Sequence Modifications Mass Mass Fractional Part Protein Groups Proteins Gene Names Protein Names Unique (Groups) Unique (Proteins) Acetyl (Protein N-term) Oxidation (M) Missed cleavages Experiment C1218 Experiment C1277 Experiment C1368 Experiment C1403 Experiment C1438 Experiment C1563 Experiment C1576 Experiment DMIX1 Experiment DMIX3 Experiment DMIX4 Experiment DMIX5 Experiment DMIX7 Experiment DMIX8 Retention time Calibrated retention time Charges PEP MS/MS scan number Raw file Score Delta score Intensity Intensity C1218 Intensity C1277 Intensity C1368 Intensity C1403 Intensity C1438 Intensity C1563 Intensity C1576 Intensity DMIX1 Intensity DMIX3 Intensity DMIX4 Intensity DMIX5 Intensity DMIX7 Intensity DMIX8 Reverse Potential contaminant id Protein group IDs Peptide ID Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs MS/MS Count AAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAK Unmodified 1595.838 0.83796706 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 85.629 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115;116;117;118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129;130;131;132;133;134;135;136;137;138;139;140;141;142;143;144;145;146;147;148;149 136 34 AAAAAGAGSGPWAAQEK Acetyl (Protein N-term) 1554.7427 0.74266969 2833 P86791;P86790;F8WD66 CCZ1;CCZ1B Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog;Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 82.286 82.286 2 6.6183E-05 83891 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.245 66.791 50061000 0 27069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22992000 14 2833 13 113;114;115;116;117 150;151;152;153;154;155 154 6 AAAAAGLGGGGAGPGPEAGDFLAR Acetyl (Protein N-term) 2052.0025 0.0024662011 2221 P23610 F8A1 Factor VIII intron 22 protein yes yes 1 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 134.54 134.54 2;3 3.5981E-63 138699 QUIQUE_C1277_190116_001 162.37 149.81 245380000 38684000 58579000 0 0 31381000 0 34812000 0 0 13855000 0 39284000 28782000 15 2221 14 118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129 156;157;158;159;160;161;162;163;164;165;166;167 159 12 AAAAAGTATSQR Acetyl (Protein N-term) 1116.5523 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196 28 AAAAASAAGPGGLVAGK Unmodified 1338.7256 0.72556306 542 A6NIH7 UNC119B Protein unc-119 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 38.338 38.338 2 0.010887 34278 QUIQUE_C1218_190116_001 101.79 79.793 29055000 29055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 542 17 154;155 210;211 210 1 AAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGR Acetyl (Protein N-term) 1795.8561 0.85613631 4561 Q9Y2K2 SIK3 Serine/threonine-protein kinase SIK3 yes yes 1 0 0 1 1 1 53.696 53.696 2 2.6543E-275 52072 QUIQUE_C1218_190116_001 276.59 262.62 85138000 38501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46637000 0 19 4561 18 156;157;158 212;213;214 212 3 AAAAASHLNLDALR Acetyl (Protein N-term) 1434.7579 0.75792582 2962 Q13049;Q5JVY0 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.98 104.98 2 4.456E-07 109584 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.57 101.9 316450000 0 58585000 42874000 0 52646000 0 41088000 0 0 21758000 51215000 48280000 0 20 2962 19 159;160;161;162;163;164;165;166 215;216;217;218;219;220;221;222 220 3 AAAAASHLNLDALR Unmodified 1392.7474 0.74736113 2962 Q13049;Q5JVY0 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes no 0 0 0 1 1 79.123 79.123 3 0.011386 81022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.179 18.791 845500000 0 0 0 0 0 438530000 0 0 0 0 406970000 0 0 21 2962 19 167;168 223;224 224 2 AAAAELSLLEK Acetyl (Protein N-term) 1156.634 0.63395409 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 136.4 136.4 2 9.1694E-05 140608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.48 94.406 766880000 0 88068000 83065000 65256000 12515000 68926000 60155000 75452000 64082000 39449000 75330000 73094000 61486000 22 1523 20 169;170;171;172;173;174;175;176;177;178;179;180;181;182 225;226;227;228;229;230;231;232;233;234;235;236;237;238;239;240;241;242;243;244;245;246;247;248 245 24 AAAAEQQQFYLLLGNLLSPDNVVR Acetyl (Protein N-term) 2671.397 0.39696528 1117 H0Y3V4 IPO5 yes yes 1 0 0 1 179.87 179.87 3 4.2527E-05 183464 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.175 45.711 30024000 0 0 0 0 0 0 0 0 30024000 0 0 0 0 23 1117 21 183 249 249 1 AAAAKPNNLSLVVHGPGDLR Acetyl (Protein N-term) 2041.1069 0.10687169 2848 Q00796;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.828 83.828 3 1.8936E-37 85634 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.5 119.58 5478800000 204920000 278590000 248210000 248750000 419040000 0 397280000 595010000 839160000 97804000 768470000 560400000 821140000 24 2848 22 184;185;186;187;188;189;190;191;192;193;194;195 250;251;252;253;254;255;256;257;258;259;260;261;262;263 258 12 AAAAPNAGGSAPETAGSAEAPLQYSLLLQYLVGDKR Acetyl (Protein N-term) 3598.8267 0.82674025 4618 Q9Y584 TIMM22 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 yes yes 1 0 1 2 1 1 1 167.97 167.97 3 8.6193E-54 172457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.52 102.99 179240000 0 0 0 0 0 0 0 41078000 31466000 0 0 56504000 50194000 25 4618 23 196;197;198;199;200 264;265;266;267;268 266 5 AAAAQLSLTQLSSGNPVYEK Acetyl (Protein N-term) 2089.0691 0.069148783 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.03 141.03 2;3 2.3923E-65 145298 QUIQUE_C1277_190116_001 223.72 209.03 398590000 0 70459000 37239000 34266000 0 24512000 34942000 42844000 50719000 16990000 0 41426000 45194000 26 2449 24 201;202;203;204;205;206;207;208;209;210;211;212;213 269;270;271;272;273;274;275;276;277;278;279;280;281;282;283 269 15 AAAAVQGGR Acetyl (Protein N-term) 841.44061 0.44061443 36 E9PL01;A0A087WUC6;E9PI68;Q15005 SPCS2 Signal peptidase complex subunit 2 yes no 1 0 0 2 1 1 28.461 28.461 2 0.021984 23016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.604 37.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 36 25 214;215;216;217 284;285;286;287 286 4 AAAAVSESWPELELAER Acetyl (Protein N-term) 1869.9109 0.91085723 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 1 0 0 2 1 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 155.98 155.98 2;3 2.8317E-75 160276 QUIQUE_C1277_190116_001 241.17 225.8 1171800000 94097000 94025000 101200000 114530000 70937000 63057000 76696000 95404000 122090000 49978000 114970000 94567000 80253000 28 3576 26 218;219;220;221;222;223;224;225;226;227;228;229;230;231;232;233;234;235;236;237;238 288;289;290;291;292;293;294;295;296;297;298;299;300;301;302;303;304;305;306;307;308;309;310;311;312;313 291 24 AAAAVVEFQR Acetyl (Protein N-term) 1102.5771 0.57710791 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 103.48 103.48 2 7.8154E-05 106519 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.52 91.83 364020000 0 0 81561000 0 78356000 56418000 39550000 0 74086000 34045000 0 0 0 29 1388 27 239;240;241;242;243;244;245;246;247;248 314;315;316;317;318;319;320;321;322;323;324;325 322 12 AAADGDDSLYPIAVLIDELR Acetyl (Protein N-term) 2158.0794 0.079379118 2309 P30153;C9J9C1;M0QXG4;M0R0K6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 3 3 2 3 3 2 182.49 182.49 2;3 1.0852E-37 184816 QUIQUE_DMIX7_190116_001 194.48 174.74 2578400000 70864000 27887000 0 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CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 169.7 169.7 3 6.7162E-12 171244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.33 104.75 187100000 0 18613000 0 13760000 37965000 0 0 40774000 36185000 11608000 0 0 28197000 33 528 31 277;278;279;280;281;282;283;284 357;358;359;360;361;362;363;364;365 360 7 AAAEAAVPR Unmodified 854.46102 0.46101552 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 16.504 16.504 2 0.029012 8644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.721 29.857 17926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17926000 0 0 0 34 4355 32 285 366 366 1 AAAEAGGDDAR Acetyl (Protein N-term) 1044.4472 0.44721595 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.645 22.645 2 0.0019523 16204 QUIQUE_C1438_190116_001 72.643 63.78 468600000 0 33286000 49214000 51313000 37857000 32912000 47871000 0 34232000 0 61948000 52605000 67365000 35 531 33 286;287;288;289;290;291;292;293;294;295 367;368;369;370;371;372;373;374;375;376 370 10 AAAEDVNVTFEDQQK Unmodified 1663.7689 0.76894402 975 E9PQY2;Q9NQP4 PFDN4 Prefoldin subunit 4 yes no 0 0 0 1 58.365 58.365 2 0.0018086 56878 QUIQUE_C1403_190116_001 69.721 56.058 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36 975 34 296 377 377 1 AAAEEEPKPK Acetyl (Protein N-term) 1110.5557 0.55570376 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.604 17.604 2 0.0033845 9780 QUIQUE_C1563_190116_001 95.502 66.353 884860000 76163000 58468000 77423000 71971000 72397000 56308000 66277000 77681000 64578000 0 108970000 66895000 87735000 37 2663 35 297;298;299;300;301;302;303;304;305;306;307;308 378;379;380;381;382;383;384;385;386;387;388;389 383 6 AAAEPSPR Acetyl (Protein N-term) 839.41373 0.41373097 3256 Q53H96;F8WEI0 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate reductase 3 yes no 1 0 0 1 1 1 22.52 22.52 2 0.0042216 15557 QUIQUE_C1563_190116_001 94.006 36.195 20960000 0 0 0 0 0 20960000 0 0 0 0 0 0 0 38 3256 36 309;310;311 390;391;392 391 3 AAAEVNQDYGLDPK Unmodified 1489.7049 0.7048872 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.078 51.078 2 2.6688E-10 49291 QUIQUE_C1277_190116_001 133.07 103.52 5721500000 562830000 398880000 494630000 426590000 413340000 436250000 460660000 359590000 459330000 209390000 547380000 436910000 515750000 39 1935 37 312;313;314;315;316;317;318;319;320;321;322;323;324 393;394;395;396;397;398;399;400;401;402;403;404;405;406;407;408;409;410;411;412;413;414;415;416;417;418;419;420 397 28 AAAFEEQENETVVVK Unmodified 1662.8101 0.81008055 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 60.383 60.383 2 8.196E-29 58649 QUIQUE_C1403_190116_001 160.36 128.51 103430000 0 0 0 45139000 0 0 0 35228000 0 23061000 0 0 0 40 4600 38 325;326;327 421;422;423 421 3 AAAFEQLQK Unmodified 1004.5291 0.52909508 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.192 35.192 2 3.0321E-06 30043 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.17 106.36 1489500000 110120000 125300000 131660000 130980000 62414000 120430000 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2 2 2 2 2 156.41 156.41 3;4 6.9015E-131 162054 QUIQUE_C1368_190116_001 157.45 153.82 7604300000 746850000 944140000 885970000 667490000 987620000 590420000 1048800000 105090000 283250000 95762000 454050000 362770000 432120000 43 3050 41 369;370;371;372;373;374;375;376;377;378;379;380;381;382;383;384;385;386;387;388;389;390;391;392;393;394 472;473;474;475;476;477;478;479;480;481;482;483;484;485;486;487;488;489;490;491;492;493;494;495;496;497;498;499;500;501;502;503;504;505;506;507;508;509;510;511;512;513;514;515;516;517;518;519;520;521 482 50 AAAGDLGGDHLAFSCDVAK Unmodified 1873.8629 0.86286118 3594 Q8N4T8;H0Y962 CBR4 Carbonyl reductase family member 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.288 72.288 2;3 5.7064E-29 72250 QUIQUE_C1368_190116_001 150.22 135.01 235340000 67835000 0 0 0 0 48349000 64593000 0 0 0 0 54564000 0 44 3594 42 395;396;397;398;399 522;523;524;525;526 523 3 AAAGEFADDPCSSVK Unmodified 1523.6562 0.65622244 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJ41 CTNNA1 Catenin alpha-1 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35334000 0 40704000 0 42606000 37416000 51176000 50 3669 48 435;436;437;438;439;440;441;442;443;444 564;565;566;567;568;569;570;571;572;573 573 3 AAAHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLK Unmodified 2716.4119 0.41190384 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 105.18 105.18 3;4;5 8.2531E-09 109177 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.864 60.832 359260000 0 0 21268000 0 28049000 0 105480000 0 0 0 47521000 48357000 108590000 51 2068 49 445;446;447;448;449;450;451 574;575;576;577;578;579;580;581 579 8 AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGK Unmodified 2264.126 0.12595216 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 3 2 3 4 2 2 3 2 4 4 3 3 4 114.31 114.31 2;3 1.0182E-59 118088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.81 145.99 13773000000 1012000000 1147300000 1000900000 1236600000 1067500000 1158500000 1192700000 690000000 1143500000 586510000 1256800000 1040100000 1240200000 52 282 50 452;453;454;455;456;457;458;459;460;461;462;463;464;465;466;467;468;469;470;471;472;473;474;475;476;477;478;479;480;481;482;483;484;485;486;487;488;489;490 582;583;584;585;586;587;588;589;590;591;592;593;594;595;596;597;598;599;600;601;602;603;604;605;606;607;608;609;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;620;621;622;623;624;625;626;627;628;629;630;631;632;633;634;635;636;637;638 616 55 AAALEAMKDYTK Unmodified 1310.654 0.6540376 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 1 1 47.415 47.415 2 0.00045189 44318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.02 96.4 70581000 0 0 0 0 0 0 0 70581000 0 0 0 0 0 53 2343 51 491 639 639 1 AAALEFLNR Unmodified 1003.5451 0.5450795 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.347 78.347 2 1.2889E-07 79140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.11 117.37 3272200000 341660000 376870000 293300000 293610000 279810000 298510000 329720000 106300000 196810000 161380000 205380000 189780000 199090000 54 2343 52 492;493;494;495;496;497;498;499;500;501;502;503;504 640;641;642;643;644;645;646;647;648;649;650;651;652;653;654;655;656;657;658;659 651 20 AAALEFLNRFEEAKR Unmodified 1763.9319 0.93186744 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 2 1 92.556 92.556 4 0.018176 93442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.815 25.407 19649000 0 0 0 0 0 0 0 19649000 0 0 0 0 0 55 2343 53 505 660 660 1 AAALEQFK Unmodified 876.47052 0.47051757 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.641 33.641 2 0.010167 28134 QUIQUE_C1368_190116_001 91.626 60.958 775110000 182600000 0 111500000 126360000 0 0 0 153460000 0 72880000 0 0 128310000 56 2993 54 506;507;508;509;510;511 661;662;663;664;665;666 662 6 AAALSPEDETWEVLEEAPPPVFPLRPGGLPGLCEWLR Unmodified 4098.0561 0.056088261 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 1 1 2 1 169.68 169.68 3;4 4.2315E-32 175084 QUIQUE_C1576_190116_001 90.944 86.871 150420000 0 0 0 0 0 0 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processed yes yes 1 1 0 1 1 1 1 43.368 43.368 2 6.5837E-19 39882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.1 115.22 12489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12489000 0 0 0 60 2768 57 528;529;530;531 683;684;685;686 684 2199 3 AAAMVPGR Acetyl (Protein N-term) 813.41671 0.41670786 1133 H0Y8X4;O43598 DNPH1 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 yes no 1 0 0 1 1 58.986 58.986 2 0.037332 58170 QUIQUE_C1277_190116_001 55.441 33.894 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61 1133 58 532;533 687;688 687 2 AAAPAPEEEMDECEQALAAEPK Unmodified 2356.0199 0.019891683 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 98.196 98.196 2;3 4.4873E-36 101786 QUIQUE_C1218_190116_001 163.8 154 546610000 65927000 56456000 55707000 62268000 43670000 80995000 42503000 0 0 0 41173000 43086000 54821000 62 2255 59 534;535;536;537;538;539;540;541;542;543;544 689;690;691;692;693;694;695;696;697;698;699;700;701 689 13 AAAPGTAVLLVTANVGSLFDDPENLQK Unmodified 2710.4178 0.4177603 3074 Q5T1B5;Q14642 INPP5A Type I inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 165.74 165.74 3 0.0002068 170848 QUIQUE_C1218_190116_001 44.161 40.45 147030000 31329000 0 27854000 0 0 0 0 0 24819000 0 63024000 0 0 63 3074 60 545;546;547;548 702;703;704;705 702 4 AAAPPSYCFVAFPPR Acetyl (Protein N-term) 1691.813 0.81299786 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 1 0 0 5 2 2 2 6 6 2 1 3 5 3 2 4 144.1 144.1 2 7.7583E-13 147696 QUIQUE_C1277_190116_001 131.28 114.65 2610800000 142740000 158780000 207400000 225090000 140710000 451590000 171640000 0 194830000 180670000 261810000 0 475510000 64 2941 61 549;550;551;552;553;554;555;556;557;558;559;560;561;562;563;564;565;566;567;568;569;570;571;572;573;574;575;576;577;578;579;580;581;582;583;584;585;586;587;588;589;590;591 706;707;708;709;710;711;712;713;714;715;716;717;718;719;720;721;722;723;724;725;726;727;728;729;730;731;732;733;734;735;736;737;738;739;740;741;742;743;744;745;746;747;748;749;750;751;752;753;754;755;756;757;758;759;760;761;762;763;764;765;766;767;768;769;770;771;772;773;774;775;776;777;778;779;780;781;782;783;784;785;786 713 80 AAAQCYIDLIIK Unmodified 1377.7326 0.73262227 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.8 121.8 2 0.00084481 125557 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.21 80.091 210610000 0 0 0 38993000 49232000 0 54308000 0 0 0 0 68077000 0 65 2629 62 592;593;594;595 787;788;789;790 790 4 AAAQLLQSQAQQSGAQQTK Unmodified 1956.0025 0.0024662011 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 41.545 41.545 2;3 1.2532E-132 37896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 289.72 279.11 21167000000 1890500000 1841100000 953040000 2045500000 2006400000 2469400000 1582900000 1853800000 986320000 701320000 1896500000 1488000000 1452100000 66 820 63 596;597;598;599;600;601;602;603;604;605;606;607;608;609;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;620;621 791;792;793;794;795;796;797;798;799;800;801;802;803;804;805;806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818;819;820;821;822;823 817 33 AAAQLLQSQAQQSGAQQTKK Unmodified 2084.0974 0.097429219 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 29.008 29.008 2;3 1.6158E-17 24242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.62 110.06 780850000 0 0 0 0 0 0 0 331010000 112650000 0 118050000 110310000 108830000 67 820 64 622;623;624;625;626;627 824;825;826;827;828;829 825 6 AAASGSVLQR Acetyl (Protein N-term) 1000.5302 0.53015772 3338 Q5VWZ2 LYPLAL1 Lysophospholipase-like protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.603 51.603 2 0.00071266 49758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.635 57.685 1488200000 140770000 0 138360000 98649000 151420000 132160000 101200000 113150000 144390000 57047000 134510000 151810000 124690000 68 3338 65 628;629;630;631;632;633;634;635;636;637;638;639 830;831;832;833;834;835;836;837;838;839;840;841 839 7 AAASTDYYK Unmodified 988.45018 0.45017606 1943 P08559 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.361 19.361 2 0.010766 12351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.665 48.771 745330000 0 138560000 0 0 0 0 0 281710000 0 238060000 0 87005000 0 69 1943 66 640;641;642;643 842;843;844;845 843 2 AAATAEEPDPK Unmodified 1098.5193 0.51931826 3972 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;A8MXH2;E9PKT8;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 13.89 13.89 2 0.0009759 6187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.051 60.978 216680000 0 21288000 0 9992600 0 0 0 90447000 0 84912000 0 10038000 0 70 3972 67 644;645;646;647;648 846;847;848;849;850 848 5 AAATGPSFWLGNETLK Acetyl (Protein N-term) 1703.8519 0.85188578 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.42 149.42 2 2.1288E-10 151937 QUIQUE_C1563_190116_001 158.4 140.13 3180100000 251390000 272650000 270740000 233580000 264030000 190190000 135790000 293760000 273850000 97311000 319490000 268790000 308570000 71 2049 68 649;650;651;652;653;654;655;656;657;658;659;660;661 851;852;853;854;855;856;857;858;859;860;861;862;863;864;865;866;867;868;869;870;871;872;873;874;875 861 25 AAATPEPAMAQPDSTAPEGATGQAPPSSK Unmodified 2735.2708 0.27083807 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 57.401 57.401 3 0.00013753 55807 QUIQUE_C1403_190116_001 43.256 36.144 42806000 0 0 0 42806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72 872;3632 69 662 876 876 1 AAATPESQEPQAK Unmodified 1326.6416 0.64155866 2520 P49006 MARCKSL1 MARCKS-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.267 14.267 2 0.00017519 5853 QUIQUE_C1563_190116_001 142.83 121.38 3731100000 551620000 328770000 240340000 228100000 551220000 479250000 324820000 61655000 247070000 46527000 237430000 188280000 245970000 73 2520 70 663;664;665;666;667;668;669;670;671;672;673;674;675 877;878;879;880;881;882;883;884;885;886;887;888;889 882 13 AAATTSQPVLTSQQIETIFFK Unmodified 2280.2002 0.20016296 2020 P11274;H0Y554 BCR Breakpoint cluster region protein yes no 0 0 0 1 1 144.94 144.94 2 0.00080504 150876 QUIQUE_C1218_190116_001 67.964 49.135 30798000 0 0 0 0 0 0 0 30798000 0 0 0 0 0 74 2020 71 676;677 890;891 890 1 AAAVAAAGAGEPQSPDELLPK Acetyl (Protein N-term) 2004.0164 0.016384931 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 1 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 131.43 131.43 2;3 3.6328E-41 133835 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.29 158.52 899460000 99993000 68336000 73202000 95562000 52695000 64757000 90765000 52205000 57029000 38351000 75701000 61968000 68893000 75 4280 72 678;679;680;681;682;683;684;685;686;687;688;689;690;691;692;693;694;695;696;697 892;893;894;895;896;897;898;899;900;901;902;903;904;905;906;907;908;909;910;911;912;913;914;915;916;917;918 909 26 AAAVDPTPAAPAR Unmodified 1206.6357 0.63568542 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 25.38 25.38 2 0.02625 19407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.094 28.535 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76 3295 73 698 919 919 1 AAAVLPVLDLAQR Unmodified 1335.7874 0.78743503 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 116.4 116.4 2;3 0.00043338 119097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.67 99.484 5937400000 620760000 537190000 563440000 409160000 436590000 412720000 523620000 311020000 434790000 175740000 547390000 473310000 491650000 77 856 74 699;700;701;702;703;704;705;706;707;708;709;710;711;712;713;714 920;921;922;923;924;925;926;927;928;929;930;931;932;933;934;935;936;937;938;939;940;941;942;943;944;945;946;947;948;949;950 939 31 AAAVPQR Acetyl (Protein N-term) 753.41334 0.41333704 2846 Q00688;G3V5F2 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes no 1 0 0 1 1 1 29.467 29.467 2 0.024433 24025 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.131 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kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.56 134.56 2 1.1974E-12 137612 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.09 122.23 209700000 0 0 38582000 15696000 27443000 17576000 0 29842000 35495000 17792000 0 27271000 0 82 1408 79 760;761;762;763;764;765;766;767 1011;1012;1013;1014;1015;1016;1017;1018 1015 8 AAAVSSVVR Acetyl (Protein N-term) 900.50288 0.50288033 532 A6NDU8;A0A0C4DGW6 C5orf51 UPF0600 protein C5orf51 yes no 1 0 0 1 74.879 74.879 2 0.019319 71023 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.436 31.287 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83 532 80 768 1019 1019 1 AAAYNLVQHGITNLCVIGGDGSLTGANIFR Unmodified 3101.5717 0.57165196 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 145.53 145.53 3;4 5.6573E-234 149761 QUIQUE_C1403_190116_001 176.7 170.98 4300500000 405820000 443790000 651360000 542070000 365670000 304250000 334940000 40068000 454930000 198190000 140890000 418530000 0 84 2129 81 769;770;771;772;773;774;775;776;777;778;779;780;781;782;783;784;785;786;787;788 1020;1021;1022;1023;1024;1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;1033;1034;1035;1036;1037;1038;1039;1040;1041;1042;1043;1044;1045;1046;1047;1048;1049;1050;1051;1052;1053 1034 33 AACAQLNDFLQEYGTQGCQV Unmodified 2271.9889 0.98886633 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 143.88 143.88 2 5.5836E-06 150753 QUIQUE_C1438_190116_001 85.522 80.204 25116000 0 0 0 0 25116000 0 0 0 0 0 0 0 0 85 290;327;328 82 789 1054 1054 1 AACLCFR Unmodified 896.39968 0.39967759 6;4349;1765;3650 A0A024RBG1;Q96G61;Q8NFP7;Q9NZJ9;O95989 NUDT4;NUDT11;NUDT10;NUDT3 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-alpha;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.155 38.155 2 0.037484 33779 QUIQUE_C1277_190116_001 85.306 66.501 1024100000 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.813 30.813 2 0.0032345 25602 QUIQUE_C1438_190116_001 132.72 97.825 5857200000 467440000 475260000 507000000 574990000 446080000 361060000 509300000 336890000 473100000 172560000 461590000 559300000 512680000 89 2861 86 806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818 1074;1075;1076;1077;1078;1079;1080;1081;1082;1083;1084;1085;1086;1087;1088 1078 15 AADAEAEVASLNR Unmodified 1315.6368 0.63680763 1260;1908 J3KN67;P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.98 43.98 2;3 7.4916E-06 41369 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 1.8939 1173900000 1007600000 40979000 38542000 42597000 0 29519000 0 0 0 14687000 0 0 0 90 1260;1908 87 819;820;821;822;823;824 1089;1090;1091;1092;1093;1094 1089 6 AADALEEQQR Unmodified 1129.5364 0.53636531 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.956 18.956 2 0.00026426 11808 QUIQUE_C1218_190116_001 126.24 101.4 526150000 32117000 43302000 72808000 39239000 48429000 65003000 0 52893000 42539000 28353000 62215000 0 39249000 91 3091 88 825;826;827;828;829;830;831;832;833;834;835;836 1095;1096;1097;1098;1099;1100;1101;1102;1103;1104;1105;1106 1095 12 AADAVEDLR Unmodified 958.47197 0.47197413 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.75 32.75 2 0.00048805 27589 QUIQUE_C1403_190116_001 114.89 39.785 1816300000 138750000 179130000 0 183180000 158530000 159660000 0 121200000 146980000 78479000 268090000 140850000 241450000 92 4510 89 837;838;839;840;841;842;843;844;845;846;847;848 1107;1108;1109;1110;1111;1112;1113;1114;1115;1116;1117;1118 1109 11 AADCEVEQWDSDEPIPAK Unmodified 2058.8841 0.88405013 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 87.183 87.183 2 2.1136E-38 88650 QUIQUE_C1277_190116_001 211.38 205.89 2040900000 181640000 181250000 248950000 201850000 172450000 147360000 216350000 79884000 155020000 54548000 136180000 140390000 124990000 93 4405 90 849;850;851;852;853;854;855;856;857;858;859;860;861;862 1119;1120;1121;1122;1123;1124;1125;1126;1127;1128;1129;1130;1131;1132;1133;1134;1135;1136;1137 1121 18 AADCEVEQWDSDEPIPAKELER Unmodified 2586.1544 0.15441133 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 97.125 97.125 3 8.9892E-12 101138 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.13 107.67 346570000 0 0 0 0 0 0 0 84868000 43273000 0 88483000 63321000 66625000 94 4405 91 863;864;865;866;867 1138;1139;1140;1141;1142;1143 1141 6 AADDFLEDLPLEETGAIER Unmodified 2103.0008 0.0007944461 3251 Q53G44 IFI44L Interferon-induced protein 44-like yes yes 0 0 0 1 1 1 150.1 150.1 2 1.1477E-07 157084 QUIQUE_C1438_190116_001 108.71 98.591 95246000 0 0 0 0 42243000 0 0 28895000 0 0 24108000 0 0 95 3251 92 868;869;870 1144;1145;1146 1144 3 AADDTWEPFASGK Unmodified 1393.615 0.61500956 1836 P02766;A0A087WT59;A0A087WV45 TTR Transthyretin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.345 86.345 2 5.5021E-17 87796 QUIQUE_C1277_190116_001 185.18 167.74 1480900000 121770000 137500000 159320000 218760000 170550000 184830000 171780000 131050000 106800000 78520000 0 0 0 96 1836 93 871;872;873;874;875;876;877;878;879;880 1147;1148;1149;1150;1151;1152;1153;1154;1155;1156;1157;1158;1159;1160 1149 14 AADEEAFEDNSEEYIR Unmodified 1886.7806 0.78063091 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.826 84.826 2 1.3484E-44 86528 QUIQUE_C1368_190116_001 184.03 169.57 501520000 37330000 56279000 45628000 0 44919000 47158000 44786000 31308000 38274000 0 52477000 46001000 57365000 97 2657 94 881;882;883;884;885;886;887;888;889;890;891 1161;1162;1163;1164;1165;1166;1167;1168;1169;1170;1171 1163 10 AADEEAFEDNSEEYIRR Unmodified 2042.8817 0.88174194 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 1 1 1 69.834 69.834 3 0.00019091 70056 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.407 47.124 61472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29339000 32133000 0 98 2657 95 892;893 1172;1173 1173 2 AADFEDLLSGQGFNAHK Unmodified 1818.8537 0.8536767 1607 O75061 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.51 113.51 3 0.0034128 118202 QUIQUE_C1218_190116_001 55.851 49.123 506580000 98896000 0 0 104050000 0 0 107960000 54362000 0 0 0 64265000 77047000 99 1607 96 894;895;896;897;898;899 1174;1175;1176;1177;1178;1179 1174 2 AADFIDQALAQK Unmodified 1289.6616 0.66156582 2580 P51452;K7ES89;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.891 98.891 2 7.3026E-05 95696 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.24 121.48 452090000 186950000 0 0 0 0 0 0 181330000 0 83809000 0 0 0 100 2580 97 900;901;902;903;904 1180;1181;1182;1183;1184 1183 5 AADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQK Unmodified 2534.1826 0.18261541 4545 Q9Y277 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes yes 0 0 0 3 3 3 3 2 3 3 4 3 2 3 2 3 78.875 78.875 2;3;4 7.6182E-128 79514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 253.48 217.09 7775900000 796420000 678370000 650690000 683170000 421090000 672550000 636220000 578810000 570120000 446450000 551890000 519390000 570730000 101 4545 98 905;906;907;908;909;910;911;912;913;914;915;916;917;918;919;920;921;922;923;924;925;926;927;928;929;930;931;932;933;934;935;936;937;938;939;940;941 1185;1186;1187;1188;1189;1190;1191;1192;1193;1194;1195;1196;1197;1198;1199;1200;1201;1202;1203;1204;1205;1206;1207;1208;1209;1210;1211;1212;1213;1214;1215;1216;1217;1218;1219;1220;1221;1222;1223;1224;1225;1226;1227;1228;1229;1230;1231;1232;1233;1234;1235;1236;1237;1238;1239;1240;1241;1242;1243;1244;1245;1246;1247;1248 1222 64 AADGNYYNAR Unmodified 1113.4839 0.4839358 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.379 20.379 2 1.1857E-06 13413 QUIQUE_C1576_190116_001 160.75 156.33 3481000000 313460000 261890000 355710000 0 285750000 263570000 276920000 243870000 391120000 143210000 393830000 326760000 224880000 102 1140;3457 99 942;943;944;945;946;947;948;949;950;951;952;953 1249;1250;1251;1252;1253;1254;1255;1256;1257;1258;1259;1260 1254 10 AADIDQEVKER Unmodified 1272.631 0.63099397 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 21.06 21.06 2;3 0.00036428 14095 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.55 67.948 981470000 0 0 0 0 0 0 0 248120000 268520000 0 210780000 86377000 167680000 103 3499 100 954;955;956;957;958;959;960 1261;1262;1263;1264;1265;1266;1267;1268 1268 5 AADIHTFSSVLEK Unmodified 1416.7249 0.72489436 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 72.456 72.456 3 0.033286 73055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 30.998 17.564 28056000 0 0 0 0 0 0 0 0 28056000 0 0 0 0 104 4080 101 961 1269 1269 1 AADISLDNLVEGK Unmodified 1343.6933 0.69325988 551 A6NNK5;Q12888;H7BZY0 TP53BP1 Tumor suppressor p53-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 101.35 101.35 2 0.025809 104638 QUIQUE_C1368_190116_001 63.212 37.826 69726000 0 0 31031000 0 0 38695000 0 0 0 0 0 0 0 105 551 102 962;963 1270;1271 1270 1 AADLLVNPLDPR Unmodified 1292.7089 0.70885036 2808 P78362;H7C5L6 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 1 1 107.08 107.08 2 0.017643 111419 QUIQUE_C1576_190116_001 60.434 33.919 34068000 0 0 0 0 34068000 0 0 0 0 0 0 0 0 106 2808 103 964;965 1272;1273 1273 2 AADLLYAMCDR Unmodified 1297.5795 0.57949245 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.328 91.328 2 0.010187 95094 QUIQUE_C1218_190116_001 79.974 68.26 432010000 74990000 0 0 0 54825000 0 67576000 0 0 0 79095000 90755000 64764000 107 1749 104 966;967;968;969;970;971;972 1274;1275;1276;1277;1278;1279;1280;1281 1274 6 AADLNLEWISLPR Acetyl (Protein N-term) 1538.8093 0.80929269 4206 Q9HAU0 PLEKHA5 Pleckstrin homology domain-containing family A member 5 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 168.13 168.13 2 2.9826E-06 172995 QUIQUE_C1368_190116_001 125.22 104.44 100130000 17824000 14106000 32738000 12001000 0 19499000 0 0 0 3958100 0 0 0 108 4206 105 973;974;975;976;977;978 1282;1283;1284;1285;1286;1287 1284 6 AADMLSGPR Unmodified 916.44365 0.44365089 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.994 29.994 2 0.0023637 24953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.114 50.991 1474200000 150900000 151310000 310650000 222550000 0 152980000 0 160970000 129970000 75563000 0 119260000 0 109 2295 106 979;980;981;982;983;984;985;986;987 1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296 1293 9 AADPGPGAELDPAAPPPAR Unmodified 1768.8744 0.87441214 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 61.189 61.189 2 0.023347 60739 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.167 47.01 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110 1327 107 988 1297 1297 1 AADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPR Unmodified 2494.2564 0.25644906 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 1 1 72.272 72.272 3 0.0014666 72806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.167 50.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 111 1592 108 989 1298 1298 1 AADVENVPPVISTPHHYLISIYR Unmodified 2590.3544 0.35437219 4566 Q9Y2T2 AP3M1 AP-3 complex subunit mu-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 105.58 105.58 4 3.3613E-06 107919 QUIQUE_C1277_190116_001 65.425 60.193 96860000 44088000 36040000 0 0 0 0 0 0 0 16732000 0 0 0 112 4566 109 990;991;992 1299;1300;1301 1300 3 AADVLVYLADDTVVPLAVENLPSLSAHELHR Unmodified 3326.7511 0.75105611 978 E9PRA3;Q9BZ67 FRMD8 FERM domain-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.44 162.44 4 2.9792E-06 167108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.198 50.108 133220000 0 0 0 0 0 0 0 23862000 64841000 4458100 40059000 0 0 113 978 110 993;994;995;996 1302;1303;1304;1305 1303 4 AAEAAAAPAESAAPAAGEEPSKEEGEPK Unmodified 2635.2249 0.22493374 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 3 2 2 1 1 2 1 36.504 36.504 2;3;4 4.3363E-91 31835 QUIQUE_C1438_190116_001 216.35 209.77 9104500000 785420000 897000000 906270000 616230000 3698200000 718190000 719370000 94688000 0 156000000 270230000 0 242860000 114 2817 111 997;998;999;1000;1001;1002;1003;1004;1005;1006;1007;1008;1009;1010;1011;1012;1013;1014;1015;1016 1306;1307;1308;1309;1310;1311;1312;1313;1314;1315;1316;1317;1318;1319;1320;1321;1322;1323;1324;1325;1326;1327;1328;1329;1330 1318 24 AAEAAINILK Unmodified 1012.5917 0.59169534 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.048 62.048 2 0.00046618 61385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.17 70.899 1154700000 115820000 101020000 118050000 83237000 0 102010000 85764000 83268000 99068000 0 146650000 96865000 122980000 115 1646 112 1017;1018;1019;1020;1021;1022;1023;1024;1025;1026;1027 1331;1332;1333;1334;1335;1336;1337;1338;1339;1340;1341;1342 1338 12 AAEAAPPTQEAQGETEPTEQAPDALEQAADTSR Unmodified 3379.5288 0.52877991 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 88.427 88.427 3 2.0359E-29 91069 QUIQUE_C1218_190116_001 90.323 81.136 77494000 36806000 0 0 0 40688000 0 0 0 0 0 0 0 0 116 3571 113 1028;1029 1343;1344 1343 2 AAEADGPLKR Acetyl (Protein N-term) 1068.5564 0.55637247 1250 J3QS48;I3L295;J3KT75;J3QW43;J3QRD5;O75352;J3KSI4;I3L1D2;I3L4E0 MPDU1 Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein yes no 1 0 1 1 31.688 31.688 2 0.023581 26517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.476 57.291 42784000 0 0 0 0 0 0 0 42784000 0 0 0 0 0 117 1250 114 1030 1345 1345 1 AAEAGGAEEQYGFLTTPTK Unmodified 1939.9163 0.91633654 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.494 84.494 2 1.1777E-73 86029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 227.42 215.81 5541700000 358370000 347170000 305500000 336770000 368510000 325870000 220470000 692850000 700200000 146380000 577730000 485590000 676320000 118 2483 115 1031;1032;1033;1034;1035;1036;1037;1038;1039;1040;1041;1042;1043 1346;1347;1348;1349;1350;1351;1352;1353;1354;1355;1356;1357;1358;1359;1360;1361;1362;1363;1364;1365 1362 20 AAEALAAEAVASR Acetyl (Protein N-term) 1270.6517 0.65172941 521 A2RTX5;B7ZLP8 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.23 126.23 2 0.0011123 130615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.403 80.445 212870000 0 0 21765000 0 29795000 0 22192000 32184000 33167000 0 0 34273000 39495000 119 521 116 1044;1045;1046;1047;1048;1049;1050 1366;1367;1368;1369;1370;1371;1372;1373 1371 6 AAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAK Oxidation (M) 2639.3953 0.39525072 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 150.09 150.09 3 3.045E-36 155517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.84 100.13 1127000000 92744000 47654000 60618000 29298000 0 97709000 24455000 239790000 159930000 45475000 144570000 0 184740000 120 2483 117 1051;1052;1053;1054;1055;1056;1057;1058;1059;1060;1061;1062;1063;1064;1065;1066;1067;1068;1069 1374;1375;1376;1377;1378;1379;1380;1381;1382;1383;1384;1385;1386;1387;1388;1389;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396 1389 1903 22 AAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAK Unmodified 2623.4003 0.4003361 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 4 2 3 4 1 3 166.14 166.14 2;3;4 1.1623E-53 167858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.88 163.06 9658000000 536660000 412790000 369000000 519140000 444840000 378480000 479790000 1737900000 1481600000 245610000 1285200000 555310000 1211700000 121 2483 117 1070;1071;1072;1073;1074;1075;1076;1077;1078;1079;1080;1081;1082;1083;1084;1085;1086;1087;1088;1089;1090;1091;1092;1093;1094;1095 1397;1398;1399;1400;1401;1402;1403;1404;1405;1406;1407;1408;1409;1410;1411;1412;1413;1414;1415;1416;1417;1418;1419;1420;1421;1422;1423;1424;1425;1426;1427;1428;1429;1430;1431;1432;1433;1434;1435;1436;1437;1438;1439;1440 1418 42 AAECNIVVTQPR Unmodified 1356.682 0.68198369 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 39.26 39.26 2 0.016156 35277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.595 52.66 529500000 88760000 0 0 79934000 151370000 0 122490000 0 0 0 86946000 0 0 122 2916 118 1096;1097;1098;1099;1100 1441;1442;1443;1444;1445 1445 4 AAEDDEDDDVDTK Unmodified 1436.5427 0.54269205 677 B8ZZQ6;P06454;B8ZZA1;B8ZZW7;H7C2N1 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.648 17.648 2 2.9804E-06 9590 QUIQUE_C1277_190116_001 128.17 126.36 391950000 83408000 65796000 13037000 25894000 84973000 18505000 23917000 0 13798000 9105000 20060000 12586000 20876000 123 677 119 1101;1102;1103;1104;1105;1106;1107;1108;1109;1110;1111;1112 1446;1447;1448;1449;1450;1451;1452;1453;1454;1455;1456;1457 1447 11 AAEDDEDDDVDTKK Unmodified 1564.6377 0.63765507 677 B8ZZQ6;P06454;B8ZZA1;B8ZZW7;H7C2N1 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 11.14 11.14 3 7.1153E-05 3763 QUIQUE_C1218_190116_001 84.566 80.964 92991000 9015800 0 0 8137200 14063000 0 0 22089000 18995000 10836000 0 9856000 0 124 677 120 1113;1114;1115;1116;1117;1118;1119 1458;1459;1460;1461;1462;1463;1464;1465;1466 1458 9 AAEDEEVPAFFK Unmodified 1351.6296 0.62959699 365 A0A1C7CYX9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.005 97.005 2 2.8606E-06 98224 QUIQUE_C1563_190116_001 138.11 128.32 1909700000 0 116210000 93213000 225850000 94961000 138320000 89598000 200740000 203910000 67149000 179910000 147350000 352460000 125 365 121 1120;1121;1122;1123;1124;1125;1126;1127;1128;1129;1130;1131;1132 1467;1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;1477;1478;1479;1480;1481;1482 1473 16 AAEDLFVNIR Unmodified 1146.6033 0.60332266 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 92.644 92.644 2 0.0059453 96368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.738 62.361 422850000 0 0 42957000 0 37611000 0 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74727000 0 95041000 131 1005;2027 127 1162;1163;1164;1165 1519;1520;1521;1522;1523 1519 5 AAEEPQQQK Acetyl (Protein N-term) 1069.504 0.50400254 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.795 18.795 2 0.00020691 11076 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.06 108.12 2898700000 228350000 277150000 311030000 309470000 0 309090000 255790000 210310000 0 114190000 327140000 202600000 353520000 132 1282 128 1166;1167;1168;1169;1170;1171;1172;1173;1174;1175;1176 1524;1525;1526;1527;1528;1529;1530;1531;1532;1533;1534;1535;1536 1536 10 AAEGAEAQGFSGLFAAYTDHPPPFR Unmodified 2606.219 0.21900092 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 137.36 137.36 3 6.1198E-15 141419 QUIQUE_C1403_190116_001 73.389 70.703 149900000 0 0 0 49086000 0 0 38206000 0 0 0 0 0 62613000 133 4378 129 1177;1178;1179;1180;1181 1537;1538;1539;1540;1541;1542;1543 1537 7 AAEGGLSSPEFSELCIWLGSQIK Unmodified 2478.2101 0.21007572 3246 Q52LJ0 FAM98B Protein FAM98B yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 2 165.34 165.34 2;3 1.4161E-06 167233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.527 62.946 425640000 48763000 35580000 0 18082000 0 0 58839000 77112000 53448000 0 56506000 77305000 0 134 3246 130 1182;1183;1184;1185;1186;1187;1188;1189;1190;1191;1192;1193;1194;1195 1544;1545;1546;1547;1548;1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556;1557 1553 13 AAEGVQEVSTACTWNGRPCSLSVHIDK Unmodified 2971.3916 0.39163868 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 80.266 80.266 3;4 1.5247E-18 81662 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.551 83.396 517770000 0 0 0 0 0 0 0 77530000 81517000 0 64814000 124110000 169790000 135 2994 131 1196;1197;1198;1199;1200;1201 1558;1559;1560;1561;1562;1563;1564 1562 7 AAEIGYEDPINPTYEATNAMYHR Unmodified 2625.1806 0.1805665 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.36 102.36 3 6.6115E-12 104409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.848 93.358 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Q8IWB7;C9JJ54 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.549 15.549 3 0.001367 7758 QUIQUE_C1576_190116_001 62.14 51.235 204430000 0 20641000 0 13591000 38054000 0 0 0 34673000 0 29248000 35470000 32758000 139 3536 134 1220;1221;1222;1223;1224;1225;1226;1227 1587;1588;1589;1590;1591;1592;1593;1594;1595 1590 8 AAELETDIR Unmodified 1016.5138 0.51383895 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 36.389 36.389 2 0.042693 32213 QUIQUE_C1368_190116_001 80.219 34.883 42558000 0 0 42558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 140 1697 135 1228 1596 1596 0 AAELFHQLSQALEVLTDAAAR Unmodified 2253.1753 0.17534519 1165 S4R343;H0YLQ7;H0YK99;Q9NVM6 DNAJC17 DnaJ homolog subfamily C member 17 yes no 0 0 0 1 1 168.34 168.34 3 3.6335E-07 172813 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.165 51.519 100380000 0 0 0 0 0 0 0 26808000 73571000 0 0 0 0 141 1165 136 1229;1230 1597;1598 1598 2 AAELIANSLATAGDGLIELR Unmodified 1997.0793 0.079319539 2370 P35232;C9JW96 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 146.78 146.78 2;3 6.8106E-30 150817 QUIQUE_C1277_190116_001 182.57 161.56 6804000000 474660000 499400000 553680000 679350000 465910000 557870000 793150000 430340000 429300000 214590000 641540000 504630000 559580000 142 2370 137 1231;1232;1233;1234;1235;1236;1237;1238;1239;1240;1241;1242;1243;1244;1245;1246;1247;1248;1249;1250;1251;1252;1253;1254;1255;1256;1257;1258 1599;1600;1601;1602;1603;1604;1605;1606;1607;1608;1609;1610;1611;1612;1613;1614;1615;1616;1617;1618;1619;1620;1621;1622;1623;1624;1625;1626;1627;1628;1629;1630;1631;1632;1633;1634;1635;1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642;1643;1644;1645;1646;1647;1648;1649;1650 1603 52 AAELQAQWER Unmodified 1200.5887 0.58873523 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 51.116 51.116 2 0.030725 49227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.816 38.079 139030000 0 0 0 0 0 0 0 58873000 80155000 0 0 0 0 143 1472 138 1259;1260 1651;1652 1651 1 AAEMMASLLK Unmodified 1063.5406 0.54058775 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 83.073 83.073 2 0.03093 83945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.191 15.228 276820000 0 0 0 0 0 0 0 276820000 0 0 0 0 0 144 2355 139 1261 1653 1653 1 AAEQISWYKPWTK Unmodified 1606.8144 0.81437807 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 84.408 84.408 3 0.00035766 85373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.904 62.226 230740000 0 52998000 55538000 0 0 0 36689000 54841000 0 30672000 0 0 0 145 205 140 1262;1263;1264;1265;1266 1654;1655;1656;1657;1658 1657 5 AAESLADPTEYENLFPGLK Unmodified 2064.0052 0.0051515425 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.71 146.71 2 5.5995E-46 149529 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.48 129.33 776900000 0 0 110690000 115330000 147800000 101020000 0 100980000 104390000 34838000 61844000 0 0 146 2380 141 1267;1268;1269;1270;1271;1272;1273;1274 1659;1660;1661;1662;1663;1664;1665;1666;1667;1668 1664 8 AAESPDQKDTDGGPKEEESPV Unmodified 2184.9659 0.9658655 2634 P53985 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes yes 0 0 2 1 28.711 28.711 3 1.2175E-05 23136 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.148 59.007 25060000 0 0 0 0 0 0 0 25060000 0 0 0 0 0 147 2634 142 1275 1669 1669 1 AAETQTLNFGPEWLR Acetyl (Protein N-term) 1773.8686 0.86859848 686 F8WCD5;C9JPV7;C9JXQ0;C9J0V6;C9JHT0;C9JRZ2;C9JHW1;E7ESB6;I1E4Y6;Q6Y7W6;C9JW88 GIGYF2 PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 156.21 156.21 2 1.9001E-06 161166 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.66 86.28 20750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20750000 148 686 143 1276 1670 1670 1 AAETTVVEVEEIVDIGAFAPEDIHIPQIYVHR Unmodified 3559.8199 0.81986396 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 4 1 166.07 166.07 3;4 2.5544E-26 170369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.819 87.654 523350000 0 0 0 0 0 0 0 0 55699000 0 410440000 57210000 0 149 2673 144 1277;1278;1279;1280;1281;1282 1671;1672;1673;1674;1675;1676 1671 4 AAEVGDDFLGDFVVGER Unmodified 1794.8424 0.84244331 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 140.73 140.73 2 2.155E-11 144585 QUIQUE_C1403_190116_001 121.4 110.85 29658000 0 0 0 29658000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 150 4414 145 1283;1284 1677;1678 1677 2 AAEWLFPLAFSK Unmodified 1378.7285 0.72852317 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 151.87 151.87 2 0.010636 156996 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.979 56.942 75432000 0 0 0 0 0 0 0 0 33430000 0 0 0 42002000 151 3402 146 1285;1286 1679;1680 1679 2 AAEWQLDQPSWSGR Unmodified 1629.7536 0.75356872 4311 Q9NVZ3;F6SKB8;D6RAN6;H0Y970 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.681 97.681 2 0.00023203 100461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.33 103.6 524220000 0 53523000 62010000 68460000 61581000 55749000 0 62495000 57991000 36324000 0 66087000 0 152 4311 147 1287;1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296 1681;1682;1683;1684;1685;1686;1687;1688;1689;1690;1691 1688 11 AAFALGGLGSGFASNR Unmodified 1494.7579 0.75792582 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 108.09 108.09 2 0.0017764 111708 QUIQUE_C1277_190116_001 62.258 39.023 43292000 0 0 0 0 0 0 0 0 43292000 0 0 0 0 153 1029 148 1297;1298 1692;1693 1692 2 AAFDDAIAELDTLSEESYK Unmodified 2086.9583 0.95826093 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 5 4 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 161.58 161.58 2;3 0 166595 QUIQUE_C1218_190116_001 344.47 322.24 95741000000 9688200000 9460700000 10631000000 9483200000 8070100000 10042000000 8874900000 2326100000 4528500000 4032900000 7577100000 6361200000 4665100000 154 2745 149 1299;1300;1301;1302;1303;1304;1305;1306;1307;1308;1309;1310;1311;1312;1313;1314;1315;1316;1317;1318;1319;1320;1321;1322;1323;1324;1325;1326;1327;1328;1329;1330;1331;1332;1333 1694;1695;1696;1697;1698;1699;1700;1701;1702;1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710;1711;1712;1713;1714;1715;1716;1717;1718;1719;1720;1721;1722;1723;1724;1725;1726;1727;1728;1729;1730;1731;1732;1733;1734;1735;1736;1737;1738;1739;1740;1741;1742;1743;1744;1745;1746;1747;1748;1749;1750;1751;1752;1753;1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761;1762;1763;1764;1765;1766;1767;1768;1769;1770;1771;1772 1700 78 AAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLR Unmodified 3257.6013 0.60133991 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 1 1 1 1 2 178.55 178.55 3;4 6.2208E-110 185232 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.13 174.87 456500000 0 0 0 0 0 4037300 0 0 18314000 0 434150000 0 0 155 2745 150 1334;1335;1336;1337;1338 1773;1774;1775;1776;1777 1776 5 AAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLR Oxidation (M) 3273.5963 0.59625453 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 1 1 2 1 2 1 175.2 175.2 3;4 2.1543E-109 178686 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.35 176.7 4124100000 0 0 0 0 38628000 0 0 0 632960000 0 2671000000 749930000 31588000 156 2745 150 1339;1340;1341;1342;1343;1344;1345 1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785 1783 2173 7 AAFEALQVK Unmodified 975.53893 0.53893149 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 56.93 56.93 2 0.052917 55796 QUIQUE_C1576_190116_001 49.933 22.446 28520000 0 0 0 0 0 0 28520000 0 0 0 0 0 0 157 3406 151 1346 1786 1786 1 AAFECMYTLLDSCLDR Unmodified 1963.8478 0.84780474 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 2 152.85 152.85 2;3 3.9478E-06 158527 QUIQUE_C1218_190116_001 132.79 117.59 1387900000 211520000 133160000 119100000 181530000 104660000 170880000 108150000 0 103120000 54013000 50904000 51499000 99387000 158 3499 152 1347;1348;1349;1350;1351;1352;1353;1354;1355;1356;1357;1358;1359;1360;1361;1362;1363;1364 1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;1794;1795;1796;1797;1798;1799;1800;1801;1802;1803;1804;1805;1806;1807;1808 1788 20 AAFFVTLDETEEGYR Unmodified 1746.8101 0.81008055 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 123.68 123.68 2 0.032205 127273 QUIQUE_C1403_190116_001 54.471 47.343 27628000 0 0 0 27628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 159 2562 153 1365 1809 1809 0 AAFGEEVDAVDTGISR Unmodified 1635.774 0.77402939 1393 O00273 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 91.654 91.654 2 2.3713E-06 93909 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.745 74.416 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 160 1393 154 1366;1367;1368;1369;1370 1810;1811;1812;1813;1814 1813 5 AAFGGAEHVPPELWEPFYTDQYAQEHVKPPVTR Unmodified 3765.8216 0.82159529 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 1 1 118.37 118.37 5 0.02455 123133 QUIQUE_C1576_190116_001 19.505 14.55 66796000 0 0 0 0 0 0 66796000 0 0 0 0 0 0 161 4375 155 1371 1815 1815 1 AAFGLSEAGFNTACVTK Unmodified 1742.8298 0.82977013 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.31 101.31 2 7.1669E-30 103714 QUIQUE_C1403_190116_001 196.7 172.62 2591400000 210460000 217630000 279570000 174360000 166090000 244450000 210720000 142250000 201290000 140260000 221720000 200260000 182390000 162 2326 156 1372;1373;1374;1375;1376;1377;1378;1379;1380;1381;1382;1383;1384 1816;1817;1818;1819;1820;1821;1822;1823;1824;1825;1826;1827;1828;1829;1830;1831 1819 14 AAFLGCLTDVR Unmodified 1221.6176 0.61759251 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 96.124 96.124 2 0.023868 99045 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.683 26.429 86886000 0 0 0 0 0 0 0 0 34854000 0 52032000 0 0 163 4449 157 1385;1386 1832;1833 1832 2 AAFLNFFR Unmodified 984.51814 0.51813647 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.17 123.17 2 0.0036392 127643 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.96 115.19 149720000 16424000 14299000 13921000 12103000 13998000 16210000 15284000 0 16732000 0 17800000 12955000 0 164 3278 158 1387;1388;1389;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396;1397;1398 1834;1835;1836;1837;1838;1839;1840;1841;1842;1843;1844;1845;1846;1847 1844 12 AAFQIISQVISEATEQVLATTVGK Unmodified 2503.3534 0.35336913 3746 Q92667 AKAP1 A-kinase anchor protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 179.74 179.74 3 2.0402E-18 183492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.45 99.131 130760000 0 0 0 0 0 0 0 0 92495000 0 38261000 0 0 165 3746 159 1399;1400 1848;1849 1848 2 AAFQLGSPWR Unmodified 1131.5825 0.58252764 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.787 94.787 2 3.7286E-30 97645 QUIQUE_C1277_190116_001 197.3 162.49 15405000000 1398000000 1174700000 1532900000 1041100000 1047800000 1033000000 1196200000 1018200000 1015500000 445230000 1576600000 1296000000 1629700000 166 1875 160 1401;1402;1403;1404;1405;1406;1407;1408;1409;1410;1411;1412;1413 1850;1851;1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861;1862;1863;1864;1865;1866;1867;1868;1869;1870;1871;1872;1873;1874;1875;1876;1877;1878;1879;1880;1881 1853 32 AAFQSLLDAQADEAVLDHPDLK Unmodified 2366.1754 0.17540477 4398 Q9UBI1;R4GMW6;H0Y4W0;H0Y6Z9;R4GMX3;R4GN54 COMMD3;COMMD3-BMI1 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.7 131.7 3 7.2109E-06 135667 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.364 62.915 892150000 91900000 99245000 0 90102000 77405000 107000000 90888000 0 105930000 40568000 95852000 93265000 0 167 4398 161 1414;1415;1416;1417;1418;1419;1420;1421;1422;1423 1882;1883;1884;1885;1886;1887;1888;1889;1890;1891;1892 1892 11 AAFSKDESKEPIVEVR Unmodified 1803.9367 0.93667805 2057;28;265 A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 2 1 3 3 2 1 1 36.781 36.781 2;3;4 1.7991E-64 32398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.32 200.47 2126400000 0 0 0 0 181070000 0 0 501570000 789240000 0 558790000 35442000 60303000 168 265;28;2057 162 1424;1425;1426;1427;1428;1429;1430;1431;1432;1433;1434 1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;1900;1901;1902;1903 1900 7 AAFTECCQAADK Unmodified 1370.5595 0.55948529 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 25.285 25.285 2 2.5569E-21 19433 QUIQUE_C1563_190116_001 177.06 167.11 47844000000 2711100000 5501900000 1736300000 5200100000 8601700000 4259900000 4182700000 770170000 2509000000 785020000 2493400000 2009400000 7083300000 + 169 769 163 1435;1436;1437;1438;1439;1440;1441;1442;1443;1444;1445;1446;1447;1448 1904;1905;1906;1907;1908;1909;1910;1911;1912;1913;1914;1915;1916;1917;1918;1919;1920;1921;1922;1923;1924;1925;1926;1927;1928;1929;1930;1931;1932;1933;1934;1935;1936;1937 1917 34 AAFVAYALAFPR Unmodified 1295.7026 0.70264277 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 108.35 108.35 2;3 0.0005392 132037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.162 74.417 266050000 0 0 0 0 0 0 20104000 82281000 55171000 0 0 57054000 51436000 170 3418 164 1449;1450;1451;1452;1453;1454 1938;1939;1940;1941;1942;1943;1944 1943 6 AAFVLPEFAR Unmodified 1119.6077 0.60767975 2150 P19623;K7EL89 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.4 111.4 2 0.00030203 116276 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.56 83.757 1182400000 109050000 116750000 0 89644000 108100000 90095000 82684000 83051000 107390000 55550000 129170000 81281000 129590000 171 2150 165 1455;1456;1457;1458;1459;1460;1461;1462;1463;1464;1465;1466;1467 1945;1946;1947;1948;1949;1950;1951;1952;1953;1954;1955;1956;1957;1958;1959;1960;1961;1962;1963;1964 1961 20 AAGAAEAAVAAVEEVGSAGQFEELLR Acetyl (Protein N-term) 2557.266 0.26601069 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 1 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 178.4 178.4 2;3 5.8305E-46 183673 QUIQUE_C1438_190116_001 179.25 160.42 1131500000 23502000 0 33338000 24873000 176680000 0 209180000 146550000 103690000 0 0 284880000 128810000 172 1676 166 1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;1477;1478;1479;1480;1481;1482 1965;1966;1967;1968;1969;1970;1971;1972;1973;1974;1975;1976;1977;1978;1979;1980;1981;1982;1983;1984 1972 20 AAGAAGAAAAAAR Unmodified 998.52574 0.52574104 530 A6NCS6 C2orf72 Uncharacterized protein C2orf72 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 15.734 15.734 2 0.00041686 8412 QUIQUE_C1218_190116_001 107.69 76.62 158400000 25194000 27949000 0 0 0 24815000 0 0 0 0 0 50863000 29577000 173 530 167 1483;1484;1485;1486;1487 1985;1986;1987;1988;1989 1985 5 AAGAEPDSILKPELLSAIEK Unmodified 2051.115 0.11503634 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 3 1 2 1 1 1 1 119.15 119.15 2;3 4.201E-21 124237 QUIQUE_C1576_190116_001 151.54 135.6 1767600000 186840000 160680000 171250000 132260000 167020000 116790000 217160000 132290000 148210000 74291000 28357000 118120000 114290000 174 4088 168 1488;1489;1490;1491;1492;1493;1494;1495;1496;1497;1498;1499;1500;1501;1502;1503;1504;1505;1506 1990;1991;1992;1993;1994;1995;1996;1997;1998;1999;2000;2001;2002;2003;2004;2005;2006;2007;2008 2001 16 AAGCDFTNVVK Unmodified 1180.5547 0.55465791 2612 P52758;H0YBX3;H0YB34 HRSP12 Ribonuclease UK114 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 50.585 50.585 1;2 7.3517E-19 49122 QUIQUE_C1438_190116_001 200.56 171.41 13703000000 0 1126500000 1521500000 780870000 1047400000 1483800000 965770000 1217600000 1186800000 456550000 1445900000 1236300000 1234300000 175 2612 169 1507;1508;1509;1510;1511;1512;1513;1514;1515;1516;1517;1518;1519;1520;1521;1522 2009;2010;2011;2012;2013;2014;2015;2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024 2014 10 AAGELEGGKPLSGLLNALAQDTFHGYPGITEELLR Acetyl (Protein N-term) 3678.8893 0.88934051 3604 Q8N668;E9PE85 COMMD1 COMM domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 2 170.52 170.52 3;4 8.7425E-46 174959 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.48 90.434 163420000 0 0 0 0 0 0 0 0 163420000 0 0 0 0 176 3604 170 1523;1524 2025;2026;2027 2026 3 AAGEVLEPANLLAEEK Unmodified 1652.8621 0.86211612 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.8 101.8 2 0.00033279 106144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.821 59.945 249060000 0 42072000 0 0 0 51201000 41596000 0 0 33289000 41764000 0 39141000 177 4624 171 1525;1526;1527;1528;1529;1530 2028;2029;2030;2031;2032;2033 2032 6 AAGEVLEPANLLAEEKDEDLLFE Unmodified 2514.2377 0.23773025 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 154.23 154.23 2;3 0.00011271 156699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.707 71.874 1442500000 112410000 158540000 132550000 101360000 97132000 75737000 203890000 156630000 140870000 0 0 137240000 126110000 178 4624 172 1531;1532;1533;1534;1535;1536;1537;1538;1539;1540;1541;1542 2034;2035;2036;2037;2038;2039;2040;2041;2042;2043;2044;2045 2042 8 AAGFDEIEQDLTQR Unmodified 1591.7478 0.74781464 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 116.13 116.13 2 0.00010493 120349 QUIQUE_C1368_190116_001 113.69 102.47 79016000 0 0 55512000 0 0 23504000 0 0 0 0 0 0 0 179 1750 173 1543;1544;1545;1546 2046;2047;2048;2049;2050 2048 5 AAGFKDPLLASGTDGVGTK Unmodified 1803.9367 0.93667805 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 70.614 70.614 2;3 0.016799 71222 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.067 31.605 53396000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53396000 180 2194 174 1547;1548 2051;2052 2052 2 AAGGDHGSPDSYR Acetyl (Protein N-term) 1330.5538 0.55380628 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5;A0A096LNY4;B4DEP1;A0A1W2PRX2;A0A096LP72 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.342 23.342 2 2.978E-06 16574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.23 113.16 233590000 26085000 27643000 0 23182000 0 0 40686000 38072000 0 0 38555000 0 39370000 181 338 175 1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556 2053;2054;2055;2056;2057;2058;2059;2060;2061 2060 7 AAGGGGPLYGDGYGFR Unmodified 1513.695 0.69499121 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.101 83.101 2 6.2691E-05 85461 QUIQUE_C1218_190116_001 95.094 80.936 322330000 50681000 39726000 0 44932000 45304000 0 0 53364000 43279000 0 0 45042000 0 182 103 176 1557;1558;1559;1560;1561;1562;1563 2062;2063;2064;2065;2066;2067;2068 2062 7 AAGGIELFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSR Unmodified 2923.4828 0.48282018 2484 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;D6RB13 GNPDA1 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.5 144.5 3 3.5574E-75 149836 QUIQUE_C1368_190116_001 156.73 137.95 1776900000 110830000 174380000 117110000 87145000 142340000 90223000 142820000 114890000 224140000 47122000 218180000 191500000 116230000 183 2484 177 1564;1565;1566;1567;1568;1569;1570;1571;1572;1573;1574;1575;1576 2069;2070;2071;2072;2073;2074;2075;2076;2077;2078;2079;2080;2081;2082;2083 2072 14 AAGIDEQENWHEGK Unmodified 1582.7012 0.7011988 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 31.806 31.806 2;3 1.2391E-37 26688 QUIQUE_C1277_190116_001 186.02 173.44 1689900000 0 274030000 430130000 101380000 198550000 277240000 205170000 26661000 27199000 20393000 77302000 18545000 33326000 184 2282 178 1577;1578;1579;1580;1581;1582;1583;1584;1585;1586;1587;1588;1589;1590;1591;1592;1593 2084;2085;2086;2087;2088;2089;2090;2091;2092;2093;2094;2095;2096;2097;2098;2099;2100;2101 2085 18 AAGIDEQENWHEGKENIR Unmodified 2094.9719 0.97189435 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 1 3 1 3 1 1 36.679 36.679 2;3;4 3.4833E-247 32061 QUIQUE_C1438_190116_001 334.6 311.51 4153700000 96555000 147250000 205630000 160870000 1146800000 97915000 136530000 307590000 716070000 36084000 723640000 167600000 211160000 185 2282 179 1594;1595;1596;1597;1598;1599;1600;1601;1602;1603;1604;1605;1606;1607;1608;1609;1610;1611;1612 2102;2103;2104;2105;2106;2107;2108;2109;2110;2111;2112;2113;2114;2115;2116;2117;2118;2119;2120;2121;2122 2108 20 AAGISLIVPGK Unmodified 1024.6281 0.62808085 985 F2Z357;J3KPC5;P47736 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 76.318 76.318 2 0.014586 77311 QUIQUE_C1368_190116_001 58.426 31.172 94891000 0 0 21735000 0 36683000 0 0 0 0 0 0 36474000 0 186 985 180 1613;1614;1615 2123;2124;2125 2123 3 AAGPCLLAECR Unmodified 1216.5693 0.56926211 464 A0A2R8YFN3;A1Z1Q3 MACROD2 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.509 51.509 2 0.012341 49456 QUIQUE_C1277_190116_001 60.518 39.572 263350000 55257000 51186000 28030000 28436000 32587000 19697000 26191000 0 0 0 0 21971000 0 187 464 181 1616;1617;1618;1619;1620;1621;1622;1623 2126;2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133 2127 7 AAGPGGGSLASSSVAK Unmodified 1315.6732 0.67319314 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.973 24.973 2 4.7189E-09 19720 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.38 130.13 562140000 71383000 0 0 0 0 0 65505000 89494000 121030000 28656000 120040000 66030000 0 188 3612 182 1624;1625;1626;1627;1628;1629;1630 2134;2135;2136;2137;2138;2139;2140;2141;2142 2136 5 AAGPLLTDECR Unmodified 1201.5761 0.57612163 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 41.364 41.364 2 0.016185 38026 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.908 56.394 168790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86110000 82685000 0 189 3990 183 1631;1632;1633 2143;2144;2145 2145 3 AAGPSLSHTSGGTQSK Unmodified 1484.7219 0.72193424 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 10.436 10.436 2;3 0.0002501 2852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.315 47.9 46453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46453000 0 0 0 190 2265 184 1634;1635 2146;2147 2146 2 AAGQYSTSYAQQK Unmodified 1401.6525 0.6524577 831 E5KLJ9 OPA1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.877 21.877 2 0.00027158 15021 QUIQUE_C1368_190116_001 112.11 84.283 208450000 0 24942000 49557000 0 0 33131000 0 24974000 0 0 37495000 0 38355000 191 831 185 1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642 2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155 2150 8 AAGSGVSDYDYLDLDK Unmodified 1687.7577 0.75771063 4090 Q9C026 TRIM9 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9 yes yes 0 0 0 1 100.6 100.6 2 0.006882 102997 QUIQUE_C1403_190116_001 57.583 46.364 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 192 4090 186 1643 2156 2156 1 AAGSPSPLPAPDPAPK Unmodified 1471.7671 0.76709352 4082 Q9BZE9;J3KRY8;J3KRF7 ASPSCR1 Tether containing UBX domain for GLUT4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.712 49.712 2 3.3268E-07 47545 QUIQUE_C1277_190116_001 117.86 94.487 375000000 29673000 36986000 36502000 36272000 43737000 0 27340000 27581000 33911000 0 29388000 27355000 46250000 193 4082 187 1644;1645;1646;1647;1648;1649;1650;1651;1652;1653;1654;1655 2157;2158;2159;2160;2161;2162;2163;2164;2165;2166;2167;2168 2158 12 AAGSSGFEAVEVAWPYAETPEALAR Unmodified 2578.234 0.23398228 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;A0A0A0MTR5 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 145.73 145.73 2 2.0843E-10 148555 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.5 95.756 26756000 0 0 0 0 0 0 0 26756000 0 0 0 0 0 194 1025 188 1656 2169 2169 1 AAGTAAALAFLSQESR Acetyl (Protein N-term) 1604.8158 0.81583463 1649 O75607 NPM3 Nucleoplasmin-3 yes yes 1 0 0 1 1 160.82 160.82 2 5.4039E-11 164592 QUIQUE_C1403_190116_001 116.24 91.384 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 1649 189 1657;1658 2170;2171 2170 2 AAGTEGPFQEVDGVATTR Unmodified 1804.8592 0.85915601 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 82.377 82.377 2 0.00013533 84592 QUIQUE_C1576_190116_001 89.231 70.606 72572000 0 0 29900000 19159000 0 0 23512000 0 0 0 0 0 0 196 1998 190 1659;1660;1661 2172;2173;2174 2174 2 AAGTLYTYPENWR Acetyl (Protein N-term) 1582.7416 0.74160705 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.71 131.71 2 2.9484E-06 138125 QUIQUE_C1438_190116_001 150.35 140.92 5937300000 461450000 473970000 426670000 493070000 424980000 375560000 417210000 484410000 420960000 184330000 725300000 526220000 523190000 197 2255 191 1662;1663;1664;1665;1666;1667;1668;1669;1670;1671;1672;1673;1674 2175;2176;2177;2178;2179;2180;2181;2182;2183;2184;2185;2186;2187;2188;2189 2180 15 AAGVAGWGVEAEEFEDAPDVEPLEPTLSNIIEQR Acetyl (Protein N-term) 3679.753 0.75296619 1543 O43681;K7ERW9 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 1 0 0 1 1 2 2 1 1 1 174.46 174.46 3;4 2.4632E-46 178425 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.76 102.7 267140000 0 0 0 0 16916000 0 16108000 19334000 79036000 0 88659000 28241000 18847000 198 1543 192 1675;1676;1677;1678;1679;1680;1681;1682;1683 2190;2191;2192;2193;2194;2195;2196;2197;2198;2199 2194 10 AAGVCLMLLATCCEDDIVPHVLPFIK Unmodified 2941.4574 0.45739875 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 166.94 166.94 3 3.1108E-20 169032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.11 98.009 415710000 0 0 0 0 0 0 0 144480000 108410000 0 0 0 162820000 199 3090 193 1684;1685;1686 2200;2201;2202 2200 3 AAGVEAAAEVAATEIK Acetyl (Protein N-term) 1541.7937 0.7937022 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019;M0R2T0;M0R0N3;M0QYQ7;M0R0Y6 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 152.05 152.05 2 2.8961E-36 157927 QUIQUE_C1218_190116_001 171.57 138.35 2417500000 374750000 331280000 473040000 531220000 0 449910000 0 0 0 0 0 0 257340000 200 2603 194 1687;1688;1689;1690;1691;1692 2203;2204;2205;2206;2207;2208;2209;2210;2211;2212;2213;2214;2215;2216;2217;2218;2219;2220;2221;2222;2223 2204 21 AAGVNVEPFWPGLFAK Unmodified 1701.8879 0.88787736 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 3 1 147.8 147.8 2;3 2.0083E-29 154677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.36 147.67 7182100000 654400000 587880000 788860000 633410000 735670000 597040000 543400000 427980000 681100000 138210000 705660000 0 688530000 201 1886 195 1693;1694;1695;1696;1697;1698;1699;1700;1701;1702;1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710 2224;2225;2226;2227;2228;2229;2230;2231;2232;2233;2234;2235;2236;2237;2238;2239;2240;2241;2242;2243;2244;2245;2246;2247;2248;2249;2250;2251;2252;2253;2254;2255 2250 32 AAGVPSATITWR Unmodified 1228.6564 0.65642086 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 74.023 74.023 2 0.0079089 74786 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.662 56.215 236750000 0 0 0 0 0 50381000 0 0 66863000 0 119500000 0 0 202 2834 196 1711;1712;1713 2256;2257;2258 2257 2 AAGVVLEMIR Unmodified 1057.5954 0.59540051 4536 Q9Y230;M0R0Y3;X6R2L4;M0QXI6 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.344 87.344 2 0.0046555 89839 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.165 57.674 828960000 176750000 0 0 116630000 0 0 134200000 0 0 112930000 181130000 0 107320000 203 4536 197 1714;1715;1716;1717;1718;1719 2259;2260;2261;2262;2263;2264 2263 3 AAHFVFR Unmodified 846.45006 0.4500569 2057;28;1218;265 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.509 26.509 2 7.0626E-05 20757 QUIQUE_C1277_190116_001 174.15 129.18 4876100000 335050000 435030000 466830000 496440000 541120000 0 585860000 424970000 0 0 644130000 323430000 623240000 204 1218;265;28;2057 198 1720;1721;1722;1723;1724;1725;1726;1727;1728;1729 2265;2266;2267;2268;2269;2270;2271;2272;2273;2274;2275 2266 10 AAHGVLLQALDEMR Unmodified 1522.7926 0.79259677 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 96.541 96.541 2;3 0.00015911 98524 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.86 86.002 449460000 22758000 34210000 32329000 31262000 52942000 25259000 30524000 0 29990000 11448000 44941000 45560000 88236000 205 3725 199 1730;1731;1732;1733;1734;1735;1736;1737;1738;1739;1740;1741;1742;1743;1744 2276;2277;2278;2279;2280;2281;2282;2283;2284;2285;2286;2287;2288;2289;2290;2291;2292;2293 2292 15 AAHLCAEAALR Unmodified 1181.5975 0.59752577 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 2 24.053 24.053 2;3 0.0028442 17771 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.15 76.375 136780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 136780000 0 206 4530 200 1745;1746 2294;2295 2295 2 AAHSEGNTTAGLDMR Oxidation (M) 1545.6842 0.68416853 2810 P78371 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 14.022 14.022 2;3 0.00030915 6343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.617 74.924 161130000 11879000 0 0 37539000 0 0 14207000 69643000 14664000 0 0 0 13199000 207 2810 201 1747;1748;1749;1750;1751;1752;1753 2296;2297;2298;2299;2300;2301;2302 2301 2255 7 AAHSEGNTTAGLDMR Unmodified 1529.6893 0.68925391 2810 P78371 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 21.386 21.386 2;3 6.8887E-66 14957 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.32 187.64 1698200000 251330000 261630000 84295000 212040000 95667000 100150000 110080000 100350000 67699000 123720000 132970000 72374000 85930000 208 2810 201 1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761;1762;1763;1764;1765;1766;1767;1768;1769;1770 2303;2304;2305;2306;2307;2308;2309;2310;2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320 2314 15 AAHVFFTDSCPDALFNELVK Unmodified 2280.0885 0.088504016 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A0D9SFQ7;A0A0D9SFW6;A0A0D9SEP9;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 141.52 141.52 2;3 2.8602E-196 147318 QUIQUE_C1218_190116_001 269.87 256.46 34431000000 3655700000 4602400000 2911800000 2902100000 3363400000 1899600000 3241700000 1330300000 1687300000 799170000 2930800000 2883000000 2224100000 209 273;342 202 1771;1772;1773;1774;1775;1776;1777;1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785;1786;1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;1794;1795;1796;1797;1798 2321;2322;2323;2324;2325;2326;2327;2328;2329;2330;2331;2332;2333;2334;2335;2336;2337;2338;2339;2340;2341;2342;2343;2344;2345;2346;2347;2348;2349;2350;2351;2352;2353;2354;2355;2356;2357;2358;2359 2324 38 AAIAAPILHVNSK Unmodified 1303.7612 0.76122028 2391 P36269;H7C1X2 GGT5 Gamma-glutamyltransferase 5;Gamma-glutamyltransferase 5 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 5 light chain yes no 0 0 0 1 48.16 48.16 2 0.065558 46259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.73 36.028 20091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20091000 0 0 210 2391 203 1799 2360 2360 1 AAIAASEVLVDSAEEGSLAAAAELAAQK Acetyl (Protein N-term) 2697.3709 0.37086969 1764 O95926 SYF2 Pre-mRNA-splicing factor SYF2 yes yes 1 0 0 1 1 1 179.37 179.37 3 4.2283E-31 182982 QUIQUE_C1218_190116_001 112.86 110.64 49885000 20099000 0 0 0 12102000 17684000 0 0 0 0 0 0 0 211 1764 204 1800;1801;1802 2361;2362;2363 2361 3 AAIDSYR Unmodified 794.39227 0.39226725 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 21.787 21.787 2 0.0099341 15151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.98 116.99 206190000 0 0 0 0 0 0 0 69571000 65754000 70866000 0 0 0 212 2233 205 1803;1804;1805 2364;2365;2366;2367;2368 2364 5 AAIDWFDGK Unmodified 1021.4869 0.48689592 19;1188 A0A075B7D9;Q92804;H3BPE7;P35637 TAF15;FUS TATA-binding protein-associated factor 2N;RNA-binding protein FUS no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.679 95.679 2 0.00014327 93342 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.39 35.347 2850300000 388260000 331650000 348090000 266450000 259510000 279990000 251160000 0 116000000 100430000 202290000 158180000 148270000 213 19;1188 206 1806;1807;1808;1809;1810;1811;1812;1813;1814;1815;1816;1817 2369;2370;2371;2372;2373;2374;2375;2376;2377;2378;2379;2380;2381;2382;2383;2384;2385;2386;2387;2388;2389;2390;2391;2392 2386 24 AAIDWFDGKEFHGNIIK Unmodified 1959.9843 0.98429694 19 A0A075B7D9;Q92804 TAF15 TATA-binding protein-associated factor 2N yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 106.12 106.12 4 0.00015541 109140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.85 66.793 249580000 0 0 0 0 0 0 0 62437000 52032000 0 49158000 43823000 42132000 214 19 207 1818;1819;1820;1821;1822 2393;2394;2395;2396;2397;2398 2397 6 AAIDWFDGKEFSGNPIK Unmodified 1893.9261 0.92611336 1188 H3BPE7;P35637 FUS RNA-binding protein FUS yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 119.35 119.35 2;3 3.568E-07 123783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.551 81.936 598610000 0 0 0 0 0 0 0 0 177080000 0 201080000 220450000 0 215 1188 208 1823;1824;1825;1826;1827 2399;2400;2401;2402;2403 2400 5 AAIEHELPTATQK Unmodified 1407.7358 0.73579339 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 27.884 27.884 3 0.00083816 22829 QUIQUE_C1403_190116_001 67.118 52.242 32464000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32464000 216 3423 209 1828;1829;1830;1831 2404;2405;2406;2407 2405 4 AAIEYGTEEDVVK Unmodified 1422.6878 0.68784015 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 59.924 59.924 2 0.000454 58389 QUIQUE_C1277_190116_001 97.813 80.583 58583000 25672000 32912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 217 264 210 1832;1833 2408;2409 2409 2 AAIGLLAR Unmodified 783.49667 0.49667274 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.82 51.82 2 0.0031858 49938 QUIQUE_C1576_190116_001 132.94 26.18 1203800000 70257000 105380000 111850000 91036000 0 116240000 139800000 87634000 108330000 0 201510000 0 171730000 218 1928 211 1834;1835;1836;1837;1838;1839;1840;1841;1842;1843 2410;2411;2412;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;2420 2416 6 AAIIADSSTFR Unmodified 1150.5982 0.59823728 170 A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 yes no 0 0 0 1 1 57.404 57.404 2 0.054204 56031 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.161 30.01 38073000 0 0 0 0 0 0 19944000 0 0 0 0 18129000 0 219 170 212 1844;1845 2421;2422 2422 2 AAILDLEK Unmodified 871.50148 0.50148335 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 57.208 57.208 2 0.023483 56858 QUIQUE_C1438_190116_001 73.26 24.504 142750000 0 0 41239000 0 59282000 0 0 0 0 0 0 42227000 0 220 3108 213 1846;1847;1848 2423;2424;2425 2424 3 AAILGDTIMVAK Acetyl (Protein N-term) 1243.6846 0.68460945 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 1 0 0 1 1 151.24 151.24 2 0.0018124 156587 QUIQUE_C1218_190116_001 71.451 40.029 22378000 13988000 0 0 0 0 0 0 8390000 0 0 0 0 0 221 3657 214 1849;1850 2426;2427 2426 2 AAILPTSIFLTNK Unmodified 1387.8075 0.80750177 1440 O14744;H0YJX6 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.4 123.4 2 0.0036921 127190 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.438 72.68 1365800000 151270000 148460000 155100000 128740000 150470000 106950000 125980000 59721000 87734000 0 0 103480000 147950000 222 1440 215 1851;1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861 2428;2429;2430;2431;2432;2433;2434;2435;2436;2437;2438 2437 3 AAILPTSIFLTNKK Unmodified 1515.9025 0.90246479 1440 O14744;H0YJX6 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 93.624 93.624 3 0.00022264 96118 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.905 73.122 311420000 0 0 0 0 0 0 0 45221000 56428000 0 67986000 69970000 71809000 223 1440 216 1862;1863;1864;1865;1866 2439;2440;2441;2442;2443;2444 2441 6 AAILQTEVDALR Unmodified 1298.7194 0.71941505 1479;1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;O15083;H7C4G9 ERC1;ERC2 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1;ERC protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.067 91.067 2 0.0061216 94799 QUIQUE_C1218_190116_001 80.755 50.437 444880000 93141000 66142000 50503000 0 67172000 91015000 0 0 0 0 76904000 0 0 224 1107;1479 217 1867;1868;1869;1870;1871;1872 2445;2446;2447;2448;2449;2450 2445 1 AAIQSQLDGVR Unmodified 1156.62 0.62003536 1585 O60645;D6RB59;D6RBR9 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 41.889 41.889 2 0.0017273 40483 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 14.379 6626200000 40779000 0 2296100000 47015000 52653000 1683900000 2296800000 0 42029000 24879000 72191000 69866000 0 225 1585 218 1873;1874;1875;1876;1877;1878;1879;1880;1881;1882;1883 2451;2452;2453;2454;2455;2456;2457;2458;2459;2460;2461;2462 2461 12 AAIQTFQNTYQVLAVTFNDTSDQIISGGIDNDIK Unmodified 3699.8268 0.82679983 3836 Q96DI7 SNRNP40 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes yes 0 0 0 1 170.71 170.71 3 0.028419 176879 QUIQUE_C1438_190116_001 19.505 13.778 27192000 0 0 0 0 27192000 0 0 0 0 0 0 0 0 226 3836 219 1884 2463 2463 1 AAITFLK Unmodified 762.46398 0.46397563 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 1 57.472 57.472 2 0.050616 55809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.439 47.122 86322000 0 0 0 0 0 0 0 28997000 0 12957000 44368000 0 0 227 1416 220 1885;1886;1887 2464;2465;2466 2464 3 AAIYGGVEGGGTR Acetyl (Protein N-term) 1248.6099 0.6098646 4455 Q9UJ70;H7C3G9;H7C1L7 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 1 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 82.002 82.002 2 0.00031959 82598 QUIQUE_C1563_190116_001 86.882 65.935 1965500000 461130000 0 86807000 540790000 78744000 454830000 57399000 0 51166000 0 75591000 74437000 84615000 228 4455 221 1888;1889;1890;1891;1892;1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;1900;1901;1902 2467;2468;2469;2470;2471;2472;2473;2474;2475;2476;2477;2478;2479;2480;2481 2474 12 AALAALCPGDLIQAINGESTELMTHLEAQNR Unmodified 3306.6337 0.63365987 2566 P50479 PDLIM4 PDZ and LIM domain protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 168.86 168.86 3;4 1.893E-05 170638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.048 41.239 131150000 0 33349000 0 64471000 0 0 0 33332000 0 0 0 0 0 229 2566 222 1903;1904;1905 2482;2483;2484 2484 3 AALADVLR Unmodified 827.4865 0.48650199 631 B5MBZ0;Q9HC35 EML4 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.47 61.47 2 0.011743 60205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.55 55.811 64035000 20770000 15884000 0 0 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1609400000 232 3051 225 1922;1923;1924;1925;1926;1927;1928;1929;1930;1931;1932;1933;1934;1935;1936;1937;1938;1939;1940;1941;1942;1943;1944;1945;1946;1947;1948;1949;1950;1951;1952;1953;1954;1955;1956;1957;1958;1959 2503;2504;2505;2506;2507;2508;2509;2510;2511;2512;2513;2514;2515;2516;2517;2518;2519;2520;2521;2522;2523;2524;2525;2526;2527;2528;2529;2530;2531;2532;2533;2534;2535;2536;2537;2538;2539;2540;2541;2542;2543;2544;2545;2546;2547;2548;2549;2550;2551;2552;2553;2554;2555;2556;2557;2558;2559;2560;2561;2562;2563;2564;2565;2566;2567;2568;2569;2570;2571 2507 67 AALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEK Oxidation (M) 2944.4376 0.43756905 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 1 119.48 119.48 3 3.42E-24 116273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.441 87.982 252230000 0 36210000 0 0 0 0 0 0 0 216020000 0 0 0 233 3051 225 1960;1961;1962 2572;2573;2574;2575 2574 2482 4 AALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWR Oxidation (M) 3152.5965 0.59646973 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 0 1 4 2 2 3 2 3 3 2 2 3 2 4 161.3 161.3 2;3;4 0 168006 QUIQUE_DMIX5_190116_001 287.01 265.17 25088000000 1239700000 1307600000 2050800000 2040000000 1482000000 1749800000 1436000000 1204000000 1563600000 971270000 2571300000 4087900000 3384300000 234 365 226 1963;1964;1965;1966;1967;1968;1969;1970;1971;1972;1973;1974;1975;1976;1977;1978;1979;1980;1981;1982;1983;1984;1985;1986;1987;1988;1989;1990;1991;1992;1993;1994;1995 2576;2577;2578;2579;2580;2581;2582;2583;2584;2585;2586;2587;2588;2589;2590;2591;2592;2593;2594;2595;2596;2597;2598;2599;2600;2601;2602;2603;2604;2605;2606;2607;2608;2609;2610;2611;2612;2613;2614;2615;2616;2617;2618;2619;2620;2621;2622;2623;2624;2625;2626;2627;2628;2629;2630;2631 2621 254 53 AALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWR Unmodified 3136.6016 0.6015551 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 3 3 4 3 2 4 3 4 2 4 6 4 165.56 165.56 2;3;4 0 172851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 400.47 375.93 79137000000 4557200000 7139000000 9432700000 3207100000 4125900000 3026600000 6398900000 5086400000 6068500000 344080000 11837000000 10789000000 7124800000 235 365 226 1996;1997;1998;1999;2000;2001;2002;2003;2004;2005;2006;2007;2008;2009;2010;2011;2012;2013;2014;2015;2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024;2025;2026;2027;2028;2029;2030;2031;2032;2033;2034;2035;2036;2037;2038;2039;2040 2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2642;2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649;2650;2651;2652;2653;2654;2655;2656;2657;2658;2659;2660;2661;2662;2663;2664;2665;2666;2667;2668;2669;2670;2671;2672;2673;2674;2675;2676;2677;2678;2679;2680;2681;2682;2683;2684;2685;2686;2687;2688;2689;2690;2691;2692;2693;2694;2695;2696;2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2704;2705;2706;2707;2708;2709;2710;2711;2712 2694 76 AALAGGTTMILDHVFPDTGVSLLAAYEQWR Oxidation (M) 3218.607 0.60703441 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 1 0 1 1 1 165.91 165.91 3 2.8307E-25 169476 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2722;2723;2724;2725;2726;2727;2728;2729;2730;2731;2732;2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;2740;2741;2742;2743;2744;2745;2746;2747;2748 2743 27 AALAPLPPLPAQFK Acetyl (Protein N-term) 1474.8548 0.85478632 70 A0A087WY55;Q9NP79 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.96 153.96 2 0.00021098 158563 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.32 94.296 3760500000 349710000 273740000 271450000 292870000 330630000 242610000 269340000 301410000 263210000 114540000 340730000 326100000 384190000 239 70 229 2072;2073;2074;2075;2076;2077;2078;2079;2080;2081;2082;2083;2084 2749;2750;2751;2752;2753;2754;2755;2756;2757;2758;2759;2760;2761;2762;2763;2764;2765;2766;2767;2768;2769;2770;2771;2772;2773;2774;2775;2776;2777 2773 29 AALCAVHVIR Unmodified 1108.6175 0.61753293 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.408 34.408 3 0.0031377 29767 QUIQUE_C1277_190116_001 68.371 56.735 588510000 59717000 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yes no 0 1 0 1 1 1 73.417 73.417 3 0.0022663 73937 QUIQUE_C1277_190116_001 58.338 54.76 96940000 0 36551000 0 0 0 0 0 0 27282000 0 0 33106000 0 242 2651 231 2119;2120;2121 2820;2821;2822 2820 2088 3 AALCHFIVDELNAK Unmodified 1599.8079 0.80791248 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 99.467 99.467 2;3 2.3443E-22 97682 QUIQUE_DMIX4_190116_001 168.74 152.36 6823400000 451000000 533310000 509610000 526050000 500920000 430330000 775440000 301930000 452360000 500680000 611040000 603530000 627220000 243 4128 232 2122;2123;2124;2125;2126;2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133;2134;2135 2823;2824;2825;2826;2827;2828;2829;2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;2840;2841;2842;2843;2844;2845;2846;2847;2848;2849;2850 2844 28 AALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK Unmodified 2672.2574 0.25743661 862 F5H6L3;E7ERK8;Q17R89;A0A087WZS3 ARHGAP44 Rho GTPase-activating protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 118.32 118.32 3 0.00057832 121909 QUIQUE_C1277_190116_001 28.404 25.963 146130000 0 50197000 0 0 45733000 0 50200000 0 0 0 0 0 0 244 862 233 2136;2137;2138 2851;2852;2853 2851 3 AALDGPLDAALDHLR Unmodified 1546.8104 0.81035532 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 3 2 3 119.72 119.72 3 3.0329E-12 122299 QUIQUE_C1563_190116_001 102.28 94.233 259110000 0 32947000 0 0 51954000 0 23904000 0 0 0 48309000 71285000 30714000 245 497 234 2139;2140;2141;2142;2143;2144;2145;2146;2147;2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;2159;2160;2161 2854;2855;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863;2864;2865;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875;2876;2877;2878;2879 2864 24 AALDGTPGMIGYGMAK 2 Oxidation (M) 1583.7324 0.73236428 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 2 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 60.024 60.024 2 5.2568E-06 58387 QUIQUE_C1277_190116_001 94.767 79.502 826910000 71721000 106830000 0 54190000 57984000 0 70372000 124260000 200280000 141270000 0 0 0 246 1959 235 2162;2163;2164;2165;2166;2167;2168;2169;2170;2171 2880;2881;2882;2883;2884;2885;2886;2887;2888;2889;2890;2891 2882 1217;1218 10 AALDGTPGMIGYGMAK Oxidation (M) 1567.7374 0.73744965 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.319 76.319 2 1.1718E-06 76246 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.86 98.502 1662800000 172020000 221520000 0 0 170150000 140760000 0 162500000 0 172830000 334400000 0 288660000 247 1959 235 2172;2173;2174;2175;2176;2177;2178;2179 2892;2893;2894;2895;2896;2897;2898;2899;2900 2896 1217;1218 7 AALDGTPGMIGYGMAK Unmodified 1551.7425 0.74253503 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.292 92.292 2 9.8156E-08 95895 QUIQUE_C1438_190116_001 139.86 120.1 5204800000 0 0 0 503810000 528820000 585870000 760990000 503430000 444020000 0 806840000 482810000 588170000 248 1959 235 2180;2181;2182;2183;2184;2185;2186;2187;2188 2901;2902;2903;2904;2905;2906;2907;2908;2909;2910 2902 8 AALDSINELPENILLELFTHVPAR Unmodified 2674.433 0.43301644 4265 Q9NRD1 FBXO6 F-box only protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 171.5 171.5 3 6.0878E-25 175793 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.85 118 235820000 0 0 0 0 0 0 0 17695000 54692000 0 98350000 0 65087000 249 4265 236 2189;2190;2191;2192 2911;2912;2913;2914 2912 4 AALDSLSLFTSLGLSEQK Acetyl (Protein N-term) 1921.0044 0.004423261 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQU2;F2Z2V6;A0A0U1RQC3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.97 174.97 2 7.0841E-163 179100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 251.24 214.09 486420000 35547000 25426000 0 5386100 55729000 0 23547000 54074000 92041000 0 84602000 64041000 46025000 250 2496 237 2193;2194;2195;2196;2197;2198;2199;2200;2201;2202 2915;2916;2917;2918;2919;2920;2921;2922;2923;2924 2921 10 AALEALDELDLFGVK Unmodified 1602.8505 0.8504888 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.23 156.23 2 1.2685E-05 151329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.96 85.448 919660000 44833000 54528000 97185000 53341000 70375000 59168000 170080000 46001000 47900000 24601000 95630000 78358000 77656000 251 550 238 2203;2204;2205;2206;2207;2208;2209;2210;2211;2212;2213;2214;2215 2925;2926;2927;2928;2929;2930;2931;2932;2933;2934;2935;2936;2937;2938 2935 12 AALEALGSCLNNK Unmodified 1359.6816 0.68164933 2360 P34897;G3V5L0;G3V4W5;G3V540;G3V241;G3V3Y8;G3V4T0;G3V4X0;G3V2W0;G3V2E4 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.749 68.749 2 1.6373E-07 68622 QUIQUE_C1368_190116_001 131.52 95.092 132400000 0 0 50478000 0 0 48072000 33847000 0 0 0 0 0 0 252 2360 239 2216;2217;2218;2219;2220;2221;2222;2223 2939;2940;2941;2942;2943;2944;2945;2946 2939 8 AALEALLGR Unmodified 912.53927 0.53926584 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 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G5EA30;Q92879;E9PQK4;E9PSH0;E9PKU1 CELF1 CUGBP Elav-like family member 1 yes no 0 0 0 1 36.906 36.906 2 6.2128E-05 32631 QUIQUE_C1218_190116_001 119.68 85.884 29743000 29743000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255 1106 242 2250 2977 2977 1 AALEEEVR Unmodified 915.46616 0.46616048 1022 F6RY50;Q96FS4 SIPA1 Signal-induced proliferation-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 25.328 25.328 2 0.0039304 19864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.01 10.82 938800000 0 0 0 0 0 0 0 417820000 0 223130000 0 0 297860000 256 1022 243 2251;2252;2253 2978;2979;2980 2978 2 AALEELVK Unmodified 871.50148 0.50148335 2035 P12081;B4DDD8;E7ETE2;B4E1C5;D6RF05;A0A2R8YCI2 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.101 54.101 2 0.020244 53279 QUIQUE_C1218_190116_001 77.058 27.699 737860000 54252000 79681000 65407000 71980000 60639000 56301000 0 63819000 0 21710000 97139000 69529000 97402000 257 2035 244 2254;2255;2256;2257;2258;2259;2260;2261;2262;2263;2264 2981;2982;2983;2984;2985;2986;2987;2988;2989;2990;2991 2981 11 AALEEVER Unmodified 915.46616 0.46616048 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.094 25.094 2 0.0036477 18852 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.93 0 1608300000 0 236010000 305110000 0 0 0 227040000 0 522240000 0 0 317910000 0 258 3117 245 2265;2266;2267;2268;2269 2992;2993;2994;2995;2996 2996 4 AALEGFLAALQADPPQAER Unmodified 1967.0112 0.011239973 658 F5GZ08;B7Z4G8;P51693;S4R3U6 APLP1 Amyloid-like protein 1;C30 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 144.32 144.32 2;3 2.6548E-07 150212 QUIQUE_C1218_190116_001 131.53 118.13 699970000 73961000 32868000 107590000 42906000 78001000 47550000 66745000 48892000 27590000 9884800 32550000 75744000 55694000 259 658 246 2270;2271;2272;2273;2274;2275;2276;2277;2278;2279;2280;2281;2282;2283;2284;2285;2286;2287;2288;2289;2290;2291 2997;2998;2999;3000;3001;3002;3003;3004;3005;3006;3007;3008;3009;3010;3011;3012;3013;3014;3015;3016;3017;3018 2998 21 AALEGTATYR Unmodified 1051.5298 0.52982336 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.156 27.156 2 1.6972E-14 21525 QUIQUE_DMIX7_190116_001 175.44 149.71 2108100000 225350000 169960000 149570000 183720000 152990000 140490000 168460000 193720000 119130000 88330000 202610000 128150000 185660000 260 4274 247 2292;2293;2294;2295;2296;2297;2298;2299;2300;2301;2302;2303;2304 3019;3020;3021;3022;3023;3024;3025;3026;3027;3028;3029;3030;3031;3032 3030 11 AALEQDLAFWYGPR Unmodified 1635.8045 0.80454166 582 B1AHA8;P09601 HMOX1 Heme oxygenase 1 yes no 0 0 0 1 139.73 139.73 2 0.050259 143619 QUIQUE_C1403_190116_001 64.374 56.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 261 582 248 2305 3033 3033 1 AALEQPCEGSLTRPK Unmodified 1655.8301 0.83010449 3400 Q6PUV4;D6RGY3;D6R960 CPLX2 Complexin-2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 35.904 35.904 2;3 9.702E-05 31988 QUIQUE_C1218_190116_001 114.76 97.822 654620000 285430000 30422000 0 194630000 0 0 144140000 0 0 0 0 0 0 262 3400 249 2306;2307;2308;2309;2310 3034;3035;3036;3037;3038 3035 5 AALEYLEDIDLK Unmodified 1391.7184 0.718412 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 124.71 124.71 2 0.00014376 127359 QUIQUE_C1563_190116_001 104.22 80.902 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 263 4006 250 2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320 3039;3040;3041;3042;3043;3044;3045;3046;3047;3048 3042 10 AALFENTPK Unmodified 989.5182 0.51819605 1026 F6VCX5;Q16816 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.98 39.98 2 0.00040546 36324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.18 85.082 4383700000 979740000 844720000 1220400000 0 0 70526000 0 461940000 806360000 0 0 0 0 264 1026 251 2321;2322;2323;2324;2325;2326 3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055 3054 7 AALFVSNNSR Unmodified 1077.5567 0.55670682 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.09 34.09 2 1.3347E-17 29322 QUIQUE_C1277_190116_001 178.83 144.58 2898800000 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3073;3074;3075;3076;3077;3078;3079;3080;3081 3075 9 AALGYDYKGETEKHESQR Unmodified 2080.9814 0.98139641 2072 P14317 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes yes 0 0 2 1 22.624 22.624 3 0.00089468 16095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.488 68.788 27739000 0 0 0 0 0 0 0 27739000 0 0 0 0 0 268 2072 255 2348 3082 3082 1 AALHPPALAVLSHTPDGATQTIAWVGK Unmodified 2721.4602 0.46023424 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 0 1 1 1 114.32 114.32 4 9.0472E-06 118339 QUIQUE_C1368_190116_001 52.321 45.289 131840000 0 34822000 51868000 0 0 0 0 45154000 0 0 0 0 0 269 3639 256 2349;2350;2351 3083;3084;3085;3086 3085 4 AALLAELALLEPEALR Unmodified 1691.9822 0.98217168 3225 Q3KQV9;A0A087X226 UAP1L1 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 164.68 164.68 2;3 3.9808E-10 171247 QUIQUE_C1438_190116_001 117.23 105.17 84127000 0 11970000 0 0 35316000 0 0 0 0 0 36840000 0 0 270 3225 257 2352;2353;2354;2355;2356 3087;3088;3089;3090;3091 3089 3 AALLDQIR Unmodified 898.52362 0.52361577 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 60.552 60.552 2 0.015844 56421 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.097 38.074 64174000 0 0 0 0 0 0 0 39459000 0 24714000 0 0 0 271 1401 258 2357;2358 3092;3093 3093 2 AALLELWELR Unmodified 1212.6867 0.68665836 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.71 141.71 2;3 1.2202E-11 148031 QUIQUE_C1218_190116_001 163.99 125.82 22788000000 2110700000 2324100000 2149500000 2629100000 2265100000 1856300000 2199000000 580320000 1165000000 1122100000 1794200000 1175800000 1416900000 272 267;275;3025 259 2359;2360;2361;2362;2363;2364;2365;2366;2367;2368;2369;2370;2371;2372 3094;3095;3096;3097;3098;3099;3100;3101;3102;3103;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3111;3112;3113;3114;3115;3116;3117;3118;3119;3120;3121;3122;3123 3096 30 AALLELWELRR Unmodified 1368.7878 0.78776939 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 3 1 2 2 2 1 2 3 2 111.44 111.44 2;3 7.5584E-30 116275 QUIQUE_DMIX5_190116_001 213.53 161.04 14823000000 51470000 445180000 452990000 236480000 1004100000 107070000 800070000 1860700000 2321000000 36348000 2766800000 2517400000 2223700000 273 267;275;3025 260 2373;2374;2375;2376;2377;2378;2379;2380;2381;2382;2383;2384;2385;2386;2387;2388;2389;2390;2391;2392;2393;2394;2395;2396;2397 3124;3125;3126;3127;3128;3129;3130;3131;3132;3133;3134;3135;3136;3137;3138;3139;3140;3141;3142;3143;3144;3145;3146;3147;3148;3149;3150;3151;3152;3153;3154;3155;3156;3157;3158 3151 35 AALLETLSLLLAK Unmodified 1354.8436 0.84355293 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 166.53 166.53 2 0.00041578 173631 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.143 83.106 237260000 0 0 0 0 0 0 0 22504000 63275000 0 56749000 94735000 0 274 3740 261 2398;2399;2400;2401 3159;3160;3161;3162 3161 2 AALLNQHYQVNFK Unmodified 1544.81 0.80996139 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 65.941 65.941 2;3 0.00012317 63117 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.479 71.279 112390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50779000 36110000 25506000 0 275 1929 262 2402;2403;2404;2405;2406;2407;2408;2409;2410 3163;3164;3165;3166;3167;3168;3169;3170;3171;3172 3170 10 AALLWALAAALER Unmodified 1367.7925 0.79252041 3561 Q8IZ83;F5H4B6 ALDH16A1 Aldehyde dehydrogenase family 16 member A1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 1 166.85 166.85 2;3 2.2374E-05 173822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.191 76.98 591240000 21056000 24216000 45050000 0 49246000 29664000 121530000 0 76181000 4268500 100270000 87525000 32235000 276 3561 263 2411;2412;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;2420;2421;2422;2423;2424;2425;2426 3173;3174;3175;3176;3177;3178;3179;3180;3181;3182;3183;3184;3185;3186;3187;3188 3185 15 AALNELVECVGSTR Unmodified 1517.7508 0.75079153 3119 Q15173;E9PNY3;E9PQN5 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 98.802 98.802 2 0.019271 102353 QUIQUE_C1218_190116_001 50.354 23.025 199320000 53467000 58019000 0 87835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 277 3119 264 2427;2428;2429 3189;3190;3191 3189 3 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR 2 Oxidation (M) 4183.0467 0.046662562 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 2 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 139.91 139.91 3;4 1.3462E-128 144403 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.36 166.09 1852500000 66558000 76130000 59999000 0 0 36728000 0 242100000 263650000 235540000 233040000 253320000 385470000 278 612 265 2430;2431;2432;2433;2434;2435;2436;2437;2438;2439;2440;2441;2442;2443;2444;2445 3192;3193;3194;3195;3196;3197;3198;3199;3200;3201;3202;3203;3204;3205;3206;3207;3208;3209;3210 3200 397;398 18 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR Oxidation (M) 4167.0517 0.05174794 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 151.78 151.78 3;4;5 1.9492E-113 156683 QUIQUE_C1368_190116_001 163 154.87 4968900000 575620000 457060000 543290000 723910000 186380000 564460000 253500000 464290000 0 606570000 0 98282000 495570000 279 612 265 2446;2447;2448;2449;2450;2451;2452;2453;2454;2455;2456;2457;2458;2459;2460;2461 3211;3212;3213;3214;3215;3216;3217;3218;3219;3220;3221;3222;3223;3224;3225;3226;3227;3228;3229;3230;3231 3218 397;398 21 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR Unmodified 4151.0568 0.056833318 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 5 2 2 2 2 3 5 3 1 3 3 4 160.34 160.34 3;4;5 6.4661E-184 165924 QUIQUE_C1218_190116_001 200.91 195.72 15957000000 1245000000 1133800000 1626000000 1184000000 871100000 990870000 1041500000 1332500000 1177900000 37581000 1530000000 2074900000 1711900000 280 612 265 2462;2463;2464;2465;2466;2467;2468;2469;2470;2471;2472;2473;2474;2475;2476;2477;2478;2479;2480;2481;2482;2483;2484;2485;2486;2487;2488;2489;2490;2491;2492;2493;2494;2495;2496;2497;2498;2499 3232;3233;3234;3235;3236;3237;3238;3239;3240;3241;3242;3243;3244;3245;3246;3247;3248;3249;3250;3251;3252;3253;3254;3255;3256;3257;3258;3259;3260;3261;3262;3263;3264;3265;3266;3267;3268;3269;3270;3271;3272;3273;3274;3275;3276;3277;3278;3279 3234 43 AALPTPALSPEDK Unmodified 1308.6925 0.6925316 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 65.748 65.748 2 0.023716 61604 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.452 39.622 20287000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20287000 0 0 0 281 4161 266 2500;2501 3280;3281;3282 3282 3 AALQEEEQASK Unmodified 1202.5779 0.57789577 1377 O00139 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.105 17.105 2 2.6325E-09 10028 QUIQUE_C1218_190116_001 166.33 135.25 1704400000 163080000 153050000 176120000 182490000 90843000 155130000 136370000 152750000 159700000 40762000 120370000 173770000 0 282 1377 267 2502;2503;2504;2505;2506;2507;2508;2509;2510;2511;2512;2513 3283;3284;3285;3286;3287;3288;3289;3290;3291;3292;3293;3294 3283 7 AALQEELQLCK Unmodified 1301.6649 0.66493664 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 71.814 71.814 2 0.003715 71959 QUIQUE_C1277_190116_001 90.709 60.454 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 283 2524 268 2514 3295 3295 1 AALQEGHQFLCSIEA Unmodified 1672.7879 0.78790532 2571 P50583 NUDT2 Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 103.53 103.53 2 0.006895 106589 QUIQUE_C1277_190116_001 56.087 38.613 223890000 0 68938000 0 0 0 0 0 74973000 0 0 79980000 0 0 284 2571 269 2515;2516;2517 3296;3297;3298 3296 2 AALQSQAEALR Unmodified 1156.62 0.62003536 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 1 1 37.007 37.007 2 0.003244 33279 QUIQUE_C1277_190116_001 74.376 9.7226 6346300000 0 1932800000 0 2328700000 2084800000 0 0 0 0 0 0 0 0 285 3725 270 2518;2519;2520 3299;3300;3301;3302;3303 3299 5 AALQSQAEALRR Unmodified 1312.7211 0.72114638 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 1 1 1 27.761 27.761 3 0.0099949 22205 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.592 2.6009 76020000 0 0 0 0 0 0 0 0 31863000 0 0 44157000 0 286 3725 271 2521;2522 3304;3305;3306 3304 3 AALSALESFLK Unmodified 1148.6441 0.64412484 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.92 131.92 2 0.0002806 136098 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.12 91.91 209730000 0 0 14062000 0 0 10449000 17395000 27939000 33215000 9708600 34001000 43321000 19637000 287 2813 272 2523;2524;2525;2526;2527;2528;2529;2530;2531;2532;2533 3307;3308;3309;3310;3311;3312;3313;3314;3315;3316;3317;3318 3317 12 AALSASEGEEVPQDKAPSHVPFLLIGGGTAAFAAAR Unmodified 3534.8107 0.81069626 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 124.38 124.38 4 1.8688E-05 127142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.003 34.956 45377000 0 0 0 0 0 0 0 45377000 0 0 0 0 0 288 1756 273 2534 3319 3319 1 AALSEMVEYITHNR Unmodified 1632.793 0.7929907 1163 H0YJ75;Q13362;Q96B13;G3V2U3 PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 119.51 119.51 2;3 7.1657E-05 123790 QUIQUE_C1368_190116_001 76.262 69.534 477340000 23185000 39961000 32388000 34252000 24427000 27131000 52298000 59417000 0 0 97365000 41051000 45866000 289 1163 274 2535;2536;2537;2538;2539;2540;2541;2542;2543;2544;2545;2546;2547 3320;3321;3322;3323;3324;3325;3326;3327;3328;3329;3330;3331;3332;3333;3334;3335 3323 14 AALSGANVLTLIEK Unmodified 1398.8082 0.80823006 2911 Q07954;H0YJI8 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 0 1 122.71 122.71 2 0.010968 127098 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.788 54.951 79011000 0 0 0 0 0 0 0 0 79011000 0 0 0 0 290 2911 275 2548 3336 3336 1 AALSGSYVNFGVFR Unmodified 1486.7569 0.75686319 4447 Q9UIA9;E7ESC6;E5RIW1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 118.56 118.56 2 0.00025845 122840 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.23 97.488 161270000 0 0 0 0 0 41092000 0 0 51286000 0 68895000 0 0 291 4447 276 2549;2550;2551 3337;3338;3339 3338 3 AALSSFQK Unmodified 850.45487 0.45486751 2717 P61201;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 24.696 24.696 2 0.020244 18246 QUIQUE_C1368_190116_001 77.058 57.136 461350000 0 0 114600000 0 0 0 0 0 0 0 0 129680000 217060000 292 2717 277 2552;2553;2554 3340;3341;3342 3340 3 AALTAEHFAALQSLLK Acetyl (Protein N-term) 1724.9461 0.94612052 4360 Q9P000;E9PJ95 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 153.08 153.08 2;3 1.2074E-29 157325 QUIQUE_C1277_190116_001 178.58 150.38 1456700000 110440000 149970000 137780000 98761000 137140000 138730000 84293000 28467000 137610000 18741000 108720000 207210000 98820000 293 4360 278 2555;2556;2557;2558;2559;2560;2561;2562;2563;2564;2565;2566;2567;2568;2569;2570;2571;2572;2573;2574;2575 3343;3344;3345;3346;3347;3348;3349;3350;3351;3352;3353;3354;3355;3356;3357;3358;3359;3360;3361;3362;3363 3346 21 AALTGLLHR Unmodified 950.56615 0.56614929 2660 P55084;B5MD38;C9JEY0;C9JE81 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.174 45.174 2 0.00012644 42922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.36 104.04 1720500000 292010000 236870000 0 206460000 0 155820000 230680000 358970000 0 0 0 0 239670000 294 2660 279 2576;2577;2578;2579;2580;2581;2582 3364;3365;3366;3367;3368;3369;3370;3371;3372 3371 8 AALTLTPSAVNK Unmodified 1184.6765 0.6764876 4032 Q9BUE6;Q5TBE9 ISCA1 Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 53.461 53.461 2 0.0014638 50422 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.08 64.56 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 295 4032 280 2583;2584;2585 3373;3374;3375 3375 3 AALTTLFK Acetyl (Protein N-term) 905.52222 0.52221879 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QRA8;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;J3QQN6;J3QL02;J3KSS4;J3QRP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 145.06 145.06 1;2 0.00081455 147855 QUIQUE_C1563_190116_001 161.11 94.077 25563000000 1692400000 1573300000 2145200000 1781400000 2262600000 1777900000 2143500000 2112400000 2121500000 897640000 2510900000 2180400000 2363900000 296 3897 281 2586;2587;2588;2589;2590;2591;2592;2593;2594;2595;2596;2597;2598;2599;2600;2601;2602;2603;2604;2605;2606;2607;2608;2609;2610;2611 3376;3377;3378;3379;3380;3381;3382;3383;3384;3385;3386;3387;3388;3389;3390;3391;3392;3393;3394;3395;3396;3397;3398;3399;3400;3401;3402;3403;3404;3405;3406;3407;3408;3409;3410;3411;3412;3413;3414;3415;3416;3417;3418 3395 35 AALTTLFK Unmodified 863.51165 0.5116541 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QRA8;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;J3QQN6;J3QL02;J3KSS4;J3QRP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 74.067 74.067 2 0.045295 73703 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.177 42.513 13642000 0 0 0 0 0 0 0 13642000 0 0 0 0 0 297 3897 281 2612 3419;3420 3420 2 AALVAQNYINYQQGTPHR Unmodified 2043.0286 0.028621372 4008 Q9BS40 LXN Latexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.201 68.201 3 8.0719E-05 68110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.317 72.034 661310000 71485000 54299000 53832000 55372000 60919000 35087000 56157000 0 42489000 28293000 66927000 72472000 63976000 298 4008 282 2613;2614;2615;2616;2617;2618;2619;2620;2621;2622;2623;2624 3421;3422;3423;3424;3425;3426;3427;3428;3429;3430;3431;3432 3428 10 AALVDLEPGTMDSVR Unmodified 1572.7818 0.78175731 4033 Q9BUF5;K7EL29;K7EN98;K7ESQ3;K7EQT3;K7EJ64;K7ERA8;K7EJZ4;K7EPE5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 98.872 98.872 2 1.3674E-05 101414 QUIQUE_C1403_190116_001 96.604 63.516 300890000 0 40943000 0 58444000 45669000 0 0 0 0 0 155840000 0 0 299 4033 283 2625;2626;2627;2628 3433;3434;3435;3436 3434 2 AALVDYLDGK Unmodified 1063.555 0.55497548 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 90.762 90.762 2 0.058232 87376 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.335 23.264 13034000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13034000 0 0 0 300 3391 284 2629 3437 3437 1 AALVEPLGLER Acetyl (Protein N-term) 1208.6765 0.6764876 4204 Q9HAP6 LIN7B Protein lin-7 homolog B yes yes 1 0 0 1 140.74 140.74 2 0.033456 144598 QUIQUE_C1403_190116_001 43.185 29.047 19305000 0 0 0 19305000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 301 4204 285 2630 3438 3438 1 AALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK Oxidation (M) 2884.4892 0.48921069 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 3 2 1 1 3 1 1 1 145.77 145.77 3 2.5589E-20 141233 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.446 87.996 3182600000 201700000 179370000 0 392020000 245310000 573630000 274190000 161360000 291610000 335040000 200090000 167330000 160950000 302 3050 286 2631;2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2642;2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649 3439;3440;3441;3442;3443;3444;3445;3446;3447;3448;3449;3450;3451;3452;3453;3454;3455;3456;3457;3458;3459;3460;3461;3462;3463 3457 2473 23 AALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK Unmodified 2868.4943 0.49429607 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 4 4 3 2 1 2 3 3 3 3 4 4 3 151.89 151.89 2;3;4 8.8431E-133 157262 QUIQUE_C1368_190116_001 246.45 236.79 12127000000 875140000 1131200000 1010600000 671370000 644360000 168870000 957000000 1089600000 1125900000 518830000 1163200000 1859100000 911560000 303 3050 286 2650;2651;2652;2653;2654;2655;2656;2657;2658;2659;2660;2661;2662;2663;2664;2665;2666;2667;2668;2669;2670;2671;2672;2673;2674;2675;2676;2677;2678;2679;2680;2681;2682;2683;2684;2685;2686;2687;2688 3464;3465;3466;3467;3468;3469;3470;3471;3472;3473;3474;3475;3476;3477;3478;3479;3480;3481;3482;3483;3484;3485;3486;3487;3488;3489;3490;3491;3492;3493;3494;3495;3496;3497;3498;3499;3500;3501;3502;3503;3504;3505;3506;3507;3508;3509;3510;3511;3512;3513;3514;3515;3516;3517;3518;3519;3520;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529;3530;3531;3532;3533;3534;3535;3536;3537;3538;3539 3486 75 AALVGGTTMIIGHVLPDK Unmodified 1791.9917 0.99169051 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 104.72 104.72 2;3 0.00036065 107917 QUIQUE_C1277_190116_001 76.01 67.878 462820000 0 129710000 66628000 0 68134000 71429000 60788000 0 0 29266000 0 0 36855000 304 3984 287 2689;2690;2691;2692;2693;2694;2695;2696 3540;3541;3542;3543;3544;3545;3546;3547;3548;3549;3550 3542 10 AALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK Unmodified 2927.5314 0.53140985 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 123.7 123.7 3;4 1.9484E-78 127145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.27 160.47 11966000000 595490000 1052700000 763110000 606330000 1105800000 521960000 1202800000 800870000 1281500000 222930000 1135100000 1074100000 1602800000 305 3984 288 2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2704;2705;2706;2707;2708;2709;2710;2711;2712;2713;2714;2715;2716;2717;2718;2719;2720;2721;2722 3551;3552;3553;3554;3555;3556;3557;3558;3559;3560;3561;3562;3563;3564;3565;3566;3567;3568;3569;3570;3571;3572;3573;3574;3575;3576;3577;3578;3579;3580;3581;3582;3583;3584;3585;3586;3587;3588;3589;3590;3591;3592;3593;3594;3595;3596;3597;3598;3599 3579 49 AALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK Oxidation (M) 2943.5263 0.52632448 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 115.68 115.68 3;4 1.8986E-18 119537 QUIQUE_C1368_190116_001 88.917 80.753 1124500000 0 66238000 70622000 40217000 0 0 0 242840000 95283000 37969000 160710000 121440000 289200000 306 3984 288 2723;2724;2725;2726;2727;2728;2729;2730;2731;2732 3600;3601;3602;3603;3604;3605;3606;3607;3608;3609 3601 2820 9 AALVLEDGSVLR Acetyl (Protein N-term) 1283.7085 0.70851601 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.89 147.89 2 2.6705E-07 153309 QUIQUE_C1368_190116_001 168.8 70.764 451500000 0 38360000 42331000 35424000 48293000 36650000 36841000 42838000 38730000 12745000 44017000 40421000 34855000 307 1029 289 2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;2740;2741;2742;2743;2744 3610;3611;3612;3613;3614;3615;3616;3617;3618;3619;3620;3621;3622 3611 12 AAMAAAQSGTPGPVFVELPVDVLYPYFMVQK Unmodified 3295.6661 0.6661292 516 A1L0T0;M0R026;E9PJS0;M0R1B5 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 0 0 1 171.94 171.94 3 0.0014927 174535 QUIQUE_C1403_190116_001 30.602 25.39 18151000 0 0 0 18151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 308 516 290 2745 3623 3623 1 AAMAVGGAGGSR Acetyl (Protein N-term) 1045.4975 0.49747738 1440 O14744;G3V580;G3V2X6;G3V2L6;C9JSX3;G3V507;G3V2F5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 50.373 50.373 2 0.029203 48982 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.161 25.647 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 309 1440 291 2746 3624 3624 1 AAMDNSEIAGEK Unmodified 1234.55 0.54996646 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.121 25.121 2 1.5995E-06 18870 QUIQUE_C1438_190116_001 139.43 115.66 1169700000 0 136390000 132590000 129180000 97886000 113800000 123530000 40947000 66181000 50494000 114720000 46518000 117450000 310 693;3205 292 2747;2748;2749;2750;2751;2752;2753;2754;2755;2756;2757;2758 3625;3626;3627;3628;3629;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636;3637;3638;3639;3640 3629 16 AAMDNSEIAGEK Oxidation (M) 1250.5449 0.54488108 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 1 0 1 15.345 15.345 2 0.0021983 7324 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 63.511 23590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23590000 0 0 0 311 693;3205 292 2759 3641;3642 3641 426 2 AAMDNSEIAGEKK Unmodified 1362.6449 0.64492948 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 16.388 16.388 2;3 1.1951E-07 8708 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.97 132.35 1677600000 73148000 109590000 107580000 135560000 98174000 0 108440000 194520000 0 0 402010000 204700000 243910000 312 693;3205 293 2760;2761;2762;2763;2764;2765;2766;2767;2768;2769;2770;2771;2772;2773;2774 3643;3644;3645;3646;3647;3648;3649;3650;3651;3652;3653;3654;3655;3656;3657;3658 3653 13 AAMEALVVEVTK Unmodified 1259.6795 0.67952407 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.657 97.657 2 0.0043849 101632 QUIQUE_C1218_190116_001 86.344 75.123 433670000 93870000 0 83656000 0 0 0 74912000 76938000 0 0 104290000 0 0 313 2916 294 2775;2776;2777;2778;2779;2780 3659;3660;3661;3662;3663;3664 3659 4 AAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQR Unmodified 3201.4859 0.485933 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 128.68 128.68 3 0.00053613 125195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.054 32.502 44275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44275000 0 0 0 314 425 295 2781 3665 3665 1 AAMIVNQLSK Unmodified 1073.5903 0.59031513 2084 P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1 JUP Junction plakoglobin yes no 0 0 0 1 1 47.473 47.473 2 0.00069041 45134 QUIQUE_C1403_190116_001 107.69 60.25 78463000 0 0 0 46363000 0 0 0 0 0 0 0 0 32100000 315 2084 296 2782;2783 3666;3667;3668 3667 3 AAMIWIVGEYAER Unmodified 1507.7493 0.74933497 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 3 3 2 2 3 3 2 130.61 130.61 2;3 0.00010934 136494 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.633 66.755 1580700000 88141000 111550000 0 98382000 92235000 10008000 144370000 233100000 166100000 116460000 179940000 200480000 139920000 316 2777;2938 297 2784;2785;2786;2787;2788;2789;2790;2791;2792;2793;2794;2795;2796;2797;2798;2799;2800;2801;2802;2803;2804;2805;2806;2807;2808;2809;2810;2811;2812 3669;3670;3671;3672;3673;3674;3675;3676;3677;3678;3679;3680;3681;3682;3683;3684;3685;3686;3687;3688;3689;3690;3691;3692;3693;3694;3695;3696;3697;3698;3699;3700;3701;3702;3703;3704;3705;3706;3707;3708;3709;3710;3711;3712;3713;3714;3715 3702 47 AAMIWIVGEYAER Oxidation (M) 1523.7442 0.74424959 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 109.64 109.64 2 0.00013923 111192 QUIQUE_C1563_190116_001 117.67 74.93 443640000 0 63339000 0 69701000 49032000 67966000 66901000 33916000 0 34932000 0 57855000 0 317 2777;2938 297 2813;2814;2815;2816;2817;2818;2819;2820;2821;2822;2823;2824 3716;3717;3718;3719;3720;3721;3722;3723;3724;3725;3726;3727;3728;3729;3730 3723 2213 15 AAMLSLLR Unmodified 873.51061 0.51060825 1481 O15111 CHUK Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 83.582 83.582 2 0.059892 84101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 33.586 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 318 1481 298 2825 3731 3731 1 AAMTSLMDLTLLLAR Unmodified 1618.8786 0.87863458 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 168.12 168.12 2 1.3837E-12 172806 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 114.51 100640000 28001000 31324000 0 17543000 0 0 0 23773000 0 0 0 0 0 319 1283 299 2826;2827;2828;2829 3732;3733;3734;3735 3732 4 AAMVGMLANFLGFR Unmodified 1496.7632 0.76321089 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.74 166.74 2 0.00020667 172202 QUIQUE_C1576_190116_001 94.692 79.719 502410000 36569000 29331000 45411000 0 0 20067000 34310000 34156000 42165000 6738100 96554000 129070000 28040000 320 1801 300 2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;2840 3736;3737;3738;3739;3740;3741;3742;3743;3744;3745;3746 3740 8 AANATTNPSQLLPLELVDK Acetyl (Protein N-term) 2036.079 0.078985188 675 B8ZZF8;Q9Y4Y9 LSM5 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.7 157.7 2 1.8889E-11 161872 QUIQUE_C1277_190116_001 140.74 128.18 315840000 32773000 37440000 42829000 0 35848000 0 0 30412000 0 12460000 37867000 47389000 38826000 321 675 301 2841;2842;2843;2844;2845;2846;2847;2848;2849;2850 3747;3748;3749;3750;3751;3752;3753;3754;3755;3756;3757;3758;3759;3760;3761 3748 15 AANDAGYFNDEMAPIEVK Unmodified 1953.8778 0.87784254 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.3 107.3 2 2.5401E-08 110754 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.81 122.72 3380800000 302820000 264060000 346350000 265580000 204970000 241000000 285390000 265320000 230460000 75213000 372130000 266190000 261270000 322 2453 302 2851;2852;2853;2854;2855;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863 3762;3763;3764;3765;3766;3767;3768;3769;3770;3771;3772;3773;3774;3775 3775 13 AANDAGYFNDEMAPIEVK Oxidation (M) 1969.8728 0.87275716 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.992 87.992 2 3.27E-38 89917 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.48 153.78 365540000 0 34550000 0 0 42094000 0 0 54912000 56016000 0 70248000 58431000 49288000 323 2453 302 2864;2865;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875 3776;3777;3778;3779;3780;3781;3782;3783;3784;3785;3786;3787 3783 1874 12 AANEVSSADVK Unmodified 1089.5302 0.5302173 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 15.993 15.993 2 0.0026434 8839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.523 66.147 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 324 1175 303 2876;2877;2878;2879 3788;3789;3790;3791 3791 4 AANGVVLATEK Unmodified 1071.5924 0.59242362 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.041 26.041 2 0.00020688 20175 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.75 46.466 1595100000 115930000 103540000 117280000 114030000 123770000 100020000 137330000 115640000 134740000 57460000 172420000 141190000 161770000 325 5 304 2880;2881;2882;2883;2884;2885;2886;2887;2888;2889;2890;2891;2892 3792;3793;3794;3795;3796;3797;3798;3799;3800;3801;3802;3803;3804;3805 3800 9 AANGVVLATEKK Unmodified 1199.6874 0.68738664 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 1 2 16.52 16.52 2;3 0.0041663 9040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.887 57.347 39542000 0 0 0 0 0 0 0 39542000 0 0 0 0 0 326 5 305 2893;2894 3806;3807 3807 2 AANILVGENLVCK Unmodified 1399.7493 0.74933497 1305;2048 J3QRU1;P07947;P12931 YES1;SRC Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src no no 0 0 0 1 85.678 85.678 2 0.0078538 82417 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.166 43.188 34412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34412000 0 0 0 327 1305;2048 306 2895 3808;3809 3809 2 AANLNNLVVEAYQK Unmodified 1545.8151 0.81510635 2247 P26012 ITGB8 Integrin beta-8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 90.115 90.115 2 0.00014501 92360 QUIQUE_C1368_190116_001 103.63 72.138 389760000 61267000 0 82058000 0 91051000 0 74308000 0 0 0 81074000 0 0 328 2247 307 2896;2897;2898;2899;2900;2901;2902;2903 3810;3811;3812;3813;3814;3815;3816;3817;3818 3812 6 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTK Unmodified 2268.1209 0.12086678 4611 Q9Y4P8 WIPI2 WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 118.22 118.22 3 2.9776E-11 122042 QUIQUE_C1277_190116_001 71.052 63.213 272390000 40474000 59296000 0 52208000 0 0 0 0 0 0 0 58046000 62365000 329 4611 308 2904;2905;2906;2907;2908 3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825 3820 7 AANSCTSYSGTTLNLK Unmodified 1686.7883 0.78829925 4520 Q9UPQ0;D6RD46 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.573 54.573 2 0.002049 52515 QUIQUE_C1403_190116_001 63.966 41.048 106820000 20121000 0 0 19891000 24438000 21339000 0 0 0 0 0 21027000 0 330 4520 309 2909;2910;2911;2912;2913 3826;3827;3828;3829;3830 3827 5 AANSLEAFIFETQDK Unmodified 1682.8152 0.81516593 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 132.96 132.96 2;3 2.8817E-06 136098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.58 125.95 790930000 0 187880000 0 130480000 68137000 52691000 0 71905000 143250000 0 67535000 0 69059000 331 89 310 2914;2915;2916;2917;2918;2919;2920;2921;2922;2923;2924;2925;2926 3831;3832;3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;3845 3842 12 AANVLLSEHGEVK Unmodified 1365.7252 0.72522871 622 B4DR80;Q9Y6E0;H0Y630 STK24 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit yes no 0 0 0 1 32.8 32.8 2 0.045674 27668 QUIQUE_C1277_190116_001 44.299 26.435 18209000 0 18209000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 332 622 311 2927 3846 3846 1 AANWYER Unmodified 908.41407 0.41406533 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 34.12 34.12 2 0.035447 29973 QUIQUE_C1438_190116_001 86.866 71.427 368670000 0 0 0 0 112220000 0 0 0 0 0 148270000 0 108170000 333 1639 312 2928;2929;2930 3847;3848;3849 3847 3 AAPAEGAGEDEDDGASR Unmodified 1616.655 0.65503647 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 0 1 1 17.931 17.931 2 9.4095E-05 10385 QUIQUE_C1368_190116_001 93.348 86.375 22811000 0 0 11051000 0 0 0 11760000 0 0 0 0 0 0 334 1015 313 2931;2932 3850;3851 3850 1 AAPAPGLISVFSSSQELGAALAQLVAQR Acetyl (Protein N-term) 2793.5025 0.50249299 1723 O95336;M0R261;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 2 2 3 1 2 2 1 182.61 182.61 2;3 8.7119E-127 188926 QUIQUE_DMIX5_190116_001 243.13 231.66 7132400000 125820000 130700000 250870000 0 598100000 251330000 307110000 798480000 1377700000 25543000 1719600000 1524400000 22738000 335 1723 314 2933;2934;2935;2936;2937;2938;2939;2940;2941;2942;2943;2944;2945;2946;2947;2948;2949;2950;2951 3852;3853;3854;3855;3856;3857;3858;3859;3860;3861;3862;3863;3864;3865;3866;3867;3868;3869;3870;3871;3872;3873;3874;3875;3876;3877;3878 3875 26 AAPAQQTTQPGGGK Acetyl (Protein N-term) 1352.6684 0.66844211 4327 Q9NXG2;H3BNW0 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.484 23.484 2 3.3942E-11 17266 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.36 121.13 464170000 47516000 44789000 0 75422000 0 36744000 44102000 58456000 46311000 0 52588000 0 58242000 336 4327 315 2952;2953;2954;2955;2956;2957;2958;2959;2960 3879;3880;3881;3882;3883;3884;3885;3886;3887;3888 3885 10 AAPAQQTTQPGGGKR Acetyl (Protein N-term) 1508.7696 0.76955314 4327 Q9NXG2;H3BNW0 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 16.576 16.576 2 1.8895E-06 8886 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.77 96.427 177310000 0 0 0 0 0 0 0 33868000 27201000 0 58619000 28009000 29616000 337 4327 316 2961;2962;2963;2964;2965 3889;3890;3891;3892;3893 3891 5 AAPCIYWLPLTDSQIVQK Unmodified 2102.087 0.087047453 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 1 1 144.39 144.39 2 0.00078165 149440 QUIQUE_C1368_190116_001 90.614 79.667 83219000 14671000 0 34110000 34438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 338 4745 317 2966;2967;2968 3894;3895;3896 3895 3 AAPDDPSGFAVLASCAR Unmodified 1703.7937 0.79371898 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 101.6 101.6 2 0.00048238 104495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.912 56.039 212040000 0 50405000 0 0 0 0 0 0 48192000 0 0 49639000 63801000 339 212 318 2969;2970;2971;2972;2973 3897;3898;3899;3900;3901 3900 5 AAPEASGTPSSDAVSR Unmodified 1501.7009 0.70086445 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.807 22.807 2 2.4271E-06 16209 QUIQUE_C1218_190116_001 140.91 123.47 6381400000 476000000 512540000 698530000 678380000 521910000 482540000 598720000 381210000 459520000 0 576960000 461720000 533340000 340 2327 319 2974;2975;2976;2977;2978;2979;2980;2981;2982;2983;2984;2985 3902;3903;3904;3905;3906;3907;3908;3909;3910;3911;3912;3913;3914 3902 12 AAPEGSGLGEDAR Acetyl (Protein N-term) 1270.579 0.5789584 3857 Q96G03;E7ENQ8;E9PD70 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.262 53.262 2 0.0020182 51890 QUIQUE_C1218_190116_001 69.65 52.979 472430000 67713000 63921000 72637000 64173000 0 43702000 0 0 0 36595000 0 62539000 61153000 341 3857 320 2986;2987;2988;2989;2990;2991;2992;2993;2994 3915;3916;3917;3918;3919;3920;3921;3922;3923;3924 3915 10 AAPEMVSLLK Unmodified 1057.5842 0.58416712 3771 Q92947;K7EQ99;K7ESA6 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.355 81.355 2 0.0046555 82481 QUIQUE_C1368_190116_001 80.165 40.098 572630000 0 0 148830000 129600000 0 116670000 0 99629000 0 0 0 77899000 0 342 3771 321 2995;2996;2997;2998;2999;3000 3925;3926;3927;3928;3929;3930;3931 3927 4 AAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFK 2 Oxidation (M) 4393.0307 0.030737726 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 2 0 1 169.04 169.04 4 1.5342E-54 176438 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.66 101.96 119410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119410000 0 0 343 1242;2047 322 3001 3932 3932 710;711 1 AAPFSLEYR Unmodified 1052.5291 0.52909508 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.758 74.758 2 2.3278E-06 76864 QUIQUE_C1218_190116_001 170.32 132.08 6632500000 436890000 324010000 448620000 301640000 664500000 181260000 454550000 580840000 552870000 0 613120000 717760000 1356500000 344 3120 323 3002;3003;3004;3005;3006;3007;3008;3009;3010;3011;3012;3013 3933;3934;3935;3936;3937;3938;3939;3940;3941;3942;3943;3944;3945;3946;3947;3948;3949;3950;3951;3952;3953;3954;3955;3956 3934 24 AAPGAEFAPNK Unmodified 1071.5349 0.53490874 3122 Q15233 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 29.887 29.887 2 0.038317 24584 QUIQUE_C1277_190116_001 64.711 41.64 117990000 0 57790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60201000 0 345 3122 324 3014;3015 3957;3958 3957 1 AAPGAEFAPNKR Unmodified 1227.636 0.63601977 3122 Q15233 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 20.144 20.144 2;3 0.0004049 12638 QUIQUE_C1563_190116_001 65.179 57.917 3432300000 235510000 350660000 247430000 429600000 229290000 184200000 155630000 276280000 293410000 57260000 439820000 193930000 339300000 346 3122 325 3016;3017;3018;3019;3020;3021;3022;3023;3024;3025;3026;3027;3028;3029;3030;3031;3032;3033 3959;3960;3961;3962;3963;3964;3965;3966;3967;3968;3969;3970;3971;3972;3973;3974;3975;3976 3968 13 AAPGALLVMGVSGSGK Acetyl (Protein N-term) 1455.7755 0.77554972 3317 Q5T6J7;Q5T6J8 IDNK Probable gluconokinase yes no 1 0 0 1 1 141.65 141.65 2 0.016096 137738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.013 35.811 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 347 3317 326 3034;3035 3977;3978 3978 2 AAPGDPQDELLPLAGPGSQWLR Acetyl (Protein N-term) 2329.1703 0.17025981 3199 Q16799 RTN1 Reticulon-1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 167.55 167.55 2 4.4009E-09 172341 QUIQUE_C1218_190116_001 96.414 76.575 378210000 80328000 82986000 0 0 90702000 0 0 58229000 65963000 0 0 0 0 348 3199 327 3036;3037;3038;3039;3040 3979;3980;3981;3982;3983 3979 4 AAPGPALCLFDVDGTLTAPR Acetyl (Protein N-term) 2083.0408 0.040825542 1179 H3BR08;H3BM92;H3BV34;H3BT06;H3BNY9;H3BRM0;O15305 PMM2 Phosphomannomutase;Phosphomannomutase 2 yes no 1 0 0 1 1 166.93 166.93 2 2.2535E-06 170127 QUIQUE_C1403_190116_001 92.468 79.267 35562000 0 0 20640000 14922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 349 1179 328 3041;3042 3984;3985 3985 2 AAPILFASAALALGSSLALK Unmodified 1884.1084 0.10843482 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 169.89 169.89 2;3 6.8947E-65 174262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.48 167.28 1037200000 59269000 48569000 75255000 26235000 59512000 21860000 75016000 130810000 176960000 20523000 108010000 88084000 147070000 350 3434 329 3043;3044;3045;3046;3047;3048;3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055;3056;3057;3058;3059;3060;3061;3062;3063;3064;3065;3066;3067;3068 3986;3987;3988;3989;3990;3991;3992;3993;3994;3995;3996;3997;3998;3999;4000;4001;4002;4003;4004;4005;4006;4007;4008;4009;4010;4011;4012;4013;4014;4015 4007 30 AAPLAGFGYGLPISR Unmodified 1488.8089 0.80889876 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 121.65 121.65 2 0.0011386 124455 QUIQUE_C1563_190116_001 87.363 73.205 485360000 0 0 67659000 0 63076000 55530000 67373000 0 53213000 0 0 84579000 93926000 351 3113 330 3069;3070;3071;3072;3073;3074;3075 4016;4017;4018;4019;4020;4021;4022 4018 4 AAPLDSIHSLAAYYIDCIR Unmodified 2148.0674 0.067374644 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 3 1 3 3 2 1 1 1 3 2 1 155.43 155.43 2;3 7.4691E-11 162313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.46 112.17 1029400000 58035000 54281000 126180000 77193000 110930000 148550000 55785000 0 91017000 27568000 192980000 86921000 0 352 2524 331 3076;3077;3078;3079;3080;3081;3082;3083;3084;3085;3086;3087;3088;3089;3090;3091;3092;3093;3094;3095;3096;3097;3098 4023;4024;4025;4026;4027;4028;4029;4030;4031;4032;4033;4034;4035;4036;4037;4038;4039;4040;4041;4042;4043;4044;4045;4046;4047;4048;4049;4050;4051;4052 4046 28 AAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYK Acetyl (Protein N-term) 2594.3268 0.32682003 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R1V5;K7EJR2;M0R330 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 1 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 162.7 162.7 2;3 7.9291E-11 167696 QUIQUE_C1368_190116_001 89.541 74.379 694220000 97146000 137020000 101320000 83529000 19249000 13172000 0 17176000 0 0 60062000 0 165540000 353 4394 332 3099;3100;3101;3102;3103;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3111;3112 4053;4054;4055;4056;4057;4058;4059;4060;4061;4062;4063;4064;4065;4066 4058 14 AAPLQGMLPGLLAPLR Oxidation (M) 1632.9385 0.93853272 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 2.6211E-06 126686 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.7 99.798 360770000 35951000 31661000 30235000 0 57948000 44119000 0 48215000 0 37451000 0 0 75191000 354 2037 333 3113;3114;3115;3116;3117;3118;3119;3120 4067;4068;4069;4070;4071;4072;4073;4074;4075;4076 4075 1344 10 AAPLQGMLPGLLAPLR Unmodified 1616.9436 0.9436181 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 149.79 149.79 2;3 5.2523E-05 155659 QUIQUE_C1218_190116_001 116.75 101.6 1409700000 89459000 90985000 87956000 187460000 210860000 135510000 77613000 96892000 76312000 49642000 94292000 81128000 131560000 355 2037 333 3121;3122;3123;3124;3125;3126;3127;3128;3129;3130;3131;3132;3133;3134;3135;3136;3137;3138;3139;3140;3141;3142;3143;3144;3145;3146 4077;4078;4079;4080;4081;4082;4083;4084;4085;4086;4087;4088;4089;4090;4091;4092;4093;4094;4095;4096;4097;4098;4099;4100;4101;4102;4103;4104 4077 27 AAPMTPAARPEDYEAALNAALADVPELAR Acetyl (Protein N-term) 3035.5022 0.50223499 2887 Q04446 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 168.94 168.94 3 2.0992E-24 173495 QUIQUE_C1218_190116_001 100.95 85.308 314570000 48930000 63020000 0 57614000 60521000 67394000 0 0 0 17088000 0 0 0 356 2887 334 3147;3148;3149;3150;3151;3152 4105;4106;4107;4108;4109;4110 4105 6 AAPMTPAARPEDYEAALNAALADVPELAR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3051.4971 0.49714961 2887 Q04446 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes yes 1 1 1 1 166.52 166.52 3 4.6195E-05 170823 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.511 39.147 49558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49558000 0 357 2887 334 3153 4111 4111 2369 0 AAPPQPVTHLIFDMDGLLLDTER Acetyl (Protein N-term) 2590.3101 0.31012411 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 172.22 172.22 2;3 5.2171E-12 178092 QUIQUE_C1438_190116_001 97.509 85.076 467560000 61056000 25587000 0 0 40880000 0 52788000 72530000 96158000 13289000 0 62500000 42773000 358 2924 335 3154;3155;3156;3157;3158;3159;3160;3161;3162;3163 4112;4113;4114;4115;4116;4117;4118;4119;4120;4121 4115 10 AAPQWCQGK Unmodified 1044.4811 0.48109903 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 22.628 22.628 2 0.042346 15664 QUIQUE_C1563_190116_001 80.462 62.614 113080000 0 0 0 0 0 62420000 0 50656000 0 0 0 0 0 359 1412 336 3164;3165 4122;4123 4122 0 AAPRPPPAR Acetyl (Protein N-term) 973.54575 0.5457482 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 1 0 1 1 2 1 19.797 19.797 2 0.0076733 12683 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.777 61.401 247150000 0 0 0 0 0 0 0 70598000 0 0 0 106440000 70105000 360 4392 337 3166;3167;3168;3169 4124;4125;4126;4127 4125 3 AAPSGGVNCEEFAEFQELLK Acetyl (Protein N-term) 2237.031 0.031048717 3242 Q4VC31 CCDC58 Coiled-coil domain-containing protein 58 yes yes 1 0 0 1 166.06 166.06 2 0.0073126 172465 QUIQUE_C1438_190116_001 45.992 24.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 361 3242 338 3170 4128 4128 1 AAPSTAPAEATPPKPGEAEAPPK Unmodified 2184.1063 0.10626257 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 1 1 35.342 35.342 3 0.062133 30302 QUIQUE_C1563_190116_001 25.924 9.9813 71950000 0 0 0 0 0 71950000 0 0 0 0 0 0 0 362 1753 339 3171 4129 4129 1 AAPSVTLFPPSSEELQANK Unmodified 1985.0106 0.010571271 1989 P0DOY3;P0DOY2;P0CF74;A0M8Q6 IGLC6;IGLC7 Ig lambda-6 chain C region;Ig lambda-7 chain C region yes no 0 0 0 2 1 4 3 4 1 2 2 2 2 2 3 101.78 101.78 2;3 1.6482E-08 104186 QUIQUE_C1438_190116_001 145.6 123.02 1349300000 60181000 0 187220000 111010000 286140000 0 32084000 95267000 98900000 30202000 170770000 67706000 209840000 363 1989 340 3172;3173;3174;3175;3176;3177;3178;3179;3180;3181;3182;3183;3184;3185;3186;3187;3188;3189;3190;3191;3192;3193;3194;3195;3196;3197;3198;3199 4130;4131;4132;4133;4134;4135;4136;4137;4138;4139;4140;4141;4142;4143;4144;4145;4146;4147;4148;4149;4150;4151;4152;4153;4154;4155;4156;4157;4158;4159;4160;4161;4162;4163;4164 4141 31 AAPTEVLSMTAQPGPGHGK Unmodified 1847.92 0.91998213 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 55.669 55.669 3 0.0066595 53894 QUIQUE_C1403_190116_001 20.596 9.5404 438100000 86606000 63572000 92213000 116690000 0 0 0 0 0 0 0 0 79015000 364 1570 341 3200;3201;3202;3203;3204 4165;4166;4167;4168;4169;4170 4169 4 AAPVDLELKK Acetyl (Protein N-term) 1124.6441 0.64412484 837 E5RGS4;O60925;D6RGG5 PFDN1 Prefoldin subunit 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 68.785 68.785 2 0.0033168 68675 QUIQUE_C1368_190116_001 98.033 76.073 434410000 0 0 96417000 0 0 52793000 0 0 0 28514000 67335000 116110000 73240000 365 837 342 3205;3206;3207;3208;3209;3210 4171;4172;4173;4174;4175;4176 4171 1 AAPVVAPPGVVVSR Acetyl (Protein N-term) 1359.7874 0.78743503 508 A0A3B3IUB1;Q13144;A0A3B3ISX3;A0A3B3IS56;A0A3B3IRP4;A0A3B3IUF2;A0A3B3ISM8;C9JRD9;A0A3B3IT53 EIF2B5 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon yes no 1 0 0 1 105.91 105.91 2 0.015563 107757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.35 33.148 15175000 0 0 0 0 0 0 0 15175000 0 0 0 0 0 366 508 343 3211 4177 4177 1 AAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICR Unmodified 2741.3847 0.38468604 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 152.89 152.89 2;3 1.2886E-49 155387 QUIQUE_C1563_190116_001 161.66 142.83 1228500000 46353000 46955000 0 264400000 391400000 0 73811000 29491000 90414000 62901000 82035000 89381000 51365000 367 756 344 3212;3213;3214;3215;3216;3217;3218;3219;3220;3221;3222;3223;3224;3225;3226;3227 4178;4179;4180;4181;4182;4183;4184;4185;4186;4187;4188;4189;4190;4191;4192;4193;4194;4195;4196;4197;4198 4188 18 AAPYWLDEPK Unmodified 1188.5815 0.58152458 1691;1214 H7BY57;D6RBU5;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.546 77.546 2 0.01529 77833 QUIQUE_C1277_190116_001 63.534 50.267 743460000 108120000 143510000 0 0 0 0 128180000 66412000 85110000 0 111440000 100690000 0 368 1214;1691 345 3228;3229;3230;3231;3232;3233;3234 4199;4200;4201;4202;4203;4204;4205 4200 7 AAQALALLR Acetyl (Protein N-term) 967.58147 0.581465 3177 Q16401;F2Z3J2 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.13 144.13 2 0.00022011 148362 QUIQUE_C1277_190116_001 118.05 63.502 862370000 60502000 70425000 0 59904000 85533000 80654000 54480000 81355000 88432000 36745000 87092000 80262000 76990000 369 3177 346 3235;3236;3237;3238;3239;3240;3241;3242;3243;3244;3245;3246 4206;4207;4208;4209;4210;4211;4212;4213;4214;4215;4216;4217;4218;4219;4220 4207 14 AAQAPDGASEPR Unmodified 1168.5473 0.54726434 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 14.909 14.909 2 0.00051588 7275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.309 80.54 26412000 0 0 0 0 0 0 0 26412000 0 0 0 0 0 370 2020 347 3247 4221 4221 1 AAQAPSSFQLLYDLK Unmodified 1650.8617 0.86172219 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 125.77 125.77 2 0.025547 128314 QUIQUE_C1563_190116_001 58.674 45.011 362910000 0 0 0 0 215890000 147020000 0 0 0 0 0 0 0 371 1005;2027 348 3248;3249 4222;4223 4223 1 AAQDFFSTCR Unmodified 1201.5186 0.51860675 1897 P06132;A0A1B0GVZ4;A0A1B0GVN9;H0Y5R6;Q5T446 UROD Uroporphyrinogen decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 62.195 62.195 2 0.0050875 60861 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.857 76.557 159890000 36949000 0 0 0 0 0 53152000 36184000 0 0 0 33606000 0 372 1897 349 3250;3251;3252;3253 4224;4225;4226;4227 4227 4 AAQDRDQIYR Unmodified 1234.6054 0.60544792 2775 P62995;H7C2L4 TRA2B Transformer-2 protein homolog beta yes no 0 0 1 1 1 2 1 14.882 14.882 2;3 0.00011123 7282 QUIQUE_DMIX7_190116_001 147.4 86.432 470130000 0 0 0 0 0 49308000 0 90240000 0 0 0 307500000 23083000 373 2775 350 3254;3255;3256;3257;3258 4228;4229;4230;4231;4232;4233 4230 5 AAQEFKHDSFVPCSEK Unmodified 1878.857 0.85704752 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 33.749 33.749 3 0.00027525 28589 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.121 71.487 80472000 0 0 0 0 0 0 0 80472000 0 0 0 0 0 374 245 351 3259 4234 4234 1 AAQELQEGQR Unmodified 1128.5523 0.55234972 1988 P0DN79;P35520;H7C2H4 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 1 14.08 14.08 2 0.0056044 6142 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.79 87.268 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 375 1988 352 3260 4235 4235 1 AAQENKHDSYIPCSER Unmodified 1903.8483 0.84827375 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 1 1 17.904 17.904 3 0.050087 10414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.029 27.463 13092000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13092000 0 0 376 1040 353 3261 4236 4236 1 AAQGEPQVQFK Acetyl (Protein N-term) 1243.6197 0.619701 643 B5MDF5;P62826;A0A087X0W0 RAN GTP-binding nuclear protein Ran yes no 1 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 69.936 69.936 1;2 2.3102E-08 66842 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.44 127.41 3616200000 256290000 353330000 264940000 302100000 292800000 273100000 250340000 244290000 231450000 159030000 389740000 284430000 314310000 377 643 354 3262;3263;3264;3265;3266;3267;3268;3269;3270;3271;3272;3273;3274;3275;3276;3277;3278 4237;4238;4239;4240;4241;4242;4243;4244;4245;4246;4247;4248;4249;4250;4251;4252;4253;4254;4255;4256;4257;4258;4259;4260;4261;4262;4263;4264;4265;4266;4267;4268;4269;4270;4271;4272;4273;4274;4275;4276;4277 4269 40 AAQIELLQLLVQIAAENNLGEGVIVK Unmodified 2745.564 0.56403061 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 175.89 175.89 3 8.4648E-08 182971 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.661 52.468 16247000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16247000 0 0 378 645 355 3279 4278 4278 1 AAQIGAHTLSGACLDPGAFK Unmodified 1983.9836 0.98364501 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 81.231 81.231 2 0.0012524 83026 QUIQUE_C1368_190116_001 78.69 56.157 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 379 3169 356 3280 4279 4279 1 AAQLATEIADIK Unmodified 1242.682 0.68196691 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.759 79.759 2 0.00052969 80539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.568 59.567 392680000 66678000 58519000 0 0 57444000 0 62181000 62228000 0 28210000 0 57416000 0 380 3108 357 3281;3282;3283;3284;3285;3286;3287 4280;4281;4282;4283;4284;4285;4286 4284 4 AAQLCGAGMAAVVDK Oxidation (M) 1476.7065 0.70648388 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.611 38.611 2 9.5015E-06 34298 QUIQUE_C1277_190116_001 105.65 91.414 910220000 69411000 79415000 86895000 66120000 60425000 79176000 73820000 55305000 62182000 36303000 60033000 92192000 88941000 381 2146 358 3288;3289;3290;3291;3292;3293;3294;3295;3296;3297;3298;3299;3300 4287;4288;4289;4290;4291;4292;4293;4294;4295;4296;4297;4298;4299;4300 4289 1489 13 AAQLCGAGMAAVVDK Unmodified 1460.7116 0.71156925 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.026 66.026 2 6.7407E-06 64598 QUIQUE_C1563_190116_001 107.18 96.011 4368900000 648160000 715040000 544020000 696050000 448870000 629630000 687130000 0 0 0 0 0 0 382 2146 358 3301;3302;3303;3304;3305;3306;3307 4301;4302;4303;4304;4305;4306;4307;4308;4309;4310;4311 4310 11 AAQLCGAGMAAVVDKIR Unmodified 1729.8967 0.89674426 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 1 1 87.149 87.149 3 0.00013195 87945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.013 61.525 78279000 0 0 0 0 0 0 0 78279000 0 0 0 0 0 383 2146 359 3308 4312 4312 1 AAQLDGLEAR Unmodified 1042.5407 0.5407224 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 39.33 39.33 2 0.00062268 36135 QUIQUE_C1438_190116_001 108.74 56.027 887280000 113590000 0 98084000 65413000 180130000 0 109760000 0 0 0 181120000 139180000 0 384 2665 360 3309;3310;3311;3312;3313;3314;3315 4313;4314;4315;4316;4317;4318;4319;4320;4321;4322 4318 9 AAQLGFK Unmodified 733.41227 0.41227441 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 25.503 25.503 2 0.060232 19342 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.432 23.982 26108000 0 0 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 0 0 385 1971 361 3316 4323 4323 1 AAQLIGTCSQNVAAIQEQVLGLGALR Unmodified 2680.433 0.43303321 4350 Q9NZL4;K7EN20;K7EL16 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.93 152.93 3 6.8361E-20 159905 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.32 92.264 790520000 0 111730000 0 56332000 69230000 85391000 81919000 53248000 90274000 36724000 88860000 65679000 51139000 386 4350 362 3317;3318;3319;3320;3321;3322;3323;3324;3325;3326;3327;3328;3329 4324;4325;4326;4327;4328;4329;4330;4331;4332;4333;4334;4335;4336;4337;4338;4339;4340 4337 16 AAQLPNDVVLQIMELCGATR Unmodified 2198.1188 0.11875829 3829 Q96D71;E9PMG1;H0YDT0;F2Z3L2 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 159.2 159.2 3 0.0057641 163085 QUIQUE_C1277_190116_001 39.647 28.025 64709000 0 20298000 20057000 13841000 0 10513000 0 0 0 0 0 0 0 387 3829 363 3330;3331;3332;3333 4341;4342;4343;4344 4341 2 AAQLQEALLHCGR Unmodified 1465.746 0.74598093 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 54.493 54.493 3 0.052858 53459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.215 23.49 40141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40141000 0 0 388 2882 364 3334 4345 4345 1 AAQLQLPQLPLAALQALGEAASCQLLAR Unmodified 2914.6062 0.60624655 2221 P23610 F8A1 Factor VIII intron 22 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.8 174.8 3 5.4471E-54 181728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.32 136.52 569020000 23997000 45304000 0 16863000 60556000 0 54229000 46260000 23432000 0 116860000 126850000 54665000 389 2221 365 3335;3336;3337;3338;3339;3340;3341;3342;3343;3344 4346;4347;4348;4349;4350;4351;4352;4353;4354;4355;4356 4353 11 AAQLVDKDSTFLSTLEHHLSR Unmodified 2367.2183 0.21827264 3789 Q969V3;K7ELZ9;A0A0C4DGP7;K7EMW4 NCLN Nicalin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 102.43 102.43 4 0.0001353 104982 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.222 57.628 270310000 0 0 0 0 26320000 0 32576000 0 55008000 0 37834000 72114000 46453000 390 3789 366 3345;3346;3347;3348;3349;3350 4357;4358;4359;4360;4361;4362 4361 6 AAQNSGEAEYIEK Unmodified 1408.647 0.64703797 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 26.52 26.52 2 0.0035137 20791 QUIQUE_C1438_190116_001 71.221 46.446 35159000 0 0 0 0 35159000 0 0 0 0 0 0 0 0 391 1093 367 3351 4363 4363 1 AAQQAASSSGQGQQAQTPTGK Unmodified 2000.9512 0.95115891 2517 P48729;U3KQ83;U3KPX3;H0Y9X2;U3KQK7 CSNK1A1 Casein kinase I isoform alpha yes no 0 0 0 1 13.75 13.75 3 0.021953 5981 QUIQUE_DMIX3_190116_001 15.522 11.802 5953500 0 0 0 0 0 0 0 0 5953500 0 0 0 0 392 2517 368 3352 4364 4364 1 AAQQQEEQEEKEEEDDEQTLHR Unmodified 2698.159 0.15903902 2802 P78318 IGBP1 Immunoglobulin-binding protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 32.332 32.332 3;4 2.4291E-54 26389 QUIQUE_C1368_190116_001 160.13 149.14 458580000 130140000 62443000 187010000 0 36490000 0 0 42488000 0 0 0 0 0 393 2802 369 3353;3354;3355;3356;3357;3358 4365;4366;4367;4368;4369;4370;4371 4369 6 AAQTELGQQILADFEEAFPSQGTK Unmodified 2578.2551 0.25511165 3331 Q5VIR6;F6VX93 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.3 167.3 3 3.5943E-28 171886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.97 120.01 811490000 37934000 91748000 33132000 51806000 73506000 46330000 63142000 54241000 58483000 23711000 67078000 130700000 79685000 394 3331 370 3359;3360;3361;3362;3363;3364;3365;3366;3367;3368;3369;3370;3371 4372;4373;4374;4375;4376;4377;4378;4379;4380;4381;4382;4383;4384 4380 9 AAQVFALLFVTEYLTK Unmodified 1813.0026 0.0025727675 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 2 170.69 170.69 2;3 0.00028977 172452 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.288 73.52 15247000 0 0 0 0 0 0 0 15247000 0 0 0 0 0 395 1534 371 3372;3373 4385;4386 4385 2 AAQYACSLLGHALQR Unmodified 1657.8359 0.83585857 1770 O96011 PEX11B Peroxisomal membrane protein 11B yes yes 0 0 0 1 78.061 78.061 3 0.0062586 80312 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.66 41.778 31214000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31214000 0 0 396 1770 372 3374 4387 4387 1 AASAAAAELQASGGPR Acetyl (Protein N-term) 1468.727 0.72701962 4230 Q9HCN4;F8WD09 GPN1 GPN-loop GTPase 1 yes no 1 0 0 1 1 94.234 94.234 2 0.0038861 95564 QUIQUE_C1563_190116_001 53.448 38.182 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 397 4230 373 3375;3376 4388;4389 4388 2 AASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEK Acetyl (Protein N-term) 2428.1102 0.11023833 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 1 0 0 1 1 1 1 97.524 97.524 3 6.3628E-25 98996 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.19 79.689 429670000 191360000 0 0 0 0 0 0 67172000 0 0 0 86421000 84717000 398 2983 374 3377;3378;3379;3380 4390;4391;4392;4393 4391 4 AASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKR Acetyl (Protein N-term) 2584.2113 0.21134936 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 1 0 1 1 2 1 2 1 1 81.876 81.876 2;3 9.8099E-103 82767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.26 155.52 543390000 0 0 0 0 46474000 0 0 127370000 76648000 0 88243000 119220000 85430000 399 2983 375 3381;3382;3383;3384;3385;3386;3387;3388 4394;4395;4396;4397;4398;4399;4400;4401 4395 8 AASAAFQENVGR Unmodified 1219.5945 0.59454889 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L0V3 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.643 32.643 2 3.2704E-05 27514 QUIQUE_C1277_190116_001 128.27 108.48 562540000 0 89546000 0 56519000 71819000 58689000 0 48443000 59175000 31785000 70863000 0 75698000 400 1283 376 3389;3390;3391;3392;3393;3394;3395;3396;3397;3398;3399 4402;4403;4404;4405;4406;4407;4408;4409;4410;4411;4412 4402 10 AASAAGAAGSAGGSSGAAGAAGGGAGAGTRPGDGGTASAGAAGPGAATK Unmodified 3668.7123 0.71233221 4479 Q9UKY7 CDV3 Protein CDV3 homolog yes yes 0 0 1 1 1 36.068 36.068 3 1.093E-108 31371 QUIQUE_C1403_190116_001 133.51 127.49 184590000 0 86198000 0 98389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 401 4479 377 3400;3401 4413;4414 4414 2 AASAAGVPLEASGEQVR Unmodified 1611.8216 0.82164829 1280 J3KQR7;Q9Y4F5 CEP170B Centrosomal protein of 170 kDa protein B yes no 0 0 0 1 53.579 53.579 2 0.0088238 52119 QUIQUE_C1576_190116_001 71.085 48.998 24959000 0 0 0 0 0 0 24959000 0 0 0 0 0 0 402 1280 378 3402 4415 4415 1 AASADSTTEGTPADGFTVLSTK Unmodified 2126.0015 0.0015227276 1626 O75367 H2AFY Core histone macro-H2A.1 yes yes 0 0 0 1 88.651 88.651 2 3.5258E-08 85225 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.911 76.483 23833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23833000 0 0 0 403 1626 379 3403 4416 4416 1 AASAFFTYVSLSQEGR Unmodified 1732.842 0.84204938 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 122.68 122.68 2;3 8.9364E-36 127929 QUIQUE_C1218_190116_001 207.88 175.55 4285400000 390600000 391740000 337220000 310370000 306930000 271120000 366810000 319840000 354250000 171190000 330580000 376470000 358230000 404 1379 380 3404;3405;3406;3407;3408;3409;3410;3411;3412;3413;3414;3415;3416;3417;3418;3419;3420 4417;4418;4419;4420;4421;4422;4423;4424;4425;4426;4427;4428;4429;4430;4431;4432;4433;4434;4435;4436;4437;4438;4439 4417 23 AASAGQEPLHNEELAGAGR Unmodified 1876.9028 0.90275216 3873 Q96HY6;A0A0A0MRX2 DDRGK1 DDRGK domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 35.087 35.087 3 4.0633E-05 30498 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.51 75.074 118030000 0 0 0 59205000 0 0 0 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.514 29.514 2 0.0020592 24750 QUIQUE_C1218_190116_001 94.692 67.438 2750700000 233930000 261130000 0 213500000 247520000 217230000 265250000 246240000 0 103520000 341030000 281780000 339590000 408 2069 384 3440;3441;3442;3443;3444;3445;3446;3447;3448;3449;3450 4462;4463;4464;4465;4466;4467;4468;4469;4470;4471;4472;4473 4462 9 AASCVLLHTGQK Acetyl (Protein N-term) 1325.6762 0.67617003 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.636 61.636 2 1.5407E-20 61001 QUIQUE_C1438_190116_001 173.32 155.01 4657300000 770480000 775640000 0 822790000 788920000 0 0 573290000 0 166820000 759320000 0 0 409 2076 385 3451;3452;3453;3454;3455;3456;3457 4474;4475;4476;4477;4478;4479;4480;4481 4477 7 AASDIAMTELPPTHPIR Oxidation (M) 1834.9247 0.92473315 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 0 6 6 5 6 5 5 6 4 6 6 7 5 5 59.547 59.547 2;3 1.5521E-31 58033 QUIQUE_C1277_190116_001 156.69 135.44 10554000000 1128400000 638920000 699150000 1021200000 793400000 918090000 988500000 710810000 855990000 218720000 898600000 800640000 881060000 410 2745 386 3458;3459;3460;3461;3462;3463;3464;3465;3466;3467;3468;3469;3470;3471;3472;3473;3474;3475;3476;3477;3478;3479;3480;3481;3482;3483;3484;3485;3486;3487;3488;3489;3490;3491;3492;3493;3494;3495;3496;3497;3498;3499;3500;3501;3502;3503;3504;3505;3506;3507;3508;3509;3510;3511;3512;3513;3514;3515;3516;3517;3518;3519;3520;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529 4482;4483;4484;4485;4486;4487;4488;4489;4490;4491;4492;4493;4494;4495;4496;4497;4498;4499;4500;4501;4502;4503;4504;4505;4506;4507;4508;4509;4510;4511;4512;4513;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529;4530;4531;4532;4533;4534;4535;4536;4537;4538;4539;4540;4541;4542;4543;4544;4545;4546;4547;4548;4549;4550;4551;4552;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4563;4564;4565;4566;4567;4568;4569;4570;4571 4499 2174 82 AASDIAMTELPPTHPIR Unmodified 1818.9298 0.92981853 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 4 5 6 6 5 5 7 3 5 5 6 6 7 74.737 74.737 2;3 3.0511E-201 73517 QUIQUE_C1277_190116_001 322.9 297.46 14381000000 882930000 1237900000 1649200000 1309400000 1234200000 874410000 1731800000 247580000 908310000 381950000 1874300000 265160000 1783800000 411 2745 386 3530;3531;3532;3533;3534;3535;3536;3537;3538;3539;3540;3541;3542;3543;3544;3545;3546;3547;3548;3549;3550;3551;3552;3553;3554;3555;3556;3557;3558;3559;3560;3561;3562;3563;3564;3565;3566;3567;3568;3569;3570;3571;3572;3573;3574;3575;3576;3577;3578;3579;3580;3581;3582;3583;3584;3585;3586;3587;3588;3589;3590;3591;3592;3593;3594;3595;3596;3597;3598;3599 4572;4573;4574;4575;4576;4577;4578;4579;4580;4581;4582;4583;4584;4585;4586;4587;4588;4589;4590;4591;4592;4593;4594;4595;4596;4597;4598;4599;4600;4601;4602;4603;4604;4605;4606;4607;4608;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616;4617;4618;4619;4620;4621;4622;4623;4624;4625;4626;4627;4628;4629;4630;4631;4632;4633;4634;4635;4636;4637;4638;4639;4640;4641;4642;4643;4644;4645;4646;4647;4648;4649;4650;4651;4652;4653;4654;4655;4656;4657;4658;4659;4660;4661;4662;4663;4664;4665;4666;4667;4668;4669;4670;4671;4672;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;4684;4685;4686;4687;4688;4689;4690;4691;4692;4693;4694;4695;4696;4697;4698;4699;4700;4701;4702;4703;4704;4705;4706;4707;4708;4709;4710;4711;4712;4713;4714;4715;4716;4717;4718;4719;4720;4721;4722;4723;4724;4725;4726;4727;4728;4729;4730;4731;4732;4733;4734;4735;4736;4737;4738;4739;4740;4741;4742;4743 4590 172 AASEFESSEGVFLFPELR Unmodified 2013.9684 0.96837211 1702 O94985;Q5SR54 CLSTN1 Calsyntenin-1;Soluble Alc-alpha;CTF1-alpha yes no 0 0 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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 414 3423 389 3622 4768 4768 1 AASGFNAMEDAQTLR Oxidation (M) 1596.7202 0.72021968 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 1 0 1 1 1 54.061 54.061 2 0.00036261 51939 QUIQUE_C1218_190116_001 82.505 57.65 55584000 21079000 0 0 0 0 0 0 0 0 34505000 0 0 0 415 1968 390 3623;3624;3625 4769;4770;4771 4769 1237 3 AASGFNAMEDAQTLR Unmodified 1580.7253 0.72530506 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.58 78.58 2 1.5323E-12 78964 QUIQUE_C1403_190116_001 165.09 142.45 1208800000 105100000 119010000 133660000 176740000 86012000 119120000 121050000 78855000 95244000 0 98503000 75480000 0 416 1968 390 3626;3627;3628;3629;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636 4772;4773;4774;4775;4776;4777;4778;4779;4780;4781;4782 4775 11 AASGFNAMEDAQTLRK Unmodified 1708.8203 0.82026808 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 57.461 57.461 3 0.0002721 55138 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.197 53.128 188050000 0 0 0 0 0 0 0 43889000 0 0 53202000 36717000 54241000 417 1968 391 3637;3638;3639;3640 4783;4784;4785;4786 4786 4 AASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDK Unmodified 3576.6501 0.65009779 3767 Q92905;E5RFS1;E5RG35;E5RK55 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 yes no 0 0 2 1 91.162 91.162 5 0.030932 92794 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.507 14.295 221080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 221080000 0 418 3767 392 3641 4787 4787 1 AASHVLQTVWSYK Unmodified 1488.7725 0.77251325 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 72.404 72.404 2;3 0.00010946 72439 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109 104.37 417270000 55827000 64842000 29722000 0 0 21978000 0 48953000 45619000 0 51141000 52471000 46713000 419 730 393 3642;3643;3644;3645;3646;3647;3648;3649;3650;3651;3652;3653;3654 4788;4789;4790;4791;4792;4793;4794;4795;4796;4797;4798;4799;4800;4801;4802;4803 4797 16 AASIFGGAKPVDTAAR Unmodified 1530.8154 0.8154407 888 E7EX17;P23588;F8VX11 EIF4B Eukaryotic translation initiation factor 4B yes no 0 0 1 1 46.579 46.579 2 4.4167E-05 43347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.66 76.723 26973000 0 0 0 0 0 0 0 26973000 0 0 0 0 0 420 888 394 3655 4804 4804 1 AASITSEVFNK Unmodified 1165.5979 0.59790293 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 60.423 60.423 2 0.02083 59564 QUIQUE_C1218_190116_001 60.717 42.178 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 421 4620 395 3656 4805 4805 1 AASKPVEAAVVAAAVPSSGSGVGGGGTAGPGTGGLPR Acetyl (Protein N-term) 3158.632 0.63200361 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 116.09 116.09 3;4 4.6343E-06 121503 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.867 43.889 475900000 0 0 0 0 0 39878000 0 134200000 176680000 0 125140000 0 0 422 1689 396 3657;3658;3659;3660 4806;4807;4808;4809 4809 4 AASLASVESALVSAIQALQHWPAPAHGGAR Unmodified 2965.5522 0.55223715 1111 H0Y2S9;H0Y7E2 MPRIP yes no 0 0 0 1 168.2 168.2 4 1.0047E-09 172496 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.155 62.811 17777000 0 0 0 0 0 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2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.63 136.63 2;3 6.5293E-26 143103 QUIQUE_C1438_190116_001 159.22 128.78 456470000 0 42703000 0 38168000 47529000 0 41651000 41682000 45974000 31559000 58551000 52006000 56647000 426 4436 400 3675;3676;3677;3678;3679;3680;3681;3682;3683;3684;3685 4826;4827;4828;4829;4830;4831;4832;4833;4834;4835;4836 4829 11 AASQGYTVAR Unmodified 1022.5145 0.51450765 4409 Q9UBV2 SEL1L Protein sel-1 homolog 1 yes yes 0 0 0 1 17.709 17.709 2 0.01529 9930 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.534 36.841 14563000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14563000 0 0 0 427 4409 401 3686 4837 4837 1 AASQPGELKDWFVGR Unmodified 1659.8369 0.83690442 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.557 89.557 3 0.0012367 91545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.709 54.129 548810000 0 0 96718000 0 60167000 0 91280000 0 0 0 87798000 87785000 125070000 428 2113 402 3687;3688;3689;3690;3691;3692 4838;4839;4840;4841;4842;4843;4844;4845;4846 4846 9 AASQQEIEQSIETLNMLMLDLEPASAAAPLHK Unmodified 3448.7218 0.72180617 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 170.15 170.15 3;4 0.00084086 174362 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.936 24.369 157470000 0 0 0 16915000 19081000 0 0 0 66085000 0 55391000 0 0 429 422 403 3693;3694;3695;3696;3697;3698 4847;4848;4849;4850;4851;4852 4851 6 AASQSTQVPTITEGVAAALLLLK Unmodified 2281.2893 0.28931231 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 169.19 169.19 3 0.035594 172042 QUIQUE_C1403_190116_001 24.558 20.964 16091000 0 0 0 16091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 430 3740 404 3699 4853 4853 1 AASQVLNSMWQYR Unmodified 1552.7456 0.74564657 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.67 103.67 2 1.5048E-13 106629 QUIQUE_C1368_190116_001 187.97 164.12 1176300000 115690000 108850000 126220000 119700000 82721000 81165000 111330000 79748000 107420000 34199000 114290000 0 94999000 431 855;928 405 3700;3701;3702;3703;3704;3705;3706;3707;3708;3709;3710;3711 4854;4855;4856;4857;4858;4859;4860;4861;4862;4863;4864;4865;4866;4867;4868 4857 14 AASQVLNSMWQYR Oxidation (M) 1568.7406 0.7405612 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 1 0 1 1 72.576 72.576 2 2.6079E-05 72862 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.42 89.657 39613000 0 0 0 39613000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 432 855;928 405 3712;3713 4869;4870 4870 507 2 AASSIYINSR Unmodified 1080.5564 0.55637247 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.049 30.049 2 0.0062253 24341 QUIQUE_C1368_190116_001 85.731 62.302 271450000 37550000 36613000 37438000 0 46867000 0 45831000 0 0 0 0 0 67154000 433 877 406 3714;3715;3716;3717;3718;3719 4871;4872;4873;4874;4875;4876 4873 6 AASSSEISEMK Acetyl (Protein N-term) 1180.5282 0.52816838 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9;A0A1B0GTS0;H3BN10;A0A1B0GU37;A0A1B0GTR2;A0A1B0GUW9;A0A1B0GUR0 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 59.534 59.534 2 0.0051451 58422 QUIQUE_C1403_190116_001 77.049 66.357 147480000 0 0 42667000 51163000 19306000 0 0 0 0 0 0 0 34344000 434 3469 407 3720;3721;3722;3723 4877;4878;4879;4880 4878 4 AASTASHRPIK Acetyl (Protein N-term) 1179.636 0.63601977 848 E7EMN6;P41236;E7EUI7;Q6NXS1 PPP1R2;PPP1R2P3 Protein phosphatase inhibitor 2;Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3 yes no 1 0 1 2 1 1 1 1 11.013 11.013 2;3 0.00061675 3454 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.68 99.126 166490000 0 0 0 0 0 0 0 88442000 31757000 9711400 0 36584000 0 435 848 408 3724;3725;3726;3727;3728;3729 4881;4882;4883;4884;4885;4886 4882 6 AASTDMAGLEESFR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1541.6668 0.66678713 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 1 0 2 1 1 1 2 97.078 97.078 2 7.1263E-05 99936 QUIQUE_C1218_190116_001 93.345 76.32 222570000 117990000 44541000 0 31069000 0 0 0 0 0 28972000 0 0 0 436 4050 409 3730;3731;3732;3733;3734;3735;3736 4887;4888;4889;4890;4891;4892;4893 4887 2842 6 AASTDMAGLEESFR Acetyl (Protein N-term) 1525.6719 0.67187251 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.02 133.02 2 3.0123E-07 138831 QUIQUE_C1218_190116_001 146.16 118.83 5016500000 845420000 373350000 545640000 557740000 354110000 433840000 472700000 179390000 267640000 200000000 266270000 228560000 291840000 437 4050 409 3737;3738;3739;3740;3741;3742;3743;3744;3745;3746;3747;3748;3749 4894;4895;4896;4897;4898;4899;4900;4901;4902;4903;4904;4905;4906;4907;4908;4909;4910 4895 17 AASTDMAGLEESFRK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1669.7618 0.76175015 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 70.434 70.434 2 7.9156E-44 69746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 184.03 160.28 3396100000 88784000 174620000 219120000 157900000 267610000 101500000 227590000 351330000 581030000 0 468490000 483190000 274950000 438 4050 410 3750;3751;3752;3753;3754;3755;3756;3757;3758;3759;3760;3761;3762;3763;3764;3765;3766;3767;3768;3769;3770;3771;3772 4911;4912;4913;4914;4915;4916;4917;4918;4919;4920;4921;4922;4923;4924;4925;4926;4927;4928;4929;4930;4931;4932;4933 4927 2842 18 AASTDMAGLEESFRK Acetyl (Protein N-term) 1653.7668 0.76683553 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.69 104.69 2 6.6784E-23 107262 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.44 134.35 17926000000 640480000 764890000 1067000000 859060000 1347700000 492020000 1163300000 1892300000 2986700000 230770000 2125400000 1882000000 2474500000 439 4050 410 3773;3774;3775;3776;3777;3778;3779;3780;3781;3782;3783;3784;3785 4934;4935;4936;4937;4938;4939;4940;4941;4942;4943;4944;4945;4946;4947;4948;4949;4950;4951;4952;4953;4954;4955 4945 22 AATAAADFTAK Unmodified 1036.5189 0.51892433 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.988 25.988 2 0.00048894 20777 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.43 73.625 1250300000 0 154000000 132000000 0 152810000 0 169320000 134470000 127230000 88137000 141590000 0 150780000 440 4592 411 3786;3787;3788;3789;3790;3791;3792;3793;3794 4956;4957;4958;4959;4960;4961;4962;4963;4964;4965;4966;4967 4963 11 AATAAEAVASGSGEPR Acetyl (Protein N-term) 1485.7059 0.70594983 968 E9PNR8;Q9NWT6 HIF1AN Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 85.018 85.018 2 0.0002723 88054 QUIQUE_C1438_190116_001 95.631 72.026 152870000 0 0 0 0 52411000 43590000 0 0 0 0 0 0 56866000 441 968 412 3795;3796;3797;3798;3799 4968;4969;4970;4971;4972;4973 4969 5 AATALKDVVK Unmodified 1014.6073 0.6073454 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 1 1 21.102 21.102 2 0.019404 14416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.01 89.723 78570000 0 0 0 0 0 0 0 78570000 0 0 0 0 0 442 3109 413 3800 4974 4974 0 AATALLEAGLAR Acetyl (Protein N-term) 1197.6717 0.67173657 973 E9PQM0;Q8WUK0 PTPMT1 Phosphatidylglycerophosphatase and protein-tyrosine phosphatase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.68 146.68 2 0.0011617 151193 QUIQUE_C1277_190116_001 90.108 68.808 30206000 0 7008300 0 0 5220100 0 0 10262000 0 0 0 7715700 0 443 973 414 3801;3802;3803;3804;3805;3806;3807;3808 4975;4976;4977;4978;4979;4980;4981;4982 4975 8 AATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGR Unmodified 3469.7365 0.73652826 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 3 2 2 2 2 1 2 1 171.08 171.08 3;4 2.7401E-75 174131 QUIQUE_C1403_190116_001 146.5 144.49 3054300000 204780000 276610000 443880000 169980000 250740000 150760000 420310000 347180000 139060000 0 0 542140000 108820000 444 4600 415 3809;3810;3811;3812;3813;3814;3815;3816;3817;3818;3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825;3826;3827;3828 4983;4984;4985;4986;4987;4988;4989;4990;4991;4992;4993;4994;4995;4996;4997;4998;4999;5000;5001;5002;5003;5004;5005;5006;5007;5008 4992 24 AATASAGAGGIDGK Acetyl (Protein N-term) 1187.5782 0.57823012 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 1 0 0 1 44.144 44.144 2 4.4078E-05 40988 QUIQUE_C1218_190116_001 114.9 90.047 40706000 40706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 445 2881 416 3829 5009 5009 1 AATASAGAGGIDGKPR Acetyl (Protein N-term) 1440.7321 0.732105 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 1 0 1 2 2 2 2 4 3 3 2 2 2 4 3 3 33.741 33.741 2 1.1745E-35 30691 QUIQUE_C1277_190116_001 182.71 143.69 11309000000 810570000 697960000 1090800000 794130000 543140000 822900000 869730000 879720000 975370000 283290000 1462700000 1004500000 1074100000 446 2881 417 3830;3831;3832;3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;3845;3846;3847;3848;3849;3850;3851;3852;3853;3854;3855;3856;3857;3858;3859;3860;3861;3862;3863 5010;5011;5012;5013;5014;5015;5016;5017;5018;5019;5020;5021;5022;5023;5024;5025;5026;5027;5028;5029;5030;5031;5032;5033;5034;5035;5036;5037;5038;5039;5040;5041;5042;5043;5044;5045;5046;5047;5048;5049;5050;5051;5052;5053;5054;5055;5056;5057;5058 5016 48 AATDIAR Acetyl (Protein N-term) 758.39227 0.39226725 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 1 0 0 1 36.353 36.353 1 0.039648 32501 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.48 46.895 132890000 0 0 0 0 0 0 0 0 132890000 0 0 0 0 447 594 418 3864 5059 5059 0 AATDLER Acetyl (Protein N-term) 816.39775 0.39774656 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 1 0 0 1 1 1 2 1 42.499 42.499 1;2 0.037985 38484 QUIQUE_C1368_190116_001 139.28 50.545 1929800000 112630000 552700000 598260000 0 0 0 0 505730000 0 160470000 0 0 0 448 535;3739 419 3865;3866;3867;3868;3869;3870 5060;5061;5062;5063;5064;5065 5062 2 AATFFGCIGIDK Unmodified 1298.6329 0.63290823 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 108.9 108.9 2 0.017799 111722 QUIQUE_C1277_190116_001 54.584 28.776 78731000 0 54823000 0 0 0 0 0 0 0 23908000 0 0 0 449 2663 420 3871;3872 5066;5067 5066 2 AATFFGEVVK Acetyl (Protein N-term) 1109.5757 0.57571092 1731 O95456;F8WBH7 PSMG1 Proteasome assembly chaperone 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.64 144.64 2 0.00016085 149562 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.36 96.427 221710000 20406000 20220000 13781000 16681000 22845000 0 13206000 19395000 25305000 8409900 21280000 19643000 20541000 450 1731 421 3873;3874;3875;3876;3877;3878;3879;3880;3881;3882;3883;3884 5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076;5077;5078;5079;5080;5081;5082;5083 5077 16 AATFGLILDDVSLTHLTFGK Unmodified 2118.1361 0.13610614 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 2 155.48 155.48 2;3 1.7653E-13 159356 QUIQUE_C1277_190116_001 90.316 86.928 2132000000 261950000 156590000 177770000 146250000 82687000 152340000 292020000 216380000 0 53543000 302440000 289990000 0 451 2370 422 3885;3886;3887;3888;3889;3890;3891;3892;3893;3894;3895;3896;3897;3898;3899;3900;3901 5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093;5094;5095;5096;5097;5098;5099;5100;5101;5102;5103;5104;5105;5106;5107;5108;5109 5087 24 AATFPLQVLGFEIDAVNSVQFSNHTGYAHWK Unmodified 3446.7048 0.70477462 1423 O00764 PDXK Pyridoxal kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 157.36 157.36 3;4 2.9262E-137 162765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.28 184.56 1576600000 0 0 92236000 0 0 0 0 220330000 293800000 0 505980000 464220000 0 452 1423 423 3902;3903;3904;3905;3906;3907;3908 5110;5111;5112;5113;5114;5115;5116;5117 5113 8 AATGEEVSAEDLGGADLHCR Unmodified 2056.912 0.91199621 4223 Q9HCC0;D6RD67;D6RDF7;D6R9R1 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 61.252 61.252 2;3 8.6284E-24 60404 QUIQUE_C1277_190116_001 136.17 119.95 1093600000 122490000 152010000 0 104060000 109860000 158850000 125050000 48230000 59008000 30923000 44404000 58566000 80178000 453 4223 424 3909;3910;3911;3912;3913;3914;3915;3916;3917;3918;3919;3920;3921;3922 5118;5119;5120;5121;5122;5123;5124;5125;5126;5127;5128;5129;5130;5131 5120 14 AATGPFDR Unmodified 833.40317 0.40316629 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.7 23.7 2 0.01159 17059 QUIQUE_C1277_190116_001 89.752 55.749 725680000 132520000 147800000 0 129130000 110960000 142620000 0 0 0 62655000 0 0 0 454 4356 425 3923;3924;3925;3926;3927;3928 5132;5133;5134;5135;5136;5137;5138 5133 7 AATGPFDREHLLMYLEK Unmodified 1989.9982 0.99823245 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 106.53 106.53 2;3;4 1.261E-11 110989 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.38 75.38 1631800000 0 54862000 0 0 0 0 0 404060000 401030000 0 202280000 171110000 398470000 455 4356 426 3929;3930;3931;3932;3933;3934;3935;3936;3937;3938;3939 5139;5140;5141;5142;5143;5144;5145;5146;5147;5148;5149;5150;5151;5152;5153;5154;5155;5156;5157 5150 18 AATHGLMLGALQGDGPLPAELEELR Unmodified 2558.3163 0.31627212 1193 H3BR29;H3BSM7;Q96GQ5 C16orf58 RUS1 family protein C16orf58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 138.11 138.11 3 2.8898E-29 144851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.979 82.292 157240000 0 33931000 47131000 0 0 30965000 0 0 0 0 45217000 0 0 456 1193 427 3940;3941;3942;3943 5158;5159;5160;5161;5162 5162 5 AATHYTITIR Unmodified 1145.6193 0.61930707 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 31.589 31.589 2;3 0.00036089 26213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.63 108.34 1515900000 59232000 55026000 0 77161000 0 0 0 199150000 719040000 99967000 81400000 224880000 0 457 2233 428 3944;3945;3946;3947;3948;3949;3950;3951;3952 5163;5164;5165;5166;5167;5168;5169;5170;5171 5168 9 AATITATSPGALWGLDR Unmodified 1699.8893 0.88933392 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.11 116.11 2 1.0436E-05 121192 QUIQUE_C1438_190116_001 123.64 99.788 3888400000 339800000 383700000 350500000 297990000 385800000 278240000 327580000 328070000 330070000 133390000 0 326980000 406270000 458 2331 429 3953;3954;3955;3956;3957;3958;3959;3960;3961;3962;3963;3964 5172;5173;5174;5175;5176;5177;5178;5179;5180;5181;5182;5183 5176 12 AATITPFR Unmodified 875.4865 0.48650199 2993 Q13423;E9PCX7;H0Y8P5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.985 42.985 2 0.023413 38899 QUIQUE_C1368_190116_001 73.324 43.948 212560000 79124000 57055000 76385000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 459 2993 430 3965;3966;3967;3968;3969 5184;5185;5186;5187;5188 5186 5 AATIVATSEGSLWGLDR Unmodified 1745.8948 0.89481323 2069 P13861;H7C1L0 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 117.31 117.31 2 8.4843E-53 122168 QUIQUE_C1576_190116_001 185.59 161.3 1340900000 0 185120000 0 122560000 59533000 152740000 117480000 219740000 166060000 84978000 0 232670000 0 460 2069 431 3970;3971;3972;3973;3974;3975;3976;3977;3978;3979 5189;5190;5191;5192;5193;5194;5195;5196;5197;5198;5199;5200;5201;5202;5203 5197 13 AATIVLQSYLR Unmodified 1233.7081 0.70812208 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.776 93.776 2 0.0056344 96163 QUIQUE_C1368_190116_001 79.974 57.261 67569000 0 0 27400000 0 0 40170000 0 0 0 0 0 0 0 461 4607 432 3980;3981;3982;3983 5204;5205;5206;5207 5204 4 AATLILEPAGR Unmodified 1110.6397 0.63970816 3487;98 A0A087X0W7;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 61.375 61.375 2 0.0002806 61303 QUIQUE_C1218_190116_001 120.12 95.964 1341800000 152620000 92959000 139250000 98509000 141960000 106600000 110250000 123590000 128830000 0 139320000 107900000 0 462 98;3487 433 3984;3985;3986;3987;3988;3989;3990;3991;3992;3993;3994;3995;3996 5208;5209;5210;5211;5212;5213;5214;5215;5216;5217;5218;5219;5220 5208 12 AATLILEPAGR Acetyl (Protein N-term) 1152.6503 0.65027285 3487;98 A0A087X0W7;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.7 123.7 2 0.00021055 127694 QUIQUE_C1403_190116_001 138.4 126.35 908180000 83907000 0 84074000 75106000 84224000 138640000 84117000 238350000 0 119750000 0 0 0 463 98;3487 433 3997;3998;3999;4000;4001;4002;4003;4004;4005 5221;5222;5223;5224;5225;5226;5227;5228;5229;5230;5231;5232;5233;5234;5235;5236;5237;5238;5239;5240 5227 20 AATMLLHTVEESAFVLADNLLK Oxidation (M) 2401.2563 0.25629763 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2;Q9HAR2;H0Y9K5 ADGRL3;LPHN3 Latrophilin-3 yes no 0 1 0 1 169.95 169.95 3 0.00026874 174278 QUIQUE_C1218_190116_001 47.392 39.399 8571500 8571500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 464 849 434 4006 5241 5241 498 1 AATMLLHTVEESAFVLADNLLK Unmodified 2385.2614 0.261383 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2;Q9HAR2;H0Y9K5 ADGRL3;LPHN3 Latrophilin-3 yes no 0 0 0 1 170.3 170.3 3 2.1416E-07 177656 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.469 53.941 31169000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31169000 0 0 465 849 434 4007 5242 5242 1 AATMSAVEAATCR Unmodified 1337.6068 0.60676983 3256 Q53H96;A0A0A0MQS1;B5MD87 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate reductase 3;Pyrroline-5-carboxylate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.106 47.106 2 1.1171E-09 44012 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.3 99.271 512640000 63206000 0 40162000 44358000 44358000 54868000 44407000 0 39402000 0 72517000 45687000 63673000 466 3256 435 4008;4009;4010;4011;4012;4013;4014;4015;4016;4017 5243;5244;5245;5246;5247;5248;5249;5250;5251;5252;5253;5254;5255 5255 12 AATNLENQLHSAQK Acetyl (Protein N-term) 1565.7798 0.77978347 1006 F5H2Z7 CCDC92 yes yes 1 0 0 1 67.655 67.655 2 0.00017145 67702 QUIQUE_C1218_190116_001 102.4 84.501 22186000 22186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 467 1006 436 4018 5256 5256 1 AATPTRPPSRPPSR Unmodified 1489.8114 0.81135837 427 H0YH87;A0A2R8Y7P6;A0A2R8YDM9;F8VQP2;F8WB06;V9GY86;A0A2R8Y5A6;Q99700;F8W0B5 ATXN2 Ataxin-2 yes no 0 0 2 1 13.327 13.327 4 0.0027958 5571 QUIQUE_C1218_190116_001 49.483 36.346 3425100 3425100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 468 427 437 4019 5257;5258 5258 2 AATPYTVSIYGVIQGYR Unmodified 1857.9625 0.96249887 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 2 3 1 2 2 2 131.28 131.28 2;3 2.9157E-17 135443 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.75 107.57 900280000 0 0 0 0 0 0 0 163070000 295240000 23250000 144420000 133850000 140450000 469 2233 438 4020;4021;4022;4023;4024;4025;4026;4027;4028;4029;4030;4031 5259;5260;5261;5262;5263;5264;5265;5266;5267;5268;5269;5270;5271;5272;5273 5270 15 AATQFWR Unmodified 878.43989 0.43988615 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.455 47.455 2 0.01933 44241 QUIQUE_C1403_190116_001 114.54 96.978 416680000 62021000 0 61770000 68133000 0 59076000 84218000 0 52503000 28961000 0 0 0 470 2059 439 4032;4033;4034;4035;4036;4037;4038 5274;5275;5276;5277;5278;5279;5280 5276 7 AATRVQDAFAAAK Unmodified 1318.6993 0.69934831 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.531 14.531 3 0.010412 7049 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.095 25.958 4445900000 830250000 0 0 0 1076400000 1066500000 0 539730000 0 187380000 745620000 0 0 471 2859 440 4039;4040;4041;4042;4043;4044 5281;5282;5283;5284;5285;5286 5284 5 AATSPALFNR Unmodified 1046.5509 0.55089316 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.732 43.732 2 0.00021145 40159 QUIQUE_C1368_190116_001 136.16 111.23 1528800000 43768000 77131000 143980000 73299000 86417000 85441000 112020000 148850000 163780000 70765000 192670000 176120000 154540000 472 3053 441 4045;4046;4047;4048;4049;4050;4051;4052;4053;4054;4055;4056;4057 5287;5288;5289;5290;5291;5292;5293;5294;5295;5296;5297;5298;5299;5300;5301;5302;5303;5304 5291 17 AATSRYTLNFEAAQK Unmodified 1669.8424 0.84238373 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 1 2 2 1 1 1 3 2 2 2 2 50.791 50.791 2;3 5.6099E-19 48648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.99 128.58 13052000000 0 328360000 400220000 40633000 174440000 0 231470000 0 2999000000 100040000 3241200000 3132200000 2403900000 473 912;826 442 4058;4059;4060;4061;4062;4063;4064;4065;4066;4067;4068;4069;4070;4071;4072;4073;4074;4075 5305;5306;5307;5308;5309;5310;5311;5312;5313;5314;5315;5316;5317;5318;5319;5320;5321;5322;5323;5324 5320 17 AATTEPTEVEEVVPALEPTETLLSEK Unmodified 2782.4012 0.40116677 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 144.3 144.3 2;3 1.0323E-14 148426 QUIQUE_C1403_190116_001 133.86 115.03 361930000 56227000 53460000 60575000 131240000 0 60437000 0 0 0 0 0 0 0 474 4062 443 4076;4077;4078;4079;4080;4081;4082;4083;4084 5325;5326;5327;5328;5329;5330;5331;5332;5333;5334;5335 5330 10 AATTGHVIDIYACALDQTGLLEMK Unmodified 2590.2771 0.27710942 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 142.6 142.6 3 1.1463E-14 149644 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.83 73.297 146900000 0 0 32402000 0 0 26287000 0 0 0 0 50982000 37232000 0 475 1007 444 4085;4086;4087;4088 5336;5337;5338;5339 5338 4 AATVGSLAGQPLQER Unmodified 1496.7947 0.79470526 1822 P02649;H0Y7L5 APOE Apolipoprotein E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.112 59.112 2 3.2583E-19 57732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.76 132.87 2826300000 228370000 235200000 341650000 214480000 294320000 223030000 0 207640000 402720000 101620000 310350000 266920000 0 476 1822 445 4089;4090;4091;4092;4093;4094;4095;4096;4097;4098;4099 5340;5341;5342;5343;5344;5345;5346;5347;5348;5349;5350;5351;5352 5349 13 AATVGYGILR Unmodified 1019.5764 0.57637963 3438 Q7L266;A0A087WUG3;A0A087WZI5;E9PJK6 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.023 63.023 2 0.00035535 61600 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.08 112.38 2679300000 190670000 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0.90981137 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.816 88.816 2 2.9681E-28 89887 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.94 122.99 3351400000 310650000 311170000 355570000 308890000 316680000 254230000 316610000 174860000 208350000 60549000 269930000 233210000 230730000 483 2067 452 4173;4174;4175;4176;4177;4178;4179;4180;4181;4182;4183;4184;4185 5490;5491;5492;5493;5494;5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;5502;5503 5498 14 AAVDAGFVPNDMQVGQTGK Oxidation (M) 1919.9047 0.90472599 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.656 67.656 2 2.3179E-16 67465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.09 98.658 435780000 0 40768000 43181000 44321000 55150000 38567000 0 24080000 43300000 23226000 52906000 42110000 28167000 484 2067 452 4186;4187;4188;4189;4190;4191;4192;4193;4194;4195;4196;4197 5504;5505;5506;5507;5508;5509;5510;5511;5512;5513;5514;5515;5516 5512 1391 10 AAVDLEK Acetyl (Protein N-term) 786.41233 0.41233399 2129 P17858;F8WEU2 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.659 53.659 1 0.032702 51994 QUIQUE_C1277_190116_001 143 58.76 1924200000 0 208250000 320310000 0 224980000 182790000 0 0 218450000 0 304310000 219670000 245470000 485 2129 453 4198;4199;4200;4201;4202;4203;4204;4205 5517;5518;5519;5520;5521;5522;5523;5524 5517 5 AAVDSFYLLYR Acetyl (Protein N-term) 1358.6871 0.68705229 3227 Q3SXM5;H3BQI7;H3BT52;H3BNH5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes no 1 0 0 1 1 160.99 160.99 2 5.5283E-06 165547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.09 103.74 221560000 0 0 0 0 0 0 0 95022000 126540000 0 0 0 0 486 3227 454 4206;4207 5525;5526 5526 2 AAVEALQSQALHATSQQPLR Unmodified 2118.1182 0.11816466 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 75.068 75.068 2;3 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5589;5590;5591;5592;5593;5594;5595;5596;5597;5598;5599;5600;5601;5602;5603;5604;5605;5606;5607;5608;5609;5610;5611;5612;5613;5614;5615;5616;5617;5618;5619;5620;5621;5622;5623;5624;5625;5626;5627;5628;5629;5630;5631;5632;5633;5634;5635;5636;5637;5638;5639;5640;5641;5642;5643;5644;5645;5646;5647;5648;5649;5650;5651;5652;5653;5654;5655;5656;5657 5633 65 AAVELEEPEDAR Unmodified 1327.6256 0.62557424 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 46.937 46.937 2 0.004947 44395 QUIQUE_C1368_190116_001 67.726 38.564 38816000 0 0 38816000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 490 1697 458 4294 5658 5658 1 AAVENLPTFLVELSR Unmodified 1657.9039 0.90392136 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 151.56 151.56 2;3 6.544E-10 154629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.26 133.39 6297500000 446360000 491900000 448370000 455120000 59337000 435070000 554400000 421120000 627100000 149400000 827940000 849400000 532030000 491 3090 459 4295;4296;4297;4298;4299;4300;4301;4302;4303;4304;4305;4306;4307;4308;4309;4310;4311;4312;4313;4314;4315;4316;4317;4318 5659;5660;5661;5662;5663;5664;5665;5666;5667;5668;5669;5670;5671;5672;5673;5674;5675;5676;5677;5678;5679;5680;5681;5682;5683;5684;5685;5686;5687;5688;5689;5690;5691;5692;5693;5694 5674 35 AAVESLGFILFR Unmodified 1321.7394 0.73942221 3954 Q99460;A0A087WW66;H7C378 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.72 145.72 2 6.3541E-14 150458 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.79 111.18 1650600000 103410000 139870000 127590000 118770000 127840000 90610000 124020000 158330000 145790000 62760000 148670000 157870000 145040000 492 3954 460 4319;4320;4321;4322;4323;4324;4325;4326;4327;4328;4329;4330;4331 5695;5696;5697;5698;5699;5700;5701;5702;5703;5704;5705;5706;5707;5708;5709;5710;5711;5712;5713;5714;5715;5716;5717;5718;5719 5710 24 AAVEWFDGK Unmodified 1021.4869 0.48689592 576 B0QYK0;Q01844;A0A0D9SFL3;C9JGE3;H7BY36 EWSR1 RNA-binding protein EWS yes no 0 0 0 1 71.937 71.937 2 0.061333 72466 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.599 16.069 89756000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89756000 493 576 461 4332 5720 5720 1 AAVEWFDGKDFQGSK Unmodified 1683.7893 0.78928553 576 B0QYK0;Q01844;A0A0D9SFL3;C9JGE3;H7BY36 EWSR1 RNA-binding protein EWS yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 81.929 81.929 2;3 1.3972E-17 82958 QUIQUE_DMIX7_190116_001 144.7 127.67 1420000000 34736000 122430000 71342000 71140000 143330000 40014000 38701000 208290000 145600000 0 217590000 188250000 138600000 494 576 462 4333;4334;4335;4336;4337;4338;4339;4340;4341;4342;4343;4344;4345;4346;4347;4348;4349 5721;5722;5723;5724;5725;5726;5727;5728;5729;5730;5731;5732;5733;5734;5735;5736;5737;5738;5739;5740 5739 20 AAVFDLDGVLALPAVFGVLGR Unmodified 2099.1779 0.17791137 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6;H0YAW7;E5RI53 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 2 2 174.9 174.9 2;3 4.1853E-08 181930 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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5758;5759;5760;5761;5762;5763;5764;5765;5766;5767;5768;5769;5770;5771;5772;5773;5774;5775;5776;5777;5778;5779;5780;5781;5782;5783;5784 5768 27 AAVLNAER Acetyl (Protein N-term) 884.47158 0.4715802 4159 Q9H3P7 ACBD3 Golgi resident protein GCP60 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.95 67.95 2 0.0058159 67327 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.55 50.758 165080000 0 16779000 0 20704000 31230000 17979000 0 18657000 0 11699000 0 23599000 24432000 501 4159 469 4380;4381;4382;4383;4384;4385;4386;4387;4388;4389 5785;5786;5787;5788;5789;5790;5791;5792;5793;5794 5794 10 AAVLQQVLER Acetyl (Protein N-term) 1167.6612 0.66117189 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.82 155.82 2 9.3843E-05 161800 QUIQUE_C1576_190116_001 140.5 119.04 563950000 40531000 35550000 40411000 31697000 54999000 59692000 40940000 41710000 56613000 16196000 53376000 50541000 41693000 502 2041 470 4390;4391;4392;4393;4394;4395;4396;4397;4398;4399;4400;4401;4402 5795;5796;5797;5798;5799;5800;5801;5802;5803;5804;5805;5806;5807;5808;5809;5810 5802 16 AAVLVQQWVSYADTELIPAACGATLPALGLR Unmodified 3253.7169 0.71691921 2254 P26640;A0A140T936;A0A140T954;A2ABF4;A0A0G2JJT9;A0A140T904 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 171.11 171.11 3 2.784E-31 176407 QUIQUE_C1576_190116_001 100.95 95.108 166620000 0 0 0 0 17876000 0 48840000 0 0 0 0 99900000 0 503 2254 471 4403;4404;4405 5811;5812;5813 5812 3 AAVMATLLFPGR Unmodified 1245.6904 0.69036353 3863 Q96GX9;S4R3D6 APIP Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase yes no 0 0 0 1 118.74 118.74 2 0.0018106 123793 QUIQUE_C1218_190116_001 78.934 58.605 95614000 95614000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 504 3863 472 4406 5814 5814 1 AAVMVHQLSK Unmodified 1082.5906 0.59064948 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 19.251 19.251 2;3 6.6317E-14 11775 QUIQUE_C1368_190116_001 185.58 156.67 6572300000 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53666000 113040000 52796000 0 143330000 42422000 56703000 507 3615 474 4433;4434;4435;4436;4437;4438;4439;4440;4441;4442;4443;4444;4445;4446 5842;5843;5844;5845;5846;5847;5848;5849;5850;5851;5852;5853;5854;5855;5856 5850 12 AAVPDAVGK Unmodified 826.45487 0.45486751 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.248 20.248 2 0.035453 12721 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.776 34.854 7400100000 522220000 566770000 985810000 729270000 574900000 505800000 628080000 661930000 859360000 0 0 556690000 809300000 508 1872;1371;590 475 4447;4448;4449;4450;4451;4452;4453;4454;4455;4456;4457 5857;5858;5859;5860;5861;5862;5863;5864;5865;5866;5867 5867 3 AAVPELLQQQEEDR Acetyl (Protein N-term) 1666.8162 0.81622856 4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;Q5QPE4;U3KQL0;U3KQP5 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 126.81 126.81 2 0.00023061 130746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.46 74.275 1309100000 0 109080000 129810000 145110000 134770000 115600000 93951000 109590000 133760000 54992000 0 131160000 151280000 509 4636 476 4458;4459;4460;4461;4462;4463;4464;4465;4466;4467;4468;4469 5868;5869;5870;5871;5872;5873;5874;5875;5876;5877;5878;5879;5880;5881;5882 5877 14 AAVPIVNLKDELLFPSWEALFSGSEGPLKPGAR Unmodified 3507.8766 0.87659098 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 162.68 162.68 3;4 2.655E-39 165188 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.46 97.089 1510600000 0 52753000 51758000 0 133700000 0 127280000 75445000 211060000 0 435070000 310130000 113400000 510 2419 477 4470;4471;4472;4473;4474;4475;4476;4477;4478;4479;4480 5883;5884;5885;5886;5887;5888;5889;5890;5891;5892;5893 5887 11 AAVPSGASTGIYEALELR Unmodified 1803.9367 0.93667805 1906;1955 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5;P09104;F5H0C8;F5H1C3;E5RI09;E5RG95;K7EPM1;K7EKN2;E5RGZ4 ENO1;ENO2;ENO3 Alpha-enolase;Enolase;Gamma-enolase no no 0 0 0 8 10 6 8 9 8 8 8 12 4 27 14 14 124.96 124.96 2;3 3.3164E-14 129791 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.42 92.755 171330000000 13849000000 14477000000 12431000000 13044000000 13521000000 13717000000 12695000000 13559000000 14041000000 7656700000 16651000000 12395000000 13298000000 511 1906;1955 478 4481;4482;4483;4484;4485;4486;4487;4488;4489;4490;4491;4492;4493;4494;4495;4496;4497;4498;4499;4500;4501;4502;4503;4504;4505;4506;4507;4508;4509;4510;4511;4512;4513;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529;4530;4531;4532;4533;4534;4535;4536;4537;4538;4539;4540;4541;4542;4543;4544;4545;4546;4547;4548;4549;4550;4551;4552;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4563;4564;4565;4566;4567;4568;4569;4570;4571;4572;4573;4574;4575;4576;4577;4578;4579;4580;4581;4582;4583;4584;4585;4586;4587;4588;4589;4590;4591;4592;4593;4594;4595;4596;4597;4598;4599;4600;4601;4602;4603;4604;4605;4606;4607;4608;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616 5894;5895;5896;5897;5898;5899;5900;5901;5902;5903;5904;5905;5906;5907;5908;5909;5910;5911;5912;5913;5914;5915;5916;5917;5918;5919;5920;5921;5922;5923;5924;5925;5926;5927;5928;5929;5930;5931;5932;5933;5934;5935;5936;5937;5938;5939;5940;5941;5942;5943;5944;5945;5946;5947;5948;5949;5950;5951;5952;5953;5954;5955;5956;5957;5958;5959;5960;5961;5962;5963;5964;5965;5966;5967;5968;5969;5970;5971;5972;5973;5974;5975;5976;5977;5978;5979;5980;5981;5982;5983;5984;5985;5986;5987;5988;5989;5990;5991;5992;5993;5994;5995;5996;5997;5998;5999;6000;6001;6002;6003;6004;6005;6006;6007;6008;6009;6010;6011;6012;6013;6014;6015;6016;6017;6018;6019;6020;6021;6022;6023;6024;6025;6026;6027;6028;6029;6030;6031;6032;6033;6034;6035;6036;6037;6038;6039;6040;6041;6042;6043;6044;6045;6046;6047;6048;6049;6050;6051;6052;6053;6054;6055;6056;6057;6058;6059;6060;6061;6062;6063;6064;6065;6066;6067;6068;6069;6070;6071;6072;6073;6074;6075;6076;6077;6078;6079;6080;6081;6082;6083;6084;6085;6086;6087;6088;6089;6090;6091;6092;6093;6094;6095;6096;6097;6098;6099;6100;6101;6102;6103;6104;6105;6106;6107;6108;6109;6110;6111;6112;6113;6114;6115;6116;6117;6118;6119;6120;6121;6122;6123;6124;6125;6126;6127;6128;6129;6130;6131;6132;6133;6134;6135;6136;6137;6138;6139;6140;6141;6142;6143;6144;6145;6146;6147;6148;6149;6150;6151;6152;6153;6154;6155;6156;6157;6158;6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170;6171;6172;6173;6174;6175;6176;6177;6178;6179;6180;6181;6182;6183;6184;6185;6186;6187;6188;6189;6190;6191;6192;6193;6194;6195;6196 6138 292 AAVPSGASTGIYEALELRDGDK Unmodified 2219.107 0.10699085 1955 P09104;F5H0C8;F5H1C3;E5RI09;E5RG95;K7EPM1;K7EKN2;E5RGZ4 ENO2;ENO3 Gamma-enolase;Enolase no no 0 0 1 1 1 102 102 3 1.1845E-08 104684 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.812 83.232 230980000 0 0 0 0 0 0 0 188220000 42752000 0 0 0 0 512 1955 479 4617;4618 6197;6198;6199 6198 3 AAVPSGASTGIYEALELRDNDK Unmodified 2276.1285 0.12845458 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 1 1 4 2 1 1 3 101.55 101.55 2;3 6.484E-44 103113 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.19 175.83 3575300000 0 0 0 0 79370000 0 0 1492100000 747830000 0 213620000 452500000 589930000 513 1906 480 4619;4620;4621;4622;4623;4624;4625;4626;4627;4628;4629;4630 6200;6201;6202;6203;6204;6205;6206;6207;6208;6209;6210;6211;6212;6213;6214;6215;6216;6217;6218;6219;6220;6221;6222 6214 23 AAVPSGASTGIYEALELRDNDKTR Unmodified 2533.2772 0.27724408 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 2 3 2 1 1 88.334 88.334 3;4 2.9047E-18 89957 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.2 110.54 1510600000 0 0 0 0 0 0 0 1255400000 109670000 0 0 70764000 74768000 514 1906 481 4631;4632;4633;4634;4635;4636;4637 6223;6224;6225;6226;6227;6228;6229;6230;6231;6232;6233;6234 6225 11 AAVPTVSDQAAAMQLSQCAK Unmodified 2045.9874 0.98740976 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 85.689 85.689 2;3 1.8386E-12 87208 QUIQUE_C1403_190116_001 147.35 126.05 298500000 0 0 48782000 63092000 30449000 21455000 42472000 0 0 0 34986000 25920000 31341000 515 4606 482 4638;4639;4640;4641;4642;4643;4644;4645;4646;4647 6235;6236;6237;6238;6239;6240;6241;6242;6243;6244 6237 9 AAVQAAEVK Acetyl (Protein N-term) 927.50255 0.50254598 3103 Q15046;H3BRC9 KARS Lysine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 44.724 44.724 2 0.0024898 41817 QUIQUE_C1403_190116_001 87.639 56.061 157640000 0 0 0 35044000 45888000 0 0 0 0 0 38716000 0 37992000 516 3103 483 4648;4649;4650;4651;4652;4653;4654 6245;6246;6247;6248;6249;6250;6251 6247 6 AAVQVLDDIEK Unmodified 1199.6398 0.63976774 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.129 76.129 2 0.002477 75238 QUIQUE_C1563_190116_001 78.098 23.941 576110000 66426000 67629000 111110000 0 0 77023000 0 45538000 93232000 33183000 0 81967000 0 517 2191 484 4655;4656;4657;4658;4659;4660;4661;4662 6252;6253;6254;6255;6256;6257;6258;6259 6255 7 AAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGK Unmodified 3084.4901 0.4900904 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5;E9PDF9;E7EV28;C9IZ65 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 2 3 1 2 2 75.036 75.036 3;4 3.8068E-197 75204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 222.95 211.53 3236600000 318270000 303240000 125180000 366390000 310970000 280800000 214230000 285720000 276640000 156830000 124360000 142670000 331300000 518 425 485 4663;4664;4665;4666;4667;4668;4669;4670;4671;4672;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;4684;4685;4686;4687;4688;4689;4690 6260;6261;6262;6263;6264;6265;6266;6267;6268;6269;6270;6271;6272;6273;6274;6275;6276;6277;6278;6279;6280;6281;6282;6283;6284;6285;6286;6287;6288;6289;6290;6291;6292;6293;6294;6295;6296;6297;6298;6299;6300;6301;6302 6286 41 AAVTMSVPGR Acetyl (Protein N-term) 1029.5277 0.52771487 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3;A0A2R8Y454 MYH14 Myosin-14 yes no 1 0 0 1 82.885 82.885 2 0.031082 83754 QUIQUE_C1403_190116_001 45.738 20.844 14332000 0 0 0 14332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 519 3459 486 4691 6303 6303 1 AAVVTSPPPTTAPHK Unmodified 1472.7987 0.798728 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;D6RF25;D6RAH3;D6RJE2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 2 2 3 1 3 2 2 21.752 21.752 2;3 4.3102E-13 14943 QUIQUE_C1403_190116_001 113.76 109.19 7570400000 489800000 435430000 415480000 823860000 599700000 680470000 451840000 753350000 878050000 202770000 515890000 464710000 859100000 520 854 487 4692;4693;4694;4695;4696;4697;4698;4699;4700;4701;4702;4703;4704;4705;4706;4707;4708;4709;4710;4711;4712;4713;4714;4715;4716;4717;4718;4719;4720;4721;4722;4723 6304;6305;6306;6307;6308;6309;6310;6311;6312;6313;6314;6315;6316;6317;6318;6319;6320;6321;6322;6323;6324;6325;6326;6327;6328;6329;6330;6331;6332;6333;6334;6335;6336;6337;6338;6339;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6346;6347;6348;6349 6313 45 AAVWQQVLAVDAR Unmodified 1425.7728 0.7728476 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 0 0 0 1 88.232 88.232 3 0.051643 90157 QUIQUE_C1218_190116_001 21.775 0 29880000 29880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 521 4137 488 4724 6350 6350 1 AAVWQQVLAVDAR Acetyl (Protein N-term) 1467.7834 0.78341229 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 1 0 0 1 1 1 164.19 164.19 2 0.0015146 165848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.681 82.709 33181000 14335000 0 0 10917000 0 0 0 7928600 0 0 0 0 0 522 4137 488 4725;4726;4727 6351;6352;6353 6353 2 AAVYHHFISDGVR Unmodified 1470.7368 0.73679645 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 3 1 3 3 1 1 1 1 31.843 31.843 2;3;4 0.0010774 27097 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 76.795 923120000 144090000 229680000 46711000 144490000 267230000 16356000 0 0 0 0 46285000 0 28282000 523 1803 489 4728;4729;4730;4731;4732;4733;4734;4735;4736;4737;4738;4739;4740;4741;4742 6354;6355;6356;6357;6358;6359;6360;6361;6362;6363;6364;6365;6366;6367;6368;6369 6365 15 AAWEVDSGR Unmodified 989.45666 0.45665842 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 37.753 37.753 2 0.008597 33256 QUIQUE_C1403_190116_001 78.334 52.44 105200000 0 0 43611000 49079000 0 0 0 0 0 12510000 0 0 0 524 666 490 4743;4744;4745 6370;6371;6372 6371 3 AAWEVDSGRR Unmodified 1145.5578 0.55776945 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 1 23.656 23.656 2;3 8.8857E-05 17140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.048 76.676 306040000 0 0 0 0 0 0 0 55657000 76265000 0 124690000 49437000 0 525 666 491 4746;4747;4748;4749;4750 6373;6374;6375;6376;6377 6377 4 AAWIPHVENR Unmodified 1191.6149 0.6148904 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.783 44.783 3 0.001951 41166 QUIQUE_C1368_190116_001 60.064 44.804 513960000 82142000 71155000 74879000 38819000 59093000 65189000 0 0 0 23724000 51480000 47474000 0 526 2056 492 4751;4752;4753;4754;4755;4756;4757;4758;4759;4760;4761 6378;6379;6380;6381;6382;6383;6384;6385;6386;6387;6388;6389;6390;6391 6380 13 AAYDIEVNTR Unmodified 1150.5619 0.56185177 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9C3;A0A140T959;A0A140T905;A2ABJ5 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.557 50.557 2 0.0013602 49353 QUIQUE_C1438_190116_001 98.582 62.187 250300000 0 0 64236000 0 49471000 0 50144000 0 0 0 47517000 0 38928000 527 1673 493 4762;4763;4764;4765;4766;4767 6392;6393;6394;6395;6396;6397 6394 6 AAYDIEVNTRR Unmodified 1306.663 0.6629628 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9C3;A0A140T959;A0A140T905;A2ABJ5 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 1 1 35.947 35.947 3 0.0082556 31508 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.829 33.666 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 528 1673 494 4768 6398 6398 1 AAYDVSSFSFFQR Unmodified 1523.7045 0.70449327 1502 O15498 YKT6 Synaptobrevin homolog YKT6 yes yes 0 0 0 1 130.42 130.42 2 0.027222 126828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.569 34.789 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 529 1502 495 4769 6399 6399 1 AAYEAELGDAR Unmodified 1164.5411 0.54111633 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.437 42.437 2 0.00010542 39769 QUIQUE_C1218_190116_001 132.01 96.13 5178500000 658430000 589730000 430770000 0 740480000 512220000 408880000 229800000 303610000 211390000 500780000 295410000 296990000 530 1819;3223 496 4770;4771;4772;4773;4774;4775;4776;4777;4778;4779;4780;4781 6400;6401;6402;6403;6404;6405;6406;6407;6408;6409;6410;6411;6412 6400 12 AAYEAELGDARK Unmodified 1292.6361 0.63607935 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 1 1 26.761 26.761 3 0.032461 20776 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.737 23.106 286190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 156500000 129680000 0 531 1819;3223 497 4782;4783 6413;6414 6413 2 AAYEAFCR Unmodified 986.428 0.42800083 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.11 39.11 2 0.0036007 34273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.04 109.88 7607100000 500590000 589620000 672560000 423210000 614560000 501660000 674170000 595190000 622190000 182820000 816620000 693520000 720360000 532 2588 498 4784;4785;4786;4787;4788;4789;4790;4791;4792;4793;4794;4795;4796 6415;6416;6417;6418;6419;6420;6421;6422;6423;6424;6425;6426;6427;6428;6429;6430 6426 9 AAYFGIYDTAK Unmodified 1218.5921 0.59208927 1878 P05141 SLC25A5 ADP/ATP translocase 2;ADP/ATP translocase 2, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 82.461 82.461 2 0.00098767 83970 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.867 84.299 4668300000 436480000 0 636180000 378130000 314560000 0 0 478690000 428140000 199170000 772220000 498910000 525780000 533 1878 499 4797;4798;4799;4800;4801;4802;4803;4804;4805;4806;4807 6431;6432;6433;6434;6435;6436;6437;6438;6439;6440;6441 6437 8 AAYFGVYDTAK Unmodified 1204.5764 0.57643921 2038;2039 P12235;V9GYG0;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.226 71.226 2 0.0014573 72200 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.62 91.259 7005900000 558300000 529490000 831670000 527650000 0 496040000 669020000 613540000 657410000 257670000 1192600000 672560000 0 534 2038;2039 500 4808;4809;4810;4811;4812;4813;4814;4815;4816;4817;4818 6442;6443;6444;6445;6446;6447;6448;6449;6450;6451;6452;6453 6452 11 AAYIYFTDFCPDNLFNK Unmodified 2097.9506 0.95061355 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.82 155.82 2 8.187E-07 160121 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.01 113.23 548900000 32881000 42907000 55511000 30873000 43708000 30233000 54912000 40802000 45242000 12349000 66047000 53403000 40032000 535 1384 501 4819;4820;4821;4822;4823;4824;4825;4826;4827;4828;4829;4830;4831 6454;6455;6456;6457;6458;6459;6460;6461;6462;6463;6464;6465;6466;6467 6466 12 AAYIYIR Unmodified 868.48069 0.48068833 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PLC6;E9PJL9 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.461 50.461 2 0.039103 46772 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.025 45.823 1370400000 256550000 0 243060000 0 171830000 0 195700000 0 202300000 67506000 0 233490000 0 536 1069 502 4832;4833;4834;4835;4836;4837;4838 6468;6469;6470;6471;6472;6473;6474 6473 7 AAYKLVLIR Acetyl (Protein N-term) 1087.6754 0.67536539 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 1 0 1 1 101.02 101.02 2 0.038937 105638 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.207 43.754 36850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36850000 0 0 537 2139 503 4839 6475 6475 1 AAYLLGCSLEELSSAIFK Unmodified 1971.0023 0.002314771 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 169.01 169.01 2;3 4.4989E-05 174357 QUIQUE_C1576_190116_001 121.04 97.923 611690000 9591100 0 142310000 8194900 49664000 0 218840000 25666000 0 21317000 23530000 0 112580000 538 271 504 4840;4841;4842;4843;4844;4845;4846;4847;4848;4849;4850 6476;6477;6478;6479;6480;6481;6482;6483;6484;6485;6486;6487 6482 12 AAYLQETGKPLDETLK Unmodified 1775.9305 0.93053004 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 64.15 64.15 2;3 1.5887E-12 64847 QUIQUE_C1218_190116_001 163.99 131.47 1414300000 29075000 101990000 192940000 191940000 82650000 218550000 162870000 0 106920000 76747000 70755000 48053000 131810000 539 1853 505 4851;4852;4853;4854;4855;4856;4857;4858;4859;4860;4861;4862;4863;4864;4865;4866;4867;4868;4869;4870;4871 6488;6489;6490;6491;6492;6493;6494;6495;6496;6497;6498;6499;6500;6501;6502;6503;6504;6505;6506;6507;6508;6509;6510;6511;6512 6488 25 AAYLQETGKPLDETLKK Unmodified 1904.0255 0.025493054 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 2 2 2 3 3 1 1 1 1 1 1 1 2 47.916 47.916 2;3;4 1.1501E-87 45476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.83 148.39 3744400000 130330000 262990000 876420000 671340000 138700000 28237000 311160000 282650000 60160000 193860000 33036000 0 755500000 540 1853 506 4872;4873;4874;4875;4876;4877;4878;4879;4880;4881;4882;4883;4884;4885;4886;4887;4888;4889;4890 6513;6514;6515;6516;6517;6518;6519;6520;6521;6522;6523;6524;6525;6526;6527;6528;6529;6530;6531 6527 15 AAYLQWR Acetyl (Protein N-term) 948.48175 0.48175096 65;4141 A0A087WXL6;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 1 0 0 1 1 1 1 126.17 126.17 2 0.0268 130251 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.618 55.654 34987000 0 12710000 0 0 0 0 0 0 14882000 7394400 0 0 0 541 65;4141 507 4891;4892;4893;4894 6532;6533;6534;6535 6534 4 AAYNLVK Unmodified 777.43849 0.43848916 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.399 27.399 2 0.023734 21189 QUIQUE_C1277_190116_001 99.511 44.069 1164900000 0 343750000 0 0 221510000 0 0 112540000 0 87955000 0 399190000 0 542 452 508 4895;4896;4897;4898;4899 6536;6537;6538;6539;6540 6536 5 AAYNLVR Unmodified 805.44464 0.44463717 3040 Q14019 COTL1 Coactosin-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.729 30.729 2 0.019175 25727 QUIQUE_C1277_190116_001 112.27 67.656 7898200000 656840000 605370000 923760000 0 662910000 0 0 0 1066200000 453510000 1226300000 947460000 1355800000 543 3040 509 4900;4901;4902;4903;4904;4905;4906;4907;4908 6541;6542;6543;6544;6545;6546;6547;6548;6549;6550;6551 6542 10 AAYNPGQAVPWNAVK Unmodified 1584.8049 0.80487601 3571 Q8N163;E5RFJ3;H0YC69;E5RGU7;H0YC58 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.001 86.001 2 0.00010916 88641 QUIQUE_C1218_190116_001 89.609 79.085 636840000 77728000 75508000 50955000 0 68601000 47139000 0 80658000 77543000 24821000 56222000 77663000 0 544 3571 510 4909;4910;4911;4912;4913;4914;4915;4916;4917;4918 6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;6560;6561;6562;6563 6552 12 AAYNVTLLNFMDPQK Unmodified 1723.8603 0.86034198 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 141.16 141.16 2 0.055957 145426 QUIQUE_C1277_190116_001 53.034 37.657 36200000 0 36200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 545 334 511 4919 6564 6564 1 AAYPDLENPPLLVTPSQQAK Unmodified 2151.1212 0.12118435 2638 P54136;E5RJM9 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 114.01 114.01 2 7.7425E-05 119753 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.265 79.387 122300000 0 36100000 0 0 0 0 0 0 0 0 50713000 0 35489000 546 2638 512 4920;4921;4922 6565;6566;6567 6566 3 AAYQVAALPK Unmodified 1030.5811 0.58113065 2612 P52758;H0YBX3;H0YB34 HRSP12 Ribonuclease UK114 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.832 49.832 2 0.00014671 47058 QUIQUE_C1563_190116_001 122.13 100.6 11579000000 642340000 845710000 1141300000 645240000 875650000 1193700000 711250000 959710000 936950000 319790000 1323300000 874030000 1110600000 547 2612 513 4923;4924;4925;4926;4927;4928;4929;4930;4931;4932;4933;4934;4935 6568;6569;6570;6571;6572;6573;6574;6575;6576;6577;6578;6579;6580 6573 13 AAYSFYNVHTQTPLLDLMSDALVLAK Unmodified 2880.4732 0.47316669 2311 P30419 NMT1 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 168.31 168.31 3 2.7636E-15 175509 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.518 87.759 239390000 0 0 0 25627000 0 0 0 0 0 0 213770000 0 0 548 2311 514 4936;4937 6581;6582 6582 2 AAYSYRPGPGAGPGPAAGAALPDQSFLWNVFQR Acetyl (Protein N-term) 3430.6847 0.68470788 1623 O75340;E7EPW6;A0A087WZ38;D6RA21;Q86W51 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 1 0 1 2 1 1 1 1 163.1 163.1 3;4 4.6908E-74 170356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.79 135.22 858720000 0 0 0 0 0 0 0 217930000 156430000 0 147060000 217480000 119820000 549 1623 515 4938;4939;4940;4941;4942;4943 6583;6584;6585;6586;6587;6588;6589 6587 7 AAYVLFYQR Unmodified 1129.592 0.59202969 1096;4605;2965 Q9Y4E8;G5E9A6;P51784;Q13107 USP15;USP11;USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 no no 0 0 0 1 86.948 86.948 2 0.023353 83561 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.616 57.088 0 0 0 0 0 0 0 0 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18.65 2;3 2.6899E-19 11064 QUIQUE_C1563_190116_001 169.65 137.33 6489000000 455020000 647050000 427070000 452530000 679550000 557530000 780160000 277730000 292380000 221990000 551080000 544220000 602690000 552 3926 518 4971;4972;4973;4974;4975;4976;4977;4978;4979;4980;4981;4982;4983;4984;4985;4986;4987;4988;4989;4990;4991;4992;4993;4994 6636;6637;6638;6639;6640;6641;6642;6643;6644;6645;6646;6647;6648;6649;6650;6651;6652;6653;6654;6655;6656;6657;6658;6659 6646 22 ACALSIEESCRPGDK Unmodified 1691.7607 0.76070429 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3;H0Y8X1 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 37.56 37.56 2;3 6.1492E-28 33355 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.14 127.18 3319200000 387330000 361320000 489770000 315700000 172170000 395040000 398370000 49700000 155560000 116130000 116130000 142320000 219630000 553 2326 519 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no no 0 1 0 1 77.585 77.585 3 5.4339E-05 78892 QUIQUE_C1368_190116_001 50.029 35.72 121360000 0 0 121360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 556 1140;3457 521 5059 6764 6764 662 1 ACCVFIFQPNGK Unmodified 1439.669 0.66897616 4091 Q9C040;A0A0J9YY97 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 89.618 89.618 2 0.0057985 91629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.069 76.862 120030000 0 0 0 40956000 0 0 0 0 0 0 0 0 79077000 557 4091 522 5060;5061;5062;5063 6765;6766;6767;6768 6766 3 ACDSVTSNVLPLLLEQFHK Unmodified 2170.1092 0.10923946 3947 Q96T76;H7C1W5 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.71 147.71 3 0.00014553 153620 QUIQUE_C1218_190116_001 66.779 58.389 477900000 46149000 40191000 34141000 50219000 46775000 34764000 50578000 24071000 35956000 9844900 30673000 25355000 49188000 558 3947 523 5064;5065;5066;5067;5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076 6769;6770;6771;6772;6773;6774;6775;6776;6777;6778;6779;6780;6781;6782;6783;6784;6785;6786;6787 6769 19 ACEAITVGK Unmodified 947.47462 0.47461667 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.781 21.781 2 0.0014309 14988 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.74 83.457 755970000 0 120730000 100720000 113550000 0 0 0 67942000 111460000 59084000 0 99652000 82826000 559 2401 524 5077;5078;5079;5080;5081;5082;5083;5084;5085 6788;6789;6790;6791;6792;6793;6794;6795;6796;6797 6794 9 ACEFAGFQCQIQFGPHNEQK Unmodified 2395.0474 0.047384258 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 93.839 93.839 3 9.6036E-25 95950 QUIQUE_C1368_190116_001 138.66 135.42 451570000 52871000 0 74879000 81713000 0 44888000 52928000 39091000 46942000 0 0 0 58260000 560 4600 525 5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093 6798;6799;6800;6801;6802;6803;6804;6805;6806 6799 9 ACEFGGFQAQIQFGPHVEHK Unmodified 2286.064 0.0640206 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 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Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.923 85.923 2 0.0031858 87541 QUIQUE_C1368_190116_001 132.94 88.41 648280000 53230000 55599000 44857000 31306000 40794000 39889000 40525000 64687000 53535000 21060000 56957000 79769000 66069000 568 2571 533 5144;5145;5146;5147;5148;5149;5150;5151;5152;5153;5154;5155;5156 6887;6888;6889;6890;6891;6892;6893;6894;6895;6896;6897;6898;6899;6900 6889 12 ACGLNFADLMAR Unmodified 1337.622 0.62202597 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 118.77 118.77 2 2.8937E-06 121321 QUIQUE_C1563_190116_001 138.08 118.29 3862600000 266210000 312520000 290520000 306010000 297090000 257350000 283180000 272800000 576290000 0 402570000 245600000 352500000 569 3958 534 5157;5158;5159;5160;5161;5162;5163;5164;5165;5166;5167;5168;5169;5170 6901;6902;6903;6904;6905;6906;6907;6908;6909;6910;6911;6912;6913;6914;6915;6916;6917;6918;6919;6920;6921;6922;6923;6924;6925 6912 25 ACGLNFADLMAR Oxidation (M) 1353.6169 0.61694059 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 0 1 1 1 91.79 91.79 2 0.0030761 93213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.533 55.753 142740000 0 0 0 0 0 0 0 44564000 63054000 35126000 0 0 0 570 3958 534 5171;5172;5173 6926;6927;6928;6929 6927 2793 3 ACGLNFIDLMVR Oxidation (M) 1423.6952 0.69519091 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 1 0 1 1 120.04 120.04 2 0.011985 124648 QUIQUE_C1576_190116_001 60.518 53.587 62564000 0 0 0 0 0 0 36159000 0 0 26405000 0 0 0 571 4226 535 5174;5175 6930;6931 6930 2886 2 ACGLVASNLNLK Acetyl (Protein N-term) 1300.6809 0.68092105 1958 P09382;F8WEI7 LGALS1 Galectin-1 yes no 1 0 0 1 1 116.42 116.42 2 0.0047334 121524 QUIQUE_C1438_190116_001 61.161 41.375 53013000 31573000 0 0 0 21439000 0 0 0 0 0 0 0 0 572 1958 536 5176;5177 6932;6933 6933 2 ACGLVASNLNLKPGECLR Acetyl (Protein N-term) 2013.0136 0.013564934 1958 P09382;F8WEI7 LGALS1 Galectin-1 yes no 1 0 1 2 2 2 2 3 2 2 2 4 2 3 2 3 112.04 112.04 2;3 1.1619E-104 117271 QUIQUE_C1218_190116_001 231.06 207.31 37267000000 2217400000 2647500000 3485700000 2392300000 3405800000 2859800000 4024900000 2499800000 3327600000 882090000 3087400000 2942500000 3493800000 573 1958 537 5178;5179;5180;5181;5182;5183;5184;5185;5186;5187;5188;5189;5190;5191;5192;5193;5194;5195;5196;5197;5198;5199;5200;5201;5202;5203;5204;5205;5206;5207;5208 6934;6935;6936;6937;6938;6939;6940;6941;6942;6943;6944;6945;6946;6947;6948;6949;6950;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;6961;6962;6963;6964;6965;6966;6967;6968;6969;6970;6971;6972;6973;6974;6975;6976;6977;6978;6979;6980;6981;6982;6983;6984;6985;6986;6987;6988;6989;6990;6991;6992;6993;6994;6995;6996;6997;6998;6999 6937 66 ACGNFGIPCELR Unmodified 1392.6278 0.62783962 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 84.067 84.067 2 7.1337E-05 85367 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 113.06 3781700000 314860000 363510000 361650000 303730000 283590000 331650000 259100000 363210000 415870000 135260000 0 282610000 366660000 574 2195 538 5209;5210;5211;5212;5213;5214;5215;5216;5217;5218;5219;5220;5221 7000;7001;7002;7003;7004;7005;7006;7007;7008;7009;7010;7011;7012;7013;7014;7015 7009 14 ACGQIFCGK Unmodified 1039.4579 0.45792075 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.058 28.058 2 0.0014299 22236 QUIQUE_C1277_190116_001 103.75 76.044 263790000 52576000 68804000 48721000 0 0 0 38651000 0 0 0 0 55043000 0 575 1464 539 5222;5223;5224;5225;5226;5227 7016;7017;7018;7019;7020;7021 7017 6 ACGVDYEVK Unmodified 1039.4644 0.46444592 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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7038 7038 1 ACIDSNEDGDLSK Unmodified 1422.5933 0.59328784 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.037 30.037 2 6.5921E-05 24983 QUIQUE_C1438_190116_001 116.77 106.39 71599000 0 0 0 37166000 0 0 34433000 0 0 0 0 0 0 579 2285 543 5245;5246;5247;5248;5249;5250;5251;5252 7039;7040;7041;7042;7043;7044;7045;7046 7042 8 ACIGDTLCQK Unmodified 1164.5267 0.5267286 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 35.645 35.645 2 0.0093035 31300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.542 69.839 184490000 0 0 0 0 0 56371000 64994000 44004000 0 19125000 0 0 0 580 514 544 5253;5254;5255;5256 7047;7048;7049;7050 7049 4 ACISIGNQNFEVK Unmodified 1478.7188 0.71876312 2606 P52564;K7EIW3;A0A0A0MRF7 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.588 85.588 2 0.00041285 87693 QUIQUE_C1368_190116_001 96.015 74.551 259240000 0 0 34225000 0 52946000 50098000 0 0 0 0 121970000 0 0 581 2606 545 5257;5258;5259;5260 7051;7052;7053;7054 7051 4 ACLAEAITLVESTHSR Unmodified 1756.8778 0.87778296 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4;A0A3B3IRG3;D6RIS5 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 16.562 16.562 3 0.023903 105230 QUIQUE_C1563_190116_001 34.909 23.436 37855000 0 37855000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 582 501 546 5261;5262 7055;7056 7056 2 ACLDTAVENMPSLK Oxidation (M) 1563.7273 0.7272789 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 59.546 59.546 2 4.033E-10 58424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.12 115.49 445770000 0 31032000 0 19239000 31513000 0 0 44590000 40720000 0 100640000 86717000 91320000 583 2524 547 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585 2389 548 5276;5277;5278;5279;5280;5281;5282;5283;5284;5285;5286;5287 7070;7071;7072;7073;7074;7075;7076;7077;7078;7079;7080;7081;7082 7077 11 ACLISLGYDVENDR Unmodified 1623.7563 0.75627084 1544 O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.12 107.12 2 1.8592E-07 104198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.13 87.334 1043000000 177430000 124330000 103340000 79426000 131710000 84505000 113140000 55092000 62812000 0 53086000 0 58131000 586 1544 549 5288;5289;5290;5291;5292;5293;5294;5295;5296;5297;5298;5299;5300 7083;7084;7085;7086;7087;7088;7089;7090;7091;7092;7093;7094;7095 7093 11 ACLISLGYDVENDRQGEAEFNR Unmodified 2555.1711 0.17106445 1544 O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 105.68 105.68 3 1.3276E-08 108157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.358 61.486 206280000 0 0 0 0 0 0 0 62355000 47737000 0 50403000 45789000 0 587 1544 550 5301;5302;5303;5304 7096;7097;7098;7099 7096 4 ACLISMGYDLGEAEFAR Unmodified 1901.8652 0.86516936 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 140.43 140.43 2;3 4.6181E-23 145818 QUIQUE_C1218_190116_001 147.87 131.34 175130000 58796000 56547000 0 38198000 0 21589000 0 0 0 0 0 0 0 588 2381 551 5305;5306;5307;5308;5309;5310;5311;5312;5313 7100;7101;7102;7103;7104;7105;7106;7107;7108;7109;7110 7100 11 ACLISMGYNMGEAEFAR Unmodified 1918.8376 0.8375744 1242 H9KV75 ACTN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 127.66 127.66 2 2.3418E-10 131495 QUIQUE_C1277_190116_001 119.39 97.188 130540000 30295000 43525000 0 24907000 31814000 0 0 0 0 0 0 0 0 589 1242 552 5314;5315;5316;5317 7111;7112;7113;7114;7115 7112 5 ACLSPSQLQK Acetyl (Protein N-term) 1172.586 0.58595803 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0;X6RFQ9;X6RCI6;F8WCG7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 72.349 72.349 2 0.062298 72975 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.486 38.246 53867000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53867000 590 3296 553 5318 7116 7116 0 ACLYAGVK Unmodified 880.44767 0.44767364 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.669 29.669 1;2 0.014048 24625 QUIQUE_C1438_190116_001 86.512 62.326 9911000000 0 0 3036600000 1435300000 1196500000 1383200000 163330000 0 0 0 0 0 2696100000 591 2086 554 5319;5320;5321;5322;5323;5324;5325 7117;7118;7119;7120;7121;7122;7123 7120 6 ACNCLLLK Unmodified 990.49906 0.49905728 1955 P09104;F5H0C8;U3KQQ1 ENO2 Gamma-enolase;Enolase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 40.851 40.851 1;2 0.0035961 37816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.25 77.372 21887000000 1971100000 2665600000 1977600000 1717000000 2236100000 1674000000 2051900000 1369600000 868980000 603290000 1601700000 1410000000 1739700000 592 1955 555 5326;5327;5328;5329;5330;5331;5332;5333;5334;5335;5336;5337;5338;5339 7124;7125;7126;7127;7128;7129;7130;7131;7132;7133;7134;7135;7136;7137;7138;7139;7140;7141;7142;7143;7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;7153;7154;7155;7156;7157;7158;7159;7160;7161;7162;7163;7164 7147 40 ACNDATLVQITSNMDSVGR Unmodified 2050.9412 0.94118785 4207 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251820000 232490000 265600000 605 2527 568 5438;5439;5440;5441;5442;5443;5444;5445 7276;7277;7278;7279;7280;7281;7282;7283 7280 8 ACVIHGTDLK Unmodified 1112.5648 0.56482866 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.026 21.026 2 1.7349E-05 13873 QUIQUE_C1368_190116_001 147.36 102.28 1577400000 224060000 203770000 352870000 256390000 0 135730000 267260000 0 0 0 137360000 0 0 606 1371 569 5446;5447;5448;5449;5450;5451;5452 7284;7285;7286;7287;7288;7289;7290;7291;7292 7287 8 ACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFAR Unmodified 3598.7726 0.77259619 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 143.84 143.84 4;5 2.2423E-26 148774 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.147 88.994 1226800000 0 123010000 0 0 0 0 60930000 227920000 305840000 0 61424000 75250000 372380000 607 1371 570 5453;5454;5455;5456;5457;5458;5459;5460;5461;5462;5463 7293;7294;7295;7296;7297;7298;7299;7300;7301;7302;7303;7304;7305 7304 13 ACVMMQGR Unmodified 951.40886 0.40886207 1786 P00491;G3V5M2;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.625 21.625 2 0.0054877 14331 QUIQUE_C1277_190116_001 105.27 69.636 420950000 0 84265000 0 0 0 0 0 105770000 80089000 0 90542000 0 60283000 608 1786 571 5464;5465;5466;5467;5468;5469 7306;7307;7308;7309;7310;7311 7306 5 ACVTDSTGVSNCK Unmodified 1397.5915 0.5915137 2809 P78369 CLDN10 Claudin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.849 20.849 2 0.00041971 14026 QUIQUE_C1576_190116_001 92.239 73.261 212360000 29918000 0 31198000 0 0 0 24628000 24137000 43635000 0 0 24075000 34766000 609 2809 572 5470;5471;5472;5473;5474;5475;5476;5477 7312;7313;7314;7315;7316;7317;7318;7319 7314 8 ACWVLHYFCEVK Unmodified 1610.7374 0.73739007 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 107.28 107.28 2;3 0.00025256 112105 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.66 115.68 191410000 0 0 0 27877000 0 0 47476000 0 0 0 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5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;5502;5503;5504;5505;5506;5507;5508;5509;5510;5511;5512;5513;5514 7342;7343;7344;7345;7346;7347;7348;7349;7350;7351;7352;7353;7354;7355;7356;7357;7358;7359;7360;7361;7362 7350 20 ACYLSINPQKDETLETEK Unmodified 2138.0201 0.02014968 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.267 71.267 2;3 6.4696E-104 71628 QUIQUE_DMIX5_190116_001 239.19 225.53 6800800000 456760000 593220000 541880000 448610000 514550000 452270000 618600000 431900000 534350000 184380000 714990000 565570000 743740000 613 2716 576 5515;5516;5517;5518;5519;5520;5521;5522;5523;5524;5525;5526;5527;5528;5529;5530;5531;5532;5533;5534;5535;5536;5537;5538;5539;5540 7363;7364;7365;7366;7367;7368;7369;7370;7371;7372;7373;7374;7375;7376;7377;7378;7379;7380;7381;7382;7383;7384;7385;7386;7387;7388;7389;7390;7391;7392;7393;7394;7395;7396;7397;7398;7399;7400;7401;7402 7395 39 ADAASQVLLGSGLTILSQPLMYVK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2532.3509 0.35092629 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 1 1 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 177.43 177.43 2;3 1.8993E-31 181077 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.44 123.34 1446400000 10999000 144060000 85111000 49472000 159930000 13049000 185940000 162330000 159020000 4231100 197640000 263270000 11328000 614 4650 577 5541;5542;5543;5544;5545;5546;5547;5548;5549;5550;5551;5552;5553;5554;5555;5556;5557;5558;5559;5560;5561;5562 7403;7404;7405;7406;7407;7408;7409;7410;7411;7412;7413;7414;7415;7416;7417;7418;7419;7420;7421;7422;7423;7424;7425;7426;7427;7428 7421 3063 25 ADAASQVLLGSGLTILSQPLMYVK Acetyl (Protein N-term) 2516.356 0.35601167 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 1 0 0 2 1 2 1 2 3 2 2 2 2 1 2 179.37 179.37 2;3 1.406E-75 184483 QUIQUE_C1438_190116_001 175.61 162.25 5234800000 421570000 42157000 117260000 86550000 348460000 0 707230000 775410000 583500000 57321000 1246300000 410330000 438710000 615 4650 577 5563;5564;5565;5566;5567;5568;5569;5570;5571;5572;5573;5574;5575;5576;5577;5578;5579;5580;5581;5582;5583;5584 7429;7430;7431;7432;7433;7434;7435;7436;7437;7438;7439;7440;7441;7442;7443;7444;7445;7446;7447;7448;7449;7450;7451;7452;7453;7454;7455 7439 26 ADAECYTAMK Oxidation (M) 1174.4635 0.46345964 1696 O94905;E5RHW4 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 1 0 1 1 18.459 18.459 2 0.0069253 11085 QUIQUE_C1218_190116_001 76.1 64.379 43081000 21827000 0 0 21254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 616 1696 578 5585;5586 7456;7457 7456 930 2 ADAEDLLDSFLSNILQDCR Unmodified 2194.0212 0.021212312 3947 Q96T76;H7C1W5 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 178.6 178.6 2 0.00018011 181869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.591 84.799 6079600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6079600 617 3947 579 5587 7458 7458 1 ADAEGESDLENSR Unmodified 1391.5801 0.58008061 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.289 25.289 2 1.5852E-07 18755 QUIQUE_C1368_190116_001 166.86 139.61 1034000000 67181000 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yes no 1 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 175.31 175.31 2;3 1.0624E-13 179482 QUIQUE_C1218_190116_001 103.39 96.807 51130000 5899600 11757000 2189500 0 12005000 0 0 4138400 5662200 0 0 6578000 2900600 620 2446 582 5625;5626;5627;5628;5629;5630;5631;5632;5633;5634 7501;7502;7503;7504;7505;7506;7507;7508;7509;7510;7511 7502 10 ADAGFVYSEAVASHYMR Unmodified 1872.8465 0.84648283 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.964 99.964 3 0.0019931 101834 QUIQUE_C1403_190116_001 52.52 43.774 351260000 66692000 74936000 0 63840000 0 0 58487000 0 0 32652000 0 54651000 0 621 472;1460 583 5635;5636;5637;5638;5639;5640 7512;7513;7514;7515;7516;7517;7518 7515 6 ADAGPSGQGDSVSIGK Unmodified 1444.6794 0.67940073 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.999 30.999 2 2.8027E-06 26159 QUIQUE_C1576_190116_001 107.17 94.376 1075000000 100120000 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7531;7532;7533;7534;7535;7536;7537;7538;7539;7540;7541;7542;7543;7544;7545;7546;7547;7548;7549;7550;7551;7552;7553;7554;7555;7556;7557;7558;7559;7560;7561;7562;7563;7564;7565;7566;7567 7554 31 ADATNVNNWHWTER Unmodified 1712.7655 0.76553039 1730 O95433;G3V3W9 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 66.345 66.345 2 1.6572E-17 67483 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 95.738 232880000 22616000 0 31844000 33260000 0 34635000 45538000 0 29978000 0 0 0 35004000 624 1730 586 5680;5681;5682;5683;5684;5685;5686;5687 7568;7569;7570;7571;7572;7573;7574;7575;7576 7568 8 ADAVQDSEMVELVELEIR Unmodified 2044.9987 0.99868596 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 156.49 156.49 3 1.3416E-05 161272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.768 71.225 140620000 18873000 0 0 0 16931000 0 0 14948000 23622000 6408400 25469000 34366000 0 625 2529 587 5688;5689;5690;5691;5692;5693;5694;5695;5696;5697 7577;7578;7579;7580;7581;7582;7583;7584;7585;7586;7587 7581 9 ADAWEEIRR Acetyl (Protein N-term) 1186.5731 0.57308516 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.277 81.277 2 0.0067219 81556 QUIQUE_C1563_190116_001 101.72 77.691 333540000 0 43693000 43588000 0 43780000 45158000 49171000 0 47950000 0 60196000 0 0 626 1692 588 5698;5699;5700;5701;5702;5703;5704 7588;7589;7590;7591;7592;7593;7594 7591 1 ADCASGIFLAAEK Unmodified 1351.6442 0.6442012 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.748 79.748 2 0.0033944 81191 QUIQUE_C1576_190116_001 71.555 58.435 402830000 61112000 62906000 41926000 0 0 0 53761000 30500000 0 0 59855000 50873000 41893000 627 1548 589 5705;5706;5707;5708;5709;5710;5711;5712 7595;7596;7597;7598;7599;7600;7601;7602 7598 5 ADCLVPSEIR Unmodified 1158.5703 0.57030797 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;F8W9E5;Q99719;E7EX32;E7EQM7 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 62.892 62.892 2 0.014657 61685 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Unmodified 2059.9264 0.92644899 2196 P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 161.71 161.71 2 0.056829 167072 QUIQUE_C1368_190116_001 58.508 44.829 36990000 0 0 36990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 631 2196 593 5724 7618 7618 1 ADDADEFGYSR Unmodified 1244.4946 0.49456007 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.123 48.123 2 0.0020261 45475 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.896 70.088 531910000 36899000 0 45089000 55643000 59431000 50861000 39065000 0 50110000 19341000 66127000 50641000 58706000 632 3432 594 5725;5726;5727;5728;5729;5730;5731;5732;5733;5734;5735;5736 7619;7620;7621;7622;7623;7624;7625;7626;7627;7628;7629;7630 7626 11 ADDDDVVVK Unmodified 974.45566 0.45565537 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 22.09 22.09 2 0.015188 15489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.494 26.469 54092000 0 0 0 0 0 0 0 54092000 0 0 0 0 0 633 4606 595 5737 7631 7631 1 ADDGRPFPQVIK Unmodified 1341.7041 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Serum albumin yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 1 1 2 20.922 20.922 2;3 2.9134E-40 14221 QUIQUE_C1218_190116_001 213.84 195.95 4958800000 403990000 493470000 472720000 599760000 0 963150000 879210000 0 86413000 168270000 155220000 150450000 586140000 + 638 769 600 5779;5780;5781;5782;5783;5784;5785;5786;5787;5788;5789;5790;5791;5792;5793;5794 7701;7702;7703;7704;7705;7706;7707;7708;7709;7710;7711;7712;7713;7714;7715;7716 7701 12 ADDKETCFAEEGKK Unmodified 1626.7196 0.71955098 769 CON__P02768-1;P02768;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 2 3 3 2 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 14.512 14.512 2;3;4 2.689E-191 5933 QUIQUE_C1563_190116_001 278.27 260.21 110160000000 9448500000 10336000000 4177800000 9569900000 22547000000 10958000000 10588000000 1515600000 6622700000 1228700000 7338500000 5509600000 10325000000 + 639 769 601 5795;5796;5797;5798;5799;5800;5801;5802;5803;5804;5805;5806;5807;5808;5809;5810;5811;5812;5813;5814;5815;5816;5817;5818;5819;5820;5821;5822;5823;5824;5825;5826;5827;5828;5829;5830;5831 7717;7718;7719;7720;7721;7722;7723;7724;7725;7726;7727;7728;7729;7730;7731;7732;7733;7734;7735;7736;7737;7738;7739;7740;7741;7742;7743;7744;7745;7746;7747;7748;7749;7750;7751;7752;7753;7754;7755;7756;7757 7733 40 ADDKLIAEEGVDSLNVK Unmodified 1814.9262 0.92617294 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 2 2 81.859 81.859 2;3 1.4588E-21 83454 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.65 122.51 366070000 0 53558000 0 0 0 0 0 0 119320000 0 131240000 61960000 0 640 1713 602 5832;5833;5834;5835;5836;5837;5838 7758;7759;7760;7761;7762;7763;7764;7765 7759 8 ADDLDFETGDAGASATFPMQCSALR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2703.1429 0.14286037 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 142.33 142.33 3 9.927E-07 146578 QUIQUE_C1277_190116_001 56.298 53.612 277260000 30628000 39607000 0 0 34706000 0 0 34900000 39518000 0 0 41433000 56466000 641 2786 603 5839;5840;5841;5842;5843;5844;5845 7766;7767;7768;7769;7770;7771;7772 7767 2233 7 ADDLDFETGDAGASATFPMQCSALR Acetyl (Protein N-term) 2687.1479 0.14794574 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 154.87 154.87 2;3 1.9175E-23 160237 QUIQUE_C1368_190116_001 153.95 143.32 198290000 41479000 50969000 15914000 0 0 0 0 42077000 47849000 0 0 0 0 642 2786 603 5846;5847;5848;5849;5850 7773;7774;7775;7776;7777 7775 5 ADDLEPIMELGR Unmodified 1357.6548 0.65476588 2606 P52564;K7EIW3;A0A0A0MRF7 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 112.68 112.68 2 0.0042744 116202 QUIQUE_C1403_190116_001 69.672 53.79 80141000 0 21149000 0 32949000 0 0 0 0 0 0 26043000 0 0 643 2606 604 5851;5852;5853 7778;7779;7780 7779 2 ADDPSAADRNVEIWK Acetyl (Protein N-term) 1727.8115 0.81147753 2755 P62495;D6RCB3 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 1 0 1 1 1 1 88.967 88.967 2 0.012617 90636 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.225 38.891 153660000 0 0 0 0 0 0 0 57657000 0 0 51027000 44978000 0 644 2755 605 5854;5855;5856 7781;7782;7783 7783 3 ADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVK Unmodified 2739.2334 0.23338993 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 153.14 153.14 2;3 1.652E-83 160201 QUIQUE_DMIX5_190116_001 213.49 205.71 6733200000 555580000 725790000 566190000 670820000 737170000 531600000 733700000 437490000 593420000 166380000 707240000 153840000 153950000 645 50 606 5857;5858;5859;5860;5861;5862;5863;5864;5865;5866;5867;5868;5869;5870;5871;5872;5873;5874;5875;5876;5877;5878;5879;5880 7784;7785;7786;7787;7788;7789;7790;7791;7792;7793;7794;7795;7796;7797;7798;7799;7800;7801;7802;7803;7804;7805;7806;7807;7808;7809 7807 23 ADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVK Oxidation (M) 2755.2283 0.22830455 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 139.64 139.64 2;3 2.6269E-158 142473 QUIQUE_DMIX1_190116_001 216.99 208.17 2111400000 0 208440000 143630000 166290000 32802000 133860000 137520000 221450000 214930000 99379000 301270000 231240000 220570000 646 50 606 5881;5882;5883;5884;5885;5886;5887;5888;5889;5890;5891;5892;5893;5894;5895;5896;5897;5898;5899;5900;5901;5902;5903;5904 7810;7811;7812;7813;7814;7815;7816;7817;7818;7819;7820;7821;7822;7823;7824;7825;7826;7827;7828;7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;7836;7837;7838;7839 7825 22 30 ADDPTMGEGPDK Oxidation (M) 1247.4976 0.49759654 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.977 16.977 2 2.3881E-05 9341 QUIQUE_C1368_190116_001 129.7 93.009 2271500000 188910000 273920000 235730000 173360000 127080000 130990000 158640000 98333000 137980000 127250000 229300000 182570000 207470000 647 273;342 607 5905;5906;5907;5908;5909;5910;5911;5912;5913;5914;5915;5916;5917 7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7847;7848;7849;7850;7851;7852;7853;7854;7855 7843 198 16 ADDPTMGEGPDK Unmodified 1231.5027 0.50268192 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.939 23.939 2 3.8192E-14 17360 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.31 138.92 5927700000 472000000 606920000 607530000 485650000 519750000 393480000 740020000 168300000 214530000 199390000 577800000 488700000 453630000 648 273;342 607 5918;5919;5920;5921;5922;5923;5924;5925;5926;5927;5928;5929;5930 7856;7857;7858;7859;7860;7861;7862;7863;7864;7865;7866;7867;7868;7869;7870;7871;7872;7873;7874 7872 17 ADDTFEALCIEPFSSPPELPDVMKPQDSGSSANEQAVQ Unmodified 4105.8409 0.84087127 3132 Q15370;B8ZZU8;I3L0M9 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 162.97 162.97 3 0.0025138 166964 QUIQUE_C1277_190116_001 32.233 27.789 19977000 0 19977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 649 3132 608 5931 7875 7875 1 ADDVDQQQTTNTVEEPLDLIR Acetyl (Protein N-term) 2441.1558 0.15579154 2750 P62310 LSM3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 yes yes 1 0 0 1 1 1 146.55 146.55 2 9.9244E-40 153667 QUIQUE_C1438_190116_001 142.97 130.42 27889000 0 27889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 650 2750 609 5932;5933;5934 7876;7877;7878 7877 3 ADDYIEITGAGGK Unmodified 1308.6198 0.61976058 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.607 65.607 2 0.00041511 65179 QUIQUE_C1368_190116_001 96.113 86.775 270970000 0 0 126520000 0 0 0 0 0 0 51944000 46380000 0 46126000 651 4598 610 5935;5936;5937;5938 7879;7880;7881;7882 7879 3 ADEALFLLLHNEMVSGVYK Acetyl (Protein N-term) 2190.1031 0.10309145 3482 Q86SZ2;G3V2H7;G3V4C3 TRAPPC6B Trafficking protein particle complex subunit 6B yes no 1 0 0 2 1 1 1 2 1 169.83 169.83 2;3 1.0513E-28 174489 QUIQUE_C1218_190116_001 145.52 132.12 354350000 81578000 51566000 0 0 31811000 0 0 43766000 0 0 113600000 0 32029000 652 3482 611 5939;5940;5941;5942;5943;5944;5945;5946 7883;7884;7885;7886;7887;7888;7889;7890 7884 5 ADEALFLLLHNEMVSGVYK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2206.098 0.09800607 3482 Q86SZ2;G3V2H7;G3V4C3 TRAPPC6B Trafficking protein particle complex subunit 6B yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.03 163.03 2;3 5.6702E-08 167635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.37 95.206 233560000 0 23590000 27835000 18029000 25750000 18844000 18036000 0 31566000 0 46288000 0 23618000 653 3482 611 5947;5948;5949;5950;5951;5952;5953;5954;5955 7891;7892;7893;7894;7895;7896;7897;7898;7899 7897 2671 8 ADEANDNLFR Unmodified 1163.5207 0.52071524 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 46.963 46.963 2 0.013076 44707 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.305 47.27 39430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39430000 0 0 654 119 612 5956;5957;5958 7900;7901;7902 7902 3 ADEASELACPTPK Unmodified 1387.6289 0.62894506 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.873 39.873 2 4.4846E-06 36086 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.71 99.453 522790000 48343000 58925000 93473000 0 60724000 67187000 77751000 21178000 31016000 13912000 0 50285000 0 655 2524 613 5959;5960;5961;5962;5963;5964;5965;5966;5967;5968;5969;5970 7903;7904;7905;7906;7907;7908;7909;7910;7911;7912;7913;7914 7910 11 ADEAYLIGR Unmodified 1006.5084 0.50835964 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.555 56.555 2 0.0010141 53950 QUIQUE_C1563_190116_001 107.66 80.14 439060000 76473000 0 89947000 0 0 91985000 81455000 0 0 52703000 0 0 46497000 656 2026 614 5971;5972;5973;5974;5975;5976;5977;5978;5979 7915;7916;7917;7918;7919;7920;7921;7922;7923;7924 7918 10 ADEDGEGIHPSAPHR Acetyl (Protein N-term) 1628.7179 0.7179115 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7;A0A2R8Y871;H7C603 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 1 0 0 1 1 1 1 30.699 30.699 3 0.00051544 24736 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.403 46.202 218160000 64886000 0 0 0 0 0 0 46469000 0 34747000 72062000 0 0 657 3899 615 5980;5981;5982;5983 7925;7926;7927;7928 7928 4 ADEDPIMGFHQMFLLK Oxidation (M) 1906.8957 0.89574121 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 126.28 126.28 3 9.6333E-09 134560 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.24 105.12 1185400000 54409000 77569000 62421000 38213000 49236000 0 60341000 192040000 199250000 34104000 204960000 76027000 136820000 658 2734 616 5984;5985;5986;5987;5988;5989;5990;5991;5992;5993;5994;5995;5996;5997;5998 7929;7930;7931;7932;7933;7934;7935;7936;7937;7938;7939;7940;7941;7942;7943;7944;7945;7946;7947;7948;7949 7941 2164;2165 21 ADEDPIMGFHQMFLLK Unmodified 1890.9008 0.90082659 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 137.69 137.69 2;3 5.5839E-06 142658 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.3 90.488 4086500000 181590000 322670000 250250000 91876000 188430000 155850000 246330000 405890000 570690000 58289000 595740000 421000000 597910000 659 2734 616 5999;6000;6001;6002;6003;6004;6005;6006;6007;6008;6009;6010;6011;6012;6013;6014;6015;6016;6017 7950;7951;7952;7953;7954;7955;7956;7957;7958;7959;7960;7961;7962;7963;7964;7965;7966;7967;7968;7969;7970;7971;7972;7973;7974;7975;7976 7976 25 ADEDPIMGFHQMFLLK 2 Oxidation (M) 1922.8907 0.89065583 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 105.33 105.33 2;3 0.015648 109070 QUIQUE_C1368_190116_001 51.03 42.944 272650000 0 15914000 45053000 0 0 0 0 0 63481000 0 0 63190000 85010000 660 2734 616 6018;6019;6020;6021;6022 7977;7978;7979;7980;7981 7978 2164;2165 2 ADEEKLPPGWEK Acetyl (Protein N-term) 1439.6933 0.69325988 3008 Q13526;K7EMU7;O15428 PIN1;PIN1P1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1;Putative PIN1-like protein yes no 1 0 1 1 1 1 2 2 1 2 3 1 2 2 3 71.08 71.08 2 0.00026488 72733 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143 106.41 874140000 0 90167000 53525000 36925000 0 82457000 48733000 116670000 126010000 29548000 186160000 0 103950000 661 3008 617 6023;6024;6025;6026;6027;6028;6029;6030;6031;6032;6033;6034;6035;6036;6037;6038;6039;6040;6041;6042;6043 7982;7983;7984;7985;7986;7987;7988;7989;7990;7991;7992;7993;7994;7995;7996;7997;7998;7999;8000;8001;8002;8003;8004;8005;8006;8007;8008;8009;8010 8005 28 ADEGISFR Unmodified 893.4243 0.42429566 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.057 41.057 2 0.00062707 37271 QUIQUE_C1277_190116_001 152.47 81.111 50022000000 3624400000 3296200000 5254100000 3328100000 4045100000 3122900000 2904000000 4601300000 4828000000 1692800000 4441900000 3826000000 5057000000 662 2904 618 6044;6045;6046;6047;6048;6049;6050;6051;6052;6053;6054;6055;6056 8011;8012;8013;8014;8015;8016;8017;8018;8019;8020;8021;8022;8023;8024;8025;8026;8027;8028;8029;8030;8031;8032;8033;8034;8035;8036;8037 8013 27 ADEHVIDQGDDGDNFYVIER Unmodified 2306.0087 0.0087333705 2069 P13861;H7C1L0 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 92.077 92.077 2;3 5.1474E-102 94137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 201.24 187.21 3517600000 276100000 351640000 325070000 242020000 257600000 249670000 261580000 315230000 207390000 106800000 379770000 244180000 300550000 663 2069 619 6057;6058;6059;6060;6061;6062;6063;6064;6065;6066;6067;6068;6069;6070;6071;6072;6073;6074;6075;6076;6077;6078;6079;6080;6081 8038;8039;8040;8041;8042;8043;8044;8045;8046;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;8055;8056;8057;8058;8059;8060;8061;8062;8063 8056 26 ADELLCWEDSAGHWLYE Unmodified 2092.8837 0.8836562 2979 Q13232;H3BPR2 NME3 Nucleoside diphosphate kinase 3;Nucleoside diphosphate kinase yes no 0 0 0 1 157.02 157.02 2 0.021175 161548 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.57 53.422 28816000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28816000 0 664 2979 620 6082 8064 8064 1 ADETKDEQFEEYVQNFK Unmodified 2118.9382 0.93819419 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 102.77 102.77 2;3 2.3141E-223 105027 QUIQUE_DMIX7_190116_001 320.57 314.3 5605400000 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ADEVVWVR Unmodified 972.50288 0.50288033 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1;H7C278;C9JQM9 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.393 59.393 2 0.0011854 58511 QUIQUE_C1576_190116_001 144.83 93.867 1979900000 120760000 144330000 172260000 151380000 140720000 123750000 180140000 178530000 178660000 78178000 189980000 156800000 164410000 670 2083 626 6146;6147;6148;6149;6150;6151;6152;6153;6154;6155;6156;6157;6158 8139;8140;8141;8142;8143;8144;8145;8146;8147;8148;8149;8150;8151;8152;8153;8154;8155 8148 14 ADFAQACQDAGVR Unmodified 1407.6201 0.62011171 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.861 48.861 2 7.5087E-08 47079 QUIQUE_C1438_190116_001 162.38 155 2184300000 146520000 201800000 240460000 186150000 205150000 0 196860000 146970000 172520000 80781000 212470000 168680000 225890000 671 2026 627 6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170 8156;8157;8158;8159;8160;8161;8162;8163;8164;8165;8166;8167;8168;8169 8162 13 ADFCIIHYAGK Unmodified 1293.6176 0.61759251 2378;2379 P35579;P35580 MYH9;MYH10 Myosin-9;Myosin-10 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 69.258 69.258 2;3 0.00045661 69169 QUIQUE_C1403_190116_001 113.62 90.193 572010000 0 114550000 0 60798000 158040000 0 0 42239000 46751000 0 93895000 55733000 0 672 2378;2379 628 6171;6172;6173;6174;6175;6176;6177;6178;6179;6180 8170;8171;8172;8173;8174;8175;8176;8177;8178;8179;8180 8172 11 ADFDDRVSDEEK Acetyl (Protein N-term) 1466.6161 0.61613177 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 1 0 1 1 1 57.927 57.927 2 0.0010238 56911 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.06 63.748 87765000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49268000 0 38498000 673 2617 629 6181;6182 8181;8182 8182 2 ADFDDRVSDEEKVR Acetyl (Protein N-term) 1721.7857 0.78565671 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 1 0 2 1 59.519 59.519 3 3.5048E-07 57880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.52 88.112 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676 3106 632 6210;6211;6212 8214;8215;8216 8214 2 ADFSGMSQTDLSLSK Unmodified 1585.7294 0.72938739 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 89.657 89.657 2 7.07E-18 90981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.56 116.99 769690000 0 57131000 54602000 80296000 48923000 59535000 48655000 73071000 94144000 56394000 62017000 51943000 82977000 677 2371 633 6213;6214;6215;6216;6217;6218;6219;6220;6221;6222;6223;6224;6225;6226;6227 8217;8218;8219;8220;8221;8222;8223;8224;8225;8226;8227;8228;8229;8230;8231;8232;8233 8224 13 ADFSPFGNSQGPSR Unmodified 1465.6586 0.65860571 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 70.493 70.493 2 0.00019123 71760 QUIQUE_C1218_190116_001 93.839 80.748 149080000 46407000 0 0 0 56029000 0 0 0 0 0 0 0 46642000 678 4148 634 6228;6229;6230;6231 8234;8235;8236;8237 8234 4 ADFVLAANSYDLAIK Unmodified 1609.8352 0.83517309 3062 Q14318;U3KQ64;M0R2K9 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 124.71 124.71 2 0.00027657 121646 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.226 58.35 55115000 0 0 0 0 0 22468000 0 0 0 32647000 0 0 0 679 3062 635 6232;6233 8238;8239 8239 1 ADGDLTLLWAEWQGR Unmodified 1729.8424 0.84238373 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4;G3V5J0 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 1 156.5 156.5 2 1.5484E-06 159130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.39 129.18 28436000 0 0 0 0 0 0 0 23844000 0 4592300 0 0 0 680 4581 636 6234;6235 8240;8241 8240 2 ADGELNVDSLITR Acetyl (Protein N-term) 1443.7205 0.72053726 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.3 138.3 2 3.436E-10 143089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.79 126.76 1649000000 0 0 165890000 0 163620000 196300000 159160000 167770000 153500000 104070000 178560000 178880000 181230000 681 2740 637 6236;6237;6238;6239;6240;6241;6242;6243;6244;6245;6246 8242;8243;8244;8245;8246;8247;8248;8249;8250;8251;8252;8253;8254;8255;8256;8257 8252 16 ADGELNVDSLITR Unmodified 1401.71 0.70997257 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 60.326 60.326 2 0.017021 59054 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.683 0 149070000 0 72723000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76347000 0 682 2740 637 6247;6248 8258;8259 8259 2 ADGFGDNPFYHCLVAEILPAPGK Unmodified 2487.1893 0.18928069 3848 Q96F10;I3L0W4 SAT2 Diamine acetyltransferase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.39 155.39 3 7.5112E-05 161190 QUIQUE_C1218_190116_001 52.483 49.834 438490000 38657000 0 49642000 48785000 0 0 0 73989000 74320000 0 72488000 80611000 0 683 3848 638 6249;6250;6251;6252;6253;6254;6255 8260;8261;8262;8263;8264;8265;8266;8267 8261 8 ADGFVNLPDFTVER Unmodified 1578.7678 0.7678218 409 A0A2Q2T6B6;G9CGD6;Q8WWN9;E5RGN6;E5RGB6;E5RJQ7 CNKSR3;IPCEF1 Interactor protein for cytohesin exchange factors 1 yes no 0 0 0 1 130.08 130.08 2 0.016946 134238 QUIQUE_C1277_190116_001 66.267 48.16 42345000 0 42345000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 684 409 639 6256 8268 8268 1 ADGGTQVIDTK Unmodified 1103.5459 0.54586736 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.422 20.422 2 2.5508E-24 13864 QUIQUE_C1218_190116_001 182.46 137.38 10046000000 1101700000 943370000 0 0 946150000 969830000 954400000 755520000 937070000 425640000 1132800000 833460000 1046600000 685 1971 640 6257;6258;6259;6260;6261;6262;6263;6264;6265;6266;6267 8269;8270;8271;8272;8273;8274;8275;8276;8277;8278;8279;8280 8270 12 ADGILVPGGFGIR Unmodified 1270.7034 0.70337105 4267 Q9NRF8 CTPS2 CTP synthase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.6 113.6 2 0.005273 118576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.299 40.74 384000000 31673000 30027000 0 45328000 0 42276000 0 45633000 59360000 0 63545000 0 66159000 686 4267 641 6268;6269;6270;6271;6272;6273;6274;6275 8281;8282;8283;8284;8285;8286;8287;8288;8289 8288 9 ADGLAVIGVLMK Oxidation (M) 1201.674 0.67404476 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RFE7;H0YBE2;E5RG81;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 2 2 103.91 103.91 2 0.0011403 106644 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.522 68.907 1197100000 44795000 70994000 171470000 32457000 238510000 67152000 0 17911000 29028000 17895000 211540000 159000000 136310000 687 1795 642 6276;6277;6278;6279;6280;6281;6282;6283;6284;6285;6286;6287;6288;6289;6290;6291;6292 8290;8291;8292;8293;8294;8295;8296;8297;8298;8299;8300;8301;8302;8303;8304;8305;8306;8307;8308 8304 1019 15 ADGLAVIGVLMK Unmodified 1185.6791 0.67913014 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RFE7;H0YBE2;E5RG81;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.8 132.8 2 5.6381E-05 137558 QUIQUE_DMIX8_190116_001 125.57 112.53 6272900000 0 554910000 556700000 356660000 1053100000 604490000 313460000 0 237110000 139140000 989260000 726780000 741210000 688 1795 642 6293;6294;6295;6296;6297;6298;6299;6300;6301;6302;6303 8309;8310;8311;8312;8313;8314;8315;8316;8317;8318;8319;8320;8321;8322;8323;8324;8325;8326 8326 18 ADGLGAGDVAAVLGPLGLQEVASFVTK Unmodified 2554.3643 0.36426817 4028 Q9BU02 THTPA Thiamine-triphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 172.72 172.72 3 4.0652E-08 174001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.351 50.239 122160000 12504000 19153000 0 0 0 0 23474000 23639000 37950000 5444400 0 0 0 689 4028 643 6304;6305;6306;6307;6308;6309 8327;8328;8329;8330;8331;8332 8330 6 ADGQMPFSCHYPSR Acetyl (Protein N-term) 1693.6977 0.6977101 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 yes yes 1 0 0 1 80.683 80.683 2 0.0044586 82342 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.274 51.255 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 690 4464 644 6310 8333 8333 1 ADGQVAELLLR Acetyl (Protein N-term) 1225.6667 0.6666512 4547 Q9Y285;K7ER16;K7EK06 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 1 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 3 2 2 147.25 147.25 2 0.00010219 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59.597 30.448 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 693 4331 647 6338 8367 8367 1 ADGYVDNLAEAVDLLLQHADK Unmodified 2269.1226 0.12264092 4111 Q9H008 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes yes 0 0 0 3 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 167.92 167.92 2;3 5.9148E-146 172597 QUIQUE_C1218_190116_001 278.2 236.8 30671000000 1956700000 2788500000 3791100000 286650000 2128200000 245860000 3103000000 292070000 6246300000 463530000 3967500000 2806600000 2595400000 694 4111 648 6339;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6346;6347;6348;6349;6350;6351;6352;6353;6354;6355;6356;6357;6358;6359;6360;6361 8368;8369;8370;8371;8372;8373;8374;8375;8376;8377;8378;8379;8380;8381;8382;8383;8384;8385;8386;8387;8388;8389;8390 8369 21 ADHDFVVQEDFMK Unmodified 1579.6977 0.69769333 124 A0A087X2I1;P62333 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 83.233 83.233 2;3 1.4842E-17 85878 QUIQUE_C1218_190116_001 165.66 148.44 901570000 26253000 97688000 38831000 83897000 68817000 71788000 95835000 87553000 91460000 17806000 99378000 77811000 44453000 695 124 649 6362;6363;6364;6365;6366;6367;6368;6369;6370;6371;6372;6373;6374;6375;6376;6377;6378;6379;6380;6381;6382;6383 8391;8392;8393;8394;8395;8396;8397;8398;8399;8400;8401;8402;8403;8404;8405;8406;8407;8408;8409;8410;8411;8412;8413;8414;8415 8391 22 ADHESQRRLLEEELR Unmodified 1879.95 0.9500367 4687 yes no 0 0 2 1 16.563 16.563 4 0.028223 8670 QUIQUE_C1277_190116_001 48.704 32.565 38415000 0 38415000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 696 4687 650 6384 8416 8416 0 ADHPPAEVTSHAASGAK Unmodified 1644.7856 0.78559713 4427 Q9UHB6;F8VRN8;F8VTU2 LIMA1 LIM domain and actin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 3 1 12.142 12.142 3 0.0045787 4030 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.145 50.585 26583000 0 0 0 0 4958700 0 1819400 0 17706000 0 0 0 2099200 697 4427 651 6385;6386;6387;6388;6389;6390 8417;8418;8419;8420;8421;8422 8422 4 ADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLR Unmodified 2995.4709 0.47093486 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 133.1 133.1 2;3 6.0179E-144 136936 QUIQUE_C1403_190116_001 256.25 244.61 2245500000 402130000 475370000 0 567380000 0 30543000 0 303290000 327360000 139430000 0 0 0 698 225 652 6391;6392;6393;6394;6395;6396;6397;6398;6399 8423;8424;8425;8426;8427;8428;8429;8430;8431;8432;8433 8427 11 ADHSFSDGVPSDSVEAAK Acetyl (Protein N-term) 1859.8174 0.81735077 3972 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;E9PS34;E9PNJ7;E9PKT8;E9PNW0;E9PJJ2;E9PP22;E9PKI2;C9J1B1 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 1 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 70.457 70.457 2 4.1939E-141 69621 QUIQUE_C1277_190116_001 234.82 213.19 1406200000 144210000 116540000 0 0 0 0 0 157650000 196930000 78998000 203850000 184120000 323890000 699 3972 653 6400;6401;6402;6403;6404;6405;6406;6407;6408;6409;6410;6411;6412 8434;8435;8436;8437;8438;8439;8440;8441;8442;8443;8444;8445;8446;8447;8448;8449 8435 16 ADHTLSSLEPAYSAK Unmodified 1588.7733 0.77330111 3336 Q5VW32;F5GXQ0 BROX BRO1 domain-containing protein BROX yes no 0 0 0 1 1 54.278 54.278 2 5.0679E-05 52721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.36 109.41 120790000 0 0 0 0 0 0 59050000 0 0 0 61745000 0 0 700 3336 654 6413;6414 8450;8451 8451 0 ADHVQSLAQLENLCK Acetyl (Protein N-term) 1766.8621 0.8621329 4447 Q9UIA9 XPO7 Exportin-7 yes yes 1 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 109.61 109.61 2;3 5.1897E-25 114559 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.09 157.22 1003400000 92021000 109740000 78027000 71429000 66096000 53750000 127050000 82032000 69409000 0 90296000 87737000 75771000 701 4447 655 6415;6416;6417;6418;6419;6420;6421;6422;6423;6424;6425;6426;6427;6428;6429;6430 8452;8453;8454;8455;8456;8457;8458;8459;8460;8461;8462;8463;8464;8465;8466;8467 8465 13 ADIAVPLVFTK Unmodified 1172.6805 0.68051035 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 111.13 111.13 2 0.0055397 113414 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.261 70.306 1117500000 263460000 202790000 0 0 0 175620000 0 195660000 219790000 60192000 0 0 0 702 3889 656 6431;6432;6433;6434;6435;6436 8468;8469;8470;8471;8472;8473 8471 4 ADIDVSGPSVDTDAPDLDIEGPEGK Unmodified 2511.15 0.15003746 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 117.53 117.53 2 1.9659E-71 119831 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.07 161.03 60389000 0 0 0 0 0 0 0 60389000 0 0 0 0 0 703 2935 657 6437 8474 8474 1 ADIEVACYGYEGIDAVK Unmodified 1871.8611 0.86112984 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 108.89 108.89 2 0.011194 105636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.042 51.136 18477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18477000 0 0 0 704 1883 658 6438 8475 8475 1 ADIFMFDEPSSYLDVK Unmodified 1875.8601 0.86006721 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.27 150.27 2 1.169E-06 155132 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.39 78.442 462580000 44636000 38442000 47486000 40442000 35993000 0 48905000 40834000 41033000 12037000 53098000 59674000 0 705 2718 659 6439;6440;6441;6442;6443;6444;6445;6446;6447;6448;6449 8476;8477;8478;8479;8480;8481;8482;8483;8484;8485;8486;8487;8488 8485 13 ADIFVDPVLHTACALDIK Unmodified 1997.0292 0.029198224 3765 Q92896 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 131.33 131.33 3 0.0014045 135730 QUIQUE_C1403_190116_001 53.278 46.387 87605000 0 0 30648000 29934000 0 0 0 0 0 0 27023000 0 0 706 3765 660 6450;6451;6452 8489;8490;8491 8490 3 ADIGTPSNFQHIGHVGWDPNTGFDLNNLDPELK Unmodified 3617.7175 0.71752415 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.68 139.68 4 8.4362E-09 144418 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.383 51.224 405810000 0 0 0 80958000 59167000 0 0 86027000 92013000 0 0 0 87642000 707 1401 661 6453;6454;6455;6456;6457 8492;8493;8494;8495;8496;8497 8495 6 ADIIHACDIVEDAAIAYGYNNIQMTLPK Unmodified 3118.5104 0.51035684 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 160.75 160.75 3 2.5619E-08 165114 QUIQUE_C1277_190116_001 59.011 47.045 64699000 0 64699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 708 4284 662 6458 8498 8498 1 ADIIHACDIVEDAAIAYGYNNIQMTLPK Oxidation (M) 3134.5053 0.50527146 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 1 0 1 156.69 156.69 3 0.0016698 161030 QUIQUE_C1277_190116_001 46.695 40.975 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 709 4284 662 6459 8499 8499 2900 1 ADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLK Unmodified 3287.602 0.60200861 1440 O14744;H0YJD3 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.56 167.56 3 6.0394E-64 171051 QUIQUE_C1277_190116_001 147.41 141.69 368210000 74219000 166360000 0 56162000 0 71476000 0 0 0 0 0 0 0 710 1440 663 6460;6461;6462;6463 8500;8501;8502;8503 8501 4 ADIIYPGHGPVIHNAEAK Unmodified 1900.9795 0.97954591 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 43.435 43.435 3 0.0098743 40209 QUIQUE_C1576_190116_001 31.836 18.208 81336000 0 0 0 35415000 0 0 23778000 22143000 0 0 0 0 0 711 3255 664 6464;6465;6466 8504;8505;8506 8505 2 ADILYFDGDDAISYR Unmodified 1732.7944 0.79443049 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 127.95 127.95 2 1.0409E-05 131734 QUIQUE_C1403_190116_001 102.66 77.808 296870000 57355000 43685000 76463000 33406000 0 28140000 0 0 0 0 0 28435000 29381000 712 2807 665 6467;6468;6469;6470;6471;6472;6473;6474;6475;6476;6477 8507;8508;8509;8510;8511;8512;8513;8514;8515;8516;8517 8512 8 ADIQLLVYTIDDLIDK Unmodified 1846.9928 0.99279594 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 173.04 173.04 2;3 2.368E-44 177429 QUIQUE_C1218_190116_001 182.02 144.84 1992300000 143330000 103760000 261060000 42724000 134110000 31886000 261560000 42275000 137120000 30357000 500280000 197330000 106510000 713 4297 666 6478;6479;6480;6481;6482;6483;6484;6485;6486;6487;6488;6489;6490;6491;6492;6493;6494 8518;8519;8520;8521;8522;8523;8524;8525;8526;8527;8528;8529;8530;8531;8532;8533;8534;8535 8519 18 ADIQMPFTCSVTYYGPSGQK Unmodified 2249.0133 0.013290163 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 119.84 119.84 2 1.4435E-05 123703 QUIQUE_C1277_190116_001 96.247 83.887 208260000 0 52825000 0 27723000 38323000 0 46864000 0 0 0 42524000 0 0 714 3023 667 6495;6496;6497;6498;6499 8536;8537;8538;8539;8540 8536 5 ADISGNITK Unmodified 917.48181 0.48181054 4344 Q9NZD2;F5H0U5 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 21.931 21.931 2 0.053215 14898 QUIQUE_C1403_190116_001 49.85 20.474 100610000 0 0 0 100610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 715 4344 668 6500 8541 8541 1 ADIVHAFLSIPSLSHSVLSQTSFR Unmodified 2611.3758 0.37583591 3683 Q8TDC3;J3KNK0 BRSK1 Serine/threonine-protein kinase BRSK1 yes no 0 0 0 1 152.9 152.9 4 0.025079 157968 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.927 0 20183000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20183000 716 3683 669 6501 8542 8542 1 ADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPLHLSAR Unmodified 3107.6 0.5999752 2953 Q12955 ANK3 Ankyrin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 138.3 138.3 3 1.6885E-30 142926 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 84.43 151320000 0 43244000 0 0 47775000 0 0 0 0 0 0 0 60298000 717 2953 670 6502;6503;6504 8543;8544;8545 8543 3 ADIWALGCLLYK Unmodified 1421.7377 0.73770765 3212 Q2M2I8;E9PG46;K4DI97;Q9NSY1 AAK1;BMP2K AP2-associated protein kinase 1;BMP-2-inducible protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.23 152.23 2 0.00033334 159152 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.84 96.53 781160000 52243000 77082000 58107000 46628000 68231000 57038000 59074000 57746000 60166000 23044000 67900000 82647000 71252000 718 3212 671 6505;6506;6507;6508;6509;6510;6511;6512;6513;6514;6515;6516;6517 8546;8547;8548;8549;8550;8551;8552;8553;8554;8555;8556;8557;8558;8559;8560;8561 8558 16 ADIWSFGITAIELATGAAPYHK Unmodified 2331.1899 0.18993262 1746 O95747;C9JIG9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 0 0 0 1 1 1 171.06 171.06 3 2.9667E-05 178285 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.366 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6525;6526;6527;6528;6529;6530;6531;6532;6533;6534;6535;6536 8569;8570;8571;8572;8573;8574;8575;8576;8577;8578;8579;8580 8576 12 ADKDYHFKVDNDENEHQLSLR Unmodified 2572.1942 0.19424273 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 2 1 1 46.447 46.447 5 0.0012662 44522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.359 52.306 368420000 0 0 0 0 0 0 0 261220000 0 0 0 0 107200000 722 1907 675 6537;6538 8581;8582 8581 1 ADKEAAFDDAVEER Acetyl (Protein N-term) 1606.7111 0.71109479 2933 Q09028;E9PNS6;E9PNS2;E9PIC4 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.262 74.262 2 9.6657E-14 74571 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.47 132.26 1339300000 121990000 0 115910000 90208000 113120000 84392000 91130000 162280000 111650000 62504000 153640000 127530000 104960000 723 2933 676 6539;6540;6541;6542;6543;6544;6545;6546;6547;6548;6549;6550 8583;8584;8585;8586;8587;8588;8589;8590;8591;8592;8593;8594;8595;8596;8597;8598;8599 8593 16 ADKEAGGSDGPR Acetyl (Protein N-term) 1200.5371 0.53709359 1521 O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A yes yes 1 0 1 2 2 1 1 2 1 2 1 13.436 13.436 2 6.9535E-07 5384 QUIQUE_C1403_190116_001 145.99 131.32 278510000 0 20957000 0 9280300 8915500 0 0 107620000 50408000 24532000 0 37338000 19453000 724 1521 677 6551;6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;6560;6561;6562 8600;8601;8602;8603;8604;8605;8606;8607;8608;8609;8610;8611 8602 8 ADKNEVAAEVAK Unmodified 1243.6408 0.64083038 2677 P56192;H0YIP0 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 16.725 16.725 2;3 0.00037182 9710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.44 75.652 550750000 41640000 49216000 39506000 152190000 0 0 37798000 0 129900000 0 0 39927000 60580000 725 2677 678 6563;6564;6565;6566;6567;6568;6569;6570;6571;6572;6573 8612;8613;8614;8615;8616;8617;8618;8619;8620;8621;8622 8618 7 ADLAAIYHER Unmodified 1157.5829 0.58292157 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 44.369 44.369 2;3 0.00029718 40965 QUIQUE_C1368_190116_001 115.71 86.553 2004500000 229800000 259230000 162340000 254900000 182820000 96423000 261060000 131750000 83743000 0 136320000 75730000 130390000 726 3409 679 6574;6575;6576;6577;6578;6579;6580;6581;6582;6583;6584;6585;6586;6587;6588;6589;6590;6591;6592;6593;6594;6595;6596;6597 8623;8624;8625;8626;8627;8628;8629;8630;8631;8632;8633;8634;8635;8636;8637;8638;8639;8640;8641;8642;8643;8644;8645;8646;8647;8648 8628 25 ADLAECNIK Acetyl (Protein N-term) 1074.5016 0.5015597 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 1 0 0 1 71.502 71.502 2 0.044734 67483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.772 30.193 14573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14573000 0 0 0 727 2355 680 6598 8649 8649 1 ADLAEEYSK Unmodified 1024.4713 0.47130543 2793 P68036 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 31.549 31.549 2 0.0010111 26207 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.69 68.902 1343200000 0 319780000 0 0 308310000 0 0 0 211980000 0 245210000 0 257880000 728 2793 681 6599;6600;6601;6602;6603 8650;8651;8652;8653;8654 8654 4 ADLAEEYSKDR Unmodified 1295.5994 0.59935949 2793 P68036 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 29.342 29.342 2;3 0.00090894 24135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.16 100.43 442680000 0 0 0 0 0 0 0 50015000 67783000 0 188120000 136760000 0 729 2793 682 6604;6605;6606;6607;6608;6609 8655;8656;8657;8658;8659;8660;8661;8662;8663 8657 9 ADLANEEKPAIAPPVFVFQK Acetyl (Protein N-term) 2225.1732 0.17321992 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7ENJ2;K7EID7;K7ENB9;K7EPW1 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 138.61 138.61 3 0.0013718 142674 QUIQUE_C1403_190116_001 60.034 55.683 175350000 20387000 0 0 38489000 0 0 0 37740000 0 11754000 32416000 0 34559000 730 665 683 6610;6611;6612;6613;6614;6615;6616 8664;8665;8666;8667;8668;8669;8670 8665 6 ADLATAPPHVTVVR Unmodified 1445.7991 0.79906235 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.658 49.658 2;3 0.0018242 47461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.451 42.936 183500000 0 24349000 36609000 32049000 0 0 0 26830000 35340000 0 0 28324000 0 731 3576 684 6617;6618;6619;6620;6621;6622;6623 8671;8672;8673;8674;8675;8676;8677 8675 4 ADLDKLNIDSIIQR Acetyl (Protein N-term) 1654.889 0.88899957 1041 F8VYE8;P36873;F8VR82;A0A087WYY5 PPP1CC Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit yes no 1 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 139.06 139.06 2;3 1.0256E-21 142002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.14 146.79 3888300000 24418000 328400000 446560000 326780000 358970000 258980000 310670000 288750000 338320000 88227000 463710000 289050000 365450000 732 1041 685 6624;6625;6626;6627;6628;6629;6630;6631;6632;6633;6634;6635;6636;6637;6638;6639;6640;6641;6642;6643;6644;6645;6646 8678;8679;8680;8681;8682;8683;8684;8685;8686;8687;8688;8689;8690;8691;8692;8693;8694;8695;8696;8697;8698;8699;8700;8701;8702;8703 8692 26 ADLDVSGPK Unmodified 900.45526 0.45526144 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 26.702 26.702 2 0.0089591 20795 QUIQUE_C1563_190116_001 77.318 0 1634000000 0 0 140060000 221770000 0 195880000 211880000 435060000 0 194240000 235150000 0 0 733 2935 686 6647;6648;6649;6650;6651;6652;6653;6654 8704;8705;8706;8707;8708;8709;8710;8711 8706 7 ADLEEQLSDEEK Acetyl (Protein N-term) 1446.6362 0.63619851 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;F8WED3 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.59 107.59 2 0.00013087 104213 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.77 97.787 1407400000 136910000 167790000 171500000 172650000 125570000 0 146590000 0 115150000 87764000 75015000 99221000 109240000 734 2492 687 6655;6656;6657;6658;6659;6660;6661;6662;6663;6664;6665 8712;8713;8714;8715;8716;8717;8718;8719;8720;8721;8722;8723 8719 12 ADLEEQLSDEEKVR Acetyl (Protein N-term) 1701.8057 0.80572345 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 1 0 1 1 1 1 98.844 98.844 2 0.00064302 101569 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Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 1 0 3 2 2 2 3 1 2 2 2 1 1 3 3 171.47 171.47 2;3 2.0767E-53 172944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.58 145.64 4519700000 249620000 370410000 473860000 91982000 380940000 120150000 146120000 157800000 662630000 100860000 145100000 1130900000 489340000 + 738 776 690 6684;6685;6686;6687;6688;6689;6690;6691;6692;6693;6694;6695;6696;6697;6698;6699;6700;6701;6702;6703;6704;6705;6706;6707;6708;6709;6710 8744;8745;8746;8747;8748;8749;8750;8751;8752;8753;8754;8755;8756;8757;8758;8759;8760;8761;8762;8763;8764;8765;8766;8767;8768;8769;8770;8771 8760 466 20 ADLEMQIESLTEELAYLKK Oxidation (M) 2239.1294 0.12936578 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 160.41 160.41 3 1.3688E-11 162658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.6 114.72 1739100000 54909000 0 48378000 0 0 0 76691000 368160000 0 0 323940000 867010000 0 + 739 776 691 6711;6712;6713;6714;6715;6716 8772;8773;8774;8775;8776;8777 8775 466 5 ADLEMQIESLTEELAYLKK Unmodified 2223.1345 0.13445116 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 159.2 159.2 3 7.3494E-29 166246 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.4 110.21 1306800000 0 0 0 0 0 0 0 89127000 163890000 0 494510000 259970000 299360000 + 740 776 691 6717;6718;6719;6720;6721 8778;8779;8780;8781;8782;8783;8784 8781 7 ADLESESFRPNLSDPSELLLPDQIEK Unmodified 2941.4557 0.45566195 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.99 137.99 3 4.8507E-51 143809 QUIQUE_C1218_190116_001 146.91 124.78 1562000000 255460000 221080000 0 0 281300000 249750000 0 0 0 0 319760000 234660000 0 741 3597 692 6722;6723;6724;6725;6726;6727 8785;8786;8787;8788;8789;8790 8785 3 ADLGALELWR Unmodified 1142.6084 0.60840804 3957 Q99523 SORT1 Sortilin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.16 125.16 2 0.00062564 128228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 82.358 304130000 31382000 34019000 26657000 26406000 30086000 0 34362000 22710000 34489000 0 38367000 0 25652000 742 3957 693 6728;6729;6730;6731;6732;6733;6734;6735;6736;6737;6738 8791;8792;8793;8794;8795;8796;8797;8798;8799;8800;8801;8802 8799 11 ADLIAYLK Unmodified 905.52222 0.52221879 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.652 93.652 1;2 0.011743 96618 QUIQUE_C1576_190116_001 89.55 33.874 9157500000 1061100000 859010000 758980000 588010000 643480000 591640000 796060000 489410000 704060000 196600000 990000000 700090000 779080000 743 722 694 6739;6740;6741;6742;6743;6744;6745;6746;6747;6748;6749;6750;6751;6752 8803;8804;8805;8806;8807;8808;8809;8810;8811;8812;8813;8814;8815;8816;8817;8818;8819;8820;8821;8822;8823;8824;8825;8826;8827 8815 24 ADLIAYLKK Unmodified 1033.6172 0.61718181 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 1 1 1 66.75 66.75 2 0.02367 66548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.351 42.165 275230000 0 0 0 0 0 0 0 140100000 0 0 135130000 0 0 744 722 695 6753;6754 8828;8829 8828 2 ADLILSYHPPIFR Unmodified 1540.8402 0.84019889 4106 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8831;8832;8833;8834;8835;8836;8837;8838;8839;8840;8841;8842;8843;8844;8845;8846;8847;8848;8849;8850;8851;8852;8853;8854;8855;8856;8857;8858;8859;8860;8861;8862;8863;8864;8865;8866;8867;8868 8840 31 ADLLGIVSELQLK Unmodified 1397.813 0.81298108 3825 Q96CV9;A0A087WY28 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 155.55 155.55 2 0.061692 150470 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.221 60.392 28408000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28408000 0 0 0 747 3825 698 6777 8869 8869 0 ADLLLSTQPGR Unmodified 1169.6404 0.64043645 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5GZI0 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.541 62.541 2 0.00048719 63023 QUIQUE_C1218_190116_001 113.62 54.272 1555400000 240430000 198550000 131150000 177100000 122900000 123220000 154170000 0 60191000 121060000 101650000 72501000 52454000 748 997 699 6778;6779;6780;6781;6782;6783;6784;6785;6786;6787;6788;6789 8870;8871;8872;8873;8874;8875;8876;8877;8878;8879;8880;8881;8882;8883 8870 10 ADLLLSTQPGREEGSPLELER Unmodified 2309.1863 0.18630381 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762 2337 712 6867;6868;6869;6870;6871;6872;6873;6874;6875;6876;6877;6878;6879;6880;6881;6882;6883;6884;6885;6886;6887;6888;6889;6890;6891;6892 8972;8973;8974;8975;8976;8977;8978;8979;8980;8981;8982;8983;8984;8985;8986;8987;8988;8989;8990;8991;8992;8993;8994;8995;8996;8997;8998;8999;9000;9001;9002;9003;9004;9005;9006;9007;9008;9009;9010;9011;9012;9013;9014;9015;9016 9010 45 ADLTSVLTSVMFSPSSK Acetyl (Protein N-term) 1810.9023 0.90226638 1292 J3KTC1 MSI2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 175.55 175.55 2 1.3708E-05 179674 QUIQUE_C1218_190116_001 129.37 112.16 39679000 6612600 6809500 4356900 3733100 6685000 0 0 5993100 0 0 0 0 5488600 763 1292 713 6893;6894;6895;6896;6897;6898;6899 9017;9018;9019;9020;9021;9022;9023;9024 9017 8 ADMETLQR Unmodified 962.44913 0.4491302 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.66 26.66 2 0.030979 21334 QUIQUE_C1218_190116_001 133.81 94.15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 764 2253 714 6900;6901;6902;6903;6904;6905 9025;9026;9027;9028;9029;9030 9025 6 ADMGGAATICSAIVSAAK Unmodified 1692.8175 0.81749089 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.82 111.82 2 5.3778E-07 115479 QUIQUE_C1403_190116_001 126.63 106.5 1444300000 98698000 111290000 227250000 222960000 128110000 0 85459000 181090000 117800000 0 0 116830000 154830000 765 2282 715 6906;6907;6908;6909;6910;6911;6912;6913;6914;6915;6916 9031;9032;9033;9034;9035;9036;9037;9038;9039;9040;9041;9042;9043;9044;9045 9037 14 ADMGGAATICSAIVSAAK Oxidation (M) 1708.8124 0.81240551 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 96.865 96.865 2 0.00037309 99553 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.888 65.089 416200000 0 0 0 0 0 0 0 96266000 90945000 0 120840000 0 108150000 766 2282 715 6917;6918;6919;6920;6921;6922 9046;9047;9048;9049;9050;9051 9048 1663 6 ADMQNLVER Acetyl (Protein N-term) 1116.5234 0.52335778 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0S3;Q5T0R8;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 93.157 93.157 1;2 0.0045683 95550 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.5 130.91 1376200000 63405000 133850000 78555000 107470000 93049000 82582000 79531000 101260000 104440000 0 261310000 107450000 163270000 767 2857;3307 716 6923;6924;6925;6926;6927;6928;6929;6930;6931;6932;6933;6934;6935;6936 9052;9053;9054;9055;9056;9057;9058;9059;9060;9061;9062;9063;9064;9065;9066 9066 12 ADMQNLVER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1132.5183 0.5182724 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0S3;Q5T0R8;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 1 1 0 1 51.609 51.609 2 0.037368 49637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.075 26.413 36690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36690000 0 768 2857;3307 716 6937 9067 9067 1 ADMVIEAVFEDLSLK Oxidation (M) 1694.8437 0.84368886 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 160.94 160.94 2;3 9.933E-09 168052 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.54 108.52 2094600000 99439000 125760000 287980000 116830000 134640000 251790000 129440000 146880000 121830000 129950000 176050000 258450000 115610000 769 1153 717 6938;6939;6940;6941;6942;6943;6944;6945;6946;6947;6948;6949;6950;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;6961;6962;6963;6964 9068;9069;9070;9071;9072;9073;9074;9075;9076;9077;9078;9079;9080;9081;9082;9083;9084;9085;9086;9087;9088;9089;9090;9091;9092;9093;9094;9095;9096;9097;9098 9091 667 30 ADMVIEAVFEDLSLK Unmodified 1678.8488 0.84877424 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 168.16 168.16 2;3 2.6464E-06 169959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.41 95.364 3793100000 282070000 413030000 686430000 191410000 276690000 318240000 390480000 300420000 144440000 83935000 145310000 155290000 405390000 770 1153 717 6965;6966;6967;6968;6969;6970;6971;6972;6973;6974;6975;6976;6977;6978;6979;6980;6981;6982;6983;6984;6985;6986;6987 9099;9100;9101;9102;9103;9104;9105;9106;9107;9108;9109;9110;9111;9112;9113;9114;9115;9116;9117;9118;9119;9120;9121 9113 22 ADMWSFGITAIELATGAAPYHK Unmodified 2349.1464 0.14635325 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 169.46 169.46 2;3 1.942E-08 176707 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.826 54.022 862970000 78310000 0 107030000 59912000 102370000 0 133400000 0 0 12625000 369330000 0 0 771 4417 718 6988;6989;6990;6991;6992;6993;6994;6995 9122;9123;9124;9125;9126;9127;9128;9129 9129 8 ADMWSFGITAIELATGAAPYHK Oxidation (M) 2365.1413 0.14126787 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 1 0 1 1 1 156.22 156.22 3 0.0010595 160522 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N-term) 1807.8224 0.82243615 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 1 0 0 1 1 1 61.474 61.474 2 0.00014981 60969 QUIQUE_C1218_190116_001 79.646 72.986 78287000 26856000 0 0 21291000 0 0 30140000 0 0 0 0 0 0 775 1894 721 7013;7014;7015 9159;9160;9161 9159 3 ADPALLNNHSNLKPAPTVPSSPDATPEPK Unmodified 2977.5145 0.51451424 3567 Q8N111 CEND1 Cell cycle exit and neuronal differentiation protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 65.359 65.359 3;4 0.00020945 64559 QUIQUE_C1403_190116_001 44.726 38.362 292570000 74524000 67575000 0 35623000 0 0 61524000 0 53323000 0 0 0 0 776 3567 722 7016;7017;7018;7019;7020 9162;9163;9164;9165;9166;9167 9164 6 ADPDNLQALHTLHLR Unmodified 1712.8958 0.89581629 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 72.041 72.041 3;4 2.7683E-05 73533 QUIQUE_C1218_190116_001 89.541 74.544 1241100000 128910000 0 132260000 116010000 102680000 101660000 130450000 0 158190000 45989000 123260000 86705000 114970000 777 877 723 7021;7022;7023;7024;7025;7026;7027;7028;7029;7030;7031;7032;7033;7034;7035;7036;7037;7038;7039;7040;7041;7042;7043 9168;9169;9170;9171;9172;9173;9174;9175;9176;9177;9178;9179;9180;9181;9182;9183;9184;9185;9186;9187;9188;9189;9190;9191;9192 9170 25 ADPEAAWEPTEAEAR Unmodified 1641.7271 0.7270792 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.558 72.558 2 9.1453E-13 72613 QUIQUE_C1368_190116_001 134.99 115.25 1016300000 104080000 86088000 87549000 83731000 80984000 78660000 99770000 51551000 71961000 26405000 78068000 73405000 94045000 778 4408 724 7044;7045;7046;7047;7048;7049;7050;7051;7052;7053;7054;7055;7056 9193;9194;9195;9196;9197;9198;9199;9200;9201;9202;9203;9204;9205;9206 9195 11 ADPEELFTKLEK Unmodified 1418.7293 0.72931103 622 B4DR80;Q9Y6E0 STK24 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit yes no 0 0 1 1 92.678 92.678 3 0.06058 93715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.998 24.813 18601000 0 0 0 0 0 0 0 18601000 0 0 0 0 0 779 622 725 7057 9207 9207 1 ADPIVGSLEPGIYAGYFDWK Unmodified 2197.0732 0.073171528 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 158.9 158.9 2 0.0011887 165216 QUIQUE_C1576_190116_001 94.09 79.832 21353000 0 21353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 780 3896 726 7058;7059 9208;9209 9209 2 ADPQDALR Unmodified 884.43519 0.4351947 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 25.495 25.495 2 0.035224 19716 QUIQUE_C1218_190116_001 63.565 40.546 130190000 50967000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79227000 0 0 781 3750 727 7060;7061;7062 9210;9211;9212 9210 3 ADPQEAINCLMR Unmodified 1416.649 0.648969 2651 P54920;M0R2M1;M0R058;M0R0I4 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 97.993 97.993 2 0.00037783 100206 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.4 100.63 711130000 59198000 71548000 75204000 73331000 0 69563000 68228000 61663000 56258000 29126000 65338000 0 81670000 782 2651 728 7063;7064;7065;7066;7067;7068;7069;7070;7071;7072;7073;7074;7075;7076 9213;9214;9215;9216;9217;9218;9219;9220;9221;9222;9223;9224;9225;9226;9227;9228;9229;9230 9230 17 ADPQEAINCLNAAIDIYTDMGR Oxidation (M) 2466.1155 0.1155234 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 161.13 161.13 2 5.4113E-20 166487 QUIQUE_C1218_190116_001 124.92 106.33 54869000 19772000 0 13395000 0 0 0 0 0 0 0 0 21702000 0 783 4128 729 7077;7078;7079;7080 9231;9232;9233;9234 9231 2868 4 ADPQEAINCLNAAIDIYTDMGR Unmodified 2450.1206 0.12060878 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.56 167.56 2;3 6.0362E-77 174780 QUIQUE_DMIX5_190116_001 209.67 196.54 1987600000 167560000 207820000 137250000 78089000 117510000 65517000 201320000 102480000 223810000 13530000 290070000 187820000 194860000 784 4128 729 7081;7082;7083;7084;7085;7086;7087;7088;7089;7090;7091;7092;7093;7094;7095;7096;7097;7098;7099;7100;7101;7102;7103;7104;7105 9235;9236;9237;9238;9239;9240;9241;9242;9243;9244;9245;9246;9247;9248;9249;9250;9251;9252;9253;9254;9255;9256;9257;9258;9259;9260;9261;9262;9263;9264 9259 29 ADPSILQNLR Unmodified 1125.6142 0.6142217 1059 F8W9X7;Q567U6 CCDC93 Coiled-coil domain-containing protein 93 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.67 134.67 2 0.023106 137380 QUIQUE_C1563_190116_001 57.281 24.44 3155700000 139340000 144340000 235080000 344310000 202480000 280480000 250210000 182450000 321610000 170290000 286110000 237380000 361580000 785 1059 730 7106;7107;7108;7109;7110;7111;7112;7113;7114;7115;7116;7117;7118 9265;9266;9267;9268;9269;9270;9271;9272;9273;9274;9275;9276;9277;9278;9279;9280;9281;9282 9272 18 ADPSIVQALSLYDGLV Unmodified 1659.872 0.87195253 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 173.48 173.48 2 0.00051373 177544 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.4 83.157 228950000 47941000 0 15910000 0 0 0 41807000 28638000 36427000 0 58225000 0 0 786 2741 731 7119;7120;7121;7122;7123;7124 9283;9284;9285;9286;9287;9288 9287 6 ADPSLNPEQLK Unmodified 1210.6194 0.61936665 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 53 53 2 0.003944 50767 QUIQUE_C1368_190116_001 72.638 52.497 292030000 0 0 81947000 0 0 0 62567000 57100000 0 0 45744000 0 44668000 787 4510 732 7125;7126;7127;7128;7129 9289;9290;9291;9292;9293;9294 9289 6 ADPSQFELLK Unmodified 1146.5921 0.59208927 982;2594 F2Z2J1;Q15349;D6RE03;D6RA62;B1AXG2;A0A2R8YGB7;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17 RPS6KA2;RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.194 86.194 2 0.0076369 87385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.879 32.878 456160000 0 51292000 47934000 0 62096000 50274000 0 47653000 61992000 24147000 47999000 62773000 0 788 982;2594 733 7130;7131;7132;7133;7134;7135;7136;7137;7138 9295;9296;9297;9298;9299;9300;9301;9302;9303;9304;9305 9300 11 ADPVAGIAGSAAK Acetyl (Protein N-term) 1168.6088 0.60880197 513 A0A5E8;Q99501;C9JFI0;C9JRR6 GAS2L1 GAS2-like protein 1 yes no 1 0 0 1 83.697 83.697 2 0.040528 84227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.383 28.555 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 789 513 734 7139 9306 9306 1 ADPWQECMDYAVTLAR Acetyl (Protein N-term) 1966.8553 0.85533296 2286 P29218;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RG13;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 163.78 163.78 2;3 3.8654E-25 170956 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.8 147.11 980000000 70993000 61923000 82262000 35268000 84725000 48148000 64249000 117720000 110310000 11646000 133750000 80056000 78964000 790 2286 735 7140;7141;7142;7143;7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;7153;7154;7155 9307;9308;9309;9310;9311;9312;9313;9314;9315;9316;9317;9318;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;9326 9322 20 ADQCYEDVR Unmodified 1154.4662 0.46623683 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.187 24.187 2 0.00040478 16956 QUIQUE_C1368_190116_001 122.13 104.84 3358600000 316770000 300630000 548530000 343520000 292050000 251120000 298680000 129540000 121240000 68440000 209890000 278750000 199440000 791 2327 736 7156;7157;7158;7159;7160;7161;7162;7163;7164;7165;7166;7167;7168 9327;9328;9329;9330;9331;9332;9333;9334;9335;9336;9337;9338;9339 9329 13 ADQELLLYSHDNIICGITSVAFSK Unmodified 2693.3371 0.33706714 4207 Q9HAV0 GNB4 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 151.3 151.3 2;3 8.8548E-64 154464 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.14 138.19 2580800000 0 245290000 0 157410000 0 0 264400000 267240000 430950000 125950000 343750000 367310000 378510000 792 4207 737 7169;7170;7171;7172;7173;7174;7175;7176;7177;7178;7179 9340;9341;9342;9343;9344;9345;9346;9347;9348;9349;9350;9351;9352;9353 9345 13 ADQELLMYSHDNIICGITSVAFSR Oxidation (M) 2755.2946 0.2945504 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 145.87 145.87 2;3 8.195E-63 150346 QUIQUE_C1277_190116_001 162.65 151.39 2987400000 152650000 300530000 343710000 420490000 257000000 283780000 0 199260000 277840000 0 251420000 246510000 254190000 793 2769 738 7180;7181;7182;7183;7184;7185;7186;7187;7188;7189;7190;7191;7192;7193 9354;9355;9356;9357;9358;9359;9360;9361;9362;9363;9364;9365;9366;9367;9368;9369 9357 2200 15 ADQELLMYSHDNIICGITSVAFSR Unmodified 2739.2996 0.29963578 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 4 2 4 2 10 6 3 157.37 157.37 2;3;4 2.0522E-201 156525 QUIQUE_C1368_190116_001 248.76 231.54 12870000000 511300000 1112500000 1101400000 726970000 930170000 691410000 1128500000 1127900000 1085200000 266030000 1443900000 1557200000 1187700000 794 2769 738 7194;7195;7196;7197;7198;7199;7200;7201;7202;7203;7204;7205;7206;7207;7208;7209;7210;7211;7212;7213;7214;7215;7216;7217;7218;7219;7220;7221;7222;7223;7224;7225;7226;7227;7228;7229;7230;7231;7232;7233;7234;7235;7236;7237;7238 9370;9371;9372;9373;9374;9375;9376;9377;9378;9379;9380;9381;9382;9383;9384;9385;9386;9387;9388;9389;9390;9391;9392;9393;9394;9395;9396;9397;9398;9399;9400;9401;9402;9403;9404;9405;9406;9407;9408;9409;9410;9411;9412;9413;9414;9415;9416;9417;9418;9419;9420;9421;9422;9423;9424;9425;9426;9427;9428;9429;9430;9431;9432 9378 62 ADQELMTYSHDNIICGITSVSFSK Unmodified 2715.252 0.25201688 2767;602 P62873;B3KVK2 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 no no 0 0 0 3 5 2 2 3 3 4 3 2 2 5 4 4 137 137 2;3 1.7104E-201 138388 QUIQUE_DMIX5_190116_001 267.69 248.37 16057000000 1298400000 1610300000 1430700000 1093600000 943790000 1204400000 1683800000 1141500000 1120400000 388160000 1255500000 1334200000 1552600000 795 2767;602 739 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9533;9534;9535;9536;9537;9538;9539;9540;9541;9542;9543;9544;9545;9546 9543 14 ADQLADESLESTRR Unmodified 1589.7645 0.76452734 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 34.796 34.796 2;3 5.6107E-05 30992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.944 65.885 1214400000 78368000 88724000 97882000 129060000 88922000 91937000 158500000 55980000 50323000 23488000 146800000 57070000 147390000 799 2699 742 7308;7309;7310;7311;7312;7313;7314;7315;7316;7317;7318;7319;7320;7321;7322;7323;7324;7325 9547;9548;9549;9550;9551;9552;9553;9554;9555;9556;9557;9558;9559;9560;9561;9562;9563;9564;9565;9566;9567;9568;9569;9570;9571;9572;9573 9564 27 ADQLCQQELR Unmodified 1259.5928 0.59283433 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.175 33.175 2 6.7259E-14 28894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.65 137.72 628260000 0 21116000 131450000 33289000 0 65272000 55187000 79218000 33334000 46379000 108580000 0 54430000 800 2435 743 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9631;9632;9633;9634;9635 9631 5 ADRDESSPYAAMLAAQDVAQR Unmodified 2264.0492 0.049158397 451 A0A2R8Y811;P62263;E5RH77 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.5 97.5 3 9.2686E-14 100389 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.201 85.7 410970000 33757000 40061000 54698000 68077000 0 0 0 0 55351000 0 37488000 66518000 55017000 806 451 749 7363;7364;7365;7366;7367;7368;7369;7370 9636;9637;9638;9639;9640;9641;9642;9643 9640 6 ADRDQYELLCLDNTR Unmodified 1880.8687 0.86867484 1838 P02787;C9JVG0 TF Serotransferrin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 82.774 82.774 2;3 1.0707E-128 85244 QUIQUE_C1438_190116_001 274.09 252.54 1850000000 0 232300000 161620000 283270000 855480000 0 0 31813000 0 50225000 0 117180000 118140000 807 1838 750 7371;7372;7373;7374;7375;7376;7377;7378;7379;7380 9644;9645;9646;9647;9648;9649;9650;9651;9652;9653;9654 9649 10 ADRPSSLPLDFNDEFSDLDGVVQQR Unmodified 2819.3362 0.33621552 906 E9PD09;Q96HH9;D6REP5;B7Z4W8 GRAMD3 GRAM domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 141.96 141.96 3 3.1659E-05 145856 QUIQUE_C1403_190116_001 53.865 47.305 63107000 0 0 0 63107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 808 906 751 7381 9655 9655 1 ADSEASSGPLLDDK Unmodified 1403.6416 0.64161824 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 40.668 40.668 2 0.0013907 37298 QUIQUE_C1218_190116_001 75.788 60.637 76687000 35148000 0 0 0 0 0 0 0 0 14922000 26617000 0 0 809 1520 752 7382;7383;7384;7385;7386 9656;9657;9658;9659;9660;9661 9656 6 ADSELQLVEQR Acetyl (Protein N-term) 1328.6572 0.65720872 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.76 107.76 2 1.0468E-46 104733 QUIQUE_DMIX4_190116_001 210.27 134.21 1267900000 93013000 104810000 0 0 111560000 103040000 111230000 142580000 136160000 78835000 132350000 102080000 152260000 810 1928 753 7387;7388;7389;7390;7391;7392;7393;7394;7395;7396;7397 9662;9663;9664;9665;9666;9667;9668;9669;9670;9671;9672;9673;9674;9675;9676;9677 9671 16 ADSLLAVVK Unmodified 914.54368 0.54368251 3138;3045 Q15424;Q14151 SAFB;SAFB2 Scaffold attachment factor B1;Scaffold attachment factor B2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.497 68.497 2 0.00098961 68281 QUIQUE_C1368_190116_001 107.9 79.789 562350000 0 57296000 50173000 60056000 57826000 40897000 24200000 61454000 51567000 0 58671000 43675000 56532000 811 3138;3045 754 7398;7399;7400;7401;7402;7403;7404;7405;7406;7407;7408 9678;9679;9680;9681;9682;9683;9684;9685;9686;9687;9688;9689 9679 11 ADSPSIDYAELLQHFEK Unmodified 1961.9371 0.93707198 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 133.98 133.98 3 8.9331E-07 139536 QUIQUE_C1218_190116_001 102.78 93.522 213540000 40676000 66471000 0 0 0 0 0 47448000 28158000 30783000 0 0 0 812 2930 755 7409;7410;7411;7412;7413 9690;9691;9692;9693;9694;9695 9690 5 ADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLK Unmodified 2464.369 0.36895962 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 3 1 1 1 2 1 1 1 2 169.16 169.16 2;3;4 1.2887E-63 173456 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.33 116.99 3411000000 188970000 338430000 510060000 177780000 548550000 180000000 237920000 135140000 273670000 32407000 394340000 141650000 252080000 813 1801 756 7414;7415;7416;7417;7418;7419;7420;7421;7422;7423;7424;7425;7426;7427;7428;7429;7430;7431;7432 9696;9697;9698;9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;9706;9707;9708;9709;9710;9711;9712;9713;9714 9708 19 ADSRDPASDQMQHWK Acetyl (Protein N-term) 1812.7849 0.78494521 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 1 0 1 1 50.006 50.006 3 0.019062 47312 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.265 45.624 28394000 0 0 0 0 0 0 0 28394000 0 0 0 0 0 814 1849 757 7433 9715 9715 1 ADSWVEKEEPAPSN Unmodified 1557.6947 0.69471644 3571 Q8N163;H0YB24 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 51.171 51.171 2 0.00073681 48929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.63 128.28 164920000 0 58822000 0 0 0 0 0 51208000 54892000 0 0 0 0 815 3571 758 7434;7435;7436 9716;9717;9718 9718 3 ADTATTASAAAASAASASSDAPPFQLGKPR Acetyl (Protein N-term) 2830.3733 0.37332931 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;F8WBH6 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 119.96 119.96 3 7.4389E-64 126104 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.16 118.22 656060000 63022000 0 93654000 0 0 63452000 0 0 96257000 0 112300000 112030000 115350000 816 3679 759 7437;7438;7439;7440;7441;7442;7443;7444 9719;9720;9721;9722;9723;9724;9725;9726;9727;9728 9725 10 ADTIDTIEK Unmodified 1004.5026 0.50260556 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31;F8VZG8;F8VVY7 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 33.17 33.17 2 0.038377 26849 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.965 29.022 59503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59503000 0 0 0 817 4605 760 7445 9729 9729 1 ADTLDPALLRPGR Unmodified 1393.7678 0.76776222 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.416 66.416 2;3 8.2852E-07 64761 QUIQUE_C1563_190116_001 105.65 89.893 1186400000 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Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.156 54.156 2 2.1757E-13 52705 QUIQUE_C1218_190116_001 157.66 103.06 18113000000 1902300000 1827000000 2341200000 1819400000 1367200000 1695100000 1905700000 407980000 787500000 730600000 1281700000 805410000 1242100000 823 3171 766 7491;7492;7493;7494;7495;7496;7497;7498;7499;7500;7501;7502;7503 9790;9791;9792;9793;9794;9795;9796;9797;9798;9799;9800;9801;9802;9803;9804;9805;9806;9807;9808 9790 19 ADTLTPEECQQFKK Unmodified 1693.7981 0.79813565 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 35.335 35.335 2;3 3.0543E-22 31320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.64 167.05 10135000000 48669000 436760000 425780000 99454000 718660000 62715000 688960000 1579700000 1444000000 124180000 1505000000 1346200000 1654700000 824 3171 767 7504;7505;7506;7507;7508;7509;7510;7511;7512;7513;7514;7515;7516;7517;7518;7519;7520;7521;7522;7523;7524;7525;7526 9809;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;9819;9820;9821;9822;9823;9824;9825;9826;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;9834;9835;9836;9837;9838 9822 27 ADTMTLEEK Unmodified 1036.4747 0.47467625 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.458 27.458 2 0.00052236 21476 QUIQUE_C1368_190116_001 112.41 66.459 1517100000 202080000 177400000 183360000 147080000 125400000 0 189010000 0 0 0 167570000 147720000 177480000 825 419 768 7527;7528;7529;7530;7531;7532;7533;7534;7535 9839;9840;9841;9842;9843;9844;9845;9846;9847;9848 9841 5 ADTQTYQPYNK Unmodified 1327.6044 0.60444487 2829 P84090 ERH Enhancer of rudimentary homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.382 24.382 2 1.0891E-83 17885 QUIQUE_C1277_190116_001 234.26 206.35 902070000 155900000 126110000 237520000 54771000 0 0 86623000 57332000 95491000 30868000 0 0 57450000 826 2829 769 7536;7537;7538;7539;7540;7541;7542;7543;7544 9849;9850;9851;9852;9853;9854;9855;9856;9857;9858 9850 10 ADTQTYQPYNKDWIK Unmodified 1869.8897 0.88972785 2829 P84090 ERH Enhancer of rudimentary homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 64.745 64.745 2 6.255E-12 64474 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.18 101.77 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 827 2829 770 7545;7546;7547 9859;9860;9861 9859 3 ADTQYILPNDIGVSSLDCR Acetyl (Protein N-term) 2178.0263 0.02629769 4330 Q9NY33;E9PKK8;E9PPK9;E9PQF2 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 150.21 150.21 2;3 2.0047E-29 155374 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 120.12 86788000 0 0 0 17957000 24004000 17738000 27088000 0 0 0 0 0 0 828 4330 771 7548;7549;7550;7551;7552;7553;7554;7555 9862;9863;9864;9865;9866;9867;9868;9869 9862 8 ADVAVESLIPGLEPPVPQR Unmodified 1986.0786 0.078591257 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 139.44 139.44 2 0.0039531 144512 QUIQUE_C1218_190116_001 105.65 91.689 29989000 14927000 0 0 15062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 829 3212 772 7556;7557 9870;9871 9870 1 ADVDISGPK Unmodified 900.45526 0.45526144 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.812 25.812 2 0.01368 19640 QUIQUE_C1277_190116_001 69.598 1.701 1155900000 168080000 195790000 157870000 0 0 333420000 0 0 0 0 0 0 300710000 830 2935 773 7558;7559;7560;7561;7562 9872;9873;9874;9875;9876 9873 4 ADVDVSGPK Unmodified 886.43961 0.43961137 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.167 19.167 2 0.0089591 12140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.318 45.363 458530000 0 0 0 0 0 65573000 0 241190000 45211000 46422000 0 60135000 0 831 2935 774 7563;7564;7565;7566;7567 9877;9878;9879;9880;9881;9882 9878 6 ADVFHAYLSLLK Unmodified 1375.75 0.7499869 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.83 135.83 2;3 1.8812E-09 139768 QUIQUE_C1403_190116_001 175.15 138.46 5714100000 459790000 430310000 384570000 346440000 448240000 298730000 443690000 451150000 593660000 144550000 546400000 604030000 562490000 832 3499 775 7568;7569;7570;7571;7572;7573;7574;7575;7576;7577;7578;7579;7580;7581;7582;7583;7584;7585;7586;7587;7588;7589;7590;7591;7592;7593 9883;9884;9885;9886;9887;9888;9889;9890;9891;9892;9893;9894;9895;9896;9897;9898;9899;9900;9901;9902;9903;9904;9905;9906;9907;9908;9909;9910;9911;9912;9913;9914;9915;9916;9917;9918 9894 36 ADVFPGNDSTASQDVANR Acetyl (Protein N-term) 1904.85 0.85004788 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.158 97.158 2;3 2.682E-45 99631 QUIQUE_C1277_190116_001 168.76 146.56 2361500000 152200000 172710000 150620000 224830000 178860000 190640000 177540000 181790000 197260000 86136000 229230000 231580000 188130000 833 2121 776 7594;7595;7596;7597;7598;7599;7600;7601;7602;7603;7604;7605;7606;7607 9919;9920;9921;9922;9923;9924;9925;9926;9927;9928;9929;9930;9931;9932 9920 13 ADVIQATGDAICIFR Unmodified 1648.8243 0.82429083 2927 Q08945;E9PMD4 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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9962;9963;9964;9965;9966;9967;9968;9969;9970;9971;9972;9973;9974;9975;9976;9977 9963 16 ADVQMEFIQGPKEESK Unmodified 1834.8771 0.87711426 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 64.466 64.466 2;3 4.7192E-12 64625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.06 102 42053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42053000 0 0 840 2009 783 7647;7648 9978;9979 9978 2 ADVQSIIGLQR Unmodified 1198.667 0.66698555 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.018 86.018 2 0.00017468 88810 QUIQUE_C1218_190116_001 126.31 66.294 1158600000 177820000 125130000 153780000 136790000 120610000 131870000 0 0 56908000 41011000 88789000 62825000 63078000 841 2983 784 7649;7650;7651;7652;7653;7654;7655;7656;7657;7658;7659 9980;9981;9982;9983;9984;9985;9986;9987;9988;9989;9990;9991;9992;9993 9981 12 ADVVESWIGEK Unmodified 1231.6085 0.60846762 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 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10018;10019;10020;10021;10022;10023;10024;10025;10026;10027;10028;10029;10030;10031;10032;10033;10034;10035;10036 10022 19 ADVVESWIGEKENSLKTDDYGR Unmodified 2510.1925 0.1925114 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 100.44 100.44 3 4.6308E-46 102024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.73 145.86 84757000 0 0 0 0 0 0 0 84757000 0 0 0 0 0 844 267;275;3025 787 7687 10037;10038 10038 2 ADVVVSGPK Unmodified 870.48108 0.48108226 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 20.832 20.832 2 0.05836 13670 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.423 30.866 40975000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40975000 0 0 0 845 2935 788 7688 10039 10039 1 ADYEIASK Unmodified 895.42871 0.42871234 4580;569 A8MYV2;Q9NQ29;B8ZZ12;Q9Y383;A0A0A6YYJ8 LUC7L;LUC7L2 Putative RNA-binding protein Luc7-like 1;Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 22.977 22.977 2 0.022129 16593 QUIQUE_C1218_190116_001 74.486 51.338 221160000 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A0A2R8Y765;J3QKS7;A0A2R8Y7U4;A0A2U3TZQ7;A0A2R8Y7I9;A0A2R8Y4T4;A0A2R8Y855;B4DGM3;Q969G3;A0A2R8YES3;J3QR61;J3KT85;A0A2R8YD78 SMARCE1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 yes no 0 0 0 1 20.061 20.061 2 0.017757 12668 QUIQUE_C1277_190116_001 61.56 22.768 40380000 0 40380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 849 423 792 7705 10057 10057 1 AEAALLLLPEAAAER Acetyl (Protein N-term) 1578.8617 0.86172219 3886 Q96JB2 COG3 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.09 169.09 2 9.4292E-08 173033 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.4 83.018 209230000 34416000 0 0 21060000 0 17408000 28583000 0 0 9922400 33974000 30467000 33398000 850 3886 793 7706;7707;7708;7709;7710;7711;7712;7713 10058;10059;10060;10061;10062;10063;10064;10065 10065 5 AEAAVESAVAGPQGR Unmodified 1411.7056 0.7055559 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 36.884 36.884 2 0.0040455 33004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.338 45.961 0 0 0 0 0 0 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10126;10127 10126 2 AEAELLQQQK Unmodified 1156.6088 0.60880197 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.738 29.738 2 0.00046618 24284 QUIQUE_C1576_190116_001 111.17 39.788 778560000 0 0 0 0 99600000 91180000 117750000 88649000 142060000 118690000 120640000 0 0 860 3117 803 7760;7761;7762;7763;7764;7765;7766 10128;10129;10130;10131;10132;10133;10134;10135 10131 6 AEAEQSVTCAHCR Unmodified 1517.6351 0.63510985 1508 O43149 ZZEF1 Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 11.729 11.729 3 0.01176 4104 QUIQUE_C1576_190116_001 45.28 39.56 3578100 0 0 0 0 0 0 2225100 0 0 0 0 0 1353000 861 1508 804 7767;7768;7769 10136;10137;10138 10137 3 AEAERPEEQAEASGLK Unmodified 1713.817 0.81695684 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 25.442 25.442 3 0.013474 19052 QUIQUE_C1277_190116_001 60.307 48.693 28002000 0 28002000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 862 2880 805 7770 10139 10139 0 AEAERPEEQAEASGLKK Unmodified 1841.9119 0.91191986 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.8 18.8 3 2.0832E-29 11823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.32 123.36 2082200000 85664000 158530000 126840000 113910000 192480000 131760000 103320000 268370000 290360000 30177000 182710000 176250000 221830000 863 2880 806 7771;7772;7773;7774;7775;7776;7777;7778;7779;7780;7781;7782;7783 10140;10141;10142;10143;10144;10145;10146;10147;10148;10149;10150;10151;10152;10153 10148 14 AEAETLVSR Unmodified 974.50327 0.50327426 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.24 25.24 2 0.014899 18263 QUIQUE_C1368_190116_001 67.897 28.875 774900000 0 0 146360000 0 0 0 0 85594000 120450000 61749000 132980000 112670000 115090000 864 3643 807 7784;7785;7786;7787;7788;7789;7790;7791 10154;10155;10156;10157;10158;10159;10160;10161 10155 7 AEAFVNTWSSMGQETVEK Unmodified 2012.915 0.91495633 812 D6RC04;Q9Y6G5;D6RJ90;H0Y9N4 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 105.84 105.84 2 0.022466 107666 QUIQUE_C1563_190116_001 49.333 36.133 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 865 812 808 7792 10162 10162 1 AEAGAGSATEFQFR Unmodified 1440.6634 0.66335673 2482 P46783;Q9NQ39 RPS10;RPS10P5 40S ribosomal protein S10;Putative 40S ribosomal protein S10-like yes no 0 0 0 1 65.842 65.842 2 0.0076168 61672 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.819 58.35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 866 2482 809 7793 10163 10163 1 AEAGDAALSVAEWLR Acetyl (Protein N-term) 1599.7893 0.78928553 3914 Q96P48 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.43 168.43 2 1.7441E-13 172057 QUIQUE_C1277_190116_001 169.89 156.23 367760000 28741000 27212000 18327000 19864000 39867000 19300000 22845000 29893000 47318000 0 36045000 41080000 37273000 867 3914 810 7794;7795;7796;7797;7798;7799;7800;7801;7802;7803;7804;7805 10164;10165;10166;10167;10168;10169;10170;10171;10172;10173;10174;10175 10165 11 AEAGDNLGALVR Unmodified 1184.6149 0.61494998 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.231 63.231 2 6.3075E-05 63266 QUIQUE_C1218_190116_001 124.81 86.387 5635600000 567600000 433540000 499780000 420400000 408690000 420880000 425850000 440140000 480900000 231400000 476470000 422800000 407190000 868 2529 811 7806;7807;7808;7809;7810;7811;7812;7813;7814;7815;7816;7817;7818 10176;10177;10178;10179;10180;10181;10182;10183;10184;10185;10186;10187;10188;10189;10190;10191;10192;10193;10194 10176 18 AEAGEAGQATAEAECHR Unmodified 1756.7435 0.74347432 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 21.93 21.93 3 0.00019578 14675 QUIQUE_C1368_190116_001 72.433 53.6 304480000 73840000 0 103110000 65463000 0 40302000 0 0 0 21758000 0 0 0 869 1741 812 7819;7820;7821;7822;7823 10195;10196;10197;10198;10199 10196 5 AEAGGGWEGSASYK Unmodified 1368.5946 0.59460847 537 K7EIJ0;K7ENL2;A6NG10;K7EMC9;Q969T9;K7EIN1;K7ESN4 WBP2 WW domain-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.758 40.758 2 0.0011986 36544 QUIQUE_C1403_190116_001 77.593 60.226 73307000 34217000 0 0 39090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 870 537 813 7824;7825;7826;7827 10200;10201;10202;10203 10202 4 AEAGPEGVAPAPEGEK Unmodified 1507.7155 0.71545188 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 32.371 32.371 2 0.0010815 26115 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.641 54.967 24071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24071000 0 0 0 871 89 814 7828 10204 10204 1 AEAGPEGVAPAPEGEKK Unmodified 1635.8104 0.8104149 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 20.347 20.347 2;3 6.0878E-10 13596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.7 104.61 559950000 0 0 56453000 66445000 0 0 0 67469000 35658000 0 184380000 130280000 19267000 872 89 815 7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;7836;7837 10205;10206;10207;10208;10209;10210;10211;10212;10213 10208 9 AEAGSGGPGFTFTFR Unmodified 1500.6997 0.69974224 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.4 103.4 2 1.0973E-07 107438 QUIQUE_C1218_190116_001 108.72 87.939 293660000 76297000 0 0 0 0 61774000 0 66714000 88871000 0 0 0 0 873 2242 816 7838;7839;7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7847;7848;7849 10214;10215;10216;10217;10218;10219;10220;10221;10222;10223;10224;10225 10214 9 AEALASAIASTK Unmodified 1131.6136 0.61355299 4310 Q9NVT9 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.705 48.705 2 0.0032442 46818 QUIQUE_C1438_190116_001 72.652 57.501 321110000 68437000 49422000 55499000 48483000 50686000 48580000 0 0 0 0 0 0 0 874 4310 817 7850;7851;7852;7853;7854;7855 10226;10227;10228;10229;10230;10231 10230 6 AEALPLQR Unmodified 896.50797 0.50796571 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.551 35.551 2 0.016146 30391 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.614 34.256 425590000 22682000 33053000 0 40421000 73070000 29480000 50620000 0 51679000 0 44395000 28451000 51742000 875 2207 818 7856;7857;7858;7859;7860;7861;7862;7863;7864;7865 10232;10233;10234;10235;10236;10237;10238;10239;10240;10241;10242 10242 11 AEAQAQYSAAVAK Unmodified 1306.6517 0.65172941 669 B7ZKJ8;Q14624 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 0 1 1 25.201 25.201 2 0.00070199 18266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.62 89.388 15840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15840000 0 0 0 876 669 819 7866;7867 10243;10244 10244 2 AEAQEAEDQQAR Unmodified 1344.5906 0.59058572 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 11.315 11.315 2 0.00052228 3651 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.78 103.55 7463600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7463600 0 0 0 877 4434 820 7868 10245 10245 1 AEASSGDHPTDTEMKEEQK Unmodified 2088.8906 0.89059207 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 12.725 12.725 2;3;4 6.5607E-55 3241 QUIQUE_C1277_190116_001 169.43 160.38 2077300000 81671000 66167000 159610000 0 253400000 192960000 6975700 209260000 220930000 0 100480000 292840000 492960000 878 2876 821 7869;7870;7871;7872;7873;7874;7875;7876;7877;7878;7879;7880;7881;7882;7883;7884;7885;7886;7887;7888;7889;7890;7891;7892 10246;10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254;10255;10256;10257;10258;10259;10260;10261;10262;10263;10264;10265;10266;10267;10268;10269;10270;10271 10248 26 AEAWEGAAVAQDLLALGYGGVPGAASR Unmodified 2599.3031 0.3030649 3207 Q17RN3;K7EQT7 FAM98C Protein FAM98C yes no 0 0 0 1 1 1 165.87 165.87 3 0.0037215 172069 QUIQUE_C1438_190116_001 31.549 23.928 57931000 0 0 0 0 27860000 0 30071000 0 0 0 0 0 0 879 3207 822 7893;7894;7895 10272;10273;10274 10273 3 AECLNPSQPSR Unmodified 1257.5772 0.57718426 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.132 21.132 2 0.00065961 14233 QUIQUE_C1438_190116_001 116.52 95.571 486730000 58165000 73914000 65760000 0 90862000 39908000 25704000 0 25088000 0 52332000 30472000 24529000 880 2075 823 7896;7897;7898;7899;7900;7901;7902;7903;7904;7905 10275;10276;10277;10278;10279;10280;10281;10282;10283;10284;10285;10286 10279 12 AECMLQQAER Unmodified 1234.5434 0.54344129 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.311 33.311 2 0.00020677 28325 QUIQUE_C1403_190116_001 124.23 92.47 540320000 38787000 0 144990000 145540000 91274000 63459000 56280000 0 0 0 0 0 0 881 2066 824 7906;7907;7908;7909;7910;7911 10287;10288;10289;10290;10291;10292;10293 10289 7 AECMLQQAER Oxidation (M) 1250.5384 0.53835592 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 18.71 18.71 2 0.0060905 11256 QUIQUE_C1368_190116_001 78.516 59.245 72993000 0 0 30455000 0 0 0 0 0 0 17089000 25450000 0 0 882 2066 824 7912;7913;7914 10294;10295;10296 10294 1390 3 AECSAEQCYK Unmodified 1244.4802 0.48017233 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 0 1 14.921 14.921 2 0.0028464 6947 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.639 76.418 11747000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11747000 0 0 0 883 2504 825 7915 10297 10297 1 AEDADMRNELEEMQR Acetyl (Protein N-term) 1877.7884 0.7883756 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 100.24 100.24 2;3 3.2949E-65 104381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.49 157.99 3195200000 151640000 331210000 365760000 289050000 190600000 0 352280000 246390000 231680000 44631000 370620000 225730000 395570000 884 2699 826 7916;7917;7918;7919;7920;7921;7922;7923;7924;7925;7926;7927;7928;7929 10298;10299;10300;10301;10302;10303;10304;10305;10306;10307;10308;10309;10310;10311;10312;10313 10310 14 AEDADMRNELEEMQR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1893.7833 0.78329023 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 68.841 68.841 2 6.5159E-06 68055 QUIQUE_C1277_190116_001 109.16 99.837 377550000 0 78129000 55848000 63351000 0 0 34042000 0 34526000 0 36922000 0 74731000 885 2699 826 7930;7931;7932;7933;7934;7935;7936;7937;7938;7939;7940 10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324 10314 2128;2129 10 AEDASKFELCQLLPLFLPPTTVPPECYR Unmodified 3290.6356 0.63555735 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 167.65 167.65 3 1.6221E-36 169665 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.62 112.73 962540000 0 35681000 0 0 0 0 0 127530000 137040000 0 377610000 284660000 0 886 4393;697 827 7941;7942;7943;7944;7945 10325;10326;10327;10328;10329 10326 5 AEDAVEAIR Unmodified 972.48762 0.4876242 4055 Q9BWF3;E9PB51;D6R9K7;J3QRR5 RBM4 RNA-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.696 30.696 2 0.00049652 25567 QUIQUE_C1576_190116_001 114.28 64.242 746660000 60360000 60340000 72158000 60963000 60616000 65311000 71279000 55027000 55398000 0 72114000 54801000 58297000 887 4055 828 7946;7947;7948;7949;7950;7951;7952;7953;7954;7955;7956;7957 10330;10331;10332;10333;10334;10335;10336;10337;10338;10339;10340;10341;10342;10343 10338 12 AEDDQPLPGVLLSLSGGLFR Unmodified 2083.095 0.094969603 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;J3KN36;P69849;Q5JPE7 NOMO1;NOMO3;NOMO2 Nodal modulator 1;Nodal modulator 3;Nodal modulator 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 169.85 169.85 2;3 6.9537E-06 174663 QUIQUE_C1368_190116_001 101.36 95.864 109820000 9369200 0 17818000 0 19939000 0 0 0 0 0 0 27849000 34850000 888 101 829 7958;7959;7960;7961;7962 10344;10345;10346;10347;10348;10349 10345 5 AEDGATPSPSNETPK Unmodified 1499.674 0.673981 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 20.656 20.656 2 7.5139E-14 12693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.76 75.944 17356000000 2194800000 2397500000 877420000 1629100000 2354900000 1143500000 931330000 621770000 1575100000 439350000 1089900000 962560000 1138800000 889 2293 830 7963;7964;7965;7966;7967;7968;7969;7970;7971;7972;7973;7974;7975;7976;7977;7978;7979;7980;7981;7982;7983;7984;7985;7986;7987;7988 10350;10351;10352;10353;10354;10355;10356;10357;10358;10359;10360;10361;10362;10363;10364;10365;10366;10367;10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375;10376;10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383 10376 33 AEDGATPSPSNETPKK Unmodified 1627.7689 0.76894402 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 13.393 13.393 2;3 1.9709E-18 5328 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.45 122.59 1608300000 122560000 276730000 44516000 32535000 93148000 46029000 90169000 166880000 203110000 0 222840000 61444000 248350000 890 2293 831 7989;7990;7991;7992;7993;7994;7995;7996;7997;7998;7999;8000;8001;8002;8003;8004;8005;8006;8007;8008;8009;8010;8011;8012;8013;8014;8015 10384;10385;10386;10387;10388;10389;10390;10391;10392;10393;10394;10395;10396;10397;10398;10399;10400;10401;10402;10403;10404;10405;10406;10407;10408;10409;10410;10411;10412;10413;10414;10415;10416;10417;10418;10419;10420;10421 10421 38 AEDGENYDIK Unmodified 1152.4935 0.49349744 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 0 1 27.016 27.016 2 0.019456 21087 QUIQUE_C1218_190116_001 82.749 38.302 92951000 92951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 891 843 832 8016 10422 10422 0 AEDGENYDIKK Unmodified 1280.5885 0.58846046 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 16.499 16.499 2;3 0.00059427 8763 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.3 88.48 1382400000 106710000 86688000 54199000 190260000 207230000 103290000 172070000 0 0 35013000 143020000 43463000 240400000 892 843 833 8017;8018;8019;8020;8021;8022;8023;8024;8025;8026;8027;8028;8029;8030;8031;8032;8033 10423;10424;10425;10426;10427;10428;10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439 10437 17 AEDGIVLDLPLYPAHPQDFHEVEDLIK Unmodified 3072.5444 0.54441738 2296 P30039;A0A0C4DFS0 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 0 1 151.23 151.23 4 0.02605 153981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.585 15.189 37050000 0 0 0 0 0 0 0 37050000 0 0 0 0 0 893 2296 834 8034 10440 10440 1 AEDGSVIDYELIDQDAR Unmodified 1907.8749 0.87486565 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 0 1 3 2 3 2 2 2 2 3 3 3 2 2 112.73 112.73 2;3 6.3625E-140 113865 QUIQUE_DMIX1_190116_001 233.37 201.36 3892500000 229700000 392480000 261130000 520900000 300870000 128620000 274350000 250700000 388810000 290800000 356840000 215280000 282000000 894 1920 835 8035;8036;8037;8038;8039;8040;8041;8042;8043;8044;8045;8046;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;8055;8056;8057;8058;8059;8060;8061;8062;8063;8064 10441;10442;10443;10444;10445;10446;10447;10448;10449;10450;10451;10452;10453;10454;10455;10456;10457;10458;10459;10460;10461;10462;10463;10464;10465;10466;10467;10468;10469;10470;10471;10472;10473;10474;10475;10476;10477;10478 10460 36 AEDHFSVIDFNQNIR Unmodified 1803.854 0.85401105 2153 Q5T985;P19823 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 94.17 94.17 3 0.0024923 95097 QUIQUE_C1563_190116_001 46.704 39.193 18806000 0 0 0 0 0 18806000 0 0 0 0 0 0 0 895 2153 836 8065 10479 10479 0 AEDLDELLDEVESK Acetyl (Protein N-term) 1645.757 0.75704193 3909 Q96NL8 C8orf37 Protein C8orf37 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.52 171.52 2 3.3809E-14 174927 QUIQUE_C1277_190116_001 142.07 129.49 151410000 0 14630000 19695000 0 20847000 0 21490000 14554000 42235000 0 0 17959000 0 896 3909 837 8066;8067;8068;8069;8070;8071;8072;8073 10480;10481;10482;10483;10484;10485;10486;10487 10480 8 AEDLNIAPR Unmodified 997.51926 0.51925868 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 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2;3 1.3569E-05 146034 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.79 79.617 2812600000 334030000 71023000 0 116130000 102590000 72741000 104930000 467890000 605260000 0 308480000 337960000 291590000 900 2495 841 8084;8085;8086;8087;8088;8089;8090;8091;8092;8093;8094;8095;8096;8097;8098 10499;10500;10501;10502;10503;10504;10505;10506;10507;10508;10509;10510;10511;10512;10513;10514;10515;10516;10517 10514 15 AEDRPQQPQLDMPLVLDQGLTR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2577.2857 0.28570027 2495 P47874 OMP Olfactory marker protein yes yes 1 1 1 1 1 2 1 117.54 117.54 2;3 7.5635E-06 121342 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.853 60.758 208670000 0 0 0 0 38329000 0 0 46700000 71341000 0 0 0 52297000 901 2495 841 8099;8100;8101;8102;8103 10518;10519;10520;10521;10522 10520 1923 4 AEDSGEYHCVYHFVSAPK Unmodified 2094.9105 0.91053965 4641 Q9Y639;Q9UFM8 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 2 2 2 2 1 2 2 2 59.398 59.398 2;3;4 1.1521E-75 58263 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.14 182.19 6570300000 711310000 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23 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.682 36.682 2 0.00047031 32479 QUIQUE_C1438_190116_001 106.68 92.009 271780000 0 0 39267000 44792000 86493000 0 0 16975000 0 0 39426000 0 44829000 904 303 844 8142;8143;8144;8145;8146;8147;8148;8149 10564;10565;10566;10567;10568;10569;10570;10571 10566 8 AEDTAVYYCAR Unmodified 1317.566 0.56595087 1814 P01780;A0A0J9YVY3;A0A0B4J1V1;P01763;P01762 IGHV3-21 Ig heavy chain V-III region JON;Ig heavy chain V-III region WEA;Ig heavy chain V-III region TRO no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 41.082 41.082 2 1.8371E-24 37640 QUIQUE_C1277_190116_001 183.65 179.71 931100000 0 593730000 69935000 77460000 101890000 0 0 0 0 27864000 60214000 0 0 905 1814 845 8150;8151;8152;8153;8154;8155;8156;8157 10572;10573;10574;10575;10576;10577;10578;10579;10580 10573 6 AEDYDVVK Unmodified 937.43928 0.43927702 1610 O75116;D6REE7;C9JFJ0 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 28.729 28.729 2 0.030205 23509 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.169 24.169 70150000 0 0 39835000 0 0 0 0 0 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8200;8201;8202;8203;8204;8205;8206;8207;8208;8209;8210;8211 10628;10629;10630;10631;10632;10633;10634;10635;10636;10637;10638;10639 10630 11 AEEEFNIEK Unmodified 1107.5084 0.50841922 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.216 43.216 2 0.00034436 39887 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.83 113.74 8963600000 997500000 1062500000 791100000 825140000 809170000 735850000 808640000 445260000 460270000 293120000 595230000 516630000 623250000 915 2397 854 8212;8213;8214;8215;8216;8217;8218;8219;8220;8221;8222;8223;8224 10640;10641;10642;10643;10644;10645;10646;10647;10648;10649;10650;10651;10652;10653;10654;10655;10656;10657;10658;10659 10654 20 AEEENEFQIPGR Unmodified 1417.6474 0.64737232 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.284 69.284 2 1.0217E-43 69571 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.26 125.69 272020000 0 0 47830000 0 40279000 0 54528000 0 0 0 59240000 0 70145000 916 3565 855 8225;8226;8227;8228;8229;8230;8231;8232 10660;10661;10662;10663;10664;10665;10666;10667;10668;10669 10664 10 AEEEQAGSAPGAGSTATK Unmodified 1660.754 0.75402223 1334 K7ES98;K7EM85;Q92619;F5H1R4;K7ES92 HMHA1 Minor histocompatibility protein HA-1;Minor histocompatibility antigen HA-1 yes no 0 0 0 1 15.956 15.956 2 1.999E-13 8277 QUIQUE_C1368_190116_001 125.97 101.72 19680000 0 0 19680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 917 1334 856 8233 10670 10670 1 AEEGIAAGGVMDVNTALQEVLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2272.1257 0.12567738 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 1 1 0 3 3 1 2 2 3 2 2 1 1 2 1 2 169.13 169.13 2;3 9.5339E-88 172053 QUIQUE_C1403_190116_001 187.37 173.65 1837700000 154830000 275140000 112020000 126180000 223430000 204840000 164850000 107710000 85715000 34979000 134540000 71215000 142240000 918 2240 857 8234;8235;8236;8237;8238;8239;8240;8241;8242;8243;8244;8245;8246;8247;8248;8249;8250;8251;8252;8253;8254;8255;8256;8257;8258 10671;10672;10673;10674;10675;10676;10677;10678;10679;10680;10681;10682;10683;10684;10685;10686;10687;10688;10689;10690;10691;10692;10693;10694;10695 10678 1599 17 AEEGIAAGGVMDVNTALQEVLK Acetyl (Protein N-term) 2256.1308 0.13076276 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 1 0 0 2 2 3 2 2 2 4 3 1 5 2 3 172.13 172.13 2;3 9.4704E-55 176605 QUIQUE_C1368_190116_001 208.47 187.63 2303600000 137410000 139350000 348830000 113390000 137230000 0 257380000 191450000 245190000 22699000 194510000 263650000 252480000 919 2240 857 8259;8260;8261;8262;8263;8264;8265;8266;8267;8268;8269;8270;8271;8272;8273;8274;8275;8276;8277;8278;8279;8280;8281;8282;8283;8284;8285;8286;8287;8288;8289 10696;10697;10698;10699;10700;10701;10702;10703;10704;10705;10706;10707;10708;10709;10710;10711;10712;10713;10714;10715;10716;10717;10718;10719;10720;10721;10722;10723;10724;10725;10726;10727;10728;10729;10730 10700 35 AEEIANEMIEAAK Unmodified 1417.6759 0.67589525 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.771 82.771 2 0.00045332 84206 QUIQUE_C1368_190116_001 107.85 68.825 599400000 73565000 70100000 64793000 0 46921000 0 0 50170000 74171000 0 93738000 58618000 67326000 920 2533 858 8290;8291;8292;8293;8294;8295;8296;8297;8298;8299 10731;10732;10733;10734;10735;10736;10737;10738;10739;10740;10741 10734 10 AEELFLWVPR Unmodified 1258.671 0.67100829 3485 Q86TU7;Q6NXR6 SETD3 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.42 136.42 2 0.0001978 141367 QUIQUE_C1368_190116_001 123.92 95.19 177680000 19651000 21509000 19510000 23674000 0 18908000 18526000 0 16322000 10125000 15278000 0 14173000 921 3485 859 8300;8301;8302;8303;8304;8305;8306;8307;8308;8309;8310 10742;10743;10744;10745;10746;10747;10748;10749;10750;10751;10752 10744 11 AEELGLPILGVLR Unmodified 1378.8184 0.81840081 1956 P09110;C9JDE9;H7C131 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 148.33 148.33 2 5.3203E-09 151108 QUIQUE_C1563_190116_001 139.96 129.13 900430000 74573000 73199000 81520000 93861000 64195000 79357000 70000000 54325000 68181000 24661000 85529000 67664000 63359000 922 1956 860 8311;8312;8313;8314;8315;8316;8317;8318;8319;8320;8321;8322;8323;8324;8325 10753;10754;10755;10756;10757;10758;10759;10760;10761;10762;10763;10764;10765;10766;10767;10768;10769;10770;10771;10772;10773;10774;10775;10776;10777;10778;10779;10780;10781;10782;10783 10768 31 AEELHYPLGER Unmodified 1312.6412 0.64116473 3058 Q14257;A8MXP8;H0YL43 RCN2 Reticulocalbin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.676 44.676 3 0.0011973 40646 QUIQUE_C1563_190116_001 56.02 37.348 409590000 115370000 71028000 38066000 50505000 0 57165000 0 23976000 0 33105000 20383000 0 0 923 3058 861 8326;8327;8328;8329;8330;8331;8332;8333 10784;10785;10786;10787;10788;10789;10790;10791;10792 10788 9 AEELIQEIQR Unmodified 1227.6459 0.64591575 610 B4DHR0;Q9H5N1;H3BNR8;H3BU67;H3BNR2;H3BT64 RABEP2 Rab GTPase-binding effector protein 2 yes no 0 0 0 1 1 68.882 68.882 2 0.0056777 68832 QUIQUE_C1403_190116_001 107.57 72.35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 924 610 862 8334;8335 10793;10794 10793 2 AEELLAEEK Unmodified 1030.5183 0.51825563 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.203 33.203 2 0.0075401 28263 QUIQUE_C1403_190116_001 116.37 86.186 1042600000 0 0 185400000 254210000 0 0 0 0 0 91050000 0 171980000 339980000 925 1108;1404 863 8336;8337;8338;8339;8340 10795;10796;10797;10798;10799 10796 0 AEELQPGFSK Unmodified 1104.5451 0.54513908 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 37.461 37.461 2 0.0057685 33765 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.345 49.383 131960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131960000 0 0 926 3949 864 8341 10800 10800 1 AEELVLER Acetyl (Protein N-term) 999.52368 0.52367535 2190 P21980;A2A299;A2A2A0 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 104.18 104.18 2 0.0081048 108625 QUIQUE_C1218_190116_001 83.265 61.494 280540000 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8412;8413;8414;8415;8416;8417;8418;8419;8420;8421;8422;8423;8424;8425;8426;8427;8428;8429;8430;8431 10877;10878;10879;10880;10881;10882;10883;10884;10885;10886;10887;10888;10889;10890;10891;10892;10893;10894;10895;10896;10897;10898;10899;10900;10901;10902;10903;10904;10905;10906;10907;10908 10877 30 AEFAEVSK Unmodified 879.4338 0.43379771 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.572 23.572 2 0.0030423 16922 QUIQUE_C1438_190116_001 133.6 37.807 42252000000 4990000000 0 0 5646400000 9989400000 4032200000 0 1126000000 3715100000 1520800000 5237700000 0 5994700000 + 938 769 874 8432;8433;8434;8435;8436;8437;8438;8439;8440;8441 10909;10910;10911;10912;10913;10914;10915;10916;10917;10918;10919;10920;10921;10922 10912 14 AEFFADVVPAVR Unmodified 1319.6874 0.68738664 4440 Q9UHY7;D6RA00;A0A0C4DGY8 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 115.15 115.15 2;3 0.00015961 117845 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1 1 1 1 1 38.156 38.156 2 0.0040675 33676 QUIQUE_C1563_190116_001 69.672 45.517 950310000 57860000 83478000 90167000 86326000 71908000 64259000 86397000 78849000 80649000 0 95595000 64779000 90042000 941 4169 877 8463;8464;8465;8466;8467;8468;8469;8470;8471;8472;8473;8474 10969;10970;10971;10972;10973;10974;10975;10976;10977;10978;10979;10980;10981;10982;10983;10984 10977 16 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEK Unmodified 3833.988 0.98799192 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 171.62 171.62 3;4 5.9589E-39 178851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.56 90.938 1493300000 0 0 0 0 0 0 0 30078000 141090000 0 480260000 771660000 70238000 942 2483 878 8475;8476;8477;8478;8479;8480;8481;8482;8483 10985;10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993 10990 9 AEFLGSGLLQHNCK Unmodified 1572.7719 0.77186132 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J3Z0;C9J4I1;C9JK59;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 1 1 1 68.913 68.913 3 0.0011787 69056 QUIQUE_C1277_190116_001 61.423 57.815 207090000 0 70394000 0 68012000 0 0 68683000 0 0 0 0 0 0 943 4476;703 879 8484;8485;8486 10994;10995;10996 10994 3 AEFTVETR Unmodified 951.46616 0.46616048 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 34.124 34.124 2 0.035455 29312 QUIQUE_C1218_190116_001 63.419 46.455 27401000 27401000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 944 2178 880 8487;8488;8489 10997;10998;10999 10997 3 AEFVEVTK Unmodified 921.48075 0.48074791 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.395 35.395 2 0.0047749 30076 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.9 67.792 902070000 100530000 67999000 45173000 0 128960000 88326000 0 0 106010000 365080000 0 0 0 + 945 770 881 8490;8491;8492;8493;8494;8495;8496 11000;11001;11002;11003;11004;11005;11006;11007;11008;11009;11010 11009 11 AEGAATEEEGTPK Unmodified 1288.5783 0.5782897 2817 P80723;U3KQP0 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.986 13.986 2 3.2141E-31 5935 QUIQUE_C1403_190116_001 177.57 117.77 2178700000 374990000 561070000 389050000 254590000 296400000 0 0 65445000 117810000 0 47649000 71727000 0 946 2817 882 8497;8498;8499;8500;8501;8502;8503;8504;8505 11011;11012;11013;11014;11015;11016;11017;11018;11019;11020;11021;11022 11014 12 AEGDISNVANGFK Unmodified 1320.631 0.63099397 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 67.056 67.056 2 0.00012736 67859 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.31 93.09 235530000 0 0 0 0 0 0 0 0 130510000 0 105030000 0 0 947 4392 883 8506;8507 11023;11024 11024 2 AEGDSWVLNGTK Unmodified 1275.6095 0.60953025 2105 P16219 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 63.526 63.526 2 0.0017523 62144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.311 57.614 42270000 0 0 0 0 0 0 0 42270000 0 0 0 0 0 948 2105 884 8508 11025 11025 1 AEGDVAALNR Unmodified 1014.5094 0.50942227 435;2791 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;P67936 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.898 26.898 2 3.3688E-11 21017 QUIQUE_C1438_190116_001 195.06 140.29 1580200000 205400000 0 202850000 214940000 280810000 227390000 207530000 0 0 0 137180000 104130000 0 949 435;2791 885 8509;8510;8511;8512;8513;8514;8515;8516 11026;11027;11028;11029;11030;11031;11032;11033 11029 7 AEGEITTFTALTEK Acetyl (Protein N-term) 1551.7668 0.76681875 1884 P05230;C9JDC5;B5MCF4;C9JUP6 FGF1 Fibroblast growth factor 1 yes no 1 0 0 1 140.9 140.9 2 0.0063928 137124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.451 54.76 46068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46068000 0 0 0 950 1884 886 8517 11034 11034 0 AEGEPCGDEGAEAPVEGDIHYQR Unmodified 2485.0452 0.045195231 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.052 59.052 3 3.2052E-14 58683 QUIQUE_C1218_190116_001 107.74 104.45 678290000 64404000 78772000 97226000 67878000 69156000 23951000 73696000 29735000 0 17752000 66611000 28790000 60317000 951 4176 887 8518;8519;8520;8521;8522;8523;8524;8525;8526;8527;8528;8529 11035;11036;11037;11038;11039;11040;11041;11042;11043;11044;11045;11046;11047 11035 13 AEGEREEEGRAEAPDK Unmodified 1771.7973 0.79728403 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 1 10.275 10.275 3 9.8853E-06 2660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.67 61.973 35743000 0 0 0 0 0 0 0 11124000 0 0 0 24619000 0 952 921 888 8530;8531 11048;11049 11048 2 AEGFFGMYR Unmodified 1076.475 0.47495102 4134 Q9H1K4 SLC25A18 Mitochondrial glutamate carrier 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.356 93.356 2 0.0058804 95666 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.798 69.58 177200000 26308000 26411000 35020000 0 20155000 0 0 22779000 20977000 0 25546000 0 0 953 4134 889 8532;8533;8534;8535;8536;8537;8538 11050;11051;11052;11053;11054;11055;11056 11055 6 AEGFVDALHR Unmodified 1113.5567 0.55670682 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.571 47.571 3 0.011798 45391 QUIQUE_C1277_190116_001 39.937 30.282 182570000 0 41794000 26313000 33905000 0 36712000 0 0 0 0 0 0 43844000 954 3875 890 8539;8540;8541;8542;8543 11057;11058;11059;11060;11061 11057 2 AEGGAADLDTQR Acetyl (Protein N-term) 1244.5633 0.56330834 4605 Q9Y4E8;F8W0H4 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 1 0 0 1 1 52.372 52.372 2 0.0014673 50518 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 65.834 62109000 33230000 0 0 0 0 0 0 28879000 0 0 0 0 0 955 4605 891 8544;8545 11062;11063;11064 11062 3 AEGGGGGGRPGAPAAGDGK Unmodified 1537.7233 0.72333123 2849 Q00839 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes yes 0 0 1 1 1 10.433 10.433 3 3.0062E-05 2771 QUIQUE_C1563_190116_001 91.589 63.728 12539000 0 5305700 0 0 0 7232900 0 0 0 0 0 0 0 956 2849 892 8546;8547 11065;11066 11066 2 AEGILDVFQTVK Unmodified 1318.7133 0.71326704 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.56 127.56 2 0.00044843 131516 QUIQUE_C1403_190116_001 110.38 72.826 628990000 60392000 55683000 80406000 51274000 44182000 46175000 84956000 26310000 52241000 27379000 46734000 0 53259000 957 2137 893 8548;8549;8550;8551;8552;8553;8554;8555;8556;8557;8558;8559 11067;11068;11069;11070;11071;11072;11073;11074;11075;11076;11077;11078;11079;11080;11081 11071 15 AEGIPVEMVVIGDDSAFTVLK Unmodified 2189.129 0.12897185 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 158.45 158.45 2 1.2133E-07 160939 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.993 85.722 477410000 43658000 45195000 48495000 46931000 53083000 55453000 0 49740000 35307000 23070000 0 31845000 44627000 958 3226 894 8560;8561;8562;8563;8564;8565;8566;8567;8568;8569;8570;8571 11082;11083;11084;11085;11086;11087;11088;11089;11090;11091;11092;11093;11094;11095;11096 11089 15 AEGIPVEMVVIGDDSAFTVLKK Unmodified 2317.2239 0.22393487 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 1 1 1 140.95 140.95 3 0.00096852 144157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.162 35.802 116140000 0 0 0 0 0 0 0 70794000 0 0 45344000 0 0 959 3226 895 8572;8573 11097;11098;11099 11098 3 AEGLGDGYR Unmodified 936.43011 0.43010932 4060 Q9BX68 HINT2 Histidine triad nucleotide-binding protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.974 25.974 2 0.0013568 19579 QUIQUE_C1563_190116_001 104.44 74.252 1525100000 154820000 136340000 129340000 110130000 0 135370000 143520000 94667000 162560000 0 183160000 127530000 147690000 960 4060 896 8574;8575;8576;8577;8578;8579;8580;8581;8582;8583;8584 11100;11101;11102;11103;11104;11105;11106;11107;11108;11109;11110;11111 11104 6 AEGLGHEQTPLPAAQAQVQATGPEAGR Unmodified 2683.3314 0.33140491 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 64.956 64.956 3 1.0642E-53 63853 QUIQUE_DMIX8_190116_001 142.4 134.95 381730000 58332000 0 0 72366000 42317000 0 0 49776000 0 0 57822000 0 101120000 961 3889 897 8585;8586;8587;8588;8589;8590;8591;8592 11112;11113;11114;11115;11116;11117;11118;11119;11120 11119 8 AEGLLDVFQAVK Unmodified 1288.7027 0.70270235 2216 P23469 PTPRE Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon yes yes 0 0 0 1 133.63 133.63 2 0.0014385 129954 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.338 62.359 13328000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13328000 0 0 0 962 2216 898 8593 11121 11121 1 AEGNTLISVDYEIFGK Acetyl (Protein N-term) 1796.8832 0.88324549 1919 P07311;G3V3F8;G3V597 ACYP1 Acylphosphatase-1 yes no 1 0 0 1 1 165.61 165.61 2 3.9102E-05 167644 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.763 66.132 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 963 1919 899 8594;8595 11122;11123 11122 2 AEGPDVAVDLPK Unmodified 1209.6241 0.62411768 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 69.415 69.415 2 0.00054432 68824 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.058 72.728 103900000 0 0 0 0 0 0 0 103900000 0 0 0 0 0 964 2935 900 8596 11124 11124 1 AEGPEVDVNLPK Unmodified 1266.6456 0.6455814 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.255 66.255 2 0.00054432 62799 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.058 75.622 4736000000 0 277080000 251780000 362310000 378730000 528740000 330630000 974210000 310140000 177140000 428440000 338500000 378300000 965 2935 901 8597;8598;8599;8600;8601;8602;8603;8604;8605;8606;8607;8608 11125;11126;11127;11128;11129;11130;11131;11132;11133;11134;11135;11136;11137;11138;11139 11135 15 AEGPPEPSR Unmodified 938.44576 0.44575938 3201 Q16849 PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N yes yes 0 0 0 1 1 15.437 15.437 2 0.020857 7149 QUIQUE_C1277_190116_001 62.582 21.46 26872000 13466000 13406000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 966 3201 902 8609;8610 11140;11141 11141 2 AEGSAVSDPQHAAR Acetyl (Protein N-term) 1436.6644 0.66441937 4143 Q9H2C0;A0A3B3ITY2;A0A0S2Z5G5 GAN Gigaxonin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 26.965 26.965 2 4.1006E-18 21565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.48 128.37 406340000 0 0 0 0 67891000 0 0 58455000 76073000 30630000 0 76145000 97148000 967 4143 903 8611;8612;8613;8614;8615;8616 11142;11143;11144;11145;11146;11147;11148;11149;11150 11144 9 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAK Oxidation (M) 2509.1312 0.13123305 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 130.17 130.17 2;3 4.3133E-98 134147 QUIQUE_C1403_190116_001 180.62 169.99 1196000000 91099000 296710000 115370000 72720000 72796000 57826000 63872000 0 28944000 81735000 175520000 36677000 102700000 968 1203;2077 904 8617;8618;8619;8620;8621;8622;8623;8624;8625;8626;8627;8628;8629;8630;8631 11151;11152;11153;11154;11155;11156;11157;11158;11159;11160;11161;11162;11163;11164;11165;11166;11167 11158 688 16 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAK Unmodified 2493.1363 0.13631842 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 4 3 3 3 2 4 3 2 2 2 2 2 2 152.5 152.5 2;3 1.2267E-217 158284 QUIQUE_C1218_190116_001 192.58 186.12 24889000000 2795000000 2873600000 3293100000 2466700000 2168200000 2127200000 2473300000 679610000 750940000 327460000 1744100000 1907900000 1282200000 969 1203;2077 904 8632;8633;8634;8635;8636;8637;8638;8639;8640;8641;8642;8643;8644;8645;8646;8647;8648;8649;8650;8651;8652;8653;8654;8655;8656;8657;8658;8659;8660;8661;8662;8663;8664;8665 11168;11169;11170;11171;11172;11173;11174;11175;11176;11177;11178;11179;11180;11181;11182;11183;11184;11185;11186;11187;11188;11189;11190;11191;11192;11193;11194;11195;11196;11197;11198;11199;11200;11201;11202;11203;11204;11205;11206;11207;11208;11209;11210;11211;11212;11213;11214;11215;11216;11217;11218;11219;11220;11221;11222;11223;11224;11225;11226;11227;11228;11229 11169 62 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVR Unmodified 3493.6341 0.63411338 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 1 1 1 155.76 155.76 3 7.6919E-99 158553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.97 149.18 152430000 0 0 0 0 0 0 0 57165000 27277000 0 67986000 0 0 970 1203;2077 905 8666;8667;8668 11230;11231;11232;11233;11234;11235 11230 6 AEGSSTASSGSQLAEGK Unmodified 1565.7169 0.71690845 4342 Q9NZB2;A0A0C4DH52 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 19.705 19.705 2 7.617E-63 12262 QUIQUE_C1368_190116_001 187.11 166.81 136320000 51073000 0 37528000 0 47721000 0 0 0 0 0 0 0 0 971 4342 906 8669;8670;8671 11236;11237;11238 11237 3 AEGVALTNATGAVESTSQAGDR Unmodified 2104.0033 0.0032540621 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 71.512 71.512 2 5.9609E-66 72305 QUIQUE_C1218_190116_001 174.39 134.28 60094000 32862000 0 0 0 0 27232000 0 0 0 0 0 0 0 972 4069 907 8672;8673 11239;11240 11239 2 AEGYEVAHGGR Unmodified 1144.5261 0.52613497 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 2 13.348 13.348 2;3 0.00066494 5373 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.044 68.882 10099000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10099000 0 0 0 973 1148 908 8674;8675 11241;11242 11241 2 AEGYNLKDEDGR Unmodified 1365.6161 0.61607219 3349 Q66LE6;H0YB06;A0A3B3IRK1 PPP2R2D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform yes no 0 0 1 1 1 21.151 21.151 2 0.015489 14474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.062 57.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 974 3349 909 8676;8677 11243;11244 11243 2 AEHDQLLLNYAK Unmodified 1413.7252 0.72522871 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.185 57.185 2 0.00073616 55169 QUIQUE_C1368_190116_001 98.257 80.821 229410000 48375000 40634000 51340000 34209000 0 54847000 0 0 0 0 0 0 0 975 2171 910 8678;8679;8680;8681;8682 11245;11246;11247;11248;11249;11250 11247 6 AEHDSILAEK Unmodified 1111.551 0.55095274 2253 P26639;D6R9F8;D6RCA5;D6RDJ6;D6RBR8 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 18.105 18.105 2;3 0.0049728 10358 QUIQUE_C1277_190116_001 117.01 50.663 185870000 0 0 0 18887000 0 0 0 70717000 28392000 67879000 0 0 0 976 2253 911 8683;8684;8685;8686;8687;8688;8689 11251;11252;11253;11254;11255;11256;11257 11252 5 AEHLDHVMFR Unmodified 1253.5975 0.59752577 1728 O95394;D6RCQ8;D6RF77;D6RCD1;D6RC77 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 31.433 31.433 2;3 0.0030649 25763 QUIQUE_C1368_190116_001 60.434 50.746 416260000 98015000 0 142140000 105310000 0 70790000 0 0 0 0 0 0 0 977 1728 912 8690;8691;8692;8693;8694;8695;8696 11258;11259;11260;11261;11262;11263;11264 11259 6 AEIAFEDRK Unmodified 1077.5455 0.54547343 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 22.405 22.405 3 0.034399 15673 QUIQUE_C1576_190116_001 32.218 22.422 25284000 0 0 0 0 0 0 25284000 0 0 0 0 0 0 978 3061 913 8697 11265 11265 1 AEIDMLDIR Unmodified 1074.5379 0.53794521 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 95.167 95.167 2 0.013805 97526 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.423 35.873 267720000 0 0 0 115410000 0 0 0 0 0 0 0 0 152310000 979 1968 914 8698;8699 11266;11267 11267 2 AEIENLHR Unmodified 980.50394 0.50394296 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;Q5SSB8;A0A0G2JIQ0;A0A0G2JHB7;A0A140T9L1;A0A0G2JJE4;A0A0G2JI49;A0A0G2JIU9;A0A0G2JHA9;A0A0G2JKI0;A0A1W2PQ17;E9PG44 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.544 17.544 2 0.0036473 10023 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.57 59.183 657820000 0 126260000 41638000 75821000 0 0 44878000 134950000 77901000 102020000 0 0 54351000 980 743 915 8700;8701;8702;8703;8704;8705;8706;8707 11268;11269;11270;11271;11272;11273;11274;11275 11274 6 AEIENYVLTYK Unmodified 1341.6816 0.68163256 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 93.356 93.356 2 0.0014212 93867 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 80.96 958770000 614330000 0 0 0 0 0 0 0 0 344440000 0 0 0 981 3753 916 8708;8709;8710;8711;8712;8713;8714;8715;8716;8717;8718;8719;8720;8721 11276;11277;11278;11279;11280;11281;11282;11283;11284;11285;11286;11287;11288;11289 11278 13 AEIISLCK Unmodified 932.5001 0.50010314 4063 Q9BXP5;H7C3A1;H7C1K0 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.032 51.032 2 0.020244 48343 QUIQUE_C1403_190116_001 77.058 47.956 127370000 0 39444000 0 32221000 0 0 0 32607000 23094000 0 0 0 0 982 4063 917 8722;8723;8724;8725 11290;11291;11292;11293 11291 4 AEIQVGLQPGQGEQLLASEPSWWTTGK Unmodified 2909.4559 0.45593672 4192 Q9H993;F5GZY1 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 149.08 149.08 3 0.047344 144629 QUIQUE_DMIX4_190116_001 20.276 15.467 31835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31835000 0 0 0 983 4192 918 8726 11294 11294 1 AEISDLDR Acetyl (Protein N-term) 959.45599 0.45598972 2693 P60510;H3BTA2;H3BV22;I3L4X0;H3BPN5;H3BVE3 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 1 0 0 1 1 80.534 80.534 2 0.025621 81867 QUIQUE_C1368_190116_001 61.999 40.