761 34.621 24.916 2 2 3 1 2 0 Median Median Leave out requantified 3.3 3.3 4.6 177810000 88528000 89285000 49030000 25095000 23935000 68648000 33410000 35238000 60136000 30024000 30112000 1641 8879;9837;16551 True;True;True 9054;10031;16899 31389;34800;34801;34802;57678;57679;57680 39864;44160;44161;73043;73044;73045 39864;44160;73043 Q8TDN6 Q8TDN6 7 7 7 Ribosome biogenesis protein BRX1 homolog BRIX1 sp|Q8TDN6|BRX1_HUMAN Ribosome biogenesis protein BRX1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRIX1 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 7 6 5 7 6 5 7 6 17.3 17.3 17.3 41.401 353 353 0 20.945 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80898 0.82557 30.62 21 13 Leave out requantified 0.61734 1.007 0.9526 0.66027 1.1405 0.96674 80.881 30.575 129.24 5 9 7 3 5 5 Median Leave out requantified Median 11.6 17.3 15 620390000 351840000 268540000 159080000 91321000 67756000 217540000 131110000 86429000 243770000 129410000 114360000 1642 5135;5438;5856;6799;6800;6801;13726 True;True;True;True;True;True;True 5234;5544;5969;6932;6933;6934;14020 17892;17893;17894;17895;17896;18850;18851;18852;20269;23502;23503;23504;23505;23506;23507;23508;23509;23510;23511;23512;23513;48042;48043 22820;22821;22822;22823;22824;22825;24011;24012;24013;24014;24015;24016;25790;29931;29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941;29942;29943;60620;60621 22824;24012;25790;29934;29936;29942;60620 Q8TDP1 Q8TDP1 1 1 1 Ribonuclease H2 subunit C RNASEH2C sp|Q8TDP1|RNH2C_HUMAN Ribonuclease H2 subunit C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNASEH2C PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.7 6.7 6.7 17.84 164 164 0 4.8932 By matching By matching By MS/MS 1.5063 1.5786 18.888 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 6.7 6.7 6.7 53420000 22853000 30567000 16029000 5955200 10074000 18774000 9259900 9514500 18616000 7637700 10979000 1643 12856 True 13135 45005;45006;45007 56737 56737 Q8TEA8 Q8TEA8 2 2 2 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1 DTD1 sp|Q8TEA8|DTD1_HUMAN D-aminoacyl-tRNA deacylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTD1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 14.8 14.8 14.8 23.423 209 209 0 18.568 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89669 0.92658 27.032 5 1 Leave out 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689;8655;9907;11241;11805;12218;13025;15849;16541;18067;18926;20370;21820;22788;22790;23724;24303;29963;30042;38411;40871;41813;41882;45724;47992;53352;53551;58964;64159;64162;66252;66551;66652;70331;70666;71079;79428;80344 Q8WUW1 Q8WUW1 4 4 4 Protein BRICK1 BRK1 sp|Q8WUW1|BRK1_HUMAN Protein BRICK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRK1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 38.7 38.7 38.7 8.7448 75 75 0 13.475 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93258 0.99951 14.427 14 8 Leave out requantified 0.93838 0.74053 1.0618 1.0052 0.78667 1.0522 56.389 76.79 21.802 4 6 4 2 5 1 Median Median Leave out requantified 26.7 38.7 38.7 372770000 184870000 187900000 119150000 59174000 59975000 144090000 72917000 71171000 109540000 52781000 56755000 1654 3661;4663;4664;13650 True;True;True;True 3736;4755;4756;13942 12870;12871;12872;16307;16308;16309;16310;16311;16312;16313;16314;47746;47747;47748 16485;16486;16487;20909;20910;20911;20912;20913;20914;20915;20916;20917;60236;60237;60238;60239;60240 16485;20909;20914;60237 Q8WUX9 Q8WUX9 1 1 1 Charged multivesicular body protein 7 CHMP7 sp|Q8WUX9|CHMP7_HUMAN Charged multivesicular body protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP7 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.4 2.4 2.4 50.91 453 453 0.0052448 2.3645 By MS/MS By MS/MS 0.63705 0.69374 23.541 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 0 Median Median Median 0 2.4 2.4 35369000 21297000 14072000 0 0 0 19171000 11909000 7262400 16198000 9388200 6810000 1655 9132 True 9316 32318;32319 41034;41035 41035 Q8WVB6 Q8WVB6 5 5 5 Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog CHTF18 sp|Q8WVB6|CTF18_HUMAN Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHTF18 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 5 4 3 5 4 3 5 8.5 8.5 8.5 107.38 975 975 0 11.716 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85038 0.90824 12.396 9 5 Leave out requantified 1.015 0.82922 0.95922 1.0536 0.89683 0.99144 6.3968 10.84 50.579 2 2 5 1 1 3 Median Median Median 7 6.2 8.5 83712000 38062000 45650000 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3685;6280;9611;12745;16226;17091 12701;12702;12703;12704;12705;12706;12707;21343;21344;33414;33415;33416;43694;43695;43696;55436;55437;55438;58341 16267;16268;16269;16270;16271;16272;16273;27170;27171;42434;42435;42436;55108;55109;55110;70112;70113;70114;70115;73904 16267;27171;42436;55109;70115;73904 Q8WW12 Q8WW12 3 3 3 PEST proteolytic signal-containing nuclear protein PCNP sp|Q8WW12|PCNP_HUMAN PEST proteolytic signal-containing nuclear protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCNP PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 24.7 24.7 24.7 18.925 178 178 0 6.3946 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0645 1.148 42.036 6 2 Leave out requantified NaN 0.74515 0.78159 NaN 0.84415 0.86156 NaN 66.591 16.786 0 3 3 0 1 1 Median Median Median 9 24.7 24.7 118700000 64349000 54352000 0 0 0 53668000 28552000 25116000 65034000 35798000 29236000 1663 465;2907;13850 True;True;True 475;2973;14146 1589;1590;1591;1592;1593;10216;10217;48470;48471 2069;2070;2071;2072;13065;13066;61110;61111 2072;13065;61110 Q8WWH5 Q8WWH5 2 2 2 Probable tRNA pseudouridine synthase 1 TRUB1 sp|Q8WWH5|TRUB1_HUMAN Probable tRNA pseudouridine synthase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRUB1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 9.5 9.5 9.5 37.252 349 349 0 5.2748 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63432 0.6691 28.282 4 2 Median NaN NaN 0.57649 NaN NaN 0.60245 NaN NaN 32.129 1 1 2 1 0 1 Median Median Median 9.5 3.4 9.5 60609000 35860000 24749000 16479000 8781300 7697500 13362000 6993900 6368400 30768000 20085000 10683000 1664 7598;17756 True;True 7742;18119 26675;26676;26677;61906;61907 33883;33884;33885;78495;78496 33885;78496 Q8WWI1 Q8WWI1 8 8 8 LIM domain only protein 7 LMO7 sp|Q8WWI1|LMO7_HUMAN LIM domain only protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LMO7 PE=1 SV=3 1 8 8 8 3 6 6 3 6 6 3 6 6 5.9 5.9 5.9 192.69 1683 1683 0 26.086 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0011 1.0868 12.145 15 3 Leave out requantified 0.91098 1.0427 0.96829 1.0027 1.1749 1.0146 33.417 17.07 18.082 4 6 5 1 2 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 1.9 5 4.5 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Prp31 PRPF31 sp|Q8WWY3|PRP31_HUMAN U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF31 PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 4 7 5 4 7 5 4 7 18.2 18.2 18.2 55.455 499 499 0 43.695 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86818 0.94649 13.948 19 8 Leave out requantified 0.83047 0.94583 0.90815 0.92227 1.0168 0.91011 9.4964 13.696 21.397 5 5 9 2 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 14.2 10 18.2 993670000 512950000 480720000 163780000 83025000 80759000 132210000 71317000 60892000 697670000 358600000 339070000 1667 1341;8013;9861;13469;16683;16954;17100 True;True;True;True;True;True;True 1375;8167;10055;13758;17032;17306;17456 4637;4638;4639;4640;28096;28097;28098;34868;47105;47106;58136;58137;58138;58139;58140;58141;58142;59107;59108;59109;59673;59674 6034;6035;6036;6037;6038;6039;6040;35657;35658;35659;44235;59426;73646;73647;73648;73649;73650;73651;73652;74902;74903;75651 6035;35658;44235;59426;73648;74902;75651 Q8WX92 Q8WX92 9 9 9 Negative elongation 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regulatory glutamine/lysine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SREK1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 10.2 10.2 10.2 59.38 508 508 0 9.5019 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1014 1.189 20.6 5 1 Leave out requantified 1.0492 1.1562 NaN 1.1198 1.2624 NaN 31.997 9.2024 NaN 2 2 1 0 0 1 Median Median Median 10.2 7.1 4.3 78793000 38232000 40561000 27001000 13411000 13590000 33969000 16147000 17822000 17823000 8673700 9149300 1670 3229;4716;16393 True;True;True 3299;4809;16741 11345;16497;16498;57164;57165;57166 14511;21148;72343;72344 14511;21148;72344 Q8WXE1 Q8WXE1 2 2 2 ATR-interacting protein ATRIP sp|Q8WXE1|ATRIP_HUMAN ATR-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATRIP PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2.8 2.8 2.8 85.837 791 791 0.0031015 2.4962 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98269 1.0472 14.658 5 0 Leave out requantified 1.0133 NaN 0.99043 1.0945 NaN 0.99424 8.4104 NaN 19.809 2 1 2 0 0 0 Median Median Median 2.8 1.4 2.8 851590000 407430000 444160000 301120000 147170000 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14 14 14 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 ARHGEF1 sp|Q92888|ARHG1_HUMAN Rho guanine nucleotide exchange factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF1 PE=1 SV=2 1 14 14 14 12 9 10 12 9 10 12 9 10 17.1 17.1 17.1 102.43 912 912 0 53.388 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85207 0.94291 17.443 38 25 Leave out requantified 0.80545 0.85207 1.0762 0.86983 0.94559 1.1362 16.376 17.523 45.388 12 13 13 7 9 9 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.6 12.3 12.4 1152600000 599990000 552650000 373760000 201210000 172550000 401790000 197110000 204680000 377090000 201670000 175420000 1704 247;382;2678;2690;3679;3798;4757;5456;6990;10373;13084;13336;13362;15888 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 249;387;2739;2751;3754;3878;4850;5562;7125;10574;13367;13625;13651;16229 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factor 2 ARHGEF2 sp|Q92974|ARHG2_HUMAN Rho guanine nucleotide exchange factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF2 PE=1 SV=4 1 3 3 3 3 1 0 3 1 0 3 1 0 2.7 2.7 2.7 111.54 986 986 0.00047103 3.1683 By MS/MS By MS/MS 0.85187 0.89169 10.331 4 4 Median 0.81964 NaN NaN 0.84408 NaN NaN 9.9438 NaN NaN 3 1 0 3 1 0 Median Median Median 2.7 1 0 38056000 20556000 17500000 26755000 14606000 12149000 11301000 5950200 5351000 0 0 0 1714 466;1045;1441 True;True;True 476;1070;1477 1594;3636;5005;5006 2073;4774;6535;6536 2073;4774;6536 Q92979 Q92979 1 1 1 Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 EMG1 sp|Q92979|NEP1_HUMAN Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMG1 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.7 3.7 3.7 26.72 244 244 0.0022584 2.6879 By matching By MS/MS By MS/MS 0.83918 0.9597 7.3506 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 66487000 35406000 31081000 20913000 10056000 10857000 22030000 11886000 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2.2765 By matching By MS/MS By MS/MS 1.1848 1.2534 26.129 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.2 0.2 0.2 109640000 51307000 58333000 28557000 14189000 14368000 42719000 22673000 20046000 38364000 14446000 23919000 1751 607 True 620 2125;2126;2127 2801;2802;2803 2801 Q96E11 Q96E11 8 8 8 Ribosome-recycling factor, mitochondrial MRRF sp|Q96E11|RRFM_HUMAN Ribosome-recycling factor, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRRF PE=1 SV=1 1 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 39.7 39.7 39.7 29.277 262 262 0 21.032 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93358 1.0321 24.494 20 10 Leave out requantified 0.94823 0.75317 1.0605 1.0668 0.81265 1.1003 21.706 16.979 23.519 7 7 6 4 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.1 27.1 30.5 622330000 324260000 298070000 226310000 114920000 111400000 193600000 106290000 87307000 202420000 103050000 99371000 1752 4321;7338;9303;12953;14395;14765;15104;16146 True;True;True;True;True;True;True;True 4411;7481;9491;13235;14700;15082;15427;16488 15167;15168;15169;25792;25793;25794;32964;45365;45366;45367;50277;50278;50279;50280;50281;51582;52670;56303;56304;56305 19479;19480;19481;32717;32718;32719;32720;32721;41841;57181;57182;57183;63447;63448;63449;63450;63451;65160;66542;71197;71198;71199;71200;71201 19480;32720;41841;57183;63447;65160;66542;71200 Q96EA4 Q96EA4 1 1 1 Protein Spindly SPDL1 sp|Q96EA4|SPDLY_HUMAN Protein Spindly OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPDL1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1.8 1.8 1.8 70.171 605 605 0.0022321 2.5795 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 Median Median Median 1.8 0 0 6287000 4061900 2225100 6287000 4061900 2225100 0 0 0 0 0 0 1753 6517 True 6640 22449 28522 28522 Q96EB1 Q96EB1 2 2 2 Elongator complex protein 4 ELP4 sp|Q96EB1|ELP4_HUMAN Elongator complex protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 7.1 7.1 7.1 46.587 424 424 0 6.0338 By MS/MS By MS/MS 1.1631 1.2531 29.63 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 9.8 9.8 9.8 61569000 34714000 26855000 22453000 12263000 10190000 20700000 9744100 10956000 18416000 12706000 5709400 1757 3508 True 3581 12329;12330;12331 15795;15796;15797 15796 Q96EK5 Q96EK5 10 10 10 KIF1-binding protein KIAA1279 sp|Q96EK5|KBP_HUMAN KIF1-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF1BP PE=1 SV=1 1 10 10 10 7 8 9 7 8 9 7 8 9 23.3 23.3 23.3 71.813 621 621 0 48.125 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87675 0.92923 31.153 29 11 Leave out requantified 0.92307 0.79749 0.8181 0.97966 0.89226 0.87949 34.132 31.993 13.654 10 10 9 4 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.2 16.4 23.3 1118100000 582330000 535770000 382340000 183850000 198490000 403270000 213800000 189470000 332490000 184670000 147820000 1758 920;927;1628;3887;4525;5091;8637;8829;16748;17737 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 943;950;1668;3969;4617;5189;8808;9003;17098;18100 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cofactor sulfurase MOCOS sp|Q96EN8|MOCOS_HUMAN Molybdenum cofactor sulfurase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOCOS PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 4.1 4.1 4.1 98.119 888 888 0 6.499 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.981 2.2471 53.818 3 2 Median 2.5586 NaN NaN 2.7311 NaN NaN 27.587 NaN NaN 2 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.5 2.6 1.5 52331000 14431000 37900000 41618000 10012000 31605000 10714000 4418800 6294800 0 0 0 1760 4178;11047;14609 True;True;True 4267;11259;14920 14691;14692;14693;38767;51003 18849;18850;18851;49029;64358 18850;49029;64358 Q96ER3 Q96ER3 3 3 3 Protein SAAL1 SAAL1 sp|Q96ER3|SAAL1_HUMAN Protein SAAL1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAAL1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 5.9 5.9 5.9 53.557 474 474 0 7.2702 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2093 1.2624 33.227 11 5 Leave out requantified 1.0295 1.1832 1.1135 1.0989 1.2382 1.1583 26.521 32.173 43.574 4 3 4 2 1 2 Median Median Median 5.9 5.9 5.9 200750000 109080000 91674000 70071000 40007000 30065000 56376000 29954000 26422000 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1834;1835;1836;1837;1838;1839;1840;1841;1842;1843;1844;1845;1846;15349;15350;15351;15352;15353;15354;15355;15356;20859;20860;20861;20862;21623;21624;21625;21626;21627;21628;25224;25225;25226;25227;25228;25229;25230;36339;36340;36341;36342;36343;36344;36345;36346;36347;43161;43162;43163;43164;46819;46820;46821;56380;56381;56382;70955;70956;70957;70958 