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 984 2693 919 8727;8728 11295;11296 11295 2 AEISELPSIVQDLANGNITWADVEAR Unmodified 2810.4087 0.40865218 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 169.87 169.87 2;3 5.4189E-99 174311 QUIQUE_DMIX3_190116_001 239.58 213.14 1541900000 0 56800000 0 0 83968000 0 254720000 176860000 345010000 0 293420000 167380000 163780000 985 2440 920 8729;8730;8731;8732;8733;8734;8735;8736;8737;8738;8739;8740 11297;11298;11299;11300;11301;11302;11303;11304;11305;11306;11307;11308 11304 12 AEISFEDR Unmodified 965.44543 0.44542503 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.942 42.942 2 0.0036626 40617 QUIQUE_C1218_190116_001 119.29 68.325 301140000 44061000 38824000 53347000 0 49258000 39416000 45476000 0 0 0 0 30762000 0 986 2178 921 8741;8742;8743;8744;8745;8746;8747 11309;11310;11311;11312;11313;11314;11315;11316;11317 11309 9 AEISFEDRK Unmodified 1093.5404 0.54038805 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 23.164 23.164 2;3 0.00085991 17447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.74 65.313 346610000 0 0 0 0 64102000 0 0 57819000 88739000 0 71562000 0 64389000 987 2178 922 8748;8749;8750;8751;8752 11318;11319;11320;11321;11322 11319 5 AEISNAIDQYVTGTIGEDEDLIK Unmodified 2493.2122 0.21224378 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 156.74 156.74 2;3 6.7178E-127 159274 QUIQUE_DMIX1_190116_001 272.95 225.76 1120400000 41430000 48028000 59627000 96919000 98639000 73729000 111810000 87525000 143690000 0 148410000 100370000 110220000 988 2339 923 8753;8754;8755;8756;8757;8758;8759;8760;8761;8762;8763;8764;8765;8766;8767;8768;8769;8770;8771;8772;8773;8774 11323;11324;11325;11326;11327;11328;11329;11330;11331;11332;11333;11334;11335;11336;11337;11338;11339;11340;11341;11342;11343;11344;11345;11346;11347;11348 11335 26 AEITDAEGLGLK Unmodified 1215.6347 0.63468237 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.51 72.51 2 0.00091976 73498 QUIQUE_C1576_190116_001 85.377 46.229 1599800000 187210000 152160000 158090000 146120000 165870000 143890000 199080000 0 0 93271000 0 149530000 204600000 989 890;3052 924 8775;8776;8777;8778;8779;8780;8781;8782;8783;8784 11349;11350;11351;11352;11353;11354;11355;11356;11357;11358;11359;11360 11357 10 AEITFDDHK Unmodified 1074.4982 0.49818889 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 24.231 24.231 3 0.0069624 17916 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.473 36.266 26839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26839000 0 990 1628 925 8785;8786;8787 11361;11362;11363 11363 3 AEIVTEAEPEVDNLLVSDATPDGFR Unmodified 2686.2974 0.2973704 2233 P24821 TNC Tenascin yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 143.45 143.45 2;3 2.5716E-57 146329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.34 188.83 2434200000 0 0 98462000 0 138370000 197790000 96860000 311780000 557160000 139830000 296140000 353370000 244470000 991 2233 926 8788;8789;8790;8791;8792;8793;8794;8795;8796;8797;8798;8799;8800;8801;8802;8803;8804;8805;8806 11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;11372;11373;11374;11375;11376;11377;11378;11379;11380;11381;11382;11383;11384;11385;11386 11373 22 AEKDEPGAWEETFK Unmodified 1635.7417 0.74166663 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 62.729 62.729 2;3 4.0061E-13 61800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.83 114.82 1618800000 148840000 108820000 149170000 129600000 180860000 104100000 126380000 140380000 114700000 67428000 103300000 141810000 103380000 992 956;3084 927 8807;8808;8809;8810;8811;8812;8813;8814;8815;8816;8817;8818;8819;8820;8821;8822;8823;8824;8825;8826;8827;8828;8829 11387;11388;11389;11390;11391;11392;11393;11394;11395;11396;11397;11398;11399;11400;11401;11402;11403;11404;11405;11406;11407;11408;11409;11410;11411;11412 11403 24 AEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLR Unmodified 2725.4473 0.44728629 1442 O14770;H0YMX5;F5GYS8;H0YNY8;U3KPR8;O00470 MEIS2;MEIS1 Homeobox protein Meis2;Homeobox protein Meis1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 167.47 167.47 3 0.00018521 172218 QUIQUE_C1218_190116_001 47.281 40.847 358470000 93996000 0 0 0 0 0 0 69574000 0 9291600 185610000 0 0 993 1442 928 8830;8831;8832;8833 11413;11414;11415;11416 11413 4 AELAELPLR Unmodified 1010.576 0.57604528 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 75.182 75.182 2 0.0053947 76401 QUIQUE_C1438_190116_001 86.794 43.548 242510000 0 0 0 0 160850000 0 0 0 0 81657000 0 0 0 994 3926 929 8834;8835 11417;11418;11419 11418 2 AELANIER Unmodified 914.48214 0.48214489 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 30.25 30.25 2 0.042452 25259 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 21.422 72207000 0 0 0 0 0 0 0 26072000 0 11844000 34291000 0 0 995 4145 930 8836;8837;8838 11420;11421;11422 11420 3 AELATEEFLPVTPILEGFVILR Unmodified 2456.3567 0.3566636 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 2 2 2 2 173.67 173.67 2;3 3.1816E-15 176871 QUIQUE_C1277_190116_001 116.65 108.26 1171000000 72719000 42922000 11607000 7634500 74946000 14651000 34821000 106650000 160940000 0 271400000 247010000 125690000 996 2976 931 8839;8840;8841;8842;8843;8844;8845;8846;8847;8848;8849;8850;8851;8852;8853;8854;8855;8856;8857;8858 11423;11424;11425;11426;11427;11428;11429;11430;11431;11432;11433;11434;11435;11436;11437;11438;11439;11440;11441;11442;11443;11444 11425 22 AELDDTPMR Unmodified 1046.4703 0.47025958 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 36.511 36.511 2 0.0053947 31795 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 60.9 282360000 0 166770000 0 0 0 115590000 0 0 0 0 0 0 0 997 2208 932 8859;8860 11445;11446 11446 1 AELDDTPMR Oxidation (M) 1062.4652 0.4651742 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 1 0 1 1 21.08 21.08 2 0.024792 14368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.546 38.591 302550000 0 0 0 0 0 0 0 144520000 0 0 158020000 0 0 998 2208 932 8861;8862 11447;11448 11448 2 AELDEVNK Unmodified 916.45018 0.45017606 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 19.947 19.947 2 0.011936 13151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.296 41.447 495270000 0 0 0 90588000 0 0 0 139040000 0 265650000 0 0 0 999 2886 933 8863;8864;8865 11449;11450;11451 11450 3 AELDGTILK Unmodified 958.53351 0.53351176 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.655 56.655 2 0.0089591 55938 QUIQUE_C1218_190116_001 77.318 38.526 720350000 95532000 108310000 90162000 75471000 0 82575000 77292000 68485000 76147000 46380000 0 0 0 1000 3719 934 8866;8867;8868;8869;8870;8871;8872;8873;8874 11452;11453;11454;11455;11456;11457;11458;11459;11460;11461;11462;11463;11464;11465;11466;11467 11453 16 AELEALLSSK Unmodified 1059.5812 0.58119023 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 81.209 81.209 2 0.0085422 83864 QUIQUE_C1438_190116_001 81.338 47.541 53220000 0 0 0 0 53220000 0 0 0 0 0 0 0 0 1001 3459 935 8875 11468 11468 1 AELEALLSSKDDVGK Unmodified 1573.8199 0.81991695 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 78.107 78.107 3 0.036004 78088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.587 28.147 33549000 0 0 0 0 0 0 0 33549000 0 0 0 0 0 1002 3459 936 8876 11469 11469 1 AELEEMEEVHPSDEEEEDATK Unmodified 2445.0013 0.0013243106 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 68.403 68.403 3 6.2112E-06 67693 QUIQUE_C1403_190116_001 74.047 65.447 113680000 27717000 0 0 40140000 0 45823000 0 0 0 0 0 0 0 1003 921 937 8877;8878;8879 11470;11471;11472 11471 3 AELEEVTLDGKPLQALR Acetyl (Protein N-term) 1923.0313 0.031306714 4745 S4R3H4 ACIN1 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.63 134.63 2 1.0093E-29 140368 QUIQUE_C1218_190116_001 152.89 131.64 384940000 35264000 31054000 0 30442000 38326000 19755000 22389000 44917000 41440000 0 46490000 35182000 39678000 1004 4745 938 8880;8881;8882;8883;8884;8885;8886;8887;8888;8889;8890 11473;11474;11475;11476;11477;11478;11479;11480;11481;11482;11483;11484;11485 11473 13 AELEHLGGK Acetyl (Protein N-term) 994.50836 0.50835964 1563 O60237;Q6GQY8 PPP1R12B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B yes no 1 0 0 1 1 1 57.827 57.827 2 0.01752 56045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.679 41.054 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1005 1563 939 8891;8892;8893 11486;11487;11488 11486 3 AELEIQK Unmodified 829.45453 0.45453316 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 23.497 23.497 2 0.019293 17085 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.02 34.569 442630000 0 152260000 0 0 0 130820000 0 0 0 66863000 0 0 92692000 1006 1928 940 8894;8895;8896;8897 11489;11490;11491;11492 11491 4 AELEIQKDALEPGQR Unmodified 1695.8792 0.87916317 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 1 2 58.091 58.091 2;3 0.0002632 55971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.415 56.93 117560000 0 0 0 0 0 0 0 117560000 0 0 0 0 0 1007 1928 941 8898;8899 11493;11494 11493 2 AELELELGR Unmodified 1028.5502 0.55022446 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 76.551 76.551 2 0.00025853 77040 QUIQUE_C1277_190116_001 137.9 39.446 1929300000 137880000 126220000 171730000 43323000 146030000 57227000 149820000 273650000 0 117220000 328470000 228470000 149210000 1008 3117 942 8900;8901;8902;8903;8904;8905;8906;8907;8908;8909;8910;8911;8912 11495;11496;11497;11498;11499;11500;11501;11502;11503;11504;11505;11506;11507;11508;11509;11510;11511;11512;11513;11514;11515;11516;11517;11518;11519;11520;11521;11522;11523 11499 29 AELFTQSCADLDK Unmodified 1496.6817 0.68170891 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 72.146 72.146 2 3.2141E-31 72845 QUIQUE_C1218_190116_001 177.57 164.99 5521300000 738590000 608650000 472860000 540750000 556170000 471460000 466170000 120480000 245350000 358760000 362940000 227750000 351340000 1009 2851 943 8913;8914;8915;8916;8917;8918;8919;8920;8921;8922;8923;8924;8925;8926;8927;8928 11524;11525;11526;11527;11528;11529;11530;11531;11532;11533;11534;11535;11536;11537;11538;11539;11540;11541;11542;11543;11544;11545;11546;11547 11524 23 AELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGK Unmodified 3353.551 0.55103568 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 2 2 161.51 161.51 3;4 8.1931E-284 168531 QUIQUE_DMIX5_190116_001 263.55 257.71 3149600000 0 131650000 0 24115000 142910000 0 164440000 56191000 520510000 0 749790000 845670000 514300000 1010 2851 944 8929;8930;8931;8932;8933;8934;8935;8936;8937;8938;8939;8940;8941;8942;8943 11548;11549;11550;11551;11552;11553;11554;11555;11556;11557;11558;11559;11560;11561;11562;11563;11564;11565;11566;11567 11559 20 AELGALPDDFIDSLEK Unmodified 1731.8567 0.85669639 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.61 149.61 2 2.7934E-09 154502 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.32 109.03 1197000000 106040000 87518000 90307000 101830000 0 59891000 226530000 71353000 202300000 32966000 91180000 60937000 66138000 1011 4078 945 8944;8945;8946;8947;8948;8949;8950;8951;8952;8953;8954;8955 11568;11569;11570;11571;11572;11573;11574;11575;11576;11577;11578;11579;11580;11581;11582;11583;11584 11578 17 AELGAVVDTVLALLEK Unmodified 1639.9396 0.93963816 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 175.69 175.69 2;3 0.0001382 179583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 60.48 203530000 74784000 0 0 0 0 0 51005000 5562200 30831000 0 38062000 0 3284400 1012 528 946 8956;8957;8958;8959;8960;8961;8962 11585;11586;11587;11588;11589;11590;11591 11588 7 AELGEYIR Unmodified 949.4869 0.48689592 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 53.8 53.8 2 0.022525 51794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.127 27.06 403380000 0 0 137210000 0 0 0 0 114440000 151730000 0 0 0 0 1013 3053 947 8963;8964;8965 11592;11593;11594 11594 3 AELGFLESCLR Unmodified 1293.6387 0.63872189 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.33 110.33 2 0.0034399 114429 QUIQUE_C1368_190116_001 109.66 90.393 422190000 0 0 63756000 55649000 81769000 0 72743000 0 59374000 0 0 88900000 0 1014 3750 948 8966;8967;8968;8969;8970;8971;8972;8973;8974;8975 11595;11596;11597;11598;11599;11600;11601;11602;11603;11604 11597 7 AELGIPLEEVPPEEINYLTR Unmodified 2281.1842 0.18417854 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.54 147.54 2;3 0.00016207 151861 QUIQUE_C1277_190116_001 92.457 80.765 314440000 37306000 50903000 43899000 22242000 37006000 30684000 21777000 25607000 0 12318000 0 32695000 0 1015 3032 949 8976;8977;8978;8979;8980;8981;8982;8983;8984;8985 11605;11606;11607;11608;11609;11610;11611;11612;11613;11614 11606 9 AELGLNEHHQNEVINYMR Acetyl (Protein N-term) 2208.0382 0.03819978 4249 Q9NQ48 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.271 91.271 3 4.0155E-11 93422 QUIQUE_C1368_190116_001 116.29 101.2 952670000 0 123760000 97787000 0 82766000 111240000 68485000 95205000 87737000 32432000 59916000 78372000 114970000 1016 4249 950 8986;8987;8988;8989;8990;8991;8992;8993;8994;8995;8996 11615;11616;11617;11618;11619;11620;11621;11622;11623;11624;11625;11626;11627;11628;11629 11616 15 AELIVQPELK Unmodified 1138.6598 0.6597749 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 70.971 70.971 2 0.013818 70649 QUIQUE_C1403_190116_001 64.711 44.935 46116000 0 0 0 46116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1017 2096 951 8997 11630 11630 1 AELLDNEKPAAVVAPITTGYTVK Unmodified 2399.2948 0.29479162 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 1 1 1 99.036 99.036 2;3 1.4366E-16 102135 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.02 135.05 143690000 0 0 0 0 111550000 0 0 0 0 0 0 0 32141000 1018 4212 952 8998;8999 11631;11632;11633 11633 3 AELLVTEAPSKPITVTVEEQR Unmodified 2309.2478 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183860000 1034 1388 966 9125;9126;9127;9128;9129;9130;9131;9132;9133 11794;11795;11796;11797;11798;11799;11800;11801;11802 11797 8 AELSEEALLSVLPTIR Acetyl (Protein N-term) 1781.9775 0.97748023 2472 P45974;F5H571 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 2 1 2 1 1 174.27 174.27 2;3 4.2024E-166 180098 QUIQUE_C1438_190116_001 259.75 243.5 8748300000 439950000 425790000 1128800000 282930000 587610000 2481300000 440510000 441500000 658610000 121030000 640150000 518960000 581060000 1035 2472 967 9134;9135;9136;9137;9138;9139;9140;9141;9142;9143;9144;9145;9146;9147;9148;9149;9150 11803;11804;11805;11806;11807;11808;11809;11810;11811;11812;11813;11814;11815;11816;11817;11818;11819;11820;11821;11822 11809 19 AELSEGQVR Unmodified 987.49852 0.49852324 1019 F5H7S3;B7Z596;H0YL42;H0YK20 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.961 19.961 2 0.00043684 13109 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.08 63.291 1706400000 0 0 283930000 0 242420000 0 227900000 144770000 304490000 0 0 225530000 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9160;9161;9162;9163;9164;9165;9166 11833;11834;11835;11836;11837;11838;11839;11840 11835 575 5 AELTALESLIEMGFPR Acetyl (Protein N-term) 1817.9233 0.92333617 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323;A0A087WTZ5 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 2 1 182.91 182.91 2 1.2608E-44 189388 QUIQUE_DMIX5_190116_001 181.66 164.64 128270000 0 0 0 0 0 0 0 9570500 29227000 0 47184000 12693000 29593000 1040 942 971 9167;9168;9169;9170;9171;9172;9173 11841;11842;11843;11844;11845;11846;11847;11848;11849 11846 9 AELTSQESQISTYEEELAK Unmodified 2155.0168 0.016838441 2449 P42566 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 109.68 109.68 2 3.7533E-47 113136 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.99 127.05 131150000 0 0 0 27247000 0 0 0 33625000 34125000 0 0 0 36156000 1041 2449 972 9174;9175;9176;9177 11850;11851;11852;11853 11852 3 AELVAISSSEDEGNLR Unmodified 1688.8217 0.82170787 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 74.972 74.972 2 0.00015948 74727 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.731 75.192 31274000 0 0 0 0 0 0 0 31274000 0 0 0 0 0 1042 1187 973 9178 11854 11854 1 AELVGQLQR Unmodified 1012.5665 0.56654322 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.368 40.368 2 2.7816E-05 37327 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.07 114.27 7133500000 499440000 530200000 719990000 520840000 456820000 577670000 536830000 454570000 519170000 290650000 752530000 594650000 680180000 1043 4111 974 9179;9180;9181;9182;9183;9184;9185;9186;9187;9188;9189;9190;9191 11855;11856;11857;11858;11859;11860;11861;11862;11863;11864;11865;11866;11867;11868;11869;11870;11871;11872;11873 11864 17 AELVQGQSAPVGMK Acetyl (Protein N-term) 1455.7392 0.73916421 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 1 0 0 1 1 96.257 96.257 2 0.0090313 97877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.5 46.258 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1044 3875 975 9192;9193 11874;11875 11875 2 AELVQLEDEITTLR Unmodified 1628.8621 0.86211612 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6;E9PNQ9 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 133.38 133.38 2 0.00045361 139541 QUIQUE_C1438_190116_001 94.191 73.985 192910000 0 0 0 63487000 58637000 0 38294000 0 0 0 0 0 32489000 1045 970 976 9194;9195;9196;9197 11876;11877;11878;11879 11877 3 AEMADQAAAWLTR Unmodified 1432.6769 0.67689831 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A3B3ISD7;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 106.3 106.3 2;3 0.00049309 109707 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.522 74.668 534920000 0 56506000 0 54518000 84654000 0 0 0 62684000 36719000 172920000 0 66921000 1046 290;327;328 977 9198;9199;9200;9201;9202;9203;9204;9205 11880;11881;11882;11883;11884;11885;11886;11887;11888;11889 11889 9 AEMDAAIASCK Oxidation (M) 1181.5057 0.5056588 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.378 18.378 2 0.00055112 10695 QUIQUE_C1403_190116_001 106.16 80.907 1863500000 142150000 0 254270000 172100000 177090000 192870000 149190000 104740000 161850000 80674000 162550000 132490000 133530000 1047 2870 978 9206;9207;9208;9209;9210;9211;9212;9213;9214;9215;9216;9217 11890;11891;11892;11893;11894;11895;11896;11897;11898;11899;11900;11901 11892 2344 12 AEMDAAIASCK Unmodified 1165.5107 0.51074418 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.8 35.8 2 0.00035758 31327 QUIQUE_C1277_190116_001 117.7 97.073 8443900000 697960000 742160000 812870000 771840000 576720000 792820000 680370000 547140000 589810000 223180000 604700000 630800000 773570000 1048 2870 978 9218;9219;9220;9221;9222;9223;9224;9225;9226;9227;9228;9229;9230 11902;11903;11904;11905;11906;11907;11908;11909;11910;11911;11912;11913;11914 11903 12 AEMDAAIASCKR Oxidation (M) 1337.6068 0.60676983 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 13.522 13.522 3 0.001713 6013 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.118 49.751 72122000 0 0 0 0 0 0 0 51748000 11292000 0 0 9082100 0 1049 2870 979 9231;9232;9233 11915;11916;11917 11915 2344 3 AEMDAAIASCKR Unmodified 1321.6119 0.61185521 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 24.166 24.166 2;3 3.6863E-05 17879 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.16 98.586 705000000 0 0 0 0 0 0 0 136960000 112490000 0 204070000 157270000 94219000 1050 2870 979 9234;9235;9236;9237;9238;9239;9240;9241 11918;11919;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926;11927 11923 8 AEMDMVAWGVDLASVEQHINSHR Unmodified 2594.2006 0.20059044 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 144.44 144.44 4 0.028094 148226 QUIQUE_C1403_190116_001 30.976 23.529 21275000 0 0 0 21275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1051 2096 980 9242 11928 11928 0 AEMDQILHGLDK Unmodified 1368.6708 0.6707503 1864 P04424 ASL Argininosuccinate lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.855 85.855 3 0.0001347 86868 QUIQUE_C1403_190116_001 93.011 81.095 264630000 0 31596000 51670000 36597000 27285000 0 31520000 30506000 38748000 16706000 0 0 0 1052 1864 981 9243;9244;9245;9246;9247;9248;9249;9250;9251 11929;11930;11931;11932;11933;11934;11935;11936;11937;11938;11939 11932 11 AEMEAVFLENLR Unmodified 1420.7021 0.70205043 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;A0A0A0MTR5;H0YB70;F6UJY9;H0YB18 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 124.97 124.97 2 0.00020157 130669 QUIQUE_C1218_190116_001 101.38 76.543 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1053 1025 982 9252;9253;9254;9255 11940;11941;11942;11943 11940 4 AEMEDLVSSKDDVGK Unmodified 1621.7505 0.75051676 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 53.409 53.409 3 0.0044935 51428 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.314 32.319 20863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20863000 0 1054 2385 983 9256 11944 11944 1 AEMELGLR Unmodified 917.46405 0.46405199 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 54.389 54.389 2 0.0003307 54027 QUIQUE_C1218_190116_001 155.51 89.838 3121000000 0 495450000 400740000 436890000 278840000 310140000 0 152690000 191000000 0 304620000 283410000 267210000 1055 2146 984 9257;9258;9259;9260;9261;9262;9263;9264;9265;9266;9267;9268;9269;9270;9271;9272 11945;11946;11947;11948;11949;11950;11951;11952;11953;11954;11955;11956;11957;11958;11959;11960;11961;11962;11963;11964;11965;11966;11967;11968;11969;11970;11971 11946 27 AEMELGLR Oxidation (M) 933.45897 0.45896661 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 31.202 31.202 2 0.030357 25661 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.342 35.849 333840000 0 0 0 0 0 0 0 98452000 0 84535000 0 150850000 0 1056 2146 984 9273;9274;9275 11972;11973;11974 11974 3 AEMETLVR Unmodified 947.47462 0.47461667 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.898 39.898 2 0.0036031 35147 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.89 54.684 2745700000 414800000 370890000 391840000 359820000 281720000 291230000 358630000 0 189080000 87682000 0 0 0 1057 3984 985 9276;9277;9278;9279;9280;9281;9282;9283;9284 11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;11982;11983;11984;11985 11985 10 AEMETLVR Oxidation (M) 963.46953 0.46953129 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 20.943 20.943 2 0.035999 14004 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.032 31.152 243150000 0 0 0 0 0 0 0 54230000 0 97964000 0 90953000 0 1058 3984 985 9285;9286;9287 11986;11987;11988 11987 3 AEMEVLLASK Unmodified 1089.574 0.57399637 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 70.217 70.217 2 0.0026934 71016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.496 53.688 2025800000 0 0 265740000 0 225620000 0 211670000 0 363970000 177270000 331200000 265130000 185190000 1059 3117 986 9288;9289;9290;9291;9292;9293;9294;9295;9296 11989;11990;11991;11992;11993;11994;11995;11996;11997;11998 11995 9 AEMEVLLASK Oxidation (M) 1105.5689 0.56891099 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 0 1 37.526 37.526 2 0.03822 33748 QUIQUE_C1576_190116_001 53.756 38.124 86589000 0 0 0 0 0 0 86589000 0 0 0 0 0 0 1060 3117 986 9297 11999 11999 1 AEMIDFNIR Unmodified 1107.5383 0.53827956 1151 H0YEX9;P57087 JAM2 Junctional adhesion molecule B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.365 93.365 2 0.015421 95657 QUIQUE_C1277_190116_001 67.169 23.362 152580000 0 38475000 0 0 0 0 0 31915000 46337000 6940200 0 0 28912000 1061 1151 987 9298;9299;9300;9301;9302 12000;12001;12002;12003;12004 12000 5 AEMLEIVQAIYK Unmodified 1406.7479 0.74793799 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.01 137.01 2 0.00016302 141361 QUIQUE_C1277_190116_001 150.61 133.39 1249100000 193970000 195100000 161620000 168840000 121060000 0 0 0 105140000 44454000 117210000 0 141670000 1062 2726 988 9303;9304;9305;9306;9307;9308;9309;9310;9311 12005;12006;12007;12008;12009;12010;12011;12012;12013;12014;12015 12006 9 AEMLEIVQAIYK Oxidation (M) 1422.7429 0.74285261 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 1 0 2 1 103.83 103.83 2 0.01093 106255 QUIQUE_C1403_190116_001 61.56 8.8345 64936000 0 42218000 0 22718000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1063 2726 988 9312;9313;9314 12016;12017;12018 12018 2160 2 AEMMELNDR 2 Oxidation (M) 1139.4587 0.45870861 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 2 17.773 17.773 2 0.0027416 6526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.635 87.648 2510400000 46030000 86325000 196650000 50274000 41128000 146600000 0 69623000 199180000 1412800000 75349000 53247000 133180000 1064 389;395;1336 989 9315;9316;9317;9318;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;9326;9327;9328;9329;9330;9331;9332;9333 12019;12020;12021;12022;12023;12024;12025;12026;12027;12028;12029;12030;12031;12032;12033;12034;12035;12036;12037;12038;12039 12031 274;275 20 AEMMELNDR Oxidation (M) 1123.4638 0.46379399 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 0 10 8 10 10 7 8 10 9 10 8 13 7 6 33.482 33.482 2 2.5363E-06 19624 QUIQUE_C1218_190116_001 153.08 146.98 320080000000 14554000000 25084000000 23642000000 30670000000 19177000000 32837000000 26211000000 16335000000 41135000000 8456300000 34013000000 18052000000 29917000000 1065 389;395;1336 989 9334;9335;9336;9337;9338;9339;9340;9341;9342;9343;9344;9345;9346;9347;9348;9349;9350;9351;9352;9353;9354;9355;9356;9357;9358;9359;9360;9361;9362;9363;9364;9365;9366;9367;9368;9369;9370;9371;9372;9373;9374;9375;9376;9377;9378;9379;9380;9381;9382;9383;9384;9385;9386;9387;9388;9389;9390;9391;9392;9393;9394;9395;9396;9397;9398;9399;9400;9401;9402;9403;9404;9405;9406;9407;9408;9409;9410;9411;9412;9413;9414;9415;9416;9417;9418;9419;9420;9421;9422;9423;9424;9425;9426;9427;9428;9429;9430;9431;9432;9433;9434;9435;9436;9437;9438;9439;9440;9441;9442;9443;9444;9445;9446;9447;9448;9449 12040;12041;12042;12043;12044;12045;12046;12047;12048;12049;12050;12051;12052;12053;12054;12055;12056;12057;12058;12059;12060;12061;12062;12063;12064;12065;12066;12067;12068;12069;12070;12071;12072;12073;12074;12075;12076;12077;12078;12079;12080;12081;12082;12083;12084;12085;12086;12087;12088;12089;12090;12091;12092;12093;12094;12095;12096;12097;12098;12099;12100;12101;12102;12103;12104;12105;12106;12107;12108;12109;12110;12111;12112;12113;12114;12115;12116;12117;12118;12119;12120;12121;12122;12123;12124;12125;12126;12127;12128;12129;12130;12131;12132;12133;12134;12135;12136;12137;12138;12139;12140;12141;12142;12143;12144;12145;12146;12147;12148;12149;12150;12151;12152;12153;12154;12155;12156;12157;12158;12159;12160;12161;12162;12163;12164;12165;12166;12167;12168;12169;12170;12171;12172;12173;12174;12175;12176;12177;12178;12179;12180;12181;12182;12183;12184;12185;12186;12187;12188;12189;12190;12191;12192;12193;12194;12195;12196;12197;12198;12199;12200;12201;12202;12203;12204;12205;12206;12207;12208;12209;12210;12211;12212;12213;12214;12215;12216;12217;12218;12219;12220;12221;12222;12223;12224;12225;12226;12227;12228;12229;12230;12231;12232;12233;12234;12235;12236;12237;12238;12239;12240;12241;12242;12243;12244;12245;12246;12247;12248;12249;12250;12251;12252;12253;12254;12255;12256;12257;12258;12259;12260;12261;12262;12263;12264;12265;12266 12041 274;275 224 AEMMELNDR Unmodified 1107.4689 0.46887937 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 2 2 2 3 3 4 2 4 2 2 3 3 48.044 48.044 1;2 1.1092E-18 40863 QUIQUE_C1277_190116_001 224.24 188.36 312890000000 21957000000 24301000000 27621000000 27552000000 22497000000 25616000000 24499000000 22795000000 24880000000 15355000000 27547000000 22668000000 25601000000 1066 389;395;1336 989 9450;9451;9452;9453;9454;9455;9456;9457;9458;9459;9460;9461;9462;9463;9464;9465;9466;9467;9468;9469;9470;9471;9472;9473;9474;9475;9476;9477;9478;9479;9480;9481;9482;9483 12267;12268;12269;12270;12271;12272;12273;12274;12275;12276;12277;12278;12279;12280;12281;12282;12283;12284;12285;12286;12287;12288;12289;12290;12291;12292;12293;12294;12295;12296;12297;12298;12299;12300;12301;12302;12303;12304;12305;12306;12307;12308;12309;12310;12311;12312;12313;12314;12315;12316;12317;12318;12319;12320;12321;12322;12323;12324;12325;12326;12327;12328;12329;12330;12331;12332;12333;12334;12335;12336;12337;12338;12339;12340;12341;12342;12343;12344;12345;12346;12347;12348;12349;12350;12351;12352;12353;12354;12355;12356;12357;12358;12359;12360;12361 12279 81 AEMMELNDRFASYIEK Oxidation (M) 1961.8863 0.88629874 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 1 3 96.585 96.585 3 0.00036468 99922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.418 72.138 651170000 0 0 0 0 0 0 0 651170000 0 0 0 0 0 1067 389;395;1336 990 9484;9485;9486 12362;12363;12364 12364 274;275 3 AEMMELNDRFASYIEK Unmodified 1945.8914 0.89138411 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 108.28 108.28 2;3 1.4946E-12 110775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146 108.29 751340000 0 0 0 0 0 0 0 751340000 0 0 0 0 0 1068 389;395;1336 990 9487;9488 12365;12366;12367;12368 12368 4 AEMTVFVR Unmodified 951.48479 0.48478743 4638 Q9Y5Z4 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.543 57.543 2 0.0083476 56902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.662 61.305 871840000 75689000 88795000 78471000 77150000 104970000 0 81615000 113690000 0 0 121770000 0 129700000 1069 4638 991 9489;9490;9491;9492;9493;9494;9495;9496;9497;9498 12369;12370;12371;12372;12373;12374;12375;12376;12377;12378;12379 12375 11 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAK Acetyl (Protein N-term) 3263.375 0.37496461 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 1 0 0 2 152.62 152.62 3 9.8349E-20 157596 QUIQUE_C1218_190116_001 77.791 76.942 54364000 54364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1070 3027 992 9499;9500 12380;12381 12380 1 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKK Acetyl (Protein N-term) 3391.4699 0.46992763 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 135.46 135.46 3 2.417E-64 138306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.13 146.53 367210000 0 0 0 0 0 37597000 0 100760000 52118000 0 68110000 56122000 52510000 1071 3027 993 9501;9502;9503;9504;9505;9506 12382;12383;12384;12385;12386;12387 12383 6 AENEEAAACPAWER Unmodified 1602.6733 0.67326949 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.569 48.569 2 9.0327E-07 45605 QUIQUE_C1563_190116_001 144.47 132.61 403260000 59912000 80512000 0 79272000 69058000 53826000 0 0 0 0 0 0 60676000 1072 921 994 9507;9508;9509;9510;9511;9512;9513 12388;12389;12390;12391;12392;12393;12394;12395 12393 8 AENELKELEQK Unmodified 1329.6776 0.67760981 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 35.226 35.226 2 0.033989 30820 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.914 53.744 37085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37085000 0 1073 2385 995 9514 12396 12396 0 AENFFILR Unmodified 1008.5393 0.53926584 1063 F8WCF6;P59998;R4GN08;F8WDD7;A0A0A6YYG9 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.443 99.443 2 5.2577E-06 102311 QUIQUE_C1277_190116_001 170.06 111.08 4605700000 318870000 288090000 379790000 347610000 375670000 305200000 375280000 292480000 357960000 162580000 531080000 433650000 437410000 1074 1063 996 9515;9516;9517;9518;9519;9520;9521;9522;9523;9524;9525;9526;9527 12397;12398;12399;12400;12401;12402;12403;12404;12405;12406;12407;12408;12409;12410;12411;12412;12413;12414;12415;12416;12417;12418;12419;12420;12421;12422 12400 26 AENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIR Unmodified 3029.5036 0.50355562 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.74 167.74 3 4.8439E-114 172191 QUIQUE_DMIX3_190116_001 187.95 176.95 1811300000 80607000 138560000 253590000 97140000 0 57239000 0 0 251480000 0 415420000 244720000 272500000 1075 3136 997 9528;9529;9530;9531;9532;9533;9534;9535;9536 12423;12424;12425;12426;12427;12428;12429;12430;12431;12432 12429 10 AENNSEVGASGYGVPGPTWDR Unmodified 2161.9665 0.96647463 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.748 88.748 2 2.1062E-86 89950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 191.44 178.24 469720000 32173000 38378000 70597000 46217000 46167000 36808000 0 50934000 0 0 58527000 45001000 44921000 1076 2916 998 9537;9538;9539;9540;9541;9542;9543;9544;9545;9546 12433;12434;12435;12436;12437;12438;12439;12440;12441;12442 12439 9 AENPQCLLGDFVTEFFK Unmodified 2013.9506 0.95061355 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 172.85 172.85 2;3 9.7778E-07 177569 QUIQUE_C1368_190116_001 105 90.126 106940000 6766100 19201000 9326500 4244100 13296000 0 23420000 6990300 0 0 10937000 5552000 7204900 1077 3102 999 9547;9548;9549;9550;9551;9552;9553;9554;9555;9556;9557 12443;12444;12445;12446;12447;12448;12449;12450;12451;12452;12453 12446 10 AENPSLENHR Acetyl (Protein N-term) 1207.5582 0.55816338 1413 O00505 KPNA3 Importin subunit alpha-4 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 24.083 24.083 2 0.0052046 17127 QUIQUE_C1563_190116_001 98.009 90.362 159800000 0 44836000 0 0 0 56541000 0 58427000 0 0 0 0 0 1078 1413 1000 9558;9559;9560;9561;9562;9563 12454;12455;12456;12457;12458;12459 12455 5 AENQVLAMR Unmodified 1030.523 0.52296385 2585 P51572;A0A2R8Y5M6 BCAP31 B-cell receptor-associated protein 31 yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.266 37.266 2 0.0031968 33026 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.853 58.303 425070000 0 0 0 0 0 0 138920000 0 109660000 56789000 0 119700000 0 1079 2585 1001 9564;9565;9566;9567 12460;12461;12462;12463 12461 4 AENSAALGKPTAGTTDAGEAAK Unmodified 2029.9916 0.99162674 3945 Q96T17 MAP7D2 MAP7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.971 22.971 3 2.3731E-07 17067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.752 73.621 209430000 0 0 0 36407000 40277000 25716000 45808000 27303000 0 0 0 0 33923000 1080 3945 1002 9568;9569;9570;9571;9572;9573 12464;12465;12466;12467;12468;12469 12468 5 AENSSLNLIGK Unmodified 1144.6088 0.60880197 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.89 50.89 2 0.00049397 48210 QUIQUE_C1563_190116_001 101.65 48.48 11421000000 1102600000 1082000000 1047600000 856410000 927610000 663550000 1129500000 527290000 658660000 433160000 1105000000 878670000 1009200000 1081 1245 1003 9574;9575;9576;9577;9578;9579;9580;9581;9582;9583;9584;9585;9586 12470;12471;12472;12473;12474;12475;12476;12477;12478;12479;12480;12481;12482;12483;12484;12485;12486;12487 12477 17 AENTEGDLNSNLLHAPYHTGDPQLDTAIGQWLR Acetyl (Protein N-term) 3687.7554 0.75536622 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.49 156.49 3 4.1968E-65 158948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.94 127.67 777620000 92158000 85304000 0 59715000 90732000 35197000 93730000 69344000 0 0 0 144910000 106530000 1082 3390 1004 9587;9588;9589;9590;9591;9592;9593;9594;9595 12488;12489;12490;12491;12492;12493;12494;12495;12496;12497;12498;12499 12495 12 AENYDIPSADR Unmodified 1249.5575 0.55749468 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.521 43.521 2 0.0011449 40361 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 86.315 7087700000 563380000 582480000 569890000 701370000 0 537960000 612860000 586490000 620970000 307280000 656100000 657130000 691760000 1083 2197 1005 9596;9597;9598;9599;9600;9601;9602;9603;9604;9605;9606;9607 12500;12501;12502;12503;12504;12505;12506;12507;12508;12509;12510;12511;12512;12513;12514 12503 12 AEPAKIEAFR Unmodified 1130.6084 0.60840804 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 1 1 29.37 29.37 3 0.0087266 24355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.359 36.597 252580000 0 0 0 0 0 0 0 115610000 0 0 136970000 0 0 1084 1790 1006 9608;9609 12515;12516 12515 2 AEPEDHYFLLTEPPLNTPENR Unmodified 2481.1812 0.18121843 2714 P61158;B4DXW1;F8WDR7 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 4 2 4 3 1 1 2 2 1 2 1 2 3 112.42 112.42 2;3 1.5539E-26 116739 QUIQUE_C1277_190116_001 132.79 118.48 1908500000 212920000 226710000 197890000 200420000 141590000 165280000 195500000 185690000 158580000 169370000 0 0 54514000 1085 2714 1007 9610;9611;9612;9613;9614;9615;9616;9617;9618;9619;9620;9621;9622;9623;9624;9625;9626;9627;9628;9629;9630;9631;9632;9633;9634;9635;9636;9637 12517;12518;12519;12520;12521;12522;12523;12524;12525;12526;12527;12528;12529;12530;12531;12532;12533;12534;12535;12536;12537;12538;12539;12540;12541;12542;12543;12544;12545;12546;12547;12548;12549;12550;12551;12552;12553;12554;12555;12556;12557;12558;12559;12560;12561;12562;12563;12564;12565;12566;12567;12568;12569;12570;12571;12572;12573 12529 56 AEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFK Unmodified 2863.4756 0.47560953 3034 Q13972 RASGRF1 Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 yes yes 0 0 0 1 165.23 165.23 4 0.02528 172671 QUIQUE_DMIX5_190116_001 24.459 12.379 29051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29051000 0 0 1086 3034 1008 9638 12574 12574 1 AEPLQPDPGAAEDAAAQAVETPGWK Acetyl (Protein N-term) 2560.2082 0.20816146 4638 Q9Y5Z4;Q5THN1 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes no 1 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 146.14 146.14 2;3 1.2364E-56 151607 QUIQUE_C1218_190116_001 151.62 140.99 1133900000 147910000 120030000 103110000 28220000 186820000 115950000 122740000 30057000 0 0 234940000 0 44077000 1087 4638 1009 9639;9640;9641;9642;9643;9644;9645;9646;9647;9648;9649;9650;9651;9652;9653;9654 12575;12576;12577;12578;12579;12580;12581;12582;12583;12584;12585;12586;12587;12588;12589;12590 12576 16 AEPPKAPEQEQAAPGPAAGGEAPK Unmodified 2297.1288 0.12878893 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 1 1 2 1 2 31.397 31.397 2;3 3.1176E-31 27117 QUIQUE_C1438_190116_001 139.67 127.52 7098300000 1190300000 987130000 611040000 763090000 1179600000 756770000 651220000 0 133170000 94035000 324120000 108790000 299090000 1088 2817 1010 9655;9656;9657;9658;9659;9660;9661;9662;9663;9664;9665;9666;9667;9668;9669;9670;9671;9672;9673;9674;9675;9676 12591;12592;12593;12594;12595;12596;12597;12598;12599;12600;12601;12602;12603;12604;12605;12606;12607;12608;12609;12610;12611;12612;12613;12614;12615;12616;12617;12618;12619;12620;12621;12622;12623;12624;12625 12608 35 AEPPQAMNALMR Unmodified 1327.6377 0.63767603 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 68.997 68.997 2 0.038427 70298 QUIQUE_C1218_190116_001 60.828 44.111 113780000 47378000 0 66404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1089 2951 1011 9677;9678 12626;12627 12626 1 AEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVR Unmodified 3067.4345 0.43454936 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;D6RF23;D6RHJ5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 152.87 152.87 3 0.0010486 155024 QUIQUE_C1563_190116_001 36.311 29.735 86025000 0 0 0 41349000 0 44676000 0 0 0 0 0 0 0 1090 2787 1012 9679;9680 12628;12629;12630 12629 2 AEPSAATQSHSISSSSFGAEPSAPGGGGSPGACPALGTK Acetyl (Protein N-term) 3611.6434 0.64343251 1712;659 O95197;F5H891;F5GWG7;F5H617;B7Z4M1 RTN3 Reticulon-3;Reticulon no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.56 93.56 3 9.0191E-79 95411 QUIQUE_C1277_190116_001 131.95 127.09 2549900000 236520000 162160000 265480000 308790000 234310000 127270000 214930000 134590000 178970000 75968000 253690000 106450000 250830000 1091 1712;659 1013 9681;9682;9683;9684;9685;9686;9687;9688;9689;9690;9691;9692;9693 12631;12632;12633;12634;12635;12636;12637;12638;12639;12640;12641;12642;12643;12644;12645 12632 15 AEPSGAETRPPIR Acetyl (Protein N-term) 1421.7263 0.72629134 4272 Q9NRR5 UBQLN4 Ubiquilin-4 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 39.196 39.196 2 0.022102 35255 QUIQUE_C1368_190116_001 75.387 55.084 198070000 0 0 53626000 0 51515000 0 0 0 0 0 40201000 0 52727000 1092 4272 1014 9694;9695;9696;9697 12646;12647;12648;12649 12646 4 AEPTAAAVPPPAAPIPTQMPPVPSPSQPPSGKPVSAVK Unmodified 3665.9491 0.94910399 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 102.5 102.5 4 0.018159 104989 QUIQUE_C1403_190116_001 20.907 16.145 34161000 0 0 0 34161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1093 2404 1015 9698 12650 12650 1 AEPVEVVAPR Unmodified 1065.5819 0.58185893 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.317 40.317 2 0.005136 36986 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.516 46.161 691690000 91783000 84828000 104540000 0 59854000 0 80365000 63770000 78011000 30855000 0 97684000 0 1094 1974 1016 9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;9706;9707;9708 12651;12652;12653;12654;12655;12656;12657;12658;12659;12660 12656 10 AEPVSSTEASSLGQK Unmodified 1489.726 0.72601657 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.449 33.449 2 4.0628E-05 29406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.43 75.086 830100000 125410000 0 151480000 0 0 0 91936000 131000000 68342000 0 85734000 68686000 107510000 1095 3452 1017 9709;9710;9711;9712;9713;9714;9715;9716 12661;12662;12663;12664;12665;12666;12667;12668 12664 7 AEPYAADEGSGEGHK Unmodified 1516.643 0.64301522 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 14.781 14.781 2;3 8.8694E-07 6185 QUIQUE_C1563_190116_001 91.076 85.592 493390000 24934000 44411000 45140000 30640000 41170000 46555000 46892000 22690000 42924000 0 71878000 32983000 43177000 1096 3895 1018 9717;9718;9719;9720;9721;9722;9723;9724;9725;9726;9727;9728;9729;9730;9731 12669;12670;12671;12672;12673;12674;12675;12676;12677;12678;12679;12680;12681;12682;12683 12674 15 AEPYCSVLPGFTFIQHLPLSER Unmodified 2560.2784 0.27843005 142 A0A0A0MRA5;B7Z4B8;Q9BUJ2;M0R3F1;M0QYZ0 HNRNPUL1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.74 150.74 3 3.3303E-06 153513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.651 64.881 1321300000 100630000 107390000 127600000 122630000 92786000 104230000 88236000 125060000 85462000 29004000 89827000 104290000 144170000 1097 142 1019 9732;9733;9734;9735;9736;9737;9738;9739;9740;9741;9742;9743;9744 12684;12685;12686;12687;12688;12689;12690;12691;12692;12693;12694;12695;12696;12697;12698 12692 15 AEQEEEFISNTLFK Unmodified 1683.7992 0.79918151 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.15 120.15 2;3 1.1917E-07 125483 QUIQUE_C1218_190116_001 129.84 77.997 678450000 56432000 73460000 72657000 65353000 55097000 69569000 0 0 59068000 42555000 59393000 61052000 63812000 1098 3173 1020 9745;9746;9747;9748;9749;9750;9751;9752;9753;9754;9755;9756;9757 12699;12700;12701;12702;12703;12704;12705;12706;12707;12708;12709;12710;12711;12712;12713;12714;12715;12716 12699 16 AEQEEMEVEER Oxidation (M) 1393.5667 0.56673874 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 1 0 1 1 19.436 19.436 2 0.0009931 11928 QUIQUE_C1368_190116_001 94.409 66.201 48036000 19792000 0 28244000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1099 2806 1021 9758;9759 12717;12718 12718 2251 2 AEQEEMEVEER Unmodified 1377.5718 0.57182411 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.269 30.269 2 0.00039512 24339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.52 81.222 355440000 70186000 63577000 69220000 66436000 0 0 0 34870000 27120000 24033000 0 0 0 1100 2806 1021 9760;9761;9762;9763;9764;9765;9766 12719;12720;12721;12722;12723;12724;12725 12725 7 AEQEEYVQEGIR Unmodified 1449.6736 0.67358707 2955 Q12965;H0YLE5 MYO1E Unconventional myosin-Ie no no 0 0 0 2 45.691 45.691 2 0.00023846 42572 QUIQUE_C1403_190116_001 99.568 71.359 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1101 2955 1022 9767;9768 12726;12727 12726 2 AEQEPTAEQLAQIAAENEEDEHSVNYKPPAQK Acetyl (Protein N-term) 3605.6758 0.6757785 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565;J3KRE2;J3KRY1;J3KS60 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 1 0 1 2 2 2 5 2 3 3 2 2 2 2 2 2 111.06 111.06 3;4 5.057E-178 114641 QUIQUE_C1368_190116_001 211.87 206.7 19646000000 1746100000 2096000000 1756300000 1590500000 1619800000 1198400000 1176000000 1454700000 1625100000 841390000 1529800000 1395100000 1617300000 1102 1293 1023 9769;9770;9771;9772;9773;9774;9775;9776;9777;9778;9779;9780;9781;9782;9783;9784;9785;9786;9787;9788;9789;9790;9791;9792;9793;9794;9795;9796;9797;9798;9799 12728;12729;12730;12731;12732;12733;12734;12735;12736;12737;12738;12739;12740;12741;12742;12743;12744;12745;12746;12747;12748;12749;12750;12751;12752;12753;12754;12755;12756;12757;12758;12759;12760;12761;12762;12763;12764;12765;12766;12767;12768;12769;12770;12771;12772;12773;12774;12775;12776;12777;12778 12734 51 AEQFYCGDTEGK Unmodified 1403.5663 0.5663448 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.049 36.049 2 0.0081161 30903 QUIQUE_C1563_190116_001 76.143 72.22 187030000 51516000 32824000 0 31457000 0 28504000 32636000 0 0 10091000 0 0 0 1103 903;2869 1024 9800;9801;9802;9803;9804;9805 12779;12780;12781;12782;12783;12784 12782 3 AEQFYCGDTEGKK Unmodified 1531.6613 0.66130782 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 1 2 21.034 21.034 2;3 0.00067463 13756 QUIQUE_C1277_190116_001 97.911 76.539 842910000 69008000 103800000 32511000 0 102590000 81604000 119490000 47684000 22834000 0 99170000 58665000 105550000 1104 903;2869 1025 9806;9807;9808;9809;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;9819;9820;9821;9822 12785;12786;12787;12788;12789;12790;12791;12792;12793;12794;12795;12796;12797;12798;12799;12800;12801 12787 16 AEQINQAAGEASAVLAK Unmodified 1669.8635 0.8635131 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4;F2Z2I8 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.631 79.631 2;3 7.9078E-38 79414 QUIQUE_C1563_190116_001 164.64 141.27 1218000000 162230000 107060000 144240000 0 89602000 107170000 98594000 62573000 93496000 47216000 125250000 70620000 109960000 1105 4466 1026 9823;9824;9825;9826;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;9834;9835 12802;12803;12804;12805;12806;12807;12808;12809;12810;12811;12812;12813;12814 12807 13 AEQLASVQYTLPK Unmodified 1446.7718 0.77184455 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 79.216 79.216 2 0.0010548 75893 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.24 89.921 114410000 39424000 0 0 0 0 0 0 0 48381000 26600000 0 0 0 1106 1074 1027 9836;9837;9838;9839;9840 12815;12816;12817;12818;12819 12818 4 AEQLFSSALCAAR Unmodified 1422.6925 0.69254837 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.99 86.99 2 7.2858E-10 89175 QUIQUE_C1277_190116_001 143.5 120.76 3077400000 398480000 400440000 357560000 286380000 356690000 0 0 264390000 271060000 0 385300000 0 357050000 1107 3859 1028 9841;9842;9843;9844;9845;9846;9847;9848;9849 12820;12821;12822;12823;12824;12825;12826;12827;12828;12829 12821 7 AEQMASVQNAQR Unmodified 1331.6252 0.62519709 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.304 20.304 2 1.2662E-09 13593 QUIQUE_C1218_190116_001 183.67 147.12 473720000 85079000 0 0 0 66220000 0 110790000 0 0 29480000 105420000 76737000 0 1108 345 1029 9850;9851;9852;9853;9854;9855 12830;12831;12832;12833;12834;12835 12830 5 AEQMASVQNAQR Oxidation (M) 1347.6201 0.62011171 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 1 0 1 11.368 11.368 2 0.0021983 3748 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 61.879 5069200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5069200 0 0 0 1109 345 1029 9856 12836 12836 243 1 AEQSDEAVK Acetyl (Protein N-term) 1017.4615 0.46146903 1773 P00167 CYB5A Cytochrome b5 yes yes 1 0 0 1 22 22 2 0.0051061 15189 QUIQUE_C1368_190116_001 74.301 52.215 21874000 0 0 21874000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1110 1773 1030 9857 12837 12837 1 AEQTILPLVDEALQHTTTK Unmodified 2107.1161 0.11609898 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 125.93 125.93 3 1.2755E-05 123249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.539 64.583 558300000 39133000 45211000 28026000 55423000 75225000 45323000 27234000 43102000 0 24116000 41556000 29045000 104910000 1111 2225 1031 9858;9859;9860;9861;9862;9863;9864;9865;9866;9867;9868;9869;9870;9871;9872 12838;12839;12840;12841;12842;12843;12844;12845;12846;12847;12848;12849;12850;12851;12852;12853;12854;12855;12856 12852 15 AEQVALSR Acetyl (Protein N-term) 914.48214 0.48214489 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 1 0 0 1 56.227 56.227 2 0.064028 53947 QUIQUE_C1563_190116_001 47.603 8.8111 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1112 2024 1032 9873 12857 12857 1 AEQVDPNFYSK Unmodified 1296.5986 0.59863121 3832 Q96DB5;H0YC67;H0YC27;H0YBD9 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 50.352 50.352 2 0.0045987 48957 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.53 78.559 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1113 3832 1033 9874 12858 12858 1 AEQVIFVR Unmodified 960.53927 0.53926584 1325 K7EKE8;Q92692 PVRL2 Nectin-2 yes no 0 0 0 1 1 53.415 53.415 2 0.017595 51637 QUIQUE_C1218_190116_001 81.297 47.558 47012000 47012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1114 1325 1034 9875;9876 12859;12860 12859 2 AEQWNVNYVETSAK Unmodified 1637.7686 0.76855009 2018 P11233;H7C3P7 RALA Ras-related protein Ral-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.573 75.573 2 3.8444E-14 75746 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.31 121.99 2133100000 0 216310000 306780000 282150000 0 184770000 0 197170000 239930000 100760000 420650000 0 184560000 1115 2018 1035 9877;9878;9879;9880;9881;9882;9883;9884;9885 12861;12862;12863;12864;12865;12866;12867;12868;12869;12870;12871;12872 12868 11 AESAPLPVSADDTPEVLNR Unmodified 1979.98 0.97999942 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.852 94.852 2 2.0156E-36 98594 QUIQUE_C1438_190116_001 156.81 139.15 559030000 35904000 25752000 63734000 56274000 43362000 50394000 52681000 53552000 44232000 0 59362000 30477000 43303000 1116 1742 1036 9886;9887;9888;9889;9890;9891;9892;9893;9894;9895;9896;9897 12873;12874;12875;12876;12877;12878;12879;12880;12881;12882;12883;12884 12877 11 AESAVIVANPR Unmodified 1125.6142 0.6142217 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.365 31.365 2 0.00022337 26126 QUIQUE_C1576_190116_001 122.44 99.007 1941700000 257550000 197410000 189340000 0 142610000 249560000 151150000 151280000 143290000 0 145720000 110190000 203610000 1117 4252 1037 9898;9899;9900;9901;9902;9903;9904;9905;9906;9907;9908 12885;12886;12887;12888;12889;12890;12891;12892;12893;12894;12895 12890 11 AESEAETPSTPGEFESK Acetyl (Protein N-term) 1836.7901 0.79013297 3998 Q9BR01;F8WE22 SULT4A1 Sulfotransferase 4A1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 76.901 76.901 2 1.0542E-22 77721 QUIQUE_DMIX7_190116_001 172.99 163.88 390170000 45266000 38976000 0 0 27157000 30879000 45483000 21656000 30816000 0 43895000 59427000 46612000 1118 3998 1038 9909;9910;9911;9912;9913;9914;9915;9916;9917;9918;9919;9920;9921 12896;12897;12898;12899;12900;12901;12902;12903;12904;12905;12906;12907;12908 12907 13 AESEEMETSQAGSK Unmodified 1482.6144 0.61441721 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.983 15.983 2 1.3678E-17 8301 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.3 166.7 1130800000 124350000 153080000 94716000 101040000 78217000 90748000 151000000 38783000 45571000 58659000 83199000 56082000 55350000 1119 2363 1039 9922;9923;9924;9925;9926;9927;9928;9929;9930;9931;9932;9933;9934 12909;12910;12911;12912;12913;12914;12915;12916;12917;12918;12919;12920;12921 12919 13 AESEQEAYLR Unmodified 1194.5517 0.55168102 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 30.655 30.655 2 0.00092514 25350 QUIQUE_C1368_190116_001 104.06 69.871 32808000 0 0 32808000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1120 4261 1040 9935;9936;9937 12922;12923;12924 12923 3 AESEQEAYLRED Unmodified 1438.6212 0.62121715 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.551 42.551 2 0.0028736 39493 QUIQUE_C1438_190116_001 129.16 95.778 622160000 68177000 75445000 49104000 75033000 63748000 43104000 35303000 38072000 62968000 21460000 43700000 46046000 0 1121 4261 1041 9938;9939;9940;9941;9942;9943;9944;9945;9946;9947;9948;9949 12925;12926;12927;12928;12929;12930;12931;12932;12933;12934;12935;12936 12929 12 AESEYTFER Unmodified 1130.488 0.48801813 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 39.908 39.908 2 0.0079449 36379 QUIQUE_C1218_190116_001 80.165 63.389 115160000 37209000 54799000 0 0 0 0 0 23154000 0 0 0 0 0 1122 734 1042 9950;9951;9952 12937;12938;12939 12937 3 AESFFQTK Unmodified 956.46035 0.46034682 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 43.518 43.518 2 0.0036855 40317 QUIQUE_C1576_190116_001 121.99 100.22 704160000 119430000 98101000 0 104650000 119030000 86172000 113300000 0 0 63474000 0 0 0 1123 727 1043 9953;9954;9955;9956;9957;9958;9959 12940;12941;12942;12943;12944;12945;12946;12947;12948;12949 12948 10 AESFMFR Unmodified 886.40072 0.40072345 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.048 61.048 2 0.031782 60917 QUIQUE_C1438_190116_001 89.673 71.907 162630000 0 0 34421000 31766000 28007000 0 0 19985000 21878000 0 0 0 26570000 1124 2966 1044 9960;9961;9962;9963;9964;9965 12950;12951;12952;12953;12954;12955 12952 6 AESGDSLGSEDR Unmodified 1221.5109 0.51093842 4258 Q9NQW6;H7C1K5 ANLN Actin-binding protein anillin yes no 0 0 0 1 1 1 17.294 17.294 2 0.0058509 9904 QUIQUE_C1218_190116_001 65.5 25.878 29705000 14213000 11558000 0 0 0 0 0 0 0 3933400 0 0 0 1125 4258 1045 9966;9967;9968 12956;12957;12958 12956 3 AESGDSLGSEDRDLLYSIDAYR Unmodified 2431.1139 0.11392672 4258 Q9NQW6 ANLN Actin-binding protein anillin yes yes 0 0 1 1 120.25 120.25 3 0.00019128 126554 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.904 40.062 32355000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32355000 0 0 1126 4258 1046 9969 12959 12959 1 AESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPK Acetyl (Protein N-term) 2951.3017 0.30168051 4503 Q9UMX0 UBQLN1 Ubiquilin-1 yes yes 1 0 0 1 73.533 73.533 3 5.293E-06 73047 QUIQUE_C1563_190116_001 43.04 40.499 33909000 0 0 0 0 0 33909000 0 0 0 0 0 0 0 1127 4503 1047 9970 12960 12960 0 AESIIIR Acetyl (Protein N-term) 842.48617 0.48616764 3660 Q8TAT6;I3L4U9 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 90.56 90.56 2 0.0096278 93316 QUIQUE_C1218_190116_001 116.11 54.992 59338000 14526000 0 0 0 0 0 0 16569000 0 10908000 0 0 17334000 1128 3660 1048 9971;9972;9973;9974 12961;12962;12963;12964 12961 4 AESLIGVYPEQGDCVISK Unmodified 1963.9561 0.95609286 3079 Q14683;G8JLG1 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 100.11 100.11 2 0.00065608 103732 QUIQUE_C1576_190116_001 89.629 76.672 40099000 0 0 0 0 0 0 40099000 0 0 0 0 0 0 1129 3079 1049 9975 12965 12965 1 AESLQQEVEALK Unmodified 1343.6933 0.69325988 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.369 90.369 2 0.0033855 92291 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.243 35.686 1051000000 182460000 0 203480000 0 0 192100000 0 0 0 95753000 116230000 107540000 153390000 1130 890;3052 1050 9976;9977;9978;9979;9980;9981;9982 12966;12967;12968;12969;12970;12971;12972 12972 3 AESLQQEVEALKER Unmodified 1628.837 0.836964 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 78.424 78.424 2;3 7.7934E-07 79968 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.84 105.05 925360000 0 45652000 0 0 0 0 0 147640000 161450000 0 226900000 172890000 170840000 1131 890;3052 1051 9983;9984;9985;9986;9987;9988;9989;9990;9991;9992;9993 12973;12974;12975;12976;12977;12978;12979;12980;12981;12982;12983 12979 10 AESLQVTR Unmodified 902.48214 0.48214489 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.741 20.741 2 0.0009417 13428 QUIQUE_C1403_190116_001 147.52 60.653 9840700000 1115400000 1569300000 710460000 1115600000 578010000 1090700000 617560000 445290000 663100000 493150000 0 850980000 591130000 1132 1245 1052 9994;9995;9996;9997;9998;9999;10000;10001;10002;10003;10004;10005 12984;12985;12986;12987;12988;12989;12990;12991;12992;12993;12994;12995 12987 7 AESMFTNAVQILEQFK Oxidation (M) 1870.9135 0.91349976 367 A0A1W2PRH3;K7EPJ2;K7EMD7;K7ELE1;A0A1W2PNW5;A0A1W2PPB6;A0A1W2PR74;A0A1W2PPR7;A0A1W2PQZ1;A0A1W2PNQ8;A0A1W2PQR8;A0A1W2PQP4;A0A1W2PNR0;A0A1W2PNH8;A0A1W2PS19;A0A1W2PQA9;O95427 PIGN GPI ethanolamine phosphate transferase 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 136.7 136.7 2 0.00436 138479 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.466 28.591 450950000 65311000 0 0 84634000 117630000 0 0 0 93525000 0 0 0 89852000 1133 367 1053 10006;10007;10008;10009;10010;10011 12996;12997;12998;12999;13000;13001 13000 265 6 AESMFTNAVQILEQFK Unmodified 1854.9186 0.91858514 367 A0A1W2PRH3;K7EPJ2;K7EMD7;K7ELE1;A0A1W2PNW5;A0A1W2PPB6;A0A1W2PR74;A0A1W2PPR7;A0A1W2PQZ1;A0A1W2PNQ8;A0A1W2PQR8;A0A1W2PQP4;A0A1W2PNR0;A0A1W2PNH8;A0A1W2PS19;A0A1W2PQA9;O95427 PIGN GPI ethanolamine phosphate transferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.53 138.53 2 0.0049571 145340 QUIQUE_C1438_190116_001 56.225 16.959 1210500000 0 106370000 0 0 195110000 115170000 149300000 0 174830000 72985000 173130000 0 223590000 1134 367 1053 10012;10013;10014;10015;10016;10017;10018;10019;10020;10021 13002;13003;13004;13005;13006;13007;13008;13009;13010;13011 13004 8 AESMLQQADK Unmodified 1119.523 0.52302343 181 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.142 26.142 2 0.00021235 19975 QUIQUE_C1277_190116_001 129.38 87.276 515820000 44740000 46438000 48824000 39462000 51538000 35932000 48264000 28066000 45724000 18822000 67054000 40960000 0 1135 181 1054 10022;10023;10024;10025;10026;10027;10028;10029;10030;10031;10032;10033 13012;13013;13014;13015;13016;13017;13018;13019;13020;13021;13022;13023;13024;13025;13026 13014 15 AESPTQHPLLR Unmodified 1247.6622 0.66223452 297 A0A0J9YW40 yes yes 0 0 0 1 20.93 20.93 3 0.024639 13941 QUIQUE_C1576_190116_001 31.478 14.453 25846000 0 0 0 0 0 0 25846000 0 0 0 0 0 0 1136 297 1055 10034 13027 13027 1 AESQLLECK Unmodified 1076.5172 0.51720977 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 1 29.174 29.174 2 0.011612 23692 QUIQUE_C1438_190116_001 72.485 41.981 90863000 0 0 0 0 32219000 0 29659000 28985000 0 0 0 0 0 1137 2041 1056 10035;10036;10037 13028;13029;13030 13028 3 AESSDKLYR Acetyl (Protein N-term) 1109.5353 0.53530267 1974 P09874;Q5VX84;Q5VX85 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes no 1 0 1 1 30.182 30.182 2 0.061724 25181 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.825 50.846 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1138 1974 1057 10038 13031 13031 1 AESSSDEAVADTSR Unmodified 1423.6063 0.60629536 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363;H0YAP9 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.432 18.432 2 7.3818E-14 11081 QUIQUE_C1438_190116_001 167.6 146.13 262910000 25026000 20740000 30089000 26050000 64795000 0 40229000 0 26680000 9502300 0 0 19798000 1139 130 1058 10039;10040;10041;10042;10043;10044;10045;10046;10047;10048;10049 13032;13033;13034;13035;13036;13037;13038;13039;13040;13041;13042;13043 13037 12 AESTFLFLVGQDDHNWK Unmodified 2005.9534 0.95339074 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 123.21 123.21 2;3 0.00013909 128685 QUIQUE_C1218_190116_001 78.249 69.317 1224500000 79288000 60094000 114990000 118180000 108390000 113570000 111020000 175010000 73306000 55264000 74138000 63817000 77461000 1140 98;3487 1059 10050;10051;10052;10053;10054;10055;10056;10057;10058;10059;10060;10061;10062;10063 13044;13045;13046;13047;13048;13049;13050;13051;13052;13053;13054;13055;13056;13057;13058;13059;13060;13061;13062;13063;13064 13044 21 AESTPEIAEQR Unmodified 1229.5888 0.58879481 721 C9JFE4;Q13098 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.669 25.669 2 0.0012865 19271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.55 82.921 911310000 0 0 83364000 0 112860000 119320000 114250000 85052000 0 35753000 140110000 95781000 124810000 1141 721 1060 10064;10065;10066;10067;10068;10069;10070;10071;10072;10073 13065;13066;13067;13068;13069;13070;13071;13072;13073;13074 13072 9 AESVAAPITVR Unmodified 1112.619 0.61897272 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 46.424 46.424 2 0.0098689 42969 QUIQUE_C1277_190116_001 62.823 46.283 111810000 41700000 42308000 0 0 0 0 0 0 0 27799000 0 0 0 1142 3895 1061 10074;10075;10076 13075;13076;13077 13076 3 AETECQNTEYQQLLDIK Unmodified 2081.9575 0.95754942 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 103.48 103.48 2;3 0 101308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 336.5 318.92 4055100000 299910000 0 150220000 235300000 246700000 189740000 115060000 213980000 267230000 651590000 402300000 548450000 734590000 + 1143 776 1062 10077;10078;10079;10080;10081;10082;10083;10084;10085;10086;10087;10088;10089;10090;10091;10092;10093;10094;10095;10096;10097;10098 13078;13079;13080;13081;13082;13083;13084;13085;13086;13087;13088;13089;13090;13091;13092;13093;13094;13095;13096;13097;13098;13099;13100;13101;13102;13103;13104;13105;13106;13107;13108;13109;13110;13111 13099 34 AETEEAEEPEEDGEEHVCVSASK Unmodified 2560.0395 0.039500731 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 44.094 44.094 3 1.1684E-05 41082 QUIQUE_C1368_190116_001 71.651 70.582 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1144 2483 1063 10099 13112 13112 1 AETEEGPDVLR Unmodified 1214.5779 0.57789577 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.029 40.029 2 0.0026838 35101 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.815 55.308 473960000 0 0 110330000 0 0 0 92544000 55040000 78653000 49767000 0 0 87623000 1145 1007 1064 10100;10101;10102;10103;10104;10105 13113;13114;13115;13116;13117;13118;13119;13120 13119 6 AETEELIR Unmodified 959.49238 0.49237523 2290 P29590;H3BT57;H3BT29;H3BUJ5 PML Protein PML yes no 0 0 0 1 31.873 31.873 2 0.056145 26784 QUIQUE_C1277_190116_001 54.157 31.138 119350000 0 119350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1146 2290 1065 10106 13121 13121 1 AETLEFNDVYQEVK Acetyl (Protein N-term) 1725.8097 0.8097462 2927 Q08945 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.72 140.72 2 2.0461E-05 147589 QUIQUE_C1438_190116_001 143.97 127.44 396550000 0 51993000 0 46984000 41862000 0 0 48989000 38292000 0 65634000 51439000 51362000 1147 2927 1066 10107;10108;10109;10110;10111;10112;10113;10114;10115 13122;13123;13124;13125;13126;13127;13128;13129;13130;13131;13132 13127 11 AETLMTVTDPVHDIAFAPNLGR Unmodified 2367.1893 0.18928069 1331 K7ELV2;Q96EE3 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 132.46 132.46 3 1.8749E-09 135347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.269 86.481 468230000 55732000 57769000 41593000 32434000 61381000 56343000 0 50452000 0 16644000 0 46739000 49143000 1148 1331 1067 10116;10117;10118;10119;10120;10121;10122;10123;10124;10125;10126;10127 13133;13134;13135;13136;13137;13138;13139;13140;13141;13142;13143;13144 13139 10 AETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTR Acetyl (Protein N-term) 2536.1889 0.18888258 3138 Q15424;K7ES42 SAFB Scaffold attachment factor B1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 135.61 135.61 3 6.2844E-13 140812 QUIQUE_C1218_190116_001 72.035 60.735 209470000 55600000 0 0 52412000 49439000 42737000 0 0 0 9284200 0 0 0 1149 3138 1068 10128;10129;10130;10131;10132 13145;13146;13147;13148;13149 13145 5 AETLVTLDFTSR Unmodified 1351.6983 0.69834526 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 106.51 106.51 2 0.0003686 108903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.83 81.609 325360000 0 35540000 0 0 39138000 42849000 0 51265000 56096000 38753000 0 61718000 0 1150 57 1069 10133;10134;10135;10136;10137;10138;10139;10140;10141;10142;10143 13150;13151;13152;13153;13154;13155;13156;13157;13158;13159;13160;13161;13162 13154 9 AETPTAAEDDNEGDKK Unmodified 1689.733 0.73295244 42 A0A087WUT6;O60841 EIF5B Eukaryotic translation initiation factor 5B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 11.253 11.253 3 0.00070941 3389 QUIQUE_C1576_190116_001 54.281 49.566 28020000 1720200 0 0 4949900 5658400 0 5489000 0 4874900 0 0 0 5327600 1151 42 1070 10144;10145;10146;10147;10148;10149 13163;13164;13165;13166;13167;13168;13169 13166 7 AETVADTR Acetyl (Protein N-term) 903.42977 0.42977497 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 1 0 0 1 35.461 35.461 2 0.061794 31557 QUIQUE_C1438_190116_001 42.287 20.585 57423000 0 0 0 0 57423000 0 0 0 0 0 0 0 0 1152 1578 1071 10150 13170 13170 1 AETVADTRR Acetyl (Protein N-term) 1059.5309 0.530886 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 1 0 1 1 1 1 22.925 22.925 2 0.0059279 16615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.41 74.528 302810000 0 0 0 0 0 0 0 302810000 0 0 0 0 0 1153 1578 1072 10151;10152;10153 13171;13172;13173 13171 3 AETVQAALEEAQR Unmodified 1414.7052 0.70522155 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 71.197 71.197 2;3 1.174E-12 71886 QUIQUE_C1438_190116_001 152.7 116 714210000 93032000 104160000 72616000 52961000 97038000 0 0 64203000 75433000 71653000 83111000 0 0 1154 2665 1073 10154;10155;10156;10157;10158;10159;10160;10161;10162;10163;10164;10165;10166 13174;13175;13176;13177;13178;13179;13180;13181;13182;13183;13184;13185;13186 13179 12 AETYDFLFK Acetyl (Protein N-term) 1174.5546 0.55464113 2706 P61018 RAB4B Ras-related protein Rab-4B no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.65 154.65 2 0.0005217 158876 QUIQUE_C1277_190116_001 107.29 94.258 350770000 31963000 36148000 36192000 28537000 27672000 24049000 26471000 0 27124000 12788000 36740000 25274000 37816000 1155 2706 1074 10167;10168;10169;10170;10171;10172;10173;10174;10175;10176;10177;10178 13187;13188;13189;13190;13191;13192;13193;13194;13195;13196;13197;13198;13199 13189 10 AETYEGVYQCTAR Unmodified 1546.6722 0.67220686 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.694 48.694 2 2.2409E-17 46977 QUIQUE_C1218_190116_001 164.43 148.8 2005300000 109370000 224930000 184180000 185900000 237560000 185130000 237250000 97505000 121700000 71198000 163800000 186730000 0 1156 756 1075 10179;10180;10181;10182;10183;10184;10185;10186;10187;10188;10189;10190 13200;13201;13202;13203;13204;13205;13206;13207;13208;13209;13210;13211;13212;13213 13201 14 AEVAAEFLNDR Unmodified 1233.599 0.59896556 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.513 75.513 2 0.00065522 72245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.249 60.773 336620000 67019000 0 0 49167000 0 70545000 0 39725000 0 32318000 77850000 0 0 1157 3664 1076 10191;10192;10193;10194;10195;10196;10197 13214;13215;13216;13217;13218;13219;13220 13219 6 AEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIAAK Unmodified 3749.9251 0.92511689 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 1 1 1 149 149 3 4.7782E-05 153638 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.438 38.629 58887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28606000 30281000 1158 3660 1077 10198;10199 13221;13222 13221 2 AEVADEKLHVTVR Unmodified 1465.7889 0.7888916 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 1 3 1 1 28.176 28.176 2;3 0.00028434 22441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.591 63.857 361600000 0 0 0 0 0 0 0 226700000 73824000 0 0 61069000 0 1159 2121 1078 10200;10201;10202;10203;10204 13223;13224;13225;13226;13227;13228 13223 5 AEVCADCSAPDPGWASISR Unmodified 2047.8728 0.87277394 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.747 87.747 2 6.9506E-55 89294 QUIQUE_C1277_190116_001 171.76 162.57 183880000 42323000 39901000 0 31355000 32178000 0 38125000 0 0 0 0 0 0 1160 245 1079 10205;10206;10207;10208;10209;10210 13229;13230;13231;13232;13233;13234 13230 6 AEVDLER Unmodified 830.4134 0.41339662 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 23.656 23.656 2 0.022679 17847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.69 9.2243 290510000 0 0 0 0 0 63487000 0 64882000 0 50894000 0 0 111250000 1161 2405 1080 10211;10212;10213;10214 13235;13236;13237;13238 13236 4 AEVDMDTDAPQVSHKPGGEPK Unmodified 2207.0165 0.016461285 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 31.264 31.264 4 0.024085 26156 QUIQUE_C1368_190116_001 27.964 17.864 32587000 0 0 32587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1162 3053 1081 10215 13239 13239 1 AEVEETLK Acetyl (Protein N-term) 959.48114 0.48114184 4240 Q9NP97;Q8TF09;H3BNG9;H3BPA0 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 no no 1 0 0 1 30.694 30.694 2 0.039494 25452 QUIQUE_C1438_190116_001 48.561 8.4581 210820000 0 0 0 0 210820000 0 0 0 0 0 0 0 0 1163 4240 1082 10216 13240 13240 1 AEVEETLKR Acetyl (Protein N-term) 1115.5823 0.58225287 4240 Q9NP97;Q8TF09;H3BNG9;H3BPA0 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.443 54.443 2 0.0039566 52424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.95 84.422 1037300000 0 153270000 0 0 0 0 150620000 150390000 162860000 43506000 203170000 173450000 0 1164 4240 1083 10217;10218;10219;10220;10221;10222;10223;10224;10225;10226 13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249;13250 13247 7 AEVEVADELLENLAK Unmodified 1641.8461 0.84613171 3444 Q7L5D6;C9JPA8;C9JHN8 GET4 Golgi to ER traffic protein 4 homolog yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 143.36 143.36 2;3 2.0284E-07 150530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.5 102.6 648950000 96583000 96399000 86980000 82711000 92904000 0 0 0 0 28855000 85749000 0 78772000 1165 3444 1084 10227;10228;10229;10230;10231;10232;10233;10234;10235;10236;10237 13251;13252;13253;13254;13255;13256;13257;13258;13259;13260;13261 13260 9 AEVGVIAK Unmodified 785.4647 0.46470391 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 20.99 20.99 2 0.04786 14219 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.122 22.764 18360000 0 0 0 0 0 0 0 18360000 0 0 0 0 0 1166 2990 1085 10238 13262 13262 1 AEVIMNYHVGETVLSLQK Unmodified 2030.0507 0.050661947 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.02 105.02 3 9.6152E-05 108256 QUIQUE_C1277_190116_001 78.021 57.93 339940000 0 53000000 33886000 37013000 42394000 32297000 0 35082000 0 0 48657000 57609000 0 1167 3135 1086 10239;10240;10241;10242;10243;10244;10245;10246 13263;13264;13265;13266;13267;13268;13269;13270;13271 13263 9 AEVLISTVGPEDCVVPFLTRPK Unmodified 2426.2879 0.28793211 2677 P56192;F5H2V6;F8VS26;F8W0M7;F8W0S4;F8VZZ9 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.47 130.47 3 3.4627E-08 134893 QUIQUE_C1277_190116_001 87.156 76.012 439620000 0 53681000 54734000 42052000 41332000 0 0 68324000 0 0 64404000 59324000 55767000 1168 2677 1087 10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254 13272;13273;13274;13275;13276;13277;13278;13279;13280;13281 13272 10 AEVLSEEPILK Unmodified 1226.6758 0.6758189 3437 Q7L1Q6 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.646 72.646 2 0.00049397 69334 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.65 56.893 482200000 92779000 60805000 73895000 77787000 0 0 0 66842000 79429000 30662000 0 0 0 1169 3437 1088 10255;10256;10257;10258;10259;10260;10261 13282;13283;13284;13285;13286;13287;13288 13288 4 AEVLWLMGAK Unmodified 1116.6002 0.60015154 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 112.5 112.5 2 0.020651 116032 QUIQUE_C1277_190116_001 59.245 34.322 11420000 0 11420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1170 1697 1089 10262;10263 13289;13290 13289 2 AEVNGLAAQGK Unmodified 1056.5564 0.55637247 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.92 19.92 2 0.00062229 13288 QUIQUE_C1218_190116_001 117.04 93.607 26749000000 1892900000 2131500000 2135200000 1844900000 2051200000 0 1583000000 3226300000 2913300000 1153400000 3077400000 2767700000 1971800000 1171 1978 1090 10264;10265;10266;10267;10268;10269;10270;10271;10272;10273;10274;10275 13291;13292;13293;13294;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303;13304 13291 11 AEVPGATGGDSPHLQPAEPPGEPR Unmodified 2365.1299 0.12985156 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WWC8 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.87 57.87 3 6.8554E-09 56364 QUIQUE_C1277_190116_001 80.683 72.879 1033200000 107870000 131630000 83036000 108420000 113960000 0 85177000 49181000 80254000 35047000 66269000 92532000 79846000 1172 140 1091 10276;10277;10278;10279;10280;10281;10282;10283;10284;10285;10286;10287 13305;13306;13307;13308;13309;13310;13311;13312;13313;13314;13315;13316 13306 11 AEVQHQLHVAVGSLQESILAQVQR Unmodified 2639.4143 0.41434668 3379 Q6P2E9;I3L3M2 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 115.88 115.88 4 0.00043923 120288 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.38 13.996 26382000 0 0 0 0 0 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no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.22 137.22 2 0.00057026 142871 QUIQUE_C1218_190116_001 104.22 86.991 111850000 14218000 0 15279000 0 26390000 0 0 20754000 35211000 0 0 0 0 1176 129 1094 10306;10307;10308;10309;10310;10311;10312 13335;13336;13337;13338;13339;13340;13341;13342 13335 8 AEVVETTQVYTEEETR Unmodified 1882.8796 0.87961668 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 64.493 64.493 2 5.6506E-06 60249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.44 89.904 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1177 3117 1095 10313 13343 13343 1 AEVVETTQVYTEEETRR Unmodified 2038.9807 0.98072771 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 3 4 1 2 2 52.854 52.854 2;3;4 5.2526E-121 50613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 226.59 183.78 4134900000 215480000 230690000 252270000 0 279810000 0 307000000 443640000 834030000 296010000 285230000 694780000 295990000 1178 3117 1096 10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324;10325;10326;10327;10328;10329;10330;10331;10332;10333;10334;10335 13344;13345;13346;13347;13348;13349;13350;13351;13352;13353;13354;13355;13356;13357;13358;13359;13360;13361;13362;13363;13364;13365;13366;13367;13368;13369 13354 24 AEVVGKPSPEFFK Unmodified 1433.7555 0.7554662 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 56.512 56.512 2;3 0.00087256 55639 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.09 80.667 4442900000 0 128610000 196210000 0 191000000 83382000 182600000 797480000 543140000 0 586690000 760300000 973480000 1179 4111 1097 10336;10337;10338;10339;10340;10341;10342;10343;10344;10345;10346;10347;10348 13370;13371;13372;13373;13374;13375;13376;13377;13378;13379;13380;13381;13382;13383 13376 13 AEVVLGNIIK Unmodified 1054.6386 0.63864553 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81;K7EKU4;K7EIR5;Q5TG84 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.758 81.758 2 0.0076369 83687 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.879 50.139 694360000 60269000 69307000 64792000 71755000 42157000 48849000 75768000 42121000 35469000 18793000 71279000 39501000 54297000 1180 2985 1098 10349;10350;10351;10352;10353;10354;10355;10356;10357;10358;10359;10360;10361 13384;13385;13386;13387;13388;13389;13390;13391;13392;13393;13394;13395;13396;13397 13394 14 AEVWDLDMLR Unmodified 1246.6016 0.6016081 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 130.39 130.39 2 0.027126 134213 QUIQUE_C1403_190116_001 55.461 16.157 87187000 0 0 0 19039000 22558000 14352000 19873000 0 11365000 0 0 0 0 1181 3379 1099 10362;10363;10364;10365;10366;10367 13398;13399;13400;13401;13402;13403 13399 6 AEWLLAVR Unmodified 956.54435 0.54435122 4271 Q9NRN7 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.098 96.098 2 0.016541 98719 QUIQUE_C1368_190116_001 120.65 72.141 346500000 0 46719000 43660000 0 0 0 55297000 36624000 38788000 18379000 58084000 48952000 0 1182 4271 1100 10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375 13404;13405;13406;13407;13408;13409;13410;13411 13405 3 AEWQVYKEEISR Unmodified 1536.7573 0.75725712 2841 Q00059;H7BYN3 TFAM Transcription factor A, mitochondrial yes no 0 0 1 1 66.617 66.617 3 0.047114 66655 QUIQUE_DMIX3_190116_001 34.179 26.808 25542000 0 0 0 0 0 0 0 0 25542000 0 0 0 0 1183 2841 1101 10376 13412 13412 1 AEYAEFLHCK Unmodified 1266.5703 0.57030797 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 51.683 51.683 2;3 0.00099864 49655 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 55.431 739340000 0 47552000 55047000 63934000 93922000 47512000 89719000 0 28726000 0 110690000 123110000 79124000 1184 840;4528 1102 10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383;10384;10385;10386;10387;10388;10389 13413;13414;13415;13416;13417;13418;13419;13420;13421;13422;13423;13424;13425;13426 13415 14 AEYDLTTR Acetyl (Protein N-term) 1009.4716 0.47163978 2690 P60228;E5RHS5;E5RII3;E5RIP5;E5RJ25 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 1 0 0 1 1 1 72.507 72.507 2 0.016132 72202 QUIQUE_C1277_190116_001 65.246 51.575 59436000 25454000 22475000 0 0 0 0 0 0 0 11507000 0 0 0 1185 2690 1103 10390;10391;10392 13427;13428;13429 13428 3 AEYEFDSPYWDDISDSAK Unmodified 2136.88 0.88001061 3039;3526 Q14012;H7C071;Q8IU85;A0A087WUR6 CAMK1;CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.18 133.18 2 1.8869E-10 135794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.87 124.79 1195800000 103090000 97022000 95895000 98472000 87485000 84376000 101020000 88810000 85357000 30783000 122960000 99451000 101080000 1186 3039;3526 1104 10393;10394;10395;10396;10397;10398;10399;10400;10401;10402;10403;10404;10405 13430;13431;13432;13433;13434;13435;13436;13437;13438;13439;13440;13441;13442 13437 13 AEYEGDGIPTVFVAVAGR Unmodified 1849.921 0.92102798 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.54 129.54 2 2.2718E-07 126131 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.13 126.1 1765300000 229520000 199390000 203710000 184150000 206740000 213300000 0 127490000 167100000 104360000 0 129520000 0 1187 2195 1105 10406;10407;10408;10409;10410;10411;10412;10413;10414;10415 13443;13444;13445;13446;13447;13448;13449;13450;13451;13452 13451 10 AEYGTLLQDLTNNITLEDLEQLK Acetyl (Protein N-term) 2675.3542 0.35415699 3114 Q15121;B1AKZ5 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 1 178.72 178.72 2;3 2.0765E-224 185329 QUIQUE_DMIX5_190116_001 260.12 242.38 1894000000 0 5240900 277640000 10859000 13661000 0 355050000 448890000 232320000 0 445230000 0 105090000 1188 3114 1106 10416;10417;10418;10419;10420;10421;10422;10423;10424;10425;10426;10427;10428 13453;13454;13455;13456;13457;13458;13459;13460;13461;13462;13463;13464;13465 13464 13 AEYLASIFGTEK Acetyl (Protein N-term) 1369.6765 0.67654718 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4;K7EJH3;K7EJM7 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.58 170.58 2 3.4562E-06 174778 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.81 119.13 2445900000 238460000 271240000 212210000 240270000 251090000 189900000 229200000 138610000 126230000 62303000 181510000 145520000 159320000 1189 1987 1107 10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439;10440;10441 13466;13467;13468;13469;13470;13471;13472;13473;13474;13475;13476;13477;13478;13479 13474 14 AEYLASIFGTEKDK Acetyl (Protein N-term) 1612.7985 0.79845323 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4;K7EJH3;K7EJM7 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 1 1 1 1 1 154.1 154.1 2 0.0012353 157017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.314 57.293 292150000 0 0 0 0 0 0 0 63624000 58682000 0 112950000 0 56894000 1190 1987 1108 10442;10443;10444;10445 13480;13481;13482;13483 13480 2 AEYLASIFGTEKDKVNCSFYFK Acetyl (Protein N-term) 2658.2676 0.26759059 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 2 1 159.36 159.36 3 8.3947E-15 161874 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.06 112.03 28098000 0 0 0 0 0 0 0 28098000 0 0 0 0 0 1191 1987 1109 10446 13484 13484 1 AFAAGADIK Unmodified 862.45487 0.45486751 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 30.198 30.198 1;2 0.0081912 24513 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.474 28.508 4786900000 459690000 481480000 548230000 406990000 545170000 0 429570000 314770000 438520000 209580000 532650000 420220000 0 1192 2305 1110 10447;10448;10449;10450;10451;10452;10453;10454;10455;10456;10457;10458;10459;10460 13485;13486;13487;13488;13489;13490;13491;13492;13493;13494;13495;13496;13497;13498 13495 11 AFAAQEDLEK Unmodified 1120.5401 0.5400537 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 40.517 40.517 2 4.3648E-05 36441 QUIQUE_C1563_190116_001 144.09 122.64 3657100000 240430000 292130000 175060000 357820000 310850000 315520000 327950000 275430000 393230000 186210000 390720000 391750000 0 1193 434 1111 10461;10462;10463;10464;10465;10466;10467;10468;10469;10470;10471;10472;10473 13499;13500;13501;13502;13503;13504;13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513 13504 14 AFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVR Oxidation (M) 3150.5036 0.5035569 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 168.54 168.54 3 1.9429E-65 170665 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.99 136.42 1012300000 58745000 123070000 119230000 84851000 109690000 137040000 0 126040000 144090000 20759000 88748000 0 0 1194 2514 1112 10474;10475;10476;10477;10478;10479;10480;10481;10482;10483;10484;10485;10486;10487 13514;13515;13516;13517;13518;13519;13520;13521;13522;13523;13524;13525;13526;13527 13523 1936;1937;1938 14 AFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVR Unmodified 3134.5086 0.50864228 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 171.07 171.07 2;3 1.4403E-66 175798 QUIQUE_C1368_190116_001 158.18 146.87 2624700000 135830000 314600000 255180000 73183000 136810000 55220000 256130000 206050000 169120000 13526000 498690000 333730000 176610000 1195 2514 1112 10488;10489;10490;10491;10492;10493;10494;10495;10496;10497;10498;10499;10500;10501 13528;13529;13530;13531;13532;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;13541 13530 13 AFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELR Unmodified 3029.538 0.53795179 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 1 168.55 168.55 2;3;4 7.1892E-66 172098 QUIQUE_C1277_190116_001 155.73 143.24 6978800000 357290000 584090000 623740000 251570000 434370000 372390000 561140000 705910000 513820000 135390000 956730000 705150000 777190000 1196 2573 1113 10502;10503;10504;10505;10506;10507;10508;10509;10510;10511;10512;10513;10514;10515;10516;10517;10518;10519;10520;10521;10522;10523;10524;10525;10526;10527 13542;13543;13544;13545;13546;13547;13548;13549;13550;13551;13552;13553;13554;13555;13556;13557;13558;13559;13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567 13545 26 AFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELR Oxidation (M) 3045.5329 0.53286642 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 158.58 158.58 3 1.1512E-15 162276 QUIQUE_C1403_190116_001 77.925 71.697 838420000 108770000 134290000 153750000 94921000 0 125360000 0 63961000 108410000 48957000 0 0 0 1197 2573 1113 10528;10529;10530;10531;10532;10533;10534;10535 13568;13569;13570;13571;13572;13573;13574;13575;13576 13571 2021 8 AFAFQASQDK Unmodified 1111.5298 0.52982336 694 C9J494;Q9H000 MKRN2 Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2 yes no 0 0 0 1 1 42.612 42.612 2 0.029338 39496 QUIQUE_C1576_190116_001 65.474 46.691 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1198 694 1114 10536;10537 13577;13578 13578 2 AFAFVTFADDQIAQSLCGEDLIIK Unmodified 2671.3204 0.32035445 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A0A0N0M3;A0A1W2PNU8;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3;A0A087WYE7;A0A087WZC9;A0A087WZM1 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.24 169.24 3 1.8805E-18 171088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.17 105.63 509220000 0 29502000 30929000 0 79010000 0 67928000 61186000 41379000 0 81430000 74947000 42906000 1199 2968 1115 10538;10539;10540;10541;10542;10543;10544;10545;10546 13579;13580;13581;13582;13583;13584;13585;13586;13587 13583 8 AFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEK Unmodified 3222.5833 0.58332208 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 173.76 173.76 3;4 6.4103E-256 180965 QUIQUE_DMIX5_190116_001 209.68 195.22 1241600000 0 36760000 11427000 0 57741000 16984000 141480000 62912000 172420000 0 213140000 426330000 102400000 1200 666 1116 10547;10548;10549;10550;10551;10552;10553;10554;10555;10556;10557 13588;13589;13590;13591;13592;13593;13594;13595;13596;13597;13598;13599 13597 12 AFAHITGGGLLENIPR Unmodified 1664.8998 0.89983903 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.679 96.679 3 1.2466E-05 100523 QUIQUE_C1438_190116_001 71.279 58.402 723930000 0 75795000 68359000 54734000 70478000 59404000 73139000 49979000 73195000 0 83655000 63745000 51443000 1201 2194 1117 10558;10559;10560;10561;10562;10563;10564;10565;10566;10567;10568 13600;13601;13602;13603;13604;13605;13606;13607;13608;13609;13610;13611;13612 13604 13 AFAHLQVPER Unmodified 1166.6196 0.61964142 2834 P98160;A0A0U1RQT3 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 43.534 43.534 3 0.029152 40718 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.883 34.28 154700000 0 0 0 0 97309000 0 0 57388000 0 0 0 0 0 1202 2834 1118 10569;10570 13613;13614 13614 2 AFALEVIK Unmodified 889.5273 0.52730417 4150 Q9H2U2 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.576 80.576 2 0.025599 82533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.342 38.872 765110000 0 0 124410000 93497000 95685000 0 88883000 0 97745000 0 125480000 0 139410000 1203 4150 1119 10571;10572;10573;10574;10575;10576;10577 13615;13616;13617;13618;13619;13620;13621;13622;13623 13619 9 AFALNDLDDYEK Unmodified 1412.646 0.64597533 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.6 103.6 2 0.0022296 105919 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.228 52.198 635800000 41401000 47857000 59396000 65305000 57599000 55199000 62238000 28612000 27656000 23158000 74824000 34820000 57735000 1204 3049 1120 10578;10579;10580;10581;10582;10583;10584;10585;10586;10587;10588;10589;10590 13624;13625;13626;13627;13628;13629;13630;13631;13632;13633;13634;13635;13636;13637 13632 14 AFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLR Unmodified 3377.6959 0.69592577 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 1 154 154 3;4 1.4414E-87 158104 QUIQUE_C1277_190116_001 160.99 153.22 2789900000 183830000 126390000 0 236480000 250290000 117340000 130860000 388850000 275140000 0 424210000 380020000 276530000 1205 3130 1121 10591;10592;10593;10594;10595;10596;10597;10598;10599;10600;10601;10602;10603;10604;10605 13638;13639;13640;13641;13642;13643;13644;13645;13646;13647;13648;13649;13650;13651;13652;13653;13654;13655;13656 13639 16 AFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLR Oxidation (M) 3393.6908 0.6908404 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 1 2 2 1 4 1 145.76 145.76 3;4 1.5519E-30 159309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.794 90.474 624050000 0 0 0 142240000 0 0 0 70884000 0 0 349540000 0 61392000 1206 3130 1121 10606;10607;10608;10609;10610;10611;10612;10613 13657;13658;13659;13660;13661;13662;13663;13664;13665 13664 2587;2588 9 AFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLR Unmodified 3350.685 0.68502674 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;F8W1G6;H3BND9;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 2 1 3 2 1 1 1 1 1 3 2 1 2 157.71 157.71 3;4 9.1375E-64 161942 QUIQUE_C1277_190116_001 146.45 140.79 2842900000 51745000 157060000 158200000 179160000 109440000 66214000 287360000 163720000 365780000 0 730350000 314490000 259370000 1207 1044;3131 1122 10614;10615;10616;10617;10618;10619;10620;10621;10622;10623;10624;10625;10626;10627;10628;10629;10630;10631;10632 13666;13667;13668;13669;13670;13671;13672;13673;13674;13675;13676;13677;13678;13679;13680;13681;13682;13683;13684;13685;13686;13687;13688;13689;13690;13691;13692 13668 24 AFANLRK Acetyl (Protein N-term) 860.48684 0.48683634 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 1 0 1 1 1 43.298 43.298 2 0.032271 41004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.54 73.442 173360000 0 0 0 0 0 0 0 0 75957000 0 0 0 97403000 1208 404 1123 10633;10634 13693;13694 13693 0 AFAVGVQQVLLK Unmodified 1271.7602 0.76015765 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.27 102.27 2 0.00053086 104841 QUIQUE_C1277_190116_001 100.02 91.974 1162000000 100960000 118870000 0 104340000 0 85517000 0 117480000 126980000 55776000 182370000 132320000 137420000 1209 1727 1124 10635;10636;10637;10638;10639;10640;10641;10642;10643;10644 13695;13696;13697;13698;13699;13700;13701;13702;13703;13704;13705 13696 7 AFAVVASALGIPSLLPFLK Unmodified 1913.139 0.13900667 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 171.12 171.12 2;3 3.2018E-17 178342 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.1 121.79 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13747;13748;13749;13750;13751;13752;13753;13754;13755 13754 3 AFCQEMLQEEPR Unmodified 1536.6701 0.67009837 4214 Q9HBH5 RDH14 Retinol dehydrogenase 14 yes yes 0 0 0 1 1 72.51 72.51 2 0.00045515 72494 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.83 91.518 42501000 0 0 0 0 0 0 0 19328000 0 0 0 23173000 0 1215 4214 1130 10692;10693 13756;13757;13758 13756 2 AFCSFQIYAVPWQGTMTLSK Unmodified 2334.1177 0.11769565 1804 P01034 CST3 Cystatin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 152.57 152.57 2;3 4.28E-06 157513 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.72 115.12 133570000 0 0 0 0 0 0 0 34924000 34972000 0 0 63678000 0 1216 1804 1131 10694;10695;10696 13759;13760;13761 13760 2 AFDITYVR Unmodified 983.50763 0.50763136 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.843 74.843 2 0.0064687 75539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 70.354 472360000 0 74780000 89314000 0 0 0 68699000 0 77214000 0 91964000 70392000 0 1217 2008 1132 10697;10698;10699;10700;10701;10702 13762;13763;13764;13765;13766;13767 13765 6 AFDLFNPNFK Unmodified 1211.5975 0.597509 1300 J3QLR8;Q9Y3D9 MRPS23 28S ribosomal protein S23, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.3 120.3 2 0.0057299 126237 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.478 59.938 148850000 0 0 24854000 14757000 0 0 0 0 17819000 0 29648000 38533000 23241000 1218 1300 1133 10703;10704;10705;10706;10707;10708;10709;10710;10711;10712;10713 13768;13769;13770;13771;13772;13773;13774;13775;13776;13777;13778 13776 11 AFDLIVDRPVTLVR Unmodified 1612.9301 0.93007653 1767 O96000;H3BPJ9;H3BV16 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 2 107.82 107.82 2;3 7.5592E-11 110724 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.84 108.52 8081200000 500680000 802410000 876460000 525600000 458660000 499700000 876980000 438600000 491760000 282280000 738160000 827800000 762090000 1219 1767 1134 10714;10715;10716;10717;10718;10719;10720;10721;10722;10723;10724;10725;10726;10727;10728;10729;10730;10731;10732 13779;13780;13781;13782;13783;13784;13785;13786;13787;13788;13789;13790;13791;13792;13793;13794;13795;13796;13797;13798;13799;13800;13801 13798 21 AFDLVPPEAVPEQK Unmodified 1538.7981 0.7980593 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.826 99.826 2 0.001336 102910 QUIQUE_C1368_190116_001 76.302 50.183 311480000 46773000 0 53705000 64905000 53518000 0 48905000 0 0 0 43677000 0 0 1220 3857 1135 10733;10734;10735;10736;10737;10738;10739 13802;13803;13804;13805;13806;13807;13808 13804 6 AFDLVPPEAVPEQKDPDPEFPTVK Unmodified 2664.3323 0.33229934 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 1 1 119.65 119.65 3 0.017921 124576 QUIQUE_C1368_190116_001 29.47 22.11 135140000 0 0 135140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1221 3857 1136 10740 13809 13809 1 AFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAK Unmodified 3487.5732 0.57321091 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 156.94 156.94 3 8.3013E-14 162240 QUIQUE_C1368_190116_001 72.603 64.737 83169000 0 0 34215000 25378000 0 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Unmodified 1040.4233 0.42330938 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.954 38.954 2 0.00051151 34474 QUIQUE_C1563_190116_001 128.61 113.94 5993400000 478770000 564630000 529160000 452560000 549100000 348400000 495640000 455400000 436770000 86243000 584160000 458160000 554390000 1229 2851 1143 10802;10803;10804;10805;10806;10807;10808;10809;10810;10811;10812;10813;10814 13876;13877;13878;13879;13880;13881;13882;13883;13884;13885;13886;13887;13888;13889;13890;13891 13884 16 AFEDEMSGR Oxidation (M) 1056.4182 0.418224 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 18.019 18.019 2 0.047156 10742 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.815 92.244 1115300000 0 0 0 0 0 0 0 0 575480000 125360000 0 414460000 0 1230 2851 1143 10815;10816;10817 13892;13893;13894 13894 2 AFEDTLQLMER Unmodified 1351.6442 0.6442012 1707 O95163;F5H2T0;H0YDF3 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 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10865;10866;10867;10868;10869;10870;10871;10872;10873;10874;10875;10876;10877 13945;13946;13947;13948;13949;13950;13951;13952;13953;13954;13955;13956;13957 13952 13 AFENDVDALCNLR Unmodified 1535.7038 0.70384134 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.09 104.09 2 6.6256E-07 107443 QUIQUE_C1368_190116_001 130.41 114.21 729580000 83405000 0 115030000 0 0 80506000 67358000 67226000 85561000 33674000 74649000 86064000 36115000 1239 739 1151 10878;10879;10880;10881;10882;10883;10884;10885;10886;10887 13958;13959;13960;13961;13962;13963;13964;13965;13966;13967 13959 10 AFEPATGR Unmodified 847.41882 0.41881635 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.585 19.585 2 0.0036229 12877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.69 44.78 8186800000 0 1137100000 326910000 768530000 292060000 1098700000 229060000 1397100000 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10941;10942;10943;10944;10945;10946;10947;10948;10949;10950;10951;10952;10953;10954;10955 14024;14025;14026;14027;14028;14029;14030;14031;14032;14033;14034;14035;14036;14037;14038;14039;14040;14041 14031 14 AFFLFDNLLVYCK Unmodified 1648.8323 0.83233632 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 2 163.41 163.41 2 0.0023561 167770 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.584 69.953 104830000 0 0 0 0 0 0 0 18754000 0 0 35714000 50358000 0 1247 3676 1159 10956;10957;10958;10959 14042;14043;14044;14045 14045 4 AFFNAVK Unmodified 795.42792 0.42792448 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 48.888 48.888 2 0.035358 46267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.935 45.726 183080000 0 0 70147000 0 0 0 0 70539000 0 42395000 0 0 0 1248 981;1154;4494 1160 10960;10961;10962 14046;14047;14048 14047 3 AFFPACYSGDGR Unmodified 1346.5714 0.5713706 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.345 78.345 2 0.0020075 78739 QUIQUE_C1403_190116_001 77.662 71.072 464540000 30452000 47865000 41163000 35612000 34745000 0 37743000 39219000 38195000 14394000 65787000 28472000 50892000 1249 4176 1161 10963;10964;10965;10966;10967;10968;10969;10970;10971;10972;10973;10974 14049;14050;14051;14052;14053;14054;14055;14056;14057;14058;14059;14060;14061;14062;14063;14064;14065;14066;14067;14068 14055 20 AFFPCFDTPAVK Unmodified 1398.6642 0.66420836 4169 Q9H4A4;A6NKB8;A0A087WU27;C9JMZ3;A0A087WUS4 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.72 115.72 2 0.0027223 119072 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 65.204 1248600000 97387000 0 160370000 138350000 126290000 129660000 104380000 78730000 0 65608000 115250000 87789000 144800000 1250 4169 1162 10975;10976;10977;10978;10979;10980;10981;10982;10983;10984;10985 14069;14070;14071;14072;14073;14074;14075;14076;14077;14078;14079;14080;14081 14071 7 AFFPNMVNMIVLDK Unmodified 1637.831 0.83095611 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.71 154.71 2 1.6968E-10 159556 QUIQUE_DMIX3_190116_001 135.66 117.35 5368700000 344200000 0 466620000 516270000 539450000 407370000 613630000 299960000 502790000 107350000 590410000 342410000 638240000 1251 4560 1163 10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993;10994;10995;10996;10997 14082;14083;14084;14085;14086;14087;14088;14089;14090;14091;14092;14093;14094;14095;14096 14091 15 AFFPNMVNMIVLDK Oxidation (M) 1653.8259 0.82587073 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 141.1 141.1 2 0.0011404 145272 QUIQUE_C1277_190116_001 79.82 68.607 601230000 46330000 53999000 75489000 94710000 0 95332000 0 46941000 0 71377000 117060000 0 0 1252 4560 1163 10998;10999;11000;11001;11002;11003;11004;11005 14097;14098;14099;14100;14101;14102;14103;14104;14105;14106 14098 3008;3009 9 AFFPNMVNMIVLDK 2 Oxidation (M) 1669.8208 0.82078535 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 2 0 1 1 115.01 115.01 2 0.0020605 112656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.342 52.403 39788000 0 0 0 0 0 39788000 0 0 0 0 0 0 0 1253 4560 1163 11006;11007 14107;14108 14108 3008;3009 2 AFFSEVER Unmodified 983.47125 0.47124585 4530 Q9UQ80;F8VR77 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.238 62.238 2 0.0036146 61235 QUIQUE_C1403_190116_001 112.17 78.621 1741300000 155500000 160210000 187890000 162950000 164800000 136210000 198200000 153290000 154920000 67134000 0 0 200220000 1254 4530 1164 11008;11009;11010;11011;11012;11013;11014;11015;11016;11017;11018 14109;14110;14111;14112;14113;14114;14115;14116;14117;14118;14119;14120;14121 14113 11 AFGAGADFVMLGGMLAGHSESGGELIER Unmodified 2778.3105 0.31053482 61;1172 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YLB8;H0YNS9 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 no no 0 0 0 1 148.21 148.21 3 8.0638E-06 155963 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.707 45.719 124880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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11038;11039;11040;11041;11042;11043;11044;11045 14143;14144;14145;14146;14147;14148;14149;14150;14151;14152;14153;14154;14155 14144 13 AFGFNVLFYDPYLSDGVER Unmodified 2208.0528 0.052770437 2989 Q13363;H0Y8W7;H0Y9M9 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 166.29 166.29 2 0.0001623 170442 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.814 65.981 177310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83316000 93991000 0 1258 2989 1168 11046;11047 14156;14157 14157 1 AFGFSHLEALLDDSK Unmodified 1648.8097 0.80968662 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 129.06 129.06 2;3 2.1548E-62 133981 QUIQUE_C1368_190116_001 232.42 196.87 8685500000 898180000 1156300000 886340000 765970000 872710000 867990000 919220000 115510000 428410000 178220000 638480000 461240000 496940000 1259 1282 1169 11048;11049;11050;11051;11052;11053;11054;11055;11056;11057;11058;11059;11060;11061;11062;11063;11064;11065;11066;11067;11068;11069;11070;11071 14158;14159;14160;14161;14162;14163;14164;14165;14166;14167;14168;14169;14170;14171;14172;14173;14174;14175;14176;14177;14178;14179;14180;14181;14182;14183;14184;14185;14186;14187;14188;14189;14190;14191;14192;14193;14194;14195;14196;14197;14198 14164 39 AFGFSHLEALLDDSKELQR Unmodified 2175.096 0.096032235 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 128.47 128.47 3;4 5.662E-55 134402 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.86 112.99 4560200000 76333000 42139000 151260000 81146000 258500000 31717000 263190000 619720000 418790000 0 649200000 703290000 1264900000 1260 1282 1170 11072;11073;11074;11075;11076;11077;11078;11079;11080;11081;11082;11083;11084;11085;11086;11087;11088;11089;11090;11091;11092 14199;14200;14201;14202;14203;14204;14205;14206;14207;14208;14209;14210;14211;14212;14213;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;14221;14222;14223;14224;14225;14226;14227;14228;14229;14230;14231;14232;14233 14225 34 AFGGPGAGCISEGR Unmodified 1334.6037 0.60373336 4166 Q9H479 FN3K Fructosamine-3-kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.851 45.851 2 6.7309E-05 43322 QUIQUE_C1438_190116_001 116.55 104.02 1805900000 174800000 202900000 149300000 161830000 122970000 131860000 158460000 93239000 104800000 41409000 163750000 146320000 154230000 1261 4166 1171 11093;11094;11095;11096;11097;11098;11099;11100;11101;11102;11103;11104;11105 14234;14235;14236;14237;14238;14239;14240;14241;14242;14243;14244;14245;14246;14247;14248;14249;14250;14251;14252 14243 19 AFGGQSLK Unmodified 806.42865 0.42865276 2326 P31040;D6RFM5 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 21.207 21.207 2 0.039433 14370 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.895 17.849 55076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55076000 0 1262 2326 1172 11106 14253 14253 1 AFGGVIFQK Unmodified 965.53345 0.53345218 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 73.605 73.605 2 0.014324 73645 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119260000 93359000 106950000 1265 2844 1175 11126;11127;11128;11129;11130;11131;11132;11133;11134 14276;14277;14278;14279;14280;14281;14282;14283;14284;14285;14286;14287 14285 12 AFGPGLEGGLVNK Unmodified 1257.6717 0.67173657 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 76.896 76.896 2 0.023598 74087 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.284 26.254 279520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114290000 0 0 165240000 1266 3061 1176 11135;11136 14288;14289 14288 1 AFGPGLEPTGCIVDKPAEFTIDAR Unmodified 2560.2632 0.26317392 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.33 117.33 3 1.0583E-11 114435 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.565 77.621 1102000000 79573000 66178000 137000000 149660000 134100000 0 263410000 90154000 0 70394000 0 111520000 0 1267 3061 1177 11137;11138;11139;11140;11141;11142;11143;11144;11145 14290;14291;14292;14293;14294;14295;14296;14297;14298;14299 14298 10 AFGPGLQGGSAGSPAR Unmodified 1428.711 0.71097563 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.406 45.406 2 8.5749E-08 42511 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.71 129.39 2489800000 121840000 157080000 252490000 224860000 279530000 149470000 175000000 165580000 228480000 79505000 237560000 228820000 189600000 1268 2178 1178 11146;11147;11148;11149;11150;11151;11152;11153;11154;11155;11156;11157;11158 14300;14301;14302;14303;14304;14305;14306;14307;14308;14309;14310;14311;14312 14307 9 AFGSPFGLEEPQWVPDKECR Unmodified 2348.0896 0.089566649 3988 Q9BQ24;G3V2M2 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.48 121.48 3 1.0123E-05 125844 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.39 74.711 493030000 0 56813000 0 50653000 43834000 0 0 96612000 69385000 0 0 69062000 106670000 1269 3988 1179 11159;11160;11161;11162;11163;11164;11165 14313;14314;14315;14316;14317;14318;14319;14320;14321 14321 7 AFGSTIVINPEK Unmodified 1274.6871 0.68705229 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 72.76 72.76 2 0.00051585 73155 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.297 74.51 217120000 33204000 42996000 28729000 0 0 0 0 25827000 28177000 0 30017000 0 28174000 1270 1310 1180 11166;11167;11168;11169;11170;11171;11172;11173 14322;14323;14324;14325;14326;14327;14328;14329 14327 8 AFGVGVAYR Unmodified 938.4974 0.49740102 4024 Q9BTV5;M0R366;M0R1R0;M0QY68 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.285 58.285 2 0.00070122 56857 QUIQUE_C1403_190116_001 110.61 76.424 194490000 0 0 0 56474000 0 0 49003000 43493000 0 0 0 0 45517000 1271 4024 1181 11174;11175;11176;11177 14330;14331;14332;14333;14334;14335 14330 6 AFGYYGPLR Unmodified 1042.5236 0.52361577 2831 P84103;A0A087X2D0 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.863 77.863 2 0.00022907 78274 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.62 123.84 4004600000 300120000 387760000 0 315190000 545740000 416590000 347830000 363160000 485520000 214690000 628060000 0 0 1272 2831 1182 11178;11179;11180;11181;11182;11183;11184;11185;11186;11187 14336;14337;14338;14339;14340;14341;14342;14343;14344;14345;14346;14347;14348;14349 14347 14 AFHITNDEPIPFWTFLSR Unmodified 2190.0898 0.089824645 3153 Q15738 NSDHL Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.29 154.29 3 0.00017682 157171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.979 65.112 235360000 0 18178000 19565000 22319000 18047000 0 20438000 19035000 31412000 0 30370000 30197000 25804000 1273 3153 1183 11188;11189;11190;11191;11192;11193;11194;11195;11196;11197 14350;14351;14352;14353;14354;14355;14356;14357;14358;14359 14355 10 AFHNEAQVNPER Unmodified 1410.664 0.66402543 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 18.684 18.684 2;3 7.973E-14 11094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 160.18 143.51 6175800000 609510000 0 1099900000 0 673640000 622650000 915120000 235720000 424420000 326950000 505640000 143950000 618290000 1274 2132 1184 11198;11199;11200;11201;11202;11203;11204;11205;11206;11207;11208;11209;11210 14360;14361;14362;14363;14364;14365;14366;14367;14368;14369;14370;14371;14372 14372 9 AFHNEAQVNPERK Unmodified 1538.759 0.75898845 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 3 3 1 1 3 12.413 12.413 2;3;4 0.00020048 4231 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.297 76.253 363240000 0 0 19460000 0 13681000 0 5779000 114740000 60097000 0 76326000 21867000 51286000 1275 2132 1185 11211;11212;11213;11214;11215;11216;11217;11218;11219;11220;11221;11222;11223;11224 14373;14374;14375;14376;14377;14378;14379;14380;14381;14382;14383;14384;14385;14386;14387 14387 15 AFHSAPGRPANPSK Unmodified 1435.732 0.73204542 172 A0A0A0MSB4;Q6ZN50;Q969R2;H7C368;H7C428;H7C1R2;C9JS84;H7C313 OSBP2 Oxysterol-binding protein;Oxysterol-binding protein 2 yes no 0 0 1 1 10.337 10.337 4 8.6821E-05 2714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.887 61.054 8654400 0 0 0 0 0 0 0 8654400 0 0 0 0 0 1276 172 1186 11225 14388 14388 1 AFIDVTAAAENIR Unmodified 1389.7252 0.72522871 2207 P23229;H7BZ97 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 0 1 106.87 106.87 2 0.0018383 109712 QUIQUE_C1403_190116_001 80.763 53.649 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1277 2207 1187 11226 14389 14389 1 AFIGIGFGDR Unmodified 1051.5451 0.5450795 4311 Q9NVZ3;F6SKB8 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 99.156 99.156 2 0.0011234 102389 QUIQUE_C1218_190116_001 101.43 80.772 56396000 20507000 0 0 0 0 0 0 10867000 0 25022000 0 0 0 1278 4311 1188 11227;11228;11229 14390;14391;14392 14390 3 AFIIQHFADK Unmodified 1188.6291 0.62914348 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 59.603 59.603 3 0.01966 57551 QUIQUE_C1403_190116_001 45.158 30.951 71599000 40051000 0 0 31548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1279 4607 1189 11230;11231 14393;14394 14394 2 AFIIQHFADKVEYQCEGFLEK Unmodified 2571.2468 0.24679557 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 114.83 114.83 4 0.01051 120804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.417 19.619 29716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29716000 0 0 1280 4607 1190 11232 14395 14395 1 AFIISFK Unmodified 824.47963 0.47962569 4203 Q9HAB8 PPCS Phosphopantothenate--cysteine ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.999 92.999 2 0.023465 95102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.07 28.046 183250000 0 20437000 25733000 0 23984000 0 27121000 24190000 28101000 0 33682000 0 0 1281 4203 1191 11233;11234;11235;11236;11237;11238;11239 14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402 14400 7 AFIITGQTYTR Unmodified 1269.6717 0.67173657 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A096LNY6;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5;A0A096LP92;A0A096LPA2 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 71.943 71.943 2 0.039667 71281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.561 15.241 59562000 0 0 0 0 0 0 0 42474000 0 17088000 0 0 0 1282 338 1192 11240;11241 14403;14404 14403 2 AFIITLNSFGTELSK Unmodified 1639.8821 0.88212328 3616 Q8N8Y2 ATP6V0D2 V-type proton ATPase subunit d 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 138.58 138.58 2 3.3275E-24 142679 QUIQUE_C1277_190116_001 186.02 0 3360700000 363870000 340170000 254470000 260280000 383820000 281210000 349680000 161720000 285620000 121680000 318130000 0 240060000 1283 3616 1193 11242;11243;11244;11245;11246;11247;11248;11249;11250;11251;11252;11253;11254;11255 14405;14406;14407;14408;14409;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14416;14417;14418;14419;14420;14421;14422;14423;14424;14425;14426;14427;14428;14429 14407 24 AFIITLNSFGTELSKEDR Unmodified 2040.0528 0.052770437 3616 Q8N8Y2 ATP6V0D2 V-type proton ATPase subunit d 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 124.17 124.17 3 3.6563E-19 127811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.02 0 321640000 0 0 0 0 0 0 0 104320000 0 0 121150000 0 96172000 1284 3616 1194 11256;11257;11258 14430;14431;14432 14430 1 AFIPAIDSFGFETDLR Unmodified 1797.8938 0.8937506 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 1 1 1 153.31 153.31 2 5.7253E-07 156240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.14 103.41 354430000 0 0 0 0 0 0 0 71508000 102430000 0 0 98138000 82351000 1285 3099 1195 11259;11260;11261;11262 14433;14434;14435;14436;14437;14438 14433 6 AFIPLPSAVVQAVFGR Unmodified 1670.9508 0.95081197 4269 Q9NRG7;G3V5T1;Q86TZ5;F6RWC2;G3V4N6;G3V4Z0;H0YJ71;G3V451 SDR39U1 Epimerase family protein SDR39U1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.29 168.29 2;3 1.831E-09 173090 QUIQUE_C1368_190116_001 150.04 137.83 4436100000 298780000 292500000 381590000 269550000 408170000 516240000 362740000 243990000 465720000 74967000 472070000 390140000 259600000 1286 4269 1196 11263;11264;11265;11266;11267;11268;11269;11270;11271;11272;11273;11274;11275;11276;11277;11278;11279;11280;11281;11282;11283;11284;11285;11286;11287;11288 14439;14440;14441;14442;14443;14444;14445;14446;14447;14448;14449;14450;14451;14452;14453;14454;14455;14456;14457;14458;14459;14460;14461;14462;14463;14464 14444 26 AFIPQLLSR Unmodified 1043.6128 0.61276513 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.15 101.15 2 0.0075799 105380 QUIQUE_C1438_190116_001 81.191 57.235 60276000 0 13727000 0 22043000 24505000 0 0 0 0 0 0 0 0 1287 490 1197 11289;11290;11291;11292;11293;11294 14465;14466;14467;14468;14469;14470;14471;14472 14469 8 AFITVLEMTPVLGTEIINYR Unmodified 2279.2235 0.22354093 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 168.19 168.19 2;3 2.5101E-56 174346 QUIQUE_C1438_190116_001 220.69 195.76 1291100000 78531000 107270000 89832000 31787000 86790000 46018000 117740000 142100000 137490000 25754000 199560000 192170000 36040000 1288 998 1198 11295;11296;11297;11298;11299;11300;11301;11302;11303;11304;11305;11306;11307;11308;11309;11310;11311;11312;11313;11314;11315;11316;11317;11318 14473;14474;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;14485;14486;14487;14488;14489;14490;14491;14492;14493;14494;14495;14496;14497;14498 14483 26 AFITVLEMTPVLGTEIINYR Oxidation (M) 2295.2185 0.21845556 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 1 0 1 1 160.54 160.54 3 4.4079E-06 164177 QUIQUE_C1403_190116_001 76.713 71.846 55481000 0 30862000 0 24620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1289 998 1198 11319;11320 14499;14500 14500 597 2 AFLADPSAFVAAAPVAAATTAAPAAAAAPAK Unmodified 2751.4596 0.45956554 1888 P05388;F8VWS0;F8W1K8 RPLP0 60S acidic ribosomal protein P0 yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 1 2 2 1 2 2 3 142.3 142.3 2;3;4 4.3479E-46 146762 QUIQUE_DMIX7_190116_001 179.46 168.99 5980600000 363080000 342460000 458800000 660880000 588770000 480140000 268170000 661060000 561800000 10021000 488520000 401650000 695280000 1290 1888 1199 11321;11322;11323;11324;11325;11326;11327;11328;11329;11330;11331;11332;11333;11334;11335;11336;11337;11338;11339;11340;11341;11342;11343;11344;11345;11346 14501;14502;14503;14504;14505;14506;14507;14508;14509;14510;14511;14512;14513;14514;14515;14516;14517;14518;14519;14520;14521;14522;14523;14524;14525;14526;14527;14528;14529;14530;14531;14532;14533;14534;14535 14531 33 AFLAELEQNSPK Unmodified 1345.6878 0.68778057 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 88.204 88.204 2 0.00020157 89980 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.38 84.332 22503000 0 0 0 0 0 22503000 0 0 0 0 0 0 0 1291 1187 1200 11347;11348;11349 14536;14537;14538 14537 3 AFLAQIHAR Unmodified 1025.577 0.57704833 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 36.169 36.169 2 0.018555 31691 QUIQUE_C1563_190116_001 64.236 53.822 212950000 0 0 0 64591000 0 58574000 0 0 0 0 0 0 89784000 1292 1367;4608 1201 11350;11351;11352;11353 14539;14540;14541;14542 14540 3 AFLASPEYVNLPINGNGK Unmodified 1902.984 0.98396259 1957 P09211;A8MX94 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 118.88 118.88 2;3 3.3118E-45 122787 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.11 145.4 3625900000 107270000 171200000 171120000 177980000 214170000 167050000 177120000 357190000 492600000 248560000 492780000 453050000 395780000 1293 1957 1202 11354;11355;11356;11357;11358;11359;11360;11361;11362;11363;11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;11372;11373;11374;11375;11376 14543;14544;14545;14546;14547;14548;14549;14550;14551;14552;14553;14554;14555;14556;14557;14558;14559;14560;14561;14562;14563;14564;14565;14566;14567;14568;14569;14570;14571;14572 14561 27 AFLDALQNQAEASSK Unmodified 1591.7842 0.78420015 2952 Q12931 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.799 96.799 2 1.3313E-08 99131 QUIQUE_C1277_190116_001 122.39 74.454 1190000000 135550000 96813000 0 97255000 132990000 0 122720000 77036000 100270000 70722000 154370000 93939000 108370000 1294 2952 1203 11377;11378;11379;11380;11381;11382;11383;11384;11385;11386;11387 14573;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582;14583;14584 14575 10 AFLDFHALPYQVVEVNPVR Unmodified 2213.1633 0.16332394 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 141.42 141.42 2;3 1.3712E-05 146367 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.401 88.012 3145700000 38641000 344180000 346600000 40905000 371640000 194060000 278170000 208280000 326920000 90981000 282380000 284040000 338940000 1295 4184 1204 11388;11389;11390;11391;11392;11393;11394;11395;11396;11397;11398;11399;11400;11401;11402;11403;11404;11405;11406;11407;11408;11409 14585;14586;14587;14588;14589;14590;14591;14592;14593;14594;14595;14596;14597;14598;14599;14600;14601;14602;14603;14604;14605;14606;14607;14608;14609 14602 21 AFLDFHALPYQVVEVNPVRR Unmodified 2369.2644 0.26443497 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 127.23 127.23 4 1.1037E-25 133287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.9 127.6 278020000 0 0 0 0 0 0 0 45865000 46556000 0 91241000 55540000 38815000 1296 4184 1205 11410;11411;11412;11413;11414 14610;14611;14612;14613;14614 14612 5 AFLDFYHSFLEK Unmodified 1515.7398 0.73981614 1369 M0QZR4;Q92888 ARHGEF1 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 137.58 137.58 3 0.0025123 141339 QUIQUE_C1403_190116_001 62.924 48.666 14745000 0 0 0 14745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1297 1369 1206 11415;11416;11417 14615;14616;14617 14616 3 AFLDGFNEVAPLEWLR Unmodified 1875.9519 0.95193418 1397 O00308 WWP2 NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 168.44 168.44 2 3.9066E-11 172379 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.39 90.063 120260000 18373000 33287000 0 0 0 0 0 24721000 0 0 0 43882000 0 1298 1397 1207 11418;11419;11420;11421 14618;14619;14620;14621 14621 3 AFLDNPGILSELCGTLSR Unmodified 1961.9881 0.98806169 3374 Q6NXE6;B4E1N1 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 155.41 155.41 2 1.5359E-45 158153 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.95 151.27 364860000 55860000 56848000 41573000 0 0 37822000 0 29761000 48685000 0 0 57609000 36700000 1299 3374 1208 11422;11423;11424;11425;11426;11427;11428;11429 14622;14623;14624;14625;14626;14627;14628;14629;14630 14627 9 AFLDNPTIILAHIR Acetyl (Protein N-term) 1634.9144 0.91442646 593 B1AMB1;B1AMB2;Q9BPZ7 MAPKAP1 Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 158.09 158.09 2 0.00049494 162073 QUIQUE_C1403_190116_001 98.943 79.181 104230000 0 15928000 0 15374000 0 12590000 25213000 0 0 0 21035000 0 14088000 1300 593 1209 11430;11431;11432;11433;11434;11435 14631;14632;14633;14634;14635;14636;14637 14632 5 AFLDSLPDVK Unmodified 1103.5863 0.58627561 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.77 101.77 2 0.006665 105431 QUIQUE_C1218_190116_001 74.301 57.188 258350000 54609000 47371000 0 42113000 0 42458000 0 46873000 0 24930000 0 0 0 1301 1497 1210 11436;11437;11438;11439;11440;11441 14638;14639;14640;14641;14642;14643 14638 6 AFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELR Unmodified 2887.4062 0.40620934 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 0 1 159.27 159.27 3 0.034912 164888 QUIQUE_C1576_190116_001 23.491 16.616 38007000 0 0 0 0 0 0 38007000 0 0 0 0 0 0 1302 65;4141 1211 11442 14644 14644 1 AFLFDVVSK Unmodified 1024.5593 0.55933258 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.28 110.28 2 0.0041331 113475 QUIQUE_C1277_190116_001 89.698 53.513 858070000 76145000 62851000 64024000 59964000 83625000 59247000 78866000 51095000 71496000 31737000 76060000 69096000 73868000 1303 4213 1212 11443;11444;11445;11446;11447;11448;11449;11450;11451;11452;11453;11454;11455 14645;14646;14647;14648;14649;14650;14651;14652;14653;14654;14655;14656;14657;14658;14659;14660;14661;14662;14663 14647 19 AFLFVNK Unmodified 837.47487 0.47487467 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.073 70.073 2 0.024217 70557 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.513 61.484 306050000 0 0 0 37972000 43693000 36272000 0 46110000 57432000 0 34931000 0 49637000 1304 3565 1213 11456;11457;11458;11459;11460;11461;11462 14664;14665;14666;14667;14668;14669;14670;14671 14670 8 AFLHVPAK Unmodified 881.51232 0.51232281 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.569 28.569 2 0.016351 22388 QUIQUE_C1368_190116_001 83.287 66.582 268450000 0 0 46121000 45043000 46549000 19057000 0 26788000 46607000 14446000 0 0 23837000 1305 2075 1214 11463;11464;11465;11466;11467;11468;11469;11470 14672;14673;14674;14675;14676;14677;14678;14679 14672 8 AFLIEPEHVNTVGYGK Unmodified 1772.9097 0.90973501 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.575 80.575 3 0.00033451 81178 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.919 59.665 248100000 63105000 40857000 0 38491000 0 27757000 0 32373000 0 0 45518000 0 0 1306 3891 1215 11471;11472;11473;11474;11475;11476;11477;11478 14680;14681;14682;14683;14684;14685;14686;14687 14684 8 AFLLMASQYQQPHENDVAALLKPISEK Oxidation (M) 3056.5641 0.56410697 2422 P40123;A0A087WZ15;A0A087X0J3 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.4 123.4 4 2.8606E-32 127509 QUIQUE_C1277_190116_001 121.35 115.63 722910000 57401000 90296000 74331000 104900000 91210000 79809000 0 39985000 0 0 88067000 0 96907000 1307 2422 1216 11479;11480;11481;11482;11483;11484;11485;11486;11487 14688;14689;14690;14691;14692;14693;14694;14695;14696;14697;14698;14699 14690 1844 12 AFLLMASQYQQPHENDVAALLKPISEK Unmodified 3040.5692 0.56919234 2422 P40123;A0A087WZ15;A0A087X0J3 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 131.86 131.86 3;4 1.1138E-36 137527 QUIQUE_C1576_190116_001 127.14 120.98 4373800000 442310000 384150000 475070000 283460000 345190000 69400000 460870000 349540000 37035000 136190000 801430000 503860000 85341000 1308 2422 1216 11488;11489;11490;11491;11492;11493;11494;11495;11496;11497;11498;11499;11500;11501;11502;11503;11504;11505;11506;11507;11508;11509;11510 14700;14701;14702;14703;14704;14705;14706;14707;14708;14709;14710;14711;14712;14713;14714;14715;14716;14717;14718;14719;14720;14721;14722;14723;14724;14725;14726;14727;14728;14729;14730;14731 14717 31 AFLLMFIK Unmodified 981.57215 0.57214587 910 E9PEM5;P50851 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 139.27 139.27 2 0.04028 143806 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.358 22.713 4707400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4707400 0 1309 910 1217 11511 14732 14732 1 AFLLSCMLLGGR Unmodified 1336.6995 0.699548 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 144.47 144.47 2 0.010215 151013 QUIQUE_C1438_190116_001 74.376 57.836 45777000 0 0 0 0 22747000 0 23030000 0 0 0 0 0 0 1310 3676 1218 11512;11513 14733;14734 14733 0 AFLLSLAALR Unmodified 1073.6597 0.65971533 3530 Q8IV08 PLD3 Phospholipase D3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.67 133.67 2 0.00013216 136388 QUIQUE_C1563_190116_001 121.62 87.822 431390000 40702000 35786000 35555000 50254000 41710000 28679000 45316000 0 32096000 19181000 44248000 31001000 26864000 1311 3530 1219 11514;11515;11516;11517;11518;11519;11520;11521;11522;11523;11524;11525;11526 14735;14736;14737;14738;14739;14740;14741;14742;14743;14744;14745;14746;14747;14748;14749;14750 14741 16 AFLMQHAPANDYLVTSHIHLHVPEGATPK Unmodified 3193.6131 0.61312284 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 91.739 91.739 4;5 0.0014413 94193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.047 26.819 329810000 0 0 250530000 35612000 0 0 0 0 43666000 0 0 0 0 1312 1324 1220 11527;11528;11529;11530 14751;14752;14753;14754 14754 3 AFLNQAQIEVR Unmodified 1287.6935 0.69353465 441 A0A2R8YDF3;A0A2R8Y6L5;A0A2R8Y6I6;Q13627;A0A2R8Y443 DYRK1A Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A yes no 0 0 0 1 76.006 76.006 2 0.042645 75852 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.725 31.197 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1313 441 1221 11531 14755 14755 1 AFLQGGQEATDIALLLR Unmodified 1814.989 0.98904797 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 147.14 147.14 2;3 6.9299E-75 151344 QUIQUE_C1277_190116_001 198.49 179.74 3833400000 307630000 339000000 390510000 252910000 351130000 287670000 346370000 264030000 284670000 136730000 319480000 317940000 235260000 1314 890;3052 1222 11532;11533;11534;11535;11536;11537;11538;11539;11540;11541;11542;11543;11544;11545;11546;11547;11548;11549;11550;11551;11552;11553;11554;11555;11556;11557 14756;14757;14758;14759;14760;14761;14762;14763;14764;14765;14766;14767;14768;14769;14770;14771;14772;14773;14774;14775;14776;14777;14778;14779;14780;14781;14782;14783;14784;14785;14786;14787;14788;14789;14790;14791;14792;14793;14794 14760 39 AFLTGPHISLADLVAITELMHPVGAGCQVFEGR Oxidation (M) 3521.7799 0.77993018 2323 P30711;A0A0G2JRQ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 156.78 156.78 4 2.7522E-29 160678 QUIQUE_C1403_190116_001 88.688 84.021 289930000 0 0 0 93353000 0 72162000 124410000 0 0 0 0 0 0 1315 2323 1223 11558;11559;11560 14795;14796;14797 14795 1706 3 AFLTGPHISLADLVAITELMHPVGAGCQVFEGRPK Oxidation (M) 3746.9277 0.92765705 2323 P30711;A0A0G2JRQ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 1 1 1 1 146.69 146.69 5 9.4023E-30 149512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.751 80.762 266160000 0 0 0 220070000 0 0 0 46092000 0 0 0 0 0 1316 2323 1224 11561;11562 14798;14799 14799 1706 1 AFLTLAEDILR Unmodified 1260.7078 0.70778773 2709 P61026 RAB10 Ras-related protein Rab-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 147.66 147.66 2 4.1333E-06 154095 QUIQUE_C1218_190116_001 147.51 112.7 8751400000 440410000 401340000 550680000 1028900000 804640000 742880000 805530000 1095800000 841330000 192600000 859070000 572040000 416180000 1317 2709 1225 11563;11564;11565;11566;11567;11568;11569;11570;11571;11572;11573;11574;11575;11576 14800;14801;14802;14803;14804;14805;14806;14807;14808;14809;14810;14811;14812;14813;14814;14815;14816;14817;14818;14819;14820;14821;14822;14823;14824;14825;14826;14827;14828;14829;14830 14801 31 AFLTLAEDILRK Unmodified 1388.8028 0.80275075 2709 P61026 RAB10 Ras-related protein Rab-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 125.73 125.73 3 0.00025824 131423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.289 59.594 68981000 0 0 0 0 0 0 0 28483000 13245000 0 27253000 0 0 1318 2709 1226 11577;11578;11579 14831;14832;14833 14833 3 AFLVGIVVPDPEVMPSWAQK Oxidation (M) 2198.1446 0.14456233 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 1 0 1 150.27 150.27 2 8.9418E-05 153112 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.958 53.9 11904000 0 0 0 0 0 0 0 11904000 0 0 0 0 0 1319 4476 1227 11580 14834 14834 2979 1 AFMLLFLK Unmodified 981.57215 0.57214587 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 141.61 141.61 2 0.051145 148459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.039 20.356 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1320 264 1228 11581;11582 14835;14836 14836 2 AFMTADLPNELIELLEK Oxidation (M) 1962.002 0.00198042 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 1 0 2 2 3 2 1 1 2 2 2 2 2 2 168.32 168.32 2;3 7.4454E-53 172916 QUIQUE_C1218_190116_001 182.1 168.42 19177000000 881170000 1751900000 1540400000 1267900000 1996400000 1599600000 1424100000 591160000 1707800000 0 1795400000 1838800000 2782600000 1321 50;2631 1229 11583;11584;11585;11586;11587;11588;11589;11590;11591;11592;11593;11594;11595;11596;11597;11598;11599;11600;11601;11602;11603;11604;11605 14837;14838;14839;14840;14841;14842;14843;14844;14845;14846;14847;14848;14849;14850;14851;14852;14853;14854;14855;14856;14857;14858;14859;14860 14837 23 23 AFMTADLPNELIELLEK Unmodified 1946.0071 0.0070657979 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 170.9 170.9 2;3 4.4131E-63 172510 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.85 177.17 20704000000 1550000000 2790200000 2778700000 566600000 292510000 68795000 163980000 2962000000 2232800000 238300000 3892900000 400780000 2766300000 1322 50;2631 1229 11606;11607;11608;11609;11610;11611;11612;11613;11614;11615;11616;11617;11618;11619;11620;11621;11622;11623;11624;11625 14861;14862;14863;14864;14865;14866;14867;14868;14869;14870;14871;14872;14873;14874;14875;14876;14877;14878;14879;14880;14881 14873 21 AFNDPFIQK Unmodified 1078.5447 0.54474515 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598;R4GN69 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.381 75.381 2 0.0014209 72869 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.83 52.867 1892500000 170340000 197950000 196670000 234700000 0 211500000 236480000 165640000 180770000 80384000 0 218050000 0 1323 180;3738 1230 11626;11627;11628;11629;11630;11631;11632;11633;11634;11635 14882;14883;14884;14885;14886;14887;14888;14889;14890;14891;14892;14893 14892 12 AFNSNYEQR Unmodified 1127.4996 0.49958587 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 22.853 22.853 2 0.019974 16321 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.248 64.426 28784000 0 11814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16970000 0 1324 4651 1231 11636;11637 14894;14895 14895 2 AFPALTSLDLSDNPGLGER Unmodified 1971.9902 0.99017018 1945 P08571;D6RFL4 CD14 Monocyte differentiation antigen CD14;Monocyte differentiation antigen CD14, urinary form;Monocyte differentiation antigen CD14, membrane-bound form yes no 0 0 0 1 1 1 136.22 136.22 2 8.6415E-17 140448 QUIQUE_C1403_190116_001 128.76 96.24 298670000 0 0 134960000 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11642;11643;11644;11645;11646;11647;11648;11649;11650;11651;11652;11653;11654;11655;11656;11657;11658;11659;11660;11661;11662;11663;11664;11665;11666;11667;11668;11669;11670;11671;11672;11673;11674;11675;11676;11677;11678;11679;11680 14900;14901;14902;14903;14904;14905;14906;14907;14908;14909;14910;14911;14912;14913;14914;14915;14916;14917;14918;14919;14920;14921;14922;14923;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;14931;14932;14933;14934;14935;14936;14937;14938;14939;14940;14941;14942;14943;14944;14945;14946;14947;14948;14949;14950;14951;14952;14953;14954;14955;14956;14957;14958;14959;14960;14961;14962;14963;14964;14965;14966;14967;14968;14969;14970;14971;14972;14973;14974;14975;14976;14977;14978;14979;14980 14900 80 AFPCWDEPAIK Unmodified 1332.6173 0.61725816 959 E9PLK3;P55786;E9PP11 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 97.786 97.786 2 0.029311 100308 QUIQUE_C1277_190116_001 67.563 48.292 91565000 0 91565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1328 959 1235 11681 14981 14981 0 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14986;14987;14988;14989;14990;14991;14992;14993;14994;14995;14996;14997;14998;14999;15000;15001;15002;15003;15004;15005;15006;15007;15008;15009;15010;15011;15012;15013;15014;15015;15016;15017;15018;15019;15020;15021;15022;15023;15024;15025;15026;15027;15028;15029;15030;15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041;15042;15043;15044;15045;15046;15047;15048;15049;15050;15051;15052;15053;15054;15055;15056;15057 14992 72 AFPFHIIFDR Unmodified 1261.6608 0.66077796 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 117.99 117.99 2;3 0.0035252 123540 QUIQUE_C1438_190116_001 58.676 53.578 288010000 26395000 26102000 24866000 21199000 32786000 24862000 39399000 0 12664000 13337000 21929000 19013000 25456000 1331 2867 1238 11716;11717;11718;11719;11720;11721;11722;11723;11724;11725;11726;11727;11728;11729 15058;15059;15060;15061;15062;15063;15064;15065;15066;15067;15068;15069;15070;15071;15072;15073;15074;15075;15076;15077;15078;15079;15080 15065 23 AFPLPALSR Unmodified 970.56 0.56000128 852;554 E7ENQ6;A6XGL0 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 89.233 89.233 2 0.0075799 92075 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.191 59.42 261660000 25023000 46423000 46903000 33869000 0 0 0 0 34517000 0 40749000 0 34181000 1332 852;554 1239 11730;11731;11732;11733;11734;11735;11736;11737;11738 15081;15082;15083;15084;15085;15086;15087;15088;15089;15090 15089 9 AFPLPMSFGQDVDAAVGAALVMLR Oxidation (M) 2491.2603 0.26033715 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 1 0 1 1 175.81 175.81 3 4.5009E-07 182804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.922 66.119 45817000 0 0 0 0 0 0 0 0 27236000 0 18581000 0 0 1333 212 1240 11739;11740 15091;15092 15092 126 2 AFPLPMSFGQDVDAAVGAALVMLR Unmodified 2475.2654 0.26542252 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 178.19 178.19 3 0.0007458 185067 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.198 40.397 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1334 212 1240 11741 15093 15093 1 AFPLQCIHIAEGHTK Unmodified 1720.8719 0.87190972 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2;H0YI78 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 1 62.216 62.216 3 0.0099042 61808 QUIQUE_C1277_190116_001 43.861 33.58 45230000 0 22186000 23045000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1335 356 1241 11742;11743 15094;15095 15094 2 AFPNPYADYNK Unmodified 1298.5932 0.5931519 1555 O43813;E9PHS0;F8WDS9 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.095 71.095 2 0.00074623 72410 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 78.346 3637100000 438490000 374140000 305990000 308170000 306930000 0 369400000 341330000 275030000 145960000 348320000 423310000 0 1336 1555 1242 11744;11745;11746;11747;11748;11749;11750;11751;11752;11753;11754;11755 15096;15097;15098;15099;15100;15101;15102;15103;15104;15105;15106;15107;15108;15109 15096 14 AFPVLLLDTVPWYLR Unmodified 1802.0131 0.013077874 368 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QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.866 22.109 134200000 0 0 0 0 0 0 0 60133000 0 0 74068000 0 0 1339 4585 1245 11768;11769 15123;15124 15124 2 AFQNVFAPR Unmodified 1048.5454 0.54541385 1023 H0YFA9;H7C3P4;F6S8M0;P15586;F5H4C6 GNS N-acetylglucosamine-6-sulfatase yes no 0 0 0 1 1 1 68.09 68.09 2 0.012404 68126 QUIQUE_C1403_190116_001 84.244 65.461 58358000 0 0 0 27727000 0 0 0 0 0 0 30631000 0 0 1340 1023 1246 11770;11771;11772 15125;15126;15127;15128 15126 4 AFQPFFVELTMPYSVIR Unmodified 2044.0492 0.049205384 1802 P01023;P20742 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 166.89 166.89 2;3 2.1858E-06 171567 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.87 90.105 544110000 0 0 0 0 0 0 29094000 0 78453000 0 291850000 0 144710000 1341 1802 1247 11773;11774;11775;11776;11777 15129;15130;15131;15132;15133 15130 5 AFQPFFVELTMPYSVIR Oxidation (M) 2060.0441 0.044120006 1802 P01023;P20742 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 1 0 2 1 159.46 159.46 2;3 0.002015 166870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.185 50.825 186930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119000000 0 67930000 1342 1802 1247 11778;11779;11780 15134;15135;15136 15134 1028 3 AFQSLLTEVNK Unmodified 1248.6714 0.67140222 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.989 86.989 2 0.00014245 88295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.85 113.22 1335000000 112330000 100630000 145540000 112820000 128300000 96463000 0 143680000 122360000 45033000 0 122830000 204960000 1343 2564 1248 11781;11782;11783;11784;11785;11786;11787;11788;11789;11790;11791 15137;15138;15139;15140;15141;15142;15143;15144;15145;15146;15147;15148;15149 15144 13 AFQSVLEVVAAPGSPYHR Unmodified 1926.9952 0.99519598 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 106.03 106.03 3 0.0082797 108064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.212 6.3282 20512000 0 0 0 0 0 0 0 20512000 0 0 0 0 0 1344 2456 1249 11792 15150 15150 1 AFQTDLYLLR Unmodified 1238.6659 0.66592292 3649 Q8NFJ9;E7EQH1 BBS1 Bardet-Biedl syndrome 1 protein yes no 0 0 0 1 1 1 111.25 111.25 2 0.0015158 114708 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.711 42.161 19351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19351000 0 1345 3649 1250 11793;11794;11795 15151;15152;15153 15152 3 AFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIK Unmodified 2746.2697 0.26971586 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 101.95 101.95 3 0.0014825 105070 QUIQUE_C1218_190116_001 37.436 31.177 91897000 91897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1346 2302 1251 11796 15154 15154 1 AFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASK Unmodified 3384.6085 0.60849098 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 89.927 89.927 3;4;5 7.7725E-65 92267 QUIQUE_C1368_190116_001 149.29 146.93 21763000000 1891000000 1723400000 2141700000 1492600000 1961100000 1825800000 1960300000 1166600000 1230800000 614910000 1477700000 1717700000 2559200000 1347 2302 1252 11797;11798;11799;11800;11801;11802;11803;11804;11805;11806;11807;11808;11809;11810;11811;11812;11813;11814;11815;11816;11817;11818;11819;11820;11821;11822;11823;11824 15155;15156;15157;15158;15159;15160;15161;15162;15163;15164;15165;15166;15167;15168;15169;15170;15171;15172;15173;15174;15175;15176;15177;15178;15179;15180;15181;15182;15183;15184;15185;15186;15187;15188;15189;15190;15191;15192;15193;15194;15195;15196;15197;15198;15199;15200;15201;15202;15203;15204;15205;15206;15207;15208;15209 15164 55 AFREEFGAEPELAVSAPGR Unmodified 2032.0014 0.0014035686 2583 P51570;K7ERJ9 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.079 87.079 3 0.00012729 90173 QUIQUE_C1438_190116_001 75.55 64.695 557630000 0 48265000 51440000 0 58748000 0 0 65276000 99489000 22137000 59758000 63824000 88696000 1348 2583 1253 11825;11826;11827;11828;11829;11830;11831;11832;11833 15210;15211;15212;15213;15214;15215;15216;15217;15218 15212 9 AFRPYGLHGGEPGAR Unmodified 1583.7957 0.79570831 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 1 1 2 28.785 28.785 3;4 0.021054 24094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.332 18.539 140160000 0 0 0 0 0 0 0 31471000 108690000 0 0 0 0 1349 1450 1254 11834;11835;11836 15219;15220;15221 15219 3 AFSDIPSPYLR Unmodified 1264.6452 0.64518747 4324 Q9NXC2 GFOD1 Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 95.462 95.462 2 0.0016231 97699 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.731 60.808 191740000 37222000 0 0 0 0 18930000 0 27528000 27099000 0 38359000 42599000 0 1350 4324 1255 11837;11838;11839;11840;11841;11842 15222;15223;15224;15225;15226;15227 15227 6 AFSDPFVEAEK Unmodified 1238.5819 0.58191851 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.178 85.178 2 0.0011193 86224 QUIQUE_C1403_190116_001 107.21 82.282 3738500000 306610000 258770000 301630000 301970000 310220000 231410000 311850000 279470000 287570000 135770000 355190000 305990000 352090000 1351 2363 1256 11843;11844;11845;11846;11847;11848;11849;11850;11851;11852;11853;11854;11855 15228;15229;15230;15231;15232;15233;15234;15235;15236;15237;15238;15239;15240;15241;15242;15243;15244;15245;15246;15247 15233 20 AFSGLEGLEHLNLGGNAIR Unmodified 1967.0225 0.022473362 3885 Q96JA1 LRIG1 Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 122.25 122.25 3 1.7738E-05 125537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.418 73.318 100780000 0 0 22470000 0 23458000 0 0 26156000 28700000 0 0 0 0 1352 3885 1257 11856;11857;11858;11859 15248;15249;15250;15251;15252 15250 3 AFSGLLSLEQLTLEK Unmodified 1647.9083 0.90833803 3447 Q7L985 LINGO2 Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 148.79 148.79 2 9.8585E-06 153447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 103.43 87.179 64153000 0 0 0 14343000 0 0 19185000 0 0 0 0 0 30626000 1353 3447 1258 11860;11861;11862 15253;15254;15255 15255 3 AFSGLNSLEQLTLEK Unmodified 1648.8672 0.8672015 3851 Q96FE5;H0YMX3 LINGO1 Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 131.11 131.11 2 0.00030423 135656 QUIQUE_C1368_190116_001 82.543 67.341 103400000 27411000 0 34294000 0 0 0 41697000 0 0 0 0 0 0 1354 3851 1259 11863;11864;11865 15256;15257;15258 15257 3 AFSGYLGTDQSK Unmodified 1272.5986 0.59863121 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.974 52.974 2 4.6337E-20 51075 QUIQUE_C1438_190116_001 171.33 153.02 6790100000 826570000 389680000 725030000 667800000 465770000 0 606910000 835220000 460410000 433380000 760060000 619310000 0 1355 2003 1260 11866;11867;11868;11869;11870;11871;11872;11873;11874;11875;11876 15259;15260;15261;15262;15263;15264;15265;15266;15267;15268;15269;15270;15271;15272 15264 12 AFSIDIIR Unmodified 933.52837 0.5283668 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 97.445 97.445 2 0.035224 101255 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.565 21.101 49339000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12445000 36894000 0 0 1356 1187 1261 11877;11878 15273;15274 15274 2 AFSITQGLLK Unmodified 1076.623 0.62299547 1477 O15067;J3KTQ5 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.311 96.311 2 0.0039024 98963 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.75 66.903 350630000 0 39156000 32300000 31246000 45680000 0 0 48640000 33358000 0 48840000 30678000 40729000 1357 1477 1262 11879;11880;11881;11882;11883;11884;11885;11886;11887 15275;15276;15277;15278;15279;15280;15281;15282;15283;15284;15285;15286 15282 12 AFSPWQILSPVQWAK Acetyl (Protein N-term) 1798.9406 0.94064121 1633 O75410;E5RJG6 TACC1 Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 175.29 175.29 2 1.9924E-06 181082 QUIQUE_C1438_190116_001 141.08 125.94 85380000 0 10292000 5969200 0 16549000 0 0 16479000 19871000 0 0 0 16219000 1358 1633 1263 11888;11889;11890;11891;11892;11893 15287;15288;15289;15290;15291;15292 15289 6 AFSQFGK Unmodified 783.39154 0.39153897 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 28.419 28.419 2 0.046614 22645 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.496 52.676 193620000 0 0 0 72899000 0 0 0 58607000 62119000 0 0 0 0 1359 1581 1264 11894;11895;11896 15293;15294;15295 15295 3 AFSSLNTLPEELRPYVPLFCSVLTK Unmodified 2880.5096 0.5095522 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 1 1 163.74 163.74 3 0.0067051 171162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.817 28.018 68476000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68476000 0 0 1360 3276 1265 11897 15296 15296 1 AFSVFLFNTENK Unmodified 1415.7085 0.70851601 3032 Q13907;C9JKM8;C9JD53 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 126.83 126.83 2 0.00024692 132684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.55 116.77 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1361 3032 1266 11898;11899;11900;11901;11902;11903 15297;15298;15299;15300;15301;15302 15301 6 AFSVNIFK Unmodified 924.5069 0.50690308 2022 P11279 LAMP1 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.62 93.62 2 0.0048352 97245 QUIQUE_C1218_190116_001 107.67 56.101 172690000 56388000 0 46776000 0 0 35514000 0 0 0 34009000 0 0 0 1362 2022 1267 11904;11905;11906;11907;11908 15303;15304;15305;15306;15307;15308;15309;15310 15303 8 AFSWASVTSK Unmodified 1082.5397 0.53965977 4508 Q9UN86 G3BP2 Ras GTPase-activating protein-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 78.034 78.034 2 0.0054741 79764 QUIQUE_C1218_190116_001 77.355 62.82 178440000 79265000 0 0 57921000 0 41253000 0 0 0 0 0 0 0 1363 4508 1268 11909;11910;11911 15311;15312;15313;15314 15311 4 AFSYLTR Unmodified 856.4443 0.44430282 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 49.821 49.821 2 0.041878 47886 QUIQUE_C1277_190116_001 81.613 69.182 83148000 0 41609000 0 0 41539000 0 0 0 0 0 0 0 0 1364 3445 1269 11912;11913 15315;15316 15315 2 AFSYYGPLR Unmodified 1072.5342 0.53418046 208 A0A0B4J1Z1;C9JAB2;Q16629 SRSF7 Serine/arginine-rich splicing factor 7 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.676 76.676 2 0.0010391 76793 QUIQUE_C1403_190116_001 107.43 78.28 1560400000 0 88282000 69310000 109510000 139160000 157570000 155450000 111700000 127850000 79464000 206400000 139840000 175830000 1365 208 1270 11914;11915;11916;11917;11918;11919;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926 15317;15318;15319;15320;15321;15322;15323;15324;15325;15326;15327;15328;15329;15330;15331 15321 13 AFTDEETEAQTGEGSWPR Unmodified 2009.8603 0.86027822 2932 Q09019;H0YGU4;M0QX08 DMWD Dystrophia myotonica WD repeat-containing protein yes no 0 0 0 1 82.268 82.268 2 2.6062E-05 84128 QUIQUE_C1576_190116_001 92.295 78.633 35924000 0 0 0 0 0 0 35924000 0 0 0 0 0 0 1366 2932 1271 11927 15332 15332 1 AFTDVPSIQIYSSR Unmodified 1582.7991 0.79912193 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 108.52 108.52 2 0.00030271 113504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.477 76.52 299720000 87516000 0 0 0 0 0 0 0 0 26001000 109540000 0 76661000 1367 310;830 1272 11928;11929;11930;11931;11932 15333;15334;15335;15336;15337 15336 4 AFTELFQVACAKPPPLGLCDYPSSR Unmodified 2823.3724 0.37240679 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 1 1 1 1 137.3 137.3 3 3.1675E-23 142222 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.54 110.09 156770000 0 0 0 0 0 0 45247000 0 0 0 0 58299000 53227000 1368 3049 1273 11933;11934;11935 15338;15339;15340 15340 3 AFTGFIVEADTPGIQIGR Unmodified 1890.984 0.98396259 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 134.54 134.54 2;3 6.7367E-54 139437 QUIQUE_C1368_190116_001 211.67 188.44 1368900000 96191000 96747000 120160000 83674000 0 100900000 117730000 154670000 192220000 30953000 144860000 124900000 105850000 1369 666 1274 11936;11937;11938;11939;11940;11941;11942;11943;11944;11945;11946;11947;11948 15341;15342;15343;15344;15345;15346;15347;15348;15349;15350;15351;15352;15353;15354;15355 15343 14 AFTHTAQYDEAISDYFR Unmodified 2033.9119 0.91191986 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 3 3 1 2 1 2 2 1 3 2 2 104.68 104.68 2;3 2.3996E-70 108153 QUIQUE_C1368_190116_001 252.02 230.72 3281800000 188740000 215920000 306870000 252290000 239850000 259890000 245920000 134450000 252170000 123860000 401800000 282510000 377560000 1370 2339 1275 11949;11950;11951;11952;11953;11954;11955;11956;11957;11958;11959;11960;11961;11962;11963;11964;11965;11966;11967;11968;11969;11970;11971;11972 15356;15357;15358;15359;15360;15361;15362;15363;15364;15365;15366;15367;15368;15369;15370;15371;15372;15373;15374;15375;15376;15377;15378;15379;15380;15381;15382;15383;15384 15362 27 AFTHTAQYDEAISDYFRK Unmodified 2162.0069 0.006882877 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 89.021 89.021 3 0.023045 89847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 17.682 13.805 43008000 0 0 0 0 0 0 0 43008000 0 0 0 0 0 1371 2339 1276 11973 15385 15385 1 AFTIQGAPSDSGPLR Unmodified 1515.7682 0.76815616 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.851 79.851 2 1.0459E-12 80258 QUIQUE_C1403_190116_001 148.28 129.5 7228200000 784910000 768720000 0 689810000 640890000 0 597720000 661000000 607440000 252400000 796600000 614840000 813860000 1372 2530 1277 11974;11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;11982;11983;11984 15386;15387;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397;15398 15388 13 AFTKPEEACSFILSADFPALVVK Unmodified 2539.3032 0.30324782 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 1 1 1 1 145.31 145.31 2;3 3.7155E-07 152234 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.055 93.024 226460000 0 0 0 0 0 91422000 109910000 0 0 0 25130000 0 0 1373 2194 1278 11985;11986;11987 15399;15400;15401 15401 3 AFTLTISALFVTPK Unmodified 1507.865 0.86501665 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 6 3 154.54 154.54 2 0.00029338 159053 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.45 98.578 659910000 34303000 27194000 23989000 0 0 0 51179000 89776000 64635000 0 261380000 107460000 0 1374 1969 1279 11988;11989;11990;11991;11992;11993;11994;11995;11996;11997;11998;11999;12000;12001;12002;12003;12004;12005 15402;15403;15404;15405;15406;15407;15408;15409;15410;15411;15412;15413;15414;15415;15416;15417;15418;15419;15420;15421;15422;15423;15424;15425 15412 20 AFTLVSAVER Unmodified 1091.5975 0.597509 3698 Q8WUH2 TGFBRAP1 Transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 81.781 81.781 2 0.012155 82411 QUIQUE_C1403_190116_001 66.27 30.777 41610000 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1283 12015;12016;12017;12018;12019;12020;12021;12022;12023;12024;12025;12026;12027;12028;12029;12030;12031;12032;12033;12034;12035 15436;15437;15438;15439;15440;15441;15442;15443;15444;15445;15446;15447;15448;15449;15450;15451;15452;15453;15454;15455;15456;15457 15438 14 AFTYTVAASGGGGVNMGSHQK Oxidation (M) 2054.948 0.94798779 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.334 40.334 3 1.7018E-08 37467 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.963 95.061 976510000 0 47474000 0 54419000 66428000 65525000 73403000 84075000 111170000 98284000 127130000 108230000 140370000 1379 4418 1283 12036;12037;12038;12039;12040;12041;12042;12043;12044;12045;12046 15458;15459;15460;15461;15462;15463;15464;15465;15466;15467;15468;15469;15470 15463 2940 12 AFVAGVLPFK Unmodified 1047.6117 0.6117025 1405 O00442 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.47 105.47 2 0.014657 109634 QUIQUE_C1576_190116_001 75.854 58.469 522280000 0 74260000 0 0 62009000 0 66206000 0 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region-related protein yes no 0 0 0 1 31.657 31.657 2 0.060883 26566 QUIQUE_C1368_190116_001 69.093 53.461 99009000 0 0 99009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1384 366 1288 12093 15539 15539 1 AFVELTK Unmodified 806.4538 0.45380487 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 43.757 43.757 2 0.043201 39988 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.462 43.369 321350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72076000 0 112170000 137100000 1385 1728 1289 12094;12095;12096 15540;15541;15542 15542 3 AFVENYPQFK Unmodified 1241.6081 0.60807369 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6;A0A2R8YEX8 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.389 76.389 2 1.6094E-05 78169 QUIQUE_C1218_190116_001 147.52 117.78 545710000 71936000 45905000 47304000 38861000 47686000 44468000 0 0 42971000 25654000 73132000 49712000 58082000 1386 4276 1290 12097;12098;12099;12100;12101;12102;12103;12104;12105;12106;12107;12108;12109 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16339 949 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALEK Oxidation (M) 3214.4553 0.45534438 1990;688 P0DPH8;P0DPH7;C9J2C0;Q9NY65 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain no no 0 1 1 1 135.33 135.33 4 0.00057758 138221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.167 38.264 44237000 0 0 0 0 0 0 0 44237000 0 0 0 0 0 1390 1990;688 1293 13024 16848 16848 421 0 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Oxidation (M) 3232.4118 0.411765 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 1 1 1 1 1 5 2 2 2 4 128.07 128.07 3;4 1.0114E-93 133392 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.3 173.54 6935300000 0 36342000 0 0 36604000 0 121910000 2266300000 1051700000 0 939470000 1222900000 1260000000 1391 2795;2796;3430;3992 1294 13025;13026;13027;13028;13029;13030;13031;13032;13033;13034;13035;13036;13037;13038;13039;13040;13041;13042 16849;16850;16851;16852;16853;16854;16855;16856;16857;16858;16859;16860;16861;16862;16863;16864;16865;16866;16867;16868;16869;16870;16871 16860 2243;2244 21 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Unmodified 3216.4169 0.41685038 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 2 2 1 3 6 17 12 5 17 7 144.71 144.71 2;3;4 2.364E-144 139877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.99 190.58 28930000000 0 122450000 111010000 110330000 187790000 0 1342500000 8709700000 5740600000 0 1719700000 4726300000 6159700000 1392 2795;2796;3430;3992 1294 13043;13044;13045;13046;13047;13048;13049;13050;13051;13052;13053;13054;13055;13056;13057;13058;13059;13060;13061;13062;13063;13064;13065;13066;13067;13068;13069;13070;13071;13072;13073;13074;13075;13076;13077;13078;13079;13080;13081;13082;13083;13084;13085;13086;13087;13088;13089;13090;13091;13092;13093;13094;13095;13096;13097;13098;13099;13100;13101;13102;13103;13104;13105;13106;13107;13108;13109;13110;13111;13112;13113;13114 16872;16873;16874;16875;16876;16877;16878;16879;16880;16881;16882;16883;16884;16885;16886;16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;16896;16897;16898;16899;16900;16901;16902;16903;16904;16905;16906;16907;16908;16909;16910;16911;16912;16913;16914;16915;16916;16917;16918;16919;16920;16921;16922;16923;16924;16925;16926;16927;16928;16929;16930;16931;16932;16933;16934;16935;16936;16937;16938;16939;16940;16941;16942;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;16951;16952;16953;16954;16955 16893 80 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK 2 Oxidation (M) 3248.4067 0.40667963 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 2 1 1 2 2 106.86 106.86 3;4 3.4958E-12 111174 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.227 66.321 375000000 0 0 0 0 0 0 0 129390000 56413000 0 0 189190000 0 1393 2795;2796;3430;3992 1294 13115;13116;13117;13118;13119 16956;16957;16958;16959;16960 16958 2243;2244 5 AFVRPSGTEDVVR Unmodified 1431.747 0.74702678 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;H0Y8I3;H0Y987 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 37.66 37.66 2;3 2.2857E-08 33056 QUIQUE_C1368_190116_001 138.42 110.56 3369800000 206350000 245190000 370380000 244670000 167710000 229090000 253750000 223820000 258250000 91663000 439750000 289680000 349460000 1394 1728 1295 13120;13121;13122;13123;13124;13125;13126;13127;13128;13129;13130;13131;13132;13133 16961;16962;16963;16964;16965;16966;16967;16968;16969;16970;16971;16972;16973;16974 16963 12 AFVVLAAPFK Unmodified 1061.6274 0.62735256 1980 P0C7M7 ACSM4 Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 107.55 107.55 2 0.03391 111112 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.953 57.852 49845000 0 0 0 0 0 0 0 0 12093000 0 0 11890000 25862000 1395 1980 1296 13134;13135;13136 16975;16976;16977 16977 2 AFVYLSNLLYPVPLVHR Unmodified 2000.1248 0.12475359 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.03 147.03 3 0.0010367 151897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.514 50.097 616530000 48054000 0 59972000 41597000 0 37812000 0 57760000 62105000 36206000 99987000 99596000 73440000 1396 497 1297 13137;13138;13139;13140;13141;13142;13143;13144;13145;13146 16978;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;16986;16987;16988;16989 16984 12 AFWAGGSPSVVDYFPSEDFYR Acetyl (Protein N-term) 2438.0855 0.085527128 1717 O95260 ATE1 Arginyl-tRNA--protein transferase 1 yes yes 1 0 0 1 1 173.68 173.68 2;3 0.0028089 175146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.257 38.159 9125400 0 0 0 0 0 0 0 4179800 0 0 0 0 4945600 1397 1717 1298 13147;13148 16990;16991 16990 2 AFWDVHRPVPGCVNTTEVDIK Unmodified 2439.2005 0.20051408 2549 P49802;Q5T3H5 RGS7 Regulator of G-protein signaling 7 yes no 0 0 1 1 1 94.802 94.802 4 0.0019997 98083 QUIQUE_C1218_190116_001 44.953 37.056 61866000 32606000 29259000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1398 2549 1299 13149;13150 16992;16993 16992 2 AFYAELYHIISSNLEK Unmodified 1896.9622 0.96216452 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 3 150.64 150.64 2;3 6.9351E-66 153783 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.41 187.83 5293100000 204130000 173910000 990430000 530260000 220890000 144560000 127040000 677610000 576860000 168280000 743270000 276280000 459620000 1399 114 1300 13151;13152;13153;13154;13155;13156;13157;13158;13159;13160;13161;13162;13163;13164;13165;13166;13167;13168;13169;13170;13171;13172;13173 16994;16995;16996;16997;16998;16999;17000;17001;17002;17003;17004;17005;17006;17007;17008;17009;17010;17011;17012;17013;17014;17015;17016;17017;17018;17019;17020;17021;17022;17023;17024;17025;17026;17027;17028;17029;17030;17031 17012 35 AFYAPVHADDLR Unmodified 1373.6728 0.67279921 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 59.664 59.664 3 0.0089004 58636 QUIQUE_C1368_190116_001 38.3 30.724 95400000 0 0 20472000 18030000 0 0 0 0 30139000 0 0 0 26758000 1400 2654 1301 13174;13175;13176;13177 17032;17033;17034;17035 17032 4 AFYELSQTHR Unmodified 1250.6044 0.60438529 4266 Q9NRD5;F6V107 PICK1 PRKCA-binding protein yes no 0 0 0 1 40.228 40.228 3 0.047686 34647 QUIQUE_DMIX4_190116_001 32.034 16.495 10006000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10006000 0 0 0 1401 4266 1302 13178 17036 17036 1 AFYGDTLVTGFAR Unmodified 1416.7038 0.70376498 4223 Q9HCC0 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 115.59 115.59 2 0.01834 112340 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.5 50.35 42574000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42574000 0 0 0 1402 4223 1303 13179 17037 17037 1 AFYGSEEDEAK Unmodified 1244.5197 0.51971219 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 32.519 32.519 2 0.0009759 27235 QUIQUE_C1277_190116_001 92.051 84.571 258120000 42146000 53629000 0 37852000 47985000 0 32578000 0 0 12149000 0 31782000 0 1403 2990 1304 13180;13181;13182;13183;13184;13185;13186;13187;13188 17038;17039;17040;17041;17042;17043;17044;17045;17046 17039 8 AFYLGSMLIK Unmodified 1141.6206 0.62055263 1160 H0YI72;Q7Z6G8;F8VR14;R4GMS8;R4GMN5;R4GN78;R4GMQ4 ANKS1B Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain-containing protein 1B yes no 0 0 0 1 1 122.27 122.27 2 0.0084486 124640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.692 47.671 76939000 50133000 0 0 0 0 0 0 26806000 0 0 0 0 0 1404 1160 1305 13189;13190 17047;17048 17048 1 AFYNNVLGEYEEYITK Unmodified 1951.9204 0.92035928 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.81 146.81 2 3.7459E-05 149447 QUIQUE_C1563_190116_001 121.04 108.27 1255700000 113680000 97456000 93443000 99133000 0 85182000 116610000 93278000 153370000 28076000 131330000 146270000 97922000 1405 1856 1306 13191;13192;13193;13194;13195;13196;13197;13198;13199;13200;13201;13202 17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057;17058;17059;17060 17053 10 AFYPEEISSMVLTK Unmodified 1613.8011 0.80109577 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 131.36 131.36 2;3 2.2545E-07 136436 QUIQUE_C1368_190116_001 102.73 99.783 10462000000 1122500000 1262200000 1523000000 1536900000 1282200000 1330800000 1492900000 144980000 147160000 92880000 199930000 149570000 177100000 1406 282;2362 1307 13203;13204;13205;13206;13207;13208;13209;13210;13211;13212;13213;13214;13215;13216;13217;13218;13219;13220;13221;13222 17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067;17068;17069;17070;17071;17072;17073;17074;17075;17076;17077;17078;17079;17080;17081;17082;17083;17084;17085;17086;17087;17088;17089;17090;17091;17092 17070 32 AFYPEEISSMVLTK Oxidation (M) 1629.796 0.79601039 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 1 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 108.61 108.61 2;3 0.00034221 105404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.215 81.351 1631700000 0 195990000 0 25172000 135800000 0 141300000 197910000 219190000 161480000 325170000 0 229740000 1407 282;2362 1307 13223;13224;13225;13226;13227;13228;13229;13230;13231;13232;13233 17093;17094;17095;17096;17097;17098;17099;17100;17101;17102;17103;17104 17101 209 12 AFYQQPDADIIGYVASEEAFVK Unmodified 2460.1849 0.18490682 1967 P09497 CLTB Clathrin light chain B yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 155.16 155.16 2;3 6.1886E-10 160836 QUIQUE_C1218_190116_001 101.48 93.163 2241100000 378470000 168840000 143630000 94997000 437690000 113390000 136340000 79162000 105240000 23259000 318800000 124560000 116730000 1408 1967 1308 13234;13235;13236;13237;13238;13239;13240;13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249 17105;17106;17107;17108;17109;17110;17111;17112;17113;17114;17115;17116;17117;17118;17119;17120;17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131 17108 26 AFYSLGNYIVASEIAK Unmodified 1744.9036 0.903587 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 135.56 135.56 2 5.3395E-07 139834 QUIQUE_C1277_190116_001 115.57 106.09 529420000 73860000 34649000 0 0 0 53796000 0 49175000 66394000 23966000 139710000 0 87873000 1409 3269 1309 13250;13251;13252;13253;13254;13255;13256;13257 17132;17133;17134;17135;17136;17137;17138;17139;17140 17133 8 AFYVNVLNEEQR Unmodified 1480.731 0.73104237 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.885 92.885 2 4.5807E-07 96555 QUIQUE_C1438_190116_001 144.65 125.38 2347400000 142500000 346400000 215800000 141040000 250350000 147740000 176450000 0 196080000 0 323990000 187530000 219460000 1410 1849 1310 13258;13259;13260;13261;13262;13263;13264;13265;13266;13267;13268;13269;13270 17141;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17148;17149;17150;17151;17152;17153 17146 4 AGAAAILIR Unmodified 854.53379 0.53378653 3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.12 47.12 2 0.0023496 43288 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.262 40.708 381130000 43012000 48795000 40285000 25730000 36384000 25013000 34472000 0 36568000 11421000 37920000 0 41529000 1411 3310 1311 13271;13272;13273;13274;13275;13276;13277;13278;13279;13280;13281 17154;17155;17156;17157;17158;17159;17160;17161;17162;17163;17164;17165 17163 8 AGAAFFNEVR Unmodified 1080.5352 0.53524309 56 B4DGL8;A0A087WW65;O75027;A0A2R8Y473;E9PJR8 ABCB7 ATP-binding cassette sub-family B member 7, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 66.163 66.163 2 0.028562 67233 QUIQUE_C1218_190116_001 54.982 29.245 88366000 35783000 0 0 0 0 0 20959000 0 0 0 0 0 31624000 1412 56 1312 13282;13283;13284 17166;17167;17168 17166 3 AGAALDPVSFAR Unmodified 1173.6142 0.6142217 1550 O43761;Q96L30 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.757 77.757 2 0.0020243 79351 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.883 59.762 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1413 1550 1313 13285;13286;13287;13288;13289;13290;13291;13292;13293 17169;17170;17171;17172;17173;17174;17175;17176;17177 17176 9 AGAAPYVQAFDSLLAGPVAEYLK Unmodified 2350.2209 0.2208984 2857 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 2 2 4 2 1 5 2 2 2 2 2 2 170.57 170.57 2;3 3.9705E-62 175710 QUIQUE_C1368_190116_001 160.8 141.13 9832600000 666900000 529740000 974160000 953840000 611050000 791530000 946290000 0 1009600000 224230000 1003200000 884440000 1237600000 1414 2857 1314 13294;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303;13304;13305;13306;13307;13308;13309;13310;13311;13312;13313;13314;13315;13316;13317;13318;13319;13320;13321 17178;17179;17180;17181;17182;17183;17184;17185;17186;17187;17188;17189;17190;17191;17192;17193;17194;17195;17196;17197;17198;17199;17200;17201;17202;17203;17204;17205;17206;17207;17208;17209;17210;17211;17212;17213 17188 32 AGAATQASLESAPR Acetyl (Protein N-term) 1370.679 0.6790068 4064 Q9BXR0 QTRT1 Queuine tRNA-ribosyltransferase yes yes 1 0 0 1 1 1 67.664 67.664 2 0.005835 67493 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.685 28.961 1697600000 0 0 475050000 0 0 0 0 269880000 0 0 0 952660000 0 1415 4064 1315 13322;13323;13324 17214;17215;17216 17215 2 AGAEDDEEKGEGTPR Unmodified 1559.67 0.66995825 863 E7ERS3;Q86VM9 ZC3H18 Zinc finger CCCH domain-containing protein 18 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.888 10.888 3 7.2006E-07 2889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.566 94.852 71850000 8208400 0 0 12370000 24476000 0 0 0 14499000 4302100 7993500 0 0 1416 863 1316 13325;13326;13327;13328;13329;13330;13331;13332 17217;17218;17219;17220;17221;17222;17223;17224;17225 17225 9 AGAGALLR Unmodified 727.43407 0.43407249 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 24.589 24.589 2 0.039603 17373 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.788 0.78689 482450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 482450000 0 0 0 1417 2435 1317 13333 17226 17226 1 AGAGGGNDIQWCFSQVK Acetyl (Protein N-term) 1835.8261 0.82608174 2781 P63151;E5RIY1;E5RHQ2;E5RJV2 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes no 1 0 0 1 1 1 1 126.76 126.76 2 1.1437E-44 130702 QUIQUE_C1277_190116_001 171.57 163.06 103280000 0 29151000 0 38082000 36047000 0 0 0 0 0 0 0 0 1418 2781 1318 13334;13335;13336;13337 17227;17228;17229;17230 17227 4 AGAGLSSLCLVLSTR Unmodified 1503.8079 0.80791248 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 120.56 120.56 2 0.037613 124573 QUIQUE_C1277_190116_001 62.088 44.029 34805000 0 34805000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1419 1762 1319 13338 17231 17231 0 AGAGLSSLCLVLSTRPHS Unmodified 1824.9516 0.9516166 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 2 2 103.01 103.01 2;3 8.3246E-75 105602 QUIQUE_DMIX8_190116_001 197.38 182.82 5761600000 254080000 429960000 325070000 273840000 442960000 287880000 444140000 557940000 610180000 130330000 555960000 621960000 827330000 1420 1762 1320 13339;13340;13341;13342;13343;13344;13345;13346;13347;13348;13349;13350;13351;13352;13353;13354;13355;13356 17232;17233;17234;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241;17242;17243;17244;17245;17246;17247;17248;17249;17250;17251;17252;17253;17254;17255;17256;17257;17258;17259;17260;17261 17260 29 AGAGSATLSMAYAGAR Oxidation (M) 1469.6933 0.69327665 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.072 45.072 2 1.0645E-25 41804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.56 141.73 4594700000 380080000 494490000 486950000 320520000 455430000 247080000 365870000 200220000 230480000 180640000 471170000 398500000 363280000 1421 2431 1321 13357;13358;13359;13360;13361;13362;13363;13364;13365;13366;13367;13368;13369 17262;17263;17264;17265;17266;17267;17268;17269;17270;17271;17272;17273;17274;17275;17276 17271 1854 15 AGAGSATLSMAYAGAR Unmodified 1453.6984 0.69836203 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 3 1 3 64.117 64.117 2 4.2354E-54 63694 QUIQUE_C1218_190116_001 186.87 164.88 14372000000 1400400000 1275700000 1278300000 1016400000 923790000 758310000 1057900000 1116200000 1006300000 628470000 1421200000 1108300000 1380800000 1422 2431 1321 13370;13371;13372;13373;13374;13375;13376;13377;13378;13379;13380;13381;13382;13383;13384;13385;13386;13387;13388;13389;13390;13391;13392;13393;13394 17277;17278;17279;17280;17281;17282;17283;17284;17285;17286;17287;17288;17289;17290;17291;17292;17293;17294;17295;17296;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306;17307;17308;17309;17310;17311;17312;17313;17314;17315;17316;17317 17277 41 AGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEK Unmodified 2179.0943 0.094317676 1888 P05388;F8VWS0;F8VW21;F8VU65;F8VPE8;G3V210;F8VQY6;F8VRK7;Q8NHW5 RPLP0;RPLP0P6 60S acidic ribosomal protein P0;60S acidic ribosomal protein P0-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.251 83.251 2 9.5043E-11 85430 QUIQUE_C1218_190116_001 139.66 127.03 1317300000 132390000 227690000 235950000 215800000 0 0 192340000 62877000 96375000 29761000 124130000 0 0 1423 1888 1322 13395;13396;13397;13398;13399;13400;13401;13402;13403 17318;17319;17320;17321;17322;17323;17324;17325;17326;17327;17328 17318 11 AGAISASGPELQGAGHSK Unmodified 1636.8169 0.81689726 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 26.657 26.657 2;3 2.2158E-11 20414 QUIQUE_C1403_190116_001 120.84 106.6 1260000000 76690000 26995000 104800000 155190000 30433000 181400000 33408000 224510000 93240000 40360000 116230000 117040000 59754000 1424 2935 1323 13404;13405;13406;13407;13408;13409;13410;13411;13412;13413;13414;13415;13416;13417;13418;13419;13420;13421;13422;13423;13424;13425 17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17339;17340;17341;17342;17343;17344;17345;17346;17347;17348;17349;17350;17351;17352;17353 17336 21 AGAKPDQIGIITPYEGQR Unmodified 1913.0007 0.0006752871 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.616 67.616 3 0.0046543 67709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.625 24.967 412740000 0 54522000 0 0 0 34884000 51035000 45668000 58517000 0 60067000 65177000 42873000 1425 3766 1324 13426;13427;13428;13429;13430;13431;13432;13433 17354;17355;17356;17357;17358;17359;17360;17361 17359 6 AGALLPAIHEQLR Unmodified 1387.7936 0.79358304 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.601 66.601 3 0.010466 65011 QUIQUE_C1563_190116_001 46.069 39.188 116620000 0 0 0 27790000 0 30632000 0 0 0 25431000 0 0 32766000 1426 1492 1325 13434;13435;13436;13437 17362;17363;17364;17365;17366;17367 17364 6 AGALNSNDAFVLK Unmodified 1318.6881 0.68811492 166;788 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.997 74.997 2 2.2775E-06 74960 QUIQUE_C1403_190116_001 157.96 121.51 22057000000 1277600000 1295200000 1722900000 1424200000 1560600000 1426900000 1875900000 1714800000 1850300000 1261000000 2476900000 1681200000 2489200000 + 1427 166;788 1326 13438;13439;13440;13441;13442;13443;13444;13445;13446;13447;13448;13449;13450 17368;17369;17370;17371;17372;17373;17374;17375;17376;17377;17378;17379;17380;17381;17382;17383;17384;17385;17386 17373 19 AGALQCSPSDAYTK Unmodified 1467.6664 0.6663932 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.23 37.23 2 0.00019383 32497 QUIQUE_C1368_190116_001 113.63 104.21 1038700000 62963000 85677000 109670000 114960000 100740000 65148000 69544000 46964000 80520000 35922000 94607000 78215000 93784000 1428 4600 1327 13451;13452;13453;13454;13455;13456;13457;13458;13459;13460;13461;13462;13463 17387;17388;17389;17390;17391;17392;17393;17394;17395;17396;17397;17398;17399;17400;17401 17389 15 AGALQVCPTDSYTK Unmodified 1509.7133 0.71334339 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.305 53.305 2 5.7508E-14 52065 QUIQUE_C1218_190116_001 143.24 128.27 604750000 70689000 61012000 48874000 58717000 50206000 41788000 61257000 39935000 0 0 46220000 61308000 64739000 1429 4606 1328 13464;13465;13466;13467;13468;13469;13470;13471;13472;13473;13474;13475 17402;17403;17404;17405;17406;17407;17408;17409;17410;17411;17412;17413;17414;17415 17403 13 AGAPVPEPPKEEQQQALEQFAAAAAHSTPVR Unmodified 3224.6214 0.62143892 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;J3QRQ6;J3QLU5;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 2 1 3 1 2 1 2 1 1 1 2 111.19 111.19 3;4 2.3676E-42 114468 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.35 106.86 3622100000 270210000 422380000 241860000 384340000 283560000 452320000 119260000 373680000 0 91819000 267450000 222000000 493220000 1430 143;4559 1329 13476;13477;13478;13479;13480;13481;13482;13483;13484;13485;13486;13487;13488;13489;13490;13491;13492;13493 17416;17417;17418;17419;17420;17421;17422;17423;17424;17425;17426;17427;17428;17429;17430;17431;17432;17433;17434;17435;17436;17437;17438;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448 17448 33 AGAPVPEPPKEEQQQALEQFAAAAAHSTPVRR Unmodified 3380.7225 0.72254995 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;J3QRQ6;J3QLU5;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 2 1 99.851 99.851 4 9.421E-20 101506 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.717 68.62 61769000 0 0 0 0 0 0 0 61769000 0 0 0 0 0 1431 143;4559 1330 13494 17449;17450;17451 17450 3 AGAQPGVHALQLKPVCVSDSLK Acetyl (Protein N-term) 2316.226 0.22600055 4250 Q9NQ66;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 yes no 1 0 1 1 1 92.284 92.284 3 4.9343E-05 93871 QUIQUE_C1277_190116_001 69.72 66.153 297630000 133060000 164570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1432 4250 1331 13495;13496 17452;17453 17453 0 AGASEQELLR Unmodified 1072.5513 0.55128709 4343 Q9NZB8 MOCS1 Molybdenum cofactor biosynthesis protein 1;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein yes yes 0 0 0 1 20.439 20.439 3 0.027993 13453 QUIQUE_C1368_190116_001 45.161 0.71393 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1433 4343 1332 13497 17454 17454 1 AGASISTLAGLSLK Unmodified 1287.7398 0.73981614 4461 Q9UJW0;E5RK21 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 101.54 101.54 2 0.0075876 98872 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.57 46.216 85730000 0 0 0 0 0 0 0 19232000 23329000 21071000 22097000 0 0 1434 4461 1333 13498;13499;13500;13501;13502;13503;13504 17455;17456;17457;17458;17459;17460;17461 17459 7 AGATSEGVLANFFNSLLSK Unmodified 1924.9894 0.9894419 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 168.14 168.14 2;3 8.2255E-37 171191 QUIQUE_C1403_190116_001 198.23 167.67 1691600000 110460000 14139000 153900000 157120000 163590000 201880000 229450000 185950000 31731000 8546400 25211000 211080000 198500000 1435 4653 1334 13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513;13514;13515;13516;13517;13518;13519;13520;13521 17462;17463;17464;17465;17466;17467;17468;17469;17470;17471;17472;17473;17474;17475;17476;17477;17478;17479 17466 18 AGAYDFPSPEWDTVTPEAK Unmodified 2079.9426 0.94255129 4533;412;3010;3299;896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7;A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3;Q13554;H7BXS4 CAMK2D;CAMK2A;CAMK2G;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 120.79 120.79 2;3 1.121E-11 124786 QUIQUE_C1277_190116_001 116.96 113.05 29303000000 2850100000 2903200000 2330700000 1929600000 2741100000 1642700000 2659300000 1698500000 1699600000 902190000 2765700000 2800100000 2380300000 1436 803;896;1135;4533;412;3299;3010 1335 13522;13523;13524;13525;13526;13527;13528;13529;13530;13531;13532;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;13541;13542;13543;13544;13545;13546;13547 17480;17481;17482;17483;17484;17485;17486;17487;17488;17489;17490;17491;17492;17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;17500;17501;17502;17503;17504;17505;17506;17507;17508;17509;17510;17511;17512;17513;17514;17515;17516;17517;17518;17519;17520;17521;17522;17523;17524;17525;17526;17527;17528;17529;17530;17531;17532;17533;17534;17535;17536 17488 57 AGCECLNESDEHGFDNCLR Unmodified 2281.8787 0.87866395 1526 O43396;K7ER96;K7EML9 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 61.4 61.4 3 7.6384E-08 60386 QUIQUE_C1368_190116_001 83.849 83.849 651540000 58848000 127330000 89417000 111190000 0 84089000 121960000 0 0 19011000 0 0 39699000 1437 1526 1336 13548;13549;13550;13551;13552;13553;13554;13555 17537;17538;17539;17540;17541;17542;17543;17544;17545 17540 8 AGCEVTILFADLHAYLDNMK Unmodified 2280.0919 0.091874835 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.56 166.56 3 2.9468E-06 171329 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.356 73.658 308700000 0 0 0 0 0 0 0 0 56194000 0 155290000 97212000 0 1438 2641 1337 13556;13557;13558;13559 17546;17547;17548;17549 17546 3 AGCQVVAPSDMMDGR Unmodified 1592.6745 0.67453182 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.767 66.767 2 1.2078E-05 63472 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.48 109.75 1079400000 103610000 0 126930000 124530000 77250000 85662000 103210000 52544000 85542000 27748000 112440000 72091000 107890000 1439 2061 1338 13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567;13568;13569;13570;13571 17550;17551;17552;17553;17554;17555;17556;17557;17558;17559;17560;17561;17562 17559 12 AGCQVVAPSDMMDGR Oxidation (M) 1608.6694 0.66944644 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 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fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.72 111.72 2 1.7394E-10 115607 QUIQUE_C1368_190116_001 135.55 119.92 321470000 29658000 26851000 40540000 0 44153000 27275000 0 0 0 39896000 64968000 0 48132000 1446 1803 1344 13588;13589;13590;13591;13592;13593;13594;13595;13596;13597 17580;17581;17582;17583;17584;17585;17586;17587;17588;17589;17590;17591;17592 17585 12 AGDIITVLEQHPDGR Unmodified 1619.8267 0.82673367 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 89.966 89.966 3 0.00038687 91186 QUIQUE_C1277_190116_001 70.529 52.9 398410000 154740000 93318000 0 0 0 115360000 0 0 0 34991000 0 0 0 1447 3718 1345 13598;13599;13600;13601 17593;17594;17595;17596;17597;17598 17595 5 AGDISCNADINPLK Unmodified 1486.7086 0.70859237 2122 P17301 ITGA2 Integrin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 67.592 67.592 2 0.021496 68613 QUIQUE_C1438_190116_001 48.998 34.791 14188000 0 0 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Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 1 1 0 1 1 1 164.06 164.06 2 0.00031548 165842 QUIQUE_C1563_190116_001 68.034 59.521 37865000 0 0 14115000 0 0 8309500 15440000 0 0 0 0 0 0 1453 2149 1349 13638;13639;13640 17636;17637;17638 17637 1500 2 AGDLVFAK Unmodified 819.44905 0.44905385 0 A0A024R216;Q9Y3E1;H3BPQ6 HDGFRP3 Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 yes no 0 0 0 1 49.462 49.462 2 0.042451 46851 QUIQUE_C1403_190116_001 58.981 18.409 56725000 0 0 0 56725000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1454 0 1350 13641 17639 17639 1 AGDREDITEPAICALR Unmodified 1785.8679 0.86794655 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 70.746 70.746 2;3 3.1494E-13 70844 QUIQUE_C1277_190116_001 132.08 125.46 4777000000 396990000 478360000 438110000 396790000 436720000 278270000 476550000 277260000 345190000 135580000 357260000 413250000 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17788;17789;17790;17791;17792;17793;17794;17795;17796;17797;17798;17799;17800;17801;17802 17797 12 AGEPDGESLDEQPSSSSSK Unmodified 1905.8076 0.80757395 4160 Q9H3Q1;J3KRZ9 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 31.696 31.696 2 4.5156E-242 26646 QUIQUE_DMIX3_190116_001 344.47 334.24 737110000 34584000 38661000 30115000 68626000 56914000 57169000 29820000 64691000 131170000 24351000 57727000 46925000 96358000 1469 4160 1363 13783;13784;13785;13786;13787;13788;13789;13790;13791;13792;13793;13794;13795;13796;13797;13798 17803;17804;17805;17806;17807;17808;17809;17810;17811;17812;17813;17814;17815;17816;17817;17818;17819;17820;17821 17813 18 AGEPLGVTFR Unmodified 1045.5556 0.55564418 4358 Q9NZW5;B8ZZG1;C9J4Q3;C9JGI8 MPP6 MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 1 65.036 65.036 2 0.018671 64702 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.828 31.93 109780000 0 0 54476000 0 0 0 0 0 0 0 0 55301000 0 1470 4358 1364 13799;13800 17822;17823 17823 2 AGEQDATIHLK Unmodified 1181.6041 0.60405094 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 22.436 22.436 2;3 4.1752E-09 15354 QUIQUE_C1563_190116_001 182.16 119.57 24825000000 2541100000 637170000 796460000 2400800000 2632700000 1776400000 2352200000 529340000 2341500000 1213000000 2744900000 1725900000 3133700000 1471 1218;28;2057 1365 13801;13802;13803;13804;13805;13806;13807;13808;13809;13810;13811;13812;13813;13814;13815;13816;13817;13818;13819;13820;13821;13822;13823 17824;17825;17826;17827;17828;17829;17830;17831;17832;17833;17834;17835;17836;17837;17838;17839;17840;17841;17842;17843;17844;17845;17846;17847;17848;17849;17850 17835 22 AGEQKPSSNLLEQFILLAK Acetyl (Protein N-term) 2127.1576 0.15756986 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3QT95;A0A087X1P5;J3KQV6;J3QT67;J3QT66;J3QT69;J3QT50;J3QT43 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.57 162.57 3 0.00053655 166409 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13837;13838;13839;13840;13841;13842;13843;13844 17864;17865;17866;17867;17868;17869;17870;17871 17869 8 AGESVLVHGASGGVGLAACQIAR Unmodified 2179.1168 0.11678445 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.093 83.093 3 4.6033E-07 80343 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.047 63.851 5136300000 378640000 447850000 520100000 411140000 399490000 423980000 267020000 365920000 427990000 175640000 422580000 387700000 508230000 1475 2917 1369 13845;13846;13847;13848;13849;13850;13851;13852;13853;13854;13855;13856;13857 17872;17873;17874;17875;17876;17877;17878;17879;17880;17881;17882;17883;17884;17885;17886;17887;17888;17889;17890 17885 18 AGETPSEEKKGEGDAATEQAAPQAPASSEEK Unmodified 3099.4116 0.41162489 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 2 1 23.334 23.334 4 1.5155E-13 16842 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.514 62.927 87069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87069000 0 1476 2128 1370 13858 17891 17891 1 AGEVFIHK Unmodified 899.4865 0.48650199 3122 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2999.5029 0.50288692 2673 P55809 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 116.56 116.56 3 3.8979E-13 118978 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.974 66.918 49890000 0 0 0 0 0 0 0 49890000 0 0 0 0 0 1500 2673 1392 14065 18168 18168 1 AGGANYDAQTE Unmodified 1095.4469 0.4468816 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.408 22.408 2 0.0025025 15601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.81 97.036 523820000 135650000 102990000 92147000 94005000 0 0 0 0 0 99030000 0 0 0 1501 3040 1393 14066;14067;14068;14069;14070 18169;18170;18171;18172;18173 18173 2 AGGASPAASSTAQPPTQHR Unmodified 1790.866 0.86597272 3525 Q8IU81 IRF2BP1 Interferon regulatory factor 2-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 14.797 14.797 3 3.1884E-05 7090 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.616 41.497 89564000 15287000 0 0 15090000 0 0 13049000 0 26517000 0 0 0 19621000 1502 3525 1394 14071;14072;14073;14074;14075 18174;18175;18176;18177;18178 18177 5 AGGDAEPRPAEPPAWAGGAR Unmodified 1931.9238 0.92382195 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 50.398 50.398 3 1.9443E-06 48208 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.146 65.593 79502000 0 0 0 0 0 0 0 47191000 32311000 0 0 0 0 1503 3871 1395 14076;14077;14078 18179;18180;18181 18181 1 AGGDATDSSQTALDNK Unmodified 1549.6856 0.68560832 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.419 21.419 2 1.5226E-79 14309 QUIQUE_C1368_190116_001 208.17 192.8 273630000 33615000 40691000 35399000 0 47856000 0 57823000 58244000 0 0 0 0 0 1504 310;830 1396 14079;14080;14081;14082;14083;14084;14085;14086;14087;14088;14089;14090;14091 18182;18183;18184;18185;18186;18187;18188;18189;18190;18191;18192;18193;18194 18184 13 AGGDSGNVDDDCER Unmodified 1465.5376 0.53756387 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 13.902 13.902 2 6.9487E-18 5825 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AGGGRPSSPSPSVVSEK Unmodified 1597.806 0.80599822 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 19.29 19.29 2;3 1.6144E-21 12434 QUIQUE_C1218_190116_001 159.08 99.658 1420600000 202040000 40207000 116890000 105400000 151730000 108510000 127450000 74135000 70271000 40986000 145430000 116410000 121090000 1514 981;4494 1406 14136;14137;14138;14139;14140;14141;14142;14143;14144;14145;14146;14147;14148;14149;14150 18239;18240;18241;18242;18243;18244;18245;18246;18247;18248;18249;18250;18251;18252;18253 18240 12 AGGIETIANEFSDR Unmodified 1478.7001 0.70013617 3738 Q92598;R4GN69 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.94 102.94 2 1.0842E-05 107010 QUIQUE_C1218_190116_001 152.54 124.53 3206500000 246510000 299100000 228870000 268230000 266980000 254670000 327640000 243970000 236840000 126430000 358220000 0 349050000 1515 3738 1407 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type-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 108.53 108.53 2;3 3.4035E-75 111789 QUIQUE_C1277_190116_001 190.37 170.16 494220000 30083000 38409000 43519000 40363000 0 42352000 0 44109000 53108000 19347000 76741000 106180000 0 1520 2169 1412 14198;14199;14200;14201;14202;14203;14204;14205;14206;14207;14208 18307;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;18315;18316;18317;18318;18319 18309 1517 13 AGGSASAMLQPLLDNQVGFK Unmodified 2003.0146 0.014610792 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 132.68 132.68 2;3 5.0233E-65 138345 QUIQUE_C1218_190116_001 237.32 206.09 2463800000 241590000 133610000 256480000 195150000 134110000 167780000 133000000 201580000 181720000 51180000 353000000 162360000 252260000 1521 2169 1412 14209;14210;14211;14212;14213;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;14221;14222;14223;14224;14225;14226;14227;14228;14229;14230;14231 18320;18321;18322;18323;18324;18325;18326;18327;18328;18329;18330;18331;18332;18333;18334;18335;18336;18337;18338;18339;18340;18341;18342;18343;18344;18345;18346;18347;18348;18349;18350;18351;18352 18321 33 AGGSLCHILAAAYK Unmodified 1430.734 0.73401926 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;F8VZW6 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.716 73.716 3 0.00046261 72929 QUIQUE_C1277_190116_001 75.102 66.066 59892000 40162000 0 0 0 0 0 0 0 0 19731000 0 0 0 1522 1039 1413 14232;14233;14234;14235;14236;14237 18353;18354;18355;18356;18357;18358 18354 6 AGGSPAPGPETPAISPSK Unmodified 1619.8155 0.81550028 2356 P33316;H0YKI0 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.569 42.569 2 5.5175E-07 38281 QUIQUE_C1563_190116_001 104.41 89.534 398680000 111970000 0 0 57933000 81450000 72041000 0 0 0 26690000 0 0 48594000 1523 2356 1414 14238;14239;14240;14241;14242;14243;14244 18359;18360;18361;18362;18363;18364;18365 18362 7 AGGSPAPGPETPAISPSKR Unmodified 1775.9166 0.91661131 2356 P33316;H0YKI0 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 30.044 30.044 3 0.0048575 24505 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.819 40.128 79510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79510000 0 1524 2356 1415 14245;14246 18366;18367 18366 1 AGGVASGLNHVLTNDLTAK Unmodified 1836.9694 0.96937516 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 81.88 81.88 2;3 1.9295E-28 83038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.76 146.29 1257200000 90504000 79533000 176610000 165310000 46894000 46509000 60788000 109560000 93706000 112630000 124220000 32556000 118400000 1525 4664 1416 14247;14248;14249;14250;14251;14252;14253;14254;14255;14256;14257;14258;14259;14260;14261;14262;14263;14264;14265;14266;14267;14268 18368;18369;18370;18371;18372;18373;18374;18375;18376;18377;18378;18379;18380;18381;18382;18383;18384;18385;18386;18387;18388;18389;18390;18391 18382 22 AGGVASGLNHVLTNDLTAKR Unmodified 1993.0705 0.070486187 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 1 1 69.913 69.913 3 0.0033723 69268 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.358 41.075 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1526 4664 1417 14269 18392 18392 1 AGGVFTPGAAFSK Unmodified 1208.619 0.61897272 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 69.942 69.942 2 0.001625 70211 QUIQUE_C1403_190116_001 78.513 64.375 326810000 0 0 108090000 88199000 0 0 0 0 0 0 130520000 0 0 1527 3629 1418 14270;14271;14272 18393;18394;18395;18396 18394 4 AGGYGIQALGGMLVESVHGDFLNVVGFPLNHFCK Unmodified 3602.7803 0.78026453 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 168.72 168.72 4 0.048859 173197 QUIQUE_DMIX3_190116_001 16.545 11.784 83118000 0 0 0 0 0 0 0 0 83118000 0 0 0 0 1528 1741 1419 14273 18397 18397 1 AGHDQVVVLLHDVR Unmodified 1556.8423 0.84232415 1285 J3KTF4;J3QRZ2;J3QLB7;J3QKS6;J3QRG5;J3KSJ5;Q9BQA9 C17orf62 Uncharacterized protein C17orf62 yes no 0 0 0 1 1 1 59.93 59.93 3 0.00022716 58023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.565 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18402;18403;18404;18405;18406;18407;18408;18409;18410;18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;18423;18424;18425;18426;18427;18428;18429 18405 23 AGHLAGPEPAPPPPPPPR Unmodified 1753.9264 0.92638813 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 37.691 37.691 3 0.006603 33407 QUIQUE_C1563_190116_001 26.548 15.694 41980000 0 0 0 0 0 41980000 0 0 0 0 0 0 0 1532 855 1423 14304 18430 18430 1 AGHSENGVEEDTEGR Unmodified 1585.6605 0.6604562 4357 Q9NZT2;A0A0A0MRN5 OGFR Opioid growth factor receptor yes no 0 0 0 1 1 11.551 11.551 3 0.0014272 3928 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.709 45.147 5316400 0 0 0 0 2731700 0 0 0 2584700 0 0 0 0 1533 4357 1424 14305;14306 18431;18432;18433 18433 3 AGHYAASIIIR Unmodified 1170.6509 0.65094155 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 39.648 39.648 2;3 0.00019109 35946 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.338 65.708 1111400000 73615000 56459000 62834000 110390000 91257000 69867000 85726000 110360000 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90780000 1536 3373 1427 14331;14332;14333;14334;14335;14336;14337;14338;14339;14340;14341;14342;14343;14344;14345;14346;14347;14348 18462;18463;18464;18465;18466;18467;18468;18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;18479;18480;18481 18463 19 AGIEAVLLSLHPGFR Unmodified 1578.8882 0.88821171 399 H0YN11;A0A286YET3;Q6ZNW5 GDPGP1 GDP-D-glucose phosphorylase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 133.14 133.14 2;3 0.00054857 139237 QUIQUE_C1438_190116_001 67.019 51.221 271470000 23340000 30764000 36032000 21325000 28455000 19698000 21242000 0 20417000 9046700 0 32341000 28807000 1537 399 1428 14349;14350;14351;14352;14353;14354;14355;14356;14357;14358;14359;14360 18482;18483;18484;18485;18486;18487;18488;18489;18490;18491;18492;18493 18486 10 AGIFPSHFPLPAAVAK Unmodified 1621.898 0.89804812 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 107.26 107.26 3 0.036978 108964 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.341 21.061 35448000 0 0 0 0 0 0 0 35448000 0 0 0 0 0 1538 1255;2856 1429 14361 18494 18494 1 AGIFQSVK Unmodified 848.4756 0.47560295 1973 P09669 COX6C Cytochrome c oxidase subunit 6C yes yes 0 0 0 1 1 2 1 40.117 40.117 1;2 0.016576 36975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.3 75.613 690050000 0 64513000 0 0 0 0 0 0 172590000 0 270240000 182700000 0 1539 1973 1430 14362;14363;14364;14365;14366 18495;18496;18497;18498;18499 18496 2 AGIIQVLLEAVAIAAK Unmodified 1578.9709 0.97087871 353 A0A1B0GUZ7;Q14156 EFR3A Protein EFR3 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 177.23 177.23 2;3 0.00031907 184042 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.288 68.911 43957000 0 1844400 0 0 0 0 10839000 6040600 9954700 0 15278000 0 0 1540 353 1431 14367;14368;14369;14370;14371;14372 18500;18501;18502;18503;18504;18505 18505 6 AGIISTVEVLK Unmodified 1128.6754 0.67542497 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 90.395 90.395 1;2 0.0035226 92420 QUIQUE_C1368_190116_001 93.098 71.561 11497000000 784860000 929290000 971290000 917100000 923220000 830880000 789090000 1075300000 1093100000 282110000 1084300000 775670000 1041000000 1541 959 1432 14373;14374;14375;14376;14377;14378;14379;14380;14381;14382;14383;14384;14385;14386;14387;14388;14389 18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;18513;18514;18515;18516;18517;18518;18519;18520;18521;18522 18508 10 AGILFEDIFDVK Acetyl (Protein N-term) 1407.7286 0.72858275 733 C9JLU1;P52434 POLR2H DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 yes no 1 0 0 1 1 1 179.26 179.26 2 0.0022502 182798 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 44.671 151380000 31908000 0 0 0 0 37982000 81487000 0 0 0 0 0 0 1542 733 1433 14390;14391;14392 18523;18524;18525 18523 3 AGILFEDIFDVKDIDPEGK Acetyl (Protein N-term) 2162.0783 0.078316486 733 C9JLU1;P52434 POLR2H DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 yes no 1 0 1 1 1 1 173.84 173.84 2 0.0041318 177560 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.588 66.536 72487000 0 0 0 0 0 0 0 30281000 18992000 0 0 23215000 0 1543 733 1434 14393;14394;14395 18526;18527;18528 18528 2 AGIPVYAWK Unmodified 1003.5491 0.54910224 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.889 80.889 2 0.020669 81981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.717 32.91 2029800000 0 0 313210000 260770000 291060000 0 288190000 0 255910000 0 330450000 290250000 0 1544 2219 1435 14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402 18529;18530;18531;18532;18533;18534;18535 18535 7 AGIQQVYTR Unmodified 1034.5509 0.55089316 3016 Q13616;A0A0C4DGX4 CUL1 Cullin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.76 32.76 2 0.0038413 28046 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.37 31.588 260950000 0 32828000 0 28427000 33877000 0 0 24753000 39811000 0 44509000 30354000 26395000 1545 3016 1436 14403;14404;14405;14406;14407;14408;14409;14410;14411 18536;18537;18538;18539;18540;18541;18542;18543;18544;18545 18544 8 AGISEAQLTDAETSK Unmodified 1519.7366 0.73658126 2454 P42768 WAS Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 55.794 55.794 2 1.5604E-05 53993 QUIQUE_C1403_190116_001 93.614 72.151 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1546 2454 1437 14412 18546 18546 1 AGITTIEAVK Acetyl (Protein N-term) 1043.5863 0.58627561 63;3271 Q5HYB6;D6RFM2;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 1 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 94.563 94.563 1;2 0.00020595 97352 QUIQUE_C1368_190116_001 111.95 68.178 7195900000 621590000 961590000 535320000 509050000 569410000 855660000 530510000 327030000 395150000 464080000 437480000 465160000 523890000 1547 3271;63 1438 14413;14414;14415;14416;14417;14418;14419;14420;14421;14422;14423;14424;14425;14426;14427;14428;14429;14430;14431;14432 18547;18548;18549;18550;18551;18552;18553;18554;18555;18556;18557;18558;18559;18560;18561;18562;18563;18564;18565;18566;18567;18568;18569;18570;18571;18572;18573;18574;18575;18576;18577;18578;18579;18580;18581 18553 30 AGITTIEAVKR Acetyl (Protein N-term) 1199.6874 0.68738664 63;3271 Q5HYB6;D6RFM2;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.963 68.963 2 0.0012194 68943 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.38 108.68 7119300000 152390000 247600000 390970000 222960000 486470000 163620000 426960000 758360000 1550700000 59478000 0 1097900000 1561800000 1548 3271;63 1439 14433;14434;14435;14436;14437;14438;14439;14440;14441;14442;14443;14444 18582;18583;18584;18585;18586;18587;18588;18589;18590;18591;18592;18593 18590 12 AGKEPGLQIWR Unmodified 1253.6881 0.68805534 166;788;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 52.3 52.3 2;3 0.00030165 50294 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.53 87.387 4078600000 0 0 0 0 87556000 0 0 1351700000 509620000 29663000 1085300000 465720000 549110000 + 1549 166;788;3305;311 1440 14445;14446;14447;14448;14449;14450;14451;14452;14453;14454;14455;14456 18594;18595;18596;18597;18598;18599;18600;18601;18602;18603;18604;18605;18606;18607;18608;18609 18604 14 AGKPVICATQMLESMIK Oxidation (M) 1891.957 0.95696126 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 1 5 5 7 4 3 3 6 5 4 4 3 2 3 94.541 94.541 2;3 1.9924E-11 100312 QUIQUE_C1403_190116_001 123.38 111.33 8620800000 959440000 1217400000 1101400000 661110000 495750000 371440000 534780000 607480000 413360000 404460000 789030000 492370000 572860000 1550 1203;2077 1441 14457;14458;14459;14460;14461;14462;14463;14464;14465;14466;14467;14468;14469;14470;14471;14472;14473;14474;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;14485;14486;14487;14488;14489;14490;14491;14492;14493;14494;14495;14496;14497;14498;14499;14500;14501;14502;14503;14504;14505;14506;14507;14508;14509;14510 18610;18611;18612;18613;18614;18615;18616;18617;18618;18619;18620;18621;18622;18623;18624;18625;18626;18627;18628;18629;18630;18631;18632;18633;18634;18635;18636;18637;18638;18639;18640;18641;18642;18643;18644;18645;18646;18647;18648;18649;18650;18651;18652;18653;18654;18655;18656;18657;18658;18659;18660;18661;18662;18663;18664;18665;18666;18667;18668;18669;18670;18671;18672;18673;18674;18675;18676 18634 689;690 60 AGKPVICATQMLESMIK Unmodified 1875.962 0.96204664 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 2 3 2 2 2 3 2 4 2 2 2 2 4 124.93 124.93 2;3 4.7469E-74 128536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.16 184.2 30899000000 3099400000 2890600000 2859300000 2567600000 1664400000 1940700000 1790700000 2675500000 1586300000 612370000 3285100000 1612700000 4314500000 1551 1203;2077 1441 14511;14512;14513;14514;14515;14516;14517;14518;14519;14520;14521;14522;14523;14524;14525;14526;14527;14528;14529;14530;14531;14532;14533;14534;14535;14536;14537;14538;14539;14540;14541;14542 18677;18678;18679;18680;18681;18682;18683;18684;18685;18686;18687;18688;18689;18690;18691;18692;18693;18694;18695;18696;18697;18698;18699;18700;18701;18702;18703;18704;18705;18706;18707;18708;18709;18710;18711;18712;18713;18714;18715;18716;18717;18718;18719;18720;18721;18722;18723;18724;18725;18726;18727;18728;18729;18730;18731;18732;18733;18734;18735;18736;18737;18738;18739;18740;18741 18717 64 AGKPVICATQMLESMIK 2 Oxidation (M) 1907.9519 0.95187588 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 2 1 1 1 1 70.005 70.005 3 0.00030987 69542 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.307 53.89 50929000 0 0 0 0 0 0 0 0 50929000 0 0 0 0 1552 1203;2077 1441 14543;14544;14545 18742;18743;18744 18743 689;690 2 AGLAASLAGPHSIVGR Unmodified 1475.8209 0.82086043 1942 P08294 SOD3 Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn] yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 64.756 64.756 2;3 0.0014311 64925 QUIQUE_C1438_190116_001 64.65 37.977 779110000 0 66672000 57479000 59794000 0 40922000 67235000 78620000 59811000 36878000 156040000 0 155660000 1553 1942 1442 14546;14547;14548;14549;14550;14551;14552;14553;14554;14555;14556;14557;14558;14559;14560 18745;18746;18747;18748;18749;18750;18751;18752;18753;18754;18755;18756;18757;18758;18759 18749 13 AGLAPETTETPAGASETAQATDLSLSPGGESK Unmodified 3043.4469 0.44694776 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9;A0A1B0GTS0;H3BN10;A0A1B0GU37;A0A1B0GTR2;A0A1B0GUW9;A0A1B0GUR0 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 99.298 99.298 3 3.5658E-31 101455 QUIQUE_C1403_190116_001 94.929 83.824 81561000 28922000 0 0 52639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1554 3469 1443 14561;14562 18760;18761 18761 1 AGLAPLEVR Unmodified 924.53927 0.53926584 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.196 55.196 2 0.017275 53504 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.156 17.12 1125600000 0 0 0 198730000 200100000 148900000 0 0 0 0 217500000 153310000 207090000 1555 1628 1444 14563;14564;14565;14566;14567;14568 18762;18763;18764;18765;18766;18767 18767 6 AGLAWTR Unmodified 773.41842 0.41842242 2271 P27987 ITPKB Inositol-trisphosphate 3-kinase B yes yes 0 0 0 1 41.25 41.25 2 0.052156 37187 QUIQUE_C1563_190116_001 73.637 47.158 33883000 0 0 0 0 0 33883000 0 0 0 0 0 0 0 1556 2271 1445 14569 18768 18768 1 AGLELGAEPETIVNSGLISPEGLAIDHIR Unmodified 2970.5662 0.56621546 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.16 148.16 3 9.1717E-93 152892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.11 145.39 1869000000 139940000 138030000 102630000 228020000 274420000 97709000 166940000 101930000 149720000 63633000 163400000 152620000 89980000 1557 3042 1446 14570;14571;14572;14573;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582 18769;18770;18771;18772;18773;18774;18775;18776;18777;18778;18779;18780;18781;18782;18783;18784;18785;18786 18780 18 AGLELLSDQGYR Acetyl (Protein N-term) 1362.6779 0.67794416 4242 Q9NPD3;E9PPI9 EXOSC4 Exosome complex component RRP41 yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 138.47 138.47 2 0.00025216 141482 QUIQUE_C1563_190116_001 105.4 85.067 128530000 0 33874000 0 0 0 15567000 18111000 24066000 0 0 18712000 18202000 0 1558 4242 1447 14583;14584;14585;14586;14587;14588;14589;14590 18787;18788;18789;18790;18791;18792;18793;18794 18789 8 AGLELSPEMK Unmodified 1073.5427 0.54269624 1895 P05937 CALB1 Calbindin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.58 62.58 2 0.021675 61376 QUIQUE_C1368_190116_001 58.426 21.869 89603000 0 0 73822000 0 0 0 0 0 0 15781000 0 0 0 1559 1895 1448 14591;14592;14593;14594 18795;18796;18797;18798 18795 4 AGLENTVAETECR Unmodified 1448.6566 0.6565568 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 46.793 46.793 2 6.5878E-06 42095 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.67 28.654 93265000 0 0 0 41937000 0 0 0 0 0 51328000 0 0 0 + 1560 760;777 1449 14595;14596;14597;14598 18799;18800;18801;18802 18801 4 AGLEVLFASAAPAITCR Acetyl (Protein N-term) 1787.924 0.92400487 3288 Q5QPM7;Q92530;Q5QPM9 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 172.85 172.85 2;3 2.4687E-63 180010 QUIQUE_DMIX5_190116_001 237.87 212.21 4546400000 376300000 389450000 241190000 252030000 390180000 351170000 338770000 251040000 491020000 107930000 509010000 455590000 392700000 1561 3288 1450 14599;14600;14601;14602;14603;14604;14605;14606;14607;14608;14609;14610;14611;14612;14613;14614;14615;14616;14617;14618;14619;14620;14621;14622;14623 18803;18804;18805;18806;18807;18808;18809;18810;18811;18812;18813;18814;18815;18816;18817;18818;18819;18820;18821;18822;18823;18824;18825;18826;18827;18828;18829 18824 26 AGLGHPAAFGR Acetyl (Protein N-term) 1094.5621 0.56212655 1684 O94760 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.25 55.25 2 8.641E-26 53591 QUIQUE_C1277_190116_001 191.63 173.3 54455000000 3984300000 3868000000 4239400000 4024700000 4176300000 3415700000 3556000000 4502000000 4947100000 2336100000 5508900000 4711300000 5184900000 1562 1684 1451 14624;14625;14626;14627;14628;14629;14630;14631;14632;14633;14634;14635;14636 18830;18831;18832;18833;18834;18835;18836;18837;18838;18839;18840;18841;18842;18843;18844;18845;18846;18847;18848;18849;18850;18851;18852;18853;18854;18855;18856;18857;18858 18833 29 AGLGLCR Unmodified 745.39049 0.39049311 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 26.72 26.72 2 0.05526 20778 QUIQUE_C1277_190116_001 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18900;18901;18902;18903;18904;18905;18906;18907;18908;18909;18910;18911;18912;18913;18914;18915;18916 18909 15 AGLLFIFNFHPSK Unmodified 1489.8082 0.80817048 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 1 132.93 132.93 3 0.001317 139817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.463 49.868 14740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14740000 0 0 1571 2887 1460 14685;14686 18917;18918 18918 2 AGLLPSGPRPGYAAIQALLSSR Unmodified 2194.2222 0.2222358 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 137.31 137.31 3 0.0099165 140135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.935 35.829 48479000 0 0 0 0 0 0 0 48479000 0 0 0 0 0 1572 2198 1461 14687 18919 18919 0 AGLLTEQAPGDTLTAVESK Unmodified 1899.9789 0.97893679 4139 Q9H267;A0A2R8YDQ0;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.932 98.932 2 3.1449E-45 101616 QUIQUE_C1277_190116_001 159 126.84 291940000 36379000 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Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 34.781 34.781 2;3 0.00080839 31263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.332 55.462 8568100000 662250000 778590000 622830000 365220000 537030000 246970000 818910000 1097000000 1087700000 407070000 422610000 1009700000 512210000 1592 3117 1480 14914;14915;14916;14917;14918;14919;14920;14921;14922;14923;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;14931;14932;14933;14934 19182;19183;19184;19185;19186;19187;19188;19189;19190;19191;19192;19193;19194;19195;19196;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204;19205;19206;19207;19208;19209;19210;19211 19198 30 AGLYGLPR Unmodified 845.47594 0.4759373 2524 P49327;A0A0U1RQF0;A0A0U1RRG3 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.589 56.589 2 0.014372 55410 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.086 39.735 1088600000 61177000 89410000 0 83866000 88482000 57839000 109730000 84671000 90747000 50344000 122990000 124930000 124420000 1593 2524 1481 14935;14936;14937;14938;14939;14940;14941;14942;14943;14944;14945;14946 19212;19213;19214;19215;19216;19217;19218;19219;19220;19221;19222;19223;19224;19225;19226;19227 19218 16 AGMSAEQAQGLLEK Unmodified 1431.7028 0.70277871 4562 Q9Y2Q3;E9PFN5 GSTK1 Glutathione S-transferase kappa 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.568 69.568 2 1.1494E-86 70671 QUIQUE_C1218_190116_001 218.54 189.49 913410000 85993000 0 86101000 52685000 69070000 56808000 66523000 85898000 87946000 32307000 138520000 61209000 90346000 1594 4562 1482 14947;14948;14949;14950;14951;14952;14953;14954;14955;14956;14957;14958;14959 19228;19229;19230;19231;19232;19233;19234;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;19242;19243;19244 19228 15 AGNAIHAILLYR Unmodified 1310.7459 0.74590457 2562 P50416;H3BMD2 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.223 73.223 3 0.0026341 71068 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.815 57.675 78213000 0 0 0 20251000 0 18248000 15084000 0 0 9036800 0 15593000 0 1595 2562 1483 14960;14961;14962;14963;14964;14965;14966;14967;14968 19245;19246;19247;19248;19249;19250;19251;19252;19253;19254;19255 19254 11 AGNASKDEIDSAVK Unmodified 1403.6892 0.68923713 2213 P23381;G3V277;G3V3P2;G3V227;G3V3X0;G3V5W1;G3V3S7;G3V4C7;G3V4N8;G3V2F2;G3V3R3;G3V4S4;G3V313;G3V339;G3V2C0 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 18.808 18.808 2;3 1.2002E-85 11266 QUIQUE_C1368_190116_001 215.34 167.74 4433000000 173000000 268620000 693260000 323450000 353830000 198930000 249390000 407870000 348220000 32708000 702770000 331630000 349330000 1596 2213 1484 14969;14970;14971;14972;14973;14974;14975;14976;14977;14978;14979;14980;14981;14982;14983;14984;14985;14986;14987;14988;14989;14990;14991;14992;14993 19256;19257;19258;19259;19260;19261;19262;19263;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270;19271;19272;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281 19260 25 AGNDLIESSAGEEASNLQNK Unmodified 2045.9502 0.95015586 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 76.669 76.669 2 3.9492E-88 78794 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.35 158.47 38595000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38595000 0 0 1597 2882 1485 14994;14995 19282;19283 19283 2 AGNELLESSAGDDASSLR Unmodified 1790.8282 0.82824981 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.084 73.084 2 2.7433E-17 74602 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.99 142.43 300690000 0 0 52291000 0 0 24582000 38226000 0 0 0 75979000 67982000 41630000 1598 1187 1486 14996;14997;14998;14999;15000;15001 19284;19285;19286;19287;19288;19289 19287 6 AGNEYLIFQK Unmodified 1181.6081 0.60807369 911 E9PER6;O15530;Q6A1A2;H3BPW1 PDPK1;PDPK2P 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1;Putative 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 79.486 79.486 2 0.0059387 80123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.761 56.978 81610000 0 0 0 0 0 0 0 36573000 45038000 0 0 0 0 1599 911 1487 15002;15003;15004 19290;19291;19292 19291 2 AGNILFTLDGDIK Unmodified 1375.7347 0.73473076 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 123.8 123.8 2 0.0018204 128554 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.017 36.297 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1600 4145 1488 15005;15006 19293;19294 19293 2 AGNILLNTEGHAK Unmodified 1336.7099 0.709913 49 A0A087WVN8;Q13043 STK4 Serine/threonine-protein kinase 4;Serine/threonine-protein kinase 4 37kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 4 18kDa subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.152 29.152 3 0.00016134 23685 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.191 82.609 228350000 41420000 47609000 41662000 0 0 31094000 0 0 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Unmodified 1241.6728 0.67279921 1315 K7EJT5;K7EP65;K7EKS7;K7ELC4;K7EMH1;K7ERI7;P35268 RPL22 60S ribosomal protein L22 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.718 56.718 2 0.014059 55071 QUIQUE_C1277_190116_001 65.395 48 453690000 0 100420000 0 0 102990000 0 0 0 0 31705000 111270000 107310000 0 1604 1315 1492 15026;15027;15028;15029;15030 19315;19316;19317;19318;19319 19315 4 AGNNMLLVGVHGPR Unmodified 1433.7562 0.75615168 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 55.744 55.744 2;3 0.00043862 54945 QUIQUE_C1438_190116_001 85.622 66.644 606090000 0 68707000 77616000 68286000 133610000 57082000 0 0 67962000 0 72901000 0 59927000 1605 2178 1493 15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041 19320;19321;19322;19323;19324;19325;19326;19327;19328;19329;19330 19325 7 AGNSLAASTAEETAGSAQGR Unmodified 1847.8609 0.86094692 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.301 45.301 2 9.9164E-174 42053 QUIQUE_C1438_190116_001 242.92 221.05 1440000000 104660000 0 139270000 83101000 269580000 0 114750000 65227000 140030000 79517000 186990000 135920000 120960000 1606 2665 1494 15042;15043;15044;15045;15046;15047;15048;15049;15050;15051;15052;15053 19331;19332;19333;19334;19335;19336;19337;19338;19339;19340;19341;19342;19343;19344;19345;19346 19336 16 AGNSLVLPIVLWGR Acetyl (Protein N-term) 1535.8824 0.88239805 4604 Q9Y4E6;A2RRE0;K7EMB8 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.89 172.89 2 4.4364E-08 177067 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.17 153.29 907210000 70334000 87348000 44932000 45100000 84257000 58564000 95717000 65222000 77481000 21601000 104200000 101160000 51288000 1607 4604 1495 15054;15055;15056;15057;15058;15059;15060;15061;15062;15063;15064;15065;15066 19347;19348;19349;19350;19351;19352;19353;19354;19355;19356;19357;19358;19359 19355 13 AGNVIFR Unmodified 775.43407 0.43407249 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.854 31.854 2 0.019819 27660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.68 43.935 4816500000 680290000 519000000 578590000 471300000 456380000 545530000 0 334980000 580450000 0 650030000 0 0 1608 2673 1496 15067;15068;15069;15070;15071;15072;15073;15074;15075 19360;19361;19362;19363;19364;19365;19366;19367;19368 19366 9 AGNVVTGEMVEELILSGADIIK Unmodified 2257.1875 0.18754936 1172 H0YNS9 GMPR2 yes yes 0 0 0 1 170.21 170.21 3 0.00098902 174540 QUIQUE_C1218_190116_001 58.964 50.676 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1609 1172 1497 15076 19369 19369 1 AGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVK Unmodified 2719.3758 0.37583591 1625 O75351;K7EL71;K7EKZ3 VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.28 167.28 4 2.504E-18 171776 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.52 114.42 436020000 0 0 0 0 0 0 76283000 0 95387000 0 167830000 96519000 0 1610 1625 1498 15077;15078;15079;15080 19370;19371;19372;19373;19374 19372 5 AGPAPPAADELPGPAAR Acetyl (Protein N-term) 1598.8053 0.80526994 177 A0A0A0MSK4;A0A087WVF5 GPSM1 yes no 1 0 0 1 1 92.315 92.315 2 0.0018664 95287 QUIQUE_C1576_190116_001 56.205 42.435 64538000 0 0 0 0 34468000 0 30069000 0 0 0 0 0 0 1611 177 1499 15081;15082 19375;19376 19376 2 AGPDLPSLPSHALEDEGWAAAAPSPGSAR Unmodified 2826.3573 0.35728531 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 119.54 119.54 2;3 2.349E-92 123420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.86 193.7 3919500000 226380000 218170000 164800000 367550000 312820000 369440000 0 471370000 663110000 148320000 297160000 0 680430000 1612 4160 1500 15083;15084;15085;15086;15087;15088;15089;15090;15091;15092;15093;15094;15095 19377;19378;19379;19380;19381;19382;19383;19384;19385;19386;19387;19388;19389;19390;19391;19392;19393;19394;19395;19396;19397 19388 19 AGPESDAQYQFTGIK Unmodified 1610.7577 0.75765105 3882 Q96IX5 USMG5 Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 74.194 74.194 2 7.3464E-112 75089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.17 203.74 1536700000 196230000 133510000 0 98446000 56367000 106350000 82988000 188790000 137050000 138410000 168070000 116080000 114410000 1613 3882 1501 15096;15097;15098;15099;15100;15101;15102;15103;15104;15105;15106;15107;15108;15109;15110 19398;19399;19400;19401;19402;19403;19404;19405;19406;19407;19408;19409;19410;19411;19412;19413;19414;19415;19416;19417;19418;19419;19420 19412 23 AGPESDAQYQFTGIKK Unmodified 1738.8526 0.85261407 3882 Q96IX5 USMG5 Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5 yes yes 0 0 1 1 2 1 51.165 51.165 2;3 0.00079389 49325 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.045 36.069 250660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97887000 100520000 52254000 1614 3882 1502 15111;15112;15113;15114 19421;19422;19423;19424 19421 4 AGPGSSPLFSLLPGYR Unmodified 1617.8515 0.85149185 4126 Q9H0W8 SMG9 Protein SMG9 yes yes 0 0 0 1 1 140.78 140.78 2 0.035664 145759 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.54 28.449 27336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27336000 1615 4126 1503 15115;15116 19425;19426 19426 2 AGPGTLSVTIEGPSK Unmodified 1412.7511 0.75110911 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 67.488 67.488 2 0.0094248 67707 QUIQUE_C1368_190116_001 58.04 35.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1616 1628 1504 15117 19427 19427 1 AGPILELEQWIDK Unmodified 1510.8031 0.80314468 3847 Q96EY8;S4R3P5;F5H4Z7 MMAB Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 149.33 149.33 2 0.00051187 155191 QUIQUE_C1576_190116_001 90.05 80.046 164180000 34489000 30741000 0 0 0 53672000 27288000 0 0 0 17990000 0 0 1617 3847 1505 15118;15119;15120;15121;15122;15123 19428;19429;19430;19431;19432;19433;19434 19433 7 AGPIWDLR Unmodified 926.4974 0.49740102 1525;1581 O43390;B4DT28;O60506;B7Z645 HNRNPR;SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.76 84.76 2 0.0064687 87230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.64 62.425 4069600000 266070000 358000000 449320000 272490000 304250000 312300000 366110000 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176.27 2;3 2.4408E-98 180390 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.6 185.11 3711800000 0 32122000 64637000 0 103860000 42727000 179590000 105850000 1086600000 0 176520000 1626300000 293590000 1621 2201 1509 15139;15140;15141;15142;15143;15144;15145;15146;15147;15148;15149;15150;15151;15152 19453;19454;19455;19456;19457;19458;19459;19460;19461;19462;19463;19464;19465;19466;19467;19468;19469;19470 19465 18 AGPSAQEPGSQTPLK Unmodified 1466.7365 0.73652168 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.423 29.423 2 1.2524E-12 23364 QUIQUE_C1277_190116_001 133.07 72.551 641090000 63676000 59981000 42403000 55752000 65070000 56235000 44454000 58919000 49603000 18461000 72609000 53926000 0 1622 1567 1510 15153;15154;15155;15156;15157;15158;15159;15160;15161;15162;15163;15164;15165 19471;19472;19473;19474;19475;19476;19477;19478;19479;19480;19481;19482;19483;19484;19485;19486;19487;19488 19473 18 AGPVQVLIVK Unmodified 1022.6488 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19519;19520;19521;19522;19523;19524;19525;19526;19527;19528 19519 5 AGQILQAELLAVYGADPGTQDSSGK Unmodified 2488.2445 0.24454697 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3;F8W822 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 0 1 138.75 138.75 3 0.055504 141603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.737 7.8844 40761000 0 0 0 0 0 0 0 40761000 0 0 0 0 0 1628 1040 1516 15204 19529 19529 1 AGQLLSELFTNR Unmodified 1347.7147 0.71466402 2205 P23141 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 119.33 119.33 2 0.00082262 124972 QUIQUE_C1218_190116_001 94.297 0 74610000 0 15082000 24589000 34939000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1629 2205 1517 15205;15206;15207;15208;15209;15210;15211;15212;15213 19530;19531;19532;19533;19534;19535;19536;19537;19538 19530 9 AGQMVTVWAAGAGVAHSPPSTLVWK Oxidation (M) 2536.2897 0.28966344 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 110.85 110.85 3 7.993E-11 115693 QUIQUE_C1218_190116_001 80.102 72.298 441840000 60955000 64646000 0 40415000 0 0 0 81525000 94125000 0 0 0 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no 0 1 0 1 1 1 165.17 165.17 2 5.2034E-18 168615 QUIQUE_C1277_190116_001 120.24 103.02 53707000 0 22614000 0 9736100 0 0 21357000 0 0 0 0 0 0 1637 3549 1523 15275;15276;15277 19611;19612;19613 19611 2684 3 AGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKK Unmodified 2458.1331 0.13308772 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 158.66 158.66 3 4.4247E-09 161409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.726 73.33 146070000 0 0 0 0 0 0 0 45422000 0 0 57031000 0 43617000 1638 3549 1524 15278;15279;15280 19614;19615;19616 19614 2 AGQSSLGGGHVSER Unmodified 1340.6433 0.64328999 705;592 C9JA33;B1ALY0 PALM2;PALM2-AKAP2 no no 0 0 0 1 1 11.434 11.434 3 0.0052096 3695 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.657 29.791 11298000 0 0 0 2971000 0 0 0 8327000 0 0 0 0 0 1639 705;592 1525 15281;15282 19617;19618 19618 2 AGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFLQLLGER Unmodified 3245.4459 0.4459019 1511 O43166;F5GYF8;H0YJY2 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 170.17 170.17 3 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19723;19724;19725;19726;19727;19728;19729;19730;19731;19732;19733;19734;19735;19736;19737;19738;19739;19740;19741;19742;19743;19744;19745;19746;19747;19748;19749;19750;19751;19752;19753;19754 19736 31 AGSDGESIGNCPFSQR Unmodified 1680.7162 0.71619694 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.394 53.394 2 2.2776E-13 51397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.27 122.84 2071700000 167250000 143120000 233120000 208560000 155880000 137970000 193120000 62498000 150360000 85538000 188260000 136080000 209970000 1651 4646 1536 15385;15386;15387;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397 19755;19756;19757;19758;19759;19760;19761;19762;19763;19764;19765;19766;19767 19762 13 AGSDYEYSEGTLVFKPGETQK Unmodified 2305.075 0.075022022 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 1 1 1 1 78.643 78.643 3 2.8698E-05 79445 QUIQUE_C1368_190116_001 72.585 68.33 123390000 28944000 29387000 65056000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1652 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protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 10.435 10.435 3 0.00022948 2824 QUIQUE_C1277_190116_001 73.833 58.276 9032300 0 3859900 0 0 0 5172400 0 0 0 0 0 0 0 1656 1688 1541 15408;15409 19779;19780 19779 2 AGSSESIAAFIQR Unmodified 1335.6783 0.67827852 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 86.97 86.97 2 0.0255 88746 QUIQUE_C1277_190116_001 49.3 31.492 59060000 0 59060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1657 7 1542 15410 19781 19781 1 AGSSSLEAVRR Acetyl (Protein N-term) 1173.6102 0.61019895 1019;1164 F5H7S3;B7Z596;H0YN06;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 36.492 36.492 2 7.0558E-24 32451 QUIQUE_DMIX3_190116_001 220.39 199.52 507840000 0 0 0 0 0 0 0 89667000 115250000 0 123110000 101720000 78098000 1658 1019;1164 1543 15411;15412;15413;15414;15415 19782;19783;19784;19785;19786 19783 3 AGSSTPGDAPPAVAEVQGR Unmodified 1765.8595 0.85949036 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 49.977 49.977 2 0.00018452 48528 QUIQUE_C1438_190116_001 76.262 63.685 23447000 0 0 0 0 23447000 0 0 0 0 0 0 0 0 1659 3471 1544 15416 19787 19787 1 AGSTALYWACHGGHK Unmodified 1614.7361 0.73614452 3763 Q92882 OSTF1 Osteoclast-stimulating factor 1 yes yes 0 0 0 1 28.793 28.793 3 0.0043871 22990 QUIQUE_C1403_190116_001 34.432 22.639 39331000 0 0 0 39331000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1660 3763 1545 15417 19788 19788 1 AGSVADSDAVVK Acetyl (Protein N-term) 1159.5721 0.57208211 3232 Q3ZCW2;U3KQ88;F8WF17;B9A055 LGALSL Galectin-related protein;Galectin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 59.958 59.958 2 0.0038776 59409 QUIQUE_C1218_190116_001 63.184 34.035 462330000 87314000 94238000 152990000 0 0 0 0 0 0 39355000 0 88436000 0 1661 3232 1546 15418;15419;15420;15421;15422;15423 19789;19790;19791;19792;19793;19794 19789 4 AGSVPSLAAGLLFGSLAGLGAYQLSQDPR Unmodified 2815.4868 0.48684292 4370 Q9P0S9 TMEM14C Transmembrane protein 14C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 172.36 172.36 3 1.5419E-19 173841 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.723 82.101 1203500000 20897000 0 259100000 0 41995000 25341000 0 218400000 214190000 11571000 216700000 0 195260000 1662 4370 1547 15424;15425;15426;15427;15428;15429;15430;15431;15432;15433 19795;19796;19797;19798;19799;19800;19801;19802;19803;19804 19799 8 AGSVSLDSVLADVR Unmodified 1387.7307 0.73070802 1321 K7EK60;K7EJE6 FMNL1 no no 0 0 0 1 117.13 117.13 2 0.070628 123299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.021 16.557 23004000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23004000 0 0 1663 1321 1548 15434 19805 19805 1 AGTEALPDGLSVEDILNLLGMESAANQK Unmodified 2855.4223 0.42225334 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 0 1 1 173.51 173.51 3 6.9117E-13 177355 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.122 65.323 134950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84785000 0 50160000 1664 2056 1549 15435;15436 19806;19807 19807 2 AGTEDEEEEEEGRR Unmodified 1634.6656 0.66560116 1731 O95456;F8WBH7 PSMG1 Proteasome assembly chaperone 1 yes no 0 0 1 1 1 13.759 13.759 3 0.0096418 5857 QUIQUE_C1438_190116_001 50.563 41.026 8446200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8446200 0 1665 1731 1550 15437;15438 19808;19809 19808 1 AGTEEAIVYSDIDLKK Unmodified 1750.8989 0.89889556 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 1 1 1 74.465 74.465 2 1.8622E-14 75329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.97 128.29 41615000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41615000 0 0 1666 4256 1551 15439;15440 19810;19811 19810 2 AGTFGLQSAR Unmodified 1006.5196 0.51959303 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 36.683 36.683 2 0.016955 32382 QUIQUE_C1563_190116_001 62.201 22.2 251430000 0 0 0 0 0 40072000 0 0 75152000 0 58744000 77461000 0 1667 2225 1552 15441;15442;15443;15444 19812;19813;19814;19815 19812 4 AGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIK Unmodified 2874.4089 0.40892695 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 3 2 2 3 2 2 3 3 2 3 2 2 142.01 142.01 2;3;4 6.9146E-218 146654 QUIQUE_C1277_190116_001 246.77 239.74 77273000000 3557500000 6354200000 5900700000 4644900000 5905300000 3546300000 8328700000 5516500000 7857800000 2815500000 8298800000 5708000000 8838700000 1668 267;275;3025 1553 15445;15446;15447;15448;15449;15450;15451;15452;15453;15454;15455;15456;15457;15458;15459;15460;15461;15462;15463;15464;15465;15466;15467;15468;15469;15470;15471;15472;15473;15474;15475 19816;19817;19818;19819;19820;19821;19822;19823;19824;19825;19826;19827;19828;19829;19830;19831;19832;19833;19834;19835;19836;19837;19838;19839;19840;19841;19842;19843;19844;19845;19846;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;19859;19860;19861;19862;19863;19864;19865;19866;19867;19868;19869;19870;19871;19872;19873;19874;19875;19876;19877;19878;19879;19880;19881;19882;19883;19884;19885;19886;19887 19822 71 AGTGLVAGEVVVDALPYFDQGYEAPGVR Acetyl (Protein N-term) 2891.4341 0.43413865 1668 O75934 BCAS2 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.62 173.62 3 3.9009E-65 177373 QUIQUE_DMIX8_190116_001 126.46 115.32 319730000 27401000 23607000 11269000 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A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 44.853 44.853 2;3 0.0018113 41445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.952 54.599 167450000 0 0 0 0 0 0 0 167450000 0 0 0 0 0 1671 404 1556 15499;15500;15501 19927;19928;19929 19927 2 AGTHILCIK Unmodified 1011.5535 0.55353569 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 24.703 24.703 2 0.011794 17845 QUIQUE_C1368_190116_001 72.23 46.058 241250000 0 0 44809000 73883000 0 0 0 0 0 0 82453000 40104000 0 1672 2026 1557 15502;15503;15504;15505 19930;19931;19932;19933 19930 4 AGTLSITEFADMLSGNAGGFR Unmodified 2114.0103 0.010253695 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 163.94 163.94 2;3 1.3661E-26 170965 QUIQUE_DMIX5_190116_001 195.94 173.71 3059500000 115800000 262350000 404050000 92735000 300830000 182320000 0 397580000 444480000 81194000 312380000 303100000 162720000 1673 3117 1558 15506;15507;15508;15509;15510;15511;15512;15513;15514;15515;15516;15517;15518;15519;15520;15521;15522;15523 19934;19935;19936;19937;19938;19939;19940;19941;19942;19943;19944;19945;19946;19947;19948;19949;19950;19951;19952;19953;19954;19955;19956;19957;19958;19959;19960;19961 19955 25 AGTLSITEFADMLSGNAGGFR Oxidation (M) 2130.0052 0.0051683175 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 148.39 148.39 2;3 6.6834E-19 152877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.97 99.851 348050000 0 0 0 0 0 0 39940000 59868000 117870000 0 58325000 42890000 29158000 1674 3117 1558 15524;15525;15526;15527;15528;15529;15530 19962;19963;19964;19965;19966;19967;19968;19969 19968 2555 7 AGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQAR Unmodified 2512.3497 0.34968074 13 A0A075B730;P58107 EPPK1 Epiplakin yes no 0 0 0 1 1 173.07 173.07 3 3.2504E-05 180319 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.323 46.326 108970000 0 0 0 0 0 0 0 0 34350000 0 74615000 0 0 1675 13 1559 15531;15532 19970;19971 19971 1 AGTPYTVTLHGEVR Unmodified 1499.7732 0.77324153 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P12814;G3V2N5;G3V5M4;G3V380 ACTN1 Alpha-actinin-1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 114.97 114.97 2;3 5.8191E-104 118679 QUIQUE_C1277_190116_001 222.81 184.18 817650000 88622000 157460000 55546000 85283000 212250000 52023000 36507000 65004000 0 0 0 0 64953000 1680 2047 1564 15588;15589;15590;15591;15592;15593;15594;15595;15596;15597;15598;15599;15600 20032;20033;20034;20035;20036;20037;20038;20039;20040;20041;20042;20043;20044;20045;20046 20036 12 AGTQLLAGLR Unmodified 998.58728 0.58727866 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.92 65.92 2 0.003914 65882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.53 60.177 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1681 1909 1565 15601;15602;15603;15604;15605;15606 20047;20048;20049;20050;20051;20052 20050 6 AGTYLPQSYLIHEHMVITDR Unmodified 2343.1682 0.16815132 509 A0A3B3IUC0;Q9Y287 ITM2B Integral membrane protein 2B;BRI2, membrane form;BRI2 intracellular domain;BRI2C, soluble form;Bri23 peptide yes no 0 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20200;20201;20202;20203;20204;20205 20202 3000 6 AGVNFSEFTGVWK Unmodified 1440.7038 0.70376498 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 129.48 129.48 2 0.00030615 133480 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.06 94.6 3554500000 280160000 273620000 250620000 188360000 283900000 249600000 293300000 232190000 360660000 104660000 401820000 317660000 317950000 1696 1623 1579 15738;15739;15740;15741;15742;15743;15744;15745;15746;15747;15748;15749;15750;15751;15752 20206;20207;20208;20209;20210;20211;20212;20213;20214;20215;20216;20217;20218;20219;20220;20221;20222;20223 20223 18 AGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVR Unmodified 2428.1477 0.14767515 1411 O00487;C9JW37 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 175.38 175.38 3 7.2061E-05 179539 QUIQUE_C1218_190116_001 55.127 48.174 155330000 4026100 5866900 3272800 0 0 0 19755000 12887000 33337000 0 50471000 25717000 0 1697 1411 1580 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20241;20242;20243;20244;20245;20246;20247;20248;20249;20250;20251;20252;20253;20254;20255;20256;20257 20255 12 AGVSVYGIVK Unmodified 991.57023 0.57023162 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.05 64.05 2 0.009734 64178 QUIQUE_C1218_190116_001 69.812 50.108 1107300000 122630000 143790000 0 0 118680000 0 0 151400000 163700000 100960000 156320000 149800000 0 1700 3835 1582 15782;15783;15784;15785;15786;15787;15788;15789 20258;20259;20260;20261;20262;20263;20264;20265;20266 20258 5 AGVTCIVLPAENKK Unmodified 1498.8177 0.81774888 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 47.767 47.767 3 0.032598 45942 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.338 15.761 62912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62912000 0 0 1701 1324 1583 15790 20267 20267 1 AGVVGPELHEQLLSAEK Unmodified 1775.9418 0.94176342 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.425 71.425 2;3 9.1464E-64 72018 QUIQUE_C1277_190116_001 229.9 184.07 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20317;20318;20319;20320;20321;20322;20323 20318 5 AGWLDSELNMFTHQYLQPSR Unmodified 2392.127 0.12701479 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.37 154.37 3 4.9565E-10 159348 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.18 94.248 137100000 0 24822000 0 0 0 0 0 0 37073000 0 39394000 35814000 0 1704 1705 1586 15824;15825;15826;15827;15828 20324;20325;20326;20327;20328 20326 5 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2774.2316 0.23161579 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.73 163.73 3 1.514E-17 165656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.366 97.022 768310000 74765000 84770000 77415000 66898000 93656000 63659000 77289000 34900000 35121000 0 65133000 41378000 53325000 + 1705 1926 1587 15829;15830;15831;15832;15833;15834;15835;15836;15837;15838;15839;15840 20329;20330;20331;20332;20333;20334;20335;20336;20337;20338;20339;20340 20336 1152 12 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYK Acetyl (Protein N-term) 2758.2367 0.23670117 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 172.12 172.12 2;3 1.165E-98 176381 QUIQUE_DMIX3_190116_001 234.67 217.18 3370800000 0 414750000 0 170720000 336680000 245440000 278560000 272790000 365320000 43020000 621870000 327100000 294510000 + 1706 1926 1587 15841;15842;15843;15844;15845;15846;15847;15848;15849;15850;15851;15852;15853;15854;15855;15856 20341;20342;20343;20344;20345;20346;20347;20348;20349;20350;20351;20352;20353;20354;20355;20356;20357;20358;20359 20353 19 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGK Acetyl (Protein N-term) 3952.84 0.84002383 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 0 1 1 169.37 169.37 3 2.183E-23 171170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.36 78.591 32343000 0 0 0 0 0 0 0 32343000 0 0 0 0 0 + 1707 1926 1588 15857 20360 20360 1 AGWQSYVDNLMCDGCCQEAAIVGYCDAK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3298.3134 0.31338964 1099;2367 G5E9Q6;C9JQ45;C9J2N0;C9J5V8;F2Z3G0;P35080 PFN2 Profilin;Profilin-2 no no 1 1 0 1 163.86 163.86 3 0.00012436 165815 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20368;20369;20370;20371;20372;20373;20374;20375;20376;20377;20378;20379;20380;20381;20382;20383 20369 16 AGYAGEDCPK Unmodified 1066.439 0.43895945 1686;1771 O94805;O96019;H7C5S0 ACTL6B;ACTL6A Actin-like protein 6B;Actin-like protein 6A no no 0 0 0 1 1 1 15.547 15.547 2 0.012136 7267 QUIQUE_C1563_190116_001 66.299 49.523 83112000 0 40219000 0 25390000 0 17503000 0 0 0 0 0 0 0 1711 1686;1771 1591 15877;15878;15879 20384;20385;20386 20386 3 AGYAHFLNVQGR Unmodified 1331.6735 0.67346791 3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 55.083 55.083 3 0.026024 53210 QUIQUE_C1277_190116_001 29.39 17.332 64124000 0 64124000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1712 3310 1592 15880 20387 20387 1 AGYIIPLQGPGLTTTESR Unmodified 1872.9945 0.99452728 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.76 110.76 2 4.649E-07 114035 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.65 88.438 1155600000 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Unmodified 1548.8586 0.85855107 3346 Q63ZY3;K7EIU4 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.83 145.83 2 0.0016503 150188 QUIQUE_C1403_190116_001 68.44 54.021 175090000 17577000 18935000 0 21506000 30122000 14315000 0 0 22724000 0 27776000 22130000 0 1716 3346 1596 15900;15901;15902;15903;15904;15905;15906;15907 20409;20410;20411;20412;20413;20414;20415;20416;20417 20412 9 AGYTDKVVIGMDVAASEFFR Unmodified 2175.067 0.067040293 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 1 10 1 2 2 152.71 152.71 3 7.3682E-24 151461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.04 121.62 706800000 0 0 0 0 0 0 0 621280000 0 0 0 63677000 21848000 1717 1906 1597 15908;15909;15910;15911;15912;15913;15914;15915;15916;15917;15918;15919;15920;15921;15922 20418;20419;20420;20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;20433;20434 20419 16 AGYVGLVTVPVATLAGR Unmodified 1642.9406 0.94064121 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.07 128.07 2 0.0017133 133651 QUIQUE_C1218_190116_001 76.533 60.396 538030000 75248000 74582000 40745000 65792000 0 49182000 71684000 0 33891000 19193000 42359000 65352000 0 1718 135 1598 15923;15924;15925;15926;15927;15928;15929;15930;15931;15932 20435;20436;20437;20438;20439;20440;20441;20442;20443;20444;20445 20435 11 AHAAQVTCVAASPHK Unmodified 1546.7674 0.76744465 3991 Q9BQA1;H0Y711 WDR77 Methylosome protein 50 yes no 0 0 0 2 2 4 2 2 1 1 2 2 1 2 10.752 10.752 2;3;4 1.8421E-54 2711 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.24 150.53 863030000 40339000 0 150560000 93563000 120480000 0 117440000 34503000 44123000 19993000 71730000 64245000 106060000 1719 3991 1599 15933;15934;15935;15936;15937;15938;15939;15940;15941;15942;15943;15944;15945;15946;15947;15948;15949;15950;15951;15952;15953 20446;20447;20448;20449;20450;20451;20452;20453;20454;20455;20456;20457;20458;20459;20460;20461;20462;20463;20464;20465;20466;20467;20468;20469 20465 23 AHAASVFLTLLHFDSPPIPHVPHR Unmodified 2658.4183 0.41830985 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1;I3L120;A0A0J9YXU4 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 119.72 119.72 4;5 5.0561E-12 123722 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.968 87.699 91919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91919000 0 1720 1283 1600 15954;15955 20470;20471 20471 2 AHADDELAALR Unmodified 1180.5836 0.58364985 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 39.381 39.381 2;3 0.0009083 35279 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.111 64.902 1229300000 0 62646000 267990000 0 39230000 56722000 177400000 0 177680000 36572000 163560000 56292000 191200000 1721 2515 1601 15956;15957;15958;15959;15960;15961;15962;15963;15964;15965;15966;15967;15968;15969 20472;20473;20474;20475;20476;20477;20478;20479;20480;20481;20482;20483;20484;20485;20486;20487;20488;20489 20488 14 AHAMAQVDAWK Oxidation (M) 1242.5815 0.58154136 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 20.385 20.385 2 5.0398E-05 13110 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 115.41 394180000 0 0 56021000 0 50367000 0 0 83023000 60713000 43048000 54534000 0 46471000 1722 98;3487 1602 15970;15971;15972;15973;15974;15975;15976 20490;20491;20492;20493;20494;20495;20496 20490 69 7 AHAMAQVDAWK Unmodified 1226.5866 0.58662674 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 2 33.97 33.97 2;3 0.0042427 29535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.732 81.51 183860000 0 0 0 0 0 59220000 0 124640000 0 0 0 0 0 1723 98;3487 1602 15977;15978;15979 20497;20498;20499 20498 3 AHCQTSGWSLTEQDPYNNIVR Unmodified 2475.1237 0.12372032 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.329 90.329 3 1.0849E-07 92455 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.64 84.188 636940000 66877000 50596000 77707000 42515000 58080000 49856000 54678000 50218000 61850000 0 89685000 0 34879000 1724 2191 1603 15980;15981;15982;15983;15984;15985;15986;15987;15988;15989;15990 20500;20501;20502;20503;20504;20505;20506;20507;20508;20509;20510;20511 20509 12 AHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDK Unmodified 2584.2194 0.21939485 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 3 3 4 3 3 3 2 3 3 3 3 3 3 105.55 105.55 2;3;4 2.3847E-142 107837 QUIQUE_DMIX1_190116_001 247.46 222.53 16840000000 1246300000 1285900000 1663800000 1483900000 1209300000 1246700000 1294800000 1125100000 1382500000 650430000 1474200000 1215100000 1561900000 1725 1609 1604 15991;15992;15993;15994;15995;15996;15997;15998;15999;16000;16001;16002;16003;16004;16005;16006;16007;16008;16009;16010;16011;16012;16013;16014;16015;16016;16017;16018;16019;16020;16021;16022;16023;16024;16025;16026;16027;16028;16029 20512;20513;20514;20515;20516;20517;20518;20519;20520;20521;20522;20523;20524;20525;20526;20527;20528;20529;20530;20531;20532;20533;20534;20535;20536;20537;20538;20539;20540;20541;20542;20543;20544;20545;20546;20547;20548;20549;20550;20551;20552;20553;20554;20555;20556;20557;20558;20559;20560;20561;20562;20563;20564;20565;20566;20567;20568;20569;20570;20571;20572;20573;20574;20575;20576;20577 20553 66 AHEACGPMEIDSALNTVQTLK Unmodified 2284.0828 0.082766711 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 106.95 106.95 3 0.0018571 109626 QUIQUE_C1403_190116_001 27.52 24.679 73186000 0 0 0 35585000 0 37601000 0 0 0 0 0 0 0 1726 4606 1605 16030;16031 20578;20579 20578 2 AHEEQLKEAQAVPATLPELEATK Unmodified 2502.2966 0.29658254 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 77.72 77.72 3;4 5.1803E-05 77916 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.152 44.719 298960000 0 0 0 0 0 0 0 261720000 0 0 0 37237000 0 1727 3117 1606 16032;16033;16034 20580;20581;20582 20581 2 AHEHIFGMVLMNDWSAR Unmodified 2012.9349 0.93492068 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 109.25 109.25 4 0.00064645 113214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.382 39.458 20873000 0 0 0 0 0 0 0 0 20873000 0 0 0 0 1728 2114 1607 16035 20583 20583 1 AHEILPNLVCCSAK Unmodified 1610.7909 0.79088221 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 63.287 63.287 2;3 0.00033439 61740 QUIQUE_C1563_190116_001 101.47 87.048 155500000 0 71205000 47905000 0 0 36388000 0 0 0 0 0 0 0 1729 2572 1608 16036;16037;16038;16039;16040;16041 20584;20585;20586;20587;20588;20589 20588 6 AHELKEHNGHITGIDWAPK Unmodified 2152.0814 0.081385224 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 1 1 37.329 37.329 4 0.0037044 33181 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.347 37.66 46545000 0 0 0 0 0 0 0 46545000 0 0 0 0 0 1730 369;3752 1609 16042 20590 20590 1 AHEQALAELTK Unmodified 1209.6354 0.63535107 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 29.032 29.032 2 0.00047493 24018 QUIQUE_C1218_190116_001 102.05 72.961 103310000 21716000 29143000 0 0 0 0 0 0 24906000 0 0 27543000 0 1731 3142 1610 16043;16044;16045;16046;16047 20591;20592;20593;20594;20595 20591 5 AHETAFLSWFR Unmodified 1363.6673 0.6673199 4317 Q9NX00 TMEM160 Transmembrane protein 160 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 110.5 110.5 3 0.00052869 114088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.261 69.684 18792000 0 0 0 8098200 0 0 0 0 10694000 0 0 0 0 1732 4317 1611 16048;16049;16050;16051;16052 20596;20597;20598;20599;20600 20600 5 AHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSR Unmodified 3452.5633 0.56327212 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 4 3 2 1 3 5 3 104.09 104.09 4;5;6;7 4.4255E-14 108151 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.13 69.225 4847500000 55354000 233730000 269400000 238930000 0 113030000 485850000 429280000 691870000 98556000 936640000 447390000 847430000 1733 3110 1612 16053;16054;16055;16056;16057;16058;16059;16060;16061;16062;16063;16064;16065;16066;16067;16068;16069;16070;16071;16072;16073;16074;16075;16076;16077;16078;16079;16080;16081;16082 20601;20602;20603;20604;20605;20606;20607;20608;20609;20610;20611;20612;20613;20614;20615;20616;20617;20618;20619;20620;20621;20622;20623;20624;20625;20626;20627;20628;20629;20630;20631 20621 20 AHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSR Oxidation (M) 3468.5582 0.55818674 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 1 0 1 1 1 91.713 91.713 4 4.145E-06 93460 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.971 51.065 183790000 0 0 0 0 0 0 0 35574000 0 0 0 56435000 91781000 1734 3110 1612 16083;16084;16085 20632;20633;20634 20633 2551 3 AHFPAALGHILIK Unmodified 1386.8136 0.81359021 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.551 72.551 3 0.0001424 72819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.653 80.601 280680000 23310000 34224000 0 20708000 22025000 0 19784000 28066000 30534000 0 34463000 39965000 27601000 1735 4080 1613 16086;16087;16088;16089;16090;16091;16092;16093;16094;16095 20635;20636;20637;20638;20639;20640;20641;20642;20643;20644 20641 10 AHFPLDVQWNDLDYMDSR Unmodified 2220.9899 0.9898526 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 136.29 136.29 3 4.0817E-05 132951 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.942 68.101 100400000 0 34320000 0 0 0 0 0 0 0 11497000 54578000 0 0 1736 1993 1614 16096;16097;16098 20645;20646;20647 20646 3 AHFQNFPNGVTDFIK Unmodified 1733.8526 0.85255449 3772 Q92973;E7EW37 TNPO1 Transportin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 98.697 98.697 3 0.0027192 103120 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.69 33.776 72033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21892000 29803000 20338000 1737 3772 1615 16099;16100;16101;16102 20648;20649;20650;20651;20652 20649 4 AHGFTFTR Unmodified 935.46135 0.46134987 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPT9;Q5JPU1 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.113 25.113 2 0.0036666 18046 QUIQUE_DMIX8_190116_001 125.25 110.84 2655100000 218860000 0 242960000 0 0 235840000 309790000 230740000 311800000 0 436630000 186670000 481780000 1738 1943 1616 16103;16104;16105;16106;16107;16108;16109;16110;16111 20653;20654;20655;20656;20657;20658;20659;20660;20661 20661 6 AHGGYSVFAGVGER Unmodified 1405.6739 0.67386184 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 4 4 7 2 2 2 5 5 5 4 6 3 6 51.615 51.615 2;3 2.166E-28 48656 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.3 160.66 27922000000 2249500000 2129100000 2506300000 1526100000 1130300000 1645700000 2243900000 2413500000 2461400000 1216100000 3342100000 1974600000 3083000000 1739 1900;1046 1617 16112;16113;16114;16115;16116;16117;16118;16119;16120;16121;16122;16123;16124;16125;16126;16127;16128;16129;16130;16131;16132;16133;16134;16135;16136;16137;16138;16139;16140;16141;16142;16143;16144;16145;16146;16147;16148;16149;16150;16151;16152;16153;16154;16155;16156;16157;16158;16159;16160;16161;16162;16163;16164;16165;16166 20662;20663;20664;20665;20666;20667;20668;20669;20670;20671;20672;20673;20674;20675;20676;20677;20678;20679;20680;20681;20682;20683;20684;20685;20686;20687;20688;20689;20690;20691;20692;20693;20694;20695;20696;20697;20698;20699;20700;20701;20702;20703;20704;20705;20706;20707;20708;20709;20710;20711;20712;20713;20714;20715;20716;20717;20718;20719;20720;20721;20722;20723;20724;20725;20726;20727;20728;20729;20730;20731;20732;20733;20734;20735;20736 20709 67 AHGIPSQGK Acetyl (Protein N-term) 935.48248 0.48247924 3157 Q15777;F2Z346;E9PQW8 MPPED2 Metallophosphoesterase MPPED2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 17.524 17.524 2 0.0037497 9606 QUIQUE_C1563_190116_001 81.215 60.061 80073000 22660000 18823000 0 16060000 0 22529000 0 0 0 0 0 0 0 1740 3157 1618 16167;16168;16169;16170;16171;16172 20737;20738;20739;20740;20741;20742 20740 6 AHGLEVEPSALEQGFR Unmodified 1738.8638 0.86384745 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 83.878 83.878 2;3 5.1398E-07 86534 QUIQUE_C1438_190116_001 144.57 109.68 1175200000 37572000 73254000 133770000 21974000 101930000 79531000 104340000 92731000 118690000 36934000 140370000 89991000 144110000 1741 4012 1619 16173;16174;16175;16176;16177;16178;16179;16180;16181;16182;16183;16184;16185;16186;16187;16188;16189;16190;16191;16192;16193;16194;16195 20743;20744;20745;20746;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754;20755;20756;20757;20758;20759;20760;20761;20762;20763;20764;20765;20766;20767 20750 25 AHGLLAEENR Unmodified 1108.5625 0.56252048 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 17.547 17.547 3 0.013518 9917 QUIQUE_C1403_190116_001 38.75 26.514 11302000 0 0 0 11302000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1742 3091 1620 16196 20768 20768 1 AHGPGLEGGLVGKPAEFTIDTK Unmodified 2193.143 0.14298243 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 76.839 76.839 3;4 9.9668E-06 77567 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.501 55.731 250740000 0 0 0 0 0 0 0 46073000 46116000 0 60175000 41403000 56974000 1743 1628 1621 16197;16198;16199;16200;16201 20769;20770;20771;20772;20773;20774;20775 20774 6 AHGQDLGTAGSCLR Unmodified 1441.6732 0.67320991 494 A0A3B3ISV3;P02462;P29400 COL4A1;COL4A5 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten;Collagen alpha-5(IV) chain yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 23.576 23.576 2;3 6.6022E-101 16500 QUIQUE_C1368_190116_001 229 197.58 6075700000 387990000 740530000 737520000 130090000 841100000 100080000 252800000 258710000 562390000 147690000 810030000 573860000 532860000 1744 494 1622 16202;16203;16204;16205;16206;16207;16208;16209;16210;16211;16212;16213;16214;16215;16216;16217;16218;16219;16220;16221;16222;16223 20776;20777;20778;20779;20780;20781;20782;20783;20784;20785;20786;20787;20788;20789;20790;20791;20792;20793;20794;20795;20796;20797 20779 15 AHGQDLGTAGSCLRK Unmodified 1569.7682 0.76817293 494 A0A3B3ISV3;P02462 COL4A1 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten yes no 0 0 1 1 17.897 17.897 3 8.5095E-05 10632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.231 54.878 29329000 0 0 0 0 0 0 0 29329000 0 0 0 0 0 1745 494 1623 16224 20798 20798 1 AHHPTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVR Unmodified 3206.4865 0.48646159 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 1 2 3 2 2 1 1 2 59.516 59.516 3;4;5 1.7848E-54 58526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.63 131.14 2325400000 219280000 167070000 224030000 254670000 213690000 56537000 281940000 220780000 178350000 137620000 108850000 75929000 186610000 1746 1436 1624 16225;16226;16227;16228;16229;16230;16231;16232;16233;16234;16235;16236;16237;16238;16239;16240;16241;16242;16243;16244;16245;16246;16247;16248;16249 20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;20808;20809;20810;20811;20812;20813;20814;20815;20816;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825 20817 22 AHIAQLCEK Unmodified 1068.5386 0.53861391 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 2 15.278 15.278 2;3 0.00037878 7601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 135 108.61 479280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 479280000 0 0 0 1747 50;2631 1625 16250;16251 20826;20827 20826 1 AHITLGCAADVEAVQTGLDLLEILR Unmodified 2677.4109 0.41090079 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 3 4 3 2 1 4 2 4 8 1 1 169.1 169.1 2;3;4 1.5621E-264 170609 QUIQUE_DMIX1_190116_001 323.54 312.27 18033000000 870820000 1250800000 0 564700000 224040000 1206900000 3248700000 2029200000 2852300000 0 5567600000 82128000 135590000 1748 1969 1626 16252;16253;16254;16255;16256;16257;16258;16259;16260;16261;16262;16263;16264;16265;16266;16267;16268;16269;16270;16271;16272;16273;16274;16275;16276;16277;16278;16279;16280;16281;16282;16283;16284 20828;20829;20830;20831;20832;20833;20834;20835;20836;20837;20838;20839;20840;20841;20842;20843;20844;20845;20846;20847;20848;20849;20850;20851;20852;20853;20854;20855;20856;20857;20858;20859;20860;20861 20846 24 AHIVFDFHQAADGIQEQQR Unmodified 2209.0665 0.066463441 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80 80 3 4.1998E-05 80633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.975 72.325 344980000 58043000 47728000 0 50465000 0 0 0 43859000 36044000 12964000 0 39194000 56687000 1749 2320 1627 16285;16286;16287;16288;16289;16290;16291;16292 20862;20863;20864;20865;20866;20867;20868;20869 20865 8 AHLALIDYLTQK Unmodified 1384.7715 0.77145062 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 107.7 107.7 3 0.033625 111011 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O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 46.253 46.253 2 0.03013 44148 QUIQUE_C1218_190116_001 90.939 67.902 77414000 40728000 0 0 0 0 0 36686000 0 0 0 0 0 0 1753 4192 1631 16305;16306 20882;20883 20882 2 AHLLAAALGPAGER Unmodified 1345.7466 0.74663285 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 3 2 1 5 3 2 2 3 3 52.79 52.79 2;3 5.0274E-12 51104 QUIQUE_C1438_190116_001 136.96 116.63 4712100000 390210000 561270000 398660000 363770000 347490000 242000000 143920000 423610000 494180000 254510000 383330000 306610000 402590000 1754 1688 1632 16307;16308;16309;16310;16311;16312;16313;16314;16315;16316;16317;16318;16319;16320;16321;16322;16323;16324;16325;16326;16327;16328;16329;16330;16331;16332;16333;16334;16335;16336;16337;16338;16339 20884;20885;20886;20887;20888;20889;20890;20891;20892;20893;20894;20895;20896;20897;20898;20899;20900;20901;20902;20903;20904;20905;20906;20907;20908;20909;20910;20911;20912;20913;20914;20915;20916;20917;20918;20919;20920;20921;20922;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929;20930 20901 41 AHLLADMAHISGLVAAK Unmodified 1716.9345 0.93450998 2360 P34897;G3V2Y4;H0YIZ0;G3V4W5 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 96.934 96.934 3;4 0.0040262 98918 QUIQUE_C1368_190116_001 45.614 38.152 48352000 0 0 13863000 0 0 0 11618000 0 0 22871000 0 0 0 1755 2360 1633 16340;16341;16342 20931;20932;20933;20934 20931 3 AHLLAEVIENLECDPR Unmodified 1877.9305 0.93054681 3818 Q96C86;A0A3B3ITF0 DCPS m7GpppX diphosphatase yes no 0 0 0 1 129.22 129.22 3 0.048092 135755 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.939 19.775 32800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32800000 0 0 1756 3818 1634 16343 20935 20935 0 AHLLSLVDVMQR Unmodified 1380.7548 0.7547547 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 99.372 99.372 3 0.0064532 102182 QUIQUE_C1277_190116_001 51.998 44.796 16906000 0 16906000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1757 1861 1635 16344 20936 20936 0 AHLPLDINFR Unmodified 1194.6509 0.65094155 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.729 82.729 3 0.00073328 84272 QUIQUE_C1368_190116_001 75.378 22.8 113590000 0 15705000 17352000 0 32500000 0 0 10785000 10792000 0 0 11245000 15212000 1758 130 1636 16345;16346;16347;16348;16349;16350;16351;16352;16353;16354;16355 20937;20938;20939;20940;20941;20942;20943;20944;20945;20946;20947;20948 20939 12 AHLQAEVQHLR Unmodified 1300.7 0.70001701 1511 O43166;F5GYF8 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.233 19.233 3 0.0044253 11944 QUIQUE_C1403_190116_001 41.338 28.46 164770000 0 0 37381000 53506000 0 0 0 0 29321000 0 44559000 0 0 1759 1511 1637 16356;16357;16358;16359 20949;20950;20951;20952 20950 4 AHLTVGQAAAGGSGNLLTER Unmodified 1921.997 0.99698689 3980 Q99959 PKP2 Plakophilin-2 yes yes 0 0 0 1 60.433 60.433 3 0.00029343 59089 QUIQUE_C1403_190116_001 59.792 49.871 35390000 0 0 0 35390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1760 3980 1638 16360 20953 20953 1 AHLVAVFNEYQR Unmodified 1445.7415 0.74154747 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 3 1 2 61.477 61.477 2;3 5.3728E-07 61038 QUIQUE_C1576_190116_001 117.67 96.042 1558800000 91389000 103160000 109300000 162310000 97659000 99049000 223710000 0 173400000 100200000 161430000 117420000 119820000 1761 2574 1639 16361;16362;16363;16364;16365;16366;16367;16368;16369;16370;16371;16372;16373;16374;16375;16376;16377;16378 20954;20955;20956;20957;20958;20959;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972;20973;20974;20975;20976;20977;20978;20979;20980;20981;20982 20969 29 AHMGMFTELAILYSK 2 Oxidation (M) 1742.8372 0.8371637 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;A0A087WV74;P53675;A0A087WXH4 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 2 0 3 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 95.087 95.087 2;3 6.7124E-06 97589 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.273 86.638 1178600000 108550000 82196000 0 48726000 108470000 59699000 110380000 134620000 85058000 98446000 148500000 112690000 81235000 1762 50;2631 1640 16379;16380;16381;16382;16383;16384;16385;16386;16387;16388;16389;16390;16391;16392;16393;16394;16395;16396;16397;16398 20983;20984;20985;20986;20987;20988;20989;20990;20991;20992;20993;20994;20995;20996;20997;20998;20999;21000;21001;21002;21003 20994 24;25 18 AHMGMFTELAILYSK Oxidation (M) 1726.8422 0.84224908 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;A0A087WV74;P53675;A0A087WXH4 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 1 0 4 3 4 3 3 3 3 4 2 2 3 3 3 111.81 111.81 2;3 2.1237E-06 121417 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.99 102.24 1782800000 97521000 179450000 168680000 79230000 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1764 50;2631 1640 16439;16440;16441;16442;16443;16444;16445;16446;16447;16448;16449 21048;21049;21050;21051;21052;21053;21054;21055;21056;21057;21058;21059;21060;21061;21062;21063 21061 15 AHMLIDMHFR Unmodified 1269.6111 0.61106735 561 R9WNI0;A8MQB8;G3V0J0;Q06787;Q8IXW7;A0A087WXI3;A0A087WY29 FMR1 Fragile X mental retardation protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61 61 3 0.0054355 60038 QUIQUE_C1368_190116_001 50.108 43.089 48311000 0 0 19830000 14004000 0 0 14477000 0 0 0 0 0 0 1765 561 1641 16450;16451;16452;16453;16454 21064;21065;21066;21067;21068 21064 5 AHNQDLGLAGSCLAR Unmodified 1581.7682 0.76817293 1946 P08572;A0A3B3IS47 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 45.669 45.669 2;3 1.2426E-08 42709 QUIQUE_C1277_190116_001 151.68 124.56 3714600000 301260000 449870000 359890000 193510000 319480000 192120000 124180000 244300000 349500000 124210000 445310000 293390000 317620000 1766 1946 1642 16455;16456;16457;16458;16459;16460;16461;16462;16463;16464;16465;16466;16467;16468;16469;16470;16471;16472;16473;16474;16475;16476;16477;16478;16479 21069;21070;21071;21072;21073;21074;21075;21076;21077;21078;21079;21080;21081;21082;21083;21084;21085;21086;21087;21088;21089;21090;21091;21092;21093;21094;21095;21096 21073 28 AHPASNAIDGTER Unmodified 1337.6324 0.63239096 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 12.76 12.76 3 0.0072143 4889 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.613 23.897 24587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24587000 0 1767 1492 1643 16480 21097 21097 1 AHPVFYQGTYSQALNDAK Unmodified 2008.9643 0.96428978 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.694 70.694 3 0.00016068 72253 QUIQUE_C1218_190116_001 45.157 38.21 427340000 58625000 56679000 59659000 0 59230000 38863000 56573000 0 0 0 41037000 0 56677000 1768 3822 1644 16481;16482;16483;16484;16485;16486;16487;16488 21098;21099;21100;21101;21102;21103;21104;21105;21106;21107 21098 9 AHPVFYQGTYSQALNDAKR Unmodified 2165.0654 0.065400809 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 60.287 60.287 3 6.2227E-05 59884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.645 58.826 71714000 0 0 0 0 0 0 0 31148000 0 0 40565000 0 0 1769 3822 1645 16489;16490 21108;21109 21108 2 AHQANQLYPFAISLIESVR Unmodified 2156.1378 0.13783747 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 147.35 147.35 2;3 4.5484E-23 152513 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.45 128.63 758960000 0 18567000 89552000 0 59309000 0 43237000 90457000 151180000 28590000 100320000 105350000 72398000 1770 3053 1646 16491;16492;16493;16494;16495;16496;16497;16498;16499;16500;16501;16502;16503;16504 21110;21111;21112;21113;21114;21115;21116;21117;21118;21119;21120;21121;21122;21123;21124;21125;21126;21127;21128;21129;21130 21120 18 AHQITDESLESTRR Unmodified 1641.8071 0.80706086 1177 H3BNE1;H3BR18;H3BM38;H3BPJ0;O00161;H3BNG6;H3BU94 SNAP23 Synaptosomal-associated protein;Synaptosomal-associated protein 23 yes no 0 0 1 1 19.848 19.848 3 0.0020001 12970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.112 37.006 27567000 0 0 0 0 0 0 0 27567000 0 0 0 0 0 1771 1177 1647 16505 21131 21131 1 AHQLVMEGYNWCHDR Unmodified 1914.8254 0.82537023 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 2 2 3 3 3 3 3 2 2 1 3 3 3 55.395 55.395 2;3;4 6.6089E-66 53210 QUIQUE_C1368_190116_001 202.44 168.48 7304200000 282910000 347670000 695980000 810180000 601470000 661000000 802490000 417030000 371620000 124170000 865460000 712030000 612190000 1772 2758;2789 1648 16506;16507;16508;16509;16510;16511;16512;16513;16514;16515;16516;16517;16518;16519;16520;16521;16522;16523;16524;16525;16526;16527;16528;16529;16530;16531;16532;16533;16534;16535;16536;16537;16538 21132;21133;21134;21135;21136;21137;21138;21139;21140;21141;21142;21143;21144;21145;21146;21147;21148;21149;21150;21151;21152;21153;21154;21155;21156;21157;21158;21159;21160;21161;21162;21163;21164;21165;21166;21167;21168;21169 21140 35 AHQLVMEGYNWCHDR Oxidation (M) 1930.8203 0.82028486 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.249 41.249 3 3.8171E-06 35813 QUIQUE_C1368_190116_001 96.208 71.92 531500000 45654000 91661000 211610000 0 53524000 52680000 0 39229000 0 37151000 0 0 0 1773 2758;2789 1648 16539;16540;16541;16542;16543;16544;16545;16546;16547;16548 21170;21171;21172;21173;21174;21175;21176;21177;21178;21179 21172 2182 8 AHQLWLSVEALK Unmodified 1393.7718 0.77178497 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.242 90.242 2;3 1.936E-09 92234 QUIQUE_C1277_190116_001 150.46 122.71 586120000 124160000 112020000 60048000 48532000 48807000 49389000 47062000 24132000 39350000 0 0 32608000 0 1774 693;3205 1649 16549;16550;16551;16552;16553;16554;16555;16556;16557;16558;16559;16560;16561 21180;21181;21182;21183;21184;21185;21186;21187;21188;21189;21190;21191;21192;21193;21194 21183 15 AHQNTLEVYPPFLFFLAVGGVYHPR Unmodified 2871.4861 0.48605506 1453 Q5VV89;O14880;Q5VV87 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 0 0 2 1 2 2 3 2 163.18 163.18 3;4 6.311E-37 169875 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.23 128.58 958770000 0 0 0 0 0 0 70991000 40688000 186060000 0 247030000 358650000 55355000 1775 1453 1650 16562;16563;16564;16565;16566;16567;16568;16569;16570;16571;16572;16573 21195;21196;21197;21198;21199;21200;21201;21202;21203;21204;21205;21206;21207;21208;21209;21210;21211;21212 21203 15 AHQTGIHATEELK Acetyl (Protein N-term) 1475.7369 0.73685603 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 1 0 0 2 1 1 1 26.785 26.785 2;3 0.0021241 19762 QUIQUE_C1563_190116_001 70.345 54.338 69202000 69202000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1776 3365 1651 16574;16575;16576;16577;16578 21213;21214;21215;21216;21217 21217 4 AHQTGIHATEELKEFFAK Acetyl (Protein N-term) 2098.0484 0.048353761 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 1 0 1 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 2 1 2 94.565 94.565 3;4 4.1945E-23 97025 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.88 133.71 1875000000 129670000 127880000 102540000 68895000 141440000 133000000 158970000 220250000 148960000 29244000 291820000 96947000 225420000 1777 3365 1652 16579;16580;16581;16582;16583;16584;16585;16586;16587;16588;16589;16590;16591;16592;16593;16594;16595;16596;16597;16598;16599;16600;16601;16602 21218;21219;21220;21221;21222;21223;21224;21225;21226;21227;21228;21229;21230;21231;21232;21233;21234;21235;21236;21237;21238;21239;21240;21241;21242;21243;21244;21245 21238 22 AHQVVEDGYEFFAK Unmodified 1638.7678 0.7678218 2740;2739;1041 P62140;F8VYE8;P36873;F8W0W8;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 80.788 80.788 2;3 7.1478E-72 83427 QUIQUE_C1218_190116_001 211.67 199.45 9710300000 818960000 946340000 827580000 682670000 703880000 673450000 787930000 588360000 609140000 284250000 973420000 771360000 1043000000 1778 2740;1041;2739 1653 16603;16604;16605;16606;16607;16608;16609;16610;16611;16612;16613;16614;16615;16616;16617;16618;16619;16620;16621;16622;16623;16624;16625;16626;16627;16628;16629 21246;21247;21248;21249;21250;21251;21252;21253;21254;21255;21256;21257;21258;21259;21260;21261;21262;21263;21264;21265;21266;21267;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;21277;21278;21279;21280;21281;21282;21283;21284;21285;21286;21287;21288 21247 43 AHSDGGDGVVSQVK Unmodified 1354.6477 0.64770667 2948 Q12860;H0YIJ1 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 15.777 15.777 2;3 1.944E-117 7847 QUIQUE_C1368_190116_001 242.45 200.16 7945900000 689930000 724880000 792940000 778080000 704040000 438540000 878380000 201700000 567820000 276210000 688490000 594370000 610540000 1779 2948 1654 16630;16631;16632;16633;16634;16635;16636;16637;16638;16639;16640;16641;16642;16643;16644;16645;16646;16647;16648;16649;16650;16651;16652;16653;16654 21289;21290;21291;21292;21293;21294;21295;21296;21297;21298;21299;21300;21301;21302;21303;21304;21305;21306;21307;21308;21309;21310;21311;21312;21313;21314;21315 21294 26 AHSLLPVDDAINGLSEEQR Unmodified 2063.0283 0.028346601 192 A0A0A0MT83;P26440;A0A087WVD3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 99.876 99.876 3 0.0030463 103313 QUIQUE_C1368_190116_001 58.01 49.016 39651000 0 0 39651000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1780 192 1655 16655 21316 21316 0 AHSPVQSGLPGMQNLK Acetyl (Protein N-term) 1704.8617 0.86173896 622 B4DR80 STK24 yes yes 1 0 0 1 1 85.076 85.076 2 0.00012386 86772 QUIQUE_C1218_190116_001 87.641 30.685 593330000 498700000 0 0 0 0 0 0 94627000 0 0 0 0 0 1781 622 1656 16656;16657 21317;21318;21319 21318 3 AHSSMVGVNLPQK Oxidation (M) 1382.6976 0.69763375 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 22.805 22.805 2;3 4.0333E-65 17397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 213.25 174.95 7947800000 542490000 528290000 662010000 470350000 496830000 459140000 417570000 511050000 788700000 466890000 1002300000 699490000 902780000 1782 1790 1657 16658;16659;16660;16661;16662;16663;16664;16665;16666;16667;16668;16669;16670;16671;16672;16673;16674;16675;16676;16677;16678;16679;16680;16681;16682;16683;16684 21320;21321;21322;21323;21324;21325;21326;21327;21328;21329;21330;21331;21332;21333;21334;21335;21336;21337;21338;21339;21340;21341;21342;21343;21344;21345;21346;21347;21348;21349;21350;21351;21352;21353;21354;21355;21356 21342 1007 37 AHSSMVGVNLPQK Unmodified 1366.7027 0.70271913 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 34.978 34.978 2;3 6.0058E-139 31536 QUIQUE_C1218_190116_001 260.76 247.4 23362000000 1944100000 2274400000 1798900000 2194700000 1645400000 1811100000 1817400000 1745600000 1640900000 550270000 2547600000 1557200000 1834500000 1783 1790 1657 16685;16686;16687;16688;16689;16690;16691;16692;16693;16694;16695;16696;16697;16698;16699;16700;16701;16702;16703;16704;16705;16706;16707;16708;16709;16710 21357;21358;21359;21360;21361;21362;21363;21364;21365;21366;21367;21368;21369;21370;21371;21372;21373;21374;21375;21376;21377;21378;21379;21380;21381;21382;21383;21384;21385;21386;21387;21388;21389;21390;21391;21392;21393;21394;21395;21396;21397;21398;21399;21400;21401;21402;21403;21404 21358 48 AHSSPASLQLGAVSPGTLTPTGVVSGPAATPTAQHLR Unmodified 3533.859 0.85904343 2485 P46937 YAP1 Transcriptional coactivator YAP1 yes yes 0 0 0 1 97.93 97.93 4 0.00050474 100029 QUIQUE_C1403_190116_001 34.91 19.511 47979000 0 0 0 47979000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1784 2485 1658 16711 21405 21405 1 AHTDFFEAFK Unmodified 1211.5611 0.56112349 2717 P61201;B4DIH5;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.941 78.941 3 5.7359E-05 78720 QUIQUE_C1563_190116_001 101.65 88.055 761580000 76073000 60188000 61597000 54985000 55425000 69610000 67868000 48149000 56148000 31998000 49665000 63883000 65989000 1785 2717 1659 16712;16713;16714;16715;16716;16717;16718;16719;16720;16721;16722;16723;16724;16725 21406;21407;21408;21409;21410;21411;21412;21413;21414;21415;21416;21417;21418;21419;21420;21421 21413 15 AHTDSLNTLVALHQLYQYTQK Unmodified 2443.2496 0.24957276 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 116.14 116.14 3;4 1.3883E-08 120633 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.28 85.972 112330000 0 0 0 0 0 0 0 0 72941000 0 39394000 0 0 1786 1473 1660 16726;16727 21422;21423;21424 21423 3 AHTKDEAEQLAGK Unmodified 1396.6947 0.69465686 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 12.889 12.889 3 0.00039467 5176 QUIQUE_C1368_190116_001 88.163 74.762 137670000 0 0 12979000 0 0 0 0 33309000 0 0 9767600 46240000 35377000 1787 228 1661 16728;16729;16730;16731;16732 21425;21426;21427;21428;21429 21425 5 AHTMTDDVTFWK Oxidation (M) 1466.65 0.65001485 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KSQ2 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 56.951 56.951 2;3 8.5505E-28 56138 QUIQUE_C1438_190116_001 180.07 157.38 3549400000 224280000 191490000 164930000 160820000 162980000 99868000 138080000 207170000 241560000 198640000 700110000 419100000 640400000 1788 50 1662 16733;16734;16735;16736;16737;16738;16739;16740;16741;16742;16743;16744;16745;16746;16747;16748;16749;16750 21430;21431;21432;21433;21434;21435;21436;21437;21438;21439;21440;21441;21442;21443;21444;21445;21446;21447;21448;21449;21450;21451;21452;21453 21437 26 22 AHTMTDDVTFWK Unmodified 1450.6551 0.65510023 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KSQ2 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 78.103 78.103 2;3 1.9008E-09 79343 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.61 133.1 5810300000 652400000 756810000 624160000 629250000 177600000 208240000 681660000 381540000 115940000 149210000 548150000 395540000 489790000 1789 50 1662 16751;16752;16753;16754;16755;16756;16757;16758;16759;16760;16761;16762;16763;16764;16765;16766;16767;16768;16769;16770;16771;16772;16773;16774;16775 21454;21455;21456;21457;21458;21459;21460;21461;21462;21463;21464;21465;21466;21467;21468;21469;21470;21471;21472;21473;21474;21475;21476;21477;21478;21479;21480;21481;21482 21477 25 AHTSSTQLQEELEK Unmodified 1599.774 0.77402939 4670 Q9Y6Y8 SEC23IP SEC23-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 32.366 32.366 3 0.0026324 27574 QUIQUE_C1277_190116_001 56.939 47.093 100510000 0 35048000 0 0 32663000 0 0 0 0 0 0 0 32797000 1790 4670 1663 16776;16777;16778 21483;21484;21485;21486;21487 21484 5 AHVAHHPISDHEATLR Unmodified 1789.8972 0.89721327 278 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21533;21534;21535;21536;21537;21538;21539;21540;21541;21542;21543;21544;21545;21546 21546 2094 13 AHVIVMAATNRPNSIDPALRR Unmodified 2301.2488 0.24880168 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 2 2 1 47.997 47.997 3;4 0.00037256 45286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.125 54.197 145800000 0 0 0 0 0 0 0 115010000 0 0 0 30796000 0 1795 2658 1667 16830;16831;16832 21547;21548;21549;21550;21551 21548 5 AHVLAASVEQATENFLEK Unmodified 1955.9953 0.99525556 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0;E5RFM3 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 114.98 114.98 2;3 4.2682E-19 118984 QUIQUE_C1368_190116_001 146.96 133.98 904020000 66448000 78372000 96782000 157620000 0 95444000 63502000 64750000 82730000 0 94141000 54933000 49294000 1796 2369 1668 16833;16834;16835;16836;16837;16838;16839;16840;16841;16842;16843;16844;16845;16846;16847;16848 21552;21553;21554;21555;21556;21557;21558;21559;21560;21561;21562;21563;21564;21565;21566;21567;21568;21569;21570;21571 21556 18 AHVLAASVEQATQNFLEK Unmodified 1955.0112 0.011239973 2250 P26232;C9IZ88 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 108.08 108.08 2;3 1.0037E-64 112027 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.47 170.46 2872000000 148770000 253280000 266940000 223310000 229890000 225710000 291300000 111810000 188490000 126170000 240120000 299470000 266760000 1797 2250 1669 16849;16850;16851;16852;16853;16854;16855;16856;16857;16858;16859;16860;16861;16862;16863;16864;16865;16866;16867;16868;16869;16870;16871 21572;21573;21574;21575;21576;21577;21578;21579;21580;21581;21582;21583;21584;21585;21586;21587;21588;21589;21590;21591;21592;21593;21594;21595;21596;21597;21598;21599;21600;21601;21602;21603;21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611 21602 40 AHVLAQPEAISTIAQSLR Unmodified 1904.048 0.047959831 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 99.375 99.375 2;3 5.6801E-06 102493 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.39 98.621 249090000 0 0 0 36373000 32257000 0 0 0 0 23420000 57296000 45962000 53786000 1798 305 1670 16872;16873;16874;16875;16876;16877;16878;16879;16880 21612;21613;21614;21615;21616;21617;21618;21619;21620 21615 8 AHVLHFGK Unmodified 907.50282 0.50282075 4020 Q9BTE3 MCMBP Mini-chromosome maintenance complex-binding protein yes yes 0 0 0 2 1 130.14 130.14 2 0.045185 135975 QUIQUE_C1277_190116_001 77.72 15.005 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1799 4020 1671 16881;16882;16883 21621;21622;21623 21622 3 AHVLYFK Unmodified 876.48577 0.48577371 3486 Q86TV6;G3V3H1 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 1 28.966 28.966 2 0.027719 23092 QUIQUE_C1368_190116_001 92.785 51.577 67253000 0 26709000 19627000 0 0 0 0 0 0 0 0 20917000 0 1800 3486 1672 16884;16885;16886 21624;21625;21626 21625 3 AHVQEVAQHNLK Unmodified 1372.7211 0.72114638 3490 Q86UP2;G3V4Y7 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 10.649 10.649 2;3 7.4264E-38 3023 QUIQUE_C1403_190116_001 161.48 141.74 816170000 35166000 0 42623000 109040000 33002000 0 29223000 110720000 155180000 43280000 10674000 190340000 56933000 1801 3490 1673 16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;16896;16897;16898;16899;16900;16901 21627;21628;21629;21630;21631;21632;21633;21634;21635;21636;21637;21638;21639;21640;21641;21642 21629 16 AHVSFKPTVAQQR Unmodified 1467.7946 0.79464568 2153 Q5T985;P19823;Q5T987 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 1 1 1 1 19.225 19.225 3 0.018581 12016 QUIQUE_C1218_190116_001 40.767 21.271 116770000 33221000 59321000 0 0 0 0 0 0 0 24224000 0 0 0 1802 2153 1674 16902;16903;16904 21643;21644;21645 21643 3 AHVTGPVEDNAR Unmodified 1264.616 0.61601261 2593 P51805 PLXNA3 Plexin-A3 yes yes 0 0 0 1 13.036 13.036 3 0.0052493 5211 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.354 35.674 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1803 2593 1675 16905 21646 21646 1 AHYGGFTVQNEANK Unmodified 1534.7165 0.71645494 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.198 30.198 2;3 5.3147E-241 24963 QUIQUE_DMIX3_190116_001 294.01 272.55 6874600000 260410000 588880000 574710000 912220000 911170000 168560000 751170000 206830000 335840000 331760000 741870000 293290000 797850000 1804 1824 1676 16906;16907;16908;16909;16910;16911;16912;16913;16914;16915;16916;16917;16918;16919;16920;16921;16922;16923;16924;16925;16926;16927;16928;16929;16930 21647;21648;21649;21650;21651;21652;21653;21654;21655;21656;21657;21658;21659;21660;21661;21662;21663;21664;21665;21666;21667;21668;21669;21670;21671 21663 25 AHYGGFTVQNEANKYQISVNK Unmodified 2367.1608 0.16075776 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 1 1 1 65.477 65.477 3;4 9.4776E-07 65542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.448 61.999 118070000 0 0 0 0 0 0 0 36778000 0 0 0 0 81292000 1805 1824 1677 16931;16932 21672;21673 21672 2 AHYTHSDYQYSQR Unmodified 1654.7124 0.71243219 3980 Q99959 PKP2 Plakophilin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.288 14.288 3 1.9764E-07 6396 QUIQUE_C1403_190116_001 130.4 119.14 51826000 0 0 0 26705000 0 0 0 0 0 0 0 9048600 16072000 1806 3980 1678 16933;16934;16935 21674;21675;21676 21674 2 AIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSK Unmodified 3953.0098 0.009849575 1838 P02787;F8WCI6;C9JB55 TF Serotransferrin yes no 0 0 1 2 3 1 2 4 2 1 2 2 2 2 167.09 167.09 3;4 1.3575E-63 171161 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.03 105.34 2745600000 88363000 128350000 34317000 56273000 1171700000 0 152470000 116140000 231720000 0 235690000 302100000 228520000 1807 1838 1679 16936;16937;16938;16939;16940;16941;16942;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;16951;16952;16953;16954;16955;16956;16957;16958 21677;21678;21679;21680;21681;21682;21683;21684;21685;21686;21687;21688;21689;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;21699;21700;21701;21702 21701 26 AIADMLR Unmodified 788.42146 0.42145889 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 59.62 59.62 2 0.026322 59067 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.163 40.454 35404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35404000 1808 4600 1680 16959 21703 21703 1 AIADTGANVVVTGGK Unmodified 1371.7358 0.73579339 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.309 50.309 2 1.0048E-06 47284 QUIQUE_C1368_190116_001 117.86 82.415 4714000000 391350000 424420000 395320000 387030000 397430000 348430000 378740000 321190000 293790000 193980000 444760000 353840000 383760000 1809 2572 1681 16960;16961;16962;16963;16964;16965;16966;16967;16968;16969;16970;16971;16972 21704;21705;21706;21707;21708;21709;21710;21711;21712;21713;21714;21715;21716;21717;21718;21719;21720;21721;21722;21723;21724;21725;21726 21706 23 AIADWYNEK Unmodified 1108.5189 0.51892433 1992 P10155;H0Y9N5 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.021 67.021 2 0.015932 67562 QUIQUE_C1438_190116_001 66.457 54.816 244040000 68014000 0 0 0 52314000 64112000 59598000 0 0 0 0 0 0 1810 1992 1682 16973;16974;16975;16976 21727;21728;21729;21730 21728 4 AIAELGIYPAVDPLDSTSR Unmodified 1987.0262 0.026221336 1900 P06576;H0YH81 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.65 134.65 2;3 2.8657E-45 138911 QUIQUE_C1403_190116_001 183.79 160.56 62789000000 5188600000 4412700000 6053100000 3456000000 4160800000 4757500000 4718900000 4210800000 5951700000 2493900000 7054900000 5306600000 5023700000 1811 1900 1683 16977;16978;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;16986;16987;16988;16989;16990;16991;16992;16993;16994;16995;16996;16997;16998;16999;17000;17001;17002 21731;21732;21733;21734;21735;21736;21737;21738;21739;21740;21741;21742;21743;21744;21745;21746;21747;21748;21749;21750;21751;21752;21753;21754;21755;21756;21757;21758;21759;21760;21761;21762;21763;21764;21765;21766;21767;21768;21769;21770;21771;21772;21773;21774;21775;21776;21777;21778 21745 48 AIAFLQQPR Unmodified 1042.5924 0.59236404 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.096 68.096 2 2.7718E-05 67768 QUIQUE_C1368_190116_001 148.07 114.07 1587600000 128600000 116380000 155330000 116530000 129070000 94398000 117350000 154460000 134380000 39388000 151990000 106510000 143240000 1812 2194 1684 17003;17004;17005;17006;17007;17008;17009;17010;17011;17012;17013;17014;17015 21779;21780;21781;21782;21783;21784;21785;21786;21787;21788;21789;21790;21791;21792;21793;21794 21782 16 AIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYR Unmodified 2698.2697 0.26971586 2203 P22830;K7ELX4 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 120.01 120.01 3 0.00093575 124046 QUIQUE_C1368_190116_001 39.693 29.71 75612000 26739000 0 48873000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1813 2203 1685 17016;17017 21795;21796 21796 1 AIAGVINQPYYNYEAGPDAVLGR Unmodified 2450.223 0.22302366 1761 O95861;F8VZG4;F8W1J0;F8VRY7 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 128.4 128.4 2;3 5.0997E-63 132280 QUIQUE_C1277_190116_001 206.2 186.87 1163200000 53912000 50115000 71335000 41005000 59062000 53140000 73273000 182950000 81160000 76679000 178590000 144130000 97867000 1814 1761 1686 17018;17019;17020;17021;17022;17023;17024;17025;17026;17027;17028;17029;17030;17031;17032;17033;17034 21797;21798;21799;21800;21801;21802;21803;21804;21805;21806;21807;21808;21809;21810;21811;21812;21813;21814;21815 21798 19 AIAHYEQQMGQK Unmodified 1402.6663 0.66633362 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 20.035 20.035 2;3 4.6079E-28 12564 QUIQUE_C1368_190116_001 182.46 150.59 356220000 0 0 180510000 0 0 0 0 39280000 53969000 25057000 57405000 0 0 1815 2350 1687 17035;17036;17037;17038;17039;17040 21816;21817;21818;21819;21820;21821 21817 6 AIAHYEQQMGQK Oxidation (M) 1418.6612 0.66124824 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 no no 0 1 0 1 10.965 10.965 3 0.015484 3372 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.604 33.127 6259200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6259200 0 0 0 1816 2350 1687 17041 21822 21822 1 AIAHYEQSADYYK Unmodified 1557.71 0.70997257 4128;2651 Q9H115;A0A087WZQ7;P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R027 NAPB;NAPA Beta-soluble NSF attachment protein;Alpha-soluble NSF attachment protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.075 37.075 2;3 1.7409E-31 32625 QUIQUE_C1277_190116_001 208.17 187.87 5492800000 547650000 555330000 508770000 477510000 841000000 422220000 509490000 224250000 310260000 291850000 289720000 232090000 282630000 1817 4128;2651 1688 17042;17043;17044;17045;17046;17047;17048;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057;17058;17059;17060;17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067 21823;21824;21825;21826;21827;21828;21829;21830;21831;21832;21833;21834;21835;21836;21837;21838;21839;21840;21841;21842;21843;21844;21845;21846;21847;21848;21849;21850 21825 28 AIAHYEQSADYYKGEESNSSANK Unmodified 2561.1306 0.13063942 4128;2651 Q9H115;A0A087WZQ7;P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R027 NAPB;NAPA Beta-soluble NSF attachment protein;Alpha-soluble NSF attachment protein no no 0 0 1 2 3 4 3 3 3 3 3 2 2 3 2 2 35.273 35.273 2;3;4 2.3041E-73 30508 QUIQUE_C1563_190116_001 206.95 195.04 11648000000 857350000 1312600000 760720000 902720000 961410000 900160000 1291500000 1457600000 456640000 350740000 944620000 685390000 766180000 1818 4128;2651 1689 17068;17069;17070;17071;17072;17073;17074;17075;17076;17077;17078;17079;17080;17081;17082;17083;17084;17085;17086;17087;17088;17089;17090;17091;17092;17093;17094;17095;17096;17097;17098;17099;17100;17101;17102 21851;21852;21853;21854;21855;21856;21857;21858;21859;21860;21861;21862;21863;21864;21865;21866;21867;21868;21869;21870;21871;21872;21873;21874;21875;21876;21877;21878;21879;21880;21881;21882;21883;21884;21885;21886;21887;21888;21889;21890;21891;21892;21893 21870 41 AIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEFSNTYGFPIIFK Unmodified 3950.0618 0.061825566 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 153.6 153.6 3;4 1.7714E-32 157861 QUIQUE_C1277_190116_001 90.323 85.996 6727100000 304070000 625510000 617480000 292100000 401710000 756990000 412650000 670580000 525360000 135060000 901420000 546040000 538100000 1819 2026 1690 17103;17104;17105;17106;17107;17108;17109;17110;17111;17112;17113;17114;17115;17116;17117;17118;17119;17120 21894;21895;21896;21897;21898;21899;21900;21901;21902;21903;21904;21905;21906;21907;21908;21909;21910;21911;21912 21895 18 AIALQPENPMAHFLLGR Unmodified 1876.9982 0.99817287 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.69 130.69 3 6.3084E-06 136443 QUIQUE_C1218_190116_001 79.771 74.111 1146400000 102940000 108700000 114990000 92330000 79317000 85074000 100220000 48219000 89239000 25028000 116970000 72939000 110440000 1820 3949 1691 17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131;17132;17133 21913;21914;21915;21916;21917;21918;21919;21920;21921;21922;21923;21924;21925;21926;21927;21928 21914 15 AIALQPENPMAHFLLGR Oxidation (M) 1892.9931 0.99308749 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 95.448 95.448 3 0.00057736 97573 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.732 52.17 291310000 0 0 0 0 0 0 0 42133000 58634000 22889000 58272000 50483000 58900000 1821 3949 1691 17134;17135;17136;17137;17138;17139 21929;21930;21931;21932;21933;21934 21934 2782 5 AIANECQANFISIK Unmodified 1577.7872 0.78717704 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.717 79.717 2 1.4334E-36 80400 QUIQUE_C1403_190116_001 178.81 161.45 7757500000 427310000 605200000 637450000 716280000 768990000 486530000 721510000 482050000 540010000 216610000 685540000 615510000 854500000 1822 2658 1692 17140;17141;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17148;17149;17150;17151;17152;17153 21935;21936;21937;21938;21939;21940;21941;21942;21943;21944;21945;21946;21947;21948;21949;21950;21951;21952;21953 21940 19 AIAQLATEYVFSDFLLK Acetyl (Protein N-term) 1970.0401 0.040080486 3929 Q96RD7 PANX1 Pannexin-1 yes yes 1 0 0 1 1 184.44 184.44 2 0.003709 190423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.153 59.783 11236000 0 0 0 0 0 0 4353900 0 0 0 6882200 0 0 1823 3929 1693 17154;17155 21954;21955 21955 2 AIAQSQSVQESLESLLQSIGEVEQNLEGK Unmodified 3113.5728 0.57281698 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 175.9 175.9 3 3.746E-127 179929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.33 184.24 334380000 0 0 0 0 0 0 0 0 104530000 0 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Unmodified 2101.1015 0.10151154 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 2 1 47.187 47.187 3 0.028129 44146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.855 35.429 25217000 0 0 0 0 0 0 0 25217000 0 0 0 0 0 1827 3125 1696 17176 21979 21979 1 AIAVLTSGGDAQGMNAAVR Oxidation (M) 1816.9101 0.91014572 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VP00;F8VW30;F8W1J8;F8VSF7;F8VUB8;F8VYK8;F8VTQ3;F8VVE3 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.303 58.303 2 3.7818E-115 57261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 217.09 184.76 1657600000 83381000 103880000 128840000 75474000 95455000 73990000 72019000 151940000 192190000 110730000 223530000 163690000 182480000 1828 452 1697 17177;17178;17179;17180;17181;17182;17183;17184;17185;17186;17187;17188;17189 21980;21981;21982;21983;21984;21985;21986;21987;21988;21989;21990;21991;21992;21993 21991 325 14 AIAVLTSGGDAQGMNAAVR Unmodified 1800.9152 0.9152311 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VP00;F8VW30;F8W1J8;F8VSF7;F8VUB8;F8VYK8;F8VTQ3;F8VVE3 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 78.426 78.426 2;3 2.0827E-219 80139 QUIQUE_C1438_190116_001 267.75 242.31 3963600000 306970000 378860000 418500000 342300000 262920000 296690000 308030000 244070000 280260000 135950000 398010000 270590000 320490000 1829 452 1697 17190;17191;17192;17193;17194;17195;17196;17197;17198;17199;17200;17201;17202;17203;17204;17205;17206;17207;17208;17209;17210;17211;17212;17213;17214 21994;21995;21996;21997;21998;21999;22000;22001;22002;22003;22004;22005;22006;22007;22008;22009;22010;22011;22012;22013;22014;22015;22016;22017;22018;22019;22020;22021;22022;22023 22004 30 AIAVTAQEMMTK Unmodified 1292.6468 0.64684373 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.353 65.353 2 0.0052816 66099 QUIQUE_C1218_190116_001 66.758 45.856 418360000 41641000 45694000 58789000 52391000 52878000 41192000 0 0 36370000 0 44664000 44742000 0 1830 4606 1698 17215;17216;17217;17218;17219;17220;17221;17222;17223 22024;22025;22026;22027;22028;22029;22030;22031;22032;22033 22024 7 AIAVTVQEMVTK Unmodified 1288.7061 0.70607317 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 80.593 80.593 2 0.011614 81853 QUIQUE_C1368_190116_001 67.207 26.855 124820000 0 0 60666000 64154000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1831 4600 1699 17224;17225 22034;22035 22034 2 AIAYLFPSGLFEK Unmodified 1454.781 0.78095267 2821 P82933 MRPS9 28S ribosomal protein S9, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.87 143.87 2 0.00047983 148512 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.943 80.336 81265000 0 0 0 0 0 0 0 11271000 0 0 30100000 22875000 17019000 1832 2821 1700 17226;17227;17228;17229 22036;22037;22038;22039 22038 3 AICALDLASEVGK Unmodified 1345.6912 0.69115139 4191 Q9H977;B9A049 WDR54 WD repeat-containing protein 54 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.39 100.39 2 7.6496E-06 103077 QUIQUE_C1368_190116_001 143.61 118.84 944170000 56203000 74199000 107940000 103970000 73369000 97830000 102890000 50432000 58984000 0 66717000 67193000 84449000 1833 4191 1701 17230;17231;17232;17233;17234;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241 22040;22041;22042;22043;22044;22045;22046;22047;22048;22049;22050;22051;22052 22043 13 AICIDPAYSK Unmodified 1136.5536 0.55359527 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 54.145 54.145 2 0.01116 53538 QUIQUE_C1218_190116_001 68.625 50.639 785140000 106790000 119840000 104980000 0 107560000 112900000 114120000 0 0 0 0 0 118940000 1834 1551 1702 17242;17243;17244;17245;17246;17247;17248 22053;22054;22055;22056;22057;22058;22059 22053 7 AICPLCQAELNVGSK Unmodified 1658.812 0.81201158 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.638 83.638 2 1.1824E-05 84964 QUIQUE_C1277_190116_001 100.04 75.746 185040000 32562000 40305000 35497000 43810000 0 0 32866000 0 0 0 0 0 0 1835 4517 1703 17249;17250;17251;17252;17253 22060;22061;22062;22063;22064 22061 5 AICSSTQAGSFHFTR Unmodified 1668.7678 0.76783858 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 64.583 64.583 3 0.0086438 47911 QUIQUE_C1277_190116_001 29.99 23.553 153900000 0 20158000 0 0 0 0 0 0 0 0 85570000 0 48170000 1836 934 1704 17254;17255;17256 22065;22066;22067 22065 3 AICTEAGLMALR Unmodified 1304.6581 0.65807712 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.034 87.034 2 0.00043535 89308 QUIQUE_C1277_190116_001 111.46 81.788 487720000 46502000 42837000 57524000 0 49789000 38636000 44461000 0 60960000 0 54859000 37505000 54648000 1837 2742 1705 17257;17258;17259;17260;17261;17262;17263;17264;17265;17266;17267 22068;22069;22070;22071;22072;22073;22074;22075;22076;22077;22078;22079;22080 22069 13 AIDAFNAALTVRPEDYSLWNR Unmodified 2421.2077 0.20770795 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 1 1 1 108.94 108.94 3;4 0.0037749 81021 QUIQUE_C1438_190116_001 25.888 17.7 103680000 0 0 0 0 60737000 0 42947000 0 0 0 0 0 0 1838 3552 1706 17268;17269 22081;22082 22081 2 AIDCLEDEKATLTLAMADWLR Unmodified 2434.1872 0.18723178 1475 O15061 SYNM Synemin yes yes 0 0 1 1 1 159.9 159.9 3 0.0032345 164857 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.353 38.641 46093000 0 0 0 0 0 0 0 0 24143000 0 0 0 21950000 1839 1475 1707 17270;17271 22083;22084 22083 2 AIDEDLTALAK Unmodified 1158.6132 0.61321864 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 0 1 84.121 84.121 2 0.0052917 85940 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.816 20.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1840 4473 1708 17272 22085 22085 1 AIDENNEPTACFLIR Unmodified 1761.8356 0.83558379 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.48 98.48 2 2.9954E-94 100134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 265.12 239.18 2254300000 166790000 236960000 255560000 263900000 148970000 231820000 224210000 61870000 95607000 179770000 119140000 113570000 156130000 1841 4390 1709 17273;17274;17275;17276;17277;17278;17279;17280;17281;17282;17283;17284;17285 22086;22087;22088;22089;22090;22091;22092;22093;22094;22095;22096;22097;22098;22099;22100 22094 15 AIDGLDR Unmodified 758.39227 0.39226725 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.177 25.177 2 0.024917 19704 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.068 32.291 945080000 0 0 0 103160000 0 91577000 55661000 519820000 174860000 0 0 0 0 1842 183 1710 17286;17287;17288;17289;17290 22101;22102;22103;22104;22105 22104 5 AIDIILR Unmodified 812.51199 0.51198846 4655 Q9Y6K5 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes yes 0 0 0 1 1 71.497 71.497 2 0.020578 72767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.74 20.163 40115000 0 0 15021000 0 0 0 0 0 0 0 25094000 0 0 1843 4655 1711 17291;17292 22106;22107 22107 2 AIDIYEQVGTNAMDSPLLK Unmodified 2077.0402 0.04015684 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 134.73 134.73 2;3 8.0296E-55 140131 QUIQUE_C1218_190116_001 218.11 182.91 1069200000 161290000 111720000 185660000 100940000 0 98788000 0 83740000 0 31749000 176570000 118770000 0 1844 2651 1712 17293;17294;17295;17296;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306 22108;22109;22110;22111;22112;22113;22114;22115;22116;22117;22118;22119;22120;22121;22122 22108 15 AIDLFTDAIK Unmodified 1105.6019 0.60192568 2567 P50502;Q3KNR6;H7C3I1;Q8NFI4;F6VDH7;Q8IZP2 ST13;ST13P5;ST13P4 Hsc70-interacting protein;Putative protein FAM10A5;Putative protein FAM10A4 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 108 108 1;2 2.7776E-05 112786 QUIQUE_C1218_190116_001 159.58 107.18 11574000000 822200000 1047200000 781970000 828980000 1013400000 814490000 836910000 906270000 989630000 408880000 1018300000 910230000 1195500000 1845 2567 1713 17307;17308;17309;17310;17311;17312;17313;17314;17315;17316;17317;17318;17319;17320;17321;17322;17323;17324;17325 22123;22124;22125;22126;22127;22128;22129;22130;22131;22132;22133;22134;22135;22136;22137;22138;22139;22140;22141;22142;22143;22144;22145;22146;22147;22148;22149;22150 22125 21 AIDLLYWR Unmodified 1048.5706 0.57056597 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 121.87 121.87 2 8.4217E-15 124329 QUIQUE_C1563_190116_001 191.03 141.67 1429200000 148630000 127850000 113530000 124540000 97520000 86332000 134020000 86846000 96788000 46849000 140240000 110400000 115700000 1846 3199 1714 17326;17327;17328;17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17339 22151;22152;22153;22154;22155;22156;22157;22158;22159;22160;22161;22162;22163;22164;22165;22166;22167;22168;22169;22170;22171;22172 22159 22 AIDNAADLLIFGK Unmodified 1359.7398 0.73981614 4635 Q9Y5X2 SNX8 Sorting nexin-8 yes yes 0 0 0 1 1 1 132.27 132.27 2 0.0036614 137507 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.808 44.87 2595000000 0 0 0 0 0 0 0 0 29644000 0 2129600000 0 435700000 1847 4635 1715 17340;17341;17342 22173;22174;22175;22176 22175 3 AIDTIYQTTDFSGIR Unmodified 1699.8417 0.84171503 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.74 107.74 2 2.0759E-35 110201 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.83 177.79 719480000 53482000 69976000 83421000 62189000 56513000 66123000 78074000 47725000 60945000 0 83862000 0 57171000 1848 1439 1716 17343;17344;17345;17346;17347;17348;17349;17350;17351;17352;17353 22177;22178;22179;22180;22181;22182;22183;22184;22185;22186;22187;22188;22189 22185 13 AIDVPGQVQVYELQPSNLEADQPLQAIMEMGAVAADK Unmodified 3937.9442 0.94415455 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 170.43 170.43 3 5.0766E-07 173275 QUIQUE_C1403_190116_001 52.455 48.054 54782000 0 13696000 0 15192000 0 0 0 25894000 0 0 0 0 0 1849 1753 1717 17354;17355;17356 22190;22191;22192 22191 3 AIEAALAAR Unmodified 884.50797 0.50796571 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 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protein 14 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 20.374 20.374 3;4 0.0001642 12896 QUIQUE_C1563_190116_001 96.866 67.061 2047900000 200150000 275270000 221570000 234040000 197230000 201050000 176170000 108320000 81364000 25931000 204770000 60557000 61526000 1852 3919 1720 17373;17374;17375;17376;17377;17378;17379;17380;17381;17382;17383;17384;17385;17386;17387;17388;17389;17390;17391;17392;17393;17394 22215;22216;22217;22218;22219;22220;22221;22222;22223;22224;22225;22226;22227;22228;22229;22230;22231;22232;22233;22234;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242 22228 27 AIEALKEFNEDGALAVLQQFK Unmodified 2333.2267 0.22671206 1581 O60506;F6UXX1 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 1 1 1 1 1 149.74 149.74 3 4.8192E-06 156844 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.957 47.295 329520000 0 0 0 0 0 0 0 81581000 0 0 104320000 72494000 71128000 1853 1581 1721 17395;17396;17397;17398 22243;22244;22245;22246 22244 4 AIEASNAYSR Unmodified 1080.52 0.51998696 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 21.3 21.3 2 0.02761 14537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.568 47.785 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1854 1492 1722 17399 22247 22247 1 AIEAVAISPWK Unmodified 1183.6601 0.66010926 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 92.314 92.314 2 0.0018421 94410 QUIQUE_C1403_190116_001 116.3 91.382 878330000 0 0 105030000 96340000 0 75268000 0 81128000 96139000 75576000 130220000 83012000 135620000 1855 4169 1723 17400;17401;17402;17403;17404;17405;17406;17407;17408;17409;17410;17411;17412;17413 22248;22249;22250;22251;22252;22253;22254;22255;22256;22257;22258;22259;22260;22261 22249 12 AIEDEGGNPDEIEITSEGNKK Unmodified 2244.0394 0.039364797 3138 Q15424;K7ES42 SAFB Scaffold attachment factor B1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.242 55.242 3 1.1349E-10 53685 QUIQUE_C1277_190116_001 96.79 89.344 832610000 68700000 78220000 65212000 69102000 57291000 54944000 51743000 102620000 55418000 26526000 83513000 56284000 63043000 1856 3138 1724 17414;17415;17416;17417;17418;17419;17420;17421;17422;17423;17424;17425;17426 22262;22263;22264;22265;22266;22267;22268;22269;22270;22271;22272;22273;22274 22263 13 AIEDYINEFSVR Unmodified 1454.7042 0.70415892 1830 P02748 C9 Complement component C9;Complement component C9a;Complement component C9b no no 0 0 0 1 1 1 129.4 129.4 2 0.00042251 135973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.36 83.196 65745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36256000 29489000 0 + 1857 1830 1725 17427;17428;17429 22275;22276;22277 22276 3 AIEEGVNHMWTVSAFQQHPR Unmodified 2336.112 0.11203343 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;V9GYK3;V9GYW0;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 82.402 82.402 3;4 3.7051E-40 82928 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.92 107.88 2945400000 335620000 337910000 204440000 153760000 144610000 202040000 208190000 251950000 0 120040000 404120000 163690000 419030000 1858 2484;3685 1726 17430;17431;17432;17433;17434;17435;17436;17437;17438;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448 22278;22279;22280;22281;22282;22283;22284;22285;22286;22287;22288;22289;22290;22291;22292;22293;22294;22295;22296;22297;22298;22299;22300;22301;22302;22303 22303 22 AIEEGVNHMWTVSAFQQHPR Oxidation (M) 2352.1069 0.10694805 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;V9GYK3;V9GYW0;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 1 0 1 1 1 67.985 67.985 3 0.0019522 68059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.278 42.44 41881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41881000 0 1859 2484;3685 1726 17449;17450;17451 22304;22305;22306 22305 1918 3 AIEFCIAR Unmodified 978.49569 0.49568646 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.841 70.841 2 0.01378 72366 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 63.847 294910000 23922000 27010000 26537000 28271000 34507000 18013000 24957000 22189000 0 0 35329000 24532000 29638000 1860 2285 1727 17452;17453;17454;17455;17456;17457;17458;17459;17460;17461;17462 22307;22308;22309;22310;22311;22312;22313;22314;22315;22316;22317;22318;22319 22307 13 AIEHADGGVAAGVAVLDNPYPV Unmodified 2134.0695 0.069483134 2513 P48637;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 124.07 124.07 2 3.9369E-06 128013 QUIQUE_C1277_190116_001 96.734 84.179 60266000 0 0 0 0 0 37389000 0 0 0 22877000 0 0 0 1861 2513 1728 17463;17464;17465;17466;17467 22320;22321;22322;22323;22324 22321 5 AIEHMFYR Unmodified 1065.5066 0.5065855 118 A0A087X256;Q2M389 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 40.233 40.233 3 0.0064931 36594 QUIQUE_C1277_190116_001 75.189 42.579 24263000 0 10855000 0 0 0 0 13408000 0 0 0 0 0 0 1862 118 1729 17468;17469;17470 22325;22326;22327 22325 3 AIEIELAK Unmodified 885.51713 0.51713341 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 56.412 56.412 2 0.03977 55822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.682 0.2923 25626000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25626000 0 0 1863 2882 1730 17471 22328 22328 1 AIEINPDSAQPYK Unmodified 1444.7198 0.71980898 2567 P50502;Q3KNR6;H7C3I1;Q8NFI4;F6VDH7;Q8IZP2 ST13;ST13P5;ST13P4 Hsc70-interacting protein;Putative protein FAM10A5;Putative protein FAM10A4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.958 61.958 2 0.00013043 58857 QUIQUE_DMIX4_190116_001 145.25 131.25 10869000000 779620000 753990000 684750000 806990000 1045600000 787780000 831190000 915070000 866720000 345590000 1072300000 889450000 1090400000 1864 2567 1731 17472;17473;17474;17475;17476;17477;17478;17479;17480;17481;17482;17483;17484 22329;22330;22331;22332;22333;22334;22335;22336;22337;22338;22339;22340;22341;22342;22343;22344;22345;22346;22347;22348 22344 20 AIEIYEQVGANTMDNPLLK Oxidation (M) 2134.0616 0.061620564 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 117.13 117.13 2 6.1536E-29 119705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.52 135.76 198160000 49808000 0 0 0 0 0 41437000 57536000 0 0 49378000 0 0 1865 4128 1732 17485;17486;17487;17488;17489;17490;17491;17492 22349;22350;22351;22352;22353;22354;22355;22356;22357;22358 22356 2869 10 AIEIYEQVGANTMDNPLLK Unmodified 2118.0667 0.066705942 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 1 2 1 1 130.65 130.65 2;3 5.4429E-74 134496 QUIQUE_C1277_190116_001 229.68 210.44 1672400000 117120000 169510000 117510000 96792000 125190000 102860000 131710000 134520000 114610000 43755000 200370000 168750000 149720000 1866 4128 1732 17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;17500;17501;17502;17503;17504;17505;17506;17507;17508;17509;17510 22359;22360;22361;22362;22363;22364;22365;22366;22367;22368;22369;22370;22371;22372;22373;22374;22375;22376;22377;22378;22379;22380;22381;22382;22383;22384;22385;22386;22387;22388;22389 22362 30 AIEIYTDMGR Unmodified 1167.5594 0.55940893 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R0I4;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.424 72.424 2 0.00046618 73432 QUIQUE_C1576_190116_001 111.17 82.018 1443100000 131440000 131890000 141600000 131570000 85669000 107480000 118840000 112800000 89938000 38732000 127770000 99248000 126120000 1867 2651 1733 17511;17512;17513;17514;17515;17516;17517;17518;17519;17520;17521;17522;17523 22390;22391;22392;22393;22394;22395;22396;22397;22398;22399;22400;22401;22402;22403;22404;22405 22398 16 AIEIYTDMGR Oxidation (M) 1183.5543 0.55432356 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R0I4;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 48.997 48.997 2 0.015625 46696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.224 35.058 1909700000 0 0 473930000 0 0 0 512210000 0 411870000 0 511740000 0 0 1868 2651 1733 17524;17525;17526;17527 22406;22407;22408;22409 22409 4 AIEKLAVEALSSLDGDLAGR Unmodified 2027.0899 0.089884225 2044 P12277;G3V4N7 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.43 144.43 2;3 1.4671E-12 150428 QUIQUE_C1218_190116_001 84.975 75.928 109980000 25831000 21995000 23795000 0 0 0 0 0 0 10313000 0 17207000 10839000 1869 2044 1734 17528;17529;17530;17531;17532;17533;17534 22410;22411;22412;22413;22414;22415;22416 22410 7 AIELFQR Unmodified 875.4865 0.48650199 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.014 64.014 2 0.019227 64254 QUIQUE_C1218_190116_001 113.08 32.528 779190000 83348000 0 271910000 71118000 0 53127000 0 0 0 30266000 269430000 0 0 1870 1452 1735 17535;17536;17537;17538;17539;17540 22417;22418;22419;22420;22421;22422;22423;22424 22417 6 AIELLEK Unmodified 814.48002 0.48001963 1456;4298 O14910;H0YIA8;J3KN23;Q9NUP9;G3V1D4 LIN7A;LIN7C Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.945 48.945 2 0.028867 46593 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.906 27.13 2033200000 0 273630000 273500000 250710000 0 240530000 0 233130000 236750000 0 0 227370000 297580000 1871 1456;4298 1736 17541;17542;17543;17544;17545;17546;17547;17548 22425;22426;22427;22428;22429;22430;22431;22432 22431 8 AIELLQEFSDQHPENAAEIK Unmodified 2281.1226 0.12264092 1683 O76094;D6RDY6 SRP72 Signal recognition particle subunit SRP72 yes no 0 0 0 1 111.91 111.91 3 0.0038964 114763 QUIQUE_C1403_190116_001 30.767 17.592 74261000 0 0 0 74261000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1872 1683 1737 17549 22433 22433 1 AIELNPANAVYFCNR Unmodified 1750.8461 0.8460889 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.7 107.7 2 9.693E-44 110813 QUIQUE_DMIX7_190116_001 180.36 147.3 1545000000 123070000 131440000 109780000 111970000 147620000 142310000 115150000 97279000 114950000 45734000 132550000 130280000 142910000 1873 1551 1738 17550;17551;17552;17553;17554;17555;17556;17557;17558;17559;17560;17561;17562 22434;22435;22436;22437;22438;22439;22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447 22446 13 AIEMELR Unmodified 860.44259 0.44258826 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 47.757 47.757 2 0.033008 44729 QUIQUE_C1368_190116_001 88.734 32.224 391580000 115420000 0 144210000 0 0 0 131950000 0 0 0 0 0 0 1874 890;3052 1739 17563;17564;17565 22448;22449;22450;22451;22452 22450 5 AIEMLGGELGSK Unmodified 1203.6169 0.61692381 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.545 78.545 2 0.00023168 80046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.67 63.265 3275000000 462860000 0 0 348820000 0 362970000 370750000 282730000 329130000 120450000 341880000 315740000 339650000 1875 1935 1740 17566;17567;17568;17569;17570;17571;17572;17573;17574;17575 22453;22454;22455;22456;22457;22458;22459;22460;22461;22462;22463;22464 22462 12 AIEMLGGELGSK Oxidation (M) 1219.6118 0.61183843 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 53.965 53.965 2 0.0090577 52301 QUIQUE_C1368_190116_001 63.408 32.179 263300000 0 0 84266000 0 0 0 0 0 0 0 91898000 87136000 0 1876 1935 1740 17576;17577;17578;17579;17580 22465;22466;22467;22468;22469;22470 22465 1166 6 AIENCEYAFNLK Unmodified 1470.6813 0.68131498 663 B7Z5N5;Q15796;K7EJX0 SMAD2 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 82.005 82.005 2 0.00122 82320 QUIQUE_C1563_190116_001 82.749 66.525 101220000 0 0 0 28742000 0 32746000 0 0 0 0 0 0 39731000 1877 663 1741 17581;17582;17583 22471;22472;22473 22472 3 AIENELLAR Unmodified 1027.5662 0.56620887 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y6Q7;A0A2R8Y7I7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.976 60.976 2 0.0004112 60125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.46 57.74 3043100000 298420000 288640000 288850000 239040000 244980000 247180000 239510000 252080000 247590000 101900000 338300000 256600000 0 1878 2513 1742 17584;17585;17586;17587;17588;17589;17590;17591;17592;17593;17594;17595 22474;22475;22476;22477;22478;22479;22480;22481;22482;22483;22484;22485;22486 22485 10 AIENIDTLTNLESLFLGK Unmodified 1990.0623 0.062272491 3140 Q15435;H7C003;C9JD73;B5MBZ8;C9J177 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.83 168.83 2;3 0 171985 QUIQUE_C1403_190116_001 393.64 359.75 11131000000 614440000 568830000 768760000 920600000 770400000 1461800000 716960000 1019300000 1508500000 401070000 786030000 736530000 857850000 1879 3140 1743 17596;17597;17598;17599;17600;17601;17602;17603;17604;17605;17606;17607;17608;17609;17610;17611;17612;17613;17614;17615;17616;17617;17618;17619;17620 22487;22488;22489;22490;22491;22492;22493;22494;22495;22496;22497;22498;22499;22500;22501;22502;22503;22504;22505;22506;22507;22508;22509;22510;22511;22512 22494 26 AIEPNDYTGK Unmodified 1106.5244 0.52440364 1618 O75223;M0QZK8 GGCT Gamma-glutamylcyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 28.926 28.926 2 0.015177 23038 QUIQUE_C1277_190116_001 74.464 45.315 769130000 0 395000000 0 0 0 374130000 0 0 0 0 0 0 0 1880 1618 1744 17621;17622 22513;22514 22513 2 AIEPPPLDAVIEAEHTLR Unmodified 1970.0473 0.047291129 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 128.05 128.05 2;3 7.2501E-06 132449 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.573 93.364 2096100000 230200000 217650000 140160000 180860000 210450000 138450000 172600000 169750000 175600000 66271000 212500000 181620000 0 1881 2916 1745 17623;17624;17625;17626;17627;17628;17629;17630;17631;17632;17633;17634;17635;17636 22515;22516;22517;22518;22519;22520;22521;22522;22523;22524;22525;22526;22527;22528;22529;22530;22531;22532;22533;22534;22535;22536;22537;22538;22539;22540;22541;22542;22543 22534 29 AIEPQKEEADENYNSVNTR Unmodified 2206.0138 0.013818748 2947 Q12846;C9JFM5 STX4 Syntaxin-4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 36.194 36.194 2;3 5.8884E-36 31636 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.11 112.51 591270000 0 52701000 57427000 56548000 0 47067000 63288000 53473000 60363000 28866000 67032000 51553000 52951000 1882 2947 1746 17637;17638;17639;17640;17641;17642;17643;17644;17645;17646;17647;17648 22544;22545;22546;22547;22548;22549;22550;22551;22552;22553;22554;22555;22556;22557;22558 22555 15 AIEQADLLQEEDESPR Unmodified 1841.8643 0.86430096 468 A0A2R8YGH5;H7C1E4;P61966 AP1S1 AP-1 complex subunit sigma-1A yes no 0 0 0 1 1 1 77.73 77.73 2 1.8738E-79 79750 QUIQUE_DMIX5_190116_001 206.69 181.25 98715000 0 0 0 0 0 0 31013000 0 0 0 33351000 34351000 0 1883 468 1747 17649;17650;17651 22559;22560;22561 22560 3 AIEQSFDQDESGNR Unmodified 1594.6859 0.68594267 2351 P32856 STX2 Syntaxin-2 yes yes 0 0 0 1 40.502 40.502 2 0.017534 37457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 57.585 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1884 2351 1748 17652 22562 22562 1 AIEQSIEQEEGLNR Unmodified 1614.7849 0.78492843 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 3 3 1 67.557 67.557 2;3 4.0223E-72 67523 QUIQUE_DMIX1_190116_001 249.5 223.56 8842300000 901360000 989220000 1082400000 1033800000 689020000 628820000 743220000 398740000 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22636;22637;22638;22639;22640;22641;22642;22643;22644;22645;22646;22647;22648;22649;22650 22644 15 AIFLFVDK Unmodified 951.54295 0.54295423 2694 P60520;H3BSM5;H3BQ50 GABARAPL2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.78 106.78 2 0.0095269 110628 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 60 2145500000 0 205030000 198790000 141570000 192780000 168650000 198360000 171210000 214580000 0 252390000 208300000 193820000 1893 2694 1757 17722;17723;17724;17725;17726;17727;17728;17729;17730;17731;17732 22651;22652;22653;22654;22655;22656;22657;22658;22659;22660;22661;22662;22663;22664 22659 14 AIFQEVHVQSLPQVDR Unmodified 1864.9795 0.97954591 3947 Q96T76;Q5T454;B0QZ77;F8WCH8 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 89.493 89.493 3 0.0033178 92657 QUIQUE_C1218_190116_001 50.079 43.509 109210000 61937000 0 47270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1894 3947 1758 17733;17734 22665;22666 22665 1 AIFQTIQNR Unmodified 1089.5931 0.59309232 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.846 51.846 2 1.9345E-09 49580 QUIQUE_C1368_190116_001 173.93 109.13 1557800000 153480000 153610000 120440000 121420000 158480000 113400000 128160000 111890000 165200000 0 205220000 0 126490000 1895 1727 1759 17735;17736;17737;17738;17739;17740;17741;17742;17743;17744;17745 22667;22668;22669;22670;22671;22672;22673;22674;22675;22676;22677;22678 22669 9 AIFSHAAGDNSTLLSFK Unmodified 1777.8999 0.89989861 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 92.236 92.236 2;3 5.4949E-06 94537 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 94.243 918840000 149300000 44689000 147250000 40309000 78343000 105680000 54050000 78292000 0 0 68772000 0 152160000 1896 4531 1760 17746;17747;17748;17749;17750;17751;17752;17753;17754;17755;17756;17757;17758;17759 22679;22680;22681;22682;22683;22684;22685;22686;22687;22688;22689;22690;22691;22692 22683 14 AIFSVYVVNK Unmodified 1138.6386 0.63864553 4550 Q9Y296;E9PQE8;E9PKS9;E9PN70;J3KP27;G3V1A0;G5EA23 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 88.766 88.766 2 0.019059 90807 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.919 52.188 67395000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29919000 37476000 1897 4550 1761 17760;17761 22693;22694 22693 2 AIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQK Unmodified 3377.6681 0.66805477 3183 Q16576;E9PC52;Q5JP02;Q5JP01 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 158.23 158.23 4;5 4.7857E-32 162524 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.57 96.727 259100000 0 58127000 0 0 23973000 0 0 0 55316000 0 47429000 74260000 0 1898 3183 1762 17762;17763;17764;17765;17766;17767 22695;22696;22697;22698;22699;22700 22700 5 AIFTGYYGK Unmodified 1018.5124 0.51238239 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.688 64.688 2 0.0015366 65094 QUIQUE_C1438_190116_001 102.72 66.839 13919000000 998430000 1089400000 1423400000 1142100000 1059500000 780490000 1632500000 881710000 970490000 498980000 1655300000 765820000 1020900000 1899 1969 1763 17768;17769;17770;17771;17772;17773;17774;17775;17776;17777;17778;17779;17780 22701;22702;22703;22704;22705;22706;22707;22708;22709;22710;22711;22712;22713;22714;22715;22716;22717;22718;22719;22720;22721;22722;22723;22724;22725 22706 25 AIGAVPLIQGEYMIPCEK Oxidation (M) 2004.006 0.0060199404 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;H7C1V0 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 117.32 117.32 2;3 3.3488E-13 121483 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.95 106.74 3469600000 184090000 378920000 286710000 163870000 341030000 313920000 248910000 193770000 188440000 191490000 346740000 261380000 370360000 1900 358 1764 17781;17782;17783;17784;17785;17786;17787;17788;17789;17790;17791;17792;17793;17794;17795;17796;17797 22726;22727;22728;22729;22730;22731;22732;22733;22734;22735;22736;22737;22738;22739;22740;22741;22742;22743;22744;22745;22746;22747;22748 22748 249 22 AIGAVPLIQGEYMIPCEK Unmodified 1988.0111 0.011105318 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;H7C1V0 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 128.64 128.64 2;3 4.8755E-31 134497 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.02 139.98 10664000000 962280000 1125100000 1089800000 941690000 866950000 901920000 915140000 480830000 431640000 206360000 838950000 772420000 1131200000 1901 358 1764 17798;17799;17800;17801;17802;17803;17804;17805;17806;17807;17808;17809;17810;17811;17812;17813;17814;17815;17816;17817;17818;17819 22749;22750;22751;22752;22753;22754;22755;22756;22757;22758;22759;22760;22761;22762;22763;22764;22765;22766;22767;22768;22769;22770;22771;22772;22773;22774;22775;22776;22777;22778;22779 22773 30 AIGGGLSSVGGGSSTIK Unmodified 1446.7678 0.7678218 764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538 KRT6C;KRT6A Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A yes no 0 0 0 1 1 1 54.592 54.592 2 0.0040495 50241 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.412 43.523 87982000 0 0 0 0 0 0 0 29944000 34772000 23265000 0 0 0 + 1902 764 1765 17820;17821;17822 22780;22781;22782 22782 3 AIGGIILTASHNPGGPNGDFGIK Unmodified 2205.1542 0.15421582 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 101.66 101.66 2;3 5.434E-88 103763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.88 115.95 930950000 62131000 36118000 71396000 75421000 0 0 0 266760000 178640000 75262000 85537000 0 79688000 1903 2400 1766 17823;17824;17825;17826;17827;17828;17829;17830;17831;17832;17833;17834;17835 22783;22784;22785;22786;22787;22788;22789;22790;22791;22792;22793;22794;22795;22796;22797;22798;22799;22800 22791 17 AIGHVIEEGGVK Unmodified 1207.6561 0.65608651 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 26.052 26.052 2;3 6.3944E-12 20127 QUIQUE_C1277_190116_001 160.75 129.38 11810000000 1002200000 1130000000 820360000 988980000 993140000 942750000 1091800000 672220000 841610000 227000000 1232200000 742990000 1125100000 1904 419;584 1767 17836;17837;17838;17839;17840;17841;17842;17843;17844;17845;17846;17847;17848;17849;17850;17851;17852;17853;17854;17855;17856;17857;17858;17859;17860 22801;22802;22803;22804;22805;22806;22807;22808;22809;22810;22811;22812;22813;22814;22815;22816;22817;22818;22819;22820;22821;22822;22823;22824;22825;22826;22827;22828 22804 23 AIGIEPSLATYHHIIR Unmodified 1789.9839 0.98390301 3846 Q96EY7 PTCD3 Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 75.498 75.498 4 0.001635 76656 QUIQUE_C1576_190116_001 51.695 47.227 17452000 0 0 0 0 0 0 17452000 0 0 0 0 0 0 1905 3846 1768 17861 22829 22829 1 AIGIGAYLVR Unmodified 1031.6128 0.61276513 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase no no 0 0 0 2 1 1 1 93.723 93.723 2 0.019072 97618 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.508 41.148 63340000 0 0 0 0 20842000 0 0 0 0 0 24371000 0 18127000 1906 2964 1769 17862;17863;17864;17865;17866 22830;22831;22832;22833;22834 22833 5 AIGISNFNHLQVEMILNKPGLK Unmodified 2435.3359 0.33588535 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 1 2 2 2 2 3 1 3 3 2 3 2 2 2 116.04 116.04 3;4 3.8196E-09 119854 QUIQUE_C1403_190116_001 93.776 90.502 10061000000 428280000 716570000 963400000 767790000 966830000 391320000 799250000 694790000 856370000 389230000 1088800000 727010000 1271400000 1907 2087 1770 17867;17868;17869;17870;17871;17872;17873;17874;17875;17876;17877;17878;17879;17880;17881;17882;17883;17884;17885;17886;17887;17888;17889;17890;17891;17892;17893;17894;17895 22835;22836;22837;22838;22839;22840;22841;22842;22843;22844;22845;22846;22847;22848;22849;22850;22851;22852;22853;22854;22855;22856;22857;22858;22859;22860;22861;22862;22863;22864;22865;22866;22867;22868;22869;22870;22871;22872;22873;22874;22875;22876;22877;22878;22879;22880;22881 22852 43 AIGISNFNHLQVEMILNKPGLK Oxidation (M) 2451.3308 0.33079997 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 107.69 107.69 3;4 2.4174E-06 111784 QUIQUE_C1576_190116_001 73.315 59.299 1835500000 0 198870000 168070000 173940000 0 256510000 139170000 55302000 254060000 121760000 171890000 0 295910000 1908 2087 1770 17896;17897;17898;17899;17900;17901;17902;17903;17904;17905;17906 22882;22883;22884;22885;22886;22887;22888;22889;22890;22891;22892 22886 1426 11 AIGLLDVDVYGPSVPK Unmodified 1641.8978 0.89777334 3663 Q8TB37;H0YHR7;F8W061 NUBPL Iron-sulfur protein NUBPL yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.47 130.47 2 0.00014486 135077 QUIQUE_C1368_190116_001 96.103 84.237 261490000 32627000 0 0 31398000 0 0 0 31336000 47196000 14341000 51489000 53106000 0 1909 3663 1771 17907;17908;17909;17910;17911;17912;17913;17914 22893;22894;22895;22896;22897;22898;22899;22900 22894 8 AIGMSLAK Unmodified 789.44186 0.44185998 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 36.461 36.461 2 0.048313 31872 QUIQUE_C1403_190116_001 56.014 19.97 82406000 0 0 0 43162000 0 0 0 0 0 0 0 39244000 0 1910 3026 1772 17915;17916 22901;22902 22901 2 AIGNEVTVDKWEPLLNNLGHVCR Unmodified 2633.3384 0.33840455 488 Q5T8C6;A0A3B3ISD2;Q13042 CDC16 Cell division cycle protein 16 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 122.74 122.74 4 0.000142 126575 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.656 45.894 121680000 0 20268000 0 23698000 22986000 0 0 0 0 0 0 25782000 28946000 1911 488 1773 17917;17918;17919;17920;17921 22903;22904;22905;22906;22907 22906 4 AIGNIELGIR Unmodified 1054.6135 0.61349341 2483 P46821;D6RA32;D6RGJ3;D6RCL2 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.96 80.96 2 3.069E-39 82216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.37 128.9 7257700000 518920000 611420000 557550000 324880000 575770000 467460000 674380000 642460000 548260000 322340000 724550000 671700000 618060000 1912 2483 1774 17922;17923;17924;17925;17926;17927;17928;17929;17930;17931;17932;17933;17934 22908;22909;22910;22911;22912;22913;22914;22915;22916;22917;22918;22919;22920;22921;22922;22923;22924;22925;22926;22927;22928;22929;22930;22931;22932;22933;22934;22935;22936;22937;22938;22939;22940 22928 33 AIGPHDVLATLLNNLK Unmodified 1687.9621 0.96210494 1644 O75533;H7C341 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.64 151.64 3 0.00040095 158440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.246 54.984 232800000 28247000 36110000 0 0 28250000 0 18483000 0 49902000 0 28940000 42872000 0 1913 1644 1775 17935;17936;17937;17938;17939;17940;17941 22941;22942;22943;22944;22945;22946;22947 22946 6 AIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPR Unmodified 3521.7063 0.70629077 1882 P05186;B1ANL0 ALPL Alkaline phosphatase, tissue-nonspecific isozyme yes no 0 0 0 1 1 126.65 126.65 4 1.1709E-38 130317 QUIQUE_C1403_190116_001 95.586 87.844 126840000 0 52563000 0 74272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1914 1882 1776 17942;17943 22948;22949;22950 22950 3 AIGSASEGAQSSLQEVYHK Unmodified 1960.949 0.94903365 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 56.613 56.613 2;3 1.5624E-241 55037 QUIQUE_C1277_190116_001 292.76 274.57 8698500000 853500000 708060000 877410000 758520000 834150000 72979000 805030000 524660000 757340000 328360000 147380000 754350000 1276800000 1915 2273 1777 17944;17945;17946;17947;17948;17949;17950;17951;17952;17953;17954;17955;17956;17957;17958;17959;17960;17961;17962;17963;17964;17965;17966 22951;22952;22953;22954;22955;22956;22957;22958;22959;22960;22961;22962;22963;22964;22965;22966;22967;22968;22969;22970;22971;22972;22973;22974;22975;22976;22977;22978 22956 25 AIGTDEDLAHSSIR Unmodified 1483.7267 0.72668527 4647 Q9Y697;H7C0I5;H0YGN5 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.668 42.668 3 0.00034939 39565 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.394 50.041 743600000 115160000 69611000 59883000 79247000 48411000 0 84570000 0 73072000 0 67471000 72673000 73509000 1916 4647 1778 17967;17968;17969;17970;17971;17972;17973;17974;17975;17976 22979;22980;22981;22982;22983;22984;22985;22986;22987;22988;22989;22990 22988 9 AIGTEPDSDVLSEIMHSFAK Unmodified 2146.0252 0.025235058 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 153.37 153.37 2;3 7.2371E-31 156714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.26 129.22 2661800000 192890000 320670000 194980000 286550000 169860000 181360000 171220000 155160000 195040000 64841000 157620000 222290000 349350000 1917 1403 1779 17977;17978;17979;17980;17981;17982;17983;17984;17985;17986;17987;17988;17989;17990;17991;17992;17993 22991;22992;22993;22994;22995;22996;22997;22998;22999;23000;23001;23002;23003;23004;23005;23006;23007;23008;23009;23010;23011;23012;23013;23014;23015;23016;23017;23018;23019;23020;23021;23022;23023;23024 23011 34 AIGTEPDTDVLSEIMNSFAK Unmodified 2137.0249 0.024900707 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 168.2 168.2 2 9.34E-18 175561 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.53 98.432 149410000 0 0 0 0 46120000 0 0 0 0 0 103290000 0 0 1918 1582 1780 17994;17995 23025;23026 23026 2 AIGTFLFGAAASQSLTDIAK Unmodified 1981.052 0.052042156 1426 O14494 PPAP2A Lipid phosphate phosphohydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 149.48 149.48 2;3 0.00077708 152682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.62 79.578 19047000 0 0 0 0 0 0 0 0 19047000 0 0 0 0 1919 1426 1781 17996;17997 23027;23028;23029 23027 3 AIGVKPPR Unmodified 836.52322 0.52322184 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 15.202 15.202 2 0.042432 7293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.94 99.088 63055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63055000 0 0 0 1920 2658 1782 17998 23030 23030 0 AIGVLTSGGDAQGMNAAVR Unmodified 1786.8996 0.89958103 2861;2129 Q01813;P17858 PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 2 76.82 76.82 2;3 3.0779E-55 77635 QUIQUE_C1368_190116_001 174.9 145.14 3787000000 358530000 483780000 371570000 402480000 290230000 0 299370000 244650000 0 173430000 461090000 361970000 339920000 1921 2861;2129 1783 17999;18000;18001;18002;18003;18004;18005;18006;18007;18008;18009;18010;18011;18012;18013;18014;18015 23031;23032;23033;23034;23035;23036;23037;23038;23039;23040;23041;23042;23043;23044;23045;23046;23047;23048 23035 15 AIGVLTSGGDAQGMNAAVR Oxidation (M) 1802.8945 0.89449566 2861;2129 Q01813;P17858 PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 56.661 56.661 2;3 1.0302E-45 55091 QUIQUE_C1277_190116_001 165.58 131.62 2269400000 0 168340000 209750000 139880000 122080000 117920000 127910000 176500000 205350000 208300000 271560000 257830000 264020000 1922 2861;2129 1783 18016;18017;18018;18019;18020;18021;18022;18023;18024;18025;18026;18027;18028 23049;23050;23051;23052;23053;23054;23055;23056;23057;23058;23059;23060;23061;23062 23049 1463 13 AIGYATAADCGR Unmodified 1224.5557 0.55572054 4663 Q9Y6R7;A0A286YF91 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 35.688 35.688 2 0.004947 29750 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.726 45.98 22326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22326000 0 0 0 1923 4663 1784 18029 23063 23063 1 AIGYLNTGYQR Unmodified 1254.6357 0.63568542 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 59.9 59.9 2 0.0004798 55480 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.57 73.322 54119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54119000 0 0 0 1924 1802 1785 18030 23064 23064 1 AIHEVFEVGVTSHR Unmodified 1579.8107 0.81068967 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C yes yes 0 0 0 1 1 1 42.992 42.992 3 0.0093531 40044 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protein 13-beta no no 0 0 0 1 1 1 1 24.831 24.831 2 0.02784 18610 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.692 37.928 233620000 0 0 0 0 0 0 57037000 44925000 45134000 0 0 0 86523000 1928 4475;3645 1789 18045;18046;18047;18048 23079;23080;23081;23082 23081 4 AIHYALNCCGLAGGVEQFISDICPK Unmodified 2792.3084 0.30842633 415 A6NNI4;A0A2R8Y478;G8JLH6;P21926 CD9 Tetraspanin;CD9 antigen yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 154.05 154.05 2;3 1.2759E-98 159874 QUIQUE_C1218_190116_001 179.42 170.4 6845100000 404640000 1078100000 478520000 311220000 343290000 352130000 611810000 760400000 681960000 196150000 596640000 419240000 610980000 1929 415 1790 18049;18050;18051;18052;18053;18054;18055;18056;18057;18058;18059;18060;18061;18062;18063 23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090;23091;23092;23093;23094;23095;23096;23097;23098;23099;23100;23101;23102;23103;23104;23105 23083 23 AIIASNIMYIVGQYPR Unmodified 1807.9655 0.96547575 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 143.33 143.33 2;3 1.6616E-36 146374 QUIQUE_DMIX1_190116_001 175.74 151.05 1079400000 82187000 92251000 57025000 74643000 92212000 56233000 107720000 126610000 108950000 30531000 30700000 117270000 103030000 1930 1470 1791 18064;18065;18066;18067;18068;18069;18070;18071;18072;18073;18074;18075;18076;18077;18078;18079;18080;18081;18082;18083;18084;18085;18086;18087;18088 23106;23107;23108;23109;23110;23111;23112;23113;23114;23115;23116;23117;23118;23119;23120;23121;23122;23123;23124;23125;23126;23127;23128;23129;23130;23131;23132;23133;23134 23122 24 AIIDGVESVSR Unmodified 1144.6088 0.60880197 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.597 61.597 2 0.00034234 57928 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.18 93.255 10438000000 1278700000 1308000000 1351200000 0 0 935150000 1186800000 1076100000 1250200000 452070000 828760000 0 770630000 1931 2217 1792 18089;18090;18091;18092;18093;18094;18095;18096;18097;18098 23135;23136;23137;23138;23139;23140;23141;23142;23143;23144 23142 6 AIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAK Unmodified 2679.4735 0.47348427 4446 Q9UI47;V9GYW4 CTNNA3 Catenin alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 172.21 172.21 3 1.2364E-07 173840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.039 54.534 64201000 0 0 0 0 21341000 0 0 42860000 0 0 0 0 0 1932 4446 1793 18099;18100 23145;23146;23147 23147 3 AIIEEMLDLLEQSEGK Unmodified 1816.9128 0.91283106 4328 Q9NXJ5 PGPEP1 Pyroglutamyl-peptidase 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 2 171.39 171.39 2;3 1.3521E-36 174771 QUIQUE_C1277_190116_001 176.05 155.47 470490000 18137000 32433000 39665000 9159600 29804000 7859200 30180000 52326000 111420000 0 31351000 48452000 59700000 1933 4328 1794 18101;18102;18103;18104;18105;18106;18107;18108;18109;18110;18111;18112;18113;18114;18115;18116;18117;18118;18119;18120 23148;23149;23150;23151;23152;23153;23154;23155;23156;23157;23158;23159;23160;23161;23162;23163;23164;23165;23166;23167;23168 23150 21 AIIEEYLHLNDMK Unmodified 1587.7967 0.79667909 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.97 106.97 3 0.0040093 111731 QUIQUE_C1438_190116_001 44.457 33.017 117830000 0 31390000 0 0 31558000 24524000 30361000 0 0 0 0 0 0 1934 922 1795 18121;18122;18123;18124 23169;23170;23171;23172 23170 4 AIIESDQEQGR Unmodified 1244.5997 0.59969384 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 22.718 22.718 2 2.9849E-18 15685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.12 147.62 24663000000 2349400000 1659900000 0 2118300000 2162300000 2385300000 2551400000 1936200000 2376600000 1353200000 2720600000 0 3049500000 1935 2941 1796 18125;18126;18127;18128;18129;18130;18131;18132;18133;18134;18135;18136 23173;23174;23175;23176;23177;23178;23179;23180;23181;23182;23183;23184;23185;23186;23187;23188;23189;23190 23188 15 AIIESDQEQGRK Unmodified 1372.6947 0.69465686 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 1 2 3 1 3 1 2 2 2 2 2 2 3 2 14.353 14.353 2;3 4.6536E-37 6823 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23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23234;23235;23236;23237;23238 23224 13 AIIGLYNYAHEMTHGASDR Oxidation (M) 2133.9902 0.99018696 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 61.141 61.141 3 8.0723E-05 56735 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.359 58.2 56048000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56048000 0 0 0 1938 4551 1798 18175 23239 23239 3005 1 AIIIFVPVPQLK Unmodified 1336.8482 0.84824438 2738 P62081;B5MCP9 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 141.34 141.34 2 0.00046265 147065 QUIQUE_C1576_190116_001 109.21 103.48 1649900000 154440000 116820000 115200000 113710000 124020000 129920000 117810000 123680000 170810000 69942000 143960000 142800000 126810000 1939 2738 1799 18176;18177;18178;18179;18180;18181;18182;18183;18184;18185;18186;18187;18188;18189 23240;23241;23242;23243;23244;23245;23246;23247;23248;23249;23250;23251;23252;23253;23254;23255;23256;23257;23258;23259;23260;23261;23262;23263;23264;23265 23252 26 AIIKPQYVDQIPK Unmodified 1511.8712 0.87116466 2718 P61221;D6R9I9;D6RGF4;H0Y990 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 1 1 64.221 64.221 3 0.037563 64026 QUIQUE_C1218_190116_001 56.139 44.699 54508000 54508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1940 2718 1800 18190 23266 23266 0 AIILNTPHNPLGK Unmodified 1386.7983 0.79833407 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 3 1 1 63.504 63.504 2;3 0.00014633 62421 QUIQUE_C1368_190116_001 105.17 95.637 579480000 47258000 51622000 93961000 0 0 68076000 40781000 102090000 34813000 0 92664000 48215000 0 1941 3422 1801 18191;18192;18193;18194;18195;18196;18197;18198;18199;18200;18201;18202;18203;18204 23267;23268;23269;23270;23271;23272;23273;23274;23275;23276;23277;23278;23279;23280;23281 23269 14 AIINLAVYGK Unmodified 1060.6281 0.62808085 4642 Q9Y646;E5RJA8;E5RH35;E5RJZ7;E5RJP8 CPQ Carboxypeptidase Q yes no 0 0 0 1 88.289 88.289 2 0.063055 85004 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.7 26.969 10869000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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complex subunit sigma-1 yes no 0 0 0 1 40.071 40.071 3 0.056405 35904 QUIQUE_C1563_190116_001 33.359 20.569 33257000 0 0 0 0 0 33257000 0 0 0 0 0 0 0 1952 3735 1812 18229 23306 23306 1 AILIFNNHGKPR Unmodified 1378.7834 0.78335271 3735 Q92572;F5H459 AP3S1 AP-3 complex subunit sigma-1 yes no 0 0 1 1 1 28.641 28.641 3 0.029171 22892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.661 35.818 94095000 0 0 0 0 0 0 0 40316000 53779000 0 0 0 0 1953 3735 1813 18230;18231 23307;23308;23309 23309 3 AILILDNDGDRLFAK Unmodified 1672.9148 0.91482039 1034 F8VVA7;P61923;F8VXB1;F8W156;F8W651;F8VYZ4;F8VUC5;F8VXR1 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 107.14 107.14 3 0.00027081 109786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.094 36.234 120910000 0 0 0 0 0 0 0 46632000 33663000 0 0 0 40614000 1954 1034 1814 18232;18233;18234 23310;23311;23312 23310 3 AILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMK Unmodified 3332.7313 0.73129145 56 B4DGL8;A0A087WW65;O75027 ABCB7 ATP-binding cassette sub-family B member 7, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 170.51 170.51 3 2.2364E-07 172230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.558 39.956 50587000 0 0 0 0 0 0 0 19669000 30918000 0 0 0 0 1955 56 1815 18235;18236 23313;23314 23313 1 AILPCQDTPSVK Unmodified 1327.6806 0.6805867 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.846 54.846 2 0.00040847 50698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.75 89.32 2259400000 242470000 222730000 253080000 278350000 0 223170000 277730000 111550000 0 77540000 155740000 204670000 212340000 1956 1977 1816 18237;18238;18239;18240;18241;18242;18243;18244;18245;18246;18247 23315;23316;23317;23318;23319;23320;23321;23322;23323;23324;23325;23326 23322 10 AILQATLREEK Unmodified 1270.7245 0.72450043 2950 Q12904;D6R937 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 35.604 35.604 2 0.053576 30997 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.716 60.579 27772000 0 0 0 0 0 0 0 27772000 0 0 0 0 0 1957 2950 1817 18248 23327 23327 0 AILQEVLDADLSNEAFPFSTHK Unmodified 2444.2224 0.22235496 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV2 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 152.6 152.6 3 0.00016499 159005 QUIQUE_C1438_190116_001 33.79 19.925 285340000 46287000 67342000 30696000 0 48334000 30475000 0 49235000 0 12968000 0 0 0 1958 4480 1818 18249;18250;18251;18252;18253;18254;18255 23328;23329;23330;23331;23332;23333;23334;23335 23331 8 AILQQILLLR Unmodified 1179.7703 0.77032841 1132 H7C380;H0Y8P0;Q86TI0 TBC1D1 TBC1 domain family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.45 136.45 2 0.0025779 140772 QUIQUE_C1277_190116_001 89.142 42.061 69143000 0 11059000 0 9886400 8176100 0 12245000 8610800 0 4444000 14722000 0 0 1959 1132 1819 18256;18257;18258;18259;18260;18261;18262;18263;18264;18265 23336;23337;23338;23339;23340;23341;23342;23343;23344;23345 23336 10 AILQQLGLNSTCDDSILVK Unmodified 2087.0933 0.093255043 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 130.05 130.05 2;3 8.9239E-55 134545 QUIQUE_C1277_190116_001 210.41 189.35 4821500000 463620000 416860000 411320000 535500000 356300000 609020000 381340000 226700000 185580000 179390000 360050000 334640000 361190000 1960 2146 1820 18266;18267;18268;18269;18270;18271;18272;18273;18274;18275;18276;18277;18278;18279;18280;18281;18282;18283;18284 23346;23347;23348;23349;23350;23351;23352;23353;23354;23355;23356;23357;23358;23359;23360;23361;23362;23363;23364;23365;23366;23367;23368;23369;23370;23371;23372;23373;23374;23375;23376;23377;23378 23349 31 AILSTKPPGTFLLR Unmodified 1512.9028 0.90279914 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 1 1 88.142 88.142 3 0.032304 88808 QUIQUE_C1563_190116_001 42.426 35.386 61233000 0 0 0 0 0 61233000 0 0 0 0 0 0 0 1961 2427 1821 18285 23379 23379 1 AILTAAIVDADR Unmodified 1227.6823 0.68230126 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.32 85.32 2 0.0010001 87922 QUIQUE_C1438_190116_001 84.17 55.771 538990000 40938000 39717000 43166000 37957000 38249000 31461000 35198000 49184000 46613000 18212000 59909000 49173000 49219000 1962 4631 1822 18286;18287;18288;18289;18290;18291;18292;18293;18294;18295;18296;18297;18298 23380;23381;23382;23383;23384;23385;23386;23387;23388;23389;23390;23391;23392 23384 12 AILTTIGVLEEPLGNAR Unmodified 1765.9938 0.993799 1615 O75170;T1ECW5 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 132.36 132.36 3 0.038439 135131 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.536 28.139 46648000 0 0 0 0 0 0 35970000 10678000 0 0 0 0 0 1963 1615 1823 18299;18300 23393;23394;23395 23395 3 AILVDLEPGTMDSVR Oxidation (M) 1630.8236 0.82362212 3030;4044;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q13509;A0A0B4J269;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 2 2 2 96.742 96.742 2;3 1.4643E-09 98504 QUIQUE_C1218_190116_001 130.1 95.405 110870000000 7483800000 8068400000 7592200000 6417800000 7350700000 6428600000 7326700000 8590900000 9405000000 7325000000 12773000000 10763000000 11347000000 1964 1922;3006;3030;4044 1824 18301;18302;18303;18304;18305;18306;18307;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;18315;18316;18317;18318;18319;18320 23396;23397;23398;23399;23400;23401;23402;23403;23404;23405;23406;23407;23408;23409;23410;23411;23412;23413;23414;23415;23416;23417;23418;23419;23420;23421;23422;23423;23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23431;23432;23433;23434;23435;23436;23437;23438;23439;23440;23441;23442;23443 23397 1146 47 AILVDLEPGTMDSVR Unmodified 1614.8287 0.8287075 3030;4044;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q13509;A0A0B4J269;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 6 6 2 4 6 3 6 5 3 3 5 5 6 129.17 129.17 1;2;3 8.3956E-234 117851 QUIQUE_C1218_190116_001 310.85 266.54 234160000000 21095000000 20605000000 18192000000 18080000000 20477000000 18693000000 21693000000 18365000000 16962000000 6021700000 17908000000 16778000000 19291000000 1965 1922;3006;3030;4044 1824 18321;18322;18323;18324;18325;18326;18327;18328;18329;18330;18331;18332;18333;18334;18335;18336;18337;18338;18339;18340;18341;18342;18343;18344;18345;18346;18347;18348;18349;18350;18351;18352;18353;18354;18355;18356;18357;18358;18359;18360;18361;18362;18363;18364;18365;18366;18367;18368;18369;18370;18371;18372;18373;18374;18375;18376;18377;18378;18379;18380 23444;23445;23446;23447;23448;23449;23450;23451;23452;23453;23454;23455;23456;23457;23458;23459;23460;23461;23462;23463;23464;23465;23466;23467;23468;23469;23470;23471;23472;23473;23474;23475;23476;23477;23478;23479;23480;23481;23482;23483;23484;23485;23486;23487;23488;23489;23490;23491;23492;23493;23494;23495;23496;23497;23498;23499;23500;23501;23502;23503;23504;23505;23506;23507;23508;23509;23510;23511;23512;23513;23514;23515;23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;23524;23525;23526;23527;23528;23529;23530;23531;23532;23533;23534;23535;23536;23537;23538;23539;23540;23541;23542;23543;23544;23545;23546;23547;23548 23453 101 AILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAK Unmodified 4394.1542 0.15423918 3030;4044;1922 Q5JP53;P07437;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 2 1 167.25 167.25 4 2.1073E-16 174666 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.422 69.646 105670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105670000 0 0 1966 1922;3030;4044 1825 18381 23549 23549 1 AILVVFANK Unmodified 973.59605 0.59605244 2426 P40616;B4DZG7;F8VYN9 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.729 81.729 2 0.019849 82973 QUIQUE_C1277_190116_001 63.306 42.648 397260000 25129000 27984000 34169000 28015000 25693000 21617000 36341000 32310000 41891000 16593000 41816000 30541000 35159000 1967 2426 1826 18382;18383;18384;18385;18386;18387;18388;18389;18390;18391;18392;18393;18394 23550;23551;23552;23553;23554;23555;23556;23557;23558;23559;23560;23561;23562 23551 12 AIMAHMTVEEIYK Unmodified 1534.7524 0.75237144 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 75.068 75.068 3 0.046244 75861 QUIQUE_C1218_190116_001 32.734 20.758 23904000 23904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1968 1673 1827 18395 23563 23563 1 AIMAHMTVEEIYKDR Unmodified 1805.8804 0.8804255 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 1 1 69.575 69.575 3 0.070925 70648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 24.832 18.395 99715000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99715000 0 0 1969 1673 1828 18396 23564 23564 1 AIMAQLPQEEK Unmodified 1256.6435 0.64347291 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.609 53.609 2 0.00037933 51180 QUIQUE_C1563_190116_001 117.01 81.362 1138200000 93819000 82578000 92485000 156400000 72575000 117580000 87126000 88225000 79704000 41755000 81385000 67495000 77125000 1970 2250 1829 18397;18398;18399;18400;18401;18402;18403;18404;18405;18406;18407;18408;18409 23565;23566;23567;23568;23569;23570;23571;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581 23572 17 AIMAQLPQEEK Oxidation (M) 1272.6384 0.63838754 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 1 0 1 39.286 39.286 2 0.043767 36145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.243 47.368 68041000 0 0 0 0 0 0 0 0 68041000 0 0 0 0 1971 2250 1829 18410 23582 23582 0 AIMKDPDDHTVCHLLFANQTEK Unmodified 2582.2257 0.22574255 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 2 76.644 76.644 3;4 1.1535E-14 78228 QUIQUE_C1218_190116_001 113.73 100.14 1329200000 53237000 229590000 284760000 249850000 0 61941000 61306000 67948000 0 50273000 72888000 197410000 0 1972 1778 1830 18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;18423;18424 23583;23584;23585;23586;23587;23588;23589;23590;23591;23592;23593;23594;23595;23596;23597;23598;23599 23583 15 AIMTYVSCFYHAFSGAQK Unmodified 2079.9547 0.95465307 1313 K7EJH8 ACTN4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 139.61 139.61 2;3 6.4214E-11 146085 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.47 123.58 1152800000 20059000 0 62122000 53570000 62558000 38767000 94660000 130840000 128140000 16161000 207940000 167280000 170670000 1973 1313 1831 18425;18426;18427;18428;18429;18430;18431;18432;18433;18434;18435;18436;18437;18438;18439 23600;23601;23602;23603;23604;23605;23606;23607;23608;23609;23610;23611;23612;23613;23614;23615;23616 23611 14 AIMTYVSSFYHAFSGAQK Unmodified 2006.956 0.95603328 1544;2047;1242 H9KV75;G3V2W4;O43707;P12814;G3V2N5 ACTN1;ACTN4 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.67 137.67 3 0.00016417 142354 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.942 67.11 1720200000 69898000 122730000 89238000 111520000 141120000 0 124530000 151590000 186020000 50069000 187300000 253540000 232630000 1974 1242;1544;2047 1832 18440;18441;18442;18443;18444;18445;18446;18447;18448;18449;18450;18451 23617;23618;23619;23620;23621;23622;23623;23624;23625;23626;23627;23628;23629;23630;23631 23627 15 AINCATSGVVGLVNCLR Unmodified 1802.9131 0.91312261 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 118.4 118.4 2;3 9.2547E-07 123496 QUIQUE_C1576_190116_001 138.24 122.7 1322000000 80906000 154250000 0 0 144690000 0 154820000 137610000 113050000 0 180110000 199400000 157180000 1975 2524 1833 18452;18453;18454;18455;18456;18457;18458;18459;18460;18461;18462;18463;18464;18465;18466;18467;18468 23632;23633;23634;23635;23636;23637;23638;23639;23640;23641;23642;23643;23644;23645;23646;23647;23648;23649;23650;23651;23652 23640 18 AINCPEDIVFPALDILR Unmodified 1955.0186 0.018633537 4541 Q9Y263 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.27 163.27 2 0.00065042 169145 QUIQUE_C1576_190116_001 80.469 63.695 484800000 0 47332000 49762000 52631000 44555000 24566000 44043000 0 29253000 11454000 0 84358000 96847000 1976 4541 1834 18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;18479 23653;23654;23655;23656;23657;23658;23659;23660;23661;23662;23663 23658 9 AINEAYKEDYHK Unmodified 1479.6994 0.69940789 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 2 17.831 17.831 2;3;4 9.7238E-14 10517 QUIQUE_C1218_190116_001 196.11 179.92 24960000000 2090200000 1672800000 2112800000 1353800000 2957900000 1215700000 2032000000 2236300000 2215500000 470320000 3004700000 1732000000 1866200000 1977 845;1936 1835 18480;18481;18482;18483;18484;18485;18486;18487;18488;18489;18490;18491;18492;18493;18494;18495;18496;18497;18498;18499;18500;18501;18502;18503;18504;18505;18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;18513;18514 23664;23665;23666;23667;23668;23669;23670;23671;23672;23673;23674;23675;23676;23677;23678;23679;23680;23681;23682;23683;23684;23685;23686;23687;23688;23689;23690;23691;23692;23693;23694;23695;23696;23697;23698;23699 23666 26 AINIADELPR Unmodified 1110.6033 0.60332266 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.723 84.723 2 0.0071629 85405 QUIQUE_C1563_190116_001 73.573 53.013 71863000 0 0 0 0 0 13664000 0 0 35270000 0 0 0 22930000 1978 3651 1836 18515;18516;18517;18518 23700;23701;23702;23703 23700 4 AINLLFDIAR Unmodified 1144.6604 0.66044361 3479 Q7Z7L7 ZER1 Protein zer-1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.16 130.16 2 0.0031972 136074 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.676 50.38 67107000 12116000 0 0 10634000 11710000 0 0 0 10737000 0 21910000 0 0 1979 3479 1837 18519;18520;18521;18522;18523;18524;18525;18526;18527;18528 23704;23705;23706;23707;23708;23709;23710;23711;23712;23713 23713 10 AINLQMFHK Unmodified 1100.5801 0.5800848 3946 Q96T51;H0YA47;H0YAC8 RUFY1 RUN and FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.163 61.163 3 0.0039205 60129 QUIQUE_C1368_190116_001 59.35 34.111 123330000 0 0 20100000 0 19701000 0 0 14358000 0 0 26731000 18074000 24369000 1980 3946 1838 18529;18530;18531;18532;18533;18534 23714;23715;23716;23717;23718;23719 23714 6 AINPINTFTK Unmodified 1117.6132 0.61315906 2912 Q07960 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.477 67.477 2 0.00091451 67296 QUIQUE_C1277_190116_001 120.15 85.347 2791000000 237830000 240420000 244960000 237380000 259720000 168760000 243240000 0 226450000 88575000 284640000 258210000 300840000 1981 2912 1839 18535;18536;18537;18538;18539;18540;18541;18542;18543;18544;18545;18546 23720;23721;23722;23723;23724;23725;23726;23727;23728;23729;23730;23731;23732;23733 23722 11 AINQGGLTSVAVR Unmodified 1284.715 0.71499837 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1;G3V3U4 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.929 52.929 2 0.00041511 50645 QUIQUE_C1403_190116_001 96.113 68.859 7588000000 607640000 652310000 658640000 650860000 575990000 556140000 467900000 550590000 741760000 236000000 665330000 683450000 541430000 1982 1091 1840 18547;18548;18549;18550;18551;18552;18553;18554;18555;18556;18557;18558;18559 23734;23735;23736;23737;23738;23739;23740;23741;23742;23743;23744;23745;23746;23747 23738 13 AINQIAAALFTIHK Unmodified 1509.8667 0.86674799 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 117.11 117.11 2;3 3.757E-05 114715 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.08 90.413 2174100000 147990000 177850000 183290000 173470000 123280000 114230000 183370000 221800000 181080000 86364000 208070000 204370000 168940000 1983 4551 1841 18560;18561;18562;18563;18564;18565;18566;18567;18568;18569;18570;18571;18572;18573;18574 23748;23749;23750;23751;23752;23753;23754;23755;23756;23757;23758;23759;23760;23761;23762;23763;23764;23765;23766;23767;23768;23769;23770;23771;23772;23773 23765 25 AINQQTGAFVEISR Unmodified 1532.7947 0.79470526 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R3J3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 70.573 70.573 2 3.6102E-47 71361 QUIQUE_C1218_190116_001 194.5 137.77 1202400000 71002000 79290000 57479000 67745000 67108000 41332000 51459000 0 214430000 29989000 245800000 208440000 68290000 1984 3770 1842 18575;18576;18577;18578;18579;18580;18581;18582;18583;18584;18585;18586;18587;18588;18589 23774;23775;23776;23777;23778;23779;23780;23781;23782;23783;23784;23785;23786;23787;23788;23789;23790;23791 23774 18 AINSCHTSSLATPEDKEQAQQMNQK Unmodified 2815.2865 0.28650491 1812 Q5I0G2;P01236;A6XMH3 PRL Prolactin yes no 0 0 1 1 29.28 29.28 4 0.055831 23750 QUIQUE_C1218_190116_001 26.849 19.403 36592000 36592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1985 1812 1843 18590 23792 23792 0 AINSSGLAHVENEEQYTQALEK Unmodified 2430.1663 0.16629665 1509 O43150 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 81.957 81.957 3 1.0517E-07 84741 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.045 58.053 41977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41977000 0 0 1986 1509 1844 18591 23793 23793 1 AINTLNGLR Unmodified 970.55598 0.55597854 3152;160 Q15717;M0QZR9;A0A0A0MRX1;Q12926;B1AM48 ELAVL1;ELAVL2 ELAV-like protein 1;ELAV-like protein;ELAV-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 43.378 43.378 2 0.0070525 40011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.671 43.453 131120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22859000 108260000 0 0 1987 3152;160 1845 18592;18593 23794;23795 23795 2 AINTQEAPVK Unmodified 1069.5768 0.57677356 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.854 20.854 2 0.005136 14077 QUIQUE_C1218_190116_001 78.516 33.795 200220000 52106000 0 0 0 0 45090000 50810000 32497000 0 19718000 0 0 0 1988 1613 1846 18594;18595;18596;18597;18598;18599 23796;23797;23798;23799;23800;23801 23796 6 AINVFVSANR Unmodified 1089.5931 0.59309232 4035 Q9BUL8;C9J363;C9J5C3 PDCD10 Programmed cell death protein 10 yes no 0 0 0 1 1 59.322 59.322 2 0.00592 59153 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.825 35.823 37607000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37607000 0 0 1989 4035 1847 18600;18601 23802;23803 23803 2 AINVLLEGNPDTHSWEMVGK Unmodified 2209.0838 0.08375299 3047 Q14157;F8W726;Q5VU77;Q5VU81;Q5VU80;Q5VU79;Q5VU78 UBAP2L Ubiquitin-associated protein 2-like yes no 0 0 0 1 113.25 113.25 3 0.020676 117280 QUIQUE_C1218_190116_001 30.464 22.626 49619000 49619000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1990 3047 1848 18602 23804 23804 1 AIPDLTAPVAAVQAAVSNLVR Unmodified 2075.1739 0.17388863 2135 P18206;A0A096LPE1 VCL Vinculin yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 170.63 170.63 2;3 6.9419E-67 175560 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 111.36 7824100000 657890000 529960000 402220000 602030000 844720000 919780000 627380000 868340000 717120000 299440000 446610000 278090000 630490000 1991 2135 1849 18603;18604;18605;18606;18607;18608;18609;18610;18611;18612;18613;18614;18615;18616;18617;18618;18619;18620;18621;18622;18623;18624;18625;18626;18627;18628 23805;23806;23807;23808;23809;23810;23811;23812;23813;23814;23815;23816;23817;23818;23819;23820;23821;23822;23823;23824;23825;23826;23827;23828;23829;23830;23831;23832;23833;23834 23812 25 AIPLFGNSLKPDSLR Unmodified 1626.9093 0.90934108 1706 O95154 AKR7A3 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 3 yes yes 0 0 1 1 1 2 97.184 97.184 2;3 0.0069485 101155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.82 65.662 194720000 0 0 0 21057000 0 0 0 0 0 0 37696000 135960000 0 1992 1706 1850 18629;18630;18631;18632 23835;23836;23837;23838 23836 4 AIPLVLVSGNHDIGNTPTAETVEEFCR Unmodified 2938.4495 0.44947114 4001 Q9BRF8 CPPED1 Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 128.68 128.68 3;4 2.7184E-08 132514 QUIQUE_C1403_190116_001 60.139 54.786 2064300000 148550000 176270000 185480000 258670000 148610000 129670000 197960000 118030000 203300000 0 154260000 170190000 173340000 1993 4001 1851 18633;18634;18635;18636;18637;18638;18639;18640;18641;18642;18643;18644;18645 23839;23840;23841;23842;23843;23844;23845;23846;23847;23848;23849;23850;23851 23842 13 AIPNQGEILVIR Unmodified 1321.7718 0.77178497 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.987 86.987 2 0.003535 89975 QUIQUE_C1438_190116_001 105.4 85.067 337360000 0 0 49910000 0 42845000 39249000 43092000 37719000 43195000 0 48856000 32497000 0 1994 2569 1852 18646;18647;18648;18649;18650;18651;18652;18653 23852;23853;23854;23855;23856;23857;23858;23859 23853 3 AIPVSPSAVEEDEDEDGHTVVATAR Unmodified 2593.2144 0.21436905 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7;H0Y3R8 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.835 80.835 3 4.2636E-58 81537 QUIQUE_C1403_190116_001 158.37 151.5 323770000 0 0 0 84897000 0 0 62605000 61903000 0 37470000 0 76892000 0 1995 1074 1853 18654;18655;18656;18657;18658;18659 23860;23861;23862;23863;23864;23865 23860 3 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK Oxidation (M) 4235.1031 0.10311481 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 1 1 2 2 1 1 2 161.89 161.89 4 5.8425E-100 168984 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.3 143.31 892620000 0 0 0 0 0 0 0 279630000 124600000 0 62869000 87422000 338100000 1996 3137;908 1854 18660;18661;18662;18663;18664;18665;18666;18667 23866;23867;23868;23869;23870;23871;23872;23873 23871 556;557 8 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK Unmodified 4219.1082 0.10820019 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 1 1 2 1 166.62 166.62 4 7.3021E-184 168542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.58 194.25 1415100000 0 0 0 0 0 0 0 317260000 482630000 0 615210000 0 0 1997 3137;908 1854 18668;18669;18670;18671 23874;23875;23876;23877 23874 4 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK 2 Oxidation (M) 4251.098 0.09802943 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 2 1 1 155.98 155.98 4 7.8141E-10 150968 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.16 56.772 31788000 0 0 0 0 0 0 0 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protein yes no 0 0 0 1 1 1 129.2 129.2 2 0.00011328 133581 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.43 66.551 128480000 56557000 0 0 0 0 0 0 0 38870000 0 0 0 33051000 2001 4119 1857 18687;18688;18689 23894;23895;23896 23895 1 AIQDTNNLKR Unmodified 1171.6309 0.63093439 1309 J9JIC5;Q9HAS0 C17orf75 Protein Njmu-R1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 14.35 14.35 3 0.0083128 6581 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.49 38.283 60842000 8540400 8329800 0 0 0 0 0 18766000 25206000 0 0 0 0 2002 1309 1858 18690;18691;18692;18693 23897;23898;23899;23900 23900 4 AIQEWLK Unmodified 886.49125 0.49125301 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 63.387 63.387 2 0.039576 63008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.614 35.372 255450000 35724000 0 0 0 54252000 0 0 61506000 0 0 56479000 47490000 0 2003 3226 1859 18694;18695;18696;18697;18698 23901;23902;23903;23904;23905;23906 23904 6 AIQGGTSHHLGQNFSK Unmodified 1680.8332 0.83321603 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 3 2 3 2 3 17.186 17.186 2;3;4 2.3352E-66 10198 QUIQUE_C1218_190116_001 202.25 166.59 3613000000 365150000 177710000 406750000 183240000 261670000 271690000 260660000 258320000 283350000 123630000 385490000 205740000 429570000 2004 1929 1860 18699;18700;18701;18702;18703;18704;18705;18706;18707;18708;18709;18710;18711;18712;18713;18714;18715;18716;18717;18718;18719;18720;18721;18722;18723;18724;18725;18726;18727;18728;18729 23907;23908;23909;23910;23911;23912;23913;23914;23915;23916;23917;23918;23919;23920;23921;23922;23923;23924;23925;23926;23927;23928;23929;23930;23931;23932;23933;23934;23935;23936;23937 23909 30 AIQILNEGASSEK Unmodified 1358.7042 0.70415892 4325 Q9NXC5 MIOS WD repeat-containing protein mio yes yes 0 0 0 1 51.619 51.619 2 0.033417 46743 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.056 31.803 0 0 0 0 0 0 0 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53.62 2 0.0070203 48644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 54.027 29524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29524000 0 0 0 2008 1516 1864 18744;18745;18746 23953;23954;23955 23954 3 AIQLNPSYIR Unmodified 1173.6506 0.6506072 3962 Q99614;H0YB37 TTC1 Tetratricopeptide repeat protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 69.897 69.897 2 0.0052305 70785 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.192 44.549 101610000 0 0 0 0 45138000 0 0 0 0 0 27231000 0 29244000 2009 3962 1865 18747;18748;18749;18750;18751;18752 23956;23957;23958;23959;23960;23961;23962 23959 7 AIQLSGAEQLEALK Unmodified 1469.809 0.80895834 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 114.37 114.37 2 0.00076559 99241 QUIQUE_C1368_190116_001 87.667 56.173 136730000 0 0 0 0 0 0 136730000 0 0 0 0 0 0 2010 824 1866 18753;18754;18755 23963;23964;23965 23963 2 AIQLTYNPDESSKPNMIDAATLK Unmodified 2519.2578 0.25775419 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 99.139 99.139 2;3 5.5104E-17 101327 QUIQUE_C1403_190116_001 122.93 105.01 985420000 120090000 30476000 147710000 324490000 0 0 221580000 0 141070000 0 0 0 0 2011 710 1867 18756;18757;18758;18759;18760;18761;18762 23966;23967;23968;23969;23970;23971;23972;23973;23974 23971 9 AIQLTYNPDESSKPNMIDAATLK Oxidation (M) 2535.2527 0.25266881 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.269 84.269 3 1.3203E-10 86530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.35 82.817 1012700000 0 26124000 67640000 171080000 105200000 0 60464000 90941000 98593000 100540000 151800000 0 140280000 2012 710 1867 18763;18764;18765;18766;18767;18768;18769;18770;18771;18772 23975;23976;23977;23978;23979;23980;23981;23982;23983;23984;23985;23986 23985 430 12 AIQTDFVQYQPDLDTILEK Unmodified 2236.1263 0.12632931 486 A0A3B3IRY9;O15079 SNPH Syntaphilin yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 144.26 144.26 2;3 4.2122E-36 150037 QUIQUE_C1218_190116_001 154.65 121.46 445950000 36733000 31909000 101330000 21686000 59449000 71241000 30133000 0 35768000 12672000 0 45028000 0 2013 486 1868 18773;18774;18775;18776;18777;18778;18779;18780;18781;18782;18783;18784;18785 23987;23988;23989;23990;23991;23992;23993;23994;23995;23996;23997;23998;23999 23987 12 AIQVFLLGGSR Unmodified 1159.6713 0.67134264 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 104.62 104.62 2 0.0045096 107827 QUIQUE_C1277_190116_001 90.15 61.001 24456000 0 24456000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2014 1492 1869 18786 24000 24000 0 AIRPQIDLK Unmodified 1052.6342 0.63422886 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 32.814 32.814 3 0.043832 28450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.819 25.355 109650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59721000 0 49927000 2015 2813 1870 18787;18788 24001;24002 24001 2 AISAANLHLR Unmodified 1064.6091 0.60907674 3381 Q6P2Q9 PRPF8 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 yes yes 0 0 0 1 1 38.923 38.923 3 0.0063958 35247 QUIQUE_C1576_190116_001 50.834 20.442 19425000 0 0 0 0 0 0 19425000 0 0 0 0 0 0 2016 3381 1871 18789;18790 24003;24004 24004 2 AISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLER Oxidation (M) 3377.6418 0.64178171 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 169.09 169.09 3 3.607E-25 176496 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.149 82.988 133690000 0 0 0 0 0 0 0 0 41470000 0 66514000 0 25705000 2017 3499 1872 18791;18792;18793 24005;24006;24007;24008 24006 2674 4 AISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLER Unmodified 3361.6469 0.64686709 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 173.98 173.98 3 2.4905E-19 181172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.479 60.663 43139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43139000 0 0 2018 3499 1872 18794 24009 24009 1 AISEELDHALNDMTSL Unmodified 1757.8142 0.81417965 435 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.96 144.96 2 0.00019656 149777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.93 0 636240000 51726000 66634000 68105000 0 69318000 61912000 0 65317000 71235000 0 59117000 63110000 59761000 2019 435 1873 18795;18796;18797;18798;18799;18800;18801;18802;18803;18804 24010;24011;24012;24013;24014;24015;24016;24017;24018;24019;24020 24017 10 AISEPNFSVAYANMCR Oxidation (M) 1844.8186 0.81855352 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 1 0 1 86.678 86.678 2 0.027577 87459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.198 45.685 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2020 922 1874 18805 24021 24021 1 AISEPNFSVAYANMCR Unmodified 1828.8236 0.8236389 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 104.03 104.03 2 0.052079 109166 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.681 21.427 18820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18820000 0 0 2021 922 1874 18806 24022 24022 1 AISESGVALTSVLVK Unmodified 1472.845 0.84500949 2205 P23141;Q9UKY3 CES1;CES1P1 Liver carboxylesterase 1;Putative inactive carboxylesterase 4 yes no 0 0 0 1 102.17 102.17 2 0.018255 104746 QUIQUE_C1403_190116_001 47.815 26.945 32051000 0 0 0 32051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2022 2205 1875 18807 24023 24023 1 AISFVGSNK Unmodified 921.49198 0.4919813 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 33.692 33.692 1;2 3.8663E-18 28429 QUIQUE_C1563_190116_001 227.62 113.19 9786400000 848790000 877580000 955040000 801470000 1033000000 1032800000 957130000 846460000 0 484420000 0 973740000 975990000 2023 2870 1876 18808;18809;18810;18811;18812;18813;18814;18815;18816;18817;18818;18819 24024;24025;24026;24027;24028;24029;24030;24031;24032;24033;24034;24035;24036;24037;24038;24039;24040 24032 15 AISGLANFLVSEALSNALK Unmodified 1917.0571 0.057127534 4470 Q9UKA4 AKAP11 A-kinase anchor protein 11 yes yes 0 0 0 1 168.88 168.88 3 0.00016877 170795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.521 48.837 12328000 0 0 0 0 0 0 0 12328000 0 0 0 0 0 2024 4470 1877 18820 24041 24041 1 AISGLTIDGHAVGAK Unmodified 1408.7674 0.76742787 4663 Q9Y6R7;A0A286YF91 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 60.094 60.094 3 0.017671 55629 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.897 29.301 24929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24929000 0 0 0 2025 4663 1878 18821 24042 24042 1 AISHEHSPSDLEAHFVPLVK Unmodified 2212.1277 0.12766671 2309 P30153;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 3 2 4 3 3 4 3 3 3 3 3 4 69.657 69.657 2;3;4;5 3.1375E-76 70141 QUIQUE_C1438_190116_001 193.9 179.13 8768300000 669990000 669520000 662140000 767040000 807030000 615740000 812500000 650180000 660220000 327650000 748220000 501740000 876280000 2026 2309 1879 18822;18823;18824;18825;18826;18827;18828;18829;18830;18831;18832;18833;18834;18835;18836;18837;18838;18839;18840;18841;18842;18843;18844;18845;18846;18847;18848;18849;18850;18851;18852;18853;18854;18855;18856;18857;18858;18859;18860;18861 24043;24044;24045;24046;24047;24048;24049;24050;24051;24052;24053;24054;24055;24056;24057;24058;24059;24060;24061;24062;24063;24064;24065;24066;24067;24068;24069;24070;24071;24072;24073;24074;24075;24076;24077;24078;24079;24080;24081;24082;24083;24084;24085;24086;24087;24088;24089;24090;24091;24092;24093;24094;24095;24096;24097;24098;24099 24060 54 AISKDHLYGTLDPNTR Unmodified 1799.9166 0.91661131 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 43.716 43.716 3 0.022304 40362 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.871 27.176 60892000 0 0 0 0 0 0 0 60892000 0 0 0 0 0 2027 3053 1880 18862 24100 24100 0 AISPDKDNFYFDVK Unmodified 1657.7988 0.79878758 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 82.442 82.442 2;3 0.0031232 83545 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.911 69.046 192840000 143070000 0 0 0 0 0 0 0 0 49766000 0 0 0 2028 2993 1881 18863;18864;18865 24101;24102;24103 24103 3 AISPDKDNFYFDVKDDFDFGTMGHVIR Unmodified 3148.46 0.46003582 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 132.32 132.32 5 5.7153E-06 138842 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.259 48.356 120950000 0 0 0 0 0 0 0 0 32857000 0 53632000 34460000 0 2029 2993 1882 18866;18867;18868 24104;24105;24106 24105 3 AISPTSATSSGR Unmodified 1133.5677 0.56766543 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.459 18.459 2 0.00023021 10882 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.973 60.327 695770000 70743000 81596000 66384000 70704000 79365000 68297000 82397000 40450000 37957000 17022000 0 33348000 47503000 2030 4607 1883 18869;18870;18871;18872;18873;18874;18875;18876;18877;18878;18879;18880;18881 24107;24108;24109;24110;24111;24112;24113;24114;24115;24116;24117;24118;24119;24120 24118 13 AISQGHQAFLLEGDSSSR Unmodified 1901.9232 0.92315325 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 55.169 55.169 2;3 0.0002403 53681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.451 78.221 193020000 0 0 53002000 0 0 46696000 0 48075000 45251000 0 0 0 0 2031 1416 1884 18882;18883;18884;18885;18886;18887 24121;24122;24123;24124;24125;24126 24126 5 AISSASSPQSPGDALR Unmodified 1542.7638 0.76379906 3898 Q96KR1 ZFR Zinc finger RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 42.913 42.913 2 0.022887 39501 QUIQUE_C1403_190116_001 63.727 37.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2032 3898 1885 18888 24127 24127 1 AISSDMFFGR Unmodified 1129.5226 0.5226295 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PMU9;H0YDN9 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 95.54 95.54 2 0.028173 98818 QUIQUE_C1576_190116_001 55.112 36.336 56925000 0 0 0 22674000 0 0 17499000 0 0 0 0 0 16752000 2033 268 1886 18889;18890;18891 24128;24129;24130 24129 3 AISSPTVSR Unmodified 916.49779 0.49779495 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.188 20.188 2 0.00046275 12896 QUIQUE_C1277_190116_001 116.73 34.942 5465900000 715120000 870590000 771990000 682170000 629380000 0 625090000 0 0 252460000 919040000 0 0 2034 1687 1887 18892;18893;18894;18895;18896;18897;18898;18899;18900 24131;24132;24133;24134;24135;24136;24137;24138;24139 24132 4 AISSSAISR Unmodified 890.48214 0.48214489 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 19.395 19.395 2 0.01031 12396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.301 40.298 69828000 0 0 0 0 46128000 0 0 0 23700000 0 0 0 0 2035 1068 1888 18901;18902 24140;24141 24141 2 AITEASPAH Unmodified 895.43995 0.43994572 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 15.808 15.808 2 0.0068332 7891 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.287 49.772 21052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21052000 0 0 0 2036 4184 1889 18903 24142 24142 1 AITGIQAFTASK Unmodified 1206.6608 0.66083754 3771 Q92947 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.606 70.606 2 0.00048287 70943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.55 88.772 720250000 35048000 57479000 57096000 46023000 84703000 0 0 109250000 103530000 0 0 115950000 111170000 2037 3771 1890 18904;18905;18906;18907;18908;18909;18910;18911;18912 24143;24144;24145;24146;24147;24148;24149;24150;24151 24148 9 AITHLNNNFMFGQK Unmodified 1633.8035 0.8034958 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 0 0 1 1 70.827 70.827 3 0.0013476 67975 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.886 72.354 300840000 0 0 211180000 0 0 0 0 0 0 89656000 0 0 0 2038 2082 1891 18913;18914 24152;24153 24153 0 AITHLNNNFMFGQK Oxidation (M) 1649.7984 0.79841043 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 1 0 2 1 1 58.302 58.302 2;3 0.00063088 56346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.327 60.618 141500000 0 0 0 0 0 0 0 75398000 26553000 39548000 0 0 0 2039 2082 1891 18915;18916;18917;18918 24154;24155;24156;24157 24154 1411 4 AITIAGIPQSIIECVK Unmodified 1711.9542 0.95424237 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8VXH9;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 138.17 138.17 2;3 2.618E-19 140743 QUIQUE_C1563_190116_001 147.72 123.37 7988900000 532240000 597820000 684440000 618170000 648510000 596730000 546970000 575160000 773770000 198460000 763370000 724060000 729220000 2040 1044;3131 1892 18919;18920;18921;18922;18923;18924;18925;18926;18927;18928;18929;18930;18931;18932;18933;18934;18935;18936;18937 24158;24159;24160;24161;24162;24163;24164;24165;24166;24167;24168;24169;24170;24171;24172;24173;24174;24175;24176;24177;24178;24179;24180;24181;24182;24183;24184;24185;24186;24187;24188;24189;24190 24172 33 AITIAGR Unmodified 700.42317 0.42317345 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.824 22.824 2 0.020606 16263 QUIQUE_C1218_190116_001 107.65 57.116 1096200000 41568000 0 0 0 0 91810000 0 357650000 0 605170000 0 0 0 2041 3050 1893 18938;18939;18940;18941 24191;24192;24193;24194 24191 2 AITIAGVPQSVTECVK Unmodified 1671.8866 0.88655673 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 94.211 94.211 2 2.9458E-24 96367 QUIQUE_C1277_190116_001 151.26 151.26 9606200000 712830000 698270000 769370000 726260000 717210000 637870000 747980000 738180000 962540000 349760000 902470000 821900000 821510000 2042 3130 1894 18942;18943;18944;18945;18946;18947;18948;18949;18950;18951;18952;18953;18954;18955 24195;24196;24197;24198;24199;24200;24201;24202;24203;24204;24205;24206;24207;24208;24209;24210;24211;24212;24213;24214;24215;24216;24217;24218 24196 24 AITIANQTNCPLYITK Unmodified 1819.9502 0.95021962 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 2 3 3 2 3 4 3 4 3 3 4 4 88.937 88.937 2;3 4.5296E-66 90923 QUIQUE_C1218_190116_001 246.26 228.52 111070000000 9881300000 11321000000 8367200000 9752100000 10420000000 6653300000 9450900000 6923400000 7079900000 6603200000 9368100000 7793300000 7454500000 2043 365 1895 18956;18957;18958;18959;18960;18961;18962;18963;18964;18965;18966;18967;18968;18969;18970;18971;18972;18973;18974;18975;18976;18977;18978;18979;18980;18981;18982;18983;18984;18985;18986;18987;18988;18989;18990;18991;18992;18993;18994;18995;18996 24219;24220;24221;24222;24223;24224;24225;24226;24227;24228;24229;24230;24231;24232;24233;24234;24235;24236;24237;24238;24239;24240;24241;24242;24243;24244;24245;24246;24247;24248;24249;24250;24251;24252;24253;24254;24255;24256;24257;24258;24259;24260;24261;24262;24263;24264;24265;24266;24267;24268;24269;24270;24271;24272;24273;24274;24275;24276;24277;24278;24279 24220 57 AITIASQTNCPLYVTK Unmodified 1778.9237 0.92367052 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 81.555 81.555 2;3 7.4859E-36 82909 QUIQUE_C1403_190116_001 215.72 180.72 23009000000 1438200000 1483600000 1982000000 2066900000 1851700000 1460000000 2038700000 1407700000 2141800000 782280000 1816200000 1904100000 2635700000 2044 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.07 122.26 1169100000 109980000 0 61222000 93655000 168710000 112590000 69311000 87390000 120480000 0 97746000 87605000 160460000 2047 2880 1899 19017;19018;19019;19020;19021;19022;19023;19024;19025;19026;19027;19028 24312;24313;24314;24315;24316;24317;24318;24319;24320;24321;24322;24323;24324 24320 13 AITSAYYR Unmodified 943.47633 0.47633123 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A no no 0 0 0 1 1 1 31.743 31.743 2 0.014923 26784 QUIQUE_C1368_190116_001 85.359 71.688 351340000 0 0 351340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2048 3168 1900 19029;19030;19031 24325;24326;24327 24326 3 AITSGGITYQDQPWHADCFVCVTCSK Unmodified 3000.3204 0.32044758 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 111.79 111.79 3 7.7286E-70 114761 QUIQUE_DMIX7_190116_001 159.73 153.89 845490000 148630000 0 0 0 0 0 0 0 0 86537000 203480000 262800000 144050000 2049 3283 1901 19032;19033;19034;19035;19036;19037;19038 24328;24329;24330;24331;24332;24333;24334;24335;24336;24337;24338;24339 24336 12 AITTGLQEYVEAVSFQHFIK Unmodified 2280.179 0.17903358 3961 Q99598;C4P0D6;C4P0D8;Q5VVQ1 TSNAX;DISC1 Translin-associated protein X yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 146.4 146.4 2;3 3.0973E-30 152506 QUIQUE_C1218_190116_001 123.41 104.62 2609200000 164060000 165740000 0 355290000 220320000 230610000 154440000 276430000 251580000 74199000 262590000 175490000 278480000 2050 3961 1902 19039;19040;19041;19042;19043;19044;19045;19046;19047;19048;19049;19050;19051;19052;19053 24340;24341;24342;24343;24344;24345;24346;24347;24348;24349;24350;24351;24352;24353;24354;24355;24356;24357;24358;24359 24341 20 AITTSLTTK Unmodified 934.53351 0.53351176 4334 Q9NYU2;F8WCI2;F8WCE6 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 27.22 27.22 2 0.048831 21268 QUIQUE_C1218_190116_001 51.066 22.538 31930000 31930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2051 4334 1903 19054 24360 24360 1 AITVFSPDGHLFQVEYAQEAVK Unmodified 2448.2325 0.23252572 1448 O14818;Q8TAA3;F5GY34 PSMA7;PSMA8 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 2 127.53 127.53 2;3 8.7229E-77 133324 QUIQUE_DMIX5_190116_001 220.61 192.32 4961300000 423960000 514530000 580320000 518020000 374080000 388780000 369730000 241040000 319840000 148320000 398010000 282060000 402650000 2052 1448 1904 19055;19056;19057;19058;19059;19060;19061;19062;19063;19064;19065;19066;19067;19068;19069;19070;19071;19072;19073;19074;19075 24361;24362;24363;24364;24365;24366;24367;24368;24369;24370;24371;24372;24373;24374;24375;24376;24377;24378;24379;24380;24381;24382;24383;24384;24385;24386;24387;24388;24389;24390;24391 24386 31 AITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKK Unmodified 2576.3275 0.32748873 1448 O14818;Q8TAA3;F5GY34 PSMA7;PSMA8 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 110.41 110.41 3;4 1.8837E-12 113474 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.19 87.633 1901800000 53289000 63376000 62398000 52440000 78274000 36835000 66972000 301960000 233100000 0 448380000 263440000 241380000 2053 1448 1905 19076;19077;19078;19079;19080;19081;19082;19083;19084;19085;19086;19087;19088;19089;19090;19091 24392;24393;24394;24395;24396;24397;24398;24399;24400;24401;24402;24403;24404;24405;24406;24407;24408;24409;24410;24411;24412;24413 24409 21 AIVAGDQNVEYK Unmodified 1305.6565 0.65648044 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.207 40.207 2 4.5713E-06 37036 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.33 118.06 10230000000 1087600000 846960000 817420000 585210000 675310000 478680000 677890000 790010000 901140000 485450000 1027400000 1041200000 815600000 2054 3283 1906 19092;19093;19094;19095;19096;19097;19098;19099;19100;19101;19102;19103;19104;19105 24414;24415;24416;24417;24418;24419;24420;24421;24422;24423;24424;24425;24426;24427;24428;24429;24430;24431 24429 14 AIVAIENPADVSVISSR Unmodified 1739.9418 0.94176342 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 106.34 106.34 2;3 5.4908E-38 110797 QUIQUE_C1438_190116_001 165.7 144.66 6203200000 468890000 536160000 669900000 491800000 521920000 445970000 505990000 417100000 437560000 189460000 565100000 494600000 458710000 2055 225 1907 19106;19107;19108;19109;19110;19111;19112;19113;19114;19115;19116;19117;19118;19119;19120;19121;19122;19123;19124;19125 24432;24433;24434;24435;24436;24437;24438;24439;24440;24441;24442;24443;24444;24445;24446;24447;24448;24449;24450;24451;24452;24453;24454;24455;24456;24457;24458;24459;24460;24461;24462;24463;24464;24465;24466;24467 24443 36 AIVDALPPPCESACTVPTDVDK Unmodified 2354.1134 0.11339814 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 99.103 99.103 2;3 1.7538E-07 102121 QUIQUE_C1368_190116_001 77.681 61.584 654540000 182550000 0 132440000 114730000 113340000 0 111470000 0 0 0 0 0 0 2056 3120 1908 19126;19127;19128;19129;19130;19131;19132;19133;19134;19135 24468;24469;24470;24471;24472;24473;24474;24475;24476;24477;24478;24479;24480;24481;24482 24475 15 AIVDALPPPCESACTVPTDVDKWFHHQK Unmodified 3217.5325 0.53248926 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 1 2 2 2 3 3 2 1 1 1 1 114.45 114.45 3;4;5 1.5251E-15 118746 QUIQUE_C1368_190116_001 81.888 75.985 3261400000 356590000 337250000 395590000 359740000 642470000 0 474100000 61346000 0 0 137910000 149440000 346990000 2057 3120 1909 19136;19137;19138;19139;19140;19141;19142;19143;19144;19145;19146;19147;19148;19149;19150;19151;19152;19153 24483;24484;24485;24486;24487;24488;24489;24490;24491;24492;24493;24494;24495;24496;24497;24498;24499;24500;24501;24502;24503;24504;24505;24506;24507;24508;24509 24491 25 AIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAK Unmodified 3650.699 0.69897902 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7;F6QYI9;A0A0G2JJL7;K7EN69;K7ENP6;K7EL56;K7EIL8;F6SXL5 DDX39B;DDX39A Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 133.92 133.92 3;4 2.0737E-55 139685 QUIQUE_C1218_190116_001 138.9 134.22 2905700000 259550000 542620000 300050000 615690000 159480000 210070000 203300000 0 87320000 0 96847000 193530000 237190000 2058 3027 1910 19154;19155;19156;19157;19158;19159;19160;19161;19162;19163;19164;19165;19166;19167;19168;19169;19170 24510;24511;24512;24513;24514;24515;24516;24517;24518;24519;24520;24521;24522;24523;24524;24525;24526;24527;24528;24529;24530;24531;24532;24533;24534;24535 24511 25 AIVDCIISIIEENSESK Unmodified 1918.9558 0.95575851 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 170.15 170.15 2;3 2.6089E-23 174036 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.63 104.25 997980000 91813000 94543000 68553000 52822000 127090000 11849000 41253000 67370000 167720000 42527000 90612000 87087000 54738000 2059 4645 1911 19171;19172;19173;19174;19175;19176;19177;19178;19179;19180;19181;19182;19183;19184;19185;19186;19187;19188 24536;24537;24538;24539;24540;24541;24542;24543;24544;24545;24546;24547;24548;24549;24550;24551;24552;24553;24554;24555 24553 19 AIVDCIISIVEENPESK Unmodified 1914.9608 0.96084389 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 158.44 158.44 2;3 0.00021459 163005 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.077 41.285 94680000 0 0 0 0 0 29553000 0 0 0 7441800 26441000 16733000 14511000 2060 4396 1912 19189;19190;19191;19192;19193;19194;19195 24556;24557;24558;24559;24560;24561;24562 24561 7 AIVDVHFDPTTAFR Unmodified 1587.8045 0.80454166 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.15 113.15 3 5.7305E-05 115682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.09 83.144 388750000 19567000 0 0 0 36250000 23518000 22246000 62308000 65478000 0 64813000 51077000 43490000 2061 1408 1913 19196;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204 24563;24564;24565;24566;24567;24568;24569;24570;24571;24572;24573;24574 24568 12 AIVFEIMEAGEPTGPILGAEALPGGLR Unmodified 2707.4255 0.42548822 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 2 1 164 164 3 1.6568E-09 166120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.423 57.977 340690000 0 0 0 0 0 0 0 143760000 0 0 0 100190000 96730000 2062 921 1914 19205;19206;19207;19208 24575;24576;24577;24578 24575 4 AIVLAAIFR Unmodified 972.61204 0.61203685 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 118.11 118.11 2 0.01186 121885 QUIQUE_C1277_190116_001 72.138 46.402 4677600 0 4677600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2063 1211 1915 19209;19210;19211 24579;24580;24581 24579 3 AIVNVIGMHK Unmodified 1080.6114 0.61138492 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 46.192 46.192 2;3 0.0055939 43603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.706 38.843 113250000 20966000 16314000 0 0 0 0 0 28439000 15129000 0 32399000 0 0 2064 1644 1916 19212;19213;19214;19215;19216;19217 24582;24583;24584;24585;24586;24587 24584 6 AIVPILLDANVSTYDK Unmodified 1730.9455 0.94545182 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 130.99 130.99 2;3 1.1515E-06 137001 QUIQUE_C1218_190116_001 120.57 95.137 22750000000 2872800000 2606800000 2114600000 1808700000 1991600000 1330900000 2078900000 907060000 1058600000 1188800000 1811500000 1681400000 1298000000 2065 273;342 1917 19218;19219;19220;19221;19222;19223;19224;19225;19226;19227;19228;19229;19230;19231;19232;19233;19234;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;19242 24588;24589;24590;24591;24592;24593;24594;24595;24596;24597;24598;24599;24600;24601;24602;24603;24604;24605;24606;24607;24608;24609;24610;24611;24612;24613;24614;24615;24616;24617;24618;24619;24620;24621;24622;24623;24624;24625;24626 24589 39 AIVPILLDANVSTYDKIR Unmodified 2000.1306 0.13062683 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 2 2 124.05 124.05 3 1.8088E-08 130356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.04 101.44 487990000 0 0 0 0 0 0 0 0 91233000 0 242860000 153890000 0 2066 273;342 1918 19243;19244;19245;19246;19247;19248;19249 24627;24628;24629;24630;24631;24632;24633;24634 24632 7 AIVPLEAR Unmodified 867.5178 0.51780212 1445 O14776;G3V220 TCERG1 Transcription elongation regulator 1 yes no 0 0 0 1 46.115 46.115 2 0.063544 43417 QUIQUE_C1576_190116_001 52.403 27.771 15236000 0 0 0 0 0 0 15236000 0 0 0 0 0 0 2067 1445 1919 19250 24635 24635 1 AIVQDQGCLPGLILFMDHPNPPVVHSALLALR Unmodified 3490.8581 0.85812092 4310 Q9NVT9;E5RJ86;E9PR92;E5RHK3 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 155.71 155.71 4 7.148E-14 161076 QUIQUE_C1368_190116_001 68.516 66.703 1120500000 47846000 0 75908000 77627000 79314000 53426000 179590000 0 113630000 0 135940000 124240000 232980000 2068 4310 1920 19251;19252;19253;19254;19255;19256;19257;19258;19259;19260;19261 24636;24637;24638;24639;24640;24641;24642;24643;24644;24645;24646 24637 10 AIVQLVNER Unmodified 1040.5978 0.59784335 3110 Q15102;M0R389 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.636 52.636 2 0.0013568 49911 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.44 36.456 2614400000 607820000 0 0 0 197450000 0 157920000 580930000 339670000 91956000 167640000 248730000 222320000 2069 3110 1921 19262;19263;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270 24647;24648;24649;24650;24651;24652;24653;24654;24655;24656;24657;24658;24659;24660;24661 24661 13 AIVQQWLEYR Unmodified 1304.6877 0.68772099 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9;H0YAL7;D6RCQ0 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.89 105.89 2 0.00033435 108845 QUIQUE_C1277_190116_001 133.86 94.841 543620000 57112000 59581000 64603000 61532000 0 54381000 64928000 50659000 0 26959000 103870000 0 0 2070 1523 1922 19271;19272;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281 24662;24663;24664;24665;24666;24667;24668;24669;24670;24671;24672;24673 24663 12 AIVSILNYVIYK Unmodified 1394.8173 0.81733818 3550 Q8IXQ6 PARP9 Poly [ADP-ribose] polymerase 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 145.05 145.05 2 0.016673 152225 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.084 38.413 39872000 0 0 0 0 0 0 0 13842000 0 0 26030000 0 0 2071 3550 1923 19282;19283;19284 24674;24675;24676 24676 3 AIVTSEQSGETELK Unmodified 1490.7464 0.74641766 4717 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.25 20.25 3 0.0057593 13396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.594 13.87 4483000000 0 540340000 436310000 0 0 241150000 0 490980000 659690000 0 797410000 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A0A087X2H1;Q9ULT8;H0YJD4 HECTD1 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 yes no 0 0 0 1 70.443 70.443 2 0.06398 71695 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.299 24.192 10985000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10985000 0 0 2075 123 1927 19309 24703 24703 1 AIWAALQTQTSNAAK Unmodified 1572.826 0.82600539 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.686 84.686 2 0.006127 87004 QUIQUE_C1218_190116_001 93.345 78.655 119470000 35339000 0 0 0 0 0 0 30340000 38186000 15602000 0 0 0 2076 4334 1928 19310;19311;19312;19313 24704;24705;24706;24707 24704 2 AIWGYCDQLK Unmodified 1252.591 0.59104341 3915 Q96P70 IPO9 Importin-9 yes yes 0 0 0 1 85.373 85.373 2 0.044864 86884 QUIQUE_C1277_190116_001 49.536 35.329 26776000 0 26776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2077 3915 1929 19314 24708 24708 1 AIWHAFTALDQDHSGK Unmodified 1795.8642 0.86418181 4425 Q9UH65;E7EMB1;E9PJK8 SWAP70 Switch-associated protein 70 yes no 0 0 0 1 1 71.179 71.179 3 0.0035605 70308 QUIQUE_C1563_190116_001 31.319 17.603 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Unmodified 1097.5869 0.58694431 4306 Q9NVH1;B1AK20;Q5TH61 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes no 0 0 1 1 1 47.452 47.452 3 0.0076297 44356 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.729 36.895 24590000 0 0 0 0 0 0 0 24590000 0 0 0 0 0 2083 4306 1935 19363;19364 24762;24763 24762 2 AIYDTPCIQAESEK Unmodified 1623.745 0.74503745 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.255 67.255 2 1.0362E-06 66651 QUIQUE_C1403_190116_001 145.55 124.68 747020000 71178000 81398000 86563000 90701000 69603000 55166000 90989000 0 32055000 29073000 47551000 41446000 51300000 2084 1389 1936 19365;19366;19367;19368;19369;19370;19371;19372;19373;19374;19375;19376 24764;24765;24766;24767;24768;24769;24770;24771;24772;24773;24774;24775;24776;24777 24768 13 AIYFDGDFGQIVR Unmodified 1499.7409 0.74087877 3932 Q96RP9;C9IZ01;F8WAU4 GFM1 Elongation factor G, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 126.85 126.85 2 0.026807 131458 QUIQUE_C1218_190116_001 58.37 21.258 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21.309 21.309 3 0.030483 14313 QUIQUE_C1218_190116_001 35.35 21.946 21840000 21840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2093 2953 1945 19431 24834 24834 1 AKDELSAQAEVK Unmodified 1287.667 0.66704513 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 19.095 19.095 2 0.045282 11419 QUIQUE_C1277_190116_001 68.676 42.571 101970000 0 101970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2094 1472 1946 19432 24835 24835 1 AKDELSAQAEVKK Unmodified 1415.762 0.76200815 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 12.849 12.849 3 0.0015786 4932 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.01 43.443 86960000 0 0 0 0 0 0 0 10073000 13113000 0 0 60539000 3234900 2095 1472 1947 19433;19434;19435;19436 24836;24837;24838;24839 24838 3 AKDEQSAVSMLK Oxidation (M) 1321.6548 0.65476588 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 19.217 19.217 2;3 4.6953E-13 11621 QUIQUE_C1368_190116_001 163.59 132.06 9808200000 430660000 1150600000 855580000 560140000 867850000 642670000 670010000 919170000 563600000 636190000 757220000 1062000000 692510000 2096 2851 1948 19437;19438;19439;19440;19441;19442;19443;19444;19445;19446;19447;19448;19449;19450;19451;19452;19453;19454;19455;19456;19457 24840;24841;24842;24843;24844;24845;24846;24847;24848;24849;24850;24851;24852;24853;24854;24855;24856;24857;24858;24859;24860 24843 2279 18 AKDEQSAVSMLK Unmodified 1305.6599 0.65985126 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 30.535 30.535 2;3 1.0908E-44 24548 QUIQUE_C1368_190116_001 201 148.06 7031000000 1057600000 989650000 1032500000 882140000 453870000 691540000 587240000 165040000 594980000 68444000 263500000 0 244600000 2097 2851 1948 19458;19459;19460;19461;19462;19463;19464;19465;19466;19467;19468;19469;19470;19471;19472;19473;19474;19475 24861;24862;24863;24864;24865;24866;24867;24868;24869;24870;24871;24872;24873;24874;24875;24876;24877;24878;24879 24867 19 AKDEQSAVSMLKK Oxidation (M) 1449.7497 0.7497289 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 2 1 1 1 5 2 2 1 14.089 14.089 2;3;4 3.1751E-05 6287 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.49 104.82 2344200000 0 0 0 11755000 0 0 0 284820000 976180000 0 268120000 529000000 274340000 2098 2851 1949 19476;19477;19478;19479;19480;19481;19482;19483;19484;19485;19486;19487;19488 24880;24881;24882;24883;24884;24885;24886;24887;24888;24889;24890;24891;24892 24884 2279 8 AKDGLVVFGK Unmodified 1032.5968 0.59678072 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 1 1 38.463 38.463 2 0.033668 35116 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.867 74.241 380420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 380420000 0 0 2099 2941 1950 19489 24893 24893 0 AKDHGLEVLGLVR Unmodified 1405.8041 0.80414773 3834 Q96DE0 NUDT16 U8 snoRNA-decapping enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.325 64.325 3 0.0030472 63841 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.277 52.024 524610000 35223000 54248000 53554000 0 43804000 44803000 35815000 71810000 73617000 19662000 0 54445000 37631000 2100 3834 1951 19490;19491;19492;19493;19494;19495;19496;19497;19498;19499;19500 24894;24895;24896;24897;24898;24899;24900;24901;24902;24903;24904;24905;24906;24907 24903 13 AKDINQEVYNFLATAGAK Unmodified 1952.0003 0.0003409361 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 125.56 125.56 2;3 6.6444E-29 129651 QUIQUE_DMIX8_190116_001 183 160.94 3108800000 98262000 0 110220000 0 0 0 135080000 545140000 491930000 37563000 694450000 346270000 649910000 2101 3975 1952 19501;19502;19503;19504;19505;19506;19507;19508;19509;19510;19511 24908;24909;24910;24911;24912;24913;24914;24915;24916;24917;24918;24919;24920 24920 9 AKDPFAHLPK Unmodified 1122.6186 0.61857879 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.019 26.019 3 0.0032386 21085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.486 46.345 2735700000 294510000 527610000 358360000 0 0 0 0 453150000 0 0 750090000 351950000 0 2102 2255 1953 19512;19513;19514;19515;19516;19517 24921;24922;24923;24924;24925;24926;24927;24928 24926 8 AKDQDILDLVGVLHDPETLLR Unmodified 2359.2747 0.27472488 483 F5H345;A0A3B3IRR1;A0A3F2YNY7;P08397 HMBS Porphobilinogen deaminase yes no 0 0 1 1 150.77 150.77 4 9.8644E-05 156543 QUIQUE_C1368_190116_001 63.056 48.596 45542000 0 0 45542000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2103 483 1954 19518 24929 24929 1 AKDQNESLDEEMFYK Unmodified 1845.8091 0.80909427 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 66.399 66.399 2;3 8.0288E-60 66361 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.06 206.21 289790000 0 42897000 29842000 0 0 0 21215000 38660000 46872000 0 91957000 18344000 0 2104 3800 1955 19519;19520;19521;19522;19523;19524;19525;19526;19527 24930;24931;24932;24933;24934;24935;24936;24937;24938 24935 9 AKEALELTDTGLLSGSEER Unmodified 2018.0168 0.016778861 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 86.562 86.562 3 0.06071 89893 QUIQUE_DMIX5_190116_001 30.288 15.594 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24942;24943;24944;24945;24946;24947;24948;24949;24950;24951;24952;24953;24954;24955;24956;24957;24958;24959;24960;24961;24962;24963;24964;24965;24966;24967;24968;24969;24970 24947 26 AKEEQQDDTVYMGK Unmodified 1640.7352 0.73520105 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 21.334 21.334 2;3 2.5516E-149 14260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 262.11 241.28 402090000 51282000 49214000 66487000 0 0 0 39808000 0 49324000 0 74466000 0 71505000 2108 890;3052 1959 19553;19554;19555;19556;19557;19558;19559;19560;19561;19562;19563;19564 24971;24972;24973;24974;24975;24976;24977;24978;24979;24980;24981;24982;24983 24981 12 AKEEQQDDTVYMGK Oxidation (M) 1656.7301 0.73011567 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 1 1 1 1 1 1 2 2 14.793 14.793 2;3 2.1629E-27 7155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.61 159.91 343920000 0 0 0 0 0 34415000 0 29691000 52799000 21569000 126140000 0 79310000 2109 890;3052 1959 19565;19566;19567;19568;19569;19570;19571;19572 24984;24985;24986;24987;24988;24989;24990;24991 24988 525 8 AKEFTNVYIK Unmodified 1211.655 0.65502388 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YBN4;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YCC8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 36.4 36.4 2 0.003841 32170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.29 55.322 309750000 0 0 0 37280000 0 0 38942000 48654000 71474000 0 113400000 0 0 2110 2031;596 1960 19573;19574;19575;19576;19577 24992;24993;24994;24995;24996 24995 4 AKEILQEEEDLAEIVQLVGK Unmodified 2253.2104 0.21039329 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 3 2 154.19 154.19 2;3 3.2341E-100 161287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 240.29 221.46 7071400000 302060000 464580000 367890000 277460000 557580000 250630000 432830000 714580000 902340000 67222000 1148600000 838720000 746850000 2111 2414 1961 19578;19579;19580;19581;19582;19583;19584;19585;19586;19587;19588;19589;19590;19591;19592;19593;19594;19595;19596;19597;19598;19599 24997;24998;24999;25000;25001;25002;25003;25004;25005;25006;25007;25008;25009;25010;25011;25012;25013;25014;25015;25016;25017;25018;25019;25020;25021;25022;25023;25024;25025;25026;25027;25028;25029;25030;25031;25032 25023 36 AKELDPTNMTYITNQAAVYFEK Unmodified 2546.2363 0.23629047 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 1 1 133.12 133.12 3 0.010865 139983 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.79 28.758 52365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52365000 0 0 2112 2343 1962 19600 25033 25033 1 AKELNVMFIETSAK Unmodified 1579.828 0.82797922 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 0 1 1 76.581 76.581 3 0.0016708 76487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.657 44.029 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2113 2167 1963 19601 25034 25034 1 AKEPTKLADVYQAELR Unmodified 1830.984 0.98396259 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 1 55.528 55.528 2 9.3612E-16 54818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.27 141.64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2114 389;395;1336 1964 19602 25035 25035 1 AKEVLEEISCYPENNDAK Unmodified 2107.9732 0.97319949 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 1 1 1 1 67.901 67.901 3 0.0060868 67816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.965 40.846 182260000 0 0 33269000 0 0 0 0 32365000 43790000 0 35933000 0 36903000 2115 472;1460 1965 19603;19604;19605;19606;19607 25036;25037;25038;25039;25040 25038 4 AKFDGIFESLLPINGLLSGDK Unmodified 2233.1994 0.19943467 4394 Q9UBC2;M0R165 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.31 163.31 3 0.0015867 167770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.645 42.826 279830000 17679000 33186000 25932000 18243000 24450000 7906500 0 60223000 92209000 0 0 0 0 2116 4394 1966 19608;19609;19610;19611;19612;19613;19614;19615 25041;25042;25043;25044;25045;25046;25047;25048 25048 8 AKFEELNMDLFR Unmodified 1511.7442 0.74424959 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.56 107.56 3 0.00035433 111009 QUIQUE_C1368_190116_001 100.04 85.351 2626700000 207470000 231700000 207480000 199300000 227280000 231070000 255890000 171250000 213600000 72244000 354110000 255280000 0 2117 2007 1967 19616;19617;19618;19619;19620;19621;19622;19623;19624;19625;19626;19627 25049;25050;25051;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25061;25062 25052 13 AKFEELNMDLFR Oxidation (M) 1527.7392 0.73916421 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 1 1 1 85.34 85.34 3 0.044887 85674 QUIQUE_C1563_190116_001 45.28 29.142 31963000 0 0 0 0 0 31963000 0 0 0 0 0 0 0 2118 2007 1967 19628 25063 25063 1286 1 AKFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIK Oxidation (M) 3327.7095 0.70945057 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 yes yes 0 1 1 1 160.31 160.31 4 1.6581E-05 162830 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175450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.183 52.883 235020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 169190000 65825000 0 2122 612 1970 19637;19638;19639 25072;25073;25074 25072 3 AKGQALPDVVAK Unmodified 1195.6925 0.69247202 1665 O75891;C9IZ36;C9JYZ6;C9JY00;D6RFJ7 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 25.857 25.857 2 0.033508 19756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.214 44.635 30511000 0 0 0 0 0 0 0 30511000 0 0 0 0 0 2123 1665 1971 19640 25075 25075 1 AKIELLGSYDPQK Unmodified 1460.7875 0.78749461 2231 P24666 ACP1 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase yes yes 0 0 1 1 66.467 66.467 3 0.043968 66075 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.343 31.765 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2124 2231 1972 19641 25076 25076 1 AKIMLDNMR Oxidation (M) 1106.5576 0.55763479 2937 Q0VDG4 SCRN3 Secernin-3 yes yes 0 1 1 1 93.302 93.302 1 0.044315 95237 QUIQUE_C1403_190116_001 55.902 15.4 47463000 0 0 0 47463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2125 2937 1973 19642 25077 25077 1 AKLDENSAFLQFNWK Unmodified 1809.905 0.90498399 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A1B0GV13;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 111.66 111.66 2;3 2.2246E-17 116477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.84 146.39 329030000 0 0 0 0 0 0 0 109850000 0 30971000 188220000 0 0 2126 267;275;3025 1974 19643;19644;19645 25078;25079;25080;25081 25081 4 AKLEEQAQQIR Unmodified 1312.7099 0.709913 1822 P02649 APOE Apolipoprotein E yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 20.819 20.819 2;3 1.3313E-07 13562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.58 137.05 5980800000 324730000 359580000 393380000 232100000 401070000 336470000 386660000 439270000 1173800000 0 796520000 552870000 584370000 2127 1822 1975 19646;19647;19648;19649;19650;19651;19652;19653;19654;19655;19656;19657;19658;19659;19660;19661;19662;19663;19664;19665;19666;19667;19668 25082;25083;25084;25085;25086;25087;25088;25089;25090;25091;25092;25093;25094;25095;25096;25097;25098;25099;25100;25101;25102;25103;25104 25099 15 AKLEETITQAR Unmodified 1258.6881 0.68811492 2640 P54289;H0Y715 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.747 27.747 2 0.0033848 21549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.74 74.394 592170000 0 117370000 90951000 0 0 0 0 94888000 85331000 0 104690000 98936000 0 2128 2640 1976 19669;19670;19671;19672;19673;19674;19675;19676 25105;25106;25107;25108;25109;25110;25111;25112;25113;25114 25111 9 AKLEQLFQDEVAK Unmodified 1517.809 0.80895834 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 80.688 80.688 2;3 7.2351E-12 82375 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.98 151.28 6551100000 122740000 165930000 410290000 86189000 433770000 92335000 393100000 1129800000 1086800000 0 1061000000 847000000 722130000 2129 3117 1977 19677;19678;19679;19680;19681;19682;19683;19684;19685;19686;19687;19688;19689;19690;19691;19692;19693;19694;19695;19696;19697 25115;25116;25117;25118;25119;25120;25121;25122;25123;25124;25125;25126;25127;25128;25129;25130;25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139 25128 24 AKNEILDEVISLSQVTPK Unmodified 1983.0888 0.088821592 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.77 135.77 2;3 1.6122E-22 140527 QUIQUE_C1368_190116_001 173.36 162.88 4204200000 272700000 302240000 282730000 246740000 402700000 178060000 387390000 235270000 375990000 110610000 593030000 370020000 446690000 2130 831;1569 1978 19698;19699;19700;19701;19702;19703;19704;19705;19706;19707;19708;19709;19710;19711;19712;19713;19714;19715;19716;19717;19718;19719;19720;19721;19722;19723 25140;25141;25142;25143;25144;25145;25146;25147;25148;25149;25150;25151;25152;25153;25154;25155;25156;25157;25158;25159;25160;25161;25162;25163;25164;25165;25166;25167;25168;25169;25170;25171;25172 25147 33 AKPAEAPAAAAPK Unmodified 1191.6612 0.66117189 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.458 10.458 3 0.0010272 3206 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.089 47.61 736310000 53261000 0 0 74481000 0 0 13676000 0 116480000 219420000 0 230110000 28882000 2131 2404 1979 19724;19725;19726;19727;19728;19729;19730 25173;25174;25175;25176;25177;25178;25179 25177 5 AKPLTDQEK Acetyl (Protein N-term) 1070.5608 0.56078914 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 1 0 1 1 19.716 19.716 2 0.046268 12245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.691 45.489 19599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19599000 0 0 0 2132 948 1980 19731 25180 25180 1 AKPLTDSEKR Acetyl (Protein N-term) 1185.6354 0.63535107 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 1 0 2 1 1 1 1 1 14.105 14.105 3 0.0017567 6262 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.75 62.122 1666500000 0 0 0 0 11889000 313750000 0 679040000 374510000 0 0 287300000 0 2133 2016 1981 19732;19733;19734;19735;19736 25181;25182;25183;25184;25185 25185 2 AKPSAPVVSGPAAR Unmodified 1306.7357 0.73573382 2803 P78324;Q5TFQ8 SIRPA;SIRPB1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 19.198 19.198 2;3 0.0043899 11771 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.692 67.862 2824100000 205460000 635660000 282680000 0 0 201460000 963850000 0 0 301720000 233300000 0 0 2134 2803 1982 19737;19738;19739;19740;19741;19742;19743;19744;19745 25186;25187;25188;25189;25190;25191;25192;25193;25194 25192 5 AKPSPAPPSTTTAPDASGPQK Unmodified 2005.0116 0.011633904 2429 P40855;Q5QNY5;B7Z8B3;E9PS71 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 21.908 21.908 3 5.3222E-12 15413 QUIQUE_C1218_190116_001 79.942 71.472 282510000 66210000 0 0 44237000 0 54319000 73626000 0 0 0 0 44116000 0 2135 2429 1983 19746;19747;19748;19749;19750 25195;25196;25197;25198;25199 25195 5 AKPYEGSILEADCDILIPAASEK Unmodified 2489.236 0.23595611 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 114.21 114.21 2;3 2.9698E-99 118282 QUIQUE_C1368_190116_001 216.3 203.38 41447000000 3613700000 3219100000 4621400000 3808000000 3986800000 3682800000 3497900000 2026500000 2068500000 1135800000 3650600000 2914500000 3221400000 2136 1777 1984 19751;19752;19753;19754;19755;19756;19757;19758;19759;19760;19761;19762;19763;19764;19765;19766;19767;19768;19769;19770;19771;19772;19773;19774;19775;19776 25200;25201;25202;25203;25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25211;25212;25213;25214;25215;25216;25217;25218;25219;25220;25221;25222;25223;25224;25225;25226;25227;25228;25229;25230;25231;25232;25233;25234;25235;25236;25237;25238;25239;25240;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249 25212 50 AKTDHGAEIVYK Unmodified 1330.6881 0.68811492 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 13.323 13.323 2;3 1.6614E-05 6005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.45 95.85 1123100000 0 8281200 0 3914100 0 773520 0 831270000 102500000 9464900 0 128020000 38844000 2137 291;1247 1985 19777;19778;19779;19780;19781;19782;19783;19784;19785;19786;19787 25250;25251;25252;25253;25254;25255;25256;25257;25258;25259;25260;25261;25262 25255 12 AKVDFILLK Unmodified 1045.6536 0.65356732 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 73.053 73.053 2 0.0035473 73790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.11 75.55 613970000 0 0 0 0 0 0 0 251340000 153540000 0 0 209080000 0 2138 3753 1986 19788;19789;19790 25263;25264;25265 25263 3 AKWDAWNALGSLPK Unmodified 1555.8147 0.81471242 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 112.3 112.3 3 0.042915 114597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.008 40.903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2139 236 1987 19791 25266 25266 1 AKWDAWNELK Unmodified 1259.6299 0.62987176 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 72.869 72.869 2;3 0.0053012 73228 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.82 82.826 1979600000 0 0 0 0 145050000 0 0 251110000 717630000 0 0 293280000 572540000 2140 1914 1988 19792;19793;19794;19795;19796;19797 25267;25268;25269;25270;25271;25272 25269 4 AKWEAWNLK Unmodified 1144.6029 0.60292873 3608 Q8N6N7 ACBD7 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 7 yes yes 0 0 1 1 1 57.919 57.919 3 0.01241 57567 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.089 39.907 16807000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16807000 0 0 2141 3608 1989 19798;19799 25273;25274 25274 2 AKWEMPFDPQDTHQSR Unmodified 1971.8897 0.88974463 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 1 2 2 2 67.066 67.066 2;3;4 0.00074778 67632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.883 45.043 207300000 0 0 0 0 0 0 0 48209000 0 0 55376000 0 103710000 2142 1800 1990 19800;19801;19802;19803;19804;19805 25275;25276;25277;25278;25279;25280 25277 6 AKWYPEVR Unmodified 1047.5502 0.55016488 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 1 1 34.628 34.628 3 0.041527 30299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.603 33.446 45462000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45462000 0 0 2143 2776 1991 19806 25281 25281 1 AKYPDYEVTWANDGY Unmodified 1790.7788 0.77878042 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 106.59 106.59 2 5.6069E-08 109664 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.42 115.06 568630000 0 81893000 89055000 44741000 97761000 58262000 0 0 196920000 0 0 0 0 2144 4277 1992 19807;19808;19809;19810;19811;19812;19813 25282;25283;25284;25285;25286;25287;25288 25287 6 ALAAAAAAAAAGVSQAAVLGFLQEHGGK Acetyl (Protein N-term) 2562.3554 0.35543482 3214 Q2M3V2 SOWAHA Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHA yes yes 1 0 0 1 1 1 175.02 175.02 3 1.1211E-12 180718 QUIQUE_C1438_190116_001 69.639 63.296 14746000 0 0 0 0 6878900 0 0 7866700 0 0 0 0 0 2145 3214 1993 19814;19815;19816 25289;25290;25291 25290 3 ALAAAGYDVEK Unmodified 1106.5608 0.56078914 1996 P22492;P16403;Q02539;P10412;P16402 HIST1H1T;HIST1H1C;HIST1H1A;HIST1H1E;HIST1H1D Histone H1t;Histone H1.2;Histone H1.1;Histone H1.4;Histone H1.3 yes no 0 0 0 1 1 1 41.263 41.263 2 0.0010651 36920 QUIQUE_C1563_190116_001 105.4 66.374 168070000 0 24525000 0 0 0 110580000 0 0 0 32972000 0 0 0 2146 1996 1994 19817;19818;19819 25292;25293;25294 25293 2 ALAAELNQLR Unmodified 1097.6193 0.61930707 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 8 14 16 14 10 15 11 13 14 11 12 11 14 118.26 118.26 1;2;3 1.9722E-39 69747 QUIQUE_C1576_190116_001 219.72 182.16 782140000000 55117000000 59865000000 65252000000 64491000000 57984000000 64166000000 58055000000 62214000000 57396000000 53661000000 56902000000 62593000000 64445000000 2147 389;395;1336 1995 19820;19821;19822;19823;19824;19825;19826;19827;19828;19829;19830;19831;19832;19833;19834;19835;19836;19837;19838;19839;19840;19841;19842;19843;19844;19845;19846;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;19859;19860;19861;19862;19863;19864;19865;19866;19867;19868;19869;19870;19871;19872;19873;19874;19875;19876;19877;19878;19879;19880;19881;19882;19883;19884;19885;19886;19887;19888;19889;19890;19891;19892;19893;19894;19895;19896;19897;19898;19899;19900;19901;19902;19903;19904;19905;19906;19907;19908;19909;19910;19911;19912;19913;19914;19915;19916;19917;19918;19919;19920;19921;19922;19923;19924;19925;19926;19927;19928;19929;19930;19931;19932;19933;19934;19935;19936;19937;19938;19939;19940;19941;19942;19943;19944;19945;19946;19947;19948;19949;19950;19951;19952;19953;19954;19955;19956;19957;19958;19959;19960;19961;19962;19963;19964;19965;19966;19967;19968;19969;19970;19971;19972;19973;19974;19975;19976;19977;19978;19979;19980;19981;19982 25295;25296;25297;25298;25299;25300;25301;25302;25303;25304;25305;25306;25307;25308;25309;25310;25311;25312;25313;25314;25315;25316;25317;25318;25319;25320;25321;25322;25323;25324;25325;25326;25327;25328;25329;25330;25331;25332;25333;25334;25335;25336;25337;25338;25339;25340;25341;25342;25343;25344;25345;25346;25347;25348;25349;25350;25351;25352;25353;25354;25355;25356;25357;25358;25359;25360;25361;25362;25363;25364;25365;25366;25367;25368;25369;25370;25371;25372;25373;25374;25375;25376;25377;25378;25379;25380;25381;25382;25383;25384;25385;25386;25387;25388;25389;25390;25391;25392;25393;25394;25395;25396;25397;25398;25399;25400;25401;25402;25403;25404;25405;25406;25407;25408;25409;25410;25411;25412;25413;25414;25415;25416;25417;25418;25419;25420;25421;25422;25423;25424;25425;25426;25427;25428;25429;25430;25431;25432;25433;25434;25435;25436;25437;25438;25439;25440;25441;25442;25443;25444;25445;25446;25447;25448;25449;25450;25451;25452;25453;25454;25455;25456;25457;25458;25459;25460;25461;25462;25463;25464;25465;25466;25467;25468;25469;25470;25471;25472;25473;25474;25475;25476;25477;25478;25479;25480;25481;25482;25483;25484;25485;25486;25487;25488;25489;25490;25491;25492;25493;25494;25495;25496;25497;25498;25499;25500;25501;25502;25503;25504;25505;25506;25507;25508;25509;25510;25511;25512;25513;25514;25515;25516;25517;25518;25519;25520;25521;25522;25523;25524;25525;25526;25527;25528;25529;25530;25531;25532;25533;25534;25535;25536;25537;25538;25539;25540;25541;25542;25543;25544;25545;25546;25547;25548;25549;25550;25551;25552;25553;25554;25555;25556;25557;25558;25559;25560;25561;25562;25563;25564;25565;25566;25567;25568;25569;25570;25571;25572;25573;25574;25575;25576;25577;25578;25579;25580;25581;25582;25583;25584;25585;25586;25587;25588;25589;25590;25591;25592;25593;25594;25595;25596;25597;25598;25599;25600;25601;25602;25603;25604;25605;25606;25607;25608;25609;25610;25611;25612;25613;25614;25615;25616;25617;25618;25619;25620;25621 25447 302 ALAAFLK Unmodified 732.45341 0.45341094 2417 P39019;M0R2L9;M0QXK4;M0QYF7;M0R140 RPS19 40S ribosomal protein S19 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.109 61.109 2 0.043299 60767 QUIQUE_C1277_190116_001 80.377 21.717 341430000 0 61397000 0 0 0 0 0 0 89389000 0 66238000 54604000 69802000 2148 2417 1996 19983;19984;19985;19986;19987 25622;25623;25624;25625;25626;25627 25622 6 ALAAGGVGSIVR Unmodified 1069.6244 0.62439245 1503 O15511 ARPC5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.57 54.57 2 0.0041263 52516 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.1 35.292 3470600000 0 0 417600000 375170000 371420000 0 360720000 307250000 336830000 152680000 402460000 308770000 437660000 2149 1503 1997 19988;19989;19990;19991;19992;19993;19994;19995;19996;19997 25628;25629;25630;25631;25632;25633;25634;25635;25636;25637 25633 10 ALAAPAAEEKEEAR Unmodified 1454.7365 0.73652168 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 19.828 19.828 2;3 0.00025235 12685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.234 60.215 539660000 0 0 44404000 127030000 0 0 0 0 154610000 0 117950000 0 95657000 2150 2859 1998 19998;19999;20000;20001;20002;20003;20004 25638;25639;25640;25641;25642;25643;25644 25643 7 ALAAQLPVLPR Unmodified 1147.7077 0.70772815 3860 Q96GK7;C9JGM0 FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.29 90.29 2 0.00043381 92593 QUIQUE_C1368_190116_001 134.15 98.794 774650000 72270000 75763000 84884000 60698000 66089000 74159000 73544000 0 61078000 33845000 62097000 40391000 69832000 2151 3860 1999 20005;20006;20007;20008;20009;20010;20011;20012;20013;20014;20015;20016 25645;25646;25647;25648;25649;25650;25651;25652;25653;25654;25655;25656;25657;25658;25659;25660;25661;25662;25663 25649 15 ALAAQLPVLPWSEVTFLAPVTWPDK Unmodified 2748.4891 0.48907475 3380 Q6P2I3 FAHD2B Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 172.17 172.17 2;3 3.0724E-17 176708 QUIQUE_C1218_190116_001 96.303 89.509 913900000 51792000 71545000 54180000 47491000 75767000 82426000 34008000 72210000 127900000 21976000 189380000 22296000 62935000 2152 3380 2000 20017;20018;20019;20020;20021;20022;20023;20024;20025;20026;20027;20028;20029;20030;20031;20032;20033;20034;20035;20036;20037 25664;25665;25666;25667;25668;25669;25670;25671;25672;25673;25674;25675;25676;25677;25678;25679;25680;25681;25682;25683;25684;25685;25686 25665 23 ALAASALPAQGSR Unmodified 1211.6622 0.66223452 1227 H7C0V0;Q8WWC4 C2orf47 Uncharacterized protein C2orf47, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.299 71.299 2 0.02259 72236 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.805 15.509 375040000 0 0 39584000 0 113900000 0 58229000 0 0 0 61211000 0 102120000 2153 1227 2001 20038;20039;20040;20041;20042 25687;25688;25689;25690;25691;25692 25691 6 ALAAVLLQALDR Unmodified 1252.7503 0.75032125 1493 O15240;Q05BJ3 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 0 1 142.8 142.8 2 0.0044113 147779 QUIQUE_C1218_190116_001 69.276 42.892 26685000 26685000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2154 1493 2002 20043 25693 25693 1 ALAAVLLQALDRPASPPAPSGSQQGPEEEAAEALLTETVR Unmodified 4053.1019 0.10185248 1493 O15240;Q05BJ3 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 1 1 1 164.67 164.67 4 0.00021859 167789 QUIQUE_C1403_190116_001 34.91 33.489 101190000 51785000 0 0 49400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2155 1493 2003 20044;20045 25694;25695 25695 1 ALADDVVGSVLDCFSFQETDK Unmodified 2315.0627 0.062742776 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 2 166.55 166.55 2;3 1.0067E-06 170380 QUIQUE_C1277_190116_001 84.566 77.685 56917000 0 15929000 0 0 21211000 0 0 0 0 0 0 19776000 0 2156 1283 2004 20046;20047;20048;20049 25696;25697;25698;25699 25696 4 ALADEREAVQK Unmodified 1228.6412 0.64116473 2851;1472;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;O15020;A4QPE4;E9PJZ2;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 1 1 1 1 18.267 18.267 2 0.04816 11241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.157 14.454 352120000 0 0 0 0 0 0 0 230100000 0 0 54191000 0 67820000 2157 2851;1472;754 2005 20050;20051;20052 25700;25701;25702 25700 3 ALADEREAVQKK Unmodified 1356.7361 0.73612775 2851;1472;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;O15020;A4QPE4;E9PJZ2;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 2 1 1 13.194 13.194 3 0.011994 5737 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.962 42.708 250040000 0 0 0 0 0 0 0 155370000 0 0 0 94664000 0 2158 2851;1472;754 2006 20053;20054 25703;25704 25703 2 ALADLVHSHIQSNELCSK Unmodified 2021 2.33601E-05 2203 P22830 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 73.482 73.482 3 0.0017653 70169 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.185 44.322 250230000 93662000 88510000 0 0 0 0 0 44496000 0 23560000 0 0 0 2159 2203 2007 20055;20056;20057;20058 25705;25706;25707;25708 25708 2 ALADSTR Acetyl (Protein N-term) 774.38718 0.38718187 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 1 0 0 1 1 1 31.068 31.068 1 0.03666 26473 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.92 98.996 768980000 0 0 0 0 304930000 0 0 213570000 250490000 0 0 0 0 2160 3827 2008 20059;20060;20061 25709;25710;25711 25710 2 ALADVATVLGR Unmodified 1084.6241 0.6240581 3731 Q92542;H0Y6T7 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.33 93.33 2 0.0013784 96511 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.744 40.064 191080000 0 0 0 0 39459000 0 0 63562000 0 14856000 73198000 0 0 2161 3731 2009 20062;20063;20064;20065 25712;25713;25714;25715 25715 4 ALADYIR Unmodified 820.4443 0.44430282 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.729 62.729 2 0.023795 63905 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156070000 2164 3993 2012 20080;20081;20082;20083;20084;20085;20086;20087;20088;20089;20090;20091;20092;20093;20094;20095;20096;20097;20098;20099;20100;20101;20102 25734;25735;25736;25737;25738;25739;25740;25741;25742;25743;25744;25745;25746;25747;25748;25749;25750;25751;25752;25753;25754;25755;25756;25757;25758 25736 24 ALAEEWGCPFMETSAK Unmodified 1825.8015 0.80150647 1991 P10114 RAP2A Ras-related protein Rap-2a yes yes 0 0 0 1 1 1 1 114.57 114.57 2 0.0017374 119431 QUIQUE_C1218_190116_001 62.528 48.067 51949000 0 51949000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2165 1991 2013 20103;20104;20105;20106 25759;25760;25761;25762 25759 4 ALAEEWSCPFMETSAK Unmodified 1855.8121 0.81207116 2720 P61225 RAP2B Ras-related protein Rap-2b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.24 115.24 2 2.8424E-14 120184 QUIQUE_C1218_190116_001 130.56 118 256260000 39151000 0 55892000 57948000 0 0 51674000 0 22815000 0 0 28783000 0 2166 2720 2014 20107;20108;20109;20110;20111;20112;20113;20114 25763;25764;25765;25766;25767;25768;25769;25770 25763 7 ALAEGGSILSR Unmodified 1072.5877 0.58767259 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.438 51.438 2 0.00075106 49514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.62 44.446 1219000000 141700000 127940000 118000000 88531000 217840000 0 115960000 106120000 0 0 175770000 127140000 0 2167 2665 2015 20115;20116;20117;20118;20119;20120;20121;20122;20123 25771;25772;25773;25774;25775;25776;25777;25778;25779;25780 25779 10 ALAEGVLLR Unmodified 940.57057 0.57056597 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.405 65.405 2 0.00054276 65424 QUIQUE_C1438_190116_001 131.04 81.678 3406600000 282620000 282830000 293570000 258340000 282730000 0 272610000 283710000 285880000 115310000 386120000 292090000 370750000 2168 2513 2016 20124;20125;20126;20127;20128;20129;20130;20131;20132;20133;20134;20135 25781;25782;25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789;25790;25791;25792;25793;25794 25787 14 ALAELFGLLVK Unmodified 1172.7169 0.71689585 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 154.19 154.19 2 0.0049122 160999 QUIQUE_C1438_190116_001 88.948 71.708 183040000 0 0 0 0 29278000 0 0 31850000 31430000 12678000 34516000 43289000 0 2169 3471 2017 20136;20137;20138;20139;20140;20141 25795;25796;25797;25798;25799;25800;25801 25795 6 ALAESWNAAFLESSAK Unmodified 1693.8312 0.83115034 3133 Q15382;C9J931 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.92 114.92 2 4.4075E-19 118244 QUIQUE_C1277_190116_001 146.5 121.07 1276800000 135060000 150870000 173000000 150090000 145350000 116310000 146380000 0 0 75575000 184160000 0 0 2170 3133 2018 20142;20143;20144;20145;20146;20147;20148;20149;20150 25802;25803;25804;25805;25806;25807;25808;25809;25810;25811;25812;25813 25804 12 ALAFHPIEPVLITASEDHTLK Unmodified 2301.2369 0.23688281 1556 O43815 STRN 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2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.27 102.27 2 1.395E-06 105313 QUIQUE_C1368_190116_001 129.7 101.3 10048000000 713840000 829520000 793060000 681150000 969210000 723070000 805150000 702720000 749260000 258640000 973510000 857980000 990910000 2173 2409 2021 20179;20180;20181;20182;20183;20184;20185;20186;20187;20188;20189;20190;20191 25843;25844;25845;25846;25847;25848;25849;25850;25851;25852;25853;25854;25855;25856;25857 25846 15 ALAGVTYAAK Unmodified 963.53893 0.53893149 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L327;I3L0M4;I3L3J7;I3L3C5 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.391 33.391 2 0.01897 28257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 41.859 493600000 0 0 0 0 0 120100000 0 87771000 0 0 170860000 114870000 0 2174 4531 2022 20192;20193;20194;20195 25858;25859;25860;25861 25860 4 ALAHLLEAER Unmodified 1121.6193 0.61930707 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 40.375 40.375 2 0.048195 37038 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.423 31.647 36754000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36754000 2175 4434 2023 20196 25862 25862 1 ALAIEEFCK Unmodified 1079.5321 0.53213155 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 74.68 74.68 2 0.0019615 74021 QUIQUE_C1563_190116_001 98.299 80.914 1493800000 269300000 203050000 208050000 132400000 0 207220000 167330000 0 0 102060000 204400000 0 0 2176 4297 2024 20197;20198;20199;20200;20201;20202;20203;20204;20205;20206;20207 25863;25864;25865;25866;25867;25868;25869;25870;25871;25872;25873 25868 9 ALAIMCR Unmodified 833.42516 0.42516406 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;E9PN18;E9PMU7;E9PL19 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 40.796 40.796 2 0.047935 36733 QUIQUE_C1563_190116_001 76.347 47.819 28049000 0 0 0 0 0 28049000 0 0 0 0 0 0 0 2177 295 2025 20208 25874 25874 1 ALAIYEGQLGPDNPNVAR Unmodified 1896.9694 0.96937516 4286 Q9NSK0;H7C4M1 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 1 92.248 92.248 2 3.1758E-24 94591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.78 139.27 53128000 0 0 0 0 0 0 0 0 29685000 0 0 23442000 0 2178 4286 2026 20209;20210 25875;25876 25875 2 ALALAALAAVEPACGSR Acetyl (Protein N-term) 1681.8821 0.88214006 4018 Q9BT67 NDFIP1 NEDD4 family-interacting protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 172.95 172.95 2 4.5618E-17 175682 QUIQUE_C1403_190116_001 135.66 108.99 36466000 10224000 8024300 4545000 5063000 0 8609500 0 0 0 0 0 0 0 2179 4018 2027 20211;20212;20213;20214;20215 25877;25878;25879;25880;25881 25880 4 ALALAPGPPTR Unmodified 1062.6186 0.61857879 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.354 50.354 2 0.000512 47350 QUIQUE_C1563_190116_001 112.84 96.369 1410100000 159610000 0 71883000 141540000 148870000 89578000 80942000 192310000 109580000 0 187380000 82259000 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27290000 28084000 24393000 2182 4484 2030 20238;20239;20240;20241;20242;20243;20244;20245;20246;20247;20248;20249;20250 25911;25912;25913;25914;25915;25916;25917;25918;25919;25920;25921;25922;25923 25923 13 ALAMLRDWCRWMGANAER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2264.0401 0.040130811 301 A0A0J9YXH5;A0A0J9YXQ4 yes no 1 1 2 1 1 1 1 42.028 42.028 2 0.0076518 38489 QUIQUE_C1277_190116_001 48.004 25.958 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2183 301 2031 20251;20252;20253;20254 25924;25925;25926;25927 25924 224;225 4 ALANIHSQLLGLER Unmodified 1533.8627 0.86272524 4154 Q9H313;A0A0G2JPK6 TTYH1 Protein tweety homolog 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.905 78.905 2;3 5.255E-22 79865 QUIQUE_C1277_190116_001 184.87 147.31 4173100000 323550000 379290000 340180000 269440000 282930000 262400000 449240000 381930000 455150000 141930000 291920000 323960000 271140000 2184 4154 2032 20255;20256;20257;20258;20259;20260;20261;20262;20263;20264;20265;20266;20267;20268;20269;20270;20271;20272;20273;20274;20275;20276;20277;20278;20279;20280 25928;25929;25930;25931;25932;25933;25934;25935;25936;25937;25938;25939;25940;25941;25942;25943;25944;25945;25946;25947;25948;25949;25950;25951;25952;25953;25954;25955;25956;25957;25958;25959;25960 25933 31 ALANMHESLEWLASR Unmodified 1726.8461 0.8460889 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 1 108.52 108.52 3 0.0079142 112331 QUIQUE_C1218_190116_001 42.338 31.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2185 3797 2033 20281 25961 25961 1 ALANSLACQGK Unmodified 1131.5706 0.57064232 1851 P04075;J3KPS3;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 26.312 26.312 2 1.6144E-30 21010 QUIQUE_C1218_190116_001 194.9 140.69 122210000000 11424000000 12049000000 10319000000 9758600000 11052000000 8892600000 12365000000 7072500000 6875300000 3121900000 10811000000 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269030000 0 22153000 0 0 0 0 0 34466000 48654000 0 50051000 48011000 65693000 2190 2476 2038 20327;20328;20329;20330;20331;20332 26020;26021;26022;26023;26024;26025;26026;26027;26028 26028 9 ALAPTWEQLALGLEHSETVK Unmodified 2192.1477 0.14773345 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.37 137.37 3 1.0945E-06 142088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.028 80.807 868260000 0 111820000 0 0 118430000 123880000 0 79395000 123840000 60511000 147120000 0 103260000 2191 3627 2039 20333;20334;20335;20336;20337;20338;20339;20340 26029;26030;26031;26032;26033;26034;26035;26036;26037 26034 9 ALAQEDQGAGEVER Unmodified 1471.6903 0.69029976 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.594 28.594 2 1.042E-36 22481 QUIQUE_C1368_190116_001 180.97 157.65 1615000000 169800000 166560000 147320000 0 137830000 117290000 137130000 102940000 100570000 42997000 184180000 150890000 157470000 2192 1472 2040 20341;20342;20343;20344;20345;20346;20347;20348;20349;20350;20351;20352 26038;26039;26040;26041;26042;26043;26044;26045;26046;26047;26048;26049;26050 26040 13 ALAQGPWWAR Unmodified 1154.5985 0.59851205 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.358 89.358 2 6.859E-05 91185 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.98 120.46 4351600000 0 228010000 524790000 350570000 327830000 332520000 393080000 0 565680000 139380000 552520000 348290000 588940000 2193 2578 2041 20353;20354;20355;20356;20357;20358;20359;20360;20361;20362;20363 26051;26052;26053;26054;26055;26056;26057;26058;26059;26060;26061;26062;26063;26064;26065 26065 14 ALAQNGSLGEGIHEPGGPR Unmodified 1858.9286 0.92857298 1498 O15354 GPR37 Prosaposin receptor GPR37 yes yes 0 0 0 1 16.753 16.753 3 0.036889 9128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 17.577 7.2007 170010000 0 0 0 0 0 0 0 170010000 0 0 0 0 0 2194 1498 2042 20364 26066 26066 1 ALAQYLVVVSK Unmodified 1189.7071 0.70705945 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 1 94.839 94.839 2 0.029642 97251 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.445 34.774 20534000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20534000 0 2195 2456 2043 20365;20366 26067;26068 26068 2 ALASILLQDHIR Unmodified 1348.7827 0.78268401 3355 Q6DD88;F5H6I7;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 85.337 85.337 2;3 2.6351E-05 87387 QUIQUE_C1576_190116_001 100.93 83.122 757840000 43345000 39560000 82699000 72329000 68422000 36119000 48370000 31173000 102990000 21715000 108750000 66352000 36029000 2196 3355 2044 20367;20368;20369;20370;20371;20372;20373;20374;20375;20376;20377;20378;20379;20380;20381;20382;20383;20384;20385;20386;20387;20388 26069;26070;26071;26072;26073;26074;26075;26076;26077;26078;26079;26080;26081;26082;26083;26084;26085;26086;26087;26088;26089;26090;26091;26092;26093;26094;26095 26082 27 ALASLMTYK Oxidation (M) 1012.5263 0.52631789 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 42.838 42.838 1;2 0.0011735 39278 QUIQUE_C1368_190116_001 107.9 96.174 4808100000 388690000 336030000 303140000 250710000 338710000 216790000 232430000 537960000 413710000 285420000 603530000 504080000 396900000 2197 1777 2045 20389;20390;20391;20392;20393;20394;20395;20396;20397;20398;20399;20400;20401;20402;20403 26096;26097;26098;26099;26100;26101;26102;26103;26104;26105;26106;26107;26108;26109;26110;26111;26112;26113;26114;26115;26116;26117;26118;26119;26120 26099 970 24 ALASLMTYK Unmodified 996.5314 0.53140327 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 2 68.904 68.904 1;2 2.0477E-08 66258 QUIQUE_DMIX4_190116_001 201.97 113.03 28206000000 2115200000 1662800000 2916800000 1998900000 1871900000 1793600000 1833500000 2100200000 2734700000 840570000 3431900000 2276300000 2630000000 2198 1777 2045 20404;20405;20406;20407;20408;20409;20410;20411;20412;20413;20414;20415;20416;20417;20418;20419;20420 26121;26122;26123;26124;26125;26126;26127;26128;26129;26130;26131;26132;26133;26134;26135;26136;26137;26138;26139;26140;26141;26142;26143;26144;26145;26146;26147;26148 26141 25 ALASPEQLAQLPSSGVPR Unmodified 1819.9792 0.97921156 1220;4597 H7BZ77;Q9Y3Q8 TSC22D4 TSC22 domain family protein 4 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 1 102.5 102.5 2;3 4.7105E-31 105288 QUIQUE_C1277_190116_001 155.14 140.36 594830000 0 41309000 26397000 68340000 44465000 80277000 48494000 65091000 70714000 0 36068000 40928000 72744000 2199 1220;4597 2046 20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;20433;20434;20435 26149;26150;26151;26152;26153;26154;26155;26156;26157;26158;26159;26160;26161;26162;26163;26164;26165;26166 26149 18 ALASQLQDSLK Unmodified 1172.6401 0.6401021 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 63.414 63.414 2 0.0011964 60162 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.52 73.586 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20454;20455;20456;20457;20458;20459;20460;20461 26187;26188;26189;26190;26191;26192;26193;26194 26190 8 ALAVSDLNR Unmodified 957.52434 0.52434406 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 42.538 42.538 2 0.0086009 37012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.324 43.516 182330000 0 0 0 0 0 0 0 117960000 0 64364000 0 0 0 2203 2026 2050 20462;20463 26195;26196 26196 2 ALAYDKLEK Unmodified 1049.5757 0.57571092 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 27.833 27.833 2 0.031466 22181 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.136 20.629 34982000 0 0 0 0 0 0 0 34982000 0 0 0 0 0 2204 2379 2051 20464 26197;26198 26198 2 ALAYFEQLK Unmodified 1081.5808 0.5807963 1534 O43592;F8WDU6;F5GYW6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.254 84.254 2 0.016045 85629 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.485 51.538 488050000 48437000 54555000 0 0 60473000 0 52540000 65857000 71824000 0 77986000 56380000 0 2205 1534 2052 20465;20466;20467;20468;20469;20470;20471;20472 26199;26200;26201;26202;26203;26204;26205;26206;26207 26207 8 ALCADLSPR Unmodified 1001.4964 0.49641475 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.49 41.49 2 0.0075799 36644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.191 46.298 848040000 100570000 105220000 100000000 113910000 0 0 96170000 72543000 0 56700000 115360000 87566000 0 2206 4259 2053 20473;20474;20475;20476;20477;20478;20479;20480;20481 26208;26209;26210;26211;26212;26213;26214;26215;26216;26217 26215 8 ALCAEADRLQQSHPLSATQIQVK Unmodified 2563.3177 0.3176691 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 3 2 2 2 2 70.355 70.355 2;3;4 1.3711E-17 70321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.31 108.36 7135000000 0 0 0 0 234980000 0 57581000 2550800000 1241800000 0 977690000 1079500000 992630000 2207 267;275;3025 2054 20482;20483;20484;20485;20486;20487;20488;20489;20490;20491;20492;20493;20494;20495 26218;26219;26220;26221;26222;26223;26224;26225;26226;26227;26228;26229;26230;26231 26225 13 ALCDNVDTR Unmodified 1062.4764 0.47640759 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.253 23.253 2 0.012404 17154 QUIQUE_C1218_190116_001 71.379 44.417 737730000 64381000 78572000 0 87499000 85072000 52439000 0 0 76234000 0 98070000 90713000 104750000 2208 617 2055 20496;20497;20498;20499;20500;20501;20502;20503;20504 26232;26233;26234;26235;26236;26237;26238;26239;26240 26232 7 ALCEAAGCGSALLWPR Acetyl (Protein N-term) 1772.8338 0.83380965 3215 Q2TAA2;F8WF34 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 154.22 154.22 2 1.0081E-07 161281 QUIQUE_C1438_190116_001 127.37 113.47 299570000 37857000 49124000 38896000 31014000 39486000 37409000 38025000 0 0 0 0 0 27755000 2209 3215 2056 20505;20506;20507;20508;20509;20510;20511;20512;20513;20514 26241;26242;26243;26244;26245;26246;26247;26248;26249;26250;26251 26247 9 ALCGFTEAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFAR Unmodified 3921.8956 0.89556487 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 162 162 3;4 1.6063E-10 165689 QUIQUE_C1403_190116_001 59.954 52.149 167780000 0 0 51654000 47102000 57342000 0 0 0 0 11679000 0 0 0 2210 4600 2057 20515;20516;20517;20518;20519;20520;20521 26252;26253;26254;26255;26256;26257;26258;26259;26260 26254 8 ALCGLDESK Unmodified 991.46445 0.46444592 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.928 27.928 2 0.00058153 22023 QUIQUE_C1403_190116_001 111.74 70.237 932990000 0 66339000 96242000 67073000 57740000 80929000 83664000 62008000 0 171490000 86112000 88746000 72649000 2211 1324 2058 20522;20523;20524;20525;20526;20527;20528;20529;20530;20531;20532;20533 26261;26262;26263;26264;26265;26266;26267;26268;26269;26270;26271;26272 26263 12 ALCGLTEAAAQAAYLVGISDPNSQAGHQGLVDPIQFAR Unmodified 3908.9479 0.9479348 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 2 164.28 164.28 3;4 3.361E-64 167909 QUIQUE_C1403_190116_001 116.59 112.52 806470000 16979000 38270000 63471000 77508000 86442000 0 94687000 18851000 25093000 0 199860000 0 185310000 2212 4606 2059 20534;20535;20536;20537;20538;20539;20540;20541;20542;20543;20544;20545;20546;20547 26273;26274;26275;26276;26277;26278;26279;26280;26281;26282;26283;26284;26285;26286;26287;26288;26289;26290 26277 17 ALCLDLLELSTTNEIFK Unmodified 1979.0285 0.028529521 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 1 1 161.95 161.95 2 2.1002E-12 166713 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.34 93.469 30070000 0 0 0 0 0 0 0 0 30070000 0 0 0 0 2213 2486 2060 20548;20549;20550 26291;26292;26293 26293 2 ALCLDLLSLSAACDALDQHNLK Unmodified 2440.209 0.20902986 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.96 145.96 3 6.6786E-08 150849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.36 74.343 744680000 0 0 0 0 0 136750000 0 135240000 145060000 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26324;26325;26326;26327;26328;26329;26330;26331;26332;26333;26334;26335;26336 26327 13 ALCYVISGQDQR Unmodified 1408.6769 0.67689831 3348 Q66K74;M0R1M7 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.862 57.862 2 0.00040656 56533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.8 91.931 387850000 58158000 49006000 65648000 0 0 53766000 58907000 41215000 61148000 0 0 0 0 2220 3348 2067 20594;20595;20596;20597;20598;20599;20600;20601;20602 26337;26338;26339;26340;26341;26342;26343;26344;26345;26346;26347 26345 10 ALDAAFYK Unmodified 897.45962 0.45961853 1992 P10155;G5E9R9 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.257 55.257 2 0.0084554 53568 QUIQUE_C1368_190116_001 94.262 53.576 287780000 0 0 82706000 0 58888000 0 70192000 0 0 0 75998000 0 0 2221 1992 2068 20603;20604;20605;20606 26348;26349;26350;26351;26352;26353;26354 26348 7 ALDDFVLGSAR Unmodified 1162.5982 0.59823728 1596 O60831;A6NP52 PRAF2 PRA1 family protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 99.813 99.813 2 0.00044225 96738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.05 75.874 424860000 116530000 101890000 0 76432000 0 0 0 97182000 0 32828000 0 0 0 2222 1596 2069 20607;20608;20609;20610;20611;20612;20613;20614;20615;20616;20617;20618;20619 26355;26356;26357;26358;26359;26360;26361;26362;26363;26364;26365;26366;26367;26368 26364 14 ALDDILNLK Unmodified 1013.5757 0.57571092 1457 O14920;G3V105;E5RGW5 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 109.85 109.85 2 0.018595 115019 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.207 44.504 36674000 0 0 0 0 0 10806000 0 13048000 0 0 12820000 0 0 2223 1457 2070 20620;20621;20622;20623 26369;26370;26371;26372 26372 4 ALDDMISTLK Unmodified 1105.5689 0.56891099 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX9;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 98.212 98.212 2 0.0045032 100469 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.688 47.138 820280000 174840000 184090000 0 0 115680000 173530000 0 0 100370000 71772000 0 0 0 2224 2527;3303 2071 20624;20625;20626;20627;20628;20629;20630;20631;20632;20633 26373;26374;26375;26376;26377;26378;26379;26380;26381;26382;26383 26380 9 ALDDMISTLKK Unmodified 1233.6639 0.663874 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 1 1 1 1 73.718 73.718 3 0.0042391 73965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.003 45.485 213640000 0 48044000 0 0 0 0 0 90712000 74884000 0 0 0 0 2225 2527;3303 2072 20634;20635;20636 26384;26385;26386 26385 3 ALDEGIPITSASYYATVTLDQVR Unmodified 2482.2591 0.2591344 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.74 151.74 2 8.4848E-11 156755 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.5 99.782 146180000 0 0 0 0 52463000 0 0 0 35584000 22171000 0 0 35959000 2226 3318 2073 20637;20638;20639;20640 26387;26388;26389;26390 26388 4 ALDELFEAIEQK Unmodified 1404.7137 0.71366097 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.53 138.53 2 5.0172E-06 141739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.86 108.74 429300000 0 40480000 37987000 42557000 67989000 35099000 39430000 37509000 41954000 0 54403000 0 31893000 2227 3210 2074 20641;20642;20643;20644;20645;20646;20647;20648;20649;20650 26391;26392;26393;26394;26395;26396;26397;26398;26399;26400;26401;26402;26403 26399 13 ALDELMDGDIIVFQK Unmodified 1705.8597 0.85967328 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 143.21 143.21 2 0.025365 146034 QUIQUE_C1563_190116_001 45.764 27.956 140020000 0 0 52814000 39721000 0 47482000 0 0 0 0 0 0 0 2228 3778 2075 20651;20652;20653 26404;26405;26406 26406 3 ALDEYYDK Unmodified 1015.4498 0.44984171 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 40.196 40.196 2 0.016365 36505 QUIQUE_C1563_190116_001 83.265 72.437 1088000000 0 0 287550000 0 0 438570000 361880000 0 0 0 0 0 0 2229 2414 2076 20654;20655;20656 26407;26408;26409 26408 3 ALDEYYDKHFTEFVPLR Unmodified 2142.0422 0.042205751 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 3 3 3 3 3 2 4 3 3 2 3 4 3 109.26 109.26 2;3;4 4.4622E-62 112097 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.87 163.15 16553000000 594010000 1208000000 1017800000 703870000 1307400000 506430000 1255000000 1511500000 1784300000 216060000 2458700000 1942300000 2048100000 2230 2414 2077 20657;20658;20659;20660;20661;20662;20663;20664;20665;20666;20667;20668;20669;20670;20671;20672;20673;20674;20675;20676;20677;20678;20679;20680;20681;20682;20683;20684;20685;20686;20687;20688;20689;20690;20691;20692;20693;20694;20695 26410;26411;26412;26413;26414;26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26424;26425;26426;26427;26428;26429;26430;26431;26432;26433;26434;26435;26436;26437;26438;26439;26440;26441;26442;26443;26444;26445;26446;26447;26448;26449;26450;26451;26452;26453;26454;26455;26456;26457;26458;26459;26460;26461;26462;26463;26464;26465;26466;26467;26468;26469;26470;26471;26472 26465 62 ALDFAVGEYNK Unmodified 1225.5979 0.59790293 1804 P01034 CST3 Cystatin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.271 80.271 2 0.0021728 81049 QUIQUE_C1277_190116_001 79.986 40.439 1897400000 159750000 158010000 217380000 144800000 232770000 162710000 165110000 199130000 0 84337000 169650000 203740000 0 2231 1804 2078 20696;20697;20698;20699;20700;20701;20702;20703;20704;20705;20706 26473;26474;26475;26476;26477;26478;26479;26480;26481;26482;26483;26484;26485;26486 26474 12 ALDFDISETR Unmodified 1165.5615 0.56151742 500 A0A3B3ITH3;Q9P2X3;J3KT25;J3QRS6 IMPACT Protein IMPACT yes no 0 0 0 1 1 1 84.639 84.639 2 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171.43 3 9.2631E-09 175952 QUIQUE_C1218_190116_001 67.239 59.706 113230000 15184000 19032000 0 0 0 0 13038000 10028000 0 0 33069000 22879000 0 2234 1083 2081 20723;20724;20725;20726;20727;20728 26512;26513;26514;26515;26516;26517 26512 4 ALDGAFTEENR Unmodified 1221.5626 0.56258006 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.287 48.287 2 2.2426E-06 45513 QUIQUE_C1403_190116_001 155.84 119.45 1641400000 126250000 0 217380000 209460000 214850000 135980000 0 121930000 184810000 0 233430000 197280000 0 2235 4600 2082 20729;20730;20731;20732;20733;20734;20735;20736;20737 26518;26519;26520;26521;26522;26523;26524;26525;26526;26527 26520 5 ALDGDFSEDNR Unmodified 1237.5211 0.52110917 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 43.716 43.716 2 0.025332 40791 QUIQUE_C1368_190116_001 59.067 47.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2236 4606 2083 20738;20739 26528;26529 26528 2 ALDGDFSEDNRNK Unmodified 1479.659 0.65899964 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 1 1 26.878 26.878 3 0.062964 21017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.013 30.634 34178000 0 0 0 0 0 0 0 34178000 0 0 0 0 0 2237 4606 2084 20740 26530 26530 1 ALDGPEQMELEEGK Acetyl (Protein N-term) 1586.7134 0.71340297 2743 P62195;J3QQM1;J3QSE0;J3KTQ9 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 109.33 109.33 2 0.00027537 112194 QUIQUE_C1403_190116_001 105.03 86.287 108280000 0 0 0 37560000 0 30000000 40717000 0 0 0 0 0 0 2238 2743 2085 20741;20742;20743;20744;20745 26531;26532;26533;26534;26535;26536 26531 6 ALDIAENEMPGLMR Unmodified 1558.7483 0.74834869 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.47 111.47 2 0.00011616 116706 QUIQUE_C1218_190116_001 112.83 95.808 1097500000 131720000 134700000 125240000 120940000 79534000 95670000 108070000 0 0 0 154060000 0 147520000 2239 2219 2086 20746;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754 26537;26538;26539;26540;26541;26542;26543;26544;26545;26546;26547;26548 26537 12 ALDIAENEMPGLMR 2 Oxidation (M) 1590.7382 0.73817794 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 2 0 1 68.497 68.497 2 0.0011295 64195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.017 66.35 35731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35731000 0 0 0 2240 2219 2086 20755 26549 26549 1581;1582 1 ALDIDLDKPLADSEK Unmodified 1641.8461 0.8461317 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 1 1 1 2 83.166 83.166 2;3 0.00069699 83411 QUIQUE_C1563_190116_001 63.682 49.599 35424000 0 0 0 0 0 35424000 0 0 0 0 0 0 0 2241 437;1437 2087 20756;20757;20758;20759 26550;26551;26552;26553 26552 4 ALDLDPENDSYK Unmodified 1378.6252 0.62523989 3843 Q96EQ0;D6RFW1 SGTB Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 70.925 70.925 2 0.0053377 70141 QUIQUE_C1563_190116_001 66.595 56.072 327450000 0 66254000 0 66520000 74082000 64571000 0 0 56023000 0 0 0 0 2242 3843 2088 20760;20761;20762;20763;20764 26554;26555;26556;26557;26558 26557 5 ALDLDSSCK Unmodified 1007.4594 0.45936054 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.284 29.284 2 0.0011864 23245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.04 58.193 3095500000 306440000 355830000 321120000 311480000 332060000 307750000 381450000 109290000 122260000 89503000 0 219660000 238710000 2243 2343 2089 20765;20766;20767;20768;20769;20770;20771;20772;20773;20774;20775;20776 26559;26560;26561;26562;26563;26564;26565;26566;26567;26568;26569;26570;26571;26572;26573;26574 26571 15 ALDLESLSLLGFVYK Unmodified 1666.9182 0.91817444 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.51 167.51 2 8.8957E-44 172421 QUIQUE_C1368_190116_001 180.88 160.1 1414700000 71582000 55120000 310780000 42493000 46828000 0 49909000 93891000 104540000 16173000 488970000 73392000 60975000 2244 1975 2090 20777;20778;20779;20780;20781;20782;20783;20784;20785;20786;20787;20788 26575;26576;26577;26578;26579;26580;26581;26582;26583;26584;26585;26586 26577 12 ALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAK Unmodified 2636.3585 0.35851409 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 171.06 171.06 2;3 2.1216E-24 174083 QUIQUE_C1403_190116_001 127.28 123.55 4268300000 222140000 593020000 1075700000 140310000 351970000 93345000 449090000 186280000 189320000 42186000 517980000 382470000 24420000 2245 3109 2091 20789;20790;20791;20792;20793;20794;20795;20796;20797;20798;20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;20808;20809;20810 26587;26588;26589;26590;26591;26592;26593;26594;26595;26596;26597;26598;26599;26600;26601;26602;26603;26604;26605;26606;26607;26608 26593 22 ALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKR Unmodified 2792.4596 0.45962512 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 1 1 1 1 166.24 166.24 3 1.5825E-10 170742 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.539 63.343 479210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 151090000 222830000 105290000 2246 3109 2092 20811;20812;20813 26609;26610;26611 26611 3 ALDLGTFTGYSALALALALPADGR Unmodified 2376.2689 0.26891122 3501 Q86VU5;R4GNF4 COMTD1 Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 172.75 172.75 3 0.00080268 177137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 27.946 19.451 17024000 0 0 0 0 0 0 0 0 17024000 0 0 0 0 2247 3501 2093 20814 26612 26612 1 ALDLLDK Unmodified 786.44872 0.4487195 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.124 58.124 2 0.011331 56886 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.85 50.114 11106000000 848950000 798590000 866300000 880000000 818860000 734610000 851880000 933760000 889720000 416090000 1053900000 985230000 1028500000 2248 2281 2094 20815;20816;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825;20826;20827 26613;26614;26615;26616;26617;26618;26619;26620;26621;26622;26623;26624;26625;26626;26627 26621 15 ALDLLDR Unmodified 814.45487 0.45486751 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;E9PQW4;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.91 65.91 2 0.020675 64976 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.43 0 1530400000 0 0 218350000 0 0 0 217650000 235420000 0 94412000 290490000 216410000 257690000 2249 897;2263 2095 20828;20829;20830;20831;20832;20833;20834 26628;26629;26630;26631;26632;26633;26634;26635 26635 8 ALDLLYGMVSK Unmodified 1208.6475 0.64749566 1437;437 A0A2R8Y611;O14617;A0A2R8Y4J3 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.15 121.15 2 0.00071972 126325 QUIQUE_C1218_190116_001 96.89 75.988 219930000 44949000 48946000 38748000 35811000 0 0 31949000 19524000 0 0 0 0 0 2250 437;1437 2096 20835;20836;20837;20838;20839;20840 26636;26637;26638;26639;26640;26641;26642 26636 6 ALDLNLK Unmodified 785.4647 0.46470391 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.672 54.672 2 0.019227 52724 QUIQUE_C1403_190116_001 113.08 9.7992 4417000000 617100000 547700000 533140000 240370000 396760000 363140000 502260000 0 392770000 0 438310000 385440000 0 2251 2085 2097 20841;20842;20843;20844;20845;20846;20847;20848;20849;20850 26643;26644;26645;26646;26647;26648;26649;26650;26651;26652;26653;26654;26655 26648 13 ALDLPSSGEGLAFFTFPNIASATK Unmodified 2453.2478 0.24784143 582 B1AHA8;P09601 HMOX1 Heme oxygenase 1 yes no 0 0 0 2 2 165.11 165.11 2;3 2.5886E-08 170044 QUIQUE_C1368_190116_001 93.754 86.346 93868000 0 0 64344000 29524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2252 582 2098 20851;20852;20853;20854 26656;26657;26658;26659 26657 4 ALDLSLYLK Unmodified 1034.6012 0.60119739 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 117.43 117.43 2 0.023183 123351 QUIQUE_C1438_190116_001 60.91 36.091 58424000 0 0 16986000 0 22953000 0 0 0 18485000 0 0 0 0 2253 4336 2099 20855;20856;20857;20858 26660;26661;26662;26663 26661 2 ALDQASEEIWNDFR Unmodified 1692.7744 0.77436375 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7;G3V1U3;F8VZX9;F8VY03 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 133.39 133.39 2 0.01431 138953 QUIQUE_C1576_190116_001 62.466 44.657 53084000 0 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20864;20865;20866;20867;20868;20869;20870;20871;20872;20873 26670;26671;26672;26673;26674;26675;26676;26677;26678;26679 26675 9 ALDTLLEQTPKEDDEHQVIIK Unmodified 2434.2591 0.2591344 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.133 86.133 4 0.0032101 87695 QUIQUE_DMIX7_190116_001 26.361 22.466 273130000 0 0 0 0 0 0 30107000 46355000 47899000 0 64922000 41900000 41950000 2258 3684 2104 20874;20875;20876;20877;20878;20879 26680;26681;26682;26683;26684;26685 26684 6 ALDTMNFDVIK Oxidation (M) 1281.6275 0.6274885 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YBN4;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;B1ANR0;Q13310;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.604 83.604 2 0.0027366 80886 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.148 52.455 348980000 20900000 43201000 37763000 30749000 34562000 0 0 37409000 41399000 25566000 41665000 35762000 0 2259 2031;596 2105 20880;20881;20882;20883;20884;20885;20886;20887;20888;20889 26686;26687;26688;26689;26690;26691;26692;26693;26694;26695 26693 391 9 ALDTMNFDVIK Unmodified 1265.6326 0.63257388 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YBN4;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;B1ANR0;Q13310;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 104.79 104.79 2 0.0005713 108108 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 65.928 385860000 0 0 0 0 0 0 0 95410000 0 0 154280000 0 136170000 2260 2031;596 2105 20890;20891;20892 26696;26697;26698;26699 26699 4 ALDTVLFGPPLLTR Unmodified 1511.8712 0.87116466 940 E9PIQ8;G0XQ39;Q13586;E9PNJ4 STIM1 Stromal interaction molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.98 143.98 2 0.00024223 148437 QUIQUE_C1277_190116_001 91.937 67.646 203390000 22805000 17887000 18403000 24946000 18932000 16777000 14001000 11148000 17120000 0 28265000 0 13105000 2261 940 2106 20893;20894;20895;20896;20897;20898;20899;20900;20901;20902;20903 26700;26701;26702;26703;26704;26705;26706;26707;26708;26709;26710 26701 9 ALDVGSGSGILTACFAR Unmodified 1693.8458 0.84575455 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;A0A3F2YNX8;C9J0F2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 2 3 2 1 3 2 2 2 1 2 2 2 2 116.94 116.94 2;3 1.9745E-88 119646 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.8 187.94 8512700000 595600000 692640000 650470000 547140000 735120000 489910000 821900000 622950000 651300000 273320000 845760000 749630000 836980000 2262 150 2107 20904;20905;20906;20907;20908;20909;20910;20911;20912;20913;20914;20915;20916;20917;20918;20919;20920;20921;20922;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929 26711;26712;26713;26714;26715;26716;26717;26718;26719;26720;26721;26722;26723;26724;26725;26726;26727;26728;26729;26730;26731;26732;26733;26734;26735;26736;26737;26738;26739;26740;26741;26742;26743;26744;26745;26746;26747 26734 35 ALDVMVSTFHK Unmodified 1246.638 0.63799361 2251 P26447 S100A4 Protein S100-A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 65.044 65.044 2;3 0.00072437 64885 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.65 59.342 883070000 53356000 45929000 35457000 0 45725000 0 0 204440000 230820000 0 100820000 73530000 92990000 2263 2251 2108 20930;20931;20932;20933;20934;20935;20936;20937;20938;20939;20940 26748;26749;26750;26751;26752;26753;26754;26755;26756;26757;26758;26759;26760;26761;26762;26763 26759 16 ALDVNVALR Unmodified 969.56073 0.56072956 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.488 67.488 2 0.00020159 67012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.28 66.241 2007700000 168820000 143290000 190340000 59148000 125850000 95724000 83474000 195630000 237500000 80527000 180590000 259410000 187380000 2264 1961 2109 20941;20942;20943;20944;20945;20946;20947;20948;20949;20950;20951;20952;20953 26764;26765;26766;26767;26768;26769;26770;26771;26772;26773;26774;26775;26776;26777;26778;26779;26780;26781;26782;26783;26784;26785 26774 20 ALDVNVALRK Unmodified 1097.6557 0.65569258 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 41.266 41.266 3 0.0014431 38520 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.489 53.047 121330000 0 0 0 0 0 0 0 0 56466000 0 0 0 64867000 2265 1961 2110 20954;20955;20956;20957;20958 26786;26787;26788;26789;26790;26791 26788 6 ALDVSASDDEIAR Unmodified 1360.647 0.64703797 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 57.843 57.843 2 0.00058053 56125 QUIQUE_C1403_190116_001 117.99 48.174 1808100000 138080000 133240000 159490000 171650000 181520000 143180000 174490000 151740000 143830000 101340000 170070000 0 139430000 2266 727 2111 20959;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972 26792;26793;26794;26795;26796;26797;26798;26799;26800;26801;26802;26803;26804;26805;26806;26807 26795 16 ALDVTVPEK Unmodified 970.53351 0.53351176 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.386 45.386 2 0.01718 42674 QUIQUE_C1218_190116_001 65.224 38.622 108890000 44805000 34722000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29362000 0 2267 156 2112 20973;20974;20975;20976 26808;26809;26810;26811 26808 4 ALDYCHSMGIMHR Unmodified 1589.6901 0.69012231 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;A0A2R8YDY7;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.829 49.829 4 0.00024823 47848 QUIQUE_C1576_190116_001 66.498 57.677 164190000 35260000 27102000 25644000 25032000 0 0 27907000 0 0 0 0 0 23248000 2268 456 2113 20977;20978;20979;20980;20981;20982 26812;26813;26814;26815;26816;26817 26816 5 ALDYIASK Unmodified 879.47018 0.47018322 2381 P35609 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 34.866 34.866 2 0.015577 30129 QUIQUE_C1277_190116_001 84.498 33.6 168370000 0 62933000 0 0 34845000 0 0 0 0 23990000 46603000 0 0 2269 2381 2114 20983;20984;20985;20986 26818;26819;26820;26821;26822;26823 26818 6 ALDYYMLR Unmodified 1043.511 0.51100218 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.486 87.486 2 0.0036655 88860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.56 68.211 279690000 34510000 0 61462000 0 0 0 0 40245000 0 18241000 0 66095000 59138000 2270 4600 2115 20987;20988;20989;20990;20991;20992 26824;26825;26826;26827;26828;26829 26826 4 ALEAAHGPGQANQEIAAMIDTEFAK Unmodified 2582.2435 0.24350111 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 126.66 126.66 3 4.2062E-14 130822 QUIQUE_C1403_190116_001 86.08 72.349 198360000 0 0 33873000 44904000 0 0 38624000 0 0 0 38735000 42220000 0 2271 3155 2116 20993;20994;20995;20996;20997;20998 26830;26831;26832;26833;26834;26835 26831 6 ALEAAQIIIDVLQLPMSK Oxidation (M) 1968.0965 0.096549507 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 1 0 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 170.62 170.62 2;3 4.1258E-13 164311 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.34 108.08 477740000 72812000 22208000 14090000 46970000 60652000 0 37000000 60515000 50783000 21493000 45680000 0 45532000 2272 2924 2117 20999;21000;21001;21002;21003;21004;21005;21006;21007;21008;21009;21010;21011;21012;21013;21014;21015;21016 26836;26837;26838;26839;26840;26841;26842;26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;26850;26851;26852;26853;26854;26855;26856 26850 2397 20 ALEAAQIIIDVLQLPMSK Unmodified 1952.1016 0.10163489 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 173.96 173.96 2;3 4.3121E-39 178579 QUIQUE_C1368_190116_001 166.9 154.85 644520000 22329000 12347000 45857000 19276000 61161000 4928300 43071000 68073000 71151000 13945000 79191000 42009000 161180000 2273 2924 2117 21017;21018;21019;21020;21021;21022;21023;21024;21025;21026;21027;21028;21029;21030;21031;21032;21033;21034;21035 26857;26858;26859;26860;26861;26862;26863;26864;26865;26866;26867;26868;26869;26870;26871;26872;26873;26874;26875;26876 26859 19 ALEAAQIIIDVLQLPMSKEELVEESQTK Unmodified 3124.6577 0.65773258 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 1 1 169.72 169.72 3 5.0506E-24 171572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.614 94.013 18643000 0 0 0 0 0 0 0 18643000 0 0 0 0 0 2274 2924 2118 21036 26877 26877 1 ALEAELAALR Unmodified 1055.5975 0.597509 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.247 89.247 2 7.3165E-18 87301 QUIQUE_DMIX4_190116_001 182.39 123.18 16282000000 1690000000 1533000000 1352200000 874180000 1231500000 955550000 1730900000 1026900000 1113200000 388490000 1746400000 1150100000 1490100000 2275 3176 2119 21037;21038;21039;21040;21041;21042;21043;21044;21045;21046;21047;21048;21049 26878;26879;26880;26881;26882;26883;26884;26885;26886;26887;26888;26889;26890;26891;26892;26893;26894;26895;26896;26897;26898;26899;26900;26901;26902;26903;26904;26905;26906 26897 29 ALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAVYTALLQPHDR Unmodified 4123.0439 0.04394367 2360 P34897;G3V5L0;G3V4W5;G3V540;G3V241;G3V3Y8;G3V4T0;G3V4X0;G3V2W0;G3V2E4 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 168.31 168.31 3;4 7.8032E-11 172811 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.942 57.216 77668000 0 0 0 0 0 0 0 34111000 43557000 0 0 0 0 2276 2360 2120 21050;21051 26907;26908 26908 2 ALEAFETFK Unmodified 1054.5335 0.53351176 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.863 82.863 2 0.0023457 80358 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.302 65.88 1027900000 126570000 126320000 117040000 0 0 115710000 157620000 41900000 78847000 67277000 83734000 0 112850000 2277 2848 2121 21052;21053;21054;21055;21056;21057;21058;21059;21060;21061 26909;26910;26911;26912;26913;26914;26915;26916;26917;26918;26919;26920 26918 10 ALEAFETFKK Unmodified 1182.6285 0.62847478 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 54.911 54.911 2;3 0.00078446 54471 QUIQUE_C1218_190116_001 86.882 55.011 1386600000 61958000 43473000 0 40028000 113970000 35594000 140390000 175780000 220990000 0 167850000 158150000 228460000 2278 2848 2122 21062;21063;21064;21065;21066;21067;21068;21069;21070;21071;21072;21073;21074;21075;21076;21077;21078;21079;21080 26921;26922;26923;26924;26925;26926;26927;26928;26929;26930;26931;26932;26933;26934;26935;26936;26937;26938;26939;26940;26941;26942;26943;26944 26922 21 ALEALVAK Unmodified 813.496 0.49600404 2076 P14550 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.367 40.367 2 0.01188 36688 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.369 40.609 3016900000 245500000 207630000 158800000 239040000 261830000 239140000 245160000 212850000 201020000 121470000 302690000 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N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.28 56.28 2 0.0099549 54044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.906 27.13 6200100000 614940000 545520000 724160000 0 0 0 0 579700000 2817000000 395620000 0 523200000 0 2282 2412 2126 21105;21106;21107;21108;21109;21110;21111 26970;26971;26972;26973;26974;26975;26976 26973 7 ALECMQVCK Unmodified 1137.4981 0.49807101 3858 Q96GA7;H0YID3;H0YIA2 SDSL Serine dehydratase-like yes no 0 0 0 1 1 35.747 35.747 2 0.040467 31985 QUIQUE_C1576_190116_001 81.784 75.471 57251000 0 0 0 0 0 0 34045000 0 0 0 0 0 23206000 2283 3858 2127 21112;21113 26977;26978 26977 1 ALEDFADNIK Unmodified 1134.5557 0.55570376 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 80.718 80.718 2 0.0056282 77433 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.827 43.986 73112000 0 0 0 0 0 28758000 25423000 0 0 18931000 0 0 0 2284 173 2128 21114;21115;21116;21117;21118 26979;26980;26981;26982;26983 26983 5 ALEDLAQELEK Unmodified 1257.6452 0.64524705 2021 P11277 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27006;27007;27008;27009;27010;27011;27012;27013;27014;27015;27016;27017;27018 27015 7 ALEEDIENHATDVHQAVK Unmodified 2017.9705 0.97049737 1187 H3BPE1;H3BQK9;A0A0A6YYJ5 MACF1 yes no 0 0 0 1 1 59.009 59.009 3 0.014941 58110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.136 24.818 85104000 0 0 0 0 0 0 0 35744000 0 0 49359000 0 0 2291 1187 2135 21150;21151 27019;27020 27020 2 ALEEEEKYEDEEEK Unmodified 1768.7527 0.75268483 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 1 1 34.281 34.281 3 0.014928 28299 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.467 43.093 14868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14868000 0 0 0 2292 3862 2136 21152 27021 27021 1 ALEEEQEAREELER Unmodified 1729.8119 0.81187146 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 1 55.169 55.169 3 0.025464 53570 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.457 35.891 109150000 0 0 0 0 47467000 0 0 0 0 0 0 0 61680000 2293 3459 2137 21153;21154 27022;27023 27023 2 ALEEETKNHEAQIQDMR Oxidation (M) 2056.9484 0.94838172 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 1 1 1 25.713 25.713 3 0.023891 19936 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27031;27032;27033;27034;27035;27036;27037;27038;27039;27040;27041;27042;27043;27044;27045;27046;27047;27048;27049;27050;27051 27043 18 ALEEKPNNPEFSSGLAIAMYHLDNHPEK Oxidation (M) 3166.503 0.50296327 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 1 1 1 86.272 86.272 4 0.00036622 89219 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.562 35.401 90769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90769000 0 0 2297 1452 2140 21177 27052 27052 808 1 ALEELATK Unmodified 873.48075 0.48074791 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.892 29.892 2 0.00077091 24395 QUIQUE_C1277_190116_001 149.4 80.225 12433000000 1542700000 970040000 1551800000 1169300000 1410100000 995130000 1440900000 0 1308500000 578950000 0 0 1465200000 2298 4050 2141 21178;21179;21180;21181;21182;21183;21184;21185;21186;21187 27053;27054;27055;27056;27057;27058;27059;27060;27061;27062;27063;27064 27054 11 ALEELATKR Unmodified 1029.5819 0.58185894 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 1 1 22.261 22.261 2 0.029128 15799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.639 51.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2299 4050 2142 21188 27065 27065 1 ALEENNNFSK Unmodified 1164.5411 0.54111633 838 E5RGX5;Q93045 STMN2 Stathmin;Stathmin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 21.792 21.792 2 2.3391E-12 14356 QUIQUE_C1403_190116_001 167.33 0 3573700000 44283000 426220000 258500000 337440000 0 251070000 326620000 229550000 254540000 215880000 591780000 318090000 319750000 2300 838 2143 21189;21190;21191;21192;21193;21194;21195;21196;21197;21198;21199;21200;21201;21202 27066;27067;27068;27069;27070;27071;27072;27073;27074;27075;27076;27077;27078;27079;27080;27081 27070 16 ALEENNNFSR Unmodified 1192.5473 0.54726434 296 A0A0J9YW36;Q9NZ72 STMN3 Stathmin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.27 27.27 2 0.00076103 21903 QUIQUE_C1218_190116_001 106.6 96.368 182460000 58339000 51616000 0 41260000 0 0 0 0 0 0 0 31246000 0 2301 296 2144 21203;21204;21205;21206;21207 27082;27083;27084;27085;27086 27082 4 ALEEPAVDMLHTVTDMVR Unmodified 2025.9863 0.98634713 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 142.2 142.2 2;3 2.7616E-31 148883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.48 129.64 1600300000 29613000 47181000 369910000 19833000 55687000 0 129770000 131130000 68082000 0 665780000 23273000 60029000 2302 2168 2145 21208;21209;21210;21211;21212;21213;21214;21215;21216;21217;21218;21219;21220;21221;21222;21223 27087;27088;27089;27090;27091;27092;27093;27094;27095;27096;27097;27098;27099;27100;27101;27102;27103 27099 17 ALEEPAVDMLHTVTDMVR Oxidation (M) 2041.9813 0.98126175 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 1 0 2 113.06 113.06 3 7.579E-05 110365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.317 71.218 98692000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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ALEETMAFTTQALASVAYQVGNLAGHTLR Unmodified 3062.5495 0.54951953 4383 Q9P2A4 ABI3 ABI gene family member 3 yes yes 0 0 0 1 172.19 172.19 3 2.617E-66 173776 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.68 146.47 53860000 0 0 0 0 0 0 0 53860000 0 0 0 0 0 2306 4383 2148 21246 27133 27133 1 ALEEVPIHIEDPPFPSLR Unmodified 2058.0786 0.078591257 3341 Q5VZK9;A0A0U1RQQ1 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 127.86 127.86 3 0.039231 131491 QUIQUE_C1403_190116_001 28.355 19.536 25993000 0 0 0 25993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2307 3341 2149 21247 27134 27134 1 ALEFAPACHR Unmodified 1170.5604 0.56041199 3963 Q99615;K7EPP7;K7ESP1;K7EIH8;K7ER44 DNAJC7 DnaJ homolog subfamily C member 7 yes no 0 0 0 1 1 32.377 32.377 3 0.042544 27063 QUIQUE_C1563_190116_001 37.344 26.734 54012000 0 0 0 0 0 24295000 29717000 0 0 0 0 0 0 2308 3963 2150 21248;21249 27135;27136 27135 2 ALEFVAR Unmodified 804.44939 0.4493882 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.599 46.599 2 0.01933 44195 QUIQUE_C1438_190116_001 114.54 57.087 1435300000 89304000 67299000 101420000 137380000 204070000 215660000 91378000 87925000 99909000 75629000 0 122130000 143190000 2309 2037 2151 21250;21251;21252;21253;21254;21255;21256;21257;21258;21259;21260;21261 27137;27138;27139;27140;27141;27142;27143;27144;27145;27146;27147;27148;27149;27150;27151;27152 27141 16 ALEHAFQLEHIMDLTR Unmodified 1922.9673 0.96726667 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 3 1 4 2 3 108.77 108.77 2;3;4 9.9255E-25 112359 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.19 116.53 1745500000 0 74446000 256800000 124400000 48704000 40247000 167530000 52072000 266750000 18615000 273440000 162590000 259880000 2310 3053 2152 21262;21263;21264;21265;21266;21267;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;21277;21278;21279;21280;21281;21282;21283;21284;21285;21286;21287 27153;27154;27155;27156;27157;27158;27159;27160;27161;27162;27163;27164;27165;27166;27167;27168;27169;27170;27171;27172;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;27180;27181;27182 27167 29 ALEHFPMLQK Unmodified 1212.6325 0.6325143 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 60.341 60.341 2;3 0.00022736 60118 QUIQUE_C1218_190116_001 111.46 99.589 269550000 32274000 0 64364000 40452000 25302000 44597000 0 18499000 0 12052000 0 0 32008000 2311 2463 2153 21288;21289;21290;21291;21292;21293;21294;21295;21296;21297 27183;27184;27185;27186;27187;27188;27189;27190;27191;27192;27193;27194;27195;27196;27197 27183 15 ALEHFTDLYDIK Unmodified 1463.7296 0.72964538 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 3 3 2 3 3 2 2 2 2 2 2 1 92.346 92.346 2;3 3.4803E-14 90061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.64 121.9 17216000000 2475500000 2277500000 1010900000 1100200000 1915700000 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21327;21328;21329;21330;21331;21332;21333;21334;21335;21336;21337;21338;21339;21340;21341;21342;21343;21344;21345;21346;21347;21348;21349;21350;21351;21352;21353;21354;21355;21356 27245;27246;27247;27248;27249;27250;27251;27252;27253;27254;27255;27256;27257;27258;27259;27260;27261;27262;27263;27264;27265;27266;27267;27268;27269;27270;27271;27272;27273;27274;27275;27276;27277;27278;27279;27280;27281;27282;27283;27284;27285;27286;27287;27288;27289;27290;27291;27292;27293;27294;27295;27296;27297;27298;27299;27300;27301;27302 27296 55 ALEHSALAINHK Unmodified 1302.7044 0.70443369 476;4267 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;B4E1E0;A0A3B3ITB8;A0A3B3ISY3;Q9NRF8 CTPS1;CTPS2 CTP synthase 1;CTP synthase;CTP synthase 2 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 17.464 17.464 2;3 4.1223E-07 10530 QUIQUE_C1218_190116_001 167.93 149.26 1018100000 20230000 96140000 97692000 86957000 11131000 67334000 109930000 88831000 97147000 0 101150000 74637000 166970000 2314 476;4267 2156 21357;21358;21359;21360;21361;21362;21363;21364;21365;21366;21367;21368;21369;21370;21371;21372;21373;21374 27303;27304;27305;27306;27307;27308;27309;27310;27311;27312;27313;27314;27315;27316;27317;27318;27319;27320;27321 27303 16 ALEIADFSGNPLSR Unmodified 1488.7573 0.75725712 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 1 116.06 116.06 2 0.013182 120501 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.267 30.853 36726000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36726000 2315 289 2157 21375;21376 27322;27323 27323 1 ALEICQQR Unmodified 1016.5073 0.50731378 2541 P49754 VPS41 Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog yes yes 0 0 0 1 27.11 27.11 2 0.058687 21259 QUIQUE_C1576_190116_001 53.554 3.4278 35321000 0 0 0 0 0 0 35321000 0 0 0 0 0 0 2316 2541 2158 21377 27324 27324 1 ALEIFAYALQYFK Unmodified 1575.8337 0.83371653 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 1 169.56 169.56 2;3 0.00011418 176856 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ALEILQEEDLIDEDDIPVR Unmodified 2224.1111 0.11107318 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.78 145.78 2 1.0514E-86 153011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.35 183.49 477800000 36465000 52976000 0 0 89607000 31978000 0 46330000 0 33245000 75270000 74095000 37829000 2319 290;327;328 2161 21407;21408;21409;21410;21411;21412;21413;21414;21415 27369;27370;27371;27372;27373;27374;27375;27376;27377 27375 7 ALEIPGEELPGVCSAR Unmodified 1696.8454 0.8454202 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3;J3QKZ8 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 104.15 104.15 2 0.048731 107398 QUIQUE_C1218_190116_001 51.013 13.67 42890000 42890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2320 2198 2162 21416 27378 27378 1 ALEIQPGFIR Unmodified 1142.6448 0.64479354 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.076 89.076 2 0.0039027 90982 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.253 37.272 182870000 0 31800000 29714000 0 0 0 0 25979000 0 0 19514000 35736000 40128000 2321 3552 2163 21417;21418;21419;21420;21421;21422 27379;27380;27381;27382;27383;27384 27383 3 ALEIYATR Unmodified 935.50763 0.50763136 4116 Q9H0B6;A8MZ87 KLC2 Kinesin light chain 2 yes no 0 0 0 1 1 45.475 45.475 2 0.053534 42195 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.776 25.675 79052000 0 0 0 0 0 0 34739000 0 0 0 0 0 44312000 2322 4116 2164 21423;21424 27385;27386 27386 2 ALEIYQTK Unmodified 964.52295 0.52294707 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.844 38.844 2 0.009742 35535 QUIQUE_C1218_190116_001 92.187 43.683 819380000 99769000 0 101560000 83996000 98599000 91626000 96970000 0 0 49486000 104570000 92802000 0 2323 1050 2165 21425;21426;21427;21428;21429;21430;21431;21432;21433 27387;27388;27389;27390;27391;27392;27393;27394;27395;27396;27397;27398 27387 11 ALELCEILAK Unmodified 1158.6318 0.63184559 2525 P49354;B3KVN2 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 107.94 107.94 2 0.015545 109909 QUIQUE_C1563_190116_001 85.731 60.808 102920000 0 0 0 0 0 102920000 0 0 0 0 0 0 0 2324 2525 2166 21434 27399 27399 0 ALELDGQSVK Unmodified 1058.5608 0.56078914 4509 Q9UNE7;H3BS86 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 1 46.124 46.124 2 0.011915 42814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.621 12.653 114190000 0 0 0 0 0 0 0 81959000 0 32230000 0 0 0 2325 4509 2167 21435;21436 27400;27401 27400 2 ALELDPDNETYK Unmodified 1406.6565 0.65654002 1551 O43765 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.917 65.917 2 0.0004795 64875 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.83 94.377 992760000 168020000 0 0 0 167660000 0 137670000 118820000 137470000 0 125900000 0 137210000 2326 1551 2168 21437;21438;21439;21440;21441;21442;21443;21444 27402;27403;27404;27405;27406;27407;27408;27409;27410;27411;27412 27412 11 ALELDPNLYR Unmodified 1202.6295 0.62953741 2379;2385 P35749;P35580 MYH11;MYH10 Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 92.288 92.288 2 0.0021892 93653 QUIQUE_C1277_190116_001 91.318 64.064 362360000 0 211770000 0 0 0 0 0 98030000 0 52554000 0 0 0 2327 2385;2379 2169 21445;21446;21447 27413;27414;27415;27416 27414 4 ALELDQER Unmodified 972.48762 0.4876242 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.235 32.235 2 0.0036109 27150 QUIQUE_C1277_190116_001 114.6 66.099 1607000000 0 198920000 0 217680000 166430000 184550000 213240000 0 244570000 139630000 241990000 0 0 2328 434 2170 21448;21449;21450;21451;21452;21453;21454;21455;21456 27417;27418;27419;27420;27421;27422;27423;27424;27425 27417 7 ALELDSNLYR Unmodified 1192.6088 0.60880197 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.867 79.867 2 0.0001484 79891 QUIQUE_C1403_190116_001 122.19 89.347 635650000 173140000 0 0 194950000 0 175680000 0 0 0 91883000 0 0 0 2329 2378 2171 21457;21458;21459;21460 27426;27427;27428;27429;27430;27431;27432 27427 7 ALELDSNNEK Unmodified 1131.5408 0.54078198 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.415 25.415 2 0.0001513 19467 QUIQUE_C1218_190116_001 120.87 88.726 2188200000 200500000 164710000 169450000 198850000 218270000 211810000 226050000 0 142810000 0 267170000 199660000 188930000 2330 2876 2172 21461;21462;21463;21464;21465;21466;21467;21468;21469;21470;21471;21472 27433;27434;27435;27436;27437;27438;27439;27440;27441;27442;27443;27444;27445 27433 12 ALELENDR Unmodified 958.47197 0.47197413 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.316 29.316 2 0.0039847 24591 QUIQUE_C1218_190116_001 110.81 63.741 3583600000 400670000 431080000 395640000 291890000 375290000 361360000 334200000 160600000 0 161090000 366560000 305240000 0 2331 2886 2173 21473;21474;21475;21476;21477;21478;21479;21480;21481;21482;21483 27446;27447;27448;27449;27450;27451;27452;27453;27454;27455;27456 27446 8 ALELENDRLLLK Unmodified 1425.8191 0.81912909 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 82.062 82.062 2;3 7.6325E-06 83306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.36 98.577 569190000 0 0 0 0 0 0 0 238260000 129450000 0 63643000 59314000 78513000 2332 2886 2174 21484;21485;21486;21487;21488;21489;21490 27457;27458;27459;27460;27461;27462;27463;27464;27465 27458 9 ALELEQER Unmodified 986.50327 0.50327426 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.958 31.958 2 0.0026609 26755 QUIQUE_C1563_190116_001 135.35 0 8561400000 0 0 0 0 1513400000 1315000000 0 1588200000 0 0 2025200000 0 2119500000 2333 2248 2175 21491;21492;21493;21494;21495;21496 27466;27467;27468;27469;27470;27471 27468 5 ALELEQERK Unmodified 1114.5982 0.59823728 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 18.129 18.129 3 0.045197 10869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.696 9.0379 45259000 0 0 0 0 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64.954 64.954 2 0.017221 64875 QUIQUE_C1576_190116_001 56.258 45.107 75064000 0 0 0 35681000 0 0 39383000 0 0 0 0 0 0 2344 3962 2185 21567;21568 27570;27571 27571 1 ALENDPDCR Unmodified 1088.4557 0.45567214 2066;181 A0A0A0MSQ0;P13797;U3KQI3;P13796;Q5TBN3 PLS3;LCP1 Plastin-3;Plastin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.369 16.369 2 0.0013568 9196 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 100.32 1113700000 60608000 113870000 72945000 190470000 50433000 74640000 41151000 112410000 110500000 87388000 27850000 120890000 50595000 2345 181;2066 2186 21569;21570;21571;21572;21573;21574;21575;21576;21577;21578;21579;21580;21581 27572;27573;27574;27575;27576;27577;27578;27579;27580;27581;27582;27583;27584;27585;27586 27581 15 ALENPDTASLLGR Unmodified 1355.7045 0.70449327 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 78.096 78.096 2 0.0014139 79782 QUIQUE_C1218_190116_001 129.89 92.161 215150000 50795000 69999000 0 0 0 0 0 0 0 0 94358000 0 0 2346 4161 2187 21582;21583;21584 27587;27588;27589 27587 1 ALENSSLMK Oxidation (M) 1007.4957 0.49574604 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 18.991 18.991 2 0.06437 12003 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.554 20.245 39721000 0 0 0 0 0 0 0 39721000 0 0 0 0 0 2347 62 2188 21585 27590 27590 1 ALENVLSGKA Unmodified 1000.5553 0.55530983 1542 O43678 NDUFA2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 yes yes 0 0 1 1 53.444 53.444 2 0.032036 52032 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.433 4.6585 58557000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58557000 2348 1542 2189 21586 27591 27591 1 ALEPQGLLLYNGNAR Unmodified 1627.8682 0.86820455 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 2 1 101.94 101.94 2;3 0.025094 105943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.167 48.848 90486000 0 0 0 0 0 0 0 42346000 0 0 48141000 0 0 2349 1408 2190 21587;21588;21589 27592;27593;27594 27594 2 ALEQFATVVEAK Unmodified 1304.6976 0.69761697 2539 P49748;G3V1M7;J3QRJ8;K7EMF8 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.909 85.909 2 9.3912E-06 88734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.28 91.239 3032200000 248120000 202380000 281220000 193400000 189040000 226720000 223680000 214440000 338850000 123480000 309840000 226610000 254390000 2350 2539 2191 21590;21591;21592;21593;21594;21595;21596;21597;21598;21599;21600;21601;21602 27595;27596;27597;27598;27599;27600;27601;27602;27603;27604;27605;27606;27607;27608;27609;27610;27611;27612;27613 27610 18 ALEQKPDDAQYYCQR Unmodified 1883.8472 0.84721111 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 1 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 35.522 35.522 2;3 7.5329E-19 30801 QUIQUE_C1563_190116_001 146.96 137.79 1785600000 88427000 164020000 139720000 155220000 158740000 176300000 163260000 126310000 121470000 48568000 166330000 113120000 164160000 2351 4572 2192 21603;21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611;21612;21613;21614;21615;21616;21617;21618;21619;21620;21621;21622;21623;21624;21625;21626;21627 27614;27615;27616;27617;27618;27619;27620;27621;27622;27623;27624;27625;27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635;27636;27637;27638;27639;27640 27626 26 ALEQLLTELDDFLK Unmodified 1646.8767 0.87670355 3595 Q8N4X5 AFAP1L2 Actin filament-associated protein 1-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 172.89 172.89 2 0.00019577 177203 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.55 87.59 45813000 0 0 0 0 0 0 0 0 25118000 0 20695000 0 0 2352 3595 2193 21628;21629 27641;27642 27641 2 ALEQQMESHR Unmodified 1227.5666 0.56661958 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 18.365 18.365 2;3 0.0027159 10791 QUIQUE_C1368_190116_001 88.37 56.528 237970000 79714000 31074000 21602000 21600000 14063000 20186000 26919000 0 0 0 0 0 22813000 2353 1568 2194 21630;21631;21632;21633;21634;21635;21636;21637;21638 27643;27644;27645;27646;27647;27648;27649;27650;27651 27646 8 ALEQQVEEMK Oxidation (M) 1219.5755 0.57545293 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 26.027 26.027 2 0.0018369 19841 QUIQUE_C1403_190116_001 96.311 61.38 89963000 16016000 13083000 17092000 23258000 20514000 0 0 0 0 0 0 0 0 2354 2378 2195 21639;21640;21641;21642;21643 27652;27653;27654;27655;27656 27655 1776 5 ALEQQVEEMK Unmodified 1203.5805 0.58053831 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 49.332 49.332 2 0.0088414 47917 QUIQUE_C1218_190116_001 109.71 68.266 599170000 131530000 0 210960000 256690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2355 2378 2195 21644;21645;21646;21647;21648 27657;27658;27659;27660;27661 27657 3 ALEQQVEEMKTQLEELEDELQATEDAK Unmodified 3146.4813 0.48128436 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 166.93 166.93 3 2.8368E-44 170689 QUIQUE_DMIX7_190116_001 131.57 124.53 74576000 0 0 0 0 0 0 0 74576000 0 0 0 0 0 2356 2378 2196 21649;21650 27662;27663;27664 27664 3 ALEQQVEEMR Unmodified 1231.5867 0.58668632 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.014 55.014 2 0.00022711 52678 QUIQUE_C1403_190116_001 135.79 102.95 603140000 96698000 107820000 107270000 100240000 0 60518000 92350000 0 0 38235000 0 0 0 2357 2379 2197 21651;21652;21653;21654;21655;21656;21657 27665;27666;27667;27668;27669;27670;27671 27668 7 ALESDMAPVLIMATNR Unmodified 1730.8695 0.86952646 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 3 1 1 1 1 128.32 128.32 2;3 7.7845E-07 132141 QUIQUE_C1403_190116_001 133.71 108.27 640370000 19684000 19810000 117220000 89023000 73877000 52352000 102440000 0 22769000 22051000 25648000 0 95504000 2358 4536 2198 21658;21659;21660;21661;21662;21663;21664;21665;21666;21667;21668;21669;21670;21671;21672 27672;27673;27674;27675;27676;27677;27678;27679;27680;27681;27682;27683;27684;27685;27686;27687;27688 27677 16 ALESDMAPVLIMATNR Oxidation (M) 1746.8644 0.86444108 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 1 0 1 99.105 99.105 2 0.039851 101717 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27694;27695;27696;27697;27698;27699 27694 6 ALESPERPFLAILGGAK Unmodified 1767.9883 0.98831969 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 117.72 117.72 2;3 5.41E-52 121604 QUIQUE_C1277_190116_001 196.11 155.96 58018000000 4413900000 4871600000 5444500000 4386800000 4630400000 3691900000 4035000000 4442500000 4848100000 1697100000 5465200000 4793800000 5297300000 2363 1790 2202 21684;21685;21686;21687;21688;21689;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;21699;21700;21701;21702;21703;21704;21705;21706;21707;21708;21709 27700;27701;27702;27703;27704;27705;27706;27707;27708;27709;27710;27711;27712;27713;27714;27715;27716;27717;27718;27719;27720;27721;27722;27723;27724;27725;27726;27727;27728;27729;27730;27731;27732;27733;27734;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;27745;27746;27747;27748;27749;27750;27751;27752;27753;27754;27755;27756;27757;27758;27759;27760;27761;27762;27763;27764;27765;27766;27767;27768;27769;27770;27771;27772;27773;27774;27775;27776;27777;27778 27710 79 ALESSEELLETANQTLQAMDSEDFPQAAK Unmodified 3165.466 0.46596864 4024 Q9BTV5;M0R366;M0R2F6 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 166.39 166.39 3 0.00012433 170832 QUIQUE_C1218_190116_001 43.681 41.124 45988000 45988000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2364 4024 2203 21710 27779 27779 1 ALESSIAPIVIFASNR Unmodified 1686.9305 0.93047046 4542 Q9Y265;E7ETR0;H7C4G5;J3QLR1;H7C4I3 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 136.55 136.55 2;3 4.1601E-30 139488 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Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.74 131.74 2 2.593E-06 136225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.24 133.37 1417000000 99652000 100020000 107700000 124140000 137820000 113970000 118260000 134100000 120090000 0 128820000 90411000 142010000 2367 4288 2206 21741;21742;21743;21744;21745;21746;21747;21748;21749;21750;21751;21752 27814;27815;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822;27823;27824;27825;27826;27827 27824 14 ALEVEECR Unmodified 1004.4597 0.45969489 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 25.068 25.068 2 0.030357 18764 QUIQUE_C1438_190116_001 67.032 41.093 178160000 0 0 57011000 0 100690000 0 0 0 0 20462000 0 0 0 2368 2834 2207 21753;21754;21755 27828;27829;27830;27831;27832 27829 5 ALEVFPEFAAAHSNLASVLQQQGK Unmodified 2554.318 0.31798668 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.84 137.84 3 6.3853E-12 142024 QUIQUE_C1277_190116_001 91.729 79.941 881390000 71318000 71362000 82181000 56848000 64526000 60212000 65595000 65575000 78947000 23484000 91648000 65026000 84672000 2369 1497 2208 21756;21757;21758;21759;21760;21761;21762;21763;21764;21765;21766;21767;21768 27833;27834;27835;27836;27837;27838;27839;27840;27841;27842;27843;27844;27845;27846;27847;27848;27849 27835 16 ALEVIKPAHILQEKEEQHQLAVTAYLK Unmodified 3098.7128 0.71282011 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 2 1 1 1 1 91.767 91.767 4;5 0.0031797 93534 QUIQUE_DMIX8_190116_001 32.708 26.678 220010000 0 0 30218000 0 0 0 0 39005000 69217000 0 0 0 81571000 2370 3046 2209 21769;21770;21771;21772 27850;27851;27852;27853 27853 4 ALEYACGIK Unmodified 1023.5059 0.5059168 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 42.757 42.757 2 0.0032955 39391 QUIQUE_C1368_190116_001 91.626 28.912 586350000 0 0 286440000 0 0 0 299910000 0 0 0 0 0 0 2371 4111 2210 21773;21774 27854;27855;27856 27854 3 ALEYFTCALQHR Unmodified 1507.7242 0.72418285 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 82.188 82.188 3 0.044559 82477 QUIQUE_C1563_190116_001 35.523 27.612 7328600 0 0 0 0 0 7328600 0 0 0 0 0 0 0 2372 3391 2211 21775 27857 27857 0 ALEYIENLR Unmodified 1119.5924 0.59242362 2056 P13521;C9JDT0;C9JQI2 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes no 0 0 0 1 80.186 80.186 2 0.028741 82736 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.169 38.008 30703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30703000 0 0 2373 2056 2212 21776 27858 27858 1 ALEYTIYNQELNETR Unmodified 1855.8952 0.89520716 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.365 94.365 2 2.7048E-24 95796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.08 168.66 166380000 0 0 0 34906000 0 28531000 26815000 31067000 0 16757000 0 28304000 0 2374 4532 2213 21777;21778;21779;21780;21781;21782;21783 27859;27860;27861;27862;27863;27864;27865 27863 7 ALFAISCLVR Unmodified 1148.6376 0.63759967 4350 Q9NZL4;K7EN20 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.05 119.05 2 0.00988 116830 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.598 49.078 466480000 0 52372000 42044000 0 54928000 0 0 0 63109000 29454000 81604000 70382000 72590000 2375 4350 2214 21784;21785;21786;21787;21788;21789;21790;21791 27866;27867;27868;27869;27870;27871;27872;27873;27874;27875 27871 10 ALFARPDLLLLDEPTNMLDVR Unmodified 2411.2883 0.28826646 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 154.09 154.09 3 0.00092415 158375 QUIQUE_C1277_190116_001 54.582 47.221 113490000 0 22738000 0 31938000 0 0 0 20402000 0 0 0 38408000 0 2376 4299 2215 21792;21793;21794;21795 27876;27877;27878;27879 27876 4 ALFAVPK Unmodified 744.45341 0.45341094 1554 O43809;H3BND3 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 59.88 59.88 2 0.05526 58282 QUIQUE_C1403_190116_001 72.021 29.302 274170000 0 78595000 0 63851000 0 0 0 0 58949000 0 0 72771000 0 2377 1554 2216 21796;21797;21798;21799 27880;27881;27882;27883 27881 4 ALFDFLK Unmodified 852.47454 0.47454032 332;2639 A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GTP5;A0A1B0GUI8;Q02641;F8VU10;P54284;F8VNV8;F8VUW8 CACNB4;CACNB1;CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 no no 0 0 0 1 1 1 129.6 129.6 2 0.053305 134536 QUIQUE_C1218_190116_001 73.039 34.668 106220000 48208000 0 0 33790000 0 0 0 24221000 0 0 0 0 0 2378 332;2639 2217 21800;21801;21802 27884;27885;27886 27884 3 ALFDFNGNDEEDLPFK Unmodified 1869.8421 0.84210896 2479 P46108 CRK Adapter molecule crk yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.61 144.61 2 1.4133E-10 149558 QUIQUE_DMIX8_190116_001 155.48 146.16 946270000 77271000 75393000 78695000 73737000 70969000 80226000 72952000 79844000 77127000 29294000 92218000 64429000 74112000 2379 2479 2218 21803;21804;21805;21806;21807;21808;21809;21810;21811;21812;21813;21814;21815 27887;27888;27889;27890;27891;27892;27893;27894;27895;27896;27897;27898;27899;27900;27901;27902;27903;27904 27904 17 ALFDFNGNDEEDLPFKK Unmodified 1997.9371 0.93707198 2479 P46108 CRK Adapter molecule crk yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 119.83 119.83 2;3 1.5962E-06 125490 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.24 94.056 912860000 46712000 54152000 45894000 52466000 53346000 51377000 61988000 84479000 122370000 27288000 141640000 75152000 96003000 2380 2479 2219 21816;21817;21818;21819;21820;21821;21822;21823;21824;21825;21826;21827;21828;21829;21830;21831 27905;27906;27907;27908;27909;27910;27911;27912;27913;27914;27915;27916;27917;27918;27919;27920 27916 13 ALFDYDKTK Unmodified 1099.555 0.55497548 487;2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG1;DLG4 Disks large homolog 1;Disks large homolog 4 no no 0 0 1 1 1 1 40.055 40.055 3 0.010151 36926 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.397 54.459 25877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25877000 0 0 2381 2954;487 2220 21832;21833;21834 27921;27922;27923 27922 3 ALFEEVPELLTEAEK Unmodified 1716.8822 0.88218286 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 148.59 148.59 2;3 1.5234E-06 144657 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.32 118.42 2618000000 202020000 183710000 284640000 274810000 285260000 337140000 238830000 78831000 166430000 127090000 161100000 112220000 165870000 2382 2339 2221 21835;21836;21837;21838;21839;21840;21841;21842;21843;21844;21845;21846;21847;21848;21849;21850;21851;21852;21853;21854;21855;21856;21857;21858 27924;27925;27926;27927;27928;27929;27930;27931;27932;27933;27934;27935;27936;27937;27938;27939;27940;27941;27942;27943;27944;27945;27946;27947;27948;27949;27950;27951;27952;27953;27954;27955;27956;27957 27948 33 ALFEEVPELLTEAEKK Unmodified 1844.9771 0.97714588 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.18 133.18 3 2.1175E-07 137922 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.751 89.023 2196100000 111150000 109170000 182260000 101680000 163810000 89615000 175890000 229220000 237460000 57595000 255860000 217570000 264780000 2383 2339 2222 21859;21860;21861;21862;21863;21864;21865;21866;21867;21868;21869;21870;21871 27958;27959;27960;27961;27962;27963;27964;27965;27966;27967;27968;27969;27970;27971;27972;27973;27974;27975;27976;27977;27978;27979;27980;27981;27982;27983 27975 26 ALFLETEQLK Unmodified 1190.6547 0.65468953 3023 Q13740;F5GXJ9 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 88.545 88.545 2 0.0015444 85351 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.367 73.98 291550000 138550000 95021000 0 0 0 0 0 0 0 57979000 0 0 0 2384 3023 2223 21872;21873;21874 27984;27985;27986;27987 27987 4 ALFLETEQLKK Unmodified 1318.7497 0.74965254 3023 Q13740;F5GXJ9 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 59.823 59.823 2;3 0.00016822 59334 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.189 68.356 1115200000 0 114880000 77465000 85856000 134810000 0 158260000 96237000 104500000 36971000 159400000 44780000 102020000 2385 3023 2224 21875;21876;21877;21878;21879;21880;21881;21882;21883;21884;21885;21886;21887;21888;21889 27988;27989;27990;27991;27992;27993;27994;27995;27996;27997;27998;27999;28000;28001;28002;28003 27997 16 ALFLIPR Unmodified 828.52216 0.52215921 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;Q8N4C8;I3L2I2;Q9UKE5;C9J338 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.672 91.672 2 0.009917 93861 QUIQUE_C1368_190116_001 143.22 45.195 1236200000 108770000 114290000 93147000 102200000 35475000 80270000 116610000 78014000 117100000 49440000 109770000 116870000 114220000 2386 263;3590;4473 2225 21890;21891;21892;21893;21894;21895;21896;21897;21898;21899;21900;21901;21902 28004;28005;28006;28007;28008;28009;28010;28011;28012;28013;28014;28015;28016;28017;28018;28019;28020;28021;28022;28023;28024;28025 28009 22 ALFLYSR Unmodified 868.48069 0.48068833 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.925 70.925 2 0.01962 72154 QUIQUE_C1218_190116_001 118.69 50.288 314450000 43445000 55584000 0 32357000 0 0 0 43890000 52469000 0 86709000 0 0 2387 1909 2226 21903;21904;21905;21906;21907;21908 28026;28027;28028;28029;28030;28031 28026 4 ALFLYTSHLR Unmodified 1219.6713 0.67134264 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.642 67.642 3 0.0045919 67501 QUIQUE_C1368_190116_001 63.216 50.6 207500000 0 19000000 43616000 0 30423000 0 0 0 34302000 0 35465000 20770000 23922000 2388 1750 2227 21909;21910;21911;21912;21913;21914;21915 28032;28033;28034;28035;28036;28037;28038 28033 6 ALFQDIK Unmodified 833.4647 0.46470391 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.005 56.005 2 0.019482 54790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.28 25.192 8962700000 614940000 545520000 724160000 606860000 610950000 745230000 0 579700000 2817000000 395620000 0 523200000 799550000 2389 1840 2228 21916;21917;21918;21919;21920;21921;21922;21923;21924;21925;21926 28039;28040;28041;28042;28043;28044;28045;28046;28047;28048;28049;28050;28051;28052;28053;28054;28055 28049 17 ALFVSEEEKK Unmodified 1178.6183 0.61830402 630 E7ETN3;B4E1Z4;P00751;H7C5H1 CFB Complement factor B;Complement factor B Ba fragment;Complement factor B Bb fragment yes no 0 0 1 1 24.408 24.408 2 0.013945 18303 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21967;21968;21969;21970;21971;21972;21973;21974;21975;21976;21977 28103;28104;28105;28106;28107;28108;28109;28110;28111;28112;28113;28114;28115;28116 28107 13 ALGAQDLTEAEGWHFFCFQGEATR Unmodified 2740.234 0.23399905 3848 Q96F10;I3L0W4 SAT2 Diamine acetyltransferase 2 yes no 0 0 0 1 1 142.35 142.35 3 0.0032313 149635 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.813 39.657 60050000 0 0 0 0 0 0 0 0 22502000 0 37548000 0 0 2395 3848 2234 21978;21979 28117;28118 28118 0 ALGDFDYK Unmodified 927.4338 0.43379771 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 0 1 62.305 62.305 2 0.046015 60632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.721 39.451 46397000 0 0 0 0 0 0 0 46397000 0 0 0 0 0 2396 2387 2235 21980 28119 28119 1 ALGDLISATK Unmodified 987.56006 0.56006086 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.423 72.423 2 0.0018689 72470 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.111 52.871 1236000000 103990000 101790000 147160000 0 138010000 99159000 0 122270000 122140000 74884000 118790000 112720000 95104000 2397 4600 2236 21981;21982;21983;21984;21985;21986;21987;21988;21989;21990;21991 28120;28121;28122;28123;28124;28125;28126;28127;28128;28129;28130;28131 28131 9 ALGEPITLFGEGPAER Unmodified 1655.8519 0.85188578 1512 O43172 PRPF4 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 yes yes 0 0 0 1 1 1 116.83 116.83 2 0.0006201 120995 QUIQUE_C1277_190116_001 75.088 60.853 111000000 0 35706000 36200000 0 39091000 0 0 0 0 0 0 0 0 2398 1512 2237 21992;21993;21994 28132;28133;28134 28132 3 ALGEYLER Unmodified 949.4869 0.48689592 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.81 52.81 2 0.0095269 51261 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 73.74 674400000 0 0 119460000 0 0 0 0 0 145930000 0 154030000 144800000 110180000 2399 3053 2238 21995;21996;21997;21998;21999 28135;28136;28137;28138;28139;28140 28137 6 ALGFPEGLVIQAYFACEK Unmodified 2012.0077 0.0077344999 2647 P54727 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes yes 0 0 0 1 159.17 159.17 2 0.05114 163691 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22011;22012;22013;22014;22015;22016;22017;22018;22019;22020;22021;22022;22023 28154;28155;28156;28157;28158;28159;28160;28161;28162;28163;28164;28165;28166;28167;28168;28169;28170;28171;28172;28173;28174;28175 28156 22 ALGGDLAPVPSSPQPK Unmodified 1532.8199 0.81985737 4665 Q9Y6V0 PCLO Protein piccolo yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.032 66.032 2 0.00095309 65393 QUIQUE_C1403_190116_001 71.153 56.692 140900000 27049000 0 20606000 19340000 25846000 0 0 30712000 0 0 0 17350000 0 2403 4665 2242 22024;22025;22026;22027;22028;22029 28176;28177;28178;28179;28180;28181;28182 28179 7 ALGHLDLSGNR Unmodified 1151.6047 0.60471964 1832 P02750 LRG1 Leucine-rich alpha-2-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 36.258 36.258 3 0.029425 32448 QUIQUE_C1438_190116_001 30.205 2.8764 55997000 0 0 0 0 55997000 0 0 0 0 0 0 0 0 2404 1832 2243 22030;22031 28183;28184 28183 2 ALGIGVYPVR Unmodified 1043.6128 0.61276513 1418 O00562 PITPNM1 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 77.848 77.848 2 0.038131 78878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.895 44.562 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2405 1418 2244 22032;22033 28185;28186 28185 2 ALGISPFHEHAEVVFTANDSGPR Unmodified 2450.1979 0.19787154 1836 P02766;A0A087WV45 TTR Transthyretin yes no 0 0 0 2 2 1 3 2 1 1 1 1 2 2 1 1 86.326 86.326 3;4 9.4862E-13 88372 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.27 87.174 848370000 79014000 35075000 55329000 100650000 90405000 65455000 78732000 48290000 41005000 58029000 83607000 68535000 44245000 2406 1836 2245 22034;22035;22036;22037;22038;22039;22040;22041;22042;22043;22044;22045;22046;22047;22048;22049;22050;22051;22052;22053 28187;28188;28189;28190;28191;28192;28193;28194;28195;28196;28197;28198;28199;28200;28201;28202;28203;28204;28205;28206;28207;28208;28209 28207 20 ALGLASGELAAR Unmodified 1127.6299 0.62987176 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.156 63.156 2 9.0021E-05 60012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.73 69.878 565370000 68014000 0 0 60156000 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ALGLNENDYK Unmodified 1135.551 0.55095274 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.741 49.741 2 0.00041584 47317 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.95 88.424 645990000 57250000 60647000 46122000 71281000 42224000 52124000 0 57247000 74367000 29449000 71649000 83632000 0 2411 153 2250 22093;22094;22095;22096;22097;22098;22099;22100;22101;22102;22103;22104 28257;28258;28259;28260;28261;28262;28263;28264;28265;28266;28267;28268;28269 28269 12 ALGLSALLLR Unmodified 1025.6597 0.65971533 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 124.27 124.27 2 0.03533 129062 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.679 31.067 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2412 934 2251 22105;22106 28270;28271 28270 2 ALGLVIR Unmodified 740.49086 0.49085908 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 59.542 59.542 2 0.067719 57841 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.939 12.995 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2413 3740 2252 22107 28272 28272 1 ALGNICYDSHEGR Unmodified 1490.6572 0.6572255 2605 P52306;D6RHH8 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 35.388 35.388 2;3 9.2559E-10 31150 QUIQUE_C1438_190116_001 141.88 134.75 1743100000 142180000 172710000 152180000 148550000 177550000 147280000 219660000 76299000 105430000 24068000 86138000 133200000 157890000 2414 2605 2253 22108;22109;22110;22111;22112;22113;22114;22115;22116;22117;22118;22119;22120;22121;22122;22123;22124;22125;22126;22127;22128;22129;22130;22131;22132 28273;28274;28275;28276;28277;28278;28279;28280;28281;28282;28283;28284;28285;28286;28287;28288;28289;28290;28291;28292;28293;28294;28295;28296;28297;28298 28283 25 ALGNICYDSHSLQAQLINMGVIPTLVK Unmodified 2954.5358 0.53578373 827 D6RHZ7 RAP1GDS1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 154.98 154.98 3 2.4924E-37 159221 QUIQUE_C1277_190116_001 128.97 126.34 1917000000 0 195590000 148590000 125310000 152410000 169490000 163310000 105610000 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28316;28317;28318;28319;28320;28321;28322;28323;28324;28325;28326;28327;28328;28329;28330;28331;28332;28333;28334;28335;28336;28337;28338;28339 28338 24 ALGPVESLQGHLR Unmodified 1375.7572 0.75719754 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 62.71 62.71 2;3 0.00016672 62881 QUIQUE_C1218_190116_001 72.496 62.708 2129000000 220160000 227440000 266690000 298310000 0 191970000 234940000 0 152170000 115280000 0 221560000 200500000 2418 57 2257 22162;22163;22164;22165;22166;22167;22168;22169;22170;22171;22172;22173;22174 28340;28341;28342;28343;28344;28345;28346;28347;28348;28349;28350;28351;28352;28353;28354;28355;28356;28357;28358;28359;28360;28361 28341 22 ALGPVESLQGHLRDPTK Unmodified 1816.9795 0.97954591 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 1 1 1 1 65.136 65.136 3;4 0.00095583 65001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.09 48.169 165430000 0 0 0 0 0 0 0 69910000 0 0 0 59456000 36066000 2419 57 2258 22175;22176;22177 28362;28363;28364;28365 28363 3 ALGQAASDNSGPEDAKR Unmodified 1685.7969 0.7968901 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;H3BUC9 NOMO1 Nodal modulator 1 yes no 0 0 1 1 23.087 23.087 3 0.032292 16482 QUIQUE_C1368_190116_001 24.287 17.298 167390000 0 0 167390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2420 101 2259 22178 28366 28366 1 ALGQNPTNAEVLK Unmodified 1353.7252 0.72522871 1048;2080 P14649;F8W1I5;F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;F8VPF3 MYL6B;MYL6 Myosin light chain 6B;Myosin light polypeptide 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.378 46.378 2 0.0015222 44200 QUIQUE_C1438_190116_001 79.201 50.115 9159800000 870890000 984160000 975070000 687500000 904840000 639670000 843920000 414140000 587440000 146480000 788700000 623840000 693170000 2421 2080;1048 2260 22179;22180;22181;22182;22183;22184;22185;22186;22187;22188;22189;22190;22191 28367;28368;28369;28370;28371;28372;28373;28374;28375;28376;28377;28378;28379 28371 2 ALGSDHCPITLYLAL Unmodified 1642.8389 0.83887826 2266 P27695 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 143.34 143.34 2 0.029374 149119 QUIQUE_C1576_190116_001 44.863 23.993 407350000 0 0 0 0 0 0 150810000 89341000 167200000 0 0 0 0 2422 2266 2261 22192;22193;22194 28380;28381;28382 28380 3 ALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTK Unmodified 2376.2384 0.23839896 907 E9PDG8;O60641;H0YBT2 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 3 2 165.36 165.36 2;3 0 167091 QUIQUE_C1563_190116_001 321.81 300.06 6334900000 777040000 1284700000 0 874720000 152750000 275820000 138640000 545290000 386640000 32794000 482160000 348920000 1035500000 2423 907 2262 22195;22196;22197;22198;22199;22200;22201;22202;22203;22204;22205;22206;22207;22208;22209;22210;22211;22212;22213;22214;22215;22216;22217;22218 28383;28384;28385;28386;28387;28388;28389;28390;28391;28392;28393;28394;28395;28396;28397;28398;28399;28400;28401;28402;28403;28404;28405;28406;28407;28408 28392 24 ALGSILAYLTDAK Unmodified 1334.7446 0.74456717 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 1 146.11 146.11 2 0.0016289 149226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 76.176 42159000 0 0 0 0 0 0 0 20263000 0 0 0 21896000 0 2424 4488 2263 22219;22220 28409;28410 28409 2 ALGSVGPVDLLVNNAAVALLQPFLEVTK Unmodified 2847.611 0.6109808 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 3 2 2 1 179.7 179.7 2;3 4.2952E-144 183272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.85 197.21 1438500000 7735900 0 0 0 0 0 0 182190000 204990000 0 772560000 149960000 121050000 2425 3464 2264 22221;22222;22223;22224;22225;22226;22227;22228;22229;22230 28411;28412;28413;28414;28415;28416;28417;28418;28419;28420;28421;28422;28423;28424;28425;28426 28416 14 ALGTEVIQLFPEK Unmodified 1443.7973 0.79733102 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 123 123 2 0.00016885 128428 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.48 117.2 1780300000 149130000 133140000 148850000 134330000 128970000 136690000 141000000 108970000 136810000 66188000 206530000 130880000 158860000 2426 1756 2265 22231;22232;22233;22234;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242;22243;22244 28427;28428;28429;28430;28431;28432;28433;28434;28435;28436;28437;28438;28439;28440;28441;28442;28443;28444 28442 17 ALGTLVSHVTLR Unmodified 1265.7456 0.74557022 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 64.997 64.997 3 0.063235 65569 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.55 11.741 15085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15085000 0 0 2427 3740 2266 22245 28445 28445 1 ALGVALLACFCSDPELAAHPQVLNK Unmodified 2693.3669 0.36692748 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 139.24 139.24 2;3;4 7.8954E-58 142614 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.02 146.81 5179800000 331390000 583940000 324320000 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28469;28470;28471;28472;28473;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482;28483;28484;28485;28486;28487;28488;28489;28490;28491;28492;28493;28494;28495;28496;28497;28498;28499 28475 31 ALGVGFATR Unmodified 890.4974 0.49740102 1505 O15540 FABP7 Fatty acid-binding protein, brain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.781 52.781 2 0.00047712 51390 QUIQUE_C1438_190116_001 126.52 76.395 13237000000 0 1391300000 1360400000 942870000 1211700000 1676200000 908000000 0 1161800000 560810000 1393600000 1232800000 1397500000 2430 1505 2269 22281;22282;22283;22284;22285;22286;22287;22288;22289;22290;22291 28500;28501;28502;28503;28504;28505;28506;28507;28508;28509;28510;28511;28512 28503 10 ALGVLAQLIWSR Unmodified 1325.782 0.78195573 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;H0YIC4 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 148.99 148.99 2;3 7.4941E-28 153519 QUIQUE_C1403_190116_001 179.8 124.82 6130000000 473250000 464930000 413100000 225160000 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162540000 149130000 118600000 172100000 189070000 184610000 59824000 245870000 154290000 258170000 2433 2292 2271 22316;22317;22318;22319;22320;22321;22322;22323;22324;22325;22326 28550;28551;28552;28553;28554;28555;28556;28557;28558;28559;28560 28551 8 ALGWAAVYLSTCK Unmodified 1438.7279 0.72787125 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;A2AB90;A0A0G2JH37;A0A0A0MT98 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 1 118.72 118.72 2 0.0088665 121271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.641 50.333 30308000 0 0 0 0 0 0 0 30308000 0 0 0 0 0 2434 185 2272 22327 28561 28561 1 ALGYFAVVTGK Unmodified 1124.623 0.62299547 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.721 93.721 2 0.012997 95024 QUIQUE_C1563_190116_001 59.908 21.821 1212600000 157830000 140090000 111220000 0 0 89943000 0 123020000 151630000 0 161170000 129920000 147770000 2435 831;1569 2273 22328;22329;22330;22331;22332;22333;22334;22335;22336 28562;28563;28564;28565;28566;28567;28568;28569;28570 28565 4 ALHDEEATIIHHYAFSENPTVFK Unmodified 2668.2922 0.29216586 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 97.044 97.044 3;4 2.2723E-06 101091 QUIQUE_C1218_190116_001 69.27 58.586 373820000 130890000 0 65875000 0 0 14932000 0 0 0 0 93676000 68451000 0 2436 3419 2274 22337;22338;22339;22340;22341;22342 28571;28572;28573;28574;28575;28576 28572 6 ALHFGEFLNTTCK Unmodified 1536.7395 0.73949856 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.178 83.178 3 0.020622 84588 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.878 27.252 96928000 0 18283000 26862000 15400000 0 0 0 18048000 18335000 0 0 0 0 2437 934 2275 22343;22344;22345;22346;22347 28577;28578;28579;28580;28581 28581 3 ALHFVFK Unmodified 860.49086 0.49085908 4220 Q9HC38;I3L3Q4;I3NI27;I3NI24;I3L2C2;I3L1F4;I3L277 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.502 49.502 2 0.037484 48954 QUIQUE_C1218_190116_001 85.306 55.465 1034000000 143650000 135710000 102200000 81073000 0 71514000 0 102070000 108870000 0 96413000 94177000 98301000 2438 4220 2276 22348;22349;22350;22351;22352;22353;22354;22355;22356;22357 28582;28583;28584;28585;28586;28587;28588;28589;28590;28591;28592 28582 11 ALHHGIDLEK Unmodified 1131.6037 0.60365701 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 15.731 15.731 2;3 5.0201E-05 8632 QUIQUE_C1218_190116_001 115.78 88.892 4151700000 361140000 427870000 449760000 420870000 370940000 399510000 372540000 368310000 374630000 0 66015000 0 540140000 2439 2083 2277 22358;22359;22360;22361;22362;22363;22364;22365;22366;22367;22368;22369;22370 28593;28594;28595;28596;28597;28598;28599;28600;28601;28602;28603;28604;28605;28606;28607 28593 13 ALHLGNNVLQSLPSR Unmodified 1617.8951 0.895088 3539 Q8IWT6 LRRC8A Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A yes yes 0 0 0 1 81.12 81.12 3 0.042708 81744 QUIQUE_C1403_190116_001 41.378 34.649 45306000 0 0 0 45306000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2440 3539 2278 22371 28608 28608 0 ALHLLEEYR Unmodified 1142.6084 0.60840804 2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B4E2H8;C9JUA9;C9JN61;C9JCP6;A8MUT6;C9J110;F2Z2L0 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.105 58.105 3 0.00014865 57360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.38 89.361 293530000 28369000 27435000 19663000 25269000 26046000 19693000 0 28298000 30458000 8322500 22843000 26517000 30620000 2441 2954 2279 22372;22373;22374;22375;22376;22377;22378;22379;22380;22381;22382;22383 28609;28610;28611;28612;28613;28614;28615;28616;28617;28618;28619;28620;28621 28615 13 ALHLVEDLR Unmodified 1064.5978 0.59784335 3504 Q86W92;A0A0A0MTP2;F5H6Q7;F5H0E0;F5H495 PPFIBP1 Liprin-beta-1 yes no 0 0 0 1 1 41.287 41.287 2;3 0.0076395 49234 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.418 19.164 40703000 0 0 0 0 0 30723000 0 0 0 9980500 0 0 0 2442 3504 2280 22384;22385 28622;28623 28623 1 ALHNLAQQAPEFSATQVFPR Unmodified 2224.1389 0.1389001 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L439;I3L163;I3L0V3;I3L500;I3L143;I3L4D2;I3L3H4;I3L131 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 96.848 96.848 3 2.5675E-09 99172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.57 94.783 994220000 78840000 0 0 90124000 77569000 0 69567000 77861000 72444000 0 70337000 96145000 361340000 2443 1283 2281 22386;22387;22388;22389;22390;22391;22392;22393;22394;22395 28624;28625;28626;28627;28628;28629;28630;28631;28632;28633;28634;28635;28636;28637 28631 13 ALHPEEDPEGR Unmodified 1248.5735 0.57347909 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 16.651 16.651 2;3 0.00013868 8938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.831 72.307 1611200000 98471000 119650000 131110000 66906000 139380000 106400000 206530000 143580000 168770000 31506000 66414000 135430000 197070000 2444 3862 2282 22396;22397;22398;22399;22400;22401;22402;22403;22404;22405;22406;22407;22408;22409;22410;22411;22412;22413;22414 28638;28639;28640;28641;28642;28643;28644;28645;28646;28647;28648;28649;28650;28651;28652;28653;28654;28655;28656;28657;28658 28652 18 ALHPLWESVDLVPGGDR Unmodified 1859.953 0.95299681 4553 Q9Y2D0;C9IZP3;C9JA11 CA5B Carbonic anhydrase 5B, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 116.37 116.37 3 8.078E-05 120749 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.975 44.06 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2445 4553 2283 22415;22416 28659;28660 28660 2 ALHRLILPSEK Unmodified 1275.7663 0.76630566 523 A3KMH1 VWA8 von Willebrand factor A domain-containing protein 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 14.374 14.374 3 0.056178 6610 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.478 18.981 686290000 0 0 0 0 0 0 0 0 179030000 0 202620000 175490000 129150000 2446 523 2284 22417;22418;22419;22420 28661;28662;28663;28664 28662 4 ALHSDRPPSASQPR Unmodified 1517.7699 0.76988749 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 10.41 10.41 4 1.3761E-07 2705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.95 104.73 59310000 19791000 6615000 0 0 0 0 0 22902000 0 10002000 0 0 0 2447 1416 2285 22421;22422;22423;22424 28665;28666;28667;28668 28667 4 ALHSLLLR Unmodified 921.57599 0.5759857 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 39.882 39.882 2 0.015597 36851 QUIQUE_C1218_190116_001 112.59 61.738 651280000 144570000 129050000 0 0 0 0 0 123780000 129330000 0 124560000 0 0 2448 3110 2286 22425;22426;22427;22428;22429 28669;28670;28671;28672;28673;28674 28669 2 ALHSPQYIFGDFSPDEFNQFFVTPR Acetyl (Protein N-term) 3000.4083 0.40825825 3082 Q14694;H3BNA1;H3BNL0;Q68D90;H3BVF1 USP10;DKFZp686E14181 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes no 1 0 0 1 1 170.2 170.2 3 6.5098E-20 172018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.06 101.29 36643000 0 0 0 0 0 0 0 17332000 0 0 0 0 19312000 2449 3082 2287 22430;22431 28675;28676 28675 2 ALHSVLQAVPLNELR Unmodified 1658.9468 0.94678922 3177 Q16401;F2Z3J2 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 3 2 2 94.928 94.928 2;3 2.2565E-54 97587 QUIQUE_C1277_190116_001 194.39 145.04 1153900000 100600000 84987000 97075000 89426000 112760000 66441000 62282000 75735000 55389000 27849000 163910000 114780000 102660000 2450 3177 2288 22432;22433;22434;22435;22436;22437;22438;22439;22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447;22448;22449;22450;22451;22452;22453;22454;22455 28677;28678;28679;28680;28681;28682;28683;28684;28685;28686;28687;28688;28689;28690;28691;28692;28693;28694;28695;28696;28697;28698;28699;28700;28701;28702;28703;28704 28680 27 ALIAAQYSGAQVR Unmodified 1346.7306 0.73064844 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.896 57.896 2 7.2767E-06 56767 QUIQUE_C1576_190116_001 107.79 48.438 11375000000 854300000 967390000 1019100000 1030200000 991380000 848410000 0 1024000000 901960000 356250000 1432500000 1127800000 821890000 2451 2255 2289 22456;22457;22458;22459;22460;22461;22462;22463;22464;22465;22466;22467;22468 28705;28706;28707;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28715;28716;28717;28718;28719;28720;28721;28722;28723 28713 19 ALIADSGLK Unmodified 886.51238 0.51238239 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A0U1RQL1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.11 42.11 2 0.00073327 39006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.31 45.506 2794000000 0 0 408680000 323380000 0 435010000 0 252940000 385730000 0 536930000 0 451300000 2452 445 2290 22469;22470;22471;22472;22473;22474;22475 28724;28725;28726;28727;28728;28729;28730;28731 28729 7 ALIAGGGAPEIELALR Unmodified 1549.8828 0.88279198 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.87 120.87 2;3 1.6814E-07 123697 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.17 77.743 3809000000 0 535690000 0 586860000 0 578740000 557510000 602820000 0 411930000 0 0 535450000 2453 2573 2291 22476;22477;22478;22479;22480;22481;22482;22483 28732;28733;28734;28735;28736;28737;28738;28739 28737 3 ALIAQLPSPAIDHEQLR Unmodified 1871.0265 0.026496107 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.708 91.708 3 3.4831E-10 94238 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.39 90.107 36932000 0 0 0 0 0 0 0 36932000 0 0 0 0 0 2454 1187 2292 22484;22485;22486;22487 28740;28741;28742;28743 28742 4 ALIDPSSGLPNR Unmodified 1238.6619 0.66190017 3288 Q5QPM7;Q92530;F5H4Z3;H0Y555 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 0 0 0 1 1 70.636 70.636 2 0.0024665 66803 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.087 70.186 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2455 3288 2293 22488;22489 28744;28745 28745 2 ALIEILATR Unmodified 998.61243 0.61243078 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 96.776 96.776 1;2 4.3078E-05 101117 QUIQUE_C1218_190116_001 147.19 25.566 12117000000 907590000 747430000 915510000 763920000 976500000 867990000 955030000 756560000 1194000000 522470000 1512300000 1134200000 863690000 2456 845;1936 2294 22490;22491;22492;22493;22494;22495;22496;22497;22498;22499;22500;22501;22502;22503 28746;28747;28748;28749;28750;28751;28752;28753;28754;28755;28756;28757;28758;28759;28760;28761;28762;28763;28764;28765;28766;28767;28768;28769;28770 28747 24 ALIESYQNLTR Unmodified 1306.6881 0.68811492 157 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0 ABI1 Abl interactor 1 yes no 0 0 0 1 76.944 76.944 2 0.031344 73062 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.841 45.054 71371000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71371000 0 0 0 2457 157 2295 22504 28771 28771 1 ALIEVLQPLIAEHQAR Unmodified 1800.0258 0.025767826 2213 P23381 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 3 117.96 117.96 2;3 4.2983E-10 121869 QUIQUE_C1368_190116_001 158.4 147.19 9404500000 523060000 610280000 1711500000 926370000 797080000 579550000 567260000 500020000 499170000 265060000 1134100000 559740000 731250000 2458 2213 2296 22505;22506;22507;22508;22509;22510;22511;22512;22513;22514;22515;22516;22517;22518;22519;22520;22521;22522;22523;22524;22525;22526;22527;22528;22529;22530 28772;28773;28774;28775;28776;28777;28778;28779;28780;28781;28782;28783;28784;28785;28786;28787;28788;28789;28790;28791;28792;28793;28794;28795;28796;28797;28798;28799;28800;28801;28802;28803;28804;28805;28806;28807;28808;28809;28810;28811;28812;28813;28814;28815 28782 43 ALIFVSHGAGEHSGR Unmodified 1536.7797 0.77972389 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;C9JAM4 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 24.491 24.491 2;3 0.00015216 18306 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.222 59.478 2935300000 310070000 228310000 478380000 251500000 212130000 205340000 165130000 202430000 266940000 88353000 305930000 42581000 178240000 2459 217 2297 22531;22532;22533;22534;22535;22536;22537;22538;22539;22540;22541;22542;22543;22544;22545;22546 28816;28817;28818;28819;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28826;28827;28828;28829;28830;28831;28832;28833;28834;28835;28836;28837 28830 21 ALIFVSHGAGEHSGRYEELAR Unmodified 2298.1505 0.15052742 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;C9JAM4 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 1 1 1 51.161 51.161 4 0.00085843 49415 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.425 36.998 76744000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38579000 38164000 0 2460 217 2298 22547;22548 28838;28839 28839 2 ALIGATNPADAPPGTIR Unmodified 1633.8788 0.87876924 2979 Q13232;H3BPR2 NME3 Nucleoside diphosphate kinase 3;Nucleoside diphosphate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.415 72.415 2 3.9645E-13 72286 QUIQUE_DMIX7_190116_001 129.34 105.74 256990000 0 51076000 0 46938000 0 46941000 0 48846000 0 0 0 63184000 0 2461 2979 2299 22549;22550;22551;22552;22553 28840;28841;28842;28843;28844;28845 28845 6 ALILVGGYGTR Unmodified 1118.6448 0.64479354 4628 Q9Y5P6 GMPPB Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta yes yes 0 0 0 1 80.94 80.94 2 0.015195 81029 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22650;22651;22652;22653;22654;22655;22656;22657;22658;22659;22660;22661;22662;22663;22664;22665;22666;22667;22668 28970;28971;28972;28973;28974;28975;28976;28977;28978;28979;28980;28981;28982;28983;28984;28985;28986;28987;28988;28989;28990;28991;28992 28986 22 ALKEEIGNVQLEK Unmodified 1469.809 0.80895834 3490 Q86UP2;G3V4Y7;H0YJZ8;G3V5G2 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.224 51.224 2 1.1945E-06 49460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.76 98.338 198800000 19722000 41574000 34939000 0 0 0 30419000 0 0 0 47408000 0 24735000 2473 3490 2310 22669;22670;22671;22672;22673;22674;22675 28993;28994;28995;28996;28997;28998;28999 28998 6 ALKHELAFK Unmodified 1055.6128 0.61276513 3433 Q7L099;H0Y8I0 RUFY3 Protein RUFY3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 17.74 17.74 3 0.026005 10039 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.731 59.626 337720000 0 0 0 0 0 0 0 153460000 69857000 0 41143000 73261000 0 2474 3433 2311 22676;22677;22678;22679 29000;29001;29002;29003 29003 1 ALLADAQLMLDHLK Unmodified 1550.849 0.84904901 271 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29069;29070;29071;29072;29073;29074;29075;29076;29077;29078;29079;29080;29081;29082 29073 2 ALLALPIR Unmodified 865.57492 0.57492306 555 A6ZKI3 FAM127A Protein FAM127A yes yes 0 0 0 1 2 1 93.029 93.029 2 0.021335 95911 QUIQUE_C1576_190116_001 75.311 50.312 8403600 0 0 0 0 0 0 8403600 0 0 0 0 0 0 2482 555 2319 22741;22742;22743;22744 29083;29084;29085;29086 29086 4 ALLALPIRPATR Unmodified 1290.8136 0.81359021 555 A6ZKI3 FAM127A Protein FAM127A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 73.626 73.626 3 0.001543 74504 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.695 69.463 31304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31304000 2483 555 2320 22745;22746;22747;22748;22749 29087;29088;29089;29090;29091;29092 29091 6 ALLANALTSALR Unmodified 1212.719 0.71902112 2683 P57088;D6RAA6 TMEM33 Transmembrane protein 33 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.07 110.07 2 1.906E-05 113062 QUIQUE_DMIX8_190116_001 129.83 78.947 1186500000 69260000 60858000 63215000 58062000 67906000 52699000 105610000 105660000 130910000 33234000 149160000 124760000 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1802 2323 22773;22774;22775;22776;22777;22778;22779;22780;22781;22782;22783;22784;22785;22786;22787;22788;22789;22790 29118;29119;29120;29121;29122;29123;29124;29125;29126;29127;29128;29129;29130;29131;29132;29133;29134;29135;29136 29126 19 ALLCYNR Acetyl (Protein N-term) 950.46439 0.46438634 4430 Q9UHD1;E9PPQ5;E9PIZ4;E9PSD5;E9PL00;E9PIF7 CHORDC1 Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.105 93.105 2 0.014715 95453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.26 74.333 209840000 27106000 35169000 21942000 0 0 25215000 0 0 0 0 28538000 35992000 35882000 2487 4430 2324 22791;22792;22793;22794;22795;22796;22797 29137;29138;29139;29140;29141;29142;29143;29144;29145 29145 9 ALLDASETTSTR Unmodified 1263.6307 0.63065962 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 42.977 42.977 2 0.00052982 40033 QUIQUE_C1218_190116_001 103.7 70.86 224590000 57543000 0 0 37510000 0 0 55260000 33228000 41047000 0 0 0 0 2488 3059 2325 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16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.43 155.43 3 1.0019E-37 158135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.62 133.04 1042400000 0 53316000 92033000 112010000 53083000 43410000 82944000 104150000 126940000 22336000 100450000 97588000 154120000 2493 16;1475 2330 22851;22852;22853;22854;22855;22856;22857;22858;22859;22860;22861;22862 29208;29209;29210;29211;29212;29213;29214;29215;29216;29217;29218;29219;29220;29221;29222;29223 29216 16 ALLEGESNPEIVIWAEHVENMPSEFR Oxidation (M) 3011.4335 0.43348672 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 1 0 1 143.3 143.3 3 0.00032408 146179 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.099 36.735 45956000 0 0 0 0 0 0 0 45956000 0 0 0 0 0 2494 16;1475 2330 22863 29224 29224 10 1 ALLELQEYFGSLAA Unmodified 1523.7872 0.78716026 4070 Q9BY32 ITPA Inosine triphosphate pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.73 169.73 2 9.7973E-07 174221 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.26 107.84 405030000 0 32051000 58394000 0 0 0 0 71934000 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1 1 1 1 1 131.69 131.69 2 0.00043526 137735 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.04 128.27 302450000 10418000 17158000 27038000 0 0 16936000 22400000 34988000 33062000 0 62656000 44603000 33189000 2497 1187 2333 22893;22894;22895;22896;22897;22898;22899;22900;22901;22902;22903;22904 29264;29265;29266;29267;29268;29269;29270;29271;29272;29273;29274;29275;29276;29277;29278 29275 15 ALLENLLQNIQSK Unmodified 1482.8406 0.84059282 829 E9PCZ3;D6RJC3;E7EQN9;O15327 INPP4B Type II inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.19 138.19 2 0.00031336 143990 QUIQUE_C1218_190116_001 110.84 78.107 112480000 19548000 23375000 20756000 25664000 23136000 0 0 0 0 0 0 0 0 2498 829 2334 22905;22906;22907;22908;22909;22910 29279;29280;29281;29282;29283;29284 29279 6 ALLEVICTLHK Unmodified 1295.7271 0.72714296 1026 F6VCX5;Q16816;C9JME8;C9J2Q6 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.383 86.383 3 0.01755 87626 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2341 22964;22965;22966;22967;22968;22969;22970;22971;22972;22973;22974;22975;22976 29351;29352;29353;29354;29355;29356;29357;29358;29359;29360;29361;29362;29363;29364;29365;29366;29367;29368;29369;29370;29371;29372;29373;29374;29375;29376;29377;29378 29369 28 ALLGPAPEDEDERPEAEDGPGAGDHALGLPAEVVEPEGPVAQR Unmodified 4356.0782 0.078216504 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GUH6;A0A1B0GVY9;A0A1B0GU96 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.47 115.47 4 5.313E-33 120729 QUIQUE_C1438_190116_001 87.753 80.615 409460000 0 0 62953000 74674000 83062000 0 103150000 0 0 42774000 0 42847000 0 2506 348 2342 22977;22978;22979;22980;22981;22982 29379;29380;29381;29382;29383;29384;29385;29386;29387 29383 8 ALLGYADNQCK Unmodified 1251.5918 0.59177169 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.109 47.109 2 4.1219E-05 44321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.1 127.87 3008700000 278440000 0 300720000 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3512.6504 0.6503948 2804 P78333;A0A087WX91 GPC5 Glypican-5;Secreted glypican-5 yes no 0 0 2 1 129.19 129.19 5 0.066024 133915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 16.801 11.257 110760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110760000 2513 2804 2349 23014 29421;29422 29421 2 ALLLDALR Unmodified 883.5491 0.54910224 1354 K7ESN3;Q8N2G8 GHDC GH3 domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.08 98.08 2 0.018116 101133 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 7.4235 48394000 0 0 15640000 0 0 13473000 0 0 0 0 19281000 0 0 2514 1354 2350 23015;23016;23017;23018;23019;23020;23021;23022;23023 29423;29424;29425;29426;29427;29428;29429;29430;29431 29425 9 ALLLGLACNHNLK Unmodified 1435.797 0.79695386 3341 Q5VZK9;A0A0U1RQQ1 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.345 71.345 3 0.0083571 71527 QUIQUE_C1368_190116_001 47.724 37.925 53876000 0 29939000 23937000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2515 3341 2351 23024;23025;23026;23027 29432;29433;29434;29435 29434 4 ALLLLCGEDD Unmodified 1117.5325 0.53252548 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 2 127.01 127.01 1;2 0.0014525 131745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.473 85.752 4333300000 0 0 194690000 333850000 618640000 276660000 293540000 602600000 202130000 207570000 589710000 347830000 666090000 2516 1954 2352 23028;23029;23030;23031;23032;23033;23034;23035;23036;23037;23038;23039;23040;23041;23042;23043 29436;29437;29438;29439;29440;29441;29442;29443;29444;29445;29446;29447;29448;29449;29450;29451;29452;29453;29454;29455;29456;29457 29446 16 ALLLPDYYLVTVMLSGIK Unmodified 2008.1319 0.13187238 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 174.11 174.11 2;3 0.00019205 181254 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.82 60.001 154100000 0 0 0 0 0 0 0 0 32029000 0 96264000 25804000 0 2517 3432 2353 23044;23045;23046;23047 29458;29459;29460;29461 29459 3 ALLLSTYIK Unmodified 1020.6219 0.62193284 1749;1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1;O95782 AP2A2;AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-2;AP-2 complex subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.752 96.752 1;2 0.0010141 98763 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.66 79.152 5059900000 379810000 404160000 372800000 326330000 403020000 252730000 437730000 359350000 400590000 145410000 618580000 505390000 454010000 2518 1701;1749 2354 23048;23049;23050;23051;23052;23053;23054;23055;23056;23057;23058;23059;23060;23061 29462;29463;29464;29465;29466;29467;29468;29469;29470;29471;29472;29473;29474;29475;29476;29477 29477 15 ALLLVGDVAQAADVAIEHR Unmodified 1960.0742 0.074174581 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.96 136.96 3 5.7668E-08 143383 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.16 96.056 502240000 46657000 57471000 36781000 49743000 58026000 33751000 51530000 0 27422000 23523000 41457000 37992000 37889000 2519 4140 2355 23062;23063;23064;23065;23066;23067;23068;23069;23070;23071;23072;23073 29478;29479;29480;29481;29482;29483;29484;29485;29486;29487;29488;29489 29487 12 ALLNNSHYYHMAHGK Oxidation (M) 1770.826 0.82602216 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 1 0 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 15.571 15.571 3;4 1.9854E-05 8428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.207 78.469 2566500000 197940000 109010000 258680000 0 164030000 77848000 0 297620000 418200000 177010000 454070000 0 412140000 2520 1971 2356 23074;23075;23076;23077;23078;23079;23080;23081;23082;23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090 29490;29491;29492;29493;29494;29495;29496;29497;29498;29499;29500;29501;29502;29503;29504;29505;29506 29498 1240 16 ALLNNSHYYHMAHGK Unmodified 1754.8311 0.83110754 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 3 4 2 3 21.986 21.986 2;3;4;5 5.6655E-79 15804 QUIQUE_C1218_190116_001 206.69 181.25 4093900000 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29538;29539;29540;29541;29542;29543;29544;29545;29546;29547;29548;29549;29550;29551;29552;29553;29554;29555;29556;29557 29554 20 ALLPHVLCK Unmodified 1049.6056 0.60557126 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.381 49.381 3 0.0046162 48726 QUIQUE_C1218_190116_001 57.96 42.298 781160000 64006000 67375000 82045000 59631000 70013000 55719000 77693000 76491000 0 0 81373000 73997000 72820000 2523 3208 2358 23132;23133;23134;23135;23136;23137;23138;23139;23140;23141;23142;23143 29558;29559;29560;29561;29562;29563;29564;29565;29566;29567;29568;29569;29570;29571;29572;29573;29574;29575;29576;29577;29578;29579 29559 22 ALLPILQWHK Unmodified 1217.7285 0.72846359 4365 Q9P0J1;E5RIV4 PDP1 [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.99 106.99 3 0.0042903 109743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.04 36.027 294890000 20338000 14189000 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29596;29597;29598;29599;29600;29601;29602;29603;29604;29605;29606;29607;29608 29598 3 ALLQEQFR Unmodified 1003.5451 0.5450795 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 55.938 55.938 2 0.033344 55610 QUIQUE_C1438_190116_001 64.757 28.056 43190000 0 0 0 0 19411000 0 0 0 0 0 23779000 0 0 2527 4299 2362 23171;23172 29609;29610 29609 2 ALLQLWQR Unmodified 1026.5974 0.59744942 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.139 99.139 2 0.0032345 102684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.72 86.702 76734000 16728000 31225000 0 0 0 0 0 0 0 0 28782000 0 0 2528 228 2363 23173;23174;23175;23176;23177;23178 29611;29612;29613;29614;29615;29616;29617 29617 7 ALLQMVQQFAVDFEK Oxidation (M) 1781.9022 0.9022068 2893;269;4528;840 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM1;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-3 no no 0 1 0 2 3 4 2 3 3 3 1 2 2 2 1 152.66 152.66 2;3 9.2117E-36 157559 QUIQUE_DMIX7_190116_001 174.84 140.88 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23207;23208;23209;23210;23211;23212;23213;23214;23215;23216;23217;23218;23219;23220;23221;23222;23223;23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23234;23235;23236 29652;29653;29654;29655;29656;29657;29658;29659;29660;29661;29662;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;29672;29673;29674;29675;29676;29677;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;29686;29687;29688 29673 35 ALLQMVQQFAVDFEKR Unmodified 1922.0084 0.0084032019 2893;269;4528;840 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM1;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.23 158.23 3 1.1437E-44 165075 QUIQUE_DMIX5_190116_001 176.23 164.76 847750000 0 0 0 0 0 0 28694000 154920000 133410000 0 201410000 226130000 103190000 2531 269;2893;840;4528 2365 23237;23238;23239;23240;23241;23242 29689;29690;29691;29692;29693;29694;29695;29696;29697;29698;29699 29695 11 ALLQMVQQFAVDFEKR Oxidation (M) 1938.0033 0.003317824 2893;269;4528;840 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0 0 1 1 1 21.82 21.82 3 0.012314 15232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.61 20.491 29409000 0 0 0 0 0 0 0 29409000 0 0 0 0 0 2535 4428 2368 23253;23254 29710;29711 29710 2 ALLQSVR Unmodified 785.47594 0.4759373 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 30.087 30.087 2 0.062217 24530 QUIQUE_C1576_190116_001 68.398 10.946 79087000 0 0 0 0 0 0 79087000 0 0 0 0 0 0 2536 3452 2369 23255 29712 29712 1 ALLSAPWYLNR Unmodified 1302.7085 0.70845643 1185 H3BS10;H3BP20;P06865 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.22 117.22 2 0.00019138 120729 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.98 84.632 470490000 29096000 32307000 43777000 33468000 33291000 24643000 34288000 34752000 31726000 15582000 58708000 38524000 60327000 2537 1185 2370 23256;23257;23258;23259;23260;23261;23262;23263;23264;23265;23266;23267;23268 29713;29714;29715;29716;29717;29718;29719;29720;29721;29722;29723;29724;29725;29726;29727;29728 29727 15 ALLSNIEK Unmodified 886.51238 0.51238239 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 42.271 42.271 2 0.032564 37883 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.252 18.258 2012500000 0 320380000 0 0 313570000 0 424760000 0 0 116850000 0 385680000 451300000 2538 4268 2371 23269;23270;23271;23272;23273;23274 29729;29730;29731;29732;29733;29734 29734 6 ALLSQAEGSLFQPMGK Oxidation (M) 1691.8553 0.8552566 4693 yes no 0 1 0 1 135.13 135.13 2 0.043448 140045 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.283 25.744 129140000 0 0 0 0 0 0 0 0 129140000 0 0 0 0 + 2539 4693 2372 23275 29735 29735 1 ALLSTMHTVLWAGETK Unmodified 1756.9182 0.91819121 1607 O75061 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 101.55 101.55 2;3 1.8178E-07 104401 QUIQUE_C1277_190116_001 114.59 77.494 841880000 123580000 143410000 67879000 98214000 61599000 78383000 69748000 0 0 12754000 93186000 50305000 42826000 2540 1607 2373 23276;23277;23278;23279;23280;23281;23282;23283;23284;23285;23286;23287;23288;23289;23290;23291;23292;23293;23294;23295 29736;29737;29738;29739;29740;29741;29742;29743;29744;29745;29746;29747;29748;29749;29750;29751;29752;29753;29754;29755;29756;29757;29758 29739 22 ALLSYDGLNQR Unmodified 1248.6463 0.64625011 4499 Q9UM22 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.649 76.649 2 8.0024E-30 74096 QUIQUE_DMIX4_190116_001 190.51 125.26 1509000000 142130000 131430000 135530000 91325000 124970000 91271000 131860000 84454000 111440000 72233000 149210000 111730000 131380000 2541 4499 2374 23296;23297;23298;23299;23300;23301;23302;23303;23304;23305;23306;23307;23308 29759;29760;29761;29762;29763;29764;29765;29766;29767;29768;29769;29770;29771;29772;29773;29774;29775 29769 17 ALLSYPLPFFAAVEVLEK Unmodified 2006.1129 0.1128515 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 172.11 172.11 2;3 0.00011439 179294 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29792;29793;29794;29795;29796;29797;29798;29799;29800;29801;29802;29803;29804;29805;29806;29807;29808;29809;29810;29811;29812;29813;29814;29815;29816;29817;29818;29819;29820;29821;29822;29823;29824;29825;29826;29827;29828;29829;29830;29831;29832;29833;29834;29835;29836;29837;29838;29839;29840 29818 48 ALLTLADGR Unmodified 928.53418 0.53418046 2045 P12429;D6RA82 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.473 63.473 2 0.0050026 62061 QUIQUE_C1563_190116_001 87.696 31.15 332820000 0 70436000 54678000 0 51298000 46272000 47765000 0 0 22588000 0 0 39786000 2544 2045 2377 23355;23356;23357;23358;23359;23360;23361 29841;29842;29843;29844;29845;29846;29847;29848 29845 6 ALLTPVAIAAGR Unmodified 1151.7026 0.70264277 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.741 87.741 2 0.00028992 88944 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.05 91.128 4614700000 487260000 374600000 305240000 418170000 421910000 295150000 387460000 310620000 322930000 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26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.23 122.23 2 0.00051689 126056 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.692 66.293 177580000 0 31567000 20615000 0 0 0 0 52478000 34461000 0 19162000 19296000 0 2547 1388 2380 23395;23396;23397;23398;23399;23400 29898;29899;29900;29901;29902;29903 29903 6 ALLVTASQCQQPAENK Unmodified 1756.8778 0.87778296 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 2 2 3 1 1 2 2 1 1 2 3 1 1 44.566 44.566 2;3 1.2446E-146 41123 QUIQUE_C1277_190116_001 244.95 231.15 4317100000 670100000 644570000 509460000 71003000 491880000 383360000 309820000 212240000 133120000 199620000 281850000 231800000 178330000 2548 2857;3307 2381 23401;23402;23403;23404;23405;23406;23407;23408;23409;23410;23411;23412;23413;23414;23415;23416;23417;23418;23419;23420;23421;23422 29904;29905;29906;29907;29908;29909;29910;29911;29912;29913;29914;29915;29916;29917;29918;29919;29920;29921;29922;29923;29924;29925;29926;29927;29928 29906 22 ALLVTGIPEGLEQADVEAVLQPTLLPLGTFR Unmodified 3259.8068 0.80678008 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 172.47 172.47 3 0.01737 177465 QUIQUE_C1576_190116_001 29.028 23.368 28830000 0 0 0 0 0 0 28830000 0 0 0 0 0 0 2549 4491 2382 23423 29929 29929 0 ALLYLCGGDD Unmodified 1095.4907 0.49066067 1920 P07355;A6NMY6 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.66 112.66 2 0.0043259 115814 QUIQUE_C1403_190116_001 81.297 77.362 414500000 27425000 45200000 0 82460000 0 0 36803000 33096000 44587000 31248000 33753000 33418000 46510000 2550 1920 2383 23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23431;23432;23433;23434 29930;29931;29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941 29932 11 ALMDEVVK Oxidation (M) 919.46847 0.46846866 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 2 27.007 27.007 2 0.022232 20839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.451 51.197 4843400000 691650000 768310000 0 0 0 359940000 0 486980000 808730000 283690000 641500000 802580000 0 2551 1790 2384 23435;23436;23437;23438;23439;23440;23441;23442;23443;23444;23445;23446 29942;29943;29944;29945;29946;29947;29948;29949;29950;29951;29952;29953;29954;29955 29949 14 ALMDEVVK Unmodified 903.47355 0.47355404 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 56.806 56.806 1;2 0.018737 55750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.469 42.375 16016000000 2220100000 1955400000 2236200000 1862100000 0 0 1479800000 1540800000 1298000000 0 1984400000 1439200000 0 2552 1790 2384 23447;23448;23449;23450;23451;23452;23453;23454;23455;23456 29956;29957;29958;29959;29960;29961;29962;29963;29964;29965;29966;29967;29968;29969;29970 29963 14 ALMDSLGPEWR Unmodified 1273.6125 0.61250714 3158 Q15785 TOMM34 Mitochondrial import receptor subunit TOM34 yes yes 0 0 0 1 1 1 108.59 108.59 2 0.0049661 111453 QUIQUE_C1403_190116_001 70.1 60.886 83659000 0 27509000 0 26286000 0 29864000 0 0 0 0 0 0 0 2553 3158 2385 23457;23458;23459 29971;29972;29973 29972 3 ALMEEFFR Unmodified 1041.4954 0.49535211 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.87 109.87 2 0.0036323 113980 QUIQUE_C1576_190116_001 116.54 85.824 344020000 34439000 33514000 27600000 30436000 23060000 21431000 37389000 31731000 23642000 10569000 0 35978000 34234000 2554 614 2386 23460;23461;23462;23463;23464;23465;23466;23467;23468;23469;23470;23471 29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986 29981 13 ALMEGYGLVGLPLVR Unmodified 1586.8854 0.88543452 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 142.96 142.96 2 0.012592 147483 QUIQUE_C1277_190116_001 73.887 56.861 12671000 0 12671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2555 4519 2387 23472;23473 29987;29988 29987 2 ALMGLYHGQVLCK Oxidation (M) 1504.753 0.75304014 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 53.29 53.29 3 0.0065262 50936 QUIQUE_C1403_190116_001 50.207 27.976 239870000 0 31646000 59197000 44824000 0 29184000 0 0 46258000 28759000 0 0 0 2556 1153 2388 23474;23475;23476;23477;23478;23479;23480;23481;23482 29989;29990;29991;29992;29993;29994;29995;29996;29997 29991 668 8 ALMGLYHGQVLCK Unmodified 1488.7581 0.75812552 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 3 1 2 2 2 69.399 69.399 2;3 5.6787E-13 69565 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.84 128.1 1720300000 0 235560000 173500000 99293000 74906000 78343000 202530000 67110000 173690000 63424000 181220000 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23503;23504;23505;23506;23507;23508;23509;23510;23511;23512;23513;23514;23515;23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;23524;23525;23526;23527;23528;23529;23530;23531;23532;23533;23534;23535;23536;23537;23538;23539;23540;23541;23542;23543;23544;23545;23546;23547;23548;23549;23550 30029;30030;30031;30032;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;30040;30041;30042;30043;30044;30045;30046;30047;30048;30049;30050;30051;30052;30053;30054;30055;30056;30057;30058;30059;30060;30061;30062;30063;30064;30065;30066;30067;30068;30069;30070;30071;30072;30073;30074;30075;30076;30077 30039 1274;1275 46 ALMLQGVDLLADAVAVTMGPK Unmodified 2112.1323 0.13228309 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4;C9JL25;C9JCQ4;C9JL19;C9J0S9 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 5 2 4 2 2 2 2 2 2 3 2 172.71 172.71 2;3 3.8741E-128 176003 QUIQUE_C1277_190116_001 265.99 255.64 20169000000 480250000 2533500000 2599000000 315490000 1425300000 2089200000 2710600000 270950000 672390000 80601000 956420000 2617600000 3417500000 2559 2004 2389 23551;23552;23553;23554;23555;23556;23557;23558;23559;23560;23561;23562;23563;23564;23565;23566;23567;23568;23569;23570;23571;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581;23582;23583;23584 30078;30079;30080;30081;30082;30083;30084;30085;30086;30087;30088;30089;30090;30091;30092;30093;30094;30095;30096;30097;30098;30099;30100;30101;30102;30103;30104;30105;30106;30107;30108;30109;30110;30111;30112;30113;30114;30115;30116;30117;30118;30119;30120;30121;30122;30123;30124 30085 45 ALMLQGVDLLADAVAVTMGPK 2 Oxidation (M) 2144.1221 0.12211233 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4;C9JL25;C9JCQ4;C9JL19;C9J0S9 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 2 0 1 2 2 1 2 160.81 160.81 2;3 9.5457E-07 163171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.379 87.779 1272600000 286040000 301800000 0 255580000 0 0 0 116050000 0 313150000 0 0 0 2560 2004 2389 23585;23586;23587;23588;23589;23590;23591;23592 30125;30126;30127;30128;30129;30130;30131;30132 30130 1274;1275 0 ALMQSLNMLVQTEGK Unmodified 1661.8481 0.84806274 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 123.02 123.02 2 5.7207E-05 127577 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 79.242 91475000 0 0 0 0 0 0 0 0 91475000 0 0 0 0 2561 1741 2390 23593;23594 30133;30134 30133 2 ALMQVVDFLSR Unmodified 1277.6802 0.68019277 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.61 137.61 2 1.3401E-12 142636 QUIQUE_C1368_190116_001 164.46 135.31 1085500000 143610000 118270000 117050000 103780000 0 103830000 0 93415000 105760000 31443000 139770000 128590000 0 2562 4106 2391 23595;23596;23597;23598;23599;23600;23601;23602;23603;23604;23605;23606;23607 30135;30136;30137;30138;30139;30140;30141;30142;30143;30144;30145;30146;30147;30148;30149;30150;30151;30152;30153 30139 18 ALMQVVDFLSR Oxidation (M) 1293.6751 0.67510739 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 1 0 1 118.23 118.23 2 0.017086 115075 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30157;30158;30159;30160;30161;30162;30163;30164;30165;30166;30167;30168;30169;30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176;30177;30178;30179;30180;30181;30182;30183;30184;30185;30186;30187 30180 28 ALNALNNLSVNVENQIK Unmodified 1853.0007 0.0006752871 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4;H7C2M7;C9J5N7;A0A0J9YXV5;H7BXQ8;A0A0J9YY38 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 114.35 114.35 2 0.0017103 118363 QUIQUE_C1218_190116_001 81.494 55.482 25272000 25272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2566 3578 2394 23639 30188 30188 1 ALNATFR Unmodified 791.42899 0.42898711 1715 O95219 SNX4 Sorting nexin-4 yes yes 0 0 0 1 1 28.49 28.49 2 0.026207 22393 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.401 33.279 61729000 0 0 0 0 0 0 0 27573000 0 0 34157000 0 0 2567 1715 2395 23640;23641 30189;30190 30190 2 ALNEACESVIQTACK Unmodified 1692.7811 0.78110538 3765 Q92896;H3BM42 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes no 0 0 0 1 1 62.776 62.776 2 0.00010147 62236 QUIQUE_C1277_190116_001 101.53 67.657 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 105.75 105.75 3 0.029241 108909 QUIQUE_C1277_190116_001 31.41 21.352 27208000 0 27208000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2578 2554 2406 23715 30275 30275 1 ALNRPPTYPTK Unmodified 1256.6877 0.68772099 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40;H0YMJ8;H0YM54;H0YK11 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 21.568 21.568 2;3 0.0018288 15179 QUIQUE_C1218_190116_001 66.262 21.126 534350000 136350000 0 40853000 58405000 0 0 0 35966000 35282000 0 138830000 0 88674000 2579 2653 2407 23716;23717;23718;23719;23720;23721;23722;23723;23724;23725;23726;23727;23728;23729 30276;30277;30278;30279;30280;30281;30282;30283;30284;30285;30286;30287;30288;30289;30290 30276 15 ALNSIIDVYHK Unmodified 1271.6874 0.68738664 1876 P05109 S100A8 Protein S100-A8;Protein S100-A8, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 67.909 67.909 2;3 0.00023902 67780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.744 68.232 1314200000 69088000 124560000 135630000 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Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 77.891 77.891 2;3 3.4794E-44 78612 QUIQUE_DMIX3_190116_001 200.82 186.56 3765500000 0 0 204320000 183610000 81852000 0 365460000 730630000 79019000 84879000 794800000 602850000 638040000 2586 2197 2414 23809;23810;23811;23812;23813;23814;23815;23816;23817;23818;23819;23820;23821;23822;23823;23824;23825;23826;23827 30386;30387;30388;30389;30390;30391;30392;30393;30394;30395;30396;30397;30398;30399;30400;30401;30402;30403;30404;30405;30406;30407;30408 30400 21 ALPCIVDVR Unmodified 1041.5641 0.56410038 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 77.143 77.143 2 0.023842 78274 QUIQUE_C1368_190116_001 60.436 45.661 169760000 0 0 169760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2587 3421 2415 23828 30409 30409 1 ALPCIVDVRDEQQISAAVEK Unmodified 2240.1471 0.14708153 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.45 105.45 3 4.8558E-07 108216 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FAM126B Protein FAM126B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.027 87.027 3 2.0289E-07 89003 QUIQUE_C1277_190116_001 91.657 79.739 500720000 38441000 54062000 36213000 40159000 37649000 33737000 44242000 36729000 35336000 0 48763000 50194000 45198000 2591 3551 2418 23842;23843;23844;23845;23846;23847;23848;23849;23850;23851;23852;23853 30423;30424;30425;30426;30427;30428;30429;30430;30431;30432;30433;30434 30424 12 ALPEFFNGK Unmodified 1021.5233 0.52328142 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;Q92922 SMARCC2;SMARCC1 SWI/SNF complex subunit SMARCC2;SWI/SNF complex subunit SMARCC1 yes no 0 0 0 1 1 82.175 82.175 2 0.014262 83896 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 54.63 185200000 0 0 0 0 0 0 0 77810000 0 0 107390000 0 0 2592 1039 2419 23854;23855 30435;30436 30435 2 ALPELQQALSALK Unmodified 1380.7977 0.79766537 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.03 131.03 2 0.013365 135087 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.93 47.79 94050000 0 0 0 0 0 0 31291000 0 26180000 0 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23866;23867;23868;23869;23870;23871;23872;23873;23874;23875;23876;23877;23878;23879;23880;23881;23882;23883;23884;23885;23886;23887;23888;23889;23890;23891;23892;23893;23894;23895;23896;23897;23898;23899;23900;23901 30448;30449;30450;30451;30452;30453;30454;30455;30456;30457;30458;30459;30460;30461;30462;30463;30464;30465;30466;30467;30468;30469;30470;30471;30472;30473;30474;30475;30476;30477;30478;30479;30480;30481;30482;30483;30484;30485;30486;30487;30488;30489;30490;30491;30492;30493;30494;30495;30496;30497;30498;30499;30500;30501;30502;30503;30504;30505;30506;30507;30508;30509;30510;30511;30512;30513;30514;30515;30516;30517;30518;30519;30520;30521;30522;30523;30524;30525;30526;30527;30528;30529;30530;30531;30532;30533;30534;30535;30536;30537;30538;30539;30540;30541;30542;30543;30544;30545;30546;30547;30548;30549;30550;30551;30552;30553;30554;30555;30556;30557;30558;30559;30560;30561;30562;30563;30564;30565;30566;30567;30568;30569;30570;30571;30572;30573;30574;30575;30576 30546 129 ALPEVHYHLGQK Unmodified 1390.7357 0.73573382 1932 P07902 GALT Galactose-1-phosphate uridylyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.124 38.124 3 0.00028015 33847 QUIQUE_C1277_190116_001 74.962 42.803 199440000 0 32026000 0 25316000 0 29419000 32394000 27585000 28224000 0 0 24471000 0 2596 1932 2423 23902;23903;23904;23905;23906;23907;23908;23909;23910 30577;30578;30579;30580;30581;30582;30583;30584;30585 30578 9 ALPFWNEEIVPQIK Unmodified 1682.9032 0.90319307 2139;2090 P15259;P18669;Q8N0Y7 PGAM2;PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 142.92 142.92 2;3 2.1721E-17 147112 QUIQUE_C1277_190116_001 150.1 127.46 114720000000 8314000000 8311800000 10002000000 8218100000 8483000000 8659600000 8483700000 8519000000 10321000000 2862900000 12512000000 9609400000 10428000000 2597 2090;2139 2424 23911;23912;23913;23914;23915;23916;23917;23918;23919;23920;23921;23922;23923;23924;23925;23926;23927;23928;23929;23930;23931;23932;23933;23934;23935;23936;23937;23938 30586;30587;30588;30589;30590;30591;30592;30593;30594;30595;30596;30597;30598;30599;30600;30601;30602;30603;30604;30605;30606;30607;30608;30609;30610;30611;30612;30613;30614;30615;30616;30617;30618;30619;30620;30621;30622;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;30636;30637;30638;30639;30640;30641 30591 55 ALPGQLKPFETLLSQNQGGK Unmodified 2125.1532 0.15315318 1957 P09211;A0A087X243 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 114.95 114.95 2;3;4 8.6612E-153 118934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 261.27 245.73 79366000000 5898100000 5275500000 7091000000 5876700000 5905200000 5569000000 5434700000 6907800000 7796600000 2750400000 6837000000 5991800000 8032200000 2598 1957 2425 23939;23940;23941;23942;23943;23944;23945;23946;23947;23948;23949;23950;23951;23952;23953;23954;23955;23956;23957;23958;23959;23960;23961;23962;23963;23964;23965;23966;23967 30642;30643;30644;30645;30646;30647;30648;30649;30650;30651;30652;30653;30654;30655;30656;30657;30658;30659;30660;30661;30662;30663;30664;30665;30666;30667;30668;30669;30670;30671;30672;30673;30674;30675;30676;30677;30678;30679;30680;30681;30682;30683;30684;30685;30686;30687;30688;30689;30690;30691;30692;30693;30694;30695;30696;30697;30698;30699;30700;30701;30702;30703;30704;30705;30706;30707;30708 30687 67 ALPIGISFVK Unmodified 1043.6379 0.63791725 866 E7ESC9;Q8IZU2;H0YAG1 WDR17 WD repeat-containing protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.2 106.2 2 0.016524 107889 QUIQUE_C1563_190116_001 62.546 43.069 207130000 26922000 0 0 17876000 0 12677000 17868000 25167000 0 6777900 30280000 34720000 34842000 2599 866 2426 23968;23969;23970;23971;23972;23973;23974;23975;23976 30709;30710;30711;30712;30713;30714;30715;30716;30717;30718;30719 30712 11 ALPIIVK Acetyl (Protein N-term) 794.52658 0.52657589 3709 Q8WVY7 UBLCP1 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 yes yes 1 0 0 1 116.41 116.41 2 0.052963 120580 QUIQUE_C1218_190116_001 53.71 53.71 8954600 8954600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2600 3709 2427 23977 30720 30720 1 ALPLALVLHELGAGR Unmodified 1528.9089 0.90894715 2157 P19971;C9JGI3;A0A1W2PQK0 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 2 1 3 1 1 3 1 1 2 2 2 1 1 142.94 142.94 2;3 3.7088E-07 147642 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.15 89.876 1878700000 65801000 53998000 500130000 140930000 204650000 74129000 77788000 86136000 137380000 56212000 384770000 48056000 48735000 2601 2157 2428 23978;23979;23980;23981;23982;23983;23984;23985;23986;23987;23988;23989;23990;23991;23992;23993;23994;23995;23996;23997;23998 30721;30722;30723;30724;30725;30726;30727;30728;30729;30730;30731;30732;30733;30734;30735;30736;30737;30738;30739;30740;30741;30742;30743;30744;30745;30746;30747;30748;30749;30750;30751;30752 30752 30 ALPLEAEVAPVKDMAQLPETEIAPAK Oxidation (M) 2746.4463 0.44628324 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 1 1 1 107.63 107.63 3 3.6511E-07 111450 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.738 45.06 47168000 0 0 0 0 0 0 0 0 47168000 0 0 0 0 2602 880 2429 23999 30753 30753 521 1 ALPLIVGAQLIHADK Unmodified 1557.9243 0.92426287 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 no no 0 0 0 1 106.77 106.77 3 0.013817 111861 QUIQUE_C1438_190116_001 40.857 27.178 25418000 0 0 0 0 25418000 0 0 0 0 0 0 0 0 2603 3297 2430 24000 30754;30755 30754 2 ALPLLFNLIK Unmodified 1140.7271 0.72706661 3491 Q86UT6 NLRX1 NLR family member X1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.73 150.73 2 0.023235 155363 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.177 46.763 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F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.501 57.501 3 0.002319 55915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.568 37.513 66416000 0 0 0 0 0 0 0 0 28579000 0 0 0 37838000 2625 656 2452 24150;24151;24152;24153;24154;24155 30967;30968;30969;30970;30971;30972 30972 6 ALQETPTSVLLHHQIGLCYK Unmodified 2307.2045 0.20453683 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 89.701 89.701 3 2.0401E-05 90663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.168 65.365 107270000 0 0 0 61552000 0 0 0 28347000 0 17375000 0 0 0 2626 1975 2453 24156;24157;24158;24159 30973;30974;30975;30976 30975 3 ALQFLEEVK Unmodified 1075.5914 0.59136099 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 89.449 89.449 1;2 0.00042731 91564 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.29 90.142 5272400000 380610000 427960000 420400000 401700000 410610000 376170000 490820000 351030000 373240000 186690000 537970000 436310000 478880000 2627 2424 2454 24160;24161;24162;24163;24164;24165;24166;24167;24168;24169;24170;24171;24172;24173;24174 30977;30978;30979;30980;30981;30982;30983;30984;30985;30986;30987;30988;30989;30990;30991;30992;30993;30994;30995;30996;30997;30998;30999;31000;31001;31002 30991 25 ALQGASQIIAEIR Unmodified 1368.7725 0.77251325 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 102.3 102.3 2;3 1.7012E-12 105395 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.96 89.522 2514900000 217770000 179360000 143390000 183340000 199930000 198800000 192150000 200630000 186400000 70152000 230920000 197170000 314820000 2628 1108;1404 2455 24175;24176;24177;24178;24179;24180;24181;24182;24183;24184;24185;24186;24187;24188;24189;24190;24191;24192;24193 31003;31004;31005;31006;31007;31008;31009;31010;31011;31012;31013;31014;31015;31016;31017;31018;31019;31020;31021;31022;31023;31024;31025;31026;31027;31028 31020 26 ALQGQISSQQVAVEK Unmodified 1584.8471 0.84713476 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 47.344 47.344 2 0.00059048 42124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.479 59.225 12901000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12901000 0 0 0 2629 2882 2456 24194 31029 31029 1 ALQHMTDFAIQFNK Oxidation (M) 1678.8137 0.81372614 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.385 67.385 3 0.00034449 66174 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.078 65.464 477020000 62271000 65540000 0 0 73405000 0 0 67652000 0 60382000 0 87620000 60149000 2630 2777 2457 24195;24196;24197;24198;24199;24200;24201;24202;24203 31030;31031;31032;31033;31034;31035;31036;31037;31038 31038 2214 7 ALQHMTDFAIQFNK Unmodified 1662.8188 0.81881152 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 90.261 90.261 2;3 1.6267E-12 92246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109 104.93 4705500000 513840000 488640000 264760000 256540000 460200000 235080000 347960000 337820000 327510000 112970000 506180000 351060000 502920000 2631 2777 2457 24204;24205;24206;24207;24208;24209;24210;24211;24212;24213;24214;24215;24216;24217;24218;24219;24220;24221;24222;24223;24224;24225;24226 31039;31040;31041;31042;31043;31044;31045;31046;31047;31048;31049;31050;31051;31052;31053;31054;31055;31056;31057;31058;31059;31060;31061;31062;31063;31064;31065;31066;31067;31068 31058 24 ALQHSYLHKDEGNPE Unmodified 1736.8118 0.81181188 2029 P11802;F8VZ13 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 17.925 17.925 3 3.6953E-05 10950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.022 65.313 65080000 0 0 0 19561000 0 0 0 24545000 20974000 0 0 0 0 2632 2029 2458 24227;24228;24229 31069;31070;31071 31070 3 ALQIPEVYLR Unmodified 1200.6867 0.68665836 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.29 106.29 2 0.023023 109501 QUIQUE_C1277_190116_001 69.812 40.436 78985000 18101000 23393000 0 0 0 0 17664000 0 0 0 0 0 19827000 2633 1057 2459 24230;24231;24232;24233 31072;31073;31074;31075 31073 4 ALQLEEER Unmodified 986.50327 0.50327426 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 32.183 32.183 2 0.0054547 26889 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.39 13.484 8248600000 0 0 0 1820600000 0 0 1553400000 0 2316700000 902530000 0 1655300000 0 2634 859 2460 24234;24235;24236;24237;24238 31076;31077;31078;31079;31080;31081 31078 5 ALQLEEERK Unmodified 1114.5982 0.59823728 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.585 18.585 2;3 0.00074595 11397 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.71 7.3503 351160000 0 55870000 0 0 26618000 29756000 0 83433000 75588000 0 0 79893000 0 2635 859 2461 24239;24240;24241;24242;24243;24244;24245 31082;31083;31084;31085;31086;31087;31088;31089 31087 6 ALQLLDEVLHTMPIADPQPLD Unmodified 2328.2035 0.20353377 1312 K7EIU8;Q13485 SMAD4 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 169.67 169.67 2;3 0.0020971 173138 QUIQUE_C1277_190116_001 36.253 27.434 33885000 22435000 0 0 0 0 0 0 11449000 0 0 0 0 0 2636 1312 2462 24246;24247;24248 31090;31091;31092 31091 3 ALQLLHCFPLDIR Unmodified 1594.8654 0.86536778 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 3 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 123.02 123.02 2;3 0.00011916 126896 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.565 65.215 1209700000 107310000 128840000 31261000 93050000 106770000 88760000 101510000 63252000 107080000 14136000 114500000 119820000 133390000 2637 514 2463 24249;24250;24251;24252;24253;24254;24255;24256;24257;24258;24259;24260;24261;24262;24263;24264;24265;24266;24267;24268;24269;24270;24271;24272 31093;31094;31095;31096;31097;31098;31099;31100;31101;31102;31103;31104;31105;31106;31107;31108;31109;31110;31111;31112;31113;31114;31115;31116;31117;31118;31119;31120;31121;31122 31110 30 ALQNAVTTFVNR Unmodified 1332.715 0.71499837 1464 O14964 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.084 79.084 2 1.6672E-05 76299 QUIQUE_DMIX4_190116_001 159.79 104.26 1342200000 0 115510000 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vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.129 47.129 2 4.031E-07 44098 QUIQUE_C1368_190116_001 123.51 107.93 1288300000 0 138630000 179900000 145270000 175520000 0 140330000 51167000 77863000 72381000 148490000 71849000 86871000 2640 3086 2466 24304;24305;24306;24307;24308;24309;24310;24311;24312;24313;24314 31163;31164;31165;31166;31167;31168;31169;31170;31171;31172;31173 31164 7 ALQPLEEGEDEEKVSHQAGDHWLIR Unmodified 2885.3944 0.3943991 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 1 2 83.516 83.516 4;5 1.9839E-46 86446 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.99 139.23 209930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 209930000 0 0 2641 3086 2467 24315;24316 31174;31175 31175 2 ALQQEQEIEQR Unmodified 1370.679 0.6790068 317 A0A0U1RR30;A0A0U1RRM1;Q8WXI9;Q86YP4 GATAD2B;GATAD2A Transcriptional repressor p66-beta;Transcriptional repressor p66-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 29.66 29.66 2 8.9349E-06 24461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.17 114.1 99926000 0 0 0 38987000 0 0 0 0 35164000 0 0 25774000 0 2642 317 2468 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31189;31190;31191;31192;31193;31194;31195;31196;31197;31198;31199;31200;31201;31202;31203;31204;31205;31206;31207;31208;31209;31210;31211;31212;31213;31214;31215;31216 31201 28 ALQSGQCAGAALDVFTEEPPRDR Unmodified 2487.1812 0.1812352 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 2 2 3 1 1 1 1 1 1 1 2 93.004 93.004 3 2.462E-160 94585 QUIQUE_C1368_190116_001 185.61 183.45 2419300000 113030000 218650000 294570000 181460000 222900000 141540000 209340000 128510000 147280000 64343000 189360000 181770000 326480000 2645 404 2471 24351;24352;24353;24354;24355;24356;24357;24358;24359;24360;24361;24362;24363;24364;24365;24366;24367;24368;24369;24370 31217;31218;31219;31220;31221;31222;31223;31224;31225;31226;31227;31228;31229;31230;31231;31232;31233;31234;31235;31236;31237;31238;31239;31240;31241;31242;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250;31251;31252;31253;31254;31255;31256;31257;31258;31259;31260;31261;31262;31263;31264;31265;31266;31267;31268;31269 31226 50 ALQSLACGKPTQR Unmodified 1428.7507 0.75073195 3017 Q13618;A0A087WTG3 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 21.78 21.78 2;3 0.0045954 15302 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.088 23.574 196040000 45739000 0 0 27772000 0 0 0 51092000 0 20092000 51344000 0 0 2646 3017 2472 24371;24372;24373;24374;24375 31270;31271;31272;31273;31274;31275 31273 5 ALQSNHFELSLR Unmodified 1413.7365 0.7364621 1408 O00468;A0A087X208;H0Y5U1 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.009 64.009 3 0.0036418 63469 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.28 30.835 235950000 0 0 35073000 0 0 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31447;31448;31449;31450;31451;31452;31453;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461;31462;31463;31464;31465;31466;31467;31468;31469;31470;31471;31472;31473;31474;31475;31476;31477;31478;31479;31480;31481;31482;31483;31484;31485;31486;31487;31488;31489;31490;31491;31492;31493;31494;31495;31496;31497;31498;31499;31500;31501;31502 31495 1063 54 ALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQK Unmodified 3130.5692 0.56920912 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BU78 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 4 4 4 4 3 4 3 4 2 1 3 4 4 73.994 73.994 3;4;5;6 5.0267E-78 75052 QUIQUE_C1277_190116_001 163.46 157.8 36501000000 2168600000 4210100000 4144100000 3009900000 3184600000 1616300000 3878200000 2542700000 1416100000 0 3380700000 2948800000 4000400000 2669 1851 2491 24566;24567;24568;24569;24570;24571;24572;24573;24574;24575;24576;24577;24578;24579;24580;24581;24582;24583;24584;24585;24586;24587;24588;24589;24590;24591;24592;24593;24594;24595;24596;24597;24598;24599;24600;24601;24602;24603;24604;24605;24606;24607;24608;24609 31503;31504;31505;31506;31507;31508;31509;31510;31511;31512;31513;31514;31515;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31523;31524;31525;31526;31527;31528;31529;31530;31531;31532;31533;31534;31535;31536;31537;31538;31539;31540;31541;31542;31543;31544;31545;31546;31547;31548;31549;31550;31551;31552;31553;31554;31555;31556;31557;31558;31559;31560;31561;31562;31563;31564;31565;31566;31567;31568 31512 63 ALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIK Oxidation (M) 3113.579 0.57904552 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 1 1 2 3 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 5 68.682 68.682 3;5 1.3905E-55 68153 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.44 142.07 8050300000 539270000 437150000 529810000 465760000 467530000 296520000 574740000 691180000 559610000 253690000 741820000 796790000 1696500000 2670 1978 2492 24610;24611;24612;24613;24614;24615;24616;24617;24618;24619;24620;24621;24622;24623;24624;24625;24626;24627;24628;24629;24630;24631;24632;24633;24634;24635;24636;24637;24638;24639;24640 31569;31570;31571;31572;31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;31593;31594;31595;31596;31597;31598;31599;31600;31601;31602;31603;31604;31605 31590 1253 35 ALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIK Unmodified 3097.5841 0.5841309 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 4 4 3 4 4 3 4 4 1 3 4 3 78.61 78.61 3;4;5;6 2.6908E-126 79743 QUIQUE_C1368_190116_001 190.19 171.41 32828000000 1135900000 2942900000 2973500000 2038000000 3208400000 1857900000 2822700000 2714700000 2785400000 119040000 3302400000 3384900000 3541900000 2671 1978 2492 24641;24642;24643;24644;24645;24646;24647;24648;24649;24650;24651;24652;24653;24654;24655;24656;24657;24658;24659;24660;24661;24662;24663;24664;24665;24666;24667;24668;24669;24670;24671;24672;24673;24674;24675;24676;24677;24678;24679;24680;24681;24682;24683 31606;31607;31608;31609;31610;31611;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;31620;31621;31622;31623;31624;31625;31626;31627;31628;31629;31630;31631;31632;31633;31634;31635;31636;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645;31646;31647;31648;31649;31650;31651;31652;31653;31654;31655;31656;31657;31658;31659;31660;31661;31662;31663;31664;31665;31666 31617 55 ALSDLISATK Unmodified 1017.5706 0.57062555 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.836 78.836 2 0.0055218 80120 QUIQUE_C1277_190116_001 77.192 31.063 488120000 0 76194000 85502000 0 0 55698000 72430000 0 64842000 0 0 54167000 79283000 2672 4606 2493 24684;24685;24686;24687;24688;24689;24690 31667;31668;31669;31670;31671;31672;31673 31667 4 ALSEALTELGYK Unmodified 1293.6816 0.68163256 2359 P34896 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.17 100.17 2 8.7313E-07 104260 QUIQUE_C1218_190116_001 166.19 136.38 545280000 35886000 28561000 51649000 42344000 35226000 32198000 57419000 39787000 43260000 19114000 64029000 53793000 42016000 2673 2359 2494 24691;24692;24693;24694;24695;24696;24697;24698;24699;24700;24701;24702;24703 31674;31675;31676;31677;31678;31679;31680;31681;31682;31683;31684;31685;31686;31687 31674 14 ALSEEQEEQAAR Unmodified 1359.6266 0.62663688 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 21.435 21.435 2 1.0539E-65 14270 QUIQUE_C1368_190116_001 219.8 199.28 1244300000 120290000 123600000 123190000 94931000 97075000 0 116390000 73426000 110880000 58772000 111100000 117180000 97448000 2674 4522 2495 24704;24705;24706;24707;24708;24709;24710;24711;24712;24713;24714;24715;24716;24717 31688;31689;31690;31691;31692;31693;31694;31695;31696;31697;31698;31699;31700;31701 31690 14 ALSEIAGMTLPYDTLDQVR Unmodified 2092.0511 0.051055878 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 142.25 142.25 2;3 9.9653E-75 146676 QUIQUE_DMIX7_190116_001 243.88 213.55 3080300000 271730000 239470000 247870000 211890000 198300000 247460000 265630000 64659000 234890000 62961000 440790000 341310000 253340000 2675 2280 2496 24718;24719;24720;24721;24722;24723;24724;24725;24726;24727;24728;24729;24730;24731;24732;24733;24734;24735;24736;24737;24738;24739 31702;31703;31704;31705;31706;31707;31708;31709;31710;31711;31712;31713;31714;31715;31716;31717;31718;31719;31720;31721;31722;31723;31724;31725;31726;31727;31728 31725 24 ALSEIAGMTLPYDTLDQVR Oxidation (M) 2108.046 0.0459705 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 123.5 123.5 2 8.7767E-05 127512 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24810;24811;24812;24813;24814;24815;24816;24817;24818;24819;24820;24821;24822;24823;24824;24825;24826;24827;24828;24829;24830;24831;24832;24833;24834;24835 31809;31810;31811;31812;31813;31814;31815;31816;31817;31818;31819;31820;31821;31822;31823;31824;31825;31826;31827;31828;31829;31830;31831;31832;31833;31834;31835;31836;31837;31838;31839;31840 31828 32 ALSSEGKPYVTKEELYQNLTR Unmodified 2425.2489 0.24890406 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 1 1 3 3 3 3 3 73.841 73.841 2;3;4 1.7161E-42 74324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.49 160.27 9281800000 0 61749000 62483000 0 0 0 45796000 2237500000 1775100000 0 1785100000 1659600000 1654500000 2689 267;275;3025 2509 24836;24837;24838;24839;24840;24841;24842;24843;24844;24845;24846;24847;24848;24849;24850;24851;24852;24853 31841;31842;31843;31844;31845;31846;31847;31848;31849;31850;31851;31852;31853;31854;31855;31856;31857;31858;31859;31860;31861 31844 20 ALSSEWKPEIR Unmodified 1314.6932 0.6932003 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 3 3 4 4 4 3 5 3 7 3 5 5 8 53.452 53.452 2;3 0.00034887 52143 QUIQUE_C1218_190116_001 105.46 78.032 12158000000 1105600000 891170000 728240000 864760000 741190000 520190000 1025600000 621260000 1177600000 547260000 1411500000 676290000 1847000000 2690 1218;28;112;2057 2510 24854;24855;24856;24857;24858;24859;24860;24861;24862;24863;24864;24865;24866;24867;24868;24869;24870;24871;24872;24873;24874;24875;24876;24877;24878;24879;24880;24881;24882;24883;24884;24885;24886;24887;24888;24889;24890;24891;24892;24893;24894;24895;24896;24897;24898;24899;24900;24901;24902;24903;24904;24905;24906;24907;24908;24909;24910 31862;31863;31864;31865;31866;31867;31868;31869;31870;31871;31872;31873;31874;31875;31876;31877;31878;31879;31880;31881;31882;31883;31884;31885;31886;31887;31888;31889;31890;31891;31892;31893;31894;31895;31896;31897;31898;31899;31900;31901;31902;31903;31904;31905;31906;31907;31908;31909;31910;31911;31912;31913;31914;31915;31916;31917;31918;31919;31920;31921;31922;31923;31924;31925;31926;31927;31928;31929;31930;31931;31932;31933;31934;31935;31936;31937;31938;31939;31940;31941;31942;31943;31944;31945;31946;31947;31948;31949 31863 83 ALSTDCTPSGDLSPLSR Unmodified 1775.836 0.83597772 1036 J3KNM6;F8VVT9;Q99490 AGAP2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 77.809 77.809 2 8.0397E-10 78659 QUIQUE_C1403_190116_001 113.99 97.734 75457000 0 0 41261000 34196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2691 1036 2511 24911;24912 31950;31951 31951 2 ALSTDPAAPNLK Unmodified 1196.6401 0.6401021 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.984 43.984 2 0.00070335 41150 QUIQUE_C1438_190116_001 112.11 87.952 1533500000 116130000 0 165160000 0 184820000 0 182570000 104020000 111730000 83817000 275810000 139940000 169500000 2692 4600 2512 24913;24914;24915;24916;24917;24918;24919;24920;24921;24922 31952;31953;31954;31955;31956;31957;31958;31959;31960;31961 31954 10 ALSTDSVER Unmodified 976.48254 0.48253882 3112 Q15119 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 21.458 21.458 2 0.053322 14340 QUIQUE_C1368_190116_001 61.962 35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2693 3112 2513 24923;24924 31962;31963 31962 2 ALSTMDLQK Unmodified 1005.5165 0.51648149 1032 F8VUA2;F8VVT7;Q9HD42;F5H875 CHMP1A Charged multivesicular body protein 1a yes no 0 0 0 1 1 1 39.841 39.841 2 0.0087437 36319 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.923 43.03 88613000 0 0 0 0 0 36943000 0 0 51670000 0 0 0 0 2694 1032 2514 24925;24926;24927 31964;31965;31966 31965 3 ALSVGNIDDALQCYSEAIK Unmodified 2065.999 0.99902031 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 144.79 144.79 2;3 2.513E-64 149147 QUIQUE_DMIX7_190116_001 223.06 210.3 9083500000 672100000 799040000 752630000 551960000 936850000 663060000 861750000 485770000 615170000 366990000 766030000 774660000 837470000 2695 2343 2515 24928;24929;24930;24931;24932;24933;24934;24935;24936;24937;24938;24939;24940;24941;24942;24943;24944;24945;24946;24947;24948;24949;24950;24951 31967;31968;31969;31970;31971;31972;31973;31974;31975;31976;31977;31978;31979;31980;31981;31982;31983;31984;31985;31986;31987;31988;31989;31990;31991;31992;31993;31994;31995 31990 26 ALSYLYEK Unmodified 985.51205 0.51204804 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 53.791 53.791 2 0.023483 52112 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 39.257 56473000 56473000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2696 3422 2516 24952 31996 31996 1 ALTAEIVK Unmodified 843.50657 0.50656873 1324 K7EKE6;P36776 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 37.12 37.12 2 0.018737 33649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.469 23.347 286050000 0 0 0 0 0 0 0 78699000 91593000 0 115760000 0 0 2697 1324 2517 24953;24954;24955 31997;31998;31999 31997 3 ALTAHLYSLLQTQHALGDAFADLSQK Unmodified 2811.4555 0.45554279 106 A0A087X1E4;P53365;E9PRV8 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 142.6 142.6 4 1.0564E-05 147252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.209 49.764 195740000 42647000 29693000 60472000 0 0 0 0 0 62927000 0 0 0 0 2698 106 2518 24956;24957;24958;24959 32000;32001;32002;32003 32003 4 ALTALFK Unmodified 762.46398 0.46397563 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.896 65.896 2 0.01933 65756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.54 68.188 796030000 76196000 84951000 0 72874000 80286000 68571000 91844000 76025000 68072000 0 0 74961000 102250000 2699 4392 2519 24960;24961;24962;24963;24964;24965;24966;24967;24968;24969 32004;32005;32006;32007;32008;32009;32010;32011;32012;32013;32014;32015;32016;32017;32018;32019;32020 32014 17 ALTALLK Unmodified 728.47963 0.47962569 698 C9J5N1;Q9BTE6;K7EQ85 PTGES3L-AARSD1;AARSD1 Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.929 52.929 2 0.023536 50546 QUIQUE_C1368_190116_001 99.919 0 84466000 0 21857000 21661000 24028000 0 16920000 0 0 0 0 0 0 0 2700 698 2520 24970;24971;24972;24973 32021;32022;32023;32024;32025 32022 5 ALTDAGCNLNPLQYIK Unmodified 1789.9033 0.90326943 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 130.24 130.24 2 0.00079438 136312 QUIQUE_C1438_190116_001 94.616 81.985 166040000 0 0 0 0 82263000 83773000 0 0 0 0 0 0 0 2701 3708 2521 24974;24975 32026;32027 32026 2 ALTDFFR Unmodified 868.4443 0.44430282 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.46 102.46 2 0.0083582 105578 QUIQUE_C1368_190116_001 153.61 85.58 504820000 65995000 55107000 86827000 0 72479000 63352000 69501000 59873000 0 31687000 0 0 0 2702 1210 2522 24976;24977;24978;24979;24980;24981;24982;24983 32028;32029;32030;32031;32032;32033;32034;32035;32036;32037 32032 10 ALTDKVTDLLGGLFSK Unmodified 1676.9349 0.93488713 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 1 1 152.79 152.79 3 0.0019523 155521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.495 49.58 32508000 0 0 0 0 0 0 0 32508000 0 0 0 0 0 2703 1535 2523 24984 32038 32038 1 ALTDMPQMR Unmodified 1061.4998 0.49978556 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.342 60.342 2 0.017141 58804 QUIQUE_C1277_190116_001 65.252 39.147 313780000 61984000 62731000 0 57061000 0 0 0 0 0 25218000 0 0 106790000 2704 1823 2524 24985;24986;24987;24988;24989 32039;32040;32041;32042;32043;32044 32040 6 ALTDSFR Unmodified 808.40792 0.40791731 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.715 41.715 2 3.1953E-05 37670 QUIQUE_C1403_190116_001 175.93 121.4 8045200000 880270000 777580000 0 785720000 0 974320000 0 788230000 1230200000 394800000 1238200000 975920000 0 2705 685 2525 24990;24991;24992;24993;24994;24995;24996;24997;24998 32045;32046;32047;32048;32049;32050;32051;32052;32053;32054;32055 32049 10 ALTFLLLQPPSPK Unmodified 1423.8439 0.84388728 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.52 134.52 2 0.00046408 138715 QUIQUE_C1277_190116_001 98.254 83.437 120850000 24155000 24326000 13819000 16247000 0 0 0 0 15626000 0 0 26677000 0 2706 4604 2526 24999;25000;25001;25002;25003;25004;25005;25006 32056;32057;32058;32059;32060;32061;32062;32063 32057 6 ALTGGIAHLFK Unmodified 1126.6499 0.64987892 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 2 3 2 2 2 2 71.963 71.963 2;3 0.00027842 72756 QUIQUE_C1438_190116_001 77.379 57.617 7181300000 886600000 634650000 873030000 553280000 287060000 479940000 532280000 595260000 533160000 271730000 545920000 524940000 463430000 2707 1971 2527 25007;25008;25009;25010;25011;25012;25013;25014;25015;25016;25017;25018;25019;25020;25021;25022;25023;25024;25025;25026;25027;25028;25029;25030;25031;25032;25033 32064;32065;32066;32067;32068;32069;32070;32071;32072;32073;32074;32075;32076;32077;32078;32079;32080;32081;32082;32083;32084;32085;32086;32087;32088;32089;32090;32091;32092;32093;32094;32095;32096;32097 32074 33 ALTGHLEEVVLALLK Unmodified 1604.9501 0.95014327 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 2 4 3 5 3 4 4 3 3 2 4 4 3 155.63 155.63 2;3 8.2376E-130 160568 QUIQUE_DMIX8_190116_001 290.61 239.18 19173000000 564560000 1234000000 1201000000 953950000 1094600000 2034600000 1375800000 590970000 3925000000 72303000 2920700000 784850000 2420700000 2708 1853 2528 25034;25035;25036;25037;25038;25039;25040;25041;25042;25043;25044;25045;25046;25047;25048;25049;25050;25051;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25061;25062;25063;25064;25065;25066;25067;25068;25069;25070;25071;25072;25073;25074;25075;25076;25077 32098;32099;32100;32101;32102;32103;32104;32105;32106;32107;32108;32109;32110;32111;32112;32113;32114;32115;32116;32117;32118;32119;32120;32121;32122;32123;32124;32125;32126;32127;32128;32129;32130;32131;32132;32133;32134;32135;32136;32137;32138;32139;32140;32141;32142;32143;32144;32145;32146;32147 32147 41 ALTGSEDYLLLACDGFFDVVPHQEVVGLVQSHLTR Unmodified 3884.9407 0.94072415 2535 P49593;B5MCT7 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 162.24 162.24 4 1.9465E-75 167007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.75 139.28 443640000 0 0 0 0 0 0 64614000 0 92866000 0 99173000 77618000 109370000 2709 2535 2529 25078;25079;25080;25081;25082 32148;32149;32150;32151;32152 32149 5 ALTHIDHSLSR Unmodified 1248.6575 0.65748349 2677 P56192;F5H2V6 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 19.286 19.286 2;3 0.00014626 12447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.9 89.946 1313600000 123010000 125190000 145900000 128090000 88407000 132460000 86700000 107320000 69535000 32177000 115740000 76878000 82161000 2710 2677 2530 25083;25084;25085;25086;25087;25088;25089;25090;25091;25092;25093;25094;25095;25096;25097;25098;25099;25100;25101 32153;32154;32155;32156;32157;32158;32159;32160;32161;32162;32163;32164;32165;32166;32167;32168;32169;32170;32171 32164 15 ALTLDQWLEQHK Unmodified 1480.7674 0.76742787 4218 Q9HBL8;I3L1Y8;I3L3Z0 NMRAL1 NmrA-like family domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 98.276 98.276 2;3 0.00015696 102174 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 65.005 576240000 65869000 76546000 26726000 53877000 80752000 63342000 23611000 0 45171000 0 37593000 44326000 58433000 2711 4218 2531 25102;25103;25104;25105;25106;25107;25108;25109;25110;25111;25112;25113;25114;25115;25116;25117 32172;32173;32174;32175;32176;32177;32178;32179;32180;32181;32182;32183;32184;32185;32186;32187 32179 15 ALTLFDTDEYRPPVWK Acetyl (Protein N-term) 1991.9993 0.9992783 2095 P15882;F8WCQ9;F8WAY4 CHN1 N-chimaerin yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.79 155.79 2 8.735E-30 160533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.68 165.9 697130000 50383000 46519000 51557000 38996000 58954000 48340000 76999000 59490000 49059000 20489000 72993000 53886000 69468000 2712 2095 2532 25118;25119;25120;25121;25122;25123;25124;25125;25126;25127;25128;25129;25130 32188;32189;32190;32191;32192;32193;32194;32195;32196;32197;32198;32199;32200;32201 32196 13 ALTLGALTLPLAR Unmodified 1308.8129 0.8129215 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.12 137.12 2 0.00032838 141527 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.38 92.562 863640000 50289000 58986000 62145000 82396000 78466000 48592000 73913000 82968000 63469000 27572000 70835000 70368000 93643000 2713 4014 2533 25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139;25140;25141;25142;25143 32202;32203;32204;32205;32206;32207;32208;32209;32210;32211;32212;32213;32214 32214 12 ALTLGLAK Unmodified 785.50109 0.50108942 4034 Q9BUH6 C9orf142 Protein PAXX yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.733 52.733 2 0.0035944 50461 QUIQUE_C1277_190116_001 113.1 11.411 463420000 156130000 139640000 95272000 0 0 0 0 0 0 0 0 72372000 0 2714 4034 2534 25144;25145;25146;25147;25148 32215;32216;32217;32218;32219 32216 5 ALTLIAGSPLK Unmodified 1082.6699 0.66994566 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.548 85.548 2 3.1964E-05 87231 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.98 124.46 4892500000 444150000 431210000 322050000 330480000 490050000 318180000 361240000 382620000 382250000 165170000 485290000 380680000 399130000 2715 3499 2535 25149;25150;25151;25152;25153;25154;25155;25156;25157;25158;25159;25160;25161 32220;32221;32222;32223;32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;32233;32234;32235;32236;32237;32238;32239;32240;32241;32242;32243 32241 24 ALTLPGSSENEYIMK Unmodified 1651.8127 0.81272309 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 96.346 96.346 2 0.00059302 99836 QUIQUE_C1576_190116_001 75.416 62.296 215400000 0 0 0 0 0 62877000 74031000 0 78490000 0 0 0 0 2716 2657 2536 25162;25163;25164 32244;32245;32246 32245 2 ALTLQDLDNIWAAQAGK Unmodified 1826.9527 0.95266246 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 150.94 150.94 2 0.0026993 155818 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.189 74.931 142640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82499000 60144000 0 2717 1414;3777 2537 25165;25166 32247;32248 32248 0 ALTPQCGSGEDLYILTGTVPSDYR Unmodified 2612.2428 0.24283241 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 134.57 134.57 3 0.0061548 130925 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.6 29.058 17804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17804000 0 0 0 2718 1699 2538 25167 32249 32249 1 ALTPQTAETDAIR Unmodified 1385.7151 0.71505795 564 A8MUM1;Q53HC9;C9J0U9;D3YTH5;F8WDS8;F8WDX0;F8WB12 TSSC1 Protein TSSC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.955 53.955 2 0.00046337 52086 QUIQUE_C1403_190116_001 110.38 77.541 907110000 83935000 76326000 109950000 80132000 98838000 83584000 0 66574000 96773000 28659000 0 83922000 98417000 2719 564 2539 25168;25169;25170;25171;25172;25173;25174;25175;25176;25177;25178 32250;32251;32252;32253;32254;32255;32256;32257;32258;32259;32260 32253 10 ALTQPLGLLR Unmodified 1080.6655 0.66552898 3941 Q96S97;C9JZL8;C9J5M0;C9JC07;C9JJV6 MYADM Myeloid-associated differentiation marker yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.682 90.682 2 0.0054954 88308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.282 39.555 1698500000 156360000 148450000 196340000 165380000 0 0 0 0 109030000 55649000 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39.874 2 0.01082 35646 QUIQUE_C1403_190116_001 68.224 46.092 5314200000 0 0 0 1301400000 0 1137800000 0 0 0 753040000 0 0 2121900000 2723 2248 2543 25200;25201;25202;25203 32285;32286;32287;32288 32285 3 ALTSFER Unmodified 822.42357 0.42356738 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.689 32.689 2 0.019682 27525 QUIQUE_C1403_190116_001 110.63 65.66 3045600000 327820000 279750000 488750000 333420000 259830000 295370000 0 214350000 362600000 171920000 0 0 311810000 2724 1153 2544 25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25211;25212;25213 32289;32290;32291;32292;32293;32294;32295;32296;32297;32298 32292 10 ALTSFLPAPTQLSQDQLEAEEK Acetyl (Protein N-term) 2457.2275 0.22749992 1081 G3V5R3;G3V3A4;Q13573 SNW1 SNW domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 163.84 163.84 3 0.0002427 165818 QUIQUE_C1563_190116_001 47.808 41.343 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32310;32311;32312;32313;32314;32315;32316;32317;32318;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32325;32326;32327;32328 32322 17 ALTVPELTQQMFDAK Oxidation (M) 1706.8549 0.85492225 2797;1862;3006 P04350;P68371;Q13509;A0A0B4J269 TUBB4A;TUBB4B;TUBB3 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain no no 0 1 0 4 4 3 4 3 4 6 4 5 3 3 3 3 101.02 101.02 2;3 6.6385E-13 101747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.01 28.633 23347000000 1221700000 2605700000 1372800000 1876200000 1262200000 1981200000 1185800000 2609100000 2771600000 1210500000 1833400000 1679400000 1737400000 2728 1862;2797;3006 2548 25238;25239;25240;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249;25250;25251;25252;25253;25254;25255;25256;25257;25258;25259;25260;25261;25262;25263;25264;25265;25266;25267;25268;25269;25270;25271;25272;25273;25274;25275;25276;25277;25278;25279;25280;25281;25282;25283;25284;25285;25286 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TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 2 3 1 3 2 1 2 2 2 1 2 1 1 126.81 126.81 2;3 5.7287E-36 134000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.95 29.579 49962000000 8390800000 703620000 578950000 7382200000 588900000 711540000 8372300000 7537700000 5355300000 1829500000 7570500000 455460000 485430000 2732 3030;4044 2550 25340;25341;25342;25343;25344;25345;25346;25347;25348;25349;25350;25351;25352;25353;25354;25355;25356;25357;25358;25359;25360;25361;25362 32562;32563;32564;32565;32566;32567;32568;32569;32570;32571;32572;32573;32574;32575;32576;32577;32578;32579;32580;32581;32582;32583;32584;32585;32586;32587;32588;32589;32590;32591;32592;32593;32594;32595;32596;32597;32598;32599;32600;32601;32602;32603;32604;32605 32591 44 ALTVPELTQQVFDAK Unmodified 1658.8879 0.88793694 1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 0 0 2 2 3 3 3 2 2 2 2 2 3 2 2 129.61 129.61 2;3 3.802E-66 132976 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159 139.33 61712000000 5295000000 4408700000 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32606;32607;32608;32609;32610;32611;32612;32613;32614;32615;32616;32617;32618;32619;32620;32621;32622;32623;32624;32625;32626;32627;32628;32629;32630;32631;32632;32633;32634;32635;32636;32637;32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;32647;32648;32649;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;32657;32658;32659;32660;32661;32662;32663;32664;32665;32666;32667;32668;32669;32670;32671;32672;32673;32674;32675;32676;32677;32678;32679;32680;32681;32682;32683;32684;32685;32686;32687;32688;32689;32690;32691;32692;32693;32694;32695;32696;32697;32698;32699;32700;32701;32702;32703;32704;32705;32706;32707;32708;32709;32710;32711;32712;32713;32714;32715;32716;32717;32718;32719;32720;32721;32722;32723 32674 118 ALVADSHPESER Unmodified 1309.6262 0.62624295 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 16.854 16.854 2;3 1.5362E-37 9200 QUIQUE_C1563_190116_001 192.12 168.76 38367000000 3148000000 3807900000 3028900000 3116200000 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32792;32793;32794;32795;32796;32797;32798;32799;32800;32801;32802;32803;32804;32805;32806;32807;32808;32809;32810;32811;32812;32813;32814;32815;32816;32817;32818;32819;32820;32821;32822;32823;32824;32825;32826;32827;32828;32829;32830;32831;32832;32833;32834;32835;32836;32837;32838;32839;32840;32841;32842 32841 51 ALVDHHDAEVK Unmodified 1232.6149 0.61494998 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4;H7C2M7 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 12.39 12.39 3 0.0028888 4668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.693 35.75 9707700 0 0 0 0 0 0 0 8545000 0 1162800 0 0 0 2740 3578 2558 25488;25489 32843;32844 32843 2 ALVDTGCLYNLISLACVDR Unmodified 2152.0657 0.065660084 4248 Q9NQ35;B7Z3Y4;E9PIW3 NRIP3 Nuclear receptor-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 164.74 164.74 2 4.6272E-06 166963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.36 79.8 72618000 0 40651000 0 0 0 0 0 31966000 0 0 0 0 0 2741 4248 2559 25490;25491 32845;32846 32846 2 ALVEEALAQR Unmodified 1098.6033 0.60332266 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.457 62.457 2 1.9961E-05 61608 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.04 99.463 1148500000 104870000 158180000 0 154420000 0 0 0 157540000 177100000 48450000 202250000 145720000 0 2742 4210 2560 25492;25493;25494;25495;25496;25497;25498;25499;25500 32847;32848;32849;32850;32851;32852;32853;32854;32855;32856 32850 10 ALVEFTNSPDCLSK Unmodified 1579.7552 0.75520821 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.785 83.785 2 1.8277E-07 85411 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.89 120.03 153010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76794000 0 76219000 2743 4447 2561 25501;25502;25503;25504;25505;25506;25507 32857;32858;32859;32860;32861;32862;32863 32859 7 ALVELLR Unmodified 812.51199 0.51198846 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 75.398 75.398 2 0.042144 75989 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.381 9.4319 77205000 0 0 0 0 0 28702000 0 0 0 0 0 27498000 21006000 2744 3773 2562 25508;25509;25510 32864;32865;32866 32865 3 ALVEMQDVVAELLR Unmodified 1584.8545 0.85452832 4097 Q9C0H2 TTYH3 Protein tweety homolog 3 yes yes 0 0 0 1 164.67 164.67 2 8.6003E-11 167799 QUIQUE_C1403_190116_001 137.89 108.42 15305000 0 0 0 15305000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2745 4097 2563 25511 32867;32868 32868 2 ALVENCLVPDLWIR Unmodified 1696.8971 0.89706184 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 144.93 144.93 2 0.0038583 150093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.153 49.344 114810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57409000 57397000 2746 3098 2564 25512;25513 32869;32870 32870 2 ALVFQPVAELK Unmodified 1213.7071 0.70705945 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.894 98.894 2 0.00043691 103161 QUIQUE_C1218_190116_001 103.55 90.092 8676300000 1067700000 987330000 951580000 885410000 702630000 727720000 754450000 249080000 416720000 439810000 621080000 388680000 484060000 2747 452 2565 25514;25515;25516;25517;25518;25519;25520;25521;25522;25523;25524;25525;25526 32871;32872;32873;32874;32875;32876;32877;32878;32879;32880;32881;32882;32883;32884;32885;32886;32887;32888;32889;32890 32873 20 ALVFQPVAELKDQTDFEHR Unmodified 2242.1382 0.1382314 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 1 1 3 2 2 2 2 2 3 2 1 3 2 2 99.612 99.612 2;3;4 5.7283E-15 102017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.68 101.94 4649100000 37471000 224770000 190060000 156760000 317760000 92923000 329920000 668920000 667300000 31575000 692710000 575590000 663390000 2748 452 2566 25527;25528;25529;25530;25531;25532;25533;25534;25535;25536;25537;25538;25539;25540;25541;25542;25543;25544;25545;25546;25547;25548;25549;25550;25551;25552;25553 32891;32892;32893;32894;32895;32896;32897;32898;32899;32900;32901;32902;32903;32904;32905;32906;32907;32908;32909;32910;32911;32912;32913;32914;32915;32916;32917;32918;32919;32920;32921;32922;32923;32924;32925 32910 33 ALVFVYGTLK Acetyl (Protein N-term) 1151.659 0.65904662 4048 Q9BVM4;M0R0M3;M0R217 GGACT Gamma-glutamylaminecyclotransferase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.94 165.94 2 0.0018247 170176 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 90.429 325980000 29982000 14376000 22130000 19168000 23532000 21343000 23309000 31402000 42310000 12675000 33817000 23477000 28460000 2749 4048 2567 25554;25555;25556;25557;25558;25559;25560;25561;25562;25563;25564;25565;25566 32926;32927;32928;32929;32930;32931;32932;32933;32934;32935;32936;32937;32938;32939 32939 13 ALVGDEVELPCR Unmodified 1356.6708 0.6707503 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;Q5SSB8;A0A0G2JIQ0;A0A140T9L1;A0A0G2JJE4;A0A0G2JI49;A0A0G2JIU9;A0A0G2JHA9;A0A0G2JKI0;H0Y8A0 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.192 80.192 2 1.0071E-24 81446 QUIQUE_C1368_190116_001 195.79 182.83 4027600000 289830000 271570000 523310000 229210000 306650000 182320000 702220000 204390000 107390000 140090000 528670000 158850000 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52.202 2825600000 276450000 0 407790000 186930000 0 0 0 470400000 553570000 0 0 371010000 559420000 2755 1099 2573 25606;25607;25608;25609;25610;25611;25612;25613 32988;32989;32990;32991;32992;32993;32994;32995 32989 7 ALVIVMGK Oxidation (M) 845.50446 0.50446024 1099 G5E9Q6;C9J0J7 PFN2 Profilin yes no 0 1 0 1 1 34.733 34.733 2 0.043361 30143 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.714 34.399 77348000 0 0 0 0 0 0 0 45245000 0 32103000 0 0 0 2756 1099 2573 25614;25615 32996;32997;32998 32997 3 ALVLAQIR Unmodified 882.56509 0.56508666 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 62.594 62.594 2 0.040044 61332 QUIQUE_C1277_190116_001 86.512 47.72 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2757 1707 2574 25616;25617;25618 32999;33000;33001 33000 3 ALVLDCHYPEDEVGQEDEAESDIFSIR Unmodified 3135.3979 0.39788908 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 3 136.63 136.63 3 6.8088E-65 142139 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34364000 31814000 23434000 37292000 0 0 0 16124000 0 0 0 17924000 0 2766 2109 2582 25711;25712;25713;25714;25715;25716;25717;25718;25719;25720;25721 33131;33132;33133;33134;33135;33136;33137;33138;33139;33140;33141;33142;33143 33134 13 ALVQCVHSVYIPNK Unmodified 1626.8552 0.85519702 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 59.153 59.153 3 0.041854 58183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.398 16.107 48892000 0 0 0 0 0 0 0 0 48892000 0 0 0 0 2767 321 2583 25722 33144 33144 1 ALVQQGLK Unmodified 855.5178 0.51780212 3407 Q6UWP2;A0A087WYV4 DHRS11 Dehydrogenase/reductase SDR family member 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.915 22.915 2 0.053491 16153 QUIQUE_C1403_190116_001 54.787 22.722 149490000 0 0 0 31993000 0 33652000 41317000 0 0 0 0 42528000 0 2768 3407 2584 25723;25724;25725;25726 33145;33146;33147;33148 33145 4 ALVQSLLAK Unmodified 941.59097 0.59096706 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 0 1 71.752 71.752 2 0.0014131 67655 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.91 68.101 33129000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33129000 0 0 0 2769 4321 2585 25727 33149 33149 1 ALVQTEDHLLLFLQQLAGK Unmodified 2136.1943 0.19428972 3611 Q8N766 EMC1 ER membrane protein complex subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 162.03 162.03 3 2.3197E-07 166103 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.035 82.781 357640000 29348000 53275000 44713000 20437000 72659000 0 0 0 69769000 0 67438000 0 0 2770 3611 2586 25728;25729;25730;25731;25732;25733;25734;25735 33150;33151;33152;33153;33154;33155;33156;33157 33157 7 ALVSAQWVAEALR Unmodified 1412.7776 0.77759863 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 132.05 132.05 2 5.0753E-05 138034 QUIQUE_C1438_190116_001 114.89 85.732 787900000 97231000 122100000 122800000 132530000 140450000 107740000 0 0 0 65045000 0 0 0 2771 2238 2587 25736;25737;25738;25739;25740;25741;25742 33158;33159;33160;33161;33162;33163;33164 33162 4 ALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLK Unmodified 2486.2904 0.29043453 3017 Q13618 CUL3 Cullin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 154.88 154.88 3 0.00029192 162233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.106 34.907 1105100000 58566000 75946000 0 49827000 0 0 82126000 71639000 118990000 0 386900000 165310000 95819000 2772 3017 2588 25743;25744;25745;25746;25747;25748;25749;25750;25751;25752;25753 33165;33166;33167;33168;33169;33170;33171;33172;33173;33174;33175 33173 9 ALVSEWKEPQAK Unmodified 1384.7351 0.73506511 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 2 42.276 42.276 2;3 0.0058654 37657 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.89 69.775 248280000 0 0 0 0 0 0 0 34432000 0 19182000 0 0 194670000 2773 3179 2589 25754;25755;25756;25757 33176;33177;33178;33179;33180 33179 5 ALVSGKPAESSAVAATEK Unmodified 1714.9101 0.91012895 1711 O95182 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.292 29.292 2 1.1126E-22 24615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.86 149.89 656080000 53361000 53456000 40648000 47321000 60604000 31712000 72886000 45172000 49139000 0 82065000 73896000 45824000 2774 1711 2590 25758;25759;25760;25761;25762;25763;25764;25765;25766;25767;25768;25769 33181;33182;33183;33184;33185;33186;33187;33188;33189;33190;33191;33192 33188 12 ALVSGKPAESSAVAATEKK Unmodified 1843.0051 0.005091963 1711 O95182 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 2 1 22.236 22.236 3 0.020926 15664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.461 42.483 42970000 0 0 0 0 0 0 0 42970000 0 0 0 0 0 2775 1711 2591 25770 33193 33193 1 ALVSHNGSLINVGSLLQR Unmodified 1877.0483 0.048294182 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.49 101.49 3 0.0043155 104732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.577 35.207 286720000 0 33334000 0 32858000 28332000 0 0 32376000 40540000 0 41169000 43746000 34360000 2776 3571 2592 25771;25772;25773;25774;25775;25776;25777;25778 33194;33195;33196;33197;33198;33199;33200;33201 33198 5 ALVSQCNLYMAAR Oxidation (M) 1511.7225 0.72246829 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 1 63.704 63.704 2 0.00060411 62459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.108 70.346 22662000 0 0 0 0 0 0 0 22662000 0 0 0 0 0 2777 617 2593 25779;25780 33202;33203 33202 403 2 ALVSQCNLYMAAR Unmodified 1495.7276 0.72755367 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 76.292 76.292 2 0.068403 77075 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.244 17.664 30703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30703000 0 2778 617 2593 25781 33204 33204 1 ALVSVVNSFHEK Unmodified 1328.7089 0.70885036 228 A0A0C4DG40;Q8NF91 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 56.75 56.75 3 0.067501 56261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 19.496 3.88 31712000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31712000 0 0 2779 228 2594 25782 33205 33205 1 ALVTGYFMQVAHLER Unmodified 1733.8923 0.89231081 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.04 117.04 3 0.00011631 122489 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.358 57.525 181340000 0 0 0 0 25776000 0 48754000 0 0 0 53136000 53676000 0 2780 1506 2595 25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789 33206;33207;33208;33209;33210;33211;33212;33213 33210 8 ALVTTHHLMVHGNER Oxidation (M) 1729.8682 0.86822133 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 3 15.193 15.193 2;3;4 3.1879E-06 6959 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.45 82.089 5528500000 479170000 453150000 426950000 585890000 45931000 169170000 56336000 132510000 594550000 67126000 787090000 906020000 824590000 2781 907 2596 25790;25791;25792;25793;25794;25795;25796;25797;25798;25799;25800;25801;25802;25803;25804;25805;25806;25807;25808;25809;25810;25811 33214;33215;33216;33217;33218;33219;33220;33221;33222;33223;33224;33225;33226;33227;33228;33229;33230;33231;33232;33233;33234;33235;33236;33237 33236 551 24 ALVTTHHLMVHGNER Unmodified 1713.8733 0.8733067 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 1 2 1 1 1 18.791 18.791 2;3;4 2.1077E-35 11271 QUIQUE_C1403_190116_001 205.8 167.78 8023400000 926820000 1354800000 927180000 727510000 664730000 717120000 1001200000 0 323010000 114970000 478120000 400090000 387910000 2782 907 2596 25812;25813;25814;25815;25816;25817;25818;25819;25820;25821;25822;25823;25824;25825;25826;25827;25828;25829;25830;25831;25832;25833 33238;33239;33240;33241;33242;33243;33244;33245;33246;33247;33248;33249;33250;33251;33252;33253;33254;33255;33256;33257;33258;33259 33245 19 ALVVEMSR Unmodified 903.48479 0.48478743 3919 Q96PK6;A0A0A6YYI9;F8WDX3;A0A0A0MSL8;B8ZZ74 RBM14;RBM14-RBM4 RNA-binding protein 14 yes no 0 0 0 1 1 1 43.976 43.976 2 0.025599 41707 QUIQUE_C1218_190116_001 71.342 29.84 111570000 40354000 0 38586000 0 0 32631000 0 0 0 0 0 0 0 2783 3919 2597 25834;25835;25836 33260;33261;33262 33260 3 ALWADSGIQNAYDR Unmodified 1578.7427 0.74266969 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.029 94.029 2 1.8649E-18 96107 QUIQUE_C1368_190116_001 158.05 135.96 2400500000 170480000 164930000 239210000 176660000 128210000 179720000 212420000 168960000 215920000 85597000 276490000 175850000 206040000 2784 3063 2598 25837;25838;25839;25840;25841;25842;25843;25844;25845;25846;25847;25848;25849 33263;33264;33265;33266;33267;33268;33269;33270;33271;33272;33273;33274;33275;33276 33265 14 ALWCSEDK Unmodified 1007.4382 0.43823117 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 38.147 38.147 2 0.030086 34107 QUIQUE_C1576_190116_001 67.277 56.163 61179000 0 0 0 0 0 0 61179000 0 0 0 0 0 0 2785 4592 2599 25850 33277 33277 1 ALWEDEGVR Unmodified 1073.5142 0.5141733 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3;Q5JWE9;H0Y7F4;S4R3V9 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 63.103 63.103 2 0.00164 61820 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.64 58.52 1942000000 152770000 144330000 165310000 170960000 166820000 152490000 184880000 177300000 141870000 80918000 155350000 120460000 128570000 2786 2778 2600 25851;25852;25853;25854;25855;25856;25857;25858;25859;25860;25861;25862;25863;25864 33278;33279;33280;33281;33282;33283;33284;33285;33286;33287;33288;33289;33290;33291;33292;33293;33294;33295;33296 33296 19 ALWEETSFQLDR Unmodified 1493.7151 0.71505795 1477 O15067;H0YGH1 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 115 115 2 0.010013 118769 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.977 43.862 57675000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24646000 33029000 2787 1477 2601 25865;25866 33297;33298 33297 2 ALWFDLQQR Unmodified 1175.6087 0.60874239 3468 Q7Z6G3 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.7 114.7 2 0.0018516 119754 QUIQUE_C1218_190116_001 114.43 81.168 310590000 32617000 0 0 0 0 41801000 48725000 0 22627000 20192000 40910000 57023000 46694000 2788 3468 2602 25867;25868;25869;25870;25871;25872;25873;25874;25875;25876;25877 33299;33300;33301;33302;33303;33304;33305;33306;33307;33308;33309;33310;33311;33312;33313;33314 33299 16 ALWFQGR Unmodified 876.46062 0.46062159 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.849 74.849 2 0.023734 75035 QUIQUE_C1368_190116_001 99.511 60.292 1577200000 152820000 143240000 101080000 104310000 151190000 99519000 130210000 126220000 107120000 80645000 114760000 129550000 136580000 2789 307 2603 25878;25879;25880;25881;25882;25883;25884;25885;25886;25887;25888;25889;25890 33315;33316;33317;33318;33319;33320;33321;33322;33323;33324;33325;33326;33327;33328;33329 33317 15 ALWLAENQAQPMLR Unmodified 1639.8504 0.850446 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 107.46 107.46 2 0.040671 112906 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.82 48.596 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2790 289 2604 25891 33330 33330 1 ALYAIPGLDYVSHEDILPYTSTDQVPIQHELFER Unmodified 3928.9523 0.9523347 4565 Q9Y2S7;B4DEM9 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 154.21 154.21 4 7.691E-06 156697 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.325 41.251 91446000 0 0 0 44701000 0 0 0 46746000 0 0 0 0 0 2791 4565 2605 25892;25893 33331;33332 33332 2 ALYDFEPENEGELGFK Unmodified 1856.8469 0.84685999 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 126.12 126.12 2;3 3.0302E-29 130400 QUIQUE_C1403_190116_001 159.44 150.01 9046600000 913180000 849780000 679390000 743070000 535040000 605310000 673530000 640820000 599640000 301960000 846210000 771570000 887130000 2792 3982 2606 25894;25895;25896;25897;25898;25899;25900;25901;25902;25903;25904;25905;25906;25907;25908 33333;33334;33335;33336;33337;33338;33339;33340;33341;33342;33343;33344;33345;33346;33347;33348;33349;33350;33351;33352;33353;33354;33355;33356;33357;33358;33359;33360 33341 27 ALYDNVAESPDELSFR Unmodified 1824.853 0.853008 416 A0A2R8Y5E4;A0A2R8YFK2;A0A2R8Y6M6;A0A2R8Y4C2;A0A2R8YFS8;A0A2R8Y8C4;A0A2R8Y5C9;A0A2R8Y596;P56945 BCAR1 Breast cancer anti-estrogen resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 112.21 112.21 2 0.00011014 115562 QUIQUE_C1403_190116_001 78.964 62.434 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2793 416 2607 25909;25910;25911 33361;33362;33363 33361 3 ALYDTFSAFGNILSCK Unmodified 1805.8658 0.86582129 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E5RGH3;E5RJB9;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 155.04 155.04 2;3 1.0127E-66 161307 QUIQUE_C1576_190116_001 215.53 196.4 2265300000 142730000 196590000 319790000 156280000 209550000 112180000 184790000 154700000 28534000 62220000 255000000 257470000 185440000 2794 2031;596 2608 25912;25913;25914;25915;25916;25917;25918;25919;25920;25921;25922;25923;25924;25925;25926;25927;25928;25929;25930;25931;25932 33364;33365;33366;33367;33368;33369;33370;33371;33372;33373;33374;33375;33376;33377;33378;33379;33380;33381;33382;33383;33384;33385;33386 33377 21 ALYDYAGQEADELSFR Unmodified 1846.8374 0.83735793 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 0 1 120.62 120.62 2 0.005345 124882 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.705 54.981 45087000 0 0 0 0 0 0 0 0 45087000 0 0 0 0 2795 241 2609 25933 33387 33387 1 ALYDYDGQEQDELSFK Unmodified 1919.8425 0.84250289 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 2 1 2 3 2 1 2 2 2 107.66 107.66 2 2.1517E-95 109640 QUIQUE_C1563_190116_001 270.74 248.68 4861300000 409260000 504730000 397410000 508580000 380120000 330950000 358860000 473560000 261250000 157250000 305860000 338850000 434610000 2796 4069 2610 25934;25935;25936;25937;25938;25939;25940;25941;25942;25943;25944;25945;25946;25947;25948;25949;25950;25951;25952;25953;25954;25955;25956 33388;33389;33390;33391;33392;33393;33394;33395;33396;33397;33398;33399;33400;33401;33402;33403;33404;33405;33406;33407;33408;33409;33410;33411;33412;33413;33414;33415;33416;33417;33418;33419;33420;33421;33422;33423;33424;33425;33426;33427;33428;33429;33430;33431;33432 33406 44 ALYDYEGQEHDELSFK Unmodified 1942.8585 0.85848731 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;H0Y923 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 87.76 87.76 2;3 1.6707E-09 88989 QUIQUE_C1403_190116_001 136.27 125.62 322930000 59187000 72042000 0 28169000 87819000 75709000 0 0 0 0 0 0 0 2797 4510 2611 25957;25958;25959;25960;25961 33433;33434;33435;33436;33437 33435 3 ALYEAGER Unmodified 907.43995 0.43994572 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.257 22.257 2 0.0073368 15788 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.418 48.828 2861900000 0 0 392400000 420220000 0 343230000 400750000 198350000 393790000 239880000 0 0 473250000 2798 1853 2612 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Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.64 105.64 2 1.4928E-17 108545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.87 149.19 1525900000 117070000 125880000 126900000 125140000 0 93412000 0 141780000 147970000 80240000 231860000 184480000 151140000 2808 2970;2974 2622 26045;26046;26047;26048;26049;26050;26051;26052;26053;26054;26055 33537;33538;33539;33540;33541;33542;33543;33544;33545;33546;33547;33548;33549 33549 13 ALYLIATNGTPELQNPER Unmodified 1999.0375 0.037454724 120 A0A087X294;O75914 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.37 107.37 2 2.082E-19 112544 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.34 116.14 312260000 0 36587000 0 0 30417000 0 35930000 35646000 35703000 0 47863000 43382000 46732000 2809 120 2623 26056;26057;26058;26059;26060;26061;26062;26063;26064 33550;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558 33556 7 ALYLQYTDETFR Unmodified 1518.7355 0.73545904 1784 P00450;E9PFZ2;D6RE86 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 103.52 103.52 2 1.8951E-05 107498 QUIQUE_C1218_190116_001 152.28 116.77 310540000 62798000 0 0 0 0 64488000 0 0 0 70545000 112710000 0 0 2810 1784 2624 26065;26066;26067;26068;26069 33559;33560;33561;33562;33563 33559 5 ALYNQYIHFK Unmodified 1295.6663 0.66625727 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 75.201 75.201 3 0.0016278 75596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.435 54.08 48316000 0 0 19690000 0 0 0 0 28627000 0 0 0 0 0 2811 1187 2625 26070;26071;26072;26073;26074;26075 33564;33565;33566;33567;33568;33569 33566 6 ALYNQYLQFK Unmodified 1286.6659 0.66592292 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 99.604 99.604 2 0.0067837 102280 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.127 62.906 16564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16564000 0 2812 2882 2626 26076 33570 33570 1 ALYPFESR Unmodified 981.49198 0.4919813 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528;H7C429 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 67.839 67.839 2 0.035359 67920 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.48 44.749 24866000 0 0 0 0 0 0 0 0 24866000 0 0 0 0 + 2813 3161 2627 26077 33571 33571 1 ALYPVIPR Unmodified 927.55419 0.55418762 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.91 69.91 2 0.02493 69038 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.949 53.265 46107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16965000 0 0 29142000 2814 3675 2628 26078;26079;26080;26081;26082;26083;26084 33572;33573;33574;33575;33576;33577;33578 33578 7 ALYTFEPR Unmodified 995.50763 0.50763136 3763 Q92882 OSTF1 Osteoclast-stimulating factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 64.042 64.042 2 0.021461 61070 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.109 31.301 177730000 0 0 0 0 0 0 0 62218000 0 27702000 51214000 0 36593000 2815 3763 2629 26085;26086;26087;26088 33579;33580;33581;33582 33580 4 ALYYDLISSPDIHGTYK Unmodified 1954.9676 0.96764382 2403 P36955;I3L4Z0;I3L2R7 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.34 105.34 3 0.00024821 109957 QUIQUE_C1218_190116_001 48.623 42.779 254250000 35938000 0 62233000 27056000 0 0 0 30381000 26979000 0 42920000 28742000 0 2816 2403 2630 26089;26090;26091;26092;26093;26094;26095 33583;33584;33585;33586;33587;33588;33589 33583 7 ALYYLQIHPQELR Unmodified 1642.8831 0.88312633 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 1 90.754 90.754 2;3 0.00046303 94237 QUIQUE_C1218_190116_001 106.29 81.999 1489000000 135380000 0 117160000 93158000 169160000 49618000 213440000 41809000 0 76309000 282130000 158150000 152630000 2817 3179 2631 26096;26097;26098;26099;26100;26101;26102;26103;26104;26105;26106;26107;26108;26109;26110;26111;26112 33590;33591;33592;33593;33594;33595;33596;33597;33598;33599;33600;33601;33602;33603;33604;33605;33606 33591 15 AMAAEAEASR Unmodified 1005.4549 0.45494386 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 0 0 1 1 15.677 15.677 2 0.0034764 8061 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.213 63.512 50220000 0 0 0 0 0 0 0 50220000 0 0 0 0 0 2818 2258 2632 26113;26114 33607;33608 33608 2 AMADELSEK Unmodified 992.44846 0.4484615 2884 Q03135;E9PCT5 CAV1 Caveolin-1;Caveolin yes no 0 0 0 1 1 29.432 29.432 2 0.013527 23713 QUIQUE_C1403_190116_001 69.812 49.89 34845000 0 0 0 34845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2819 2884 2633 26115;26116 33609;33610 33609 2 AMADPEVQQIMSDPAMR Unmodified 1888.8481 0.84813909 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.83 106.83 2;3 1.7719E-16 104248 QUIQUE_DMIX4_190116_001 160.69 142.42 1597200000 131120000 151410000 143560000 162490000 117390000 104700000 128190000 98937000 92054000 38086000 174640000 126390000 128280000 2820 2343 2634 26117;26118;26119;26120;26121;26122;26123;26124;26125;26126;26127;26128;26129;26130;26131 33611;33612;33613;33614;33615;33616;33617;33618;33619;33620;33621;33622;33623;33624;33625;33626;33627;33628;33629;33630;33631;33632 33627 22 AMADPEVQQIMSDPAMR Oxidation (M) 1904.8431 0.84305371 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 94.358 94.358 2 1.4594E-12 96298 QUIQUE_C1277_190116_001 126.1 107.83 76201000 0 35344000 0 0 0 24217000 0 0 0 16639000 0 0 0 2821 2343 2634 26132;26133;26134;26135 33633;33634;33635;33636 33633 1747 3 AMAGSVLLDKR Unmodified 1159.6383 0.63832796 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 1 1 37.086 37.086 2 0.035486 33115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.349 44.965 34916000 0 0 0 0 0 0 0 0 34916000 0 0 0 0 2822 882 2635 26136 33637 33637 0 AMAVLTDHPYASLTLPDDAAADCLFLRPGLPGVPPFLLHR Oxidation (M) 4343.2235 0.22350472 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 1 1 1 2 1 1 1 1 155.71 155.71 4;5 7.4772E-43 161115 QUIQUE_C1218_190116_001 94.642 90.489 1655000000 57256000 0 0 1057400000 0 0 111790000 0 0 53834000 0 180330000 194370000 2823 1762 2636 26137;26138;26139;26140;26141;26142;26143 33638;33639;33640;33641;33642;33643;33644;33645 33638 962 7 AMAVLTDHPYASLTLPDDAAADCLFLRPGLPGVPPFLLHR Unmodified 4327.2286 0.22859009 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 1 1 2 3 2 1 1 2 3 3 2 3 3 158.59 158.59 4;5 3.8034E-143 162677 QUIQUE_C1277_190116_001 175.38 168.24 4852000000 106150000 947800000 541950000 354430000 223100000 111400000 352330000 247120000 363080000 0 493340000 665970000 445360000 2824 1762 2636 26144;26145;26146;26147;26148;26149;26150;26151;26152;26153;26154;26155;26156;26157;26158;26159;26160;26161;26162;26163;26164;26165;26166;26167;26168;26169 33646;33647;33648;33649;33650;33651;33652;33653;33654;33655;33656;33657;33658;33659;33660;33661;33662;33663;33664;33665;33666;33667;33668;33669;33670;33671;33672;33673;33674;33675;33676;33677;33678;33679;33680;33681 33648 34 AMDDSSVTEHQK Unmodified 1346.5772 0.57724384 2462 P43155;H0Y4Z7 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 14.262 14.262 2;3 0.00012073 5919 QUIQUE_C1563_190116_001 120.76 111.42 1016700000 218280000 96009000 130750000 97905000 29910000 240450000 0 17125000 45711000 23196000 60931000 30094000 26364000 2825 2462 2637 26170;26171;26172;26173;26174;26175;26176;26177;26178;26179;26180;26181;26182;26183;26184 33682;33683;33684;33685;33686;33687;33688;33689;33690;33691;33692;33693;33694;33695;33696 33690 13 AMDEIQPDLR Unmodified 1186.5652 0.56522259 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.078 60.078 2 0.0001715 58528 QUIQUE_C1368_190116_001 120.15 101.37 528330000 45681000 47984000 72701000 49378000 52519000 47201000 63706000 40846000 54727000 0 0 53588000 0 2826 4467 2638 26185;26186;26187;26188;26189;26190;26191;26192;26193;26194 33697;33698;33699;33700;33701;33702;33703;33704;33705;33706;33707;33708 33700 11 AMDFNGILTIR Unmodified 1249.6489 0.64889264 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 124.83 124.83 2 0.0064878 127548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.15 67.079 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2827 2834 2639 26195;26196;26197 33709;33710;33711 33710 3 AMDIGGTSDPYVK Unmodified 1352.6282 0.62821678 1532 O43581 SYT7 Synaptotagmin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 63.224 63.224 2 0.010613 62997 QUIQUE_C1218_190116_001 70.977 51.19 68759000 34224000 34535000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2828 1532 2640 26198;26199;26200 33712;33713;33714 33712 2 AMDLDQDVLSALAEVEQLSK Oxidation (M) 2190.0726 0.072579181 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 1 0 1 172.27 172.27 2 1.794E-05 178272 QUIQUE_C1438_190116_001 77.42 65.362 20774000 0 0 0 0 20774000 0 0 0 0 0 0 0 0 2829 1093 2641 26201 33715 33715 633 1 AMDLHAVLAELPR Unmodified 1434.7653 0.76531938 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 126.37 126.37 3 0.002086 131214 QUIQUE_C1368_190116_001 70.438 63.231 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2830 4287 2642 26202;26203 33716;33717 33716 2 AMDLHAVLAELPRPR Unmodified 1687.9192 0.91919426 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.67 113.67 4 8.297E-05 116901 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.769 70.221 153950000 0 12788000 0 0 13627000 0 25864000 24197000 20550000 0 25667000 0 31254000 2831 4287 2643 26204;26205;26206;26207;26208;26209;26210 33718;33719;33720;33721;33722;33723;33724;33725;33726;33727 33723 8 AMDLVQEEFLQR Unmodified 1477.7235 0.72351415 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.53 109.53 2 0.0018476 112272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 50.779 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2832 4210 2644 26211;26212;26213;26214;26215;26216;26217 33728;33729;33730;33731;33732;33733;33734 33731 7 AMDNVTVR Unmodified 904.44365 0.44365089 4372;3092 Q14982;Q9P121;F8VTR5 OPCML;NTM Opioid-binding protein/cell adhesion molecule;Neurotrimin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.167 22.167 2 0.019703 15076 QUIQUE_C1368_190116_001 77.923 33.156 786250000 129320000 132400000 143440000 0 87501000 0 106880000 0 73980000 0 112730000 0 0 2833 3092;4372 2645 26218;26219;26220;26221;26222;26223;26224 33735;33736;33737;33738;33739;33740;33741 33737 7 AMDPQDLQNTEVPIATTAK Unmodified 2041.999 0.99902031 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 91.226 91.226 2 1.7401E-08 93626 QUIQUE_C1218_190116_001 111.74 98.76 24967000 24967000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2834 4148 2646 26225 33742 33742 1 AMDQEITVNPQFVQK Oxidation (M) 1762.856 0.85598488 4514 Q9UNS2;H7C3P9 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 72.926 72.926 2 1.3691E-05 73046 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.55 80.424 93311000 30950000 0 0 0 0 0 0 0 25712000 10916000 0 25733000 0 2835 4514 2647 26226;26227;26228;26229 33743;33744;33745;33746 33744 2987 4 AMDQEITVNPQFVQK Unmodified 1746.8611 0.86107026 4514 Q9UNS2;H7C3P9 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.205 85.205 2 1.4712E-12 86295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.83 116.93 981480000 105170000 118390000 0 104800000 77010000 74088000 78878000 78841000 62681000 25156000 96606000 87537000 72332000 2836 4514 2647 26230;26231;26232;26233;26234;26235;26236;26237;26238;26239;26240;26241 33747;33748;33749;33750;33751;33752;33753;33754;33755;33756;33757;33758 33753 12 AMDSDWFAENYMGR Oxidation (M) 1707.6657 0.66574127 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 107.29 107.29 2 0.00024021 108537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.465 89.765 492180000 0 37559000 105440000 35213000 38756000 0 30523000 39315000 46152000 21662000 95423000 0 42142000 2837 2660 2648 26242;26243;26244;26245;26246;26247;26248;26249;26250;26251;26252;26253;26254 33759;33760;33761;33762;33763;33764;33765;33766;33767;33768;33769;33770;33771;33772;33773 33766 2106;2107 15 AMDSDWFAENYMGR Unmodified 1691.6708 0.67082665 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.54 126.54 2 1.7495E-35 131169 QUIQUE_C1368_190116_001 185.77 183.62 1140800000 87601000 80704000 140860000 102250000 43940000 57200000 85421000 81745000 97142000 18122000 115730000 119000000 111090000 2838 2660 2648 26255;26256;26257;26258;26259;26260;26261;26262;26263;26264;26265;26266;26267 33774;33775;33776;33777;33778;33779;33780;33781;33782;33783;33784;33785;33786 33776 7 AMDSDWFAENYMGR 2 Oxidation (M) 1723.6607 0.6606559 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 2 0 1 91.808 91.808 2 0.0012057 88456 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.862 79.161 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2839 2660 2648 26268 33787 33787 2106;2107 1 AMDTLGIEYGDK Unmodified 1311.6017 0.60166768 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.686 76.686 2 0.00014489 78686 QUIQUE_C1218_190116_001 120.09 110.14 3247500000 676060000 422330000 358420000 379850000 187270000 401400000 254190000 0 114130000 186230000 94284000 77145000 96143000 2840 1963 2649 26269;26270;26271;26272;26273;26274;26275;26276;26277;26278;26279;26280 33788;33789;33790;33791;33792;33793;33794;33795;33796;33797;33798;33799;33800;33801;33802;33803;33804;33805 33790 14 AMDTLGIEYGDK Oxidation (M) 1327.5966 0.5965823 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 0 1 1 1 60.417 60.417 2 0.0041343 56348 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.298 73.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2841 1963 2649 26281;26282;26283 33806;33807;33808 33808 1226 3 AMDTLGIEYGDKER Oxidation (M) 1612.7403 0.74028642 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 45.107 45.107 2;3 1.4811E-35 42765 QUIQUE_C1218_190116_001 178.81 153.96 3870300000 253680000 414190000 460110000 278740000 372610000 248340000 332650000 102730000 306570000 130010000 396590000 195580000 378450000 2842 1963 2650 26284;26285;26286;26287;26288;26289;26290;26291;26292;26293;26294;26295;26296;26297;26298;26299;26300;26301;26302;26303;26304;26305;26306;26307;26308;26309 33809;33810;33811;33812;33813;33814;33815;33816;33817;33818;33819;33820;33821;33822;33823;33824;33825;33826;33827;33828;33829;33830;33831;33832;33833;33834;33835;33836 33810 1226 22 AMDTLGIEYGDKER Unmodified 1596.7454 0.7453718 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 59.48 59.48 2;3 8.5212E-86 58316 QUIQUE_DMIX5_190116_001 217.83 182.28 27785000000 2130400000 2571500000 3073900000 2170900000 1937800000 1249700000 2557200000 1728000000 2318500000 487310000 3055500000 1745600000 2758500000 2843 1963 2650 26310;26311;26312;26313;26314;26315;26316;26317;26318;26319;26320;26321;26322;26323;26324;26325;26326;26327;26328;26329;26330;26331;26332;26333;26334;26335;26336 33837;33838;33839;33840;33841;33842;33843;33844;33845;33846;33847;33848;33849;33850;33851;33852;33853;33854;33855;33856;33857;33858;33859;33860;33861;33862;33863;33864;33865;33866;33867;33868;33869;33870;33871;33872;33873;33874;33875;33876;33877;33878 33868 42 AMDYDLLLR Unmodified 1108.5587 0.55868065 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 107.75 107.75 2 0.015924 111937 QUIQUE_C1368_190116_001 95.909 37.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2844 2665 2651 26337 33879 33879 1 AMEAEAAGLR Unmodified 1017.4913 0.49132937 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 32.64 32.64 2 0.0042528 27616 QUIQUE_C1218_190116_001 81.548 62.033 89949000 38589000 0 0 0 0 0 0 0 0 12812000 38549000 0 0 2845 3459 2652 26338;26339;26340 33880;33881;33882 33880 3 AMEALATAEQACK Unmodified 1392.6377 0.63773561 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 52.364 52.364 2 0.058952 50521 QUIQUE_C1368_190116_001 61.815 45.482 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2846 51 2653 26341 33883 33883 1 AMEAVAAQGK Unmodified 974.48552 0.48551571 2139;2090 P15259;P18669 PGAM2;PGAM1 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 16.319 16.319 2 0.00073468 8322 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.01 59.092 605730000 0 12540000 0 0 0 10401000 0 33505000 0 549280000 0 0 0 2847 2090;2139 2654 26342;26343;26344;26345 33884;33885;33886;33887 33887 4 AMEFVDVTESNAR Unmodified 1467.6664 0.6663932 3622 Q8NB37;E9PLI5;E9PQD8 PDDC1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.027 78.027 2 0.00038335 78575 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.4 79.001 330590000 41508000 0 0 32819000 29316000 0 30605000 40777000 0 23222000 49478000 40851000 42018000 2848 3622 2655 26346;26347;26348;26349;26350;26351;26352;26353;26354 33888;33889;33890;33891;33892;33893;33894;33895;33896 33896 8 AMENGEIDQASEEK Unmodified 1549.6566 0.65661638 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 31.344 31.344 2 0.00030084 25944 QUIQUE_C1277_190116_001 105.2 67.476 26032000 0 26032000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2849 4066 2656 26355;26356 33897;33898 33897 2 AMETYEQQLQEK Unmodified 1496.6817 0.68170891 4718 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 30.316 30.316 2 0.00047565 24608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.15 33.88 1086200000 176520000 125110000 88876000 77665000 0 79906000 103370000 124130000 94547000 0 69638000 68101000 78352000 + 2850 4718 2657 26357;26358;26359;26360;26361;26362;26363;26364;26365;26366;26367;26368;26369;26370;26371 33899;33900;33901;33902;33903;33904;33905;33906;33907;33908;33909;33910;33911;33912;33913 33912 8 AMEVDERPTEQYSDIGGLDK Unmodified 2252.0267 0.026691621 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 78.183 78.183 2;3 9.6767E-57 79966 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.22 166.53 1788900000 163950000 185020000 219640000 149520000 118620000 113870000 135150000 180590000 151340000 61865000 187560000 0 121790000 2851 4672 2658 26372;26373;26374;26375;26376;26377;26378;26379;26380;26381;26382;26383;26384;26385;26386;26387;26388;26389;26390;26391 33914;33915;33916;33917;33918;33919;33920;33921;33922;33923;33924;33925;33926;33927;33928;33929;33930;33931;33932;33933 33932 17 AMEWITAK Unmodified 948.47389 0.47388839 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.057 63.057 2 0.013835 61989 QUIQUE_C1368_190116_001 86.794 68.758 1065400000 203630000 166330000 143420000 157560000 93119000 96154000 0 111820000 93406000 0 0 0 0 2852 2861 2659 26392;26393;26394;26395;26396;26397;26398;26399 33934;33935;33936;33937;33938;33939;33940;33941;33942;33943;33944 33937 11 AMEWITAK Oxidation (M) 964.4688 0.46880301 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 1 0 1 38.371 38.371 2 0.043626 34392 QUIQUE_C1403_190116_001 62.573 41.273 47861000 0 0 0 47861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2853 2861 2659 26400 33945 33945 1 AMFEQMR Acetyl (Protein N-term) 953.40991 0.40990792 4404 Q9UBQ5;K7ES31;K7EQM4;A0A087WVB9;K7ERF1 EIF3K Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K yes no 1 0 0 1 1 1 1 107.14 107.14 2 0.030732 111230 QUIQUE_C1218_190116_001 68.485 53.821 49303000 20225000 14916000 0 14161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2854 4404 2660 26401;26402;26403;26404 33946;33947;33948;33949 33946 4 AMFINYEQVNMGDR Unmodified 1686.7494 0.74941132 4448 Q9UIC8;I3L4A2;I3L2E3;I3L537 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.08 102.08 2 3.7108E-14 105961 QUIQUE_C1576_190116_001 145.46 120.6 514210000 45010000 39197000 49047000 57534000 0 60687000 82191000 0 0 36030000 75815000 0 68700000 2855 4448 2661 26405;26406;26407;26408;26409;26410;26411;26412;26413;26414 33950;33951;33952;33953;33954;33955;33956;33957;33958;33959;33960;33961;33962;33963;33964 33960 14 AMGAAQVVVTDLSATR Unmodified 1588.8243 0.82429083 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 101.01 101.01 2;3 9.409E-10 105146 QUIQUE_C1218_190116_001 135.6 119.35 1974400000 152080000 136910000 193210000 136840000 187140000 28546000 49231000 146830000 200000000 72987000 234520000 182910000 253150000 2856 2848 2662 26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26424;26425;26426;26427;26428;26429;26430;26431;26432;26433;26434;26435;26436;26437;26438 33965;33966;33967;33968;33969;33970;33971;33972;33973;33974;33975;33976;33977;33978;33979;33980;33981;33982;33983;33984;33985;33986;33987;33988;33989;33990;33991;33992;33993 33967 28 AMGAAQVVVTDLSATR Oxidation (M) 1604.8192 0.81920545 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 3 1 84.802 84.802 2;3 8.6384E-14 82681 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.94 122.3 156970000 0 0 33792000 0 0 21765000 0 40467000 0 60950000 0 0 0 2857 2848 2662 26439;26440;26441;26442;26443;26444;26445 33994;33995;33996;33997;33998;33999;34000;34001 34000 2274 8 AMGEQAVALAR Unmodified 1115.5757 0.5757277 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 49.473 49.473 2 0.00043965 45463 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.8 67.409 93223000 0 0 0 0 0 67288000 0 0 0 25935000 0 0 0 2858 1881 2663 26446;26447 34002;34003 34003 1 AMGGGIVDLKECLER Unmodified 1646.812 0.81201158 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 1 1 85.892 85.892 3 0.0072001 86479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.695 42.038 28050000 0 0 0 0 0 0 0 28050000 0 0 0 0 0 2859 2531 2664 26448 34004 34004 1 AMGIGWWVR Unmodified 1074.5433 0.54330536 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.74 116.74 2 0.00041907 120726 QUIQUE_C1277_190116_001 119.89 76.641 40877000 0 15695000 0 0 0 0 0 12616000 0 0 12565000 0 0 2860 3684 2665 26449;26450;26451;26452;26453;26454 34005;34006;34007;34008;34009;34010 34005 6 AMGIMNSFVNDIFER 2 Oxidation (M) 1774.8018 0.80184082 1910;1593 Q8N257;Q16778;P33778;P23527;P06899;U3KQK0;Q99880;Q99879;Q99877;Q93079;Q5QNW6;P62807;P58876;P57053;O60814 HIST3H2BB;HIST2H2BE;HIST1H2BB;HIST1H2BO;HIST1H2BJ;HIST1H2BN;HIST1H2BL;HIST1H2BM;HIST1H2BH;HIST2H2BF;HIST1H2BC;HIST1H2BD;H2BFS;HIST1H2BK Histone H2B type 3-B;Histone H2B type 2-E;Histone H2B type 1-B;Histone H2B type 1-O;Histone H2B type 1-J;Histone H2B;Histone H2B type 1-L;Histone H2B type 1-M;Histone H2B type 1-N;Histone H2B type 1-H;Histone H2B type 2-F;Histone H2B type 1-C/E/F/G/I;Histone H2B type 1-D;Histone H2B type F-S;Histone H2B type 1-K no no 0 2 0 1 2 3 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 125.63 125.63 2 9.2229E-36 131359 QUIQUE_C1218_190116_001 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1-N;Histone H2B type 1-H;Histone H2B type 2-F;Histone H2B type 1-C/E/F/G/I;Histone H2B type 1-D;Histone H2B type F-S;Histone H2B type 1-K no no 0 1 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 142.75 142.75 2;3 2.9926E-94 152537 QUIQUE_DMIX3_190116_001 217.14 192.84 10182000000 1120500000 1116400000 702180000 650440000 938500000 876690000 854020000 632950000 940200000 137590000 848350000 715420000 649300000 2862 1910;1593 2666 26475;26476;26477;26478;26479;26480;26481;26482;26483;26484;26485;26486;26487;26488;26489;26490;26491;26492;26493;26494;26495;26496;26497;26498;26499;26500 34046;34047;34048;34049;34050;34051;34052;34053;34054;34055;34056;34057;34058;34059;34060;34061;34062;34063;34064;34065;34066;34067;34068;34069;34070;34071;34072;34073;34074;34075;34076;34077;34078;34079;34080;34081;34082;34083;34084;34085;34086;34087;34088;34089;34090;34091;34092;34093;34094;34095;34096;34097;34098;34099;34100;34101 34087 870;871 56 AMGIMNSFVNDIFER Unmodified 1742.812 0.81201158 1910;1593 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family member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 39.392 39.392 3 0.00017924 35332 QUIQUE_C1563_190116_001 49.721 44.719 77157000 0 0 0 0 0 49398000 0 0 0 0 0 27759000 0 2870 299 2670 26567;26568;26569;26570 34195;34196;34197;34198 34196 4 AMIAGLALLR Unmodified 1027.6212 0.62122133 3609 Q8N6R0 METTL13 Methyltransferase-like protein 13 yes yes 0 0 0 1 112.22 112.22 2 0.029687 116672 QUIQUE_C1368_190116_001 65.252 46.447 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2871 3609 2671 26571 34199 34199 1 AMIEVINHK Unmodified 1053.5641 0.56410038 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 29.572 29.572 2 0.011332 24696 QUIQUE_C1218_190116_001 72.875 26.859 165560000 54981000 0 54075000 56507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2872 2285 2672 26572;26573;26574 34200;34201;34202 34200 2 AMINLHIQK Unmodified 1066.5957 0.59573486 4338 Q9NZ45 CISD1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 3 2 2 1 2 43.377 43.377 2;3 0.00010067 40007 QUIQUE_C1368_190116_001 143.85 116.73 2251400000 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co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 15.612 15.612 2 0.01906 7935 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.258 73.991 43585000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21112000 0 22472000 2875 3181 2675 26604;26605 34241;34242 34241 2 AMLDQLMGTSR Unmodified 1221.5846 0.58457783 4580 Q9Y383;V9GZ75;F8WEU3 LUC7L2;C7orf55-LUC7L2 Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.626 95.626 2 0.0039565 98149 QUIQUE_C1277_190116_001 72.607 46.165 100680000 0 19987000 0 21790000 0 27773000 0 0 0 0 31130000 0 0 2876 4580 2676 26606;26607;26608;26609 34243;34244;34245;34246 34243 4 AMLESIGVPLEK Unmodified 1285.6952 0.69517413 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.753 97.753 2 0.00053566 100659 QUIQUE_C1368_190116_001 103.22 59.413 933790000 107560000 126390000 114690000 102640000 0 0 60146000 91272000 87079000 0 140160000 103850000 0 2877 2641 2677 26610;26611;26612;26613;26614;26615;26616;26617;26618 34247;34248;34249;34250;34251;34252;34253;34254;34255;34256;34257;34258 34251 10 AMLHLQWPYK Unmodified 1285.6641 0.66414878 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 88.561 88.561 3 0.029104 91962 QUIQUE_C1218_190116_001 40.386 29.461 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2878 1909 2678 26619;26620 34259;34260 34259 2 AMLNNVVRPR Unmodified 1168.6499 0.6498957 936 E9PI87;Q9BUP3 HTATIP2 Oxidoreductase HTATIP2 yes no 0 0 1 1 29.118 29.118 3 0.014582 23781 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.318 32.724 34424000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34424000 2879 936 2679 26621 34261 34261 1 AMLPPNSFQGK Unmodified 1188.5961 0.59612879 3190 Q16698;E5RJG7;E5RFV2;E5RID6 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 55.855 55.855 2 0.012129 53276 QUIQUE_C1563_190116_001 60.717 37.397 42163000 0 0 0 0 0 23918000 0 18245000 0 0 0 0 0 2880 3190 2680 26622;26623;26624 34262;34263;34264 34263 3 AMLQLLQDK Unmodified 1058.5794 0.57941609 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 81.6 81.6 2 0.02689 82464 QUIQUE_C1277_190116_001 69.628 27.231 79439000 0 79439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2881 2168 2681 26625 34265 34265 1 AMLQLLQDKDTYSWLLK Unmodified 2065.0918 0.09179848 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 144.32 144.32 2;3 7.237E-88 151378 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.23 196.57 1503500000 0 35998000 214000000 0 31289000 0 57577000 143380000 99570000 0 789530000 43507000 88617000 2882 2168 2682 26626;26627;26628;26629;26630;26631;26632;26633;26634;26635 34266;34267;34268;34269;34270;34271;34272;34273;34274;34275;34276 34273 10 AMLSANIR Unmodified 874.46947 0.46947171 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 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1072.5488 0.54878467 2455 P42785;E9PIG4;E9PNF7;E9PQB5;E9PL85;E9PQN3;E9PKN6;E9PLY4;E9PNJ1;E9PL49;E9PR42 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.566 45.566 3 0.0024711 43177 QUIQUE_C1277_190116_001 66.568 49.1 391710000 0 45878000 32769000 31638000 32453000 0 47123000 30345000 53806000 0 38245000 41503000 37948000 2886 2455 2685 26651;26652;26653;26654;26655;26656;26657;26658;26659;26660 34292;34293;34294;34295;34296;34297;34298;34299;34300;34301;34302;34303;34304 34293 13 AMLWLSEK Unmodified 976.50519 0.50518852 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.683 83.683 2 0.0057328 86244 QUIQUE_C1218_190116_001 104.37 73.076 517750000 121510000 116490000 0 0 0 59489000 110540000 0 0 0 0 109720000 0 2887 2129 2686 26661;26662;26663;26664;26665 34305;34306;34307;34308;34309;34310 34305 6 AMMVFPR Acetyl (Protein N-term) 892.42992 0.42991509 4116 Q9H0B6;A8MX29;E9PQ02;E9PP09;C9JHT2;E9PM83;E9PI24 KLC2 Kinesin light chain 2 yes no 1 0 0 1 1 1 126.49 126.49 2 0.039458 130123 QUIQUE_C1403_190116_001 66.994 38.465 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2888 4116 2687 26666;26667;26668 34311;34312;34313 34312 3 AMNLHVGNLR Unmodified 1123.592 0.59204647 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 40.072 40.072 3 0.015191 35913 QUIQUE_C1368_190116_001 47.187 34.231 156080000 0 0 56947000 0 0 34001000 0 0 38106000 0 0 27028000 0 2889 4161 2688 26669;26670;26671;26672 34314;34315;34316;34317 34314 4 AMNWMSGK Unmodified 923.39934 0.39934324 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 46.727 46.727 2 0.03109 43626 QUIQUE_C1576_190116_001 104.37 61.319 180420000 0 0 0 0 0 0 95958000 84464000 0 0 0 0 0 2890 452 2689 26673;26674 34318;34319 34318 1 AMQHAEVYYK Unmodified 1238.5754 0.57539335 4045 Q9BVG4;A6NDF3 PBDC1 Protein PBDC1 yes no 0 0 0 1 1 20.372 20.372 2 0.012302 13629 QUIQUE_C1218_190116_001 66.056 41.237 52849000 22972000 0 0 29877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2891 4045 2690 26675;26676 34320;34321 34320 2 AMSDDTVTAVCCTLHEVITK Unmodified 2250.033 0.033039327 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.26 129.26 3 1.1658E-06 133665 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.565 80.378 525160000 0 71300000 112640000 66868000 55693000 103660000 68472000 0 0 0 0 0 46530000 2892 855;928 2691 26677;26678;26679;26680;26681;26682;26683 34322;34323;34324;34325;34326;34327;34328;34329;34330 34330 9 AMSDDTVTAVCCTLHEVITK Oxidation (M) 2266.028 0.027953949 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 1 0 1 117.62 117.62 3 0.0012857 114390 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.883 46.356 13879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13879000 0 0 0 2893 855;928 2691 26684 34331 34331 508 1 AMSDLELR Unmodified 933.45897 0.45896661 1810 P01185 AVP Vasopressin-neurophysin 2-copeptin;Arg-vasopressin;Neurophysin 2;Copeptin yes yes 0 0 0 1 52.857 52.857 2 0.05185 51058 QUIQUE_C1218_190116_001 72.485 35.464 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2894 1810 2692 26685 34332 34332 1 AMSFEWPWQYR Acetyl (Protein N-term) 1541.6762 0.67617003 4002 Q9BRG1;K7EP45 VPS25 Vacuolar protein-sorting-associated protein 25 yes no 1 0 0 1 1 1 1 170.55 170.55 2 0.0007667 175417 QUIQUE_C1368_190116_001 101.54 90.712 32157000 0 7555300 4890000 0 0 0 0 0 0 0 12440000 0 7271000 2895 4002 2693 26686;26687;26688;26689 34333;34334;34335;34336 34334 4 AMSLLQDWCR Acetyl (Protein N-term) 1320.5955 0.59547686 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 162.21 162.21 2 0.00085012 164197 QUIQUE_C1563_190116_001 105.78 45.985 78025000 10019000 0 0 0 15919000 13530000 16855000 0 0 0 0 9973300 11729000 2896 4491 2694 26690;26691;26692;26693;26694;26695;26696 34337;34338;34339;34340;34341;34342;34343 34339 7 AMSQDGASQFQEVIR Unmodified 1665.7781 0.77806891 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7;C9J6Q0 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.819 77.819 2 2.2664E-94 78441 QUIQUE_C1277_190116_001 217.83 191.15 478610000 51816000 44084000 45043000 0 57105000 0 40350000 66234000 0 36237000 81744000 0 56001000 2897 3202 2695 26697;26698;26699;26700;26701;26702;26703;26704;26705 34344;34345;34346;34347;34348;34349;34350;34351;34352;34353;34354 34346 11 AMSRPILYSNWLSK Oxidation (M) 1680.8658 0.86576171 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 1 1 82.936 82.936 3 0.006565 83476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.165 56.361 72564000 0 0 0 0 0 0 0 72564000 0 0 0 0 0 2898 3053 2696 26706 34355 34355 2494 1 AMSTTSISSPQPGK Unmodified 1390.6762 0.67622961 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.263 32.263 2 0.0004449 26588 QUIQUE_C1368_190116_001 101.95 88.185 363090000 75002000 60521000 62814000 104180000 0 0 0 60573000 0 0 0 0 0 2899 605;4460 2697 26707;26708;26709;26710;26711;26712 34356;34357;34358;34359;34360;34361 34358 6 AMSTTSISSPQPGK Oxidation (M) 1406.6711 0.67114423 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 1 0 1 1 20.802 20.802 2 0.0014154 13783 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.64 62.974 34130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34130000 2900 605;4460 2697 26713;26714 34362;34363 34363 395 2 AMSVEQLTDVLMNEILHGADGTSIK Unmodified 2671.3197 0.31970252 3812 Q96BW5 PTER Phosphotriesterase-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 170.7 170.7 3 3.8172E-57 172272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.05 139.54 998430000 34951000 0 0 0 41187000 0 106540000 350050000 126030000 0 142560000 0 197110000 2901 3812 2698 26715;26716;26717;26718;26719;26720;26721 34364;34365;34366;34367;34368;34369;34370 34367 7 AMSVEQLTDVLMNEILHGADGTSIK Oxidation (M) 2687.3146 0.31461714 3812 Q96BW5 PTER Phosphotriesterase-related protein yes yes 0 1 0 1 1 1 167.26 167.26 3 4.0637E-09 171104 QUIQUE_C1277_190116_001 69.981 62.787 192610000 0 67062000 31225000 0 0 0 0 0 94328000 0 0 0 0 2902 3812 2698 26722;26723;26724 34371;34372;34373 34371 2743 2 AMTEPSALIEK Oxidation (M) 1204.6009 0.6009394 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 40.247 40.247 2 0.0030206 36813 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.662 55.515 245830000 0 0 0 0 0 0 0 97624000 0 0 70455000 0 77751000 2903 2009 2699 26725;26726;26727 34374;34375;34376 34375 1289 3 AMTFHGHGFLR Unmodified 1272.6186 0.61859557 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 37.622 37.622 3 0.01068 33673 QUIQUE_C1277_190116_001 38.783 23.153 44191000 0 23627000 20564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2904 1492 2700 26728;26729 34377;34378 34377 2 AMTGVEQWPYR Unmodified 1336.6234 0.62340617 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.86 78.86 2 0.00040997 80035 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.05 88.279 1096900000 81114000 0 294780000 0 0 121940000 132940000 58697000 68858000 22331000 136820000 88377000 91021000 2905 2527 2701 26730;26731;26732;26733;26734;26735;26736;26737;26738;26739;26740;26741;26742;26743;26744 34379;34380;34381;34382;34383;34384;34385;34386;34387;34388;34389;34390;34391;34392;34393;34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;34401;34402 34396 23 AMTGVEQWPYR Oxidation (M) 1352.6183 0.6183208 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 62.682 62.682 2 0.00027361 62800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.85 98.529 64805000 0 0 0 0 0 0 0 0 27922000 0 36883000 0 0 2906 2527 2701 26745;26746;26747;26748;26749;26750 34403;34404;34405;34406;34407;34408 34405 1959 6 AMTHVINQGMAMYWGTSR Unmodified 2052.9332 0.93320612 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 no no 0 0 0 1 1 1 96.271 96.271 3 0.0019447 98714 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.348 41.427 77558000 15922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32726000 0 28910000 2907 2985 2702 26751;26752;26753 34409;34410;34411 34411 2 AMTLLEDWCR Acetyl (Protein N-term) 1335.5951 0.59514251 3636 Q8ND90 PNMA1 Paraneoplastic antigen Ma1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.84 167.84 2 0.00018193 174991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.65 134.5 116580000 18816000 14100000 0 11767000 10873000 10796000 10570000 0 0 2888900 18152000 0 18618000 2908 3636 2703 26754;26755;26756;26757;26758;26759;26760;26761;26762;26763 34412;34413;34414;34415;34416;34417;34418;34419;34420;34421;34422 34421 11 AMTLMEYLIK Unmodified 1211.6294 0.62940275 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 134.99 134.99 2 0.017191 139744 QUIQUE_C1277_190116_001 84.476 75.262 1144300000 112180000 111680000 98574000 86211000 0 73482000 98547000 104280000 81441000 0 128920000 116810000 132140000 2909 4654 2704 26764;26765;26766;26767;26768;26769;26770;26771;26772;26773;26774;26775 34423;34424;34425;34426;34427;34428;34429;34430;34431;34432;34433;34434;34435 34424 12 AMTLQEAEAFVGAER Oxidation (M) 1637.7719 0.7719209 1473 O15031;H0Y6J7 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 1 0 1 100 100 2 2.3262E-05 103547 QUIQUE_C1368_190116_001 96.103 79.849 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2910 1473 2705 26776 34436 34436 818 1 AMTLQEAEAFVGAER Unmodified 1621.777 0.77700628 1473 O15031;H0Y6J7 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 0 1 1 123.93 123.93 3 0.0040469 128869 QUIQUE_C1368_190116_001 58.461 39.067 23751000 0 0 0 0 23751000 0 0 0 0 0 0 0 0 2911 1473 2705 26777;26778 34437;34438 34437 2 AMTPEQEETASLLSSVTQGMESAYVSPSGYR Unmodified 3305.5068 0.5067876 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 165.51 165.51 3 4.8794E-06 168556 QUIQUE_C1403_190116_001 50.492 44.698 27727000 0 0 0 27727000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2912 3125 2706 26779 34439 34439 1 AMTTGAIAAMLSTILYSR Oxidation (M) 1885.9642 0.96415513 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 1 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.9 166.9 2;3 2.072E-38 171923 QUIQUE_C1218_190116_001 163.27 141.04 1692900000 102500000 45289000 58111000 75021000 72080000 110190000 145170000 137490000 167080000 91325000 288500000 232110000 168050000 2913 2169 2707 26780;26781;26782;26783;26784;26785;26786;26787;26788;26789;26790;26791;26792;26793;26794;26795;26796;26797;26798;26799;26800;26801;26802;26803;26804 34440;34441;34442;34443;34444;34445;34446;34447;34448;34449;34450;34451;34452;34453;34454;34455;34456;34457;34458;34459;34460;34461;34462;34463;34464;34465;34466;34467;34468;34469;34470 34441 1518 31 AMTTGAIAAMLSTILYSR Unmodified 1869.9692 0.9692405 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 170.48 170.48 2;3 1.2279E-63 174765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 234.82 203.93 2207400000 110980000 176900000 115860000 132090000 140340000 27275000 133820000 309320000 157910000 11456000 355630000 362360000 173420000 2914 2169 2707 26805;26806;26807;26808;26809;26810;26811;26812;26813;26814;26815;26816;26817;26818;26819;26820;26821;26822;26823;26824;26825;26826;26827;26828 34471;34472;34473;34474;34475;34476;34477;34478;34479;34480;34481;34482;34483;34484;34485;34486;34487;34488;34489;34490;34491;34492;34493;34494;34495 34488 24 AMVALIDVFHQYSGR Oxidation (M) 1721.8559 0.85592531 1860 P04271;A8MRB1 S100B Protein S100-B yes no 0 1 0 3 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 113.77 113.77 2;3 1.84E-12 117208 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.37 116.68 8256300000 287180000 617800000 359880000 56593000 392260000 251750000 389050000 792070000 1494600000 357390000 1143700000 791190000 1322800000 2915 1860 2708 26829;26830;26831;26832;26833;26834;26835;26836;26837;26838;26839;26840;26841;26842;26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;26850;26851;26852;26853 34496;34497;34498;34499;34500;34501;34502;34503;34504;34505;34506;34507;34508;34509;34510;34511;34512;34513;34514;34515;34516;34517;34518;34519;34520;34521;34522;34523;34524;34525;34526;34527;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34538;34539;34540 34524 1074 45 AMVALIDVFHQYSGR Unmodified 1705.861 0.86101068 1860 P04271;A8MRB1 S100B Protein S100-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 129.77 129.77 2;3 1.4561E-09 133977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.71 115.16 27682000000 439640000 842690000 698140000 0 507120000 426340000 853500000 2980000000 4950300000 801790000 5672400000 2963500000 6546200000 2916 1860 2708 26854;26855;26856;26857;26858;26859;26860;26861;26862;26863;26864;26865;26866;26867;26868;26869 34541;34542;34543;34544;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;34554;34555;34556;34557;34558;34559;34560;34561;34562;34563;34564;34565;34566;34567;34568;34569;34570;34571;34572;34573;34574 34560 34 AMVASGSELGK Unmodified 1048.5223 0.52229515 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;G3V213 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.613 26.613 2 0.0039565 20323 QUIQUE_C1368_190116_001 72.607 38.81 456310000 0 80132000 119510000 109620000 40384000 0 57064000 0 0 14984000 0 0 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P35580;E7ERA5 MYH10 Myosin-10 yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 16.155 16.155 2;3 0.0036189 8277 QUIQUE_C1576_190116_001 77.533 52.06 191000000 0 0 56864000 17588000 0 0 56178000 22572000 0 0 37800000 0 0 2920 2379 2712 26888;26889;26890;26891;26892;26893;26894;26895 34593;34594;34595;34596;34597;34598;34599;34600 34596 7 AMVSEFLK Acetyl (Protein N-term) 965.4892 0.4892041 1853 P04083;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 143.36 143.36 1;2 0.011401 147613 QUIQUE_C1403_190116_001 136.16 76.95 832920000 34331000 0 114230000 141580000 0 126460000 44188000 0 115520000 0 0 39924000 216680000 2921 1853 2713 26896;26897;26898;26899;26900;26901;26902;26903 34601;34602;34603;34604;34605;34606;34607;34608;34609 34603 8 AMVSEFLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 981.48412 0.48411873 1853 P04083;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 110.24 110.24 2 0.0036512 114000 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.626 48.503 95229000 0 0 10961000 0 13056000 14371000 0 0 30689000 0 0 0 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34620;34621;34622;34623;34624 34621 0 AMYPDYFAK Unmodified 1104.495 0.49501776 4658 Q9Y6M9;E9PH64;A0A3B3IT57;E7EWZ0;E9PF49 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.87 78.87 2 0.019489 79765 QUIQUE_C1368_190116_001 63.565 54.62 440350000 0 0 100880000 71470000 41134000 73322000 0 55427000 0 0 98112000 0 0 2926 4658 2717 26917;26918;26919;26920;26921;26922 34625;34626;34627;34628;34629;34630;34631 34626 7 AMYQYRPQNEDELELR Unmodified 2053.9527 0.95273882 1580 O60504;H0YAZ3 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 74.19 74.19 3 0.0048462 74368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.004 44.216 102520000 0 31180000 0 0 0 32808000 0 38534000 0 0 0 0 0 2927 1580 2718 26923;26924;26925;26926 34632;34633;34634;34635 34635 4 ANAAAYLQHLCFENEGVK Unmodified 2033.9629 0.96290957 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 96.1 96.1 3 5.1037E-05 97324 QUIQUE_C1563_190116_001 87.16 70.494 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26946;26947;26948;26949;26950;26951;26952;26953;26954;26955 34655;34656;34657;34658;34659;34660;34661;34662;34663;34664 34662 10 ANALLIR Unmodified 769.48102 0.48102268 2294 P29992 GNA11 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 yes yes 0 0 0 1 1 37.138 37.138 2 0.022056 33872 QUIQUE_C1218_190116_001 102.98 56.629 206950000 94346000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112610000 0 0 2931 2294 2722 26956;26957 34665;34666 34665 2 ANAQAAALYK Unmodified 1019.54 0.53999412 2421 P40121;E7ENU9;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.519 23.519 2 0.0053752 16384 QUIQUE_C1403_190116_001 109.86 76.424 724220000 0 0 0 0 0 0 0 450110000 0 274110000 0 0 0 2932 2421 2723 26958;26959;26960;26961;26962;26963;26964;26965;26966 34667;34668;34669;34670;34671;34672;34673;34674;34675 34669 9 ANATEFGLASGVFTR Unmodified 1539.7682 0.76815616 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 108.37 108.37 2;3 8.7593E-13 112057 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63.111 1263400000 0 207800000 0 163640000 0 206940000 298370000 44808000 325380000 16420000 0 0 0 2935 3169 2726 26987;26988;26989;26990;26991;26992;26993 34697;34698;34699;34700;34701;34702;34703 34697 6 ANCPYIVQFGSTDDPFLPWK Unmodified 2354.1042 0.10415408 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.81 156.81 2;3 1.1554E-17 163864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.18 135.74 622800000 23623000 74554000 58955000 30941000 40269000 24465000 0 55073000 86250000 0 91818000 62418000 74434000 2936 1663 2727 26994;26995;26996;26997;26998;26999;27000;27001;27002;27003;27004;27005 34704;34705;34706;34707;34708;34709;34710;34711;34712;34713;34714;34715 34713 11 ANCSDNEFTQALTAAIPPESLTR Unmodified 2505.1806 0.1805665 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 1 1 3 2 2 140.15 140.15 2;3 6.0552E-102 144767 QUIQUE_C1277_190116_001 195.89 191.34 1549900000 135950000 145660000 149220000 130340000 121010000 114330000 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RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.234 46.234 2 0.00059909 43275 QUIQUE_C1277_190116_001 91.937 74.706 527650000 86410000 80097000 0 63795000 61644000 58426000 0 72856000 57837000 0 0 0 46581000 2939 4213 2730 27043;27044;27045;27046;27047;27048;27049;27050 34768;34769;34770;34771;34772;34773;34774;34775;34776 34769 9 ANDDLLSEFPDK Unmodified 1362.6303 0.63032527 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 96.492 96.492 2 0.00051818 97744 QUIQUE_C1563_190116_001 117.14 87.966 371840000 0 97755000 0 67374000 0 64411000 99944000 0 0 0 42354000 0 0 2940 487 2731 27051;27052;27053;27054;27055 34777;34778;34779;34780;34781 34779 4 ANDGEGGDEEAGTEEAVPR Unmodified 1901.7875 0.78750721 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.261 38.261 2 3.9006E-115 34262 QUIQUE_DMIX1_190116_001 263.83 240.91 765290000 49751000 54090000 52230000 68875000 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ANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPR Unmodified 3449.6211 0.62112135 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 2 4 2 1 3 3 3 1 3 3 2 126.82 126.82 3;4;5 1.6322E-87 131178 QUIQUE_C1368_190116_001 159.75 149.87 5584000000 159310000 608720000 381610000 539410000 281100000 189000000 854910000 330380000 263860000 76958000 820100000 631980000 446610000 2951 2302 2742 27170;27171;27172;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;27180;27181;27182;27183;27184;27185;27186;27187;27188;27189;27190;27191;27192;27193;27194;27195;27196;27197;27198;27199;27200;27201 34959;34960;34961;34962;34963;34964;34965;34966;34967;34968;34969;34970;34971;34972;34973;34974;34975;34976;34977;34978;34979;34980;34981;34982;34983;34984;34985;34986;34987;34988;34989;34990;34991;34992;34993;34994;34995;34996;34997;34998;34999;35000;35001;35002;35003;35004;35005;35006;35007;35008;35009;35010;35011;35012;35013;35014 34970 51 ANEGTVGVSAATER Unmodified 1360.6583 0.65827136 1882 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protein yes yes 0 0 0 1 1 48.876 48.876 2 0.00086693 46718 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.277 49.497 70031000 0 0 24724000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45307000 2963 3812 2754 27257;27258 35073;35074 35074 2 ANGMELDGR Unmodified 961.42873 0.42872911 2775;3014 Q13595;P62995;H7BXF3 TRA2A;TRA2B Transformer-2 protein homolog alpha;Transformer-2 protein homolog beta no no 0 0 0 1 24.96 24.96 2 0.053702 18371 QUIQUE_C1403_190116_001 49.715 28.415 50233000 0 0 0 50233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2964 3014;2775 2755 27259 35075 35075 1 ANHEEVLAAGK Unmodified 1137.5778 0.57783619 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 0 0 2 13.794 13.794 2;3 0.0012381 5811 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.942 60.941 69474000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69474000 0 0 0 2965 1786 2756 27260;27261 35076;35077 35077 2 ANHFFTVTDPR Unmodified 1303.6309 0.63093439 4195 Q9H9B4;D6RFI0;S4R2X2;D6RDG7;D6RAE9 SFXN1 Sideroflexin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 51.477 51.477 2;3 0.00047493 49633 QUIQUE_C1576_190116_001 115.82 86.738 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812.45045 0.45045083 2711 P61086;D6RDM7;D6RFX1 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 1 0 0 1 2 1 1 44.307 44.307 2 0.022113 40786 QUIQUE_C1403_190116_001 89.903 65.931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2973 2711 2764 27286;27287;27288;27289;27290 35106;35107;35108;35109;35110 35109 5 ANIGDAQAMGQRPITFLR Unmodified 1958.0156 0.015613845 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.078 89.078 3 3.2804E-05 92020 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.979 54.095 479620000 0 19485000 0 28224000 34807000 0 29414000 88233000 72473000 0 86148000 62635000 58203000 2974 2226 2765 27291;27292;27293;27294;27295;27296;27297;27298;27299 35111;35112;35113;35114;35115;35116;35117;35118;35119 35117 9 ANILYAWAR Unmodified 1076.5767 0.57671398 2140 P19021 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.018 97.018 2 0.028377 98726 QUIQUE_C1403_190116_001 57.177 28.028 91339000 0 27144000 0 19533000 0 0 33143000 0 0 11519000 0 0 0 2975 2140 2766 27300;27301;27302;27303 35120;35121;35122;35123;35124;35125 35122 6 ANINVENAFFTLAR Unmodified 1578.8154 0.8154407 2704 P61006 RAB8A Ras-related protein Rab-8A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.36 135.36 2 2.9485E-10 139594 QUIQUE_C1403_190116_001 132.32 116.43 920080000 0 68273000 99966000 99767000 71183000 0 96166000 89293000 0 47543000 155080000 87718000 105100000 2976 2704 2767 27304;27305;27306;27307;27308;27309;27310;27311;27312;27313 35126;35127;35128;35129;35130;35131;35132;35133;35134;35135;35136;35137 35128 11 ANIPIMDTGENPEVPFPR Unmodified 1995.9724 0.97241163 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7EN36;K7ELZ6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 121.86 121.86 2;3 2.2466E-89 127401 QUIQUE_C1218_190116_001 208.27 179.51 1097600000 80230000 97737000 95375000 85910000 73855000 77200000 67362000 59022000 92628000 25536000 116510000 70377000 155890000 2977 3780 2768 27314;27315;27316;27317;27318;27319;27320;27321;27322;27323;27324;27325;27326;27327;27328 35138;35139;35140;35141;35142;35143;35144;35145;35146;35147;35148;35149;35150;35151;35152;35153;35154 35139 16 ANIPIMDTGENPEVPFPR Oxidation (M) 2011.9673 0.96732625 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7EN36;K7ELZ6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 1 0 1 102.29 102.29 2 7.0817E-07 104075 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.76 91.201 35526000 0 0 0 0 0 0 0 35526000 0 0 0 0 0 2978 3780 2768 27329 35155 35155 2730 1 ANIQAVSLK Unmodified 942.54983 0.54983053 1537 O43633;M0R1L7;M0R1T5 CHMP2A Charged multivesicular body protein 2a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.24 36.24 2 0.0071923 31992 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.279 15.286 1253000000 119010000 99505000 83296000 132090000 0 94585000 96262000 97476000 124650000 47644000 129000000 110570000 118870000 2979 1537 2769 27330;27331;27332;27333;27334;27335;27336;27337;27338;27339;27340;27341 35156;35157;35158;35159;35160;35161;35162;35163;35164;35165;35166;35167 35166 10 ANITAIR Unmodified 757.44464 0.44463717 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.307 22.307 2 0.012374 15705 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.83 69.798 1607300000 0 228580000 52860000 129930000 46618000 187040000 42933000 258270000 163410000 230370000 0 217590000 49706000 2980 2527 2770 27342;27343;27344;27345;27346;27347;27348;27349;27350;27351;27352 35168;35169;35170;35171;35172;35173;35174;35175;35176;35177;35178;35179;35180;35181;35182 35178 14 ANIVAYHDSIMNPDYNVEFFR Unmodified 2514.1638 0.16379422 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.84 126.84 3 1.6343E-10 129761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.847 75.692 565650000 79098000 73804000 47347000 57835000 57108000 40103000 0 49263000 44366000 0 66902000 0 49822000 2981 4408 2771 27353;27354;27355;27356;27357;27358;27359;27360;27361;27362 35183;35184;35185;35186;35187;35188;35189;35190;35191;35192;35193 35189 10 ANIVAYHDSIMNPDYNVEFFR Oxidation (M) 2530.1587 0.15870885 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 1 0 1 114.3 114.3 3 1.5884E-05 111045 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.592 64.869 20466000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20466000 0 0 0 2982 4408 2771 27363 35194 35194 2936 1 ANIVHLMLSSPEQIQK Unmodified 1806.9662 0.96620404 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 92.334 92.334 2;3 0.00032399 95259 QUIQUE_C1438_190116_001 43.904 36.312 82641000 17520000 0 0 0 65120000 0 0 0 0 0 0 0 0 2983 2657 2772 27364;27365 35195;35196;35197 35196 2 ANIWLVR Unmodified 870.50757 0.50757178 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 75.082 75.082 2 0.024075 76496 QUIQUE_C1218_190116_001 98.807 58.359 65759000 31763000 33996000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2984 3351 2773 27366;27367 35198;35199 35198 2 ANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER Unmodified 3619.837 0.83697059 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 138.76 138.76 3;4 5.224E-45 145337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.98 101.41 1587200000 0 0 0 139740000 200460000 22348000 178670000 190510000 163540000 0 230410000 159550000 302020000 2985 2355 2774 27368;27369;27370;27371;27372;27373;27374;27375;27376;27377;27378;27379;27380;27381;27382;27383;27384 35200;35201;35202;35203;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211;35212;35213;35214;35215;35216;35217;35218;35219 35212 17 ANLEIMTK Unmodified 918.48445 0.48445308 288 A0A0G2JMH6;P01903;Q30118;A0A0G2JH46 HLA-DRA HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain yes no 0 0 0 1 1 40.077 40.077 2 0.027186 36578 QUIQUE_C1277_190116_001 69.905 42.65 133070000 0 56173000 0 0 0 0 0 0 0 0 76899000 0 0 2986 288 2775 27385;27386 35220;35221 35220 2 ANLENPIR Unmodified 925.49813 0.49812931 1399 O00330;H0YD97 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.452 33.452 2 0.020103 28020 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.282 43.844 510600000 99815000 0 0 100470000 0 0 0 76632000 120700000 0 0 0 112990000 2987 1399 2776 27387;27388;27389;27390;27391 35222;35223;35224;35225;35226;35227 35226 6 ANLINNIFELAGLGK Unmodified 1585.8828 0.88279198 4451 Q9UIQ6 LNPEP Leucyl-cystinyl aminopeptidase;Leucyl-cystinyl aminopeptidase, pregnancy serum form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 166.48 166.48 2 1.267E-06 172829 QUIQUE_C1438_190116_001 116.87 93.269 215530000 0 34789000 0 0 34015000 0 0 18253000 20887000 0 34948000 50376000 22265000 2988 4451 2777 27392;27393;27394;27395;27396;27397;27398 35228;35229;35230;35231;35232;35233;35234 35229 7 ANLIVLGAVPR Unmodified 1121.6921 0.69207809 1102 G5E9V7;G5E9V6;Q8IUR7;B7Z637;C9J8P8;C9JAA7;C9JBY2 ARMC8 Armadillo repeat-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 90.976 90.976 2 0.017395 95497 QUIQUE_C1218_190116_001 76.064 53.484 14827000 0 0 14827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2989 1102 2778 27399;27400 35235;35236 35235 2 ANLLEIAPHLSAPLPIMLPVYK Oxidation (M) 2415.36 0.35997484 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.42 151.42 3 3.1838E-08 156106 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.776 77.412 1330700000 66996000 118130000 152330000 108350000 86315000 113910000 0 91574000 133840000 89750000 241680000 127820000 0 2990 2463 2779 27401;27402;27403;27404;27405;27406;27407;27408;27409;27410;27411 35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;35247;35248 35244 1892 12 ANLLEIAPHLSAPLPIMLPVYK Unmodified 2399.3651 0.36506021 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 156.96 156.96 2;3 1.9071E-45 161325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.8 146.36 4728600000 210580000 494610000 572320000 413280000 235300000 529730000 317220000 196160000 318030000 98777000 441980000 455820000 444820000 2991 2463 2779 27412;27413;27414;27415;27416;27417;27418;27419;27420;27421;27422;27423;27424;27425;27426;27427;27428;27429;27430;27431;27432 35249;35250;35251;35252;35253;35254;35255;35256;35257;35258;35259;35260;35261;35262;35263;35264;35265;35266;35267;35268;35269;35270;35271;35272 35270 24 ANLLNNEAHAITMQVTK Unmodified 1866.9622 0.96218129 2477 P46063 RECQL ATP-dependent DNA helicase Q1 yes yes 0 0 0 1 86.34 86.34 3 0.05039 82888 QUIQUE_DMIX4_190116_001 27.838 16.577 16819000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16819000 0 0 0 2992 2477 2780 27433 35273 35273 1 ANLNALDR Unmodified 885.46683 0.46682918 526;3401;1984 A5A3E0;A0A0G2JRD4;Q495V5;A0A0D9SFE8;A0A0G2JQ08;A0A087WXQ7;A6NC16;D7UEQ8;A0A0G2JQB7;A0A0C4DH93;A0A087X187;A0A087X092;A0A087X067;A0A087WTB9;A0A0A6YYL3;A0A0G2JMU2;Q6S8J7;Q6S5H5;A6NI47;B2RU33;H3BUK9;Q6S545;A0JP26;P0CG39;Q6S8J3 POTEF;POTEB;POTEI;POTEC;POTEB3;POTEG;POTEE;POTEH;POTEA;POTEM;POTEB2;POTEJ POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member A;POTE ankyrin domain family member G;Putative POTE ankyrin domain family member M;POTE ankyrin domain family member C;POTE ankyrin domain family member B2;POTE ankyrin domain family member H;POTE ankyrin domain family member B3;POTE ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 25.752 25.752 2 0.009742 19664 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.187 52.084 4691100000 900750000 0 764060000 0 916520000 682940000 0 0 494850000 374960000 0 557030000 0 2993 526;1984;3401 2781 27434;27435;27436;27437;27438;27439;27440 35274;35275;35276;35277;35278;35279;35280 35279 7 ANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIK Unmodified 3091.5504 0.55044751 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 172.36 172.36 3 3.4285E-54 176205 QUIQUE_DMIX7_190116_001 136.16 127.54 269300000 0 0 0 0 0 0 0 0 49872000 0 121180000 98246000 0 2994 445 2782 27441;27442;27443 35281;35282;35283 35283 3 ANLPQSFQVDTSK Unmodified 1433.7151 0.71505795 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.016 65.016 2 3.0551E-24 64016 QUIQUE_C1368_190116_001 176.48 148.28 1576100000 90386000 129970000 158930000 165050000 196890000 120890000 137150000 178230000 0 87818000 154800000 155980000 0 2995 2178 2783 27444;27445;27446;27447;27448;27449;27450;27451;27452;27453;27454 35284;35285;35286;35287;35288;35289;35290;35291;35292;35293;35294;35295 35287 12 ANLQAALQVLELHHSK Unmodified 1770.9741 0.97406661 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 87.125 87.125 3 0.016898 90541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.053 36.948 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2996 3888 2784 27455 35296 35296 1 ANLQIDQINTDLNLER Unmodified 1868.9592 0.9592044 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.72 113.72 2 1.8046E-81 116211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 259.23 242.29 1983900000 177790000 142180000 189200000 203780000 221820000 134400000 153390000 150710000 181270000 81207000 192380000 0 155790000 2997 2378 2785 27456;27457;27458;27459;27460;27461;27462;27463;27464;27465;27466;27467 35297;35298;35299;35300;35301;35302;35303;35304;35305;35306;35307;35308;35309 35304 13 ANLSLLR Unmodified 785.47594 0.4759373 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.356 48.356 2 0.011709 46303 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.48 19.258 2453600000 202430000 238170000 215610000 183030000 200710000 178460000 173490000 175950000 211820000 0 247610000 227390000 198940000 2998 2208 2786 27468;27469;27470;27471;27472;27473;27474;27475;27476;27477;27478;27479 35310;35311;35312;35313;35314;35315;35316;35317;35318;35319;35320;35321;35322;35323;35324;35325 35318 15 ANMQGLVER Acetyl (Protein N-term) 1058.5179 0.51787847 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385;F8WDB9;F8WEW0 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 83.161 83.161 2 0.0022361 79943 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.819 62.217 191600000 47613000 0 0 0 0 0 35068000 21541000 0 15015000 0 28634000 43732000 2999 2422 2787 27480;27481;27482;27483;27484;27485 35326;35327;35328;35329;35330;35331 35329 6 ANNIDYTVHSVR Unmodified 1387.6844 0.68442653 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 32.331 32.331 2;3 0.002452 27324 QUIQUE_C1218_190116_001 74.944 48.901 299250000 90765000 84790000 0 17422000 33349000 0 27425000 22110000 0 0 0 23385000 0 3000 2285 2788 27486;27487;27488;27489;27490;27491;27492;27493;27494;27495 35332;35333;35334;35335;35336;35337;35338;35339;35340;35341;35342 35333 11 ANNSTYGLAAAVFTK Unmodified 1526.7729 0.77290718 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.924 97.924 2 2.4288E-06 100800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.51 104.86 10462000000 0 1195700000 1638400000 0 1073500000 0 0 1193500000 1024100000 0 1503900000 1275400000 1557600000 3001 1875 2789 27496;27497;27498;27499;27500;27501;27502;27503 35343;35344;35345;35346;35347;35348;35349;35350;35351 35348 9 ANNTFYGLSAGVFTK Unmodified 1588.7886 0.78855725 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 114.42 114.42 2 1.4896E-05 119305 QUIQUE_C1218_190116_001 113.24 98.56 2921100000 423650000 0 0 663840000 0 560320000 501100000 0 0 0 772180000 0 0 3002 1776 2790 27504;27505;27506;27507;27508 35352;35353;35354;35355;35356 35352 3 ANNYNEAVYLVR Unmodified 1424.7048 0.70482762 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.859 73.859 2 0.00076734 73869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.496 39.515 131230000 0 0 0 0 0 0 0 40071000 0 0 0 0 91158000 3003 2934 2791 27509;27510;27511;27512;27513;27514 35357;35358;35359;35360;35361;35362 35362 6 ANPDLPILIR Unmodified 1120.6604 0.66044361 1542 O43678 NDUFA2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 95.352 95.352 2 0.00325 97966 QUIQUE_C1277_190116_001 85.38 68.869 452660000 81417000 102020000 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1090.5924 0.59236404 3347 Q66K14;E5RIN2 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 1 1 100.15 100.15 2 0.019983 104554 QUIQUE_C1438_190116_001 63.21 39.007 72329000 0 0 0 0 33913000 0 38416000 0 0 0 0 0 0 3007 3347 2795 27538;27539;27540 35390;35391;35392 35390 3 ANPGAWILR Unmodified 996.5505 0.55049923 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 no no 0 0 0 1 77.522 77.522 2 0.065724 78863 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.813 28.082 24538000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24538000 3008 4334 2796 27541 35393 35393 1 ANPQVGVAFPHIK Unmodified 1376.7565 0.75646926 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 3 1 63.108 63.108 2;3 0.0006437 62499 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.03 54.399 1014500000 63536000 169830000 113070000 77400000 0 0 54039000 163360000 0 0 324450000 0 48793000 3009 2051 2797 27542;27543;27544;27545;27546;27547;27548;27549;27550;27551;27552;27553;27554;27555;27556;27557 35394;35395;35396;35397;35398;35399;35400;35401;35402;35403;35404;35405;35406;35407;35408;35409;35410;35411;35412 35406 18 ANPTQLNTVEFLWDPAK Unmodified 1942.9789 0.97887721 2945 Q12800;F8VWL0;F8VX55 TFCP2 Alpha-globin transcription factor CP2 yes no 0 0 0 1 1 138.49 138.49 2 0.00048004 142556 QUIQUE_C1403_190116_001 94.728 78.59 78983000 0 0 0 38926000 0 0 0 0 0 0 0 0 40057000 3010 2945 2798 27558;27559 35413;35414 35413 1 ANPTVTLFPPSSEELQANK Unmodified 2042.032 0.032034995 209 A0A0B4J231;B9A064;P0CG04 IGLL5;IGLC1 Immunoglobulin lambda-like polypeptide 5;Ig lambda-1 chain C regions yes no 0 0 0 1 1 101.31 101.31 2 2.4582E-06 104981 QUIQUE_C1438_190116_001 94.781 72.726 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3011 209 2799 27560;27561 35415;35416 35416 2 ANPVFDYQLYFQEPGVAEAELEQNLSR Unmodified 3126.4934 0.49344444 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 166.35 166.35 3 1.1141E-26 173712 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35485 2 ANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPK Unmodified 2983.6131 0.61310607 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.45 129.45 3 1.5419E-19 133501 QUIQUE_C1277_190116_001 89.723 87.138 443890000 54420000 47764000 0 40165000 53993000 47702000 41713000 40154000 0 23512000 46660000 47807000 0 3027 636 2815 27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635 35488;35489;35490;35491;35492;35493;35494;35495;35496;35497;35498;35499 35490 12 ANSVTWNPHK Unmodified 1152.5676 0.56760585 2894;3950 Q05329;A0A3B3IU09;Q99259 GAD2;GAD1 Glutamate decarboxylase 2;Glutamate decarboxylase 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 19.293 19.293 2;3 0.00076103 12113 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.6 71.243 3553700000 416990000 275500000 337870000 364370000 334460000 0 395180000 261400000 224950000 38131000 226730000 464250000 213850000 3028 2894;3950 2816 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0.91482039 4170 Q9H4A6 GOLPH3 Golgi phosphoprotein 3 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 2 169.99 169.99 2;3 1.0256E-24 177183 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.78 100.44 511150000 25418000 37532000 44380000 28446000 25968000 16004000 67740000 36575000 50222000 8018400 35962000 56316000 78571000 3030 4170 2818 27675;27676;27677;27678;27679;27680;27681;27682;27683;27684;27685;27686;27687;27688;27689;27690;27691;27692;27693 35550;35551;35552;35553;35554;35555;35556;35557;35558;35559;35560;35561;35562;35563;35564;35565;35566;35567;35568;35569 35565 20 ANTVYGLGFSSEHHLSK Unmodified 1845.901 0.90096124 3523 Q86YM7 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 49.914 49.914 3 0.006376 47334 QUIQUE_C1403_190116_001 32.565 20.542 88117000 0 47220000 0 40897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3031 3523 2819 27694;27695 35570;35571;35572 35572 3 ANVAVVSGAPLQGLVAR Unmodified 1620.9311 0.93113916 1105 G5EA09 SDCBP yes yes 0 0 0 1 101.25 101.25 2 0.00089897 102741 QUIQUE_C1563_190116_001 85.288 70.609 31950000 0 0 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139.52 139.52 2 0.0005192 144268 QUIQUE_C1277_190116_001 95.573 78.735 569450000 35002000 41272000 42395000 34171000 45961000 41040000 39440000 55670000 56292000 20215000 51511000 42170000 64309000 3035 1534 2823 27712;27713;27714;27715;27716;27717;27718;27719;27720;27721;27722;27723;27724 35590;35591;35592;35593;35594;35595;35596;35597;35598;35599;35600;35601;35602;35603;35604;35605 35592 15 ANVIHATVTSVTLHSTEGK Unmodified 1964.0327 0.032703697 3625 Q8NBM8;E7EVZ5 PCYOX1L Prenylcysteine oxidase-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.587 47.587 3 4.5516E-06 45206 QUIQUE_C1277_190116_001 97.271 83.439 161520000 31079000 31524000 0 27902000 0 0 35974000 0 0 0 35045000 0 0 3036 3625 2824 27725;27726;27727;27728;27729 35606;35607;35608;35609;35610;35611 35608 6 ANVINEIMSTER Unmodified 1375.6766 0.67656396 202 A0A1B0GTF0;A0A1B0GVC4;A0A1B0GV82;A0A1B0GVV2;A0A0A6YYB3;B1AMR4;A0A1B0GTC2;B1AMR3;A0A1B0GV84;A0A1B0GWI5;A0A0A6YYF8;O43307;A0A096LNQ4;A0A096LNK4;A0A096LP05;A0A096LPE7;A0A096LPI8 ARHGEF9 Rho guanine nucleotide exchange factor 9 yes no 0 0 0 1 1 1 99.505 99.505 2 0.010547 103102 QUIQUE_C1576_190116_001 65.5 53.212 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3037 202 2825 27730;27731;27732 35612;35613;35614 35613 3 ANVNEILDFFHGYR Unmodified 1693.8213 0.82125436 680 B9ZVT1;Q8IXT5 RBM12B RNA-binding protein 12B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.1 137.1 3 4.5106E-05 142227 QUIQUE_C1368_190116_001 100.19 92.779 356100000 30832000 38421000 27438000 19959000 35873000 21624000 20806000 28962000 34999000 7300600 38286000 20946000 30657000 3038 680 2826 27733;27734;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;27745 35615;35616;35617;35618;35619;35620;35621;35622;35623;35624;35625;35626;35627 35617 13 ANVPWAEVCEK Acetyl (Protein N-term) 1343.618 0.61798644 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GVY9 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 1 0 0 1 1 115.27 115.27 2 0.036295 119438 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.336 20.486 20591000 0 0 0 0 0 0 0 0 20591000 0 0 0 0 3039 348 2827 27746;27747 35628;35629 35629 2 ANWEAQQR Unmodified 1001.4679 0.46789181 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 0 1 1 18.853 18.853 2 0.016589 11860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 84.914 879970000 0 0 0 0 0 0 0 168380000 0 711590000 0 0 0 3040 3171 2828 27748;27749 35630;35631 35630 1 ANWYFLLAR Unmodified 1152.608 0.60801411 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.84 132.84 2 0.00011147 137688 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.23 124.13 918700000 0 66500000 109510000 0 68823000 52309000 91135000 117510000 133960000 0 159530000 119420000 0 3041 666 2829 27750;27751;27752;27753;27754;27755;27756;27757;27758 35632;35633;35634;35635;35636;35637;35638;35639;35640;35641 35639 7 ANYDVLESQK Unmodified 1165.5615 0.56151742 1390 O00233;J3KN29;F5H5V4;F5GX23;F5H7X1 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes no 0 0 0 1 46.734 46.734 2 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35646;35647;35648;35649;35650;35651;35652;35653;35654;35655;35656;35657;35658;35659;35660;35661;35662;35663;35664;35665;35666;35667;35668;35669;35670;35671;35672;35673 35661 25 ANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYK Unmodified 3410.603 0.60301167 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 3 1 1 170.96 170.96 2;3 7.8917E-178 178166 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.97 204.1 2038000000 0 0 0 0 55856000 0 222300000 80920000 528390000 0 619650000 339410000 191440000 3045 1875 2833 27789;27790;27791;27792;27793;27794;27795;27796;27797;27798 35674;35675;35676;35677;35678;35679;35680;35681;35682;35683 35679 10 ANYWWLR Unmodified 1007.4977 0.49773538 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.6 102.6 2 0.0058587 105566 QUIQUE_C1368_190116_001 159.75 131.58 1757700000 104350000 114260000 148850000 115360000 125930000 117330000 154990000 126330000 141370000 81703000 182000000 154470000 190760000 3046 2339 2834 27799;27800;27801;27802;27803;27804;27805;27806;27807;27808;27809;27810;27811 35684;35685;35686;35687;35688;35689;35690;35691;35692;35693;35694;35695;35696;35697;35698;35699;35700;35701 35687 13 APAEILNGK Unmodified 911.50763 0.50763136 2027 P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 27.463 27.463 2 0.000347 21570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.77 88.721 91155000 0 0 0 0 0 0 0 71202000 0 19954000 0 0 0 3047 2027 2835 27812;27813 35702;35703 35702 2 APALGGSFAGLEPMGLLWALEPEKPLVR Oxidation (M) 2934.5677 0.56773578 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 157.93 157.93 3 1.8805E-23 162667 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.389 89.233 769240000 67967000 49514000 103910000 0 135710000 69588000 0 159710000 0 0 91937000 0 90899000 3048 98;3487 2836 27814;27815;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822 35704;35705;35706;35707;35708;35709;35710;35711;35712;35713;35714 35714 70 10 APALGGSFAGLEPMGLLWALEPEKPLVR Unmodified 2918.5728 0.57282116 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.78 166.78 3 1.0968E-94 171745 QUIQUE_C1368_190116_001 177.38 171.6 2906700000 255460000 226370000 849120000 292470000 223800000 415870000 0 0 410970000 232660000 0 0 0 3049 98;3487 2836 27823;27824;27825;27826;27827;27828;27829;27830 35715;35716;35717;35718;35719;35720;35721;35722;35723 35717 9 APAPAPPGTVTQVDVR Unmodified 1574.8417 0.84165545 424 A0A2R8Y4W2;A0A2R8YE63;Q12929;H0YFG1 EPS8 Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.079 57.079 2 0.00047462 56271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.014 69.257 202960000 0 0 0 0 0 33887000 0 34382000 35361000 0 34252000 27479000 37600000 3050 424 2837 27831;27832;27833;27834;27835;27836 35724;35725;35726;35727;35728;35729 35727 6 APAPEAEDEEVAR Unmodified 1382.6314 0.6313879 3626 Q8NBN7 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.065 28.065 2 0.0012978 22022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.706 64.035 222910000 39449000 47285000 36398000 0 0 0 0 0 59127000 0 40652000 0 0 3051 3626 2838 27837;27838;27839;27840;27841;27842 35730;35731;35732;35733;35734;35735 35735 6 APAPQPPSLPDR Unmodified 1244.6513 0.65133548 3585 Q8N3V7 SYNPO Synaptopodin yes yes 0 0 0 1 50.968 50.968 2 0.0148 48628 QUIQUE_C1403_190116_001 61.765 15.124 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3052 3585 2839 27843 35736 35736 1 APASEEEFQFLR Unmodified 1422.6779 0.67794416 2290 P29590;H3BT57 PML Protein PML yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 95.64 95.64 2 3.0144E-06 97973 QUIQUE_C1403_190116_001 137.95 104.58 425310000 0 0 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27858;27859;27860;27861;27862;27863;27864;27865;27866;27867;27868;27869;27870;27871 35751;35752;35753;35754;35755;35756;35757;35758;35759;35760;35761;35762;35763;35764;35765;35766 35751 12 APAVTEATPLK Unmodified 1096.6128 0.61282471 2953 Q12955;A0A087WTF3 ANK3 Ankyrin-3 yes no 0 0 0 1 65.279 65.279 2 0.039632 64807 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.574 11.364 36518000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36518000 0 3056 2953 2843 27872 35767 35767 1 APCFPVESKEEEQIEK Unmodified 1918.8982 0.89824363 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 57.503 57.503 3 0.00023128 55342 QUIQUE_C1563_190116_001 70.038 56.808 119570000 0 0 0 0 0 63375000 0 0 0 0 56198000 0 0 3057 2009 2844 27873;27874;27875;27876 35768;35769;35770;35771 35768 4 APDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR Unmodified 3954.9139 0.91387425 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 1 1 132.48 132.48 4 0.00017176 137920 QUIQUE_C1368_190116_001 37.238 32.661 32633000 0 0 32633000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3058 1824 2845 27877 35772 35772 1 APDEETLIALLAHAK Unmodified 1590.8617 0.86172219 1278 J3KQ48;Q9Y3E5 PTRH2 Peptidyl-tRNA hydrolase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 128.92 128.92 3 0.002911 132304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.196 52.966 152510000 0 29959000 19651000 33028000 0 15547000 0 0 0 0 0 20760000 33561000 3059 1278 2846 27878;27879;27880;27881;27882;27883;27884;27885;27886;27887;27888 35773;35774;35775;35776;35777;35778;35779;35780;35781;35782;35783 35779 7 APDELHYTYLDTFGRPVIVAYK Unmodified 2567.306 0.30602501 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 1 1 2 1 114.38 114.38 3;4 7.1138E-05 119933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.826 50.252 202610000 0 0 0 35066000 0 0 0 0 0 0 121680000 0 45861000 3060 1868 2847 27889;27890;27891;27892 35784;35785;35786;35787;35788 35787 5 APDFLPLLNK Unmodified 1126.6386 0.63864553 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 119.9 119.9 2 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35806;35807;35808;35809;35810;35811;35812;35813;35814;35815;35816;35817;35818;35819;35820;35821;35822;35823;35824;35825;35826;35827;35828;35829;35830;35831;35832;35833;35834;35835;35836;35837;35838;35839;35840;35841;35842;35843;35844;35845;35846;35847;35848;35849 35843 44 APDVAPEEVDESK Unmodified 1384.6358 0.63580458 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 37 37 2 0.002538 32950 QUIQUE_C1218_190116_001 73.951 57.749 63448000 29647000 0 0 0 0 33800000 0 0 0 0 0 0 0 3063 800 2850 27916;27917;27918;27919;27920 35850;35851;35852;35853;35854 35850 5 APDVTTLPR Unmodified 968.5291 0.52909508 3731 Q92542;H0Y6T7;H0Y3Z4;Q5T205 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 0 1 42.071 42.071 2 0.027329 38678 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.931 33.776 48972000 0 0 0 0 0 0 0 0 48972000 0 0 0 0 3064 3731 2851 27921 35855 35855 1 APDVVIGADTIVTVGGLILEKPVDK Unmodified 2518.4258 0.4258058 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 155.8 155.8 3 1.1482E-69 159860 QUIQUE_C1277_190116_001 131.37 128.65 754240000 37764000 106450000 81369000 103710000 68812000 20677000 47118000 30198000 54792000 39360000 0 102590000 61402000 3065 1741 2852 27922;27923;27924;27925;27926;27927;27928;27929;27930;27931;27932;27933;27934;27935;27936 35856;35857;35858;35859;35860;35861;35862;35863;35864;35865;35866;35867;35868;35869;35870;35871;35872;35873 35857 17 APDWVDAEECHR Unmodified 1483.615 0.61502633 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 47.259 47.259 2 0.028905 44907 QUIQUE_C1576_190116_001 55.353 44.188 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3066 1464 2853 27937 35874 35874 1 APEAWDYGQGFVNEEMIR Oxidation (M) 2126.9368 0.9367544 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 118.68 118.68 2 2.7567E-17 115851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.97 120.34 237620000 30507000 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Q9Y5Z4;Q5THN1 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 54.499 54.499 2 8.0732E-13 52709 QUIQUE_C1368_190116_001 135.6 115.84 987890000 0 0 307030000 0 0 0 339680000 341180000 0 0 0 0 0 3069 4638 2855 27965;27966;27967 35912;35913;35914 35912 3 APEDTVAEMK Unmodified 1089.5012 0.50122535 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.944 33.944 2 0.017857 28371 QUIQUE_C1368_190116_001 61.48 46.232 439900000 75217000 76344000 69242000 69283000 0 98413000 0 0 0 0 51399000 0 0 3070 921 2856 27968;27969;27970;27971;27972;27973 35915;35916;35917;35918;35919;35920 35917 2 APEDTVAEMK Oxidation (M) 1105.4961 0.49613997 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 1 0 1 1 17.046 17.046 2 0.0053401 9203 QUIQUE_C1563_190116_001 80.688 71.172 130030000 0 61185000 0 0 0 68847000 0 0 0 0 0 0 0 3071 921 2856 27974;27975 35921;35922 35922 570 2 APEEFELLSK Unmodified 1161.5918 0.59175492 4307 Q9NVH6 TMLHE Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.644 83.644 2 0.0054514 85819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.55 70.418 294990000 0 0 70584000 0 0 0 0 0 80411000 0 68659000 0 75341000 3072 4307 2857 27976;27977;27978;27979 35923;35924;35925;35926 35924 2 APEGEETEFYVSPEDLEAQLQSDER Unmodified 2867.2621 0.2621071 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 2 2 1 3 1 1 2 1 2 1 2 2 1 145.4 145.4 2;3 1.596E-83 149588 QUIQUE_C1403_190116_001 231.71 226.17 961580000 127390000 85864000 0 112670000 31171000 49019000 92054000 31929000 141390000 27364000 149470000 113260000 0 3073 4162 2858 27980;27981;27982;27983;27984;27985;27986;27987;27988;27989;27990;27991;27992;27993;27994;27995;27996;27997;27998;27999;28000 35927;35928;35929;35930;35931;35932;35933;35934;35935;35936;35937;35938;35939;35940;35941;35942;35943;35944;35945;35946;35947;35948;35949;35950;35951 35934 21 APEIMLNSK Oxidation (M) 1017.5165 0.51648149 2281;2263 P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49;P28482 MAPK3;MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase;Mitogen-activated protein kinase 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.408 31.408 2 0.00052691 25790 QUIQUE_C1368_190116_001 118.06 79.096 2351600000 176810000 193210000 198550000 174750000 132250000 174360000 166060000 0 0 194670000 356630000 289470000 294860000 3074 2263;2281 2859 28001;28002;28003;28004;28005;28006;28007;28008;28009;28010;28011;28012 35952;35953;35954;35955;35956;35957;35958;35959;35960;35961;35962;35963;35964;35965 35954 1632 13 APEIMLNSK Unmodified 1001.5216 0.52156686 2281;2263 P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49;P28482 MAPK3;MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase;Mitogen-activated protein kinase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.128 40.128 2 0.00030436 36455 QUIQUE_C1576_190116_001 136.8 111.98 6564900000 493600000 573180000 662730000 607820000 469630000 483570000 485310000 451570000 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28030;28031;28032;28033;28034;28035;28036;28037;28038;28039;28040;28041;28042;28043;28044;28045;28046 35983;35984;35985;35986;35987;35988;35989;35990;35991;35992;35993;35994;35995;35996;35997;35998;35999;36000;36001;36002;36003;36004;36005 36005 22 APELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQK Unmodified 3148.6809 0.68085128 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 3 2 3 5 1 2 165.59 165.59 3;4 2.0668E-194 170473 QUIQUE_C1368_190116_001 226.89 187.01 6238800000 143230000 711630000 639300000 237940000 140790000 369730000 890990000 364420000 665460000 0 1462000000 254730000 358650000 3078 2716 2862 28047;28048;28049;28050;28051;28052;28053;28054;28055;28056;28057;28058;28059;28060;28061;28062;28063;28064;28065;28066;28067;28068;28069;28070;28071 36006;36007;36008;36009;36010;36011;36012;36013;36014;36015;36016;36017;36018;36019;36020;36021;36022;36023;36024;36025;36026;36027;36028;36029;36030;36031;36032;36033;36034 36011 28 APEMVNLYSGK Unmodified 1207.5907 0.59070906 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.138 64.138 2 0.0026838 64041 QUIQUE_C1576_190116_001 76.815 35.933 229570000 54956000 0 51370000 0 0 0 53171000 0 34465000 0 0 0 35603000 3079 3212 2863 28072;28073;28074;28075;28076;28077 36035;36036;36037;36038;36039;36040 36038 6 APEPGPAGDGGPGAPAR Unmodified 1472.7008 0.70080487 3930 Q96RF0 SNX18 Sorting nexin-18 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 25.648 25.648 2 4.9965E-07 19765 QUIQUE_C1576_190116_001 108.56 83.005 325710000 0 0 59294000 67202000 0 0 54229000 38741000 0 19203000 0 0 87043000 3080 3930 2864 28078;28079;28080;28081;28082;28083;28084;28085 36041;36042;36043;36044;36045;36046;36047;36048;36049;36050 36046 8 APEPHVEEDDDDELDSK Unmodified 1938.7967 0.79667491 2607 P52566;F5H3P3;F5H6Q0;F5H2R5 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 1 1 2 1 1 38.577 38.577 2;3 4.6945E-45 33978 QUIQUE_C1368_190116_001 190.27 175.58 1228500000 61652000 123740000 196180000 200710000 130020000 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29862000 0 0 0 3083 2817 2867 28109;28110;28111;28112;28113;28114;28115;28116;28117 36084;36085;36086;36087;36088;36089;36090;36091;36092;36093;36094;36095 36087 12 APEQSSTAAAQSASATDTATPGAADR Unmodified 2432.1052 0.10515295 872 E7ETR1 CAMKV yes yes 0 0 0 1 39.097 39.097 3 0.0034972 35205 QUIQUE_C1218_190116_001 32.065 23.675 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3084 872 2868 28118 36096 36096 1 APESDTGDEDQDQER Unmodified 1690.6554 0.6554304 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.995 14.995 2 0 7466 QUIQUE_C1218_190116_001 326.43 323.7 983110000 67560000 126380000 118560000 98589000 93116000 76831000 93371000 32293000 46168000 34235000 74487000 48754000 72767000 3085 4172;346 2869 28119;28120;28121;28122;28123;28124;28125;28126;28127;28128;28129;28130;28131 36097;36098;36099;36100;36101;36102;36103;36104;36105;36106;36107;36108;36109;36110 36097 14 APESDTGDEDQDQERDTVFLK Unmodified 2394.0459 0.045906738 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 1 59.835 59.835 3 3.9954E-06 59579 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.122 45.028 87951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42493000 45458000 0 3086 4172;346 2870 28132;28133 36111;36112 36111 2 APEVILGMGYK Unmodified 1176.6213 0.62128091 397;2473 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFN2;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEQ0;A0A286YEQ7;A0A286YEX7;A0A1P0B7D2;A0A286YFD7;A0A286YES9;A0A286YF97;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;Q499Y8;P45983;A0A286YFE2;D6RCB1;A0A1W2PRF2;D7R525;A0A1W2PPZ3;P45984;J3KNK1 MAPK10;MAPK8;MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 0 1 83.963 83.963 2 0.0027955 85690 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 65.258 66507000 66507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3087 397;2473 2871 28134 36113 36113 0 APEVILGMGYK Oxidation (M) 1192.6162 0.61619553 397;2473 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFN2;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEQ0;A0A286YEQ7;A0A286YEX7;A0A1P0B7D2;A0A286YFD7;A0A286YES9;A0A286YF97;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;Q499Y8;P45983;A0A286YFE2;D6RCB1;A0A1W2PRF2;D7R525;A0A1W2PPZ3;P45984;J3KNK1 MAPK10;MAPK8;MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 1 0 1 1 1 59.411 59.411 2 0.01204 58320 QUIQUE_C1368_190116_001 62.558 40.472 79668000 0 0 30547000 0 0 24078000 0 0 0 0 25043000 0 0 3088 397;2473 2871 28135;28136;28137 36114;36115;36116 36114 283 3 APEVNLNAPDVDVHGPDWNLK Unmodified 2299.1233 0.12330962 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 107.4 107.4 3 3.325E-05 110849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.318 39.377 115150000 0 0 0 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36159;36160;36161;36162;36163;36164;36165;36166;36167;36168;36169;36170;36171;36172;36173;36174;36175;36176;36177;36178;36179;36180 36173 22 APFAAHGYGAFLTLSILDR Unmodified 2019.0578 0.057796236 2538 P49721;A0A087WVV1 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 140.88 140.88 3 0.001187 145634 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.083 27.373 425840000 41163000 40849000 46438000 0 0 0 35974000 0 131460000 0 129960000 0 0 3094 2538 2877 28193;28194;28195;28196;28197;28198 36181;36182;36183;36184;36185;36186 36185 5 APFAAPSPFAELVLPPQQ Unmodified 1878.988 0.98798534 2157 P19971 TYMP Thymidine phosphorylase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 164.93 164.93 2;3 2.9367E-05 169934 QUIQUE_C1368_190116_001 97.734 83.476 189770000 0 17287000 64825000 67985000 0 0 0 39668000 0 0 0 0 0 3095 2157 2878 28199;28200;28201;28202;28203;28204;28205;28206 36187;36188;36189;36190;36191;36192;36193;36194;36195 36188 9 APFDLFENK Unmodified 1079.5288 0.52876073 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.43 100.43 2 6.3921E-08 104546 QUIQUE_C1438_190116_001 166.68 136.17 1860200000 218680000 160460000 138460000 170870000 177490000 206020000 194250000 0 133210000 81676000 139570000 103040000 136440000 3096 1938 2879 28207;28208;28209;28210;28211;28212;28213;28214;28215;28216;28217;28218 36196;36197;36198;36199;36200;36201;36202;36203;36204;36205;36206;36207;36208 36200 13 APFDLFENKK Unmodified 1207.6237 0.62372375 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 69.687 69.687 2;3 4.7286E-05 69890 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.52 83.778 740370000 75579000 60995000 0 57561000 138270000 75807000 72098000 40608000 41085000 29867000 59734000 47162000 41601000 3097 1938 2880 28219;28220;28221;28222;28223;28224;28225;28226;28227;28228;28229;28230;28231;28232;28233 36209;36210;36211;36212;36213;36214;36215;36216;36217;36218;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225 36220 17 APFDLFENR Unmodified 1107.5349 0.53490874 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.51 104.51 2 6.9455E-34 107572 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.26 188.96 9190400000 834740000 797550000 640680000 734450000 776980000 999180000 939610000 431340000 554210000 407340000 836180000 549630000 688520000 3098 1931 2881 28234;28235;28236;28237;28238;28239;28240;28241;28242;28243;28244;28245;28246 36226;36227;36228;36229;36230;36231;36232;36233;36234;36235;36236;36237;36238;36239;36240;36241;36242;36243;36244;36245;36246;36247;36248;36249;36250;36251;36252;36253;36254;36255 36246 30 APFDLFENRK Unmodified 1235.6299 0.62987176 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 73.511 73.511 2;3 0.0030809 71043 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.92 50.783 1044600000 0 61125000 37202000 52916000 101600000 37013000 110440000 174850000 93874000 34073000 128960000 88879000 123640000 3099 1931 2882 28247;28248;28249;28250;28251;28252;28253;28254;28255;28256;28257;28258;28259 36256;36257;36258;36259;36260;36261;36262;36263;36264;36265;36266;36267;36268;36269;36270 36266 15 APFLGIPR Unmodified 869.51232 0.51232281 182 E7EUA2;A6NHU9;A0A0A0MSQ6;Q9UPX8;H7C1X5;E7EX50;H0Y7S5;B7ZKU9 SHANK2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 yes no 0 0 0 1 1 73.832 73.832 2 0.046296 74346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.847 35.344 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3100 182 2883 28260;28261 36271;36272 36272 2 APFQIIR Unmodified 843.49667 0.49667274 3812 Q96BW5;A0A0A0MSI3 PTER Phosphotriesterase-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.849 59.849 2 0.019338 58731 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.67 89.669 441020000 47092000 64738000 59045000 63720000 0 0 0 0 59283000 0 97555000 49584000 0 3101 3812 2884 28262;28263;28264;28265;28266;28267;28268 36273;36274;36275;36276;36277;36278;36279;36280 36279 8 APGAAAPSSGPGPCAAAR Unmodified 1564.7416 0.74162383 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.71 24.71 2 0.00023061 18549 QUIQUE_C1403_190116_001 106.01 88.571 204630000 0 23965000 0 23638000 23073000 0 41675000 0 0 0 37472000 0 54802000 3102 3676 2885 28269;28270;28271;28272;28273;28274 36281;36282;36283;36284;36285;36286 36282 6 APGAEEYAQQDVLK Unmodified 1517.7362 0.73618733 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.254 61.254 2 2.6301E-101 59945 QUIQUE_C1277_190116_001 231.54 204.21 26292000000 3023300000 2546800000 3058000000 2430200000 2225400000 2127400000 3180700000 975080000 1264700000 873310000 2105800000 952630000 1528200000 3103 1969 2886 28275;28276;28277;28278;28279;28280;28281;28282;28283;28284;28285;28286;28287 36287;36288;36289;36290;36291;36292;36293;36294;36295;36296;36297;36298;36299;36300;36301;36302;36303;36304;36305;36306;36307 36289 21 APGAEEYAQQDVLKK Unmodified 1645.8312 0.83115034 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 43.626 43.626 2;3 5.3479E-61 40664 QUIQUE_C1277_190116_001 198.29 198.29 23004000000 1092800000 1589200000 1814600000 1265300000 1253400000 549910000 2555700000 2575600000 1907800000 436800000 3770200000 1844000000 2348700000 3104 1969 2887 28288;28289;28290;28291;28292;28293;28294;28295;28296;28297;28298;28299;28300;28301;28302;28303;28304;28305;28306;28307;28308;28309;28310;28311 36308;36309;36310;36311;36312;36313;36314;36315;36316;36317;36318;36319;36320;36321;36322;36323;36324;36325;36326;36327;36328;36329;36330;36331;36332;36333;36334 36311 21 APGAGLGQDR Unmodified 940.47264 0.47264284 2561 P50402;Q5HY57 EMD Emerin yes no 0 0 0 1 16.832 16.832 2 0.0040375 9052 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.287 55.157 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29816000 47813000 0 34782000 44199000 42637000 3107 4449 2890 28331;28332;28333;28334;28335;28336;28337;28338;28339;28340;28341;28342 36358;36359;36360;36361;36362;36363;36364;36365;36366;36367;36368;36369 36369 11 APGDEEAQVENLITANATEPQK Unmodified 2324.1132 0.11319844 4122 Q9H0Q3 FXYD6 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 119.1 119.1 2;3 0 123659 QUIQUE_C1368_190116_001 280.5 272.11 2775000000 309850000 287680000 354640000 170820000 326660000 275680000 451500000 75359000 76335000 30294000 94966000 189290000 131910000 3108 4122 2891 28343;28344;28345;28346;28347;28348;28349;28350;28351;28352;28353;28354;28355;28356;28357;28358;28359;28360;28361;28362;28363 36370;36371;36372;36373;36374;36375;36376;36377;36378;36379;36380;36381;36382;36383;36384;36385;36386;36387;36388;36389;36390;36391;36392;36393;36394;36395;36396;36397;36398;36399;36400;36401 36378 28 APGDEEAQVENLITANATEPQKAEN Unmodified 2638.2358 0.23583277 4122 Q9H0Q3 FXYD6 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 120.53 120.53 2;3 2.8517E-10 123267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.098 63.323 378930000 0 0 0 0 0 0 0 58412000 88392000 0 61462000 69946000 100720000 3109 4122 2892 28364;28365;28366;28367;28368;28369 36402;36403;36404;36405;36406;36407;36408 36402 7 APGDQAWTQALPSVIK Unmodified 1680.8835 0.88352026 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.5 119.5 2 9.5542E-14 124743 QUIQUE_C1218_190116_001 164.81 147.44 982630000 242660000 141730000 192860000 0 0 155510000 164970000 0 0 84892000 0 0 0 3110 1140;3457 2893 28370;28371;28372;28373;28374;28375 36409;36410;36411;36412;36413;36414;36415;36416 36409 8 APGDQAWTQALPSVIKEEK Unmodified 2067.0637 0.063669474 3457 Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.3 103.3 3 0.00031048 108070 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.655 63.994 1350000000 97987000 140690000 123700000 0 157070000 0 0 152860000 162710000 0 257340000 161690000 95951000 3111 3457 2894 28376;28377;28378;28379;28380;28381;28382;28383;28384 36417;36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427;36428 36424 11 APGEQTVPALNLQNAFR Unmodified 1824.9482 0.94824579 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.38 113.38 2 0.0099924 118369 QUIQUE_C1218_190116_001 66.538 30.892 430570000 67359000 63995000 0 62423000 60920000 0 60984000 0 0 0 47095000 30383000 37407000 3112 4620 2895 28385;28386;28387;28388;28389;28390;28391;28392 36429;36430;36431;36432;36433;36434;36435;36436 36429 2 APGFAHLAGLDK Unmodified 1195.635 0.63495714 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 61.142 61.142 2;3 9.7547E-17 61283 QUIQUE_C1218_190116_001 185.14 149.23 5387200000 661570000 536580000 512270000 353810000 403970000 377970000 491140000 317930000 449400000 124230000 525960000 483430000 148910000 3113 1620 2896 28393;28394;28395;28396;28397;28398;28399;28400;28401;28402;28403;28404;28405;28406;28407;28408;28409;28410;28411;28412;28413;28414;28415;28416;28417 36437;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;36447;36448;36449;36450;36451;36452;36453;36454;36455;36456;36457;36458;36459;36460;36461;36462 36438 15 APGFAQMLK Unmodified 961.50552 0.50552287 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.314 69.314 2 0.00039966 69458 QUIQUE_C1277_190116_001 121.29 94.155 1216300000 156760000 140670000 147250000 113330000 140610000 108080000 142470000 145870000 0 0 0 0 121260000 3114 2572 2897 28418;28419;28420;28421;28422;28423;28424;28425;28426;28427 36463;36464;36465;36466;36467;36468;36469;36470;36471;36472;36473;36474 36464 10 APGFAQMLK Oxidation (M) 977.50044 0.50043749 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 37.797 37.797 2 0.036653 32541 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.503 73.871 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36483;36484;36485;36486;36487 36484 5 APGIIPR Unmodified 722.44391 0.44390889 2243;1351 K7ERX7;P25705;K7EK77;K7ENJ4;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.569 29.569 2 0.019338 23989 QUIQUE_C1563_190116_001 114.67 30.058 17024000000 1649800000 1327400000 1291200000 1003900000 1121300000 1345100000 1249100000 1302700000 1427800000 578310000 1782300000 1548000000 1397000000 3119 1351;2243 2901 28440;28441;28442;28443;28444;28445;28446;28447;28448;28449;28450;28451;28452 36488;36489;36490;36491;36492;36493;36494;36495;36496;36497;36498;36499;36500;36501;36502 36493 15 APGLAAADAADAAR Unmodified 1239.6208 0.62076364 277 A0A0E3D6M1;A0A0D9SGI1;Q86UL8 MAGI2 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 42.853 42.853 2 0.0066398 39425 QUIQUE_C1403_190116_001 61.344 39.213 33547000 0 0 0 33547000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3120 277 2902 28453 36503 36503 1 APGLGVLSPSGEER Unmodified 1367.7045 0.70449327 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 66.85 66.85 2 0.034367 66938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.906 50.227 36096000 0 0 0 0 0 0 0 0 36096000 0 0 0 0 3121 3154 2903 28454 36504;36505 36505 2 APGPGLAQGLPQLHSLVLR Unmodified 1923.1054 0.10541513 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 112.16 112.16 3 4.5678E-64 115859 QUIQUE_C1277_190116_001 181.41 174.84 1635700000 108550000 117270000 188370000 153350000 82969000 126410000 124560000 116210000 135020000 78221000 159950000 143430000 101370000 3122 3576 2904 28455;28456;28457;28458;28459;28460;28461;28462;28463;28464;28465;28466;28467;28468;28469;28470 36506;36507;36508;36509;36510;36511;36512;36513;36514;36515;36516;36517;36518;36519;36520;36521;36522;36523;36524;36525;36526;36527;36528;36529;36530;36531;36532;36533;36534;36535;36536 36509 30 APGPWDPLASAAGLKEGGK Unmodified 1820.9421 0.94209778 1616 O75190;E9PH18 DNAJB6 DnaJ homolog subfamily B member 6 yes no 0 0 1 1 61.766 61.766 4 0.036599 61186 QUIQUE_C1218_190116_001 22.221 12.09 34695000 34695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3123 1616 2905 28471 36537 36537 0 APGQLALFSVSDK Unmodified 1331.7085 0.70851601 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.154 97.154 2 0.0015544 101072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.943 71.437 843510000 0 139450000 0 0 0 126430000 0 0 146590000 113680000 172570000 144780000 0 3124 2339 2906 28472;28473;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482 36538;36539;36540;36541;36542;36543;36544;36545;36546;36547;36548;36549;36550 36547 13 APGTVLSQEEVEGELAELAMGFLGSR Oxidation (M) 2705.3218 0.32181101 2535 P49593;A8MX49 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 172.29 172.29 3 1.2992E-30 176911 QUIQUE_C1368_190116_001 130.15 122.79 154950000 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Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 132.32 132.32 2 0.00062777 128648 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.298 81.757 8564900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8564900 0 0 0 3128 4663 2909 28504 36572 36572 1 APHLAYLR Unmodified 939.52904 0.5290355 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 31.369 31.369 2 0.0085572 25272 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.883 57.839 182470000 0 0 0 0 0 0 0 73774000 0 34679000 0 74019000 0 3129 4054 2910 28505;28506;28507 36573;36574;36575 36575 3 APHLQLIEGK Unmodified 1104.6291 0.62914348 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 39.289 39.289 2;3 5.2124E-05 35580 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.03 119.27 3993200000 132580000 348240000 0 614250000 320700000 214300000 171130000 475940000 576340000 190820000 158890000 213730000 576280000 3130 933;1529 2911 28508;28509;28510;28511;28512;28513;28514;28515;28516;28517;28518;28519;28520;28521;28522;28523;28524;28525;28526 36576;36577;36578;36579;36580;36581;36582;36583;36584;36585;36586;36587;36588;36589;36590;36591;36592;36593;36594;36595;36596;36597 36589 20 APHWTSAPLTEASAHSHPPEIK Unmodified 2363.1658 0.16584314 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 1 3 3 2 54.683 54.683 3;4;5 1.2707E-36 53032 QUIQUE_C1277_190116_001 141.97 133.98 9131700000 1311700000 861430000 778290000 1168400000 1166100000 637770000 436660000 427310000 210210000 89796000 753560000 470450000 820030000 3131 2009 2912 28527;28528;28529;28530;28531;28532;28533;28534;28535;28536;28537;28538;28539;28540;28541;28542;28543;28544;28545;28546;28547;28548;28549;28550;28551;28552;28553;28554;28555;28556;28557;28558;28559;28560;28561 36598;36599;36600;36601;36602;36603;36604;36605;36606;36607;36608;36609;36610;36611;36612;36613;36614;36615;36616;36617;36618;36619;36620;36621;36622;36623;36624;36625;36626;36627;36628;36629;36630;36631;36632;36633;36634;36635;36636;36637;36638;36639;36640;36641;36642;36643;36644 36602 45 APHWTSAPLTEASAHSHPPEIKDQGGAGEGLVR Unmodified 3402.6705 0.67051438 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 2 68.141 68.141 4;5 2.3336E-65 67944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.8 126.64 558610000 0 0 0 0 0 0 0 340700000 217910000 0 0 0 0 3132 2009 2913 28562;28563;28564;28565 36645;36646;36647;36648 36646 3 APIDHGLEQLETWFTAGAK Unmodified 2083.0375 0.037454724 2610 P52630;B4DLC8 STAT2 Signal transducer and activator of transcription 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 152.16 152.16 3 9.6126E-23 155387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.203 67.906 39914000 0 0 24673000 0 15241000 0 0 0 0 0 0 0 0 3133 2610 2914 28566;28567;28568;28569;28570 36649;36650;36651;36652;36653;36654 36654 5 APIFTSEQGEK Unmodified 1205.5928 0.59281755 2108 P16333;C9JAB9 NCK1 Cytoplasmic protein NCK1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 32.845 32.845 2 0.0010685 27879 QUIQUE_C1563_190116_001 90.601 71.497 148350000 29764000 40367000 40582000 0 0 37637000 0 0 0 0 0 0 0 3134 2108 2915 28571;28572;28573;28574 36655;36656;36657;36658 36658 3 APIIAVTR Unmodified 839.52289 0.52288749 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.788 37.788 1;2 0.00055683 34719 QUIQUE_C1218_190116_001 154.01 111.24 77410000000 7520100000 6256500000 6909700000 6337600000 4435800000 5037400000 5736500000 5647100000 5883100000 2812000000 7639000000 6273300000 6922400000 3135 1203;2077 2916 28575;28576;28577;28578;28579;28580;28581;28582;28583;28584;28585;28586;28587;28588 36659;36660;36661;36662;36663;36664;36665;36666;36667;36668;36669;36670;36671;36672;36673;36674;36675;36676;36677;36678;36679;36680;36681;36682;36683 36660 24 APIISGVTK Unmodified 884.53312 0.53311783 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 33.659 33.659 1;2 0.00046932 29799 QUIQUE_C1218_190116_001 116.25 34.954 9936200000 1028200000 1645200000 783330000 669040000 1131100000 589280000 656250000 684850000 559070000 510000000 883660000 0 796220000 3136 1687 2917 28589;28590;28591;28592;28593;28594;28595;28596;28597;28598;28599;28600;28601;28602 36684;36685;36686;36687;36688;36689;36690;36691;36692;36693;36694;36695;36696;36697;36698;36699;36700;36701 36686 14 APILIATDVASR Unmodified 1225.703 0.7030367 381;1290 J3KTA4;P17844;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841;A0A0U1RQJ0 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.419 74.419 2 0.00051557 74576 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.06 90.155 4750300000 537990000 436650000 394750000 296110000 423690000 343050000 254080000 413460000 348690000 191130000 408670000 426880000 275170000 3137 1290;381 2918 28603;28604;28605;28606;28607;28608;28609;28610;28611;28612;28613;28614;28615;28616 36702;36703;36704;36705;36706;36707;36708;36709;36710;36711;36712;36713;36714;36715;36716;36717;36718;36719;36720;36721;36722;36723;36724;36725;36726;36727;36728 36726 26 APIQWEER Unmodified 1027.5087 0.50869399 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YKD0;H0YM64 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.226 45.226 2 0.0036515 42330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.84 96.554 8347700000 828990000 744150000 741850000 591870000 849260000 0 881450000 465960000 818710000 0 840260000 742340000 842890000 3138 2558 2919 28617;28618;28619;28620;28621;28622;28623;28624;28625;28626;28627 36729;36730;36731;36732;36733;36734;36735;36736;36737;36738;36739;36740 36738 12 APIRPDIVNFVHTNLR Unmodified 1861.0323 0.032250187 2399 P36578;H3BTP7;H3BU31 RPL4 60S ribosomal protein L4 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 89.337 89.337 3;4 0.00046799 92873 QUIQUE_C1218_190116_001 74.12 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1188 2921 28651;28652;28653;28654;28655;28656 36764;36765;36766;36767;36768;36769 36769 681 6 APKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN Unmodified 3358.4485 0.4484639 3894 Q96K17 BTF3L4 Transcription factor BTF3 homolog 4 yes yes 0 0 2 1 1 128.68 128.68 3 1.9913E-07 131579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.087 56.181 103020000 0 0 0 0 0 0 0 47863000 55157000 0 0 0 0 3142 3894 2922 28657;28658 36770;36771 36770 2 APLAEEWDNMTMK Oxidation (M) 1550.6745 0.67451505 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.04 90.04 2 0.0017242 87529 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.659 61.795 543480000 49629000 65680000 83208000 50651000 44861000 62127000 0 0 71082000 29303000 49044000 0 37897000 3143 2261 2923 28659;28660;28661;28662;28663;28664;28665;28666;28667;28668;28669 36772;36773;36774;36775;36776;36777;36778;36779;36780;36781;36782 36780 1621;1622 9 APLAEEWDNMTMK Unmodified 1534.6796 0.67960042 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.97 101.97 2 0.00022717 103992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.69 91.836 5344400000 376260000 416790000 469860000 423210000 255750000 372560000 339710000 489340000 486650000 159010000 642220000 434890000 478130000 3144 2261 2923 28670;28671;28672;28673;28674;28675;28676;28677;28678;28679;28680;28681;28682 36783;36784;36785;36786;36787;36788;36789;36790;36791;36792;36793;36794;36795;36796;36797;36798 36790 15 APLAEEWDNMTMK 2 Oxidation (M) 1566.6694 0.66942967 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 60.402 60.402 2 0.0028692 59861 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.197 61.039 166770000 0 28103000 43842000 0 0 0 0 0 0 24276000 46954000 0 23591000 3145 2261 2923 28683;28684;28685;28686;28687 36799;36800;36801;36802;36803 36802 1621;1622 5 APLALFGHTLVASLEDMK Oxidation (M) 1928.0077 0.0077344999 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 0 1 1 131.41 131.41 3 0.0013379 136796 QUIQUE_C1218_190116_001 53.773 37.28 88657000 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activator complex subunit 2 yes no 0 0 2 1 1 83.001 83.001 4 0.022241 85521 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.298 15.029 145770000 0 48809000 0 0 0 0 0 0 0 0 96959000 0 0 3149 114 2926 28704;28705 36822;36823 36823 2 APLDIPVPDPVK Unmodified 1259.7125 0.71253876 2901 Q06323 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 102.19 102.19 2 7.1407E-07 105345 QUIQUE_C1368_190116_001 141.93 113.53 1081400000 117690000 75783000 158920000 127780000 110410000 97994000 77984000 38289000 50466000 63340000 61810000 37662000 63245000 3150 2901 2927 28706;28707;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28715;28716;28717;28718;28719 36824;36825;36826;36827;36828;36829;36830;36831;36832;36833;36834;36835;36836;36837;36838;36839;36840;36841;36842;36843;36844;36845;36846;36847;36848 36828 25 APLDIPVPDPVKEK Unmodified 1516.8501 0.85009487 2901 Q06323 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.088 83.088 3 0.00018682 85063 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.506 60.04 768070000 40209000 69548000 100540000 81422000 0 0 0 0 142150000 23102000 177850000 0 133240000 3151 2901 2928 28720;28721;28722;28723;28724;28725;28726;28727 36849;36850;36851;36852;36853;36854;36855;36856;36857;36858;36859;36860 36857 12 APLDLDK Acetyl (Protein N-term) 812.42798 0.42798405 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 1 0 0 1 100.38 100.38 2 0.057358 101868 QUIQUE_C1563_190116_001 57.463 39.697 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3152 1421 2929 28728 36861 36861 1 APLDLDKYVEIAR Unmodified 1501.814 0.81404372 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.8 104.8 3 4.7803E-05 107128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.31 82.68 365070000 0 0 0 0 0 0 0 66811000 82433000 0 0 108030000 107800000 3153 1421 2930 28729;28730;28731;28732;28733;28734 36862;36863;36864;36865;36866;36867 36864 6 APLEITEYPCVEVR Unmodified 1674.8287 0.8287075 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 102.16 102.16 2 0.00029414 106364 QUIQUE_C1218_190116_001 99.522 68.028 427430000 71203000 47746000 99926000 55324000 0 0 109490000 0 0 0 43735000 0 0 3154 1255;2856 2931 28735;28736;28737;28738;28739;28740;28741;28742 36868;36869;36870;36871;36872;36873;36874;36875;36876 36868 7 APLEVAQEH Unmodified 992.49271 0.49270958 1695 O94903 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.634 26.634 2 0.00054298 20407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.03 106.18 2487600000 173650000 178040000 166060000 222680000 192310000 242000000 160030000 212160000 267960000 0 225060000 192000000 255660000 3155 1695 2932 28743;28744;28745;28746;28747;28748;28749;28750;28751;28752;28753;28754 36877;36878;36879;36880;36881;36882;36883;36884;36885;36886;36887;36888;36889 36887 11 APLGNPVQGR Unmodified 1007.5512 0.55122751 4711 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 17.008 17.008 2 0.00065526 9200 QUIQUE_C1277_190116_001 108.24 58.879 325120000 0 119300000 36106000 53370000 33958000 49483000 32903000 0 0 0 0 0 0 + 3156 4711 2933 28755;28756;28757;28758;28759;28760;28761 36890;36891;36892;36893;36894;36895;36896 36890 6 APLHFPIPVIR Unmodified 1258.755 0.75501269 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 95.663 95.663 3 0.027108 98672 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.598 35.911 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3157 3814 2934 28762 36897 36897 1 APLPLGHIK Unmodified 944.58074 0.58073672 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 31.249 31.249 2 0.024045 25843 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.262 56.616 196030000 0 0 0 0 0 0 0 64525000 0 38875000 92633000 0 0 3158 1977 2935 28763;28764;28765 36898;36899;36900 36899 2 APLQVAVLGPTGVAEPVEVR Unmodified 2001.1259 0.1258758 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.16 117.16 2 1.3851E-05 122546 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.069 85.656 738400000 48981000 22581000 55173000 86447000 0 0 127370000 37938000 67328000 68485000 66123000 56727000 101250000 3159 3061 2936 28766;28767;28768;28769;28770;28771;28772;28773;28774;28775;28776 36901;36902;36903;36904;36905;36906;36907;36908;36909;36910;36911 36909 9 APLSQLYFCR Unmodified 1253.6227 0.62267789 4461 Q9UJW0;E5RI97 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 1 2 2 2 3 1 1 3 1 1 87.926 87.926 2 0.00025977 89634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.04 84.716 301900000 0 0 0 0 0 0 0 89517000 61301000 0 0 74145000 76933000 3160 4461 2937 28777;28778;28779;28780;28781;28782;28783;28784;28785;28786;28787;28788;28789;28790;28791;28792;28793 36912;36913;36914;36915;36916;36917;36918;36919;36920;36921;36922;36923;36924;36925;36926;36927;36928;36929 36922 17 APLVCLPVFVSR Unmodified 1356.7588 0.75877744 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PJU8;A0A1W2PRB8 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.23 126.23 2 0.00053092 132098 QUIQUE_C1218_190116_001 123.86 106.84 2167000000 135650000 147970000 287600000 223020000 270560000 168790000 216870000 0 0 70305000 226680000 192280000 227280000 3161 4127 2938 28794;28795;28796;28797;28798;28799;28800;28801;28802;28803;28804 36930;36931;36932;36933;36934;36935;36936;36937;36938;36939;36940;36941;36942;36943;36944;36945;36946 36931 17 APLVLKD Unmodified 754.45889 0.45889025 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.577 31.577 2 0.025681 25901 QUIQUE_C1563_190116_001 132.96 93.742 21033000000 3085200000 0 2960900000 0 2948000000 2763000000 0 2616100000 0 0 3618600000 3041100000 0 3162 3956 2939 28805;28806;28807;28808;28809;28810;28811 36947;36948;36949;36950;36951;36952;36953;36954 36950 8 APLVPPGSPVVNALFR Unmodified 1632.9352 0.9351619 4245 Q9NPH2;J3QS51 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 132.68 132.68 2;3 0.00042686 137383 QUIQUE_C1277_190116_001 107.06 101.02 1306900000 85028000 89430000 82838000 114870000 155450000 0 102330000 91455000 108330000 64092000 133280000 141330000 138420000 3163 4245 2940 28812;28813;28814;28815;28816;28817;28818;28819;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28826;28827;28828;28829;28830 36955;36956;36957;36958;36959;36960;36961;36962;36963;36964;36965;36966;36967;36968;36969;36970;36971;36972;36973;36974;36975;36976;36977;36978 36958 24 APMAAQGMVETR Unmodified 1260.5955 0.59547686 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.768 38.768 2 6.9739E-14 35665 QUIQUE_C1218_190116_001 161.17 141.39 1032900000 82471000 96648000 92136000 94937000 53052000 95799000 79866000 77448000 93767000 0 115780000 73288000 77736000 3164 3063 2941 28831;28832;28833;28834;28835;28836;28837;28838;28839;28840;28841;28842 36979;36980;36981;36982;36983;36984;36985;36986;36987;36988;36989;36990;36991;36992;36993;36994;36995;36996;36997 36980 18 APMAAQGMVETR 2 Oxidation (M) 1292.5853 0.58530611 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 1 15.272 15.272 2 0.00065941 7440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.21 80.749 103250000 0 0 24520000 0 0 11514000 0 0 29924000 17436000 19855000 0 0 3165 3063 2941 28843;28844;28845;28846;28847;28848 36998;36999;37000;37001;37002;37003 37002 2517;2518 6 APMVNPTLGVHEADLLK Oxidation (M) 1819.9502 0.95021962 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 82.915 82.915 2;3 2.6798E-05 84784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.226 73.472 761020000 70263000 56445000 0 0 0 0 0 107040000 187650000 72858000 146870000 0 119890000 3166 2993 2942 28849;28850;28851;28852;28853;28854;28855;28856 37004;37005;37006;37007;37008;37009;37010;37011 37009 2442 8 APMVNPTLGVHEADLLK Unmodified 1803.9553 0.955305 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 92.077 92.077 2;3 1.241E-05 94347 QUIQUE_C1368_190116_001 94.007 90.174 1600000000 218860000 0 210450000 157320000 0 178890000 200160000 0 209370000 0 219310000 205620000 0 3167 2993 2942 28857;28858;28859;28860;28861;28862;28863;28864;28865;28866;28867;28868 37012;37013;37014;37015;37016;37017;37018;37019;37020;37021;37022;37023;37024 37015 12 APNDFKLQDFNVGDYIEAVLDR Unmodified 2538.2391 0.23906766 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 1 167.65 167.65 3 4.8196E-05 169588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.37 52.161 64180000 0 0 0 0 0 0 0 64180000 0 0 0 0 0 3168 2016 2943 28869 37025 37025 1 APNDFNLK Unmodified 917.46068 0.46068117 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 35.489 35.489 2 0.019817 31736 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.741 38.095 777030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195020000 326330000 255680000 3169 2017 2944 28870;28871;28872;28873 37026;37027;37028;37029 37028 4 APNTPDILEIEFK Unmodified 1485.7715 0.7715102 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 122.09 122.09 2 0.0021576 125999 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.35 83.081 349470000 0 0 0 0 0 167590000 0 0 0 102680000 0 0 79200000 3170 1797 2945 28874;28875;28876;28877 37030;37031;37032;37033 37033 2 APNTPDILEIEFKK Unmodified 1613.8665 0.86647322 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 93.999 93.999 2;3 4.2183E-18 91806 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.95 120.01 2198300000 41854000 139180000 112430000 104120000 136620000 76025000 134490000 340670000 257010000 61866000 358920000 192980000 242180000 3171 1797 2946 28878;28879;28880;28881;28882;28883;28884;28885;28886;28887;28888;28889;28890;28891;28892;28893 37034;37035;37036;37037;37038;37039;37040;37041;37042;37043;37044;37045;37046;37047;37048;37049;37050;37051;37052;37053;37054;37055;37056;37057;37058;37059;37060 37052 27 APNYPTEGNHR Unmodified 1254.5741 0.5741478 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734;B8ZZI0 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 13.711 13.711 2;3 0.00013104 5577 QUIQUE_C1403_190116_001 84.507 67.14 296500000 30564000 56063000 18703000 12975000 10152000 2938000 18253000 57174000 25616000 0 12976000 18575000 32512000 3172 4106 2947 28894;28895;28896;28897;28898;28899;28900;28901;28902;28903;28904;28905;28906;28907;28908 37061;37062;37063;37064;37065;37066;37067;37068;37069;37070;37071;37072;37073;37074;37075;37076 37065 15 APPAPGPASGGSGEVDELFDVK Unmodified 2096.0062 0.006214175 1359 M0QXB4;O14579;M0R061 COPE Coatomer subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 110.45 110.45 2 3.2524E-36 114020 QUIQUE_C1403_190116_001 144.68 134.89 174700000 0 0 0 30449000 33685000 0 0 0 0 0 44054000 31167000 35343000 3173 1359 2948 28909;28910;28911;28912;28913;28914 37077;37078;37079;37080;37081;37082 37077 6 APPASKPTPAPVPTPTGAASPLAAAAAPATEAPQAK Unmodified 3272.7405 0.74049143 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 81.856 81.856 3;4 3.4271E-144 83210 QUIQUE_C1368_190116_001 184.49 165.11 3469200000 214200000 100430000 157220000 343960000 407200000 188420000 292570000 257230000 408420000 38560000 210590000 210730000 639640000 3174 265 2949 28915;28916;28917;28918;28919;28920;28921;28922;28923;28924;28925;28926;28927;28928;28929;28930;28931;28932;28933;28934;28935;28936 37083;37084;37085;37086;37087;37088;37089;37090;37091;37092;37093;37094;37095;37096;37097;37098;37099;37100;37101;37102;37103;37104;37105;37106;37107;37108;37109;37110;37111;37112;37113;37114;37115;37116;37117;37118;37119;37120;37121;37122 37089 40 APPEPADSLTEACK Unmodified 1484.6817 0.68170891 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 48.226 48.226 2 0.015929 46082 QUIQUE_C1576_190116_001 52.391 39.271 42621000 0 0 0 0 0 0 42621000 0 0 0 0 0 0 3175 1394 2950 28937 37123 37123 1 APPGCLTPER Unmodified 1096.5335 0.53352853 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 26.271 26.271 2 0.0029057 20299 QUIQUE_C1576_190116_001 87.308 66.787 230160000 0 0 0 0 105890000 0 60302000 0 0 0 63971000 0 0 3176 1140;3457 2951 28938;28939;28940 37124;37125;37126 37125 3 APPGFLGSLVPVVVETLGDAYPELQR Unmodified 2723.4534 0.45341753 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 174.22 174.22 3 7.6182E-15 181332 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.475 87.89 79716000 0 13306000 0 0 0 0 0 0 33173000 0 33237000 0 0 3177 3278 2952 28941;28942;28943 37127;37128;37129;37130 37129 4 APPHELTEEEK Unmodified 1278.6092 0.6091959 2992;858 E7EQL5;E7EV09;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 16.173 16.173 2;3 0.00014696 9037 QUIQUE_C1368_190116_001 93.345 52.228 1865900000 182220000 172270000 179300000 183250000 190890000 111540000 199390000 0 152180000 66232000 174810000 128430000 125350000 3178 858;2992 2953 28944;28945;28946;28947;28948;28949;28950;28951;28952;28953;28954;28955;28956;28957;28958 37131;37132;37133;37134;37135;37136;37137;37138;37139;37140;37141;37142;37143;37144;37145;37146;37147 37134 16 APPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTR Unmodified 3480.6586 0.65861229 2992;858 E7EQL5;E7EV09;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 1 1 2 2 4 1 2 125.77 125.77 4;5 2.6987E-32 129263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 114.99 1123900000 0 51778000 0 0 0 0 149760000 182370000 389860000 0 0 120510000 229620000 3179 858;2992 2954 28959;28960;28961;28962;28963;28964;28965;28966;28967;28968;28969;28970 37148;37149;37150;37151;37152;37153;37154;37155;37156;37157;37158;37159;37160;37161;37162;37163 37153 15 APPILPPHLLQVILNK Unmodified 1762.0869 0.086911519 4599 Q9Y478;F5H610;F5H2X8 PRKAB1 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 136.91 136.91 3 7.4505E-07 143060 QUIQUE_C1438_190116_001 83.729 83.642 385750000 26631000 49482000 54012000 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149021 QUIQUE_C1403_190116_001 54.559 47.836 43896000 0 0 0 43896000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3183 917 2958 28987 37180;37181 37181 2 APPPSLTDCIGTVDSR Unmodified 1684.809 0.80903469 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.057 79.057 2 3.2247E-07 79700 QUIQUE_DMIX8_190116_001 117.98 101.03 162560000 43408000 33441000 0 43244000 0 0 0 0 0 0 0 0 42470000 3184 4359 2959 28988;28989;28990;28991;28992;28993;28994;28995 37182;37183;37184;37185;37186;37187;37188;37189;37190 37190 8 APPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTR Unmodified 2784.3175 0.31754576 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;F6S6P2;X6REW1;A0A0G2JJM1;F6UR09;F6U1F2;F6XTU0;A0A0G2JJR8;A0A1B0GX79;F6WML8;F6VEM6;F6X9W3;F6U341;F6TC96 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.015 26.015 4 7.8975E-31 17701 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.242 87.735 514610000 56250000 65243000 0 64409000 57372000 0 64070000 54626000 44632000 0 0 0 108010000 3185 7 2960 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37293;37294;37295;37296;37297;37298;37299;37300;37301;37302;37303 37303 11 APQITTPVK Unmodified 953.55458 0.55458155 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 28.553 28.553 2 0.06278 23233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.198 26.539 21894000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21894000 0 0 3194 3199 2968 29074 37304 37304 1 APQLHLEYR Unmodified 1125.5931 0.59309232 4657 Q9Y6M4;P78368;A0A0U1RQK2;A0A0U1RR14;A0A087WXD7;A0A087WWF5;K7ESB6;U3KQA5;A0A0U1RQT7;Q8IXA3;A0A0U1RQY7;U3KQB3;Q9HCP0 CSNK1G3;CSNK1G2;hCG_2004507;CSNK1G1 Casein kinase I isoform gamma-3;Casein kinase I isoform gamma-2;Casein kinase I isoform gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.132 40.132 3 0.0036372 36563 QUIQUE_C1277_190116_001 71.349 48.82 245220000 42109000 21632000 0 33565000 33099000 29715000 29018000 0 0 0 0 23598000 32488000 3195 4657 2969 29075;29076;29077;29078;29079;29080;29081;29082 37305;37306;37307;37308;37309;37310;37311;37312;37313;37314 37306 8 APQLVGQFIAR Unmodified 1198.6822 0.68224168 3247 Q53EL6 PDCD4 Programmed cell death protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.854 83.854 2 0.0055601 80872 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.625 43.066 163730000 41829000 0 0 34666000 0 0 0 40776000 27592000 18866000 0 0 0 3196 3247 2970 29083;29084;29085;29086;29087 37315;37316;37317;37318;37319 37319 3 APQSLASSNSAQAR Unmodified 1386.6852 0.68515481 363 H3BLV5;A0A1B0GWD1;A8K340;O43602 DCX Neuronal migration protein doublecortin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.653 17.653 2 6.2629E-29 10474 QUIQUE_C1218_190116_001 174.77 150.68 543460000 57179000 36957000 42429000 59325000 44261000 63546000 39597000 70240000 43390000 0 45193000 41345000 0 3197 363 2971 29088;29089;29090;29091;29092;29093;29094;29095;29096;29097;29098 37320;37321;37322;37323;37324;37325;37326;37327;37328;37329;37330;37331 37320 12 APSDLYQIILK Unmodified 1259.7125 0.71253876 1921 P07384;E9PL37 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 119.73 119.73 2 1.8019E-05 122953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.75 91.336 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37374;37375;37376;37377;37378;37379;37380;37381;37382 37379 9 APSTWLTAYVVK Unmodified 1334.7234 0.72343779 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.52 111.52 2 0.0004402 109463 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.06 85.498 628670000 67121000 62788000 57871000 0 106600000 55162000 47119000 0 0 145860000 86146000 0 0 3203 1803 2977 29141;29142;29143;29144;29145;29146;29147;29148;29149 37383;37384;37385;37386;37387;37388;37389;37390;37391;37392;37393 37391 11 APSTYGGGLSVSSSR Unmodified 1424.6896 0.68957148 763 CON__P02533;P02533 KRT14 Keratin, type I cytoskeletal 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.675 42.675 2 4.8338E-05 39120 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.216 65.366 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1 1 1 1 1 1 1 1 50.267 50.267 2 7.4706E-05 48584 QUIQUE_C1438_190116_001 119.22 90.825 912590000 76316000 78586000 99388000 82687000 89698000 71242000 0 76555000 98427000 28142000 117940000 0 93607000 3207 1047 2981 29161;29162;29163;29164;29165;29166;29167;29168;29169;29170;29171;29172 37406;37407;37408;37409;37410;37411;37412;37413;37414;37415;37416;37417;37418;37419;37420 37412 15 APSWEASAPPPPR Unmodified 1361.6728 0.67279921 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.678 53.678 2 0.00059136 52355 QUIQUE_C1218_190116_001 113.44 96.675 258340000 68616000 0 67863000 63935000 57927000 0 0 0 0 0 0 0 0 3208 3452 2982 29173;29174;29175;29176;29177 37421;37422;37423;37424;37425 37421 4 APSWFDTGLSEMR Oxidation (M) 1511.6715 0.67147858 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;E9PS12 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.72 101.72 2 0.00057529 104504 QUIQUE_C1403_190116_001 90.685 80.399 3642700000 189270000 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37440;37441;37442;37443;37444;37445;37446;37447;37448;37449;37450;37451;37452;37453;37454;37455;37456;37457;37458;37459;37460;37461;37462;37463;37464;37465;37466;37467;37468;37469;37470;37471;37472;37473;37474;37475;37476 37468 36 APSWFDTGLSEMRLEK Oxidation (M) 1881.8931 0.89309867 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;E9PS12 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 1 1 1 96.095 96.095 3 0.0369 97237 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.962 35.302 81882000 0 0 0 0 0 0 0 81882000 0 0 0 0 0 3211 977 2984 29206 37477 37477 591 1 APSYLEISSMR Unmodified 1252.6122 0.61217279 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 1 83.317 83.317 2 0.016843 79249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.404 40.071 125860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 125860000 0 0 0 3212 2805 2985 29207 37478 37478 1 APTADEIHVTVGEAR Unmodified 1564.7845 0.7845345 1877 P05129;M0R0I9 PRKCG Protein kinase C gamma type yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 48.795 48.795 2;3 7.506E-06 46396 QUIQUE_C1576_190116_001 96.82 84.243 1162600000 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29243;29244;29245;29246;29247;29248;29249;29250;29251;29252;29253;29254;29255;29256;29257;29258;29259;29260;29261;29262;29263;29264;29265;29266;29267;29268;29269;29270;29271;29272;29273;29274;29275;29276 37518;37519;37520;37521;37522;37523;37524;37525;37526;37527;37528;37529;37530;37531;37532;37533;37534;37535;37536;37537;37538;37539;37540;37541;37542;37543;37544;37545;37546;37547;37548;37549;37550;37551;37552;37553;37554;37555;37556;37557;37558;37559;37560;37561;37562;37563;37564;37565;37566;37567;37568;37569;37570;37571;37572;37573;37574;37575;37576;37577;37578;37579;37580;37581;37582;37583;37584;37585;37586;37587;37588;37589;37590;37591;37592;37593;37594;37595;37596;37597;37598;37599;37600;37601;37602;37603 37530 86 APVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYR Unmodified 2693.302 0.30201904 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 3 2 2 3 3 2 3 2 3 2 3 3 3 116.59 116.59 3;4;5 4.004E-75 120282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.04 142.75 4540700000 366210000 377710000 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29334;29335;29336;29337;29338;29339;29340;29341;29342;29343;29344;29345;29346;29347;29348;29349;29350;29351;29352;29353;29354;29355;29356;29357;29358;29359;29360 37691;37692;37693;37694;37695;37696;37697;37698;37699;37700;37701;37702;37703;37704;37705;37706;37707;37708;37709;37710;37711;37712;37713;37714;37715;37716;37717;37718;37719;37720;37721;37722;37723;37724;37725;37726 37691 36 APVDITGQFEK Unmodified 1203.6136 0.61355299 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 69.08 69.08 2 0.00046475 68450 QUIQUE_C1277_190116_001 106.16 68.439 410140000 139790000 116580000 0 0 0 0 0 95553000 0 58217000 0 0 0 3221 617 2992 29361;29362;29363;29364;29365 37727;37728;37729;37730;37731 37728 5 APVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFR Unmodified 3558.8246 0.82461499 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 180.84 180.84 4 1.643E-10 183852 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.096 59.191 47472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33294000 14178000 0 3222 3753 2993 29366;29367 37732;37733;37734 37734 3 APVGSAPGTSFLGSEPAR Unmodified 1699.8529 0.85294842 3296 Q5SRE7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.359 74.359 2 4.6381E-31 76445 QUIQUE_C1218_190116_001 187.11 170.86 1585600000 182070000 114410000 70827000 75153000 146410000 88386000 117500000 126720000 150770000 74722000 165340000 106720000 166580000 3223 3296 2994 29368;29369;29370;29371;29372;29373;29374;29375;29376;29377;29378;29379;29380;29381;29382 37735;37736;37737;37738;37739;37740;37741;37742;37743;37744;37745;37746;37747;37748;37749;37750;37751;37752;37753 37736 17 APVGSVVSVPSQSSASSDK Unmodified 1787.8901 0.89012178 2608 P52594 AGFG1 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.694 49.694 2 5.5206E-36 47138 QUIQUE_C1277_190116_001 197.19 182.93 577450000 50816000 43481000 48429000 67765000 58410000 68931000 36192000 20044000 33260000 26727000 32673000 38078000 52645000 3224 2608 2995 29383;29384;29385;29386;29387;29388;29389;29390;29391;29392;29393;29394;29395 37754;37755;37756;37757;37758;37759;37760;37761;37762;37763;37764;37765;37766 37755 13 APVIIIPQSSVSPNAVIADLGLIR Unmodified 2442.421 0.42099519 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.11 166.11 3 2.0908E-11 170193 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.762 77.486 405740000 0 26932000 59505000 0 30911000 0 22638000 41356000 40149000 23284000 44769000 73465000 42734000 3225 3428 2996 29396;29397;29398;29399;29400;29401;29402;29403;29404;29405 37767;37768;37769;37770;37771;37772;37773;37774;37775;37776 37775 10 APVILGSPDDVLEFLK Unmodified 1711.9396 0.93963816 1962 P09467;A0A3B3IUC7 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.92 158.92 2 4.8058E-05 162764 QUIQUE_C1403_190116_001 120.55 85.663 291270000 0 0 62101000 59769000 0 41380000 38227000 28101000 48176000 13512000 0 0 0 3226 1962 2997 29406;29407;29408;29409;29410;29411;29412 37777;37778;37779;37780;37781;37782;37783;37784 37779 6 APVIRPGGTLGLSEAADSDAHLFQDSTEPR Unmodified 3106.532 0.53195521 4093 Q9C0C2 TNKS1BP1 182 kDa tankyrase-1-binding protein yes yes 0 0 1 1 104.81 104.81 4 0.063601 106859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 16.966 10.167 30779000 0 0 0 0 0 0 0 30779000 0 0 0 0 0 3227 4093 2998 29413 37785 37785 1 APVIWDNIHANDYDQK Unmodified 1897.8959 0.89587586 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 0 1 1 1 79.777 79.777 3 0.0043133 80512 QUIQUE_C1403_190116_001 32.746 21.371 147110000 0 56641000 0 42172000 0 48301000 0 0 0 0 0 0 0 3228 1579 2999 29414;29415;29416 37786;37787;37788 37787 3 APVKPGIPYK Unmodified 1068.6332 0.63316622 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 23.956 23.956 3 0.0019958 16980 QUIQUE_C1368_190116_001 70.908 51.814 137420000 76999000 0 60425000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3229 2993 3000 29417;29418 37789;37790 37790 2 APVLFNK Unmodified 787.45922 0.4592246 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 35.511 35.511 2 0.020857 30634 QUIQUE_C1403_190116_001 106.84 76.774 468680000 99529000 0 0 81756000 0 0 0 85438000 122400000 0 0 0 79557000 3230 2993 3001 29419;29420;29421;29422;29423 37791;37792;37793;37794;37795;37796 37792 6 APVLLSSLDR Unmodified 1069.6132 0.61315906 4384 Q9P2B2 PTGFRN Prostaglandin F2 receptor negative regulator yes yes 0 0 0 1 77.731 77.731 2 0.063897 77724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.756 29.602 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3231 4384 3002 29424 37797 37797 1 APVLPVGTELPAGTLPSEQLPPFPGPSLTQSQQPLEDLDAQLR Unmodified 4503.3537 0.35371007 988 F5GWT4;Q9H4A3 WNK1 Serine/threonine-protein kinase WNK1 yes no 0 0 0 1 1 166.59 166.59 4 5.9964E-05 169707 QUIQUE_C1403_190116_001 43.951 41.71 46037000 0 0 0 25895000 0 20142000 0 0 0 0 0 0 0 3232 988 3003 29425;29426 37798;37799 37798 2 APVLSDSSCK Unmodified 1062.5016 0.5015597 761 CON__P00761 yes yes 0 0 0 1 1 19.07 19.07 2 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2312;1995;2316;2318;377;2315;2317;2314 A0A1W2PPR8;P01889;F6U0H7;P10316;P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30461;P30479;P30480;P30462;P30481;A0A140T9Y5;A0A140T997;A0A140TA14;A0A140TA11;P30685;P30491;P30498;P30490;P18464 HLA-B;HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.67 113.67 2 3.9346E-22 117293 QUIQUE_C1368_190116_001 180.97 168.7 2059800000 185100000 98439000 216340000 155380000 114080000 84905000 91674000 84033000 141690000 52048000 500100000 120540000 215520000 3246 377;1995;2312;2314;2315;2316;2317;2318 3017 29558;29559;29560;29561;29562;29563;29564;29565;29566;29567;29568;29569;29570 37987;37988;37989;37990;37991;37992;37993;37994;37995;37996;37997;37998;37999;38000;38001;38002 37990 16 APWIEQERPEYWDQETR Unmodified 2232.0236 0.023595574 2104 P16188 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain no no 0 0 1 1 1 1 1 1 92.833 92.833 3 3.0821E-23 94460 QUIQUE_C1403_190116_001 123.03 113.62 479250000 0 61042000 151520000 167000000 0 57477000 0 42209000 0 0 0 0 0 3247 2104 3018 29571;29572;29573;29574;29575 38003;38004;38005;38006;38007 38005 5 APWVEQEGPEYWDR Unmodified 1760.7794 0.77944912 325 O19617;A0A140T921;A0A140T9H5;A0A140T9U8;A2AEA2;P10321;A0A140TA05;A0A140T9L3;A0A140T9E1;A0A140T942;F8W9Z8;A0A140TA12;A0A140T9Z7;A0A140TA19;A0A140T9S7;A0A140T9Q4 HLA-C HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.5 104.5 2 1.2038E-14 108471 QUIQUE_C1218_190116_001 148.18 135.97 204650000 54462000 0 0 0 0 24311000 47081000 0 0 14388000 64407000 0 0 3248 325 3019 29576;29577;29578;29579;29580 38008;38009;38010;38011;38012 38008 5 APYFSGSSTFSPTILSSDKETIEIIDLAK Unmodified 3116.5805 0.58052812 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 1 1 1 151.36 151.36 3 7.5226E-05 153607 QUIQUE_C1563_190116_001 37.344 31.858 153600000 0 0 0 0 0 65884000 87719000 0 0 0 0 0 0 3249 356 3020 29581;29582 38013;38014 38013 2 AQAALAVNISAAR Unmodified 1254.7044 0.70443369 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 60.111 60.111 2 0.0292 58864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.08 54.552 74283000 0 37496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36787000 0 3250 2424 3021 29583;29584;29585 38015;38016;38017 38016 3 AQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLR Unmodified 3679.8774 0.87741239 322 A0A0U1RRM4;P26599;A6NLN1;A0A087WU68 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 1 168.97 168.97 3;4 1.3764E-129 173312 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.1 168.83 941890000 85958000 58024000 70909000 59015000 37835000 87982000 0 138020000 80640000 0 228850000 46933000 47728000 3251 322 3022 29586;29587;29588;29589;29590;29591;29592;29593;29594;29595;29596;29597;29598;29599;29600;29601;29602 38018;38019;38020;38021;38022;38023;38024;38025;38026;38027;38028;38029;38030;38031;38032;38033;38034 38030 17 AQAALVEFVEDVNHAAIPR Unmodified 2049.0643 0.064338176 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 137.96 137.96 3 8.4511E-05 134044 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1491100000 1034900000 3254 3117 3025 29620;29621;29622;29623;29624;29625;29626;29627;29628;29629;29630;29631;29632;29633;29634;29635;29636;29637;29638;29639;29640;29641;29642;29643;29644;29645 38059;38060;38061;38062;38063;38064;38065;38066;38067;38068;38069;38070;38071;38072;38073;38074;38075;38076;38077;38078;38079;38080;38081;38082;38083;38084;38085;38086;38087;38088;38089;38090;38091;38092;38093;38094;38095;38096;38097;38098 38065 40 AQAELENVSGALNEAESK Unmodified 1858.8909 0.89085007 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.749 85.749 2 2.8136E-122 87363 QUIQUE_DMIX3_190116_001 229.9 203.19 912140000 77781000 74401000 81903000 72057000 86954000 71600000 80482000 59408000 61912000 31124000 84334000 71937000 58248000 3255 3459 3026 29646;29647;29648;29649;29650;29651;29652;29653;29654;29655;29656;29657;29658 38099;38100;38101;38102;38103;38104;38105;38106;38107;38108;38109;38110;38111 38107 13 AQAELNALK Unmodified 956.5291 0.52909508 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 0 1 30.273 30.273 2 0.042881 23863 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.716 13.924 23864000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23864000 0 0 0 3256 1009 3027 29659 38112 38112 1 AQAELVGTADEATR Unmodified 1430.7001 0.70013617 2303 P30049 ATP5D ATP synthase subunit delta, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.361 41.361 2 3.5132E-22 36891 QUIQUE_C1368_190116_001 161.94 59.882 6713900000 831660000 650190000 535320000 447260000 528910000 581560000 549430000 296430000 432100000 202250000 539940000 458120000 660700000 3257 2303 3028 29660;29661;29662;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;29672;29673;29674;29675;29676 38113;38114;38115;38116;38117;38118;38119;38120;38121;38122;38123;38124;38125;38126;38127;38128;38129;38130;38131;38132;38133;38134;38135;38136;38137;38138;38139;38140;38141;38142;38143;38144 38122 32 AQAEVEGLGK Unmodified 1000.5189 0.51892433 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.832 23.832 2 0.00057519 17987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.48 81.372 4386900000 409000000 382300000 0 208540000 374350000 208790000 0 540480000 523340000 429800000 604110000 432430000 273760000 3258 3117 3029 29677;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;29686;29687 38145;38146;38147;38148;38149;38150;38151;38152;38153;38154;38155;38156;38157;38158;38159;38160;38161 38153 15 AQAGEGVRPSPMQLELR Oxidation (M) 1853.9418 0.9417802 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 49.192 49.192 3 0.00069258 45988 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.558 50.821 1567500000 60229000 128300000 112170000 108170000 108810000 97728000 0 189520000 186180000 222810000 0 194810000 158770000 3259 1423 3030 29688;29689;29690;29691;29692;29693;29694;29695;29696;29697;29698;29699 38162;38163;38164;38165;38166;38167;38168;38169;38170;38171;38172;38173;38174;38175 38172 793 14 AQAGEGVRPSPMQLELR Unmodified 1837.9469 0.94686558 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 63.502 63.502 2;3 3.1581E-09 62285 QUIQUE_C1368_190116_001 117.03 68.288 4934100000 399550000 409740000 368960000 479950000 205890000 389050000 251310000 557280000 465420000 104160000 450000000 445910000 406910000 3260 1423 3030 29700;29701;29702;29703;29704;29705;29706;29707;29708;29709;29710;29711;29712;29713;29714;29715;29716;29717;29718;29719;29720;29721;29722 38176;38177;38178;38179;38180;38181;38182;38183;38184;38185;38186;38187;38188;38189;38190;38191;38192;38193;38194;38195;38196;38197;38198;38199;38200;38201;38202;38203;38204;38205;38206;38207;38208;38209 38185 33 AQAGVVGEVTQVLCAAGGALELPELR Acetyl (Protein N-term) 2649.3796 0.37960066 1100 G5E9U9;Q9H0J9 PARP12 Poly [ADP-ribose] polymerase 12 yes no 1 0 0 1 180.11 180.11 3 2.3122E-05 186781 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.237 58.962 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3261 1100 3031 29723 38210 38210 1 AQALAIETEAELQR Unmodified 1541.8049 0.80493559 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 79.72 79.72 2 0.000164 80703 QUIQUE_C1576_190116_001 110.66 85.808 256960000 27880000 44826000 0 43795000 0 30861000 42201000 33732000 0 33665000 0 0 0 3262 3086 3032 29724;29725;29726;29727;29728;29729;29730;29731;29732;29733;29734;29735 38211;38212;38213;38214;38215;38216;38217;38218;38219;38220;38221;38222;38223 38217 13 AQALLADVDTLLFDCDGVLWR Unmodified 2390.194 0.19403172 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 171.99 171.99 2 8.7306E-08 177104 QUIQUE_C1576_190116_001 98.694 85.575 231650000 0 0 0 0 0 0 87354000 0 0 0 144300000 0 0 3263 531 3033 29736;29737 38224;38225 38224 2 AQALQEECGYLR Unmodified 1436.6718 0.67181293 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.882 55.882 2 0.00051794 53808 QUIQUE_C1403_190116_001 116.52 99.492 1110100000 182640000 151930000 148010000 74457000 0 122480000 197470000 52974000 0 0 104780000 75365000 0 3264 2033 3034 29738;29739;29740;29741;29742;29743;29744;29745;29746;29747 38226;38227;38228;38229;38230;38231;38232;38233;38234;38235;38236;38237 38231 12 AQALSEEEFQR Acetyl (Protein N-term) 1348.6259 0.62590859 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 94.938 94.938 2 0.00052617 96527 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.696 67.267 200980000 0 0 0 0 0 0 0 36968000 31340000 0 45016000 45535000 42118000 3265 3241 3035 29748;29749;29750;29751;29752 38238;38239;38240;38241;38242;38243 38238 6 AQALVQYLEEPLTQVAAS Unmodified 1930.0048 0.004757612 4563 Q9Y2Q5 LAMTOR2 Ragulator complex protein LAMTOR2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.35 160.35 2;3 0.0020265 162643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.479 62.711 635970000 35844000 70419000 36966000 0 0 38939000 37373000 58730000 70920000 17443000 70334000 118960000 80049000 3266 4563 3036 29753;29754;29755;29756;29757;29758;29759;29760;29761;29762;29763;29764 38244;38245;38246;38247;38248;38249;38250;38251;38252;38253;38254;38255 38250 12 AQAQELQEEEERPGAGAASPR Unmodified 2223.0516 0.051601238 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.887 35.887 3 3.7785E-14 31987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.84 90.377 164130000 41064000 0 21710000 25648000 29002000 25367000 0 21339000 0 0 0 0 0 3267 4519 3037 29765;29766;29767;29768;29769;29770 38256;38257;38258;38259;38260;38261 38261 6 AQAQPIQLTDLYPGMTYTLR Unmodified 2279.162 0.16200331 1691 O94856;H7C073 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 140.94 140.94 2 2.1427E-06 148320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.063 79.436 49923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49923000 0 0 3268 1691 3038 29771 38262 38262 1 AQASEILLEELQQGLSQAK Unmodified 2055.0848 0.084798847 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 153.06 153.06 2;3 1.247E-46 155686 QUIQUE_C1563_190116_001 127.59 99.872 1225900000 79325000 102140000 81966000 61552000 91234000 68325000 154610000 68571000 95657000 39530000 151720000 163590000 67717000 3269 3125 3039 29772;29773;29774;29775;29776;29777;29778;29779;29780;29781;29782;29783;29784;29785;29786;29787 38263;38264;38265;38266;38267;38268;38269;38270;38271;38272;38273;38274;38275;38276;38277;38278;38279;38280;38281;38282;38283;38284 38270 22 AQASSIPVGSR Unmodified 1071.5673 0.5672715 3951 Q99426;K7EP07;K7EK42 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.336 21.336 2 0.00032535 14220 QUIQUE_C1368_190116_001 118.71 54.447 2317500000 369430000 350460000 388290000 300230000 0 351410000 346250000 0 0 211420000 0 0 0 3270 3951 3040 29788;29789;29790;29791;29792;29793;29794 38285;38286;38287;38288;38289;38290;38291;38292;38293 38288 7 AQATISVLQKPR Unmodified 1310.767 0.76703394 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BQ94 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.309 32.309 2;3 0.017282 26516 QUIQUE_C1368_190116_001 45.911 37.606 774640000 102790000 77785000 218590000 0 70444000 0 0 0 115910000 59691000 0 129430000 0 3271 4641 3041 29795;29796;29797;29798;29799;29800;29801 38294;38295;38296;38297;38298;38299;38300;38301 38297 5 AQATPDHVLFMLLNAK Unmodified 1767.9342 0.93417563 4380 Q9P265 DIP2B Disco-interacting protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 135.54 135.54 3 0.00033319 138958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.972 59.314 81841000 0 0 0 0 0 0 0 17954000 15278000 0 12911000 22238000 13460000 3272 4380 3042 29802;29803;29804;29805;29806 38302;38303;38304;38305;38306 38302 5 AQATQLLEGLVQELQK Unmodified 1767.9731 0.97306355 1320 K7EK35;P42229;C9JVV6 STAT5A Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A yes no 0 0 0 1 156.78 156.78 3 0.00071944 159477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.813 57.758 14922000 0 0 0 0 0 0 0 14922000 0 0 0 0 0 3273 1320 3043 29807 38307 38307 1 AQAVHPGYGFLSENK Unmodified 1616.7947 0.79470526 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 51.645 51.645 2;3 1.087E-43 50446 QUIQUE_C1218_190116_001 179.59 157.11 684170000 49452000 0 56665000 181360000 0 108830000 187870000 0 26861000 40157000 0 32987000 0 3274 1881 3044 29808;29809;29810;29811;29812;29813;29814;29815;29816;29817;29818;29819 38308;38309;38310;38311;38312;38313;38314;38315;38316;38317;38318;38319 38308 11 AQAVHPGYGFLSENKEFAR Unmodified 2120.0439 0.043937085 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 65.895 65.895 3 0.0013249 64800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.414 47.664 32116000 0 0 0 0 0 0 0 32116000 0 0 0 0 0 3275 1881 3045 29820;29821 38320;38321 38320 2 AQAVLEEDHYGMEDVK Unmodified 1832.8251 0.82507869 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.039 61.039 2;3 1.9177E-14 59744 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 120.9 145930000 24807000 22539000 33594000 0 64989000 0 0 0 0 0 0 0 0 3276 1324 3046 29822;29823;29824;29825;29826 38322;38323;38324;38325;38326 38324 5 AQAVLEEDHYGMEDVK Oxidation (M) 1848.82 0.81999331 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 1 1 42.284 42.284 2;3 0.0032634 39009 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.559 43.286 168380000 0 0 0 0 0 0 0 0 57917000 31599000 0 32568000 46294000 3277 1324 3046 29827;29828;29829;29830;29831 38327;38328;38329;38330;38331 38327 749 5 AQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPVLR Unmodified 3662.9479 0.94791802 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 136.09 136.09 3;4 1.2679E-54 141721 QUIQUE_C1218_190116_001 109.09 100.55 317800000 27850000 0 0 37576000 0 33808000 0 103290000 32883000 0 0 82389000 0 3278 4471 3047 29832;29833;29834;29835;29836;29837;29838;29839 38332;38333;38334;38335;38336;38337;38338;38339;38340;38341;38342 38332 11 AQAVLQQYQHLPSFR Unmodified 1784.9322 0.93220179 4449 Q9UID3;E9PJ36;E9PKX7;E9PRV0 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.28 83.28 3 0.00030341 85998 QUIQUE_C1218_190116_001 69.261 62.691 417000000 54104000 52653000 0 47136000 56505000 32348000 47895000 46691000 33716000 0 0 0 45950000 3279 4449 3048 29840;29841;29842;29843;29844;29845;29846;29847;29848;29849 38343;38344;38345;38346;38347;38348;38349;38350;38351;38352 38343 6 AQAVSEDAGGNEGR Unmodified 1359.6015 0.60148476 2674 P55884;C9JZG1 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.433 14.433 2 2.353E-10 6629 QUIQUE_C1438_190116_001 133.91 121.68 1518700000 133320000 103150000 129800000 107320000 144680000 102580000 138150000 83805000 159010000 27422000 150640000 107290000 131480000 3280 2674 3049 29850;29851;29852;29853;29854;29855;29856;29857;29858;29859;29860;29861;29862 38353;38354;38355;38356;38357;38358;38359;38360;38361;38362;38363;38364;38365;38366 38358 12 AQAVTQPVPLANKPVPAQSTFPSK Unmodified 2475.3486 0.34855853 2540 P49750;H0YIQ2 YLPM1 YLP motif-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 68.915 68.915 3 0.00014705 68144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.25 43.37 36396000 0 0 0 0 0 0 0 36396000 0 0 0 0 0 3281 2540 3050 29863 38367;38368 38367 2 AQAWCYSK Unmodified 1012.4437 0.44365089 2576 P51149;C9J592;C9J8S3;C9J4V0;C9IZZ0 RAB7A Ras-related protein Rab-7a yes no 0 0 0 1 31.169 31.169 2 0.045999 25619 QUIQUE_C1277_190116_001 98.299 87.23 141880000 0 141880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3282 2576 3051 29864 38369 38369 0 AQCEDDLAEK Unmodified 1177.4921 0.49211723 2944 Q12797;A0A087WW51 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes no 0 0 0 1 1 1 18.082 18.082 2 0.01651 10309 QUIQUE_C1277_190116_001 62.558 51.195 41018000 16088000 10609000 0 14320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3283 2944 3052 29865;29866;29867 38370;38371;38372 38371 3 AQCGGGLLGVR Unmodified 1086.5604 0.56041199 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.012 44.012 2 8.2848E-05 41231 QUIQUE_C1438_190116_001 134.15 112.47 20260000000 1043900000 1033000000 1775100000 572470000 1587400000 898490000 3200000000 1157600000 1358800000 651730000 2081000000 2669100000 2231900000 3284 912;826 3053 29868;29869;29870;29871;29872;29873;29874;29875;29876;29877;29878;29879;29880 38373;38374;38375;38376;38377;38378;38379;38380;38381;38382;38383;38384;38385;38386;38387;38388;38389;38390;38391;38392;38393;38394;38395;38396;38397;38398;38399;38400;38401;38402;38403;38404;38405;38406;38407;38408;38409;38410;38411 38385 39 AQCPIVER Unmodified 971.48585 0.48585006 1370 M0R0F0;M0R0R2;P46782 RPS5 40S ribosomal protein S5;40S ribosomal protein S5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 20.105 20.105 2 0.022385 13235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.255 56.869 133220000 0 0 0 0 0 0 0 0 133220000 0 0 0 0 3285 1370 3054 29881 38412 38412 1 AQDAPLSLLQTQGGR Unmodified 1553.8162 0.81616898 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 87.03 87.03 2 0.00017988 89456 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.31 83.864 71503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71503000 3286 2515 3055 29882 38413 38413 1 AQDEGLLSDVVPFK Unmodified 1516.7773 0.77732386 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.72 128.72 2 0.00022607 133385 QUIQUE_C1368_190116_001 112.13 94.689 1289600000 152610000 141730000 248950000 191270000 0 144470000 129430000 0 91056000 90815000 0 0 99235000 3287 2660 3056 29883;29884;29885;29886;29887;29888;29889;29890;29891 38414;38415;38416;38417;38418;38419;38420;38421;38422 38416 4 AQDEGLLSDVVPFKVPGK Unmodified 1898.0149 0.014928368 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 1 1 1 1 122.26 122.26 3 0.0047975 125532 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.604 39.945 277790000 0 0 63475000 0 0 0 0 72061000 0 0 142250000 0 0 3288 2660 3057 29892;29893;29894 38423;38424;38425 38424 3 AQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSR Unmodified 3628.7897 0.78968604 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.17 153.17 3 3.693E-21 160287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.554 77.785 918220000 34116000 60550000 74369000 82457000 74348000 41343000 0 0 119730000 14772000 123340000 100410000 192790000 3289 2466 3058 29895;29896;29897;29898;29899;29900;29901;29902;29903;29904;29905 38426;38427;38428;38429;38430;38431;38432;38433;38434;38435;38436;38437 38435 12 AQDGSHPLSLQDLIEK Unmodified 1749.8897 0.88972785 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 96.367 96.367 2;3 8.2518E-06 97994 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.73 68.204 182700000 23772000 39754000 0 0 0 0 0 89415000 0 29754000 0 0 0 3290 821 3059 29906;29907;29908;29909;29910;29911 38438;38439;38440;38441;38442;38443;38444 38443 7 AQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTK Unmodified 2620.2902 0.29017653 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 1 1 1 2 2 1 1 156.16 156.16 2;3 1.5204E-19 160220 QUIQUE_C1277_190116_001 144.72 128.53 978210000 122410000 102120000 123480000 95837000 87418000 95993000 24166000 70899000 68541000 69956000 0 52877000 64521000 3291 2573 3060 29912;29913;29914;29915;29916;29917;29918;29919;29920;29921;29922;29923;29924;29925;29926;29927;29928;29929;29930;29931 38445;38446;38447;38448;38449;38450;38451;38452;38453;38454;38455;38456;38457;38458;38459;38460;38461;38462;38463;38464;38465;38466;38467 38450 22 AQDIQCGLQSR Unmodified 1274.6037 0.60373336 3707 Q8WVJ2;E5RFP0 NUDCD2 NudC domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.21 29.21 2 3.231E-06 23951 QUIQUE_C1576_190116_001 147.95 96.881 1064100000 67213000 65762000 125760000 77600000 85009000 91954000 112050000 59608000 62998000 26026000 108230000 98171000 83694000 3292 3707 3061 29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941;29942;29943;29944 38468;38469;38470;38471;38472;38473;38474;38475;38476;38477;38478;38479;38480;38481 38475 14 AQDITLPHLCSVLLAFAR Unmodified 2024.0877 0.087716155 3790 Q969Z0;H7C4R5 TBRG4 Protein TBRG4 yes no 0 0 0 1 1 153.14 153.14 3 9.6196E-05 160766 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.012 61.889 16470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16470000 0 0 3293 3790 3062 29945;29946 38482;38483 38482 2 AQDLSNLENTVAALK Unmodified 1585.8312 0.83115034 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 118.27 118.27 2 0.01187 115021 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.328 40.438 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3294 4249 3063 29947 38484 38484 1 AQDPSEVLTMLTNETGFEISSSDATVK Unmodified 2869.3539 0.353899 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 2 1 1 163.94 163.94 2;3 3.8823E-19 169012 QUIQUE_C1218_190116_001 91.767 83.148 172200000 116420000 0 30663000 0 0 0 0 0 0 25120000 0 0 0 3295 626 3064 29948;29949;29950;29951 38485;38486;38487;38488 38486 4 AQDQGEKENPMR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1459.6362 0.6361557 2771 P62913 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes yes 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.58 14.58 2 0.00061116 6551 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.752 89.564 293150000 0 16876000 18877000 9582000 0 0 24552000 31571000 46393000 0 67583000 33571000 44144000 3296 2771 3065 29952;29953;29954;29955;29956;29957;29958;29959;29960 38489;38490;38491;38492;38493;38494;38495;38496;38497 38497 2202 7 AQDQGEKENPMR Acetyl (Protein N-term) 1443.6412 0.64124108 2771 P62913 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes yes 1 0 1 1 2 1 1 26.032 26.032 2 0.002426 19357 QUIQUE_C1277_190116_001 123.8 109.8 51896000 0 0 0 0 0 0 0 51896000 0 0 0 0 0 3297 2771 3065 29961;29962;29963;29964;29965 38498;38499;38500;38501;38502 38498 4 AQDVDATNPNYEIMCMIR Unmodified 2139.9387 0.93874501 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 125.86 125.86 2 9.5438E-07 131466 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 112.02 54797000 0 0 0 0 0 0 54797000 0 0 0 0 0 0 3298 1377 3066 29966;29967;29968;29969 38503;38504;38505;38506 38504 4 AQEAAATQLGLK Unmodified 1199.651 0.65100113 2559 P50336;H0YFP3;F5GZT7;A0A1W2PPA5;A0A1W2PQM0;F5H825;H0YFE1 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes no 0 0 0 1 39.725 39.725 2 0.0023335 36178 QUIQUE_C1368_190116_001 81.017 28.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3299 2559 3067 29970 38507 38507 1 AQEACGPLEMDSALSVVQNLEK Unmodified 2388.1301 0.13011083 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 148.65 148.65 2;3 9.3273E-45 151501 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.95 142.69 957430000 76336000 70309000 126090000 45112000 120580000 70291000 73931000 68882000 35436000 11669000 99540000 75733000 83516000 3300 4600 3068 29971;29972;29973;29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986;29987;29988;29989;29990;29991;29992;29993 38508;38509;38510;38511;38512;38513;38514;38515;38516;38517;38518;38519;38520;38521;38522;38523;38524;38525;38526;38527;38528;38529;38530;38531;38532;38533;38534;38535;38536 38527 28 AQEADAGPAPWAASSAAACELVLTTMHR Unmodified 2881.3487 0.34871124 340 A0A1B0GTL5;Q9BXF6 RAB11FIP5 Rab11 family-interacting protein 5 yes no 0 0 0 1 143.92 143.92 3 0.0069429 148476 QUIQUE_C1277_190116_001 34.861 28.699 48113000 0 48113000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3301 340 3069 29994 38537 38537 0 AQEAEENYVIK Unmodified 1292.6248 0.62484596 3820 Q96CN4 EVI5L EVI5-like protein yes yes 0 0 0 1 37.833 37.833 2 0.051056 34371 QUIQUE_C1438_190116_001 67.414 45.668 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3302 3820 3070 29995 38538 38538 1 AQEAEQLLR Unmodified 1056.5564 0.55637247 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 39.101 39.101 2 0.010536 34899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.265 19.7 94280000 0 0 0 0 0 0 0 94280000 0 0 0 0 0 3303 2665 3071 29996;29997 38539;38540 38540 2 AQEALDAVSTLEEGHAQYLTSLADASALVAALTR Unmodified 3484.7686 0.76855667 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 170.56 170.56 3;4 5.6306E-150 174929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.08 185.15 918990000 0 22996000 0 0 36077000 0 132980000 168980000 261700000 0 45840000 0 250420000 3304 1613 3072 29998;29999;30000;30001;30002;30003;30004;30005;30006;30007 38541;38542;38543;38544;38545;38546;38547;38548;38549;38550 38546 9 AQEALLQLSQVLSLMETVK Unmodified 2100.15 0.15004164 1586 O60664 PLIN3 Perilipin-3 yes yes 0 0 0 1 2 2 170.64 170.64 2;3 5.648E-29 175476 QUIQUE_C1368_190116_001 145.88 137.02 374150000 0 0 26935000 0 135540000 0 0 0 0 0 0 0 211680000 3305 1586 3073 30008;30009;30010;30011;30012 38551;38552;38553;38554;38555 38551 5 AQEAPGQAEPPAAAEVQGAGNENEPR Unmodified 2587.1899 0.18988563 1441 O14745;J3QRP6 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 3 3 2 56.74 56.74 2;3 4.9371E-143 54821 QUIQUE_C1277_190116_001 270.42 253.75 3141900000 171640000 227530000 209720000 269670000 206810000 227420000 136540000 227030000 296110000 97579000 247690000 322180000 501960000 3306 1441 3074 30013;30014;30015;30016;30017;30018;30019;30020;30021;30022;30023;30024;30025;30026;30027;30028;30029;30030;30031;30032;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;30040;30041;30042 38556;38557;38558;38559;38560;38561;38562;38563;38564;38565;38566;38567;38568;38569;38570;38571;38572;38573;38574;38575;38576;38577;38578;38579;38580;38581;38582;38583;38584;38585;38586;38587;38588;38589;38590;38591;38592;38593;38594;38595;38596;38597;38598;38599;38600;38601 38560 46 AQEDFFQK Unmodified 1011.4662 0.46616048 1718 O95278 EPM2A Laforin yes yes 0 0 0 1 1 44.142 44.142 2 0.033344 41010 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.757 44.203 90598000 0 0 0 0 0 0 54832000 0 0 0 0 35766000 0 3307 1718 3075 30043;30044 38602;38603 38603 2 AQEEAERLEADR Unmodified 1415.6641 0.66408501 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 21.191 21.191 2;3 1.0213E-08 13725 QUIQUE_C1277_190116_001 152.07 114.72 3324800000 0 219350000 42634000 199160000 211450000 0 89450000 672390000 706560000 0 528010000 191760000 464020000 3308 859 3076 30045;30046;30047;30048;30049;30050;30051;30052;30053;30054;30055;30056;30057;30058;30059;30060;30061 38604;38605;38606;38607;38608;38609;38610;38611;38612;38613;38614;38615;38616;38617;38618;38619;38620;38621 38606 17 AQEEWTTGAWK Unmodified 1305.599 0.59896556 3658 Q8TAC9;H3BMY4 SCAMP5 Secretory carrier-associated membrane protein 5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 68.871 68.871 2 0.00036987 69519 QUIQUE_C1438_190116_001 117.31 109.7 1370100000 109960000 121420000 123290000 137600000 90330000 101340000 120710000 117420000 116830000 0 125550000 116410000 89236000 3309 3658 3077 30062;30063;30064;30065;30066;30067;30068;30069;30070;30071;30072;30073;30074;30075 38622;38623;38624;38625;38626;38627;38628;38629;38630;38631;38632;38633;38634;38635;38636 38627 14 AQEFVNCK Acetyl (Protein N-term) 1036.4648 0.46478027 2386 P35754 GLRX Glutaredoxin-1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.25 65.25 2 0.0093888 65548 QUIQUE_C1218_190116_001 79.116 62.659 184380000 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Q9HCC0;D6RDF7;D6R9R1;A0A0G2JM88 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 19.596 19.596 2 0.011606 11991 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.492 48.917 302520000 138570000 0 0 0 0 0 109640000 0 0 0 0 0 54317000 3313 4223 3081 30097;30098;30099 38659;38660;38661 38661 2 AQEILSQLPIK Unmodified 1238.7234 0.72343779 2386 P35754 GLRX Glutaredoxin-1 yes yes 0 0 0 1 90.091 90.091 2 0.055483 93862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.092 35.831 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3314 2386 3082 30100 38662 38662 1 AQEINHLFGPK Unmodified 1252.6564 0.65642086 2468 P45381 ASPA Aspartoacylase yes yes 0 0 0 1 1 1 44.34 44.34 3 0.00056012 41102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.979 55.744 108400000 0 33808000 0 0 0 0 0 45020000 0 29578000 0 0 0 3315 2468 3083 30101;30102;30103 38663;38664;38665 38664 3 AQELDALDNSHPIEVSVGHPSEVDEIFDAISYSK Unmodified 3710.7588 0.75877985 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PJ74;E9PRQ5 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 144.96 144.96 3;4 0 152273 QUIQUE_DMIX5_190116_001 269.65 256.74 2232800000 153300000 132790000 256220000 0 331970000 453740000 192590000 218230000 141840000 0 209240000 142850000 0 3316 959 3084 30104;30105;30106;30107;30108;30109;30110;30111;30112;30113;30114;30115 38666;38667;38668;38669;38670;38671;38672;38673;38674;38675;38676;38677;38678;38679;38680;38681;38682 38680 17 AQELGHSQSALASAQR Unmodified 1652.823 0.82304527 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 22.062 22.062 2 3.2858E-54 15340 QUIQUE_C1368_190116_001 188.92 170.17 33848000 0 0 33848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3317 3091 3085 30116 38683 38683 1 AQELGLAPDMFFCLR Unmodified 1766.8484 0.84839709 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 152.31 152.31 2;3 3.2315E-06 157276 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.39 99.412 404850000 0 0 100590000 0 0 0 0 93393000 0 24295000 122870000 0 63703000 3318 2226 3086 30117;30118;30119;30120;30121;30122 38684;38685;38686;38687;38688;38689;38690 38690 7 AQELQQTGVLGAFESSFWHMQEK Unmodified 2650.2486 0.24858649 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.53 149.53 3 8.3727E-18 155978 QUIQUE_C1438_190116_001 112.85 104.98 967280000 110870000 149920000 111510000 96309000 157270000 55566000 67725000 0 110600000 22298000 0 85215000 0 3319 2665 3087 30123;30124;30125;30126;30127;30128;30129;30130;30131;30132 38691;38692;38693;38694;38695;38696;38697;38698;38699;38700;38701 38695 10 AQELSALLGCEVDADQVILSHSPMK Unmodified 2710.3306 0.33060156 4067 Q9BXW7 CECR5 Cat eye syndrome critical region protein 5 yes yes 0 0 0 1 143.71 143.71 3 0.0035979 146715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.835 26.723 28522000 0 0 0 0 0 0 0 28522000 0 0 0 0 0 3320 4067 3088 30133 38702 38702 1 AQEPLQDQGQR Unmodified 1268.6109 0.61092723 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2;A0A0G2JN53 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.062 18.062 2 0.00025295 10307 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 83.924 153010000 37748000 27240000 20060000 33266000 0 0 0 0 18653000 0 0 16039000 0 3321 4519 3089 30134;30135;30136;30137;30138;30139;30140;30141 38703;38704;38705;38706;38707;38708;38709;38710;38711 38705 6 AQESVGIYEVTHQFVK Unmodified 1833.9261 0.92611336 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 94.132 94.132 2;3 3.4899E-54 96318 QUIQUE_DMIX3_190116_001 188.48 171.11 2596800000 232240000 202750000 334470000 67777000 184030000 197220000 0 195280000 307120000 82784000 251550000 258020000 283540000 3322 4315 3090 30142;30143;30144;30145;30146;30147;30148;30149;30150;30151;30152;30153;30154;30155;30156;30157;30158;30159 38712;38713;38714;38715;38716;38717;38718;38719;38720;38721;38722;38723;38724;38725;38726;38727;38728;38729;38730;38731;38732;38733 38727 22 AQFAEATQR Unmodified 1020.4989 0.49885759 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.395 19.395 2 0.0034294 12238 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.318 47.504 897350000 85384000 105810000 95992000 85727000 82231000 0 92917000 0 88677000 0 90239000 86731000 83642000 3323 1692 3091 30160;30161;30162;30163;30164;30165;30166;30167;30168;30169 38734;38735;38736;38737;38738;38739;38740;38741;38742;38743 38742 9 AQFAQPEILIGTIPGAGGTQR Unmodified 2124.1328 0.13275209 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 125.83 125.83 2;3 2.0824E-53 132044 QUIQUE_C1438_190116_001 210.34 193.12 11073000000 920000000 822830000 1211000000 682830000 868470000 717950000 829220000 604400000 835850000 296740000 1148800000 928190000 1207000000 3324 2305 3092 30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176;30177;30178;30179;30180;30181;30182;30183;30184;30185;30186;30187;30188;30189;30190;30191;30192;30193;30194;30195;30196 38744;38745;38746;38747;38748;38749;38750;38751;38752;38753;38754;38755;38756;38757;38758;38759;38760;38761;38762;38763;38764;38765;38766;38767;38768;38769;38770;38771;38772;38773;38774;38775;38776;38777;38778;38779;38780;38781;38782;38783;38784;38785;38786;38787;38788;38789;38790 38760 46 AQFEGIVTDLIR Unmodified 1360.7351 0.73506511 2415 P38646;H0YBG6 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 128.89 128.89 2;3 2.9925E-06 134039 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 110.23 13603000000 1290100000 964530000 1307300000 835230000 1142700000 1052300000 1195900000 802930000 1032600000 525370000 1274400000 1095500000 1084100000 3325 2415 3093 30197;30198;30199;30200;30201;30202;30203;30204;30205;30206;30207;30208;30209;30210;30211;30212;30213;30214;30215;30216;30217;30218;30219;30220;30221 38791;38792;38793;38794;38795;38796;38797;38798;38799;38800;38801;38802;38803;38804;38805;38806;38807;38808;38809;38810;38811;38812;38813;38814;38815;38816;38817;38818;38819;38820;38821;38822;38823;38824;38825;38826;38827;38828;38829;38830;38831;38832;38833;38834;38835;38836;38837;38838;38839 38800 49 AQFEQLCASLLAR Unmodified 1505.766 0.76604767 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.61 110.61 2 0.00074528 113688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.507 60.126 1349100000 0 209250000 205320000 0 211920000 0 0 174090000 0 0 334570000 0 213940000 3326 1748 3094 30222;30223;30224;30225;30226;30227 38840;38841;38842;38843;38844;38845 38843 5 AQFEQLK Unmodified 862.45487 0.45486751 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 26.502 26.502 1;2 1.707E-07 20303 QUIQUE_C1438_190116_001 215.07 35.097 1158400000 0 0 0 0 79390000 0 0 0 723280000 355740000 0 0 0 3327 3117 3095 30228;30229;30230 38846;38847;38848 38846 2 AQFEQLKDGK Unmodified 1162.5982 0.59823728 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 20.441 20.441 2;3 2.2871E-13 13793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 173.37 145.29 1400800000 0 0 0 0 0 0 0 863250000 0 0 537520000 0 0 3328 3117 3096 30231;30232;30233 38849;38850;38851 38849 2 AQFETLQQLVQHYSER Unmodified 1975.9752 0.97518882 1898 P06241 FYN Tyrosine-protein kinase Fyn yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 125.31 125.31 2;3 1.0304E-13 130503 QUIQUE_C1576_190116_001 134.14 114.05 881330000 0 91824000 109200000 57613000 58442000 69026000 96209000 77642000 67204000 36779000 92252000 51029000 74107000 3329 1898 3097 30234;30235;30236;30237;30238;30239;30240;30241;30242;30243;30244;30245;30246;30247;30248;30249;30250 38852;38853;38854;38855;38856;38857;38858;38859;38860;38861;38862;38863;38864;38865;38866;38867;38868 38860 16 AQFEYDPAKDDLIPCK Unmodified 1908.8928 0.89276432 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 1 1 1 87.299 87.299 2 0.0049658 89695 QUIQUE_C1576_190116_001 73.435 55.167 164100000 39454000 0 40545000 0 0 0 52131000 0 0 0 0 31966000 0 3330 472;1460 3098 30251;30252;30253;30254 38869;38870;38871;38872 38871 4 AQFFLGTTNK Unmodified 1125.5819 0.58185894 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 62.868 62.868 2 0.013795 63151 QUIQUE_C1218_190116_001 78.149 53.946 138200000 54609000 0 0 0 83596000 0 0 0 0 0 0 0 0 3331 4310 3099 30255;30256 38873;38874 38873 2 AQFFLGTTNKR Unmodified 1281.683 0.68296996 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 39.808 39.808 3 0.019277 35842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.94 21.562 24979000 0 0 0 0 0 0 0 24979000 0 0 0 0 0 3332 4310 3100 30257 38875 38875 1 AQFLVEK Unmodified 833.4647 0.46470391 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 34.645 34.645 2 0.01947 29213 QUIQUE_C1563_190116_001 116.54 49.549 832950000 0 0 0 0 0 364330000 0 0 338630000 129990000 0 0 0 3333 1272 3101 30258;30259;30260 38876;38877;38878 38876 3 AQFSVAGVHTVPGSPQAR Unmodified 1807.9329 0.93293007 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.994 56.994 3 0.00010057 56164 QUIQUE_C1218_190116_001 70.335 58.189 161520000 31831000 35459000 0 0 50033000 27109000 0 0 0 17087000 0 0 0 3334 422 3102 30261;30262;30263;30264;30265 38879;38880;38881;38882;38883 38879 4 AQGFTEDTIVFLPQTDK Unmodified 1908.9469 0.94690838 2436 P41222 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 123.34 123.34 2;3 5.3994E-30 128409 QUIQUE_C1218_190116_001 188.19 179.68 9386400000 469360000 813610000 1075000000 780700000 988800000 515990000 930240000 752620000 641530000 386280000 633510000 733410000 665370000 3335 2436 3103 30266;30267;30268;30269;30270;30271;30272;30273;30274;30275;30276;30277;30278;30279;30280;30281;30282;30283;30284;30285 38884;38885;38886;38887;38888;38889;38890;38891;38892;38893;38894;38895;38896;38897;38898;38899;38900;38901;38902;38903;38904;38905;38906;38907;38908;38909;38910;38911;38912;38913;38914;38915;38916;38917 38884 31 AQGGSSDSSLALHER Unmodified 1513.7121 0.71209784 2919 Q08378 GOLGA3 Golgin subfamily A member 3 yes yes 0 0 0 1 1 19.861 19.861 3 0.030121 12432 QUIQUE_C1277_190116_001 25.957 14.164 57677000 0 22120000 0 0 35557000 0 0 0 0 0 0 0 0 3336 2919 3104 30286;30287 38918;38919 38918 2 AQGIAQGAIR Unmodified 983.55123 0.55122751 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.966 22.966 2 0.00014671 16148 QUIQUE_C1576_190116_001 122.13 66.598 1408200000 154290000 135710000 120990000 85527000 208940000 85196000 128420000 112300000 130400000 0 0 121390000 125070000 3337 2665 3105 30288;30289;30290;30291;30292;30293;30294;30295;30296;30297;30298 38920;38921;38922;38923;38924;38925;38926;38927;38928;38929;38930 38926 10 AQGLIEVER Acetyl (Protein N-term) 1055.5611 0.56112349 4028 Q9BU02;G3V5B9;G3V5Q5 THTPA Thiamine-triphosphatase yes no 1 0 0 1 1 1 1 95.343 95.343 2 0.0083882 97770 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.679 25.613 9453600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9453600 0 0 0 3338 4028 3106 30299;30300;30301;30302 38931;38932;38933;38934 38934 4 AQGMPEGGGALAEGFQVR Unmodified 1773.8468 0.84681718 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 92.643 92.643 2 0.014297 95200 QUIQUE_C1218_190116_001 62.287 39.061 31706000 31706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3339 1705 3107 30303 38935 38935 1 AQGPAASAEEPKPVEAPAANSDQTVTVK Unmodified 2762.3723 0.37226668 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 51.089 51.089 3 1.1029E-45 49091 QUIQUE_C1218_190116_001 139.93 129.95 351200000 131170000 0 0 130000000 0 90035000 0 0 0 0 0 0 0 3340 2817 3108 30304;30305;30306 38936;38937;38938;38939 38936 4 AQGPAASAEEPKPVEAPAANSDQTVTVKE Unmodified 2891.4149 0.41485977 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.565 54.565 3 5.734E-108 52470 QUIQUE_C1403_190116_001 177.78 163.72 2169600000 190070000 255010000 225530000 250950000 395060000 197460000 252010000 42415000 33234000 25366000 113160000 65708000 123650000 3341 2817 3109 30307;30308;30309;30310;30311;30312;30313;30314;30315;30316;30317;30318;30319 38940;38941;38942;38943;38944;38945;38946;38947;38948;38949;38950;38951;38952 38943 13 AQGPAGQEADGPR Unmodified 1252.5796 0.5796271 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.604 14.604 2 2.3066E-31 6838 QUIQUE_C1438_190116_001 180.15 164.94 446320000 48940000 35029000 45305000 44294000 53197000 49317000 36494000 0 30197000 0 42608000 22034000 38905000 3342 4517 3110 30320;30321;30322;30323;30324;30325;30326;30327;30328;30329;30330;30331 38953;38954;38955;38956;38957;38958;38959;38960;38961;38962;38963;38964;38965;38966 38958 12 AQGPDGGLTASTYSYLGGFDSSSNVLAGQLR Unmodified 3088.4738 0.47377163 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 147.95 147.95 3 9.4107E-31 150818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.123 91.145 301060000 0 0 0 33976000 0 0 0 68580000 57303000 0 49663000 46059000 45483000 3343 3418 3111 30332;30333;30334;30335;30336;30337;30338 38967;38968;38969;38970;38971;38972;38973;38974;38975;38976 38968 10 AQGPPKPNTDEGGAVLPSCADLFVYYK Unmodified 2893.3956 0.39564465 3331 Q5VIR6;F6VX93;E7EVT8 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 1 1 118.29 118.29 3 0.031755 124525 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.562 30.457 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3344 3331 3112 30339 38977 38977 1 AQGPQQQPGSEGPSYAK Unmodified 1728.8067 0.80672651 3231 Q3ZCQ8;M0R003;M0R1Y4;M0R047;M0QXC3;M0R2Z3;M0R303;M0R2D2 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.947 22.947 2 5.8786E-30 15975 QUIQUE_C1368_190116_001 184.34 166.94 617640000 35590000 41357000 46207000 55871000 39569000 29861000 70682000 30310000 63683000 18716000 75418000 43658000 66717000 3345 3231 3113 30340;30341;30342;30343;30344;30345;30346;30347;30348;30349;30350;30351;30352 38978;38979;38980;38981;38982;38983;38984;38985;38986;38987;38988;38989;38990 38980 13 AQGSTDYFLSSGDK Unmodified 1474.6576 0.65760265 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.834 59.834 2 0.00010445 58332 QUIQUE_C1368_190116_001 132.76 118.35 1154900000 0 104550000 105670000 84219000 100630000 0 116890000 50000000 128450000 63930000 120570000 82569000 197450000 3346 3296 3114 30353;30354;30355;30356;30357;30358;30359;30360;30361;30362;30363 38991;38992;38993;38994;38995;38996;38997;38998;38999;39000;39001 38992 11 AQGSTDYFLSSGDKIR Unmodified 1743.8428 0.84277766 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 62.225 62.225 2 0.00010177 61862 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.66 86.283 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3347 3296 3115 30364 39002 39002 1 AQGSVAFDYR Unmodified 1112.5251 0.52507234 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 48.419 48.419 2 0.032903 45790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.216 27.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3348 1472 3116 30365;30366 39003;39004 39004 2 AQGVLAAQAR Unmodified 983.55123 0.55122751 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.065 20.065 2 0.0074125 12662 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.208 36.812 135560000 62634000 45636000 0 0 0 0 0 0 0 27288000 0 0 0 3349 2665 3117 30367;30368;30369 39005;39006;39007;39008 39008 4 AQGVLFDCDGVLWNGER Unmodified 1934.8945 0.89449566 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.49 128.49 2 1.5962E-12 131233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.5 138.25 1447300000 118750000 129670000 97105000 97334000 116490000 107040000 162410000 113080000 0 47346000 160080000 161250000 136690000 3350 3859 3118 30370;30371;30372;30373;30374;30375;30376;30377;30378;30379;30380;30381;30382 39009;39010;39011;39012;39013;39014;39015;39016;39017;39018;39019;39020;39021;39022;39023;39024;39025;39026;39027 39020 19 AQGVVGPGPHEEQRPYPQGLPGR Unmodified 2425.2251 0.22508935 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 47.385 47.385 3;4 1.3579E-12 44605 QUIQUE_C1218_190116_001 102.48 69.076 1279000000 322500000 91809000 86360000 126900000 85094000 97866000 114000000 43607000 56795000 0 92984000 66142000 94942000 3351 4517 3119 30383;30384;30385;30386;30387;30388;30389;30390;30391;30392;30393;30394;30395;30396;30397 39028;39029;39030;39031;39032;39033;39034;39035;39036;39037;39038;39039;39040;39041;39042;39043;39044;39045;39046 39029 19 AQHEDQVEQYK Unmodified 1373.6212 0.62115757 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 14.645 14.645 2;3 5.2155E-09 6892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.97 136.4 2098900000 312680000 255310000 313330000 251370000 412850000 0 264210000 0 24738000 88917000 125350000 15188000 35004000 3352 1819;3223 3120 30398;30399;30400;30401;30402;30403;30404;30405;30406;30407;30408;30409;30410;30411;30412;30413;30414;30415;30416 39047;39048;39049;39050;39051;39052;39053;39054;39055;39056;39057;39058;39059;39060;39061;39062;39063;39064;39065 39063 16 AQHEQYVAEAEEK Unmodified 1530.6951 0.69505079 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 19.312 19.312 2;3 6.5764E-53 12458 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.29 156.29 1593900000 133850000 176970000 167130000 172530000 121670000 183280000 218560000 39510000 41186000 64135000 64563000 152530000 57948000 3353 4414 3121 30417;30418;30419;30420;30421;30422;30423;30424;30425;30426;30427;30428;30429;30430;30431;30432;30433;30434;30435;30436;30437;30438 39066;39067;39068;39069;39070;39071;39072;39073;39074;39075;39076;39077;39078;39079;39080;39081;39082;39083;39084;39085;39086;39087;39088 39081 23 AQHIVPCTISQLLSATLVDEVFR Unmodified 2596.3683 0.36830769 2097 P15927;Q5TEJ7 RPA2 Replication protein A 32 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 166.08 166.08 3 6.9159E-18 173046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.37 107.81 1276600000 0 185630000 0 119440000 0 0 185990000 116020000 91985000 0 111670000 274700000 191120000 3354 2097 3122 30439;30440;30441;30442;30443;30444;30445;30446;30447 39089;39090;39091;39092;39093;39094;39095;39096;39097 39095 7 AQHQDPGLGGTQEGAR Unmodified 1620.7604 0.76044502 2242 P25686 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 2 15.122 15.122 2;3 1.116E-07 7738 QUIQUE_C1218_190116_001 117.31 98.064 1269200000 144490000 112300000 148270000 0 162360000 23133000 161100000 15183000 55010000 0 175400000 113780000 158210000 3355 2242 3123 30448;30449;30450;30451;30452;30453;30454;30455;30456;30457;30458;30459;30460;30461;30462;30463;30464 39098;39099;39100;39101;39102;39103;39104;39105;39106;39107;39108;39109;39110;39111;39112;39113;39114;39115;39116;39117 39099 19 AQHQLGEFK Unmodified 1056.5352 0.53524309 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BPA9 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 17.911 17.911 3 0.0557 10182 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.956 4.0335 10326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10326000 0 0 0 3356 3574 3124 30465 39118 39118 1 AQHSWFCK Unmodified 1062.4705 0.47053435 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 24.532 24.532 3 0.04821 18301 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.263 24.048 23473000 0 0 0 0 0 0 0 23473000 0 0 0 0 0 3357 4522 3125 30466 39119 39119 1 AQHTHDAITEAAQLMK Unmodified 1763.8625 0.86246725 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.99 57.99 2 4.394E-05 56088 QUIQUE_C1368_190116_001 97.631 79.822 47721000 16542000 0 13903000 17276000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3358 4606 3126 30467;30468;30469;30470 39120;39121;39122;39123 39121 4 AQHVFQHAVPQEGKPITNQK Unmodified 2256.1763 0.17634824 3028 Q13867;K7ES02;J3KS79;K7ENH5 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 1 1 1 22.088 22.088 3;4 2.3438E-06 15784 QUIQUE_C1218_190116_001 73.688 55.63 166390000 54104000 0 0 0 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59.225 59.225 2;3 1.9361E-05 58589 QUIQUE_C1576_190116_001 116.63 102.67 27402000000 2110500000 2401500000 2769800000 2308700000 2599700000 1787900000 2739400000 1587500000 2052900000 0 2709500000 1820800000 2513900000 3362 282 3130 30483;30484;30485;30486;30487;30488;30489;30490;30491;30492;30493;30494;30495;30496;30497;30498;30499;30500;30501;30502;30503;30504;30505;30506;30507 39138;39139;39140;39141;39142;39143;39144;39145;39146;39147;39148;39149;39150;39151;39152;39153;39154;39155;39156;39157;39158;39159;39160;39161;39162;39163;39164;39165;39166;39167;39168;39169;39170;39171;39172;39173;39174;39175 39156 38 AQIHEQNPSVEVVYYNK Unmodified 2016.9905 0.99050453 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 55.294 55.294 2;3 3.2999E-55 54329 QUIQUE_C1218_190116_001 222.1 194.67 2771100000 244560000 290760000 297550000 194610000 143810000 167920000 171140000 228590000 218070000 90964000 237090000 211050000 275000000 3363 163 3131 30508;30509;30510;30511;30512;30513;30514;30515;30516;30517;30518;30519;30520;30521;30522;30523;30524;30525;30526;30527;30528;30529 39176;39177;39178;39179;39180;39181;39182;39183;39184;39185;39186;39187;39188;39189;39190;39191;39192;39193;39194;39195;39196;39197;39198;39199 39177 21 AQIHGGILR Unmodified 963.5614 0.56139826 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 19.67 19.67 2 0.058457 12737 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.492 44.788 57449000 0 0 0 0 0 0 0 57449000 0 0 0 0 0 3364 2834 3132 30530 39200 39200 0 AQIHQFREDSLDSVLFLK Unmodified 2145.1219 0.12185306 1310 K4DI93;Q13620;A6NE76 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 1 1 1 106.36 106.36 4 3.2943E-05 108801 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.522 64.85 57276000 0 0 0 0 0 0 0 24357000 0 0 0 32920000 0 3365 1310 3133 30531;30532 39201;39202 39201 2 AQIIELLCIVEALKK Unmodified 1740.0219 0.021928001 4623 Q9Y5K6 CD2AP CD2-associated protein yes yes 0 0 1 1 1 1 154.91 154.91 3 1.9161E-06 159477 QUIQUE_DMIX7_190116_001 106.52 94.239 50186000 0 0 0 0 0 0 0 13392000 0 0 0 27099000 9694600 3366 4623 3134 30533;30534;30535 39203;39204;39205 39204 3 AQIINDAFNLASAHK Unmodified 1611.8369 0.83690442 2088 P15144 ANPEP Aminopeptidase N yes yes 0 0 0 1 88.328 88.328 3 0.0012687 89831 QUIQUE_C1403_190116_001 54.402 48.497 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3367 2088 3135 30536 39206 39206 1 AQILPIR Acetyl (Protein N-term) 851.52289 0.52288749 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KSQ2;J3QL20 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.33 106.33 2 0.009678 109989 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.56 74.495 3793000000 366950000 306930000 234960000 276210000 369990000 269370000 293210000 231550000 279240000 123120000 367210000 335930000 338340000 3368 50 3136 30537;30538;30539;30540;30541;30542;30543;30544;30545;30546;30547;30548;30549 39207;39208;39209;39210;39211;39212;39213;39214;39215;39216;39217;39218;39219;39220;39221;39222;39223;39224;39225;39226;39227;39228;39229;39230;39231;39232 39224 26 AQILVADTWSVLEGK Unmodified 1628.8774 0.87737225 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 135.9 135.9 2 0.0014676 141461 QUIQUE_C1218_190116_001 69.602 38.171 201900000 46016000 35726000 0 0 0 40184000 0 41798000 0 0 0 0 38179000 3369 3318 3137 30550;30551;30552;30553;30554 39233;39234;39235;39236;39237;39238 39233 6 AQIMNVSWSADHR Unmodified 1513.7096 0.70959542 2014 P11182 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 3 2 60.133 60.133 2;3 0.0030455 59144 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.531 52.228 863200000 216740000 73020000 99287000 23629000 0 0 0 0 128970000 0 102800000 109870000 108880000 3370 2014 3138 30555;30556;30557;30558;30559;30560;30561;30562;30563;30564;30565;30566;30567;30568 39239;39240;39241;39242;39243;39244;39245;39246;39247;39248;39249;39250;39251;39252 39246 14 AQIQQFHSQIAAQTSASVLAEELHK Unmodified 2734.4038 0.40384158 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 93.833 93.833 3;4 1.0559E-07 96376 QUIQUE_C1403_190116_001 61.039 54.811 1074100000 0 91131000 106670000 83748000 172280000 0 0 60467000 128450000 51254000 203410000 0 176680000 3371 3490 3139 30569;30570;30571;30572;30573;30574;30575;30576;30577;30578;30579;30580 39253;39254;39255;39256;39257;39258;39259;39260;39261;39262;39263;39264;39265;39266 39257 13 AQIWDTAGQER Unmodified 1273.6051 0.60511357 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.327 53.327 2 0.00011143 52022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.44 117.67 1837500000 0 0 215120000 0 182490000 0 230010000 0 176230000 236440000 345460000 182040000 269670000 3372 3168 3140 30581;30582;30583;30584;30585;30586;30587;30588 39267;39268;39269;39270;39271;39272;39273;39274;39275;39276;39277;39278 39274 12 AQKDEEKMEIQEIQLK Unmodified 1958.9983 0.99829203 1019;3424;1164 Q6ZN40;F5H7S3;B7Z596;H0YL42;H0YK20;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 2 1 1 54.243 54.243 3 0.048171 52378 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.223 32.729 288070000 0 0 0 0 0 0 0 147820000 0 0 140250000 0 0 3373 3424;1019;1164 3141 30589;30590 39279;39280 39280 2 AQLAAITLIIGTFER Unmodified 1615.9297 0.92974218 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.84 166.84 2;3 1.4145E-19 170553 QUIQUE_C1277_190116_001 148.41 113.97 1814600000 130880000 116130000 64543000 85216000 96875000 97175000 249590000 118010000 214920000 76248000 232070000 245740000 87254000 3374 3926 3142 30591;30592;30593;30594;30595;30596;30597;30598;30599;30600;30601;30602;30603;30604;30605;30606;30607;30608;30609;30610;30611;30612;30613;30614;30615;30616 39281;39282;39283;39284;39285;39286;39287;39288;39289;39290;39291;39292;39293;39294;39295;39296;39297;39298;39299;39300;39301;39302;39303;39304;39305;39306;39307 39283 26 AQLADSFHLQQFFR Unmodified 1706.8529 0.85288884 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 4 2 2 4 3 2 2 2 3 2 2 3 3 122.56 122.56 2;3 1.2418E-115 126780 QUIQUE_C1368_190116_001 237.93 224.98 51110000000 2874600000 4410700000 4578000000 3855800000 4303300000 3144800000 4248200000 2759000000 4944100000 877820000 5600700000 4076400000 5437100000 3375 267;275;3025 3143 30617;30618;30619;30620;30621;30622;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;30636;30637;30638;30639;30640;30641;30642;30643;30644;30645;30646;30647;30648;30649;30650 39308;39309;39310;39311;39312;39313;39314;39315;39316;39317;39318;39319;39320;39321;39322;39323;39324;39325;39326;39327;39328;39329;39330;39331;39332;39333;39334;39335;39336;39337;39338;39339;39340;39341;39342;39343;39344;39345;39346;39347;39348;39349;39350;39351;39352;39353;39354;39355;39356;39357;39358;39359;39360;39361;39362;39363;39364;39365;39366;39367;39368;39369;39370;39371;39372;39373;39374;39375;39376;39377;39378;39379;39380;39381;39382;39383;39384;39385;39386;39387;39388;39389;39390;39391;39392 39325 85 AQLDAAVTFGPSQVAR Unmodified 1629.8475 0.84746911 224 A0A0C4DFZ2;P15289 ARSA Arylsulfatase A;Arylsulfatase A component B;Arylsulfatase A component C yes no 0 0 0 1 1 1 1 87.177 87.177 2 0.0013622 88765 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.431 56.577 394610000 0 165450000 0 193660000 0 0 0 0 0 0 0 35502000 0 3376 224 3144 30651;30652;30653;30654 39393;39394;39395;39396 39396 2 AQLDYVDLYLIHSPMSLKPGEELSPTDENGK Unmodified 3458.6916 0.6915519 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5 AKR1C3 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39400;39401;39402;39403;39404;39405;39406;39407;39408;39409;39410;39411;39412;39413;39414;39415;39416 39404 17 AQLEEASSAR Unmodified 1060.5149 0.51490158 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 15.773 15.773 2 0.00019822 8645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.21 97.464 3287900000 0 530940000 0 158730000 0 251120000 0 1149600000 0 845320000 0 352170000 0 3380 3176 3147 30672;30673;30674;30675;30676;30677 39417;39418;39419;39420;39421;39422;39423 39421 6 AQLEGHAVQSTLQSEEWFR Unmodified 2215.0658 0.065794739 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 97.827 97.827 2;3 3.5645E-75 102020 QUIQUE_C1438_190116_001 152.01 137.76 2523400000 222450000 229470000 217090000 158840000 207360000 185350000 71831000 229980000 170090000 94937000 253350000 165100000 317570000 3381 2033 3148 30678;30679;30680;30681;30682;30683;30684;30685;30686;30687;30688;30689;30690;30691;30692;30693;30694;30695;30696;30697;30698;30699;30700;30701;30702 39424;39425;39426;39427;39428;39429;39430;39431;39432;39433;39434;39435;39436;39437;39438;39439;39440;39441;39442;39443;39444;39445;39446;39447;39448;39449;39450;39451 39432 26 AQLELFSQPLLVANAMK Unmodified 1872.0179 0.017905256 3551 Q8IXS8 FAM126B Protein FAM126B yes yes 0 0 0 1 146.58 146.58 2 0.010468 151106 QUIQUE_C1277_190116_001 75.479 60.091 24637000 0 24637000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3382 3551 3149 30703 39452 39452 0 AQLEPVASPAK Unmodified 1109.6081 0.60807369 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.503 28.503 2 4.7677E-06 22928 QUIQUE_C1277_190116_001 147.2 104.6 7713500000 548450000 591470000 689910000 271560000 489790000 284240000 561750000 745120000 859880000 363980000 1081500000 719060000 506790000 3383 3117 3150 30704;30705;30706;30707;30708;30709;30710;30711;30712;30713;30714;30715;30716 39453;39454;39455;39456;39457;39458;39459;39460;39461;39462;39463;39464;39465;39466;39467;39468;39469;39470;39471 39456 19 AQLEQGEPVLETPVESQQHEIESR Unmodified 2732.3253 0.32531648 2610 P52630;B4DLC8 STAT2 Signal transducer and activator of transcription 2 yes no 0 0 0 1 77.636 77.636 3 0.015867 79151 QUIQUE_C1368_190116_001 35.016 25.168 38036000 0 0 38036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3384 2610 3151 30717 39472 39472 0 AQLEQGGVGIR Unmodified 1126.6095 0.60947067 3378 Q6P1N0;K7EMP1 CC2D1A Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 35.679 35.679 2 0.020525 31730 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.828 30.