1837;1846;15356;20859;21623;25225;36344;43163;46821;56380;70958 Q96GA3 Q96GA3 3 3 3 Protein LTV1 homolog LTV1 sp|Q96GA3|LTV1_HUMAN Protein LTV1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LTV1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 7.6 7.6 7.6 54.854 475 475 0 6.8567 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0439 1.1184 21.047 8 2 Leave out requantified 1.088 1.0309 0.92753 1.2042 1.1184 0.89499 13.604 21.047 15.425 3 2 3 1 0 1 Median Median Median 7.6 7.6 7.6 76951000 38890000 38061000 30843000 14256000 16587000 16218000 8568600 7649500 29890000 16065000 13824000 1768 13727;14835;15532 True;True;True 14021;15154;15864 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 0 3 3 18000000 11358000 6642200 0 0 0 8791600 7024600 1767000 9208500 4333300 4875100 1775 9777 True 9969 34566;34567 43838;43839 43838 Q96HY6 Q96HY6 1 1 1 DDRGK domain-containing protein 1 DDRGK1 sp|Q96HY6|DDRGK_HUMAN DDRGK domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDRGK1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4.5 4.5 4.5 35.61 314 314 0.0044014 2.4355 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 0 4.5 4.5 10691000 7238400 3452200 0 0 0 3137600 3137600 0 7553000 4100700 3452200 1776 17897 True 18264 62367;62368 79040;79041 79040 Q96I24 Q96I24 5 4 4 Far upstream element-binding protein 3 FUBP3 sp|Q96I24|FUBP3_HUMAN Far upstream element-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FUBP3 PE=1 SV=2 1 5 4 4 4 5 5 3 4 4 3 4 4 11.2 9.6 9.6 61.64 572 572 0 7.7145 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.79048 0.82405 8.3358 11 1 Leave out requantified 0.80868 0.81457 0.78849 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protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPDL PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.4 8.4 8.4 39.385 371 371 0 5.1589 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.4847 0.50544 34.281 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 5.7 5.7 2.7 20843000 15973000 4870000 8821600 5623400 3198200 12021000 10350000 1671800 0 0 0 1780 6804;12730 True;True 6937;13007 23516;23517;44595 29946;29947;56217 29947;56217 Q96IU4 Q96IU4 5 5 5 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B ABHD14B sp|Q96IU4|ABHEB_HUMAN Protein ABHD14B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABHD14B PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 4 3 5 4 3 5 4 3 40.5 40.5 40.5 22.345 210 210 0 23.693 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76304 0.85064 14.619 19 13 Leave out requantified 0.7482 0.7598 0.97777 0.79231 0.87483 1.0302 20.73 15.107 19.481 7 6 6 5 3 5 Median Leave out requantified Median 40.5 35.7 29 878100000 507570000 370530000 291650000 176570000 115080000 274550000 171660000 102890000 311900000 159340000 152560000 1781 1517;3195;5337;5541;15981 True;True;True;True;True 1555;3265;5442;5649;16323 5266;5267;5268;11243;18535;18536;19210;19211;19212;19213;55770;55771;55772;55773;55774;55775;55776;55777;55778 6871;6872;6873;6874;6875;6876;14364;23620;23621;24460;24461;24462;24463;70537;70538;70539;70540;70541;70542;70543;70544;70545;70546 6876;14364;23620;24460;70541 Q96IZ0 Q96IZ0 3 3 3 PRKC apoptosis WT1 regulator protein PAWR sp|Q96IZ0|PAWR_HUMAN PRKC apoptosis WT1 regulator protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAWR PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 1 3 2 1 3 2 1 3 12.1 12.1 12.1 36.567 340 340 0 21.829 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83883 0.90186 30.704 6 1 Leave out requantified 0.85969 NaN 1.2339 0.91464 NaN 1.2234 25.438 NaN 43.572 2 1 3 0 0 1 Median Median Median 4.4 3.8 12.1 101910000 48284000 53625000 31951000 16157000 15794000 20078000 10240000 9837900 49881000 21887000 27993000 1782 15006;15051;18410 True;True;True 15327;15373;18784 52338;52478;52479;52480;64136;64137 66146;66312;66313;66314;66315;66316;66317;81219 66146;66314;81219 Q96JB5 Q96JB5 2 2 2 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 CDK5RAP3 sp|Q96JB5|CK5P3_HUMAN CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK5RAP3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 4.2 4.2 4.2 56.92 506 506 0 3.827 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3504 1.4874 26.644 5 2 Median 1.2556 NaN 1.9059 1.3826 NaN 1.9364 10.332 NaN 24.475 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 4.2 1.6 4.2 691420000 286230000 405180000 228310000 95128000 133180000 241860000 119640000 122220000 221240000 71466000 149780000 1783 5741;8619 True;True 5852;8790 19894;19895;19896;30316;30317 25329;25330;25331;38533;38534 25331;38533 Q96JG6 Q96JG6 2 2 2 Coiled-coil domain-containing protein 132 CCDC132 sp|Q96JG6|VPS50_HUMAN Syndetin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS50 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.8 3.8 3.8 111.17 964 964 0 17.731 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94289 1.0816 50.347 8 6 Median 1.101 0.94289 0.82418 1.1981 1.0892 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phosphoprotein 1 CHAMP1 sp|Q96JM3|CHAP1_HUMAN Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHAMP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 2.2 2.2 2.2 89.098 812 812 0 4.6606 By MS/MS By MS/MS 0.6816 0.76417 54.685 2 2 Median NaN 0.6816 NaN NaN 0.76417 NaN NaN 54.685 NaN 0 2 0 0 2 0 Median Median Median 1.1 2.2 0 27717000 14767000 12950000 0 0 0 27717000 14767000 12950000 0 0 0 1786 429;15140 True;True 438;15464 1479;52792;52793 1944;66706;66707 1944;66706 Q96K17 Q96K17 3 3 3 Transcription factor BTF3 homolog 4 BTF3L4 sp|Q96K17|BT3L4_HUMAN Transcription factor BTF3 homolog 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BTF3L4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 24.1 24.1 24.1 17.27 158 158 0 30.748 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97339 1.0897 21.528 6 2 Median 0.9775 0.94796 NaN 1.0938 1.111 NaN 32.626 3.2649 NaN 3 2 1 1 0 1 Median Median Median 24.1 24.1 24.1 353540000 150200000 203340000 151490000 65873000 85620000 139600000 66434000 73170000 62440000 17888000 44552000 1787 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requantified Leave out requantified 1.7 1.7 2.5 479960000 238890000 241070000 164990000 85296000 79692000 141690000 68207000 73482000 173280000 85388000 87897000 1799 1609;4325;6774;15905;17298 True;True;True;True;True 1648;4415;6906;16246;17657 5532;5533;5534;15180;15181;15182;23392;23393;23394;55506;60378;60379;60380 7239;7240;19493;19494;19495;19496;29810;29811;70213;76535;76536;76537 7240;19494;29811;70213;76536 Q96NC0 Q96NC0 2 2 2 Zinc finger matrin-type protein 2 ZMAT2 sp|Q96NC0|ZMAT2_HUMAN Zinc finger matrin-type protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZMAT2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 8 8 8 23.612 199 199 0.0026655 2.5407 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89266 0.94448 24.866 7 1 Median 0.86174 0.76169 0.94757 0.94448 0.85646 0.97328 35.638 23.977 7.1666 3 2 2 1 0 0 Median Median Median 8 4.5 4.5 91180000 48622000 42558000 39242000 19286000 19956000 25950000 14809000 11141000 25988000 14527000 11461000 1800 12972;15014 True;True 13254;15335 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2281;2282;2283;5380;5649;5650;5651;11254;11255;11256;11257;11258;11259;13825;14022;14023;14024;14272;14273;14274;16087;16088;16089;16090;16091;16092;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;19792;19793;19794;36736;36737;36738;36739;36740;36741;36742;36743;36744;45117;45118;45119;45120;45121;45586;45587;45588;47338;47339;59830;59831;59832;59833;59834;59835;59836;60623;60624;60625;60701;60702;60703 2991;2992;2993;2994;7023;7362;7363;14378;14379;14380;14381;14382;14383;14384;14385;14386;14387;14388;17693;17954;17955;17956;18251;18252;18253;20658;20659;20660;20661;23313;23314;23315;23316;23317;23318;23319;23320;23321;23322;23323;25192;25193;25194;25195;25196;46555;46556;46557;46558;46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567;46568;46569;56866;56867;56868;56869;56870;57460;57461;57462;57463;57464;57465;59721;59722;59723;75843;75844;75845;75846;75847;75848;75849;75850;75851;75852;75853;75854;76864;76865;76866;76867;76967;76968;76969;76970 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9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTMR9 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 63.461 549 549 0.0043975 2.4297 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72131 0.72746 9.5739 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 27215000 15797000 11418000 8302700 4437900 3864800 10210000 6172400 4037200 8702700 5186700 3516000 1808 11152 True 11365 39100;39101;39102 49434;49435;49436;49437 49435 Q96QK1 Q96QK1 3 3 3 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 VPS35 sp|Q96QK1|VPS35_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS35 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 1 2 2 1 2 2 1 2 6 6 6 91.706 796 796 0 7.6548 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91404 1.0652 72.942 5 1 Median 0.66201 NaN 0.74342 0.68441 NaN 0.7817 69.167 NaN 123.25 2 1 2 1 0 0 Median Median Median 4.3 2.4 4.1 124990000 71105000 53881000 41134000 23941000 17192000 46291000 25810000 20482000 37561000 21354000 16207000 1809 6856;8176;14017 True;True;True 6990;8335;14314 23724;28690;28691;28692;49014 30178;36427;61792 30178;36427;61792 Q96QR8 Q96QR8 1 1 1 Transcriptional activator protein Pur-beta PURB sp|Q96QR8|PURB_HUMAN Transcriptional activator protein Pur-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PURB PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.2 4.2 4.2 33.24 312 312 0 7.2097 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61714 0.69513 51.302 5 5 Median 0.67298 0.51519 NaN 0.75633 0.5814 NaN 74.271 25.266 NaN 2 2 1 2 2 1 Median Median Median 4.2 4.2 4.2 84746000 50878000 33868000 34888000 21400000 13488000 35205000 22296000 12909000 14652000 7181300 7471000 1810 5861 True 5974 20280;20281;20282;20283;20284 25804;25805;25806;25807;25808 25806 Q96QU8 Q96QU8 2 2 2 Exportin-6 XPO6 sp|Q96QU8|XPO6_HUMAN Exportin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO6 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1.9 1.9 1.9 128.88 1125 1125 0 6.45 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.69809 0.74567 43.157 5 2 Median 0.65747 NaN 0.47377 0.71371 NaN 0.47587 19.31 NaN 70.345 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 1.9 1.9 1.9 111020000 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159850000 78909000 80941000 160000000 97043000 62953000 154280000 68832000 85448000 1814 720;5810;6053;14141;17037;18574;18575 True;True;True;True;True;True;True 738;5922;6169;14439;17389;18953;18954 2519;20126;20948;20949;20950;49396;49397;59410;59411;59412;59413;59414;64678;64679;64680;64681 3297;25611;26650;26651;62275;62276;75292;75293;75294;81913;81914;81915;81916;81917;81918;81919 3297;25611;26650;62276;75293;81915;81919 Q96RS6 Q96RS6 5 5 5 NudC domain-containing protein 1 NUDCD1 sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 1 5 2 1 5 2 1 5 2 13.6 13.6 13.6 66.755 583 583 0 20.452 By matching By MS/MS By MS/MS 0.53891 0.60324 36.109 7 3 Median NaN 0.52703 NaN NaN 0.57959 NaN NaN 34.664 NaN 1 5 1 0 3 0 Median Median Median 3.6 13.6 5.5 142220000 101500000 40722000 12755000 8193000 4561700 106000000 80578000 25427000 23461000 12727000 10734000 1815 2814;4350;8972;10951;13302 True;True;True;True;True 2877;4440;9152;11162;13590 9874;9875;15254;31728;38462;38463;38464;46574 12619;12620;19579;40258;48660;48661;58749 12620;19579;40258;48660;58749 Q96RU2 Q96RU2 2 2 2 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28 USP28 sp|Q96RU2|UBP28_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP28 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 122.49 1077 1077 0.00093153 3.0422 By MS/MS By MS/MS By matching 1.2512 1.3627 11.369 6 0 Leave out requantified 1.3971 1.0779 1.1535 1.4736 1.2021 1.1958 0.30541 6.3688 72.581 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 3 3 3 1585300000 671420000 913900000 510900000 208970000 301930000 640910000 321210000 319700000 433510000 141240000 292270000 1816 5410;15311 True;True 5516;15641 18753;18754;18755;53403;53404;53405 23898;67499 23898;67499 Q96S19 Q96S19 2 2 2 UPF0585 protein C16orf13 C16orf13 sp|Q96S19|MTL26_HUMAN Methyltransferase-like 26 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL26 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 12.3 12.3 12.3 22.578 204 204 0 10.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92874 0.97794 33.15 8 5 Median 1.1608 0.8876 0.84555 1.2201 0.9428 0.84016 10.272 48.129 6.4616 3 3 2 2 2 1 Plateau Median Median 7.4 12.3 7.4 90813000 50921000 39892000 31624000 13086000 18538000 38060000 26297000 11762000 21130000 11538000 9591900 1817 440;2877 True;True 449;2942 1505;1506;1507;1508;1509;1510;1511;10124 1970;1971;1972;1973;1974;1975;12946 1973;12946 Q96S44 Q96S44 5 5 5 TP53-regulating kinase TP53RK sp|Q96S44|PRPK_HUMAN EKC/KEOPS complex subunit TP53RK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TP53RK PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 4 3 4 4 3 4 4 3 27.3 27.3 27.3 28.16 253 253 0 46.95 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87626 0.94501 11.397 15 9 Leave out requantified 0.90272 0.58996 0.92057 0.93266 0.67318 0.96355 30.773 83.25 54.522 5 6 4 2 6 1 Median Median Median 27.3 20.2 20.2 434750000 255220000 179530000 200850000 112070000 88776000 126320000 86178000 40141000 107580000 56970000 50614000 1818 435;1495;3059;3060;5114 True;True;True;True;True 444;1533;3127;3128;5212 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protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBL7 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 5.8 5.8 5.8 40.51 380 380 0 3.7795 By matching By MS/MS By MS/MS 0.8418 1.3355 22.182 5 2 Linear NaN 0.89919 1.0587 NaN 1.0144 1.0866 NaN 16.265 34.01 1 2 2 0 1 1 Median Median Median 3.4 5.8 5.8 122220000 63611000 58605000 10694000 5168700 5525000 54970000 29784000 25186000 56552000 28658000 27894000 1820 9238;17290 True;True 9426;17649 32752;32753;60345;60346;60347 41575;41576;76496 41575;76496 Q96SB4;Q9UPE1 Q96SB4 8;1 8;1 6;0 SRSF protein kinase 1 SRPK1 sp|Q96SB4|SRPK1_HUMAN SRSF protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRPK1 PE=1 SV=2 2 8 8 6 6 7 6 6 7 6 5 5 5 18.8 18.8 16.2 74.324 655 655;567 0 39.219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99749 1.1274 15.258 22 13 Leave out requantified 0.77409 1.1202 1.0706 0.84801 1.2331 1.1073 121.44 10.549 17.525 7 7 8 5 3 5 Median Leave out requantified Leave out requantified 14.2 15.6 14.4 449260000 250820000 198430000 123150000 76220000 46934000 147360000 84073000 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12.7 12.7 59.058 537 537 0 33.163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.983 1.0326 0.29646 14 8 Leave out requantified 0.983 0.78135 1.5526 1.0326 0.84747 1.6035 14.62 20.289 101.32 4 4 6 2 2 4 Median Median Median 7.6 8 9.3 691530000 355890000 335630000 192490000 99269000 93220000 233350000 130710000 102640000 265690000 125910000 139780000 1857 2418;6590;11327;11886;12658;13980;15864 True;True;True;True;True;True;True 2475;6714;11543;12142;12934;14277;16204 8446;22719;39688;39689;39690;41690;41691;41692;44367;48893;48894;48895;55356;55357;55358 10868;28914;50170;50171;52627;52628;52629;55915;61630;61631;61632;61633;61634;70012;70013;70014 10868;28914;50170;52629;55915;61632;70014 Q99832 Q99832 30 30 30 T-complex protein 1 subunit eta CCT7 sp|Q99832|TCPH_HUMAN T-complex protein 1 subunit eta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCT7 PE=1 SV=2 1 30 30 30 30 29 28 30 29 28 30 29 28 67.8 67.8 67.8 59.366 543 543 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85546 0.93563 17.491 150 39 Leave out requantified 0.79503 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EBNA1BP2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2.9 2.9 2.9 34.852 306 306 0.0048246 2.4096 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92156 1.0006 27.19 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 1 0 Median Median Median 2.6 2.9 2.6 62316000 32877000 29439000 22622000 11535000 11087000 12070000 6236800 5833000 27624000 15105000 12520000 1860 9163;17620 True;True 9348;17982 32422;61445;61446;61447 41171;77937;77938;77939 41171;77938 Q99873 Q99873 5 5 5 Protein arginine N-methyltransferase 1 PRMT1 sp|Q99873|ANM1_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT1 PE=1 SV=3 1 5 5 5 3 2 4 3 2 4 3 2 4 18.9 18.9 18.9 42.461 371 371 0 14.311 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96408 1.0429 24.444 9 4 Leave out requantified 0.84142 0.47676 0.77364 0.94913 0.57587 0.8392 32.403 5.4094 43.988 3 2 4 1 1 2 Median Median Median 11.3 7.3 15.4 252040000 135550000 116490000 81315000 40586000 40729000 68447000 41120000 27327000 102280000 53842000 48434000 1861 1126;2466;2934;6399;9143 True;True;True;True;True 1157;2524;3000;6522;9327 3928;3929;8623;8624;10320;10321;10322;22099;32352 5137;5138;11086;13198;13199;13200;13201;13202;13203;28099;41071 5137;11086;13199;28099;41071 Q99933 Q99933 6 6 6 BAG family molecular chaperone regulator 1 BAG1 sp|Q99933|BAG1_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAG1 PE=1 SV=4 1 6 6 6 3 5 3 3 5 3 3 5 3 19.7 19.7 19.7 38.778 345 345 0 19.339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0721 1.1186 24.43 11 6 Leave out requantified 1.1669 0.75895 1.0721 1.2676 0.87144 1.1186 98.77 22.272 19.811 3 5 3 2 3 1 Median Median Plateau 13.3 17.1 10.7 452050000 239600000 212450000 117030000 51848000 65185000 184220000 105830000 78392000 150800000 81920000 68877000 1862 2622;4060;7244;7245;7875;9158 True;True;True;True;True;True 2680;4142;7385;7386;8023;9343 9197;14308;25453;25454;25455;25456;25457;27656;27657;27658;27659;32406 11765;18302;32312;32313;32314;32315;32316;35130;35131;35132;35133;41153 11765;18302;32312;32315;35133;41153 Q99961 Q99961 14 14 12 Endophilin-A2 SH3GL1 sp|Q99961|SH3G1_HUMAN Endophilin-A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH3GL1 PE=1 SV=1 1 14 14 12 13 11 13 13 11 13 11 9 11 41 41 35.1 41.489 368 368 0 102.14 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86581 0.89646 20.14 43 19 Leave out requantified 0.86687 0.84842 0.86473 0.94496 0.92589 0.89906 24.729 16.916 19.923 15 13 15 7 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.5 37 40.2 2559900000 1370000000 1189900000 881360000 475360000 406000000 767290000 397430000 369860000 911220000 497200000 414020000 1863 1651;3910;6898;9272;11066;12329;12653;12688;12689;12849;13179;13180;15642;16890 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1691;3992;7032;9460;11278;12598;12929;12965;12966;13128;13466;13467;15977;17242 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5962;14166;17473;38146 Q9BRP1 Q9BRP1 3 3 3 Programmed cell death protein 2-like PDCD2L sp|Q9BRP1|PDD2L_HUMAN Programmed cell death protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD2L PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 3 2 1 3 2 1 3 2 14.5 14.5 14.5 39.416 358 358 0 9.616 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0578 1.2729 44.343 6 3 Median NaN 0.9843 1.145 NaN 1.2283 1.1817 NaN 34.158 85.963 1 3 2 1 2 0 Median Median Median 6.4 14.5 12 113100000 53727000 59370000 18402000 5686600 12716000 51740000 28632000 23108000 42954000 19408000 23547000 1882 3497;9813;14782 True;True;True 3570;10007;15099 12289;12290;12291;12292;34696;34697;51644 15735;15736;15737;15738;15739;44012;44013;65247 15738;44012;65247 Q9BRP8 Q9BRP8 3 3 3 Partner of Y14 and mago WIBG sp|Q9BRP8|PYM1_HUMAN Partner of Y14 and mago OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYM1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 27 27 27 22.655 204 204 0 27.696 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97416 1.0934 19.232 15 6 Leave out requantified 0.97416 1.0062 0.86788 1.0934 1.174 0.93186 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complex GINS protein SLD5, N-terminally processed GINS4 sp|Q9BRT9|SLD5_HUMAN DNA replication complex GINS protein SLD5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 19.7 19.7 19.7 26.047 223 223 0 17.04 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95538 0.9962 41.427 8 1 Leave out requantified 0.81964 0.69588 1.0077 0.86857 0.77827 1.0109 19.389 74.647 29.009 2 3 3 0 1 0 Median Median Leave out requantified 14.8 19.7 19.7 303680000 150270000 153410000 67603000 35925000 31678000 119760000 63478000 56282000 116320000 50864000 65455000 1885 3444;15609;16087 True;True;True 3516;15942;16429 12111;12112;54447;54448;54449;56118;56119;56120 15503;15504;15505;15506;68873;68874;70959;70960;70961;70962 15504;68874;70962 Q9BRX2 Q9BRX2 7 7 7 Protein pelota homolog PELO sp|Q9BRX2|PELO_HUMAN Protein pelota homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PELO PE=1 SV=2 1 7 7 7 5 5 6 5 5 6 5 5 6 19.2 19.2 19.2 43.359 385 385 0 13.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99036 1.1116 11.776 15 5 Leave out requantified 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Median Median Median 11.1 18.5 11.1 61758000 39334000 22424000 16285000 11266000 5019400 27684000 19299000 8385100 17789000 8769600 9019100 1887 6382;9592;13864 True;True;True 6504;9784;14160 22045;33995;33996;33997;48527;48528;48529 28019;43155;43156;61172;61173;61174 28019;43156;61173 Q9BS26 Q9BS26 2 2 2 Endoplasmic reticulum resident protein 44 ERP44 sp|Q9BS26|ERP44_HUMAN Endoplasmic reticulum resident protein 44 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERP44 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 4.7 4.7 4.7 46.971 406 406 0 4.6862 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67192 0.69429 48.02 7 2 Median 0.67192 0.55708 1.342 0.69429 0.5891 1.3637 57.849 3.0727 4.7995 3 2 2 1 0 1 Median Median Median 4.7 3 4.7 89671000 45477000 44194000 33332000 15996000 17337000 23928000 16305000 7622600 32411000 13176000 19235000 1888 774;16617 True;True 793;16965 2733;2734;57901;57902;57903;57904;57905 3580;3581;73330;73331;73332;73333;73334 3580;73334 Q9BSC4 Q9BSC4 1 1 1 Nucleolar protein 10 NOL10 sp|Q9BSC4|NOL10_HUMAN Nucleolar protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOL10 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 80.301 688 688 0.0026619 2.522 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.935 2.0363 44.683 3 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 1 Median Median Median 1.5 1.5 1.5 44601000 17264000 27337000 14964000 6411400 8552400 13749000 5067100 8681800 15888000 5785300 10103000 1889 9977 True 10174 35256;35257;35258 44710;44711;44712;44713 44712 Q9BSD7 Q9BSD7 4 4 4 Cancer-related nucleoside-triphosphatase NTPCR sp|Q9BSD7|NTPCR_HUMAN Cancer-related nucleoside-triphosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NTPCR PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 4 29.5 29.5 29.5 20.713 190 190 0 17.372 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73501 0.79327 9.8221 13 5 Leave out requantified 0.69825 0.75826 0.74589 0.74004 0.87695 0.79973 10.23 7.7094 79.273 3 5 5 1 2 2 Median Median Median 23.2 23.2 29.5 259290000 143070000 116220000 69610000 38660000 30950000 92304000 52990000 39314000 97375000 51418000 45957000 1890 6090;7196;13413;14903 True;True;True;True 6206;7336;13702;15223 21108;21109;21110;21111;21112;25236;46928;46929;46930;46931;52026;52027;52028 26853;26854;26855;26856;32078;59191;59192;59193;59194;65746;65747;65748;65749;65750;65751 26853;32078;59192;65749 Q9BSH4 Q9BSH4 3 3 3 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 TACO1 sp|Q9BSH4|TACO1_HUMAN Translational activator of cytochrome c oxidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACO1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 14.8 14.8 14.8 32.477 297 297 0 11.362 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4355 1.6619 101.87 7 2 Median 0.62427 0.91612 2.214 0.69947 1.0348 2.2948 42.693 67.002 88.554 2 2 3 1 0 1 Median Median Median 14.8 14.8 14.8 172730000 80391000 92344000 41986000 25945000 16041000 61045000 31833000 29212000 69704000 22613000 47091000 1891 853;854;6337 True;True;True 874;875;6459 2984;2985;2986;2987;2988;21903;21904;21905 3906;3907;3908;3909;27841 3907;3908;27841 Q9BSJ2 Q9BSJ2 1 1 1 Gamma-tubulin complex component 2 TUBGCP2 sp|Q9BSJ2|GCP2_HUMAN Gamma-tubulin complex component 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.4 1.4 1.4 102.53 902 902 0.00093633 3.0984 By MS/MS By MS/MS 0.58158 0.60359 32.351 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 1.4 1.4 0 22750000 15109000 7641500 13424000 7655800 5768600 9325700 7452800 1872900 0 0 0 1892 15475 True 15807 53931;53932 68185;68186 68185 Q9BSJ8 Q9BSJ8 1 1 1 Extended synaptotagmin-1 ESYT1 sp|Q9BSJ8|ESYT1_HUMAN Extended synaptotagmin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESYT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.4 1.4 1.4 122.85 1104 1104 0 3.8833 By matching By matching By MS/MS 0.92299 0.97925 17.142 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 1.4 1.4 1.4 23478000 12481000 10996000 7901800 4783700 3118100 4927300 2250200 2677100 10648000 5447400 5201100 1893 10496 True 10697 36985;36986;36987 46863 46863 Q9BSL1 Q9BSL1 2 2 2 Ubiquitin-associated domain-containing protein 1 UBAC1 sp|Q9BSL1|UBAC1_HUMAN Ubiquitin-associated domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBAC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 5.2 5.2 5.2 45.338 405 405 0 4.1087 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95022 1.0199 49.309 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 0 0 Median Median Median 2.2 2.2 5.2 41355000 19934000 21421000 12085000 4332100 7752900 13523000 7004300 6518500 15747000 8597700 7149400 1894 1422;11374 True;True 1456;11590 4911;39823;39824;39825 6394;50324;50325 6394;50324 Q9BT73 Q9BT73 4 4 4 Proteasome assembly chaperone 3 PSMG3 sp|Q9BT73|PSMG3_HUMAN Proteasome assembly chaperone 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMG3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 50 50 50 13.104 122 122 0 24.047 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.47177 0.52973 56.83 8 6 Median 0.45437 0.34233 0.65486 0.51291 0.39458 0.70652 86.883 23.305 27.489 3 3 2 2 3 1 Median Median Median 50 39.3 32 272200000 177750000 94448000 130870000 78400000 52469000 78573000 59010000 19564000 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3156;3157;3158;3159;3160;3161;6173;6174;6175;6176;6762;6763;6764;6765;6766;6767;7139;7140;7141;7142;7143;7144;7145;7146;7147;16904;16905;16906;16907;16908;16909;22141;32654;32655;50205;50206;51219;51550;52285;52286;52287;52288;52289;52290;52291;56174;56175;56176;56177;56843;56844;56845;56846;56847;56848;56849;56850;56851;56852;57856;57857;57858;57859;57860;59682;59683;59684;69272;69273;69274;69275;69276;69277;69278;69279;75579;75580;75581;75582;75583;75584;75585;75586;75587;75588 3161;6173;6763;7139;16908;22141;32655;50205;51219;51550;52290;56176;56848;57860;59683;69272;75585 Q9BTA9 Q9BTA9 1 1 1 WW domain-containing adapter protein with coiled-coil WAC sp|Q9BTA9|WAC_HUMAN WW domain-containing adapter protein with coiled-coil OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WAC PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.9 2.9 2.9 70.723 647 647 0 5.0482 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77689 0.81237 14.677 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 2.9 2.9 2.9 70137000 42845000 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complex-binding protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MCMBP PE=1 SV=2 1 13 13 13 13 10 9 13 10 9 13 10 9 27.6 27.6 27.6 72.979 642 642 0 88.684 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.61866 0.6758 58.863 31 13 Leave out requantified 0.86689 0.62891 0.92669 0.93567 0.6994 0.94512 76.121 56.105 28.572 12 10 9 6 2 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.6 20.1 20.7 989000000 599730000 389270000 353590000 214210000 139380000 335520000 210550000 124970000 299880000 174970000 124920000 1899 1548;1865;2067;2929;2996;3269;5394;8970;10776;10805;12443;12639;15181 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1586;1909;2113;2995;3063;3340;5499;9150;10986;11016;12713;12914;15507 5364;5365;6441;6442;6443;7158;7159;7160;7161;10300;10301;10536;10537;11491;11492;11493;18694;18695;18696;31725;31726;37902;37903;38001;38002;38003;43594;43595;44289;44290;44291;44292;52925;52926;52927 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134;912;1692;5629;6293;7502;8153;8381;9402;9636;9915;11364;13204;15149;16085;17375;18096 426;427;428;3114;3115;3116;5676;5677;5678;5679;5680;19142;19143;21382;21383;21384;25858;25859;28051;28052;28878;28879;28880;32666;32667;32668;32669;32670;32671;33481;33482;34406;34407;34408;34409;34410;34411;34412;39094;39095;39096;39097;39098;39099;45250;45251;51811;51812;51813;54975;59367;59368;59369;61825;61826;61827 561;562;563;4086;4087;4088;7397;7398;7399;7400;7401;7402;7403;24379;27208;27209;27210;32800;32801;35603;35604;36627;36628;36629;41466;41467;41468;41469;41470;41471;41472;41473;42524;42525;43646;43647;43648;43649;43650;43651;43652;43653;49428;49429;49430;49431;49432;49433;57024;57025;57026;57027;65479;65480;65481;69522;75240;75241;75242;75243;75244;75245;78396;78397;78398 561;4087;7397;24379;27209;32800;35603;36628;41466;42525;43649;49431;57025;65480;69522;75243;78397 Q9BTX7 Q9BTX7 1 1 1 Alpha-tocopherol transfer protein-like TTPAL sp|Q9BTX7|TTPAL_HUMAN Alpha-tocopherol transfer protein-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTPAL PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.6 2.6 2.6 38.515 342 342 0.0090478 2.246 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1417 1.171 4.1149 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.6 2.6 2.6 9291500 4472100 4819400 0 0 0 4256000 2045000 2210900 5035600 2427100 2608500 1904 1579 True 1618 5451;5452;5453 7130;7131;7132;7133 7133 Q9BTY7 Q9BTY7 6 6 6 Protein HGH1 homolog HGH1 sp|Q9BTY7|HGH1_HUMAN Protein HGH1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HGH1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 4 5 4 4 5 4 4 5 4 19.2 19.2 19.2 42.129 390 390 0 12.612 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92961 0.97678 0.1777 12 8 Leave out requantified 0.83718 0.82076 0.98902 0.87882 0.89039 0.97555 38.644 29.477 54.25 4 5 3 3 3 2 Median Median Median 10.5 15.9 10.5 320100000 185350000 134750000 83323000 47530000 35792000 170770000 103260000 67506000 66008000 34559000 31450000 1905 250;428;796;1056;3829;10398 True;True;True;True;True;True 252;437;815;1081;3910;10599 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357;13137;13138;13139;15754;18135;18136;18137;18138;18139;18140;18141;18142;18979;18980;20597;20598;20599;20600;20601;20602;28362;28363;28364;28693;28694;28695;31249;31250;31251;33229;33230;33231;33232;33233;33234;33235;33236;33237;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;43024;43025;43026;43027;43561;43562;43563;43564;43565;43566;64451;64452;64453 