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3385 3378 3152 30718 39473 39473 1 AQLEQSVEENK Unmodified 1273.615 0.61500956 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 23.286 23.286 2 0.027782 16781 QUIQUE_C1368_190116_001 76.815 49.684 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3386 800 3153 30719 39474 39474 1 AQLEQSVEENKER Unmodified 1558.7587 0.75871368 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 19.662 19.662 2;3 5.7714E-20 11977 QUIQUE_C1277_190116_001 167.12 141.07 539610000 100700000 138470000 0 138210000 0 0 0 0 0 0 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39559;39560;39561;39562;39563;39564;39565;39566;39567;39568;39569;39570;39571;39572;39573;39574;39575;39576;39577;39578;39579;39580;39581;39582;39583;39584;39585;39586;39587;39588;39589;39590;39591;39592;39593;39594;39595;39596;39597;39598;39599;39600;39601;39602;39603;39604;39605;39606;39607 39567 45 AQLHDTNMELTDLK Unmodified 1627.7876 0.78757097 1467 O14974;H0YIS3;H0YIM2;A0A0U1RQZ1 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 58.271 58.271 2;3 0.006525 56744 QUIQUE_C1403_190116_001 34.382 23.277 282950000 0 46428000 46206000 70147000 34631000 0 36165000 0 19571000 0 0 29806000 0 3397 1467 3164 30831;30832;30833;30834;30835;30836;30837;30838 39608;39609;39610;39611;39612;39613;39614;39615 39610 8 AQLHGASEEPGHFSLTNAASTHTTNEGIFSPTPGELGFSSFHR Unmodified 4523.1167 0.1166677 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 105.83 105.83 4;5;6 2.3748E-24 108932 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39634;39635;39636;39637;39638;39639;39640;39641;39642;39643;39644 39636 11 AQLLQPTLEINPR Unmodified 1491.8409 0.84092717 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.978 92.978 2 1.4868E-07 96110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.32 124.09 1792500000 182850000 116630000 170280000 129640000 139710000 132250000 167190000 75122000 161040000 75315000 153190000 129620000 159610000 3401 2952 3168 30862;30863;30864;30865;30866;30867;30868;30869;30870;30871;30872;30873;30874 39645;39646;39647;39648;39649;39650;39651;39652;39653;39654;39655;39656;39657 39655 13 AQLLVVGSPGPVPR Unmodified 1388.814 0.81398414 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.283 82.283 2 0.00031586 85104 QUIQUE_C1218_190116_001 100.72 89.008 2373100000 228490000 201820000 224960000 160410000 226720000 106470000 234330000 155230000 156230000 93596000 179510000 158850000 246500000 3402 2345 3169 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RAD21 Double-strand-break repair protein rad21 homolog yes yes 0 0 0 1 146.57 146.57 2 0.0050162 151674 QUIQUE_C1218_190116_001 50.305 40.772 16633000 16633000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3407 1561 3173 30920 39719 39719 1 AQLSTILEEEK Unmodified 1259.6609 0.66089712 865 H0YBP1;E7ESA6;Q05397;E9PEI4;H0YB16;H0YBZ1 PTK2 Focal adhesion kinase 1 yes no 0 0 0 1 73.641 73.641 2 0.039667 74403 QUIQUE_C1218_190116_001 47.561 36.397 32699000 32699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3408 865 3174 30921 39720 39720 1 AQMASAGQGKEEAVK Unmodified 1503.7351 0.73514147 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 11.564 11.564 3 0.00038405 4101 QUIQUE_C1438_190116_001 65.113 52.845 63265000 0 0 5516500 0 12068000 0 7367500 0 7707900 0 21514000 0 9090800 3409 3459 3175 30922;30923;30924;30925;30926;30927 39721;39722;39723;39724;39725;39726;39727;39728;39729;39730 39725 9 AQMKNPILER Oxidation (M) 1214.6441 0.64414162 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A096LP33;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 1 1 1 1 18.853 18.853 3 0.011902 11552 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.19 49.164 306980000 0 0 0 0 0 0 0 0 39757000 0 174750000 92472000 0 3410 273;342 3176 30928;30929;30930 39731;39732;39733 39732 199 3 AQMQTVPNAGHWIHADRPQDFIAAIR Unmodified 2942.4722 0.47221269 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 107.47 107.47 5 0.025469 111291 QUIQUE_C1277_190116_001 24.096 17.591 83694000 0 38209000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45486000 3411 3651 3177 30931;30932 39734;39735 39734 2 AQMVQEDLEK Oxidation (M) 1205.5598 0.55980286 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 22.789 22.789 2 0.0011361 15802 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.55 78.728 1030800000 51532000 68934000 91586000 0 93085000 0 77393000 53203000 124190000 143130000 123250000 89686000 114830000 3412 2248 3178 30933;30934;30935;30936;30937;30938;30939;30940;30941;30942;30943;30944;30945;30946;30947 39736;39737;39738;39739;39740;39741;39742;39743;39744;39745;39746;39747;39748;39749;39750 39748 1603 13 AQMVQEDLEK Unmodified 1189.5649 0.56488824 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.801 34.801 2 0.00035401 29365 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.71 96.467 5630100000 346680000 431170000 351270000 582310000 348320000 331050000 384710000 463150000 584500000 304730000 534600000 405570000 562060000 3413 2248 3178 30948;30949;30950;30951;30952;30953;30954;30955;30956;30957;30958;30959;30960;30961 39751;39752;39753;39754;39755;39756;39757;39758;39759;39760;39761;39762;39763;39764;39765 39762 13 AQNAIAGEGMGISHELITLEISSR Unmodified 2496.2642 0.26423655 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 131.49 131.49 3 1.9448E-18 138068 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.88 99.69 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31022;31023;31024;31025;31026;31027;31028;31029;31030;31031;31032 39833;39834;39835;39836;39837;39838;39839;39840;39841;39842;39843;39844;39845;39846;39847 39836 14 AQPAQPADEPAEKADEPMEH Unmodified 2159.943 0.94296199 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 32.584 32.584 3 9.2625E-05 27698 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.938 46.586 291120000 0 0 0 0 0 0 0 0 62298000 0 75508000 68357000 84952000 3425 2244 3190 31033;31034;31035;31036 39848;39849;39850;39851;39852 39850 4 AQPARPPPPAQPGEIGEAIAK Unmodified 2094.1222 0.12218741 1693 O94875 SORBS2 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.198 55.198 3 1.5671E-06 51603 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.952 55.324 376340000 47060000 81888000 36062000 0 62538000 0 0 0 38350000 25501000 0 50999000 33941000 3426 1693 3191 31037;31038;31039;31040;31041;31042;31043;31044 39853;39854;39855;39856;39857;39858;39859;39860;39861 39859 9 AQPSVSLGAAYR Unmodified 1218.6357 0.63568542 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 53.565 53.565 2 0.0080519 50884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.162 1.5551 259230000 0 0 0 0 0 0 0 259230000 0 0 0 0 0 3427 3919 3192 31045 39862 39862 1 AQPSVSLGAPYR Unmodified 1244.6513 0.65133548 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 55.887 55.887 2 0.0017775 54062 QUIQUE_C1403_190116_001 79.148 44.895 109180000 52823000 0 0 56353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3428 3919 3193 31046;31047 39863;39864 39864 1 AQPSVVLSAAHTVAAR Unmodified 1576.8685 0.8685389 475 A0A384DVU0;Q8IY17 PNPLA6 Neuropathy target esterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.094 57.094 3 0.0005729 55053 QUIQUE_C1368_190116_001 47.223 36.738 102500000 17129000 22349000 37081000 0 0 25938000 0 0 0 0 0 0 0 3429 475 3194 31048;31049;31050;31051 39865;39866;39867;39868 39867 4 AQPTPSSSATQSKPTPVKPNYALK Unmodified 2497.3177 0.31765233 2733 P61964;V9GYQ5;V9GZ59 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes no 0 0 2 1 32.671 32.671 4 0.0011159 27744 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.256 33.494 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39871;39872;39873;39874;39875;39876;39877;39878;39879;39880;39881;39882;39883;39884;39885;39886;39887;39888;39889;39890;39891;39892;39893;39894;39895;39896;39897;39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915;39916;39917;39918;39919 39879 49 AQPVSCFTHLVQANVR Unmodified 1825.9257 0.92573621 715 C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.084 86.084 3 0.02065 88027 QUIQUE_C1277_190116_001 46.319 34.295 115530000 0 23358000 30800000 0 27551000 0 33820000 0 0 0 0 0 0 3433 715 3198 31079;31080;31081;31082 39920;39921;39922;39923 39920 3 AQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRR Unmodified 3213.3121 0.31205096 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 1 1 152.29 152.29 3 2.1115E-09 155105 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.052 68.941 22147000 0 0 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Core-binding factor subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.664 86.664 2 3.8835E-19 88258 QUIQUE_C1403_190116_001 183.89 168.69 287200000 0 0 55690000 28879000 0 36280000 0 47809000 51191000 0 0 0 67345000 3440 1284 3205 31105;31106;31107;31108;31109;31110 39948;39949;39950;39951;39952;39953 39949 5 AQQEFAAGVFSNPAVR Unmodified 1690.8427 0.84271808 1449 O14828 SCAMP3 Secretory carrier-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 92.05 92.05 2 1.6889E-06 93864 QUIQUE_DMIX8_190116_001 141.37 101.22 275740000 85596000 0 0 78804000 0 0 0 0 0 0 0 0 111340000 3441 1449 3206 31111;31112;31113 39954;39955;39956 39956 2 AQQEFATGVMSNK Unmodified 1409.6609 0.66091389 1483 O15126;A0A087WXB0;A0A087WU14 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.169 45.169 2 0.00031147 42896 QUIQUE_C1277_190116_001 97.452 61.544 162050000 0 0 0 65948000 46144000 49954000 0 0 0 0 0 0 0 3442 1483 3207 31114;31115;31116;31117 39957;39958;39959;39960 39957 4 AQQEHQSLLEK Unmodified 1309.6626 0.66262845 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 15.092 15.092 2;3 0.00037181 7445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.25 60.688 38177000 0 0 0 0 0 0 0 10804000 0 27374000 0 0 0 3443 88 3208 31118;31119 39961;39962 39961 2 AQQELEEQTR Unmodified 1230.584 0.58404378 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.18 17.18 2 1.794E-07 9752 QUIQUE_C1438_190116_001 152.34 136.46 5231800000 605890000 416170000 538190000 614770000 355200000 427860000 470930000 146380000 321350000 306420000 364550000 264200000 399840000 3444 2248 3209 31120;31121;31122;31123;31124;31125;31126;31127;31128;31129;31130;31131;31132 39963;39964;39965;39966;39967;39968;39969;39970;39971;39972;39973;39974;39975 39967 12 AQQELEEQTRR Unmodified 1386.6852 0.68515481 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 13.472 13.472 2;3 2.8154E-30 5377 QUIQUE_C1403_190116_001 162.38 127.18 1334000000 0 32771000 206750000 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39988;39989;39990;39991;39992;39993;39994;39995;39996;39997;39998;39999;40000;40001;40002 39990 15 AQQEVLQALEPQVDYLR Unmodified 1999.0375 0.037454724 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 2 1 126.93 126.93 2;3 0.00015482 130024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.466 54.377 116800000 0 0 0 0 0 0 0 24652000 0 0 65797000 26351000 0 3448 1187 3213 31155;31156;31157;31158 40003;40004;40005;40006 40003 4 AQQLAEVEVK Unmodified 1113.603 0.60298831 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.909 35.909 2 0.0016283 32237 QUIQUE_C1218_190116_001 95.358 65.173 671960000 69664000 83265000 91069000 105980000 90002000 77054000 0 23031000 0 51648000 80250000 0 0 3449 3086 3214 31159;31160;31161;31162;31163;31164;31165;31166;31167 40007;40008;40009;40010;40011;40012;40013;40014;40015 40007 6 AQQLAEVEVKK Unmodified 1241.698 0.69795133 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 20.741 20.741 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31219 40077 40077 1 AQQTPTEEDNEDLK Unmodified 1616.7166 0.71657409 947 E9PJP2;Q5TF21 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 24.394 24.394 2 1.2118E-10 18096 QUIQUE_C1218_190116_001 136.96 106.34 36222000 36222000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3458 947 3223 31220;31221 40078;40079 40078 2 AQQVAVQEQEIAR Unmodified 1468.7634 0.76340513 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9W4;A0A140T907 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.836 37.836 2 3.0551E-24 34228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.48 149 1876300000 171110000 149360000 213890000 137320000 140770000 132840000 205880000 91982000 117430000 66014000 171580000 127280000 150790000 3459 1673 3224 31222;31223;31224;31225;31226;31227;31228;31229;31230;31231;31232;31233;31234 40080;40081;40082;40083;40084;40085;40086;40087;40088;40089;40090;40091;40092 40087 12 AQQVLHLQVLQLQQEK Unmodified 1902.0687 0.068695273 4539 Q9Y250 LZTS1 Leucine zipper putative tumor suppressor 1 yes yes 0 0 0 1 85.613 85.613 3 0.015964 86952 QUIQUE_C1403_190116_001 26.307 24.022 27019000 0 0 0 27019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3460 4539 3225 31235 40093 40093 1 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTK Unmodified 3687.8283 0.82832016 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 3 2 4 3 3 170.11 170.11 3;4 1.3476E-76 174256 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.4 144.54 7807300000 62697000 82339000 192450000 25873000 314010000 231870000 483260000 493450000 1883200000 39049000 2228500000 902340000 868350000 3461 4560 3226 31236;31237;31238;31239;31240;31241;31242;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250;31251;31252;31253;31254;31255;31256;31257;31258;31259;31260;31261;31262;31263 40094;40095;40096;40097;40098;40099;40100;40101;40102;40103;40104;40105;40106;40107;40108;40109;40110;40111;40112;40113;40114;40115;40116;40117;40118;40119;40120;40121;40122;40123 40108 27 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTK Oxidation (M) 3703.8232 0.82323478 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 2 2 1 165.97 165.97 3;4 5.6572E-46 160204 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.9 100.79 1095900000 0 0 0 0 0 80294000 0 196450000 445710000 195350000 0 178090000 0 3462 4560 3226 31264;31265;31266;31267;31268;31269;31270 40124;40125;40126;40127;40128;40129;40130 40129 3010 7 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKK Unmodified 3815.9233 0.92328317 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 166.52 166.52 4 1.7055E-51 168530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.76 110.61 236790000 0 0 0 0 0 0 0 236790000 0 0 0 0 0 3463 4560 3227 31271 40131 40131 1 AQQVSQGLDVLTAK Unmodified 1456.7886 0.78855725 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.233 71.233 2 1.9161E-16 71387 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.85 131.86 4153000000 276030000 316840000 338740000 334310000 425760000 271130000 402280000 305310000 342210000 137800000 344430000 260430000 397740000 3464 2135 3228 31272;31273;31274;31275;31276;31277;31278;31279;31280;31281;31282;31283;31284 40132;40133;40134;40135;40136;40137;40138;40139;40140;40141;40142;40143;40144;40145;40146;40147 40143 8 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK 2 Oxidation (M) 3309.3464 0.34644713 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 156.01 156.01 3 4.5127E-12 161335 QUIQUE_C1368_190116_001 67.586 65.796 148140000 27789000 37690000 30056000 15642000 0 24471000 0 0 0 12494000 0 0 0 3465 2851 3229 31285;31286;31287;31288;31289;31290 40148;40149;40150;40151;40152;40153 40150 2280;2281 4 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK Oxidation (M) 3293.3515 0.35153251 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 163.89 163.89 3 4.0781E-19 168220 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.541 89.177 175140000 0 19114000 0 0 0 0 0 33359000 46581000 0 0 45125000 30965000 3466 2851 3229 31291;31292;31293;31294;31295 40154;40155;40156;40157;40158 40157 2280;2281 3 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK Unmodified 3277.3566 0.35661789 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 167.7 167.7 3 3.9005E-08 171992 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.691 57.383 32413000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32413000 3467 2851 3229 31296 40159 40159 1 AQSDGIWGEHEIDYILLVR Unmodified 2213.1117 0.1116823 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.41 146.41 3 7.936E-08 151415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.85 95.372 347760000 0 34128000 0 0 0 0 41571000 51319000 66123000 0 63118000 55505000 35992000 3468 3032 3230 31297;31298;31299;31300;31301;31302;31303;31304 40160;40161;40162;40163;40164;40165;40166;40167;40168 40165 9 AQSHSFPNYGLSHGLTSR Unmodified 1957.9395 0.93947201 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 48.936 48.936 3;4 0.00077783 46375 QUIQUE_C1403_190116_001 53.327 48.619 836460000 75515000 77702000 161310000 91363000 48502000 29342000 52191000 0 0 19402000 116090000 36956000 128080000 3469 4012 3231 31305;31306;31307;31308;31309;31310;31311;31312;31313;31314;31315;31316;31317;31318;31319;31320;31321 40169;40170;40171;40172;40173;40174;40175;40176;40177;40178;40179;40180;40181;40182;40183;40184;40185 40175 15 AQSINITELNLPQLEMLK Acetyl (Protein N-term) 2096.1187 0.11874151 3955 Q99471;H3BMQ1;F8VNW6;F8VQZ2 PFDN5 Prefoldin subunit 5 yes no 1 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 169.23 169.23 2;3 4.8893E-20 173329 QUIQUE_DMIX8_190116_001 170.56 154.21 1089400000 89638000 115530000 76835000 56530000 55460000 83114000 121230000 81132000 113590000 10338000 77019000 79524000 129450000 3470 3955 3232 31322;31323;31324;31325;31326;31327;31328;31329;31330;31331;31332;31333;31334;31335;31336;31337;31338 40186;40187;40188;40189;40190;40191;40192;40193;40194;40195;40196;40197;40198;40199;40200;40201;40202 40202 17 AQSLEPYGTGLR Unmodified 1290.6568 0.65681479 3346 Q63ZY3;K7ERU2 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 57.935 57.935 2 0.027445 55586 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.297 27.254 181710000 0 0 0 0 0 0 0 181710000 0 0 0 0 0 3471 3346 3233 31339 40203 40203 1 AQSLLSTDR Unmodified 989.51417 0.5141733 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 29.771 29.771 2 0.0029423 25008 QUIQUE_C1218_190116_001 92.439 39.273 1013700000 106080000 82443000 114380000 91526000 97024000 108040000 86279000 54482000 73812000 0 0 85140000 114460000 3472 1388 3234 31340;31341;31342;31343;31344;31345;31346;31347;31348;31349;31350;31351;31352;31353 40204;40205;40206;40207;40208;40209;40210;40211;40212;40213;40214;40215;40216;40217;40218 40205 15 AQSQLLVPEQK Unmodified 1239.6823 0.68230126 2862 Q01968 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes yes 0 0 0 1 40.111 40.111 2 0.029621 36292 QUIQUE_C1403_190116_001 59.645 49.414 25228000 0 0 0 25228000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3473 2862 3235 31354 40219 40219 1 AQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLR Unmodified 2386.1223 0.12232334 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 149.88 149.88 2;3 6.2896E-88 154598 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.96 170.95 442060000 26497000 28778000 31692000 33208000 29003000 43677000 22907000 60684000 43745000 9506900 44591000 33611000 34160000 3474 295 3236 31355;31356;31357;31358;31359;31360;31361;31362;31363;31364;31365;31366;31367;31368;31369;31370;31371 40220;40221;40222;40223;40224;40225;40226;40227;40228;40229;40230;40231;40232;40233;40234;40235;40236;40237 40233 16 AQSTDSLGTSGSLQSK Unmodified 1565.7533 0.75329395 3125 Q15276;I3L456 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 29.748 29.748 2 0.0044445 24541 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.212 41.074 42526000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42526000 3475 3125 3237 31372 40238 40238 1 AQTEGINISEEALNHLGEIGTK Unmodified 2323.1656 0.16556836 4542 Q9Y265;H7C4G5;J3QLR1 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 114.75 114.75 2;3 5.0241E-100 118698 QUIQUE_C1368_190116_001 235.16 222.04 3033600000 226090000 254390000 351240000 206940000 242960000 232510000 261040000 226950000 226520000 128500000 255950000 206970000 213520000 3476 4542 3238 31373;31374;31375;31376;31377;31378;31379;31380;31381;31382;31383;31384;31385;31386;31387;31388;31389;31390 40239;40240;40241;40242;40243;40244;40245;40246;40247;40248;40249;40250;40251;40252;40253;40254;40255;40256;40257;40258;40259;40260;40261;40262;40263;40264 40244 26 AQTEWNTGTWR Unmodified 1348.616 0.61601261 3783 Q969E2 SCAMP4 Secretory carrier-associated membrane protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.772 63.772 2 1.9546E-46 63481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.6 168.49 985130000 104980000 79301000 99997000 95937000 58770000 0 92367000 111130000 99838000 0 89377000 77858000 75569000 3477 3783 3239 31391;31392;31393;31394;31395;31396;31397;31398;31399;31400;31401 40265;40266;40267;40268;40269;40270;40271;40272;40273;40274;40275;40276 40271 12 AQTGSGGADPTTDVSGQS Unmodified 1634.702 0.70198666 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 32.671 32.671 2 0.043788 27547 QUIQUE_C1277_190116_001 43.798 33.566 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3478 310;830 3240 31402 40277 40277 1 AQTLPTSVVTITSESSPGK Unmodified 1901.9946 0.99458686 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 86.792 86.792 2;3 1.1181E-16 87430 QUIQUE_C1563_190116_001 136.17 130.22 9099000000 1157000000 972570000 716270000 1049500000 1255600000 943830000 775950000 420910000 159310000 529640000 491380000 468560000 158520000 3479 2851 3241 31403;31404;31405;31406;31407;31408;31409;31410;31411;31412;31413;31414;31415;31416;31417;31418;31419;31420;31421;31422;31423;31424;31425 40278;40279;40280;40281;40282;40283;40284;40285;40286;40287;40288;40289;40290;40291;40292;40293;40294;40295;40296;40297;40298;40299;40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;40307 40292 26 AQTLPTSVVTITSESSPGKR Unmodified 2058.0957 0.095697884 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 69.917 69.917 2;3 9.2034E-18 69951 QUIQUE_C1277_190116_001 153.09 124.47 10574000000 241610000 548810000 309200000 490480000 919150000 251500000 502860000 1493000000 1541800000 138540000 1525700000 1131600000 1480000000 3480 2851 3242 31426;31427;31428;31429;31430;31431;31432;31433;31434;31435;31436;31437;31438;31439;31440;31441;31442;31443;31444;31445;31446;31447;31448;31449;31450 40308;40309;40310;40311;40312;40313;40314;40315;40316;40317;40318;40319;40320;40321;40322;40323;40324;40325;40326;40327;40328;40329;40330;40331;40332;40333;40334;40335;40336;40337;40338;40339;40340;40341;40342;40343;40344;40345;40346;40347 40312 37 AQTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWR Unmodified 3418.6721 0.67213709 1243 H9KV90;Q9Y566 SHANK1 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1 yes no 0 0 0 1 1 171.14 171.14 3 9.5205E-06 176419 QUIQUE_C1576_190116_001 47.159 42.582 44680000 0 0 26716000 0 0 0 17964000 0 0 0 0 0 0 3481 1243 3243 31451;31452 40348;40349;40350 40350 2 AQTYELQESNVQLK Unmodified 1649.8261 0.82606496 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.598 65.598 2 1.6572E-17 65269 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.44 151.4 1813200000 147890000 0 230470000 0 0 129300000 271960000 109250000 184160000 81220000 263450000 0 395520000 3482 646 3244 31453;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461 40351;40352;40353;40354;40355;40356;40357;40358;40359 40356 9 AQVADVVVSR Unmodified 1042.5771 0.57710791 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 38.189 38.189 2 0.03223 34161 QUIQUE_C1218_190116_001 53.756 21.436 348710000 138820000 0 0 0 0 0 0 126560000 0 83330000 0 0 0 3483 2524 3245 31462;31463;31464 40360;40361;40362 40360 3 AQVARPGGDTIFGK Unmodified 1415.7521 0.75211216 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60;D6RC06 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 41.035 41.035 2;3 6.3566E-06 38429 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.33 87.523 2201300000 0 71267000 60528000 0 92784000 0 62333000 872310000 211690000 0 283490000 236970000 309890000 3484 2546 3246 31465;31466;31467;31468;31469;31470;31471;31472;31473;31474;31475 40363;40364;40365;40366;40367;40368;40369;40370;40371;40372;40373;40374;40375 40370 12 AQVDSSFLSLYDSHVAK Unmodified 1865.9159 0.9159426 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 3 1 1 1 100.52 100.52 2;3 3.3759E-10 103627 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.992 79.412 291480000 0 0 0 74654000 0 0 62188000 0 0 0 66360000 88279000 0 3485 3578 3247 31476;31477;31478;31479;31480;31481;31482;31483;31484;31485;31486;31487;31488;31489;31490 40376;40377;40378;40379;40380;40381;40382;40383;40384;40385;40386;40387;40388;40389;40390;40391;40392 40387 17 AQVEGLTCSHCR Unmodified 1416.6238 0.62381688 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.067 18.067 3 0.00026254 10555 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 65.749 210320000 0 56542000 0 23387000 39869000 23863000 32323000 0 0 0 19172000 15169000 0 3486 2834 3248 31491;31492;31493;31494;31495;31496;31497 40393;40394;40395;40396;40397;40398;40399 40395 7 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPK Unmodified 2352.1883 0.18827764 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 138.85 138.85 2;3 5.7525E-130 143316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 222.45 207.66 2351400000 303590000 81532000 218940000 65200000 188450000 199170000 211590000 135930000 256880000 103800000 223240000 143610000 219430000 3487 2421 3249 31498;31499;31500;31501;31502;31503;31504;31505;31506;31507;31508;31509;31510;31511;31512;31513;31514;31515;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31523 40400;40401;40402;40403;40404;40405;40406;40407;40408;40409;40410;40411;40412;40413;40414;40415;40416;40417;40418;40419;40420;40421;40422;40423;40424;40425;40426;40427;40428;40429;40430;40431;40432;40433;40434;40435;40436;40437;40438;40439;40440;40441;40442;40443;40444 40425 45 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALK Unmodified 2761.4572 0.45718228 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 129.77 129.77 3 1.2862E-36 133344 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.37 125.21 1231800000 0 0 0 0 0 0 0 208500000 219280000 0 437760000 165670000 200610000 3488 2421 3250 31524;31525;31526;31527;31528 40445;40446;40447;40448;40449;40450;40451;40452;40453;40454 40445 10 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALK Oxidation (M) 2777.4521 0.4520969 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 1 1 1 105.5 105.5 3 0.00010888 110696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.807 41.966 140940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 140940000 0 0 3489 2421 3250 31529 40455;40456 40455 1839 2 AQVEQELTTLR Unmodified 1286.683 0.68302954 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.07 65.07 2 2.3786E-12 64739 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.63 138.89 8656600000 590090000 577930000 715330000 218190000 515850000 253730000 524940000 1065200000 1118700000 504160000 1107900000 869050000 595500000 3490 3117 3251 31530;31531;31532;31533;31534;31535;31536;31537;31538;31539;31540;31541;31542 40457;40458;40459;40460;40461;40462;40463;40464;40465;40466;40467;40468;40469;40470;40471;40472;40473;40474;40475 40472 17 AQVIDLQAEGYWEELLDTTQPAIVVK Unmodified 2928.5121 0.51205462 405 A0A286YF37;Q9UK22 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 168.03 168.03 2;3 1.0954E-56 174244 QUIQUE_C1438_190116_001 195.27 189.15 1636700000 66044000 58716000 51258000 38130000 155260000 255880000 180670000 184010000 197370000 27639000 161230000 117080000 143380000 3491 405 3252 31543;31544;31545;31546;31547;31548;31549;31550;31551;31552;31553;31554;31555;31556;31557;31558;31559;31560;31561 40476;40477;40478;40479;40480;40481;40482;40483;40484;40485;40486;40487;40488;40489;40490;40491;40492;40493;40494;40495 40481 20 AQVLGHVEQLK Unmodified 1220.6877 0.68772099 3492 Q86UU1 PHLDB1 Pleckstrin homology-like domain family B member 1 yes yes 0 0 0 1 33.372 33.372 2 0.055665 28257 QUIQUE_C1563_190116_001 44.945 29.283 24237000 0 0 0 0 0 24237000 0 0 0 0 0 0 0 3492 3492 3253 31562 40496 40496 1 AQVLQLVAELEETR Unmodified 1597.8675 0.86753585 3893 Q96JN2;C9JE17;C9JU31;C9J884;C9IYI5 CCDC136 Coiled-coil domain-containing protein 136 yes no 0 0 0 1 1 1 1 144.69 144.69 3 6.3531E-05 148678 QUIQUE_C1277_190116_001 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31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;31593;31594;31595;31596;31597;31598;31599;31600;31601;31602;31603;31604;31605;31606;31607 40507;40508;40509;40510;40511;40512;40513;40514;40515;40516;40517;40518;40519;40520;40521;40522;40523;40524;40525;40526;40527;40528;40529;40530;40531;40532;40533;40534;40535;40536;40537;40538;40539;40540;40541;40542;40543;40544 40513 34 AQVSLLIR Unmodified 898.56 0.56000128 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.28 61.28 2 2.4839E-06 61679 QUIQUE_C1218_190116_001 173.93 106.9 2364100000 245430000 217750000 231720000 179890000 189430000 183680000 182550000 191380000 142330000 76937000 200510000 187230000 135290000 3496 1272 3257 31608;31609;31610;31611;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;31620 40545;40546;40547;40548;40549;40550;40551;40552;40553;40554;40555;40556;40557;40558;40559 40545 15 AQVSPTASDMLHMR Unmodified 1542.7283 0.72828195 3412 Q6UXB8 PI16 Peptidase inhibitor 16 yes yes 0 0 0 1 62.146 62.146 3 0.03074 60701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.037 34.677 26040000 0 0 0 0 0 0 0 26040000 0 0 0 0 0 3497 3412 3258 31621 40560 40560 0 AQVTSLLGELQESQSR Unmodified 1744.8955 0.89554151 44 A0A087X0G7;A0A087WUW6;A0A087X1B1;Q9Y6K9;A0A087WV30;C9JH59;C9J2V2;C9JN51 IKBKG NF-kappa-B essential modulator yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.16 109.16 2 0.00037413 111306 QUIQUE_C1563_190116_001 100.55 59.31 229350000 0 39129000 54051000 0 36157000 31808000 0 31480000 0 0 0 36724000 0 3498 44 3259 31622;31623;31624;31625;31626;31627 40561;40562;40563;40564;40565;40566 40564 6 AQVWLEQVCAHLGLGVQEPHPGER Unmodified 2709.3446 0.34455256 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 118.25 118.25 4 0.0042424 121424 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.682 31.473 152780000 0 0 53398000 30579000 0 0 0 68804000 0 0 0 0 0 3499 3418 3260 31628;31629;31630 40567;40568;40569 40569 2 AQWGENLQVTLIPTHDTEVTR Unmodified 2407.2132 0.21318726 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 108.76 108.76 2;3 2.4404E-16 111245 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.05 129.94 3003700000 210390000 294540000 226390000 251300000 190280000 206980000 287790000 235070000 178170000 97245000 347660000 244730000 233150000 3500 921 3261 31631;31632;31633;31634;31635;31636;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645 40570;40571;40572;40573;40574;40575;40576;40577;40578;40579;40580;40581;40582;40583;40584;40585;40586;40587;40588;40589;40590 40582 21 AQWGSNMQVTLIPTHDSEVMR Oxidation (M) 2415.1311 0.13111389 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 94.11 94.11 3 1.4121E-06 99226 QUIQUE_C1218_190116_001 76.704 70.144 887990000 106770000 160930000 140020000 221120000 95110000 0 0 0 102200000 61841000 0 0 0 3501 2483 3262 31646;31647;31648;31649;31650;31651;31652;31653 40591;40592;40593;40594;40595;40596;40597;40598 40591 1904;1905 8 AQWGSNMQVTLIPTHDSEVMR Unmodified 2399.1362 0.13619927 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 105.6 105.6 2;3 1.1657E-185 108789 QUIQUE_C1368_190116_001 244.05 219.12 1938900000 489790000 47249000 56775000 519040000 34416000 438470000 46769000 0 45311000 88020000 75765000 45908000 51362000 3502 2483 3262 31654;31655;31656;31657;31658;31659;31660;31661;31662;31663;31664;31665;31666;31667;31668;31669 40599;40600;40601;40602;40603;40604;40605;40606;40607;40608;40609;40610;40611;40612;40613;40614;40615 40602 16 AQWNQLQQLDTR Acetyl (Protein N-term) 1541.7587 0.7586541 2427 P40763 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 122.77 122.77 2 0.0013364 128993 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.477 78.505 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3503 2427 3263 31670;31671;31672 40616;40617;40618 40617 3 AQYEDIANR Unmodified 1078.5043 0.5043369 792;772 CON__P05787;P05787;F8VUG2;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 no no 0 0 0 1 29.784 29.784 2 0.04263 24707 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.786 31.015 36638000 0 0 0 0 0 0 0 0 36638000 0 0 0 0 + 3504 772;792 3264 31673 40619 40619 1 AQYEDIAQK Unmodified 1064.5138 0.51383895 1859 P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.11 25.11 2 0.00038656 19045 QUIQUE_DMIX7_190116_001 134.81 104.31 10052000000 510440000 0 322310000 0 1055200000 517120000 562420000 897740000 796730000 1350100000 1345900000 926270000 1767600000 + 3505 1859 3265 31674;31675;31676;31677;31678;31679;31680;31681;31682;31683;31684 40620;40621;40622;40623;40624;40625;40626;40627;40628;40629;40630;40631;40632;40633;40634 40632 14 AQYEDIAQR Unmodified 1092.52 0.51998696 775 CON__P12035;P12035 KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 0 1 28.148 28.148 2 0.021021 22272 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.464 5.7432 123350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123350000 0 + 3506 775 3266 31685 40635 40635 1 AQYEEIANR Unmodified 1092.52 0.51998696 778 CON__P13647;P13647;H0YI76;H0YIN9 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.078 28.078 2 0.032733 22433 QUIQUE_C1438_190116_001 55.531 10.449 413100000 0 0 0 0 66298000 0 52289000 78259000 77741000 0 138520000 0 0 + 3507 778 3267 31686;31687;31688;31689;31690 40636;40637;40638;40639;40640 40636 5 AQYEEIAQR Unmodified 1106.5356 0.53563702 781;782;764;779 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__P19013;P19013 KRT2;KRT6C;KRT6A;KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.014 29.014 2 0.00040546 23571 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.18 86.296 3145900000 0 0 0 0 0 0 0 329100000 0 615930000 756150000 698460000 746260000 + 3508 781;782;764;779 3268 31691;31692;31693;31694;31695 40641;40642;40643;40644;40645 40642 4 AQYEQTLAELHR Unmodified 1457.7263 0.72629134 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6;E9PIY1 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.203 56.203 3 0.0079964 54635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.73 31.03 525330000 0 51231000 56625000 47339000 0 51077000 60903000 50204000 53394000 28680000 65606000 0 60273000 3509 241 3269 31696;31697;31698;31699;31700;31701;31702;31703;31704;31705 40646;40647;40648;40649;40650;40651;40652;40653;40654;40655;40656;40657 40653 10 AQYESLAAK Unmodified 979.49746 0.4974606 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 23.06 23.06 2 0.0070365 16546 QUIQUE_C1368_190116_001 82.716 0 6988700000 1211200000 940520000 802660000 678450000 886880000 733620000 0 868490000 711800000 92202000 62914000 0 0 3510 3176 3270 31706;31707;31708;31709;31710;31711;31712;31713;31714;31715;31716;31717 40658;40659;40660;40661;40662;40663;40664;40665;40666;40667;40668;40669 40661 11 AQYPIADLVK Unmodified 1116.6179 0.61791009 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 83.311 83.311 2 0.049902 85081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.853 25.113 268560000 0 0 116130000 0 0 0 0 48143000 0 0 0 104290000 0 3511 2993 3271 31718;31719;31720 40670;40671;40672 40671 3 AQYYLPDGSTIEIGPSR Unmodified 1865.9159 0.9159426 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 0 2 3 2 1 3 3 1 2 4 2 1 1 1 128.32 128.32 2;3 6.0453E-18 132802 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.51 111.09 2612200000 512840000 423360000 432300000 421240000 18552000 377900000 380090000 17603000 28278000 0 0 0 0 3512 2716 3272 31721;31722;31723;31724;31725;31726;31727;31728;31729;31730;31731;31732;31733;31734;31735;31736;31737;31738;31739;31740;31741;31742;31743;31744;31745;31746 40673;40674;40675;40676;40677;40678;40679;40680;40681;40682;40683;40684;40685;40686;40687;40688;40689;40690;40691;40692;40693;40694;40695;40696;40697;40698;40699;40700;40701;40702;40703;40704;40705;40706;40707;40708;40709;40710;40711;40712;40713 40707 39 ARDDLITDLLNEAK Unmodified 1585.8312 0.83115034 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 129.86 129.86 2;3 6.9541E-37 134353 QUIQUE_C1277_190116_001 150.11 123.99 25196000000 782640000 2482000000 2137400000 1642700000 2045200000 2463600000 2088100000 1366900000 1795700000 864060000 2836100000 2927200000 1764500000 3513 2397 3273 31747;31748;31749;31750;31751;31752;31753;31754;31755;31756;31757;31758;31759;31760;31761;31762;31763;31764;31765;31766;31767;31768;31769;31770;31771 40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;40724;40725;40726;40727;40728;40729;40730;40731;40732;40733;40734;40735;40736;40737;40738;40739;40740;40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;40748;40749;40750;40751;40752;40753;40754 40717 41 ARDPHSGHFVALK Unmodified 1433.7528 0.75278086 2029 P11802;F8VYH9;F8VTV8;F8VWX7;F8VYY1;Q96BE9;F8W1L8 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 13.478 13.478 4 0.0015824 5341 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.108 43.478 57442000 0 0 0 0 9616800 0 0 0 0 0 18632000 0 29193000 3514 2029 3274 31772;31773;31774 40755;40756;40757;40758 40758 4 ARDYDAMGSQTK Unmodified 1341.5983 0.59831364 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 1 1 15.343 15.343 2 0.0035975 7791 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.56 49.888 11602000 0 0 0 0 0 0 0 11602000 0 0 0 0 0 3515 4536 3275 31775 40759 40759 1 AREEAERELER Unmodified 1386.6852 0.68515481 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 2 1 3 1 1 13.115 13.115 2;3 1.0817E-08 4978 QUIQUE_DMIX7_190116_001 144.57 108.16 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40847;40848;40849;40850;40851;40852;40853;40854;40855;40856;40857;40858;40859;40860;40861;40862;40863;40864;40865;40866;40867;40868;40869;40870;40871;40872;40873;40874;40875;40876;40877;40878;40879;40880;40881;40882;40883;40884;40885;40886;40887;40888;40889;40890;40891 40871 45 ARFPAFEL Unmodified 949.50215 0.50215205 1555 O43813 LANCL1 LanC-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 105.81 105.81 2 0.050351 107974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.071 85.166 96039000 0 0 0 0 0 0 0 96039000 0 0 0 0 0 3524 1555 3284 31872 40892 40892 1 ARLEDALLR Unmodified 1055.6087 0.60874239 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.302 49.302 2;3 0.0051793 47512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.414 43.891 209730000 0 0 11539000 0 16218000 0 28049000 29971000 32066000 0 39576000 22290000 30017000 3525 16;1475 3285 31873;31874;31875;31876;31877;31878;31879;31880 40893;40894;40895;40896;40897;40898;40899;40900 40896 8 ARLEIEPEWAYGK Unmodified 1560.7936 0.79364262 2846 Q00688 FKBP3 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ARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAK Unmodified 2607.2983 0.29825429 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 1 4 2 3 2 3 2 3 3 4 1 2 1 60.313 60.313 3;4;5;6 5.378E-113 59864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.4 185.09 4944900000 100570000 684640000 309920000 613760000 232630000 426490000 319060000 409660000 776330000 431780000 204390000 371440000 64259000 3531 2017 3291 31916;31917;31918;31919;31920;31921;31922;31923;31924;31925;31926;31927;31928;31929;31930;31931;31932;31933;31934;31935;31936;31937;31938;31939;31940;31941;31942;31943;31944;31945;31946 40939;40940;40941;40942;40943;40944;40945;40946;40947;40948;40949;40950;40951;40952;40953;40954;40955;40956;40957;40958;40959;40960;40961;40962;40963;40964;40965;40966;40967;40968;40969;40970;40971;40972;40973;40974;40975;40976 40961 36 ARPEYMLPVHFYGR Oxidation (M) 1750.8613 0.86134503 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 70.405 70.405 3;4 0.00014046 68247 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31968;31969;31970;31971;31972;31973;31974;31975;31976;31977;31978;31979;31980;31981;31982;31983;31984;31985;31986;31987;31988;31989;31990;31991;31992;31993;31994;31995;31996;31997;31998;31999 41002;41003;41004;41005;41006;41007;41008;41009;41010;41011;41012;41013;41014;41015;41016;41017;41018;41019;41020;41021;41022;41023;41024;41025;41026;41027;41028;41029;41030;41031;41032;41033;41034;41035;41036;41037;41038;41039;41040;41041;41042;41043;41044;41045 41009 41 ARPFPDGLAEDIDKGEVSAR Unmodified 2142.0705 0.070545766 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 2 2 3 1 1 3 2 1 2 3 2 2 1 2 82.763 82.763 3;4 1.4717E-31 83936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.29 111.58 1143400000 146360000 88584000 155620000 0 0 0 202670000 138880000 0 94327000 0 178070000 138910000 3534 2058 3293 32000;32001;32002;32003;32004;32005;32006;32007;32008;32009;32010;32011;32012;32013;32014;32015;32016;32017;32018;32019;32020;32021;32022;32023;32024 41046;41047;41048;41049;41050;41051;41052;41053;41054;41055;41056;41057;41058;41059;41060;41061;41062;41063;41064;41065;41066;41067;41068;41069;41070;41071;41072;41073;41074;41075;41076 41066 29 ARPGEITGYMATVPGLLK Unmodified 1873.0132 0.013154229 3941 Q96S97;C9JZL8;C9J5M0;C9JC07 MYADM Myeloid-associated differentiation marker yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.17 108.17 3 0.0023133 111827 QUIQUE_C1277_190116_001 55.688 49.271 283430000 0 40635000 41272000 47894000 0 0 59628000 0 0 0 57863000 36140000 0 3535 3941 3294 32025;32026;32027;32028;32029;32030 41077;41078;41079;41080;41081;41082;41083;41084 41077 8 ARPILHVSHEVSIAPR Unmodified 1781.006 0.0060354365 1266;3022 J3KNV4;Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 32.227 32.227 3;4 1.3065E-09 26464 QUIQUE_C1368_190116_001 100.4 85.243 1524200000 252110000 58210000 349800000 115930000 101780000 60601000 105740000 54880000 125770000 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11 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 97.305 97.305 2;3 7.7142E-09 94826 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.48 99.471 1947400000 158850000 272510000 288940000 303010000 159760000 217960000 207680000 0 0 90782000 67305000 82067000 98519000 3539 1688 3298 32052;32053;32054;32055;32056;32057;32058;32059;32060;32061;32062;32063;32064;32065 41109;41110;41111;41112;41113;41114;41115;41116;41117;41118;41119;41120;41121;41122;41123;41124;41125;41126;41127 41124 19 ARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLR Unmodified 2792.3453 0.34528084 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 99.321 99.321 3;4 1.799E-142 103230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 216.65 204.8 5943000000 118730000 192460000 420140000 76560000 411420000 91670000 505060000 488950000 911990000 132530000 962970000 878830000 751710000 3540 1688 3299 32066;32067;32068;32069;32070;32071;32072;32073;32074;32075;32076;32077;32078;32079;32080;32081;32082;32083;32084;32085;32086 41128;41129;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;41147;41148;41149;41150;41151;41152;41153;41154;41155;41156;41157;41158;41159;41160 41154 32 ARPTDYPTQEQQLHFIR Unmodified 2099.0548 0.054836123 4540 Q9Y259 CHKB Choline/ethanolamine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.684 59.684 3 2.8716E-05 58830 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.514 62.435 479650000 24120000 46000000 53426000 49591000 32321000 21097000 39240000 48170000 0 17079000 47403000 42429000 58770000 3541 4540 3300 32087;32088;32089;32090;32091;32092;32093;32094;32095;32096;32097;32098 41161;41162;41163;41164;41165;41166;41167;41168;41169;41170;41171;41172 41168 12 ARQEELYSELQAR Unmodified 1591.7954 0.79543354 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 3 3 2 2 2 3 2 2 2 1 3 2 2 52.641 52.641 2;3 6.9688E-23 50414 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.21 128.05 5443000000 398370000 531840000 506510000 90351000 166300000 166650000 462500000 732990000 1057700000 205330000 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3303 32134;32135 41210;41211 41210 2 ARVDHGAEIITQSPGR Unmodified 1705.886 0.88597988 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 2 25.837 25.837 3;4 0.019016 19792 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.365 16.2 107050000 0 0 0 0 0 0 0 107050000 0 0 0 0 0 3545 2009 3304 32136;32137 41212;41213 41213 2 ARYEAANWK Unmodified 1107.5461 0.54614213 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 1 1 20.231 20.231 3 0.04748 13424 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.153 45.46 53803000 0 0 0 0 0 0 0 53803000 0 0 0 0 0 3546 1091 3305 32138 41214 41214 0 ASAAFSSVGSVITK Unmodified 1323.7034 0.70343063 2667 P55327;H0YC42 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.735 71.735 2 0.00016653 71385 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.4 75.511 1487900000 111980000 145620000 105540000 145190000 0 109610000 145190000 127570000 107780000 65193000 106140000 109300000 208800000 3547 2667 3306 32139;32140;32141;32142;32143;32144;32145;32146;32147;32148;32149;32150 41215;41216;41217;41218;41219;41220;41221;41222;41223;41224;41225;41226 41226 7 ASAAPKPEPVPVQK Unmodified 1417.7929 0.79291434 3865 Q96HC4;H0YBI4;A0A0D9SFR4;H0Y929 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 19.173 19.173 2;3 0.0016781 11749 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.417 79.788 2751500000 275160000 346380000 410760000 396220000 58878000 90902000 61372000 69797000 454690000 0 348820000 238500000 0 3548 3865 3307 32151;32152;32153;32154;32155;32156;32157;32158;32159;32160;32161;32162;32163;32164;32165;32166;32167;32168 41227;41228;41229;41230;41231;41232;41233;41234;41235;41236;41237;41238;41239;41240;41241;41242;41243;41244 41242 18 ASAATTAILIAR Unmodified 1157.6768 0.67682195 1911 P07093 SERPINE2 Glia-derived nexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.218 62.218 2 0.0050825 61457 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.334 43.905 176570000 0 0 0 31220000 0 0 0 0 48097000 0 0 55560000 41689000 3549 1911 3308 32169;32170;32171;32172 41245;41246;41247;41248 41247 2 ASADLMSYCEEHAR Unmodified 1638.6766 0.67664031 4399 Q9UBI6 GNG12 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.153 47.153 3 0.0025582 44888 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.414 54.655 196580000 0 25743000 0 0 0 0 0 39118000 60521000 0 32365000 38831000 0 3550 4399 3309 32173;32174;32175;32176;32177 41249;41250;41251;41252;41253 41250 5 ASAELALGENSEVLK Unmodified 1529.7937 0.7937022 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 1 3 2 2 1 5 4 1 4 2 2 79.569 79.569 2 6.4675E-29 79162 QUIQUE_C1368_190116_001 161.99 127.27 3960000000 0 0 434810000 403900000 363700000 500090000 373660000 524080000 0 351950000 451530000 70321000 485920000 3551 1788 3310 32178;32179;32180;32181;32182;32183;32184;32185;32186;32187;32188;32189;32190;32191;32192;32193;32194;32195;32196;32197;32198;32199;32200;32201;32202;32203;32204;32205;32206;32207;32208;32209 41254;41255;41256;41257;41258;41259;41260;41261;41262;41263;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;41271;41272;41273;41274;41275;41276;41277;41278;41279;41280;41281;41282;41283;41284;41285;41286;41287;41288;41289;41290;41291;41292;41293;41294;41295;41296;41297 41259 43 ASAELIEEEVAK Unmodified 1287.6558 0.65581174 2035 P12081;B4DDD8;E7ETE2;B4E1C5;D6RF05;A0A2R8YCI2;A0A2R8YFR1 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 68.047 68.047 2 0.001806 66924 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.04 70.027 158880000 0 0 0 0 0 0 0 105050000 0 53829000 0 0 0 3552 2035 3311 32210;32211 41298;41299 41298 1 ASAETVDPASLWEY Unmodified 1537.6937 0.69365381 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.43 146.43 2 3.7203E-12 150701 QUIQUE_C1403_190116_001 176.38 166.43 2063600000 246030000 206570000 142230000 189650000 188910000 148210000 166020000 197380000 179020000 0 195400000 0 204140000 3553 3187 3312 32212;32213;32214;32215;32216;32217;32218;32219;32220;32221;32222 41300;41301;41302;41303;41304;41305;41306;41307;41308;41309;41310 41303 4 ASAFALQEQPVVNAVIDDTTK Unmodified 2216.1325 0.13247732 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 136.09 136.09 3 0.017409 131931 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.576 20.931 98121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98121000 0 0 0 3554 2404 3313 32223 41311 41311 1 ASAFNSWFENAEEDLTDPVR Unmodified 2297.0237 0.023655153 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 159.35 159.35 2;3 6.5146E-243 165405 QUIQUE_C1576_190116_001 335.07 314.49 10958000000 593270000 812610000 904510000 696290000 781390000 471220000 722550000 858250000 1195300000 209860000 1302700000 1191800000 1218600000 3555 267;275;3025 3314 32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;32233;32234;32235;32236;32237;32238;32239;32240;32241;32242;32243;32244;32245;32246;32247;32248 41312;41313;41314;41315;41316;41317;41318;41319;41320;41321;41322;41323;41324;41325;41326;41327;41328;41329;41330;41331;41332;41333;41334;41335;41336;41337;41338;41339;41340;41341;41342;41343;41344;41345;41346;41347;41348;41349;41350;41351;41352;41353;41354;41355;41356;41357;41358 41333 47 ASAGHAVSIAQDDAGADDWETDPDFVNDVSEK Unmodified 3331.4389 0.43890227 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 111.17 111.17 3 5.2397E-41 113572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.77 113.32 359930000 61645000 74127000 0 0 62929000 0 0 70308000 23972000 0 0 0 66944000 3556 3056 3315 32249;32250;32251;32252;32253;32254 41359;41360;41361;41362;41363;41364;41365;41366 41362 8 ASAGLLGAHAAAITAYALTLTK Unmodified 2084.163 0.16298959 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.01 137.01 2;3 4.4993E-24 141754 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.58 121.31 1103200000 24521000 66108000 28960000 36759000 120190000 0 87560000 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123.3 785810000 38789000 52986000 0 0 101380000 0 0 39549000 103000000 0 207390000 95042000 147660000 3559 2272 3318 32280;32281;32282;32283;32284;32285;32286;32287;32288 41399;41400;41401;41402;41403;41404;41405;41406;41407;41408 41405 9 ASAHAITGPPTELITSEVTAR Unmodified 2121.1066 0.10659692 2897 Q05707;J3QT83;Q4G0W3;H0YBB2 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.924 89.924 3 8.2433E-54 91001 QUIQUE_C1403_190116_001 134.29 117.6 725580000 122250000 160080000 0 169840000 163040000 0 110370000 0 0 0 0 0 0 3560 2897 3319 32289;32290;32291;32292;32293 41409;41410;41411;41412;41413;41414 41412 6 ASALEQFVNSVR Acetyl (Protein N-term) 1361.6939 0.69392858 4514 Q9UNS2;C9JLV5;J3QKR0;J3KTQ1;J3QL22;J3QS85 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.45 165.45 2 2.622E-93 169965 QUIQUE_DMIX3_190116_001 239.31 137.67 3042700000 307070000 211650000 236610000 243910000 264060000 215800000 231810000 255460000 230240000 86312000 238440000 266080000 255230000 3561 4514 3320 32294;32295;32296;32297;32298;32299;32300;32301;32302;32303;32304;32305;32306 41415;41416;41417;41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425;41426;41427;41428;41429 41424 13 ASALIDRPAPYFER Unmodified 1604.8311 0.83109076 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3KT37;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 3 69.254 69.254 2;3 1.9016E-23 66440 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.46 117.27 5016000000 592630000 417080000 363800000 286590000 324250000 368250000 377780000 404940000 390480000 199240000 429610000 324730000 536660000 3562 143;560;4559 3321 32307;32308;32309;32310;32311;32312;32313;32314;32315;32316;32317;32318;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32325;32326;32327;32328;32329;32330;32331;32332 41430;41431;41432;41433;41434;41435;41436;41437;41438;41439;41440;41441;41442;41443;41444;41445;41446;41447;41448;41449;41450;41451;41452;41453;41454;41455;41456;41457;41458;41459;41460;41461;41462 41451 26 ASALQDMMR Unmodified 1021.4685 0.46848544 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 60.542 60.542 2 0.025354 59279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.35 43.911 35674000 0 0 0 17509000 0 0 0 18165000 0 0 0 0 0 3563 1534 3322 32333;32334 41463;41464 41464 2 ASALVFFSCR Unmodified 1156.5699 0.56991404 2116 P17050 NAGA Alpha-N-acetylgalactosaminidase yes yes 0 0 0 1 1 1 98.241 98.241 2 0.0076035 95897 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.928 58.152 60454000 0 0 0 0 0 0 0 0 24480000 11515000 0 24459000 0 3564 2116 3323 32335;32336;32337 41465;41466;41467;41468 41466 4 ASANMDLMR Oxidation (M) 1023.4477 0.44774999 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 1 0 1 21.277 21.277 2 0.046324 14466 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.775 34.992 44036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44036000 0 0 3565 2282 3324 32338 41469 41469 1 ASANMDLMR Unmodified 1007.4528 0.45283537 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 40.291 40.291 2 0.048856 37429 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.059 34.504 135530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135530000 0 0 3566 2282 3324 32339 41470 41470 1 ASAPAAAAAAAAAAAAAAAALAAAAGGGR Unmodified 2205.1614 0.16142646 1571 O60346 PHLPP1 PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 1 yes yes 0 0 0 1 169.01 169.01 3 4.323E-06 171844 QUIQUE_C1403_190116_001 53.998 46.3 14524000 0 0 0 14524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3567 1571 3325 32340 41471 41471 1 ASAPESGLLSK Unmodified 1058.5608 0.56078914 3821 Q96CN7 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.25 35.25 2 0.00045796 30872 QUIQUE_C1438_190116_001 105.52 64.746 1206800000 125670000 125070000 94638000 114040000 123680000 73938000 107910000 81925000 109810000 0 128380000 121760000 0 3568 3821 3326 32341;32342;32343;32344;32345;32346;32347;32348;32349;32350;32351 41472;41473;41474;41475;41476;41477;41478;41479;41480;41481;41482 41476 11 ASAPLPGLSAPGR Unmodified 1192.6564 0.65642086 1433 O14558;A0A1X7SC65;K7EP04 HSPB6 Heat shock protein beta-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.208 61.208 2 0.0098246 60415 QUIQUE_C1368_190116_001 59.198 41.213 250070000 0 0 61406000 0 0 107280000 0 0 0 0 0 0 81384000 3569 1433 3327 32352;32353;32354;32355 41483;41484;41485;41486 41483 3 ASAPSPNAQVACDHCLK Unmodified 1824.8247 0.82470153 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.44 29.44 3 0.00012351 23684 QUIQUE_C1277_190116_001 80.738 71.333 215490000 0 28967000 62749000 0 42257000 0 58521000 22999000 0 0 0 0 0 3570 3059 3328 32356;32357;32358;32359;32360 41487;41488;41489;41490;41491 41487 5 ASAQQENSSTCIGSAIK Unmodified 1750.8156 0.81557663 4329 Q9NXV6 CDKN2AIP CDKN2A-interacting protein yes yes 0 0 0 1 35.05 35.05 2 0.0046762 30366 QUIQUE_C1403_190116_001 55.105 31.729 24645000 0 0 0 24645000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3571 4329 3329 32361 41492 41492 1 ASASAPAPASATEILLTPAR Unmodified 1894.016 0.015991 4260 Q9NQX7;C9JG41 ITM2C Integral membrane protein 2C;CT-BRI3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.567 98.567 2 8.0005E-07 102416 QUIQUE_C1218_190116_001 98.943 90.214 144770000 29818000 29017000 27433000 33128000 0 25373000 0 0 0 0 0 0 0 3572 4260 3330 32362;32363;32364;32365;32366 41493;41494;41495;41496;41497 41493 4 ASASDGSSFVVAR Unmodified 1252.6048 0.60477922 4173 Q9H4G4;Q5VZR0;A0A087WUM5 GLIPR2 Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1 yes no 0 0 0 1 41.421 41.421 2 0.00045944 37975 QUIQUE_C1368_190116_001 106.4 78.001 81193000 0 0 81193000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3573 4173 3331 32367 41498;41499 41499 2 ASASGAMAK Acetyl (Protein N-term) 834.39055 0.39055269 4369 Q9P0L0;J3QKM9 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes no 1 0 0 1 1 1 22.026 22.026 1 0.0044999 15088 QUIQUE_C1403_190116_001 143.73 80.587 450840000 0 172700000 0 132660000 0 0 0 0 0 0 145480000 0 0 3574 4369 3332 32368;32369;32370 41500;41501;41502 41501 0 ASASGSGAQVGGPISSGSSASSVTVTR Unmodified 2364.1517 0.15170921 1819 P02545;A0A0C4DGC5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 55.871 55.871 2;3 8.7213E-126 54109 QUIQUE_C1277_190116_001 188.6 137.58 1423400000 130920000 137490000 147870000 191160000 217480000 110560000 43991000 44299000 54502000 87574000 76657000 55358000 125570000 3575 1819 3333 32371;32372;32373;32374;32375;32376;32377;32378;32379;32380;32381;32382;32383;32384;32385;32386;32387;32388;32389;32390;32391 41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524 41506 21 ASASTQPAALSAEQAK Acetyl (Protein N-term) 1571.7791 0.77911477 992 F5GXW5;U3KQ07;Q99622 C12orf57 Protein C10 yes no 1 0 0 1 57.689 57.689 2 0.015963 56961 QUIQUE_C1576_190116_001 42.446 17.592 26816000 0 0 0 0 0 0 26816000 0 0 0 0 0 0 3576 992 3334 32392 41525 41525 1 ASASYHISNLLEK Acetyl (Protein N-term) 1473.7464 0.74635808 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.526 94.526 2 1.3714E-31 97639 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.46 144.46 5266700000 720260000 0 601620000 569070000 0 496340000 0 545500000 606720000 276760000 728050000 722330000 0 3577 3499 3335 32393;32394;32395;32396;32397;32398;32399;32400;32401;32402;32403;32404 41526;41527;41528;41529;41530;41531;41532;41533;41534;41535;41536;41537;41538;41539;41540;41541 41539 16 ASATGMIIMDGVEVPEENVLPGASSLGGPFGCLNNAR Unmodified 3729.7801 0.78006611 3771 Q92947 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 160.71 160.71 3 0.010027 165495 QUIQUE_DMIX8_190116_001 25.063 10.132 23304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23304000 3578 3771 3336 32405 41542 41542 1 ASAVSPANLPAVLLQPR Acetyl (Protein N-term) 1744.9836 0.98356866 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 156.27 156.27 3 3.1945E-07 160344 QUIQUE_C1277_190116_001 74.296 70.392 61019000 12447000 20427000 15659000 12486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3579 533 3337 32406;32407;32408;32409;32410 41543;41544;41545;41546;41547;41548 41545 6 ASAYVFASPGCK Unmodified 1256.586 0.58595803 1761 O95861;A6NF51 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.651 51.651 2 0.0045896 48067 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.76 48.973 417330000 0 99696000 0 89879000 0 86160000 0 0 0 21366000 0 0 120230000 3580 1761 3338 32411;32412;32413;32414;32415 41549;41550;41551;41552;41553 41552 5 ASCLYGQLPK Unmodified 1135.5696 0.56957969 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.117 53.117 2 0.00024951 51427 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.4 82.103 37676000000 2842800000 3495300000 4182500000 0 3993500000 3536700000 3309700000 3475100000 4543400000 1251100000 3242900000 3802900000 0 3581 1957 3339 32416;32417;32418;32419;32420;32421;32422;32423;32424;32425;32426 41554;41555;41556;41557;41558;41559;41560;41561;41562;41563;41564;41565;41566;41567;41568;41569;41570;41571;41572;41573 41566 20 ASCQPQPLER Unmodified 1184.5608 0.56080592 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;A0A2R8YG95;E7ET92;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 19.961 19.961 2 0.0015474 12919 QUIQUE_C1438_190116_001 96.331 78.296 247100000 0 0 0 0 77506000 77853000 91744000 0 0 0 0 0 0 3582 454 3340 32427;32428;32429 41574;41575;41576 41574 1 ASDCEPALNQAEGR Acetyl (Protein N-term) 1558.6682 0.66818411 697 C9J5H8 NCDN yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 63.414 63.414 2 4.1761E-06 59371 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.02 104.39 680710000 0 0 0 0 213350000 0 182440000 0 0 36419000 133750000 0 114740000 3583 697 3341 32430;32431;32432;32433;32434;32435 41577;41578;41579;41580;41581;41582 41580 6 ASDESVLSMHK Unmodified 1202.5601 0.56013721 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.269 27.269 2;3 0.016455 20969 QUIQUE_C1368_190116_001 35.523 1.4363 128690000 0 0 29622000 30945000 0 32750000 0 35378000 0 0 0 0 0 3584 2361 3342 32436;32437;32438;32439;32440 41583;41584;41585;41586;41587;41588 41585 6 ASDLAGSVDTGSAGSVK Unmodified 1520.7318 0.73183023 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 42.298 42.298 2 0.00056851 38753 QUIQUE_C1403_190116_001 74.537 37.473 39521000 0 0 0 25133000 0 0 14387000 0 0 0 0 0 0 3585 3718 3343 32441;32442 41589;41590 41589 2 ASDMLYFK Unmodified 973.4579 0.45790397 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 69.227 69.227 2 0.031896 69132 QUIQUE_C1277_190116_001 65.676 49.509 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41612;41613;41614;41615;41616;41617;41618;41619 41614 7 ASDYLVDLIAFLR Unmodified 1494.8082 0.80823006 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 170.8 170.8 2;3 9.7295E-05 175234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 109.71 67557000 0 0 0 0 16376000 0 0 17639000 14655000 0 0 0 18887000 3589 318 3347 32470;32471;32472;32473;32474;32475 41620;41621;41622;41623;41624;41625;41626 41624 6 ASEAASPLPDSPGDK Unmodified 1440.6733 0.67325272 3350 Q68CZ2 TNS3 Tensin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 37.455 37.455 2 3.6956E-09 32608 QUIQUE_DMIX8_190116_001 108.98 95.55 50698000 0 0 0 0 0 25428000 0 0 0 25270000 0 0 0 3590 3350 3348 32476;32477;32478;32479;32480 41627;41628;41629;41630;41631;41632 41632 6 ASEAGEVPFNHEILR Unmodified 1667.8267 0.82673367 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 66.14 66.14 2;3 2.9055E-18 66573 QUIQUE_C1438_190116_001 153.63 130.02 2145700000 73581000 295890000 96971000 274200000 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1 104.97 104.97 2 1.2807E-64 107535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 245.58 214.16 925760000 0 0 0 0 0 0 0 165680000 117810000 0 280350000 181750000 180170000 3594 4212 3352 32502;32503;32504;32505;32506 41654;41655;41656;41657;41658;41659 41655 6 ASEGASSESLLSVPGQK Unmodified 1645.8159 0.81589421 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 67.476 67.476 2 0.00040719 66337 QUIQUE_C1563_190116_001 103.88 85.256 75835000 0 0 0 0 0 23272000 52562000 0 0 0 0 0 0 3595 3684 3353 32507;32508 41660;41661 41660 2 ASEGPAFFPGR Unmodified 1134.5458 0.54580778 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.638 65.638 2 0.0004904 62728 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.72 63.561 1485200000 181220000 201590000 0 144340000 171180000 141790000 0 0 117990000 78474000 249570000 199020000 0 3596 4284 3354 32509;32510;32511;32512;32513;32514;32515;32516;32517 41662;41663;41664;41665;41666;41667;41668;41669;41670;41671;41672;41673 41669 12 ASEGTNIPSPVVR Acetyl (Protein N-term) 1367.7045 0.70449327 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;A0A0J9YW70;C9JVI3;A0A0J9YXY2 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 81.842 81.842 2 0.020764 82694 QUIQUE_C1403_190116_001 59.84 30.753 95603000 23284000 45234000 0 27085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3597 4091 3355 32518;32519;32520;32521 41674;41675;41676;41677 41676 3 ASEHAADIQMVNFDYHQMVK Unmodified 2333.0569 0.056886312 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 89.701 89.701 3;4 1.5311E-06 92963 QUIQUE_C1218_190116_001 84.493 80.141 803130000 105080000 135520000 84449000 72579000 45851000 35353000 109180000 33261000 23152000 9073200 73152000 76484000 0 3598 723 3356 32522;32523;32524;32525;32526;32527;32528;32529;32530;32531;32532;32533;32534;32535;32536;32537;32538 41678;41679;41680;41681;41682;41683;41684;41685;41686;41687;41688;41689;41690;41691;41692;41693;41694;41695;41696;41697 41678 19 ASEKPLAAVTCTAPVNIAVIK Acetyl (Protein N-term) 2194.2031 0.20313984 2626 P53602;H3BP35;H3BRZ1;H3BVC4;H3BQ47 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.45 119.45 2 4.0477E-19 122306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.79 142.33 391180000 25694000 0 28896000 24391000 47167000 27510000 55512000 30131000 34772000 0 41417000 32607000 43085000 3599 2626 3357 32539;32540;32541;32542;32543;32544;32545;32546;32547;32548;32549 41698;41699;41700;41701;41702;41703;41704;41705;41706;41707;41708 41704 11 ASELDKDTASTIILLASSEMTK Unmodified 2323.1829 0.18285791 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 1 1 145.92 145.92 3 0.01846 150512 QUIQUE_C1277_190116_001 33.187 25.29 26927000 0 26927000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3600 934 3358 32550 41709 41709 1 ASENAIVWK Unmodified 1016.5291 0.52909508 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;H7C4C3 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.871 45.871 2 0.00048535 42546 QUIQUE_C1563_190116_001 127.02 92.197 2288300000 226330000 219670000 222560000 204130000 164980000 146650000 219080000 0 178430000 68643000 233100000 200380000 204380000 3601 71 3359 32551;32552;32553;32554;32555;32556;32557;32558;32559;32560;32561;32562 41710;41711;41712;41713;41714;41715;41716;41717;41718;41719;41720;41721;41722 41715 9 ASENLRQEGVR Unmodified 1257.6426 0.64256171 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 14.056 14.056 3 0.062576 6068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.783 20.709 31703000 0 0 0 0 0 0 0 31703000 0 0 0 0 0 3602 2037 3360 32563 41723 41723 1 ASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYK Unmodified 4368.155 0.15501026 756 C9JYY6;Q92823;F8W775 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 2 1 140.77 140.77 4 0.0037555 143886 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.1 25.395 100860000 0 0 0 0 0 0 0 100860000 0 0 0 0 0 3603 756 3361 32564 41724 41724 1 ASEQIYGTPSSSPYECLR Unmodified 2043.9208 0.92076999 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.753 81.753 2 1.313E-53 83234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.61 167.41 1015600000 0 0 202400000 147410000 179320000 149910000 0 0 157320000 0 0 0 179200000 3604 890;3052 3362 32565;32566;32567;32568;32569;32570 41725;41726;41727;41728;41729;41730 41729 6 ASEQVLSLVAQFQK Unmodified 1546.8355 0.83550744 1754 O95822 MLYCD Malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 124.38 124.38 2 0.00091471 128076 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.397 62.526 95822000 0 36199000 0 21735000 0 0 16930000 20959000 0 0 0 0 0 3605 1754 3363 32571;32572;32573;32574;32575;32576;32577;32578 41731;41732;41733;41734;41735;41736;41737;41738 41738 8 ASERAEMMELNDR 2 Oxidation (M) 1582.6716 0.67155493 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 1 2 1 1 15.681 15.681 2;3 0.0024709 8299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.615 67.827 390640000 0 0 0 0 0 0 0 272810000 0 0 67078000 0 50750000 3606 389;395;1336 3364 32579;32580;32581;32582 41739;41740;41741;41742 41739 274;275 4 ASERAEMMELNDR Unmodified 1550.6817 0.68172569 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 37.85 37.85 3 0.0048317 34405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.03 40.563 85321000 0 0 0 0 0 0 0 53957000 0 0 31363000 0 0 3607 389;395;1336 3364 32583;32584 41743;41744 41743 2 ASESSKPWPDATYGTGSASR Unmodified 2053.9341 0.93411186 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 46.026 46.026 3 8.5761E-05 43724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.001 60.72 185470000 0 0 0 0 0 0 0 51988000 51216000 0 0 33006000 49261000 3608 504 3365 32585;32586;32587;32588 41745;41746;41747;41748 41745 3 ASEVQLHLYGQHYR Unmodified 1699.8431 0.84305243 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 40.789 40.789 4 0.001964 38300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.761 35.584 291510000 0 0 157300000 0 0 0 0 134210000 0 0 0 0 0 3609 4626 3366 32589;32590 41749;41750 41750 2 ASEWVQQVSGLMDGK Unmodified 1633.777 0.77700628 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 124.18 124.18 2 8.5524E-24 128983 QUIQUE_C1218_190116_001 184.55 154.78 648990000 286190000 0 0 0 0 0 0 284640000 0 78167000 0 0 0 3610 2533 3367 32591;32592;32593 41751;41752;41753 41751 3 ASEWVQQVSGLMDGK Oxidation (M) 1649.7719 0.7719209 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 1 88.093 88.093 2 0.00014096 89373 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.189 73.599 183180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72071000 48111000 62994000 3611 2533 3367 32594;32595;32596 41754;41755;41756;41757 41757 1974 4 ASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIK Unmodified 3537.8389 0.83888484 4459 Q9UJS0 SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.23 170.23 3 1.039E-87 173238 QUIQUE_C1403_190116_001 140.54 137.19 524460000 49999000 33317000 0 71897000 30595000 37365000 0 0 64612000 6817000 82749000 56862000 90243000 3612 4459 3368 32597;32598;32599;32600;32601;32602;32603;32604;32605;32606 41758;41759;41760;41761;41762;41763;41764;41765;41766;41767;41768;41769 41760 12 ASFATPYGYAMETAK Unmodified 1606.7337 0.73374448 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.727 91.727 2 1.1005E-05 93920 QUIQUE_C1277_190116_001 101.56 73.351 501990000 38481000 64145000 0 57236000 50034000 40939000 32940000 43487000 81054000 0 0 47380000 46298000 3613 1741 3369 32607;32608;32609;32610;32611;32612;32613;32614;32615;32616 41770;41771;41772;41773;41774;41775;41776;41777;41778;41779;41780 41771 9 ASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMK Oxidation (M) 3331.5343 0.53432298 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 170.73 170.73 3 1.4031E-44 174582 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.28 123.99 625330000 0 0 0 0 0 0 58235000 0 60399000 0 260720000 245970000 0 3614 2051 3370 32617;32618;32619;32620 41781;41782;41783;41784 41784 1365 4 ASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMK Unmodified 3315.5394 0.53940836 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 172.27 172.27 3 9.7863E-127 176034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 191.18 178.83 680550000 0 0 0 0 0 0 117580000 0 58841000 0 237010000 267120000 0 3615 2051 3370 32621;32622;32623;32624 41785;41786;41787;41788 41788 4 ASFENNCEIGCFAK Unmodified 1645.6865 0.68647672 2681 P56537;B7ZBH1;F8WD20;A0A0B4J1Y7 EIF6 Eukaryotic translation initiation factor 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.098 74.098 2 3.3379E-10 71611 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.28 121.33 608370000 57939000 70191000 51567000 62251000 43905000 39848000 32146000 56840000 34841000 33156000 42172000 40954000 42557000 3616 2681 3371 32625;32626;32627;32628;32629;32630;32631;32632;32633;32634;32635;32636;32637 41789;41790;41791;41792;41793;41794;41795;41796;41797;41798;41799;41800;41801;41802 41799 13 ASFETLPNISDLCLR Unmodified 1734.8611 0.86107026 4112 Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PRW1;E9PSD6 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.78 136.78 2 0.00010218 141800 QUIQUE_C1368_190116_001 115.33 101.93 614620000 65844000 58418000 67225000 59486000 59144000 0 69835000 0 55216000 0 52372000 55970000 71111000 3617 4112 3372 32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;32647 41803;41804;41805;41806;41807;41808;41809;41810;41811;41812 41805 10 ASFHELYNMYK Unmodified 1401.6387 0.63872189 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 74.764 74.764 3 0.025955 74421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.243 34.111 16497000 0 0 0 0 0 0 0 16497000 0 0 0 0 0 3618 153 3373 32648 41813 41813 1 ASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAK Unmodified 2805.4115 0.41149441 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 3 3 2 2 1 1 1 1 2 1 2 169.39 169.39 2;3 1.5314E-32 172837 QUIQUE_C1277_190116_001 121.3 104.64 1253500000 64562000 119920000 117710000 84399000 189050000 110730000 119730000 0 64845000 6510100 124580000 119590000 131820000 3619 1005;2027 3374 32649;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;32657;32658;32659;32660;32661;32662;32663;32664;32665;32666;32667;32668;32669 41814;41815;41816;41817;41818;41819;41820;41821;41822;41823;41824;41825;41826;41827;41828;41829;41830;41831;41832;41833;41834;41835;41836;41837 41816 23 ASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAK Oxidation (M) 2821.4064 0.40640904 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 1 1 165.96 165.96 3 2.6397E-15 167920 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.558 74.351 158530000 0 0 0 0 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0.44642809 2047;1242;2381 H9KV75;H7C5W8;H0YJW3;H0YJ11;P12814;P35609;F6THM6 ACTN1;ACTN2 Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 0 0 1 20.323 20.323 2 0.039539 13090 QUIQUE_C1277_190116_001 60.828 34.657 183520000 0 183520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3623 1242;2047;2381 3377 32690 41858 41858 1 ASFPQGPIGGANR Unmodified 1270.6418 0.64183343 109 A0A087X1K9;E5RGR0;O75608 LYPLA1 Acyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 52.001 52.001 2 0.0044235 50307 QUIQUE_C1218_190116_001 89.047 66.81 436340000 87132000 93472000 0 0 0 0 68289000 87625000 0 30568000 0 69252000 0 3624 109 3378 32691;32692;32693;32694;32695;32696 41859;41860;41861;41862;41863;41864;41865 41859 7 ASFSAVPVLANPAATSGCR Unmodified 1874.9309 0.93088116 3866 Q96HD9 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.414 95.414 2 4.1632E-22 97904 QUIQUE_C1277_190116_001 132.86 119.66 226450000 34265000 33254000 0 21232000 0 0 0 0 0 0 33501000 49741000 54461000 3625 3866 3379 32697;32698;32699;32700;32701;32702;32703 41866;41867;41868;41869;41870;41871;41872 41867 7 ASFSHDFTYLVSGSEDKYVYIWSTYHDLSK Unmodified 3544.6463 0.64631627 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 146.25 146.25 4 0.038725 150938 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.689 14.53 61283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61283000 0 3626 3277 3380 32704 41873 41873 1 ASFTNSELHR Unmodified 1160.5574 0.5574351 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.928 21.928 3 0.0033132 15504 QUIQUE_C1218_190116_001 53.597 32.727 410500000 55880000 0 47907000 34432000 40610000 52205000 41096000 41631000 0 21286000 0 45282000 30175000 3627 4161 3381 32705;32706;32707;32708;32709;32710;32711;32712;32713;32714 41874;41875;41876;41877;41878;41879;41880;41881;41882;41883 41874 10 ASFVTEVLAHSGR Acetyl (Protein N-term) 1414.7205 0.72047768 1518 O43264;F5H3C1 ZW10 Centromere/kinetochore protein zw10 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.69 142.69 2 2.9706E-53 148621 QUIQUE_C1218_190116_001 202.56 182.26 507210000 44437000 47454000 31416000 42849000 40149000 43377000 38357000 32513000 0 21008000 69246000 50480000 45925000 3628 1518 3382 32715;32716;32717;32718;32719;32720;32721;32722;32723;32724;32725;32726 41884;41885;41886;41887;41888;41889;41890;41891;41892;41893;41894;41895;41896 41884 12 ASFWLGELQR Unmodified 1205.6193 0.61930707 4625 Q9Y5L0;C9J7E5 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 111.33 111.33 2 0.04206 113531 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.473 37.095 24784000 0 0 0 0 0 0 0 24784000 0 0 0 0 0 3629 4625 3383 32727 41897 41897 1 ASGADSKGDDLSTAILK Acetyl (Protein N-term) 1689.8421 0.84210896 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 1 0 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 81.475 81.475 2;3 7.6417E-122 82434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 232.53 202.99 6579200000 214410000 388060000 346760000 274360000 512760000 173890000 418630000 834030000 799840000 71932000 851490000 794200000 898850000 3630 2658 3384 32728;32729;32730;32731;32732;32733;32734;32735;32736;32737;32738;32739;32740;32741;32742;32743;32744;32745;32746;32747 41898;41899;41900;41901;41902;41903;41904;41905;41906;41907;41908;41909;41910;41911;41912;41913;41914;41915;41916;41917;41918 41908 17 ASGAPAAADGFQNVFTGR Unmodified 1735.8278 0.8277963 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 97.073 97.073 2 0.0041598 101439 QUIQUE_C1438_190116_001 78.615 61.02 144280000 0 0 0 0 49468000 0 0 0 0 0 50284000 44527000 0 3631 4340 3385 32748;32749;32750 41919;41920;41921 41919 3 ASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQER Oxidation (M) 3579.725 0.72503688 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 169.79 169.79 3;4 9.6954E-58 174562 QUIQUE_C1368_190116_001 127.64 116.26 1383200000 106360000 117220000 280620000 0 93729000 119440000 309700000 0 248060000 0 56158000 51890000 0 3632 2132 3386 32751;32752;32753;32754;32755;32756;32757;32758;32759;32760;32761;32762;32763;32764;32765 41922;41923;41924;41925;41926;41927;41928;41929;41930;41931;41932;41933;41934;41935;41936 41926 1467 15 ASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQER Unmodified 3563.7301 0.73012225 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 3 2 174.13 174.13 3;4 2.5857E-65 181122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.94 128.56 748200000 0 0 0 0 0 0 0 38941000 57769000 0 554000000 97491000 0 3633 2132 3386 32766;32767;32768;32769;32770;32771;32772;32773 41937;41938;41939;41940;41941;41942;41943;41944 41940 8 ASGEHSPGSGAAR Acetyl (Protein N-term) 1224.5483 0.54832698 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 1 0 0 1 11.182 11.182 2 0.0045684 3389 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.102 44.44 31387000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31387000 0 0 0 3634 4169 3387 32774 41945 41945 1 ASGELMTVAR Unmodified 1033.5226 0.5226295 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 37.179 37.179 2 0.00065106 32575 QUIQUE_C1277_190116_001 108.3 67.278 183400000 0 49195000 70129000 0 0 0 0 40052000 0 24021000 0 0 0 3635 438;2509 3388 32775;32776;32777;32778 41946;41947;41948;41949 41946 3 ASGELMTVAR Oxidation (M) 1049.5175 0.51754412 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 1 0 1 20.977 20.977 2 0.0059869 14326 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.816 44.859 71952000 0 0 0 0 0 0 0 0 71952000 0 0 0 0 3636 438;2509 3388 32779 41950 41950 314 1 ASGEMASAQYITAALR Unmodified 1638.8036 0.80355538 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.52 104.52 2 5.7832E-05 106617 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.36 112.47 689240000 77874000 85780000 79275000 91262000 0 90099000 59175000 93267000 76073000 36437000 0 0 0 3637 2642 3389 32780;32781;32782;32783;32784;32785;32786;32787;32788 41951;41952;41953;41954;41955;41956;41957;41958;41959;41960;41961 41959 10 ASGEMASAQYITAALR Oxidation (M) 1654.7985 0.79847001 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 0 1 87.639 87.639 2 0.013265 89634 QUIQUE_C1277_190116_001 50.222 33.197 71511000 0 71511000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3638 2642 3389 32789 41962 41962 2080 1 ASGGTSEFITGK Unmodified 1153.5615 0.56151742 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 34.075 34.075 2 0.00029247 29290 QUIQUE_C1438_190116_001 118.4 85.025 211540000 58971000 0 0 0 45039000 34602000 0 34384000 0 38545000 0 0 0 3639 1416 3390 32790;32791;32792;32793;32794;32795;32796;32797;32798;32799;32800;32801 41963;41964;41965;41966;41967;41968;41969;41970;41971;41972;41973;41974 41966 10 ASGIYYVPK Unmodified 996.52803 0.52803245 3466 Q7Z5R6;C9J164;C9K0J5;Q70E73 APBB1IP;RAPH1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein;Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 45.162 45.162 2 0.060793 42360 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.749 22.758 39396000 0 0 0 0 0 0 0 0 39396000 0 0 0 0 3640 3466 3391 32802 41975 41975 1 ASGLEIALDLHGMIK Oxidation (M) 1582.8389 0.83887826 4733 yes yes 0 1 0 1 1 1 68.931 68.931 2 0.007659 68708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.404 15.908 146710000 0 36034000 0 0 0 0 0 49524000 61152000 0 0 0 0 + 3641 4733 3392 32803;32804;32805 41976;41977;41978 41977 3095 2 ASGPGLNASGIPASLPVEFTIDAR Unmodified 2339.2121 0.21212463 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 2 143 143 2;3 2.1088E-35 147607 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.83 109.73 39070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39070000 0 0 0 3642 3061 3393 32806;32807;32808 41979;41980;41981 41979 3 ASGPGLNTTGVPASLPVEFTIDAK Unmodified 2341.2165 0.2165413 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 135.2 135.2 2;3 8.1598E-31 141701 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.05 155.21 974120000 0 69977000 61688000 86840000 157180000 36409000 51678000 147820000 74027000 34493000 100130000 99447000 54430000 3643 2178 3394 32809;32810;32811;32812;32813;32814;32815;32816;32817;32818;32819;32820;32821;32822;32823 41982;41983;41984;41985;41986;41987;41988;41989;41990;41991;41992;41993;41994;41995;41996;41997;41998;41999 41997 18 ASGPIDHYR Unmodified 1014.4883 0.4882929 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 16.048 16.048 2 0.0066803 8201 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.97 107.36 69910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69910000 0 0 0 3644 3753 3395 32824 42000 42000 0 ASGQAFELILSPR Unmodified 1387.746 0.74596415 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 109.28 109.28 2;3 6.7271E-24 112995 QUIQUE_C1368_190116_001 143.98 129.41 12156000000 1164300000 1512400000 965470000 873700000 1174300000 640010000 1010300000 541420000 809620000 342820000 1190200000 929210000 1002100000 3645 2115 3396 32825;32826;32827;32828;32829;32830;32831;32832;32833;32834;32835;32836;32837;32838;32839;32840;32841;32842;32843;32844;32845;32846;32847;32848;32849;32850;32851 42001;42002;42003;42004;42005;42006;42007;42008;42009;42010;42011;42012;42013;42014;42015;42016;42017;42018;42019;42020;42021;42022;42023;42024;42025;42026;42027;42028;42029;42030;42031;42032;42033;42034;42035;42036;42037;42038;42039;42040;42041;42042;42043;42044;42045;42046;42047;42048;42049;42050;42051;42052;42053;42054 42010 54 ASGTNDKPGGPHYILR Unmodified 1681.8536 0.85361712 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 3 3 3 2 3 3 3 3 3 2 3 21.044 21.044 2;3;4 3.1321E-79 14262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.59 187.73 11508000000 393360000 522400000 1654800000 1144300000 901950000 598590000 1095200000 788950000 835770000 246850000 1548600000 567050000 1210300000 3646 2295 3397 32852;32853;32854;32855;32856;32857;32858;32859;32860;32861;32862;32863;32864;32865;32866;32867;32868;32869;32870;32871;32872;32873;32874;32875;32876;32877;32878;32879;32880;32881;32882;32883;32884;32885;32886 42055;42056;42057;42058;42059;42060;42061;42062;42063;42064;42065;42066;42067;42068;42069;42070;42071;42072;42073;42074;42075;42076;42077;42078;42079;42080;42081;42082;42083;42084;42085;42086;42087;42088;42089;42090;42091;42092 42081 29 ASGTTTTAVK Acetyl (Protein N-term) 977.50294 0.50293991 2966 Q13126;J3QSB7;F2Z2F3;F8WES2 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 1 0 0 1 1 21.369 21.369 1;2 0.00094453 14659 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.71 60.184 38477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38477000 0 3647 2966 3398 32887;32888 42093;42094 42094 2 ASGVAVSDGVIK Acetyl (Protein N-term) 1143.6136 0.61355299 2220 P23528;E9PP50;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 1 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 80.001 80.001 2 4.172E-05 82520 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.82 98.022 41169000000 4778900000 4713700000 0 0 0 0 3794300000 5006000000 5331900000 2439800000 5267400000 4779700000 5057800000 3648 2220 3399 32889;32890;32891;32892;32893;32894;32895;32896;32897;32898;32899;32900;32901;32902;32903;32904;32905 42095;42096;42097;42098;42099;42100;42101;42102;42103;42104;42105;42106;42107;42108;42109;42110;42111;42112;42113;42114;42115;42116;42117;42118;42119;42120;42121;42122;42123;42124;42125 42113 30 ASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNR Unmodified 2654.301 0.30101599 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 4 6 12 4 3 176.14 176.14 3 0.00048241 181091 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.454 35.502 395710000 14200000 3892100 12537000 0 8483700 0 0 28044000 70007000 0 168200000 71434000 18911000 3649 2941 3400 32906;32907;32908;32909;32910;32911;32912;32913;32914;32915;32916;32917;32918;32919;32920;32921;32922;32923;32924;32925;32926;32927;32928;32929;32930;32931;32932;32933;32934;32935;32936;32937;32938;32939;32940;32941 42126;42127;42128;42129;42130;42131;42132;42133;42134;42135;42136;42137;42138;42139;42140;42141;42142;42143;42144;42145;42146;42147;42148;42149;42150;42151;42152;42153;42154;42155;42156;42157;42158;42159;42160;42161;42162 42139 31 ASGVEGADVVK Unmodified 1030.5295 0.52948901 2146 P19367;B1AR63 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.614 23.614 2 0.000179 17671 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.97 82.2 17324000000 1857800000 1640300000 1495400000 1544100000 1195600000 1183800000 1535900000 1123200000 1063200000 661960000 1454000000 1321300000 1247800000 3650 2146 3401 32942;32943;32944;32945;32946;32947;32948;32949;32950;32951;32952;32953;32954 42163;42164;42165;42166;42167;42168;42169;42170;42171;42172;42173;42174;42175;42176;42177;42178 42173 11 ASGVQVADEVCR Acetyl (Protein N-term) 1331.614 0.6139637 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 77.18 77.18 2 3.0349E-20 78676 QUIQUE_C1218_190116_001 169.37 149.59 6828200000 541850000 580030000 585170000 0 522040000 0 634160000 780440000 682280000 356320000 648900000 617790000 879180000 3651 2702 3402 32955;32956;32957;32958;32959;32960;32961;32962;32963;32964;32965;32966;32967;32968;32969;32970 42179;42180;42181;42182;42183;42184;42185;42186;42187;42188;42189;42190;42191;42192;42193;42194;42195;42196;42197;42198;42199;42200;42201;42202;42203;42204;42205;42206 42180 28 ASGVTVNDEVIK Acetyl (Protein N-term) 1272.6561 0.65614609 4546 Q9Y281;F8WDN3;G3V2U0 CFL2 Cofilin-2 yes no 1 0 0 1 1 81.783 81.783 2 0.00037555 84022 QUIQUE_C1576_190116_001 88.681 42.522 359770000 0 0 0 0 0 0 158460000 0 0 0 201310000 0 0 3652 4546 3403 32971;32972 42207;42208 42207 2 ASGYFTRPWQWEK Unmodified 1654.7892 0.78922595 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 86.949 86.949 2;3 6.1407E-07 88523 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.24 92.239 1654500000 44306000 146800000 73672000 67139000 118280000 51376000 128860000 242450000 241300000 0 169360000 115230000 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2256.1936 0.19363779 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 139.37 139.37 3 0.0072366 142254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.249 21.43 66718000 0 0 0 0 0 0 0 66718000 0 0 0 0 0 3660 2179 3411 33046 42301 42301 1 ASIHEAWTDGK Unmodified 1213.5728 0.57275081 1544;2047;1242 H9KV75;O43707;P12814 ACTN1;ACTN4 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 27.231 27.231 2;3 1.4811E-13 21520 QUIQUE_DMIX7_190116_001 167.69 118.34 5210300000 474200000 561780000 558100000 404990000 626510000 283050000 645980000 231190000 243590000 214340000 583990000 172230000 210320000 3661 1242;1544;2047 3412 33047;33048;33049;33050;33051;33052;33053;33054;33055;33056;33057;33058;33059;33060;33061;33062;33063;33064;33065;33066;33067;33068 42302;42303;42304;42305;42306;42307;42308;42309;42310;42311;42312;42313;42314;42315;42316;42317;42318;42319;42320;42321;42322;42323;42324;42325;42326;42327;42328;42329;42330;42331 42329 28 ASILDEYENSLSR Acetyl (Protein N-term) 1537.726 0.72601657 4378 Q9P253;H0YMC9;H0YLM6 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.15 155.15 2 0.0002069 159883 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.229 46.929 365860000 28879000 26714000 35078000 31459000 45039000 35679000 31453000 28684000 29058000 11457000 31518000 0 30845000 3662 4378 3413 33069;33070;33071;33072;33073;33074;33075;33076;33077;33078;33079;33080 42332;42333;42334;42335;42336;42337;42338;42339;42340;42341;42342;42343;42344 42341 13 ASILNTWISLK Unmodified 1244.7129 0.71287311 2195 P22234;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 129.76 129.76 2 1.4578E-05 135847 QUIQUE_C1438_190116_001 142.43 125.04 3875100000 298860000 257470000 281290000 209550000 265670000 276070000 269230000 368310000 402210000 151170000 450450000 312990000 331800000 3663 2195 3414 33081;33082;33083;33084;33085;33086;33087;33088;33089;33090;33091;33092;33093;33094 42345;42346;42347;42348;42349;42350;42351;42352;42353;42354;42355;42356;42357;42358;42359;42360;42361;42362;42363;42364;42365;42366;42367;42368;42369;42370;42371;42372;42373;42374;42375 42355 31 ASILWLIGENCER Unmodified 1559.7766 0.77661235 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.05 134.05 2 0.0012514 140432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.017 70.645 113390000 0 0 0 0 0 0 0 27285000 43665000 13606000 28834000 0 0 3664 1386 3415 33095;33096;33097;33098;33099 42376;42377;42378;42379;42380 42380 5 ASILWLIGEYCEHVPR Unmodified 1941.9771 0.97710307 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.42 144.42 3 1.0464E-06 148836 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.966 75.035 655740000 27406000 52986000 40641000 25497000 43450000 38115000 56702000 58005000 64317000 0 82813000 111230000 54575000 3665 2990 3416 33100;33101;33102;33103;33104;33105;33106;33107;33108;33109;33110;33111 42381;42382;42383;42384;42385;42386;42387;42388;42389;42390;42391;42392;42393;42394;42395;42396;42397;42398;42399;42400 42397 18 ASIPFSVVGSNQLIEAK Unmodified 1758.9516 0.95159983 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 117.42 117.42 2;3 4.3948E-32 120179 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.47 108.21 26309000000 1390000000 1647700000 1981900000 1557300000 1978700000 1580700000 1697200000 2417400000 2702600000 603920000 3428700000 2216200000 3106100000 3666 640;3097 3417 33112;33113;33114;33115;33116;33117;33118;33119;33120;33121;33122;33123;33124;33125;33126;33127;33128;33129;33130;33131;33132;33133;33134;33135 42401;42402;42403;42404;42405;42406;42407;42408;42409;42410;42411;42412;42413;42414;42415;42416;42417;42418;42419;42420;42421;42422;42423;42424;42425;42426;42427;42428;42429;42430;42431;42432;42433;42434;42435;42436;42437;42438 42425 35 ASITALEAK Unmodified 902.5073 0.50729701 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 33.839 33.839 2 0.060033 28910 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.96 10.148 242260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 242260000 0 3667 2378 3418 33136 42439 42439 1 ASITPGTILIILTGR Unmodified 1524.9239 0.92392852 2878 Q02878;F8VR69;F8VZ45;U3KQR5 RPL6 60S ribosomal protein L6 yes no 0 0 0 1 1 162.85 162.85 2 0.0013607 166359 QUIQUE_C1403_190116_001 73.848 33.259 24271000 0 0 14578000 9693800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3668 2878 3419 33137;33138 42440;42441 42441 2 ASIVDDIHSTFDELQK Unmodified 1816.8843 0.88430813 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.06 132.06 3 1.3919E-07 137949 QUIQUE_C1218_190116_001 100.43 83.547 1926700000 167540000 186670000 0 158570000 126550000 354720000 0 166680000 212220000 111590000 198870000 0 243280000 3669 4091 3420 33139;33140;33141;33142;33143;33144;33145;33146;33147;33148 42442;42443;42444;42445;42446;42447;42448;42449;42450;42451;42452;42453 42442 8 ASIWVGHR Acetyl (Protein N-term) 966.50355 0.50354903 2045 P12429;D6RFG5;D6RCA8;D6RAZ8 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 65.82 65.82 2 0.013482 64680 QUIQUE_C1563_190116_001 94.662 56.424 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3670 2045 3421 33149;33150;33151;33152;33153 42454;42455;42456;42457;42458 42455 5 ASLAAVHLFTAK Unmodified 1227.6976 0.69755739 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.414 66.414 2 0.0034978 68803 QUIQUE_C1218_190116_001 79.659 56.23 55508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25466000 0 30042000 3671 4449 3422 33154;33155;33156;33157;33158;33159;33160 42459;42460;42461;42462;42463;42464;42465 42459 6 ASLAETDKITLEVAK Unmodified 1587.872 0.87195252 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 3 1 3 2 2 1 2 3 2 2 2 2 68.289 68.289 2;3 3.6171E-06 69839 QUIQUE_C1218_190116_001 120.87 99.873 1812100000 206630000 255370000 59656000 177640000 61883000 160390000 59409000 0 219050000 112730000 212850000 227080000 59433000 3672 2414 3423 33161;33162;33163;33164;33165;33166;33167;33168;33169;33170;33171;33172;33173;33174;33175;33176;33177;33178;33179;33180;33181;33182;33183;33184;33185;33186;33187 42466;42467;42468;42469;42470;42471;42472;42473;42474;42475;42476;42477;42478;42479;42480;42481;42482;42483;42484;42485;42486;42487;42488;42489;42490;42491;42492;42493;42494;42495;42496;42497 42469 30 ASLASLPPLHVAK Unmodified 1302.766 0.76597131 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.071 65.071 3 0.00057543 64977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.157 32.748 1620500000 222620000 198890000 181430000 0 158930000 0 157340000 185580000 176250000 0 0 144740000 194750000 3673 890;3052 3424 33188;33189;33190;33191;33192;33193;33194;33195;33196 42498;42499;42500;42501;42502;42503;42504;42505;42506;42507;42508;42509;42510;42511;42512 42509 15 ASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDAK Unmodified 3252.6667 0.66665778 1869 P04844;Q5JYR7 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 169.97 169.97 3 1.7767E-87 174351 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.32 150.42 650070000 0 0 0 0 34581000 0 0 35334000 220070000 0 257880000 102210000 0 3674 1869 3425 33197;33198;33199;33200;33201 42513;42514;42515;42516;42517 42515 5 ASLEAAIADAEQR Unmodified 1343.6681 0.66810776 772 CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 yes no 0 0 0 2 1 89.688 89.688 2;3 0.027222 92581 QUIQUE_C1218_190116_001 53.569 23.825 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3675 772 3426 33202;33203;33204 42518;42519;42520 42519 3 ASLENSLEETK Unmodified 1219.5932 0.59321148 763;774;789 CON__P02533;P02533;CON__P08779;P08779;K7ENW6;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 KRT14;KRT16 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.456 45.456 2 9.2584E-05 40027 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.23 92.959 71309000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71309000 0 0 0 + 3676 763;774;789 3427 33205;33206;33207;33208;33209;33210 42521;42522;42523;42524;42525;42526 42524 6 ASLENSLEETKGR Unmodified 1432.7158 0.71578623 763;774;789 CON__P02533;P02533;CON__P08779;P08779;K7ENW6;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 KRT14;KRT16 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16 no no 0 0 1 1 33.341 33.341 3 0.04457 28412 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.604 22.998 29034000 0 0 0 0 0 0 0 29034000 0 0 0 0 0 + 3677 763;774;789 3428 33211 42527 42527 1 ASLESWWQNPVPGLR Unmodified 1738.8791 0.87910359 4655 Q9Y6K5;F8VWK9;F8VS35 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes no 0 0 0 1 1 140.36 140.36 2 1.604E-05 147565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.442 79.779 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3678 4655 3429 33212;33213 42528;42529 42529 2 ASLGLADHR Unmodified 938.49338 0.49337828 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.059 19.059 2 0.0078478 11577 QUIQUE_C1563_190116_001 80.438 42.88 704820000 103330000 0 0 102730000 72498000 75034000 0 0 94062000 0 68094000 105980000 83094000 3679 4551 3430 33214;33215;33216;33217;33218;33219;33220;33221 42530;42531;42532;42533;42534;42535;42536;42537;42538;42539;42540 42534 11 ASLHALVGSPIIWGGEPR Unmodified 1859.0054 0.0053667345 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 106.72 106.72 2;3 2.7316E-13 111255 QUIQUE_C1218_190116_001 152.99 121.76 2687400000 234440000 140920000 286500000 194430000 277700000 240020000 194280000 396520000 178110000 125860000 202510000 99336000 116750000 3680 98;3487 3431 33222;33223;33224;33225;33226;33227;33228;33229;33230;33231;33232;33233;33234;33235;33236;33237;33238;33239;33240;33241;33242;33243;33244;33245;33246;33247;33248;33249 42541;42542;42543;42544;42545;42546;42547;42548;42549;42550;42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;42559;42560;42561;42562;42563;42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;42571;42572;42573;42574;42575 42541 34 ASLHGGEPTTIIR Unmodified 1350.7256 0.72556306 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 32.113 32.113 2;3 5.1879E-06 27250 QUIQUE_C1218_190116_001 126.03 94.265 1163700000 122890000 0 0 0 267650000 0 0 40549000 170540000 13228000 294680000 111910000 142250000 3681 2075 3432 33250;33251;33252;33253;33254;33255;33256;33257;33258;33259 42576;42577;42578;42579;42580;42581;42582;42583;42584;42585;42586;42587 42577 8 ASLINNAFQLVSIGK Unmodified 1573.8828 0.88279198 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 140.34 140.34 2 0.0015102 144691 QUIQUE_C1277_190116_001 88.021 64.701 532600000 0 56884000 111220000 135880000 78858000 50455000 0 0 0 18725000 0 0 80584000 3682 4336 3433 33260;33261;33262;33263;33264;33265;33266 42588;42589;42590;42591;42592;42593;42594 42588 7 ASLLHSMPTHSSPR Oxidation (M) 1535.7515 0.75146023 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 1 0 1 14.067 14.067 4 0.015118 6334 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.751 29.138 21676000 0 0 0 0 0 0 0 21676000 0 0 0 0 0 3683 310;830 3434 33267 42595 42595 1 ASLLHSMPTHSSPR Unmodified 1519.7565 0.75654561 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 23.182 23.182 4 0.049734 16677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.524 1.4244 28021000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28021000 0 0 3684 310;830 3434 33268 42596 42596 1 ASLLQNESTNEQLQIHYK Unmodified 2115.0596 0.059646729 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 75.143 75.143 3 1.2207E-22 75398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.63 112.31 724900000 68176000 0 42228000 78176000 96507000 0 71691000 0 104960000 76712000 0 86012000 100440000 3685 824 3435 33269;33270;33271;33272;33273;33274;33275;33276;33277;33278;33279;33280;33281;33282 42597;42598;42599;42600;42601;42602;42603;42604;42605;42606;42607;42608;42609;42610;42611;42612 42604 16 ASLLQSDR Acetyl (Protein N-term) 930.47706 0.47705951 4461 Q9UJW0;E5RI97 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 1 0 0 1 1 1 1 78.351 78.351 2 0.0017818 79022 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.41 59.857 188610000 23392000 0 0 0 0 0 84420000 0 0 0 42967000 0 37828000 3686 4461 3436 33283;33284;33285;33286 42613;42614;42615;42616;42617 42617 5 ASLMNDDFEK Unmodified 1168.507 0.50703901 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;B0QYG7;B0QYG8 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 57.391 57.391 2 0.012394 56091 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.263 68.799 168430000 0 0 64640000 59794000 0 0 0 0 0 0 0 0 44001000 3687 4510 3437 33287;33288;33289 42618;42619;42620 42620 0 ASLNGADIYSGCCTLK Unmodified 1728.7811 0.78110538 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4;M0R1W6;B4DVF8 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.842 74.842 2 1.7934E-05 75265 QUIQUE_C1277_190116_001 120.14 94.093 831290000 0 118630000 0 0 82204000 79316000 104520000 66418000 64678000 45682000 96074000 89453000 84311000 3688 2082 3438 33290;33291;33292;33293;33294;33295;33296;33297;33298;33299;33300;33301 42621;42622;42623;42624;42625;42626;42627;42628;42629;42630;42631;42632;42633 42622 13 ASLPTGEGSISHEEQK Unmodified 1668.7955 0.79549312 1308 J3QTA6;Q9BRQ6;H0Y922;J3QTB2 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 29.144 29.144 2;3 5.5071E-07 23142 QUIQUE_C1277_190116_001 138.89 117.9 1605100000 196240000 162040000 139040000 132130000 151320000 21086000 99324000 82688000 132570000 33934000 170240000 143760000 140750000 3689 1308 3439 33302;33303;33304;33305;33306;33307;33308;33309;33310;33311;33312;33313;33314;33315;33316;33317;33318;33319;33320;33321;33322;33323;33324 42634;42635;42636;42637;42638;42639;42640;42641;42642;42643;42644;42645;42646;42647;42648;42649;42650;42651;42652;42653;42654;42655;42656;42657;42658;42659;42660;42661 42637 26 ASLPTLGFTHFQPAQLTTVGK Unmodified 2213.1845 0.18445331 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A096LNY6;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 120.89 120.89 3 1.5448E-08 124983 QUIQUE_C1277_190116_001 82.975 69.549 468270000 0 47733000 37718000 52501000 45469000 0 39575000 53479000 56945000 18157000 0 48117000 68578000 3690 338 3440 33325;33326;33327;33328;33329;33330;33331;33332;33333;33334;33335;33336 42662;42663;42664;42665;42666;42667;42668;42669;42670;42671;42672;42673;42674 42664 11 ASLQVQLDAVNKR Unmodified 1440.8049 0.80487601 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;C9J084 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.8 49.8 3 0.0004662 47838 QUIQUE_C1277_190116_001 77.527 49.863 862290000 82731000 89059000 71723000 0 137480000 0 90120000 51679000 79912000 0 78937000 85831000 94821000 3691 4091 3441 33337;33338;33339;33340;33341;33342;33343;33344;33345;33346 42675;42676;42677;42678;42679;42680;42681;42682;42683;42684;42685 42676 11 ASLSGLASALESYR Acetyl (Protein N-term) 1465.7413 0.7412727 3864 Q96HA9 PEX11G Peroxisomal membrane protein 11C yes yes 1 0 0 1 165.03 165.03 2 3.6349E-07 170317 QUIQUE_C1368_190116_001 124.42 93.001 14931000 0 0 14931000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3692 3864 3442 33347 42686 42686 1 ASLSLAPVNIFK Acetyl (Protein N-term) 1300.7391 0.73908786 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 158.12 158.12 2 1.5309E-07 164252 QUIQUE_C1576_190116_001 146.23 123.99 6828200000 509990000 540950000 613940000 518440000 608630000 523160000 576980000 523680000 511220000 226120000 554970000 541270000 578900000 3693 2810 3443 33348;33349;33350;33351;33352;33353;33354;33355;33356;33357;33358;33359;33360;33361;33362;33363 42687;42688;42689;42690;42691;42692;42693;42694;42695;42696;42697;42698;42699;42700;42701;42702;42703;42704;42705;42706;42707 42697 21 ASLSLSHAR Unmodified 940.50903 0.50902834 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 15.592 15.592 2 0.0066803 7639 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.97 90.912 94471000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94471000 0 0 0 3694 1140;3457 3444 33364 42708 42708 0 ASLSPVIYDSLTGLMTSLVAVELEK Unmodified 2635.403 0.40302144 164 A0A0A0MS45;J3KNI1;Q9H9E3 COG4 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 177.07 177.07 3 3.8142E-05 184028 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.25 45.283 14894000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14894000 0 0 3695 164 3445 33365 42709;42710 42709 2 ASLTLFCPEEGDWK Unmodified 1651.7552 0.75520821 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.76 119.76 2 1.2134E-07 125361 QUIQUE_C1218_190116_001 129.82 110.58 7372400000 501370000 669620000 681080000 0 604440000 0 872720000 564070000 670600000 256330000 865310000 814910000 871920000 3696 2483 3446 33366;33367;33368;33369;33370;33371;33372;33373;33374;33375;33376 42711;42712;42713;42714;42715;42716;42717;42718;42719;42720;42721;42722 42711 12 ASLTLTLLR Unmodified 986.61243 0.61243078 4500 Q9UMF0;K7EIL3 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.25 95.25 2 1.2836E-06 97586 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.88 120.63 865110000 74818000 89395000 61091000 40690000 83860000 65738000 78363000 57746000 49617000 23254000 91891000 96121000 52528000 3697 4500 3447 33377;33378;33379;33380;33381;33382;33383;33384;33385;33386;33387;33388;33389 42723;42724;42725;42726;42727;42728;42729;42730;42731;42732;42733;42734;42735;42736;42737;42738;42739;42740;42741 42740 19 ASLYHEFPGLDK Unmodified 1375.6772 0.67721588 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 72.057 72.057 3 0.024503 72113 QUIQUE_C1277_190116_001 31.526 21.738 17114000 0 17114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3698 3562 3448 33390 42742 42742 1 ASLYNAVTIEDVQK Unmodified 1549.7988 0.79878758 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 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79826000 60879000 77528000 37683000 59812000 20187000 114560000 55599000 80488000 3700 3780 3450 33419;33420;33421;33422;33423;33424;33425;33426;33427;33428;33429;33430;33431;33432;33433 42781;42782;42783;42784;42785;42786;42787;42788;42789;42790;42791;42792;42793;42794;42795;42796;42797;42798;42799;42800;42801 42784 21 ASMAAAIAASR Acetyl (Protein N-term) 1060.5335 0.53352853 4163 Q9H425 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes yes 1 0 0 1 1 1 105.31 105.31 2 0.0022733 108108 QUIQUE_C1403_190116_001 74.533 48.091 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3701 4163 3451 33434;33435;33436 42802;42803;42804 42802 3 ASMGTLAFDEYGRPFLIIK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2186.1082 0.10817683 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.6 150.6 2 7.1699E-46 157134 QUIQUE_C1438_190116_001 166.48 152.89 1470500000 105740000 147760000 120660000 104290000 130090000 0 127680000 113680000 144570000 43239000 148020000 133970000 150770000 3702 2514 3452 33437;33438;33439;33440;33441;33442;33443;33444;33445;33446;33447;33448;33449 42805;42806;42807;42808;42809;42810;42811;42812;42813;42814;42815;42816;42817 42809 1939 13 ASMGTLAFDEYGRPFLIIK Acetyl (Protein N-term) 2170.1133 0.1132622 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 2 162.32 162.32 2;3 1.9588E-115 169402 QUIQUE_DMIX5_190116_001 251.68 231.01 4235900000 326770000 451980000 436780000 281680000 268240000 140190000 396240000 286190000 0 42967000 729970000 385010000 489860000 3703 2514 3452 33450;33451;33452;33453;33454;33455;33456;33457;33458;33459;33460;33461;33462;33463;33464;33465;33466;33467;33468 42818;42819;42820;42821;42822;42823;42824;42825;42826;42827;42828;42829;42830;42831;42832;42833;42834;42835;42836;42837;42838 42834 20 ASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2700.3218 0.32175143 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 1 2 1 136.55 136.55 3 7.9939E-08 139623 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.112 63.371 50609000 0 0 0 0 0 0 0 50609000 0 0 0 0 0 3704 2514 3453 33469 42839 42839 1939 1 ASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDR Acetyl (Protein N-term) 2684.3268 0.32683681 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 0 2 1 149.82 149.82 3 6.3536E-23 152727 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.02 114.6 74761000 0 0 0 0 0 0 0 74761000 0 0 0 0 0 3705 2514 3453 33470 42840 42840 1 ASMHPVTAMLVGK Unmodified 1340.6945 0.69446263 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 55.995 55.995 2;3 0.0001487 55226 QUIQUE_C1218_190116_001 72.327 59.142 591360000 122050000 138050000 34484000 126670000 0 90002000 0 0 0 30322000 49778000 0 0 3706 1977 3454 33471;33472;33473;33474;33475;33476;33477;33478;33479;33480;33481;33482 42841;42842;42843;42844;42845;42846;42847;42848;42849;42850;42851;42852;42853;42854 42841 10 ASMMYLENGTPDTAAMALER Unmodified 2170.9697 0.96971079 3973 Q99747;J3KTJ6 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 117.36 117.36 2;3 3.1356E-12 121182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.1 122 403670000 11711000 36448000 33818000 40174000 0 0 50040000 76149000 38814000 10464000 0 52463000 53584000 3707 3973 3455 33483;33484;33485;33486;33487;33488;33489;33490;33491;33492;33493 42855;42856;42857;42858;42859;42860;42861;42862;42863;42864;42865 42862 10 ASNAMMNNNDLVR Unmodified 1448.65 0.65003163 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 46.792 46.792 2 0.00065059 44418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.9 84.027 67197000 0 0 0 0 0 0 0 27764000 0 0 39432000 0 0 3708 2279 3456 33494;33495;33496;33497 42866;42867;42868;42869 42868 4 ASNAMMNNNDLVR 2 Oxidation (M) 1480.6399 0.63986087 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 2 0 1 18.47 18.47 2 0.0056131 11145 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 54.079 18019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18019000 0 0 3709 2279 3456 33498 42870 42870 1647;1648 1 ASNGDAWVEAHGK Unmodified 1340.6109 0.61092723 2415 P38646;A0A3B3ITI4;D6RJI2 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 21.456 21.456 2;3 9.39E-08 14698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.09 147.32 2600200000 329340000 295730000 261310000 157920000 256890000 136000000 200230000 99490000 127410000 253500000 114190000 104390000 263840000 3710 2415 3457 33499;33500;33501;33502;33503;33504;33505;33506;33507;33508;33509;33510;33511;33512;33513;33514;33515;33516;33517;33518 42871;42872;42873;42874;42875;42876;42877;42878;42879;42880;42881;42882;42883;42884;42885;42886;42887;42888;42889;42890;42891 42885 18 ASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLR Unmodified 3484.8103 0.81030233 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 1 153.66 153.66 3 0.015418 156333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.79 19.665 69196000 0 0 0 0 0 0 0 69196000 0 0 0 0 0 3711 4654 3458 33519 42892 42892 1 ASNTADTLFQEVLGR Unmodified 1620.8107 0.81074925 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 137.8 137.8 2 0.0019267 141679 QUIQUE_C1403_190116_001 83.617 65.753 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3712 3896 3459 33520 42893 42893 1 ASNTAEVFFDGVR Unmodified 1411.6732 0.67319314 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.748 92.748 2 1.6053E-12 95246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.46 131.71 2721000000 213960000 141670000 257120000 147060000 168760000 191670000 206930000 228460000 291310000 102660000 305710000 216640000 249010000 3713 2539 3460 33521;33522;33523;33524;33525;33526;33527;33528;33529;33530;33531;33532;33533 42894;42895;42896;42897;42898;42899;42900;42901;42902;42903;42904;42905;42906;42907;42908;42909;42910 42904 17 ASPAAAEEVVPEWASCLK Unmodified 1913.9193 0.91931342 3585 Q8N3V7 SYNPO Synaptopodin yes yes 0 0 0 1 118.9 118.9 2 1.7552E-05 121312 QUIQUE_C1563_190116_001 125.61 110.74 33813000 0 0 0 0 0 33813000 0 0 0 0 0 0 0 3714 3585 3461 33534 42911 42911 1 ASPAPGSGHPEGPGAHLDMNSLDR Unmodified 2369.0819 0.081855509 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.974 51.974 3 6.4884E-15 50678 QUIQUE_C1218_190116_001 88.168 70.592 134010000 63780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70233000 0 0 3715 1689 3462 33535;33536;33537;33538 42912;42913;42914;42915 42912 3 ASPATQPPPLLPPSATGPDATVGGPAPTPLLPPSATASVK Unmodified 3725.988 0.98799192 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 133.68 133.68 3 1.6237E-05 137980 QUIQUE_C1277_190116_001 46.714 37.333 37460000 0 37460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3716 2908 3463 33539 42916 42916 1 ASPDGLCQVSLQQGR Unmodified 1614.7784 0.77840327 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.919 60.919 2 7.283E-06 57146 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.84 117.26 203060000 0 0 0 0 45794000 0 0 33195000 58687000 28977000 0 0 36406000 3717 1492 3464 33540;33541;33542;33543;33544 42917;42918;42919;42920;42921 42920 5 ASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVIGQMK Unmodified 2870.2164 0.21635966 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 151.17 151.17 2;3 1.2873E-19 156632 QUIQUE_C1218_190116_001 139.04 133.26 169430000 20479000 0 20980000 61050000 0 66920000 0 0 0 0 0 0 0 3718 3089 3465 33545;33546;33547;33548 42922;42923;42924;42925 42922 4 ASPDLVPMGEWTAR Unmodified 1528.7344 0.73441319 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.28 106.28 2 0.0064442 110359 QUIQUE_C1576_190116_001 90.653 80.998 1289600000 134200000 155890000 127070000 0 100520000 91720000 146210000 118330000 102870000 0 175560000 137260000 0 3719 1749 3466 33549;33550;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558 42926;42927;42928;42929;42930;42931;42932;42933;42934;42935;42936;42937;42938 42932 10 ASPDLVPMGEWTAR Oxidation (M) 1544.7293 0.72932781 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 1 0 1 1 85.344 85.344 2 0.021713 87495 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.435 45.806 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3720 1749 3466 33559;33560 42939;42940 42939 2 ASPDQNASTHTPQSSVK Unmodified 1753.8231 0.82310485 3078 Q14677;H0YD52 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.047 14.047 3 2.2215E-05 6189 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.367 76.676 369910000 46129000 32724000 52393000 27400000 35418000 58395000 0 0 57748000 0 22586000 37117000 0 3721 3078 3467 33561;33562;33563;33564;33565;33566;33567;33568;33569 42941;42942;42943;42944;42945;42946;42947;42948;42949 42949 9 ASPDWGYDDKNGPEQWSK Acetyl (Protein N-term) 2120.9076 0.90756276 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFL2;E5RGU8;E5RII2;E5RHS7 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 101.26 101.26 2 1.9534E-140 104510 QUIQUE_DMIX7_190116_001 270.8 231.8 755440000 0 0 36905000 0 106290000 0 0 0 0 0 282280000 187110000 142860000 3722 1795 3468 33570;33571;33572;33573;33574 42950;42951;42952;42953;42954;42955;42956;42957 42956 7 ASPFLLQYIQEEIPDYR Unmodified 2081.047 0.046956778 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;I3L0S1 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 3 1 1 1 1 1 161.13 161.13 2;3 1.5624E-16 164964 QUIQUE_C1403_190116_001 168.61 154.16 741900000 58959000 83698000 0 74201000 52736000 0 0 60578000 57853000 0 60186000 293680000 0 3723 1565 3469 33575;33576;33577;33578;33579;33580;33581;33582;33583;33584;33585;33586 42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972 42962 15 ASPFLLQYIQEEIPNYR Unmodified 2080.0629 0.062941193 3071 Q14558;B4DP31;C9J168;C9JUN4 PRPSAP1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 2 2 1 158.91 158.91 2;3 8.7783E-10 165027 QUIQUE_C1576_190116_001 141.58 105.84 899370000 64901000 95229000 24512000 85041000 97849000 32514000 47063000 88313000 81663000 14352000 117160000 99751000 51014000 3724 3071 3470 33587;33588;33589;33590;33591;33592;33593;33594;33595;33596;33597;33598;33599;33600;33601;33602;33603;33604;33605;33606 42973;42974;42975;42976;42977;42978;42979;42980;42981;42982;42983;42984;42985;42986;42987;42988;42989;42990;42991;42992;42993;42994;42995;42996;42997 42984 23 ASPFPVYK Unmodified 907.48035 0.48035398 2948 Q12860;F8VUI9;F8VUI8 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 52.528 52.528 2 0.039647 50038 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.76 38.629 812560000 0 0 0 354540000 0 0 0 0 331300000 126720000 0 0 0 3725 2948 3471 33607;33608;33609 42998;42999;43000 42999 3 ASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTAR Acetyl (Protein N-term) 2600.0688 0.068767445 2894 Q05329;Q5VZ31 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 1 0 0 2 145.42 145.42 2;3 2.2837E-14 150441 QUIQUE_C1218_190116_001 124.84 113.9 57958000 57958000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3726 2894 3472 33610;33611 43001;43002 43002 2 ASPLLPANHVTMAK Unmodified 1448.781 0.78096945 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 44.631 44.631 3 0.0042259 41358 QUIQUE_C1277_190116_001 53.3 41.242 38812000 0 38812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3727 4285 3473 33612 43003 43003 1 ASPNSDDTVLSPQELQK Unmodified 1827.885 0.88503641 4424 Q9UH62 ARMCX3 Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.129 66.129 2 6.5968E-07 66664 QUIQUE_C1218_190116_001 107.37 91.482 105650000 20590000 0 24495000 25327000 0 35237000 0 0 0 0 0 0 0 3728 4424 3474 33613;33614;33615;33616 43004;43005;43006;43007 43004 4 ASPSEVVFLDDIGANLKPAR Unmodified 2098.1059 0.10586864 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 125.01 125.01 2;3 5.1242E-06 128800 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.213 80.098 1424600000 106190000 116700000 152170000 140270000 83722000 108290000 75279000 139210000 130510000 67999000 15511000 161380000 127400000 3729 2361 3475 33617;33618;33619;33620;33621;33622;33623;33624;33625;33626;33627;33628;33629;33630;33631;33632;33633 43008;43009;43010;43011;43012;43013;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;43024;43025;43026 43024 17 ASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGFR Unmodified 2225.1845 0.18445331 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 122.13 122.13 2;3 1.7827E-10 126683 QUIQUE_C1368_190116_001 121.18 110.61 1660300000 192820000 122530000 164510000 145190000 78927000 134730000 137410000 120710000 162030000 53894000 193890000 63479000 90142000 3730 2026 3476 33634;33635;33636;33637;33638;33639;33640;33641;33642;33643;33644;33645;33646;33647;33648;33649;33650;33651;33652;33653;33654;33655;33656;33657;33658;33659;33660;33661 43027;43028;43029;43030;43031;43032;43033;43034;43035;43036;43037;43038;43039;43040;43041;43042;43043;43044;43045;43046;43047;43048;43049;43050;43051;43052;43053;43054;43055;43056;43057;43058;43059;43060;43061;43062;43063;43064;43065;43066;43067 43036 40 ASPSTAGETPSGVK Unmodified 1287.6307 0.63065962 26 A0A087WTA5;E7ERK9;Q9UI10;A0A087WW69;F8W8L6 EIF2B4 Translation initiation factor eIF-2B subunit delta yes no 0 0 0 1 18.348 18.348 2 0.018189 10751 QUIQUE_C1403_190116_001 51.013 28.232 16834000 0 0 0 16834000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3731 26 3477 33662 43068 43068 1 ASPTSTEEEQVMLR Unmodified 1576.7403 0.74028642 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 0 1 57.577 57.577 2 0.045624 55570 QUIQUE_C1563_190116_001 42.976 28.286 26883000 0 0 0 0 0 26883000 0 0 0 0 0 0 0 3732 3916 3478 33663 43069 43069 1 ASPYPVILSLENHCTLEQQR Unmodified 2354.1689 0.1688796 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.85 105.85 3 2.252E-24 109252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.4 113.72 2015100000 158800000 146950000 239740000 154430000 0 172960000 169410000 117220000 160330000 129310000 188330000 137640000 239950000 3733 2578 3479 33664;33665;33666;33667;33668;33669;33670;33671;33672;33673;33674;33675 43070;43071;43072;43073;43074;43075;43076;43077;43078;43079;43080;43081;43082;43083;43084;43085;43086;43087;43088;43089;43090;43091;43092 43084 23 ASQKPQPNFPSPEYMIFDHEFTK Unmodified 2737.2846 0.28463764 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 1 1 111.04 111.04 3 0.0027864 114524 QUIQUE_C1277_190116_001 40.098 32.565 30319000 0 30319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3734 1591 3480 33676 43093 43093 1 ASQLFSEK Unmodified 908.46035 0.46034682 3983 Q99963;H3BRH8 SH3GL3 Endophilin-A3 yes no 0 0 0 1 1 1 27.447 27.447 2 0.0078889 22129 QUIQUE_C1218_190116_001 96.367 44.737 134850000 45365000 0 0 0 0 0 0 27256000 0 0 0 0 62228000 3735 3983 3481 33677;33678;33679 43094;43095;43096 43094 3 ASQMIVSYDEHEVNNTFK Unmodified 2110.963 0.96296915 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.54 76.54 3 4.0615E-05 77868 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.049 82.321 470600000 54288000 51330000 33070000 48280000 34698000 37366000 37670000 36533000 45327000 0 41738000 50304000 0 3736 354 3482 33680;33681;33682;33683;33684;33685;33686;33687;33688;33689;33690;33691 43097;43098;43099;43100;43101;43102;43103;43104;43105;43106;43107;43108;43109;43110 43108 13 ASQQINALR Unmodified 999.54614 0.54614213 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YIM7 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.895 21.895 2 0.0053254 14662 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.953 61.217 932190000 77092000 0 104480000 96250000 0 81078000 102020000 63513000 74752000 38068000 107350000 120310000 67274000 3737 356 3483 33692;33693;33694;33695;33696;33697;33698;33699;33700;33701;33702 43111;43112;43113;43114;43115;43116;43117;43118;43119;43120;43121 43121 11 ASQSQGIQQLLQAEK Acetyl (Protein N-term) 1669.8635 0.8635131 1624;1740 O75348;O95670;F2Z307 ATP6V1G1;ATP6V1G2;ATP6V1G2-DDX39B V-type proton ATPase subunit G 1;V-type proton ATPase subunit G 2 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.14 122.14 2 3.5761E-66 126410 QUIQUE_DMIX8_190116_001 202.18 167.37 6365800000 752060000 722340000 703260000 566680000 511430000 519180000 592200000 205380000 303220000 143660000 484870000 413400000 448120000 3738 1624;1740 3484 33703;33704;33705;33706;33707;33708;33709;33710;33711;33712;33713;33714;33715 43122;43123;43124;43125;43126;43127;43128;43129;43130;43131;43132;43133;43134;43135;43136;43137;43138;43139;43140;43141 43141 20 ASRDEIFAQSK Unmodified 1250.6255 0.62551466 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 21.914 21.914 3 0.053368 15581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.295 16.02 102030000 0 0 0 0 0 0 0 49347000 52680000 0 0 0 0 3739 2379 3485 33716;33717 43142;43143 43142 2 ASREEILAQAK Unmodified 1214.6619 0.66190017 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 21.002 21.002 3 0.043925 14130 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.999 17.409 83472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83472000 0 0 3740 2378 3486 33718 43144 43144 1 ASSAAGCVVIVGSGVIGR Acetyl (Protein N-term) 1700.888 0.88795372 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A2R8Y4K2;A0A2R8Y7B4;A0A2R8Y5S5 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 1 0 0 1 1 3 1 2 2 1 132.14 132.14 2 1.2282E-23 128193 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.98 125.23 276840000 0 113540000 0 92467000 0 30032000 0 0 0 40801000 0 0 0 3741 4564 3487 33719;33720;33721;33722;33723;33724;33725;33726;33727;33728;33729 43145;43146;43147;43148;43149;43150;43151;43152;43153;43154;43155;43156 43154 12 ASSAASSEHFEK Acetyl (Protein N-term) 1291.5681 0.56805936 1088 J3KMW2;G3V5I2;Q9UEU0 VTI1B Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.08 28.08 2 0.00058267 21645 QUIQUE_C1403_190116_001 86.014 69.474 66511000 0 0 0 0 0 0 0 30602000 0 12911000 0 22998000 0 3742 1088 3488 33730;33731;33732;33733;33734;33735;33736;33737 43157;43158;43159;43160;43161;43162;43163;43164 43158 8 ASSAQSGGSSGGPAVPTVQR Acetyl (Protein N-term) 1841.8868 0.88676774 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.053 60.053 2 4.0241E-47 58895 QUIQUE_C1277_190116_001 161.84 140.98 257970000 0 33014000 42660000 41492000 0 0 34230000 30945000 39569000 0 0 36063000 0 3743 3432 3489 33738;33739;33740;33741;33742;33743;33744 43165;43166;43167;43168;43169;43170;43171;43172 43165 8 ASSDIQVK Acetyl (Protein N-term) 888.45526 0.45526144 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.487 39.487 1;2 0.010604 34275 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.189 52.153 2065300000 0 340290000 182810000 211610000 0 188450000 220050000 189700000 178480000 115350000 251930000 0 186670000 3744 2115 3490 33745;33746;33747;33748;33749;33750;33751;33752;33753;33754;33755 43173;43174;43175;43176;43177;43178;43179;43180;43181;43182;43183 43181 10 ASSDVMLNGFGGDAPTLR Unmodified 1806.857 0.85704752 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 107.66 107.66 2 2.4468E-17 110834 QUIQUE_C1277_190116_001 132.59 105.91 61936000 0 36571000 0 0 0 25365000 0 0 0 0 0 0 0 3745 902;1255;2856;1134 3491 33756;33757;33758 43184;43185;43186 43184 3 ASSEDAGPSPQTR Unmodified 1301.5848 0.58477206 3314 Q5T5P2 KIAA1217 Sickle tail protein homolog yes yes 0 0 0 1 13.887 13.887 2 0.0023312 5881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.53 57.504 26904000 0 0 0 0 0 0 0 26904000 0 0 0 0 0 3746 3314 3492 33759 43187 43187 1 ASSEGGTAAGAGLDSLHK Unmodified 1627.7802 0.7801774 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.613 32.613 2;3 0.00046596 26758 QUIQUE_C1368_190116_001 98.592 83.021 949860000 87760000 74601000 87223000 124610000 102530000 90947000 102710000 78955000 0 0 88687000 0 111840000 3747 369;1485 3493 33760;33761;33762;33763;33764;33765;33766;33767;33768;33769;33770 43188;43189;43190;43191;43192;43193;43194;43195;43196;43197;43198 43191 7 ASSFAGYVGMLTGFK Unmodified 1534.749 0.74900062 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GUJ3 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 146.22 146.22 2 0.00064687 150500 QUIQUE_C1277_190116_001 86.814 77.86 144820000 27907000 35268000 27859000 20766000 0 33022000 0 0 0 0 0 0 0 3748 341 3494 33771;33772;33773;33774;33775 43199;43200;43201;43202;43203 43200 5 ASSFAGYVGMLTGFKPGLFSLTLNER Unmodified 2762.4102 0.41017251 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 164.6 164.6 3 2.7468E-17 169269 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.887 89.855 291970000 0 0 0 0 0 0 0 28426000 59482000 0 100670000 103400000 0 3749 341 3495 33776;33777;33778;33779 43204;43205;43206;43207 43205 4 ASSGLLYPLER Unmodified 1204.6452 0.64518747 2927 Q08945 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.877 84.877 2 0.002477 87224 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.098 53.175 227690000 33121000 31779000 0 0 39815000 25787000 0 0 34393000 0 36717000 26080000 0 3750 2927 3496 33780;33781;33782;33783;33784;33785;33786 43208;43209;43210;43211;43212;43213;43214 43213 4 ASSGSSPNQASKPGATLASQPRPPVQGR Unmodified 2732.3954 0.39540215 1471 O14994;A0A0A0MR68 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 2 1 30.178 30.178 4 8.8175E-24 24794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.366 87.339 72472000 0 0 0 0 0 0 0 72472000 0 0 0 0 0 3751 1471 3497 33787 43215 43215 1 ASSHSTDLMEAMAMGSVEASYK Unmodified 2301.9916 0.99156844 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 0 0 5 5 3 2 2 2 2 3 1 1 4 3 4 112.77 112.77 2;3 9.8745E-188 117165 QUIQUE_C1218_190116_001 286.93 265.09 3665500000 434280000 513910000 372590000 284480000 197600000 215260000 233500000 320630000 145570000 105580000 268820000 241290000 332050000 3752 1203 3498 33788;33789;33790;33791;33792;33793;33794;33795;33796;33797;33798;33799;33800;33801;33802;33803;33804;33805;33806;33807;33808;33809;33810;33811;33812;33813;33814;33815;33816;33817;33818;33819;33820;33821;33822;33823;33824 43216;43217;43218;43219;43220;43221;43222;43223;43224;43225;43226;43227;43228;43229;43230;43231;43232;43233;43234;43235;43236;43237;43238;43239;43240;43241;43242;43243;43244;43245;43246;43247;43248;43249;43250;43251;43252;43253;43254;43255;43256;43257;43258;43259;43260;43261;43262;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270 43216 52 ASSHSTDLMEAMAMGSVEASYK Oxidation (M) 2317.9865 0.98648306 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.902 88.902 3 8.8532E-08 90630 QUIQUE_C1277_190116_001 95.206 89.214 723060000 0 110240000 66840000 59490000 53052000 49973000 48531000 42854000 49149000 37072000 60816000 65192000 79848000 3753 1203 3498 33825;33826;33827;33828;33829;33830;33831;33832;33833;33834;33835;33836 43271;43272;43273;43274;43275;43276;43277;43278;43279;43280;43281;43282;43283;43284;43285 43271 691 10 ASSIIDELFQDR Unmodified 1392.6885 0.68850885 2005 P10909;H0YLK8;E7ERK6;H0YC35 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain;Clusterin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 138.34 138.34 2 3.4162E-12 143404 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.61 155.87 4611200000 0 416950000 384160000 463240000 0 361170000 467430000 347000000 498590000 238960000 489980000 476870000 466860000 3754 2005 3499 33837;33838;33839;33840;33841;33842;33843;33844;33845;33846;33847;33848 43286;43287;43288;43289;43290;43291;43292;43293;43294;43295;43296;43297;43298;43299;43300;43301;43302 43294 16 ASSLIEEAK Unmodified 946.49713 0.49712625 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 27.378 27.378 2 0.00055943 20966 QUIQUE_C1277_190116_001 111.95 54.666 273700000 53700000 62806000 0 89284000 0 0 0 33696000 0 34212000 0 0 0 3755 4600 3500 33849;33850;33851;33852;33853 43303;43304;43305;43306;43307;43308 43304 6 ASSLIEEAKK Unmodified 1074.5921 0.59208927 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 2 1 17.946 17.946 2;3 0.0063707 10649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.639 14.973 92466000 0 0 0 0 0 0 0 84193000 0 8273400 0 0 0 3756 4600 3501 33854;33855;33856 43309;43310;43311 43309 3 ASSLISLLK Unmodified 930.57498 0.57498264 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;E9PKF8 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.002 94.002 2 0.0035378 96003 QUIQUE_C1403_190116_001 91.069 40.437 538510000 48771000 50932000 46044000 33891000 45996000 0 50130000 51284000 44968000 0 62911000 48756000 54831000 3757 798 3502 33857;33858;33859;33860;33861;33862;33863;33864;33865;33866;33867 43312;43313;43314;43315;43316;43317;43318;43319;43320;43321;43322;43323;43324;43325;43326 43316 15 ASSLNENVDHSALLK Unmodified 1596.8107 0.81074925 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 45.869 45.869 2;3 6.2744E-06 43233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.33 90.489 457930000 69814000 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33885;33886;33887;33888;33889;33890;33891;33892;33893;33894;33895;33896;33897;33898;33899;33900;33901;33902;33903;33904;33905;33906;33907 43346;43347;43348;43349;43350;43351;43352;43353;43354;43355;43356;43357;43358;43359;43360;43361;43362;43363;43364;43365;43366;43367;43368;43369;43370;43371;43372;43373;43374;43375;43376;43377 43348 748 29 ASSNMHEAEEWYR Unmodified 1608.6627 0.66270481 1322 K7EKD1 GFAP yes yes 0 0 0 2 3 3 3 2 2 2 2 3 2 2 3 2 49.843 49.843 2;3 1.1182E-52 42793 QUIQUE_DMIX4_190116_001 234.63 227.78 45609000000 4928400000 3984300000 5853800000 5249500000 1597800000 6327000000 4946400000 625110000 2233600000 2332300000 3062000000 1715600000 2753700000 3761 1322 3504 33908;33909;33910;33911;33912;33913;33914;33915;33916;33917;33918;33919;33920;33921;33922;33923;33924;33925;33926;33927;33928;33929;33930;33931;33932;33933;33934;33935;33936;33937;33938 43378;43379;43380;43381;43382;43383;43384;43385;43386;43387;43388;43389;43390;43391;43392;43393;43394;43395;43396;43397;43398;43399;43400;43401;43402;43403;43404;43405;43406;43407;43408;43409;43410;43411;43412;43413;43414;43415;43416;43417;43418;43419;43420 43410 37 ASSNTVLMR Acetyl (Protein N-term) 1019.507 0.50697943 1761 O95861;A6NF51;F8VVW8;F8VZG4;F8W1J0 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.975 61.975 2 0.00022793 60866 QUIQUE_C1368_190116_001 125.5 86.535 241460000 0 0 43876000 0 0 0 36640000 32388000 31824000 12906000 0 37172000 46656000 3762 1761 3505 33939;33940;33941;33942;33943;33944;33945;33946;33947;33948;33949 43421;43422;43423;43424;43425;43426;43427;43428;43429;43430;43431 43423 11 ASSQVNVEGQSR Unmodified 1260.6058 0.60584185 1540 O43665 RGS10 Regulator of G-protein signaling 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.508 15.508 2 0.0022135 7486 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.332 46.859 181100000 0 0 0 0 51711000 0 0 27246000 52763000 0 0 0 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43455;43456;43457;43458;43459;43460;43461 43455 7 ASSSILIDESEPTTNIQIR Unmodified 2073.059 0.058978027 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.63 101.63 2 5.081E-55 105848 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.33 209.58 914790000 47769000 62067000 117150000 46067000 56518000 107680000 50933000 105160000 0 23862000 120660000 109020000 67902000 3766 4516 3509 33979;33980;33981;33982;33983;33984;33985;33986;33987;33988;33989;33990;33991 43462;43463;43464;43465;43466;43467;43468;43469;43470;43471;43472;43473;43474;43475 43473 13 ASSSTVPLGFHYETK Acetyl (Protein N-term) 1664.8046 0.80460124 4062 Q9BXK5;E9PDD6;F2Z2C3;A0A087WW80;A0A0A0MR90;F6VJB4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 1 0 0 1 89.18 89.18 2 0.017613 91462 QUIQUE_C1218_190116_001 46.063 30.173 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3767 4062 3510 33992 43476 43476 1 ASSTCPLTFENVK Unmodified 1452.6919 0.69187967 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 64.114 64.114 2 0.018552 64138 QUIQUE_C1438_190116_001 69.346 51.034 239410000 0 0 0 112320000 127090000 0 0 0 0 0 0 0 0 3768 2470 3511 33993;33994 43477;43478 43478 1 ASSTPSSETQEEFVDDFR Unmodified 2030.8705 0.87050855 2322 P30622;J3KP58;F5H6A0;F5H1T5;F5H367;F5H270 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 94.856 94.856 2 3.1108E-23 96190 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.57 128.32 25614000 0 0 0 0 0 0 0 25614000 0 0 0 0 0 3769 2322 3512 33995 43479 43479 1 ASSTSPVEISEWLDQK Unmodified 1775.8578 0.85775902 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 119.93 119.93 2;3 3.0257E-13 123523 QUIQUE_C1277_190116_001 134.99 117.78 3963000000 322440000 334660000 374690000 333880000 390220000 379450000 340370000 323240000 340140000 139550000 0 331480000 352860000 3770 2067 3513 33996;33997;33998;33999;34000;34001;34002;34003;34004;34005;34006;34007;34008;34009;34010;34011;34012 43480;43481;43482;43483;43484;43485;43486;43487;43488;43489;43490;43491;43492;43493;43494;43495;43496;43497;43498;43499 43481 18 ASSVIFGLK Unmodified 920.53312 0.53311783 4117 Q9H0C8;F8SNU6 ILKAP;ILKAP2 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.648 70.648 2 0.010766 70017 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.665 11.006 85576000 14451000 19033000 0 0 0 0 0 20768000 15973000 0 0 15353000 0 3771 4117 3514 34013;34014;34015;34016;34017;34018;34019;34020;34021;34022 43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507;43508;43509;43510;43511 43510 12 ASSVTTFTGEPNTCPR Unmodified 1723.7835 0.78354822 2618 P52943;H0YFA4 CRIP2 Cysteine-rich protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.431 51.431 2 2.328E-149 49894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 251.81 210.1 2601800000 185680000 250510000 132700000 229910000 224530000 183980000 147880000 272980000 267770000 70134000 214420000 216770000 204520000 3772 2618 3515 34023;34024;34025;34026;34027;34028;34029;34030;34031;34032;34033;34034;34035 43512;43513;43514;43515;43516;43517;43518;43519;43520;43521;43522;43523;43524;43525;43526;43527;43528;43529;43530;43531;43532;43533;43534;43535;43536 43526 25 ASSVVVSGTPIR Unmodified 1171.6561 0.65608651 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.059 41.059 2 8.9542E-07 37560 QUIQUE_C1576_190116_001 140.17 93.744 1494900000 104410000 93580000 124520000 155520000 116170000 85663000 69625000 159030000 157480000 66743000 152160000 107170000 102850000 3773 2114 3516 34036;34037;34038;34039;34040;34041;34042;34043;34044;34045;34046;34047;34048 43537;43538;43539;43540;43541;43542;43543;43544;43545;43546;43547;43548;43549;43550;43551;43552 43546 15 ASSYFDPVPLGTHLTVQVR Unmodified 2086.0847 0.084739267 4735 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 123.31 123.31 2 0.0029381 128651 QUIQUE_C1218_190116_001 55.261 42.061 324760000 71491000 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10486000 0 0 54866000 8477800 37387000 0 60547000 3776 2458;417 3519 34067;34068;34069;34070;34071;34072;34073 43571;43572;43573;43574;43575;43576;43577 43576 296 7 ASTEGANNMPK Acetyl (Protein N-term) 1160.5132 0.51318702 2458;417 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3U0E3;A0A2R8YG01;A0A163QEF0;H0YEK4;A0A2R8Y6B8;C9J9N5;A0A2R8YH93;A0A2R8Y4D1 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2;Amino acid transporter no no 1 0 0 1 34.441 34.441 2 0.056716 29684 QUIQUE_C1403_190116_001 47.187 32.98 57052000 0 0 0 57052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3777 2458;417 3519 34074 43578 43578 1 ASTEQAPELENLTVTEVGWDGLR Unmodified 2514.2238 0.22381152 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 140.89 140.89 2 1.1011E-17 144039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.48 137.77 713060000 0 0 51375000 31792000 0 46461000 36104000 96581000 165000000 0 97087000 96468000 92198000 3778 2233 3520 34075;34076;34077;34078;34079;34080;34081;34082;34083;34084 43579;43580;43581;43582;43583;43584;43585;43586;43587;43588;43589;43590;43591;43592;43593 43585 14 ASTEVGEMAK Unmodified 1021.475 0.4750106 2259 P27144 AK4 Adenylate kinase 4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 18.956 18.956 2 0.029339 11316 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.722 24.11 130160000 0 0 0 0 0 0 0 98118000 0 32045000 0 0 0 3779 2259 3521 34085;34086 43594;43595 43595 2 ASTGSQASDIDEIFGFFNDGEPPTK Acetyl (Protein N-term) 2671.1926 0.19257097 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;G3V179;E9PMW3;E9PIM5 FAM118B Protein FAM118B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 172.52 172.52 3 9.7028E-18 173968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.62 94.117 166700000 14031000 24994000 18637000 13493000 26638000 0 0 34073000 34832000 0 0 0 0 3780 962 3522 34087;34088;34089;34090;34091;34092;34093 43596;43597;43598;43599;43600;43601;43602 43601 7 ASTHETWAYGK Unmodified 1249.5728 0.57275081 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 20.857 20.857 2;3 0.0018647 14011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.52 102.22 112760000 0 0 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34115;34116;34117;34118;34119;34120;34121;34122;34123;34124;34125;34126;34127 43626;43627;43628;43629;43630;43631;43632;43633;43634;43635;43636;43637;43638;43639;43640;43641;43642;43643 43638 16 ASTPAILFLDEIDSILGAR Unmodified 2001.0783 0.078256906 4049 Q9BVQ7;H0YCA5 SPATA5L1 Spermatogenesis-associated protein 5-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 176.58 176.58 2 0.0035841 180037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.276 33.488 17792000 0 0 0 0 0 0 0 0 9871400 0 0 7920700 0 3787 4049 3529 34128;34129 43644;43645 43645 2 ASTPNGYDNGIIWATWK Unmodified 1892.9057 0.90571227 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 124.52 124.52 2 9.7641E-18 128551 QUIQUE_C1368_190116_001 122.45 106.56 1097700000 0 75762000 0 130330000 90055000 0 69709000 84791000 0 0 557760000 0 89258000 3788 710 3530 34130;34131;34132;34133;34134;34135;34136;34137;34138;34139 43646;43647;43648;43649;43650;43651;43652;43653;43654;43655;43656;43657;43658 43647 13 ASTTLDIK Unmodified 847.4651 0.46509784 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.7 24.7 2 0.0392 18495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.752 48.45 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3789 2483 3531 34140;34141;34142;34143;34144 43659;43660;43661;43662;43663 43662 5 ASTTLDIKDSISAVSSEK Unmodified 1850.9473 0.94730231 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 81.942 81.942 3 0.0053232 83285 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.528 39.997 251630000 0 0 0 0 0 0 0 111030000 57785000 0 0 25840000 56977000 3790 2483 3532 34145;34146;34147;34148;34149 43664;43665;43666;43667;43668;43669 43665 5 ASTVVAVGLTIAAAGFAGR Acetyl (Protein N-term) 1772.9785 0.97848328 3831 Q96DA6;G5E9V2;F2Z3A7 DNAJC19 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 180.38 180.38 2 1.3708E-11 183281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.21 128.02 48960000 0 5354900 0 0 3955800 0 3900400 6369800 5522900 0 11196000 7208000 5452300 3791 3831 3533 34150;34151;34152;34153;34154;34155;34156;34157;34158;34159;34160;34161 43670;43671;43672;43673;43674;43675;43676;43677;43678;43679;43680;43681;43682 43681 13 ASVCAEAYNPDEEEDDAESR Unmodified 2255.8761 0.87606422 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 58.966 58.966 2 9.4865E-06 56997 QUIQUE_C1563_190116_001 109.83 106.87 22655000 0 0 0 0 0 22655000 0 0 0 0 0 0 0 3792 2331 3534 34162 43683 43683 1 ASVDELFAEIVR Unmodified 1347.7034 0.70343063 2720 P61225 RAP2B Ras-related protein Rap-2b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.55 147.55 2 5.3713E-10 151802 QUIQUE_DMIX7_190116_001 156.48 129.37 2165900000 185910000 0 157860000 181740000 190740000 0 535690000 221510000 202030000 54304000 227700000 104890000 103510000 3793 2720 3535 34163;34164;34165;34166;34167;34168;34169;34170;34171;34172;34173 43684;43685;43686;43687;43688;43689;43690;43691;43692;43693;43694;43695;43696;43697;43698 43694 13 ASVDGWFK Unmodified 908.43922 0.43921744 1894 P05771;I3L1Z0 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.919 73.919 2 0.025599 74492 QUIQUE_C1368_190116_001 71.342 43.124 203710000 0 0 36384000 0 0 0 75034000 37974000 0 0 54316000 0 0 3794 1894 3536 34174;34175;34176;34177 43699;43700;43701;43702 43699 4 ASVETSPLLR Unmodified 1071.5924 0.59242362 2626 P53602;H3BP35 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 48.967 48.967 2 0.011915 46347 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.621 22.174 516000000 103550000 126560000 0 0 0 0 0 146240000 0 0 139640000 0 0 3795 2626 3537 34178;34179;34180;34181;34182 43703;43704;43705;43706;43707 43707 5 ASVFSNLR Unmodified 892.47667 0.47666558 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 49.006 49.006 2 0.0455 46951 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.047 9.1988 18232000 0 0 0 0 0 0 0 0 18232000 0 0 0 0 3796 4340 3538 34183 43708 43708 1 ASVGQDSPEPR Unmodified 1141.5364 0.53636531 3411 Q6UX71 PLXDC2 Plexin domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 16.189 16.189 2 0.066896 8385 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.282 28.641 28656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28656000 3797 3411 3539 34184 43709 43709 1 ASVHTLSGHTNAVATVR Unmodified 1719.9016 0.90162994 1539 O43660;H0YA24 PLRG1 Pleiotropic regulator 1 yes no 0 0 0 1 20.249 20.249 3 0.030459 12913 QUIQUE_C1277_190116_001 40.602 32.218 23086000 0 23086000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3798 1539 3540 34185 43710 43710 0 ASVILAGLGFTPK Unmodified 1272.7442 0.74417324 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 114.67 114.67 2 0.010787 118546 QUIQUE_C1368_190116_001 63.32 39.892 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3799 4299 3541 34186;34187;34188 43711;43712;43713 43712 3 ASVITQVFHVPLEER Unmodified 1723.9257 0.92571943 2 A0A024R4E5;Q00341;C9JIZ1;C9J5E5;C9JT62;C9JHS7;C9JK79;C9JHZ8;C9JES8;C9JZI8 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.48 106.48 2;3 0.0012399 110159 QUIQUE_C1403_190116_001 75.088 49.651 214560000 0 0 0 0 58428000 0 0 0 0 0 56560000 43105000 56470000 3800 2 3542 34189;34190;34191;34192;34193;34194 43714;43715;43716;43717;43718;43719 43714 6 ASVLDTSMSAGSGSPSK Unmodified 1580.7352 0.73520105 4520 Q9UPQ0;D6RD46;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 51.36 51.36 2 8.1497E-13 49031 QUIQUE_C1403_190116_001 127.71 93.754 17628000 0 0 0 17628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3801 4520 3543 34195 43720 43720 1 ASVLFDTMQHHLALNR Unmodified 1851.9414 0.94138627 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 3 1 1 2 1 1 3 1 3 2 2 85.549 85.549 2;3;4 8.2266E-25 87405 QUIQUE_C1368_190116_001 156.69 121.27 3491300000 115400000 108230000 510880000 89144000 124000000 131990000 124250000 170960000 417790000 24220000 666880000 349020000 658540000 3802 2483 3544 34196;34197;34198;34199;34200;34201;34202;34203;34204;34205;34206;34207;34208;34209;34210;34211;34212;34213;34214;34215;34216;34217 43721;43722;43723;43724;43725;43726;43727;43728;43729;43730;43731;43732;43733;43734;43735;43736;43737;43738;43739;43740;43741;43742;43743;43744;43745;43746;43747;43748;43749;43750;43751;43752 43727 32 ASVLFDTMQHHLALNR Oxidation (M) 1867.9363 0.93630089 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 60.112 60.112 3 0.00013339 59432 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.652 62.583 203750000 0 0 0 0 0 0 0 0 87876000 43219000 0 0 72654000 3803 2483 3544 34218;34219;34220 43753;43754;43755 43753 1906 3 ASVMLFMK Unmodified 925.47653 0.47653093 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 83.531 83.531 2 0.063544 86473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.403 35.439 27152000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27152000 0 0 3804 1676 3545 34221 43756 43756 1 ASVMVYDDTSKK Unmodified 1342.6439 0.64386684 4441 Q9UI08;G3V3G2;G3V535;A0A087WYI2 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 23.522 23.522 2 0.0034286 17077 QUIQUE_C1403_190116_001 75.652 45.843 110980000 0 19302000 0 28305000 0 0 0 0 0 0 32515000 0 30858000 3805 4441 3546 34222;34223;34224;34225;34226 43757;43758;43759;43760;43761 43758 5 ASVPDGFLSELTQQLAQATGK Unmodified 2160.1063 0.10626257 2070 P14174 MIF Macrophage migration inhibitory factor yes yes 0 0 0 1 1 165.72 165.72 2 0.00033325 172278 QUIQUE_C1438_190116_001 62.861 47.316 114550000 0 0 0 0 66192000 48359000 0 0 0 0 0 0 0 3806 2070 3547 34227;34228 43762;43763 43762 2 ASVPPVPGKPR Unmodified 1103.6451 0.64512789 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 20.976 20.976 3 0.0091484 14023 QUIQUE_C1438_190116_001 48.44 35.087 70611000 0 0 0 0 23339000 0 0 26069000 0 0 0 0 21203000 3807 3718 3548 34229;34230;34231 43764;43765;43766;43767;43768 43764 5 ASVPTIQDQASAMQLSQCAK Unmodified 2133.0194 0.019438173 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.384 87.384 2 1.7407E-29 90455 QUIQUE_C1218_190116_001 140.82 128.03 289190000 26517000 29657000 0 44837000 27694000 33301000 25020000 29398000 0 0 0 29274000 43496000 3808 4600 3549 34232;34233;34234;34235;34236;34237;34238;34239;34240 43769;43770;43771;43772;43773;43774;43775;43776;43777;43778 43769 10 ASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDK Acetyl (Protein N-term) 2919.4059 0.40593457 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.66 172.66 3 1.479E-99 175940 QUIQUE_C1277_190116_001 184.47 152.39 540720000 51872000 59798000 56671000 21375000 71144000 0 94219000 13089000 42138000 3388900 67701000 0 59319000 3809 1886 3550 34241;34242;34243;34244;34245;34246;34247;34248;34249;34250;34251;34252 43779;43780;43781;43782;43783;43784;43785;43786;43787;43788;43789;43790 43780 12 ASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIK Acetyl (Protein N-term) 3571.8331 0.83313076 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 1 0 1 1 1 2 1 1 171.78 171.78 3;4 5.6662E-215 176080 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86310000 133910000 3812 2483 3552 34265;34266;34267;34268;34269;34270;34271;34272;34273;34274;34275;34276;34277 43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;43811;43812;43813;43814;43815;43816 43811 13 ASVSQVEADLK Unmodified 1145.5928 0.59281755 2907 Q07065 CKAP4 Cytoskeleton-associated protein 4 yes yes 0 0 0 1 57.745 57.745 2 0.025311 53077 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.124 27.387 14349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14349000 0 0 0 3813 2907 3553 34278 43817 43817 1 ASVSSATFSGHGAR Acetyl (Protein N-term) 1375.648 0.64804102 3461 Q7Z4H3;V9GYS5;V9GZ04 HDDC2 HD domain-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 45.286 45.286 2 1.3903E-05 40478 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.53 71.105 246730000 75036000 29912000 0 0 0 0 0 96841000 0 44940000 0 0 0 3814 3461 3554 34279;34280;34281;34282 43818;43819;43820;43821 43821 4 ASVTVGGEQISAIGR Unmodified 1443.7682 0.76815616 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.755 71.755 2 0.00020344 73055 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VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 0 1 58.896 58.896 2 0.052818 57654 QUIQUE_C1218_190116_001 49.96 34.298 45390000 45390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3818 1493 3558 34298 43838 43838 1 ASWSSLSMDEK Oxidation (M) 1255.5391 0.53906742 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 49.175 49.175 2 0.0019051 47010 QUIQUE_C1218_190116_001 83.499 72.136 210240000 85579000 0 0 0 0 80297000 0 0 0 44362000 0 0 0 3819 2052 3559 34299;34300;34301 43839;43840;43841 43839 1372 1 ASWSSLSMDEK Unmodified 1239.5442 0.5441528 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.991 67.991 2 0.0034399 64883 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.048 89.516 1275900000 0 0 0 0 0 0 297270000 112120000 0 106150000 462270000 0 298080000 3820 2052 3559 34302;34303;34304;34305;34306 43842;43843;43844;43845;43846 43844 1 ASWSSLSMDEKVELYR Oxidation (M) 1915.8986 0.89857798 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 86.811 86.811 3 0.00065795 88026 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.428 68.465 205600000 0 0 0 0 0 0 0 90390000 115210000 0 0 0 0 3821 2052 3560 34307;34308 43847;43848 43847 1372 2 ASWSSLSMDEKVELYR Unmodified 1899.9037 0.90366336 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 99.1 99.1 3 0.00040647 101730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.463 65.541 106550000 0 0 0 0 0 0 0 56481000 50067000 0 0 0 0 3822 2052 3560 34309;34310;34311 43849;43850;43851;43852 43851 4 ASWTWGPEGQGAILLVNCDR Unmodified 2229.0637 0.063686249 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 1 2 2 2 1 1 2 140.01 140.01 2;3 7.7793E-76 145777 QUIQUE_C1218_190116_001 194.48 186.09 4970500000 453500000 268390000 545990000 634130000 276200000 478690000 219770000 361160000 447470000 252700000 296600000 239800000 496100000 3823 4560 3561 34312;34313;34314;34315;34316;34317;34318;34319;34320;34321;34322;34323;34324;34325;34326;34327;34328;34329;34330;34331;34332;34333;34334 43853;43854;43855;43856;43857;43858;43859;43860;43861;43862;43863;43864;43865;43866;43867;43868;43869;43870;43871;43872;43873;43874;43875;43876;43877;43878;43879;43880;43881;43882;43883 43854 29 ASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPK Unmodified 3080.5178 0.51782548 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 149.53 149.53 3 1.037E-25 152310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.95 92.976 72215000 0 0 0 0 0 0 0 72215000 0 0 0 0 0 3824 4560 3562 34335 43884 43884 1 ASYAAGPASNYADPYR Unmodified 1672.7481 0.74814899 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 65.308 65.308 2 0.040724 64517 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.224 51.269 79195000 0 0 0 0 0 0 0 49082000 0 0 0 30112000 0 3825 855;928 3563 34336;34337 43885;43886 43886 1 ASYAQQPAESR Unmodified 1206.5629 0.56291441 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.407 16.407 2 1.506E-05 8457 QUIQUE_C1403_190116_001 171.33 146.19 2386300000 130650000 238770000 221280000 123120000 320120000 98112000 148890000 188350000 199250000 64240000 309290000 196810000 147450000 3826 2834 3564 34338;34339;34340;34341;34342;34343;34344;34345;34346;34347;34348;34349;34350 43887;43888;43889;43890;43891;43892;43893;43894;43895;43896;43897;43898;43899 43890 13 ASYAVSETIPK Unmodified 1164.6027 0.60265396 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.496 49.496 2 0.012829 46504 QUIQUE_C1403_190116_001 60.064 44.422 594150000 111660000 0 0 107520000 0 0 0 88433000 93683000 51883000 0 0 140970000 3827 4259 3565 34351;34352;34353;34354;34355;34356 43900;43901;43902;43903;43904;43905;43906 43901 6 ASYDVSDSGQLEHVQPWSV Unmodified 2102.9545 0.95451296 2861 Q01813;B1APP8 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.56 117.56 2 5.5289E-11 121569 QUIQUE_C1403_190116_001 152.88 145.3 2805900000 250920000 236280000 218350000 246270000 182040000 131160000 208580000 251630000 212160000 95348000 265070000 262360000 245780000 3828 2861 3566 34357;34358;34359;34360;34361;34362;34363;34364;34365;34366;34367;34368;34369 43907;43908;43909;43910;43911;43912;43913;43914;43915;43916;43917;43918;43919;43920;43921;43922;43923;43924;43925 43913 18 ASYFICHDQETIK Unmodified 1610.7399 0.73989249 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.974 48.974 2;3 0.00032845 45644 QUIQUE_C1563_190116_001 88.596 78.364 118480000 0 21564000 22181000 22726000 0 28680000 0 0 0 23330000 0 0 0 3829 3857 3567 34370;34371;34372;34373;34374 43926;43927;43928;43929;43930;43931 43929 6 ASYFICHDQETIKK Unmodified 1738.8349 0.83485551 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 31.991 31.991 3;4 0.00014465 27745 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.692 71.331 395000000 0 0 0 0 61691000 0 0 79196000 75951000 29354000 0 59466000 89341000 3830 3857 3568 34375;34376;34377;34378;34379;34380;34381 43932;43933;43934;43935;43936;43937;43938 43934 5 ASYGHSMVVDPWGTVVAR Unmodified 1930.936 0.93596654 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 96.021 96.021 2;3 5.4661E-14 98010 QUIQUE_C1277_190116_001 111.39 79.326 291080000 71654000 0 20827000 36561000 25355000 104930000 0 0 0 31756000 0 0 0 3831 3515 3569 34382;34383;34384;34385;34386;34387;34388;34389;34390;34391;34392;34393 43939;43940;43941;43942;43943;43944;43945;43946;43947;43948;43949;43950 43941 12 ASYGVEDPEYAVTQLAQTTMR Unmodified 2329.0896 0.089626228 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.53 140.53 2 1.7005E-13 144831 QUIQUE_C1277_190116_001 116.43 102.4 365370000 45008000 56488000 55244000 31251000 0 41038000 54311000 38122000 0 0 43904000 0 0 3832 4466 3570 34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;34401;34402 43951;43952;43953;43954;43955;43956;43957;43958;43959;43960 43953 9 ASYIIVPQDGIFSPTSNLLLLDLGHLK Unmodified 2923.6059 0.60589543 3931 Q96RL7 VPS13A Vacuolar protein sorting-associated protein 13A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 166.18 166.18 3 1.9158E-12 171109 QUIQUE_C1218_190116_001 63.361 62.181 167110000 35704000 54163000 0 0 35346000 0 0 0 0 0 41899000 0 0 3833 3931 3571 34403;34404;34405;34406 43961;43962;43963;43964 43961 4 ASYILMEK Unmodified 953.4892 0.4892041 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 52.839 52.839 2 0.025559 51385 QUIQUE_C1438_190116_001 71.379 26.298 399890000 0 116000000 0 0 98598000 92241000 0 0 0 0 0 93050000 0 3834 2513 3572 34407;34408;34409;34410;34411 43965;43966;43967;43968;43969;43970 43967 6 ASYLDCIR Unmodified 996.46987 0.46986564 1838 P02787;F8WCI6;C9JB55;F8WEK9 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.069 62.069 2 0.0065653 61916 QUIQUE_C1576_190116_001 101.28 62.322 1566300000 0 0 163770000 0 522820000 0 148770000 0 158480000 63678000 157070000 156780000 194960000 3835 1838 3573 34412;34413;34414;34415;34416;34417;34418;34419 43971;43972;43973;43974;43975;43976;43977;43978;43979;43980 43974 10 ASYLEIYQEEIRDLLSK Unmodified 2069.0681 0.06808615 1476 O15066;F8WAR6;F8WER6;O14782 KIF3B;KIF3C Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3C yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.95 159.95 3 1.7598E-05 164629 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.579 84.916 203810000 0 0 16796000 0 19667000 0 17843000 24700000 26258000 0 37949000 27830000 32771000 3836 1476 3574 34420;34421;34422;34423;34424;34425;34426;34427 43981;43982;43983;43984;43985;43986;43987;43988;43989 43989 9 ASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFR Unmodified 2762.334 0.33403068 1923 P07585;H0YI87 DCN Decorin yes no 0 0 0 2 2 1 160.85 160.85 2;3 3.2066E-06 164475 QUIQUE_C1403_190116_001 87.148 75.887 151780000 0 0 45212000 74770000 0 0 0 31802000 0 0 0 0 0 3837 1923 3575 34428;34429;34430;34431;34432 43990;43991;43992;43993;43994 43992 4 ASYSSQHGHLGPELR Unmodified 1637.791 0.79101686 855;928;813 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5;D6RC65 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 21.819 21.819 3;4 0.00045131 15135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.169 44.119 1020300000 138400000 39238000 126740000 133390000 74479000 122500000 105590000 0 90283000 0 53038000 49912000 86706000 3838 855;928;813 3576 34433;34434;34435;34436;34437;34438;34439;34440;34441;34442;34443;34444;34445;34446;34447;34448 43995;43996;43997;43998;43999;44000;44001;44002;44003;44004;44005;44006;44007;44008;44009;44010;44011;44012 44008 17 ASYVAPLTAQPATYR Unmodified 1607.8308 0.83075641 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.521 71.521 2 1.3964E-05 71565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.067 63.57 1139400000 64322000 91482000 110590000 127630000 82235000 100810000 74027000 105630000 89854000 0 113670000 78831000 100320000 3839 3919 3577 34449;34450;34451;34452;34453;34454;34455;34456;34457;34458;34459;34460 44013;44014;44015;44016;44017;44018;44019;44020;44021;44022;44023;44024 44020 10 ASYVAWGHSTVVNPWGEVLAK Unmodified 2270.1484 0.14840216 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 121.96 121.96 2;3 7.1289E-99 125947 QUIQUE_C1277_190116_001 202.63 172.19 2463900000 219420000 196520000 201810000 161050000 230340000 111620000 254160000 193340000 249760000 66483000 236760000 46272000 296390000 3840 4256 3578 34461;34462;34463;34464;34465;34466;34467;34468;34469;34470;34471;34472;34473;34474;34475;34476;34477;34478;34479;34480;34481;34482;34483 44025;44026;44027;44028;44029;44030;44031;44032;44033;44034;44035;44036;44037;44038;44039;44040;44041;44042;44043;44044;44045;44046;44047;44048;44049;44050;44051;44052 44028 27 ASYYEILDVPR Acetyl (Protein N-term) 1366.6769 0.67688153 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.13 147.13 2 0.00022692 151210 QUIQUE_C1277_190116_001 119.68 80.376 654050000 54894000 54358000 42561000 46780000 55730000 55860000 60997000 34927000 44213000 21157000 62202000 62950000 57420000 3841 2242 3579 34484;34485;34486;34487;34488;34489;34490;34491;34492;34493;34494;34495;34496;34497 44053;44054;44055;44056;44057;44058;44059;44060;44061;44062;44063;44064;44065;44066;44067;44068;44069;44070;44071;44072;44073;44074;44075;44076 44055 24 ASYYEISVDDGPWEK Unmodified 1757.7784 0.77844607 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.52 113.52 2 1.9678E-06 116868 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.24 105.29 524760000 54258000 41856000 61219000 45641000 0 39518000 48990000 62142000 86528000 22151000 0 62453000 0 3842 3235 3580 34498;34499;34500;34501;34502;34503;34504;34505;34506;34507 44077;44078;44079;44080;44081;44082;44083;44084;44085;44086 44084 7 ASYYVVSGNDPANGEPSR Unmodified 1881.8493 0.8493196 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.386 58.386 2 1.8833E-45 57834 QUIQUE_DMIX5_190116_001 174.39 166.29 815100000 44432000 67029000 78346000 62458000 58783000 46844000 74424000 70487000 64745000 26466000 80501000 74862000 65726000 3843 921 3581 34508;34509;34510;34511;34512;34513;34514;34515;34516;34517;34518;34519;34520 44087;44088;44089;44090;44091;44092;44093;44094;44095;44096;44097;44098;44099;44100;44101;44102;44103;44104;44105;44106 44102 20 ATAAETSASEPEAESK Acetyl (Protein N-term) 1619.7162 0.71623974 3098 Q15020;F8VV04;F8W667 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 1 0 0 1 1 43.901 43.901 2 6.1155E-113 40544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 267.75 227.16 39049000 0 0 0 0 0 0 0 39049000 0 0 0 0 0 3844 3098 3582 34521;34522 44107;44108 44108 2 ATAAFILANEHNVALFK Unmodified 1828.9836 0.98356866 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 2 106.12 106.12 2;3 2.2104E-08 110711 QUIQUE_C1438_190116_001 109.48 100.07 2918200000 191210000 260140000 169890000 180520000 238210000 161860000 237470000 270040000 400260000 62004000 0 334950000 411690000 3845 1403 3583 34523;34524;34525;34526;34527;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34538;34539;34540;34541;34542 44109;44110;44111;44112;44113;44114;44115;44116;44117;44118;44119;44120;44121;44122;44123;44124;44125;44126;44127;44128;44129;44130 44116 19 ATAAFSNVGTAISK Unmodified 1336.6987 0.69867961 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.037 57.037 2 0.00025602 55591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.54 76.187 1628300000 0 137590000 142190000 136070000 148600000 167110000 120140000 104230000 101580000 51052000 147050000 109370000 263340000 3846 970 3584 34543;34544;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;34554 44131;44132;44133;44134;44135;44136;44137;44138;44139;44140;44141;44142;44143 44139 13 ATAAPAGAPPQPQDLEFTK Unmodified 1908.9581 0.95814177 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9;H3BUE4;H3BUI9 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 78.752 78.752 2 5.2312E-74 81487 QUIQUE_DMIX5_190116_001 192.14 174.4 4990600000 525320000 513620000 495350000 310720000 358450000 322710000 399010000 353740000 437740000 141250000 429470000 358680000 344560000 3847 2202 3585 34555;34556;34557;34558;34559;34560;34561;34562;34563;34564;34565;34566;34567;34568 44144;44145;44146;44147;44148;44149;44150;44151;44152;44153;44154;44155;44156;44157;44158;44159;44160;44161;44162;44163;44164;44165;44166;44167;44168;44169;44170;44171;44172;44173;44174;44175;44176;44177;44178;44179;44180;44181;44182;44183;44184;44185;44186 44180 43 ATAAPAGAPPQPQDLEFTKLPNGLVIASLENYSPVSR Unmodified 3818.9843 0.98430353 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9;H3BUE4;H3BUI9 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 151.06 151.06 3;4 2.1552E-41 157083 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.915 85.44 222100000 0 0 0 0 0 0 0 90278000 46107000 0 85713000 0 0 3848 2202 3586 34569;34570;34571;34572;34573 44187;44188;44189;44190;44191;44192;44193 44193 4 ATAAVLR Acetyl (Protein N-term) 742.43374 0.43373813 180 A0A0A0MSM0 HSPH1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.335 40.335 2 0.03215 36773 QUIQUE_C1277_190116_001 66.994 20.642 2465700000 284880000 244740000 186650000 0 294780000 121800000 0 378660000 278830000 0 450920000 0 224450000 3849 180 3587 34574;34575;34576;34577;34578;34579;34580;34581;34582 44194;44195;44196;44197;44198;44199;44200;44201;44202;44203;44204;44205;44206;44207 44195 14 ATAAYEQLK Acetyl (Protein N-term) 1035.5237 0.52367535 4293 Q9NTJ5;F8WCQ2 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 1 0 0 1 74.85 74.85 2 0.019846 70993 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.074 43.871 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3850 4293 3588 34583 44208 44208 1 ATACQMLVYYAK Unmodified 1417.6734 0.67339283 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 91.325 91.325 2 0.012786 93734 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.534 43.927 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3851 1582 3589 34584 44209 44209 1 ATADDELSFK Unmodified 1095.5084 0.50841922 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.592 50.592 2 0.00014691 47699 QUIQUE_C1563_190116_001 122.13 103.35 2360300000 0 226070000 258610000 238940000 205350000 209580000 209850000 163170000 161240000 94620000 225880000 164600000 202410000 3852 2774 3590 34585;34586;34587;34588;34589;34590;34591;34592;34593;34594;34595;34596 44210;44211;44212;44213;44214;44215;44216;44217;44218;44219;44220;44221;44222 44214 13 ATADDELSFKR Unmodified 1251.6095 0.60953025 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 33.793 33.793 2;3 0.002075 29285 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synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.57 101.57 2 1.5369E-08 98480 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.68 103.07 3787200000 315020000 261310000 301940000 338860000 370270000 340660000 270960000 246910000 281600000 172330000 295180000 274720000 317440000 3855 2195 3593 34620;34621;34622;34623;34624;34625;34626;34627;34628;34629;34630;34631;34632 44248;44249;44250;44251;44252;44253;44254;44255;44256;44257;44258;44259;44260;44261;44262;44263;44264;44265 44261 18 ATAEVLNIGKK Acetyl (Protein N-term) 1184.6765 0.6764876 2195 P22234;E9PBS1 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 1 0 1 1 1 1 2 1 1 69.948 69.948 2 1.7625E-06 70626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.34 129.6 2053300000 0 0 0 0 49836000 0 0 616030000 289220000 0 453860000 357740000 286650000 3856 2195 3594 34633;34634;34635;34636;34637;34638;34639 44266;44267;44268;44269;44270;44271;44272 44270 4 ATAFNEQVDK Unmodified 1121.5353 0.53530267 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.658 25.658 2 0.0066736 20122 QUIQUE_C1218_190116_001 100.02 79.392 453170000 80170000 97579000 79389000 95827000 100200000 0 0 0 0 0 0 0 0 3857 2265 3595 34640;34641;34642;34643;34644 44273;44274;44275;44276;44277 44273 2 ATAFNEQVDKFFPLIEVNK Unmodified 2209.1419 0.1419198 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 139.78 139.78 3 0.0011117 144728 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.252 50.206 105420000 0 0 0 0 0 0 0 0 32622000 0 0 36005000 36787000 3858 2265 3596 34645;34646;34647;34648 44278;44279;44280;44281 44279 3 ATAGAYIASQTVK Unmodified 1279.6772 0.67721588 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 3 2 40.69 40.69 2 1.5825E-13 36428 QUIQUE_C1563_190116_001 157.97 138.35 2067000000 84166000 76216000 211130000 118050000 201420000 85215000 162820000 81805000 132630000 83847000 317550000 204120000 308050000 3859 2276 3597 34649;34650;34651;34652;34653;34654;34655;34656;34657;34658;34659;34660;34661;34662;34663;34664;34665;34666;34667;34668;34669 44282;44283;44284;44285;44286;44287;44288;44289;44290;44291;44292;44293;44294;44295;44296;44297;44298;44299;44300;44301;44302;44303 44289 19 ATAGAYIASQTVKK Unmodified 1407.7722 0.7721789 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 1 1 27.013 27.013 2 0.0010642 21269 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.266 52.932 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3860 2276 3598 34670 44304 44304 1 ATAGDTHLGGEDFDNR Unmodified 1674.7234 0.72339081 282;2362;2117 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931;P17066;P48741 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L;HSPA6;HSPA7 Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like;Heat shock 70 kDa protein 6;Putative heat shock 70 kDa protein 7 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.001 37.001 2;3 3.0543E-66 32760 QUIQUE_C1277_190116_001 211.26 205.02 34636000000 2519900000 2886200000 1784400000 3117300000 3331100000 2009000000 3335000000 2280400000 3004400000 1803300000 3107600000 2420600000 3036700000 3861 282;2362;2117 3599 34671;34672;34673;34674;34675;34676;34677;34678;34679;34680;34681;34682;34683;34684;34685;34686;34687;34688;34689;34690;34691;34692;34693;34694;34695;34696 44305;44306;44307;44308;44309;44310;44311;44312;44313;44314;44315;44316;44317;44318;44319;44320;44321;44322;44323;44324;44325;44326;44327;44328;44329;44330;44331;44332;44333;44334;44335;44336;44337 44310 32 ATAIDIATSK Unmodified 989.53933 0.53932542 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 36.593 36.593 1;2 0.0012683 32303 QUIQUE_C1277_190116_001 99.688 71.469 3024300000 313170000 282360000 292880000 286850000 189180000 263420000 330410000 0 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factor 1-delta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 17.527 17.527 2;3 4.1766E-08 10436 QUIQUE_C1218_190116_001 137.89 111.96 2110600000 241210000 163220000 142560000 165430000 189220000 182580000 112630000 183820000 171190000 0 192480000 122090000 244210000 3867 958;979;2291 3604 34735;34736;34737;34738;34739;34740;34741;34742;34743;34744;34745;34746;34747;34748;34749;34750;34751;34752;34753;34754;34755;34756;34757;34758 44380;44381;44382;44383;44384;44385;44386;44387;44388;44389;44390;44391;44392;44393;44394;44395;44396;44397;44398;44399;44400;44401;44402;44403;44404 44381 24 ATAPVPTVGEGYGYGHESELSQASAAAR Unmodified 2775.31 0.31000077 4055 Q9BWF3;E9PB51 RBM4 RNA-binding protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.711 79.711 3 8.5609E-78 80730 QUIQUE_C1368_190116_001 119.85 112.82 541450000 0 58828000 60202000 70802000 44411000 51998000 43496000 48062000 49331000 25139000 52817000 36367000 0 3868 4055 3605 34759;34760;34761;34762;34763;34764;34765;34766;34767;34768;34769 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type;Proteasome subunit beta type yes no 0 1 0 1 1 53.714 53.714 2 0.0042365 51717 QUIQUE_C1368_190116_001 59.67 44.98 72211000 0 0 44806000 0 0 0 0 0 0 0 0 27406000 0 3884 2246 3618 34937;34938 44677;44678 44677 1601 2 ATCISPGVVETQFAFK Unmodified 1753.8709 0.87090667 3407 Q6UWP2;A0A087WZN3 DHRS11 Dehydrogenase/reductase SDR family member 11 yes no 0 0 0 1 1 110.73 110.73 2 0.0013469 115439 QUIQUE_C1438_190116_001 65.234 54.482 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3885 3407 3619 34939;34940 44679;44680 44680 2 ATDAEADVASLNR Unmodified 1331.6317 0.63172225 3424;557;3325 Q6ZN40;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM1;TPM2b;TPM2 Tropomyosin beta chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.162 49.162 2 2.7567E-07 46823 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.63 134.43 1121300000 134700000 207320000 132580000 97207000 195540000 82434000 90194000 0 38424000 41314000 49635000 0 51963000 + 3886 3424;557;3325 3620 34941;34942;34943;34944;34945;34946;34947;34948;34949;34950;34951;34952 44681;44682;44683;44684;44685;44686;44687;44688;44689;44690;44691;44692 44689 11 ATDAMAHVAGFTVAHDVSAR Oxidation (M) 2041.964 0.9639722 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 1 0 1 1 1 1 1 47.309 47.309 3 2.1897E-05 44650 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.801 68.251 228940000 79878000 42498000 0 34073000 33321000 0 0 0 39170000 0 0 0 0 3887 3380;3860 3621 34953;34954;34955;34956;34957 44693;44694;44695;44696;44697;44698 44698 2649 4 ATDAMAHVAGFTVAHDVSAR Unmodified 2025.9691 0.96905758 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 66.267 66.267 3;4 4.686E-38 65975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.6 145.51 2486000000 174860000 227090000 255740000 227430000 178200000 301110000 120430000 109420000 139140000 94922000 235600000 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2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.684 78.684 2;3 7.7966E-37 79447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.41 157.57 15452000000 1477900000 1562900000 1446100000 1303100000 1118400000 1195000000 1581100000 877820000 814180000 401990000 1326600000 1296300000 1051100000 3890 2146 3623 34993;34994;34995;34996;34997;34998;34999;35000;35001;35002;35003;35004;35005;35006;35007;35008;35009;35010;35011;35012;35013;35014;35015;35016;35017;35018 44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754;44755;44756;44757;44758;44759;44760;44761;44762;44763;44764;44765;44766;44767;44768;44769;44770;44771;44772;44773;44774;44775;44776;44777;44778;44779;44780;44781;44782;44783;44784;44785;44786;44787;44788 44771 41 ATDETDRDIIREPLTELK Unmodified 2114.0855 0.085527128 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 2 2 75.222 75.222 3;4 0.039386 76072 QUIQUE_DMIX3_190116_001 24.594 15.993 29913000 0 0 0 0 0 0 0 0 29913000 0 0 0 0 3891 1187 3624 35019;35020 44789;44790 44789 2 ATDFVADR Unmodified 893.4243 0.42429566 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.79 25.79 2 0.00033036 20093 QUIQUE_C1218_190116_001 159.04 109.68 17038000000 1289200000 1290900000 1500900000 1292100000 1231600000 1259000000 1280800000 1067300000 1491900000 472680000 2017200000 1449300000 1395400000 3892 2518 3625 35021;35022;35023;35024;35025;35026;35027;35028;35029;35030;35031;35032;35033 44791;44792;44793;44794;44795;44796;44797;44798;44799;44800;44801;44802;44803;44804 44791 13 ATDFVVPGPGK Unmodified 1086.571 0.5709599 1662 O75874;C9J4N6 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.425 55.425 2 0.0059934 55099 QUIQUE_C1218_190116_001 85.731 65.21 2246200000 161090000 183990000 202720000 208440000 188080000 184860000 182930000 0 190100000 105310000 212510000 192500000 233660000 3893 1662 3626 35034;35035;35036;35037;35038;35039;35040;35041;35042;35043;35044;35045 44805;44806;44807;44808;44809;44810;44811;44812;44813;44814;44815;44816 44805 9 ATDKDITGTLSNPEVFNYGVETHEAYK Unmodified 2998.4196 0.4196108 2099 P16083;Q5TD07;Q5TD05 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 96.629 96.629 3 4.8327E-27 99270 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.55 86.879 423170000 0 73752000 0 0 91936000 0 0 0 80626000 0 0 81084000 95769000 3894 2099 3627 35046;35047;35048;35049;35050 44817;44818;44819;44820;44821;44822 44819 6 ATDLGGTSQAGTSQR Unmodified 1448.6855 0.68554874 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.568 18.568 2 1.5996E-35 11295 QUIQUE_C1218_190116_001 172.13 150.76 466990000 46365000 37626000 37909000 46005000 36762000 39765000 39745000 50917000 37887000 11301000 50878000 31833000 0 3895 3453 3628 35051;35052;35053;35054;35055;35056;35057;35058;35059;35060;35061;35062;35063 44823;44824;44825;44826;44827;44828;44829;44830;44831;44832;44833;44834;44835 44823 13 ATDLRPIYISVQPPSLHVLEQR Unmodified 2531.386 0.38600667 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 115.3 115.3 3;4 3.0863E-08 120340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.09 81.138 4687500000 136780000 628640000 740790000 151830000 477730000 228350000 209370000 133140000 150540000 198570000 219620000 453450000 958720000 3896 3194 3629 35064;35065;35066;35067;35068;35069;35070;35071;35072;35073;35074;35075;35076;35077;35078;35079;35080;35081;35082 44836;44837;44838;44839;44840;44841;44842;44843;44844;44845;44846;44847;44848;44849;44850;44851;44852;44853;44854;44855;44856;44857 44851 19 ATDQVVALACAFNK Unmodified 1506.7501 0.75006325 1402 O00408;E9PEF1;H0YFL1;H0YG13 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 101.53 101.53 2 0.043916 104654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.415 48.725 113880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47495000 66381000 3897 1402 3630 35083;35084 44858;44859 44859 2 ATDSSDPLKPYQDFIIDSR Unmodified 2167.0433 0.043327963 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 121.2 121.2 3 0.0059726 126323 QUIQUE_C1218_190116_001 58.997 50.908 78096000 28831000 0 0 26123000 0 23142000 0 0 0 0 0 0 0 3898 3923 3631 35085;35086;35087 44860;44861;44862 44860 2 ATDSWALAVDEQEAAAESLSNLHLK Acetyl (Protein N-term) 2710.3086 0.30860379 1021 F6QDS0;H3BTX1 DDX19A;DDX19B no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 164.82 164.82 3 6.5063E-18 169843 QUIQUE_C1368_190116_001 101.41 95.189 181510000 0 23515000 28105000 44586000 24436000 27026000 0 0 0 11098000 0 0 22744000 3899 1021 3632 35088;35089;35090;35091;35092;35093;35094 44863;44864;44865;44866;44867;44868;44869 44864 7 ATDTSQGELVHPK Acetyl (Protein N-term) 1423.6943 0.69432251 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 no no 1 0 0 1 36.546 36.546 2 0.0009366 32981 QUIQUE_C1438_190116_001 96.113 80.963 23138000 0 0 0 0 23138000 0 0 0 0 0 0 0 0 3900 3297 3633 35095 44870 44870 1 ATDVMIAGK Unmodified 904.4688 0.46880301 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.909 25.909 2 0.0053778 19624 QUIQUE_C1368_190116_001 86.833 55.543 1757900000 172000000 160370000 203670000 163080000 128340000 139280000 150690000 0 155100000 0 184810000 128860000 171670000 3901 2219 3634 35096;35097;35098;35099;35100;35101;35102;35103;35104;35105;35106 44871;44872;44873;44874;44875;44876;44877;44878;44879;44880;44881 44873 8 ATEDEGSEQKIPEATNR Unmodified 1873.8654 0.8653636 1798 P01008;Q8TCE1 SERPINC1 Antithrombin-III yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 23.076 23.076 2;3 2.2117E-12 16489 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.56 111.02 281060000 26546000 46046000 36346000 0 60602000 0 0 0 0 0 56807000 0 54716000 3902 1798 3635 35107;35108;35109;35110;35111;35112;35113 44882;44883;44884;44885;44886;44887;44888 44887 6 ATEDGTPYDPYK Unmodified 1355.5881 0.5881261 2192 P22059 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 44.996 44.996 2 0.0045747 42250 QUIQUE_C1368_190116_001 84.817 78.513 44690000 0 0 44690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3903 2192 3636 35114 44889 44889 0 ATEEFIIR Acetyl (Protein N-term) 1019.5288 0.52876073 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2;H3BUK7;H3BNF6;H3BP76;H3BPZ2;H3BNF2;H3BUP3;H3BQE7 MVP Major vault protein yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.27 110.27 2 0.0002037 113405 QUIQUE_C1277_190116_001 157.21 124.37 355520000 27349000 38241000 55556000 50013000 0 37311000 0 34636000 0 24534000 41465000 0 46411000 3904 3086 3637 35115;35116;35117;35118;35119;35120;35121;35122;35123;35124;35125;35126 44890;44891;44892;44893;44894;44895;44896;44897;44898;44899;44900;44901 44892 12 ATEEKKPETEAAR Acetyl (Protein N-term) 1500.742 0.74200098 2733 P61964;V9GYQ5;V9GZ59 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes no 1 0 2 1 1 1 1 11.778 11.778 3 7.8996E-08 4126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 96.102 72921000 0 0 0 0 0 0 0 0 10801000 0 23954000 28325000 9841400 3905 2733 3638 35127;35128;35129;35130 44902;44903;44904;44905 44902 1 ATEGLHENETLASLK Acetyl (Protein N-term) 1653.821 0.82097959 1173 H0YNW7;Q96F32 GNB5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.041 80.041 2 9.8435E-112 81119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 249.66 205.34 2126000000 167530000 197490000 173020000 167320000 164380000 158790000 173240000 201560000 157470000 0 202140000 178690000 184370000 3906 1173 3639 35131;35132;35133;35134;35135;35136;35137;35138;35139;35140;35141;35142 44906;44907;44908;44909;44910;44911;44912;44913;44914;44915;44916;44917;44918 44915 13 ATEGMILTNHDHQIR Acetyl (Protein N-term) 1776.8577 0.85771622 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;G3V4R0;G3V355;G3V4D2 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 1 0 0 1 1 1 62.458 62.458 3 0.0012859 61642 QUIQUE_C1277_190116_001 77.204 67.674 263950000 85412000 101260000 0 0 0 0 0 0 77277000 0 0 0 0 3907 998 3640 35143;35144;35145 44919;44920;44921 44920 0 ATEGMVVADK Unmodified 1019.4957 0.49574604 3952 Q99436;Q5TBG5 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.285 22.285 2 0.0016837 15533 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.692 71.263 1301200000 0 0 152200000 143080000 134170000 130850000 115670000 104800000 129450000 46305000 155590000 0 189110000 3908 3952 3641 35146;35147;35148;35149;35150;35151;35152;35153;35154;35155 44922;44923;44924;44925;44926;44927;44928;44929;44930;44931;44932 44930 11 ATEGMVVADKNCSK Unmodified 1508.6963 0.69631312 3952 Q99436;Q5TBG5 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 15.828 15.828 2;3 1.3257E-27 8548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.67 144.54 233220000 0 0 0 0 0 0 0 84239000 31119000 0 68912000 48952000 0 3909 3952 3642 35156;35157;35158;35159;35160;35161;35162;35163 44933;44934;44935;44936;44937;44938;44939;44940;44941 44935 9 ATEHLSTLSEK Unmodified 1214.6143 0.61428128 1821 P02647;F8W696 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 2 2 17.178 17.178 2;3 1.8345E-84 9750 QUIQUE_C1438_190116_001 241.13 170.87 4308800000 0 161780000 138050000 499470000 1501800000 351000000 131900000 0 437490000 99935000 534160000 453150000 0 3910 1821 3643 35164;35165;35166;35167;35168;35169;35170;35171;35172;35173;35174;35175;35176;35177;35178 44942;44943;44944;44945;44946;44947;44948;44949;44950;44951;44952;44953;44954;44955;44956;44957;44958 44946 14 ATEILNLLLK Unmodified 1126.6962 0.69616041 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.39 130.39 2 0.00019641 135857 QUIQUE_C1576_190116_001 119.27 94.352 965140000 101570000 109590000 77405000 72804000 0 0 83542000 100210000 69250000 50912000 95149000 95759000 108950000 3911 1568 3644 35179;35180;35181;35182;35183;35184;35185;35186;35187;35188;35189 44959;44960;44961;44962;44963;44964;44965;44966;44967;44968;44969;44970;44971;44972 44965 12 ATELEYESVLCVKPDVSVYR Acetyl (Protein N-term) 2398.1726 0.17262758 387 F5GYH1;A0A1W2PRM0;A0A1W2PRL5;A0A1W2PR09;Q8NC96;A0A1W2PR27;A0A1W2PPF5;A0A1W2PRQ7;A0A1W2PNT6 NECAP1 Adaptin ear-binding coat-associated protein 1 yes no 1 0 1 1 2 2 1 2 1 1 141.45 141.45 2;3 2.5821E-38 145557 QUIQUE_C1403_190116_001 152.99 133.15 223240000 38964000 85003000 0 32822000 0 0 29441000 0 0 0 0 37014000 0 3912 387 3645 35190;35191;35192;35193;35194;35195;35196;35197;35198;35199 44973;44974;44975;44976;44977;44978;44979;44980;44981;44982 44977 9 ATELKLEATQDMTPSSK Oxidation (M) 1864.9088 0.90880832 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 1 2 36.062 36.062 2;3 1.6687E-36 31590 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.04 148.27 76856000 0 0 0 0 0 0 0 76856000 0 0 0 0 0 3913 2009 3646 35200;35201 44983;44984 44984 1292 2 ATELKLEATQDMTPSSK Unmodified 1848.9139 0.91389369 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 54.296 54.296 3 0.00017307 52110 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.419 77.042 58874000 0 0 0 0 0 0 0 58874000 0 0 0 0 0 3914 2009 3646 35202 44985 44985 1 ATEMLIFGK Unmodified 1008.5314 0.53140327 236 A0A0C4DGA2;O75521 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.673 84.673 2 0.0017546 84950 QUIQUE_C1563_190116_001 100.45 83.675 716030000 103040000 0 0 0 68306000 67471000 0 65667000 86586000 30740000 106420000 83798000 104000000 3915 236 3647 35203;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211 44986;44987;44988;44989;44990;44991;44992;44993;44994 44988 6 ATENDIANFFSPLNPIR Unmodified 1917.9585 0.95847612 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 151.92 151.92 2;3 6.7709E-76 156962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.18 131.69 7320700000 496900000 498910000 574200000 432310000 653490000 501500000 539390000 596730000 692270000 198140000 800060000 758730000 578110000 3916 2340 3648 35212;35213;35214;35215;35216;35217;35218;35219;35220;35221;35222;35223;35224;35225;35226;35227;35228;35229 44995;44996;44997;44998;44999;45000;45001;45002;45003;45004;45005;45006;45007;45008;45009;45010;45011;45012;45013;45014;45015;45016;45017;45018;45019;45020;45021;45022;45023;45024;45025 45011 30 ATENDIYNFFSPLNPMR Unmodified 2027.9411 0.9411115 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 156.68 156.68 2;3 1.812E-75 159356 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.7 140.41 3187900000 323360000 294910000 305460000 220270000 216200000 177920000 247760000 247410000 221670000 46630000 410360000 286940000 188990000 3917 2672 3649 35230;35231;35232;35233;35234;35235;35236;35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;35247;35248;35249;35250;35251;35252;35253;35254 45026;45027;45028;45029;45030;45031;45032;45033;45034;45035;45036;45037;45038;45039;45040;45041;45042;45043;45044;45045;45046;45047;45048;45049;45050;45051;45052;45053;45054;45055;45056;45057;45058 45046 33 ATENDIYNFFSPLNPMR Oxidation (M) 2043.936 0.93602612 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.98 145.98 2 6.791E-05 148778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.756 82.194 528540000 0 63482000 17013000 45098000 0 48012000 33871000 53304000 52017000 35994000 69738000 47886000 62126000 3918 2672 3649 35255;35256;35257;35258;35259;35260;35261;35262;35263;35264;35265;35266;35267 45059;45060;45061;45062;45063;45064;45065;45066;45067;45068;45069;45070;45071;45072;45073 45067 2112 14 ATENDIYNFFSPLNPVR Unmodified 1995.969 0.96904081 2609;905 P52597;E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7 HNRNPF;HNRNPH1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 1 2 152.5 152.5 2;3 1.5286E-88 158151 QUIQUE_C1368_190116_001 257.95 235.23 8027800000 646280000 795610000 749820000 651320000 708770000 632210000 477530000 621630000 727880000 235280000 763030000 428940000 589450000 3919 2609;905 3650 35268;35269;35270;35271;35272;35273;35274;35275;35276;35277;35278;35279;35280;35281;35282;35283;35284;35285;35286;35287;35288;35289;35290;35291;35292 45074;45075;45076;45077;45078;45079;45080;45081;45082;45083;45084;45085;45086;45087;45088;45089;45090;45091;45092;45093;45094;45095;45096;45097;45098;45099;45100;45101;45102;45103;45104;45105;45106;45107;45108;45109;45110 45083 35 ATENTVNPCPDDTLISFLPLAHMFER Unmodified 2987.4157 0.41572817 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;D6RER0 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.96 166.96 3 8.5913E-20 170055 QUIQUE_C1403_190116_001 103.53 97.651 178570000 0 43200000 0 58072000 22393000 0 54909000 0 0 0 0 0 0 3920 2354 3651 35293;35294;35295;35296 45111;45112;45113;45114 45112 4 ATEPVIAFYEK Unmodified 1266.6496 0.64960415 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 2 82.76 82.76 1;2 1.4315E-15 79869 QUIQUE_DMIX4_190116_001 183.67 139.87 8658300000 0 0 0 0 7627300000 0 165840000 0 0 865100000 0 0 0 3921 1791 3652 35297;35298;35299;35300 45115;45116;45117;45118;45119 45119 3 ATEPVIAFYEKR Unmodified 1422.7507 0.75071518 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 63.986 63.986 2;3 4.7438E-07 64024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.11 125.11 799700000 0 0 0 0 0 0 0 319140000 177260000 0 72780000 142980000 87544000 3922 1791 3653 35301;35302;35303;35304;35305;35306;35307;35308;35309 45120;45121;45122;45123;45124;45125;45126;45127;45128;45129;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136;45137 45125 18 ATEQYYAMK Unmodified 1103.4957 0.49574604 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.137 32.137 2 0.0016745 26955 QUIQUE_C1277_190116_001 101.28 83.59 815480000 121620000 160890000 112680000 100660000 0 0 94755000 95404000 91886000 37595000 0 0 0 3923 167 3654 35310;35311;35312;35313;35314;35315;35316;35317 45138;45139;45140;45141;45142;45143;45144;45145;45146 45140 7 ATESGAQSAPLPMEGVDISPK Unmodified 2084.0096 0.0095849934 2876 Q02790;F5H120 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.248 92.248 2 1.1559E-08 94428 QUIQUE_C1368_190116_001 131.24 115.65 917700000 65391000 93412000 67198000 94179000 58835000 62680000 81570000 70157000 59733000 25210000 86693000 72160000 80484000 3924 2876 3655 35318;35319;35320;35321;35322;35323;35324;35325;35326;35327;35328;35329;35330 45147;45148;45149;45150;45151;45152;45153;45154;45155;45156;45157;45158;45159;45160;45161 45149 14 ATESGAQSAPLPMEGVDISPK Oxidation (M) 2100.0045 0.0044996155 2876 Q02790;F5H120 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.323 71.323 2 6.6834E-19 72538 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ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNDIYQWCGSSSNR Unmodified 4036.7632 0.76323007 788 CON__Q3SX14 yes yes 0 0 0 1 164.97 164.97 3 1.0531E-07 172308 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.033 51.686 100840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100840000 0 0 + 3928 788 3658 35349 45180 45180 1 ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNR Unmodified 4036.7857 0.78569685 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 161.08 161.08 3 3.5789E-257 163363 QUIQUE_DMIX1_190116_001 241.41 238.29 1668900000 30562000 0 82629000 64362000 93639000 32772000 141520000 179520000 285970000 13483000 220350000 338690000 185430000 3929 166;3305;311 3659 35350;35351;35352;35353;35354;35355;35356;35357;35358;35359;35360;35361;35362 45181;45182;45183;45184;45185;45186;45187;45188;45189;45190;45191;45192;45193;45194 45188 14 ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYER Unmodified 4484.9927 0.99272951 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 1 1 153.65 153.65 4 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35411;35412;35413;35414;35415;35416;35417;35418;35419;35420;35421;35422;35423 45258;45259;45260;45261;45262;45263;45264;45265;45266;45267;45268;45269;45270;45271;45272 45270 15 ATFMVGSYGPRPEEYEFLTPVEEAPK Oxidation (M) 2959.395 0.39497595 2607 P52566;H0YGX7 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 1 1 1 127.08 127.08 3 2.3201E-07 129767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.814 54.381 59073000 0 0 0 0 0 0 0 59073000 0 0 0 0 0 3937 2607 3666 35424 45273 45273 2067 1 ATFQTPDFIVPLTDLR Unmodified 1832.9672 0.96724989 1854 P04114 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes yes 0 0 0 1 1 151.08 151.08 2 0.0019938 153515 QUIQUE_C1563_190116_001 64.121 44.99 30345000 0 0 0 0 0 21735000 0 0 0 8610000 0 0 0 3938 1854 3667 35425;35426 45274;45275;45276 45274 3 ATFSEFAAK Unmodified 970.476 0.47599688 1445 O14776;G3V220 TCERG1 Transcription elongation regulator 1 yes no 0 0 0 1 47.24 47.24 2 0.052818 44728 QUIQUE_C1368_190116_001 49.96 30.446 35349000 0 0 35349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3939 1445 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35443;35444;35445;35446;35447;35448;35449 45307;45308;45309;45310;45311;45312;45313;45314;45315 45310 9 ATFSSVPLAASISAVSLEVAQPGPSNRPR Unmodified 2908.5407 0.54066941 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 134.34 134.34 3 1.7447E-14 140935 QUIQUE_C1438_190116_001 78.991 69.28 192990000 0 40592000 59027000 0 93376000 0 0 0 0 0 0 0 0 3942 2834 3671 35450;35451;35452 45316;45317;45318 45318 1 ATFYLLIGNANAAKPDLDK Unmodified 2034.0786 0.078591257 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 107.68 107.68 2;3 1.1406E-05 112707 QUIQUE_C1218_190116_001 119.32 87.676 775880000 106740000 0 36543000 0 0 0 42468000 0 45316000 69646000 312010000 0 163160000 3943 1689 3672 35453;35454;35455;35456;35457;35458;35459;35460;35461;35462 45319;45320;45321;45322;45323;45324;45325;45326;45327;45328;45329;45330 45321 11 ATFYLNVLEQK Unmodified 1324.7027 0.70270235 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.82 108.82 2 0.0056344 106223 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.974 60.187 340740000 34197000 43876000 31986000 29267000 37718000 0 45112000 41426000 0 15279000 0 61882000 0 3944 4645 3673 35463;35464;35465;35466;35467;35468;35469;35470;35471 45331;45332;45333;45334;45335;45336;45337;45338;45339;45340 45338 9 ATFYLNVLQQR Unmodified 1351.7248 0.72483478 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 1 107.21 107.21 2 0.013011 111713 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.621 42.591 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3945 4396 3674 35472;35473 45341;45342 45342 2 ATGEADVEFVTHEDAVAAMSK Unmodified 2176.9947 0.99466321 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.288 92.288 3 9.7578E-11 94492 QUIQUE_C1368_190116_001 93.73 51.607 313860000 0 56964000 53087000 0 37255000 0 0 32271000 49696000 29093000 0 0 55497000 3946 2340 3675 35474;35475;35476;35477;35478;35479;35480 45343;45344;45345;45346;45347;45348;45349;45350;45351;45352 45346 10 ATGEADVEFVTHEDAVAAMSK Oxidation (M) 2192.9896 0.98957783 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 1 0 1 75.72 75.72 3 3.3753E-05 71551 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.227 55.332 22741000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22741000 0 0 0 3947 2340 3675 35481 45353 45353 1740 1 ATGEESTQAEISCESPFLAK Unmodified 2153.9787 0.9786788 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.148 88.148 2 1.7356E-101 89940 QUIQUE_C1277_190116_001 250.52 240.4 482670000 106810000 83168000 0 75138000 65850000 96327000 0 0 0 0 0 0 55379000 3948 2009 3676 35482;35483;35484;35485;35486;35487 45354;45355;45356;45357;45358;45359;45360;45361 45355 7 ATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMR Unmodified 3291.5044 0.50436026 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 139.37 139.37 5 6.1632E-05 143976 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.555 39.55 68222000 0 0 0 0 0 0 0 0 34740000 0 0 33482000 0 3949 3003 3677 35488;35489 45362;45363 45363 1 ATGGPYGSLGVDYEFEK Unmodified 1788.8206 0.82064524 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.68 101.68 2 3.7217E-30 104300 QUIQUE_C1277_190116_001 154.23 137.1 726980000 107980000 114200000 95668000 67431000 56059000 64048000 83584000 42640000 0 0 55335000 0 40041000 3950 335;1521 3678 35490;35491;35492;35493;35494;35495;35496;35497;35498;35499;35500 45364;45365;45366;45367;45368;45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375;45376;45377 45366 13 ATGILLYGLASR Unmodified 1233.7081 0.70812208 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQU2;A0A0U1RQL2;F2Z2V6 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.59 104.59 2 0.00094349 107218 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.43 78.875 463370000 33110000 0 47842000 36639000 43546000 28357000 30227000 42458000 55182000 17286000 71139000 0 57585000 3951 2496 3679 35501;35502;35503;35504;35505;35506;35507;35508;35509;35510;35511 45378;45379;45380;45381;45382;45383;45384;45385;45386;45387;45388 45388 11 ATGMFLQYTVPGTEGVTQLK Unmodified 2140.0874 0.087441384 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 128.94 128.94 2 1.0104E-37 133494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 205.3 191.33 276670000 0 0 0 0 0 0 0 59871000 50366000 0 55025000 61509000 49896000 3952 3988 3680 35512;35513;35514;35515;35516 45389;45390;45391;45392;45393 45390 5 ATGPAAPPPR Unmodified 933.50321 0.50321468 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 13.774 13.774 2 4.5271E-05 5755 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.89 123.23 25418000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25418000 0 0 0 3953 16;1475 3681 35517 45394;45395;45396;45397 45395 4 ATGPAPGPTGER Unmodified 1109.5465 0.54653606 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.013 15.013 2 0.0010478 7028 QUIQUE_C1438_190116_001 83.862 65.086 1161200000 433280000 0 255730000 0 265210000 0 206980000 0 0 0 0 0 0 3954 3889 3682 35518;35519;35520;35521 45398;45399;45400;45401 45400 4 ATGPAPGPTGEREPAAGPGR Unmodified 1844.9129 0.91292291 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 21.399 21.399 2;3 7.178E-38 14579 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.13 123.34 2414000000 280930000 42789000 175800000 289050000 299210000 202820000 169070000 234850000 155120000 57757000 0 184520000 322120000 3955 3889 3683 35522;35523;35524;35525;35526;35527;35528;35529;35530;35531;35532;35533;35534;35535;35536;35537;35538;35539;35540 45402;45403;45404;45405;45406;45407;45408;45409;45410;45411;45412;45413;45414;45415;45416;45417;45418;45419;45420;45421;45422;45423;45424;45425;45426;45427 45421 25 ATGPLEAQALVK Unmodified 1196.6765 0.6764876 3398 Q6PL24 TMED8 Protein TMED8 yes yes 0 0 0 1 60.752 60.752 2 0.00075829 60888 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.681 67.81 37334000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37334000 0 0 3956 3398 3684 35541 45428 45428 1 ATGQSFSQGTTSR Unmodified 1326.6164 0.61640654 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.126 17.126 2 1.0022E-23 9329 QUIQUE_C1563_190116_001 174.4 154.64 1126100000 0 0 90438000 126270000 97832000 119550000 92922000 107550000 135160000 0 103590000 82671000 170140000 3957 855 3685 35542;35543;35544;35545;35546;35547;35548;35549;35550;35551 45429;45430;45431;45432;45433;45434;45435;45436;45437;45438 45432 7 ATGQSHKPVPPTQVQK Unmodified 1701.9162 0.91621738 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 10.359 10.359 3;4 2.6308E-38 2637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 137.32 115.48 273890000 26524000 143940000 0 17034000 19764000 0 10634000 0 13873000 5484900 0 19674000 16961000 3958 981;1154;4494 3686 35552;35553;35554;35555;35556;35557;35558;35559;35560;35561;35562 45439;45440;45441;45442;45443;45444;45445;45446;45447;45448;45449 45448 10 ATGVNVNISDLK Unmodified 1229.6616 0.66156582 1291 J3KTA9;J3QQN7;Q8N9F7 GDPD1 Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 69.052 69.052 2 0.010257 68715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.342 28.964 66773000 0 0 0 0 0 38249000 0 28524000 0 0 0 0 0 3959 1291 3687 35563;35564 45450;45451 45451 1 ATGYLELSNWPEVAPDPSVR Unmodified 2200.08 0.08004782 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 136.77 136.77 2 0.0048482 139311 QUIQUE_C1563_190116_001 68.513 55.746 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3960 1386 3688 35565;35566 45452;45453 45453 2 ATGYQELPDWPEEAPDPSVR Unmodified 2256.0335 0.033491558 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.05 116.05 2 6.9537E-06 119845 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.943 85.743 506310000 52498000 56325000 58117000 44092000 59111000 56338000 35906000 49193000 0 0 0 38432000 56300000 3961 2990 3689 35567;35568;35569;35570;35571;35572;35573;35574;35575;35576 45454;45455;45456;45457;45458;45459;45460;45461;45462;45463;45464 45464 11 ATIAGGGVIPHIHK Unmodified 1369.783 0.78301836 1979 Q71UI9;P0C0S5 H2AFV;H2AFZ Histone H2A.V;Histone H2A.Z yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.547 36.547 3 0.00086881 32152 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.76 52.547 431550000 86625000 104030000 0 0 0 0 0 69538000 105240000 0 0 66116000 0 3962 1979 3690 35577;35578;35579;35580;35581 45465;45466;45467;45468;45469 45468 4 ATIEGYYQK Unmodified 1071.5237 0.52367535 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.193 36.193 2 0.013967 31382 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.198 51.35 767850000 0 0 0 0 0 100640000 104740000 106300000 121410000 66357000 126270000 0 142140000 3963 1728 3691 35582;35583;35584;35585;35586;35587;35588 45470;45471;45472;45473;45474;45475;45476 45476 7 ATIELCSTHANDASALR Unmodified 1828.8738 0.87376021 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 51.849 51.849 2;3 5.3965E-17 49761 QUIQUE_C1277_190116_001 105.39 94.731 642690000 81969000 106560000 55462000 93856000 0 0 80667000 48899000 0 40812000 58192000 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35609;35610;35611;35612;35613;35614;35615;35616;35617;35618;35619;35620 45497;45498;45499;45500;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508 45499 12 ATIGLIR Unmodified 742.47012 0.47012364 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 0 0 1 43.651 43.651 2 0.056495 38283 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.378 5.4805 17548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17548000 0 0 0 3967 2084 3695 35621 45509 45509 1 ATILCTSYVQFK Unmodified 1429.7275 0.72753689 2373 P35244;B5MC59 RPA3 Replication protein A 14 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 95.653 95.653 2 0.0040231 93124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.399 58.909 240820000 0 0 0 0 0 44707000 0 30349000 0 23377000 84486000 0 57899000 3968 2373 3696 35622;35623;35624;35625;35626 45510;45511;45512;45513;45514 45512 3 ATILYATETGK Unmodified 1166.6183 0.61830402 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 44.98 44.98 2 0.0012887 41637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.149 67.362 39001000 0 0 0 0 0 0 0 39001000 0 0 0 0 0 3969 699 3697 35627;35628;35629;35630 45515;45516;45517;45518 45517 4 ATIQGVLR Unmodified 856.51305 0.51305109 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.68 38.68 2 0.0040378 35586 QUIQUE_C1218_190116_001 110.61 69.691 1634400000 154930000 189400000 0 170160000 167170000 130940000 169360000 0 172960000 55497000 217240000 206700000 0 3970 1749 3698 35631;35632;35633;35634;35635;35636;35637;35638;35639;35640 45519;45520;45521;45522;45523;45524;45525;45526;45527;45528;45529;45530;45531 45519 9 ATIRPVFDPSK Unmodified 1229.6768 0.67682195 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 42.002 42.002 3 0.032808 36452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.383 19.602 44882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44882000 0 0 0 3971 3061 3699 35641 45532 45532 1 ATISALEAK Unmodified 902.5073 0.50729701 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 31.64 31.64 2 0.026913 25856 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.23 25.418 117120000 0 86600000 0 0 0 0 0 0 0 30520000 0 0 0 3972 2379 3700 35642;35643 45533;45534 45534 1 ATISNDGATILK Unmodified 1202.6507 0.65066678 3977 Q99832;F8WAM2 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.387 48.387 2 4.0176E-07 46752 QUIQUE_C1218_190116_001 145.25 94.641 4847200000 294880000 374050000 453790000 335640000 404600000 335360000 437110000 283170000 342920000 150580000 515730000 399180000 520240000 3973 3977 3701 35644;35645;35646;35647;35648;35649;35650;35651;35652;35653;35654;35655;35656 45535;45536;45537;45538;45539;45540;45541;45542;45543;45544;45545;45546;45547;45548 45535 11 ATITCTR Acetyl (Protein N-term) 863.4171 0.41710179 4533 Q9UQM7;D6RFJ0 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes no 1 0 0 1 1 1 34.223 34.223 2 0.033329 29608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.715 48.678 346630000 0 0 0 0 346630000 0 0 0 0 0 0 0 0 3974 4533 3702 35657;35658;35659 45549;45550;45551 45551 2 ATIVSLEDFEQR Unmodified 1406.7042 0.70415892 544 A6NIZ0;Q9GZM8;J3KRK9;J3QL85 NDEL1 Nuclear distribution protein nudE-like 1 yes no 0 0 0 1 106 106 2 0.04706 109797 QUIQUE_C1218_190116_001 54.471 37.24 26009000 26009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3975 544 3703 35660 45552 45552 1 ATLADIVEQLQEK Unmodified 1456.7773 0.77732386 754 C9JY79;Q9H254 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.08 140.08 2 0.010241 145440 QUIQUE_C1368_190116_001 63.944 37.898 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3976 754 3704 35661;35662;35663;35664 45553;45554;45555;45556 45554 4 ATLELTHNWGTEDDETQSYHNGNSDPR Unmodified 3086.3238 0.32381293 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 67.868 67.868 3;4 7.8296E-19 68378 QUIQUE_C1438_190116_001 89.829 83.031 733750000 39097000 71451000 0 44044000 180880000 0 57988000 36110000 0 193780000 65327000 45077000 0 3977 2888 3705 35665;35666;35667;35668;35669;35670;35671;35672;35673;35674;35675;35676;35677 45557;45558;45559;45560;45561;45562;45563;45564;45565;45566;45567;45568;45569;45570;45571 45563 15 ATLEMVNHEK Unmodified 1170.5703 0.57030797 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 19.712 19.712 2;3 0.0023157 12581 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.478 64.553 5492000000 575940000 1254600000 296510000 368180000 414140000 377180000 753470000 219060000 300970000 147290000 0 514530000 270100000 3978 869 3706 35678;35679;35680;35681;35682;35683;35684;35685;35686;35687;35688;35689;35690;35691;35692 45572;45573;45574;45575;45576;45577;45578;45579;45580;45581;45582;45583;45584;45585;45586 45583 4 ATLEMVNHEK Oxidation (M) 1186.5652 0.56522259 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 1 0 1 12.222 12.222 3 0.0067168 4467 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.359 44.146 2149200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2149200 0 0 0 3979 869 3706 35693 45587 45587 517 1 ATLENITNLRPVGEDFR Unmodified 1944.0065 0.0064889465 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 99.397 99.397 2;3 6.6317E-11 103513 QUIQUE_C1438_190116_001 120.66 112.01 3975900000 313860000 0 387440000 381620000 322550000 261530000 331000000 370870000 492200000 115720000 358010000 360880000 280160000 3980 4315 3707 35694;35695;35696;35697;35698;35699;35700;35701;35702;35703;35704;35705;35706;35707;35708;35709;35710;35711;35712 45588;45589;45590;45591;45592;45593;45594;45595;45596;45597;45598;45599;45600;45601;45602;45603;45604;45605;45606;45607;45608;45609;45610 45594 23 ATLITITNNIGSIAR Unmodified 1556.8886 0.88860564 461 A0A2R8YF29;Q9BZ23;V9GYH1 PANK2 Pantothenate kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 113.89 113.89 2 0.012035 117048 QUIQUE_C1403_190116_001 52.344 45.96 18842000 0 0 0 18842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3981 461 3708 35713 45611 45611 1 ATLKDQLIYNLLK Acetyl (Protein N-term) 1573.9079 0.9079441 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8;F5GZQ4;F5H8H6;F5GXC7;F5GWW2;F5GXU1 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 147.77 147.77 2 1.5746E-09 150864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.01 106.86 5454100000 0 0 0 0 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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 132.04 132.04 2 0.0080661 137115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.674 34.688 102010000 0 0 56562000 0 0 0 0 0 45451000 0 0 0 0 3985 3118 3712 35727;35728 45626;45627 45627 2 ATLPDADKER Unmodified 1114.5619 0.56185177 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.972 15.972 3 0.0005155 8792 QUIQUE_C1218_190116_001 90.827 69.363 935040000 144340000 173910000 98803000 123910000 163590000 0 133960000 0 0 0 96533000 0 0 3986 1242;2047 3713 35729;35730;35731;35732;35733;35734;35735 45628;45629;45630;45631;45632;45633;45634;45635;45636 45628 8 ATLPSPDK Unmodified 827.43888 0.43888309 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 20.14 20.14 2 0.056538 12762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.984 53.437 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3987 2197 3714 35736 45637 45637 1 ATLPSPDKLPGFK Unmodified 1369.7606 0.76055158 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 3 3 2 3 2 2 74.966 74.966 2;3 0.00071134 76069 QUIQUE_C1277_190116_001 64.224 58.038 3540200000 208320000 233140000 65814000 205980000 318700000 170050000 240850000 456290000 422800000 152270000 461480000 306540000 297980000 3988 2197 3715 35737;35738;35739;35740;35741;35742;35743;35744;35745;35746;35747;35748;35749;35750;35751;35752;35753;35754;35755;35756;35757;35758;35759;35760;35761;35762;35763 45638;45639;45640;45641;45642;45643;45644;45645;45646;45647;45648;45649;45650;45651;45652;45653;45654;45655;45656;45657;45658;45659;45660;45661;45662;45663;45664;45665;45666;45667;45668;45669;45670;45671;45672;45673;45674;45675;45676;45677;45678;45679;45680;45681;45682;45683;45684;45685;45686 45642 48 ATLPVFDKEELLECIQQLVK Unmodified 2372.2661 0.26613403 2644 P54687;F5H2F2;A0A087WYF2 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 162.73 162.73 2;3 2.4508E-22 166728 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63.885 63.885 2 0.003669 63304 QUIQUE_C1277_190116_001 124.83 37.551 1635000000 168920000 173670000 117150000 93269000 148000000 98575000 142990000 97470000 118470000 0 178180000 143760000 154590000 3991 981;4494;1236 3718 35781;35782;35783;35784;35785;35786;35787;35788;35789;35790;35791;35792 45705;45706;45707;45708;45709;45710;45711;45712;45713;45714;45715;45716;45717;45718;45719 45707 14 ATLSSTSGLDLMSESGEGEISPQR Unmodified 2451.1435 0.14351229 193 A0A0A0MTE2;E9PMT2;F8WD26;J3KP06;Q8WWI1;H0Y424;E9PMS6;E9PMP7;H0YDG6 LMO7 LIM domain only protein 7 yes no 0 0 0 1 46.918 46.918 3 0.060156 44010 QUIQUE_C1403_190116_001 19.549 2.7972 29536000 0 0 0 29536000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3992 193 3719 35793 45720 45720 1 ATLTDLVPGTEYGVGISAVMNSQQSVPATMNAR Unmodified 3377.6595 0.65954027 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 151.91 151.91 3 2.0363E-40 154902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.91 91.652 134620000 0 0 0 0 0 0 0 47807000 37676000 0 0 49142000 0 3993 3753 3720 35794;35795;35796 45721;45722;45723 45721 3 ATLTLAMADWLR Unmodified 1360.7173 0.71730656 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 142.28 142.28 2 0.00060022 145592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.86 78.749 104050000 0 0 0 0 0 0 0 29934000 38557000 0 0 0 35554000 3994 16;1475 3721 35797;35798;35799;35800;35801;35802;35803 45724;45725;45726;45727;45728;45729;45730 45727 7 ATLTQMLNVIFAR Unmodified 1476.8123 0.81226958 4652 Q9Y6D6 ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 164.6 164.6 2 0.0037285 168977 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.31 64.331 73826000 0 0 0 0 0 0 0 8189500 13271000 0 17532000 15891000 18944000 3995 4652 3722 35804;35805;35806;35807;35808 45731;45732;45733;45734;45735 45735 3 ATLTQMLNVIFTR Unmodified 1506.8228 0.82283426 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 162.35 162.35 2 0.00043246 166301 QUIQUE_C1277_190116_001 91.936 74.072 121170000 12454000 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45772;45773;45774;45775;45776;45777;45778;45779;45780;45781;45782;45783;45784;45785;45786;45787;45788;45789;45790;45791;45792;45793;45794;45795;45796;45797;45798;45799 45772 25 ATLYVTAIEDR Unmodified 1250.6507 0.65066678 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6;H0YDE4;E9PNR9 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.911 76.911 2 0.00046475 76948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.16 92.442 213060000 0 110940000 0 0 0 0 0 102120000 0 0 0 0 0 4001 953 3728 35857;35858;35859;35860;35861;35862 45800;45801;45802;45803;45804;45805;45806 45805 7 ATMCNLLAYLK Unmodified 1296.657 0.65701449 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 128.3 128.3 2 0.0008802 134442 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.551 73.764 130710000 0 0 38882000 0 0 0 18541000 19153000 0 0 54133000 0 0 4002 119 3729 35863;35864;35865;35866 45807;45808;45809;45810 45810 4 ATMILTVGGTAYAIYELAVASFPK Oxidation (M) 2502.308 0.30799885 1109 H0UI06;P14406;D6R9C3 COX7A2 Cytochrome c oxidase subunit 7A2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 174.38 174.38 3 0.00027734 178008 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.061 44.947 17201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17201000 0 4003 1109 3730 35867 45811 45811 646 0 ATMYNLLAYIK Oxidation (M) 1315.6846 0.68460945 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 1 0 1 1 116.71 116.71 2 0.026915 122432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.735 49.631 33667000 0 0 33667000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4004 1452 3731 35868;35869 45812;45813 45813 2 ATMYNLLAYIK Unmodified 1299.6897 0.68969482 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 136.22 136.22 2 0.0035971 140526 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.069 78.492 618320000 0 0 0 0 55573000 26064000 0 87862000 91579000 0 305890000 51353000 0 4005 1452 3731 35870;35871;35872;35873;35874;35875 45814;45815;45816;45817;45818;45819 45819 6 ATNDEIFSILK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 1 114.06 114.06 2 0.026172 118104 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.79 35.693 37702000 0 0 0 0 0 0 0 0 37702000 0 0 0 0 4006 2934 3732 35876 45820 45820 1 ATNFLAHEK Acetyl (Protein N-term) 1071.5349 0.53490874 2291;958 E9PL71;E9PN91;E9PKK3;E9PNW6;E9PJD0;P29692;E9PQZ1;E9PK01;E9PPR1;E9PL12;E9PQ49;E9PI39;E9PMW7;E9PK06;E9PK72 EEF1D Elongation factor 1-delta no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.259 57.259 2 0.00029495 55906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.61 89.115 3101500000 233280000 248920000 0 341830000 309360000 247560000 224110000 300280000 337240000 119340000 333380000 0 406150000 4007 958;2291 3733 35877;35878;35879;35880;35881;35882;35883;35884;35885;35886;35887;35888 45821;45822;45823;45824;45825;45826;45827;45828;45829;45830;45831;45832;45833;45834;45835;45836 45833 15 ATNIEQIFR Acetyl (Protein N-term) 1132.5877 0.58767259 2138 P18583;J3QSZ5 SON Protein SON yes no 1 0 0 1 1 136.21 136.21 2 0.018629 142490 QUIQUE_C1438_190116_001 60.91 46.753 13085000 0 0 0 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45890;45891;45892;45893;45894;45895;45896;45897;45898 45891 7 ATNWGSLLQDK Acetyl (Protein N-term) 1273.6303 0.63026569 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7;A0A2R8Y2F2 GSS Glutathione synthetase yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 135.25 135.25 1;2 0.00057026 141128 QUIQUE_C1218_190116_001 111.61 75.211 816280000 88519000 116540000 0 83143000 0 103020000 88523000 0 0 58918000 146690000 0 130930000 4016 2513 3741 35937;35938;35939;35940;35941;35942;35943;35944;35945;35946;35947 45899;45900;45901;45902;45903;45904;45905;45906;45907;45908;45909;45910 45899 9 ATNWGSLLQDKQQLEELAR Acetyl (Protein N-term) 2241.139 0.13895968 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7;A0A2R8Y2F2 GSS Glutathione synthetase yes no 1 0 1 1 148.37 148.37 2 6.1678E-100 151159 QUIQUE_DMIX1_190116_001 212.87 191.92 53942000 0 0 0 0 0 0 0 53942000 0 0 0 0 0 4017 2513 3742 35948 45911 45911 1 ATPATAPGTSPR Unmodified 1125.5778 0.57783619 3913 Q96P47;H0Y873 AGAP3 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.677 15.677 2 0.0020815 7960 QUIQUE_C1218_190116_001 93.096 72.225 44675000 24452000 0 0 0 0 0 0 20223000 0 0 0 0 0 4018 3913 3743 35949;35950;35951;35952;35953 45912;45913;45914;45915;45916 45912 5 ATPATEESTVPTTQSSAMLATK Unmodified 2221.0784 0.07839284 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.734 66.734 2 5.427E-08 66377 QUIQUE_C1277_190116_001 125.75 111.5 265290000 41110000 37723000 49669000 50991000 34122000 23362000 0 28317000 0 0 0 0 0 4019 872;3632 3744 35954;35955;35956;35957;35958;35959;35960 45917;45918;45919;45920;45921;45922;45923 45918 7 ATPEQYQILK Unmodified 1189.6343 0.63428844 2073 P14324;A0A087X090 FDPS Farnesyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.817 53.817 2 0.001716 51307 QUIQUE_C1563_190116_001 94.302 67.918 3958800000 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4052 3747 35977;35978;35979;35980;35981;35982;35983;35984;35985;35986;35987;35988 45942;45943;45944;45945;45946;45947;45948;45949;45950;45951;45952;45953;45954;45955 45951 14 ATPMPSRPSTTPFIDK Unmodified 1744.8818 0.8818057 880;1058 E7EVA0;P27816;B5MEG9;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 57.437 57.437 2 1.4745E-18 55044 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.96 124.11 224410000 0 0 0 0 27109000 0 0 36293000 50685000 0 37164000 0 73160000 4023 880;1058 3748 35989;35990;35991;35992;35993 45956;45957;45958;45959;45960 45960 5 ATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLK Unmodified 3814.8036 0.80362155 4142 Q9H299 SH3BGRL3 SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 173.54 173.54 3 1.1576E-15 177777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.625 72.078 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4024 4142 3749 35994 45961 45961 1 ATPQHTVSFTCESHGFSPR Unmodified 2144.9698 0.96978586 2803 P78324;Q5TFQ8 SIRPA;SIRPB1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3 yes no 0 0 0 2 2 4 3 2 3 2 3 3 2 3 2 4 43.518 43.518 2;3;4 1.7344E-46 40790 QUIQUE_C1438_190116_001 143.39 133.01 4168000000 310100000 470620000 649890000 482370000 349540000 285450000 371970000 0 239540000 138630000 433670000 214830000 221430000 4025 2803 3750 35995;35996;35997;35998;35999;36000;36001;36002;36003;36004;36005;36006;36007;36008;36009;36010;36011;36012;36013;36014;36015;36016;36017;36018;36019;36020;36021;36022;36023;36024;36025;36026;36027;36028;36029 45962;45963;45964;45965;45966;45967;45968;45969;45970;45971;45972;45973;45974;45975;45976;45977;45978;45979;45980;45981;45982;45983;45984;45985;45986;45987;45988;45989;45990;45991;45992;45993;45994;45995;45996;45997;45998;45999;46000;46001;46002;46003;46004;46005;46006 45981 44 ATPSENLVPSSAR Unmodified 1327.6732 0.67319314 3605 Q8N684;F5H669;F5H6M0;F5H047 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 41.68 41.68 2 0.016168 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3756 36043;36044;36045;36046;36047;36048;36049;36050;36051;36052;36053;36054;36055;36056;36057;36058;36059 46022;46023;46024;46025;46026;46027;46028;46029;46030;46031;46032;46033;46034;46035;46036;46037;46038;46039;46040 46025 18 ATQPETTEEVTDLKR Unmodified 1716.853 0.853008 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 35.561 35.561 2;3 0.0013427 31206 QUIQUE_C1277_190116_001 89.548 73.657 141720000 0 18360000 0 0 0 0 0 0 0 0 97373000 25986000 0 4032 515 3757 36060;36061;36062 46041;46042;46043 46041 3 ATQQAEQLSNELATER Unmodified 1787.865 0.86496967 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 65.593 65.593 2 4.7655E-165 64948 QUIQUE_C1277_190116_001 253.42 229.67 117830000 0 62324000 40507000 0 0 0 0 0 0 14995000 0 0 0 4033 2385 3758 36063;36064;36065 46044;46045;46046;46047 46045 4 ATQQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIK Unmodified 3839.853 0.85301458 2202 P22695;H3BRG4 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 3 3 2 169.65 169.65 3 1.4474E-32 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46078;46079;46080;46081;46082;46083;46084;46085;46086;46087;46088;46089;46090;46091;46092;46093;46094;46095;46096;46097;46098;46099;46100;46101;46102;46103;46104;46105;46106;46107;46108 46105 25 ATSEIFHSQSFLATGSNLR Unmodified 2065.0229 0.022867292 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 2 1 87.244 87.244 2;3 1.6025E-36 89208 QUIQUE_C1403_190116_001 189.09 173.89 234050000 0 0 0 20078000 26185000 0 0 0 98610000 0 0 0 89178000 4043 646 3768 36122;36123;36124;36125;36126 46109;46110;46111;46112;46113 46109 5 ATSETLAADPTPAATIVHFK Unmodified 2040.0528 0.052770437 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 85.413 85.413 3 0.012815 88497 QUIQUE_C1438_190116_001 26.742 21.763 196810000 0 0 0 0 63747000 59597000 0 0 0 0 0 0 73468000 4044 422 3769 36127;36128;36129 46114;46115;46116 46114 1 ATSFLLALEPELEAR Unmodified 1658.8879 0.88793694 1868 P04843;F8WF32 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.19 145.19 2 9.3278E-06 151019 QUIQUE_C1218_190116_001 104.07 89.912 561260000 46136000 53721000 40266000 50678000 53854000 39755000 54436000 49698000 70863000 20152000 81700000 0 0 4045 1868 3770 36130;36131;36132;36133;36134;36135;36136;36137;36138;36139;36140 46117;46118;46119;46120;46121;46122;46123;46124;46125;46126;46127 46117 9 ATSHVGEIEQELALAR Unmodified 1722.8901 0.89006221 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 84.762 84.762 2 0.01304 87719 QUIQUE_C1438_190116_001 52.576 44.063 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4046 2322 3771 36141;36142 46128;46129 46128 2 ATSIDPNTYITWIDK Unmodified 1736.8621 0.86211612 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 133.08 133.08 2 0.00047674 139885 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.362 73.617 81357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81357000 0 0 4047 3053 3772 36143 46130 46130 1 ATSISTQLPDDPAK Unmodified 1442.7253 0.72528829 4461 Q9UJW0;E5RGG1;H9KVE0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 56.491 56.491 2 0.00064214 55041 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.24 84.46 407190000 0 0 94324000 0 0 0 0 0 64150000 38003000 110690000 0 100020000 4048 4461 3773 36144;36145;36146;36147;36148;36149;36150;36151 46131;46132;46133;46134;46135;46136;46137;46138;46139 46133 9 ATSITVTGSGSCR Unmodified 1295.614 0.6139637 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.889 22.889 2 0.00041967 16890 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.39 113.51 388810000 56728000 38368000 29358000 36723000 49440000 40930000 33730000 32991000 0 21631000 0 0 48908000 4049 3043 3774 36152;36153;36154;36155;36156;36157;36158;36159;36160;36161;36162 46140;46141;46142;46143;46144;46145;46146;46147;46148;46149;46150;46151 46148 8 ATSLGSNTYNR Acetyl (Protein N-term) 1224.5735 0.57347909 844 E5RJW4;Q9NW64 RBM22 Pre-mRNA-splicing factor RBM22 yes no 1 0 0 1 55.393 55.393 2 0.0088076 53243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.345 57.565 19931000 0 0 0 0 0 0 0 19931000 0 0 0 0 0 4050 844 3775 36163 46152 46152 0 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGK Unmodified 2643.3214 0.32141708 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 148.88 148.88 3 0.0036545 154226 QUIQUE_C1218_190116_001 34.723 32.216 101880000 67081000 0 0 0 0 34798000 0 0 0 0 0 0 0 4051 196 3776 36164;36165 46153;46154 46153 2 ATSNVFAMFDQSQIQEFK Unmodified 2089.9779 0.97789093 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 143.59 143.59 2;3 1.1144E-75 149323 QUIQUE_C1368_190116_001 198.37 191.24 3001900000 260090000 362250000 342300000 0 238100000 173730000 241830000 158290000 268250000 60962000 316110000 276800000 303230000 4052 1303;2234 3777 36166;36167;36168;36169;36170;36171;36172;36173;36174;36175;36176;36177;36178;36179;36180;36181;36182;36183;36184;36185 46155;46156;46157;46158;46159;46160;46161;46162;46163;46164;46165;46166;46167;46168;46169;46170;46171;46172;46173;46174;46175;46176;46177 46160 21 ATSNVFAMFDQSQIQEFK Oxidation (M) 2105.9728 0.97280556 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 126.35 126.35 2 1.2647E-53 131031 QUIQUE_C1368_190116_001 181.76 170.32 207220000 0 70476000 54044000 36265000 46438000 0 0 0 0 0 0 0 0 4053 1303;2234 3777 36186;36187;36188;36189;36190 46178;46179;46180;46181;46182 46179 742 4 ATSSSSGSLSATGR Unmodified 1267.6004 0.60042213 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 14.571 14.571 2 3.1347E-10 6387 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.83 101.66 267600000 0 13723000 0 0 0 0 0 90067000 0 163810000 0 0 0 4054 2886 3778 36191;36192;36193;36194;36195 46183;46184;46185;46186;46187;46188 46186 5 ATSTATSGFAGAIGQK Unmodified 1466.7365 0.73652168 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.657 49.657 2 2.537E-44 46697 QUIQUE_C1368_190116_001 181.68 146.03 1665300000 0 192150000 231980000 156990000 160120000 0 166470000 139480000 0 69638000 187610000 193950000 166910000 4055 455 3779 36196;36197;36198;36199;36200;36201;36202;36203;36204;36205 46189;46190;46191;46192;46193;46194;46195;46196;46197;46198;46199;46200;46201 46192 13 ATSVALTWSR Unmodified 1090.5771 0.57710791 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.356 63.356 2 0.00036904 62352 QUIQUE_C1403_190116_001 113.18 82.564 1406500000 209580000 248960000 0 171920000 252000000 0 231630000 0 135660000 0 156720000 0 0 4056 2948 3780 36206;36207;36208;36209;36210;36211;36212 46202;46203;46204;46205;46206;46207;46208;46209;46210;46211;46212 46206 11 ATSVPGPAQAAAPPEVGR Unmodified 1674.8689 0.86893283 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 57.068 57.068 2 0.00020308 55075 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.84 94.305 39563000 0 0 0 0 0 0 0 39563000 0 0 0 0 0 4057 4517 3781 36213 46213 46213 1 ATTAALLLEAQAATGFLVDPVR Unmodified 2227.2212 0.22123275 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 7 10 14 5 10 3 11 19 16 4 29 22 8 171.6 171.6 2;3 7.0874E-100 172288 QUIQUE_C1368_190116_001 249.13 203.87 9840300000 438580000 486450000 1032400000 215940000 618710000 216490000 905470000 751010000 957110000 661320000 1618700000 1411700000 526490000 4058 3117 3782 36214;36215;36216;36217;36218;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225;36226;36227;36228;36229;36230;36231;36232;36233;36234;36235;36236;36237;36238;36239;36240;36241;36242;36243;36244;36245;36246;36247;36248;36249;36250;36251;36252;36253;36254;36255;36256;36257;36258;36259;36260;36261;36262;36263;36264;36265;36266;36267;36268;36269;36270;36271;36272;36273;36274;36275;36276;36277;36278;36279;36280;36281;36282;36283;36284;36285;36286;36287;36288;36289;36290;36291;36292;36293;36294;36295;36296;36297;36298;36299;36300;36301;36302;36303;36304;36305;36306;36307;36308;36309;36310;36311;36312;36313;36314;36315;36316;36317;36318;36319;36320;36321;36322;36323;36324;36325;36326;36327;36328;36329;36330;36331;36332;36333;36334;36335;36336;36337;36338;36339;36340;36341;36342;36343;36344;36345;36346;36347;36348;36349;36350;36351;36352;36353;36354;36355;36356;36357;36358;36359;36360;36361;36362;36363;36364;36365;36366;36367;36368;36369;36370;36371 46214;46215;46216;46217;46218;46219;46220;46221;46222;46223;46224;46225;46226;46227;46228;46229;46230;46231;46232;46233;46234;46235;46236;46237;46238;46239;46240;46241;46242;46243;46244;46245;46246;46247;46248;46249;46250;46251;46252;46253;46254;46255;46256;46257;46258;46259;46260;46261;46262;46263;46264;46265;46266;46267;46268;46269;46270;46271;46272;46273;46274;46275;46276;46277;46278;46279;46280;46281;46282;46283;46284;46285;46286;46287;46288;46289;46290;46291;46292;46293;46294;46295;46296;46297;46298;46299;46300;46301;46302;46303;46304;46305;46306;46307;46308;46309;46310;46311;46312;46313;46314;46315;46316;46317;46318;46319;46320;46321;46322;46323;46324;46325;46326;46327;46328;46329;46330;46331;46332;46333;46334;46335;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347;46348;46349;46350;46351;46352;46353;46354;46355;46356;46357;46358;46359;46360;46361;46362;46363;46364;46365;46366;46367;46368;46369;46370;46371;46372;46373;46374;46375;46376;46377;46378;46379;46380;46381;46382;46383;46384;46385;46386;46387;46388;46389;46390;46391;46392;46393;46394;46395;46396;46397;46398;46399;46400;46401;46402;46403;46404;46405;46406;46407;46408 46239 171 ATTAELFEEPFVADEYIER Acetyl (Protein N-term) 2271.0583 0.058309325 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8;G3V377 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 1 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 169.66 169.66 2;3 6.393E-64 174504 QUIQUE_C1368_190116_001 182.33 168.92 289730000 35278000 35883000 21855000 23780000 42774000 21535000 0 29122000 14080000 10470000 0 18024000 36925000 4059 174 3783 36372;36373;36374;36375;36376;36377;36378;36379;36380;36381;36382;36383;36384;36385;36386;36387;36388;36389 46409;46410;46411;46412;46413;46414;46415;46416;46417;46418;46419;46420;46421;46422;46423;46424;46425;46426;46427 46413 18 ATTATCTR Acetyl (Protein N-term) 922.41783 0.41783007 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 1 0 0 1 18.416 18.416 2 0.01953 11007 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.895 44.384 91304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91304000 0 4060 412;3299 3784 36390 46428;46429 46429 2 ATTATMATSGSAR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1282.5823 0.58232922 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 1 1 0 1 26.762 26.762 2 0.033813 20828 QUIQUE_C1368_190116_001 67.385 40.596 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4061 2416 3785 36391 46430 46430 1 ATTATMATSGSAR Acetyl (Protein N-term) 1266.5874 0.5874146 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 1 1 42.205 42.205 2 3.6138E-05 39493 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.63 105.37 51981000 0 0 0 0 0 20911000 0 0 0 0 0 0 31071000 4062 2416 3785 36392;36393;36394 46431;46432;46433 46432 2 ATTLSNAVSSLASTGLSLTK Unmodified 1921.0368 0.036786022 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.93 142.93 2 3.1112E-13 147596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.59 129.58 1380400000 90422000 112250000 97374000 111890000 145140000 102450000 0 108090000 135050000 60474000 161380000 140150000 115710000 4063 3002 3786 36395;36396;36397;36398;36399;36400;36401;36402;36403;36404;36405;36406 46434;46435;46436;46437;46438;46439;46440;46441;46442;46443;46444;46445;46446;46447 46442 14 ATTPASTANSDVATIPTDTPLKEENEGFVK Unmodified 3103.5197 0.51971877 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.996 92.996 3 2.4937E-30 94488 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.29 92.195 233320000 48543000 0 0 49861000 0 43796000 0 48822000 0 0 0 0 42297000 4064 1567 3787 36407;36408;36409;36410;36411;36412 46448;46449;46450;46451;46452;46453 46451 6 ATTPVNIDSQAQLADDVLR Unmodified 2026.0331 0.033097627 1458 O14924 RGS12 Regulator of G-protein signaling 12 yes yes 0 0 0 1 114.82 114.82 2 0.00017469 118879 QUIQUE_C1218_190116_001 89.466 65.79 19592000 19592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4065 1458 3788 36413 46454 46454 1 ATTVSTQR Acetyl (Protein N-term) 904.46141 0.46140945 4119 Q9H0E2;F2Z2Y8;E9PP67;E9PQ25;E9PNS3 TOLLIP Toll-interacting protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 23.551 23.551 1;2 0.0018228 17144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.92 88.451 521270000 0 0 0 0 88732000 0 0 97309000 150700000 0 184530000 0 0 4066 4119 3789 36414;36415;36416;36417 46455;46456;46457;46458 46458 2 ATTVTCTR Acetyl (Protein N-term) 950.44913 0.4491302 3010 Q13554;H7BXS4;E9PBE8;E7ETC9;E7ERS6 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.183 29.183 2 0.001825 23519 QUIQUE_C1277_190116_001 121.31 97.114 3832600000 568110000 660850000 296990000 357100000 491660000 256490000 453330000 160380000 188270000 0 0 399390000 0 4067 3010 3790 36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427 46459;46460;46461;46462;46463;46464;46465;46466;46467;46468 46460 7 ATVAAFAASEGHSHPR Unmodified 1607.7805 0.78045218 1456;4298 O14910;H0YIA8;H0YI92;Q9NUP9 LIN7A;LIN7C Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C no no 0 0 0 3 3 1 3 2 1 3 3 3 1 3 3 3 22.031 22.031 2;3;4 2.1156E-24 14881 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.38 119 8059600000 714890000 513400000 534480000 505750000 611860000 418710000 749770000 611790000 876220000 44679000 773760000 721070000 983200000 4068 1456;4298 3791 36428;36429;36430;36431;36432;36433;36434;36435;36436;36437;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;36447;36448;36449;36450;36451;36452;36453;36454;36455;36456;36457;36458;36459 46469;46470;46471;46472;46473;46474;46475;46476;46477;46478;46479;46480;46481;46482;46483;46484;46485;46486;46487;46488;46489;46490;46491;46492;46493;46494;46495;46496;46497;46498;46499;46500;46501;46502;46503;46504 46496 35 ATVAAFTASEGHAHPR Unmodified 1621.7961 0.79610224 4204 Q9HAP6 LIN7B Protein lin-7 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 20.95 20.95 3 0.0008842 13882 QUIQUE_C1403_190116_001 61.226 40.273 77297000 0 29838000 0 47459000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4069 4204 3792 36460;36461 46505;46506 46506 2 ATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDR Acetyl (Protein N-term) 2165.1077 0.10765955 1096 G5E9A6 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes yes 1 0 0 1 1 1 165.85 165.85 3 5.0614E-07 169643 QUIQUE_C1277_190116_001 68.88 54.408 53913000 0 20435000 17464000 16013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4070 1096 3793 36462;36463;36464 46507;46508;46509 46507 3 ATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWR Acetyl (Protein N-term) 3966.946 0.94602054 1096 G5E9A6 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.75 157.75 4 6.1703E-70 163922 QUIQUE_C1576_190116_001 129.61 124.6 1474000000 91377000 142670000 128680000 140290000 168900000 80513000 116620000 123840000 104510000 28288000 100950000 124740000 122650000 4071 1096 3794 36465;36466;36467;36468;36469;36470;36471;36472;36473;36474;36475;36476;36477 46510;46511;46512;46513;46514;46515;46516;46517;46518;46519;46520;46521;46522;46523 46517 13 ATVAEWK Unmodified 803.41775 0.41775372 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 25.766 25.766 2 0.060724 19852 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.176 17.388 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4 ATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIK Acetyl (Protein N-term) 3948.8389 0.83888066 1904 P06730;D6RFJ3 EIF4E Eukaryotic translation initiation factor 4E yes no 1 0 1 1 1 1 91.015 91.015 3 4.1869E-15 94052 QUIQUE_C1218_190116_001 73.797 68.841 178150000 48665000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75390000 54090000 4075 1904 3798 36497;36498;36499 46547;46548;46549 46547 3 ATVEQLMFEEK Unmodified 1323.6381 0.63805318 3125 Q15276;K7ENJ9 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.81 94.81 2 0.00048589 95906 QUIQUE_C1563_190116_001 108.15 82.573 38808000 0 0 0 0 0 38808000 0 0 0 0 0 0 0 4076 3125 3799 36500;36501;36502;36503;36504 46550;46551;46552;46553;46554 46552 5 ATVGILITTIASK Unmodified 1286.781 0.78095267 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 107.74 107.74 2 0.022659 111738 QUIQUE_C1368_190116_001 64.266 52.418 226340000 0 0 52151000 0 52670000 56808000 0 0 0 0 64713000 0 0 4077 3772 3800 36505;36506;36507;36508 46555;46556;46557;46558 46555 0 ATVGLIR Unmodified 728.45447 0.45447358 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.453 30.453 2 0.019355 25919 QUIQUE_C1218_190116_001 111.69 53.027 2514200000 259930000 264600000 197090000 237490000 0 231300000 0 236110000 278850000 94350000 212190000 236810000 265500000 4078 425 3801 36509;36510;36511;36512;36513;36514;36515;36516;36517;36518;36519 46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567;46568;46569;46570;46571 46559 13 ATVLNYLPK Unmodified 1017.5859 0.58588168 1802 P01023;P20742;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000024146 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.83 82.83 2 0.010434 85914 QUIQUE_C1438_190116_001 74.127 33.776 453090000 82911000 67766000 0 0 86405000 0 0 0 0 0 107030000 0 108970000 4079 1802 3802 36520;36521;36522;36523;36524 46572;46573;46574;46575;46576 46574 5 ATVLQNQLDESQQER Unmodified 1757.8544 0.85440498 4376 Q9P1Z2;F8VQE3 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.677 55.677 2 1.4979E-09 53376 QUIQUE_C1403_190116_001 152.14 121.27 96051000 27749000 0 0 30435000 0 24623000 0 0 0 13243000 0 0 0 4080 4376 3803 36525;36526;36527;36528 46577;46578;46579;46580 46578 4 ATVMAATAAER Acetyl (Protein N-term) 1132.5547 0.55465791 4101 Q9GZN7;K7EPS3;K7EPN1;K7ERP1;K7EMJ5;K7EL91 ROGDI Protein rogdi homolog yes no 1 0 0 1 78.197 78.197 2 0.0083418 79584 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 38.18 30940000 0 0 30940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4081 4101 3804 36529 46581 46581 1 ATVMDVKPVDYR Unmodified 1392.7071 0.7071358 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 53.108 53.108 3 0.036015 51421 QUIQUE_C1368_190116_001 43.991 29.43 73391000 0 0 73391000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4082 2265 3805 36530 46582 46582 1 ATVMLYDDGNKR Unmodified 1381.666 0.66599927 2568 P50552;K7ENR7;K7ENL7;K7EIG8 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 31.633 31.633 2;3 0.0027412 26381 QUIQUE_C1403_190116_001 78.655 31.764 209540000 0 49047000 33267000 67187000 0 0 26599000 0 0 0 33440000 0 0 4083 2568 3806 36531;36532;36533;36534;36535;36536;36537;36538;36539;36540;36541;36542;36543;36544 46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590;46591;46592;46593;46594;46595;46596 46586 14 ATVNLLGEEK Unmodified 1072.5764 0.57643921 2847 Q00765 REEP5 Receptor expression-enhancing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.535 50.535 2 0.00032216 46610 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.27 94.181 1181700000 228910000 0 0 134680000 0 122240000 95542000 83067000 126920000 79456000 120240000 98442000 92187000 4084 2847 3807 36545;36546;36547;36548;36549;36550;36551;36552;36553;36554 46597;46598;46599;46600;46601;46602;46603;46604;46605;46606 46603 8 ATVNLLGEEKK Unmodified 1200.6714 0.67140222 2847 Q00765 REEP5 Receptor expression-enhancing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 28.546 28.546 3 0.022843 22889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 29.264 1.7826 152140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82013000 0 70129000 4085 2847 3808 36555;36556 46607;46608 46608 2 ATVPAGEGVSLEEAK Unmodified 1456.7409 0.74093835 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.572 54.572 2 1.4816E-05 50235 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.97 87.433 1966800000 491330000 400440000 0 0 0 0 0 438200000 0 83283000 553520000 0 0 4086 2530 3809 36557;36558;36559;36560;36561 46609;46610;46611;46612;46613;46614 46613 6 ATVPIYATGVLTCYIQEEDRK Unmodified 2426.2152 0.21516109 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785;A0A075B768 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 1 1 1 127.98 127.98 3 9.5937E-05 132165 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.03 43.843 106620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53270000 53354000 4087 426 3810 36562;36563 46615;46616 46615 2 ATVQQLEGR Acetyl (Protein N-term) 1042.5407 0.5407224 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 68.993 68.993 1;2 1.5657E-09 69079 QUIQUE_C1277_190116_001 171.73 90.099 14942000000 1242600000 1073900000 787380000 1145300000 726410000 962010000 833250000 1693100000 2593400000 1079100000 1165700000 782880000 856810000 4088 2855 3811 36564;36565;36566;36567;36568;36569;36570;36571;36572;36573;36574;36575;36576;36577 46617;46618;46619;46620;46621;46622;46623;46624;46625;46626;46627;46628;46629;46630;46631;46632;46633;46634;46635;46636;46637;46638;46639;46640;46641;46642;46643;46644;46645;46646;46647;46648;46649;46650;46651 46620 35 ATVSAPFGK Unmodified 876.47052 0.47051757 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.312 34.312 2 0.00098961 29398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.9 87.27 3483600000 269450000 241370000 253860000 109290000 321400000 117050000 240140000 404430000 314420000 303080000 441450000 286980000 180710000 4089 3117 3812 36578;36579;36580;36581;36582;36583;36584;36585;36586;36587;36588;36589;36590 46652;46653;46654;46655;46656;46657;46658;46659;46660;46661;46662;46663;46664;46665;46666;46667;46668;46669;46670;46671;46672;46673;46674;46675;46676 46671 25 ATVTATTK Acetyl (Protein N-term) 833.44945 0.44944778 4536 Q9Y230;X6R2L4;M0R0Z0;M0QXZ7 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 1 0 0 1 23.022 23.022 1 0.012874 15971 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.98 85.192 34479000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34479000 0 0 0 4090 4536 3813 36591 46677 46677 0 ATVTPSPVK Unmodified 898.51238 0.51238239 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.946 17.946 2 0.00043526 10240 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.98 94.834 312670000 21495000 37737000 0 14845000 0 0 0 0 52687000 148090000 0 37817000 0 4091 4130 3814 36592;36593;36594;36595;36596;36597 46678;46679;46680;46681;46682;46683 46682 6 ATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHR Acetyl (Protein N-term) 3003.4785 0.47852266 2483 P46821;D6RA32;D6RGJ3;D6RCL2 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 1 2 111.93 111.93 2;3 2.0653E-148 114938 QUIQUE_C1277_190116_001 223.36 206.68 1529900000 78167000 70828000 57655000 221120000 80271000 312960000 99780000 0 101680000 284310000 124680000 98421000 0 4092 2483 3815 36598;36599;36600;36601;36602;36603;36604;36605;36606;36607;36608;36609;36610;36611;36612;36613;36614;36615 46684;46685;46686;46687;46688;46689;46690;46691;46692;46693;46694;46695;46696;46697;46698;46699;46700;46701;46702;46703;46704;46705;46706;46707;46708 46686 25 ATVVYQGER Unmodified 1021.5193 0.51925868 1831 P02749 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.863 20.863 2 0.0013972 13442 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 74.907 680200000 109030000 124590000 102210000 0 80055000 66027000 61350000 0 0 43712000 0 0 93232000 4093 1831 3816 36616;36617;36618;36619;36620;36621;36622;36623;36624 46709;46710;46711;46712;46713;46714;46715;46716;46717 46710 9 ATVWDEAEQDGIGEEVLK Acetyl (Protein N-term) 2029.948 0.94803059 4672 R4GNH3;E9PN50 PSMC3 yes no 1 0 0 1 156.42 156.42 2 0.0012358 151220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.69 67.262 27687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27687000 0 0 0 4094 4672 3817 36625 46718 46718 1 ATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIER Unmodified 3203.6907 0.69068769 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 157.57 157.57 3 1.3158E-26 162948 QUIQUE_C1368_190116_001 104.3 99.245 173800000 23730000 0 33338000 0 0 0 0 0 0 10814000 47959000 57954000 0 4095 4278 3818 36626;36627;36628;36629;36630 46719;46720;46721;46722;46723;46724 46720 6 ATWLHQALR Unmodified 1094.5985 0.59851205 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 40.317 40.317 2;3 0.00040425 37769 QUIQUE_C1218_190116_001 88.948 62.903 4645400000 368360000 443340000 567740000 492360000 405080000 420740000 475480000 63942000 401040000 0 225810000 391560000 389920000 4096 2989 3819 36631;36632;36633;36634;36635;36636;36637;36638;36639;36640;36641;36642;36643;36644;36645;36646;36647;36648;36649;36650;36651;36652;36653 46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731;46732;46733;46734;46735;46736;46737;46738;46739;46740;46741;46742;46743;46744;46745;46746;46747;46748;46749;46750;46751;46752 46726 25 ATWTEVVHINR Unmodified 1324.6888 0.68878362 168 A0A0A0MS69;Q14123 PDE1C Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C yes no 0 0 0 1 66.778 66.778 3 0.050908 66397 QUIQUE_C1277_190116_001 38.021 22.131 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4097 168 3820 36654 46753 46753 1 ATYFGSIVLLSPAVIDSPLK Unmodified 2090.1663 0.16634363 2656 P55058 PLTP Phospholipid transfer protein yes yes 0 0 0 1 161.33 161.33 2 0.0013044 164561 QUIQUE_C1403_190116_001 57.328 52.15 18252000 0 0 0 18252000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4098 2656 3821 36655 46754 46754 1 ATYFLAGLGLGPGR Unmodified 1391.7561 0.75613491 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 128.46 128.46 2 0.00023285 132213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.239 76.979 55001000 22308000 0 0 0 0 0 0 0 32693000 0 0 0 0 4099 528 3822 36656;36657;36658;36659;36660;36661;36662;36663 46755;46756;46757;46758;46759;46760;46761;46762 46760 8 ATYIHNCLK Unmodified 1118.5543 0.55426398 70 A0A087WY55;Q9NP79;Q5TGM0 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.386 19.386 3 0.006761 12291 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.35 46.23 1283600000 173090000 222270000 0 158160000 164930000 0 0 0 126230000 61623000 168110000 0 209220000 4100 70 3823 36664;36665;36666;36667;36668;36669;36670;36671 46763;46764;46765;46766;46767;46768;46769;46770 46768 5 ATYLDDLR Unmodified 965.48181 0.48181054 3750 Q92696;H0YLG7;H0YMG5;H0YKZ8 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 68.498 68.498 2 0.028069 68466 QUIQUE_C1218_190116_001 69.105 53.473 49427000 49427000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4101 3750 3824 36672 46771 46771 1 ATYLEFIQQNEER Acetyl (Protein N-term) 1681.7948 0.79476484 463 A0A2R8YFH5;Q15437;Q5QPE2;A0A2R8YF30;A0A2R8Y633;A0A2R8Y7S7 SEC23B Protein transport protein Sec23B yes no 1 0 0 1 1 1 153.36 153.36 2 2.7151E-06 157614 QUIQUE_C1277_190116_001 125.74 109.54 49145000 0 49145000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4102 463 3825 36673;36674;36675 46772;46773;46774;46775 46772 4 AVAAAAAAAGPAGAGGGR Acetyl (Protein N-term) 1407.7219 0.72187466 3029 Q13884;A0A3B3ITC2;E5RIX7 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 1 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 81.865 81.865 2 2.2205E-06 83465 QUIQUE_DMIX8_190116_001 131.28 107.43 1784700000 170240000 150120000 136840000 130110000 116270000 99934000 0 137960000 113320000 62312000 223300000 223990000 220370000 4103 3029 3826 36676;36677;36678;36679;36680;36681;36682;36683;36684;36685;36686;36687;36688;36689 46776;46777;46778;46779;46780;46781;46782;46783;46784;46785;46786;46787;46788;46789;46790;46791;46792;46793;46794;46795;46796;46797;46798 46798 23 AVAAEAQDTATR Unmodified 1202.5891 0.58912916 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.447 16.447 2 0.00052762 8387 QUIQUE_C1277_190116_001 121.83 90.458 912130000 80128000 136180000 0 54464000 123980000 45226000 84484000 0 102940000 35175000 184820000 64730000 0 4104 1492 3827 36690;36691;36692;36693;36694;36695;36696;36697;36698;36699 46799;46800;46801;46802;46803;46804;46805;46806;46807;46808;46809 46801 7 AVAALLTIPEAEK Unmodified 1324.7602 0.76021723 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.046 96.046 2 3.4534E-05 99477 QUIQUE_C1576_190116_001 120.68 103.25 5882600000 585020000 514940000 439270000 424460000 562700000 441540000 496150000 324480000 364490000 226910000 486300000 480460000 535830000 4105 3499 3828 36700;36701;36702;36703;36704;36705;36706;36707;36708;36709;36710;36711;36712;36713 46810;46811;46812;46813;46814;46815;46816;46817;46818;46819;46820;46821;46822;46823;46824;46825;46826;46827;46828 46818 19 AVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQK Oxidation (M) 4203.1661 0.16609222 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 1 1 1 2 2 168.25 168.25 3;4 5.3177E-32 170304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.507 82.273 376860000 0 0 0 0 0 0 0 84305000 0 0 196790000 0 95771000 4106 3499 3829 36714;36715;36716;36717;36718 46829;46830;46831;46832;46833 46829 2675 5 AVADLALIPDVDIDSDGVFK Acetyl (Protein N-term) 2114.0783 0.078316486 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 1 0 0 2 3 2 3 2 2 3 2 2 2 3 3 174.73 174.73 2;3 9.0099E-24 177450 QUIQUE_C1277_190116_001 161.63 140.77 8884900000 529630000 415000000 0 169490000 761040000 265400000 691760000 1007300000 1290700000 133750000 1502000000 1008700000 1110200000 4107 4277 3830 36719;36720;36721;36722;36723;36724;36725;36726;36727;36728;36729;36730;36731;36732;36733;36734;36735;36736;36737;36738;36739;36740;36741;36742;36743;36744;36745;36746;36747 46834;46835;46836;46837;46838;46839;46840;46841;46842;46843;46844;46845;46846;46847;46848;46849;46850;46851;46852;46853;46854;46855;46856;46857;46858;46859;46860;46861;46862;46863;46864;46865;46866 46838 33 AVADQCPDSACK Unmodified 1320.5438 0.54383522 2250 P26232;A0A0A0MRI5 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.028 15.028 2 1.7597E-09 7401 QUIQUE_C1218_190116_001 151.22 147.1 1721000000 151350000 233110000 234730000 170930000 168020000 0 273290000 33158000 60618000 29477000 140440000 95947000 129970000 4108 2250 3831 36748;36749;36750;36751;36752;36753;36754;36755;36756;36757;36758;36759 46867;46868;46869;46870;46871;46872;46873;46874;46875;46876;46877;46878 46867 12 AVADTGSEDQGPGTGELTAVHK Unmodified 2139.008 0.008005089 1126 H0Y6F5;Q9H4I2 ZHX3 Zinc fingers and homeoboxes protein 3 yes no 0 0 0 1 1 46.873 46.873 3 0.00052192 43166 QUIQUE_C1563_190116_001 32.695 27.026 98918000 17358000 0 0 0 0 81560000 0 0 0 0 0 0 0 4109 1126 3832 36760;36761 46879;46880 46880 2 AVAEAVETGEEDVIMEALR Unmodified 2030.983 0.98303589 4247 Q9NPQ8;E9PSI0;E9PI04;E9PLE5 RIC8A Synembryn-A yes no 0 0 0 1 1 2 1 145.75 145.75 2;3 4.9325E-10 148567 QUIQUE_C1563_190116_001 126.63 104.59 111890000 0 0 0 0 0 29058000 0 0 0 0 0 0 82835000 4110 4247 3833 36762;36763;36764;36765;36766 46881;46882;46883;46884;46885 46884 4 AVAEIEEMCNILK Unmodified 1518.7422 0.74220068 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 118.65 118.65 2 3.4534E-05 121936 QUIQUE_C1403_190116_001 120.68 102.37 764100000 0 193890000 0 168910000 0 0 0 97469000 248960000 54867000 0 0 0 4111 2563 3834 36767;36768;36769;36770;36771 46886;46887;46888;46889;46890;46891;46892;46893;46894 46887 9 AVAENQPFLIEAMTYR Unmodified 1851.9189 0.91891949 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.86 130.86 2 1.31E-23 134645 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.02 130.16 1063500000 83662000 91827000 105330000 78185000 82097000 0 83053000 108300000 87847000 29539000 100070000 110590000 102970000 4112 1012 3835 36772;36773;36774;36775;36776;36777;36778;36779;36780;36781;36782;36783 46895;46896;46897;46898;46899;46900;46901;46902;46903;46904;46905;46906;46907;46908;46909;46910;46911;46912 46911 16 AVAEQIPLLVQGVR Unmodified 1491.8773 0.87731267 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 3 3 3 2 2 3 3 3 2 109.7 109.7 2;3 7.6912E-14 114777 QUIQUE_C1438_190116_001 161.17 143.31 1508600000 93275000 106180000 154010000 143670000 155640000 75330000 107900000 128510000 126290000 54144000 122350000 122820000 118480000 4113 4600 3836 36784;36785;36786;36787;36788;36789;36790;36791;36792;36793;36794;36795;36796;36797;36798;36799;36800;36801;36802;36803;36804;36805;36806;36807;36808;36809;36810;36811;36812;36813;36814;36815;36816 46913;46914;46915;46916;46917;46918;46919;46920;46921;46922;46923;46924;46925;46926;46927;46928;46929;46930;46931;46932;46933;46934;46935;46936;46937;46938;46939;46940;46941;46942;46943;46944;46945;46946;46947;46948;46949;46950;46951 46927 39 AVAFFLESIAMHDIIAAEK Unmodified 2075.0761 0.076148416 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 158.16 158.16 3 0.0031761 162936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.916 36.681 13465000 0 0 0 0 0 0 0 0 13465000 0 0 0 0 4114 2813 3837 36817 46952 46952 1 AVAFHPAGGLYAVGSNSK Unmodified 1744.8897 0.88966827 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.987 60.987 2;3 4.7815E-05 59596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.38 99.167 494770000 93807000 93293000 0 79538000 0 0 88717000 77437000 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46961;46962;46963;46964;46965;46966;46967;46968;46969;46970;46971;46972;46973;46974;46975;46976;46977;46978;46979;46980;46981;46982;46983;46984;46985;46986;46987;46988;46989;46990;46991;46992;46993;46994;46995;46996;46997;46998;46999;47000;47001;47002;47003;47004;47005;47006;47007;47008;47009;47010;47011;47012;47013;47014;47015;47016;47017;47018;47019;47020;47021;47022;47023;47024;47025 46999 65 AVAFSPVTELK Unmodified 1160.6441 0.64412484 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 77.89 77.89 2 0.001374 78941 QUIQUE_C1403_190116_001 90.15 59.965 337730000 0 0 0 166540000 112130000 0 0 0 0 0 0 0 59059000 4117 2129 3840 36863;36864;36865 47026;47027;47028 47026 3 AVAFSPVTELKK Unmodified 1288.7391 0.73908786 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 53.206 53.206 2;3 0.0010921 50862 QUIQUE_C1368_190116_001 56.205 43.991 2926000000 180180000 263890000 328340000 274190000 286420000 28129000 331400000 231580000 60525000 50152000 422260000 264040000 204900000 4118 2129 3841 36866;36867;36868;36869;36870;36871;36872;36873;36874;36875;36876;36877;36878;36879;36880;36881;36882;36883;36884;36885;36886 47029;47030;47031;47032;47033;47034;47035;47036;47037;47038;47039;47040;47041;47042;47043;47044;47045;47046;47047;47048;47049;47050;47051;47052;47053;47054 47035 26 AVAGDASESALLK Unmodified 1230.6456 0.6455814 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.197 49.197 2 0.00016949 46847 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.78 69.356 1505700000 0 123580000 226730000 163140000 118990000 0 163380000 112650000 143650000 49102000 152960000 83279000 168200000 4119 1872 3842 36887;36888;36889;36890;36891;36892;36893;36894;36895;36896;36897 47055;47056;47057;47058;47059;47060;47061;47062;47063;47064;47065 47061 10 AVAGEFSEPVTLETPAFMFR Unmodified 2198.0718 0.07179132 4024 Q9BTV5;M0R366 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.16 149.16 2 2.0096E-12 152087 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.19 95.235 428800000 36646000 48973000 57651000 30200000 38410000 27773000 37834000 32272000 26155000 0 33608000 26880000 32400000 4120 4024 3843 36898;36899;36900;36901;36902;36903;36904;36905;36906;36907;36908;36909 47066;47067;47068;47069;47070;47071;47072;47073;47074;47075;47076;47077;47078 47073 13 AVAGEYSDPVTLETK Unmodified 1578.7777 0.77771779 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450;C9JD05 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 69.871 69.871 2 9.7394E-07 69980 QUIQUE_C1218_190116_001 117.98 89.962 218490000 109830000 0 0 0 0 0 0 62892000 0 45769000 0 0 0 4121 156 3844 36910;36911;36912;36913;36914;36915;36916;36917;36918;36919 47079;47080;47081;47082;47083;47084;47085;47086;47087;47088 47079 10 AVAGLPSGSAGPSPAPSPAR Unmodified 1745.906 0.90604662 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.837 54.837 2 5.8635E-24 53975 QUIQUE_C1218_190116_001 137.46 104.51 469940000 44290000 34859000 31940000 61443000 35900000 34226000 0 49237000 40872000 0 38466000 40220000 58490000 4122 3718 3845 36920;36921;36922;36923;36924;36925;36926;36927;36928;36929;36930 47089;47090;47091;47092;47093;47094;47095;47096;47097;47098;47099;47100 47089 12 AVAGNISDPGLQK Unmodified 1268.6725 0.67246486 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.686 39.686 2 0.00024419 35344 QUIQUE_C1277_190116_001 143.4 104.62 1780900000 0 350020000 0 382000000 0 0 0 241320000 338220000 172340000 0 296990000 0 4123 2135 3846 36931;36932;36933;36934;36935;36936 47101;47102;47103;47104;47105;47106 47101 6 AVAGVMITASHNR Unmodified 1325.6874 0.68740341 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 28.349 28.349 2;3 0.00026377 22107 QUIQUE_C1563_190116_001 112.36 86.798 439430000 67064000 71395000 0 76260000 0 99619000 0 0 46145000 32279000 0 46672000 0 4124 3390 3847 36937;36938;36939;36940;36941;36942;36943;36944;36945;36946;36947;36948;36949 47107;47108;47109;47110;47111;47112;47113;47114;47115;47116;47117;47118;47119 47114 12 AVAHHTDCTFIR Unmodified 1426.6776 0.67756701 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1;J3QRR3 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 3 3 2 3 1 3 2 3 1 3 1 3 16.529 16.529 2;3;4 0.00015324 8644 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.214 89.67 2772100000 16798000 321730000 250230000 262210000 258940000 123280000 330020000 121780000 211540000 26926000 363360000 161910000 323340000 4125 2743 3848 36950;36951;36952;36953;36954;36955;36956;36957;36958;36959;36960;36961;36962;36963;36964;36965;36966;36967;36968;36969;36970;36971;36972;36973;36974;36975;36976;36977;36978 47120;47121;47122;47123;47124;47125;47126;47127;47128;47129;47130;47131;47132;47133;47134;47135;47136;47137;47138;47139;47140;47141;47142;47143;47144;47145;47146;47147;47148 47148 28 AVAHHTTAAFIR Unmodified 1293.6942 0.69420335 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 14.866 14.866 2;3 1.5328E-06 7103 QUIQUE_C1403_190116_001 125.23 106.13 1696700000 199230000 271000000 238370000 276470000 19082000 276300000 18424000 0 0 43909000 34068000 22687000 297120000 4126 2466 3849 36979;36980;36981;36982;36983;36984;36985;36986;36987;36988;36989;36990;36991;36992;36993;36994 47149;47150;47151;47152;47153;47154;47155;47156;47157;47158;47159;47160;47161;47162;47163;47164;47165 47156 13 AVAIDLPGLGHSK Unmodified 1276.7139 0.71393574 3881 Q96IU4;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 3 1 3 2 1 69.53 69.53 2;3 4.3561E-06 69639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.99 87.554 1340800000 107780000 37521000 46247000 53448000 156360000 135370000 89575000 70126000 190470000 45977000 157090000 160000000 90835000 4127 3881 3850 36995;36996;36997;36998;36999;37000;37001;37002;37003;37004;37005;37006;37007;37008;37009;37010;37011;37012;37013;37014;37015 47166;47167;47168;47169;47170;47171;47172;47173;47174;47175;47176;47177;47178;47179;47180;47181;47182;47183;47184;47185;47186;47187;47188;47189;47190;47191;47192;47193;47194;47195 47184 29 AVAIETQPAQGELDAVAR Unmodified 1837.9534 0.95339074 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 3 1 2 2 3 2 1 2 2 1 1 1 1 83.954 83.954 2;3 9.4213E-182 86684 QUIQUE_C1438_190116_001 253.88 215.89 1642200000 178770000 112520000 134360000 133220000 193990000 106610000 108300000 136490000 130410000 7761000 134060000 117430000 148310000 4128 3889 3851 37016;37017;37018;37019;37020;37021;37022;37023;37024;37025;37026;37027;37028;37029;37030;37031;37032;37033;37034;37035;37036;37037 47196;47197;47198;47199;47200;47201;47202;47203;47204;47205;47206;47207;47208;47209;47210;47211;47212;47213;47214;47215;47216;47217;47218;47219;47220;47221;47222;47223;47224;47225;47226;47227;47228;47229;47230;47231;47232;47233;47234;47235;47236;47237;47238;47239 47214 42 AVALDEAISQSTQFHDKIDQILESLER Unmodified 3055.5462 0.5462083 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 1 1 1 164.18 164.18 4 6.7897E-16 168327 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.966 82.044 165330000 0 0 0 0 0 0 0 0 57774000 0 0 107550000 0 4129 2882 3852 37038;37039 47240;47241 47241 1 AVALDSDNISLK Unmodified 1244.6612 0.66123147 149 A0A0A0MRJ3;Q8NEY1;H0Y6F6 NAV1 Neuron navigator 1 yes no 0 0 0 1 68.914 68.914 2 0.057369 69141 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.472 11.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4130 149 3853 37040 47242 47242 1 AVAMLWK Unmodified 817.45203 0.45203074 1428 O14521 SDHD Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 66.55 66.55 2 0.05526 66140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.021 45.225 78751000 0 0 0 0 0 0 0 25539000 28170000 0 0 25042000 0 4131 1428 3854 37041;37042;37043 47243;47244;47245 47244 3 AVANAAAMLVLK Unmodified 1170.6795 0.67946449 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.535 90.535 2 0.0026367 87981 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.01 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A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.618 34.618 2 1.4723E-12 29727 QUIQUE_C1403_190116_001 151.15 129.06 731870000 0 0 0 170400000 154860000 183270000 0 0 0 0 223340000 0 0 4136 455 3858 37094;37095;37096;37097 47314;47315;47316;47317 47314 3 AVAQALEVIPR Unmodified 1165.6819 0.68190733 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.338 78.338 2 0.0073643 80126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.157 47.338 3545300000 0 431790000 386500000 325650000 346420000 311490000 423190000 0 297340000 195450000 476770000 350650000 0 4137 2527 3859 37098;37099;37100;37101;37102;37103;37104;37105;37106;37107 47318;47319;47320;47321;47322;47323;47324;47325;47326;47327 47326 9 AVASAAAALVLK Unmodified 1083.6652 0.66519463 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.078 77.078 2 0.0036065 77778 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AVCMLSNTTAIAEAWAR Unmodified 1863.8971 0.89713819 2795;3430;2796;1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;P68366;Q71U36;C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 0 88 88 116 69 94 71 119 87 105 15 117 119 117 161.72 161.72 2;3 3.0916E-201 136960 QUIQUE_DMIX3_190116_001 262.56 246.42 187600000000 14642000000 17963000000 16399000000 15826000000 16241000000 12677000000 22482000000 10210000000 10903000000 3341400000 15758000000 13728000000 17429000000 4150 1990;2795;2796;3430;688 3871 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48577 1449 AVCMLSNTTAVAEAWAR Unmodified 1849.8815 0.88148813 3992 Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1C Tubulin alpha-1C chain yes no 0 0 0 1 119.52 119.52 2 0.0063181 123907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.326 58.058 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4151 3992 3872 38499 49196 49196 1 AVCVEAGMIALR Unmodified 1288.6632 0.6631625 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.771 91.771 2 0.00099347 93529 QUIQUE_C1277_190116_001 84.213 61.473 436000000 62333000 66051000 71097000 65471000 0 68839000 0 78747000 0 23466000 0 0 0 4152 4672 3873 38500;38501;38502;38503;38504;38505;38506 49197;49198;49199;49200;49201;49202;49203;49204;49205 49199 8 AVDAGLNVMPYIK Unmodified 1389.7326 0.73262227 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.24 106.24 2 0.00041285 109311 QUIQUE_C1277_190116_001 96.015 69.342 141960000 14296000 32894000 24162000 23841000 0 0 0 0 0 18622000 0 0 28145000 4153 2180 3874 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49254;49255;49256;49257;49258;49259;49260;49261;49262;49263;49264 49255 11 AVDEAVILLQEIGVLDQR Unmodified 1980.0892 0.089155943 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.27 168.27 3 6.6059E-24 170086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.29 99.099 115930000 21562000 0 53812000 15532000 0 9235400 0 15792000 0 0 0 0 0 4158 1211 3879 38560;38561;38562;38563;38564 49265;49266;49267;49268;49269 49269 5 AVDEDPENQTLR Unmodified 1385.6423 0.64228694 3758 Q92845 KIFAP3 Kinesin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.337 35.337 2 0.00017831 30570 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 81.653 99029000 0 35061000 0 33643000 0 30325000 0 0 0 0 0 0 0 4159 3758 3880 38565;38566;38567;38568;38569;38570;38571;38572 49270;49271;49272;49273;49274;49275;49276;49277 49271 8 AVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAK Unmodified 2679.201 0.20102717 2166 P20339 RAB5A Ras-related protein Rab-5A yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 144.51 144.51 3 1.5455E-06 147395 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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49511;49512;49513;49514;49515;49516;49517;49518;49519;49520;49521;49522;49523;49524;49525 49511 13 AVDQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEK Unmodified 2916.5154 0.51542544 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 145.2 145.2 3 1.1286E-12 151570 QUIQUE_C1438_190116_001 73.676 62.045 1208000000 80014000 110980000 129360000 103150000 146470000 47683000 68270000 0 81174000 30911000 131950000 64209000 213820000 4177 1802 3896 38761;38762;38763;38764;38765;38766;38767;38768;38769;38770;38771;38772;38773 49526;49527;49528;49529;49530;49531;49532;49533;49534;49535;49536;49537;49538;49539;49540 49530 11 AVDRPMLPQEYAVEAHFK Unmodified 2100.0462 0.046245271 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;A0A3B3ISA7 ADAP1 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 80.643 80.643 4 0.0026667 83049 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.429 27.824 31958000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31958000 0 0 4178 1129 3897 38774 49541 49541 1 AVDSFETQR Unmodified 1051.4934 0.49343786 139 A0A0A0MR09;P43378;H3BQT6 PTPN9 Protein-tyrosine-phosphatase;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9 yes no 0 0 0 1 26.431 26.431 2 0.033312 20568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.37 31.846 52520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52520000 0 0 4179 139 3898 38775 49542 49542 1 AVDSLVPIGR Unmodified 1025.5869 0.58694431 2243;1351 K7ERX7;P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.387 70.387 2 1.2824E-11 70653 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.77 84.659 46623000000 4139600000 3766700000 4011400000 3016100000 3277800000 3648400000 3809900000 2995700000 3776900000 1269000000 5159900000 3798600000 3952900000 4180 1351;2243 3899 38776;38777;38778;38779;38780;38781;38782;38783;38784;38785;38786;38787;38788 49543;49544;49545;49546;49547;49548;49549;49550;49551;49552;49553;49554;49555;49556;49557;49558;49559;49560;49561;49562;49563;49564;49565 49557 23 AVDSLVPIGRG Unmodified 1082.6084 0.60840804 1351 K7ERX7 ATP5A1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 62.395 62.395 2 0.0060925 61945 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.709 52.981 289880000 0 0 0 0 79138000 41147000 0 0 98100000 0 0 71496000 0 4181 1351 3900 38789;38790;38791;38792;38793 49566;49567;49568;49569;49570;49571 49571 5 AVDTDMIILPCLSR Unmodified 1602.8109 0.81094895 1508 O43149 ZZEF1 Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 19.925 19.925 3 0.063055 12575 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.297 18.497 257630000 0 0 0 0 0 0 82335000 0 0 0 0 0 175300000 4182 1508 3901 38794;38795 49572;49573 49573 2 AVDTICSFLK Unmodified 1152.5849 0.5848954 4655 Q9Y6K5 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 93.763 93.763 2 0.012865 95862 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.474 40.384 126870000 0 0 43358000 0 0 0 0 31897000 0 0 51616000 0 0 4183 4655 3902 38796;38797;38798 49574;49575;49576 49575 2 AVDTLAYLSDGDAR Unmodified 1465.7049 0.7048872 3938 Q96S55 WRNIP1 ATPase WRNIP1 yes yes 0 0 0 1 88.774 88.774 2 0.010107 91030 QUIQUE_C1218_190116_001 70.488 43.374 0 0 0 0 0 0 0 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49598;49599;49600;49601;49602;49603;49604;49605;49606;49607;49608;49609;49610;49611;49612;49613;49614;49615;49616;49617;49618;49619;49620;49621;49622;49623;49624;49625;49626;49627;49628;49629;49630;49631;49632;49633;49634;49635;49636;49637;49638;49639;49640;49641;49642;49643;49644;49645;49646;49647;49648 49642 51 AVEDFLR Unmodified 848.43922 0.43921744 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9;H0Y7L7;B1APQ1 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 0 1 66.069 66.069 2 0.057767 65481 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.716 32.345 25063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25063000 0 4189 3276 3907 38843 49649 49649 1 AVEDIHGLFSLSK Unmodified 1414.7456 0.7456298 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 93.882 93.882 2;3 2.1383E-09 96109 QUIQUE_C1368_190116_001 116.51 94.961 1080300000 101490000 161130000 116290000 66993000 53285000 55698000 107200000 108060000 67640000 27768000 65934000 93833000 55022000 4190 3046 3908 38844;38845;38846;38847;38848;38849;38850;38851;38852;38853;38854;38855;38856;38857;38858;38859;38860;38861;38862 49650;49651;49652;49653;49654;49655;49656;49657;49658;49659;49660;49661;49662;49663;49664;49665;49666;49667;49668;49669;49670;49671;49672 49656 23 AVEDVRPPHK Unmodified 1146.6146 0.61455605 263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;H7C0P6 MAP4K4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 yes no 0 0 1 1 12.699 12.699 3 0.012754 4776 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.013 38.54 5562400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5562400 0 4191 263 3909 38863 49673 49673 1 AVEEEDKMTPEQLAIK Unmodified 1829.9081 0.90808003 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 61.957 61.957 2 8.7095E-18 61977 QUIQUE_C1218_190116_001 173.72 140.66 205330000 27327000 0 33964000 0 0 0 0 29658000 0 0 45321000 69062000 0 4192 1411 3910 38864;38865;38866;38867;38868;38869;38870;38871;38872 49674;49675;49676;49677;49678;49679;49680;49681;49682 49674 9 AVEELLECLDLEK Unmodified 1559.7753 0.77527495 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.08 138.08 2 8.9062E-06 143602 QUIQUE_C1218_190116_001 122.42 96.8 210760000 26439000 42280000 0 51622000 0 59661000 30759000 0 0 0 0 0 0 4193 271 3911 38873;38874;38875;38876;38877;38878;38879 49683;49684;49685;49686;49687;49688;49689 49683 6 AVEELQSIIK Acetyl (Protein N-term) 1170.6496 0.64960415 3775 Q92990 GLMN Glomulin yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.09 148.09 2 0.00069627 152873 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.033 69.815 177320000 14264000 17626000 13018000 13536000 15910000 13168000 15728000 12151000 11807000 7331900 12540000 12140000 18098000 4194 3775 3912 38880;38881;38882;38883;38884;38885;38886;38887;38888;38889;38890;38891;38892 49690;49691;49692;49693;49694;49695;49696;49697;49698;49699;49700;49701;49702 49702 13 AVEEPLNAFK Unmodified 1116.5815 0.58152458 2925 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38909;38910;38911;38912;38913 49719;49720;49721;49722;49723;49724 49719 6 AVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIK Unmodified 2917.4557 0.45566195 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 148.57 148.57 3 4.0163E-24 144378 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.387 96.39 201070000 0 0 21977000 0 0 0 0 46488000 0 25213000 50463000 56930000 0 4202 2008 3920 38914;38915;38916;38917;38918 49725;49726;49727;49728;49729;49730 49728 6 AVELAANTK Unmodified 915.50255 0.50254598 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 1 18.338 18.338 2 0.01218 10892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.692 35.297 91684000 0 0 18305000 0 0 0 0 0 0 52679000 20700000 0 0 4203 2288 3921 38919;38920;38921 49731;49732;49733 49733 3 AVELLGDIVQNCSLEDSQIEK Unmodified 2359.1577 0.15770579 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 132.56 132.56 2;3 2.2524E-208 136401 QUIQUE_C1403_190116_001 254.1 234.9 7337600000 777770000 691360000 773630000 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49788;49789;49790;49791;49792;49793;49794;49795;49796;49797;49798;49799;49800;49801 49798 12 AVENYLIQMAR Unmodified 1306.6704 0.67035637 1344 K7EQA1;O14737 PDCD5 Programmed cell death protein 5 yes no 0 0 0 1 98.146 98.146 2 0.0017272 101868 QUIQUE_C1576_190116_001 82.75 54.868 166600000 0 0 0 0 0 0 166600000 0 0 0 0 0 0 4209 1344 3927 38974 49802 49802 1 AVESLKPSIETLSTDLHTIK Unmodified 2181.1893 0.18926392 1509 O43150;A0A286YFG8 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 96.573 96.573 4 0.053741 99578 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.548 16.459 92821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45240000 0 47581000 4210 1509 3928 38975;38976 49803;49804 49804 2 AVESSKPLSNAQPSGPLKPVGNAK Unmodified 2375.2809 0.28087289 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 2 1 32.452 32.452 4 0.045749 28039 QUIQUE_DMIX3_190116_001 25.52 22.597 52584000 0 0 0 0 0 0 0 0 52584000 0 0 0 0 4211 3154 3929 38977 49805 49805 1 AVETLLDLIMK Unmodified 1244.705 0.70501054 1385 O00194 RAB27B Ras-related protein Rab-27B yes yes 0 0 0 1 1 157.69 157.69 2 0.032459 161890 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.49 29.75 107060000 68973000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38082000 4212 1385 3930 38978;38979 49806;49807;49808 49807 2 AVETPPLSSVNLLEGLSR Unmodified 1881.0207 0.020742027 1057 F8W9S7;Q14C86;B0QZ65;A0A0A0MQV8;B4DGD8;H0Y4E7;H0Y7I9;C9IZ08 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 138.46 138.46 2 0.019578 143097 QUIQUE_C1277_190116_001 56.956 42.394 21924000 0 21924000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4213 1057 3931 38980 49809 49809 1 AVEVACYVCK Unmodified 1197.5522 0.55221507 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.711 52.711 2 0.0023978 50487 QUIQUE_C1368_190116_001 106.04 92.463 674790000 81001000 129240000 67390000 0 73753000 0 73837000 0 43725000 33027000 53049000 72331000 47438000 4214 2474 3932 38981;38982;38983;38984;38985;38986;38987;38988;38989;38990;38991 49810;49811;49812;49813;49814;49815;49816;49817;49818;49819;49820;49821;49822;49823 49814 14 AVEVAWETLQEEFSR Unmodified 1792.8632 0.86317875 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 141.87 141.87 2;3 9.5185E-14 146224 QUIQUE_C1277_190116_001 162.6 129.19 2289300000 212700000 216950000 260660000 221110000 205800000 215510000 36108000 0 193150000 9797200 218540000 254730000 244220000 4215 831;1569 3933 38992;38993;38994;38995;38996;38997;38998;38999;39000;39001;39002;39003;39004;39005;39006;39007;39008;39009;39010;39011;39012 49824;49825;49826;49827;49828;49829;49830;49831;49832;49833;49834;49835;49836;49837;49838;49839;49840;49841;49842;49843;49844;49845;49846;49847 49826 23 AVEVDPSLLLHMLE Unmodified 1564.8171 0.81708018 2814 P78560 CRADD Death domain-containing protein CRADD yes yes 0 0 0 1 1 166.76 166.76 2 0.0074874 172973 QUIQUE_C1438_190116_001 59.757 41.446 75458000 0 0 0 0 41341000 0 0 34116000 0 0 0 0 0 4216 2814 3934 39013;39014 49848;49849 49848 2 AVEVLPK Unmodified 754.45889 0.45889025 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.634 27.634 2 0.039849 21901 QUIQUE_C1576_190116_001 83.377 18.114 7839400000 764400000 592330000 649250000 588530000 671740000 0 560760000 901840000 725300000 459430000 757980000 594260000 573600000 4217 166 3935 39015;39016;39017;39018;39019;39020;39021;39022;39023;39024;39025;39026 49850;49851;49852;49853;49854;49855;49856;49857;49858;49859;49860;49861;49862;49863;49864;49865 49857 16 AVEVQGPSLESGDHGK Unmodified 1608.7744 0.77436375 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 31.218 31.218 2;3 5.0437E-19 25515 QUIQUE_C1368_190116_001 146.07 116.3 937430000 87032000 138770000 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50205;50206;50207;50208;50209;50210;50211;50212;50213;50214;50215;50216;50217;50218;50219;50220;50221;50222;50223;50224;50225;50226;50227;50228;50229;50230;50231;50232;50233;50234;50235;50236;50237;50238;50239;50240;50241;50242;50243;50244;50245;50246;50247;50248;50249;50250;50251;50252;50253;50254;50255;50256;50257;50258;50259;50260;50261;50262;50263;50264;50265;50266;50267;50268;50269;50270;50271;50272;50273;50274;50275;50276;50277;50278;50279;50280;50281;50282;50283;50284;50285;50286;50287;50288;50289;50290;50291;50292;50293;50294;50295;50296;50297;50298;50299;50300;50301;50302;50303;50304;50305;50306;50307;50308;50309;50310;50311;50312;50313;50314;50315;50316;50317;50318;50319;50320;50321;50322;50323;50324;50325;50326;50327;50328;50329;50330;50331;50332;50333;50334;50335;50336;50337;50338;50339;50340;50341;50342;50343;50344;50345;50346;50347;50348;50349;50350;50351;50352;50353;50354;50355;50356;50357;50358;50359;50360;50361;50362;50363;50364;50365;50366;50367;50368;50369;50370;50371;50372;50373;50374;50375;50376;50377;50378;50379;50380;50381;50382;50383;50384;50385;50386;50387;50388;50389;50390;50391;50392;50393;50394;50395;50396;50397;50398;50399;50400;50401;50402;50403;50404;50405;50406;50407;50408;50409;50410;50411;50412;50413;50414;50415;50416;50417 50417 207 AVFVLSCLLK Unmodified 1148.6628 0.66275179 3695 Q8WU76;A0A087WUD7 SCFD2 Sec1 family domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 130.81 130.81 2 0.047085 135696 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.794 32.461 12203000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12203000 4239 3695 3957 39344;39345 50418;50419 50419 2 AVFVPDIYSR Unmodified 1165.6132 0.61315906 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.78 92.78 2 0.0046555 94961 QUIQUE_C1277_190116_001 80.165 59.645 488730000 39425000 47683000 48077000 53706000 41737000 42770000 42479000 51069000 54549000 0 67241000 0 0 4240 1692 3958 39346;39347;39348;39349;39350;39351;39352;39353;39354;39355 50420;50421;50422;50423;50424;50425;50426;50427;50428;50429;50430;50431 50422 12 AVFVSEGK Unmodified 835.44397 0.44396847 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 22.224 22.224 2 0.047991 15266 QUIQUE_C1277_190116_001 56.091 21.013 138850000 0 138850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4241 2327 3959 39356 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50653;50654;50655;50656;50657;50658;50659;50660;50661;50662;50663;50664;50665 50660 11 AVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPK Unmodified 3545.8586 0.85857443 1587 O60684;O15131;Q5TFJ7 KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 168.22 168.22 3 9.6784E-15 173546 QUIQUE_C1576_190116_001 70.98 60.819 235970000 0 0 0 0 0 0 149560000 0 0 0 0 86415000 0 4264 1587 3982 39561;39562 50666;50667 50666 2 AVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPK Unmodified 3544.7984 0.79841701 1420 O00629;H7C4F6 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.74 136.74 4 1.137E-51 141229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.5 114.64 2493900000 0 386230000 389920000 286530000 219180000 271210000 289260000 0 135620000 0 180640000 145170000 190150000 4265 1420 3983 39563;39564;39565;39566;39567;39568;39569;39570;39571;39572 50668;50669;50670;50671;50672;50673;50674;50675;50676;50677;50678;50679;50680;50681;50682 50680 14 AVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPK Unmodified 3601.8199 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AVHAHVNLGYTK Unmodified 1308.6939 0.693869 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 17.825 17.825 2;3 8.7166E-14 10227 QUIQUE_C1277_190116_001 155.15 128.36 5745000000 655570000 437850000 460320000 444810000 678800000 318620000 507780000 286000000 529420000 152070000 483560000 38045000 752150000 4276 4419 3993 39634;39635;39636;39637;39638;39639;39640;39641;39642;39643;39644;39645;39646;39647;39648;39649;39650;39651;39652;39653;39654;39655;39656;39657;39658 50755;50756;50757;50758;50759;50760;50761;50762;50763;50764;50765;50766;50767;50768;50769;50770;50771;50772;50773;50774;50775;50776;50777;50778;50779;50780;50781;50782;50783 50759 26 AVHLQGHEGPVYAVHAVYQR Unmodified 2230.1396 0.13956881 3363 Q6IA86 ELP2 Elongator complex protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 46.223 46.223 4 0.0013828 43830 QUIQUE_C1576_190116_001 49.425 39.911 115670000 0 0 32408000 0 0 0 47187000 0 0 0 0 36075000 0 4277 3363 3994 39659;39660;39661 50784;50785;50786;50787 50785 4 AVHSNPGDPALWSLLSR Unmodified 1818.9377 0.9376811 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 110.75 110.75 3 0.0035463 107637 QUIQUE_DMIX4_190116_001 39.338 23.032 12174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12174000 0 0 0 4278 3391 3995 39662 50788 50788 1 AVHTNYHAALR Unmodified 1251.6473 0.64725316 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 12.661 12.661 3 0.00054735 5067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.865 58.014 4187600 0 0 0 0 0 0 0 4187600 0 0 0 0 0 4279 4304 3996 39663 50789 50789 1 AVIDLNNR Unmodified 913.49813 0.49812931 1987 P0DN76;Q01081 U2AF1 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 38.507 38.507 2 0.049678 34050 QUIQUE_C1277_190116_001 74.191 46.704 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4280 1987 3997 39664;39665 50790;50791 50791 2 AVIDQCNHDNILR Unmodified 1566.7573 0.75727389 2122;868 E7ESP4;E9PB77;E7EMF1;P17301 ITGA2 Integrin alpha-2 no no 0 0 0 1 42.058 42.058 3 0.00090166 38965 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.139 48.514 50680000 0 0 0 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dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.211 87.211 2 5.4077E-14 88764 QUIQUE_C1368_190116_001 143.61 118.76 675500000 138000000 0 147900000 122840000 102070000 122530000 0 0 0 42169000 0 0 0 4286 4477 4003 39713;39714;39715;39716;39717;39718 50851;50852;50853;50854;50855;50856 50852 6 AVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIR Unmodified 2272.2249 0.22493792 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 5 2 1 2 1 2 1 1 2 3 2 1 140.33 140.33 2;3 1.5856E-11 144388 QUIQUE_C1403_190116_001 131.72 105.59 1158600000 165520000 94780000 67507000 92747000 0 0 119000000 36331000 90835000 62724000 181820000 151280000 96063000 4287 2881 4004 39719;39720;39721;39722;39723;39724;39725;39726;39727;39728;39729;39730;39731;39732;39733;39734;39735;39736;39737;39738;39739;39740;39741 50857;50858;50859;50860;50861;50862;50863;50864;50865;50866;50867;50868;50869;50870;50871;50872;50873;50874;50875;50876;50877;50878;50879;50880;50881;50882;50883;50884 50866 27 AVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIR Oxidation (M) 2288.2199 0.21985254 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 1 0 1 1 127.78 127.78 3 5.7948E-05 132927 QUIQUE_C1368_190116_001 49.577 42.004 90558000 0 0 52929000 0 0 0 0 0 37629000 0 0 0 0 4288 2881 4004 39742;39743 50885;50886 50885 2361 2 AVIGSTYMLTQDEVLWEK Unmodified 2082.0343 0.034343181 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 137.34 137.34 2 0.00028235 141091 QUIQUE_C1403_190116_001 80.905 70.056 31017000 0 0 0 31017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4289 3086 4005 39744 50887 50887 1 AVIHYRDDETMYVESK Oxidation (M) 1970.9044 0.90439164 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 1 1 1 39.555 39.555 3 0.040424 35629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.008 29.843 28792000 0 0 0 0 0 0 0 28792000 0 0 0 0 0 4290 1486 4006 39745 50888 50888 1 AVILELK Unmodified 784.50584 0.50584045 2615 P52888;K7EP46 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 59.233 59.233 2 0.060724 57385 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68248 QUIQUE_C1403_190116_001 56.122 48.752 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4297 4307 4012 39769;39770;39771 50918;50919;50920 50918 3 AVIQHFQEK Unmodified 1098.5822 0.58219329 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9;H7C2L2 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 17.758 17.758 2;3 6.1063E-07 10765 QUIQUE_C1218_190116_001 158.07 112.06 888180000 141740000 89418000 47550000 75708000 57372000 0 65962000 95108000 92275000 42641000 15954000 71989000 92462000 4298 147 4013 39772;39773;39774;39775;39776;39777;39778;39779;39780;39781;39782;39783;39784;39785;39786;39787;39788;39789;39790;39791;39792;39793 50921;50922;50923;50924;50925;50926;50927;50928;50929;50930;50931;50932;50933;50934;50935;50936;50937;50938;50939;50940;50941;50942;50943;50944 50922 24 AVIQVSQIVAR Unmodified 1182.7085 0.70845643 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5;J3QS45 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.043 73.043 2 0.00074751 73309 QUIQUE_C1403_190116_001 138.1 58.501 4022100000 343330000 313030000 403070000 294540000 306000000 308560000 321560000 294600000 299470000 127470000 359090000 337500000 313870000 4299 3464 4014 39794;39795;39796;39797;39798;39799;39800;39801;39802;39803;39804;39805;39806 50945;50946;50947;50948;50949;50950;50951;50952;50953;50954;50955;50956;50957;50958 50948 6 AVITSLLDQIPEMFADTR Unmodified 2019.0347 0.034677532 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 168.96 168.96 2;3 3.0245E-45 170443 QUIQUE_C1563_190116_001 172.57 148.9 919800000 63441000 0 20677000 31941000 39304000 185980000 194790000 87554000 59600000 0 70439000 75128000 90941000 4300 2636 4015 39807;39808;39809;39810;39811;39812;39813;39814;39815;39816;39817;39818;39819;39820 50959;50960;50961;50962;50963;50964;50965;50966;50967;50968;50969;50970;50971;50972;50973 50965 14 AVITVQR Unmodified 785.47594 0.4759373 1093 G3XAI2;P07942;E7EPA6 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 22.257 22.257 2 0.060883 14893 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.093 2.0582 601080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 601080000 0 0 0 4301 1093 4016 39821 50974 50974 1 AVITVQRPGR Unmodified 1095.6513 0.6512759 1093 G3XAI2;P07942;E7EPA6 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 21.604 21.604 3 0.067318 14712 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.715 11.374 19989000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19989000 0 0 4302 1093 4017 39822 50975 50975 1 AVIVIQDIFGWQLPNTR Unmodified 1969.0785 0.078531678 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 0 2 2 2 3 1 1 163.38 163.38 2;3 3.4605E-24 167775 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.59 140.04 594240000 0 0 0 0 0 0 85109000 138010000 126840000 0 141830000 102450000 0 4303 3835 4018 39823;39824;39825;39826;39827;39828;39829;39830;39831;39832;39833 50976;50977;50978;50979;50980;50981;50982;50983;50984;50985;50986;50987;50988 50988 12 AVIVLVENFYK Unmodified 1293.7333 0.7332742 3855 Q96FQ6 S100A16 Protein S100-A16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.18 120.18 2 0.00040416 124071 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.9 93.751 842510000 33400000 55762000 83891000 31855000 58160000 41890000 63943000 84456000 110410000 23178000 95102000 89434000 71031000 4304 3855 4019 39834;39835;39836;39837;39838;39839;39840;39841;39842;39843;39844;39845;39846 50989;50990;50991;50992;50993;50994;50995;50996;50997;50998;50999;51000;51001;51002;51003;51004;51005 50999 17 AVIVPGNGGGDVTTHGWYGWVK Unmodified 2269.128 0.12800107 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.83 108.83 3 8.6421E-06 113764 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.784 56.965 686760000 0 71290000 75920000 71333000 73439000 0 72482000 0 126910000 0 103190000 0 92196000 4305 1663 4020 39847;39848;39849;39850;39851;39852;39853;39854 51006;51007;51008;51009;51010;51011;51012;51013 51012 8 AVKSEANATQLLR Unmodified 1399.7783 0.77832691 115 A0A087X211;Q8TCG1;F8WF26;F8WAX6 KIAA1524 Protein CIP2A yes no 0 0 1 1 62.335 62.335 3 0.066133 62384 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.327 8.5867 62494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62494000 0 0 4306 115 4021 39855 51014 51014 1 AVLAELPQQVVQYFK Unmodified 1731.956 0.95595693 3853 Q96FN4 CPNE2 Copine-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 147.45 147.45 2 0.0085278 143418 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.499 59.08 177490000 0 0 0 31269000 0 30843000 0 0 58772000 11758000 0 0 44849000 4307 3853 4022 39856;39857;39858;39859;39860 51015;51016;51017;51018;51019 51018 3 AVLAESYER Unmodified 1036.5189 0.51892433 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.454 34.454 2 0.0010141 29839 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.66 63.218 1703900000 120350000 137040000 122930000 144990000 0 120510000 131490000 138680000 143060000 78354000 224690000 150730000 191070000 4308 2180 4023 39861;39862;39863;39864;39865;39866;39867;39868;39869;39870;39871;39872 51020;51021;51022;51023;51024;51025;51026;51027;51028;51029;51030;51031;51032;51033;51034;51035 51032 13 AVLAHVDVQTLSSQLAVTVGPGER Unmodified 2446.318 0.31798668 3787 Q969P0 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.8 123.8 3 7.1639E-12 127778 QUIQUE_C1277_190116_001 63.376 51.41 582110000 56097000 51743000 89175000 0 73255000 0 88991000 0 82783000 62633000 0 0 77433000 4309 3787 4024 39873;39874;39875;39876;39877;39878;39879;39880 51036;51037;51038;51039;51040;51041;51042;51043 51037 7 AVLAPLIALVYSVPR Unmodified 1580.9654 0.9653994 4577 Q9Y320;E9PSF0;E9PRL5;H3BSU7;E9PLR1;G3V155 TMX2;TMX2-CTNND1 Thioredoxin-related transmembrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 166.65 166.65 2;3 3.2859E-13 171006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.03 98.866 57769000 0 8366400 0 12818000 0 0 0 23877000 12708000 0 0 0 0 4310 4577 4025 39881;39882;39883;39884;39885 51044;51045;51046;51047;51048 51048 4 AVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDVIR Oxidation (M) 3285.5242 0.524169 2582 P51553 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 112.07 112.07 3 3.1733E-54 116068 QUIQUE_C1218_190116_001 133.44 125.58 47612000 47612000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4311 2582 4026 39886 51049 51049 2030 1 AVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDVIR Unmodified 3269.5293 0.52925438 2582 P51553 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.77 120.77 3 1.4301E-102 126211 QUIQUE_C1218_190116_001 172.06 166.09 794260000 102400000 78251000 72023000 68660000 45715000 0 98608000 0 58566000 27178000 62962000 99479000 80419000 4312 2582 4026 39887;39888;39889;39890;39891;39892;39893;39894;39895;39896;39897 51050;51051;51052;51053;51054;51055;51056;51057;51058;51059;51060;51061;51062;51063 51051 14 AVLCPPPVK Unmodified 979.55247 0.55247306 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 38.55 38.55 2 0.0048582 34163 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 59.517 3365700000 280360000 329930000 393880000 367410000 265910000 328390000 390780000 222090000 242790000 82071000 268770000 193340000 0 4313 2776 4027 39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915 51064;51065;51066;51067;51068;51069;51070;51071;51072;51073;51074;51075;51076;51077;51078;51079;51080;51081;51082;51083;51084;51085;51086;51087;51088;51089;51090;51091;51092;51093;51094;51095;51096;51097;51098;51099;51100 51089 37 AVLCPPPVKK Unmodified 1107.6474 0.64743608 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 1 1 21.431 21.431 3 0.044293 14618 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 26.354 69110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69110000 0 0 4314 2776 4028 39916 51101 51101 0 AVLDALLASK Unmodified 999.59645 0.59644637 3348 Q66K74;M0R1M7 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.17 97.17 2 0.014657 100188 QUIQUE_C1368_190116_001 64.04 31.2 448180000 0 62556000 77241000 49035000 0 0 0 53849000 0 0 88526000 63865000 53105000 4315 3348 4029 39917;39918;39919;39920;39921;39922;39923 51102;51103;51104;51105;51106;51107;51108 51103 7 AVLDALLEGK Unmodified 1027.5914 0.59136099 2483;921 E9PGC8;P78559;P46821 MAP1A;MAP1B Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2;Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.83 104.83 2 0.00095808 108270 QUIQUE_C1368_190116_001 103.55 73.973 19029000000 1345600000 1324500000 1843500000 1327400000 1159800000 1457800000 1765500000 1161700000 1362400000 623220000 1793600000 1974600000 1889300000 4316 921;2483 4030 39924;39925;39926;39927;39928;39929;39930;39931;39932;39933;39934;39935;39936 51109;51110;51111;51112;51113;51114;51115;51116;51117;51118;51119;51120;51121;51122;51123;51124;51125;51126;51127;51128;51129;51130;51131;51132;51133;51134;51135;51136;51137;51138;51139;51140 51114 32 AVLDLVDQCPK Unmodified 1256.6435 0.64347291 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.063 79.063 2 0.000395 79879 QUIQUE_C1368_190116_001 116.52 85.149 565250000 73021000 0 77436000 0 42043000 0 37553000 47240000 64755000 23532000 109770000 30704000 59193000 4317 3269 4031 39937;39938;39939;39940;39941;39942;39943;39944;39945;39946 51141;51142;51143;51144;51145;51146;51147;51148;51149;51150;51151 51142 11 AVLDPQGLMNPGK Unmodified 1338.6966 0.69657112 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 87.31 87.31 2 0.00038801 90133 QUIQUE_C1218_190116_001 108.57 80.688 196690000 41907000 0 90737000 0 0 64042000 0 0 0 0 0 0 0 4318 3511 4032 39947;39948;39949;39950 51152;51153;51154;51155 51152 3 AVLDSTNADGISALHQACIDENLEVVR Unmodified 2909.4189 0.41889929 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 118.91 118.91 3 1.6362E-05 122542 QUIQUE_C1277_190116_001 50.055 43.103 70883000 0 35176000 0 0 0 0 35707000 0 0 0 0 0 0 4319 1327 4033 39951;39952 51156;51157;51158 51156 3 AVLDVFEEGTEASAATAVK Unmodified 1906.9524 0.95238769 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 2 2 3 1 1 1 1 1 1 2 3 1 1 119.74 119.74 2;3 2.0553E-45 124866 QUIQUE_C1576_190116_001 200.13 170.19 2409700000 125340000 200730000 427060000 141220000 198770000 71893000 160230000 119630000 61266000 205880000 452690000 57969000 187060000 4320 1800 4034 39953;39954;39955;39956;39957;39958;39959;39960;39961;39962;39963;39964;39965;39966;39967;39968;39969;39970;39971;39972 51159;51160;51161;51162;51163;51164;51165;51166;51167;51168;51169;51170;51171;51172;51173;51174;51175;51176;51177;51178;51179;51180;51181;51182;51183;51184;51185;51186;51187 51175 27 AVLEALGSCLNNK Unmodified 1387.7129 0.71294946 2359 P34896;J3KRZ5;J3KRK5 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.619 81.619 2 5.5258E-06 83751 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.7 82.256 223710000 0 0 0 0 0 0 0 0 43066000 15942000 59532000 57478000 47687000 4321 2359 4035 39973;39974;39975;39976;39977;39978;39979 51188;51189;51190;51191;51192;51193;51194 51192 6 AVLEECTSFIPEAR Unmodified 1620.7818 0.78175731 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.149 95.149 2 0.00042969 97465 QUIQUE_C1368_190116_001 108.35 90.289 600800000 69867000 0 97213000 46392000 0 59195000 62380000 60767000 0 0 129830000 0 75163000 4322 3269 4036 39980;39981;39982;39983;39984;39985;39986;39987;39988 51195;51196;51197;51198;51199;51200;51201;51202;51203;51204 51196 10 AVLENALR Unmodified 884.50797 0.50796571 3764 Q92890;C9IZG3;C9JNP9 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.504 39.504 2 0.0092599 36584 QUIQUE_C1218_190116_001 92.822 32.023 524470000 102090000 83117000 0 125520000 91481000 0 0 0 58653000 63609000 0 0 0 4323 3764 4037 39989;39990;39991;39992;39993;39994 51205;51206;51207;51208;51209;51210 51205 6 AVLENNLGAAVLR Unmodified 1338.7619 0.76194857 4351 Q9NZL9;H7C0X7 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.249 86.249 2 2.6574E-09 88009 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.91 109.61 1977300000 143350000 203270000 196450000 151140000 0 137380000 163880000 126960000 177520000 72328000 217650000 188100000 199310000 4324 4351 4038 39995;39996;39997;39998;39999;40000;40001;40002;40003;40004;40005;40006 51211;51212;51213;51214;51215;51216;51217;51218;51219;51220;51221;51222 51218 0 AVLEPIQSTSLIGTLTR Unmodified 1798.02 0.020013746 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 3.8611E-11 135395 QUIQUE_C1218_190116_001 121.24 103.43 490550000 32123000 35684000 25626000 39845000 40376000 41935000 29659000 44131000 46659000 11649000 46945000 35438000 60476000 4325 3423 4039 40007;40008;40009;40010;40011;40012;40013;40014;40015;40016;40017;40018;40019 51223;51224;51225;51226;51227;51228;51229;51230;51231;51232;51233;51234;51235 51223 13 AVLEQEETAAASR Unmodified 1373.6787 0.67867245 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.532 37.532 2 1.809E-05 34250 QUIQUE_C1576_190116_001 140.3 122.44 7972700000 664810000 647560000 818690000 697470000 518790000 737640000 783770000 561170000 463920000 204250000 599580000 513660000 761380000 4326 143;560;4559 4040 40020;40021;40022;40023;40024;40025;40026;40027;40028;40029;40030;40031;40032 51236;51237;51238;51239;51240;51241;51242;51243;51244;51245;51246;51247;51248;51249;51250;51251;51252;51253;51254;51255;51256;51257 51248 22 AVLEQFGFPLTGTEAR Unmodified 1734.8941 0.89408495 4552 Q9Y2C4;H7C0W6;F8WE28;F8WE38 EXOG Nuclease EXOG, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 128.46 128.46 2 1.198E-06 134004 QUIQUE_C1218_190116_001 111.31 78.984 156990000 45557000 0 0 0 0 0 0 31212000 0 0 0 39431000 40790000 4327 4552 4041 40033;40034;40035;40036;40037 51258;51259;51260;51261;51262;51263 51259 6 AVLEQFLSFAK Unmodified 1251.6863 0.68632401 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.27 135.27 2 0.0018206 140397 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 81.18 247290000 21500000 24071000 18045000 0 25777000 0 0 31438000 29111000 0 32359000 36705000 28286000 4328 264 4042 40038;40039;40040;40041;40042;40043;40044;40045;40046;40047;40048 51264;51265;51266;51267;51268;51269;51270;51271;51272;51273;51274;51275 51266 11 AVLFCLSDDKR Unmodified 1322.6653 0.66527099 4546 Q9Y281;F8WDN3 CFL2 Cofilin-2 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 3 2 2 2 61.344 61.344 2;3 0.00022028 60778 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.36 89.213 3446300000 253820000 285760000 317120000 78809000 330070000 175840000 337000000 119820000 233880000 107760000 408850000 326940000 470600000 4329 4546 4043 40049;40050;40051;40052;40053;40054;40055;40056;40057;40058;40059;40060;40061;40062;40063;40064;40065;40066;40067;40068;40069;40070;40071 51276;51277;51278;51279;51280;51281;51282;51283;51284;51285;51286;51287;51288;51289;51290;51291;51292;51293;51294;51295;51296;51297;51298;51299;51300;51301 51295 24 AVLFCLSEDK Unmodified 1180.5798 0.57981002 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.277 84.277 2 2.5411E-07 86816 QUIQUE_C1218_190116_001 149.65 130.87 2546200000 349800000 174250000 273570000 267320000 282360000 371650000 221450000 106290000 136940000 133130000 0 103370000 126030000 4330 2220 4044 40072;40073;40074;40075;40076;40077;40078;40079;40080;40081;40082;40083;40084 51302;51303;51304;51305;51306;51307;51308;51309;51310;51311;51312;51313;51314;51315;51316 51302 15 AVLFCLSEDKK Unmodified 1308.6748 0.67477304 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 1 2 2 3 3 2 2 2 3 3 2 3 2 2 56.309 56.309 2;3 5.323E-08 54436 QUIQUE_C1403_190116_001 149.82 120.01 36441000000 2421500000 2700500000 2909800000 2370400000 2782800000 2102400000 3001200000 2907000000 2946100000 1656800000 3861300000 2953200000 3827700000 4331 2220 4045 40085;40086;40087;40088;40089;40090;40091;40092;40093;40094;40095;40096;40097;40098;40099;40100;40101;40102;40103;40104;40105;40106;40107;40108;40109;40110;40111;40112;40113;40114;40115 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4339 2209;4270 4053 40187 51460 51460 0 AVLLEALGSPSEDVR Unmodified 1554.8253 0.82533668 1614 O75155 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 102.59 102.59 2 0.0016503 105313 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.44 42.322 97768000 0 26134000 0 0 15824000 0 0 0 0 0 23507000 32303000 0 4340 1614 4054 40188;40189;40190;40191 51461;51462;51463;51464 51464 4 AVLLGPPGAGK Unmodified 978.58622 0.58621603 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;F8VY04;G3V213;F8VPP1 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.794 45.794 2 0.021177 43431 QUIQUE_C1438_190116_001 60.59 22.352 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4341 1047 4055 40192;40193;40194;40195;40196;40197;40198 51465;51466;51467;51468;51469;51470;51471 51468 7 AVLLLEHVER Unmodified 1177.6819 0.68190733 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 57.087 57.087 2;3 0.018569 57045 QUIQUE_C1218_190116_001 60.91 39.462 566620000 123860000 0 102050000 62339000 0 0 0 44770000 31648000 0 101660000 0 100290000 4342 4476;703 4056 40199;40200;40201;40202;40203;40204;40205;40206;40207;40208;40209 51472;51473;51474;51475;51476;51477;51478;51479;51480;51481;51482 51472 8 AVLLSLAEEDY Unmodified 1221.6129 0.61288429 1026 F6VCX5;Q16816 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 136.68 136.68 2 0.02252 139597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.205 40.486 25715000 0 0 0 0 0 0 0 25715000 0 0 0 0 0 4343 1026 4057 40210 51483 51483 1 AVLLTGEQGTAK Unmodified 1186.6558 0.65575216 1130 H0Y7V4;A0A075B6F3;Q96JB1 DNAH8 Dynein heavy chain 8, axonemal yes no 0 0 0 1 117.87 117.87 2 0.049285 122130 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.753 12.398 14991000 0 0 0 0 0 0 0 0 14991000 0 0 0 0 4344 1130 4058 40211 51484 51484 1 AVLNLLFSPR Unmodified 1128.6655 0.66552898 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 119.96 119.96 2 0.0015231 123637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.624 70.021 184890000 0 0 0 30852000 38737000 0 29720000 0 0 0 38690000 46887000 0 4345 1913 4059 40212;40213;40214;40215;40216 51485;51486;51487;51488;51489 51489 5 AVLNLLR Unmodified 797.51232 0.51232281 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 69.534 69.534 2 0.019666 69669 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.05 39.702 24492000 0 0 0 0 0 0 0 0 24492000 0 0 0 0 4346 3777 4060 40217 51490 51490 1 AVLNPLCQVDYR Unmodified 1446.7289 0.72893388 1007;463 F5H365;Q15436;G3V4V1;G3V1W4;G3V3G5;G3V2R6;A0A2R8YFH5;Q15437;Q5QPE2 SEC23A;SEC23B Protein transport protein Sec23A;Protein transport protein Sec23B no no 0 0 0 1 91.485 91.485 2 0.00055081 94016 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.24 69.768 95588000 0 0 0 0 0 0 0 0 95588000 0 0 0 0 4347 1007;463 4061 40218 51491;51492 51491 2 AVLNPTPIKR Unmodified 1107.6764 0.67642802 2830 P84095 RHOG Rho-related GTP-binding protein RhoG yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 24.785 24.785 2;3 0.0023637 18763 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.908 57.099 631900000 0 0 31954000 0 0 0 42976000 61207000 105640000 14772000 165200000 14564000 195590000 4348 2830 4062 40219;40220;40221;40222;40223;40224;40225;40226;40227;40228;40229;40230 51493;51494;51495;51496;51497;51498;51499;51500;51501;51502;51503;51504;51505 51497 12 AVLPLLDAQQPCYLLYR Unmodified 2032.0816 0.081568145 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 148.23 148.23 2;3 4.6554E-30 155296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.48 173.26 1479400000 79183000 127730000 141040000 158050000 154820000 39341000 92270000 88459000 94657000 40340000 182430000 119680000 161440000 4349 3365 4063 40231;40232;40233;40234;40235;40236;40237;40238;40239;40240;40241;40242;40243;40244;40245;40246;40247;40248;40249;40250;40251;40252 51506;51507;51508;51509;51510;51511;51512;51513;51514;51515;51516;51517;51518;51519;51520;51521;51522;51523;51524;51525;51526;51527;51528;51529;51530;51531 51527 25 AVLPVAESFGFADEIR Unmodified 1719.8832 0.88318591 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 138.23 138.23 2 0.018159 145477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.159 34.427 30731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30731000 0 0 4350 3454 4064 40253 51532 51532 1 AVLQEFGR Unmodified 918.49232 0.49231565 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 50.095 50.095 2 0.045132 47626 QUIQUE_C1403_190116_001 57.281 23.543 81121000 0 0 0 81121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4351 4581 4065 40254 51533 51533 1 AVLQWTK Unmodified 844.48069 0.48068833 3867 Q96HE7;G3V3E6;G3V5B3 ERO1L ERO1-like protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 47.346 47.346 2 0.030434 44795 QUIQUE_C1277_190116_001 90.706 45.733 200780000 58927000 52398000 47000000 0 0 0 0 0 0 0 0 42457000 0 4352 3867 4066 40255;40256;40257;40258 51534;51535;51536;51537 51535 4 AVLSAEQLRDEEVHAGLGELLR Unmodified 2404.271 0.27103649 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PQ34 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 115.23 115.23 3;4 3.9108E-07 119147 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.847 74.279 291350000 0 0 0 30271000 102260000 0 0 55682000 36071000 0 42472000 0 24596000 4353 2565 4067 40259;40260;40261;40262;40263;40264;40265;40266 51538;51539;51540;51541;51542;51543;51544;51545 51543 8 AVLSLYASGR Unmodified 1035.5713 0.57129425 1333 K7EM38 ACTG1 yes yes 0 0 0 1 59.943 59.943 2 0.025539 59232 QUIQUE_C1368_190116_001 78.113 38.015 33298000 0 0 33298000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4354 1333 4068 40267 51546 51546 0 AVLTIDEK Unmodified 887.4964 0.49639797 1799;4 A0A024R6I7;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.74 36.74 2 0.008111 32461 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.541 45.517 5232100000 794270000 0 771280000 0 1029100000 0 680500000 0 0 412180000 735340000 0 809380000 4355 4;1799 4069 40268;40269;40270;40271;40272;40273;40274;40275 51547;51548;51549;51550;51551;51552;51553;51554;51555;51556;51557;51558 51553 12 AVLTPNHVEFSR Unmodified 1368.715 0.71499837 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 46.226 46.226 2;3 0.00048854 43966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.16 70.359 2837800000 151790000 224330000 223260000 190120000 229480000 120680000 242440000 223320000 239220000 48147000 308630000 270950000 365480000 4356 3533 4070 40276;40277;40278;40279;40280;40281;40282;40283;40284;40285;40286;40287;40288;40289;40290;40291;40292;40293;40294;40295;40296;40297;40298 51559;51560;51561;51562;51563;51564;51565;51566;51567;51568;51569;51570;51571;51572;51573;51574;51575;51576;51577;51578;51579;51580;51581;51582;51583;51584;51585;51586 51574 27 AVLVALK Unmodified 712.48471 0.48471107 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 41.454 41.454 2 0.05526 38826 QUIQUE_C1438_190116_001 72.021 7.4579 32618000 0 0 0 0 32618000 0 0 0 0 0 0 0 0 4357 2254 4071 40299 51587 51587 1 AVLVDLEPGTMDSVR Oxidation (M) 1616.808 0.80797206 2797;1862;3230;1363 P04350;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;A0A075B724;P68371;Q3ZCM7;M0QY37 TUBB4A;TUBB8;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-8 chain no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.335 86.335 2 8.1122E-06 87655 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.06 97.568 48143000000 2873000000 3954900000 3514000000 2870900000 3134500000 0 3110600000 4250300000 4835700000 3821100000 5733000000 4491400000 5554100000 4358 1862;2797;3230;1363 4072 40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;40307;40308;40309;40310;40311 51588;51589;51590;51591;51592;51593;51594;51595;51596;51597;51598;51599;51600;51601 51596 764 14 AVLVDLEPGTMDSVR Unmodified 1600.8131 0.81305744 2797;1862;3230;1363 P04350;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;A0A075B724;P68371;Q3ZCM7;M0QY37 TUBB4A;TUBB8;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-8 chain no no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 4 104.51 104.51 2;3 4.1228E-18 107892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.24 99.127 118710000000 11371000000 12474000000 10019000000 9809600000 9801600000 9564100000 12167000000 9349800000 9559300000 2945500000 11941000000 9515500000 189840000 4359 1862;2797;3230;1363 4072 40312;40313;40314;40315;40316;40317;40318;40319;40320;40321;40322;40323;40324;40325;40326;40327;40328;40329;40330;40331;40332;40333;40334;40335;40336;40337;40338;40339;40340;40341;40342;40343;40344;40345;40346;40347;40348;40349;40350 51602;51603;51604;51605;51606;51607;51608;51609;51610;51611;51612;51613;51614;51615;51616;51617;51618;51619;51620;51621;51622;51623;51624;51625;51626;51627;51628;51629;51630;51631;51632;51633;51634;51635;51636;51637;51638;51639;51640;51641;51642;51643;51644;51645;51646;51647;51648;51649;51650;51651;51652;51653;51654;51655;51656;51657;51658;51659;51660;51661;51662;51663;51664 51642 62 AVLVDLSGTLHIEDAAVPGAQEALKR Unmodified 2672.4497 0.44972914 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7;A0A1B0GXB1;K7EJQ8;K7EKX8 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 121.64 121.64 3;4 0.0034924 126412 QUIQUE_DMIX8_190116_001 29.47 22.254 459640000 0 0 0 0 0 0 0 42200000 113850000 0 0 110050000 193540000 4360 4123 4073 40351;40352;40353;40354;40355 51665;51666;51667;51668;51669;51670 51669 6 AVLVGYDEHFSFAK Unmodified 1581.7827 0.78274359 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 3 3 2 2 1 2 3 5 2 2 2 2 2 90.534 90.534 2;3 7.662E-05 92503 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.944 80.467 2148100000 218860000 202580000 176140000 90566000 116970000 159190000 206210000 195200000 164650000 51351000 195840000 177450000 193130000 4361 3859 4074 40356;40357;40358;40359;40360;40361;40362;40363;40364;40365;40366;40367;40368;40369;40370;40371;40372;40373;40374;40375;40376;40377;40378;40379;40380;40381;40382;40383;40384;40385;40386 51671;51672;51673;51674;51675;51676;51677;51678;51679;51680;51681;51682;51683;51684;51685;51686;51687;51688;51689;51690;51691;51692;51693;51694;51695;51696;51697;51698;51699;51700;51701;51702;51703;51704;51705;51706 51695 30 AVLWVSADGLR Unmodified 1185.6506 0.6506072 2544 P49757;G3V3R1;G3V3M5 NUMB Protein numb homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 100.3 100.3 2 0.002534 102190 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.358 53.929 128600000 24262000 0 0 25577000 0 0 0 23588000 0 0 27559000 27610000 0 4362 2544 4075 40387;40388;40389;40390;40391;40392;40393;40394 51707;51708;51709;51710;51711;51712;51713;51714 51711 8 AVLYNYR Unmodified 897.47085 0.47085192 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 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51716;51717;51718;51719;51720;51721;51722;51723;51724;51725;51726;51727;51728;51729;51730;51731;51732;51733;51734;51735;51736;51737;51738;51739;51740;51741;51742;51743;51744;51745;51746;51747;51748;51749;51750;51751;51752;51753;51754;51755;51756;51757;51758;51759;51760;51761;51762;51763;51764;51765;51766 51720 456 51 AVMDDFAAFVEK Unmodified 1341.6275 0.6274885 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 3 131.62 131.62 2;3 0.00012363 135221 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.68 111.34 52375000000 4526900000 5296400000 2252500000 5721100000 7028000000 4053700000 3348300000 1196500000 3479600000 962670000 4307700000 4356400000 5845500000 + 4365 769 4077 40422;40423;40424;40425;40426;40427;40428;40429;40430;40431;40432;40433;40434;40435;40436;40437;40438;40439;40440;40441;40442;40443;40444;40445;40446;40447;40448 51767;51768;51769;51770;51771;51772;51773;51774;51775;51776;51777;51778;51779;51780;51781;51782;51783;51784;51785;51786;51787;51788;51789;51790;51791;51792;51793;51794;51795;51796;51797;51798;51799;51800;51801;51802;51803;51804;51805;51806;51807;51808;51809;51810;51811;51812;51813 51804 45 AVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAK Oxidation (M) 2740.4357 0.43571855 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.57 167.57 3 8.9558E-24 169489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.43 110.93 2119300000 150450000 178430000 240310000 149260000 0 52702000 157120000 243590000 227030000 0 332840000 156020000 231500000 4366 2250 4078 40449;40450;40451;40452;40453;40454;40455;40456;40457;40458;40459;40460 51814;51815;51816;51817;51818;51819;51820;51821;51822;51823;51824;51825 51821 1609 11 AVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAK Unmodified 2724.4408 0.44080393 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 169.9 169.9 2;3 1.2806E-195 175218 QUIQUE_C1576_190116_001 236.02 231.98 4275100000 0 311410000 232300000 107600000 185700000 348350000 687310000 255540000 687050000 65659000 492730000 492030000 409440000 4367 2250 4078 40461;40462;40463;40464;40465;40466;40467;40468;40469;40470;40471;40472;40473;40474 51826;51827;51828;51829;51830;51831;51832;51833;51834;51835;51836;51837;51838;51839 51832 14 AVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAK Unmodified 2710.4252 0.42515387 2369 P35221;G3XAM7;E5RFK9;E5RFM5;E5RJP7;E5RGD2;E5RFG3;A0A087WZL6;E5RGU3;E5RHJ5;E5RGG4;E5RJ43;E5RGS1 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.67 168.67 3 2.9296E-29 170561 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.19 120.67 1293600000 74918000 72879000 0 160700000 112640000 0 136570000 214910000 113350000 21220000 143760000 129310000 113330000 4368 2369 4079 40475;40476;40477;40478;40479;40480;40481;40482;40483;40484;40485 51840;51841;51842;51843;51844;51845;51846;51847;51848;51849;51850 51845 10 AVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAK Oxidation (M) 2726.4201 0.42006849 2369 P35221;G3XAM7;E5RFK9;E5RFM5;E5RJP7;E5RGD2;E5RFG3;A0A087WZL6;E5RGU3;E5RHJ5;E5RGG4;E5RJ43;E5RGS1 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 1 0 1 1 1 166.27 166.27 3 1.5608E-17 168354 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.387 92.738 192210000 0 0 0 0 0 0 0 52822000 0 0 81004000 58387000 0 4369 2369 4079 40486;40487;40488 51851;51852;51853 51851 1768 3 AVMEIMTK Unmodified 921.46636 0.46636017 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.001 46.001 2 0.0095269 42850 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 60.535 2951100000 291760000 330130000 306170000 287030000 0 237860000 311740000 215320000 224280000 71947000 0 279070000 395760000 4370 3982 4080 40489;40490;40491;40492;40493;40494;40495;40496;40497;40498;40499;40500;40501 51854;51855;51856;51857;51858;51859;51860;51861;51862;51863;51864;51865;51866 51862 13 AVMEQANLQR Unmodified 1158.5815 0.58154136 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 30.218 30.218 2 0.00053379 24864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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40568;40569;40570;40571;40572;40573;40574;40575;40576;40577;40578;40579;40580;40581;40582;40583;40584 51945;51946;51947;51948;51949;51950;51951;51952;51953;51954;51955;51956;51957;51958;51959;51960;51961;51962;51963 51947 3017 19 AVMVSNILLINK Unmodified 1313.7741 0.77409316 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.3 108.3 2 0.0001339 113097 QUIQUE_C1438_190116_001 130.96 103.22 5040700000 379160000 464100000 504210000 412540000 318130000 319520000 455970000 411760000 326280000 130000000 439740000 419230000 460050000 4378 4567 4086 40585;40586;40587;40588;40589;40590;40591;40592;40593;40594;40595;40596;40597 51964;51965;51966;51967;51968;51969;51970;51971;51972;51973;51974;51975;51976 51968 5 AVNPFLADVDK Unmodified 1187.6186 0.61863837 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 85.247 85.247 2 0.043288 86697 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.49 29.418 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4379 3037 4087 40598 51977 51977 1 AVNPFLADVDKLK Unmodified 1428.7977 0.79766537 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.672 95.672 3 0.00097037 97960 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.891 45.562 186930000 0 0 0 0 21028000 0 12047000 26217000 26084000 0 37600000 29390000 34558000 4380 3037 4088 40599;40600;40601;40602;40603;40604;40605 51978;51979;51980;51981;51982;51983;51984 51980 7 AVNTAPVPGQTPHDESDRR Unmodified 2045.9879 0.98787877 1532 O43581;F5H8G7 SYT7 Synaptotagmin-7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 19.75 19.75 3;4 5.0181E-05 12124 QUIQUE_C1277_190116_001 75.548 59.606 243910000 50838000 41326000 91572000 60172000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4381 1532 4089 40606;40607;40608;40609 51985;51986;51987;51988 51986 3 AVNTAQGLFQR Unmodified 1203.636 0.63601977 1549 O43752 STX6 Syntaxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.664 54.664 2 0.011417 52361 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.136 38.938 144520000 36342000 0 0 0 36406000 31733000 40036000 0 0 0 0 0 0 4382 1549 4090 40610;40611;40612;40613;40614 51989;51990;51991;51992;51993 51993 4 AVNTQALSGAGILR Unmodified 1369.7678 0.76776223 1590 O60749 SNX2 Sorting nexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.739 76.739 2 2.7074E-10 78753 QUIQUE_C1218_190116_001 164.65 140.56 1462600000 80206000 97889000 104900000 127330000 115700000 109340000 95106000 159380000 125770000 80947000 115360000 103640000 147100000 4383 1590 4091 40615;40616;40617;40618;40619;40620;40621;40622;40623;40624;40625;40626;40627;40628 51994;51995;51996;51997;51998;51999;52000;52001;52002;52003;52004;52005;52006;52007;52008;52009 51995 16 AVNVAFLGCPGFAEVLQTFSTCK Unmodified 2515.224 0.22395164 3588 Q8N465;B5MCV2 D2HGDH D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 167.27 167.27 3 7.795E-06 169243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.913 34.613 56963000 0 0 0 0 0 23232000 0 33731000 0 0 0 0 0 4384 3588 4092 40629;40630;40631 52010;52011;52012 52012 2 AVNVYSTSITQETMSR Acetyl (Protein N-term) 1827.8673 0.86727785 1349 K7ERD8;M0QX52;K7ENB3 MAPRE2 yes no 1 0 0 1 1 118.16 118.16 2 0.00070728 121737 QUIQUE_C1277_190116_001 73.881 57.262 117740000 0 44182000 0 0 0 0 0 0 0 0 73554000 0 0 4385 1349 4093 40632;40633 52013;52014 52013 2 AVNVYSTSITQETMSR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1843.8622 0.86219247 1349 K7ERD8;M0QX52;K7ENB3 MAPRE2 yes no 1 1 0 1 1 1 104.1 104.1 2 9.5598E-07 107640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.53 93.85 101050000 0 0 0 0 0 0 0 0 48431000 0 52617000 0 0 4386 1349 4093 40634;40635;40636 52015;52016;52017 52015 755 2 AVNVYSTSVTSDNLSR Acetyl (Protein N-term) 1753.8483 0.84825697 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 2 1 2 104.43 104.43 2 6.2745E-30 108115 QUIQUE_C1218_190116_001 164.48 144.19 1354300000 166460000 165560000 189830000 212150000 0 276290000 0 226170000 0 117830000 0 0 0 4387 3150 4094 40637;40638;40639;40640;40641;40642;40643;40644;40645 52018;52019;52020;52021;52022;52023;52024;52025;52026;52027;52028 52018 11 AVNVYSTSVTSENLSR Acetyl (Protein N-term) 1767.8639 0.86390703 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 1 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 105.26 105.26 2 4.1828E-36 108142 QUIQUE_DMIX8_190116_001 168.98 150.88 2603600000 194300000 256460000 128670000 154840000 151370000 131180000 153170000 183790000 355400000 101020000 283510000 299630000 210310000 4388 4524 4095 40646;40647;40648;40649;40650;40651;40652;40653;40654;40655;40656;40657;40658;40659;40660;40661;40662;40663;40664 52029;52030;52031;52032;52033;52034;52035;52036;52037;52038;52039;52040;52041;52042;52043;52044;52045;52046;52047;52048;52049;52050;52051;52052;52053;52054;52055;52056;52057;52058 52057 30 AVNYFSK Unmodified 827.41775 0.41775372 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 29.408 29.408 2 0.034902 24044 QUIQUE_C1576_190116_001 87.284 36.745 3031900000 0 0 0 0 0 0 864460000 0 0 0 1103500000 0 1064000000 4389 50 4096 40665;40666;40667 52059;52060;52061 52059 3 AVPAALILR Acetyl (Protein N-term) 964.60695 0.60695147 812 D6RC04;Q9Y6G5 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.93 137.93 2 0.0058737 144261 QUIQUE_C1438_190116_001 72.138 61.322 285020000 26482000 26868000 18650000 0 26545000 24283000 26059000 19682000 24741000 7790900 19172000 31721000 33025000 4390 812 4097 40668;40669;40670;40671;40672;40673;40674;40675;40676;40677;40678;40679 52062;52063;52064;52065;52066;52067;52068;52069;52070;52071;52072;52073 52065 11 AVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGR Unmodified 2434.3948 0.39478044 3642 Q8NE01 CNNM3 Metal transporter CNNM3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.13 172.13 3 1.251E-08 175504 QUIQUE_C1277_190116_001 65.213 61.939 135830000 10920000 14430000 8029300 19742000 11478000 0 0 15109000 19227000 6027500 0 30871000 0 4391 3642 4098 40680;40681;40682;40683;40684;40685;40686;40687;40688 52074;52075;52076;52077;52078;52079;52080;52081;52082;52083 52075 10 AVPEGFVIPR Unmodified 1083.6077 0.60767975 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.458 81.458 2 0.0033951 83374 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.568 57.314 747200000 55010000 46208000 83712000 100480000 56531000 74639000 57367000 51625000 0 30861000 89570000 0 101190000 4392 2465 4099 40689;40690;40691;40692;40693;40694;40695;40696;40697;40698;40699;40700;40701 52084;52085;52086;52087;52088;52089;52090;52091;52092;52093;52094;52095;52096;52097;52098;52099;52100;52101;52102 52098 19 AVPETRPNHTIYINNLNEK Acetyl (Protein N-term) 2264.1549 0.1549441 1373 M0R268;P09012;M0R0G9;M0QXK2;M0R221;M0R2B8 SNRPA U1 small nuclear ribonucleoprotein A yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.477 67.477 3 2.8727E-06 67657 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.33 92.852 1264100000 113670000 0 113220000 0 118920000 52915000 115480000 0 180710000 50362000 215350000 153470000 150000000 4393 1373 4100 40702;40703;40704;40705;40706;40707;40708;40709;40710;40711 52103;52104;52105;52106;52107;52108;52109;52110;52111;52112 52110 10 AVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDR Unmodified 2569.292 0.29203121 1599 O60883 GPR37L1 Prosaposin receptor GPR37L1 yes yes 0 0 0 1 1 170.18 170.18 3 0.0021714 178144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.576 16.279 74093000 0 0 0 0 0 0 0 28928000 0 0 45165000 0 0 4394 1599 4101 40712;40713 52113;52114 52114 2 AVPFQNAILNVK Unmodified 1312.7503 0.75032125 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.27 100.27 2 7.8345E-07 104659 QUIQUE_C1218_190116_001 141.2 109.77 358400000 33027000 44113000 38397000 37507000 43328000 40465000 42356000 0 0 0 44129000 0 35073000 4395 45 4102 40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;40724;40725 52115;52116;52117;52118;52119;52120;52121;52122;52123;52124;52125;52126 52115 12 AVPGAPELLER Unmodified 1150.6346 0.63462279 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.925 72.925 2 0.029666 73406 QUIQUE_C1277_190116_001 51.436 33.527 1379000000 279160000 299590000 0 0 221310000 0 0 0 0 69997000 286860000 222130000 0 4396 3859 4103 40726;40727;40728;40729;40730;40731 52127;52128;52129;52130;52131;52132 52128 5 AVPGGAGDASVLPSLPR Unmodified 1562.8417 0.84165545 3949 Q96TC7;H0YLG5;H0YNE5 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.281 92.281 2 0.000874 94206 QUIQUE_C1368_190116_001 86.467 69.442 337620000 46411000 30895000 47050000 54287000 38385000 0 0 39930000 60873000 19785000 0 0 0 4397 3949 4104 40732;40733;40734;40735;40736;40737;40738;40739 52133;52134;52135;52136;52137;52138;52139;52140;52141;52142 52136 9 AVPKEDIYSGGGGGGSR Unmodified 1605.7747 0.7746981 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 1 1 23.743 23.743 3 8.7147E-05 17407 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.081 53.262 75599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75599000 0 4398 2969 4105 40740 52143 52143 1 AVPLALALISVSNPR Unmodified 1519.9086 0.9086128 2976 Q13200;H7C1H2 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 139.25 139.25 2;3 2.7696E-06 144491 QUIQUE_C1368_190116_001 81.632 76.783 1980100000 156930000 180190000 160770000 153570000 220220000 129420000 187870000 204920000 181110000 71361000 60333000 54397000 219010000 4399 2976 4106 40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;40748;40749;40750;40751;40752;40753;40754;40755;40756;40757;40758;40759;40760;40761;40762;40763;40764 52144;52145;52146;52147;52148;52149;52150;52151;52152;52153;52154;52155;52156;52157;52158;52159;52160;52161;52162;52163;52164;52165;52166;52167;52168;52169;52170;52171;52172;52173;52174;52175;52176;52177;52178;52179;52180 52151 34 AVPLAVPLGQTEVFQALQR Unmodified 2036.1419 0.14186022 3503 Q86W42 THOC6 THO complex subunit 6 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 143.37 143.37 2;3 0.00047834 150709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.434 53.724 47045000 0 0 0 0 0 0 0 0 10842000 0 21404000 14799000 0 4400 3503 4107 40765;40766;40767 52181;52182;52183 52182 2 AVPLIHQEGNR Unmodified 1232.6626 0.66256887 1381 O00170;E9PMH2;V9GYQ3 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.935 21.935 2;3 0.00040373 14364 QUIQUE_C1277_190116_001 72.652 52.89 331040000 57739000 53457000 51074000 47494000 0 0 0 47578000 0 27207000 46493000 0 0 4401 1381 4108 40768;40769;40770;40771;40772;40773;40774;40775;40776;40777;40778 52184;52185;52186;52187;52188;52189;52190;52191;52192;52193;52194 52185 10 AVPLPMTVR Oxidation (M) 998.55829 0.55828672 3850;3734 Q92561;E5RHN5;Q96FC7 PHYHIP;PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 1 0 1 42.745 42.745 2 0.02802 39418 QUIQUE_C1277_190116_001 60.59 27.749 52504000 0 52504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4402 3734;3850 4109 40779 52195 52195 1 AVPLPMTVR Unmodified 982.56337 0.5633721 3850;3734 Q92561;E5RHN5;Q96FC7 PHYHIP;PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.257 64.257 2 0.036508 63644 QUIQUE_C1277_190116_001 84.568 67.641 1189500000 0 243250000 233000000 0 0 0 280410000 0 0 49554000 383320000 0 0 4403 3734;3850 4109 40780;40781;40782;40783;40784 52196;52197;52198;52199;52200 52196 3 AVPPTYADLGK Acetyl (Protein N-term) 1172.6077 0.60773933 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 1 0 0 2 3 3 2 4 3 3 2 4 1 3 3 3 97.79 97.79 1;2 0.00036958 99816 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 68.157 4059700000 293870000 377260000 234610000 303330000 314400000 314630000 261400000 235320000 371790000 97194000 472500000 344580000 438780000 4404 726;2185 4110 40785;40786;40787;40788;40789;40790;40791;40792;40793;40794;40795;40796;40797;40798;40799;40800;40801;40802;40803;40804;40805;40806;40807;40808;40809;40810;40811;40812;40813;40814;40815;40816;40817;40818;40819;40820 52201;52202;52203;52204;52205;52206;52207;52208;52209;52210;52211;52212;52213;52214;52215;52216;52217;52218;52219;52220;52221;52222;52223;52224;52225;52226;52227;52228;52229;52230;52231;52232;52233;52234;52235;52236;52237;52238;52239;52240;52241;52242;52243;52244;52245;52246;52247;52248;52249;52250;52251;52252;52253;52254;52255;52256;52257;52258;52259;52260;52261;52262;52263;52264;52265;52266;52267;52268;52269;52270;52271;52272;52273;52274;52275;52276;52277 52213 70 AVPREELFVTSK Unmodified 1374.7507 0.75071518 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 0 0 1 1 2 2 2 46.919 46.919 2;3 0.01157 44615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.201 46.471 379040000 0 0 0 0 0 0 0 0 46345000 0 64442000 125220000 143040000 4405 2076 4111 40821;40822;40823;40824;40825;40826;40827 52278;52279;52280;52281;52282;52283;52284;52285 52279 8 AVPSWFVR Unmodified 960.51814 0.51813647 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 84.975 84.975 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52289;52290;52291;52292;52293;52294;52295;52296;52297;52298;52299;52300;52301;52302;52303;52304;52305;52306 52291 18 AVQEIMQEK Unmodified 1074.5379 0.53794521 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.846 29.846 2 0.004515 23896 QUIQUE_C1368_190116_001 88.819 23.567 432710000 104290000 0 132680000 93968000 0 101770000 0 0 0 0 0 0 0 4409 2194 4115 40847;40848;40849;40850;40851 52307;52308;52309;52310;52311;52312 52308 6 AVQELWLR Unmodified 1013.5658 0.56581494 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.834 78.834 2 0.00089185 80174 QUIQUE_C1576_190116_001 148.07 85.354 1583500000 0 117080000 155800000 111920000 149690000 128360000 137650000 120010000 103040000 44096000 190500000 167410000 157970000 4410 2443 4116 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Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 100.96 100.96 2;3 6.1356E-161 103892 QUIQUE_C1368_190116_001 247.88 231.74 4260600000 258160000 361020000 347650000 230110000 299470000 278490000 349660000 296760000 353300000 131140000 456180000 410740000 487940000 4415 3973 4121 40898;40899;40900;40901;40902;40903;40904;40905;40906;40907;40908;40909;40910;40911;40912;40913;40914;40915;40916;40917;40918;40919;40920 52361;52362;52363;52364;52365;52366;52367;52368;52369;52370;52371;52372;52373;52374;52375;52376;52377;52378;52379;52380;52381;52382;52383;52384;52385;52386;52387;52388;52389 52365 29 AVQMGMSSVFFNK Unmodified 1444.6843 0.68429187 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 104.89 104.89 2 1.3825E-07 107264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.88 94.572 1457500000 0 93792000 209790000 121950000 0 203000000 160190000 117540000 104060000 33005000 157980000 111320000 144910000 4416 1665 4122 40921;40922;40923;40924;40925;40926;40927;40928;40929;40930;40931;40932;40933 52390;52391;52392;52393;52394;52395;52396;52397;52398;52399;52400;52401;52402;52403 52397 14 AVQNPPEGTAEDQK Unmodified 1482.6951 0.69505079 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.876 16.876 2 2.1872E-17 8790 QUIQUE_C1403_190116_001 150.04 142.4 602380000 74513000 69499000 63804000 61298000 38238000 44279000 55420000 20643000 27405000 15761000 57503000 30144000 43871000 4417 1402 4123 40934;40935;40936;40937;40938;40939;40940;40941;40942;40943;40944;40945;40946 52404;52405;52406;52407;52408;52409;52410;52411;52412;52413;52414;52415;52416;52417;52418 52407 15 AVQQPDGLAVLGIFLK Unmodified 1667.961 0.9610423 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 0 2 3 3 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 160.65 160.65 2;3 9.273E-37 166598 QUIQUE_C1438_190116_001 139.58 128.99 26061000000 1224600000 2146500000 1680700000 1411100000 2454100000 1367000000 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2 0.00053008 139172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.27 96.846 28914000 0 0 0 0 0 0 0 0 28914000 0 0 0 0 4420 2900 4126 40980 52463 52463 1 AVQTQQPCSVR Unmodified 1272.6245 0.62446881 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y493;H0Y7J9 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 16.913 16.913 2 0.0018561 9987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.95 62.174 53186000 0 0 0 0 0 0 0 11403000 0 0 21049000 0 20734000 4421 1056 4127 40981;40982;40983 52464;52465;52466 52464 3 AVQTSIATAYR Unmodified 1179.6248 0.62478638 108 A0A087X1H5;Q15057;A0A0U1RQT1;H7C3Q8 ACAP2 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 41.587 41.587 2 0.039277 38789 QUIQUE_C1438_190116_001 62.869 32.132 32613000 0 0 0 0 32613000 0 0 0 0 0 0 0 0 4422 108 4128 40984 52467 52467 1 AVQVHQDTLR Unmodified 1165.6204 0.62036971 4482 Q9UL18;Q5TA58;Q9UKV8 AGO1;AGO2 Protein argonaute-1;Protein argonaute;Protein argonaute-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.041 16.041 3 0.0032134 8200 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0.032034995 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0Y9E4 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 108.4 108.4 3 0.0043949 113143 QUIQUE_C1438_190116_001 43.116 33.7 346300000 43447000 52656000 0 0 60227000 0 0 76471000 51346000 0 0 0 62156000 4426 4304 4132 41000;41001;41002;41003;41004;41005;41006 52485;52486;52487;52488;52489;52490;52491 52487 5 AVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIK Unmodified 2451.2745 0.27445011 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 175.8 175.8 2;3 1.3041E-56 177058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.07 188.78 1724500000 76512000 127700000 290650000 117260000 213070000 0 133630000 146830000 173010000 14371000 351680000 0 79820000 4427 1068 4133 41007;41008;41009;41010;41011;41012;41013;41014;41015;41016;41017;41018;41019;41020;41021;41022;41023;41024;41025;41026 52492;52493;52494;52495;52496;52497;52498;52499;52500;52501;52502;52503;52504;52505;52506;52507;52508;52509;52510;52511;52512;52513;52514 52506 22 AVSDWIDEQEK Unmodified 1318.6041 0.60411052 2951 Q12906;K7EKJ9;K7ER69;K7EJ09;K7ERM6;K7ENK6;K7EM82;K7EQ75 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.759 75.759 2 0.004812 72933 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.247 64.472 962940000 0 178510000 138150000 157230000 109440000 161270000 0 113740000 0 59465000 0 0 45133000 4428 2951 4134 41027;41028;41029;41030;41031;41032;41033;41034 52515;52516;52517;52518;52519;52520;52521;52522 52521 6 AVSESQLK Acetyl (Protein N-term) 902.47091 0.4709115 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 42.213 42.213 1;2 0.00042585 39577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.53 92.395 127780000 0 0 35319000 0 0 33461000 0 0 0 0 32916000 0 26079000 4429 1009 4135 41035;41036;41037;41038 52523;52524;52525;52526 52525 4 AVSETPAVPPVSEDEDDDDDDATPPPVIAPRPEHTK Unmodified 3807.7599 0.75990206 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 1 1 80.088 80.088 4 0.027718 81029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.731 16.507 42201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42201000 0 4430 2970 4136 41039 52527 52527 1 AVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIK Unmodified 2435.2795 0.27953549 3605 Q8N684;F5H669 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 176.56 176.56 2;3 1.7763E-19 180876 QUIQUE_C1368_190116_001 104.52 97.064 787490000 31151000 44323000 39684000 17784000 0 0 62503000 59181000 180470000 0 152840000 106740000 92815000 4431 3605 4137 41040;41041;41042;41043;41044;41045;41046;41047;41048;41049;41050;41051;41052 52528;52529;52530;52531;52532;52533;52534;52535;52536;52537;52538;52539;52540;52541;52542 52532 14 AVSHLVTWQDGR Unmodified 1367.6946 0.69459728 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 43.05 43.05 2;3 0.0039649 40125 QUIQUE_C1438_190116_001 56.493 41.806 364790000 0 0 28664000 32049000 46544000 0 0 34059000 42148000 21526000 76494000 25152000 58150000 4432 212 4138 41053;41054;41055;41056;41057;41058;41059;41060;41061;41062;41063;41064 52543;52544;52545;52546;52547;52548;52549;52550;52551;52552;52553;52554 52546 10 AVSHSLNNCVNCLPGQK Unmodified 1896.8934 0.8934498 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.875 38.875 3 8.8101E-05 34945 QUIQUE_C1403_190116_001 63.31 55.901 472560000 0 0 58453000 37531000 57135000 0 67433000 79620000 51505000 0 0 49903000 70983000 4433 4606 4139 41065;41066;41067;41068;41069;41070;41071;41072 52555;52556;52557;52558;52559;52560;52561;52562 52556 8 AVSILGDEVFR Unmodified 1204.6452 0.64518747 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 1 106.45 106.45 2 0.012341 108891 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.518 18.944 47344000 0 0 0 0 0 0 0 21578000 25766000 0 0 0 0 4434 3428 4140 41073;41074 52563;52564 52563 2 AVSIQTGYLIQSTGPK Unmodified 1661.8988 0.89883598 1002 F5H8G1;F5H1Z6;F5H8H3;Q9Y365;F5GY11;H0YGA9;H0YFF3;H0YH17;H0YGN8 STARD10 PCTP-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 86.338 86.338 2 0.011334 87004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.924 42.62 73500000 24683000 29472000 0 0 0 0 0 19344000 0 0 0 0 0 4435 1002 4141 41075;41076;41077 52565;52566;52567 52567 3 AVSISTEPPTYLR Unmodified 1432.7562 0.75619449 294 A0A0U1RQQ2;A0A0U1RRB8;A0A2R8YEE8;A0A0G2JSE9;C9JTA6;A0A2R8Y5N5;G5E975;Q12824 SMARCB1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.208 78.208 2 0.00043576 80042 QUIQUE_C1218_190116_001 111.06 67.545 369490000 48728000 32846000 43209000 31581000 34638000 34823000 0 37051000 27021000 11759000 32874000 34958000 0 4436 294 4142 41078;41079;41080;41081;41082;41083;41084;41085;41086;41087;41088;41089;41090;41091 52568;52569;52570;52571;52572;52573;52574;52575;52576;52577;52578;52579;52580;52581;52582;52583;52584 52568 17 AVSLINAIDTGR Unmodified 1228.6776 0.67755023 812 D6RC04;Q9Y6G5;D6RJ90 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 87.766 87.766 2 0.017391 88442 QUIQUE_C1563_190116_001 60.547 29.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4437 812 4143 41092 52585 52585 1 AVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTK Unmodified 3152.6017 0.60165749 4261 Q9NR28;A0A024RBT2;H7BZK7;A0A2U3TZH2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 181.32 181.32 3 2.6057E-13 187910 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.425 66.459 146090000 0 0 0 0 0 0 0 0 12504000 0 133590000 0 0 4438 4261 4144 41093;41094 52586;52587 52587 1 AVSNPFQQR Unmodified 1045.5305 0.53049207 4154 Q9H313;A0A0G2JPK6 TTYH1 Protein tweety homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 40.553 40.553 2 0.0032955 37163 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.626 63.52 104860000 0 0 0 0 0 0 0 0 104860000 0 0 0 0 4439 4154 4145 41095;41096;41097;41098;41099;41100 52588;52589;52590;52591;52592;52593 52593 6 AVSPENMVTFSENHGVVIQPAYK Oxidation (M) 2532.2319 0.23187379 2434 U3KQG5;P41217;F8WC99 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.327 83.327 3 3.2053E-11 86203 QUIQUE_C1218_190116_001 90.968 77.696 558530000 50724000 56580000 67655000 49383000 67445000 0 64552000 41648000 48992000 0 73709000 37843000 0 4440 2434 4146 41101;41102;41103;41104;41105;41106;41107;41108;41109;41110 52594;52595;52596;52597;52598;52599;52600;52601;52602;52603;52604 52595 1856 10 AVSPENMVTFSENHGVVIQPAYK Unmodified 2516.237 0.23695917 2434 U3KQG5;P41217;F8WC99 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 107.85 107.85 2;3 3.9353E-18 111198 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 95.613 2674000000 219360000 275450000 265950000 290940000 207490000 225920000 295350000 123350000 146880000 80604000 221710000 120210000 200740000 4441 2434 4146 41111;41112;41113;41114;41115;41116;41117;41118;41119;41120;41121;41122;41123;41124 52605;52606;52607;52608;52609;52610;52611;52612;52613;52614;52615;52616;52617;52618;52619;52620;52621;52622;52623;52624;52625;52626 52611 22 AVSPLLLTTTNSSEGLSMGNYIGLINR Unmodified 2820.4691 0.46914395 2149 P19525;C9JZT2 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 0 0 0 1 158.06 158.06 3 0.0023976 163012 QUIQUE_C1218_190116_001 34.218 14.142 49229000 49229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4442 2149 4147 41125 52627 52627 1 AVSPLPYLR Unmodified 1014.5862 0.58621603 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 1 78.645 78.645 2 0.02075 79071 QUIQUE_C1277_190116_001 62.659 33.282 31880000 15626000 16254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4443 1861 4148 41126;41127 52628;52629 52629 2 AVSQVLDSLEEIHALTDCSEK Unmodified 2343.1264 0.12640567 1460 O14936;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 137.26 137.26 3 0.0030413 141131 QUIQUE_C1403_190116_001 42.618 37.548 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4444 1460 4149 41128 52630 52630 1 AVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAAR Unmodified 2572.3245 0.32452862 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 1 1 2 2 2 1 1 161.6 161.6 2;3 3.4977E-114 167230 QUIQUE_C1218_190116_001 190.19 187.43 2727300000 170250000 161410000 355080000 218360000 296360000 163980000 118470000 272940000 287200000 0 364980000 169490000 148790000 4445 4600 4150 41129;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;41147 52631;52632;52633;52634;52635;52636;52637;52638;52639;52640;52641;52642;52643;52644;52645;52646;52647;52648;52649;52650;52651;52652;52653;52654;52655;52656 52632 25 AVSSQMIGK Unmodified 919.4797 0.47970205 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.917 20.917 2 0.011065 13416 QUIQUE_C1277_190116_001 73.248 47.076 1191400000 312990000 282820000 227430000 0 145980000 0 222210000 0 0 0 0 0 0 4446 445 4151 41148;41149;41150;41151;41152 52657;52658;52659;52660;52661 52658 5 AVSSTELSALENICK Unmodified 1620.8029 0.80288668 521 A2RTX5;B7ZLP8 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 99.603 99.603 2 0.001414 102808 QUIQUE_C1368_190116_001 71.085 56.927 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4447 521 4152 41153;41154 52662;52663 52662 2 AVSTCAHLFWSGR Unmodified 1490.7089 0.70886714 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 65.628 65.628 2;3 1.031E-07 65344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.75 112.66 1058300000 0 120560000 90262000 109870000 0 0 120530000 104110000 116410000 42792000 150480000 95910000 107350000 4448 3926 4153 41155;41156;41157;41158;41159;41160;41161;41162;41163;41164;41165;41166 52664;52665;52666;52667;52668;52669;52670;52671;52672;52673;52674;52675;52676;52677 52672 14 AVSTGVK Acetyl (Protein N-term) 702.3912 0.39120462 3164 Q15819 UBE2V2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 24.292 24.292 1 0.052701 17757 QUIQUE_C1277_190116_001 132.09 36.137 817760000 0 316780000 0 0 0 0 0 410520000 0 0 0 0 90464000 4449 3164 4154 41167;41168;41169 52678;52679;52680 52678 1 AVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYR Oxidation (M) 2824.32 0.32003687 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 1 0 1 1 150.04 150.04 3 0.00029578 156789 QUIQUE_C1438_190116_001 53.475 47.38 8074500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8074500 0 0 0 4450 2602 4155 41170;41171 52681;52682 52681 2051 2 AVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYR Unmodified 2808.3251 0.32512225 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 2 160.9 160.9 2 3.6401E-14 168452 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.27 104.05 87173000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87173000 0 0 4451 2602 4155 41172;41173 52683;52684 52683 2 AVSTHQITQLEGDRR Unmodified 1709.8809 0.8808945 4511 Q9UNK0;I3L305 STX8 Syntaxin-8 yes no 0 0 1 1 28.234 28.234 3 0.031433 22564 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.444 24.247 55035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55035000 4452 4511 4156 41174 52685 52685 1 AVSTLIDSLKK Unmodified 1173.6969 0.69688869 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 1 1 59.546 59.546 3 0.036742 57848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.544 18.645 12686000 0 0 0 0 0 0 0 12686000 0 0 0 0 0 4453 407 4157 41175 52686 52686 1 AVSVTPIRDTK Acetyl (Protein N-term) 1227.6823 0.68230126 133 C9JP00;A0A0A0MQX8;Q9NR56 MBNL1 Muscleblind-like protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 49.074 49.074 2 0.0010429 46906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.29 70.514 151760000 0 0 0 0 0 0 0 32014000 16838000 0 46818000 25090000 30997000 4454 133 4158 41176;41177;41178;41179;41180 52687;52688;52689;52690;52691;52692 52688 5 AVTAADMEAR Unmodified 1033.4862 0.48624399 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.955 25.955 2 0.0085022 19757 QUIQUE_C1563_190116_001 71.614 37.525 215530000 0 0 0 61016000 0 44304000 48355000 0 0 13860000 0 0 47990000 4455 877 4159 41181;41182;41183;41184;41185 52693;52694;52695;52696;52697 52694 4 AVTAMGILNTIDTLLSVVEDHK Unmodified 2339.2406 0.24064756 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 176.34 176.34 3 1.9662E-05 183327 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.89 49.81 132170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 132170000 0 0 4456 1727 4160 41186 52698 52698 1 AVTAMGILNTIDTLLSVVEDHK Oxidation (M) 2355.2356 0.23556218 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 1 0 1 174.24 174.24 3 1.2397E-05 178050 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.405 65.412 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4457 1727 4160 41187 52699 52699 942 1 AVTAYSPEDEKKGEK Unmodified 1650.8101 0.81008055 1566 O60268;H3BMU3;H3BNA7 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 2 2 2 1 2 2 2 13.291 13.291 3;4 5.2797E-08 5685 QUIQUE_C1576_190116_001 122.34 101.04 910120000 0 0 0 0 125260000 0 51940000 118380000 0 0 103400000 208480000 302670000 4458 1566 4161 41188;41189;41190;41191;41192;41193;41194;41195;41196;41197;41198 52700;52701;52702;52703;52704;52705;52706;52707;52708;52709;52710;52711 52702 11 AVTDLLGR Unmodified 843.48142 0.48141661 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.466 62.466 2 0.020384 61902 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.833 30.031 245680000 0 31333000 25199000 24557000 0 23359000 23437000 0 34943000 19169000 35484000 28198000 0 4459 1401 4162 41199;41200;41201;41202;41203;41204;41205;41206;41207;41208 52712;52713;52714;52715;52716;52717;52718;52719;52720;52721;52722;52723 52720 12 AVTDSINQLITMCTQQAPGQK Unmodified 2303.125 0.12496588 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 129.07 129.07 2 7.3986E-31 133119 QUIQUE_C1403_190116_001 135.24 109.12 88991000 0 0 0 43396000 0 0 0 0 0 0 45595000 0 0 4460 4600 4163 41209;41210 52724;52725 52724 1 AVTEGAQAVEEPSIC Unmodified 1559.7137 0.71373732 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.818 78.818 2 3.0889E-09 81007 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 103.25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4461 2280 4164 41211;41212;41213;41214 52726;52727;52728;52729 52727 4 AVTEILQDIQYK Unmodified 1419.7609 0.76094551 2368 P35219 CA8 Carbonic anhydrase-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.95 105.95 2 0.00052228 111079 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.78 89.739 148960000 0 0 28035000 0 24941000 0 33866000 0 0 0 35106000 0 27008000 4462 2368 4165 41215;41216;41217;41218;41219;41220;41221 52730;52731;52732;52733;52734;52735;52736 52735 7 AVTELGRPDAEYWNSQK Unmodified 1962.9436 0.94355434 3211;1816;2065 P13760;Q30167;Q29974;P04229;Q30154;Q5Y7A7;P01912 HLA-DRB1;HLA-DRB5 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-4 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-10 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-16 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-1 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-13 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-3 chain no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 67.772 67.772 2;3 4.8088E-37 68541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.88 127.2 518450000 0 0 84184000 0 0 44317000 44275000 0 120270000 0 163920000 0 61481000 4463 2065;3211;1816 4166 41222;41223;41224;41225;41226;41227;41228 52737;52738;52739;52740;52741;52742;52743 52742 7 AVTELGRPVAESWNSQK Unmodified 1870.9537 0.95372509 2815 P79483;A0A140T958;Q9TQE0;P13761 HLA-DRB3;HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-9 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-7 beta chain no no 0 0 1 1 1 59.084 59.084 2;3 5.6807E-17 56569 QUIQUE_C1403_190116_001 119.87 90.891 57793000 0 0 0 0 0 0 0 57793000 0 0 0 0 0 4464 2815 4167 41229;41230 52744;52745 52744 1 AVTELNEPLSNEDR Unmodified 1585.7584 0.75837933 2891 Q04917 YWHAH 14-3-3 protein eta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.033 57.033 2 1.521E-58 56445 QUIQUE_C1218_190116_001 202.65 185.63 25990000000 2162900000 2439400000 2174500000 1796600000 1958800000 2179400000 2207600000 1222900000 1661200000 863900000 2668900000 1933500000 2720300000 4465 2891 4168 41231;41232;41233;41234;41235;41236;41237;41238;41239;41240;41241;41242;41243 52746;52747;52748;52749;52750;52751;52752;52753;52754;52755;52756;52757;52758;52759;52760;52761;52762 52746 15 AVTELNEPLSNEDRNLLSVAYK Unmodified 2474.2653 0.26528241 2891 Q04917 YWHAH 14-3-3 protein eta yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 108.57 108.57 2;3 9.8027E-65 111151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184 163.89 1245400000 0 0 0 0 0 0 0 595120000 156630000 0 168570000 174020000 151050000 4466 2891 4169 41244;41245;41246;41247;41248;41249 52763;52764;52765;52766;52767;52768 52764 5 AVTEQGAELSNEER Unmodified 1531.7114 0.71142914 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.544 31.544 2 7.0373E-35 26742 QUIQUE_C1576_190116_001 178.81 152.14 45173000000 4840500000 4234000000 3639500000 3292500000 3470800000 3441600000 3247200000 2918600000 3539500000 1321500000 4273700000 3352800000 3601200000 4467 2262 4170 41250;41251;41252;41253;41254;41255;41256;41257;41258;41259;41260;41261;41262 52769;52770;52771;52772;52773;52774;52775;52776;52777;52778;52779;52780;52781;52782;52783;52784;52785;52786 52775 17 AVTEQGHELSNEER Unmodified 1597.7332 0.73322721 2341 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;A0A0J9YWZ2 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 18.532 18.532 2;3 1.1028E-240 11240 QUIQUE_C1438_190116_001 289.37 257.77 100280000000 7134700000 9182500000 8950300000 9043500000 6967500000 8388800000 11158000000 5268600000 6242500000 3443000000 10681000000 6081400000 7742200000 4468 2341 4171 41263;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;41271;41272;41273;41274;41275;41276;41277;41278;41279;41280;41281;41282;41283;41284;41285;41286;41287 52787;52788;52789;52790;52791;52792;52793;52794;52795;52796;52797;52798;52799;52800;52801;52802;52803;52804;52805;52806;52807;52808;52809;52810;52811;52812;52813 52796 26 AVTESINQLITLCTQQAPGQK Unmodified 2299.1842 0.18419532 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.24 121.24 2 2.0089E-53 126492 QUIQUE_C1576_190116_001 218.11 196.06 67976000 0 0 0 0 0 0 39127000 0 0 0 0 0 28849000 4469 4606 4172 41288;41289;41290;41291 52814;52815;52816;52817 52815 4 AVTEVLAR Unmodified 857.49707 0.49706667 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0;M0R2K6 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 0 1 31.175 31.175 2 0.039586 25963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.799 11.44 97501000 0 0 0 0 0 0 0 97501000 0 0 0 0 0 4470 3981 4173 41292 52818 52818 1 AVTGTHTLALAAK Unmodified 1252.7139 0.71393574 2545 P49770;H0YK01 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes no 0 0 0 1 1 25.793 25.793 2 0.0027612 19903 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.327 37.889 27521000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27521000 0 0 4471 2545 4174 41293;41294 52819;52820 52820 2 AVTGWLESLR Acetyl (Protein N-term) 1172.619 0.61897272 3274 Q5JQQ4;Q9BVM2 DPCD Protein DPCD yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.94 162.94 2 1.3058E-12 167127 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52843;52844;52845;52846;52847;52848;52849 52845 2557 7 AVTGYKDPYTGQQISLFQAMQK Unmodified 2473.2311 0.23114551 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 110.46 110.46 2;3 4.2813E-99 115455 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.39 188.07 1791400000 0 0 0 0 0 0 0 498700000 212340000 0 517570000 329360000 233420000 4475 3117 4177 41320;41321;41322;41323;41324;41325;41326;41327;41328 52850;52851;52852;52853;52854;52855;52856;52857;52858;52859;52860;52861 52858 12 AVTGYRDPYSGSTISLFQAMQK Unmodified 2419.1842 0.18419532 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 116.25 116.25 3 0.00027654 118726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.692 26.616 47623000 0 0 0 0 0 0 0 47623000 0 0 0 0 0 4476 3117 4178 41329 52862 52862 1 AVTGYRDPYTEQTISLFQAMK Unmodified 2418.1889 0.18894634 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 125.15 125.15 2;3 9.2235E-86 128269 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.7 182.01 1284900000 0 34917000 0 0 0 0 0 325460000 213010000 0 505780000 205770000 0 4477 3117 4179 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41363;41364;41365;41366;41367;41368;41369;41370;41371;41372 52901;52902;52903;52904;52905;52906;52907;52908;52909;52910;52911;52912;52913;52914 52908 14 AVTISGTPDAIIQCVK Unmodified 1671.8866 0.88655673 916 E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP3 Poly(rC)-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.38 100.38 2 8.1415E-25 104310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.71 132.37 1572500000 138490000 179620000 145460000 142270000 0 119650000 102820000 150760000 152660000 38750000 152720000 120870000 128450000 4483 916 4184 41373;41374;41375;41376;41377;41378;41379;41380;41381;41382;41383;41384 52915;52916;52917;52918;52919;52920;52921;52922;52923;52924;52925;52926;52927;52928 52926 14 AVTKDEDEWKELEQK Unmodified 1846.8949 0.89487281 4479 Q9UKY7 CDV3 Protein CDV3 homolog yes yes 0 0 2 1 47.81 47.81 3 0.0025711 44767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.158 50.4 53029000 0 0 0 0 0 0 0 53029000 0 0 0 0 0 4484 4479 4185 41385 52929 52929 1 AVTLDKDAYYR Acetyl (Protein N-term) 1355.6721 0.67213051 4620 Q9Y5B9;G3V5A4;G3V401;G3V2X0 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes no 1 0 1 3 1 1 1 75.19 75.19 2 0.0026382 75433 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.01 87.