476;16832;16833;16834;16835;20227;23109;23110;23111;23112;23113;23114;23115;24174;24175;26205;26206;26207;26208;26209;26210;26211;26212;35997;35998;35999;36000;36001;36002;36428;36429;36430;36431;36432;39701;39702;39703;42191;42192;42193;42194;42195;42196;42197;42198;42199;42200;42201;42202;42203;54216;54217;54218;54219;54220;54221;54222;54223;54224;54225;54226;54227;54228;54229;54230;54231;54232;54233;54234;54235;54236;54237;54921;54922;54923;54924;54925;54926;54927;54928;54929;54930;54931;81598;81599;81600;81601 476;16834;20227;23109;23114;24174;26207;26208;35999;36428;39702;42191;54235;54925;81601 36;37;38 257;299;300 Q9BUH6 Q9BUH6 2 2 2 Protein PAXX C9orf142 sp|Q9BUH6|PAXX_HUMAN Protein PAXX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAXX PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.8 9.8 9.8 21.639 204 204 0 4.4711 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85091 0.89209 1.9133 6 0 Leave out requantified 0.87879 0.68939 0.86524 0.96061 0.77907 0.89102 4.0144 21.071 1.7437 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 9.8 9.8 9.8 119560000 65175000 54381000 39256000 22034000 17222000 38961000 21188000 17772000 41340000 21953000 19386000 1909 1021;4896 True;True 1046;4992 3540;3541;3542;17116;17117;17118 4621;4622;4623;21916;21917;21918 4623;21918 Q9BUI4 Q9BUI4 2 2 2 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3 POLR3C sp|Q9BUI4|RPC3_HUMAN DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3C PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 3.6 3.6 3.6 60.611 534 534 0.00047824 3.3225 By MS/MS By MS/MS 0.75075 0.76397 7.5979 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 0 1.7 36037000 19414000 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death protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD10 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 7 7 5 7 7 5 7 7 38.2 38.2 38.2 24.701 212 212 0 55.826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77322 0.85586 5.3258 18 9 Leave out requantified 0.75525 0.88414 0.83835 0.82326 1.0041 0.88994 5.1018 40.252 4.3897 4 6 8 0 4 5 Leave out requantified Median Leave out requantified 34.9 38.2 38.2 719670000 389480000 330190000 149150000 87639000 61512000 261060000 135600000 125460000 309460000 166240000 143220000 1912 346;4162;10007;11366;14138;15091;17506 True;True;True;True;True;True;True 351;4251;10205;11582;14436;15414;17868 1174;1175;1176;1177;14643;14644;35355;35356;35357;39796;39797;39798;49389;49390;52625;52626;52627;52628;61081;61082;61083 1540;1541;1542;1543;1544;18783;18784;44827;44828;44829;44830;44831;50291;50292;50293;50294;50295;50296;62268;62269;66490;66491;66492;66493;77455;77456;77457 1544;18784;44831;50296;62269;66492;77455 Q9BUQ8 Q9BUQ8 9 9 9 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 DDX23 sp|Q9BUQ8|DDX23_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX23 PE=1 SV=3 1 9 9 9 7 8 8 7 8 8 7 8 8 15.2 15.2 15.2 95.581 820 820 0 49.875 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.90219 0.99087 12.487 23 10 Leave out requantified 0.94037 0.77766 1.0435 1.0406 0.91015 1.0946 11.367 13.288 21.794 7 9 7 3 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 12.8 13.8 14.3 902590000 481160000 421430000 264830000 147170000 117660000 369710000 209740000 159970000 268050000 124250000 143790000 1913 1276;2338;2367;3414;3833;5804;7878;12036;12646 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1310;2394;2423;3486;3914;5916;8026;12293;12922 4445;4446;4447;8179;8281;8282;8283;11984;11985;11986;13566;13567;13568;13569;20108;20109;20110;27666;27667;27668;42155;44322;44323;44324;44325 5784;5785;10538;10671;10672;10673;15341;15342;17374;17375;17376;17377;17378;17379;25585;25586;25587;25588;25589;35142;35143;35144;53166;55871;55872;55873;55874 5784;10538;10673;15342;17378;25585;35144;53166;55872 Q9BV20 Q9BV20 5 5 5 Methylthioribose-1-phosphate isomerase MRI1 sp|Q9BV20|MTNA_HUMAN Methylthioribose-1-phosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRI1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 1 3 2 1 3 2 1 3 14.4 14.4 14.4 39.149 369 369 0 24.837 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.4188 5.4232 13.044 4 4 Median NaN NaN 5.5861 NaN NaN 5.2946 NaN NaN 15.299 1 0 3 1 0 3 Median Median Median 5.7 3 9.2 90149000 13966000 76183000 9182700 1839300 7343400 12720000 0 12720000 68246000 12127000 56119000 1914 2472;3127;6497;14311;17003 True;True;True;True;True 2530;3195;6620;14614;17355 8651;10980;10981;10982;22397;49971;59305 11113;14005;14006;14007;28467;63056;75156 11113;14006;28467;63056;75156 Q9BV68 Q9BV68 1 1 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 RNF126 sp|Q9BV68|RN126_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RNF126 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF126 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.3 10.3 10.3 33.861 311 311 0 5.1849 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6999 0.77922 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1948;1949;2389;4093;5991;8767;9064;10501;11421;11522;13058;14381;14484;14982;15043;17299;17363 6592;6593;6594;6595;6596;6597;8163;8164;8165;14149;14150;14151;20343;20344;20345;30233;30234;30235;30236;31420;31421;31422;36384;36385;36386;39285;39286;39287;39623;44742;49233;49234;49235;49561;49562;49563;49564;51247;51248;51249;51250;51455;51456;51457;59089;59090;59091;59328;59329;59330;59331;59332;59333 8558;8559;8560;8561;8562;8563;10522;10523;10524;18100;18101;18102;18103;18104;18105;25874;38422;38423;38424;38425;38426;38427;39909;39910;39911;46112;46113;46114;46115;46116;46117;49668;49669;49670;50108;56393;62068;62069;62532;62533;62534;62535;62536;62537;64699;64700;64701;64702;64703;64980;64981;64982;64983;64984;74881;74882;74883;74884;74885;74886;75186;75187;75188;75189;75190;75191;75192 8560;8561;10524;18100;25874;38427;39909;46114;49670;50108;56393;62069;62532;64702;64983;74882;75186 Q9BVQ7 Q9BVQ7 3 3 3 Spermatogenesis-associated protein 5-like protein 1 SPATA5L1 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hydrolase domain-containing 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDHD5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 6.9 6.9 6.9 46.321 423 423 0 3.6803 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.96438 0.8215 21.432 4 4 Linear NaN 0.64922 NaN NaN 0.6775 NaN NaN 4.9071 NaN 1 2 1 1 2 1 Median Median Median 2.1 6.9 2.1 71355000 36566000 34789000 23230000 12732000 10499000 29001000 15605000 13396000 19123000 8229300 10894000 1934 12338;12566 True;True 12607;12841 43215;44073;44074;44075 54483;55552;55553;55554 54483;55552 Q9BXW9 Q9BXW9 1 1 1 Fanconi anemia group D2 protein FANCD2 sp|Q9BXW9|FACD2_HUMAN Fanconi anemia group D2 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCD2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0.9 0.9 0.9 164.13 1451 1451 0.0065246 2.3226 By MS/MS By MS/MS 0.76294 0.7816 0.017749 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 0.9 0 0.9 9407300 5417300 3990000 4491400 2632000 1859300 0 0 0 4916000 2785300 2130700 1935 2245 True 2300 7830;7831 10117;10118;10119 10117 Q9BXY0 Q9BXY0 1 1 1 Protein MAK16 homolog MAK16 sp|Q9BXY0|MAK16_HUMAN Protein MAK16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAK16 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 6 6 6 35.368 300 300 0.001845 2.9006 By MS/MS By MS/MS 0.83012 0.94607 7.669 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 0 0 Median Median Median 6 6 0 28821000 15173000 13648000 15132000 8567900 6564300 13688000 6605200 7083200 0 0 0 1936 891 True 914 3123;3124 4095;4096 4096 Q9BY32 Q9BY32 3 3 3 Inosine triphosphate pyrophosphatase ITPA sp|Q9BY32|ITPA_HUMAN Inosine triphosphate pyrophosphatase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITPA PE=1 SV=2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 21.6 21.6 21.6 21.445 194 194 0 52.706 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89537 0.96706 125.09 15 5 Leave out requantified 0.83466 0.82624 1.2101 0.91696 0.96706 1.3312 147.75 103.81 39.52 4 6 5 0 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 21.6 21.6 21.6 489610000 259370000 230240000 116990000 54665000 62321000 209950000 130320000 79634000 162680000 74386000 88289000 1937 7399;8414;10148 True;True;True 7542;8581;10348 25992;25993;25994;25995;25996;25997;25998;29531;29532;29533;29534;29535;29536;35839;35840;35841 32988;32989;32990;32991;32992;32993;32994;32995;32996;32997;32998;37451;37452;37453;37454;37455;45440;45441;45442;45443;45444;45445 32990;37451;45442 Q9BY42 Q9BY42 4 4 4 Protein RTF2 homolog RTFDC1 sp|Q9BY42|RTF2_HUMAN Protein RTF2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTFDC1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 3 4 3 3 4 3 3 4 3 18.3 18.3 18.3 33.886 306 306 0 18.826 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1618 1.2991 10.76 11 1 Leave out requantified 1.1582 0.74225 1.2774 1.3204 0.84753 1.3334 8.5492 32.752 3.5551 3 4 4 0 1 0 Median Median Leave out requantified 14.1 18.3 14.1 644810000 302950000 341850000 197370000 91220000 106150000 207110000 111600000 95513000 240320000 100130000 140190000 1938 58;4945;14280;15537 True;True;True;True 59;5041;14583;15869 189;190;191;192;17272;49881;49882;49883;54141;54142;54143;54144;54145;54146 249;250;22112;62939;62940;62941;68458;68459;68460;68461;68462;68463 249;22112;62939;68461 Q9BY44 Q9BY44 12 12 12 Eukaryotic translation initiation factor 2A;Eukaryotic translation initiation factor 2A, N-terminally processed EIF2A sp|Q9BY44|EIF2A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2A PE=1 SV=3 1 12 12 12 12 10 11 12 10 11 12 10 11 31.6 31.6 31.6 64.989 585 585 0 108.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73535 0.82187 22.19 43 7 Leave out requantified 0.79922 0.76989 0.77639 0.87626 0.86443 0.81542 24.946 24.691 18.739 15 15 13 5 1 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.6 23.6 26.5 1993000000 1121800000 871240000 745160000 424780000 320380000 590900000 335260000 255640000 656970000 361750000 295220000 1939 1530;1750;2272;5578;6175;8040;10056;11351;12494;12538;13972;15696 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1568;1793;2327;5688;6291;8198;10255;11567;12766;12812;14269;16031 5309;5310;5311;6016;6017;6018;7945;7946;7947;7948;7949;19356;19357;19358;21375;21376;21377;21378;28214;28215;28216;28217;28218;28219;35494;39759;39760;43764;43765;43766;43767;43768;43769;43960;43961;43962;43963;48877;48878;48879;54755;54756;54757;54758;54759;54760;54761 6930;6931;6932;7875;7876;7877;10259;10260;10261;10262;10263;24653;24654;24655;24656;27198;27199;27200;27201;27202;27203;27204;35802;35803;35804;35805;35806;35807;35808;35809;35810;35811;35812;35813;45025;50248;50249;55192;55193;55194;55195;55196;55197;55198;55199;55200;55424;55425;55426;55427;61611;61612;61613;69253;69254;69255;69256;69257;69258;69259;69260;69261 6930;7876;10260;24653;27198;35808;45025;50249;55198;55427;61611;69255 Q9BYG3 Q9BYG3 1 1 1 MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein NIFK sp|Q9BYG3|MK67I_HUMAN MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIFK PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.4 4.4 4.4 34.222 293 293 0 3.9073 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1563 1.2422 18.439 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4.4 4.4 4.4 34935000 16634000 18301000 10148000 5582900 4565100 12860000 5435700 7424400 11926000 5615000 6311500 1940 3380 True 3452 11893;11894;11895 15223;15224;15225;15226;15227;15228 15227 Q9BYV8 Q9BYV8 2 2 2 Centrosomal protein of 41 kDa CEP41 sp|Q9BYV8|CEP41_HUMAN Centrosomal protein of 41 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP41 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 8.3 8.3 8.3 41.368 373 373 0 11.366 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0851 1.183 16.569 4 3 Median NaN NaN 1.1525 NaN NaN 1.183 NaN NaN 1.4835 1 1 2 1 1 1 Median Median Median 8.3 3.5 8.3 53453000 26032000 27422000 16174000 8849500 7324600 15171000 6934300 8237100 22108000 10248000 11860000 1941 9529;15929 True;True 9721;16271 33792;33793;55591;55592;55593 42907;70315;70316;70317 42907;70317 Q9BZE4 Q9BZE4 2 2 2 Nucleolar GTP-binding protein 1 GTPBP4 sp|Q9BZE4|NOG1_HUMAN Nucleolar GTP-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 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Myotubularin-related protein 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTMR12 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 2 1 2 2 1 2 2 9.5 9.5 9.5 86.147 747 747 0 10.882 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99948 1.0643 29.2 5 1 Leave out requantified NaN 0.79447 1.0754 NaN 0.91467 1.1189 NaN 40.374 7.0756 1 2 2 1 0 0 Median Median Median 2.8 4.3 5 64735000 35278000 29457000 14000000 8992400 5007400 24601000 14133000 10468000 26134000 12152000 13982000 1955 4600;7267;8442;14991 True;True;True;True 4692;7408;8610;15312 16105;25518;25519;29623;52293 20675;32386;37571;66087 20675;32386;37571;66087 Q9GZN8 Q9GZN8 2 2 2 UPF0687 protein C20orf27 C20orf27 sp|Q9GZN8|CT027_HUMAN UPF0687 protein C20orf27 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C20orf27 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 16.7 16.7 16.7 19.291 174 174 0 4.3742 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.55443 0.63965 18.945 7 1 Leave out requantified 0.5337 0.51142 0.7498 0.59969 0.58227 0.79705 28.068 23.908 2.0786 2 3 2 0 1 0 Median Plateau Median 16.7 16.7 16.7 105210000 69593000 35612000 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kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C ILKAP sp|Q9H0C8|ILKAP_HUMAN Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILKAP PE=1 SV=1 1 8 8 8 8 7 6 8 7 6 8 7 6 18.6 18.6 18.6 42.906 392 392 0 29.025 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84444 0.91381 16.491 20 9 Leave out requantified 0.63834 0.78676 0.90656 0.69141 0.87181 0.9259 27.908 15.565 16.423 7 7 6 3 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.6 16.3 14.5 844570000 451140000 393430000 271900000 150930000 120960000 323670000 170910000 152760000 249000000 129290000 119710000 1971 1809;1858;1919;4696;4968;5690;7164;17281 True;True;True;True;True;True;True;True 1853;1902;1964;4789;5065;5801;7304;17640 6202;6203;6204;6422;6423;6648;6649;6650;16433;16434;16435;17345;17346;17347;17348;19738;19739;19740;25133;25134;25135;25136;60317 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0.00093197 3.062 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0051 1.0582 4.7643 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.6 3.6 3.6 31154000 12442000 18712000 11680000 4746200 6933400 7926200 3172000 4754200 11548000 4523900 7024300 1973 3214 True 3284 11299;11300;11301 14449;14450 14450 Q9H0S4 Q9H0S4 1 1 1 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 DDX47 sp|Q9H0S4|DDX47_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX47 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4 4 4 50.646 455 455 0 5.7585 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97484 1.0493 18.74 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 4 4 4 79606000 36605000 43001000 24084000 12587000 11497000 28141000 13639000 14502000 27381000 10378000 17003000 1974 14859 True 15178 51898;51899;51900 65576;65577;65578;65579;65580;65581 65578 Q9H0U4;Q92928 Q9H0U4 7;3 2;1 2;1 Ras-related protein Rab-1B RAB1B sp|Q9H0U4|RAB1B_HUMAN Ras-related protein Rab-1B OS=Homo 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15314;21083;46293;50906;52515;68996;69245 Q9H0W8 Q9H0W8 2 2 2 Protein SMG9 SMG9 sp|Q9H0W8|SMG9_HUMAN Protein SMG9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMG9 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 10 10 10 57.65 520 520 0 3.8231 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88173 1.0089 25.757 6 3 Median 0.88173 0.88032 0.99537 0.9737 1.0186 1.0709 24.918 21.232 46.419 2 2 2 1 1 1 Median Median Median 10 10 10 75109000 46853000 28255000 24283000 16919000 7364100 20338000 11810000 8528600 30487000 18124000 12363000 1976 3369;14848 True;True 3441;15167 11855;11856;11857;51862;51863;51864 15170;15171;15172;15173;65541 15173;65541 395;396 478;480 Q9H1A4 Q9H1A4 3 3 3 Anaphase-promoting complex subunit 1 ANAPC1 sp|Q9H1A4|APC1_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 3 1 1 3 1 1 3 2.1 2.1 2.1 216.5 1944 1944 0 4.7968 By matching By MS/MS By MS/MS 1.0374 1.0623 23.545 5 2 Median NaN NaN 1.053 NaN NaN 1.0722 NaN NaN 26.014 1 1 3 0 0 2 Median Median Plateau 0.5 0.5 2.1 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Q9H1I8 1 1 1 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 ASCC2 sp|Q9H1I8|ASCC2_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASCC2 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.3 1.3 1.3 86.359 757 757 0 3.9036 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98664 1.09 15.602 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 1.3 1.3 1.3 37125000 19408000 17717000 0 0 0 20578000 10327000 10251000 16547000 9080700 7466100 1979 16144 True 16486 56297;56298;56299 71191;71192;71193 71191 Q9H1P3 Q9H1P3 2 2 2 Oxysterol-binding protein-related protein 2 OSBPL2 sp|Q9H1P3|OSBL2_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.6 4.6 4.6 55.201 480 480 0 3.8236 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.055 1.1316 96.026 3 1 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 2.5 2.1 2.5 23639000 13733000 9906000 9488300 3961800 5526500 6359200 3578200 2781000 7791000 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1023;12093 True;False 1048;12350 3546;3547;3548;3549;42338;42339;42340;42341;42342 4630;4631;4632;4633;4634;4635;53383;53384;53385 4631;53385 Q9H211 Q9H211 1 1 1 DNA replication factor Cdt1 CDT1 sp|Q9H211|CDT1_HUMAN DNA replication factor Cdt1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDT1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.5 3.5 3.5 60.39 546 546 0 3.7432 By MS/MS By MS/MS By matching 1.0425 1.1356 39.282 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 3.5 3.5 3.5 84007000 41758000 42249000 22456000 10340000 12115000 25997000 15270000 10727000 35554000 16148000 19406000 1983 421 True 430 1456;1457;1458 1922;1923 1922 397 321 Q9H223 Q9H223 8 7 6 EH domain-containing protein 4 EHD4 sp|Q9H223|EHD4_HUMAN EH domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHD4 PE=1 SV=1 1 8 7 6 8 7 6 7 6 5 6 5 5 15 13.5 12 61.174 541 541 0 39.32 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88968 0.93824 75.379 16 13 Median 0.87056 0.98135 0.85169 0.90655 1.1063 0.86354 76.401 93.189 26.569 7 6 3 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out requantified Leave out requantified 5.5 5.5 3.2 425290000 201140000 224150000 174760000 82188000 92574000 131370000 74200000 57168000 119160000 44756000 74409000 1988 1078;2020;2184;5875;12714;15281;17057;17930 True;True;True;True;True;True;True;True 1103;2066;2234;5988;12991;15611;17412;18298 3740;3741;6982;6983;6984;7569;20333;44550;44551;53291;53292;59522;59523;62491;62492;62493;62494;62495;62496 4903;9028;9029;9030;9031;9032;9033;9783;25865;56165;56166;67357;75475;75476;79195;79196;79197;79198;79199;79200;79201;79202;79203 4903;9032;9783;25865;56165;67357;75476;79196 Q9H2P0 Q9H2P0 1 1 1 Activity-dependent neuroprotector homeobox protein ADNP sp|Q9H2P0|ADNP_HUMAN Activity-dependent neuroprotector homeobox protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADNP PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.9 0.9 0.9 123.56 1102 1102 0.0018399 2.8847 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99979 1.0337 34.938 5 4 Median 1.0586 NaN 0.71722 1.0917 NaN 0.73264 7.7122 NaN 56.673 2 1 2 2 0 2 Median Median Median 0.9 0.9 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protein 3 PCNXL3 sp|Q9H6A9|PCX3_HUMAN Pecanex-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCNX3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1.1 1.1 1.1 222.04 2034 2034 0 3.9117 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.83151 0.89594 12.054 16 0 Median 0.79066 0.87834 0.82615 0.8475 0.94817 0.85497 9.6123 12.016 9.4734 5 7 4 0 0 0 Median Median Median 1.1 1.1 1.1 34076000000 18803000000 15273000000 9611900000 5356300000 4255700000 13892000000 7702500000 6189800000 10572000000 5744200000 4827800000 2009 10930 True 11141 38387;38388;38389;38390;38391;38392;38393;38394;38395;38396;38397;38398;38399;38400;38401;38402 48588;48589;48590;48591;48592;48593;48594;48595;48596;48597 48595 Q9H6F5 Q9H6F5 4 4 4 Coiled-coil domain-containing protein 86 CCDC86 sp|Q9H6F5|CCD86_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 86 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC86 PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 2 4 2 2 4 2 2 4 18.1 18.1 18.1 40.235 360 360 0 7.6421 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0213 1.1099 27.415 8 4 Leave out requantified 0.94947 0.88921 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3 RPAP3 sp|Q9H6T3|RPAP3_HUMAN RNA polymerase II-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPAP3 PE=1 SV=2 1 10 10 10 4 8 7 4 8 7 4 8 7 18.2 18.2 18.2 75.718 665 665 0 30.185 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99481 1.0816 28.656 19 7 Leave out requantified 0.79786 0.99481 0.89227 0.84567 1.0964 0.87616 29.112 31.349 24.771 4 8 7 2 1 4 Median Leave out requantified Leave out requantified 9.5 15.6 14.1 330120000 176470000 153660000 73083000 40924000 32159000 153310000 78275000 75030000 103730000 57267000 46466000 2012 628;5950;5957;6254;7903;8145;12140;12692;17242;17243 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 641;6064;6071;6370;8051;8304;12398;12969;17601;17602 2182;2183;2184;20588;20589;20618;21635;21636;21637;27752;28586;28587;28588;42521;44490;60186;60187;60188;60189 2873;26196;26197;26237;27517;27518;27519;35261;36284;36285;36286;36287;36288;53625;56086;76302;76303;76304;76305 2873;26196;26237;27518;35261;36285;53625;56086;76303;76304 Q9H6Z4 Q9H6Z4 2 2 2 Ran-binding protein 3 RANBP3 sp|Q9H6Z4|RANB3_HUMAN Ran-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 4.8 4.8 4.8 60.209 567 567 0 7.276 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.54155 0.59753 49.149 5 3 Median NaN 0.38177 0.76365 NaN 0.43479 0.80948 NaN 62.795 42.934 1 2 2 1 1 1 Median Median Median 2.1 4.8 4.8 75207000 51568000 23639000 13608000 9042300 4565600 35467000 26634000 8832400 26132000 15891000 10241000 2013 8305;10558 True;True 8470;10764 29174;29175;29176;37180;37181;37182 37019;37020;37021;47107;47108;47109 37020;47107 Q9H773 Q9H773 5 5 5 dCTP pyrophosphatase 1 DCTPP1 sp|Q9H773|DCTP1_HUMAN dCTP pyrophosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCTPP1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 22.9 22.9 22.9 18.681 170 170 0 26.995 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80244 0.91133 25.601 13 6 Leave out requantified 0.69011 0.50811 0.77695 0.74402 0.55751 0.79095 49.294 32.319 42.09 4 5 4 2 2 2 Median Leave out requantified Median 22.9 22.9 22.9 387640000 225490000 162150000 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True;True;True;True;True 9012;10281;15173;16826;18417 31210;31211;31212;35585;35586;35587;51885;57440;57441;57442;57443;57444;62846;62847;62848 39656;45149;65563;72718;72719;72720;72721;79625;79626;79627 39656;45149;65563;72720;79626 Q9H7D0 Q9H7D0 3 3 3 Dedicator of cytokinesis protein 5 DOCK5 sp|Q9H7D0|DOCK5_HUMAN Dedicator of cytokinesis protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DOCK5 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.2 3.2 3.2 215.31 1870 1870 0 6.7248 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.084 1.086 25.546 5 4 Median NaN 1.1588 1.3893 NaN 1.2421 1.3263 NaN 18.998 35.058 1 2 2 1 2 1 Median Median Median 1.1 2.5 1.1 67132000 24212000 42921000 6224300 3872400 2351900 46945000 14166000 32779000 13964000 6173400 7790200 2016 4984;10937;14332 True;True;True 5081;11148;14635 17395;17396;38424;50031;50032;50033 22258;22259;48618;63130;63131;63132 22259;48618;63130 Q9H832 Q9H832 7 7 7 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z UBE2Z sp|Q9H832|UBE2Z_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z OS=Homo sapiens 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protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKZF1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 80.926 726 726 0 3.8683 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82666 0.81784 5.2147 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 1 Median Median Median 2.1 1.2 1.2 13674000 7897000 5777500 8165700 4921400 3244300 0 0 0 5508800 2975600 2533200 2018 10342;11291 True;True 10543;11507 36508;39582;39583 46268;50067;50068 46268;50068 Q9H8Y8 Q9H8Y8 4 4 4 Golgi reassembly-stacking protein 2 GORASP2 sp|Q9H8Y8|GORS2_HUMAN Golgi reassembly-stacking protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GORASP2 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 8.6 8.6 8.6 47.145 452 452 0 14.91 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.86719 0.97494 24.108 10 2 Leave out requantified 0.8959 0.83941 0.89951 0.99975 0.95076 0.91514 25.525 33.586 27.207 3 3 4 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Median 8.6 8.6 8.6 438050000 219870000 218180000 138350000 72371000 65982000 127620000 60348000 67275000 172070000 87147000 84923000 2019 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 1.8 1.9 6591400 2559400 4032000 0 0 0 0 0 0 6591400 2559400 4032000 2025 9739;10933 True;True 9931;11144 34462;38414 43717;48608 43717;48608 Q9H9H4 Q9H9H4 1 1 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 37B VPS37B sp|Q9H9H4|VP37B_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 37B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS37B PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.9 3.9 3.9 31.307 285 285 0.0026631 2.5315 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 3.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2026 11458 True 11681 40124 50697 50697 Q9H9Q2 Q9H9Q2 6 6 6 COP9 signalosome complex subunit 7b COPS7B sp|Q9H9Q2|CSN7B_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 7b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS7B PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 26.5 26.5 26.5 29.622 264 264 0 111.93 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87937 0.96345 21.006 23 10 Leave out requantified 0.95043 0.80245 0.95951 1.0296 0.87778 0.98397 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5695;5696;5697;5698;9668;9669;9670;9671;9672;9673;26525;29667;29668;29669;34468;34469;34470;34471;34472;35173;35174;35175;36118;36119;36120;36629;36630;36631;39843;42827;42828;42829;48587;48738;48739;48740;50765;50766;50767;53445;53446;56070;56071;56072;60645;60646;60647 7424;7425;7426;7427;7428;12368;12369;12370;12371;12372;12373;33693;37635;37636;37637;43723;43724;43725;43726;43727;44613;44614;44615;44616;44617;44618;45781;45782;46422;46423;46424;50343;54003;54004;54005;61245;61441;61442;61443;64067;64068;64069;64070;67547;67548;70907;76901;76902 7424;12373;33693;37636;43725;43727;44616;45781;46422;50343;54004;61245;61443;64070;67548;70907;76901 Q9HAV7 Q9HAV7 2 2 2 GrpE protein homolog 1, mitochondrial GRPEL1 sp|Q9HAV7|GRPE1_HUMAN GrpE protein homolog 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GRPEL1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 10.1 10.1 10.1 24.279 217 217 0 4.3821 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.68732 0.81372 7.6428 5 3 Median NaN 0.66812 0.70122 NaN 0.79498 0.75604 NaN 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357;2579;3830;3831;3866;8435;8436;8647;8664;8991;14397;14719;15529;15530;15714;17994;18404;18405 1190;1191;1192;1193;8851;13235;13236;13237;13238;13239;13240;13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249;13374;13375;13376;13377;13378;13379;29067;29068;29069;29070;29071;29072;29746;29747;29748;29749;29806;29807;29808;29809;29810;29811;31117;31118;31119;31120;31121;31122;31123;31124;49284;49285;49286;50357;50358;50359;53021;53022;53023;53024;53025;53026;53027;53028;53029;53030;53643;53644;53645;61486;61487;61488;61489;62813;62814;62815;62816;62817;62818;62819;62820 1561;1562;1563;1564;11347;16957;16958;16959;16960;16961;16962;16963;16964;16965;16966;16967;16968;16969;16970;16971;16972;16973;16974;16975;16976;16977;17147;17148;17149;17150;17151;17152;17153;36887;36888;36889;36890;36891;36892;36893;36894;36895;37741;37742;37743;37744;37745;37746;37818;37819;37820;37821;37822;37823;37824;37825;39535;39536;39537;39538;39539;39540;39541;39542;39543;39544;39545;39546;39547;62130;62131;62132;62133;62134;62135;63539;63540;67008;67009;67010;67011;67012;67013;67014;67015;67016;67017;67018;67019;67020;67021;67022;67023;67024;67805;67806;67807;77989;77990;77991;77992;77993;77994;77995;79587;79588;79589;79590;79591;79592;79593;79594;79595 1562;11347;16968;16969;17147;36888;36889;37743;37825;39540;62132;63540;67016;67806;77993;79590;79592 398 127 Q9HB90;Q9NQL2 Q9HB90;Q9NQL2 2;1 2;1 2;1 Ras-related GTP-binding protein C;Ras-related GTP-binding protein D RRAGC;RRAGD sp|Q9HB90|RRAGC_HUMAN Ras-related GTP-binding protein C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRAGC PE=1 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4620;11179;11180;31956;51998;69779;69780;82300;82301;82302;82303;82304 4620;11179;31956;51998;69780;82302 Q9HBM1 Q9HBM1 3 3 3 Kinetochore protein Spc25 SPC25 sp|Q9HBM1|SPC25_HUMAN Kinetochore protein Spc25 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPC25 PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 18.8 18.8 18.8 26.152 224 224 0 8.0489 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.946 0.95391 39.672 8 4 Leave out requantified 0.70159 1.254 1.1344 0.72057 1.3514 1.1234 36.289 92.533 44.264 3 2 3 2 1 1 Median Median Plateau 18.8 8.9 18.8 109390000 54289000 55103000 42925000 21028000 21897000 21896000 11087000 10809000 44570000 22173000 22397000 2040 2924;3055;14990 True;True;True 2990;3123;15311 10273;10274;10275;10752;10753;52290;52291;52292 13126;13127;13128;13704;13705;66084;66085;66086 13126;13705;66085 Q9HC35 Q9HC35 5 5 5 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 EML4 sp|Q9HC35|EMAL4_HUMAN Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML4 PE=1 SV=3 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 8 8 8 108.91 981 981 0 16.941 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.95195 1.0821 66.593 11 8 Median 1.0814 0.53372 1.2574 1.1233 0.57816 1.3265 53.734 41.194 43.039 3 4 4 2 3 3 Median Median Median 3.7 5.3 6.3 259980000 140960000 119010000 50964000 20493000 30471000 107300000 76667000 30628000 101720000 43804000 57916000 2041 2979;3644;10954;11142;16247 True;True;True;True;True 3046;3718;11165;11355;16592 10481;10482;10483;12813;12814;12815;12816;38470;39076;56649;56650;56651 13383;13384;13385;16397;16398;16399;16400;48667;49414;71670;71671;71672;71673;71674;71675 13385;16400;48667;49414;71673 Q9HCE5 Q9HCE5 1 1 1 N6-adenosine-methyltransferase subunit METTL14 METTL14 sp|Q9HCE5|MET14_HUMAN