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4485 4620 4186 41386;41387;41388;41389;41390;41391 52930;52931;52932;52933;52934;52935 52933 6 AVTLDPNFLDAYINLGNVLK Unmodified 2189.1732 0.17321992 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 169.79 169.79 2;3 3.2652E-12 174258 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.46 120.22 314720000 0 0 0 0 46093000 0 56436000 0 52278000 5612900 92329000 61972000 0 4486 1497 4187 41392;41393;41394;41395;41396;41397;41398 52936;52937;52938;52939;52940;52941;52942 52938 7 AVTLECVSAGEPR Unmodified 1387.6766 0.67656396 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 57.914 57.914 2 0.01239 56124 QUIQUE_C1277_190116_001 69.01 48.707 25675000 0 18621000 0 0 0 0 0 0 0 7053400 0 0 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4190 41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425 52965;52966;52967;52968;52969;52970;52971;52972;52973;52974;52975;52976 52969 12 AVTLNPDNSYIK Unmodified 1333.6878 0.68778057 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.53 63.53 2 0.0018462 62592 QUIQUE_C1368_190116_001 89.679 71.814 209210000 28311000 0 37238000 0 0 0 48776000 0 0 0 61118000 33764000 0 4490 2986 4191 41426;41427;41428;41429;41430;41431;41432;41433;41434 52977;52978;52979;52980;52981;52982;52983;52984;52985 52978 8 AVTLSALIYCLR Unmodified 1378.7643 0.76425675 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 140.17 140.17 2 0.0059821 143630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.347 44.477 146880000 0 0 17149000 0 0 0 0 25130000 31237000 0 23243000 29398000 20722000 4491 1450 4192 41435;41436;41437;41438;41439;41440;41441 52986;52987;52988;52989;52990;52991;52992 52988 7 AVTNEPEEEELATLSEEEIAMAVTAWEK Unmodified 3118.454 0.45400697 2677 P56192;H0YHV5 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.87 172.87 3 2.8751E-31 177083 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.34 109.51 265450000 0 5247800 14087000 0 12456000 0 21565000 20926000 82673000 0 70985000 0 37508000 4492 2677 4193 41442;41443;41444;41445;41446;41447;41448;41449 52993;52994;52995;52996;52997;52998;52999;53000;53001;53002;53003 53000 11 AVTNEPEEEELATLSEEEIAMAVTAWEK Oxidation (M) 3134.4489 0.4489216 2677 P56192;H0YHV5 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 171.72 171.72 3 5.5691E-06 176518 QUIQUE_C1368_190116_001 53.705 51.166 18780000 0 0 18780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4493 2677 4193 41450 53004 53004 2119 1 AVTPAPPIK Unmodified 892.5382 0.53820321 1711 O95182;M0R0N0 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.502 29.502 2 0.029255 24910 QUIQUE_C1218_190116_001 56.547 30.608 300500000 82198000 54171000 48554000 51715000 0 63861000 0 0 0 0 0 0 0 4494 1711 4194 41451;41452;41453;41454;41455 53005;53006;53007;53008;53009 53005 5 AVTPAPPIKR Unmodified 1048.6393 0.63931423 1711 O95182;M0R0N0 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.524 19.524 3 0.0004088 12056 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 61.972 456100000 29314000 55270000 46637000 44792000 29082000 29317000 45600000 0 29225000 10358000 57164000 41577000 37760000 4495 1711 4195 41456;41457;41458;41459;41460;41461;41462;41463;41464;41465;41466;41467;41468 53010;53011;53012;53013;53014;53015;53016;53017;53018;53019;53020;53021;53022 53020 13 AVTPPMPLLTPATPGGLPPAAAVAAAAATAK Unmodified 2793.5463 0.54627206 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 153.34 153.34 3 0.029361 155709 QUIQUE_C1563_190116_001 20.82 9.1881 509040000 0 0 87283000 93292000 100850000 72852000 0 0 0 26796000 0 0 127980000 4496 295 4196 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MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.98 29.98 2 0.012875 24605 QUIQUE_C1277_190116_001 65.465 25.802 311850000 0 59993000 55969000 0 49666000 0 73672000 0 72551000 0 0 0 0 4500 4358 4200 41481;41482;41483;41484;41485 53036;53037;53038;53039;53040 53036 5 AVVETVDNLLRPEALESWK Unmodified 2168.1477 0.14773345 1698 O94910;K7ESH3 LPHN1;ADGRL1 Latrophilin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.56 135.56 3 0.00024527 132122 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.335 30.95 173550000 31308000 0 39086000 27717000 35213000 0 30609000 0 0 9620200 0 0 0 4501 1698 4201 41486;41487;41488;41489;41490;41491 53041;53042;53043;53044;53045;53046;53047 53047 6 AVVFLEPQWYR Unmodified 1406.7347 0.73467118 383 C9JC71;A0A1W2PQB1;H0Y755;M9MML0;P08637 FCGR3A Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A yes no 0 0 0 1 1 1 123.79 123.79 2 6.5129E-05 128642 QUIQUE_C1368_190116_001 135.83 102.61 105690000 0 0 32720000 41177000 0 0 0 0 0 0 31795000 0 0 4502 383 4202 41492;41493;41494 53048;53049;53050;53051 53048 4 AVVGEEALTSDDLLYLEFLQK Unmodified 2352.2101 0.21005894 2175 P21281;H0YC45 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 3 4 4 2 2 3 2 3 2 2 6 4 4 162.84 162.84 2;3 3.3113E-53 166073 QUIQUE_C1277_190116_001 163.27 153.74 3830700000 282530000 314290000 249660000 143850000 250310000 186610000 283520000 331010000 290420000 77942000 436320000 509860000 474400000 4503 2175 4203 41495;41496;41497;41498;41499;41500;41501;41502;41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524;41525;41526;41527;41528;41529;41530;41531;41532;41533;41534;41535 53052;53053;53054;53055;53056;53057;53058;53059;53060;53061;53062;53063;53064;53065;53066;53067;53068;53069;53070;53071;53072;53073;53074;53075;53076;53077;53078;53079;53080;53081;53082;53083;53084;53085;53086;53087;53088;53089;53090;53091;53092;53093;53094;53095;53096;53097;53098;53099;53100;53101;53102;53103;53104;53105;53106 53056 50 AVVGGSHVSTAAVVR Unmodified 1408.7787 0.77866126 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 2 1 1 25.858 25.858 2;3 0.00038671 19786 QUIQUE_C1277_190116_001 89.805 61.406 476420000 60259000 82297000 0 20358000 20103000 89713000 0 44406000 69017000 0 34922000 0 55342000 4504 3511 4204 41536;41537;41538;41539;41540;41541;41542;41543;41544;41545;41546;41547;41548;41549;41550 53107;53108;53109;53110;53111;53112;53113;53114;53115;53116;53117;53118;53119;53120;53121 53110 13 AVVGYEDGTIR Unmodified 1178.5932 0.5931519 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;C9JTS3 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 1 48.097 48.097 2 0.028266 46021 QUIQUE_C1576_190116_001 60.045 37.914 100560000 0 0 0 0 0 0 48318000 0 0 0 52239000 0 0 4505 716 4205 41551;41552 53122;53123;53124 53122 3 AVVHGILMGVPVPFPIPEPDGCK Unmodified 2428.2647 0.26469424 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;G3V2V8;H0YIZ1 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.16 146.16 3 0.00012142 151232 QUIQUE_DMIX8_190116_001 49.528 45.724 336400000 0 0 72222000 98306000 41776000 61298000 0 0 0 0 0 30122000 32680000 4506 850 4206 41553;41554;41555;41556;41557;41558 53125;53126;53127;53128;53129;53130;53131;53132 53132 8 AVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSVEDSLECLR Unmodified 3496.7449 0.74492488 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 1 1 165.32 165.32 3;4 6.3591E-49 172688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.87 123.21 1035600000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 670710000 313870000 51012000 4507 50 4207 41559;41560;41561;41562 53133;53134;53135;53136;53137;53138 53134 6 AVVIVDDR Unmodified 885.49198 0.4919813 3122;2208 P23246;Q15233;H7C367;C9IZL7 SFPQ;NONO Splicing factor, proline- and glutamine-rich;Non-POU domain-containing octamer-binding protein no no 0 0 0 1 1 1 31.53 31.53 2 0.046027 26158 QUIQUE_C1277_190116_001 77.058 35.556 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4508 2208;3122 4208 41563;41564;41565 53139;53140;53141 53140 3 AVVLAANHFGR Unmodified 1153.6356 0.63562584 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 36.69 36.69 2;3 8.9846E-05 32231 QUIQUE_C1277_190116_001 98.048 82.419 2209800000 130670000 79168000 229010000 108520000 70663000 103000000 196590000 157210000 289390000 79214000 342600000 133630000 290190000 4509 2993 4209 41566;41567;41568;41569;41570;41571;41572;41573;41574;41575;41576;41577;41578;41579;41580;41581;41582;41583;41584;41585 53142;53143;53144;53145;53146;53147;53148;53149;53150;53151;53152;53153;53154;53155;53156;53157;53158;53159;53160;53161;53162;53163 53144 16 AVVLAGFGGLNK Unmodified 1144.6604 0.66044361 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.127 88.127 2 2.9048E-05 91251 QUIQUE_C1218_190116_001 128.69 101.43 2114400000 216090000 188250000 131180000 133660000 195230000 115960000 158830000 135970000 156800000 96258000 177480000 178650000 230030000 4510 4226 4210 41586;41587;41588;41589;41590;41591;41592;41593;41594;41595;41596;41597;41598 53164;53165;53166;53167;53168;53169;53170;53171;53172;53173;53174;53175;53176;53177;53178;53179 53165 13 AVVLSHYIHNLSSEMFSEFDK Unmodified 2452.1733 0.17329628 1812 Q5I0G2;P01236 PRL Prolactin yes no 0 0 0 1 139.8 139.8 3 0.00076804 144726 QUIQUE_C1218_190116_001 50.916 37.044 35028000 35028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4511 1812 4211 41599 53180 53180 1 AVVLSHYIHNLSSEMFSEFDKR Unmodified 2608.2744 0.27440731 1812 Q5I0G2;P01236 PRL Prolactin yes no 0 0 1 1 131.14 131.14 4 3.8836E-05 135750 QUIQUE_C1218_190116_001 64.422 56.333 45781000 45781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4512 1812 4212 41600 53181 53181 0 AVVMDLLR Unmodified 915.52117 0.52117293 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 90.337 90.337 2 0.033344 91092 QUIQUE_C1563_190116_001 64.757 28.572 22468000 0 11517000 0 0 0 10951000 0 0 0 0 0 0 0 4513 2964 4213 41601;41602;41603 53182;53183;53184 53184 3 AVVMLEYVER Unmodified 1207.6271 0.62709457 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5;Q5T2B7 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.933 92.933 2 0.011867 95034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.692 41.133 290230000 0 35797000 0 35084000 28803000 32104000 47923000 0 0 28269000 0 82247000 0 4514 196 4214 41604;41605;41606;41607;41608;41609;41610 53185;53186;53187;53188;53189;53190;53191 53191 4 AVVMTPVPLFSK Unmodified 1287.7261 0.72608033 1469 O14976 GAK Cyclin-G-associated kinase yes yes 0 0 0 1 108.93 108.93 2 0.013702 113195 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 35.884 15496000 0 0 15496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4515 1469 4215 41611 53192 53192 1 AVVNDATIFK Unmodified 1076.5866 0.58660996 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 62.36 62.36 2 0.024022 61783 QUIQUE_C1403_190116_001 67.897 34.347 83409000 0 0 0 42391000 0 0 0 0 0 0 0 0 41018000 4516 3779 4216 41612;41613 53193;53194 53193 2 AVVNIFLVAK Unmodified 1072.6645 0.66446635 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.78 106.78 2 0.017645 110861 QUIQUE_C1576_190116_001 72.485 61.416 293730000 0 48969000 47235000 34901000 0 30628000 43524000 47781000 40693000 0 0 0 0 4517 4176 4217 41614;41615;41616;41617;41618;41619;41620 53195;53196;53197;53198;53199;53200;53201;53202 53200 8 AVVPASLSGQDVGSFAYLTIK Acetyl (Protein N-term) 2164.1416 0.14158544 4192 Q9H993 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes yes 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 165.03 165.03 2;3 2.5501E-05 168686 QUIQUE_C1277_190116_001 98.943 85.758 589890000 40982000 85398000 39700000 46500000 63334000 39362000 0 59665000 51175000 0 84759000 79009000 0 4518 4192 4218 41621;41622;41623;41624;41625;41626;41627;41628;41629;41630;41631 53203;53204;53205;53206;53207;53208;53209;53210;53211;53212;53213 53204 9 AVVPASLSGQDVGSFAYLTIKDR Acetyl (Protein N-term) 2435.2696 0.2696395 4192 Q9H993 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes yes 1 0 1 1 149.49 149.49 3 0.0017619 152284 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.784 39.327 9699500 0 0 0 0 0 0 0 9699500 0 0 0 0 0 4519 4192 4219 41632 53214 53214 1 AVVPEMEKR Unmodified 1057.559 0.559015 4027 Q9BTZ2;P0CG22;A0A087WXI8;H0YN69;Q6PKH6;H0YLE1;H0YKN3;A0A087WSZ6 DHRS4;DHRS4L1;DHRS4L2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4;Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1;Dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2 yes no 0 0 1 1 20.365 20.365 3 0.051945 13435 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 16.87 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4520 4027 4220 41633 53215 53215 1 AVVPGPAEHPLQYNYTFWYSR Unmodified 2494.207 0.20697967 674 C9JEL3;B9A044;B8ZZ50;O60573 EIF4E2 Eukaryotic translation initiation factor 4E type 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 120 120 3 0.0065669 124784 QUIQUE_C1368_190116_001 36.454 24.832 196680000 0 0 41791000 0 0 0 0 0 49761000 0 55587000 49537000 0 4521 674 4221 41634;41635;41636;41637 53216;53217;53218;53219 53216 4 AVVQLKPR Unmodified 909.57599 0.5759857 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 17.123 17.123 2 0.043309 9735 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.07 73.298 149700000 0 0 0 0 0 0 0 149700000 0 0 0 0 0 4522 3117 4222 41638 53220 53220 0 AVVQVFEGTSGIDAK Unmodified 1519.7882 0.7882229 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 83.054 83.054 2;3 3.8448E-112 84960 QUIQUE_DMIX5_190116_001 232.14 208.16 17148000000 1421800000 1684400000 1525800000 1216400000 1323800000 1308200000 1411100000 1048500000 1133300000 648910000 1614400000 1330200000 1480700000 4523 2175 4223 41639;41640;41641;41642;41643;41644;41645;41646;41647;41648;41649;41650;41651;41652;41653;41654;41655;41656;41657;41658;41659;41660;41661 53221;53222;53223;53224;53225;53226;53227;53228;53229;53230;53231;53232;53233;53234;53235;53236;53237;53238;53239;53240;53241;53242;53243;53244;53245;53246;53247;53248;53249;53250;53251;53252;53253;53254;53255;53256;53257;53258;53259;53260;53261 53253 36 AVVQVFEGTSGIDAKK Unmodified 1647.8832 0.88318591 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 1 1 61.665 61.665 2 0.0015429 60038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.089 53.147 17595000 0 0 0 0 0 0 0 17595000 0 0 0 0 0 4524 2175 4224 41662 53262 53262 1 AVVTGKMDENQFVAVTSTNAAK Oxidation (M) 2296.1369 0.13691077 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 1 1 55.479 55.479 3 2.2507E-05 53145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.864 64.576 98460000 0 0 0 0 0 0 0 98460000 0 0 0 0 0 4525 365 4225 41663 53263 53263 255 1 AVVTHSSGNHGQALTYAAK Unmodified 1910.9599 0.9598731 4104 Q9GZT4;I3L4B4;I3L3N0 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 17.62 17.62 2;3;4 4.6384E-56 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PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 100.24 100.24 3 0.00053987 102313 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.262 63.635 60656000 0 38427000 0 0 0 0 0 22229000 0 0 0 0 0 4528 531 4228 41696;41697;41698;41699;41700;41701;41702;41703 53299;53300;53301;53302;53303;53304;53305;53306;53307 53307 9 AVVVHAGEDDLGR Unmodified 1336.6735 0.67352749 1942 P08294 SOD3 Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 30.39 30.39 3 0.013112 24981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.457 30.447 447330000 0 0 0 0 0 98578000 0 0 104120000 50920000 0 84614000 109090000 4529 1942 4229 41704;41705;41706;41707;41708 53308;53309;53310;53311;53312 53311 2 AVVVNAAQLASYSQSK Unmodified 1634.8628 0.86278482 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 80.395 80.395 2;3 5.2972E-37 80965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.87 155.09 4726700000 362840000 311120000 488400000 367610000 202720000 343810000 321490000 436470000 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53431;53432;53433;53434;53435;53436;53437;53438;53439;53440;53441;53442;53443;53444;53445;53446;53447;53448;53449;53450;53451;53452;53453;53454;53455;53456;53457;53458;53459;53460;53461;53462 53456 32 AVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVR Acetyl (Protein N-term) 3530.7881 0.7881271 2592 P51692;C9J4I3 STAT5B Signal transducer and activator of transcription 5B yes no 1 0 0 1 1 169.42 169.42 4 8.6757E-26 176771 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.632 83.794 133870000 0 0 0 0 0 0 0 0 39288000 0 94586000 0 0 4538 2592 4237 41823;41824 53463;53464 53464 2 AVWLPAMK Oxidation (M) 930.49971 0.49970921 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 53.861 53.861 2 0.053419 52995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.335 31.885 147410000 0 0 0 0 0 0 0 44039000 0 0 51053000 0 52315000 4539 2938 4238 41825;41826;41827 53465;53466;53467 53465 3 AVWLPAMK Unmodified 914.50479 0.50479459 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 84.121 84.121 2 0.053491 80993 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.787 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53497;53498;53499;53500 53499 4 AVYDTNPAK Unmodified 977.48181 0.48181054 4344 Q9NZD2;F5H0U5 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 1 1 20.981 20.981 2 0.046681 14031 QUIQUE_C1403_190116_001 51.662 28.353 145780000 0 46421000 0 29138000 0 0 0 0 0 0 70219000 0 0 4543 4344 4241 41845;41846;41847 53501;53502;53503 53502 2 AVYEAVLR Unmodified 919.51272 0.51271674 2049 P12955;K7ES25 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 51.914 51.914 2 0.016541 50026 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.65 72.471 340510000 0 0 0 0 158810000 0 0 181700000 0 0 0 0 0 4544 2049 4242 41848;41849 53504;53505 53505 1 AVYEDRPPGSVVPTSAAEASR Unmodified 2158.0655 0.065460388 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.695 57.695 3 9.1954E-10 56329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 94.879 362560000 34828000 41328000 0 48217000 36183000 0 0 40634000 39522000 15257000 52697000 53890000 0 4545 4137 4243 41850;41851;41852;41853;41854;41855;41856;41857;41858 53506;53507;53508;53509;53510;53511;53512;53513;53514 53510 9 AVYIFAK Unmodified 810.46398 0.46397563 2323;1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29;P30711;A0A0G2JRQ5;A0A0G2JQD2;A0A0G2JQM0;A0A0G2JRN4;A0A0G2JMS2;A0A0G2JQD8;A0A0G2JRG0;A0A1B0GXB6;A0A0G2JRJ5 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2;GSTT1 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2;Glutathione S-transferase theta-1 no no 0 0 0 1 1 1 54.343 54.343 2 0.046099 49838 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.944 33.413 500770000 0 0 0 188030000 0 0 0 227690000 0 85044000 0 0 0 4546 1983;2323 4244 41859;41860;41861 53515;53516;53517 53517 3 AVYSIQNEK Unmodified 1050.5346 0.53457439 931 E9PHR9;Q9NRQ2;C9J6E1 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.355 26.355 2 0.00047694 20500 QUIQUE_C1438_190116_001 133.9 97.506 706940000 0 0 138510000 0 104430000 0 104760000 55812000 0 0 195520000 0 107900000 4547 931 4245 41862;41863;41864;41865;41866;41867 53518;53519;53520;53521;53522;53523 53519 6 AVYSIQNEKK Unmodified 1178.6295 0.62953741 931 E9PHR9;Q9NRQ2;C9J6E1 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 yes no 0 0 1 1 16.718 16.718 3 0.05864 9263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.755 21.401 23209000 0 0 0 0 0 0 0 23209000 0 0 0 0 0 4548 931 4246 41868 53524 53524 1 AVYSTNCPVWEEAFR Unmodified 1827.825 0.82501911 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 118.1 118.1 2 0.013696 121882 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.135 33.767 34861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34861000 0 4549 4014 4247 41869 53525 53525 1 AVYTLTSLYR Unmodified 1185.6394 0.63937381 4261 Q9NR28;A0A024RBT2;H7BZK7;A0A2U3TZH2;H7BZQ7 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 90.367 90.367 2 0.0015903 92178 QUIQUE_C1403_190116_001 95.815 17.481 1398700000 0 319460000 301780000 150360000 0 0 245900000 0 0 0 0 0 381210000 4550 4261 4248 41870;41871;41872;41873;41874;41875 53526;53527;53528;53529;53530;53531 53528 6 AVYTQDCPLAAAK Unmodified 1406.6864 0.68640036 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.143 51.143 2 0.00037383 49329 QUIQUE_C1403_190116_001 94.309 73.609 2896300000 0 0 0 328530000 393530000 325680000 363550000 0 339470000 0 432580000 297950000 414990000 4551 2533 4249 41876;41877;41878;41879;41880;41881;41882;41883 53532;53533;53534;53535;53536;53537;53538;53539;53540 53532 9 AWALDVAELHR Unmodified 1279.6673 0.6673199 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 89.053 89.053 2;3 1.6392E-09 90695 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.11 125.9 998590000 40095000 78852000 92937000 70638000 71436000 59486000 63880000 108140000 97712000 41656000 110730000 73700000 89332000 4552 2226 4250 41884;41885;41886;41887;41888;41889;41890;41891;41892;41893;41894;41895;41896;41897 53541;53542;53543;53544;53545;53546;53547;53548;53549;53550;53551;53552;53553;53554;53555;53556;53557;53558 53550 18 AWALGQGLECFETSVK Unmodified 1794.8611 0.86107026 4053 Q9BW83 IFT27 Intraflagellar transport protein 27 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.84 134.84 2 1.9568E-06 139378 QUIQUE_C1277_190116_001 134.99 117.52 291870000 0 45923000 51509000 31645000 0 0 0 48069000 0 0 58489000 56239000 0 4553 4053 4251 41898;41899;41900;41901;41902;41903;41904;41905 53559;53560;53561;53562;53563;53564;53565;53566 53559 7 AWCQVAQK Unmodified 989.47529 0.47528537 2894 Q05329;Q5VZ31 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.019 23.019 2 0.0093583 16352 QUIQUE_C1438_190116_001 92.692 53.03 796630000 206530000 0 0 117900000 112830000 116800000 0 99618000 0 33121000 0 0 109830000 4554 2894 4252 41906;41907;41908;41909;41910;41911;41912;41913;41914;41915 53567;53568;53569;53570;53571;53572;53573;53574;53575;53576 53569 10 AWDDFFPGSDR Unmodified 1311.552 0.55201537 1667 O75915;F8WF90;C9JQU6;F8WF33 ARL6IP5 PRA1 family protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.27 123.27 2 0.00082046 125852 QUIQUE_C1563_190116_001 111.61 103.68 1710300000 157040000 147630000 156030000 133650000 121980000 133090000 134170000 129430000 123840000 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cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 88.247 88.247 2 0.03223 89585 QUIQUE_C1403_190116_001 53.756 25.548 59775000 0 0 0 32908000 0 26866000 0 0 0 0 0 0 0 4557 2998 4255 41942;41943 53609;53610 53609 2 AWDVLLDHIQSAALSK Unmodified 1765.9363 0.93628412 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 129.39 129.39 3 7.3151E-05 132274 QUIQUE_C1563_190116_001 87.647 73.782 294470000 22625000 34083000 26572000 31172000 24937000 21703000 20774000 0 26991000 11160000 46497000 0 27956000 4558 407 4256 41944;41945;41946;41947;41948;41949;41950;41951;41952;41953;41954;41955;41956 53611;53612;53613;53614;53615;53616;53617;53618;53619;53620;53621;53622;53623 53616 11 AWDVTVR Unmodified 845.43955 0.43955179 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 49.872 49.872 2 0.019688 47836 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 59.646 589580000 0 142310000 187760000 0 0 0 0 0 0 0 0 259500000 0 4559 2017 4257 41957;41958;41959 53624;53625;53626 53624 3 AWEDAEKDCR Unmodified 1278.5299 0.52989972 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 1 1 21.756 21.756 2 0.058011 14998 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.867 84.299 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4560 1436 4258 41960 53627 53627 1 AWEEYYK Unmodified 987.4338 0.43379771 3770;909 E9PEB5;Q96AE4;Q92945;A0A087WTP3;M0R0C6;M0R3J3;M0R251;M0QYG1;M0R263 FUBP1;KHSRP Far upstream element-binding protein 1;Far upstream element-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 55.252 55.252 2 0.024915 53472 QUIQUE_C1403_190116_001 97.071 86.886 404330000 0 0 0 156710000 123640000 0 0 0 0 0 80645000 43327000 0 4561 909;3770 4259 41961;41962;41963;41964 53628;53629;53630;53631;53632 53628 5 AWEEYYKK Unmodified 1115.5288 0.52876073 3770;909 E9PEB5;Q96AE4;Q92945;A0A087WTP3;M0R0C6;M0R3J3;M0R251;M0QYG1;M0R263 FUBP1;KHSRP Far upstream element-binding protein 1;Far upstream element-binding protein 2 no no 0 0 1 1 1 33.967 33.967 2;3 0.052578 29349 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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2723 P61328;C9JUK8;C9JEN8;Q92915 FGF12;FGF14 Fibroblast growth factor 12;Fibroblast growth factor;Fibroblast growth factor 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.98 102.98 2 0.015866 106967 QUIQUE_C1438_190116_001 84.064 63.204 359110000 43606000 39421000 0 40234000 34118000 36523000 59003000 33661000 18831000 0 0 0 53713000 4565 2723 4263 41983;41984;41985;41986;41987;41988;41989;41990;41991 53654;53655;53656;53657;53658;53659;53660;53661;53662 53657 9 AWFVSLDGKPVAQVR Unmodified 1671.9097 0.90967544 3386 Q6P995 FAM171B Protein FAM171B yes yes 0 0 1 1 1 95.446 95.446 3 0.012222 97625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.774 35.391 56307000 0 0 0 0 0 0 0 25892000 0 0 0 0 30415000 4566 3386 4264 41992;41993 53663;53664 53663 2 AWFVSLDGR Unmodified 1049.5294 0.52942943 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.49 108.49 2 0.0077234 111993 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.093 71.694 77478000 0 0 0 17404000 16664000 0 0 0 26616000 0 0 16794000 0 4567 3334 4265 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53765;53766;53767;53768;53769;53770;53771;53772;53773;53774 53770 6 AWGPGLETGQVGK Unmodified 1298.6619 0.66190017 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.453 65.453 2 4.1939E-05 64172 QUIQUE_C1563_190116_001 116.3 85.231 911180000 51216000 17848000 68355000 96918000 64021000 54884000 147660000 0 71051000 74686000 59115000 46976000 158450000 4573 3061 4270 42085;42086;42087;42088;42089;42090;42091;42092;42093;42094;42095;42096 53775;53776;53777;53778;53779;53780;53781;53782;53783;53784;53785;53786;53787 53780 9 AWGPGLHGGIVGR Unmodified 1275.6836 0.68363867 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.69 56.69 3 0.0016807 55113 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.252 43.819 294880000 0 0 0 0 0 0 0 38119000 45190000 21910000 65186000 61375000 63101000 4574 1628 4271 42097;42098;42099;42100;42101;42102 53788;53789;53790;53791;53792;53793;53794;53795 53789 8 AWGPTSQDTIR Unmodified 1230.5993 0.59929991 4088 Q9BZV1;K7EP32;K7EJ02 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.695 50.695 2 0.0026439 47053 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.688 52.29 287270000 0 0 0 0 0 0 0 79674000 43875000 33668000 69654000 0 60401000 4575 4088 4272 42103;42104;42105;42106;42107 53796;53797;53798;53799;53800;53801 53798 2 AWHGGCLALAELGR Unmodified 1509.7511 0.7510663 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.521 82.521 2;3 9.7357E-05 83983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.324 69.811 478560000 20039000 52945000 51130000 44049000 49834000 31292000 49239000 30458000 38996000 0 31313000 38070000 41199000 4576 1283 4273 42108;42109;42110;42111;42112;42113;42114;42115;42116;42117;42118;42119;42120 53802;53803;53804;53805;53806;53807;53808;53809;53810;53811;53812;53813;53814;53815;53816;53817;53818 53814 17 AWLTEKEEALNK Unmodified 1430.7405 0.74054442 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 50.969 50.969 2;3 0.022198 48837 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.712 30.345 125640000 0 0 32104000 0 0 0 0 33401000 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53835;53836;53837;53838;53839;53840;53841;53842 53838 8 AWNAVCPLVVR Unmodified 1283.6809 0.68086147 4121 Q9H0Q0;C9IYV6 FAM49A Protein FAM49A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.565 93.565 2 0.00045843 95334 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.47 72.658 1135000000 73641000 97914000 90070000 89986000 83956000 100770000 112790000 80193000 91358000 21276000 111080000 82914000 99045000 4580 4121 4277 42143;42144;42145;42146;42147;42148;42149;42150;42151;42152;42153;42154;42155 53843;53844;53845;53846;53847;53848;53849;53850;53851;53852;53853;53854;53855;53856;53857;53858 53857 16 AWNAYPYCR Unmodified 1199.5182 0.51821282 2842;2519 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459;I3L4C0;I3L2X8;I3L3W1;I3L471;I3L4U7;P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6;B3KYB7 PITPNA;PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform;Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.174 61.174 2 0.0029423 61138 QUIQUE_C1218_190116_001 105.12 90.45 3735300000 199820000 297690000 267090000 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1001.5294 0.52942943 2846 Q00688;G3V5F2 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 67.94 67.94 2 0.0036122 67802 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 87.759 851580000 106900000 125950000 0 0 0 84874000 128920000 111680000 0 28443000 0 119540000 145280000 4590 2846 4287 42250;42251;42252;42253;42254;42255;42256;42257 53962;53963;53964;53965;53966;53967;53968;53969 53966 7 AWVWNTHADFADECPKPELLAIR Unmodified 2738.3275 0.32750551 2464 P43487;F6WQW2;C9JXG8;C9JJ34;C9JGV6 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 124.8 124.8 3;4 4.2925E-23 128103 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.43 108.67 408560000 0 80355000 0 72517000 78569000 0 0 65959000 0 0 111150000 0 0 4591 2464 4288 42258;42259;42260;42261;42262;42263;42264;42265;42266;42267 53970;53971;53972;53973;53974;53975;53976;53977;53978;53979;53980 53977 10 AYAACQDALWALDSLGQVFIR Unmodified 2367.1682 0.16815132 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 171.35 171.35 3 1.3747E-06 176401 QUIQUE_C1576_190116_001 55.763 52.962 18220000 0 0 0 0 0 0 18220000 0 0 0 0 0 0 4592 1474 4289 42268 53981 53981 1 AYAAGFGDR Unmodified 926.42463 0.42463001 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.213 31.213 2 0.013518 25988 QUIQUE_C1576_190116_001 69.825 43.716 761060000 0 0 0 0 0 92969000 63349000 0 243910000 75365000 146850000 138610000 0 4593 2233 4290 42269;42270;42271;42272;42273;42274 53982;53983;53984;53985;53986;53987 53983 5 AYAAGFGDRR Unmodified 1082.5257 0.52574104 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 2 1 1 19.978 19.978 2;3 0.00069991 13042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.681 69.438 571430000 0 0 0 0 0 0 0 79983000 338440000 0 62020000 90980000 0 4594 2233 4291 42275;42276;42277;42278;42279 53988;53989;53990;53991;53992 53989 5 AYAALAALEK Unmodified 1019.5651 0.56514624 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.267 71.267 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51.624 2 0.019227 50720 QUIQUE_C1218_190116_001 113.08 77.59 833890000 68320000 0 50503000 41057000 0 45336000 69223000 124770000 121810000 0 190070000 0 122800000 4598 1973 4295 42292;42293;42294;42295;42296;42297;42298;42299;42300 54005;54006;54007;54008;54009;54010;54011;54012;54013 54005 9 AYAEALKENSYVK Unmodified 1484.7511 0.75110911 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 1 2 42.883 42.883 2;3 0.0083619 39313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.834 64.163 72992000 0 0 0 0 0 0 0 72992000 0 0 0 0 0 4599 2279 4296 42301;42302 54014;54015 54014 2 AYAEELASR Unmodified 1008.4876 0.4876242 3227 Q3SXM5;H3BQI7;H3BT52 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 32.786 32.786 2 0.020627 28416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.75 52.331 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4600 3227 4297 42303;42304;42305 54016;54017;54018 54016 3 AYAGDKAEEIGR Unmodified 1278.6204 0.62042929 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 19.94 19.94 2;3 0.00034497 12778 QUIQUE_C1576_190116_001 88.021 68.778 921760000 33906000 36023000 34380000 63325000 35991000 0 37710000 130740000 124090000 0 166020000 147590000 111990000 4601 1472 4298 42306;42307;42308;42309;42310;42311;42312;42313;42314;42315;42316;42317;42318;42319;42320;42321;42322;42323 54019;54020;54021;54022;54023;54024;54025;54026;54027;54028;54029;54030;54031;54032;54033;54034;54035;54036 54025 17 AYALAFAER Unmodified 1010.5185 0.5185304 455 A0A2R8YD50;P51659;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45;A0A2R8YEG2 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.398 69.398 2 0.00045846 69206 QUIQUE_C1368_190116_001 117.04 75.534 1591000000 136650000 138830000 139720000 116700000 139450000 116360000 125610000 89313000 115190000 0 196720000 155820000 120680000 4602 455 4299 42324;42325;42326;42327;42328;42329;42330;42331;42332;42333;42334;42335 54037;54038;54039;54040;54041;54042;54043;54044;54045;54046;54047;54048;54049;54050;54051;54052;54053 54041 17 AYAPGGPAYQPVVEAFGTDILHK Unmodified 2400.2114 0.21139634 2963 Q13057 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.96 131.96 3 6.9995E-06 136130 QUIQUE_C1277_190116_001 62.303 54.591 1569500000 136050000 174940000 221670000 0 0 144850000 178280000 143670000 164230000 69710000 133570000 0 202510000 4603 2963 4300 42336;42337;42338;42339;42340;42341;42342;42343;42344;42345 54054;54055;54056;54057;54058;54059;54060;54061;54062;54063;54064;54065 54056 11 AYAQGISR Unmodified 864.44537 0.44536545 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.218 18.218 2 0.0036031 11038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.89 44.506 1263900000 0 119690000 0 49337000 0 0 0 583200000 78745000 347120000 0 85843000 0 4604 612 4301 42346;42347;42348;42349;42350;42351;42352 54066;54067;54068;54069;54070;54071;54072 54069 6 AYAQQLTEWAR Unmodified 1335.6571 0.65714914 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;B0QYG7;B0QYG8 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.955 84.955 2 5.8078E-06 85881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.69 102.89 854530000 128330000 142040000 0 0 0 137900000 0 153620000 0 92441000 200210000 0 0 4605 4510 4302 42353;42354;42355;42356;42357;42358 54073;54074;54075;54076;54077;54078 54076 6 AYAVVCDCK Unmodified 1084.4682 0.46815109 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 25.594 25.594 2 0.043726 20385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.482 36.338 51794000 0 0 0 0 0 0 0 16780000 0 0 0 0 35014000 4606 4631 4303 42359;42360 54079;54080 54079 2 AYAYLFK Acetyl (Protein N-term) 916.46945 0.46945494 2707 P61019;E9PKL7 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 138.84 138.84 1;2 0.021444 143342 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.377 35.766 1330100000 59524000 85073000 75680000 181860000 69794000 165120000 77082000 55910000 74066000 38968000 114340000 75303000 257340000 4607 2707 4304 42361;42362;42363;42364;42365;42366;42367;42368;42369;42370;42371;42372;42373;42374;42375;42376 54081;54082;54083;54084;54085;54086;54087;54088;54089;54090;54091;54092;54093;54094;54095;54096;54097 54096 14 AYCHILLGNYCVAVADAK Unmodified 2036.9812 0.98120217 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 94.911 94.911 3 3.47E-06 96702 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.786 65.502 188170000 0 0 0 76793000 0 0 0 0 0 36037000 0 0 75344000 4608 4572 4305 42377;42378;42379 54098;54099;54100;54101;54102 54100 5 AYDATHLVK Unmodified 1016.5291 0.52909508 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.291 26.291 2 0.004459 20167 QUIQUE_C1277_190116_001 88.948 63.009 9347000000 716580000 770470000 765400000 779810000 434850000 643240000 843050000 786350000 921210000 223250000 1002400000 565510000 894810000 4609 2003 4306 42380;42381;42382;42383;42384;42385;42386;42387;42388;42389;42390;42391;42392 54103;54104;54105;54106;54107;54108;54109;54110;54111;54112;54113;54114;54115 54104 10 AYDAVQLFALTGPAESK Unmodified 1779.9043 0.90431529 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 130.4 130.4 2;3 7.5333E-53 135136 QUIQUE_C1368_190116_001 185.87 163.15 2317400000 210920000 209060000 273900000 193510000 155040000 232140000 223130000 107970000 148040000 49013000 213280000 125260000 176170000 4610 2142 4307 42393;42394;42395;42396;42397;42398;42399;42400;42401;42402;42403;42404;42405;42406;42407;42408;42409;42410;42411;42412;42413 54116;54117;54118;54119;54120;54121;54122;54123;54124;54125;54126;54127;54128;54129;54130;54131;54132;54133;54134;54135;54136;54137;54138;54139;54140;54141;54142;54143 54122 27 AYDAVQLFALTGPAESKGEITPELLGVMR Unmodified 3075.5951 0.59507274 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 1 1 156.33 156.33 3 2.1177E-17 161380 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.615 84.24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4611 2142 4308 42414 54144 54144 1 AYDDLLDEFMQAVTDK Oxidation (M) 1888.8401 0.84006005 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 158.08 158.08 2 2.3505E-07 163187 QUIQUE_C1368_190116_001 119.39 97.991 272160000 35615000 47113000 45509000 27685000 34501000 39081000 31399000 0 0 11255000 0 0 0 4612 3198 4309 42415;42416;42417;42418;42419;42420;42421;42422 54145;54146;54147;54148;54149;54150;54151;54152;54153 54147 2625 9 AYDDLLDEFMQAVTDK Unmodified 1872.8451 0.84514543 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 172.66 172.66 2;3 8.0573E-95 177091 QUIQUE_C1218_190116_001 255.23 230.38 3231200000 251760000 350860000 354940000 137410000 236970000 130020000 248800000 157150000 266630000 42263000 396520000 372030000 285880000 4613 3198 4309 42423;42424;42425;42426;42427;42428;42429;42430;42431;42432;42433;42434;42435;42436;42437;42438;42439;42440;42441;42442;42443;42444;42445;42446;42447;42448 54154;54155;54156;54157;54158;54159;54160;54161;54162;54163;54164;54165;54166;54167;54168;54169;54170;54171;54172;54173;54174;54175;54176;54177;54178;54179;54180;54181;54182 54156 29 AYDIYSR Unmodified 886.41848 0.418482 3192 Q16740;M0QYV5 CLPP ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial;ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit yes no 0 0 0 1 37.415 37.415 2 0.056653 33040 QUIQUE_C1277_190116_001 71.296 15.791 59626000 0 59626000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4614 3192 4310 42449 54183 54183 1 AYDPDYER Unmodified 1027.4247 0.42468959 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 25.197 25.197 2 0.018957 19212 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.116 60.385 268950000 0 55643000 0 0 0 0 0 98745000 87177000 27381000 0 0 0 4615 345 4311 42450;42451;42452;42453 54184;54185;54186;54187 54185 4 AYEDQTKPVLEYYQK Unmodified 1873.9098 0.90979459 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 64.431 64.431 2;3 2.9721E-28 64016 QUIQUE_C1576_190116_001 184.31 133.96 3790100000 391350000 432470000 470990000 492880000 0 514340000 81818000 80228000 525460000 158870000 108100000 96073000 437550000 4616 4450 4312 42454;42455;42456;42457;42458;42459;42460;42461;42462;42463;42464;42465;42466;42467;42468;42469;42470;42471;42472;42473 54188;54189;54190;54191;54192;54193;54194;54195;54196;54197;54198;54199;54200;54201;54202;54203;54204;54205;54206;54207;54208;54209 54198 20 AYEFAER Unmodified 884.40283 0.40283194 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.845 32.845 2 0.021961 27997 QUIQUE_C1576_190116_001 103.29 31.265 9967300000 1308500000 0 0 1265700000 0 1091200000 1673400000 1062000000 0 430830000 1799100000 1336600000 0 4617 50;2631 4313 42474;42475;42476;42477;42478;42479;42480;42481 54210;54211;54212;54213;54214;54215;54216;54217 54213 8 AYELALYLR Unmodified 1110.6073 0.6073454 1099 G5E9Q6;C9J0J7 PFN2 Profilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 106.73 106.73 2 9.6027E-05 111235 QUIQUE_DMIX5_190116_001 165.11 131.56 3367900000 123650000 162040000 217160000 82810000 189670000 260960000 305730000 323040000 501930000 121960000 355320000 358480000 365200000 4618 1099 4314 42482;42483;42484;42485;42486;42487;42488;42489;42490;42491;42492;42493;42494;42495 54218;54219;54220;54221;54222;54223;54224;54225;54226;54227;54228;54229;54230;54231;54232;54233;54234;54235;54236;54237;54238;54239;54240;54241;54242;54243;54244 54237 26 AYELEQSVVK Unmodified 1164.6027 0.60265396 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 54.745 54.745 2 0.011915 53298 QUIQUE_C1368_190116_001 66.621 43.193 100660000 0 0 38052000 0 0 0 0 0 0 0 62608000 0 0 4619 550 4315 42496;42497 54245;54246 54245 2 AYEMALK Unmodified 824.41023 0.4102255 4344 Q9NZD2;F5H0U5;H0YFS9 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 35.804 35.804 2 0.067021 31551 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.897 8.4448 24776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24776000 4620 4344 4316 42498 54247 54247 1 AYEPQELKPFVTAISSALVIAAVFDR Unmodified 2834.5218 0.52183145 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 1 1 174.12 174.12 3 1.2667E-36 178300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.47 94.673 21775000 0 0 0 0 0 0 0 0 21775000 0 0 0 0 4621 1283 4317 42499 54248;54249 54249 2 AYEQAGMMLK Unmodified 1140.5308 0.53075134 3973 Q99747;J3KTJ6 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 51.766 51.766 2 0.016321 49832 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 40.617 0 0 0 0 0 0 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AYFAVFDGHGGVDAAR Unmodified 1651.7743 0.77430417 2535 P49593;A8MX49;B5MCT7;C9J2F3 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.613 84.613 3 0.00025572 82326 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.265 52.468 244680000 35411000 0 32145000 35849000 34747000 0 0 0 28576000 43448000 0 0 34505000 4626 2535 4322 42512;42513;42514;42515;42516;42517;42518 54262;54263;54264;54265;54266;54267;54268 54267 7 AYFHLLNQIAPK Unmodified 1413.7769 0.77687035 181;3076 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2;C9JAM8;Q14651 PLS3;PLS1 Plastin-3;Plastin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 86.59 86.59 2;3 0.00037219 86108 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.417 74.688 859560000 60446000 69218000 72747000 65321000 54901000 51867000 58577000 0 87834000 35259000 128480000 63184000 111720000 4627 181;3076 4323 42519;42520;42521;42522;42523;42524;42525;42526;42527;42528;42529;42530;42531;42532;42533 54269;54270;54271;54272;54273;54274;54275;54276;54277;54278;54279;54280;54281;54282;54283 54278 10 AYFLDGSLLK Unmodified 1125.607 0.60701105 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 112.81 112.81 2 0.022257 115390 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 34.005 63140000 0 0 0 0 0 6872800 0 0 0 0 26987000 11602000 17678000 4628 1820 4324 42534;42535;42536;42537 54284;54285;54286;54287 54284 4 AYFQQYGCTFTAVIPTNVFGPHDNFNIEDGHVLPGLIHK Unmodified 4416.1426 0.14261186 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 2 149.7 149.7 4;5 2.3931E-05 152561 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.32 42.615 131140000 0 0 0 0 0 0 0 131140000 0 0 0 0 0 4629 3020 4325 42538;42539 54288;54289 54289 2 AYGAGLLSSYGELLHCLSEEPEIR Unmodified 2663.2901 0.29011695 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 159.76 159.76 3 4.6834E-24 166377 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.884 79.895 385690000 0 0 50511000 38476000 0 0 0 0 48782000 0 96150000 84781000 66987000 4630 1913 4326 42540;42541;42542;42543;42544;42545;42546 54290;54291;54292;54293;54294;54295;54296 54293 6 AYGELPEHAK Unmodified 1113.5455 0.54547343 2494 P47813;X6RAC9;O14602;A6NJH9 EIF1AX;EIF1AY Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.646 19.646 2;3 0.0026604 12194 QUIQUE_C1563_190116_001 101.64 65.763 512700000 0 150290000 0 0 114900000 132170000 115340000 0 0 0 0 0 0 4631 2494 4327 42547;42548;42549;42550 54297;54298;54299;54300 54299 4 AYGENIGYSEK Unmodified 1229.5564 0.55643205 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.295 38.295 2 0.00043198 34520 QUIQUE_C1438_190116_001 123.35 93.188 15874000000 1442500000 1637400000 1581400000 1490800000 1102000000 1147300000 1505200000 1008000000 993520000 466480000 1201300000 1069700000 1228300000 4632 1873 4328 42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;42559;42560;42561;42562;42563 54301;54302;54303;54304;54305;54306;54307;54308;54309;54310;54311;54312;54313;54314;54315;54316;54317;54318;54319;54320;54321;54322 54307 21 AYGENIGYSEKDR Unmodified 1500.6845 0.68448611 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 29.539 29.539 2;3 0.00026641 24094 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.417 81.16 3211700000 28439000 50420000 45645000 0 104890000 0 0 642580000 290660000 0 1034300000 617980000 396750000 4633 1873 4329 42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;42571;42572;42573;42574;42575;42576 54323;54324;54325;54326;54327;54328;54329;54330;54331;54332;54333;54334;54335;54336;54337 54336 13 AYGLLVATTSR Unmodified 1150.6346 0.63462279 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.845 68.845 2 0.016207 68688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.916 42.503 193920000 0 0 0 0 0 41556000 0 30313000 44814000 12463000 64770000 0 0 4634 319 4330 42577;42578;42579;42580;42581 54338;54339;54340;54341;54342 54339 5 AYGPGIEPTGNMVK Oxidation (M) 1448.697 0.69696505 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 1 0 1 1 2 1 43.927 43.927 2 0.0056895 41005 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.792 42.453 254070000 0 0 0 0 0 0 0 49808000 0 37999000 98455000 67809000 0 4635 2178 4331 42582;42583;42584;42585;42586 54343;54344;54345;54346;54347 54346 1532 5 AYGQQLTDWAK Unmodified 1279.6197 0.619701 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.037 80.037 2 7.1778E-31 82229 QUIQUE_C1218_190116_001 203.29 164.14 7587100000 651000000 732380000 666390000 487980000 558600000 435770000 668880000 601550000 567070000 194380000 732460000 630820000 659780000 4636 4069 4332 42587;42588;42589;42590;42591;42592;42593;42594;42595;42596;42597;42598;42599 54348;54349;54350;54351;54352;54353;54354;54355;54356;54357;54358;54359;54360;54361;54362;54363;54364;54365;54366;54367;54368;54369;54370;54371;54372;54373;54374;54375 54350 28 AYGTGFVGCLR Unmodified 1199.5757 0.5757277 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.588 73.588 2 0.013991 74845 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.981 34.826 92706000 0 0 0 0 0 0 0 0 45069000 0 47637000 0 0 4637 1408 4333 42600;42601;42602;42603 54376;54377;54378;54379 54378 4 AYHEQLSVAEITNACFEPANQMVK Oxidation (M) 2765.2789 0.27890034 2795;3430;2796;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;C9JDS9;P68366;Q71U36 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain no no 0 1 0 11 8 10 8 6 4 7 7 2 5 9 10 7 103.75 103.75 2;3 0 101869 QUIQUE_C1277_190116_001 292.45 267.65 31954000000 2588000000 3568100000 3336300000 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54380;54381;54382;54383;54384;54385;54386;54387;54388;54389;54390;54391;54392;54393;54394;54395;54396;54397;54398;54399;54400;54401;54402;54403;54404;54405;54406;54407;54408;54409;54410;54411;54412;54413;54414;54415;54416;54417;54418;54419;54420;54421;54422;54423;54424;54425;54426;54427;54428;54429;54430;54431;54432;54433;54434;54435;54436;54437;54438;54439;54440;54441;54442;54443;54444;54445;54446;54447;54448;54449;54450;54451;54452;54453;54454;54455;54456;54457;54458;54459;54460;54461;54462;54463;54464;54465;54466;54467;54468;54469;54470;54471;54472;54473;54474;54475;54476;54477;54478;54479;54480;54481;54482;54483;54484;54485;54486;54487;54488;54489;54490;54491;54492;54493;54494;54495;54496;54497;54498;54499;54500;54501;54502;54503;54504;54505;54506;54507;54508;54509;54510;54511;54512;54513;54514;54515;54516;54517;54518;54519;54520;54521;54522;54523;54524;54525;54526 54403 1259 133 AYHEQLSVAEITNACFEPANQMVK Unmodified 2749.284 0.28398571 2795;3430;2796;1990 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54527 267 AYHEQLSVAEITSSCFEPNSQMVK Oxidation (M) 2770.2578 0.25783054 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 96.33 96.33 3 5.6244E-15 98724 QUIQUE_C1277_190116_001 108.64 101.45 247040000 0 82757000 0 0 60734000 0 69557000 0 0 33989000 0 0 0 4640 688 4335 42892;42893;42894;42895;42896 54826;54827;54828;54829;54830;54831 54827 424 5 AYHEQLSVAEITSSCFEPNSQMVK Unmodified 2754.2629 0.26291592 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 1 1 106.53 106.53 3 1.1373E-07 108992 QUIQUE_C1277_190116_001 73.994 61.798 314670000 0 278620000 0 0 0 0 0 0 0 36055000 0 0 0 4641 688 4335 42897;42898 54832;54833 54832 2 AYHEQLTVAEITNACFEPANQMVK Oxidation (M) 2779.2946 0.2945504 3992 Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1C Tubulin alpha-1C chain yes no 0 1 0 2 1 2 2 2 3 3 2 1 4 2 102.16 102.16 2;3 5.1938E-24 103221 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.71 120.79 24544000000 1325600000 121660000 0 1110700000 936550000 1219700000 0 5925600000 5257300000 3603300000 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42923;42924;42925;42926;42927;42928;42929;42930;42931;42932;42933;42934;42935;42936;42937;42938;42939;42940;42941;42942;42943;42944;42945;42946;42947;42948;42949;42950;42951;42952;42953;42954;42955;42956;42957;42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972;42973;42974;42975;42976;42977;42978;42979;42980;42981;42982;42983;42984;42985;42986;42987;42988;42989;42990;42991;42992;42993;42994;42995;42996;42997;42998;42999;43000;43001;43002;43003;43004;43005;43006;43007;43008;43009;43010;43011;43012;43013;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;43024;43025;43026;43027;43028 54870;54871;54872;54873;54874;54875;54876;54877;54878;54879;54880;54881;54882;54883;54884;54885;54886;54887;54888;54889;54890;54891;54892;54893;54894;54895;54896;54897;54898;54899;54900;54901;54902;54903;54904;54905;54906;54907;54908;54909;54910;54911;54912;54913;54914;54915;54916;54917;54918;54919;54920;54921;54922;54923;54924;54925;54926;54927;54928;54929;54930;54931;54932;54933;54934;54935;54936;54937;54938;54939;54940;54941;54942;54943;54944;54945;54946;54947;54948;54949;54950;54951;54952;54953;54954;54955;54956;54957;54958;54959;54960;54961;54962;54963;54964;54965;54966;54967;54968;54969;54970;54971;54972;54973;54974;54975;54976;54977;54978;54979;54980;54981;54982;54983;54984;54985;54986;54987;54988;54989;54990;54991;54992;54993;54994;54995;54996;54997;54998;54999;55000;55001;55002;55003;55004;55005;55006;55007;55008;55009;55010;55011;55012;55013;55014;55015;55016;55017;55018;55019;55020;55021;55022;55023;55024;55025;55026;55027;55028;55029;55030;55031;55032;55033;55034;55035;55036;55037;55038;55039;55040;55041;55042;55043;55044;55045;55046;55047;55048;55049;55050;55051;55052;55053;55054;55055;55056;55057;55058;55059;55060;55061;55062;55063;55064;55065;55066;55067;55068;55069;55070;55071;55072 54985 198 AYHLQDDGTQTVR Unmodified 1502.7114 0.71136956 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 26.991 26.991 2;3 0.00047709 21139 QUIQUE_C1277_190116_001 105.86 73.929 88030000 0 29771000 0 24210000 0 0 0 0 0 0 0 0 34050000 4644 3838 4337 43029;43030;43031;43032 55073;55074;55075;55076 55073 4 AYHSFLVEPISCHAWNK Acetyl (Protein N-term) 2099.9887 0.98873039 1485 O15143;C9JEY1;C9K057;C9JBJ7;C9J4Z7;F8VXW2;C9JQM8;C9JFG9;C9J6C8;C9JTT6;C9JM51;F8WEB3 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 110.03 110.03 3 1.9728E-07 113016 QUIQUE_C1277_190116_001 106.6 88.307 487550000 63256000 67750000 137450000 109440000 0 0 0 72654000 0 36999000 0 0 0 4645 1485 4338 43033;43034;43035;43036;43037;43038 55077;55078;55079;55080;55081;55082;55083 55078 7 AYIAAQGPLK Unmodified 1030.5811 0.58113065 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 42.369 42.369 2 0.042203 39401 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.69 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tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 135.83 135.83 2 3.2241E-13 141711 QUIQUE_C1218_190116_001 122.97 102.11 299290000 34387000 40564000 50466000 39741000 0 0 0 0 0 22456000 57347000 0 54324000 4649 987;2987 4342 43050;43051;43052;43053;43054;43055;43056;43057;43058;43059 55096;55097;55098;55099;55100;55101;55102;55103;55104;55105;55106;55107 55097 10 AYICAHPLDR Unmodified 1214.5866 0.58662674 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 33.372 33.372 3 0.0086884 28895 QUIQUE_C1403_190116_001 48.004 30.978 61295000 0 0 0 34477000 0 0 0 0 0 0 0 0 26818000 4650 4186 4343 43060;43061;43062 55108;55109;55110 55108 3 AYIDSFR Unmodified 870.42357 0.42356738 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 55.405 55.405 2 0.020194 53462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 9.5988 324540000 0 0 0 0 0 146440000 0 178110000 0 0 0 0 0 4651 2083 4344 43063;43064 55111;55112 55112 2 AYIFIDEAHITQALIWLSQR Unmodified 2387.2638 0.26376627 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 169.31 169.31 3 0.0013598 176581 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.938 47.344 130060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 130060000 0 0 4652 1802 4345 43065 55113 55113 1 AYIGFIQSLAQFLGADASR Unmodified 2027.0476 0.04762548 2662 P55160 NCKAP1L Nck-associated protein 1-like yes yes 0 0 0 1 172.37 172.37 3 0.00023472 179665 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.094 39.44 25006000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25006000 0 0 4653 2662 4346 43066 55114 55114 1 AYILNLVK Unmodified 932.5695 0.56950333 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.694 85.694 2 0.0036845 87351 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.15 85.126 3707800000 331230000 322600000 0 280350000 354060000 283280000 342340000 291440000 283560000 133720000 412560000 302730000 369970000 4654 2573 4347 43067;43068;43069;43070;43071;43072;43073;43074;43075;43076;43077;43078 55115;55116;55117;55118;55119;55120;55121;55122;55123;55124;55125;55126;55127 55122 9 AYINKVEELK Unmodified 1205.6656 0.66558856 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 1 1 2 1 2 37.921 37.921 2;3 0.019946 33901 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.539 38.533 968880000 0 0 0 0 0 0 0 0 145600000 0 405190000 145120000 272960000 4655 1914 4348 43079;43080;43081;43082;43083;43084 55128;55129;55130;55131;55132;55133 55132 3 AYINKVEELKK Unmodified 1333.7606 0.76055158 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 2 1 1 1 25.257 25.257 2;3 0.013021 20146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.531 58.178 481480000 0 0 0 0 0 0 0 307280000 148890000 0 25309000 0 0 4656 1914 4349 43085;43086;43087 55134;55135;55136 55134 1 AYIQEFQEFSK Unmodified 1388.6612 0.66123147 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 93.065 93.065 2 0.0023415 95321 QUIQUE_C1403_190116_001 78.939 49.777 123140000 0 0 0 70483000 52661000 0 0 0 0 0 0 0 0 4657 3410 4350 43088;43089 55137;55138 55137 2 AYIQENLELVEK Unmodified 1447.7559 0.75586013 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.349 87.349 2 7.3426E-05 84760 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.63 71.347 342870000 0 0 50626000 39975000 0 55728000 61227000 66486000 33499000 35332000 0 0 0 4658 1005;2027 4351 43090;43091;43092;43093;43094;43095;43096;43097;43098;43099 55139;55140;55141;55142;55143;55144;55145;55146;55147;55148 55146 10 AYIVEWR Unmodified 935.4865 0.48650199 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.052 74.052 2 0.039576 74251 QUIQUE_C1368_190116_001 83.614 46.594 102650000 25893000 26888000 28942000 0 0 0 0 0 20927000 0 0 0 0 4659 3779 4352 43100;43101;43102;43103 55149;55150;55151;55152 55151 4 AYIVQLQIEDLTR Unmodified 1560.8512 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43128 55178 55178 1 AYLEGTCVEWLR Unmodified 1495.7129 0.71294946 2312;1995;324;2104;2316;2315;325 A0A140T955;A0A140T933;A0A1W2PRT9;A0A140T9I0;A0A140T9X5;A0A140T913;P01892;A0A1W2PPQ2;P10316;P16188;P30453;P16190;P30479;P30480;P30462;O19617;A0A140T921;A0A140T9H5;A0A140T9U8;A2AEA2;P10321;A0A140TA05;A0A1W2PRU9;A0A140T9L3;A0A140T9E1;A0A140T942;A0A140TA19;A0A140T9S7;A0A140T9Q4 HLA-A;HLA-B;HLA-C HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.02 111.02 2 7.1163E-05 114355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.88 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43142;43143;43144;43145;43146;43147;43148;43149;43150;43151;43152 55194;55195;55196;55197;55198;55199;55200;55201;55202;55203;55204;55205;55206 55199 13 AYLNQTVTEFK Unmodified 1312.6663 0.66631685 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 71.966 71.966 2 0.0014573 71888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.07 82.796 631110000 0 0 0 0 0 0 0 115160000 140660000 0 0 196520000 178760000 4672 3895 4365 43153;43154;43155;43156 55207;55208;55209;55210 55208 4 AYLPVNESFGFTADLR Unmodified 1798.889 0.88899957 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 3 2 3 1 2 2 2 134.88 134.88 2;3 1.1652E-13 138134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.11 156.49 1553000000 149060000 180290000 157370000 135370000 61198000 137470000 17376000 274590000 343730000 65537000 0 30981000 0 4673 2058 4366 43157;43158;43159;43160;43161;43162;43163;43164;43165;43166;43167;43168;43169;43170;43171;43172;43173;43174;43175;43176;43177;43178;43179;43180;43181 55211;55212;55213;55214;55215;55216;55217;55218;55219;55220;55221;55222;55223;55224;55225;55226;55227;55228;55229;55230;55231;55232;55233;55234;55235;55236;55237;55238;55239;55240;55241;55242;55243;55244;55245 55233 31 AYLQQLR Unmodified 890.4974 0.49740102 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.832 38.832 2 0.029928 34904 QUIQUE_C1277_190116_001 91.093 54.065 2745000000 0 461020000 517160000 0 379120000 0 531440000 0 364920000 0 491350000 0 0 4674 1487 4367 43182;43183;43184;43185;43186;43187 55246;55247;55248;55249;55250;55251;55252;55253 55246 8 AYLSIWTELQAYIK Unmodified 1697.9029 0.90285872 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 1 166.67 166.67 2 0.0097593 168682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.893 53.994 8769900 0 0 0 0 0 0 0 8769900 0 0 0 0 0 4675 2857;3307 4368 43188 55254 55254 0 AYLSSGGGFPEGPEPR Unmodified 1619.758 0.7579854 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 76.104 76.104 2 0.00079898 76927 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.03 51.166 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4676 730 4369 43189;43190 55255;55256 55256 2 AYLTEENGQIAVFDATNTTR Unmodified 2213.06 0.060040659 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 108.04 108.04 2;3 8.9649E-174 110335 QUIQUE_DMIX1_190116_001 243.78 223.4 358100000 41644000 47560000 0 45647000 0 0 0 97033000 104750000 21463000 0 0 0 4677 1594 4370 43191;43192;43193;43194;43195;43196;43197;43198 55257;55258;55259;55260;55261;55262;55263;55264;55265;55266 55261 9 AYLTVLADQATPTNR Unmodified 1632.8471 0.84713476 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.777 86.777 2 6.0218E-112 89850 QUIQUE_C1218_190116_001 231.54 212.79 975540000 106730000 97934000 94640000 83130000 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Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 2 132.99 132.99 2;3 2.2001E-20 139864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.5 155.08 71106000 0 0 0 0 0 0 0 0 29796000 0 41309000 0 0 4680 831;1569 4373 43224;43225;43226 55298;55299;55300 55299 3 AYNHHIQELQR Unmodified 1407.7007 0.70074529 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.09 16.09 3 1.6792E-05 9008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.55 94.315 424540000 40521000 45507000 50473000 0 0 48319000 65279000 38843000 0 17197000 64602000 0 53800000 4681 4378 4374 43227;43228;43229;43230;43231;43232;43233;43234;43235 55301;55302;55303;55304;55305;55306;55307;55308;55309;55310 55307 10 AYNHYFDLIIINDNLDK Unmodified 2080.0266 0.026555687 4358 Q9NZW5;B8ZZG1 MPP6 MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 132.48 132.48 3 0.018681 137984 QUIQUE_C1576_190116_001 45.704 31.663 37284000 0 0 0 0 0 0 37284000 0 0 0 0 0 0 4682 4358 4375 43236 55311 55311 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55325;55326;55327;55328;55329;55330;55331;55332;55333;55334 55331 8 AYPDVAALSDGYWVVSNR Unmodified 1981.9534 0.95339074 467 A0A2R8YGD1;O14773;A0A2R8Y7U1;A0A2R8YD45 TPP1 Tripeptidyl-peptidase 1 yes no 0 0 0 2 2 4 1 2 1 2 2 2 2 2 2 3 139.23 139.23 2;3 3.8704E-31 144618 QUIQUE_C1368_190116_001 182.33 159.75 6947500000 293930000 757360000 711840000 185940000 491670000 343280000 521140000 596940000 590950000 202590000 843140000 595000000 813730000 4685 467 4378 43257;43258;43259;43260;43261;43262;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270;43271;43272;43273;43274;43275;43276;43277;43278;43279;43280;43281;43282;43283 55335;55336;55337;55338;55339;55340;55341;55342;55343;55344;55345;55346;55347;55348;55349;55350;55351;55352;55353;55354;55355;55356;55357;55358;55359;55360;55361;55362;55363;55364;55365;55366;55367;55368;55369;55370;55371;55372;55373;55374;55375;55376;55377;55378 55342 43 AYPGYYFTGDGAYR Unmodified 1599.6994 0.69940789 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 93.302 93.302 2 8.7051E-05 94519 QUIQUE_C1277_190116_001 99.283 77.29 60775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60775000 0 0 0 4686 4296 4379 43284;43285 55379;55380 55379 2 AYPHFCAFGHAVDTLLEELGGER Unmodified 2588.2118 0.21180705 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 154.3 154.3 4 1.5733E-07 161880 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.776 70.876 95304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95304000 0 0 4687 699 4380 43286 55381 55381 1 AYPLADAHLTK Unmodified 1198.6346 0.63462279 2670 P55769 NHP2L1 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed no no 0 0 0 1 2 1 41.654 41.654 3 0.0074089 39101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.48 28.127 83559000 0 0 36075000 0 0 0 0 24949000 0 0 0 22535000 0 4688 2670 4381 43287;43288;43289;43290 55382;55383;55384;55385;55386 55384 5 AYQAEVDKLR Unmodified 1191.6248 0.62478638 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 29.991 29.991 2;3 0.0066736 24690 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43331;43332 55429;55430 55430 2 AYSDPSTGEPATYGELQQR Unmodified 2068.9338 0.93377751 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 66.655 66.655 2;3 1.8666E-132 66721 QUIQUE_C1277_190116_001 295.62 288.01 5230200000 331160000 363640000 350610000 158910000 354270000 205880000 299390000 662410000 661710000 279830000 769240000 517410000 275770000 4698 3117 4391 43333;43334;43335;43336;43337;43338;43339;43340;43341;43342;43343;43344;43345;43346;43347;43348;43349 55431;55432;55433;55434;55435;55436;55437;55438;55439;55440;55441;55442;55443;55444;55445;55446;55447;55448;55449;55450;55451;55452;55453;55454;55455;55456;55457;55458;55459 55434 28 AYSEAHEISKEHMQPTHPIR Oxidation (M) 2376.1281 0.12807742 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 1 1 2 17.662 17.662 3;5 7.9889E-09 10276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.94 84.043 203280000 0 0 0 0 0 0 0 203280000 0 0 0 0 0 4699 2736 4392 43350;43351 55460;55461 55461 2170 2 AYSEAHEISKEHMQPTHPIR Unmodified 2360.1332 0.1331628 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 22.117 22.117 5 0.00096056 15994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.298 44.586 481370000 0 0 0 0 0 0 0 260980000 67676000 0 49005000 103710000 0 4700 2736 4392 43352;43353;43354;43355 55462;55463;55464;55465 55462 4 AYSEALAAFGNGALFVEK Unmodified 1856.9309 0.93086439 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.64 138.64 2;3 0.00053522 144745 QUIQUE_C1438_190116_001 71.513 58.313 5071000000 1711100000 0 23841000 71947000 1848900000 1387200000 0 18306000 0 0 0 9624300 0 4701 2026 4393 43356;43357;43358;43359;43360;43361;43362 55466;55467;55468;55469;55470;55471;55472;55473 55469 8 AYSFAMGCWPK Unmodified 1316.5682 0.56819948 1120 H0Y4B0;O43414;A0A3B3ISV9;F6QUN3 ERI3 ERI1 exoribonuclease 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104 104 2 0.00080473 106544 QUIQUE_C1403_190116_001 95.099 79.891 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no 0 0 0 1 1 69.808 69.808 3 0.0057593 68608 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.785 30.017 104060000 0 0 0 0 0 0 0 104060000 0 0 0 0 0 4705 177 4396 43378;43379 55492;55493 55492 2 AYSNWPTYPQLYVK Unmodified 1728.8512 0.8511575 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 114.43 114.43 2 0.0036853 117873 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.726 58.038 332970000 40328000 46405000 0 36848000 0 0 0 0 0 0 117780000 35793000 55815000 4706 1676 4397 43380;43381;43382;43383;43384;43385;43386;43387;43388;43389 55494;55495;55496;55497;55498;55499;55500;55501;55502;55503 55502 8 AYSPELIVHPVLDSPNAVHEVEK Unmodified 2542.3068 0.30675329 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 1 2 90.992 90.992 3;4 3.2052E-14 93126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.74 93.157 3425900000 135350000 142810000 281460000 363220000 381970000 333800000 448920000 128280000 383760000 162190000 166090000 106040000 391980000 4707 3533 4398 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2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.71 123.71 2 3.2743E-22 128331 QUIQUE_C1368_190116_001 162.36 129.84 1286100000 150880000 157400000 188770000 0 152210000 142690000 0 0 186070000 0 170460000 137570000 0 4719 2026 4410 43485;43486;43487;43488;43489;43490;43491;43492 55610;55611;55612;55613;55614;55615;55616;55617;55618 55612 8 AYVLGSPALAAELEAVGVASVGVGPEPLQGEGPGDWLHAPLEPDVR Unmodified 4589.3442 0.34420802 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 169.62 169.62 4 1.8785E-11 173784 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.69 49.432 103960000 0 0 0 0 0 0 0 23017000 33412000 0 0 0 47533000 4720 531 4411 43493;43494;43495 55619;55620;55621 55621 3 AYVQAMVETVNNLLQPQALNAWR Unmodified 2628.3482 0.34824095 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2 ADGRL3 yes no 0 0 0 1 1 168.7 168.7 3 7.112E-12 170708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.379 84.183 84296000 0 0 0 0 0 0 0 34881000 0 0 0 0 49414000 4721 849 4412 43496;43497 55622;55623 55622 2 AYVSTLMGVPGR Unmodified 1249.6489 0.64889264 1396 O00303 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.817 81.817 2 0.00082269 82993 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.61 72.039 278200000 0 16380000 0 31052000 0 24545000 45959000 0 0 0 64040000 45838000 50392000 4722 1396 4413 43498;43499;43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507 55624;55625;55626;55627;55628;55629;55630;55631;55632;55633 55632 10 AYVVLGQFLVLK Unmodified 1348.8119 0.81185887 1643 O75531 BANF1 Barrier-to-autointegration factor;Barrier-to-autointegration factor, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 142.99 142.99 2 0.00053513 147465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 87.345 450860000 39588000 48932000 0 0 31495000 29420000 0 44768000 53800000 21637000 68397000 61338000 51485000 4723 1643 4414 43508;43509;43510;43511;43512;43513;43514;43515;43516;43517;43518;43519;43520;43521;43522 55634;55635;55636;55637;55638;55639;55640;55641;55642;55643;55644;55645;55646;55647;55648;55649;55650;55651;55652;55653 55643 20 AYWQVHLDQVEVASGLTLCK Unmodified 2316.1573 0.15725228 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 1 5 3 2 2 2 2 2 1 1 2 2 130.55 130.55 2;3 3.4629E-56 136545 QUIQUE_C1438_190116_001 169.92 151.51 1529800000 129440000 47446000 238030000 135450000 223420000 102330000 186050000 0 0 67788000 141660000 145070000 113170000 4724 358 4415 43523;43524;43525;43526;43527;43528;43529;43530;43531;43532;43533;43534;43535;43536;43537;43538;43539;43540;43541;43542;43543;43544;43545;43546;43547 55654;55655;55656;55657;55658;55659;55660;55661;55662;55663;55664;55665;55666;55667;55668;55669;55670;55671;55672;55673;55674;55675;55676;55677;55678;55679;55680;55681;55682;55683;55684;55685 55668 29 AYYEFREEAYHSR Unmodified 1719.7641 0.76413341 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 42.209 42.209 3 0.0047899 38540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.185 47.245 56542000 0 0 0 0 0 0 0 56542000 0 0 0 0 0 4725 3208 4416 43548 55686 55686 1 AYYENSPQQVFSTEFEVK Unmodified 2164.9953 0.99531514 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.79 119.79 2 4.4749E-07 125300 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.37 127.69 280350000 0 41980000 0 0 79954000 0 0 0 32025000 23779000 51889000 0 50728000 4726 1803 4417 43549;43550;43551;43552;43553;43554 55687;55688;55689;55690;55691;55692 55691 6 AYYHLLEQVAPK Unmodified 1430.7558 0.75580056 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 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39579000 179590000 136150000 146500000 4745 2600 4436 43691;43692;43693;43694;43695;43696;43697;43698;43699;43700;43701;43702;43703 55859;55860;55861;55862;55863;55864;55865;55866;55867;55868;55869;55870;55871;55872;55873;55874;55875;55876;55877;55878;55879;55880;55881;55882 55861 24 CALGVFR Unmodified 821.42179 0.42179324 2976 Q13200;C9JPC0 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 53.227 53.227 2 0.0098755 50664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.24 78.483 108120000 60619000 0 0 0 0 0 0 47497000 0 0 0 0 0 4746 2976 4437 43704;43705 55883;55884 55884 2 CALGWDHQEK Unmodified 1242.5452 0.54515585 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 26.281 26.281 2;3 0.0065151 21121 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.35 36.774 155530000 0 0 0 37680000 0 0 0 34306000 0 10738000 0 0 72807000 4747 3056 4438 43706;43707;43708;43709 55885;55886;55887;55888 55886 3 CALLAAQANK Unmodified 1058.5543 0.55426398 4390 Q9P2R3;I3L3P8 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes no 0 0 0 1 1 27.316 27.316 2 0.0067527 21331 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.47 46.045 111480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16797000 0 0 94687000 4748 4390 4439 43710;43711 55889;55890 55889 1 CALSSVDIYR Unmodified 1182.5703 0.57030797 4576 Q9Y316 MEMO1 Protein MEMO1 yes yes 0 0 0 1 1 68.166 68.166 2 0.029731 68557 QUIQUE_C1576_190116_001 65.224 30.972 19633000 0 0 0 0 0 19633000 0 0 0 0 0 0 0 4749 4576 4440 43712;43713 55891;55892 55892 2 CAMTALSSK Unmodified 967.44669 0.44668736 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 22.899 22.899 2 0.014899 16053 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.897 43.265 478510000 0 0 0 0 0 0 139730000 0 83155000 0 126980000 0 128650000 4750 3977 4441 43714;43715;43716;43717 55893;55894;55895;55896 55896 4 CANLFEALVGTLK Unmodified 1434.7541 0.754086 4373 Q9P1F3 ABRACL Costars family protein ABRACL yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 156.46 156.46 2 0.00036659 159235 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.67 120.38 231030000 0 58660000 0 0 54074000 20814000 0 36371000 0 14181000 0 46933000 0 4751 4373 4442 43718;43719;43720;43721;43722;43723 55897;55898;55899;55900;55901;55902;55903 55901 7 CASIPDIMEQLQFIGVK Unmodified 1947.9798 0.97980519 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 162.01 162.01 2 0.054529 167492 QUIQUE_C1368_190116_001 46.592 30.06 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4752 3405 4443 43724 55904 55904 1 CASPLVLLEFQCPTPQICVEK Unmodified 2488.2164 0.21642342 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 147.46 147.46 3 1.1757E-06 151686 QUIQUE_C1277_190116_001 78.794 70.991 171030000 63599000 60837000 0 0 0 0 0 0 0 0 46590000 0 0 4753 3535 4444 43725;43726;43727 55905;55906;55907;55908 55907 4 CASQAGMTAYGTR Unmodified 1372.5864 0.58636874 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 27.205 27.205 2 0.0054618 21579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.343 94.892 117680000 0 37289000 0 0 0 0 0 69699000 0 10692000 0 0 0 4754 3137;908 4445 43728;43729;43730 55909;55910;55911 55910 2 CASQAGMTAYGTR Oxidation (M) 1388.5813 0.58128336 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 1 0 1 1 1 16.207 16.207 2 0.0021835 8353 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.062 7.3418 58345000 0 0 0 0 22226000 0 0 0 0 7973600 0 0 28145000 4755 3137;908 4445 43731;43732;43733 55912;55913;55914 55914 558 3 CATCSQPILDR Unmodified 1319.5962 0.59620515 3149 Q15654;H7BZE2 TRIP6 Thyroid receptor-interacting protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.312 32.312 2 0.00047451 27376 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.08 96.555 255560000 0 0 0 39281000 40306000 39035000 41048000 20932000 26558000 0 26080000 22317000 0 4756 3149 4446 43734;43735;43736;43737;43738;43739;43740;43741 55915;55916;55917;55918;55919;55920;55921;55922 55921 8 CATITPDEAR Unmodified 1132.5183 0.5182724 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.125 23.125 2 9.3413E-12 17007 QUIQUE_C1218_190116_001 164.96 150.8 8271900000 878530000 1049800000 1208400000 0 0 817680000 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P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 31.066 31.066 2 0.00067899 25887 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.1 116.54 358650000 0 0 0 0 0 0 0 47503000 83881000 0 99741000 0 127530000 4760 1853 4450 43764;43765;43766;43767 55946;55947;55948;55949 55948 3 CATSSQPLAAR Unmodified 1160.5608 0.56080592 3031 Q13905;H0Y6R4 RAPGEF1 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 17.881 17.881 2 0.030053 10299 QUIQUE_C1576_190116_001 62.463 51.103 20412000 0 0 0 0 0 0 11016000 0 0 0 0 9395900 0 4761 3031 4451 43768;43769 55950;55951 55950 2 CAVVDVPFGGAK Unmodified 1218.6067 0.60669348 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.598 73.598 2 0.00011368 74380 QUIQUE_C1277_190116_001 142.92 91.068 31023000000 2341600000 2205800000 3212400000 2366600000 2513400000 2107500000 2432100000 2292400000 2228200000 808160000 3086100000 2648600000 2780700000 4762 1777 4452 43770;43771;43772;43773;43774;43775;43776;43777;43778;43779;43780;43781;43782 55952;55953;55954;55955;55956;55957;55958;55959;55960;55961;55962;55963;55964;55965;55966;55967;55968;55969;55970;55971;55972;55973;55974;55975;55976;55977;55978 55956 27 CAWCGGQSR Unmodified 1080.4229 0.42293223 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 19.385 19.385 2 0.045989 12445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.854 37.016 14892000 0 0 0 0 0 0 0 0 14892000 0 0 0 0 4763 1473 4453 43783 55979 55979 1 CAYEVSQAHK Unmodified 1191.5343 0.53425682 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 2 13.624 13.624 2;3 0.0010822 5667 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.456 68.305 11109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11109000 0 0 0 4764 1384 4454 43784;43785 55980;55981 55980 2 CAYEVTQANGK Unmodified 1239.5554 0.55538619 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9;A0A096LP52 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.421 21.421 2 9.7206E-84 14893 QUIQUE_C1218_190116_001 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+ 4767 769 4457 43800;43801;43802;43803;43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;43811;43812;43813;43814;43815;43816;43817;43818;43819;43820;43821;43822;43823;43824 55998;55999;56000;56001;56002;56003;56004;56005;56006;56007;56008;56009;56010;56011;56012;56013;56014;56015;56016;56017;56018;56019;56020;56021;56022;56023;56024;56025;56026;56027;56028;56029;56030;56031;56032;56033 56006 36 CCAADDKEACFAVEGPK Unmodified 1926.791 0.79101814 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 46.221 46.221 3 0.010578 40956 QUIQUE_DMIX4_190116_001 38.696 36.627 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 4768 770 4458 43825 56034 56034 1 CCESASEDCMAK Unmodified 1446.4884 0.48837053 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 17.265 17.265 2 0.003732 9289 QUIQUE_C1277_190116_001 83 83 12016000 0 12016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4769 822 4459 43826 56035 56035 1 CCMPYTPICIAK Unmodified 1512.6597 0.65973338 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.915 86.915 2 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60.884 1;2 5.0993E-09 59245 QUIQUE_C1563_190116_001 163.38 143.61 11670000000 1067300000 970850000 1392800000 1119700000 803220000 760190000 830590000 938920000 759860000 440260000 792990000 904560000 889160000 4773 2077 4463 43838;43839;43840;43841;43842;43843;43844;43845;43846;43847;43848;43849;43850;43851;43852;43853 56047;56048;56049;56050;56051;56052;56053;56054;56055;56056;56057;56058;56059;56060;56061;56062 56054 12 CCTESLVNR Unmodified 1137.4907 0.49067744 769;770 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2;CON__P02769 ALB Serum albumin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.876 23.876 2 9.6555E-05 17512 QUIQUE_C1438_190116_001 162.5 146.3 14819000000 0 2566400000 0 2871700000 4417900000 0 2087800000 0 0 0 900850000 1974300000 0 + 4774 769;770 4464 43854;43855;43856;43857;43858;43859 56063;56064;56065;56066;56067;56068 56065 4 CCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPK Unmodified 2907.3944 0.39440456 402 A0A286YEY4;P01859 IGHG2 Ig gamma-2 chain C region yes no 0 0 1 1 117.36 117.36 3 5.9969E-08 124108 QUIQUE_C1438_190116_001 64.152 61.271 51637000 0 0 0 0 51637000 0 0 0 0 0 0 0 0 4775 402 4465 43860 56069;56070;56071 56071 3 CCWDEPVR Unmodified 1120.443 0.44299897 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 46.452 46.452 2 0.030357 42862 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.032 59.385 141420000 40284000 0 0 0 0 0 0 55933000 0 0 0 0 45207000 4776 98;3487 4466 43861;43862;43863 56072;56073;56074 56074 3 CDAGWLADGSVR Unmodified 1305.5772 0.57718426 2006 P10915 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.918 72.918 2 0.00019845 73148 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.6 106.75 983160000 94984000 136190000 0 103210000 80675000 70434000 194590000 0 0 34562000 55348000 140480000 72691000 4777 2006 4467 43864;43865;43866;43867;43868;43869;43870;43871;43872;43873 56075;56076;56077;56078;56079;56080;56081;56082;56083;56084;56085;56086 56084 8 CDAISVLEK Unmodified 1033.5114 0.51139611 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.745 59.745 2 0.025628 58952 QUIQUE_C1277_190116_001 59.153 41.244 354460000 0 66764000 68232000 64509000 50511000 42095000 62348000 0 0 0 0 0 0 4778 4653 4468 43874;43875;43876;43877;43878;43879 56087;56088;56089;56090;56091;56092 56087 5 CDAVSVLEK Unmodified 1019.4957 0.49574604 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 45.799 45.799 2 0.015763 42555 QUIQUE_C1277_190116_001 66.692 36.885 124520000 0 124520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4779 1515 4469 43880;43881 56093;56094 56093 2 CDAVSVLEKEHDYRDEHLDFIQSHLR Unmodified 3210.5153 0.51525929 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 2 1 1 2 92.222 92.222 4;5 5.9919E-11 94672 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.445 69.266 224930000 0 0 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56100;56101;56102;56103;56104;56105;56106;56107;56108;56109;56110;56111 56103 12 CDDSVGYFVEPCIVESK Unmodified 2002.8652 0.86522894 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.31 116.31 2 1.5044E-12 120040 QUIQUE_C1368_190116_001 125.03 112.23 471950000 39776000 58774000 126400000 72657000 46476000 68550000 59317000 0 0 0 0 0 0 4783 2295 4473 43898;43899;43900;43901;43902;43903;43904 56112;56113;56114;56115;56116;56117;56118 56114 7 CDENILWLDYK Unmodified 1467.6704 0.67041595 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 2 3 1 1 1 1 1 2 2 2 3 1 127.6 127.6 2 2.7453E-06 126946 QUIQUE_C1218_190116_001 169.37 158.85 25136000000 1835600000 2656800000 2275400000 2036400000 1591400000 1378200000 2233900000 2101500000 1690200000 758690000 2252100000 2513000000 1812600000 4784 1203;2077 4474 43905;43906;43907;43908;43909;43910;43911;43912;43913;43914;43915;43916;43917;43918;43919;43920;43921;43922;43923;43924;43925;43926 56119;56120;56121;56122;56123;56124;56125;56126;56127;56128;56129;56130;56131;56132;56133;56134;56135;56136;56137;56138;56139;56140;56141;56142;56143;56144;56145;56146;56147;56148;56149;56150;56151;56152;56153;56154;56155;56156;56157;56158;56159;56160;56161;56162;56163;56164;56165;56166 56120 47 CDEPILSNR Unmodified 1102.5077 0.50770771 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.352 33.352 1;2 1.7556E-07 28494 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.99 95.07 52396000000 3575500000 5669900000 4616600000 5326100000 4012800000 4333100000 4229700000 2744900000 4266100000 1651400000 3918900000 4537400000 3513400000 4785 2307 4475 43927;43928;43929;43930;43931;43932;43933;43934;43935;43936;43937;43938;43939;43940 56167;56168;56169;56170;56171;56172;56173;56174;56175;56176;56177;56178;56179;56180;56181;56182;56183;56184;56185;56186;56187;56188;56189;56190;56191 56186 24 CDEPLSILVR Unmodified 1200.6173 0.61725816 1880 P05161;A0A096LNZ9;A0A096LPJ4 ISG15 Ubiquitin-like protein ISG15 yes no 0 0 0 1 100.49 100.49 2 0.045074 105210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.916 36.014 35788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35788000 0 0 4786 1880 4476 43941 56192 56192 1 CDEWSVNSVGK Unmodified 1279.5503 0.55030081 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.797 55.797 2 0.00078221 53537 QUIQUE_C1403_190116_001 95.573 83.726 503880000 0 90507000 0 94839000 195670000 51849000 50449000 0 0 20567000 0 0 0 4787 1838 4477 43942;43943;43944;43945;43946;43947;43948;43949 56193;56194;56195;56196;56197;56198;56199;56200;56201;56202 56195 8 CDFPIMK Unmodified 909.40885 0.40884529 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.442 61.442 2 0.017367 60915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 1 2 13.53 13.53 2;3 0.00062416 5441 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.636 89.123 79511000 0 0 0 0 0 0 0 28756000 0 50755000 0 0 0 4803 2121 4491 44056;44057;44058 56326;56327;56328 56327 3 CDTCMMNVHK Unmodified 1294.4927 0.49266805 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.102 20.102 3 0.0064702 12935 QUIQUE_C1576_190116_001 58.083 54.954 244380000 49919000 61529000 28592000 39229000 26205000 0 38909000 0 0 0 0 0 0 4804 1894 4492 44059;44060;44061;44062;44063;44064 56329;56330;56331;56332;56333;56334 56334 6 CDVIAQGIVMAVK Unmodified 1402.7312 0.73124206 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A0U1RQL1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.47 105.47 2 0.00020488 109722 QUIQUE_C1576_190116_001 114.5 92.751 1558800000 0 167550000 195280000 0 0 202750000 205050000 106650000 124580000 54982000 178270000 155210000 168420000 4805 445 4493 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44154;44155;44156;44157;44158;44159;44160;44161;44162;44163 56441;56442;56443;56444;56445;56446;56447;56448;56449;56450;56451;56452;56453 56445 13 CEASGKPEVQFR Unmodified 1406.6612 0.66124824 2345 P32004;E7EVM4;E7EPI4;E9PHJ4;E7EMY4 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 23.204 23.204 2;3 0.00055861 16323 QUIQUE_C1277_190116_001 122.26 77.121 677910000 84359000 151330000 29768000 133370000 21868000 0 142560000 47376000 0 37008000 0 0 30263000 4815 2345 4502 44164;44165;44166;44167;44168;44169;44170;44171;44172;44173;44174;44175;44176;44177 56454;56455;56456;56457;56458;56459;56460;56461;56462;56463;56464;56465;56466;56467;56468;56469 56457 11 CEASNIVGK Unmodified 976.46478 0.46478027 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.43 19.43 2 0.00042581 12145 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.86 94.2 2124800000 200160000 350020000 0 294060000 206590000 233220000 260940000 81788000 115740000 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44207;44208;44209;44210;44211;44212;44213;44214;44215;44216;44217;44218;44219;44220;44221;44222;44223;44224;44225;44226;44227;44228;44229;44230;44231;44232 56507;56508;56509;56510;56511;56512;56513;56514;56515;56516;56517;56518;56519;56520;56521;56522;56523;56524;56525;56526;56527;56528;56529;56530;56531;56532;56533;56534;56535;56536;56537;56538;56539;56540;56541;56542;56543 56514 35 CEFQDAYVLLSEKK Unmodified 1728.8393 0.83927219 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 97.05 97.05 2;3 0.00052867 99036 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.859 48.482 823440000 0 0 0 0 0 0 0 244600000 48072000 0 116190000 259530000 155040000 4822 2004 4509 44233;44234;44235;44236;44237;44238;44239 56544;56545;56546;56547;56548;56549;56550;56551;56552;56553 56544 10 CEFVMEVTNK Unmodified 1255.5577 0.55769437 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.768 65.768 2 0.0039027 65157 QUIQUE_C1277_190116_001 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TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.516 65.516 2 0.0012367 65216 QUIQUE_C1277_190116_001 105.57 91.849 242210000 0 35437000 0 39989000 26547000 31282000 0 0 20558000 12610000 43869000 0 31916000 4828 4550 4515 44280;44281;44282;44283;44284;44285;44286;44287 56600;56601;56602;56603;56604;56605;56606;56607;56608 56600 9 CELLSDDSLAVSSPR Unmodified 1647.7774 0.77740021 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 88.665 88.665 2 1.1632E-09 91065 QUIQUE_C1576_190116_001 114.82 89.52 173450000 50013000 54939000 0 68498000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4829 727 4516 44288;44289;44290;44291;44292;44293;44294 56609;56610;56611;56612;56613;56614;56615 56613 7 CELLYEGPPDDEAAMGIK Unmodified 2006.8965 0.89652907 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110 110 2 3.2628E-38 113146 QUIQUE_C1277_190116_001 159.08 153.24 527050000 56168000 79725000 71124000 78528000 47356000 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56630;56631;56632;56633 56630 4 CEQSLLKEPQK Unmodified 1358.6864 0.68640036 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 22.579 22.579 2 2.5386E-07 15822 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.67 127.83 110220000 0 0 0 0 0 0 0 18427000 0 0 44163000 47633000 0 4834 4393 4520 44310;44311;44312;44313;44314 56634;56635;56636;56637;56638 56637 5 CEQVQPGYFR Unmodified 1282.5765 0.57645598 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 47.766 47.766 2 0.015945 45043 QUIQUE_C1438_190116_001 80.438 64.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4835 2665 4521 44315;44316 56639;56640 56639 2 CESAPGCGVWQR Unmodified 1405.5867 0.58670309 2269 P27824;D6RGY2 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.914 45.914 2 0.00011264 43198 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 93.246 341940000 47693000 49469000 65100000 104330000 19079000 56259000 0 0 0 0 0 0 0 4836 2269 4522 44317;44318;44319;44320;44321;44322 56641;56642;56643;56644;56645;56646 56642 3 CESAPGCGVWQRPVIDNPNYK Unmodified 2446.1158 0.11579817 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.224 75.224 3 1.9621E-07 75914 QUIQUE_C1403_190116_001 92.492 84.688 416560000 0 0 68660000 99763000 0 59077000 81843000 0 0 0 46473000 0 60740000 4837 2269 4523 44323;44324;44325;44326;44327;44328 56647;56648;56649;56650;56651;56652;56653;56654;56655;56656 56650 10 CESQSTLDPGAGEAR Unmodified 1576.6787 0.6787488 3163 Q15818 NPTX1 Neuronal pentraxin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 28.313 28.313 2 1.2468E-08 23083 QUIQUE_C1218_190116_001 147.71 131.07 188610000 29205000 47209000 34308000 0 0 0 39223000 0 0 0 0 38664000 0 4838 3163 4524 44329;44330;44331;44332;44333 56657;56658;56659;56660;56661 56657 5 CETNVAPNCGVDAR Unmodified 1561.6613 0.6613246 2868 Q02156;E9PBI2 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes no 0 0 0 1 28.261 28.261 2 0.00182 22410 QUIQUE_C1277_190116_001 73.9 57.647 29806000 0 29806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4839 2868 4525 44334 56662 56662 1 CEVLQYSAR Unmodified 1124.5284 0.52844316 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;H7C2W5;H7C1Y7;H7C2X4 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.372 40.372 2 0.0047102 36743 QUIQUE_C1576_190116_001 88.37 65.878 835100000 195830000 272570000 0 0 151170000 0 215520000 0 0 0 0 0 0 4840 64 4526 44335;44336;44337;44338 56663;56664;56665;56666;56667 56667 5 CEVNGAGAHPLFAFLR Unmodified 1757.8672 0.86715869 41 A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.09 103.09 3 2.0523E-05 106293 QUIQUE_C1368_190116_001 94.09 86.799 880050000 0 72791000 72707000 73434000 64839000 69487000 0 66550000 76211000 34215000 108100000 138430000 103290000 4841 41 4527 44339;44340;44341;44342;44343;44344;44345;44346;44347;44348;44349 56668;56669;56670;56671;56672;56673;56674;56675;56676;56677;56678 56669 10 CEVQHGIDDSSDAVEVK Unmodified 1886.8316 0.83162063 3862 Q96GW7;Q5T3I6;Q5T3I7;V9GY88 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 40.531 40.531 2;3 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44391;44392;44393 56724;56725;56726 56725 3 CFEKNEAIQAAHDAVAQEGQCR Unmodified 2531.1282 0.12815377 1976 P09936;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 2 2 69.455 69.455 3;4 1.7814E-11 69635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.221 74.168 626690000 0 0 0 0 0 0 0 99278000 0 0 105440000 246330000 175640000 4847 1976 4532 44394;44395;44396;44397;44398;44399 56727;56728;56729;56730;56731;56732;56733 56727 5 CFGFVTYSNVEEADAAMAASPHAVDGNTVELK Unmodified 3399.5388 0.53875643 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 134.38 134.38 3 1.4916E-64 139283 QUIQUE_C1218_190116_001 146.78 135.42 44484000 44484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4848 2969 4533 44400 56734;56735 56734 2 CFGGLQK Unmodified 808.39016 0.39015876 2003 P10768 ESD S-formylglutathione hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 23.74 23.74 2 0.024501 16805 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.926 77.578 697180000 0 0 0 0 0 0 0 352360000 0 0 0 0 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16 CFPAIHAYK Unmodified 1105.5379 0.53788563 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 39.836 39.836 3 0.030931 35244 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.876 31.589 442240000 0 0 0 131350000 118660000 129620000 0 0 0 62620000 0 0 0 4855 3535 4540 44433;44434;44435;44436 56772;56773;56774;56775 56775 1 CFSCDQFIEGEVVSALGK Unmodified 2044.9234 0.92341252 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 144.81 144.81 2;3 1.2929E-07 148931 QUIQUE_C1277_190116_001 110.44 102.57 212240000 19410000 35742000 23262000 40163000 0 0 35472000 18583000 24003000 15610000 0 0 0 4856 3362 4541 44437;44438;44439;44440;44441;44442;44443;44444;44445;44446;44447 56776;56777;56778;56779;56780;56781;56782;56783;56784;56785;56786;56787 56777 9 CFSEENHEPLR Unmodified 1416.6092 0.60921267 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 25.695 25.695 2;3 0.00010289 19586 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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56883;56884;56885;56886;56887;56888;56889;56890;56891;56892;56893;56894;56895;56896;56897;56898;56899;56900;56901;56902;56903;56904;56905;56906 56903 24 CGASYAQVMR Unmodified 1141.5008 0.5008482 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A0U1RQX0;A0A096LPH4;A0A096LPB7;A0A096LP96 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.292 36.292 2 0.0084486 31969 QUIQUE_C1576_190116_001 71.692 55.489 107600000 25411000 0 33536000 17082000 0 0 31568000 0 0 0 0 0 0 4865 330 4550 44554;44555;44556;44557;44558 56907;56908;56909;56910;56911 56911 5 CGDGAFLLTTTPR Unmodified 1407.6816 0.68164933 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 83.074 83.074 2 3.918E-05 84962 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.22 94.444 132660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60213000 0 72447000 4866 3719 4551 44559;44560;44561;44562;44563 56912;56913;56914;56915;56916 56915 5 CGDLEEELK Unmodified 1091.4805 0.48048991 435;2791;3325 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yes 0 0 0 1 1 45.704 45.704 2 0.026319 43005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 53.985 178060000 0 0 0 0 98016000 0 0 80046000 0 0 0 0 0 4869 2596 4554 44576;44577 56929;56930 56930 2 CGDSVYAAEK Unmodified 1098.4652 0.4651742 3178 Q16527;F8VQR7;F8VW96 CSRP2 Cysteine and glycine-rich protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 19.245 19.245 2 0.0025891 11611 QUIQUE_C1277_190116_001 89.08 62.665 99500000 0 42450000 0 0 0 26932000 0 30117000 0 0 0 0 0 4870 3178 4555 44578;44579;44580 56931;56932;56933 56931 3 CGEDYKLHFIFR Unmodified 1583.7555 0.75548298 2269;1466 P27824;D6RGY2;D6RFL1;H0Y9H1;O14967 CANX;CLGN Calnexin;Calmegin no no 0 0 1 1 80.527 80.527 4 0.00019713 80818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.014 68.541 25756000 0 0 0 0 0 0 0 25756000 0 0 0 0 0 4871 2269;1466 4556 44581 56934 56934 1 CGEEIAVQFVDMVK Unmodified 1623.7637 0.7636644 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 2 2 3 4 1 2 2 3 144.28 144.28 2;3 7.3115E-07 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carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 155.49 155.49 2 3.2695E-09 160667 QUIQUE_C1218_190116_001 141.13 128.98 104430000 29104000 0 0 33987000 0 0 41339000 0 0 0 0 0 0 4877 2195 4561 44623;44624;44625 56986;56987;56988 56986 3 CGETGHVAINCSK Unmodified 1431.6235 0.62348253 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 14.667 14.667 2;3 6.3586E-10 6406 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.66 133.66 776340000 18838000 26300000 0 127580000 160820000 0 76738000 21845000 42472000 0 0 123170000 178570000 4878 2756 4562 44626;44627;44628;44629;44630;44631;44632;44633;44634;44635;44636;44637;44638 56989;56990;56991;56992;56993;56994;56995;56996;56997;56998;56999;57000;57001;57002;57003;57004 57004 15 CGFAGETGPR Unmodified 1050.4553 0.45527821 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6;G3V524 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.01 25.01 2 0.0015491 18583 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.311 83.484 486710000 28938000 61864000 28723000 48379000 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168.18 168.18 3 3.0332E-75 174688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.8 151.69 826870000 47261000 80030000 97514000 47884000 77435000 45125000 82668000 45828000 84212000 0 66235000 94399000 58281000 4887 4418 4571 44690;44691;44692;44693;44694;44695;44696;44697;44698;44699;44700;44701;44702;44703 57062;57063;57064;57065;57066;57067;57068;57069;57070;57071;57072;57073;57074;57075;57076;57077;57078 57075 17 CGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEK Unmodified 3452.681 0.68098722 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 3 2 1 2 2 2 1 2 157.7 157.7 3;4 7.8239E-103 163282 QUIQUE_C1218_190116_001 173.98 163.92 17653000000 608040000 2546700000 2109500000 1547400000 1733700000 889170000 2019900000 824130000 424560000 643430000 1412500000 1140800000 1753500000 4888 854 4572 44704;44705;44706;44707;44708;44709;44710;44711;44712;44713;44714;44715;44716;44717;44718;44719;44720;44721;44722;44723;44724;44725 57079;57080;57081;57082;57083;57084;57085;57086;57087;57088;57089;57090;57091;57092;57093;57094;57095;57096;57097;57098;57099;57100;57101;57102;57103;57104;57105;57106;57107;57108 57079 29 CGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQK Unmodified 4034.0711 0.071069623 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 1 1 1 1 162.17 162.17 5 3.8204E-54 166341 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.31 96.441 392580000 0 0 0 0 0 0 0 126730000 49989000 0 0 215870000 0 4889 854 4573 44726;44727;44728 57109;57110;57111 57111 3 CGLQFLGNIASR Unmodified 1334.6765 0.67650438 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.58 103.58 2 7.4889E-13 105880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.79 138.49 481360000 57856000 74320000 69554000 0 0 56629000 0 83636000 82094000 0 0 57272000 0 4890 4392 4574 44729;44730;44731;44732;44733;44734;44735 57112;57113;57114;57115;57116;57117;57118;57119;57120;57121;57122 57118 10 CGLVLSWK Unmodified 961.50552 0.50552287 2543 P49756;E9PQU5;E9PSE8 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 0 1 1 87.365 87.365 2 0.031416 89397 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 44.526 11719000 11719000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4891 2543 4575 44736;44737 57123;57124 57123 2 CGMTTVLTLTGVSR Unmodified 1494.7534 0.75343407 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.53 107.53 2 4.1562E-05 109848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.86 96.65 558190000 100180000 129800000 0 75738000 0 84055000 90459000 77958000 0 0 0 0 0 4892 3859 4576 44738;44739;44740;44741;44742;44743 57125;57126;57127;57128;57129;57130;57131;57132;57133 57133 8 CGMTTVLTLTGVSR Oxidation (M) 1510.7483 0.74834869 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 80.68 80.68 2 0.0046804 82799 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.062 62.764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4893 3859 4576 44744;44745;44746 57134;57135;57136 57136 2752 3 CGNCGEISDKWQYIR Unmodified 1884.8247 0.82470153 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 1 69.158 69.158 3 0.0088674 68304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.675 58.094 42810000 0 0 0 0 0 0 0 42810000 0 0 0 0 0 4894 4315 4577 44747 57137 57137 0 CGNCGPGYSTPLEAMK Unmodified 1740.727 0.72696132 2978 Q13228;A6PVX1;H0Y532;F2Z2W8;F8WCR4;F8WBA9 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.015 70.015 2 6.0913E-07 71049 QUIQUE_C1438_190116_001 114.72 108.06 263370000 0 33913000 49780000 45511000 28881000 35288000 37110000 0 0 0 0 0 32890000 4895 2978 4578 44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754 57138;57139;57140;57141;57142;57143;57144 57141 7 CGNIASIMVFK Unmodified 1238.6151 0.61514967 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.52 101.52 2 0.0011688 106172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.029 76.793 233190000 0 0 0 38487000 28564000 0 0 0 32160000 0 45944000 40196000 47843000 4896 1421 4579 44755;44756;44757;44758;44759;44760;44761;44762;44763 57145;57146;57147;57148;57149;57150;57151;57152;57153 57151 9 CGNQAAIMELDDTLK Unmodified 1677.7702 0.77020634 2758;2789 P62714;H0YC23;H0YBN9;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.212 99.212 2 1.7387E-06 101919 QUIQUE_C1277_190116_001 147.26 130.63 1663200000 205760000 287270000 263280000 252940000 0 0 250070000 0 95558000 0 0 171180000 137170000 4897 2758;2789 4580 44764;44765;44766;44767;44768;44769;44770;44771 57154;57155;57156;57157;57158;57159;57160;57161;57162 57155 9 CGNVAAILELDEHLQK Unmodified 1808.9091 0.90908309 2693 P60510;H3BTA2 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 102.04 102.04 3 0.05004 104894 QUIQUE_C1277_190116_001 15.78 5.5835 19151000 0 19151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4898 2693 4581 44772 57163 57163 1 CGNVNFAR Unmodified 936.42358 0.42358415 1714 O95218 ZRANB2 Zinc finger Ran-binding domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 21.253 21.253 2 0.045115 14652 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.21 84.507 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4899 1714 4582 44773 57164 57164 1 CGPASVQAIK Unmodified 1029.5277 0.52771487 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 1 25.095 25.095 2 0.035995 18414 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.157 46.7 23898000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23898000 0 0 0 4900 1785 4583 44774;44775 57165;57166 57165 1 CGPLIDLCR Unmodified 1102.5263 0.52633467 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.843 71.843 2 0.0068239 72337 QUIQUE_C1277_190116_001 83.313 64.219 199750000 0 52183000 0 0 23397000 21819000 33767000 0 0 0 18053000 25416000 25115000 4901 2253 4584 44776;44777;44778;44779;44780;44781;44782;44783;44784 57167;57168;57169;57170;57171;57172;57173;57174;57175 57167 9 CGPMVLDALIK Unmodified 1215.6356 0.63555076 2187 P21912;A0A087WWT1 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.64 113.64 2 0.0009083 116514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.111 69.682 1323600000 123430000 156860000 147140000 110800000 87811000 93898000 119770000 86181000 104170000 0 175280000 0 118300000 4902 2187 4585 44785;44786;44787;44788;44789;44790;44791;44792;44793;44794;44795;44796 57176;57177;57178;57179;57180;57181;57182;57183;57184;57185;57186;57187;57188 57184 11 CGSGIVGAVVK Unmodified 1045.559 0.559015 76 A0A2U3TZH4;A0A087WYF8;Q53GG5 PDLIM3 PDZ and LIM domain protein 3 yes no 0 0 0 1 45.25 45.25 2 0.03983 42006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.756 36.517 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4903 76 4586 44797 57189 57189 1 CGSLGNIHHKPGGGQVEVK Unmodified 1972.9901 0.99012738 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 2 3 2 3 2 2 2 3 3 2 3 3 2 15.258 15.258 2;3;4 3.5885E-73 8224 QUIQUE_DMIX1_190116_001 218.4 146.84 16328000000 738550000 895720000 804460000 2415600000 946520000 401410000 853810000 2401600000 1887600000 387760000 932610000 3214300000 447720000 4904 291;1247 4587 44798;44799;44800;44801;44802;44803;44804;44805;44806;44807;44808;44809;44810;44811;44812;44813;44814;44815;44816;44817;44818;44819;44820;44821;44822;44823;44824;44825;44826;44827;44828;44829 57190;57191;57192;57193;57194;57195;57196;57197;57198;57199;57200;57201;57202;57203;57204;57205;57206;57207;57208;57209;57210;57211;57212;57213;57214;57215;57216;57217;57218;57219;57220;57221;57222 57209 32 CGTTGVVTFIR Unmodified 1209.6176 0.61759251 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.853 69.853 2 0.00065025 70070 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.65 90.75 881810000 105130000 0 98326000 98714000 0 97612000 103280000 87873000 0 27164000 102450000 92386000 68876000 4905 3722 4588 44830;44831;44832;44833;44834;44835;44836;44837;44838;44839;44840;44841 57223;57224;57225;57226;57227;57228;57229;57230;57231;57232;57233;57234;57235;57236 57233 14 CGVALSTPGGAR Unmodified 1144.5659 0.56589129 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 33.679 33.679 2 0.01104 28636 QUIQUE_C1403_190116_001 59.426 8.953 67469000 0 0 0 67469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4906 725 4589 44842 57237 57237 1 CGVPFTDLLDAAK Unmodified 1405.6912 0.69115139 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 2 129.39 129.39 2 0.0079164 132275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.595 50.589 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4907 2854 4590 44843;44844 57238;57239 57239 2 CGWLDLVLLK Unmodified 1215.6686 0.66856545 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.12 158.12 2 0.0039997 163014 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.502 70.683 115710000 0 17350000 9477400 16385000 13111000 0 0 10258000 11496000 6292700 13824000 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45028;45029;45030;45031;45032;45033;45034;45035;45036;45037;45038;45039;45040;45041;45042;45043;45044;45045;45046;45047;45048;45049;45050;45051;45052;45053;45054;45055;45056;45057;45058 57453;57454;57455;57456;57457;57458;57459;57460;57461;57462;57463;57464;57465;57466;57467;57468;57469;57470;57471;57472;57473;57474;57475;57476;57477;57478;57479;57480;57481;57482;57483;57484;57485;57486;57487;57488;57489;57490;57491;57492;57493;57494;57495 57454 38 CIAYPFNAK Unmodified 1082.5219 0.52190122 4494;981 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 61.573 61.573 2 0.027289 60954 QUIQUE_C1277_190116_001 68.7 46.569 198650000 43495000 42269000 45306000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67576000 4928 981;4494 4611 45059;45060;45061;45062 57496;57497;57498;57499 57497 4 CICSQLSLTTK Unmodified 1309.637 0.63700733 2941 Q12765;C9K052 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 57.891 57.891 2 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Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.273 83.273 2 0.00052034 85747 QUIQUE_C1218_190116_001 96.009 82.889 1431500000 75710000 87904000 275530000 156410000 119440000 120400000 150860000 89384000 0 0 0 179800000 176020000 4931 3181 4614 45087;45088;45089;45090;45091;45092;45093;45094;45095;45096;45097 57529;57530;57531;57532;57533;57534;57535;57536;57537;57538;57539;57540 57529 8 CIEECVEPWNGSWNDNLVDTSPLK Unmodified 2861.2636 0.2636442 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 142.95 142.95 3 3.1464E-06 147159 QUIQUE_C1277_190116_001 56.681 53.8 78350000 0 39541000 0 38810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4932 3390 4615 45098;45099;45100 57541;57542;57543 57542 3 CIELCCGSVK Unmodified 1224.5301 0.53009941 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 42.634 42.634 2 0.013818 38746 QUIQUE_C1368_190116_001 64.711 44.505 183020000 0 0 33327000 0 0 0 42998000 32321000 0 0 0 27651000 46725000 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45118;45119;45120;45121;45122;45123;45124;45125 57563;57564;57565;57566;57567;57568;57569;57570;57571;57572;57573 57569 11 CIESLIAVFQK Unmodified 1306.6955 0.69550848 2344 P31949 S100A11 Protein S100-A11;Protein S100-A11, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.67 129.67 2 0.0003229 127027 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.75 110.19 1178700000 0 115650000 177120000 95278000 106370000 57690000 93011000 0 89325000 60541000 162410000 100030000 121280000 4936 2344 4619 45126;45127;45128;45129;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136 57574;57575;57576;57577;57578;57579;57580;57581;57582;57583;57584;57585;57586 57583 9 CIEVMGDGCLNNEHFEELGGILK Unmodified 2633.1924 0.19239352 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 130.66 130.66 3 0.025988 134273 QUIQUE_C1403_190116_001 26.13 18.327 76976000 0 0 0 76976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4937 1403 4620 45137 57587 57587 1 CIFYDTEHLK Unmodified 1324.6122 0.61217279 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 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57594;57595;57596;57597;57598;57599;57600;57601;57602;57603;57604;57605;57606;57607;57608;57609;57610;57611;57612;57613;57614;57615;57616;57617;57618;57619;57620;57621;57622;57623;57624;57625;57626;57627;57628;57629;57630;57631;57632;57633;57634;57635;57636;57637;57638;57639;57640;57641;57642;57643;57644;57645;57646;57647;57648;57649;57650;57651;57652;57653;57654;57655;57656;57657;57658;57659;57660;57661;57662 57594 64 CIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVR Unmodified 2810.385 0.38502039 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 3 125.84 125.84 3;4 4.6046E-18 128799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.54 102.69 258960000 0 0 0 0 0 0 0 258960000 0 0 0 0 0 4940 1978 4623 45189;45190;45191 57663;57664;57665 57664 3 CIHKPTSQEYAVK Unmodified 1559.7766 0.77661235 1026 F6VCX5;Q16816;F8WD25 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.175 15.175 3 3.2953E-05 6447 QUIQUE_C1563_190116_001 94.023 74.181 200260000 0 0 0 39153000 0 0 33643000 29561000 36696000 0 28303000 0 32899000 4941 1026 4624 45192;45193;45194;45195;45196;45197;45198 57666;57667;57668;57669;57670;57671;57672 57667 7 CIIEVLSNALSK Unmodified 1345.7275 0.72753689 1874 P05060;A0A0A0MT66 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.37 130.37 2 0.0023187 135090 QUIQUE_C1368_190116_001 75.652 35.585 215970000 40932000 36468000 22226000 0 19603000 31750000 30776000 0 0 0 34218000 0 0 4942 1874 4625 45199;45200;45201;45202;45203;45204;45205;45206 57673;57674;57675;57676;57677;57678;57679;57680 57675 6 CIIHLHTPATAAVSAMK Unmodified 1819.9437 0.94369446 2382 P35612;C9JTM0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 3 1 1 2 1 60.563 60.563 2;3;4 4.6597E-45 60904 QUIQUE_C1218_190116_001 178.71 155.04 1418500000 124880000 211370000 157420000 136860000 126800000 160740000 166800000 60567000 65268000 0 122870000 84907000 0 4943 2382 4626 45207;45208;45209;45210;45211;45212;45213;45214;45215;45216;45217;45218;45219;45220;45221;45222;45223;45224;45225;45226;45227 57681;57682;57683;57684;57685;57686;57687;57688;57689;57690;57691;57692;57693;57694;57695;57696;57697;57698;57699;57700;57701;57702;57703;57704;57705 57682 21 CIIPNHEK Unmodified 1009.5015 0.50150012 2378;2379;2385 P35579;P35749;P35580 MYH9;MYH11;MYH10 Myosin-9;Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 16.209 16.209 2 0.058803 8173 QUIQUE_C1277_190116_001 69.176 22.512 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4944 2378;2385;2379 4627 45228 57706 57706 1 CIIPSVIK Unmodified 928.54157 0.54157402 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6;G3V524 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 75.061 75.061 2 0.02842 74766 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 49.15 15882000 0 0 0 0 0 0 0 15882000 0 0 0 0 0 4945 4337 4628 45229;45230;45231 57707;57708;57709 57708 3 CIIVEEGK Unmodified 946.47937 0.4793677 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.361 28.361 2 0.0036146 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Unmodified 1673.8294 0.82943578 3791 Q969Z3 MARC2 Mitochondrial amidoxime reducing component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.935 96.935 2 0.00013614 100687 QUIQUE_C1218_190116_001 88.441 63.586 418250000 71413000 90301000 62139000 0 0 61003000 0 0 0 0 80702000 0 52697000 4952 3791 4635 45261;45262;45263;45264;45265;45266 57741;57742;57743;57744;57745;57746 57741 4 CILVITWIQHLIPK Unmodified 1733.0062 0.0062183574 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70;H0YKU2 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 164.92 164.92 3 6.487E-05 172003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.105 87.46 188030000 0 0 0 14260000 0 0 0 31818000 0 6456600 101380000 21626000 12490000 4953 114 4636 45267;45268;45269;45270;45271;45272;45273 57747;57748;57749;57750;57751;57752;57753 57751 6 CIMFLEGHLK Unmodified 1246.6202 0.62023505 1512 O43172 PRPF4 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 yes yes 0 0 0 1 76.488 76.488 3 0.01146 77122 QUIQUE_C1277_190116_001 51.445 28.884 8144800 0 8144800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4954 1512 4637 45274 57754 57754 1 CIPALDSLTPANEDQK Unmodified 1770.8458 0.84581413 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 90.637 90.637 2 2.8456E-19 92281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.53 161.8 4637500000 316470000 387490000 628350000 278930000 267600000 480300000 517390000 328720000 244050000 186490000 325750000 403120000 272890000 4955 2004 4638 45275;45276;45277;45278;45279;45280;45281;45282;45283;45284;45285;45286;45287;45288;45289;45290;45291 57755;57756;57757;57758;57759;57760;57761;57762;57763;57764;57765;57766;57767;57768;57769;57770;57771;57772;57773;57774;57775;57776;57777;57778;57779;57780;57781;57782 57770 28 CIPYAVLLEALALR Unmodified 1600.9011 0.90108458 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 167.49 167.49 2;3 1.3823E-22 171958 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.98 106.34 1717300000 26819000 21152000 335390000 97727000 116950000 0 123280000 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57812 5 CISEVQANNVVLGQYVGNPDGEGEATK Unmodified 2847.3345 0.33450096 2024 P11413;E7EUI8 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 105.05 105.05 3 9.3013E-16 107211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.435 78.262 138560000 0 0 47770000 0 0 41360000 0 49432000 0 0 0 0 0 4959 2024 4642 45324;45325;45326 57815;57816;57817 57817 2 CITDPQTGLCLLPLK Unmodified 1727.895 0.89501293 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 139.69 139.69 2 9.0359E-24 131031 QUIQUE_DMIX8_190116_001 151.15 126.8 4527600000 325810000 407290000 496590000 164720000 358490000 260980000 479400000 283770000 264080000 266470000 410790000 389500000 419710000 4960 3117 4643 45327;45328;45329;45330;45331;45332;45333;45334;45335;45336;45337;45338;45339;45340;45341;45342;45343;45344;45345;45346;45347 57818;57819;57820;57821;57822;57823;57824;57825;57826;57827;57828;57829;57830;57831;57832;57833;57834;57835;57836;57837;57838;57839;57840;57841;57842;57843;57844;57845;57846;57847;57848 57848 31 CIVNNVSAETVQTVR Unmodified 1688.8516 0.85156821 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.693 69.693 2 1.5516E-12 66356 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.37 87.857 76695000 0 0 0 0 0 0 0 26107000 0 13812000 0 0 36776000 4961 3565 4644 45348;45349;45350;45351;45352;45353 57849;57850;57851;57852;57853;57854 57853 6 CIVYYKEPFWR Unmodified 1559.7595 0.75950572 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 90.203 90.203 2;3 0.00076318 92008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.1 123.42 365460000 0 0 0 0 0 0 0 154920000 54369000 0 66086000 51139000 38938000 4962 2261 4645 45354;45355;45356;45357;45358;45359 57855;57856;57857;57858;57859;57860;57861 57855 7 CIWLNSQFR Unmodified 1222.5917 0.59171211 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 89.454 89.454 2 0.041258 91971 QUIQUE_C1576_190116_001 53.166 32.837 17440000 0 0 0 0 0 0 17440000 0 0 0 0 0 0 4963 3778 4646 45360;45361 57862;57863 57863 2 CIYNLLQSSSPAVK Unmodified 1578.8076 0.80757813 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.585 94.585 2 9.3401E-05 98201 QUIQUE_C1218_190116_001 138.25 111.13 270060000 37676000 52349000 31474000 35595000 0 0 26681000 36435000 0 0 0 49853000 0 4964 2629 4647 45362;45363;45364;45365;45366;45367;45368 57864;57865;57866;57867;57868;57869;57870 57864 7 CIYNTAGFYCDR Unmodified 1538.6282 0.62823356 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.408 78.408 2 0.00052207 80257 QUIQUE_C1218_190116_001 96.665 89.459 353600000 23333000 45329000 34683000 22903000 52171000 0 28549000 38240000 39227000 10035000 33197000 25931000 0 4965 2008 4648 45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375;45376;45377;45378;45379;45380 57871;57872;57873;57874;57875;57876;57877;57878;57879;57880;57881;57882;57883 57871 13 CKAEHDQLLLNYAK Unmodified 1701.8508 0.85083993 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 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57887;57888;57889;57890;57891;57892;57893;57894;57895;57896;57897;57898;57899;57900;57901;57902;57903;57904;57905;57906;57907;57908;57909;57910;57911;57912;57913;57914;57915;57916;57917;57918;57919;57920;57921;57922;57923;57924;57925;57926;57927;57928;57929;57930;57931;57932;57933;57934;57935;57936;57937;57938;57939;57940;57941;57942;57943;57944;57945 57908 58 CKDGVVFGVEK Unmodified 1236.6173 0.61725816 2245 P25788 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes yes 0 0 1 1 32.717 32.717 2 0.0031346 27967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.29 85.032 44100000 0 0 0 0 0 0 0 44100000 0 0 0 0 0 4968 2245 4651 45417 57946 57946 1 CKDISSALR Unmodified 1048.5335 0.53352853 2055 P13489;E9PIM9;E9PMJ3;E9PLZ3;E9PIK5;E9PMN0;E9PMA9 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 1 1 1 1 1 19.736 19.736 3 0.0059793 12490 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.157 48.617 227510000 0 0 0 0 0 0 0 78722000 0 0 61765000 40473000 46555000 4969 2055 4652 45418;45419;45420;45421 57947;57948;57949;57950 57948 4 CKDVLTGQEFDVR Unmodified 1565.7508 0.75079153 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 61.462 61.462 2;3 6.4555E-06 60134 QUIQUE_C1403_190116_001 130.1 116.98 590420000 35485000 56673000 47018000 146580000 0 0 94624000 96054000 0 7069000 0 0 106920000 4970 2463 4653 45422;45423;45424;45425;45426;45427;45428;45429;45430;45431;45432;45433 57951;57952;57953;57954;57955;57956;57957;57958;57959;57960;57961;57962;57963 57955 13 CKEENTIILQQLLPLR Unmodified 1967.0874 0.087381804 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 123.12 123.12 3 0.008724 126902 QUIQUE_C1277_190116_001 48.405 40.32 34515000 0 20893000 0 13622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4971 4078 4654 45434;45435 57964;57965 57964 1 CKLEEMGFK Oxidation (M) 1156.5257 0.52566596 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 1 1 1 1 1 1 20.293 20.293 3 0.015452 13001 QUIQUE_C1563_190116_001 66.568 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57974;57975;57976;57977;57978;57979;57980;57981;57982;57983;57984;57985 57976 11 CLAAALIVLTESGR Unmodified 1472.8021 0.80209882 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 0 0 6 7 5 4 4 5 4 5 6 3 5 9 4 146.31 146.31 2;3 6.122E-19 134018 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.54 111.28 13502000000 1244600000 1354300000 1203800000 948000000 998920000 934500000 1265000000 1008900000 885180000 465960000 895710000 1295000000 1001900000 4975 1203 4657 45456;45457;45458;45459;45460;45461;45462;45463;45464;45465;45466;45467;45468;45469;45470;45471;45472;45473;45474;45475;45476;45477;45478;45479;45480;45481;45482;45483;45484;45485;45486;45487;45488;45489;45490;45491;45492;45493;45494;45495;45496;45497;45498;45499;45500;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508;45509;45510;45511;45512;45513;45514;45515;45516;45517;45518;45519;45520;45521;45522 57986;57987;57988;57989;57990;57991;57992;57993;57994;57995;57996;57997;57998;57999;58000;58001;58002;58003;58004;58005;58006;58007;58008;58009;58010;58011;58012;58013;58014;58015;58016;58017;58018;58019;58020;58021;58022;58023;58024;58025;58026;58027;58028;58029;58030;58031;58032;58033;58034;58035;58036;58037;58038;58039;58040;58041;58042;58043;58044;58045;58046;58047;58048;58049;58050;58051;58052;58053;58054;58055;58056;58057;58058;58059;58060;58061;58062;58063;58064;58065;58066;58067;58068;58069;58070;58071;58072;58073;58074;58075;58076;58077;58078;58079;58080;58081;58082;58083;58084;58085;58086;58087;58088;58089;58090;58091;58092;58093;58094;58095;58096;58097;58098;58099;58100;58101;58102;58103;58104;58105;58106;58107;58108;58109;58110;58111;58112;58113 58079 127 CLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDK Unmodified 2457.1668 0.16683069 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 121.1 121.1 3 8.8243E-05 126180 QUIQUE_C1218_190116_001 51.645 47.568 144010000 76301000 0 0 67707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4976 1881 4658 45523;45524 58114;58115;58116 58115 3 CLAALTECAASGDGNILALAVDASR Unmodified 2518.2156 0.2155718 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.78 154.78 3 0.0024527 159568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.546 20.932 179520000 0 0 43912000 0 0 30690000 0 24778000 43528000 0 0 36617000 0 4977 2191 4659 45525;45526;45527;45528;45529 58117;58118;58119;58120;58121 58120 4 CLAENAVYLCDR Unmodified 1482.6595 0.65953368 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 70.954 70.954 2 0.012799 71557 QUIQUE_C1368_190116_001 72.2 54.381 17706000 0 0 17706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4978 1414;3777 4660 45530 58122 58122 0 CLAENSLGSAR Unmodified 1176.5557 0.55572054 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.043 30.043 2 0.0027056 24470 QUIQUE_C1277_190116_001 97.857 46.003 707420000 108470000 128560000 123430000 0 0 70852000 0 0 0 37429000 60542000 86609000 91536000 4979 2345 4661 45531;45532;45533;45534;45535;45536;45537;45538 58123;58124;58125;58126;58127;58128;58129;58130 58124 3 CLAFHDISPQAPTHFLVIPK Unmodified 2290.1932 0.19324386 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 0 3 3 2 2 3 2 3 2 3 2 3 3 3 108.74 108.74 2;3;4 8.9307E-47 111953 QUIQUE_C1277_190116_001 198.78 169.44 17299000000 1640800000 1797900000 1416700000 1141300000 1550000000 953460000 1465200000 899980000 1203900000 389440000 1596500000 1551300000 1692800000 4980 2546 4662 45539;45540;45541;45542;45543;45544;45545;45546;45547;45548;45549;45550;45551;45552;45553;45554;45555;45556;45557;45558;45559;45560;45561;45562;45563;45564;45565;45566;45567;45568;45569;45570;45571;45572 58131;58132;58133;58134;58135;58136;58137;58138;58139;58140;58141;58142;58143;58144;58145;58146;58147;58148;58149;58150;58151;58152;58153;58154;58155;58156;58157;58158;58159;58160;58161;58162;58163;58164;58165;58166;58167;58168;58169;58170;58171;58172;58173;58174;58175;58176;58177;58178;58179;58180;58181;58182;58183;58184;58185;58186;58187 58140 57 CLAMDVQAFER Unmodified 1338.606 0.60604155 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.939 95.939 2 0.0029289 98289 QUIQUE_C1403_190116_001 75.294 51.865 546540000 91789000 89492000 72586000 77553000 57440000 0 80083000 0 0 0 77597000 0 0 4981 2331 4663 45573;45574;45575;45576;45577;45578;45579 58188;58189;58190;58191;58192;58193;58194 58191 6 CLAPLEGAR Unmodified 985.5015 0.50150012 1858 P04217 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 38.557 38.557 2 0.025868 35160 QUIQUE_C1438_190116_001 58.981 30.468 49526000 0 0 0 0 49526000 0 0 0 0 0 0 0 0 4982 1858 4664 45580 58195 58195 1 CLAPMMSEVIR Unmodified 1305.6243 0.62433415 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 95.695 95.695 2 0.0060595 98599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.95 55.567 257920000 0 0 92635000 0 57487000 0 0 0 43565000 0 0 0 64237000 4983 1153 4665 45581;45582;45583;45584;45585;45586;45587;45588 58196;58197;58198;58199;58200;58201;58202;58203 58201 8 CLATGPGIASTVK Unmodified 1273.67 0.67002202 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 47.597 47.597 2 0.0045039 45230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.488 51.246 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4984 1628 4666 45589;45590;45591;45592;45593;45594;45595;45596 58204;58205;58206;58207;58208;58209;58210;58211 58207 8 CLAYDFYPGK Unmodified 1232.5536 0.55359527 2237 P25311 AZGP1 Zinc-alpha-2-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 87.727 87.727 2 0.0097252 90996 QUIQUE_C1438_190116_001 69.825 60.467 51853000 0 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Unmodified 1694.845 0.84502627 1965 P09488;E7EWW9 GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 1 yes no 0 0 1 2 2 129.32 129.32 2;3 1.9679E-10 132591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.96 107.99 1031900000 0 0 0 0 0 0 0 744950000 286950000 0 0 0 0 4990 1965 4672 45646;45647;45648;45649 58274;58275;58276;58277;58278;58279 58276 6 CLDAISSLLYLPPEQQTDDLLR Unmodified 2559.2891 0.28905432 3177 Q16401;Q4VXH0 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 163.57 163.57 3 3.3301E-09 157613 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.231 80.926 27041000 0 0 0 18441000 0 0 0 0 0 8600500 0 0 0 4991 3177 4673 45650;45651 58280;58281 58281 2 CLDAVVSTR Unmodified 1019.507 0.50697943 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 37.885 37.885 2 0.008597 32089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 55.186 97212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97212000 0 0 0 4992 3499 4674 45652 58282 58282 1 CLDEFPNLK Unmodified 1134.5379 0.53794521 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.908 77.908 2 5.3319E-10 78394 QUIQUE_DMIX3_190116_001 207.6 138.82 11578000000 520260000 785350000 737650000 609690000 894050000 1003700000 775450000 1723300000 995120000 596960000 820170000 1154800000 961560000 4993 2174 4675 45653;45654;45655;45656;45657;45658;45659;45660;45661;45662;45663;45664;45665 58283;58284;58285;58286;58287;58288;58289;58290;58291;58292;58293;58294;58295;58296;58297;58298;58299;58300;58301;58302;58303;58304;58305;58306;58307;58308;58309;58310;58311;58312 58303 30 CLDPVPHPINFGGPHNFVQVPGFPR Unmodified 2797.3911 0.39110882 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 123.25 123.25 4 0.042625 129431 QUIQUE_C1438_190116_001 20.757 13.302 52821000 0 0 0 0 52821000 0 0 0 0 0 0 0 0 4994 2807 4676 45666 58313 58313 1 CLDQQCELR Unmodified 1220.5278 0.52779123 17 A0A075B7B5;B7ZM87;O75044;A0A286YEY3;P0DMP2;P0DJJ0;A0A075B7C8;A0A075B743 SRGAP2;SRGAP2B;SRGAP2C SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2;SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B;SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.145 29.145 2 0.013527 23063 QUIQUE_C1563_190116_001 69.812 51.5 83741000 24614000 36732000 0 0 0 22395000 0 0 0 0 0 0 0 4995 17 4677 45667;45668;45669;45670;45671;45672 58314;58315;58316;58317;58318;58319 58318 6 CLDYVLEELK Unmodified 1280.6322 0.63223953 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 114.86 114.86 2 0.0017727 118876 QUIQUE_C1368_190116_001 93.649 63.482 138490000 0 0 85610000 52884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4996 62 4678 45673;45674 58320;58321 58320 2 CLDYVLEELKHNAK Unmodified 1730.8662 0.86615564 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 86.228 86.228 4 0.022281 87011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.793 28.263 16502000 0 0 0 0 0 0 0 16502000 0 0 0 0 0 4997 62 4679 45675 58322 58322 1 CLEEFELLGK Unmodified 1236.606 0.60602477 645 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58378;58379;58380;58381;58382;58383;58384;58385;58386;58387;58388;58389;58390 58381 13 CLELFSELAEDK Unmodified 1452.6806 0.68064628 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 0 1 126.05 126.05 2 0.040344 130674 QUIQUE_C1218_190116_001 64.103 25.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5007 1938 4689 45735 58391 58391 1 CLELFSELAEDKENYK Unmodified 1986.9245 0.92445838 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 109.5 109.5 2;3 2.1269E-62 113743 QUIQUE_C1576_190116_001 229.54 190.91 2160000000 181000000 294970000 215530000 228080000 241500000 247530000 215250000 57067000 87195000 79556000 125600000 100390000 86299000 5008 1938 4690 45736;45737;45738;45739;45740;45741;45742;45743;45744;45745;45746;45747;45748;45749;45750;45751;45752;45753;45754;45755 58392;58393;58394;58395;58396;58397;58398;58399;58400;58401;58402;58403;58404;58405;58406;58407;58408;58409;58410;58411;58412;58413;58414;58415;58416 58409 23 CLELFSELAEDKENYKK Unmodified 2115.0194 0.019421398 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 2 1 2 2 3 3 2 3 2 3 2 3 3 3 89.287 89.287 2;3;4 1.7327E-28 91960 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.93 157.01 5961100000 184950000 587980000 315500000 396380000 416600000 343160000 491160000 556690000 500080000 227400000 661830000 667320000 612040000 5009 1938 4691 45756;45757;45758;45759;45760;45761;45762;45763;45764;45765;45766;45767;45768;45769;45770;45771;45772;45773;45774;45775;45776;45777;45778;45779;45780;45781;45782;45783;45784;45785;45786;45787 58417;58418;58419;58420;58421;58422;58423;58424;58425;58426;58427;58428;58429;58430;58431;58432;58433;58434;58435;58436;58437;58438;58439;58440;58441;58442;58443;58444;58445;58446;58447;58448;58449;58450 58443 28 CLELFTELAEDK Unmodified 1466.6963 0.69629635 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.08 129.08 2 0.00023168 125889 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.67 73.364 234940000 46870000 48394000 39663000 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2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 1 1 1 17.878 17.878 3 0.0068167 10380 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.823 57.098 20289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20289000 0 0 5016 2970;2974 4697 45860 58547 58547 2429 1 CLEQAALVNYSR Unmodified 1422.6925 0.69254837 4494;981;1236 F1T0E5;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 68.424 68.424 2 0.012658 68884 QUIQUE_C1576_190116_001 57.532 44.44 187780000 0 0 92955000 0 0 0 94821000 0 0 0 0 0 0 5017 981;4494;1236 4698 45861;45862 58548;58549 58549 2 CLEVLQASDNAIESLDGVTNLPR Unmodified 2513.2432 0.24316676 3750 Q92696;H0YLG7;H0YMG5 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 152.95 152.95 3 6.8424E-05 157677 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.909 45.212 48722000 0 0 0 29350000 0 0 0 0 0 0 0 0 19371000 5018 3750 4699 45863;45864;45865 58550;58551;58552 58552 3 CLFAMPETAIGLFPDVGGGYFLPR Oxidation (M) 2643.2866 0.2865519 3373 Q6NVY1;B8ZZZ0 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 1 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CLHMFLQEEAIDR Unmodified 1660.7701 0.77014677 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.505 82.505 3 0.00037269 83977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.871 63.617 273360000 0 56773000 24953000 48566000 0 0 0 40469000 41463000 0 0 25917000 35218000 5030 95 4710 45930;45931;45932;45933;45934;45935;45936 58623;58624;58625;58626;58627;58628;58629 58627 3 CLHPCVISR Unmodified 1140.5532 0.55321812 1949;587 P08603;B1AKG0;Q03591 CFH;CFHR1 Complement factor H;Complement factor H-related protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 20.955 20.955 3 0.016033 14241 QUIQUE_C1438_190116_001 44.318 11.997 68050000 0 0 0 0 28829000 0 0 0 0 0 18512000 0 20709000 5031 1949;587 4711 45937;45938;45939 58630;58631;58632 58630 3 CLHPLANETFVAK Unmodified 1498.7602 0.76023401 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 49.433 49.433 2;3 2.9826E-13 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58897;58898;58899;58900;58901;58902;58903;58904;58905;58906;58907;58908;58909;58910;58911;58912;58913;58914;58915;58916;58917;58918;58919;58920;58921;58922;58923;58924 58903 25 CLVDASDTSQGR Unmodified 1307.5776 0.57757819 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.182 31.182 2 0.010781 26184 QUIQUE_C1576_190116_001 80.706 53.591 48933000 22707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26225000 5061 3402 4741 46186;46187;46188 58925;58926;58927 58926 3 CLVFSLIGLHFK Unmodified 1432.7901 0.79007757 3798 Q96A72 MAGOHB Protein mago nashi homolog 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.26 137.26 3 0.00036867 142560 QUIQUE_C1576_190116_001 82.494 78.704 131030000 10233000 23213000 0 8004300 0 0 33783000 21207000 25771000 8814500 0 0 0 5062 3798 4742 46189;46190;46191;46192;46193;46194;46195;46196;46197 58928;58929;58930;58931;58932;58933;58934;58935;58936 58932 9 CLVGEFVSDALLVPDK Unmodified 1760.9019 0.90187244 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 150.08 150.08 2 1.615E-05 154496 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.39 76.535 279510000 0 39021000 0 0 54429000 33682000 64781000 28949000 0 12091000 0 46559000 0 5063 147 4743 46198;46199;46200;46201;46202;46203;46204 58937;58938;58939;58940;58941;58942;58943 58943 7 CLVLTGFGGYDK Unmodified 1328.6435 0.64347291 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.57 98.57 2 0.00050608 96432 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.75 107.88 3367400000 273240000 383900000 319550000 353960000 308220000 232790000 0 259360000 248750000 117460000 239390000 292110000 338680000 5064 3958 4744 46205;46206;46207;46208;46209;46210;46211;46212;46213;46214;46215;46216 58944;58945;58946;58947;58948;58949;58950;58951;58952;58953;58954;58955;58956;58957 58954 12 CLVMDVQAFER Unmodified 1366.6373 0.63734168 2069 P13861;H7C330 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.56 106.56 2 0.00019842 111268 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.77 88.339 980890000 63131000 86510000 72794000 85988000 70451000 74429000 79533000 87078000 79362000 35673000 95595000 91338000 59004000 5065 2069 4745 46217;46218;46219;46220;46221;46222;46223;46224;46225;46226;46227;46228;46229 58958;58959;58960;58961;58962;58963;58964;58965;58966;58967;58968;58969;58970 58968 10 CLYASVLTAQPR Unmodified 1377.7075 0.70747015 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.758 79.758 2 1.5134E-09 80544 QUIQUE_C1403_190116_001 152.28 102.86 3252800000 226440000 296830000 304440000 291060000 280160000 211020000 243880000 300280000 215600000 105480000 264460000 227320000 285810000 5066 2058 4746 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yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.335 76.335 2 0.0002529 77041 QUIQUE_C1368_190116_001 108.7 90.257 758110000 0 84295000 77805000 60109000 80097000 61394000 0 82311000 60851000 59410000 57697000 72325000 61810000 5069 2870 4749 46251;46252;46253;46254;46255;46256;46257;46258;46259;46260;46261;46262;46263 58995;58996;58997;58998;58999;59000;59001;59002;59003;59004;59005;59006;59007;59008;59009;59010;59011 58998 2345 17 CMALSTAVLVGEAK Unmodified 1448.7367 0.73672137 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.845 94.845 2 0.0023413 96675 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.187 77.663 2594300000 282160000 307520000 319490000 0 274490000 0 311430000 195200000 160490000 81931000 187470000 229210000 244870000 5070 2870 4749 46264;46265;46266;46267;46268;46269;46270;46271;46272;46273;46274 59012;59013;59014;59015;59016;59017;59018;59019;59020;59021;59022;59023;59024 59024 10 CMALSTAVLVGEAKK Unmodified 1576.8317 0.83168439 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 73.67 73.67 3 0.046889 73232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 21.458 0.99532 54203000 0 0 0 0 0 0 0 54203000 0 0 0 0 0 5071 2870 4750 46275 59025 59025 1 CMELISLPLANK Unmodified 1387.7203 0.72034303 4133 Q9H1K0 RBSN Rabenosyn-5 yes yes 0 0 0 1 117.7 117.7 2 0.016274 121462 QUIQUE_C1277_190116_001 69.276 53.396 19737000 0 19737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5072 4133 4751 46276 59026 59026 0 CMMAQYNR Unmodified 1072.4252 0.42524041 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.232 27.232 2 0.025651 22044 QUIQUE_C1218_190116_001 84.064 74.67 246480000 49662000 57534000 0 0 0 45840000 40118000 0 0 0 53322000 0 0 5073 2343 4752 46277;46278;46279;46280;46281;46282 59027;59028;59029;59030;59031;59032 59027 6 CMPTFQFFK Unmodified 1204.5409 0.5409221 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.63 116.63 2 0.026145 120450 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kDa protein no no 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 3 4 1 3 3 3 94.589 94.589 3;4;5 2.7356E-143 96670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 215.48 205.68 13561000000 184350000 902830000 263860000 427570000 699140000 214710000 654010000 1586200000 1473300000 94043000 2233400000 2720500000 2106600000 5083 558;2010 4761 46358;46359;46360;46361;46362;46363;46364;46365;46366;46367;46368;46369;46370;46371;46372;46373;46374;46375;46376;46377;46378;46379;46380;46381;46382;46383;46384;46385;46386;46387;46388;46389 59131;59132;59133;59134;59135;59136;59137;59138;59139;59140;59141;59142;59143;59144;59145;59146;59147;59148;59149;59150;59151;59152;59153;59154;59155;59156;59157;59158;59159;59160;59161;59162;59163;59164;59165;59166;59167;59168;59169;59170;59171;59172;59173;59174;59175;59176;59177 59155 47 CNENYTTDFIFNLYSEEGK Unmodified 2343.0001 0.0001425191 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;H0YIS9 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 149.17 149.17 2;3 2.8686E-45 152083 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20 CNGVLEGIR Unmodified 1016.5073 0.50731378 2378;2379;3459;2385 P35579;A0A087X0T3;P13535;Q9Y623;P12882;A7E2Y1;P35749;Q7Z406;M0QY43;P35580 MYH9;MYH7B;MYH8;MYH4;MYH1;MYH11;MYH14;MYH10 Myosin-9;Myosin-8;Myosin-4;Myosin-1;Myosin-7B;Myosin-11;Myosin-14;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.335 45.335 2 0.0005012 41673 QUIQUE_C1277_190116_001 113.94 89.124 200740000 0 111380000 0 0 0 0 0 89360000 0 0 0 0 0 5086 2378;2385;3459;2379 4764 46422;46423;46424;46425;46426;46427 59217;59218;59219;59220;59221;59222;59223;59224;59225 59218 9 CNINNFIFHK Unmodified 1305.6288 0.6288259 2896 Q05655 PRKCD Protein kinase C delta type;Protein kinase C delta type regulatory subunit;Protein kinase C delta type catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 68.17 68.17 3 0.033831 68483 QUIQUE_C1576_190116_001 30.392 18.179 17417000 0 0 0 0 0 0 17417000 0 0 0 0 0 0 5087 2896 4765 46428 59226 59226 1 CNLEAAFFEGHFLK Unmodified 1681.7923 0.79226242 3343 Q5W0V3 FAM160B1 Protein FAM160B1 yes yes 0 0 0 1 122 122 3 0.0073333 125948 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junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.747 28.747 2 1.8477E-65 22491 QUIQUE_DMIX8_190116_001 197.3 195.47 962840000 76924000 97345000 118250000 112810000 64281000 99274000 169000000 29048000 39912000 0 43529000 43920000 68540000 5094 2123 4772 46456;46457;46458;46459;46460;46461;46462;46463;46464;46465;46466;46467 59258;59259;59260;59261;59262;59263;59264;59265;59266;59267;59268;59269 59269 12 CNVSFLLSEDGSGK Unmodified 1511.6926 0.69260795 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 88.626 88.626 2 4.7189E-58 90281 QUIQUE_DMIX3_190116_001 197.07 179.64 2851200000 230440000 294590000 226940000 233050000 200250000 173510000 229620000 248900000 169560000 95538000 223740000 304830000 220200000 5095 2146 4773 46468;46469;46470;46471;46472;46473;46474;46475;46476;46477;46478;46479;46480;46481;46482;46483 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ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 1 1 1 1 2 3 2 129.3 129.3 3;4 2.7977E-06 143076 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.171 50.619 725460000 0 0 0 0 75912000 0 0 47711000 176360000 30849000 110030000 163120000 121490000 5102 526;1984;3401 4780 46538;46539;46540;46541;46542;46543;46544;46545;46546;46547;46548 59361;59362;59363;59364;59365;59366;59367;59368;59369;59370;59371 59369 9 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTF Unmodified 2657.16 0.16003075 458 A0A2R8YEA7 yes yes 0 0 0 1 2 1 155.18 155.18 2;3 6.6258E-06 158729 QUIQUE_C1403_190116_001 62.684 60.142 109800000 39757000 0 0 45461000 0 24578000 0 0 0 0 0 0 0 5103 458 4781 46549;46550;46551;46552 59372;59373;59374;59375 59373 4 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK 2 Oxidation (M) 3262.4443 0.44432746 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 2 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.54 130.54 2;3 4.5325E-24 133896 QUIQUE_C1368_190116_001 98.98 94.768 12279000000 788570000 1410500000 1366900000 1194400000 868520000 1331900000 941180000 667560000 605750000 915410000 573820000 749650000 865010000 5104 447;2696;2788 4782 46553;46554;46555;46556;46557;46558;46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567 59376;59377;59378;59379;59380;59381;59382;59383;59384;59385;59386;59387;59388;59389;59390;59391;59392;59393;59394;59395;59396;59397 59381 316;317 22 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Oxidation (M) 3246.4494 0.44941284 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 0 9 8 6 5 7 7 7 5 7 3 6 3 5 140.14 140.14 2;3;4 2.1926E-65 144266 QUIQUE_C1368_190116_001 155.56 153.36 83452000000 6442100000 10294000000 9094200000 7323100000 6465800000 7084900000 7035200000 4573200000 4524600000 2247400000 5667300000 5390900000 7309100000 5105 447;2696;2788 4782 46568;46569;46570;46571;46572;46573;46574;46575;46576;46577;46578;46579;46580;46581;46582;46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590;46591;46592;46593;46594;46595;46596;46597;46598;46599;46600;46601;46602;46603;46604;46605;46606;46607;46608;46609;46610;46611;46612;46613;46614;46615;46616;46617;46618;46619;46620;46621;46622;46623;46624;46625;46626;46627;46628;46629;46630;46631;46632;46633;46634;46635;46636;46637;46638;46639;46640;46641;46642;46643;46644;46645 59398;59399;59400;59401;59402;59403;59404;59405;59406;59407;59408;59409;59410;59411;59412;59413;59414;59415;59416;59417;59418;59419;59420;59421;59422;59423;59424;59425;59426;59427;59428;59429;59430;59431;59432;59433;59434;59435;59436;59437;59438;59439;59440;59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;59448;59449;59450;59451;59452;59453;59454;59455;59456;59457;59458;59459;59460;59461;59462;59463;59464;59465;59466;59467;59468;59469;59470;59471;59472;59473;59474;59475;59476;59477;59478;59479;59480;59481;59482;59483;59484;59485;59486;59487;59488;59489;59490;59491;59492;59493;59494;59495;59496;59497;59498;59499;59500;59501;59502;59503;59504;59505;59506;59507 59424 316;317 107 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Unmodified 3230.4545 0.45449822 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 0 4 5 7 6 5 5 8 4 3 3 8 10 8 151.61 151.61 2;3;4 1.1987E-108 151614 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144527 QUIQUE_C1277_190116_001 151.65 143.78 2235400000 255210000 504200000 144430000 242630000 248020000 46220000 150010000 69489000 108440000 40307000 96052000 277970000 52433000 5107 2759;2792 4783 46722;46723;46724;46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731;46732;46733;46734;46735;46736 59621;59622;59623;59624;59625;59626;59627;59628;59629;59630;59631;59632;59633;59634;59635;59636;59637;59638;59639;59640;59641;59642;59643;59644;59645 59624 24 CPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMK Oxidation (M) 3203.4614 0.46135773 2792;2759 P62736;P63267;P68032;P68133 ACTA2;ACTG2;ACTC1;ACTA1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 1 0 1 1 2 1 1 130.33 130.33 3 2.3183E-31 134523 QUIQUE_C1277_190116_001 117.08 103.35 315630000 0 148990000 0 32044000 70741000 0 0 0 30034000 0 0 33821000 0 5108 2759;2792 4783 46737;46738;46739;46740;46741;46742 59646;59647;59648;59649;59650;59651;59652;59653 59646 2186;2187 8 CPFGGAFALAAGLR Unmodified 1406.7129 0.71288988 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2;H0YF31 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 130.31 130.31 2 0.06096 135275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.937 27.649 49065000 0 0 0 0 0 0 0 0 49065000 0 0 0 0 5109 3418 4784 46743 59654 59654 1 CPFIDDFILALHR Unmodified 1615.8181 0.81808324 1269 J3KPJ3;Q8N5S9 CAMKK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.99 148.99 3 1.6623E-13 153516 QUIQUE_C1277_190116_001 128.28 119 174860000 13622000 20427000 12801000 10600000 11674000 10252000 16590000 8447900 16801000 4146000 15223000 18503000 15768000 5110 1269 4785 46744;46745;46746;46747;46748;46749;46750;46751;46752;46753;46754;46755;46756 59655;59656;59657;59658;59659;59660;59661;59662;59663;59664;59665;59666;59667 59656 12 CPFYAAEQDK Unmodified 1227.523 0.52302343 2319 P30519;A0A087WT44;I3L1Y2 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 38.046 38.046 2 0.018191 33781 QUIQUE_C1277_190116_001 74.173 19.396 112240000 0 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CPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDR Oxidation (M) 4161.9677 0.96768396 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 166.4 166.4 4 5.5768E-88 170661 QUIQUE_DMIX8_190116_001 144.2 135.51 692770000 0 54575000 0 0 64765000 0 0 0 124950000 0 0 152890000 295590000 5114 2197 4789 46776;46777;46778;46779;46780;46781 59689;59690;59691;59692;59693;59694 59693 1543 4 CPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDR Unmodified 4145.9728 0.97276934 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 169.23 169.23 4 7.5299E-88 173190 QUIQUE_DMIX7_190116_001 141.9 134.03 1245400000 0 0 0 0 0 0 242090000 0 261970000 0 424050000 317280000 0 5115 2197 4789 46782;46783;46784;46785;46786 59695;59696;59697;59698;59699;59700 59700 6 CPHVTEHIPR Unmodified 1244.6084 0.60842481 2507 P48449;A0A0G2JQD0 LSS Lanosterol synthase yes no 0 0 0 1 1 16.113 16.113 3 0.0094165 8354 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.303 27.582 15296000 0 0 0 0 0 0 15296000 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1 1 2 1 2 1 1 65.465 65.465 2;3 0.0038748 65476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.302 70.213 1553900000 266730000 150960000 212260000 105920000 99115000 76138000 190910000 108980000 224380000 39197000 79264000 0 0 5121 4281 4795 46825;46826;46827;46828;46829;46830;46831;46832;46833;46834;46835;46836;46837;46838;46839 59758;59759;59760;59761;59762;59763;59764;59765;59766;59767;59768;59769;59770;59771;59772;59773 59769 9 CPLNYFACPSGR Unmodified 1440.6278 0.62783962 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 77.634 77.634 2 0.0020804 77469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.192 67.759 29367000 0 0 0 0 0 0 0 29367000 0 0 0 0 0 5122 2911 4796 46840 59774 59774 1 CPLPRPWALTFSYGR Unmodified 1819.9192 0.91919426 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 113.57 113.57 3 7.7411E-06 119023 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.45 94.55 714450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 714450000 0 0 5123 1978 4797 46841;46842;46843 59775;59776;59777;59778 59776 4 CPLQDFLR Unmodified 1047.5172 0.51715019 932 E9PHY0;P11117;B7Z7D2;E9PQY3 ACP2 Lysosomal acid phosphatase yes no 0 0 0 1 90.468 90.468 2 0.065856 92420 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.854 45.03 27482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27482000 0 5124 932 4798 46844 59779 59779 1 CPNLTHLNLSGNK Unmodified 1466.73 0.72999651 1170 H0YN26;P39687 ANP32A Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A yes no 0 0 0 2 2 1 2 3 2 2 2 1 1 2 2 2 44.329 44.329 2;3 4.2323E-283 41140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 341.35 282.92 2233200000 331370000 325850000 0 211910000 196980000 0 101340000 275450000 68297000 86612000 277520000 103230000 254650000 5125 1170 4799 46845;46846;46847;46848;46849;46850;46851;46852;46853;46854;46855;46856;46857;46858;46859;46860;46861;46862;46863;46864;46865;46866;46867;46868 59780;59781;59782;59783;59784;59785;59786;59787;59788;59789;59790;59791;59792;59793;59794;59795;59796;59797;59798;59799;59800;59801;59802;59803;59804;59805;59806;59807;59808 59799 29 CPNPEEGESVLELSLR Unmodified 1827.8673 0.86727785 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 110.4 110.4 2 1.1708E-18 113942 QUIQUE_C1368_190116_001 163.51 152.29 552490000 72723000 97409000 70843000 57498000 68228000 53507000 77467000 0 0 0 0 54818000 0 5126 3390 4800 46869;46870;46871;46872;46873;46874;46875;46876 59809;59810;59811;59812;59813;59814;59815;59816;59817;59818 59813 10 CPNPPVQENFDVNK Unmodified 1656.7566 0.75660519 719 C9JF17;P05090;C9JX71;F8WBT9 APOD Apolipoprotein D yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 57.16 57.16 2 3.9346E-22 56631 QUIQUE_C1576_190116_001 193.96 176.53 1091200000 87934000 0 324920000 0 0 0 200750000 0 0 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Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.566 14.566 3 0.00035239 6331 QUIQUE_C1563_190116_001 65.329 52.144 149950000 0 0 0 26701000 0 28392000 34201000 0 0 0 28630000 0 32028000 5130 2524 4803 46897;46898;46899;46900;46901;46902 59844;59845;59846;59847;59848;59849;59850 59846 7 CPQIVIAFYEER Unmodified 1523.7442 0.74424959 2975;2471 Q13185;P45973 CBX3;CBX5 Chromobox protein homolog 3;Chromobox protein homolog 5 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 113.08 113.08 2 9.0049E-07 115091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.16 119.83 101980000 19856000 20524000 0 0 0 0 0 34931000 0 26671000 0 0 0 5131 2975;2471 4804 46903;46904;46905;46906;46907;46908;46909;46910;46911;46912;46913;46914;46915 59851;59852;59853;59854;59855;59856;59857;59858;59859;59860;59861;59862;59863 59858 13 CPSIAAAIAAVNALHGR Unmodified 1690.8937 0.8937078 3069 Q14498 RBM39 RNA-binding protein 39 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.36 120.36 3 3.2282E-21 123623 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.34 130.99 345500000 27788000 35375000 45367000 0 41198000 28963000 29370000 0 0 0 58599000 38773000 40070000 5132 3069 4805 46916;46917;46918;46919;46920;46921;46922;46923;46924;46925 59864;59865;59866;59867;59868;59869;59870;59871;59872;59873;59874 59871 11 CPSIILHDR Unmodified 1109.5652 0.56516301 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 27.058 27.058 2 0.009134 20909 QUIQUE_C1563_190116_001 76.827 57.35 141560000 0 27130000 0 26692000 27171000 25219000 0 0 0 0 35344000 0 0 5133 4435 4806 46926;46927;46928;46929;46930;46931;46932 59875;59876;59877;59878;59879;59880;59881 59879 7 CPSPPMINLISVGGQHQGVFGLPR Unmodified 2560.3043 0.30426765 406 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regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 19.098 19.098 3 0.00015238 11593 QUIQUE_C1563_190116_001 77.204 65.289 163870000 0 0 0 46899000 0 55502000 61467000 0 0 0 0 0 0 5136 2510 4808 46947;46948;46949 59906;59907;59908 59907 3 CPTDELSLTNCAVVNEK Unmodified 1948.887 0.88702702 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 85.671 85.671 2;3 2.3464E-121 88317 QUIQUE_C1438_190116_001 273.27 259.59 1519600000 189420000 239590000 177600000 174050000 141150000 163330000 259950000 0 0 33730000 0 68588000 72235000 5137 1245 4809 46950;46951;46952;46953;46954;46955;46956;46957;46958;46959;46960;46961;46962 59909;59910;59911;59912;59913;59914;59915;59916;59917;59918;59919;59920;59921;59922;59923;59924;59925 59917 17 CPTDELSLTNCAVVNEKDFQSGQHVIVR Unmodified 3215.5339 0.53394582 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 100.2 100.2 4 0.0036048 103389 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.206 24.486 103880000 0 0 0 0 0 0 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growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.676 65.676 2 0.0095136 65715 QUIQUE_C1576_190116_001 61.213 50.061 264480000 0 0 0 0 34404000 0 28053000 34820000 36706000 0 44636000 37898000 47962000 5153 4394 4823 47097;47098;47099;47100;47101;47102;47103 60092;60093;60094;60095;60096;60097;60098 60093 7 CQEENYLPSPCQSGQK Unmodified 1923.8091 0.80911105 1810 P01185;P01178 AVP;OXT Vasopressin-neurophysin 2-copeptin;Arg-vasopressin;Neurophysin 2;Copeptin;Oxytocin-neurophysin 1;Oxytocin;Neurophysin 1 yes no 0 0 0 1 54.057 54.057 2 4.7113E-19 52107 QUIQUE_C1218_190116_001 182.55 162.89 34632000 34632000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5154 1810 4824 47104 60099 60099 1 CQEVINWLDR Unmodified 1331.6292 0.62921983 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 110.1 110.1 2 3.4084E-39 100872 QUIQUE_C1368_190116_001 207.68 187.16 6156700000 0 546690000 538480000 470850000 482840000 385030000 487630000 363410000 593200000 320030000 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60251;60252;60253;60254;60255;60256;60257;60258;60259;60260;60261;60262;60263;60264;60265 60261 13 CQQEGLVPEGGVEEERDHWQQFYFLSK Unmodified 3294.504 0.5040259 405 A0A286YF37;Q9UK22 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 3 1 1 3 1 122.37 122.37 3;4 7.5105E-31 126745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.05 113.09 5088500000 195890000 630650000 0 68963000 638420000 55444000 0 1771800000 142570000 121700000 1139200000 0 323840000 5169 405 4839 47235;47236;47237;47238;47239;47240;47241;47242;47243;47244;47245;47246;47247;47248;47249;47250 60266;60267;60268;60269;60270;60271;60272;60273;60274;60275;60276;60277;60278;60279;60280;60281;60282;60283;60284;60285;60286;60287 60279 22 CQQLAAYGILEK Unmodified 1392.7071 0.7071358 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.47 81.47 2 0.00053227 82367 QUIQUE_C1368_190116_001 114.83 98.165 1062500000 73727000 113300000 85407000 78774000 89461000 82821000 101500000 79456000 64590000 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47290;47291;47292;47293;47294;47295;47296 60333;60334;60335;60336;60337;60338;60339 60334 7 CQTYTSEYK Unmodified 1178.4914 0.49138895 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 20.381 20.381 2 0.015591 13224 QUIQUE_C1403_190116_001 103.87 87.361 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5176 3410 4846 47297 60340 60340 1 CQVFEETQIGGER Unmodified 1551.6988 0.69875596 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 1 1 62.269 62.269 2 0.0046404 61494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.069 55.113 347580000 0 0 0 0 0 0 0 115690000 92999000 0 0 0 138890000 5177 3977 4847 47298;47299;47300 60341;60342;60343;60344 60342 4 CQVNSSVEER Unmodified 1206.5299 0.52989972 4258 Q9NQW6;H7C3S1;H7C1C2 ANLN Actin-binding protein anillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.043 16.043 2 1.1968E-07 8293 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.49 128.75 136570000 16621000 27761000 0 0 0 0 35156000 0 0 0 34420000 22616000 0 5178 4258 4848 47301;47302;47303;47304;47305;47306 60345;60346;60347;60348;60349;60350;60351 60348 7 CRDDSFFGETSHNYHK Unmodified 1998.8279 0.82787265 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991;H0Y8T4 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 28.484 28.484 3;4 0.0058402 22960 QUIQUE_C1576_190116_001 52.569 48.183 526160000 0 143390000 51607000 53646000 117100000 0 160420000 0 0 0 0 0 0 5179 307 4849 47307;47308;47309;47310;47311;47312;47313;47314 60352;60353;60354;60355;60356;60357;60358;60359 60359 7 CRPDQLTGLSLLPLSEK Unmodified 1926.0244 0.024447197 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 113.07 113.07 2;3 2.5023E-67 116539 QUIQUE_DMIX8_190116_001 205.3 177.89 3577500000 208200000 341640000 236180000 111170000 228710000 107370000 266860000 372550000 413040000 150030000 515140000 348040000 278540000 5180 3117 4850 47315;47316;47317;47318;47319;47320;47321;47322;47323;47324;47325;47326;47327;47328;47329;47330;47331;47332;47333;47334;47335;47336;47337;47338;47339 60360;60361;60362;60363;60364;60365;60366;60367;60368;60369;60370;60371;60372;60373;60374;60375;60376;60377;60378;60379;60380;60381;60382;60383;60384;60385;60386;60387;60388;60389;60390;60391;60392;60393;60394;60395;60396;60397;60398;60399 60399 40 CSAAALDVLANVFR Unmodified 1505.766 0.76604767 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 3 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 148.15 148.15 2;3 1.3769E-28 152866 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.62 146.84 685830000 81380000 101190000 64815000 51083000 60726000 75405000 70803000 19668000 33200000 22661000 42529000 33516000 28858000 5181 1446 4851 47340;47341;47342;47343;47344;47345;47346;47347;47348;47349;47350;47351;47352;47353;47354;47355;47356;47357;47358 60400;60401;60402;60403;60404;60405;60406;60407;60408;60409;60410;60411;60412;60413;60414;60415;60416;60417;60418;60419;60420;60421 60416 22 CSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLK Unmodified 2903.5943 0.59428488 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 168.21 168.21 3;4 3.4863E-24 172772 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.22 105.2 1063900000 0 0 0 0 242250000 0 0 51111000 574350000 0 119060000 77090000 0 5182 3772 4852 47359;47360;47361;47362;47363;47364 60422;60423;60424;60425;60426;60427 60424 6 CSACNVWR Unmodified 1051.4328 0.43276863 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 29.946 29.946 2 0.0073139 24225 QUIQUE_C1368_190116_001 98.503 84.995 78768000 0 25665000 28712000 24391000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5183 1645 4853 47365;47366;47367;47368;47369;47370;47371;47372 60428;60429;60430;60431;60432;60433;60434;60435 60430 8 CSALATQYMHCVNHAK Unmodified 1889.8335 0.83349208 741 C9JRZ6;Q9NX63 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 0 1 1 36.668 36.668 3 0.00016654 32204 QUIQUE_C1277_190116_001 76.82 70.067 96151000 0 96151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5184 741 4854 47373;47374 60436;60437 60436 2 CSALLQVIFSPLEEEVK Unmodified 1961.018 0.017964835 2350 P32455;Q9H0R5;H3BNS1 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 2 164.09 164.09 2 0.01629 169417 QUIQUE_C1368_190116_001 74.769 60.863 135010000 0 0 135010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5185 2350 4855 47375;47376 60438;60439 60438 0 CSATGSPTPTLEWTGGPGGQLPAK Unmodified 2369.1322 0.13215975 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 97.002 97.002 2 1.5813E-06 101250 QUIQUE_C1438_190116_001 111.12 97.152 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5186 2834 4856 47377 60440 60440 1 CSCCEMNVHR Unmodified 1351.489 0.48897966 1877 P05129;M0R0I9;H7BZ60;M0R0Z4 PRKCG Protein kinase C gamma type yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 14.501 14.501 2;3 5.4958E-06 6615 QUIQUE_C1368_190116_001 125.97 122.11 226400000 29147000 68974000 27329000 28468000 0 30457000 31070000 0 0 0 0 0 10953000 5187 1877 4857 47378;47379;47380;47381;47382;47383;47384;47385 60441;60442;60443;60444;60445;60446;60447;60448 60444 8 CSCHGHSEACEPETGACQGCQHHTEGPR Unmodified 3235.2131 0.21311552 2834 P98160;H0Y5A9 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 10.32 10.32 5 9.5691E-05 2795 QUIQUE_C1277_190116_001 44.3 42.27 2868600 0 2868600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5188 2834 4858 47386 60449 60449 1 CSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAK Unmodified 3944.8639 0.86393039 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 110.93 110.93 4;5 8.375E-05 114286 QUIQUE_C1277_190116_001 41.011 35.745 288700000 0 67875000 85343000 65704000 69780000 0 0 0 0 0 0 0 0 5189 3130 4859 47387;47388;47389;47390 60450;60451;60452;60453 60450 4 CSDFTEEICR Unmodified 1315.5173 0.51728612 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5;H0YM46 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.004 58.004 2 7.1856E-14 56638 QUIQUE_DMIX8_190116_001 169.12 155.54 3566100000 313090000 447840000 369090000 320940000 239290000 270810000 373090000 140010000 251840000 116940000 220350000 271150000 231630000 5190 2558 4860 47391;47392;47393;47394;47395;47396;47397;47398;47399;47400;47401;47402;47403;47404 60454;60455;60456;60457;60458;60459;60460;60461;60462;60463;60464;60465;60466;60467;60468;60469;60470 60470 17 CSDFTEEICRR Unmodified 1471.6184 0.61839715 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5;H0YM46 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 43.039 43.039 3 0.0041713 40222 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.241 55.954 107030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67674000 39354000 5191 2558 4861 47405;47406;47407 60471;60472;60473 60471 2 CSDIVFAR Unmodified 966.4593 0.45930096 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.132 46.132 2 0.0036515 44114 QUIQUE_C1218_190116_001 127.84 87.741 688210000 64123000 77217000 86516000 81257000 0 48581000 0 45147000 57877000 0 80041000 70470000 76983000 5192 3700 4862 47408;47409;47410;47411;47412;47413;47414;47415;47416;47417;47418 60474;60475;60476;60477;60478;60479;60480;60481;60482;60483;60484 60474 11 CSDSTLLSNLLEEMK Unmodified 1738.8117 0.81173681 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 155.9 155.9 2 8.5264E-06 161685 QUIQUE_C1576_190116_001 105.03 89.766 27358000 0 0 0 0 0 0 27358000 0 0 0 0 0 0 5193 437;1437 4863 47419 60485 60485 1 CSEGPGLCLAR Unmodified 1218.5485 0.54852667 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.809 46.809 2 0.00049474 44445 QUIQUE_C1438_190116_001 108.98 95.924 228500000 39850000 42784000 26170000 45164000 39685000 0 34849000 0 0 0 0 0 0 5194 3515 4864 47420;47421;47422;47423;47424;47425;47426;47427 60486;60487;60488;60489;60490;60491;60492;60493;60494 60490 7 CSEGSFLLTTFPR Unmodified 1513.7235 0.72351415 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 3 1 1 2 1 1 1 1 118.65 118.65 2;3 6.4242E-120 121673 QUIQUE_C1218_190116_001 248.88 227.43 2188400000 229580000 341080000 265230000 253450000 149570000 175790000 151030000 78688000 128760000 68150000 127920000 123020000 96125000 5195 3122 4865 47428;47429;47430;47431;47432;47433;47434;47435;47436;47437;47438;47439;47440;47441;47442;47443;47444;47445;47446;47447 60495;60496;60497;60498;60499;60500;60501;60502;60503;60504;60505;60506;60507;60508;60509;60510;60511;60512;60513;60514;60515;60516;60517;60518;60519;60520;60521 60496 27 CSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEK Unmodified 3635.7011 0.70113031 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 146.31 146.31 3 1.6038E-54 149433 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.84 126.37 187220000 0 0 0 0 0 0 0 67962000 0 0 46314000 72940000 0 5196 3122 4866 47448;47449;47450 60522;60523;60524 60522 3 CSEGVFLLTTTPR Unmodified 1479.7392 0.73916421 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.826 96.826 2 2.1025E-17 94546 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.65 143.95 1038000000 0 269980000 0 0 168570000 0 0 0 167910000 95626000 0 211490000 124450000 5197 2208 4867 47451;47452;47453;47454;47455;47456 60525;60526;60527;60528;60529;60530;60531;60532 60529 7 CSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEK Unmodified 3595.7967 0.79674526 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 1 1 1 151.98 151.98 3 2.0598E-75 154850 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.03 151.36 121200000 0 0 0 0 0 0 0 60489000 0 0 0 60713000 0 5198 2208 4868 47457;47458 60533;60534 60533 2 CSELEEELK Unmodified 1135.5067 0.50670466 1908 P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 45.731 45.731 2 0.00043685 42244 QUIQUE_C1403_190116_001 124.08 93.576 1217900000 135210000 214330000 167300000 163010000 70507000 152190000 124940000 0 25026000 41845000 40119000 39243000 44162000 5199 1908 4869 47459;47460;47461;47462;47463;47464;47465;47466;47467;47468;47469;47470;47471 60535;60536;60537;60538;60539;60540;60541;60542;60543;60544;60545;60546;60547 60538 12 CSELEEELKNVTNNLK Unmodified 1918.9306 0.93060639 1908 P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.89 114.89 3 0.00029089 118699 QUIQUE_C1277_190116_001 81.327 71.797 679980000 0 181620000 0 54396000 54723000 0 0 73583000 65005000 0 55610000 79630000 115420000 5200 1908 4870 47472;47473;47474;47475;47476;47477;47478;47479 60548;60549;60550;60551;60552;60553;60554;60555;60556 60548 7 CSENKLPAELQELPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSR Unmodified 4202.0379 0.037872014 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 131.23 131.23 5 0.0014096 134070 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.372 26.45 47634000 0 0 0 0 0 0 0 47634000 0 0 0 0 0 5201 2266 4871 47480 60557 60557 1 CSEQVQDFTK Unmodified 1240.5394 0.53940177 3477 Q7Z7K0 CMC1 COX assembly mitochondrial protein homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 32.868 32.868 2 0.00072191 27746 QUIQUE_C1277_190116_001 107.21 97.424 72974000 18136000 23024000 0 0 0 14846000 0 0 0 0 0 16968000 0 5202 3477 4872 47481;47482;47483;47484;47485 60558;60559;60560;60561;60562 60559 5 CSESSTLLEK Unmodified 1152.5333 0.53325376 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 26.07 26.07 2 0.0036969 20065 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.456 56.202 33031000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33031000 5203 3596 4873 47486 60563 60563 1 CSGIASAAAAAVEAAR Unmodified 1474.7198 0.71982575 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 93.521 93.521 2;3 0.00096948 96788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.552 64.566 517910000 16748000 0 138820000 23033000 29362000 23103000 29023000 34443000 28890000 15370000 131560000 0 47557000 5204 3124 4874 47487;47488;47489;47490;47491;47492;47493;47494;47495;47496;47497;47498;47499 60564;60565;60566;60567;60568;60569;60570;60571;60572;60573;60574;60575;60576 60575 8 CSGPGLSPGMVR Unmodified 1216.5693 0.56926211 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 46.774 46.774 2 0.0099149 41927 QUIQUE_C1368_190116_001 66.056 48.96 9890400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9890400 0 0 0 5205 2178 4875 47500;47501;47502 60577;60578;60579 60577 3 CSILNYLK Unmodified 1009.5267 0.52665224 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 92.756 92.756 2 0.031742 94851 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.777 46.141 39795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39795000 0 5206 438;2509 4876 47503;47504;47505 60580;60581;60582 60582 3 CSLICLCALQLVSALER Unmodified 2005.0159 0.01587312 3613 Q8N8D7;E5RIL3 NKAIN3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 167.93 167.93 3 0.00020621 172510 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.685 55 35143000 0 0 0 0 0 0 0 0 35143000 0 0 0 0 5207 3613 4877 47506 60583 60583 1 CSLNPEWNETFR Unmodified 1551.6776 0.67762659 1894 P05771;I3L1Z0 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 88.322 88.322 2 0.00047172 91104 QUIQUE_C1576_190116_001 108.47 88.708 145990000 0 0 0 0 0 0 38033000 0 0 0 67668000 40288000 0 5208 1894 4878 47507;47508;47509;47510;47511;47512 60584;60585;60586;60587;60588;60589 60586 4 CSLPAEEDSVLEK Unmodified 1475.6814 0.68137456 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.398 65.398 2 0.018515 64700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.274 33.498 203140000 60083000 0 0 104380000 0 0 0 0 0 0 0 38675000 0 5209 880 4879 47513;47514;47515;47516 60590;60591;60592;60593 60592 4 CSLPATLSR Unmodified 1003.5121 0.51206481 4251 Q9NQ88;A0A0U1RQD1 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes no 0 0 0 1 1 1 41.889 41.889 2 0.0095368 38814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.696 8.3517 90802000 0 31383000 0 0 0 0 37049000 22370000 0 0 0 0 0 5210 4251 4880 47517;47518;47519 60594;60595;60596 60596 3 CSLPVSVGSSAHLSQGLR Unmodified 1853.9418 0.9417802 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 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1004.5325 0.5324659 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.171 25.171 2 0.0063617 18629 QUIQUE_C1403_190116_001 84.568 58.674 1245900000 95553000 70935000 190760000 103910000 107700000 63138000 0 153980000 146020000 32033000 117740000 0 164160000 5220 590 4890 47560;47561;47562;47563;47564;47565;47566;47567;47568;47569;47570 60638;60639;60640;60641;60642;60643;60644;60645;60646;60647;60648;60649;60650;60651;60652;60653;60654 60643 17 CSTSSLLEACTFR Unmodified 1530.6807 0.68066306 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.607 83.607 2 3.8166E-13 85188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.77 160.91 1974100000 110650000 176990000 185190000 216090000 461730000 131620000 136900000 37094000 101030000 33428000 111810000 137770000 133860000 5221 1838 4891 47571;47572;47573;47574;47575;47576;47577;47578;47579;47580;47581;47582;47583 60655;60656;60657;60658;60659;60660;60661;60662;60663;60664;60665;60666;60667;60668;60669;60670;60671;60672 60665 18 CSVCEAPAIAIAVHSQDVSIPHCPAGWR Unmodified 3087.4477 0.44771377 1946 P08572;A0A3B3IS47 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes no 0 0 0 1 108.97 108.97 4 0.033435 113094 QUIQUE_C1368_190116_001 21.052 15.844 67194000 0 0 67194000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5222 1946 4892 47584 60673 60673 1 CSVDFTR Unmodified 883.3858 0.38580166 1977 P09960;B4DEH5 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes no 0 0 0 1 1 29.678 29.678 2 0.039864 24447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.364 62.099 129500000 0 79684000 0 0 0 0 0 49812000 0 0 0 0 0 5223 1977 4893 47585;47586 60674;60675 60675 2 CSVFYGAPSK Unmodified 1114.5117 0.51173046 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 42.374 42.374 2 0.0042594 39673 QUIQUE_C1438_190116_001 81.525 49.17 92505000 0 0 0 0 57797000 0 0 0 0 0 0 34708000 0 5224 290;327;328 4894 47587;47588;47589 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subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 29.952 29.952 2 0.040078 24320 QUIQUE_C1403_190116_001 53.493 42.272 28212000 0 0 0 28212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5232 2911 4901 47633 60727 60727 1 CTELNQAWSSLGK Unmodified 1492.698 0.69802768 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.695 87.695 2 2.0185E-31 90231 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.97 164.74 7642800000 496320000 892710000 558240000 712000000 791480000 445420000 797970000 452920000 425970000 218570000 691080000 610490000 549610000 5233 267;275;3025 4902 47634;47635;47636;47637;47638;47639;47640;47641;47642;47643;47644;47645;47646 60728;60729;60730;60731;60732;60733;60734;60735;60736;60737;60738;60739;60740;60741;60742;60743;60744;60745;60746;60747;60748;60749;60750;60751;60752 60748 25 CTESEEEEVTK Unmodified 1339.5449 0.54494066 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.835 17.835 2 3.5812E-13 10205 QUIQUE_C1576_190116_001 167.12 161.78 1024700000 106380000 131090000 110400000 112360000 102920000 83025000 111030000 31442000 29269000 20017000 63419000 56216000 67142000 5234 2642 4903 47647;47648;47649;47650;47651;47652;47653;47654;47655;47656;47657;47658;47659 60753;60754;60755;60756;60757;60758;60759;60760;60761;60762;60763;60764;60765;60766 60760 14 CTFFQILHHTCQR Unmodified 1746.8083 0.80826361 3653 Q8NFX7 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 3 2 2 2 3 1 2 1 2 64.101 64.101 2;3;4 0.00010129 63411 QUIQUE_C1277_190116_001 109.84 97.822 1219800000 59165000 196030000 145930000 117940000 0 120000000 166660000 81909000 154340000 17574000 0 160280000 0 5235 3653 4904 47660;47661;47662;47663;47664;47665;47666;47667;47668;47669;47670;47671;47672;47673;47674;47675;47676;47677;47678 60767;60768;60769;60770;60771;60772;60773;60774;60775;60776;60777;60778;60779;60780;60781;60782;60783;60784;60785;60786;60787;60788 60768 22 CTGGEVGATSALAPK Unmodified 1417.6871 0.68712864 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.319 39.319 2 3.0585E-13 35888 QUIQUE_C1218_190116_001 138.45 125.49 1147600000 93158000 132450000 139740000 0 80756000 0 0 139570000 97708000 58076000 133670000 151110000 121350000 5236 2304 4905 47679;47680;47681;47682;47683;47684;47685;47686;47687;47688 60789;60790;60791;60792;60793;60794;60795;60796;60797;60798;60799;60800;60801;60802 60789 14 CTIEAGYPGVLSSR Unmodified 1508.7293 0.72932781 2042 P12271 RLBP1 Retinaldehyde-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 77.331 77.331 2 0.0063901 77987 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.395 38.797 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5237 2042 4906 47689 60803 60803 1 CTLACQQFR Unmodified 1182.5274 0.5273973 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.416 35.416 2 0.00039833 31026 QUIQUE_C1576_190116_001 121.74 106.37 462840000 36898000 31710000 46353000 48697000 45507000 18971000 54851000 23380000 27945000 0 31739000 33535000 63249000 5238 1654 4907 47690;47691;47692;47693;47694;47695;47696;47697;47698;47699;47700;47701 60804;60805;60806;60807;60808;60809;60810;60811;60812;60813;60814;60815 60810 11 CTLHPNDSLAMEGPLSR Unmodified 1896.8822 0.88221641 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 70.974 70.974 3 0.00021241 70888 QUIQUE_C1403_190116_001 56.407 40.008 66427000 0 0 42358000 24068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5239 57 4908 47702;47703 60816;60817 60817 2 CTLPLTGK Unmodified 888.47389 0.47388839 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.757 34.757 2 0.0073084 31248 QUIQUE_C1218_190116_001 98.523 69.147 3225800000 321580000 316360000 302640000 258460000 270780000 310000000 340390000 289720000 343290000 136810000 0 0 335800000 5240 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60845 5 CTSCGVVAENYK Unmodified 1386.5908 0.59078542 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.833 28.833 2 0.00034857 24108 QUIQUE_C1218_190116_001 105.98 99.94 84314000 0 25940000 20161000 20375000 0 0 0 0 0 0 0 17839000 0 5243 4323 4912 47732;47733;47734;47735;47736;47737;47738;47739 60846;60847;60848;60849;60850;60851;60852;60853 60846 8 CTSNPAEIAMFLEPLDLPNKR Unmodified 2415.1927 0.19265151 3901 Q96LD8;H3BTK5 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes no 0 0 1 2 1 141.03 141.03 3 0.0017362 143905 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.03 48.535 48323000 0 0 0 0 0 0 0 48323000 0 0 0 0 0 5244 3901 4913 47740;47741;47742 60854;60855;60856 60856 2 CTTDHISAAGPWLK Unmodified 1555.7453 0.74531222 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 63.251 63.251 2;3 6.0361E-05 63532 QUIQUE_C1218_190116_001 91.62 87.99 3123800000 450670000 527390000 0 371360000 564620000 266580000 0 175490000 278560000 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49279000 37920000 53378000 37470000 33198000 23154000 52532000 92799000 50267000 5247 2524 4916 47754;47755;47756;47757;47758;47759;47760;47761;47762;47763;47764;47765;47766;47767;47768 60871;60872;60873;60874;60875;60876;60877;60878;60879;60880;60881;60882;60883;60884;60885;60886 60872 16 CTVGEITDALKK Unmodified 1333.6912 0.69115139 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 1 58.513 58.513 2;3 0.0052855 56960 QUIQUE_C1368_190116_001 74.849 48.731 75646000 0 0 0 0 0 0 0 0 22145000 0 0 53501000 0 5248 2191 4917 47769;47770;47771;47772 60887;60888;60889;60890 60887 3 CTVVSVPDSLLWR Unmodified 1530.7864 0.78644876 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.49 125.49 2 1.1171E-09 129772 QUIQUE_C1368_190116_001 140.3 121.69 1245400000 130340000 0 166850000 154320000 150680000 87955000 138430000 99783000 0 0 115000000 100990000 101060000 5249 3827 4918 47773;47774;47775;47776;47777;47778;47779;47780;47781;47782 60891;60892;60893;60894;60895;60896;60897;60898;60899;60900;60901;60902;60903;60904;60905;60906;60907 60893 17 CTYIEIDQVPETYAVVLSR Unmodified 2255.1144 0.11438442 2937 Q0VDG4;F8W0M9;C9JID8;H9KVC8;F8WBX0;C9JNS3 SCRN3 Secernin-3 yes no 0 0 0 1 47.994 47.994 5 0.057348 45538 QUIQUE_DMIX8_190116_001 13.037 5.4156 68351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68351000 5250 2937 4919 47783 60908 60908 1 CTYLVLDEADR Unmodified 1353.6235 0.62346575 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 80.735 80.735 2 5.9913E-05 82560 QUIQUE_C1218_190116_001 136.33 112.9 211880000 83579000 0 0 0 0 59632000 68673000 0 0 0 0 0 0 5251 381 4920 47784;47785;47786;47787;47788;47789;47790;47791;47792;47793 60909;60910;60911;60912;60913;60914;60915;60916;60917;60918 60909 10 CVAALAR Unmodified 759.40614 0.40614318 1379 O00154;K7EKP8;Q6ZUV0 ACOT7;ACOT7L Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase;Putative cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase-like yes no 0 0 0 1 19.712 19.712 2 0.022903 12719 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.23 55.478 53553000 0 0 0 0 0 0 0 53553000 0 0 0 0 0 5252 1379 4921 47794 60919 60919 1 CVALAIYYHIK Unmodified 1349.7166 0.71657828 3635 Q8ND76;R4GNF3 CCNY Cyclin-Y yes no 0 0 0 1 81.782 81.782 3 0.033977 82890 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.684 20.306 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5253 3635 4922 47795 60920 60920 1 CVANNQVETLEK Unmodified 1403.6715 0.67147858 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.682 34.682 2 8.5038E-07 30209 QUIQUE_C1576_190116_001 140.49 113.6 908740000 80106000 0 76532000 88732000 71058000 89462000 82731000 59183000 73796000 30170000 88892000 77949000 90131000 5254 2452 4923 47796;47797;47798;47799;47800;47801;47802;47803;47804;47805;47806;47807 60921;60922;60923;60924;60925;60926;60927;60928;60929;60930;60931;60932;60933 60926 13 CVCEQGFK Unmodified 1026.4263 0.42628627 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 20.269 20.269 2 0.020821 13028 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.134 62.132 218860000 0 0 0 0 0 0 0 85926000 102050000 30876000 0 0 0 5255 2233 4924 47808;47809;47810 60934;60935;60936 60936 3 CVDLVIQELINTVR Unmodified 1670.9025 0.90254115 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 162.92 162.92 2 0.027903 168390 QUIQUE_C1368_190116_001 60.598 42.701 9214700 0 0 9214700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5256 2569 4925 47811 60937 60937 0 CVDLVVSELATVIK Unmodified 1544.8484 0.84838031 1337 K7EMQ3 DNM2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.75 146.75 2 0.00024612 151170 QUIQUE_C1403_190116_001 102.4 87.727 345030000 0 35008000 66891000 62627000 40182000 36390000 63845000 14762000 0 0 25324000 0 0 5257 1337 4926 47812;47813;47814;47815;47816;47817;47818;47819 60938;60939;60940;60941;60942;60943;60944;60945;60946;60947 60941 10 CVDLYNQAQSK Unmodified 1324.6082 0.60815004 1597 O60861 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes yes 0 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61000;61001;61002;61003;61004;61005;61006;61007;61008;61009;61010;61011;61012;61013;61014;61015;61016;61017;61018;61019;61020;61021;61022;61023;61024 61002 23 CVDMVVSELTATIR Oxidation (M) 1608.7851 0.78512813 1240 H7C5U0 DNM1 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 125.98 125.98 2 3.3001E-10 129858 QUIQUE_C1277_190116_001 132.76 105.02 106660000 0 40720000 0 0 37330000 0 0 0 0 28612000 0 0 0 5262 1240 4929 47893;47894;47895;47896;47897;47898 61025;61026;61027;61028;61029;61030 61026 709 4 CVEDPETGLCLLPLTDK Unmodified 1958.9329 0.93291458 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 3 3 2 1 3 3 2 1 2 2 2 2 2 140.34 140.34 2;3 1.9637E-37 133104 QUIQUE_C1277_190116_001 159.52 148.57 3798100000 368400000 402790000 437380000 17734000 378430000 199340000 461550000 35402000 304840000 167080000 377430000 355870000 291800000 5263 3117 4930 47899;47900;47901;47902;47903;47904;47905;47906;47907;47908;47909;47910;47911;47912;47913;47914;47915;47916;47917;47918;47919;47920;47921;47922;47923;47924;47925;47926 61031;61032;61033;61034;61035;61036;61037;61038;61039;61040;61041;61042;61043;61044;61045;61046;61047;61048;61049;61050;61051;61052;61053;61054;61055;61056;61057;61058;61059;61060;61061;61062;61063 61035 32 CVEDPETGLR Unmodified 1174.5288 0.52883709 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 35.918 35.918 2 2.1363E-11 31535 QUIQUE_C1368_190116_001 160.88 146.72 3851400000 269380000 314930000 362230000 146930000 249730000 0 351280000 391680000 402300000 172440000 484710000 419950000 285870000 5264 3117 4931 47927;47928;47929;47930;47931;47932;47933;47934;47935;47936;47937;47938;47939 61064;61065;61066;61067;61068;61069;61070;61071;61072;61073;61074;61075;61076;61077;61078;61079;61080;61081;61082 61068 19 CVEELPEWNFDGSSTLQSEGSNSDMYLVPAAMFR Oxidation (M) 3881.6859 0.68589095 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 1 0 2 1 1 163.17 163.17 3 3.3711E-10 169428 QUIQUE_C1368_190116_001 61.112 56.206 75145000 0 39876000 25878000 0 0 9390600 0 0 0 0 0 0 0 5265 2086 4932 47940;47941;47942;47943 61083;61084;61085;61086 61085 1420;1421 3 CVEELPEWNFDGSSTLQSEGSNSDMYLVPAAMFR Unmodified 3865.691 0.69097633 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.5 167.5 3 1.5455E-46 174806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.77 104.87 291810000 0 23115000 34345000 0 0 0 0 0 0 0 150320000 84033000 0 5266 2086 4932 47944;47945;47946;47947 61087;61088;61089;61090 61089 4 CVELDCWK Unmodified 1108.4682 0.46815109 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.824 65.824 2 0.031416 66367 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 39.689 179000000 17407000 33291000 31415000 0 22767000 18505000 20230000 13861000 0 0 0 21525000 0 5267 4250 4933 47948;47949;47950;47951;47952;47953;47954;47955 61091;61092;61093;61094;61095;61096;61097;61098 61091 8 CVELGAYGQAVR Unmodified 1321.6449 0.6448699 4449 Q9UID3;E9PJ36;E9PKX7;E9PRV0 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes no 0 0 0 1 1 59.784 59.784 2 0.0091907 59106 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.692 16.879 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5268 4449 4934 47956;47957 61099;61100 61100 2 CVELVHEEMQR Unmodified 1428.649 0.648969 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 37.519 37.519 2;3 0.001104 33554 QUIQUE_C1218_190116_001 63.727 47.59 427190000 95614000 120250000 72365000 96540000 0 0 0 0 0 42426000 0 0 0 5269 1108;1404 4935 47958;47959;47960;47961;47962;47963;47964 61101;61102;61103;61104;61105;61106;61107 61101 7 CVELVHEEMQR Oxidation (M) 1444.6439 0.64388362 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 1 0 1 23.34 23.34 2 0.019363 16541 QUIQUE_C1277_190116_001 72.643 58.873 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5270 1108;1404 4935 47965 61108 61108 1 CVFELPAENDKPHDVEINK Unmodified 2253.0736 0.073582234 1719 O95292 VAPB Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C yes yes 0 0 1 1 73.653 73.653 3 0.0055836 74349 QUIQUE_C1218_190116_001 59.182 51.484 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5271 1719 4936 47966 61109 61109 1 CVFEMPNENDKLNDMEPSK Unmodified 2295.981 0.98100376 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 1 1 1 90.086 90.086 3 9.8774E-06 91665 QUIQUE_C1403_190116_001 77.39 73.439 64084000 0 31065000 0 33019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5272 4369 4937 47967;47968 61110;61111 61111 1 CVFNGNAGACR Unmodified 1224.5128 0.51280987 1550 O43761;Q96L30;H3BNA6 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 27.005 27.005 2 8.9197E-05 21971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.55 120.49 209940000 0 0 0 28534000 21471000 0 30745000 31002000 0 0 42311000 0 55882000 5273 1550 4938 47969;47970;47971;47972;47973;47974;47975;47976 61112;61113;61114;61115;61116;61117;61118;61119 61117 8 CVFSDHGLLTTVAYK Unmodified 1709.8447 0.84469192 2348 P32189;Q14409 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.078 93.078 3 0.0013469 96561 QUIQUE_C1218_190116_001 43.557 31.272 202450000 44611000 0 45138000 45073000 27019000 0 40605000 0 0 0 0 0 0 5274 2348 4939 47977;47978;47979;47980;47981 61120;61121;61122;61123;61124;61125 61120 6 CVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPR Unmodified 2246.1365 0.13651684 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 116.54 116.54 2 1.0514E-112 120188 QUIQUE_C1277_190116_001 200.55 194.07 31228000 0 31228000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5275 4500 4940 47982 61126 61126 1 CVIALQEGDVDTLDR Unmodified 1702.8196 0.81959938 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.122 96.122 2 8.43E-30 98383 QUIQUE_C1277_190116_001 167.3 132.61 959880000 109830000 140100000 119200000 141110000 99188000 89811000 120810000 40215000 0 32235000 0 67380000 0 5276 2250 4941 47983;47984;47985;47986;47987;47988;47989;47990;47991;47992;47993 61127;61128;61129;61130;61131;61132;61133;61134;61135;61136;61137;61138 61128 12 CVIALQEK Unmodified 959.511 0.51100218 2369 P35221;G3XAM7 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 38.532 38.532 2 0.045295 34400 QUIQUE_C1368_190116_001 57.177 36.478 148170000 0 0 148170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5277 2369 4942 47994 61139 61139 1 CVICGGPGVSDAYYCK Unmodified 1804.7583 0.75826145 3450 Q7RTV0 PHF5A PHD finger-like domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 74.086 74.086 2 4.5634E-10 73803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.01 121 35570000 0 0 0 0 0 0 0 35570000 0 0 0 0 0 5278 3450 4943 47995 61140 61140 1 CVIFEIPGAPDDEAVR Unmodified 1786.856 0.85598488 3876 Q96I25 RBM17 Splicing factor 45 yes yes 0 0 0 1 1 122.61 122.61 2 0.00073827 126270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.451 35.49 57934000 0 0 57934000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5279 3876 4944 47996;47997 61141;61142 61142 2 CVIHIHTLATAAVSSMK Unmodified 1837.9543 0.95425914 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 2 3 3 2 1 1 2 1 3 2 2 2 1 71.952 71.952 2;3;4 7.0858E-53 72004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.15 177.7 2878600000 71746000 239360000 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1 1 2 1 1 85.863 85.863 2 0.00020621 86548 QUIQUE_C1563_190116_001 93.096 68.258 1093700000 81621000 82794000 197030000 134300000 76963000 77659000 78086000 46897000 63212000 33865000 72638000 74744000 73933000 5282 2463 4946 48029;48030;48031;48032;48033;48034;48035;48036;48037;48038;48039;48040;48041;48042;48043;48044;48045 61178;61179;61180;61181;61182;61183;61184;61185;61186;61187;61188;61189;61190;61191;61192;61193;61194;61195;61196;61197;61198;61199;61200 61189 21 CVLAEVPR Unmodified 942.49569 0.49568646 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.046 48.046 2 0.0049318 45170 QUIQUE_C1277_190116_001 107.32 64.251 3126200000 420200000 628690000 470750000 0 481890000 0 0 0 0 190680000 0 454970000 479040000 5283 1745 4947 48046;48047;48048;48049;48050;48051;48052 61201;61202;61203;61204;61205;61206;61207;61208;61209 61202 8 CVLHFKPCGLFGK Unmodified 1561.7898 0.78976 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;E7ET92 OSBPL2 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.28 103.28 3 1.5252E-19 105266 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.61 85.538 1155500000 82519000 95361000 108310000 122560000 0 73789000 126100000 77852000 77599000 29592000 110630000 131180000 119980000 5286 2524 4950 48067;48068;48069;48070;48071;48072;48073;48074;48075;48076;48077;48078 61225;61226;61227;61228;61229;61230;61231;61232;61233;61234;61235;61236;61237;61238 61236 14 CVLNEGMPIYR Unmodified 1350.6424 0.64242706 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 80.376 80.376 2 0.0052386 82783 QUIQUE_C1438_190116_001 69.423 53.458 45987000 0 0 0 0 45987000 0 0 0 0 0 0 0 0 5287 2334 4951 48079;48080;48081;48082 61239;61240;61241;61242 61241 4 CVLNFKPCGLFGK Unmodified 1538.7738 0.77377558 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding 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CVSSPHFQVAER Unmodified 1415.6616 0.66158259 917;1163;3180;3119 Q15173;Q16537;E9PFR3;Q14738;H0Y8C4;H7C5Q9;H0YJ75;Q13362;Q96B13;H0YN84 PPP2R5B;PPP2R5E;PPP2R5D;PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform no no 0 0 0 1 1 31.995 31.995 2;3 0.0080138 26681 QUIQUE_C1368_190116_001 67.726 53.607 84648000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84648000 0 0 5301 3119;3180;917;1163 4964 48171;48172 61339;61340 61339 2 CVSTLLDLIQTK Unmodified 1389.7538 0.75375164 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 3 1 2 1 1 1 1 2 2 143.74 143.74 2;3 3.5409E-12 135654 QUIQUE_C1277_190116_001 164.64 145.38 7599000000 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61366 2 CVVHIHTPAGAAVSAMK Unmodified 1747.8862 0.88617958 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 45.612 45.612 2;3;4 5.5316E-104 43148 QUIQUE_C1277_190116_001 217.09 199.61 3197200000 288820000 446600000 196480000 322470000 454600000 270110000 243720000 191330000 165270000 81474000 116870000 213940000 205520000 5305 854 4968 48195;48196;48197;48198;48199;48200;48201;48202;48203;48204;48205;48206;48207;48208;48209;48210;48211;48212;48213;48214;48215;48216;48217 61368;61369;61370;61371;61372;61373;61374;61375;61376;61377;61378;61379;61380;61381;61382;61383;61384;61385;61386;61387;61388;61389;61390;61391;61392;61393;61394 61370 26 CVVHIHTPAGAAVSAMK Oxidation (M) 1763.8811 0.8810942 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 31.61 31.61 2;3 1.0048E-05 26832 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.055 86.216 210320000 0 0 0 0 0 0 0 75261000 0 57808000 77247000 0 0 5306 854 4968 48218;48219;48220;48221;48222;48223;48224 61395;61396;61397;61398;61399;61400;61401;61402 61396 500 7 CVVILPDSVR Unmodified 1156.6274 0.62742892 1988 P0DN79;P35520;H7C2H4 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 76.824 76.824 2 0.004314 77657 QUIQUE_C1277_190116_001 94.302 80.096 455110000 0 59512000 66316000 0 0 54021000 81385000 0 0 30694000 48505000 54986000 59693000 5307 1988 4969 48225;48226;48227;48228;48229;48230;48231;48232;48233;48234;48235 61403;61404;61405;61406;61407;61408;61409;61410;61411;61412;61413 61403 8 CVVTGEDGSESEATVNVK Unmodified 1879.8469 0.84693634 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 2 2 3 2 1 1 1 1 1 1 1 1 49.397 49.397 2 2.2142E-141 47002 QUIQUE_C1218_190116_001 274.8 260.02 2183000000 94369000 244720000 213570000 285750000 241520000 161450000 194960000 101600000 117840000 88813000 124350000 119410000 194660000 5308 1218;28;2057 4970 48236;48237;48238;48239;48240;48241;48242;48243;48244;48245;48246;48247;48248;48249;48250;48251;48252;48253 61414;61415;61416;61417;61418;61419;61420;61421;61422;61423;61424;61425;61426;61427;61428;61429;61430;61431;61432;61433;61434;61435;61436;61437;61438;61439;61440;61441 61415 28 CVVVGDGAVGK Unmodified 1059.5383 0.53827956 2776;2701;2830;2118 P60953;Q5JYX0;A0A3B3IRV0;F8WET9;B1AH79;G3V4H1;G3V476;Q9H4E5;P17081;P63000;P15153;B1AH78;P84095 CDC42;RHOQ;RAC2;RHOJ;RAC1;RHOG Cell division control protein 42 homolog;Rho-related GTP-binding protein RhoJ;Rho-related GTP-binding protein RhoQ;Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1;Ras-related C3 botulinum toxin substrate 2;Rho-related GTP-binding protein RhoG no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.737 28.737 2 0.0027057 23123 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.679 44.324 8251700000 481100000 670210000 0 738900000 579610000 638260000 873010000 634190000 772300000 314980000 928600000 652430000 968100000 5309 2701;2118;2776;2830 4971 48254;48255;48256;48257;48258;48259;48260;48261;48262;48263;48264;48265;48266 61442;61443;61444;61445;61446;61447;61448;61449;61450;61451;61452;61453;61454 61450 12 CWAGSLWLFK Unmodified 1266.6219 0.62194961 3991 Q9BQA1 WDR77 Methylosome protein 50 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.89 141.89 2 0.0015158 148462 QUIQUE_C1438_190116_001 96.711 74.625 353720000 19185000 23598000 44861000 25593000 27749000 22834000 32024000 25275000 25030000 0 30063000 39760000 37747000 5310 3991 4972 48267;48268;48269;48270;48271;48272;48273;48274;48275;48276;48277;48278 61455;61456;61457;61458;61459;61460;61461;61462;61463;61464;61465;61466;61467 61459 13 CWEVQDSGQTIPK Unmodified 1546.7086 0.70859237 2811 P78406;E9PQ57;E9PPG9;B0QZ36;B0QZ37 RAE1 mRNA export factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.6 65.6 2 0.00023948 65022 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 117.11 509310000 0 62971000 52638000 49409000 43094000 40402000 57318000 0 31228000 17292000 40997000 47281000 66678000 5311 2811 4973 48279;48280;48281;48282;48283;48284;48285;48286;48287;48288;48289;48290 61468;61469;61470;61471;61472;61473;61474;61475;61476;61477;61478;61479;61480;61481 61469 13 CWFLAWNPAGTLLASCGGDR Unmodified 2251.0303 0.030277631 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 1 1 164.36 164.36 2 0.0035644 169698 QUIQUE_C1368_190116_001 70.412 65.317 14670000 0 0 14670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5312 1682 4974 48291;48292;48293 61482;61483;61484 61483 3 CWIFSCLNVMR Unmodified 1484.6727 0.67268133 3028 Q13867;K7ES02 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 0 1 1 140.34 140.34 2 0.0058148 147640 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.993 56.503 22797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22797000 0 0 5313 3028 4975 48294;48295 61485;61486;61487 61485 3 CWYIHDLLK Unmodified 1246.6169 0.61686423 4588 Q9Y3C8 UFC1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 93.545 93.545 2;3 0.00027211 95330 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.502 81.693 758310000 35410000 41975000 40980000 29778000 90044000 44866000 39814000 35982000 120640000 17795000 165850000 38048000 57140000 5314 4588 4976 48296;48297;48298;48299;48300;48301;48302;48303;48304;48305;48306;48307;48308;48309;48310;48311 61488;61489;61490;61491;61492;61493;61494;61495;61496;61497;61498;61499;61500;61501;61502;61503;61504;61505 61497 17 CYELCDTYPALLVVPYR Unmodified 2131.0118 0.0118336 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 1 155.13 155.13 2;3 0.022364 175513 QUIQUE_C1218_190116_001 43.628 30.861 82791000 10119000 0 27364000 0 0 0 0 0 0 0 0 45307000 0 5315 3003 4977 48312;48313;48314 61506;61507;61508 61506 3 CYEMASHLR Oxidation (M) 1181.4958 0.49576282 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 2 1 15.01 15.01 2;3 0.011922 7449 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.579 47.682 464150000 15084000 0 0 96971000 0 32938000 0 0 177600000 113530000 0 0 28035000 + 5316 1926 4978 48315;48316;48317;48318;48319;48320;48321;48322 61509;61510;61511;61512;61513;61514;61515;61516 61515 1153 7 CYEMASHLR Unmodified 1165.5008 0.5008482 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 25.662 25.662 2;3 0.00048658 19511 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.623 73.968 4476500000 205240000 430980000 296490000 237890000 300480000 223330000 277230000 473420000 191610000 212160000 623930000 218120000 785570000 + 5317 1926 4978 48323;48324;48325;48326;48327;48328;48329;48330;48331;48332;48333;48334;48335;48336;48337;48338;48339;48340;48341;48342;48343;48344;48345;48346;48347 61517;61518;61519;61520;61521;61522;61523;61524;61525;61526;61527;61528;61529;61530;61531;61532;61533;61534;61535;61536;61537;61538;61539;61540;61541;61542 61539 22 CYEMASHLRR Unmodified 1321.602 0.60195923 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 1 1 19.658 19.658 3 0.025909 12660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.282 34.769 60197000 0 0 0 0 0 0 0 60197000 0 0 0 0 0 + 5318 1926 4979 48348 61543 61543 1 CYGLHAFIVPIR Unmodified 1444.7649 0.76492545 3107 Q15067 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 95.475 95.475 3 0.0006565 99214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.143 62.398 154380000 0 0 0 0 35074000 0 0 0 0 0 32334000 42176000 44798000 5319 3107 4980 48349;48350;48351;48352 61544;61545;61546;61547 61545 4 CYLEDGASK Unmodified 1041.4437 0.44371047 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 24.166 24.166 2 0.023713 17251 QUIQUE_C1368_190116_001 78.334 62.672 47877000 0 0 0 0 47877000 0 0 0 0 0 0 0 0 5320 3455 4981 48353;48354;48355;48356;48357;48358;48359;48360 61548;61549;61550;61551;61552;61553;61554;61555 61548 7 CYLTMTQALEAR Unmodified 1455.685 0.68502015 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 92.283 92.283 2 0.000536 89534 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.97 81.645 76945000 0 0 0 0 56898000 0 0 0 0 20047000 0 0 0 5321 3053 4982 48361;48362;48363 61556;61557;61558 61558 3 CYQLPPGAR Unmodified 1060.5124 0.51239916 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.813 35.813 2 0.020983 31100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.407 83.534 269500000 0 0 47246000 25578000 0 26839000 0 0 0 0 58124000 44659000 67049000 5322 2061 4983 48364;48365;48366;48367;48368;48369;48370;48371 61559;61560;61561;61562;61563;61564;61565;61566 61563 8 CYQSEFGR Unmodified 1045.4287 0.42872911 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 29.865 29.865 2 0.047236 24271 QUIQUE_C1576_190116_001 56.27 50.327 157350000 0 0 0 0 0 0 157350000 0 0 0 0 0 0 5323 2161 4984 48372 61567 61567 1 CYSAEVVTLWYRPPDVLFGAK Unmodified 2470.2355 0.2355026 2844 Q00535 CDK5 Cyclin-dependent-like kinase 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 147.38 147.38 3 0.0014727 151827 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.874 59.428 150730000 0 32409000 0 0 0 0 54257000 0 0 0 0 0 64060000 5324 2844 4985 48373;48374;48375;48376 61568;61569;61570;61571 61570 2 CYSCGEFGHIQK Unmodified 1484.6177 0.61766887 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 34.353 34.353 2;3 0.00050764 28962 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.52 99.218 581070000 22338000 0 0 28650000 22562000 0 0 98014000 101030000 19015000 59656000 121430000 108380000 5325 2756 4986 48377;48378;48379;48380;48381;48382;48383;48384;48385;48386;48387;48388;48389;48390 61572;61573;61574;61575;61576;61577;61578;61579;61580;61581;61582;61583;61584;61585;61586 61585 15 CYTQNIDTLER Unmodified 1411.6402 0.64017845 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.229 57.229 2 0.00045729 53544 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.86 104.59 3310900000 250670000 385320000 323230000 0 254970000 223440000 386670000 251840000 203800000 109230000 302100000 266530000 353120000 5326 3549 4987 48391;48392;48393;48394;48395;48396;48397;48398;48399;48400;48401;48402 61587;61588;61589;61590;61591;61592;61593;61594;61595;61596;61597;61598 61595 7 CYVDMSTVDADTVTELAQVIVSR Unmodified 2571.2197 0.21965412 1335 K7EMM8;Q49A26 GLYR1 Putative oxidoreductase GLYR1 yes no 0 0 0 1 169.04 169.04 3 3.7995E-12 170572 QUIQUE_C1563_190116_001 80.303 76.048 8504200 0 0 0 0 0 8504200 0 0 0 0 0 0 0 5327 1335 4988 48403 61599 61599 1 CYVLSQNLR Unmodified 1151.5757 0.5757277 2207 P23229;C9JXX7 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 52.724 52.724 2 0.020062 51227 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 56.552 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5328 2207 4989 48404;48405 61600;61601 61600 2 DAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFR Unmodified 2853.2617 0.26171317 4461 Q9UJW0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.7 155.7 3 2.0981E-23 160417 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.45 109.58 554200000 58857000 55547000 56811000 59402000 41175000 51454000 53800000 0 38762000 16977000 42485000 42785000 36139000 5329 4461 4990 48406;48407;48408;48409;48410;48411;48412;48413;48414;48415;48416;48417 61602;61603;61604;61605;61606;61607;61608;61609;61610;61611;61612;61613;61614 61609 12 DAAAPAEPQAQHTR Unmodified 1461.6961 0.69605384 1677 O76024 WFS1 Wolframin yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 14.254 14.254 2;3 1.4623E-05 5865 QUIQUE_C1563_190116_001 120.55 90.777 463650000 40860000 26373000 80834000 55589000 0 158000000 68720000 33279000 0 0 0 0 0 5330 1677 4991 48418;48419;48420;48421;48422;48423;48424;48425;48426;48427;48428;48429 61615;61616;61617;61618;61619;61620;61621;61622;61623;61624;61625;61626 61622 12 DAAAVLVSR Unmodified 900.50288 0.50288033 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 43.938 43.938 2 0.0094055 41561 QUIQUE_C1438_190116_001 76.064 38.506 35734000 0 0 0 0 35734000 0 0 0 0 0 0 0 0 5331 1283 4992 48430;48431;48432;48433;48434;48435 61627;61628;61629;61630;61631;61632;61633 61632 7 DAACYVCWAFAR Unmodified 1488.6278 0.62783962 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 129.44 129.44 2 0.022377 134125 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4999 48462 61660 61660 1 DAALATALGDKK Unmodified 1172.6401 0.6401021 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.216 35.216 2 0.00079031 31170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.29 62.088 1626800000 104710000 108360000 135880000 128570000 136270000 106150000 143860000 115810000 133230000 44619000 206300000 126570000 136480000 5339 2171 5000 48463;48464;48465;48466;48467;48468;48469;48470;48471;48472;48473;48474;48475 61661;61662;61663;61664;61665;61666;61667;61668;61669;61670;61671;61672;61673;61674;61675;61676 61670 15 DAALAVAEAMADK Unmodified 1274.6177 0.61765209 2476 P46060;H0Y4Q3 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.87 105.87 2 0.0022781 108522 QUIQUE_C1403_190116_001 87.363 70.337 122140000 31301000 0 0 27715000 24945000 19201000 18975000 0 0 0 0 0 0 5340 2476 5001 48476;48477;48478;48479;48480;48481 61677;61678;61679;61680;61681;61682 61679 5 DAALAVAEAMADKAELEK Unmodified 1844.919 0.91897907 2476 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DAASLESQLQDTQELLQEETR Unmodified 2403.1401 0.14014147 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 152 152 2;3 1.0089E-75 157371 QUIQUE_C1368_190116_001 223.72 189.03 1744500000 43895000 128740000 221360000 140420000 249280000 120490000 63406000 152620000 121950000 74574000 191900000 235900000 0 5347 2379 5008 48506;48507;48508;48509;48510;48511;48512;48513;48514;48515;48516;48517;48518;48519;48520;48521;48522;48523;48524;48525;48526;48527;48528 61712;61713;61714;61715;61716;61717;61718;61719;61720;61721;61722;61723;61724;61725;61726;61727;61728;61729;61730;61731;61732;61733;61734;61735;61736;61737 61717 25 DAATIMQPYFTSNGLVTK Unmodified 1955.9663 0.96626362 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 131 131 2 8.4787E-25 133823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.6 91.342 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5348 3053 5009 48529 61738 61738 1 DAATVTQMHFLTGQGR Unmodified 1731.8363 0.8362525 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 78.909 78.909 2;3 2.4888E-06 80804 QUIQUE_C1438_190116_001 133.16 108.31 1753400000 83179000 106960000 151230000 120780000 190440000 107000000 227340000 0 113570000 48124000 148710000 233330000 222700000 5349 57 5010 48530;48531;48532;48533;48534;48535;48536;48537;48538;48539;48540;48541;48542;48543;48544;48545 61739;61740;61741;61742;61743;61744;61745;61746;61747;61748;61749;61750;61751;61752;61753;61754;61755 61744 15 DAATVTQMHFLTGQGR Oxidation (M) 1747.8312 0.83116712 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 1 0 1 1 53.756 53.756 3 0.0018894 52620 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.842 77.062 123030000 0 0 0 0 0 0 0 0 53759000 0 0 0 69269000 5350 57 5010 48546;48547 61756;61757 61756 45 1 DAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDPSVVVR Unmodified 4562.4025 0.40245664 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 2 1 173.18 173.18 4 0.023152 180330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.929 16.971 38093000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38093000 0 0 5351 3090 5011 48548 61758 61758 1 DAAYCFMSDHYLEVLR Unmodified 1988.8761 0.8760684 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 132.46 132.46 2;3 2.4488E-29 136826 QUIQUE_DMIX8_190116_001 161.1 144.75 3619100000 259340000 383220000 313070000 252510000 235500000 286240000 306480000 228130000 291580000 77339000 330990000 316990000 337730000 5352 1688 5012 48549;48550;48551;48552;48553;48554;48555;48556;48557;48558;48559;48560;48561;48562;48563;48564;48565;48566;48567;48568;48569;48570;48571;48572;48573;48574;48575;48576 61759;61760;61761;61762;61763;61764;61765;61766;61767;61768;61769;61770;61771;61772;61773;61774;61775;61776;61777;61778;61779;61780;61781;61782;61783;61784;61785;61786;61787;61788;61789;61790;61791 61791 33 DAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGR Unmodified 2745.2679 0.26794172 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 142.37 142.37 3;4 1.6616E-10 145656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.625 75.936 518400000 0 0 0 0 0 0 0 154290000 42391000 0 155960000 117550000 48204000 5353 1688 5013 48577;48578;48579;48580;48581;48582;48583;48584 61792;61793;61794;61795;61796;61797;61798;61799 61793 8 DACELESGTEPCVVR Unmodified 1720.7396 0.7396345 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 67.618 67.618 2 0.023938 68130 QUIQUE_C1218_190116_001 58.274 49.573 28611000 15350000 0 0 0 0 13262000 0 0 0 0 0 0 0 5354 4517 5014 48585;48586 61800;61801 61800 0 DACFTSLMNTLMTSLPALVQQQGR Oxidation (M) 2697.2924 0.29244191 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 168.67 168.67 2;3 1.3031E-13 172949 QUIQUE_C1218_190116_001 102.48 95.204 215460000 47351000 86143000 0 36179000 29960000 0 0 0 0 15823000 0 0 0 5355 4393 5015 48587;48588;48589;48590;48591;48592 61802;61803;61804;61805;61806;61807 61802 2928;2929 6 DACFTSLMNTLMTSLPALVQQQGR Unmodified 2681.2975 0.29752729 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 176.31 176.31 2;3 3.5652E-201 179839 QUIQUE_DMIX7_190116_001 246.5 231.71 3899800000 3978100 10680000 150740000 28895000 290840000 17594000 296640000 198960000 224030000 0 857170000 1599600000 220670000 5356 4393 5015 48593;48594;48595;48596;48597;48598;48599;48600;48601;48602;48603;48604;48605;48606;48607;48608;48609;48610 61808;61809;61810;61811;61812;61813;61814;61815;61816;61817;61818;61819;61820;61821;61822;61823;61824;61825;61826;61827 61825 20 DADDAVYELDGK Unmodified 1309.5674 0.56739066 2981 Q13243;B4DJK0;B4DUA4;G3V5K8 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 70.895 70.895 2 0.00030253 69628 QUIQUE_C1218_190116_001 115.7 79.756 107420000 30484000 40417000 0 0 0 0 19868000 0 0 16653000 0 0 0 5357 2981 5016 48611;48612;48613;48614;48615;48616;48617;48618 61828;61829;61830;61831;61832;61833;61834;61835 61828 8 DADDAVYELNGK Unmodified 1308.5834 0.58337508 2982;259 A0A0D9SEM4;Q08170;Q13247 SRSF4;SRSF6 Serine/arginine-rich splicing factor 4;Serine/arginine-rich splicing factor 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.924 65.924 2 8.9542E-07 65480 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.17 125.5 206530000 0 33570000 0 0 0 0 0 25627000 33899000 28628000 35911000 48897000 0 5358 259;2982 5017 48619;48620;48621;48622;48623;48624;48625;48626 61836;61837;61838;61839;61840;61841;61842;61843;61844 61844 9 DADETKEWIEEK Unmodified 1491.6729 0.67291837 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 53.956 53.956 2;3 6.9863E-37 52515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.3 165.56 8840900000 0 183440000 0 0 859740000 106810000 296620000 1051900000 1461500000 39377000 1888100000 1200900000 1752500000 5359 267;275;3025 5018 48627;48628;48629;48630;48631;48632;48633;48634;48635;48636;48637;48638;48639;48640;48641;48642 61845;61846;61847;61848;61849;61850;61851;61852;61853;61854;61855;61856;61857;61858;61859;61860;61861;61862;61863;61864;61865;61866 61854 21 DADETKEWIEEKNQALNTDNYGHDLASVQALQR Unmodified 3800.7878 0.78778856 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 115.58 115.58 4 5.8881E-15 117959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.657 71.931 73465000 0 0 0 0 0 0 0 73465000 0 0 0 0 0 5360 267;275;3025 5019 48643 61867;61868 61868 2 DADIGVAEAER Unmodified 1144.536 0.53603095 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3;K7EKW9 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.412 43.412 2 0.0015447 40529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.883 43.881 369500000 0 0 54843000 38161000 63419000 38800000 57821000 0 0 17207000 45076000 0 54174000 5361 3057 5020 48644;48645;48646;48647;48648;48649;48650;48651;48652 61869;61870;61871;61872;61873;61874;61875;61876;61877;61878 61877 7 DADLTDTAQTR Unmodified 1205.5524 0.5524093 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13;E9PLH9 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.954 28.954 2 8.4501E-05 23221 QUIQUE_C1563_190116_001 133.99 100.2 1265000000 78714000 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Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.749 14.749 2 1.1022E-17 7148 QUIQUE_C1218_190116_001 166.29 155.59 380470000 41124000 0 40399000 44717000 42523000 37201000 44172000 0 34995000 15744000 45962000 0 33635000 5365 2630 5024 48671;48672;48673;48674;48675;48676;48677;48678;48679;48680 61898;61899;61900;61901;61902;61903;61904;61905;61906;61907 61898 10 DADVQFLASVLPPDTDPAFFEHLR Unmodified 2699.3231 0.32313164 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2;H0YF31;H0YDA6 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 165.08 165.08 3 1.0498E-08 169447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.717 73.263 679330000 0 0 109530000 0 0 39263000 129340000 78376000 107590000 0 0 108030000 107190000 5366 3418 5025 48681;48682;48683;48684;48685;48686;48687 61908;61909;61910;61911;61912;61913;61914 61914 7 DADVQNFVSFISK Unmodified 1468.7198 0.71980898 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.3 139.3 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28;Keratin, type I cytoskeletal 25;Keratin, type I cytoskeletal 27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.313 79.313 2 2.7656E-06 76180 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.04 120.87 2732700000 188380000 130060000 104980000 179830000 136220000 126590000 132020000 142280000 176640000 399980000 316730000 335410000 363600000 + 5369 776 5028 48707;48708;48709;48710;48711;48712;48713;48714;48715;48716;48717;48718;48719 61937;61938;61939;61940;61941;61942;61943;61944;61945;61946;61947;61948;61949;61950;61951;61952;61953 61947 16 DAEDAIYGR Unmodified 1008.4512 0.45123869 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.201 45.201 2 0.009538 42048 QUIQUE_C1218_190116_001 75.692 42.05 33500000 33500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5370 2980 5029 48720;48721;48722;48723 61954;61955;61956;61957 61954 4 DAEDALHNLDR Unmodified 1267.5793 0.57929275 1640 Q5JRI1;O75494 SRSF10 Serine/arginine-rich splicing factor 10 yes no 0 0 0 1 1 2 55.723 55.723 2;3 0.0016164 53754 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61987;61988;61989;61990;61991;61992;61993;61994;61995;61996;61997;61998;61999;62000;62001;62002;62003;62004;62005;62006;62007;62008;62009;62010;62011;62012;62013;62014;62015 61998 24 DAEEAISQTIDTIVDMIK Oxidation (M) 2006.9718 0.9718025 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 1 0 2 1 1 1 4 4 2 2 3 2 3 1 2 174.93 174.93 2;3 2.1872E-53 179070 QUIQUE_DMIX3_190116_001 178.15 168.86 1128000000 45171000 23892000 45029000 0 269330000 207530000 78746000 34475000 138810000 22793000 115530000 50797000 95870000 5376 96 5034 48776;48777;48778;48779;48780;48781;48782;48783;48784;48785;48786;48787;48788;48789;48790;48791;48792;48793;48794;48795;48796;48797;48798;48799;48800;48801;48802;48803 62016;62017;62018;62019;62020;62021;62022;62023;62024;62025;62026;62027;62028;62029;62030;62031;62032;62033;62034;62035;62036;62037;62038;62039;62040;62041;62042;62043;62044;62045;62046;62047 62039 67 30 DAEEAISQTIDTIVDMIK Unmodified 1990.9769 0.97688788 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 181.69 181.69 2;3 4.7976E-76 185023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.32 176.85 1005400000 0 5846200 0 6161700 103740000 0 20687000 35996000 103100000 0 660270000 21671000 47942000 5377 96 5034 48804;48805;48806;48807;48808;48809;48810;48811;48812;48813 62048;62049;62050;62051;62052;62053;62054;62055;62056;62057 62053 9 DAEELEKWIQEK Unmodified 1516.7409 0.74093835 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 104.3 104.3 2;3 0.00035869 105923 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.65 80.327 249460000 0 0 0 0 0 0 0 249460000 0 0 0 0 0 5378 267;275;3025 5035 48814;48815 62058;62059 62058 2 DAEEWFFTK Unmodified 1171.5186 0.51858998 763 CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2 KRT14 Keratin, type I cytoskeletal 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.69 119.69 2 0.020857 123289 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.582 52.508 158530000 0 0 0 11280000 0 14741000 0 31445000 0 33459000 29633000 37967000 0 + 5379 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108.66 931530000 58442000 78704000 132320000 75168000 123320000 105350000 161960000 0 0 0 0 0 196250000 5399 2465 5056 48954;48955;48956;48957;48958;48959;48960;48961 62242;62243;62244;62245;62246;62247;62248;62249;62250 62247 9 DAFLEQFR Unmodified 1024.4978 0.49779495 4270 Q9NRH3 TUBG2 Tubulin gamma-2 chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.319 97.319 2 0.0049318 100935 QUIQUE_C1218_190116_001 107.32 80.715 73535000 20349000 15769000 21127000 16289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5400 4270 5057 48962;48963;48964;48965 62251;62252;62253;62254;62255 62251 5 DAFLGSFLYEYSR Unmodified 1566.7355 0.73545904 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 153.46 153.46 2 6.1134E-08 158386 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.36 146.76 2136900000 132590000 192930000 129830000 127390000 178580000 187800000 217270000 107850000 254730000 345780000 76567000 99157000 86473000 + 5401 770 5058 48966;48967;48968;48969;48970;48971;48972;48973;48974;48975;48976;48977;48978;48979 62256;62257;62258;62259;62260;62261;62262;62263;62264;62265;62266;62267;62268;62269;62270;62271;62272 62266 16 DAFLVFR Unmodified 866.46504 0.46503826 4651;4652 Q9Y6D5;Q9Y6D6 ARFGEF2;ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2;Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 107.64 107.64 2 0.026664 109458 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.593 71.356 55656000 15513000 0 0 0 0 0 16058000 16673000 0 7412600 0 0 0 5402 4651;4652 5059 48980;48981;48982;48983 62273;62274;62275;62276 62275 4 DAFPEAIIVKPSDIFGR Unmodified 1873.9938 0.993799 3197 Q16795;A0A3B3ISG8 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 141.51 141.51 3 0.00028435 145244 QUIQUE_C1403_190116_001 80.545 71.13 467390000 44708000 43590000 0 45220000 0 71911000 0 29802000 75940000 28372000 72445000 0 55407000 5403 3197 5060 48984;48985;48986;48987;48988;48989;48990;48991;48992;48993;48994 62277;62278;62279;62280;62281;62282;62283;62284;62285;62286;62287;62288 62280 10 DAFPVAGQK Unmodified 931.47633 0.47633123 2647;2646 P54725;K7ENJ0;K7ELW1;P54727;Q5W0S5;Q5W0S4 RAD23A;RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog A;UV excision repair protein RAD23 homolog B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.041 34.041 2 0.0086526 28753 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.178 55.687 1771900000 260080000 176030000 185620000 0 189820000 139400000 157190000 74814000 136380000 101550000 167980000 0 183070000 5404 2646;2647 5061 48995;48996;48997;48998;48999;49000;49001;49002;49003;49004;49005 62289;62290;62291;62292;62293;62294;62295;62296;62297;62298;62299;62300;62301;62302 62299 10 DAFQNAYLELGGLGER Unmodified 1751.8479 0.84786304 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.35 143.35 2 1.2615E-13 148866 QUIQUE_C1218_190116_001 138.02 120.99 213100000 50287000 0 71934000 42207000 0 0 48668000 0 0 0 0 0 0 5405 1872 5062 49006;49007;49008;49009 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Unmodified 1358.7558 0.75580056 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.41 163.41 2 2.3838E-05 165498 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.28 101.98 506390000 37388000 43494000 37178000 41819000 44926000 29757000 47699000 43239000 47728000 14112000 45361000 31547000 42140000 5408 3713 5065 49027;49028;49029;49030;49031;49032;49033;49034;49035;49036;49037;49038;49039 62343;62344;62345;62346;62347;62348;62349;62350;62351;62352;62353;62354;62355;62356;62357 62351 15 DAGAPTYMYEFQYR Unmodified 1710.7348 0.73480712 2205 P23141 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 114.07 114.07 2 0.0038583 117128 QUIQUE_C1403_190116_001 67.153 49.786 21496000 0 0 0 21496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5409 2205 5066 49040 62358 62358 1 DAGDKDKEQELSEEDK Unmodified 1834.8068 0.80684567 2976 Q13200;C9JPC0 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 17.139 17.139 3 1.5711E-18 9299 QUIQUE_C1563_190116_001 116.96 91.37 297910000 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1 93.81 93.81 2;3 1.2509E-15 97346 QUIQUE_C1218_190116_001 159.08 138.13 1480500000 40548000 161170000 183220000 143900000 192550000 106630000 87281000 188630000 182260000 18121000 60988000 61039000 54174000 5413 2178 5070 49060;49061;49062;49063;49064;49065;49066;49067;49068;49069;49070;49071;49072;49073;49074;49075;49076;49077;49078;49079 62379;62380;62381;62382;62383;62384;62385;62386;62387;62388;62389;62390;62391;62392;62393;62394;62395;62396;62397;62398 62379 20 DAGEGLLAVQITDQEGKPK Unmodified 1968.0164 0.016384931 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.822 86.822 3 5.9632E-05 88559 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.155 67.363 275870000 0 0 0 31463000 0 29179000 0 30884000 63741000 24033000 50093000 0 46477000 5414 1628 5071 49080;49081;49082;49083;49084;49085;49086 62399;62400;62401;62402;62403;62404;62405 62402 7 DAGEGLLTVQILDPEGKPK Unmodified 1979.0575 0.057521464 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 1 116.92 116.92 3 0.0033436 120563 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5076 49128 62455;62456 62455 2 DAGMAEAWLCSQEPLVR Unmodified 1931.887 0.88696744 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.95 138.95 2 3.5879E-10 143300 QUIQUE_C1277_190116_001 152.4 139.2 209330000 0 47830000 0 30645000 43780000 33430000 0 0 19773000 0 0 33877000 0 5420 1472 5077 49129;49130;49131;49132;49133;49134 62457;62458;62459;62460;62461;62462 62457 6 DAGMQLQGYR Oxidation (M) 1153.5186 0.51860675 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 35.554 35.554 2 0.00017191 31983 QUIQUE_C1218_190116_001 121.09 96.937 2243800000 112050000 237760000 139400000 90379000 96270000 192420000 97647000 205520000 251720000 166440000 336510000 159920000 157790000 5421 1788 5078 49135;49136;49137;49138;49139;49140;49141;49142;49143;49144;49145;49146;49147;49148;49149;49150;49151;49152;49153 62463;62464;62465;62466;62467;62468;62469;62470;62471;62472;62473;62474;62475;62476;62477;62478;62479;62480;62481;62482 62463 1001 19 DAGMQLQGYR Unmodified 1137.5237 0.52369213 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 52.78 52.78 2 0.00016294 50751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.74 103.08 6128300000 0 860280000 776930000 576470000 0 571020000 642100000 548130000 608970000 0 801510000 742910000 0 5422 1788 5078 49154;49155;49156;49157;49158;49159;49160;49161;49162;49163 62483;62484;62485;62486;62487;62488;62489;62490;62491;62492;62493;62494;62495;62496 62491 12 DAGPLLISLK Unmodified 1025.6121 0.61209643 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 0 1 1 2 105.01 105.01 1;2 0.0076651 106699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.965 60.901 1140200000 0 0 0 0 0 0 480360000 429690000 0 230150000 0 0 0 5423 2327 5079 49164;49165;49166;49167 62497;62498;62499;62500 62498 2 DAGQCIDPYITVSVK Unmodified 1664.808 0.80797206 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 104.02 104.02 2 0.00038612 108249 QUIQUE_C1218_190116_001 80.522 66.558 125450000 47702000 0 63321000 0 0 0 0 0 0 14426000 0 0 0 5424 3807 5080 49168;49169;49170 62501;62502;62503 62501 3 DAGQISGLNVLR Unmodified 1241.6728 0.67279921 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 90.056 90.056 1;2 6.4888E-05 92426 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.85 105.43 1220200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 782800000 0 437390000 5425 2415 5081 49171;49172;49173;49174 62504;62505;62506;62507 62507 3 DAGTELTGHLVPHHDGLR Unmodified 1923.9551 0.95512208 4232 Q9HCU4 CELSR2 Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.444 54.444 3 0.00025489 53216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.423 47.506 197540000 0 0 45479000 0 29885000 0 40924000 0 42148000 0 0 0 39106000 5426 4232 5082 49175;49176;49177;49178;49179 62508;62509;62510;62511;62512;62513 62512 4 DAGTIAGLNVLR Unmodified 1198.667 0.66698555 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.49 101.49 2 9.7811E-28 105540 QUIQUE_C1218_190116_001 177.7 145.77 45512000000 3260800000 3976900000 3357500000 3347400000 3601800000 3602700000 3713200000 2681100000 2974100000 2108900000 4672700000 3917600000 4297300000 5427 2010 5083 49180;49181;49182;49183;49184;49185;49186;49187;49188;49189;49190;49191;49192 62514;62515;62516;62517;62518;62519;62520;62521;62522;62523;62524;62525;62526;62527;62528;62529;62530;62531;62532;62533;62534;62535;62536;62537;62538;62539;62540;62541;62542;62543;62544;62545;62546;62547;62548;62549;62550;62551;62552 62515 39 DAGTIAGLNVMR Unmodified 1216.6234 0.62340617 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 90.498 90.498 2 6.0785E-20 92424 QUIQUE_C1277_190116_001 169.44 108.85 543360000 0 407350000 0 0 0 0 0 0 0 136020000 0 0 0 5428 2007 5084 49193;49194 62553;62554 62553 2 DAGTITGLNVLR Unmodified 1228.6776 0.67755023 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.907 97.907 2 8.2511E-07 95552 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.75 93.556 12556000000 875300000 919330000 955980000 738350000 912980000 798680000 900080000 964120000 1282400000 672330000 1232100000 1023500000 1281200000 5429 2643 5085 49195;49196;49197;49198;49199;49200;49201;49202;49203;49204;49205;49206;49207 62555;62556;62557;62558;62559;62560;62561;62562;62563;62564;62565;62566;62567;62568;62569;62570;62571;62572;62573;62574 62568 20 DAGVIAGLNVLR Unmodified 1196.6877 0.68772099 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.53 114.53 2 0.00028992 117022 QUIQUE_C1563_190116_001 116.05 96.689 19605000000 1274900000 1541700000 1567700000 1674700000 1669300000 1660200000 1647800000 1321400000 1468100000 1099200000 1531200000 1568300000 1580300000 5430 282;2362 5086 49208;49209;49210;49211;49212;49213;49214;49215;49216;49217;49218;49219;49220 62575;62576;62577;62578;62579;62580;62581;62582;62583;62584;62585;62586;62587;62588;62589;62590;62591;62592;62593;62594 62584 20 DAGYEFDICFTSVQK Unmodified 1778.7822 0.78215124 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 0 0 7 1 3 5 1 7 10 12 22 15 9 145.42 145.42 2 1.443E-08 148851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.68 110.34 2759400000 184690000 34392000 65733000 0 185320000 30518000 257050000 226290000 301130000 0 735600000 463070000 275560000 5431 2139 5087 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62595;62596;62597;62598;62599;62600;62601;62602;62603;62604;62605;62606;62607;62608;62609;62610;62611;62612;62613;62614;62615;62616;62617;62618;62619;62620;62621;62622;62623;62624;62625;62626;62627;62628;62629;62630;62631;62632;62633;62634;62635;62636;62637;62638;62639;62640;62641;62642;62643;62644;62645;62646;62647;62648;62649;62650;62651;62652;62653;62654;62655;62656;62657;62658;62659;62660;62661;62662;62663;62664;62665;62666;62667;62668;62669;62670;62671;62672;62673;62674;62675;62676;62677;62678;62679;62680;62681;62682;62683;62684;62685;62686;62687;62688;62689;62690;62691;62692;62693;62694 62636 82 DAGYGGISLAVEGPSK Unmodified 1519.7518 0.75183739 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 89.886 89.886 2 0.0032967 90479 QUIQUE_C1403_190116_001 60.448 47.468 439530000 0 0 0 187440000 0 0 252090000 0 0 0 0 0 0 5432 1628 5088 49313;49314 62695;62696 62695 1 DAGYGGLSLSIEGPSK Unmodified 1549.7624 0.76240208 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 107.05 107.05 2 0.033533 109133 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.659 33.088 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5433 2178 5089 49315 62697 62697 1 DAHIPVVEEHVMGK Unmodified 1559.7766 0.77661235 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 3 1 3 1 1 1 1 53.199 53.199 2;3;4 2.7211E-07 51471 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.11 94.628 1290900000 220310000 166980000 89437000 222740000 107830000 172800000 62209000 174870000 0 24118000 0 49593000 0 5434 2009 5090 49316;49317;49318;49319;49320;49321;49322;49323;49324;49325;49326;49327;49328;49329;49330;49331;49332;49333;49334;49335;49336;49337 62698;62699;62700;62701;62702;62703;62704;62705;62706;62707;62708;62709;62710;62711;62712;62713;62714;62715;62716;62717;62718;62719;62720;62721;62722 62717 23 DAHIPVVEEHVMGK Oxidation (M) 1575.7715 0.77152697 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 37.185 37.185 3 0.0020421 33663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.864 56.26 314540000 0 0 0 0 78116000 98039000 0 138390000 0 0 0 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24.305 24.305 2;3 0.00015166 17906 QUIQUE_C1438_190116_001 128.91 84.458 2206400000 238250000 132700000 187580000 189290000 243610000 82942000 212830000 111250000 201590000 29923000 250920000 138840000 186650000 5438 2026 5093 49351;49352;49353;49354;49355;49356;49357;49358;49359;49360;49361;49362;49363;49364;49365;49366;49367;49368;49369;49370;49371;49372;49373;49374 62737;62738;62739;62740;62741;62742;62743;62744;62745;62746;62747;62748;62749;62750;62751;62752;62753;62754;62755;62756;62757;62758;62759;62760;62761;62762;62763;62764;62765;62766 62748 29 DAIAALGLLQK Unmodified 1111.6601 0.66010926 527 A5YKK6;H3BMZ2 CNOT1 CCR4-NOT transcription complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 118.8 118.8 2 0.013575 124730 QUIQUE_C1438_190116_001 59.368 37.921 84415000 0 0 0 0 14629000 11399000 0 0 0 0 22826000 20646000 14915000 5439 527 5094 49375;49376;49377;49378;49379 62767;62768;62769;62770;62771 62767 4 DAIAQAVR Unmodified 842.46102 0.46101552 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 26.633 26.633 1;2 0.001666 20626 QUIQUE_C1438_190116_001 139.92 79.129 16321000000 1352600000 1247100000 1648700000 1479400000 1731800000 1420900000 1612800000 702180000 1290000000 730710000 1734700000 1177100000 192930000 5440 2288 5095 49380;49381;49382;49383;49384;49385;49386;49387;49388;49389;49390;49391;49392;49393;49394;49395;49396;49397;49398 62772;62773;62774;62775;62776;62777;62778;62779;62780;62781;62782;62783;62784;62785;62786;62787;62788;62789;62790 62778 9 DAIELNAANYTVWHFR Unmodified 1918.9326 0.93259572 2525 P49354;E9PQP6;H0YCW1 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 127.87 127.87 3 0.0023792 130616 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.169 42.054 155270000 0 28261000 0 22689000 0 23447000 0 39354000 26433000 15090000 0 0 0 5441 2525 5096 49399;49400;49401;49402;49403;49404 62791;62792;62793;62794;62795;62796 62794 6 DAIFIMTSNVASDEIAQHALQLR Unmodified 2542.285 0.28497199 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;A0A2R8Y602 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 149.89 149.89 3 8.3259E-05 152985 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.882 49.044 91377000 0 0 0 0 0 0 0 21993000 0 0 69384000 0 0 5442 474;436 5097 49405;49406 62797;62798 62797 1 DAIGEFIR Unmodified 919.47633 0.47633123 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 86.935 86.935 2 0.02842 87693 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 38.283 59917000 0 0 0 0 0 31271000 0 18911000 0 9734800 0 0 0 5443 135 5098 49407;49408;49409 62799;62800;62801 62800 3 DAIGISLLK Unmodified 928.55933 0.55933258 3652 Q8NFW8 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.25 100.25 2 0.0089591 103078 QUIQUE_C1277_190116_001 77.318 31.345 600420000 54667000 65149000 65770000 52520000 48362000 59527000 61159000 49480000 42825000 28107000 72855000 0 0 5444 3652 5099 49410;49411;49412;49413;49414;49415;49416;49417;49418;49419;49420 62802;62803;62804;62805;62806;62807;62808;62809;62810;62811;62812 62803 11 DAIHFYNK Unmodified 1006.4872 0.48723027 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.791 35.791 2 0.0048568 30931 QUIQUE_C1563_190116_001 107.59 64.679 2351400000 282050000 284940000 284360000 274570000 216130000 267980000 279030000 0 150040000 140270000 0 0 171970000 5445 2343 5100 49421;49422;49423;49424;49425;49426;49427;49428;49429;49430 62813;62814;62815;62816;62817;62818;62819;62820;62821;62822;62823;62824;62825;62826;62827 62822 15 DAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADR Unmodified 3900.9945 0.99449106 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 1 2 140.84 140.84 4;5 0.0032382 145975 QUIQUE_DMIX8_190116_001 27.923 18.423 108280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 108280000 5446 1005;2027 5101 49431;49432 62828;62829 62829 2 DAILDALENLTAEELK Unmodified 1756.9095 0.90946024 4497 Q9ULZ3;H3BP42 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 171.9 171.9 2;3 4.3363E-07 176244 QUIQUE_C1218_190116_001 116.71 100.85 72777000 14110000 0 0 24285000 14717000 0 0 0 0 5359300 14305000 0 0 5447 4497 5102 49433;49434;49435;49436;49437;49438 62830;62831;62832;62833;62834;62835 62830 5 DAILDALENLTAEELKK Unmodified 1885.0044 0.004423261 4497 Q9ULZ3;H3BP42 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 161.73 161.73 2;3 7.6458E-45 166826 QUIQUE_C1368_190116_001 143.14 113.16 582830000 33695000 24677000 92116000 57625000 40696000 46888000 23220000 56044000 44175000 34388000 80429000 48875000 0 5448 4497 5103 49439;49440;49441;49442;49443;49444;49445;49446;49447;49448;49449;49450;49451;49452;49453 62836;62837;62838;62839;62840;62841;62842;62843;62844;62845;62846;62847;62848;62849;62850;62851;62852 62839 16 DAINQGMDEELER Unmodified 1518.662 0.6620361 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.697 73.697 2 1.7012E-12 74556 QUIQUE_C1576_190116_001 149.96 133.74 1758300000 231460000 177610000 175200000 157020000 107380000 245170000 176380000 54941000 81982000 74482000 109640000 71758000 95280000 5449 2013 5104 49454;49455;49456;49457;49458;49459;49460;49461;49462;49463;49464;49465;49466 62853;62854;62855;62856;62857;62858;62859;62860;62861;62862;62863;62864;62865;62866;62867;62868 62861 16 DAINQGMDEELER Oxidation (M) 1534.657 0.65695073 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 46.62 46.62 2 0.0014738 43580 QUIQUE_C1368_190116_001 110.84 100.01 210280000 0 0 73923000 0 0 60234000 0 0 0 47219000 0 0 28900000 5450 2013 5104 49467;49468;49469;49470 62869;62870;62871;62872 62869 1313 3 DAINQGMDEELERDEK Unmodified 1890.8265 0.82653525 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 64.462 64.462 2;3 1.3514E-129 63910 QUIQUE_C1277_190116_001 240.42 204.71 1930500000 93875000 83996000 118520000 364400000 65492000 76314000 94497000 74276000 439420000 0 118640000 307160000 93919000 5451 2013 5105 49471;49472;49473;49474;49475;49476;49477;49478;49479;49480;49481;49482;49483;49484;49485;49486 62873;62874;62875;62876;62877;62878;62879;62880;62881;62882;62883;62884;62885;62886;62887;62888;62889;62890;62891;62892;62893 62875 21 DAINQGMDEELERDEK Oxidation (M) 1906.8214 0.82144987 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 38.595 38.595 2 1.4338E-08 34545 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.99 97.85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5452 2013 5105 49487;49488 62894;62895 62895 1313 2 DAIPENLPPLTADFAEDK Unmodified 1954.9524 0.95238769 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 134.81 134.81 2 4.969E-05 131112 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.023 77.886 69833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69833000 0 0 0 + 5453 770 5106 49489 62896;62897 62897 2 DAIPENLPPLTADFAEDKDVCK Unmodified 2457.1734 0.17335586 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 120.45 120.45 3 2.9262E-05 116864 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.295 61.286 392040000 104710000 0 0 67707000 66431000 0 0 0 0 153200000 0 0 0 + 5454 770 5107 49490;49491;49492;49493 62898;62899;62900;62901;62902;62903 62902 6 DAIQNPNDIQLQEK Unmodified 1624.8057 0.80566387 4121 Q9H0Q0;C9IYV6;C9JPE5 FAM49A Protein FAM49A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.895 63.895 2 9.1232E-37 62820 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.68 150.19 1706100000 95717000 150230000 109910000 118950000 116090000 134140000 166080000 112000000 122710000 53730000 211330000 153470000 161710000 5455 4121 5108 49494;49495;49496;49497;49498;49499;49500;49501;49502;49503;49504;49505;49506 62904;62905;62906;62907;62908;62909;62910;62911;62912;62913;62914;62915;62916;62917;62918;62919;62920 62912 16 DAISGIGTDEK Unmodified 1104.5299 0.52988294 1936 P08133;E5RK63;E5RI05;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 41.009 41.009 2 1.5299E-12 37318 QUIQUE_C1563_190116_001 163.94 65.907 5981600000 502650000 434800000 838040000 534400000 552690000 556180000 591620000 0 498890000 501060000 0 448570000 522700000 5456 1936 5109 49507;49508;49509;49510;49511;49512;49513;49514;49515;49516;49517;49518;49519 62921;62922;62923;62924;62925;62926;62927;62928;62929;62930;62931;62932;62933;62934;62935;62936;62937;62938;62939 62934 18 DAIVTIVSAMSTIIPPVPLANPENQFR Unmodified 2892.5419 0.54191496 2413 P38405;K7EPE2 GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 176.66 176.66 3;4 1.6803E-18 183488 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.423 72.99 1046700000 29311000 0 67046000 36274000 129520000 104740000 71983000 63048000 136860000 0 147530000 185690000 74728000 5457 2413 5110 49520;49521;49522;49523;49524;49525;49526;49527;49528;49529;49530;49531;49532;49533;49534 62940;62941;62942;62943;62944;62945;62946;62947;62948;62949;62950;62951;62952;62953;62954;62955;62956 62952 16 DALDGPAAEAEPEHSFDGLR Unmodified 2095.9447 0.94467655 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 3 2 1 2 3 5 3 2 2 1 90.73 90.73 2;3 4.0567E-134 92421 QUIQUE_C1277_190116_001 228.25 212.31 2048800000 27142000 151210000 188060000 98355000 96737000 82786000 0 360660000 370060000 208350000 196490000 204690000 64285000 5458 3117 5111 49535;49536;49537;49538;49539;49540;49541;49542;49543;49544;49545;49546;49547;49548;49549;49550;49551;49552;49553;49554;49555;49556;49557;49558;49559;49560;49561 62957;62958;62959;62960;62961;62962;62963;62964;62965;62966;62967;62968;62969;62970;62971;62972;62973;62974;62975;62976;62977;62978;62979;62980;62981;62982;62983;62984;62985;62986;62987;62988;62989;62990;62991 62959 33 DALDGPAAEAEPEHSFDGLRR Unmodified 2252.0458 0.045787579 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 75.943 75.943 4 9.1332E-06 75916 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.086 66.506 307010000 0 0 0 0 0 0 0 182230000 124780000 0 0 0 0 5459 3117 5112 49562;49563 62992;62993;62994 62993 3 DALDQAQQVEK Unmodified 1243.6044 0.60444487 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.883 42.883 2 5.3108E-09 39962 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.96 121.51 541030000 0 0 57372000 73516000 81538000 54079000 88921000 0 0 38514000 78510000 68583000 0 5460 4414 5113 49564;49565;49566;49567;49568;49569;49570;49571 62995;62996;62997;62998;62999;63000;63001;63002 63001 6 DALECLEQAEEIIQQEHSDKEEVR Unmodified 2897.3349 0.33489489 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 133.27 133.27 4 0.0010644 138016 QUIQUE_C1368_190116_001 39.021 32.991 198900000 39829000 40767000 74756000 43552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5461 2986 5114 49572;49573;49574;49575 63003;63004;63005;63006 63005 4 DALEIYK Unmodified 850.44363 0.44363412 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 55.833 55.833 2 0.052195 51273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.616 41.503 92731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92731000 0 0 0 5462 907 5115 49576 63007 63007 1 DALEIYKR Unmodified 1006.5447 0.54474515 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.362 37.362 2 0.01004 33007 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.45 13.498 1875200000 102250000 0 147880000 143440000 113150000 0 169000000 240900000 190220000 41347000 271690000 214340000 240930000 5463 907 5116 49577;49578;49579;49580;49581;49582;49583;49584;49585;49586;49587 63008;63009;63010;63011;63012;63013;63014;63015;63016;63017;63018 63016 9 DALEPGQR Unmodified 884.43519 0.4351947 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 18.885 18.885 2 0.043045 11248 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.604 6.8172 18900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18900000 0 0 0 5464 1928 5117 49588 63019 63019 1 DALFTILHDLRPQDR Unmodified 1808.9533 0.95333116 128 G5E9D8;A0A096LP62;C9J2H1;Q86UX2 ITIH5 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5 yes no 0 0 1 1 1 126.7 126.7 3 0.0048507 133092 QUIQUE_C1438_190116_001 70.98 60.125 19134000 0 0 0 0 19134000 0 0 0 0 0 0 0 0 5465 128 5118 49589;49590 63020;63021 63020 1 DALGAQNASGER Unmodified 1187.5531 0.553078 3877 Q96I59;E9PRK2 NARS2 Probable asparagine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 20.156 20.156 2 0.00061286 13046 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.656 68.968 66032000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29128000 0 36904000 5466 3877 5119 49591;49592 63022;63023 63023 2 DALLDQIR Unmodified 942.51345 0.51344502 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.511 75.511 2 0.020996 76526 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.854 24.956 141250000 0 0 0 38923000 0 30215000 0 0 42451000 0 0 0 29658000 5467 1401 5120 49593;49594;49595;49596 63024;63025;63026;63027 63026 4 DALLLIFANK Unmodified 1116.6543 0.6542956 2394 P36406 TRIM23 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 0.00018305 133805 QUIQUE_C1277_190116_001 143.61 0 484210000 36786000 37587000 46190000 30421000 30461000 51291000 39592000 44045000 48346000 22356000 31520000 28910000 36707000 5468 2394 5121 49597;49598;49599;49600;49601;49602;49603;49604;49605;49606;49607;49608;49609 63028;63029;63030;63031;63032;63033;63034;63035;63036;63037;63038;63039;63040;63041;63042;63043;63044;63045 63030 18 DALLLWCQMK Oxidation (M) 1292.6257 0.62571436 2851;1472;2021;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTB;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.42 107.42 2 0.0011142 110652 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.83 93.568 2091400000 126650000 185180000 129110000 134260000 180760000 100640000 0 192970000 260250000 97227000 231230000 221350000 231800000 5469 2851;2021;1472;754 5122 49610;49611;49612;49613;49614;49615;49616;49617;49618;49619;49620;49621 63046;63047;63048;63049;63050;63051;63052;63053;63054;63055;63056;63057;63058;63059;63060 63058 446 14 DALLLWCQMK Unmodified 1276.6308 0.63079974 2851;1472;2021;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTB;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.89 127.89 2 9.158E-06 124974 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.38 129.11 6931500000 488800000 571320000 434640000 494670000 494500000 309250000 483400000 601120000 715290000 186790000 771890000 657920000 721910000 5470 2851;2021;1472;754 5122 49622;49623;49624;49625;49626;49627;49628;49629;49630;49631;49632;49633;49634 63061;63062;63063;63064;63065;63066;63067;63068;63069;63070;63071;63072;63073;63074;63075;63076;63077;63078;63079;63080 63074 20 DALLSALSIQNYHLECNETK Unmodified 2318.1213 0.12126071 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 125.5 125.5 2;3 4.0772E-117 128639 QUIQUE_DMIX1_190116_001 221.59 204.47 10947000000 687920000 933410000 948210000 728760000 1137300000 626240000 913890000 654550000 822220000 405770000 894640000 1200800000 992930000 5471 2851 5123 49635;49636;49637;49638;49639;49640;49641;49642;49643;49644;49645;49646;49647;49648;49649;49650;49651 63081;63082;63083;63084;63085;63086;63087;63088;63089;63090;63091;63092;63093;63094;63095;63096;63097;63098;63099;63100;63101;63102;63103;63104;63105 63091 25 DALNIETAIK Unmodified 1086.5921 0.59208927 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;A6NMY6;H0YKS4;H0YMM1;H0YKZ7;H0YLV6;H0YMT9;H0YKX9;H0YKL9;H0YMW4;H0YKV8;H0YMD9;H0YNB8;H0YKN4 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.939 81.939 1;2 0.00034896 83891 QUIQUE_C1218_190116_001 152.04 74.723 1269800000 68404000 0 83137000 0 0 69122000 101020000 342360000 0 605730000 0 0 0 5472 1920 5124 49652;49653;49654;49655;49656;49657 63106;63107;63108;63109;63110;63111;63112 63106 3 DALNLAQMQEQTLQLEQQSK Unmodified 2315.1427 0.14272443 1112 H0Y2W2;Q5T2N8;J3QSF3 ATAD3A;ATAD3C ATPase family AAA domain-containing protein 3C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.86 131.86 2;3 5.1963E-32 137315 QUIQUE_C1218_190116_001 168.1 155.94 137440000 0 0 0 0 0 0 26235000 0 36094000 29160000 45947000 0 0 5473 1112 5125 49658;49659;49660;49661;49662;49663 63113;63114;63115;63116;63117;63118 63113 6 DALQGFK Unmodified 777.4021 0.40210366 1948;1373 M0R268;P09012;P08579 SNRPA;SNRPB2 U1 small nuclear ribonucleoprotein A;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' no no 0 0 0 1 41.746 41.746 2 0.050466 38141 QUIQUE_C1218_190116_001 74.517 42.938 81132000 81132000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5474 1373;1948 5126 49664 63119 63119 1 DALQVAQEMK Unmodified 1131.5594 0.55940893 753 C9JY26;Q9BZG1;C9JBG0;Q96PJ7;E7ES60;J3QLC6 RAB34 Ras-related protein Rab-34 yes no 0 0 0 1 1 66.575 66.575 2 0.018905 66702 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.607 49.826 50592000 0 0 0 0 0 0 0 0 20310000 0 30283000 0 0 5475 753 5127 49665;49666 63120;63121 63120 2 DALRPPLQNINSVQLK Unmodified 1805.0159 0.015931421 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 88.374 88.374 3 0.00032991 85162 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.347 69.008 19857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19857000 0 0 0 5476 3037 5128 49667 63122 63122 1 DALSDFFEVESELGR Unmodified 1712.7893 0.78934511 3182 Q16566;D6REY7;D6RE65;D6RCD6 CAMK4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 168.46 168.46 2;3 6.2777E-54 172053 QUIQUE_C1277_190116_001 191.53 177.37 742420000 59674000 83786000 87107000 0 60698000 57051000 68997000 45826000 79796000 15437000 0 122340000 61705000 5477 3182 5129 49668;49669;49670;49671;49672;49673;49674;49675;49676;49677;49678;49679;49680;49681 63123;63124;63125;63126;63127;63128;63129;63130;63131;63132;63133;63134;63135;63136;63137 63126 15 DALSDLALHFLNK Unmodified 1455.7722 0.7721789 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.97 150.97 2;3 1.5733E-28 157588 QUIQUE_C1438_190116_001 196.88 171.49 12952000000 864530000 1010900000 1026900000 957520000 1112300000 942230000 1119400000 917550000 989550000 279750000 1305800000 1025000000 1400600000 5478 2573 5130 49682;49683;49684;49685;49686;49687;49688;49689;49690;49691;49692;49693;49694;49695;49696;49697;49698;49699;49700;49701;49702;49703;49704;49705;49706;49707 63138;63139;63140;63141;63142;63143;63144;63145;63146;63147;63148;63149;63150;63151;63152;63153;63154;63155;63156;63157;63158;63159;63160;63161;63162;63163;63164;63165;63166;63167;63168;63169;63170;63171;63172;63173;63174;63175;63176;63177;63178 63152 34 DALSLEEILR Unmodified 1157.6292 0.62920306 2929 Q08AE8 SPIRE1 Protein spire homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 25.05 25.05 3 0.058769 18471 QUIQUE_C1563_190116_001 26.673 12.466 7599300000 0 0 0 0 3321500000 4277800000 0 0 0 0 0 0 0 5479 2929 5131 49708;49709 63179;63180 63180 2 DALSSVQESQVAQQAR Unmodified 1715.8438 0.84384029 580 B0YIW2;P02656 APOC3 Apolipoprotein C-III yes no 0 0 0 1 1 65.302 65.302 2 4.9079E-130 66075 QUIQUE_C1438_190116_001 237.53 204.8 191800000 0 0 0 0 110420000 0 0 0 0 0 81387000 0 0 5480 580 5132 49710;49711 63181;63182;63183 63181 3 DALVNAVIDSLSAYR Unmodified 1605.8362 0.83623572 1733 O95486 SEC24A Protein transport protein Sec24A yes yes 0 0 0 1 1 1 167.31 167.31 2 3.1296E-13 172357 QUIQUE_C1368_190116_001 126.1 112.75 69755000 0 0 23405000 0 0 0 33623000 0 0 12727000 0 0 0 5481 1733 5133 49712;49713;49714 63184;63185;63186;63187 63184 3 DALVNAVVDSLSAYGSTVSNLQHSALMAPSSLK Unmodified 3344.6922 0.69222061 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 170.69 170.69 3;4 2.7619E-29 172227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.129 78.518 133520000 7441600 0 0 10558000 0 0 50771000 64750000 0 0 0 0 0 5482 1734 5134 49715;49716;49717;49718 63188;63189;63190;63191 63191 4 DALVNAVVDSLSAYGSTVSNLQHSALMAPSSLK Oxidation (M) 3360.6871 0.68713523 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 168.79 168.79 3 9.7153E-75 170677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.37 130.31 285180000 0 0 0 0 0 0 0 63686000 112710000 12700000 46083000 50006000 0 5483 1734 5134 49719;49720;49721;49722;49723 63192;63193;63194;63195;63196 63192 946 5 DALVSGALESTK Unmodified 1189.619 0.6190323 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 63.019 63.019 2 0.064252 62802 QUIQUE_C1576_190116_001 48.561 28.774 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5484 2020 5135 49724 63197 63197 1 DAMPSDANLNSINK Unmodified 1488.6879 0.68785692 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.122 64.122 2 0.00027408 62677 QUIQUE_C1563_190116_001 90.913 73.477 541260000 0 0 67990000 157790000 0 81248000 0 118470000 0 0 0 0 115760000 5485 2915 5136 49725;49726;49727;49728;49729;49730;49731;49732 63198;63199;63200;63201;63202;63203;63204;63205;63206;63207;63208 63203 11 DAMQSFMMPFYLMK Unmodified 1738.7591 0.75911307 537 K7EIJ0;K7ENL2;A6NG10;K7EMC9;Q969T9 WBP2 WW domain-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 168.12 168.12 2 1.5618E-10 170064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.02 116.78 127700000 0 0 0 0 0 0 0 68206000 0 0 0 0 59495000 5486 537 5137 49733;49734 63209;63210 63209 2 DAMQYASESK Oxidation (M) 1144.4707 0.47065351 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.348 16.348 2 0.0026072 8485 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.265 76.73 610130000 40380000 123690000 23946000 60137000 0 0 0 0 114020000 101870000 19387000 126700000 0 5487 50;1314 5138 49735;49736;49737;49738;49739;49740;49741;49742 63211;63212;63213;63214;63215;63216;63217;63218 63218 28 8 DAMQYASESK Unmodified 1128.4757 0.47573888 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.323 30.323 2 2.2724E-05 24879 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.69 125.17 5960500000 552570000 529560000 504800000 620970000 465480000 462830000 602540000 339970000 383890000 176330000 455820000 376720000 489050000 5488 50;1314 5138 49743;49744;49745;49746;49747;49748;49749;49750;49751;49752;49753;49754;49755 63219;63220;63221;63222;63223;63224;63225;63226;63227;63228;63229;63230;63231;63232;63233;63234;63235;63236 63231 15 DAMTAQNTGISTLYR Unmodified 1640.7828 0.78281994 855 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 85.864 85.864 2 1.0921E-05 87064 QUIQUE_C1403_190116_001 101.71 84.798 358370000 88818000 71332000 0 57951000 0 0 0 0 76327000 0 0 0 63942000 5489 855 5139 49756;49757;49758;49759;49760 63237;63238;63239;63240;63241 63239 5 DANLYISGLPR Unmodified 1217.6404 0.64043645 3152 Q15717;M0QZR9;M0R055 ELAVL1 ELAV-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.229 96.229 2 0.00020843 98831 QUIQUE_C1277_190116_001 123.63 102.72 1401600000 123830000 120500000 147570000 95768000 98374000 107400000 102150000 105090000 99809000 47816000 146500000 113640000 93196000 5490 3152 5140 49761;49762;49763;49764;49765;49766;49767;49768;49769;49770;49771;49772;49773 63242;63243;63244;63245;63246;63247;63248;63249;63250;63251;63252;63253;63254;63255 63243 13 DANNGNLQLR Unmodified 1113.5527 0.55268407 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.5 31.5 2 0.00013216 25784 QUIQUE_C1368_190116_001 121.62 95.882 697690000 81533000 96588000 101220000 0 0 0 77229000 98595000 103580000 43695000 0 95245000 0 5491 1890 5141 49774;49775;49776;49777;49778;49779;49780;49781 63256;63257;63258;63259;63260;63261;63262;63263 63258 5 DANTQVHTLR Unmodified 1153.584 0.5839842 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 16.143 16.143 2;3 0.0065521 8075 QUIQUE_C1277_190116_001 54.094 47.075 113890000 0 40705000 0 54400000 0 0 0 0 0 18789000 0 0 0 5492 3921 5142 49782;49783;49784;49785;49786 63264;63265;63266;63267;63268;63269 63265 6 DAPELGYAK Unmodified 962.47091 0.4709115 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 39.602 39.602 2 0.042881 35649 QUIQUE_C1403_190116_001 52.716 25.191 38525000 0 0 0 38525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5493 3660 5143 49787 63270 63270 1 DAPQDFHPDR Unmodified 1196.521 0.52104959 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 23.57 23.57 3 0.019194 16203 QUIQUE_C1277_190116_001 37.968 29.436 74748000 29197000 45551000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5494 2178 5144 49788;49789 63271;63272 63272 2 DAPSGIGSIFLSASELEDGSEEMGQGAVSSSPR Unmodified 3266.4885 0.488495 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 162.26 162.26 3 3.5235E-21 169486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.418 75.206 184180000 0 0 58076000 30701000 0 0 0 0 0 0 95404000 0 0 5495 1452 5145 49790;49791;49792 63273;63274;63275 63275 3 DAPWTASSSEK Unmodified 1177.5251 0.52513192 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C3D0 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 36.852 36.852 2 0.048316 32851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.033 24.733 26001000 0 0 0 0 0 0 0 0 26001000 0 0 0 0 5496 2 5146 49793 63276 63276 1 DAQELYAAGENR Unmodified 1335.6055 0.6055075 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.957 47.957 2 4.7505E-19 45195 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49807;49808;49809;49810;49811;49812;49813;49814;49815;49816;49817;49818;49819;49820;49821;49822 63290;63291;63292;63293;63294;63295;63296;63297;63298;63299;63300;63301;63302;63303;63304;63305 63303 16 DAQIFIQK Unmodified 961.52328 0.52328142 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 51.403 51.403 2 0.0077002 49025 QUIQUE_C1368_190116_001 97.068 22.652 751100000 89340000 129770000 119450000 88129000 129650000 93024000 101740000 0 0 0 0 0 0 5500 1849 5150 49823;49824;49825;49826;49827;49828;49829 63306;63307;63308;63309;63310;63311;63312;63313 63309 8 DAQIGWIQTVEDLHER Unmodified 1908.933 0.93298965 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 124.52 124.52 3 0.00089626 128258 QUIQUE_C1277_190116_001 50.787 46.946 186240000 40560000 30572000 0 37679000 55983000 0 0 0 0 21443000 0 0 0 5501 4148 5151 49830;49831;49832;49833;49834;49835 63314;63315;63316;63317;63318;63319;63320 63315 6 DAQQSSSPAADNLR Unmodified 1458.6699 0.66989867 3044 Q14139;B7Z7P0 UBE4A Ubiquitin conjugation factor E4 A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.928 24.928 2 4.9088E-07 18192 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.09 121.37 224530000 36927000 0 41603000 0 53654000 0 0 0 0 15009000 0 24543000 52791000 5502 3044 5152 49836;49837;49838;49839;49840;49841 63321;63322;63323;63324;63325;63326;63327 63327 7 DAQVVQVVLDGLSNILK Unmodified 1810.02 0.020013746 1420 O00629;H7C4F6 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 176.01 176.01 2;3 2.2916E-17 182809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.34 125.23 4174900000 201440000 163250000 217200000 49177000 229180000 463980000 386050000 250400000 688280000 11285000 473540000 561360000 479720000 5503 1420 5153 49842;49843;49844;49845;49846;49847;49848;49849;49850;49851;49852;49853;49854;49855;49856;49857;49858;49859;49860;49861;49862;49863;49864;49865;49866 63328;63329;63330;63331;63332;63333;63334;63335;63336;63337;63338;63339;63340;63341;63342;63343;63344;63345;63346;63347;63348;63349;63350;63351;63352;63353;63354;63355;63356 63351 27 DASDDLDDLNFFNQK Unmodified 1755.7588 0.75877326 2160 P20042 EIF2S2 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.71 142.71 2 3.3939E-18 145515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.57 166.99 487780000 33599000 43143000 27285000 45125000 41888000 34684000 40325000 33984000 56475000 9141600 32122000 47148000 42859000 5504 2160 5154 49867;49868;49869;49870;49871;49872;49873;49874;49875;49876;49877;49878;49879 63357;63358;63359;63360;63361;63362;63363;63364;63365;63366;63367;63368;63369;63370;63371;63372 63367 15 DASDQNFDYMFK Unmodified 1479.5976 0.59764493 2164 P20337 RAB3B Ras-related protein Rab-3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 109.97 109.97 2 0.00017399 113782 QUIQUE_C1368_190116_001 125.75 96.274 783600000 0 115520000 115780000 97525000 0 87421000 0 0 92230000 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63403;63404;63405;63406;63407;63408;63409;63410;63411;63412;63413 63404 11 DASIFQWR Unmodified 1021.4981 0.49812931 648 G3V195;B7WPE2;Q32P44;H7C355 EML3 Echinoderm microtubule-associated protein-like 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.66 107.66 2 0.015753 112898 QUIQUE_C1438_190116_001 84.244 60.815 15919000 0 0 0 0 15919000 0 0 0 0 0 0 0 0 5511 648 5160 49916;49917;49918;49919;49920;49921 63414;63415;63416;63417;63418;63419 63416 6 DASIVGFFDDSFSEAHSEFLK Unmodified 2347.0645 0.064457335 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 3 3 3 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 161.11 161.11 2;3 8.0289E-65 165139 QUIQUE_C1277_190116_001 168.2 159.18 6451600000 834920000 751720000 826420000 518720000 680260000 67930000 700610000 236640000 327220000 246100000 369840000 495810000 395440000 5512 2308 5161 49922;49923;49924;49925;49926;49927;49928;49929;49930;49931;49932;49933;49934;49935;49936;49937;49938;49939;49940;49941;49942;49943;49944;49945;49946 63420;63421;63422;63423;63424;63425;63426;63427;63428;63429;63430;63431;63432;63433;63434;63435;63436;63437;63438;63439;63440;63441;63442;63443;63444;63445;63446;63447;63448;63449;63450;63451;63452;63453;63454;63455 63425 30 DASLMVTNDGATILK Unmodified 1547.7865 0.78650834 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 103.21 103.21 2 5.5658E-14 105213 QUIQUE_C1368_190116_001 142.08 118.77 54524000 54524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5513 2810 5162 49947;49948;49949;49950;49951;49952;49953;49954;49955;49956;49957 63456;63457;63458;63459;63460;63461;63462;63463;63464;63465;63466 63460 11 DASLMVTNDGATILK Oxidation (M) 1563.7814 0.78142296 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 87.756 87.756 2 0.00040242 84374 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.676 75.573 70230000 0 0 0 0 0 0 0 37741000 0 32489000 0 0 0 5514 2810 5162 49958;49959;49960 63467;63468;63469 63469 2256 3 DASLVFK Unmodified 778.4225 0.42250475 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 53.128 53.128 2 0.039849 51417 QUIQUE_C1368_190116_001 83.377 17.705 31647000 0 0 31647000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5515 2718 5163 49961 63470;63471 63470 2 DASLVVTTSGDHK Unmodified 1328.6572 0.65720872 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;H7C0R2 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.604 26.604 2 4.2689E-10 20504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.99 110.48 412650000 34591000 35751000 32315000 23860000 32042000 36981000 49104000 26956000 25155000 17944000 36578000 24596000 36774000 5516 716 5164 49962;49963;49964;49965;49966;49967;49968;49969;49970;49971;49972;49973;49974 63472;63473;63474;63475;63476;63477;63478;63479;63480;63481;63482;63483;63484;63485 63483 14 DASSQGFLPHFQHFATQAIHVGQDPEQWTSR Unmodified 3521.6501 0.65011329 2352 P32929 CTH Cystathionine gamma-lyase yes yes 0 0 0 1 130.31 130.31 4 0.065952 135161 QUIQUE_DMIX8_190116_001 14.978 10.874 67066000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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5520 2851 5168 49978;49979;49980;49981;49982;49983;49984;49985;49986;49987;49988;49989;49990;49991;49992;49993;49994;49995;49996;49997;49998;49999;50000;50001;50002;50003;50004;50005;50006 63489;63490;63491;63492;63493;63494;63495;63496;63497;63498;63499;63500;63501;63502;63503;63504;63505;63506;63507;63508;63509;63510;63511;63512;63513;63514;63515;63516;63517;63518;63519;63520;63521;63522;63523;63524;63525;63526;63527;63528;63529;63530;63531;63532;63533;63534;63535;63536;63537;63538;63539;63540;63541;63542;63543;63544;63545;63546;63547;63548 63493 60 DASVPLIDVTNLPTPR Unmodified 1706.9203 0.9202997 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 2 1 133 133 2 0.0069105 137869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.343 37.711 39767000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39767000 5521 3797 5169 50007;50008;50009 63549;63550;63551 63551 3 DATHDEAVQALK Unmodified 1296.631 0.63099397 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 29.733 29.733 2;3 6.9669E-07 24183 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974.50327 0.50327426 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.274 53.274 2 0.00011524 51896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.01 96.016 3547700000 329360000 245860000 375620000 256060000 213700000 282960000 232390000 253570000 296610000 195080000 340570000 240840000 285100000 5525 1153 5173 50031;50032;50033;50034;50035;50036;50037;50038;50039;50040;50041;50042;50043 63574;63575;63576;63577;63578;63579;63580;63581;63582;63583;63584;63585;63586;63587;63588;63589;63590;63591 63589 18 DATNVAAAFEEAVR Unmodified 1462.7052 0.70522155 2577 P51151 RAB9A Ras-related protein Rab-9A yes yes 0 0 0 1 125.83 125.83 2 0.00081981 132411 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.114 72.761 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5526 2577 5174 50044 63592 63592 1 DATNVGDEGGFAPNILENK Unmodified 1959.9174 0.91739917 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 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63716;63717;63718;63719;63720;63721;63722;63723 63721 8 DAVALCELFNWLEK Unmodified 1706.8338 0.83379288 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 172.12 172.12 2;3 7.8592E-29 175540 QUIQUE_C1277_190116_001 174.1 155.35 1316900000 0 104050000 37632000 114760000 76563000 60602000 107740000 79197000 168800000 21358000 255980000 203500000 86660000 5532 4259 5180 50130;50131;50132;50133;50134;50135;50136;50137;50138;50139;50140;50141;50142;50143;50144;50145;50146 63724;63725;63726;63727;63728;63729;63730;63731;63732;63733;63734;63735;63736;63737;63738;63739;63740 63725 16 DAVDWVHYK Unmodified 1131.5349 0.53490874 2552 P49902;Q5JUV4;Q5JUV3 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.384 65.384 2;3 0.016045 64588 QUIQUE_C1403_190116_001 67.169 40.039 516360000 89800000 52183000 0 41564000 43276000 26558000 44630000 55147000 0 13090000 61416000 0 88696000 5533 2552 5181 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63789;63790;63791;63792;63793;63794;63795;63796;63797 63790 9 DAVLLLFANK Unmodified 1102.6386 0.63864553 2134 P18085;C9JAK5;C9JPM4;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.42 128.42 2 0.0021417 130704 QUIQUE_C1563_190116_001 105.57 89.274 1304500000 122220000 114740000 150620000 111650000 0 137590000 130530000 40695000 126320000 69826000 129610000 71854000 98886000 5538 2134 5186 50198;50199;50200;50201;50202;50203;50204;50205;50206;50207;50208;50209 63798;63799;63800;63801;63802;63803;63804;63805;63806;63807;63808;63809;63810;63811;63812;63813 63804 16 DAVLLVFANK Unmodified 1088.623 0.62299547 2827;2828 P84085;C9J1Z8;P84077;P61204;F5H423 ARF5;ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 5;ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 no no 0 0 0 1 2 1 1 2 3 2 1 2 1 3 2 2 112.27 112.27 2 4.7495E-05 117980 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.61 109.52 8005600000 842280000 758470000 645620000 682420000 536190000 619910000 693310000 402110000 507420000 699190000 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Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 127.88 127.88 2;3 8.4105E-06 131927 QUIQUE_C1277_190116_001 116.71 99.8 2011600000 204900000 231240000 187950000 191240000 174020000 188160000 83371000 150140000 119290000 84513000 151720000 109940000 135140000 5541 2537 5189 50237;50238;50239;50240;50241;50242;50243;50244;50245;50246;50247;50248;50249;50250;50251;50252;50253;50254;50255;50256;50257;50258;50259;50260;50261 63880;63881;63882;63883;63884;63885;63886;63887;63888;63889;63890;63891;63892;63893;63894;63895;63896;63897;63898;63899;63900;63901;63902;63903;63904;63905;63906;63907;63908;63909;63910;63911;63912 63883 32 DAVSGMGVIVHIIEK Oxidation (M) 1582.8389 0.83887826 2537 P49720 PSMB3 Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 1 0 2 1 1 1 87.851 87.851 3 0.0010414 89026 QUIQUE_C1368_190116_001 62.055 51.774 155430000 0 81872000 31409000 0 19761000 0 0 0 0 22386000 0 0 0 5542 2537 5189 50262;50263;50264;50265;50266 63913;63914;63915;63916;63917 63915 1984 5 DAVSGMGVIVHIIEKDK Unmodified 1809.9659 0.96586969 2537 P49720 PSMB3 Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 0 1 1 121.64 121.64 3 0.0006253 124235 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.809 55.694 100510000 0 0 0 0 0 0 0 100510000 0 0 0 0 0 5543 2537 5190 50267 63918 63918 1 DAVSNTTNQLESK Unmodified 1405.6685 0.66850169 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.964 45.964 2 4.5224E-08 43308 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.64 136.47 819290000 72417000 95919000 83100000 72130000 97696000 85698000 83482000 50203000 84540000 0 0 94102000 0 5544 3490 5191 50268;50269;50270;50271;50272;50273;50274;50275;50276;50277;50278 63919;63920;63921;63922;63923;63924;63925;63926;63927;63928;63929;63930;63931 63927 13 DAVTYTEHAK Unmodified 1133.5353 0.53530267 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 16.188 16.188 2;3 0.0001513 8288 QUIQUE_C1277_190116_001 120.87 84.108 2945600000 120860000 296290000 0 0 0 141930000 0 513220000 712660000 659350000 0 501320000 0 5545 2762 5192 50279;50280;50281;50282;50283;50284;50285;50286 63932;63933;63934;63935;63936;63937;63938;63939;63940 63933 8 DAVTYTEHAKR Unmodified 1289.6364 0.6364137 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 1 1 12.771 12.771 3 0.053013 4990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.995 26.676 1360900 0 0 0 0 0 0 0 1360900 0 0 0 0 0 5546 2762 5193 50287 63941 63941 1 DAVVQHSQLAAAVENLK Unmodified 1791.9479 0.94791144 1585 O60645;D6RB59 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 86.596 86.596 2;3 6.8656E-13 88003 QUIQUE_C1403_190116_001 99.021 89.616 500840000 42999000 51012000 41459000 56586000 45997000 37443000 75327000 0 0 26569000 43371000 43489000 36592000 5547 1585 5194 50288;50289;50290;50291;50292;50293;50294;50295;50296;50297;50298;50299;50300 63942;63943;63944;63945;63946;63947;63948;63949;63950;63951;63952;63953;63954;63955 63945 14 DAVVYPILVEFTR Unmodified 1520.8239 0.82388012 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 157.32 157.32 2;3 8.814E-06 152109 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.51 109.13 985240000 108970000 112350000 103180000 110460000 0 93695000 92845000 56363000 92893000 31914000 0 91174000 91400000 5548 89 5195 50301;50302;50303;50304;50305;50306;50307;50308;50309;50310;50311;50312;50313;50314;50315;50316;50317;50318;50319;50320 63956;63957;63958;63959;63960;63961;63962;63963;63964;63965;63966;63967;63968;63969;63970;63971;63972;63973;63974;63975;63976;63977;63978;63979 63975 24 DAWEIPR Unmodified 885.43447 0.43446642 1305;2048;1934 J3QRU1;P07947;P12931;P07948;H0Y3C5;J3KPD6;F6SF04;P08631 YES1;SRC;LYN;HCK Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src;Tyrosine-protein kinase Lyn;Tyrosine-protein kinase HCK no no 0 0 0 1 75.177 75.177 2 0.053305 75324 QUIQUE_C1277_190116_001 73.039 49.067 58886000 0 58886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5549 1305;2048;1934 5196 50321 63980;63981 63980 2 DAWVQAIESQILASLQSCESSK Unmodified 2449.1795 0.17950387 876;4521 E7EUN2;A0A087X1U1;F5GXM9;H7C0A7;Q9UPQ3 AGAP1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 173.39 173.39 3 0.0002125 178396 QUIQUE_C1576_190116_001 50.055 46.899 25313000 0 0 0 0 0 0 8460700 0 0 0 0 16853000 0 5550 876;4521 5197 50322;50323 63982;63983 63982 2 DAWWAEIR Unmodified 1045.4981 0.49812931 3524 Q86YS7;H0YGU7 C2CD5 C2 domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 119.48 119.48 2 0.037693 124049 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.999 32.426 12928000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12928000 5551 3524 5198 50324 63984 63984 1 DAYCSEVK Unmodified 970.4066 0.40659669 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 19.999 19.999 2 0.022385 13137 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.255 38.761 315780000 0 0 0 0 0 0 0 202220000 113560000 0 0 0 0 5552 2483 5199 50325;50326 63985;63986 63985 2 DAYELQEVIGSGATAVVQAALCK Unmodified 2392.1944 0.19442565 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 170.76 170.76 3 0.0016017 175081 QUIQUE_C1218_190116_001 37.817 35.909 26022000 26022000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5553 4417 5200 50327 63987 63987 1 DAYELQEVIGSGATAVVQAALCKPR Unmodified 2645.3483 0.34830053 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 162.84 162.84 2;3;4 1.0295E-36 166836 QUIQUE_C1403_190116_001 137.16 129.88 2106300000 144960000 187300000 173540000 149420000 149610000 127080000 187190000 147250000 202040000 5408600 206700000 158020000 267790000 5554 4417 5201 50328;50329;50330;50331;50332;50333;50334;50335;50336;50337;50338;50339;50340;50341;50342;50343;50344;50345;50346;50347;50348;50349;50350 63988;63989;63990;63991;63992;63993;63994;63995;63996;63997;63998;63999;64000;64001;64002;64003;64004;64005;64006;64007;64008;64009;64010;64011;64012;64013;64014 63999 25 DAYQVILDGVK Unmodified 1219.6449 0.64485312 1073 G3V1C3;Q9BZZ5;E9PQK6 API5 Apoptosis inhibitor 5 yes no 0 0 0 1 111.11 111.11 2 0.0074138 107956 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.499 40.687 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5555 1073 5202 50351 64015 64015 1 DAYSGGAVNLYHVR Unmodified 1520.7372 0.73719038 2276 P28074 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 62.714 62.714 2;3 2.8072E-05 62524 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.53 100.86 2299200000 0 146490000 154120000 0 327940000 174200000 152430000 265130000 203350000 70953000 283080000 242320000 279230000 5556 2276 5203 50352;50353;50354;50355;50356;50357;50358;50359;50360;50361;50362;50363;50364;50365;50366;50367;50368;50369 64016;64017;64018;64019;64020;64021;64022;64023;64024;64025;64026;64027;64028;64029;64030;64031;64032;64033;64034;64035 64030 19 DCALSPDELKDLFK Unmodified 1649.7971 0.79707302 3548 Q8IXI2;H7BXZ6 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 1 1 129.35 129.35 3 0.046065 135848 QUIQUE_C1438_190116_001 38.376 27.431 20400000 0 0 0 0 20400000 0 0 0 0 0 0 0 0 5557 3548 5204 50370 64036 64036 0 DCAVIVTQK Unmodified 1032.5274 0.52738052 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1;G3V3U4 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.361 28.361 2 0.0018648 22550 QUIQUE_C1277_190116_001 99.305 81.61 554840000 0 83933000 122170000 80343000 63587000 86074000 69244000 0 49491000 0 0 0 0 5558 1091 5205 50371;50372;50373;50374;50375;50376;50377 64037;64038;64039;64040;64041;64042;64043;64044 64037 8 DCDLQEDACYNCGR Unmodified 1774.6345 0.6345175 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 53.323 53.323 2 9.1043E-05 51226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.2 132.94 180300000 24951000 41377000 0 39464000 0 0 0 36064000 0 0 0 0 38448000 5559 2756 5206 50378;50379;50380;50381;50382;50383 64045;64046;64047;64048;64049;64050;64051 64049 7 DCEDPNPLIR Unmodified 1227.5554 0.55538619 2777;2938 P63010;A0A087WU93;A0A087WZQ6;K7ERB2;K7EN71;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.855 57.855 2 2.5224E-07 55995 QUIQUE_C1563_190116_001 159.04 151.82 5121300000 465560000 584890000 498430000 503880000 541740000 416860000 557130000 197070000 0 0 460260000 424230000 471300000 5560 2777;2938 5207 50384;50385;50386;50387;50388;50389;50390;50391;50392;50393;50394;50395 64052;64053;64054;64055;64056;64057;64058;64059;64060;64061;64062;64063;64064;64065 64058 14 DCEECIQLEPTFIK Unmodified 1780.8012 0.80117212 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.63 116.63 2 3.1862E-07 120180 QUIQUE_C1277_190116_001 128.08 116.6 1507400000 248180000 268690000 262930000 0 0 247580000 288990000 0 0 0 87997000 0 103050000 5561 2343 5208 50396;50397;50398;50399;50400;50401;50402;50403 64066;64067;64068;64069;64070;64071;64072;64073;64074 64067 9 DCEQAENWMAAR Oxidation (M) 1495.582 0.58201164 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.464 46.464 2 3.6907E-06 43575 QUIQUE_C1368_190116_001 137.85 132.31 1367300000 68422000 125870000 100280000 104920000 80511000 76143000 105410000 96245000 117750000 57834000 152120000 141600000 140200000 5562 267;275;3025 5209 50404;50405;50406;50407;50408;50409;50410;50411;50412;50413;50414;50415;50416 64075;64076;64077;64078;64079;64080;64081;64082;64083;64084;64085;64086;64087;64088;64089;64090;64091;64092;64093;64094;64095;64096;64097;64098;64099;64100;64101 64079 155 27 DCEQAENWMAAR Unmodified 1479.5871 0.58709702 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.93 73.93 2 3.6435E-37 75674 QUIQUE_C1218_190116_001 186.78 177.81 5943200000 376560000 592590000 718080000 469840000 523540000 430580000 625550000 237180000 330950000 121050000 597770000 413640000 505860000 5563 267;275;3025 5209 50417;50418;50419;50420;50421;50422;50423;50424;50425;50426;50427;50428;50429 64102;64103;64104;64105;64106;64107;64108;64109;64110;64111;64112;64113;64114;64115;64116;64117;64118 64103 17 DCEVVMMIGLPGAGK Unmodified 1575.7459 0.74590585 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7;A0A1W2PQD4 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 132.67 132.67 2 1.3992E-05 137434 QUIQUE_C1368_190116_001 96.015 87.615 183090000 24046000 37399000 29426000 0 0 37855000 54363000 0 0 0 0 0 0 5564 2849 5210 50430;50431;50432;50433;50434;50435 64119;64120;64121;64122;64123;64124 64121 6 DCFGCLR Unmodified 926.37386 0.37385677 1643 O75531 BANF1 Barrier-to-autointegration factor;Barrier-to-autointegration factor, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 48.684 48.684 2 0.054113 46311 QUIQUE_C1368_190116_001 72.618 62.868 45616000 0 0 45616000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5565 1643 5211 50436 64125 64125 1 DCFIIYQGHHGDVGAPIADVILPGAAYTEK Unmodified 3226.5757 0.57573428 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 1 2 133.76 133.76 3;4 1.075E-30 138370 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.37 93.262 2607200000 451680000 154120000 186150000 133220000 300940000 331670000 114660000 0 212670000 0 320070000 148170000 253900000 5566 2280 5212 50437;50438;50439;50440;50441;50442;50443;50444;50445;50446;50447;50448;50449;50450;50451;50452;50453;50454 64126;64127;64128;64129;64130;64131;64132;64133;64134;64135;64136;64137;64138;64139;64140;64141;64142;64143;64144;64145;64146;64147;64148;64149;64150 64140 22 DCFTCSNCK Unmodified 1190.4155 0.41546359 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.094 20.094 2 0.00045761 12757 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.1 113.73 2618800000 362690000 574380000 0 311010000 0 280480000 0 0 0 152270000 434850000 503140000 0 5567 3283 5213 50455;50456;50457;50458;50459;50460;50461 64151;64152;64153;64154;64155;64156;64157 64155 2 DCGATWVVLGHSER Unmodified 1585.7307 0.73072479 2688 P60174;U3KPZ0;U3KQF3;U3KPS5 TPI1 Triosephosphate isomerase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 3 2 3 2 2 73.609 73.609 2;3 2.7035E-241 75081 QUIQUE_C1368_190116_001 296.14 261.6 65497000000 4883100000 5949700000 6094800000 5226100000 4279000000 4389700000 5711400000 4718100000 4397400000 2243500000 6385200000 4567500000 6651300000 5568 2688 5214 50462;50463;50464;50465;50466;50467;50468;50469;50470;50471;50472;50473;50474;50475;50476;50477;50478;50479;50480;50481;50482;50483;50484;50485;50486;50487;50488;50489;50490;50491 64158;64159;64160;64161;64162;64163;64164;64165;64166;64167;64168;64169;64170;64171;64172;64173;64174;64175;64176;64177;64178;64179;64180;64181;64182;64183;64184;64185;64186;64187;64188;64189;64190;64191;64192;64193;64194;64195;64196;64197;64198;64199;64200;64201;64202;64203;64204;64205;64206;64207;64208;64209;64210;64211;64212;64213;64214;64215;64216;64217;64218;64219;64220;64221;64222 64175 65 DCGEATAQWITSFLK Unmodified 1725.8032 0.80322103 3332 Q5VT66;H7BYZ9 MARC1 Mitochondrial amidoxime-reducing component 1 yes no 0 0 0 1 162.41 162.41 2 0.02012 164428 QUIQUE_C1563_190116_001 60.301 49.082 9730200 0 0 0 0 0 9730200 0 0 0 0 0 0 0 5569 3332 5215 50492 64223 64223 0 DCGFLSQALSFR Unmodified 1399.6554 0.65543458 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.05 140.05 2 3.4762E-05 145665 QUIQUE_C1218_190116_001 128.03 117.95 941320000 104420000 105330000 93586000 77400000 87055000 69860000 119790000 51059000 72672000 35955000 124190000 0 0 5570 487 5216 50493;50494;50495;50496;50497;50498;50499;50500;50501;50502;50503 64224;64225;64226;64227;64228;64229;64230;64231;64232;64233;64234;64235 64224 10 DCGGAAAVLGAFR Unmodified 1263.603 0.60300508 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 0 1 1 1 108.28 108.28 2 0.00043576 112114 QUIQUE_C1368_190116_001 111.06 100.35 79500000 0 0 46672000 0 0 0 32828000 0 0 0 0 0 0 5571 3639 5217 50504;50505;50506 64236;64237;64238 64236 3 DCGSVDGVIK Unmodified 1048.4859 0.48590964 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;G3V2V8 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 39.355 39.355 2 0.048195 35927 QUIQUE_C1218_190116_001 48.423 31.46 124670000 49164000 0 0 75502000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5572 850 5218 50507;50508;50509 64239;64240;64241 64239 3 DCHHLGIQNNFDYK Unmodified 1759.7737 0.77365224 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 50.022 50.022 3 0.019327 47006 QUIQUE_C1563_190116_001 38.933 32.352 82831000 0 0 0 0 0 82831000 0 0 0 0 0 0 0 5573 4598 5219 50510 64242 64242 1 DCHHLGIQNNFDYKR Unmodified 1915.8748 0.87476327 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 1 1 38.681 38.681 4 0.060152 34517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.431 16.527 62126000 0 0 0 0 0 0 0 62126000 0 0 0 0 0 5574 4598 5220 50511 64243 64243 1 DCLCQLCAQPMSSSPK Oxidation (M) 1896.7838 0.78382427 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 1 0 1 56.9 56.9 2 0.014174 55738 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.483 37.05 35736000 0 0 0 0 0 0 0 0 35736000 0 0 0 0 5575 151 5221 50512 64244 64244 1 DCLINAAK Unmodified 903.4484 0.44840192 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H7Y1 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.431 32.431 2 0.0058019 27727 QUIQUE_C1218_190116_001 104.11 76.974 1487200000 235610000 0 316510000 240960000 0 242960000 264760000 108360000 0 78064000 0 0 0 5576 2132 5222 50513;50514;50515;50516;50517;50518;50519;50520 64245;64246;64247;64248;64249;64250;64251;64252;64253 64245 9 DCLIPMGITSENVAER Unmodified 1803.8495 0.8495193 1956 P09110;C9JDE9;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 115.08 115.08 2 0.0047683 119067 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.602 54.062 663600000 0 0 0 113510000 0 100970000 125040000 0 90231000 0 106180000 0 127680000 5577 1956 5223 50521;50522;50523;50524;50525;50526 64254;64255;64256;64257;64258;64259 64259 4 DCLLELIEQK Unmodified 1259.6431 0.64313856 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.41 131.41 2 0.00091605 137775 QUIQUE_C1438_190116_001 104.2 89.991 969350000 68454000 51463000 92458000 66101000 82119000 77635000 0 76072000 125350000 40706000 108920000 71289000 108790000 5578 3318 5224 50527;50528;50529;50530;50531;50532;50533;50534;50535;50536;50537;50538 64260;64261;64262;64263;64264;64265;64266;64267;64268;64269;64270;64271;64272 64265 10 DCLPELK Unmodified 873.4266 0.42660385 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 50.853 50.853 2 0.035909 48833 QUIQUE_C1403_190116_001 86.512 60.686 311010000 0 0 0 72932000 85572000 72178000 0 0 80330000 0 0 0 0 5579 1108;1404 5225 50539;50540;50541;50542 64273;64274;64275;64276;64277 64273 5 DCLTESNLIK Unmodified 1191.5805 0.58053831 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 66.141 66.141 2 0.028317 66984 QUIQUE_C1438_190116_001 55.064 17.336 98065000 0 0 0 0 98065000 0 0 0 0 0 0 0 0 5580 2190 5226 50543 64278 64278 1 DCLTPVMAVNMLTQQEVPVVILAK Unmodified 2668.4002 0.40020145 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 169.26 169.26 3 9.1965E-15 174163 QUIQUE_C1368_190116_001 106.69 100.7 73638000 0 0 27145000 22814000 23679000 0 0 0 0 0 0 0 0 5581 3100 5227 50544;50545;50546 64279;64280;64281 64279 3 DCLVLESFK Unmodified 1109.5427 0.54269624 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 98.018 98.018 2 0.022113 100452 QUIQUE_C1277_190116_001 61.679 14.105 58579000 0 58579000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5582 1570 5228 50547;50548;50549 64282;64283;64284 64282 3 DCLYEVFDDLESK Unmodified 1631.7025 0.70250394 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;E9PMW3 FAM118B Protein FAM118B yes no 0 0 0 1 1 1 1 145.42 145.42 2 0.00066294 149637 QUIQUE_C1277_190116_001 86.463 71.49 71116000 18808000 30887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21421000 5583 962 5229 50550;50551;50552;50553 64285;64286;64287;64288 64286 4 DCPDPCIGW Unmodified 1118.4161 0.41611551 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 115.96 115.96 2 0.052219 118997 QUIQUE_C1403_190116_001 50.127 48.662 15154000 0 0 0 15154000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5584 341 5230 50554 64289 64289 1 DCPDSAEEYER Unmodified 1369.5092 0.50922386 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 31.233 31.233 2 0.016638 26167 QUIQUE_C1277_190116_001 63.184 56.593 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5585 292;3442 5231 50555;50556 64290;64291 64290 2 DCPGTAEEYER Unmodified 1325.5194 0.51939461 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.803 29.803 2 0.0041614 23780 QUIQUE_C1368_190116_001 87.149 56.585 20996000 0 0 0 0 0 0 20996000 0 0 0 0 0 0 5586 882 5232 50557;50558;50559;50560;50561;50562;50563 64292;64293;64294;64295;64296;64297;64298 64292 7 DCPSGHLSMEEFKK Unmodified 1663.7334 0.73342691 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1;E5RJJ6;E5RGZ0;E5RI95;A0A1B0GXG3;E5RHE8;E5RI78;E5RHC8;E5RIG4;E5RIA5;E5RK89;E5RFL9;E5RJT1;E5RIX3 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.517 42.517 3 8.4458E-05 38570 QUIQUE_C1403_190116_001 73.022 68.631 352770000 56887000 68653000 0 58803000 48446000 0 0 27543000 0 14408000 39522000 38511000 0 5587 2726 5233 50564;50565;50566;50567;50568;50569;50570;50571 64299;64300;64301;64302;64303;64304;64305;64306 64301 8 DCPSGILNLEEFQQLYIK Unmodified 2166.0667 0.066705942 4498 Q9UM19;B4DGW9 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 161.27 161.27 2;3 6.9435E-105 165266 QUIQUE_C1277_190116_001 218.5 202.15 1774600000 143420000 191350000 117050000 105110000 112060000 129410000 165790000 127380000 139370000 43695000 129820000 223390000 146780000 5588 4498 5234 50572;50573;50574;50575;50576;50577;50578;50579;50580;50581;50582;50583;50584;50585;50586;50587;50588;50589;50590;50591;50592;50593;50594;50595 64307;64308;64309;64310;64311;64312;64313;64314;64315;64316;64317;64318;64319;64320;64321;64322;64323;64324;64325;64326;64327;64328;64329;64330;64331;64332;64333;64334;64335;64336;64337;64338 64313 30 DCPSGQLDAAGFQK Unmodified 1492.6616 0.66164217 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 59.583 59.583 2 0.0068765 58507 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Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.025 87.025 3 0.0057308 88585 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.823 41.453 568840000 88637000 76296000 69173000 0 49588000 0 89833000 0 0 0 61091000 62210000 72013000 5592 2826 5238 50613;50614;50615;50616;50617;50618;50619;50620 64360;64361;64362;64363;64364;64365;64366;64367 64367 8 DCPVPLPGDGDLLVR Unmodified 1621.8134 0.81339179 3592 Q8N4Q0 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 122.4 122.4 2 0.0034028 126740 QUIQUE_C1218_190116_001 62.89 47.918 86057000 86057000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5593 3592 5239 50621 64368 64368 1 DCPVSSYNEWDPLEEVIVGR Unmodified 2363.074 0.073976164 2563 P50440;H0YKW9 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 163.09 163.09 2;3 3.0189E-18 170359 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.75 143.19 1000500000 63996000 144740000 106550000 98855000 0 145230000 0 40508000 66922000 15093000 120040000 198580000 0 5594 2563 5240 50622;50623;50624;50625;50626;50627;50628;50629;50630;50631;50632;50633;50634;50635;50636 64369;64370;64371;64372;64373;64374;64375;64376;64377;64378;64379;64380;64381;64382;64383;64384 64381 15 DCPYMCAYK Unmodified 1206.4508 0.45078646 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.596 54.596 2 0.041244 52717 QUIQUE_C1368_190116_001 53.17 47.873 252070000 0 62111000 59032000 60137000 0 0 70790000 0 0 0 0 0 0 5595 2842 5241 50637;50638;50639;50640 64385;64386;64387;64388 64386 4 DCQEASGHLESR Unmodified 1387.5786 0.57864083 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 14.685 14.685 2;3 0.0050221 6374 QUIQUE_C1563_190116_001 71.241 58.104 74188000 0 28006000 0 0 0 46182000 0 0 0 0 0 0 0 5596 1058 5242 50641;50642;50643 64389;64390;64391 64391 2 DCQLNAHKDHQYQFLEDAVR Unmodified 2486.1397 0.13970474 2983 Q13263;M0R3C0;M0R2I3 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 1 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ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 119.38 119.38 2 0.011256 122725 QUIQUE_C1403_190116_001 73.499 63.844 119420000 38420000 0 0 46410000 0 0 0 21140000 0 13446000 0 0 0 5600 2283 5246 50659;50660;50661;50662 64407;64408;64409;64410 64408 2 DCTALLHLFHAAVQR Unmodified 1750.8937 0.8937078 3647 Q8NFF5;Q5T196 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.98 115.98 3 0.0013334 113346 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.401 49.916 96395000 26693000 27096000 0 0 0 31710000 0 0 0 10897000 0 0 0 5601 3647 5247 50663;50664;50665;50666 64411;64412;64413;64414 64414 3 DCTPIEYPKPDGQISFDLLSSVALSGTNHEHDQPAHLTLR Unmodified 4458.155 0.15502704 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 135.21 135.21 5 0.010409 140026 QUIQUE_C1218_190116_001 21.665 17.552 33165000 33165000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5602 3169 5248 50667 64415 64415 1 DCTVEMPILK Unmodified 1204.5832 0.58318084 2989;2682 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1;E7EUB3;Q5SQP8;P56545 CTBP1;CTBP2 C-terminal-binding protein 1;C-terminal-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.066 91.066 2 0.017608 94448 QUIQUE_C1438_190116_001 61.679 48.031 652800000 0 76133000 68586000 86513000 49363000 59584000 58364000 0 61362000 0 74868000 60276000 57749000 5603 2989;2682 5249 50668;50669;50670;50671;50672;50673;50674;50675;50676;50677 64416;64417;64418;64419;64420;64421;64422;64423;64424;64425;64426;64427 64420 12 DCVGPEVEK Unmodified 1031.4594 0.45936054 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.253 23.253 2 0.0062856 16610 QUIQUE_C1277_190116_001 84.743 69.111 13917000000 2126300000 2186200000 0 2039300000 0 1710200000 2033900000 1197800000 0 695310000 1928400000 0 0 5604 1790 5250 50678;50679;50680;50681;50682;50683;50684;50685 64428;64429;64430;64431;64432;64433;64434;64435 64429 7 DCVSPSEYTAACSR Unmodified 1601.645 0.64500583 4467 Q9UK41;E9PQR7 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.099 48.099 2 1.1917E-07 45671 QUIQUE_C1218_190116_001 129.84 126.8 308640000 30862000 33099000 42036000 0 0 0 52807000 30513000 35229000 0 39508000 0 44582000 5605 4467 5251 50686;50687;50688;50689;50690;50691;50692;50693;50694 64436;64437;64438;64439;64440;64441;64442;64443;64444;64445 64436 10 DDAGIRAVCQR Unmodified 1259.6041 0.60406772 4299 Q9NUQ8;F8WCU6 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes no 0 0 1 1 31.841 31.841 3 0.0070325 26534 QUIQUE_C1218_190116_001 51.927 34.901 92148000 92148000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5606 4299 5252 50695 64446 64446 1 DDAGWSPLHIAASAGR Unmodified 1622.7801 0.78011783 1660 O75832 PSMD10 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 95.545 95.545 2;3 0.00018369 97675 QUIQUE_C1403_190116_001 59.872 50.552 287630000 76776000 26156000 34499000 24181000 25314000 64095000 36604000 0 0 0 0 0 0 5607 1660 5253 50696;50697;50698;50699;50700;50701;50702;50703 64447;64448;64449;64450;64451;64452;64453;64454;64455;64456 64452 9 DDALAWK Unmodified 817.39702 0.39701828 995 F5GZH3;F5H866;F5GZ38;F5H1B8;Q9UF11;F5H3M1;F5GYU9;F5H114;F5H0R6;F5GY87 PLEKHB1 Pleckstrin homology domain-containing family B member 1 yes no 0 0 0 1 55.783 55.783 2 0.036465 50937 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.086 52.348 12397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12397000 0 0 0 5608 995 5254 50704 64457 64457 1 DDAMLLK Unmodified 804.40514 0.40514012 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.942 47.942 2 0.023465 45548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.07 68.763 4600400000 534890000 411530000 523050000 422310000 285200000 437210000 425870000 173440000 267370000 186340000 354700000 267690000 310800000 5609 2004 5255 50705;50706;50707;50708;50709;50710;50711;50712;50713;50714;50715;50716;50717 64458;64459;64460;64461;64462;64463;64464;64465;64466;64467;64468;64469;64470;64471;64472;64473;64474;64475 64466 18 DDANNDPQWSEEQLIAAK Unmodified 2042.9181 0.91812745 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.48 101.48 2 5.3429E-39 105342 QUIQUE_C1576_190116_001 166.62 152.06 567320000 127240000 97927000 0 0 46433000 96128000 80595000 0 0 0 67196000 51804000 0 5610 2195 5256 50718;50719;50720;50721;50722;50723;50724;50725;50726 64476;64477;64478;64479;64480;64481;64482;64483;64484;64485;64486 64483 11 DDASMPLPFDLTDIVSELR Oxidation (M) 2149.0249 0.024900707 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUY7 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 1 0 1 1 1 1 172.83 172.83 2 3.1566E-11 177853 QUIQUE_C1576_190116_001 118.37 108.83 58536000 11593000 26252000 0 10298000 0 0 10393000 0 0 0 0 0 0 5611 334 5257 50727;50728;50729;50730 64487;64488;64489;64490 64490 231 4 DDASMPLPFDLTDIVSELR Unmodified 2133.03 0.029986085 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUY7 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 175.62 175.62 2;3 8.079E-17 178672 QUIQUE_C1277_190116_001 128.9 120.8 179400000 10994000 14254000 0 6060200 15512000 56238000 14232000 9115100 7793300 0 40550000 0 4652200 5612 334 5257 50731;50732;50733;50734;50735;50736;50737;50738;50739;50740;50741;50742 64491;64492;64493;64494;64495;64496;64497;64498;64499;64500;64501;64502;64503;64504 64493 14 DDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR Unmodified 2726.3698 0.36976425 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.9 170.9 3 1.3724E-31 173560 QUIQUE_C1403_190116_001 135.1 122.29 1838400000 75709000 135490000 287440000 35941000 132330000 0 249200000 110890000 93178000 10546000 218400000 319430000 169840000 5613 1548 5258 50743;50744;50745;50746;50747;50748;50749;50750;50751;50752;50753;50754 64505;64506;64507;64508;64509;64510;64511;64512;64513;64514;64515;64516 64508 12 DDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR Oxidation (M) 2742.3647 0.36467888 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 169.74 169.74 3 1.9276E-13 173864 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.21 89.411 490740000 0 62313000 0 0 54408000 0 78555000 91515000 0 0 76102000 62600000 65243000 5614 1548 5258 50755;50756;50757;50758;50759;50760;50761 64517;64518;64519;64520;64521;64522;64523 64523 843 7 DDDAETGLTDGEEKEEPK Unmodified 1976.8335 0.83345435 2182 P21579;C9JX50 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 1 1 40.78 40.78 3 0.0001368 35224 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.013 72.891 21514000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21514000 0 0 0 5615 2182 5259 50762 64524;64525 64525 2 DDDAETGLTDGEEKEEPKEEEK Unmodified 2492.0562 0.056196653 2182 P21579;C9JX50 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 35.853 35.853 3;4 5.6085E-54 30962 QUIQUE_C1368_190116_001 164.98 157.36 648550000 147000000 99259000 101880000 99905000 44851000 117750000 37890000 0 0 0 0 0 0 5616 2182 5260 50763;50764;50765;50766;50767;50768;50769;50770;50771;50772;50773;50774 64526;64527;64528;64529;64530;64531;64532;64533;64534;64535;64536;64537;64538;64539;64540 64531 15 DDDDVVIGK Unmodified 974.45566 0.45565537 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 37.641 37.641 2 0.027619 33102 QUIQUE_C1563_190116_001 57.722 32.799 30149000 0 0 0 0 0 30149000 0 0 0 0 0 0 0 5617 1486 5261 50775;50776;50777 64541;64542;64543 64542 3 DDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGR Unmodified 3668.8906 0.89060284 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9;E7ENH5;Q5JX45;Q5JX56;Q5JX58;Q5JX59;Q5JX60;Q5JX44;Q5JX54;Q5JX55;Q5JX61;Q5JX52;Q5JX57;E7EV27 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 2 1 1 1 168.84 168.84 4 2.8832E-21 174940 QUIQUE_C1438_190116_001 77.733 76.008 169030000 0 0 0 38340000 59485000 0 71206000 0 0 0 0 0 0 5618 579 5262 50778;50779;50780 64544;64545;64546 64545 3 DDDIAALVVDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1836.787 0.78697862 2696;447 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;P60709 ACTB Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed no no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 135.34 135.34 2 2.1831E-63 139616 QUIQUE_C1403_190116_001 188.91 181.64 9509300000 662910000 898620000 978710000 894060000 870450000 816840000 742210000 439940000 441800000 481440000 793650000 789490000 699170000 5619 447;2696 5263 50781;50782;50783;50784;50785;50786;50787;50788;50789;50790;50791;50792;50793;50794 64547;64548;64549;64550;64551;64552;64553;64554;64555;64556;64557;64558;64559;64560;64561;64562;64563;64564;64565;64566;64567;64568;64569;64570;64571;64572;64573;64574;64575;64576;64577;64578;64579;64580 64556 318 33 DDDIAALVVDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term) 1820.7921 0.792064 2696;447 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;P60709 ACTB Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed no no 1 0 0 2 2 3 4 3 4 3 1 1 2 2 1 2 146.28 146.28 2 4.8169E-224 152432 QUIQUE_C1218_190116_001 276.95 262.27 30765000000 3088600000 3423500000 3403500000 3923200000 2592800000 3085100000 2720200000 1282900000 896100000 552520000 1663900000 2018900000 2113800000 5620 447;2696 5263 50795;50796;50797;50798;50799;50800;50801;50802;50803;50804;50805;50806;50807;50808;50809;50810;50811;50812;50813;50814;50815;50816;50817;50818;50819;50820;50821;50822;50823;50824 64581;64582;64583;64584;64585;64586;64587;64588;64589;64590;64591;64592;64593;64594;64595;64596;64597;64598;64599;64600;64601;64602;64603;64604;64605;64606;64607;64608;64609;64610;64611;64612;64613;64614;64615;64616;64617;64618;64619;64620;64621;64622;64623;64624;64625;64626;64627;64628;64629;64630 64583 42 DDDIEEGDLPEHK Unmodified 1510.6423 0.64234652 3083 Q14696 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 42.62 42.62 2;3 0.00031095 38432 QUIQUE_C1563_190116_001 97.456 87.801 141070000 28827000 28120000 0 29036000 0 55089000 0 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50850;50851;50852;50853;50854;50855;50856;50857;50858;50859;50860;50861;50862;50863;50864;50865;50866;50867;50868;50869;50870;50871;50872;50873;50874;50875 64657;64658;64659;64660;64661;64662;64663;64664;64665;64666;64667;64668;64669;64670;64671;64672;64673;64674;64675;64676;64677;64678;64679;64680;64681;64682;64683;64684;64685 64670 28 DDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSR Oxidation (M) 3780.7021 0.7020696 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 139.92 139.92 4 2.5337E-47 142728 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.56 107.53 512810000 83692000 142790000 0 0 0 0 0 98330000 0 48585000 0 139420000 0 5627 2851 5269 50876;50877;50878;50879;50880 64686;64687;64688;64689;64690 64688 2282 5 DDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSR Unmodified 3764.7072 0.70715498 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 155.04 155.04 3;4 1.5756E-149 162037 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.4 186.99 5919400000 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Unmodified 2046.9858 0.98581308 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 141.15 141.15 3 5.3307E-05 146100 QUIQUE_C1218_190116_001 76.539 73.011 32976000 32976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5630 4631 5271 50914 64732 64732 1 DDEFTHLYTLIVRPDNTYEVK Unmodified 2567.2544 0.25438337 2268 P27797;K7EJB9 CALR Calreticulin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 140.94 140.94 4 8.2629E-05 143536 QUIQUE_C1563_190116_001 63.857 54.836 112870000 29057000 0 21553000 18948000 0 33530000 0 0 0 9777200 0 0 0 5631 2268 5272 50915;50916;50917;50918;50919 64733;64734;64735;64736;64737 64736 5 DDEGFIIR Unmodified 963.46616 0.46616048 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 74.783 74.783 2 0.053305 75807 QUIQUE_C1368_190116_001 71.342 40.73 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5632 153 5273 50920 64738 64738 1 DDELYILTNVGEPTEFK Unmodified 1981.9521 0.95205334 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 146.64 146.64 2 0.029448 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[ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 25.041 25.041 2 0.016846 18877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.47 100.54 165710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 165710000 0 5644 2187 5284 50976 64798 64798 1 DDFTEFGK Unmodified 957.40798 0.40797689 1658 O75822;H0YGJ7;H0YLP3 EIF3J Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J yes no 0 0 0 1 1 67.022 67.022 2 0.063544 63122 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.403 45.901 95526000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36432000 59094000 0 0 5645 1658 5285 50977;50978 64799;64800 64799 2 DDGCYRGEPSWFHR Unmodified 1780.7376 0.73760108 4444 Q9UI15;C9J5W6 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 1 1 61.688 61.688 3 0.0068529 60060 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.841 49.404 62384000 0 0 0 0 0 0 0 62384000 0 0 0 0 0 5646 4444 5286 50979 64801 64801 1 DDGEEEFAGAK Unmodified 1166.4728 0.472762 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;A0A087X2B6 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 37.478 37.478 2 0.048528 33232 QUIQUE_C1403_190116_001 46.001 35.736 20358000 0 0 0 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64940;64941;64942;64943;64944;64945;64946;64947;64948;64949;64950;64951;64952;64953;64954;64955;64956;64957;64958;64959 64944 16 DDIENMVK Unmodified 962.4379 0.43789681 2415 P38646;H0Y8S0 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.137 55.137 2 0.0036515 54304 QUIQUE_C1218_190116_001 127.84 78.485 1331200000 205850000 150080000 176740000 145190000 96061000 173170000 0 0 77325000 87041000 71369000 57173000 91158000 5659 2415 5299 51079;51080;51081;51082;51083;51084;51085;51086;51087;51088;51089 64960;64961;64962;64963;64964;64965;64966;64967;64968;64969;64970;64971 64960 11 DDIGIILINQYIAEMVR Oxidation (M) 1991.0398 0.03976291 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 167.71 167.71 2;3 7.0544E-11 169424 QUIQUE_C1563_190116_001 121.04 107.61 59956000 0 27571000 18450000 0 0 13935000 0 0 0 0 0 0 0 5660 3204 5300 51090;51091;51092;51093;51094 64972;64973;64974;64975;64976 64975 2630 5 DDIGIILINQYIAEMVR Unmodified 1975.0448 0.044848288 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 175.48 175.48 2;3 6.0482E-38 179179 QUIQUE_DMIX8_190116_001 204.48 154.55 286500000 0 19004000 11194000 0 21446000 7496300 0 43751000 63817000 0 19966000 58989000 40834000 5661 3204 5300 51095;51096;51097;51098;51099;51100;51101;51102;51103;51104;51105 64977;64978;64979;64980;64981;64982;64983;64984;64985;64986;64987;64988 64988 12 DDIIENAPTTHTEEYSGEEK Unmodified 2276.9921 0.99208025 1440 O14744;H0YJX6;G3V580;G3V2X6;G3V5L5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 2 58.944 58.944 2;3 1.7115E-29 57168 QUIQUE_C1277_190116_001 163.23 141.19 212020000 23533000 25465000 0 95096000 0 0 0 0 0 67923000 0 0 0 5662 1440 5301 51106;51107;51108;51109;51110 64989;64990;64991;64992;64993 64990 5 DDILNGSHPVSFDK Unmodified 1542.7314 0.7314363 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 69.544 69.544 2 0.00086416 68956 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65009;65010;65011;65012;65013;65014;65015;65016;65017;65018;65019 65011 10 DDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLAK Unmodified 2628.2973 0.29725124 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 1 2 1 123.17 123.17 3;4 3.1251E-09 126346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.504 85.515 85530000 0 0 0 0 0 0 0 46923000 0 0 0 0 38607000 5666 4256 5305 51133;51134;51135 65020;65021;65022 65021 3 DDKHGSYEDAVHSGALND Unmodified 1928.8137 0.81366238 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 39.424 39.424 2;3 1.6356E-22 35299 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.93 118.4 791110000 60531000 0 84225000 24549000 30880000 0 27578000 158010000 36004000 0 61837000 44251000 263240000 5667 2132 5306 51136;51137;51138;51139;51140;51141;51142;51143;51144;51145;51146;51147 65023;65024;65025;65026;65027;65028;65029;65030;65031;65032;65033;65034 65034 12 DDKNTMTDSTILLEDVQK Unmodified 2064.9885 0.9885152 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;O95317 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 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65065;65066;65067;65068;65069;65070;65071;65072;65073;65074;65075;65076;65077;65078;65079;65080;65081;65082;65083;65084;65085;65086;65087;65088;65089;65090;65091;65092;65093;65094;65095;65096;65097;65098;65099;65100;65101;65102;65103;65104;65105;65106;65107;65108;65109;65110;65111;65112;65113;65114;65115;65116;65117;65118 65118 53 DDLNSQLQESLR Unmodified 1416.6845 0.68448611 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.586 85.586 2 0.0018371 85960 QUIQUE_C1563_190116_001 90.685 65.831 139630000 48778000 0 0 49020000 0 41828000 0 0 0 0 0 0 0 5673 3241 5312 51199;51200;51201;51202 65119;65120;65121;65122;65123 65122 5 DDLQNGLLSTCR Unmodified 1390.6511 0.65107749 4206 Q9HAU0;A0JP02;B4DJX4;H0YGJ6 PLEKHA5 Pleckstrin homology domain-containing family A member 5 yes no 0 0 0 1 77.33 77.33 2 0.034511 77311 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.228 63.438 13226000 0 0 0 0 0 0 0 13226000 0 0 0 0 0 5674 4206 5313 51203 65124 65124 0 DDLSFAGYQK Unmodified 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O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.049 48.049 2 0.00035401 45843 QUIQUE_C1218_190116_001 113.71 92.406 566980000 76294000 87263000 0 80602000 81558000 67468000 0 0 80296000 0 0 93497000 0 5693 150 5331 51345;51346;51347;51348;51349;51350;51351 65326;65327;65328;65329;65330;65331;65332;65333 65326 8 DDPVTNLNNAFEVAEK Unmodified 1774.8374 0.83735793 1544;1313 O43707;K7EJH8 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.96 122.96 2 2.7334E-24 125604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.05 160.65 619240000 58354000 91187000 101790000 71528000 95979000 61516000 67417000 71476000 0 0 0 0 0 5694 1544;1313 5332 51352;51353;51354;51355;51356;51357;51358;51359;51360 65334;65335;65336;65337;65338;65339;65340;65341;65342;65343;65344;65345 65344 12 DDQFLLDGQLLPDNFIAACTEK Unmodified 2522.1999 0.19990496 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 165.23 165.23 2;3 3.2357E-66 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65399 1 DDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELK Unmodified 2905.3909 0.39093643 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 1 1 174.12 174.12 3 2.6198E-18 181203 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.44 110.65 212550000 0 0 0 0 0 0 44179000 0 0 0 168370000 0 0 5710 820 5348 51409;51410 65400;65401 65401 2 DDTDDEIAK Unmodified 1020.4247 0.42474917 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RDP7;D6RB85;D6RAU8;D6RAQ8 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 20.128 20.128 2 0.027329 12749 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.931 13.814 12393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12393000 0 0 0 5711 2269 5349 51411 65402 65402 1 DDTIYEDEDVK Unmodified 1340.562 0.56197093 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 53.039 53.039 2 0.0011193 51072 QUIQUE_C1368_190116_001 107.21 87.419 826870000 277520000 216460000 89922000 0 76052000 43961000 93749000 0 0 0 29212000 0 0 5712 2085 5350 51412;51413;51414;51415;51416;51417;51418;51419;51420 65403;65404;65405;65406;65407;65408;65409;65410;65411;65412;65413 65407 10 DDTIYEDEDVKEAIR Unmodified 1809.8269 0.82685283 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 3 1 2 1 2 2 1 74.219 74.219 2;3 3.774E-29 74492 QUIQUE_C1277_190116_001 199.43 185.27 2073000000 237310000 284040000 179710000 162980000 89331000 169570000 277980000 59519000 217720000 23331000 187270000 103810000 80444000 5713 2085 5351 51421;51422;51423;51424;51425;51426;51427;51428;51429;51430;51431;51432;51433;51434;51435;51436;51437;51438;51439;51440;51441;51442;51443 65414;65415;65416;65417;65418;65419;65420;65421;65422;65423;65424;65425;65426;65427;65428;65429;65430;65431;65432;65433;65434;65435;65436;65437;65438 65416 24 DDTVCLAK Unmodified 920.42733 0.42733213 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.642 27.642 2 0.016172 21845 QUIQUE_C1438_190116_001 124.34 76.6 296320000 62470000 0 0 0 233850000 0 0 0 0 0 0 0 0 5714 1838 5352 51444;51445;51446;51447;51448;51449 65439;65440;65441;65442;65443;65444 65443 5 DDVALEGVSHFFR Unmodified 1490.7154 0.7153923 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 117.57 117.57 2;3 1.3901E-88 121582 QUIQUE_C1403_190116_001 227.27 198.57 9547500000 561180000 631790000 939390000 651380000 579760000 884040000 693310000 329880000 2622200000 408680000 405300000 293760000 546810000 5715 1840 5353 51450;51451;51452;51453;51454;51455;51456;51457;51458;51459;51460;51461;51462;51463;51464;51465;51466;51467;51468;51469;51470;51471;51472;51473;51474;51475 65445;65446;65447;65448;65449;65450;65451;65452;65453;65454;65455;65456;65457;65458;65459;65460;65461;65462;65463;65464;65465;65466;65467;65468;65469;65470;65471;65472;65473;65474;65475;65476;65477;65478;65479;65480;65481;65482;65483;65484;65485;65486;65487;65488;65489;65490;65491;65492;65493;65494;65495;65496 65460 52 DDVAQTDLLQIDPNFGSK Unmodified 1974.9535 0.95345032 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5H0E2 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 134.61 134.61 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DDVFLSVPCILGQNGISDLVK Unmodified 2288.1722 0.17223365 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 0 1 1 1 168.26 168.26 2 4.2687E-06 169944 QUIQUE_C1563_190116_001 102.38 81.077 596450000 0 0 0 0 0 258910000 0 0 0 62947000 274600000 0 0 5719 1775 5357 51494;51495;51496 65516;65517;65518 65516 3 DDVIQICGPADGIR Unmodified 1527.7351 0.73514147 2945 Q12800;F8VWL0 TFCP2 Alpha-globin transcription factor CP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.467 95.467 2 0.00012519 99280 QUIQUE_C1218_190116_001 98.353 8.8056 102180000 0 0 0 0 48668000 27988000 0 0 25528000 0 0 0 0 5720 2945 5358 51497;51498;51499;51500;51501;51502;51503 65519;65520;65521;65522;65523;65524;65525 65519 7 DDVPFFGPPLPDPAVFR Unmodified 1884.941 0.94103514 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.11 163.11 2 8.036E-05 167126 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.191 70.341 1186400000 99118000 114900000 103970000 98593000 134860000 84174000 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subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.765 20.765 2 0.002311 13558 QUIQUE_C1403_190116_001 94.662 42.026 1921500000 282150000 390020000 306820000 294580000 260600000 0 0 114130000 166040000 107120000 0 0 0 5724 1701;1749 5362 51525;51526;51527;51528;51529;51530;51531;51532 65548;65549;65550;65551;65552;65553;65554;65555;65556 65552 9 DDWLEWLR Unmodified 1131.5349 0.53490874 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 157.93 157.93 2 0.027492 164187 QUIQUE_C1576_190116_001 79.451 56.711 35192000 0 0 8196700 0 8970600 0 7941900 0 0 0 10083000 0 0 5725 2447 5363 51533;51534;51535;51536;51537 65557;65558;65559;65560;65561 65560 5 DDYELIDVLVNNAK Unmodified 1619.8043 0.80426689 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 1 157.5 157.5 2 0.002361 162837 QUIQUE_C1218_190116_001 75.229 62.273 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5726 3391 5364 51538;51539 65562;65563 65562 2 DDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPK Unmodified 2654.2534 0.25339709 1746 O95747;C9JIG9;F8WBK9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 0 0 0 1 166.67 166.67 3 3.6424E-05 160698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.577 42.546 6374900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6374900 0 0 0 5727 1746 5365 51540 65564 65564 1 DDYVHEFCR Unmodified 1239.4979 0.49787131 3012 Q13564 NAE1 NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 55.593 55.593 2;3 0.0014209 53218 QUIQUE_C1563_190116_001 103.83 96.71 410020000 0 49686000 90247000 61971000 38554000 40717000 46865000 0 27301000 13779000 0 0 40902000 5728 3012 5366 51541;51542;51543;51544;51545;51546;51547;51548;51549;51550 65565;65566;65567;65568;65569;65570;65571;65572;65573;65574 65570 10 DEAAYGELR Unmodified 1022.4669 0.46688876 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.544 41.544 2 0.0014496 38542 QUIQUE_C1438_190116_001 103.56 76.038 917640000 120950000 122000000 0 0 121990000 126630000 0 0 92891000 68057000 108040000 76285000 80808000 5729 114 5367 51551;51552;51553;51554;51555;51556;51557;51558;51559 65575;65576;65577;65578;65579;65580;65581;65582;65583 65577 8 DEAEMSSWLR Unmodified 1222.5288 0.52883709 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 100.34 100.34 2 0.057273 101651 QUIQUE_C1563_190116_001 46.462 26.675 21949000 0 0 0 0 0 21949000 0 0 0 0 0 0 0 5730 1472 5368 51560 65584 65584 1 DEAFDPFDK Unmodified 1082.4557 0.45565537 2143 P19174;V9GY63 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 95.672 95.672 2 0.040078 98743 QUIQUE_C1218_190116_001 53.493 43.31 34918000 17006000 17912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5731 2143 5369 51561;51562 65585;65586 65585 2 DEAFPPVPQSLGYK Unmodified 1546.7668 0.76675917 1921 P07384;E9PRM1;E9PJJ3;E9PLC9;E9PMC6;E9PJA6;E9PSA6;E9PQB3 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit no no 0 0 0 2 1 3 2 3 1 1 106.77 106.77 2 0.0066347 108668 QUIQUE_C1563_190116_001 61.353 43.489 376610000 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Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.093 46.093 2 0.0023813 43753 QUIQUE_C1218_190116_001 91.584 71.797 99939000 21415000 18981000 0 20650000 14158000 24735000 0 0 0 0 0 0 0 5737 660 5375 51607;51608;51609;51610;51611 65637;65638;65639;65640;65641 65637 5 DEAWVLETIGK Unmodified 1259.6398 0.63976774 2941 Q12765;C9K052 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.34 126.34 2 1.3331E-05 131215 QUIQUE_C1368_190116_001 143.03 134.81 4693400000 0 464340000 634590000 583990000 480350000 919140000 559970000 0 329550000 0 227340000 193210000 300900000 5738 2941 5376 51612;51613;51614;51615;51616;51617;51618;51619;51620;51621;51622;51623;51624;51625;51626 65642;65643;65644;65645;65646;65647;65648;65649;65650;65651;65652;65653;65654;65655;65656;65657;65658;65659;65660;65661;65662;65663;65664;65665;65666;65667;65668;65669;65670;65671 65649 30 DECSFHIFYQLLGGAGEQLK Unmodified 2311.0943 0.094317676 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 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2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 150.08 150.08 3;4 2.7207E-10 154283 QUIQUE_C1277_190116_001 112.8 106.98 843940000 78079000 70631000 71643000 59248000 108570000 64563000 90576000 61805000 59999000 33051000 24049000 68712000 53006000 5742 2808 5379 51635;51636;51637;51638;51639;51640;51641;51642;51643;51644;51645;51646;51647;51648;51649;51650;51651;51652;51653;51654;51655;51656;51657 65681;65682;65683;65684;65685;65686;65687;65688;65689;65690;65691;65692;65693;65694;65695;65696;65697;65698;65699;65700;65701;65702;65703;65704;65705;65706;65707;65708;65709;65710;65711 65683 29 DEDILQVLQFTK Unmodified 1447.7559 0.75586013 3315 Q5T5U3;E7ESW5 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 152.93 152.93 2 0.0038816 148089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.808 61.85 14865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14865000 0 0 0 5743 3315 5380 51658 65712 65712 1 DEDKDKVGNVEYFGLGNSPGFPLQYYPYYGK Unmodified 3558.662 0.66196633 1873 P05026 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65723;65724;65725;65726;65727;65728;65729;65730;65731;65732 65729 9 DEEEEMMEVSLDATK Unmodified 1754.7226 0.72264703 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 119.75 119.75 2 0.0092905 116625 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.343 47.653 14776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14776000 0 0 0 5747 3753 5384 51674 65733 65733 1 DEEEEMMEVSLDATKR Unmodified 1910.8238 0.82375806 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 101.22 101.22 3 0.0017684 103191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.463 44.034 197860000 0 0 0 0 0 0 0 72012000 34421000 0 37882000 53549000 0 5748 3753 5385 51675;51676;51677;51678 65734;65735;65736;65737 65734 3 DEEFPEQK Unmodified 1020.44 0.4400053 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 28.131 28.131 2 0.04088 22810 QUIQUE_C1218_190116_001 83.753 56.048 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5749 2135 5386 51679;51680;51681;51682 65738;65739;65740;65741 65738 4 DEEKMELQEIQLK Unmodified 1631.8076 0.80763771 63;1260;1908 J3KN67;P06753;A0A087WWU8 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 1 1 1 77.183 77.183 2 0.0012916 78390 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.76 0 83561000 0 0 43643000 0 0 0 0 0 39918000 0 0 0 0 5750 1260;1908;63 5387 51683;51684 65742;65743;65744 65744 3 DEELEEIKK Unmodified 1131.5659 0.5659341 3966 Q99653;H0YNG9;H0YKE7;F5GX29;H0YLX1 CHP1 Calcineurin B homologous protein 1 yes no 0 0 1 1 1 26.187 26.187 2 0.003264 20035 QUIQUE_C1218_190116_001 95.741 50.66 28131000 28131000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5751 3966 5388 51685;51686 65745;65746 65745 2 DEELSCTVVELK Unmodified 1420.6756 0.6755609 1800 P01011;G3V3A0;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 1 1 87.943 87.943 2 1.3913E-05 90626 QUIQUE_C1218_190116_001 130.41 93.856 265410000 69985000 71448000 0 123970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5752 1800 5389 51687;51688;51689 65747;65748;65749 65747 3 DEEVHAGLGELLR Unmodified 1436.726 0.72595699 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PQ34 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 86.447 86.447 3 0.0058778 83037 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Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 29.161 29.161 3 0.036212 23593 QUIQUE_C1368_190116_001 39.547 15.325 27323000 0 0 27323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5773 3357 5410 51814 65919 65919 1 DELADEIANSSGK Unmodified 1347.6154 0.61540349 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 69.956 69.956 2 0.051836 65720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.262 54.037 43582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43582000 0 0 0 5774 2378 5411 51815 65920 65920 0 DELADEITNSASGK Unmodified 1448.6631 0.66308196 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 79.04 79.04 2 0.0054243 80576 QUIQUE_C1368_190116_001 67.252 46.418 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5775 2379 5412 51816 65921 65921 1 DELELELAENRK Unmodified 1457.7362 0.73618733 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 1 1 124.85 124.85 3 0.00013735 129388 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.9 10.174 30426000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30426000 5776 3091 5413 51817 65922 65922 1 DELEVIHLIEEHR Unmodified 1630.8315 0.83148469 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 113.4 113.4 3 4.1045E-06 116412 QUIQUE_C1277_190116_001 109.22 88.758 35852000 0 27422000 0 0 0 0 0 0 0 8430200 0 0 0 5777 1992 5414 51818;51819;51820;51821;51822 65923;65924;65925;65926;65927 65924 4 DELFALEQSCAQVVLQAANER Unmodified 2390.1536 0.15362347 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 157.86 157.86 3 0.00020882 152729 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.009 52.656 11100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11100000 0 0 0 5778 3187 5415 51823 65928 65928 1 DELFTDDK Unmodified 981.42911 0.42910627 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 47.461 47.461 2 0.056943 45044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.968 31.346 18003000 0 0 0 0 0 0 0 0 18003000 0 0 0 0 5779 2223 5416 51824 65929 65929 1 DELGDYLKPK Unmodified 1176.6027 0.60265396 4151 Q9H2W6 MRPL46 39S ribosomal protein L46, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 65.132 65.132 3 0.032444 64933 QUIQUE_C1218_190116_001 48.284 44.094 29939000 15738000 0 0 0 0 0 0 14201000 0 0 0 0 0 5780 4151 5417 51825;51826 65930;65931 65930 2 DELHIVEAEAMNYEGSPIK Oxidation (M) 2160.0045 0.0044996155 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 119.87 119.87 2;3 4.6504E-05 123630 QUIQUE_C1403_190116_001 78.021 72.917 332450000 52455000 47393000 25513000 32984000 67555000 74124000 0 0 0 32422000 0 0 0 5781 1907 5418 51827;51828;51829;51830;51831;51832;51833;51834;51835 65932;65933;65934;65935;65936;65937;65938;65939;65940 65935 1126 8 DELHIVEAEAMNYEGSPIK Unmodified 2144.0096 0.0095849934 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 4 2 2 2 2 129.31 129.31 2;3 2.0504E-152 134785 QUIQUE_C1218_190116_001 241.41 221.57 2942000000 376180000 378380000 267910000 325860000 165460000 335110000 240280000 64660000 145980000 149530000 157380000 130860000 204400000 5782 1907 5418 51836;51837;51838;51839;51840;51841;51842;51843;51844;51845;51846;51847;51848;51849;51850;51851;51852;51853;51854;51855;51856;51857;51858;51859;51860;51861 65941;65942;65943;65944;65945;65946;65947;65948;65949;65950;65951;65952;65953;65954;65955;65956;65957;65958;65959;65960;65961;65962;65963;65964;65965;65966;65967;65968;65969;65970;65971;65972;65973;65974;65975;65976;65977;65978;65979;65980;65981 65941 40 DELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVK Unmodified 2883.5077 0.50769752 2353 P32969;D6RAN4;A0A2R8Y5Y7;H0Y9V9;H0Y9R4 RPL9 60S ribosomal protein L9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.27 169.27 3 1.1981E-53 173860 QUIQUE_C1218_190116_001 141.5 128.83 488440000 58674000 88920000 75433000 68604000 0 82120000 88604000 0 0 26084000 0 0 0 5783 2353 5419 51862;51863;51864;51865;51866;51867;51868 65982;65983;65984;65985;65986;65987;65988 65982 7 DELLFPSWEALFSGSEGPLKPGAR Unmodified 2602.3068 0.30675329 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.24 165.24 3 9.4782E-15 169147 QUIQUE_C1277_190116_001 109.75 102.48 576010000 82629000 71730000 70481000 53651000 90964000 34388000 46126000 0 0 21140000 50207000 19979000 34712000 5784 2419 5420 51869;51870;51871;51872;51873;51874;51875;51876;51877;51878;51879 65989;65990;65991;65992;65993;65994;65995;65996;65997;65998;65999;66000;66001;66002 65991 14 DELLPHILPLLK Unmodified 1399.8439 0.84388728 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 139.77 139.77 2;3 0.00055718 143692 QUIQUE_C1403_190116_001 63.408 53.083 312310000 50045000 32307000 29065000 61087000 21569000 30528000 31942000 0 22601000 14973000 0 0 18197000 5785 3772 5421 51880;51881;51882;51883;51884;51885;51886;51887;51888;51889;51890;51891;51892;51893 66003;66004;66005;66006;66007;66008;66009;66010;66011;66012;66013;66014;66015;66016;66017;66018;66019;66020;66021 66010 18 DELLQVLR Unmodified 984.5604 0.56039521 3966 Q99653 CHP1 Calcineurin B homologous protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.344 97.344 2 0.0038569 101295 QUIQUE_C1438_190116_001 111.28 75.093 224380000 33730000 0 21977000 28303000 19652000 26427000 28687000 0 0 9798700 16509000 18012000 21284000 5786 3966 5422 51894;51895;51896;51897;51898;51899;51900;51901;51902;51903 66022;66023;66024;66025;66026;66027;66028;66029;66030;66031;66032 66026 10 DELQEGLR Unmodified 958.47197 0.47197413 610 B4DHR0;Q9H5N1 RABEP2 Rab GTPase-binding effector protein 2 yes no 0 0 0 1 29.947 29.947 2 0.063544 24196 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.403 7.0674 161090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 161090000 0 0 0 5787 610 5423 51904 66033 66033 1 DELRETLK Unmodified 1002.5346 0.53457439 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 23.134 23.134 2 0.035441 16889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.52 32.261 481170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 262330000 0 218840000 5788 2533 5424 51905;51906 66034;66035 66034 2 DELWLVMK Unmodified 1032.5314 0.53140327 1746;4417 O95747;C9JIG9;F8WBK9;Q9UEW8 OXSR1;STK39 Serine/threonine-protein kinase OSR1;STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 121.04 121.04 2 0.0099549 123351 QUIQUE_C1563_190116_001 91.906 46.188 154340000 29452000 0 32740000 19847000 27469000 28596000 0 0 0 16239000 0 0 0 5789 1746;4417 5425 51907;51908;51909;51910;51911;51912;51913;51914;51915 66036;66037;66038;66039;66040;66041;66042;66043;66044;66045;66046;66047;66048;66049;66050;66051;66052 66046 17 DENATLDGGDVLFTGR Unmodified 1678.7798 0.77984305 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.59 111.59 2;3 1.6445E-79 114927 QUIQUE_C1277_190116_001 207.66 173.7 7445800000 1416700000 461630000 733920000 718410000 542580000 716200000 480740000 186430000 280690000 741690000 579760000 298760000 288260000 5790 1684 5426 51916;51917;51918;51919;51920;51921;51922;51923;51924;51925;51926;51927;51928;51929;51930;51931 66053;66054;66055;66056;66057;66058;66059;66060;66061;66062;66063;66064;66065;66066;66067;66068;66069;66070;66071;66072;66073;66074;66075;66076;66077;66078;66079;66080;66081;66082;66083;66084;66085 66056 33 DENHPNLIR Unmodified 1106.5469 0.54687041 4344 Q9NZD2;F5H0U5;H0YFS9 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 21.791 21.791 3 0.0010391 14278 QUIQUE_C1277_190116_001 79.906 59.603 265050000 54164000 43690000 0 36279000 0 28556000 47693000 35241000 0 19431000 0 0 0 5791 4344 5427 51932;51933;51934;51935;51936;51937;51938;51939;51940 66086;66087;66088;66089;66090;66091;66092;66093;66094;66095 66087 9 DENQSINHQMAQEDAQR Oxidation (M) 2028.8555 0.85554397 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.05 18.05 3 6.2056E-13 10394 QUIQUE_C1403_190116_001 122.1 113.61 564950000 80491000 55748000 52410000 56727000 55158000 53840000 0 25752000 37966000 43733000 46026000 28027000 29072000 5792 2161 5428 51941;51942;51943;51944;51945;51946;51947;51948;51949;51950;51951;51952 66096;66097;66098;66099;66100;66101;66102;66103;66104;66105;66106;66107;66108 66100 1503 12 DENQSINHQMAQEDAQR Unmodified 2012.8606 0.86062935 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 29.984 29.984 2;3 1.3638E-223 24101 QUIQUE_C1368_190116_001 275.83 250.98 1445500000 187480000 143960000 179080000 170700000 62826000 159350000 167330000 56100000 61059000 65338000 72985000 53376000 65883000 5793 2161 5428 51953;51954;51955;51956;51957;51958;51959;51960;51961;51962;51963;51964;51965;51966;51967;51968;51969;51970;51971;51972 66109;66110;66111;66112;66113;66114;66115;66116;66117;66118;66119;66120;66121;66122;66123;66124;66125;66126;66127;66128;66129;66130 66115 21 DENSDYTLFNLIPVGLR Unmodified 1964.9844 0.98435652 2723 P61328;C9JIN3;C9JUK8 FGF12 Fibroblast growth factor 12;Fibroblast growth factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 170.63 170.63 2;3 6.6257E-17 175363 QUIQUE_C1368_190116_001 136.93 127.4 206210000 16155000 9514800 36556000 0 38646000 8462700 66555000 0 0 9172200 0 0 21149000 5794 2723 5429 51973;51974;51975;51976;51977;51978;51979;51980;51981 66131;66132;66133;66134;66135;66136;66137;66138;66139 66133 9 DENSVELTMAEGPYK Unmodified 1681.7505 0.75051676 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.028 95.028 2 2.4021E-18 98112 QUIQUE_C1218_190116_001 144.1 125.84 952160000 92945000 94555000 96482000 99924000 80799000 98545000 99712000 40610000 56473000 42943000 83784000 65391000 0 5795 956;3084 5430 51982;51983;51984;51985;51986;51987;51988;51989;51990;51991;51992;51993 66140;66141;66142;66143;66144;66145;66146;66147;66148;66149;66150;66151;66152;66153;66154;66155;66156;66157;66158 66140 18 DENSVELTMAEGPYK Oxidation (M) 1697.7454 0.74543138 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 1 0 1 70.012 70.012 2 0.00068384 71277 QUIQUE_C1438_190116_001 75.819 58.383 29813000 0 0 0 0 29813000 0 0 0 0 0 0 0 0 5796 956;3084 5430 51994 66159 66159 579 1 DENYYQLEELAFR Unmodified 1688.7682 0.76821574 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 139.57 139.57 2;3 0.00037681 135963 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.258 83.37 93515000 0 0 0 0 31075000 0 0 0 0 18239000 44201000 0 0 5797 1187 5431 51995;51996;51997;51998;51999 66160;66161;66162;66163;66164;66165 66163 6 DEPDWESLIFLAR Unmodified 1589.7726 0.77257283 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 167.98 167.98 2 0.00036954 175142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.78 97.917 250490000 63071000 0 0 0 0 56809000 0 0 25973000 0 42026000 37668000 24938000 5798 2554 5432 52000;52001;52002;52003;52004;52005;52006 66166;66167;66168;66169;66170;66171;66172 66170 7 DEPGAWEETFK Unmodified 1307.567 0.56699673 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 89.217 89.217 2 0.052275 91499 QUIQUE_C1368_190116_001 51.436 33.124 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5799 956;3084 5433 52007;52008 66173;66174 66173 2 DEPSVAAMVYPFTGDHK Unmodified 1862.8509 0.85089951 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 116.25 116.25 2;3 0.00568 119892 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.567 33.933 288850000 0 0 0 41595000 0 0 0 73415000 65181000 0 76704000 31954000 0 5800 2623 5434 52009;52010;52011;52012;52013;52014;52015;52016 66175;66176;66177;66178;66179;66180;66181;66182;66183;66184 66184 9 DEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQR Unmodified 3660.7332 0.7332338 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 170.56 170.56 3 0.018883 173197 QUIQUE_C1403_190116_001 22.773 17.717 15351000 0 0 0 15351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5801 7 5435 52017 66185 66185 1 DEQFEEYVQNFK Unmodified 1574.6889 0.68890278 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 117.44 117.44 2 0.0006885 114456 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52034;52035;52036;52037;52038;52039;52040;52041;52042;52043 66203;66204;66205;66206;66207;66208;66209;66210;66211;66212;66213;66214 66214 12 DEQGFGGAFPAR Unmodified 1250.568 0.56799978 3801 Q96AG3 SLC25A46 Solute carrier family 25 member 46 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.977 71.977 2 0.00068644 72137 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.15 69.525 227180000 0 0 0 41756000 0 46197000 0 0 45651000 0 46583000 0 46995000 5805 3801 5439 52044;52045;52046;52047;52048 66215;66216;66217;66218;66219;66220 66220 4 DEQLESLFQR Unmodified 1263.6095 0.60953025 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 106.85 106.85 2 0.0078433 103636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.81 70.154 48927000 0 0 0 0 0 0 31946000 0 0 16981000 0 0 0 5806 1883 5440 52049;52050;52051;52052;52053 66221;66222;66223;66224;66225 66225 3 DEQLLTNVLETLR Unmodified 1542.8253 0.82533668 4388 Q9P2I0 CPSF2 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 yes yes 0 0 0 1 157.23 157.23 2 0.0018865 160855 QUIQUE_C1403_190116_001 93.345 69.359 28279000 0 0 0 28279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5807 4388 5441 52054 66226 66226 1 DEQQISAAVEK Unmodified 1216.5935 0.59354583 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.183 37.183 2 0.0001167 32741 QUIQUE_C1403_190116_001 130.94 56.813 1200200000 149540000 109180000 190850000 172060000 58387000 159600000 120200000 0 0 0 111170000 61171000 68062000 5808 3421 5442 52055;52056;52057;52058;52059;52060;52061;52062;52063;52064 66227;66228;66229;66230;66231;66232;66233;66234;66235;66236;66237;66238;66239;66240;66241;66242;66243 66231 17 DEQSAVSMLK Oxidation (M) 1122.5227 0.52268908 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 36.759 36.759 2 0.019578 31221 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.558 35.033 214700000 50730000 34016000 0 0 0 0 0 0 27733000 74379000 0 27841000 0 5809 2851 5443 52065;52066;52067;52068;52069;52070 66244;66245;66246;66247;66248;66249 66247 2279 5 DEQSAVSMLK Unmodified 1106.5278 0.52777445 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.411 58.411 2 0.00048526 57907 QUIQUE_C1218_190116_001 110.87 45.834 400150000 64788000 70058000 71008000 50737000 45676000 44488000 53393000 0 0 0 0 0 0 5810 2851 5443 52071;52072;52073;52074;52075;52076;52077;52078;52079 66250;66251;66252;66253;66254;66255;66256;66257;66258 66250 8 DEQYLFLVR Unmodified 1181.6081 0.60807369 3747 Q92673;E9PKB0;E9PS32;E9PP43;E9PPB3 SORL1 Sortilin-related receptor yes no 0 0 0 1 1 117.74 117.74 2 0.023501 122111 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.682 37.611 18608000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18608000 5811 3747 5444 52080;52081 66259;66260 66260 2 DEREDITHTYK Unmodified 1405.6474 0.64737232 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 21.861 21.861 2;3 0.0051516 14807 QUIQUE_C1368_190116_001 64.827 52.558 379260000 35829000 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66275;66276;66277;66278;66279;66280;66281;66282;66283;66284;66285;66286;66287 66278 13 DESGSPESIR Unmodified 1075.4782 0.47818172 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.94 21.94 2 0.0029074 15257 QUIQUE_C1576_190116_001 99.802 45.253 167010000 0 39315000 0 27285000 0 28614000 42768000 0 0 0 0 29031000 0 5815 982 5448 52109;52110;52111;52112;52113;52114 66288;66289;66290;66291;66292;66293 66291 6 DESKEPIVEVR Unmodified 1299.667 0.66704513 2057;28;265 A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 31.828 31.828 2;3 4.6295E-05 26725 QUIQUE_C1403_190116_001 113.38 91.708 9900200000 714080000 1111900000 925390000 804590000 820670000 543930000 883030000 330710000 984710000 373380000 894900000 309900000 1203100000 5816 265;28;2057 5449 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transcripts 1 yes yes 0 0 1 1 1 21.955 21.955 2 0.0019567 14842 QUIQUE_C1368_190116_001 92.943 56.25 43848000 0 0 0 0 0 0 43848000 0 0 0 0 0 0 5819 3766 5452 52142;52143 66323;66324 66323 2 DETMSPSTAFQVK Unmodified 1439.6602 0.66024519 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 78.505 78.505 2 0.00041643 79383 QUIQUE_C1218_190116_001 96.171 48.569 61588000 61588000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5820 2948 5453 52144;52145 66325;66326;66327 66326 3 DETNYGIPQR Unmodified 1191.552 0.55201537 2787 P63244;D6RAC2;D6REE5;D6RHH4;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RBD0;D6RFZ9;D6RAU2;E9PD14;D6RGK8;D6R909 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48 48 2 0.00022828 45952 QUIQUE_C1218_190116_001 124.98 102.24 4374200000 302490000 342150000 456400000 391860000 359420000 335300000 409400000 257580000 289190000 147790000 435620000 313370000 333670000 5821 2787 5454 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66375;66376;66377;66378;66379;66380 66377 6 DEVLYVFPSDFCR Unmodified 1645.7446 0.74464352 394 A0A1W2PS43;Q14108;A0A1W2PPX5;A0A1W2PQR6;A0A1W2PQB7;A0A1W2PRS1;A0A1W2PRF6 SCARB2 Lysosome membrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.29 139.29 2 1.7454E-07 143514 QUIQUE_C1277_190116_001 130.94 116.27 1120700000 116830000 99095000 91537000 95211000 99306000 80715000 101220000 50865000 94091000 41552000 99318000 60342000 90607000 5831 394 5464 52194;52195;52196;52197;52198;52199;52200;52201;52202;52203;52204;52205;52206 66381;66382;66383;66384;66385;66386;66387;66388;66389;66390;66391;66392;66393;66394 66382 12 DEVPYLR Unmodified 890.44978 0.44978213 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 1 58.924 58.924 2 0.048432 57942 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.915 39.328 23886000 0 0 0 0 0 0 0 0 23886000 0 0 0 0 5832 2282 5465 52207 66395 66395 1 DEVQEVVFVPAGTHTPGSR Unmodified 2023.9963 0.99631819 1297 J3QL71;Q96FV2;J3QRJ1;J3QR84;J3KT79;J3KS57 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 0 2 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52230;52231;52232;52233;52234;52235;52236;52237;52238;52239;52240;52241;52242;52243;52244;52245;52246;52247;52248;52249;52250;52251;52252;52253;52254;52255;52256;52257;52258;52259;52260;52261;52262;52263;52264;52265;52266;52267;52268;52269;52270;52271;52272;52273;52274;52275;52276;52277;52278;52279;52280;52281;52282;52283;52284;52285;52286;52287;52288;52289;52290;52291;52292;52293;52294 66420;66421;66422;66423;66424;66425;66426;66427;66428;66429;66430;66431;66432;66433;66434;66435;66436;66437;66438;66439;66440;66441;66442;66443;66444;66445;66446;66447;66448;66449;66450;66451;66452;66453;66454;66455;66456;66457;66458;66459;66460;66461;66462;66463;66464;66465;66466;66467;66468;66469;66470;66471;66472;66473;66474;66475;66476;66477;66478;66479;66480;66481;66482;66483;66484;66485;66486;66487;66488;66489;66490;66491;66492;66493;66494;66495;66496;66497;66498;66499;66500;66501;66502;66503;66504;66505;66506;66507;66508;66509;66510;66511;66512;66513;66514;66515;66516;66517;66518;66519;66520;66521;66522;66523;66524;66525;66526;66527;66528 66438 100 DEVQNAVQR Unmodified 1057.5152 0.51523593 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 22.438 22.438 2 0.035319 15655 QUIQUE_C1218_190116_001 69.998 45.844 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5835 2037 5468 52295 66529 66529 1 DEWGLVAPISPGPLTPMR Unmodified 1934.9924 0.99241879 2009 P11137;E7EV03 MAP2 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DEYDDLSDLNAVQMESVR Unmodified 2097.9161 0.91607854 1488 O15173;U3KQM0 PGRMC2 Membrane-associated progesterone receptor component 2 yes no 0 0 0 1 1 130.81 130.81 2 0.002841 135692 QUIQUE_C1218_190116_001 75.764 65.976 63917000 39293000 0 0 24623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5838 1488 5471 52325;52326 66569;66570 66569 1 DFAAEVVHPGDLK Unmodified 1396.6987 0.69867961 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 1 77.74 77.74 2;3 3.5783E-07 79543 QUIQUE_C1218_190116_001 152.7 124.95 1160200000 214880000 250060000 96668000 207830000 196440000 0 0 0 0 29046000 0 67325000 98000000 5839 2641 5472 52327;52328;52329;52330;52331;52332;52333;52334;52335;52336;52337;52338;52339;52340;52341 66571;66572;66573;66574;66575;66576;66577;66578;66579;66580;66581;66582;66583;66584;66585;66586 66572 12 DFAAVEEVAPAKPPR Unmodified 1595.8308 0.83075641 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 69.757 69.757 3 0.02527 69094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.277 58.828 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5840 3277 5473 52342 66587 66587 1 DFADIPNLR Unmodified 1059.5349 0.53490874 2172 P20774;Q5TBF5 OGN Mimecan yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.419 99.419 2 0.0020096 101522 QUIQUE_C1403_190116_001 97.798 64.06 1020800000 93656000 0 0 255660000 298670000 0 248770000 0 0 60786000 63213000 0 0 5841 2172 5474 52343;52344;52345;52346;52347;52348;52349 66588;66589;66590;66591;66592;66593;66594;66595;66596;66597 66590 10 DFAIDIIK Unmodified 933.51713 0.51713341 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 111.68 111.68 2 0.03977 116297 QUIQUE_C1576_190116_001 60.682 27.166 289660000 0 0 35773000 0 82204000 27499000 48798000 41880000 0 17563000 0 35940000 0 5842 3120 5475 52350;52351;52352;52353;52354;52355;52356 66598;66599;66600;66601;66602;66603;66604;66605 66602 8 DFALLSLQVPLK Unmodified 1342.786 0.78603805 290;327;328 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QUIQUE_C1218_190116_001 46.41 35.152 28728000 0 28728000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5853 3393 5486 52451;52452 66709;66710 66709 2 DFDPAVTEYIQR Unmodified 1452.6885 0.68850885 1962 P09467;A0A3B3IUC7;Q5VZC3 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 106.99 106.99 2 0.0016085 110193 QUIQUE_C1403_190116_001 80.24 62.376 78451000 0 0 0 37509000 0 0 0 0 0 0 40942000 0 0 5854 1962 5487 52453;52454 66711;66712 66711 2 DFDTALK Unmodified 808.39668 0.39668393 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.365 47.365 2 0.030069 45032 QUIQUE_C1368_190116_001 90.986 55.88 862740000 0 0 223550000 0 0 0 0 0 0 0 230370000 199060000 209760000 5855 2343 5488 52455;52456;52457;52458 66713;66714;66715;66716;66717 66713 5 DFEELKAEEVDVTK Unmodified 1650.7988 0.79884716 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 83.221 83.221 2;3 6.0207E-58 85687 QUIQUE_C1438_190116_001 203.7 176.59 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DFEGCSVLR Unmodified 1081.4862 0.48624399 4161 Q9H3S7;C9JD91 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes no 0 0 0 1 1 1 64.705 64.705 2 0.012317 64617 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.501 53.466 39333000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39333000 5859 4161 5492 52481;52482;52483 66752;66753;66754 66754 3 DFEIIDNHDYSYTVK Unmodified 1857.8421 0.84210896 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 2 100.23 100.23 2;3 0.0014064 96898 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.862 52.214 62820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62820000 0 0 0 5860 3061 5493 52484;52485;52486 66755;66756;66757 66756 3 DFENSMNQVK Unmodified 1210.5288 0.52883709 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 52.278 52.278 2 0.0093574 50023 QUIQUE_C1218_190116_001 88.294 60.412 61997000 47025000 0 0 0 0 0 0 0 0 14973000 0 0 0 5861 236 5494 52487;52488;52489 66758;66759;66760 66758 2 DFENSMNQVK Oxidation (M) 1226.5238 0.52375171 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 23.735 23.735 2 0.033938 17213 QUIQUE_C1218_190116_001 93.162 64.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5862 236 5494 52490 66761 66761 1 DFEPSLGPVCPFR Unmodified 1519.7129 0.71294946 1923 P07585;F8VX58;F8VXZ8;F8VUF6;F8VWU0;F8VNW0;F8VU58;F8VSI3;F8VNV6 DCN Decorin yes no 0 0 0 1 1 1 125.88 125.88 2 0.028033 131264 QUIQUE_C1438_190116_001 37.556 28.975 161380000 37570000 0 0 67499000 56311000 0 0 0 0 0 0 0 0 5863 1923 5495 52491;52492;52493 66762;66763;66764 66764 3 DFEQPLAISR Unmodified 1174.5982 0.59823728 1378 O00151 PDLIM1 PDZ and LIM domain protein 1 yes yes 0 0 0 1 17.461 17.461 3 0.060986 9784 QUIQUE_C1438_190116_001 24.838 8.167 1070100000 0 0 0 0 1070100000 0 0 0 0 0 0 0 0 5864 1378 5496 52494 66765 66765 1 DFESHITSYK Unmodified 1225.5615 0.56151742 645 Q99613;B5ME19;H3BPE3 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 49.641 49.641 2;3 0.0012409 47325 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.02 83.477 354950000 90300000 57026000 0 50569000 0 32019000 0 49258000 20450000 11509000 0 43817000 0 5865 645 5497 52495;52496;52497;52498;52499;52500;52501;52502;52503;52504 66766;66767;66768;66769;66770;66771;66772;66773;66774;66775;66776;66777 66772 10 DFFHGLR Unmodified 890.43989 0.43988615 4295 Q9NTZ6 RBM12 RNA-binding protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 63.969 63.969 2 0.025454 63756 QUIQUE_C1277_190116_001 95.957 44.17 79934000 0 21151000 20321000 17346000 21115000 0 0 0 0 0 0 0 0 5866 4295 5498 52505;52506;52507;52508;52509 66778;66779;66780;66781;66782;66783 66778 6 DFFLANASR Unmodified 1039.5087 0.50869399 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 85.227 85.227 1;2 0.00046545 86967 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.81 112.04 1829400000 0 158940000 175240000 186960000 162590000 123880000 167710000 23995000 193540000 83005000 203890000 171550000 178060000 5867 1921 5499 52510;52511;52512;52513;52514;52515;52516;52517;52518;52519;52520;52521;52522 66784;66785;66786;66787;66788;66789;66790;66791;66792;66793;66794;66795;66796;66797;66798;66799 66798 15 DFFNYLPLSSQDPAPVR Unmodified 1964.9632 0.96322715 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.86 147.86 2;3 2.3707E-05 153617 QUIQUE_C1218_190116_001 71.601 30.877 475640000 58901000 0 225850000 0 0 0 0 49737000 0 24826000 68215000 0 48113000 5868 739 5500 52523;52524;52525;52526;52527;52528 66800;66801;66802;66803;66804;66805;66806 66800 7 DFFQSYGNVVELR Unmodified 1572.7573 0.75725712 2984 Q13283 G3BP1 Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 135.66 135.66 2 0.0005113 139889 QUIQUE_C1277_190116_001 104.82 93.918 109640000 0 41753000 0 0 0 0 0 0 0 23026000 44858000 0 0 5869 2984 5501 52529;52530;52531 66807;66808;66809 66807 3 DFFSLPLPLAPEFIR Unmodified 1760.9501 0.95014327 4092 Q9C0B6 BRINP2 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 172.71 172.71 2 0.0013216 175989 QUIQUE_C1277_190116_001 88.187 77.577 70603000 16400000 17712000 0 0 0 0 13985000 7796500 0 0 0 14709000 0 5870 4092 5502 52532;52533;52534;52535;52536 66810;66811;66812;66813;66814 66811 5 DFFSMKPEWENLNQSNVR Unmodified 2240.0321 0.03205177 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 126.11 126.11 3 1.3743E-10 130018 QUIQUE_C1277_190116_001 99.891 85.419 164430000 28590000 51288000 0 25260000 0 0 24533000 0 0 0 34758000 0 0 5871 4152 5503 52537;52538;52539;52540;52541 66815;66816;66817;66818;66819 66816 3 DFFTSGSPEETAFR Unmodified 1589.6998 0.69980182 1569 O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4;A0A2R8Y5G3;C9JY58 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.95 112.95 2 0.0005593 115173 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 91.298 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5872 1569 5504 52542;52543;52544;52545;52546;52547 66820;66821;66822;66823;66824;66825 66825 6 DFGGVTNGKPEDK Unmodified 1362.6416 0.64155866 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 24.718 24.718 2 0.0045144 18720 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.813 60.574 24686000 0 0 0 0 0 0 0 0 24686000 0 0 0 0 5873 4186 5505 52548;52549 66826;66827 66827 2 DFGLWTTPAGPK Unmodified 1288.6452 0.64518747 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.57 114.57 2 0.0043205 111661 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.977 50.648 148760000 0 0 0 49297000 0 29651000 46163000 23645000 0 0 0 0 0 5874 4197 5506 52550;52551;52552;52553;52554 66828;66829;66830;66831;66832 66832 5 DFGNYLFNFASAATK Unmodified 1664.7835 0.78347187 3796 Q96A49 SYAP1 Synapse-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.92 159.92 2 1.3522E-12 163674 QUIQUE_C1403_190116_001 132.5 115.03 528350000 27260000 31010000 41434000 44986000 60971000 53319000 32005000 44420000 44774000 17483000 43334000 37480000 49869000 5875 3796 5507 52555;52556;52557;52558;52559;52560;52561;52562;52563;52564;52565;52566;52567 66833;66834;66835;66836;66837;66838;66839;66840;66841;66842;66843;66844;66845;66846;66847;66848 66837 16 DFGSFDK Unmodified 814.34973 0.34973373 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.862 50.862 1;2 0.0021747 49643 QUIQUE_C1218_190116_001 197.65 126.29 8961800000 1016000000 707190000 1123400000 717170000 621790000 900470000 770200000 320890000 567800000 437250000 642930000 493820000 642820000 5876 1855 5508 52568;52569;52570;52571;52572;52573;52574;52575;52576;52577;52578;52579;52580;52581 66849;66850;66851;66852;66853;66854;66855;66856;66857;66858;66859;66860;66861;66862;66863;66864 66850 15 DFGSFDKFK Unmodified 1089.5131 0.51311067 1855 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transmembrane protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 127.33 127.33 3 0.00029379 130427 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.191 83.866 120160000 0 0 0 16576000 0 0 0 23900000 25779000 0 20286000 15879000 17744000 5892 4158 5524 52721;52722;52723;52724;52725;52726;52727 67029;67030;67031;67032;67033;67034;67035;67036 67031 8 DFINSELLAQLYSSEDQNTLMEESAEQAQR Unmodified 3458.5784 0.57837264 4528 Q9UQ16;H0YBC6 DNM3 Dynamin-3 yes no 0 0 0 1 166.54 166.54 3 0.018252 171123 QUIQUE_C1218_190116_001 24.454 22.251 39649000 39649000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5893 4528 5525 52728 67037 67037 1 DFISLGLQDGHLVFR Unmodified 1715.8995 0.89950468 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 145.2 145.2 3 0.00079354 149084 QUIQUE_C1403_190116_001 65.805 46.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5894 2834 5526 52729 67038 67038 1 DFISNLLK Unmodified 948.52803 0.52803245 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.23 134.23 2 0.0084554 140538 QUIQUE_C1438_190116_001 94.262 56.024 637460000 52292000 0 61323000 54824000 56879000 0 59826000 62683000 68517000 30916000 49265000 74938000 65999000 5895 3154 5527 52730;52731;52732;52733;52734;52735;52736;52737;52738;52739;52740 67039;67040;67041;67042;67043;67044;67045;67046;67047;67048;67049 67042 11 DFITGEVISALGR Unmodified 1376.73 0.72997974 237 A0A0C4DGA7;O94929;D6RHE7 ABLIM3 Actin-binding LIM protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 148.08 148.08 2 0.0010792 154234 QUIQUE_C1576_190116_001 82.171 65.5 48049000 0 0 0 0 18392000 0 15180000 14477000 0 0 0 0 0 5896 237 5528 52741;52742;52743;52744 67050;67051;67052;67053 67052 4 DFIWGVIGK Unmodified 1033.5597 0.55966693 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.26 134.26 2 0.0043079 138393 QUIQUE_C1403_190116_001 89.296 70.513 248210000 29060000 35359000 25209000 30294000 0 23698000 0 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67077;67078;67079;67080;67081;67082;67083;67084 67080 2 DFKPGDLIFAK Unmodified 1249.6707 0.67067394 1637 O75475 PSIP1 PC4 and SFRS1-interacting protein yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 2 102.8 102.8 2;3 0.00014137 105644 QUIQUE_C1368_190116_001 103.08 87.544 2231800000 248480000 151110000 250850000 189220000 116170000 165190000 236810000 176220000 104130000 36909000 138940000 161740000 256060000 5900 1637 5532 52773;52774;52775;52776;52777;52778;52779;52780;52781;52782;52783;52784;52785;52786;52787;52788;52789;52790;52791;52792 67085;67086;67087;67088;67089;67090;67091;67092;67093;67094;67095;67096;67097;67098;67099;67100;67101;67102;67103;67104;67105;67106;67107;67108;67109;67110;67111;67112;67113;67114 67091 29 DFLAGGIAAAISK Unmodified 1232.6765 0.6764876 2039 P12236 SLC25A6 ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 3 3 2 126.45 126.45 2 0.00043768 130566 QUIQUE_C1277_190116_001 111.52 92.254 3648100000 267640000 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144751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.85 70.782 47281000 0 0 0 0 0 0 0 0 18048000 0 0 0 29233000 5965 4560 5590 53371;53372;53373 67933;67934;67935 67933 2 DFQALNPMK Unmodified 1062.5168 0.51681584 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;A0A0A0MR33;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.416 83.416 2 0.01031 83559 QUIQUE_C1563_190116_001 74.301 46.565 138550000 28877000 0 0 0 0 25963000 30532000 0 0 0 0 21062000 32115000 5966 216;1545 5591 53374;53375;53376;53377;53378 67936;67937;67938;67939;67940;67941;67942 67938 6 DFQDYMEPEEGCQGSPQR Unmodified 2171.8524 0.85243242 1515 O43237;B4E2E0;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 91.215 91.215 2 7.0206E-20 92567 QUIQUE_C1403_190116_001 163.27 158.19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5967 1515 5592 53379;53380 67943;67944 67944 2 DFQEYVEPGEDFPASPQR Unmodified 2109.928 0.92796385 4653 Q9Y6G9;E9PHI6;C9JGM7 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 114.47 114.47 2 2.921E-17 118509 QUIQUE_C1368_190116_001 160.27 152.55 86455000 0 0 46628000 0 0 39827000 0 0 0 0 0 0 0 5968 4653 5593 53381;53382;53383;53384;53385 67945;67946;67947;67948;67949 67946 4 DFQIQVQPVR Unmodified 1228.6564 0.65642086 1158 H0YI08;Q9Y6F6 MRVI1 Protein MRVI1 yes no 0 0 0 1 1 1 83.503 83.503 2 0.0047113 85004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.439 64.265 47644000 0 0 0 21880000 0 0 0 0 25764000 0 0 0 0 5969 1158 5594 53386;53387;53388 67950;67951;67952 67951 3 DFQPVLHLVALNSPLSGGMR Unmodified 2150.1306 0.1306436 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.8 144.8 3 3.8053E-57 151543 QUIQUE_C1438_190116_001 143.04 134.82 650880000 53267000 74700000 36770000 54394000 118150000 28592000 47807000 0 46269000 19606000 57915000 52393000 61016000 5970 2419 5595 53389;53390;53391;53392;53393;53394;53395;53396;53397;53398;53399;53400 67953;67954;67955;67956;67957;67958;67959;67960;67961;67962;67963;67964;67965;67966;67967;67968;67969 67959 17 DFQQYLPLVIEPLIK Unmodified 1815.0182 0.018222832 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 168.98 168.98 2;3 2.8969E-06 170796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.39 87.752 464050000 30980000 41057000 169510000 0 0 0 0 37896000 40445000 0 98693000 45468000 0 5971 1582 5596 53401;53402;53403;53404;53405;53406;53407;53408;53409;53410;53411 67970;67971;67972;67973;67974;67975;67976;67977;67978;67979;67980 67976 11 DFQSGQHVIVR Unmodified 1284.6575 0.65748349 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.525 34.525 2 3.3747E-13 29812 QUIQUE_C1403_190116_001 167.67 156.08 7547100000 770230000 955800000 574850000 720280000 657550000 486520000 884910000 0 387340000 277460000 682300000 522560000 627300000 5972 1245 5597 53412;53413;53414;53415;53416;53417;53418;53419;53420;53421;53422;53423 67981;67982;67983;67984;67985;67986;67987;67988;67989;67990;67991;67992;67993;67994 67986 11 DFQWTDNTGLQFENWR Unmodified 2055.9075 0.90750318 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 150.23 150.23 2;3 2.3261E-44 157505 QUIQUE_DMIX5_190116_001 218.01 207.4 651500000 65726000 39763000 46925000 29094000 56516000 21956000 74151000 48692000 83177000 0 66197000 73165000 46135000 5973 1436 5598 53424;53425;53426;53427;53428;53429;53430;53431;53432;53433;53434;53435;53436;53437;53438 67995;67996;67997;67998;67999;68000;68001;68002;68003;68004;68005;68006;68007;68008;68009;68010;68011;68012;68013;68014 68010 19 DFQYNEEEMK Unmodified 1331.534 0.53398204 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.835 59.835 2 0.0018689 57887 QUIQUE_C1563_190116_001 93.111 86.493 370910000 58442000 74149000 70580000 58629000 32181000 56367000 0 0 0 20559000 0 0 0 5974 2176 5599 53439;53440;53441;53442;53443;53444;53445 68015;68016;68017;68018;68019;68020;68021;68022;68023 68020 9 DFQYNEEEMKADKEEMNR Unmodified 2304.9627 0.96271116 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 57.227 57.227 3;4 6.8578E-23 54740 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.62 135.81 970130000 0 98377000 51800000 69486000 0 0 31193000 122430000 81929000 0 102840000 99371000 312700000 5975 2176 5600 53446;53447;53448;53449;53450;53451;53452;53453;53454;53455;53456;53457;53458;53459;53460 68024;68025;68026;68027;68028;68029;68030;68031;68032;68033;68034;68035;68036;68037;68038 68037 13 DFQYVDRDGKDQGVNVR Unmodified 2009.9555 0.95551601 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 2 1 1 46.717 46.717 3 0.0014301 44348 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.12 59.167 144270000 0 0 0 0 0 0 0 86065000 0 0 0 0 58207000 5976 4654 5601 53461;53462 68039;68040;68041 68039 3 DFSAFINLVEFCR Unmodified 1616.7657 0.76571331 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 169.31 169.31 2 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69.201 50144000 0 0 0 34415000 0 0 0 0 0 15729000 0 0 0 5979 2566 5604 53490;53491 68073;68074;68075 68073 3 DFSELEPDKFQNK Unmodified 1595.7468 0.74675201 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 1 1 1 77.5 77.5 2 0.0074116 78663 QUIQUE_C1368_190116_001 91.584 73.272 23423000 0 0 23423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5980 948 5605 53492;53493 68076;68077 68076 1 DFSGNASCHPPEAK Unmodified 1515.6412 0.64124108 1514 O43236;J3QLA8;J3QRS4 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 0 1 21.759 21.759 2 0.034987 14766 QUIQUE_C1277_190116_001 52.495 43.647 25657000 0 25657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5981 1514 5606 53494 68078 68078 1 DFSGTSDPFVK Unmodified 1198.5506 0.55061839 1532 O43581 SYT7 Synaptotagmin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.153 81.153 2 0.0023707 81820 QUIQUE_C1403_190116_001 103.55 89.967 372820000 53932000 60234000 69737000 56799000 0 47741000 57305000 0 0 27071000 0 0 0 5982 1532 5607 53495;53496;53497;53498;53499;53500;53501 68079;68080;68081;68082;68083;68084;68085 68082 3 DFSHPCTWQVLDGAEDTLR Unmodified 2246.0062 0.00623095 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 130.06 130.06 3 0.026027 135003 QUIQUE_C1368_190116_001 30.534 26.871 59660000 0 0 38125000 0 0 21535000 0 0 0 0 0 0 0 5983 4012 5608 53502;53503 68086;68087 68086 1 DFSISGGELGPTMK Unmodified 1437.681 0.68098063 3861 Q96GR2;F5H4U6 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.46 103.46 2 0.00044374 106110 QUIQUE_C1277_190116_001 104.79 67.604 216250000 31121000 32299000 37261000 0 0 34620000 0 37528000 31339000 12085000 0 0 0 5984 3861 5609 53504;53505;53506;53507;53508;53509;53510 68088;68089;68090;68091;68092;68093;68094 68089 7 DFSISGGELGPTMK Oxidation (M) 1453.6759 0.67589525 3861 Q96GR2;F5H4U6 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 1 0 1 1 1 86.13 86.13 2 0.0037359 88211 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.184 74.568 121100000 0 0 0 0 0 0 0 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68114;68115;68116;68117;68118;68119;68120;68121 68120 8 DFSPSGIFGAFQR Unmodified 1427.6834 0.68336389 729 C9JJT5;C9JU26;G3V325;P56134 ATP5J2-PTCD1;ATP5J2 ATP synthase subunit f, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.46 146.46 2 4.3023E-08 151568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.95 130.31 3520000000 254320000 240780000 289920000 155680000 123570000 204040000 220500000 377670000 414460000 99877000 476470000 347880000 314850000 5988 729 5612 53534;53535;53536;53537;53538;53539;53540;53541;53542;53543;53544;53545;53546;53547 68122;68123;68124;68125;68126;68127;68128;68129;68130;68131;68132;68133;68134;68135;68136;68137;68138;68139;68140;68141;68142;68143;68144;68145;68146 68137 25 DFSPVPWSQYFESMEDVEVENETGKDTFR Unmodified 3467.514 0.51398147 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 164.99 164.99 3 3.5012E-31 170738 QUIQUE_C1576_190116_001 112.99 108.09 260600000 0 0 0 0 40280000 0 36709000 0 48983000 0 0 63763000 70865000 5989 4617 5613 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0.29930143 2897 Q05707;A0A0A0MQT7 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 146.9 146.9 3 0.00028186 150808 QUIQUE_C1403_190116_001 44.632 41.946 41138000 0 0 0 41138000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5992 2897 5616 53573 68174 68174 1 DFSSVFQFLR Unmodified 1244.619 0.61897272 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 161.66 161.66 2 0.00010962 166035 QUIQUE_DMIX7_190116_001 139.19 89.373 625860000 0 0 153520000 0 0 137140000 0 0 115720000 0 126810000 92676000 0 5993 2338 5617 53574;53575;53576;53577;53578;53579 68175;68176;68177;68178;68179;68180 68180 6 DFSSVFQFLREEETF Unmodified 1879.8628 0.8628444 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.26 172.26 2 1.9702E-110 173809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 224.82 211.83 353470000 0 0 0 0 16081000 0 22653000 46913000 80067000 0 71255000 87046000 29451000 5994 2338 5618 53580;53581;53582;53583;53584;53585;53586 68181;68182;68183;68184;68185;68186;68187 68183 6 DFSVFFQK Unmodified 1016.4967 0.49673232 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.43 121.43 2 0.0040378 125100 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 96.94 574380000 61217000 39326000 58861000 37188000 29104000 40922000 39383000 39883000 0 27050000 75539000 69769000 56133000 5995 1713 5619 53587;53588;53589;53590;53591;53592;53593;53594;53595;53596;53597;53598;53599 68188;68189;68190;68191;68192;68193;68194;68195;68196;68197;68198;68199;68200;68201 68189 14 DFSWSPGGNIIAFWVPEDKDIPAR Unmodified 2716.3286 0.32855137 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 164.5 164.5 3 0.0011353 169130 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.523 30.335 182250000 0 0 0 0 0 0 0 0 44022000 0 48579000 59712000 29937000 5996 2674 5620 53600;53601;53602;53603 68202;68203;68204;68205 68202 3 DFTATDLSEFAAK Unmodified 1414.6616 0.6616254 2453 P42765;A0A0B4J2A4 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 116.99 116.99 2 1.5411E-52 119465 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.25 162.95 6545100000 450310000 470820000 660200000 451650000 482390000 512960000 546590000 528790000 476200000 206310000 682000000 462400000 614470000 5997 2453 5621 53604;53605;53606;53607;53608;53609;53610;53611;53612;53613;53614;53615;53616;53617;53618;53619 68206;68207;68208;68209;68210;68211;68212;68213;68214;68215;68216;68217;68218;68219;68220;68221;68222;68223 68215 18 DFTATFGPLDSLNTR Unmodified 1653.7999 0.79985021 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.29 137.29 2 6.051E-09 142748 QUIQUE_C1368_190116_001 138.45 129.02 2351700000 180290000 188910000 226860000 159790000 205040000 176000000 177920000 157920000 201170000 75077000 252410000 160500000 189780000 5998 2026 5622 53620;53621;53622;53623;53624;53625;53626;53627;53628;53629;53630;53631;53632 68224;68225;68226;68227;68228;68229;68230;68231;68232;68233;68234;68235;68236;68237;68238;68239;68240;68241;68242;68243;68244;68245;68246;68247 68229 24 DFTCVHQALK Unmodified 1217.5863 0.58629239 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 39.183 39.183 2;3 0.00023561 35846 QUIQUE_C1438_190116_001 117.89 88.741 684350000 41728000 71296000 82832000 28627000 165470000 38178000 43124000 0 0 29333000 144280000 0 39478000 5999 1879 5623 53633;53634;53635;53636;53637;53638;53639;53640;53641;53642;53643;53644;53645;53646 68248;68249;68250;68251;68252;68253;68254;68255;68256;68257;68258;68259;68260;68261;68262;68263 68255 15 DFTDIQQDFLPWK Unmodified 1651.7882 0.7882229 870 E7ESY4;Q13330;H0Y4T7 MTA1 Metastasis-associated protein MTA1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 159.53 159.53 2 4.1066E-05 163685 QUIQUE_C1277_190116_001 130.98 117.89 29218000 0 0 24508000 0 0 0 0 0 0 4709800 0 0 0 6000 870 5624 53647;53648;53649;53650 68264;68265;68266;68267;68268 68264 4 DFTENPCLR Unmodified 1150.5077 0.50770771 1407 O00451 GFRA2 GDNF family receptor alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 56.054 56.054 2 0.015343 54722 QUIQUE_C1576_190116_001 67.277 47.641 50992000 23755000 0 0 0 0 0 27237000 0 0 0 0 0 0 6001 1407 5625 53651;53652 68269;68270;68271 68271 3 DFTLEPLR Unmodified 989.5182 0.51819605 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y7R3;H0Y493;H0Y7J9 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.56 100.56 2 0.031344 103668 QUIQUE_C1368_190116_001 66.138 14.12 338570000 0 0 66224000 0 91662000 0 72938000 107740000 0 0 0 0 0 6002 1056 5626 53653;53654;53655;53656 68272;68273;68274;68275 68272 4 DFTPAELR Unmodified 947.47125 0.47124585 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.238 65.238 2 0.0067895 65984 QUIQUE_C1218_190116_001 100.45 74.714 3209500000 389180000 339630000 259470000 309900000 308870000 241160000 313180000 138220000 213330000 120940000 0 288470000 287180000 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68303;68304;68305;68306;68307;68308;68309;68310;68311;68312;68313 68305 11 DFTPVCTTELGR Unmodified 1394.65 0.65001485 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 82.78 82.78 2 2.2479E-06 83959 QUIQUE_C1277_190116_001 147.95 132.33 66916000000 4035400000 4893000000 5128200000 5640700000 4635700000 5142500000 4914500000 5169600000 6237500000 2601200000 6156200000 5194900000 7167100000 6006 2298 5630 53685;53686;53687;53688;53689;53690;53691;53692;53693;53694;53695;53696;53697;53698 68314;68315;68316;68317;68318;68319;68320;68321;68322;68323;68324;68325;68326;68327;68328;68329;68330;68331;68332;68333;68334;68335;68336 68316 23 DFTSEQIDEILQNHTEIVFAR Unmodified 2504.2183 0.21833222 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 152.76 152.76 3 1.5537E-07 157769 QUIQUE_C1368_190116_001 89.859 60.018 689800000 101370000 91815000 132710000 108550000 0 92405000 162950000 0 0 0 0 0 0 6007 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Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 73.156 73.156 2;3 0 74302 QUIQUE_C1218_190116_001 309.86 268.86 2240900000 351760000 393780000 262420000 299580000 101450000 307070000 151550000 46845000 58912000 67187000 132490000 67813000 0 6010 3055 5633 53716;53717;53718;53719;53720;53721;53722;53723;53724;53725;53726;53727;53728;53729;53730;53731;53732;53733 68360;68361;68362;68363;68364;68365;68366;68367;68368;68369;68370;68371;68372;68373;68374;68375;68376;68377;68378 68361 19 DFTVSALHGDMDQKER Unmodified 1847.8472 0.84721111 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 59.322 59.322 3 7.985E-06 58648 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.96 92.034 476130000 0 0 0 0 0 0 0 176360000 83891000 0 57142000 74381000 84363000 6011 3055 5634 53734;53735;53736;53737;53738 68379;68380;68381;68382;68383 68379 5 DFTVSALHGDMDQKER Oxidation (M) 1863.8421 0.84212573 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 1 1 1 43.136 43.136 3 0.047804 39517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.493 18.166 107240000 0 0 0 0 0 0 0 107240000 0 0 0 0 0 6012 3055 5634 53739 68384 68384 2512 0 DFTVSAMHGDMDQK Unmodified 1580.6599 0.65992761 2697 P60842;J3KT12;J3KSZ0;J3QL52 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 62.242 62.242 2;3 1.4627E-36 61237 QUIQUE_C1368_190116_001 178.65 142.71 479720000 37793000 74473000 85627000 94189000 42547000 65464000 34449000 0 0 0 45178000 0 0 6013 2697 5635 53740;53741;53742;53743;53744;53745;53746;53747;53748;53749;53750;53751 68385;68386;68387;68388;68389;68390;68391;68392;68393;68394;68395;68396 68389 12 DFTVSAMHGDMDQKER Unmodified 1865.8036 0.80363174 2697 P60842;J3KT12;J3KSZ0;J3QL52 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 1 1 50.664 50.664 3 0.024192 47949 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68404;68405;68406;68407;68408;68409;68410;68411;68412 68409 9 DFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLK Unmodified 2710.3742 0.37416416 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 2 166.44 166.44 2;3 1.6616E-87 170904 QUIQUE_DMIX3_190116_001 223.06 212.27 5918300000 25160000 508250000 518030000 351150000 37265000 458500000 46245000 865270000 781800000 151030000 1071900000 0 1103700000 6017 2528 5638 53767;53768;53769;53770;53771;53772;53773;53774;53775;53776;53777;53778;53779;53780;53781;53782;53783;53784;53785 68413;68414;68415;68416;68417;68418;68419;68420;68421;68422;68423;68424;68425;68426;68427;68428;68429;68430;68431 68425 19 DFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLK Unmodified 2711.3694 0.36941313 2347 P32121;K7ENA6;I3L412 ARRB2 Beta-arrestin-2 yes no 0 0 1 1 145.84 145.84 3 0.032541 151610 QUIQUE_C1576_190116_001 27.563 20.685 19026000 0 0 0 0 0 0 19026000 0 0 0 0 0 0 6018 2347 5639 53786 68432 68432 1 DFVEALK Unmodified 820.43307 0.43306943 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 65.945 65.945 2 0.057389 65931 QUIQUE_C1576_190116_001 70.912 37.555 64646000 0 0 0 0 0 26636000 19460000 0 0 0 0 18550000 0 6019 3511 5640 53787;53788;53789 68433;68434;68435 68434 3 DFVEAPSQMLENWVWEQEPLLR Unmodified 2715.3003 0.30028771 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EMU4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 173.21 173.21 3 1.3095E-05 177422 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.203 57.554 152780000 0 0 6523800 0 0 0 23255000 0 34275000 0 50869000 22665000 15194000 6020 2615 5641 53790;53791;53792;53793;53794;53795;53796;53797 68436;68437;68438;68439;68440;68441;68442;68443 68439 5 DFVEAPSQMLENWVWEQEPLLR Oxidation (M) 2731.2952 0.29520233 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EMU4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 168.79 168.79 3 0.00026874 173087 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.392 43.994 101930000 0 0 0 0 0 0 0 41671000 33752000 0 0 0 26510000 6021 2615 5641 53798;53799;53800 68444;68445;68446 68446 2069 2 DFVLVPQMSQHMEDWIPHLK Unmodified 2449.1923 0.19225758 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 149.76 149.76 3;4 0.0010324 154570 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.819 43.111 234550000 0 0 72906000 41659000 0 12584000 43889000 0 22023000 0 0 24279000 17214000 6022 2361 5642 53801;53802;53803;53804;53805;53806;53807;53808;53809 68447;68448;68449;68450;68451;68452;68453;68454;68455;68456;68457 68454 9 DFVNMMLGK Unmodified 1053.4987 0.49872293 3995 Q9BQI0;A6PVM9 AIF1L Allograft inflammatory factor 1-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 124.05 124.05 2 0.025644 126593 QUIQUE_C1563_190116_001 86.953 66.399 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6023 3995 5643 53810;53811;53812;53813;53814 68458;68459;68460;68461;68462 68461 5 DFVNYLVR Unmodified 1024.5342 0.53418046 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 106.09 106.09 2 0.0036731 103613 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.12 87.103 1567200000 130800000 156790000 150440000 112620000 134180000 108380000 117430000 126370000 102850000 45815000 153290000 128910000 99358000 6024 2916 5644 53815;53816;53817;53818;53819;53820;53821;53822;53823;53824;53825;53826;53827;53828 68463;68464;68465;68466;68467;68468;68469;68470;68471;68472;68473;68474;68475;68476;68477;68478;68479;68480;68481 68478 17 DFVPFITK Acetyl (Protein N-term) 1007.5328 0.53278348 428 A0A2R8Y5F1;A0A2R8YGU4;X5D2U8;H3BMQ0;A0A2R8YDZ2;A0A2R8Y7X5;A0A2R8YDR3;A0A2R8Y7C8;A0A2R8YGD6;P49815;A0A2R8Y6C9;I3L3B1 TSC2 Tuberin yes no 1 0 0 1 18.379 18.379 2 0.063365 11049 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.892 6.0201 19618000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19618000 0 0 6025 428 5645 53829 68482 68482 1 DFVSEAYLLTLGK Unmodified 1454.7657 0.76569654 882 E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;A0A087WTQ3;A0A087WVE1 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 155.57 155.57 2 1.5825E-13 162522 QUIQUE_C1368_190116_001 157.97 0 2030300000 149170000 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2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 167.71 167.71 3 1.6078E-17 174888 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.11 92.606 396050000 22508000 70884000 0 20508000 0 0 0 76282000 48956000 11489000 145420000 0 0 6028 2638 5648 53865;53866;53867;53868;53869;53870;53871 68525;68526;68527;68528;68529;68530;68531 68531 7 DFVTEALQSR Unmodified 1164.5775 0.57750184 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.31 105.31 2 2.2724E-05 107979 QUIQUE_C1403_190116_001 146.69 113.43 1060900000 69890000 110650000 107400000 79767000 77649000 117600000 97244000 50425000 78623000 46298000 68510000 68851000 87955000 6029 3116 5649 53872;53873;53874;53875;53876;53877;53878;53879;53880;53881;53882;53883;53884 68532;68533;68534;68535;68536;68537;68538;68539;68540;68541;68542;68543;68544;68545;68546;68547 68535 16 DFWEQEVR Unmodified 1107.4985 0.49852324 3200 Q16822;H0YML5 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 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68633;68634;68635;68636;68637;68638;68639;68640;68641;68642;68643;68644;68645;68646;68647;68648;68649;68650;68651;68652;68653 68652 14 DFYMTDSISR Unmodified 1233.5336 0.53358811 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.167 87.167 2 0.020063 87855 QUIQUE_C1563_190116_001 82.287 58.132 930930000 140010000 96900000 117500000 0 61981000 104450000 104420000 0 104830000 0 77509000 68744000 54591000 6036 2280 5656 53961;53962;53963;53964;53965;53966;53967;53968;53969;53970 68654;68655;68656;68657;68658;68659;68660;68661;68662;68663 68658 7 DFYMTDSISR Oxidation (M) 1249.5285 0.52850274 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 63.785 63.785 2 0.020862 63839 QUIQUE_C1576_190116_001 61.691 49.844 158620000 0 32946000 53768000 0 0 0 34213000 0 0 0 0 37695000 0 6037 2280 5656 53971;53972;53973;53974 68664;68665;68666;68667;68668 68667 5 DFYQFTFNFAK Unmodified 1426.6558 0.65575216 749 C9JVE2;Q96GG9 DCUN1D1 DCN1-like protein;DCN1-like protein 1 yes no 0 0 0 2 1 148.67 148.67 2 0.00044387 153945 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 98.66 18890000 8226900 0 0 0 0 0 10663000 0 0 0 0 0 0 6038 749 5657 53975;53976;53977 68669;68670;68671 68669 2 DGADFAKWR Unmodified 1064.5039 0.50394296 1851;1978 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8;H3BU78;P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;K7EKH5 ALDOA;ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 1 2 53.456 53.456 2;3 0.0092138 51082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.65 49.019 44947000 0 0 0 0 0 0 0 44947000 0 0 0 0 0 6039 1851;1978 5658 53978;53979 68672;68673 68673 2 DGADIHSDLFISIAQALLGGTAR Unmodified 2340.2074 0.2073736 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.56 173.56 3 5.0947E-51 177757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.51 113.57 446110000 32422000 26163000 21998000 8776500 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antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain;HLA 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histocompatibility antigen, A-80 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 69.809 69.809 2;3 5.3044E-223 69691 QUIQUE_C1368_190116_001 298.33 279.49 2792800000 174440000 120150000 380800000 235160000 258860000 89630000 179960000 111580000 180240000 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yes 0 0 0 1 151.38 151.38 2 0.011377 155896 QUIQUE_C1277_190116_001 58.172 54.851 12085000 0 12085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6090 1492 5705 54423 69233 69233 1 DGFFGLSISDR Unmodified 1212.5775 0.57750184 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.86 134.86 2 0.019301 140125 QUIQUE_C1218_190116_001 64.297 43.968 78824000 18600000 14776000 0 11987000 0 0 0 24909000 0 8551800 0 0 0 6091 2665 5706 54424;54425;54426;54427;54428 69234;69235;69236;69237;69238 69234 5 DGFFGNPR Unmodified 908.41407 0.41406533 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 1 58.413 58.413 2 0.0076993 58393 QUIQUE_C1438_190116_001 97.071 77.225 349600000 0 0 164840000 0 184770000 0 0 0 0 0 0 0 0 6092 352 5707 54429;54430 69239;69240 69240 1 DGFIDKEDLHDMLASLGK Oxidation (M) 2018.9619 0.96190652 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 1 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69246;69247;69248;69249;69250;69251;69252;69253;69254;69255;69256;69257;69258;69259;69260;69261;69262;69263;69264;69265;69266;69267;69268;69269;69270;69271;69272;69273;69274;69275;69276;69277;69278;69279;69280;69281;69282;69283;69284;69285 69279 36 DGFIDLMELK Unmodified 1179.5846 0.58456105 3815;4036 Q96C19;H0Y4Y4;Q9BUP0;A0A087X1Z2 EFHD2;EFHD1 EF-hand domain-containing protein D2;EF-hand domain-containing protein D1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 147.79 147.79 2 0.0034764 152482 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.213 68.069 716480000 0 108910000 145560000 143070000 0 92433000 0 97475000 85675000 43358000 0 0 0 6095 3815;4036 5709 54470;54471;54472;54473;54474;54475;54476 69286;69287;69288;69289;69290;69291;69292 69291 7 DGFLADQLDPIYVAYNM Oxidation (M) 1959.8924 0.89242997 315;3080 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4;Q14689 DIP2C;DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog C;Disco-interacting protein 2 homolog A no no 0 1 0 1 170.84 170.84 2 0.00040463 172581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.479 71.471 9882600 0 0 0 0 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69296;69297;69298;69299;69300;69301;69302;69303;69304;69305;69306;69307;69308;69309;69310;69311;69312 69305 16 DGFLMYLLSADGSAFSLAHR Oxidation (M) 2186.0466 0.046639202 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.64 164.64 2;3 6.4259E-08 169686 QUIQUE_C1368_190116_001 101.38 95.854 637970000 0 53632000 46205000 41354000 58903000 0 87777000 40254000 84857000 27912000 64701000 79295000 53075000 6099 2578 5711 54496;54497;54498;54499;54500;54501;54502;54503;54504;54505;54506;54507 69313;69314;69315;69316;69317;69318;69319;69320;69321;69322;69323;69324;69325 69314 2027 10 DGFNPADVEAGLYGSHLYVWDWQR Unmodified 2794.2776 0.27757843 2978 Q13228;A6PVX1;H0Y532 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.67 159.67 3 1.1724E-14 164057 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.16 98.651 1577500000 66203000 0 218320000 116160000 0 0 0 0 573970000 48735000 0 0 554140000 6100 2978 5712 54508;54509;54510;54511;54512;54513;54514 69326;69327;69328;69329;69330;69331;69332;69333;69334 69330 9 DGFPSGTPALNAK Unmodified 1273.6303 0.63026569 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 0 0 0 1 68.126 68.126 2 0.0052395 63745 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.807 68.567 21830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21830000 0 0 0 6101 2974 5713 54515 69335 69335 1 DGFQGCLASVDLNGR Unmodified 1607.7362 0.7362041 319;1097 G5E9G7;Q9P2S2;A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN2;NRXN3 Neurexin-2;Neurexin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.23 104.23 2 0.00054818 106986 QUIQUE_C1277_190116_001 76.522 60.269 136730000 31860000 33173000 0 0 0 0 0 0 0 10462000 61233000 0 0 6102 1097;319 5714 54516;54517;54518;54519;54520 69336;69337;69338;69339;69340 69337 4 DGFVMGEGAAVLVLEEYEHAVQR Unmodified 2518.2162 0.21622373 4313 Q9NWU1 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 166.83 166.83 3 0.0048742 172048 QUIQUE_C1368_190116_001 39.288 36.322 32823000 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42.191 2 0.042768 39260 QUIQUE_C1218_190116_001 80.165 69.292 232630000 50133000 86967000 0 0 0 0 0 0 0 13356000 0 0 82178000 6108 1924 5720 54560;54561;54562;54563 69387;69388;69389;69390 69387 2 DGGIPADPNNVFLSTGASDAIVTVLK Unmodified 2570.3228 0.32279729 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 162.07 162.07 2;3 1.031E-10 164270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.165 87.22 398560000 0 51910000 0 59062000 53422000 45073000 0 116930000 72159000 0 0 0 0 6109 2226 5721 54564;54565;54566;54567;54568;54569;54570 69391;69392;69393;69394;69395;69396;69397;69398 69397 8 DGGLICTSCR Unmodified 1137.4907 0.49067744 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.23 38.23 2 0.0078732 34256 QUIQUE_C1368_190116_001 125.04 109.38 868460000 0 0 217110000 252510000 192460000 0 0 0 93084000 113290000 0 0 0 6110 2327 5722 54571;54572;54573;54574;54575 69399;69400;69401;69402;69403 69399 2 DGGNPFAEPSELDNPFQDPAVIQHRPSR Unmodified 3089.4591 0.45912462 1449 O14828 SCAMP3 Secretory carrier-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 114.91 114.91 4 0.021485 117783 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.054 13.53 78116000 0 0 0 0 0 0 0 31394000 0 0 46722000 0 0 6111 1449 5723 54576;54577 69404;69405 69404 2 DGGNQEVEIAR Unmodified 1186.5578 0.55782903 2069 P13861;H7C330 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.472 30.472 2 3.2247E-06 25227 QUIQUE_C1403_190116_001 177.06 162.91 1301300000 150870000 156510000 130710000 132580000 115420000 0 0 86311000 118830000 69617000 123940000 93702000 122800000 6112 2069 5724 54578;54579;54580;54581;54582;54583;54584;54585;54586;54587;54588 69406;69407;69408;69409;69410;69411;69412;69413;69414;69415;69416;69417 69409 10 DGGSEDQVEDPALSEPGEEPQRPSPSEPGT Unmodified 3092.333 0.33304021 4412 Q9UD71;J3KT77 PPP1R1B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B yes no 0 0 1 1 2 1 84.016 84.016 2;3 1.7061E-36 85094 QUIQUE_C1403_190116_001 111.4 108.77 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2400.1306 0.13057984 3396 Q6PJG6 BRAT1 BRCA1-associated ATM activator 1 yes yes 0 0 0 1 1 163.2 163.2 3 4.6671E-06 166920 QUIQUE_C1277_190116_001 64.68 55.86 23899000 7978800 15920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6116 3396 5728 54609;54610 69440;69441 69441 1 DGHDQHVLELEAK Unmodified 1489.7161 0.71612058 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 30.923 30.923 2;3 0.0023444 25113 QUIQUE_C1403_190116_001 57.796 34.807 128240000 0 0 0 34669000 0 42235000 0 31186000 0 20151000 0 0 0 6117 2322 5729 54611;54612;54613;54614;54615 69442;69443;69444;69445;69446 69442 5 DGHGEAIMFK Unmodified 1103.507 0.50697943 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 36.295 36.295 2;3 0.00023783 31562 QUIQUE_C1403_190116_001 117.81 100.57 5362400000 537970000 128690000 550260000 656030000 354700000 518830000 632090000 290110000 199790000 188380000 474960000 294110000 536500000 6118 4560 5730 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Unmodified 1286.6904 0.69042311 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.47 128.47 2 0.0002247 131599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.33 75.131 4574300000 310710000 301250000 420500000 391190000 429260000 453280000 318010000 422980000 473040000 195230000 455690000 403120000 0 6132 3137;908 5743 54758;54759;54760;54761;54762;54763;54764;54765;54766;54767;54768;54769 69603;69604;69605;69606;69607;69608;69609;69610;69611;69612;69613;69614;69615 69610 12 DGIISDIFDK Unmodified 1121.5605 0.56045479 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 131.9 131.9 2 0.033515 128211 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.327 34.551 29211000 0 0 0 0 0 17962000 0 0 0 11249000 0 0 0 6133 2149 5744 54770;54771 69616;69617 69617 2 DGIISDIFDKK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 104.2 104.2 2;3 0.021512 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69792 32 DGLALGPGPFVTALEYATDTK Unmodified 2135.0787 0.078650837 4123 Q9H0R4;K7ER15 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 3 1 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 169.83 169.83 2;3 1.7925E-26 174189 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.65 122.61 4452600000 284740000 313150000 495610000 214630000 291520000 160550000 492340000 351800000 581650000 82746000 427580000 366230000 390070000 6149 4123 5759 54937;54938;54939;54940;54941;54942;54943;54944;54945;54946;54947;54948;54949;54950;54951;54952;54953;54954;54955;54956;54957;54958;54959;54960;54961;54962;54963;54964 69819;69820;69821;69822;69823;69824;69825;69826;69827;69828;69829;69830;69831;69832;69833;69834;69835;69836;69837;69838;69839;69840;69841;69842;69843;69844;69845;69846;69847;69848;69849;69850;69851;69852;69853;69854;69855;69856;69857 69845 36 DGLAQELANEIR Unmodified 1327.6732 0.67319314 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 120.46 120.46 2 0.0010001 117076 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 116.78 116.78 3 0.00030222 121706 QUIQUE_C1218_190116_001 67.995 60.003 752120000 143630000 0 0 0 0 0 248840000 0 149310000 0 0 210350000 0 6160 2524 5770 55073;55074;55075;55076;55077 69995;69996;69997;69998;69999 69995 5 DGLLPENTFIVGYAR Unmodified 1663.857 0.85697116 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.49 139.49 2 4.4995E-09 145229 QUIQUE_C1218_190116_001 128.01 102.58 2508600000 135400000 182560000 220810000 170260000 191430000 161540000 203120000 249710000 200890000 78666000 263660000 201520000 249040000 6161 2024 5771 55078;55079;55080;55081;55082;55083;55084;55085;55086;55087;55088;55089;55090 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2;3 0.00015299 22732 QUIQUE_C1368_190116_001 83.314 76.837 541290000 53564000 68851000 71740000 100900000 44440000 54222000 78816000 0 38650000 30113000 0 0 0 6192 1021 5798 55369;55370;55371;55372;55373;55374;55375;55376;55377;55378;55379;55380;55381;55382 70366;70367;70368;70369;70370;70371;70372;70373;70374;70375;70376;70377;70378;70379 70369 13 DGNPFYFTDHR Unmodified 1367.5895 0.58946351 92 A0A087X0M8;O00533;C9J905;C9JH37;C9JW79 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.999 72.999 3 0.010259 72502 QUIQUE_C1563_190116_001 41.401 35.558 212810000 0 0 40603000 37523000 0 32147000 0 0 46291000 0 0 29009000 27233000 6193 92 5799 55383;55384;55385;55386;55387;55388 70380;70381;70382;70383;70384;70385 70382 5 DGNVLLHEMQIQHPTASLIAK Oxidation (M) 2330.2053 0.20526511 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 76.556 76.556 3;4 1.7027E-07 77125 QUIQUE_C1277_190116_001 88.872 68.959 464080000 55734000 61611000 65609000 0 0 0 0 58802000 81439000 53531000 87357000 0 0 6194 2424 5800 55389;55390;55391;55392;55393;55394;55395 70386;70387;70388;70389;70390;70391;70392;70393;70394;70395 70388 1850 10 DGNVLLHEMQIQHPTASLIAK Unmodified 2314.2104 0.21035049 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 3 2 2 2 3 1 2 99.734 99.734 2;3;4 2.2722E-43 103581 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.18 150.26 4137700000 468770000 0 282560000 141380000 230620000 0 669820000 328620000 323470000 198900000 620050000 276100000 597380000 6195 2424 5800 55396;55397;55398;55399;55400;55401;55402;55403;55404;55405;55406;55407;55408;55409;55410;55411;55412;55413;55414;55415;55416 70396;70397;70398;70399;70400;70401;70402;70403;70404;70405;70406;70407;70408;70409;70410;70411;70412;70413;70414;70415;70416;70417;70418;70419;70420;70421 70416 25 DGPGETDAFGNSEGK Unmodified 1479.6114 0.61138074 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.774 40.774 2 2.25E-79 37181 QUIQUE_DMIX3_190116_001 211.46 195.83 914830000 127180000 87550000 91312000 0 84235000 65123000 0 66957000 55976000 57847000 109260000 77331000 92058000 6196 1700 5801 55417;55418;55419;55420;55421;55422;55423;55424;55425;55426;55427 70422;70423;70424;70425;70426;70427;70428;70429;70430;70431;70432 70428 11 DGPGFYTTR Unmodified 1012.4614 0.46140945 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.417 44.417 2 0.00046764 41876 QUIQUE_C1218_190116_001 116.37 102.38 1394800000 150690000 124070000 150720000 119240000 0 123490000 105530000 136180000 0 109720000 124170000 133250000 117730000 6197 1153 5802 55428;55429;55430;55431;55432;55433;55434;55435;55436;55437;55438 70433;70434;70435;70436;70437;70438;70439;70440;70441;70442;70443;70444;70445 70433 10 DGPLNMILDDGGDLTNLIHTK Oxidation (M) 2267.1104 0.11036167 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 2 152.51 152.51 3 1.5137E-06 155498 QUIQUE_C1563_190116_001 76.015 62.183 419510000 47636000 57377000 0 0 0 91656000 0 39390000 0 63443000 120000000 0 0 6198 2219 5803 55439;55440;55441;55442;55443;55444;55445;55446 70446;70447;70448;70449;70450;70451;70452;70453 70449 1583 7 DGPLNMILDDGGDLTNLIHTK Unmodified 2251.1154 0.11544705 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 159.76 159.76 2;3 2.2762E-35 166702 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.83 134.29 4960500000 555430000 326160000 337370000 432870000 580590000 291820000 314850000 318150000 374460000 138250000 371760000 389710000 529120000 6199 2219 5803 55447;55448;55449;55450;55451;55452;55453;55454;55455;55456;55457;55458;55459;55460;55461;55462;55463 70454;70455;70456;70457;70458;70459;70460;70461;70462;70463;70464;70465;70466;70467;70468;70469;70470;70471;70472;70473;70474;70475;70476;70477;70478;70479 70476 26 DGPNALTPPPTTPEWVK Unmodified 1818.9152 0.91521432 590;1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2;B1AKY9;P50993 ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 103.19 103.19 2 4.3016E-10 106659 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.89 126.66 2678700000 155380000 160770000 320390000 205920000 199800000 156520000 268640000 200810000 252250000 59418000 301150000 145950000 251720000 6200 1371;590 5804 55464;55465;55466;55467;55468;55469;55470;55471;55472;55473;55474;55475;55476;55477 70480;70481;70482;70483;70484;70485;70486;70487;70488;70489;70490;70491;70492;70493;70494;70495;70496;70497;70498;70499;70500;70501;70502;70503;70504;70505;70506;70507 70500 28 DGPSAGCTIVTALLSLAMGR Oxidation (M) 2004.9972 0.99724617 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 1 3 2 1 1 1 2 1 2 2 1 1 174.6 174.6 2;3 1.1552E-37 178963 QUIQUE_C1368_190116_001 156.24 133.36 271670000 9727300 49203000 27513000 5595200 12223000 13788000 42562000 6110400 27382000 0 53221000 14790000 9557200 6201 1324 5805 55478;55479;55480;55481;55482;55483;55484;55485;55486;55487;55488;55489;55490;55491;55492;55493;55494;55495 70508;70509;70510;70511;70512;70513;70514;70515;70516;70517;70518;70519;70520;70521;70522;70523;70524;70525 70512 750 17 DGPSAGCTIVTALLSLAMGR Unmodified 1989.0023 0.002331546 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 178.7 178.7 2;3 4.8303E-65 183251 QUIQUE_C1576_190116_001 223.72 208.84 654600000 26914000 13512000 72136000 6734200 28749000 11106000 19406000 11802000 53648000 0 134740000 144100000 131740000 6202 1324 5805 55496;55497;55498;55499;55500;55501;55502;55503;55504;55505;55506;55507;55508;55509;55510;55511;55512 70526;70527;70528;70529;70530;70531;70532;70533;70534;70535;70536;70537;70538;70539;70540;70541;70542 70533 15 DGPSAGCTIVTALLSLAMGRPVR Oxidation (M) 2357.2195 0.21953496 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 1 1 168.8 168.8 3 8.0586E-06 170712 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.88 62.002 30385000 0 0 0 0 0 0 0 30385000 0 0 0 0 0 6203 1324 5806 55513 70543 70543 750 1 DGPSAGCTIVTALLSLAMGRPVR Unmodified 2341.2246 0.22462034 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 172.78 172.78 3 7.6045E-06 177129 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.467 52.007 169440000 0 0 0 0 0 0 0 44753000 44740000 0 79944000 0 0 6204 1324 5806 55514;55515;55516 70544;70545;70546 70545 3 DGPSLLVVEQVR Unmodified 1310.7194 0.71941505 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.62 101.62 2 0.010179 104598 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.434 48.387 903990000 0 0 114130000 53760000 76176000 78791000 110550000 50572000 61333000 0 133150000 116180000 109350000 6205 3576 5807 55517;55518;55519;55520;55521;55522;55523;55524;55525;55526 70547;70548;70549;70550;70551;70552;70553;70554;70555;70556;70557;70558 70553 12 DGPVGFADFVYK Unmodified 1313.6292 0.62920306 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.59 125.59 2 0.00064854 129726 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.52 88.32 859400000 59865000 59677000 61356000 69129000 84208000 69133000 77309000 86473000 57041000 31663000 104140000 0 99406000 6206 1534 5808 55527;55528;55529;55530;55531;55532;55533;55534;55535;55536;55537;55538 70559;70560;70561;70562;70563;70564;70565;70566;70567;70568;70569;70570;70571;70572 70572 14 DGPVRPQNAEEEKR Unmodified 1623.7965 0.79649617 3727 Q92504 SLC39A7 Zinc transporter SLC39A7 yes yes 0 0 2 2 1 1 10.537 10.537 3;4 0.00010374 2993 QUIQUE_C1368_190116_001 88.075 69.973 52695000 0 0 36085000 0 0 0 0 0 0 0 16610000 0 0 6207 3727 5809 55539;55540;55541;55542 70573;70574;70575;70576 70573 4 DGQAMLWDLNEGK Unmodified 1475.6715 0.67147858 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.45 112.45 2 8.3494E-08 114731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.8 122.13 1826200000 149080000 160010000 190690000 181440000 127670000 151730000 156130000 131630000 126120000 28801000 172580000 115670000 134650000 6208 2787 5810 55543;55544;55545;55546;55547;55548;55549;55550;55551;55552;55553;55554;55555 70577;70578;70579;70580;70581;70582;70583;70584;70585;70586;70587;70588;70589;70590;70591;70592;70593;70594;70595 70590 19 DGQAMLWDLNEGK Oxidation (M) 1491.6664 0.6663932 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 93.977 93.977 2 0.027799 96085 QUIQUE_C1368_190116_001 62.924 55.195 33292000 0 0 0 0 0 33292000 0 0 0 0 0 0 0 6209 2787 5810 55556;55557 70596;70597 70596 2 DGQAVLENVSEGGK Unmodified 1401.6736 0.67358707 547 A6NKZ2;P51606 RENBP N-acylglucosamine 2-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.471 58.471 2 0.00026667 56926 QUIQUE_C1277_190116_001 117.86 105.65 477970000 82053000 96125000 0 85910000 0 0 0 90065000 123820000 0 0 0 0 6210 547 5811 55558;55559;55560;55561;55562 70598;70599;70600;70601;70602 70599 4 DGQEAAFASYDR Unmodified 1328.5633 0.56330834 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.588 59.588 2 1.5011E-37 58114 QUIQUE_C1368_190116_001 192.21 187.24 4453400000 277470000 390420000 323970000 206150000 285230000 238840000 378010000 439230000 388420000 176440000 444660000 462500000 442100000 6211 3753 5812 55563;55564;55565;55566;55567;55568;55569;55570;55571;55572;55573;55574;55575 70603;70604;70605;70606;70607;70608;70609;70610;70611;70612;70613;70614;70615;70616;70617;70618;70619;70620;70621;70622;70623 70610 21 DGQLMTELFNR Unmodified 1322.6289 0.62888548 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.14 122.14 2 0.0065099 124356 QUIQUE_C1563_190116_001 79.148 57.776 87380000 29261000 0 23003000 18221000 0 16895000 0 0 0 0 0 0 0 6212 3557 5813 55576;55577;55578;55579;55580;55581 70624;70625;70626;70627;70628;70629 70628 5 DGQVINETSQHHDDLE Unmodified 1835.7922 0.79219865 1952 P08670 VIM Vimentin yes yes 0 0 0 5 7 4 10 7 4 4 7 8 6 4 6 5 38.734 38.734 2;3 2.9169E-80 34030 QUIQUE_C1368_190116_001 213.38 204.37 50635000000 1926800000 3355100000 2559400000 8548900000 3875200000 3727300000 2189300000 5610700000 5440000000 1765600000 3391700000 3524900000 4720500000 6213 1952 5814 55582;55583;55584;55585;55586;55587;55588;55589;55590;55591;55592;55593;55594;55595;55596;55597;55598;55599;55600;55601;55602;55603;55604;55605;55606;55607;55608;55609;55610;55611;55612;55613;55614;55615;55616;55617;55618;55619;55620;55621;55622;55623;55624;55625;55626;55627;55628;55629;55630;55631;55632;55633;55634;55635;55636;55637;55638;55639;55640;55641;55642;55643;55644;55645;55646;55647;55648;55649;55650;55651;55652;55653;55654;55655;55656;55657;55658 70630;70631;70632;70633;70634;70635;70636;70637;70638;70639;70640;70641;70642;70643;70644;70645;70646;70647;70648;70649;70650;70651;70652;70653;70654;70655;70656;70657;70658;70659;70660;70661;70662;70663;70664;70665;70666;70667;70668;70669;70670;70671;70672;70673;70674;70675;70676;70677;70678;70679;70680;70681;70682;70683;70684;70685;70686;70687;70688;70689;70690;70691;70692;70693;70694;70695;70696;70697;70698;70699;70700;70701;70702;70703;70704;70705;70706;70707;70708;70709;70710;70711;70712;70713;70714;70715;70716;70717;70718;70719;70720;70721;70722;70723;70724;70725;70726;70727;70728;70729;70730;70731;70732;70733;70734;70735 70650 101 DGRDHIIEVVGSSMPLIGDHQDEDK Unmodified 2761.2977 0.29772152 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 1 1 1 3 1 2 1 107.22 107.22 3;4 2.0705E-07 111037 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.922 53.571 397530000 0 0 0 0 40601000 0 0 44522000 76455000 0 57467000 79583000 98907000 6214 2125 5815 55659;55660;55661;55662;55663;55664;55665;55666;55667 70736;70737;70738;70739;70740;70741;70742;70743;70744;70745;70746 70740 11 DGRDHIIEVVGSSMPLIGDHQDEDKQLIVELVVNK Unmodified 3896.9942 0.99421629 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 2 2 2 1 145.51 145.51 4;5 2.6809E-10 150165 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.158 54.9 511930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 183850000 268450000 59627000 6215 2125 5816 55668;55669;55670;55671;55672 70747;70748;70749;70750;70751 70749 5 DGRLDLNDLAR Unmodified 1256.6473 0.64731274 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 1 1 68.535 68.535 3 0.0003066 67633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.215 46.426 19988000 0 0 0 0 0 0 0 19988000 0 0 0 0 0 6216 1678 5817 55673 70752;70753 70752 2 DGSAFEDGLR Unmodified 1065.4727 0.47270242 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.809 57.809 2 0.014937 56636 QUIQUE_C1277_190116_001 63.816 38.079 57312000 0 22512000 0 0 0 0 0 0 0 0 34800000 0 0 6217 2664 5818 55674;55675;55676;55677;55678 70754;70755;70756;70757;70758 70754 5 DGSAMVYNLANALR Unmodified 1493.7297 0.72966216 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 137.49 137.49 2 2.1417E-15 141766 QUIQUE_DMIX7_190116_001 161.76 146.19 916870000 0 0 104760000 78161000 108030000 0 121110000 56977000 90747000 19466000 128360000 119770000 89483000 6218 3596 5819 55679;55680;55681;55682;55683;55684;55685;55686;55687;55688;55689 70759;70760;70761;70762;70763;70764;70765;70766;70767;70768;70769;70770;70771;70772;70773;70774;70775 70772 17 DGSAVEIVGLSK Unmodified 1173.6241 0.62411768 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 79.559 79.559 2 0.00089137 79977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.958 55.394 136410000 0 0 0 0 0 0 0 59826000 0 0 76588000 0 0 6219 2377 5820 55690;55691;55692;55693;55694;55695 70776;70777;70778;70779;70780;70781 70778 6 DGSCGVAYVVQEPGDYEVSVK Unmodified 2257.0209 0.020877961 2178 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72.504 2 0.00025443 73896 QUIQUE_C1438_190116_001 79.283 59.293 113380000 0 0 0 47248000 0 25560000 0 0 0 0 40570000 0 0 6227 3047 5828 55755;55756;55757;55758;55759;55760;55761;55762 70846;70847;70848;70849;70850;70851;70852;70853 70849 7 DGSLFWQSPK Unmodified 1163.5611 0.56112349 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.026 94.026 2 0.01038 95915 QUIQUE_C1403_190116_001 93.166 73.379 213020000 39608000 43584000 29334000 57464000 0 0 43030000 0 0 0 0 0 0 6228 514 5829 55763;55764;55765;55766;55767 70854;70855;70856;70857;70858 70857 1 DGSLIVSSSYDGLCR Unmodified 1627.7512 0.75118546 2733 P61964 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 98.397 98.397 2 0.0038681 100947 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.924 38.937 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6229 2733 5830 55768 70859 70859 1 DGSNIIYTAK Unmodified 1080.5451 0.54513908 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 0 1 1 43.474 43.474 2 0.019651 39896 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domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 175.8 175.8 3 3.037E-05 179752 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.266 42.763 40639000 0 0 0 0 10841000 0 5171500 7351900 11753000 0 0 0 5521100 6233 3346 5834 55781;55782;55783;55784;55785 70874;70875;70876;70877;70878 70877 5 DGSTATCVLAVDNILYIANLGDSR Unmodified 2537.2432 0.24316676 4117 Q9H0C8;F8SNU7;H7C2I8 ILKAP;ILKAP3 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 1 1 169.87 169.87 3 1.7943E-05 171591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.728 49.066 50767000 0 0 0 7999100 12805000 0 0 29963000 0 0 0 0 0 6234 4117 5835 55786;55787;55788 70879;70880;70881 70881 3 DGSTAVHFEHSWGDGVAVLR Unmodified 2139.0134 0.013365238 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.034 94.034 3 0.00034016 95747 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.49 54.231 205890000 46561000 0 0 0 0 31542000 0 0 53455000 23580000 0 50749000 0 6235 2223 5836 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70902;70903;70904;70905;70906;70907;70908 70907 3 DGSVLGVTVTR Unmodified 1102.5982 0.59823728 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 72.089 72.089 2 0.037693 72595 QUIQUE_C1218_190116_001 54.539 36.554 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6238 315 5839 55814 70909 70909 1 DGSVLVPPALQSYLGTDR Unmodified 1886.9738 0.97379183 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;M0R259;M0QX29 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 150.83 150.83 2 0.0023991 155251 QUIQUE_C1403_190116_001 65.395 26.993 116400000 0 0 0 40743000 0 30681000 0 44976000 0 0 0 0 0 6239 1358 5840 55815;55816;55817;55818;55819 70910;70911;70912;70913;70914 70911 4 DGSWFIQSLCAMLK Unmodified 1654.7847 0.7847342 2450 P42574 CASP3 Caspase-3;Caspase-3 subunit p17;Caspase-3 subunit p12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.73 171.73 2 2.096E-22 175999 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.43 148.42 471670000 0 0 23053000 20990000 22603000 0 43926000 62998000 88180000 0 69492000 65597000 74827000 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71045;71046;71047;71048;71049;71050;71051;71052;71053;71054;71055;71056;71057;71058;71059;71060;71061;71062;71063;71064;71065;71066;71067;71068;71069;71070;71071;71072;71073;71074;71075;71076;71077;71078;71079;71080;71081;71082 71059 35 DGTVLCELINALYPEGQAPVKK Unmodified 2414.2515 0.2515466 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 2 4 4 161.82 161.82 2;3 3.9887E-37 165876 QUIQUE_C1403_190116_001 147.25 126.62 6166200000 154410000 266680000 814220000 334270000 438710000 124270000 355400000 553700000 395580000 128280000 580520000 1018300000 1001800000 6258 2408 5858 55971;55972;55973;55974;55975;55976;55977;55978;55979;55980;55981;55982;55983;55984;55985;55986;55987;55988;55989;55990;55991;55992;55993;55994;55995;55996 71083;71084;71085;71086;71087;71088;71089;71090;71091;71092;71093;71094;71095;71096;71097;71098;71099;71100;71101;71102;71103;71104;71105;71106;71107;71108;71109;71110;71111;71112;71113;71114;71115;71116;71117;71118;71119 71091 33 DGTVTAGNASGVADGAGAVIIASEDAVK Unmodified 2515.2402 0.24018987 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 134.6 134.6 2;3 3.4559E-108 139453 QUIQUE_C1368_190116_001 232.54 220.18 3728700000 294400000 279830000 401790000 343130000 288020000 434240000 269930000 255530000 279360000 133760000 257190000 239140000 252380000 6259 2453 5859 55997;55998;55999;56000;56001;56002;56003;56004;56005;56006;56007;56008;56009;56010;56011;56012;56013;56014;56015;56016;56017;56018;56019;56020;56021 71120;71121;71122;71123;71124;71125;71126;71127;71128;71129;71130;71131;71132;71133;71134;71135;71136;71137;71138;71139;71140;71141;71142;71143;71144;71145;71146;71147;71148;71149;71150;71151;71152;71153 71127 33 DGTVTAGNASGVADGAGAVIIASEDAVKK Unmodified 2643.3352 0.33515289 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 117.68 117.68 3 9.7223E-09 121728 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.89 56.096 572080000 0 0 0 0 0 0 0 0 211350000 0 360730000 0 0 6260 2453 5860 56022;56023;56024 71154;71155;71156 71155 3 DGVADVSIEDSVISLSGDHCIIGR Unmodified 2513.2068 0.20678125 1783 P00441;H7BYH4 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 0 3 3 3 5 3 4 3 1 3 2 3 2 2 142.88 142.88 2;3 0 146828 QUIQUE_C1368_190116_001 391.91 362.89 22231000000 3431800000 2878700000 2557000000 2106600000 2631600000 2638200000 1893200000 508570000 933390000 751020000 583630000 529730000 787150000 6261 1783 5861 56025;56026;56027;56028;56029;56030;56031;56032;56033;56034;56035;56036;56037;56038;56039;56040;56041;56042;56043;56044;56045;56046;56047;56048;56049;56050;56051;56052;56053;56054;56055;56056;56057;56058;56059;56060;56061 71157;71158;71159;71160;71161;71162;71163;71164;71165;71166;71167;71168;71169;71170;71171;71172;71173;71174;71175;71176;71177;71178;71179;71180;71181;71182;71183;71184;71185;71186;71187;71188;71189;71190;71191;71192;71193;71194;71195;71196;71197;71198;71199;71200;71201;71202;71203;71204;71205;71206;71207;71208 71168 51 DGVAVITLPLGGSIK Unmodified 1438.8395 0.83953018 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.15 132.15 2 0.00041655 136036 QUIQUE_C1277_190116_001 96.103 89.8 329080000 38348000 57669000 32673000 26656000 31644000 33615000 29460000 30930000 27686000 20404000 0 0 0 6262 3684 5862 56062;56063;56064;56065;56066;56067;56068;56069;56070;56071 71209;71210;71211;71212;71213;71214;71215;71216;71217;71218;71219 71210 11 DGVCAQIEK Unmodified 1018.4753 0.47534495 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 27.815 27.815 2 0.009778 22279 QUIQUE_C1218_190116_001 75.043 38.023 265670000 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56087;56088;56089;56090;56091;56092;56093;56094;56095;56096;56097;56098 71236;71237;71238;71239;71240;71241;71242;71243;71244;71245;71246;71247;71248;71249 71237 14 DGVLLCQLLNNLR Unmodified 1526.8239 0.8238969 1146 H0YDG2;Q9UKW4 VAV3 Guanine nucleotide exchange factor VAV3 yes no 0 0 0 1 160.87 160.87 2 0.036214 168431 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.276 31.49 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6266 1146 5866 56099 71250 71250 1 DGVLTLANNVTPAK Unmodified 1411.7671 0.76709352 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.012 89.012 2 0.00068653 90620 QUIQUE_C1403_190116_001 117.25 88.524 1191800000 88715000 85109000 0 137540000 133540000 88315000 61184000 134260000 174710000 0 0 106370000 182040000 6267 880 5867 56100;56101;56102;56103;56104;56105;56106;56107;56108;56109 71251;71252;71253;71254;71255;71256;71257;71258;71259;71260;71261 71253 9 DGVLVDEFGLPQIPAS Unmodified 1655.8407 0.8406524 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 168.88 168.88 2 0.042318 171875 QUIQUE_C1403_190116_001 39.785 33.401 38003000 0 0 0 38003000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6268 4359 5868 56110 71262 71262 1 DGVMFQIDQATK Unmodified 1351.6442 0.6442012 4499 Q9UM22 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 94.231 94.231 2 0.03547 96919 QUIQUE_C1218_190116_001 52.391 37.628 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6269 4499 5869 56111 71263 71263 1 DGVPGGPGETGK Unmodified 1069.504 0.50400254 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.955 20.955 2 0.0055242 14024 QUIQUE_C1438_190116_001 66.056 43.925 1006700000 0 114410000 0 189230000 246230000 329380000 0 127490000 0 0 0 0 0 6270 2037 5870 56112;56113;56114;56115;56116 71264;71265;71266;71267;71268 71266 2 DGVSAAVISAELASFLATK Unmodified 1848.9833 0.98329389 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 170.49 170.49 2;3 2.1809E-64 175248 QUIQUE_C1368_190116_001 243.49 232.54 1557300000 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56134;56135;56136;56137;56138;56139;56140;56141;56142;56143;56144;56145;56146 71287;71288;71289;71290;71291;71292;71293;71294;71295;71296;71297;71298;71299;71300;71301;71302;71303;71304;71305;71306;71307;71308;71309;71310;71311;71312;71313 71292 27 DGVVEITGKHEER Unmodified 1467.7318 0.73177065 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 0 1 3 2 2 2 2 20.225 20.225 2;3;4 0.0028793 13607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.214 78.434 1490900000 0 0 0 0 0 0 0 366100000 319910000 0 206110000 242630000 356100000 6274 1866 5874 56147;56148;56149;56150;56151;56152;56153;56154;56155;56156;56157 71314;71315;71316;71317;71318;71319;71320;71321;71322;71323;71324;71325 71314 12 DGVWKPTLVILR Unmodified 1395.8238 0.82382054 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 113.45 113.45 3 2.32E-05 121094 QUIQUE_C1277_190116_001 114.24 96.103 3235100000 346060000 344370000 370600000 291570000 312500000 244550000 416650000 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8 DGWQVEEADDWLR Unmodified 1617.7059 0.70594983 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 0 1 137.7 137.7 2 0.009162 141628 QUIQUE_C1403_190116_001 76.332 61.652 19243000 0 0 0 19243000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6286 948 5886 56229 71402 71402 1 DGWSLWYSEYR Unmodified 1460.6361 0.63607935 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.17 137.17 2 0.0012112 142124 QUIQUE_C1368_190116_001 88.364 74.772 1151800000 59916000 79268000 135520000 108900000 60565000 120190000 131320000 0 78961000 53877000 132250000 100710000 90341000 6287 2255 5887 56230;56231;56232;56233;56234;56235;56236;56237;56238;56239;56240;56241 71403;71404;71405;71406;71407;71408;71409;71410;71411;71412;71413;71414;71415;71416 71405 12 DGWSQYHFVASSSTIER Unmodified 1968.8966 0.89660415 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 2 91.015 91.015 2 0.00095802 92922 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.044 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71480;71481;71482;71483;71484;71485;71486;71487;71488;71489;71490;71491;71492;71493 71482 10 DGYISNGELFQVLK Unmodified 1581.8039 0.80387296 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3;A0A1B0GUC7;Q96LZ3 PPP3R1;PPP3R2 Calcineurin subunit B type 1;Calcineurin subunit B type 2 yes no 0 0 0 1 1 136.41 136.41 2 0.010268 141577 QUIQUE_C1218_190116_001 69.672 35.781 151440000 79249000 72190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6292 801 5892 56297;56298 71494;71495 71494 2 DGYLFQLLR Unmodified 1123.6026 0.60259438 1857 P04196 HRG Histidine-rich glycoprotein yes yes 0 0 0 1 142.16 142.16 2 0.030814 149056 QUIQUE_C1438_190116_001 72.789 51.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6293 1857 5893 56299 71496 71496 1 DGYNYTLSK Unmodified 1059.4873 0.48728985 2344 P31949 S100A11 Protein S100-A11;Protein S100-A11, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 47.61 47.61 2 0.018939 45368 QUIQUE_C1438_190116_001 63.961 39.94 348810000 0 0 0 0 121790000 0 0 117460000 0 0 0 109570000 0 6294 2344 5894 56300;56301;56302 71497;71498;71499 71497 3 DGYVEVSGK Unmodified 952.45018 0.45017606 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.137 28.137 2 0.014831 22167 QUIQUE_C1403_190116_001 67.993 7.4028 435400000 0 66839000 57976000 96378000 51389000 83823000 78994000 0 0 0 0 0 0 6295 4464 5895 56303;56304;56305;56306;56307;56308 71500;71501;71502;71503;71504;71505;71506 71503 7 DGYVEVSGKHEEK Unmodified 1475.6892 0.68923713 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 14.334 14.334 2;3;4 0.00031885 6632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.861 74.135 606840000 0 20711000 23158000 15231000 42363000 0 39005000 61810000 146540000 0 64305000 53552000 140170000 6296 4464 5896 56309;56310;56311;56312;56313;56314;56315;56316;56317;56318;56319;56320;56321 71507;71508;71509;71510;71511;71512;71513;71514;71515;71516;71517;71518;71519;71520 71517 14 DGYWFLK Unmodified 927.44905 0.44905385 4554 Q9Y2H0;F8WF49;A0A0B4J2C2;A0A087X246 DLGAP4 Disks large-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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no no 0 0 0 1 1 1 1 19.649 19.649 3 0.0015703 12183 QUIQUE_C1403_190116_001 66.056 54.891 178580000 39495000 0 0 52545000 0 51955000 0 0 0 34584000 0 0 0 6301 1228;1544 5901 56365;56366;56367;56368 71588;71589;71590;71591;71592 71590 4 DHASIQMNVAEVDKVTGR Unmodified 1968.9687 0.96872323 2785 Q8WVC2;P63220;Q9BYK1 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 70.26 70.26 3 1.6154E-05 70431 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.505 67.935 298700000 0 0 0 0 0 0 0 63914000 45378000 0 67122000 67118000 55170000 6302 2785 5902 56369;56370;56371;56372;56373 71593;71594;71595;71596;71597 71594 5 DHATLNDIFMNNVIVR Unmodified 1870.936 0.93596654 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 126.16 126.16 3 8.6308E-05 129788 QUIQUE_C1277_190116_001 62.104 51.469 82947000 19319000 21944000 0 21250000 0 0 0 0 20434000 0 0 0 0 6303 1520 5903 56374;56375;56376;56377;56378 71598;71599;71600;71601;71602 71599 5 DHAVDLIQK Unmodified 1037.5506 0.55055881 290;327;328 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72129;72130;72131;72132;72133;72134;72135;72136;72137;72138;72139;72140;72141;72142;72143;72144;72145;72146;72147;72148;72149;72150;72151;72152;72153;72154;72155;72156 72153 27 DHLLSVSLSGYINYLDR Unmodified 1964.0003 0.0003409361 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 5 5 1 150.64 150.64 3 0.00073008 156053 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.307 56.273 267560000 0 0 0 0 0 0 30191000 0 113650000 0 105240000 18483000 0 6336 1609 5932 56778;56779;56780;56781;56782;56783;56784;56785;56786;56787;56788;56789;56790 72157;72158;72159;72160;72161;72162;72163;72164;72165;72166;72167;72168;72169 72161 11 DHLNFYCTGSSLGNLILSVK Unmodified 2237.1151 0.11505312 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 146.31 146.31 3 0.00030502 151389 QUIQUE_C1218_190116_001 59.469 56.23 25096000 25096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6337 354 5933 56791 72170 72170 1 DHLNHHHYVAAAFK Unmodified 1658.8066 0.80660735 4289 Q9NT99 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes yes 0 0 0 1 15.568 15.568 4 0.0056021 7776 QUIQUE_C1576_190116_001 32.127 14.427 22217000 0 0 0 0 0 0 22217000 0 0 0 0 0 0 6338 4289 5934 56792 72171 72171 1 DHLPPPEEEPLVLMCGPPPMIQYACLPNLDHVGHPTER Unmodified 4355.0636 0.063574954 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 0 0 1 1 143.46 143.46 4 1.5598E-10 149350 QUIQUE_C1576_190116_001 59.158 54.925 112040000 0 0 0 0 0 57519000 54517000 0 0 0 0 0 0 6339 1778 5935 56793;56794 72172;72173 72173 2 DHLVTAYNHLFETK Unmodified 1686.8366 0.83657007 2846 Q00688 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 72.621 72.621 2;3 2.4811E-14 73781 QUIQUE_C1218_190116_001 140.27 129.22 835000000 178500000 117850000 97760000 143280000 0 100940000 96111000 0 37758000 62807000 0 0 0 6340 2846 5936 56795;56796;56797;56798;56799;56800;56801;56802;56803;56804 72174;72175;72176;72177;72178;72179;72180;72181;72182;72183;72184;72185;72186 72175 12 DHLYGTLDPNTR Unmodified 1400.6684 0.66844211 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 47.546 47.546 2;3 0.0013158 45310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.685 51.189 620350000 0 0 63490000 99350000 0 47818000 0 75517000 75539000 45670000 82150000 71124000 59690000 6341 3053 5937 56805;56806;56807;56808;56809;56810;56811;56812;56813;56814 72187;72188;72189;72190;72191;72192;72193;72194;72195;72196 72191 6 DHMLIPVSMSELEK Unmodified 1627.795 0.79496453 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 108.16 108.16 2;3 0.00011807 105704 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.756 75.969 2617600000 196810000 291460000 574360000 221770000 296270000 219820000 117320000 72479000 120870000 102480000 168480000 124980000 110490000 6342 1684 5938 56815;56816;56817;56818;56819;56820;56821;56822;56823;56824;56825;56826;56827;56828;56829;56830 72197;72198;72199;72200;72201;72202;72203;72204;72205;72206;72207;72208;72209;72210;72211;72212;72213;72214;72215;72216 72211 18 DHMLIPVSMSELEK Oxidation (M) 1643.7899 0.78987915 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 97.649 97.649 2;3 0.0074915 101499 QUIQUE_C1218_190116_001 72.817 58.911 106100000 26076000 29721000 29591000 0 0 20709000 0 0 0 0 0 0 0 6343 1684 5938 56831;56832;56833;56834;56835 72217;72218;72219;72220;72221 72217 921 2 DHPAFAPLYFPMELHR Unmodified 1939.9403 0.94032364 2319 P30519;A0A087WT44;I3L159;I3L1F5;I3L276;I3L4P8;A0A1B0GXH0;I3L463 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 120.87 120.87 3 0.00032428 123223 QUIQUE_C1563_190116_001 69.331 62.761 75665000 0 0 0 0 0 37886000 37779000 0 0 0 0 0 0 6344 2319 5939 56836;56837 72222;72223 72222 2 DHPALNYNIVSGPPSHK Unmodified 1844.9169 0.91694566 1496 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72586 12 DIASTPHELYR Unmodified 1300.6412 0.64116473 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 45.5 45.5 2;3 0.00020548 43113 QUIQUE_C1438_190116_001 123.86 101.08 4084500000 436330000 254010000 275430000 506010000 529970000 532980000 252040000 0 161530000 83519000 387890000 280940000 383870000 6381 2036 5976 57125;57126;57127;57128;57129;57130;57131;57132;57133;57134;57135;57136;57137;57138;57139;57140;57141;57142;57143;57144 72589;72590;72591;72592;72593;72594;72595;72596;72597;72598;72599;72600;72601;72602;72603;72604;72605;72606;72607;72608;72609;72610;72611 72598 19 DIATIVADK Unmodified 944.51786 0.51786169 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.84 63.84 2 0.0094055 60127 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.064 35.961 425450000 55737000 0 79150000 0 0 0 0 0 65820000 38258000 0 85101000 101390000 6382 4583 5977 57145;57146;57147;57148;57149;57150 72612;72613;72614;72615;72616;72617;72618 72615 7 DIAWTEDSK Unmodified 1063.4822 0.48220447 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 52.321 52.321 2 0.025747 50742 QUIQUE_C1218_190116_001 67.897 34.101 78327000 57072000 0 0 21255000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6383 1609 5978 57151;57152 72619;72620 72619 2 DIAWTEDSKR Unmodified 1219.5833 0.5833155 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 33.86 33.86 2;3 3.641E-07 28459 QUIQUE_C1368_190116_001 149.94 101.65 2461300000 226330000 0 261090000 284230000 293160000 259810000 291490000 79443000 163820000 159590000 149270000 139720000 153370000 6384 1609 5979 57153;57154;57155;57156;57157;57158;57159;57160;57161;57162;57163;57164;57165;57166;57167;57168;57169;57170;57171 72621;72622;72623;72624;72625;72626;72627;72628;72629;72630;72631;72632;72633;72634;72635;72636;72637;72638;72639;72640;72641;72642;72643 72623 20 DIAYQLMHNIR Unmodified 1372.6922 0.69215444 1882 P05186 ALPL Alkaline phosphatase, tissue-nonspecific isozyme yes yes 0 0 0 1 2 1 1 96.38 96.38 2;3 0.0021332 98762 QUIQUE_C1403_190116_001 80.231 54.61 65330000 0 0 0 33996000 0 0 15986000 0 0 0 0 0 15348000 6385 1882 5980 57172;57173;57174;57175;57176 72644;72645;72646;72647;72648 72645 5 DICEEQVNSLPGSITK Unmodified 1788.8564 0.85637882 1803 P01024;M0R0Q9 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 88.314 88.314 2 0.021253 84844 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.809 43.276 23192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23192000 0 0 0 6386 1803 5981 57177 72649 72649 1 DICNDVLSLLEK Unmodified 1417.7123 0.71228076 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 4 3 3 2 3 3 2 3 2 3 3 1 2 160.6 160.6 1;2;3 1.7401E-37 165791 QUIQUE_C1368_190116_001 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199710000 0 0 0 204440000 0 162710000 6392 23 5987 57244;57245;57246;57247;57248;57249;57250;57251;57252;57253;57254;57255;57256;57257;57258;57259 72756;72757;72758;72759;72760;72761;72762;72763;72764;72765;72766;72767;72768;72769;72770;72771 72760 9 DIDGHMVNLDK Oxidation (M) 1271.5816 0.58160094 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;K7EKX7;K7ENB4;R4GNE4;A0A087X247 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 33.805 33.805 2 0.018435 28036 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.532 33.377 37939000 0 25916000 0 0 0 0 0 0 0 12023000 0 0 0 6393 23 5987 57260;57261;57262 72772;72773;72774 72773 3 DIDGHMVNLDKYR Unmodified 1574.7511 0.75112588 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;K7EKX7;K7ENB4;R4GNE4 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 61.398 61.398 2;4 5.7287E-05 60929 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.551 76.322 123810000 0 0 0 0 0 0 0 27996000 25472000 0 0 17045000 53294000 6394 23 5988 57263;57264;57265;57266 72775;72776;72777;72778 72775 4 DIDIEDLEELDPDFIMAK Unmodified 2119.9871 0.98711822 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.24 169.24 2 7.8972E-31 173281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 187.44 170.5 333480000 0 32985000 24036000 15789000 32738000 18510000 22867000 35435000 48652000 2054000 0 67590000 32824000 6395 3046 5989 57267;57268;57269;57270;57271;57272;57273;57274;57275;57276;57277 72779;72780;72781;72782;72783;72784;72785;72786;72787;72788;72789;72790;72791 72789 11 DIDIHEVR Unmodified 995.50361 0.50360861 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.365 34.365 2 0.0054066 29529 QUIQUE_C1368_190116_001 105.57 60.957 2541100000 209280000 287550000 325730000 301570000 0 292860000 0 0 273010000 96371000 418280000 336490000 0 6396 2849 5990 57278;57279;57280;57281;57282;57283;57284;57285;57286 72792;72793;72794;72795;72796;72797;72798;72799;72800;72801 72795 9 DIDILIVR Unmodified 955.57023 0.57023162 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 112.46 112.46 2 0.0051766 115566 QUIQUE_C1277_190116_001 106.42 33.376 373510000 61523000 60379000 45031000 35032000 38834000 47957000 64105000 0 20651000 0 0 0 0 6397 2582 5991 57287;57288;57289;57290;57291;57292;57293;57294;57295;57296;57297 72802;72803;72804;72805;72806;72807;72808;72809;72810;72811;72812 72803 11 DIDISSPEFK Unmodified 1149.5554 0.55536941 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.097 84.097 2 0.0058504 85312 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.064 45.879 979190000 50168000 75941000 102560000 75403000 98994000 0 149170000 99596000 58918000 31911000 90482000 67735000 78316000 6398 2935 5992 57298;57299;57300;57301;57302;57303;57304;57305;57306;57307;57308;57309 72813;72814;72815;72816;72817;72818;72819;72820;72821;72822;72823;72824;72825 72824 12 DIDNLVQR Unmodified 971.50361 0.50360861 2523 P49257 LMAN1 Protein ERGIC-53 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 56.496 56.496 2 0.023067 54485 QUIQUE_C1403_190116_001 73.637 43.001 69710000 0 0 0 28102000 27129000 0 0 0 0 14479000 0 0 0 6399 2523 5993 57310;57311;57312;57313 72826;72827;72828;72829 72826 4 DIDPQNDLTFLR Unmodified 1445.7151 0.71505795 4240 Q9NP97;Q8TF09;B1AKR6;H3BQI1 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.22 123.22 2 4.2751E-06 129490 QUIQUE_C1438_190116_001 136.63 115.17 2075200000 152450000 200200000 138670000 59378000 168620000 106670000 182470000 147380000 192740000 52886000 249800000 198900000 225050000 6400 4240 5994 57314;57315;57316;57317;57318;57319;57320;57321;57322;57323;57324;57325;57326 72830;72831;72832;72833;72834;72835;72836;72837;72838;72839;72840;72841;72842;72843;72844;72845;72846 72835 16 DIDSFVPSK Unmodified 1006.4971 0.49712625 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.323 72.323 2 0.0013972 72364 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 73.445 1475200000 154140000 121000000 139480000 112850000 96157000 0 160560000 98739000 111950000 75302000 155070000 113630000 136350000 6401 1997 5995 57327;57328;57329;57330;57331;57332;57333;57334;57335;57336;57337;57338 72847;72848;72849;72850;72851;72852;72853;72854;72855;72856;72857;72858;72859;72860;72861;72862;72863;72864 72849 18 DIEAMDPSILK Unmodified 1230.6166 0.61658946 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.78 102.78 2 0.00065522 105241 QUIQUE_C1403_190116_001 98.249 74.094 2979600000 476710000 450550000 303140000 277040000 211770000 230020000 359810000 205440000 0 122800000 342320000 0 0 6402 1245 5996 57339;57340;57341;57342;57343;57344;57345;57346;57347;57348;57349 72865;72866;72867;72868;72869;72870;72871;72872;72873;72874;72875;72876;72877;72878;72879;72880 72869 16 DIEAMDPSILK Oxidation (M) 1246.6115 0.61150408 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 1 73.265 73.265 2 0.0023182 68984 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.338 30.731 97971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97971000 0 0 0 6403 1245 5996 57350 72881;72882 72881 720 2 DIEDELTTGLELVDSCIR Unmodified 2076.9885 0.9885152 855;928;813 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6RF55;D6RHE9;E9PHB5;D6RC65;D6RBA8 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 171.76 171.76 2;3 5.2191E-122 176460 QUIQUE_C1368_190116_001 227.06 196.62 1531700000 72249000 131530000 88460000 115350000 133460000 89661000 204290000 131920000 162250000 19195000 140340000 85561000 157480000 6404 855;928;813 5997 57351;57352;57353;57354;57355;57356;57357;57358;57359;57360;57361;57362;57363;57364;57365;57366;57367;57368;57369;57370;57371;57372;57373;57374 72883;72884;72885;72886;72887;72888;72889;72890;72891;72892;72893;72894;72895;72896;72897;72898;72899;72900;72901;72902;72903;72904;72905;72906;72907;72908;72909 72888 26 DIEDPEIVVQATVL Unmodified 1539.8032 0.80320426 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 161.71 161.71 2 0.008307 166759 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.223 42.633 321910000 0 0 36756000 0 84591000 0 0 64667000 107690000 28210000 0 0 0 6405 1423 5998 57375;57376;57377;57378;57379;57380;57381 72910;72911;72912;72913;72914;72915;72916;72917;72918 72915 8 DIEDVFYK Unmodified 1027.4862 0.48622722 1294 J3KTL2;Q07955;J3QQV5;J3KSW7 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.248 97.248 2 0.019858 99248 QUIQUE_C1277_190116_001 77.674 45.204 265880000 95259000 78935000 0 0 0 0 0 42183000 0 49502000 0 0 0 6406 1294 5999 57382;57383;57384;57385;57386 72919;72920;72921;72922;72923;72924 72920 6 DIEEASLVK Unmodified 1002.5233 0.523341 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 54.321 54.321 1;2 0.0023457 53407 QUIQUE_C1218_190116_001 94.302 27.62 4735800000 651590000 0 405080000 403740000 536860000 383440000 929380000 359750000 356810000 309600000 0 399600000 0 6407 869 6000 57387;57388;57389;57390;57391;57392;57393;57394;57395;57396;57397;57398 72925;72926;72927;72928;72929;72930;72931;72932;72933;72934;72935;72936;72937;72938 72925 13 DIEEGAIVNPGR Unmodified 1268.6361 0.63607935 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.898 61.898 2 0.00034217 60525 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 97.033 304510000 113850000 0 0 33935000 0 55393000 36576000 26889000 37865000 0 0 0 0 6408 2217 6001 57399;57400;57401;57402;57403;57404;57405;57406;57407;57408 72939;72940;72941;72942;72943;72944;72945;72946;72947;72948 72940 10 DIEEIIDELK Unmodified 1215.6234 0.62344898 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.53 151.53 2 1.618E-05 157583 QUIQUE_C1218_190116_001 147.51 103.37 4296400000 483440000 418810000 396870000 329300000 222690000 474780000 366130000 192740000 371260000 170620000 342630000 277320000 249810000 6409 856 6002 57409;57410;57411;57412;57413;57414;57415;57416;57417;57418;57419;57420;57421;57422 72949;72950;72951;72952;72953;72954;72955;72956;72957;72958;72959;72960;72961;72962;72963;72964;72965;72966;72967;72968;72969;72970;72971;72972;72973 72950 25 DIEIDDYNLPMQILK Unmodified 1818.9074 0.90735175 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 155.86 155.86 2 7.0515E-19 161177 QUIQUE_C1218_190116_001 147.91 118.57 213020000 71797000 53965000 0 49384000 0 37871000 0 0 0 0 0 0 0 6410 914 6003 57423;57424;57425;57426 72974;72975;72976;72977;72978 72974 5 DIEIIHEELQLK Unmodified 1478.7981 0.7980593 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 102.29 102.29 2 0.0013047 105523 QUIQUE_C1218_190116_001 100.69 63.495 23217000 23217000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6411 1276 6004 57427 72979 72979 1 DIEIVNVQDSEYVK Unmodified 1649.8148 0.81483158 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin yes no 0 0 0 1 54.85 54.85 3 0.049882 53854 QUIQUE_C1368_190116_001 31.526 24.117 44491000 0 0 44491000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6412 2882 6005 57428 72980 72980 0 DIELQIR Unmodified 885.49198 0.4919813 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;O00429;F8VZ52;B4DDQ3;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.929 69.929 2 0.019819 69579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.68 25.727 417760000 0 82655000 0 0 85228000 60740000 60681000 48094000 0 0 0 0 80365000 6413 1108;1404 6006 57429;57430;57431;57432;57433;57434 72981;72982;72983;72984;72985;72986;72987;72988 72987 8 DIELTLR Unmodified 858.48108 0.48108226 4218 Q9HBL8;I3L1Y8;I3L3Z0 NMRAL1 NmrA-like family domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 76.919 76.919 2 0.055848 78051 QUIQUE_C1368_190116_001 71.715 14.612 34768000 0 0 20358000 0 0 0 0 0 0 0 0 14410000 0 6414 4218 6007 57435;57436 72989;72990 72989 2 DIELVMSQANVSR Unmodified 1460.7293 0.72932781 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 0 0 1 94.956 94.956 2 0.0005414 99083 QUIQUE_C1438_190116_001 103.91 7.6799 117790000 0 0 0 0 117790000 0 0 0 0 0 0 0 0 6415 892 6008 57437 72991;72992 72991 2 DIELVMSQANVSR Oxidation (M) 1476.7242 0.72424243 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 1 0 1 66.282 66.282 2 0.023406 65871 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.278 17.054 196810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 196810000 6416 892 6008 57438 72993 72993 1 DIENQYETQITQIEHEVSSSGQEVQSSAK Unmodified 3263.5066 0.5065879 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 142.09 142.09 3;4 0 148843 QUIQUE_C1438_190116_001 272.52 248.85 4231100000 37009000 0 80445000 215870000 628330000 121230000 213290000 567260000 350030000 389670000 553480000 492250000 582200000 + 6417 780 6009 57439;57440;57441;57442;57443;57444;57445;57446;57447;57448;57449;57450;57451;57452;57453;57454;57455;57456 72994;72995;72996;72997;72998;72999;73000;73001;73002;73003;73004;73005;73006;73007;73008;73009;73010;73011;73012;73013;73014 72998 21 DIENSTEIMLDR Unmodified 1434.6661 0.66605885 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 42.609 42.609 2 0.040838 37108 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.129 16.361 66506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 66506000 0 0 0 6418 636 6010 57457 73015 73015 1 DIEQASLAAVSQSLATR Unmodified 1758.9112 0.91119158 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 134.16 134.16 3 0.00012619 138545 QUIQUE_C1277_190116_001 57.936 50.344 238900000 0 36500000 49930000 38258000 0 0 0 0 0 24858000 39382000 0 49976000 6419 4606 6011 57458;57459;57460;57461;57462;57463 73016;73017;73018;73019;73020;73021;73022 73016 5 DIEQSIK Unmodified 831.4338 0.43379771 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 27.396 27.396 2 0.062051 21583 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.485 13.72 121690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 121690000 6420 1968 6012 57464 73023 73023 1 DIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFR Unmodified 3380.5837 0.58371601 2774 P62993 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 170.66 170.66 3 3.0242E-36 177977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.36 117.27 826640000 52082000 38601000 0 16994000 0 0 126320000 0 217420000 4704400 208310000 0 162210000 6421 2774 6013 57465;57466;57467;57468;57469;57470;57471;57472 73024;73025;73026;73027;73028;73029;73030;73031;73032;73033 73032 9 DIEQYYSTQIDEMPMNVADLI Unmodified 2487.1185 0.1185431 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 1 177.22 177.22 2;3 0.007677 184209 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.628 47.224 42516000 0 0 0 0 0 0 0 15088000 0 0 27428000 0 0 6422 2416 6014 57473;57474;57475 73034;73035;73036 73036 3 DIEREDIEFICK Unmodified 1565.7396 0.73955814 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.184 84.184 3 0.00015829 85218 QUIQUE_C1403_190116_001 97.463 67.774 2127400000 125030000 289420000 191360000 152330000 167180000 122620000 178800000 146850000 165740000 57240000 181440000 188980000 160400000 6423 2573 6015 57476;57477;57478;57479;57480;57481;57482;57483;57484;57485;57486;57487;57488;57489 73037;73038;73039;73040;73041;73042;73043;73044;73045;73046;73047;73048;73049;73050;73051;73052 73041 14 DIETFYNTSIEEMPLNVADLI Oxidation (M) 2442.1512 0.15122343 2697 P60842 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes yes 0 1 0 1 1 176.96 176.96 2 5.527E-06 183972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.593 56.036 59345000 0 0 0 0 0 0 0 0 18829000 0 40516000 0 0 6424 2697 6016 57490;57491 73053;73054;73055;73056 73056 2125 4 DIETFYNTSIEEMPLNVADLI Unmodified 2426.1563 0.15630881 2697 P60842 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes yes 0 0 0 1 1 182.02 182.02 2 0.039982 184733 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.967 44.679 25371000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25371000 6425 2697 6016 57492;57493 73057;73058 73058 1 DIETFYNTTVEEMPMNVADLI Oxidation (M) 2460.1076 0.10764406 3055 Q14240 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 175.17 175.17 2 0.0006487 178767 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.57 46.166 119040000 0 0 4638700 0 11160000 0 11316000 13880000 24038000 0 43488000 0 10525000 6426 3055 6017 57494;57495;57496;57497;57498;57499;57500;57501;57502 73059;73060;73061;73062;73063;73064;73065;73066;73067 73063 2513;2514 9 DIETFYNTTVEEMPMNVADLI Unmodified 2444.1127 0.11272944 3055 Q14240 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 180.4 180.4 2 0.024505 186972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.088 49.728 107350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 107350000 0 0 6427 3055 6017 57503 73068 73068 0 DIFAMDDKSENEPIENEAAK Unmodified 2265.0107 0.010707205 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 86.027 86.027 3 0.0018168 87899 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.223 46.89 205050000 0 0 50893000 39233000 39828000 0 0 0 41887000 0 0 33210000 0 6428 3878 6018 57504;57505;57506;57507;57508 73069;73070;73071;73072;73073 73072 5 DIFGLLQAYADGVDLTEK Unmodified 1966.9888 0.9887732 1509 O43150 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.06 174.06 2 4.294E-07 175365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.54 110.46 186690000 5565000 0 0 2799200 0 4814200 45971000 19565000 19565000 0 24775000 50034000 13598000 6429 1509 6019 57509;57510;57511;57512;57513;57514;57515;57516;57517;57518 73074;73075;73076;73077;73078;73079;73080;73081;73082;73083 73079 10 DIFPYSENK Unmodified 1111.5186 0.51858998 1637 O75475 PSIP1 PC4 and SFRS1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.941 71.941 2 0.0063921 72973 QUIQUE_C1218_190116_001 84.498 58.761 584980000 120410000 116990000 86609000 69640000 0 63707000 0 31424000 45524000 0 0 50684000 0 6430 1637 6020 57519;57520;57521;57522;57523;57524;57525;57526 73084;73085;73086;73087;73088;73089;73090;73091 73084 7 DIFQEIFDK Unmodified 1153.5655 0.56554017 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 148.78 148.78 1;2 0.00041107 154921 QUIQUE_C1218_190116_001 122.52 86.07 6517600000 840730000 762030000 868650000 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73145 73145 1 DIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK Unmodified 2417.1223 0.12226376 1473 O15031;E2PU09 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 58.87 58.87 4 0.00017865 58559 QUIQUE_C1438_190116_001 32.896 25.536 245340000 0 0 59800000 46411000 63775000 0 75357000 0 0 0 0 0 0 6437 1473 6027 57561;57562;57563;57564 73146;73147;73148;73149 73148 4 DIGAIAQVHAENGDIIAEEQQR Unmodified 2376.167 0.16696535 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 4 4 6 7 5 8 6 7 8 2 16 7 9 108.3 108.3 2;3 0 96205 QUIQUE_C1277_190116_001 349.19 329.35 34333000000 2374400000 2572700000 2450300000 2427600000 2004600000 2833100000 2957300000 2751600000 2384600000 4185200000 2306500000 2034400000 3050400000 6438 365 6028 57565;57566;57567;57568;57569;57570;57571;57572;57573;57574;57575;57576;57577;57578;57579;57580;57581;57582;57583;57584;57585;57586;57587;57588;57589;57590;57591;57592;57593;57594;57595;57596;57597;57598;57599;57600;57601;57602;57603;57604;57605;57606;57607;57608;57609;57610;57611;57612;57613;57614;57615;57616;57617;57618;57619;57620;57621;57622;57623;57624;57625;57626;57627;57628;57629;57630;57631;57632;57633;57634;57635;57636;57637;57638;57639;57640;57641;57642;57643;57644;57645;57646;57647;57648;57649;57650;57651;57652;57653 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73167 198 DIGAIAR Unmodified 714.40244 0.40243801 3984 Q9BPU6;E7EWB4 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 29.998 29.998 2 0.019541 26126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.56 46.202 8282900000 0 854580000 827630000 0 1104600000 245030000 343200000 799410000 1478700000 416970000 0 1013600000 1199200000 6439 3984 6029 57654;57655;57656;57657;57658;57659;57660;57661;57662;57663;57664;57665;57666;57667;57668;57669;57670 73363;73364;73365;73366;73367;73368;73369;73370;73371;73372;73373;73374;73375;73376;73377;73378;73379;73380;73381;73382;73383 73374 21 DIGEGNLSTAAAAALAAAAVK Unmodified 1883.9953 0.99525556 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 146.77 146.77 2;3 0.00014324 151380 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.812 80.279 598690000 0 56128000 0 53675000 76064000 0 0 103260000 59641000 18201000 61676000 109630000 60409000 6440 1039 6030 57671;57672;57673;57674;57675;57676;57677;57678;57679;57680;57681 73384;73385;73386;73387;73388;73389;73390;73391;73392;73393;73394 73393 10 DIGSALTR Unmodified 831.44503 0.4450311 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 0 1 42.263 42.263 2 0.050353 38771 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.531 3.2994 51104000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51104000 0 6441 67 6031 57682 73395 73395 1 DIGYSDIMVLCVLK Unmodified 1624.8205 0.820451 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 157.28 157.28 2 0.0066893 161599 QUIQUE_C1277_190116_001 64.82 39.