N6-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METTL14 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 52.15 456 456 0 5.4289 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82098 0.9293 11.831 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.4 2.4 2.4 47174000 25303000 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Leave out requantified Median 15.2 20.6 15.2 329690000 147880000 181810000 85629000 36583000 49046000 137590000 62220000 75370000 106470000 49076000 57394000 2044 2687;2851;4678;6592;11044 True;True;True;True;True 2748;2915;4770;6716;11256 9453;9454;10004;10005;10006;16354;16355;16356;22723;22724;22725;38761 12114;12115;12768;12769;12770;20970;20971;28921;49023 12114;12770;20971;28921;49023 Q9HD26 Q9HD26 4 4 4 Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein GOPC sp|Q9HD26|GOPC_HUMAN Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOPC PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 12.6 12.6 12.6 50.519 462 462 0 14.896 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98338 1.0475 13.683 8 1 Leave out requantified 0.79557 0.83448 1.1555 0.84832 0.91603 1.1935 21.312 16.456 7.8095 2 3 3 0 1 0 Median Median Leave out requantified 10.6 10.6 7.4 138180000 79041000 59137000 40522000 26256000 14266000 50026000 29440000 20586000 47629000 23345000 24285000 2045 3227;11337;13748;14054 True;True;True;True 3297;11553;14042;14352 11339;39718;39719;48120;48121;48122;49134;49135;49136 14503;50203;50204;60714;61937;61938;61939;61940;61941 14503;50203;60714;61938 Q9NP61 Q9NP61 2 2 2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 ARFGAP3 sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5.2 5.2 5.2 56.928 516 516 0 6.973 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.882 1.0003 7.1956 6 1 Leave out requantified 0.75212 0.8854 0.79959 0.82752 1.0458 0.84085 34.012 4.8757 8.7489 2 2 2 1 0 0 Median Median Median 5.2 5.2 5.2 108770000 54492000 54277000 34096000 17186000 16910000 34479000 16157000 18322000 40194000 21149000 19045000 2046 1468;13668 True;True 1505;13961 5102;5103;5104;47828;47829;47830 6658;6659;6660;60349;60350;60351;60352;60353 6658;60353 Q9NP79 Q9NP79 3 3 3 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog VTA1 sp|Q9NP79|VTA1_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VTA1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 12.4 12.4 12.4 33.879 307 307 0 18.308 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.80765 0.8729 25.662 8 5 Median 0.49136 0.82968 0.83781 0.55911 0.94601 0.88868 23.404 11.894 11.189 2 4 2 2 2 1 Median Median Median 9.8 12.4 5.9 319620000 177140000 142480000 91028000 58918000 32110000 150190000 79536000 70659000 78402000 38687000 39715000 2047 10517;11073;18175 True;True;True 10719;11285;18545 37054;37055;37056;38840;38841;63258;63259;63260 46954;46955;46956;46957;49120;49121;80136;80137;80138 46956;49121;80137 Q9NPD3 Q9NPD3 3 3 3 Exosome complex component RRP41 EXOSC4 sp|Q9NPD3|EXOS4_HUMAN Exosome complex component RRP41 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC4 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 13.1 13.1 13.1 26.383 245 245 0 8.268 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94952 0.9681 17.366 8 6 Median 0.91429 0.82126 1.0459 0.93187 0.87372 1.0118 37.004 11.257 2.8243 2 3 3 2 3 1 Median Median Plateau 7.3 13.1 13.1 266250000 136280000 129980000 89287000 48224000 41063000 83744000 44306000 39437000 93222000 43747000 49475000 2048 2974;13392;17218 True;True;True 3041;13681;17577 10464;10465;10466;46861;46862;60119;60120;60121 13360;13361;13362;59110;59111;76225;76226;76227 13361;59110;76226 Q9NPD8 Q9NPD8 8 8 8 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T UBE2T sp|Q9NPD8|UBE2T_HUMAN Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2T PE=1 SV=1 1 8 8 8 7 7 7 7 7 7 7 7 7 54.8 54.8 54.8 22.521 197 197 0 73.111 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1163 1.1773 20.247 21 9 Leave out requantified 0.95837 1.2031 0.98671 1.0506 1.3311 1.0161 15.418 10.706 27.217 8 7 6 4 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.6 41.6 46.2 1044600000 493010000 551570000 405970000 193800000 212170000 303390000 136030000 167360000 335220000 163180000 172050000 2049 211;1252;3926;5130;8564;9638;12968;18537 True;True;True;True;True;True;True;True 213;1284;4008;5228;8733;9830;13250;18915 696;697;698;699;4359;4360;4361;4362;4363;13882;17871;17872;17873;17874;30066;30067;30068;34142;34143;45413;45414;45415;64557;64558;64559 905;906;907;908;909;910;5681;5682;5683;5684;5685;5686;5687;17767;22799;22800;22801;22802;38171;38172;38173;43333;57244;57245;57246;57247;81735;81736;81737 909;5687;17767;22799;38173;43333;57246;81736 Q9NPF4 Q9NPF4 5 5 5 Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OSGEP sp|Q9NPF4|OSGEP_HUMAN Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSGEP PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 3 4 3 3 4 3 3 4 22.1 22.1 22.1 36.426 335 335 0 15.661 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62601 0.68018 24.17 10 8 Median 0.59845 0.69189 0.82624 0.63878 0.76225 0.84808 5.1148 20.78 35.585 3 3 4 2 2 4 Median Plateau Median 16.1 13.1 15.8 294460000 162950000 131510000 65406000 38776000 26630000 113400000 62856000 50541000 115660000 61321000 54341000 2050 1076;8266;11167;16008;16441 True;True;True;True;True 1101;8431;11380;16350;16789 3738;29056;29057;29058;39152;55853;55854;57309;57310;57311 4900;36872;36873;36874;36875;36876;49496;70633;70634;72567;72568;72569 4900;36873;49496;70633;72567 Q9NPI6 Q9NPI6 1 1 1 mRNA-decapping enzyme 1A DCP1A sp|Q9NPI6|DCP1A_HUMAN mRNA-decapping enzyme 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCP1A PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.4 2.4 2.4 63.278 582 582 0.0022452 2.6167 By MS/MS NaN NaN NaN 0 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 Median Median Median 0 0 2.4 6358600 0 6358600 0 0 0 0 0 0 6358600 0 6358600 2051 7027 True 7164 24544 31113 31113 Q9NPQ8 Q9NPQ8 4 4 4 Synembryn-A RIC8A sp|Q9NPQ8|RIC8A_HUMAN Synembryn-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RIC8A PE=1 SV=3 1 4 4 4 2 3 3 2 3 3 2 3 3 15.1 15.1 15.1 59.709 531 531 0 18.219 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8401 0.90712 2.3204 9 4 Leave out requantified 1.0423 0.85156 0.83954 1.166 0.91704 0.92213 8.2734 4.351 9.0329 3 3 3 2 1 1 Plateau Median Median 8.9 11.7 12.2 241530000 128920000 112600000 77841000 39039000 38803000 65952000 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4279;33037;33038;33039;37786;37787;37788;38145;38146;50582;50583;50584;54525;54526;54527 5581;41938;41939;41940;41941;41942;47857;47858;47859;47860;47861;48296;48297;63824;63825;63826;63827;68971;68972;68973 5581;41940;47860;48296;63827;68973 Q9NQ88 Q9NQ88 5 5 5 Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR TIGAR sp|Q9NQ88|TIGAR_HUMAN Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIGAR PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 28.5 28.5 28.5 30.062 270 270 0 68.081 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91532 0.97157 36.194 18 7 Leave out requantified 0.96265 0.66361 1.42 1.0303 0.75353 1.4413 30.683 56.53 22.767 6 6 6 4 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified 28.5 28.5 28.5 389620000 188460000 201160000 121500000 60589000 60907000 158520000 82962000 75557000 109610000 44908000 64701000 2054 3358;4218;4729;7745;14497 True;True;True;True;True 3430;4307;4822;7893;14805 11824;11825;11826;11827;11828;11829;14817;14818;14819;16549;16550;16551;27196;27197;27198;50636;50637;50638 15136;15137;15138;15139;15140;15141;18997;18998;18999;21214;34554;34555;34556;34557;63893;63894;63895;63896 15139;18998;21214;34555;63894 Q9NQA3;A8K0Z3;A8MWX3 Q9NQA3;A8K0Z3;A8MWX3 2;1;1 2;1;1 1;0;0 WAS protein family homolog 6;WAS protein family homolog 1;Putative WAS protein family homolog 4 WASH6P;WASH1;WASH4P sp|Q9NQA3|WASH6_HUMAN WAS protein family homolog 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASH6P PE=1 SV=3;sp|A8K0Z3|WASH1_HUMAN WASH complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WASHC1 PE=1 SV=2;sp|A8MWX3|WASH4_HUMAN Putative WAS protein family homolog 4 OS=Homo sapi 3 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 5.8 5.8 3.8 47.989 447 447;465;477 0 8.1328 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99975 1.0397 0.90765 8 0 Leave out requantified 1.0464 1.1058 0.98441 1.076 1.2995 1.0331 9.8038 17.501 9.0005 2 3 3 0 0 0 Median Median Median 5.8 5.8 5.8 238500000 116180000 122320000 66512000 33130000 33382000 85048000 40245000 44803000 86941000 42807000 44134000 2055 12711;14849 True;True 12988;15168 44542;44543;44544;51865;51866;51867;51868;51869 56154;56155;56156;65542;65543;65544;65545 56154;65542 Q9NQC3 Q9NQC3 2 2 2 Reticulon-4 RTN4 sp|Q9NQC3|RTN4_HUMAN Reticulon-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTN4 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2.3 2.3 2.3 129.93 1192 1192 0 8.4594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0484 1.1277 82.106 10 6 Median 0.99829 1.2852 0.45718 1.0345 1.459 0.48737 78.75 47.713 114.3 4 4 2 3 3 0 Median Median Median 2.3 2.3 2.3 298270000 139540000 158740000 107010000 47246000 59761000 131770000 54055000 77712000 59497000 38235000 21262000 2056 6342;7089 True;True 6464;7226 21921;21922;21923;24759;24760;24761;24762;24763;24764;24765 27859;27860;27861;31360;31361;31362;31363;31364;31365;31366 27861;31363 Q9NQG5 Q9NQG5 6 6 6 Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B RPRD1B sp|Q9NQG5|RPR1B_HUMAN Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1 1 6 6 6 6 5 6 6 5 6 6 5 6 23.9 23.9 23.9 36.899 326 326 0 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repeat-containing protein 6 BIRC6 sp|Q9NR09|BIRC6_HUMAN Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BIRC6 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.5 0.5 0.5 530.25 4857 4857 0 4.0693 By MS/MS By matching By MS/MS 0.97296 1.1007 33.403 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 0.2 0.2 0.2 45630000 27326000 18305000 11411000 5166000 6244900 12973000 6340700 6632400 21246000 15819000 5427300 2064 7858;17662 True;True 8006;18025 27606;27607;61588 35083;78109 35083;78109 Q9NR12 Q9NR12 7 7 7 PDZ and LIM domain protein 7 PDLIM7 sp|Q9NR12|PDLI7_HUMAN PDZ and LIM domain protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM7 PE=1 SV=1 1 7 7 7 5 6 6 5 6 6 5 6 6 21.9 21.9 21.9 49.844 457 457 0 21.242 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77825 0.86603 22.343 17 4 Leave out requantified 0.77404 0.77138 1.0465 0.82605 0.88512 1.0401 26.509 16.534 20.602 5 6 6 1 1 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.1 17.3 19.3 550880000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.5611 0.61763 25.322 10 2 Leave out requantified 0.80784 0.57781 0.54487 0.83089 0.6848 0.55705 33.849 31.839 23.733 3 3 4 1 0 1 Median Leave out requantified Leave out requantified 3.9 5.1 5.5 221280000 127740000 93542000 62820000 33602000 29219000 66608000 39379000 27229000 91857000 54763000 37094000 2076 4621;10058;11268;11469;12414 True;True;True;True;True 4713;10257;11484;11692;12684 16185;35504;35505;35506;39502;39503;39504;40152;40153;40154;43490 20772;45041;49961;49962;49963;49964;49965;49966;50728;50729;50730;54826 20772;45041;49966;50730;54826 Q9NS87 Q9NS87 10 10 10 Kinesin-like protein KIF15 KIF15 sp|Q9NS87|KIF15_HUMAN Kinesin-like protein KIF15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF15 PE=1 SV=1 1 10 10 10 5 7 9 5 7 9 5 7 9 8.7 8.7 8.7 160.16 1388 1388 0 29.107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77872 0.86851 39.396 19 2 Leave out requantified 0.8799 0.68034 1.0824 0.98275 0.77039 1.1065 29.504 35.366 36.501 3 7 9 0 0 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.5 6 7.9 370940000 189400000 181540000 79804000 46392000 33413000 126930000 70746000 56180000 164210000 72258000 91949000 2077 1234;3186;10281;10955;13039;13237;15251;16133;16345;17223 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1266;3256;10482;11166;13322;13524;15580;16475;16691;17582 4304;4305;11205;11206;11207;36321;36322;36323;38471;38472;38473;45675;46362;46363;46364;53198;56274;56977;56978;60138;60139 5612;5613;14315;14316;14317;46022;46023;46024;46025;48668;48669;57580;58491;58492;67238;71162;72101;76247 5613;14317;46023;48669;57580;58491;67238;71162;72101;76247 Q9NSD9 Q9NSD9 18 18 18 Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit FARSB sp|Q9NSD9|SYFB_HUMAN Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FARSB PE=1 SV=3 1 18 18 18 17 15 15 17 15 15 17 15 15 31.6 31.6 31.6 66.115 589 589 0 163.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97608 1.061 23.731 55 19 Leave out requantified 0.95891 0.91497 1.0962 1.0337 1.0173 1.1149 20.969 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289;290;291;6026;6027;6028;7790;7791;7792;7793;7794;7795;11606;11607;11608;11609;11610;11611;12604;12605;12606;20045;20046;20047;20048;20049;20050;20984;20985;33103;43433;43434;43435;43436;43437;43438;43439;43440;43441;43442;43443;43444;44398;44399;44400;44847;44848;44849;44850;44851;44852;53205;53206;53207;53208;53209;53210;53211;54443;62907;62908;62909;62910;62911;62912;62913;62914;62915;62916;69381;69382;71555;71556;71557;71558;71559;71560;72559;72560;72561;72562;72563;72564;72565 291;6028;7791;11607;12604;20048;20984;33103;43435;43444;44400;44847;53207;54443;62912;69381;71560;72562 Q9NSK0 Q9NSK0 3 2 2 Kinesin light chain 4 KLC4 sp|Q9NSK0|KLC4_HUMAN Kinesin light chain 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KLC4 PE=1 SV=3 1 3 2 2 2 3 2 1 2 1 1 2 1 4.4 3.2 3.2 68.639 619 619 0.00047529 3.2465 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.67993 0.76455 15.234 4 4 Median NaN 0.71905 NaN NaN 0.79347 NaN NaN 1.3477 NaN 1 2 1 1 2 1 Median Median Median 2.6 4.4 2.6 53951000 31237000 22714000 13629000 8321800 5306800 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domain-containing protein 1 PIH1D1 sp|Q9NWS0|PIHD1_HUMAN PIH1 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIH1D1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 3 3 5 3 3 5 3 3 5 27.9 27.9 27.9 32.363 290 290 0 41.501 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65212 0.64444 15.281 11 5 Leave out requantified 0.56444 0.97239 1.0467 0.62225 1.1161 1.1061 32.636 37.376 31.69 3 3 5 1 1 3 Median Median Median 17.2 17.2 27.9 200570000 109470000 91106000 49666000 31384000 18282000 54469000 30669000 23800000 96436000 47412000 49024000 2110 3512;4019;4802;6392;8126 True;True;True;True;True 3585;4101;4897;6514;8285 12342;12343;12344;14167;14168;14169;16802;16803;16804;22081;28526 15812;15813;18122;18123;18124;18125;18126;18127;18128;21532;21533;21534;28079;36209 15813;18128;21533;28079;36209 Q9NWU2 Q9NWU2 1 1 1 Glucose-induced degradation protein 8 homolog GID8 sp|Q9NWU2|GID8_HUMAN Glucose-induced degradation protein 8 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GID8 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.5 10.5 10.5 26.748 228 228 0 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(guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRMT1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 3 1 1 3 1 1 3 1 5.5 5.5 5.5 72.233 659 659 0 10.797 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.59902 0.6548 59.052 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 2 5.5 2 34758000 25000000 9757100 7556600 5429100 2127500 18390000 15331000 3059000 8811400 4240700 4570700 2117 4311;4575;17224 True;True;True 4401;4667;17583 15136;16026;16027;16028;60140 19447;20579;20580;20581;76248 19447;20580;76248 Q9NXR7 Q9NXR7 2 2 2 BRCA1-A complex subunit BRE BRE sp|Q9NXR7|BABA2_HUMAN BRISC and BRCA1-A complex member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 7.8 7.8 7.8 43.551 383 383 0 5.6228 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66419 0.69099 29.425 4 4 Median NaN 0.51175 NaN NaN 0.55403 NaN NaN 27.19 NaN 1 2 1 1 2 1 Median Median Median 3.7 7.8 3.7 59485000 40788000 18697000 11992000 7222000 4770400 38222000 27655000 10567000 9270200 5911000 3359300 2118 14164;15509 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26577;26578;26579;54916;54917;54918;54919;54920;65919;65920;65921;65922;65923;65924;65925;65926;65927;65928;65929;65930;65932;65933;65934;66278;66279;66280;66282;66283;66284;66723;66724;71286;71287;71288;71289;71290;71291 26577;54916;65919;65929;65932;66280;66283;66724;71291 Q9NY12 Q9NY12 1 1 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 GAR1 sp|Q9NY12|GAR1_HUMAN H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAR1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 8.3 8.3 8.3 22.348 217 217 0.00048193 3.4347 By MS/MS By MS/MS 1.4042 1.5202 38.838 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 1 0 0 Median Median Median 8.3 0 8.3 80144000 51899000 28245000 39604000 28398000 11205000 0 0 0 40540000 23500000 17040000 2120 17898 True 18265 62369;62370 79042;79043;79044 79043 Q9NY93 Q9NY93 2 2 2 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 DDX56 sp|Q9NY93|DDX56_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX56 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 4.6 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38013;50380;50381;50382;50383;50384;50988;50989;50990;50991;50992;50993;50994;50995;50996;55066;55067;55068;65288;65289;65290;65291;65292;65293;65294;65295;65296;65297;65298;65299;65300;65716;65717;65718;65719;65720;65721;68875 38013;50383;50988;55066;65299;65719;68875 401 537 Q9NYL2 Q9NYL2 4 4 4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase MLT ZAK sp|Q9NYL2|M3K20_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K20 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 3 2 4 3 2 4 3 2 5.6 5.6 5.6 91.154 800 800 0 10.542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98819 1.0643 1.909 9 5 Leave out requantified 0.57355 1.0104 1.1187 0.6117 1.1115 1.1595 170.99 44.488 18 3 4 2 2 2 1 Median Median Median 5.6 4.4 3 146250000 79736000 66512000 47686000 30612000 17074000 60440000 31524000 28916000 38123000 17600000 20523000 2124 1769;2637;12564;14091 True;True;True;True 1812;2695;12839;14389 6083;6084;6085;9245;44067;44068;44069;49259;49260;49261 7963;7964;7965;7966;7967;11829;55547;55548;55549;62096;62097;62098;62099 7965;11829;55547;62098 Q9NYL9;P28289 Q9NYL9 8;1 8;1 8;1 Tropomodulin-3 TMOD3 sp|Q9NYL9|TMOD3_HUMAN Tropomodulin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMOD3 PE=1 SV=1 2 8 8 8 7 8 5 7 8 5 7 8 5 31.8 31.8 31.8 39.594 352 352;359 0 35.069 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0059 1.1475 21.109 22 6 Leave out requantified 1.1259 0.92031 1.3216 1.273 1.0692 1.4415 37.941 22.189 17.49 8 9 5 1 3 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 27.8 31.8 20.2 1055700000 548670000 507000000 296460000 144720000 151740000 416960000 223150000 193800000 342250000 180800000 161460000 2125 7944;11578;12075;12995;13265;14681;15710;18399 True;True;True;True;True;True;True;True 8095;11812;12332;13278;13552;14996;16045;18773 27876;27877;27878;40573;40574;42271;42272;42273;45518;45519;45520;45521;45522;45523;46449;46450;46451;51303;54828;54829;64093;64094;64095 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Q9NZD2 Q9NZD2 1 1 1 Glycolipid transfer protein GLTP sp|Q9NZD2|GLTP_HUMAN Glycolipid transfer protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLTP PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.7 5.7 5.7 23.85 209 209 0 3.9227 By MS/MS By MS/MS 0.76569 0.79795 16.536 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 1 0 0 0 Median Median Median 5.7 0 5.7 20081000 10895000 9186700 10568000 6196900 4371600 0 0 0 9512800 4697700 4815100 2129 6407 True 6530 22119;22120 28126;28127;28128 28128 Q9NZI8 Q9NZI8 5 4 4 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 IGF2BP1 sp|Q9NZI8|IF2B1_HUMAN Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGF2BP1 PE=1 SV=2 1 5 4 4 2 5 5 1 4 4 1 4 4 10.9 8.7 8.7 63.48 577 577 0 17.614 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0894 1.1488 18.117 8 2 Leave out requantified NaN 1.0894 1.2574 NaN 1.1488 1.2746 NaN 49.368 34.698 1 4 3 0 1 1 Median Leave out requantified Median 5 10.9 10.9 205030000 113080000 91946000 41765000 22600000 19165000 83879000 49319000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1429 1.2378 38.651 5 1 Leave out requantified NaN NaN 1.4 NaN NaN 1.4113 NaN NaN 34.512 1 1 3 0 0 1 Median Median Median 2.8 2.8 6.5 145470000 87651000 57822000 35943000 22853000 13090000 38178000 23676000 14502000 71352000 41122000 30229000 2134 4;7119;13637;15644 True;True;True;True 4;7259;13928;15979 14;15;16;24956;24957;24958;47693;54576 28;29;30;31755;31756;31757;60173;69033 28;31757;60173;69033 Q9NZT2 Q9NZT2 11 11 11 Opioid growth factor receptor OGFR sp|Q9NZT2|OGFR_HUMAN Opioid growth factor receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OGFR PE=1 SV=3 1 11 11 11 7 9 7 7 9 7 7 9 7 26.3 26.3 26.3 73.324 677 677 0 64.628 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72995 0.73162 9.8961 31 7 Leave out requantified 0.64923 0.67596 0.802 0.68653 0.70542 0.80913 17.386 16.62 22.9 9 13 9 1 4 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.7 20.5 16.2 723690000 440510000 283180000 217600000 140690000 76910000 279410000 167580000 111820000 226690000 132240000 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Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLA2 PE=1 SV=3 1 3 3 3 2 2 3 2 2 3 2 2 3 6.5 6.5 6.5 50.317 463 463 0 7.5078 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93736 1.0694 17.355 7 1 Leave out requantified 0.87071 0.93736 0.89613 0.96122 1.0803 0.92517 32.44 18.793 9.2705 2 2 3 0 0 1 Median Median Median 3.9 3.9 6.5 189500000 97741000 91763000 51016000 26166000 24849000 46917000 22199000 24718000 91572000 49376000 42196000 2149 1641;4206;7826 True;True;True 1681;4295;7974 5644;5645;5646;14783;14784;14785;27502 7356;7357;7358;7359;18957;34943 7357;18957;34943 Q9UBB4 Q9UBB4 22 22 22 Ataxin-10 ATXN10 sp|Q9UBB4|ATX10_HUMAN Ataxin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATXN10 PE=1 SV=1 1 22 22 22 20 19 19 20 19 19 20 19 19 49.3 49.3 49.3 53.488 475 475 0 230.03 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93806 1.0234 33.856 96 41 Leave out requantified 0.8963 1.0575 0.9658 0.97448 1.2088 0.98572 38.097 35.472 15.581 34 30 32 14 11 16 Leave out requantified Leave out 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repeat-containing X-linked protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARMCX3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 7.1 7.1 7.1 42.5 379 379 0 5.9691 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3567 1.3954 98.363 5 5 Median NaN 0.80764 0.78348 NaN 0.90493 0.81653 NaN 162.52 75.78 1 2 2 1 2 2 Median Median Median 2.6 7.1 2.6 62375000 37400000 24975000 15479000 9446700 6031900 24278000 14407000 9870900 22619000 13546000 9072600 2172 1384;2542 True;True 1418;2600 4784;8932;8933;8934;8935;8936;8937 6222;11431;11432;11433;11434;11435;11436 6222;11436 Q9UH65 Q9UH65 10 10 10 Switch-associated protein 70 SWAP70 sp|Q9UH65|SWP70_HUMAN Switch-associated protein 70 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SWAP70 PE=1 SV=1 1 10 10 10 8 8 9 8 8 9 8 8 9 20.9 20.9 20.9 68.997 585 585 0 35.161 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93952 0.97295 18.489 26 2 Leave out requantified 0.95604 0.84542 0.87202 1.0318 0.90845 0.91177 17.917 23.967 17.863 8 8 10 1 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 16.9 14.4 15.7 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2 PFDN2 sp|Q9UHV9|PFD2_HUMAN Prefoldin subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 5 3 2 5 3 2 5 3 39 39 39 16.648 154 154 0 62.516 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.026 1.1504 0.65978 13 7 Leave out requantified 1.3946 1.0064 1.1631 1.5799 1.1504 1.2567 57.725 37.168 52.107 3 6 4 1 4 2 Median Median Median 14.9 39 24 440280000 222060000 218220000 62077000 27313000 34764000 256250000 137390000 118850000 121960000 57352000 64607000 2182 4552;5607;6072;7697;10526 True;True;True;True;True 4644;5717;6188;7844;10729;10730 15966;15967;19453;19454;21024;21025;27043;27044;27045;37088;37089;37090;37091;37092 20502;20503;24783;24784;26753;26754;34377;34378;34379;46999;47000;47001;47002;47003;47004 20502;24783;26754;34378;47004 406 127 Q9UHW5 Q9UHW5 2 2 2 GPN-loop GTPase 3 GPN3 sp|Q9UHW5|GPN3_HUMAN GPN-loop GTPase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPN3 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 9.2 9.2 9.2 32.761 284 284 0 4.0876 By MS/MS By MS/MS 0.83816 0.91838 17.471 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 0 1 1 0 Median Median Median 4.6 4.6 0 26562000 15456000 11106000 13315000 8087700 5227700 13247000 7368600 5878300 0 0 0 2183 609;18195 True;True 622;18567 2131;63340 2810;80240 2810;80240 Q9UHX1 Q9UHX1 17 17 17 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 PUF60 sp|Q9UHX1|PUF60_HUMAN Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUF60 PE=1 SV=1 1 17 17 17 14 13 16 14 13 16 14 13 16 38.8 38.8 38.8 59.875 559 559 0 170.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.91682 1.0022 29.067 54 15 Leave out requantified 0.93359 0.8938 0.9234 1.0104 1.0101 0.97046 34.975 19.228 12.835 17 17 20 2 5 8 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 37.4 36 38.8 3195700000 1638400000 1557300000 959780000 482280000 477500000 985270000 497930000 487340000 1250700000 658230000 592460000 2184 1287;2307;6756;8505;8506;8636;9169;9170;9858;12631;12836;14290;15092;16932;17048;17836;18012 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Drebrin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBNL PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.3 2.3 2.3 48.207 430 430 0.0098712 2.2033 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.4044 1.4626 16.742 3 0 Plateau NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2.3 2.3 2.3 29374000 12864000 16511000 9861800 4741200 5120600 9102400 4428500 4673900 10410000 3693800 6716200 2195 17117 True 17474 59730;59731;59732 75713;75714;75715 75713 Q9UJX2 Q9UJX2 2 2 2 Cell division cycle protein 23 homolog CDC23 sp|Q9UJX2|CDC23_HUMAN Cell division cycle protein 23 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC23 PE=1 SV=3 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.5 4.5 4.5 68.833 597 597 0 3.6427 By MS/MS By MS/MS By matching 0.79982 0.79332 20.954 3 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 0 Median Median Median 2 2.5 2 53053000 31578000 21474000 21249000 14411000 6838700 12243000 5710000 6532800 19560000 11457000 8103000 2196 1741;8822 True;True 1784;8996 5989;5990;31147 7847;39570 7847;39570 Q9UJX3 Q9UJX3 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protein beta-8 HSPB8 sp|Q9UJY1|HSPB8_HUMAN Heat shock protein beta-8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPB8 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7.7 7.7 7.7 21.604 196 196 0 5.3938 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.078 1.1756 20.025 9 1 Leave out requantified 1.0241 0.83256 1.2989 1.1368 1.0376 1.3544 6.6141 23.12 23.287 3 3 3 0 1 0 Median Median Plateau 7.7 7.7 7.7 126060000 63268000 62795000 54834000 27034000 27799000 21454000 11938000 9516000 49775000 24295000 25480000 2199 15708;15709 True;True 16043;16044 54819;54820;54821;54822;54823;54824;54825;54826;54827 69344;69345;69346;69347;69348;69349;69350;69351;69352 69344;69351 Q9UJY4;Q9UJY5;Q9NZ52 Q9UJY4;Q9UJY5;Q9NZ52 2;1;1 2;1;1 2;1;1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2;ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1;ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3 GGA2;GGA1;GGA3 sp|Q9UJY4|GGA2_HUMAN ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GGA2 PE=1 SV=3;sp|Q9UJY5|GGA1_HUMAN ADP-ribosylation factor-binding 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43213;43214;74325;74326;74327 43214;74326 Q9UKN8 Q9UKN8 12 12 12 General transcription factor 3C polypeptide 4 GTF3C4 sp|Q9UKN8|TF3C4_HUMAN General transcription factor 3C polypeptide 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF3C4 PE=1 SV=2 1 12 12 12 10 8 9 10 8 9 10 8 9 26.3 26.3 26.3 91.981 822 822 0 68.211 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78597 0.82253 48.079 24 9 Leave out requantified 0.78294 0.63784 1.0905 0.85285 0.69464 1.0769 56.056 21.364 23.574 9 6 9 3 2 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.4 15.3 20.8 533200000 284620000 248580000 177080000 101800000 75272000 159730000 96242000 63490000 196390000 86578000 109820000 2207 3683;7922;7946;10437;10864;10943;13070;13440;14287;14400;16172;16923 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3758;8071;8097;10638;11075;11154;13353;13729;14590;14706;16514;17275 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MS/MS 0.65332 0.68831 19.193 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 Median Median Median 0 5.3 4.4 19469000 13659000 5810100 0 0 0 13412000 10355000 3057100 6057600 3304600 2753100 2214 4928;5973 True;True 5024;6087 17224;20665 22054;26297 22054;26297 Q9UL46 Q9UL46 14 14 14 Proteasome activator complex subunit 2 PSME2 sp|Q9UL46|PSME2_HUMAN Proteasome activator complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSME2 PE=1 SV=4 1 14 14 14 13 12 10 13 12 10 13 12 10 69.5 69.5 69.5 27.401 239 239 0 165.17 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.94096 1.0007 14.321 59 10 Leave out requantified 0.95663 0.88379 1.0277 1.0177 0.97868 1.0509 16.062 27.226 13.954 21 20 18 2 6 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 66.5 59.4 56.5 5632000000 2884200000 2747800000 1805400000 942630000 862790000 2062000000 1077900000 984060000 1764500000 863580000 900960000 2215 463;1050;1106;1169;1798;2132;4426;5708;7439;7780;9048;13187;15733;18291 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domains-containing protein 1 LIMCH1 sp|Q9UPQ0|LIMC1_HUMAN LIM and calponin homology domains-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LIMCH1 PE=1 SV=4 1 17 17 17 11 14 14 11 14 14 11 14 14 18.8 18.8 18.8 121.87 1083 1083 0 119.02 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98928 1.0076 18.05 46 10 Leave out requantified 0.91172 0.92473 0.95812 1.0195 1.0162 0.96994 27.688 24.995 24.064 13 16 17 1 5 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 13.5 15.2 15.3 1609300000 818490000 790780000 379880000 182740000 197140000 599050000 353770000 245280000 630330000 281970000 348350000 2241 1409;1763;2882;4365;5360;6403;6455;6499;9407;11922;13418;14134;14339;14340;15145;17732;18066 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1443;1806;2947;4455;5465;6526;6578;6622;9597;12179;13707;14432;14642;14643;15469;18095;18435 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Leucine-rich repeat protein SHOC-2 SHOC2 sp|Q9UQ13|SHOC2_HUMAN Leucine-rich repeat protein SHOC-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHOC2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.7 5.7 5.7 64.887 582 582 0 11.059 By MS/MS By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 Median Median Median 2.2 0 3.4 30186000 14558000 15628000 0 0 0 0 0 0 30186000 14558000 15628000 2245 3857;11215 True;True 3938;11429 13648;39308 17490;49697 17490;49697 Q9UQ35 Q9UQ35 5 5 5 Serine/arginine repetitive matrix protein 2 SRRM2 sp|Q9UQ35|SRRM2_HUMAN Serine/arginine repetitive matrix protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRM2 PE=1 SV=2 1 5 5 5 3 4 4 3 4 4 3 4 4 2.7 2.7 2.7 299.61 2752 2752 0 21.