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6442 4268 6032 57683 73396 73396 1 DIHDDQDYLHSLGK Unmodified 1654.7587 0.75871368 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 3 1 1 1 1 63.713 63.713 2;3 4.6785E-18 63847 QUIQUE_C1218_190116_001 126.16 112.41 1157200000 118580000 122920000 122390000 117430000 85495000 77325000 135100000 87982000 0 56393000 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93.324 2 0.037851 96128 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.973 40.071 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6447 442 6037 57736 73464 73464 1 DIIEHLNTSGAPADTSDPLQQICK Unmodified 2622.2595 0.2595451 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 1 1 110.27 110.27 3 1.7165E-11 113272 QUIQUE_C1403_190116_001 86.557 74.935 108380000 0 0 0 63283000 0 45093000 0 0 0 0 0 0 0 6448 1362 6038 57737;57738;57739 73465;73466;73467 73466 3 DIIEYAELK Unmodified 1092.5703 0.5702912 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.502 97.502 2 0.014665 100042 QUIQUE_C1368_190116_001 68.224 25.354 230720000 62054000 61015000 54122000 53533000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6449 882 6039 57740;57741;57742;57743;57744;57745;57746;57747 73468;73469;73470;73471;73472;73473;73474;73475 73470 8 DIIFAIK Unmodified 818.49019 0.49019038 2013 P11177 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 96.396 96.396 2 0.046324 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motility protein 2 no no 0 0 1 1 77.894 77.894 3 0.0046289 77901 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.212 57.958 12890000 0 0 0 0 0 0 0 12890000 0 0 0 0 0 6453 3732;3280 6043 57753 73481 73481 1 DIIHFFR Unmodified 946.50249 0.5024864 1053 F8W7U8;P49959 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 0 1 92.229 92.229 2 0.050815 94726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.335 24.296 16413000 0 0 0 0 0 0 0 0 16413000 0 0 0 0 6454 1053 6044 57754 73482 73482 1 DIILATDLAHHLR Unmodified 1486.8256 0.82561145 1402 O00408;E9PEF1;H7C009;C9JPD5 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 85.581 85.581 2;3 0.00016478 87356 QUIQUE_C1277_190116_001 90.793 63.463 1124700000 94507000 147150000 71280000 75319000 121610000 59325000 89428000 84941000 72311000 28875000 87770000 93241000 98936000 6455 1402 6045 57755;57756;57757;57758;57759;57760;57761;57762;57763;57764;57765;57766;57767;57768 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89.383 3 0.058253 91506 QUIQUE_DMIX3_190116_001 21.039 5.6522 11623000 0 0 0 0 0 0 0 0 11623000 0 0 0 0 6463 2964 6053 57855 73603 73603 1 DIIVLVTSLGK Unmodified 1156.7067 0.7067251 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 140.41 140.41 2 0.0010057 144553 QUIQUE_C1403_190116_001 91.584 74.198 93088000 13027000 15216000 17008000 14401000 11271000 9745200 0 0 12419000 0 0 0 0 6464 2459 6054 57856;57857;57858;57859;57860;57861;57862;57863 73604;73605;73606;73607;73608;73609;73610;73611;73612;73613 73608 10 DIKDTTVGTLSQR Unmodified 1432.7522 0.75217174 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.157 50.157 2 0.0028212 47455 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.961 67.186 479710000 0 0 23270000 20766000 45619000 0 0 60934000 83123000 0 106140000 64738000 75118000 6465 2589 6055 57864;57865;57866;57867;57868;57869;57870;57871 73614;73615;73616;73617;73618;73619;73620;73621;73622 73622 9 DIKEHAFFR Unmodified 1161.5931 0.59309232 1894 P05771;I3L148 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 1 1 1 35.568 35.568 3 0.0098982 31632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.191 41.852 112630000 0 0 0 0 0 0 0 60920000 0 0 0 51710000 0 6466 1894 6056 57872;57873 73623;73624 73623 2 DIKPAATHHYLVVPK Unmodified 1687.941 0.94097556 4254 Q9NQE9 HINT3 Histidine triad nucleotide-binding protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 31.87 31.87 4 0.015317 26120 QUIQUE_C1277_190116_001 40.278 34.267 469170000 0 279590000 0 0 0 0 0 189580000 0 0 0 0 0 6467 4254 6057 57874;57875 73625;73626 73625 2 DIKPANVFITATGVVK Unmodified 1671.956 0.95595693 3686 Q8TDX7;Q5TBH0 NEK7;NEK6 Serine/threonine-protein kinase Nek7 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.42 105.42 3 0.0026256 110144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.565 57.732 339240000 0 0 0 44714000 0 0 61044000 40411000 0 29463000 55477000 49875000 58254000 6468 3686 6058 57876;57877;57878;57879;57880;57881;57882 73627;73628;73629;73630;73631;73632;73633 73631 1 DIKPDNLLLDAK Unmodified 1353.7504 0.75038083 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MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 91.322 91.322 2;3 2.9808E-30 92927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.21 164.06 5786900000 594700000 426200000 316370000 460200000 540820000 526970000 408620000 339860000 687650000 137070000 528820000 394950000 424660000 6473 2483 6063 57931;57932;57933;57934;57935;57936;57937;57938;57939;57940;57941;57942;57943;57944;57945;57946;57947;57948;57949;57950;57951;57952;57953;57954;57955;57956;57957 73694;73695;73696;73697;73698;73699;73700;73701;73702;73703;73704;73705;73706;73707;73708;73709;73710;73711;73712;73713;73714;73715;73716;73717;73718;73719;73720;73721;73722;73723;73724;73725;73726;73727;73728;73729;73730;73731 73717 37 DIKPQLELIEDEEKLK Unmodified 1939.0514 0.051373454 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 2 1 1 93.97 93.97 4 0.0008247 95971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.787 35.865 55097000 0 0 0 0 0 0 0 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73857;73858;73859;73860;73861;73862;73863;73864;73865;73866;73867;73868;73869;73870;73871;73872;73873;73874;73875;73876;73877;73878;73879;73880;73881;73882;73883;73884;73885;73886;73887;73888;73889 73867 33 DILGGIR Unmodified 742.43374 0.43373813 61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YK13;H0YK71;H0YN22;H0YMW6 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 65.229 65.229 2 0.045523 64702 QUIQUE_C1277_190116_001 78.445 28.325 346340000 0 62782000 79600000 0 68274000 0 64758000 0 0 0 0 70922000 0 6488 61 6078 58073;58074;58075;58076;58077 73890;73891;73892;73893;73894;73895 73890 6 DILIVVGNEIIEAPMAWR Oxidation (M) 2054.087 0.087047453 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 164.38 164.38 2 0.00063007 166282 QUIQUE_C1563_190116_001 85.288 64.335 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6489 2563 6079 58078 73896 73896 2011 1 DILLIGHR Unmodified 935.55525 0.55525025 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.322 56.322 2 0.026786 52828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.268 46.958 416860000 0 0 93586000 0 87941000 0 95626000 0 0 32190000 107520000 0 0 6490 4474 6080 58079;58080;58081;58082;58083 73897;73898;73899;73900;73901 73900 5 DILLLPLQLPR Unmodified 1289.8071 0.80710784 967 E9PNR2;Q13671 RIN1 Ras and Rab interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.74 155.74 2 0.001148 162196 QUIQUE_C1438_190116_001 89.355 81.787 234530000 16871000 19199000 22795000 16082000 23352000 22734000 16901000 12736000 13292000 7055400 22307000 17961000 23244000 6491 967 6081 58084;58085;58086;58087;58088;58089;58090;58091;58092;58093;58094;58095;58096 73902;73903;73904;73905;73906;73907;73908;73909;73910;73911;73912;73913;73914 73906 13 DILLMLSDMDINAIAGTLK Unmodified 2046.0741 0.074099506 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 174.92 174.92 2 0.012228 180728 QUIQUE_C1438_190116_001 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74006;74007 74006 2 DIMEDTIEDK Unmodified 1207.5278 0.52783403 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 2 1 1 75.914 75.914 1;2 1.9862E-09 76969 QUIQUE_C1218_190116_001 179.8 120.82 471340000 363570000 0 0 0 0 0 0 0 0 63538000 0 0 44230000 6502 273;342 6092 58169;58170;58171;58172 74008;74009;74010;74011 74009 2 DIMEDTIEDKLDTK Unmodified 1664.7815 0.78148254 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 3 4 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 97.345 97.345 2;3 1.2807E-45 101836 QUIQUE_C1438_190116_001 187.85 157.24 16783000000 1530700000 1977300000 1539200000 1409600000 1135800000 1032100000 1447900000 876000000 962900000 530930000 1498800000 1489300000 1352300000 6503 273;342 6093 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74063;74064;74065;74066;74067;74068;74069;74070;74071;74072;74073;74074;74075;74076;74077;74078;74079 74065 200 12 DIMSIYKEPPPGMFVVPDTVDMTK Unmodified 2709.3104 0.31038339 4185 Q9H832;H0Y9X8 UBE2Z Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z yes no 0 0 1 1 149.61 149.61 3 4.3184E-06 152423 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.356 52.633 30681000 0 0 0 0 0 0 0 30681000 0 0 0 0 0 6505 4185 6094 58218 74080 74080 1 DINAVAASLR Unmodified 1028.5615 0.56145784 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;C9JFN4 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 77.852 77.852 2 0.015687 78248 QUIQUE_C1277_190116_001 63.216 27.859 301240000 61054000 57374000 0 75136000 0 0 0 67521000 0 40154000 0 0 0 6506 3437 6095 58219;58220;58221;58222;58223 74081;74082;74083;74084;74085 74082 4 DINAYNCEEPTEK Unmodified 1581.6617 0.66170175 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.727 44.727 2 6.7442E-19 40305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 196.88 192.23 22355000000 1843200000 1255600000 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74137;74138;74139;74140;74141;74142;74143;74144;74145;74146;74147;74148;74149;74150;74151;74152 74144 2157 13 DINLASFIEQVAVSMT Unmodified 1736.8655 0.86548694 2724 P61457 PCBD1 Pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 190.72 190.72 2 1.8307E-07 189082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.84 105.49 69397000 0 0 0 0 0 0 0 12518000 56879000 0 0 0 0 6512 2724 6100 58272;58273 74153;74154 74153 1 DINQEVYNFLATAGAK Unmodified 1752.8683 0.86826413 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 160.39 160.39 2;3 5.2044E-66 165804 QUIQUE_C1218_190116_001 198.49 157.77 20439000000 2212600000 2069800000 1844400000 1459600000 1537800000 1342200000 1431900000 1118800000 1781000000 905630000 1454100000 1371600000 1909200000 6513 3975 6101 58274;58275;58276;58277;58278;58279;58280;58281;58282;58283;58284;58285;58286;58287;58288;58289;58290;58291;58292;58293;58294;58295;58296;58297;58298;58299 74155;74156;74157;74158;74159;74160;74161;74162;74163;74164;74165;74166;74167;74168;74169;74170;74171;74172;74173;74174;74175;74176;74177;74178;74179;74180;74181;74182;74183;74184;74185;74186;74187;74188;74189;74190;74191;74192;74193;74194;74195;74196;74197;74198;74199;74200;74201;74202;74203;74204;74205;74206;74207 74159 53 DINSVAGVLK Unmodified 1014.571 0.5709599 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 76.901 76.901 2 0.041293 78146 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.019 18.717 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6514 1520 6102 58300 74208 74208 1 DINTDFLLVVLR Unmodified 1416.7977 0.79766537 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 168.27 168.27 2;3 8.1081E-07 172965 QUIQUE_C1218_190116_001 169.93 119.89 1145500000 72563000 81189000 88564000 48399000 114420000 126260000 79202000 104700000 90861000 18946000 144800000 129090000 46467000 6515 2916 6103 58301;58302;58303;58304;58305;58306;58307;58308;58309;58310;58311;58312;58313;58314 74209;74210;74211;74212;74213;74214;74215;74216;74217;74218;74219;74220;74221;74222 74209 14 DINWDSSQWQPLIQDR Unmodified 1999.9388 0.93880331 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.22 143.22 2 6.4692E-07 147890 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.42 122.53 158630000 0 0 0 0 0 0 0 0 32563000 18358000 64205000 43507000 0 6516 3766 6104 58315;58316;58317;58318 74223;74224;74225;74226;74227 74227 5 DIPCIFR Unmodified 919.45857 0.45857268 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta no no 0 0 0 1 1 95.985 95.985 2 0.050081 99367 QUIQUE_C1576_190116_001 74.717 38.161 42917000 0 0 0 23252000 0 0 19665000 0 0 0 0 0 0 6517 4631 6105 58319;58320 74228;74229 74229 2 DIPDYLCGK Unmodified 1079.4957 0.49574604 4509 Q9UNE7;H3BTA3;H3BUD0 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 81.3 81.3 2 0.021668 82636 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.999 31.814 27056000 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1655 6108 58336;58337;58338;58339;58340;58341;58342;58343;58344;58345;58346;58347;58348;58349;58350;58351;58352;58353;58354;58355;58356;58357;58358;58359 74247;74248;74249;74250;74251;74252;74253;74254;74255;74256;74257;74258;74259;74260;74261;74262;74263;74264;74265;74266;74267;74268;74269;74270;74271;74272 74269 23 DIPIWGTLIQYIR Unmodified 1586.8821 0.8820637 3646 Q8NF37;A0A0G2JQ62 LPCAT1 Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 171.13 171.13 2 0.00044583 178400 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.456 73.074 51215000 0 0 0 0 0 0 0 0 16897000 0 34317000 0 0 6521 3646 6109 58360;58361 74273;74274 74274 2 DIPLGIR Unmodified 782.46504 0.46503826 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 68.538 68.538 2 0.037484 69125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.306 23.309 64343000 0 0 0 28721000 0 0 0 0 0 0 35622000 0 0 6522 3660 6110 58362;58363 74275;74276;74277 74276 3 DIPLNQGCLAPVR Unmodified 1451.7555 0.75548298 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.293 85.293 2 0.00018312 87215 QUIQUE_C1368_190116_001 137.14 104.92 310360000 0 39051000 56072000 0 47717000 43680000 0 0 41492000 0 42651000 39699000 0 6523 1450 6111 58364;58365;58366;58367;58368;58369;58370 74278;74279;74280;74281;74282;74283;74284 74279 6 DIPNENEAQFQIR Unmodified 1572.7532 0.75323437 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.823 82.823 2 0.00015692 85810 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.43 115.91 671110000 0 0 0 0 0 0 0 107690000 106260000 58091000 137430000 131210000 130430000 6524 2938 6112 58371;58372;58373;58374;58375;58376 74285;74286;74287;74288;74289;74290;74291;74292;74293;74294;74295;74296;74297 74293 13 DIPNENELQFQIK Unmodified 1586.794 0.79403655 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.75 106.75 2 1.6257E-12 110104 QUIQUE_C1277_190116_001 150.35 124.97 3498100000 368370000 388710000 0 0 322440000 278390000 349400000 323200000 343350000 151660000 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74385;74386;74387;74388;74389;74390;74391;74392;74393;74394;74395;74396;74397;74398;74399;74400;74401;74402;74403;74404;74405;74406;74407;74408;74409;74410;74411 74407 27 DIQAQIDSIVELVCK Unmodified 1729.892 0.89203604 1162 H0YIE9;Q4G104;O94952 FBXO21 F-box only protein 21 yes no 0 0 0 1 1 1 170.2 170.2 3 0.0020632 173565 QUIQUE_C1277_190116_001 55.975 38.756 30827000 0 15495000 0 7899500 0 0 7432700 0 0 0 0 0 0 6534 1162 6122 58470;58471;58472 74412;74413;74414 74412 3 DIQDSLTVSNEVQTAK Unmodified 1746.8636 0.86357268 2492 P47755 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 82.686 82.686 2;3 5.5509E-66 83841 QUIQUE_C1403_190116_001 198.03 165.51 1235900000 82068000 106490000 189190000 109200000 81439000 98528000 105500000 63017000 61722000 103090000 77226000 77245000 81150000 6535 2492 6123 58473;58474;58475;58476;58477;58478;58479;58480;58481;58482;58483;58484;58485;58486;58487 74415;74416;74417;74418;74419;74420;74421;74422;74423;74424;74425;74426;74427;74428;74429;74430;74431;74432;74433;74434;74435;74436;74437;74438;74439;74440;74441;74442;74443 74424 29 DIQENDEEAVQVK Unmodified 1515.7053 0.70528113 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.74 46.74 2 0.00025066 43947 QUIQUE_C1218_190116_001 112.83 74.53 47029000 47029000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6536 1388 6124 58488;58489;58490;58491;58492 74444;74445;74446;74447;74448 74444 5 DIQGALHSYK Unmodified 1130.572 0.57202253 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 42.274 42.274 2 0.011083 36731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.838 27.487 32273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32273000 0 0 0 6537 3555 6125 58493 74449 74449 1 DIQHAVVNLDNSVVDLETLQALYENR Unmodified 2967.4938 0.49377879 4340 Q9NZ56;B0QZD5 FMN2 Formin-2 yes no 0 0 0 1 166.78 166.78 3 8.5117E-70 170618 QUIQUE_C1277_190116_001 158.88 146.68 79325000 0 79325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6538 4340 6126 58494 74450 74450 1 DIQMPDGIR Oxidation (M) 1059.5019 0.50189405 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 37.386 37.386 2 0.021957 33027 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.265 26.619 77811000 0 0 0 0 0 0 0 0 46669000 31143000 0 0 0 6539 3053 6127 58495;58496 74451;74452 74451 2 DIQMPDGIR Unmodified 1043.507 0.50697943 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 74.244 74.244 2 0.016694 74895 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.302 47.235 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6540 3053 6127 58497;58498;58499;58500 74453;74454;74455;74456 74455 4 DIQMTQSPSSLSASVGDR Unmodified 1877.8789 0.87890517 411 A0A2Q2TTZ9 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 83.582 83.582 2;3 1.3419E-53 86569 QUIQUE_C1218_190116_001 180.48 139.76 578640000 39344000 115980000 76939000 55472000 47032000 27889000 0 36084000 0 30924000 78631000 0 70346000 6541 411 6128 58501;58502;58503;58504;58505;58506;58507;58508;58509;58510;58511 74457;74458;74459;74460;74461;74462;74463;74464;74465;74466;74467;74468;74469 74457 13 DIQMTQSPSSLSASVGDR Oxidation (M) 1893.8738 0.87381979 411 A0A2Q2TTZ9 yes yes 0 1 0 1 1 1 62.503 62.503 2 3.108E-13 60578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.45 107.08 230150000 0 161180000 0 0 0 0 0 0 0 22767000 46201000 0 0 6542 411 6128 58512;58513;58514 74470;74471;74472 74471 293 3 DIQSLPR Unmodified 827.45012 0.45011648 4352;4175 Q9NZN3;Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 EHD3;EHD1 EH domain-containing protein 3;EH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 36.306 36.306 2 0.039576 31905 QUIQUE_C1277_190116_001 83.614 14.225 559900000 0 198970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 189590000 171340000 6543 4352;4175 6129 58515;58516;58517 74473;74474;74475;74476 74473 4 DIQTLLSR Unmodified 944.5291 0.52909508 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;F6S6P2;X6REW1;A0A0G2JJM1;F6UR09;F6U1F2;F6XTU0;A0A0G2JJR8;A0A1B0GX79;F6WML8;F6VEM6;F6X9W3;F6U341 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74481;74482;74483;74484;74485;74486;74487;74488;74489;74490;74491;74492;74493;74494;74495;74496;74497;74498;74499;74500;74501;74502;74503;74504;74505;74506;74507;74508;74509;74510;74511;74512;74513;74514;74515;74516;74517;74518;74519;74520;74521;74522;74523;74524;74525;74526;74527;74528;74529;74530;74531;74532;74533;74534;74535;74536;74537;74538;74539;74540;74541;74542;74543;74544;74545;74546;74547;74548;74549;74550;74551;74552;74553;74554;74555;74556;74557;74558;74559;74560;74561;74562;74563;74564;74565;74566;74567;74568;74569;74570;74571;74572;74573;74574;74575;74576;74577;74578;74579;74580;74581;74582;74583;74584;74585;74586;74587;74588;74589;74590;74591;74592;74593;74594;74595 74553 92 DIRFELLAR Unmodified 1131.64 0.64004252 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 93.709 93.709 3 0.054928 94943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.56 45.467 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6547 2389 6133 58627 74596 74596 1 DISCLNRDPAR Unmodified 1315.6303 0.63028247 3231 Q3ZCQ8;M0R003;M0R1Y4;M0R2Q2 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 1 1 29.159 29.159 3 0.063281 23806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.008 10.779 42091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42091000 0 0 6548 3231 6134 58628 74597 74597 1 DISILQCHGDCDPLVPLMFGSLTVEK Unmodified 2943.418 0.41803636 109 A0A087X1K9;E5RGR0;O75608;B4DP64 LYPLA1 Acyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 163.54 163.54 3 1.2321E-07 168800 QUIQUE_C1218_190116_001 56.694 50.33 338700000 53719000 63273000 56311000 42631000 0 52161000 0 0 0 0 0 0 70604000 6549 109 6135 58629;58630;58631;58632;58633;58634 74598;74599;74600;74601;74602;74603;74604 74598 7 DISLSDYK Unmodified 939.45493 0.45492709 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.361 62.361 2 0.0036109 61831 QUIQUE_C1277_190116_001 114.6 21.34 48077000000 3155500000 3291900000 3924700000 3467500000 3394900000 3142000000 3829500000 3365700000 4509600000 1918000000 4817000000 3927700000 5333200000 6550 2904 6136 58635;58636;58637;58638;58639;58640;58641;58642;58643;58644;58645;58646;58647 74605;74606;74607;74608;74609;74610;74611;74612;74613;74614;74615;74616;74617;74618;74619;74620;74621;74622;74623;74624 74608 18 DISLSDYKGK Unmodified 1124.5714 0.57135383 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 1 1 40.383 40.383 2 0.025217 36703 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.442 57.993 251370000 0 0 0 0 0 0 0 251370000 0 0 0 0 0 6551 2904 6137 58648 74625 74625 0 DISNLEENDETR Unmodified 1433.627 0.62703081 4135 Q9H1V8 SLC6A17 Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.208 50.208 2 0.00036399 47274 QUIQUE_C1563_190116_001 136.02 104.09 351320000 0 31731000 39766000 34039000 38334000 33944000 41593000 30693000 0 0 54145000 47074000 0 6552 4135 6138 58649;58650;58651;58652;58653;58654;58655;58656;58657;58658 74626;74627;74628;74629;74630;74631;74632;74633;74634;74635 74630 8 DISPEEIDLKNEPWYK Unmodified 1974.9575 0.95747307 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 2 2 1 1 110.66 110.66 2;3 0.00030646 113250 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.79 96.037 349870000 0 0 0 0 46366000 0 0 95496000 100890000 0 0 48242000 58875000 6553 309;4058 6139 58659;58660;58661;58662;58663;58664;58665 74636;74637;74638;74639;74640;74641;74642 74638 6 DISPVLKDPASFR Unmodified 1443.7722 0.7721789 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 1 2 80.422 80.422 2;3 0.00028434 77526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.591 76.495 1832800000 61009000 86868000 103630000 124730000 167290000 61451000 80247000 290050000 172380000 126750000 229790000 148780000 179860000 6554 1928 6140 58666;58667;58668;58669;58670;58671;58672;58673;58674;58675;58676;58677;58678;58679;58680;58681;58682;58683;58684;58685 74643;74644;74645;74646;74647;74648;74649;74650;74651;74652;74653;74654;74655;74656;74657;74658;74659;74660;74661;74662;74663;74664;74665 74658 23 DISQAYYTVYK Unmodified 1349.6503 0.65033243 2045 P12429;D6RA82;D6RFG5 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 88.46 88.46 2 0.035745 85209 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.56 44.329 51268000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51268000 0 0 0 6555 2045 6141 58686 74666 74666 1 DISSIGLK Unmodified 831.47018 0.47018322 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 56.833 56.833 1;2 0.028279 55864 QUIQUE_C1277_190116_001 68.915 11.451 1053500000 0 279480000 0 0 0 71882000 66428000 0 77712000 0 96966000 68548000 392480000 6556 3499 6142 58687;58688;58689;58690;58691;58692;58693;58694;58695;58696 74667;74668;74669;74670;74671;74672;74673;74674;74675;74676 74667 4 DISSITMFADYR Unmodified 1417.6548 0.65476588 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.1 133.1 2 0.00051585 137307 QUIQUE_C1403_190116_001 94.297 67.182 367080000 30612000 34370000 39079000 33969000 39917000 34663000 0 49112000 0 15740000 38719000 0 50897000 6557 3318 6143 58697;58698;58699;58700;58701;58702;58703;58704;58705;58706;58707 74677;74678;74679;74680;74681;74682;74683;74684;74685;74686;74687;74688 74681 12 DISSTLIALADK Unmodified 1245.6816 0.68163256 870 E7ESY4;Q13330;H7C3F3 MTA1 Metastasis-associated protein MTA1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 139.7 139.7 2 0.0015731 144895 QUIQUE_C1368_190116_001 94.616 70.461 73853000 0 18615000 16159000 0 0 25044000 14035000 0 0 0 0 0 0 6558 870 6144 58708;58709;58710;58711;58712 74689;74690;74691;74692;74693 74690 5 DISTNYYASQK Unmodified 1288.5935 0.59354583 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.509 45.509 2 0.00065522 42788 QUIQUE_C1438_190116_001 98.249 87.098 2653300000 188520000 206460000 258210000 265710000 254560000 224210000 322150000 138080000 209960000 0 0 240350000 345070000 6559 2079 6145 58713;58714;58715;58716;58717;58718;58719;58720;58721;58722;58723 74694;74695;74696;74697;74698;74699;74700;74701;74702;74703;74704;74705;74706;74707;74708;74709;74710 74702 15 DISTTLNADEAVAR Unmodified 1474.7264 0.72635092 3738;1748;180 O95757;E9PDE8;D6RJ96;A0A0A0MSM0;Q92598 HSPA4L;HSPH1 Heat shock 70 kDa protein 4L;Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.197 81.197 2 2.0837E-17 81596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.46 115.92 2004000000 173490000 193520000 147750000 187290000 144400000 172430000 179970000 151890000 136640000 107770000 137690000 144610000 126550000 6560 1748;180;3738 6146 58724;58725;58726;58727;58728;58729;58730;58731;58732;58733;58734;58735;58736;58737 74711;74712;74713;74714;74715;74716;74717;74718;74719;74720;74721;74722;74723;74724;74725;74726;74727;74728 74722 18 DITAALAAER Unmodified 1029.5455 0.54547343 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 72.417 72.417 1;2 0.00029303 72686 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.86 80.755 5052800000 441520000 439540000 437040000 432490000 419950000 347600000 440050000 330030000 299820000 218780000 466460000 345140000 434380000 6561 269;2893 6147 58738;58739;58740;58741;58742;58743;58744;58745;58746;58747;58748;58749;58750;58751;58752;58753;58754 74729;74730;74731;74732;74733;74734;74735;74736;74737;74738;74739;74740;74741;74742;74743;74744;74745;74746;74747;74748;74749;74750;74751;74752;74753;74754 74742 23 DITAEEEEEEVESLK Unmodified 1748.784 0.78398496 461 A0A2R8YF29;Q9BZ23;V9GYZ0 PANK2 Pantothenate kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 105.57 105.57 2 0.0031682 102392 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.234 56.279 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6562 461 6148 58755 74755 74755 1 DITDTLVAVTISEGAHHLDLR Unmodified 2275.1808 0.1808245 2455 P42785 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 147.96 147.96 3;4 1.5527E-53 152895 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.04 150.34 874780000 47317000 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1225.6091 0.60913632 4146 Q9H2H8;B8ZZ77;H7BZ14 PPIL3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 100.19 100.19 2 0.025974 103362 QUIQUE_C1218_190116_001 52.867 38.872 41560000 41560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6566 4146 6152 58777 74781 74781 1 DITLEASR Unmodified 903.46616 0.46616048 2781 P63151;E5RFR9 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 39.417 39.417 2 0.018737 35226 QUIQUE_C1277_190116_001 79.469 30.11 157390000 0 80283000 0 0 0 0 77105000 0 0 0 0 0 0 6567 2781 6153 58778;58779;58780 74782;74783;74784 74782 3 DITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER Unmodified 2531.2867 0.28674613 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 131.11 131.11 3 1.563E-08 136164 QUIQUE_C1218_190116_001 80.683 73.913 218040000 61605000 0 0 52879000 0 38478000 30448000 0 0 34625000 0 0 0 6568 2355 6154 58781;58782;58783;58784;58785 74785;74786;74787;74788;74789 74785 5 DITPLQVVLPNTALHLK Unmodified 1871.088 0.088033731 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2 MVP Major vault protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 1 132.29 132.29 2;3 6.6122E-13 137906 QUIQUE_C1576_190116_001 128.31 105.98 2492100000 128690000 174820000 277240000 205260000 358060000 153500000 243070000 135780000 156480000 101590000 279240000 88126000 190250000 6569 3086 6155 58786;58787;58788;58789;58790;58791;58792;58793;58794;58795;58796;58797;58798;58799;58800;58801;58802;58803;58804;58805;58806;58807;58808;58809;58810 74790;74791;74792;74793;74794;74795;74796;74797;74798;74799;74800;74801;74802;74803;74804;74805;74806;74807;74808;74809;74810;74811;74812;74813;74814;74815;74816;74817 74806 27 DITSDTSGDFR Unmodified 1212.5259 0.5258602 1853 P04083;Q5T3N1 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 56.837 56.837 2 0.00010744 55413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.07 133.77 3962400000 166130000 0 403530000 456190000 190600000 400850000 418930000 234970000 414250000 233640000 341280000 182900000 519140000 6570 1853 6156 58811;58812;58813;58814;58815;58816;58817;58818;58819;58820;58821;58822;58823 74818;74819;74820;74821;74822;74823;74824;74825;74826;74827;74828;74829;74830;74831;74832;74833;74834 74827 17 DITSSIHFEAYR Unmodified 1437.6888 0.6888432 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 86.578 86.578 2;3 1.4594E-05 88926 QUIQUE_C1277_190116_001 106.49 90.736 3608700000 0 251110000 268320000 248890000 199220000 271330000 227190000 461680000 403320000 304440000 263200000 238120000 471880000 6571 4432 6157 58824;58825;58826;58827;58828;58829;58830;58831;58832;58833;58834;58835;58836;58837;58838;58839 74835;74836;74837;74838;74839;74840;74841;74842;74843;74844;74845;74846;74847;74848;74849;74850;74851;74852;74853;74854;74855;74856;74857;74858;74859;74860;74861;74862;74863;74864;74865;74866;74867;74868;74869;74870;74871;74872;74873;74874;74875;74876 74837 41 DITVLDLGCGK Unmodified 1189.6013 0.60127375 1507 O43148;K7EP06 RNMT mRNA cap guanine-N7 methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 102.87 102.87 2 0.002989 105283 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 69.916 65685000 24512000 0 0 23909000 0 17264000 0 0 0 0 0 0 0 6572 1507 6158 58840;58841;58842;58843 74877;74878;74879;74880;74881 74879 4 DITYFIQQLLR Unmodified 1408.7715 0.77145062 2714;4374 P61158;B4DXW1;Q9P1U1;A0A0A0MTI9;Q9C0K3;H7C4J1;C9IZN3 ACTR3;ACTR3B;ACTR3C Actin-related protein 3;Actin-related protein 3B;Actin-related protein 3C no no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 172.85 172.85 2;3 5.799E-08 166293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.65 75.722 2741700000 695290000 18208000 459400000 586560000 0 344710000 0 38228000 23960000 519440000 29002000 20406000 6501700 6573 2714;4374 6159 58844;58845;58846;58847;58848;58849;58850;58851;58852;58853;58854;58855;58856;58857 74882;74883;74884;74885;74886;74887;74888;74889;74890;74891;74892;74893;74894;74895;74896;74897;74898 74893 17 DIVAAIQHNYK Unmodified 1270.667 0.66698555 3327 Q5TFE4;Q5QPD0 NT5DC1 5'-nucleotidase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.873 61.873 2 0.00023011 61017 QUIQUE_C1277_190116_001 144.09 119.93 524210000 69054000 48993000 50577000 52622000 58808000 0 75108000 24643000 0 11010000 67208000 0 66189000 6574 3327 6160 58858;58859;58860;58861;58862;58863;58864;58865;58866;58867 74899;74900;74901;74902;74903;74904;74905;74906;74907;74908 74900 8 DIVCYLSLLER Unmodified 1379.7119 0.71188683 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 1 1 155.3 155.3 2 0.0028642 149955 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.624 63.884 117920000 65668000 0 0 35002000 0 0 0 0 0 17255000 0 0 0 6575 636 6161 58868;58869;58870 74909;74910;74911;74912;74913 74912 5 DIVEAHYR Unmodified 1001.493 0.49304393 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.137 25.137 2 0.0006708 18617 QUIQUE_C1403_190116_001 151.51 95.5 39383000000 2252000000 2562600000 4296600000 2689400000 2098200000 2442600000 2113600000 2837400000 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mitochondrial yes yes 0 1 0 3 2 4 3 3 4 3 4 1 4 4 4 3 70.111 70.111 2;3 0.00011945 71468 QUIQUE_C1218_190116_001 118.28 83.558 7264500000 277290000 276810000 970220000 452110000 515490000 532810000 368390000 477190000 255640000 604060000 1183300000 734290000 616930000 6581 1777 6166 58915;58916;58917;58918;58919;58920;58921;58922;58923;58924;58925;58926;58927;58928;58929;58930;58931;58932;58933;58934;58935;58936;58937;58938;58939;58940;58941;58942;58943;58944;58945;58946;58947;58948;58949;58950;58951;58952;58953;58954;58955;58956 74970;74971;74972;74973;74974;74975;74976;74977;74978;74979;74980;74981;74982;74983;74984;74985;74986;74987;74988;74989;74990;74991;74992;74993;74994;74995;74996;74997;74998;74999;75000;75001;75002;75003;75004;75005;75006;75007;75008;75009;75010;75011;75012;75013;75014;75015;75016;75017 74971 971 47 DIVHSGLAYTMER Unmodified 1490.7188 0.71876312 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 84.688 84.688 2;3 9.757E-18 87772 QUIQUE_C1218_190116_001 126.34 116.02 29363000000 2754800000 2447900000 3313900000 2483000000 2455300000 2156300000 2364900000 1533800000 1874600000 782590000 3190700000 1872000000 2132800000 6582 1777 6166 58957;58958;58959;58960;58961;58962;58963;58964;58965;58966;58967;58968;58969;58970;58971;58972;58973;58974;58975;58976;58977;58978;58979;58980;58981;58982;58983 75018;75019;75020;75021;75022;75023;75024;75025;75026;75027;75028;75029;75030;75031;75032;75033;75034;75035;75036;75037;75038;75039;75040;75041;75042;75043;75044;75045;75046;75047;75048;75049;75050;75051;75052;75053;75054;75055;75056;75057;75058;75059;75060;75061;75062;75063;75064;75065;75066;75067;75068;75069;75070;75071;75072;75073;75074;75075;75076;75077;75078;75079;75080 75019 63 DIVINANPASPPLSLLVLHR Unmodified 2138.2212 0.22117317 2971 Q13155;A8MU58 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes no 0 0 0 1 2 3 1 1 1 1 1 1 1 142.19 142.19 3 5.694E-05 147243 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Unmodified 1499.8096 0.80962704 2889;2616 P52895;B4DK69;Q04828;H0Y804 AKR1C2;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 111.12 111.12 2;3 1.0022E-05 114221 QUIQUE_C1403_190116_001 107.18 92.969 159710000 0 35994000 0 0 23637000 24383000 23610000 0 0 52086000 0 0 0 6586 2616;2889 6170 59001;59002;59003;59004;59005;59006;59007;59008 75098;75099;75100;75101;75102;75103;75104;75105 75100 6 DIVLVAYSALGSQR Unmodified 1490.8093 0.80929269 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;A0A3B3IRI8 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 0 1 130.75 130.75 2 4.1824E-05 126959 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.48 81.79 16000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16000000 0 0 0 6587 183 6171 59009 75106;75107 75107 2 DIVNGLR Unmodified 785.43955 0.43955179 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.511 46.511 2 0.019915 41892 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.88 51.22 776860000 0 0 102520000 96446000 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75117;75118;75119;75120;75121;75122;75123;75124;75125;75126;75127;75128;75129;75130;75131;75132;75133;75134;75135;75136;75137;75138;75139;75140;75141;75142;75143;75144;75145;75146;75147;75148;75149;75150;75151;75152;75153;75154 75130 35 DIVNMLMHHDR Oxidation (M) 1395.6387 0.63873866 2016;2017 P11216;H0Y4Z6;P11217 PYGB;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 3 60.984 60.984 2;3 0.0015486 60370 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.44 57.535 374670000 0 0 88281000 0 0 63749000 40386000 32643000 0 149610000 0 0 0 6590 2016;2017 6173 59041;59042;59043;59044;59045;59046;59047;59048;59049;59050 75155;75156;75157;75158;75159;75160;75161;75162;75163;75164;75165 75164 1321;1322;1330;1331 9 DIVPGDIVEIAVGDKVPADIR Unmodified 2190.1896 0.18959827 2112 P16615 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.89 145.89 3 0.00013529 151006 QUIQUE_C1368_190116_001 64.87 44.78 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75174;75175;75176;75177;75178;75179;75180;75181;75182;75183;75184;75185;75186;75187;75188;75189;75190;75191;75192;75193;75194;75195;75196;75197;75198;75199;75200;75201;75202;75203;75204;75205 75187 32 DIVQFVPYR Unmodified 1135.6026 0.60259438 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;H0Y524 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.37 104.37 2 0.00042893 107480 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.17 85.623 909980000 45453000 63232000 94090000 81966000 84946000 0 88050000 33721000 88913000 55334000 113810000 67479000 92988000 6593 579 6176 59072;59073;59074;59075;59076;59077;59078;59079;59080;59081;59082;59083 75206;75207;75208;75209;75210;75211;75212;75213;75214;75215;75216;75217;75218;75219 75219 13 DIVSGLK Unmodified 730.4225 0.42250475 2607 P52566;F5H3P3;H0YGX7 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 44.594 44.594 2 0.049128 41289 QUIQUE_C1403_190116_001 75.311 18.8 192550000 0 0 0 78532000 0 47835000 0 0 0 0 66180000 0 0 6594 2607 6177 59084;59085;59086 75220;75221;75222 75220 3 DIVTESNKFDLVSFIPLLR Unmodified 2205.2045 0.20452005 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.34 166.34 3 1.8094E-07 172589 QUIQUE_C1438_190116_001 103.85 94.568 602950000 0 41257000 27562000 18661000 73381000 0 0 60367000 102760000 0 96059000 104680000 78221000 6595 2930 6178 59087;59088;59089;59090;59091;59092;59093;59094;59095 75223;75224;75225;75226;75227;75228;75229;75230;75231 75226 7 DIVTPVPQEEVK Unmodified 1352.7187 0.71874635 4494;981;1236 F1T0E5;H7C4P2;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 66.431 66.431 2 0.0043953 65840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.162 54.375 1304600000 236870000 217860000 133010000 132230000 0 0 0 158090000 132300000 0 0 162920000 131300000 6596 981;4494;1236 6179 59096;59097;59098;59099;59100;59101;59102;59103 75232;75233;75234;75235;75236;75237;75238;75239;75240 75237 5 DIVTVANAVFVK Unmodified 1274.7234 0.72343779 1911 P07093;C9JN98 SERPINE2 Glia-derived nexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.39 126.39 2 0.02198 128803 QUIQUE_C1563_190116_001 52.725 43.542 98248000 27432000 15253000 23048000 15924000 0 16591000 0 0 0 0 0 0 0 6597 1911 6180 59104;59105;59106;59107;59108;59109;59110 75241;75242;75243;75244;75245;75246;75247 75245 5 DIVVLGVEK Unmodified 970.5699 0.56989727 1448 O14818 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.695 77.695 2 0.0098665 78220 QUIQUE_C1277_190116_001 74.92 31.702 759000000 126620000 109080000 126340000 0 0 98838000 0 37285000 0 67196000 68493000 56418000 68737000 6598 1448 6181 59111;59112;59113;59114;59115;59116;59117;59118;59119 75248;75249;75250;75251;75252;75253;75254;75255;75256 75249 8 DIWDFLR Unmodified 963.48142 0.48141661 3647 Q8NFF5;Q5T190 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.52 157.52 2 0.033008 161248 QUIQUE_C1403_190116_001 88.734 53.629 50641000 0 0 14998000 8721800 0 0 9203800 12602000 0 5116000 0 0 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kinase 2, mitochondrial;Pantothenate kinase 3;Pantothenate kinase 1 yes no 0 0 0 1 47.699 47.699 2 0.050487 45033 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.607 40.528 14926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14926000 0 6604 461 6187 59163 75306 75306 1 DIYKRMAGTAFDFENMK Unmodified 2035.9496 0.94956769 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 2 1 95.238 95.238 3 0.03977 97691 QUIQUE_C1277_190116_001 49.993 44.991 34826000 0 34826000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6605 2328 6188 59164 75307 75307 0 DKADFCIIHYAGK Unmodified 1536.7395 0.73949856 2378;2379 P35579;P35580 MYH9;MYH10 Myosin-9;Myosin-10 no no 0 0 1 1 1 1 2 60.215 60.215 2;3 0.0069462 59373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.32 38.214 313290000 97161000 104930000 0 0 0 0 0 83031000 0 0 28160000 0 0 6606 2378;2379 6189 59165;59166;59167;59168;59169 75308;75309;75310;75311;75312 75310 3 DKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEK Unmodified 4077.1099 0.10989797 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 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75499;75500;75501;75502;75503;75504;75505 75504 6 DKELVASAGLDR Unmodified 1272.6674 0.66737948 3659 Q8TAF3;C9JC24 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes no 0 0 1 1 1 37.948 37.948 2 0.027853 33921 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.171 36.013 78703000 0 0 0 0 0 0 0 0 30397000 0 0 48306000 0 6624 3659 6207 59327;59328 75506;75507 75507 2 DKEPDTQDADEVKK Unmodified 1616.753 0.7529596 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 12.396 12.396 3 0.01356 5621 QUIQUE_C1563_190116_001 53.3 44.018 28057000 0 0 0 0 3633200 11863000 6308000 0 0 0 6251900 0 0 6625 2946 6208 59329;59330;59331;59332;59333;59334 75508;75509;75510;75511;75512;75513;75514 75511 7 DKEPDVLFVGDSMVQLMQQYEIWR Unmodified 2925.4041 0.40410085 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 1 171.73 171.73 3 5.4827E-13 175756 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.81 90.404 482100000 0 0 31140000 0 0 0 0 0 0 0 326680000 0 124270000 6626 2798 6209 59335;59336;59337 75515;75516;75517 75517 0 DKEPEVVFIGDSLVQLMHQCEIWR Unmodified 2927.431 0.4309843 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 3 1 166.31 166.31 3;4 5.6337E-27 173126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.45 119.07 3195900000 59392000 175770000 0 60002000 141310000 0 300290000 241570000 474700000 9905500 667050000 752100000 313850000 6627 3110 6210 59338;59339;59340;59341;59342;59343;59344;59345;59346;59347;59348;59349;59350;59351;59352;59353;59354;59355;59356 75518;75519;75520;75521;75522;75523;75524;75525;75526;75527;75528;75529;75530;75531;75532;75533;75534;75535;75536;75537;75538;75539 75533 16 DKESGICMDSGGFR Unmodified 1557.6552 0.65517659 1297 J3QL71;Q96FV2;J3QQM9 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 50.183 50.183 2;3 0.0015901 48245 QUIQUE_C1277_190116_001 93.766 82.276 88043000 0 29113000 29205000 0 0 0 0 0 0 0 29725000 0 0 6628 1297 6211 59357;59358;59359 75540;75541;75542 75540 1 DKETTENENTKFEVR Unmodified 1838.8646 0.86463532 1874 P05060;A0A0A0MT66 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes no 0 0 2 1 20.909 20.909 3 0.014845 14020 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.104 50.989 38604000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38604000 6629 1874 6212 59360 75543 75543 1 DKEVGNLYDMFHTR Unmodified 1723.7988 0.79880436 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.232 86.232 3 0.0030517 88562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.022 68.903 553610000 36309000 62755000 119050000 71461000 0 0 69272000 59281000 44771000 0 90715000 0 0 6630 4598 6213 59361;59362;59363;59364;59365;59366;59367;59368 75544;75545;75546;75547;75548;75549;75550;75551;75552 75552 6 DKEVTALTSQTEMLR Unmodified 1720.8665 0.86654957 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 72.35 72.35 2;3 0.010893 73862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.223 43.108 134590000 0 0 0 0 0 0 55125000 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0.8566434 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 1 1 170.45 170.45 3 3.3533E-07 172232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.867 48.996 44214000 0 0 0 0 0 0 0 44214000 0 0 0 0 0 6636 4330 6219 59417 75607 75607 1 DKFNECGHVLYADIK Unmodified 1807.8563 0.85631924 2603 P52272;A0A087X0X3 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 60.181 60.181 2;3 8.0673E-09 59368 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.1 101.47 1658200000 0 0 298910000 324290000 43901000 327970000 24393000 0 343960000 0 219760000 32371000 42639000 6637 2603 6220 59418;59419;59420;59421;59422;59423;59424;59425;59426;59427;59428;59429;59430;59431 75608;75609;75610;75611;75612;75613;75614;75615;75616;75617;75618;75619;75620;75621;75622 75621 12 DKFSFDLGKGEVIK Unmodified 1581.8403 0.84025847 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 2 1 1 1 77.185 77.185 3 0.0040969 77466 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.813 44.189 105010000 0 0 0 0 0 0 0 58030000 0 0 0 46982000 0 6638 2876 6221 59432;59433;59434 75623;75624;75625;75626 75623 4 DKGDEEEEGEEKLEEK Unmodified 1891.8171 0.817076 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 26.523 26.523 2;3 1.0078E-183 20021 QUIQUE_C1403_190116_001 262.66 218.98 1333000000 193060000 172020000 135550000 267200000 46374000 154960000 153960000 70637000 0 62881000 38560000 37755000 0 6639 2269 6222 59435;59436;59437;59438;59439;59440;59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;59448;59449 75627;75628;75629;75630;75631;75632;75633;75634;75635;75636;75637;75638;75639;75640;75641;75642 75634 16 DKGEIAQAYIGLK Unmodified 1404.7613 0.76127986 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 67.693 67.693 2;3 0.00097708 67679 QUIQUE_C1576_190116_001 128.01 109.04 371790000 43242000 57412000 40289000 0 45089000 0 40102000 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12 DKGVNSFMVYMAYK Oxidation (M) 1667.7687 0.76874978 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 85.705 85.705 3 0.00031426 86990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.359 77.301 152060000 0 0 0 0 0 0 0 37186000 50763000 0 0 29006000 35101000 6643 3051 6225 59474;59475;59476;59477;59478 75672;75673;75674;75675;75676 75672 2483 5 DKHPDLPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLK Unmodified 3519.7398 0.73977992 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 1 1 154.54 154.54 4 0.0049979 160268 QUIQUE_C1576_190116_001 27.547 23.561 53777000 0 0 0 0 0 0 53777000 0 0 0 0 0 0 6644 2061 6226 59479 75677 75677 1 DKKPALGNHHDPAVPR Unmodified 1750.9227 0.92269974 3466 Q7Z5R6 APBB1IP Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein yes yes 0 0 2 1 1 10.323 10.323 4 0.0015112 2705 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.975 46.187 26289000 0 0 11350000 0 0 0 0 0 0 0 14939000 0 0 6645 3466 6227 59480;59481 75678;75679 75679 1 DKLCGPYEK Unmodified 1108.5223 0.52229515 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 1 1 1 1 18.91 18.91 2 0.0010857 11711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.14 101.12 412710000 68625000 121270000 0 75126000 0 0 0 98236000 0 49450000 0 0 0 6646 180;3738 6228 59482;59483;59484;59485;59486 75680;75681;75682;75683;75684 75683 5 DKLDQVSSEIK Unmodified 1260.6561 0.65614609 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 1 1 1 1 41.611 41.611 2 0.017433 38375 QUIQUE_C1576_190116_001 76.927 53.574 154210000 0 48915000 0 43075000 0 0 62224000 0 0 0 0 0 0 6647 3252 6229 59487;59488;59489 75685;75686;75687 75687 3 DKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCR Unmodified 3318.5901 0.59006372 4605 Q9Y4E8;H0YI26 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 1 1 169.03 169.03 3 4.1258E-08 173279 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.282 48.766 25358000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25358000 6648 4605 6230 59490 75688 75688 1 DKLDTVVEFPIR Unmodified 1430.7769 0.77692993 2965 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A0A087WTS0;P18283;H0YJK8 GPX2 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 137.05 137.05 3 0.0040932 139897 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.045 39.996 87156000 23037000 0 0 0 0 0 0 22593000 0 0 0 0 41526000 6654 30 6236 59525;59526;59527 75732;75733;75734 75733 2 DKLTELQLR Unmodified 1114.6346 0.63462279 3475 Q7Z7H5 TMED4 Transmembrane emp24 domain-containing protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.125 50.125 2;3 0.004475 48249 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.647 6.9681 111300000 0 0 24691000 0 16032000 0 0 40255000 18895000 0 0 0 11430000 6655 3475 6237 59528;59529;59530;59531;59532;59533 75735;75736;75737;75738;75739;75740 75738 6 DKLVGAIVYYDGQHNDAR Unmodified 2032.9967 0.99665254 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 67.767 67.767 3 0.0062033 67830 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.726 37.562 344090000 0 0 0 0 0 0 0 0 120150000 0 0 105490000 118460000 6656 2463 6238 59534;59535;59536 75741;75742;75743 75741 3 DKMMNGGHYTYSENR Oxidation (M) 1817.7461 0.74611686 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 16.681 16.681 3 4.3992E-05 8997 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.38 88.075 149000000 0 0 0 0 0 0 0 28052000 35770000 0 42347000 0 42832000 6657 3956 6239 59537;59538;59539;59540 75744;75745;75746;75747 75745 2789;2790 4 DKMMNGGHYTYSENR 2 Oxidation (M) 1833.741 0.74103148 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 1 1 1 1 2 11.406 11.406 3;4 6.2068E-06 3769 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.582 94.548 124550000 0 0 0 0 0 0 0 14523000 41092000 0 0 17420000 51512000 6658 3956 6239 59541;59542;59543;59544;59545 75748;75749;75750;75751;75752 75749 2789;2790 1 DKMMNGGHYTYSENRVEK 2 Oxidation (M) 2189.947 0.94700151 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 2 1 1 2 1 3 13.31 13.31 3;4;5 4.0483E-17 5863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.26 127.44 698620000 0 0 0 0 0 0 0 57441000 82457000 0 275880000 32215000 250630000 6659 3956 6240 59546;59547;59548;59549;59550;59551;59552;59553 75753;75754;75755;75756;75757;75758;75759;75760;75761;75762 75753 2789;2790 10 DKMMNGGHYTYSENRVEK Oxidation (M) 2173.9521 0.95208689 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 2 2 2 1 17.669 17.669 3;4 1.244E-05 10499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.165 89.877 254140000 0 0 0 0 0 0 0 162650000 49836000 0 0 41648000 0 6660 3956 6240 59554;59555;59556;59557;59558 75763;75764;75765;75766;75767 75763 2789;2790 4 DKMMNGGHYTYSENRVEK Unmodified 2157.9572 0.95717227 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 2 1 22.472 22.472 4 0.00018879 16035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.512 49.982 51708000 0 0 0 0 0 0 0 51708000 0 0 0 0 0 6661 3956 6240 59559 75768 75768 1 DKNEQAFEEVFQNANFR Unmodified 2084.9552 0.95518166 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 120.02 120.02 2;3 2.6077E-67 124253 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yes no 0 0 1 1 1 125.45 125.45 3 0.01599 130017 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.53 31.742 51754000 0 0 0 0 0 0 0 0 51754000 0 0 0 0 6672 4175 6251 59686;59687 75927;75928 75928 2 DKPVCVNTYGSYR Unmodified 1557.7246 0.72457678 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 1 1 1 37.795 37.795 2 0.021442 33520 QUIQUE_C1277_190116_001 82.171 54.842 48020000 0 25981000 0 0 0 0 22039000 0 0 0 0 0 0 6673 218 6252 59688;59689 75929;75930 75929 2 DKPVTVVQSIGTEVIGTLRPDYR Unmodified 2542.3755 0.37550156 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.93 134.93 3;4 1.832E-50 137957 QUIQUE_C1563_190116_001 151.82 144.94 20029000000 1145600000 1155800000 1575200000 1025400000 1345100000 1414300000 1610600000 1490100000 2638700000 1350700000 1915000000 1366300000 1996200000 6674 3093 6253 59690;59691;59692;59693;59694;59695;59696;59697;59698;59699;59700;59701;59702;59703;59704;59705;59706;59707;59708;59709;59710;59711;59712;59713;59714;59715 75931;75932;75933;75934;75935;75936;75937;75938;75939;75940;75941;75942;75943;75944;75945;75946;75947;75948;75949;75950;75951;75952;75953;75954;75955;75956;75957;75958;75959;75960;75961;75962;75963;75964;75965;75966;75967;75968;75969;75970;75971;75972;75973;75974 75951 43 DKPVYYALEGSVAIAGAVIR Unmodified 2091.1364 0.13644049 2348 P32189;Q14409 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 1 1 145.23 145.23 3 0.022105 150470 QUIQUE_C1218_190116_001 43.12 36.346 21864000 21864000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6675 2348 6254 59716 75975 75975 0 DKPYPDCPFLLLDVR Unmodified 1846.9288 0.9287559 4079 Q9BYV8;C9J9X8;C9JCX6;C9JXA0 CEP41 Centrosomal protein of 41 kDa yes no 0 0 1 1 134.29 134.29 3 0.046341 137247 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.892 36.299 12376000 0 0 0 0 0 0 0 12376000 0 0 0 0 0 6676 4079 6255 59717 75976 75976 0 DKQELEDFIK Unmodified 1263.6347 0.63468237 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 83.414 83.414 3 0.05166 87099 QUIQUE_C1368_190116_001 35.541 7.6275 283060000 0 0 124690000 0 0 0 0 0 0 0 158380000 0 0 6677 3125 6256 59718;59719 75977;75978 75977 2 DKQQQQLLNLR Unmodified 1382.763 0.7630112 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2;A0A1B0GW62;A0A0D9SGI7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 1 1 1 1 46.291 46.291 2 0.0054911 42686 QUIQUE_C1403_190116_001 104.2 50.515 44894000 0 0 0 21397000 0 0 0 23497000 0 0 0 0 0 6678 4250 6257 59720;59721;59722 75979;75980;75981 75979 3 DKQWLEHVQQEDEHQRPR Unmodified 2357.1261 0.12610359 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 2 1 1 1 29.765 29.765 4;5 8.7806E-11 24087 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.094 86.615 164800000 0 0 0 0 0 0 0 39202000 0 0 55336000 0 70257000 + 6679 3161 6258 59723;59724;59725 75982;75983;75984 75983 3 DKRPEGYNLK Unmodified 1218.6357 0.63568542 2781;2839;4568 P63151;Q9Y2T4;Q00005 PPP2R2A;PPP2R2C;PPP2R2B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform no no 0 0 2 1 13.413 13.413 3 0.00092239 5410 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.94 81.52 64611000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64611000 0 0 0 6680 2781;4568;2839 6259 59726 75985;75986 75985 2 DKSDSDTEGLLFSR Unmodified 1568.7318 0.73183023 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.76 71.76 2 2.4461E-11 71956 QUIQUE_C1277_190116_001 160.48 145.21 783670000 57242000 88342000 90060000 75647000 75715000 71511000 102450000 0 94245000 16773000 0 0 111680000 6681 4172;346 6260 59727;59728;59729;59730;59731;59732;59733;59734;59735;59736 75987;75988;75989;75990;75991;75992;75993;75994;75995;75996 75988 9 DKSFLAMVVDIVQELK Unmodified 1833.991 0.9910218 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 175.21 175.21 2;3 2.2743E-19 182112 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.31 101.07 3427700000 8235800 47916000 0 0 33672000 45543000 0 155440000 475330000 0 488120000 1946000000 227480000 6682 1423 6261 59737;59738;59739;59740;59741;59742;59743;59744;59745;59746;59747 75997;75998;75999;76000;76001;76002;76003;76004;76005;76006;76007 76004 11 DKSFLAMVVDIVQELK Oxidation (M) 1849.9859 0.98593643 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 169.95 169.95 3 4.5276E-05 173363 QUIQUE_C1277_190116_001 97.291 86.824 1494200000 0 69486000 0 0 296620000 0 197280000 203440000 0 11600000 328430000 387340000 0 6683 1423 6261 59748;59749;59750;59751;59752;59753;59754;59755;59756;59757 76008;76009;76010;76011;76012;76013;76014;76015;76016;76017;76018 76008 794 11 DKSPNIQFEAFHVFK Unmodified 1805.9101 0.91006937 4199 Q9H9S4;Q5TAW7;B7ZBJ4 CAB39L Calcium-binding protein 39-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.098 95.098 3;4 6.7058E-07 97627 QUIQUE_C1368_190116_001 90.725 79.871 386780000 33880000 51179000 71606000 0 41430000 0 64401000 18714000 0 0 46964000 58606000 0 6684 4199 6262 59758;59759;59760;59761;59762;59763;59764;59765 76019;76020;76021;76022;76023;76024;76025;76026 76021 8 DKTEFSIIHYAGK Unmodified 1507.7671 0.76709352 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 58.706 58.706 3 0.0074016 57484 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.132 29.699 39127000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39127000 0 6685 2385 6263 59766 76027 76027 1 DKTEKPDTVQLLTVK Unmodified 1713.9513 0.95126548 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 1 47.976 47.976 2;3 0.014419 46060 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.574 64.656 150500000 0 0 0 0 0 0 0 128320000 0 0 0 0 22180000 6686 2880 6264 59767;59768 76028;76029 76028 1 DKTLEHKEVVEPK Unmodified 1550.8304 0.83042206 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 11.197 11.197 4 0.0030208 3642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.651 63.593 16648000 0 0 0 0 0 0 0 16648000 0 0 0 0 0 6687 921 6265 59769 76030 76030 0 DKTSPFELYQFFVR Unmodified 1775.8883 0.88827129 4573 Q9Y2Z4;H0YHS6 YARS2 Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 149.66 149.66 2;3 7.0174E-05 154515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.228 81.327 164050000 11647000 0 14490000 9158400 13579000 11902000 14962000 21048000 18981000 0 26412000 21867000 0 6688 4573 6266 59770;59771;59772;59773;59774;59775;59776;59777;59778;59779;59780 76031;76032;76033;76034;76035;76036;76037;76038;76039;76040;76041;76042 76039 8 DKTVVLGDLLIDDKDTVR Unmodified 2014.0946 0.094635252 3673 Q8TCD5;J3KRC4;J3KSY6 NT5C 5'(3')-deoxyribonucleotidase, cytosolic type yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 98.413 98.413 3;4 2.3986E-17 102642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.3 118.21 639490000 30035000 44452000 57765000 35808000 0 0 0 0 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76086;76087;76088;76089;76090;76091;76092;76093;76094;76095;76096;76097;76098;76099;76100;76101;76102;76103;76104;76105;76106;76107;76108;76109;76110;76111;76112;76113;76114;76115;76116;76117 76090 29 DKYENEDLIK Unmodified 1265.6139 0.61394692 3510 Q86WR0;Q0VGD4;G3V121;B7Z2L8 CCDC25 Coiled-coil domain-containing protein 25 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.395 35.395 2 0.0091822 31021 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.055 69.656 232080000 29547000 29864000 27078000 40551000 0 0 0 31687000 34195000 0 0 0 39156000 6697 3510 6275 59840;59841;59842;59843;59844;59845;59846 76118;76119;76120;76121;76122;76123;76124 76123 7 DKYEPAAVSEQGDKK Unmodified 1663.8053 0.80532952 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 16.348 16.348 2;3 3.2209E-08 8614 QUIQUE_C1438_190116_001 125.67 99.941 508840000 0 0 0 24445000 129510000 0 140360000 0 9963300 0 186930000 0 17635000 6698 1872 6276 59847;59848;59849;59850;59851;59852 76125;76126;76127;76128;76129;76130 76126 6 DKYPNLQVIGGNVVTAAQAK Unmodified 2085.1219 0.12185306 2040 P12268;H0Y4R1 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 100.65 100.65 2;3 0.00010169 104684 QUIQUE_C1218_190116_001 70.121 62.105 272280000 62211000 52938000 54426000 43728000 0 0 0 58975000 0 0 0 0 0 6699 2040 6277 59853;59854;59855;59856;59857;59858 76131;76132;76133;76134;76135;76136 76131 5 DKYVAEFLEWAK Unmodified 1497.7504 0.75038083 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 1 1 1 130.12 130.12 3 0.0068562 134734 QUIQUE_C1368_190116_001 58.098 48.047 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6700 4631 6278 59859;59860 76137;76138 76138 2 DKYVAEFLEWAKPFTQLVK Unmodified 2311.2253 0.22525549 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 2 1 162.68 162.68 3 0.049174 167019 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.138 37.24 101490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101490000 0 6701 4631 6279 59861 76139 76139 1 DLAADPLNRR Unmodified 1139.6047 0.60471964 4310 Q9NVT9;E5RJ86;E9PR92;E5RHK3 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 38.616 38.616 3 0.047026 35093 QUIQUE_DMIX3_190116_001 27.481 1.4385 54267000 0 0 0 0 0 0 0 0 10561000 0 43706000 0 0 6702 4310 6280 59862;59863 76140;76141 76140 2 DLAAFDK Unmodified 778.38612 0.38611924 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 47.903 47.903 2 0.060724 44859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.176 16.493 73217000 0 0 0 0 0 0 0 73217000 0 0 0 0 0 6703 1977 6281 59864 76142 76142 1 DLAALEDK Unmodified 873.44436 0.4443624 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 48.69 48.69 1;2 0.011168 46880 QUIQUE_C1218_190116_001 90.308 48.08 5691300000 826830000 1311500000 326360000 1144500000 0 1008300000 267470000 185750000 138610000 481930000 0 0 0 6704 267;275;3025 6282 59865;59866;59867;59868;59869;59870;59871;59872;59873;59874;59875;59876;59877 76143;76144;76145;76146;76147;76148;76149;76150;76151;76152;76153;76154;76155;76156;76157;76158 76143 10 DLAALEDKVK Unmodified 1100.6077 0.60773933 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 59.961 59.961 2;3 0.008794 59018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.314 21.439 1979600000 0 27018000 0 16169000 41769000 0 0 134370000 144580000 0 1615700000 0 0 6705 267;275;3025 6283 59878;59879;59880;59881;59882;59883;59884 76159;76160;76161;76162;76163;76164;76165 76162 7 DLAALGDK Unmodified 801.42323 0.42323303 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 39.045 39.045 1;2 0.017005 35487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.241 10.945 3990600000 0 0 0 345990000 795130000 694780000 0 264120000 492980000 0 708130000 0 689450000 6706 267;275;3025 6284 59885;59886;59887;59888;59889;59890;59891 76166;76167;76168;76169;76170;76171;76172;76173 76170 7 DLAALGDKVNSLGETAER Unmodified 1857.9432 0.94321999 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 92.885 92.885 2;3 2.1357E-38 94260 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.26 126.98 6538100000 0 0 101280000 0 245770000 0 0 1378400000 819720000 0 1420700000 1158700000 1413500000 6707 267;275;3025 6285 59892;59893;59894;59895;59896;59897;59898;59899;59900;59901;59902 76174;76175;76176;76177;76178;76179;76180;76181;76182;76183;76184;76185;76186;76187;76188;76189;76190;76191 76176 17 DLADELALVDVIEDK Unmodified 1656.8458 0.84579735 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8;F5GZQ4 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 3 4 3 3 2 2 4 3 3 3 5 3 3 167.98 167.98 2;3 1.2269E-35 170384 QUIQUE_C1368_190116_001 191.26 166.4 28722000000 2946400000 3251400000 4412100000 2689900000 2278200000 2217100000 2150600000 955650000 1043600000 1261800000 2073900000 1782400000 1659300000 6708 1775 6286 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59944;59945;59946;59947;59948;59949;59950;59951;59952;59953;59954;59955;59956;59957;59958;59959 76244;76245;76246;76247;76248;76249;76250;76251;76252;76253;76254;76255;76256;76257;76258;76259 76259 14 DLADIAAFFR Unmodified 1137.5819 0.58185893 1674 O75962 TRIO Triple functional domain protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.76 161.76 2 0.000957 167033 QUIQUE_C1368_190116_001 103.56 69.767 102960000 0 15448000 11884000 13844000 0 0 0 10564000 12217000 3741700 18748000 16513000 0 6710 1674 6288 59960;59961;59962;59963;59964;59965;59966;59967;59968;59969;59970;59971;59972 76260;76261;76262;76263;76264;76265;76266;76267;76268;76269;76270;76271;76272 76263 11 DLADLAAYTALK Unmodified 1263.6711 0.67106787 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.31 131.31 2 0.0032982 135706 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.958 65.629 407190000 42041000 48028000 37778000 0 40714000 33734000 0 0 57965000 30120000 81714000 35098000 0 6711 1492 6289 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DLAGIIAIQR Unmodified 1068.6291 0.62914348 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.76 105.76 2 0.00037936 110413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.27 80.913 235090000 26160000 28007000 15334000 12843000 18798000 12953000 15119000 14502000 16026000 7529000 34397000 17919000 15502000 6722 2021 6300 60050;60051;60052;60053;60054;60055;60056;60057;60058;60059;60060;60061;60062 76368;76369;76370;76371;76372;76373;76374;76375;76376;76377;76378;76379;76380;76381;76382 76380 15 DLAGSIIGK Unmodified 872.49673 0.49673232 2735 P61978;S4R359 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.89 71.89 1;2 0.0002938 72846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.88 71.329 10685000000 975280000 954070000 893530000 927280000 881900000 756190000 742840000 673150000 819790000 356850000 986790000 781930000 934930000 6723 2735 6301 60063;60064;60065;60066;60067;60068;60069;60070;60071;60072;60073;60074;60075;60076;60077;60078;60079;60080;60081;60082;60083;60084;60085;60086;60087;60088 76383;76384;76385;76386;76387;76388;76389;76390;76391;76392;76393;76394;76395;76396;76397;76398;76399;76400;76401;76402;76403;76404;76405;76406;76407;76408;76409;76410 76406 15 DLAHQFTQVQR Unmodified 1341.6789 0.67894722 2283 P28907;H0Y950 CD38 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 1 56.917 56.917 2;3 0.00013412 54845 QUIQUE_C1368_190116_001 102.4 79.024 485510000 83412000 61060000 98168000 0 0 78586000 63642000 14912000 47784000 37948000 0 0 0 6724 2283 6302 60089;60090;60091;60092;60093;60094;60095;60096;60097;60098;60099;60100 76411;76412;76413;76414;76415;76416;76417;76418;76419;76420;76421;76422;76423;76424;76425 76415 11 DLAILQCHGELDPMVPVR Unmodified 2062.034 0.033966025 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPQ1 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 123.75 123.75 3 0.00049355 126409 QUIQUE_C1563_190116_001 61.821 53.22 421840000 78252000 76892000 0 0 45280000 40756000 0 31095000 0 0 60556000 0 89008000 6725 1726 6303 60101;60102;60103;60104;60105;60106;60107;60108 76426;76427;76428;76429;76430;76431;76432;76433 76429 3 DLAILQCHGELDPMVPVR Oxidation (M) 2078.0289 0.028880648 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPQ1 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 1 0 1 110.09 110.09 3 0.00029546 113137 QUIQUE_C1403_190116_001 64.52 54.94 28811000 0 0 0 28811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6726 1726 6303 60109 76434;76435 76434 941 2 DLALAIR Unmodified 770.46504 0.46503826 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.186 69.186 2 0.019712 69115 QUIQUE_C1277_190116_001 110.54 0 1488400000 125430000 156250000 0 105700000 0 119750000 134150000 0 169960000 157550000 212720000 137900000 168960000 6727 2421 6304 60110;60111;60112;60113;60114;60115;60116;60117;60118;60119 76436;76437;76438;76439;76440;76441;76442;76443;76444;76445;76446;76447;76448;76449;76450;76451 76438 16 DLALGLVPGDR Unmodified 1124.619 0.61897272 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 104.31 104.31 2 0.0045129 101305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.749 34.466 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6728 271 6305 60120;60121;60122 76452;76453;76454 76454 3 DLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVER Unmodified 3251.5075 0.5074563 3521 Q86Y82 STX12 Syntaxin-12 yes yes 0 0 0 1 1 162.62 162.62 4 7.3437E-13 167112 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.951 61.985 55970000 0 0 0 0 0 0 14515000 0 41455000 0 0 0 0 6729 3521 6306 60123;60124 76455;76456 76456 2 DLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVER Oxidation (M) 3267.5024 0.50237092 3521 Q86Y82 STX12 Syntaxin-12 yes yes 0 1 0 1 162.33 162.33 4 1.1648E-15 167170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.63 72.418 35649000 0 0 0 0 0 0 0 0 35649000 0 0 0 0 6730 3521 6306 60125 76457 76457 2681 1 DLAMVASDMMVLLK Unmodified 1535.7761 0.77614335 4211 Q9HB40;I3L4Z3 SCPEP1 Retinoid-inducible serine carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 170.7 170.7 2 0.003589 173498 QUIQUE_C1403_190116_001 85.813 29.18 34912000 0 0 0 17355000 0 0 0 0 17556000 0 0 0 0 6731 4211 6307 60126;60127 76458;76459 76458 1 DLANDIMTLMSHTKPYIR Unmodified 2118.0602 0.060180776 1437 O14617;A0A2R8Y4J3 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 151.55 151.55 4 5.7596E-05 158788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.479 78.166 103280000 0 0 0 0 0 0 0 0 16454000 0 50609000 36222000 0 6732 1437 6308 60128;60129;60130 76460;76461;76462;76463 76461 3 DLAPIGIR Unmodified 853.50215 0.50215205 3969 Q99714 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.64 68.64 2 0.0076993 68632 QUIQUE_C1368_190116_001 97.071 21.802 3671600000 307760000 296740000 312340000 244630000 247920000 276220000 284610000 262090000 278210000 102630000 373050000 323300000 362100000 6733 3969 6309 60131;60132;60133;60134;60135;60136;60137;60138;60139;60140;60141;60142;60143 76464;76465;76466;76467;76468;76469;76470;76471;76472;76473;76474;76475;76476;76477;76478;76479 76466 16 DLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHR Unmodified 3165.4639 0.46393523 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 97.403 97.403 4 0.00011153 99875 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.743 37.078 401200000 0 0 0 0 0 71235000 0 42324000 127690000 95270000 0 0 64672000 6734 2233 6310 60144;60145;60146;60147;60148;60149 76480;76481;76482;76483;76484;76485;76486;76487;76488 76484 9 DLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFK Unmodified 2454.1849 0.1849236 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 109.46 109.46 2;3 1.268E-08 114447 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.05 115.64 1473300000 93663000 107960000 151990000 122850000 104620000 116610000 144520000 0 249100000 0 0 147160000 234870000 6735 57 6311 60150;60151;60152;60153;60154;60155;60156;60157;60158;60159;60160;60161 76489;76490;76491;76492;76493;76494;76495;76496;76497;76498;76499;76500;76501 76498 13 DLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFK Oxidation (M) 2470.1798 0.17983822 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 93.265 93.265 3 1.7958E-08 96275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.949 69.821 330680000 0 0 43735000 0 0 0 0 0 130280000 44582000 56985000 0 55096000 6736 57 6311 60162;60163;60164;60165;60166;60167 76502;76503;76504;76505;76506;76507 76504 46 6 DLAQLAEQSSTAAELAHILQEPHFQSLLETHDSVASK Unmodified 4013.9971 0.99705306 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;E5RI47;A0A087WVY2;E5RK50;E5RJK0;E5RK44;E5RI32;E5RIU3 MPP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 154.59 154.59 4;5 3.048E-70 157477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.45 121.13 2866100000 0 184650000 0 89844000 50390000 0 129960000 1005500000 473500000 0 461050000 346980000 124200000 6737 159 6312 60168;60169;60170;60171;60172;60173;60174;60175;60176;60177;60178;60179 76508;76509;76510;76511;76512;76513;76514;76515;76516;76517;76518;76519 76513 8 DLAQYDAAHHEEFKR Unmodified 1828.8493 0.84926002 2877 Q02818;C9JKZ2;H7BZI1 NUCB1 Nucleobindin-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 31.123 31.123 3;4 0.0004418 25906 QUIQUE_C1277_190116_001 68.257 56.341 611390000 93192000 114490000 89072000 32769000 98359000 29806000 82570000 0 0 17289000 53839000 0 0 6738 2877 6313 60180;60181;60182;60183;60184;60185;60186;60187;60188;60189;60190;60191;60192;60193 76520;76521;76522;76523;76524;76525;76526;76527;76528;76529;76530;76531;76532;76533;76534 76523 15 DLARPGEITQSQAFDFEFTHVEKPYESYTGQNVK Unmodified 3930.8701 0.87006163 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 2 1 1 2 1 116.21 116.21 4;5 1.237E-29 120346 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.485 82.01 369280000 0 0 0 0 0 0 0 50553000 62298000 0 188330000 68100000 0 6739 3234 6314 60194;60195;60196;60197;60198 76535;76536;76537;76538;76539 76536 4 DLASGAVPTNLKPSK Unmodified 1496.8199 0.81985737 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 3 1 2 1 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S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 2 2 1 1 1 43.894 43.894 3 0.0018909 41434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.05 59.161 187010000 0 0 0 0 0 0 0 71685000 0 0 0 65060000 50265000 6777 2329 6351 60501;60502;60503;60504;60505 76933;76934;76935;76936;76937 76933 5 DLDLVQTWNLEK Unmodified 1472.7511 0.75110911 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 133.08 133.08 2 0.027675 139895 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.194 36.603 34258000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34258000 0 0 6778 1187 6352 60506 76938 76938 1 DLDPEVFQR Unmodified 1117.5404 0.54038805 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0;X6RE05 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 80.649 80.649 2 0.064833 83271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.245 33.508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6779 3312 6353 60507 76939 76939 1 DLDQASLAAVSQQLAPR Unmodified 1781.9272 0.92717599 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 127.46 127.46 2;3 3.0832E-44 132471 QUIQUE_C1368_190116_001 169.62 146.01 1203200000 121990000 77445000 105790000 97225000 90064000 73033000 70157000 118840000 112820000 47537000 107730000 75749000 104810000 6780 4600 6354 60508;60509;60510;60511;60512;60513;60514;60515;60516;60517;60518;60519;60520;60521;60522;60523;60524;60525 76940;76941;76942;76943;76944;76945;76946;76947;76948;76949;76950;76951;76952;76953;76954;76955;76956;76957;76958;76959 76945 18 DLDSGHVVCKAAR Unmodified 1426.6987 0.69869638 4692 yes no 0 0 1 1 42.917 42.917 3 0.058369 39973 QUIQUE_C1576_190116_001 28.806 4.9549 307940000 0 0 0 0 0 0 307940000 0 0 0 0 0 0 + 6781 4692 6355 60526 76960 76960 1 DLDSQTMMVLVNYIFFK 2 Oxidation (M) 2095.0006 0.0006002115 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 2 0 1 2 1 1 1 168.59 168.59 2;3 2.1949E-22 173570 QUIQUE_C1368_190116_001 143.79 118.94 117800000 0 21885000 42062000 0 20863000 0 28714000 0 0 4273700 0 0 0 6782 1800 6356 60527;60528;60529;60530;60531;60532 76961;76962;76963;76964;76965;76966;76967 76963 1023;1024 7 DLDSQTMMVLVNYIFFK Oxidation (M) 2079.0057 0.0056855894 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 1 0 1 1 1 1 176.93 176.93 2 8.3262E-07 183686 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.06 94.787 98458000 0 7480900 9223700 0 0 0 0 0 0 0 68471000 0 13282000 6783 1800 6356 60533;60534;60535;60536 76968;76969;76970;76971;76972;76973 76971 1023;1024 6 DLDSQTMMVLVNYIFFK Unmodified 2063.0108 0.010770967 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 2 1 179.83 179.83 2;3 1.186E-17 186444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 172.92 151.29 87605000 0 0 0 0 0 0 0 8367900 0 0 70250000 8987500 0 6784 1800 6356 60537;60538;60539;60540 76974;76975;76976;76977;76978;76979 76976 6 DLDTGEEVTR Unmodified 1133.52 0.52004654 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.553 35.553 2 0.0077984 30625 QUIQUE_C1368_190116_001 72.643 34.557 490750000 49581000 53618000 63635000 49871000 53130000 67327000 71098000 0 37704000 0 0 44789000 0 6785 3049 6357 60541;60542;60543;60544;60545;60546;60547;60548;60549 76980;76981;76982;76983;76984;76985;76986;76987;76988 76982 7 DLDVAILVGSMPR Oxidation (M) 1400.7334 0.73335055 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 1 122.96 122.96 2;3 0.00032119 127187 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.13 94.899 3912000000 296870000 488300000 0 187510000 311310000 318850000 268740000 321220000 390940000 218770000 324700000 394060000 390760000 6786 720;2430;740 6358 60550;60551;60552;60553;60554;60555;60556;60557;60558;60559;60560;60561;60562;60563;60564;60565;60566;60567;60568;60569 76989;76990;76991;76992;76993;76994;76995;76996;76997;76998;76999;77000;77001;77002;77003;77004;77005;77006;77007;77008;77009;77010;77011;77012;77013;77014;77015;77016;77017;77018;77019;77020;77021;77022;77023;77024;77025;77026 77023 432 38 DLDVAILVGSMPR Unmodified 1384.7384 0.73843593 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 3 2 147.16 147.16 2;3 3.4898E-17 152783 QUIQUE_C1218_190116_001 162.38 133.42 8058000000 883050000 684890000 614170000 391420000 643140000 526160000 554890000 421870000 722390000 132010000 1039400000 918850000 525810000 6787 720;2430;740 6358 60570;60571;60572;60573;60574;60575;60576;60577;60578;60579;60580;60581;60582;60583;60584;60585;60586;60587;60588;60589;60590;60591;60592;60593;60594;60595;60596;60597;60598;60599 77027;77028;77029;77030;77031;77032;77033;77034;77035;77036;77037;77038;77039;77040;77041;77042;77043;77044;77045;77046;77047;77048;77049;77050;77051;77052;77053;77054;77055;77056;77057;77058;77059;77060;77061;77062;77063;77064;77065;77066;77067;77068;77069;77070;77071 77029 43 DLDVITIPSK Unmodified 1099.6125 0.61249036 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 93.822 93.822 2 0.006758 96494 QUIQUE_C1368_190116_001 74.165 48.226 458190000 70312000 0 81848000 0 49891000 0 85207000 0 0 0 56478000 48242000 66212000 6788 1377 6359 60600;60601;60602;60603;60604;60605;60606;60607 77072;77073;77074;77075;77076;77077;77078;77079;77080 77074 9 DLDVITIPSKDVVMVHEPK Unmodified 2134.1344 0.13439158 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 1 1 1 1 100.75 100.75 3 0.00046494 103759 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.83 58.228 130840000 0 0 0 0 0 0 0 52735000 35453000 0 42651000 0 0 6789 1377 6360 60608;60609;60610 77081;77082;77083 77082 3 DLDVVVVSVAGAFR Unmodified 1445.7878 0.78782897 3355 Q6DD88;F5H6I7;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 155.03 155.03 2 0.016708 150134 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.404 43.789 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6790 3355 6361 60611 77084 77084 1 DLDYYGTLLK Unmodified 1199.6074 0.60740498 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 114.53 114.53 2 0.019683 117792 QUIQUE_C1403_190116_001 60.019 39.394 403640000 0 220570000 0 183070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6791 2938 6362 60612;60613 77085;77086;77087 77086 3 DLDYYGTLLKK Unmodified 1327.7024 0.702368 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 87.245 87.245 3 0.028443 88876 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.18 25.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6792 2938 6363 60614 77088 77088 1 DLEAAGAER Unmodified 930.44067 0.44067401 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 21.868 21.868 2 0.025868 14906 QUIQUE_C1218_190116_001 58.981 20.189 52284000 52284000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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77090;77091;77092;77093;77094;77095;77096;77097;77098;77099;77100;77101;77102;77103;77104;77105;77106;77107;77108;77109;77110;77111;77112;77113;77114;77115;77116;77117;77118;77119;77120;77121;77122;77123;77124;77125;77126;77127;77128;77129;77130;77131;77132;77133;77134;77135;77136;77137;77138;77139;77140;77141;77142;77143;77144;77145;77146;77147;77148;77149;77150;77151;77152;77153;77154;77155;77156;77157;77158;77159;77160;77161;77162;77163 77139 73 DLEAEHVEVEDTTLNR Unmodified 1868.8752 0.8752 4157 Q9H3K6;A0A087WZT3;H3BV85;H3BTW0;A0A0B4J295;H3BVE0 BOLA2;BOLA2B BolA-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 70.91 70.91 2;3 1.1836E-05 71077 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.508 68.08 472080000 0 54383000 0 0 65390000 39801000 52298000 0 83546000 0 97993000 78674000 0 6795 4157 6366 60653;60654;60655;60656;60657;60658;60659;60660 77164;77165;77166;77167;77168;77169;77170;77171 77171 4 DLEAHIDSANK Unmodified 1211.5782 0.57823012 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.915 26.915 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77183;77184;77185;77186;77187;77188;77189;77190;77191;77192;77193;77194;77195;77196;77197 77185 14 DLEALMFDR Unmodified 1108.5223 0.52229515 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 131.13 131.13 2 2.2774E-06 127729 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.63 82.363 4862900000 309210000 335810000 443160000 465270000 228020000 438250000 345770000 361970000 393590000 178990000 417100000 399010000 546710000 6799 2400 6370 60686;60687;60688;60689;60690;60691;60692;60693;60694;60695;60696;60697;60698;60699 77198;77199;77200;77201;77202;77203;77204;77205;77206;77207;77208;77209;77210;77211;77212;77213;77214;77215;77216;77217;77218;77219;77220;77221;77222;77223;77224 77218 27 DLEALMFDR Oxidation (M) 1124.5172 0.51720977 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.886 95.886 2 0.010894 97120 QUIQUE_C1563_190116_001 76.679 50.785 304380000 0 33352000 38198000 31195000 0 42131000 0 0 41151000 0 35517000 30466000 52368000 6800 2400 6370 60700;60701;60702;60703;60704;60705;60706;60707 77225;77226;77227;77228;77229;77230;77231;77232 77228 1804 8 DLEALVTDK Unmodified 1002.5233 0.523341 3115 Q15124 PGM5 Phosphoglucomutase-like protein 5 yes yes 0 0 0 1 85.216 85.216 2 0.03976 87456 QUIQUE_C1576_190116_001 68.016 20.273 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6801 3115 6371 60708 77233 77233 1 DLEAPEVQESYR Unmodified 1434.6627 0.66268803 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 69.558 69.558 2 0.00054247 68799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.096 55.904 25092000 0 0 0 0 0 0 0 25092000 0 0 0 0 0 6802 7 6372 60709;60710 77234;77235 77235 2 DLEAQIEAANK Unmodified 1200.5986 0.59863121 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 74.965 74.965 2 0.0013802 70957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.716 11.447 33938000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33938000 0 0 0 6803 2379 6373 60711;60712 77236;77237;77238 77237 3 DLEASIAR Unmodified 873.4556 0.45559579 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 1 45.869 45.869 2 0.046189 42674 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.77 45.31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6804 3053 6374 60713;60714;60715 77239;77240;77241 77240 3 DLECVTNLQEVAR Unmodified 1545.7457 0.74570615 4748 X6R5C5;X6R8A1;P10619;Q5JZH0 CTSA Carboxypeptidase;Lysosomal protective protein;Lysosomal protective protein 32 kDa chain;Lysosomal protective protein 20 kDa chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.792 94.792 2 3.1358E-06 96888 QUIQUE_C1403_190116_001 128.01 93.483 224070000 0 48261000 46408000 50445000 0 0 0 0 0 26988000 0 51966000 0 6805 4748 6375 60716;60717;60718;60719;60720 77242;77243;77244;77245;77246 77244 5 DLEDIVGGGEYKPDK Unmodified 1633.7835 0.78353145 313 A0A0U1RQT8;Q8TCZ2;H0Y4H3 CD99L2 CD99 antigen-like protein 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 84.781 84.781 2;3 1.767E-35 87168 QUIQUE_C1218_190116_001 176.51 146.76 468940000 209740000 81516000 0 82492000 0 72092000 0 0 0 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493 A0A3B3ISS9;P01241;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2 GH1;CSH1;CSH2 Somatotropin;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 137.13 137.13 2;3 1.4786E-37 142017 QUIQUE_C1218_190116_001 192.26 155.57 2841300000 2594600000 0 0 118210000 18603000 0 109960000 0 0 0 0 0 0 6819 493 6388 60812;60813;60814;60815;60816 77349;77350;77351;77352;77353;77354 77349 6 DLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEK Unmodified 2829.359 0.35898438 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 175.7 175.7 3 5.8249E-54 180043 QUIQUE_C1368_190116_001 145.61 138.65 756730000 11417000 29546000 146840000 16019000 49826000 16312000 0 16240000 72213000 0 272240000 83186000 42889000 6820 3779 6389 60817;60818;60819;60820;60821;60822;60823;60824;60825;60826;60827 77355;77356;77357;77358;77359;77360;77361;77362;77363;77364;77365;77366;77367;77368;77369 77357 15 DLEEILYTLGLHLSR Unmodified 1770.9516 0.95159983 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;H0YFJ7 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 169.53 169.53 2;3 3.3952E-06 175572 QUIQUE_C1438_190116_001 100.45 74.736 125290000 17724000 17576000 0 11119000 46196000 0 18895000 0 13781000 0 0 0 0 6821 3545 6390 60828;60829;60830;60831;60832;60833;60834;60835;60836 77370;77371;77372;77373;77374;77375;77376;77377;77378 77375 9 DLEEKLETLR Unmodified 1244.6612 0.66123147 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 78.956 78.956 2;3 0.0002526 79907 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.943 66.419 635580000 0 0 0 0 27469000 0 18278000 180630000 170380000 0 109750000 37517000 91558000 6822 890;3052 6391 60837;60838;60839;60840;60841;60842;60843;60844;60845;60846 77379;77380;77381;77382;77383;77384;77385;77386;77387;77388;77389 77381 10 DLEELEVILRD Unmodified 1342.698 0.6980109 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 151.16 151.16 2 0.0010642 156142 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.89 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77405;77406;77407;77408;77409;77410;77411;77412;77413;77414;77415;77416;77417;77418;77419;77420 77405 16 DLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQR Unmodified 2997.388 0.38797632 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 1 1 160.73 160.73 3 1.8712E-38 165198 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.87 121.49 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6826 2244 6395 60870 77421 77421 1 DLEGLSQR Unmodified 916.46141 0.46140945 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.809 39.809 2 0.026319 35752 QUIQUE_C1277_190116_001 70.69 24.027 356810000 0 91792000 0 158760000 0 0 0 106260000 0 0 0 0 0 6827 2378 6396 60871;60872;60873 77422;77423;77424 77422 1 DLEGQLSDLEQR Unmodified 1401.6736 0.67358707 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 106.08 106.08 2 0.0095314 111119 QUIQUE_C1438_190116_001 82.261 46.816 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6828 3523 6397 60874 77425 77425 1 DLEGSDIDTR Unmodified 1119.5044 0.50439647 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.759 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1538.7075 0.70752973 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.99 153.99 2 0.00051669 159466 QUIQUE_C1218_190116_001 94.616 59.105 287510000 42258000 33648000 32133000 30448000 18410000 26128000 23173000 17727000 0 7981200 26919000 0 28679000 6842 4487 6411 60966;60967;60968;60969;60970;60971;60972;60973;60974;60975;60976 77542;77543;77544;77545;77546;77547;77548;77549;77550;77551;77552;77553;77554;77555;77556;77557 77542 15 DLEQLEHIHEQQCEVK Unmodified 2033.9477 0.94765344 4706 yes no 0 0 0 1 99.389 99.389 3 0.050751 101742 QUIQUE_C1403_190116_001 28.956 20.462 61167000 0 0 0 61167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 6843 4706 6412 60977 77558 77558 1 DLEQTDKAPEQK Unmodified 1400.6783 0.6783381 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 16.514 16.514 2;3 2.6088E-27 9477 QUIQUE_C1218_190116_001 183.03 137.43 1881200000 158580000 197350000 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77635;77636;77637;77638;77639;77640;77641;77642;77643;77644;77645 77644 11 DLEVVEGSAARFDCK Unmodified 1694.7934 0.79338463 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 165.78 165.78 3 0.0033414 170516 QUIQUE_C1218_190116_001 44.457 9.772 148780000 35421000 0 0 54630000 34648000 24085000 0 0 0 0 0 0 0 6853 3154 6422 61055;61056;61057;61058 77646;77647;77648;77649 77646 4 DLFAEGLLEFLR Unmodified 1421.7555 0.7554662 1721 O95295 SNAPIN SNARE-associated protein Snapin yes yes 0 0 0 1 173.5 173.5 2 0.011682 177613 QUIQUE_C1218_190116_001 71.349 52.078 5063500 5063500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6854 1721 6423 61059 77650 77650 1 DLFAEGLLEFLRPAVQQLDSHVHAVR Unmodified 2959.5668 0.56682458 1721 O95295 SNAPIN SNARE-associated protein Snapin yes yes 0 0 1 1 1 166.41 166.41 4 5.0891E-11 173662 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.717 72.556 91868000 0 0 0 0 0 0 0 0 64075000 0 27793000 0 0 6855 1721 6424 61060;61061 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1 DLFEDELVPLFEK Unmodified 1592.7974 0.7973906 1581 O60506;B7Z645;F6UXX1 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.22 166.22 2 0.00031027 170797 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.93 85.546 3172700000 0 305950000 812350000 277130000 297290000 0 253200000 0 270010000 90639000 235410000 311410000 319360000 6860 1581 6429 61100;61101;61102;61103;61104;61105;61106;61107;61108;61109 77736;77737;77738;77739;77740;77741;77742;77743;77744;77745;77746 77741 11 DLFELLVACVAK Unmodified 1376.7374 0.7373733 3328 Q5TH69 ARFGEF3 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 169.95 169.95 2 0.0018106 172928 QUIQUE_C1403_190116_001 78.934 49.461 10732000 0 0 4553700 3616100 0 0 0 0 0 2562200 0 0 0 6861 3328 6430 61110;61111;61112;61113 77747;77748;77749;77750 77748 4 DLFELLVACVAKPTETISR Unmodified 2161.1453 0.14529061 3328 Q5TH69 ARFGEF3 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 yes yes 0 0 1 1 163.47 163.47 3 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1258.6459 0.64585618 3837 Q96DV4 MRPL38 39S ribosomal protein L38, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 88.066 88.066 3 0.00012292 89835 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.28 103.08 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6865 3837 6433 61133;61134;61135;61136 77770;77771;77772;77773 77773 4 DLFIDGR Unmodified 834.42357 0.42356738 319;1097 G5E9G7;Q9P2S2;A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN2;NRXN3 Neurexin-2;Neurexin-3 no no 0 0 0 1 72.295 72.295 2 0.050661 72185 QUIQUE_C1277_190116_001 74.415 16.169 41393000 0 41393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6866 1097;319 6434 61137 77774 77774 1 DLFLQGAYDTVR Unmodified 1396.6987 0.69867961 4436 Q9UHL4 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.5 117.5 2 0.00032274 122792 QUIQUE_C1218_190116_001 134.68 114.91 1191000000 93693000 124030000 100480000 88105000 126870000 75313000 128400000 78556000 72019000 59372000 0 114930000 129190000 6867 4436 6435 61138;61139;61140;61141;61142;61143;61144;61145;61146;61147;61148;61149 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61443;61444;61445;61446;61447;61448;61449;61450;61451;61452;61453;61454;61455;61456;61457;61458 78145;78146;78147;78148;78149;78150;78151;78152;78153;78154;78155;78156;78157;78158;78159;78160;78161;78162;78163;78164;78165 78157 18 DLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVR Unmodified 2739.2819 0.28187722 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 2 2 3 1 2 2 1 114.62 114.62 3;4 2.2804E-23 118144 QUIQUE_C1403_190116_001 122.3 115.11 1139900000 64059000 88250000 136850000 160640000 85553000 242170000 286800000 0 0 0 0 0 75600000 6903 4560 6471 61459;61460;61461;61462;61463;61464;61465;61466;61467;61468;61469;61470;61471;61472 78166;78167;78168;78169;78170;78171;78172;78173;78174;78175;78176;78177;78178;78179;78180;78181;78182;78183;78184;78185;78186;78187;78188;78189;78190 78173 24 DLGLAQDSATSTK Unmodified 1305.6412 0.64122431 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.301 44.301 2 1.685E-12 41652 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167.02 4 2.2711E-78 174430 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.69 132.1 328280000 0 0 0 0 76012000 0 0 0 86585000 0 165680000 0 0 6906 1501 6474 61499;61500;61501 78220;78221;78222;78223 78223 4 DLGMVTILVQDTDTALK Unmodified 1831.9601 0.96011561 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 164.32 164.32 2;3 1.2639E-44 169490 QUIQUE_C1218_190116_001 174.21 150.6 533750000 73346000 60191000 87795000 67766000 0 54776000 42846000 0 46047000 27807000 22884000 0 50291000 6907 2361 6475 61502;61503;61504;61505;61506;61507;61508;61509;61510;61511;61512;61513 78224;78225;78226;78227;78228;78229;78230;78231;78232;78233;78234;78235;78236;78237;78238;78239;78240;78241;78242 78225 18 DLGMVTILVQDTDTALKELEK Oxidation (M) 2347.2192 0.21924342 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 1 1 1 1 164.54 164.54 3 3.4752E-06 169272 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78280;78281;78282;78283;78284;78285;78286;78287;78288;78289;78290;78291;78292;78293;78294;78295;78296;78297;78298;78299;78300;78301;78302;78303;78304;78305;78306;78307;78308;78309;78310;78311;78312;78313;78314;78315;78316;78317 78280 37 DLGTQLAPIIQEFFSSEQYR Unmodified 2341.159 0.15902642 2488 P46952;C9IY88 HAAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 175.4 175.4 2;3 4.0811E-23 182375 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.47 135.26 421360000 13765000 24797000 10781000 5646400 30336000 5298200 32079000 58906000 94023000 2802600 65478000 54818000 22632000 6916 2488 6483 61568;61569;61570;61571;61572;61573;61574;61575;61576;61577;61578;61579;61580;61581;61582;61583;61584;61585;61586;61587 78318;78319;78320;78321;78322;78323;78324;78325;78326;78327;78328;78329;78330;78331;78332;78333;78334;78335;78336;78337;78338;78339;78340 78337 21 DLGVFIPAPMAQGMR Unmodified 1601.8058 0.80580399 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 140.69 140.69 2 0.063601 148163 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.37 39.238 50482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50482000 0 0 6917 798 6484 61588 78341 78341 0 DLGVLGSFIHR Unmodified 1212.6615 0.66150624 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;F5H6Y0 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 116.82 116.82 2;3 0.00072437 121333 QUIQUE_C1218_190116_001 63.408 50.911 112960000 47335000 0 0 0 0 49985000 0 0 0 15641000 0 0 0 6918 462 6485 61589;61590;61591;61592;61593;61594;61595;61596;61597 78342;78343;78344;78345;78346;78347;78348;78349;78350 78342 9 DLGYIYFYQR Unmodified 1336.6452 0.64518747 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.96 123.96 2 1.2824E-11 128588 QUIQUE_C1368_190116_001 163.77 128.55 2305100000 222000000 278660000 234780000 162120000 204950000 149230000 202100000 178060000 206980000 71994000 131430000 146680000 116070000 6919 2472 6486 61598;61599;61600;61601;61602;61603;61604;61605;61606;61607;61608;61609;61610 78351;78352;78353;78354;78355;78356;78357;78358;78359;78360;78361;78362;78363;78364;78365;78366;78367;78368;78369;78370;78371;78372 78354 22 DLHDANTDLIGR Unmodified 1338.6528 0.65279205 2634 P53985;Q5T8R5;Q5T8R3 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 51.495 51.495 2;3 0.00099347 47128 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 61.473 326790000 36107000 0 0 0 38033000 0 32502000 22741000 41472000 34421000 52593000 26297000 42623000 6920 2634 6487 61611;61612;61613;61614;61615;61616;61617;61618;61619;61620 78373;78374;78375;78376;78377;78378;78379;78380;78381;78382;78383 78378 11 DLHDQFQHQLK Unmodified 1407.6895 0.6895119 65 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92 VPS11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 35.826 35.826 2;3 0.00077457 31909 QUIQUE_C1218_190116_001 72.187 51.347 253120000 48161000 47588000 0 0 0 25916000 49960000 26539000 54955000 0 0 0 0 6921 65 6488 61621;61622;61623;61624;61625;61626;61627 78384;78385;78386;78387;78388;78389;78390 78384 7 DLHDQFQHQLR Unmodified 1435.6957 0.69565991 4141 Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 38.318 38.318 3 0.00013406 34439 QUIQUE_C1403_190116_001 84.188 62.959 60795000 0 0 24756000 36039000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6922 4141 6489 61628;61629;61630 78391;78392;78393 78392 3 DLHEEMNYITAIIEEQPK Unmodified 2172.0409 0.040885122 2525 P49354;E9PQP6;H0YCW1;E9PN85 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 161.07 161.07 2;3 1.8077E-14 166484 QUIQUE_C1218_190116_001 106.93 103.49 645070000 44556000 46809000 99082000 42006000 38293000 55385000 44712000 50630000 61671000 30698000 48549000 0 82676000 6923 2525 6490 61631;61632;61633;61634;61635;61636;61637;61638;61639;61640;61641;61642;61643 78394;78395;78396;78397;78398;78399;78400;78401;78402;78403;78404;78405;78406;78407;78408 78394 15 DLHESSFSLSGSQIDDHVPK Unmodified 2197.0287 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78631;78632;78633;78634;78635;78636;78637;78638;78639;78640;78641;78642;78643;78644;78645;78646;78647;78648;78649;78650;78651;78652;78653;78654;78655;78656;78657;78658;78659 78641 28 DLIALANTAGEVLLHR Unmodified 1704.9523 0.95226853 807 D6RFM7;D6RAP6;Q9UJX5 ANAPC4 Anaphase-promoting complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 158.08 158.08 3 6.3531E-05 163178 QUIQUE_C1218_190116_001 88.768 77.077 16347000 6844900 0 0 9502000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6939 807 6503 61855;61856 78660;78661 78660 2 DLIDDATNLVQLYHVLHPDGQSAQGAK Unmodified 2917.457 0.45699936 1101 G5E9W7;G5E9V5;P82650 MRPS22 28S ribosomal protein S22, mitochondrial yes no 0 0 0 1 155.61 155.61 4 0.00046987 159966 QUIQUE_C1277_190116_001 38.537 28.115 30731000 0 30731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6940 1101 6504 61857 78662 78662 1 DLIDLMTLWK Unmodified 1246.6631 0.66314572 4265 Q9NRD1;J3KQ72 FBXO6 F-box only protein 6 yes no 0 0 0 1 170.88 170.88 2 0.0031874 173562 QUIQUE_C1403_190116_001 85.731 61.576 9891800 0 0 0 9891800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6941 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0.72237516 2644 P54687;F5H2F2 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.09 121.09 2 0.0021883 124933 QUIQUE_C1403_190116_001 92.732 48.355 457600000 53695000 52999000 48856000 45790000 43329000 68275000 35975000 0 0 0 42700000 32000000 33978000 6965 2644 6527 62094;62095;62096;62097;62098;62099;62100;62101;62102;62103 78942;78943;78944;78945;78946;78947;78948;78949;78950;78951;78952;78953;78954 78945 13 DLIYTLYYWK Unmodified 1376.7016 0.70163972 2062 P13726 F3 Tissue factor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.96 150.96 2 0.00019686 158214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.92 75.12 1272000000 41698000 74770000 109830000 93930000 61494000 41731000 103550000 109040000 194460000 34915000 152420000 136420000 117780000 6966 2062 6528 62104;62105;62106;62107;62108;62109;62110;62111;62112;62113;62114;62115;62116 78955;78956;78957;78958;78959;78960;78961;78962;78963;78964;78965;78966;78967;78968;78969;78970;78971;78972;78973 78969 19 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3 0.00036146 118106 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.746 66.93 59893000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38022000 0 21871000 6975 1026 6536 62150;62151 79010;79011 79010 2 DLKPENILLDDYGHIR Unmodified 1909.9898 0.98977625 2364 P34947 GRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 yes yes 0 0 1 1 1 104.05 104.05 3 0.02665 107950 QUIQUE_DMIX8_190116_001 37.583 20.094 47686000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28912000 0 18774000 6976 2364 6537 62152;62153 79012;79013 79013 1 DLKPENILLDEEGHIK Unmodified 1861.9785 0.97854286 982;2594 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5;D6R910;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y7S9 RPS6KA2;RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 no no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 92.161 92.161 3;4 9.6381E-05 94017 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.643 64.158 1606600000 177100000 226790000 36287000 141360000 176850000 120020000 167130000 128290000 146880000 18050000 118340000 0 149480000 6977 982;2594 6538 62154;62155;62156;62157;62158;62159;62160;62161;62162;62163;62164;62165;62166;62167;62168;62169;62170;62171;62172;62173;62174 79014;79015;79016;79017;79018;79019;79020;79021;79022;79023;79024;79025;79026;79027;79028;79029;79030;79031;79032;79033;79034;79035;79036;79037;79038;79039 79033 25 DLKPENILVTSGGTVK Unmodified 1669.9251 0.92505073 2029 P11802;F8VYH9;F8VTV8;F8VWX7;F8VZ51;F8VXD2;F8VZZ0 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 78.951 78.951 3 0.0074019 75308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.765 25.626 12051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12051000 0 0 0 6978 2029 6539 62175 79040 79040 1 DLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAK Unmodified 2760.4123 0.412281 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 139.24 139.24 3;4 1.0342E-06 142397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.239 59.963 2533800000 154670000 139190000 338800000 132930000 97764000 0 138620000 317700000 329880000 62045000 360630000 129010000 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type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 83.558 83.558 2;3 1.2877E-09 86154 QUIQUE_C1438_190116_001 150.49 133.76 53836000000 5548200000 6405800000 3706700000 4302400000 4342000000 3241400000 4688100000 3142500000 3230000000 1878900000 4737100000 4627600000 3985300000 6981 803;896;4533;412;3299;3010 6542 62204;62205;62206;62207;62208;62209;62210;62211;62212;62213;62214;62215;62216;62217;62218;62219;62220;62221;62222;62223;62224;62225;62226;62227;62228;62229;62230 79073;79074;79075;79076;79077;79078;79079;79080;79081;79082;79083;79084;79085;79086;79087;79088;79089;79090;79091;79092;79093;79094;79095;79096;79097;79098;79099;79100;79101;79102;79103;79104;79105;79106;79107;79108;79109;79110;79111;79112;79113;79114;79115;79116 79085 44 DLKPENLLLDEK Unmodified 1425.7715 0.7715102 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8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 37.734 37.734 2;3 0.0028872 33652 QUIQUE_C1403_190116_001 68.657 53.343 930110000 88412000 93089000 66227000 83552000 0 82885000 66671000 0 65797000 0 216820000 83454000 83203000 6992 397;2473 6553 62319;62320;62321;62322;62323;62324;62325;62326;62327;62328;62329 79218;79219;79220;79221;79222;79223;79224;79225;79226;79227;79228 79221 7 DLKPSNLLLNTTCDLK Unmodified 1843.9713 0.97134899 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 1 2 3 3 2 2 2 1 102.41 102.41 2;3 5.9351E-18 105100 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.05 0 20409000000 784050000 1846100000 2497800000 1705500000 1582500000 1211000000 1989900000 1450600000 1496800000 493240000 1850900000 2231600000 1268500000 6993 2281 6554 62330;62331;62332;62333;62334;62335;62336;62337;62338;62339;62340;62341;62342;62343;62344;62345;62346;62347;62348;62349;62350;62351;62352;62353;62354;62355;62356 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DDX3X;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.971 38.971 2 0.00061273 35016 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.658 70.063 240210000 0 30505000 31039000 39504000 31965000 30578000 0 0 0 0 26054000 20429000 30134000 7063 266;1504 6622 62949;62950;62951;62952;62953;62954;62955;62956;62957 80008;80009;80010;80011;80012;80013;80014;80015;80016 80016 9 DLMHGLITLMLDSR Unmodified 1613.8269 0.82693336 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 168.57 168.57 2;3 2.4983E-05 174819 QUIQUE_C1438_190116_001 105 93.957 102390000 0 9931500 0 5326600 11627000 0 0 0 0 0 36360000 39144000 0 7064 3037 6623 62958;62959;62960;62961;62962;62963 80017;80018;80019;80020;80021;80022 80019 6 DLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNR Unmodified 2960.4637 0.46368141 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 138.29 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1 2 1 147.85 147.85 2;3 1.1016E-09 152229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.38 95.114 1288800000 0 36017000 21446000 14980000 58252000 0 37224000 299560000 276740000 0 218300000 175510000 150730000 7075 845;1936 6629 63077;63078;63079;63080;63081;63082;63083;63084;63085;63086;63087;63088 80155;80156;80157;80158;80159;80160;80161;80162;80163;80164;80165;80166;80167;80168;80169 80168 15 DLMTDLKSEISGDLAR Oxidation (M) 1778.872 0.87202888 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 1 1 1 2 1 1 1 118.44 118.44 3 4.2774E-14 124142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.63 114.07 441530000 0 0 0 0 0 0 0 100360000 151890000 0 70402000 48164000 70710000 7076 845;1936 6629 63089;63090;63091;63092;63093;63094 80170;80171;80172;80173;80174;80175;80176;80177 80174 493 7 DLMTLPIQNK Unmodified 1171.6271 0.62709457 2203 P22830;K7ELX4;K7EPN2;K7EKP7 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 95.3 95.3 2 0.011083 97851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.838 50.326 42168000 0 0 0 0 0 0 0 0 42168000 0 0 0 0 7077 2203 6630 63095 80178 80178 1 DLMVGDEASELR Unmodified 1333.6184 0.61838038 2715 P61160 ACTR2 Actin-related protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.301 86.301 2 0.00065504 87491 QUIQUE_C1403_190116_001 99.568 71.826 2750600000 396910000 357300000 317260000 321380000 228650000 237390000 253980000 0 168180000 0 279300000 190240000 0 7078 2715 6631 63096;63097;63098;63099;63100;63101;63102;63103;63104;63105;63106 80179;80180;80181;80182;80183;80184;80185;80186;80187;80188;80189 80182 11 DLMVGDEASELR Oxidation (M) 1349.6133 0.613295 2715 P61160 ACTR2 Actin-related protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 73.067 73.067 2 0.0050775 69819 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.65 48.187 241070000 0 0 68167000 56467000 0 46625000 0 30700000 0 39106000 0 0 0 7079 2715 6631 63107;63108;63109;63110;63111 80190;80191;80192;80193;80194;80195 80195 2144 6 DLMVTASSETSISLIWTK Unmodified 1981.0078 0.0077940794 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 3 12 4 180.48 180.48 2 0.00025615 188450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.543 67.004 167580000 0 0 0 0 0 0 0 0 17891000 0 122730000 26958000 0 7080 3753 6632 63112;63113;63114;63115;63116;63117;63118;63119;63120;63121;63122;63123;63124;63125;63126;63127;63128;63129;63130 80196;80197;80198;80199;80200;80201;80202;80203;80204;80205;80206;80207;80208;80209;80210;80211;80212;80213;80214;80215;80216 80204 20 DLNAAEALQR Unmodified 1099.5622 0.56218613 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 59.591 59.591 2 0.00083867 55100 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.4 62.527 600970000 0 0 0 0 89098000 62211000 87091000 85215000 0 28303000 120140000 128910000 0 7081 1472 6633 63131;63132;63133;63134;63135;63136;63137;63138;63139;63140 80217;80218;80219;80220;80221;80222;80223;80224;80225;80226;80227 80223 9 DLNAVAFR Unmodified 904.47667 0.47666558 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 65.312 65.312 2 0.040732 65030 QUIQUE_C1368_190116_001 84.244 14.811 14368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14368000 0 0 7082 490 6634 63141;63142;63143 80228;80229;80230 80228 3 DLNCVPEIADTLGAVAK Unmodified 1784.8978 0.8978497 1440 O14744;G3V580;G3V2X6;G3V2L6;C9JSX3;G3V507;G3V2F5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 139.92 139.92 2;3 0.00040512 144006 QUIQUE_C1403_190116_001 64.327 60.084 401640000 89930000 68879000 0 19012000 14534000 81214000 72053000 56018000 0 0 0 0 0 7083 1440 6635 63144;63145;63146;63147;63148;63149;63150;63151;63152;63153;63154;63155;63156;63157 80231;80232;80233;80234;80235;80236;80237;80238;80239;80240;80241;80242;80243;80244;80245;80246 80237 15 DLNGIDLTPVQDTPVASR Unmodified 1909.9745 0.97452012 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.18 113.18 2 2.838E-17 117133 QUIQUE_C1368_190116_001 175.6 159.07 628900000 0 0 84776000 56497000 30872000 54471000 56163000 50483000 60082000 23592000 66432000 74908000 70625000 7084 3807 6636 63158;63159;63160;63161;63162;63163;63164;63165;63166;63167;63168;63169 80247;80248;80249;80250;80251;80252;80253;80254;80255;80256;80257;80258 80248 9 DLNHICVINEHGK Unmodified 1547.7515 0.75146023 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 35.449 35.449 3 0.0094006 30776 QUIQUE_C1277_190116_001 40.315 32.064 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7085 4268 6637 63170 80259 80259 1 DLNHLLQQESGNR Unmodified 1522.7488 0.7488177 1479 O15083 ERC2 ERC protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 67.685 67.685 2;3 0.00049722 68820 QUIQUE_C1218_190116_001 105.25 55.884 205060000 36051000 46097000 74672000 0 0 0 0 17248000 0 0 30995000 0 0 7086 1479 6638 63171;63172;63173;63174;63175;63176 80260;80261;80262;80263;80264;80265;80266 80260 7 DLNHVCVISETGK Unmodified 1470.7137 0.71367774 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 47.834 47.834 2;3 4.6383E-41 44713 QUIQUE_C1368_190116_001 227.48 194.49 4270700000 212020000 523170000 456170000 430240000 244270000 203640000 499390000 168390000 157290000 148700000 435900000 252070000 539430000 7087 1787 6639 63177;63178;63179;63180;63181;63182;63183;63184;63185;63186;63187;63188;63189;63190;63191;63192;63193;63194;63195 80267;80268;80269;80270;80271;80272;80273;80274;80275;80276;80277;80278;80279;80280;80281;80282;80283;80284;80285;80286;80287;80288;80289;80290;80291;80292;80293 80273 26 DLNMDCIIAEIK Unmodified 1433.6894 0.68943683 100 A0A087X106;CON__O43790;CON__Q14533;O43790;Q14533;CON__P78386;P78386;F5GYI5 KRT81;KRT86;KRT85 Keratin, type II cuticular Hb6;Keratin, type II cuticular Hb1;Keratin, type II cuticular Hb5 yes no 0 0 0 1 146.2 146.2 2 0.039009 151332 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.641 38.648 30667000 0 0 0 0 0 0 0 0 30667000 0 0 0 0 + 7088 100 6640 63196 80294 80294 0 DLNPDVNVFQR Unmodified 1315.6521 0.65206377 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7ELZ6;K7EQW2 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.16 94.16 2 0.00045793 95399 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.52 85.217 1971000000 160970000 130170000 177520000 0 166830000 116620000 154420000 171820000 168050000 81287000 229570000 164020000 249730000 7089 3780 6641 63197;63198;63199;63200;63201;63202;63203;63204;63205;63206;63207;63208 80295;80296;80297;80298;80299;80300;80301;80302;80303;80304;80305;80306;80307 80301 13 DLNQLFQQDSSSR Unmodified 1536.7168 0.71684887 1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;K7EPP6;A0A0U1RQM4 ERC1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.463 97.463 2 0.0043039 98820 QUIQUE_C1563_190116_001 69.01 54.038 31220000 0 0 0 0 0 31220000 0 0 0 0 0 0 0 7090 1107 6642 63209;63210;63211;63212 80308;80309;80310;80311 80308 4 DLNSDMDSILASLK Unmodified 1520.7392 0.73922379 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 166.15 166.15 2;3 1.025E-15 171028 QUIQUE_C1218_190116_001 149.38 113.05 4735800000 424500000 322520000 785290000 433000000 267250000 301710000 228930000 197600000 402530000 158280000 418540000 488810000 306840000 7091 1153 6643 63213;63214;63215;63216;63217;63218;63219;63220;63221;63222;63223;63224;63225;63226;63227;63228;63229;63230;63231;63232;63233;63234;63235;63236;63237;63238;63239 80312;80313;80314;80315;80316;80317;80318;80319;80320;80321;80322;80323;80324;80325;80326;80327;80328;80329;80330;80331;80332;80333;80334;80335;80336;80337;80338;80339;80340 80313 25 DLNSDMDSILASLK Oxidation (M) 1536.7341 0.73413841 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 2 124.38 124.38 2 0.003167 120924 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.085 49.621 73173000 0 0 0 0 0 0 0 31193000 0 41979000 0 0 0 7092 1153 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DLNTLAEDLLSSGTFNVDQIVK Unmodified 2391.2169 0.21693523 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 174.12 174.12 2 2.204E-34 181331 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.75 116.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7096 1820 6646 63295 80411 80411 1 DLNVISSLLK Unmodified 1100.6441 0.64412484 3315 Q5T5U3;A0A1B0GV73;A0A087WW76;A0A1B0GTZ9;Q5JSD8;H0Y468 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 1 136.95 136.95 2 0.0034764 141897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.213 48.333 31931000 0 15874000 0 0 0 0 0 0 16057000 0 0 0 0 7097 3315 6647 63296;63297 80412;80413 80413 2 DLNVLTPTGF Unmodified 1075.555 0.55497548 24 A0A087WT18;Q96A73 KIAA1191 Putative monooxygenase p33MONOX yes no 0 0 0 1 1 149.39 149.39 2 0.035136 154427 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.786 38.783 11868000 0 0 0 0 5491500 0 0 0 6376400 0 0 0 0 7098 24 6648 63298;63299 80414;80415 80415 2 DLNYCFSGMSDHR Unmodified 1600.6399 0.63986087 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 73.693 73.693 2;3 0.00070558 73993 QUIQUE_C1368_190116_001 89.805 74.793 3496700000 155250000 303340000 518130000 306250000 225910000 261240000 283430000 309430000 320530000 57561000 237540000 227000000 291110000 7099 905;2672 6649 63300;63301;63302;63303;63304;63305;63306;63307;63308;63309;63310;63311;63312;63313;63314;63315 80416;80417;80418;80419;80420;80421;80422;80423;80424;80425;80426;80427;80428;80429;80430;80431 80419 15 DLNYCFSGMSDHR Oxidation (M) 1616.6348 0.6347755 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 1 0 1 1 53.121 53.121 2 0.0017181 51991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.693 72.047 44638000 0 0 0 0 0 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80580;80581;80582;80583;80584;80585;80586;80587;80588;80589;80590;80591;80592;80593;80594;80595;80596;80597;80598;80599;80600;80601;80602;80603;80604;80605;80606;80607;80608;80609;80610;80611 80599 32 DLPNALDEK Unmodified 1013.5029 0.50293991 4308 Q9NVJ2 ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 53.449 53.449 2 0.0018516 50763 QUIQUE_C1563_190116_001 99.442 56.442 418900000 0 0 0 0 114340000 170810000 0 133750000 0 0 0 0 0 7117 4308 6666 63441;63442;63443;63444;63445;63446;63447 80612;80613;80614;80615;80616;80617;80618 80615 6 DLPPILLVR Unmodified 1034.6488 0.64881629 2654 P55011 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 127.05 127.05 2 0.0081474 131019 QUIQUE_C1403_190116_001 79.597 43.717 84149000 16650000 0 21369000 19984000 0 0 0 0 0 0 26146000 0 0 7118 2654 6667 63448;63449;63450;63451 80619;80620;80621;80622;80623 80622 5 DLPPVSGSIIWAK Unmodified 1381.7606 0.76055158 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes 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molecule L1 yes no 0 0 1 2 3 2 2 2 1 2 1 1 1 3 2 2 107.22 107.22 2;3 6.1451E-37 110428 QUIQUE_C1277_190116_001 163.99 145.37 1179900000 80500000 132450000 100700000 61641000 114660000 39197000 181680000 60192000 29529000 0 105600000 102190000 171570000 7133 2345 6682 63572;63573;63574;63575;63576;63577;63578;63579;63580;63581;63582;63583;63584;63585;63586;63587;63588;63589;63590;63591;63592;63593;63594;63595 80783;80784;80785;80786;80787;80788;80789;80790;80791;80792;80793;80794;80795;80796;80797;80798;80799;80800;80801;80802;80803;80804;80805;80806;80807;80808;80809;80810 80787 28 DLQEPEFSAK Unmodified 1162.5506 0.55061839 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.745 58.745 2 0.0023978 57177 QUIQUE_C1277_190116_001 90.15 52.592 3237700000 247570000 260960000 327130000 283180000 0 333640000 318450000 438930000 0 0 430750000 0 597060000 7134 2555 6683 63596;63597;63598;63599;63600;63601;63602;63603;63604 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MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 173.2 173.2 2;3 1.7593E-265 175924 QUIQUE_C1403_190116_001 268.09 254.5 4044200000 347460000 394620000 73556000 261540000 353770000 308010000 369560000 555490000 452470000 47896000 511330000 175730000 192730000 7152 307 6699 63764;63765;63766;63767;63768;63769;63770;63771;63772;63773;63774;63775;63776;63777;63778;63779;63780;63781;63782;63783;63784;63785;63786;63787 81008;81009;81010;81011;81012;81013;81014;81015;81016;81017;81018;81019;81020;81021;81022;81023;81024;81025;81026;81027;81028;81029;81030;81031;81032;81033;81034 81016 25 DLSAGAVSAVQCIANPIK Unmodified 1812.9404 0.94038322 3438 Q7L266;A0A087WUG3;A0A087WZI5 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 128.24 128.24 2;3 1.4603E-75 133848 QUIQUE_C1218_190116_001 247.13 209.11 3811600000 314580000 276650000 446690000 351070000 386420000 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63811;63812;63813;63814;63815;63816;63817;63818;63819;63820;63821;63822;63823;63824;63825 81063;81064;81065;81066;81067;81068;81069;81070;81071;81072;81073;81074;81075;81076;81077;81078;81079;81080;81081 81078 14 DLSGLDAETLLK Unmodified 1273.6765 0.67654718 2287 P29350;F5H5H9;F5H1Z8;F5H0N8;F5H1V7;F5H4Z1;F5GXD4;U3KQS1 PTPN6 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.27 122.27 2 0.0018005 126339 QUIQUE_C1403_190116_001 85.958 63.218 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7160 2287 6707 63826;63827;63828;63829;63830;63831 81082;81083;81084;81085;81086;81087 81083 6 DLSHIGDAVVISCAK Unmodified 1583.7977 0.79774172 2032 P12004 PCNA Proliferating cell nuclear antigen yes yes 0 0 0 1 1 83.807 83.807 3 0.00053958 86931 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.403 41.712 87822000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39275000 0 48547000 7161 2032 6708 63832;63833 81088;81089;81090 81088 2 DLSIDDTSQIR Unmodified 1261.615 0.61500956 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 0 1 59.791 59.791 2 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81190;81191;81192;81193;81194;81195;81196;81197;81198;81199;81200;81201;81202;81203;81204;81205;81206;81207;81208;81209;81210;81211;81212;81213;81214;81215;81216;81217;81218;81219;81220;81221;81222;81223;81224;81225;81226;81227;81228 81227 37 DLSLSCTTQFLQYFLEK Unmodified 2092.0187 0.018693117 3522 Q86YJ6;C9JU10 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 172.42 172.42 2 1.5709E-16 173961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.2 134.6 54872000 0 13195000 0 0 15074000 0 0 26603000 0 0 0 0 0 7171 3522 6718 63931;63932;63933 81229;81230;81231 81231 3 DLSQAPFSWPAGALVAQACHAATAALHTHR Unmodified 3154.5519 0.55191957 3360 Q6GMV3 PTRHD1 Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 149.65 149.65 4;5 1.7473E-47 152567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.32 119.51 967450000 27779000 0 80852000 40514000 44704000 35701000 106230000 159440000 101330000 0 75389000 82407000 213110000 7172 3360 6719 63934;63935;63936;63937;63938;63939;63940;63941;63942;63943;63944;63945 81232;81233;81234;81235;81236;81237;81238;81239;81240;81241;81242;81243;81244;81245 81238 13 DLSQLQENLK Unmodified 1186.6194 0.61936665 3545 Q8IX12 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 77.595 77.595 2 0.0069483 77835 QUIQUE_C1403_190116_001 88.819 52.424 57034000 0 0 0 25588000 0 0 0 31446000 0 0 0 0 0 7173 3545 6720 63946;63947 81246;81247 81246 2 DLSQMLK Unmodified 833.43169 0.43168922 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.953 72.953 2 0.01933 73646 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.54 36.791 6422300000 759290000 781550000 608940000 598150000 397020000 463200000 601990000 275380000 315130000 203700000 515060000 474360000 428570000 7174 273;342 6721 63948;63949;63950;63951;63952;63953;63954;63955;63956;63957;63958;63959;63960 81248;81249;81250;81251;81252;81253;81254;81255;81256;81257;81258;81259;81260;81261;81262;81263 81256 16 DLSQMLKK Unmodified 961.52665 0.52665224 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 45.649 45.649 2 0.044952 42177 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.993 13.115 70054000 0 0 0 0 0 0 0 70054000 0 0 0 0 0 7175 273;342 6722 63961;63962 81264;81265 81264 2 DLSSAEAILALFPENFHQNLK Unmodified 2356.2063 0.20631097 4360 Q9P000;E9PJ95 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 162.08 162.08 2;3 1.6454E-06 168530 QUIQUE_C1438_190116_001 107.14 93.736 974850000 0 113760000 0 10535000 130970000 84308000 97913000 110110000 104780000 30457000 97677000 96331000 98011000 7176 4360 6723 63963;63964;63965;63966;63967;63968;63969;63970;63971;63972;63973;63974 81266;81267;81268;81269;81270;81271;81272;81273;81274;81275;81276;81277;81278 81269 12 DLSSHQLNEFLAQTLQR Unmodified 1999.0123 0.012302606 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 3 2 2 2 2 132.34 132.34 2;3 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A;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 77.746 77.746 2 0.012317 78790 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.501 0 518740000 31734000 26614000 0 27418000 0 114560000 83857000 46389000 21448000 43921000 0 122800000 0 7181 1170 6728 64015;64016;64017;64018;64019;64020;64021;64022;64023;64024 81341;81342;81343;81344;81345;81346;81347;81348;81349;81350;81351 81348 10 DLSTIEPLKK Unmodified 1142.6547 0.65468953 1170 H0YN26;P39687;O95626 ANP32A;ANP32D Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 49.151 49.151 2;3 0.02796 46806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.229 0 370970000 64790000 39065000 19759000 31055000 108480000 0 0 13033000 20748000 12602000 42681000 0 18758000 7182 1170 6729 64025;64026;64027;64028;64029;64030;64031;64032;64033;64034;64035 81352;81353;81354;81355;81356;81357;81358;81359;81360;81361;81362;81363 81362 11 DLSTPGLEK Unmodified 958.49713 0.49712625 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 43.679 43.679 2 0.0013568 40620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 53.539 1130800000 0 0 0 163000000 0 253120000 0 296550000 213530000 0 0 204560000 0 7183 2483 6730 64036;64037;64038;64039;64040;64041;64042 81364;81365;81366;81367;81368;81369;81370 81366 5 DLSTVEALQNLK Unmodified 1329.714 0.71399532 4022 Q9BTT0;E9PPH5 ANP32E Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.2 107.2 2 1.9436E-10 108960 QUIQUE_C1563_190116_001 157.96 116.51 994180000 128940000 90910000 0 85972000 109090000 112760000 93892000 53468000 96145000 45796000 95883000 81327000 0 7184 4022 6731 64043;64044;64045;64046;64047;64048;64049;64050;64051;64052;64053;64054 81371;81372;81373;81374;81375;81376;81377;81378;81379;81380;81381;81382;81383;81384;81385;81386;81387 81376 16 DLSVFEVDGNMSK Oxidation (M) 1455.6552 0.65515981 477 A0A3B3ISW3;A0A3B3ISF5;A0A3B3IT63;A0A3B3IS73;A0A3B3IRI4;A0A3B3IU93;A0A3B3IT19;A0A3B3ITI0;A0A3B3ISI1;Q8WYB5 KAT6B Histone acetyltransferase KAT6B yes no 0 1 0 1 1 160.44 160.44 3 0.010064 165076 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.915 16.108 145170000 0 0 0 0 0 0 0 76016000 69158000 0 0 0 0 7185 477 6732 64055;64056 81388;81389 81389 348 2 DLSYCLSGMYDHR Unmodified 1615.6759 0.67591203 2609 P52597 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 90.057 90.057 2;3 0.00027988 91983 QUIQUE_C1368_190116_001 111.86 97.697 482150000 30908000 38408000 71188000 70629000 24026000 57529000 39338000 57187000 41231000 12274000 0 0 39436000 7186 2609 6733 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A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 0 0 5 3 4 2 2 3 3 4 3 4 2 4 5 114.51 114.51 1;2 0.0024467 113942 QUIQUE_C1563_190116_001 136.33 80.892 179220000000 15526000000 10013000000 17139000000 11154000000 9979500000 14432000000 17313000000 12184000000 15599000000 7954200000 12423000000 17090000000 18415000000 7188 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6735 64092;64093;64094;64095;64096;64097;64098;64099;64100;64101;64102;64103;64104;64105;64106;64107;64108;64109;64110;64111;64112;64113;64114;64115;64116;64117;64118;64119;64120;64121;64122;64123;64124;64125;64126;64127;64128;64129;64130;64131;64132;64133;64134;64135 81438;81439;81440;81441;81442;81443;81444;81445;81446;81447;81448;81449;81450;81451;81452;81453;81454;81455;81456;81457;81458;81459;81460;81461;81462;81463;81464;81465;81466;81467;81468;81469;81470;81471;81472;81473;81474;81475;81476;81477;81478;81479;81480;81481;81482;81483;81484;81485;81486;81487;81488;81489;81490;81491;81492;81493;81494;81495;81496;81497;81498;81499;81500;81501;81502;81503;81504;81505;81506;81507;81508;81509;81510;81511;81512;81513;81514;81515;81516;81517;81518;81519;81520;81521;81522;81523;81524;81525;81526;81527;81528;81529;81530;81531;81532;81533;81534 81480 88 DLTDYLMK Oxidation (M) 1013.4739 0.47394797 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 1 0 2 3 3 2 3 3 2 2 3 1 3 3 3 97.732 97.732 1;2 0.0048797 92611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.34 136.64 29078000000 1843300000 3517200000 3389000000 2185800000 2708300000 2504300000 2081700000 1306700000 1893100000 1143600000 2670600000 1875500000 1958800000 7189 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6735 64136;64137;64138;64139;64140;64141;64142;64143;64144;64145;64146;64147;64148;64149;64150;64151;64152;64153;64154;64155;64156;64157;64158;64159;64160;64161;64162;64163;64164;64165;64166;64167;64168 81535;81536;81537;81538;81539;81540;81541;81542;81543;81544;81545;81546;81547;81548;81549;81550;81551;81552;81553;81554;81555;81556;81557;81558;81559;81560;81561;81562;81563;81564;81565;81566;81567;81568;81569;81570;81571;81572;81573;81574;81575;81576;81577;81578;81579;81580;81581;81582;81583;81584;81585;81586;81587;81588;81589;81590;81591;81592;81593;81594;81595;81596;81597;81598;81599 81588 319 60 DLTDYLMKILTER Unmodified 1609.8385 0.83854391 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.16 168.16 3 0.00032909 172222 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.42 66.345 434180000 56262000 0 96757000 23270000 118980000 0 0 0 29704000 0 49046000 60155000 0 7190 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6736 64169;64170;64171;64172;64173;64174;64175 81600;81601;81602;81603;81604;81605;81606 81606 7 DLTDYLMKILTER Oxidation (M) 1625.8335 0.83345853 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 1 1 1 156.97 156.97 3 0.0012131 162641 QUIQUE_C1368_190116_001 76.262 58.756 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7191 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6736 64176 81607 81607 319 1 DLTEFTQVVQHDTACTIAATASVVK Unmodified 2704.3378 0.33779542 4312 Q9NW68;F8W6C6;E9PNA9 BSDC1 BSD domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 161.9 161.9 3 0.055631 167401 QUIQUE_C1576_190116_001 19.714 6.9119 35398000 0 0 0 0 0 0 35398000 0 0 0 0 0 0 7192 4312 6737 64177 81608 81608 1 DLTEYLSR Unmodified 995.49238 0.49237523 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.323 90.323 2 0.0015347 93268 QUIQUE_C1576_190116_001 140.98 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1 1 1 1 1 1 55.509 55.509 2 1.7508E-06 54413 QUIQUE_C1576_190116_001 154.35 104.99 24399000000 1809300000 2247100000 2110400000 1931000000 2259700000 1876400000 2191000000 1685300000 1858300000 1014500000 1943900000 1880400000 1591600000 7197 267;275;3025 6742 64219;64220;64221;64222;64223;64224;64225;64226;64227;64228;64229;64230;64231 81673;81674;81675;81676;81677;81678;81679;81680;81681;81682;81683;81684;81685;81686;81687;81688;81689;81690;81691;81692;81693;81694 81683 22 DLTGVQNLRK Unmodified 1142.6408 0.6407708 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 32.554 32.554 2;3 0.0022889 28406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.906 47.823 919800000 0 0 0 0 0 0 0 248040000 189570000 0 149920000 151060000 181200000 7198 267;275;3025 6743 64232;64233;64234;64235;64236;64237;64238;64239;64240;64241 81695;81696;81697;81698;81699;81700;81701;81702;81703;81704 81696 9 DLTLAGR Unmodified 744.413 0.41300269 1 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reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 170.84 170.84 2;3 1.5335E-17 172371 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.37 143.99 6042400000 245820000 687870000 94136000 100880000 356870000 57841000 780950000 306010000 342700000 23943000 444030000 753520000 1847800000 7228 2524 6771 64498;64499;64500;64501;64502;64503;64504;64505;64506;64507;64508;64509;64510;64511;64512;64513;64514;64515;64516;64517;64518;64519;64520;64521;64522 82016;82017;82018;82019;82020;82021;82022;82023;82024;82025;82026;82027;82028;82029;82030;82031;82032;82033;82034;82035;82036;82037;82038;82039;82040;82041;82042 82031 27 DLVEMCR Unmodified 921.40482 0.40482255 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.666 48.666 2 0.02784 46213 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.692 56.105 533890000 89576000 114610000 0 102570000 77169000 0 93711000 56263000 0 0 0 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alpha-induced protein 8-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 76.298 76.298 3 0.00093578 78524 QUIQUE_C1218_190116_001 80.231 39.507 51483000 15427000 0 12928000 0 0 0 0 0 0 0 10351000 0 12777000 7232 339 6775 64543;64544;64545;64546;64547;64548;64549;64550;64551;64552;64553 82065;82066;82067;82068;82069;82070;82071;82072;82073;82074;82075 82065 11 DLVHTEGQLQNEEIVAHDGSATYLR Unmodified 2794.3522 0.35219994 4616 Q9Y547 HSPB11 Intraflagellar transport protein 25 homolog yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 3 2 2 95.338 95.338 3;4 4.999E-197 98965 QUIQUE_C1218_190116_001 241.65 224.39 1488600000 69067000 120050000 141070000 189980000 147550000 102660000 130110000 67782000 88441000 24997000 145680000 107930000 153300000 7233 4616 6776 64554;64555;64556;64557;64558;64559;64560;64561;64562;64563;64564;64565;64566;64567;64568;64569;64570;64571;64572;64573;64574;64575;64576 82076;82077;82078;82079;82080;82081;82082;82083;82084;82085;82086;82087;82088;82089;82090;82091;82092;82093;82094;82095;82096;82097;82098;82099;82100;82101;82102;82103 82076 27 DLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANR Unmodified 3001.5397 0.53966635 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 4 16 3 178.69 178.69 3;4 8.9833E-65 182383 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.47 136.88 773330000 0 0 0 0 0 0 0 6530600 72618000 0 579550000 114630000 0 7234 1931 6777 64577;64578;64579;64580;64581;64582;64583;64584;64585;64586;64587;64588;64589;64590;64591;64592;64593;64594;64595;64596;64597;64598;64599;64600 82104;82105;82106;82107;82108;82109;82110;82111;82112;82113;82114;82115;82116;82117;82118;82119;82120;82121;82122;82123;82124;82125;82126;82127;82128;82129 82110 22 DLVIVAANLQK Unmodified 1182.6972 0.69722304 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 91.51 91.51 2 0.016768 92647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.434 21.626 69530000 0 0 0 0 0 0 0 30474000 0 0 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131513 QUIQUE_C1576_190116_001 120.15 93.462 66984000 0 0 0 0 0 38829000 28155000 0 0 0 0 0 0 7238 2867 6781 64615;64616 82146;82147;82148;82149 82148 4 DLVLLGEQFREEYK Unmodified 1737.8938 0.8937506 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.39 119.39 3 0.00021211 122381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.507 59.373 207410000 0 0 17796000 12290000 17854000 0 20735000 23825000 27308000 10485000 29697000 20601000 26820000 7239 2867 6782 64617;64618;64619;64620;64621;64622;64623;64624;64625;64626 82150;82151;82152;82153;82154;82155;82156;82157;82158;82159;82160;82161;82162 82155 13 DLVLLSEIEVAQANDIISSTEISSAEK Unmodified 2873.4757 0.47572869 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 4 174.47 174.47 3 1.3192E-18 176291 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.196 82.089 61946000 0 0 0 0 0 0 0 0 61946000 0 0 0 0 7240 880 6783 64627;64628;64629;64630 82163;82164;82165;82166 82163 4 DLVLQGHHTR Unmodified 1174.6207 0.62070406 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 15.2 15.2 3 0.0010402 7063 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 39.109 194270000 30364000 52247000 0 34783000 0 51181000 0 0 0 0 0 25692000 0 7241 3563 6784 64631;64632;64633;64634;64635 82167;82168;82169;82170;82171;82172;82173;82174 82170 7 DLVLSGDLGSLYAMTQDK Unmodified 1924.9452 0.94519382 1473 O15031;E2PU09 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 155.81 155.81 2;3 0.00016814 158282 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.84 87.64 98252000 25017000 6191300 19023000 22887000 0 0 0 25133000 0 0 0 0 0 7242 1473 6785 64636;64637;64638;64639;64640 82175;82176;82177;82178;82179 82179 3 DLVLSPNHQYLYAMTEK Unmodified 2020.9928 0.99281272 4452 Q9UIW2 PLXNA1 Plexin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 103.92 103.92 3 0.00093262 106920 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.913 36.639 99020000 0 0 0 0 0 0 0 15212000 23729000 0 0 34549000 25531000 7243 4452 6786 64641;64642;64643;64644 82180;82181;82182;82183 82183 4 DLVLSVHNR Unmodified 1051.5774 0.57744226 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.606 36.606 2 0.023842 32161 QUIQUE_C1368_190116_001 60.436 41.706 89026000 0 29151000 34495000 0 0 25379000 0 0 0 0 0 0 0 7244 3098 6787 64645;64646;64647;64648;64649 82184;82185;82186;82187;82188 82185 5 DLVPDLSNFYAQYK Unmodified 1671.8144 0.81443765 2187 P21912;A0A087WWT1 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 146.44 146.44 2 0.00028966 142050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.93 75.144 2442600000 409150000 449180000 373760000 0 0 305770000 0 0 0 144080000 0 402700000 358000000 7245 2187 6788 64650;64651;64652;64653;64654;64655;64656 82189;82190;82191;82192;82193;82194;82195 82193 7 DLVPEPGAAAGLEVFTQK Unmodified 1840.9571 0.95707914 346 A0A1B0GTW6 yes yes 0 0 0 1 135.4 135.4 2 0.0055134 142404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.891 34.314 42314000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42314000 0 0 7246 346 6789 64657 82196 82196 1 DLVQDPSLLGGTISAYK Unmodified 1775.9305 0.93053004 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 128.86 128.86 2;3 1.6963E-12 125395 QUIQUE_DMIX4_190116_001 155.08 127.75 2191700000 240770000 228000000 173620000 197160000 207610000 229250000 178280000 206390000 96267000 64802000 0 177200000 192350000 7247 998 6790 64658;64659;64660;64661;64662;64663;64664;64665;64666;64667;64668;64669;64670;64671;64672 82197;82198;82199;82200;82201;82202;82203;82204;82205;82206;82207;82208;82209;82210;82211;82212 82210 15 DLVSGLFSFSSCPFSR Unmodified 1804.8454 0.8454202 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.55 165.55 2 3.3439E-13 172720 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.2 125.11 1193200000 0 64525000 97535000 49238000 84212000 42653000 108180000 188890000 245500000 22161000 114850000 0 175450000 7248 4626 6791 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64725;64726;64727;64728;64729;64730;64731;64732;64733;64734;64735;64736;64737;64738;64739;64740;64741;64742;64743 82269;82270;82271;82272;82273;82274;82275;82276;82277;82278;82279;82280;82281;82282;82283;82284;82285;82286;82287 82285 17 DLVVAYGTTENSPVTFAHFPEDTVEQK Unmodified 2993.4294 0.4294472 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 130.12 130.12 3 1.6904E-24 135483 QUIQUE_C1218_190116_001 102.07 89.132 303430000 38880000 0 54789000 0 0 0 62959000 0 47240000 0 0 50695000 48872000 7253 3819 6795 64744;64745;64746;64747;64748;64749;64750 82288;82289;82290;82291;82292;82293;82294;82295 82288 8 DLVVGFVADGGLSVLPR Unmodified 1712.9461 0.94612052 1067 F8WEC6 SLC25A17 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.793 38.793 3 0.0004689 34676 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.408 22.577 159470000 0 0 0 0 0 0 0 41115000 0 0 0 44485000 73872000 7254 1067 6796 64751;64752;64753;64754;64755;64756 82296;82297;82298;82299;82300;82301 82299 6 DLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNR Unmodified 2987.524 0.52401629 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 0 2 178.46 178.46 3 2.1461E-05 185990 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.708 25.551 28737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28737000 0 0 7255 1938 6797 64757;64758 82302;82303 82303 2 DLVVSYYQFHR Unmodified 1425.7041 0.70409934 3998 Q9BR01 SULT4A1 Sulfotransferase 4A1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 87.901 87.901 2;3 4.5797E-05 89692 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.76 115.71 1041800000 95979000 98976000 40678000 87257000 92315000 78752000 92430000 89820000 40670000 0 136610000 136140000 52219000 7256 3998 6798 64759;64760;64761;64762;64763;64764;64765;64766;64767;64768;64769;64770;64771;64772;64773;64774;64775;64776;64777;64778;64779;64780;64781;64782;64783 82304;82305;82306;82307;82308;82309;82310;82311;82312;82313;82314;82315;82316;82317;82318;82319;82320;82321;82322;82323;82324;82325;82326;82327;82328;82329;82330;82331;82332;82333;82334 82322 29 DLVWDWQQAASGVLVAVGR Unmodified 2069.0694 0.069423554 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 137.09 137.09 3 0.024329 142760 QUIQUE_C1368_190116_001 23.329 7.9073 77790000 0 0 77790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7257 934 6799 64784 82335 82335 1 DLYANNVLSGGTTMYPGIADR Oxidation (M) 2243.0528 0.052846792 2792;2759 P62736;P63267;P68032 ACTA2;ACTG2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 118.27 118.27 2;3 3.0263E-76 122335 QUIQUE_C1368_190116_001 184.99 171.31 1103600000 72923000 179040000 70545000 66884000 139050000 30054000 56681000 56350000 138160000 139740000 0 116030000 38115000 7258 2759;2792 6800 64785;64786;64787;64788;64789;64790;64791;64792;64793;64794;64795;64796;64797;64798;64799 82336;82337;82338;82339;82340;82341;82342;82343;82344;82345;82346;82347;82348;82349;82350 82338 2188 15 DLYANNVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2227.0579 0.057932169 2792;2759 P62736;P63267;P68032 ACTA2;ACTG2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 1 131.04 131.04 2;3 9.5217E-186 137821 QUIQUE_C1438_190116_001 245.48 223.92 3552100000 372650000 850150000 232200000 313460000 511720000 106680000 160400000 188850000 217960000 0 166500000 339360000 92209000 7259 2759;2792 6800 64800;64801;64802;64803;64804;64805;64806;64807;64808;64809;64810;64811;64812;64813;64814;64815;64816;64817;64818;64819;64820;64821;64822 82351;82352;82353;82354;82355;82356;82357;82358;82359;82360;82361;82362;82363;82364;82365;82366;82367;82368;82369;82370;82371;82372;82373;82374;82375;82376;82377;82378;82379 82362 27 DLYANTVLSGGSTMYPGIADR Oxidation (M) 2216.0419 0.041947754 3261 Q562R1 ACTBL2 Beta-actin-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 166.65 166.65 2 0.012789 182937 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.001 37.97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7260 3261 6801 64823;64824 82380;82381 82381 2642 2 DLYANTVLSGGSTMYPGIADRMQK Oxidation (M) 2603.236 0.23597289 3261 Q562R1 ACTBL2 Beta-actin-like protein 2 yes yes 0 1 1 1 140.46 140.46 2 0.015379 146184 QUIQUE_C1576_190116_001 61.212 49.046 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7261 3261 6802 64825 82382 82382 2642 1 DLYANTVLSGGTTMYPGIADR Oxidation (M) 2230.0576 0.057597819 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 0 5 8 7 5 4 4 5 6 11 6 13 8 9 125.08 125.08 2;3 0 127297 QUIQUE_C1218_190116_001 297.56 249.57 84781000000 5474900000 6725100000 6351400000 5898500000 5004900000 5692100000 4720400000 8293200000 7048200000 7106000000 8006500000 7254200000 7206100000 7262 447;2696;2788 6803 64826;64827;64828;64829;64830;64831;64832;64833;64834;64835;64836;64837;64838;64839;64840;64841;64842;64843;64844;64845;64846;64847;64848;64849;64850;64851;64852;64853;64854;64855;64856;64857;64858;64859;64860;64861;64862;64863;64864;64865;64866;64867;64868;64869;64870;64871;64872;64873;64874;64875;64876;64877;64878;64879;64880;64881;64882;64883;64884;64885;64886;64887;64888;64889;64890;64891;64892;64893;64894;64895;64896;64897;64898;64899;64900;64901;64902;64903;64904;64905;64906;64907;64908;64909;64910;64911;64912;64913;64914;64915;64916 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82385 320 171 DLYANTVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2214.0627 0.062683196 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 0 10 10 19 9 11 13 20 19 22 2 48 32 20 147.57 147.57 2;3 0 140369 QUIQUE_C1218_190116_001 367.6 302.96 108550000000 9600600000 11103000000 9555900000 10455000000 7551400000 9137500000 8630300000 9560400000 6965000000 3176800000 7798800000 7504600000 7507600000 7263 447;2696;2788 6803 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yes yes 0 0 0 1 1 1 22.065 22.065 2 0.025188 15052 QUIQUE_C1563_190116_001 71.715 38.744 22816000 0 0 0 0 0 22816000 0 0 0 0 0 0 0 7274 1405 6814 65209;65210;65211 83082;83083;83084 83084 3 DMAAFNERPIIFALSNPTSK Unmodified 2221.1201 0.1201385 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 133.52 133.52 2 6.5442E-37 138086 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.17 134.94 235830000 0 0 0 58010000 0 0 27641000 0 56967000 0 54018000 0 39197000 7275 2504 6815 65212;65213;65214;65215;65216 83085;83086;83087;83088;83089 83089 4 DMAAFNERPIIFALSNPTSK Oxidation (M) 2237.1151 0.11505312 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.9 120.9 3 9.0466E-06 124876 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.967 68.135 313220000 0 0 0 0 42152000 0 0 41946000 0 36218000 63330000 49464000 80109000 7276 2504 6815 65217;65218;65219;65220;65221;65222;65223 83090;83091;83092;83093;83094;83095;83096 83096 1931 7 DMAGLLKPTACTMLVSSLR Unmodified 2063.0577 0.057737935 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.83 132.83 3 2.0921E-16 137159 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.19 114.7 723080000 30584000 61262000 71123000 58037000 0 74747000 65179000 57539000 55636000 0 92121000 71267000 85583000 7277 2026 6816 65224;65225;65226;65227;65228;65229;65230;65231;65232;65233;65234 83097;83098;83099;83100;83101;83102;83103;83104;83105;83106;83107;83108 83108 10 DMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQPHDLGK Unmodified 3096.5074 0.50737995 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 4 8 4 13 11 13 24 13 12 176.1 176.1 3 3.3899E-36 162654 QUIQUE_C1277_190116_001 108.32 99.467 1906200000 68996000 101880000 84546000 0 66441000 0 230740000 186320000 270840000 0 486380000 203400000 206690000 7278 2004 6817 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83109;83110;83111;83112;83113;83114;83115;83116;83117;83118;83119;83120;83121;83122;83123;83124;83125;83126;83127;83128;83129;83130;83131;83132;83133;83134;83135;83136;83137;83138;83139;83140;83141;83142;83143;83144;83145;83146;83147;83148;83149;83150;83151;83152;83153;83154;83155;83156;83157;83158;83159;83160;83161;83162;83163;83164;83165;83166;83167;83168;83169;83170;83171;83172;83173;83174;83175;83176;83177;83178;83179;83180;83181;83182;83183;83184;83185;83186;83187;83188;83189;83190;83191;83192;83193;83194;83195;83196;83197;83198;83199;83200;83201;83202;83203;83204;83205;83206;83207;83208;83209;83210;83211;83212;83213;83214;83215;83216;83217;83218;83219;83220;83221;83222;83223;83224 83114 106 DMANPTALLLSAVMMLR 3 Oxidation (M) 1893.9362 0.93622582 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 3 0 4 4 3 2 1 3 2 2 3 2 3 2 168.8 168.8 2;3 1.825E-05 170624 QUIQUE_C1563_190116_001 97.631 84.43 687960000 57441000 125540000 107160000 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65415;65416;65417;65418;65419;65420;65421;65422;65423;65424;65425;65426;65427;65428;65429;65430;65431;65432;65433;65434;65435;65436;65437;65438;65439;65440;65441;65442;65443;65444;65445;65446;65447;65448;65449;65450;65451;65452;65453;65454;65455;65456;65457;65458;65459 83303;83304;83305;83306;83307;83308;83309;83310;83311;83312;83313;83314;83315;83316;83317;83318;83319;83320;83321;83322;83323;83324;83325;83326;83327;83328;83329;83330;83331;83332;83333;83334;83335;83336;83337;83338;83339;83340;83341;83342;83343;83344;83345;83346;83347;83348;83349;83350;83351;83352;83353;83354 83348 1997;1998;1999 48 DMANPTALLLSAVMMLR Unmodified 1845.9515 0.95148195 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 178.77 178.77 2;3 1.0819E-22 179536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.51 163.13 3470100000 192700000 78536000 290100000 36570000 108490000 23003000 179090000 134740000 351740000 0 762710000 914760000 397620000 7282 2558 6818 65460;65461;65462;65463;65464;65465;65466;65467;65468;65469;65470;65471;65472;65473;65474;65475;65476;65477;65478;65479;65480;65481 83355;83356;83357;83358;83359;83360;83361;83362;83363;83364;83365;83366;83367;83368;83369;83370;83371;83372;83373;83374;83375;83376;83377;83378;83379 83369 24 DMAQLPETEIAPAK Unmodified 1512.7494 0.74939455 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.628 83.628 2 0.0023114 84853 QUIQUE_C1277_190116_001 75.416 57.104 54246000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54246000 0 7283 880 6819 65482;65483;65484;65485 83380;83381;83382;83383 83380 4 DMAQLPETEIAPAK Oxidation (M) 1528.7443 0.74430917 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 1 0 1 64.966 64.966 2 0.054928 63614 QUIQUE_C1563_190116_001 53.08 27.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7284 880 6819 65486 83384 83384 521 1 DMASFHERPIIFALSNPTSK Unmodified 2260.131 0.13103753 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 105.82 105.82 3;4 1.1744E-37 109078 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.19 146.1 1639300000 134260000 165530000 66779000 38836000 129460000 39239000 147000000 154910000 91737000 0 226990000 206330000 238280000 7285 3198 6820 65487;65488;65489;65490;65491;65492;65493;65494;65495;65496;65497;65498;65499;65500;65501;65502;65503;65504;65505;65506 83385;83386;83387;83388;83389;83390;83391;83392;83393;83394;83395;83396;83397;83398;83399;83400;83401;83402;83403;83404;83405;83406;83407;83408;83409 83403 25 DMASFHERPIIFALSNPTSK Oxidation (M) 2276.126 0.12595216 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 1 1 1 94.007 94.007 3 0.00044334 95257 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.203 50.187 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7286 3198 6820 65507 83410 83410 2626 1 DMDDEESWIK Oxidation (M) 1282.5023 0.50234756 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.821 70.821 2 0.0002452 71212 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.23 119.62 1820100000 107230000 174250000 130320000 107890000 114000000 114460000 98517000 140670000 183610000 86594000 214950000 145130000 202460000 7287 267;275;3025 6821 65508;65509;65510;65511;65512;65513;65514;65515;65516;65517;65518;65519;65520 83411;83412;83413;83414;83415;83416;83417;83418;83419;83420;83421;83422;83423;83424;83425;83426;83427;83428;83429 83428 159 18 DMDDEESWIK Unmodified 1266.5074 0.50743294 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.875 89.875 2 0.0016836 91802 QUIQUE_C1403_190116_001 109.71 105.51 5301900000 464980000 609260000 511240000 483980000 351950000 439270000 418290000 369130000 374650000 135960000 421940000 365700000 355590000 7288 267;275;3025 6821 65521;65522;65523;65524;65525;65526;65527;65528;65529;65530;65531;65532;65533 83430;83431;83432;83433;83434;83435;83436;83437;83438;83439;83440;83441;83442;83443;83444;83445;83446;83447;83448 83437 15 DMDDEESWIKEK Oxidation (M) 1539.6399 0.63990368 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 1 53.581 53.581 2 0.0078779 51369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.596 86.196 22482000 0 0 0 0 0 0 0 22482000 0 0 0 0 0 7289 267;275;3025 6822 65534 83449 83449 159 1 DMDDEESWIKEK Unmodified 1523.645 0.64498906 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 70.648 70.648 2 0.0023901 69781 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.63 105.96 69966000 0 0 0 0 0 0 0 69966000 0 0 0 0 0 7290 267;275;3025 6822 65535 83450;83451 83450 2 DMDIAGFTQK Unmodified 1124.5172 0.51720977 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 83.612 83.612 2 0.017413 86391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.355 47.28 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7291 271 6823 65536;65537 83452;83453 83452 2 DMDKVETFLR Unmodified 1252.6122 0.61217279 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;B1A4G9;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2;A0A087WXJ5;B1A4H2;A0A0B4J1R0;J3QT06;Q14406 GH1;GH2;CSH1;CSH2;CSHL1 Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1;Chorionic somatomammotropin hormone-like 1 yes no 0 0 1 2 1 1 78.603 78.603 2;3 4.1445E-08 80417 QUIQUE_C1218_190116_001 158.57 107.45 1561700000 1511700000 0 0 30646000 0 0 19333000 0 0 0 0 0 0 7292 493 6824 65538;65539;65540;65541 83454;83455;83456;83457;83458;83459;83460 83457 7 DMDKVETFLR Oxidation (M) 1268.6071 0.60708741 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;B1A4G9;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2;A0A087WXJ5;B1A4H2;A0A0B4J1R0;J3QT06;Q14406 GH1;GH2;CSH1;CSH2;CSHL1 Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1;Chorionic somatomammotropin hormone-like 1 yes no 0 1 1 1 57.238 57.238 3 0.049597 55698 QUIQUE_C1218_190116_001 55.401 28.512 132720000 132720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7293 493 6824 65542 83461 83461 0 DMDLTEVITGTLWNLSSHDSIK Unmodified 2474.1999 0.19990496 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.8 170.8 3 5.941E-15 174681 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.37 98.636 929420000 0 87119000 50857000 0 81631000 0 120170000 77625000 78712000 0 110100000 143610000 179590000 7294 759 6825 65543;65544;65545;65546;65547;65548;65549;65550;65551 83462;83463;83464;83465;83466;83467;83468;83469;83470;83471 83470 7 DMDLVEVNEAFAPQYLAVER Oxidation (M) 2324.0995 0.099462633 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 1 1 1 144.54 144.54 2;3 3.0955E-47 149667 QUIQUE_C1368_190116_001 166.09 152.06 864560000 76408000 92185000 107770000 61133000 94060000 89693000 50791000 50571000 83327000 15817000 63185000 40921000 38698000 7295 2453 6826 65552;65553;65554;65555;65556;65557;65558;65559;65560;65561;65562;65563;65564;65565;65566;65567;65568;65569;65570;65571;65572;65573 83472;83473;83474;83475;83476;83477;83478;83479;83480;83481;83482;83483;83484;83485;83486;83487;83488;83489;83490;83491;83492;83493;83494;83495;83496 83477 1875 23 DMDLVEVNEAFAPQYLAVER Unmodified 2308.1045 0.10454801 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 155.72 155.72 2;3 6.2998E-09 150626 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.14 120.58 256720000 0 0 0 0 0 0 0 160920000 0 95797000 0 0 0 7296 2453 6826 65574;65575;65576 83497;83498;83499;83500;83501;83502 83498 5 DMDLYSYR Unmodified 1061.4488 0.44879585 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 79.276 79.276 1;2 0.00029504 80228 QUIQUE_C1277_190116_001 160.03 134.2 4842200000 411010000 452980000 497340000 432240000 0 417530000 369120000 446440000 490100000 142370000 446900000 359830000 376340000 7297 2870 6827 65577;65578;65579;65580;65581;65582;65583;65584;65585;65586;65587;65588;65589;65590 83503;83504;83505;83506;83507;83508;83509;83510;83511;83512;83513;83514;83515;83516;83517;83518;83519;83520;83521;83522;83523 83506 19 DMDLYSYR Oxidation (M) 1077.4437 0.44371047 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.613 55.613 2 0.0042844 54320 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.78 107.56 884970000 0 90532000 88500000 87968000 66072000 75953000 54551000 0 110910000 0 113650000 89758000 107070000 7298 2870 6827 65591;65592;65593;65594;65595;65596;65597;65598;65599;65600;65601 83524;83525;83526;83527;83528;83529;83530;83531;83532;83533;83534;83535;83536;83537;83538;83539 83538 2346 16 DMEALLPLMNMVIYSIDK Unmodified 2095.0404 0.040356536 3794 Q96A33;A0A087WYW6 CCDC47 Coiled-coil domain-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 180.33 180.33 2 0.00068449 183366 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.647 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kinase DCLK1 no no 0 0 1 1 49.624 49.624 3 0.054733 46563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.424 26.288 40694000 0 0 0 0 0 0 0 40694000 0 0 0 0 0 7302 1478;3342 6830 65619 83557 83557 1 DMELEHFDERDK Oxidation (M) 1578.662 0.6620361 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 1 1 1 1 1 31.137 31.137 3 0.00539 26769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.937 51.064 97530000 0 0 0 0 0 0 0 40272000 0 0 0 23807000 33452000 7303 1478;3342 6830 65620;65621;65622 83558;83559;83560 83558 822 2 DMELPTEK Unmodified 961.44265 0.44264784 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.491 48.491 2 0.016707 46061 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.716 56.607 233450000 36057000 0 0 37499000 0 0 0 46497000 54098000 0 31934000 27366000 0 7304 880 6831 65623;65624;65625;65626;65627;65628 83561;83562;83563;83564;83565;83566;83567 83566 6 DMESPTKLDVTLAK Unmodified 1546.7913 0.79125936 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 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11 DMFPGPYPR Oxidation (M) 1094.4855 0.48551571 1710 O95169;E9PQ68;K9J7I2;E9PIZ8 NDUFB8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial yes no 0 1 0 1 62.645 62.645 2 0.020681 58414 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.038 51.114 6070900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6070900 0 0 0 7311 1710 6836 65653 83594 83594 1 DMFQETMEAMR Unmodified 1387.557 0.55704245 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 125.59 125.59 2 8.9349E-06 129254 QUIQUE_C1403_190116_001 145.17 134.34 129610000 19554000 16647000 20536000 33352000 17206000 22317000 0 0 0 0 0 0 0 7312 2378 6837 65654;65655;65656;65657;65658;65659 83595;83596;83597;83598;83599;83600 83598 6 DMGEDLECLCQIMR Unmodified 1768.7252 0.72524676 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5;H0YD77 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 154.02 154.02 2 0.00025673 159974 QUIQUE_C1576_190116_001 97.456 84.029 32906000 0 0 0 0 0 18339000 14567000 0 0 0 0 0 0 7313 798 6838 65660;65661 83601;83602 83602 2 DMGEMVTQGQTDAQYMFLR Oxidation (M) 2235.9599 0.95987438 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 3 4 3 4 3 1 1 2 3 3 2 4 2 128.21 128.21 2;3 1.0067E-85 133328 QUIQUE_DMIX3_190116_001 197.56 184.58 1359800000 127070000 147570000 117480000 31026000 122710000 34782000 29525000 108500000 145990000 84947000 132220000 174760000 103220000 7314 2851 6839 65662;65663;65664;65665;65666;65667;65668;65669;65670;65671;65672;65673;65674;65675;65676;65677;65678;65679;65680;65681;65682;65683;65684;65685;65686;65687;65688;65689;65690;65691;65692;65693;65694;65695;65696 83603;83604;83605;83606;83607;83608;83609;83610;83611;83612;83613;83614;83615;83616;83617;83618;83619;83620;83621;83622;83623;83624;83625;83626;83627;83628;83629;83630;83631;83632;83633;83634;83635;83636;83637;83638;83639;83640;83641 83629 2286;2287;2288 35 DMGEMVTQGQTDAQYMFLR Unmodified 2219.965 0.96495976 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 147.61 147.61 2;3 1.2137E-115 151871 QUIQUE_C1277_190116_001 278.41 270.5 4008900000 372500000 426210000 263210000 214680000 374200000 257110000 352330000 208970000 330130000 83634000 404330000 361400000 360170000 7315 2851 6839 65697;65698;65699;65700;65701;65702;65703;65704;65705;65706;65707;65708;65709;65710;65711;65712;65713;65714;65715;65716;65717;65718;65719 83642;83643;83644;83645;83646;83647;83648;83649;83650;83651;83652;83653;83654;83655;83656;83657;83658;83659;83660;83661;83662;83663;83664;83665;83666;83667;83668;83669;83670;83671 83646 22 DMGGYSTTTDFIK Oxidation (M) 1450.6286 0.62861071 86 A0A087WZN1;O43837;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 75.69 75.69 2 0.00045517 75223 QUIQUE_C1563_190116_001 108.7 97.867 651210000 63972000 61831000 52261000 44078000 0 40937000 0 43624000 78327000 58861000 68461000 79307000 59554000 7316 86 6840 65720;65721;65722;65723;65724;65725;65726;65727;65728;65729;65730;65731;65732;65733 83672;83673;83674;83675;83676;83677;83678;83679;83680;83681;83682;83683;83684;83685;83686 83678 58 15 DMGGYSTTTDFIK Unmodified 1434.6337 0.63369609 86 A0A087WZN1;O43837;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.189 92.189 2 0.00047041 93668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.83 106.35 864200000 0 0 0 103220000 69300000 91865000 0 84677000 125100000 0 140620000 118830000 130580000 7317 86 6840 65734;65735;65736;65737;65738;65739;65740;65741 83687;83688;83689;83690;83691;83692;83693;83694;83695;83696 83691 8 DMGTVVLGK Unmodified 918.48445 0.48445308 2089 P15170;H3BR35 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A no no 0 0 0 1 1 58.54 58.54 2 0.029012 57239 QUIQUE_C1403_190116_001 56.721 26.217 105910000 0 0 0 58451000 0 47460000 0 0 0 0 0 0 0 7318 2089 6841 65742;65743 83697;83698 83697 2 DMGYHVSMMADSTSR Unmodified 1686.68 0.68001113 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 3 1 2 2 2 3 1 1 1 2 1 66.016 66.016 2;3 0.00046036 65952 QUIQUE_C1576_190116_001 92.247 84.689 843190000 105570000 147130000 50784000 106090000 74500000 86160000 120430000 24411000 20483000 0 16998000 44572000 46072000 7319 2414 6842 65744;65745;65746;65747;65748;65749;65750;65751;65752;65753;65754;65755;65756;65757;65758;65759;65760;65761;65762;65763;65764 83699;83700;83701;83702;83703;83704;83705;83706;83707;83708;83709;83710;83711;83712;83713;83714;83715;83716;83717;83718;83719;83720 83713 21 DMGYHVSMMADSTSR Oxidation (M) 1702.6749 0.67492575 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 49.912 49.912 2 0.0033592 48471 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.121 60.104 46350000 0 0 22944000 0 0 0 0 0 0 0 23406000 0 0 7320 2414 6842 65765;65766 83721;83722 83722 1820 1 DMHYYQSCLEAILQNSPDAK Unmodified 2382.062 0.062031269 3441 Q7L523;Q5VZM0 RRAGA;RRAGB Ras-related GTP-binding protein A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.29 142.29 3 4.1824E-09 146691 QUIQUE_C1277_190116_001 102.98 95.356 294560000 26841000 35343000 32085000 27607000 37163000 27630000 39096000 0 38181000 0 30613000 0 0 7321 3441 6843 65767;65768;65769;65770;65771;65772;65773;65774;65775 83723;83724;83725;83726;83727;83728;83729;83730;83731 83724 9 DMIDLEANFEK Unmodified 1323.6017 0.60166768 3780 Q93050;K7EM24;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.2 117.2 2 0.0025929 122027 QUIQUE_C1218_190116_001 77.379 62.712 222150000 25752000 0 30846000 0 23627000 15987000 32608000 0 0 0 22277000 36232000 34821000 7322 3780 6844 65776;65777;65778;65779;65780;65781;65782;65783;65784;65785;65786 83732;83733;83734;83735;83736;83737;83738;83739;83740;83741;83742;83743 83732 10 DMIDLEANFEKIENELK Unmodified 2049.9929 0.9928723 3780 Q93050;K7EM24;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 158.96 158.96 3 2.0055E-10 166232 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.096 85.553 152640000 0 0 0 0 0 0 0 29710000 22234000 0 50882000 27121000 22694000 7323 3780 6845 65787;65788;65789;65790;65791 83744;83745;83746;83747;83748 83746 5 DMIDNLLSPDLIDGVLTR Unmodified 1999.0296 0.029592154 1911 P07093;C9JN98 SERPINE2 Glia-derived nexin yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 2 2 172.02 172.02 2;3 1.7172E-38 176287 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.33 167.51 541410000 43539000 25902000 0 0 41925000 0 20963000 44098000 116400000 0 52728000 138660000 57195000 7324 1911 6846 65792;65793;65794;65795;65796;65797;65798;65799;65800;65801;65802;65803;65804;65805;65806 83749;83750;83751;83752;83753;83754;83755;83756;83757;83758;83759;83760;83761;83762;83763;83764 83757 16 DMILNFAEQNSFK Unmodified 1555.7341 0.73407884 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.77 130.77 2 0.00040407 127411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.63 87.115 303630000 0 0 0 0 0 0 0 111340000 0 30137000 0 69171000 92988000 7325 1594 6847 65807;65808;65809;65810;65811;65812;65813;65814 83765;83766;83767;83768;83769;83770;83771;83772;83773 83770 8 DMILNFAEQNSFK Oxidation (M) 1571.729 0.72899346 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 1 0 1 1 1 111.92 111.92 2 0.0036115 115454 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.531 56.393 52783000 0 0 0 0 0 0 0 0 34465000 18318000 0 0 0 7326 1594 6847 65815;65816;65817 83774;83775;83776;83777 83775 872 4 DMILQFISR Unmodified 1121.5903 0.59031513 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 133.3 133.3 2 0.004459 137350 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.948 56.107 310840000 51547000 0 51136000 0 0 45723000 0 0 51633000 0 0 65936000 44865000 7327 2569 6848 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activator of morphogenesis 2;Disheveled-associated activator of morphogenesis 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 124.57 124.57 2 0.041477 127097 QUIQUE_C1563_190116_001 81.784 23.617 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7330 305;4602 6851 65842;65843;65844;65845 83805;83806;83807;83808 83808 4 DMLFQVLALEEPNVR Unmodified 1772.9131 0.91310583 2375 P35270 SPR Sepiapterin reductase yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 2 159.9 159.9 2;3 2.4616E-24 162000 QUIQUE_C1563_190116_001 156.71 140.82 818300000 51665000 16042000 80619000 48590000 21773000 74752000 73724000 75290000 82935000 29292000 89280000 75910000 98431000 7331 2375 6852 65846;65847;65848;65849;65850;65851;65852;65853;65854;65855;65856;65857;65858;65859;65860;65861;65862;65863;65864;65865;65866;65867;65868;65869;65870 83809;83810;83811;83812;83813;83814;83815;83816;83817;83818;83819;83820;83821;83822;83823;83824;83825;83826;83827;83828;83829;83830;83831;83832;83833;83834;83835;83836;83837;83838 83820 29 DMLFQVLALEEPNVR Oxidation (M) 1788.908 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1295.7271 0.72714296 1606 O75052 NOS1AP Carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase protein yes yes 0 0 0 1 1 107.2 107.2 3 0.014918 111851 QUIQUE_C1218_190116_001 44.847 28.983 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7340 1606 6859 65910;65911 83902;83903 83902 2 DMMELVQPSISGVDLDK Unmodified 1875.8958 0.89580079 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.25 141.25 2 1.3223E-37 146959 QUIQUE_C1218_190116_001 162.32 150.79 1024700000 217780000 202550000 221640000 0 0 237970000 0 0 93574000 51176000 0 0 0 7341 1678 6860 65912;65913;65914;65915;65916;65917 83904;83905;83906;83907;83908;83909;83910;83911;83912;83913;83914 83905 11 DMMELVQPSISGVDLDK Oxidation (M) 1891.8907 0.89071541 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 1 1 122.19 122.19 2 0.0018268 126817 QUIQUE_C1368_190116_001 63.76 44.102 87632000 0 29280000 29534000 0 0 28818000 0 0 0 0 0 0 0 7342 1678 6860 65918;65919;65920 83915;83916;83917 83916 910;911 3 DMMELVQPSISGVDLDKFR Oxidation (M) 2195.0602 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74.16 74.16 2 0.0032363 74166 QUIQUE_C1277_190116_001 90.913 72.601 55351000 33354000 0 0 0 0 21997000 0 0 0 0 0 0 0 7345 2914 6862 65945;65946;65947 83948;83949;83950 83949 3 DMNEVETQFK Unmodified 1239.5442 0.5441528 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 66.305 66.305 2 0.02484 66398 QUIQUE_C1368_190116_001 63.283 47.701 27904000 0 0 27904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7346 4336 6863 65948 83951 83951 1 DMNLTLEPEIMPAATDNR Unmodified 2029.9449 0.94487625 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 1 131.27 131.27 2 1.2827E-17 134133 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.97 141.72 103580000 0 0 34469000 0 0 35578000 0 33533000 0 0 0 0 0 7347 2885 6864 65949;65950;65951 83952;83953;83954 83954 3 DMNQVLDAYENK Oxidation (M) 1454.6348 0.63475872 2213 P23381;G3V277;G3V3H8;G3V3Y5;G3V423;G3V5U1;G3V456 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 66.106 66.106 2 0.0011307 65533 QUIQUE_C1403_190116_001 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yes no 0 0 2 1 124.76 124.76 4 0.0037745 131178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.258 32.292 72552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72552000 0 0 7350 2213 6866 65974 83980 83980 1 DMPIQAFLLYQEPVLGPVR Oxidation (M) 2201.1555 0.15546137 766 CON__P02666 yes yes 0 1 0 1 3 1 1 3 1 1 2 1 1 158.68 158.68 2;3 4.995E-36 162716 QUIQUE_C1277_190116_001 154.65 132.89 449540000 29731000 119480000 28498000 20085000 86263000 25206000 0 11128000 0 65369000 42546000 0 21232000 + 7351 766 6867 65975;65976;65977;65978;65979;65980;65981;65982;65983;65984;65985;65986;65987;65988;65989 83981;83982;83983;83984;83985;83986;83987;83988;83989;83990;83991;83992;83993;83994;83995;83996 83984 455 13 DMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMK Unmodified 2959.4307 0.43070953 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 3 157.68 157.68 3;4 4.8672E-20 160513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.446 82.36 2042700000 192840000 180820000 196880000 228880000 249720000 68447000 76218000 203620000 69598000 0 179550000 114390000 281740000 7352 2009 6868 65990;65991;65992;65993;65994;65995;65996;65997;65998;65999;66000;66001;66002;66003;66004;66005;66006;66007;66008;66009;66010;66011;66012 83997;83998;83999;84000;84001;84002;84003;84004;84005;84006;84007;84008;84009;84010;84011;84012;84013;84014;84015;84016;84017;84018;84019;84020;84021;84022;84023 84012 20 DMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMK Oxidation (M) 2975.4256 0.42562415 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 1 2 1 1 155.33 155.33 3;4 9.3572E-13 158146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.072 65.205 337500000 0 0 0 0 0 0 0 175830000 0 0 47817000 0 113850000 7353 2009 6868 66013;66014;66015;66016 84024;84025;84026;84027;84028 84026 1290;1294 4 DMQPSMESDMALVK Unmodified 1580.6885 0.68845055 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 98.435 98.435 2 0.01214 99919 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.7 41.346 74913000 33851000 17112000 0 0 0 0 0 23950000 0 0 0 0 0 7354 880 6869 66017;66018;66019;66020;66021 84029;84030;84031;84032;84033 84031 4 DMSGTMGFNEFK 2 Oxidation (M) 1394.5483 0.5482519 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.604 61.604 2 0.0017212 60401 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 80.018 461320000 50342000 60295000 0 57201000 0 0 47471000 0 58597000 48561000 50300000 44180000 44369000 7355 685 6870 66022;66023;66024;66025;66026;66027;66028;66029;66030 84034;84035;84036;84037;84038;84039;84040;84041;84042;84043;84044 84035 418;419 11 DMSGTMGFNEFK Oxidation (M) 1378.5533 0.55333728 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 81.237 81.237 2 0.0024765 79188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.14 69.31 2012900000 234650000 253310000 313930000 237460000 0 235140000 193950000 40214000 211180000 141080000 151960000 0 0 7356 685 6870 66031;66032;66033;66034;66035;66036;66037;66038;66039;66040;66041;66042;66043;66044;66045;66046;66047;66048 84045;84046;84047;84048;84049;84050;84051;84052;84053;84054;84055;84056;84057;84058;84059;84060;84061;84062;84063 84059 418;419 17 DMSGTMGFNEFK Unmodified 1362.5584 0.55842266 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.41 102.41 2 3.416E-07 104127 QUIQUE_C1563_190116_001 145.89 140.92 3479400000 362380000 298580000 0 339700000 262380000 339150000 397600000 145430000 256900000 103620000 425490000 223130000 325060000 7357 685 6870 66049;66050;66051;66052;66053;66054;66055;66056;66057;66058;66059;66060 84064;84065;84066;84067;84068;84069;84070;84071;84072;84073;84074;84075;84076;84077;84078;84079 84068 13 DMSGTMGFNEFKELWAVLNGWR 2 Oxidation (M) 2619.1886 0.18862877 685 C9J0K6;P30626 SRI Sorcin yes no 0 2 1 1 170.4 170.4 3 1.7649E-09 174379 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.058 89.346 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7358 685 6871 66061 84080 84080 418;419 1 DMSIIQWK Unmodified 1019.511 0.51100218 631 B5MBZ0;Q9HC35 EML4 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 yes no 0 0 0 1 103.61 103.61 2 0.042928 107673 QUIQUE_C1368_190116_001 58.679 38.225 11689000 0 0 11689000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7359 631 6872 66062 84081 84081 1 DMSLYASLTSEK Unmodified 1343.6279 0.62788243 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 2 4 2 2 106.32 106.32 2 0.00042714 110890 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.13 90.043 215440000 26582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 118610000 22227000 48016000 7360 2483 6873 66063;66064;66065;66066;66067;66068;66069;66070;66071;66072;66073;66074 84082;84083;84084;84085;84086;84087;84088;84089;84090;84091;84092;84093;84094 84086 12 DMSLYASLTSEK Oxidation (M) 1359.6228 0.62279705 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 86.583 86.583 2 0.00040975 88449 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.22 96.53 160760000 0 0 0 0 0 0 0 0 75569000 0 0 0 85195000 7361 2483 6873 66075;66076;66077;66078;66079 84095;84096;84097;84098;84099;84100;84101 84098 1908 7 DMSPLSETEMALGK Unmodified 1507.6898 0.68983076 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 117.26 117.26 2 0.0065997 120372 QUIQUE_C1403_190116_001 61.419 46.275 59634000 0 0 0 59634000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7362 880 6874 66080;66081 84102;84103 84102 2 DMSQMILR Unmodified 992.47832 0.47832184 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.305 84.305 2 0.012067 86052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.123 67.858 2003400000 0 133180000 236900000 308330000 163990000 0 272080000 0 175230000 0 286180000 172910000 254560000 7363 4560 6875 66082;66083;66084;66085;66086;66087;66088;66089;66090 84104;84105;84106;84107;84108;84109;84110;84111;84112;84113;84114;84115;84116;84117 84110 14 DMSVVEGGLR Unmodified 1061.5175 0.51754412 3142 Q15477;H7C5N0 SKIV2L Helicase SKI2W yes no 0 0 0 1 66.898 66.898 2 0.041293 66369 QUIQUE_C1403_190116_001 60.019 28.79 0 0 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21900000 0 0 7367 590 6879 66099;66100;66101 84126;84127;84128 84126 381 3 DMTTGIVENK Unmodified 1106.5278 0.52777445 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 45.655 45.655 2 0.034228 43082 QUIQUE_C1438_190116_001 53.089 17.209 84144000 0 0 0 0 22486000 0 61658000 0 0 0 0 0 0 7368 2142 6880 66102;66103 84129;84130 84129 2 DMTVPILVSKPPVFTGK Unmodified 1828.0168 0.016842623 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.75 117.75 3 0.0016646 123688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.307 47.681 340570000 0 48491000 52225000 50880000 0 0 0 0 0 0 67894000 48498000 72579000 7369 2014 6881 66104;66105;66106;66107;66108;66109 84131;84132;84133;84134;84135;84136;84137;84138 84135 8 DMVGIAQTGSGK Oxidation (M) 1178.5601 0.56013721 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.267 23.267 2 0.00025939 16809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.03 96.733 335100000 24653000 0 0 26271000 24584000 29849000 0 0 41949000 33272000 54824000 55455000 44242000 7370 381 6882 66110;66111;66112;66113;66114;66115;66116;66117;66118 84139;84140;84141;84142;84143;84144;84145;84146;84147;84148 84146 268 10 DMVGIAQTGSGK Unmodified 1162.5652 0.56522259 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 44.259 44.259 2 0.00047219 41380 QUIQUE_C1218_190116_001 108.43 82.695 219800000 84986000 78625000 0 0 0 0 0 56190000 0 0 0 0 0 7371 381 6882 66119;66120;66121 84149;84150;84151 84149 3 DMVGQVAITR Unmodified 1088.5648 0.56482866 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.511 61.511 2 0.0016837 60957 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.692 65.119 459040000 0 108070000 77458000 0 49904000 81625000 0 0 83005000 0 0 58969000 0 7372 903;2869 6883 66122;66123;66124;66125;66126;66127 84152;84153;84154;84155;84156;84157;84158 84158 7 DMVGQVAITR Oxidation (M) 1104.5597 0.55974328 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 40.739 40.739 2 0.024625 37154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.153 42.642 108420000 0 0 0 0 0 0 0 47026000 0 61389000 0 0 0 7373 903;2869 6883 66128;66129 84159;84160 84159 2 DMVVDIQR Unmodified 974.48552 0.48551571 4543 Q9Y266 NUDC Nuclear migration protein nudC yes yes 0 0 0 1 1 1 1 59.184 59.184 2 0.020996 58193 QUIQUE_C1368_190116_001 75.854 55.572 316250000 0 0 78115000 0 0 0 68342000 0 0 0 81627000 0 88166000 7374 4543 6884 66130;66131;66132;66133 84161;84162;84163;84164 84161 4 DMVVQLIDDFK Unmodified 1321.6588 0.65878863 2808 P78362;C9J2M4;C9JWF7 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.13 157.13 2 0.0023872 162459 QUIQUE_C1218_190116_001 78.655 55.227 50406000 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C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 48.232 48.232 2;3 4.8327E-31 45436 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.57 169.81 27563000000 701410000 926290000 1679700000 1250900000 1875600000 565610000 1685000000 4318800000 3777400000 168160000 3636500000 3681300000 3296300000 7380 1978 6890 66167;66168;66169;66170;66171;66172;66173;66174;66175;66176;66177;66178;66179;66180;66181;66182;66183;66184;66185;66186;66187;66188;66189 84225;84226;84227;84228;84229;84230;84231;84232;84233;84234;84235;84236;84237;84238;84239;84240;84241;84242;84243;84244;84245;84246;84247;84248;84249;84250;84251;84252;84253;84254;84255;84256 84248 30 DNALCENAR Unmodified 1061.456 0.45600649 272 A0A0D9SFU4;O95970;A0A1B0GUD3;A0A1B0GV33;A0A0D9SFH6;A0A0D9SFS5;A0A0D9SFE3;A0A1B0GTM5;A0A1B0GWB4 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 19.891 19.891 2 0.043052 12688 QUIQUE_C1576_190116_001 66.546 48.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7381 272 6891 66190 84257 84257 1 DNALLAQLIQDK Unmodified 1340.73 0.72997974 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 3 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 129.66 129.66 2;3 5.4551E-28 136108 QUIQUE_C1438_190116_001 181.68 150.19 19238000000 2805000000 2828100000 2076600000 2008900000 1401200000 1811000000 1753200000 157160000 499120000 1248100000 1086600000 803660000 759240000 7382 273;342 6892 66191;66192;66193;66194;66195;66196;66197;66198;66199;66200;66201;66202;66203;66204;66205;66206;66207;66208;66209 84258;84259;84260;84261;84262;84263;84264;84265;84266;84267;84268;84269;84270;84271;84272;84273;84274;84275;84276;84277;84278;84279;84280;84281;84282;84283;84284;84285;84286;84287;84288 84271 31 DNALLAQLIQDKLDAYK Unmodified 1931.0364 0.036392091 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 143.67 143.67 2;3 1.2066E-139 146823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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5 DNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDK Unmodified 3144.5285 0.52850932 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 2 1 141.84 141.84 3 9.7756E-15 147042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.554 68.904 95402000 0 0 0 0 0 0 0 0 95402000 0 0 0 0 7385 273;342 6894 66239 84337;84338 84338 2 DNALLSAIEESR Unmodified 1316.6572 0.65720872 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BM93;H3BNN5;H3BV11;H3BRI8 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 119.32 119.32 2 0.011234 115782 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.198 40.418 14035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14035000 0 0 0 7386 3574 6895 66240 84339 84339 1 DNAMLEYLK Unmodified 1095.527 0.52704617 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.569 99.569 2 0.0020253 101682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.635 70.11 3385000000 345660000 239870000 0 386420000 214390000 265180000 274850000 240460000 372000000 168060000 301390000 265450000 311230000 7387 859 6896 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P-component(1-203) yes yes 0 0 0 1 66.413 66.413 2 0.057322 67225 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.878 25.996 70157000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70157000 0 0 7400 1827 6908 66336 84446 84446 1 DNENVVNEYSSELEK Unmodified 1767.7799 0.77990263 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.592 94.592 2 2.8038E-44 97743 QUIQUE_C1218_190116_001 233 226.46 4026000000 255110000 359790000 296320000 554390000 492000000 114570000 494250000 106050000 108170000 229140000 505500000 125470000 385230000 7401 1824 6909 66337;66338;66339;66340;66341;66342;66343;66344;66345;66346;66347;66348;66349 84447;84448;84449;84450;84451;84452;84453;84454;84455;84456;84457;84458;84459;84460;84461;84462;84463;84464;84465 84447 19 DNETLAELK Unmodified 1031.5135 0.5135046 4333 Q9NYL9;H0YKU1;H0YNJ8 TMOD3 Tropomodulin-3 yes no 0 0 0 1 49.703 49.703 2 0.043333 47171 QUIQUE_C1277_190116_001 52.591 25.287 35733000 0 35733000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7402 4333 6910 66350 84466 84466 1 DNEVLLQIDKDVR Unmodified 1555.8206 0.82058566 4305 Q9NVG8 TBC1D13 TBC1 domain family member 13 yes yes 0 0 1 1 91.764 91.764 2 0.014817 94218 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.34 42.135 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7403 4305 6911 66351 84467 84467 1 DNFADVQVSVVDCPDLTKEPFTFPVK Unmodified 2966.4372 0.43717512 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PPB5;E9PIP1;E9PR95;E9PSC3;E9PLC5;E9PLB3 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 1 1 148.43 148.43 3 1.5683E-20 151350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.58 104.78 33966000 0 0 0 0 0 0 0 33966000 0 0 0 0 0 7404 4127 6912 66352 84468 84468 1 DNFALIPEGTNGIEER Unmodified 1773.8533 0.85334235 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.99 111.99 2 4.3767E-09 114161 QUIQUE_C1563_190116_001 122.45 99.211 1851700000 151780000 133010000 136790000 149990000 131580000 132100000 147140000 131430000 145640000 117710000 182540000 163990000 127980000 7405 1430 6913 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84498;84499;84500 84500 3 DNFNVDEIFLK Unmodified 1352.6612 0.66123147 502 A0A3B3ITT1;Q6IQ22 RAB12 Ras-related protein Rab-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.51 137.51 2 0.00026011 142723 QUIQUE_C1368_190116_001 120.76 100.62 467640000 38424000 45353000 45776000 38334000 56262000 44882000 61207000 0 35887000 12318000 47704000 41489000 0 7408 502 6916 66380;66381;66382;66383;66384;66385;66386;66387;66388;66389;66390 84501;84502;84503;84504;84505;84506;84507;84508;84509;84510;84511;84512;84513 84504 12 DNFTAIPEGTNGVEER Unmodified 1747.8013 0.80130678 3051 Q14195;H0YBT4 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.2 78.2 2 1.8228E-07 75079 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.86 100 9241000000 575040000 578710000 731580000 755220000 0 479480000 641400000 821280000 1127600000 643910000 923110000 944030000 1019700000 7409 3051 6917 66391;66392;66393;66394;66395;66396;66397;66398;66399;66400;66401;66402 84514;84515;84516;84517;84518;84519;84520;84521;84522;84523;84524;84525 84522 5 DNFTLIPEGTNGTEER Unmodified 1791.8275 0.82752153 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 95.742 95.742 2;3 2.1605E-13 99335 QUIQUE_C1576_190116_001 161.1 145.9 52492000000 3752600000 3891300000 4107000000 3665600000 3577600000 3472500000 4396200000 3932400000 3748600000 2827300000 5104600000 4876100000 5139800000 7410 365 6918 66403;66404;66405;66406;66407;66408;66409;66410;66411;66412;66413;66414;66415;66416;66417;66418;66419;66420;66421;66422;66423;66424;66425;66426;66427 84526;84527;84528;84529;84530;84531;84532;84533;84534;84535;84536;84537;84538;84539;84540;84541;84542;84543;84544;84545;84546;84547;84548;84549;84550;84551;84552;84553;84554;84555;84556;84557;84558;84559;84560;84561;84562;84563;84564;84565;84566;84567;84568;84569 84546 44 DNFTLIPEGVNGIEER Unmodified 1801.8846 0.88464248 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 127.99 127.99 2;3 8.8568E-08 132021 QUIQUE_C1277_190116_001 118.2 93.643 13714000000 1226400000 1347800000 1233400000 1007300000 993070000 963100000 1098100000 1070500000 1295200000 633540000 1563800000 63704000 1218000000 7411 3050 6919 66428;66429;66430;66431;66432;66433;66434;66435;66436;66437;66438;66439;66440;66441;66442;66443;66444;66445;66446;66447;66448;66449;66450 84570;84571;84572;84573;84574;84575;84576;84577;84578;84579;84580;84581;84582;84583;84584;84585;84586;84587;84588;84589;84590;84591;84592;84593;84594;84595;84596;84597;84598;84599;84600;84601;84602;84603;84604 84576 35 DNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDR Unmodified 2642.0261 0.026056469 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.27 116.27 3 2.1838E-11 119702 QUIQUE_C1277_190116_001 105.92 102.65 351280000 35610000 64655000 45928000 48982000 49812000 54342000 51947000 0 0 0 0 0 0 7412 2533 6920 66451;66452;66453;66454;66455;66456;66457 84605;84606;84607;84608;84609;84610;84611;84612;84613 84606 9 DNGDGTHTVHYTPATDGPYTVAVK Unmodified 2515.1615 0.16154562 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 2 2 1 61.608 61.608 3;4 2.9332E-06 61433 QUIQUE_C1576_190116_001 44.711 40.548 166620000 0 0 0 0 0 0 91489000 0 0 32707000 0 0 42429000 7413 3061 6921 66458;66459;66460;66461;66462 84614;84615;84616;84617;84618;84619 84615 6 DNGIRPSSLEQMAK Unmodified 1544.7617 0.76169057 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 59.246 59.246 2;3 2.5428E-05 57600 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.265 78.037 1094000000 100130000 49262000 128530000 133200000 41435000 64195000 0 151080000 149500000 51236000 0 134830000 90606000 7414 2660 6922 66463;66464;66465;66466;66467;66468;66469;66470;66471;66472;66473;66474;66475;66476;66477;66478;66479;66480 84620;84621;84622;84623;84624;84625;84626;84627;84628;84629;84630;84631;84632;84633;84634;84635;84636;84637;84638;84639;84640 84638 21 DNHFAIFIIPQGR Unmodified 1526.7994 0.7993967 3609 Q8N6R0 METTL13 Methyltransferase-like protein 13 yes yes 0 0 0 1 116.25 116.25 3 0.012766 119996 QUIQUE_DMIX7_190116_001 41.621 28.854 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7415 3609 6923 66481 84641 84641 1 DNHLAIER Unmodified 966.48829 0.4882929 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.491 20.491 2 0.014542 13160 QUIQUE_C1403_190116_001 85.862 35.735 799690000 84356000 142390000 0 124800000 0 107010000 116630000 0 0 0 111220000 0 113280000 7416 4172;346 6924 66482;66483;66484;66485;66486;66487;66488 84642;84643;84644;84645;84646;84647;84648 84644 7 DNHLLGTFDLTGIPPAPR Unmodified 1933.0058 0.005760665 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 4 1 2 5 2 3 4 3 5 1 2 3 2 128.3 128.3 2;3 7.2134E-08 132210 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.77 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6926 66526 84709 84709 1 DNHVVAAGGVEK Unmodified 1194.5993 0.59929991 3124 Q15274 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.791 15.791 2 0.00053101 7942 QUIQUE_C1403_190116_001 100.07 74.45 226710000 0 0 0 78308000 42098000 29566000 0 76743000 0 0 0 0 0 7419 3124 6927 66527;66528;66529;66530 84710;84711;84712;84713 84710 4 DNIACVILTFK Unmodified 1292.6799 0.67985842 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 138.65 138.65 2 0.00091167 134789 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.058 56.364 270190000 0 0 37794000 37552000 45003000 34296000 35299000 0 0 20571000 30299000 29370000 0 7420 2024 6928 66531;66532;66533;66534;66535;66536;66537;66538;66539;66540 84714;84715;84716;84717;84718;84719;84720;84721;84722;84723 84721 8 DNIACVILTFKEPFGTEGR Unmodified 2166.0779 0.07793933 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 143.87 143.87 3 2.5881E-06 147043 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.64 93.247 223740000 0 0 0 0 0 0 0 65034000 51329000 0 57429000 49952000 0 7421 2024 6929 66541;66542;66543;66544 84724;84725;84726;84727;84728 84724 5 DNIDITLQWLIQHSK Unmodified 1822.9577 0.95774784 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.23 149.23 3 3.2214E-06 152207 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.2 85.921 269070000 33549000 25360000 30332000 15013000 26113000 26755000 32555000 11064000 22961000 0 27785000 17587000 0 7422 3808;4308 6930 66545;66546;66547;66548;66549;66550;66551;66552;66553;66554;66555;66556 84729;84730;84731;84732;84733;84734;84735;84736;84737;84738;84739;84740;84741 84737 13 DNIISDYDQIIDYVER Unmodified 1969.9269 0.92690122 3907 Q96MZ0;H0Y6A7;H0UIB3;Q5TE61;A0A087WWT8 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 167.86 167.86 2;3 3.6235E-13 175045 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Unmodified 1324.7463 0.7462985 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 41.716 41.716 2;3 0.001045 38347 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.7 94.798 18944000000 1592400000 1539700000 454560000 547610000 1353100000 0 1600200000 2261400000 2550900000 381450000 2225000000 2281600000 2156500000 7428 2762 6936 66601;66602;66603;66604;66605;66606;66607;66608;66609;66610;66611;66612;66613;66614;66615;66616;66617;66618;66619;66620;66621 84789;84790;84791;84792;84793;84794;84795;84796;84797;84798;84799;84800;84801;84802;84803;84804;84805;84806;84807;84808;84809 84806 7 DNITNNTAAATVR Unmodified 1359.6743 0.67425577 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7;F8VZV1 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 0 1 1 35.051 35.051 2 0.023846 30378 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.435 32.708 115800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26059000 89739000 7429 407 6937 66622;66623 84810;84811 84811 2 DNKIPSDLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQR Unmodified 4172.1933 0.19329325 686 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85113 291 DNLAQQSFNMEQANYTIQSLK Unmodified 2442.1485 0.14853809 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 132.45 132.45 2 8.2943E-65 136107 QUIQUE_C1403_190116_001 174.62 162.47 32488000 0 0 0 32488000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7436 4359 6943 66846 85204 85204 1 DNLEFFLAGIGR Unmodified 1350.6932 0.6932003 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.13 153.13 2 7.4933E-28 155542 QUIQUE_C1563_190116_001 179.81 165.04 1570800000 108230000 124310000 125430000 113530000 135680000 110010000 145590000 108180000 117200000 70858000 154960000 154630000 102140000 7437 2524 6944 66847;66848;66849;66850;66851;66852;66853;66854;66855;66856;66857;66858;66859 85205;85206;85207;85208;85209;85210;85211;85212;85213;85214;85215;85216;85217;85218;85219;85220;85221;85222 85212 17 DNLEWLAR Unmodified 1015.5087 0.50869399 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.105 91.105 2 0.014857 93681 QUIQUE_C1368_190116_001 129.56 90.772 356340000 0 0 90958000 78461000 0 0 0 0 75982000 0 0 0 110940000 7438 3954 6945 66860;66861;66862;66863 85223;85224;85225;85226 85223 1 DNLFEIITSSR Unmodified 1293.6565 0.65648044 83 A0A087WZ32;A0A087X038;A8K727;Q9HB19 PLEKHA2 Pleckstrin homology domain-containing family A member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.21 141.21 2 0.0019552 145973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.335 8.9704 156160000 13973000 0 26623000 22026000 0 19112000 22286000 17740000 19890000 0 0 0 14512000 7439 83 6946 66864;66865;66866;66867;66868;66869;66870;66871;66872;66873 85227;85228;85229;85230;85231;85232;85233;85234;85235;85236 85234 10 DNLFEIVTTSR Unmodified 1293.6565 0.65648044 3290 Q5RGS4;Q9HB21 PLEKHA1 Pleckstrin homology domain-containing family A member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 124.41 124.41 2 0.0018061 130889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.261 13.703 24907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24907000 0 0 7440 3290 6947 66874;66875;66876 85237;85238;85239 85239 3 DNLHAVFCLAENSVGPNATRPDDIHLLYSGK Unmodified 3422.6677 0.66773719 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 134.62 134.62 4 1.1161E-30 139296 QUIQUE_C1277_190116_001 95.244 85.616 312560000 0 59677000 79924000 54795000 48901000 0 0 0 0 0 69265000 0 0 7441 3639 6948 66877;66878;66879;66880;66881 85240;85241;85242;85243;85244;85245;85246 85240 7 DNLHQIDAVEGPAAFLDILAPPYDPDDGR Unmodified 3133.4993 0.4992581 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 168.26 168.26 3 1.1526E-15 169725 QUIQUE_C1563_190116_001 78.311 72.216 126970000 0 0 29737000 25616000 0 71619000 0 0 0 0 0 0 0 7442 3944 6949 66882;66883;66884 85247;85248;85249 85249 3 DNLIVPILEEEVQNSVSGESEA Unmodified 2370.1438 0.14382987 4746 S4R3N1;Q9Y3A3;B4DM50 HSPE1-MOB4;MOB4 MOB-like protein phocein yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 173.03 173.03 2;3 5.9986E-05 177694 QUIQUE_C1368_190116_001 81.632 74.903 521480000 71527000 88845000 47211000 54657000 82723000 0 0 44600000 60842000 0 0 0 71078000 7443 4746 6950 66885;66886;66887;66888;66889;66890;66891;66892;66893;66894;66895;66896;66897 85250;85251;85252;85253;85254;85255;85256;85257;85258;85259;85260;85261;85262 85254 2 DNLSYIEHIFEISR Unmodified 1734.8577 0.85769944 3114 Q15121 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 150.37 150.37 2;3 2.1349E-170 154542 QUIQUE_C1277_190116_001 265.22 241.37 9571100000 887540000 928800000 854230000 614360000 942750000 790490000 913870000 357930000 786240000 244050000 790430000 616870000 843570000 7444 3114 6951 66898;66899;66900;66901;66902;66903;66904;66905;66906;66907;66908;66909;66910;66911;66912;66913;66914;66915;66916;66917;66918;66919;66920;66921;66922;66923;66924 85263;85264;85265;85266;85267;85268;85269;85270;85271;85272;85273;85274;85275;85276;85277;85278;85279;85280;85281;85282;85283;85284;85285;85286;85287;85288;85289;85290;85291;85292;85293;85294;85295;85296;85297;85298;85299;85300 85269 38 DNLTLWTSDMQGDGEEQNK Oxidation (M) 2195.9277 0.92770586 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 93.324 93.324 2 3.1774E-172 96484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 242.79 231.85 1453400000 129800000 153960000 130530000 121780000 101570000 169730000 104350000 69419000 89612000 131870000 80043000 66580000 104140000 7445 2745 6952 66925;66926;66927;66928;66929;66930;66931;66932;66933;66934;66935;66936;66937;66938;66939 85301;85302;85303;85304;85305;85306;85307;85308;85309;85310;85311;85312;85313;85314;85315;85316;85317;85318;85319;85320;85321;85322;85323 85320 2175 23 DNLTLWTSDMQGDGEEQNK Unmodified 2179.9328 0.93279124 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 0 4 3 2 3 3 4 2 1 2 3 2 2 2 114.49 114.49 2;3 5.7355E-134 117092 QUIQUE_DMIX7_190116_001 280.9 265.87 6594900000 899830000 781100000 604980000 725140000 465930000 900070000 569980000 261590000 271800000 253480000 248250000 253170000 359560000 7446 2745 6952 66940;66941;66942;66943;66944;66945;66946;66947;66948;66949;66950;66951;66952;66953;66954;66955;66956;66957;66958;66959;66960;66961;66962;66963;66964;66965;66966;66967;66968;66969;66970;66971;66972 85324;85325;85326;85327;85328;85329;85330;85331;85332;85333;85334;85335;85336;85337;85338;85339;85340;85341;85342;85343;85344;85345;85346;85347;85348;85349;85350;85351;85352;85353;85354;85355;85356;85357;85358;85359;85360;85361;85362;85363;85364;85365;85366;85367;85368;85369;85370;85371;85372;85373 85369 49 DNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ Unmodified 3450.4641 0.46413074 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 140.79 140.79 2;3 6.9608E-53 143168 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.33 181.78 1937100000 103430000 136520000 96225000 108470000 99709000 90201000 124170000 270180000 171330000 0 216820000 321720000 198310000 7447 2745 6953 66973;66974;66975;66976;66977;66978;66979;66980;66981;66982;66983;66984;66985;66986;66987 85374;85375;85376;85377;85378;85379;85380;85381;85382;85383;85384;85385;85386;85387;85388;85389 85383 15 DNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ Oxidation (M) 3466.459 0.45904536 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.48 129.48 3 2.2839E-24 131862 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.595 83.783 802230000 0 42955000 0 39129000 78871000 0 54898000 115290000 112880000 0 102780000 163160000 92259000 7448 2745 6953 66988;66989;66990;66991;66992;66993;66994;66995;66996 85390;85391;85392;85393;85394;85395;85396;85397;85398;85399;85400 85394 2175 11 DNLTLWTSDQQDDDGGEGNN Unmodified 2192.873 0.87302775 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 127.35 127.35 2 0.00031844 130353 QUIQUE_C1403_190116_001 100.69 92.179 802230000 61032000 70436000 0 48664000 78534000 75524000 86727000 58029000 37193000 0 119720000 91134000 75236000 7449 2736 6954 66997;66998;66999;67000;67001;67002;67003;67004;67005;67006;67007;67008 85401;85402;85403;85404;85405;85406;85407;85408;85409;85410;85411;85412;85413 85404 12 DNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN Unmodified 2407.9888 0.98878579 2780 P63104;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 132.04 132.04 2;3 2.017E-13 136438 QUIQUE_C1218_190116_001 149.3 148.96 417580000 47803000 0 0 74948000 41289000 70559000 46111000 0 24521000 0 0 68917000 43431000 7450 2780 6955 67009;67010;67011;67012;67013;67014;67015;67016;67017;67018;67019;67020 85414;85415;85416;85417;85418;85419;85420;85421;85422;85423;85424;85425;85426;85427 85414 14 DNLTLWTSENQGDEGDAGEGEN Unmodified 2349.9469 0.94692097 2341 P31946 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 126.43 126.43 2 2.702E-08 133621 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.22 123.9 525940000 0 61064000 33466000 45159000 52768000 41931000 46044000 38175000 35631000 0 45543000 63690000 62471000 7451 2341 6956 67021;67022;67023;67024;67025;67026;67027;67028;67029;67030;67031;67032 85428;85429;85430;85431;85432;85433;85434;85435;85436;85437;85438;85439;85440;85441;85442;85443 85439 14 DNMSVILICFPNAPK Oxidation (M) 1733.8481 0.84806274 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 126.92 126.92 2 0.0015748 131392 QUIQUE_C1368_190116_001 70.488 48.15 171030000 29125000 31436000 43317000 0 0 30733000 36415000 0 0 0 0 0 0 7452 2387 6957 67033;67034;67035;67036;67037 85444;85445;85446;85447;85448;85449 85447 1793 6 DNMSVILICFPNAPK Unmodified 1717.8531 0.85314811 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 141.13 141.13 2 3.5455E-13 146262 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dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 3 1 2 1 1 2 2 1 1 1 173.11 173.11 3 2.2567E-12 177571 QUIQUE_C1218_190116_001 68.207 61.254 1027400000 87662000 71351000 184570000 25691000 107850000 65531000 106800000 61814000 129310000 0 61900000 56998000 67932000 7458 2013 6962 67063;67064;67065;67066;67067;67068;67069;67070;67071;67072;67073;67074;67075;67076;67077;67078;67079;67080 85478;85479;85480;85481;85482;85483;85484;85485;85486;85487;85488;85489;85490;85491;85492;85493;85494;85495;85496;85497;85498 85478 1314 17 DNNPVVVLENELMYGVPFEFPPEAQSK Unmodified 3061.4743 0.47428891 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 176.04 176.04 3 2.788E-27 180038 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.01 99.107 1828200000 36848000 72097000 235450000 0 70626000 0 128430000 124850000 341410000 0 351620000 295800000 171100000 7459 2013 6962 67081;67082;67083;67084;67085;67086;67087;67088;67089;67090;67091;67092;67093;67094;67095;67096;67097;67098;67099;67100;67101 85499;85500;85501;85502;85503;85504;85505;85506;85507;85508;85509;85510;85511;85512;85513;85514;85515;85516;85517;85518;85519;85520;85521 85514 21 DNNQFASASLDR Unmodified 1336.6008 0.60075648 2380 P35606;D6R997 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.557 53.557 2 8.0965E-05 51757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.77 110.54 560360000 0 0 0 0 91750000 80757000 72677000 69092000 0 0 105350000 61857000 78878000 7460 2380 6963 67102;67103;67104;67105;67106;67107;67108 85522;85523;85524;85525;85526;85527;85528;85529 85525 7 DNPGVVTCLDEAR Unmodified 1444.6616 0.66164217 2197 P22314;Q5JRR9;Q5JRS0 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 3 1 1 1 1 1 1 1 69.364 69.364 2 1.4861E-07 68914 QUIQUE_C1403_190116_001 132.32 115.09 3588000000 0 404700000 348970000 377700000 483920000 358450000 465700000 147250000 89472000 126300000 249700000 222770000 313030000 7461 2197 6964 67109;67110;67111;67112;67113;67114;67115;67116;67117;67118;67119;67120;67121;67122;67123;67124 85530;85531;85532;85533;85534;85535;85536;85537;85538;85539;85540;85541;85542;85543;85544;85545;85546;85547;85548;85549;85550;85551;85552;85553 85535 22 DNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDR Unmodified 3404.6121 0.61205603 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;U3KQJ2;A0A3B3IU26;B1AN86 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 146.46 146.46 3 1.0458E-08 142470 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.783 49.816 63074000 0 0 0 0 0 0 0 0 50170000 12904000 0 0 0 7462 345 6965 67125;67126 85554;85555 85555 1 DNPHFQSGETSIVISDVLK Unmodified 2085.0378 0.037848654 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7;H0YKB1;H0YLT6 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 114.54 114.54 3 1.2126E-05 119512 QUIQUE_C1438_190116_001 65.954 57.135 307310000 71494000 0 0 0 67585000 0 0 67397000 0 44557000 0 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yes yes 0 0 0 1 79.396 79.396 2 0.044864 80728 QUIQUE_C1218_190116_001 49.536 35.888 16651000 16651000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7466 3802 6969 67147 85580 85580 1 DNPLNEGTDAAR Unmodified 1271.5742 0.57420737 637 B5MCD7;O43759 SYNGR1 Synaptogyrin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.315 38.315 2 0.00052969 35196 QUIQUE_C1218_190116_001 99.568 84.308 1471700000 113420000 146920000 132660000 111410000 143090000 96488000 145180000 104990000 109480000 0 143670000 114920000 109460000 7467 637 6970 67148;67149;67150;67151;67152;67153;67154;67155;67156;67157;67158;67159;67160 85581;85582;85583;85584;85585;85586;85587;85588;85589;85590;85591;85592;85593;85594;85595;85596;85597;85598;85599;85600;85601;85602 85581 19 DNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTK Unmodified 3548.8304 0.83036907 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 1 1 137.14 137.14 4 0.0001555 141645 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.456 36.641 87876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87876000 0 7468 1506 6971 67161 85603 85603 1 DNSGMIDKNELK Unmodified 1362.6449 0.64492948 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 31.388 31.388 2;3 0.00096031 25808 QUIQUE_C1563_190116_001 119.27 87.34 1040300000 148750000 161140000 90536000 92957000 133140000 89006000 106910000 30161000 53388000 0 61472000 0 72812000 7469 1623 6972 67162;67163;67164;67165;67166;67167;67168;67169;67170;67171;67172;67173;67174;67175 85604;85605;85606;85607;85608;85609;85610;85611;85612;85613;85614;85615;85616;85617 85612 13 DNSLFVPTPVQR Unmodified 1371.7147 0.71466402 3296 Q5SRE7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.109 90.109 2 0.00030253 93679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.7 99.028 1093300000 0 76770000 89189000 0 128900000 0 162450000 85240000 0 0 228700000 0 322100000 7470 3296 6973 67176;67177;67178;67179;67180;67181;67182 85618;85619;85620;85621;85622;85623;85624;85625 85624 7 DNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLR Unmodified 2588.1498 0.14980042 167;2126 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1;P17612;Q15136;K7ERP6 PRKACB;PRKACA;KIN27 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta;cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 162.55 162.55 2;3 2.8097E-45 169819 QUIQUE_DMIX5_190116_001 173.36 154.52 1028300000 0 93867000 131110000 49664000 52827000 40821000 0 0 192880000 0 346230000 0 120900000 7471 167;2126 6974 67183;67184;67185;67186;67187;67188;67189;67190;67191 85626;85627;85628;85629;85630;85631;85632;85633;85634 85633 9 DNSQVNAVTVLTLLDK Unmodified 1728.9258 0.92577901 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 152.74 152.74 2 0.010852 160358 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.649 50.662 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7472 1751 6975 67192 85635 85635 1 DNSTMGYMAAK Oxidation (M) 1203.49 0.49000874 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 24.779 24.779 2 0.00053774 17838 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1 15.605 15.605 2 0.0018557 7609 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.862 77.521 112100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112100000 0 0 0 7475 1931 6976 67217 85668 85668 1159;1160 1 DNSTMGYMMAK Unmodified 1247.4985 0.49846494 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.127 63.127 2 0.0013193 61588 QUIQUE_C1563_190116_001 86.67 68.762 470870000 60888000 87250000 0 90936000 0 73638000 0 51643000 48169000 0 0 0 58349000 7476 1938 6977 67218;67219;67220;67221;67222;67223;67224 85669;85670;85671;85672;85673;85674;85675;85676 85673 5 DNSTMGYMMAK 3 Oxidation (M) 1295.4832 0.4832088 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 3 0 1 1 15.705 15.705 2 0.0021927 8183 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.168 76.272 79308000 0 0 0 0 0 0 0 24799000 0 54509000 0 0 0 7477 1938 6977 67225;67226 85677;85678 85677 1175;1176;1177 2 DNTIEHLLPLFLAQLK Unmodified 1864.0458 0.045834566 2309 P30153;B3KQV6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 3 1 1 1 2 1 168.17 168.17 2;3 1.2347E-28 162303 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.57 140.08 12213000000 1173400000 1405600000 3524200000 1107500000 846130000 2753900000 0 150640000 243620000 102050000 0 698180000 208160000 7478 2309 6978 67227;67228;67229;67230;67231;67232;67233;67234;67235;67236;67237;67238;67239;67240;67241 85679;85680;85681;85682;85683;85684;85685;85686;85687;85688;85689;85690;85691;85692;85693 85690 10 DNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVR Unmodified 2749.4109 0.41090079 2309 P30153;B3KQV6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 3 2 163.64 163.64 3;4 1.627E-179 168285 QUIQUE_DMIX3_190116_001 235.76 228.22 12365000000 410630000 601680000 1040400000 440160000 910500000 430410000 1409300000 805320000 782350000 52398000 990070000 2810500000 1681600000 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77.4 2;3 3.1962E-13 77982 QUIQUE_C1277_190116_001 109.79 79.986 257360000 64124000 0 0 0 0 0 106980000 0 0 0 86251000 0 0 7483 3726 6983 67304;67305;67306;67307;67308;67309;67310;67311;67312 85781;85782;85783;85784;85785;85786;85787;85788;85789 85783 9 DNTTLLTQVQTTMR Oxidation (M) 1636.809 0.80903469 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.692 76.692 2 2.416E-10 76302 QUIQUE_C1563_190116_001 134.75 93.354 631860000 83227000 89919000 57234000 54711000 43346000 48436000 0 41038000 54427000 29682000 58956000 38724000 32162000 7484 3011 6984 67313;67314;67315;67316;67317;67318;67319;67320;67321;67322;67323;67324;67325 85790;85791;85792;85793;85794;85795;85796;85797;85798;85799;85800;85801;85802 85795 2458 13 DNTTLLTQVQTTMR Unmodified 1620.8141 0.81412007 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.37 106.37 2 1.7039E-17 109465 QUIQUE_C1403_190116_001 151.98 135.72 2293800000 277340000 295640000 0 274080000 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161680000 7491 959 6990 67393;67394;67395;67396;67397;67398;67399;67400;67401;67402;67403;67404;67405 85875;85876;85877;85878;85879;85880;85881;85882;85883;85884;85885;85886;85887;85888;85889;85890;85891;85892;85893;85894;85895;85896 85891 19 DNYLFLK Unmodified 911.47527 0.4752686 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.461 90.461 2 0.02099 93579 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.42 69.828 6052500000 513390000 311520000 360740000 495600000 500640000 543110000 677510000 0 385520000 394570000 678380000 512240000 679310000 7492 4560 6991 67406;67407;67408;67409;67410;67411;67412;67413;67414;67415;67416;67417 85897;85898;85899;85900;85901;85902;85903;85904;85905;85906;85907;85908;85909;85910;85911;85912;85913;85914;85915;85916;85917;85918;85919;85920 85914 24 DNYSPGWK Unmodified 965.4243 0.42429566 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 42.353 42.353 2 0.027098 36837 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.984 60.514 45836000 29368000 0 0 0 0 0 0 0 0 16468000 0 0 0 7493 1929 6992 67418;67419 85921;85922 85922 2 DNYVPEVSALDQEIIEVDPDTK Unmodified 2488.1857 0.18569468 1183 H3BNC9;P08708;H0YN88;A0A075B716 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 153.42 153.42 2;3 9.1748E-05 158610 QUIQUE_C1368_190116_001 67.605 56.661 175560000 50993000 0 25023000 0 0 49960000 24430000 0 0 25148000 0 0 0 7494 1183 6993 67420;67421;67422;67423;67424;67425;67426 85923;85924;85925;85926;85927;85928;85929 85925 6 DNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLK Unmodified 2989.4478 0.44779938 1183 H3BNC9;P08708;H0YN88;A0A075B716 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 1 1 153.89 153.89 3 0.0070575 156557 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.835 27.74 33769000 0 0 0 0 0 0 0 33769000 0 0 0 0 0 7495 1183 6994 67427 85930 85930 1 DPAAAPATGNR Unmodified 1039.5047 0.50467125 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 13.705 13.705 2 0.048528 5638 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2 yes yes 0 0 0 1 49.33 49.33 2 0.00061849 46763 QUIQUE_C1403_190116_001 78.486 67.538 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7501 3612 7000 67468 85976 85976 1 DPAGIFELVELVGNGTYGQVYK Unmodified 2368.1951 0.19507758 4473 Q9UKE5;C9JVV1 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes no 0 0 0 1 1 173.29 173.29 3 5.2292E-05 176659 QUIQUE_C1277_190116_001 48.229 44.425 11565000 0 8129600 0 0 0 0 0 0 0 3435400 0 0 0 7502 4473 7001 67469;67470 85977;85978 85977 2 DPASDQMQHWK Unmodified 1341.5772 0.57718426 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 42.173 42.173 2 0.003944 39005 QUIQUE_C1277_190116_001 72.638 53.367 106940000 0 34509000 30414000 0 0 42020000 0 0 0 0 0 0 0 7503 1849 7002 67471;67472;67473;67474 85979;85980;85981;85982 85980 3 DPASDQMQHWK Oxidation (M) 1357.5721 0.57209888 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 1 0 1 20.801 20.801 2 0.054434 13502 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.39 35.239 10077000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10077000 0 0 0 7504 1849 7002 67475 85983 85983 1 DPASGTALQEISFWLNLER Unmodified 2146.0695 0.069483134 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 172.54 172.54 2;3 8.7291E-05 176348 QUIQUE_DMIX7_190116_001 109.22 77.581 78554000 0 0 0 0 0 0 0 0 10194000 0 25119000 43241000 0 7505 3053 7003 67476;67477;67478;67479 85984;85985;85986;85987 85987 4 DPCPHQVDCFLSR Unmodified 1629.7028 0.70279548 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 65.592 65.592 2;3 0.010833 64834 QUIQUE_C1368_190116_001 66.289 51.598 86670000 0 27665000 15575000 0 0 32962000 0 0 0 10468000 0 0 0 7506 2123 7004 67480;67481;67482;67483 85988;85989;85990;85991 85989 4 DPCPHQVDCFLSRPTEK Unmodified 2084.9408 0.94079392 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.748 55.748 3 0.00020954 54353 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.449 62.582 444440000 0 57578000 81826000 57001000 42234000 47704000 75817000 82278000 0 0 0 0 0 7507 2123 7005 67484;67485;67486;67487;67488;67489;67490;67491 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Unmodified 2025.0452 0.045242218 3645 Q8NEU8;H0YH86;F8VS86 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 169.99 169.99 2;3 3.5808E-09 171575 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.42 103.91 52306000 11032000 12039000 0 6695600 0 0 0 18150000 0 4390100 0 0 0 7523 3645 7019 67660;67661;67662;67663;67664;67665 86252;86253;86254;86255;86256;86257 86256 5 DPEAPIFQVADYGIVADLFK Unmodified 2207.115 0.11503634 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL83 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 173.95 173.95 2;3 4.0254E-09 175244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.37 120.81 1572700000 67375000 103510000 121120000 25763000 157290000 0 305720000 140680000 213380000 10328000 176010000 180810000 70758000 7524 2067 7020 67666;67667;67668;67669;67670;67671;67672;67673;67674;67675;67676;67677;67678;67679;67680;67681;67682;67683;67684;67685;67686 86258;86259;86260;86261;86262;86263;86264;86265;86266;86267;86268;86269;86270;86271;86272;86273;86274;86275;86276;86277;86278;86279;86280 86270 23 DPECLLVATDR Unmodified 1287.6129 0.61290107 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.089 79.089 2 0.00012016 78575 QUIQUE_C1563_190116_001 130.66 108.42 811340000 127060000 115110000 103610000 87449000 83384000 141750000 81932000 0 0 38573000 0 32477000 0 7525 3859 7021 67687;67688;67689;67690;67691;67692;67693;67694;67695 86281;86282;86283;86284;86285;86286;86287;86288;86289 86286 8 DPECLLVATDRDPWHPLSDGSR Unmodified 2535.1812 0.1812352 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 111.33 111.33 3 2.7717E-08 115912 QUIQUE_C1218_190116_001 88.872 80.481 121870000 57488000 0 64383000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7526 3859 7022 67696;67697 86290;86291;86292 86291 3 DPEEIEKEEQAAAEK Unmodified 1714.7897 0.78973904 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 1 1 1 1 1 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42.802 2;3 0.00047841 38599 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.97 78.546 3326200000 211940000 235060000 275290000 390400000 424170000 231030000 487580000 121710000 198140000 48889000 221860000 193530000 286610000 7545 50;2631 7041 67826;67827;67828;67829;67830;67831;67832;67833;67834;67835;67836;67837;67838;67839;67840;67841;67842;67843;67844;67845;67846 86465;86466;86467;86468;86469;86470;86471;86472;86473;86474;86475;86476;86477;86478;86479;86480;86481;86482;86483;86484;86485;86486;86487;86488;86489;86490;86491;86492;86493;86494 86492 28 DPILFPSFIHSQK Unmodified 1527.8086 0.80856441 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 110.75 110.75 2;3 0.00011524 114345 QUIQUE_C1403_190116_001 92.856 75.455 1296200000 156490000 126490000 122440000 112410000 259210000 125820000 0 40969000 77303000 63583000 99759000 0 111710000 7546 1849 7042 67847;67848;67849;67850;67851;67852;67853;67854;67855;67856;67857;67858;67859;67860 86495;86496;86497;86498;86499;86500;86501;86502;86503;86504;86505;86506;86507;86508;86509;86510;86511;86512;86513;86514;86515;86516;86517;86518 86505 22 DPIVNVWYSVNGER Unmodified 1646.8053 0.80526994 2988 Q13347;Q5TFK1 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes no 0 0 0 1 20.765 20.765 3 0.052521 13937 QUIQUE_DMIX1_190116_001 20.236 0 58138000 0 0 0 0 0 0 0 58138000 0 0 0 0 0 7547 2988 7043 67861 86519 86519 1 DPLADLNIK Unmodified 997.54441 0.5444108 907 E9PDG8;O60641 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.312 89.312 2 0.0078419 92712 QUIQUE_C1218_190116_001 80.455 52.826 190930000 74700000 39237000 0 38475000 20671000 17846000 0 0 0 0 0 0 0 7548 907 7044 67862;67863;67864;67865;67866 86520;86521;86522;86523;86524;86525 86521 6 DPLADLNIKDFL Unmodified 1372.7238 0.72383172 907 E9PDG8;O60641 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.82 163.82 2 8.1814E-12 167396 QUIQUE_C1277_190116_001 155.11 136.44 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DPLYIGLR Unmodified 945.52837 0.5283668 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.776 88.776 2 0.0055063 89793 QUIQUE_C1563_190116_001 105.2 75.89 91612000 0 15839000 23518000 0 17023000 19764000 15468000 0 0 0 0 0 0 7559 2504 7055 67940;67941;67942;67943;67944;67945 86621;86622;86623;86624;86625;86626;86627 86626 7 DPNAFLFDHLLTLKPVK Unmodified 1967.088 0.088033731 3439 Q7L2H7;J3KNJ2;H0YCQ8 EIF3M Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.34 133.34 3 8.6942E-06 137983 QUIQUE_C1368_190116_001 101.67 97.571 769870000 137090000 90313000 127460000 75067000 97849000 0 99322000 0 45520000 40913000 0 0 56339000 7560 3439 7056 67946;67947;67948;67949;67950;67951;67952;67953;67954 86628;86629;86630;86631;86632;86633;86634;86635;86636 86630 9 DPNIVIAK Unmodified 868.50182 0.5018177 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.682 40.682 2 0.0078552 35434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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86901 5 DPSIHSVNVFQGHTDTVTSAVFTVGDNVVSGSDDR Unmodified 3658.7136 0.71356099 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 134.58 134.58 4 6.753E-05 130817 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.662 31.33 35320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35320000 0 0 0 7584 498 7079 68154 86904 86904 1 DPSLLINACLNK Unmodified 1356.7071 0.7071358 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 1 1 99.293 99.293 2 0.0040362 101080 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.806 74.037 40162000 0 0 0 0 0 14969000 0 25193000 0 0 0 0 0 7585 4137 7080 68155;68156 86905;86906 86906 1 DPSLPLLELQDIMTSVSGR Unmodified 2070.0667 0.066705942 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 173.72 173.72 2 1.4536E-37 178009 QUIQUE_C1218_190116_001 194.85 182.49 57581000 19266000 16073000 0 0 10317000 0 0 0 11925000 0 0 0 0 7586 2964 7081 68157;68158;68159;68160 86907;86908;86909;86910 86907 4 DPSQELEFIADILNQDAK Unmodified 2044.9953 0.99531514 2525 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mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 166.39 166.39 2 0.00024716 160320 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.24 93.48 35827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10381000 0 25446000 0 7594 2188 7089 68254;68255;68256;68257;68258 87021;87022;87023;87024;87025 87023 4 DPTFIPAPIQAK Unmodified 1296.7078 0.70778773 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.688 93.688 2 0.00088269 94881 QUIQUE_C1563_190116_001 86.136 68.662 498790000 0 81809000 0 37334000 67791000 54077000 46864000 38869000 0 25703000 65080000 41901000 39362000 7595 1801 7090 68259;68260;68261;68262;68263;68264;68265;68266;68267;68268;68269;68270;68271 87026;87027;87028;87029;87030;87031;87032;87033;87034;87035;87036;87037;87038;87039;87040 87033 14 DPTSLLGVLQAEADSTSEGLEDAVHSR Unmodified 2796.3414 0.34136048 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.65 166.65 3 4.7676E-09 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87147;87148;87149;87150;87151;87152;87153;87154;87155;87156;87157;87158;87159;87160;87161;87162;87163 87157 17 DPWHPLSDGSR Unmodified 1265.5789 0.57889882 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 51.333 51.333 2;3 0.014019 48700 QUIQUE_C1277_190116_001 58.955 41.724 347310000 106640000 104250000 0 0 0 0 0 61780000 48618000 26026000 0 0 0 7605 3859 7100 68348;68349;68350;68351;68352 87164;87165;87166;87167;87168 87165 5 DPWPVPQGK Unmodified 1022.5185 0.5185304 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 62.232 62.232 2 0.018094 62253 QUIQUE_C1438_190116_001 64.567 49.898 40176000 0 0 0 0 30493000 0 0 0 0 9683500 0 0 0 7606 1007 7101 68353;68354 87169;87170;87171 87169 3 DPWYSWDQPGLR Unmodified 1518.6892 0.68917755 1710 O95169;E9PQ68;K9J7I2 NDUFB8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.4 126.4 2 0.0029836 131016 QUIQUE_C1368_190116_001 106.2 90.308 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Unmodified 1853.8982 0.89818405 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 124.82 124.82 2;3 7.1622E-257 121759 QUIQUE_DMIX4_190116_001 296.28 279.9 2508800000 381620000 316290000 268130000 87809000 240650000 95765000 238260000 201990000 148350000 189160000 190580000 150180000 0 7613 3117 7105 68440;68441;68442;68443;68444;68445;68446;68447;68448;68449;68450;68451;68452;68453;68454;68455;68456;68457 87281;87282;87283;87284;87285;87286;87287;87288;87289;87290;87291;87292;87293;87294;87295;87296;87297;87298;87299;87300;87301;87302;87303;87304;87305;87306;87307 87301 26 DPYTGQSVSLFQALK Unmodified 1652.841 0.84098675 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.68 128.68 2 4.2214E-29 133337 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.11 153.16 6896000000 579660000 631460000 683940000 254110000 596360000 261500000 602810000 386810000 606730000 448340000 799900000 612150000 432220000 7614 3117 7106 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Unmodified 1361.6398 0.63978452 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.444 97.444 2 4.094E-08 100109 QUIQUE_C1277_190116_001 152.34 126.78 914110000 0 97280000 102420000 92332000 0 79780000 99791000 85694000 0 0 139260000 104790000 112760000 7617 1472 7109 68487;68488;68489;68490;68491;68492;68493;68494;68495 87349;87350;87351;87352;87353;87354;87355;87356;87357;87358 87350 10 DQAGEYECSAENDVSFPDVR Unmodified 2286.9335 0.93351952 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 106.64 106.64 2;3 1.0246E-87 111693 QUIQUE_C1438_190116_001 202.82 190.46 481670000 28509000 93120000 96833000 93107000 50066000 38840000 81195000 0 0 0 0 0 0 7618 3455 7110 68496;68497;68498;68499;68500;68501;68502;68503;68504;68505 87359;87360;87361;87362;87363;87364;87365;87366;87367;87368;87369 87367 11 DQALILMNAR Unmodified 1143.607 0.60702783 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 1 81.913 81.913 2 0.050783 83390 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87380;87381;87382;87383;87384;87385;87386;87387;87388;87389;87390;87391;87392;87393;87394;87395;87396;87397;87398;87399 87384 20 DQASQLLAGTEATLGHAK Unmodified 1809.9221 0.92209062 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.818 99.818 3 0.0012847 97579 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.427 44.088 310150000 0 0 0 0 67809000 0 0 56221000 70372000 26954000 88790000 0 0 7622 1492 7114 68532;68533;68534;68535;68536;68537 87400;87401;87402;87403;87404;87405 87403 5 DQAVENILVSPVVVASSLGLVSLGGK Unmodified 2550.4269 0.42686843 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PLA6 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 174.07 174.07 2;3 5.2099E-05 178636 QUIQUE_C1368_190116_001 46.938 44.014 229950000 0 0 20588000 0 96788000 0 85442000 0 0 0 27128000 0 0 7623 2565 7115 68538;68539;68540;68541;68542 87406;87407;87408;87409;87410;87411;87412 87406 7 DQDELKPGPTNR Unmodified 1368.6634 0.66335673 3045 Q14151 SAFB2 Scaffold attachment factor B2 yes yes 0 0 1 1 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68566;68567;68568;68569 87436;87437;87438;87439 87436 4 DQDLEPGAPSMGAK Oxidation (M) 1430.6348 0.63475872 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 31.367 31.367 2 0.00039439 26445 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.032 63.473 90014000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44454000 45560000 0 7630 1929 7122 68570;68571;68572;68573 87440;87441;87442;87443 87442 1155 4 DQDLEPGAPSMGAK Unmodified 1414.6398 0.6398441 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 52.003 52.003 2 0.045416 50922 QUIQUE_C1438_190116_001 48.468 22.084 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7631 1929 7122 68574 87444 87444 1 DQDLNTYSLLAVFAATDGGITR Unmodified 2340.1598 0.1597547 715 C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 170.57 170.57 2 1.4007E-20 176674 QUIQUE_C1438_190116_001 129.05 115.64 43635000 0 0 0 9059900 15002000 0 0 0 0 0 0 0 19573000 7632 715 7123 68575;68576;68577 87445;87446;87447 87446 3 DQDLTQEIAMEHFVK Unmodified 1802.8509 0.85089951 4496 Q9ULX6 AKAP8L A-kinase anchor protein 8-like yes yes 0 0 0 1 102.69 102.69 3 0.0025759 107679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.823 43.408 33454000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33454000 0 0 7633 4496 7124 68578 87448 87448 1 DQDNMQAELNR Unmodified 1332.5728 0.57282717 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.446 42.446 2 5.1575E-08 38899 QUIQUE_C1403_190116_001 150.66 141.15 248190000 23732000 21365000 30563000 32841000 0 0 30869000 0 33339000 0 36810000 38668000 0 7634 2355 7125 68579;68580;68581;68582;68583;68584;68585;68586;68587;68588 87449;87450;87451;87452;87453;87454;87455;87456;87457;87458;87459 87452 10 DQDTLIQHGIHDGLTVHLVIK Unmodified 2351.2597 0.25974352 4433 Q9UHD9 UBQLN2 Ubiquilin-2 yes yes 0 0 0 1 104.21 104.21 4 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ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 4 2 3 2 2 2 3 3 3 1 2 2 2 176.08 176.08 2;3 0 181073 QUIQUE_C1576_190116_001 336.68 286.57 24364000000 321340000 479830000 900930000 114930000 816480000 548020000 1602500000 961750000 2533600000 62343000 7384000000 7342800000 1296000000 7638 1900;1046 7129 68604;68605;68606;68607;68608;68609;68610;68611;68612;68613;68614;68615;68616;68617;68618;68619;68620;68621;68622;68623;68624;68625;68626;68627;68628;68629;68630;68631;68632;68633;68634 87476;87477;87478;87479;87480;87481;87482;87483;87484;87485;87486;87487;87488;87489;87490;87491;87492;87493;87494;87495;87496;87497;87498;87499;87500;87501;87502;87503;87504;87505;87506;87507;87508;87509;87510;87511;87512;87513 87494 37 DQELYFFHELSPGSCFFLPK Unmodified 2460.146 0.1460189 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 158.21 158.21 2;3 0.0011202 164061 QUIQUE_C1576_190116_001 58.831 54.201 65337000 0 0 0 0 0 0 35889000 29448000 0 0 0 0 0 7639 2253 7130 68635;68636;68637;68638;68639 87514;87515;87516;87517;87518 87517 5 DQEPIPQNIDR Unmodified 1323.6419 0.64189301 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 51.447 51.447 2 0.00045939 48785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.5 75.348 26366000 0 0 0 0 0 0 0 26366000 0 0 0 0 0 7640 1187 7131 68640 87519 87519 1 DQEPTTDMLK Unmodified 1176.5333 0.53325376 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 49.242 49.242 2 0.01605 47051 QUIQUE_C1368_190116_001 88.136 49.33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7641 2009 7132 68641 87520 87520 1 DQEVLLQTFLDDASPGDKR Unmodified 2146.0542 0.054227 1854 P04114;A8MUN2 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes no 0 0 1 1 111.29 111.29 2 0.051784 116662 QUIQUE_C1438_190116_001 36.982 20.844 34808000 0 0 0 0 34808000 0 0 0 0 0 0 0 0 7642 1854 7133 68642 87521 87521 1 DQEVLLQTGR Unmodified 1157.6041 0.60405094 2605;827 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68653;68654;68655;68656;68657;68658;68659;68660;68661;68662;68663;68664;68665;68666;68667;68668;68669;68670 87532;87533;87534;87535;87536;87537;87538;87539;87540;87541;87542;87543;87544;87545;87546;87547;87548;87549;87550;87551;87552;87553 87545 22 DQFGFINYEVGDSK Unmodified 1617.7311 0.73110195 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 122.6 122.6 2 0.0034612 126895 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.021 73.341 123260000 0 0 35916000 0 25264000 0 40006000 0 0 22070000 0 0 0 7646 1645 7137 68671;68672;68673;68674;68675 87554;87555;87556;87557;87558 87558 3 DQFNLIVFSTEATQWRPSLVPASAENVNK Unmodified 3260.6466 0.64659104 669 B7ZKJ8;Q14624;H7C0L5 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 1 1 1 1 159.7 159.7 3 1.6504E-25 166222 QUIQUE_C1438_190116_001 102.65 92.501 155360000 0 0 0 0 73701000 0 39250000 0 0 0 42405000 0 0 7647 669 7138 68676;68677;68678 87559;87560;87561;87562 87559 3 DQFNSHIQLVR Unmodified 1355.6946 0.69459728 964 E9PN76;Q8ND24 RNF214 RING finger protein 214 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.824 58.824 3 0.0026371 57575 QUIQUE_C1368_190116_001 63.624 52.305 126050000 0 23819000 22636000 0 0 0 22280000 0 25875000 0 31439000 0 0 7648 964 7139 68679;68680;68681;68682;68683;68684 87563;87564;87565;87566;87567;87568 87564 6 DQFPEVYVPTVFENYIADIEVDGK Unmodified 2786.3327 0.33269327 1937 Q5JR08;P08134;E9PQH6;Q5JR07;Q5JR05 RHOC Rho-related GTP-binding protein RhoC no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 173.15 173.15 2;3 4.7412E-07 177518 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.981 63.332 562190000 0 0 10099000 0 12962000 0 46289000 38005000 210670000 0 177720000 42070000 24378000 7649 1937 7140 68685;68686;68687;68688;68689;68690;68691;68692;68693;68694 87569;87570;87571;87572;87573;87574;87575;87576;87577;87578;87579 87574 11 DQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGK Unmodified 2772.317 0.31704321 2725 P61586;C9JNR4;C9JX21;C9JRM1 RHOA Transforming protein RhoA yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 171.71 171.71 2;3 1.1459E-13 174960 QUIQUE_C1277_190116_001 76.471 69.967 2483500000 56092000 58307000 81480000 18835000 183400000 52126000 166150000 207970000 554750000 7653800 619360000 204850000 272490000 7650 2725 7141 68695;68696;68697;68698;68699;68700;68701;68702;68703;68704;68705;68706;68707;68708;68709;68710;68711;68712;68713;68714 87580;87581;87582;87583;87584;87585;87586;87587;87588;87589;87590;87591;87592;87593;87594;87595;87596;87597;87598;87599;87600;87601;87602;87603;87604 87582 24 DQFSPDDFLGR Unmodified 1295.5782 0.57823012 3161 Q15811 ITSN1 Intersectin-1 no no 0 0 0 1 115.66 115.66 2 0.042645 117913 QUIQUE_C1563_190116_001 52.725 27.588 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 7651 3161 7142 68715 87605 87605 1 DQFTTTEVNMAR Unmodified 1411.6402 0.64017845 2729 P61758;B4DWR3 VBP1 Prefoldin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.252 66.252 2 0.0002832 64795 QUIQUE_C1563_190116_001 137.98 98.429 687380000 0 119130000 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A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RJE6;A0A2R8Y4X6;A0A2R8Y5E8;P12081;B3KWE1 HARS2;HARS Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial;Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.128 80.128 2 0.00169 81901 QUIQUE_C1576_190116_001 94.692 9.48 508920000 0 83870000 0 0 86170000 0 99932000 0 76731000 42919000 119300000 0 0 7655 413;2035 7146 68734;68735;68736;68737;68738;68739 87624;87625;87626;87627;87628;87629 87626 5 DQGGYTMHQDQEGDTDAGLK Oxidation (M) 2180.8917 0.8916547 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 31.227 31.227 2;3 1.2482E-24 26283 QUIQUE_C1218_190116_001 138.07 134.84 291090000 61853000 56237000 57028000 0 40726000 38215000 0 0 0 37034000 0 0 0 7656 291 7147 68740;68741;68742;68743;68744;68745;68746;68747 87630;87631;87632;87633;87634;87635;87636;87637;87638;87639 87630 217 10 DQGGYTMHQDQEGDTDAGLK Unmodified 2164.8967 0.89674008 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 43.867 43.867 2;3 4.3678E-10 40241 QUIQUE_C1403_190116_001 89.484 67.927 346830000 107130000 57854000 0 81435000 54851000 0 0 0 0 45556000 0 0 0 7657 291 7147 68748;68749;68750;68751;68752;68753;68754;68755 87640;87641;87642;87643;87644;87645;87646;87647;87648 87644 7 DQGPAVPEPLK Unmodified 1149.603 0.60298831 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.652 58.652 2 0.0025472 57721 QUIQUE_C1576_190116_001 77.662 40.104 670880000 82279000 69720000 0 82424000 68752000 60583000 65457000 0 74330000 21606000 0 62673000 83062000 7658 3889 7148 68756;68757;68758;68759;68760;68761;68762;68763;68764;68765 87649;87650;87651;87652;87653;87654;87655;87656;87657;87658;87659 87654 11 DQGPIVPAPVK Unmodified 1119.6288 0.62880913 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.683 51.683 2 0.0034836 49161 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regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 172.23 172.23 3 1.5994E-30 178285 QUIQUE_C1438_190116_001 96.123 78.476 39386000 0 0 0 0 39386000 0 0 0 0 0 0 0 0 7662 1615 7152 68783 87677 87677 1 DQGSYTCVASTELDQDLAK Unmodified 2099.9317 0.9317286 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.46 104.46 2 1.1054E-151 109031 QUIQUE_C1438_190116_001 236.55 205.48 668660000 77415000 91401000 0 74485000 74587000 58100000 98017000 0 26989000 16524000 63206000 41759000 46174000 7663 1214;1691 7153 68784;68785;68786;68787;68788;68789;68790;68791;68792;68793;68794 87678;87679;87680;87681;87682;87683;87684;87685;87686;87687;87688;87689;87690;87691;87692 87684 15 DQGTYEDYVEGLR Unmodified 1543.6791 0.67906638 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7;F8VPF3;F8VZU9;F8W180;H0YI43 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.59 103.59 2 7.5087E-08 108217 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.96 130.72 1575800000 211430000 192100000 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88132;88133;88134;88135;88136;88137;88138;88139;88140;88141;88142;88143;88144;88145;88146;88147;88148;88149;88150;88151;88152;88153;88154;88155;88156;88157;88158;88159;88160;88161;88162;88163;88164;88165;88166;88167;88168;88169;88170;88171;88172;88173;88174;88175;88176 88166 1214 43 DQQEAALVDMVNDGVEDLR Unmodified 2115.9743 0.97426212 1957 P09211;A8MX94 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 3 2 3 3 2 3 2 4 2 2 2 2 2 152.19 152.19 2;3 7.4864E-173 161734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 249.3 224.44 36347000000 2458300000 2540200000 3958100000 2880000000 2624800000 2194500000 2067000000 1986800000 3142000000 962190000 4580400000 2870800000 4082000000 7710 1957 7199 69168;69169;69170;69171;69172;69173;69174;69175;69176;69177;69178;69179;69180;69181;69182;69183;69184;69185;69186;69187;69188;69189;69190;69191;69192;69193;69194;69195;69196;69197;69198;69199 88177;88178;88179;88180;88181;88182;88183;88184;88185;88186;88187;88188;88189;88190;88191;88192;88193;88194;88195;88196;88197;88198;88199;88200;88201;88202;88203;88204;88205;88206;88207;88208;88209;88210;88211;88212;88213;88214;88215 88207 34 DQQPGTFLLR Unmodified 1173.6142 0.6142217 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.983 83.983 2 2.1789E-05 86208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.81 131.43 984720000 0 0 0 139570000 0 132550000 128140000 159210000 0 0 252710000 0 172540000 7711 2444 7200 69200;69201;69202;69203;69204;69205;69206;69207 88216;88217;88218;88219;88220;88221;88222;88223 88222 8 DQQQKPLYHHFTTAINTENIR Unmodified 2553.2724 0.27243347 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 3 1 2 2 57.419 57.419 3;4;5 1.3011E-43 55771 QUIQUE_C1277_190116_001 152.06 143.21 2031100000 39087000 59977000 88235000 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yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 82.355 82.355 1;2 9.6502E-14 82700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.91 191.13 22611000000 2797100000 2795500000 0 2129700000 2032500000 525490000 861650000 2838200000 2065200000 968840000 1295000000 2822400000 1479900000 7714 2661 7203 69241;69242;69243;69244;69245;69246;69247;69248;69249;69250;69251;69252;69253;69254;69255;69256;69257;69258;69259;69260 88264;88265;88266;88267;88268;88269;88270;88271;88272;88273;88274;88275;88276;88277;88278;88279;88280;88281;88282;88283;88284;88285;88286;88287;88288;88289;88290 88281 19 DQSGEYECSALNDVAAPDVR Unmodified 2194.9437 0.94369027 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.332 99.332 2 9.1787E-24 102896 QUIQUE_C1218_190116_001 171.46 159.1 519430000 63213000 81554000 102070000 71304000 66736000 51452000 83103000 0 0 0 0 0 0 7715 3092 7204 69261;69262;69263;69264;69265;69266;69267 88291;88292;88293;88294;88295;88296;88297 88291 7 DQSGVQELVK Unmodified 1101.5666 0.5666028 3374 Q6NXE6;B4E1N1;H0YH65 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 47.468 47.468 2 0.013549 44507 QUIQUE_C1368_190116_001 64.927 44.346 188580000 40666000 52923000 44021000 0 50968000 0 0 0 0 0 0 0 0 7716 3374 7205 69268;69269;69270;69271 88298;88299;88300;88301 88300 3 DQSTEQSPSDLPQR Unmodified 1586.7172 0.7172428 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 32.572 32.572 2 0.0007116 27765 QUIQUE_C1368_190116_001 82.171 66.631 8048500 0 0 8048500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7717 3891 7206 69272 88302 88302 1 DQTDDQVTIDSALATQK Unmodified 1847.8749 0.87486565 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 86.271 86.271 2;3 7.1613E-182 87479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 316.42 289.74 6094200000 599530000 606450000 674060000 564200000 469760000 638500000 437380000 278000000 342260000 314680000 473550000 355400000 340440000 7718 2518 7207 69273;69274;69275;69276;69277;69278;69279;69280;69281;69282;69283;69284;69285;69286;69287;69288;69289 88303;88304;88305;88306;88307;88308;88309;88310;88311;88312;88313;88314;88315;88316;88317;88318;88319;88320;88321;88322;88323;88324;88325;88326;88327;88328;88329;88330;88331;88332;88333;88334;88335;88336;88337;88338;88339 88325 34 DQTTSTTHINHISTVK Unmodified 1781.8908 0.89079049 3386 Q6P995 FAM171B Protein FAM171B yes yes 0 0 0 1 19.628 19.628 3 0.0079688 12376 QUIQUE_C1576_190116_001 43.767 27.102 41373000 0 0 0 0 0 0 41373000 0 0 0 0 0 0 7719 3386 7208 69290 88340 88340 1 DQVANSAFVER Unmodified 1234.5942 0.59421454 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.489 45.489 2 1.3943E-38 43012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.09 147.81 41951000000 2251300000 3235200000 2920100000 3738800000 3858300000 3889600000 4324300000 2125400000 3460200000 1050800000 4081200000 3679000000 3336900000 7720 1931 7209 69291;69292;69293;69294;69295;69296;69297;69298;69299;69300;69301;69302;69303 88341;88342;88343;88344;88345;88346;88347;88348;88349;88350;88351;88352;88353;88354;88355;88356;88357;88358;88359;88360;88361;88362;88363;88364;88365 88354 25 DQVAYLIQQNVIPPFCNLLTVK Unmodified 2572.3723 0.37233044 1420 O00629 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 168.59 168.59 3 1.4002E-05 170401 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.883 62.311 143310000 0 0 0 0 0 0 35467000 41801000 0 0 0 66038000 0 7721 1420 7210 69304;69305;69306 88366;88367;88368 88367 3 DQVDIAVQELLQLK Unmodified 1610.8879 0.88793694 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 162.2 162.2 2;3 1.4321E-05 169792 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.57 102.31 33984000 0 0 0 0 6218300 0 0 0 0 0 27766000 0 0 7722 1929 7211 69307;69308 88369;88370 88370 2 DQVDSYSLEAK Unmodified 1253.5776 0.57756142 507 F8W717;A0A3B3IU69;O00423;G3V500;G3V3N9 EML1 Echinoderm microtubule-associated protein-like 1 yes no 0 0 0 1 51.439 51.439 2 0.021396 48952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.14 53.711 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7723 507 7212 69309 88371 88371 1 DQVELVENMVTVGK Unmodified 1559.7865 0.78650834 4254 Q9NQE9 HINT3 Histidine triad nucleotide-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 121.2 121.2 2 0.0031702 123823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.189 70.582 363740000 0 73653000 81551000 81566000 0 0 0 86767000 0 40205000 0 0 0 7724 4254 7213 69310;69311;69312;69313;69314 88372;88373;88374;88375;88376 88375 2 DQVGEDNWQQFSEQFPPLLK Unmodified 2404.1335 0.13353995 1446 O14787;K7ESG1 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 1 1 1 158.2 158.2 2;3 7.6702E-13 163796 QUIQUE_C1218_190116_001 114.55 110.6 493000000 96379000 73300000 90706000 51854000 76594000 21942000 42565000 0 0 17448000 22208000 0 0 7725 1446 7214 69315;69316;69317;69318;69319;69320;69321;69322;69323;69324;69325;69326;69327;69328;69329 88377;88378;88379;88380;88381;88382;88383;88384;88385;88386;88387;88388;88389;88390;88391;88392;88393;88394 88379 17 DQVGGGGEFGGHDKPK Unmodified 1583.7328 0.73283328 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 1 1 1 1 1 16.157 16.157 2 3.0945E-12 8092 QUIQUE_C1277_190116_001 132.06 119.44 154220000 0 32725000 0 45692000 0 0 0 26511000 49290000 0 0 0 0 7726 4176 7215 69330;69331;69332;69333 88395;88396;88397;88398 88395 3 DQVGILAGWFK Unmodified 1232.6554 0.65535823 87 A0A087WZT0;M0QZ22;Q5PRF9;M0QY61;M0R0X3;M0QXV2 SAMD4B Protein Smaug homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 147.02 147.02 2 0.0061825 152686 QUIQUE_C1368_190116_001 81.972 61.272 9564200 0 0 9564200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7727 87 7216 69334;69335;69336 88399;88400;88401 88399 3 DQVLHEHIQR Unmodified 1273.6527 0.65273247 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.95 16.95 3 0.0015749 9125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.01 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1 1 73.64 73.64 2;3 1.6056E-153 73920 QUIQUE_C1277_190116_001 281.07 258.19 2365400000 287890000 216430000 263410000 282900000 237140000 217200000 219970000 84851000 121010000 126360000 104140000 90672000 113390000 7730 2051 7219 69363;69364;69365;69366;69367;69368;69369;69370;69371;69372;69373;69374;69375;69376;69377;69378;69379;69380;69381;69382 88429;88430;88431;88432;88433;88434;88435;88436;88437;88438;88439;88440;88441;88442;88443;88444;88445;88446;88447;88448;88449;88450;88451;88452;88453;88454 88434 25 DQVYPQYVIEYTEDK Unmodified 1888.8731 0.87307474 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 117.41 117.41 2 0.001076 121475 QUIQUE_C1277_190116_001 72.089 59.109 213380000 0 32818000 49657000 0 0 0 0 0 33433000 0 50057000 47415000 0 7731 3453 7220 69383;69384;69385;69386;69387 88455;88456;88457;88458;88459 88455 4 DQWAAAMTLR Unmodified 1161.5601 0.56007764 2711 P61086 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 95.083 95.083 2 0.010101 97854 QUIQUE_C1368_190116_001 69.276 47.748 130740000 0 0 42270000 0 0 0 43949000 0 0 0 0 0 44520000 7732 2711 7221 69388;69389;69390;69391;69392 88460;88461;88462;88463;88464 88460 4 DQWEDRIQVWHAEHR Unmodified 2003.9351 0.93505534 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 2 70.636 70.636 3;4 3.0897E-06 70095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.21 88.519 150270000 0 0 0 0 0 0 0 150270000 0 0 0 0 0 7733 859 7222 69393;69394 88465;88466;88467 88467 3 DQYANYVVQK Unmodified 1226.5932 0.5931519 976 E9PR38;H0YEH2;Q5T1Z4;Q5T1Z8;Q14671;H0YDK8;A0A0C4DG68;A0A0A0MR59;Q8TB72 PUM1;PUM2 Pumilio homolog 1;Pumilio homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.277 50.277 2 0.0075763 47988 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.968 43.886 210710000 33144000 36112000 31326000 42337000 0 0 0 26278000 0 0 0 0 41515000 7734 976 7223 69395;69396;69397;69398;69399;69400;69401 88468;88469;88470;88471;88472;88473;88474 88472 7 DQYELLCLDNTR Unmodified 1538.7035 0.70350699 1838 P02787;C9JVG0 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 108.12 108.12 2 5.4345E-13 112697 QUIQUE_C1218_190116_001 161.67 148.47 225380000 0 64057000 0 0 114680000 46646000 0 0 0 0 0 0 0 7735 1838 7224 69402;69403;69404;69405 88475;88476;88477;88478;88479 88475 5 DQYSVIFESGDR Unmodified 1414.6365 0.63647328 2674 P55884;C9JZG1;C9JQN7 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 95.138 95.138 2 0.0015977 97806 QUIQUE_C1368_190116_001 103.87 83.842 95637000 0 0 42078000 30036000 23523000 0 0 0 0 0 0 0 0 7736 2674 7225 69406;69407;69408;69409;69410 88480;88481;88482;88483;88484;88485 88482 4 DRAEWADIDPVPQNDGPNPVVQIIYSDK Unmodified 3150.5258 0.5258072 2525 P49354;E9PQP6 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 147.6 147.6 3 9.8943E-07 152731 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.463 50.797 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7737 2525 7226 69411 88486 88486 1 DRDDFPVVLVGNK Unmodified 1472.7623 0.7623425 1994 P10301 RRAS Ras-related protein R-Ras yes yes 0 0 1 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112130000 7740 921 7229 69425;69426;69427;69428;69429;69430;69431;69432;69433;69434;69435 88502;88503;88504;88505;88506;88507;88508;88509;88510;88511;88512 88511 11 DRDVTFSPATIENELIK Unmodified 1946.9949 0.99492121 559 A8K878;P55145;H7C2D6 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 1 1 1 1 127.42 127.42 3 0.00032219 132623 QUIQUE_C1368_190116_001 57.173 53.72 26218000 0 0 26218000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7741 559 7230 69436;69437;69438 88513;88514;88515 88514 3 DRDYSDHPSGGSYR Unmodified 1610.671 0.67096131 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 1 2 3 3 1 3 1 2 3 3 1 3 2 3 15.422 15.422 2;3;4 3.086E-57 8240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.07 163.11 3702000000 166150000 277740000 319270000 313930000 318180000 123010000 301690000 531390000 372900000 15548000 387210000 257820000 317120000 7742 2412;3840 7231 69439;69440;69441;69442;69443;69444;69445;69446;69447;69448;69449;69450;69451;69452;69453;69454;69455;69456;69457;69458;69459;69460;69461;69462;69463;69464;69465;69466;69467;69468 88516;88517;88518;88519;88520;88521;88522;88523;88524;88525;88526;88527;88528;88529;88530;88531;88532;88533;88534;88535;88536;88537;88538;88539;88540;88541;88542;88543;88544;88545 88531 28 DREDFVPFTGEK Unmodified 1438.6729 0.67285879 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 68.636 68.636 2;3 2.5166E-06 68453 QUIQUE_C1368_190116_001 142.83 102.91 4395500000 255890000 937470000 768270000 295900000 468190000 0 716250000 0 0 0 479910000 0 473630000 7743 4356 7232 69469;69470;69471;69472;69473;69474;69475;69476;69477;69478;69479;69480;69481 88546;88547;88548;88549;88550;88551;88552;88553;88554;88555;88556;88557;88558;88559;88560 88551 7 DREGFFTNGLTLGAK Unmodified 1624.8209 0.82092001 1099;2367 G5E9Q6;C9J0J7;C9JQ45;C9J2N0;P35080;C9J712 PFN2 Profilin;Profilin-2 no no 0 0 1 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protein 3 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 3 3 1 5 3 3 55.396 55.396 2;3 1.6188E-20 53345 QUIQUE_C1277_190116_001 182.02 157.93 903310000 0 37210000 41843000 0 30205000 25719000 116800000 139450000 43523000 0 283070000 99417000 86072000 7746 2714 7235 69510;69511;69512;69513;69514;69515;69516;69517;69518;69519;69520;69521;69522;69523;69524;69525;69526;69527;69528;69529;69530;69531;69532;69533;69534 88595;88596;88597;88598;88599;88600;88601;88602;88603;88604;88605;88606;88607;88608;88609;88610;88611;88612;88613;88614;88615;88616;88617;88618;88619;88620;88621 88597 22 DRFEHELQK Unmodified 1200.5887 0.58873523 947 E9PJP2;Q5TF21 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 1 1 17.028 17.028 3 0.014679 9333 QUIQUE_C1403_190116_001 61.765 36.927 39436000 0 0 0 39436000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7747 947 7236 69535 88622 88622 1 DRFGIDDQDYLVSLTR Unmodified 1911.9327 0.9326553 3668 Q8TBX8;F8VNT5;F8VU68 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma yes no 0 0 1 1 1 124.9 124.9 2;3 7.6217E-09 130965 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2 yes no 0 0 1 1 3 3 1 1 2 3 1 1 1 3 4 1 160.37 160.37 2;3 1.5871E-10 161824 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.47 106.6 6690700000 228260000 518580000 548540000 608560000 401310000 513920000 766200000 304880000 434260000 149390000 760720000 865830000 590280000 7751 365 7240 69543;69544;69545;69546;69547;69548;69549;69550;69551;69552;69553;69554;69555;69556;69557;69558;69559;69560;69561;69562;69563;69564;69565;69566;69567 88632;88633;88634;88635;88636;88637;88638;88639;88640;88641;88642;88643;88644;88645;88646;88647;88648;88649;88650;88651;88652;88653;88654;88655;88656;88657;88658;88659;88660;88661;88662;88663;88664;88665;88666 88651 31 DRFSVNLDVK Unmodified 1191.6248 0.62478638 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;A0A024R3B9;E9PNH7 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.214 62.214 3 0.0029925 60761 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.355 46.027 94420000 0 0 0 0 0 0 14125000 40992000 0 0 14173000 0 25130000 7752 977 7241 69568;69569;69570;69571;69572;69573 88667;88668;88669;88670;88671;88672;88673 88673 6 DRGPVVSLWPAPGK Unmodified 1477.8041 0.80414773 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 1 1 1 1 85.843 85.843 3 0.0097038 87459 QUIQUE_DMIX8_190116_001 40.278 33.22 80371000 0 0 0 0 0 0 0 0 18536000 0 36637000 0 25198000 7753 3409 7242 69574;69575;69576 88674;88675;88676 88676 3 DRGYIYWR Unmodified 1127.5512 0.55122751 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 1 1 1 2 1 60.233 60.233 2;3 0.018665 59464 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.679 48.852 179690000 0 0 0 0 0 0 0 0 21903000 0 42619000 86525000 28641000 7754 2777;2938 7243 69577;69578;69579;69580;69581 88677;88678;88679;88680;88681 88679 5 DRHPEEGVVAELQGFAVDK Unmodified 2095.0334 0.033431979 707 C9JAI6;Q96DZ9 CMTM5 CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 102.59 102.59 3 0.0001373 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Synembryn-A yes no 0 0 1 1 59.115 59.115 3 0.043608 57953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.847 28.96 17716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17716000 0 7762 4247 7251 69646 88755 88755 1 DRNDFWEGIK Unmodified 1278.5993 0.59929991 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 77.214 77.214 3 0.0011449 78983 QUIQUE_C1218_190116_001 78.513 56.485 104060000 17327000 20358000 0 0 0 0 0 18844000 0 0 0 26138000 21392000 7763 3277 7252 69647;69648;69649;69650;69651;69652;69653 88756;88757;88758;88759;88760;88761;88762 88756 7 DRPFFAGLVK Unmodified 1148.6342 0.63422886 3222;2092 P15531;E7ERL0;E5RHP0;Q32Q12;J3KPD9 NME1;NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase A;Nucleoside diphosphate kinase no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 84.805 84.805 2;3 0.00037274 86870 QUIQUE_C1576_190116_001 142.43 70.926 12246000000 977440000 1098700000 1111900000 881220000 1018400000 775720000 1023800000 615200000 969180000 332850000 1433400000 915320000 1093300000 7764 2092;3222 7253 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88842 88842 1 DRPGHSHLCPSVR Unmodified 1516.7317 0.73172784 1489 O15211 RGL2 Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 10.486 10.486 4 0.00012432 2778 QUIQUE_C1438_190116_001 72.681 62.328 39714000 7063000 0 0 9537500 10713000 0 0 0 12400000 0 0 0 0 7768 1489 7257 69708;69709;69710;69711 88843;88844;88845;88846 88845 3 DRPHEVLLCSDLVK Unmodified 1679.8665 0.86648999 1308 J3QTA6;Q9BRQ6;H0Y922 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 1 1 1 2 1 59.624 59.624 2;3 0.001567 59625 QUIQUE_C1218_190116_001 107.65 82.793 186690000 25404000 31034000 130250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7769 1308 7258 69712;69713;69714;69715;69716 88847;88848;88849;88850;88851 88847 5 DRPLEADGQEVPLDTSGSQAR Unmodified 2240.0669 0.066916951 3934 Q96RR4;F5H4I7 CAMKK2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 1 1 62.792 62.792 3 0.026158 62483 QUIQUE_C1218_190116_001 33.342 26.31 65517000 34481000 0 0 0 0 31036000 0 0 0 0 0 0 0 7770 3934 7259 69717;69718 88852;88853 88852 2 DRPMEESLLLFEAMR Unmodified 1835.891 0.89099018 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQQ5;A0A1B0GTT3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 141.4 141.4 3 0.0044096 147199 QUIQUE_C1576_190116_001 53.995 43.798 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7771 2496 7260 69719;69720;69721 88854;88855;88856 88855 3 DRPQEADGIDSVIVVDNVPQVGPDR Unmodified 2689.3307 0.33073621 2674 P55884;C9JZG1 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.6 113.6 3 1.0478E-13 116044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.376 72.188 685640000 0 95098000 108920000 0 129930000 0 0 86285000 0 45492000 75943000 72737000 71234000 7772 2674 7261 69722;69723;69724;69725;69726;69727;69728;69729 88857;88858;88859;88860;88861;88862;88863;88864 88860 8 DRTDIQCLIPCAIDQDPYFR Unmodified 2495.1573 0.15732864 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.81 141.81 2;3 8.253E-06 147311 QUIQUE_C1368_190116_001 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1501.7671 0.7671103 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 1 1 67.025 67.025 3 0.028537 66035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.959 17.242 17871000 0 0 0 0 0 0 0 17871000 0 0 0 0 0 7776 959 7265 69745 88881 88881 1 DRVNDVCTNGQDLIK Unmodified 1745.8366 0.83664643 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 53.824 53.824 2;3 3.7603E-08 52315 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.46 87.164 360110000 0 41357000 0 0 0 0 0 61545000 58253000 0 78292000 0 120670000 7777 267;275;3025 7266 69746;69747;69748;69749;69750;69751;69752 88882;88883;88884;88885;88886;88887;88888;88889 88883 7 DRVNDVCTNGQDLIKK Unmodified 1873.9316 0.93160944 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 1 1 41.791 41.791 3 0.0014407 37317 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.851 45.807 71532000 0 0 0 0 0 0 0 71532000 0 0 0 0 0 7778 267;275;3025 7267 69753;69754;69755 88890;88891;88892 88892 2 DRVTDALNATR Unmodified 1230.6317 0.63166267 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 2 48.717 48.717 2;3 0.034173 46272 QUIQUE_C1277_190116_001 83.226 51.291 174370000 0 38015000 0 0 35864000 27308000 0 0 0 0 0 73182000 0 7779 2004 7268 69756;69757;69758;69759;69760 88893;88894;88895;88896;88897 88893 5 DRVTSAVEALLSADSASR Unmodified 1846.9385 0.93846896 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 134.58 134.58 2;3 0.00021406 137941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.41 46.925 899150000 41429000 36556000 57711000 44050000 58313000 39997000 69144000 110310000 77428000 16595000 191690000 72448000 83487000 7780 2472 7269 69761;69762;69763;69764;69765;69766;69767;69768;69769;69770;69771;69772;69773;69774 88898;88899;88900;88901;88902;88903;88904;88905;88906;88907;88908;88909;88910;88911;88912 88906 15 DRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSK Unmodified 2602.2035 0.20347001 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 100.14 100.14 3 8.7269E-12 102596 QUIQUE_C1277_190116_001 99.454 88.911 154140000 0 78256000 0 0 0 0 75884000 0 0 0 0 0 0 7781 921 7270 69775;69776 88913;88914;88915 88913 3 DRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSKETSLDVSSK Unmodified 3548.6642 0.66421076 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 2 103.73 103.73 3;4 6.3226E-41 105476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.6 112.49 105980000 0 0 0 0 0 0 0 105980000 0 0 0 0 0 7782 921 7271 69777;69778 88916;88917 88916 2 DRYDSFIELQEK Unmodified 1541.7362 0.73618733 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 82.714 82.714 2;3 0.0003546 83751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.19 78.886 1363000000 67925000 204290000 68864000 63092000 131460000 83006000 87498000 59775000 63021000 51920000 114740000 186550000 180850000 7783 4284 7272 69779;69780;69781;69782;69783;69784;69785;69786;69787;69788;69789;69790;69791;69792;69793;69794;69795 88918;88919;88920;88921;88922;88923;88924;88925;88926;88927;88928;88929;88930;88931;88932;88933;88934;88935;88936;88937 88929 16 DSAAAVVVYDITNVNSFQQTTK Unmodified 2370.1703 0.17031939 3258 Q53S08;Q9H0N0 RAB6C Ras-related protein Rab-6C yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 3 2 2 145.88 145.88 2;3 1.0797E-44 148748 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.74 173.8 888780000 48678000 74931000 88532000 101480000 35221000 97719000 42954000 133770000 104840000 73842000 0 0 86807000 7784 3258 7273 69796;69797;69798;69799;69800;69801;69802;69803;69804;69805;69806;69807;69808;69809;69810;69811;69812;69813;69814;69815 88938;88939;88940;88941;88942;88943;88944;88945;88946;88947;88948;88949;88950;88951;88952;88953;88954;88955;88956;88957;88958;88959;88960 88951 22 DSAGDSDVVVQELK Unmodified 1460.6995 0.69946747 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 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Unmodified 2169.059 0.058978027 3107 Q15067;K7ELT1;I3L0T4;I3L2U4 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 143.46 143.46 2;3 1.6077E-07 149386 QUIQUE_C1218_190116_001 99.092 92.49 620410000 59797000 72796000 108600000 28006000 96754000 61967000 49919000 0 45421000 24299000 27086000 45759000 0 7791 3107 7280 69846;69847;69848;69849;69850;69851;69852;69853;69854;69855;69856;69857;69858;69859;69860 88997;88998;88999;89000;89001;89002;89003;89004;89005;89006;89007;89008;89009;89010;89011 88997 15 DSATAQAWFSAIHSNVNDLLTR Unmodified 2416.1771 0.1771361 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 155.55 155.55 3 1.7112E-36 161379 QUIQUE_C1218_190116_001 137.09 127.1 1265300000 147570000 118900000 111550000 0 0 58499000 152420000 85720000 146980000 52042000 88535000 135340000 167730000 7792 3029 7281 69861;69862;69863;69864;69865;69866;69867;69868;69869;69870;69871;69872 89012;89013;89014;89015;89016;89017;89018;89019;89020;89021;89022;89023;89024 89012 11 DSAVMDDSVVIPSHQVSTLAK Unmodified 2198.0889 0.088897947 2856;1255;902 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 89.928 89.928 2;3 2.276E-35 91290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.88 164.7 2150100000 27632000 147770000 239870000 236530000 0 213110000 159550000 301470000 227670000 0 186450000 141890000 268210000 7793 902;1255;2856 7282 69873;69874;69875;69876;69877;69878;69879;69880;69881;69882;69883;69884;69885;69886;69887;69888;69889;69890;69891;69892;69893 89025;89026;89027;89028;89029;89030;89031;89032;89033;89034;89035;89036;89037;89038;89039;89040;89041;89042;89043;89044;89045;89046;89047 89038 22 DSAYQSITHYRPVSASR Unmodified 1936.9391 0.93913766 2561 P50402;Q5HY57 EMD Emerin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 54.712 54.712 3;4 1.6257E-05 52443 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.41 85.256 592840000 42455000 34381000 86017000 102510000 0 47221000 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89065;89066;89067;89068;89069;89070;89071;89072;89073;89074;89075;89076;89077;89078;89079;89080;89081;89082;89083 89065 19 DSDDEEEVVHVDRDHFMDEFFEQVEEIR Unmodified 3494.4845 0.48447225 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 1 1 154.93 154.93 4 0.068625 159533 QUIQUE_DMIX7_190116_001 17.222 16.475 62053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62053000 0 7797 2721 7286 69930 89084 89084 1 DSDDVPMVLVGNK Unmodified 1387.6653 0.66533057 1808;1807 P01112;P01111 HRAS;NRAS GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 0 1 1 94.028 94.028 2 0.0022189 97161 QUIQUE_C1218_190116_001 78.816 69.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7798 1808;1807 7287 69931;69932 89085;89086 89085 2 DSDEADLVLAK Unmodified 1174.5717 0.57174776 2975 Q13185 CBX3 Chromobox protein homolog 3 yes yes 0 0 0 1 67.883 67.883 2 0.03968 67294 QUIQUE_C1403_190116_001 64.191 39.101 25293000 0 0 0 25293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7799 2975 7288 69933 89087 89087 1 DSDELKSWVNEK Unmodified 1448.6783 0.6783381 267;275;3025 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disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.29 103.29 3 6.7726E-10 107427 QUIQUE_C1218_190116_001 89.028 84.027 500310000 51822000 0 0 50168000 54413000 46217000 71226000 32215000 55704000 23383000 58881000 0 56287000 7835 3622 7323 70133;70134;70135;70136;70137;70138;70139;70140;70141;70142 89319;89320;89321;89322;89323;89324;89325;89326;89327;89328;89329 89319 10 DSGDENEPIQER Unmodified 1387.5852 0.58516599 3716 Q8WX93 PALLD Palladin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.021 25.021 2 0.0004639 18022 QUIQUE_C1368_190116_001 114.39 94.607 32115000 0 0 0 0 0 32115000 0 0 0 0 0 0 0 7836 3716 7324 70143;70144;70145;70146;70147 89330;89331;89332;89333;89334 89330 5 DSGDVAALR Unmodified 902.44576 0.44575938 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.361 30.361 2 0.0063617 24471 QUIQUE_C1563_190116_001 84.568 42.915 107800000 0 0 0 43541000 0 43243000 0 0 0 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(M) 1210.5401 0.54007047 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.866 35.866 2 0.0001645 31481 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.31 101.8 461730000 39611000 57029000 54422000 0 0 0 28988000 27977000 75138000 0 103020000 0 75541000 7841 1838 7329 70164;70165;70166;70167;70168;70169;70170;70171 89351;89352;89353;89354;89355;89356;89357;89358 89356 1053 7 DSGFQMNQLR Unmodified 1194.5452 0.54515585 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.34 66.34 2 1.3136E-11 67241 QUIQUE_C1438_190116_001 163.67 90.409 1146700000 0 128710000 0 140230000 353500000 0 70829000 0 84042000 39422000 123410000 128130000 78412000 7842 1838 7329 70172;70173;70174;70175;70176;70177;70178;70179;70180 89359;89360;89361;89362;89363;89364;89365;89366;89367;89368;89369;89370 89362 12 DSGITYLGIK Unmodified 1065.5706 0.57062555 2580 P51452;K7ES89 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.393 86.393 2 0.00026909 88775 QUIQUE_C1576_190116_001 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70197;70198;70199;70200;70201;70202;70203;70204;70205;70206;70207 89389;89390;89391;89392;89393;89394;89395;89396;89397;89398;89399;89400 89394 10 DSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESK Unmodified 2794.2107 0.21068066 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.23 105.23 3 3.244E-26 108163 QUIQUE_C1277_190116_001 130.83 124.73 243890000 44430000 48272000 35400000 40760000 0 28671000 46360000 0 0 0 0 0 0 7846 1096 7333 70208;70209;70210;70211;70212;70213 89401;89402;89403;89404;89405;89406 89402 6 DSGSSSVFAESPGGK Unmodified 1410.6263 0.62630252 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.519 46.519 2 4.7606E-06 43455 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.89 124.11 92480000 30439000 30050000 0 0 0 0 0 31990000 0 0 0 0 0 7847 103 7334 70214;70215;70216;70217;70218 89407;89408;89409;89410;89411 89411 5 DSGVASTEDSSSSHITAAAIAAK Unmodified 2175.0291 0.029134462 998 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89439;89440;89441;89442;89443;89444;89445;89446;89447;89448;89449;89450;89451;89452;89453;89454;89455;89456;89457;89458;89459;89460;89461;89462;89463;89464;89465;89466;89467;89468;89469;89470;89471;89472;89473;89474;89475;89476;89477;89478;89479;89480;89481;89482;89483;89484;89485;89486;89487;89488 89469 48 DSHQPIMCSYK Unmodified 1364.5853 0.58530611 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 27.932 27.932 2 0.0052427 22265 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.939 70.245 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7855 4474 7342 70272 89489 89489 1 DSHSLTTNIMEILR Unmodified 1628.8192 0.81920545 1823 P02671;A0A087WUA0 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 2 127.66 127.66 2;3 1.1062E-22 131947 QUIQUE_C1277_190116_001 161.48 140.82 2315400000 119360000 280520000 248440000 292100000 331800000 46083000 292500000 99044000 80272000 63930000 100340000 37538000 323510000 7856 1823 7343 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89538;89539;89540;89541;89542;89543;89544;89545;89546;89547;89548;89549;89550;89551;89552;89553;89554;89555;89556;89557;89558;89559;89560;89561;89562;89563;89564;89565;89566;89567;89568;89569;89570;89571;89572;89573;89574 89567 37 DSIGWMFSK Unmodified 1069.4903 0.49026674 1004 F5H283;Q92563 SPOCK2 Testican-2 yes no 0 0 0 1 113.47 113.47 2 0.044544 117035 QUIQUE_C1277_190116_001 52.255 34.869 9139000 0 9139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7860 1004 7346 70330 89575 89575 1 DSIHLTPVLTSSILNQLTGR Unmodified 2164.1852 0.18518159 4104 Q9GZT4;I3L4B4;I3L3N0;I3L4W4;Q3ZK31 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 149.82 149.82 2;3 3.5456E-30 155915 QUIQUE_C1576_190116_001 143.46 134.4 2739800000 88749000 120820000 245700000 239350000 196590000 145290000 217790000 260760000 354970000 112620000 233570000 195400000 328220000 7861 4104 7347 70331;70332;70333;70334;70335;70336;70337;70338;70339;70340;70341;70342;70343;70344;70345;70346;70347;70348;70349;70350 89576;89577;89578;89579;89580;89581;89582;89583;89584;89585;89586;89587;89588;89589;89590;89591;89592;89593;89594;89595;89596;89597 89584 22 DSIIYLTADSPNVMTTFR Unmodified 2042.9983 0.99829203 3435 Q7L0Y3;C9JVB6 TRMT10C Mitochondrial ribonuclease P protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 144.56 144.56 2 0.00052954 149828 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.469 57.59 27264000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27264000 0 0 7862 3435 7348 70351;70352;70353 89598;89599;89600 89599 3 DSIKLDDDSERK Unmodified 1419.6842 0.68415175 3499 Q86VP6;F5H6I6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 2 1 17.242 17.242 3 0.034284 9825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.463 55.586 64125000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64125000 0 0 7863 3499 7349 70354 89601 89601 1 DSILGEPGMGFK Unmodified 1249.6013 0.60127375 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 100.4 100.4 2 0.00018934 102595 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.14 50.336 296510000 29649000 39645000 32781000 22515000 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RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 69.667 69.667 3 0.02738 70116 QUIQUE_C1368_190116_001 28.859 13.32 31677000 0 0 31677000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7876 1642 7360 70426 89693 89693 1 DSLDPSFTHAMQLLTAEIEK Oxidation (M) 2261.0886 0.088563596 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 141.21 141.21 3 0.00053058 145147 QUIQUE_C1277_190116_001 55.575 49.608 85413000 37246000 48167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7877 2908 7361 70427;70428 89694;89695 89695 2385 2 DSLDPSFTHAMQLLTAEIEK Unmodified 2245.0936 0.093648974 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 164.13 164.13 2;3 1.1429E-87 169048 QUIQUE_C1368_190116_001 231.23 195.58 5289500000 520630000 597650000 645010000 524060000 394760000 286410000 438610000 175310000 401360000 132090000 341780000 317200000 514660000 7878 2908 7361 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89871 1 DSLQNQLINIR Unmodified 1312.7099 0.709913 351 Q5VTI5;A0A1B0GUN5;Q9Y2H5 PLEKHA6 Pleckstrin homology domain-containing family A member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.213 96.213 2 0.0015342 97840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.948 54.204 282210000 27425000 24827000 21825000 22327000 23309000 23920000 20815000 20029000 25746000 7981000 0 30415000 33591000 7892 351 7374 70562;70563;70564;70565;70566;70567;70568;70569;70570;70571;70572;70573 89872;89873;89874;89875;89876;89877;89878;89879;89880;89881;89882;89883;89884 89880 13 DSLSDDVVK Unmodified 976.47131 0.47130543 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.114 42.114 2 0.0034294 37173 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.318 38.152 1220900000 0 144170000 180750000 168410000 0 0 0 132810000 175300000 70382000 0 174870000 174180000 7893 3421 7375 70574;70575;70576;70577;70578;70579;70580;70581 89885;89886;89887;89888;89889;89890;89891;89892 89890 7 DSLSPVLHPSDLILTR Unmodified 1761.9625 0.96249887 4230 Q9HCN4 GPN1 GPN-loop GTPase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 114.01 114.01 3 0.0010495 119332 QUIQUE_C1438_190116_001 59.634 48.114 135180000 0 23205000 0 22183000 18549000 24606000 0 19857000 0 0 0 0 26781000 7894 4230 7376 70582;70583;70584;70585;70586;70587 89893;89894;89895;89896;89897;89898;89899 89895 6 DSLSVNEFK Unmodified 1037.5029 0.50293991 3960 Q99584 S100A13 Protein S100-A13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.856 62.856 2 0.013659 61833 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.628 51.481 1092300000 146560000 0 161910000 69953000 0 76131000 0 146830000 219290000 72364000 0 199290000 0 7895 3960 7377 70588;70589;70590;70591;70592;70593;70594;70595 89900;89901;89902;89903;89904;89905;89906;89907 89904 8 DSLSVNEFKELVTQQLPHLLK Unmodified 2437.3217 0.32167508 3960 Q99584 S100A13 Protein S100-A13 yes yes 0 0 1 1 151.92 151.92 3 6.3125E-05 156869 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.122 61.869 70370000 0 0 0 0 0 0 0 0 70370000 0 0 0 0 7896 3960 7378 70596 89908 89908 1 DSLTLVFVETK Unmodified 1250.6758 0.6758189 266 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;A0A0J9YVQ7 DDX3X ATP-dependent RNA helicase DDX3X yes no 0 0 0 1 117.88 117.88 2 0.025311 114545 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.124 38.444 12564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12564000 0 0 0 7897 266 7379 70597 89909;89910 89910 2 DSLVDIIGICK Unmodified 1231.6482 0.64822394 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 130.52 130.52 2 0.003329 126774 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.165 46.911 176770000 32049000 42431000 34454000 0 0 0 32888000 20761000 0 14191000 0 0 0 7898 2265 7380 70598;70599;70600;70601;70602;70603 89911;89912;89913;89914;89915;89916 89916 6 DSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPR Unmodified 2642.2653 0.26528241 849 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90022 1 DSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTK Oxidation (M) 3065.5049 0.50493711 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 169.57 169.57 3 5.8744E-25 173083 QUIQUE_C1277_190116_001 86.304 80.009 38459000 15323000 23136000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7912 4466 7393 70682;70683 90023;90024 90024 2975 2 DSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTK Unmodified 3049.51 0.51002248 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 176.4 176.4 2;3 2.8086E-54 177409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.89 131.44 800110000 9301600 16568000 18126000 0 37878000 0 59793000 55127000 141930000 0 244250000 124460000 92678000 7913 4466 7393 70684;70685;70686;70687;70688;70689;70690;70691;70692;70693;70694 90025;90026;90027;90028;90029;90030;90031;90032;90033;90034;90035;90036 90030 12 DSNYHLLMSVQESLER Oxidation (M) 1935.8996 0.89964061 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 5 3 5 3 4 4 3 4 4 5 4 4 3 112.95 112.95 2;3 2.5853E-24 109418 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.22 139.54 9684500000 626010000 405650000 921310000 477970000 621600000 610970000 399150000 686910000 966460000 646010000 1501900000 1018900000 801730000 7914 1777 7394 70695;70696;70697;70698;70699;70700;70701;70702;70703;70704;70705;70706;70707;70708;70709;70710;70711;70712;70713;70714;70715;70716;70717;70718;70719;70720;70721;70722;70723;70724;70725;70726;70727;70728;70729;70730;70731;70732;70733;70734;70735;70736;70737;70738;70739;70740;70741;70742;70743;70744;70745 90037;90038;90039;90040;90041;90042;90043;90044;90045;90046;90047;90048;90049;90050;90051;90052;90053;90054;90055;90056;90057;90058;90059;90060;90061;90062;90063;90064;90065;90066;90067;90068;90069;90070;90071;90072;90073;90074;90075;90076;90077;90078;90079;90080;90081;90082;90083;90084;90085;90086;90087;90088;90089;90090;90091;90092;90093;90094;90095;90096;90097;90098;90099;90100;90101;90102;90103 90082 972 67 DSNYHLLMSVQESLER Unmodified 1919.9047 0.90472599 1777 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90229;90230 90230 1 DSPDLLLLLR Unmodified 1153.6707 0.67067394 3715 Q8WX92 NELFB Negative elongation factor B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.42 149.42 2 0.0024786 154182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.698 48.669 115130000 0 19691000 0 13480000 13969000 0 11443000 8958600 14760000 6264500 12521000 14041000 0 7917 3715 7396 70812;70813;70814;70815;70816;70817;70818;70819;70820 90231;90232;90233;90234;90235;90236;90237;90238;90239 90236 8 DSPFGSIHPR Unmodified 1111.5411 0.54105675 4205 Q9HAT2 SIAE Sialate O-acetylesterase yes yes 0 0 0 1 44.785 44.785 3 0.012573 41793 QUIQUE_C1218_190116_001 56.404 42.198 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7918 4205 7397 70821 90240 90240 1 DSPLFDFIESCLR Unmodified 1597.7446 0.74464352 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.25 172.25 2 0.00044576 174995 QUIQUE_C1403_190116_001 100.88 85.613 367680000 17487000 30542000 18503000 20143000 0 16545000 62405000 28437000 31731000 5284800 46540000 54476000 35588000 7919 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P07737;CON__P02584;I3L3D5 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.594 81.594 2 0.00043323 83114 QUIQUE_C1368_190116_001 139.98 122.07 15227000000 1082000000 1198700000 1398500000 1119400000 1339600000 1067100000 1318300000 798470000 1063100000 683480000 1740500000 969100000 1448700000 + 7922 1926 7400 70849;70850;70851;70852;70853;70854;70855;70856;70857;70858;70859;70860;70861 90268;90269;90270;90271;90272;90273;90274;90275;90276;90277;90278;90279;90280;90281;90282;90283;90284;90285;90286;90287;90288;90289 90273 22 DSPTGANSYVIIK Unmodified 1363.6983 0.69834526 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 71.379 71.379 2 0.027114 67608 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.32 43.534 64605000 0 34013000 0 0 0 0 0 0 0 30592000 0 0 0 7923 877 7401 70862;70863 90290;90291 90291 2 DSPTILQQVDETLR Unmodified 1613.8261 0.82606496 3705 Q8WVF1;C9JF58 OSCP1 Protein OSCP1 no no 0 0 0 1 1 132.29 132.29 2 0.049588 136472 QUIQUE_C1403_190116_001 51.612 38.258 77663000 0 0 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DSQDAGGFGPEDR Unmodified 1349.5484 0.54838655 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.309 39.309 2 2.3282E-31 36044 QUIQUE_DMIX5_190116_001 212.72 183.64 4826100000 284790000 362490000 448070000 128140000 336350000 136370000 292020000 500710000 581510000 212470000 663540000 539280000 340360000 7927 3117 7405 70884;70885;70886;70887;70888;70889;70890;70891;70892;70893;70894;70895;70896 90314;90315;90316;90317;90318;90319;90320;90321;90322;90323;90324;90325;90326;90327;90328;90329;90330;90331;90332 90330 17 DSQDPYCGWCVVEGR Unmodified 1826.7352 0.73521782 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 105.97 105.97 2 9.2407E-06 108091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.17 93.01 25883000 0 0 0 0 0 0 0 25883000 0 0 0 0 0 7928 1473 7406 70897 90333 90333 1 DSQEEEKTEALTSAK Unmodified 1664.7741 0.77408897 166;788 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14 GSN Gelsolin no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 27.963 27.963 2;3 2.5469E-230 22364 QUIQUE_DMIX1_190116_001 320.01 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90375;90376;90377;90378;90379;90380;90381;90382;90383;90384;90385;90386;90387 90381 11 DSSAPGGPPER Unmodified 1068.4836 0.48360145 4096 Q9C0E8 LNP Protein lunapark yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 16.071 16.071 2 0.0022528 8667 QUIQUE_C1218_190116_001 79.489 62.258 225170000 31484000 0 29806000 54495000 30028000 22211000 0 0 33947000 0 0 0 23203000 7934 4096 7412 70949;70950;70951;70952;70953;70954;70955 90388;90389;90390;90391;90392;90393;90394 90388 4 DSSDQNFDYMFK Unmodified 1495.5926 0.59255956 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.65 107.65 2 0.00051998 110730 QUIQUE_C1277_190116_001 93.556 85.631 515850000 84344000 81776000 81924000 71731000 0 0 88655000 0 41648000 0 65775000 0 0 7935 3839 7413 70956;70957;70958;70959;70960;70961;70962;70963 90395;90396;90397;90398;90399;90400;90401;90402 90396 5 DSSDQNFDYMFK Oxidation (M) 1511.5875 0.58747418 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 1 0 1 1 80.794 80.794 2 0.029261 83029 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90408;90409;90410;90411;90412;90413;90414;90415;90416;90417;90418;90419;90420;90421;90422;90423;90424;90425;90426;90427;90428;90429;90430;90431 90421 24 DSSLEADHVISAIPASVLSELLPAEAAPLAR Unmodified 3141.6558 0.65575874 2559 P50336 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.6 169.6 3 2.4629E-37 173122 QUIQUE_C1277_190116_001 111.79 105.43 2176300000 250580000 144850000 295190000 100040000 134580000 158040000 63410000 140930000 197070000 36933000 202670000 211530000 240440000 7939 2559 7416 70992;70993;70994;70995;70996;70997;70998;70999;71000;71001;71002;71003;71004 90432;90433;90434;90435;90436;90437;90438;90439;90440;90441;90442;90443;90444 90433 13 DSSLFDIFTLSCNLLK Unmodified 1871.9339 0.93390085 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 175.12 175.12 2;3 4.2016E-66 179464 QUIQUE_C1368_190116_001 199.8 177.6 993120000 24686000 54582000 27046000 14783000 56505000 154470000 84591000 110840000 131260000 11050000 172440000 150870000 0 7940 4447 7417 71005;71006;71007;71008;71009;71010;71011;71012;71013;71014;71015;71016;71017;71018;71019 90445;90446;90447;90448;90449;90450;90451;90452;90453;90454;90455;90456;90457;90458;90459;90460;90461;90462;90463 90448 18 DSSQLGTDATK Unmodified 1121.52 0.52004654 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;E9PQD2;E9PRG1;E9PIG0;E9PQN0;E9PJP4;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 18.517 18.517 2 0.0079026 10836 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.275 48.12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7941 933;1529 7418 71020;71021 90464;90465 90465 2 DSSSLAGTPSDETLATDPLGLAK Unmodified 2245.0962 0.096151394 1612 O75145 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 128.34 128.34 2 3.0201E-17 132372 QUIQUE_C1403_190116_001 155.57 135.48 84998000 0 0 24818000 35240000 0 0 0 24940000 0 0 0 0 0 7942 1612 7419 71022;71023;71024 90466;90467;90468 90467 3 DSSSLSSCTSGILEER Unmodified 1726.768 0.76795774 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.025 85.025 2 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DSVDSAGTSPTAVLAAGEEVGAGGGPGGGRPGAGTPLR Unmodified 3347.6342 0.63418845 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.14 109.14 3 7.7092E-88 114132 QUIQUE_C1438_190116_001 144.45 133.94 615880000 0 66847000 44568000 52149000 62704000 46364000 55850000 64142000 0 0 64146000 82482000 76627000 7962 3304 7438 71321;71322;71323;71324;71325;71326;71327;71328;71329;71330 90870;90871;90872;90873;90874;90875;90876;90877;90878;90879;90880;90881;90882;90883;90884 90874 15 DSVFLSCSEDNR Unmodified 1427.5987 0.59870757 3991 Q9BQA1;H0Y711 WDR77 Methylosome protein 50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.369 62.369 2 0.0004402 58628 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.06 98.245 521550000 50282000 49799000 58497000 42629000 41337000 53381000 52586000 28122000 28988000 20879000 30399000 34682000 29967000 7963 3991 7439 71331;71332;71333;71334;71335;71336;71337;71338;71339;71340;71341;71342;71343 90885;90886;90887;90888;90889;90890;90891;90892;90893;90894;90895;90896;90897;90898;90899;90900 90897 16 DSVGEPLYMLFR Unmodified 1425.6962 0.69623677 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.04 152.04 2 1.5517E-09 159208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.11 133.33 456480000 62103000 0 52538000 49175000 38746000 0 39947000 37581000 25914000 18894000 44316000 37913000 49354000 7964 1510 7440 71344;71345;71346;71347;71348;71349;71350;71351;71352;71353;71354 90901;90902;90903;90904;90905;90906;90907;90908;90909;90910;90911 90909 11 DSVGEPLYMLFR Oxidation (M) 1441.6912 0.69115139 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 1 0 1 138.88 138.88 2 0.056789 141858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.98 32.191 21039000 0 0 0 0 0 0 0 21039000 0 0 0 0 0 7965 1510 7440 71355 90912 90912 1 DSVLFSVADR Unmodified 1107.556 0.55603811 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 90.386 90.386 2 0.020428 94163 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A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C0K6;A0A087WWA3;Q4R9M9;O60333 KIF1A;KIF1B;KIF1Bbeta Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.84 156.84 2 4.9983E-13 162061 QUIQUE_C1368_190116_001 183.24 147.36 543400000 57080000 39238000 34052000 72967000 46929000 28721000 65024000 49948000 44596000 15000000 53576000 36272000 0 7969 497 7444 71367;71368;71369;71370;71371;71372;71373;71374;71375;71376;71377;71378;71379 90924;90925;90926;90927;90928;90929;90930;90931;90932;90933;90934;90935;90936 90926 13 DSVMVSWSPPVASFDYYR Unmodified 2104.9564 0.95642721 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 2 3 1 2 1 151.79 151.79 2;3 1.7646E-19 156805 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.54 106.67 227900000 15489000 0 0 0 0 0 0 54198000 31237000 6845300 75360000 44771000 0 7970 3753 7445 71380;71381;71382;71383;71384;71385;71386;71387;71388;71389 90937;90938;90939;90940;90941;90942;90943;90944;90945;90946;90947 90942 11 DSVMVSWSPPVASFDYYR Oxidation (M) 2120.9513 0.95134183 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 1 0 1 143.69 143.69 2 0.039176 151159 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.092 41.304 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7971 3753 7445 71390 90948 90948 1 DSVNPGVMVLLGCGALSSTCGQLASYPLALVR Unmodified 3304.6618 0.66178888 3372 Q6NUK1 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 170.83 170.83 3 7.8244E-14 174779 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.942 63.162 176410000 29913000 0 0 0 0 0 47320000 32797000 0 0 0 0 66375000 7972 3372 7446 71391;71392;71393;71394 90949;90950;90951;90952 90952 4 DSVTHLFDR Unmodified 1088.5251 0.52507234 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 59.816 59.816 2;3 0.0094948 56082 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.749 70.513 818550000 91154000 84839000 84292000 56249000 70060000 82046000 106690000 86195000 60120000 39120000 0 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Unmodified 2064.002 0.001997195 329 A0A140TA86;Q5XKP0 QIL1 Protein QIL1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 169.51 169.51 2;3 2.6513E-87 173637 QUIQUE_DMIX8_190116_001 198.87 182.73 1805100000 67478000 43936000 134280000 14362000 113190000 19665000 118710000 244380000 86664000 11912000 304780000 350200000 295590000 7976 329 7450 71425;71426;71427;71428;71429;71430;71431;71432;71433;71434;71435;71436;71437;71438;71439;71440;71441;71442;71443;71444;71445;71446 90988;90989;90990;90991;90992;90993;90994;90995;90996;90997;90998;90999;91000;91001;91002;91003;91004;91005;91006;91007;91008;91009;91010;91011;91012 91011 25 DSWNAGIMTVMSALSVAPSK Oxidation (M) 2079.9969 0.99691182 329 A0A140TA86;Q5XKP0 QIL1 Protein QIL1 yes no 0 1 0 1 164.57 164.57 2 8.7345E-05 169063 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.022 64.89 16984000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16984000 7977 329 7450 71447 91013 91013 230 1 DSYDSYATHNE Unmodified 1300.4844 0.48438931 3038 Q14011 CIRBP Cold-inducible RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.226 37.226 2 1.2962E-05 33602 QUIQUE_C1576_190116_001 143.21 141 1336900000 116260000 105390000 118080000 108840000 113390000 62040000 90993000 0 175840000 33744000 112440000 100160000 199660000 7978 3038 7451 71448;71449;71450;71451;71452;71453;71454;71455;71456;71457;71458;71459 91014;91015;91016;91017;91018;91019;91020;91021;91022;91023;91024;91025;91026;91027 91022 14 DSYESYGNSR Unmodified 1176.4683 0.46834532 2412;3840 P38159;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.412 26.412 2 0.010719 20729 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.371 52.227 447950000 47197000 53181000 51536000 67480000 54942000 0 0 0 0 0 69303000 42932000 61380000 7979 2412;3840 7452 71460;71461;71462;71463;71464;71465;71466;71467 91028;91029;91030;91031;91032;91033;91034;91035;91036 91035 5 DSYIASQGPLLHTIEDFWR Unmodified 2247.096 0.096032235 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 161.01 161.01 3 4.573E-05 168138 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.511 63.745 120640000 14374000 17773000 17923000 0 0 0 18083000 0 0 0 28075000 24416000 0 7980 2137 7453 71468;71469;71470;71471;71472;71473 91037;91038;91039;91040;91041;91042;91043 91041 6 DSYIEVLLPLGSEPELR Unmodified 1929.0095 0.0095086389 4575 Q9Y305;H7C5Q2;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 158.76 158.76 2;3 1.778E-12 163192 QUIQUE_DMIX7_190116_001 149.26 134.38 744750000 84861000 78085000 67846000 70079000 59467000 70842000 59043000 44871000 50210000 22297000 53168000 41873000 42109000 7981 4575 7454 71474;71475;71476;71477;71478;71479;71480;71481;71482;71483;71484;71485;71486;71487;71488 91044;91045;91046;91047;91048;91049;91050;91051;91052;91053;91054;91055;91056;91057;91058;91059;91060 91059 16 DSYLILETLPTEYDSR Unmodified 1913.9258 0.92583859 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.28 145.28 2 1.4764E-24 149906 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.02 132.78 1376000000 199450000 160830000 162050000 0 185430000 0 168120000 0 151390000 0 0 173380000 175340000 7982 4672 7455 71489;71490;71491;71492;71493;71494;71495;71496 91061;91062;91063;91064;91065;91066;91067;91068 91067 7 DSYSGGVVNMYHMK Unmodified 1586.6857 0.68574843 2272 X5D2R7;P28062;Q5JNW7;A0A140T998 PSM8;PSMB8 Proteasome subunit beta type;Proteasome subunit beta type-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.252 67.252 2 0.00024768 67869 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.957 86.433 176440000 0 0 39384000 38043000 0 0 0 0 25140000 0 43739000 0 30132000 7983 2272 7456 71497;71498;71499;71500;71501 91069;91070;91071;91072;91073;91074 91072 5 DSYTLTEELAEYAEIR Unmodified 1901.8895 0.88945308 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 155.21 155.21 2 0.025076 160925 QUIQUE_C1368_190116_001 50.207 37.007 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7984 2173 7457 71502 91075 91075 1 DSYVAIANACCAPR Unmodified 1566.6919 0.69189644 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.153 68.153 2 1.7414E-17 68064 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.83 141.59 502450000 0 69288000 54382000 39746000 31339000 39711000 55726000 37630000 33129000 10823000 37135000 45360000 48183000 7985 4176 7458 71503;71504;71505;71506;71507;71508;71509;71510;71511;71512;71513;71514 91076;91077;91078;91079;91080;91081;91082;91083;91084;91085;91086;91087 91083 11 DSYVGDEAQSK Unmodified 1197.515 0.51496116 2788;2696;2792;447;2759;548;1333 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;A6NL76;F8WB63;B8ZZJ2;K7EM38;P60709;P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L3R2;J3KT65;P68032;P68133 ACTB;ACTA1;ACTG2;ACTG1;ACTA2;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 4 4 3 4 3 3 1 4 3 4 2 4 2 23.238 23.238 1;2 0 14892 QUIQUE_C1368_190116_001 335.66 289.24 349100000000 30090000000 30114000000 33257000000 30053000000 28870000000 24235000000 27778000000 22905000000 27625000000 17844000000 21730000000 25642000000 28953000000 7986 447;548;1333;2696;2759;2788;2792 7459 71515;71516;71517;71518;71519;71520;71521;71522;71523;71524;71525;71526;71527;71528;71529;71530;71531;71532;71533;71534;71535;71536;71537;71538;71539;71540;71541;71542;71543;71544;71545;71546;71547;71548;71549;71550;71551;71552;71553;71554;71555 91088;91089;91090;91091;91092;91093;91094;91095;91096;91097;91098;91099;91100;91101;91102;91103;91104;91105;91106;91107;91108;91109;91110;91111;91112;91113;91114;91115;91116;91117;91118;91119;91120;91121;91122;91123;91124;91125;91126;91127;91128;91129;91130;91131;91132;91133;91134;91135;91136;91137;91138;91139;91140;91141;91142;91143;91144;91145;91146;91147;91148;91149;91150;91151;91152;91153;91154;91155;91156;91157;91158;91159;91160;91161;91162;91163;91164 91104 70 DSYVGDEAQSKR Unmodified 1353.6161 0.61607219 2788;2696;2792;447;2759;548;1333 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;A6NL76;F8WB63;B8ZZJ2;K7EM38;P60709;P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L3R2;J3KT65;P68032;P68133 ACTB;ACTA1;ACTG2;ACTG1;ACTA2;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 17.072 17.072 2;3 1.2911E-06 9585 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.75 116.88 72993000000 233100000 690670000 237020000 243100000 1690700000 111840000 572410000 15039000000 10180000000 0 19503000000 9952000000 14540000000 7987 447;548;1333;2696;2759;2788;2792 7460 71556;71557;71558;71559;71560;71561;71562;71563;71564;71565;71566;71567;71568;71569;71570;71571;71572;71573;71574;71575 91165;91166;91167;91168;91169;91170;91171;91172;91173;91174;91175;91176;91177;91178;91179;91180;91181;91182;91183;91184;91185;91186;91187;91188;91189;91190;91191;91192;91193;91194;91195;91196;91197;91198 91183 34 DTAAWTVGR Unmodified 975.47739 0.47739386 3090 Q14974;J3KTM9;J3QKQ5 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.419 50.419 2 0.00053812 48349 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.22 102.11 1923700000 0 145710000 199230000 170340000 178530000 149690000 199800000 126830000 163340000 0 200270000 161500000 228480000 7988 3090 7461 71576;71577;71578;71579;71580;71581;71582;71583;71584;71585;71586 91199;91200;91201;91202;91203;91204;91205;91206;91207;91208;91209;91210;91211 91206 11 DTADGVSQELFSAGLVDGHDVVIVAANLQK Unmodified 3067.5462 0.5462083 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 162.33 162.33 3 3.0504E-14 166987 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.516 69.229 150850000 0 0 0 0 0 0 0 0 150850000 0 0 0 0 7989 4417 7462 71587 91212 91212 1 DTAEGVSQELISAGLVDGR Unmodified 1915.9487 0.9486993 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 133.22 133.22 2 1.9313E-06 129220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.53 101.93 256640000 57957000 0 0 0 0 0 107910000 62028000 0 28740000 0 0 0 7990 1746 7463 71588;71589;71590;71591 91213;91214;91215;91216 91216 4 DTAGDASESALLK Unmodified 1276.6147 0.61467521 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.69 54.69 2 8.7652E-13 52982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.24 121.43 865330000 207980000 0 0 0 0 0 0 271950000 230510000 0 0 0 154890000 7991 590 7464 71592;71593;71594;71595 91217;91218;91219;91220;91221 91219 4 DTAIYQKDEALHVK Unmodified 1629.8362 0.83623572 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 2 1 36.013 36.013 2;3 0.00060412 32392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.17 105.8 379120000 0 0 0 0 0 0 0 198460000 0 0 124120000 56543000 0 7992 921 7465 71596;71597;71598;71599;71600 91222;91223;91224;91225;91226 91223 5 DTAIYQKDEALHVKNEAVK Unmodified 2171.1222 0.12224699 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 39.528 39.528 4 0.047246 35526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.21 22.513 26283000 0 0 0 0 0 0 0 26283000 0 0 0 0 0 7993 921 7466 71601 91227 91227 1 DTALLEDLGK Unmodified 1073.5605 0.56045479 82 A0A087WYU2;Q96S19 C16orf13 UPF0585 protein C16orf13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.276 92.276 2 0.0011275 94331 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0.066447945 3193 Q16762;B1AH48 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 157 157 2;3 2.8949E-28 162366 QUIQUE_C1218_190116_001 139.58 132.04 152860000 49440000 34883000 31696000 18387000 0 18456000 0 0 0 0 0 0 0 8000 3193 7472 71630;71631;71632;71633;71634;71635;71636 91260;91261;91262;91263;91264;91265;91266 91261 7 DTATLNCQSSGSKPAAR Unmodified 1762.8268 0.82681002 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 15.447 15.447 3 2.1442E-31 7688 QUIQUE_C1368_190116_001 138.39 114.11 211350000 0 33234000 52778000 0 0 17793000 45841000 0 24380000 0 0 0 37325000 8001 3569 7473 71637;71638;71639;71640;71641;71642 91267;91268;91269;91270;91271;91272 91268 6 DTAVQGNIR Unmodified 972.49886 0.49885759 4410 Q9UBV8 PEF1 Peflin yes yes 0 0 0 1 19.386 19.386 2 0.04059 12441 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.351 34.569 44409000 0 0 0 0 0 0 0 0 44409000 0 0 0 0 8002 4410 7474 71643 91273 91273 1 DTCLNGLVQLLSNR Unmodified 1601.8195 0.8195398 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 150.25 150.25 2 0.042073 152941 QUIQUE_C1563_190116_001 43.68 31.103 23256000 0 0 0 0 0 23256000 0 0 0 0 0 0 0 8003 2990 7475 71644 91274 91274 1 DTDAAVGDNIGYITFVLFPR Unmodified 2183.0899 0.089884225 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 171.34 171.34 2;3 6.3168E-30 179044 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.28 164.49 821750000 16628000 42950000 71524000 28692000 49373000 16009000 69919000 56527000 141460000 0 135600000 71869000 121190000 8004 1486 7476 71645;71646;71647;71648;71649;71650;71651;71652;71653;71654;71655;71656;71657;71658;71659;71660;71661;71662 91275;91276;91277;91278;91279;91280;91281;91282;91283;91284;91285;91286;91287;91288;91289;91290;91291;91292;91293;91294 91291 18 DTDDVPMILVGNK Unmodified 1415.6966 0.6966307 2719 P61224;E7ESV4;F5H7Y6;F5GX62;A6NIZ1;F5H6R7;F5H004;F5H823;B7ZB78;F5GZG1 RAP1B Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.19 108.19 2 0.00061002 111299 QUIQUE_C1277_190116_001 113.1 96.07 163580000 35949000 26716000 52108000 48804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8005 2719 7477 71663;71664;71665;71666;71667;71668;71669 91295;91296;91297;91298;91299;91300;91301 91296 7 DTDIVDEAIYYFK Unmodified 1590.7454 0.74535503 1487 O15145;C9JZD1;F8VR50 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 1 161.55 161.55 2;3 2.9826E-13 165853 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.24 136.94 3254300000 340670000 306890000 296540000 286160000 298140000 16705000 227760000 286190000 294200000 205910000 298960000 197200000 198950000 8006 1487 7478 71670;71671;71672;71673;71674;71675;71676;71677;71678;71679;71680;71681;71682;71683;71684;71685;71686;71687;71688 91302;91303;91304;91305;91306;91307;91308;91309;91310;91311;91312;91313;91314;91315;91316;91317;91318;91319;91320;91321;91322;91323 91322 19 DTDLMTFNISVHR Unmodified 1547.7402 0.74022685 3613 Q8N8D7 NKAIN3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 yes yes 0 0 0 1 101.93 101.93 3 0.062362 105214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 38.279 21.162 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8007 3613 7479 71689 91324 91324 1 DTDPDSKPFSLQETYEAK Unmodified 2069.9429 0.94294522 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 75.31 75.31 2;3 5.2109E-76 76370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 228.93 211.56 8196300000 602150000 639170000 1069100000 812820000 772350000 689120000 968060000 219690000 339390000 365910000 734260000 418190000 566100000 8008 820;594 7480 71690;71691;71692;71693;71694;71695;71696;71697;71698;71699;71700;71701;71702;71703;71704;71705;71706;71707;71708;71709;71710;71711;71712;71713;71714;71715;71716 91325;91326;91327;91328;91329;91330;91331;91332;91333;91334;91335;91336;91337;91338;91339;91340;91341;91342;91343;91344;91345;91346;91347;91348;91349;91350;91351;91352;91353;91354;91355;91356;91357;91358;91359;91360;91361;91362;91363;91364;91365;91366;91367;91368;91369;91370;91371;91372;91373;91374;91375;91376;91377 91367 53 DTDSEEEIR Unmodified 1092.4571 0.45711193 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 CALM2;CALM1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.095 21.095 2 0.00014327 13710 QUIQUE_C1563_190116_001 141.39 110.1 7193600000 1826000000 995680000 882750000 540920000 536530000 630490000 583040000 36413000 141920000 128050000 428400000 184610000 278860000 8009 1128 7481 71717;71718;71719;71720;71721;71722;71723;71724;71725;71726;71727;71728;71729 91378;91379;91380;91381;91382;91383;91384;91385;91386;91387;91388;91389;91390;91391 91384 14 DTDSEEEIREAFR Unmodified 1595.7063 0.70634376 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 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isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 84.208 84.208 2 0.00065298 86927 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.27 95.068 127720000 0 0 30233000 0 0 0 0 0 0 16269000 81221000 0 0 8012 1187 7484 71756;71757;71758 91420;91421;91422 91422 1 DTDTGALLFIGK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2403 P36955;CON__Q95121 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 116.85 116.85 2 0.057369 120591 QUIQUE_C1277_190116_001 49.472 31.437 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8013 2403 7485 71759 91423 91423 1 DTDVEYLEIVR Unmodified 1350.6667 0.66671078 272 A0A0D9SFU4;O95970 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 111.8 111.8 2 0.004713 114754 QUIQUE_C1277_190116_001 79.489 68.855 72022000 51429000 20593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8014 272 7486 71760;71761;71762 91424;91425;91426 91425 2 DTEAVMAFLEAK Unmodified 1323.6381 0.63805318 3298 Q5SW79;H0Y2V6 CEP170 Centrosomal protein of 170 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.24 136.24 2 0.00053444 140360 QUIQUE_C1403_190116_001 101.38 89.426 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7.0555E-131 71357 QUIQUE_C1277_190116_001 270.21 256.3 2481700000 323830000 352520000 0 188110000 572670000 27327000 89222000 126610000 49862000 179270000 241330000 41741000 289170000 8018 1799 7490 71778;71779;71780;71781;71782;71783;71784;71785;71786;71787;71788;71789;71790;71791;71792;71793;71794;71795;71796;71797;71798;71799;71800;71801 91446;91447;91448;91449;91450;91451;91452;91453;91454;91455;91456;91457;91458;91459;91460;91461;91462;91463;91464;91465;91466;91467;91468;91469;91470;91471;91472;91473;91474;91475 91453 27 DTEGLIQEINDLR Unmodified 1514.7577 0.75765105 3504 Q86W92;A0A0A0MTP2;F5GZP6 PPFIBP1 Liprin-beta-1 yes no 0 0 0 1 140.27 140.27 2 0.045301 144226 QUIQUE_C1403_190116_001 57.149 36.371 29831000 0 0 0 29831000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8019 3504 7491 71802 91476 91476 0 DTEIDDLK Unmodified 947.44476 0.44475633 486 A0A3B3IRY9;O15079 SNPH Syntaphilin yes no 0 0 0 1 43.133 43.133 2 0.035224 39461 QUIQUE_C1563_190116_001 63.565 24.759 30588000 0 0 0 0 0 30588000 0 0 0 0 0 0 0 8020 486 7492 71803 91477 91477 1 DTELAEELLQWFLQEEK Unmodified 2120.0314 0.031366293 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 177.16 177.16 2;3 0 184048 QUIQUE_DMIX5_190116_001 303.51 258.01 499040000 0 7443800 8152400 0 30203000 0 0 0 72561000 0 284850000 58441000 37392000 8021 50;1314 7493 71804;71805;71806;71807;71808;71809;71810;71811;71812;71813;71814;71815 91478;91479;91480;91481;91482;91483;91484;91485;91486;91487;91488;91489;91490;91491;91492;91493;91494;91495 91487 18 DTELAEELLQWFLQEEKR Unmodified 2276.1325 0.13247732 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 171 171 3 1.4367E-45 175359 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.69 156.32 2605600000 0 0 66494000 0 0 0 75645000 0 237550000 0 849900000 1223100000 152940000 8022 50;1314 7494 71816;71817;71818;71819;71820;71821 91496;91497;91498;91499;91500;91501 91498 6 DTELIYGAK Unmodified 1008.5128 0.51277632 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 51.781 51.781 2 0.0018944 50305 QUIQUE_C1218_190116_001 98.997 24.581 123660000 71353000 0 0 52307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8023 699 7495 71822;71823;71824 91502;91503;91504 91502 2 DTEMLATGAQDGK Unmodified 1335.5976 0.59764493 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 38.105 38.105 2 2.116E-05 34937 QUIQUE_C1218_190116_001 110.84 92.232 37556000 0 0 37556000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8024 3217 7496 71825;71826;71827;71828 91505;91506;91507;91508 91505 4 DTEPGPASGGTLGPSGEEAPRPR Unmodified 2234.0564 0.056352265 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.291 47.291 3 7.8717E-14 44408 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.39 94.261 885260000 74285000 0 0 92282000 0 0 0 170100000 139450000 30049000 108370000 71623000 199100000 8025 67 7497 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91558;91559;91560;91561;91562;91563;91564;91565;91566 91561 160 8 DTFEHDPSESIDEFNK Unmodified 1908.8014 0.80136636 4332 Q9NYF8;A0A1W2PQ43;E9PK09;E9PQN2;E9PKI6;E9PK91;E9PJA7 BCLAF1 Bcl-2-associated transcription factor 1 yes no 0 0 0 1 78.96 78.96 3 0.050259 81285 QUIQUE_C1438_190116_001 29.077 26.425 30643000 0 0 0 0 30643000 0 0 0 0 0 0 0 0 8030 4332 7501 71874 91567 91567 1 DTFFQNPQYIFEVK Unmodified 1774.8566 0.85663681 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 146.14 146.14 2 0.00029535 150427 QUIQUE_C1403_190116_001 109.39 95.569 702860000 0 83150000 89350000 91347000 70559000 63288000 0 61941000 107140000 43768000 0 0 92315000 8031 877 7502 71875;71876;71877;71878;71879;71880;71881;71882;71883;71884 91568;91569;91570;91571;91572;91573;91574;91575;91576;91577;91578 91572 9 DTFNHLTTWLEDAR Unmodified 1717.806 0.80599822 2707 P61019;E9PKL7;H7C125 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 3 1 126.47 126.47 2;3 5.1155E-14 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91607;91608;91609;91610;91611;91612;91613;91614;91615;91616;91617;91618;91619;91620;91621;91622;91623;91624 91620 18 DTFTPSGQEPILTEKETELK Unmodified 2262.1267 0.12672324 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 87.332 87.332 3 0.00067585 88187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.053 38.683 26077000 0 0 0 0 0 0 0 26077000 0 0 0 0 0 8034 2009 7505 71923 91625 91625 1 DTFTPSGQEPILTEKETELKLEEK Unmodified 2761.3909 0.39093643 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 2 1 1 1 93.69 93.69 3 1.2637E-05 95278 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.425 58.627 250730000 0 0 0 0 0 0 0 146070000 47634000 0 0 0 57027000 8035 2009 7506 71924;71925;71926 91626;91627;91628 91626 3 DTGEGYQTPNIILDIQPGGNHVIEDSHKK Unmodified 3174.5582 0.55816997 3239 Q4J6C6;H7C0M0 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes no 0 0 1 1 1 92.67 92.67 4 0.026625 95368 QUIQUE_DMIX3_190116_001 19.22 12.992 138040000 0 0 0 0 0 0 0 0 72130000 0 65905000 0 0 8036 3239 7507 71927;71928 91629;91630 91629 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91716;91717;91718;91719;91720;91721;91722;91723;91724;91725;91726;91727;91728 91721 13 DTGQLYAALHHR Unmodified 1380.6898 0.68984625 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7EIJ4 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.294 42.294 3 0.0013661 38826 QUIQUE_C1277_190116_001 68.536 57.926 324140000 55986000 62949000 0 0 31059000 0 36908000 0 34114000 28679000 35207000 39239000 0 8042 665 7512 72008;72009;72010;72011;72012;72013;72014;72015 91729;91730;91731;91732;91733;91734;91735;91736 91730 6 DTHDQLSEPSEVR Unmodified 1511.6852 0.68521439 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 30.265 30.265 2;3 1.5353E-23 24296 QUIQUE_C1563_190116_001 172.8 155.78 11167000000 966420000 936390000 1425500000 563680000 424200000 221100000 1343100000 1146700000 1319500000 593500000 598630000 1240300000 388270000 8043 3117 7513 72016;72017;72018;72019;72020;72021;72022;72023;72024;72025;72026;72027;72028;72029;72030;72031;72032;72033;72034;72035;72036;72037 91737;91738;91739;91740;91741;91742;91743;91744;91745;91746;91747;91748;91749;91750;91751;91752;91753;91754;91755;91756;91757;91758;91759 91746 19 DTHEDHDTSTENTDESNHDPQFEPIVSLPEQEIK Unmodified 3932.7097 0.7096574 2464 P43487;C9JJ34 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 1 1 3 1 3 3 2 95.557 95.557 3;4;5 6.3491E-40 97255 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.58 100.97 2115500000 251400000 254810000 226080000 223250000 222880000 88749000 93210000 193170000 0 37028000 204810000 192740000 127400000 8044 2464 7514 72038;72039;72040;72041;72042;72043;72044;72045;72046;72047;72048;72049;72050;72051;72052;72053;72054;72055;72056;72057;72058;72059;72060;72061;72062;72063;72064;72065;72066 91760;91761;91762;91763;91764;91765;91766;91767;91768;91769;91770;91771;91772;91773;91774;91775;91776;91777;91778;91779;91780;91781;91782;91783;91784;91785;91786;91787;91788;91789;91790 91778 30 DTHLTITPTVLGER Unmodified 1551.8257 0.82567103 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 2 1 81.037 81.037 2;3 0.00012918 81426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.536 73.175 81640000 0 0 0 28883000 0 0 0 24705000 0 28052000 0 0 0 8045 212 7515 72067;72068;72069;72070 91791;91792;91793;91794;91795 91792 5 DTICNQDER Unmodified 1149.4721 0.47205049 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 0 1 15.505 15.505 2 0.023183 7540 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.91 46.703 25946000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25946000 0 0 0 8046 4495 7516 72071 91796 91796 1 DTIFDVPVER Unmodified 1189.5979 0.59790293 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.22 104.22 2 0.00025977 108228 QUIQUE_C1576_190116_001 117.04 108.82 2208500000 125720000 16813000 278780000 190870000 126670000 147470000 155640000 199760000 242400000 100370000 206640000 175380000 242000000 8047 1670 7517 72072;72073;72074;72075;72076;72077;72078;72079;72080;72081;72082;72083;72084 91797;91798;91799;91800;91801;91802;91803;91804;91805;91806;91807;91808;91809;91810;91811;91812;91813;91814;91815 91806 19 DTILAELLQIHK Unmodified 1392.7977 0.79766537 2478 P46100 ATRX Transcriptional regulator ATRX yes yes 0 0 0 1 1 141.36 141.36 3 0.00022903 144318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.187 78.653 13314000 0 0 0 0 0 0 0 13314000 0 0 0 0 0 8048 2478 7518 72085;72086 91816;91817 91816 2 DTILHDNLK Unmodified 1067.5611 0.56112349 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 32.888 32.888 2;3 0.00057289 27755 QUIQUE_C1277_190116_001 111.82 71.489 1067100000 89075000 173770000 105310000 181170000 0 114240000 111490000 48802000 146780000 51155000 0 45308000 0 8049 3063 7519 72087;72088;72089;72090;72091;72092;72093;72094;72095;72096;72097;72098;72099 91818;91819;91820;91821;91822;91823;91824;91825;91826;91827;91828;91829;91830 91819 9 DTILQLNLK Unmodified 1056.6179 0.61791009 2294;2556 P50148;P29992;K7EL62 GNAQ;GNA11 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.858 98.858 1;2 2.3339E-05 101561 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.33 96.309 1678200000 199800000 220950000 118030000 100880000 121340000 199620000 158760000 167280000 153880000 81930000 155710000 0 0 8050 2556;2294 7520 72100;72101;72102;72103;72104;72105;72106;72107;72108;72109;72110;72111 91831;91832;91833;91834;91835;91836;91837;91838;91839;91840;91841;91842;91843;91844;91845;91846;91847 91845 16 DTINTSCDIELLAACR Unmodified 1850.8502 0.85024758 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1;Q5JVM0 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 117.74 117.74 2 0.0016562 121100 QUIQUE_C1403_190116_001 63.091 50.531 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8051 153 7521 72112 91848 91848 1 DTIQHQQGEAVWVSEGK Unmodified 1910.9123 0.91225421 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 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MAVS Mitochondrial antiviral-signaling protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.36 137.36 3 2.6487E-05 143924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.68 108.91 137060000 19029000 0 0 21029000 17555000 0 0 0 23045000 0 21579000 16964000 17859000 8076 3460 7545 72275;72276;72277;72278;72279;72280;72281;72282 92045;92046;92047;92048;92049;92050;92051;92052 92050 8 DTMDLPEELPGVKPFTR Unmodified 1943.9663 0.96626362 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 118.27 118.27 3 0.00024641 122621 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.783 60.587 77733000 0 0 0 0 0 0 0 0 40480000 0 37253000 0 0 8077 2191 7546 72283;72284 92053;92054 92053 2 DTMSDQALEALSASLGTR Unmodified 1864.8837 0.8836562 240 E7ES10;E9PCH5;E7EVY3;B7Z574;A0A0C4DGB5;P20810;H0Y7F0;H0Y9H6;E9PDE4 CAST Calpastatin no no 0 0 0 1 1 153.3 153.3 3 0.00025164 158349 QUIQUE_C1218_190116_001 49.865 42.733 22524000 22524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8078 240 7547 72285;72286 92055;92056 92055 2 DTNGENIAESLVAEGLATR Unmodified 1958.9545 0.95451296 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 146.63 146.63 2;3 4.0212E-28 151916 QUIQUE_C1368_190116_001 173.36 151.72 885340000 83348000 81805000 115450000 96980000 90142000 27424000 77180000 90610000 0 32894000 96640000 0 92866000 8079 3432 7548 72287;72288;72289;72290;72291;72292;72293;72294;72295;72296;72297;72298;72299;72300;72301;72302;72303;72304;72305;72306;72307;72308 92057;92058;92059;92060;92061;92062;92063;92064;92065;92066;92067;92068;92069;92070;92071;92072;92073;92074;92075;92076;92077;92078;92079;92080;92081;92082 92062 25 DTNGSQFFITTVK Unmodified 1456.7198 0.71980898 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.208 98.208 2 8.6819E-06 102280 QUIQUE_C1218_190116_001 145.91 127.24 2622200000 174050000 208640000 216390000 201640000 191020000 178230000 217780000 240840000 261040000 0 218880000 271110000 242620000 8080 2210 7549 72309;72310;72311;72312;72313;72314;72315;72316;72317;72318;72319;72320 92083;92084;92085;92086;92087;92088;92089;92090;92091;92092;92093;92094;92095;92096 92084 14 DTNVMLVALAAK Unmodified 1244.6799 0.67985842 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 113.64 113.64 2 0.0016479 116792 QUIQUE_C1277_190116_001 79.986 65.983 63214000 0 25059000 0 0 0 0 0 29272000 0 8883000 0 0 0 8081 3037 7550 72321;72322;72323 92097;92098;92099 92097 2 DTNYTLNTDSLDWALYDHLMDFLADR Oxidation (M) 3133.3975 0.39749515 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 171.64 171.64 3 1.6844E-14 178968 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.131 75.424 54758000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54758000 0 0 8082 2906 7551 72324 92100 92100 2383 1 DTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHAR Unmodified 3160.6557 0.65569917 2551 P49841;A0A3B3ITW1 GSK3B Glycogen synthase kinase-3 beta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 166.08 166.08 3;4 2.0708E-13 171017 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95.492 2;3 1.1812E-46 97241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.39 178.04 3071300000 170260000 285580000 218280000 147890000 234950000 140320000 218030000 271940000 265090000 58527000 399310000 365670000 295440000 8087 856 7556 72370;72371;72372;72373;72374;72375;72376;72377;72378;72379;72380;72381;72382;72383;72384;72385;72386;72387;72388;72389;72390;72391;72392;72393 92154;92155;92156;92157;92158;92159;92160;92161;92162;92163;92164;92165;92166;92167;92168;92169;92170;92171;92172;92173;92174;92175;92176;92177;92178;92179;92180 92169 26 DTPGFIVNR Unmodified 1017.5243 0.52434406 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQV5;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.806 60.806 2 0.00042351 59788 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.57 84.742 3599700000 0 299590000 384370000 310780000 338290000 346420000 288660000 219620000 361200000 0 390520000 287560000 372690000 8088 913 7557 72394;72395;72396;72397;72398;72399;72400;72401;72402;72403;72404 92181;92182;92183;92184;92185;92186;92187;92188;92189;92190;92191;92192;92193;92194;92195;92196;92197;92198;92199 92198 18 DTPGHGSGWAETPR Unmodified 1466.6539 0.65385468 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 29.194 29.194 3 0.044981 23654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 32.341 17.139 82863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44997000 0 37866000 8089 1644 7558 72405;72406 92200;92201 92201 1 DTPGLHIGKPENK Unmodified 1404.7361 0.73612775 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 22.808 22.808 2;3 0.00078768 15826 QUIQUE_C1563_190116_001 81.494 59.863 689930000 28149000 63237000 0 97114000 30106000 102240000 116240000 0 107040000 0 63314000 0 82485000 8090 2470 7559 72407;72408;72409;72410;72411;72412;72413;72414;72415;72416;72417;72418 92202;92203;92204;92205;92206;92207;92208;92209;92210;92211;92212;92213;92214 92207 13 DTPQEMEQTR Unmodified 1233.5296 0.52956537 196 A0A0A0MTN0;Q13617 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 25.149 25.149 2 0.027566 18928 QUIQUE_C1218_190116_001 76.827 65.467 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8091 196 7560 72419 92215 92215 1 DTPTQEDWLVSVLPEGSR Unmodified 2027.98 0.97999942 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2;Q5T6H3 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 3 3 1 147.31 147.31 2;3 1.2209E-17 152444 QUIQUE_C1368_190116_001 136.39 114.2 1272800000 135890000 117490000 123130000 100430000 134180000 95002000 126760000 68708000 0 59628000 119280000 89504000 102780000 8092 4259 7561 72420;72421;72422;72423;72424;72425;72426;72427;72428;72429;72430;72431;72432;72433;72434;72435;72436;72437;72438;72439;72440;72441;72442;72443;72444;72445;72446 92216;92217;92218;92219;92220;92221;92222;92223;92224;92225;92226;92227;92228;92229;92230;92231;92232;92233;92234;92235;92236;92237;92238;92239;92240;92241;92242;92243;92244;92245;92246;92247;92248 92223 30 DTPTSAGPNSFNK Unmodified 1334.6103 0.61025853 3710 Q8WW12 PCNP PEST proteolytic signal-containing nuclear protein yes yes 0 0 0 1 1 31.462 31.462 2 0.015854 26740 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.286 37.617 69496000 0 0 0 0 0 0 0 35661000 0 0 0 0 33835000 8093 3710 7562 72447;72448 92249;92250;92251 92250 3 DTQDIVHDLESPGIDPSIIK Unmodified 2191.1008 0.10084284 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 2 135 135 2;3 0.00078513 141973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.163 84.893 110710000 0 0 0 0 0 0 0 0 32593000 0 78118000 0 0 8094 1187 7563 72449;72450;72451 92252;92253;92254 92253 2 DTQEVPLEK Unmodified 1057.5292 0.52915466 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 32.086 32.086 2 0.0091346 27172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.825 44.47 200720000 65064000 51765000 0 0 0 39474000 0 0 44412000 0 0 0 0 8095 4075 7564 72452;72453;72454;72455 92255;92256;92257;92258 92258 4 DTQFSYAVFK Unmodified 1204.5764 0.57643921 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.363 98.363 2 0.0015465 100165 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.95 83.773 1043000000 166580000 152380000 0 128930000 0 0 0 99796000 124560000 69379000 113170000 0 188180000 8096 3787 7565 72456;72457;72458;72459;72460;72461;72462;72463 92259;92260;92261;92262;92263;92264;92265;92266 92262 7 DTQSGSLLFIGR Unmodified 1292.6725 0.67246486 2565 P50454;E9PKH2;H0YEP8 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.94 104.94 2 3.2589E-05 107641 QUIQUE_C1403_190116_001 150.08 74.337 183690000 31265000 0 0 42351000 0 0 25878000 0 33356000 16046000 34798000 0 0 8097 2565 7566 72464;72465;72466;72467;72468;72469;72470 92267;92268;92269;92270;92271;92272;92273 92268 7 DTSASAVAVGLK Unmodified 1117.5979 0.59790293 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.192 51.192 2 0.0032626 48801 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.4 62.15 3805400000 393520000 339720000 0 408820000 326040000 337100000 0 313290000 428910000 0 467240000 381460000 409350000 8098 1153 7567 72471;72472;72473;72474;72475;72476;72477;72478;72479;72480 92274;92275;92276;92277;92278;92279;92280;92281;92282;92283 92283 1 DTSEDIEELVEPVAAHGPK Unmodified 2034.9746 0.9745797 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.07 117.07 3 1.0908E-08 121116 QUIQUE_C1277_190116_001 84.829 80.988 1511100000 125020000 127430000 135020000 111460000 170490000 81988000 134120000 97721000 88919000 43723000 148830000 108940000 137440000 8099 3954 7568 72481;72482;72483;72484;72485;72486;72487;72488;72489;72490;72491;72492;72493 92284;92285;92286;92287;92288;92289;92290;92291;92292;92293;92294;92295;92296;92297;92298;92299;92300;92301;92302;92303;92304;92305;92306 92287 23 DTSFEQHVLWHTGGK Unmodified 1740.822 0.82198264 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 62.519 62.519 2;3 3.5423E-09 62467 QUIQUE_C1576_190116_001 146.08 132.4 631720000 0 0 0 0 167120000 53759000 186430000 0 0 0 191760000 32661000 0 8100 2524 7569 72494;72495;72496;72497;72498;72499 92307;92308;92309;92310;92311;92312 92310 5 DTSFSGLSLEEYK Unmodified 1474.6828 0.68275477 3323 Q5TAQ0;V5IRT4;Q9BRT2 UQCC2 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2 yes no 0 0 0 1 2 1 108.7 108.7 2 0.0015602 113933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.687 75.032 122860000 0 38861000 0 0 0 0 0 0 0 0 54824000 29174000 0 8101 3323 7570 72500;72501;72502;72503 92313;92314;92315;92316 92314 3 DTSISCYK Unmodified 972.42225 0.42224675 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 25.727 25.727 2 0.032902 20254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.038 29.42 103600000 0 0 0 0 0 0 0 40602000 0 0 0 0 63003000 8102 3800 7571 72504;72505 92317;92318 92317 2 DTSITGELEK Unmodified 1091.5346 0.53463397 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 52.597 52.597 2 0.0015194 50666 QUIQUE_C1277_190116_001 96.668 52.221 76721000 0 49366000 0 0 27354000 0 0 0 0 0 0 0 0 8103 2385 7572 72506;72507;72508;72509 92319;92320;92321;92322 92320 4 DTSLYRPALEELR Unmodified 1561.81 0.81002097 2976 Q13200;C9JPC0;H7C2Q3 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 86.027 86.027 3 0.00071718 87380 QUIQUE_C1277_190116_001 82.202 70.51 176020000 57459000 45731000 0 47585000 0 0 0 0 0 25242000 0 0 0 8104 2976 7573 72510;72511;72512;72513 92323;92324;92325;92326 92324 4 DTSLYRPALEELRR Unmodified 1717.9111 0.911132 2976 Q13200;C9JPC0;H7C2Q3 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 2 1 72.18 72.18 4 0.0028642 71668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.078 65.817 35133000 0 0 0 0 0 0 0 35133000 0 0 0 0 0 8105 2976 7574 72514 92327 92327 0 DTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIK Unmodified 2600.2395 0.23946159 2852;745 Q01085;E7ETJ9;E7ETC0;A6NKZ9;C9JTN7;H7BY49 TIAL1;TIA1 Nucleolysin TIAR no no 0 0 0 1 1 1 1 114.38 114.38 3;4 9.8874E-05 120011 QUIQUE_C1438_190116_001 39.506 31.973 226500000 0 50461000 53591000 0 66281000 0 0 0 0 0 56171000 0 0 8106 2852;745 7575 72515;72516;72517;72518 92328;92329;92330;92331 92330 3 DTSVLQWR Unmodified 1003.5087 0.50869399 1757 O95834 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.008 80.008 2 0.016585 81643 QUIQUE_C1218_190116_001 82.913 58.71 95847000 21623000 0 28405000 0 0 0 0 22254000 0 23566000 0 0 0 8107 1757 7576 72519;72520;72521;72522;72523;72524 92332;92333;92334;92335;92336;92337 92332 6 DTSYLFITGPDVVK Unmodified 1553.7977 0.79772495 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.78 129.78 2 0.00082664 132455 QUIQUE_C1563_190116_001 81.09 75.309 550590000 79001000 0 126060000 68502000 73208000 75376000 0 0 0 39669000 0 88769000 0 8108 739 7577 72525;72526;72527;72528;72529;72530;72531 92338;92339;92340;92341;92342;92343;92344 92342 4 DTTALSFFHMLNGAALR Unmodified 1863.9302 0.93015288 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 148.25 148.25 3 2.3035E-07 153738 QUIQUE_C1368_190116_001 106.42 98.173 167350000 0 39737000 36835000 0 0 43423000 0 47359000 0 0 0 0 0 8109 2452 7578 72532;72533;72534;72535 92345;92346;92347;92348 92346 3 DTTINEIEDTFR Unmodified 1452.6733 0.67325272 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 127.18 127.18 2 1.7809E-45 132790 QUIQUE_C1218_190116_001 200.71 174.27 1667300000 172620000 194430000 130330000 63047000 113460000 96304000 140150000 109630000 151140000 46451000 158470000 135160000 156140000 8110 3204 7579 72536;72537;72538;72539;72540;72541;72542;72543;72544;72545;72546;72547;72548;72549 92349;92350;92351;92352;92353;92354;92355;92356;92357;92358;92359;92360;92361;92362;92363;92364;92365;92366;92367 92350 18 DTTPDELLSAVMTAVLK Unmodified 1802.9336 0.9335665 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4;F2Z2Q6;F2Z3P7 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 177.44 177.44 2;3 8.0049E-05 184168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.813 54.021 765300000 25285000 89399000 0 0 119720000 0 34474000 39149000 182930000 0 140110000 134230000 0 8111 1956 7580 72550;72551;72552;72553;72554;72555;72556;72557;72558;72559;72560;72561;72562 92368;92369;92370;92371;92372;92373;92374;92375;92376;92377;92378;92379;92380;92381;92382;92383 92382 15 DTTPDELLSAVMTAVLK Oxidation (M) 1818.9285 0.92848113 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4;F2Z2Q6;F2Z3P7 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 1 0 1 167.13 167.13 2 0.021493 170104 QUIQUE_C1403_190116_001 66.393 51.493 12271000 0 0 0 12271000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8112 1956 7580 72563 92384 92384 0 DTTPLNVLCSPGIQVVSVGIK Unmodified 2196.1824 0.1824044 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 149 149 2;3 1.3856E-07 153063 QUIQUE_C1403_190116_001 108.89 94.636 2389100000 286950000 123550000 110500000 221150000 547830000 284630000 133300000 47195000 72574000 130080000 112940000 103920000 214480000 8113 96 7581 72564;72565;72566;72567;72568;72569;72570;72571;72572;72573;72574;72575;72576;72577;72578;72579;72580;72581 92385;92386;92387;92388;92389;92390;92391;92392;92393;92394;92395;92396;92397;92398;92399;92400;92401;92402;92403;92404 92390 19 DTTSPMELAALEK Unmodified 1404.6806 0.68064628 3415 Q6VY07 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 98.298 98.298 2 0.022186 100898 QUIQUE_C1403_190116_001 51.013 32.332 107360000 0 0 0 42850000 0 0 30963000 0 0 0 0 0 33550000 8114 3415 7582 72582;72583;72584 92405;92406;92407 92405 3 DTTVGTLSQR Unmodified 1076.5462 0.54620171 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 30.844 30.844 2 0.001841 25673 QUIQUE_C1218_190116_001 93.267 69.743 286390000 161010000 0 0 125370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8115 2589 7583 72585;72586 92408;92409 92408 2 DTTVIIWQVDPDTHLLK Unmodified 1993.052 0.052042156 4182 Q9H7D7;H0Y9R3 WDR26 WD repeat-containing protein 26 yes no 0 0 0 1 132.03 132.03 3 0.002157 135766 QUIQUE_C1403_190116_001 37.583 28.651 15575000 0 0 0 15575000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8116 4182 7584 72587 92410 92410 1 DTTYWCQMFK Unmodified 1378.5686 0.56859341 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 123.37 123.37 2 0.019072 128403 QUIQUE_C1218_190116_001 60.508 53.613 47833000 19010000 0 0 20654000 0 8169300 0 0 0 0 0 0 0 8117 3405 7585 72588;72589;72590 92411;92412;92413 92411 3 DTVASALMYHR Unmodified 1262.6078 0.60775611 3253 Q53GT1;C9J191 KLHL22 Kelch-like protein 22 yes no 0 0 0 1 1 62.057 62.057 3 0.025955 60819 QUIQUE_C1277_190116_001 29.245 18.148 28696000 11261000 17435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8118 3253 7586 72591;72592 92414;92415 92415 2 DTVATQLSEAVDATR Unmodified 1575.774 0.77402939 1586 O60664;K7ERZ3;K7EL96 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 2 1 2 2 104.74 104.74 2;3 1.0326E-23 101645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.06 124.67 280090000 0 0 0 12719000 0 12700000 0 181390000 0 73280000 0 0 0 8119 1586 7587 72593;72594;72595;72596;72597;72598;72599 92416;92417;92418;92419;92420;92421;92422 92421 6 DTVCSGVTGAANVAK Unmodified 1448.6929 0.6929423 302 A0A0J9YXN7;Q96Q06 PLIN4 Perilipin-4 yes no 0 0 0 1 46.5 46.5 2 0.0018611 43251 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.813 65.509 24615000 0 0 0 0 0 0 0 24615000 0 0 0 0 0 8120 302 7588 72600 92423 92423 1 DTVFALVNYIFFK Unmodified 1575.8337 0.83371653 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.7 174.7 2;3 5.0769E-07 179603 QUIQUE_C1576_190116_001 160.59 137.27 523080000 0 2022700 140900000 15676000 0 0 205490000 27929000 65883000 0 0 0 65177000 8121 4;1799 7589 72601;72602;72603;72604;72605;72606;72607;72608;72609 92424;92425;92426;92427;92428;92429;92430;92431;92432;92433;92434;92435 92429 12 DTVIKPLLVEPEGLEK Unmodified 1779.003 0.002966698 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 101.15 101.15 2;3 2.2475E-05 105427 QUIQUE_C1438_190116_001 107.53 101.5 1984700000 207240000 214090000 218340000 66238000 370330000 0 66300000 0 128870000 89233000 330190000 0 293910000 8122 1802 7590 72610;72611;72612;72613;72614;72615;72616;72617;72618;72619;72620;72621;72622;72623;72624;72625;72626;72627 92436;92437;92438;92439;92440;92441;92442;92443;92444;92445;92446;92447;92448;92449;92450;92451;92452;92453 92444 17 DTVTISGPQAPVFEFVEQLR Unmodified 2232.1426 0.14264808 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 166.57 166.57 2;3 1.2886E-56 171332 QUIQUE_C1218_190116_001 174.62 159.23 603350000 114180000 142540000 93113000 0 61694000 62600000 79876000 0 0 49341000 0 0 0 8123 2524 7591 72628;72629;72630;72631;72632;72633;72634;72635;72636;72637;72638;72639;72640;72641 92454;92455;92456;92457;92458;92459;92460;92461;92462;92463;92464;92465;92466;92467;92468;92469;92470 92456 14 DTVTISGPQAPVFEFVEQLRK Unmodified 2360.2376 0.23761109 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 151.36 151.36 3 2.6574E-14 154551 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.352 80.076 386130000 0 0 0 0 0 0 0 111780000 83085000 0 107910000 83367000 0 8124 2524 7592 72642;72643;72644;72645 92471;92472;92473;92474;92475;92476 92471 6 DTVYAVIPAEK Unmodified 1204.634 0.63395408 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.663 72.663 2 0.0038143 74120 QUIQUE_C1218_190116_001 90.263 57.942 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8125 1253 7593 72646;72647;72648;72649;72650;72651;72652 92477;92478;92479;92480;92481;92482;92483 92477 7 DTWVEHWPEEDECQDEENQK Unmodified 2602.019 0.01904006 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain 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Unmodified 1763.9054 0.90537792 1392 O00267 SUPT5H Transcription elongation factor SPT5 yes yes 0 0 0 1 104.8 104.8 2 0.055619 108343 QUIQUE_C1218_190116_001 44.616 19.824 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8129 1392 7597 72659 92490 92490 1 DTYMLSSTVSSK Unmodified 1317.6122 0.61223236 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 61.809 61.809 2 0.020086 57578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.567 41.326 29525000 0 0 0 19373000 0 0 0 0 0 10152000 0 0 0 8130 3857 7598 72660;72661 92491;92492 92492 1 DTYSWLLK Unmodified 1024.5229 0.52294707 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.04 112.04 2 0.0068059 116034 QUIQUE_C1368_190116_001 100.39 84.758 135740000 0 0 88944000 0 22489000 0 24312000 0 0 0 0 0 0 8131 2168 7599 72662;72663;72664;72665 92493;92494;92495;92496;92497 92494 5 DTYYDTPELSLMQADHWLR Unmodified 2353.0685 0.068496856 4028 Q9BU02;G3V5B9;G3V5Q5 THTPA 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92634;92635;92636;92637;92638;92639;92640;92641;92642;92643;92644;92645;92646;92647;92648;92649;92650;92651;92652;92653;92654;92655;92656;92657;92658;92659;92660;92661;92662;92663;92664;92665;92666;92667;92668;92669;92670;92671;92672;92673;92674;92675;92676;92677;92678;92679;92680;92681;92682;92683;92684;92685;92686;92687;92688;92689;92690;92691;92692;92693;92694;92695;92696;92697;92698;92699;92700;92701;92702;92703;92704;92705;92706;92707;92708;92709;92710 92648 77 DVAEVDTVR Unmodified 1002.4982 0.49818889 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.581 34.581 2 0.00049432 29792 QUIQUE_C1368_190116_001 127.56 83.757 1484700000 0 0 451580000 0 0 0 0 280590000 0 330390000 422150000 0 0 8136 3117 7604 72830;72831;72832;72833 92711;92712;92713;92714;92715;92716 92712 6 DVAEVDTVRR Unmodified 1158.5993 0.59929991 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 23.262 23.262 2;3 0.00025508 16508 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.12 84.763 4808500000 0 0 0 65246000 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1 1 43.476 43.476 2 0.017384 40754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.635 65.588 2241000000 274780000 205500000 215000000 132970000 0 0 188230000 193640000 225340000 0 261480000 249460000 294590000 8153 2890 7621 73019;73020;73021;73022;73023;73024;73025;73026;73027;73028 92926;92927;92928;92929;92930;92931;92932;92933;92934;92935;92936 92932 11 DVCIVLAK Unmodified 916.50519 0.50518852 4591 Q9Y3E7;A0A140T963 CHMP3 Charged multivesicular body protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 62.847 62.847 2 0.0304 58666 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.993 0 72235000 21128000 32074000 0 0 0 0 0 0 0 19033000 0 0 0 8154 4591 7622 73029;73030;73031 92937;92938;92939 92939 3 DVCLYPR Unmodified 921.43784 0.43783723 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.531 54.531 2 0.029287 52521 QUIQUE_C1277_190116_001 91.584 55.028 511980000 120200000 131230000 99389000 90074000 0 71088000 0 0 0 0 0 0 0 8155 1553 7623 73032;73033;73034;73035;73036 92940;92941;92942;92943;92944 92941 5 DVCTELLPLIK Unmodified 1299.7108 0.7108242 2102 P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.98 134.98 2 0.00046613 141321 QUIQUE_C1438_190116_001 110.87 78.937 571370000 40264000 51714000 64275000 76152000 61724000 90562000 59016000 0 34663000 41204000 0 17364000 34427000 8156 2102 7624 73037;73038;73039;73040;73041;73042;73043;73044;73045;73046;73047;73048 92945;92946;92947;92948;92949;92950;92951;92952;92953;92954;92955;92956;92957;92958;92959;92960 92952 16 DVCTELLPLIKPQGR Unmodified 1737.9447 0.94474031 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 115.84 115.84 2;3 7.6502E-30 119766 QUIQUE_DMIX3_190116_001 189.72 183.06 17714000000 554020000 1118900000 1334400000 1276000000 1661700000 1191100000 1742800000 1395200000 1802000000 483590000 1511700000 1464400000 2178400000 8157 2102 7625 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QUIQUE_C1576_190116_001 206.97 162.65 12418000000 910650000 1200600000 1002700000 947260000 946240000 926940000 1319100000 931470000 958330000 517340000 772760000 1009600000 975310000 8161 267;275;3025 7629 73104;73105;73106;73107;73108;73109;73110;73111;73112;73113;73114;73115;73116;73117;73118;73119;73120;73121;73122;73123;73124;73125;73126 93051;93052;93053;93054;93055;93056;93057;93058;93059;93060;93061;93062;93063;93064;93065;93066;93067;93068;93069;93070;93071;93072;93073;93074;93075;93076;93077;93078;93079;93080;93081;93082;93083;93084;93085;93086;93087;93088;93089;93090;93091;93092;93093;93094;93095;93096 93074 44 DVDETGITVASLER Unmodified 1503.7417 0.74166663 3696 Q8WU90;H7C466 ZC3H15 Zinc finger CCCH domain-containing protein 15 yes no 0 0 0 1 1 97.123 97.123 2 0.0098645 99823 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.087 39.061 54103000 0 0 0 0 0 0 32942000 0 0 0 0 0 21162000 8162 3696 7630 73127;73128 93097;93098 93098 1 DVDETISWIK Unmodified 1204.5976 0.59756858 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 108.37 108.37 1;2 2.6725E-10 113163 QUIQUE_C1576_190116_001 190.02 147.42 17651000000 975210000 1501200000 1436300000 1143100000 1692200000 1176300000 1506500000 1119500000 1575900000 589640000 1694800000 1456200000 1784500000 8163 267;275;3025 7631 73129;73130;73131;73132;73133;73134;73135;73136;73137;73138;73139;73140;73141;73142;73143;73144;73145;73146;73147;73148;73149 93099;93100;93101;93102;93103;93104;93105;93106;93107;93108;93109;93110;93111;93112;93113;93114;93115;93116;93117;93118;93119;93120;93121;93122;93123;93124;93125;93126 93112 20 DVDFELIK Unmodified 977.50696 0.50696266 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.03 102.03 2 0.0068603 106032 QUIQUE_C1218_190116_001 100.19 42.907 1336500000 191890000 242110000 0 172150000 219040000 187150000 212120000 0 0 112040000 0 0 0 8164 2514 7632 73150;73151;73152;73153;73154;73155;73156;73157 93127;93128;93129;93130;93131;93132;93133;93134;93135;93136 93128 10 DVDFELIKVEGK Unmodified 1390.7344 0.73439641 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.878 95.878 3 0.00066757 99689 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.169 74.381 322220000 0 0 0 0 23739000 0 0 64092000 54886000 0 91617000 40202000 47681000 8165 2514 7633 73158;73159;73160;73161;73162;73163 93137;93138;93139;93140;93141;93142 93140 6 DVDGATLAR Unmodified 916.46141 0.46140945 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 29.863 29.863 1;2 0.00016097 24004 QUIQUE_C1277_190116_001 165.11 66.115 4189200000 1219100000 123800000 0 0 0 94646000 970270000 616270000 0 423820000 0 741280000 0 8166 3176 7634 73164;73165;73166;73167;73168;73169;73170;73171;73172;73173 93143;93144;93145;93146;93147;93148;93149;93150;93151;93152 93145 4 DVDGAYMTK Unmodified 998.4379 0.43789681 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 32.663 32.663 1;2 0.010177 27265 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.486 42.131 1897800000 0 96260000 45705000 0 176170000 95846000 0 166590000 168600000 226870000 303260000 272280000 346200000 + 8167 1859 7635 73174;73175;73176;73177;73178;73179;73180;73181;73182;73183;73184 93153;93154;93155;93156;93157;93158;93159;93160;93161;93162;93163 93162 9 DVDGLTSINAGK Unmodified 1188.5986 0.59863121 1005 F5H2F4;V9GY75 MTHFD1 yes no 0 0 0 1 60.187 60.187 2 0.0049359 59618 QUIQUE_C1368_190116_001 83.869 67.329 110110000 0 0 110110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8168 1005 7636 73185 93164 93164 0 DVDGLTSINAGR Unmodified 1216.6048 0.60477922 2027 P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 65.221 65.221 2 0.0022428 66474 QUIQUE_C1438_190116_001 76.143 64.096 259540000 0 0 0 0 117510000 0 0 0 0 0 0 0 142020000 8169 2027 7637 73186;73187 93165;93166 93165 1 DVDHLFQK Unmodified 1000.4978 0.49779495 2350 P32455;Q9H0R5;H3BNS1 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 42.271 42.271 2 0.04789 39476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.25 82.536 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8170 2350 7638 73188;73189 93167;93168 93167 2 DVDIIDHHDNTYTVK Unmodified 1783.8377 0.83769228 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 53.9 53.9 2;3 6.8887E-66 51761 QUIQUE_C1368_190116_001 202.32 165.74 2083000000 156860000 0 289410000 267960000 271680000 0 228330000 203210000 243420000 0 226860000 27265000 168050000 8171 2178 7639 73190;73191;73192;73193;73194;73195;73196;73197;73198;73199;73200;73201;73202;73203;73204;73205;73206;73207 93169;93170;93171;93172;93173;93174;93175;93176;93177;93178;93179;93180;93181;93182;93183;93184;93185;93186;93187 93171 14 DVDKFGNEITQLAR Unmodified 1604.8158 0.81583463 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 91.081 91.081 3 0.0012499 93446 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.92 56.502 116120000 0 0 0 25508000 0 0 0 0 0 0 50822000 0 39786000 8172 3660 7640 73208;73209;73210;73211;73212 93188;93189;93190;93191;93192 93190 5 DVDLEFLAK Unmodified 1048.5441 0.54407645 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 113.14 113.14 1;2 0.00042731 117030 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.29 93.068 4156600000 250220000 264930000 295360000 290700000 354510000 256460000 341390000 308890000 417660000 155040000 365380000 443500000 412550000 8173 2658 7641 73213;73214;73215;73216;73217;73218;73219;73220;73221;73222;73223;73224;73225;73226;73227;73228 93193;93194;93195;93196;93197;93198;93199;93200;93201;93202;93203;93204;93205;93206;93207;93208;93209;93210;93211;93212;93213;93214;93215;93216;93217;93218;93219;93220 93208 26 DVDNAYMIK Oxidation (M) 1083.4907 0.49066067 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 1 0 1 1 1 1 43.201 43.201 2 0.033651 39762 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.177 43.598 329190000 50905000 0 0 0 0 0 0 40490000 0 170100000 0 0 67699000 + 8174 781;782 7642 73229;73230;73231;73232 93221;93222;93223;93224 93222 4 DVDNAYMIK Unmodified 1067.4957 0.49574604 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 58.794 58.794 2 0.012308 54353 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.75 90.589 203830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87534000 0 116300000 0 + 8175 781;782 7642 73233;73234 93225;93226 93225 1 DVDNLFFLQGFLK Unmodified 1554.8082 0.80823006 1608 O75064;E9PAK5 DENND4B DENN domain-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 169.98 169.98 2 0.0011389 171649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.771 67.564 34323000 0 0 0 8313800 13388000 0 0 12621000 0 0 0 0 0 8176 1608 7643 73235;73236;73237 93227;93228;93229 93229 2 DVDPDVIQTHLDK Unmodified 1493.7362 0.73618733 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 64.828 64.828 3 0.064572 64766 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.532 22.055 37516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37516000 8177 2486 7644 73238 93230 93230 1 DVDQNLMDR Unmodified 1104.487 0.48697227 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.235 49.235 2 0.0010839 47536 QUIQUE_C1218_190116_001 107.01 78.833 245630000 67460000 47109000 39384000 0 49751000 0 41928000 0 0 0 0 0 0 8178 2008 7645 73239;73240;73241;73242;73243;73244;73245;73246 93231;93232;93233;93234;93235;93236;93237;93238 93231 8 DVDYVCISDNYWLGK Unmodified 1845.8244 0.82435041 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3QRA8;J3QRH4;J3KRJ8 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 140.68 140.68 2 3.4202E-13 147334 QUIQUE_C1438_190116_001 149.31 135.4 2219400000 150080000 166520000 177070000 146140000 143820000 213360000 194450000 167390000 178700000 116650000 208340000 196250000 160650000 8179 3897 7646 73247;73248;73249;73250;73251;73252;73253;73254;73255;73256;73257;73258;73259;73260 93239;93240;93241;93242;93243;93244;93245;93246;93247;93248;93249;93250;93251;93252;93253;93254;93255;93256;93257;93258;93259;93260;93261;93262;93263;93264;93265 93247 26 DVEDEETWIR Unmodified 1290.5728 0.57281039 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.23 87.23 2 1.8751E-11 88896 QUIQUE_C1403_190116_001 182.69 182.69 16555000000 1227000000 1423900000 1532000000 1286000000 1560700000 1275600000 1613200000 1338600000 1455900000 571350000 1169400000 1043600000 1058300000 8180 267;275;3025 7647 73261;73262;73263;73264;73265;73266;73267;73268;73269;73270;73271;73272;73273 93266;93267;93268;93269;93270;93271;93272;93273;93274;93275;93276;93277;93278;93279;93280;93281;93282;93283;93284;93285;93286;93287;93288;93289;93290;93291;93292;93293;93294;93295;93296;93297;93298;93299;93300;93301;93302 93275 37 DVEDEILWVGER Unmodified 1458.6991 0.69907354 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.86 135.86 2;3 2.3864E-08 139995 QUIQUE_C1277_190116_001 168.79 151.36 15965000000 1151100000 1286500000 1209100000 1158100000 1345200000 850280000 1303400000 1352800000 1469200000 537510000 1473900000 1481000000 1346700000 8181 2851 7648 73274;73275;73276;73277;73278;73279;73280;73281;73282;73283;73284;73285;73286;73287;73288;73289;73290;73291;73292;73293;73294;73295;73296;73297 93303;93304;93305;93306;93307;93308;93309;93310;93311;93312;93313;93314;93315;93316;93317;93318;93319;93320;93321;93322;93323;93324;93325;93326;93327;93328;93329;93330;93331;93332;93333;93334;93335;93336;93337;93338;93339;93340;93341;93342 93306 40 DVEDEILWVTER Unmodified 1502.7253 0.72528829 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 149.18 149.18 2;3 3.5974E-10 153630 QUIQUE_C1277_190116_001 157.24 128.52 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Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 123.48 123.48 3 0.001494 128631 QUIQUE_C1368_190116_001 42.172 38.934 38401000 0 0 38401000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8187 3813 7654 73342 93389 93389 1 DVEFEVVGDAPEK Unmodified 1432.6722 0.67219008 4408 Q9UBT2;U3KQ93 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 88.209 88.209 2 0.0013705 91158 QUIQUE_C1438_190116_001 87.363 60.849 60253000 60253000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8188 4408 7655 73343;73344;73345 93390;93391;93392 93391 3 DVEFLAQLK Unmodified 1061.5757 0.57571092 2806;2505 P78356;P48426;H7BXS3;S4R320 PIP4K2B;PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta;Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 108.35 108.35 2 0.0019615 111335 QUIQUE_C1403_190116_001 98.299 70.465 1319000000 117210000 122720000 117690000 78811000 0 96892000 126370000 136760000 111310000 51607000 133250000 130710000 95629000 8189 2806;2505 7656 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93448;93449;93450;93451;93452;93453;93454;93455;93456;93457;93458 93454 1881;1882 9 DVEMGNSVIEENEMK Unmodified 1722.7441 0.74405117 2457 P43003;A0A087X0U3;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.876 82.876 2 2.0459E-29 85027 QUIQUE_C1218_190116_001 166.16 152.26 714570000 63712000 50779000 86837000 92825000 37009000 62741000 44788000 50827000 71210000 20369000 47406000 37162000 48907000 8198 2457 7664 73405;73406;73407;73408;73409;73410;73411;73412;73413;73414;73415;73416;73417 93459;93460;93461;93462;93463;93464;93465;93466;93467;93468;93469;93470;93471;93472 93459 14 DVEPEDPMFLMDPFAIHR Unmodified 2157.9863 0.98634713 3156 Q15773;F5H7L5;F5H800;F5H0Y3 MLF2 Myeloid leukemia factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 158.52 158.52 2;3 0.00016394 162872 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.96 67.391 2840900000 84620000 108570000 100620000 87842000 52267000 70491000 130120000 63885000 92109000 13966000 140940000 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2 1 1 1 1 1 164.13 164.13 2;3 5.728E-20 170553 QUIQUE_C1438_190116_001 106.45 99.574 1244500000 129280000 98996000 88795000 151580000 251820000 132610000 113570000 0 37874000 35378000 83192000 59582000 61836000 8208 96 7673 73515;73516;73517;73518;73519;73520;73521;73522;73523;73524;73525;73526;73527;73528;73529;73530 93585;93586;93587;93588;93589;93590;93591;93592;93593;93594;93595;93596;93597;93598;93599;93600;93601 93590 14 DVFDFIPGSDQLNVISCQGLAPSQGRPGLSLVK Unmodified 3513.7926 0.79260335 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 158.46 158.46 3 7.5419E-07 163029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.482 48.216 245160000 0 0 0 0 99093000 0 0 0 0 0 51551000 55282000 39231000 8209 96 7674 73531;73532;73533;73534 93602;93603;93604;93605 93604 4 DVFEAFYK Unmodified 1017.4807 0.48074791 1310;3018 K4DI93;Q13620;Q13619;A0A0A0MR50 CUL4B;CUL4A Cullin-4B;Cullin-4A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.22 109.22 2 0.018957 112540 QUIQUE_C1277_190116_001 79.116 48.931 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p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 139.35 139.35 2;3 1.663E-13 143873 QUIQUE_C1277_190116_001 102.9 94.659 422440000 0 25452000 22065000 31626000 20884000 19519000 68689000 35126000 39919000 12035000 94723000 29210000 23190000 8214 2675 7678 73582;73583;73584;73585;73586;73587;73588;73589;73590;73591;73592;73593;73594;73595;73596 93661;93662;93663;93664;93665;93666;93667;93668;93669;93670;93671;93672;93673;93674;93675 93661 15 DVFIDSGGVR Unmodified 1063.5298 0.52982336 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 66.717 66.717 2 0.013076 66827 QUIQUE_C1218_190116_001 65.305 34.232 302390000 66414000 63005000 0 0 0 0 0 57471000 0 40411000 0 0 75085000 8215 3318 7679 73597;73598;73599;73600;73601 93676;93677;93678;93679;93680;93681 93676 5 DVFIDSGGVRR Unmodified 1219.6309 0.63093439 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 1 1 45.387 45.387 2 0.0098792 42030 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.056 3.5521 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Aminomethyltransferase;Aminomethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 178.47 178.47 3;4 1.8063E-06 185272 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.236 47.333 28421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28421000 0 0 8224 331 7687 73701;73702 93801;93802 93801 2 DVHNIYGLYVHMATADGLR Unmodified 2144.0473 0.047307904 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 3 2 1 120.59 120.59 2;3;4 1.866E-37 126029 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.26 118.17 1252900000 112520000 123760000 131980000 114420000 127570000 38577000 105830000 0 112080000 0 175280000 137900000 73024000 8225 956;3084 7688 73703;73704;73705;73706;73707;73708;73709;73710;73711;73712;73713;73714;73715;73716;73717;73718;73719;73720;73721;73722 93803;93804;93805;93806;93807;93808;93809;93810;93811;93812;93813;93814;93815;93816;93817;93818;93819;93820;93821;93822;93823;93824;93825;93826;93827;93828;93829;93830;93831;93832;93833;93834 93825 32 DVIAQSQSGTGK Unmodified 1189.5939 0.59388018 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.552 19.552 2 2.5819E-05 12523 QUIQUE_C1218_190116_001 140.16 116.74 674030000 95090000 92147000 96098000 89770000 91469000 0 83001000 0 95633000 30821000 0 0 0 8226 2416 7689 73723;73724;73725;73726;73727;73728;73729;73730 93835;93836;93837;93838;93839;93840;93841;93842 93835 3 DVIATDKEDVAFK Unmodified 1449.7351 0.73512469 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 1 3 3 4 4 4 3 4 3 2 5 4 2 3 57.355 57.355 2;3 2.0638E-16 56447 QUIQUE_C1218_190116_001 169.52 136.14 38222000000 3777300000 3883300000 3481800000 3310900000 3108000000 3019700000 3194700000 1394000000 2053500000 1782500000 3028200000 2595300000 3593100000 8227 720;2430;740 7690 73731;73732;73733;73734;73735;73736;73737;73738;73739;73740;73741;73742;73743;73744;73745;73746;73747;73748;73749;73750;73751;73752;73753;73754;73755;73756;73757;73758;73759;73760;73761;73762;73763;73764;73765;73766;73767;73768;73769;73770;73771;73772;73773;73774 93843;93844;93845;93846;93847;93848;93849;93850;93851;93852;93853;93854;93855;93856;93857;93858;93859;93860;93861;93862;93863;93864;93865;93866;93867;93868;93869;93870;93871;93872;93873;93874;93875;93876;93877;93878;93879;93880;93881;93882;93883;93884;93885;93886;93887;93888;93889;93890;93891;93892;93893;93894;93895;93896;93897;93898;93899;93900;93901;93902;93903;93904;93905;93906;93907;93908;93909;93910;93911;93912;93913;93914;93915;93916;93917;93918;93919;93920;93921;93922;93923;93924;93925 93846 83 DVIATDKEDVAFKDLDVAILVGSMPR Oxidation (M) 2832.4579 0.45791056 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 1 2 2 1 1 1 139.8 139.8 3;4 9.0565E-12 142855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.701 77.197 902040000 0 0 0 0 0 0 0 575030000 145090000 0 76473000 0 105450000 8228 720;2430;740 7691 73775;73776;73777;73778;73779 93926;93927;93928;93929;93930 93926 432 5 DVIATDKEDVAFKDLDVAILVGSMPR Unmodified 2816.463 0.46299594 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 2 1 1 1 1 1 150.28 150.28 3 4.7109E-113 153463 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.19 179.64 637950000 0 0 0 0 0 0 0 227650000 125510000 0 66552000 154830000 63414000 8229 720;2430;740 7691 73780;73781;73782;73783;73784 93931;93932;93933;93934;93935;93936 93931 6 DVIDEPIIEEPSR Unmodified 1510.7515 0.75150304 1561 O60216 RAD21 Double-strand-break repair protein rad21 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.747 93.747 2 0.00039329 95500 QUIQUE_C1403_190116_001 92.866 75.393 285420000 33619000 28729000 0 54100000 53588000 55632000 0 31517000 0 0 0 28231000 0 8230 1561 7692 73785;73786;73787;73788;73789;73790;73791 93937;93938;93939;93940;93941;93942;93943;93944 93939 8 DVIEEYFK Unmodified 1041.5019 0.50187728 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.89 103.89 2 0.010611 107442 QUIQUE_C1368_190116_001 91.041 73.006 2477200000 213260000 385400000 243840000 169950000 196710000 187270000 219980000 163120000 206430000 63163000 0 220480000 207560000 8231 2240 7693 73792;73793;73794;73795;73796;73797;73798;73799;73800;73801;73802;73803;73804 93945;93946;93947;93948;93949;93950;93951;93952;93953;93954;93955;93956;93957;93958;93959;93960;93961 93948 17 DVIELTDDSFDK Unmodified 1395.6406 0.64055561 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 1 1 1 105.5 105.5 2 0.0032982 109270 QUIQUE_C1218_190116_001 85.958 59.853 125500000 62484000 63017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8232 3109 7694 73805;73806;73807 93962;93963;93964 93962 3 DVIEPLFLLAEVEIPNIQK Unmodified 2179.214 0.21402211 862 F5H6L3;E7ERK8;Q17R89;J3KRS3 ARHGAP44 Rho GTPase-activating protein 44 yes no 0 0 0 2 174.15 174.15 2;3 0.00086612 181365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.11 81.381 21141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21141000 0 0 8233 862 7695 73808;73809 93965;93966 93965 1 DVIEQLNLVTTWLQLQIPR Unmodified 2278.2685 0.26851729 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 2 178.6 178.6 2;3 0.0001363 185345 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.644 60.532 136890000 0 0 9624300 0 0 0 0 0 0 0 127260000 0 0 8234 2901 7696 73810;73811;73812 93967;93968;93969 93968 2 DVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLK Unmodified 2640.366 0.36599951 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 91.721 91.721 4 0.028131 92606 QUIQUE_C1563_190116_001 24.303 16.681 72114000 0 0 0 0 0 72114000 0 0 0 0 0 0 0 8235 3217 7697 73813 93970 93970 1 DVIIADCGK Unmodified 989.48518 0.48518136 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.839 37.839 2 0.013805 34049 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94017;94018;94019;94020;94021;94022;94023;94024 94018 5 DVKPHNVMIDHEHR Unmodified 1725.8369 0.8369212 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 14.046 14.046 3;4 1.5381E-07 6246 QUIQUE_C1438_190116_001 126.48 121.58 688950000 136530000 87739000 0 62807000 46543000 136840000 88613000 31870000 12077000 7098800 30805000 48021000 0 8244 456 7706 73867;73868;73869;73870;73871;73872;73873;73874;73875;73876;73877;73878;73879;73880;73881;73882 94025;94026;94027;94028;94029;94030;94031;94032;94033;94034;94035;94036;94037;94038;94039;94040;94041 94030 13 DVKPHNVMIDHEHR Oxidation (M) 1741.8318 0.83183582 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 1 1 1 10.556 10.556 4 2.6577E-05 3010 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protein kinase kinase 1;Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 no no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 2 44.709 44.709 2;3 0.0001989 42164 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.83 78.778 2846100000 583770000 373590000 89341000 137210000 144510000 130170000 434030000 191300000 118800000 117860000 145240000 380300000 0 8248 2875;2395 7708 73898;73899;73900;73901;73902;73903;73904;73905;73906;73907;73908;73909;73910;73911;73912;73913 94057;94058;94059;94060;94061;94062;94063;94064;94065;94066;94067;94068;94069;94070;94071;94072;94073;94074 94069 12 DVKPSNVLINALGQVK Unmodified 1693.9727 0.97266962 2606 P52564 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.13 110.13 3 0.00083865 113453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.579 53.236 319900000 0 23578000 0 37249000 0 29749000 35873000 30998000 42942000 15689000 26295000 34618000 42909000 8249 2606 7709 73914;73915;73916;73917;73918;73919;73920;73921;73922;73923 94075;94076;94077;94078;94079;94080;94081;94082;94083;94084;94085 94085 11 DVLAEIPDQLVSYMK Unmodified 1719.8753 0.87532334 4225 Q9HCH3 CPNE5 Copine-5 yes yes 0 0 0 1 158.09 158.09 2 0.0476 162307 QUIQUE_C1277_190116_001 40.767 22.709 34734000 0 34734000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8250 4225 7710 73924 94086 94086 1 DVLAEIPEQFLSYMR Unmodified 1809.8971 0.89712142 853 E7ENV7;Q86YQ8 CPNE8 Copine-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 168.92 168.92 2 7.3101E-06 173464 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.49 96.487 22079000 0 0 0 0 0 0 0 0 22079000 0 0 0 0 8251 853 7711 73925;73926;73927;73928 94087;94088;94089;94090 94090 4 DVLAQITELHQNLDGLKK Unmodified 2034.111 0.11095402 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 115.91 115.91 3;4 0.031194 113598 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.603 21.002 35881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18878000 17003000 0 0 8252 2225 7712 73929;73930 94091;94092 94091 2 DVLASGFLTVLPHTDPR Unmodified 1836.9734 0.9733979 4025 Q9BTX7;Q5QPC2;A6PVK2 TTPAL Alpha-tocopherol transfer protein-like yes no 0 0 0 1 1 131.21 131.21 3 0.00033248 135611 QUIQUE_C1277_190116_001 65.225 48.541 41650000 0 22435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19215000 8253 4025 7713 73931;73932 94093;94094 94093 2 DVLCGYLLCTNIGNIPR Unmodified 1976.9812 0.98120217 4367 Q9P0K1;F8WAD8 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 144.32 144.32 2 4.7919E-07 148742 QUIQUE_C1277_190116_001 108.72 86.661 18442000 0 18442000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8254 4367 7714 73933 94095;94096 94096 2 DVLDNLFEK Unmodified 1091.5499 0.5498901 3466 Q7Z5R6 APBB1IP Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 124.09 124.09 2 0.044544 127551 QUIQUE_C1403_190116_001 52.255 31.63 25766000 0 0 0 25766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8255 3466 7715 73934 94097 94097 1 DVLEAIAETAFK Unmodified 1305.6816 0.68163256 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 154.15 154.15 2 0.00053744 159444 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 88.945 61283000 0 8079800 16777000 12758000 0 11946000 0 0 0 11721000 0 0 0 8256 2863 7716 73935;73936;73937;73938;73939;73940 94098;94099;94100;94101;94102;94103 94100 6 DVLEGYNGTIFAYGQTSSGK Unmodified 2105.9906 0.99056411 2355;1568 P33176;O60282 KIF5B;KIF5C Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C no no 0 0 0 1 1 1 125.93 125.93 2 0.00043272 128956 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.349 63.801 61142000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61142000 0 0 8257 2355;1568 7717 73941;73942;73943 94104;94105;94106 94105 3 DVLETFTVK Unmodified 1050.5597 0.55972651 415 A6NNI4;A0A2R8Y478;G8JLH6;P21926 CD9 Tetraspanin;CD9 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.023 93.023 2 0.01368 93679 QUIQUE_C1563_190116_001 69.598 42.073 670240000 76761000 107610000 122980000 0 0 100980000 0 85640000 116340000 59935000 0 0 0 8258 415 7718 73944;73945;73946;73947;73948;73949;73950 94107;94108;94109;94110;94111;94112;94113;94114 94111 7 DVLEVGELAK Unmodified 1071.5812 0.58119023 696 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dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 171.49 171.49 2;3 1.8053E-05 174836 QUIQUE_C1277_190116_001 89.846 86.748 740840000 57932000 51453000 80607000 44645000 73499000 66879000 48861000 18475000 138390000 0 101970000 12971000 45155000 8264 2602 7723 73988;73989;73990;73991;73992;73993;73994;73995;73996;73997;73998;73999;74000;74001;74002;74003;74004;74005;74006;74007 94153;94154;94155;94156;94157;94158;94159;94160;94161;94162;94163;94164;94165;94166;94167;94168;94169;94170;94171;94172 94156 16 DVLGTGAFSEVILAEDKR Unmodified 1919 6.5851E-06 3039 Q14012 CAMK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 126.93 126.93 2;3 2.0039E-32 132426 QUIQUE_C1218_190116_001 130.56 113.87 1030800000 88147000 101160000 99754000 79020000 61473000 78762000 114030000 0 107990000 39669000 71749000 76001000 113090000 8265 3039 7724 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94194;94195;94196;94197;94198;94199;94200;94201;94202;94203;94204;94205;94206;94207 94194 14 DVLLDVAYAYGK Unmodified 1325.6867 0.68671794 3790 Q969Z0;C9IZN7 TBRG4 Protein TBRG4 yes no 0 0 0 1 129.28 129.28 2 0.018378 132085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.102 42.59 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8268 3790 7727 74039 94208 94208 1 DVLLQVDDERR Unmodified 1356.6997 0.69974224 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 54.205 54.205 3 0.0062793 49218 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.915 23.338 29071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29071000 0 0 0 8269 2378 7728 74040 94209 94209 1 DVLLTELSNCTVR Unmodified 1518.7712 0.77119262 3162 Q15814 TBCC Tubulin-specific chaperone C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 112.38 112.38 2 1.2147E-06 116152 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.88 100.11 511530000 52988000 62423000 66345000 47953000 43158000 57688000 36907000 0 52204000 0 48071000 43794000 0 8270 3162 7729 74041;74042;74043;74044;74045;74046;74047;74048;74049;74050;74051;74052;74053 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94244;94245;94246;94247;94248;94249;94250;94251;94252;94253;94254;94255;94256 94246 13 DVLSPLRPSR Unmodified 1138.6459 0.64585618 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 1 1 1 48.072 48.072 3 0.032446 46321 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.715 28.138 44608000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19883000 0 24725000 8276 497 7734 74085;74086 94257;94258 94257 2 DVLSVAFSSDNR Unmodified 1308.631 0.63099397 2787 P63244;J3KPE3;H0YAF8;H0Y8W2;D6RHH4;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RFZ9;D6RAU2;E9PD14 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 100.52 100.52 2 3.3316E-20 102882 QUIQUE_C1403_190116_001 212.03 192.76 1160200000 85431000 112730000 94425000 119740000 63597000 107490000 73987000 101890000 60690000 65616000 89835000 85074000 99693000 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94285;94286;94287;94288;94289;94290;94291;94292;94293;94294;94295;94296;94297;94298;94299;94300;94301;94302;94303;94304;94305;94306;94307;94308;94309;94310;94311;94312;94313;94314;94315;94316;94317;94318;94319;94320;94321 94293 34 DVLTGQEFDVR Unmodified 1277.6252 0.62518031 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 89.383 89.383 2 0.022989 91465 QUIQUE_C1368_190116_001 67.207 46.336 111650000 0 0 63847000 0 0 0 47804000 0 0 0 0 0 0 8279 2463 7737 74127;74128 94322;94323 94322 2 DVLTSTYGATAETLSTSTTTHVTK Unmodified 2484.2231 0.22314282 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;H0Y482;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 103.65 103.65 2;3 3.516E-113 106564 QUIQUE_C1277_190116_001 252.47 239.59 3080500000 29588000 403490000 464020000 465060000 312920000 430060000 453380000 37967000 334150000 13034000 50492000 34412000 51970000 8280 1230;4172;346 7738 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74213;74214;74215;74216;74217;74218;74219 94429;94430;94431;94432;94433;94434;94435 94431 5 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITK Unmodified 2742.1814 0.18141394 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 117 117 2;3 2.2809E-13 120986 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.6 135.5 219790000 0 0 0 0 0 33624000 0 63796000 0 0 53667000 0 68698000 8290 2483 7746 74220;74221;74222;74223;74224 94436;94437;94438;94439;94440;94441;94442 94440 7 DVMWIGFLTR Unmodified 1236.6325 0.6325143 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 155.82 155.82 2 0.010435 160243 QUIQUE_C1277_190116_001 83.647 56.344 35396000 0 35396000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8291 341 7747 74225 94443;94444 94444 2 DVNAAIAAIK Unmodified 984.5604 0.56039521 2796 P68366 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 73.123 73.123 1;2 1.9862E-09 74621 QUIQUE_C1218_190116_001 179.8 57.289 24262000000 2193500000 2209200000 1995200000 1992400000 1812100000 1721900000 1967900000 1690600000 1304100000 1237600000 2184300000 1824200000 2128800000 8292 2796 7748 74226;74227;74228;74229;74230;74231;74232;74233;74234;74235;74236;74237;74238;74239;74240;74241;74242;74243;74244;74245;74246;74247;74248;74249;74250 94445;94446;94447;94448;94449;94450;94451;94452;94453;94454;94455;94456;94457;94458;94459;94460;94461;94462;94463;94464;94465;94466;94467;94468;94469;94470;94471;94472;94473;94474;94475;94476;94477;94478;94479;94480;94481;94482;94483;94484;94485;94486;94487 94446 31 DVNAAIATIK Unmodified 1014.571 0.5709599 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 2 1 3 1 2 63.816 63.816 1;2 1.5981E-11 63340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 219.03 90.649 307580000000 23985000000 24697000000 23687000000 22504000000 23548000000 22391000000 26654000000 21002000000 22475000000 13027000000 32840000000 23754000000 27017000000 8293 1990;2795;3430;3992 7749 74251;74252;74253;74254;74255;74256;74257;74258;74259;74260;74261;74262;74263;74264;74265;74266;74267;74268;74269;74270;74271 94488;94489;94490;94491;94492;94493;94494;94495;94496;94497;94498;94499;94500;94501;94502;94503;94504;94505;94506;94507;94508;94509;94510;94511;94512;94513;94514;94515;94516;94517;94518;94519;94520;94521;94522;94523;94524;94525;94526;94527;94528;94529;94530;94531;94532;94533;94534;94535;94536;94537;94538;94539 94529 52 DVNAAIATIKTK Unmodified 1243.7136 0.71360139 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 1 1 1 1 50.719 50.719 2 0.0054959 48721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.001 74.717 196950000 0 29129000 0 0 0 0 29966000 0 0 0 98586000 39270000 0 8294 1990;2795;3430;3992 7750 74272;74273;74274;74275;74276 94540;94541;94542;94543;94544;94545 94543 5 DVNCPFK Unmodified 878.39564 0.39563807 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 1 34.72 34.72 2 0.062217 29989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.398 39.976 40532000 0 0 0 0 0 0 0 40532000 0 0 0 0 0 8295 4535 7751 74277 94546 94546 1 DVNFEFPEFQL Unmodified 1383.6347 0.63468237 2738 P62081 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.23 173.23 2 0.00047031 180310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.68 80.169 1639900000 114120000 0 64565000 73146000 101840000 73015000 159570000 191750000 247760000 42571000 252690000 170310000 148600000 8296 2738 7752 74278;74279;74280;74281;74282;74283;74284;74285;74286;74287;74288;74289 94547;94548;94549;94550;94551;94552;94553;94554;94555;94556;94557;94558;94559 94556 11 DVNLRPEQLGDICVGNVLQPGAGAIMAR Unmodified 2962.5117 0.51169424 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.38 140.38 3 2.615E-108 146154 QUIQUE_C1218_190116_001 135.75 124.22 1014100000 115550000 169290000 135600000 118600000 104490000 115700000 0 0 0 0 103510000 0 151380000 8297 1956 7753 74290;74291;74292;74293;74294;74295;74296;74297 94560;94561;94562;94563;94564;94565;94566;94567;94568;94569;94570 94561 10 DVNLRPEQLGDICVGNVLQPGAGAIMAR Oxidation (M) 2978.5066 0.50660886 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 1 1 1 133.12 133.12 3 3.8937E-08 137400 QUIQUE_C1277_190116_001 62.683 47.073 50760000 0 50760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8298 1956 7753 74298 94571 94571 1212 1 DVNNFDQDFTR Unmodified 1369.5899 0.58985744 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.936 79.936 2 2.3701E-08 81755 QUIQUE_C1218_190116_001 155.06 139.44 289130000 36216000 43463000 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Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 179.42 179.42 3 0.0019812 183055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.569 41.935 22231000 0 0 0 0 0 0 0 0 10755000 0 11475000 0 0 8302 3071 7756 74316;74317 94590;94591 94590 2 DVNTDFLLILLK Unmodified 1402.8072 0.80716742 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 171.07 171.07 2 0.0002808 175443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.3 94.841 62136000 10945000 0 0 0 0 0 0 11862000 16461000 0 0 22869000 0 8303 1211 7757 74318;74319;74320;74321 94592;94593;94594;94595;94596 94594 5 DVNVAIAAIK Unmodified 1012.5917 0.59169534 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 76.291 76.291 1;2 0.0011141 78046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.54 62.75 5944800000 461560000 472790000 416860000 366050000 533050000 473430000 423700000 277620000 605980000 212210000 895410000 371230000 434900000 8304 688 7758 74322;74323;74324;74325;74326;74327;74328;74329;74330;74331;74332;74333;74334;74335;74336;74337;74338;74339 94597;94598;94599;94600;94601;94602;94603;94604;94605;94606;94607;94608;94609;94610;94611;94612;94613;94614;94615;94616;94617;94618;94619;94620;94621;94622;94623;94624 94621 23 DVNVNFEK Unmodified 963.46616 0.46616048 81 A0A087WYT3;Q15185;B4DDC6 PTGES3 Prostaglandin E synthase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.119 45.119 2 0.0079195 41788 QUIQUE_C1277_190116_001 96.253 61.445 1836800000 0 187770000 0 209770000 312060000 291230000 202350000 59151000 0 187280000 138790000 79616000 168750000 8305 81 7759 74340;74341;74342;74343;74344;74345;74346;74347;74348;74349 94625;94626;94627;94628;94629;94630;94631;94632;94633;94634;94635;94636 94625 10 DVPASGMYFMTYEWLK Unmodified 1936.8739 0.87394313 1552 O43772;C9JPE1 SLC25A20 Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.77 164.77 2 0.00022336 169832 QUIQUE_C1368_190116_001 88.552 77.704 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94647;94648;94649;94650;94651;94652;94653;94654;94655;94656;94657;94658;94659;94660;94661;94662;94663;94664;94665;94666;94667;94668;94669;94670;94671;94672;94673;94674;94675;94676;94677;94678;94679;94680;94681;94682;94683;94684;94685;94686;94687;94688 94671 42 DVPAYSQDTFK Unmodified 1269.5877 0.58773217 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 61.919 61.919 2 0.0284 61045 QUIQUE_C1368_190116_001 51.927 32.14 79751000 0 0 37270000 0 42481000 0 0 0 0 0 0 0 0 8308 1868 7762 74385;74386 94689;94690 94689 2 DVPDLTLIDLPGITR Unmodified 1636.9036 0.903587 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 160.11 160.11 2;3 0.00080147 167827 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.719 74.366 1366800000 0 61476000 319330000 0 0 0 85367000 136150000 74342000 53161000 609990000 27020000 0 8309 2168 7763 74387;74388;74389;74390;74391;74392;74393;74394;74395;74396;74397;74398;74399 94691;94692;94693;94694;94695;94696;94697;94698;94699;94700;94701;94702;94703;94704;94705;94706;94707 94706 17 DVPFSVVYFPLFANLNQLGR Unmodified 2295.2052 0.20518875 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 4 2 176.14 176.14 2;3 1.9633E-117 180883 QUIQUE_C1438_190116_001 222.79 205.68 5814100000 212790000 384820000 392370000 161780000 298560000 0 293810000 378710000 766600000 17118000 1554600000 1353000000 0 8310 4190 7764 74400;74401;74402;74403;74404;74405;74406;74407;74408;74409;74410;74411;74412;74413;74414;74415;74416;74417;74418;74419;74420;74421 94708;94709;94710;94711;94712;94713;94714;94715;94716;94717;94718;94719;94720;94721;94722;94723;94724;94725;94726;94727;94728;94729;94730;94731;94732 94719 24 DVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEK Unmodified 2936.5072 0.50724401 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 168.41 168.41 3 6.4743E-18 170353 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.58 92.367 582730000 0 0 0 0 0 0 0 136480000 55816000 0 83878000 169910000 136640000 8311 4190 7765 74422;74423;74424;74425;74426 94733;94734;94735;94736;94737 94733 5 DVPGTLLNIALLNLGSSDPSLR Unmodified 2264.2376 0.23761109 1119 H0Y465;P21359;A0A1W2PS74 NF1 Neurofibromin;Neurofibromin truncated yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 172.29 172.29 2;3 0.00095262 175575 QUIQUE_C1277_190116_001 43.799 36.087 216170000 26345000 32709000 16247000 11186000 26596000 0 0 0 31555000 0 28035000 43497000 0 8312 1119 7766 74427;74428;74429;74430;74431;74432;74433;74434;74435;74436;74437 94738;94739;94740;94741;94742;94743;94744;94745;94746;94747;94748 94739 11 DVPIDHSDLVADLLK Unmodified 1648.8672 0.8672015 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 133 133 2;3 4.5419E-13 138614 QUIQUE_C1218_190116_001 110.77 76.09 227060000 48551000 52440000 18728000 20784000 24992000 0 17766000 0 22034000 9907800 0 11861000 0 8313 1060 7767 74438;74439;74440;74441;74442;74443;74444;74445;74446;74447;74448 94749;94750;94751;94752;94753;94754;94755;94756;94757;94758;94759;94760 94750 12 DVPIGAIICITVGKPEDIEAFK Unmodified 2384.2661 0.26613403 1997 P10515;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 2 1 153.79 153.79 2;3 8.7089E-14 158591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.55 122.23 2408000000 245470000 145670000 148800000 0 118770000 236150000 240040000 101500000 245920000 31792000 395960000 287420000 210510000 8314 1997 7768 74449;74450;74451;74452;74453;74454;74455;74456;74457;74458;74459;74460;74461;74462;74463;74464 94761;94762;94763;94764;94765;94766;94767;94768;94769;94770;94771;94772;94773;94774;94775;94776;94777;94778;94779;94780;94781 94771 21 DVPLGTPLCIIVEK Unmodified 1552.8535 0.85346569 1997 P10515;H0YDD4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.39 135.39 2 0.00025141 138164 QUIQUE_C1563_190116_001 97.163 69.859 4826100000 511000000 442120000 469970000 348440000 407240000 453020000 488280000 231220000 335130000 0 454720000 342220000 342770000 8315 1997 7769 74465;74466;74467;74468;74469;74470;74471;74472;74473;74474;74475;74476 94782;94783;94784;94785;94786;94787;94788;94789;94790;94791;94792;94793 94787 9 DVPLTQYQR Unmodified 1118.572 0.57202253 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 50.192 50.192 2 0.0044163 47264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.046 52.861 83170000 28558000 0 0 0 0 0 0 43774000 0 10837000 0 0 0 8316 4197 7770 74477;74478;74479;74480 94794;94795;94796;94797 94796 4 DVPNETLQVEEDDRPELPWWK Unmodified 2594.2289 0.2288969 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.47 134.47 3 1.2017E-07 137413 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.057 84.077 851980000 107740000 93871000 0 0 0 67483000 127080000 93688000 96689000 37952000 129270000 98208000 0 8317 1727 7771 74481;74482;74483;74484;74485;74486;74487;74488;74489 94798;94799;94800;94801;94802;94803;94804;94805;94806 94802 8 DVPNNQLR Unmodified 954.48829 0.4882929 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 yes no 0 0 0 1 20.528 20.528 2 0.042098 13595 QUIQUE_C1368_190116_001 59.205 35.05 23780000 0 0 23780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8318 4075 7772 74490 94807 94807 1 DVPPLSETEATPVPIK Unmodified 1691.8982 0.89816728 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 95.88 95.88 2 0.0041302 98897 QUIQUE_C1218_190116_001 58.098 42.897 178860000 44857000 32112000 0 59932000 0 22360000 0 0 0 19600000 0 0 0 8319 880 7773 74491;74492;74493;74494;74495;74496 94808;94809;94810;94811;94812;94813 94808 6 DVPPLSETEATPVPIKDMEIAQTQK Unmodified 2736.3892 0.38916229 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 113.9 113.9 3 1.3837E-09 116677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.748 55.026 343140000 0 0 0 0 0 0 0 93786000 118640000 0 0 0 130720000 8320 880 7774 74497;74498;74499 94814;94815;94816;94817 94814 3 DVPPVPTLADIAWIAADEEETYAR Unmodified 2641.2912 0.29116281 4112 Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PRW1;E9PSD6 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 173.33 173.33 2;3 4.6788E-11 177411 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.211 87.968 327240000 36765000 35796000 0 3848800 0 0 16364000 55088000 55313000 0 80075000 43989000 0 8321 4112 7775 74500;74501;74502;74503;74504;74505;74506;74507;74508;74509;74510;74511;74512;74513 94818;94819;94820;94821;94822;94823;94824;94825;94826;94827;94828;94829;94830;94831 94827 14 DVPRPILLGASAPLK Unmodified 1545.9243 0.92426287 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 92.176 92.176 3 0.0030993 94183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.209 52.801 109990000 34516000 0 0 0 0 0 0 0 46714000 0 0 28756000 0 8322 1416 7776 74514;74515;74516 94832;94833;94834 94833 3 DVPSSEQPELFLK Unmodified 1487.7508 0.75077476 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 0 0 0 1 1 98.922 98.922 2 0.0079364 101480 QUIQUE_C1277_190116_001 76.143 63.527 122270000 0 67337000 0 54933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8323 3180 7777 74517;74518 94835;94836 94835 1 DVPVAEEVSALFAGELNPVAPK Unmodified 2251.1736 0.17361385 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 170.7 170.7 2;3 2.4274E-36 175443 QUIQUE_C1368_190116_001 185.12 161.71 1067600000 149640000 144170000 44057000 154910000 57572000 55718000 184560000 40600000 0 24784000 50964000 101750000 58859000 8324 437;1437 7778 74519;74520;74521;74522;74523;74524;74525;74526;74527;74528;74529;74530;74531;74532;74533;74534;74535 94837;94838;94839;94840;94841;94842;94843;94844;94845;94846;94847;94848;94849;94850;94851;94852;94853;94854;94855 94843 17 DVPVYLFSR Unmodified 1094.576 0.57604528 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.59 109.59 2 0.00045846 112894 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.04 104.05 2479100000 256000000 247690000 212270000 183710000 177550000 150110000 209630000 161750000 148760000 153620000 199820000 196120000 182040000 8325 3390 7779 74536;74537;74538;74539;74540;74541;74542;74543;74544;74545;74546;74547;74548 94856;94857;94858;94859;94860;94861;94862;94863;94864;94865;94866;94867;94868;94869;94870;94871;94872;94873;94874;94875;94876;94877 94874 22 DVPWGVDSLITLAFQDQR Unmodified 2059.0375 0.037454724 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 172.56 172.56 2;3 3.3018E-38 175860 QUIQUE_C1277_190116_001 201.48 179.73 4528000000 230160000 310700000 279260000 80562000 438580000 0 156830000 387210000 680410000 11518000 956690000 647050000 349060000 8326 3187 7780 74549;74550;74551;74552;74553;74554;74555;74556;74557;74558;74559;74560;74561;74562;74563;74564;74565;74566;74567;74568;74569;74570;74571 94878;94879;94880;94881;94882;94883;94884;94885;94886;94887;94888;94889;94890;94891;94892;94893;94894;94895;94896;94897;94898;94899;94900;94901;94902;94903;94904 94880 27 DVPYPPPLSPAIEAIQK Unmodified 1833.9877 0.98765098 3614 Q8N8N7;G3V3Y1;G3V2R9 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 131.67 131.67 2 0.00028863 135585 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.99 101.41 678260000 0 0 81791000 40876000 0 0 0 75722000 81002000 35261000 155360000 116910000 91342000 8327 3614 7781 74572;74573;74574;74575;74576;74577;74578;74579;74580;74581 94905;94906;94907;94908;94909;94910;94911;94912;94913;94914;94915;94916;94917;94918;94919;94920;94921 94910 16 DVQAGSHDYPGEGIYLLK Unmodified 1960.9531 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Unmodified 1704.8166 0.81662249 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.504 57.504 2 6.8852E-80 56594 QUIQUE_DMIX5_190116_001 263.44 248.57 1701300000 126860000 139190000 153290000 167500000 155120000 159180000 144230000 95690000 91718000 103460000 135980000 120560000 108490000 8331 2617 7785 74596;74597;74598;74599;74600;74601;74602;74603;74604;74605;74606;74607;74608 94939;94940;94941;94942;94943;94944;94945;94946;94947;94948;94949;94950;94951;94952;94953;94954;94955;94956 94952 18 DVQEFIDNPK Unmodified 1203.5772 0.57716749 4544 Q9Y276;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 70.815 70.815 2 0.015951 70197 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.231 44.936 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8332 4544 7786 74609 94957 94957 1 DVQEIFR Unmodified 905.46068 0.46068117 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.99 66.99 2 0.0096417 66605 QUIQUE_C1277_190116_001 150.02 50.1 3018600000 214180000 237870000 294900000 229530000 284990000 210390000 290790000 220410000 201100000 94749000 262590000 191780000 285390000 8333 3027 7787 74610;74611;74612;74613;74614;74615;74616;74617;74618;74619;74620;74621;74622 94958;94959;94960;94961;94962;94963;94964;94965;94966;94967;94968;94969;94970;94971;94972;94973;94974;94975 94961 18 DVQELLTQYTK Unmodified 1336.6874 0.68744622 1085 G3V4F7;P61011 SRP54 Signal recognition particle 54 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 116.8 116.8 2 0.00020633 120818 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.79 78.425 212040000 0 0 35309000 39466000 0 39368000 0 0 39944000 0 0 0 57955000 8334 1085 7788 74623;74624;74625;74626;74627 94976;94977;94978;94979;94980;94981;94982;94983 94983 5 DVQGTDASLDEELDR Unmodified 1661.738 0.73803782 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.142 80.142 2 0.00034943 82485 QUIQUE_C1438_190116_001 99.011 76.965 402060000 0 0 99996000 58348000 69866000 51000000 0 0 36479000 0 0 34981000 51387000 8335 4466 7789 74628;74629;74630;74631;74632;74633;74634;74635 94984;94985;94986;94987;94988;94989;94990;94991 94987 6 DVQGWGENDR Unmodified 1174.5003 0.50031415 2740;2739 P62140;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase no no 0 0 0 1 40.608 40.608 2 0.039491 36814 QUIQUE_C1277_190116_001 60.518 50.931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8336 2740;2739 7790 74636 94992 94992 1 DVQIGDIVTVGECRPLSK Unmodified 1985.0252 0.025175478 2747 P62280;M0R1H5 RPS11 40S ribosomal protein S11 yes no 0 0 1 1 103.93 103.93 3 0.021905 107443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.111 32.379 36878000 0 0 0 0 0 0 0 0 36878000 0 0 0 0 8337 2747 7791 74637 94993 94993 1 DVQMLQDAISK Unmodified 1246.6227 0.62273747 3181 Q16543;K7EQA9;K7EL68;K7EIU0 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 85.08 85.08 2 0.00050657 86154 QUIQUE_C1277_190116_001 101.38 69.026 177390000 0 129140000 0 0 0 0 0 0 0 48254000 0 0 0 8338 3181 7792 74638;74639 94994;94995 94994 2 DVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIK Unmodified 2939.4011 0.40112396 2109 P16435;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 171.96 171.96 3 4.3968E-37 175683 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.32 126.95 387480000 0 21260000 0 0 0 0 47133000 0 66960000 0 128610000 97606000 25909000 8339 2109 7793 74640;74641;74642;74643;74644;74645 94996;94997;94998;94999;95000;95001 95000 6 DVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKK Unmodified 3067.4961 0.49608698 2109 P16435;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 1 1 167.6 167.6 4 0.0014506 169583 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.324 32.241 17605000 0 0 0 0 0 0 0 17605000 0 0 0 0 0 8340 2109 7794 74646 95002 95002 1 DVQTALALAK Unmodified 1028.5866 0.58660996 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 72.783 72.783 1;2 0.00026909 69427 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.41 79.345 8268700000 259080000 183330000 1231800000 829050000 1217900000 1019600000 0 64119000 989460000 109060000 0 1067600000 1297600000 8341 3969 7795 74647;74648;74649;74650;74651;74652;74653;74654;74655;74656;74657;74658 95003;95004;95005;95006;95007;95008;95009;95010;95011;95012;95013;95014;95015 95012 12 DVQVLFMR Unmodified 1006.527 0.52698659 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 102.18 102.18 2 0.033344 106907 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.757 37.795 26961000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26961000 0 0 8342 1450 7796 74659 95016 95016 1 DVRPYIVGAVVR Unmodified 1342.7721 0.77211932 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 76.475 76.475 2;3 0.0013691 77135 QUIQUE_C1277_190116_001 64.65 55.921 424900000 25176000 29055000 0 0 83756000 21955000 29969000 47655000 59209000 17877000 60262000 49985000 0 8343 3576 7797 74660;74661;74662;74663;74664;74665;74666;74667;74668;74669;74670;74671 95017;95018;95019;95020;95021;95022;95023;95024;95025;95026;95027;95028;95029;95030;95031 95019 15 DVSALFPDVVNCMQTDNLELKK Unmodified 2535.2349 0.23491026 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.12 144.12 3 1.5887E-05 148912 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.589 54.968 456780000 0 0 0 0 65595000 0 71572000 66428000 0 14964000 70145000 76365000 91708000 8344 2938 7798 74672;74673;74674;74675;74676;74677;74678 95032;95033;95034;95035;95036;95037;95038;95039;95040;95041;95042 95041 10 DVSALFPDVVNCMQTDNLELKK Oxidation (M) 2551.2298 0.22982488 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 1 1 1 126.45 126.45 3 9.7003E-06 129355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.887 52.432 32429000 0 0 0 0 0 0 0 32429000 0 0 0 0 0 8345 2938 7798 74679 95043 95043 2408 1 DVSDEKLRDYIWNTLNSGR Unmodified 2280.1135 0.11347321 612 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95049;95050;95051;95052;95053;95054;95055;95056;95057;95058;95059;95060;95061;95062;95063;95064;95065;95066;95067;95068;95069;95070;95071;95072;95073;95074;95075;95076;95077;95078;95079;95080;95081;95082;95083;95084;95085;95086;95087;95088;95089;95090;95091;95092;95093;95094;95095;95096;95097;95098;95099;95100;95101;95102;95103;95104;95105;95106;95107;95108;95109;95110;95111;95112;95113;95114;95115;95116;95117;95118;95119;95120;95121;95122;95123;95124;95125;95126;95127;95128;95129;95130;95131;95132;95133;95134;95135 95095 86 DVSELTGFPEMLGGR Unmodified 1606.7661 0.76610724 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.94 141.94 2 3.284E-44 146082 QUIQUE_C1277_190116_001 184.55 121.27 2226700000 175880000 142190000 203920000 218410000 191840000 189290000 182330000 153450000 141330000 63013000 219520000 147990000 197570000 8348 2339 7801 74740;74741;74742;74743;74744;74745;74746;74747;74748;74749;74750;74751;74752 95136;95137;95138;95139;95140;95141;95142;95143;95144;95145;95146;95147;95148;95149;95150;95151;95152;95153 95138 17 DVSELTGFPEMLGGR Oxidation (M) 1622.761 0.76102187 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 1 0 1 1 120.07 120.07 2 0.00023344 126549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.813 71.394 175620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84356000 0 91267000 8349 2339 7801 74753;74754 95154;95155 95154 1738 1 DVSGVLFQYPDTEGKVEDFTELVER Unmodified 2871.3814 0.38143438 2212 P23378;A0A1W2PPK8;A0A1W2PPE1 GLDC Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial yes no 0 0 1 1 154.45 154.45 3 0.026737 159601 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.359 28.71 63719000 0 0 0 0 0 0 0 0 63719000 0 0 0 0 8350 2212 7802 74755 95156 95156 0 DVSLLTQK Unmodified 902.5073 0.50729701 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 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95166;95167;95168;95169;95170;95171;95172 95172 4 DVSSLFPDVVNCMQTDNLELK Unmodified 2423.1349 0.13486186 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7ERB2;K7EN71;K7EJX1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 161.73 161.73 2;3 1.9385E-07 165316 QUIQUE_C1403_190116_001 88.396 72.875 434240000 74307000 104140000 32393000 106200000 30219000 44992000 29128000 0 0 12857000 0 0 0 8354 2777 7806 74772;74773;74774;74775;74776;74777;74778;74779;74780;74781 95173;95174;95175;95176;95177;95178;95179;95180;95181;95182;95183;95184 95178 10 DVSSLFPDVVNCMQTDNLELKK Unmodified 2551.2298 0.22982488 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7ERB2;K7EN71;K7EJX1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.26 144.26 2;3 2.5732E-11 149644 QUIQUE_C1368_190116_001 103.95 77.107 2453600000 0 242170000 295020000 189210000 193190000 174960000 243610000 181460000 198360000 49949000 229910000 232300000 223500000 8355 2777 7807 74782;74783;74784;74785;74786;74787;74788;74789;74790;74791;74792;74793;74794;74795 95185;95186;95187;95188;95189;95190;95191;95192;95193;95194;95195;95196;95197;95198;95199;95200;95201;95202;95203;95204 95188 20 DVSSTEEFLELSPQK Unmodified 1707.8203 0.82031089 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 2 1 115.62 115.62 2;3 7.2212E-05 121139 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.718 75.285 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8356 4143 7808 74796;74797;74798 95205;95206;95207 95207 3 DVSSVELLMNNHQGIK Oxidation (M) 1798.8883 0.88834765 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 65.934 65.934 2;3 2.7573E-231 66004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 286.95 261.48 4634000000 272440000 378100000 288610000 124130000 403480000 108620000 139340000 456650000 561540000 209950000 583320000 438550000 669330000 8357 2851 7809 74799;74800;74801;74802;74803;74804;74805;74806;74807;74808;74809;74810;74811;74812;74813;74814;74815;74816;74817;74818;74819;74820;74821 95208;95209;95210;95211;95212;95213;95214;95215;95216;95217;95218;95219;95220;95221;95222;95223;95224;95225;95226;95227;95228;95229;95230;95231;95232;95233;95234;95235;95236;95237;95238;95239;95240 95228 2289 32 DVSSVELLMNNHQGIK Unmodified 1782.8934 0.89343302 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 89.805 89.805 2;3 4.8424E-130 92145 QUIQUE_C1277_190116_001 247.79 223.45 17123000000 1489400000 1821600000 1643300000 1291600000 1435200000 1135300000 1463000000 1057800000 1252900000 549810000 1417200000 1200600000 1365100000 8358 2851 7809 74822;74823;74824;74825;74826;74827;74828;74829;74830;74831;74832;74833;74834;74835;74836;74837;74838;74839;74840;74841;74842;74843;74844;74845;74846;74847 95241;95242;95243;95244;95245;95246;95247;95248;95249;95250;95251;95252;95253;95254;95255;95256;95257;95258;95259;95260;95261;95262;95263;95264;95265;95266;95267;95268;95269;95270;95271;95272;95273;95274;95275;95276;95277;95278;95279;95280;95281;95282;95283;95284;95285;95286;95287 95248 47 DVTADFEGQSPK Unmodified 1292.5885 0.58846046 4436 Q9UHL4 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.091 59.091 2 9.42E-05 58318 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.5 87.296 507490000 60055000 0 0 0 0 0 98530000 48058000 57101000 36900000 52657000 73206000 80980000 8359 4436 7810 74848;74849;74850;74851;74852;74853;74854;74855 95288;95289;95290;95291;95292;95293;95294;95295;95296 95294 8 DVTATVDSLPLITASILSK Unmodified 1943.0827 0.082673582 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 168.01 168.01 2;3 5.477E-12 174251 QUIQUE_C1438_190116_001 146.47 131.91 1186700000 37729000 43674000 433650000 91262000 102020000 75763000 0 83109000 72419000 25305000 169900000 0 51853000 8360 2157 7811 74856;74857;74858;74859;74860;74861;74862;74863;74864;74865;74866;74867;74868;74869;74870;74871;74872;74873;74874;74875;74876 95297;95298;95299;95300;95301;95302;95303;95304;95305;95306;95307;95308;95309;95310;95311;95312;95313;95314;95315;95316;95317;95318;95319;95320;95321;95322 95307 26 DVTCDVHYENYR Unmodified 1569.6518 0.65180577 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;Q99719 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 48.82 48.82 2;3 1.795E-65 47102 QUIQUE_C1218_190116_001 251.56 243.63 3668700000 286200000 541640000 559270000 476310000 490990000 355370000 188150000 33609000 146130000 115350000 118330000 275060000 82336000 8361 1092;3970 7812 74877;74878;74879;74880;74881;74882;74883;74884;74885;74886;74887;74888;74889;74890;74891;74892;74893;74894;74895;74896;74897;74898 95323;95324;95325;95326;95327;95328;95329;95330;95331;95332;95333;95334;95335;95336;95337;95338;95339;95340;95341;95342;95343;95344;95345;95346;95347;95348;95349;95350 95324 28 DVTDTTALITWFK Unmodified 1509.7715 0.7715102 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.95 155.95 2 0.00031057 158286 QUIQUE_C1563_190116_001 136.02 119.37 131320000 25457000 0 23263000 0 0 43073000 0 0 39523000 0 0 0 0 8362 2233 7813 74899;74900;74901;74902 95351;95352;95353;95354 95353 4 DVTEALILQLFSQIGPCK Unmodified 2031.0711 0.071063038 745 C9JTN7;F8W8I6;P31483;H7BY49;E5RGV5;E5RG67 TIA1 Nucleolysin TIA-1 isoform p40 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 175.64 175.64 2;3 2.1386E-10 176848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.57 121.85 72688000 3829100 5337800 0 0 5472400 0 4419400 15116000 21684000 0 16829000 0 0 8363 745 7814 74903;74904;74905;74906;74907;74908;74909;74910;74911 95355;95356;95357;95358;95359;95360;95361;95362;95363;95364 95359 10 DVTFSPATIENELIK Unmodified 1675.8669 0.86686715 559 A8K878;P55145;H7C2D6 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.85 146.85 2 0.00027833 151816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.182 69.755 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3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 17.936 17.936 2;3 5.4265E-22 10483 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.67 146.66 1134500000 0 89154000 100080000 207550000 106280000 0 220100000 0 190140000 15150000 0 206000000 0 8375 3390 7826 75014;75015;75016;75017;75018;75019;75020;75021;75022;75023;75024;75025;75026 95486;95487;95488;95489;95490;95491;95492;95493;95494;95495;95496;95497;95498 95494 12 DVTVFDKDDK Unmodified 1180.5612 0.56118307 720 C9JF79;F8WFC2 MDH1 Malate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 32.009 32.009 2 0.05116 26684 QUIQUE_C1563_190116_001 72.607 37.312 21394000 0 0 0 0 0 21394000 0 0 0 0 0 0 0 8376 720 7827 75027 95499 95499 1 DVTVPELR Unmodified 927.50255 0.50254598 2198 P22570 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 65.613 65.613 2 0.027083 66073 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.998 40.192 52184000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32248000 19935000 0 8377 2198 7828 75028;75029 95500;95501;95502 95500 3 DVTVTAIGIGDMFHEK Unmodified 1731.8502 0.85017123 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 1 2 3 1 1 2 2 1 121.98 121.98 2;3 0.00040848 124448 QUIQUE_C1563_190116_001 65.943 54.664 717700000 91988000 118460000 176550000 0 87914000 112630000 50860000 0 0 45217000 0 0 34076000 8378 2036 7829 75030;75031;75032;75033;75034;75035;75036;75037;75038;75039;75040;75041;75042 95503;95504;95505;95506;95507;95508;95509;95510;95511;95512;95513;95514;95515;95516;95517;95518;95519 95512 16 DVTVTAIGIGDMFHEK Oxidation (M) 1747.8451 0.84508585 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 1 0 1 2 95.707 95.707 2;3 0.0027112 92210 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.495 39.472 35670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35670000 0 0 0 8379 2036 7829 75043;75044;75045 95520;95521;95522;95523 95522 1342 3 DVTYEEAK Unmodified 953.43419 0.43419164 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 1 1 20.541 20.541 2 0.02931 13221 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 49.995 116080000 0 71842000 0 0 0 44236000 0 0 0 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DVVHTSEEAR Unmodified 1141.5364 0.53636531 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 14.518 14.518 3 0.042607 6656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.708 11.468 22133000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22133000 0 0 0 8389 1534 7839 75140 95648 95648 1 DVVICPDASLEDAK Unmodified 1530.7236 0.72357373 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.957 84.957 2 8.4322E-06 86240 QUIQUE_C1368_190116_001 121.02 97.035 4577200000 658590000 493220000 617850000 587560000 447620000 633390000 467040000 68380000 85868000 171580000 174150000 0 171990000 8390 3956 7840 75141;75142;75143;75144;75145;75146;75147;75148;75149;75150;75151;75152 95649;95650;95651;95652;95653;95654;95655;95656;95657;95658;95659;95660;95661;95662;95663;95664;95665 95653 15 DVVICPDASLEDAKK Unmodified 1658.8185 0.81853675 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 62.852 62.852 2 5.5337E-06 63202 QUIQUE_C1576_190116_001 110.08 99.845 2992900000 0 0 0 0 717280000 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Unmodified 1624.7733 0.77330111 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 111.97 111.97 2 0.0010485 109168 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.03 73.221 194800000 0 0 0 0 56930000 0 0 0 65697000 18472000 0 0 53696000 8398 2101 7848 75176;75177;75178;75179 95693;95694;95695;95696 95695 3 DVVTAAGDMLK Unmodified 1118.5642 0.56415996 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 95.808 95.808 2 0.014647 97024 QUIQUE_C1563_190116_001 58.37 37.07 26025000 0 0 0 0 0 26025000 0 0 0 0 0 0 0 8399 1924 7849 75180 95697 95697 1 DVVTEAIYPEAVTMFSVNLFR Unmodified 2400.2035 0.20353377 917 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4 PPP2R5D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 173.52 173.52 2;3 3.3408E-10 177233 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.79 97.498 102500000 0 0 0 0 6517900 0 0 9691300 14356000 0 34368000 25012000 12558000 8400 917 7850 75181;75182;75183;75184;75185;75186;75187 95698;95699;95700;95701;95702;95703;95704 95702 7 DVVVDLVCYR Unmodified 1236.6173 0.61725816 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.48 107.48 2 0.00097688 110583 QUIQUE_C1277_190116_001 121.09 93.268 1805300000 175430000 130550000 171840000 104590000 140600000 144230000 156110000 120330000 176180000 36981000 160730000 139140000 148620000 8401 903;2869;4487 7851 75188;75189;75190;75191;75192;75193;75194;75195;75196;75197;75198;75199;75200 95705;95706;95707;95708;95709;95710;95711;95712;95713;95714;95715;95716;95717;95718;95719;95720 95706 16 DVVVQHVHFDGLGR Unmodified 1576.811 0.81102402 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.597 68.597 3;4 0.00079103 69334 QUIQUE_C1218_190116_001 70.98 64.251 871320000 213010000 102690000 29795000 45945000 0 118500000 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motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 38.72 38.72 2 0.037414 34932 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.359 25.066 583850000 137470000 0 0 160100000 0 122790000 0 0 163490000 0 0 0 0 8412 2412;3840 7861 75315;75316;75317;75318 95855;95856;95857;95858;95859;95860 95860 6 DVYQMSDSQLYEAFTFLK Oxidation (M) 2200.0034 0.003436983 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 2 2 3 2 1 2 1 1 1 2 2 1 161.15 161.15 2;3 8.1718E-122 164997 QUIQUE_C1403_190116_001 225.09 211.06 2199000000 214230000 280670000 227870000 165440000 147140000 242320000 113700000 100740000 115340000 165050000 0 284750000 141720000 8413 3050 7862 75319;75320;75321;75322;75323;75324;75325;75326;75327;75328;75329;75330;75331;75332;75333;75334;75335;75336;75337;75338 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75582 96210 96210 1 DWVLNEFK Unmodified 1049.5182 0.51819605 1290 J3KTA4;P17844 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.16 115.16 2 0.0036109 120068 QUIQUE_C1218_190116_001 114.6 92.831 811530000 68226000 83150000 96980000 79507000 49175000 61094000 59746000 53530000 72956000 23801000 47350000 66709000 49310000 8449 1290 7896 75583;75584;75585;75586;75587;75588;75589;75590;75591;75592;75593;75594;75595 96211;96212;96213;96214;96215;96216;96217;96218;96219;96220;96221;96222;96223;96224;96225;96226 96212 16 DWVLNEFR Unmodified 1077.5243 0.52434406 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841;A0A0U1RQJ0 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 118.55 118.55 2 0.040827 122425 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.195 41.408 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8450 381 7897 75596;75597;75598 96227;96228;96229 96229 3 DWVQLDRPFEDFIDR Unmodified 1949.9272 0.92717599 1461 O14939 PLD2 Phospholipase D2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 149 149 3 9.0864E-05 156134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.961 61.347 74448000 0 0 11949000 11131000 0 0 8162100 0 0 0 16759000 14745000 11702000 8451 1461 7898 75599;75600;75601;75602;75603;75604 96230;96231;96232;96233;96234;96235 96233 5 DWYPHSR Unmodified 959.42496 0.42496436 1866 P04792;F8WE04 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes no 0 0 0 1 31.016 31.016 2 0.056949 25694 QUIQUE_C1277_190116_001 71.141 62.458 139790000 0 139790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8452 1866 7899 75605 96236 96236 1 DYAAYNVLDDPELR Unmodified 1652.7682 0.76821573 3481 Q86SX6 GLRX5 Glutaredoxin-related protein 5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.54 121.54 2 5.3769E-11 125188 QUIQUE_C1277_190116_001 138.75 116.22 492580000 73229000 73603000 70508000 42673000 0 51138000 79072000 43341000 59014000 0 0 0 0 8453 3481 7900 75606;75607;75608;75609;75610;75611;75612;75613 96237;96238;96239;96240;96241;96242;96243;96244;96245 96239 8 DYAEVGR Unmodified 808.37153 0.37153181 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.878 22.878 2 0.01944 16299 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.11 75.263 1981200000 0 439760000 0 0 0 0 479880000 0 242480000 0 819110000 0 0 8454 1793 7901 75614;75615;75616;75617 96246;96247;96248;96249 96248 4 DYAFIHFDER Unmodified 1311.5884 0.58840088 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.975 96.975 2;3 0.0011055 99627 QUIQUE_C1368_190116_001 101.65 84.994 188150000 19074000 0 31783000 28474000 42210000 0 66608000 0 0 0 0 0 0 8455 1581 7902 75618;75619;75620;75621;75622;75623;75624;75625 96250;96251;96252;96253;96254;96255;96256;96257;96258 96251 9 DYAFVHFEDR Unmodified 1297.5728 0.57275081 1525 O43390;B4DT28;A0A286YEZ8 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.31 85.31 2;3 0.0083608 86778 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.314 47.427 434990000 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96279;96280;96281;96282;96283;96284;96285;96286;96287 96283 9 DYAKDDPLEFK Unmodified 1339.6296 0.62959699 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 1 1 66.33 66.33 2 0.015559 66254 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.879 61.071 43036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43036000 8459 1909 7906 75654 96288 96288 1 DYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVAR Unmodified 2773.3936 0.39361124 3183 Q16576;E9PC52;C9J7L0 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.55 110.55 4 1.5485E-06 114325 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.453 63.5 465880000 0 86149000 95583000 0 64157000 0 73296000 0 55547000 0 0 91143000 0 8460 3183 7907 75655;75656;75657;75658;75659;75660 96289;96290;96291;96292;96293;96294;96295 96294 5 DYAPPPR Unmodified 814.39735 0.39735263 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 20.023 20.023 2 0.043299 12678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.377 54.268 232080000 39204000 0 0 75518000 0 0 0 0 63148000 0 54214000 0 0 8461 2412;3840 7908 75661;75662;75663;75664 96296;96297;96298;96299 96299 4 DYAVQQYVR Unmodified 1140.5564 0.55637247 4477 Q9UKU7 ACAD8 Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.819 64.819 2 0.00048805 64763 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.4 103.01 510560000 45590000 42658000 63881000 58492000 0 0 0 44954000 43204000 30239000 71381000 40646000 69518000 8462 4477 7909 75665;75666;75667;75668;75669;75670;75671;75672;75673;75674;75675;75676 96300;96301;96302;96303;96304;96305;96306;96307;96308;96309;96310;96311;96312;96313;96314 96311 15 DYAVSTVPVADGLHLK Unmodified 1683.8832 0.88318591 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 6 5 6 5 5 5 4 4 4 5 5 4 4 96.421 96.421 2;3 1.8217E-09 90238 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.37 118.42 56001000000 5779500000 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96315;96316;96317;96318;96319;96320;96321;96322;96323;96324;96325;96326;96327;96328;96329;96330;96331;96332;96333;96334;96335;96336;96337;96338;96339;96340;96341;96342;96343;96344;96345;96346;96347;96348;96349;96350;96351;96352;96353;96354;96355;96356;96357;96358;96359;96360;96361;96362;96363;96364;96365;96366;96367;96368;96369;96370;96371;96372;96373;96374;96375;96376;96377;96378;96379;96380;96381;96382;96383;96384;96385;96386;96387;96388;96389;96390;96391;96392;96393;96394;96395;96396;96397;96398;96399;96400;96401;96402;96403;96404;96405;96406;96407;96408;96409;96410;96411 96383 96 DYCAHHLIR Unmodified 1183.5557 0.55566096 2124 P17568 NDUFB7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.868 18.868 3 0.0034716 11456 QUIQUE_C1277_190116_001 60.91 39.462 1536500000 117290000 159300000 169790000 179500000 135920000 126330000 158750000 0 176600000 0 174780000 0 138220000 8464 2124 7911 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1 DYDALFPVAEDISLLQQASSVLDETR Unmodified 2894.4185 0.41854817 4132 Q9H1I8 ASCC2 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 178.55 178.55 3 1.6652E-17 182344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.542 88.178 9456900 0 0 0 0 0 0 0 0 9456900 0 0 0 0 8468 4132 7914 75754 96427 96427 1 DYDAMGSQTK Unmodified 1114.4601 0.46008882 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.961 24.961 2 0.0057685 18336 QUIQUE_C1277_190116_001 76.345 69.152 222190000 38776000 32876000 0 26031000 0 31714000 0 18041000 0 12481000 35590000 26686000 0 8469 4536 7915 75755;75756;75757;75758;75759;75760;75761;75762 96428;96429;96430;96431;96432;96433;96434;96435 96429 7 DYDDMSPR Unmodified 997.38111 0.38111022 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 35.583 35.583 2 0.016543 30995 QUIQUE_C1403_190116_001 120.49 116.64 670990000 0 0 0 120910000 0 105860000 0 85462000 103100000 0 126050000 0 129600000 8470 2735;3319 7916 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Unmodified 1647.7165 0.71651452 855 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.981 77.981 2 3.2352E-09 78938 QUIQUE_C1277_190116_001 140.07 129.84 516150000 29391000 41175000 34347000 58205000 44519000 36826000 34519000 48673000 49313000 0 40371000 41217000 57589000 8489 855 7934 75932;75933;75934;75935;75936;75937;75938;75939;75940;75941;75942;75943 96650;96651;96652;96653;96654;96655;96656;96657;96658;96659;96660;96661;96662 96651 12 DYFDMFAPK Unmodified 1132.4899 0.48993238 344 A0A1B0GTU4;P49023;F5GZ78 PXN Paxillin yes no 0 0 0 1 130.54 130.54 2 0.032733 137369 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.531 32.511 13233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13233000 0 0 8490 344 7935 75944 96663 96663 1 DYFEEYGK Unmodified 1049.4342 0.43419164 2200 P22626;A0A087WUI2 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.068 68.068 2 0.0061806 67800 QUIQUE_C1403_190116_001 102.71 98.696 9995800000 1064100000 1014700000 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96726;96727;96728;96729;96730;96731;96732;96733;96734;96735;96736;96737;96738;96739;96740;96741;96742;96743;96744;96745;96746;96747;96748;96749;96750;96751;96752;96753;96754;96755;96756;96757;96758;96759;96760;96761;96762;96763;96764 96728 38 DYFFALAHTVR Unmodified 1338.6721 0.67207093 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 104.27 104.27 2;3 6.2005E-05 107970 QUIQUE_C1368_190116_001 103.08 94.979 11927000000 366340000 418230000 433220000 321590000 473160000 289610000 533330000 1358300000 1834900000 180230000 2168000000 1574900000 1975200000 8494 2016 7939 76018;76019;76020;76021;76022;76023;76024;76025;76026;76027;76028;76029;76030;76031;76032;76033;76034;76035;76036;76037;76038 96765;96766;96767;96768;96769;96770;96771;96772;96773;96774;96775;96776;96777;96778;96779;96780;96781;96782;96783;96784;96785;96786;96787;96788;96789;96790;96791;96792;96793 96767 29 DYFGAHTYELLAK Unmodified 1526.7405 0.74054442 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 101 101 2;3 1.3569E-75 104082 QUIQUE_C1368_190116_001 215.87 189.36 8684700000 788310000 659380000 1028700000 739110000 772990000 623400000 747840000 497240000 661270000 359670000 778840000 645770000 382120000 8495 2602 7940 76039;76040;76041;76042;76043;76044;76045;76046;76047;76048;76049;76050;76051;76052;76053;76054;76055;76056;76057;76058;76059;76060;76061;76062;76063 96794;96795;96796;96797;96798;96799;96800;96801;96802;96803;96804;96805;96806;96807;96808;96809;96810;96811;96812;96813;96814;96815;96816;96817;96818;96819;96820;96821;96822;96823;96824;96825;96826;96827;96828;96829 96803 35 DYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGTVSSSSYNA Unmodified 3912.8132 0.81321545 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 128.47 128.47 3;4;5 7.5363E-64 131970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.89 115.13 972340000 0 0 0 0 0 0 0 268700000 43075000 0 273180000 183010000 204360000 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23 DYFLEFEGDPHCLR Unmodified 1796.7828 0.78281994 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 113.15 113.15 2;3 0.00035293 116792 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.527 74.2 1283000000 112390000 155730000 183830000 100320000 119170000 135750000 0 20895000 108880000 41555000 142170000 46396000 115960000 8500 3063 7945 76113;76114;76115;76116;76117;76118;76119;76120;76121;76122;76123;76124;76125;76126;76127;76128;76129;76130;76131;76132 96900;96901;96902;96903;96904;96905;96906;96907;96908;96909;96910;96911;96912;96913;96914;96915;96916;96917;96918;96919;96920;96921 96914 20 DYFLFNPVTDIEEIIR Unmodified 1982.9989 0.99894395 3372 Q6NUK1;A0A3B3IU96 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 174.15 174.15 2 2.3952E-19 177879 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.87 133.61 205090000 0 0 0 0 0 0 109100000 0 0 0 0 50136000 45858000 8501 3372 7946 76133;76134;76135;76136 96922;96923;96924;96925 96925 4 DYFMPCPGR Unmodified 1141.4685 0.46848544 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.586 77.586 2 0.0094802 79297 QUIQUE_C1218_190116_001 75.854 67.082 380190000 60505000 45208000 21149000 36629000 55600000 0 28542000 0 19253000 11753000 31608000 23779000 46159000 8502 1839 7947 76137;76138;76139;76140;76141;76142;76143;76144;76145;76146;76147 96926;96927;96928;96929;96930;96931;96932;96933;96934;96935;96936 96926 11 DYFMPCPGR Oxidation (M) 1157.4634 0.46340006 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 1 0 1 1 1 1 56.059 56.059 2 0.016803 54914 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.915 60.574 157440000 0 0 0 0 34806000 0 0 0 0 22926000 43594000 0 56111000 8503 1839 7947 76148;76149;76150;76151 96937;96938;96939;96940 96939 4 DYFNVPYPLPK Unmodified 1351.6812 0.68123863 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.08 127.08 2 6.5546E-05 133602 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2973 Q13162;H7C3T4 PRDX4 Peroxiredoxin-4 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 79.74 79.74 2;3 0.00047025 80814 QUIQUE_C1277_190116_001 84.605 70.242 932330000 62441000 49953000 62620000 54777000 70712000 91448000 33215000 100650000 85137000 26579000 146170000 84091000 64542000 8511 2973 7955 76208;76209;76210;76211;76212;76213;76214;76215;76216;76217;76218;76219;76220;76221;76222;76223;76224;76225;76226;76227;76228;76229 97021;97022;97023;97024;97025;97026;97027;97028;97029;97030;97031;97032;97033;97034;97035;97036;97037;97038;97039;97040;97041;97042;97043 97023 20 DYHFVSSR Unmodified 1009.4617 0.4617438 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 28.053 28.053 2 0.024959 22591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.922 24.348 59029000 0 0 0 0 0 0 0 59029000 0 0 0 0 0 8512 487 7956 76230 97044 97044 1 DYHFVTSR Unmodified 1023.4774 0.47739386 2954 Q12959;A0A0C4DFT3 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 32.386 32.386 2 0.039916 27694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 26.947 37951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37951000 0 0 8513 2954 7957 76231 97045 97045 1 DYHIGIPLTYSQYK Unmodified 1696.8461 0.84607213 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 103.09 103.09 3 0.042431 105683 QUIQUE_C1277_190116_001 32.925 26.894 29933000 0 29933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8514 4140 7958 76232 97046 97046 1 DYHLLHPVENIPEIILYWK Unmodified 2391.2627 0.26270363 3368 Q6KCM7 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes yes 0 0 0 1 1 151.87 151.87 3 0.013001 159310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.131 42.18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8515 3368 7959 76233;76234 97047;97048 97047 2 DYHNLFSPR Unmodified 1147.5411 0.54105675 344 A0A1B0GTU4;P49023;F5GZ78 PXN Paxillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.133 62.133 3 0.0067861 59733 QUIQUE_C1563_190116_001 61.78 43.971 84123000 19640000 0 0 0 0 20539000 22938000 0 0 21006000 0 0 0 8516 344 7960 76235;76236;76237;76238;76239;76240 97049;97050;97051;97052;97053;97054 97051 6 DYIDISVAVATPR Unmodified 1418.7405 0.74054442 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 136.26 136.26 2 0.051987 143414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.741 37.