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.99237 1.0352 34.106 13 3 Leave out requantified 1.0519 0.89376 1.0038 1.1073 0.98092 1.0141 10.051 31.815 23.087 3 6 4 0 2 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 1.9 2.4 2.2 237480000 120680000 116790000 55494000 28906000 26588000 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UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNE PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2.6 2.6 2.6 79.274 722 722 0.00048852 3.6092 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.77432 0.79714 18.4 4 1 Median NaN NaN 0.6649 NaN NaN 0.66981 NaN NaN 10.488 1 1 2 0 0 1 Median Median Median 2.6 1.4 2.6 42056000 24875000 17181000 12700000 7275400 5424800 9295800 6069700 3226100 20060000 11530000 8530400 2250 5974;14289 True;True 6088;14592 20666;20667;49909;49910;49911 26298;26299;62977 26298;62977 Q9Y224 Q9Y224 12 12 12 UPF0568 protein C14orf166 C14orf166 sp|Q9Y224|RTRAF_HUMAN RNA transcription, translation and transport factor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTRAF PE=1 SV=1 1 12 12 12 8 10 10 8 10 10 8 10 10 54.5 54.5 54.5 28.068 244 244 0 66.943 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.88445 0.97309 23.824 33 6 Leave out requantified 0.95114 0.85916 0.96243 0.98689 1.0017 1.0026 17.731 23.859 29.852 10 11 12 1 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out 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Median 0 6.6 12 46548000 21001000 25547000 0 0 0 16520000 7060700 9458900 30028000 13940000 16088000 2267 10232;18610 True;True 10433;18989 36162;64793;64794 45843;82073;82074 45843;82073 Q9Y2S6 Q9Y2S6 1 1 1 Translation machinery-associated protein 7 TMA7 sp|Q9Y2S6|TMA7_HUMAN Translation machinery-associated protein 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMA7 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.1 14.1 14.1 7.0662 64 64 0 3.8842 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.73226 0.8268 2.6119 3 3 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 14.1 14.1 14.1 169030000 113360000 55672000 54359000 37428000 16931000 53065000 34658000 18407000 61611000 41276000 20335000 2268 6341 True 6463 21917;21918;21919;21920 27855;27856;27857;27858 27857 Q9Y2T2;P53677 Q9Y2T2;P53677 2;1 2;1 2;1 AP-3 complex subunit mu-1;AP-3 complex subunit mu-2 AP3M1;AP3M2 sp|Q9Y2T2|AP3M1_HUMAN AP-3 complex subunit mu-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3M1 PE=1 SV=1;sp|P53677|AP3M2_HUMAN AP-3 complex subunit mu-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3M2 PE=2 SV=1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.9 7.9 7.9 46.939 418 418;418 0 7.949 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.84538 0.96489 11.052 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 1 1 Median Median Median 2.4 5.5 5.5 69862000 39448000 30414000 0 0 0 31640000 17373000 14267000 38222000 22075000 16147000 2269 3932;6238 True;True 4014;6354 13897;21585;21586 17785;27456;27457 17785;27457 Q9Y2U5 Q9Y2U5 2 2 2 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 MAP3K2 sp|Q9Y2U5|M3K2_HUMAN Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 3.4 3.4 3.4 69.74 619 619 0.0018587 3.0221 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1093 1.2093 13.714 4 0 Leave out requantified NaN 1.1093 NaN NaN 1.2093 NaN NaN 13.714 NaN 1 2 1 0 0 0 Median Median Median 1.5 3.4 1.5 50335000 25718000 24617000 10158000 5683700 4474400 27441000 13053000 14388000 12736000 6981400 5754200 2270 1557;7329 True;True 1596;7472 5386;25761;25762;25763 7032;32675;32676 7032;32675 Q9Y2V7 Q9Y2V7 3 3 3 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6 COG6 sp|Q9Y2V7|COG6_HUMAN Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG6 PE=1 SV=2 1 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 5.3 5.3 5.3 73.278 657 657 0 7.5309 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87458 0.95595 15.004 8 5 Median 0.93852 0.79413 0.9555 1.0175 0.86977 0.96619 10.334 12.904 19.926 2 3 3 1 1 3 Median Median Median 3.8 5.3 3.8 185090000 94320000 90766000 39644000 19018000 20627000 62776000 35533000 27243000 82666000 39769000 42897000 2271 1293;4261;4541 True;True;True 1327;4350;4633 4494;14967;14968;14969;15937;15938;15939;15940 5848;19217;19218;19219;20467;20468;20469;20470;20471 5848;19218;20467 Q9Y2W1 Q9Y2W1 4 4 4 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 THRAP3 sp|Q9Y2W1|TR150_HUMAN Thyroid hormone receptor-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THRAP3 PE=1 SV=2 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 7.7 7.7 7.7 108.66 955 955 0 22.592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0437 1.0298 15.128 7 0 Leave out requantified 0.97371 0.93401 1.0437 1.0846 1.0942 1.0298 20.971 0.6254 21.242 2 2 3 0 0 0 Median Median Leave out requantified 7.7 5.8 5.8 195110000 96123000 98991000 46963000 22164000 24800000 53126000 28926000 24200000 95025000 45033000 49991000 2272 2863;6469;11434;14307 True;True;True;True 2927;6592;11654;14610 10039;10040;10041;22308;22309;22310;40026;49963;49964;49965 12811;12812;12813;12814;12815;12816;12817;28352;28353;28354;50571;63045;63046;63047;63048 12813;28353;50571;63048 Q9Y2W2 Q9Y2W2 8 8 8 WW domain-binding protein 11 WBP11 sp|Q9Y2W2|WBP11_HUMAN WW domain-binding protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WBP11 PE=1 SV=1 1 8 8 8 5 6 7 5 6 7 5 6 7 14.4 14.4 14.4 69.997 641 641 0 24.235 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.97577 1.0263 3.898 24 15 Leave out requantified 0.92226 0.83987 1.0288 1.0289 0.94377 1.0166 10.166 49.629 10.763 6 8 10 2 6 7 Leave out requantified Median Leave out requantified 8.1 10 12.5 716940000 386220000 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1727;4947;9311;9759;9782;9923;12177;12849;12850;13103;14793;18408 5783;5784;5785;16963;16964;16965;16966;16967;32305;33906;33907;33908;33987;33988;33989;34442;34443;34444;34445;41798;41799;41800;44088;44089;44090;44091;44886;44887;50596;62824 7547;7548;7549;7550;21706;21707;21708;21709;21710;21711;21712;21713;21714;41020;43050;43051;43052;43143;43144;43145;43146;43147;43148;43695;43696;43697;43698;52754;52755;55567;55568;55569;56581;56582;63840;79599 7548;21710;41020;43050;43147;43697;52755;55567;55569;56581;63840;79599 Q9Y305 Q9Y305 1 1 1 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial ACOT9 sp|Q9Y305|ACOT9_HUMAN Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACOT9 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.3 2.3 2.3 49.901 439 439 0.0052516 2.3833 By MS/MS By MS/MS 1.0598 1.0496 23.82 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 1 Median Median Median 0 2.3 2.3 15866000 8664900 7200900 0 0 0 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NaN NaN 1 1 1 1 1 1 Median Median Median 3.7 3.7 3.7 28658000 10809000 17850000 9908300 3329400 6578900 9856800 4557300 5299500 8893300 2921800 5971400 2282 4307 True 4397 15120;15121;15122 19428;19429;19430 19429 Q9Y3A5 Q9Y3A5 11 11 11 Ribosome maturation protein SBDS SBDS sp|Q9Y3A5|SBDS_HUMAN Ribosome maturation protein SBDS OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SBDS PE=1 SV=4 1 11 11 11 9 7 10 9 7 10 9 7 10 41.2 41.2 41.2 28.763 250 250 0 63.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0569 1.1041 28.293 25 9 Leave out requantified 0.92111 0.71274 1.5216 0.97313 0.80125 1.6652 28.263 18.507 21.743 8 7 10 2 3 4 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 38.4 30 41.2 1389000000 626550000 762410000 436190000 202800000 233390000 476580000 259490000 217090000 476200000 164270000 311930000 2283 2305;2964;3307;3616;4969;4970;6488;7178;8614;11072;17025 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2360;3031;3378;3690;5066;5067;6611;7318;8785;11284;17377 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5021;5022;5023;49386;49387;49388 6550;6551;6552;62265;62266;62267 6550;62266 Q9Y3B4 Q9Y3B4 4 4 4 Splicing factor 3B subunit 6 SF3B6 sp|Q9Y3B4|SF3B6_HUMAN Splicing factor 3B subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 39.2 39.2 39.2 14.585 125 125 0 26.123 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89118 0.95076 40.938 11 2 Leave out requantified 0.98973 0.6603 0.86192 1.0737 0.74928 0.90146 57.56 38.039 39.391 4 3 4 2 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified 39.2 29.6 39.2 692520000 348720000 343790000 264980000 132280000 132700000 125930000 70595000 55332000 301610000 145840000 155760000 2285 6553;8301;11816;18324 True;True;True;True 6677;8466;12071;18697 22569;22570;22571;29163;29164;41432;41433;41434;63815;63816;63817;63818 28701;28702;28703;28704;28705;37008;37009;37010;52293;52294;52295;80832;80833;80834;80835;80836 28703;37008;52295;80834 Q9Y3B8 Q9Y3B8 2 2 2 Oligoribonuclease, mitochondrial REXO2 sp|Q9Y3B8|ORN_HUMAN Oligoribonuclease, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=REXO2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 12.7 12.7 12.7 26.832 237 237 0 5.1357 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1016 1.2125 36.518 5 2 Median 1.0133 NaN 1.582 1.1051 NaN 1.6901 19.129 NaN 46.965 2 1 2 1 0 1 Median Median Median 12.7 4.2 12.7 156300000 74218000 82079000 58023000 29366000 28657000 39986000 22845000 17141000 58288000 22007000 36282000 2286 800;13300 True;True 819;13588 2814;2815;2816;46569;46570 3673;3674;3675;58741;58742 3673;58741 Q9Y3C1 Q9Y3C1 2 2 2 Nucleolar protein 16 NOP16 sp|Q9Y3C1|NOP16_HUMAN Nucleolar protein 16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP16 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 8.4 8.4 8.4 21.188 178 178 0.00048286 3.4641 By MS/MS By MS/MS 2.3361 2.5887 74.88 4 4 Median 2.3361 NaN 2.177 2.5887 NaN 2.2804 76.307 NaN 104.1 2 0 2 2 0 2 Median Median Median 4.5 0 8.4 61150000 24126000 37024000 30951000 11138000 19812000 0 0 0 30199000 12987000 17212000 2287 2550;12602 True;True 2608;12877 8953;44184;44185;44186;44187 11459;55683;55684;55685;55686 11459;55685 Q9Y3C4 Q9Y3C4 1 1 1 EKC/KEOPS complex subunit TPRKB TPRKB sp|Q9Y3C4|TPRKB_HUMAN EKC/KEOPS complex subunit TPRKB OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPRKB PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.9 10.9 10.9 19.661 175 175 0.00093853 3.1111 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6999 0.79863 42.547 3 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 0 0 1 Median Median Median 10.9 10.9 10.9 70581000 36029000 34552000 23102000 11546000 11555000 25386000 13426000 11960000 22093000 11057000 11036000 2288 12939 True 13220 45317;45318;45319 57107;57108;57109 57107 Q9Y3C8 Q9Y3C8 2 2 2 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 UFC1 sp|Q9Y3C8|UFC1_HUMAN Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UFC1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 11.4 11.4 11.4 19.458 167 167 0 4.8486 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2057 1.3002 4.9218 6 0 Leave out requantified 1.2057 0.91227 1.6407 1.312 1.0457 1.714 6.1969 6.4671 34.156 2 2 2 0 0 0 Median Median Median 11.4 11.4 11.4 392540000 182670000 209880000 128280000 59312000 68965000 142610000 72980000 69630000 121660000 50373000 71283000 2289 10103;17932 True;True 10302;18300 35660;35661;35662;62504;62505;62506 45244;45245;45246;45247;79213;79214;79215 45246;79214 Q9Y3D0 Q9Y3D0 4 4 4 Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 FAM96B sp|Q9Y3D0|CIA2B_HUMAN Cytosolic iron-sulfur assembly component 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CIAO2B PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 3 3 4 3 3 4 3 3 41.7 41.7 41.7 17.663 163 163 0 11.753 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92753 0.99418 26.977 10 0 Leave out requantified 1.0899 0.90232 0.90667 1.1806 0.97035 0.90502 23.619 18.625 6.3847 4 3 3 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 41.7 30.7 30.7 355090000 182260000 172830000 117830000 58552000 59277000 112800000 60045000 52755000 124460000 63661000 60801000 2290 3645;11441;14176;14338 True;True;True;True 3719;11663;14476;14641 12817;12818;12819;40062;49537;49538;49539;50046;50047;50048 16401;16402;16403;16404;16405;16406;50618;62497;62498;63149 16406;50618;62497;63149 Q9Y3D6 Q9Y3D6 2 2 2 Mitochondrial fission 1 protein FIS1 sp|Q9Y3D6|FIS1_HUMAN Mitochondrial fission 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIS1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 15.8 15.8 15.8 16.937 152 152 0 27.258 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7645 0.84811 7.1283 8 2 Leave out requantified 0.80762 0.71994 1.1663 0.88425 0.82033 1.2114 1.2266 1.576 59.53 2 3 3 0 1 1 Median Median Median 15.8 15.8 15.8 198950000 115520000 83430000 52926000 29136000 23790000 69792000 42730000 27062000 76237000 43658000 32579000 2291 6060;6181 True;True 6176;6297 20985;20986;20987;21394;21395;21396;21397;21398 26699;26700;26701;26702;26703;26704;27221;27222;27223;27224;27225;27226;27227 26701;27223 Q9Y3D8 Q9Y3D8 4 4 4 Adenylate kinase isoenzyme 6 AK6 sp|Q9Y3D8|KAD6_HUMAN Adenylate kinase isoenzyme 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AK6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 29.7 29.7 29.7 20.061 172 172 0 21.241 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.93237 0.97349 8.5867 15 1 Leave out requantified 0.89056 0.92793 0.83958 0.94361 1.0168 0.8341 8.2505 9.8972 18.099 5 5 5 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 29.7 29.7 29.7 490900000 248060000 242840000 157040000 77990000 79049000 161620000 82882000 78739000 172240000 87187000 85049000 2292 3494;11598;15383;18385 True;True;True;True 3567;11834;15713;18759 12279;12280;12281;40655;40656;40657;40658;40659;40660;53640;53641;53642;64044;64045;64046 15724;51322;51323;51324;51325;51326;51327;51328;51329;51330;51331;51332;67801;67802;67803;67804;81103;81104;81105;81106;81107 15724;51325;67802;81106 Q9Y3D9 Q9Y3D9 1 1 1 28S ribosomal protein S23, mitochondrial MRPS23 sp|Q9Y3D9|RT23_HUMAN 28S ribosomal protein S23, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS23 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 5.3 5.3 5.3 21.77 190 190 0.0094583 2.2331 By MS/MS NaN NaN NaN 1 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 1 Median Median Median 0 0 5.3 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Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit STK24 sp|Q9Y6E0|STK24_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK24 PE=1 SV=1 1 14 14 8 11 13 11 11 13 11 5 8 5 32.5 32.5 22.3 49.307 443 443 0 72.307 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.9345 1.0191 14.115 41 12 Leave out requantified 0.89713 0.9327 0.9453 0.97903 1.0623 0.98191 16.187 13.959 12.775 13 15 13 3 6 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 25.3 30.7 25.3 2314200000 1378900000 935340000 788820000 520190000 268640000 697800000 319370000 378440000 827620000 539360000 288260000 2335 115;255;256;3468;5750;6133;6465;9101;9231;9232;12153;12307;14780;16179 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 117;257;258;3540;5861;6249;6588;9285;9419;9420;12412;12576;15097;16521 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