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8517 2404 7961 76241 97055 97055 1 DYIDQWNK Unmodified 1080.4876 0.4876242 397 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEX7;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;P45983 MAPK10;MAPK8 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.216 73.216 2 0.017595 69642 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.297 64.521 327560000 43784000 45483000 0 38723000 36176000 33366000 44563000 0 30724000 11471000 0 43272000 0 8518 397 7962 76242;76243;76244;76245;76246;76247;76248;76249;76250 97056;97057;97058;97059;97060;97061;97062;97063;97064;97065;97066;97067 97066 12 DYIFEVMDCSMPLIGEHQVEDR Oxidation (M) 2698.1713 0.17132372 3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 137.32 137.32 3 3.022E-09 141335 QUIQUE_C1277_190116_001 94.837 88.26 195240000 41769000 30363000 35367000 35717000 0 38253000 0 0 0 13767000 0 0 0 8519 58;3755 7963 76251;76252;76253;76254;76255;76256 97068;97069;97070;97071;97072;97073 97069 47;48 5 DYIFEVMDCSMPLIGEHQVEDR Unmodified 2682.1764 0.1764091 3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.22 153.22 3 4.6324E-45 158621 QUIQUE_C1368_190116_001 150.58 142.87 1486100000 194750000 227080000 202090000 143450000 103030000 143100000 204510000 0 0 48153000 64833000 74398000 80707000 8520 58;3755 7963 76257;76258;76259;76260;76261;76262;76263;76264;76265;76266;76267 97074;97075;97076;97077;97078;97079;97080;97081;97082;97083;97084;97085;97086;97087 97078 13 DYIHVVDLAK Unmodified 1171.6237 0.62372375 3065 Q14376;Q5QPP3;Q5QPP4;Q5QPP9 GALE UDP-glucose 4-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 76.543 76.543 2;3 0.0042673 78331 QUIQUE_C1218_190116_001 64.103 37.43 455460000 45067000 42143000 42188000 42667000 42660000 37399000 33551000 21421000 33720000 22373000 35566000 29812000 26888000 8521 3065 7964 76268;76269;76270;76271;76272;76273;76274;76275;76276;76277;76278;76279;76280;76281 97088;97089;97090;97091;97092;97093;97094;97095;97096;97097;97098;97099;97100;97101;97102;97103 97088 16 DYIIDPR Unmodified 890.44978 0.44978213 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43;C9JF43;C9J8B6;C9JUR7 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.111 62.111 2 0.057389 61338 QUIQUE_C1368_190116_001 70.912 8.1982 1194100000 0 0 150640000 149590000 172720000 127750000 192670000 0 187600000 0 0 213110000 0 8522 756 7965 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deacetylase MACROD2 yes no 0 0 1 1 1 139.35 139.35 3 0.0020435 142599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.862 42.941 54334000 0 0 0 0 0 0 0 28298000 0 0 0 0 26037000 8525 464 7968 76303;76304 97128;97129 97128 2 DYIPVDQEELR Unmodified 1375.662 0.66195975 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 82.865 82.865 2 0.0043565 85806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.614 53.628 246930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 246930000 0 0 8526 3053 7969 76305 97130 97130 1 DYIPVDQEELRDYVK Unmodified 1880.9156 0.91560825 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 105.05 105.05 3 0.05114 106778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.775 29.544 169770000 0 0 0 0 0 0 0 169770000 0 0 0 0 0 8527 3053 7970 76306 97131 97131 1 DYIPVEGELLFQPGEAWK Unmodified 2090.0361 0.03605774 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.55 156.55 2 2.219E-05 161928 QUIQUE_C1368_190116_001 128.54 105.32 464140000 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synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.92 112.92 2 3.1025E-18 116142 QUIQUE_C1403_190116_001 168.8 128.75 3125900000 941400000 562910000 0 556650000 0 599510000 0 293080000 0 172380000 0 0 0 8531 612 7974 76323;76324;76325;76326;76327;76328 97150;97151;97152;97153;97154;97155;97156;97157;97158;97159;97160 97156 11 DYIYAVTPLLEDALMDR Unmodified 1996.9816 0.98157933 1644 O75533;H7C341 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 168.98 168.98 2 0.00089315 174300 QUIQUE_C1576_190116_001 83.087 70.727 42789000 0 20767000 0 0 0 0 22022000 0 0 0 0 0 0 8532 1644 7975 76329;76330 97161;97162;97163 97163 2 DYKAEEDPAK Unmodified 1164.5299 0.52988294 2842 Q00169;F5GWE5;I3L459;I3L4C0;I3NI10 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 15.313 15.313 2;3 0.0022744 7492 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.93 85.752 335040000 16249000 52225000 0 30686000 0 0 0 0 68286000 13778000 0 153810000 0 8533 2842 7976 76331;76332;76333;76334;76335;76336;76337;76338 97164;97165;97166;97167;97168;97169;97170;97171 97170 7 DYKVDQEIINIMQDR Unmodified 1878.9146 0.9145624 1767 O96000;H3BV16 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 129.99 129.99 2;3 3.3563E-10 133172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.29 76.428 1262900000 0 0 0 0 0 0 144420000 121430000 128130000 0 403270000 312020000 153610000 8534 1767 7977 76339;76340;76341;76342;76343;76344;76345;76346 97172;97173;97174;97175;97176;97177;97178;97179 97173 6 DYLGDFIEHYAQLGPSQPPDLAQAQDEPR Unmodified 3269.5265 0.52653549 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 158.81 158.81 2;3;4 2.0499E-259 162831 QUIQUE_C1277_190116_001 320.22 296.59 10292000000 962830000 1221800000 1200100000 669940000 854770000 731430000 677530000 565460000 709760000 224640000 1056700000 775230000 641980000 8535 2845 7978 76347;76348;76349;76350;76351;76352;76353;76354;76355;76356;76357;76358;76359;76360;76361;76362;76363;76364;76365;76366;76367;76368;76369;76370;76371;76372;76373;76374 97180;97181;97182;97183;97184;97185;97186;97187;97188;97189;97190;97191;97192;97193;97194;97195;97196;97197;97198;97199;97200;97201;97202;97203;97204;97205;97206;97207;97208;97209;97210;97211;97212;97213;97214;97215;97216;97217;97218;97219;97220;97221 97185 40 DYLHLPPEIVPATLR Unmodified 1732.9512 0.9512059 384;2482 A0A1W2PQS6;A0A2R8Y6L3;F6U211;A0A2R8Y7H1;S4R435;A0A2R8YFH6;P46783 RPS10;RPS10-NUDT3 40S ribosomal protein S10 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 3 1 1 1 1 129.04 129.04 3 8.4729E-05 134652 QUIQUE_C1218_190116_001 82.908 72.985 568900000 58181000 43753000 50613000 52254000 57625000 117030000 0 41827000 0 11424000 55124000 0 81069000 8536 384;2482 7979 76375;76376;76377;76378;76379;76380;76381;76382;76383;76384;76385;76386;76387;76388 97222;97223;97224;97225;97226;97227;97228;97229;97230;97231;97232;97233;97234;97235;97236;97237;97238;97239;97240;97241;97242;97243 97223 21 DYLHYHIK Unmodified 1087.5451 0.5450795 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 35.811 35.811 2;3 0.0059643 31731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.981 58.623 2381200000 110560000 132400000 167870000 164360000 119240000 119090000 485050000 237540000 142110000 140170000 210490000 150680000 201610000 8537 1486 7980 76389;76390;76391;76392;76393;76394;76395;76396;76397;76398;76399;76400;76401;76402 97244;97245;97246;97247;97248;97249;97250;97251;97252;97253;97254;97255;97256;97257;97258;97259 97256 14 DYLIDGSR Unmodified 937.45051 0.45051041 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.008 53.008 2 0.0073368 48641 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.418 45.255 456630000 0 0 0 0 0 111480000 0 0 0 56675000 107300000 86718000 94458000 8538 2135 7981 76403;76404;76405;76406;76407 97260;97261;97262;97263;97264;97265;97266;97267;97268 97262 9 DYLLCDYNR Unmodified 1230.5339 0.53392246 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 81.815 81.815 2 3.731E-05 81853 QUIQUE_C1563_190116_001 147.52 131.86 4807300000 365360000 492170000 460690000 408930000 363510000 381890000 517720000 189270000 307850000 171640000 407320000 352430000 388520000 8539 585;2493 7982 76408;76409;76410;76411;76412;76413;76414;76415;76416;76417;76418;76419;76420;76421;76422 97269;97270;97271;97272;97273;97274;97275;97276;97277;97278;97279;97280;97281;97282;97283;97284;97285;97286;97287;97288;97289;97290;97291;97292;97293;97294;97295;97296 97280 28 DYLMSTHFWGPVANWGLPIAAINDMK Oxidation (M) 2962.4146 0.41460596 4633 Q9Y5U8 MPC1 Mitochondrial pyruvate carrier 1 yes yes 0 1 0 1 165.76 165.76 3 9.5691E-08 173192 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.332 51.756 57501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57501000 0 0 8540 4633 7983 76423 97297 97297 3054 1 DYLSHQVPISFHK Unmodified 1569.794 0.79397698 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 66.888 66.888 3 0.0029477 67642 QUIQUE_C1218_190116_001 55.105 46.069 142040000 63783000 0 78254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8541 3419 7984 76424;76425 97298;97299;97300 97299 3 DYMAVLIK Unmodified 951.50994 0.50993955 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 96.826 96.826 2 0.042451 98587 QUIQUE_C1277_190116_001 58.981 41.42 78845000 34728000 31866000 0 0 0 0 0 0 0 12251000 0 0 0 8542 2807 7985 76426;76427;76428 97301;97302;97303 97302 3 DYMEMYNVIMTVK Unmodified 1635.7347 0.73467246 4135 Q9H1V8 SLC6A17 Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17 yes yes 0 0 0 1 1 154.2 154.2 2 0.00077688 157034 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.198 74.765 16607000 0 0 0 0 0 0 0 16607000 0 0 0 0 0 8543 4135 7986 76429;76430 97304;97305 97304 2 DYMFSGLKDETVGR Unmodified 1616.7505 0.75045718 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 89.684 89.684 2;3 0.0012923 91996 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.191 72.728 321120000 0 0 58780000 54167000 25141000 0 0 27287000 72408000 0 0 27193000 56140000 8544 1654 7987 76431;76432;76433;76434;76435;76436;76437;76438;76439;76440 97306;97307;97308;97309;97310;97311;97312;97313;97314;97315 97312 6 DYNDADMAR Unmodified 1069.4135 0.41347298 3083 Q14696;H0YLI4 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes no 0 0 0 1 28.905 28.905 2 0.054774 23059 QUIQUE_C1277_190116_001 49.418 44.844 21143000 0 21143000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8545 3083 7988 76441 97316 97316 1 DYNLNDILLQLGIEEAFTSK Unmodified 2295.1634 0.1634431 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 175.33 175.33 3 7.9585E-07 182368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.968 79.18 43428000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43428000 0 0 8546 1800 7989 76442 97317 97317 1 DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPR Unmodified 2554.2679 0.26786537 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 158.83 158.83 3 0.0087172 163375 QUIQUE_DMIX7_190116_001 24.552 16.839 79156000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36716000 42440000 0 8547 1096 7990 76443;76444 97318;97319 97319 1 DYNPLLAR Unmodified 960.50288 0.50288033 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.168 66.168 2 0.004682 62841 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.24 84.714 4156900000 535660000 507780000 426970000 409310000 417230000 387280000 448310000 186790000 0 162190000 0 299450000 375890000 8548 4524 7991 76445;76446;76447;76448;76449;76450;76451;76452;76453;76454;76455 97320;97321;97322;97323;97324;97325;97326;97327;97328;97329;97330;97331;97332;97333 97330 13 DYNPYNYSDSISPFNK Unmodified 1922.8323 0.83227255 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.58 116.58 2 3.1662E-24 120687 QUIQUE_C1368_190116_001 150.69 142.83 442260000 21773000 30883000 30453000 39579000 45025000 29200000 56588000 40400000 28628000 0 37554000 36024000 46152000 8549 310;830 7992 76456;76457;76458;76459;76460;76461;76462;76463;76464;76465;76466;76467 97334;97335;97336;97337;97338;97339;97340;97341;97342;97343;97344;97345 97336 11 DYNVTANSK Unmodified 1010.4669 0.46688876 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.037 20.037 2 0.00044066 12576 QUIQUE_C1277_190116_001 118.32 104.17 3477400000 0 533170000 0 361580000 0 348640000 0 987750000 379650000 471820000 0 394830000 0 8550 1775 7993 76468;76469;76470;76471;76472;76473;76474 97346;97347;97348;97349;97350;97351;97352 97346 3 DYPDFSPSVDAEAIQK Unmodified 1780.8156 0.81555986 2045 P12429;D6RFG5;D6RCA8;D6RAZ8 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.55 105.55 2 3.0226E-06 109667 QUIQUE_C1218_190116_001 136.38 121.7 1099000000 66367000 78121000 85666000 78114000 96635000 73070000 98530000 73436000 60105000 38365000 166950000 66906000 116770000 8551 2045 7994 76475;76476;76477;76478;76479;76480;76481;76482;76483;76484;76485;76486;76487 97353;97354;97355;97356;97357;97358;97359;97360;97361;97362;97363;97364;97365 97353 13 DYPFHEEF Unmodified 1082.4345 0.434526 2087 P15121 AKR1B1 Aldose reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.02 100.02 2 0.0096416 103906 QUIQUE_C1218_190116_001 92.319 92.319 3346200000 209240000 334810000 325960000 258270000 309400000 263840000 268970000 145220000 225140000 195360000 266970000 251480000 291530000 8552 2087 7995 76488;76489;76490;76491;76492;76493;76494;76495;76496;76497;76498;76499;76500 97366;97367;97368;97369;97370;97371;97372;97373;97374;97375;97376;97377;97378;97379;97380;97381;97382;97383;97384;97385;97386 97366 21 DYPLELFMAQCYGNISDLGK Unmodified 2333.0708 0.070805042 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9;H0YH31 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.13 169.13 2 6.3133E-09 170759 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.46 125.84 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76510;76511;76512;76513;76514;76515;76516;76517;76518;76519;76520;76521;76522;76523;76524;76525;76526;76527;76528;76529;76530;76531;76532;76533;76534;76535;76536 97397;97398;97399;97400;97401;97402;97403;97404;97405;97406;97407;97408;97409;97410;97411;97412;97413;97414;97415;97416;97417;97418;97419;97420;97421;97422;97423;97424;97425;97426;97427 97421 30 DYPVVSIEDPFDQDDWGAWQK Unmodified 2509.1074 0.10738478 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 4 2 3 2 2 4 2 2 3 2 4 3 2 166.9 166.9 2;3 2.9454E-233 169177 QUIQUE_C1277_190116_001 267.93 251.71 63153000000 3822200000 3720300000 4778700000 3298800000 4955700000 2884300000 4926900000 6824500000 6675700000 1313600000 6842900000 6928400000 6180800000 8556 1906 7999 76537;76538;76539;76540;76541;76542;76543;76544;76545;76546;76547;76548;76549;76550;76551;76552;76553;76554;76555;76556;76557;76558;76559;76560;76561;76562;76563;76564;76565;76566;76567;76568;76569;76570;76571 97428;97429;97430;97431;97432;97433;97434;97435;97436;97437;97438;97439;97440;97441;97442;97443;97444;97445;97446;97447;97448;97449;97450;97451;97452;97453;97454;97455;97456;97457;97458;97459;97460;97461;97462;97463;97464;97465;97466;97467;97468;97469;97470;97471;97472;97473;97474;97475;97476;97477;97478;97479;97480;97481;97482;97483;97484;97485;97486;97487;97488;97489;97490;97491;97492;97493;97494;97495;97496;97497;97498;97499;97500;97501;97502;97503;97504 97435 75 DYQDLLQVK Unmodified 1120.5764 0.57643921 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.342 94.342 2 0.00048805 96858 QUIQUE_C1368_190116_001 114.89 89.158 1300800000 0 136200000 186030000 136940000 87767000 114390000 121300000 0 144450000 75880000 133450000 0 164390000 8557 16;1475 8000 76572;76573;76574;76575;76576;76577;76578;76579;76580;76581;76582 97505;97506;97507;97508;97509;97510;97511;97512;97513;97514;97515;97516 97507 10 DYQDNKADVILK Unmodified 1420.7198 0.71980898 2494 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DYQELMNTK Unmodified 1140.5121 0.51212439 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.835 60.835 2 0.00011683 56953 QUIQUE_DMIX4_190116_001 160.88 82.957 2557200000 154860000 158760000 0 0 253090000 170710000 0 259520000 0 442660000 327240000 363570000 426790000 + 8560 1859 8002 76604;76605;76606;76607;76608;76609;76610;76611;76612 97543;97544;97545;97546;97547;97548;97549;97550;97551 97548 6 DYQELMNVK Unmodified 1138.5329 0.53285983 781;782;775 CON__P35908;H0YID6;CON__P35908v2;P35908;CON__P12035;P12035 KRT79;KRT2;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.728 76.728 2 0.0014209 73574 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.83 93.005 977290000 84930000 58875000 42366000 61884000 68274000 0 55182000 39506000 84302000 151430000 115260000 103700000 111570000 + 8561 781;782;775 8003 76613;76614;76615;76616;76617;76618;76619;76620;76621;76622;76623;76624 97552;97553;97554;97555;97556;97557;97558;97559;97560;97561;97562;97563;97564 97561 12 DYQELMNVK Oxidation (M) 1154.5278 0.52777445 781;782;775 CON__P35908;H0YID6;CON__P35908v2;P35908;CON__P12035;P12035 KRT79;KRT2;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 1 0 2 1 46.484 46.484 2 0.00050483 41826 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.41 69.965 233670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 179800000 0 53868000 0 + 8562 781;782;775 8003 76625;76626;76627 97565;97566;97567 97566 465 3 DYQGLFGVK Unmodified 1025.5182 0.51819605 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.934 92.934 2 0.0053778 90416 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.833 33.123 856110000 94481000 0 86432000 109670000 94191000 0 91933000 51842000 78147000 67795000 0 71996000 109610000 8563 151 8004 76628;76629;76630;76631;76632;76633;76634;76635;76636;76637 97568;97569;97570;97571;97572;97573;97574;97575;97576;97577;97578 97576 11 DYQTSPLLETQAEDHPPR Unmodified 2095.9811 0.98106206 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.117 70.117 3 0.0002033 69961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.062 51.131 419850000 0 0 0 69606000 38119000 0 54842000 77523000 0 0 85458000 0 94307000 8564 4664 8005 76638;76639;76640;76641;76642;76643 97579;97580;97581;97582;97583;97584 97582 3 DYRPYADLVSEIR Unmodified 1595.7944 0.79437091 3251 Q53G44;H7C1K6 IFI44L Interferon-induced protein 44-like yes no 0 0 1 1 106.07 106.07 3 0.0030286 111419 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.482 37.087 13048000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13048000 0 0 8565 3251 8006 76644 97585 97585 1 DYSDHPSGGSYR Unmodified 1339.5429 0.54290725 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 19.182 19.182 2;3 4.0785E-06 11514 QUIQUE_C1277_190116_001 136.84 86.006 769470000 113990000 102040000 102650000 113510000 0 90894000 34439000 66495000 0 15636000 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Unmodified 1333.6514 0.65139506 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 54.115 54.115 2 0.0011946 52438 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.914 64.541 373650000 77979000 137420000 0 0 0 0 0 0 0 0 158250000 0 0 8582 3432 8022 76803;76804;76805 97760;97761;97762 97762 3 DYVAPTANLDQKDK Unmodified 1576.7733 0.77330111 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 39.189 39.189 2;3 0.0008037 35554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.079 46.159 71285000 0 0 0 0 0 0 0 38518000 32767000 0 0 0 0 8583 3432 8023 76806;76807;76808;76809 97763;97764;97765;97766 97763 4 DYVISLGVVK Unmodified 1091.6227 0.62266112 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 104.67 104.67 2 0.02052 107446 QUIQUE_C1277_190116_001 59.35 47.839 170330000 38143000 34878000 40353000 0 0 43815000 0 0 0 13141000 0 0 0 8584 1420;1413 8024 76810;76811;76812;76813;76814;76815 97767;97768;97769;97770;97771;97772 97768 6 DYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLR Unmodified 2873.667 0.66703912 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 1 1 174.35 174.35 3 0.0070575 181537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.835 27.931 47655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47655000 0 0 8585 1420;1413 8025 76816 97773 97773 1 DYVLDCNILPPLLQLFSK Unmodified 2147.1337 0.1336633 2604 P52294;C9JYI4 KPNA1 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 175.96 175.96 2;3 4.7779E-11 176693 QUIQUE_C1563_190116_001 119.96 106 206140000 0 13954000 0 0 0 27163000 0 33594000 37259000 0 61959000 0 32209000 8586 2604 8026 76817;76818;76819;76820;76821;76822;76823 97774;97775;97776;97777;97778;97779;97780;97781 97775 8 DYVLNCSILNPLLTLLTK Unmodified 2089.1493 0.14931336 1587 O60684;Q5TFJ7 KPNA6 Importin subunit alpha-7 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 2 175.11 175.11 2;3 9.4905E-31 180842 QUIQUE_C1438_190116_001 151.44 130.58 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97797;97798;97799;97800;97801;97802;97803;97804;97805;97806;97807;97808;97809;97810;97811;97812;97813;97814;97815;97816;97817;97818;97819;97820;97821;97822;97823 97811 26 DYVSQFEGSALGK Unmodified 1399.662 0.66195975 1821 P02647 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 109.24 109.24 2 6.0003E-16 113728 QUIQUE_C1218_190116_001 158.79 140.48 2127200000 348950000 237420000 87874000 244300000 847110000 253470000 0 0 0 108060000 0 0 0 8589 1821 8029 76864;76865;76866;76867;76868;76869;76870;76871;76872;76873;76874;76875;76876 97824;97825;97826;97827;97828;97829;97830;97831;97832;97833;97834;97835;97836;97837;97838 97825 15 DYWSYLER Unmodified 1130.5033 0.50327426 525 C9J1X0;A4D1P6 WDR91 WD repeat-containing protein 91 yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.4 115.4 2 0.020103 120936 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.282 62.132 57492000 19508000 10375000 0 0 11994000 0 0 0 0 0 15615000 0 0 8590 525 8030 76877;76878;76879;76880 97839;97840;97841;97842 97842 4 DYYCILGIEK Unmodified 1272.606 0.60602477 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 0 1 114.18 114.18 2 0.063916 116372 QUIQUE_C1563_190116_001 53.751 38.136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8591 4416 8031 76881 97843 97843 1 DYYFALAHTVR Unmodified 1354.667 0.66698555 2017;948 E9PK47;P06737;P11217 PYGL;PYGM Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 86.308 86.308 3 0.00014921 87742 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.39 101.38 1976400000 51745000 100050000 111420000 140020000 159940000 82514000 123850000 191620000 312910000 59133000 156870000 261690000 224710000 8592 948;2017 8032 76882;76883;76884;76885;76886;76887;76888;76889;76890;76891;76892;76893;76894;76895;76896 97844;97845;97846;97847;97848;97849;97850;97851;97852;97853;97854;97855;97856;97857;97858;97859;97860;97861;97862;97863;97864;97865 97854 21 DYYINIR Unmodified 955.47633 0.47633123 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 76.37 76.37 2 0.029928 77620 QUIQUE_C1218_190116_001 91.093 60.425 73640000 30522000 43118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8593 1506 8033 76897;76898 97866;97867 97866 2 DYYQTLGLAR Unmodified 1198.5982 0.59823728 2241 P25685 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes yes 0 0 0 1 93.237 93.237 2 0.058436 89940 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.465 48.352 24662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24662000 0 0 0 8594 2241 8034 76899 97868 97868 0 EAAAAAAAAVAAAAAAAAAAEPYPVSGAK Unmodified 2453.2551 0.25505207 3385 Q6P6C2 ALKBH5 RNA demethylase ALKBH5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.12 154.12 3 2.4301E-08 159617 QUIQUE_C1368_190116_001 57.058 45.809 104400000 0 21804000 28110000 0 0 14099000 0 29518000 0 10868000 0 0 0 8595 3385 8035 76900;76901;76902;76903;76904 97869;97870;97871;97872;97873 97870 4 EAAAALVEEETRR Unmodified 1443.7318 0.73177065 1668 O75934 BCAS2 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 yes yes 0 0 1 1 1 48.966 48.966 2;3 0.0038427 45957 QUIQUE_C1277_190116_001 73.781 30.499 51360000 0 34819000 0 0 0 0 0 16542000 0 0 0 0 0 8596 1668 8036 76905;76906 97874;97875 97874 2 EAAAQEAGADTPGK Unmodified 1314.6052 0.60517315 1321 K7EK60;K7EJE6;K7EMY8;K7ERL1 FMNL1 no no 0 0 0 1 1 15.73 15.73 2 0.0038398 7669 QUIQUE_C1403_190116_001 67.214 47.38 28489000 15724000 0 0 12764000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8597 1321 8037 76907;76908 97876;97877 97877 2 EAAASGLPLMVIIHK Unmodified 1548.8698 0.86978446 1763 O95881 TXNDC12 Thioredoxin domain-containing protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.62 105.62 3 0.00083164 108656 QUIQUE_C1277_190116_001 44.132 33.793 455070000 41168000 52131000 0 34932000 52357000 32357000 36196000 33852000 29570000 0 48379000 37304000 56829000 8598 1763 8038 76909;76910;76911;76912;76913;76914;76915;76916;76917;76918;76919 97878;97879;97880;97881;97882;97883;97884;97885;97886;97887;97888;97889;97890;97891;97892 97879 14 EAAAVAPPER Unmodified 1009.5193 0.51925868 800 D3DTX6;Q96SB3 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chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.25 82.25 3 2.0944E-06 83542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.12 100.65 476330000 27203000 45684000 35659000 37957000 41894000 31991000 46011000 34308000 49113000 17199000 30690000 37240000 41386000 8615 4116 8055 77053;77054;77055;77056;77057;77058;77059;77060;77061;77062;77063;77064;77065 98049;98050;98051;98052;98053;98054;98055;98056;98057;98058;98059;98060;98061;98062 98057 14 EAAHLLNDALSIR Unmodified 1421.7627 0.76267685 4286 Q9NSK0;C9J8T5 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 82.843 82.843 2;3 0.001186 84212 QUIQUE_C1368_190116_001 69.716 49.253 294100000 24833000 30054000 45737000 26727000 47031000 55244000 27892000 0 0 0 0 0 36583000 8616 4286 8056 77066;77067;77068;77069;77070;77071;77072;77073;77074;77075;77076;77077;77078;77079 98063;98064;98065;98066;98067;98068;98069;98070;98071;98072;98073;98074;98075;98076;98077 98066 15 EAAIVDPVQPQK Unmodified 1293.6929 0.69286595 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BQW8 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 47.354 47.354 2 0.00056642 43901 QUIQUE_C1277_190116_001 110.88 102.66 818740000 337560000 285930000 0 0 0 0 0 195250000 0 0 0 0 0 8617 3195 8057 77080;77081;77082 98078;98079;98080 98079 3 EAAIWELEER Unmodified 1244.6037 0.60371659 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 93.666 93.666 2 0.023917 96022 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.632 38.407 75665000 0 0 0 37400000 0 0 0 0 38265000 0 0 0 0 8618 4145 8058 77083;77084;77085 98081;98082;98083 98083 3 EAALGAGFSDK Unmodified 1064.5138 0.51383895 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38;C9JEY0;C9JE81 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.984 41.984 2 0.00046515 38537 QUIQUE_C1403_190116_001 106.2 83.707 2951200000 235260000 236100000 439050000 331870000 201550000 312970000 285940000 216710000 0 158520000 238710000 0 294530000 8619 2660 8059 77086;77087;77088;77089;77090;77091;77092;77093;77094;77095;77096;77097 98084;98085;98086;98087;98088;98089;98090;98091;98092;98093;98094;98095 98088 11 EAALILGVSPTANK Unmodified 1382.7769 0.77692993 3831 Q96DA6 DNAJC19 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14 yes yes 0 0 0 1 79.537 79.537 2 0.0087519 80365 QUIQUE_C1277_190116_001 57.39 26.205 40671000 0 40671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8620 3831 8060 77098 98096 98096 1 EAALSTALSEK Unmodified 1118.5819 0.58191851 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.408 45.408 2 0.00043115 42349 QUIQUE_C1277_190116_001 103.01 71.071 4372800000 0 522930000 682540000 0 735700000 537310000 510820000 0 406530000 239140000 0 314990000 422800000 8621 1819;3223 8061 77099;77100;77101;77102;77103;77104;77105;77106;77107 98097;98098;98099;98100;98101;98102;98103;98104;98105;98106;98107;98108;98109;98110;98111;98112 98098 16 EAALSTALSEKR Unmodified 1274.683 0.68302954 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 2 2 1 2 31.167 31.167 2;3 0.0029497 26817 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.744 51.85 623000000 0 0 0 0 0 0 0 0 194200000 0 187120000 102880000 138800000 8622 1819;3223 8062 77108;77109;77110;77111;77112;77113;77114 98113;98114;98115;98116;98117;98118;98119 98114 6 EAALTSEEVGADLEQVEVLQK Unmodified 2257.1325 0.1325369 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 4 3 2 132.01 132.01 2;3 1.829E-128 136704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 287.48 271.54 14647000000 931770000 1095400000 972250000 1206200000 1269500000 1307800000 999980000 1346800000 1359900000 509420000 1003900000 984370000 1659800000 8623 267;275;3025 8063 77115;77116;77117;77118;77119;77120;77121;77122;77123;77124;77125;77126;77127;77128;77129;77130;77131;77132;77133;77134;77135;77136;77137;77138;77139;77140;77141;77142;77143;77144 98120;98121;98122;98123;98124;98125;98126;98127;98128;98129;98130;98131;98132;98133;98134;98135;98136;98137;98138;98139;98140;98141;98142;98143;98144;98145;98146;98147;98148;98149;98150;98151;98152;98153;98154;98155;98156;98157;98158;98159;98160;98161;98162;98163;98164;98165;98166;98167;98168;98169;98170;98171;98172;98173;98174;98175;98176;98177;98178;98179;98180;98181;98182;98183;98184;98185 98164 66 EAALVQQEEEK Unmodified 1272.6198 0.61976058 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 24.55 24.55 2 0.0026169 17889 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.642 70.083 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8624 3098 8064 77145;77146 98186;98187 98187 2 EAALVQQEEEKAEQR Unmodified 1756.8592 0.85915601 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 1 1 1 1 42.187 42.187 2;3 3.8105E-18 38368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.18 118.42 41471000 0 0 0 0 0 0 0 24900000 0 16571000 0 0 0 8625 3098 8065 77147;77148;77149 98188;98189;98190 98189 3 EAAMGQGFDR Unmodified 1080.4658 0.4658429 2223 P23786 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 32.27 32.27 2 0.033017 27357 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.493 36.717 19651000 0 0 0 0 0 0 0 19651000 0 0 0 0 0 8626 2223 8066 77150;77151 98191;98192 98191 2 EAAPDAGAEPITADSDPAYSSK Unmodified 2161.9651 0.96513722 3571 Q8N163;E5RHJ4 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.741 63.741 2 7.0946E-100 63895 QUIQUE_C1218_190116_001 201.3 187.62 538160000 49708000 63608000 66866000 48615000 58554000 43854000 0 0 45003000 0 67858000 56314000 37781000 8627 3571 8067 77152;77153;77154;77155;77156;77157;77158;77159;77160;77161;77162 98193;98194;98195;98196;98197;98198;98199;98200;98201;98202;98203;98204;98205 98193 13 EAAQALLLAELR Unmodified 1296.7402 0.74015049 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.6 117.6 2 0.00051629 121589 QUIQUE_C1368_190116_001 94.465 41.983 417680000 43681000 59230000 47346000 34618000 37862000 28047000 47650000 0 29667000 19648000 38773000 0 31154000 8628 4604 8068 77163;77164;77165;77166;77167;77168;77169;77170;77171;77172;77173;77174;77175 98206;98207;98208;98209;98210;98211;98212;98213;98214;98215;98216;98217;98218;98219 98208 14 EAAQALLLAELRR Unmodified 1452.8413 0.84126152 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 1 1 1 1 96.442 96.442 3 0.0026759 99938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.809 33.164 67645000 0 0 0 0 0 0 0 25410000 0 0 20228000 22008000 0 8629 4604 8069 77176;77177;77178 98220;98221;98222 98221 3 EAAQAMYIDSYNSR Unmodified 1617.7093 0.70932065 4029 Q9BU61 NDUFAF3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.913 65.913 2 0.0002629 66519 QUIQUE_C1218_190116_001 119.39 109.73 193450000 22329000 30679000 0 0 0 19637000 0 29169000 22100000 0 0 29848000 39687000 8630 4029 8070 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EAASQRPLSSSASNR Unmodified 1559.7652 0.76519604 123 A0A087X2H1;Q9ULT8;H0YJP0 HECTD1 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 yes no 0 0 1 1 10.701 10.701 3 0.00020304 3108 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.965 58.989 17011000 0 0 0 0 0 0 0 17011000 0 0 0 0 0 8634 123 8074 77195 98239 98239 1 EAASYQEALAR Unmodified 1207.5833 0.5833155 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 11 13 15 12 10 6 17 12 17 11 12 13 20 77.263 77.263 1;2;3 7.9973E-144 36445 QUIQUE_DMIX8_190116_001 287.77 216.08 864140000000 50464000000 59836000000 80056000000 68715000000 63444000000 68256000000 65372000000 62534000000 76064000000 56677000000 68658000000 65148000000 78921000000 8635 389;395;1336 8075 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98533 296 EAATLEVERPLPMEVEK Unmodified 1939.9925 0.99247837 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 79.894 79.894 2;3 1.6962E-200 80908 QUIQUE_C1277_190116_001 263.83 228.18 1059300000 212460000 223290000 48271000 167790000 0 145250000 75135000 0 0 42248000 0 61385000 83430000 8636 2596 8076 77365;77366;77367;77368;77369;77370;77371;77372;77373;77374;77375;77376;77377;77378;77379;77380 98553;98554;98555;98556;98557;98558;98559;98560;98561;98562;98563;98564;98565;98566;98567;98568;98569 98557 16 EAATLEVERPLPMEVEK Oxidation (M) 1955.9874 0.98739299 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 1 1 1 64.369 64.369 3 0.010019 60032 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.314 31.033 38783000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38783000 0 0 0 8637 2596 8076 77381 98570 98570 2044 1 EAATQAQQTLGSTIDK Unmodified 1660.8268 0.82679325 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RQU2;F2Z2V6 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.583 54.583 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EACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTR Unmodified 3388.6028 0.60275367 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 114.35 114.35 3 1.0812E-51 117635 QUIQUE_C1403_190116_001 119.89 115.27 59789000 0 0 0 25934000 0 0 33854000 0 0 0 0 0 0 8645 1510 8084 77451;77452 98648;98649 98648 2 EACITLGHLSSVLGNK Unmodified 1697.8771 0.87705468 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 93.786 93.786 3 0.0031571 95694 QUIQUE_C1403_190116_001 50.608 46.305 14979000 0 0 0 14979000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8646 1060 8085 77453 98650 98650 1 EACITVAHLSTVLGNK Unmodified 1711.8927 0.89270474 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.73 84.73 3 0.00039873 86156 QUIQUE_C1277_190116_001 66.335 62.432 375970000 49048000 75309000 0 0 53303000 26477000 47947000 0 41388000 22239000 60262000 0 0 8647 310;830 8086 77454;77455;77456;77457;77458;77459;77460;77461;77462;77463 98651;98652;98653;98654;98655;98656;98657;98658;98659;98660;98661 98652 11 EACPELDYFVVFSSVSCGR Unmodified 2220.982 0.98199003 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 156.15 156.15 2 0.00011273 161677 QUIQUE_C1368_190116_001 93.823 88.339 138130000 0 0 26736000 0 0 18689000 34692000 0 0 0 0 35162000 22846000 8648 2524 8087 77464;77465;77466;77467;77468 98662;98663;98664;98665;98666 98662 5 EACWTISNITAGNR Unmodified 1591.7413 0.74128948 1587;2604 P52294;O60684;Q5TFJ7 KPNA1;KPNA6 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.712 91.712 2 8.5347E-05 95034 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20.888 2 0.0050407 13899 QUIQUE_C1403_190116_001 69.915 61.732 22115000 0 0 0 22115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8654 3410 8092 77510 98713 98713 1 EADESLNFEEQILEAAK Unmodified 1934.9109 0.91091681 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.18 140.18 2 1.4629E-88 136382 QUIQUE_DMIX4_190116_001 208.08 187.95 953480000 0 116470000 130930000 171510000 0 0 0 112160000 101930000 64282000 0 123780000 132420000 8655 4600 8093 77511;77512;77513;77514;77515;77516;77517;77518;77519 98714;98715;98716;98717;98718;98719;98720;98721;98722;98723;98724 98722 11 EADFLGGMECTLGQIVSQR Unmodified 2109.9823 0.98232439 3793 Q96A23;D6RCT2 CPNE4 Copine-4 yes no 0 0 0 1 1 163.17 163.17 2;3 5.9991E-11 166689 QUIQUE_C1403_190116_001 140.08 120.48 30324000 0 21296000 0 9027600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8656 3793 8094 77520;77521 98725;98726 98726 2 EADGEQDEEEKDDGEAK Unmodified 1892.7396 0.73955396 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;F5H1H2;F5H2E6 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 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98737 9 EADGSETPEPFAAEAK Unmodified 1647.7264 0.7264105 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.475 57.475 2 5.9554E-46 56213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.58 177.63 1078000000 61328000 82803000 126980000 97018000 74232000 81800000 84112000 77921000 80854000 30010000 105910000 91029000 84001000 8660 3432 8098 77538;77539;77540;77541;77542;77543;77544;77545;77546;77547;77548;77549;77550 98744;98745;98746;98747;98748;98749;98750;98751;98752;98753;98754;98755;98756;98757;98758;98759 98753 15 EADGSLQPLPQR Unmodified 1309.6626 0.66262845 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 43.278 43.278 2 0.011298 41108 QUIQUE_C1218_190116_001 64.841 45.054 28134000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28134000 0 0 8661 3278 8099 77551;77552 98760;98761 98760 2 EADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK Oxidation (M) 2505.0676 0.067570157 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;M0QZ52 CALM2;CALM1;CALM3 yes no 0 1 0 4 4 4 2 2 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0.77548596 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.652 37.652 2 7.377E-104 33275 QUIQUE_C1403_190116_001 214.81 182.29 715840000 85065000 97906000 65561000 82572000 47741000 82776000 62972000 0 37660000 29969000 50149000 22310000 51156000 8672 4522 8108 77763;77764;77765;77766;77767;77768;77769;77770;77771;77772;77773;77774 99084;99085;99086;99087;99088;99089;99090;99091;99092;99093;99094;99095;99096 99087 12 EAEALIER Unmodified 929.48181 0.48181054 3573 Q8N1B4;A0A0G2JIG2 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes no 0 0 0 1 31.396 31.396 2 0.031416 26049 QUIQUE_C1403_190116_001 66.073 15.946 26345000 0 0 0 26345000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8673 3573 8109 77775 99097 99097 1 EAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSK Unmodified 2792.3976 0.39761849 858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E9PGG1 DYNC1I2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 148.96 148.96 3 1.7859E-08 151838 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.069 49.14 322570000 0 0 0 0 56904000 0 0 57060000 69869000 0 79352000 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91695 QUIQUE_C1438_190116_001 62.408 51.243 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8676 2651 8111 77800 99136 99136 1 EAEAMALLAEAERK Unmodified 1530.7712 0.77119262 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0QZM9;M0QZN5;M0R031 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 2 1 1 92.653 92.653 2;3 0.00036846 95126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.037 50.159 170840000 0 0 0 0 0 0 0 33901000 71250000 0 30702000 0 34989000 8677 2651 8112 77801;77802;77803;77804;77805 99137;99138;99139;99140;99141;99142 99139 6 EAEAQAAMEANSEGSLTRPK Unmodified 2088.9746 0.97459647 828 D6RI11;O14810;D6RAG3 CPLX1 Complexin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 47.61 47.61 3 1.1869E-75 44805 QUIQUE_C1218_190116_001 159.7 139.33 339600000 148780000 77384000 0 68553000 44891000 0 0 0 0 0 0 0 0 8678 828 8113 77806;77807;77808;77809 99143;99144;99145;99146;99147 99143 5 EAEDGIIAYDDCGVK Unmodified 1653.7192 0.71921663 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 75.987 75.987 2 0.0031847 76334 QUIQUE_C1403_190116_001 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EAEESLQQQQQEQEEALK Unmodified 2143.9869 0.9869353 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 55.341 55.341 2 5.683E-46 54073 QUIQUE_C1576_190116_001 225.33 212.7 43227000 0 0 0 0 0 0 43227000 0 0 0 0 0 0 8682 3241 8117 77828 99167 99167 1 EAEFGQGTGPIWLNEVK Unmodified 1873.921 0.92102798 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7;H0YGZ7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 1 1 121.54 121.54 2 1.3537E-22 125296 QUIQUE_C1403_190116_001 184.31 169.75 240310000 0 0 0 129300000 0 0 0 73896000 0 0 0 0 37113000 8683 725 8118 77829;77830;77831 99168;99169;99170;99171;99172;99173 99169 6 EAEGAPQVEAGK Unmodified 1184.5673 0.56733108 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.31 19.31 2 4.9206E-05 12086 QUIQUE_C1438_190116_001 126.39 93.125 1043700000 134630000 207460000 0 0 218090000 164670000 146420000 0 172440000 0 0 0 0 8684 926;889 8119 77832;77833;77834;77835;77836;77837 99174;99175;99176;99177;99178;99179;99180 99176 5 EAEGAPQVEAGKR Unmodified 1340.6684 0.66844211 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 1 14.458 14.458 3 0.045051 6360 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.551 26.894 43558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43558000 0 0 8685 926;889 8120 77838 99181 99181 1 EAEGEQFVEEALEK Unmodified 1606.7362 0.7362469 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.91 111.91 2;3 1.4604E-36 116048 QUIQUE_C1368_190116_001 178.67 162.03 882150000 54536000 47363000 190800000 0 92425000 0 65308000 64179000 59593000 0 258160000 49788000 0 8686 1452 8121 77839;77840;77841;77842;77843;77844;77845;77846;77847;77848;77849 99182;99183;99184;99185;99186;99187;99188;99189;99190;99191;99192;99193;99194;99195 99185 13 EAEHHCLLHSPIPVNCPIR Unmodified 2278.1099 0.10992494 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 1 2 1 3 1 1 2 2 1 57.354 57.354 2;3;4;5 7.1995E-55 54789 QUIQUE_C1563_190116_001 206.69 194.33 2884400000 458300000 339450000 0 357810000 255030000 278460000 315390000 150700000 260180000 83353000 0 0 385680000 8687 4297 8122 77850;77851;77852;77853;77854;77855;77856;77857;77858;77859;77860;77861;77862;77863;77864;77865;77866 99196;99197;99198;99199;99200;99201;99202;99203;99204;99205;99206;99207;99208;99209;99210;99211;99212;99213 99206 12 EAEILSVLSHR Unmodified 1252.6776 0.67755023 802 D4Q8H0;C9J3F7;Q9NYL2 pk;ZAK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase MLT yes no 0 0 0 1 1 82.49 82.49 3 0.040131 83593 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.677 14.282 35313000 0 0 0 0 0 0 23126000 0 0 0 0 12187000 0 8688 802 8123 77867;77868 99214;99215 99215 2 EAEISVPYLTSITALVVWLPANPTEK Unmodified 2840.5212 0.52116274 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 173.98 173.98 2;3 5.7528E-17 175350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.01 107.22 695000000 0 0 0 0 0 0 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77881;77882;77883;77884;77885;77886;77887;77888;77889;77890;77891;77892;77893;77894;77895;77896;77897;77898;77899;77900;77901;77902;77903;77904;77905;77906;77907;77908;77909;77910;77911;77912;77913;77914;77915;77916;77917;77918;77919 99228;99229;99230;99231;99232;99233;99234;99235;99236;99237;99238;99239;99240;99241;99242;99243;99244;99245;99246;99247;99248;99249;99250;99251;99252;99253;99254;99255;99256;99257;99258;99259;99260;99261;99262;99263;99264;99265;99266;99267;99268;99269;99270;99271;99272;99273;99274;99275;99276;99277;99278;99279;99280;99281;99282;99283;99284;99285;99286;99287;99288;99289;99290;99291;99292;99293;99294 99235 67 EAELDKYLECR Unmodified 1424.6606 0.66057954 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 1 1 2 67.531 67.531 2;3 0.013941 68443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.24 63.522 73372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30919000 0 42453000 8692 2387 8127 77920;77921;77922 99295;99296;99297 99295 3 EAELDVNEELDKK Unmodified 1530.7413 0.74133228 2460 P43034;I3L495 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 3 2 2 47.957 47.957 2;3 1.475E-53 45875 QUIQUE_C1218_190116_001 221.5 168.92 2516800000 81183000 104040000 316140000 252270000 110570000 95796000 118360000 95626000 317120000 113280000 334570000 269270000 308570000 8693 2460 8128 77923;77924;77925;77926;77927;77928;77929;77930;77931;77932;77933;77934;77935;77936;77937;77938;77939;77940;77941;77942;77943 99298;99299;99300;99301;99302;99303;99304;99305;99306;99307;99308;99309;99310;99311;99312;99313;99314;99315;99316;99317;99318;99319;99320;99321;99322;99323;99324;99325;99326;99327 99298 28 EAELGTVISQDDLGEEFYR Unmodified 2170.0066 0.0066081055 4675 yes no 0 0 0 1 2 2 13.518 13.518 4 0.0065189 5720 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.808 17.525 445610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84779000 110740000 250090000 + 8694 4675 8129 77944;77945;77946;77947;77948 99328;99329;99330;99331;99332;99333 99328 4 EAELKEAEKELHEK Unmodified 1681.8523 0.85227972 820;594 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99576 3 EAFEETHLTSLDPVK Unmodified 1714.8414 0.84138068 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;A0A286YFL3 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 2 2 2 1 2 3 1 82.639 82.639 2;3 3.2171E-65 83724 QUIQUE_DMIX7_190116_001 211.26 191.13 6302800000 453750000 575160000 684070000 202600000 599630000 563090000 549390000 499040000 414450000 133160000 699400000 543600000 385480000 8715 4309 8149 78134;78135;78136;78137;78138;78139;78140;78141;78142;78143;78144;78145;78146;78147;78148;78149;78150;78151;78152;78153;78154;78155;78156;78157;78158 99579;99580;99581;99582;99583;99584;99585;99586;99587;99588;99589;99590;99591;99592;99593;99594;99595;99596;99597;99598;99599;99600;99601;99602;99603;99604;99605;99606;99607;99608 99607 29 EAFEISK Unmodified 822.41233 0.41233399 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 33.238 33.238 2 0.02614 28873 QUIQUE_C1576_190116_001 94.539 39.968 1705900000 0 0 499120000 0 0 0 736380000 0 470380000 0 0 0 0 8716 2891 8150 78159;78160;78161 99609;99610;99611 99610 3 EAFLEQFRK Unmodified 1166.6084 0.60840804 2209 P23258 TUBG1 Tubulin gamma-1 chain yes yes 0 0 1 1 60.902 60.902 3 0.026262 59380 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.424 24.136 13634000 0 0 0 0 0 0 0 13634000 0 0 0 0 0 8717 2209 8151 78162 99612 99612 1 EAFLNTEDK Unmodified 1065.4979 0.49785453 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.362 37.362 2 0.00022207 32954 QUIQUE_C1277_190116_001 138.78 122.45 859400000 121630000 105460000 101670000 101230000 70167000 105370000 93628000 0 45713000 67531000 0 47008000 0 8718 267;275;3025 8152 78163;78164;78165;78166;78167;78168;78169;78170;78171;78172 99613;99614;99615;99616;99617;99618;99619;99620;99621;99622 99614 7 EAFLNTEDKGDSLDSVEALIK Unmodified 2293.1325 0.1325369 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 3 3 2 1 3 2 2 129.19 129.19 2;3 4.5474E-145 135175 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267;275;3025 8154 78202;78203 99675;99676;99677 99676 3 EAFLQEVWK Unmodified 1148.5866 0.58660996 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.37 109.37 2 0.00041479 112174 QUIQUE_C1403_190116_001 122.74 82.474 490230000 46615000 66369000 0 53323000 46870000 39193000 52537000 63699000 52481000 24003000 0 0 45140000 8721 2254 8155 78204;78205;78206;78207;78208;78209;78210;78211;78212;78213 99678;99679;99680;99681;99682;99683;99684;99685;99686;99687;99688;99689 99680 9 EAFNEFQK Unmodified 1011.4662 0.46616048 3782 Q93100;I3L1N3 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes no 0 0 0 1 1 41.56 41.56 2 0.042156 37319 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.098 44.949 31786000 0 0 0 0 31786000 0 0 0 0 0 0 0 0 8722 3782 8156 78214;78215 99690;99691 99691 2 EAFNMIDQNR Oxidation (M) 1252.5506 0.55063516 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 0 1 1 2 2 1 1 1 1 36.119 36.119 2 0.0018017 30905 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.668 75.968 360180000 30460000 47178000 0 0 0 0 61683000 0 74196000 19495000 53817000 39556000 33793000 8723 1303;2234 8157 78216;78217;78218;78219;78220;78221;78222;78223;78224;78225 99692;99693;99694;99695;99696;99697;99698;99699;99700;99701;99702;99703;99704;99705 99701 744 14 EAFNMIDQNR Unmodified 1236.5557 0.55572054 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.934 59.934 2 1.7941E-05 58595 QUIQUE_C1403_190116_001 147.29 118.87 1396500000 0 0 282530000 223990000 0 187280000 195030000 89554000 0 0 226060000 0 192040000 8724 1303;2234 8157 78226;78227;78228;78229;78230;78231;78232;78233;78234;78235 99706;99707;99708;99709;99710;99711;99712;99713;99714;99715 99709 10 EAFPVGPEPGPPGGR Unmodified 1462.7205 0.72047768 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 68.529 68.529 2 0.0098069 69634 QUIQUE_C1438_190116_001 53.967 36.102 38242000 0 0 0 0 38242000 0 0 0 0 0 0 0 0 8725 730 8158 78236 99716 99716 1 EAFQALEK Unmodified 934.476 0.47599688 2943 Q12792;F8VS81 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 38.818 38.818 2 0.01606 34942 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.753 29.874 473460000 0 0 0 0 124900000 0 0 0 145470000 56519000 0 146570000 0 8726 2943 8159 78237;78238;78239;78240 99717;99718;99719;99720 99718 4 EAFQLFDR Unmodified 1024.4978 0.49779495 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 90.462 90.462 1;2 0.0065537 91317 QUIQUE_C1563_190116_001 101.33 64.626 2412300000 303860000 361500000 370520000 0 342650000 240180000 0 155830000 0 73495000 331950000 232310000 0 8727 1048 8160 78241;78242;78243;78244;78245;78246;78247;78248;78249;78250 99721;99722;99723;99724;99725;99726;99727;99728;99729;99730 99725 5 EAFQNAYLELGGLGER Unmodified 1765.8635 0.8635131 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733 ATP1A3;ATP1A4 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 127.14 127.14 2;3 1.7255E-09 131496 QUIQUE_C1368_190116_001 127.56 116.95 1095000000 136080000 116100000 241020000 133540000 0 148510000 135590000 0 60326000 42287000 0 0 81519000 8728 1371 8161 78251;78252;78253;78254;78255;78256;78257;78258;78259;78260;78261 99731;99732;99733;99734;99735;99736;99737;99738;99739;99740;99741 99733 9 EAFQSVVLPAFEK Unmodified 1463.766 0.76603089 3379 Q6P2E9;I3L2F4 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 117.14 117.14 2 0.057201 120902 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.243 28.55 29132000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29132000 0 8729 3379 8162 78262 99742 99742 1 EAFSLFDK Unmodified 955.4651 0.46509784 1128 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100026;100027;100028;100029;100030;100031;100032;100033;100034;100035;100036;100037;100038;100039;100040;100041;100042;100043;100044;100045;100046;100047;100048;100049;100050;100051;100052;100053;100054;100055;100056;100057;100058;100059;100060 100031 32 EAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSR Unmodified 2967.4726 0.47264942 3685 Q8TDQ7 GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.93 146.93 3 2.3215E-63 153553 QUIQUE_C1438_190116_001 141.49 129.86 778680000 69568000 72765000 0 68647000 86320000 65728000 78598000 0 0 45134000 118370000 99131000 74415000 8749 3685 8182 78487;78488;78489;78490;78491;78492;78493;78494;78495;78496;78497;78498 100061;100062;100063;100064;100065;100066;100067;100068;100069;100070;100071;100072;100073;100074 100066 13 EAGLAHLCEFIEDCEHTVLATK Unmodified 2542.1832 0.18320904 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 142.08 142.08 4 0.03226 149075 QUIQUE_C1438_190116_001 24.896 13.752 19479000 0 0 0 0 19479000 0 0 0 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100148;100149;100150;100151;100152;100153;100154;100155;100156;100157;100158 100157 11 EAHQLFLEPEVLDPESVELK Unmodified 2321.1791 0.17909316 2420 P39748;I3L3E9 FEN1 Flap endonuclease 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 131.27 131.27 3 1.1645E-06 134200 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.574 82.92 165220000 56604000 0 36713000 0 27328000 0 0 44575000 0 0 0 0 0 8764 2420 8196 78578;78579;78580;78581;78582 100159;100160;100161;100162;100163 100163 5 EAHSDENPSEGDGAVNKEEK Unmodified 2140.9145 0.91449863 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 1 1 2 1 1 11.127 11.127 3;4 7.2383E-07 3737 QUIQUE_C1438_190116_001 95.205 90.019 30174000 0 0 5200500 0 14275000 0 4569200 0 0 0 0 0 6129800 8765 4354 8197 78583;78584;78585;78586;78587 100164;100165;100166;100167;100168 100166 5 EAIAELER Unmodified 929.48181 0.48181054 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.265 39.265 2 0.0036393 35451 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.18 16.506 4671200000 259230000 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Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.5 114.5 3 3.3846E-05 118192 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.575 74.211 746780000 65418000 0 71223000 66550000 75950000 59681000 64563000 47661000 73179000 19280000 94760000 49701000 58811000 8769 3766 8201 78606;78607;78608;78609;78610;78611;78612;78613;78614;78615;78616;78617 100188;100189;100190;100191;100192;100193;100194;100195;100196;100197;100198;100199;100200;100201 100197 12 EAIDSYIK Unmodified 937.47566 0.47566253 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.867 51.867 2 0.013433 49337 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.323 33.613 7012700000 1197000000 0 762980000 0 0 578040000 0 953400000 608530000 441790000 872420000 873910000 724630000 8770 50 8202 78618;78619;78620;78621;78622;78623;78624;78625;78626 100202;100203;100204;100205;100206;100207;100208;100209;100210 100210 5 EAIENATTNAEVLR Unmodified 1529.7686 0.76855009 980 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alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 173.05 173.05 2;3;4 1.6787E-143 178148 QUIQUE_C1576_190116_001 259.98 242.27 6544400000 243570000 514740000 1323100000 303920000 109230000 0 643710000 432950000 1386700000 9034400 903800000 20817000 652800000 8773 2778 8205 78642;78643;78644;78645;78646;78647;78648;78649;78650;78651;78652;78653;78654;78655;78656;78657;78658;78659;78660;78661;78662;78663;78664;78665 100226;100227;100228;100229;100230;100231;100232;100233;100234;100235;100236;100237;100238;100239;100240;100241;100242;100243;100244;100245;100246;100247;100248;100249;100250;100251 100238 20 EAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFR Oxidation (M) 2967.5012 0.50117236 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3;Q5JWE9;H0Y7F4;S4R3V9 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 1 0 1 1 154.3 154.3 3 3.1541E-08 156475 QUIQUE_C1563_190116_001 58.812 46.616 80851000 0 0 43116000 0 0 37735000 0 0 0 0 0 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78671;78672;78673;78674;78675;78676;78677;78678;78679;78680;78681;78682;78683;78684;78685;78686;78687;78688;78689;78690;78691;78692;78693;78694;78695;78696;78697;78698;78699;78700;78701;78702;78703;78704;78705;78706;78707;78708;78709;78710;78711;78712;78713;78714;78715;78716;78717;78718 100257;100258;100259;100260;100261;100262;100263;100264;100265;100266;100267;100268;100269;100270;100271;100272;100273;100274;100275;100276;100277;100278;100279;100280;100281;100282;100283;100284;100285;100286;100287;100288;100289;100290;100291;100292;100293;100294;100295;100296;100297;100298;100299;100300;100301;100302;100303;100304;100305;100306;100307;100308;100309;100310;100311 100306 46 EAIHSQLLEK Unmodified 1166.6295 0.62953741 837 E5RGS4;O60925 PFDN1 Prefoldin subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 26.602 26.602 2 0.003187 21340 QUIQUE_C1218_190116_001 85.733 40.752 268290000 80457000 0 51555000 0 0 38973000 59127000 0 0 0 0 0 38180000 8777 837 8208 78719;78720;78721;78722;78723 100312;100313;100314;100315;100316 100312 5 EAIINLATQPK Unmodified 1196.6765 0.6764876 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 65.664 65.664 2 0.003288 65543 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.267 48.374 105500000 0 0 0 0 46570000 0 0 0 58933000 0 0 0 0 8778 2101 8209 78724;78725;78726 100317;100318;100319 100318 3 EAIIPGSVYDR Unmodified 1218.6245 0.62445203 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 2 70.832 70.832 2 0.010392 66853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.062 38.892 13830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13830000 0 0 0 8779 3766 8210 78727;78728;78729 100320;100321;100322 100322 2 EAILAIHK Unmodified 893.53345 0.53345218 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 26.873 26.873 2 0.012898 21146 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 56.093 1106500000 0 0 0 0 0 354300000 0 0 373220000 0 0 378970000 0 8780 1228;1544 8211 78730;78731;78732 100323;100324;100325 100324 3 EAILDIITSR Unmodified 1129.6343 0.63428844 1936;845 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EALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK Unmodified 2640.3258 0.32577417 1611 O75131 CPNE3 Copine-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 169.84 169.84 2;3 2.6223E-63 174602 QUIQUE_C1368_190116_001 215.23 196.77 3808700000 144090000 137160000 309530000 99985000 223760000 217390000 495550000 431160000 701600000 22161000 287850000 260390000 478020000 8801 1611 8231 78943;78944;78945;78946;78947;78948;78949;78950;78951;78952;78953;78954;78955;78956;78957;78958;78959;78960;78961;78962;78963;78964;78965 100600;100601;100602;100603;100604;100605;100606;100607;100608;100609;100610;100611;100612;100613;100614;100615;100616;100617;100618;100619;100620;100621;100622 100605 22 EALAQTVLAEVPTQLVSYFR Unmodified 2234.1947 0.19468365 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.7 168.7 2;3 3.9815E-101 173692 QUIQUE_C1368_190116_001 268.9 248.43 2298500000 45826000 138890000 215640000 125220000 205120000 193030000 248820000 103420000 254130000 31415000 183090000 301080000 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100666;100667;100668;100669;100670;100671;100672;100673;100674;100675;100676;100677;100678;100679;100680;100681;100682;100683;100684;100685;100686;100687;100688;100689;100690;100691;100692;100693;100694;100695;100696;100697;100698;100699;100700;100701;100702;100703;100704;100705;100706;100707;100708;100709;100710;100711;100712;100713;100714;100715;100716;100717;100718 100670 53 EALDSDGWLHTGDIGK Unmodified 1712.8006 0.8005785 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 90.442 90.442 2;3 4.1345E-06 93423 QUIQUE_C1218_190116_001 79.346 72.307 145200000 45382000 33998000 41674000 0 0 0 0 0 0 24147000 0 0 0 8807 4476 8237 79029;79030;79031;79032;79033;79034;79035;79036 100719;100720;100721;100722;100723;100724;100725;100726 100719 7 EALDVLGAVLK Unmodified 1126.6598 0.6597749 1104 G5EA06;Q92552;D6RH20 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 128.34 128.34 2 0.0020066 134010 QUIQUE_C1218_190116_001 97.635 53.827 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100916;100917;100918;100919;100920;100921;100922;100923;100924;100925;100926;100927;100928 100919 10 EALMAHGLGNR Oxidation (M) 1183.5768 0.57679033 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 19.072 19.072 2;3 0.021315 11672 QUIQUE_C1563_190116_001 41.704 35.268 146420000 0 42021000 0 0 0 44927000 0 0 59472000 0 0 0 0 8832 2061 8261 79209;79210;79211 100929;100930;100931 100930 3 EALMTELSTVK Unmodified 1220.6322 0.63223953 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.489 83.489 2 0.0060393 86011 QUIQUE_C1438_190116_001 76.943 46.256 31617000 0 31617000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8833 3108 8262 79212;79213;79214;79215 100932;100933;100934;100935 100934 3 EALNIIGDISTSTVSTPVPPPVDDTWLQSASSHSPTPQR Unmodified 4100.0338 0.033832494 2569 P50570;K7ENE7 DNM2 Dynamin-2 yes no 0 0 0 2 148.03 148.03 4 0.00032551 155576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.639 26.235 87731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87731000 0 0 8834 2569 8263 79216;79217 100936;100937 100936 0 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100980;100981;100982;100983;100984;100985;100986;100987;100988;100989;100990;100991;100992;100993;100994;100995;100996;100997 100980 17 EALPGSGQAR Unmodified 984.49886 0.49885759 3881 Q96IU4;F8W9U3;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.81 18.81 2 0.00592 11231 QUIQUE_C1368_190116_001 75.825 54.054 1643100000 188960000 166300000 237770000 184190000 0 0 0 184880000 0 0 261720000 163260000 256040000 8842 3881 8270 79269;79270;79271;79272;79273;79274;79275;79276 100998;100999;101000;101001;101002;101003;101004;101005;101006 101000 7 EALPTWDK Unmodified 958.476 0.47599688 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 55.185 55.185 2 0.021461 54794 QUIQUE_C1438_190116_001 75.109 42.639 85580000 0 0 0 0 85580000 0 0 0 0 0 0 0 0 8843 824 8271 79277 101007 101007 1 EALQDVEDENQ Unmodified 1288.5419 0.54190419 2745 P62258;I3L0W5 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.754 56.754 2 0.00048107 54550 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.69 86.955 12483000000 1239900000 1351200000 1190500000 1267600000 882530000 1541900000 1101800000 316120000 695540000 659590000 776950000 655760000 804100000 8844 2745 8272 79278;79279;79280;79281;79282;79283;79284;79285;79286;79287;79288;79289;79290 101008;101009;101010;101011;101012;101013;101014;101015;101016;101017;101018;101019;101020;101021;101022;101023 101018 15 EALQLMATYLPK Unmodified 1376.7374 0.7373733 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 124.12 124.12 2 0.00053075 129628 QUIQUE_C1576_190116_001 99.973 81.637 761780000 56310000 84994000 65817000 92596000 71094000 54126000 68285000 54724000 49490000 0 0 77187000 87152000 8845 3954 8273 79291;79292;79293;79294;79295;79296;79297;79298;79299;79300;79301;79302;79303 101024;101025;101026;101027;101028;101029;101030;101031;101032;101033;101034;101035;101036;101037 101031 14 EALQLWSALQLK Unmodified 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101051;101052;101053;101054;101055;101056;101057;101058;101059;101060;101061;101062;101063;101064;101065 101064 13 EALQSDWLPFELLASGGQK Unmodified 2088.0528 0.052770437 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 163.32 163.32 2;3 1.0973E-99 167832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.15 164.47 1958800000 138250000 172970000 167240000 170660000 172260000 91677000 183930000 118730000 144160000 49705000 171640000 246550000 131070000 8848 4088 8276 79329;79330;79331;79332;79333;79334;79335;79336;79337;79338;79339;79340;79341;79342;79343;79344;79345;79346;79347;79348;79349;79350 101066;101067;101068;101069;101070;101071;101072;101073;101074;101075;101076;101077;101078;101079;101080;101081;101082;101083;101084;101085;101086;101087;101088;101089;101090;101091;101092;101093;101094;101095;101096;101097 101088 32 EALSAVLPR Unmodified 954.54983 0.54983053 1402 O00408;F5H3Z7;F5H130;F5H5P8 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 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79361;79362;79363;79364;79365;79366;79367;79368;79369;79370;79371;79372;79373;79374;79375;79376;79377 101109;101110;101111;101112;101113;101114;101115;101116;101117;101118;101119;101120;101121;101122;101123;101124;101125;101126;101127;101128;101129;101130 101111 21 EALSTATVQAAER Unmodified 1345.6838 0.68375782 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 46.733 46.733 2 0.0041067 44260 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.942 50.04 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8852 3428 8280 79378 101131 101131 1 EALTYDGALLGDR Unmodified 1392.6885 0.68850885 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 91.666 91.666 2 2.8772E-07 93912 QUIQUE_C1277_190116_001 156.48 125.06 3418800000 460420000 412550000 441920000 397130000 353220000 407280000 439270000 0 0 171640000 335410000 0 0 8853 3106 8281 79379;79380;79381;79382;79383;79384;79385;79386;79387;79388 101132;101133;101134;101135;101136;101137;101138;101139;101140;101141;101142;101143 101134 8 EALVSVWLQCTAISR Unmodified 1731.8978 0.89779012 2113 P16870;H0YAM0 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 1 139.88 139.88 2 0.0003901 135960 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.324 58.697 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8854 2113 8282 79389 101144 101144 1 EAMDPIAELLSQLSGVR Oxidation (M) 1843.935 0.93496349 4366 Q9P0J7 KCMF1 E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1 yes yes 0 1 0 1 1 1 171.14 171.14 2 2.4995E-22 174575 QUIQUE_C1277_190116_001 142.08 120.38 59010000 0 31793000 0 11685000 0 0 0 15531000 0 0 0 0 0 8855 4366 8283 79390;79391;79392 101145;101146;101147 101145 2922 3 EAMDPIAELLSQLSGVR Unmodified 1827.94 0.94004887 4366 Q9P0J7 KCMF1 E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 173.55 173.55 2;3 5.7466E-63 175024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 189.3 166.58 222570000 0 34561000 0 19661000 24340000 0 0 29600000 24477000 4054200 45946000 39926000 0 8856 4366 8283 79393;79394;79395;79396;79397;79398;79399;79400;79401 101148;101149;101150;101151;101152;101153;101154;101155;101156 101151 9 EAMECSDVIWQR Oxidation (M) 1538.6494 0.64936293 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 64.577 64.577 2 0.019401 63836 QUIQUE_C1277_190116_001 75.294 69.191 19879000 0 19879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8857 4281 8284 79402 101157 101157 0 EAMECSDVIWQR Unmodified 1522.6544 0.65444831 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 81.067 81.067 2 0.017649 81772 QUIQUE_C1403_190116_001 70.908 43.794 151020000 0 0 0 56866000 0 35022000 59135000 0 0 0 0 0 0 8858 4281 8284 79403;79404;79405 101158;101159;101160 101158 2 EAMEDGEIDGNK Oxidation (M) 1322.5296 0.52962495 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.021 17.021 2 7.4797E-05 9416 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.81 113.32 420330000 38454000 32389000 26622000 31551000 44211000 44615000 28376000 19123000 36953000 0 39876000 32806000 45349000 8859 2145 8285 79406;79407;79408;79409;79410;79411;79412;79413;79414;79415;79416;79417 101161;101162;101163;101164;101165;101166;101167;101168;101169;101170;101171;101172;101173;101174;101175;101176 101174 1488 16 EAMEDGEIDGNK Unmodified 1306.5347 0.53471033 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.453 28.453 2 0.00045647 22310 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.86 103.87 854960000 128500000 83562000 55943000 82446000 82066000 90929000 90608000 33037000 0 35400000 62152000 49180000 61136000 8860 2145 8285 79418;79419;79420;79421;79422;79423;79424;79425;79426;79427;79428;79429 101177;101178;101179;101180;101181;101182;101183;101184;101185;101186;101187;101188;101189 101185 8 EAMEDGEIDGNKVTLDWAKPK Unmodified 2345.1209 0.12092636 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 2 1 1 1 84.469 84.469 3;4 0.00064504 85345 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.117 46.314 277040000 0 0 0 0 0 0 0 82766000 85956000 0 0 108320000 0 8861 2145 8286 79430;79431;79432 101190;101191;101192 101190 3 EAMEHPYFYTVVK Unmodified 1612.7596 0.7595653 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A087WY74 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.13 73.13 2 0.00023168 73628 QUIQUE_C1368_190116_001 123.62 101.63 168900000 0 74075000 30739000 0 0 21915000 0 0 0 0 42171000 0 0 8862 456 8287 79433;79434;79435;79436 101193;101194;101195;101196;101197 101195 5 EAMGIYISTLK Unmodified 1224.6424 0.64241028 1730 O95433;G3V438;H0YJU2;H0YJG7 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.549 92.549 2 0.0067314 93814 QUIQUE_C1563_190116_001 97.456 87.17 876840000 95690000 0 0 0 103920000 104840000 124840000 0 112740000 0 130430000 88642000 115740000 8863 1730 8288 79437;79438;79439;79440;79441;79442;79443;79444 101198;101199;101200;101201;101202;101203;101204;101205 101200 0 EAMSAYNSHEEGR Unmodified 1479.6049 0.60485558 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.55 17.55 2;3 0.00054638 10453 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.441 78.132 131760000 37730000 21292000 21836000 17390000 0 0 0 15430000 0 18079000 0 0 0 8864 2377 8289 79445;79446;79447;79448;79449;79450 101206;101207;101208;101209;101210;101211 101210 6 EAMTDIITLFGLSSNSK Unmodified 1825.9132 0.91316541 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 162.93 162.93 2 0.010031 164952 QUIQUE_C1563_190116_001 53.448 31.89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8865 2562 8290 79451 101212 101212 1 EANALAAGHPAQAVAINAR Unmodified 1843.9653 0.96529283 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 46.472 46.472 2;3 3.2311E-101 43978 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.42 197.05 1757100000 0 0 518260000 0 95624000 313620000 721170000 0 0 67018000 41368000 0 0 8866 1472 8291 79452;79453;79454;79455;79456;79457;79458 101213;101214;101215;101216;101217;101218;101219 101219 7 EANEILQR Unmodified 971.50361 0.50360861 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5;C9K0R9;A0A3B3IRL5;C9J381;P20839 IMPDH2;IMPDH1 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2;Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase;Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1 yes no 0 0 0 1 1 27.092 27.092 2 0.015753 20898 QUIQUE_C1576_190116_001 84.244 44.141 133490000 0 0 0 0 0 0 91493000 0 0 42000000 0 0 0 8867 2040 8292 79459;79460 101220;101221 101220 1 EANELQQWINEK Unmodified 1500.7209 0.72087161 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.241 99.241 2 1.2388E-92 101602 QUIQUE_DMIX1_190116_001 235.01 213.55 24157000000 1604700000 1813700000 1781500000 1697100000 2129800000 1468900000 2087200000 1839000000 2240500000 759610000 2475100000 2075700000 2184200000 8868 267;275;3025 8293 79461;79462;79463;79464;79465;79466;79467;79468;79469;79470;79471;79472;79473 101222;101223;101224;101225;101226;101227;101228;101229;101230;101231;101232;101233;101234;101235;101236;101237;101238;101239;101240;101241;101242;101243;101244;101245;101246;101247;101248;101249;101250;101251;101252;101253 101240 32 EANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLR Unmodified 3627.6664 0.66635698 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 162.86 162.86 3 2.6912E-54 170390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.03 128.04 219900000 0 0 0 0 0 0 0 0 37692000 0 54084000 128130000 0 8869 903;2869 8294 79474;79475;79476 101254;101255;101256;101257 101256 4 EANFTVSSMHGDMPQK Unmodified 1777.7764 0.77635436 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 53.946 53.946 2;3 5.6706E-30 52287 QUIQUE_C1277_190116_001 166.48 148.81 446660000 0 97163000 58067000 63510000 0 0 46277000 35680000 0 0 67771000 28268000 49926000 8870 2416 8295 79477;79478;79479;79480;79481;79482;79483;79484;79485;79486;79487 101258;101259;101260;101261;101262;101263;101264;101265;101266;101267;101268 101260 11 EANGLPIMESNCFDPSK Unmodified 1907.8393 0.83934854 4319 Q9NX14 NDUFB11 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 106.63 106.63 2 0.00036341 110277 QUIQUE_C1218_190116_001 83.474 69.665 25405000 25405000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8871 4319 8296 79488 101269 101269 1 EANHNVSAPYGR Unmodified 1313.6113 0.61126158 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 15.922 15.922 2;3 3.6475E-14 8334 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.48 147.71 1300000000 32445000 45796000 0 45841000 57169000 27869000 180290000 184850000 221520000 16617000 71431000 215000000 201130000 8872 292;882;3442 8297 79489;79490;79491;79492;79493;79494;79495;79496;79497;79498;79499;79500;79501;79502;79503;79504;79505 101270;101271;101272;101273;101274;101275;101276;101277;101278;101279;101280;101281;101282;101283;101284;101285;101286;101287 101280 18 EANIQAVDSEVGLTK Unmodified 1572.7995 0.79951586 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 77.325 77.325 2 0.0093755 78891 QUIQUE_C1218_190116_001 70.089 59.857 96041000 96041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8873 4145 8298 79506 101288 101288 1 EANKQQNFNTGIK Unmodified 1490.7478 0.74775506 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 17.966 17.966 2 0.041493 10513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.439 33.875 22192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22192000 0 0 8874 267;275;3025 8299 79507 101289 101289 1 EANLAAIIER Unmodified 1098.6033 0.60332266 838 E5RGX5;Q93045 STMN2 Stathmin;Stathmin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.866 84.866 2 0.008683 86404 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.349 34.158 226550000 0 31616000 23457000 22481000 21563000 0 28838000 19474000 0 0 30538000 21729000 26859000 8875 838 8300 79508;79509;79510;79511;79512;79513;79514;79515;79516 101290;101291;101292;101293;101294;101295;101296;101297;101298 101295 8 EANLAASFGK Unmodified 1006.5084 0.50835964 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.077 47.077 2 0.00017251 44919 QUIQUE_C1438_190116_001 120.12 60.914 6144500000 517860000 381660000 565390000 396130000 449070000 462670000 490270000 409090000 493930000 183280000 659540000 486190000 649390000 8876 1971 8301 79517;79518;79519;79520;79521;79522;79523;79524;79525;79526;79527;79528;79529 101299;101300;101301;101302;101303;101304;101305;101306;101307;101308;101309;101310;101311;101312;101313;101314 101305 15 EANLLNAVIVQR Unmodified 1338.7619 0.76194857 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 102.13 102.13 2;3 3.1553E-07 104601 QUIQUE_C1403_190116_001 176.38 157.4 2217700000 202040000 180460000 127780000 135550000 200570000 160620000 174440000 195920000 168200000 49932000 231970000 164910000 225310000 8877 4516 8302 79530;79531;79532;79533;79534;79535;79536;79537;79538;79539;79540;79541;79542;79543;79544 101315;101316;101317;101318;101319;101320;101321;101322;101323;101324;101325;101326;101327;101328;101329;101330;101331 101319 16 EANLQALIATGGDINAAIER Unmodified 2039.0647 0.064732107 4433;4503;4272 Q9UHD9;Q9UMX0;Q9NRR5 UBQLN2;UBQLN1;UBQLN4 Ubiquilin-2;Ubiquilin-1;Ubiquilin-4 no no 0 0 0 1 142.39 142.39 2 0.0054714 138329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.092 54.767 16020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16020000 0 0 0 8878 4433;4503;4272 8303 79545 101332 101332 1 EANMPLPGYK Oxidation (M) 1134.5379 0.53794521 181 A0A0A0MSQ0;P13797;U3KQI3 PLS3 Plastin-3 yes no 0 1 0 1 31.371 31.371 2 0.060166 26257 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.574 28.792 31942000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31942000 0 8879 181 8304 79546 101333 101333 1 EANQQQQFNR Unmodified 1261.58 0.57996145 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.589 14.589 2 3.2949E-23 6164 QUIQUE_C1563_190116_001 190.93 143.84 907520000 11235000 30164000 0 13031000 0 25418000 0 122240000 36045000 654680000 0 14710000 0 8880 267;275;3025 8305 79547;79548;79549;79550;79551;79552;79553;79554 101334;101335;101336;101337;101338;101339;101340;101341 101337 8 EANSIIITPGYGLCAAK Unmodified 1776.908 0.90802046 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.01 101.01 2 6.2203E-05 105046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.95 108.98 757230000 137120000 0 114830000 94504000 0 81982000 99080000 0 116260000 0 113460000 0 0 8881 2993 8306 79555;79556;79557;79558;79559;79560;79561;79562 101342;101343;101344;101345;101346;101347;101348;101349;101350 101349 9 EAPAEGEAAEPGSPTAAEGEAASAASSTSSPK Unmodified 2914.2952 0.29519815 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 5 4 2 3 2 2 2 3 3 4 2 2 2 70.796 70.796 2;3;4 0 71819 QUIQUE_C1218_190116_001 304.51 299.46 15473000000 1425600000 1841900000 811090000 1497700000 1301400000 1155900000 1212800000 731340000 1443600000 476410000 1084800000 1017300000 1473500000 8882 2293 8307 79563;79564;79565;79566;79567;79568;79569;79570;79571;79572;79573;79574;79575;79576;79577;79578;79579;79580;79581;79582;79583;79584;79585;79586;79587;79588;79589;79590;79591;79592;79593;79594;79595;79596;79597;79598 101351;101352;101353;101354;101355;101356;101357;101358;101359;101360;101361;101362;101363;101364;101365;101366;101367;101368;101369;101370;101371;101372;101373;101374;101375;101376;101377;101378;101379;101380;101381;101382;101383;101384;101385;101386;101387;101388;101389;101390;101391;101392;101393;101394;101395;101396;101397;101398;101399;101400;101401;101402;101403;101404;101405;101406;101407;101408;101409;101410;101411;101412;101413;101414;101415;101416;101417;101418;101419 101355 69 EAPCVLIYIPDGHTK Unmodified 1711.8603 0.86034198 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 93.691 93.691 3 0.014447 95508 QUIQUE_C1277_190116_001 26.89 16.832 1001300000 0 582970000 0 0 0 418300000 0 0 0 0 0 0 0 8883 1929 8308 79599;79600 101420;101421;101422 101421 3 EAPDGCPDHVLR Unmodified 1364.6143 0.61429805 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 26.113 26.113 2;3 9.1689E-06 19850 QUIQUE_C1368_190116_001 131.52 106.66 4121800000 488350000 357830000 283830000 453810000 448200000 412770000 426760000 68403000 225120000 122610000 346400000 259310000 228450000 8884 4393;697 8309 79601;79602;79603;79604;79605;79606;79607;79608;79609;79610;79611;79612;79613;79614;79615;79616;79617;79618;79619;79620;79621;79622;79623;79624 101423;101424;101425;101426;101427;101428;101429;101430;101431;101432;101433;101434;101435;101436;101437;101438;101439;101440;101441;101442;101443;101444;101445;101446;101447;101448;101449;101450;101451;101452;101453;101454;101455;101456;101457;101458;101459;101460;101461 101429 39 EAPDSLPEFTVQMGNLR Unmodified 1902.9146 0.9145624 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 128.58 128.58 2 0.003353 132818 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.57 33.452 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8885 1510 8310 79625 101462 101462 1 EAPEDIQDLMDIFGDR Unmodified 1862.8356 0.83564337 1103 G5E9W9;Q9NUV9 GIMAP4 GTPase IMAP family member 4 yes no 0 0 0 2 1 165.86 165.86 2 0.00023566 170817 QUIQUE_C1368_190116_001 108.59 97.062 54908000 0 0 35674000 19234000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8886 1103 8311 79626;79627;79628 101463;101464;101465 101463 3 EAPEPMELDGPK Unmodified 1311.6017 0.60166768 2444 P42224;J3KPM9;H7BZB5 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 55.886 55.886 2 0.020495 55170 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.595 50.393 246300000 0 0 130560000 0 0 0 0 0 0 0 115730000 0 0 8887 2444 8312 79629;79630 101466;101467 101467 0 EAPEPMELDGPK Oxidation (M) 1327.5966 0.5965823 2444 P42224;J3KPM9;H7BZB5 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 0 1 1 36.2 36.2 2 0.036578 32137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.785 31.35 132420000 0 0 0 0 0 0 0 0 47557000 0 84868000 0 0 8888 2444 8312 79631;79632 101468;101469 101468 2 EAPFVPVGIAGFAAIVAYGLYK Unmodified 2252.2245 0.22452721 708 C9JAW5;C9JNU6;Q9Y241 HIGD1A HIG1 domain family member 1A, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 174.76 174.76 2;3 1.5203E-05 178670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.412 76.448 477440000 24205000 0 0 0 0 3114900 0 0 60597000 0 234730000 127520000 27269000 8889 708 8313 79633;79634;79635;79636;79637;79638;79639 101470;101471;101472;101473;101474;101475;101476;101477;101478 101473 9 EAPGMALAMLMGSLNVTPLGMLSR Oxidation (M) 2475.2358 0.23577866 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 1 0 1 2 1 172.36 172.36 2;3 8.0697E-18 173959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.67 88.109 126960000 0 19430000 0 0 0 0 0 82217000 0 0 0 0 25312000 8890 998 8314 79640;79641;79642;79643 101479;101480;101481;101482 101481 598 4 EAPGMALAMLMGSLNVTPLGMLSR Unmodified 2459.2409 0.24086403 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 175.45 175.45 2;3 7.0184E-13 182505 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.91 126.99 192400000 0 0 0 0 0 0 5648400 32829000 45027000 0 102370000 6534100 0 8891 998 8314 79644;79645;79646;79647;79648;79649;79650;79651 101483;101484;101485;101486;101487;101488;101489;101490;101491 101490 9 EAPLPFILLGGSEK Unmodified 1469.813 0.81298108 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8;H0Y8N8 RAPGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 141.43 141.43 2 0.010906 148660 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.452 37.141 25908000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25908000 0 0 8892 439 8315 79652;79653 101492;101493 101492 2 EAPNPIHLTVDTSLQNGR Unmodified 1960.9967 0.99665254 1396 O00303 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.11 79.11 3 9.6745E-05 79844 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.658 53.088 252590000 0 33408000 0 0 39782000 0 45953000 42799000 0 0 47823000 42829000 0 8893 1396 8316 79654;79655;79656;79657;79658;79659 101494;101495;101496;101497;101498;101499 101497 5 EAPTAYSLLIMHR Unmodified 1500.7759 0.77588407 2899 Q06203 PPAT Amidophosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.518 93.518 3 0.0069026 97538 QUIQUE_C1438_190116_001 39.424 30.826 155770000 0 0 0 0 23396000 0 0 0 32529000 0 48098000 26512000 25237000 8894 2899 8317 79660;79661;79662;79663;79664 101500;101501;101502;101503;101504 101500 5 EAPVPSLHLK Unmodified 1089.6182 0.61824444 4102 Q9GZN8;H7BYU9 C20orf27 UPF0687 protein C20orf27 yes no 0 0 0 1 1 1 44.914 44.914 3 0.015182 41681 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.918 25.711 52186000 28233000 0 0 0 0 0 0 0 23954000 0 0 0 0 8895 4102 8318 79665;79666;79667 101505;101506;101507 101507 3 EAQAALAEAQEDLESER Unmodified 1858.8545 0.85446456 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.472 94.472 2 3.0124E-75 96085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 249.75 224.41 714860000 53964000 53848000 76103000 74494000 65364000 60768000 72438000 48374000 0 23052000 75935000 47352000 63164000 8896 3459 8319 79668;79669;79670;79671;79672;79673;79674;79675;79676;79677;79678;79679;79680 101508;101509;101510;101511;101512;101513;101514;101515;101516;101517;101518;101519;101520 101515 13 EAQAQHNNSEFTEEQKK Unmodified 2016.9137 0.91371077 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 1 1 2 1 1 10.365 10.365 3;4 7.281E-24 2654 QUIQUE_DMIX7_190116_001 148.52 138.42 91028000 9064000 39513000 0 0 0 0 0 0 0 4097100 0 38354000 0 8897 3807 8320 79681;79682;79683;79684;79685 101521;101522;101523;101524;101525 101525 5 EAQAVAQEWK Unmodified 1158.5669 0.56693715 1703 O95057 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes yes 0 0 0 1 1 34.583 34.583 2 0.024502 30515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.148 55.573 47525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47525000 8898 1703 8321 79686;79687 101526;101527 101526 1 EAQAVPATLPELEATK Unmodified 1666.8778 0.87776618 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.689 88.689 2 0.00069941 90644 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 78.195 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54604 QUIQUE_C1563_190116_001 96.015 69.631 545600000 75736000 56937000 85456000 57308000 0 49259000 51435000 0 35870000 0 93057000 40542000 0 8902 4285 8325 79704;79705;79706;79707;79708;79709;79710;79711;79712 101544;101545;101546;101547;101548;101549;101550;101551;101552 101548 9 EAQNLSAMEIR Oxidation (M) 1276.6082 0.60815004 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 31.452 31.452 2 0.00014611 26644 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.41 104.47 212670000 0 0 31642000 0 0 0 0 0 61982000 0 0 60874000 58169000 8903 4285 8325 79713;79714;79715;79716;79717;79718 101553;101554;101555;101556;101557;101558;101559 101558 2901 6 EAQNSHVYWWR Unmodified 1474.6742 0.67419619 4565 Q9Y2S7;B4DEM9 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 61.134 61.134 3 0.029854 60036 QUIQUE_C1403_190116_001 39.148 27.615 17087000 0 0 0 17087000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8904 4565 8326 79719 101560 101560 1 EAQNTCAMLTTFNEIDMSNIQEMR Unmodified 2846.2343 0.23433468 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 148.32 148.32 3 4.2928E-05 150989 QUIQUE_C1563_190116_001 56.95 50.075 68451000 0 20767000 0 17705000 0 29978000 0 0 0 0 0 0 0 8905 2404 8327 79720;79721;79722 101561;101562;101563 101563 0 EAQQALGSAAADATEAK Unmodified 1630.7798 0.77984305 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 47.89 47.89 2;3 5.0367E-38 45138 QUIQUE_C1218_190116_001 202.13 188.31 2048300000 171410000 214610000 164440000 121390000 251600000 110770000 137400000 137050000 157680000 111210000 151150000 185940000 133680000 8906 2008 8328 79723;79724;79725;79726;79727;79728;79729;79730;79731;79732;79733;79734;79735;79736;79737;79738 101564;101565;101566;101567;101568;101569;101570;101571;101572;101573;101574;101575;101576;101577;101578;101579;101580;101581;101582;101583;101584 101564 21 EAQQYSEALASTR Unmodified 1452.6845 0.68448611 4173 Q9H4G4;Q5VZR0 GLIPR2 Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.478 45.478 2 4.9812E-17 42158 QUIQUE_C1403_190116_001 159.94 132.82 751590000 0 0 189530000 154760000 0 0 0 77308000 113570000 0 0 87418000 129010000 8907 4173 8329 79739;79740;79741;79742;79743;79744 101585;101586;101587;101588;101589;101590 101586 4 EAQTLDSQIQETSI Unmodified 1561.7471 0.74714594 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 98.218 98.218 2 0.020917 101714 QUIQUE_C1218_190116_001 49.35 31.542 78680000 33360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45319000 8908 880 8330 79745;79746 101591;101592 101591 2 EAQTLQQYR Unmodified 1135.5622 0.56218613 2592;1320 K7EK35;P42229;K7EIF9;P51692 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 1 25.811 25.811 2 0.00062951 19535 QUIQUE_C1403_190116_001 111.29 84.15 113860000 0 56857000 0 57007000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8909 1320;2592 8331 79747;79748 101593;101594 101594 2 EAQTSFLHLGYLPNQLFR Unmodified 2133.1007 0.10072368 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 1 2 2 2 137.66 137.66 2;3 1.6677E-83 140778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.82 178.09 3586700000 261390000 339840000 168780000 298610000 293380000 198540000 169480000 308500000 331520000 78591000 518710000 351390000 267980000 8910 3726 8332 79749;79750;79751;79752;79753;79754;79755;79756;79757;79758;79759;79760;79761;79762;79763;79764;79765;79766;79767;79768;79769;79770;79771;79772;79773 101595;101596;101597;101598;101599;101600;101601;101602;101603;101604;101605;101606;101607;101608;101609;101610;101611;101612;101613;101614;101615;101616;101617;101618;101619;101620;101621;101622;101623;101624;101625;101626;101627 101613 31 EAQVDAEAQR Unmodified 1115.5207 0.52071524 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 14.577 14.577 2 0.063897 6649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.756 28.981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8911 2863 8333 79774 101628 101628 1 EAQVYQAFK Unmodified 1082.5397 0.53965977 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 46.268 46.268 2 0.010394 43238 QUIQUE_C1277_190116_001 74.184 41.574 124130000 0 124130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8912 3878 8334 79775 101629 101629 1 EASAALQVR Unmodified 943.50869 0.50869399 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 23.176 23.176 2 0.050487 16564 QUIQUE_C1576_190116_001 50.607 18.672 62507000 0 0 0 0 0 0 62507000 0 0 0 0 0 0 8913 3718 8335 79776 101630 101630 1 EASADLSPYVR Unmodified 1206.5881 0.58806652 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.737 57.737 2 0.0023111 56086 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.128 53.915 389650000 37865000 42807000 0 47597000 54649000 0 0 52202000 73268000 21142000 0 60122000 0 8914 1386 8336 79777;79778;79779;79780;79781;79782;79783;79784 101631;101632;101633;101634;101635;101636;101637;101638 101636 8 EASDLLEQNR Unmodified 1173.5626 0.56258006 1111;3416 H0Y2S9;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 39.226 39.226 2 0.047017 35698 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.433 36.44 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8915 1111;3416 8337 79785 101639 101639 1 EASDPQPEEADGGLK Unmodified 1541.6845 0.68454569 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 31.796 31.796 2 1.8884E-36 27398 QUIQUE_C1403_190116_001 176.78 160.52 2028700000 309750000 0 27892000 248690000 231190000 197900000 257840000 0 0 147780000 292190000 38335000 277120000 8916 2617 8338 79786;79787;79788;79789;79790;79791;79792;79793;79794;79795;79796;79797;79798;79799 101640;101641;101642;101643;101644;101645;101646;101647;101648;101649;101650;101651;101652;101653;101654 101642 14 EASDTGQPIVFSQPESDEAK Unmodified 2133.9702 0.9702226 3663 Q8TB37;F8W0A2 NUBPL Iron-sulfur protein NUBPL yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.128 72.128 2 6.5163E-38 72387 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.09 122.4 327900000 31764000 0 26589000 20316000 33217000 15480000 54390000 19782000 29513000 0 41820000 0 55029000 8917 3663 8339 79800;79801;79802;79803;79804;79805;79806;79807;79808;79809 101655;101656;101657;101658;101659;101660;101661;101662;101663;101664 101662 10 EASDVLCTITK Unmodified 1235.6068 0.60675306 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 68.022 68.022 2 0.012432 67186 QUIQUE_C1563_190116_001 60.434 38.441 164430000 0 0 39855000 0 0 43708000 46704000 0 0 0 0 0 34166000 8918 982 8340 79810;79811;79812;79813 101665;101666;101667;101668;101669;101670;101671 101668 7 EASEEAFSGSAQPRPPSVVHESR Unmodified 2453.1571 0.15712894 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.634 47.634 3 2.0382E-39 44456 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106.4 81.555 1152200000 189970000 80703000 152940000 155250000 0 72150000 83169000 111070000 155370000 28253000 0 51089000 72220000 8922 1388 8344 79825;79826;79827;79828;79829;79830;79831;79832;79833;79834;79835;79836;79837;79838;79839;79840 101683;101684;101685;101686;101687;101688;101689;101690;101691;101692;101693;101694;101695;101696;101697;101698 101690 13 EASITVSVLHGTHSGPSYTPVPGSTRPIR Unmodified 3002.5574 0.5573821 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 68.413 68.413 4 1.0757E-15 68876 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.991 73.504 267910000 0 0 39503000 0 0 0 0 51777000 50931000 0 60561000 65139000 0 8923 2834 8345 79841;79842;79843;79844;79845 101699;101700;101701;101702;101703 101700 5 EASIYTGITLSEYFR Unmodified 1748.8621 0.86211612 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 4 4 3 4 2 4 4 2 7 2 6 5 2 144.22 144.22 2 3.3019E-18 149344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.08 121.95 2606400000 192500000 375020000 150020000 251160000 105380000 322860000 113470000 159830000 416840000 125800000 101870000 233910000 57785000 8924 2414 8346 79846;79847;79848;79849;79850;79851;79852;79853;79854;79855;79856;79857;79858;79859;79860;79861;79862;79863;79864;79865;79866;79867;79868;79869;79870;79871;79872;79873;79874;79875;79876;79877;79878;79879;79880;79881;79882;79883;79884;79885;79886;79887;79888;79889;79890;79891;79892;79893;79894 101704;101705;101706;101707;101708;101709;101710;101711;101712;101713;101714;101715;101716;101717;101718;101719;101720;101721;101722;101723;101724;101725;101726;101727;101728;101729;101730;101731;101732;101733;101734;101735;101736;101737;101738;101739;101740;101741;101742;101743;101744;101745;101746;101747;101748;101749;101750;101751;101752;101753;101754;101755;101756;101757;101758;101759;101760 101737 56 EASMEGIVTIVGLKPETTYAVR Unmodified 2363.2406 0.24064756 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 3 2 2 2 2 1 3 2 2 127.06 127.06 2;3;4 1.7523E-166 131467 QUIQUE_C1368_190116_001 242.19 230.21 16774000000 1027000000 1208400000 1607400000 1437800000 1615500000 1014800000 1030700000 1210800000 1661100000 319550000 1630800000 1158700000 1851400000 8925 1218;28;112;2057 8347 79895;79896;79897;79898;79899;79900;79901;79902;79903;79904;79905;79906;79907;79908;79909;79910;79911;79912;79913;79914;79915;79916;79917;79918;79919;79920;79921 101761;101762;101763;101764;101765;101766;101767;101768;101769;101770;101771;101772;101773;101774;101775;101776;101777;101778;101779;101780;101781;101782;101783;101784;101785;101786;101787;101788;101789;101790;101791;101792;101793;101794;101795;101796;101797;101798;101799;101800;101801;101802;101803;101804;101805;101806;101807;101808;101809;101810;101811;101812 101771 52 EASMEGIVTIVGLKPETTYAVR Oxidation (M) 2379.2356 0.23556218 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 106.39 106.39 2;3 8.4674E-54 109784 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.3 154.51 2332500000 0 32339000 0 27678000 524830000 36001000 0 0 596900000 210490000 0 319600000 584670000 8926 1218;28;112;2057 8347 79922;79923;79924;79925;79926;79927;79928;79929;79930;79931;79932;79933;79934;79935 101813;101814;101815;101816;101817;101818;101819;101820;101821;101822;101823;101824;101825;101826;101827 101820 14 14 EASMVITESPAALQLR Oxidation (M) 1730.8873 0.88728501 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 1 0 1 1 1 2 89.869 89.869 2 0.0059032 91059 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.205 37.58 175690000 20808000 0 23835000 0 0 0 0 0 0 26703000 0 0 104340000 8927 2258 8348 79936;79937;79938;79939;79940 101828;101829;101830;101831;101832 101831 1617 4 EASMVITESPAALQLR Unmodified 1714.8924 0.89237039 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.75 105.75 2 3.1832E-20 109070 QUIQUE_C1277_190116_001 170.62 108.31 2429400000 258320000 206250000 242900000 167870000 211830000 115970000 237660000 198210000 0 86701000 196450000 103890000 403330000 8928 2258 8348 79941;79942;79943;79944;79945;79946;79947;79948;79949;79950;79951;79952 101833;101834;101835;101836;101837;101838;101839;101840;101841;101842;101843;101844;101845 101834 9 EASPNPEDGIVR Unmodified 1282.6153 0.61534391 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 40.068 40.068 2 0.0067374 36545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.847 48.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8929 1473 8349 79953;79954;79955 101846;101847;101848 101848 3 EASQELPPGFLYK Unmodified 1477.7453 0.74529545 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 2 3 1 2 1 1 2 3 2 93.117 93.117 2 0.00052752 95728 QUIQUE_C1277_190116_001 89.679 73.101 1102700000 75696000 126600000 97408000 130250000 78804000 76955000 0 143550000 0 0 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79979;79980;79981;79982;79983;79984;79985 101875;101876;101877;101878;101879;101880;101881;101882 101875 3065 8 EASSLPQLVEMIVDHQIETGLLKPELK Unmodified 3016.6155 0.61547383 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 166.98 166.98 3;4 6.0703E-37 171147 QUIQUE_DMIX8_190116_001 126.46 123.71 7565200000 664930000 750850000 191760000 142260000 0 169120000 2711300000 675230000 437980000 271760000 975970000 0 574120000 8933 4662 8352 79986;79987;79988;79989;79990;79991;79992;79993;79994;79995;79996;79997;79998;79999;80000;80001 101883;101884;101885;101886;101887;101888;101889;101890;101891;101892;101893;101894;101895;101896;101897;101898 101897 16 EASSSACDLPR Unmodified 1191.519 0.51900068 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.667 22.667 2 0.0014591 15638 QUIQUE_C1277_190116_001 99.815 54.135 191420000 40616000 38185000 0 0 0 0 45071000 0 0 0 0 41323000 26224000 8934 3944 8353 80002;80003;80004;80005;80006;80007 101899;101900;101901;101902;101903;101904 101900 6 EASSTQDTGKLPVK Unmodified 1459.7518 0.75183739 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 1 1 19.18 19.18 2 0.046406 11833 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.49 26.284 51971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51971000 0 0 8935 2439 8354 80008 101905 101905 1 EASSVSEELHK Unmodified 1214.5779 0.57789577 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.453 18.453 2 0.0026231 10819 QUIQUE_C1438_190116_001 77.192 45.257 84563000 29132000 23633000 0 0 23849000 0 0 0 0 7949100 0 0 0 8936 334 8355 80009;80010;80011;80012;80013;80014;80015;80016 101906;101907;101908;101909;101910;101911;101912;101913 101908 8 EATADDLIK Unmodified 974.49204 0.49204087 3179 Q16531 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.149 39.149 2 0.01218 34841 QUIQUE_C1277_190116_001 71.692 34.134 663960000 97971000 93346000 92424000 0 96808000 75392000 0 80094000 78446000 49476000 0 0 0 8937 3179 8356 80017;80018;80019;80020;80021;80022;80023;80024 101914;101915;101916;101917;101918;101919;101920;101921 101915 8 EATAGNPGGQTVR Unmodified 1256.6109 0.61092723 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.632 14.632 2 7.3049E-09 6883 QUIQUE_C1438_190116_001 139.86 115.7 524300000 47308000 35638000 59023000 37246000 78524000 0 52633000 38287000 55356000 13020000 57938000 0 49326000 8938 1029 8357 80025;80026;80027;80028;80029;80030;80031;80032;80033;80034;80035 101922;101923;101924;101925;101926;101927;101928;101929;101930;101931;101932;101933;101934 101927 13 EATDAIGHLDR Unmodified 1196.5786 0.57856447 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 31.844 31.844 2;3 2.1195E-12 26773 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.34 117.26 3810500000 516900000 395250000 273510000 279110000 237770000 278710000 311300000 208170000 295990000 118070000 387480000 266210000 242050000 8939 2951 8358 80036;80037;80038;80039;80040;80041;80042;80043;80044;80045;80046;80047;80048;80049;80050;80051;80052;80053;80054;80055;80056;80057;80058;80059;80060 101935;101936;101937;101938;101939;101940;101941;101942;101943;101944;101945;101946;101947;101948;101949;101950;101951;101952;101953;101954;101955;101956;101957;101958;101959;101960;101961;101962 101952 25 EATDPRPCEVENAVESWR Unmodified 2143.9593 0.95928076 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 95.878 95.878 2;3 1.4767E-13 98762 QUIQUE_C1368_190116_001 125.45 116.39 2305300000 248040000 212420000 254630000 317540000 180670000 203030000 252540000 84258000 73717000 55854000 154520000 134700000 133350000 8940 2492 8359 80061;80062;80063;80064;80065;80066;80067;80068;80069;80070;80071;80072;80073;80074;80075;80076;80077 101963;101964;101965;101966;101967;101968;101969;101970;101971;101972;101973;101974;101975;101976;101977;101978;101979;101980;101981;101982;101983;101984;101985;101986;101987;101988 101967 25 EATDTPIVIQPASATETTQLTADSHPSYHTDGFN Unmodified 3614.6649 0.66487946 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.44 109.44 3 1.4664E-57 111761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.28 121.7 987880000 106620000 93673000 52354000 106140000 73822000 0 53967000 107470000 127630000 0 88286000 71137000 106770000 8941 4162 8360 80078;80079;80080;80081;80082;80083;80084;80085;80086;80087;80088 101989;101990;101991;101992;101993;101994;101995;101996;101997;101998;101999;102000;102001 101996 13 EATDYLR Unmodified 866.4134 0.41339662 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 32.163 32.163 2 0.061637 27299 QUIQUE_C1368_190116_001 68.7 39.362 20841000 0 0 20841000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8942 2882 8361 80089 102002 102002 1 EATEYEIELYGISK Unmodified 1643.793 0.7930335 2233 P24821;J3QSU6;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.68 109.68 2 0.00023158 106649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.97 91.713 525010000 0 0 0 0 0 59114000 0 127570000 128500000 78745000 0 57942000 73134000 8943 2233 8362 80090;80091;80092;80093;80094;80095 102003;102004;102005;102006;102007;102008;102009;102010;102011 102008 9 EATNPPVIQEEKPK Unmodified 1578.8253 0.82533668 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 24.239 24.239 2;3 1.2196E-17 17548 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.05 144.28 9398800000 1262600000 505030000 1101500000 521590000 799350000 386820000 830300000 411520000 710480000 201790000 837820000 1060900000 769170000 8944 2308 8363 80096;80097;80098;80099;80100;80101;80102;80103;80104;80105;80106;80107;80108;80109;80110;80111;80112;80113;80114;80115;80116;80117;80118;80119;80120;80121;80122 102012;102013;102014;102015;102016;102017;102018;102019;102020;102021;102022;102023;102024;102025;102026;102027;102028;102029;102030;102031;102032;102033;102034;102035;102036;102037;102038;102039;102040;102041;102042;102043;102044 102039 33 EATSILEENQALCTITSFPR Unmodified 2279.1104 0.11036167 2509 P48506;B4E2I4;A0A0C4DGB2 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.6 140.6 2;3 1.1838E-06 143570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.25 103.64 108530000 30795000 0 0 40269000 0 0 0 0 0 0 0 0 37470000 8945 2509 8364 80123;80124;80125;80126 102045;102046;102047;102048 102047 3 EATSLHDANDKLENELASK Unmodified 2084.0022 0.0021914296 1612 O75145;R4GN36 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.555 57.555 3 1.9961E-16 54993 QUIQUE_C1563_190116_001 123.54 107.42 361150000 38042000 45360000 0 37676000 0 55025000 68688000 38520000 0 0 0 0 77842000 8946 1612 8365 80127;80128;80129;80130;80131;80132;80133 102049;102050;102051;102052;102053;102054;102055 102052 7 EATSVPHIYAIGDVVEGRPELTPIAIMAGR Unmodified 3161.6543 0.65431896 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPK7;A0A0U1RQX0 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 138.78 138.78 4 9.2103E-32 144386 QUIQUE_C1218_190116_001 102.6 98.113 270430000 81700000 0 73806000 49584000 0 0 65342000 0 0 0 0 0 0 8947 330 8366 80134;80135;80136;80137 102056;102057;102058;102059;102060 102056 5 EATTDFTVDSRPLTQVGGDHIK Unmodified 2386.1765 0.1764674 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 75.027 75.027 3 1.5182E-09 74710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.772 75.109 46419000 0 0 0 0 0 0 0 46419000 0 0 0 0 0 8948 1628 8367 80138 102061 102061 1 EATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTK Unmodified 3407.8035 0.80354519 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 171.18 171.18 3;4 8.385E-31 172528 QUIQUE_C1563_190116_001 87.882 83.389 2793300000 0 65445000 123440000 59649000 310360000 173300000 632350000 144930000 99537000 46347000 108120000 727480000 302360000 8949 3700 8368 80139;80140;80141;80142;80143;80144;80145;80146;80147;80148;80149;80150;80151 102062;102063;102064;102065;102066;102067;102068;102069;102070;102071;102072;102073;102074;102075;102076;102077 102067 15 EATTMHLESLR Oxidation (M) 1302.6238 0.6238001 4737 yes yes 0 1 0 1 161.31 161.31 2 0.012306 166828 QUIQUE_C1368_190116_001 124.08 76.121 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 8950 4737 8369 80152 102078 102078 3098 1 EATTNAPFR Unmodified 1005.488 0.48795855 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.517 23.517 2 2.8264E-06 17080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.84 95.161 2264800000 233640000 227890000 0 0 282130000 226560000 0 0 297230000 0 408130000 216650000 372590000 8951 2324 8370 80153;80154;80155;80156;80157;80158;80159;80160;80161;80162 102079;102080;102081;102082;102083;102084;102085;102086;102087;102088 102086 10 EATVIQDLK Unmodified 1015.555 0.55497548 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.802 48.802 2 0.017275 45350 QUIQUE_C1563_190116_001 65.156 28.455 209050000 45239000 50444000 0 0 0 42815000 0 0 0 15810000 0 0 54743000 8952 3108 8371 80163;80164;80165;80166;80167 102089;102090;102091;102092;102093 102091 5 EATWESVSMMLQLGGTVIGSAR Oxidation (M) 2338.1297 0.1297169 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 166.46 166.46 2;3 1.0947E-10 171274 QUIQUE_C1218_190116_001 104.41 99.431 410640000 19189000 81184000 30816000 42792000 16394000 0 43519000 28482000 89190000 14700000 0 0 44375000 8953 452 8372 80168;80169;80170;80171;80172;80173;80174;80175;80176;80177;80178;80179;80180;80181 102094;102095;102096;102097;102098;102099;102100;102101;102102;102103;102104;102105;102106;102107;102108;102109 102094 326;327 14 EATWESVSMMLQLGGTVIGSAR Unmodified 2322.1348 0.13480228 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 169.82 169.82 3 1.12E-05 177229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.87 59.661 185550000 0 0 11289000 0 0 0 0 22958000 60289000 0 71520000 19498000 0 8954 452 8372 80182;80183;80184;80185;80186;80187;80188 102110;102111;102112;102113;102114;102115;102116 102114 7 EAVAMESYAK Unmodified 1097.5063 0.50631073 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.31 36.31 2 0.0015474 32592 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 64.397 3032600000 246780000 266370000 253740000 260560000 197230000 207490000 270980000 229470000 206960000 83682000 288720000 218200000 302470000 8955 2810 8373 80189;80190;80191;80192;80193;80194;80195;80196;80197;80198;80199;80200;80201 102117;102118;102119;102120;102121;102122;102123;102124;102125;102126;102127;102128;102129 102117 7 EAVAMESYAK Oxidation (M) 1113.5012 0.50122535 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.889 18.889 2 0.0018369 11380 QUIQUE_C1368_190116_001 96.311 74.783 406330000 0 50871000 59558000 0 41425000 44820000 0 29404000 36643000 30809000 46517000 28290000 37995000 8956 2810 8373 80202;80203;80204;80205;80206;80207;80208;80209;80210;80211 102130;102131;102132;102133;102134;102135;102136;102137;102138;102139 102131 2257 10 EAVAPVQEESDLEK Unmodified 1542.7413 0.74133228 2992;858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E7ESD3;E7EMU4;E9PGG1;E7ET01;E7EUM4;E7ERR6;E7ERH4;E7EU01;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.415 51.415 2 2.0339E-14 49642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.28 122.44 2732200000 218670000 247010000 0 251130000 289020000 220170000 156780000 179050000 288310000 97541000 238800000 242470000 303260000 8957 858;2992 8374 80212;80213;80214;80215;80216;80217;80218;80219;80220;80221;80222;80223;80224 102140;102141;102142;102143;102144;102145;102146;102147;102148;102149;102150;102151;102152;102153;102154 102149 15 EAVAPVQEESDLEKK Unmodified 1670.8363 0.8362953 2992;858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E7ESD3;E7EMU4;E9PGG1;E7ET01;E7EUM4;E7ERR6;E7ERH4;E7EU01;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 37.256 37.256 2;3 3.1868E-06 32545 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.911 74.366 769840000 0 67798000 0 0 0 71870000 86520000 78858000 106710000 34787000 131760000 83690000 107850000 8958 858;2992 8375 80225;80226;80227;80228;80229;80230;80231;80232;80233;80234;80235;80236;80237 102155;102156;102157;102158;102159;102160;102161;102162;102163;102164;102165;102166;102167;102168 102164 14 EAVATAVQR Unmodified 943.50869 0.50869399 1585 O60645;D6RB59;D6RBR9 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 1 1 17.895 17.895 2 0.0013972 10558 QUIQUE_C1218_190116_001 104.06 63.028 118210000 38229000 42613000 0 0 0 37364000 0 0 0 0 0 0 0 8959 1585 8376 80238;80239;80240 102169;102170;102171 102169 1 EAVCEVALDYK Unmodified 1295.6068 0.60675306 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 69.257 69.257 2 1.8215E-24 69099 QUIQUE_DMIX3_190116_001 183.67 154.59 5366100000 698630000 608120000 444630000 301750000 446930000 313750000 400750000 324810000 298450000 403040000 458980000 330490000 335820000 8960 2851 8377 80241;80242;80243;80244;80245;80246;80247;80248;80249;80250;80251;80252;80253;80254;80255 102172;102173;102174;102175;102176;102177;102178;102179;102180;102181;102182;102183;102184;102185;102186;102187;102188;102189;102190;102191;102192;102193;102194;102195;102196;102197 102190 26 EAVCEVALDYKK Unmodified 1423.7017 0.70171607 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 47.268 47.268 2;3 3.9346E-06 44696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.93 154.19 6665000000 267510000 156170000 132540000 83146000 795650000 82227000 196330000 977790000 1180000000 208940000 1213400000 262090000 1109200000 8961 2851 8378 80256;80257;80258;80259;80260;80261;80262;80263;80264;80265;80266;80267;80268;80269;80270;80271;80272;80273;80274;80275 102198;102199;102200;102201;102202;102203;102204;102205;102206;102207;102208;102209;102210;102211;102212;102213;102214;102215;102216;102217;102218;102219 102215 14 EAVEAIQNSTSIK Unmodified 1388.7147 0.7147236 1310 K4DI93;Q13620;A6NE76 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 46.823 46.823 2 2.1373E-10 44429 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.74 68.542 202260000 0 70219000 0 0 0 0 0 0 0 0 60155000 71882000 0 8962 1310 8379 80276;80277;80278 102220;102221;102222 102221 3 EAVEKEFEPLLNWMK Unmodified 1861.9284 0.92842155 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 139.54 139.54 2;3 3.7728E-78 146510 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.49 186.91 584020000 0 0 0 0 0 0 0 88275000 117810000 0 301940000 0 76003000 8963 2079 8380 80279;80280;80281;80282;80283;80284 102223;102224;102225;102226;102227;102228;102229 102227 7 EAVELPLTHFELYK Unmodified 1687.8821 0.88212328 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 3 2 2 118.26 118.26 2;3 0.00021334 121039 QUIQUE_C1563_190116_001 92.866 78.447 1474900000 154770000 149300000 134120000 146280000 46692000 118380000 54688000 143790000 126490000 29074000 124770000 93906000 152680000 8964 2466 8381 80285;80286;80287;80288;80289;80290;80291;80292;80293;80294;80295;80296;80297;80298;80299;80300;80301;80302;80303;80304;80305;80306;80307;80308;80309 102230;102231;102232;102233;102234;102235;102236;102237;102238;102239;102240;102241;102242;102243;102244;102245;102246;102247;102248;102249;102250;102251;102252;102253;102254;102255;102256;102257;102258;102259;102260;102261;102262;102263;102264 102246 33 EAVEQFESQGVDLSNIVK Unmodified 1990.9848 0.98475045 3374 Q6NXE6;F5H2X2;F5H2K4;F5GWV0;F5H4P3;F5H052;F5H3X1 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.87 122.87 2 6.8499E-76 125584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 201.04 177.81 285280000 39834000 29246000 31518000 27358000 40504000 28074000 0 25279000 28429000 0 0 35035000 0 8965 3374 8382 80310;80311;80312;80313;80314;80315;80316;80317;80318;80319 102265;102266;102267;102268;102269;102270;102271;102272;102273;102274 102271 10 EAVFFQSHSAR Unmodified 1277.6153 0.61528433 2402 P36954 POLR2I DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.007 31.007 2 0.0048497 26047 QUIQUE_C1368_190116_001 70.389 51.609 873190000 0 0 370270000 0 0 229860000 0 0 273050000 0 0 0 0 8966 2402 8383 80320;80321;80322 102275;102276;102277 102275 2 EAVFPFQPGSVAEVCITFDQANLTVK Unmodified 2866.4211 0.42113112 1958 P09382 LGALS1 Galectin-1 yes yes 0 0 0 4 6 6 1 1 162.87 162.87 2;3 1.1036E-56 167629 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.41 134.27 1114900000 0 0 0 0 0 0 0 193170000 400650000 0 295170000 159520000 66355000 8967 1958 8384 80323;80324;80325;80326;80327;80328;80329;80330;80331;80332;80333;80334;80335;80336;80337;80338;80339;80340 102278;102279;102280;102281;102282;102283;102284;102285;102286;102287;102288;102289;102290;102291;102292;102293;102294;102295;102296;102297;102298 102285 20 EAVGDLLDAFK Unmodified 1176.6027 0.60265396 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.35 133.35 2 0.00051267 137961 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.4 85.968 279960000 0 0 0 48718000 47329000 0 22334000 0 38073000 18502000 48148000 0 56859000 8968 922 8385 80341;80342;80343;80344;80345;80346;80347 102299;102300;102301;102302;102303;102304;102305;102306 102306 6 EAVIAAAFAK Unmodified 989.55458 0.55458155 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 64.12 64.12 1;2 0.00015879 63312 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.51 132.35 12151000000 652300000 530150000 992820000 561780000 675590000 855730000 1282200000 866640000 1702700000 0 1316500000 743940000 1970600000 8969 1353;3033 8386 80348;80349;80350;80351;80352;80353;80354;80355;80356;80357;80358;80359;80360;80361;80362;80363 102307;102308;102309;102310;102311;102312;102313;102314;102315;102316;102317;102318;102319;102320;102321;102322;102323;102324;102325;102326;102327;102328;102329;102330;102331;102332;102333;102334;102335 102335 25 EAVIAQISSHVK Unmodified 1280.7089 0.70885036 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 53.916 53.916 2;3 0.00062606 51648 QUIQUE_C1403_190116_001 55.188 42.381 186450000 34614000 29665000 0 30688000 0 30415000 0 0 38125000 22940000 0 0 0 8970 1439 8387 80364;80365;80366;80367;80368;80369;80370;80371 102336;102337;102338;102339;102340;102341;102342;102343;102344 102339 9 EAVILPIK Unmodified 881.5586 0.5586043 4507;1625 Q9UN37;O75351 VPS4A;VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4A;Vacuolar protein sorting-associated protein 4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 66.197 66.197 2 0.014923 66398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.359 50.159 384110000 85190000 0 0 0 90501000 95675000 0 0 0 0 48967000 63777000 0 8971 4507;1625 8388 80372;80373;80374;80375;80376 102345;102346;102347;102348;102349;102350;102351 102350 7 EAVLDVIPTDIHQR Unmodified 1604.8522 0.85222014 1962 P09467;A0A3B3IUC7 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 86.53 86.53 3 0.019485 87886 QUIQUE_C1403_190116_001 35.118 22.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8972 1962 8389 80377 102352 102352 1 EAVLIDPVLETAPR Unmodified 1521.8403 0.84025847 1736 O95571;M0QXB5;M0QY80 ETHE1 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.6 108.6 2 0.00033518 111791 QUIQUE_C1403_190116_001 118.9 83.491 1228800000 0 154750000 147110000 132340000 107980000 112780000 106990000 106810000 0 57298000 142850000 0 159880000 8973 1736 8390 80378;80379;80380;80381;80382;80383;80384;80385;80386;80387 102353;102354;102355;102356;102357;102358;102359;102360;102361;102362;102363;102364;102365;102366;102367;102368;102369;102370 102358 18 EAVLYVDSQEAALK Unmodified 1534.7879 0.78788854 3088 Q14894;I3L325;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.512 81.512 2 6.3473E-05 82900 QUIQUE_C1277_190116_001 137.17 102.45 7567100000 527770000 688070000 479460000 585530000 658750000 561570000 609010000 435760000 675640000 277740000 888710000 615730000 563320000 8974 3088 8391 80388;80389;80390;80391;80392;80393;80394;80395;80396;80397;80398;80399;80400;80401 102371;102372;102373;102374;102375;102376;102377;102378;102379;102380;102381;102382;102383;102384;102385;102386;102387;102388;102389;102390;102391;102392;102393;102394;102395;102396;102397;102398;102399;102400;102401 102374 31 EAVNLQQDAFVVIGR Unmodified 1657.8788 0.87876924 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RCQ8;D6RF77;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 2 120.99 120.99 2 0.00052381 117537 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.124 54.206 26920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26920000 0 0 0 8975 1728 8392 80402;80403;80404;80405 102402;102403;102404;102405 102404 4 EAVQCVQELASPSLLFIFVR Unmodified 2305.214 0.21403888 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 169.01 169.01 2;3 1.9774E-07 162805 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.175 89.011 621670000 44423000 51355000 31182000 23874000 49340000 0 101310000 43068000 58566000 14143000 103280000 77199000 23929000 8976 922 8393 80406;80407;80408;80409;80410;80411;80412;80413;80414;80415;80416;80417;80418;80419 102406;102407;102408;102409;102410;102411;102412;102413;102414;102415;102416;102417;102418;102419 102416 14 EAVQLLEDYK Unmodified 1206.6132 0.61321864 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.804 79.804 2 0.00027754 79702 QUIQUE_C1563_190116_001 145.72 104.7 1160100000 125630000 109380000 147140000 147600000 0 96133000 96139000 72887000 111770000 0 140850000 112570000 0 8977 3679 8394 80420;80421;80422;80423;80424;80425;80426;80427;80428;80429;80430 102420;102421;102422;102423;102424;102425;102426;102427;102428;102429;102430 102424 9 EAVQLLEDYKHGTLRPGVTNEQLWSAQK Unmodified 3209.6469 0.64692539 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 2 1 99.287 99.287 4 6.4168E-24 100788 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.441 90.253 101740000 0 0 0 0 0 0 0 101740000 0 0 0 0 0 8978 3679 8395 80431 102431 102431 1 EAVQLMAEAEK Unmodified 1217.5962 0.59618837 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.894 53.894 2 0.0004542 51939 QUIQUE_C1277_190116_001 120.09 95.935 3321900000 587830000 577340000 390590000 503700000 0 450290000 424140000 100690000 0 0 71373000 99933000 115980000 8979 4128 8396 80432;80433;80434;80435;80436;80437;80438;80439;80440;80441;80442 102432;102433;102434;102435;102436;102437;102438;102439;102440;102441;102442;102443;102444;102445 102433 14 EAVQLMAEAEK Oxidation (M) 1233.5911 0.59110299 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 30.932 30.932 2 0.03518 24691 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.436 28.007 15363000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15363000 0 0 0 8980 4128 8396 80443 102446 102446 1 EAVQLMAEAEKR Unmodified 1373.6973 0.6972994 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 43.449 43.449 2;3 1.3131E-05 40205 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.82 105.3 2933800000 93399000 274500000 144630000 118500000 150940000 69472000 192240000 396220000 211520000 32958000 448420000 384530000 416460000 8981 4128 8397 80444;80445;80446;80447;80448;80449;80450;80451;80452;80453;80454;80455;80456;80457;80458;80459;80460;80461 102447;102448;102449;102450;102451;102452;102453;102454;102455;102456;102457;102458;102459;102460;102461;102462;102463;102464;102465;102466;102467;102468 102461 22 EAVSNFLTALSLQR Unmodified 1547.8308 0.83075641 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 140.55 140.55 2 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311280000 301210000 247360000 8984 924 8400 80477;80478;80479;80480;80481;80482;80483;80484;80485;80486;80487;80488;80489;80490;80491;80492;80493;80494;80495;80496;80497;80498 102488;102489;102490;102491;102492;102493;102494;102495;102496;102497;102498;102499;102500;102501;102502;102503;102504;102505;102506;102507;102508;102509;102510;102511;102512;102513;102514 102509 24 EAVTFDQANPTQILGK Unmodified 1730.8839 0.88391419 4541 Q9Y263;E5RIM3;H0YC16 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 102.96 102.96 2 0.00042922 106469 QUIQUE_C1368_190116_001 81.552 73.152 160520000 0 0 37106000 25201000 0 0 0 0 0 0 40965000 23520000 33731000 8985 4541 8401 80499;80500;80501;80502;80503 102515;102516;102517;102518;102519 102515 5 EAVTFLR Unmodified 834.45995 0.45995289 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.02 52.02 2 0.019293 50903 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.02 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115.5 110.07 1799400000 178900000 112570000 75245000 100510000 111100000 76095000 114680000 96227000 245400000 65172000 185230000 209710000 228550000 8989 3029 8405 80515;80516;80517;80518;80519;80520;80521;80522;80523;80524;80525;80526;80527;80528;80529;80530;80531;80532 102532;102533;102534;102535;102536;102537;102538;102539;102540;102541;102542;102543;102544;102545;102546;102547;102548;102549;102550;102551;102552;102553;102554;102555;102556 102548 25 EAYALCHCLPVLSTDK Unmodified 1875.8859 0.8859048 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 88.421 88.421 2;3 1.2314E-29 89946 QUIQUE_C1368_190116_001 162.32 145.15 33698000 0 33698000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8990 846 8406 80533;80534;80535 102557;102558;102559 102558 2 EAYEAGLIGK Unmodified 1049.5393 0.53932542 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;H0YE81;E9PLC6;E9PJL9 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.416 50.416 2 0.018569 48348 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390570000 76175000 0 0 51311000 41868000 55534000 0 0 0 0 51171000 53587000 60920000 8993 2198 8409 80556;80557;80558;80559;80560;80561;80562 102582;102583;102584;102585;102586;102587;102588 102582 7 EAYMGNVLQGGEGQAPTR Oxidation (M) 1892.8687 0.86867484 2232 P24752;H0YEL7;E9PRQ6 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 3 52.914 52.914 2 6.7568E-45 48646 QUIQUE_DMIX4_190116_001 168.31 161.05 852160000 66920000 56754000 95811000 50601000 64228000 60754000 52222000 71104000 44089000 40665000 125760000 61702000 61550000 8994 2232 8410 80563;80564;80565;80566;80567;80568;80569;80570;80571;80572;80573;80574;80575;80576;80577;80578 102589;102590;102591;102592;102593;102594;102595;102596;102597;102598;102599;102600;102601;102602;102603;102604;102605 102599 1588 16 EAYMGNVLQGGEGQAPTR Unmodified 1876.8738 0.87376021 2232 P24752;H0YEL7;E9PRQ6 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.351 73.351 2 1.7595E-45 73665 QUIQUE_DMIX3_190116_001 224.43 213.82 5231400000 441880000 473360000 528290000 429670000 310470000 339790000 468170000 369040000 437170000 139850000 468330000 353040000 472330000 8995 2232 8410 80579;80580;80581;80582;80583;80584;80585;80586;80587;80588;80589;80590;80591 102606;102607;102608;102609;102610;102611;102612;102613;102614;102615;102616;102617;102618;102619;102620;102621;102622 102618 17 EAYNLFAVNGILFNHESPR Unmodified 2190.0858 0.0858019 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 134.78 134.78 3 0.0099816 138192 QUIQUE_C1403_190116_001 31.917 16.663 59885000 30659000 0 0 29226000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8996 1583 8411 80592;80593 102623;102624 102624 2 EAYPDHTQFEK Unmodified 1363.6044 0.60444487 4361 Q9P016 THYN1 Thymocyte nuclear protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 27.495 27.495 3 0.0066352 21388 QUIQUE_C1368_190116_001 65.241 46.11 31340000 0 31340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8997 4361 8412 80594;80595;80596 102625;102626;102627 102627 3 EAYPEEAYIADLDAK Unmodified 1696.7832 0.7831971 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 3 1 2 1 2 111.8 111.8 2 0.00047182 115589 QUIQUE_C1368_190116_001 78.324 64.924 526800000 0 0 0 55666000 42920000 0 153800000 0 0 0 142490000 65178000 66751000 8998 2623 8413 80597;80598;80599;80600;80601;80602;80603;80604;80605;80606;80607;80608;80609;80610;80611;80612;80613;80614 102628;102629;102630;102631;102632;102633;102634;102635;102636;102637;102638;102639;102640;102641;102642;102643;102644;102645;102646 102631 17 EAYPGDVFYLHSR Unmodified 1552.731 0.73104237 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.609 81.609 2;3 7.923E-08 83095 QUIQUE_C1277_190116_001 136.02 110.21 43420000000 3789500000 3830800000 3845600000 2762800000 3033100000 3421000000 3879500000 2642200000 3573500000 1266600000 4294400000 3289200000 3792100000 8999 2243 8414 80615;80616;80617;80618;80619;80620;80621;80622;80623;80624;80625;80626;80627;80628;80629;80630;80631;80632;80633;80634;80635;80636;80637;80638;80639;80640 102647;102648;102649;102650;102651;102652;102653;102654;102655;102656;102657;102658;102659;102660;102661;102662;102663;102664;102665;102666;102667;102668;102669;102670;102671;102672;102673;102674;102675;102676;102677;102678;102679;102680;102681;102682;102683;102684;102685;102686;102687;102688;102689 102653 43 ECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELK Unmodified 2879.5103 0.51028048 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.68 163.68 4 2.7981E-29 165776 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.81 121.61 1817200000 147150000 44973000 203950000 63017000 138910000 52085000 146410000 213270000 172100000 0 185510000 449810000 0 9000 4600 8415 80641;80642;80643;80644;80645;80646;80647;80648;80649;80650;80651 102690;102691;102692;102693;102694;102695;102696;102697;102698;102699;102700 102697 10 ECCDKPLLEK Unmodified 1290.5948 0.59480816 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 19.593 19.593 2 0.01346 12088 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.051 51.022 25147000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25147000 0 0 0 + 9001 770 8416 80652 102701 102701 1 ECCEKPLLEK Unmodified 1304.6105 0.61045823 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 19.3 19.3 2;3 1.8024E-23 12481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 195.58 128.89 23012000000 2660200000 2528700000 1626200000 3979400000 3713000000 3536600000 1720300000 182450000 839330000 399460000 234810000 0 1591500000 + 9002 769 8417 80653;80654;80655;80656;80657;80658;80659;80660;80661;80662;80663;80664;80665;80666;80667;80668;80669;80670;80671;80672;80673 102702;102703;102704;102705;102706;102707;102708;102709;102710;102711;102712;102713;102714;102715;102716;102717;102718;102719;102720;102721;102722 102714 12 ECCHGDLLECADDR Unmodified 1748.6553 0.65525294 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 41.987 41.987 3 9.5544E-05 38782 QUIQUE_C1218_190116_001 89.231 89.159 206930000 37493000 41452000 0 41395000 0 0 35758000 0 0 50831000 0 0 0 + 9003 770 8418 80674;80675;80676;80677;80678 102723;102724;102725;102726;102727 102723 5 ECCHGDLLECADDRADLAK Unmodified 2246.9355 0.93545055 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 58.505 58.505 4 0.0043252 56672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.382 41.108 19433000 0 0 0 0 0 0 0 19433000 0 0 0 0 0 + 9004 770 8419 80679 102728 102728 1 ECDHSQTDSLEDEEIEAFYK Unmodified 2443.9962 0.99617935 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 106.6 106.6 2;3 6.2722E-267 109956 QUIQUE_C1368_190116_001 282.55 270.57 1310500000 72802000 72674000 198970000 173600000 85602000 153390000 108170000 49404000 85237000 48297000 71754000 89442000 101140000 9005 2578 8420 80680;80681;80682;80683;80684;80685;80686;80687;80688;80689;80690;80691;80692;80693;80694;80695 102729;102730;102731;102732;102733;102734;102735;102736;102737;102738;102739;102740;102741;102742;102743;102744;102745 102732 17 ECEDVMDWINDK Oxidation (M) 1568.6123 0.61230872 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 89.258 89.258 2 0.00081982 91840 QUIQUE_C1438_190116_001 90.05 85.585 563680000 58101000 75140000 91452000 62533000 140920000 0 0 0 98713000 36817000 0 0 0 9006 267;275;3025 8421 80696;80697;80698;80699;80700;80701;80702;80703;80704 102746;102747;102748;102749;102750;102751;102752;102753;102754 102750 161 8 ECEDVMDWINDK Unmodified 1552.6174 0.6173941 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.36 119.36 2 0.0034363 121850 QUIQUE_C1563_190116_001 108.48 104.18 3102600000 424070000 544720000 563200000 373410000 0 409380000 458170000 0 0 133780000 195880000 0 0 9007 267;275;3025 8421 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alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 0 2 1 2 2 3 1 2 1 2 2 3 4 143.72 143.72 3;4 0 146339 QUIQUE_DMIX1_190116_001 292.44 284.48 7840300000 315250000 399530000 329520000 68333000 359050000 62560000 1608400000 312870000 1843500000 0 490300000 1110300000 940670000 9021 1990;2795;3430;3992 8433 80842;80843;80844;80845;80846;80847;80848;80849;80850;80851;80852;80853;80854;80855;80856;80857;80858;80859;80860;80861;80862;80863;80864;80865;80866 102909;102910;102911;102912;102913;102914;102915;102916;102917;102918;102919;102920;102921;102922;102923;102924;102925;102926;102927;102928;102929;102930;102931;102932;102933;102934;102935;102936;102937;102938;102939;102940;102941;102942 102927 32 ECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDK Oxidation (M) 4311.9446 0.94458203 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;F8W0F6;P68363;F8VVB9;F8VS66;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 1 0 2 3 1 2 2 3 2 140.83 140.83 3;4 6.3784E-64 145383 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.68 108.61 3223000000 0 0 250790000 0 0 0 799380000 145160000 387230000 0 396930000 600380000 643190000 9022 1990;2795;3430;3992 8433 80867;80868;80869;80870;80871;80872;80873;80874;80875;80876;80877;80878;80879;80880;80881 102943;102944;102945;102946;102947;102948;102949;102950;102951;102952;102953;102954;102955;102956;102957;102958 102949 1260 15 ECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDK Unmodified 4299.8904 0.89043797 2796 P68366;C9JJQ8;C9JDL2 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.22 135.22 4 1.0367E-10 140136 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.374 57.3 265630000 0 0 0 0 69863000 60048000 64754000 0 0 0 0 0 70969000 9023 2796 8434 80882;80883;80884;80885 102959;102960;102961;102962 102962 4 ECLPENLGGYVK Unmodified 1377.6599 0.65985126 139 A0A0A0MR09;P43378 PTPN9 Protein-tyrosine-phosphatase;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9 yes no 0 0 0 1 1 82.232 82.232 2 0.033394 83649 QUIQUE_C1277_190116_001 53.327 35.059 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9024 139 8435 80886;80887 102963;102964 102963 2 ECLPLIIFLR Unmodified 1272.7264 0.72641468 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.69 153.69 2 0.0019176 157862 QUIQUE_C1403_190116_001 111.82 104.6 361630000 45332000 37957000 22848000 47669000 28022000 51637000 41823000 0 25707000 9032900 16776000 11771000 23051000 9025 2757 8436 80888;80889;80890;80891;80892;80893;80894;80895;80896;80897;80898;80899 102965;102966;102967;102968;102969;102970;102971;102972;102973;102974;102975;102976;102977;102978;102979;102980 102970 16 ECLQALDFLHSNQVIHR Unmodified 2079.032 0.031992191 120 A0A087X294;O75914 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.329 97.329 3 1.5917E-17 101310 QUIQUE_C1218_190116_001 137.52 122 828860000 65164000 80375000 67059000 52044000 71675000 51600000 92244000 48042000 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ECLQALEFLHSNQVIHR Unmodified 2093.0476 0.047642255 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 0 1 3 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 93.485 93.485 2;3;4 5.6732E-45 95301 QUIQUE_C1403_190116_001 171.67 161.48 3323400000 263510000 485890000 250940000 208900000 210880000 201730000 250360000 235790000 173340000 142160000 384740000 236700000 278480000 9028 2970 8439 80936;80937;80938;80939;80940;80941;80942;80943;80944;80945;80946;80947;80948;80949;80950;80951;80952;80953 103024;103025;103026;103027;103028;103029;103030;103031;103032;103033;103034;103035;103036;103037;103038;103039;103040;103041;103042;103043;103044 103031 21 ECMAGTSGSEEVK Unmodified 1383.5646 0.56463025 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;G3V5P0 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.192 20.192 2 9.7454E-06 12754 QUIQUE_C1563_190116_001 121.61 89.673 402130000 37639000 58555000 45834000 47281000 37667000 46549000 33150000 0 0 0 34629000 22299000 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Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.286 50.286 2 0.0025363 48335 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.374 62.762 15567000000 932980000 990670000 1204100000 1249900000 1024100000 1252100000 1182300000 1422200000 1689700000 632340000 1257300000 1284800000 1444100000 9035 4639 8446 80983;80984;80985;80986;80987;80988;80989;80990;80991;80992;80993;80994;80995 103076;103077;103078;103079;103080;103081;103082;103083;103084;103085;103086;103087;103088;103089;103090;103091;103092;103093;103094;103095;103096;103097;103098;103099 103092 24 ECQEESFWK Unmodified 1241.5023 0.50228798 3262 Q56VL3;D6RD77;J3KPI9 OCIAD2 OCIA domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.723 60.723 2 0.00078076 60890 QUIQUE_C1218_190116_001 109.86 88.992 140970000 33489000 0 0 0 0 0 0 0 25226000 0 21695000 27001000 33555000 9036 3262 8447 80996;80997;80998;80999;81000;81001;81002;81003 103100;103101;103102;103103;103104;103105;103106;103107 103100 8 ECSIYLIGGSIPEEDAGK Unmodified 1936.9088 0.90880832 4256 Q9NQR4;H7C579 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes no 0 0 0 1 1 111.67 111.67 2 0.00028746 109022 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.592 87.744 141370000 0 81306000 0 0 0 0 0 0 0 60059000 0 0 0 9037 4256 8448 81004;81005 103108;103109 103109 1 ECTEGEHAEHPTVPLKDVVEQHK Unmodified 2668.2551 0.25512843 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;C9J084 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 35.787 35.787 5 0.062209 30947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 18.56 11.027 66141000 0 0 0 0 0 0 0 66141000 0 0 0 0 0 9038 4091 8449 81006 103110 103110 1 ECVDGVLGGEDYNHNNINQWTASIVEQSLTHLVK Unmodified 3838.8221 0.82206558 538 A6NGJ0;P51808;F2Z328 DYNLT3 Dynein light chain Tctex-type 3 yes no 0 0 0 1 158.26 158.26 4 0.01008 160769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.062 20.205 169360000 0 0 0 0 0 0 0 169360000 0 0 0 0 0 9039 538 8450 81007 103111 103111 1 ECYCPPDFPSALYCDSR Unmodified 2135.8387 0.83869662 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 1 116.48 116.48 2 3.4277E-11 121390 QUIQUE_C1576_190116_001 121.28 119.84 64740000 0 0 0 0 0 0 64740000 0 0 0 0 0 0 9040 2598 8451 81008 103112;103113 103113 2 EDAAEETVKPGPEEGTLEK Unmodified 2027.9535 0.9535099 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 1 2 1 41.385 41.385 2;3 2.0913E-64 38235 QUIQUE_C1218_190116_001 188.4 163.55 257740000 58714000 57784000 0 67710000 0 73528000 0 0 0 0 0 0 0 9041 921 8452 81009;81010;81011;81012;81013;81014 103114;103115;103116;103117;103118;103119 103115 6 EDAAEETVKPGPEEGTLEKEEK Unmodified 2414.1337 0.13365911 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 2 1 1 39.477 39.477 3;4 1.5418E-06 35345 QUIQUE_C1403_190116_001 80.303 65.062 190550000 59392000 87814000 0 43343000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9042 921 8453 81015;81016;81017;81018;81019 103120;103121;103122;103123;103124 103123 5 EDAANNYAR Unmodified 1022.4417 0.44173664 2795;3430;3992;2796;1990;688;1031;737;539 C9JQ00;C9K0S6;F8VQQ4;F8VRZ4;F8VWV9;F8VX09;P0DPH8;P0DPH7;P68363;F8VVB9;F8VS66;P68366;C9JJQ8;C9JEV8;C9JDL2;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2;C9J2C0;Q9NY65;A6NHL2 TUBA4A;TUBA8;TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C;TUBAL3 Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain;Tubulin alpha chain-like 3 no no 0 0 0 1 14.047 14.047 2 0.055932 5842 QUIQUE_C1277_190116_001 49.097 23.697 10710000 0 10710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9043 737;1031;1990;2795;2796;3430;3992;688;539 8454 81020 103125 103125 1 EDAEHNLVLFR Unmodified 1341.6677 0.66771383 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 73.102 73.102 3 0.0023871 73191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.189 36.233 119560000 0 0 38690000 0 0 0 0 29743000 0 31580000 19548000 0 0 9044 2435 8455 81021;81022;81023;81024;81025 103126;103127;103128;103129;103130;103131;103132 103129 7 EDAGTYHCVATNAHGTDSR Unmodified 2060.8606 0.86062935 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.58 18.58 2;3 1.1666E-87 10884 QUIQUE_C1277_190116_001 204.94 196.79 1766100000 101490000 305980000 189830000 159210000 155080000 124730000 193740000 39845000 48566000 45165000 104710000 153090000 144720000 9045 4500 8456 81026;81027;81028;81029;81030;81031;81032;81033;81034;81035;81036;81037;81038;81039 103133;103134;103135;103136;103137;103138;103139;103140;103141;103142;103143;103144;103145;103146 103134 14 EDAIWNLLR Unmodified 1128.5928 0.59275797 857 E7EQB2;E7ER44;P02788 LTF Lactotransferrin;Lactoferricin-H;Kaliocin-1;Lactoferroxin-A;Lactoferroxin-B;Lactoferroxin-C yes no 0 0 0 1 133.85 133.85 2 0.00053564 140414 QUIQUE_C1438_190116_001 112.17 80.237 17520000 0 0 0 0 17520000 0 0 0 0 0 0 0 0 9046 857 8457 81040 103147 103147 1 EDAMAMVDHCLK Unmodified 1418.5992 0.59924161 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 74.234 74.234 2;3 0.0025708 74408 QUIQUE_C1277_190116_001 74.6 64.369 386270000 156980000 69929000 54560000 0 0 0 77087000 27717000 0 0 0 0 0 9047 307 8458 81041;81042;81043;81044;81045;81046;81047;81048 103148;103149;103150;103151;103152;103153;103154;103155 103150 8 EDAMAMVDHCLKK Unmodified 1546.6942 0.69420463 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 58.019 58.019 3 0.00057435 56910 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.622 63.583 238690000 0 0 0 0 0 0 37182000 0 68197000 0 78256000 55052000 0 9048 307 8459 81049;81050;81051;81052 103156;103157;103158;103159;103160;103161 103161 6 EDAMPEALK Unmodified 1002.4692 0.46919694 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 42.058 42.058 2 0.026091 38384 QUIQUE_C1403_190116_001 76.478 57.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9049 734 8460 81053;81054 103162;103163 103163 2 EDANVFASAMMHALEVLNSQETGPTLPR Unmodified 3027.443 0.44300555 3615 Q8N8S7;A0A0U1RQP7 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 0 1 1 169.73 169.73 3 1.4397E-10 173660 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.921 72.557 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9050 3615 8461 81055;81056 103164;103165 103165 2 EDAPIGPHLQSMPSEQIR Unmodified 2003.9735 0.97347426 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.604 74.604 3 4.9842E-11 74703 QUIQUE_C1277_190116_001 95.094 79.856 194830000 62737000 63331000 0 36285000 0 0 0 32482000 0 0 0 0 0 9051 3046 8462 81057;81058;81059;81060 103166;103167;103168;103169;103170 103168 5 EDAPIGPHLQSMPSEQIR Oxidation (M) 2019.9684 0.96838888 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 1 0 1 58.129 58.129 3 0.0059922 53197 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.382 32.594 38662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38662000 0 0 0 9052 3046 8462 81061 103171 103171 2472 1 EDAQEIADTPSGDK Unmodified 1474.6423 0.64234652 845 E5RK69 ANXA6 Annexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.068 32.068 2 1.8238E-22 26306 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.9 142.91 1068900000 0 128800000 141470000 128940000 96941000 101150000 133800000 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103187;103188;103189;103190;103191;103192;103193;103194;103195;103196;103197;103198;103199;103200;103201;103202;103203;103204;103205;103206;103207;103208;103209;103210;103211;103212;103213;103214;103215;103216;103217;103218 103191 32 EDAQVAAEILEIADTPSGDKTSLETR Unmodified 2758.3509 0.35086253 1936 P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 1 2 132.52 132.52 2;3 1.0452E-112 135525 QUIQUE_DMIX1_190116_001 229.6 218.49 3515100000 56311000 74615000 107780000 55789000 132280000 0 111580000 509660000 556320000 0 851850000 572570000 486330000 9056 1936 8466 81097;81098;81099;81100;81101;81102;81103;81104;81105;81106;81107;81108;81109;81110;81111;81112 103219;103220;103221;103222;103223;103224;103225;103226;103227;103228;103229;103230;103231;103232;103233;103234;103235;103236;103237;103238 103228 18 EDAVLEYLK Unmodified 1078.5546 0.55464113 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 93.552 93.552 1;2 3.8539E-05 94590 QUIQUE_C1563_190116_001 176.6 128.86 5045500000 392950000 364880000 541180000 494520000 407050000 450180000 453700000 181660000 375420000 320250000 371350000 277430000 414970000 9057 2248 8467 81113;81114;81115;81116;81117;81118;81119;81120;81121;81122;81123;81124;81125;81126 103239;103240;103241;103242;103243;103244;103245;103246;103247;103248;103249;103250;103251;103252;103253;103254;103255;103256;103257;103258;103259;103260;103261;103262;103263;103264;103265;103266 103251 27 EDAVLYLLEIPK Unmodified 1401.7755 0.77553294 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.88 149.88 2 0.00053578 152569 QUIQUE_C1563_190116_001 123.75 110.4 1894300000 97604000 139710000 129690000 163680000 182880000 89105000 224140000 109240000 180150000 89171000 143620000 157000000 188270000 9058 345 8468 81127;81128;81129;81130;81131;81132;81133;81134;81135;81136;81137;81138;81139 103267;103268;103269;103270;103271;103272;103273;103274;103275;103276;103277;103278;103279;103280;103281;103282;103283;103284;103285;103286;103287;103288 103276 22 EDAVSFAEK Unmodified 994.46074 0.46074075 1513 O43181 NDUFS4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 38.589 38.589 2 0.045687 33783 QUIQUE_C1277_190116_001 78.113 55.621 404090000 0 284540000 0 0 0 0 0 119540000 0 0 0 0 0 9059 1513 8469 81140;81141 103289;103290 103289 0 EDCIAYICR Unmodified 1198.5111 0.51107853 3590 Q8N4C8 MINK1 Misshapen-like kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.616 59.616 2 0.0016745 58101 QUIQUE_C1368_190116_001 101.28 84.044 148770000 15273000 26577000 33531000 0 27789000 19917000 25679000 0 0 0 0 0 0 9060 3590 8470 81142;81143;81144;81145;81146;81147 103291;103292;103293;103294;103295;103296 103293 6 EDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAK Unmodified 2545.2271 0.22712276 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 145.51 145.51 2;3 9.113E-24 149815 QUIQUE_C1403_190116_001 166.48 159.9 984060000 28727000 87388000 140340000 112640000 73597000 72598000 0 26052000 127530000 63253000 153930000 0 98007000 9061 3124 8471 81148;81149;81150;81151;81152;81153;81154;81155;81156;81157;81158;81159;81160;81161;81162;81163;81164;81165;81166;81167 103297;103298;103299;103300;103301;103302;103303;103304;103305;103306;103307;103308;103309;103310;103311;103312;103313;103314;103315;103316;103317;103318;103319;103320 103304 23 EDCSPADKPYIDEAR Unmodified 1764.7625 0.76247843 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.289 38.289 2 4.7202E-05 33864 QUIQUE_C1368_190116_001 100.02 85.864 121320000 31785000 0 51891000 37640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9062 3835 8472 81168;81169;81170;81171;81172;81173 103321;103322;103323;103324;103325;103326 103322 6 EDDGASIVCSVNHESLK Unmodified 1858.8367 0.83670601 3569 Q8N126 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 64.252 64.252 2;3 4.2707E-89 64084 QUIQUE_DMIX5_190116_001 234.92 217.45 3614200000 319780000 308030000 514700000 400370000 88438000 261440000 441030000 182170000 255120000 87828000 279580000 195460000 280300000 9063 3569 8473 81174;81175;81176;81177;81178;81179;81180;81181;81182;81183;81184;81185;81186;81187;81188;81189;81190;81191;81192;81193;81194;81195;81196;81197 103327;103328;103329;103330;103331;103332;103333;103334;103335;103336;103337;103338;103339;103340;103341;103342;103343;103344;103345;103346;103347;103348;103349;103350;103351;103352;103353 103350 22 EDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQR Unmodified 2661.2817 0.28167753 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8;F5H8J9 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 95.095 95.095 3 2.7733E-06 97918 QUIQUE_C1218_190116_001 41.763 34.317 39187000 39187000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9064 113 8474 81198 103354 103354 1 EDDKPETVIK Unmodified 1172.5925 0.5924832 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 18.864 18.864 2;3 0.031734 11594 QUIQUE_C1438_190116_001 79.489 26.138 468950000 0 0 0 0 468950000 0 0 0 0 0 0 0 0 9065 4450 8475 81199;81200 103355;103356 103356 2 EDDKPETVIKR Unmodified 1328.6936 0.69359423 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 15.068 15.068 3 0.024249 7355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.153 45.924 234030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 234030000 0 9066 4450 8476 81201 103357 103357 1 EDDLNSFNATDLK Unmodified 1480.6682 0.66816734 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.059 85.059 2 7.5087E-08 87490 QUIQUE_C1218_190116_001 162.38 146.16 2530400000 197510000 196140000 240070000 287190000 257730000 167740000 252450000 60183000 140510000 165440000 231430000 163340000 170660000 9067 1977 8477 81202;81203;81204;81205;81206;81207;81208;81209;81210;81211;81212;81213;81214 103358;103359;103360;103361;103362;103363;103364;103365;103366;103367;103368;103369;103370;103371;103372;103373;103374;103375 103359 16 EDDLNSFNATDLKDLSSHQLNEFLAQTLQR Unmodified 3461.6699 0.66990526 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 155.68 155.68 4 7.0146E-25 160575 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.814 75.666 663540000 0 0 0 0 86634000 0 0 0 162160000 0 92927000 146890000 174930000 9068 1977 8478 81215;81216;81217;81218;81219 103376;103377;103378;103379;103380;103381;103382 103378 7 EDDPNFFK Unmodified 1010.4345 0.434526 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.753 59.753 2 0.0036692 59312 QUIQUE_C1218_190116_001 119.89 99.605 720990000 205420000 104540000 154450000 0 0 132550000 0 34744000 0 89282000 0 0 0 9069 1777 8479 81220;81221;81222;81223;81224;81225 103383;103384;103385;103386;103387;103388 103383 6 EDDRETLVSQCR Unmodified 1506.6733 0.67326949 4258 Q9NQW6 ANLN Actin-binding protein anillin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 25.787 25.787 2;3 0.010233 19961 QUIQUE_C1576_190116_001 93.058 77.167 209910000 0 19034000 0 0 0 0 70120000 0 0 0 93610000 0 27145000 9070 4258 8480 81226;81227;81228;81229;81230;81231 103389;103390;103391;103392;103393;103394 103391 6 EDDSIRPFK Unmodified 1105.5404 0.54038805 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.378 30.378 2;3 0.01906 24794 QUIQUE_C1403_190116_001 48.091 27.221 412440000 0 87608000 68726000 100870000 0 0 0 47738000 69781000 0 37710000 0 0 9071 1912 8481 81232;81233;81234;81235;81236;81237 103395;103396;103397;103398;103399;103400 103397 5 EDDSIRPFKVETSDEEIHDLHQR Unmodified 2794.3158 0.31581443 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 2 1 1 2 62.671 62.671 3;4;5 2.6443E-05 62299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.69 72.414 135060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135060000 0 9072 1912 8482 81238;81239;81240;81241 103401;103402;103403;103404 103401 4 EDDSLTIFGVAER Unmodified 1450.694 0.69398816 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 118.71 118.71 2 0.00018159 123933 QUIQUE_C1218_190116_001 143.5 125.19 1575200000 156940000 181960000 132990000 112490000 170930000 110000000 241320000 102270000 125840000 86397000 154030000 0 0 9073 1214;1691 8483 81242;81243;81244;81245;81246;81247;81248;81249;81250;81251;81252;81253;81254;81255;81256;81257;81258 103405;103406;103407;103408;103409;103410;103411;103412;103413;103414;103415;103416;103417;103418;103419;103420;103421;103422;103423;103424;103425;103426;103427;103428;103429 103407 25 EDDVFLTELMK Unmodified 1338.6377 0.63771883 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 136.43 136.43 2 0.0027402 132698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.465 58.952 9652700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9652700 0 0 0 9074 4390 8484 81259 103430 103430 1 EDEDDKTVLDLAVVLFETATLR Unmodified 2491.2694 0.26936473 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 1 1 1 177.08 177.08 3 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99125 QUIQUE_C1438_190116_001 247.14 242.06 1654600000 134130000 181930000 159150000 186940000 199010000 179830000 199270000 56085000 68470000 39318000 80717000 73711000 96090000 9077 2658 8487 81277;81278;81279;81280;81281;81282;81283;81284;81285;81286;81287;81288;81289;81290;81291;81292 103455;103456;103457;103458;103459;103460;103461;103462;103463;103464;103465;103466;103467;103468;103469;103470;103471;103472 103460 18 EDEEESLNEVGYDDIGGCRK Unmodified 2312.9703 0.97029895 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 75.676 75.676 3 1.3288E-07 76320 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.413 94.223 273600000 0 0 0 0 0 0 0 47691000 46864000 0 65899000 53468000 59678000 9078 2658 8488 81293;81294;81295;81296;81297;81298 103473;103474;103475;103476;103477;103478;103479;103480;103481 103474 8 EDEEGAFGEHGSQGTYSNTK Unmodified 2141.8774 0.87738485 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 32.868 32.868 3 4.6938E-38 26812 QUIQUE_C1368_190116_001 123.43 111.58 293060000 96602000 0 45868000 53381000 31182000 52199000 0 0 0 13825000 0 0 0 9079 2009 8489 81299;81300;81301;81302;81303;81304;81305 103482;103483;103484;103485;103486;103487;103488 103484 7 EDEGEPGDEGQLEDEGSQEK Unmodified 2175.8564 0.85637463 3784 Q969E4 TCEAL3 Transcription elongation factor A protein-like 3 yes yes 0 0 0 1 1 46.272 46.272 2 1.9492E-30 43157 QUIQUE_C1277_190116_001 148.52 128.99 37566000 0 37566000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9080 3784 8490 81306;81307 103489;103490 103489 2 EDEIPETVSLEMLDAAK Unmodified 1888.8976 0.89757493 1052 F8W7Q4;Q96A26;E9PH05 FAM162A Protein FAM162A yes no 0 0 0 1 138.65 138.65 2 0.00039347 144154 QUIQUE_C1218_190116_001 82.069 57.214 206570000 206570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9081 1052 8491 81308 103491 103491 1 EDEISPPPPNPVVK Unmodified 1516.7773 0.77732386 2002 P10644;K7EPB2;K7EIE5;K7EID3;K7EJ40;K7EK41;K7EMU2;K7EMZ6 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 61.926 61.926 2 0.04047 61324 QUIQUE_C1403_190116_001 67.704 50.764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9082 2002 8492 81309;81310 103492;103493 103493 2 EDELTFIK Unmodified 993.50188 0.50187728 2143 P19174 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes yes 0 0 0 1 77.106 77.106 2 0.039433 78140 QUIQUE_C1218_190116_001 60.895 22.059 27115000 27115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9083 2143 8493 81311 103494 103494 1 EDENAEPVGTTYQK Unmodified 1579.7002 0.70019575 3186 Q16643;D6R9W4 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 1 1 30.008 30.008 2 9.5124E-07 24871 QUIQUE_C1218_190116_001 122.51 101.14 49696000 35093000 14603000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9084 3186 8494 81312;81313 103495;103496 103495 2 EDENSWFNLFVIHQNR Unmodified 2046.9548 0.95478773 1053 F8W7U8;P49959;F5GXT0 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 0 1 1 143.24 143.24 3 0.00052761 146530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.09 47.52 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1647.7417 0.74166663 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.185 80.185 2 4.0734E-14 81032 QUIQUE_C1277_190116_001 192.21 174.04 351500000 42708000 75477000 77414000 0 59478000 0 59037000 0 0 37390000 0 0 0 9088 2640 8498 81337;81338;81339;81340;81341;81342;81343 103520;103521;103522;103523;103524;103525;103526 103521 7 EDFATFDYILCMDESNLR Unmodified 2237.9609 0.96092024 2231 P24666 ACP1 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 163.34 163.34 2 2.3579E-30 165289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.54 149.67 68159000 14436000 0 0 0 0 0 14966000 13327000 0 0 0 0 25431000 9089 2231 8499 81344;81345;81346;81347 103527;103528;103529;103530 103529 3 EDFDSLLQSAK Unmodified 1251.5983 0.59829686 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 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131.56 3 6.8387E-20 135581 QUIQUE_C1403_190116_001 109.23 103.34 340780000 0 66963000 57292000 64021000 56018000 45907000 50578000 0 0 0 0 0 0 9092 3563 8502 81370;81371;81372;81373;81374;81375 103554;103555;103556;103557;103558;103559 103556 5 EDFSSMSAQLLYK Unmodified 1517.7072 0.70719538 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 118.87 118.87 2 0.0022425 122866 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.78 102.19 287580000 0 32496000 0 45389000 0 36634000 81665000 0 0 0 0 41004000 50388000 9093 4390 8503 81376;81377;81378;81379;81380;81381;81382;81383 103560;103561;103562;103563;103564;103565;103566;103567;103568;103569 103569 9 EDFTLLDFINAVK Unmodified 1523.7872 0.78716026 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 169.35 169.35 2;3 0.00011358 172911 QUIQUE_C1277_190116_001 83.137 63.861 385180000 5716700 9095800 0 8993100 0 0 12291000 0 143450000 44032000 154710000 0 6891500 9094 514 8504 81384;81385;81386;81387;81388;81389;81390;81391;81392;81393 103570;103571;103572;103573;103574;103575;103576;103577;103578;103579 103571 9 EDFTSLSLVLYSR Unmodified 1528.7773 0.77732386 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7;D6RF20 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 142.35 142.35 2 0.0016871 149223 QUIQUE_C1438_190116_001 78.096 67.725 40927000 0 0 0 0 40927000 0 0 0 0 0 0 0 0 9095 822 8505 81394 103580;103581 103580 2 EDGAISTIVLR Unmodified 1172.6401 0.6401021 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.645 80.645 2 0.00049983 81143 QUIQUE_C1403_190116_001 140.88 77.461 733560000 201390000 0 0 149810000 0 168550000 0 122090000 0 91723000 0 0 0 9096 2572 8506 81395;81396;81397;81398;81399;81400 103582;103583;103584;103585;103586;103587;103588 103583 7 EDGFTAEHLAAEAMAADMDPWLVFDAR Unmodified 2978.3215 0.32149343 4156 Q9H3H3 C11orf68 UPF0696 protein C11orf68 yes yes 0 0 0 1 170.01 170.01 3 0.0032825 174021 QUIQUE_DMIX7_190116_001 32.434 29.606 8585900 0 0 0 0 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103602 103602 1 EDGLAQQQTQLNLR Unmodified 1612.8169 0.81689726 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.879 64.879 2 1.7731E-17 63571 QUIQUE_C1403_190116_001 192.12 146.52 954090000 160630000 0 0 292480000 0 0 0 148840000 272740000 79397000 0 0 0 9100 2524 8510 81412;81413;81414;81415;81416 103603;103604;103605;103606;103607 103604 5 EDGNEEDKENQGDETQGQQPPQR Unmodified 2627.0968 0.096773109 1118 H0Y449;P67809 YBX1 Nuclease-sensitive element-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.623 18.623 3 1.4285E-142 11158 QUIQUE_C1403_190116_001 215.98 213.01 537190000 26672000 78004000 63799000 73335000 49909000 52918000 54624000 0 34129000 22874000 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core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.888 10.888 3 9.0312E-05 3178 QUIQUE_C1403_190116_001 92.295 66.178 266230000 15574000 0 24765000 18500000 0 0 0 103740000 0 41610000 0 62040000 0 9104 2834 8514 81432;81433;81434;81435;81436;81437;81438 103624;103625;103626;103627;103628;103629;103630;103631 103627 8 EDGSEVGVGGAQVTGSNTR Unmodified 1818.8344 0.83439782 3017 Q13618;A0A087WTG3;H7C399 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.046 41.046 2 5.6258E-10 37434 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.77 125.61 244780000 0 42710000 0 0 0 0 52780000 0 0 31313000 64500000 53482000 0 9105 3017 8515 81439;81440;81441;81442;81443;81444 103632;103633;103634;103635;103636;103637 103634 6 EDGSGDRGDGPFR Unmodified 1363.5753 0.57527001 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 20.101 20.101 2;3 0.00026276 13215 QUIQUE_C1218_190116_001 92.856 52.939 1430100000 78438000 101700000 157770000 134550000 101330000 80207000 81543000 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.955 28.955 2 0.0028247 23985 QUIQUE_C1218_190116_001 98.73 74.508 523400000 86899000 95902000 0 111200000 0 97531000 0 0 0 0 131870000 0 0 9111 3536 8520 81488;81489;81490;81491;81492 103684;103685;103686;103687;103688;103689 103684 5 EDGVLCCQGECQWLHLDLIK Unmodified 2472.1236 0.12358567 2150 P19623 SRM Spermidine synthase yes yes 0 0 0 1 1 135.75 135.75 3 0.00019213 139962 QUIQUE_C1277_190116_001 62.617 55.256 82080000 0 43460000 0 38620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9112 2150 8521 81493;81494 103690;103691 103690 1 EDGVTPYMIFFK Unmodified 1445.6901 0.69008876 214 Q5W0H4;A0A0B4J2C3;P13693;J3KPG2;H0YCX0 TPT1 Translationally-controlled tumor protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.35 145.35 2 0.0013484 150798 QUIQUE_C1368_190116_001 90.696 73.978 1000100000 0 55705000 51783000 57066000 87239000 0 55741000 142230000 167200000 0 179940000 0 203180000 9113 214 8522 81495;81496;81497;81498;81499;81500;81501;81502;81503 103692;103693;103694;103695;103696;103697;103698;103699;103700;103701;103702;103703;103704;103705 103694 13 EDIANLADEFK Unmodified 1263.5983 0.59829686 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.04 109.04 2 1.8215E-24 113841 QUIQUE_C1218_190116_001 183.67 150.83 2887800000 714940000 361890000 448930000 362980000 0 0 253460000 0 0 294670000 174680000 123130000 153100000 9114 3975 8523 81504;81505;81506;81507;81508;81509;81510;81511;81512;81513;81514 103706;103707;103708;103709;103710;103711;103712;103713;103714;103715;103716;103717;103718;103719;103720;103721;103722;103723;103724 103707 19 EDIDTAMK Unmodified 921.41135 0.41134771 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 27.882 27.882 2 0.031416 22458 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 16.65 257710000 151970000 0 0 0 105750000 0 0 0 0 0 0 0 0 9115 913 8524 81515;81516 103725;103726 103725 2 EDIEFICK Unmodified 1052.4848 0.48484701 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 68.345 68.345 2 0.013433 69152 QUIQUE_C1218_190116_001 87.323 56.819 240220000 79216000 0 0 0 0 66174000 0 0 24072000 33664000 0 0 37090000 9116 2573 8525 81517;81518;81519;81520;81521 103727;103728;103729;103730;103731;103732 103727 6 EDIFYTSK Unmodified 1001.4706 0.47057715 183;2889;2616 P52895;B4DK69;S4R3P0;A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5;Q04828;H0Y804;A6NHU4 AKR1C2;AKR1C3;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C3;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 49.695 49.695 2 0.039276 47843 QUIQUE_C1403_190116_001 89.046 76.839 91163000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91163000 9117 2616;183;2889 8526 81522;81523;81524;81525;81526 103733;103734;103735;103736;103737 103734 5 EDIIQGFR Unmodified 976.49779 0.49779495 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.663 71.663 2 0.004032 71919 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.63 43.64 579990000 76933000 60232000 63447000 57858000 43774000 70495000 57874000 0 27229000 46234000 26496000 23644000 25773000 9118 2051 8527 81527;81528;81529;81530;81531;81532;81533;81534;81535;81536;81537;81538 103738;103739;103740;103741;103742;103743;103744;103745;103746;103747;103748;103749;103750;103751;103752;103753;103754;103755;103756;103757;103758 103753 21 EDILENQFMDSR Oxidation (M) 1511.6562 0.65622244 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 80.645 80.645 2 0.00081982 81660 QUIQUE_C1277_190116_001 90.05 75.36 176290000 32384000 25965000 26648000 28754000 0 28195000 0 0 0 34341000 0 0 0 9119 2277 8528 81539;81540;81541;81542;81543;81544 103759;103760;103761;103762;103763;103764;103765 103761 1645 7 EDILENQFMDSR Unmodified 1495.6613 0.66130782 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.46 101.46 2 1.528E-28 105403 QUIQUE_C1576_190116_001 185.29 169.72 849690000 107460000 114190000 91480000 113750000 66667000 100140000 65234000 0 41994000 0 52252000 46607000 49927000 9120 2277 8528 81545;81546;81547;81548;81549;81550;81551;81552;81553;81554;81555 103766;103767;103768;103769;103770;103771;103772;103773;103774;103775;103776;103777 103773 9 EDILNYLEK Unmodified 1135.5761 0.57610486 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 111.15 111.15 2 0.0025828 113228 QUIQUE_C1563_190116_001 93.267 51.158 34760000 0 0 0 0 0 34760000 0 0 0 0 0 0 0 9121 2014 8529 81556 103778 103778 1 EDIQSVMTEIR Unmodified 1319.6391 0.63911582 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 100.81 100.81 2 0.0048459 103230 QUIQUE_C1403_190116_001 70.399 37.4 18020000 0 0 0 18020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9122 2629 8530 81557 103779 103779 1 EDIQSVMTEIRR Unmodified 1475.7402 0.74022685 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 1 1 84.329 84.329 3 0.00085762 84946 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.531 54.341 26437000 0 0 0 0 0 0 0 26437000 0 0 0 0 0 9123 2629 8531 81558 103780 103780 1 EDISGIASCVFTR Unmodified 1453.6871 0.68712864 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.66 114.66 2 2.599E-17 118440 QUIQUE_DMIX7_190116_001 163.84 136.1 316550000 0 0 0 0 0 0 0 53103000 56867000 0 62928000 70556000 73094000 9124 57 8532 81559;81560;81561;81562;81563 103781;103782;103783;103784;103785;103786 103785 4 EDISSIEIVGGATR Unmodified 1445.7362 0.73618733 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 88.687 88.687 2 8.0107E-14 91154 QUIQUE_C1368_190116_001 140.78 117.71 754860000 0 0 106340000 0 146620000 0 133880000 0 0 0 92965000 136250000 138790000 9125 1748 8533 81564;81565;81566;81567;81568;81569;81570;81571 103787;103788;103789;103790;103791;103792;103793;103794;103795;103796 103788 8 EDITHTYK Unmodified 1005.4767 0.47672516 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 16.08 16.08 2 0.0086993 8365 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.561 51.669 25189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25189000 0 0 0 9126 2190 8534 81572 103797 103797 1 EDITQEFPGK Unmodified 1162.5506 0.55061839 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YE22 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 61.712 61.712 2 0.040284 61810 QUIQUE_C1438_190116_001 51.066 33.826 85804000 0 0 0 0 85804000 0 0 0 0 0 0 0 0 9127 798 8535 81573 103798 103798 1 EDITQSAQHALR Unmodified 1367.6793 0.67934115 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 41.463 41.463 2;3 8.2778E-28 38452 QUIQUE_C1438_190116_001 179.08 139.46 2723500000 126530000 367830000 254490000 102990000 102580000 112360000 327900000 83846000 124730000 116050000 513910000 126850000 363410000 9128 2951 8536 81574;81575;81576;81577;81578;81579;81580;81581;81582;81583;81584;81585;81586;81587;81588;81589;81590;81591 103799;103800;103801;103802;103803;103804;103805;103806;103807;103808;103809;103810;103811;103812;103813;103814;103815;103816;103817;103818;103819;103820 103805 19 EDIVVPVYLR Unmodified 1201.6707 0.67067394 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.13 105.13 2 0.00019132 108439 QUIQUE_C1277_190116_001 123.69 80.443 668150000 60992000 81926000 55526000 50292000 126610000 58316000 51032000 49274000 36796000 0 0 54539000 42846000 9129 1096 8537 81592;81593;81594;81595;81596;81597;81598;81599;81600;81601;81602 103821;103822;103823;103824;103825;103826;103827;103828;103829;103830;103831 103822 11 EDIYAVEIVGGATR Unmodified 1491.7569 0.75692277 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 3 2 1 1 1 3 103.17 103.17 2;3 7.768E-05 100153 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.271 61.595 280300000 17411000 0 0 15389000 0 19333000 20472000 16786000 0 19221000 59594000 112090000 0 9130 2363 8538 81603;81604;81605;81606;81607;81608;81609;81610;81611;81612;81613;81614;81615;81616;81617;81618;81619;81620;81621;81622;81623 103832;103833;103834;103835;103836;103837;103838;103839;103840;103841;103842;103843;103844;103845;103846;103847;103848;103849;103850;103851;103852;103853;103854;103855 103848 22 EDIYSGGGGGGSR Unmodified 1210.5214 0.52144352 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.052 21.052 2 7.3049E-09 13570 QUIQUE_C1277_190116_001 139.86 125.7 2058200000 286510000 243710000 249830000 205050000 0 171960000 157680000 185600000 155990000 95015000 153150000 0 153680000 9131 2969 8539 81624;81625;81626;81627;81628;81629;81630;81631;81632;81633;81634 103856;103857;103858;103859;103860;103861;103862;103863;103864;103865;103866;103867 103858 10 EDKDAQFYCELNYR Unmodified 1849.7941 0.79411291 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 1 1 1 76.405 76.405 3 0.015922 77462 QUIQUE_DMIX8_190116_001 36.445 30.904 70156000 0 0 37836000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32320000 9132 2461 8540 81635;81636 103868;103869 103869 2 EDKESNPATINAATELDTPK Unmodified 2143.0281 0.028071829 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 60.213 60.213 2;3 5.7766E-116 59698 QUIQUE_DMIX5_190116_001 256.26 228.4 1742400000 40680000 56859000 80302000 0 83363000 134110000 65837000 128580000 380520000 177790000 183880000 188990000 221460000 9133 2233 8541 81637;81638;81639;81640;81641;81642;81643;81644;81645;81646;81647;81648;81649;81650;81651;81652;81653;81654;81655 103870;103871;103872;103873;103874;103875;103876;103877;103878;103879;103880;103881;103882;103883;103884;103885;103886;103887;103888;103889 103885 19 EDKHECPFGR Unmodified 1273.551 0.55096951 3280;3732 Q92556;H7C0S6;Q5JVZ5;Q96JJ3;H0YCM7;Q5JVZ8 ELMO1;ELMO2 Engulfment and cell motility protein 1;Engulfment and cell motility protein 2 no no 0 0 1 1 13.846 13.846 3 0.028431 5852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.292 37.337 26114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26114000 0 0 0 9134 3732;3280 8542 81656 103890 103890 1 EDKLECSEELGDLVK Unmodified 1762.8295 0.82949536 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 81.263 81.263 2;3 1.9541E-129 82191 QUIQUE_C1277_190116_001 241.51 199.97 5110600000 800010000 945310000 215870000 795780000 656170000 177790000 736950000 42872000 65195000 180980000 242560000 113560000 137520000 9135 50;2631 8543 81657;81658;81659;81660;81661;81662;81663;81664;81665;81666;81667;81668;81669;81670;81671;81672;81673;81674;81675;81676 103891;103892;103893;103894;103895;103896;103897;103898;103899;103900;103901;103902;103903;103904;103905;103906;103907;103908;103909;103910 103893 16 EDKSPSEESAPTTSPESVSGSVPSSGSSGR Unmodified 2921.301 0.3010118 2646 P54725 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.181 47.181 3 1.5119E-35 44508 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.53 94.941 424290000 0 46493000 0 55775000 64257000 52465000 0 0 53439000 0 62061000 43667000 46136000 9136 2646 8544 81677;81678;81679;81680;81681;81682;81683;81684 103911;103912;103913;103914;103915;103916;103917;103918;103919 103915 9 EDKYEEEIK Unmodified 1181.5452 0.54519866 3271;435;2791;1260;1908;557;3325 J3KN67;A0A2R8Y6A3;P06753;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;K7EMU5;U3KQK2;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9;Q5HYB6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM3;TPM4;TPM2;DKFZp686J1372;TPM2b Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 21.102 21.102 2;3 4.1554E-06 14800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.99 120.44 2622000000 383710000 519680000 757090000 393170000 0 0 359630000 55136000 153610000 0 0 0 0 + 9137 1260;1908;435;2791;3271;557;3325 8545 81685;81686;81687;81688;81689;81690;81691;81692 103920;103921;103922;103923;103924;103925;103926;103927;103928 103927 8 EDLAAFVEELDKVESQER Unmodified 2106.0117 0.011693483 2879 Q02880 TOP2B DNA topoisomerase 2-beta yes yes 0 0 1 1 1 2 1 148.38 148.38 3 5.5709E-06 154054 QUIQUE_C1218_190116_001 103.5 88.731 89613000 18535000 33692000 0 0 0 37386000 0 0 0 0 0 0 0 9138 2879 8546 81693;81694;81695;81696;81697 103929;103930;103931;103932;103933 103929 3 EDLAALEK Unmodified 887.46001 0.46001246 1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;C9J2C0;Q9NY65 TUBA3E;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 42.346 42.346 2 0.025424 36932 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.501 28.587 1702500000 702620000 0 0 637400000 0 0 0 172910000 0 189600000 0 0 0 9139 1990;688 8547 81698;81699;81700;81701 103934;103935;103936;103937 103937 3 EDLDKVEPAVIEAQNAVK Unmodified 1967.0211 0.021135958 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 3 91.289 91.289 2;3 9.1599E-21 93264 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104127;104128;104129;104130;104131;104132;104133;104134;104135;104136;104137;104138;104139;104140;104141;104142;104143;104144;104145;104146;104147;104148;104149;104150;104151;104152;104153;104154;104155;104156;104157;104158;104159;104160;104161;104162 104153 35 EDLRPSAPQQEGEASK Unmodified 1740.8279 0.82785588 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.717 22.717 2 1.153E-13 16610 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.96 122.11 737960000 86418000 103640000 78829000 117190000 75479000 58797000 0 30727000 36686000 0 98967000 0 51220000 9164 1681 8570 81894;81895;81896;81897;81898;81899;81900;81901;81902;81903 104163;104164;104165;104166;104167;104168;104169;104170;104171;104172 104169 10 EDLSPSITQR Unmodified 1144.5724 0.57241646 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 41.65 41.65 2 0.0031639 39424 QUIQUE_C1438_190116_001 85.862 50.506 135390000 0 0 0 0 99783000 0 0 0 0 0 0 0 35604000 9165 2075 8571 81904;81905 104173;104174 104173 1 EDLSWPGLAVGNLFHR Unmodified 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104181;104182;104183;104184;104185;104186;104187;104188;104189;104190;104191;104192;104193 104181 13 EDLVQDQDLEAIR Unmodified 1542.7526 0.75256567 3479 Q7Z7L7;X6RC68;X6RD87 ZER1 Protein zer-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 90.263 90.263 2 0.010751 92609 QUIQUE_C1368_190116_001 69.01 50.265 59487000 0 0 37482000 0 0 0 0 0 0 22004000 0 0 0 9171 3479 8577 81924;81925 104194;104195 104194 2 EDLVVAPAGITLK Unmodified 1324.7602 0.76021723 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 103.93 103.93 2 0.015697 100762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.595 58.014 11759000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11759000 0 0 0 9172 2040 8578 81926 104196 104196 0 EDLVYQAK Unmodified 964.48656 0.48656157 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1;I3L0W5 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 31.521 31.521 2 0.0036026 26688 QUIQUE_C1218_190116_001 113.85 76.237 1865700000 773300000 0 595450000 496970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9173 2745 8579 81927;81928;81929 104197;104198;104199 104197 3 EDLYEAADK Unmodified 1052.4662 0.46622005 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 1 1 1 35.602 35.602 2 0.016065 31907 QUIQUE_C1218_190116_001 66.27 38.096 232610000 83459000 0 60342000 0 45842000 0 42964000 0 0 0 0 0 0 9174 4184 8580 81930;81931;81932;81933 104200;104201;104202;104203;104204 104200 5 EDLYEAADKWVAAVGK Unmodified 1763.873 0.87301516 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 1 1 1 133.49 133.49 3 0.00065288 139964 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.878 58.439 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9175 4184 8581 81934;81935 104205;104206 104206 2 EDLYLKPIQR Unmodified 1273.703 0.7030367 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 51.683 51.683 2;3 0.0012143 49609 QUIQUE_C1368_190116_001 151.56 134.18 2334400000 163000000 0 227650000 237260000 109250000 261050000 265070000 201330000 236680000 0 159360000 247150000 226600000 9176 2058 8582 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104228;104229;104230;104231;104232;104233;104234;104235;104236;104237;104238;104239;104240;104241;104242;104243;104244;104245;104246;104247;104248;104249;104250;104251;104252;104253;104254;104255;104256;104257;104258;104259 104236 31 EDNGIGILTLNNPSR Unmodified 1611.8216 0.82164829 4294 Q9NTX5;H0Y5L2;J3KP84;E9PPG7;E9PRU6;F2Z2D6;E9PJS8;E9PLY6;E9PIU8 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.42 100.42 2 8.5907E-07 103234 QUIQUE_C1277_190116_001 140 113.49 84612000 0 0 0 0 84612000 0 0 0 0 0 0 0 0 9178 4294 8584 81968;81969;81970;81971;81972;81973;81974;81975;81976 104260;104261;104262;104263;104264;104265;104266;104267;104268 104261 8 EDPANILQELPAPLLDDK Unmodified 1990.0259 0.025886985 372 A0A1W2PNY5;A0A1W2PQZ6;A0A1W2PRF0;A0A1W2PRJ0;A0A1W2PPP6;A0A1X7SBS0;A0A1W2PS93;A0A1W2PR08;A0A1W2PRF5;G5E9D4;Q96EB1;E9PPJ9;A0A1W2PQA7 ELP4 Elongator complex protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.5 157.5 2 5.7741E-05 163499 QUIQUE_C1576_190116_001 93.348 77.809 73621000 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EDSLQDAWDYVQAQVK Unmodified 1893.8745 0.87447172 2267 P27701;E9PJC7 CD82 CD82 antigen;Tetraspanin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 153.8 153.8 3 0.0003471 157782 QUIQUE_C1403_190116_001 68.413 64.241 178890000 0 0 37232000 23184000 24931000 24160000 34421000 0 18507000 16450000 0 0 0 9205 2267 8611 82142;82143;82144;82145;82146;82147;82148 104485;104486;104487;104488;104489;104490;104491 104486 7 EDSMMEYLK Unmodified 1144.478 0.47804707 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PKN5 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.191 87.191 2 0.0026282 84554 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.162 89.05 530690000 0 0 78855000 70244000 42258000 68211000 78271000 35092000 53038000 28501000 30044000 46179000 0 9206 434 8612 82149;82150;82151;82152;82153;82154;82155;82156;82157;82158 104492;104493;104494;104495;104496;104497;104498;104499;104500;104501;104502 104499 9 EDSPQSHVLVMK Unmodified 1368.6708 0.6707503 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 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Oxidation (M) 1644.8644 0.86442431 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 150.6 150.6 2 0.00012582 157694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.001 69.634 221000000 22824000 20567000 30449000 19263000 21408000 0 15555000 0 25079000 19847000 0 0 46011000 9228 2976 8634 82325;82326;82327;82328;82329;82330;82331;82332;82333;82334;82335 104698;104699;104700;104701;104702;104703;104704;104705;104706;104707;104708;104709 104707 2434 12 EDVLTLLLPVMGDSK Unmodified 1628.8695 0.86950968 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 167.03 167.03 2;3 3.434E-13 171798 QUIQUE_C1218_190116_001 138.24 103.54 1425800000 203070000 166560000 258140000 138360000 98841000 86562000 113270000 32530000 57727000 40366000 69192000 61202000 100030000 9229 2976 8634 82336;82337;82338;82339;82340;82341;82342;82343;82344;82345;82346;82347;82348;82349;82350;82351;82352;82353 104710;104711;104712;104713;104714;104715;104716;104717;104718;104719;104720;104721;104722;104723;104724;104725;104726;104727;104728 104710 19 EDVPTFGPPLPSPPVFQK Unmodified 1951.0091 0.0091147084 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 136.08 136.08 2 2.2158E-11 141522 QUIQUE_C1218_190116_001 120.84 99.063 368030000 41302000 38769000 28651000 39105000 0 35356000 32013000 56514000 0 17411000 41090000 0 37819000 9230 354 8635 82354;82355;82356;82357;82358;82359;82360;82361;82362;82363;82364;82365 104729;104730;104731;104732;104733;104734;104735;104736;104737;104738;104739;104740;104741 104729 12 EDVSLHGYK Unmodified 1046.5033 0.50327426 2943 Q12792;F8VS81;F8W1Q9 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 0 1 23.837 23.837 2 0.038939 17218 QUIQUE_C1403_190116_001 68.383 32.889 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9231 2943 8636 82366 104742 104742 1 EDVSLHGYKK Unmodified 1174.5982 0.59823728 2943 Q12792;F8VS81;F8W1Q9 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 15.25 15.25 2;3 0.029915 7539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.652 17.593 158060000 0 0 0 0 0 0 0 23813000 88654000 0 0 0 45594000 9232 2943 8637 82367;82368;82369 104743;104744;104745;104746 104745 4 EDVYVVGTVLR Unmodified 1248.6714 0.67140222 1847 P04003 C4BPA C4b-binding protein alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.232 93.232 2 0.0080154 90145 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.162 50.734 132620000 21882000 22705000 0 0 58698000 0 0 0 0 29332000 0 0 0 9233 1847 8638 82370;82371;82372;82373;82374 104747;104748;104749;104750;104751 104751 5 EDWIAYISR Unmodified 1151.5611 0.56112349 263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62 MAP4K4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 120.43 120.43 2 0.010193 124197 QUIQUE_C1403_190116_001 74.464 52.614 27673000 0 0 0 11895000 0 0 0 0 0 0 15778000 0 0 9234 263 8639 82375;82376;82377;82378;82379;82380;82381 104752;104753;104754;104755;104756;104757;104758 104754 7 EDYAGLKEEFR Unmodified 1355.6357 0.635745 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 3 58.705 58.705 2;3 0.015732 57773 QUIQUE_C1368_190116_001 93.096 64.369 79877000 0 0 79877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9235 2812 8640 82382;82383;82384 104759;104760;104761 104761 3 EDYICYAR Unmodified 1088.4597 0.45969489 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.331 54.331 2 0.013463 49876 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.284 61.547 117390000 0 0 0 0 74068000 0 0 0 0 43323000 0 0 0 9236 756 8641 82385;82386;82387;82388 104762;104763;104764;104765 104765 3 EDYIEFASLDGSNR Unmodified 1614.7162 0.71618016 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 111.37 111.37 2 0.0009464 113646 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protein FAM213A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 45.164 45.164 2 0.006881 42077 QUIQUE_C1403_190116_001 73.985 32.956 1049200000 106530000 131890000 184420000 135440000 0 132590000 164600000 0 0 0 193690000 0 0 9240 4006 8645 82400;82401;82402;82403;82404;82405;82406;82407;82408 104778;104779;104780;104781;104782;104783;104784;104785;104786;104787;104788 104783 11 EEAAGPALALSLIER Unmodified 1538.8304 0.83042206 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 4 3 3 2 1 2 136.84 136.84 2;3 1.5747E-12 141408 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.47 126.16 2499600000 156050000 145910000 252680000 88218000 166650000 184750000 193990000 224280000 302730000 147390000 224510000 175750000 236700000 9241 2578 8646 82409;82410;82411;82412;82413;82414;82415;82416;82417;82418;82419;82420;82421;82422;82423;82424;82425;82426;82427;82428;82429;82430;82431;82432;82433 104789;104790;104791;104792;104793;104794;104795;104796;104797;104798;104799;104800;104801;104802;104803;104804;104805;104806;104807;104808;104809;104810;104811;104812;104813;104814;104815;104816;104817;104818;104819;104820;104821;104822;104823;104824;104825;104826;104827 104812 37 EEAENTLQSFR Unmodified 1322.6103 0.61025853 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 57.105 57.105 1;2 1.1165E-83 56135 QUIQUE_C1277_190116_001 234.05 195.89 128650000000 9069500000 9088300000 14471000000 15487000000 12361000000 11906000000 11209000000 5763800000 10580000000 5788600000 11899000000 0 11023000000 9242 1952 8647 82434;82435;82436;82437;82438;82439;82440;82441;82442;82443;82444;82445;82446;82447;82448;82449;82450;82451;82452;82453;82454 104828;104829;104830;104831;104832;104833;104834;104835;104836;104837;104838;104839;104840;104841;104842;104843;104844;104845;104846;104847;104848;104849;104850;104851;104852;104853;104854;104855;104856;104857;104858;104859;104860;104861;104862;104863;104864;104865;104866 104831 32 EEAENTLQSFRQDVDNASLAR Unmodified 2392.1255 0.12549446 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 106.5 106.5 3 8.378E-10 108296 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.166 72.378 459550000 0 0 0 0 0 0 0 459550000 0 0 0 0 0 9243 1952 8648 82455 104867;104868 104868 2 EEAERELER Unmodified 1159.5469 0.54692999 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 1 15.391 15.391 2 0.0032543 7642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.48 66.371 77020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37813000 39207000 0 9244 3117 8649 82456;82457 104869;104870 104869 2 EEAFDAICQLVAGK Unmodified 1549.7446 0.74464352 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.86 139.86 2 0.0018271 145100 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104939 13 EEAQMEVEQYR Oxidation (M) 1426.6035 0.60345859 1740 O95670;H0Y474;F2Z307 ATP6V1G2;ATP6V1G2-DDX39B V-type proton ATPase subunit G 2 yes no 0 1 0 1 1 1 37.531 37.531 2 0.01331 32959 QUIQUE_C1563_190116_001 61.56 41.783 93235000 36785000 0 28476000 0 0 27974000 0 0 0 0 0 0 0 9255 1740 8659 82521;82522;82523 104944;104945;104946 104946 947 2 EEAQYDLR Unmodified 1022.4669 0.46688876 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 29.73 29.73 2 0.013835 24072 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 58.62 132180000 0 0 0 0 46351000 85826000 0 0 0 0 0 0 0 9256 1570 8660 82524;82525 104947;104948 104948 2 EEASDYLELDTIK Unmodified 1524.7195 0.71953421 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.32 104.32 2;3 1.5806E-07 107127 QUIQUE_C1403_190116_001 131.82 101.56 4165200000 421060000 459540000 402780000 464130000 421320000 421020000 438940000 172880000 244440000 194890000 0 254870000 269360000 9257 2079 8661 82526;82527;82528;82529;82530;82531;82532;82533;82534;82535;82536;82537;82538 104949;104950;104951;104952;104953;104954;104955;104956;104957;104958;104959;104960;104961;104962;104963;104964;104965 104953 16 EEASGSSVTAEEAK Unmodified 1393.6209 0.6208828 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.476 17.476 2 8.9461E-07 9715 QUIQUE_C1576_190116_001 123.01 113.67 1974500000 0 265000000 323310000 211840000 0 269260000 234990000 0 0 130280000 208370000 120610000 210810000 9258 2051 8662 82539;82540;82541;82542;82543;82544;82545;82546;82547 104966;104967;104968;104969;104970;104971;104972;104973;104974 104970 9 EEASGSSVTAEEAKK Unmodified 1521.7158 0.71584581 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 2 3 2 2 1 2 1 2 2 2 11.734 11.734 2;3 7.328E-36 4472 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.31 126.9 1107000000 881190 0 76200000 23765000 186080000 0 105630000 72107000 147390000 2621300 281900000 57120000 153300000 9259 2051 8663 82548;82549;82550;82551;82552;82553;82554;82555;82556;82557;82558;82559;82560;82561;82562;82563;82564;82565;82566;82567 104975;104976;104977;104978;104979;104980;104981;104982;104983;104984;104985;104986;104987;104988;104989;104990;104991;104992;104993;104994;104995;104996;104997;104998;104999;105000;105001 104996 26 EEATGGLLGGPQLLPAEGALFLTTYR Unmodified 2673.4014 0.40138196 3507 Q86WG5 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes yes 0 0 0 1 166.8 166.8 3 0.00018936 160859 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.404 26.121 8315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8315000 0 0 0 9260 3507 8664 82568 105002 105002 1 EEATTFSNAMLFALNIMNSQEGGPSSQR Unmodified 3029.3859 0.3858846 4441 Q9UI08;G3V2K5;G3V5F7 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 0 1 170.25 170.25 3 7.2904E-05 172019 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.003 39.842 15706000 0 0 0 0 0 0 0 15706000 0 0 0 0 0 9261 4441 8665 82569 105003 105003 1 EEAVLFLLDLPK Unmodified 1385.7806 0.78061832 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.24 156.24 2 7.1572E-05 162431 QUIQUE_C1576_190116_001 143.89 128.88 860080000 62975000 58975000 71624000 64582000 68020000 55245000 94728000 54995000 85274000 24287000 88309000 68364000 62699000 9262 1074 8666 82570;82571;82572;82573;82574;82575;82576;82577;82578;82579;82580;82581;82582 105004;105005;105006;105007;105008;105009;105010;105011;105012;105013;105014;105015;105016;105017 105011 14 EEAVPEASPVTQAGASVITVETVIQENVGAQK Unmodified 3250.6569 0.65688096 933;1529 E9PHY5;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.88 160.88 3 1.2786E-25 166229 QUIQUE_C1218_190116_001 85.745 78.648 789910000 51290000 53243000 67616000 114890000 71938000 83981000 60403000 53750000 49759000 45905000 31431000 46807000 58900000 9263 933;1529 8667 82583;82584;82585;82586;82587;82588;82589;82590;82591;82592;82593;82594;82595 105018;105019;105020;105021;105022;105023;105024;105025;105026;105027;105028;105029;105030;105031;105032;105033 105018 15 EECDKYALQSQQR Unmodified 1653.7417 0.74168341 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.842 21.842 2 7.701E-227 15543 QUIQUE_DMIX1_190116_001 292.33 278.53 1645700000 125590000 118750000 155770000 111600000 157100000 98068000 166940000 158620000 0 25025000 150220000 125780000 252190000 9264 2453 8668 82596;82597;82598;82599;82600;82601;82602;82603;82604;82605;82606;82607 105034;105035;105036;105037;105038;105039;105040;105041;105042;105043;105044;105045;105046 105041 13 EECPVFTPPGGETLDQVK Unmodified 2001.9354 0.93535742 4251 Q9NQ88;A0A0U1RQD1 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes no 0 0 0 1 98.388 98.388 2 0.0029349 101531 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.414 48.503 24681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24681000 9265 4251 8669 82608 105047 105047 1 EEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYER Unmodified 3142.3668 0.36684823 2646 P54725 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes yes 0 0 0 1 1 173.16 173.16 3 2.1382E-15 174689 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.711 74.745 19331000 0 0 0 0 0 0 0 7358500 0 0 0 0 11973000 9266 2646 8670 82609;82610 105048;105049 105048 2 EEDACHLIIPLR Unmodified 1464.7395 0.73949856 3347 Q66K14 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes yes 0 0 0 1 1 1 80.976 80.976 3 0.017718 83658 QUIQUE_C1438_190116_001 47.288 41.915 101820000 0 26423000 0 0 38220000 0 0 0 0 0 0 0 37174000 9267 3347 8671 82611;82612;82613 105050;105051;105052 105051 2 EEDATLSSPAVVMPTMGR Unmodified 1889.8863 0.88629874 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 104.88 104.88 2;3 1.6453E-17 108992 QUIQUE_C1218_190116_001 175.21 164.22 1379900000 356690000 313310000 0 297910000 0 291660000 0 0 0 0 0 120300000 0 9268 2870 8672 82614;82615;82616;82617;82618;82619 105053;105054;105055;105056;105057;105058 105053 5 EEDATLSSPAVVMPTMGR Oxidation (M) 1905.8812 0.88121336 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 83.823 83.823 2 3.0898E-13 86283 QUIQUE_C1277_190116_001 124.48 110.82 473960000 0 52289000 130540000 119460000 0 74002000 49045000 0 0 48630000 0 0 0 9269 2870 8672 82620;82621;82622;82623;82624;82625;82626;82627 105059;105060;105061;105062;105063;105064;105065;105066 105059 2347;2348 7 EEDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELK Unmodified 2864.3087 0.30872294 1936 P08133 ANXA6 Annexin A6 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 161.19 161.19 2;3 8.3593E-196 165679 QUIQUE_DMIX3_190116_001 298.71 288.37 8954900000 893130000 701300000 984720000 734440000 792760000 821010000 803390000 301590000 718620000 381920000 817440000 625510000 379120000 9270 1936 8673 82628;82629;82630;82631;82632;82633;82634;82635;82636;82637;82638;82639;82640;82641;82642;82643;82644;82645;82646;82647;82648;82649;82650;82651;82652;82653;82654;82655 105067;105068;105069;105070;105071;105072;105073;105074;105075;105076;105077;105078;105079;105080;105081;105082;105083;105084;105085;105086;105087;105088;105089;105090;105091;105092;105093;105094;105095;105096;105097;105098;105099;105100;105101;105102 105089 35 EEDEEPESPPEK Unmodified 1413.5783 0.57834928 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.426 20.426 2 0.00048854 13097 QUIQUE_C1563_190116_001 127.76 120.12 72135000 0 0 0 0 0 35852000 21231000 0 0 15051000 0 0 0 9271 4130 8674 82656;82657;82658 105103;105104;105105;105106 105104 4 EEDEEPESPPEKK Unmodified 1541.6733 0.6733123 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 12.902 12.902 2;3 0.00020547 3351 QUIQUE_C1277_190116_001 71.268 64.066 204700000 22278000 56420000 0 0 43873000 36307000 13574000 0 15243000 7954100 0 9052200 0 9272 4130 8675 82659;82660;82661;82662;82663;82664;82665;82666;82667;82668;82669;82670 105107;105108;105109;105110;105111;105112;105113;105114;105115;105116;105117;105118;105119;105120;105121;105122;105123;105124 105108 18 EEDFDQLLEALR Unmodified 1476.7096 0.70963822 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 1 1 153.16 153.16 2 0.0042664 159117 QUIQUE_C1218_190116_001 83 58.077 17051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17051000 9273 4488 8676 82671;82672;82673 105125;105126;105127 105125 3 EEDIAVLAEEK Unmodified 1244.6136 0.61361257 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 1 24.308 24.308 3 0.020933 17243 QUIQUE_C1277_190116_001 33.088 6.4154 150640000 0 84547000 0 0 0 0 0 0 0 66094000 0 0 0 9274 3659 8677 82674;82675 105128;105129 105128 2 EEDKEPLIELFVK Unmodified 1587.8396 0.83958976 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 1 1 123.27 123.27 3 0.005351 119914 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.212 48.334 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9275 4646 8678 82676 105130 105130 1 EEDNKYCADCEAK Unmodified 1630.6239 0.62393604 3553 Q8IYB5 SMAP1 Stromal membrane-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 14.377 14.377 3 0.035028 5938 QUIQUE_C1277_190116_001 36.77 32.222 31571000 12614000 18957000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9276 3553 8679 82677;82678 105131;105132 105132 2 EEDPATGTGDPPR Unmodified 1340.5844 0.58443771 2472 P45974;F5H571 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.038 21.038 2 0.00032845 14392 QUIQUE_C1218_190116_001 136.96 121.3 4506700000 531460000 503230000 531800000 580590000 592710000 544640000 391590000 111070000 142330000 64772000 183170000 145000000 184370000 9277 2472 8680 82679;82680;82681;82682;82683;82684;82685;82686;82687;82688;82689;82690;82691 105133;105134;105135;105136;105137;105138;105139;105140;105141;105142;105143;105144;105145;105146;105147;105148;105149;105150;105151;105152 105133 20 EEDPAVLISEVLR Unmodified 1468.7773 0.77732386 4112 Q9H019;E9PLD2 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 1 1 152.93 152.93 2 0.0046404 155406 QUIQUE_C1563_190116_001 68.069 60.182 12839000 0 0 0 0 0 12839000 0 0 0 0 0 0 0 9278 4112 8681 82692;82693 105153;105154 105154 2 EEDPSLLWQVFGSATGLAR Unmodified 2075.0324 0.032369346 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 169.3 169.3 2 7.8564E-05 163103 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.075 54.88 8855700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8855700 0 0 0 9279 2640 8682 82694 105155 105155 1 EEEAIQLDGLNASQIR Unmodified 1784.8905 0.89045614 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.915 99.915 2 5.9554E-46 102517 QUIQUE_C1277_190116_001 186.58 165.33 568740000 133230000 89052000 0 0 92382000 110760000 0 0 0 73557000 69763000 0 0 9280 2079 8683 82695;82696;82697;82698;82699;82700 105156;105157;105158;105159;105160;105161;105162 105158 7 EEEATEWQHK Unmodified 1285.5575 0.55749468 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 2 18.842 18.842 2;3 5.9821E-23 11242 QUIQUE_C1277_190116_001 201.39 170.8 862020000 36124000 67782000 62723000 59952000 46314000 50475000 128990000 41403000 67058000 77110000 34374000 46884000 142830000 9281 434 8684 82701;82702;82703;82704;82705;82706;82707;82708;82709;82710;82711;82712;82713;82714;82715;82716 105163;105164;105165;105166;105167;105168;105169;105170;105171;105172;105173;105174;105175;105176;105177;105178 105164 16 EEEDGQWKEEQK Unmodified 1533.6583 0.65833093 2669 P55735;A8MXL6 SEC13 Protein SEC13 homolog yes no 0 0 1 1 1 18.036 18.036 3 0.0046514 10219 QUIQUE_C1277_190116_001 58.17 49.525 45087000 25618000 19470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9282 2669 8685 82717;82718 105179;105180 105180 1 EEEEEEEDDDEEEKAPVTLLDAQSLAQSFFNR Unmodified 3740.6337 0.63369849 2535 P49593;A8MX49 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 163.84 163.84 3 9.4135E-26 165756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.113 89.301 161290000 0 0 0 16851000 36097000 16095000 38813000 27042000 0 0 0 0 26394000 9283 2535 8686 82719;82720;82721;82722;82723;82724 105181;105182;105183;105184;105185;105186 105185 6 EEEEGGEGEEGEETK Unmodified 1636.6224 0.62239894 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 14.029 14.029 2 1.2396E-53 5864 QUIQUE_C1563_190116_001 216.03 205.72 95111000 0 16415000 0 0 0 26866000 15890000 0 0 0 8123800 0 27816000 9284 1916 8687 82725;82726;82727;82728;82729 105187;105188;105189;105190;105191 105188 5 EEEEVGFDWSDR Unmodified 1496.6056 0.60556708 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 94.397 94.397 2 0.00029958 90837 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.78 110.99 23213000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23213000 0 0 0 9285 3117 8688 82730 105192 105192 1 EEEGEKEEEEGQEEEEEEDEGAK Unmodified 2695.0264 0.026412667 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 36.346 36.346 3 2.6089E-31 31861 QUIQUE_C1438_190116_001 139.2 123.3 124760000 0 59318000 0 0 65440000 0 0 0 0 0 0 0 0 9286 869 8689 82731;82732 105193;105194 105194 2 EEEGMLSPILAHGGVR Unmodified 1693.8458 0.84575455 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7ENA7;K7EPJ8;K7ER75;K7EQ90 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 85.342 85.342 3 0.0019838 86906 QUIQUE_C1277_190116_001 40.237 33.18 189680000 47137000 42370000 39494000 35350000 25330000 0 0 0 0 0 0 0 0 9287 4065 8690 82733;82734;82735;82736;82737 105195;105196;105197;105198;105199 105196 5 EEEIAALVIDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1892.8496 0.84957888 2788;1333 K7EM38;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTG1 Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 1 1 0 1 3 2 3 2 1 3 1 1 1 1 1 3 156.99 156.99 2 7.591E-141 157309 QUIQUE_C1403_190116_001 239.48 217.45 19831000000 36874000 3202900000 2019500000 2104900000 1640000000 1768700000 1480900000 892200000 1023700000 1077600000 1476700000 1415300000 1692200000 9288 1333;2788 8691 82738;82739;82740;82741;82742;82743;82744;82745;82746;82747;82748;82749;82750;82751;82752;82753;82754;82755;82756;82757;82758;82759;82760 105200;105201;105202;105203;105204;105205;105206;105207;105208;105209;105210;105211;105212;105213;105214;105215;105216;105217;105218;105219;105220;105221;105222;105223;105224;105225;105226;105227;105228;105229;105230;105231;105232;105233;105234;105235;105236;105237;105238;105239;105240 105210 753 39 EEEIAALVIDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term) 1876.8547 0.85466426 2788;1333 K7EM38;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTG1 Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.67 161.67 2;3 0 163698 QUIQUE_C1563_190116_001 372.71 351.94 52834000000 5771800000 6831400000 6389900000 4616500000 4872700000 4450100000 4794500000 1956700000 1796400000 762470000 3147400000 3457200000 3986900000 9289 1333;2788 8691 82761;82762;82763;82764;82765;82766;82767;82768;82769;82770;82771;82772;82773;82774 105241;105242;105243;105244;105245;105246;105247;105248;105249;105250;105251;105252;105253;105254;105255;105256;105257;105258;105259;105260;105261;105262;105263;105264;105265;105266;105267;105268;105269;105270;105271;105272;105273;105274;105275;105276;105277;105278;105279;105280;105281;105282 105259 42 EEELSLQDITMR Unmodified 1462.6974 0.69735898 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 108.84 108.84 2 0.00029958 112989 QUIQUE_C1218_190116_001 115.78 97.917 64334000 31072000 0 0 33262000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9290 3733 8692 82775;82776;82777 105283;105284;105285 105283 2 EEEPEADQEHA Unmodified 1282.495 0.494954 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 17.281 17.281 2 0.0026819 9271 QUIQUE_C1563_190116_001 76.827 46.66 98883000 21651000 0 0 23609000 0 22904000 19947000 0 0 10772000 0 0 0 9291 2128 8693 82778;82779;82780;82781;82782 105286;105287;105288;105289;105290 105288 4 EEEQTAEEILSK Unmodified 1404.662 0.66201933 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.861 63.861 2 8.7577E-14 64221 QUIQUE_C1218_190116_001 159.4 89.579 801850000 151090000 109020000 96251000 107640000 68142000 114890000 91170000 0 0 0 63644000 0 0 9292 2382 8694 82783;82784;82785;82786;82787;82788;82789;82790 105291;105292;105293;105294;105295;105296;105297;105298;105299;105300 105291 10 EEETEAAIGAPPTATEGPETKPVLMALAEGPGAEGPR Unmodified 3672.7829 0.78288611 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 126.58 126.58 3 1.5457E-69 131387 QUIQUE_C1218_190116_001 122.45 113.31 82170000 44666000 0 0 0 0 37504000 0 0 0 0 0 0 0 9293 2983 8695 82791;82792 105301;105302 105301 2 EEETLDTIK Unmodified 1076.5237 0.52373493 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 36.491 36.491 2 0.011794 31996 QUIQUE_C1403_190116_001 72.23 32.584 176050000 0 0 0 93416000 0 82636000 0 0 0 0 0 0 0 9294 1021 8696 82793;82794;82795 105303;105304;105305;105306 105303 4 EEEVQYIQAEK Unmodified 1364.646 0.64597533 1750 O95786 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes yes 0 0 0 1 1 44.7 44.7 2 0.0015573 41836 QUIQUE_C1368_190116_001 113.62 88.063 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9295 1750 8697 82796;82797 105307;105308 105307 2 EEEYEPEKMEAEDYVMAVVDK Unmodified 2532.0924 0.092387924 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 132.55 132.55 3 0.00093263 135402 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.405 70.98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9296 2483 8698 82798 105309 105309 1 EEFAQSAIR Unmodified 1049.5142 0.5141733 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 37.796 37.796 2 0.052014 32182 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.546 39.806 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9297 1655 8699 82799 105310 105310 1 EEFASTCPDDEEIELAYEQVAK Unmodified 2572.1163 0.11629449 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.26 136.26 2 1.2976E-44 140376 QUIQUE_C1277_190116_001 196.95 190.79 375440000 28321000 38922000 49788000 69302000 41058000 28267000 37961000 0 0 0 42066000 0 39759000 9298 1395 8700 82800;82801;82802;82803;82804;82805;82806;82807;82808 105311;105312;105313;105314;105315;105316;105317;105318;105319;105320 105312 10 EEFCGLLSSPTGPLSSCHK Unmodified 2104.9558 0.95577528 4663 Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 97.613 97.613 3 0.029749 94293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.625 26.82 20664000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20664000 0 0 0 9299 4663 8701 82809 105321 105321 1 EEFEHQQKELEK Unmodified 1572.742 0.74200098 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 1 1 18.379 18.379 3 0.0033017 11152 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.122 38.911 46224000 0 0 0 0 0 0 0 46224000 0 0 0 0 0 9300 558;2010 8702 82810 105322 105322 1 EEFEYIAFR Unmodified 1202.5608 0.56078914 4096 Q9C0E8 LNP Protein lunapark yes yes 0 0 0 1 1 104.19 104.19 2 0.050487 107133 QUIQUE_C1403_190116_001 50.607 16.354 50523000 0 0 23785000 26738000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9301 4096 8703 82811;82812 105323;105324 105324 2 EEFQQYAAALQAGMEIGWLKPVIGSQYPLEK Unmodified 3493.7592 0.75917796 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 166.77 166.77 3;4 5.8736E-89 171685 QUIQUE_C1218_190116_001 167.87 162.26 1067200000 89621000 44619000 125770000 22109000 40689000 0 57463000 0 296860000 0 0 158890000 231220000 9302 2917 8704 82813;82814;82815;82816;82817;82818;82819;82820;82821;82822 105325;105326;105327;105328;105329;105330;105331;105332;105333;105334 105325 10 EEFQQYAAALQAGMEIGWLKPVIGSQYPLEK Oxidation (M) 3509.7541 0.75409258 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 1 1 1 1 158.86 158.86 3 1.5236E-24 165628 QUIQUE_C1438_190116_001 84.515 80.225 68291000 0 0 0 0 37603000 0 0 0 0 0 0 0 30689000 9303 2917 8704 82823;82824 105335;105336 105335 2396 2 EEFRPNAPYR Unmodified 1277.6153 0.61528433 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 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Unmodified 2019.9037 0.90366336 3128 Q15293;E9PP27 RCN1 Reticulocalbin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.34 111.34 3;4 0.0016753 116499 QUIQUE_C1218_190116_001 60.209 49.165 120010000 0 0 0 0 24938000 0 51676000 0 0 0 0 43398000 0 9306 3128 8707 82853;82854;82855;82856;82857 105368;105369;105370;105371;105372 105368 5 EEFTAFLHPEEYDYMK Unmodified 2047.8873 0.88734459 1557 O43852;H0Y875 CALU Calumenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.12 126.12 3 0.0020228 130543 QUIQUE_C1368_190116_001 50.827 39.782 251860000 42752000 0 41170000 0 38737000 35456000 40436000 0 0 0 34607000 0 18700000 9307 1557 8708 82858;82859;82860;82861;82862;82863;82864 105373;105374;105375;105376;105377;105378;105379 105374 5 EEFTSGGPLGQK Unmodified 1248.5986 0.59863121 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.09 48.09 2 4.8127E-14 46208 QUIQUE_C1218_190116_001 163.32 118.24 3970800000 418040000 422170000 413760000 391510000 382060000 427560000 351600000 122340000 212110000 144720000 225640000 211710000 247630000 9308 2460 8709 82865;82866;82867;82868;82869;82870;82871;82872;82873;82874;82875;82876;82877 105380;105381;105382;105383;105384;105385;105386;105387;105388;105389;105390;105391;105392;105393;105394;105395;105396;105397;105398 105382 16 EEFVETCPSEHK Unmodified 1490.6348 0.63475872 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 24.829 24.829 2;3 1.2211E-09 17304 QUIQUE_C1368_190116_001 189.18 175.82 3964600000 361390000 677040000 397940000 408660000 211590000 541600000 182770000 43366000 60475000 0 419420000 183330000 476960000 9309 2009 8710 82878;82879;82880;82881;82882;82883;82884;82885;82886;82887;82888;82889;82890;82891;82892;82893;82894;82895;82896;82897;82898 105399;105400;105401;105402;105403;105404;105405;105406;105407;105408;105409;105410;105411;105412;105413;105414;105415;105416;105417;105418;105419;105420;105421;105422 105407 23 EEFVQWVELLPDTQTPSWLGLPNNAER Unmodified 3167.5564 0.55637905 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 170.18 170.18 3 2.8509E-12 174359 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.925 55.922 31196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31196000 9310 3053 8711 82899 105423 105423 1 EEFWLGLDNLNK Unmodified 1476.7249 0.72489436 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 136.27 136.27 2 7.2345E-05 140991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.75 98.873 373380000 0 0 0 0 0 0 0 0 317390000 55995000 0 0 0 9311 2233 8712 82900;82901 105424;105425;105426 105424 3 EEGAGGSAGGPALLPAEGAVFLTTYR Unmodified 2490.2391 0.23906766 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 147.36 147.36 3 0.0004389 142969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 34.715 27.094 8716100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8716100 0 0 0 9312 1716 8713 82902 105427 105427 1 EEGASPLDFD Unmodified 1078.4455 0.44548461 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 102.29 102.29 2 0.0001583 107184 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.62 119.62 176560000 0 0 0 0 0 0 61930000 0 0 0 51229000 63404000 0 9313 1245 8714 82903;82904;82905 105428;105429;105430 105429 2 EEGCTHVIVTTACGSLR Unmodified 1888.8771 0.87713103 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7;F2Z2F3;A0A2R8Y4K0 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.448 55.448 2;3 4.4148E-07 53080 QUIQUE_C1368_190116_001 109 95.797 101710000 23449000 0 24717000 0 0 22164000 0 0 0 31377000 0 0 0 9314 2966 8715 82906;82907;82908;82909 105431;105432;105433;105434;105435 105432 5 EEGFPIRPHYFWPLLVGR Unmodified 2212.1582 0.15817898 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 134.71 134.71 3;4 6.6907E-05 140934 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.874 81.001 602840000 0 0 27289000 0 0 16036000 54012000 37565000 72084000 0 231270000 95796000 68791000 9315 2452 8716 82910;82911;82912;82913;82914;82915;82916;82917;82918 105436;105437;105438;105439;105440;105441;105442;105443;105444;105445;105446 105443 11 EEGGENLDQAR Unmodified 1216.532 0.53200821 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.675 19.675 2 2.9979E-18 12291 QUIQUE_C1576_190116_001 169.09 156 14032000000 1235700000 1446700000 1746800000 1470300000 1136600000 1383100000 1405400000 325650000 630680000 905570000 1089500000 661520000 594960000 9316 845;1936 8717 82919;82920;82921;82922;82923;82924;82925;82926;82927;82928;82929;82930;82931 105447;105448;105449;105450;105451;105452;105453;105454;105455;105456;105457;105458;105459 105453 13 EEGIDELAK Unmodified 1002.487 0.4869555 709 C9JBI3;P78330;C9JEJ7;F8WD74 PSPH Phosphoserine phosphatase yes no 0 0 0 1 43.267 43.267 2 0.05881 40766 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 23.601 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9317 709 8718 82932 105460 105460 1 EEGIENFDVYAIKPGHPLQPDFFLDEYPEAVSK Unmodified 3792.8199 0.81992354 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 2 1 148.31 148.31 3;4 1.1867E-29 153094 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.817 88.056 1683200000 178740000 200740000 239710000 133750000 112730000 199680000 0 54080000 238980000 63682000 150590000 110500000 0 9318 3421 8719 82933;82934;82935;82936;82937;82938;82939;82940;82941;82942;82943;82944;82945;82946;82947;82948;82949 105461;105462;105463;105464;105465;105466;105467;105468;105469;105470;105471;105472;105473;105474;105475;105476;105477;105478 105473 18 EEGILGFFAGLVPR Unmodified 1503.8086 0.80856441 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 170.29 170.29 2;3 0.00015244 175200 QUIQUE_C1368_190116_001 136.63 101.12 2373800000 172270000 163530000 166840000 182420000 140450000 263810000 174590000 88284000 216700000 37882000 326450000 277520000 163020000 9319 4650 8720 82950;82951;82952;82953;82954;82955;82956;82957;82958;82959;82960;82961;82962;82963;82964;82965;82966;82967;82968;82969;82970;82971 105479;105480;105481;105482;105483;105484;105485;105486;105487;105488;105489;105490;105491;105492;105493;105494;105495;105496;105497;105498;105499;105500 105484 22 EEGLAYIWMPTPDMSTEGR Unmodified 2181.9711 0.971091 1718 O95278;H0Y6I8 EPM2A Laforin yes no 0 0 0 1 148.03 148.03 2 0.00058546 153823 QUIQUE_C1576_190116_001 89.46 78.85 24089000 0 0 0 0 0 0 24089000 0 0 0 0 0 0 9320 1718 8721 82972 105501 105501 1 EEGLMQNCNQMHASYLFQQDK Unmodified 2570.0988 0.098827481 2894 Q05329;A0A3B3IU09 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 90.474 90.474 3 1.1778E-10 93571 QUIQUE_C1218_190116_001 91.889 89.16 118200000 48560000 41737000 27904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9321 2894 8722 82973;82974;82975 105502;105503;105504 105502 3 EEGPSAFWK Unmodified 1049.4818 0.48181054 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.126 70.126 2 0.0053947 68862 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 58.282 593300000 95116000 84420000 62698000 62072000 38798000 55916000 61010000 0 42410000 42166000 48697000 0 0 9322 1655 8723 82976;82977;82978;82979;82980;82981;82982;82983;82984;82985;82986 105505;105506;105507;105508;105509;105510;105511;105512;105513;105514;105515;105516;105517;105518;105519;105520;105521 105514 16 EEGPYEVEVTYDGVPVPGSPFPLEAVAPTKPSK Unmodified 3484.729 0.72898327 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.07 142.07 3 1.1905E-38 145005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.2 96.622 851690000 55178000 50871000 70749000 58385000 66936000 39642000 58107000 86150000 75398000 54668000 89084000 91144000 55375000 9323 2178 8724 82987;82988;82989;82990;82991;82992;82993;82994;82995;82996;82997;82998;82999;83000 105522;105523;105524;105525;105526;105527;105528;105529;105530;105531;105532;105533;105534;105535;105536;105537;105538 105530 16 EEGSAHLAVPGVYFTCPLTGATLR Unmodified 2545.2635 0.26350827 4088 Q9BZV1;K7EJ02 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 127.66 127.66 3 2.719E-06 133277 QUIQUE_C1218_190116_001 58.373 51.429 514860000 129940000 0 129700000 0 0 0 0 0 104720000 46532000 0 103960000 0 9324 4088 8725 83001;83002;83003;83004;83005 105539;105540;105541;105542;105543 105539 3 EEGSPLELER Unmodified 1157.5564 0.55643205 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5GZI0 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.686 53.686 2 0.00064277 51779 QUIQUE_C1277_190116_001 127.68 72.309 979710000 146950000 115300000 0 130350000 0 118810000 0 0 74413000 100410000 122420000 52979000 118080000 9325 997 8726 83006;83007;83008;83009;83010;83011;83012;83013;83014 105544;105545;105546;105547;105548;105549;105550;105551;105552;105553 105545 6 EEGVIDSSDKEIVAEAER Unmodified 1974.9382 0.93819419 2653 P55010 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 75.294 75.294 3 0.058701 75404 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EEIAEYRR Unmodified 1064.5251 0.52507234 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 17.727 17.727 2;3 0.0014546 10183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.253 74.789 955270000 0 63154000 27610000 0 135870000 14673000 113250000 239420000 145700000 10726000 108090000 0 96774000 9333 869 8734 83080;83081;83082;83083;83084;83085;83086;83087;83088;83089;83090;83091;83092 105633;105634;105635;105636;105637;105638;105639;105640;105641;105642;105643;105644;105645 105641 12 EEIAPINFK Unmodified 1059.5601 0.56006086 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 70.697 70.697 2 0.040078 71051 QUIQUE_C1368_190116_001 64.567 20.172 40879000 0 0 40879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9334 2486 8735 83093 105646 105646 1 EEIDHAEYYLYK Unmodified 1571.7144 0.71438925 1104 G5EA06;Q92552;D6RH20;D6RJC7;E5RJ73 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 69.23 69.23 2 0.0040017 70339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.173 52.427 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9335 1104 8736 83094 105647 105647 1 EEIDSILNK Unmodified 1059.5448 0.54480473 2613 P52788;H7C2R7 SMS Spermine synthase yes no 0 0 0 1 1 66.408 66.408 2 0.0053947 64585 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 36.162 116250000 66647000 0 0 0 0 49604000 0 0 0 0 0 0 0 9336 2613 8737 83095;83096 105648;105649 105649 1 EEIFGPVLSVYVYPDDK Unmodified 1968.9721 0.9720605 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.12 149.12 2 9.2788E-06 144594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.46 89.402 557700000 97166000 52355000 96966000 0 57515000 116120000 46149000 0 0 38421000 0 31181000 21832000 9337 2295 8738 83097;83098;83099;83100;83101;83102;83103;83104;83105;83106 105650;105651;105652;105653;105654;105655;105656;105657;105658;105659;105660;105661 105658 11 EEIFGPVLSVYVYPDDKYK Unmodified 2260.1304 0.13035206 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 134.31 134.31 2 0.0012664 139476 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0.74793799 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 2 1 122.69 122.69 2 0.00058343 126645 QUIQUE_C1277_190116_001 99.802 36.323 321060000 0 0 71708000 0 0 0 0 0 0 56684000 103850000 0 88823000 9340 1875 8740 83126;83127;83128;83129;83130;83131;83132;83133;83134;83135;83136;83137;83138;83139;83140;83141;83142;83143;83144 105711;105712;105713;105714;105715;105716;105717;105718;105719;105720;105721;105722;105723;105724;105725;105726;105727;105728;105729;105730;105731;105732;105733;105734 105713 1096 24 EEIFGPVMSILSFDTEAEVLER Unmodified 2510.2251 0.22505708 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 3 2 2 172.71 172.71 2;3 2.3399E-15 176596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.44 131.08 510920000 5624800 0 0 0 17542000 0 19613000 61404000 97346000 0 156030000 84582000 68779000 9341 2522 8741 83145;83146;83147;83148;83149;83150;83151;83152;83153;83154;83155;83156;83157;83158 105735;105736;105737;105738;105739;105740;105741;105742;105743;105744;105745;105746;105747;105748;105749;105750 105742 15 EEIFGPVMSILSFDTEAEVLER Oxidation (M) 2526.22 0.2199717 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 1 0 1 2 2 1 2 1 168.34 168.34 2;3 1.5418E-37 172891 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.3 138.81 348940000 0 19025000 0 0 74681000 0 65278000 36978000 118670000 0 0 34306000 0 9342 2522 8741 83159;83160;83161;83162;83163;83164;83165;83166;83167 105751;105752;105753;105754;105755;105756;105757;105758;105759 105758 1946 8 EEIFGPVQPLFK Unmodified 1402.7497 0.74965254 2325 P30837 ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.81 126.81 2 0.0010538 139784 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.439 0 164570000 0 0 0 31795000 0 49916000 38895000 0 0 0 0 0 43968000 9343 2325 8742 83168;83169;83170;83171;83172;83173;83174 105760;105761;105762;105763;105764;105765;105766;105767 105766 8 EEIFGPVQQIMK Oxidation (M) 1433.7225 0.72245152 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105782;105783;105784;105785;105786;105787;105788;105789;105790;105791;105792;105793;105794;105795;105796;105797;105798;105799;105800;105801;105802;105803;105804;105805;105806;105807;105808;105809;105810;105811;105812;105813;105814;105815;105816;105817 105789 36 EEIIGNGEQQYVYLK Unmodified 1781.8836 0.88357984 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 92.829 92.829 2 0.0011601 95270 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.555 58.355 61167000 0 0 0 0 0 0 0 0 61167000 0 0 0 0 9346 3255 8744 83202 105818 105818 1 EEIIPVAAEYDK Unmodified 1375.6871 0.68711187 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310;E9PJM9;E9PRX4 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 82.896 82.896 2 0.00026424 85303 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.77 91.89 1622100000 157040000 164400000 0 157280000 147450000 142360000 147310000 181080000 0 0 217220000 141970000 165990000 9347 666 8745 83203;83204;83205;83206;83207;83208;83209;83210;83211;83212;83213 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105855;105856;105857 105856 3 EEIQDASQLPPAFDLFEAFAK Unmodified 2365.1478 0.14779303 4181 Q9H7B4;B0QZA0;B0QZ88 SMYD3 Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 170.49 170.49 2;3 9.0135E-07 175212 QUIQUE_C1368_190116_001 117.08 104.93 200870000 9053300 0 41699000 31368000 0 22193000 0 32735000 25751000 0 0 38070000 0 9353 4181 8751 83241;83242;83243;83244;83245;83246;83247;83248 105858;105859;105860;105861;105862;105863;105864;105865 105860 8 EEIQDSLVGQR Unmodified 1272.631 0.63099397 900 E9PC69;Q7KZI7;E7ETY4 MARK2 Serine/threonine-protein kinase MARK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.899 54.899 2 0.0026439 53750 QUIQUE_C1218_190116_001 91.867 38.312 226220000 25765000 31085000 42649000 33763000 0 0 0 0 0 0 52468000 40488000 0 9354 900 8752 83249;83250;83251;83252;83253;83254 105866;105867;105868;105869;105870;105871 105866 5 EEIQPGDIVIIDQFIDR Unmodified 1999.0262 0.026221336 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7;F2Z2F3;A0A2R8Y4K0 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 158.95 158.95 2;3 4.4471E-09 161221 QUIQUE_C1563_190116_001 113.35 100.79 1186500000 121600000 105260000 183620000 127910000 160870000 121240000 15808000 54423000 109460000 0 25284000 82882000 78182000 9355 2966 8753 83255;83256;83257;83258;83259;83260;83261;83262;83263;83264;83265;83266;83267;83268;83269;83270 105872;105873;105874;105875;105876;105877;105878;105879;105880;105881;105882;105883;105884;105885;105886;105887;105888 105881 16 EEIQSSISGVTAAYNR Unmodified 1723.8377 0.83769228 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8;A0A087WWP1 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 82.697 82.697 2 0.00010487 84161 QUIQUE_C1368_190116_001 130.99 91.687 328670000 0 0 63514000 44154000 47934000 25350000 31606000 30104000 0 16841000 38270000 0 30897000 9356 2487 8754 83271;83272;83273;83274;83275;83276;83277;83278;83279;83280 105889;105890;105891;105892;105893;105894;105895;105896;105897;105898 105889 5 EEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDPEGK Unmodified 2826.4691 0.46912717 2609 P52597 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 170.98 170.98 3 6.113E-11 174886 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.231 73.89 134400000 0 0 0 0 0 0 0 0 70841000 0 0 50635000 12920000 9357 2609 8755 83281;83282;83283 105899;105900;105901 105900 3 EEIVYLPCIYR Unmodified 1453.7275 0.72753689 2978 Q13228;H0Y532;F2Z2W8;F8WCR4;C9JVL0 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 119.18 119.18 2 5.921E-09 116673 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.86 145.28 5938400000 274580000 372350000 449500000 381180000 475860000 466980000 513270000 475820000 506140000 188200000 603730000 460040000 770720000 9358 2978 8756 83284;83285;83286;83287;83288;83289;83290;83291;83292;83293;83294;83295;83296;83297 105902;105903;105904;105905;105906;105907;105908;105909;105910;105911;105912;105913;105914;105915;105916;105917;105918;105919;105920;105921;105922;105923;105924;105925 105921 24 EEIYQLNSDK Unmodified 1237.5826 0.5826468 810 D6RB81;Q9UHK6 AMACR Alpha-methylacyl-CoA racemase yes no 0 0 0 1 47.263 47.263 2 0.01651 44575 QUIQUE_C1368_190116_001 62.558 38.336 22309000 0 0 22309000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9359 810 8757 83298 105926 105926 1 EEKPAVTAAPK Unmodified 1139.6186 0.61863837 977 E9PR44;P02511;A0A024R3B9;H0YCW8 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 11.085 11.085 2;3 0.0068513 3766 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.6 80.574 426910000 0 0 0 0 0 37106000 0 256630000 31891000 96416000 0 0 4868200 9360 977 8758 83299;83300;83301;83302;83303;83304;83305 105927;105928;105929;105930;105931;105932;105933 105932 5 EELAFLK Unmodified 848.46437 0.46436956 789 CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 yes no 0 0 0 1 98.071 98.071 2 0.049128 100198 QUIQUE_C1403_190116_001 75.311 0 14538000 0 0 0 14538000 0 0 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.529 70.529 2 0.0045575 67174 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.7 66.805 1795400000 222810000 254520000 0 232860000 0 244010000 0 196230000 0 104260000 299440000 0 241290000 9374 2087 8772 83392;83393;83394;83395;83396;83397;83398;83399 106038;106039;106040;106041;106042;106043;106044;106045;106046;106047 106044 9 EELFVTSK Unmodified 951.49131 0.49131259 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 44.835 44.835 2 0.0081139 41544 QUIQUE_C1403_190116_001 95.531 66.382 842020000 203670000 0 0 227550000 0 0 0 97915000 0 0 152740000 0 160150000 9375 2076 8773 83400;83401;83402;83403;83404;83405 106048;106049;106050;106051;106052;106053;106054;106055 106050 8 EELGDEWLKPELFR Unmodified 1759.8781 0.87810054 969 G3V158;E9PPM8;Q9Y315 DERA Deoxyribose-phosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.74 127.74 3 0.0053274 133304 QUIQUE_C1576_190116_001 58.831 49.511 204050000 0 0 26571000 23845000 30219000 30559000 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106223 139 EELINFK Unmodified 891.47018 0.47018322 4636 Q9Y5X3 SNX5 Sorting nexin-5 yes yes 0 0 0 1 63.472 63.472 2 0.046614 61957 QUIQUE_C1563_190116_001 77.496 16.697 38161000 0 0 0 0 0 38161000 0 0 0 0 0 0 0 9380 4636 8778 83556 106224 106224 1 EELITNWEQIR Unmodified 1429.7201 0.72014333 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.71 106.71 2 1.7778E-18 109509 QUIQUE_DMIX7_190116_001 172.47 137.75 7626400000 395180000 610630000 570590000 412750000 629650000 434840000 603930000 709530000 829810000 288230000 801230000 565580000 774460000 9381 267;275;3025 8779 83557;83558;83559;83560;83561;83562;83563;83564;83565;83566;83567;83568;83569 106225;106226;106227;106228;106229;106230;106231;106232;106233;106234;106235;106236;106237;106238;106239;106240;106241;106242;106243;106244;106245;106246;106247;106248;106249 106245 25 EELLDHLEK Unmodified 1124.5714 0.57135383 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.022 53.022 2;3 0.0019201 50914 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.1 58.538 311800000 0 0 47212000 49408000 21723000 0 34970000 54569000 47955000 34106000 21862000 0 0 9382 2279 8780 83570;83571;83572;83573;83574;83575;83576;83577 106250;106251;106252;106253;106254;106255;106256;106257 106255 8 EELLEYEEK Unmodified 1180.5499 0.54994968 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.444 58.444 2 0.0026282 57458 QUIQUE_C1277_190116_001 93.162 51.975 320090000 63387000 55439000 58269000 55423000 38582000 0 48994000 0 0 0 0 0 0 9383 2472 8781 83578;83579;83580;83581;83582;83583 106258;106259;106260;106261;106262;106263 106259 5 EELLPHLLPLLK Unmodified 1413.8595 0.85953735 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.79 131.79 3 0.0036291 137404 QUIQUE_C1218_190116_001 57.836 47.784 994670000 64532000 162110000 55721000 84241000 93187000 93975000 109990000 23360000 33077000 36815000 93620000 43581000 100460000 9384 1446 8782 83584;83585;83586;83587;83588;83589;83590;83591;83592;83593;83594;83595;83596 106264;106265;106266;106267;106268;106269;106270;106271;106272;106273;106274;106275;106276;106277;106278;106279;106280 106264 16 EELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVR Unmodified 2557.2258 0.22578536 1429 O14525;B1AJS1 ASTN1 Astrotactin-1 yes no 0 0 0 1 173.62 173.62 3 0.0046434 177849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 34.914 30.465 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9385 1429 8783 83597 106281 106281 1 EELNAISGPNEFAEFYNR Unmodified 2098.9596 0.95959833 2949 Q12874 SF3A3 Splicing factor 3A subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.04 129.04 2 1.6205E-10 133290 QUIQUE_C1277_190116_001 138.42 114.57 209050000 32891000 46389000 0 0 27139000 0 0 0 30515000 0 39284000 32833000 0 9386 2949 8784 83598;83599;83600;83601;83602;83603 106282;106283;106284;106285;106286;106287;106288 106284 7 EELNFLAR Unmodified 990.51345 0.51344502 3705 Q8WVF1;C9JF58;H0YAG0 OSCP1 Protein OSCP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.998 77.998 2 0.0049014 79074 QUIQUE_C1368_190116_001 107.43 30.583 261860000 0 25555000 29440000 27431000 24909000 0 25420000 33939000 0 0 28014000 29367000 37787000 9387 3705 8785 83604;83605;83606;83607;83608;83609;83610;83611;83612;83613 106289;106290;106291;106292;106293;106294;106295;106296;106297;106298;106299;106300;106301;106302;106303;106304;106305;106306 106292 18 EELPENVPIGNIPK Unmodified 1547.8195 0.81952302 673 Q5VT82;B7ZM79;Q9HC56 PCDH9 Protocadherin-9 yes no 0 0 0 1 92.1 92.1 2 0.037672 94813 QUIQUE_C1576_190116_001 58.699 44.541 49221000 0 0 0 0 0 0 49221000 0 0 0 0 0 0 9388 673 8786 83614 106307 106307 0 EELQANGSAPAADKEEPAAAGSGAASPSAAEK Unmodified 2981.385 0.38501621 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.509 41.509 3 1.2401E-196 38166 QUIQUE_C1277_190116_001 216.7 208.4 1919800000 162120000 189250000 168560000 208630000 220650000 291760000 65742000 44334000 165600000 71025000 88282000 77094000 166740000 9389 2293 8787 83615;83616;83617;83618;83619;83620;83621;83622;83623;83624;83625;83626;83627 106308;106309;106310;106311;106312;106313;106314;106315;106316;106317;106318;106319;106320;106321;106322;106323 106310 16 EELQANGSAPAADKEEPAAAGSGAASPSAAEKGEPAAAAAPEAGASPVEK Unmodified 4585.1692 0.16921636 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 2 1 64.222 64.222 3 1.8867E-12 63004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.328 57.104 30962000 0 0 0 0 0 0 0 30962000 0 0 0 0 0 9390 2293 8788 83628 106324 106324 1 EELQNLIQSLEAANK Unmodified 1698.8788 0.87882882 4318 Q9NX08 COMMD8 COMM domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 146.26 146.26 2;3 3.6851E-06 150660 QUIQUE_C1277_190116_001 142.76 126.39 480990000 57797000 61185000 61496000 69118000 63028000 116810000 15745000 0 0 6163500 29644000 0 0 9391 4318 8789 83629;83630;83631;83632;83633;83634;83635;83636;83637;83638;83639;83640;83641;83642;83643;83644 106325;106326;106327;106328;106329;106330;106331;106332;106333;106334;106335;106336;106337;106338;106339;106340 106328 15 EELQQQDVER Unmodified 1272.5946 0.59460847 1522 O43310 CTIF CBP80/20-dependent translation initiation factor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.11 24.11 2 0.0085768 17501 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.139 68.972 106090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 106090000 9392 1522 8790 83645;83646;83647;83648;83649 106341;106342;106343;106344;106345 106344 5 EELTLEGIR Unmodified 1058.5608 0.56078914 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3KTN0 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.681 76.681 2 0.0080372 77155 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.906 34.825 610510000 48886000 59049000 76293000 88036000 54693000 78814000 0 0 50217000 0 62159000 43618000 48745000 9393 2697 8791 83650;83651;83652;83653;83654;83655;83656;83657;83658;83659 106346;106347;106348;106349;106350;106351;106352;106353;106354;106355 106355 9 EELVAAVEDVRK Unmodified 1356.7249 0.72489436 2250;2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0;P26232;C9IZ88 CTNNA1;CTNNA2 Catenin alpha-1;Catenin alpha-2 no no 0 0 1 1 1 60.446 60.446 3 0.016213 58621 QUIQUE_C1563_190116_001 44.616 32.348 94785000 0 0 0 0 0 59137000 35648000 0 0 0 0 0 0 9394 2369;2250 8792 83660;83661 106356;106357;106358 106356 3 EELVAEQALK Unmodified 1128.6027 0.60265396 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 49.324 49.324 2 0.049232 46968 QUIQUE_C1218_190116_001 67.897 0 37440000 37440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9395 873 8793 83662 106359 106359 0 EELVEESQTK Unmodified 1190.5667 0.56666238 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.84 22.84 2 1.4167E-11 16203 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.32 129.07 1389100000 152250000 83592000 110990000 118810000 136430000 114480000 112930000 73950000 85300000 63553000 105310000 77371000 154110000 9396 2924 8794 83663;83664;83665;83666;83667;83668;83669;83670;83671;83672;83673;83674;83675 106360;106361;106362;106363;106364;106365;106366;106367;106368;106369;106370;106371;106372;106373 106369 13 EELYQNLTR Unmodified 1164.5775 0.57750184 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.686 57.686 2 1.246E-13 55923 QUIQUE_C1403_190116_001 185.84 142.59 22792000000 1708500000 2143900000 2299300000 1931600000 1952000000 2040900000 2058500000 1032100000 1664900000 906200000 2012800000 1439500000 1601500000 9397 267;275;3025 8795 83676;83677;83678;83679;83680;83681;83682;83683;83684;83685;83686;83687;83688 106374;106375;106376;106377;106378;106379;106380;106381;106382;106383;106384;106385;106386;106387;106388;106389;106390;106391 106378 18 EEMGIGGVLGLLWFQK Unmodified 1775.928 0.92802762 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 170.49 170.49 2 0.0021453 174736 QUIQUE_C1218_190116_001 63.694 54.261 17191000 17191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9398 2623 8796 83689 106392 106392 1 EEMGIGGVLGLLWFQK Oxidation (M) 1791.9229 0.92294224 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 1 0 2 166.69 166.69 2 0.019994 170552 QUIQUE_C1277_190116_001 69.01 54.331 79842000 0 79842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9399 2623 8796 83690;83691 106393;106394 106393 0 EEMIHNLQ Unmodified 1012.4648 0.46478027 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.471 39.471 2 0.0093704 35621 QUIQUE_C1218_190116_001 92.677 68.478 122110000 41789000 51614000 0 0 0 0 0 28710000 0 0 0 0 0 9400 1389 8797 83692;83693;83694 106395;106396;106397 106395 3 EEMLEIVQAIYK Unmodified 1464.7534 0.75341729 2826 P84074 HPCA Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 141.91 141.91 2 7.6224E-06 147276 QUIQUE_C1368_190116_001 133.13 112.16 497290000 97435000 89474000 121130000 0 94051000 0 0 0 0 0 0 0 95200000 9401 2826 8798 83695;83696;83697;83698;83699 106398;106399;106400;106401;106402;106403 106401 5 EEMLSWILR Unmodified 1175.6009 0.60087982 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 137.76 137.76 2 0.00068043 142082 QUIQUE_C1277_190116_001 110.81 85.957 62632000 0 14549000 14765000 11796000 0 13524000 7997000 0 0 0 0 0 0 9402 3997 8799 83700;83701;83702;83703;83704;83705 106404;106405;106406;106407;106408;106409;106410 106405 7 EEMQSNVEVVHTYR Unmodified 1719.7886 0.7886336 3737 Q92597 NDRG1 Protein NDRG1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 43.548 43.548 2;3 7.9345E-87 40204 QUIQUE_C1277_190116_001 259.55 227.13 1275200000 167260000 179750000 228300000 282070000 127170000 134140000 51876000 47071000 0 57564000 0 0 0 9403 3737 8800 83706;83707;83708;83709;83710;83711;83712;83713;83714;83715;83716;83717;83718;83719;83720 106411;106412;106413;106414;106415;106416;106417;106418;106419;106420;106421;106422;106423;106424;106425;106426;106427;106428 106414 18 EENEGVYNGSWGGR Unmodified 1552.6542 0.65424861 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6;F8VVF2;F8WDY6;A0A1B0GW65;F8WD33;A0A0J9YWM6;A0A0J9YWK1 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.926 56.926 2 3.0249E-07 55323 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.68 120.57 4260400000 339910000 322320000 508570000 309630000 319710000 372150000 455330000 165150000 290090000 202600000 371770000 287550000 315610000 9404 336 8801 83721;83722;83723;83724;83725;83726;83727;83728;83729;83730;83731;83732;83733 106429;106430;106431;106432;106433;106434;106435;106436;106437;106438;106439;106440;106441;106442;106443 106436 15 EENIEDATEK Unmodified 1176.5146 0.51462681 2822 Q5JSL0;Q5JSK6;Q5JSK9;P82970 HMGN5 High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 22.952 22.952 2 0.00064267 16441 QUIQUE_C1218_190116_001 108.43 64.575 54486000 31136000 0 0 0 0 23350000 0 0 0 0 0 0 0 9405 2822 8802 83734;83735;83736 106444;106445;106446 106444 3 EENQAGPEATTSDPQDLDMK Unmodified 2174.9274 0.92737151 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.691 58.691 2 7.32E-47 57082 QUIQUE_C1368_190116_001 162.46 140.59 279990000 50436000 44998000 57425000 66352000 0 60781000 0 0 0 0 0 0 0 9406 1656 8803 83737;83738;83739;83740;83741 106447;106448;106449;106450;106451 106449 5 EENQAGPEATTSDPQDLDMKK Unmodified 2303.0223 0.022334524 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.541 41.541 2;3 1.1107E-14 37908 QUIQUE_C1403_190116_001 96.131 86.374 613520000 0 55268000 0 55308000 44430000 53332000 45563000 70445000 82688000 0 42104000 58978000 105410000 9407 1656 8804 83742;83743;83744;83745;83746;83747;83748;83749;83750;83751;83752 106452;106453;106454;106455;106456;106457;106458;106459;106460;106461;106462;106463;106464 106454 13 EENQAGPEATTSDPQDLDMKK Oxidation (M) 2319.0172 0.017249146 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.867 31.867 3 2.5196E-07 26238 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.326 78.725 441770000 0 38787000 0 48675000 0 0 0 62688000 90650000 32302000 81840000 0 86833000 9408 1656 8804 83753;83754;83755;83756;83757;83758;83759 106465;106466;106467;106468;106469;106470;106471 106469 892 6 EENVEIHQTLDQTLLELNNL Unmodified 2364.1809 0.18088408 3325 Q5TCU3 TPM2 yes yes 0 0 0 1 2 159.55 159.55 2;3 1.4859E-56 163716 QUIQUE_C1277_190116_001 198.29 171.19 149410000 0 35264000 0 0 114140000 0 0 0 0 0 0 0 0 9409 3325 8805 83760;83761;83762 106472;106473;106474 106472 3 EENVGLHQTLDQTLNELNCI Unmodified 2339.1063 0.10633893 2791 P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.42 148.42 2 7.8023E-47 152546 QUIQUE_C1403_190116_001 203.27 177.15 1135000000 87634000 0 85224000 346470000 133370000 0 103780000 36496000 64000000 0 88340000 109430000 80260000 9410 2791 8806 83763;83764;83765;83766;83767;83768;83769;83770;83771;83772 106475;106476;106477;106478;106479;106480;106481;106482;106483;106484 106477 9 EEPAAAGSGAASPSAAEK Unmodified 1599.7376 0.73764389 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.518 20.518 2 1.7532E-31 13597 QUIQUE_C1438_190116_001 157.43 124.8 237480000 60977000 0 0 42686000 49647000 37020000 0 0 29073000 18080000 0 0 0 9411 2293 8807 83773;83774;83775;83776;83777;83778 106485;106486;106487;106488;106489;106490 106487 6 EEPDIYQIAK Unmodified 1204.5976 0.59756858 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.867 68.867 2 0.032181 69584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.673 33.103 27005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27005000 0 0 9412 1074 8808 83779;83780;83781;83782;83783;83784;83785;83786 106491;106492;106493;106494;106495;106496;106497;106498 106494 8 EEPFFPPPEEFVFIHAVPVEER Unmodified 2640.29 0.2900406 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.13 153.13 3 3.0977E-11 158285 QUIQUE_C1368_190116_001 103.26 95.987 2994200000 229860000 254150000 340530000 249670000 249980000 300540000 282980000 131690000 174930000 116550000 308170000 195030000 160090000 9413 3208 8809 83787;83788;83789;83790;83791;83792;83793;83794;83795;83796;83797;83798;83799 106499;106500;106501;106502;106503;106504;106505;106506;106507;106508;106509;106510;106511;106512;106513;106514;106515;106516;106517;106518;106519;106520;106521;106522;106523;106524;106525;106526;106527 106506 29 EEPIPCTAHWHFGQ Unmodified 1707.7464 0.74637486 2099 P16083;Q5TD07 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 82.165 82.165 2;3 0.00070031 84879 QUIQUE_C1438_190116_001 68.809 64.341 403590000 0 0 54738000 0 121610000 39779000 0 0 41954000 0 29946000 42585000 72982000 9414 2099 8810 83800;83801;83802;83803;83804;83805;83806;83807 106528;106529;106530;106531;106532;106533;106534;106535 106529 8 EEPVLFLR Unmodified 1001.5546 0.55458155 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 90.969 90.969 2 0.036566 92122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.714 30.244 11856000 0 0 0 0 0 0 0 11856000 0 0 0 0 0 9415 4488 8811 83808 106536 106536 1 EEPWVDPNSPVLLEDPVLCALAK Unmodified 2590.2989 0.29889072 2889;2616 P52895;B4DK69;Q04828;H0Y804 AKR1C2;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 166.34 166.34 2;3 1.5364E-14 171912 QUIQUE_C1576_190116_001 111.64 99.952 1433200000 195120000 144100000 0 180630000 161430000 145620000 173870000 35669000 45339000 105360000 49260000 99290000 97545000 9416 2616;2889 8812 83809;83810;83811;83812;83813;83814;83815;83816;83817;83818;83819;83820;83821;83822;83823;83824;83825;83826;83827;83828;83829 106537;106538;106539;106540;106541;106542;106543;106544;106545;106546;106547;106548;106549;106550;106551;106552;106553;106554;106555;106556;106557;106558;106559 106549 23 EEQCILYLGPR Unmodified 1376.6758 0.67583567 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.435 90.435 2 1.4501E-08 93792 QUIQUE_C1438_190116_001 156.51 117.49 651530000 49466000 62201000 104710000 75687000 65143000 78996000 0 68782000 0 0 96430000 50116000 0 9417 2998 8813 83830;83831;83832;83833;83834;83835;83836;83837;83838 106560;106561;106562;106563;106564;106565;106566;106567;106568;106569 106565 10 EEQELHDIHSTR Unmodified 1492.6906 0.69063412 2590 P51674 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 15.351 15.351 2;3;4 2.6235E-78 7946 QUIQUE_C1218_190116_001 245.58 219.93 6922100000 70593000 252890000 1184000000 998780000 589920000 439820000 1011300000 347660000 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0.96005184 933;1529 E9PHY5;E9PK52;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.584 49.584 3 2.2992E-13 47655 QUIQUE_C1576_190116_001 95.767 91.498 537320000 0 0 0 116950000 68145000 0 70274000 0 91785000 43521000 89948000 56693000 0 9421 933;1529 8817 83868;83869;83870;83871;83872;83873;83874 106603;106604;106605;106606;106607;106608;106609 106605 5 EEQIPDGMCIDAEGK Unmodified 1690.7178 0.71783642 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 79.315 79.315 2 0.045154 79819 QUIQUE_C1403_190116_001 41.317 32.804 25341000 0 0 0 25341000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9422 3143 8818 83875 106610 106610 1 EEQTDTSDGESVTHHIR Unmodified 1939.8508 0.85077617 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 20.197 20.197 3 0.005732 13215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.391 40.786 63773000 0 0 0 0 0 0 36044000 0 27729000 0 0 0 0 9423 2401 8819 83876;83877 106611;106612 106612 2 EEQTILPGDNLITECR Unmodified 1886.9044 0.90439164 3405 Q6UVY6 MOXD1 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P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 31.074 31.074 3;4 1.957E-06 25665 QUIQUE_C1277_190116_001 101.67 93.517 910040000 146750000 132620000 81453000 76229000 86563000 60199000 71733000 0 0 43568000 165670000 45257000 0 9429 2079 8825 83913;83914;83915;83916;83917;83918;83919;83920;83921;83922;83923;83924;83925;83926 106652;106653;106654;106655;106656;106657;106658;106659;106660;106661;106662;106663;106664;106665;106666;106667 106655 16 EESEPEVKEDVIEK Unmodified 1658.7887 0.78867641 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 37.226 37.226 2;3 2.123E-10 33266 QUIQUE_C1403_190116_001 139.32 115.47 315980000 0 40809000 0 32176000 97368000 32362000 31882000 38827000 0 0 42553000 0 0 9430 921 8826 83927;83928;83929;83930;83931;83932;83933;83934;83935;83936;83937 106668;106669;106670;106671;106672;106673;106674;106675;106676;106677;106678 106670 11 EESESTAVGQAHSDISK Unmodified 1773.8017 0.80170071 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 27.592 27.592 2;3 1.9943E-06 21238 QUIQUE_C1277_190116_001 101.62 88.196 240650000 56475000 0 0 0 83319000 100850000 0 0 0 0 0 0 0 9431 2880 8827 83938;83939;83940;83941;83942;83943 106679;106680;106681;106682;106683;106684 106680 4 EESESVLTLK Unmodified 1133.5816 0.58158416 2915;2107 Q08209;E7ETC2;P16298;Q5F2F8;Q5F2G0 PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.066 55.066 2 0.0010325 53170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.89 93.735 3372200000 594130000 619080000 435180000 482310000 0 394180000 0 301780000 337650000 207860000 0 0 0 9432 2915;2107 8828 83944;83945;83946;83947;83948;83949;83950;83951 106685;106686;106687;106688;106689;106690;106691;106692;106693 106692 9 EESFGPVMIISR Unmodified 1363.6806 0.6805867 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.15 109.15 2 9.1156E-05 111999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.6 110.11 2146700000 145570000 158330000 387850000 184230000 145560000 129930000 202860000 194710000 0 0 269100000 105600000 222990000 9433 1665 8829 83952;83953;83954;83955;83956;83957;83958;83959;83960;83961;83962 106694;106695;106696;106697;106698;106699;106700;106701;106702;106703;106704;106705 106701 12 EESFGPVMIISR Oxidation (M) 1379.6755 0.67550132 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 93.868 93.868 2 0.011282 96133 QUIQUE_C1368_190116_001 61.213 35.319 196820000 0 0 71839000 0 27555000 0 0 0 0 20331000 77098000 0 0 9434 1665 8829 83963;83964;83965;83966;83967 106706;106707;106708;106709;106710 106706 898 4 EESLATEPAPGTQK Unmodified 1456.7046 0.70455285 705 C9JA33 PALM2 no no 0 0 0 1 1 30.239 30.239 2 4.2877E-05 24514 QUIQUE_C1403_190116_001 118.4 88.149 56922000 31203000 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family homolog 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 10.793 10.793 3 0.00081665 3509 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.089 46.972 78952000 0 0 0 0 0 0 0 0 24391000 8479200 14913000 19710000 11459000 9438 3800 8833 83984;83985;83986;83987;83988 106729;106730;106731;106732;106733 106730 2738 5 EESSYILESNR Unmodified 1325.6099 0.60992418 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 0 1 1 47.954 47.954 2 0.030078 42684 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.276 31.279 10307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10307000 0 0 0 9439 3433 8834 83989;83990 106734;106735 106735 2 EESTVFSQAIHYANR Unmodified 1750.8275 0.82746195 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 83.487 83.487 3 0.0010777 84319 QUIQUE_C1368_190116_001 62.287 49.795 188650000 82543000 0 106110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9440 1716 8835 83991;83992;83993 106736;106737;106738 106737 3 EETGFSTYNPQVIIR Unmodified 1752.8683 0.86826413 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 99.95 99.95 2 0.00018531 103091 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106750;106751;106752;106753;106754;106755;106756;106757;106758 106756 9 EETQEDKDCPIKEEK Unmodified 1876.836 0.8360373 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 2 1 2 13.854 13.854 3;4 0.0087082 5995 QUIQUE_C1576_190116_001 65.467 52.949 41791000 0 0 0 0 10961000 0 30830000 0 0 0 0 0 0 9444 2133 8839 84014;84015;84016 106759;106760;106761 106761 3 EETVLATVQALQTASHLSQQADLR Unmodified 2608.3457 0.34565799 1869 P04844 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.5 137.5 3 1.9628E-11 143325 QUIQUE_C1218_190116_001 85.376 70.968 433140000 52330000 0 64020000 57726000 51933000 57572000 53316000 0 51911000 0 0 44336000 0 9445 1869 8840 84017;84018;84019;84020;84021;84022;84023;84024 106762;106763;106764;106765;106766;106767;106768;106769;106770 106762 9 EETVNDFWR Unmodified 1194.5306 0.53055165 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 86.239 86.239 2 0.038361 87589 QUIQUE_C1403_190116_001 83.265 74.051 33179000 0 0 0 33179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9446 2137 8841 84025 106771 106771 0 EEVALSEYK Unmodified 1066.5183 0.51825563 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 43.072 43.072 2 0.00051281 39304 QUIQUE_C1563_190116_001 128.69 96.752 308500000 87929000 51815000 41757000 0 64246000 62754000 0 0 0 0 0 0 0 9447 2009 8842 84026;84027;84028;84029;84030 106772;106773;106774;106775;106776 106776 4 EEVASAVSSSYR Unmodified 1283.5994 0.59935949 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.89 39.89 2 0.00052122 34960 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.342 84.494 1028500000 69630000 0 128740000 0 95173000 97917000 88815000 116730000 0 51569000 107330000 89579000 183040000 9448 3889 8843 84031;84032;84033;84034;84035;84036;84037;84038;84039;84040 106777;106778;106779;106780;106781;106782;106783;106784;106785;106786;106787;106788 106783 9 EEVDQVAR Unmodified 944.45632 0.45632407 1296 J3QL56;O75880 SCO1 Protein SCO1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 18.214 18.214 2 0.035632 10434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.306 25.146 22773000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22773000 0 0 0 9449 1296 8844 84041 106789 106789 1 EEVEGESLDLCLQQLYK Unmodified 2051.9721 0.97213685 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.19 133.19 2 1.9456E-63 137327 QUIQUE_C1403_190116_001 193.73 172.5 521030000 77965000 70645000 67665000 50014000 59636000 71103000 57901000 0 30254000 0 0 0 35849000 9450 3722 8845 84042;84043;84044;84045;84046;84047;84048;84049;84050 106790;106791;106792;106793;106794;106795;106796;106797;106798 106793 6 EEVGQYLK Unmodified 964.48656 0.48656157 3360 Q6GMV3 PTRHD1 Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.284 40.284 2 0.018939 36653 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.146 57.464 426460000 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Dehydrogenase/reductase SDR family member 1 yes yes 0 0 0 1 66.34 66.34 2 0.049356 67147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.036 19.137 21500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21500000 0 0 9454 3902 8849 84064 106813 106813 1 EEVNIAR Unmodified 829.42938 0.42938104 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 1 20.408 20.408 2 0.044891 12981 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.994 34.463 170340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 170340000 0 0 0 9455 419;584 8850 84065 106814 106814 1 EEVTELLAR Unmodified 1058.5608 0.56078914 53 A0A087WVZ9;P19388;A0A087WWX0;A0A0A0MQR7 POLR2E DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 yes no 0 0 0 1 73.817 73.817 2 0.048831 74496 QUIQUE_C1218_190116_001 51.066 20.33 23486000 23486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9456 53 8851 84066 106815 106815 1 EEVVAMIGDGPCVVK Unmodified 1601.7793 0.77931447 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 97.246 97.246 2 0.0062255 100096 QUIQUE_C1368_190116_001 79.23 60.558 157830000 0 28405000 26467000 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106863 106863 0 EEWTEAIQAVADR Unmodified 1516.7158 0.71578623 4538 Q9Y243;F8VS91 AKT3 RAC-gamma serine/threonine-protein kinase yes no 0 0 0 1 120.28 120.28 2 0.0062352 124687 QUIQUE_C1218_190116_001 78.342 67.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9463 4538 8858 84106 106864 106864 1 EEWTTAIQTVADGLK Unmodified 1660.8308 0.83081599 2335 P31749 AKT1 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 142.48 142.48 2 0.0012349 145337 QUIQUE_C1563_190116_001 90.614 66.627 25833000 0 0 0 0 0 25833000 0 0 0 0 0 0 0 9464 2335 8859 84107 106865 106865 1 EEYADFKPFER Unmodified 1429.6514 0.65139506 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 72.879 72.879 3 0.035743 73724 QUIQUE_C1218_190116_001 45.257 37.892 162150000 64488000 45353000 39214000 0 0 0 0 0 0 13090000 0 0 0 9465 4252 8860 84108;84109;84110;84111 106866;106867;106868;106869 106866 3 EEYNGVIEEFLATGEK Unmodified 1826.8574 0.85742467 4169 Q9H4A4;C9JMZ3;H7C2T3 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 142.98 142.98 2;3 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106934;106935;106936;106937;106938;106939;106940;106941;106942;106943;106944;106945;106946;106947 106935 13 EFAGEDTSDLFLEER Unmodified 1756.7792 0.77917435 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.59 116.59 2 6.1047E-24 113285 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.63 136.26 244350000 54331000 0 0 47282000 0 30332000 0 46954000 23155000 42300000 0 0 0 9473 1470 8868 84171;84172;84173;84174;84175;84176 106948;106949;106950;106951;106952;106953 106953 4 EFAILHQNLK Unmodified 1211.6663 0.66625727 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 2 58.961 58.961 2;3 0.00084198 56733 QUIQUE_C1563_190116_001 110.55 81.243 796560000 101020000 98841000 114710000 46752000 104390000 102820000 67723000 0 0 45250000 47965000 31756000 35324000 9474 3899 8869 84177;84178;84179;84180;84181;84182;84183;84184;84185;84186;84187;84188;84189;84190;84191;84192;84193;84194 106954;106955;106956;106957;106958;106959;106960;106961;106962;106963;106964;106965;106966;106967;106968;106969;106970;106971;106972;106973 106963 18 EFAIPEEEAEWVGLTLEEAIEK Unmodified 2531.2319 0.23191659 519 A2IDC6;Q13084;Q4TT37 MRPL28 39S ribosomal protein L28, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 173.35 173.35 3 0.0067786 180568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.217 31.809 29810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11612000 18198000 0 9475 519 8870 84195;84196 106974;106975 106974 2 EFANFDFDVWR Unmodified 1444.6412 0.64116473 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314;H0Y4F5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 147.12 147.12 2 0.0044631 151882 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.349 52.078 10813000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10813000 0 9476 1187 8871 84197 106976 106976 1 EFANFTFPR Unmodified 1127.54 0.53999412 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.34 102.34 2 0.0017963 103724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.02 67.889 299750000 87717000 88891000 0 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1399.5496 0.54964888 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.221 50.221 2 2.3793E-10 48767 QUIQUE_C1576_190116_001 158.76 129.28 2752300000 346720000 288210000 256600000 293810000 213130000 331720000 261490000 104620000 106080000 97134000 144140000 144860000 163810000 9483 2309 8878 84231;84232;84233;84234;84235;84236;84237;84238;84239;84240;84241;84242;84243 107010;107011;107012;107013;107014;107015;107016;107017;107018;107019;107020;107021;107022;107023;107024;107025;107026;107027;107028;107029 107022 19 EFCPLYYLLNAIPTK Unmodified 1840.9433 0.94334333 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 169.73 169.73 2 0.0011601 172711 QUIQUE_C1403_190116_001 71.555 65.322 31301000 0 0 0 20817000 0 10484000 0 0 0 0 0 0 0 9484 1474 8879 84244;84245 107030;107031 107030 2 EFCPNEQNWR Unmodified 1378.5724 0.57243324 3711 Q8WW22 DNAJA4 DnaJ homolog subfamily A member 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.581 57.581 2 0.0032227 56898 QUIQUE_C1576_190116_001 91.069 76.554 185550000 0 0 22168000 33627000 25534000 0 37309000 0 0 0 32804000 34110000 0 9485 3711 8880 84246;84247;84248;84249;84250;84251 107032;107033;107034;107035;107036;107037 107035 5 EFCQQEVEPMCK Unmodified 1583.6418 0.64183471 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 53.743 53.743 2 2.2783E-20 51977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.41 159.08 1613200000 142470000 176770000 197340000 158170000 124750000 152420000 192970000 43797000 46468000 20784000 112170000 88126000 156910000 9486 1282 8881 84252;84253;84254;84255;84256;84257;84258;84259;84260;84261;84262;84263;84264;84265 107038;107039;107040;107041;107042;107043;107044;107045;107046;107047;107048;107049;107050;107051 107045 13 EFCQQEVEPMCK Oxidation (M) 1599.6367 0.63674933 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.797 38.797 2 0.00048104 35704 QUIQUE_C1218_190116_001 101.82 94.26 159810000 0 0 34238000 0 0 0 42939000 0 28530000 0 54101000 0 0 9487 1282 8881 84266;84267;84268;84269;84270;84271;84272;84273;84274 107052;107053;107054;107055;107056;107057;107058;107059;107060 107052 738 9 EFDAILINPK Unmodified 1158.6285 0.62847478 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.619 94.619 2 0.00022828 96925 QUIQUE_C1277_190116_001 124.98 103.46 4492600000 478090000 415110000 433100000 423760000 347930000 422860000 501850000 193420000 189270000 215970000 282920000 234790000 353490000 9488 4567 8882 84275;84276;84277;84278;84279;84280;84281;84282;84283;84284;84285;84286;84287 107061;107062;107063;107064;107065;107066;107067;107068;107069;107070;107071;107072;107073;107074;107075;107076;107077;107078 107063 18 EFDEDLEDKTENDK Unmodified 1725.7217 0.72171905 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 44.626 44.626 2;3 9.4517E-46 41258 QUIQUE_C1277_190116_001 211.37 186.53 875990000 223780000 166010000 74334000 128090000 62958000 80834000 139990000 0 0 0 0 0 0 9489 419 8883 84288;84289;84290;84291;84292;84293;84294;84295;84296;84297;84298;84299;84300 107079;107080;107081;107082;107083;107084;107085;107086;107087;107088;107089;107090;107091 107081 8 EFDEDLEDKTENDKIR Unmodified 1994.9069 0.90689406 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 50.488 50.488 2;3;4 1.1057E-34 48205 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.86 180.09 1960000000 38050000 43318000 213510000 0 255460000 19680000 31163000 162720000 202340000 64088000 0 34755000 894920000 9490 419 8884 84301;84302;84303;84304;84305;84306;84307;84308;84309;84310;84311;84312;84313;84314;84315;84316 107092;107093;107094;107095;107096;107097;107098;107099;107100;107101;107102;107103;107104;107105;107106;107107;107108;107109 107104 16 EFDEDSEDR Unmodified 1140.4207 0.42072643 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.97 21.97 2 0.025503 14813 QUIQUE_C1403_190116_001 103.56 93.149 657190000 110240000 0 175340000 112430000 92587000 0 119720000 0 0 0 0 46874000 0 9491 4432 8885 84317;84318;84319;84320;84321;84322 107110;107111;107112;107113;107114;107115 107112 5 EFDEDSEDRLVNEK Unmodified 1723.7537 0.75368788 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 52.213 52.213 2;3 1.3646E-67 49782 QUIQUE_DMIX8_190116_001 205.12 171.23 171010000 34002000 0 0 0 0 0 0 61386000 0 0 75622000 0 0 9492 4432 8886 84323;84324;84325;84326 107116;107117;107118;107119 107119 4 EFDELNPSAQR Unmodified 1304.5997 0.59969384 2112 P16615;H7C5W9 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 58.164 58.164 2 0.00045128 56521 QUIQUE_C1403_190116_001 102.55 78.525 92836000 0 0 0 44058000 0 0 0 48777000 0 0 0 0 0 9493 2112 8887 84327;84328 107120;107121;107122 107120 3 EFDFAAAYSYLDTAK Unmodified 1710.7777 0.77771779 2937 Q0VDG4 SCRN3 Secernin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.28 147.28 2 1.4559E-05 152131 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.66 85.225 226820000 0 0 0 0 34526000 29538000 48660000 32822000 0 0 0 40463000 40813000 9494 2937 8888 84329;84330;84331;84332;84333;84334 107123;107124;107125;107126;107127;107128 107128 4 EFDFFNK Unmodified 945.42323 0.42323303 2448 P42356;Q8N8J0;A8MTF1 PI4KA;PI4KAP1 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha;Putative inactive phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P1 yes no 0 0 0 1 1 1 95.607 95.607 2 0.046099 99113 QUIQUE_C1218_190116_001 77.944 68.999 45664000 16256000 16516000 12892000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9495 2448 8889 84335;84336;84337 107129;107130;107131 107129 3 EFDGIGAVSGGGATSR Unmodified 1479.6954 0.69538514 2649 P54803;A0A087WX10;G3V5E8;G3V4M2 GALC Galactocerebrosidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.873 65.873 2 3.8865E-05 65629 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.431 57.827 321160000 0 75438000 97180000 0 0 0 0 54081000 43889000 0 50574000 0 0 9496 2649 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0.39774656 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 30.451 30.451 2 0.060724 25376 QUIQUE_C1368_190116_001 69.176 32.082 545040000 0 0 545040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9499 4128 8893 84355 107150 107150 1 EFDSLHWFQSVR Unmodified 1549.7314 0.73137672 118 A0A087X256;Q2M389 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.35 113.35 3 0.00042109 116938 QUIQUE_C1403_190116_001 67.456 62.813 191400000 11673000 16874000 13339000 14557000 19252000 12033000 14395000 12402000 18980000 0 22302000 14058000 21537000 9500 118 8894 84356;84357;84358;84359;84360;84361;84362;84363;84364;84365;84366;84367 107151;107152;107153;107154;107155;107156;107157;107158;107159;107160;107161;107162;107163;107164;107165;107166;107167 107157 17 EFDSPETADLK Unmodified 1250.5667 0.56666238 3641 Q8NDN9 RCBTB1 RCC1 and BTB domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 55.971 55.971 2 0.036981 55346 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.602 24.646 15981000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15981000 0 0 9501 3641 8895 84368 107168 107168 1 EFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLR Unmodified 3272.5401 0.54011986 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 169.89 169.89 2;3 1.5639E-126 177253 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.29 182.39 1172200000 0 43032000 0 0 0 89170000 173960000 106000000 193650000 0 262350000 205400000 98581000 9502 2613 8896 84369;84370;84371;84372;84373;84374;84375;84376;84377 107169;107170;107171;107172;107173;107174;107175;107176;107177 107174 9 EFEEDLTGIDDR Unmodified 1437.626 0.62596817 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.25 88.25 2 0.00050608 91250 QUIQUE_C1218_190116_001 125.75 114.6 1093100000 152280000 123410000 189470000 71839000 84517000 101490000 0 27694000 0 92729000 134380000 0 115280000 9503 1961 8897 84378;84379;84380;84381;84382;84383;84384;84385;84386;84387;84388;84389 107178;107179;107180;107181;107182;107183;107184;107185;107186;107187;107188;107189;107190;107191;107192 107178 14 EFEEDLTGIDDRK Unmodified 1565.7209 0.72093119 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 66.47 66.47 2;3 2.6069E-53 66227 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.5 179.72 1488200000 25459000 113050000 171220000 0 42336000 0 27690000 142900000 239960000 36657000 204260000 220670000 263950000 9504 1961 8898 84390;84391;84392;84393;84394;84395;84396;84397;84398;84399;84400;84401;84402;84403;84404;84405;84406;84407 107193;107194;107195;107196;107197;107198;107199;107200;107201;107202;107203;107204;107205;107206;107207;107208;107209;107210;107211;107212;107213 107205 21 EFEETMDALQADIDQLEAEK Unmodified 2324.0366 0.036587605 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 2 2 1 1 2 3 2 1 1 164.33 164.33 2;3 8.9008E-65 169302 QUIQUE_C1218_190116_001 178.67 166.61 279420000 48899000 49947000 23959000 25879000 56330000 29084000 37746000 0 0 7575400 0 0 0 9505 890;3052 8899 84408;84409;84410;84411;84412;84413;84414;84415;84416;84417;84418;84419;84420;84421;84422 107214;107215;107216;107217;107218;107219;107220;107221;107222;107223;107224;107225;107226;107227;107228 107215 14 EFEETMDALQADIDQLEAEKAELK Unmodified 2765.2953 0.29532149 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 156.14 156.14 3 4.6807E-13 163565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.21 98.216 255590000 0 0 0 0 0 0 0 85337000 0 0 170250000 0 0 9506 890;3052 8900 84423;84424 107229;107230;107231 107231 2 EFEGEEEYLEILGITR Unmodified 1925.9258 0.92583859 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 1 2 3 1 3 1 2 159.84 159.84 2;3 7.7934E-112 167077 QUIQUE_DMIX5_190116_001 277.06 252.21 4497500000 316480000 354320000 503000000 338800000 614300000 276910000 422200000 255060000 350410000 94087000 448270000 259880000 263840000 9507 1175 8901 84425;84426;84427;84428;84429;84430;84431;84432;84433;84434;84435;84436;84437;84438;84439;84440;84441;84442;84443;84444;84445;84446;84447;84448;84449;84450;84451 107232;107233;107234;107235;107236;107237;107238;107239;107240;107241;107242;107243;107244;107245;107246;107247;107248;107249;107250;107251;107252;107253;107254;107255;107256;107257;107258;107259;107260;107261;107262 107256 29 EFENLYIENLELR Unmodified 1680.8359 0.83590137 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.6 135.6 2 8.0454E-05 139661 QUIQUE_C1403_190116_001 137.17 102.28 780060000 86803000 83786000 82122000 68883000 76966000 70850000 0 0 40117000 36838000 114340000 51666000 67691000 9508 498 8902 84452;84453;84454;84455;84456;84457;84458;84459;84460;84461;84462 107263;107264;107265;107266;107267;107268;107269;107270;107271;107272;107273;107274;107275 107266 13 EFENLYIENLELRR Unmodified 1836.937 0.9370124 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 111.38 111.38 3 6.0675E-05 114210 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.498 70.833 266650000 0 0 0 0 0 0 0 57134000 47699000 0 48262000 70558000 42992000 9509 498 8903 84463;84464;84465;84466;84467 107276;107277;107278;107279;107280 107276 5 EFEPLLNWMK Oxidation (M) 1321.6377 0.63765925 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 118.34 118.34 2 0.00019478 123843 QUIQUE_C1218_190116_001 122.74 105.35 291680000 32443000 0 29429000 0 30587000 31486000 26540000 16804000 26754000 46273000 0 30511000 20853000 9510 2079 8904 84468;84469;84470;84471;84472;84473;84474;84475;84476;84477;84478 107281;107282;107283;107284;107285;107286;107287;107288;107289;107290;107291 107281 1404 11 EFEPLLNWMK Unmodified 1305.6427 0.64274463 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.11 142.11 2 1.7565E-05 145329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.34 109.78 3012600000 283580000 354420000 279110000 368140000 237480000 255530000 316190000 107430000 169240000 85708000 192430000 160310000 203100000 9511 2079 8904 84479;84480;84481;84482;84483;84484;84485;84486;84487;84488;84489;84490;84491 107292;107293;107294;107295;107296;107297;107298;107299;107300;107301;107302;107303;107304;107305;107306;107307;107308;107309;107310;107311;107312;107313;107314;107315;107316;107317 107309 26 EFESAIVEAAR Unmodified 1220.6037 0.60371659 3098 Q15020;F8VV04;F8W667;F8VVK9;F8VZM2 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 74.848 74.848 2 0.0038393 71576 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.15 48.702 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9512 3098 8905 84492;84493;84494 107318;107319;107320 107319 3 EFESVLVDAFSHVAR Unmodified 1704.8471 0.84713476 4255 Q9NQG5 RPRD1B Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 137.83 137.83 2;3 4.1011E-06 143619 QUIQUE_C1218_190116_001 95.981 86.931 873500000 61819000 58212000 76564000 46816000 52646000 126130000 63567000 40940000 68088000 13604000 129360000 70198000 65559000 9513 4255 8906 84495;84496;84497;84498;84499;84500;84501;84502;84503;84504;84505;84506;84507;84508;84509 107321;107322;107323;107324;107325;107326;107327;107328;107329;107330;107331;107332;107333;107334;107335;107336;107337 107321 16 EFEVYGPIK Unmodified 1080.5492 0.54916182 1950 P08621;M0QYR1 SNRNP70 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 78.165 78.165 2 0.0089716 74777 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.282 37.014 95633000 45231000 0 0 27998000 0 0 0 0 0 22404000 0 0 0 9514 1950 8907 84510;84511;84512 107338;107339;107340 107340 3 EFEVYGPIKR Unmodified 1236.6503 0.65027285 1950 P08621;M0QYR1 SNRNP70 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa yes no 0 0 1 1 1 1 55.601 55.601 3 0.017823 54467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 25.611 133370000 0 0 0 0 0 0 0 35462000 0 0 60154000 0 37757000 9515 1950 8908 84513;84514;84515 107341;107342;107343;107344 107343 4 EFEWNLK Unmodified 964.46543 0.46543219 4075 Q9BYJ9 YTHDF1 YTH domain-containing family protein 1 yes yes 0 0 0 1 83.597 83.597 2 0.063196 85382 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.889 18.83 18978000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18978000 9516 4075 8909 84516 107345 107345 1 EFFDSLNEAIMR Unmodified 1470.6813 0.68131498 2457 P43003;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.16 135.16 2 1.5134E-09 137944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.28 112.23 1068600000 124560000 91138000 176260000 137720000 0 76167000 67960000 80743000 88550000 42300000 80554000 45672000 57021000 9517 2457 8910 84517;84518;84519;84520;84521;84522;84523;84524;84525;84526;84527;84528 107346;107347;107348;107349;107350;107351;107352;107353;107354;107355;107356;107357;107358 107352 13 EFFDSLNEAIMR Oxidation (M) 1486.6762 0.67622961 2457 P43003;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 1 0 1 1 121.6 121.6 2 0.025709 125461 QUIQUE_C1403_190116_001 65.719 44.721 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9518 2457 8910 84529;84530 107359;107360 107359 2 EFFEIMPNYAK Unmodified 1387.6482 0.64822394 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.1 117.1 2 0.0014505 120553 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.615 74.834 305520000 27377000 31852000 0 22220000 26327000 24835000 42529000 30109000 0 0 36295000 33952000 30021000 9519 739 8911 84531;84532;84533;84534;84535;84536;84537;84538;84539;84540;84541 107361;107362;107363;107364;107365;107366;107367;107368;107369;107370;107371 107370 9 EFFLELTMGR Oxidation (M) 1257.6064 0.60635913 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 1 0 1 1 120.73 120.73 2 0.013366 117941 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.563 46.938 37681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19162000 0 0 18519000 9520 292;882;3442 8912 84542;84543 107372;107373;107374 107373 221 3 EFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVK Oxidation (M) 3894.8397 0.83973228 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 172.33 172.33 3 4.8921E-39 176525 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.492 90.546 252340000 0 13807000 0 0 0 0 27521000 31458000 32934000 0 44288000 102340000 0 9521 2087 8913 84544;84545;84546;84547;84548;84549 107375;107376;107377;107378;107379;107380 107378 1427 6 EFFPNHQWVK Unmodified 1330.6459 0.64585618 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 65.661 65.661 3 0.024742 64902 QUIQUE_C1403_190116_001 38.754 29.542 17766000 0 0 0 17766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9522 2133 8914 84550 107381 107381 1 EFFSQGDLEK Unmodified 1198.5506 0.55061839 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.133 71.133 2 0.00069041 72146 QUIQUE_C1438_190116_001 107.69 64.779 611670000 0 96400000 95252000 78638000 73054000 59334000 89357000 50316000 0 0 0 69321000 0 9523 1402 8915 84551;84552;84553;84554;84555;84556;84557;84558 107382;107383;107384;107385;107386;107387;107388;107389;107390 107386 4 EFFSQYGDVMDVFIPK Unmodified 1920.8968 0.89678707 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A0A0N0M3;K7EN94;A0A1W2PNU8;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3;A0A087WYE7;A0A087WZC9;A0A087WZM1 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 164.15 164.15 2 0.001801 169495 QUIQUE_C1368_190116_001 62.088 44.422 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9524 2968 8916 84559 107391 107391 1 EFFSTIVVDAIDVLK Unmodified 1694.9131 0.91308906 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 173.25 173.25 2 0.0001139 180336 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.403 71.136 27452000 0 0 0 0 0 0 6782700 0 0 0 20669000 0 0 9525 2813 8917 84560;84561 107392;107393;107394;107395 107394 4 EFFVGLSK Unmodified 925.49092 0.49091866 1684;1762 O94760;B4DYP1;O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH1;DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1;N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 no no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 3 2 1 81.918 81.918 1;2 0.0064801 83705 QUIQUE_C1576_190116_001 101.6 38.622 40683000000 2757500000 3059100000 3522100000 2671200000 2592200000 2863400000 2389200000 3642100000 4151100000 1230800000 4634500000 3669900000 3499400000 9526 1684;1762 8918 84562;84563;84564;84565;84566;84567;84568;84569;84570;84571;84572;84573;84574;84575;84576;84577;84578;84579;84580;84581;84582;84583 107396;107397;107398;107399;107400;107401;107402;107403;107404;107405;107406;107407;107408;107409;107410;107411;107412;107413;107414;107415;107416;107417;107418;107419;107420;107421;107422;107423;107424;107425;107426;107427;107428;107429 107410 26 EFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQER Unmodified 2814.4262 0.4262165 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 173.71 173.71 3 1.0515E-08 175128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.217 60.023 64780000 0 0 0 0 16505000 0 0 21981000 26295000 0 0 0 0 9527 1644 8919 84584;84585;84586;84587 107430;107431;107432;107433 107431 4 EFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQER Oxidation (M) 2830.4211 0.42113112 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 1 0 1 170.49 170.49 3 7.1837E-06 172270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.051 41.731 20827000 0 0 0 0 0 0 0 20827000 0 0 0 0 0 9528 1644 8919 84588 107434 107434 886 1 EFGATECINPQDFSK Unmodified 1741.7618 0.76175015 2028 P11766;H0YAG8 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.337 92.337 2 4.7797E-54 95758 QUIQUE_C1218_190116_001 192.6 167.21 1517400000 293330000 216900000 253410000 240880000 158670000 246810000 0 0 0 107400000 0 0 0 9529 2028 8920 84589;84590;84591;84592;84593;84594;84595 107435;107436;107437;107438;107439;107440;107441;107442;107443;107444;107445;107446;107447 107437 11 EFGDKVNLLSVLEAAK Unmodified 1731.9407 0.94070079 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 137.28 137.28 3 6.3496E-05 143774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.151 64.459 159950000 0 0 0 0 0 0 0 32646000 23723000 0 29183000 33993000 40402000 9530 4006 8921 84596;84597;84598;84599;84600 107448;107449;107450;107451;107452;107453 107451 5 EFGDSLSLEILQIIK Unmodified 1703.9346 0.93455278 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.54 169.54 2 1.2101E-05 174312 QUIQUE_C1218_190116_001 99.522 74.136 85754000 18146000 12842000 0 8686400 16870000 0 0 11890000 17319000 0 0 0 0 9531 4428 8922 84601;84602;84603;84604;84605;84606 107454;107455;107456;107457;107458;107459;107460 107454 7 EFGEEALNSLQK Unmodified 1363.662 0.66195975 1232 H7C386;Q9BW91;D6RAW2 NUDT9 ADP-ribose pyrophosphatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 85.643 85.643 2 0.022154 87281 QUIQUE_C1277_190116_001 80.896 62.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9532 1232 8923 84607 107461 107461 1 EFGFSGLNVK Unmodified 1096.5553 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107508;107509;107510;107511;107512;107513;107514;107515;107516;107517;107518;107519;107520;107521;107522;107523 107512 117 15 EFGIDPQNMFEFWDWVGGR Unmodified 2329.0262 0.026238111 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 175.03 175.03 2 0.0003893 178641 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.013 55.818 193810000 0 0 0 0 0 0 0 0 37728000 0 100470000 55606000 0 + 9540 199;790 8929 84663;84664;84665 107524;107525;107526;107527 107527 3 EFGNLTR Unmodified 835.41882 0.41881635 1462 O14949 UQCRQ Cytochrome b-c1 complex subunit 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.359 33.359 2 0.042242 28670 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.297 57.324 476740000 0 0 0 0 93088000 0 93960000 0 0 0 171320000 118370000 0 9541 1462 8930 84666;84667;84668;84669 107528;107529;107530;107531 107531 4 EFGPVVIDYGK Unmodified 1222.6234 0.6233894 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.08 93.08 2 0.00124 94483 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1 1 1 2 1 1 1 78.101 78.101 3;4 1.6449E-05 79890 QUIQUE_C1438_190116_001 67.928 62.4 756070000 104660000 138360000 44838000 74889000 54446000 52358000 60707000 0 35830000 42227000 59143000 35711000 52899000 9544 1050 8933 84692;84693;84694;84695;84696;84697;84698;84699;84700;84701;84702;84703;84704;84705;84706 107562;107563;107564;107565;107566;107567;107568;107569;107570;107571;107572;107573;107574;107575;107576;107577 107569 15 EFGTNIK Unmodified 807.41267 0.41266834 2079 P14625;Q58FF3 HSP90B1;HSP90B2P Endoplasmin;Putative endoplasmin-like protein yes no 0 0 0 1 26.145 26.145 2 0.050616 20268 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.439 33.753 261680000 0 0 0 0 0 0 0 0 261680000 0 0 0 0 9545 2079 8934 84707 107578 107578 1 EFGVSPDK Unmodified 877.41815 0.41814765 2254 P26640;A0A140T936;H0Y426 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 28.594 28.594 2 0.040092 23594 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.478 36.291 113110000 0 0 0 0 0 0 0 51349000 0 0 61765000 0 0 9546 2254 8935 84708;84709 107579;107580 107579 2 EFHGLGDCIIK Unmodified 1287.6282 0.6281572 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 66.369 66.369 2;3 5.4916E-24 67374 QUIQUE_C1218_190116_001 206.78 154.07 3165100000 253870000 213920000 277020000 0 149840000 238940000 206130000 532480000 313010000 0 402400000 277660000 299850000 9547 2038 8936 84710;84711;84712;84713;84714;84715;84716;84717;84718;84719;84720;84721;84722 107581;107582;107583;107584;107585;107586;107587;107588;107589;107590;107591;107592;107593 107581 12 EFHGNIIK Unmodified 956.50797 0.50796571 19 A0A075B7D9;Q92804 TAF15 TATA-binding protein-associated factor 2N yes no 0 0 0 1 1 20.634 20.634 2 0.014995 13321 QUIQUE_C1277_190116_001 85.265 58.144 196850000 0 110430000 0 0 0 86418000 0 0 0 0 0 0 0 9548 19 8937 84723;84724 107594;107595 107594 2 EFHLNESGDPSSK Unmodified 1445.6423 0.64228694 221 A0A0C4DFV9;Q01105;A0A087X027;P0DME0 SET;SETSIP Protein SET;Protein SETSIP yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 30.803 30.803 2;3 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107619;107620;107621;107622;107623;107624;107625;107626;107627;107628;107629;107630;107631;107632;107633;107634;107635 107624 14 EFHTTGLAWSK Unmodified 1275.6248 0.62478638 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0S3;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 54.9 54.9 2;3 2.3681E-24 53133 QUIQUE_C1576_190116_001 182.76 151 6612800000 568300000 474870000 735100000 768290000 604870000 332240000 548540000 510850000 311580000 331890000 547750000 542750000 335810000 9551 2857;3307 8940 84759;84760;84761;84762;84763;84764;84765;84766;84767;84768;84769;84770;84771;84772;84773;84774;84775;84776;84777;84778;84779;84780;84781;84782 107636;107637;107638;107639;107640;107641;107642;107643;107644;107645;107646;107647;107648;107649;107650;107651;107652;107653;107654;107655;107656;107657;107658;107659;107660;107661;107662;107663;107664;107665;107666;107667;107668;107669;107670;107671 107656 35 EFIANHPDYK Unmodified 1232.5826 0.58258722 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 30.378 30.378 2 0.00021266 25779 QUIQUE_C1218_190116_001 136.21 114.74 241750000 70162000 0 46922000 74394000 50273000 0 0 0 0 0 0 0 0 9552 438;2509 8941 84783;84784;84785;84786 107672;107673;107674;107675 107672 4 EFIATTPSITTETISTTMENSLK Unmodified 2514.2411 0.24110107 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 2 143.95 143.95 2;3 7.7303E-14 149298 QUIQUE_C1368_190116_001 137.52 119.97 718380000 0 101850000 36924000 87765000 31549000 37846000 76906000 91210000 77859000 22577000 33843000 29256000 90795000 9553 1230;4172;346 8942 84787;84788;84789;84790;84791;84792;84793;84794;84795;84796;84797;84798;84799;84800;84801;84802;84803;84804 107676;107677;107678;107679;107680;107681;107682;107683;107684;107685;107686;107687;107688;107689;107690;107691;107692;107693;107694;107695;107696;107697 107679 22 EFICALSVTSR Unmodified 1281.6387 0.63872189 4498 Q9UM19 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.901 86.901 2 0.0018527 88604 QUIQUE_C1403_190116_001 81.972 61.642 918470000 0 175810000 171810000 115110000 143150000 0 0 55504000 117430000 0 0 0 139660000 9554 4498 8943 84805;84806;84807;84808;84809;84810;84811 107698;107699;107700;107701;107702;107703;107704;107705;107706 107702 5 EFIDQYYSSIK Unmodified 1391.6609 0.66089712 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 98.497 98.497 2 0.043489 101883 QUIQUE_C1368_190116_001 63.184 43.194 113940000 0 0 113940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9555 699 8944 84812 107707 107707 0 EFIEFLK Unmodified 924.49567 0.49566969 915 E9PFK9;Q9UJ41 RABGEF1 Rab5 GDP/GTP exchange factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.62 103.62 2 0.024917 107847 QUIQUE_C1218_190116_001 97.068 76.083 217690000 17864000 23826000 0 17687000 0 0 26486000 23804000 19261000 9607100 22423000 27801000 28936000 9556 915 8945 84813;84814;84815;84816;84817;84818;84819;84820;84821;84822 107708;107709;107710;107711;107712;107713;107714;107715;107716;107717 107708 10 EFIEGVSQFSVK Unmodified 1368.6925 0.6925316 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.458 98.458 2 0.00027497 102391 QUIQUE_C1218_190116_001 119.22 88.426 1366100000 264990000 190410000 157350000 159130000 154250000 178550000 131820000 0 0 80514000 49125000 0 0 9557 801 8946 84823;84824;84825;84826;84827;84828;84829;84830;84831 107718;107719;107720;107721;107722;107723;107724;107725;107726;107727;107728;107729;107730;107731 107718 13 EFIEKYDK Unmodified 1070.5284 0.52842638 1936;845 E5RK69;H0YC77;P08133;E7EMC6;E5RFF0 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 2 27.115 27.115 2;3 0.023767 21485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.61 88.339 182480000 0 0 0 0 0 0 0 182480000 0 0 0 0 0 9558 845;1936 8947 84832;84833 107732;107733;107734 107733 3 EFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQR Oxidation (M) 3508.5763 0.57626415 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171 171 3 8.0429E-88 178311 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.72 157.94 714200000 27438000 56612000 0 0 25705000 22654000 76166000 27082000 43151000 0 161520000 207470000 66396000 9559 269;2893 8948 84834;84835;84836;84837;84838;84839;84840;84841;84842;84843 107735;107736;107737;107738;107739;107740;107741;107742;107743;107744 107742 188 10 EFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQR Unmodified 3492.5813 0.58134953 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 172.39 172.39 3 7.9459E-20 179653 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.534 65.52 156350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 111530000 0 44826000 9560 269;2893 8948 84844;84845 107745;107746 107745 2 EFIGSFLEMFGPEGALK Unmodified 1870.9175 0.91752251 717 C9JEJ2;P49585 PCYT1A Choline-phosphate cytidylyltransferase A yes no 0 0 0 1 1 1 168.94 168.94 2 4.7919E-07 173707 QUIQUE_C1218_190116_001 108.72 86.242 166730000 31367000 0 0 0 0 0 0 0 73409000 0 0 61957000 0 9561 717 8949 84846;84847;84848 107747;107748;107749 107747 2 EFIHILYFR Unmodified 1236.6655 0.66552898 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 110.81 110.81 2;3 0.0035605 115978 QUIQUE_C1218_190116_001 58.596 43.917 433200000 19187000 32147000 37493000 31925000 42671000 25285000 53222000 33104000 32096000 14718000 38546000 38136000 34666000 9562 4337 8950 84849;84850;84851;84852;84853;84854;84855;84856;84857;84858;84859;84860;84861;84862;84863;84864;84865 107750;107751;107752;107753;107754;107755;107756;107757;107758;107759;107760;107761;107762;107763;107764;107765;107766;107767 107751 17 EFILCCLAR Unmodified 1180.5733 0.57328486 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.95 106.95 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107819;107820;107821;107822;107823;107824;107825;107826;107827;107828;107829;107830;107831;107832;107833;107834;107835 107831 17 EFLLIFHK Unmodified 1045.5961 0.59605244 4036 Q9BUP0;A0A087X1Z2;C9JTV4;Q8WYH2 EFHD1;PP1187 EF-hand domain-containing protein D1 yes no 0 0 0 1 95.673 95.673 2 0.036561 96875 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.717 18.903 31076000 0 0 0 0 0 0 0 31076000 0 0 0 0 0 9582 4036 8970 84931 107836 107836 1 EFLLIFR Unmodified 936.54329 0.54328858 3815 Q96C19;H0Y4Y4 EFHD2 EF-hand domain-containing protein D2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.4 132.4 2 0.00011419 138469 QUIQUE_C1438_190116_001 172.15 121.84 712390000 69847000 57037000 61063000 53233000 60629000 37759000 55315000 39692000 55988000 0 88023000 72389000 61416000 9583 3815 8971 84932;84933;84934;84935;84936;84937;84938;84939;84940;84941;84942;84943 107837;107838;107839;107840;107841;107842;107843;107844;107845;107846;107847;107848 107841 12 EFLNEENK Unmodified 1021.4716 0.47163978 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.297 28.297 2 0.019173 22266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.77 29.18 197080000 40559000 37603000 0 0 0 0 33073000 0 0 21333000 37818000 26697000 0 9584 3921 8972 84944;84945;84946;84947;84948;84949 107849;107850;107851;107852;107853;107854 107852 6 EFLNVLALTFEDFK Unmodified 1684.8712 0.87122424 728 C9JJN9;Q8N3P4;H7C058 VPS8 Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 170.27 170.27 2 0.00029441 175083 QUIQUE_C1368_190116_001 105.46 88.828 81532000 16165000 9171900 15966000 0 11358000 0 15902000 0 0 0 0 0 12970000 9585 728 8973 84950;84951;84952;84953;84954;84955 107855;107856;107857;107858;107859;107860 107857 6 EFLPEGQDIGAFVAEQK Unmodified 1876.9207 0.92069363 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C0V6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.84 127.84 2;3 4.3558E-07 131763 QUIQUE_C1277_190116_001 137.84 125.57 827710000 74070000 77167000 76846000 64698000 0 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Serotransferrin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 57.806 57.806 2;3 0.0004366 56337 QUIQUE_C1403_190116_001 71.555 59.689 3171200000 207430000 259980000 293540000 322890000 846860000 254000000 190950000 0 161950000 46313000 235010000 210230000 142040000 9620 1838 9008 85241;85242;85243;85244;85245;85246;85247;85248;85249;85250;85251;85252;85253;85254;85255;85256;85257;85258;85259;85260;85261;85262;85263;85264 108241;108242;108243;108244;108245;108246;108247;108248;108249;108250;108251;108252;108253;108254;108255;108256;108257;108258;108259;108260;108261;108262;108263;108264;108265;108266;108267;108268;108269;108270;108271;108272 108249 26 EFQLGESVK Unmodified 1035.5237 0.52367535 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 54.097 54.097 2 0.042881 50709 QUIQUE_C1563_190116_001 52.716 4.2124 442340000 0 0 0 0 0 319300000 0 0 0 123030000 0 0 0 9621 3063 9009 85265;85266 108273;108274 108273 2 EFQLPTTTFIGGSENTLSLR Unmodified 2210.1219 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Unmodified 912.43413 0.43413207 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.223 88.223 2 0.019775 90174 QUIQUE_C1368_190116_001 120.9 22.483 2011200000 286970000 258910000 240770000 169000000 198070000 179830000 198740000 26922000 56558000 125400000 94237000 71993000 103810000 9630 1245 9017 85315;85316;85317;85318;85319;85320;85321;85322;85323;85324;85325;85326;85327 108328;108329;108330;108331;108332;108333;108334;108335;108336;108337;108338;108339;108340;108341;108342;108343;108344;108345;108346;108347;108348;108349;108350 108333 23 EFSDIFRR Unmodified 1068.5352 0.53524309 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 65.612 65.612 3 0.0033932 65603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.923 45.568 92294000 0 0 0 0 0 0 0 21581000 14674000 0 19344000 15577000 21120000 9631 1245 9018 85328;85329;85330;85331;85332 108351;108352;108353;108354;108355;108356 108351 5 EFSFLDILR Unmodified 1138.6023 0.60226003 3669 Q8TC07 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.38 157.38 2 0.0052265 162072 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.181 68.49 263470000 0 24783000 26181000 20094000 27869000 20334000 26635000 18306000 24314000 15446000 19483000 21587000 18443000 9632 3669 9019 85333;85334;85335;85336;85337;85338;85339;85340;85341;85342;85343;85344 108357;108358;108359;108360;108361;108362;108363;108364;108365;108366;108367;108368;108369;108370 108370 14 EFSGNPIK Unmodified 890.44978 0.44978213 1188 H3BPE7;P35637 FUS RNA-binding protein FUS yes no 0 0 0 1 1 1 1 30.122 30.122 2 0.028279 24079 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.915 46.293 633070000 189810000 197780000 0 0 186330000 0 0 0 0 59157000 0 0 0 9633 1188 9020 85345;85346;85347;85348 108371;108372;108373;108374 108374 4 EFSGYVESGLK Unmodified 1214.5819 0.58191851 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.056 68.056 2 0.0014915 67482 QUIQUE_C1368_190116_001 84.213 65.433 2238300000 215500000 190820000 165230000 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ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.299 89.299 2 0.00029303 90726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.86 96.59 778720000 56952000 0 105590000 111260000 68618000 87886000 85869000 91476000 94200000 0 0 76871000 0 9636 2714 9023 85373;85374;85375;85376;85377;85378;85379;85380;85381 108409;108410;108411;108412;108413;108414;108415;108416;108417;108418;108419 108417 10 EFSITDLVPYSITLR Unmodified 1752.9298 0.92980175 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.56 163.56 2 1.3634E-12 167444 QUIQUE_C1277_190116_001 158.4 142.51 1539800000 40698000 105710000 77001000 47066000 131760000 0 133460000 159720000 138680000 16452000 165140000 173860000 350290000 9637 1748 9024 85382;85383;85384;85385;85386;85387;85388;85389;85390;85391;85392;85393;85394 108420;108421;108422;108423;108424;108425;108426;108427;108428;108429;108430;108431;108432 108421 12 EFSITDVVPYPISLR Unmodified 1734.9192 0.91923707 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 155.55 155.55 2;3 4.3474E-28 159663 QUIQUE_C1277_190116_001 164.04 148.84 6892300000 496430000 499180000 489490000 810760000 644780000 353660000 562140000 468330000 536370000 202200000 619390000 494390000 715240000 9638 2363 9025 85395;85396;85397;85398;85399;85400;85401;85402;85403;85404;85405;85406;85407;85408;85409 108433;108434;108435;108436;108437;108438;108439;108440;108441;108442;108443;108444;108445;108446;108447;108448 108434 14 EFSIYMTK Unmodified 1017.4841 0.48411873 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 73.894 73.894 1;2 1.2363E-05 75025 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.03 155.75 5374700000 534330000 602930000 445510000 399570000 450340000 332650000 73582000 458770000 413740000 0 710200000 567120000 385950000 9639 1788 9026 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159.54 2 0.00021046 166517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.011 83.07 553040000 0 86692000 0 49486000 68065000 0 91446000 56719000 90037000 0 110590000 0 0 9644 2474 9030 85446;85447;85448;85449;85450;85451;85452 108496;108497;108498;108499;108500;108501;108502 108502 7 EFSQSFDAAMK Unmodified 1259.5492 0.54923818 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.17 20.17 2 0.010792 13040 QUIQUE_C1438_190116_001 61.962 46.714 335540000 157760000 0 0 42039000 81032000 0 0 0 0 0 54707000 0 0 9645 4622 9031 85453;85454;85455;85456;85457 108503;108504;108505;108506;108507 108506 5 EFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSR Unmodified 3658.7216 0.72160648 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 3 165.56 165.56 4 1.4453E-06 172121 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.566 46.805 239100000 0 0 0 0 0 0 64709000 0 0 0 174390000 0 0 9646 180;3738 9032 85458;85459;85460;85461;85462 108508;108509;108510;108511;108512 108510 4 EFTAQNLGK Unmodified 1006.5084 0.50835964 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.615 35.615 2 0.0022266 30715 QUIQUE_C1403_190116_001 95.541 58.382 476440000 66101000 0 84174000 59465000 0 66740000 74762000 0 0 37182000 0 88012000 0 9647 600 9033 85463;85464;85465;85466;85467;85468;85469 108513;108514;108515;108516;108517;108518;108519;108520;108521 108517 9 EFTEAVEAK Unmodified 1022.492 0.49204087 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.449 31.449 2 0.0068412 26195 QUIQUE_C1563_190116_001 83.265 57.528 4918900000 420260000 397770000 438200000 465250000 351060000 409890000 469690000 0 400820000 180970000 465120000 382940000 536940000 9648 2370 9034 85470;85471;85472;85473;85474;85475;85476;85477;85478;85479;85480;85481 108522;108523;108524;108525;108526;108527;108528;108529;108530;108531;108532;108533 108527 7 EFTEREQGEVR Unmodified 1378.6477 0.64770667 1976 P09936;D6RE83 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 19.027 19.027 2 7.9063E-12 12068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.09 124.49 382080000 0 0 0 0 0 0 0 250190000 53669000 0 0 78224000 0 9649 1976 9035 85482;85483;85484 108534;108535;108536 108534 3 EFTESQLQEGK Unmodified 1294.6041 0.60411052 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 40.387 40.387 2 5.7564E-08 36237 QUIQUE_C1403_190116_001 149.72 114.43 2573800000 0 963660000 0 308060000 952270000 349800000 0 0 0 0 0 0 0 9650 2864 9036 85485;85486;85487;85488;85489;85490;85491 108537;108538;108539;108540;108541;108542;108543;108544;108545 108539 9 EFTGSQNSIFPVFDNLLLLDR Unmodified 2424.2325 0.23252572 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;F5H2X5 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 170.79 170.79 2;3 6.0045E-53 178033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.34 130.37 580570000 46021000 65505000 0 32776000 70606000 65354000 26173000 49292000 54702000 16058000 46236000 44849000 62996000 9651 462 9037 85492;85493;85494;85495;85496;85497;85498;85499;85500;85501;85502;85503;85504;85505;85506;85507;85508;85509;85510;85511;85512;85513;85514 108546;108547;108548;108549;108550;108551;108552;108553;108554;108555;108556;108557;108558;108559;108560;108561;108562;108563;108564;108565;108566;108567;108568;108569;108570;108571;108572;108573 108569 28 EFTKLEEVLTNK Unmodified 1449.7715 0.7715102 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 1 1 83.375 83.375 2 0.012496 85892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.737 53.622 95870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57025000 38845000 0 9652 2812 9038 85515;85516 108574;108575 108574 1 EFTKLEEVLTNKK Unmodified 1577.8665 0.86647322 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 2 2 1 64.756 64.756 2;3 0.0017685 64005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.275 78.988 411710000 0 0 0 0 0 0 0 252890000 158810000 0 0 0 0 9653 2812 9039 85517;85518;85519 108576;108577;108578 108576 2 EFTMAEIEHFVDPSEK Unmodified 1907.8611 0.86112984 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 139.06 139.06 2;3 4.7275E-06 144470 QUIQUE_C1218_190116_001 81.428 76.218 180440000 43422000 24340000 25087000 19498000 0 33599000 20798000 0 0 13701000 0 0 0 9654 2440 9040 85520;85521;85522;85523;85524;85525;85526;85527 108579;108580;108581;108582;108583;108584;108585;108586 108579 6 EFTMAEIEHFVDPSEKDHPK Unmodified 2385.0947 0.094711606 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 107.47 107.47 3;4;5 0.00033145 111675 QUIQUE_C1576_190116_001 59.182 51.967 1033900000 86401000 0 175160000 0 91060000 70600000 82099000 52424000 76645000 0 157640000 125850000 116030000 9655 2440 9041 85528;85529;85530;85531;85532;85533;85534;85535;85536;85537;85538;85539;85540;85541 108587;108588;108589;108590;108591;108592;108593;108594;108595;108596;108597;108598;108599;108600;108601;108602;108603;108604 108594 17 EFTNVYIK Unmodified 1012.5229 0.52294707 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YBN4;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YCC8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.695 58.695 2 0.015753 58372 QUIQUE_C1438_190116_001 84.244 61.095 256740000 0 0 75937000 47481000 61903000 0 45523000 0 0 0 0 25899000 0 9656 2031;596 9042 85542;85543;85544;85545;85546 108605;108606;108607;108608;108609 108607 5 EFTPEVQASWQK Unmodified 1448.6936 0.69359423 2800 P69892;A0A2R8Y7X9;P69891;E9PBW4 HBG2;HBG1 Hemoglobin subunit gamma-2;Hemoglobin subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 76.73 76.73 2 8.3659E-14 77786 QUIQUE_C1218_190116_001 159.79 141.35 154330000 109870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44461000 0 9657 2800 9043 85547;85548 108610;108611 108610 1 EFTPPVQAAYQK Unmodified 1377.6929 0.69286595 2799 P68871 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes yes 0 0 0 2 3 3 2 3 2 2 2 1 2 4 4 3 61.563 61.563 1;2;3 7.0675E-55 60226 QUIQUE_DMIX8_190116_001 236.92 192.06 182580000000 12914000000 17974000000 15923000000 6650000000 18438000000 11755000000 9423100000 7507500000 11486000000 2969700000 26290000000 20693000000 20555000000 9658 2799 9044 85549;85550;85551;85552;85553;85554;85555;85556;85557;85558;85559;85560;85561;85562;85563;85564;85565;85566;85567;85568;85569;85570;85571;85572;85573;85574;85575;85576;85577;85578;85579;85580;85581 108612;108613;108614;108615;108616;108617;108618;108619;108620;108621;108622;108623;108624;108625;108626;108627;108628;108629;108630;108631;108632;108633;108634;108635;108636;108637;108638;108639;108640;108641;108642;108643;108644;108645;108646;108647;108648;108649;108650;108651;108652;108653;108654;108655;108656;108657;108658;108659;108660;108661;108662;108663;108664;108665;108666;108667;108668;108669;108670;108671;108672;108673;108674;108675;108676;108677;108678;108679;108680;108681;108682;108683;108684;108685;108686;108687;108688;108689;108690;108691;108692;108693;108694;108695 108695 78 EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH Unmodified 2808.4711 0.47113328 2799 P68871 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes yes 0 0 2 2 1 1 1 3 2 142.03 142.03 4;5 2.2595E-24 148919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.905 76.793 611240000 147500000 0 37597000 0 55792000 35910000 0 0 0 0 241640000 92804000 0 9659 2799 9045 85582;85583;85584;85585;85586;85587;85588;85589;85590;85591 108696;108697;108698;108699;108700;108701;108702;108703;108704;108705;108706;108707;108708 108704 13 EFTPQMQAAYQK Oxidation (M) 1456.6657 0.66566492 1817 P02042 HBD Hemoglobin subunit delta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 35.24 35.24 2 1.1854E-09 30510 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.49 128.38 1242700000 77428000 128790000 98924000 0 86114000 75738000 110620000 0 77252000 28728000 239230000 161250000 158630000 9660 1817 9046 85592;85593;85594;85595;85596;85597;85598;85599;85600;85601;85602;85603 108709;108710;108711;108712;108713;108714;108715;108716;108717;108718;108719;108720;108721;108722;108723 108718 1036 14 EFTPQMQAAYQK Unmodified 1440.6708 0.6707503 1817 P02042 HBD Hemoglobin subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.089 57.089 2 1.8503E-05 55800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.09 123.57 5601600000 402980000 709920000 565010000 210610000 418440000 374740000 350260000 190820000 339440000 96316000 1170700000 0 772410000 9661 1817 9046 85604;85605;85606;85607;85608;85609;85610;85611;85612;85613;85614;85615 108724;108725;108726;108727;108728;108729;108730;108731;108732;108733;108734;108735;108736;108737;108738;108739;108740 108735 17 EFTRPEEIIFLR Unmodified 1548.83 0.83002813 2206 P23142;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000016046 FBLN1 Fibulin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.26 106.26 3 0.00035242 109363 QUIQUE_C1403_190116_001 83.617 71.257 102080000 0 0 0 13630000 20058000 10931000 23767000 0 0 9345800 24349000 0 0 9662 2206 9047 85616;85617;85618;85619;85620;85621;85622 108741;108742;108743;108744;108745;108746;108747;108748 108743 8 EFTTPEGVPSAPR Unmodified 1386.6779 0.67794416 1691 O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.466 65.466 2 0.0010426 64411 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.417 64.552 872400000 0 135680000 111760000 96950000 0 0 125280000 78879000 0 43557000 129070000 0 151230000 9663 1691 9048 85623;85624;85625;85626;85627;85628;85629;85630 108749;108750;108751;108752;108753;108754;108755;108756;108757;108758;108759 108759 10 EFVADETER Unmodified 1094.488 0.48801813 1647 O75582 RPS6KA5 Ribosomal protein S6 kinase alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 31.032 31.032 2 0.0522 25930 QUIQUE_C1368_190116_001 71.501 42.352 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9664 1647 9049 85631;85632 108760;108761 108760 2 EFVAQNNTVQIK Unmodified 1389.7252 0.72522871 2930 Q08AM6;H3BUU8 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 51.697 51.697 2 0.00064025 49953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.095 72.87 150670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77856000 72816000 9665 2930 9050 85633;85634 108762;108763 108762 1 EFVAVTGAEEDR Unmodified 1321.615 0.61500956 4516 Q9UNZ2;F2Z2K0;R4GNE6;G3V4V8;R4GMY2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.51 53.51 2 0.0002924 51157 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.73 83.721 395220000 88489000 94217000 57421000 0 0 42868000 0 68805000 0 43419000 0 0 0 9666 4516 9051 85635;85636;85637;85638;85639;85640;85641;85642 108764;108765;108766;108767;108768;108769;108770;108771;108772 108771 9 EFVDLMNSK Unmodified 1081.5114 0.51139611 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.611 77.611 2 0.00042571 77683 QUIQUE_C1403_190116_001 119.41 83.913 561070000 57201000 52744000 82931000 56594000 0 46661000 0 84856000 107900000 33897000 0 38279000 0 9667 1670 9052 85643;85644;85645;85646;85647;85648;85649;85650;85651;85652 108773;108774;108775;108776;108777;108778;108779;108780;108781;108782;108783;108784 108776 12 EFVEAVLELR Unmodified 1203.6499 0.6499385 1626 O75367;B4DJC3 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 124.68 124.68 2 0.0015737 127559 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 81.84 97135000 0 14576000 14546000 0 0 0 0 52702000 0 15311000 0 0 0 9668 1626 9053 85653;85654;85655;85656;85657;85658;85659;85660;85661;85662;85663;85664 108785;108786;108787;108788;108789;108790;108791;108792;108793;108794;108795;108796;108797;108798 108795 13 EFVEEFIWPAIQSSALYEDR Unmodified 2428.1587 0.15869207 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.87 167.87 2;3 5.5282E-24 172509 QUIQUE_C1218_190116_001 176.89 162.86 1760700000 64554000 102570000 0 95943000 110170000 0 185390000 205650000 223850000 14263000 367070000 215990000 175200000 9669 1797 9054 85665;85666;85667;85668;85669;85670;85671;85672;85673;85674;85675;85676;85677;85678;85679;85680;85681;85682;85683;85684;85685;85686 108799;108800;108801;108802;108803;108804;108805;108806;108807;108808;108809;108810;108811;108812;108813;108814;108815;108816;108817;108818;108819;108820;108821;108822;108823;108824;108825;108826;108827 108801 28 EFVGCFIDFPK Unmodified 1357.6377 0.63765925 236 A0A0C4DGA2;O75521 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.5 130.5 2 0.0009083 127192 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.111 72.781 410490000 0 34061000 44894000 38075000 33896000 29973000 43154000 25979000 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108895;108896;108897;108898;108899;108900;108901;108902;108903;108904;108905;108906;108907;108908;108909;108910 108905 16 EFVYQEAAGPHQTLAR Unmodified 1815.8904 0.89039656 3665 Q8TBC5;M0R1U9;M0R364 ZSCAN18 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 18 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.414 56.414 3 1.1925E-06 54375 QUIQUE_C1368_190116_001 92.575 74.473 691500000 64211000 55731000 85277000 54237000 60928000 38682000 49695000 42468000 59603000 20562000 54081000 50212000 55816000 9681 3665 9066 85762;85763;85764;85765;85766;85767;85768;85769;85770;85771;85772;85773;85774 108911;108912;108913;108914;108915;108916;108917;108918;108919;108920;108921;108922;108923;108924;108925 108913 13 EFVYSER Unmodified 928.42905 0.42904669 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 33.896 33.896 2 0.050661 29492 QUIQUE_C1368_190116_001 74.415 41.945 69845000 0 0 69845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9682 2173 9067 85775 108926 108926 1 EFWVNMPNLMTHLK Unmodified 1758.8586 0.85856784 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108953;108954;108955;108956;108957;108958;108959;108960;108961;108962;108963;108964;108965;108966;108967;108968;108969;108970;108971;108972;108973;108974;108975;108976;108977;108978;108979;108980;108981 108967 29 EGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNGK Unmodified 4274.0556 0.055630569 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 1 2 1 2 138.62 138.62 4;5 1.8094E-100 141835 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.26 148.26 358710000 0 0 0 0 0 0 0 122020000 46525000 0 0 0 190160000 9688 2492 9073 85821;85822;85823;85824;85825 108982;108983;108984;108985;108986;108987 108982 6 EGAAHAFAQYNMDQFTPVK Unmodified 2123.9735 0.97347426 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 94.051 94.051 2;3 7.1898E-219 96463 QUIQUE_C1277_190116_001 325.24 303.29 2058200000 149260000 40499000 250650000 259580000 220320000 214330000 253990000 100550000 125220000 98688000 157310000 120510000 67327000 9689 2617 9074 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0.93153309 4541 Q9Y263;H0YBW4 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.08 107.08 3 0.0019144 112121 QUIQUE_C1218_190116_001 54.7 44.642 234970000 29769000 32457000 67440000 36944000 0 0 0 0 0 0 34444000 33921000 0 9702 4541 9084 85917;85918;85919;85920;85921;85922 109093;109094;109095;109096;109097;109098 109093 5 EGAQYLMQAAGLGR Unmodified 1463.7191 0.71909747 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 101.95 101.95 2 0.062535 105320 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.625 22.954 32356000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32356000 9703 2654 9085 85923 109099 109099 1 EGASILLDGR Unmodified 1029.5455 0.54547343 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.292 62.292 2 0.00017757 61395 QUIQUE_C1403_190116_001 123.21 85.397 10989000000 1048000000 1152300000 1248900000 1007200000 883850000 1092600000 932630000 371500000 563590000 424870000 882420000 635570000 745160000 9704 2870 9086 85924;85925;85926;85927;85928;85929;85930;85931;85932;85933;85934;85935;85936 109100;109101;109102;109103;109104;109105;109106;109107;109108;109109;109110;109111;109112;109113;109114;109115;109116 109103 17 EGASILLDGRK Unmodified 1157.6404 0.64043645 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 35.637 35.637 2;3 0.00018557 30975 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.27 85.982 3036500000 0 0 115540000 100350000 174850000 0 144850000 1200000000 507790000 0 394550000 398520000 0 9705 2870 9087 85937;85938;85939;85940;85941;85942;85943;85944;85945 109117;109118;109119;109120;109121;109122;109123;109124;109125;109126 109125 7 EGATLVCGGNQVPR Unmodified 1456.7093 0.70926107 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.4 44.4 2 4.7912E-14 40841 QUIQUE_C1368_190116_001 189.18 161.7 1698200000 178280000 145920000 280840000 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Unmodified 1580.6195 0.61951936 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.057 23.057 2 0.00030523 16393 QUIQUE_C1403_190116_001 129.89 125.59 236370000 0 29066000 0 41667000 43574000 28578000 57434000 0 0 0 0 0 36052000 9708 2207 9090 85975;85976;85977;85978;85979;85980 109161;109162;109163;109164;109165;109166 109162 6 EGCPGPLLATLDQVAAGAGDPGVAAR Unmodified 2462.2224 0.22237174 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 149.86 149.86 3 0.032895 153504 QUIQUE_C1403_190116_001 14.483 6.7706 26489000 0 0 0 26489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9709 3563 9091 85981 109167 109167 1 EGCYGDKDEFPGVR Unmodified 1627.6937 0.69367058 111 Q6PID9;A0A087X1T7;H0YMF1;P16112 ACAN Aggrecan core protein;Aggrecan core protein 2 yes no 0 0 1 1 1 48.21 48.21 2;3 0.0054827 46247 QUIQUE_C1576_190116_001 80.979 71.026 69253000 0 0 42024000 0 0 0 27229000 0 0 0 0 0 0 9710 111 9092 85982;85983 109168;109169 109169 2 EGDALELTCEAIGK Unmodified 1504.7079 0.70792366 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 95.697 95.697 2 0.0015322 98222 QUIQUE_C1368_190116_001 97.163 84.207 111400000 44414000 32417000 34565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9711 113 9093 85984;85985;85986 109170;109171;109172 109172 3 EGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVR Unmodified 2698.3459 0.34585769 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 136.18 136.18 2;3 4.3775E-115 140438 QUIQUE_C1277_190116_001 256.37 244.68 2813600000 248950000 317550000 321060000 283410000 291200000 232560000 341450000 0 0 45064000 240320000 220050000 271960000 9712 113 9094 85987;85988;85989;85990;85991;85992;85993;85994;85995;85996;85997;85998;85999;86000;86001;86002 109173;109174;109175;109176;109177;109178;109179;109180;109181;109182;109183;109184;109185;109186;109187;109188;109189 109175 17 EGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVR Oxidation (M) 2714.3408 0.34077231 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 1 1 1 1 127.29 127.29 3 3.1014E-06 131228 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.454 58.178 73002000 0 0 0 0 0 0 36881000 0 0 0 0 36121000 0 9713 113 9094 86003;86004 109190;109191 109191 73 2 EGDELCGQEEAFR Unmodified 1538.6307 0.63073598 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62 62 2 9.1907E-10 60993 QUIQUE_C1368_190116_001 141.93 125.68 191100000 0 43231000 51276000 0 29170000 0 33966000 0 0 0 0 33455000 0 9714 699 9095 86005;86006;86007;86008;86009;86010;86011;86012 109192;109193;109194;109195;109196;109197;109198;109199;109200 109193 9 EGDETPNSIPADIVFIIK Unmodified 1957.0044 0.004423261 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 151.14 151.14 2 0.00015602 146619 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.62 88.715 386780000 0 0 0 0 0 0 113460000 74906000 0 36562000 161850000 0 0 9715 4416 9096 86013;86014;86015;86016;86017 109201;109202;109203;109204;109205;109206 109205 6 EGDEVTLICSAR Unmodified 1348.6293 0.62927941 66 A0A087WXM8;P50895 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 65.773 65.773 2 0.033843 65331 QUIQUE_C1277_190116_001 62.303 35.788 51097000 0 51097000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9716 66 9097 86018 109207 109207 0 EGDFGCTVMELR Unmodified 1412.6064 0.60643548 2222 P23634 ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.02 95.02 2 0.0005192 97213 QUIQUE_C1403_190116_001 95.573 83.337 192340000 18428000 0 42967000 23289000 0 19542000 30054000 0 0 0 29179000 0 28878000 9717 2222 9098 86019;86020;86021;86022;86023;86024;86025;86026 109208;109209;109210;109211;109212;109213;109214;109215;109216 109212 8 EGDFTLSLR Unmodified 1036.5189 0.51892433 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.591 83.591 2 0.003694 85497 QUIQUE_C1277_190116_001 90.709 59.419 1180600000 0 118480000 124130000 95839000 95252000 93507000 126080000 0 106350000 0 142960000 134610000 143380000 9718 4091 9099 86027;86028;86029;86030;86031;86032;86033;86034;86035;86036 109217;109218;109219;109220;109221;109222;109223;109224;109225;109226 109217 7 EGDGSCFPDALDR Unmodified 1437.5831 0.5830575 2390 P36222 CHI3L1 Chitinase-3-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 72.401 72.401 2 0.036617 72313 QUIQUE_C1403_190116_001 45.915 35.108 20478000 0 0 0 20478000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9719 2390 9100 86037 109227 109227 1 EGDLIAAQAR Unmodified 1042.5407 0.5407224 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.281 33.281 1;2 0.00019383 28486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.75 109.89 5643400000 468090000 0 558080000 623580000 0 493630000 503300000 434390000 495220000 263350000 764120000 449400000 590250000 9720 1819;3223 9101 86038;86039;86040;86041;86042;86043;86044;86045;86046;86047;86048;86049 109228;109229;109230;109231;109232;109233;109234;109235;109236;109237;109238;109239;109240;109241 109238 13 EGDLITLLVPEAR Unmodified 1424.7875 0.78749461 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.89 144.89 2 0.0004293 152484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.18 91.653 249800000 0 0 0 0 0 0 0 54399000 27005000 18420000 56552000 39904000 53515000 9721 4531 9102 86050;86051;86052;86053;86054;86055;86056;86057;86058 109242;109243;109244;109245;109246;109247;109248;109249;109250;109251;109252;109253;109254 109251 13 EGDLLFTVAK Unmodified 1091.5863 0.58627561 2988 Q13347;Q5TFK1 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.463 90.463 2 0.003379 93915 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.331 63.491 512550000 54108000 66752000 48169000 40557000 69856000 0 41924000 0 0 0 68861000 60678000 61644000 9722 2988 9103 86059;86060;86061;86062;86063;86064;86065;86066;86067;86068 109255;109256;109257;109258;109259;109260;109261;109262;109263;109264;109265;109266;109267 109264 10 EGDLPPLWWYIVTR Unmodified 1743.8984 0.89844205 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 168.07 168.07 2;3 7.4688E-05 175296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.925 71.819 942500000 106320000 84706000 148420000 71909000 65725000 129080000 157080000 0 24657000 0 73664000 36451000 44494000 9723 4658 9104 86069;86070;86071;86072;86073;86074;86075;86076;86077;86078;86079;86080;86081;86082;86083 109268;109269;109270;109271;109272;109273;109274;109275;109276;109277;109278;109279;109280;109281;109282;109283 109280 14 EGDLPPLWWYIVTRPR Unmodified 1997.0523 0.052316927 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.43 152.43 3 6.8899E-14 159357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.38 92.629 758850000 0 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EGDQIVGATIYFDNLQSGEVTQLLNTMGHHTVGLK Oxidation (M) 3800.868 0.86795314 2935 Q09666;E9PJZ0;E9PKR9;E9PJC6;E9PLK4;E9PQE3 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 1 0 1 143.72 143.72 4 2.6542E-05 148927 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.921 37.16 119490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119490000 9727 2935 9107 86100 109304 109304 2399 1 EGDQTSNNIPADIVFVLK Unmodified 1958.9949 0.99492121 2241 P25685;M0R080 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.4 142.4 2 1.1664E-05 148988 QUIQUE_C1438_190116_001 129.77 121.04 1193700000 0 126590000 0 91664000 109830000 111850000 119100000 106050000 113950000 42311000 139870000 112620000 119880000 9728 2241 9108 86101;86102;86103;86104;86105;86106;86107;86108;86109;86110;86111 109305;109306;109307;109308;109309;109310;109311;109312;109313;109314;109315;109316;109317;109318 109307 12 EGDTLVLTCAVTGNPR Unmodified 1701.8356 0.83558379 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 85.638 85.638 2 7.1491E-07 87150 QUIQUE_C1368_190116_001 140.63 121.39 247200000 61160000 60468000 52974000 43491000 0 0 0 0 0 29101000 0 0 0 9729 3655 9109 86112;86113;86114;86115;86116 109319;109320;109321;109322;109323 109321 5 EGDTLVLTCAVTGNPRPNQIR Unmodified 2310.175 0.17502761 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.168 80.168 3 7.8445E-54 82363 QUIQUE_C1438_190116_001 130.85 116.24 708900000 0 62424000 0 0 100090000 0 92923000 99179000 114140000 33370000 113870000 92905000 0 9730 3655 9110 86117;86118;86119;86120;86121;86122;86123;86124;86125;86126;86127 109324;109325;109326;109327;109328;109329;109330;109331;109332;109333;109334;109335;109336;109337;109338;109339 109329 16 EGDTMMGQQVAK Oxidation (M) 1309.5642 0.56423631 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 1 0 1 1 2 18.258 18.258 2 0.0048294 10566 QUIQUE_C1218_190116_001 70.256 55.958 84914000 15601000 18799000 50514000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9731 3089 9111 86128;86129;86130;86131 109340;109341;109342;109343;109344 109340 2533;2534 5 EGDTMMGQQVAK Unmodified 1293.5693 0.56932169 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 31.217 31.217 2 3.0042E-05 26273 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.57 90.297 448570000 100590000 0 0 103080000 0 0 116890000 0 63955000 0 0 0 64053000 9732 3089 9111 86132;86133;86134;86135;86136 109345;109346;109347;109348;109349 109348 4 EGDTVIFASDDEQDR Unmodified 1695.7224 0.72238775 4494;981;1154 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;F8W8P5;H7BYR4;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.736 69.736 2 1.8011E-06 70838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.93 85.665 179620000 66182000 53783000 0 0 0 0 0 0 0 30029000 0 29622000 0 9733 981;1154;4494 9112 86137;86138;86139;86140;86141;86142;86143;86144;86145 109350;109351;109352;109353;109354;109355;109356;109357;109358 109356 7 EGDTVQLLCR Unmodified 1189.5761 0.57612163 66 A0A087WXM8;P50895;K7ENU8 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.454 59.454 2 0.012155 58842 QUIQUE_C1438_190116_001 66.27 45.75 164450000 40657000 44528000 0 0 48947000 30319000 0 0 0 0 0 0 0 9734 66 9113 86146;86147;86148;86149;86150 109359;109360;109361;109362;109363 109361 5 EGDVLTLLESER Unmodified 1359.6882 0.6881745 2766 P62857 RPS28 40S ribosomal protein S28 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 124.57 124.57 2 0.00012889 130606 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.95 83.98 460920000 108110000 127120000 101740000 0 0 89530000 0 0 0 34425000 0 0 0 9735 2766 9114 86151;86152;86153;86154;86155;86156;86157;86158;86159;86160;86161 109364;109365;109366;109367;109368;109369;109370;109371;109372;109373;109374;109375;109376 109376 13 EGDYVLFHHEGGVDVGDVDAK Unmodified 2257.0287 0.028740531 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 81.304 81.304 4 0.020862 77894 QUIQUE_DMIX4_190116_001 18.597 14.329 138310000 0 56581000 0 0 0 0 0 43274000 0 38457000 0 0 0 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168.97 2;3;4 9.1131E-66 173282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.36 183.33 12728000000 877550000 960650000 1677700000 871860000 1036900000 1090100000 1928100000 340560000 878380000 162350000 1184700000 662960000 1055900000 9738 1218;28;2057 9117 86184;86185;86186;86187;86188;86189;86190;86191;86192;86193;86194;86195;86196;86197;86198;86199;86200;86201;86202;86203;86204;86205;86206;86207;86208;86209;86210;86211;86212;86213;86214;86215;86216;86217;86218 109408;109409;109410;109411;109412;109413;109414;109415;109416;109417;109418;109419;109420;109421;109422;109423;109424;109425;109426;109427;109428;109429;109430;109431;109432;109433;109434;109435;109436;109437;109438;109439;109440;109441;109442;109443;109444;109445 109433 38 EGEDMIAEEHFGSEK Oxidation (M) 1722.7043 0.70429485 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 3 2 1 2 2 1 1 3 3 2 2 1 2 44.153 44.153 2;3 2.8359E-35 40405 QUIQUE_C1368_190116_001 169.52 144.66 1169800000 237400000 136130000 68924000 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86244;86245;86246;86247;86248;86249;86250;86251;86252;86253;86254;86255;86256;86257;86258;86259;86260;86261;86262;86263;86264;86265;86266;86267;86268;86269;86270 109473;109474;109475;109476;109477;109478;109479;109480;109481;109482;109483;109484;109485;109486;109487;109488;109489;109490;109491;109492;109493;109494;109495;109496;109497;109498;109499;109500;109501;109502;109503;109504;109505;109506 109476 32 EGEEATAEAEEK Unmodified 1291.5416 0.54156984 2961 Q13045 FLII Protein flightless-1 homolog yes yes 0 0 0 1 18.024 18.024 2 0.0077133 10075 QUIQUE_C1277_190116_001 63.32 45.095 8396100 0 8396100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9741 2961 9119 86271 109507 109507 1 EGEEPTVYSDEEEPK Unmodified 1736.7265 0.72647008 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.939 46.939 2 7.2669E-07 44588 QUIQUE_C1576_190116_001 118.9 112.3 177560000 0 26583000 0 27652000 18652000 37846000 41518000 0 0 25312000 0 0 0 9742 1391 9120 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93.152 2 0.00029405 91020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.79 124.01 417730000 0 0 63753000 0 0 0 65937000 47756000 72036000 35360000 80040000 0 52847000 9763 3949 9141 86452;86453;86454;86455;86456;86457;86458;86459;86460 109725;109726;109727;109728;109729;109730;109731;109732;109733 109730 8 EGFTQASLGLLANQR Unmodified 1603.8318 0.83181904 3890 Q96JG6;C9JA29 CCDC132 Coiled-coil domain-containing protein 132 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.18 108.18 2 1.6786E-06 112903 QUIQUE_C1218_190116_001 115.33 97.015 167950000 29384000 29588000 27535000 0 40952000 0 0 0 0 0 0 40489000 0 9764 3890 9142 86461;86462;86463;86464;86465;86466 109734;109735;109736;109737;109738;109739 109734 6 EGFVEYTEQVVK Unmodified 1426.698 0.6980109 1403;1582 O00410;H0Y8C6;O60518 IPO5;RANBP6 Importin-5;Ran-binding protein 6 no no 0 0 0 1 1 96.913 96.913 2 0.016611 99402 QUIQUE_C1403_190116_001 60.899 44.701 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9765 1403;1582 9143 86467;86468 109740;109741 109740 2 EGFYDLSSEDPFGCK Unmodified 1749.7192 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109745;109746;109747;109748;109749;109750;109751;109752;109753;109754;109755 109746 6 EGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGR Oxidation (M) 2337.9783 0.97830164 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 173.42 173.42 2 1.2983E-06 177162 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.692 62.871 43229000 0 6479700 0 0 0 0 9788500 6995400 0 0 0 11803000 8163000 9769 2334 9147 86483;86484;86485;86486;86487;86488 109756;109757;109758;109759;109760;109761 109760 1728;1729 6 EGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGR Unmodified 2321.9834 0.98338702 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 176.9 176.9 3 0.0041091 183890 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.155 30.917 23747000 0 0 0 0 0 0 0 0 7303900 0 16444000 0 0 9770 2334 9147 86489;86490 109762;109763 109763 2 EGGDGEEQDVGDAGR Unmodified 1489.5917 0.59170793 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.758 20.758 2 3.8155E-54 13954 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.28 177.71 1034400000 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hydrolase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 4 2 2 2 2 2 129.02 129.02 2;3 0.00015696 133546 QUIQUE_C1368_190116_001 86.911 77.423 1834800000 136740000 137030000 133830000 136110000 151230000 170680000 175810000 125690000 141370000 46768000 149450000 179600000 150540000 9773 2524 9150 86505;86506;86507;86508;86509;86510;86511;86512;86513;86514;86515;86516;86517;86518;86519;86520;86521;86522;86523;86524;86525;86526;86527;86528;86529;86530;86531;86532;86533 109778;109779;109780;109781;109782;109783;109784;109785;109786;109787;109788;109789;109790;109791;109792;109793;109794;109795;109796;109797;109798;109799;109800;109801;109802;109803;109804;109805;109806;109807;109808;109809;109810;109811;109812;109813;109814;109815;109816;109817;109818;109819;109820;109821;109822;109823;109824;109825;109826 109789 48 EGGGAIEEEAKEK Unmodified 1345.6361 0.63613893 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 1 2 1 17.057 17.057 2;3 0.0027041 10065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.716 49.289 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109841;109842;109843;109844;109845;109846;109847;109848;109849;109850;109851;109852;109853;109854;109855;109856;109857;109858;109859;109860;109861;109862;109863;109864;109865;109866;109867;109868;109869;109870;109871;109872;109873;109874;109875;109876;109877;109878;109879;109880;109881;109882;109883;109884;109885;109886;109887;109888;109889;109890;109891;109892;109893;109894;109895;109896;109897;109898;109899;109900;109901;109902;109903;109904;109905;109906;109907;109908;109909;109910 109854 70 EGGLGPLNIPLLADVTRR Unmodified 1890.0687 0.068695273 2346 P32119;A6NIW5 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes no 0 0 1 1 140.94 140.94 3 8.465E-05 143753 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.441 72.025 41727000 0 0 0 0 0 0 0 41727000 0 0 0 0 0 9779 2346 9155 86581 109911 109911 1 EGGLLTLAGAK Unmodified 1028.5866 0.58660996 1959 P09417;B7Z415;D6RGG7;H0Y8F7 QDPR Dihydropteridine reductase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 72.952 72.952 1;2 7.649E-17 73356 QUIQUE_C1368_190116_001 195.48 131.22 15386000000 1382000000 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110056;110057;110058;110059;110060;110061;110062;110063;110064;110065;110066;110067;110068;110069;110070;110071;110072;110073;110074;110075;110076;110077;110078;110079;110080;110081;110082;110083;110084;110085;110086;110087;110088;110089 110064 32 EGHPVYPQLRPGYIPIPVLHEGAENR Unmodified 2937.525 0.52495976 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 97.574 97.574 4 2.4947E-05 100593 QUIQUE_C1277_190116_001 55.469 48.82 185190000 0 28814000 0 0 31759000 0 0 0 0 0 0 50047000 74571000 9792 1753 9168 86729;86730;86731;86732 110090;110091;110092;110093 110090 2 EGHQVALLSGEMMVEQR Unmodified 1912.9135 0.91351654 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 1 83.836 83.836 3 0.003421 85209 QUIQUE_C1403_190116_001 67.449 57.392 141520000 37561000 0 0 31954000 0 0 0 0 28925000 0 0 0 43082000 9793 1021 9169 86733;86734;86735;86736 110094;110095;110096;110097 110095 2 EGHVETVLALLEK Unmodified 1436.7875 0.78749461 2103 P16157 ANK1 Ankyrin-1 yes yes 0 0 0 1 1 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110144;110145;110146;110147;110148;110149;110150;110151;110152;110153;110154;110155;110156;110157;110158;110159;110160;110161;110162;110163;110164;110165;110166;110167;110168;110169;110170;110171;110172;110173 110160 28 EGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEK Unmodified 2769.2035 0.20354637 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.803 54.803 3 2.4304E-57 52585 QUIQUE_C1403_190116_001 153.24 148.55 208430000 0 28607000 55064000 104330000 0 0 0 0 0 20430000 0 0 0 9798 2066 9174 86791;86792;86793;86794 110174;110175;110176;110177 110176 4 EGICALGGTSELSSEGTQHSYSEEEK Unmodified 2784.2032 0.20321202 181 A0A0A0MSQ0;P13797 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.55 72.55 3 1.4866E-21 73893 QUIQUE_C1438_190116_001 112.13 105.33 199270000 0 0 0 48132000 60476000 34352000 56308000 0 0 0 0 0 0 9799 181 9175 86795;86796;86797;86798 110178;110179;110180;110181 110179 4 EGIDPTPYYWYTDQR Unmodified 1902.8424 0.84244331 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120 120 2 1.395E-08 125516 QUIQUE_C1438_190116_001 150.06 140.4 2091900000 153060000 200280000 201170000 183750000 148290000 131530000 156500000 124450000 158390000 85500000 225260000 165030000 158670000 9800 1553 9176 86799;86800;86801;86802;86803;86804;86805;86806;86807;86808;86809;86810;86811 110182;110183;110184;110185;110186;110187;110188;110189;110190;110191;110192;110193;110194;110195;110196 110187 14 EGIDPTPYYWYTDQRK Unmodified 2030.9374 0.93740633 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 97.958 97.958 3 0.0022772 99389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.324 59.606 96411000 0 0 0 0 0 0 0 96411000 0 0 0 0 0 9801 1553 9177 86812 110197 110197 0 EGIILFK Unmodified 818.49019 0.49019038 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 1 81.517 81.517 2 0.049176 84030 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.269 3.248 496050000 0 0 175680000 0 0 0 0 135250000 0 0 185130000 0 0 9802 1890 9178 86813;86814;86815 110198;110199;110200 110200 3 EGIIPANYVQK Unmodified 1230.6608 0.66083754 2439 P41240;H3BUM9 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes no 0 0 0 1 1 1 1 66.786 66.786 2 0.0043186 66575 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.708 52.977 392200000 0 79187000 98439000 101760000 0 0 0 0 112820000 0 0 0 0 9803 2439 9179 86816;86817;86818;86819 110201;110202;110203;110204 110204 4 EGILGQHQFLEGPEGIENTR Unmodified 2223.092 0.09200949 868 E7ESP4;E9PB77;E7EMF1 ITGA2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.086 99.086 3 1.6499E-08 101975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.67 89.957 405090000 0 57109000 0 70989000 75164000 0 62740000 0 90693000 0 48395000 0 0 9804 868 9180 86820;86821;86822;86823;86824;86825 110205;110206;110207;110208;110209;110210;110211;110212 110211 8 EGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSK Unmodified 2865.4106 0.41062602 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 3 2 1 3 2 2 166.02 166.02 2;3 3.3362E-84 170485 QUIQUE_DMIX8_190116_001 234.04 224.99 8753900000 519590000 454080000 1053100000 717910000 579050000 435430000 611510000 657640000 1037600000 256870000 783430000 642210000 1005400000 9805 2248 9181 86826;86827;86828;86829;86830;86831;86832;86833;86834;86835;86836;86837;86838;86839;86840;86841;86842;86843;86844;86845;86846;86847;86848;86849;86850;86851;86852 110213;110214;110215;110216;110217;110218;110219;110220;110221;110222;110223;110224;110225;110226;110227;110228;110229;110230;110231;110232;110233;110234;110235;110236;110237;110238;110239;110240;110241;110242;110243;110244;110245;110246;110247;110248;110249;110250;110251 110251 37 EGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAK Unmodified 2822.4048 0.40481236 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 159.75 159.75 2;3 2.1788E-100 164733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 246.27 235.65 7065300000 445870000 567800000 501250000 463770000 741120000 380390000 564630000 429150000 736920000 180070000 683760000 643780000 726760000 9806 859 9182 86853;86854;86855;86856;86857;86858;86859;86860;86861;86862;86863;86864;86865;86866;86867;86868;86869;86870;86871;86872;86873;86874;86875;86876;86877;86878 110252;110253;110254;110255;110256;110257;110258;110259;110260;110261;110262;110263;110264;110265;110266;110267;110268;110269;110270;110271;110272;110273;110274;110275;110276;110277;110278;110279;110280;110281;110282;110283;110284;110285;110286;110287;110288;110289;110290;110291;110292;110293;110294;110295 110281 43 EGINIFLDGYVPTENLR Unmodified 1948.9894 0.9894419 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 147.61 147.61 2 1.3735E-12 150521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.54 94.813 253740000 54690000 0 0 0 0 0 0 62097000 0 0 71112000 65845000 0 9807 2718 9183 86879;86880;86881;86882 110296;110297;110298;110299 110297 3 EGIPALDNFLDK Unmodified 1330.6769 0.67688153 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.61 130.61 2 0.00065806 134874 QUIQUE_C1368_190116_001 106.29 78.548 351890000 63102000 47067000 44188000 53678000 22012000 53324000 42092000 0 0 26424000 0 0 0 9808 2058 9184 86883;86884;86885;86886;86887;86888;86889;86890 110300;110301;110302;110303;110304;110305;110306;110307;110308;110309 110303 10 EGIPALDNFLDKL Unmodified 1443.7609 0.76094551 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 3 3 1 2 2 1 1 1 2 4 2 162.48 162.48 2 0.00046516 166723 QUIQUE_C1403_190116_001 139.43 101.74 5956200000 257600000 284880000 730060000 546970000 343000000 190040000 628320000 301230000 413630000 98960000 674340000 1048000000 439210000 9809 2058 9185 86891;86892;86893;86894;86895;86896;86897;86898;86899;86900;86901;86902;86903;86904;86905;86906;86907;86908;86909;86910;86911;86912;86913;86914 110310;110311;110312;110313;110314;110315;110316;110317;110318;110319;110320;110321;110322;110323;110324;110325;110326;110327;110328;110329;110330;110331;110332;110333;110334;110335;110336;110337;110338;110339;110340;110341;110342;110343;110344;110345;110346;110347;110348;110349 110324 39 EGIPGLYR Unmodified 903.48142 0.48141661 3372 Q6NUK1 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.725 62.725 2 0.017542 62978 QUIQUE_C1576_190116_001 81.381 56.383 39105000 0 0 0 0 0 0 16459000 0 0 0 0 0 22645000 9810 3372 9186 86915;86916;86917;86918 110350;110351;110352;110353 110352 4 EGIPPDQQR Unmodified 1038.5094 0.50942227 623 J3QS39;J3QTR3;F5H6Q2;F5GYU3;F5H2Z3;F5H265;B4DV12;F5H388;F5H747;F5GXK7;J3QKN0;Q5PY61;Q96C32;P62987;P62979;P0CG47;P0CG48;M0R1V7;Q49A90;M0R1M6;M0R2S1;A0A2R8Y422;J3QSA3;F5GZ39 UBB;RPS27A;UBC;UBA52 Ubiquitin-60S ribosomal protein L40;Ubiquitin;60S ribosomal protein L40;Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a;Ubiquitin;40S ribosomal protein S27a;Polyubiquitin-B;Ubiquitin;Polyubiquitin-C;Ubiquitin yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 3 1 2 1 17.109 17.109 2 0.0004731 8305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.28 97.38 2027100000 93542000 297030000 72731000 131350000 63148000 163740000 85970000 59037000 97705000 571590000 53443000 251270000 86556000 9811 623 9187 86919;86920;86921;86922;86923;86924;86925;86926;86927;86928;86929;86930;86931;86932;86933;86934;86935;86936 110354;110355;110356;110357;110358;110359;110360;110361;110362;110363;110364;110365;110366;110367;110368;110369;110370;110371;110372;110373;110374;110375;110376;110377;110378 110370 24 EGIREETVSLR Unmodified 1287.6783 0.67827852 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 36.578 36.578 2;3 0.0036388 32866 QUIQUE_C1218_190116_001 58.674 43.798 675010000 136740000 0 0 0 236440000 100180000 0 201660000 0 0 0 0 0 9812 2169 9188 86937;86938;86939;86940;86941;86942 110379;110380;110381;110382;110383;110384 110379 6 EGISINCGLLALGNVISALGDK Unmodified 2213.1726 0.172568 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YIM7 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 1 172.15 172.15 2;3 2.4873E-54 176813 QUIQUE_C1368_190116_001 204.13 168.61 720620000 54049000 56073000 18524000 90978000 47429000 33686000 25031000 38597000 64683000 0 100170000 165600000 25805000 9813 356 9189 86943;86944;86945;86946;86947;86948;86949;86950;86951;86952;86953;86954;86955;86956;86957;86958;86959;86960;86961 110385;110386;110387;110388;110389;110390;110391;110392;110393;110394;110395;110396;110397;110398;110399;110400;110401;110402;110403;110404 110388 20 EGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAAR Unmodified 3369.7351 0.73508847 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 2 1 168.96 168.96 3;4 5.9706E-119 173326 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.6 170.67 3296500000 190760000 190530000 0 0 0 354940000 430110000 308010000 636410000 0 486720000 473240000 225740000 9814 4600 9190 86962;86963;86964;86965;86966;86967;86968;86969;86970;86971;86972;86973;86974;86975 110405;110406;110407;110408;110409;110410;110411;110412;110413;110414;110415;110416;110417;110418 110414 13 EGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAAR Oxidation (M) 3385.73 0.7300031 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 1 156.78 156.78 4 4.7024E-08 161094 QUIQUE_C1277_190116_001 50.492 45.226 169890000 0 79959000 0 0 0 0 0 89935000 0 0 0 0 0 9815 4600 9190 86976;86977 110419;110420 110419 3032 1 EGITVYSMQFGGYAK Unmodified 1649.7759 0.77594365 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 111.49 111.49 2 5.8045E-09 113918 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.47 107.5 60813000 0 0 0 0 0 0 0 60813000 0 0 0 0 0 9816 4274 9191 86978 110421 110421 0 EGIVALR Unmodified 756.44939 0.4493882 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 38.783 38.783 2 0.03642 35260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.121 7.6766 967650000 0 0 0 231720000 219590000 0 273040000 0 0 0 243300000 0 0 9817 2424 9192 86979;86980;86981;86982 110422;110423;110424;110425 110425 4 EGIVALRR Unmodified 912.5505 0.55049923 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 1 1 22.869 22.869 2 0.038194 16299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.134 29.946 41688000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41688000 0 0 9818 2424 9193 86983 110426 110426 1 EGIVTATEQEVKEDIAK Unmodified 1858.9524 0.95238769 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 97.59 97.59 2;3 8.7499E-20 100076 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.84 104.84 675900000 0 52284000 37870000 0 0 24228000 68577000 62347000 120660000 0 87206000 127770000 94952000 9819 2952 9194 86984;86985;86986;86987;86988;86989;86990;86991;86992;86993;86994;86995 110427;110428;110429;110430;110431;110432;110433;110434;110435;110436;110437;110438;110439 110431 12 EGKEPSEIGNLVK Unmodified 1398.7355 0.73545904 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 1 1 41.919 41.919 2 0.020144 39264 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.434 53.654 29774000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29774000 0 0 9820 1187 9195 86996 110440 110440 1 EGKPCIIIK Unmodified 1056.6002 0.60015154 1873 P05026;V9GYR2 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 23.122 23.122 2 0.01723 17062 QUIQUE_C1218_190116_001 104.44 47.39 1870800000 532820000 0 0 0 0 0 0 0 0 138190000 597050000 0 602710000 9821 1873 9196 86997;86998;86999;87000 110441;110442;110443;110444 110441 2 EGKPTIVEEDDPELFK Unmodified 1844.9044 0.90437487 1671 O75937 DNAJC8 DnaJ homolog subfamily C member 8 yes yes 0 0 1 1 1 77.358 77.358 2;3 0.0082561 78904 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.917 28.479 96088000 34792000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61296000 0 0 9822 1671 9197 87001;87002 110445;110446 110446 1 EGKPYLVLGLLWQVIK Unmodified 1855.0971 0.097141855 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 1 1 164.36 164.36 3 0.0045026 171611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.501 48.841 40237000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40237000 0 0 9823 2066 9198 87003 110447 110447 1 EGLAELYEYK Unmodified 1213.5867 0.58666954 3037 Q14008;H0YDX5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 0 0 0 1 90.201 90.201 2 0.056169 91211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.898 34.391 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9824 3037 9199 87004 110448 110448 1 EGLAQQVQQSLEK Unmodified 1456.7522 0.75217174 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 84.974 84.974 2 0.00046786 87774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.095 80.638 400630000 0 0 0 0 69317000 0 0 75109000 0 0 104920000 92300000 58984000 9825 3423 9200 87005;87006;87007;87008;87009 110449;110450;110451;110452;110453 110451 5 EGLDDQGLTK Unmodified 1074.5193 0.51931826 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.778 36.778 2 0.00080387 32912 QUIQUE_C1218_190116_001 105.94 75.681 490390000 156390000 115820000 105460000 0 0 0 74346000 0 0 38379000 0 0 0 9826 4471 9201 87010;87011;87012;87013;87014;87015;87016 110454;110455;110456;110457;110458;110459;110460;110461;110462 110454 7 EGLEEGDQILR Unmodified 1257.6201 0.62009493 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 67.637 67.637 2 0.010614 67732 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 47.805 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9827 1074 9202 87017;87018 110463;110464 110463 2 EGLEETLR Unmodified 945.47673 0.47672516 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.676 41.676 2 0.0046215 36851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.46 64.653 9392400000 1227500000 0 959200000 863610000 1016700000 860980000 2127900000 0 726110000 529080000 0 0 1081200000 9828 1916 9203 87019;87020;87021;87022;87023;87024;87025;87026;87027 110465;110466;110467;110468;110469;110470;110471;110472;110473 110472 4 EGLEIVK Unmodified 786.44872 0.4487195 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 39.579 39.579 2 0.048295 36535 QUIQUE_C1438_190116_001 76.035 16.425 202060000 0 0 0 0 202060000 0 0 0 0 0 0 0 0 9829 2051 9204 87028 110474 110474 1 EGLELLK Unmodified 800.46437 0.46436956 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.215 63.215 2 0.041082 62552 QUIQUE_C1403_190116_001 82.305 1.2052 34501000000 0 2903800000 3479000000 3034400000 2959800000 2822000000 2715000000 2407800000 2634800000 2357100000 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110492;110493;110494;110495;110496;110497;110498;110499;110500;110501;110502;110503;110504;110505;110506;110507;110508;110509;110510;110511;110512;110513;110514;110515;110516;110517;110518;110519 110497 28 EGLELPEDEEEKK Unmodified 1543.7253 0.72534787 1931;1938;3263 P08238;Q58FF7;P07900;Q58FG0;Q58FF6 HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AA1;HSP90AA5P;HSP90AB4P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Heat shock protein HSP 90-alpha;Putative heat shock protein HSP 90-alpha A5;Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 3 2 2 1 2 3 2 44.418 44.418 2;3 5.4494E-07 40781 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 127.24 3587600000 487590000 539120000 271560000 443480000 291340000 479980000 188380000 260110000 101970000 94661000 207600000 221770000 0 9832 1938;1931;3263 9207 87054;87055;87056;87057;87058;87059;87060;87061;87062;87063;87064;87065;87066;87067;87068;87069;87070;87071;87072;87073;87074;87075;87076;87077;87078;87079;87080;87081 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110642;110643;110644;110645;110646;110647;110648;110649;110650;110651;110652;110653;110654;110655;110656;110657;110658;110659;110660;110661;110662;110663;110664 110646 23 EGLLSMANAGR Unmodified 1117.555 0.55499226 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 70.168 70.168 2 0.040548 70089 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.493 24.576 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9842 2926 9217 87171 110665 110665 1 EGLMLDSHEELYK Unmodified 1562.7287 0.72865911 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 74.109 74.109 2;3 0.00010867 74486 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.701 74.48 388730000 0 0 49482000 34793000 0 53509000 0 90171000 41841000 27196000 40234000 51507000 0 9843 3053 9218 87172;87173;87174;87175;87176;87177;87178;87179;87180;87181;87182 110666;110667;110668;110669;110670;110671;110672;110673;110674;110675;110676;110677;110678 110674 12 EGLMLDSHEELYK Oxidation (M) 1578.7236 0.72357373 3053 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110682;110683;110684;110685;110686;110687;110688;110689;110690;110691;110692 110690 10 EGLPVALDK Unmodified 940.52295 0.52294707 4535 Q9Y224 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 59.04 59.04 2 0.025354 58717 QUIQUE_C1438_190116_001 59.35 32.22 647590000 0 131350000 0 0 133210000 0 119300000 0 0 0 152200000 0 111530000 9847 4535 9221 87196;87197;87198;87199;87200 110693;110694;110695;110696;110697;110698 110695 5 EGLQDIVIGIIK Unmodified 1296.7653 0.76530261 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 152.42 152.42 2 0.0034387 158981 QUIQUE_C1576_190116_001 94.409 80.291 825370000 0 0 132310000 0 0 0 196910000 81176000 68149000 0 93562000 112790000 140480000 9848 2867 9222 87201;87202;87203;87204;87205;87206;87207 110699;110700;110701;110702;110703;110704;110705 110700 2 EGLQNMEAR Unmodified 1046.4815 0.48149296 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.686 28.686 2 0.0016704 22713 QUIQUE_C1277_190116_001 101.33 60.1 924330000 0 924330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9849 2343 9223 87208;87209;87210;87211;87212;87213;87214;87215 110706;110707;110708;110709;110710;110711;110712;110713;110714 110707 9 EGLTGTGTGPSR Unmodified 1131.552 0.55201537 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.468 20.468 2 0.012441 13379 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.785 24.522 734200000 0 272530000 0 0 0 0 0 120340000 0 81311000 0 0 260020000 9850 2242 9224 87216;87217;87218;87219 110715;110716;110717;110718 110717 4 EGLTPVLSLLTECSR Unmodified 1673.8658 0.86582129 651 B7WPL0;Q9NVN3;H0YHS3 RIC8B Synembryn-B yes no 0 0 0 1 144.33 144.33 2 0.00070281 149381 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.46 60.797 43250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43250000 9851 651 9225 87220 110719 110719 1 EGLTSIEEVTK Unmodified 1204.6187 0.61869795 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.485 67.485 2 0.00067123 66503 QUIQUE_C1563_190116_001 112.75 73.726 9071600000 542820000 571850000 698780000 339700000 612410000 329850000 776270000 1028900000 1142200000 448530000 1061800000 803410000 715150000 9852 3117 9226 87221;87222;87223;87224;87225;87226;87227;87228;87229;87230;87231;87232;87233 110720;110721;110722;110723;110724;110725;110726;110727;110728;110729;110730;110731;110732;110733;110734 110725 10 EGLVMVEVR Unmodified 1030.5481 0.54811597 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.495 71.495 2 0.009134 71886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.827 32.38 293960000 0 63961000 63922000 0 0 52126000 0 0 59625000 0 0 54327000 0 9853 3432 9227 87234;87235;87236;87237;87238 110735;110736;110737;110738;110739 110738 5 EGLWAEGQAR Unmodified 1115.536 0.53597137 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.883 48.883 2 0.0015231 46719 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.624 75.323 608640000 47216000 78880000 0 0 0 83431000 0 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EGLYFNPYFPGQAIAMAPPIYTDVLEFDDGTPATMSQIAK 2 Oxidation (M) 4410.0752 0.075228303 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 2 0 2 1 169.89 169.89 3;4 7.9148E-16 174341 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.817 63.181 162910000 0 0 0 0 0 0 0 0 142820000 0 0 20098000 0 9857 1947 9229 87256;87257;87258 110761;110762;110763 110761 1188;1189 3 EGMAALQSDPWQQELYR Unmodified 2020.9313 0.93127509 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.62 121.62 2 1.5693E-37 126973 QUIQUE_C1218_190116_001 204.85 186.58 1118200000 134870000 150300000 169970000 0 0 119800000 0 113030000 200730000 48898000 0 0 180640000 9858 2539 9230 87259;87260;87261;87262;87263;87264;87265;87266 110764;110765;110766;110767;110768;110769;110770;110771;110772;110773;110774 110765 10 EGMAALQSDPWQQELYR Oxidation (M) 2036.9262 0.92618971 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.26 104.26 2 3.0321E-44 107421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.95 155.19 163580000 0 0 29054000 15461000 23122000 0 0 14545000 45771000 15769000 0 19856000 0 9859 2539 9230 87267;87268;87269;87270;87271;87272;87273;87274 110775;110776;110777;110778;110779;110780;110781;110782 110779 1988 7 EGMELLAR Unmodified 917.46405 0.46405199 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 59.086 59.086 2 0.056145 57676 QUIQUE_C1277_190116_001 54.157 32.611 24079000 0 24079000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9860 4148 9231 87275 110783 110783 1 EGMNIVEAMER 2 Oxidation (M) 1309.5642 0.56423631 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 2 0 4 1 3 3 2 3 2 1 2 4 2 2 2 27.957 27.957 2 0.00064199 22579 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.06 82.285 3116200000 382590000 97987000 358240000 321530000 167780000 248710000 195910000 79441000 111270000 427150000 278610000 204950000 242080000 9861 2772 9232 87276;87277;87278;87279;87280;87281;87282;87283;87284;87285;87286;87287;87288;87289;87290;87291;87292;87293;87294;87295;87296;87297;87298;87299;87300;87301;87302;87303;87304;87305;87306 110784;110785;110786;110787;110788;110789;110790;110791;110792;110793;110794;110795;110796;110797;110798;110799;110800;110801;110802;110803;110804;110805;110806;110807;110808;110809;110810;110811;110812;110813;110814;110815 110808 2203;2204 27 EGMNIVEAMER Oxidation (M) 1293.5693 0.56932169 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 1 0 3 4 3 4 4 4 3 4 4 4 4 4 4 58.045 58.045 2 0.00024362 48266 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 116.21 19782000000 1345000000 2389300000 1421500000 1657100000 1314900000 1694200000 1043700000 1203200000 1353000000 1173700000 1873500000 1524100000 1788700000 9862 2772 9232 87307;87308;87309;87310;87311;87312;87313;87314;87315;87316;87317;87318;87319;87320;87321;87322;87323;87324;87325;87326;87327;87328;87329;87330;87331;87332;87333;87334;87335;87336;87337;87338;87339;87340;87341;87342;87343;87344;87345;87346;87347;87348;87349;87350;87351;87352;87353;87354;87355 110816;110817;110818;110819;110820;110821;110822;110823;110824;110825;110826;110827;110828;110829;110830;110831;110832;110833;110834;110835;110836;110837;110838;110839;110840;110841;110842;110843;110844;110845;110846;110847;110848;110849;110850;110851;110852;110853;110854;110855;110856;110857;110858;110859;110860;110861;110862;110863;110864;110865;110866;110867;110868;110869;110870 110846 2203;2204 52 EGMNIVEAMER Unmodified 1277.5744 0.57440707 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.706 92.706 2 1.9667E-24 96527 QUIQUE_C1218_190116_001 183.43 171.94 27495000000 3163700000 2980200000 2859400000 2615400000 1892800000 2375000000 2624900000 1447300000 1618900000 673190000 1850400000 1478900000 1915300000 9863 2772 9232 87356;87357;87358;87359;87360;87361;87362;87363;87364;87365;87366;87367;87368 110871;110872;110873;110874;110875;110876;110877;110878;110879;110880;110881;110882;110883;110884;110885;110886;110887;110888;110889;110890;110891;110892;110893;110894;110895 110872 25 EGMQLISEKPETEAVVK Oxidation (M) 1902.9608 0.96084389 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 50.338 50.338 2;3 1.5242E-43 47958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 173.68 155.87 4355200000 437700000 516240000 76358000 66268000 507520000 341640000 357070000 462520000 630160000 293040000 126190000 446770000 93750000 9864 2851 9233 87369;87370;87371;87372;87373;87374;87375;87376;87377;87378;87379;87380;87381;87382;87383;87384;87385;87386;87387;87388;87389;87390 110896;110897;110898;110899;110900;110901;110902;110903;110904;110905;110906;110907;110908;110909;110910;110911;110912;110913;110914;110915;110916;110917;110918 110909 2291 14 EGMQLISEKPETEAVVK Unmodified 1886.9659 0.96592926 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 67.14 67.14 2;3 5.0515E-160 67266 QUIQUE_C1277_190116_001 246.86 223.74 21032000000 1870200000 2104100000 1937900000 1592300000 1831000000 929330000 1484900000 1551000000 1756500000 635640000 2111700000 1728200000 1499400000 9865 2851 9233 87391;87392;87393;87394;87395;87396;87397;87398;87399;87400;87401;87402;87403;87404;87405;87406;87407;87408;87409;87410;87411;87412;87413;87414;87415;87416 110919;110920;110921;110922;110923;110924;110925;110926;110927;110928;110929;110930;110931;110932;110933;110934;110935;110936;110937;110938;110939;110940;110941;110942;110943;110944;110945;110946;110947;110948;110949;110950;110951 110922 33 EGMSNNSTTSISQAR Oxidation (M) 1597.7002 0.70021252 2557 P50150 GNG4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-4 yes yes 0 1 0 1 18.321 18.321 2 0.00059843 10554 QUIQUE_C1277_190116_001 77.597 62.917 17835000 0 17835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9866 2557 9234 87417 110952 110952 1996 1 EGMTAFVEK Oxidation (M) 1026.4692 0.46919694 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 22.629 22.629 2 0.018753 15877 QUIQUE_C1277_190116_001 66.621 42.419 220050000 0 61752000 0 0 0 0 0 29514000 0 34455000 57581000 36749000 0 9867 2305 9235 87418;87419;87420;87421;87422 110953;110954;110955;110956;110957 110953 5 EGMTAFVEK Unmodified 1010.4743 0.47428232 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.333 49.333 2 0.0051716 45588 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.308 60.705 1249200000 0 0 0 0 180850000 0 234220000 0 180740000 91736000 303090000 0 258530000 9868 2305 9235 87423;87424;87425;87426;87427;87428 110958;110959;110960;110961;110962;110963;110964;110965 110962 8 EGMTAFVEKR Unmodified 1166.5754 0.57539335 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 35.868 35.868 3 0.038147 31421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.148 20.708 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9869 2305 9236 87429 110966 110966 1 EGMTKEECLQFTANALALAMER Unmodified 2512.176 0.17601517 2275 P28072 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6 yes yes 0 0 1 1 141.05 141.05 3 0.041152 144048 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.185 34.381 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9870 2275 9237 87430 110967 110967 1 EGNAIFTFPNTPVK Unmodified 1533.7827 0.78274359 4660 Q9Y6N5;H3BNX3;H3BMS6 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 106.6 106.6 2 0.0030541 110451 QUIQUE_C1368_190116_001 84.605 67.137 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9871 4660 9238 87431;87432 110968;110969 110968 2 EGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDK Unmodified 2593.3599 0.35991107 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 1 1 1 1 157.48 157.48 3 1.4245E-09 159596 QUIQUE_C1563_190116_001 88.79 76.127 663920000 0 0 0 338100000 0 185430000 0 0 0 140390000 0 0 0 9872 469 9239 87433;87434;87435 110970;110971;110972 110971 2 EGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLR Unmodified 2959.5978 0.59784994 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 147.42 147.42 3;4 9.1849E-144 152112 QUIQUE_C1277_190116_001 198.68 192.58 19236000000 1087000000 1754400000 1678300000 968840000 1509800000 2248900000 1205400000 2090500000 1316800000 396350000 1913000000 1687500000 1378900000 9873 469 9240 87436;87437;87438;87439;87440;87441;87442;87443;87444;87445;87446;87447;87448;87449;87450;87451;87452;87453;87454;87455;87456;87457;87458;87459;87460;87461;87462 110973;110974;110975;110976;110977;110978;110979;110980;110981;110982;110983;110984;110985;110986;110987;110988;110989;110990;110991;110992;110993;110994;110995;110996;110997;110998;110999;111000;111001;111002;111003;111004;111005;111006;111007;111008;111009;111010;111011;111012;111013;111014;111015;111016;111017;111018;111019;111020;111021;111022;111023;111024;111025 110980 53 EGNDLYHEMIESGVINLK Oxidation (M) 2075.9834 0.98337024 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 1 0 2 3 2 4 3 2 2 2 2 3 2 2 1 92.755 92.755 2;3 7.9763E-141 95689 QUIQUE_C1218_190116_001 236.4 198.38 2189700000 99302000 358460000 136290000 350110000 205220000 88746000 89455000 58034000 123600000 347990000 167780000 95507000 69173000 9874 1900;1046 9241 87463;87464;87465;87466;87467;87468;87469;87470;87471;87472;87473;87474;87475;87476;87477;87478;87479;87480;87481;87482;87483;87484;87485;87486;87487;87488;87489;87490;87491;87492 111026;111027;111028;111029;111030;111031;111032;111033;111034;111035;111036;111037;111038;111039;111040;111041;111042;111043;111044;111045;111046;111047;111048;111049;111050;111051;111052;111053;111054;111055;111056;111057 111026 613 32 EGNDLYHEMIESGVINLK Unmodified 2059.9885 0.98845562 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 131.74 131.74 2;3 0 137551 QUIQUE_C1218_190116_001 351.69 324.01 30118000000 3275900000 2566500000 3350400000 2296500000 1794200000 3175200000 2621700000 1669300000 2210500000 815860000 2463500000 1957300000 1920700000 9875 1900;1046 9241 87493;87494;87495;87496;87497;87498;87499;87500;87501;87502;87503;87504;87505;87506;87507;87508;87509;87510;87511;87512;87513;87514;87515;87516;87517;87518;87519 111058;111059;111060;111061;111062;111063;111064;111065;111066;111067;111068;111069;111070;111071;111072;111073;111074;111075;111076;111077;111078;111079;111080;111081;111082;111083;111084;111085;111086;111087;111088;111089;111090;111091;111092;111093;111094;111095;111096;111097;111098;111099;111100;111101;111102;111103;111104;111105;111106;111107;111108;111109;111110;111111;111112;111113;111114;111115;111116 111059 58 EGNPAPEYTWFK Unmodified 1437.6565 0.65648044 1151 H0YEX9;P57087 JAM2 Junctional adhesion molecule B yes no 0 0 0 1 95.491 95.491 2 0.032964 92020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.844 35.228 31475000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31475000 0 0 0 9876 1151 9242 87520 111117 111117 1 EGNPEEDLTADK Unmodified 1316.5732 0.57320432 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.853 37.853 2 8.9169E-05 33720 QUIQUE_C1403_190116_001 121.83 113.07 3994500000 182280000 242610000 340380000 249770000 319030000 313190000 345650000 268120000 403700000 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87535;87536;87537;87538;87539;87540;87541;87542;87543;87544;87545;87546;87547 111147;111148;111149;111150;111151;111152;111153;111154;111155;111156;111157;111158;111159 111149 12 EGPAVVGQFIQDVK Unmodified 1485.7827 0.78274359 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.05 111.05 2 8.931E-11 114004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.9 153.14 5861100000 502390000 482980000 417980000 328750000 551470000 331810000 503300000 499330000 508380000 178860000 480780000 541990000 533080000 9880 3499 9246 87548;87549;87550;87551;87552;87553;87554;87555;87556;87557;87558;87559;87560;87561 111160;111161;111162;111163;111164;111165;111166;111167;111168;111169;111170;111171;111172;111173;111174;111175;111176;111177;111178;111179;111180;111181;111182;111183;111184;111185;111186 111174 27 EGPCLVHTITGDLLR Unmodified 1679.8665 0.86648999 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.37 105.37 3 4.1927E-06 108355 QUIQUE_C1277_190116_001 77.222 59.522 190110000 30113000 31704000 0 22966000 0 0 24892000 24137000 22450000 0 0 33851000 0 9881 264 9247 87562;87563;87564;87565;87566;87567;87568 111187;111188;111189;111190;111191;111192;111193 111188 6 EGPDLDRPGSDR Unmodified 1312.6008 0.60075648 3463 Q7Z4V5;A0A087WZ99 HDGFRP2 Hepatoma-derived growth factor-related protein 2 yes no 0 0 1 1 1 20.771 20.771 3 0.0062691 13975 QUIQUE_C1438_190116_001 51.875 11.873 76543000 0 0 0 37926000 38617000 0 0 0 0 0 0 0 0 9882 3463 9248 87569;87570 111194;111195 111195 2 EGPEGFAR Unmodified 861.39808 0.39808091 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.793 24.793 2 0.0099596 18453 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.9 10.519 447000000 0 0 99786000 0 0 78625000 0 0 0 34956000 147100000 86534000 0 9883 2026 9249 87571;87572;87573;87574;87575 111196;111197;111198;111199;111200 111199 5 EGPEGNDIR Unmodified 985.44649 0.44648767 2854;2853 Q01433;H0Y360;H0YF16;Q01432 AMPD2;AMPD3 AMP deaminase 2;AMP deaminase 3 no no 0 0 0 1 16.202 16.202 2 0.004515 8262 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.819 71.877 43314000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43314000 0 0 0 9884 2854;2853 9250 87576 111201 111201 1 EGPETPPRPR Unmodified 1134.5782 0.57817054 513 A0A5E8;Q99501 GAS2L1 GAS2-like protein 1 yes no 0 0 1 1 14.302 14.302 3 0.026684 6604 QUIQUE_C1403_190116_001 60.398 48.235 16074000 0 0 0 16074000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9885 513 9251 87577 111202 111202 0 EGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIPETEPLQSPTTK Unmodified 4336.1944 0.19435588 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7;Q5T3T1 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 168.71 168.71 4 0.00013305 170578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.357 35.116 48943000 0 0 0 0 0 0 0 48943000 0 0 0 0 0 9886 985 9252 87578 111203 111203 0 EGPFYPTLR Unmodified 1078.5447 0.54474515 4486 Q9ULC4 MCTS1 Malignant T-cell-amplified sequence 1 yes yes 0 0 0 1 76.418 76.418 2 0.025868 72163 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.981 40.198 80384000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80384000 0 0 0 9887 4486 9253 87579 111204 111204 1 EGPGLAELLANVASSILSHIK Unmodified 2118.1685 0.1684689 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 176.36 176.36 3 0.032988 180977 QUIQUE_C1576_190116_001 19.722 16.434 45129000 0 0 0 0 0 0 45129000 0 0 0 0 0 0 9888 4449 9254 87580 111205 111205 1 EGPGPEDTVQDNLGAAGAEEEQEEHQK Unmodified 2863.238 0.23801762 847 E7EMG9;P33241;C9JU59;E9PBD8;C9JKF7 LSP1 Lymphocyte-specific protein 1 yes no 0 0 0 1 1 73.023 73.023 3 1.8813E-27 72479 QUIQUE_C1403_190116_001 110.75 100.23 47766000 0 0 0 30074000 0 0 0 0 0 17692000 0 0 0 9889 847 9255 87581;87582 111206;111207 111206 2 EGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEK Unmodified 2681.3119 0.31191502 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4;H0Y4E0 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 135.97 135.97 3 7.2425E-06 140781 QUIQUE_C1218_190116_001 56.562 37.681 119100000 119100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9890 4622 9256 87583 111208 111208 1 EGPIGGESDSEEVR Unmodified 1459.6427 0.64268087 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.135 34.135 2 0.0041261 29842 QUIQUE_C1218_190116_001 66.267 45.396 107620000 40581000 0 33335000 0 0 0 0 0 33703000 0 0 0 0 9891 947 9257 87584;87585;87586;87587 111209;111210;111211;111212 111209 4 EGPLSVFGDR Unmodified 1075.5298 0.52982336 2132 P17987;E7ERF2;F5GZ03;F5GZI8;F5GYL4 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 154.39 154.39 2 0.028317 156944 QUIQUE_C1563_190116_001 55.064 36.333 3214500 0 0 0 0 0 3214500 0 0 0 0 0 0 0 9892 2132 9258 87588 111213 111213 1 EGPPSEHSGMSR Unmodified 1269.5408 0.54079876 171 A0A0A0MSA9;A0A0C4DG49 PVR yes no 0 0 0 1 11.239 11.239 3 0.0036377 3567 QUIQUE_C1403_190116_001 57.802 43.135 3587000 0 0 0 3587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9893 171 9259 87589 111214 111214 1 EGPVLILGR Unmodified 952.57057 0.57056597 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.613 73.613 2 0.0016745 73906 QUIQUE_C1368_190116_001 101.28 55.268 360260000 36198000 40745000 35774000 30234000 32855000 38667000 39312000 18233000 0 0 24504000 26954000 36782000 9894 2140 9260 87590;87591;87592;87593;87594;87595;87596;87597;87598;87599;87600;87601 111215;111216;111217;111218;111219;111220;111221;111222;111223;111224;111225;111226 111217 12 EGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESAAVK Unmodified 2583.318 0.31804626 3956 Q99497;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 130.59 130.59 2;3 4.5661E-99 135527 QUIQUE_C1368_190116_001 180.63 167.04 41682000000 3067100000 3164700000 3356800000 2981500000 3782300000 3230200000 2882400000 3777400000 3617400000 1664700000 3581400000 3455500000 3120100000 9895 3956 9261 87602;87603;87604;87605;87606;87607;87608;87609;87610;87611;87612;87613;87614;87615;87616;87617;87618;87619;87620;87621;87622;87623;87624;87625;87626;87627 111227;111228;111229;111230;111231;111232;111233;111234;111235;111236;111237;111238;111239;111240;111241;111242;111243;111244;111245;111246;111247;111248;111249;111250;111251;111252;111253;111254;111255;111256;111257;111258;111259;111260;111261;111262;111263;111264;111265;111266;111267;111268;111269;111270;111271;111272;111273;111274;111275;111276;111277;111278;111279;111280 111236 54 EGPYSISVLYGDEEVPR Unmodified 1908.9105 0.91052288 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.78 118.78 2 3.567E-11 122277 QUIQUE_C1277_190116_001 148.68 110.28 1251400000 76745000 100210000 105690000 107240000 135500000 77367000 73300000 115460000 104630000 55987000 112780000 118140000 68312000 9896 2178 9262 87628;87629;87630;87631;87632;87633;87634;87635;87636;87637;87638;87639;87640 111281;111282;111283;111284;111285;111286;111287;111288;111289;111290;111291;111292;111293;111294;111295;111296 111282 15 EGQETLVKEEVEAFLR Unmodified 1875.9578 0.95780742 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 1 1 1 135.37 135.37 3 0.0065536 140297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.445 46.633 38312000 0 0 0 0 0 0 0 0 18162000 0 0 20150000 0 9897 528 9263 87641;87642 111297;111298 111297 0 EGQGFVSEDEYLEISDIKR Unmodified 2213.0488 0.048807271 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.69 105.69 3 2.9474E-05 108792 QUIQUE_C1277_190116_001 66.874 58.785 1206100000 91140000 114810000 158620000 132850000 131920000 0 130650000 67491000 74749000 0 111000000 91663000 101220000 9898 3092 9264 87643;87644;87645;87646;87647;87648;87649;87650;87651;87652;87653 111299;111300;111301;111302;111303;111304;111305;111306;111307;111308;111309;111310;111311 111300 12 EGQGGPGSVSVDVK Unmodified 1314.6416 0.64155866 16;1475 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87679;87680;87681;87682;87683;87684;87685;87686;87687;87688;87689;87690;87691;87692;87693;87694;87695;87696;87697;87698;87699;87700;87701;87702;87703;87704 111337;111338;111339;111340;111341;111342;111343;111344;111345;111346;111347;111348;111349;111350;111351;111352;111353;111354;111355;111356;111357;111358;111359;111360;111361;111362;111363;111364;111365;111366;111367;111368;111369;111370;111371 111343 33 EGQVDVASVLLEAGAAHSLATKK Unmodified 2293.2278 0.22777469 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 1 109.9 109.9 4 0.047168 113329 QUIQUE_DMIX7_190116_001 18.101 14.703 55008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55008000 0 9904 1255;2856 9270 87705 111372 111372 1 EGREESEAEAPR Unmodified 1358.6062 0.60623578 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 10.393 10.393 3 1.3512E-09 2758 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.56 107.19 21014000 0 0 0 0 0 0 0 12127000 0 8886900 0 0 0 9905 2515 9271 87706;87707 111373;111374;111375 111373 3 EGRPPEPTPAK Unmodified 1177.6091 0.60913632 4529 Q9UQ35 SRRM2 Serine/arginine repetitive matrix protein 2 yes yes 0 0 1 1 10.503 10.503 3 0.059178 2953 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.245 14.101 5447400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5447400 0 0 0 9906 4529 9272 87708 111376 111376 1 EGRPSGEAFVELESEDEVK Unmodified 2105.9753 0.97530798 905 E9PCY7;G8JLB6;P31943;D6RIT2;D6RIU0;D6RBM0;E7EQJ0;D6RAM1;D6R9T0;D6RFM3;D6RDU3;D6RJ04;D6RIH9;E7EN40;D6RDL0 HNRNPH1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 80.001 80.001 3 0.0011585 79758 QUIQUE_C1563_190116_001 58.848 46.575 201250000 44075000 0 0 0 67232000 38187000 0 0 0 0 0 51757000 0 9907 905 9273 87709;87710;87711;87712;87713 111377;111378;111379;111380;111381;111382;111383 111382 7 EGSALTEGAKEEGGEEVAK Unmodified 1889.8854 0.88543034 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.603 30.603 2;3 0 25482 QUIQUE_C1438_190116_001 290.71 266.64 6894300000 580880000 605120000 744310000 613510000 522760000 443370000 746530000 479020000 407510000 165920000 544380000 387540000 653420000 9908 143;560;4559 9274 87714;87715;87716;87717;87718;87719;87720;87721;87722;87723;87724;87725;87726;87727;87728;87729;87730;87731;87732;87733;87734;87735;87736;87737;87738;87739 111384;111385;111386;111387;111388;111389;111390;111391;111392;111393;111394;111395;111396;111397;111398;111399;111400;111401;111402;111403;111404;111405;111406;111407;111408;111409;111410;111411;111412;111413;111414 111396 31 EGSGGGGGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSR Unmodified 2990.3076 0.3075747 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 170.93 170.93 3 1.6197E-19 178313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.588 75.277 148550000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90156000 58397000 0 9909 1600 9275 87740;87741 111415;111416 111415 2 EGSGIGAIDSNLDWSHNFTNMLGYTDHQFTELTR Oxidation (M) 3841.7278 0.72783084 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 143.52 143.52 3;4 1.1858E-21 149142 QUIQUE_C1368_190116_001 82.058 72.43 1749900000 83549000 381810000 251560000 114950000 100850000 82868000 0 0 213800000 193400000 185000000 0 142090000 9910 612 9276 87742;87743;87744;87745;87746;87747;87748;87749;87750;87751;87752;87753;87754;87755 111417;111418;111419;111420;111421;111422;111423;111424;111425;111426;111427;111428;111429;111430 111421 399 13 EGSGIGAIDSNLDWSHNFTNMLGYTDHQFTELTR Unmodified 3825.7329 0.73291622 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 158.81 158.81 3;4 3.2738E-236 162726 QUIQUE_C1277_190116_001 226.5 218.5 11313000000 588910000 1711500000 921740000 0 447950000 312330000 823110000 734660000 1019000000 33417000 2398900000 1483300000 838030000 9911 612 9276 87756;87757;87758;87759;87760;87761;87762;87763;87764;87765;87766;87767;87768;87769;87770;87771 111431;111432;111433;111434;111435;111436;111437;111438;111439;111440;111441;111442;111443;111444;111445;111446;111447;111448;111449;111450;111451;111452 111432 22 EGSIEIDIPVPK Unmodified 1295.6973 0.69728262 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.38 104.38 2 0.0016497 107617 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.974 62.861 407810000 38435000 33365000 46319000 0 0 34666000 0 32583000 53000000 15039000 52850000 45734000 55815000 9912 3933 9277 87772;87773;87774;87775;87776;87777;87778;87779;87780;87781 111453;111454;111455;111456;111457;111458;111459;111460;111461;111462;111463 111463 5 EGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK Unmodified 1972.9814 0.98139641 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 30.209 30.209 2;3 6.0386E-13 24665 QUIQUE_C1403_190116_001 106.16 91.469 735710000 88188000 58620000 70950000 130130000 65065000 130570000 97247000 0 0 0 0 34962000 59986000 9913 135 9278 87782;87783;87784;87785;87786;87787;87788;87789;87790;87791;87792;87793 111464;111465;111466;111467;111468;111469;111470;111471;111472;111473;111474;111475;111476 111470 13 EGSLGDELLPLGYSEPEQQEGASAGAPSPTLELASR Unmodified 3654.7537 0.75369447 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.21 148.21 3 3.8233E-54 152273 QUIQUE_C1277_190116_001 105.48 96.179 1444200000 99482000 87741000 135150000 149890000 138920000 95898000 62428000 120830000 143140000 70900000 155860000 89032000 94887000 9914 3827 9279 87794;87795;87796;87797;87798;87799;87800;87801;87802;87803;87804;87805;87806 111477;111478;111479;111480;111481;111482;111483;111484;111485;111486;111487;111488;111489 111478 13 EGSLKDQLALAIGK Unmodified 1441.814 0.81404372 2467 P43897;C9JT21 TSFM Elongation factor Ts, mitochondrial;Elongation factor Ts yes no 0 0 1 1 1 86.228 86.228 3 0.036796 89238 QUIQUE_C1438_190116_001 41.092 28.296 69462000 0 0 0 0 20313000 0 0 0 0 0 0 49150000 0 9915 2467 9280 87807;87808 111490;111491 111490 2 EGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPK Unmodified 4408.2802 0.28021078 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 169.61 169.61 4 0.0092566 174055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 19.611 18.307 92449000 0 0 0 0 0 0 0 0 34365000 0 58084000 0 0 9916 1408 9281 87809;87810 111492;111493 111492 2 EGSLVINSK Unmodified 945.51311 0.51311067 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 24.099 24.099 2 0.052818 17676 QUIQUE_C1368_190116_001 49.96 0.90219 21201000 0 0 21201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9917 4620 9282 87811 111494 111494 1 EGSQGELTPANSQSR Unmodified 1559.7176 0.71757715 721 C9JFE4;Q13098;A0A096LP07;A0A096LPJ3;A8K070;J3QQX0 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.399 20.399 2 1.4399E-129 13713 QUIQUE_DMIX1_190116_001 237.67 198.05 1102800000 106380000 138910000 0 68186000 115200000 0 80211000 90917000 118030000 41400000 143950000 92266000 107360000 9918 721 9283 87812;87813;87814;87815;87816;87817;87818;87819;87820;87821;87822 111495;111496;111497;111498;111499;111500;111501;111502;111503;111504;111505 111500 11 EGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAK Unmodified 2996.2014 0.20141692 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 54.024 54.024 3 3.4412E-65 52638 QUIQUE_C1576_190116_001 156.7 154.91 126790000 0 59610000 0 0 0 0 67178000 0 0 0 0 0 0 9919 869 9284 87823;87824 111506;111507 111507 2 EGSTHNWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVER Oxidation (M) 3460.5929 0.59285769 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 116.8 116.8 4;5 2.2244E-15 120806 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111519;111520;111521;111522;111523;111524;111525;111526;111527;111528;111529;111530;111531;111532;111533;111534;111535;111536;111537;111538;111539;111540;111541;111542;111543;111544;111545;111546;111547;111548;111549;111550;111551;111552;111553;111554;111555;111556;111557;111558;111559;111560;111561;111562;111563;111564;111565;111566;111567;111568;111569;111570;111571;111572;111573;111574;111575;111576;111577;111578;111579;111580;111581;111582;111583;111584;111585;111586;111587;111588 111532 70 EGSVMLQVDVDTVK Unmodified 1518.76 0.75995923 2978 Q13228 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 92.261 92.261 2 0.0013114 87980 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.533 62.627 57413000 0 0 0 0 0 0 0 20459000 0 36955000 0 0 0 9922 2978 9286 87874;87875;87876 111589;111590;111591;111592 111591 4 EGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKK Unmodified 3815.9622 0.9621711 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 2 174.18 174.18 3;4 1.3701E-16 181056 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111779;111780;111781;111782;111783;111784;111785;111786;111787;111788 111784 9 EGVKFDESEKTK Unmodified 1395.6882 0.6881745 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 2 2 1 14.508 14.508 2;3 0.020501 6763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.989 51.601 208100000 0 0 0 0 0 0 0 128320000 79779000 0 0 0 0 9944 2079 9307 88048;88049;88050 111789;111790;111791 111789 3 EGVKTENDHINLK Unmodified 1495.7631 0.76307078 563 A8MUA9;A8MU27;P55854 SUMO3 Small ubiquitin-related modifier 3 yes no 0 0 1 1 18.394 18.394 3 0.040495 11117 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.106 42.164 50467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50467000 0 0 9945 563 9308 88051 111792 111792 0 EGVLYVGSK Unmodified 950.5073 0.50729701 2410;3170 P37840;E7EPV7;D6RA31;Q16143 SNCA;SNCB Alpha-synuclein;Beta-synuclein no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 39.13 39.13 1;2 0.0010925 35115 QUIQUE_C1368_190116_001 106.93 80.703 18278000000 2127500000 2007200000 1148200000 1620500000 1456600000 916390000 1656300000 1222000000 1146500000 577990000 1362500000 1126200000 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88110;88111;88112;88113;88114;88115;88116;88117;88118;88119;88120;88121;88122;88123;88124;88125;88126;88127;88128;88129;88130;88131 111857;111858;111859;111860;111861;111862;111863;111864;111865;111866;111867;111868;111869;111870;111871;111872;111873;111874;111875;111876;111877;111878;111879;111880;111881;111882;111883 111863 21 EGVVQGVASVAEK Unmodified 1271.6721 0.67213051 3170 Q16143 SNCB Beta-synuclein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.428 57.428 2 0.00032416 56844 QUIQUE_C1438_190116_001 136.5 85.523 13616000000 1439600000 1578000000 756940000 1115700000 1347100000 0 981170000 960590000 1015800000 379740000 1474000000 899410000 1668400000 9954 3170 9317 88132;88133;88134;88135;88136;88137;88138;88139;88140;88141;88142;88143 111884;111885;111886;111887;111888;111889;111890;111891;111892;111893;111894;111895;111896;111897;111898;111899 111890 14 EGVYELATFQMK Unmodified 1414.6803 0.68025235 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 110.63 110.63 2 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111915;111916;111917 111916 2947 2 EGVYELATFQMKPGGPALWGDAFKR Unmodified 2767.3792 0.37920673 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 2 1 2 1 1 134.56 134.56 3;4 5.9979E-05 137889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.029 43.231 323030000 0 0 0 0 0 0 0 83120000 108470000 0 0 70547000 60892000 9958 4419 9320 88162;88163;88164;88165;88166 111918;111919;111920;111921;111922 111918 5 EGVYELAVFQMK Unmodified 1412.701 0.70098779 4009 Q9BS92 NIPSNAP3B Protein NipSnap homolog 3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.8 126.8 2 0.00122 131285 QUIQUE_C1368_190116_001 82.749 58.406 170160000 0 41114000 34774000 41569000 26945000 0 25761000 0 0 0 0 0 0 9959 4009 9321 88167;88168;88169;88170;88171;88172;88173 111923;111924;111925;111926;111927;111928;111929;111930 111925 6 EGVYTVFAPTNEAFR Unmodified 1699.8206 0.82058566 3146 Q15582;H0Y8L3 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 114.62 114.62 2 0.01764 111411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.344 37.925 0 0 0 0 0 0 0 0 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EGWPNSPYGVSK Unmodified 1319.6146 0.61461563 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 66.104 66.104 2 0.004922 66024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.441 52.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9963 1659 9325 88193 111959 111959 1 EGWPSSAYGVTK Unmodified 1280.6037 0.60371659 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.675 65.675 2 0.0038048 65129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.03 49.582 11454000000 0 0 0 0 1473500000 1454900000 1588700000 1348500000 1645100000 559410000 0 1345200000 2038200000 9964 2102 9326 88194;88195;88196;88197;88198;88199;88200;88201 111960;111961;111962;111963;111964;111965;111966;111967;111968;111969;111970;111971;111972;111973;111974;111975 111966 16 EGYAWAEDKEHCEEYGR Unmodified 2127.8592 0.85923236 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 1 3 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 47.195 47.195 2;3;4 0 44666 QUIQUE_C1218_190116_001 338.12 324.09 1956900000 542700000 175380000 140460000 150390000 72628000 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112001;112002;112003;112004;112005;112006;112007;112008;112009;112010;112011;112012;112013;112014;112015;112016;112017;112018;112019;112020;112021;112022;112023;112024;112025;112026;112027;112028;112029;112030 112019 29 EGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPK Unmodified 3751.7941 0.79405992 2933 Q09028 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 152.2 152.2 4 0.00053478 156592 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.727 28.821 424050000 0 0 0 0 0 0 73056000 63913000 70171000 0 0 126870000 90041000 9967 2933 9329 88249;88250;88251;88252;88253 112031;112032;112033;112034;112035 112034 4 EGYLQIGANTQAAQK Unmodified 1590.8002 0.80018457 2205 P23141;H3BQV8;A0A140TA63 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 59.101 59.101 2 0.02875 57116 QUIQUE_C1403_190116_001 45.004 26.332 45538000 0 0 0 32671000 0 0 0 0 0 12866000 0 0 0 9968 2205 9330 88254;88255 112036;112037 112036 2 EGYSGVGLLSR Unmodified 1136.5826 0.58258722 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 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112060;112061;112062;112063;112064;112065;112066;112067;112068;112069;112070;112071 112069 9 EHALAQAELLKR Unmodified 1377.7728 0.7728476 1483 O15126;A0A087WXB0;A0A087WTX8;A0A087WZA6 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 1 1 30.938 30.938 3 0.0009562 25722 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.69 72.29 45182000 0 0 0 0 0 0 0 45182000 0 0 0 0 0 9974 1483 9336 88288 112072 112072 0 EHALLAYTLGVK Unmodified 1313.7343 0.73433683 2794;469 A0A2U3TZH3;Q05639;A0A2R8Y488;A0A2R8Y660;P68104;Q5VTE0;A0A087WV01 EEF1A2;EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 2;Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha no no 0 0 0 3 5 3 4 3 3 5 6 4 3 5 3 2 76.66 76.66 2;3 1.7394E-45 76743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 232.84 208.06 36999000000 1801400000 2340800000 4006200000 2979800000 2448000000 2376400000 3462300000 2427600000 3188200000 1076600000 4492900000 3426700000 2972200000 9975 469;2794 9337 88289;88290;88291;88292;88293;88294;88295;88296;88297;88298;88299;88300;88301;88302;88303;88304;88305;88306;88307;88308;88309;88310;88311;88312;88313;88314;88315;88316;88317;88318;88319;88320;88321;88322;88323;88324;88325;88326;88327;88328;88329;88330;88331;88332;88333;88334;88335;88336;88337 112073;112074;112075;112076;112077;112078;112079;112080;112081;112082;112083;112084;112085;112086;112087;112088;112089;112090;112091;112092;112093;112094;112095;112096;112097;112098;112099;112100;112101;112102;112103;112104;112105;112106;112107;112108;112109;112110;112111;112112;112113;112114;112115;112116;112117;112118;112119;112120;112121;112122;112123;112124;112125;112126;112127;112128;112129;112130;112131;112132;112133;112134;112135;112136;112137;112138;112139;112140;112141;112142;112143;112144;112145;112146;112147;112148;112149;112150;112151;112152;112153;112154;112155;112156;112157 112121 83 EHAPSIIFMDEIDSIGSSR Unmodified 2102.9943 0.99426928 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 132.15 132.15 2;3 8.0636E-37 135130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.59 104.58 1764100000 161800000 180550000 149670000 139700000 109480000 129610000 185930000 123010000 118440000 48807000 100570000 134060000 182530000 9976 2743 9338 88338;88339;88340;88341;88342;88343;88344;88345;88346;88347;88348;88349;88350;88351;88352;88353;88354;88355;88356 112158;112159;112160;112161;112162;112163;112164;112165;112166;112167;112168;112169;112170;112171;112172;112173;112174;112175;112176;112177;112178;112179;112180 112173 22 EHASIDAQSGAGVPNPSTSASPK Unmodified 2207.0455 0.045453228 3549 Q8IXJ6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 40.206 40.206 2;3 2.7915E-248 36947 QUIQUE_C1218_190116_001 268.2 242.21 1207900000 152180000 130400000 132180000 72283000 125760000 0 109960000 63973000 80139000 65600000 105360000 75775000 94268000 9977 3549 9339 88357;88358;88359;88360;88361;88362;88363;88364;88365;88366;88367;88368;88369;88370;88371 112181;112182;112183;112184;112185;112186;112187;112188;112189;112190;112191;112192;112193;112194;112195;112196;112197;112198;112199 112182 19 EHASSLASAGLK Unmodified 1169.6041 0.60405094 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 19.864 19.864 2 0.0033196 12639 QUIQUE_C1368_190116_001 72.434 51.487 157630000 0 51152000 38623000 0 0 0 67859000 0 0 0 0 0 0 9978 1479 9340 88372;88373;88374 112200;112201;112202 112201 3 EHASSLASSGLK Unmodified 1185.599 0.59896556 1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2 ERC1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.591 16.591 2 0.0022521 8788 QUIQUE_C1277_190116_001 81.771 63.368 39349000 0 0 19523000 0 0 0 19826000 0 0 0 0 0 0 9979 1107 9341 88375;88376;88377;88378;88379;88380;88381;88382 112203;112204;112205;112206;112207;112208;112209;112210 112203 8 EHAVEGDCDFQLLK Unmodified 1659.7563 0.75627084 748 C9JV77;P02765 AHSG 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P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 26.807 26.807 2 0.057511 21126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.853 34.876 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9985 2657 9346 88421 112251 112251 1 EHDVQNTFEELEK Unmodified 1616.7318 0.73183023 3594 Q8N4T8;H0Y962 CBR4 Carbonyl reductase family member 4 yes no 0 0 0 1 68.095 68.095 3 0.00049299 68055 QUIQUE_C1218_190116_001 55.98 40.039 33216000 33216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9986 3594 9347 88422 112252 112252 1 EHDYRDEHFDFIQSHIR Unmodified 2243.0144 0.014427871 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 64.196 64.196 3;5 0.0001053 63581 QUIQUE_C1277_190116_001 80.738 71.048 581380000 39838000 108490000 66872000 58008000 56576000 69216000 0 0 39409000 28268000 69437000 45264000 0 9987 4653 9348 88423;88424;88425;88426;88427;88428;88429;88430;88431;88432;88433 112253;112254;112255;112256;112257;112258;112259;112260;112261;112262;112263;112264;112265;112266;112267 112255 14 EHDYRDEHLDFIQSHLR Unmodified 2209.0301 0.030077935 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 1 2 3 3 3 3 2 3 1 3 2 1 2 3 63.853 63.853 3;4;5 1.1711E-37 63165 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.43 152.48 3565400000 255730000 490180000 483140000 381510000 339820000 170670000 389120000 105430000 290840000 145890000 66028000 169330000 277750000 9988 1515 9349 88434;88435;88436;88437;88438;88439;88440;88441;88442;88443;88444;88445;88446;88447;88448;88449;88450;88451;88452;88453;88454;88455;88456;88457;88458;88459;88460;88461;88462;88463;88464 112268;112269;112270;112271;112272;112273;112274;112275;112276;112277;112278;112279;112280;112281;112282;112283;112284;112285;112286;112287;112288;112289;112290;112291;112292;112293;112294;112295;112296;112297;112298;112299;112300;112301;112302;112303;112304;112305;112306;112307 112299 36 EHEEFQITAK Unmodified 1230.5881 0.58806652 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7;F5H228 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 29.952 29.952 3 0.025803 24508 QUIQUE_C1218_190116_001 41.664 33.532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9989 1674 9350 88465 112308 112308 1 EHEHVVECISWAPESSYSSISEATGSETK Unmodified 3235.4252 0.42516646 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 96.782 96.782 3;4 3.5626E-45 99238 QUIQUE_C1277_190116_001 134.4 126.59 1032800000 63063000 201220000 177560000 156880000 148640000 125600000 159880000 0 0 0 0 0 0 9990 2460 9351 88466;88467;88468;88469;88470;88471;88472;88473;88474;88475;88476;88477;88478 112309;112310;112311;112312;112313;112314;112315;112316;112317;112318;112319;112320;112321;112322;112323 112311 13 EHEHVVECISWAPESSYSSISEATGSETKK Unmodified 3363.5201 0.52012948 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.754 84.754 4 2.0196E-35 86515 QUIQUE_C1368_190116_001 115.69 108.68 387230000 0 0 62125000 41309000 63580000 0 52919000 48369000 0 0 0 55157000 63772000 9991 2460 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112341;112342;112343;112344;112345;112346;112347;112348;112349;112350;112351;112352;112353;112354;112355;112356;112357;112358 112342 17 EHFAQFGHVR Unmodified 1226.5945 0.59448931 40 A0A087WUN7;H0YJ40;G3V4X6;G3V2S9;Q9GZT3;H0YJW7;H0YJ07;H0YJU7 SLIRP SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 22.846 22.846 2;3 0.0033397 16390 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.01 96.314 48018000 0 0 0 0 0 0 0 48018000 0 0 0 0 0 9994 40 9355 88507;88508;88509 112359;112360;112361 112360 2 EHFFDLYR Unmodified 1125.5243 0.52434406 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.624 76.624 3 0.0078407 77031 QUIQUE_C1403_190116_001 63.48 46.24 9071600 0 0 0 9071600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9995 1255;2856 9356 88510;88511;88512;88513;88514;88515;88516;88517;88518;88519 112362;112363;112364;112365;112366;112367;112368;112369;112370;112371 112363 10 EHFQDDVFNEK Unmodified 1406.6103 0.61025853 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 48.697 48.697 2;3 0.00038223 44870 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.815 64.331 447670000 33661000 30793000 70919000 77590000 24619000 51054000 21318000 0 29010000 29864000 27239000 16995000 34611000 9996 2465 9357 88520;88521;88522;88523;88524;88525;88526;88527;88528;88529;88530;88531;88532;88533;88534 112372;112373;112374;112375;112376;112377;112378;112379;112380;112381;112382;112383;112384;112385;112386 112381 14 EHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLK Unmodified 3472.4824 0.48236376 3055;1065 Q14240;E7EQG2;E7EMV8;E9PBH4;C9JUF0;F8WE11 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.49 167.49 3 6.7125E-157 171055 QUIQUE_C1277_190116_001 196.08 190.92 1266300000 26684000 115660000 0 0 62610000 65732000 99271000 104730000 172110000 0 297660000 161300000 160550000 9997 3055;1065 9358 88535;88536;88537;88538;88539;88540;88541;88542;88543;88544 112387;112388;112389;112390;112391;112392;112393;112394;112395;112396;112397 112388 11 EHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLK Oxidation (M) 3488.4773 0.47727839 3055;1065 Q14240;E7EQG2;E7EMV8;E9PBH4;C9JUF0;F8WE11 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 1 0 1 163.47 163.47 3 1.6657E-25 165726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.123 85.408 37607000 0 0 0 0 0 0 0 37607000 0 0 0 0 0 9998 3055;1065 9358 88545 112398 112398 628 1 EHGLIFMETSAK Unmodified 1361.6649 0.66493664 2707;3697 P61019;H7C125;Q8WUD1;A0A3B3ITL1 RAB2A;RAB2B Ras-related protein Rab-2A;Ras-related protein Rab-2B no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 60.534 60.534 2;3 4.8693E-06 60122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.86 155.77 3761200000 318480000 371910000 392380000 174430000 278360000 286270000 351440000 226640000 313380000 87930000 397720000 162810000 399460000 9999 2707;3697 9359 88546;88547;88548;88549;88550;88551;88552;88553;88554;88555;88556;88557;88558;88559;88560;88561;88562;88563;88564;88565;88566;88567;88568;88569 112399;112400;112401;112402;112403;112404;112405;112406;112407;112408;112409;112410;112411;112412;112413;112414;112415;112416;112417;112418;112419;112420;112421;112422;112423;112424;112425;112426 112416 24 EHGLNPDVVQNIQDICNSK Unmodified 2179.0328 0.032780052 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 91.184 91.184 3 0.0089932 92273 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.919 41.969 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10000 3453 9360 88570 112427 112427 1 EHGPENIVMAIAGNK Unmodified 1578.7824 0.78242601 3021 Q13636 RAB31 Ras-related protein Rab-31 yes yes 0 0 0 1 1 84.722 84.722 3 0.00053172 85056 QUIQUE_C1563_190116_001 51.03 33.819 37580000 0 16843000 0 0 0 20737000 0 0 0 0 0 0 0 10001 3021 9361 88571;88572 112428;112429 112429 1 EHGQIEFYR Unmodified 1177.5516 0.55162144 3498 Q86VN1;A0A3B3ISW7 VPS36 Vacuolar protein-sorting-associated protein 36 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 34.318 34.318 3 0.029699 29100 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.922 20.307 71284000 0 0 0 0 0 15757000 0 0 0 9486500 29456000 0 16584000 10002 3498 9362 88573;88574;88575;88576;88577 112430;112431;112432;112433;112434 112434 5 EHHFEAIALVEK Unmodified 1421.7303 0.73031409 1528 O43488;H3BLU7 AKR7A2 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 50.427 50.427 2;3 1.6327E-146 49486 QUIQUE_C1218_190116_001 265.01 228.32 9337200000 957590000 670260000 747130000 750280000 704870000 683200000 628920000 745530000 773610000 399410000 790310000 633680000 852420000 10003 1528 9363 88578;88579;88580;88581;88582;88583;88584;88585;88586;88587;88588;88589;88590;88591;88592;88593;88594;88595;88596;88597;88598;88599;88600;88601;88602;88603;88604 112435;112436;112437;112438;112439;112440;112441;112442;112443;112444;112445;112446;112447;112448;112449;112450;112451;112452;112453;112454;112455;112456;112457;112458;112459;112460;112461;112462;112463;112464;112465;112466;112467;112468;112469;112470;112471;112472;112473;112474;112475;112476;112477;112478;112479;112480;112481;112482;112483;112484;112485;112486;112487 112436 53 EHHFGSSGMTLHER Unmodified 1623.7212 0.72122274 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 0 2 1 1 18.395 18.395 3;4 0.0058762 10923 QUIQUE_C1218_190116_001 47.774 42.059 130300000 55980000 43508000 0 0 0 0 0 30813000 0 0 0 0 0 10004 504 9364 88605;88606;88607;88608 112488;112489;112490;112491 112489 4 EHHFGSSGMTLHER Oxidation (M) 1639.7161 0.71613736 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 10.476 10.476 3;4 0.00012958 2868 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.566 79.675 139740000 0 6432800 0 0 0 0 0 41146000 29734000 11732000 0 50698000 0 10005 504 9364 88609;88610;88611;88612;88613;88614 112492;112493;112494;112495;112496;112497 112494 357 6 EHHTTGLTWSK Unmodified 1295.6258 0.62584901 2422 P40123;E9PDI2;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 17.26 17.26 2;3 0.00062439 9570 QUIQUE_C1277_190116_001 97.565 51.885 2250400000 86920000 295560000 47742000 355140000 242330000 39669000 0 0 150220000 137430000 169030000 286350000 440030000 10006 2422 9365 88615;88616;88617;88618;88619;88620;88621;88622;88623;88624;88625;88626;88627;88628;88629;88630;88631;88632;88633 112498;112499;112500;112501;112502;112503;112504;112505;112506;112507;112508;112509;112510;112511;112512;112513;112514;112515;112516;112517 112500 15 EHIEELLR Unmodified 1037.5506 0.55055881 2717 P61201;B4DIH5;H0YMC2 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.997 44.997 2 0.00062973 42835 QUIQUE_C1218_190116_001 152.41 39.819 856190000 87006000 0 87604000 113670000 88333000 73375000 96270000 47323000 0 0 92262000 72831000 97518000 10007 2717 9366 88634;88635;88636;88637;88638;88639;88640;88641;88642;88643 112518;112519;112520;112521;112522;112523;112524;112525;112526;112527;112528 112518 11 EHIEQQIQTYQR Unmodified 1571.7692 0.76921879 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 36.449 36.449 2 0.00017633 32210 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.83 61.369 86055000 0 29519000 30907000 0 0 25628000 0 0 0 0 0 0 0 10008 173 9367 88644;88645;88646;88647;88648;88649;88650;88651 112529;112530;112531;112532;112533;112534;112535;112536;112537 112535 9 EHIKNPDWR Unmodified 1193.5942 0.59415496 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 16.438 16.438 3 0.017019 8786 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.278 43.064 548680000 22914000 67172000 0 0 0 0 0 0 0 0 306310000 152280000 0 10009 3090 9368 88652;88653;88654;88655 112538;112539;112540;112541 112540 4 EHILPSLAHLLPALDCLEGSTPGL Unmodified 2552.3309 0.33085955 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 164.91 164.91 3 1.1159E-06 169356 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.723 53.423 445540000 0 0 0 68583000 266180000 0 0 0 51414000 0 0 0 59362000 10010 4012 9369 88656;88657;88658;88659 112542;112543;112544;112545 112545 3 EHIMQMLQNPDWK Unmodified 1668.7752 0.77523214 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 1 92.371 92.371 2;3 0.00046282 95612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.215 80.187 409580000 40832000 40547000 44132000 37689000 69685000 0 40389000 23664000 0 0 70670000 0 41971000 10011 1403 9370 88660;88661;88662;88663;88664;88665;88666;88667;88668;88669;88670;88671 112546;112547;112548;112549;112550;112551;112552;112553;112554;112555;112556;112557;112558;112559 112557 14 EHINLGCDMDFDIAGPSIR Oxidation (M) 2174.9725 0.97248798 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 1 101.95 101.95 2;3 3.1097E-16 104761 QUIQUE_DMIX8_190116_001 124.45 109.89 1157700000 208060000 0 251620000 210860000 0 191350000 0 0 0 99478000 0 153160000 43138000 10012 726;2185 9371 88672;88673;88674;88675;88676;88677;88678;88679;88680;88681 112560;112561;112562;112563;112564;112565;112566;112567;112568;112569;112570 112570 435 7 EHINLGCDMDFDIAGPSIR Unmodified 2158.9776 0.97757336 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 0 0 3 4 2 2 3 3 2 5 4 2 5 2 3 121.21 121.21 2;3 2.2741E-74 127700 QUIQUE_C1576_190116_001 150.7 145.61 4901600000 493370000 441820000 373960000 435370000 299640000 526400000 342000000 230350000 421570000 182410000 537770000 341570000 275360000 10013 726;2185 9371 88682;88683;88684;88685;88686;88687;88688;88689;88690;88691;88692;88693;88694;88695;88696;88697;88698;88699;88700;88701;88702;88703;88704;88705;88706;88707;88708;88709;88710;88711;88712;88713;88714;88715;88716;88717;88718;88719;88720;88721 112571;112572;112573;112574;112575;112576;112577;112578;112579;112580;112581;112582;112583;112584;112585;112586;112587;112588;112589;112590;112591;112592;112593;112594;112595;112596;112597;112598;112599;112600;112601;112602;112603;112604;112605;112606;112607;112608;112609;112610;112611;112612;112613;112614;112615;112616;112617;112618;112619;112620;112621;112622;112623;112624;112625;112626;112627;112628;112629;112630;112631;112632;112633;112634;112635;112636;112637;112638;112639;112640;112641;112642;112643;112644;112645;112646;112647;112648;112649;112650;112651;112652;112653;112654;112655 112618 81 EHIPGTLR Unmodified 921.50321 0.50321468 1399 O00330;E9PLU0;E9PRI6 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.873 19.873 2 0.018116 12565 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 52.244 288520000 0 86563000 92042000 0 66653000 0 0 0 0 0 0 43261000 0 10014 1399 9372 88722;88723;88724;88725 112656;112657;112658;112659 112657 4 EHLAQLQEK Unmodified 1094.572 0.57202253 3734 Q92561;E5RHN5 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes no 0 0 0 1 16.212 16.212 3 0.0034629 8643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.358 80.346 18823000 0 0 0 0 0 0 0 18823000 0 0 0 0 0 10015 3734 9373 88726 112660 112660 0 EHLDENSPLGDLLR Unmodified 1606.7951 0.79509919 2143 P19174;A0A0D9SEK2 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes no 0 0 0 1 99.908 99.908 2 0.013657 102685 QUIQUE_C1277_190116_001 71.555 55.665 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10016 2143 9374 88727 112661 112661 1 EHLELFWSR Unmodified 1215.6037 0.60365701 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 3 3 3 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 88.137 88.137 2;3 8.1799E-26 89535 QUIQUE_C1403_190116_001 204.27 191.64 5123100000 655940000 693300000 547320000 484090000 633330000 475490000 0 192640000 253730000 167200000 384900000 376260000 258870000 10017 50 9375 88728;88729;88730;88731;88732;88733;88734;88735;88736;88737;88738;88739;88740;88741;88742;88743;88744;88745;88746;88747;88748;88749;88750;88751;88752;88753;88754;88755;88756;88757;88758 112662;112663;112664;112665;112666;112667;112668;112669;112670;112671;112672;112673;112674;112675;112676;112677;112678;112679;112680;112681;112682;112683;112684;112685;112686;112687;112688;112689;112690;112691;112692;112693;112694;112695;112696;112697;112698;112699;112700;112701;112702;112703;112704;112705;112706 112675 45 EHLIDELDYILLPTEGWNK Unmodified 2297.158 0.15796379 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31;F8VZG8 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 161.14 161.14 3 0.056283 166592 QUIQUE_C1368_190116_001 24.793 13.347 77365000 0 0 77365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10018 4605 9376 88759 112707 112707 1 EHLIDELDYVLVPTEAWNK Unmodified 2283.1423 0.14231373 2965 Q13107;C9JNU9 USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 yes no 0 0 0 1 152.23 152.23 3 0.0096436 158025 QUIQUE_C1576_190116_001 37.292 29.67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10019 2965 9377 88760 112708 112708 1 EHLIENEVSILR Unmodified 1450.778 0.77799256 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 3 3 1 2 3 1 1 1 1 75.313 75.313 2;3 0.00026142 76025 QUIQUE_C1277_190116_001 85.924 78.495 174800000 0 60365000 0 0 38018000 0 0 0 53382000 23036000 0 0 0 10020 3596 9378 88761;88762;88763;88764;88765;88766;88767;88768;88769;88770;88771;88772;88773;88774;88775;88776;88777 112709;112710;112711;112712;112713;112714;112715;112716;112717;112718;112719;112720;112721;112722;112723;112724;112725 112711 16 EHLILVSQLEQLHR Unmodified 1713.9526 0.95260288 4013 Q9BSJ2;F2Z2B9 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.599 87.599 3 3.0445E-05 88264 QUIQUE_C1563_190116_001 113.76 105.78 258780000 16575000 32933000 0 25211000 33828000 27450000 37787000 0 0 0 47768000 37231000 0 10021 4013 9379 88778;88779;88780;88781;88782;88783;88784;88785;88786 112726;112727;112728;112729;112730;112731;112732;112733;112734 112730 7 EHLLDDEEEDEEIMR Unmodified 1900.7997 0.7996518 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 78.528 78.528 3 0.035698 79673 QUIQUE_C1218_190116_001 33.724 29.82 17885000 17885000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10022 4604 9380 88787 112735 112735 1 EHLLLAR Unmodified 850.50249 0.5024864 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.051 24.051 2 0.0083371 17783 QUIQUE_C1277_190116_001 153.67 81.651 3239900000 427030000 320480000 580980000 0 0 0 0 289430000 378910000 0 475050000 444600000 323430000 10023 2529 9381 88788;88789;88790;88791;88792;88793;88794;88795 112736;112737;112738;112739;112740;112741;112742;112743 112737 8 EHLLMALADLDELLIR Oxidation (M) 1880.0077 0.0077344999 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 1 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 1 165.8 165.8 3 2.4449E-19 171867 QUIQUE_C1438_190116_001 143.46 125.54 370510000 26340000 47864000 42376000 42955000 55386000 34012000 53102000 10433000 21046000 0 36995000 0 0 10024 2834 9382 88796;88797;88798;88799;88800;88801;88802;88803;88804;88805;88806;88807;88808 112744;112745;112746;112747;112748;112749;112750;112751;112752;112753;112754;112755;112756;112757 112750 2269 12 EHLLMALADLDELLIR Unmodified 1864.0128 0.012819878 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 2 166.05 166.05 2;3 1.5906E-10 173110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.41 86.926 82539000 0 0 0 0 0 0 0 0 52973000 0 29565000 0 0 10025 2834 9382 88809;88810;88811 112758;112759;112760 112759 3 EHLLMALAGIDTLLIR Unmodified 1778.0124 0.012425947 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.08 155.08 3 0.0003699 159799 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.978 58.781 127130000 12467000 14507000 0 0 0 0 0 0 10064000 0 30729000 59366000 0 10026 2834 9383 88812;88813;88814;88815;88816;88817 112761;112762;112763;112764;112765;112766 112766 3 EHLLMALAGIDTLLIR Oxidation (M) 1794.0073 0.0073405694 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 149.56 149.56 3 3.2285E-08 155959 QUIQUE_C1438_190116_001 120.3 101.57 393990000 0 87290000 82336000 0 97746000 35261000 0 58018000 0 33335000 0 0 0 10027 2834 9383 88818;88819;88820;88821;88822;88823 112767;112768;112769;112770;112771;112772 112769 2270 5 EHLLMYLEK Unmodified 1174.6056 0.60563084 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 68.549 68.549 2;3 6.377E-44 66158 QUIQUE_DMIX4_190116_001 215.88 165.08 4648300000 489680000 421520000 535660000 532320000 440910000 481770000 497360000 185020000 59245000 121690000 426670000 52181000 404240000 10028 4356 9384 88824;88825;88826;88827;88828;88829;88830;88831;88832;88833;88834;88835;88836;88837;88838;88839;88840;88841;88842;88843 112773;112774;112775;112776;112777;112778;112779;112780;112781;112782;112783;112784;112785;112786;112787;112788;112789;112790;112791;112792;112793 112789 15 EHLLMYLEK Oxidation (M) 1190.6005 0.60054547 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 61.466 61.466 2;3 4.2451E-07 60656 QUIQUE_C1368_190116_001 159.58 111.72 786020000 0 108260000 144440000 104160000 97879000 87954000 0 0 63473000 0 93565000 86290000 0 10029 4356 9384 88844;88845;88846;88847;88848;88849;88850;88851;88852 112794;112795;112796;112797;112798;112799;112800;112801;112802;112803 112795 2915 10 EHLLSYLEK Unmodified 1130.5972 0.59717465 4333 Q9NYL9 TMOD3 Tropomodulin-3 yes yes 0 0 0 1 1 60.528 60.528 3 0.015384 58755 QUIQUE_C1368_190116_001 50.034 34.826 20078000 0 0 11734000 0 0 0 0 0 0 8344400 0 0 0 10030 4333 9385 88853;88854 112804;112805 112804 2 EHLLTNHLK Unmodified 1103.6087 0.60874239 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 15.259 15.259 2;3 0.00048677 7601 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.99 28.155 522400000 0 91272000 0 68835000 0 75637000 0 0 109710000 0 0 176950000 0 10031 1992 9386 88855;88856;88857;88858;88859;88860;88861;88862;88863;88864 112806;112807;112808;112809;112810;112811;112812;112813;112814;112815 112815 10 EHLLVSIPLLINHLQAESIVVHTYAAHALER Unmodified 3485.9147 0.91470782 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 153.96 153.96 5 2.7247E-37 161646 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.43 96.137 36084000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36084000 0 0 10032 2657 9387 88865 112816 112816 1 EHLPAPGDDVLVLLCGPPPMVQLACHPNLDK Unmodified 3401.6934 0.69342335 4437 Q9UHQ9 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 148.33 148.33 4 5.3197E-09 152796 QUIQUE_C1403_190116_001 60.527 55.367 506170000 0 61955000 71358000 101640000 0 39905000 88735000 0 81619000 0 0 0 60954000 10033 4437 9388 88866;88867;88868;88869;88870;88871;88872 112817;112818;112819;112820;112821;112822;112823;112824 112819 8 EHMGDILYK Oxidation (M) 1120.5223 0.52229515 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.101 21.101 3 0.00097233 14178 QUIQUE_C1368_190116_001 91.069 71.307 721080000 58536000 89265000 75338000 72251000 106340000 0 0 0 66981000 0 124180000 0 128200000 10034 2414 9389 88873;88874;88875;88876;88877;88878;88879;88880 112825;112826;112827;112828;112829;112830;112831;112832;112833 112827 1821 8 EHMGDILYK Unmodified 1104.5274 0.52738052 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 1 40.461 40.461 1;2;3 4.3078E-05 36574 QUIQUE_C1403_190116_001 147.19 123.23 7388500000 716480000 749170000 598790000 676060000 573160000 586220000 803460000 453950000 372090000 98021000 913760000 631600000 215750000 10035 2414 9389 88881;88882;88883;88884;88885;88886;88887;88888;88889;88890;88891;88892;88893;88894;88895;88896;88897;88898;88899;88900;88901;88902;88903;88904;88905 112834;112835;112836;112837;112838;112839;112840;112841;112842;112843;112844;112845;112846;112847;112848;112849;112850;112851;112852;112853;112854;112855;112856;112857;112858;112859;112860;112861;112862;112863;112864;112865;112866 112843 32 EHMIQNEVSILR Unmodified 1467.7504 0.7503976 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 62.531 62.531 2;3 9.9259E-05 63225 QUIQUE_C1218_190116_001 138.22 101.53 274900000 0 0 32392000 57576000 41136000 0 71861000 0 0 0 33988000 37947000 0 10036 1478 9390 88906;88907;88908;88909;88910;88911;88912;88913;88914;88915 112867;112868;112869;112870;112871;112872;112873;112874;112875;112876;112877 112867 11 EHMIQNEVSILR Oxidation (M) 1483.7453 0.74531222 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 1 0 1 52.625 52.625 3 0.0022207 47835 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112913;112914;112915;112916;112917;112918;112919;112920;112921;112922;112923;112924;112925;112926;112927;112928;112929;112930;112931;112932 112928 19 EHNGQVTGIDWAPESNR Unmodified 1908.8715 0.87145203 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057;C9JBJ7;C9J4Z7;F8VXW2;C9JQM8;C9JFG9;C9J6C8;C9JTT6 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 0 1 60.848 60.848 3 0.02399 56542 QUIQUE_DMIX4_190116_001 27.7 17.912 19711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19711000 0 0 0 10042 369;1485 9394 88966 112933 112933 0 EHNLQVLGLVK Unmodified 1248.719 0.71902112 3760 Q92859;Q59FP8 NEO1 Neogenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.219 66.219 2;3 0.00015645 66142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.76 106.08 189060000 25567000 21452000 32744000 0 0 0 24400000 17310000 0 0 39734000 27855000 0 10043 3760 9395 88967;88968;88969;88970;88971;88972;88973;88974;88975 112934;112935;112936;112937;112938;112939;112940;112941;112942;112943 112938 10 EHNPTQYEER Unmodified 1301.5636 0.56364269 4117 Q9H0C8;F8SNU7;H7C2I8 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113048;113049;113050;113051;113052;113053;113054;113055;113056;113057;113058;113059;113060;113061;113062;113063;113064;113065;113066;113067;113068;113069;113070 113055 18 EHSSLAFWK Unmodified 1103.54 0.53999412 1831 P02749;J3KS17;CON__P17690 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.579 57.579 2;3 0.00069495 55825 QUIQUE_C1403_190116_001 77.318 63.019 219670000 64761000 0 30966000 14397000 17960000 0 8138300 6794800 0 11563000 25376000 17317000 22399000 10058 1831 9409 89089;89090;89091;89092;89093;89094;89095;89096;89097;89098;89099 113071;113072;113073;113074;113075;113076;113077;113078;113079;113080;113081;113082 113074 11 EHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLK Unmodified 3198.559 0.55903836 1381 O00170;V9GYQ3 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 121.75 121.75 4;5 0.023182 126666 QUIQUE_C1576_190116_001 23.62 17.459 110350000 0 40794000 0 0 0 0 69552000 0 0 0 0 0 0 10059 1381 9410 89100;89101 113083;113084 113084 2 EHSVFTGVAIVHCSSK Unmodified 1756.8567 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protein kinase 8 yes no 0 0 1 1 1 94.676 94.676 3 0.0129 96252 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.023 41.298 68637000 0 0 0 0 0 0 0 39313000 0 0 0 29323000 0 10064 397 9415 89111;89112 113095;113096 113095 2 EHTLAWK Unmodified 883.4552 0.45520186 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 20.951 20.951 2 0.042242 14217 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.297 38.297 32857000 0 0 0 0 0 0 0 32857000 0 0 0 0 0 10065 2194 9416 89113 113097 113097 1 EHTQLLQQSSSQK Unmodified 1512.7532 0.75323437 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 15.066 15.066 3 0.0001772 6781 QUIQUE_C1563_190116_001 87.831 68.153 46761000 0 0 0 31529000 0 15232000 0 0 0 0 0 0 0 10066 3406 9417 89114;89115;89116 113098;113099;113100 113100 2 EHVAHLLFLR Unmodified 1233.6982 0.6982261 2151 P19652 ORM2 Alpha-1-acid glycoprotein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 58.268 58.268 2;3 1.3354E-14 55577 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.72 130.13 2176200000 260700000 145820000 170040000 95438000 463880000 61335000 107890000 108490000 81291000 68152000 372950000 82202000 157970000 10067 2151 9418 89117;89118;89119;89120;89121;89122;89123;89124;89125;89126;89127;89128;89129;89130;89131;89132 113101;113102;113103;113104;113105;113106;113107;113108;113109;113110;113111;113112;113113;113114;113115;113116;113117;113118;113119;113120;113121;113122 113120 21 EHVEEISELFYDAK Unmodified 1707.7992 0.79918151 4542 Q9Y265;H7C4G5 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 103.31 103.31 2;3 3.9416E-29 106171 QUIQUE_C1277_190116_001 175.74 149.07 375080000 0 68045000 0 45807000 0 50370000 74511000 20937000 26182000 32941000 27301000 0 28984000 10068 4542 9419 89133;89134;89135;89136;89137;89138;89139;89140;89141;89142;89143;89144 113123;113124;113125;113126;113127;113128;113129;113130;113131;113132;113133;113134;113135;113136;113137 113123 15 EHVESFFQK Unmodified 1149.5455 0.54547343 440 A6NFF4;A0A2R8Y6D7;Q9NS61 KCNIP2 Kv channel-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 41.101 41.101 2 2.9195E-06 37501 QUIQUE_C1218_190116_001 176.75 151.9 35379000 35379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10069 440 9420 89145 113138 113138 1 EHVIANSGQFHCQR Unmodified 1681.7743 0.77432094 2662 P55160;F8W050 NCKAP1L Nck-associated protein 1-like yes no 0 0 0 1 17.714 17.714 3 0.0023607 10226 QUIQUE_C1368_190116_001 58.595 56.12 12336000 0 0 12336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10070 2662 9421 89146 113139 113139 1 EHVIEALRR Unmodified 1121.6305 0.63054046 46 F8W7C6;A0A087WV22;X1WI28;P27635;H7C123;H7C2C5 RPL10 60S ribosomal protein L10 yes no 0 0 1 1 18.926 18.926 3 0.03838 11816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.344 0 28595000 0 0 0 0 0 0 0 0 28595000 0 0 0 0 10071 46 9422 89147 113140 113140 1 EHVKPLFNMEDK Unmodified 1485.7286 0.72859953 3028 Q13867;K7ES02;K7ESE8;J3KSD8 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 1 1 36.6 36.6 2 0.010427 32480 QUIQUE_C1576_190116_001 79.148 62.575 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10072 3028 9423 89148 113141 113141 1 EHVMNEVDTNKDR Unmodified 1585.7155 0.71546866 21 E9PKG6;A0A087WSV8;P80303;H0YD18 NUCB2 Nucleobindin-2;Nesfatin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 14.699 14.699 3 2.592E-05 6477 QUIQUE_C1277_190116_001 120.53 109.89 56794000 14246000 16168000 0 0 16963000 0 0 0 0 0 0 0 9418000 10073 21 9424 89149;89150;89151;89152 113142;113143;113144;113145 113143 4 EHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANALTR Unmodified 3050.6037 0.60366359 2037 P12111 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes yes 0 0 0 1 164.4 164.4 3 5.0627E-15 166268 QUIQUE_C1563_190116_001 75.703 69.476 20877000 0 0 0 0 0 20877000 0 0 0 0 0 0 0 10074 2037 9425 89153 113146;113147 113146 2 EHVYDLFEK Unmodified 1178.5608 0.56078914 3098 Q15020;F8VV04;F8W667;F8VVK9;F8VZM2 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 66.519 66.519 2;3 0.001203 67027 QUIQUE_C1438_190116_001 76.1 53.761 148260000 28628000 19078000 0 15514000 14569000 15729000 11896000 0 0 0 12338000 0 30510000 10075 3098 9426 89154;89155;89156;89157;89158;89159;89160;89161;89162;89163 113148;113149;113150;113151;113152;113153;113154;113155;113156;113157 113153 10 EHWNPAIVALVYNVLK Unmodified 1865.02 0.019954166 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 157.94 157.94 3 2.5898E-06 162881 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.38 90.858 212850000 0 82343000 43181000 0 0 0 0 0 51330000 0 0 35999000 0 10076 3180 9427 89164;89165;89166;89167 113158;113159;113160;113161 113160 4 EHWNPTIVALVYNVLK Unmodified 1895.0305 0.030518853 3118 Q15172 PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 156.98 156.98 3 4.8157E-06 161529 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.746 68.927 125140000 0 0 0 0 0 0 0 0 65059000 0 0 60081000 0 10077 3118 9428 89168;89169;89170 113162;113163;113164 113164 3 EHWSHDPFEAFK Unmodified 1528.6735 0.67352749 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 69.88 69.88 2 0.012294 71073 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.103 34.36 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10078 2885 9429 89171 113165 113165 1 EHWSHDPFEAFKDSEGYIYAR Unmodified 2583.1455 0.14550162 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 1 1 1 109.72 109.72 4 6.2575E-08 112295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.5 89.69 95643000 0 0 0 0 0 0 0 47392000 48252000 0 0 0 0 10079 2885 9430 89172;89173 113166;113167 113166 2 EHYVDLKDRPFFAGLVK Unmodified 2033.0734 0.0734463 3222;2092 P15531;E7ERL0;E5RHP0;Q32Q12;J3KPD9 NME1;NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase A;Nucleoside diphosphate kinase no no 0 0 2 1 89.099 89.099 3 0.013408 90011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.297 35.6 47837000 0 0 0 0 0 0 0 47837000 0 0 0 0 0 10080 2092;3222 9431 89174 113168 113168 1 EIAALHEICNHESVIK Unmodified 1861.9356 0.93563219 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 66.415 66.415 3 0.037992 65998 QUIQUE_C1576_190116_001 32.091 20.948 104050000 0 55987000 0 0 0 0 48065000 0 0 0 0 0 0 10081 3684 9432 89175;89176 113169;113170 113170 2 EIADLGEALATAVIPQWQK Unmodified 2052.0892 0.089155943 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 163.42 163.42 2;3 8.685E-74 168599 QUIQUE_C1368_190116_001 250.13 241.41 5995800000 390910000 437800000 452850000 442420000 518050000 340070000 540730000 355890000 427100000 119260000 601860000 511710000 857150000 10082 2533 9433 89177;89178;89179;89180;89181;89182;89183;89184;89185;89186;89187;89188;89189;89190;89191;89192;89193;89194;89195;89196;89197;89198;89199;89200;89201;89202;89203 113171;113172;113173;113174;113175;113176;113177;113178;113179;113180;113181;113182;113183;113184;113185;113186;113187;113188;113189;113190;113191;113192;113193;113194;113195;113196;113197;113198;113199;113200;113201;113202;113203;113204;113205;113206;113207;113208;113209;113210;113211;113212;113213;113214;113215;113216;113217 113180 47 EIADLGEALATAVIPQWQKDELR Unmodified 2565.3439 0.34386708 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 156.97 156.97 3 1.7237E-05 161780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.011 37.9 157550000 0 0 0 0 0 0 0 76152000 25097000 0 0 27206000 29091000 10083 2533 9434 89204;89205;89206;89207 113218;113219;113220;113221 113219 3 EIAEAYDVLSDPR Unmodified 1476.7096 0.70963822 2241 P25685 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.268 93.268 2 0.0029856 94746 QUIQUE_C1368_190116_001 94.465 70.435 37404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37404000 0 0 0 10084 2241 9435 89208;89209;89210;89211;89212;89213;89214 113222;113223;113224;113225;113226;113227;113228 113224 7 EIAEAYLGGK Unmodified 1049.5393 0.53932542 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 54.465 54.465 2 0.0061575 49434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.043 35.79 426030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 426030000 0 0 0 10085 2643 9436 89215;89216 113229;113230 113230 2 EIAEAYLGK Unmodified 992.51786 0.51786169 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 51.362 51.362 1;2 0.0021642 49860 QUIQUE_C1438_190116_001 96.19 27.706 21465000000 2236600000 2160200000 1992600000 2011700000 2159900000 1945000000 2073400000 548400000 1075600000 1143000000 1460500000 1196300000 1461600000 10086 2010 9437 89217;89218;89219;89220;89221;89222;89223;89224;89225;89226;89227;89228;89229;89230 113231;113232;113233;113234;113235;113236;113237;113238;113239;113240;113241;113242;113243;113244;113245;113246;113247;113248;113249 113238 18 EIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQR Unmodified 3000.4869 0.4869025 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 3 2 159.14 159.14 2;3 3.1808E-54 162986 QUIQUE_DMIX7_190116_001 193.9 173.25 9911800000 940870000 1046900000 834840000 744830000 986070000 1085700000 859670000 373160000 615730000 484480000 865340000 583330000 490900000 10087 282 9438 89231;89232;89233;89234;89235;89236;89237;89238;89239;89240;89241;89242;89243;89244;89245;89246;89247;89248;89249;89250;89251;89252;89253;89254;89255;89256;89257;89258;89259 113250;113251;113252;113253;113254;113255;113256;113257;113258;113259;113260;113261;113262;113263;113264;113265;113266;113267;113268;113269;113270;113271;113272;113273;113274;113275;113276;113277;113278;113279;113280;113281;113282;113283;113284;113285;113286;113287;113288;113289;113290;113291;113292;113293;113294;113295;113296;113297;113298;113299;113300 113296 49 EIAEELFTR Unmodified 1106.5608 0.56078914 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1;E9PJF6 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.743 84.743 2 0.0083817 87472 QUIQUE_C1438_190116_001 91.069 54.227 338490000 68763000 69611000 61549000 0 49933000 0 0 0 0 0 39646000 0 48989000 10088 2854 9439 89260;89261;89262;89263;89264;89265 113301;113302;113303;113304;113305;113306 113304 5 EIAEGMISEIR Oxidation (M) 1262.6177 0.61765209 1125 H0Y5G8;P0DPD6;P0DPD8 ECE2 yes no 0 1 0 1 1 1 2 51.711 51.711 2 0.0014911 45267 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.639 6.0917 718210000 0 0 428680000 0 0 150260000 0 0 0 0 0 0 139270000 10089 1125 9440 89266;89267;89268;89269;89270 113307;113308;113309;113310;113311 113310 651 4 EIAENALGK Unmodified 943.49746 0.4974606 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.287 27.287 2 0.00164 21278 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 43.832 2066300000 269540000 205500000 129330000 134970000 203410000 150290000 195600000 194400000 139540000 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63343000 0 0 0 45236000 0 0 0 10092 2992 9443 89294;89295;89296;89297;89298 113338;113339;113340;113341;113342 113342 5 EIAVLCHK Unmodified 968.51134 0.51133653 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22 22 2 0.01378 15802 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 52.15 2165500000 320680000 442890000 205770000 332850000 0 378710000 161440000 323190000 0 0 0 0 0 10093 2530 9444 89299;89300;89301;89302;89303;89304;89305 113343;113344;113345;113346;113347;113348;113349 113343 7 EICCYSISCK Unmodified 1318.5356 0.53557872 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.152 46.152 2 0.0001715 43341 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.15 111.29 1248300000 56045000 104870000 90270000 86927000 71665000 79762000 142370000 78768000 116370000 0 116940000 134770000 169560000 10094 3808;4308 9445 89306;89307;89308;89309;89310;89311;89312;89313;89314;89315;89316;89317;89318 113350;113351;113352;113353;113354;113355;113356;113357;113358;113359;113360;113361;113362;113363 113361 14 EICDHQAEQLSR Unmodified 1484.6678 0.66779018 3284 Q5M775;J3KSG2;J3QQM0;J3KRN9 SPECC1 Cytospin-B yes no 0 0 0 1 22.33 22.33 2 0.0071739 15336 QUIQUE_C1277_190116_001 55.718 30.097 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10095 3284 9446 89319 113364 113364 1 EICWNLQNIR Unmodified 1344.6609 0.66085431 4063 Q9BXP5;H7C3A1 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 99.761 99.761 2 0.0021808 101966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.11 60.901 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10096 4063 9447 89320;89321;89322;89323 113365;113366;113367;113368 113366 4 EIDDSVLGQTGPYR Unmodified 1548.742 0.74200098 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 0 1 1 84.103 84.103 2 0.00046563 85707 QUIQUE_C1277_190116_001 105.46 68.875 64569000 0 64569000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10097 1535 9448 89324;89325 113369;113370;113371 113370 3 EIDELIKK Unmodified 986.56481 0.56481189 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 1 1 31.15 31.15 2 0.058745 25907 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.709 26.896 64190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64190000 0 10098 4583 9449 89326 113372 113372 1 EIDGGLETLR Unmodified 1101.5666 0.5666028 2411 P38117;M0QY67 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.304 64.304 2 0.0051889 63813 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.334 41.633 1936400000 232530000 0 0 0 248530000 0 209860000 260650000 210380000 123640000 215750000 225920000 209180000 10099 2411 9450 89327;89328;89329;89330;89331;89332;89333;89334;89335 113373;113374;113375;113376;113377;113378;113379;113380;113381;113382 113378 8 EIDIAATLEHLR Unmodified 1379.7409 0.74087877 3769 Q92932;E7EM83;A0A3B3IU41 PTPRN2 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.42 115.42 3 0.00014618 120472 QUIQUE_C1218_190116_001 85.845 70.643 255760000 21604000 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113414;113415;113416;113417;113418 113417 5 EIDTDSTSQGESK Unmodified 1395.6001 0.60014735 2548 P49792 RANBP2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.992 14.992 2 0.0022973 6547 QUIQUE_C1563_190116_001 94.616 48.62 25663000 0 0 14190000 0 0 0 0 11474000 0 0 0 0 0 10106 2548 9457 89367;89368;89369 113419;113420;113421 113420 3 EIDTLNER Unmodified 988.48254 0.48253882 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 27.05 27.05 2 0.0078552 20610 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.492 14.708 176000000 0 0 0 0 0 137550000 0 22362000 0 16090000 0 0 0 10107 498 9458 89370;89371;89372 113422;113423;113424;113425 113425 4 EIDWVLLEQK Unmodified 1271.6762 0.67615325 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.85 120.85 2 0.0014954 124917 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.3 72.691 63379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31790000 31590000 0 10108 2868 9459 89373;89374;89375;89376;89377;89378;89379;89380 113426;113427;113428;113429;113430;113431;113432;113433 113432 7 EIDWVLLEQKK Unmodified 1399.7711 0.77111627 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 91.573 91.573 3 0.0014394 93417 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.691 52.178 70218000 0 0 0 0 0 0 0 17536000 12864000 0 0 16731000 23088000 10109 2868 9460 89381;89382;89383;89384;89385 113434;113435;113436;113437;113438 113434 5 EIDYIQYLR Unmodified 1211.6186 0.61863837 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 112.2 112.2 2 0.004459 109555 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.45 75.528 100810000 0 19387000 0 68059000 0 0 0 0 0 13367000 0 0 0 10110 3410 9461 89386;89387;89388;89389 113439;113440;113441;113442 113442 3 EIEAEIQALR Unmodified 1170.6245 0.62445203 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 79.831 79.831 2 6.5339E-05 81311 QUIQUE_C1576_190116_001 141.39 74.357 5115400000 354070000 0 430970000 391310000 523010000 322140000 983350000 0 363260000 258390000 646620000 361080000 481170000 10111 869 9462 89390;89391;89392;89393;89394;89395;89396;89397;89398;89399;89400;89401 113443;113444;113445;113446;113447;113448;113449;113450;113451;113452;113453;113454;113455;113456;113457;113458;113459;113460;113461;113462;113463;113464 113453 21 EIEDAAQFATADPEPPLEELGYHIYSSDPPFEVR Unmodified 3831.7792 0.77918094 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 3 2 1 2 2 2 158.9 158.9 3;4 9.1126E-131 164356 QUIQUE_C1218_190116_001 180.6 171.1 2572000000 231960000 251070000 215360000 182310000 109140000 157000000 203450000 146580000 238690000 23043000 311260000 288720000 213430000 10112 1943 9463 89402;89403;89404;89405;89406;89407;89408;89409;89410;89411;89412;89413;89414;89415;89416;89417;89418;89419;89420;89421;89422;89423;89424;89425 113465;113466;113467;113468;113469;113470;113471;113472;113473;113474;113475;113476;113477;113478;113479;113480;113481;113482;113483;113484;113485;113486;113487;113488;113489;113490;113491;113492;113493;113494;113495;113496 113465 32 EIEDAEKYSFMATVTK Unmodified 1860.8815 0.88153093 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 1 90.132 90.132 3 0.00046799 91114 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.12 55.662 44457000 0 0 0 0 0 0 0 44457000 0 0 0 0 0 10113 1558 9464 89426 113497 113497 1 EIEDFDSLEALR Unmodified 1435.6831 0.68308912 2476 P46060;B0QYT5;B0QYT4 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 117.46 117.46 2 0.00012363 114408 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.68 94.168 229500000 40050000 51948000 0 0 0 54088000 0 25912000 0 25256000 0 32243000 0 10114 2476 9465 89427;89428;89429;89430;89431;89432 113498;113499;113500;113501;113502;113503;113504;113505 113503 5 EIEDPEDR Unmodified 1001.4302 0.4301689 2269 P27824;D6RGY2 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 1 1 21.009 21.009 2 0.027967 14619 QUIQUE_C1218_190116_001 69.198 50.392 667370000 179450000 0 0 286470000 0 201450000 0 0 0 0 0 0 0 10115 2269 9466 89433;89434;89435 113506;113507;113508 113506 3 EIEELKQELIQAEIQNGVK Unmodified 2210.1794 0.17942751 2950 Q12904;D6R937 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 1 113.65 113.65 3 0.00010189 117405 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.92 70.756 83656000 0 0 0 0 0 0 0 40706000 42950000 0 0 0 0 10116 2950 9467 89436;89437 113509;113510 113510 2 EIEELQSQAQALSQEGK Unmodified 1886.9222 0.92215019 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 84.457 84.457 2;3 0 86708 QUIQUE_C1218_190116_001 325.29 271.73 15136000000 1150200000 1486400000 892290000 1537400000 1515600000 962640000 927200000 1045800000 1514000000 472040000 1125800000 1048300000 1458200000 10117 2851 9468 89438;89439;89440;89441;89442;89443;89444;89445;89446;89447;89448;89449;89450;89451;89452;89453;89454;89455;89456;89457;89458;89459;89460 113511;113512;113513;113514;113515;113516;113517;113518;113519;113520;113521;113522;113523;113524;113525;113526;113527;113528;113529;113530;113531;113532;113533;113534;113535;113536;113537;113538;113539;113540;113541;113542;113543;113544 113511 34 EIEGEEIEIVLAKPPDKK Unmodified 2036.1041 0.10413731 1525 O43390;B4DT28;A0A286YEZ8 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 2 1 80.955 80.955 4 0.0044673 83167 QUIQUE_C1368_190116_001 48.59 42.075 78726000 0 0 78726000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10118 1525 9469 89461 113545 113545 1 EIEGLLENIR Unmodified 1184.6401 0.6401021 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.93 100.93 2 0.014578 103719 QUIQUE_C1277_190116_001 74.464 16.875 126350000 26549000 24146000 0 0 0 0 0 0 0 0 46407000 29243000 0 10119 88 9470 89462;89463;89464;89465 113546;113547;113548;113549 113547 3 EIEIAEQDMSALISLR Unmodified 1816.9241 0.92406445 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 3 1 4 4 4 4 4 4 149.28 149.28 2;3 2.1858E-66 154065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.44 178.15 1170600000 26950000 19296000 50013000 0 64908000 34910000 22676000 245350000 259680000 224370000 116820000 72827000 32847000 10120 1558 9471 89466;89467;89468;89469;89470;89471;89472;89473;89474;89475;89476;89477;89478;89479;89480;89481;89482;89483;89484;89485;89486;89487;89488;89489;89490;89491;89492;89493;89494;89495;89496;89497;89498;89499;89500;89501;89502 113550;113551;113552;113553;113554;113555;113556;113557;113558;113559;113560;113561;113562;113563;113564;113565;113566;113567;113568;113569;113570;113571;113572;113573;113574;113575;113576;113577;113578;113579;113580;113581;113582;113583;113584;113585;113586;113587;113588;113589;113590;113591 113572 38 EIEIAEQDMSALISLR Oxidation (M) 1832.919 0.91897907 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 1 0 1 1 2 1 117.66 117.66 2 4.2668E-09 114290 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.95 98.475 130710000 0 0 0 0 0 0 0 36051000 34614000 60043000 0 0 0 10121 1558 9471 89503;89504;89505;89506;89507 113592;113593;113594;113595;113596 113596 849 5 EIEIAEQDMSALISLRK Unmodified 1945.019 0.019027468 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 2 1 1 125.55 125.55 3 5.7061E-13 128317 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.39 91.557 171980000 0 0 0 0 0 0 0 98845000 50568000 0 0 0 22565000 10122 1558 9472 89508;89509;89510;89511 113597;113598;113599;113600 113597 4 EIEIAEQEMPALMALR Unmodified 1842.922 0.92195596 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 142.5 142.5 2;3 2.9121E-95 146669 QUIQUE_C1403_190116_001 221.55 181.92 1284000000 213900000 22064000 26326000 168250000 34864000 160710000 174320000 13478000 106240000 0 243200000 96922000 23684000 10123 1131;3868 9473 89512;89513;89514;89515;89516;89517;89518;89519;89520;89521;89522;89523;89524;89525;89526;89527;89528 113601;113602;113603;113604;113605;113606;113607;113608;113609;113610;113611;113612;113613;113614;113615;113616;113617;113618;113619;113620;113621 113608 18 EIEIAEQEMPALMALR Oxidation (M) 1858.9169 0.91687058 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.42 129.42 2 4.9272E-13 133619 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.05 110.13 249850000 68721000 0 0 0 0 46744000 0 0 0 43991000 0 0 90391000 10124 1131;3868 9473 89529;89530;89531;89532;89533;89534;89535;89536;89537 113622;113623;113624;113625;113626;113627;113628;113629;113630;113631;113632;113633 113632 657;658 11 EIEIAEQEMPALMALR 2 Oxidation (M) 1874.9118 0.9117852 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 2 0 1 1 1 2 1 101.81 101.81 2 3.9473E-25 104097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.214 17.316 27370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27370000 10128 432 9476 89548 113647 113647 1 EIELIGSGGFGQVFK Unmodified 1579.8246 0.8246084 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 134.49 134.49 2 0.0097893 141541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.785 5.5067 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10129 2149 9477 89549 113648 113648 1 EIELLCQEHGQENDDLVQR Unmodified 2324.0703 0.07028777 3145 Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 80.347 80.347 2;3 1.1729E-241 81252 QUIQUE_C1368_190116_001 307.32 253.35 3048300000 329510000 285850000 288190000 274000000 282600000 261390000 302220000 153570000 149900000 134550000 146750000 158790000 280970000 10130 3145 9478 89550;89551;89552;89553;89554;89555;89556;89557;89558;89559;89560;89561;89562;89563;89564;89565;89566;89567;89568;89569;89570;89571;89572;89573;89574 113649;113650;113651;113652;113653;113654;113655;113656;113657;113658;113659;113660;113661;113662;113663;113664;113665;113666;113667;113668;113669;113670;113671;113672;113673;113674;113675;113676;113677;113678;113679;113680;113681;113682;113683;113684;113685;113686;113687 113659 38 EIEMASEERPPAQALEIMMGLK Unmodified 2472.2063 0.20625267 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 141.39 141.39 3 1.7293E-20 147216 QUIQUE_C1218_190116_001 127.5 103.77 810670000 54471000 46511000 0 58255000 75338000 31162000 32507000 141200000 119260000 0 81858000 0 170120000 10131 880 9479 89575;89576;89577;89578;89579;89580;89581;89582;89583;89584;89585;89586;89587 113688;113689;113690;113691;113692;113693;113694;113695;113696;113697;113698;113699;113700;113701;113702;113703;113704;113705;113706 113688 19 EIENLTQQYEEK Unmodified 1522.7151 0.71511753 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 59.649 59.649 2 1.1009E-09 58551 QUIQUE_C1368_190116_001 154.05 131.72 259070000 0 172860000 86210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10132 2385 9480 89588;89589 113707;113708;113709 113709 2 EIENMILNDPDFQHEDLNFLTR Unmodified 2702.2646 0.26463048 3107 Q15067;K7ELT1;I3L0T4 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 146.96 146.96 3 3.2471E-18 154337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.3 115.35 278950000 0 0 83575000 0 74711000 0 0 0 0 0 120670000 0 0 10133 3107 9481 89590;89591;89592 113710;113711;113712 113712 2 EIENYPTCYK Unmodified 1315.5755 0.57545293 3973 Q99747 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.943 44.943 2 0.00028766 41800 QUIQUE_C1368_190116_001 116.05 106.63 841030000 86361000 0 108840000 102470000 122560000 0 168030000 0 0 0 85109000 70648000 97017000 10134 3973 9482 89593;89594;89595;89596;89597;89598;89599;89600 113713;113714;113715;113716;113717;113718;113719;113720 113714 8 EIEPVLSLLTSGSR Unmodified 1499.8195 0.81952302 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.46 135.46 2 0.00086746 141126 QUIQUE_C1218_190116_001 97.911 70.582 386490000 48401000 35867000 0 64330000 44764000 40572000 0 59237000 18980000 14277000 0 22402000 37657000 10135 699 9483 89601;89602;89603;89604;89605;89606;89607;89608;89609;89610 113721;113722;113723;113724;113725;113726;113727;113728;113729;113730;113731 113721 10 EIEQEAAVELSQLR Unmodified 1613.8261 0.82606496 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 109.95 109.95 2;3 3.3854E-47 115104 QUIQUE_C1218_190116_001 237.53 186.72 7216600000 991570000 819810000 812860000 738120000 518550000 718060000 864610000 202740000 355490000 290170000 463510000 221400000 219690000 10136 2498 9484 89611;89612;89613;89614;89615;89616;89617;89618;89619;89620;89621;89622;89623;89624;89625;89626;89627;89628;89629;89630;89631;89632;89633;89634 113732;113733;113734;113735;113736;113737;113738;113739;113740;113741;113742;113743;113744;113745;113746;113747;113748;113749;113750;113751;113752;113753;113754;113755;113756;113757;113758;113759;113760;113761;113762;113763;113764;113765;113766;113767;113768;113769;113770;113771;113772;113773;113774;113775;113776 113733 45 EIEQEAAVELSQLRDPQHDLDR Unmodified 2590.2623 0.2623223 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 105.68 105.68 3;4 3.8047E-77 108326 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.98 111.6 8976900000 214810000 563440000 597370000 440020000 603850000 357770000 770830000 1078300000 909680000 109450000 1194500000 1090000000 1046900000 10137 2498 9485 89635;89636;89637;89638;89639;89640;89641;89642;89643;89644;89645;89646;89647;89648;89649;89650;89651;89652;89653;89654;89655;89656;89657;89658;89659;89660 113777;113778;113779;113780;113781;113782;113783;113784;113785;113786;113787;113788;113789;113790;113791;113792;113793;113794;113795;113796;113797;113798;113799;113800;113801;113802;113803;113804;113805;113806;113807;113808;113809;113810;113811;113812;113813;113814;113815;113816;113817;113818;113819;113820;113821;113822;113823;113824;113825;113826;113827;113828 113807 52 EIEQELHLAQAEIQSLR Unmodified 2006.0433 0.043268383 3893 Q96JN2;C9JE17;C9JU31;H7C4R2 CCDC136 Coiled-coil domain-containing protein 136 yes no 0 0 0 1 132.46 132.46 3 0.0027603 128907 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.343 39.763 7537400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7537400 0 0 0 10138 3893 9486 89661 113829 113829 1 EIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIK Unmodified 3252.6145 0.61454714 2786 P63241;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 0 0 1 1 176.66 176.66 3 0.0053835 177871 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.702 26.755 5160200 0 0 0 0 0 0 0 5160200 0 0 0 0 0 10139 2786 9487 89662 113830 113830 1 EIESSPQYR Unmodified 1107.5197 0.51965261 3714 Q8WWM7;H3BUF6;H3BSK9 ATXN2L Ataxin-2-like protein yes no 0 0 0 1 22.491 22.491 2 0.030211 16009 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.26 45.042 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10140 3714 9488 89663 113831 113831 1 EIESTDTACIGPTLR Unmodified 1661.7931 0.79305028 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38;F8W6R7 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 1 71.23 71.23 2 1.0437E-09 71766 QUIQUE_C1218_190116_001 117.98 90.646 60773000 30654000 30119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10141 318 9489 89664;89665 113832;113833 113832 1 EIETFVSLLR Unmodified 1205.6656 0.66558856 3072 Q14571 ITPR2 Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 yes yes 0 0 0 1 128.65 128.65 2 0.022223 135391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.934 55.506 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10142 3072 9490 89666 113834 113834 1 EIETYHNLLEGGQEDFESSGAGK Unmodified 2509.1245 0.12449141 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 97.643 97.643 2;3 9.7001E-161 100153 QUIQUE_C1277_190116_001 288.16 256.09 5788500000 218460000 35672000 98559000 297190000 784670000 239870000 0 880950000 77193000 726170000 660230000 794140000 975360000 + 10143 780 9491 89667;89668;89669;89670;89671;89672;89673;89674;89675;89676;89677;89678;89679;89680;89681;89682;89683;89684;89685;89686;89687 113835;113836;113837;113838;113839;113840;113841;113842;113843;113844;113845;113846;113847;113848;113849;113850;113851;113852;113853;113854;113855;113856;113857;113858;113859 113836 22 EIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMR Unmodified 2823.3484 0.34841969 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.09 167.09 2;3 4.6571E-129 172071 QUIQUE_C1368_190116_001 197.46 191 993570000 93348000 100950000 67273000 76088000 72019000 67673000 77478000 69905000 86906000 26442000 68189000 66298000 121000000 10144 2720;4595;1991 9492 89688;89689;89690;89691;89692;89693;89694;89695;89696;89697;89698;89699;89700;89701 113860;113861;113862;113863;113864;113865;113866;113867;113868;113869;113870;113871;113872;113873;113874;113875 113863 15 EIEVLER Unmodified 886.476 0.47599688 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 44.09 44.09 2 0.026204 41519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.407 8.3208 682980000 0 184980000 100700000 0 174800000 0 0 0 0 0 112500000 0 110010000 10145 1656 9493 89702;89703;89704;89705;89706 113876;113877;113878;113879;113880;113881 113880 6 EIFAPLDER Unmodified 1088.5502 0.55022446 3653 Q8NFX7;F8VZZ2 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.851 79.851 2 0.0085179 81980 QUIQUE_C1438_190116_001 89.698 50.736 1394600000 141190000 164390000 128730000 166810000 118770000 0 119150000 0 151330000 0 141250000 148120000 114850000 10146 3653 9494 89707;89708;89709;89710;89711;89712;89713;89714;89715;89716 113882;113883;113884;113885;113886;113887;113888;113889;113890;113891;113892;113893;113894;113895 113889 12 EIFAQEALAPFR Unmodified 1390.7245 0.72450043 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.54 121.54 2 7.6843E-06 124171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.92 120.58 809590000 148900000 0 0 96097000 0 0 0 136770000 195710000 66052000 166060000 0 0 10147 3643 9495 89717;89718;89719;89720;89721;89722;89723;89724;89725 113896;113897;113898;113899;113900;113901;113902;113903;113904 113900 9 EIFDIAFPDEQAEALAVER Unmodified 2162.0532 0.053164368 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 151.86 151.86 2;3 7.6852E-08 158991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.46 116.21 953010000 58753000 33268000 119480000 97864000 0 137400000 0 45915000 92953000 19604000 182440000 0 165330000 10148 1324 9496 89726;89727;89728;89729;89730;89731;89732;89733;89734;89735;89736;89737;89738;89739;89740;89741;89742;89743 113905;113906;113907;113908;113909;113910;113911;113912;113913;113914;113915;113916;113917;113918;113919;113920;113921;113922;113923;113924 113922 16 EIFDLIR Unmodified 904.50182 0.5018177 4589 Q9Y3D0;H3BNV7;J3KS95 FAM96B Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 yes no 0 0 0 1 1 106.84 106.84 2 0.055397 108875 QUIQUE_C1563_190116_001 71.949 35.483 36703000 0 0 0 0 0 15546000 0 0 0 0 21158000 0 0 10149 4589 9497 89744;89745 113925;113926 113925 2 EIFGLYGQTTGK Unmodified 1312.6663 0.66631685 4262 Q9NR31;H0Y5E8 SAR1A GTP-binding protein SAR1a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.028 84.028 2 0.0004691 85413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.85 107.6 1371200000 142280000 132240000 137430000 137520000 111810000 124040000 130220000 88655000 110890000 44842000 0 99830000 111420000 10150 4262 9498 89746;89747;89748;89749;89750;89751;89752;89753;89754;89755;89756;89757 113927;113928;113929;113930;113931;113932;113933;113934;113935;113936;113937;113938;113939;113940;113941;113942;113943 113938 15 EIFGMSIQEFDR Unmodified 1470.6813 0.68131498 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.02 131.02 2 7.5336E-06 135410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.23 109.38 387520000 54659000 64576000 0 47832000 52015000 0 0 0 52665000 30060000 38208000 0 47500000 10151 151 9499 89758;89759;89760;89761;89762;89763;89764;89765;89766;89767 113944;113945;113946;113947;113948;113949;113950;113951;113952;113953 113950 10 EIFGMSIQEFDRLPLWR Unmodified 2136.0826 0.082630778 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6 ABLIM1 no no 0 0 1 1 1 1 1 158.97 158.97 3 1.0383E-18 166168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.39 86.914 149040000 0 0 0 0 0 0 0 19763000 35483000 0 51588000 42206000 0 10152 151 9500 89768;89769;89770;89771 113954;113955;113956;113957 113956 3 EIFGQTIIHHHIPFNWDCEFIR Unmodified 2808.3595 0.35947434 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 125.73 125.73 3;4 1.6903E-09 129961 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.74 83.69 683880000 0 0 86096000 0 0 0 71415000 0 0 0 240350000 286010000 0 10153 1655 9501 89772;89773;89774;89775;89776;89777 113958;113959;113960;113961;113962;113963;113964;113965 113964 7 EIFITFR Unmodified 924.5069 0.50690308 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 95.755 95.755 2 0.021367 97276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 70.484 57870000 21834000 0 17628000 0 0 0 0 18408000 0 0 0 0 0 10154 3845 9502 89778;89779;89780 113966;113967;113968 113968 3 EIFLNILETSTSSFEHR Unmodified 2022.0058 0.0058202445 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 143.77 143.77 3 0.0023276 151248 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.916 37.1 25972000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25972000 0 0 10155 4651 9503 89781 113969 113969 1 EIFLSQPILLELEAPLK Unmodified 1952.1234 0.12341618 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48;F8WE71;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7;F5H1L6;F5H037 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.08 166.08 2;3 2.6912E-38 171111 QUIQUE_C1368_190116_001 206.69 191.3 16080000000 1466200000 1476300000 2010700000 919760000 1011600000 664610000 1233000000 884540000 1246700000 486040000 1416600000 1414200000 1849400000 10156 2740;1041;2739 9504 89782;89783;89784;89785;89786;89787;89788;89789;89790;89791;89792;89793;89794;89795;89796;89797;89798;89799;89800;89801;89802;89803;89804;89805;89806;89807 113970;113971;113972;113973;113974;113975;113976;113977;113978;113979;113980;113981;113982;113983;113984;113985;113986;113987;113988;113989;113990;113991;113992;113993;113994;113995;113996;113997;113998;113999;114000;114001;114002 113977 32 EIFMQVEDERR Unmodified 1450.6875 0.68746299 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 54.877 54.877 3 0.016732 53093 QUIQUE_C1368_190116_001 34.75 23.844 244180000 0 53597000 46783000 0 0 0 0 31358000 41269000 0 0 42020000 29156000 10157 2379 9505 89808;89809;89810;89811;89812;89813;89814 114003;114004;114005;114006;114007;114008;114009 114004 7 EIFNFVLK Unmodified 1008.5644 0.56441796 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 114.24 114.24 2 0.01603 118590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.801 65.765 68208000 0 0 11829000 0 0 0 0 0 21616000 0 34764000 0 0 10158 2813 9506 89815;89816;89817 114010;114011;114012 114011 3 EIFSVLDLMK Unmodified 1193.6366 0.63659662 941 E9PJ55;Q9NUJ3 TCP11L1 T-complex protein 11-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 150.68 150.68 2 0.0090473 156403 QUIQUE_C1218_190116_001 70.816 40.741 97081000 24924000 26590000 0 0 22230000 0 0 0 0 6101400 17235000 0 0 10159 941 9507 89818;89819;89820;89821;89822;89823;89824 114013;114014;114015;114016;114017;114018;114019;114020 114013 8 EIFTNLAPFSEVSADGEKR Unmodified 2109.0378 0.037848654 3371 Q8TCE6;Q6NSW5;A0A3B3IRE4 FAM45A;FAM45B Protein FAM45A;Protein FAM45B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.06 110.06 3 5.1672E-08 113909 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.891 81.735 336210000 0 37662000 0 0 44268000 0 37146000 0 57851000 0 71083000 49250000 38946000 10160 3371 9508 89825;89826;89827;89828;89829;89830;89831;89832;89833 114021;114022;114023;114024;114025;114026;114027;114028;114029;114030;114031;114032;114033 114028 13 EIFVDFAPFLSR Unmodified 1439.7449 0.74490152 264;910 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9;E9PEM5;P50851;H0YAC6 NBEA;LRBA Neurobeachin;Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein no no 0 0 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114064;114065;114066;114067;114068;114069;114070;114071;114072;114073;114074;114075;114076;114077;114078 114065 15 EIGELTQLK Unmodified 1029.5706 0.57062555 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 60.665 60.665 2 0.035529 59086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.905 35.802 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10166 3136 9514 89875 114079 114079 1 EIGELYLPK Unmodified 1060.5805 0.58046195 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.281 83.281 2 0.011732 80649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.04 65.939 940590000 0 0 0 0 273880000 0 0 170500000 0 136600000 0 92580000 267040000 10167 1800 9515 89876;89877;89878;89879;89880 114080;114081;114082;114083;114084 114082 2 EIGHGSFGAVYFAR Unmodified 1509.7365 0.7364621 3446 Q7L7X3;J3QS76 TAOK1 Serine/threonine-protein kinase TAO1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.839 77.839 3 6.0337E-05 78140 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.611 54.323 421840000 31194000 37195000 36018000 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O75145;H0YIJ4;G3V200;O75334;H0YHK3;H0YHJ4;A0A2R8Y7R9;Q13136;A0A1B0GVT3;H0YDW2 PPFIA3;PPFIA2;PPFIA1 Liprin-alpha-3;Liprin-alpha-2;Liprin-alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 50.701 50.701 3 0.012416 49511 QUIQUE_C1218_190116_001 50.353 33.123 137800000 36232000 37200000 35009000 0 0 0 0 0 0 0 29358000 0 0 10170 1612;1078;448 9518 89906;89907;89908;89909 114113;114114;114115;114116 114113 4 EIGLLSEEVELYGETK Unmodified 1807.9091 0.90912589 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 133.52 133.52 2 2.7737E-05 138693 QUIQUE_C1368_190116_001 84.365 69.803 336560000 37173000 0 56706000 32392000 38258000 0 53308000 70418000 48304000 0 0 0 0 10171 1005;2027 9519 89910;89911;89912;89913;89914;89915;89916;89917;89918;89919;89920 114117;114118;114119;114120;114121;114122;114123;114124;114125;114126;114127;114128 114119 10 EIGLQMHEELLK Unmodified 1438.749 0.74900062 1520 O43295;A0A087WZH4 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes no 0 0 0 1 77.782 77.782 3 0.04722 78544 QUIQUE_C1277_190116_001 33.204 18.758 13852000 0 13852000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10172 1520 9520 89921 114129 114129 1 EIGNIISDAMK Unmodified 1189.6013 0.60127375 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 95.575 95.575 2 0.00047489 99261 QUIQUE_C1218_190116_001 131.62 92.81 3265500000 528310000 324490000 377810000 313360000 209020000 384450000 286990000 90434000 268680000 141180000 159240000 0 181560000 10173 2004 9521 89922;89923;89924;89925;89926;89927;89928;89929;89930;89931;89932;89933;89934 114130;114131;114132;114133;114134;114135;114136;114137;114138;114139;114140;114141;114142;114143 114130 12 EIGNIISDAMK Oxidation (M) 1205.5962 0.59618837 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 64.24 64.24 2 0.028812 64351 QUIQUE_C1403_190116_001 53.517 25.78 74754000 0 0 26460000 48294000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10174 2004 9521 89935;89936 114144;114145 114145 1276 2 EIGNLLHPSVPISNDEDVDNKVER Unmodified 2688.3355 0.33548724 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 85.211 85.211 3;4 7.9341E-91 86742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.69 168.4 4383200000 340780000 348180000 487860000 408410000 317740000 364090000 278440000 413900000 451820000 185810000 205430000 0 580780000 10175 2534 9522 89937;89938;89939;89940;89941;89942;89943;89944;89945;89946;89947;89948;89949;89950;89951;89952;89953;89954;89955;89956 114146;114147;114148;114149;114150;114151;114152;114153;114154;114155;114156;114157;114158;114159;114160;114161;114162;114163;114164;114165;114166;114167;114168;114169 114163 23 EIGPNDGFLAQLCQLNDR Unmodified 2058.9793 0.97928792 2580 P51452;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 2 2 139.73 139.73 2;3 1.1735E-53 144545 QUIQUE_DMIX3_190116_001 181.26 150.71 1676400000 112340000 172580000 96572000 139400000 70893000 116830000 114340000 149360000 152290000 43264000 195600000 161720000 151230000 10176 2580 9523 89957;89958;89959;89960;89961;89962;89963;89964;89965;89966;89967;89968;89969;89970;89971;89972;89973;89974;89975;89976 114170;114171;114172;114173;114174;114175;114176;114177;114178;114179;114180;114181;114182;114183;114184;114185;114186;114187;114188;114189;114190;114191;114192;114193;114194;114195;114196;114197;114198;114199;114200;114201;114202;114203 114189 34 EIGQSVDEVEK Unmodified 1231.5932 0.59321148 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.578 34.578 2 0.00025295 30327 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.99 79.113 20582000000 1454900000 1892300000 1261000000 1538500000 1884600000 1155900000 1483000000 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Q01813;H0Y3Y3 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.6 140.6 2 2.1904E-76 144704 QUIQUE_C1277_190116_001 237.1 223.33 4702800000 434890000 531360000 517820000 526830000 418050000 359940000 422680000 358870000 0 177150000 405000000 550260000 0 10180 2861 9527 89999;90000;90001;90002;90003;90004;90005;90006;90007;90008;90009;90010;90011 114229;114230;114231;114232;114233;114234;114235;114236;114237;114238;114239;114240;114241;114242 114230 13 EIGYPVMIK Unmodified 1048.5627 0.5627034 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 78.589 78.589 2 0.041258 75246 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.166 29.012 80936000 0 0 0 0 0 0 0 30448000 0 14344000 0 36144000 0 10181 1881 9528 90012;90013;90014 114243;114244;114245 114244 3 EIHDFVLEQFNTSQGELQK Unmodified 2261.0964 0.096426166 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 110.01 110.01 3 0.0075581 112135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.756 30.366 64885000 0 0 0 0 0 0 0 64885000 0 0 0 0 0 10182 2448 9529 90015 114246 114246 1 EIHKPGYLANDR Unmodified 1411.7208 0.72081203 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PNV3;A0A2R8Y5P0 RDX Radixin yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 18.412 18.412 2;3 0.00078833 10564 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.241 55.701 4572000000 46387000 413110000 407120000 461510000 295770000 349480000 0 271460000 518830000 260670000 587730000 478400000 481570000 10183 434 9530 90016;90017;90018;90019;90020;90021;90022;90023;90024;90025;90026;90027;90028;90029;90030;90031;90032 114247;114248;114249;114250;114251;114252;114253;114254;114255;114256;114257;114258;114259;114260;114261;114262;114263 114263 8 EIHTVPDMGK Unmodified 1125.5488 0.54884425 3123 Q15257;A6PVN5;Q5T949;Q5T948;Q68CR8;A6PVN6 PPP2R4;DKFZp781M17165 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 0 1 25.052 25.052 3 0.037719 19004 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.937 24.322 0 0 0 0 0 0 0 0 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114381 173 EIIDLVLDRIR Unmodified 1353.798 0.79799972 2795;3430;3992;1031 F8VQQ4;F8VRZ4;P68363;F8VVB9;F8VS66;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 131.17 131.17 3 0.0076056 133999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.397 68.195 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10187 1031;2795;3430;3992 9534 90147 114452 114452 1 EIIDPVLDR Unmodified 1068.5815 0.58152458 2796;737 C9JQ00;P68366;C9JJQ8;C9JEV8 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.851 76.851 2 0.00046275 77348 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.73 70.3 37358000000 3299600000 3733200000 2954000000 2783600000 2762400000 2562700000 3698600000 2250700000 2214500000 1495400000 3349500000 2898700000 3354800000 10188 737;2796 9535 90148;90149;90150;90151;90152;90153;90154;90155;90156;90157;90158;90159;90160 114453;114454;114455;114456;114457;114458;114459;114460;114461;114462;114463;114464;114465;114466;114467;114468;114469;114470;114471;114472;114473;114474;114475;114476;114477;114478;114479 114473 27 EIIDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIR Unmodified 3321.6551 0.65510682 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.37 166.37 3 2.9291E-255 168148 QUIQUE_DMIX1_190116_001 243.81 227.36 889970000 79051000 101450000 0 90869000 112230000 77756000 68713000 70762000 102000000 20960000 0 54334000 111850000 10189 2663 9536 90161;90162;90163;90164;90165;90166;90167;90168;90169;90170;90171 114480;114481;114482;114483;114484;114485;114486;114487;114488;114489;114490 114486 10 EIIEGCIR Unmodified 988.50117 0.50116577 988 F5GWT4;Q9H4A3;Q96J92 WNK1;WNK4 Serine/threonine-protein kinase WNK1;Serine/threonine-protein kinase WNK4 no no 0 0 0 1 1 41.203 41.203 2 0.039586 38682 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.799 16.078 88628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43293000 0 45334000 10190 988 9537 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Q9Y265;E7ETR0;H7C4G5;H7C4I3 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 153.51 153.51 4 2.4502E-10 157909 QUIQUE_C1277_190116_001 62.302 56.05 389390000 0 84951000 65405000 0 0 0 0 145550000 0 0 0 0 93489000 10195 4542 9542 90217;90218;90219;90220 114545;114546;114547;114548 114545 4 EIISEMGELGVLGPTIK Unmodified 1784.9594 0.95938732 3771 Q92947;K7EKT3;K7ES74 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.42 138.42 2 0.00072462 134636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.866 73.948 721320000 97779000 56091000 112490000 0 37773000 107580000 62683000 89617000 0 29984000 0 56389000 70943000 10196 3771 9543 90221;90222;90223;90224;90225;90226;90227;90228;90229;90230 114549;114550;114551;114552;114553;114554;114555;114556;114557;114558;114559 114556 10 EIISEVQR Unmodified 972.52401 0.52400971 1509 O43150;A0A286YFG8 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 52.047 52.047 2 0.039647 49794 QUIQUE_C1403_190116_001 60.76 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38783000 38589000 42442000 28947000 0 46123000 42522000 41519000 10200 3060 9547 90238;90239;90240;90241;90242;90243;90244;90245;90246;90247;90248 114567;114568;114569;114570;114571;114572;114573;114574;114575;114576;114577;114578;114579;114580 114577 12 EIIVDAVK Unmodified 885.51713 0.51713341 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 48.364 48.364 2 0.068045 45977 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.335 12.529 33005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33005000 0 10201 3449 9548 90249 114581 114581 1 EIKDAISGIGTDEK Unmodified 1474.7515 0.75150304 1936 P08133;E5RK63;E5RI05;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 49.75 49.75 2;3 2.0208E-21 47017 QUIQUE_C1368_190116_001 162.68 131.19 1915600000 30756000 53275000 57186000 38473000 77203000 25561000 75840000 204350000 228200000 0 272420000 408920000 443440000 10202 1936 9549 90250;90251;90252;90253;90254;90255;90256;90257;90258;90259;90260;90261;90262;90263 114582;114583;114584;114585;114586;114587;114588;114589;114590;114591;114592;114593;114594;114595;114596 114584 14 EIKDFFEVAK Unmodified 1224.639 0.63903946 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 81.568 81.568 3 0.015616 82529 QUIQUE_C1277_190116_001 45.598 32.982 62667000 16425000 31888000 0 0 0 14355000 0 0 0 0 0 0 0 10203 4302 9550 90264;90265;90266 114597;114598;114599 114598 3 EIKDILIQYDR Unmodified 1404.7613 0.76127986 1372 M0R210;P62249 RPS16 40S ribosomal protein S16 yes no 0 0 1 1 1 85.397 85.397 2;3 0.046491 86864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.283 28.059 92664000 0 0 0 0 0 0 0 18622000 0 0 0 0 74042000 10204 1372 9551 90267;90268 114600;114601 114600 2 EIKIEISELNR Unmodified 1342.7456 0.7456298 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 1 1 1 1 1 74.554 74.554 3 0.001733 74296 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.792 30.921 20973000 0 0 0 0 0 0 0 20973000 0 0 0 0 0 + 10205 781;782 9552 90269;90270;90271;90272 114602;114603;114604;114605 114602 4 EILAELTGR Unmodified 1000.5553 0.55530983 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPT9;Q5JPU1 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.401 83.401 2 1.5308E-07 86224 QUIQUE_C1218_190116_001 164.53 66.11 5445800000 558680000 444180000 486820000 325620000 345340000 447060000 485590000 342310000 381950000 192870000 563930000 434180000 437300000 10206 1943 9553 90273;90274;90275;90276;90277;90278;90279;90280;90281;90282;90283;90284;90285 114606;114607;114608;114609;114610;114611;114612;114613;114614;114615;114616;114617;114618;114619;114620;114621;114622;114623;114624;114625 114606 20 EILALIGYVDPVK Unmodified 1428.8228 0.82281749 230 A0A0C4DG51;Q9NP80 PNPLA8 Calcium-independent phospholipase A2-gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.03 146.03 2 0.00092518 148685 QUIQUE_C1563_190116_001 102.52 76.009 287810000 24935000 25093000 23046000 15545000 21002000 24929000 20888000 17090000 31986000 8278000 28780000 23237000 23006000 10207 230 9554 90286;90287;90288;90289;90290;90291;90292;90293;90294;90295;90296;90297;90298 114626;114627;114628;114629;114630;114631;114632;114633;114634;114635;114636;114637;114638 114631 12 EILDAFDK Unmodified 949.47566 0.47566253 1924 P07602;C9JIZ6;A0A0J9YXB8 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 79.51 79.51 2 0.015763 80756 QUIQUE_C1277_190116_001 84.227 51.444 82389000 0 82389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10208 1924 9555 90299 114639;114640 114640 2 EILDESLR Unmodified 973.50803 0.50802529 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 58.424 58.424 2 0.044601 57311 QUIQUE_C1218_190116_001 78.178 22.087 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10209 3700 9556 90300 114641 114641 1 EILDKFTEEVVK Unmodified 1448.7763 0.77626123 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 89.852 89.852 2;3 3.8654E-06 91766 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.24 107.29 9304900000 133570000 283710000 820990000 257550000 389020000 216320000 358390000 1516300000 1377400000 121780000 1264800000 1220000000 1345100000 10210 2522 9557 90301;90302;90303;90304;90305;90306;90307;90308;90309;90310;90311;90312;90313;90314;90315;90316;90317;90318;90319 114642;114643;114644;114645;114646;114647;114648;114649;114650;114651;114652;114653;114654;114655;114656;114657;114658;114659;114660;114661;114662;114663;114664;114665;114666;114667;114668;114669;114670;114671;114672;114673 114657 31 EILDYIFSGQIR Unmodified 1452.7613 0.76127986 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.33 146.33 2 0.00051588 149265 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.309 44.594 436080000 38498000 51399000 41246000 37493000 51681000 0 0 38688000 62683000 18532000 0 57645000 38216000 10211 4143 9558 90320;90321;90322;90323;90324;90325;90326;90327;90328;90329;90330 114674;114675;114676;114677;114678;114679;114680;114681;114682;114683;114684;114685 114679 11 EILEQGLFSK Unmodified 1162.6234 0.6233894 936 E9PI87;Q9BUP3 HTATIP2 Oxidoreductase HTATIP2 yes no 0 0 0 1 88.209 88.209 2 0.01389 90413 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.654 20.259 61799000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61799000 10212 936 9559 90331 114686 114686 1 EILEQLLEAIVVATNPSGR Unmodified 2051.1263 0.12626973 736 C9JPI5;H0Y5B5;E7EVG2;Q86U86 PBRM1 Protein polybromo-1 yes no 0 0 0 1 1 178.01 178.01 3 0.0001154 185008 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.278 43.908 11111000 0 0 0 0 0 0 0 0 5802200 0 5308900 0 0 10213 736 9560 90332;90333 114687;114688 114688 2 EILETLIK Unmodified 957.57465 0.57464829 2900 Q06210 GFPT1 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1 yes yes 0 0 0 1 89.931 89.931 2 0.027083 90585 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.998 6.8509 30296000 0 0 0 0 0 0 0 30296000 0 0 0 0 0 10214 2900 9561 90334 114689 114689 1 EILEVLDGR Unmodified 1042.5659 0.56587452 3378 Q6P1N0;K7EMP1 CC2D1A Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 90.249 90.249 2 0.057371 92649 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.91 32.736 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10215 3378 9562 90335 114690 114690 1 EILFLSLVSLGR Unmodified 1345.7969 0.79693709 3340 X6R5W5;Q5VZ89 DENND4C DENN domain-containing protein 4C yes no 0 0 0 1 1 162.52 162.52 2 0.00050211 169873 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.98 92.622 12230000 0 0 2952800 0 0 0 0 0 0 0 9277200 0 0 10216 3340 9563 90336;90337 114691;114692 114692 2 EILGTAQSVGCNVDGR Unmodified 1674.7995 0.79953264 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.224 65.224 2;3 2.1475E-67 65249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.02 182.11 3193000000 225940000 281700000 386630000 377210000 238950000 271870000 311960000 116730000 148120000 69439000 243650000 220490000 300270000 10217 2304 9564 90338;90339;90340;90341;90342;90343;90344;90345;90346;90347;90348;90349;90350;90351;90352;90353 114693;114694;114695;114696;114697;114698;114699;114700;114701;114702;114703;114704;114705;114706;114707;114708;114709;114710;114711;114712;114713;114714;114715 114713 23 EILHAMGK Unmodified 897.47422 0.47422274 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.953 20.953 2 0.0032247 13956 QUIQUE_C1576_190116_001 160.03 104 3562500000 428570000 0 430540000 0 272980000 0 296270000 370700000 503090000 118190000 394360000 407130000 340680000 10218 2261 9565 90354;90355;90356;90357;90358;90359;90360;90361;90362;90363 114716;114717;114718;114719;114720;114721;114722;114723;114724;114725 114719 4 EILHHVNQAVR Unmodified 1314.7157 0.71566708 1369 M0QZR4;Q92888;M0R2C7;M0QYC1 ARHGEF1 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 16.989 16.989 3 0.0049646 9147 QUIQUE_C1403_190116_001 56.359 41.483 31972000 0 0 14954000 17019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10219 1369 9566 90364;90365 114726;114727 114727 2 EILHSVYECIEK Unmodified 1518.7388 0.73882986 2348 P32189;Q14409;A6NP46;F8WC39 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 77.424 77.424 2;3 0.00052041 77396 QUIQUE_C1563_190116_001 96.034 5.4208 163100000 0 0 41905000 0 0 83205000 0 0 0 0 0 37989000 0 10220 2348 9567 90366;90367;90368 114728;114729;114730 114729 3 EILIPVFK Unmodified 957.5899 0.58990443 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.4 109.4 2 0.018116 112816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.462 49.794 1300000000 155370000 0 0 0 138060000 121110000 168750000 0 140620000 75603000 171240000 144230000 185060000 10221 2623 9568 90369;90370;90371;90372;90373;90374;90375;90376;90377;90378;90379;90380 114731;114732;114733;114734;114735;114736;114737;114738;114739;114740;114741;114742;114743;114744;114745;114746;114747;114748 114743 18 EILKEQENR Unmodified 1157.6041 0.60405094 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 13.776 13.776 3 0.0014404 6033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.731 61.439 19470000 0 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QUIQUE_C1218_190116_001 110.29 65.984 259540000 90351000 66446000 0 35912000 0 0 43353000 0 0 23475000 0 0 0 10225 330 9572 90396;90397;90398;90399;90400;90401 114764;114765;114766;114767;114768;114769 114765 2 EILLSADHIIIATGGRPR Unmodified 1931.0952 0.095244374 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPK7;A0A096LPD9;E7EWK1;A0A096LNY7 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 85.143 85.143 4 0.03386 87238 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.428 23.857 17654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17654000 10226 330 9573 90402 114770 114770 1 EILNLTSELLQK Unmodified 1399.7922 0.79224564 3485 Q86TU7;Q6NXR6;C9K0W5 SETD3 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 yes no 0 0 0 1 123.42 123.42 2 0.050773 127102 QUIQUE_C1403_190116_001 57.174 24.956 26279000 0 0 0 26279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10227 3485 9574 90403 114771 114771 1 EILQEAPELITEQLAHR Unmodified 1989.0531 0.053104788 3703 Q8WUY3;A0A088AWP5;X6R9J3 PRUNE2 Protein prune homolog 2 yes no 0 0 0 1 124.68 124.68 3 0.00014575 131259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.872 51.272 28665000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28665000 0 0 10228 3703 9575 90404 114772 114772 1 EILQEEEDLAEIVQLVGK Unmodified 2054.0783 0.078316486 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 3 3 2 2 3 2 167.45 167.45 2;3 3.5571E-224 171452 QUIQUE_DMIX8_190116_001 273.3 242.02 34365000000 3837100000 4326400000 2948400000 3161700000 2794600000 2192200000 2279100000 1282500000 1840800000 1182800000 2581600000 3766400000 2171100000 10229 2414 9576 90405;90406;90407;90408;90409;90410;90411;90412;90413;90414;90415;90416;90417;90418;90419;90420;90421;90422;90423;90424;90425;90426;90427;90428;90429;90430;90431;90432;90433;90434 114773;114774;114775;114776;114777;114778;114779;114780;114781;114782;114783;114784;114785;114786;114787;114788;114789;114790;114791;114792;114793;114794;114795;114796;114797;114798;114799;114800;114801;114802;114803;114804;114805;114806;114807;114808;114809;114810;114811;114812;114813;114814;114815;114816;114817;114818;114819;114820 114819 46 EILQEIQR Unmodified 1027.5662 0.56620887 4608;1367;1350 K7ERH7;M0QZ28;M0R021;E9PEY4;E7EVB6;O60941;Q9Y4J8 DTNA;DTNB Dystrobrevin;Dystrobrevin beta;Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.648 53.648 2 0.0051766 52313 QUIQUE_C1438_190116_001 106.42 40.612 1721800000 156620000 181940000 187980000 0 174680000 232740000 199890000 0 0 86764000 0 180270000 320890000 10230 1350;1367;4608 9577 90435;90436;90437;90438;90439;90440;90441;90442;90443 114821;114822;114823;114824;114825;114826;114827;114828;114829;114830;114831;114832 114825 8 EILQTYGYEHILTLHNLEK Unmodified 2313.2005 0.20049731 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;A0A2R8Y5U3 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 1 109.63 109.63 4 0.025824 113457 QUIQUE_C1218_190116_001 28.813 20.213 21183000 21183000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10231 462 9578 90444 114833 114833 1 EILSDDKHDWDQR Unmodified 1655.754 0.75396265 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 39.83 39.83 2;3 0.004408 36583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.342 60.906 281290000 0 82461000 0 0 0 0 0 0 0 0 59531000 69405000 69896000 10232 310;830 9579 90445;90446;90447;90448;90449 114834;114835;114836;114837;114838;114839 114835 4 EILSDDKHDWEQR Unmodified 1669.7696 0.76961272 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1;C9J151;C9JP76 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 39.669 39.669 3 0.0027041 35704 QUIQUE_C1403_190116_001 69.716 48.763 163650000 32442000 36283000 40520000 30258000 0 24153000 0 0 0 0 0 0 0 10233 1060 9580 90450;90451;90452;90453;90454 114840;114841;114842;114843;114844 114843 5 EILSEVER Unmodified 973.50803 0.50802529 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.776 46.776 2 0.0049014 42594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.43 13.168 1827800000 375870000 287910000 240470000 0 0 0 260480000 0 203060000 183690000 0 0 276320000 10234 2527 9581 90455;90456;90457;90458;90459;90460;90461;90462;90463 114845;114846;114847;114848;114849;114850;114851;114852;114853 114852 9 EILSPVDIIDR Unmodified 1268.6976 0.69761697 1427 O14495;A0A286YES4;A0A286YEZ7;A0A286YF41 PPAP2B Lipid phosphate phosphohydrolase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.96 117.96 2 0.00015012 121702 QUIQUE_C1403_190116_001 128.27 99.352 921260000 81477000 80941000 47338000 96568000 67961000 55625000 43329000 62840000 110360000 42964000 74026000 61574000 96258000 10235 1427 9582 90464;90465;90466;90467;90468;90469;90470;90471;90472;90473;90474;90475;90476 114854;114855;114856;114857;114858;114859;114860;114861;114862;114863;114864;114865;114866;114867;114868;114869;114870;114871;114872;114873;114874 114862 21 EILSVDCSTNNPSQAK Unmodified 1761.8203 0.82032766 2005 P10909;H0YC35 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain;Clusterin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.227 51.227 2 3.0938E-54 49101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.24 198.53 2866600000 233330000 305120000 302880000 280860000 297200000 262230000 362990000 82460000 114070000 92850000 181600000 154370000 196610000 10236 2005 9583 90477;90478;90479;90480;90481;90482;90483;90484;90485;90486;90487;90488;90489 114875;114876;114877;114878;114879;114880;114881;114882;114883;114884;114885;114886;114887;114888;114889 114884 15 EILTLLQGVHQGAGFQDIPK Unmodified 2163.1688 0.16880325 924 E9PGT1;Q15631;H7C1D4 TSN Translin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 123.23 123.23 2;3 3.7583E-87 128679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.18 161.91 4800300000 494030000 445790000 480900000 366730000 395140000 217310000 327440000 323230000 447920000 144540000 414260000 394200000 348860000 10237 924 9584 90490;90491;90492;90493;90494;90495;90496;90497;90498;90499;90500;90501;90502;90503;90504;90505;90506;90507;90508;90509;90510;90511;90512 114890;114891;114892;114893;114894;114895;114896;114897;114898;114899;114900;114901;114902;114903;114904;114905;114906;114907;114908;114909;114910;114911;114912;114913;114914;114915 114912 24 EILTTACLAAQCIDR Unmodified 1733.844 0.84403999 3925 Q96QG7 MTMR9 Myotubularin-related protein 9 yes yes 0 0 0 1 101.5 101.5 2 0.0038174 104372 QUIQUE_C1277_190116_001 63.091 36.305 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10238 3925 9585 90513 114916 114916 1 EILVEESNVQR Unmodified 1314.6779 0.67794416 2693 P60510;H3BTA2;H3BV22;I3L4X0 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 47.762 47.762 2 0.00071707 45082 QUIQUE_C1368_190116_001 123.5 60.623 59572000 0 0 40795000 0 0 0 0 0 0 0 0 18777000 0 10239 2693 9586 90514;90515 114917;114918 114917 2 EILVGDVGQTVDDPYATFVK Unmodified 2165.0892 0.089215523 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 136.14 136.14 2;3 1.4867E-117 141610 QUIQUE_C1368_190116_001 223.06 182.48 51700000000 6418000000 5136300000 6008900000 5934700000 4265100000 5350000000 4119900000 1419100000 2689200000 2843200000 2794300000 2091700000 2629800000 10240 2220 9587 90516;90517;90518;90519;90520;90521;90522;90523;90524;90525;90526;90527;90528;90529;90530;90531;90532;90533;90534;90535;90536;90537;90538;90539;90540;90541 114919;114920;114921;114922;114923;114924;114925;114926;114927;114928;114929;114930;114931;114932;114933;114934;114935;114936;114937;114938;114939;114940;114941;114942;114943;114944;114945;114946;114947;114948;114949;114950;114951;114952;114953;114954;114955;114956;114957;114958;114959;114960;114961;114962;114963 114927 45 EILVGDVGVTITDPFK Unmodified 1701.9189 0.91890272 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 145.87 145.87 2 3.5248E-11 150339 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.45 87.726 881270000 104570000 81260000 91944000 70116000 0 126000000 106280000 57652000 76444000 100350000 66651000 0 0 10241 2702 9588 90542;90543;90544;90545;90546;90547;90548;90549;90550;90551;90552;90553;90554;90555;90556;90557;90558 114964;114965;114966;114967;114968;114969;114970;114971;114972;114973;114974;114975;114976;114977;114978;114979;114980;114981;114982 114978 15 EIMDAAEDYAK Unmodified 1254.5438 0.54381845 2083 P14868;H7C278 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 66.379 66.379 2 0.032618 67026 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.292 34.751 44907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44907000 0 0 10242 2083 9589 90559 114983 114983 1 EIMENYNIALR Unmodified 1364.6758 0.67583567 1949;587 P08603;B1AKG0;Q03591 CFH;CFHR1 Complement factor H;Complement factor H-related protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.101 89.101 2 0.0020567 92691 QUIQUE_C1438_190116_001 99.139 76.399 169640000 0 0 27229000 0 29229000 0 23814000 0 0 0 38580000 18356000 32429000 10243 1949;587 9590 90560;90561;90562;90563;90564;90565;90566 114984;114985;114986;114987;114988;114989;114990;114991 114986 6 EINGISVANQTVEQLQK Unmodified 1869.9796 0.97960549 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.92 105.92 2 7.6017E-89 109012 QUIQUE_DMIX3_190116_001 211.22 150.01 310580000 34195000 0 0 45482000 0 0 0 53913000 93861000 0 83133000 0 0 10244 472;1460 9591 90567;90568;90569;90570;90571;90572 114992;114993;114994;114995;114996;114997 114996 6 EINLLPDR Unmodified 968.5291 0.52909508 3112 Q15119;D6RDN9;D6RJH7;D6RGV8;D6RHG2 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 71 71 2 0.048509 71068 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.109 32.109 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10245 3112 9592 90573;90574 114998;114999 114999 2 EINNAHAILTDATK Unmodified 1509.7787 0.77872084 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 45.368 45.368 2;3 2.2313E-115 42128 QUIQUE_C1438_190116_001 275.44 242.06 8013400000 753510000 880390000 828610000 993250000 837570000 710540000 931810000 75354000 383240000 231950000 520720000 377310000 489180000 10246 4162 9593 90575;90576;90577;90578;90579;90580;90581;90582;90583;90584;90585;90586;90587;90588;90589;90590;90591;90592;90593;90594;90595;90596;90597;90598;90599 115000;115001;115002;115003;115004;115005;115006;115007;115008;115009;115010;115011;115012;115013;115014;115015;115016;115017;115018;115019;115020;115021;115022;115023;115024;115025;115026;115027;115028;115029 115011 29 EINNAHAILTDATKR Unmodified 1665.8798 0.87983187 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 38.23 38.23 2;3 9.0831E-07 35069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.657 72.446 1622100000 0 79076000 68262000 0 72846000 0 91810000 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0.56122321 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 138.35 138.35 4 1.1868E-15 142808 QUIQUE_C1277_190116_001 77.065 74.8 53622000 0 53622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10261 4140 9606 90713 115161 115161 1 EIQELQSKPDR Unmodified 1341.6888 0.6888432 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02;H0Y9I0;H0Y8L4 MLLT4 Afadin yes no 0 0 1 1 1 19.35 19.35 2 0.0021918 12094 QUIQUE_C1403_190116_001 118.4 82.892 41566000 0 0 0 23970000 0 0 0 0 0 0 17596000 0 0 10262 1258 9607 90714;90715 115162;115163 115162 1 EIQEPLESVEVNQETFR Unmodified 2045.9906 0.99056411 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 3 106.27 106.27 2;3 6.3463E-89 109712 QUIQUE_DMIX8_190116_001 256.95 237.85 252710000 0 0 0 0 0 25819000 0 0 82607000 0 0 37561000 106720000 10263 2515 9608 90716;90717;90718;90719;90720;90721 115164;115165;115166;115167;115168;115169 115167 4 EIQGFFNIPVDNLR Unmodified 1660.8573 0.85730551 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;C9JDU5;I3L0S1 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.01 140.01 2 1.4207E-29 145937 QUIQUE_C1218_190116_001 176.8 126.51 2342900000 186820000 0 189290000 190920000 154920000 143660000 205480000 203390000 216890000 86324000 315820000 248910000 200520000 10264 1565 9609 90722;90723;90724;90725;90726;90727;90728;90729;90730;90731;90732;90733 115170;115171;115172;115173;115174;115175;115176;115177;115178;115179;115180;115181 115170 12 EIQMLAR Unmodified 859.45857 0.45857268 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 40.306 40.306 2 0.054113 36626 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.618 24.445 35797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35797000 0 10265 266;1504 9610 90734 115182 115182 1 EIQNAVNGVK Unmodified 1070.572 0.57202253 2005 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protease 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 83.721 83.721 3 0.00025374 86356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.87 50.41 272820000 0 0 77891000 0 0 0 0 54925000 0 0 81249000 58752000 0 10268 825 9613 90752;90753;90754;90755 115205;115206;115207;115208;115209 115208 5 EIQSGMLLR Unmodified 1045.559 0.559015 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 60.444 60.444 2 0.011393 59609 QUIQUE_C1277_190116_001 72.789 26.419 97663000 0 38600000 0 28998000 0 0 0 0 0 0 30065000 0 0 10269 3916 9614 90756;90757;90758 115210;115211;115212 115210 3 EIQTLMQFGDTEIK Unmodified 1651.8127 0.81272309 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 1 116.39 116.39 2;3 2.1872E-17 121319 QUIQUE_C1218_190116_001 150.04 115.24 2476900000 280410000 248340000 25627000 257890000 176550000 215600000 303360000 13743000 140950000 90704000 270750000 219170000 233840000 10270 335;1521 9615 90759;90760;90761;90762;90763;90764;90765;90766;90767;90768;90769;90770;90771;90772;90773;90774;90775;90776 115213;115214;115215;115216;115217;115218;115219;115220;115221;115222;115223;115224;115225;115226;115227;115228;115229;115230;115231;115232 115213 19 EIQTTTGNQQVLVR Unmodified 1585.8424 0.84238373 3670 Q8TC12 RDH11 Retinol dehydrogenase 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.074 46.074 2 2.9432E-37 42535 QUIQUE_DMIX8_190116_001 185.08 150.69 800800000 44300000 50986000 75127000 78866000 43401000 65941000 64767000 40873000 0 27648000 115480000 92576000 100830000 10271 3670 9616 90777;90778;90779;90780;90781;90782;90783;90784;90785;90786;90787;90788 115233;115234;115235;115236;115237;115238;115239;115240;115241;115242;115243;115244;115245 115245 13 EIQVIPLQR Unmodified 1094.6448 0.64479354 2286 P29218 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.277 74.277 2 2.6871E-06 71381 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.29 66.027 2579000000 308350000 301930000 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EIRPALELLEPIEQK Unmodified 1776.9986 0.99855002 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 109.88 109.88 2;3 8.2024E-20 113573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.85 140.13 11646000000 1051600000 1147000000 1101600000 1059200000 941720000 1108800000 1097500000 694950000 884410000 444960000 706710000 576110000 831300000 10275 2560 9620 90807;90808;90809;90810;90811;90812;90813;90814;90815;90816;90817;90818;90819;90820;90821;90822;90823;90824;90825;90826;90827;90828;90829;90830;90831;90832 115275;115276;115277;115278;115279;115280;115281;115282;115283;115284;115285;115286;115287;115288;115289;115290;115291;115292;115293;115294;115295;115296;115297;115298;115299;115300;115301;115302;115303;115304;115305;115306;115307;115308;115309;115310;115311;115312 115302 35 EIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHR Unmodified 2721.3194 0.31940044 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 77.041 77.041 5 8.3972E-05 78523 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.728 47.106 201560000 0 0 0 29615000 38467000 0 0 41999000 0 0 49531000 0 41952000 10276 1785 9621 90833;90834;90835;90836;90837 115313;115314;115315;115316;115317;115318 115317 6 EISEAFTSTGFDR Unmodified 1458.6627 0.66268803 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4;E9PDD6 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 85.862 85.862 2 0.032093 89024 QUIQUE_C1438_190116_001 67.93 43.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10277 4062 9622 90838 115319 115319 1 EISEITGGPINETLK Unmodified 1599.8356 0.83556702 1754 O95822 MLYCD Malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.079 86.079 2 0.0015102 88844 QUIQUE_C1218_190116_001 88.021 40.017 285580000 30964000 27099000 0 43571000 0 41089000 47548000 0 30294000 0 0 33453000 31561000 10278 1754 9623 90839;90840;90841;90842;90843;90844;90845;90846 115320;115321;115322;115323;115324;115325;115326;115327 115320 8 EISEVFPDQFIHLGGDEVEFK Unmodified 2434.1693 0.16925676 1925 P07686;Q5URX0;H0Y9B6 HEXB Beta-hexosaminidase subunit beta;Beta-hexosaminidase subunit beta chain B;Beta-hexosaminidase subunit beta chain A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.81 143.81 3 0.00045125 150893 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.117 49.568 460990000 48254000 48959000 48636000 46974000 62147000 0 53338000 0 0 0 64947000 49797000 37934000 10279 1925 9624 90847;90848;90849;90850;90851;90852;90853;90854;90855 115328;115329;115330;115331;115332;115333;115334;115335;115336 115334 8 EISFAYEVLSNPEK Unmodified 1624.7985 0.79845323 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 116.06 116.06 2;3 0.00017866 119120 QUIQUE_C1403_190116_001 110.08 94.933 607680000 9845200 0 0 166500000 104320000 0 115340000 0 205490000 6196500 0 0 0 10280 1600 9625 90856;90857;90858;90859;90860;90861;90862 115337;115338;115339;115340;115341;115342;115343;115344 115338 7 EISFAYEVLSNPEKR Unmodified 1780.8996 0.89956426 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 96.387 96.387 2;3 9.0776E-13 99796 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.7 101.16 1804200000 41128000 102120000 88548000 0 119710000 39134000 113760000 219300000 207470000 15221000 367640000 264150000 226000000 10281 1600 9626 90863;90864;90865;90866;90867;90868;90869;90870;90871;90872;90873;90874;90875;90876;90877;90878;90879;90880;90881;90882;90883 115345;115346;115347;115348;115349;115350;115351;115352;115353;115354;115355;115356;115357;115358;115359;115360;115361;115362;115363;115364;115365;115366;115367;115368;115369;115370 115365 25 EISGLWNELDSLK Unmodified 1502.7617 0.76167379 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJV5 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.99 140.99 2 0.00048513 143577 QUIQUE_C1563_190116_001 90.685 72.866 91982000 23831000 0 23356000 0 0 24143000 20652000 0 0 0 0 0 0 10282 3490 9627 90884;90885;90886;90887 115371;115372;115373;115374;115375 115374 3 EISLLPDNLLR Unmodified 1281.7293 0.72925145 3111 Q15118;C9JKT3;F8WEJ6;C9IYB4;F8WC75 PDK1 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.07 131.07 2 0.0018206 134988 QUIQUE_C1277_190116_001 96.331 74.245 108280000 23770000 23456000 20832000 0 0 16752000 0 23473000 0 0 0 0 0 10283 3111 9628 90888;90889;90890;90891;90892;90893;90894 115376;115377;115378;115379;115380;115381;115382 115377 7 EISLWFKPEELVDYK Unmodified 1894.9717 0.97166657 3222 Q32Q12;P22392 NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 139.13 139.13 2;3 6.9069E-43 145658 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.81 160.76 9765100000 645980000 584940000 1048700000 410410000 387500000 367850000 852110000 581590000 1153700000 359630000 1329100000 844390000 1199300000 10284 3222 9629 90895;90896;90897;90898;90899;90900;90901;90902;90903;90904;90905;90906;90907;90908;90909;90910;90911;90912;90913;90914 115383;115384;115385;115386;115387;115388;115389;115390;115391;115392;115393;115394;115395;115396;115397;115398;115399;115400;115401;115402;115403;115404;115405;115406;115407;115408;115409;115410 115404 28 EISNFEYLMFLNTIAGR Oxidation (M) 2032.9928 0.99281272 264;910 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9;E9PEM5;P50851;H0YAC6;A0A3B3IU76;A0A3B3IS13 NBEA;LRBA Neurobeachin;Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein no no 0 1 0 1 160.83 160.83 2 0.0010745 163051 QUIQUE_C1563_190116_001 67.456 43.707 17397000 0 0 0 0 0 17397000 0 0 0 0 0 0 0 10285 264;910 9630 90915 115411 115411 151 1 EISPDTTLLDLQNNDISELR Unmodified 2285.1387 0.13868491 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 140.43 140.43 2;3 1.3072E-87 144546 QUIQUE_C1277_190116_001 202.13 167.13 989540000 168410000 203470000 80738000 224620000 95075000 65426000 31182000 0 0 79870000 0 40738000 0 10286 2186 9631 90916;90917;90918;90919;90920;90921;90922;90923;90924;90925;90926;90927;90928;90929;90930;90931;90932;90933 115412;115413;115414;115415;115416;115417;115418;115419;115420;115421;115422;115423;115424;115425;115426;115427;115428;115429;115430 115415 19 EISPDTTLLDLQNNDISELRK Unmodified 2413.2336 0.23364793 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 120.07 120.07 3 7.1631E-65 123996 QUIQUE_C1277_190116_001 168.27 154.4 2076800000 140340000 287660000 97296000 225170000 148220000 154720000 341330000 0 0 94037000 117750000 286490000 183810000 10287 2186 9632 90934;90935;90936;90937;90938;90939;90940;90941;90942;90943;90944;90945 115431;115432;115433;115434;115435;115436;115437;115438;115439;115440;115441;115442;115443;115444 115433 11 EISPGSGPGEIR Unmodified 1197.599 0.59896556 933;1529 E9PHY5;E9PK52;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.412 36.412 2 0.00047931 31885 QUIQUE_C1563_190116_001 127.4 89.889 1525800000 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0.18319226 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.12 163.12 3 4.648E-24 167160 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.79 121.17 646910000 52959000 58715000 67439000 0 51374000 0 0 54254000 75948000 0 73478000 74573000 138160000 10291 3555 9636 90966;90967;90968;90969;90970;90971;90972;90973;90974 115468;115469;115470;115471;115472;115473;115474;115475;115476 115475 8 EITALAPSTM Unmodified 1032.5161 0.51614714 447 A0A2R8Y793 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 93.574 93.574 1;2 0.00025579 95546 QUIQUE_C1403_190116_001 117.18 89.003 300080000 42001000 79915000 47976000 40373000 0 39331000 33907000 0 0 16581000 0 0 0 10292 447 9637 90975;90976;90977;90978;90979;90980;90981;90982 115477;115478;115479;115480;115481;115482;115483;115484;115485;115486 115481 7 EITALAPSTMK Unmodified 1160.6111 0.61111015 2788;2696;2792;2759;548 A6NL76;P60709;A0A2R8YFE2;P62736;P63267;P63261;P68032;P68133 ACTA1;ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 54.994 54.994 2 1.8712E-08 56015 QUIQUE_C1218_190116_001 155.84 125.68 211880000000 18063000000 19775000000 19526000000 18952000000 15416000000 16036000000 17958000000 15803000000 14596000000 8272400000 16679000000 14531000000 16270000000 10293 548;2696;2759;2788;2792 9638 90983;90984;90985;90986;90987;90988;90989;90990;90991;90992;90993;90994;90995;90996;90997;90998;90999;91000;91001;91002;91003;91004;91005;91006 115487;115488;115489;115490;115491;115492;115493;115494;115495;115496;115497;115498;115499;115500;115501;115502;115503;115504;115505;115506;115507;115508;115509;115510;115511;115512;115513;115514;115515;115516;115517;115518;115519;115520;115521;115522;115523;115524;115525;115526;115527;115528;115529;115530;115531;115532;115533;115534;115535;115536;115537;115538;115539;115540;115541;115542;115543;115544;115545;115546;115547;115548;115549;115550 115488 62 EITALAPSTMK Oxidation (M) 1176.606 0.60602477 2788;2696;2792;2759;548 A6NL76;P60709;A0A2R8YFE2;P62736;P63267;P63261;P68032;P68133 ACTA1;ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 1 0 1 2 1 1 1 3 5 4 3 3 1 1 42.355 42.355 2 6.2743E-05 34261 QUIQUE_C1438_190116_001 136.99 82.378 75763000000 0 54171000 8194800000 6294000000 5905800000 5622100000 5492800000 6996000000 7950200000 7363200000 7463300000 7345200000 7081100000 10294 548;2696;2759;2788;2792 9638 91007;91008;91009;91010;91011;91012;91013;91014;91015;91016;91017;91018;91019;91020;91021;91022;91023;91024;91025;91026;91027;91028;91029;91030;91031;91032 115551;115552;115553;115554;115555;115556;115557;115558;115559;115560;115561;115562;115563;115564;115565;115566;115567;115568;115569;115570;115571;115572;115573;115574;115575;115576;115577;115578;115579;115580;115581;115582;115583;115584;115585;115586;115587;115588;115589;115590;115591;115592;115593;115594;115595;115596;115597;115598;115599;115600;115601;115602 115560 366 51 EITENLMATGDLDQDGR Unmodified 1876.8473 0.84727069 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 95.949 95.949 2 2.3083E-05 92697 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.55 76.26 14279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14279000 0 0 0 10295 2066 9639 91033 115603 115603 1 EITFENGEELTEEGLPFLILFHMK Unmodified 2835.4041 0.40408408 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 169.6 169.6 3 1.9998E-06 176913 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.222 55.061 57420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57420000 0 0 10296 4007 9640 91034 115604 115604 1 EITFLDAK Unmodified 935.4964 0.49639797 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 71.963 71.963 2 0.065856 72639 QUIQUE_C1576_190116_001 51.854 15.974 19598000 0 0 0 0 0 0 19598000 0 0 0 0 0 0 10297 3210 9641 91035 115605 115605 1 EITGIGPSTTTETETIAK Unmodified 1847.9364 0.93640328 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.215 72.215 2 3.5502E-45 73590 QUIQUE_C1218_190116_001 171.73 139.13 1166500000 118030000 125330000 0 105750000 109530000 87404000 114350000 0 114110000 0 143690000 133990000 114260000 10298 1635 9642 91036;91037;91038;91039;91040;91041;91042;91043;91044;91045 115606;115607;115608;115609;115610;115611;115612;115613;115614;115615;115616 115606 10 EITKPLRPLGK Unmodified 1250.7711 0.77105669 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C0V6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 20.542 20.542 2;3 0.015658 14215 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.132 49.555 599420000 0 0 131160000 0 0 0 156250000 104020000 176510000 0 31467000 0 0 10299 922 9643 91046;91047;91048;91049;91050;91051 115617;115618;115619;115620;115621;115622 115619 3 EITLENKDNIR Unmodified 1343.7045 0.70449327 4288 Q9NT62;C9JNW8 ATG3 Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3 yes no 0 0 1 1 1 1 31.315 31.315 2 0.0056643 26342 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.55 53.506 87415000 0 0 0 0 0 0 0 36186000 0 0 0 0 51228000 10300 4288 9644 91052;91053;91054 115623;115624;115625;115626 115625 4 EITQDTNDITYADLNLPK Unmodified 2063.0059 0.005879824 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 111.94 111.94 2;3 4.327E-45 117203 QUIQUE_C1438_190116_001 205.61 179.96 1290700000 104750000 115860000 83820000 143580000 150450000 117130000 117630000 65292000 99649000 94372000 0 94108000 104090000 10301 2803 9645 91055;91056;91057;91058;91059;91060;91061;91062;91063;91064;91065;91066;91067;91068 115627;115628;115629;115630;115631;115632;115633;115634;115635;115636;115637;115638;115639;115640;115641;115642 115633 14 EITTCLPDYYK Unmodified 1401.6486 0.64861787 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 83.646 83.646 2 0.026423 84795 QUIQUE_C1403_190116_001 62.823 43.845 25663000 0 0 0 25663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10302 3100 9646 91069 115643 115643 1 EIVDPLYGIAEVEIPNIQK Unmodified 2139.1463 0.14633647 3353 Q68EM7;C9IZD3;I3L4P6 ARHGAP17 Rho GTPase-activating protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 154.78 154.78 2 2.607E-16 157497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.48 102.73 143900000 23209000 0 0 0 25900000 0 0 16239000 30332000 0 0 0 48222000 10303 3353 9647 91070;91071;91072;91073;91074 115644;115645;115646;115647;115648 115646 5 EIVDSYLPVILDIIK Unmodified 1728.9913 0.99133938 1924 P07602;C9JIZ6 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 171.04 171.04 2;3 6.8251E-06 172146 QUIQUE_C1563_190116_001 126.1 101.76 3157000000 334570000 67871000 1248200000 28722000 528830000 497080000 328700000 16879000 36618000 0 0 69558000 0 10304 1924 9648 91075;91076;91077;91078;91079;91080;91081;91082;91083;91084;91085;91086;91087 115649;115650;115651;115652;115653;115654;115655;115656;115657;115658;115659;115660;115661;115662;115663;115664 115657 15 EIVDWFNALR Unmodified 1261.6455 0.64552182 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;H7BZT6;H7C4B3;H7C264;J3KST1;K7ENT1;J3QLP8;Q2V6Q1;Q9NPF8 ADAP1;ADAP2;CENTA2 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1;Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 145.55 145.55 2 0.011291 149917 QUIQUE_C1403_190116_001 91.853 66.959 53974000 0 0 0 36085000 0 0 0 0 0 0 17889000 0 0 10305 1129 9649 91088;91089;91090;91091;91092;91093;91094 115665;115666;115667;115668;115669;115670;115671 115667 6 EIVEMNEIEEGK Unmodified 1418.6599 0.65991084 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 73.889 73.889 2 0.046992 74578 QUIQUE_C1218_190116_001 45.126 23.068 23723000 23723000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10306 4145 9650 91095 115672 115672 1 EIVESCDLK Unmodified 1091.5169 0.51687542 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.759 34.759 2 0.0052265 30522 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.181 28.399 426180000 0 58744000 56769000 54418000 74360000 0 0 0 37398000 0 75174000 0 69319000 10307 821 9651 91096;91097;91098;91099;91100;91101;91102 115673;115674;115675;115676;115677;115678;115679;115680 115677 8 EIVHIQAGQCGNQIGTK Unmodified 1851.9261 0.92613014 4033 Q9BUF5;K7ESM5;K7EL29;K7EN98;K7ESQ3;K7EQT3;K7EJ64;K7ERA8;K7EJZ4;K7EPE5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes no 0 0 0 1 1 1 2 4 4 2 2 3 39.777 39.777 2;3 4.7298E-13 38746 QUIQUE_C1218_190116_001 89.232 73.388 1583200000 51602000 0 0 0 58674000 0 0 249660000 293970000 219050000 178890000 203130000 328180000 10308 4033 9652 91103;91104;91105;91106;91107;91108;91109;91110;91111;91112;91113;91114;91115;91116;91117;91118;91119;91120;91121;91122 115681;115682;115683;115684;115685;115686;115687;115688;115689;115690;115691;115692;115693;115694;115695;115696;115697;115698;115699;115700;115701;115702;115703;115704;115705;115706;115707 115681 27 EIVHLQAGQCGNQIGAK Unmodified 1821.9156 0.91556545 2797;1862;1364;1363 P04350;M0R2D3;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;M0R2T4;P68371;M0QYM7;M0R042;M0QY37 TUBB4A;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain no no 0 0 0 3 7 5 4 4 5 5 4 5 4 5 4 5 43.334 43.334 2;3 9.0212E-202 40729 QUIQUE_C1277_190116_001 312.31 0 368340000000 28298000000 37476000000 24379000000 33419000000 38884000000 28108000000 39937000000 18004000000 23035000000 12570000000 27617000000 25244000000 31369000000 10309 1862;2797;1364;1363 9653 91123;91124;91125;91126;91127;91128;91129;91130;91131;91132;91133;91134;91135;91136;91137;91138;91139;91140;91141;91142;91143;91144;91145;91146;91147;91148;91149;91150;91151;91152;91153;91154;91155;91156;91157;91158;91159;91160;91161;91162;91163;91164;91165;91166;91167;91168;91169;91170;91171;91172;91173;91174;91175;91176;91177;91178;91179;91180;91181;91182 115708;115709;115710;115711;115712;115713;115714;115715;115716;115717;115718;115719;115720;115721;115722;115723;115724;115725;115726;115727;115728;115729;115730;115731;115732;115733;115734;115735;115736;115737;115738;115739;115740;115741;115742;115743;115744;115745;115746;115747;115748;115749;115750;115751;115752;115753;115754;115755;115756;115757;115758;115759;115760;115761;115762;115763;115764;115765;115766;115767;115768;115769;115770;115771;115772;115773;115774;115775;115776;115777;115778;115779;115780;115781;115782;115783;115784;115785;115786;115787;115788;115789;115790;115791;115792;115793;115794;115795;115796;115797;115798;115799 115717 87 EIVLADVIDNDSWR Unmodified 1643.8155 0.81550028 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 140.16 140.16 2;3 3.9808E-18 146977 QUIQUE_C1438_190116_001 191.53 149.53 6251400000 485160000 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1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.829 54.829 2 7.9618E-06 53734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.78 91.75 892480000 0 0 222270000 0 0 103190000 0 0 145550000 45702000 177300000 0 198470000 10312 1961 9656 91218;91219;91220;91221;91222;91223 115838;115839;115840;115841;115842;115843 115842 6 EIVTNFLAGFEA Unmodified 1309.6554 0.65541781 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 165.98 165.98 2 0.00053086 167283 QUIQUE_C1563_190116_001 100.02 80.923 10801000000 1460000000 981660000 1832800000 773990000 879650000 1240700000 974950000 465330000 566480000 0 530640000 514520000 580490000 10313 2243 9657 91224;91225;91226;91227;91228;91229;91230;91231;91232;91233;91234;91235;91236 115844;115845;115846;115847;115848;115849;115850;115851;115852;115853;115854;115855;115856;115857;115858;115859;115860;115861;115862;115863;115864;115865;115866;115867;115868;115869 115852 26 EIVVIHQDPEALK Unmodified 1489.814 0.81404372 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 3 2 2 56.921 56.921 2;3 1.0621E-05 56255 QUIQUE_C1438_190116_001 111.86 91.825 618540000 24042000 63419000 39699000 44534000 42179000 34982000 49578000 24031000 30242000 20664000 89702000 64947000 90525000 10314 2441 9658 91237;91238;91239;91240;91241;91242;91243;91244;91245;91246;91247;91248;91249;91250;91251;91252;91253;91254;91255;91256;91257 115870;115871;115872;115873;115874;115875;115876;115877;115878;115879;115880;115881;115882;115883;115884;115885;115886;115887;115888;115889;115890;115891;115892;115893 115879 22 EIVVLETLEDIDK Unmodified 1514.808 0.80795528 3128 Q15293;E9PP27 RCN1 Reticulocalbin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.27 144.27 2 3.3208E-11 148962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.23 123.19 1067800000 217790000 183160000 0 88787000 130370000 160320000 129070000 34781000 70829000 0 0 0 52722000 10315 3128 9659 91258;91259;91260;91261;91262;91263;91264;91265;91266;91267 115894;115895;115896;115897;115898;115899;115900;115901;115902;115903;115904;115905;115906;115907 115905 14 EIWDMFGVFFANHPDLR Oxidation (M) 2108.9778 0.97783136 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 1 1 1 2 155.54 155.54 3 0.00015299 160067 QUIQUE_C1277_190116_001 74.786 65.037 428580000 61080000 82742000 47165000 0 0 0 70445000 0 37035000 0 130120000 0 0 10316 1639 9660 91268;91269;91270;91271;91272;91273;91274;91275;91276 115908;115909;115910;115911;115912;115913;115914;115915;115916 115911 884 9 EIWDMFGVFFANHPDLR Unmodified 2092.9829 0.98291673 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 167.82 167.82 2;3 7.3914E-75 174941 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.03 180.82 1112100000 0 21381000 20578000 14829000 0 0 98672000 0 128240000 0 494670000 283520000 50179000 10317 1639 9660 91277;91278;91279;91280;91281;91282;91283;91284;91285;91286;91287 115917;115918;115919;115920;115921;115922;115923;115924;115925;115926;115927;115928 115924 11 EIWDMFGVFFANHPDLRR Unmodified 2249.084 0.084027761 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 79.422 79.422 4 0.064136 75627 QUIQUE_DMIX4_190116_001 9.9958 1.5161 16452000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16452000 0 0 0 10318 1639 9661 91288 115929 115929 1 EIWGVEPSDLQIPPPNIPR Unmodified 2156.1266 0.12660408 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 142.19 142.19 2;3 0.00016056 144457 QUIQUE_C1563_190116_001 105.17 97.805 333330000 101990000 0 0 74020000 18459000 65526000 49745000 0 0 23595000 0 0 0 10319 2016 9662 91289;91290;91291;91292;91293;91294;91295;91296;91297;91298;91299;91300;91301;91302 115930;115931;115932;115933;115934;115935;115936;115937;115938;115939;115940;115941;115942;115943 115937 9 EIWGVEPSDLQIPPPNIPRD Unmodified 2271.1535 0.15354711 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 2 3 4 6 4 5 5 5 3 5 4 3 142.8 142.8 2;3 2.2295E-66 147232 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.56 166.14 2458700000 0 64497000 235830000 160820000 197930000 131750000 253450000 269910000 292240000 53995000 314670000 263830000 219760000 10320 2016 9663 91303;91304;91305;91306;91307;91308;91309;91310;91311;91312;91313;91314;91315;91316;91317;91318;91319;91320;91321;91322;91323;91324;91325;91326;91327;91328;91329;91330;91331;91332;91333;91334;91335;91336;91337;91338;91339;91340;91341;91342;91343;91344;91345;91346;91347;91348;91349;91350;91351 115944;115945;115946;115947;115948;115949;115950;115951;115952;115953;115954;115955;115956;115957;115958;115959;115960;115961;115962;115963;115964;115965;115966;115967;115968;115969;115970;115971;115972;115973;115974;115975;115976;115977;115978;115979;115980;115981;115982;115983;115984;115985;115986;115987;115988;115989;115990;115991;115992;115993;115994;115995;115996;115997;115998;115999;116000;116001;116002;116003;116004;116005;116006;116007;116008;116009;116010;116011;116012;116013 115981 66 EIWGVEPSR Unmodified 1071.5349 0.53490874 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.2 64.2 2 0.0023637 64380 QUIQUE_C1438_190116_001 94.114 65.94 2908000000 64922000 159310000 196570000 255630000 194220000 192470000 293300000 262890000 374150000 96626000 162290000 347250000 308380000 10321 2017 9664 91352;91353;91354;91355;91356;91357;91358;91359;91360;91361;91362;91363;91364 116014;116015;116016;116017;116018;116019;116020;116021;116022;116023;116024;116025;116026 116018 12 EIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLR Oxidation (M) 3739.7644 0.76441605 1963 P09471;A0A1W2PP38;A0A1W2PQ24 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 0 1 173.89 173.89 3 8.3522E-14 181108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.104 58.559 22927000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22927000 0 0 10322 1963 9665 91365 116027 116027 1227 1 EIYCPAPPQIDNGIIQGER Unmodified 2169.0525 0.052452861 597 H3BLV0;B1AP13;H7BY55;P08174;B1AP15;A0A2R8YDY3;A0A2R8YEC5 CD55 Complement decay-accelerating factor yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 104.89 104.89 2;3 1.3579E-22 109067 QUIQUE_C1218_190116_001 137.8 124.92 282500000 25902000 117180000 0 27840000 31904000 0 32037000 0 0 0 0 0 47638000 10323 597 9666 91366;91367;91368;91369;91370;91371;91372;91373 116028;116029;116030;116031;116032;116033;116034;116035 116028 8 EIYDDSFIR Unmodified 1156.5401 0.5400537 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 55.46 55.46 3 0.03229 53139 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.892 7.9696 13292000 0 0 0 0 0 0 0 13292000 0 0 0 0 0 10324 4334 9667 91374 116036 116036 1 EIYDDSFIRPVTFWIVGDFDSPSGR Unmodified 2917.3923 0.39227384 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 1 1 167.91 167.91 3 0.065365 171970 QUIQUE_DMIX7_190116_001 24.629 19.175 30055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30055000 0 10325 4334 9668 91375 116037 116037 1 EIYDQFGEEGLK Unmodified 1426.6616 0.6616254 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 0 1 89.132 89.132 2 0.018678 85631 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.29 67.778 26373000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26373000 0 0 0 10326 4416 9669 91376 116038 116038 0 EIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFR Unmodified 2645.1994 0.19938769 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 1 1 90.773 90.773 3 3.898E-09 91738 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.19 69.198 49477000 0 0 0 0 0 0 0 49477000 0 0 0 0 0 10327 4416 9670 91377 116039 116039 1 EIYEESSTWK Unmodified 1270.5717 0.57174776 1768 O96007 MOCS2 Molybdopterin synthase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 54.154 54.154 2 0.014657 53252 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.04 55.127 45288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45288000 0 0 10328 1768 9671 91378 116040 116040 1 EIYGSTLYDSR Unmodified 1302.6092 0.6091959 3922 Q96Q05 TRAPPC9 Trafficking protein particle complex subunit 9 yes yes 0 0 0 1 1 65.349 65.349 2 0.052925 66206 QUIQUE_C1438_190116_001 60.398 44.959 61874000 0 0 33134000 0 28740000 0 0 0 0 0 0 0 0 10329 3922 9672 91379;91380 116041;116042 116042 1 EIYHFTLEK Unmodified 1178.5972 0.59717465 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 60.902 60.902 2;3 3.5208E-05 57963 QUIQUE_DMIX4_190116_001 156.75 84.525 915190000 0 140790000 0 0 158130000 0 115340000 115540000 0 0 137230000 112890000 135280000 10330 824 9673 91381;91382;91383;91384;91385;91386;91387;91388;91389;91390;91391 116043;116044;116045;116046;116047;116048;116049;116050;116051;116052;116053;116054 116051 12 EIYLPIR Unmodified 902.52255 0.52255314 3227 Q3SXM5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.714 79.714 2 0.026457 81715 QUIQUE_C1218_190116_001 93.885 40.7 362540000 49377000 53156000 0 0 0 0 0 52867000 61734000 22130000 65289000 0 57988000 10331 3227 9674 91392;91393;91394;91395;91396;91397;91398 116055;116056;116057;116058;116059;116060;116061 116055 7 EIYNQVNVVLK Unmodified 1317.7293 0.72925145 4300 Q9NUQ9;E5RI16;E5RGI7;E5RJE1;E5RIR8;E5RJL8;E5RK61;E5RFS4;E5RHU5;E5RK81;E5RH75 FAM49B Protein FAM49B yes no 0 0 0 1 1 1 82.402 82.402 2 0.0028712 78866 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.629 63.272 173380000 64688000 57554000 0 0 0 0 0 0 0 51141000 0 0 0 10332 4300 9675 91399;91400;91401 116062;116063;116064;116065 116064 2 EIYPYVIQELRPTLNELGISTPEELGLDKV Unmodified 3427.8127 0.81265332 2170 P20674;H3BRM5;H3BV69 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 168.17 168.17 2;3;4 1.0276E-64 175526 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.24 133.61 11103000000 108130000 0 0 0 1171500000 0 2808500000 785910000 1500500000 0 1342800000 3385600000 0 10333 2170 9676 91402;91403;91404;91405;91406;91407;91408;91409;91410;91411;91412;91413 116066;116067;116068;116069;116070;116071;116072;116073;116074;116075;116076;116077;116078 116076 11 EIYQEALK Unmodified 992.51786 0.51786169 3357 Q6DKK2 TTC19 Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 41.059 41.059 2 0.020821 38040 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.134 7.8222 36635000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36635000 0 0 10334 3357 9677 91414 116079;116080 116080 2 EIYRPVTTWPFIIK Unmodified 1761.9818 0.98177775 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 127.05 127.05 3 0.0037369 129475 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.292 56.741 95972000 28820000 0 0 38888000 0 0 0 28264000 0 0 0 0 0 10335 3405 9678 91415;91416;91417 116081;116082;116083 116083 3 EIYTHFTCATDTK Unmodified 1585.7083 0.70825802 1870;2779;1953 P63096;P08754;P04899 GNAI1;GNAI3;GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1;Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 45.106 45.106 2;3 4.708E-103 42161 QUIQUE_DMIX3_190116_001 233.54 212.67 9905300000 504760000 662340000 1212300000 1137100000 1343200000 0 784220000 511720000 634870000 167780000 1044600000 798950000 1103500000 10336 2779;1953;1870 9679 91418;91419;91420;91421;91422;91423;91424;91425;91426;91427;91428;91429;91430;91431;91432;91433;91434;91435;91436;91437;91438;91439 116084;116085;116086;116087;116088;116089;116090;116091;116092;116093;116094;116095;116096;116097;116098;116099;116100;116101;116102;116103;116104;116105;116106;116107;116108;116109;116110;116111;116112;116113;116114 116104 30 EIYTNLGPR Unmodified 1061.5506 0.55055881 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 50.455 50.455 2 0.016207 48445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.073 28.427 119810000 0 0 0 35798000 0 0 0 45737000 38278000 0 0 0 0 10337 1414;3777 9680 91440;91441;91442;91443 116115;116116;116117;116118 116117 4 EIYYHGEPISVNVHVTNNTNK Unmodified 2427.1819 0.18188713 2528;1150 P49407;E9PM35;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 0 2 1 3 1 1 2 1 64.622 64.622 3;4 3.6607E-09 61772 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.43 60.31 536680000 88917000 58890000 86126000 80979000 57563000 127800000 0 0 0 36400000 0 0 0 10338 2528;1150 9681 91444;91445;91446;91447;91448;91449;91450;91451;91452;91453;91454 116119;116120;116121;116122;116123;116124;116125;116126;116127;116128;116129;116130;116131 116131 12 EKADIQLLVYTIDDLIDK Unmodified 2104.1304 0.13035206 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 167.63 167.63 2;3 3.3516E-53 174796 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116149;116150;116151;116152;116153;116154;116155;116156;116157;116158;116159;116160;116161;116162;116163;116164;116165;116166 116166 17 EKAEGDVAALNRR Unmodified 1427.7481 0.74808942 435;2791 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;P67936 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain no no 0 0 2 1 1 1 1 16.258 16.258 3;4 0.0097055 9169 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.176 48.258 176370000 0 0 0 0 0 0 0 62322000 82983000 0 15509000 0 15557000 10341 435;2791 9684 91489;91490;91491;91492 116167;116168;116169;116170 116167 4 EKAPDFLPLLNK Unmodified 1383.7762 0.77620165 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.343 98.343 3 0.0090071 100432 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.551 50.55 164880000 0 0 23382000 17727000 25869000 0 0 19581000 18740000 0 0 25848000 33737000 10342 1654 9685 91493;91494;91495;91496;91497;91498;91499;91500 116171;116172;116173;116174;116175;116176;116177;116178;116179 116179 9 EKAPSIIFIDELDAIGTK Unmodified 1959.0565 0.056458831 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 138.42 138.42 2;3 0.0031857 141914 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.506 67.957 775190000 0 82373000 0 0 85938000 0 83155000 106680000 87036000 0 130560000 93425000 106030000 10343 4672 9686 91501;91502;91503;91504;91505;91506;91507;91508;91509;91510 116180;116181;116182;116183;116184;116185;116186;116187;116188;116189;116190;116191;116192 116183 10 EKDILTAIAADLCK Unmodified 1559.8229 0.82289384 2587 P51648;J3QRD1;J3QKK9;J3KTG1;C9JGJ2;I3L0X1;K7EN73 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.53 128.53 3 0.00031384 132881 QUIQUE_C1368_190116_001 65.038 52.117 253820000 37565000 16871000 39771000 20725000 28293000 25232000 30635000 23805000 0 14969000 0 15959000 0 10344 2587 9687 91511;91512;91513;91514;91515;91516;91517;91518;91519;91520 116193;116194;116195;116196;116197;116198;116199;116200;116201;116202 116195 10 EKDILVLPLDLTDTGSHEAATK Unmodified 2365.2377 0.23767067 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 2 106.16 106.16 3;4 1.1525E-07 109589 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.059 74.443 618720000 0 87390000 57146000 114420000 0 69123000 42986000 52255000 37413000 10904000 44888000 0 102200000 10345 4581 9688 91521;91522;91523;91524;91525;91526;91527;91528;91529;91530;91531;91532;91533;91534;91535 116203;116204;116205;116206;116207;116208;116209;116210;116211;116212;116213;116214;116215;116216;116217;116218;116219;116220 116215 18 EKDIQEESTFSSR Unmodified 1554.7162 0.71618016 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 27.247 27.247 2 3.3202E-06 21793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.56 107.65 156270000 39265000 0 0 0 0 0 0 31583000 52365000 0 33053000 0 0 10346 2452 9689 91536;91537;91538;91539 116221;116222;116223;116224;116225;116226 116223 6 EKDLEDLFYK Unmodified 1298.6394 0.63943339 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.424 86.424 2;3 0.0065939 87841 QUIQUE_C1277_190116_001 57.785 39.45 192520000 32860000 39199000 0 45697000 0 0 0 21648000 28345000 0 0 24767000 0 10347 2980 9690 91540;91541;91542;91543;91544;91545 116227;116228;116229;116230;116231;116232 116228 6 EKDNIDITLQWLIQHSK Unmodified 2080.0953 0.095303954 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 131.34 131.34 2;3;4 1.3744E-30 135527 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.87 104.57 3435500000 180740000 256670000 291230000 200830000 150830000 207510000 377070000 275480000 467790000 69357000 281180000 346830000 329950000 10348 3808;4308 9691 91546;91547;91548;91549;91550;91551;91552;91553;91554;91555;91556;91557;91558;91559;91560;91561;91562;91563;91564;91565;91566;91567;91568;91569;91570;91571;91572 116233;116234;116235;116236;116237;116238;116239;116240;116241;116242;116243;116244;116245;116246;116247;116248;116249;116250;116251;116252;116253;116254;116255;116256;116257;116258;116259;116260;116261;116262;116263;116264;116265;116266;116267;116268;116269;116270;116271;116272;116273;116274;116275 116259 43 EKDPFEVDLSHVYLAYTEESLR Unmodified 2639.2755 0.27551274 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496;H7C2F6 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 1 1 142.76 142.76 3 1.4165E-07 150216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.56 75.114 29431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29431000 0 0 10349 88 9692 91573 116276 116276 1 EKDTATLNCQSSGSKPAAR Unmodified 2019.9644 0.96436614 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 10.385 10.385 3;4 7.9356E-172 2622 QUIQUE_DMIX8_190116_001 245.03 196.82 881660000 40593000 0 52855000 164690000 142790000 0 71414000 74684000 128150000 12703000 34698000 84645000 74442000 10350 3569 9693 91574;91575;91576;91577;91578;91579;91580;91581;91582;91583;91584;91585;91586;91587;91588;91589;91590;91591;91592;91593 116277;116278;116279;116280;116281;116282;116283;116284;116285;116286;116287;116288;116289;116290;116291;116292;116293;116294;116295;116296;116297 116296 21 EKDVFDDIPK Unmodified 1204.5976 0.59756858 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 62.701 62.701 2;3 0.026885 60972 QUIQUE_C1563_190116_001 41.704 28.613 144000000 0 0 0 0 0 68681000 0 24716000 0 0 0 0 50599000 10351 2009 9694 91594;91595;91596 116298;116299;116300 116298 3 EKDVFDDIPKWEGK Unmodified 1704.8359 0.83590137 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 2 1 86.81 86.81 4 0.0015796 87803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.98 48.921 47064000 0 0 0 0 0 0 0 47064000 0 0 0 0 0 10352 2009 9695 91597 116301;116302 116302 2 EKEDAQEVELQEGK Unmodified 1630.7686 0.76860967 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 24.26 24.26 2 0.010669 18069 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4.7327E-11 116875 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.136 59.047 42904000 0 0 0 0 0 0 0 42904000 0 0 0 0 0 10355 2282 9698 91624 116338 116338 1 EKEDPEPSTDGTYVWK Unmodified 1879.8476 0.84758827 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 56.221 56.221 2;3 3.1123E-54 54636 QUIQUE_DMIX3_190116_001 194.98 138.75 1514300000 117960000 146550000 133680000 115200000 148550000 111430000 147830000 105590000 144810000 0 222730000 119910000 0 10356 4435 9699 91625;91626;91627;91628;91629;91630;91631;91632;91633;91634;91635;91636;91637;91638;91639;91640;91641;91642;91643;91644;91645;91646;91647 116339;116340;116341;116342;116343;116344;116345;116346;116347;116348;116349;116350;116351;116352;116353;116354;116355;116356;116357;116358;116359;116360;116361;116362;116363;116364 116358 21 EKEEFAVPENSSVQQFK Unmodified 1994.9585 0.9585357 4433;4503 Q9UHD9;Q9UMX0 UBQLN2;UBQLN1 Ubiquilin-2;Ubiquilin-1 no no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 68.619 68.619 2;3 2.8714E-103 68158 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116382;116383;116384;116385;116386;116387 116383 3 EKEEVAEEAQSGGD Unmodified 1476.6216 0.62161108 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.909 19.909 2 1.218E-45 12996 QUIQUE_C1218_190116_001 218.01 200.15 4229000000 412250000 354880000 308560000 378260000 379440000 219760000 579560000 121650000 254160000 0 321760000 334480000 564190000 10360 1681 9703 91670;91671;91672;91673;91674;91675;91676;91677;91678;91679;91680;91681 116388;116389;116390;116391;116392;116393;116394;116395;116396;116397;116398;116399 116388 10 EKEFEETMDALQADIDQLEAEK Unmodified 2581.1741 0.17414372 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 160.12 160.12 3 6.1055E-07 165529 QUIQUE_C1368_190116_001 75.033 67.041 239440000 0 48973000 53474000 0 0 48447000 0 0 35444000 0 0 53104000 0 10361 890;3052 9704 91682;91683;91684;91685;91686 116400;116401;116402;116403;116404 116401 3 EKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELK Unmodified 3022.4329 0.4328776 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 2 1 1 1 1 2 154.18 154.18 3;4 1.2687E-06 157398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.924 55.953 441160000 0 0 0 0 28989000 0 0 24182000 33097000 0 70695000 0 284200000 10362 890;3052 9705 91687;91688;91689;91690;91691;91692 116405;116406;116407;116408;116409;116410 116406 6 EKEFGDKVNLLSVLEAAK Unmodified 1989.0783 0.078256906 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 115.37 115.37 3;4 6.2996E-07 120918 QUIQUE_C1438_190116_001 77.221 67.806 953410000 0 25884000 0 0 24628000 0 23582000 62626000 162080000 0 131060000 173240000 350310000 10363 4006 9706 91693;91694;91695;91696;91697;91698;91699;91700;91701;91702;91703;91704 116411;116412;116413;116414;116415;116416;116417;116418;116419;116420;116421;116422;116423 116413 13 EKEISGLWNELDSLK Unmodified 1759.8992 0.89922991 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJV5 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 1 123.33 123.33 3 0.0044397 128301 QUIQUE_C1218_190116_001 73.802 56.733 28772000 14973000 0 0 0 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116436;116437;116438;116439;116440;116441;116442;116443;116444;116445;116446;116447;116448;116449;116450;116451;116452;116453;116454 116449 19 EKENLVQAFK Unmodified 1204.6452 0.64518747 3974 Q99766 ATP5S ATP synthase subunit s, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 36.851 36.851 3 0.019473 32482 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.338 24.902 144720000 0 0 0 0 0 0 0 37929000 41528000 0 29617000 35645000 0 10370 3974 9712 91734;91735;91736;91737 116455;116456;116457;116458 116458 4 EKENSLEAIR Unmodified 1187.6146 0.61461563 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;A0A3B3ITA2;F5H6A0 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 21.106 21.106 2;3 0.021474 14059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.297 13.824 79246000 0 0 0 0 26778000 0 0 17827000 0 0 34642000 0 0 10371 2322 9713 91738;91739;91740 116459;116460;116461 116461 3 EKEPIAASTNR Unmodified 1214.6255 0.62551466 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 10.907 10.907 2;3 0.00030331 3618 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.338 72.798 664590000 0 0 0 0 0 0 0 29520000 0 635080000 0 0 0 10372 267;275;3025 9714 91741;91742;91743;91744;91745 116462;116463;116464;116465;116466 116466 5 EKEPIVGSTDYGK Unmodified 1421.7038 0.70382456 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.687 28.687 2 0.001766 22377 QUIQUE_C1368_190116_001 131.43 38.322 332270000 35040000 59861000 46963000 41858000 33402000 51488000 44368000 0 0 19285000 0 0 0 10373 267;275;3025 9715 91746;91747;91748;91749;91750;91751;91752;91753;91754 116467;116468;116469;116470;116471;116472;116473;116474;116475 116469 9 EKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLK Unmodified 2493.2122 0.21224378 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 3 3 4 3 3 3 3 3 3 3 2 2 3 85.418 85.418 2;3;4 3.1096E-246 88055 QUIQUE_C1218_190116_001 275.49 232.11 28657000000 2695200000 2684600000 3183200000 1200500000 3053300000 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53.182 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10375 3467 9717 91793;91794 116538;116539 116538 2 EKEQLMASDDFGR Unmodified 1524.6879 0.68785692 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 46.237 46.237 2;3 3.1303E-88 43599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.17 213.11 9429200000 298900000 1152900000 1075300000 831650000 862820000 641400000 416370000 644520000 693810000 255960000 777890000 746950000 1030800000 10376 267;275;3025 9718 91795;91796;91797;91798;91799;91800;91801;91802;91803;91804;91805;91806;91807;91808;91809;91810;91811;91812;91813;91814;91815;91816;91817;91818 116540;116541;116542;116543;116544;116545;116546;116547;116548;116549;116550;116551;116552;116553;116554;116555;116556;116557;116558;116559;116560;116561;116562;116563;116564;116565;116566;116567 116556 20 EKEQLMASDDFGR Oxidation (M) 1540.6828 0.68277155 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 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Unmodified 4224.0552 0.055236638 120 A0A087X294 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase yes yes 0 0 2 1 1 155.03 155.03 5 0.00023762 159907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.276 33.043 106350000 0 0 0 0 0 0 0 0 27420000 0 0 0 78933000 10380 120 9720 91830;91831 116579;116580 116579 2 EKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWAR Unmodified 4242.0117 0.011657264 2970 Q13153;B3KNX7;E9PKH9 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 2 1 153.39 153.39 5 0.055511 158025 QUIQUE_DMIX7_190116_001 16.179 10.93 104030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 104030000 0 10381 2970 9721 91832 116581 116581 1 EKESVLGNLAK Unmodified 1186.6558 0.65575216 3680 Q8TD30 GPT2 Alanine aminotransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 32.493 32.493 2 0.016862 27823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.716 43.429 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10382 3680 9722 91833;91834 116582;116583 116583 2 EKETLAVNYEKEEEFLTNELSR Unmodified 2670.3025 0.30245578 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 2 1 1 1 120.97 120.97 4 0.0006374 124954 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.808 40.967 139910000 0 39639000 0 35560000 0 0 0 0 0 0 0 0 64716000 10383 3173 9723 91835;91836;91837 116584;116585;116586 116586 2 EKEVEAIQAQAK Unmodified 1342.7092 0.70924429 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.035 21.035 2;3 0.0026486 14580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.91 99.948 609050000 0 120840000 0 0 56977000 0 59035000 58780000 79344000 0 141410000 92668000 0 10384 1472 9724 91838;91839;91840;91841;91842;91843;91844;91845 116587;116588;116589;116590;116591;116592;116593;116594;116595 116591 9 EKFEEMIQQIK Unmodified 1421.7225 0.72245152 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.712 81.712 2;3 2.0683E-30 84225 QUIQUE_C1218_190116_001 195.79 173.55 3753400000 310320000 394900000 318750000 306690000 274530000 271840000 376730000 237610000 219460000 104110000 348070000 260580000 329800000 10385 2514 9725 91846;91847;91848;91849;91850;91851;91852;91853;91854;91855;91856;91857;91858;91859;91860;91861;91862;91863;91864;91865;91866;91867;91868;91869;91870;91871;91872 116596;116597;116598;116599;116600;116601;116602;116603;116604;116605;116606;116607;116608;116609;116610;116611;116612;116613;116614;116615;116616;116617;116618;116619;116620;116621;116622;116623;116624;116625;116626;116627;116628;116629;116630 116597 31 EKFEGVELNTDEPPMVFK Unmodified 2108.0136 0.013607739 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 111.98 111.98 3 0.00023699 115549 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.731 42.116 497200000 57701000 72173000 111390000 73808000 0 0 54612000 0 70311000 0 0 0 57204000 10386 2642 9726 91873;91874;91875;91876;91877;91878;91879;91880;91881;91882 116631;116632;116633;116634;116635;116636;116637;116638;116639;116640;116641;116642 116640 9 EKFENLGIQPPK Unmodified 1398.7507 0.75071518 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 55.555 55.555 2 0.016133 54849 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.096 46.157 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10387 4672 9727 91883 116643 116643 1 EKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNK Unmodified 2464.2023 0.20228822 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 112.79 112.79 3;4 0.0048545 117578 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.683 37.571 149560000 0 0 0 0 0 0 0 69174000 0 0 80388000 0 0 10388 1609 9728 91884;91885 116644;116645 116645 0 EKFTMVQVWPVR Unmodified 1518.8017 0.80170489 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 1 1 96.695 96.695 3 0.020913 99840 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.568 37.622 22769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22769000 10389 2414 9729 91886 116646 116646 1 EKGDPLNIAIDK Unmodified 1311.7034 0.70343063 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 55.147 55.147 2;3 0.00066757 52736 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.169 65.834 634720000 0 44079000 30460000 0 0 0 107620000 106010000 56323000 27523000 38703000 118990000 105020000 10390 2250 9730 91887;91888;91889;91890;91891;91892;91893;91894;91895;91896;91897;91898;91899 116647;116648;116649;116650;116651;116652;116653;116654;116655;116656;116657;116658;116659;116660;116661;116662 116662 12 EKGLPILVELLR Unmodified 1378.8548 0.85478632 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 1 1 130.59 130.59 3 0.0012372 137422 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.563 44.262 9992300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9992300 0 0 10391 855;928 9731 91900 116663 116663 1 EKGQEDFSETR Unmodified 1324.5895 0.58952309 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein no no 0 0 1 2 1 1 2 1 15.031 15.031 2;3 0.0028409 7410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.31 88.161 296210000 0 66244000 0 50379000 0 22546000 0 82512000 74530000 0 0 0 0 10392 1058 9732 91901;91902;91903;91904;91905;91906;91907 116664;116665;116666;116667;116668;116669;116670 116670 7 EKGSSASLVLKR Unmodified 1273.7354 0.73539946 2843 Q00325 SLC25A3 Phosphate carrier protein, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 15.122 15.122 3 0.0058653 7604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.705 53.96 58850000 0 0 0 0 0 0 0 29992000 28858000 0 0 0 0 10393 2843 9733 91908;91909 116671;116672 116671 2 EKGVNSFQMFMTYK Unmodified 1708.7953 0.79529888 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 95.276 95.276 2;3 1.3689E-27 98539 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.61 153.07 160730000 0 0 0 0 0 0 0 54008000 0 0 62220000 44504000 0 10394 3984 9734 91910;91911;91912;91913 116673;116674;116675;116676 116674 4 EKIDLENTLEQEQEALVNR Unmodified 2270.139 0.13901926 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.49 119.49 2 1.7401E-10 125165 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.58 118.92 171740000 0 26493000 34936000 0 30718000 23080000 29521000 0 0 0 26995000 0 0 10395 3173 9735 91914;91915;91916;91917;91918;91919;91920;91921;91922 116677;116678;116679;116680;116681;116682;116683;116684;116685 116683 9 EKIEAELQDICNDVLELLDK Unmodified 2386.1938 0.19375695 2341 P31946 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 171.62 171.62 2;3 2.6001E-243 178809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 328.37 292.73 5339100000 0 82186000 9108200 0 98488000 0 448050000 0 248460000 0 3512800000 654480000 285560000 10396 2341 9736 91923;91924;91925;91926;91927;91928;91929;91930;91931 116686;116687;116688;116689;116690;116691;116692;116693;116694 116692 6 EKIETELR Unmodified 1016.5502 0.55022446 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 1 1 1 1 19.26 19.26 2 0.023742 12171 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.37 39.089 7946900000 0 0 2966300000 0 2393500000 0 0 0 0 0 0 2587000000 0 10397 2780 9737 91932;91933;91934 116695;116696;116697 116697 3 EKIETELRDICNDVLSLLEK Unmodified 2416.2519 0.25194053 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 2 2 1 2 2 167.05 167.05 3;4 1.5955E-46 169123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.98 146.26 2665600000 0 0 0 0 0 0 0 417380000 0 0 364200000 1370700000 513410000 10398 2780 9738 91935;91936;91937;91938;91939;91940;91941 116698;116699;116700;116701;116702;116703;116704 116698 6 EKIFFENHPYFR Unmodified 1625.7991 0.79906235 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 1 67.621 67.621 3;4 0.00073052 67491 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.727 53.806 177230000 0 0 0 0 0 0 0 58417000 0 0 118810000 0 0 10399 2168 9739 91942;91943;91944 116705;116706;116707 116705 3 EKIIDQVYR Unmodified 1162.6346 0.63462279 1473 O15031;A0A087WU36 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 1 1 1 62.225 62.225 3 0.060091 61351 QUIQUE_C1368_190116_001 46.462 11.017 31575000 0 0 20091000 11483000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10400 1473 9740 91945;91946 116708;116709 116708 2 EKINISEELR Unmodified 1229.6616 0.66156582 4701 yes no 0 0 1 1 2 44.582 44.582 3 0.023189 41840 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.463 24.955 65357000 0 0 0 35041000 0 0 0 0 0 0 30316000 0 0 + 10401 4701 9741 91947;91948;91949 116710;116711;116712 116712 1 EKIQVLGSLVSLEMGK Unmodified 1729.9648 0.96480705 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;F8VVF2;A0A1B0GVU0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 119.71 119.71 3 6.8734E-19 123958 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.35 85.986 461460000 0 0 0 0 0 0 0 141460000 95509000 0 102500000 62181000 59810000 10402 336 9742 91950;91951;91952;91953;91954 116713;116714;116715;116716;116717;116718 116714 6 EKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEK Unmodified 2806.3041 0.30411203 2788;2696;447;3401;458 A0A2R8Y793;P60709;P63261;I3L4N8;Q6S8J3;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTG1;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 3 2 1 4 3 3 147.5 147.5 2;3 2.8724E-128 150445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.2 189.75 6485700000 77998000 173730000 181900000 133010000 335950000 92594000 299900000 855260000 840350000 36080000 1308200000 1258300000 892450000 10403 447;2696;2788;3401;458 9743 91955;91956;91957;91958;91959;91960;91961;91962;91963;91964;91965;91966;91967;91968;91969;91970;91971;91972;91973;91974;91975;91976;91977;91978 116719;116720;116721;116722;116723;116724;116725;116726;116727;116728;116729;116730;116731;116732;116733;116734;116735;116736;116737;116738;116739;116740;116741;116742;116743;116744;116745;116746;116747;116748;116749;116750;116751;116752;116753;116754;116755;116756 116733 38 EKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEK Oxidation (M) 2822.299 0.29902666 2788;2696;447;3401;458 A0A2R8Y793;P60709;P63261;I3L4N8;Q6S8J3;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTG1;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member E no no 0 1 1 1 1 1 1 113.28 113.28 3 1.7658E-17 117380 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.86 97.078 424030000 0 0 0 0 0 0 0 123030000 90854000 0 105000000 105150000 0 10404 447;2696;2788;3401;458 9743 91979;91980;91981;91982 116757;116758;116759;116760;116761 116758 321 4 EKLCYVGYNIEQEQK Unmodified 1899.9037 0.90366336 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 1 2 1 1 62.303 62.303 2;3 8.2957E-06 61741 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.21 95.174 149510000 0 0 0 0 0 0 0 58283000 0 0 48976000 42248000 0 10405 2715 9744 91983;91984;91985;91986 116762;116763;116764;116765 116763 4 EKLDSVIEFSIPDSLLIR Unmodified 2073.1358 0.13577179 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;F8VY04 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 150.26 150.26 3 0.0013504 155273 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.893 48.737 143300000 0 0 0 0 0 0 0 0 91173000 0 0 52132000 0 10406 1047 9745 91987;91988 116766;116767 116766 1 EKLDTLVEFPIR Unmodified 1458.8082 0.80823006 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.94 100.94 3 0.013675 105043 QUIQUE_C1438_190116_001 53.388 34.288 127990000 22206000 0 24249000 0 26090000 27464000 27980000 0 0 0 0 0 0 10407 1096 9746 91989;91990;91991;91992;91993;91994 116768;116769;116770;116771;116772;116773;116774 116770 6 EKLEAEMEAAR Unmodified 1275.6129 0.61290107 3719 Q8WXF1 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 33.255 33.255 2;3 0.0043429 28583 QUIQUE_C1277_190116_001 48.944 31.508 149800000 0 81129000 42779000 0 25896000 0 0 0 0 0 0 0 0 10408 3719 9747 91995;91996;91997;91998 116775;116776;116777;116778 116776 4 EKLEAEMEAAR Oxidation (M) 1291.6078 0.60781569 3719 Q8WXF1 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes yes 0 1 1 1 14.724 14.724 2 0.024666 6925 QUIQUE_C1368_190116_001 78.655 48.401 11462000 0 0 11462000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10409 3719 9747 91999 116779 116779 1 EKLEATINELV Unmodified 1257.6816 0.68163256 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.67 104.67 2 1.952E-17 107286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.12 152.35 5190200000 353490000 469160000 437570000 65865000 0 317470000 433800000 503770000 542450000 157960000 708390000 542160000 658150000 10410 1999 9748 92000;92001;92002;92003;92004;92005;92006;92007;92008;92009;92010;92011 116780;116781;116782;116783;116784;116785;116786;116787;116788;116789;116790;116791;116792;116793;116794;116795;116796;116797;116798;116799;116800 116789 20 EKLEDPDPGVQSAAVNVICELAR Unmodified 2509.2483 0.24825214 1437 O14617;A0A2R8Y4J3;A0A087WYN6 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.02 137.02 3 1.2196E-07 142934 QUIQUE_C1576_190116_001 77.576 65.62 238460000 0 45847000 50441000 37407000 0 25179000 50489000 0 0 0 0 29098000 0 10411 1437 9749 92012;92013;92014;92015;92016;92017 116801;116802;116803;116804;116805;116806 116805 6 EKLEMEMEAAR Unmodified 1335.6163 0.61627189 3122 Q15233;H7C367;C9JYS8 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.91 40.91 2 0.014155 36898 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.037 56.609 324450000 0 75492000 56464000 0 0 0 0 0 48176000 0 0 71901000 72417000 10412 3122 9750 92018;92019;92020;92021;92022;92023;92024;92025 116807;116808;116809;116810;116811;116812;116813;116814;116815 116815 9 EKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFWMDNSFQR Unmodified 4373.3068 0.30684041 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 2 1 1 1 167.25 167.25 4 2.3426E-100 174586 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.23 155.18 541720000 0 0 0 0 0 0 0 0 142510000 0 234710000 164510000 0 10413 756 9751 92026;92027;92028 116816;116817;116818;116819;116820;116821 116817 6 EKLEQAAIVK Unmodified 1127.655 0.65502388 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 21.728 21.728 2 0.014152 15049 QUIQUE_C1368_190116_001 104.01 43.994 226450000 0 0 57152000 0 44331000 54300000 0 0 0 0 70666000 0 0 10414 2998 9752 92029;92030;92031;92032 116822;116823;116824;116825 116822 1 EKLIAPVAEEEATVPNNK Unmodified 1951.0262 0.026221336 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 58.265 58.265 2;3 8.7759E-53 57170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.48 142.46 3329200000 0 0 0 0 41408000 0 33271000 791970000 601860000 0 529100000 702680000 628920000 10415 1915 9753 92033;92034;92035;92036;92037;92038;92039;92040;92041;92042;92043;92044 116826;116827;116828;116829;116830;116831;116832;116833;116834;116835;116836;116837;116838;116839;116840 116831 15 EKLILPHVDIQLK Unmodified 1544.929 0.92901389 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 86.75 86.75 4 0.00079305 88803 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116849;116850;116851;116852;116853;116854;116855;116856;116857;116858;116859;116860;116861;116862;116863;116864;116865;116866;116867;116868;116869;116870;116871;116872;116873;116874;116875;116876;116877;116878;116879;116880;116881;116882;116883;116884 116868 30 EKLQEEMLQR Oxidation (M) 1318.6551 0.65510023 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 19.667 19.667 2;3 7.0285E-07 12515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.35 97.671 1660100000 0 126420000 224830000 243220000 157170000 194220000 0 49339000 110990000 258300000 118540000 100180000 76897000 10419 1952 9756 92073;92074;92075;92076;92077;92078;92079;92080;92081;92082;92083;92084;92085 116885;116886;116887;116888;116889;116890;116891;116892;116893;116894;116895;116896;116897 116891 1196 12 EKLQEEMLQREEAENTLQSFR Unmodified 2607.2599 0.25987945 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 0 2 1 2 2 1 2 2 90.951 90.951 3;4 3.9834E-146 92768 QUIQUE_DMIX7_190116_001 206.71 190.42 2546800000 0 0 0 0 0 0 0 915740000 411170000 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yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.64 103.64 2;3 2.9524E-05 106322 QUIQUE_C1277_190116_001 104.55 89.988 507980000 38032000 41447000 31350000 187320000 0 172460000 37378000 0 0 0 0 0 0 10435 4212 9772 92187;92188;92189;92190;92191;92192;92193 117014;117015;117016;117017;117018;117019;117020 117015 7 EKPTDMQNFGLR Unmodified 1434.6925 0.69254837 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 54.818 54.818 2;3 0.015341 53069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.095 29.263 79466000 0 20190000 0 22814000 0 21599000 0 14863000 0 0 0 0 0 10436 1039 9773 92194;92195;92196;92197;92198 117021;117022;117023;117024;117025 117025 4 EKPYFPIPEEYTFIQNVPLEDR Unmodified 2723.3483 0.34828376 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 143.5 143.5 2;3 3.3499E-37 146279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.75 138.06 15905000000 1092900000 1352300000 1508000000 1111100000 1359800000 1216400000 1271800000 1438900000 1301300000 346980000 1509600000 1270200000 1125600000 10437 2849 9774 92199;92200;92201;92202;92203;92204;92205;92206;92207;92208;92209;92210;92211;92212;92213;92214;92215;92216;92217;92218;92219;92220;92221;92222 117026;117027;117028;117029;117030;117031;117032;117033;117034;117035;117036;117037;117038;117039;117040;117041;117042;117043;117044;117045;117046;117047;117048;117049;117050;117051;117052;117053;117054;117055;117056;117057;117058;117059;117060;117061;117062;117063;117064;117065;117066;117067;117068;117069;117070 117052 44 EKQDTFALASQQK Unmodified 1492.7522 0.75217174 1956 P09110;C9JDE9;H7C131;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.823 27.823 2 1.6916E-30 22629 QUIQUE_C1218_190116_001 179.35 113.73 699440000 56979000 47091000 61211000 44809000 56578000 61552000 49695000 68427000 54727000 0 63833000 65625000 68913000 10438 1956 9775 92223;92224;92225;92226;92227;92228;92229;92230;92231;92232;92233;92234;92235 117071;117072;117073;117074;117075;117076;117077;117078;117079;117080;117081;117082;117083;117084;117085;117086 117071 16 EKVDKLDASESLR Unmodified 1488.7784 0.77838649 1314 K7EJJ5 CLTC yes yes 0 0 2 1 24.758 24.758 3 0.044118 18613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.136 44.509 39252000 0 0 0 0 0 0 0 39252000 0 0 0 0 0 10439 1314 9776 92236 117087 117087 1 EKVDLVLLGK Unmodified 1112.6805 0.68051035 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 65.518 65.518 2;3 0.026075 65999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.743 30.879 471130000 0 0 34985000 23880000 0 109010000 101600000 0 0 0 43036000 29000000 129630000 10440 2411 9777 92237;92238;92239;92240;92241;92242;92243;92244 117088;117089;117090;117091;117092;117093;117094;117095;117096 117094 5 EKVEVQLPELFHK Unmodified 1594.8719 0.87189295 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes no 0 0 1 1 82.626 82.626 4 0.01527 82892 QUIQUE_C1563_190116_001 43.594 37.879 16553000 0 0 0 0 0 16553000 0 0 0 0 0 0 0 10441 2985 9778 92245 117097 117097 1 EKVFDVIIR Unmodified 1117.6495 0.64954457 2035 P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 69.007 69.007 3 0.049612 70097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.305 17.022 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10442 2035 9779 92246 117098 117098 1 EKVGEQAQVVIIDMNDPSNPIR Unmodified 2451.2428 0.24277283 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KSQ2;J3QL20 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 104.29 104.29 3 5.2816E-21 106313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.85 123.69 379540000 0 49292000 0 63586000 0 0 0 95507000 0 0 0 94930000 76229000 10443 50 9780 92247;92248;92249;92250;92251 117099;117100;117101;117102;117103;117104 117101 5 EKVNVDIINFGEEEVNTEK Unmodified 2205.0801 0.0801074 2655 Q5VWC4;P55036;A6PVX3 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 no no 0 0 1 1 1 105.55 105.55 3 0.0049998 109241 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Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 89.561 89.561 2;3 0.0091311 86972 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.414 46.635 292400000 58540000 54059000 81864000 53034000 0 0 0 0 0 44901000 0 0 0 10448 2083 9785 92257;92258;92259;92260;92261 117111;117112;117113;117114;117115 117115 5 EKYDTDFYILDKYPLAVR Unmodified 2248.1416 0.14158544 2083 P14868 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 2 1 118.05 118.05 4 0.018392 122879 QUIQUE_C1368_190116_001 37.624 29.234 35323000 0 0 35323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10449 2083 9786 92262 117116 117116 1 EKYEITEQR Unmodified 1194.5881 0.58806652 2878 Q02878 RPL6 60S ribosomal protein L6 yes yes 0 0 1 1 1 19.307 19.307 2;3 0.037329 12063 QUIQUE_C1438_190116_001 40.994 12.789 63713000 0 37350000 0 0 26363000 0 0 0 0 0 0 0 0 10450 2878 9787 92263;92264 117117;117118 117118 2 EKYIDQEELNK Unmodified 1407.6882 0.6881745 1931;1938;3264 P08238;Q58FF8;P07900;Q14568 HSP90AB1;HSP90AB2P;HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2;Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 30.435 30.435 2;3 2.9158E-24 24838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 185.96 134.89 1869700000 101450000 108100000 101380000 106660000 163490000 238380000 380510000 97909000 106150000 18147000 138270000 145980000 163330000 10451 1938;3264;1931 9788 92265;92266;92267;92268;92269;92270;92271;92272;92273;92274;92275;92276;92277;92278;92279 117119;117120;117121;117122;117123;117124;117125;117126;117127;117128;117129;117130;117131;117132;117133;117134 117132 16 EKYPSHSFIGEESVAAGEK Unmodified 2063.98 0.97999942 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RIP7;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 46.152 46.152 4 0.0073832 42851 QUIQUE_C1403_190116_001 27.904 21.13 400030000 0 0 210350000 72507000 0 0 0 117180000 0 0 0 0 0 10452 2286 9789 92280;92281;92282 117135;117136;117137 117136 3 EKYSIGEPTVPSTLAEEFTYNPFMR Unmodified 2905.3844 0.38441127 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BV79 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 150.09 150.09 3 2.4996E-06 157328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.298 49.794 206940000 0 0 0 0 0 0 0 72182000 0 0 34126000 46503000 54131000 10453 3195 9790 92283;92284;92285;92286;92287 117138;117139;117140;117141;117142;117143 117139 5 EKYSLEQDIR Unmodified 1279.6408 0.64083038 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 38.591 38.591 2 0.028353 34742 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.263 28.715 32890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32890000 0 10454 4394 9791 92288 117144 117144 1 ELAACQLLISQHEAK Unmodified 1709.8771 0.87705468 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 69.063 69.063 3 0.00080962 69627 QUIQUE_C1576_190116_001 43.432 34.501 473320000 72505000 0 0 0 65713000 54350000 68796000 0 41022000 26378000 55904000 88655000 0 10455 1568 9792 92289;92290;92291;92292;92293;92294;92295;92296;92297 117145;117146;117147;117148;117149;117150;117151;117152;117153;117154;117155;117156 117150 10 ELAAEDEQVFLMK Unmodified 1521.7385 0.73849551 1515 O43237;J3KRI4;J3KSD2 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 96.164 96.164 2;4 3.3937E-06 105431 QUIQUE_C1563_190116_001 127.76 106.79 902270000 123920000 0 0 121810000 123490000 117130000 94963000 53245000 67788000 59151000 63537000 0 77237000 10456 1515 9793 92298;92299;92300;92301;92302;92303;92304;92305;92306;92307;92308 117157;117158;117159;117160;117161;117162;117163;117164;117165;117166;117167;117168;117169;117170;117171 117162 15 ELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPK Unmodified 2532.257 0.25702591 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 172.18 172.18 2;3 3.0356E-24 175524 QUIQUE_C1277_190116_001 125.73 117.88 614330000 63757000 75876000 25855000 0 61238000 73301000 61255000 32067000 52708000 11531000 88618000 40936000 27187000 10457 3135 9794 92309;92310;92311;92312;92313;92314;92315;92316;92317;92318;92319;92320;92321;92322;92323;92324 117172;117173;117174;117175;117176;117177;117178;117179;117180;117181;117182;117183;117184;117185;117186;117187 117174 16 ELAAEVEVQDGPNEDGEMFMRPGK Unmodified 2647.1894 0.18941663 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 101.61 101.61 3 3.4515E-06 105541 QUIQUE_C1218_190116_001 72.033 64.5 102330000 65746000 0 0 36582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10458 1947 9795 92325;92326 117188;117189 117188 1 ELAAEVEVQDGPNEDGEMFMRPGK Oxidation (M) 2663.1843 0.18433125 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 90.799 90.799 3 1.5212E-06 91951 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.174 62.462 29349000 0 0 0 0 0 0 0 29349000 0 0 0 0 0 10459 1947 9795 92327 117190;117191 117191 1190;1191 2 ELAALFYSVVVSTVSGNELK Unmodified 2125.1307 0.13068641 1259 J3KN16;Q5VYK3;R4GMY1 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 2 1 1 172.33 172.33 2;3 3.9544E-07 176672 QUIQUE_C1218_190116_001 124.45 110.78 28466000 18591000 5988800 0 0 0 0 0 0 0 3886400 0 0 0 10460 1259 9796 92328;92329;92330;92331 117192;117193;117194;117195 117192 3 ELAALWGIETR Unmodified 1257.6717 0.67173657 588 F5H7V1;B1AKJ5;O43847 NRD1 Nardilysin yes no 0 0 0 1 1 101.67 101.67 2 0.0040057 103393 QUIQUE_C1563_190116_001 72.485 0 190740000 0 0 0 0 0 78781000 111960000 0 0 0 0 0 0 10461 588 9797 92332;92333 117196;117197 117196 2 ELACLEENLR Unmodified 1245.6023 0.60233638 4742 yes yes 0 0 0 2 1 5 2 2 2 1 1 2 3 2 1 56.92 56.92 2 0.0055609 50500 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.058 23.891 2690300000 121790000 0 780000000 0 389320000 0 0 0 471160000 227320000 700660000 0 0 + 10462 4742 9798 92334;92335;92336;92337;92338;92339;92340;92341;92342;92343;92344;92345;92346;92347;92348;92349;92350;92351;92352;92353;92354;92355;92356;92357 117198;117199;117200;117201;117202;117203;117204;117205;117206;117207;117208;117209;117210;117211;117212;117213;117214;117215;117216;117217;117218;117219;117220;117221;117222 117220 23 ELADESQTLK Unmodified 1132.5612 0.56118307 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 30.784 30.784 2 2.5411E-07 25891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.65 103.23 546140000 0 0 0 0 0 0 139090000 0 0 0 154130000 87368000 165550000 10463 4516 9799 92358;92359;92360;92361 117223;117224;117225;117226 117224 4 ELAEDDSILK Unmodified 1131.5659 0.5659341 2679 P56385 ATP5I ATP synthase subunit e, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 60.746 60.746 1;2 0.00029763 59714 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.7 61.494 3846800000 0 0 322230000 0 289470000 174700000 359840000 362790000 430340000 134120000 655280000 510610000 607440000 10464 2679 9800 92362;92363;92364;92365;92366;92367;92368;92369;92370;92371;92372;92373;92374;92375 117227;117228;117229;117230;117231;117232;117233;117234;117235;117236;117237;117238;117239;117240;117241 117236 14 ELAEDGYSGVEVR Unmodified 1422.6627 0.66268803 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;H0YEU2;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.816 61.816 2 7.7796E-06 60814 QUIQUE_C1368_190116_001 123.51 95.771 1055700000 95558000 112070000 123510000 121530000 0 93733000 86886000 134930000 0 44905000 0 119660000 122970000 10465 2214 9801 92376;92377;92378;92379;92380;92381;92382;92383;92384;92385 117242;117243;117244;117245;117246;117247;117248;117249;117250;117251;117252 117244 9 ELAEEEPHLVEQFQK Unmodified 1824.8894 0.8893935 2429 P40855;Q5QNY5;B7Z8B3;E9PS71 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 1 78.561 78.561 3 0.0004787 79582 QUIQUE_C1218_190116_001 59.709 45.877 30052000 30052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10466 2429 9802 92386 117253 117253 1 ELAELSAELDKDLR Unmodified 1600.8308 0.83081599 1580 O60504;E7EQH0 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 102.43 102.43 3 0.0010414 105372 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.374 37.405 61747000 0 0 0 20174000 0 0 0 12667000 19028000 0 9877300 0 0 10467 1580 9803 92387;92388;92389;92390;92391 117254;117255;117256;117257;117258 117256 5 ELAEQELEK Unmodified 1087.5397 0.53971935 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.031 34.031 2 4.4012E-25 29407 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.7 23.618 4203000000 332570000 347620000 452720000 170940000 401250000 0 379560000 307130000 460090000 0 611490000 406080000 333550000 10468 3117 9804 92392;92393;92394;92395;92396;92397;92398;92399;92400;92401;92402 117259;117260;117261;117262;117263;117264;117265;117266;117267;117268;117269;117270;117271;117272;117273;117274;117275 117269 17 ELAEQLEFIK Unmodified 1218.6496 0.64960415 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 100.1 100.1 2 0.0016163 104587 QUIQUE_C1438_190116_001 95.502 62.503 83486000 0 0 0 0 48052000 0 0 0 35433000 0 0 0 0 10469 1093 9805 92403;92404;92405 117276;117277;117278 117276 3 ELAEQLGLSTGEK Unmodified 1373.7038 0.70382456 1657 O75821;K7EL20;K7ER90 EIF3G Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G yes no 0 0 0 1 1 1 72.481 72.481 2 0.0021588 73782 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.48 35.855 356010000 0 0 0 0 0 0 123870000 0 0 0 102430000 0 129710000 10470 1657 9806 92406;92407;92408 117279;117280;117281 117280 3 ELAEQTLNNIK Unmodified 1271.6721 0.67213051 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.892 59.892 2 0.00023011 58355 QUIQUE_C1403_190116_001 144.09 51.649 1915900000 218840000 0 0 214220000 247820000 203660000 0 271580000 0 119570000 271790000 165930000 202520000 10471 3726 9807 92409;92410;92411;92412;92413;92414;92415;92416;92417;92418 117282;117283;117284;117285;117286;117287;117288;117289;117290;117291;117292 117283 10 ELAESDFASTFR Unmodified 1371.6307 0.63065962 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 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Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.73 88.73 2 0.0016056 90790 QUIQUE_C1368_190116_001 102 67.07 775410000 68431000 65556000 69984000 75503000 71508000 69306000 0 80712000 82869000 0 90662000 0 100880000 10475 3953 9811 92431;92432;92433;92434;92435;92436;92437;92438;92439;92440 117306;117307;117308;117309;117310;117311;117312;117313;117314;117315;117316 117309 11 ELAFQISK Unmodified 934.51238 0.51238239 3027;260 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T996;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4;F6R6M7;F6QYI9;A0A0G2JJL7;K7EN69;A0A140T9K2;A0A140T9N3;A0A0D9SEM9 DDX39B;DDX39A Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 63.156 63.156 1;2 0.0036416 62590 QUIQUE_C1277_190116_001 129.55 94.449 1632400000 177220000 159310000 123720000 104100000 127170000 113910000 107330000 128830000 107490000 71044000 186230000 111730000 114320000 10476 3027;260 9812 92441;92442;92443;92444;92445;92446;92447;92448;92449;92450;92451;92452;92453;92454;92455;92456 117317;117318;117319;117320;117321;117322;117323;117324;117325;117326;117327;117328;117329;117330;117331;117332;117333;117334;117335;117336;117337;117338 117319 19 ELAGHTGYLSCCR Unmodified 1522.6657 0.66568169 2767;602 P62873;F6UT28;F6X3N5;B3KVK2 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 32.36 32.36 2;3 1.289E-179 26468 QUIQUE_C1368_190116_001 276 254.26 61409000000 7815900000 6131800000 8975200000 4551700000 4566200000 4280200000 6174100000 2701600000 2886200000 1129400000 3589100000 3674300000 4933300000 10477 2767;602 9813 92457;92458;92459;92460;92461;92462;92463;92464;92465;92466;92467;92468;92469;92470;92471;92472;92473;92474;92475;92476;92477;92478;92479;92480;92481;92482 117339;117340;117341;117342;117343;117344;117345;117346;117347;117348;117349;117350;117351;117352;117353;117354;117355;117356;117357;117358;117359;117360;117361;117362;117363;117364;117365;117366;117367;117368;117369;117370;117371;117372;117373;117374;117375;117376;117377;117378;117379;117380;117381;117382;117383;117384 117345 46 ELAGIVCTLNSENK Unmodified 1546.7661 0.76610725 4327 Q9NXG2 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 84.448 84.448 2 0.0072214 86856 QUIQUE_C1576_190116_001 60.255 25.031 233950000 0 128280000 0 0 0 0 105670000 0 0 0 0 0 0 10478 4327 9814 92483;92484 117385;117386 117386 2 ELAGMFLSEDENFLLLFR Oxidation (M) 2159.0609 0.060892282 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.17 170.17 2 4.7771E-18 175432 QUIQUE_C1576_190116_001 138.94 117.68 243620000 17035000 14245000 21125000 0 15495000 16677000 50806000 0 36876000 0 55431000 0 15934000 10479 1678 9815 92485;92486;92487;92488;92489;92490;92491;92492;92493 117387;117388;117389;117390;117391;117392;117393;117394;117395 117392 912 9 ELAGQGLLR Unmodified 955.54508 0.5450795 3492 Q86UU1;A0A087WZL0 PHLDB1 Pleckstrin homology-like domain family B member 1 yes no 0 0 0 1 53.218 53.218 2 0.007183 50535 QUIQUE_C1563_190116_001 82.305 30.006 18514000 0 0 0 0 0 18514000 0 0 0 0 0 0 0 10480 3492 9816 92494 117396 117396 1 ELAGVLIFESHAK Unmodified 1412.7664 0.76636524 653 B7Z278;Q8WZA2 RAPGEF4 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 no no 0 0 0 1 90.162 90.162 3 0.062362 92059 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.219 11.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10481 653 9817 92495 117397 117397 1 ELAILLGMLDPAEK Oxidation (M) 1527.8218 0.82183121 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 134.93 134.93 2 3.4267E-06 138054 QUIQUE_C1563_190116_001 117.09 95.643 1450500000 149670000 161220000 135340000 156480000 106450000 222010000 88938000 39078000 94000000 197730000 31497000 28129000 39920000 10482 2298 9818 92496;92497;92498;92499;92500;92501;92502;92503;92504;92505;92506;92507;92508;92509;92510;92511;92512;92513;92514;92515;92516;92517 117398;117399;117400;117401;117402;117403;117404;117405;117406;117407;117408;117409;117410;117411;117412;117413;117414;117415;117416;117417;117418;117419;117420 117409 1680 16 ELAILLGMLDPAEK Unmodified 1511.8269 0.82691659 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 157.94 157.94 2;3 0.00013696 163906 QUIQUE_C1218_190116_001 130.01 80.638 5893300000 561040000 472060000 508310000 541000000 497430000 549800000 412850000 291790000 487220000 323190000 588240000 272800000 387570000 10483 2298 9818 92518;92519;92520;92521;92522;92523;92524;92525;92526;92527;92528;92529;92530;92531;92532;92533;92534;92535;92536 117421;117422;117423;117424;117425;117426;117427;117428;117429;117430;117431;117432;117433;117434;117435;117436;117437;117438;117439;117440;117441;117442;117443;117444;117445;117446;117447;117448;117449;117450;117451 117421 31 ELAILLGMLDPAEKDEK Oxidation (M) 1899.9863 0.98633036 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 1 4 5 4 4 4 4 4 4 4 4 5 4 4 114.96 114.96 2;3 2.0242E-87 119104 QUIQUE_C1403_190116_001 205.87 182.12 16931000000 893450000 1247800000 1473600000 1495600000 1101200000 1268000000 1032300000 1079900000 1888800000 948970000 1637200000 1353800000 1510300000 10484 2298 9819 92537;92538;92539;92540;92541;92542;92543;92544;92545;92546;92547;92548;92549;92550;92551;92552;92553;92554;92555;92556;92557;92558;92559;92560;92561;92562;92563;92564;92565;92566;92567;92568;92569;92570;92571;92572;92573;92574;92575;92576;92577;92578;92579;92580;92581;92582;92583;92584;92585;92586;92587;92588;92589;92590 117452;117453;117454;117455;117456;117457;117458;117459;117460;117461;117462;117463;117464;117465;117466;117467;117468;117469;117470;117471;117472;117473;117474;117475;117476;117477;117478;117479;117480;117481;117482;117483;117484;117485;117486;117487;117488;117489;117490;117491;117492;117493;117494;117495;117496;117497;117498;117499;117500;117501;117502;117503;117504;117505;117506;117507;117508;117509;117510;117511;117512;117513;117514;117515;117516;117517;117518;117519;117520;117521;117522;117523;117524;117525;117526;117527;117528;117529 117474 1680 78 ELAILLGMLDPAEKDEK Unmodified 1883.9914 0.99141573 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 1 2 4 5 4 4 3 3 3 7 2 10 4 3 156.54 156.54 2;3 3.4794E-139 146255 QUIQUE_C1218_190116_001 234.87 229.69 78742000000 3579900000 4760200000 4767500000 7616400000 4188900000 4522500000 5003900000 6369300000 11539000000 3038800000 8788000000 6681000000 7886700000 10485 2298 9819 92591;92592;92593;92594;92595;92596;92597;92598;92599;92600;92601;92602;92603;92604;92605;92606;92607;92608;92609;92610;92611;92612;92613;92614;92615;92616;92617;92618;92619;92620;92621;92622;92623;92624;92625;92626;92627;92628;92629;92630;92631;92632;92633;92634;92635;92636;92637;92638;92639;92640;92641;92642;92643;92644 117530;117531;117532;117533;117534;117535;117536;117537;117538;117539;117540;117541;117542;117543;117544;117545;117546;117547;117548;117549;117550;117551;117552;117553;117554;117555;117556;117557;117558;117559;117560;117561;117562;117563;117564;117565;117566;117567;117568;117569;117570;117571;117572;117573;117574;117575;117576;117577;117578;117579;117580;117581;117582;117583;117584;117585;117586;117587;117588;117589;117590;117591;117592;117593;117594;117595;117596;117597;117598;117599;117600;117601;117602;117603;117604;117605;117606;117607;117608;117609 117533 76 ELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTAR Oxidation (M) 2612.3554 0.35535974 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 2 1 124.65 124.65 4 1.1924E-08 127187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.293 73.181 61899000 0 0 0 0 0 0 0 61899000 0 0 0 0 0 10486 2298 9820 92645 117610 117610 1680;1681 1 ELAKVEEEIQTLSQVLAAK Unmodified 2098.1522 0.15215013 2667 P55327;H0YC42;E5RFR7;H0YC44 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 151.63 151.63 2;3 1.5987E-63 156551 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.39 135.59 265560000 0 0 0 0 0 0 0 129880000 40566000 0 0 34181000 60932000 10487 2667 9821 92646;92647;92648;92649;92650;92651 117611;117612;117613;117614;117615;117616 117613 6 ELALECDYQR Unmodified 1295.5816 0.58160094 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.604 60.604 2 0.0012588 58230 QUIQUE_C1563_190116_001 99.802 80.531 92975000 40610000 0 0 0 0 24297000 0 16112000 0 11956000 0 0 0 10488 3657 9822 92652;92653;92654;92655;92656;92657;92658;92659;92660 117617;117618;117619;117620;117621;117622;117623;117624;117625 117620 9 ELALGQDR Unmodified 900.46649 0.46649483 2301 P30046;J3KQ18;B5MC82;A6NHG4 DDT;DDTL D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 28.423 28.423 2 0.008495 22925 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.114 45.941 1257400000 0 0 0 323740000 0 0 0 0 0 200650000 0 302940000 430100000 10489 2301 9823 92661;92662;92663;92664 117626;117627;117628;117629 117628 4 ELALNTAQFAK Unmodified 1204.6452 0.64518747 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.552 73.552 2 1.9688E-05 70614 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.14 103.58 1398600000 104230000 0 150650000 0 169980000 96943000 165680000 102240000 122830000 50775000 157450000 109280000 168590000 10490 3015 9824 92665;92666;92667;92668;92669;92670;92671;92672;92673;92674;92675;92676 117630;117631;117632;117633;117634;117635;117636;117637;117638;117639;117640;117641 117638 8 ELALPGELTQSR Unmodified 1312.6987 0.69867961 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.794 85.794 2 0.00051557 87268 QUIQUE_C1277_190116_001 109.42 64.258 1019100000 111930000 108640000 95241000 110860000 0 0 106890000 97029000 105390000 53266000 0 114380000 115510000 10491 1635 9825 92677;92678;92679;92680;92681;92682;92683;92684;92685;92686 117642;117643;117644;117645;117646;117647;117648;117649;117650;117651;117652;117653 117643 12 ELALQQEEGK Unmodified 1143.5772 0.57716749 4544 Q9Y276;C9J8G3;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 31.193 31.193 2 0.011577 26193 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.502 65.317 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10492 4544 9826 92687 117654 117654 1 ELAMPGEDLK Unmodified 1101.5376 0.53761086 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.298 66.298 2 0.0035536 62397 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.948 62.648 680580000 264020000 0 284570000 0 0 0 0 82992000 0 49001000 0 0 0 10493 2529 9827 92688;92689;92690;92691 117655;117656;117657;117658 117658 3 ELAMPGEDLKFNLILR Unmodified 1858.0023 0.0022551915 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 134.43 134.43 3 0.00038817 137640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.391 63.272 85193000 0 0 0 0 0 0 0 55240000 0 0 0 0 29954000 10494 2529 9828 92692;92693 117659;117660 117659 2 ELANSPDCPQMCAYK Unmodified 1782.7375 0.73752601 2519 P48739;A0A0A0MSW4 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 0 1 1 57.368 57.368 2 1.6718E-24 55871 QUIQUE_C1277_190116_001 157.38 138.25 58142000 0 36708000 0 0 0 0 21434000 0 0 0 0 0 0 10495 2519 9829 92694;92695 117661;117662 117661 2 ELAPAVSVLQLFCSSPK Unmodified 1844.9706 0.97062071 4645;4396 Q9Y678;Q9UBF2 COPG1;COPG2 Coatomer subunit gamma-1;Coatomer subunit gamma-2 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 156 156 2;3 1.1363E-17 161192 QUIQUE_C1368_190116_001 121.56 108.13 1270100000 74042000 178350000 90778000 107740000 111000000 87355000 84171000 73368000 77964000 23142000 80300000 93483000 188390000 10496 4645;4396 9830 92696;92697;92698;92699;92700;92701;92702;92703;92704;92705;92706;92707;92708;92709;92710;92711;92712 117663;117664;117665;117666;117667;117668;117669;117670;117671;117672;117673;117674;117675;117676;117677;117678;117679;117680;117681;117682;117683;117684;117685;117686;117687;117688;117689 117670 27 ELAPAWEDTSPEQDNR Unmodified 1856.8177 0.81768512 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.172 74.172 2 2.2878E-30 74817 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.44 155.91 1036900000 72257000 91087000 125700000 81761000 102160000 157220000 66619000 103810000 79424000 30379000 67706000 58794000 0 10497 921 9831 92713;92714;92715;92716;92717;92718;92719;92720;92721;92722;92723;92724;92725 117690;117691;117692;117693;117694;117695;117696;117697;117698;117699;117700;117701;117702;117703;117704;117705 117701 15 ELAPAWEDTSPEQDNRYWR Unmodified 2362.0614 0.061437643 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 98.224 98.224 3 0.00027416 99817 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.148 60.499 41507000 0 0 0 0 0 0 0 41507000 0 0 0 0 0 10498 921 9832 92726 117706 117706 1 ELAPEAVLFTYVGK Unmodified 1535.8235 0.82354577 1415 O00519 FAAH Fatty-acid amide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 142.06 142.06 2 0.0017238 147422 QUIQUE_C1368_190116_001 87.363 68.583 198970000 15170000 28521000 27393000 16135000 26588000 22657000 0 30851000 0 0 0 0 31654000 10499 1415 9833 92727;92728;92729;92730;92731;92732;92733;92734 117707;117708;117709;117710;117711;117712;117713;117714 117709 3 ELAPLFEELR Unmodified 1215.6499 0.6499385 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.31 122.31 2 0.0018783 128031 QUIQUE_C1438_190116_001 104.17 37.91 1106700000 95900000 94913000 82099000 43694000 77969000 81503000 86570000 81647000 101350000 30752000 122240000 89763000 118300000 10500 4426 9834 92735;92736;92737;92738;92739;92740;92741;92742;92743;92744;92745;92746;92747 117715;117716;117717;117718;117719;117720;117721;117722;117723;117724;117725;117726;117727;117728;117729;117730 117719 16 ELAPLQELIEK Unmodified 1281.718 0.71801807 3448 Q7L9L4 MOB1B MOB kinase activator 1B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.46 115.46 2 0.0070958 118901 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.849 34.781 930260000 0 98479000 58778000 75357000 94190000 67496000 0 135010000 0 0 136420000 117740000 146790000 10501 3448 9835 92748;92749;92750;92751;92752;92753;92754;92755;92756 117731;117732;117733;117734;117735;117736;117737;117738;117739;117740 117739 9 ELAPYDENWFYTR Unmodified 1702.7627 0.76273643 2417 P39019;M0R2L9;M0QXK4;M0QYF7;M0R140 RPS19 40S ribosomal protein S19 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 126 126 2 0.00047554 130645 QUIQUE_C1368_190116_001 90.913 65.476 975140000 95525000 90635000 75346000 85696000 96054000 75206000 93166000 29320000 81316000 32960000 76638000 69643000 73631000 10502 2417 9836 92757;92758;92759;92760;92761;92762;92763;92764;92765;92766;92767;92768;92769;92770;92771 117741;117742;117743;117744;117745;117746;117747;117748;117749;117750;117751;117752;117753;117754;117755;117756 117744 15 ELAQQIQK Unmodified 956.5291 0.52909508 2697;3055 P60842;J3KT12;J3KTB5;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;Q14240;E7EQG2;J3KSN7 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.68 19.68 2 0.014205 12698 QUIQUE_C1218_190116_001 132.72 18.532 3037400000 391210000 0 245720000 589530000 218550000 0 0 531610000 430790000 0 0 630020000 0 10503 2697;3055 9837 92772;92773;92774;92775;92776;92777;92778 117757;117758;117759;117760;117761;117762;117763 117757 3 ELAQQVQQVAAEYCR Unmodified 1791.8574 0.85738187 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRZ1 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 1 3 2 3 2 1 103.51 103.51 2;3 6.6528E-79 106457 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92807;92808;92809;92810;92811;92812;92813;92814;92815;92816;92817;92818;92819 117799;117800;117801;117802;117803;117804;117805;117806;117807;117808;117809;117810;117811;117812;117813;117814 117802 16 ELAQVLLQK Unmodified 1040.623 0.62299547 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4;A0A3B3IRG3;D6RIS5 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 70.448 70.448 2 0.012464 70530 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.296 38.686 37345000 0 0 0 0 0 0 0 0 19397000 0 0 17949000 0 10506 501 9840 92820;92821;92822 117815;117816;117817 117816 3 ELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAK Unmodified 3028.5757 0.57571751 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 1 6 4 3 4 4 4 3 4 3 4 4 4 4 154.07 154.07 2;3;4 6.7254E-283 160176 QUIQUE_C1368_190116_001 264.66 249.02 116540000000 8302000000 8288800000 11287000000 9223500000 9578400000 6705300000 6989800000 7280800000 9660100000 3477900000 15284000000 10161000000 10299000000 10507 2688 9841 92823;92824;92825;92826;92827;92828;92829;92830;92831;92832;92833;92834;92835;92836;92837;92838;92839;92840;92841;92842;92843;92844;92845;92846;92847;92848;92849;92850;92851;92852;92853;92854;92855;92856;92857;92858;92859;92860;92861;92862;92863;92864;92865;92866;92867;92868;92869;92870;92871;92872;92873 117818;117819;117820;117821;117822;117823;117824;117825;117826;117827;117828;117829;117830;117831;117832;117833;117834;117835;117836;117837;117838;117839;117840;117841;117842;117843;117844;117845;117846;117847;117848;117849;117850;117851;117852;117853;117854;117855;117856;117857;117858;117859;117860;117861;117862;117863;117864;117865;117866;117867;117868;117869;117870;117871;117872;117873;117874;117875;117876;117877;117878;117879;117880;117881;117882;117883;117884;117885;117886;117887;117888;117889;117890;117891;117892;117893;117894;117895;117896;117897;117898;117899;117900;117901;117902;117903;117904;117905;117906;117907;117908;117909;117910;117911;117912;117913;117914;117915;117916;117917;117918;117919;117920 117846 101 ELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ Unmodified 3156.6343 0.63429502 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 2 2 153.68 153.68 3;4 1.6605E-29 156562 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.691 92.261 516460000 0 0 0 0 0 0 0 516460000 0 0 0 0 0 10508 2688 9842 92874;92875 117921;117922 117922 2 ELATVLSDQPGLLGPK Unmodified 1636.9036 0.903587 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.68 110.68 2 1.1527E-07 114119 QUIQUE_C1403_190116_001 107.85 84.242 1656900000 147280000 128770000 115160000 126350000 114850000 104070000 151210000 156920000 135930000 69580000 109020000 158840000 138930000 10509 4551 9843 92876;92877;92878;92879;92880;92881;92882;92883;92884;92885;92886;92887;92888 117923;117924;117925;117926;117927;117928;117929;117930;117931;117932;117933;117934;117935;117936;117937;117938;117939 117926 16 ELAVEGMHR Unmodified 1040.5073 0.50731378 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 25.973 25.973 2 0.018516 19854 QUIQUE_C1368_190116_001 64.265 29.44 18536000 0 0 18536000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10510 4389 9844 92889 117940 117940 1 ELAVQIQK Unmodified 927.53893 0.53893149 2416 P38919 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.595 36.595 2 0.0080433 32008 QUIQUE_C1403_190116_001 95.793 40.189 382580000 83715000 0 0 70846000 0 60557000 64703000 0 0 26319000 0 76436000 0 10511 2416 9845 92890;92891;92892;92893;92894;92895 117941;117942;117943;117944;117945;117946;117947 117942 6 ELAVQIYEEAR Unmodified 1319.6721 0.67213051 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.527 86.527 2 0.0020595 83318 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.688 60.902 2070400000 160720000 150270000 212160000 184460000 184400000 164890000 0 138410000 184050000 88195000 240320000 147730000 214830000 10512 266;1504 9846 92896;92897;92898;92899;92900;92901;92902;92903;92904;92905;92906;92907;92908 117948;117949;117950;117951;117952;117953;117954;117955;117956;117957;117958;117959;117960;117961 117958 13 ELCALFIGSELLPK Unmodified 1588.8535 0.85346569 3522 Q86YJ6;C9JU10;C9J3J1 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 0 1 152.11 152.11 2 0.01186 147476 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.509 60.176 13202000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13202000 0 0 0 10513 3522 9847 92909 117962 117962 1 ELCALFIGSELLPKDELNDLIDR Unmodified 2672.3731 0.3731183 3522 Q86YJ6;C9JU10;C9J3J1 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 1 1 1 162.68 162.68 3 1.3897E-05 165107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.225 52.387 56924000 0 0 0 0 0 0 0 32869000 24055000 0 0 0 0 10514 3522 9848 92910;92911 117963;117964 117963 2 ELCDYFVDHMGDYEDVLASLETLNHSVLK Unmodified 3411.5639 0.56390855 3468 Q7Z6G3;H3BPH6 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 168.39 168.39 4 0.0012356 172538 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.885 28.51 117240000 0 0 0 0 0 0 45676000 0 0 0 0 0 71565000 10515 3468 9849 92912;92913 117965;117966 117966 2 ELCEENLNPNAHPR Unmodified 1691.7686 0.76856686 1424 O14490;A8MYR7;A8MXQ8;A0A0A0MTP4 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.007 31.007 3 0.0018957 29809 QUIQUE_C1277_190116_001 47.189 39.408 318540000 0 45576000 37784000 0 29823000 0 0 0 0 205350000 0 0 0 10516 1424 9850 92914;92915;92916;92917 117967;117968;117969;117970;117971 117967 5 ELCHTQSSHASLR Unmodified 1524.7103 0.7103237 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 10.409 10.409 4 0.00080834 2890 QUIQUE_C1218_190116_001 59.898 48.793 12634000 6392600 0 0 0 0 0 0 6240900 0 0 0 0 0 10517 51 9851 92918;92919 117972;117973 117972 2 ELCQGLGQPGSVLR Unmodified 1512.7719 0.77186132 2055 P13489;H0YCR7 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.132 74.132 2 4.491E-11 75348 QUIQUE_C1438_190116_001 138.99 101.8 7508700000 415260000 559600000 821310000 711400000 720210000 628160000 680720000 653640000 642640000 271640000 0 609680000 794450000 10518 2055 9852 92920;92921;92922;92923;92924;92925;92926;92927;92928;92929;92930;92931;92932 117974;117975;117976;117977;117978;117979;117980;117981;117982;117983;117984;117985;117986;117987;117988;117989;117990 117980 16 ELCQLLLEGLEGVLR Unmodified 1740.9444 0.94440596 1072 G3V1A6;P57764;H0YDB0 GSDMD Gasdermin-D yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 1 2 1 170.48 170.48 2;3 9.6128E-45 175253 QUIQUE_C1368_190116_001 151.56 140.04 386920000 15473000 36079000 34189000 14225000 73315000 0 15363000 31919000 33847000 3500600 107260000 0 21740000 10519 1072 9853 92933;92934;92935;92936;92937;92938;92939;92940;92941;92942;92943;92944;92945;92946;92947;92948;92949 117991;117992;117993;117994;117995;117996;117997;117998;117999;118000;118001;118002;118003;118004;118005;118006;118007 117995 17 ELDAFFLHMLMK Oxidation (M) 1509.736 0.73599309 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 3 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 137.18 137.18 2;3 0.00082935 146498 QUIQUE_C1218_190116_001 89.886 43.424 609060000 102700000 78722000 80967000 33787000 56329000 90792000 0 26092000 48284000 15147000 16367000 0 59865000 10520 1678 9854 92950;92951;92952;92953;92954;92955;92956;92957;92958;92959;92960;92961;92962;92963;92964;92965;92966;92967 118008;118009;118010;118011;118012;118013;118014;118015;118016;118017;118018;118019;118020;118021;118022;118023;118024;118025;118026 118010 913;914 16 ELDAFFLHMLMK Unmodified 1493.7411 0.74107847 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 150.44 150.44 2;3 1.0065E-27 156323 QUIQUE_C1218_190116_001 193.38 161.62 2272500000 209880000 238870000 121220000 0 76886000 119960000 243300000 87100000 291160000 21817000 374580000 335050000 152630000 10521 1678 9854 92968;92969;92970;92971;92972;92973;92974;92975;92976;92977;92978;92979;92980;92981;92982;92983;92984;92985;92986;92987 118027;118028;118029;118030;118031;118032;118033;118034;118035;118036;118037;118038;118039;118040;118041;118042;118043;118044;118045;118046;118047;118048;118049;118050 118028 23 ELDALDANDELTPLGR Unmodified 1740.853 0.853008 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.47 115.47 2 6.6122E-95 119453 QUIQUE_C1368_190116_001 218.54 200.28 2625900000 229470000 282060000 217680000 202470000 264300000 184640000 219830000 206920000 243150000 48699000 238050000 288690000 0 10522 2916 9855 92988;92989;92990;92991;92992;92993;92994;92995;92996;92997;92998;92999 118051;118052;118053;118054;118055;118056;118057;118058;118059;118060;118061;118062 118053 12 ELDALGHELPVLAPQWEGYDELQTDGNR Unmodified 3164.5051 0.50507176 2675 P55957;B2ZP78 BID BH3-interacting domain death agonist;BH3-interacting domain death agonist p15;BH3-interacting domain death agonist p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes no 0 0 0 1 146.95 146.95 3 2.4157E-14 149889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.732 80.766 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10523 2675 9856 93000 118063 118063 1 ELDAYNPNTPEWR Unmodified 1603.7267 0.72668527 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 81.873 81.873 2 6.983E-06 84521 QUIQUE_C1218_190116_001 137.98 120.54 120310000 0 30784000 40522000 0 0 0 0 0 0 0 49001000 0 0 10524 647 9857 93001;93002;93003;93004 118064;118065;118066;118067 118064 4 ELDDATEANEGLSR Unmodified 1518.6798 0.67979466 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.855 47.855 2 0.00019592 44733 QUIQUE_C1368_190116_001 109.39 94.698 1276600000 0 128020000 136410000 105300000 114180000 92110000 134440000 95908000 95893000 38630000 127450000 116930000 91340000 10525 2379 9858 93005;93006;93007;93008;93009;93010;93011;93012;93013;93014;93015;93016 118068;118069;118070;118071;118072;118073;118074;118075;118076;118077;118078;118079;118080 118070 13 ELDDELMK Oxidation (M) 1007.4481 0.44812715 3088 Q14894;I3L325;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 36.921 36.921 2 0.014154 32300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.296 58.684 344100000 69240000 94824000 0 0 0 0 60099000 23849000 70431000 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118120;118121;118122;118123;118124;118125;118126;118127;118128;118129;118130;118131;118132;118133;118134;118135;118136;118137 118120 18 ELDDISLTPDPEPTHEDPNYLMANER Oxidation (M) 3026.3451 0.34512523 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 1 0 1 1 106.67 106.67 3 6.1822E-08 111623 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.109 55.134 106440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52511000 53926000 0 0 10531 3433 9861 93056;93057 118138;118139 118139 2657 2 ELDDISQEIAQLQR Unmodified 1656.8319 0.83187862 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 129.33 129.33 2 0.0078026 134790 QUIQUE_C1218_190116_001 83.081 66.944 398850000 0 117060000 104500000 0 0 0 0 60464000 0 0 116830000 0 0 10532 4394 9862 93058;93059;93060;93061;93062 118140;118141;118142;118143;118144 118140 4 ELDEATESNEAMGR Unmodified 1550.6519 0.65186535 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 42.001 42.001 2 6.0141E-05 38732 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.09 93.002 259840000 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ELDRDTVFALVNYIFFK Unmodified 2089.0884 0.088427662 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 172.13 172.13 2;3 2.8959E-44 179321 QUIQUE_DMIX5_190116_001 200.76 163.34 2649700000 0 10822000 19363000 0 0 0 84544000 137070000 174300000 0 1651700000 339420000 232540000 10556 4;1799 9885 93248;93249;93250;93251;93252;93253;93254;93255;93256;93257;93258;93259;93260 118375;118376;118377;118378;118379;118380;118381;118382;118383;118384;118385;118386;118387;118388 118385 14 ELDRYSLDSEDLYSR Unmodified 1859.8537 0.85373628 182 E7EUA2;A6NHU9;A0A0A0MSQ6;Q9UPX8;H7C1X5 SHANK2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 yes no 0 0 1 1 1 42.709 42.709 3 0.011754 39532 QUIQUE_DMIX7_190116_001 34.432 6.6655 122970000 0 0 0 0 0 0 0 0 58057000 0 0 64915000 0 10557 182 9886 93261;93262 118389;118390 118390 2 ELDSGLAESVSTLIWAAPR Unmodified 2014.0371 0.037120373 2635 P53990;H3BMU1;H3BUI0;H3BQF7;J3KR23;F5GXM3 IST1 IST1 homolog yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 162.8 162.8 2;3 3.646E-74 166324 QUIQUE_C1403_190116_001 141.55 135.84 778890000 47979000 56140000 188840000 45450000 162290000 117420000 78107000 0 0 0 0 63466000 19198000 10558 2635 9887 93263;93264;93265;93266;93267;93268;93269;93270;93271;93272;93273;93274;93275;93276;93277 118391;118392;118393;118394;118395;118396;118397;118398;118399;118400;118401;118402;118403;118404;118405;118406;118407;118408;118409;118410;118411;118412;118413;118414;118415;118416 118400 26 ELDSITPEVLPGWK Unmodified 1582.8243 0.82427405 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.66 128.66 2 0.00023876 134748 QUIQUE_C1438_190116_001 120.06 93.547 4808300000 493390000 426990000 382150000 398990000 376760000 367360000 448430000 0 413300000 196190000 446580000 379780000 478380000 10559 693;3205 9888 93278;93279;93280;93281;93282;93283;93284;93285;93286;93287;93288;93289 118417;118418;118419;118420;118421;118422;118423;118424;118425;118426;118427;118428 118421 10 ELDSNPFASLVFYWEPLNR Unmodified 2296.1164 0.11643333 4309 Q9NVS9;J3QQV6 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 172.6 172.6 2;3 4.2637E-06 176863 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.24 111.58 619840000 0 19059000 22365000 7783700 41786000 0 67735000 37419000 91840000 0 193500000 88143000 50212000 10560 4309 9889 93290;93291;93292;93293;93294;93295;93296;93297;93298;93299;93300;93301;93302;93303 118429;118430;118431;118432;118433;118434;118435;118436;118437;118438;118439;118440;118441;118442;118443;118444;118445;118446 118438 18 ELDTVTLEDIKEHVK Unmodified 1767.9254 0.92544466 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 83.999 83.999 3;4 0.0003915 86339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.574 59.69 595630000 0 36452000 62503000 21064000 33713000 17214000 79449000 72980000 78425000 9622300 83010000 78815000 22378000 10561 1516 9890 93304;93305;93306;93307;93308;93309;93310;93311;93312;93313;93314;93315;93316;93317;93318;93319;93320;93321 118447;118448;118449;118450;118451;118452;118453;118454;118455;118456;118457;118458;118459;118460;118461;118462;118463;118464;118465;118466 118461 16 ELDVEEAHAASTEEK Unmodified 1656.7479 0.74787422 3818 Q96C86 DCPS m7GpppX diphosphatase yes yes 0 0 0 1 32.189 32.189 2 5.049E-09 26873 QUIQUE_C1277_190116_001 162.93 146.29 18469000 0 18469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10562 3818 9891 93322 118467 118467 1 ELDVLQGR Unmodified 928.49779 0.49779495 396 A0A1X7SBT7;O95502 NPTXR Neuronal pentraxin receptor yes no 0 0 0 1 52.751 52.751 2 0.035632 51046 QUIQUE_C1368_190116_001 63.306 23.203 59565000 0 0 59565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10563 396 9892 93323 118468 118468 1 ELDVVDPDGSVPVGLR Unmodified 1665.8574 0.85736509 2289 P29536;Q9BV00 LMOD1 Leiomodin-1 yes no 0 0 0 1 1 111.05 111.05 2 0.00088408 114349 QUIQUE_C1277_190116_001 68.44 55.24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10564 2289 9893 93324;93325 118469;118470 118469 2 ELEAELEDERK Unmodified 1359.6518 0.65178899 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 36.243 36.243 2;3 2.8725E-05 32776 QUIQUE_C1218_190116_001 140.16 53.266 619540000 27476000 39139000 36368000 41447000 54217000 30084000 43790000 0 0 0 279470000 33134000 34409000 10565 2379 9894 93326;93327;93328;93329;93330;93331;93332;93333;93334;93335;93336 118471;118472;118473;118474;118475;118476;118477;118478;118479;118480;118481;118482 118472 12 ELEAENYHDIK Unmodified 1359.6307 0.63065962 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.321 32.321 3 0.00021844 27070 QUIQUE_C1277_190116_001 82.171 74.446 6446300000 1195100000 807590000 842870000 644650000 603710000 512830000 534590000 175970000 266210000 322830000 0 233620000 306270000 10566 2851 9895 93337;93338;93339;93340;93341;93342;93343;93344;93345;93346;93347;93348 118483;118484;118485;118486;118487;118488;118489;118490;118491;118492;118493;118494 118484 7 ELEAENYHDIKR Unmodified 1515.7318 0.73177065 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.807 23.807 2;3;4 2.5053E-45 17618 QUIQUE_C1218_190116_001 225.01 193.59 19846000000 1031600000 1580400000 1630700000 953850000 1856300000 586620000 1110600000 1829700000 2325300000 433020000 1746000000 2829800000 1932000000 10567 2851 9896 93349;93350;93351;93352;93353;93354;93355;93356;93357;93358;93359;93360;93361;93362;93363;93364;93365;93366;93367;93368;93369;93370;93371;93372;93373;93374;93375 118495;118496;118497;118498;118499;118500;118501;118502;118503;118504;118505;118506;118507;118508;118509;118510;118511;118512;118513;118514;118515;118516;118517;118518;118519;118520;118521;118522;118523;118524;118525;118526 118496 32 ELEAIFGR Unmodified 933.49198 0.4919813 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.576 82.576 2 0.0048393 79582 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.66 44.816 90993000 30526000 0 0 22220000 0 24316000 0 0 0 13932000 0 0 0 10568 2395 9897 93376;93377;93378;93379 118527;118528;118529;118530 118530 4 ELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPR Unmodified 2619.2929 0.29289414 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 92.032 92.032 3;4 6.9681E-101 93540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.29 159.11 3621100000 236640000 289140000 292600000 253500000 288540000 212640000 298750000 237530000 334480000 92833000 368910000 279120000 436410000 10569 2395 9898 93380;93381;93382;93383;93384;93385;93386;93387;93388;93389;93390;93391;93392;93393;93394;93395;93396;93397;93398;93399;93400;93401;93402;93403;93404;93405 118531;118532;118533;118534;118535;118536;118537;118538;118539;118540;118541;118542;118543;118544;118545;118546;118547;118548;118549;118550;118551;118552;118553;118554;118555;118556;118557;118558;118559;118560;118561;118562;118563;118564;118565;118566;118567;118568;118569 118556 39 ELEALDEVFTK Unmodified 1292.65 0.64999808 4504 Q9UMX5 NENF Neudesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 113.05 113.05 2 0.00043381 117501 QUIQUE_C1218_190116_001 103.26 56.057 131040000 44594000 33394000 0 33059000 0 0 0 19995000 0 0 0 0 0 10570 4504 9899 93406;93407;93408;93409;93410 118570;118571;118572;118573;118574;118575 118570 5 ELEALIQNLDNVVEDSMLVDPK Unmodified 2483.2465 0.2465208 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C2D1 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 173.02 173.02 3 7.6182E-09 177255 QUIQUE_C1218_190116_001 66.644 43.943 70587000 22997000 14583000 0 0 0 0 33007000 0 0 0 0 0 0 10571 2 9900 93411;93412;93413 118576;118577;118578 118576 3 ELEAPSEDNSGR Unmodified 1302.5688 0.56878765 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 25.765 25.765 2 4.4905E-78 19048 QUIQUE_C1563_190116_001 225.66 138.87 5291500000 401710000 533370000 405480000 347430000 476540000 326420000 569400000 369960000 421280000 177900000 497550000 325080000 439380000 10572 3862 9901 93414;93415;93416;93417;93418;93419;93420;93421;93422;93423;93424;93425;93426;93427;93428;93429;93430;93431;93432;93433;93434;93435;93436;93437;93438 118579;118580;118581;118582;118583;118584;118585;118586;118587;118588;118589;118590;118591;118592;118593;118594;118595;118596;118597;118598;118599;118600;118601;118602;118603;118604;118605;118606;118607;118608;118609;118610;118611;118612;118613;118614;118615;118616 118594 38 ELEAQLDDAVAEASK Unmodified 1587.7628 0.76279601 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.488 99.488 2 4.4245E-09 101772 QUIQUE_C1403_190116_001 144.57 124.81 283450000 0 55549000 0 55952000 67435000 0 0 47598000 0 0 0 0 56921000 10573 4631 9902 93439;93440;93441;93442;93443;93444;93445;93446 118617;118618;118619;118620;118621;118622;118623;118624;118625;118626 118619 10 ELEAVCQDVLSLLDNYLIK Unmodified 2234.1504 0.15043557 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 3 2 2 1 3 3 2 175.02 175.02 2;3 2.2165E-152 181761 QUIQUE_DMIX5_190116_001 297.5 274.92 32242000000 296770000 540980000 984210000 158950000 1924700000 274130000 2618900000 1234500000 2426000000 39359000 12451000000 7220700000 2071300000 10574 2736 9903 93447;93448;93449;93450;93451;93452;93453;93454;93455;93456;93457;93458;93459;93460;93461;93462;93463;93464;93465;93466;93467;93468;93469;93470 118627;118628;118629;118630;118631;118632;118633;118634;118635;118636;118637;118638;118639;118640;118641;118642;118643;118644;118645;118646;118647;118648;118649;118650;118651;118652;118653;118654;118655 118646 21 ELEDATETADAMNR Unmodified 1564.6675 0.66751541 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.6 55.6 2 1.4757E-36 53807 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.87 202.64 1373600000 98106000 99542000 151300000 156290000 102480000 93453000 96117000 98348000 106560000 40945000 110010000 89529000 130890000 10575 2378 9904 93471;93472;93473;93474;93475;93476;93477;93478;93479;93480;93481;93482;93483 118656;118657;118658;118659;118660;118661;118662;118663;118664;118665;118666;118667;118668 118664 13 ELEDFKLQHGSILGFPK Unmodified 1957.0309 0.030912783 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 3 1 3 3 5 3 3 101.86 101.86 2;3;4 1.8903E-200 104039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 286.74 257.2 4638900000 0 26849000 27648000 0 253350000 0 110160000 1137000000 730460000 0 956790000 424330000 972330000 10576 1777 9905 93484;93485;93486;93487;93488;93489;93490;93491;93492;93493;93494;93495;93496;93497;93498;93499;93500;93501;93502;93503;93504;93505;93506 118669;118670;118671;118672;118673;118674;118675;118676;118677;118678;118679;118680;118681;118682;118683;118684;118685;118686;118687;118688;118689;118690;118691;118692;118693;118694;118695;118696;118697;118698;118699;118700;118701;118702;118703;118704;118705;118706;118707;118708;118709;118710;118711;118712;118713;118714;118715;118716;118717;118718;118719;118720;118721;118722;118723;118724;118725;118726;118727;118728;118729;118730;118731;118732;118733;118734;118735;118736;118737;118738 118686 70 ELEDKVIELHK Unmodified 1351.7347 0.73473076 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 39.066 39.066 2;3 0.0016984 35250 QUIQUE_C1576_190116_001 67.153 41.036 1857800000 0 0 0 0 58982000 0 63380000 501090000 265320000 0 261040000 351130000 356910000 10577 143;560;4559 9906 93507;93508;93509;93510;93511;93512;93513;93514;93515;93516 118739;118740;118741;118742;118743;118744;118745;118746;118747;118748;118749;118750;118751;118752 118740 13 ELEDLIIEAVYTDIIQGK Unmodified 2061.0882 0.08815289 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3KQ34;J3QT95;A0A087X1P5 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 175.54 175.54 2;3 8.4207E-39 180465 QUIQUE_C1576_190116_001 126.63 117.53 182280000 4614600 5140500 3743200 0 10897000 0 40029000 14215000 22965000 0 55365000 25311000 0 10578 1277 9907 93517;93518;93519;93520;93521;93522;93523;93524;93525;93526 118753;118754;118755;118756;118757;118758;118759;118760;118761;118762;118763 118757 11 ELEDLLSPLEELVK Unmodified 1625.8764 0.8763692 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.31 168.31 2 3.1223E-08 171909 QUIQUE_C1277_190116_001 163.83 86.687 468040000 84579000 188810000 145630000 0 0 0 0 0 0 49016000 0 0 0 10579 1362 9908 93527;93528;93529;93530;93531 118764;118765;118766;118767;118768 118765 5 ELEDLQK Unmodified 873.44436 0.4443624 1459 O14933 UBE2L6 Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 yes yes 0 0 0 1 24.911 24.911 2 0.056949 18786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.141 12.895 45372000 0 0 0 0 0 0 0 45372000 0 0 0 0 0 10580 1459 9909 93532 118769 118769 1 ELEDLVR Unmodified 872.46035 0.46034682 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.933 57.933 2 0.026025 56738 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.777 19.508 1080000000 0 244070000 179670000 0 0 0 241690000 154550000 134750000 125290000 0 0 0 10581 3549 9910 93533;93534;93535;93536;93537;93538 118770;118771;118772;118773;118774;118775 118774 6 ELEDSLER Unmodified 989.46655 0.46655441 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 37.273 37.273 2 0.032902 33612 QUIQUE_C1438_190116_001 65.038 17.971 28860000 0 0 0 0 28860000 0 0 0 0 0 0 0 0 10582 1394 9911 93539;93540 118776;118777 118776 2 ELEDVTESAESMNR Unmodified 1608.6937 0.69373016 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.849 67.849 2 2.8682E-12 67689 QUIQUE_C1368_190116_001 147.72 121.67 101940000 0 0 0 0 22908000 23411000 0 0 0 0 34475000 21141000 0 10583 3459 9912 93541;93542;93543;93544;93545 118778;118779;118780;118781;118782 118778 4 ELEDYIDNLLVR Unmodified 1490.7617 0.76167379 3417 Q6WKZ4;E7EX40;Q7L804 RAB11FIP1;RAB11FIP2 Rab11 family-interacting protein 1;Rab11 family-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 150.56 150.56 2 0.002184 155791 QUIQUE_C1368_190116_001 91.584 62.857 54969000 19197000 0 15409000 0 0 0 0 0 20364000 0 0 0 0 10584 3417 9913 93546;93547;93548 118783;118784;118785 118784 3 ELEEALR Unmodified 858.4447 0.44469675 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 32.274 32.274 2 0.033128 27064 QUIQUE_C1403_190116_001 88.643 4.5793 103180000 0 0 0 103180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10585 16;1475 9914 93549 118786 118786 1 ELEEAMAGER Oxidation (M) 1149.4972 0.49720261 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.083 19.083 2 0.00098503 11719 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0 0 0 0 0 0 0 0 10588 2379 9916 93574 118811 118811 1 ELEEAVTSALQQETEK Unmodified 1803.8738 0.87380302 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 107 107 2;3 1.0251E-18 110726 QUIQUE_C1368_190116_001 182.71 142.56 201790000 0 0 44027000 0 0 0 0 0 0 0 114910000 42856000 0 10589 1187 9917 93575;93576;93577;93578;93579;93580 118812;118813;118814;118815;118816;118817 118812 6 ELEEDFIK Unmodified 1021.4968 0.4967919 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 94.772 94.772 2 0.010611 67793 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.041 56.149 2433300000 0 612100000 0 0 0 705770000 0 0 668520000 441650000 5255400 0 0 10590 3040 9918 93581;93582;93583;93584;93585;93586;93587;93588;93589 118818;118819;118820;118821;118822;118823;118824;118825;118826 118823 9 ELEEDFIKSELK Unmodified 1478.7504 0.75044041 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 1 1 88.862 88.862 3 0.0077822 91045 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pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.727 26.727 2 0.0025126 20313 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.429 34.511 538350000 59231000 63677000 74589000 90001000 57608000 52013000 0 30150000 41877000 39984000 0 29219000 0 10594 536 9922 93600;93601;93602;93603;93604;93605;93606;93607;93608;93609 118838;118839;118840;118841;118842;118843;118844;118845;118846;118847;118848 118847 11 ELEEETNAFNR Unmodified 1350.6052 0.60517315 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.518 51.518 2 2.4439E-24 49803 QUIQUE_C1277_190116_001 214.12 172.02 6232000000 0 1000200000 951070000 847030000 0 0 929850000 0 739820000 0 602240000 707270000 454510000 10595 535;3739 9923 93610;93611;93612;93613;93614;93615;93616;93617 118849;118850;118851;118852;118853;118854;118855;118856;118857 118849 9 ELEEETNAFNRR Unmodified 1506.7063 0.70628418 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 1 1 1 1 1 38.333 38.333 2;3 0.0041578 33860 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.516 38.894 140790000 0 0 0 0 0 0 0 51726000 44968000 0 44096000 0 0 10596 535;3739 9924 93618;93619;93620;93621 118858;118859;118860;118861 118861 3 ELEEEVNNFQK Unmodified 1377.6412 0.64122431 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.091 58.091 2 1.5536E-30 57823 QUIQUE_C1218_190116_001 240.53 191.97 12713000000 1060300000 1166800000 1173900000 1102000000 931130000 992840000 1006100000 959140000 956670000 482070000 969210000 906690000 1006100000 10597 820 9925 93622;93623;93624;93625;93626;93627;93628;93629;93630;93631;93632;93633;93634 118862;118863;118864;118865;118866;118867;118868;118869;118870;118871;118872;118873;118874;118875;118876;118877;118878;118879;118880;118881 118862 20 ELEEEWVK Unmodified 1060.5077 0.50769094 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 63.477 63.477 2 0.046289 59202 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.547 14.655 24886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24886000 0 0 0 10598 3037 9926 93635 118882 118882 1 ELEEIAR Unmodified 858.4447 0.44469675 3354 Q6BCY4 CYB5R2 NADH-cytochrome b5 reductase 2 yes yes 0 0 0 1 1 32.031 32.031 2 0.040382 27144 QUIQUE_C1403_190116_001 82.913 0 199580000 0 0 0 103180000 0 0 0 0 0 0 0 0 96399000 10599 3354 9927 93636;93637 118883;118884 118883 2 ELEEIVQPIISK Unmodified 1396.7813 0.7813466 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.28 101.28 2 1.8459E-20 103270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.98 143.03 6665100000 663160000 611270000 626740000 625890000 682190000 673860000 569800000 187000000 326070000 312910000 548120000 400680000 437430000 10600 2007 9928 93638;93639;93640;93641;93642;93643;93644;93645;93646;93647;93648;93649;93650 118885;118886;118887;118888;118889;118890;118891;118892;118893;118894;118895;118896;118897;118898;118899;118900;118901;118902;118903;118904;118905;118906;118907;118908;118909;118910 118900 26 ELEELLESALDDFDK Unmodified 1764.8305 0.83054122 2429 P40855;B7Z8B3 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 169.71 169.71 2;3 1.0649E-13 175771 QUIQUE_C1438_190116_001 170.04 143.25 319960000 0 45022000 89927000 30665000 31675000 38696000 83976000 0 0 0 0 0 0 10601 2429 9929 93651;93652;93653;93654;93655;93656;93657;93658;93659 118911;118912;118913;118914;118915;118916;118917;118918;118919 118917 8 ELEEQLENETLHK Unmodified 1610.7788 0.77878042 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 62.761 62.761 2;3 0.046259 62639 QUIQUE_C1438_190116_001 21.942 18.039 129390000 38506000 0 0 0 47193000 43687000 0 0 0 0 0 0 0 10602 515 9930 93660;93661;93662 118920;118921;118922 118921 3 ELEETLNK Unmodified 974.49204 0.49204087 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 26.291 26.291 2 0.042765 20052 QUIQUE_C1218_190116_001 58.782 21.136 57713000 57713000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10603 310;830 9931 93663 118923 118923 1 ELEEVAIK Unmodified 929.50696 0.50696266 941 E9PJ55;Q9NUJ3;H0YES4 TCP11L1 T-complex protein 11-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 42.543 42.543 2 0.042928 39102 QUIQUE_C1576_190116_001 58.679 3.9053 42802000 20876000 0 0 0 0 0 21926000 0 0 0 0 0 0 10604 941 9932 93664;93665;93666 118924;118925;118926 118925 3 ELEEWYAR Unmodified 1094.5033 0.50327426 1966 P09496;F8WF69;C9J8P9 CLTA Clathrin light chain A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.97 68.97 2 0.0036109 68783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.6 88.865 2724700000 496380000 546320000 225920000 309060000 263030000 240790000 0 224480000 218540000 0 94673000 0 105450000 10605 1966 9933 93667;93668;93669;93670;93671;93672;93673;93674;93675;93676 118927;118928;118929;118930;118931;118932;118933;118934;118935;118936;118937 118934 11 ELEFLGWYTTGGPPDPSDIHVHK Unmodified 2594.2442 0.24415304 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 127.55 127.55 3;4 2.2817E-40 131794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.41 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Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 89.71 89.71 3 0.00066381 86250 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.127 52.577 76620000 55962000 0 0 0 0 0 0 0 0 20658000 0 0 0 10608 2385 9936 93706;93707 118977;118978 118978 2 ELEGVILELQEQLTGLIPSDHAPLAQGSK Unmodified 3084.6343 0.63429502 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 169.11 169.11 3 1.5832E-08 170992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.093 37.694 58683000 0 0 0 0 0 0 0 58683000 0 0 0 0 0 10609 3265 9937 93708 118979 118979 1 ELELKVPLVVR Unmodified 1293.802 0.80202247 3878 Q96I99;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 94.916 94.916 3 0.0018274 96071 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.434 54.4 20802000 0 0 0 0 0 0 0 20802000 0 0 0 0 0 10610 3878 9938 93709 118980 118980 1 ELELLDR Unmodified 886.476 0.47599688 1072 G3V1A6;P57764 GSDMD Gasdermin-D yes no 0 0 0 1 65.937 65.937 2 0.059144 65901 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.998 7.2812 14081000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14081000 10611 1072 9939 93710 118981 118981 1 ELELQILTEAIR Unmodified 1426.8031 0.80314468 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.61 143.61 2 8.0057E-14 148014 QUIQUE_DMIX7_190116_001 188.04 137.43 636750000 58097000 64820000 67191000 38549000 65760000 43181000 61785000 45407000 0 23496000 69180000 52605000 46678000 10612 465 9940 93711;93712;93713;93714;93715;93716;93717;93718;93719;93720;93721;93722 118982;118983;118984;118985;118986;118987;118988;118989;118990;118991;118992;118993;118994;118995;118996;118997;118998 118995 15 ELELVQNAFFTDPNDQSAWFYHR Unmodified 2826.3038 0.30379318 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 151.95 151.95 3 3.4138E-11 158329 QUIQUE_C1576_190116_001 90.968 83.774 540660000 0 0 65934000 0 0 45731000 69494000 66471000 65939000 22527000 0 101580000 102990000 10613 3750 9941 93723;93724;93725;93726;93727;93728;93729;93730 118999;119000;119001;119002;119003;119004;119005;119006;119007;119008;119009 119002 10 ELELVYAR Unmodified 991.53385 0.53384611 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 68.9 68.9 2 0.015425 69095 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.699 32.912 142700000 0 0 45187000 0 57484000 0 0 0 0 0 0 0 40027000 10614 3086 9942 93731;93732;93733 119010;119011;119012 119012 3 ELENAVGSWTDDLTQLSLLK Unmodified 2231.1321 0.13214297 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325;H0Y326 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 165.27 165.27 2 0.00096528 169158 QUIQUE_C1277_190116_001 62.287 50.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10615 228 9943 93734 119013 119013 1 ELENFFQELEK Unmodified 1424.6824 0.68236084 2201 P22676;H3BN14;A6NER6 CALB2 Calretinin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.95 134.95 2 1.2385E-29 131548 QUIQUE_DMIX4_190116_001 187.5 135.65 23665000000 1871800000 1732000000 1985300000 1307200000 2269300000 1644500000 1868400000 1646500000 2150900000 635650000 2124100000 1791500000 2638100000 10616 2201 9944 93735;93736;93737;93738;93739;93740;93741;93742;93743;93744;93745;93746;93747 119014;119015;119016;119017;119018;119019;119020;119021;119022;119023;119024;119025;119026;119027;119028;119029;119030;119031;119032;119033;119034;119035;119036;119037;119038;119039;119040;119041;119042 119035 29 ELENLATSLEHYK Unmodified 1545.7675 0.76748745 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.41 87.41 3 0.011634 89796 QUIQUE_C1576_190116_001 45.357 35.008 212330000 0 27724000 28951000 29551000 24603000 0 42114000 0 44923000 14466000 0 0 0 10617 348 9945 93748;93749;93750;93751;93752;93753;93754 119043;119044;119045;119046;119047;119048;119049 119047 7 ELEQANDDLER Unmodified 1330.6001 0.60008777 544 A6NIZ0;Q9GZM8;J3KRK9;J3QL85;Q9NXR1;I3L3G9;I3L2S8 NDEL1;NDE1 Nuclear distribution protein nudE-like 1;Nuclear distribution protein nudE homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.397 35.397 2 0.00018187 30649 QUIQUE_C1277_190116_001 135.71 97.625 408380000 41651000 28346000 29415000 48053000 32311000 29182000 42501000 26852000 26328000 0 38105000 24554000 41080000 10618 544 9946 93755;93756;93757;93758;93759;93760;93761;93762;93763;93764;93765;93766;93767 119050;119051;119052;119053;119054;119055;119056;119057;119058;119059;119060;119061;119062;119063 119051 14 ELEQELAEQK Unmodified 1215.5983 0.59829686 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 32.805 32.805 2 0.023806 27908 QUIQUE_C1563_190116_001 56.721 0.45125 178120000 0 0 0 0 0 178120000 0 0 0 0 0 0 0 10619 228 9947 93768 119064 119064 1 ELEQIFCQFDSK Unmodified 1542.7024 0.70244436 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.66 120.66 2 5.488E-05 124417 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.74 109.6 1128900000 133170000 99088000 143200000 0 0 104610000 112450000 76014000 93991000 0 139160000 109510000 117750000 10620 903;2869 9948 93769;93770;93771;93772;93773;93774;93775;93776;93777;93778 119065;119066;119067;119068;119069;119070;119071;119072;119073;119074;119075;119076;119077 119074 13 ELEQLFSQYGR Unmodified 1368.6674 0.66737948 160 A0A0A0MRX1;Q12926;B1AM48;C9JB16 ELAVL2 ELAV-like protein;ELAV-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.52 105.52 2 3.3165E-12 110112 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.38 152.68 503640000 48128000 55627000 45804000 54914000 0 44274000 0 42998000 53231000 20381000 83538000 54746000 0 10621 160 9949 93779;93780;93781;93782;93783;93784;93785;93786;93787;93788 119078;119079;119080;119081;119082;119083;119084;119085;119086;119087;119088 119087 9 ELEQLGR Unmodified 843.44503 0.4450311 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.047 27.047 2 0.020578 20730 QUIQUE_C1368_190116_001 107.74 6.4156 2707800000 0 502950000 537260000 167880000 429110000 0 0 479380000 591250000 0 0 0 0 10622 3117 9950 93789;93790;93791;93792;93793;93794 119089;119090;119091;119092;119093;119094;119095 119090 7 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPK Unmodified 3054.4869 0.48691928 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 3 2 2 3 3 3 3 3 140.01 140.01 2;3;4 7.8156E-137 147184 QUIQUE_DMIX5_190116_001 268.42 252.54 19312000000 1380400000 1348100000 1514000000 1874200000 1493700000 1354600000 1587100000 1193800000 1524300000 1098300000 1829400000 1369700000 1744700000 10623 282 9951 93795;93796;93797;93798;93799;93800;93801;93802;93803;93804;93805;93806;93807;93808;93809;93810;93811;93812;93813;93814;93815;93816;93817;93818;93819;93820;93821;93822;93823;93824;93825;93826;93827 119096;119097;119098;119099;119100;119101;119102;119103;119104;119105;119106;119107;119108;119109;119110;119111;119112;119113;119114;119115;119116;119117;119118;119119;119120;119121;119122;119123;119124;119125;119126;119127;119128;119129;119130;119131;119132;119133;119134;119135;119136;119137;119138;119139;119140;119141;119142;119143;119144;119145;119146;119147;119148 119139 51 ELESEKEQLKK Unmodified 1359.7246 0.72456001 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52;A0A2R8YCU9;A0A2R8Y820 CCDC88A Girdin yes no 0 0 2 1 10.976 10.976 3 0.058571 3376 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.958 29.924 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10624 473 9952 93828 119149 119149 1 ELESFLR Unmodified 892.46543 0.46543219 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 71.435 71.435 2 0.049128 71262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.311 8.3171 116160000 0 0 46133000 0 0 0 32713000 0 0 0 0 0 37319000 10625 1187 9953 93829;93830;93831 119150;119151;119152 119152 3 ELESMIGIDPGNR Unmodified 1429.6871 0.68712864 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 92.625 92.625 2 0.0055558 96473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.627 38.954 81310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81310000 0 0 10626 1140;3457 9954 93832 119153 119153 1 ELESQISELQEDLESER Unmodified 2032.9437 0.9436735 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 134.16 134.16 2;3 5.4754E-181 137954 QUIQUE_C1403_190116_001 254.47 227.5 1865300000 182570000 228740000 189810000 258920000 185690000 130520000 229980000 63245000 86263000 0 90849000 113140000 105570000 10627 2378 9955 93833;93834;93835;93836;93837;93838;93839;93840;93841;93842;93843;93844;93845;93846;93847;93848;93849;93850;93851;93852;93853;93854;93855 119154;119155;119156;119157;119158;119159;119160;119161;119162;119163;119164;119165;119166;119167;119168;119169;119170;119171;119172;119173;119174;119175;119176;119177;119178;119179;119180;119181;119182;119183 119162 28 ELESVCVVEAGPGTCTFDHR Unmodified 2262.0045 0.0045163905 3369 Q6L8Q7;F6T1Q0 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes no 0 0 0 1 84.534 84.534 3 0.0036635 86706 QUIQUE_C1576_190116_001 43.848 34.684 39536000 0 0 0 0 0 0 39536000 0 0 0 0 0 0 10628 3369 9956 93856 119184 119184 1 ELETLQQTVEELQAQVHSMDGAK Unmodified 2583.2486 0.24864607 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45;A0A087WXA6 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.29 151.29 3 1.6784E-11 155488 QUIQUE_C1403_190116_001 92.913 82.763 473570000 0 72507000 133780000 48057000 53715000 66255000 50432000 0 0 0 0 0 48823000 10629 3241 9957 93857;93858;93859;93860;93861;93862;93863 119185;119186;119187;119188;119189;119190;119191 119187 7 ELETVCNDVLSLLDK Unmodified 1746.871 0.87096625 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 153.1 153.1 2;3 6.1042E-130 157934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 279.86 243.28 24701000000 2598700000 2736700000 1771400000 1410000000 2080100000 2364100000 2185300000 929260000 1619700000 909390000 2005300000 2360500000 1730100000 10630 2891 9958 93864;93865;93866;93867;93868;93869;93870;93871;93872;93873;93874;93875;93876;93877;93878;93879 119192;119193;119194;119195;119196;119197;119198;119199;119200;119201;119202;119203;119204;119205;119206;119207;119208;119209;119210;119211;119212;119213;119214;119215;119216;119217;119218;119219;119220;119221;119222;119223 119211 32 ELETVCNDVLSLLDKFLIK Unmodified 2248.2025 0.20247114 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 1 1 2 1 1 172.59 172.59 2;3 7.9896E-12 176297 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.544 82.672 578320000 0 0 0 0 0 0 0 75792000 0 0 216800000 187940000 97790000 10631 2891 9959 93880;93881;93882;93883;93884 119224;119225;119226;119227;119228 119227 5 ELEVLSEQYSQK Unmodified 1451.7144 0.71438925 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;H7C3G6;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 69.628 69.628 2 0.057369 70784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.472 26.118 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10632 1111;3416 9960 93885 119229 119229 1 ELEVNGIEFYPQK Unmodified 1564.7773 0.77732386 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.03 108.03 2 4.9586E-05 112417 QUIQUE_C1218_190116_001 143.5 98.341 2351400000 225540000 259540000 242580000 224670000 166810000 186950000 216360000 98479000 171900000 111990000 131100000 153350000 162160000 10633 419 9961 93886;93887;93888;93889;93890;93891;93892;93893;93894;93895;93896;93897;93898 119230;119231;119232;119233;119234;119235;119236;119237;119238;119239;119240;119241;119242;119243;119244;119245;119246;119247;119248;119249;119250 119230 21 ELEVQHPAAK Unmodified 1120.5877 0.58767259 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 15.227 15.227 2;3 3.9402E-18 7444 QUIQUE_DMIX4_190116_001 184.38 111.59 1854900000 175680000 310950000 19449000 244530000 39546000 220680000 9928900 246690000 190830000 152430000 0 194460000 49754000 10634 2572 9962 93899;93900;93901;93902;93903;93904;93905;93906;93907;93908;93909;93910;93911;93912;93913;93914;93915;93916;93917 119251;119252;119253;119254;119255;119256;119257;119258;119259;119260;119261;119262;119263;119264;119265;119266;119267;119268;119269;119270;119271;119272 119269 19 ELFASLTPWACGSHTPLLAGR Unmodified 2283.147 0.14702195 3347 Q66K14;G3V133 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.81 135.81 3 3.2737E-05 141496 QUIQUE_C1576_190116_001 57.496 52.286 214600000 0 0 0 55683000 55089000 0 39870000 0 0 0 0 63956000 0 10635 3347 9963 93918;93919;93920;93921 119273;119274;119275;119276 119275 2 ELFCHNER Unmodified 1103.4818 0.48182731 4420 Q9UG56 PISD Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme;Phosphatidylserine decarboxylase alpha chain;Phosphatidylserine decarboxylase beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 18.217 18.217 3 0.020698 10216 QUIQUE_C1277_190116_001 44.753 29.091 48756000 21699000 10535000 0 0 0 16522000 0 0 0 0 0 0 0 10636 4420 9964 93922;93923;93924 119277;119278;119279 119278 3 ELFDELVK Unmodified 991.52261 0.52261272 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.59 100.59 2 0.0029428 104294 QUIQUE_C1218_190116_001 134.06 91.582 316400000 62685000 0 53132000 63362000 0 0 51548000 26898000 35866000 22908000 0 0 0 10637 2663 9965 93925;93926;93927;93928;93929;93930;93931 119280;119281;119282;119283;119284;119285;119286;119287 119281 8 ELFDELVKK Unmodified 1119.6176 0.61757574 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 73.914 73.914 2;3 0.0016737 74788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.233 60.114 116900000 0 0 0 0 0 0 0 43881000 26891000 0 21359000 24766000 0 10638 2663 9966 93932;93933;93934;93935;93936;93937;93938;93939;93940 119288;119289;119290;119291;119292;119293;119294;119295;119296 119294 9 ELFDLALR Unmodified 975.53893 0.53893149 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.85 114.85 2 0.0036323 119915 QUIQUE_C1218_190116_001 116.54 59.44 245560000 42527000 33523000 35536000 26323000 27659000 30038000 0 0 0 0 34907000 15047000 0 10639 882 9967 93941;93942;93943;93944;93945;93946;93947;93948;93949;93950 119297;119298;119299;119300;119301;119302;119303;119304;119305;119306 119297 10 ELFDYNLR Unmodified 1068.524 0.52400971 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 91.519 91.519 2 0.040827 95384 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.006 51.61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10640 3312 9968 93951 119307 119307 1 ELFEDLLR Unmodified 1033.5444 0.5444108 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 125.09 125.09 2 0.048509 130302 QUIQUE_C1218_190116_001 75.109 20.952 4793800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4793800 0 0 0 10641 3565 9969 93952;93953 119308;119309 119308 2 ELFEMAR Unmodified 894.42694 0.4269382 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.508 64.508 2 0.019333 63953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.59 65.375 400810000 0 0 0 59035000 0 36213000 49717000 43200000 46367000 16899000 48994000 41111000 59276000 10642 2389 9970 93954;93955;93956;93957;93958;93959;93960;93961;93962 119310;119311;119312;119313;119314;119315;119316;119317;119318 119313 9 ELFEPYGAVYQINVLR Unmodified 1909.9938 0.993799 299 V9GYD9;Q5VZZ6;A0A0J9YX66;A0A1B0GU44;E9PC62;A0A1B0GUN8;A0A0J9YXJ0;O95319;V9GY47;A0A0J9YXK1 CELF2 CUGBP Elav-like family member 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 144.33 144.33 2;3 5.5084E-25 150289 QUIQUE_C1218_190116_001 192.3 161.43 2885200000 247980000 269060000 278460000 175530000 227100000 224880000 197950000 173070000 242990000 64925000 334570000 305910000 142730000 10643 299 9971 93963;93964;93965;93966;93967;93968;93969;93970;93971;93972;93973;93974;93975;93976;93977;93978;93979;93980;93981;93982;93983;93984;93985 119319;119320;119321;119322;119323;119324;119325;119326;119327;119328;119329;119330;119331;119332;119333;119334;119335;119336;119337;119338;119339;119340;119341;119342;119343;119344 119319 25 ELFESSTNNNK Unmodified 1281.5837 0.58370943 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.686 27.686 2 0.0016401 21532 QUIQUE_C1277_190116_001 130.31 105.37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10644 153 9972 93986;93987;93988;93989;93990 119345;119346;119347;119348;119349 119346 5 ELFGIHVAEVTYKPLR Unmodified 1871.0305 0.030518852 4179 Q9H6Q4 NARFL Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NARFL yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.409 97.409 3 0.00092478 100036 QUIQUE_C1403_190116_001 66.059 52.996 152890000 0 0 32196000 21002000 0 19947000 0 0 18200000 0 0 24988000 36557000 10645 4179 9973 93991;93992;93993;93994;93995;93996 119350;119351;119352;119353;119354;119355 119351 6 ELFLLGQHYVFEAK Unmodified 1692.8875 0.88754301 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 117.94 117.94 2;3 9.8625E-05 121055 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.89 83.29 396670000 0 47176000 43858000 52169000 37192000 10027000 0 18866000 41447000 16715000 37407000 34525000 57289000 10646 348 9974 93997;93998;93999;94000;94001;94002;94003;94004;94005;94006;94007;94008 119356;119357;119358;119359;119360;119361;119362;119363;119364;119365;119366;119367 119362 8 ELFNITNGARK Unmodified 1261.6779 0.67788459 2015 P11215 ITGAM Integrin alpha-M yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.063 34.063 3 0.01037 29112 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.087 17.061 203880000 0 0 22699000 30368000 29292000 0 0 0 33955000 0 40211000 0 47359000 10647 2015 9975 94009;94010;94011;94012;94013;94014 119368;119369;119370;119371;119372;119373;119374 119373 6 ELFPDWK Unmodified 933.45962 0.45961853 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.458 96.458 2 0.026204 99149 QUIQUE_C1368_190116_001 94.407 45.647 358930000 0 33160000 44304000 0 42261000 37611000 55495000 0 38580000 0 57411000 50111000 0 10648 3169 9976 94015;94016;94017;94018;94019;94020;94021;94022 119375;119376;119377;119378;119379;119380;119381;119382;119383;119384 119376 10 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVK Unmodified 2350.2685 0.26851729 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 3 1 2 1 2 1 1 1 1 115.2 115.2 3;4 1.1864E-05 120217 QUIQUE_C1218_190116_001 72.883 65.668 973510000 215470000 64493000 191440000 43344000 0 0 168480000 82002000 97927000 28761000 0 0 81588000 10649 2105 9977 94023;94024;94025;94026;94027;94028;94029;94030;94031;94032;94033;94034;94035 119385;119386;119387;119388;119389;119390;119391;119392;119393;119394;119395;119396;119397;119398;119399 119386 10 ELFQELLNLEK Unmodified 1374.7395 0.73948179 3872 Q96HU8 DIRAS2 GTP-binding protein Di-Ras2 yes yes 0 0 0 1 147.54 147.54 2 0.0093516 152627 QUIQUE_C1218_190116_001 82.417 53.69 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10650 3872 9978 94036 119400 119400 1 ELFQELLTLETR Unmodified 1490.7981 0.7980593 1703 O95057 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 151.99 151.99 2 0.0020514 158814 QUIQUE_C1438_190116_001 77.379 55.293 287250000 0 0 0 0 39099000 0 55314000 0 0 14520000 75272000 64373000 38676000 10651 1703 9979 94037;94038;94039;94040;94041;94042 119401;119402;119403;119404;119405;119406 119401 6 ELFQEMAIDIIPPYMIAAK Unmodified 2192.1261 0.12613508 1686 O94805 ACTL6B Actin-like protein 6B yes yes 0 0 0 1 168.09 168.09 3 0.0089218 170040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.678 7.5866 14476000 0 0 0 0 0 0 0 14476000 0 0 0 0 0 10652 1686 9980 94043 119407 119407 1 ELFQETLESLR Unmodified 1363.6983 0.69834526 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.12 120.12 2 0.0012865 125800 QUIQUE_C1438_190116_001 103.55 52.94 260650000 0 0 0 49930000 55600000 0 57406000 0 37528000 16165000 44019000 0 0 10653 3459 9981 94044;94045;94046;94047;94048;94049;94050;94051 119408;119409;119410;119411;119412;119413;119414;119415 119410 7 ELFSNLQEFAGPSGK Unmodified 1622.794 0.79403656 1159 H0YI09;Q9H8H3;F8VQX6 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.06 116.06 2 7.6971E-44 118775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.66 143.36 2989000000 293380000 0 0 397980000 205680000 0 0 506090000 512580000 0 637820000 435470000 0 10654 1159 9982 94052;94053;94054;94055;94056;94057;94058 119416;119417;119418;119419;119420;119421;119422;119423;119424;119425 119422 9 ELFSPLHALNFGIGGDGTQHVLWR Unmodified 2663.3609 0.36085455 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 1 2 2 2 143.57 143.57 3;4 3.9718E-88 147844 QUIQUE_C1403_190116_001 179.19 168.35 6247300000 295260000 412220000 493450000 289290000 470890000 320790000 603580000 430190000 762200000 66627000 822670000 762890000 517240000 10655 3110 9983 94059;94060;94061;94062;94063;94064;94065;94066;94067;94068;94069;94070;94071;94072;94073;94074;94075;94076;94077;94078;94079;94080;94081;94082;94083;94084 119426;119427;119428;119429;119430;119431;119432;119433;119434;119435;119436;119437;119438;119439;119440;119441;119442;119443;119444;119445;119446;119447;119448;119449;119450;119451;119452;119453;119454;119455;119456;119457;119458;119459;119460;119461;119462;119463;119464;119465;119466;119467;119468;119469;119470;119471;119472;119473;119474 119440 48 ELFSPLHALNFGIGGDTTR Unmodified 2044.0378 0.037789075 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 135.86 135.86 2;3 0 141695 QUIQUE_C1218_190116_001 305.23 285.55 14529000000 1158600000 1320000000 1347200000 1089700000 1132800000 875610000 1112400000 1133700000 1178100000 334500000 1235100000 1215300000 1396100000 10656 2798 9984 94085;94086;94087;94088;94089;94090;94091;94092;94093;94094;94095;94096;94097;94098;94099;94100;94101;94102;94103;94104;94105;94106;94107;94108 119475;119476;119477;119478;119479;119480;119481;119482;119483;119484;119485;119486;119487;119488;119489;119490;119491;119492;119493;119494;119495;119496;119497;119498;119499;119500;119501;119502;119503;119504 119475 30 ELFVMAR Unmodified 864.45276 0.45275902 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.015 67.015 2 0.042468 67484 QUIQUE_C1576_190116_001 81.1 38.053 241540000 0 0 0 0 57876000 45513000 64363000 0 0 0 73785000 0 0 10657 2743 9985 94109;94110;94111;94112 119505;119506;119507;119508;119509 119508 4 ELFVQSEIFPLETPAFAIK Unmodified 2178.1613 0.16125825 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 162.99 162.99 2 2.1177E-29 168046 QUIQUE_C1368_190116_001 175.28 167.37 527380000 36129000 60243000 64845000 0 59068000 40861000 50328000 32829000 49813000 18700000 72121000 0 42441000 10658 2554 9986 94113;94114;94115;94116;94117;94118;94119;94120;94121;94122;94123;94124 119510;119511;119512;119513;119514;119515;119516;119517;119518;119519;119520;119521 119513 11 ELFWHALR Unmodified 1070.5661 0.56614929 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.276 77.276 3 0.010503 79509 QUIQUE_C1218_190116_001 54.611 36.703 32717000 14636000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18081000 0 0 10659 3891 9987 94125;94126;94127;94128;94129;94130 119522;119523;119524;119525;119526;119527 119522 6 ELGAFGLQVPSELGGVGLCNTQYAR Unmodified 2635.3064 0.30643572 2539 P49748;K7EQP4;J3QKU9 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 149.98 149.98 2;3 4.7246E-69 152637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.51 183.58 1243100000 83901000 82569000 166290000 78340000 24503000 18927000 35488000 107020000 151240000 51479000 175430000 111040000 156890000 10660 2539 9988 94131;94132;94133;94134;94135;94136;94137;94138;94139;94140;94141;94142;94143;94144;94145;94146;94147;94148;94149;94150;94151;94152;94153;94154 119528;119529;119530;119531;119532;119533;119534;119535;119536;119537;119538;119539;119540;119541;119542;119543;119544;119545;119546;119547;119548;119549;119550;119551;119552;119553;119554 119543 27 ELGATECINPQDYK Unmodified 1636.7403 0.74028643 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327;P00326 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A;ADH1C Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A;Alcohol dehydrogenase 1C yes no 0 0 0 1 1 2 1 70.224 70.224 2 0.00011102 69128 QUIQUE_C1563_190116_001 113.22 87.839 128600000 0 0 0 0 24748000 39592000 64265000 0 0 0 0 0 0 10661 1774 9989 94155;94156;94157;94158;94159 119555;119556;119557;119558;119559 119557 5 ELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYK Unmodified 2661.3286 0.32861095 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.41 171.41 3 6.5661E-20 174819 QUIQUE_C1277_190116_001 109.41 98.855 628730000 0 81018000 61889000 0 0 0 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dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 1 2 2 1 2 2 99.835 99.835 2 7.1552E-14 101187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.71 116.09 8315300000 966200000 1132100000 1592100000 1069100000 0 930730000 38764000 1008100000 1102600000 417620000 0 58117000 0 10675 1875 10001 94332;94333;94334;94335;94336;94337;94338;94339;94340;94341;94342;94343;94344;94345;94346;94347;94348;94349;94350;94351 119779;119780;119781;119782;119783;119784;119785;119786;119787;119788;119789;119790;119791;119792;119793;119794;119795;119796;119797;119798;119799;119800;119801;119802 119792 21 ELGGADNIR Unmodified 943.47231 0.47230849 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 0 1 24.884 24.884 2 0.013805 18313 QUIQUE_C1277_190116_001 69.423 28.394 29315000 0 29315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10676 45 10002 94352 119803 119803 1 ELGGADNIRK Unmodified 1071.5673 0.5672715 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 1 1 15.683 15.683 3 0.035126 8127 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.088 17.06 14667000 0 0 0 0 0 0 0 14667000 0 0 0 0 0 10677 45 10003 94353 119804 119804 1 ELGGESNFGDALLDAGESMK Unmodified 2038.9154 0.91535026 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.66 136.66 2 7.4901E-47 142611 QUIQUE_C1576_190116_001 200.44 180.34 709100000 78539000 77501000 88989000 92829000 64286000 65530000 92263000 0 59037000 25647000 0 64474000 0 10678 3981 10004 94354;94355;94356;94357;94358;94359;94360;94361;94362;94363;94364 119805;119806;119807;119808;119809;119810;119811;119812;119813;119814;119815;119816 119812 11 ELGGESNFGDALLDAGESMKR Unmodified 2195.0165 0.016461285 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 1 1 119.08 119.08 3 0.044719 121522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.892 14.608 40481000 0 0 0 0 0 0 0 40481000 0 0 0 0 0 10679 3981 10005 94365 119817 119817 1 ELGGEVFYVGPAR Unmodified 1392.7038 0.70376498 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 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0.98765098 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 125.47 125.47 3 0.00015677 131269 QUIQUE_C1438_190116_001 82.651 71.606 433010000 40836000 45169000 44937000 0 36082000 0 29917000 49073000 52155000 0 45083000 44163000 45592000 10686 3639 10012 94384;94385;94386;94387;94388;94389;94390;94391;94392;94393;94394 119846;119847;119848;119849;119850;119851;119852;119853;119854;119855;119856;119857 119849 11 ELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSK Unmodified 2472.2206 0.2206404 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 139.64 139.64 3 0.037618 144562 QUIQUE_C1218_190116_001 23.485 16.125 96481000 96481000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10687 1556 10013 94395 119858 119858 1 ELGITALHIK Unmodified 1093.6495 0.64954457 451 A0A2R8Y811;P62263;E5RH77 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 0 1 1 1 67.769 67.769 3 0.025343 67936 QUIQUE_C1403_190116_001 38.75 24.116 139250000 0 0 0 50999000 0 0 44871000 0 0 0 43377000 0 0 10688 451 10014 94396;94397;94398 119859;119860;119861 119859 3 ELGIWEPLAVK Unmodified 1253.702 0.70197407 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.07 123.07 2 0.000995 127835 QUIQUE_C1368_190116_001 105.94 90.728 4956600000 404920000 397320000 401510000 417920000 382380000 355410000 449880000 268030000 336660000 177670000 508070000 382770000 474000000 10689 2527 10015 94399;94400;94401;94402;94403;94404;94405;94406;94407;94408;94409;94410;94411 119862;119863;119864;119865;119866;119867;119868;119869;119870;119871;119872;119873;119874;119875;119876;119877 119864 14 ELGLEKDDKDAIEEK Unmodified 1730.8574 0.85742467 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27;K7ER56 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 36.179 36.179 2;3 2.1557E-42 32048 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.74 147.19 874870000 16431000 0 122160000 0 0 0 117220000 17679000 146320000 0 178640000 136120000 140310000 10690 1324 10016 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119910;119911 119911 2 ELGLNADLFQPTSLVR Unmodified 1771.9468 0.9468488 3311 Q5T447 HECTD3 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.1 141.1 2 0.0018416 145924 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.55 41.633 287270000 0 32085000 39806000 0 0 29380000 0 0 58544000 29039000 0 50504000 47913000 10693 3311 10019 94440;94441;94442;94443;94444;94445;94446 119912;119913;119914;119915;119916;119917;119918 119915 6 ELGLPEELVSR Unmodified 1240.6663 0.66631685 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.13 101.13 2 0.0025583 104216 QUIQUE_C1368_190116_001 90.108 44.947 551640000 76517000 82335000 57305000 50687000 66301000 0 49170000 0 51255000 0 75195000 0 42877000 10694 2554 10020 94447;94448;94449;94450;94451;94452;94453;94454;94455;94456 119919;119920;119921;119922;119923;119924;119925;119926;119927;119928;119929;119930;119931 119921 13 ELGLREENEGVYNGSWGGR Unmodified 2120.9875 0.98754442 336 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119981;119982;119983;119984;119985;119986;119987;119988;119989;119990;119991;119992;119993;119994;119995;119996;119997;119998;119999;120000;120001;120002 119992 19 ELGMEERPYSSR Unmodified 1452.6667 0.66672755 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 34.688 34.688 3 0.0064077 30053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.11 47.08 148200000 33111000 0 0 0 0 30441000 0 0 0 0 37629000 0 47017000 10698 4321 10024 94512;94513;94514;94515 120003;120004;120005;120006;120007 120006 4 ELGPQDLLWMLDHQEDGGEALR Unmodified 2521.1907 0.19073726 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.49 155.49 3 5.1056E-05 161240 QUIQUE_C1218_190116_001 67.866 60.327 279300000 26297000 0 43987000 54323000 42017000 0 34796000 0 0 0 0 40948000 36931000 10699 3563 10025 94516;94517;94518;94519;94520;94521;94522 120008;120009;120010;120011;120012;120013;120014 120008 6 ELGQTWANLDHMVGQLK Unmodified 1938.9622 0.96218129 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 126.32 126.32 3 0.00013632 129111 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.257 54.098 40159000 0 22668000 0 0 0 0 0 17491000 0 0 0 0 0 10700 228 10026 94523;94524 120015;120016 120016 2 ELGSLPLPLSTSEQR Unmodified 1625.8625 0.86245047 3521 Q86Y82;B1AJQ6 STX12 Syntaxin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.78 107.78 2 9.853E-06 111119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.44 78.054 1787500000 183810000 177150000 170220000 157770000 169900000 156980000 130270000 123220000 145430000 47383000 157030000 0 168370000 10701 3521 10027 94525;94526;94527;94528;94529;94530;94531;94532;94533;94534;94535;94536 120017;120018;120019;120020;120021;120022;120023;120024;120025;120026;120027;120028 120025 10 ELGSLPQEAFEK Unmodified 1346.6718 0.67179615 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 82.313 82.313 2 0.0064322 84214 QUIQUE_C1218_190116_001 64.82 39.876 53848000 53848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10702 4532 10028 94537;94538 120029;120030 120029 2 ELGSSTNALR Unmodified 1046.5356 0.53563702 1948 P08579 SNRPB2 U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' yes yes 0 0 0 1 25.965 25.965 2 0.00592 20319 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.825 37.692 370370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 370370000 0 0 10703 1948 10029 94539 120031 120031 1 ELGSSVALYSR Unmodified 1180.6088 0.60880197 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.291 61.291 2 1.8651E-05 60141 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.45 95.754 700000000 0 69412000 92364000 87753000 58933000 72554000 92030000 0 68331000 0 0 71833000 86791000 10704 2952 10030 94540;94541;94542;94543;94544;94545;94546;94547;94548 120032;120033;120034;120035;120036;120037;120038;120039;120040 120040 7 ELGSSVDEVEQLIR Unmodified 1572.7995 0.79951586 754 C9JY79;Q9H254 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 1 1 126.6 126.6 2 0.0018401 131418 QUIQUE_C1368_190116_001 91.961 67.17 115930000 0 0 43525000 0 0 0 0 37151000 35251000 0 0 0 0 10705 754 10031 94549;94550;94551 120041;120042;120043 120041 3 ELGTAGLYLHSK Unmodified 1287.6823 0.68230126 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 50.002 50.002 2;3 0.0044275 46871 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.789 46.76 647130000 87526000 58493000 0 62037000 0 40084000 0 72932000 130040000 0 46943000 47444000 101630000 10706 1058 10032 94552;94553;94554;94555;94556;94557;94558;94559;94560;94561;94562;94563;94564 120044;120045;120046;120047;120048;120049;120050;120051;120052;120053;120054;120055;120056;120057 120057 14 ELGTVMR Unmodified 804.41637 0.41637351 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;M0QZ52;F8WBR5;G3V479;C9J7T9;P02585 CALM2;CALM1;CALM3;TNNC2 Troponin C, skeletal muscle no no 0 0 0 1 1 1 27.527 27.527 2 0.024915 22430 QUIQUE_C1218_190116_001 97.071 46.105 2239500000 1555900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 391430000 292110000 0 10707 1128 10033 94565;94566;94567 120058;120059;120060 120058 3 ELGVGIALR Unmodified 926.55492 0.5549159 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 76.777 76.777 1;2 3.4291E-05 77539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.69 93.168 14387000000 1182600000 1213500000 919980000 779970000 680610000 1274600000 666200000 1570700000 1960800000 736060000 1118700000 1203100000 1080600000 10708 2855 10034 94568;94569;94570;94571;94572;94573;94574;94575;94576;94577;94578;94579;94580;94581;94582;94583 120061;120062;120063;120064;120065;120066;120067;120068;120069;120070;120071;120072;120073;120074;120075;120076;120077;120078;120079;120080;120081;120082;120083;120084;120085;120086;120087;120088;120089;120090;120091;120092;120093;120094;120095;120096;120097;120098;120099;120100;120101;120102;120103;120104;120105;120106;120107 120087 46 ELGVGIALRK Unmodified 1054.6499 0.64987892 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 0 1 2 2 1 48.137 48.137 2;3 0.0032333 46241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.751 32.287 237830000 0 0 0 0 0 0 0 150690000 74307000 0 12836000 0 0 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ELHDMFVDMAMLVESQGEMIDR Unmodified 2595.1478 0.14775151 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 1 1 169.11 169.11 3 1.6276E-08 176340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.539 78.788 38891000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22643000 16248000 0 10713 2721 10038 94596;94597 120120;120121 120120 1 ELHEKFDLLK Unmodified 1270.6921 0.69213767 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 1 1 49.823 49.823 2 1.4969E-10 47047 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.36 85.149 23528000 0 0 0 0 0 0 0 23528000 0 0 0 0 0 10714 820 10039 94598;94599 120122;120123 120122 2 ELHEKFEHLKR Unmodified 1464.7837 0.78374664 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 2 2 2 1 1 2 13.049 13.049 3;4 0.00022418 5024 QUIQUE_DMIX8_190116_001 103.34 90.715 533220000 0 0 0 0 0 0 0 327480000 68110000 0 4836200 49686000 83107000 10715 535;3739 10040 94600;94601;94602;94603;94604;94605;94606;94607 120124;120125;120126;120127;120128;120129;120130;120131 120130 8 ELHEQLVALDK Unmodified 1293.6929 0.69286595 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75;A0A1B0GTM0 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 50.302 50.302 2;3 0.00099967 47746 QUIQUE_C1368_190116_001 73.951 55.892 463570000 62013000 0 126840000 38694000 0 0 76367000 0 43851000 0 62557000 0 53245000 10716 2223 10041 94608;94609;94610;94611;94612;94613;94614;94615 120132;120133;120134;120135;120136;120137;120138;120139;120140;120141 120133 7 ELHEVCHLLEQER Unmodified 1690.8097 0.80970339 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 54.092 54.092 2;3 0.010294 52313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.287 48.542 79767000 0 0 0 0 0 43637000 0 36130000 0 0 0 0 0 10717 3125 10042 94616;94617 120142;120143 120143 1 ELHINLIPNK Unmodified 1189.6819 0.68190733 1931 P07900;G3V2J8;Q14568 HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 66.345 66.345 2;3 6.4021E-31 66464 QUIQUE_C1277_190116_001 203.93 176.8 17314000000 2058900000 2050400000 1440600000 1875700000 1767800000 2372200000 727660000 578840000 837480000 1034400000 978430000 707340000 883700000 10718 1931 10043 94618;94619;94620;94621;94622;94623;94624;94625;94626;94627;94628;94629;94630;94631;94632;94633;94634;94635;94636;94637;94638;94639;94640;94641;94642 120144;120145;120146;120147;120148;120149;120150;120151;120152;120153;120154;120155;120156;120157;120158;120159;120160;120161;120162;120163;120164;120165;120166;120167;120168;120169;120170;120171;120172;120173;120174;120175;120176;120177;120178;120179;120180;120181;120182;120183;120184;120185;120186 120150 43 ELHINLIPNKQDR Unmodified 1588.8685 0.8685389 1931 P07900;G3V2J8 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 50.802 50.802 2;3;4 1.7107E-12 48847 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.85 187.94 20772000000 752300000 1164300000 1038000000 894000000 1818800000 779100000 1698100000 1886700000 1960100000 393330000 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94682;94683;94684;94685;94686;94687;94688;94689;94690 120241;120242;120243;120244;120245;120246;120247;120248;120249;120250;120251 120247 10 ELHLLGVQVQQFQDVATR Unmodified 2080.1065 0.10653734 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 116.01 116.01 3 0.0024847 121099 QUIQUE_C1218_190116_001 47.222 38.058 201350000 95851000 0 105500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10721 2021 10046 94691;94692 120252;120253 120252 1 ELHSEFSEVMNEIWASDQIR Oxidation (M) 2435.1063 0.10633893 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 127.72 127.72 3 6.1566E-13 132250 QUIQUE_C1368_190116_001 115.57 111.37 339960000 34702000 37271000 60561000 43131000 31239000 0 0 35506000 52099000 0 0 45454000 0 10722 1153 10047 94693;94694;94695;94696;94697;94698;94699;94700 120254;120255;120256;120257;120258;120259;120260;120261;120262 120256 670 9 ELHSEFSEVMNEIWASDQIR Unmodified 2419.1114 0.1114243 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 153.03 153.03 2;3 6.9526E-154 157196 QUIQUE_DMIX7_190116_001 290.65 257.38 3197000000 240700000 274060000 416450000 246090000 0 199430000 242540000 224640000 466800000 97906000 436340000 56138000 295930000 10723 1153 10047 94701;94702;94703;94704;94705;94706;94707;94708;94709;94710;94711;94712;94713;94714;94715;94716;94717;94718;94719 120263;120264;120265;120266;120267;120268;120269;120270;120271;120272;120273;120274;120275;120276;120277;120278;120279;120280;120281;120282;120283;120284 120282 17 ELHTCDINDK Unmodified 1243.5503 0.55030081 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 16.414 16.414 2;3 0.0068382 9369 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 86.212 47236000 0 0 0 21644000 0 0 0 0 25592000 0 0 0 0 10724 3405 10048 94720;94721;94722;94723 120285;120286;120287;120288 120285 3 ELICVPYMAK Unmodified 1222.609 0.60900166 2953 Q12955;A0A087WTF3;A0A087WZ65 ANK3 Ankyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.904 91.904 2 0.0057299 94286 QUIQUE_C1277_190116_001 76.478 0 688540000 0 78803000 0 0 79839000 0 95881000 67542000 76543000 0 93024000 89970000 106940000 10725 2953 10049 94724;94725;94726;94727;94728;94729;94730;94731 120289;120290;120291;120292;120293;120294;120295;120296;120297 120289 9 ELICWGDSVK Unmodified 1205.5751 0.575059 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.997 84.997 2 0.007395 86554 QUIQUE_C1277_190116_001 73.233 41.012 221540000 0 32746000 0 0 47448000 18035000 0 36546000 0 0 0 38189000 48575000 10726 2377 10050 94732;94733;94734;94735;94736;94737;94738;94739;94740 120298;120299;120300;120301;120302;120303;120304;120305;120306;120307 120298 9 ELIDHSPK Unmodified 937.4869 0.48689592 886 E7EWP0;H0Y886;O43674 NDUFB5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial yes no 0 0 0 1 15.499 15.499 2 0.0065653 7490 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.28 43.117 26141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26141000 0 0 0 10727 886 10051 94741 120308 120308 1 ELIECAR Unmodified 889.43275 0.43275186 4600;4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;Q9Y490 TLN2;TLN1 Talin-2;Talin-1 no no 0 0 0 1 1 25.719 25.719 2 0.023465 19670 QUIQUE_C1218_190116_001 100.07 10.393 248530000 116710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131820000 0 10728 4606;4600 10052 94742;94743 120309;120310 120309 2 ELIEIISGAAALD Unmodified 1313.7078 0.70784731 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 5 2 1 2 2 2 5 1 6 3 157.7 157.7 2 4.7895E-06 152542 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.41 83.165 290440000 0 166200000 0 0 0 0 0 0 0 124240000 0 0 0 10729 2396 10053 94744;94745;94746;94747;94748;94749;94750;94751;94752;94753;94754;94755;94756;94757;94758;94759;94760;94761;94762;94763;94764;94765;94766;94767;94768;94769;94770;94771;94772;94773;94774;94775 120311;120312;120313;120314;120315;120316;120317;120318;120319;120320;120321;120322;120323;120324;120325;120326;120327;120328;120329;120330;120331;120332;120333;120334;120335;120336;120337;120338;120339;120340;120341;120342;120343;120344 120335 34 ELIEPVLTCFNDADSR Unmodified 1877.8829 0.88292792 2930 Q08AM6;H3BUU8 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.44 123.44 2 5.3395E-07 127563 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.57 73.574 417560000 45819000 41287000 0 40207000 66102000 26279000 0 34159000 49811000 16577000 0 47261000 50053000 10730 2930 10054 94776;94777;94778;94779;94780;94781;94782;94783;94784;94785;94786 120345;120346;120347;120348;120349;120350;120351;120352;120353;120354;120355;120356 120353 11 ELIFEETAR Unmodified 1106.5608 0.56078914 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.059 71.059 2 3.37E-09 71159 QUIQUE_C1277_190116_001 173.23 70.515 9285500000 1145400000 968850000 889280000 887980000 722710000 853070000 776450000 505000000 571780000 479810000 431700000 536070000 517460000 10731 2281 10055 94787;94788;94789;94790;94791;94792;94793;94794;94795;94796;94797;94798;94799 120357;120358;120359;120360;120361;120362;120363;120364;120365;120366;120367;120368;120369;120370;120371;120372;120373;120374;120375;120376;120377;120378;120379 120361 23 ELIFQETAR Unmodified 1105.5768 0.57677356 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.281 65.281 2 0.00047672 64990 QUIQUE_C1277_190116_001 130.27 105.35 1512900000 194390000 207370000 0 220860000 183400000 179190000 172470000 58214000 113790000 68632000 0 0 114580000 10732 897;2263 10056 94800;94801;94802;94803;94804;94805;94806;94807;94808;94809 120380;120381;120382;120383;120384;120385;120386;120387;120388;120389 120381 8 ELIFSAR Unmodified 834.45995 0.45995289 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.112 57.112 2 0.019322 55044 QUIQUE_C1403_190116_001 114.43 15.928 207850000 0 88837000 0 67031000 0 0 0 51981000 0 0 0 0 0 10733 3026 10057 94810;94811;94812;94813 120390;120391;120392;120393;120394 120391 5 ELIHISDWLPTLVK Unmodified 1662.9345 0.9344932 2094 P15848;A0A2U3U034 ARSB Arylsulfatase B yes no 0 0 0 1 1 146.52 146.52 3 8.8124E-05 152152 QUIQUE_C1368_190116_001 80.312 73.893 54575000 0 0 16236000 0 0 0 0 38339000 0 0 0 0 0 10734 2094 10058 94814;94815 120395;120396 120395 2 ELIIEFSK Unmodified 977.54335 0.54334816 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 86.66 86.66 2 0.040092 88152 QUIQUE_C1277_190116_001 60.478 19.25 16656000 0 16656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10735 1789 10059 94816 120397 120397 1 ELIIGDR Unmodified 814.45487 0.45486751 2243 P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.528 42.528 2 0.0098659 39365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.94 29.246 23539000000 2484300000 2199200000 2024400000 0 1778500000 1918800000 2166700000 1711800000 1917100000 831490000 2404000000 2149500000 1952900000 10736 2243 10060 94817;94818;94819;94820;94821;94822;94823;94824;94825;94826;94827;94828 120398;120399;120400;120401;120402;120403;120404;120405;120406;120407;120408;120409;120410;120411;120412;120413;120414 120410 17 ELIINEILVMR Unmodified 1341.769 0.76900778 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.18 146.18 2 1.7473E-05 153334 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.02 96.67 437030000 31714000 35225000 29189000 20245000 28178000 44261000 37457000 28297000 57956000 10920000 35693000 42573000 35325000 10737 2970;120 10061 94829;94830;94831;94832;94833;94834;94835;94836;94837;94838;94839;94840;94841 120415;120416;120417;120418;120419;120420;120421;120422;120423;120424;120425;120426;120427;120428;120429;120430 120428 16 ELIINEILVMR Oxidation (M) 1357.7639 0.7639224 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.49 129.49 2 0.00052595 126380 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.17 45.186 92308000 0 18144000 17555000 16245000 16999000 14738000 0 0 0 8627200 0 0 0 10738 2970;120 10061 94842;94843;94844;94845;94846;94847;94848;94849 120431;120432;120433;120434;120435;120436;120437;120438;120439 120438 74 9 ELIKPPTILR Unmodified 1178.7387 0.73869393 2632;4566 Q9Y2T2;P53677;E5RJ52;E7ER80;H0YBA0 AP3M1;AP3M2 AP-3 complex subunit mu-1;AP-3 complex subunit mu-2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 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94865;94866;94867;94868 120456;120457;120458;120459 120459 3 ELILTLCDLIR Unmodified 1357.7639 0.7639224 4041 Q9BV79 MECR Trans-2-enoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 152.78 152.78 2 0.00048696 157063 QUIQUE_C1277_190116_001 131.44 37.137 277080000 41292000 11619000 0 0 21223000 38189000 38255000 0 27045000 0 34836000 34219000 30401000 10742 4041 10065 94869;94870;94871;94872;94873;94874;94875;94876;94877;94878;94879;94880;94881;94882 120460;120461;120462;120463;120464;120465;120466;120467;120468;120469;120470;120471;120472;120473;120474 120461 15 ELINNELSHFLEEIK Unmodified 1826.9414 0.94142907 1860 P04271 S100B Protein S100-B yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 146.9 146.9 2;3 1.1173E-164 153673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 255.15 203.39 4472000000 241790000 267350000 362080000 34228000 167360000 223660000 284190000 240760000 572190000 252360000 715120000 398580000 712330000 10743 1860 10066 94883;94884;94885;94886;94887;94888;94889;94890;94891;94892;94893;94894;94895;94896;94897;94898;94899;94900;94901;94902;94903;94904;94905;94906 120475;120476;120477;120478;120479;120480;120481;120482;120483;120484;120485;120486;120487;120488;120489;120490;120491;120492;120493;120494;120495;120496;120497;120498;120499;120500;120501;120502;120503;120504 120498 30 ELINNELSHFLEEIKEQEVVDK Unmodified 2654.3439 0.34392666 1860 P04271 S100B Protein S100-B yes yes 0 0 1 1 1 3 1 3 1 2 3 3 2 3 3 4 147.74 147.74 2;3;4 6.9657E-234 154404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 302.14 283.31 68685000000 1025900000 2380900000 3809400000 253460000 2347400000 1127700000 2699800000 5851600000 18084000000 1227100000 15492000000 6932900000 7452900000 10744 1860 10067 94907;94908;94909;94910;94911;94912;94913;94914;94915;94916;94917;94918;94919;94920;94921;94922;94923;94924;94925;94926;94927;94928;94929;94930;94931;94932;94933;94934;94935;94936 120505;120506;120507;120508;120509;120510;120511;120512;120513;120514;120515;120516;120517;120518;120519;120520;120521;120522;120523;120524;120525;120526;120527;120528;120529;120530;120531;120532;120533;120534;120535;120536;120537;120538;120539;120540;120541;120542;120543;120544;120545;120546;120547;120548;120549;120550;120551;120552;120553;120554;120555;120556;120557 120543 52 ELIPNIPFQMLLR Unmodified 1582.8905 0.8905199 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.48 161.48 2 7.0229E-05 166477 QUIQUE_C1368_190116_001 121.73 96.111 2596500000 176140000 152390000 282550000 156290000 254940000 258000000 224980000 135830000 252690000 39638000 270450000 217630000 174970000 10745 2026 10068 94937;94938;94939;94940;94941;94942;94943;94944;94945;94946;94947;94948;94949 120558;120559;120560;120561;120562;120563;120564;120565;120566;120567;120568;120569;120570;120571 120561 13 ELIPNIPFQMLLR Oxidation (M) 1598.8854 0.88543452 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 151.67 151.67 2 0.009786 147061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.231 61.559 147390000 0 0 0 0 0 0 0 0 83358000 64035000 0 0 0 10746 2026 10068 94950;94951;94952 120572;120573;120574 120573 1337 1 ELIPTEEALR Unmodified 1169.6292 0.62920306 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 72.123 72.123 2;3 0.00037849 73429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.84 31.545 8659700000 552120000 490500000 766030000 241450000 700550000 326620000 825130000 699660000 934030000 503360000 1149900000 874060000 596330000 10747 3117 10069 94953;94954;94955;94956;94957;94958;94959;94960;94961;94962;94963;94964;94965;94966 120575;120576;120577;120578;120579;120580;120581;120582;120583;120584;120585;120586;120587;120588;120589;120590;120591;120592;120593;120594;120595;120596;120597;120598;120599;120600;120601;120602;120603 120595 29 ELIQTSALNFLTPLR Unmodified 1714.9618 0.96177059 55 A0A087WW40;Q9Y371 SH3GLB1 Endophilin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.1 149.1 2 7.283E-06 155910 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.84 74.774 1533900000 123490000 125460000 140070000 130530000 118140000 111260000 140150000 88717000 150590000 59187000 117530000 114160000 114630000 10748 55 10070 94967;94968;94969;94970;94971;94972;94973;94974;94975;94976;94977;94978;94979 120604;120605;120606;120607;120608;120609;120610;120611;120612;120613;120614;120615;120616;120617 120615 14 ELIRDEGVTSLYK Unmodified 1521.8039 0.80387296 1552 O43772;C9JPE1 SLC25A20 Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 68.569 68.569 2;3 0.0035314 68332 QUIQUE_C1368_190116_001 89.382 40.588 463490000 0 41778000 94674000 0 0 49834000 0 121120000 123850000 0 0 32240000 0 10749 1552 10071 94980;94981;94982;94983;94984;94985;94986;94987;94988;94989 120618;120619;120620;120621;120622;120623;120624;120625;120626;120627;120628 120621 11 ELISFLSEPEILVK Unmodified 1615.9073 0.9072754 532 A6NDU8;A0A0C4DGW6 C5orf51 UPF0600 protein C5orf51 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.11 150.11 2 0.00020809 154945 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.9 77.409 550070000 76274000 47367000 50155000 0 0 54034000 63676000 0 49058000 20544000 70103000 55602000 63257000 10750 532 10072 94990;94991;94992;94993;94994;94995;94996;94997;94998;94999 120629;120630;120631;120632;120633;120634;120635;120636;120637;120638 120634 9 ELISLYPFLLPTSSSFTR Unmodified 2070.1037 0.10374338 3698 Q8WUH2 TGFBRAP1 Transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 166.01 166.01 2 0.0018501 171086 QUIQUE_C1368_190116_001 84.297 63.87 89280000 0 0 51007000 0 0 24294000 0 0 0 13978000 0 0 0 10751 3698 10073 95000;95001;95002 120639;120640;120641 120639 3 ELISNASDALDK Unmodified 1274.6354 0.63541065 1938;2079 P08238;P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1;F8W026 HSP90AB1;HSP90B1 Heat shock protein HSP 90-beta;Endoplasmin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.948 61.948 2 0.00016149 61999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.61 111.46 21525000000 1739600000 1620100000 1498900000 1939100000 2310300000 1938900000 2308200000 848560000 1061900000 998390000 2154500000 1212900000 1893700000 10752 1938;2079 10074 95003;95004;95005;95006;95007;95008;95009;95010;95011;95012;95013;95014;95015 120642;120643;120644;120645;120646;120647;120648;120649;120650;120651;120652;120653;120654;120655 120653 11 ELISNASDALDKIR Unmodified 1543.8206 0.82058566 1938;2079 P08238;P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1;F8W026 HSP90AB1;HSP90B1 Heat shock protein HSP 90-beta;Endoplasmin no no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 84.561 84.561 2;3 5.1434E-05 85882 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.8 87.599 3668700000 0 50164000 40508000 32326000 195990000 0 117140000 940840000 517820000 0 705600000 599490000 468830000 10753 1938;2079 10075 95016;95017;95018;95019;95020;95021;95022;95023;95024;95025;95026;95027;95028 120656;120657;120658;120659;120660;120661;120662;120663;120664;120665;120666;120667;120668;120669;120670;120671;120672;120673 120673 18 ELISNASDALEK Unmodified 1288.6511 0.65106071 2952 Q12931 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 62.852 62.852 2 5.0904E-05 62244 QUIQUE_C1368_190116_001 126.19 62.629 407130000 0 0 81467000 0 84875000 0 90178000 0 0 0 96258000 54348000 0 10754 2952 10076 95029;95030;95031;95032;95033;95034;95035;95036;95037 120674;120675;120676;120677;120678;120679;120680;120681;120682;120683 120675 8 ELISNSSDALDK Unmodified 1290.6303 0.63032527 1931 P07900;G3V2J8;Q14568 HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.423 48.423 2 4.491E-14 46128 QUIQUE_C1218_190116_001 163.64 74.089 36683000000 2587600000 3297200000 2483500000 3241500000 3541000000 3760700000 3875000000 1503700000 2298500000 1556400000 3281400000 2584800000 2671700000 10755 1931 10077 95038;95039;95040;95041;95042;95043;95044;95045;95046;95047;95048;95049;95050;95051 120684;120685;120686;120687;120688;120689;120690;120691;120692;120693;120694;120695;120696;120697;120698;120699;120700;120701;120702;120703;120704;120705;120706 120684 23 ELISNSSDALDKIR Unmodified 1559.8155 0.81550028 1931 P07900;G3V2J8 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 67.647 67.647 2;3 1.8092E-36 67635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.18 140.87 7834100000 0 0 100540000 60710000 381460000 0 0 1819800000 1422300000 0 1509200000 1354700000 1185300000 10756 1931 10078 95052;95053;95054;95055;95056;95057;95058;95059;95060;95061;95062;95063;95064;95065;95066 120707;120708;120709;120710;120711;120712;120713;120714;120715;120716;120717;120718;120719;120720;120721;120722 120713 16 ELITILEK Unmodified 957.57465 0.57464829 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.35 172.35 2 0.0030423 177562 QUIQUE_C1576_190116_001 133.6 64.217 96525000 0 0 0 0 16292000 6020000 11456000 12279000 12188000 0 14009000 8537800 15744000 10757 3090 10079 95067;95068;95069;95070;95071;95072;95073;95074 120723;120724;120725;120726;120727;120728;120729;120730 120725 8 ELIVDAEDTWIR Unmodified 1458.7355 0.73545904 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.4 122.4 2 4.1874E-14 126386 QUIQUE_C1277_190116_001 163.94 95.205 4792500000 332960000 395750000 334160000 184610000 339720000 228420000 413790000 525630000 435010000 162320000 486950000 589020000 364180000 10758 3753 10080 95075;95076;95077;95078;95079;95080;95081;95082;95083;95084;95085;95086;95087 120731;120732;120733;120734;120735;120736;120737;120738;120739;120740;120741;120742;120743;120744;120745;120746;120747;120748 120732 18 ELIYNQK Unmodified 906.48108 0.48108226 2803 P78324;Q5TFQ8;H3BRP9;H3BV43;H3BML4;H9KV29;O00241;Q9P1W8 SIRPA;SIRPB1;SIRPG Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3;Signal-regulatory protein beta-1;Signal-regulatory protein gamma yes no 0 0 0 1 24.948 24.948 2 0.049334 18457 QUIQUE_C1368_190116_001 75.131 50.775 385860000 0 0 385860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10759 2803 10081 95088 120749 120749 1 ELKELLQTELSGFLDAQK Unmodified 2061.0994 0.099386279 2211 P23297;Q5T7Y6 S100A1 Protein S100-A1;Protein S100 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 153.13 153.13 2;3 2.2661E-30 156258 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.48 133.19 357830000 0 0 0 0 0 0 0 119830000 63734000 0 38176000 81265000 54828000 10760 2211 10082 95089;95090;95091;95092;95093;95094 120750;120751;120752;120753;120754;120755 120751 6 ELKENGELLPILR Unmodified 1522.8719 0.87189295 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 90.232 90.232 3 0.00030748 91625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.538 54.155 35564000 0 0 0 0 0 0 0 17158000 18406000 0 0 0 0 10761 1676 10083 95095;95096;95097 120756;120757;120758 120756 3 ELKESAPFAVIGSNTVVEAK Unmodified 2088.1103 0.11028532 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;Q99719;E7EX32 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 1 1 92.596 92.596 3 0.0084472 93752 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.765 35.057 45062000 0 0 0 0 0 0 0 45062000 0 0 0 0 0 10762 1092;3970 10084 95098 120759 120759 1 ELKIDIIPNPQER Unmodified 1563.8621 0.86205654 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 1 1 1 1 85.212 85.212 3 0.018341 86229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.277 40.292 215730000 0 0 0 0 0 0 0 94927000 82246000 0 38558000 0 0 10763 1938 10085 95099;95100;95101 120760;120761;120762 120760 3 ELKPEQETTPR Unmodified 1326.6779 0.67794416 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 16.164 16.164 3 0.026022 8276 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.917 19.077 1338300000 250600000 268620000 331680000 0 0 225390000 0 0 0 0 0 0 262000000 10764 4172 10086 95102;95103;95104;95105;95106 120763;120764;120765;120766;120767 120767 1 ELKPTKPMQFLGDEETVR Unmodified 2117.0827 0.082690357 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 70.297 70.297 3 1.118E-05 70265 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.58 88.95 574920000 82060000 89872000 121090000 77795000 0 0 0 63998000 140110000 0 0 0 0 10765 2090 10087 95107;95108;95109;95110;95111;95112 120768;120769;120770;120771;120772;120773 120773 5 ELKPTKPMQFLGDEETVR Oxidation (M) 2133.0776 0.077604979 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 1 2 1 2 1 53.354 53.354 3 0.0012453 50794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.511 70.692 107690000 0 0 0 0 0 0 0 0 68408000 39282000 0 0 0 10766 2090 10087 95113;95114;95115;95116 120774;120775;120776;120777 120775 1429 4 ELLAFQTSEK Unmodified 1164.6027 0.60265396 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.212 67.212 2 0.018419 66639 QUIQUE_C1368_190116_001 75.378 32.132 110580000 0 35282000 0 0 0 0 33760000 0 0 0 0 41541000 0 10767 1414;3777 10088 95117;95118;95119;95120;95121 120778;120779;120780;120781;120782 120779 5 ELLALDSVDPEGR Unmodified 1412.7147 0.7147236 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.6 103.6 2 5.1128E-05 100944 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.83 65.021 887410000 71724000 61221000 46545000 90689000 93328000 105810000 49536000 47118000 57859000 32352000 61620000 49985000 119620000 10768 1753 10089 95122;95123;95124;95125;95126;95127;95128;95129;95130;95131;95132;95133;95134 120783;120784;120785;120786;120787;120788;120789;120790;120791;120792;120793;120794;120795;120796;120797;120798 120795 15 ELLAVACEQFLGK Unmodified 1476.7647 0.76465068 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.29 119.29 2 0.00014383 123193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.39 79.496 792510000 64986000 77816000 106990000 72549000 73343000 54274000 81389000 40164000 48346000 32622000 48094000 34131000 57798000 10769 3057 10090 95135;95136;95137;95138;95139;95140;95141;95142;95143;95144;95145;95146;95147 120799;120800;120801;120802;120803;120804;120805;120806;120807;120808;120809;120810;120811;120812;120813;120814 120810 15 ELLAVPDNYK Unmodified 1160.6077 0.60773933 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.884 75.884 1;2 6.2157E-14 75933 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.24 136.15 7931400000 0 0 0 1200200000 977080000 0 82681000 1571700000 1795400000 692210000 159650000 0 1452500000 10770 4639 10091 95148;95149;95150;95151;95152;95153;95154;95155 120815;120816;120817;120818;120819;120820;120821;120822;120823;120824;120825;120826;120827;120828;120829;120830;120831;120832;120833;120834;120835;120836;120837;120838;120839 120825 23 ELLCVSEK Unmodified 976.48993 0.48993238 2531 P49441;E7ET59;E7EUX4;E7ENF2;C9J173;B8ZZF6;C9J128;C9J2Z6;C9J2N5 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes no 0 0 0 1 40.416 40.416 2 0.032469 37088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.313 29.433 57906000 0 0 0 0 0 0 0 0 57906000 0 0 0 0 10771 2531 10092 95156 120840 120840 1 ELLDALPMDAYTHGCILHPELTTDSMIPK Unmodified 3280.5818 0.58180722 3907 Q96MZ0;H0Y6A7;H0UIB3;A0A087WWT8 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 156.13 156.13 3 0.066584 161080 QUIQUE_DMIX8_190116_001 16.666 6.6076 33098000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33098000 10772 3907 10093 95157 120841 120841 1 ELLDGGANPLQR Unmodified 1281.6677 0.66771383 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;F5H392;A0A2R8Y602;A0A2R8YDH5 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 1 77.261 77.261 2 0.0048686 73933 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.1 40.805 55792000 39409000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16383000 0 0 10773 474;436 10094 95158;95159;95160 120842;120843;120844 120843 2 ELLDLAMQNAWFR Unmodified 1605.7973 0.79734779 175 A0A0A0MSJ0;Q86XP3 DDX42 ATP-dependent RNA helicase DDX42 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.07 155.07 2 0.000383 160602 QUIQUE_C1368_190116_001 93.111 72.273 103400000 0 0 31124000 0 0 14470000 0 0 35219000 0 0 22587000 0 10774 175 10095 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120851;120852;120853;120854;120855;120856;120857;120858;120859;120860;120861;120862;120863;120864;120865;120866;120867;120868;120869;120870;120871;120872;120873;120874;120875;120876;120877;120878;120879;120880;120881;120882;120883;120884;120885;120886;120887;120888;120889;120890;120891;120892;120893;120894;120895;120896;120897;120898;120899;120900;120901;120902;120903;120904;120905;120906;120907;120908;120909;120910;120911;120912;120913;120914;120915;120916;120917;120918;120919;120920;120921;120922;120923;120924;120925;120926;120927;120928;120929;120930;120931;120932;120933;120934;120935;120936;120937;120938;120939;120940;120941 120912 69 ELLDLLYK Unmodified 1005.5746 0.57464829 986 F5GWI4;P00813 ADA Adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 123.61 123.61 2 0.054491 120230 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.549 8.8314 7256600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7256600 0 0 0 10776 986 10097 95216 120942 120942 1 ELLDSLPMDAYTHGCILHPELTVDSMIPAYATTR Unmodified 3829.8365 0.83651836 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 3 2 1 1 1 1 1 1 155.16 155.16 3;4 1.4903E-29 160719 QUIQUE_C1218_190116_001 89.129 83.473 1254700000 105060000 118170000 109530000 188660000 0 153960000 147880000 72585000 49208000 0 99558000 90596000 119440000 10777 3662 10098 95217;95218;95219;95220;95221;95222;95223;95224;95225;95226;95227;95228;95229;95230 120943;120944;120945;120946;120947;120948;120949;120950;120951;120952;120953;120954;120955;120956;120957;120958;120959 120944 16 ELLDTVNNVFK Unmodified 1290.682 0.68196691 4035 Q9BUL8;C9J363;C9J5C3;C9J6F3 PDCD10 Programmed cell death protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.14 115.14 2 0.00061313 117010 QUIQUE_C1563_190116_001 99.136 47.14 196750000 31334000 41695000 0 26591000 22770000 26045000 23660000 0 0 24650000 0 0 0 10778 4035 10099 95231;95232;95233;95234;95235;95236;95237;95238 120960;120961;120962;120963;120964;120965;120966;120967;120968 120966 8 ELLDTVTAPQK Unmodified 1213.6554 0.65541781 2403 P36955;I3L4Z0 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 61.307 61.307 2 0.019277 59738 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.461 35.974 24229000 0 0 0 0 0 0 0 24229000 0 0 0 0 0 10779 2403 10100 95239 120969 120969 1 ELLDVGNIGR Unmodified 1084.5877 0.58767259 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.44 86.44 2 0.0015964 88197 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 41.584 443770000 0 107810000 83538000 0 87159000 71161000 0 0 51960000 42150000 0 0 0 10780 4250 10101 95240;95241;95242;95243;95244;95245 120970;120971;120972;120973;120974;120975;120976;120977;120978 120971 9 ELLEAVDAR Unmodified 1014.5346 0.53457439 2290 P29590;H3BT57;H3BT29;H3BUJ5 PML Protein PML yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.965 56.965 2 0.0025126 55816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.429 6.5957 245340000 0 0 41284000 28165000 44383000 0 0 21473000 22425000 0 0 29575000 58036000 10781 2290 10102 95246;95247;95248;95249;95250;95251;95252 120979;120980;120981;120982;120983;120984;120985;120986;120987 120985 9 ELLEDYR Unmodified 936.45526 0.45526144 554 A6XGL0;A0A087WUA6 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 53.531 53.531 2 0.027096 51573 QUIQUE_C1368_190116_001 93.262 65.156 64272000 0 0 34409000 29863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10782 554 10103 95253;95254 120988;120989;120990 120989 3 ELLEEMEILK Unmodified 1245.6526 0.65264062 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.6 122.6 2 0.0027159 128250 QUIQUE_C1438_190116_001 88.37 37.31 237270000 38404000 0 0 37368000 31220000 22517000 38097000 21685000 0 0 23996000 0 23988000 10783 4631 10104 95255;95256;95257;95258;95259;95260;95261;95262;95263 120991;120992;120993;120994;120995;120996;120997;120998;120999;121000 120994 10 ELLEIVK Unmodified 842.51132 0.51131975 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.759 68.759 2 0.019707 65738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.89 21.601 1143200000 139680000 141240000 0 0 116060000 95332000 108910000 74936000 95963000 70024000 96453000 101300000 103260000 10784 2329 10105 95264;95265;95266;95267;95268;95269;95270;95271;95272;95273;95274 121001;121002;121003;121004;121005;121006;121007;121008;121009;121010;121011;121012;121013;121014 121011 14 ELLEIVKK Unmodified 970.60628 0.60628277 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 1 1 1 41.571 41.571 2 0.041354 38820 QUIQUE_C1218_190116_001 69.198 45.674 58619000 26080000 0 32539000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10785 2329 10106 95275;95276 121015;121016 121015 2 ELLELASR Unmodified 929.5182 0.51819605 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 65.062 65.062 2 0.039841 63843 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.181 28.577 39525000 0 0 0 0 0 0 0 39525000 0 0 0 0 0 10786 2 10107 95277;95278;95279 121017;121018;121019 121019 3 ELLELEALSMAVESTGTAK Unmodified 1991.0133 0.013273388 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 157.61 157.61 2;3 5.584E-39 161728 QUIQUE_C1277_190116_001 149.73 136.31 524900000 36196000 47265000 84918000 42951000 38962000 0 76490000 0 23348000 43140000 48453000 23709000 59471000 10787 3086 10108 95280;95281;95282;95283;95284;95285;95286;95287;95288;95289;95290;95291;95292;95293;95294;95295 121020;121021;121022;121023;121024;121025;121026;121027;121028;121029;121030;121031;121032;121033;121034;121035;121036;121037 121021 13 ELLELEALSMAVESTGTAK Oxidation (M) 2007.0082 0.0081880099 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 1 0 1 1 149.08 149.08 2;3 0.0085625 152625 QUIQUE_C1403_190116_001 73.834 60.065 35807000 0 0 0 35807000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10788 3086 10108 95296;95297 121038;121039 121039 2522 1 ELLELLGFK Unmodified 1060.6168 0.61684746 814 D6RCC4;D6RCC9;Q8NEC7 GSTCD Glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.64 146.64 2 0.0087437 152263 QUIQUE_C1218_190116_001 77.923 55.431 26160000 11457000 0 0 0 0 0 6524700 0 0 0 0 8178300 0 10789 814 10109 95298;95299;95300;95301;95302;95303 121040;121041;121042;121043;121044;121045 121040 6 ELLENPVQPINDMSYFGCLDSVMENSK Unmodified 3128.4141 0.41407319 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 163.33 163.33 3 0.0029898 168630 QUIQUE_C1218_190116_001 33.024 30.711 59282000 21798000 0 37484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10790 4600 10110 95304;95305 121046;121047 121046 1 ELLEPLFK Unmodified 987.56408 0.56408361 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 103.55 103.55 2 0.059533 108366 QUIQUE_C1438_190116_001 68.915 28.812 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10791 3838 10111 95306 121048 121048 1 ELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSR Unmodified 2570.403 0.40296186 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 178.11 178.11 3 7.3577E-05 181488 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.182 40.988 39618000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13618000 26000000 0 10792 2447 10112 95307;95308 121049;121050 121050 2 ELLEQNPGK Unmodified 1026.5346 0.53457439 3240 Q4KMP7;H3BSE1 TBC1D10B TBC1 domain family member 10B yes no 0 0 0 1 1 25.899 25.899 2 0.027843 19412 QUIQUE_C1368_190116_001 75.109 40.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10793 3240 10113 95309;95310 121051;121052 121052 2 ELLEQVAEFEK Unmodified 1333.6765 0.67654718 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.52 106.52 2 0.0004883 109910 QUIQUE_C1277_190116_001 125.71 76.295 996290000 0 82069000 98825000 80021000 97829000 83692000 110080000 0 103460000 34367000 98781000 94431000 112730000 10794 4249 10114 95311;95312;95313;95314;95315;95316;95317;95318;95319;95320;95321 121053;121054;121055;121056;121057;121058;121059;121060;121061;121062;121063 121053 10 ELLESYIDGR Unmodified 1193.5928 0.59281755 1792 P00734;E9PIT3 F2 Prothrombin;Activation peptide fragment 1;Activation peptide fragment 2;Thrombin light chain;Thrombin heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 93.382 93.382 2 0.029295 91388 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.378 57.054 22700000 0 0 22700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10795 1792 10115 95322;95323;95324 121064;121065;121066 121065 3 ELLETTCR Unmodified 1020.491 0.49099502 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.081 31.081 2 0.007181 25440 QUIQUE_C1368_190116_001 98.997 57.344 1098400000 113700000 113350000 123850000 102920000 95652000 0 0 0 121280000 45353000 127850000 121680000 132800000 10796 4296 10116 95325;95326;95327;95328;95329;95330;95331;95332;95333;95334 121067;121068;121069;121070;121071;121072;121073;121074;121075;121076 121069 10 ELLEVIGK Unmodified 899.53278 0.53278348 3531 Q8IV38;G3V0G5;F8WB95 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 75.958 75.958 2 0.028944 77131 QUIQUE_C1218_190116_001 68.312 22.43 59106000 38209000 0 0 0 0 20896000 0 0 0 0 0 0 0 10797 3531 10117 95335;95336 121077;121078 121077 2 ELLEYDLQQR Unmodified 1305.6565 0.65648044 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 1 81.03 81.03 2 0.027525 81696 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.621 29.928 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10798 3312 10118 95337;95338 121079;121080 121079 2 ELLFHHEWVVK Unmodified 1435.7612 0.76122028 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 71.383 71.383 3 0.0069309 68233 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.247 33.979 122170000 0 0 0 86518000 0 0 0 0 0 35652000 0 0 0 10799 3772 10119 95339;95340 121081;121082;121083;121084 121084 4 ELLFHPALFEVPSLK Unmodified 1738.9658 0.96579333 4439 Q9UHY1;F8W6G1 NRBP1 Nuclear receptor-binding protein yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 137.96 137.96 2;3 0.00042139 142276 QUIQUE_C1277_190116_001 101.35 74.563 544460000 0 71471000 46336000 53455000 0 48717000 43942000 37887000 36758000 25368000 43615000 50920000 85995000 10800 4439 10120 95341;95342;95343;95344;95345;95346;95347;95348;95349;95350;95351;95352;95353 121085;121086;121087;121088;121089;121090;121091;121092;121093;121094;121095;121096;121097 121086 12 ELLFNEVVIMR Unmodified 1361.7377 0.73770765 4381 Q9P286;O96013;Q9NQU5 PAK7;PAK4;PAK6 Serine/threonine-protein kinase PAK 7;Serine/threonine-protein kinase PAK 4;Serine/threonine-protein kinase PAK 6 yes no 0 0 0 1 1 1 133.96 133.96 2 0.0053569 140564 QUIQUE_C1438_190116_001 90.629 54.685 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10801 4381 10121 95354;95355;95356 121098;121099;121100 121098 3 ELLGPDFGYVTR Unmodified 1365.6929 0.69286595 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.74 109.74 2 8.7259E-11 113107 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.36 119.45 16566000000 1117600000 660570000 1334200000 1502000000 1071000000 1163500000 1594500000 1175200000 1577700000 854340000 1693500000 1243800000 1577800000 10802 4560 10122 95357;95358;95359;95360;95361;95362;95363;95364;95365;95366;95367;95368;95369;95370 121101;121102;121103;121104;121105;121106;121107;121108;121109;121110;121111;121112;121113;121114;121115;121116;121117;121118;121119;121120;121121;121122;121123;121124;121125;121126;121127;121128 121117 28 ELLGQGIDYEK Unmodified 1263.6347 0.63468237 4115 Q9H0A8;H3BM91;H3BQF2;H3BRX0 COMMD4 COMM domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.744 71.744 2 0.0010624 72454 QUIQUE_C1576_190116_001 90.696 50.651 208960000 0 53303000 0 0 0 47889000 51073000 56697000 0 0 0 0 0 10803 4115 10123 95371;95372;95373;95374 121129;121130;121131;121132 121131 3 ELLGQGLLLR Unmodified 1110.6761 0.67609367 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 110.79 110.79 2 0.031866 107294 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.878 25.66 33713000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33713000 0 0 0 10804 645 10124 95375 121133 121133 1 ELLGWVSTLAR Unmodified 1243.6925 0.69247202 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 134.36 134.36 2 0.012341 139189 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.518 28.584 133700000 0 0 0 0 0 0 0 23769000 33233000 0 50025000 0 26670000 10805 1187 10125 95376;95377;95378;95379;95380 121134;121135;121136;121137;121138 121136 5 ELLIFLAQYLCNEYQK Unmodified 2044.0339 0.03394925 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 2 1 1 168.54 168.54 2;3 4.0955E-07 170598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.38 99.867 41099000 0 0 0 0 0 0 0 17963000 0 0 23136000 0 0 10806 2113 10126 95381;95382;95383;95384 121139;121140;121141;121142 121140 4 ELLIFNK Unmodified 875.51165 0.5116541 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.591 79.591 2 0.022786 80556 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.47 21.638 446760000 46194000 0 57810000 38492000 38968000 39592000 0 29508000 37405000 21201000 56168000 42622000 38800000 10807 1974 10127 95385;95386;95387;95388;95389;95390;95391;95392;95393;95394;95395 121143;121144;121145;121146;121147;121148;121149;121150;121151;121152;121153;121154 121150 12 ELLIIGGVAAR Unmodified 1110.6761 0.67609367 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 93.709 93.709 2 5.4938E-05 96428 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.8 86.67 1164400000 97198000 135100000 95038000 76831000 81127000 71070000 99145000 89980000 77242000 63534000 99052000 89406000 89687000 10808 3726 10128 95396;95397;95398;95399;95400;95401;95402;95403;95404;95405;95406;95407;95408;95409;95410;95411 121155;121156;121157;121158;121159;121160;121161;121162;121163;121164;121165;121166;121167;121168;121169;121170;121171;121172;121173;121174;121175;121176;121177;121178;121179;121180;121181;121182 121174 28 ELLIQFYK Unmodified 1052.5906 0.59063271 4482 Q9UL18;Q5TA58;Q9UKV8;Q9HCK5 AGO1;AGO2;AGO4 Protein argonaute-1;Protein argonaute;Protein argonaute-2;Protein argonaute-4 no no 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Q09666;E9PJZ0;E9PKR9;E9PJC6;E9PLK4;E9PQE3 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 109.83 109.83 2;3 1.2585E-30 113409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.65 103.42 917690000 0 0 0 36684000 0 0 73423000 282730000 191240000 0 173590000 160030000 0 10812 2935 10132 95426;95427;95428;95429;95430;95431;95432 121198;121199;121200;121201;121202;121203;121204;121205 121202 8 ELLLQPVTISR Unmodified 1267.75 0.7499869 1063 F8WCF6;P59998;F8WDD7;H7C0A3;A0A0A6YYG9 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.639 97.639 2 0.00049749 101490 QUIQUE_C1438_190116_001 127.94 102.81 6763700000 516410000 560090000 557380000 498830000 510050000 481590000 564240000 520480000 483080000 232790000 666930000 557530000 614330000 10813 1063 10133 95433;95434;95435;95436;95437;95438;95439;95440;95441;95442;95443;95444;95445 121206;121207;121208;121209;121210;121211;121212;121213;121214;121215;121216;121217;121218;121219;121220;121221;121222;121223 121212 17 ELLLTGPGLEER Unmodified 1325.7191 0.7190807 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.279 92.279 2 0.00045214 93983 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.68 68.335 1849100000 157590000 180490000 206220000 139560000 121840000 146390000 152590000 133070000 171520000 76438000 0 176440000 186970000 10814 3576 10134 95446;95447;95448;95449;95450;95451;95452;95453;95454;95455;95456;95457;95458;95459;95460 121224;121225;121226;121227;121228;121229;121230;121231;121232;121233;121234;121235;121236;121237;121238;121239 121238 13 ELLLYGR Unmodified 862.49125 0.49125301 511 X6RGP5;A0A3F2YNX0;A0A3F2YNZ0;F1T0I1;O15027;A0A0C4DH09 SEC16A Protein transport protein Sec16A yes no 0 0 0 1 1 65.897 65.897 2 0.025482 65041 QUIQUE_C1277_190116_001 95.9 39.734 26734000 0 14478000 0 0 0 0 0 12255000 0 0 0 0 0 10815 511 10135 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ELLQESALIR Unmodified 1170.6608 0.66083754 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.692 82.692 2 0.0001922 83863 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.72 79.371 1272600000 136170000 0 150850000 110560000 134180000 110550000 146820000 77057000 0 43060000 138460000 94767000 130180000 10823 2952 10142 95510;95511;95512;95513;95514;95515;95516;95517;95518;95519;95520 121315;121316;121317;121318;121319;121320;121321;121322;121323;121324;121325 121324 10 ELLQHPFLK Unmodified 1123.639 0.63897988 2974;120 A0A087X294;O75914;Q13177 PAK3;PAK2 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3;Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 55.992 55.992 2;3 0.0045916 55273 QUIQUE_C1438_190116_001 55.112 31.792 1074800000 80355000 84367000 123540000 80285000 78440000 76206000 77085000 101230000 100550000 28396000 70127000 78976000 95247000 10824 120;2974 10143 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95623;95624;95625;95626;95627;95628;95629;95630;95631;95632;95633;95634;95635;95636;95637 121463;121464;121465;121466;121467;121468;121469;121470;121471;121472;121473;121474;121475;121476;121477;121478;121479 121465 16 ELLSNVDEGIYQLEK Unmodified 1748.8832 0.88324549 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 125.07 125.07 2 0.0036087 129645 QUIQUE_C1218_190116_001 81.92 66.582 21855000 21855000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10835 3773 10154 95638 121480 121480 0 ELLSNWYHFLVTR Unmodified 1676.8675 0.86747627 1287 J3QL54;J3KT10;Q9BW27;J3KTC7;J3QLV0;J3QLD4 NUP85 Nuclear pore complex protein Nup85 yes no 0 0 0 1 147.53 147.53 3 0.0045358 152631 QUIQUE_C1218_190116_001 61.212 42.481 7742200 7742200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10836 1287 10155 95639 121481 121481 1 ELLTEFGYK Unmodified 1098.5597 0.55972651 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 92.325 92.325 1;2 3.6231E-05 94359 QUIQUE_C1277_190116_001 175.44 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Unmodified 3689.8862 0.88622897 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 2 1 1 1 157.81 157.81 3;4 2.5501E-86 160418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.25 146.06 2207300000 0 0 0 0 0 0 163730000 393970000 350680000 0 567690000 303520000 427750000 10839 2529 10158 95669;95670;95671;95672;95673;95674;95675 121520;121521;121522;121523;121524;121525;121526;121527;121528 121523 8 ELLTENHQLK Unmodified 1223.651 0.65100113 3825 Q96CV9;A0A087X2G2;X6RKL2 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27 27 2;3 0.00013245 20867 QUIQUE_C1368_190116_001 121.53 83.116 420630000 0 40964000 52738000 59176000 39889000 39814000 51316000 0 0 0 42468000 40514000 53751000 10840 3825 10159 95676;95677;95678;95679;95680;95681;95682;95683;95684;95685;95686 121529;121530;121531;121532;121533;121534;121535;121536;121537;121538;121539;121540 121530 9 ELLTLIR Unmodified 856.5382 0.53820321 3107 Q15067;K7ESC7;K7ENF1 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 1 85.586 85.586 2 0.050661 86177 QUIQUE_C1563_190116_001 74.415 7.3804 53970000 0 0 0 0 0 53970000 0 0 0 0 0 0 0 10841 3107 10160 95687 121541 121541 1 ELLTSFGPLK Unmodified 1103.6227 0.62266112 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.79 102.79 2 0.0010709 105578 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.89 81.081 1076200000 121520000 134640000 0 97035000 97511000 112490000 0 48236000 75230000 60283000 122790000 97466000 109020000 10842 1338 10161 95688;95689;95690;95691;95692;95693;95694;95695;95696;95697;95698 121542;121543;121544;121545;121546;121547;121548;121549;121550;121551;121552;121553;121554;121555;121556 121556 14 ELLTTMGDR Unmodified 1034.5066 0.50664508 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.97 50.97 2 0.0012706 48331 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.25 51.673 2154800000 231640000 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10848 2113 10166 95726 121589;121590 121589 2 ELLVLDPEAFTILAK Unmodified 1670.9495 0.94947456 3649 Q8NFJ9;E9PMB7 BBS1 Bardet-Biedl syndrome 1 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.63 163.63 2 0.00025102 168258 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.21 49.462 203930000 0 0 0 0 33263000 20446000 45186000 18964000 23918000 7550200 0 30778000 23820000 10849 3649 10167 95727;95728;95729;95730;95731;95732;95733;95734 121591;121592;121593;121594;121595;121596;121597;121598;121599;121600 121597 10 ELLVPLTSSMYVPGK Unmodified 1632.8797 0.87968044 3955 Q99471 PFDN5 Prefoldin subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.09 126.09 2 0.00053178 129068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.927 52.838 692920000 95271000 94599000 78693000 46726000 57048000 53942000 64237000 55166000 0 0 65234000 0 82009000 10850 3955 10168 95735;95736;95737;95738;95739;95740;95741;95742;95743;95744 121601;121602;121603;121604;121605;121606;121607;121608;121609;121610;121611 121609 11 ELLYFLDSCEPEFK Unmodified 1788.828 0.8280388 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.22 144.22 2 1.8439E-28 148464 QUIQUE_C1277_190116_001 169.65 154.45 1141700000 105650000 114790000 137150000 93753000 79918000 66879000 81433000 69315000 75225000 28631000 98735000 102590000 87636000 10851 1548 10169 95745;95746;95747;95748;95749;95750;95751;95752;95753;95754;95755;95756;95757 121612;121613;121614;121615;121616;121617;121618;121619;121620;121621;121622;121623;121624;121625;121626;121627 121613 16 ELLYGGTSPTAETILK Unmodified 1691.8982 0.89816728 104 A0A087X1A5;Q5JW30;O95793 STAU1 Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 104.52 104.52 2 0.0014326 107212 QUIQUE_C1403_190116_001 64.64 51.048 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10852 104 10170 95758;95759;95760 121628;121629;121630 121628 3 ELMAWNQAENRR Oxidation (M) 1532.7154 0.71540908 4077 Q9BYN8 MRPS26 28S ribosomal protein S26, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 19.509 19.509 2 0.006098 12004 QUIQUE_C1277_190116_001 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121648;121649;121650;121651 121651 2958 4 ELMENGPVQALMEVHEDFFLYK Unmodified 2638.2447 0.24474666 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 0 1 1 1 160.22 160.22 3 0.013029 167772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.333 17.701 137030000 0 36689000 0 0 0 0 0 0 49201000 0 51137000 0 0 10856 4100 10173 95779;95780;95781 121652;121653;121654 121654 2 ELMENGPVQALMEVHEDFFLYK Oxidation (M) 2654.2397 0.23966128 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 1 0 1 154.65 154.65 3 0.00030908 158987 QUIQUE_C1277_190116_001 55.972 49.174 39520000 0 39520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10857 4100 10173 95782 121655 121655 2855 0 ELMGEEILGASLSAPLTSYK Unmodified 2108.0711 0.071122618 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 151.46 151.46 2;3 1.2473E-06 156910 QUIQUE_C1368_190116_001 94.023 88.744 58481000 0 0 47360000 0 0 11121000 0 0 0 0 0 0 0 10858 4389 10174 95783;95784 121656;121657 121656 2 ELMIPGGAK Oxidation (M) 930.48445 0.48445308 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 41.576 41.576 2 0.013511 36834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.789 45.993 415090000 0 0 0 64882000 0 0 54875000 0 0 69206000 143330000 82802000 0 10859 3984 10175 95785;95786;95787;95788;95789 121658;121659;121660;121661;121662;121663;121664 121660 2821 7 ELMQWYK Unmodified 996.47389 0.47388839 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.89 77.89 2 0.033196 78677 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.591 51.57 347100000 64689000 0 0 0 42080000 0 0 39044000 37445000 0 60752000 45897000 57196000 10860 1148 10176 95790;95791;95792;95793;95794;95795;95796 121665;121666;121667;121668;121669;121670;121671 121668 7 ELMVQLEGLMK Unmodified 1289.6723 0.6723302 4608;1367 M0QZ28;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.92 129.92 2 0.00043691 134256 QUIQUE_C1277_190116_001 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121740;121741;121742;121743;121744;121745 121740 6 ELNHMLSDTGNRK Unmodified 1513.7307 0.73072479 3855 Q96FQ6 S100A16 Protein S100-A16 yes yes 0 0 1 1 18.724 18.724 3 0.048842 11356 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.874 21.878 51868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51868000 10872 3855 10187 95861 121746 121746 1 ELNHYLEAEK Unmodified 1244.6037 0.60371659 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 32.604 32.604 2 0.010641 27409 QUIQUE_C1563_190116_001 68.485 49.131 16978000 0 0 0 0 0 16978000 0 0 0 0 0 0 0 10873 3125 10188 95862 121747 121747 1 ELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGR Unmodified 2835.4437 0.44365748 2717 P61201;B4DIH5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 173.47 173.47 3 3.1434E-37 177191 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.08 131.71 374890000 0 0 0 0 0 0 0 0 42336000 0 236970000 43375000 52207000 10874 2717 10189 95863;95864;95865;95866 121748;121749;121750;121751;121752 121751 5 ELNIQVDDSYAR Unmodified 1421.6787 0.67867245 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.807 75.807 2 0.00051235 75645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.13 74.337 812730000 0 0 108190000 0 70379000 0 89155000 131370000 0 113280000 119530000 75489000 105320000 10875 2578 10190 95867;95868;95869;95870;95871;95872;95873;95874;95875 121753;121754;121755;121756;121757;121758;121759;121760;121761;121762 121758 8 ELNITAAK Unmodified 858.48108 0.48108226 2738 P62081;B5MCP9;A0A2R8Y623 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.856 27.856 2 0.021461 22465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.109 25.751 1252400000 129820000 114100000 130420000 0 98216000 155050000 0 0 145460000 0 160560000 159690000 159090000 10876 2738 10191 95876;95877;95878;95879;95880;95881;95882;95883;95884 121763;121764;121765;121766;121767;121768;121769;121770;121771;121772 121768 10 ELNKPVQGPLAHR Unmodified 1457.8103 0.81029574 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 19.426 19.426 4 0.0014835 12010 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.7 47.498 76799000 10110000 0 0 0 0 0 0 0 19545000 0 28555000 18589000 0 10877 1416 10192 95885;95886;95887;95888 121773;121774;121775;121776 121775 3 ELNLILTTGGTGFAPR Unmodified 1658.8992 0.89917033 998 F5H039;Q9NQX3;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 123.29 123.29 2 2.4727E-09 126084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.12 75.835 544420000 77433000 93438000 0 61720000 0 75851000 0 29790000 69743000 30565000 0 49082000 56804000 10878 998 10193 95889;95890;95891;95892;95893;95894;95895;95896;95897;95898 121777;121778;121779;121780;121781;121782;121783;121784;121785;121786 121781 8 ELNLVLSVR Unmodified 1041.6182 0.61824444 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 93.752 93.752 2 0.020343 90601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.431 57.327 35100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17275000 17825000 0 0 10879 2524 10194 95899;95900;95901;95902;95903;95904;95905;95906 121787;121788;121789;121790;121791;121792;121793;121794 121791 7 ELNMIIMLPDETTDLR Oxidation (M) 1918.938 0.93799995 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 137.71 137.71 2 1.7948E-13 135932 QUIQUE_DMIX4_190116_001 137.59 103.7 228050000 40904000 0 0 26629000 30546000 25059000 0 44157000 0 16506000 0 0 44253000 10880 2371 10195 95907;95908;95909;95910;95911;95912;95913;95914 121795;121796;121797;121798;121799;121800;121801;121802 121800 1769;1770 8 ELNMIIMLPDETTDLR Unmodified 1902.9431 0.94308533 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 2 147.8 147.8 2;3 1.1094E-36 152681 QUIQUE_DMIX3_190116_001 219.43 173.52 1673600000 0 0 0 0 178290000 117500000 0 261740000 293310000 69004000 276060000 235330000 242320000 10881 2371 10195 95915;95916;95917;95918;95919;95920;95921;95922;95923;95924;95925;95926;95927;95928;95929 121803;121804;121805;121806;121807;121808;121809;121810;121811;121812;121813;121814;121815;121816;121817;121818 121812 15 ELNNEILGPVVQFLGVPYATPPLGAR Unmodified 2763.496 0.49595105 3654 Q8NFZ4 NLGN2 Neuroligin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 170.04 170.04 3 1.7645E-09 171747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.445 74.17 62113000 0 21556000 0 0 22646000 0 0 17910000 0 0 0 0 0 10882 3654 10196 95930;95931;95932 121819;121820;121821 121821 2 ELNNTCEPVVTQPK Unmodified 1627.7876 0.78757097 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.08 41.08 2 0.00099911 37377 QUIQUE_C1403_190116_001 80.979 61.626 257390000 82166000 64815000 44951000 0 0 65458000 0 0 0 0 0 0 0 10883 180;3738 10197 95933;95934;95935;95936;95937;95938 121822;121823;121824;121825;121826;121827 121825 6 ELNNTCEPVVTQPKPK Unmodified 1852.9353 0.93529784 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.927 29.927 3 0.00022412 24418 QUIQUE_C1563_190116_001 66.965 49.264 531820000 65937000 0 47442000 63676000 71391000 48260000 85830000 0 0 0 62061000 31042000 56185000 10884 180;3738 10198 95939;95940;95941;95942;95943;95944;95945;95946;95947 121828;121829;121830;121831;121832;121833;121834;121835;121836 121832 9 ELNQLLGPK Unmodified 1010.576 0.57604528 3866 Q96HD9 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.713 55.713 2 0.0090517 55139 QUIQUE_C1218_190116_001 77.058 45.829 246740000 45127000 33369000 34212000 0 29238000 20206000 27185000 0 0 0 0 0 57401000 10885 3866 10199 95948;95949;95950;95951;95952;95953;95954;95955 121837;121838;121839;121840;121841;121842;121843;121844 121837 8 ELNSEVGSETESNVDSEFAR Unmodified 2197.9611 0.96111448 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.944 85.944 2 1.6353E-243 87051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 277.52 255.65 316210000 0 0 40957000 51209000 0 43030000 37189000 44608000 44634000 0 0 0 54586000 10886 1367;4608 10200 95956;95957;95958;95959;95960;95961;95962 121845;121846;121847;121848;121849;121850;121851 121849 7 ELNVMFIETSAK Oxidation (M) 1396.6908 0.69081704 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.692 89.692 2 0.0011307 91093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.687 62.348 535880000 51055000 60831000 72911000 46668000 60757000 33497000 24508000 0 37419000 53355000 0 33933000 60943000 10887 2167 10201 95963;95964;95965;95966;95967;95968;95969;95970;95971;95972;95973 121852;121853;121854;121855;121856;121857;121858;121859;121860;121861;121862;121863;121864;121865 121865 1511 13 ELNVMFIETSAK Unmodified 1380.6959 0.69590241 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 0 0 1 1 106.36 106.36 2 6.9971E-07 108966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.08 94.261 432600000 0 0 0 0 0 0 0 170940000 261660000 0 0 0 0 10888 2167 10201 95974;95975 121866;121867 121866 2 ELNVSFINEK Unmodified 1191.6136 0.61355299 717 C9JEJ2;P49585;C9J050;Q9Y5K3 PCYT1A;PCYT1B Choline-phosphate cytidylyltransferase A;Choline-phosphate cytidylyltransferase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.05 80.05 2 0.018983 81029 QUIQUE_C1403_190116_001 74.269 46.051 79574000 0 0 0 0 38592000 40982000 0 0 0 0 0 0 0 10889 717 10202 95976;95977;95978;95979 121868;121869;121870;121871 121868 4 ELNWDDYK Unmodified 1081.4716 0.47163978 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.549 73.549 2 0.022385 75117 QUIQUE_C1218_190116_001 74.255 53.773 389550000 45877000 42262000 36266000 39720000 22568000 32475000 36945000 0 28199000 0 39468000 29401000 36365000 10890 2463 10203 95980;95981;95982;95983;95984;95985;95986;95987;95988;95989;95990 121872;121873;121874;121875;121876;121877;121878;121879;121880;121881;121882 121872 11 ELNWDDYKK Unmodified 1209.5666 0.5666028 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 47.507 47.507 2;3 0.0030431 43768 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.347 54.422 882780000 42614000 53711000 70990000 55182000 134630000 65660000 0 0 67110000 29847000 222900000 73137000 66997000 10891 2463 10204 95991;95992;95993;95994;95995;95996;95997;95998;95999;96000;96001;96002;96003 121883;121884;121885;121886;121887;121888;121889;121890;121891;121892;121893;121894;121895;121896;121897 121892 15 ELNYFAK Unmodified 883.44397 0.44396847 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.745 47.745 2 0.023536 46048 QUIQUE_C1218_190116_001 99.919 45.394 24826000000 1858900000 2001600000 2249100000 1877600000 1544400000 1429100000 1908000000 1954600000 1980200000 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ELPAWVSFPDVEK Unmodified 1515.7609 0.76094551 4014 Q9BSJ8;F8VZB1 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 136.29 136.29 2 0.011349 139638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.014 60.743 191760000 0 0 0 0 64246000 0 0 0 53896000 0 0 0 73619000 10894 4014 10207 96038;96039;96040;96041 121945;121946;121947;121948;121949 121946 5 ELPDLEDLMK Unmodified 1201.59 0.59004036 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.57 133.57 2 0.00097688 138338 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.05 79.396 2070900000 185700000 160550000 178000000 143960000 170950000 141920000 146800000 142120000 178850000 58463000 227350000 154330000 181880000 10895 4220 10208 96042;96043;96044;96045;96046;96047;96048;96049;96050;96051;96052;96053;96054 121950;121951;121952;121953;121954;121955;121956;121957;121958;121959;121960;121961;121962;121963;121964;121965;121966;121967;121968 121963 18 ELPDLEDLMKR Oxidation (M) 1373.6861 0.68606601 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 1 1 1 80.454 80.454 3 0.019233 80705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.614 28.749 33134000 0 0 0 0 0 0 0 33134000 0 0 0 0 0 10896 4220 10209 96055 121969 121969 1 ELPDLEDLMKR Unmodified 1357.6912 0.69115139 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 112.38 112.38 3 0.00012747 114634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.82 86.489 55721000 0 0 0 0 0 0 0 55721000 0 0 0 0 0 10897 4220 10209 96056;96057;96058;96059;96060 121970;121971;121972;121973;121974 121970 5 ELPELLQR Unmodified 996.5604 0.56039521 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 76.001 76.001 2 0.003959 77897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.9 61.312 428390000 0 0 137740000 0 0 0 137050000 0 0 0 153600000 0 0 10898 3700 10210 96061;96062;96063 121975;121976;121977 121977 1 ELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAK Unmodified 3008.4695 0.4695211 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.13 169.13 3 3.3592E-08 173153 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.812 52.846 201860000 0 31329000 22488000 0 30149000 0 0 0 36363000 0 47049000 34481000 0 10899 2020 10211 96064;96065;96066;96067;96068;96069 121978;121979;121980;121981;121982;121983 121983 6 ELPEPLLTDR Unmodified 1181.6292 0.62920306 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.768 81.768 2 0.0040375 84081 QUIQUE_C1438_190116_001 82.287 56.55 1263700000 114680000 129830000 116700000 103240000 89876000 0 120770000 91461000 97247000 43935000 137760000 115210000 103000000 10900 366 10212 96070;96071;96072;96073;96074;96075;96076;96077;96078;96079;96080;96081 121984;121985;121986;121987;121988;121989;121990;121991;121992;121993;121994;121995;121996;121997;121998 121990 14 ELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQR Unmodified 3040.5546 0.55458814 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 168.37 168.37 3 3.6493E-20 172879 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.57 102.34 1227900000 0 0 0 0 0 0 83184000 76231000 154020000 0 361460000 254920000 298040000 10901 2912 10213 96082;96083;96084;96085;96086;96087 121999;122000;122001;122002;122003;122004 122001 6 ELPEVTNSVFHEINMWVSQR Unmodified 2414.1689 0.1688796 217 A0A0C4DFN3;Q99685;E7EWX8;H7C599;H7C5K5;H7C4E0 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 157.99 157.99 3 2.2599E-23 161966 QUIQUE_C1277_190116_001 120.11 96.939 278800000 105070000 0 0 0 0 44601000 0 0 61109000 0 0 0 68016000 10902 217 10214 96088;96089;96090;96091;96092;96093 122005;122006;122007;122008;122009;122010 122006 5 ELPGFVNYR Unmodified 1093.5556 0.55564418 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.703 81.703 2 0.0023496 82872 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.262 58.382 788090000 0 0 290140000 0 0 0 0 87545000 77783000 0 332630000 0 0 10903 2168 10215 96094;96095;96096;96097;96098;96099;96100 122011;122012;122013;122014;122015;122016;122017 122014 7 ELPGHTGYLSCCR Unmodified 1548.6813 0.68133176 2769;4207 P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1;Q9HAV0;H7C5J5 GNB2;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 39.071 39.071 2;3 2.5878E-23 36191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.65 154.12 13007000000 912240000 1408500000 1353500000 1181200000 935370000 1118800000 1584000000 738260000 620440000 448160000 626700000 966190000 1113100000 10904 2769;4207 10216 96101;96102;96103;96104;96105;96106;96107;96108;96109;96110;96111;96112;96113;96114;96115;96116;96117;96118;96119;96120;96121;96122;96123;96124;96125;96126;96127 122018;122019;122020;122021;122022;122023;122024;122025;122026;122027;122028;122029;122030;122031;122032;122033;122034;122035;122036;122037;122038;122039;122040;122041;122042;122043;122044;122045;122046;122047;122048;122049;122050;122051;122052;122053;122054;122055;122056;122057;122058;122059;122060;122061;122062;122063;122064;122065;122066;122067;122068;122069;122070;122071;122072;122073;122074;122075;122076;122077 122057 60 ELPLSPAFFGEDGIFR Unmodified 1793.8988 0.89883598 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 158.86 158.86 2;3 9.409E-10 164351 QUIQUE_C1218_190116_001 129.34 118.44 2594800000 11355000 197740000 8625900 211740000 201350000 301910000 257350000 132520000 277730000 96065000 344370000 267310000 286680000 10905 3803 10217 96128;96129;96130;96131;96132;96133;96134;96135;96136;96137;96138;96139;96140;96141;96142;96143;96144;96145;96146;96147;96148 122078;122079;122080;122081;122082;122083;122084;122085;122086;122087;122088;122089;122090;122091;122092;122093;122094;122095;122096;122097;122098;122099;122100;122101;122102;122103;122104;122105 122079 28 ELPLYCSGGLR Unmodified 1263.6282 0.6281572 3068 Q14457 BECN1 Beclin-1 yes yes 0 0 0 1 1 77.073 77.073 2 0.052806 78177 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.368 24.068 74008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23589000 50419000 10906 3068 10218 96149;96150 122106;122107 122106 2 ELPNIEER Unmodified 998.50327 0.50327426 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.607 45.607 2 0.018262 42019 QUIQUE_C1563_190116_001 80.229 40.126 1836600000 0 0 0 345200000 323950000 381740000 0 187000000 208830000 108290000 0 0 281560000 10907 2037 10219 96151;96152;96153;96154;96155;96156;96157 122108;122109;122110;122111;122112;122113;122114;122115 122111 8 ELPPDQAEYCIAR Unmodified 1560.7242 0.72424243 1544;2047;1242;1228 H7C144;H9KV75;H0YJW3;O43707;F5GXS2;P12814 ACTN4;ACTN1 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S100-A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.357 80.357 2 0.016964 81539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.305 35.539 653670000 0 0 0 0 0 0 0 125510000 176790000 21504000 105500000 93006000 131360000 10914 2251 10226 96237;96238;96239;96240;96241;96242 122206;122207;122208;122209;122210;122211;122212;122213;122214;122215 122208 10 ELPSTFGQLSALK Unmodified 1389.7504 0.75038083 495 H3BSW0;A0A3B3ISV5;Q8N9N7 LRRC57 Leucine-rich repeat-containing protein 57 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 107.8 107.8 2 0.00089638 112493 QUIQUE_C1438_190116_001 83.397 59.546 652100000 85650000 0 0 0 108730000 0 115390000 0 95686000 0 122680000 123960000 0 10915 495 10227 96243;96244;96245;96246;96247;96248;96249 122216;122217;122218;122219;122220;122221;122222 122217 5 ELPTAFDYVEFTR Unmodified 1586.7617 0.76167379 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 135.15 135.15 2;3 0.0003774 141088 QUIQUE_C1218_190116_001 97.734 88.079 36787000000 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122255;122256;122257;122258;122259;122260;122261;122262;122263;122264;122265;122266;122267;122268;122269 122265 15 ELPVNAQNYVR Unmodified 1301.6728 0.67279921 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 65.31 65.31 2 0.00022235 66298 QUIQUE_C1438_190116_001 122.52 96.132 419590000 0 0 76880000 80483000 62092000 0 95038000 0 0 0 0 0 105100000 10918 2320 10230 96284;96285;96286;96287;96288 122270;122271;122272;122273;122274 122272 3 ELQAGTPLSLFGDTYETQVIAYGQGSSEGLR Unmodified 3286.5994 0.59936608 2488 P46952 HAAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase yes yes 0 0 0 1 159.54 159.54 3 0.00012742 154267 QUIQUE_DMIX4_190116_001 38.012 31.785 10423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10423000 0 0 0 10919 2488 10231 96289 122275 122275 1 ELQAHGADELLK Unmodified 1322.683 0.68302954 1486 O15144;C9JTV5;G5E9J0 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 44.123 44.123 2;3 3.5433E-45 40763 QUIQUE_C1403_190116_001 196.16 117.39 2322100000 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gamma 1 yes no 0 0 0 1 2 1 178.9 178.9 3 8.1842E-09 185870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.57 94.014 106720000 0 0 0 0 0 0 0 0 9385200 0 61150000 36186000 0 10922 922 10234 96316;96317;96318;96319 122307;122308;122309;122310 122309 2 ELQAQIAELQEDFESEK Unmodified 2005.948 0.94803059 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 138.48 138.48 2;3 1.4971E-13 145082 QUIQUE_C1438_190116_001 128.9 118.73 514240000 0 0 0 61243000 56340000 48574000 51621000 50596000 56720000 0 60324000 80879000 47943000 10923 2379 10235 96320;96321;96322;96323;96324;96325;96326;96327;96328;96329;96330 122311;122312;122313;122314;122315;122316;122317;122318;122319;122320;122321;122322 122313 11 ELQDALALISR Unmodified 1227.6823 0.68230126 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 12.953 12.953 3 0.052682 5058 QUIQUE_DMIX7_190116_001 23.724 0 22861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22861000 0 10924 1187 10236 96331 122323 122323 1 ELQDQLEAEQYFSTLYK Unmodified 2104.0001 6.61646E-05 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 141.45 141.45 2 6.2151E-10 137451 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.62 79.395 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10925 2999;1610 10237 96332 122324 122324 1 ELQEALGAR Unmodified 985.51926 0.51925868 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.763 33.763 2 0.00039833 29415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.74 4.567 1229100000 0 0 170900000 0 158830000 0 168080000 174010000 189340000 0 168520000 0 199360000 10926 16;1475 10238 96333;96334;96335;96336;96337;96338;96339;96340 122325;122326;122327;122328;122329;122330;122331;122332;122333;122334 122332 10 ELQEALPEAPAPLLPHITATSLLGTR Unmodified 2737.5014 0.50143035 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.28 142.28 3 3.4361E-11 146828 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.359 77.53 1339000000 80748000 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Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 78.025 78.025 2 0.00044235 80565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.701 59.483 102230000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62027000 0 40206000 10930 2041 10242 96360;96361 122354;122355;122356 122355 3 ELQELVQYPVEHPDK Unmodified 1822.9101 0.91012895 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.216 75.216 3 8.0321E-06 75699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.75 84.874 6380600000 0 664700000 756750000 897990000 0 602890000 0 613030000 690390000 0 704260000 600710000 849920000 10931 2658 10243 96362;96363;96364;96365;96366;96367;96368;96369;96370 122357;122358;122359;122360;122361;122362;122363;122364;122365;122366 122362 7 ELQELVQYPVEHPDKFLK Unmodified 2211.1576 0.15756986 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 100.99 100.99 4 1.2877E-07 103446 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.31 96.982 314200000 0 0 0 0 0 0 0 115560000 48333000 0 99592000 0 50719000 10932 2658 10244 96371;96372;96373;96374 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122388;122389;122390;122391;122392;122393;122394;122395;122396;122397;122398;122399;122400;122401;122402;122403;122404;122405;122406;122407;122408;122409;122410;122411;122412;122413;122414;122415;122416;122417;122418;122419;122420;122421;122422;122423;122424;122425;122426;122427;122428;122429;122430;122431;122432;122433;122434;122435;122436;122437;122438;122439;122440;122441;122442;122443;122444;122445;122446;122447;122448;122449;122450;122451;122452;122453;122454;122455;122456;122457;122458;122459;122460;122461;122462;122463;122464;122465;122466;122467;122468;122469;122470;122471;122472;122473;122474;122475;122476;122477;122478;122479;122480;122481;122482;122483;122484;122485;122486;122487;122488;122489;122490;122491;122492;122493;122494;122495;122496;122497;122498;122499;122500;122501;122502;122503 122424 104 ELQEQMSR Unmodified 1019.4706 0.47059393 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;H0Y503 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 19.727 19.727 2 0.039307 12663 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0.08619583 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.693 68.693 4 0.00012996 68367 QUIQUE_C1368_190116_001 50.938 45.485 838820000 91980000 0 103040000 51949000 71064000 60619000 90438000 62506000 119320000 0 112250000 0 75650000 10952 3643 10263 96557;96558;96559;96560;96561;96562;96563;96564;96565;96566 122610;122611;122612;122613;122614;122615;122616;122617;122618;122619 122611 9 ELQPPAAGDPQAK Unmodified 1320.6674 0.66737948 3347 Q66K14;G3V133 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 2 31.194 31.194 2 0.041956 26777 QUIQUE_C1576_190116_001 50.353 26.925 46335000 0 0 0 0 0 0 0 0 46335000 0 0 0 0 10953 3347 10264 96567;96568;96569 122620;122621;122622 122620 1 ELQPQQQPR Unmodified 1122.5782 0.57817054 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.513 15.513 2 0.003052 7616 QUIQUE_C1403_190116_001 92.187 56.938 84177000 12528000 15994000 0 23191000 0 14952000 0 0 17512000 0 0 0 0 10954 1258 10265 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122660;122661;122662;122663;122664;122665;122666;122667;122668;122669;122670;122671;122672;122673;122674;122675;122676;122677;122678;122679;122680;122681 122666 20 ELQTLHNLRK Unmodified 1250.7095 0.70951906 2355;1568;2946 P33176;O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5B;KIF5C;KIF5A Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 1 1 1 1 1 17.853 17.853 3 0.016628 10163 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.863 10.611 216320000 0 0 0 0 0 0 0 82735000 42331000 0 49094000 42158000 0 10963 2355;1568;2946 10274 96618;96619;96620;96621 122682;122683;122684;122685 122684 3 ELQTQYDALKK Unmodified 1335.7034 0.70343063 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 31.769 31.769 2 0.006117 27881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.013 46.297 38583000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38583000 0 0 10964 271 10275 96622;96623 122686;122687 122686 2 ELQTVLSTYLR Unmodified 1321.7242 0.72416608 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 117.96 117.96 2 0.0018611 122572 QUIQUE_C1218_190116_001 96.342 71.566 64865000 35940000 0 0 0 0 28924000 0 0 0 0 0 0 0 10965 465 10276 96624;96625 122688;122689 122688 2 ELQTVLSTYLRPLQTSEK Unmodified 2105.1368 0.13683442 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 123.08 123.08 2;3 1.5941E-16 127379 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.65 100.75 889150000 0 95439000 59570000 68467000 102090000 0 147050000 0 30036000 0 187300000 35681000 163520000 10966 465 10277 96626;96627;96628;96629;96630;96631;96632;96633;96634;96635;96636;96637;96638;96639 122690;122691;122692;122693;122694;122695;122696;122697;122698;122699;122700;122701;122702;122703 122698 12 ELQVGIPVADEAGQR Unmodified 1580.8158 0.81583463 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.21 84.21 2 8.4046E-20 85140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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98079 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.75 91.803 229180000 0 0 0 0 0 0 0 87427000 53579000 0 26662000 26026000 35488000 10969 3168 10280 96659;96660;96661;96662;96663;96664 122724;122725;122726;122727;122728;122729;122730 122725 6 ELREELGEAAAAFR Unmodified 1560.7896 0.78961988 3834 Q96DE0 NUDT16 U8 snoRNA-decapping enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.7 96.7 3 8.6906E-11 98536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.72 125.67 251530000 30744000 34671000 34160000 23459000 0 28385000 0 40694000 46670000 12745000 0 0 0 10970 3834 10281 96665;96666;96667;96668;96669;96670;96671;96672 122731;122732;122733;122734;122735;122736;122737;122738;122739 122737 6 ELRPLLVFIWAK Unmodified 1483.8915 0.89150618 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 1 1 141.5 141.5 3 0.0002685 146172 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.767 90.299 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10971 3568 10282 96673 122740 122740 1 ELRVEQESLLTAFR Unmodified 1689.905 0.90498399 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 1 1 1 104.97 104.97 3 0.0050144 107408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.709 49.064 41281000 0 0 0 0 0 0 0 17519000 0 0 23763000 0 0 10972 4392 10283 96674;96675 122741;122742 122741 2 ELSAALQDKK Unmodified 1101.603 0.60298831 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 1 1 2 18.275 18.275 2;3 0.0077683 11257 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.113 41.352 80232000 0 0 0 0 0 0 0 32872000 47360000 0 0 0 0 10973 3091 10284 96676;96677;96678 122743;122744;122745 122743 3 ELSANTAAFAK Unmodified 1121.5717 0.57168818 1590 O60749 SNX2 Sorting nexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 45.022 45.022 2 0.00048107 41814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.69 50.516 170250000 0 90145000 0 0 0 0 0 80109000 0 0 0 0 0 10974 1590 10285 96679;96680;96681;96682;96683 122746;122747;122748;122749;122750 122749 4 ELSAQPEVHR Unmodified 1164.5887 0.58873523 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;F8WDN7 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 18.623 18.623 2;3 0.022257 11052 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 34.531 174370000 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2.7163E-06 89575 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.087 72.429 953560000 0 79025000 90731000 75478000 115660000 50430000 75208000 0 166070000 0 72503000 95314000 133140000 10977 2455 10288 96703;96704;96705;96706;96707;96708;96709;96710;96711;96712;96713;96714;96715 122778;122779;122780;122781;122782;122783;122784;122785;122786;122787;122788;122789;122790 122787 13 ELSDEIEDYTHR Unmodified 1505.6634 0.66341631 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.373 77.373 3 0.0034132 77838 QUIQUE_C1277_190116_001 77.124 64.143 167200000 0 38645000 43948000 0 0 0 0 25169000 0 11643000 0 47798000 0 10978 3620 10289 96716;96717;96718;96719;96720;96721 122791;122792;122793;122794;122795;122796;122797 122791 7 ELSDFISYLQR Unmodified 1369.6878 0.68778057 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.88 139.88 2;3 7.7816E-09 136231 QUIQUE_DMIX4_190116_001 185.6 127.64 10737000000 971240000 939370000 1020300000 876450000 913330000 898570000 789770000 607390000 795690000 348590000 1112500000 705520000 758180000 10979 2308 10290 96722;96723;96724;96725;96726;96727;96728;96729;96730;96731;96732;96733;96734;96735 122798;122799;122800;122801;122802;122803;122804;122805;122806;122807;122808;122809;122810;122811;122812;122813;122814;122815;122816;122817;122818;122819;122820;122821 122814 23 ELSDFLR Unmodified 878.44978 0.44978213 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7;Q75MG1;E9PFD4 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 84.459 84.459 2 0.040989 86003 QUIQUE_C1277_190116_001 82.386 33.625 8378000 0 8378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10980 873 10291 96736 122822 122822 1 ELSDIAHR Unmodified 939.47739 0.47739386 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.281 20.281 2 0.0011854 13065 QUIQUE_C1576_190116_001 144.83 77.778 79121000000 7375400000 7896000000 6831400000 6591000000 5800600000 4887400000 6387300000 5745700000 6156800000 1815200000 7829400000 5165700000 6639300000 10981 1851 10292 96737;96738;96739;96740;96741;96742;96743;96744;96745;96746;96747;96748;96749 122823;122824;122825;122826;122827;122828;122829;122830;122831;122832;122833;122834;122835;122836;122837 122830 9 ELSDIALR Unmodified 915.50255 0.50254598 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.23 58.23 2 0.0028106 56508 QUIQUE_C1368_190116_001 134.66 30.552 44091000000 3160300000 3396200000 3907700000 3358200000 3208300000 2869200000 3042700000 4244900000 3654400000 1813300000 3885100000 3692200000 3858600000 10982 1978 10293 96750;96751;96752;96753;96754;96755;96756;96757;96758;96759;96760;96761;96762 122838;122839;122840;122841;122842;122843;122844;122845;122846;122847;122848;122849;122850;122851;122852;122853;122854;122855;122856;122857;122858;122859;122860;122861;122862;122863;122864;122865;122866;122867;122868;122869 122843 32 ELSDLVSICK Unmodified 1162.5904 0.59037471 189 H3BUD4;A0A0A0MT40;Q15111 PLCL1 Phosphoinositide phospholipase C;Inactive phospholipase C-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 109.27 109.27 2 0.012875 111464 QUIQUE_C1563_190116_001 65.465 37.583 104480000 0 23197000 0 0 0 38803000 0 0 42480000 0 0 0 0 10983 189 10294 96763;96764;96765 122870;122871;122872 122871 3 ELSDPAGAIIYTSR Unmodified 1491.7569 0.75692277 1477 O15067;J3KT98 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.063 90.063 2 4.6802E-07 92143 QUIQUE_C1277_190116_001 126.76 54.122 604780000 44217000 60386000 46676000 49005000 51074000 28258000 41045000 59418000 41557000 21714000 63196000 42607000 55623000 10984 1477 10295 96766;96767;96768;96769;96770;96771;96772;96773;96774;96775;96776;96777;96778 122873;122874;122875;122876;122877;122878;122879;122880;122881;122882;122883;122884;122885;122886 122875 12 ELSDQAGSEFENSDVR Unmodified 1781.7704 0.77040058 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ELE6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.635 64.635 2 4.6636E-207 63645 QUIQUE_C1277_190116_001 271.01 258.43 2600700000 329330000 326500000 293520000 271490000 208580000 218930000 282050000 162910000 181840000 129650000 0 195910000 0 10985 335;1521 10296 96779;96780;96781;96782;96783;96784;96785;96786;96787;96788;96789;96790;96791 122887;122888;122889;122890;122891;122892;122893;122894;122895;122896;122897;122898;122899;122900 122888 14 ELSDQATASPIVAR Unmodified 1456.7522 0.75217174 3277 Q5JSH3 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.234 54.234 2 0.00028116 49501 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.685 80.732 1507100000 0 0 370220000 0 0 181930000 215760000 0 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domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 36.921 36.921 2 0.026207 33503 QUIQUE_C1218_190116_001 94.401 53.549 739980000 201220000 0 0 0 0 150320000 184740000 0 203710000 0 0 0 0 10991 3437 10302 96833;96834;96835;96836 122945;122946;122947;122948 122945 4 ELSGLGSALK Unmodified 973.54441 0.5444108 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.495 56.495 2 0.012952 54590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.404 6.7172 1159000000 165470000 0 0 0 0 134650000 0 109490000 159850000 108010000 193140000 131670000 156760000 10992 2539 10303 96837;96838;96839;96840;96841;96842;96843;96844 122949;122950;122951;122952;122953;122954;122955;122956;122957 122953 8 ELSHLQSENDAAKDEVK Unmodified 1911.9174 0.91739917 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.442 23.442 3 2.9628E-63 16575 QUIQUE_C1277_190116_001 190.82 169.16 163180000 25029000 20805000 0 36151000 0 0 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3459 10316 96972;96973;96974;96975;96976;96977;96978;96979;96980 123111;123112;123113;123114;123115;123116;123117;123118;123119 123115 7 ELSTLHALLWEVLPQLSK Unmodified 2076.1619 0.16192696 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.11 162.11 3 1.0436E-10 169072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.36 97.756 207630000 0 0 0 0 0 0 93575000 48300000 65759000 0 0 0 0 11006 135 10317 96981;96982;96983;96984 123120;123121;123122;123123 123123 2 ELSTTLNADEAVTR Unmodified 1518.7526 0.75256567 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 64.053 64.053 2 3.3062E-10 64034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 131.37 100.8 1749300000 152530000 156690000 121410000 162550000 156800000 138670000 147210000 0 153570000 117920000 141800000 156440000 143760000 11007 2363 10318 96985;96986;96987;96988;96989;96990;96991;96992;96993;96994;96995;96996;96997;96998;96999;97000;97001 123124;123125;123126;123127;123128;123129;123130;123131;123132;123133;123134;123135;123136;123137;123138;123139;123140;123141;123142;123143;123144;123145;123146;123147;123148 123146 25 ELSVMFIETSAK Unmodified 1353.685 0.68500338 4275 Q9NRW1 RAB6B Ras-related protein Rab-6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.68 107.68 2 2.9925E-06 110008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.98 103.72 1057400000 104370000 104210000 123480000 110890000 92916000 117800000 112020000 91349000 152360000 48035000 0 0 0 11008 4275 10319 97002;97003;97004;97005;97006;97007;97008;97009;97010;97011 123149;123150;123151;123152;123153;123154;123155;123156;123157;123158;123159;123160;123161;123162 123160 13 ELSYMVVSR Unmodified 1082.543 0.54303059 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 2 66.227 66.227 2 0.014665 66304 QUIQUE_C1576_190116_001 68.224 37.999 20726000 0 0 0 0 0 0 20726000 0 0 0 0 0 0 11009 3420 10320 97012;97013 123163;123164 123163 2 ELTADARELK Unmodified 1144.6088 0.60880197 2501 P48059;A0A0M3HER1 LIMS1 LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1 yes no 0 0 1 1 69.905 69.905 3 0.035086 71168 QUIQUE_C1438_190116_001 37.556 1.1745 11275000 0 0 0 0 11275000 0 0 0 0 0 0 0 0 11010 2501 10321 97014 123165 123165 1 ELTAEPTIVAQLCK Unmodified 1571.8229 0.82289384 4028 Q9BU02;G3V5B9 THTPA Thiamine-triphosphatase yes no 0 0 0 1 102.29 102.29 2 0.0033088 99094 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.184 62.33 26744000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26744000 0 0 0 11011 4028 10322 97015 123166 123166 1 ELTAVVQK Unmodified 886.51238 0.51238239 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.687 24.687 2 0.036561 18120 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.717 23.499 1523100000 118080000 0 190950000 171290000 147120000 0 167970000 0 164040000 0 215430000 135130000 213080000 11012 2214 10323 97016;97017;97018;97019;97020;97021;97022;97023;97024 123167;123168;123169;123170;123171;123172;123173;123174;123175 123174 7 ELTDEEAER Unmodified 1090.4778 0.47784737 4543 Q9Y266;A0A0A0MSS4;A0A0A0MSU9 NUDC Nuclear migration protein nudC yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.523 20.523 2 0.0019462 13487 QUIQUE_C1576_190116_001 98.458 43.909 1602300000 237410000 0 0 257460000 0 245110000 268430000 121150000 197440000 0 0 0 275270000 11013 4543 10324 97025;97026;97027;97028;97029;97030;97031;97032 123176;123177;123178;123179;123180;123181;123182;123183 123179 7 ELTDEEILASVMIK Unmodified 1589.8222 0.82222514 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 146.25 146.25 2 0.0014426 151331 QUIQUE_C1218_190116_001 78.692 45.463 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11014 3277 10325 97033 123184 123184 1 ELTEEKESAFEFLSSA Unmodified 1815.8414 0.84144026 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 2 129.93 129.93 2;3 7.6618E-17 134879 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123193;123194;123195;123196;123197;123198;123199;123200;123201;123202;123203;123204;123205;123206;123207;123208;123209;123210;123211;123212;123213;123214;123215;123216;123217;123218;123219;123220 123215 28 ELTLEKPELK Unmodified 1198.6809 0.68090428 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 48.371 48.371 2;3 0.0021658 47059 QUIQUE_C1218_190116_001 114.51 63.167 833210000 71691000 131330000 115730000 85692000 124470000 37216000 93012000 0 0 23807000 0 70805000 79463000 11018 1472 10329 97056;97057;97058;97059;97060;97061;97062;97063;97064;97065;97066;97067;97068;97069;97070;97071;97072;97073;97074 123221;123222;123223;123224;123225;123226;123227;123228;123229;123230;123231;123232;123233;123234;123235;123236;123237;123238;123239;123240 123223 14 ELTLQDVELLK Unmodified 1299.7286 0.72858275 2962 Q13049 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 123.08 123.08 2 0.0021728 129282 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.986 44.69 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123284;123285;123286;123287;123288;123289;123290;123291;123292;123293;123294;123295;123296;123297 123294 14 ELTSTCSPIISK Unmodified 1334.6752 0.67516697 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 48.537 48.537 2 0.00051585 46398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.297 61.882 231850000 30776000 0 0 0 0 0 0 0 0 71476000 74529000 0 55066000 11024 2363 10335 97122;97123;97124;97125 123298;123299;123300;123301;123302 123301 5 ELTSTCSPIISKPK Unmodified 1559.8229 0.82289384 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 36.3 36.3 2;3 6.2193E-06 32066 QUIQUE_C1576_190116_001 122.51 76.049 1570200000 122290000 191690000 161060000 178730000 317160000 120230000 216600000 18620000 97495000 9761500 54703000 30958000 50915000 11025 2363 10336 97126;97127;97128;97129;97130;97131;97132;97133;97134;97135;97136;97137;97138;97139;97140;97141;97142;97143;97144;97145;97146 123303;123304;123305;123306;123307;123308;123309;123310;123311;123312;123313;123314;123315;123316;123317;123318;123319;123320;123321;123322;123323;123324 123317 22 ELTTEIDNNIEQISSYK Unmodified 1995.9637 0.96368066 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 122.15 122.15 2;3 3.2166E-201 128130 QUIQUE_C1218_190116_001 320.07 293.36 2724100000 197530000 162800000 111080000 177690000 149750000 150140000 160010000 103130000 158050000 525440000 199770000 294310000 334410000 + 11026 776 10337 97147;97148;97149;97150;97151;97152;97153;97154;97155;97156;97157;97158;97159;97160;97161 123325;123326;123327;123328;123329;123330;123331;123332;123333;123334;123335;123336;123337;123338;123339;123340;123341;123342;123343;123344 123325 20 ELTTYEIEEFKK Unmodified 1528.7661 0.76609047 3324 Q5TC84 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 70.493 70.493 2;3 0.00082938 69445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.78 84.36 21916000 0 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yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.58 108.58 2 0.00013172 111923 QUIQUE_C1368_190116_001 141.2 95.86 1679100000 110490000 130450000 130370000 128580000 150650000 104300000 136150000 116790000 139990000 81335000 145500000 152950000 151520000 11030 1977 10341 97180;97181;97182;97183;97184;97185;97186;97187;97188;97189;97190;97191;97192;97193 123368;123369;123370;123371;123372;123373;123374;123375;123376;123377;123378;123379;123380;123381;123382 123371 14 ELVASSPEMGQDFDHVTLLR Unmodified 2243.0892 0.089232298 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 1 1 113.42 113.42 3 0.015543 117547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.171 17.917 189440000 0 0 53387000 0 55577000 0 0 0 38687000 0 0 41792000 0 11031 2021 10342 97194;97195;97196;97197 123383;123384;123385;123386 123385 4 ELVDDSVNNVR Unmodified 1258.6153 0.61534391 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8;C9J0F2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.102 47.102 2 3.9678E-08 44800 QUIQUE_C1218_190116_001 182.53 144.97 5151400000 624930000 1138100000 542640000 787540000 980720000 879780000 0 0 0 197670000 0 0 0 11032 150 10343 97198;97199;97200;97201;97202;97203;97204 123387;123388;123389;123390;123391;123392;123393 123387 7 ELVDEEADEAYELLSQAESWQR Unmodified 2609.1769 0.17692091 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 168.81 168.81 2;3 1.003E-05 175102 QUIQUE_C1438_190116_001 94.728 87.526 61707000 0 0 0 0 12350000 0 0 0 0 0 49357000 0 0 11033 130 10344 97205;97206 123394;123395 123394 2 ELVDGAPLWLLK Unmodified 1352.7704 0.77038799 405 A0A286YF37;Q9UK22;R4GNH2 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 142.73 142.73 2 0.00050838 149526 QUIQUE_C1218_190116_001 128.36 118.85 19076000000 1228800000 1437500000 1433900000 1335800000 1681000000 2183900000 1747400000 1220100000 1632500000 1013000000 1282300000 1082000000 1798300000 11034 405 10345 97207;97208;97209;97210;97211;97212;97213;97214;97215;97216;97217;97218;97219;97220;97221;97222;97223;97224;97225;97226 123396;123397;123398;123399;123400;123401;123402;123403;123404;123405;123406;123407;123408;123409;123410;123411;123412;123413;123414;123415;123416;123417;123418;123419;123420;123421;123422;123423;123424;123425;123426;123427;123428;123429;123430;123431;123432;123433;123434;123435 123397 38 ELVDYFLNVATAQGR Unmodified 1694.8628 0.86278482 1422 O00754 MAN2B1 Lysosomal alpha-mannosidase;Lysosomal alpha-mannosidase A peptide;Lysosomal alpha-mannosidase B peptide;Lysosomal alpha-mannosidase C peptide;Lysosomal alpha-mannosidase D peptide;Lysosomal alpha-mannosidase E peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 149.17 149.17 2 5.4572E-06 154738 QUIQUE_C1368_190116_001 108.72 88.51 63479000 0 21832000 34888000 0 0 0 0 0 0 6758800 0 0 0 11035 1422 10346 97227;97228;97229 123436;123437;123438 123437 2 ELVEFAQDDDR Unmodified 1335.5943 0.59427411 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 66.267 66.267 2 0.00089332 66819 QUIQUE_C1438_190116_001 109.66 79.409 264730000 41437000 38734000 40998000 45610000 39087000 32545000 26318000 0 0 0 0 0 0 11036 3078 10347 97230;97231;97232;97233;97234;97235;97236;97237 123439;123440;123441;123442;123443;123444;123445;123446 123443 7 ELVEFAQDDDRLR Unmodified 1604.7794 0.77944912 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 1 1 71.763 71.763 3 0.052677 71990 QUIQUE_C1277_190116_001 38.366 26.573 23350000 0 23350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11037 3078 10348 97238 123447 123447 1 ELVEIAVPENLVGAILGK Unmodified 1863.0717 0.071714965 4515 Q9UNW9 NOVA2 RNA-binding protein Nova-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.9 167.9 2 4.7838E-11 169803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.35 152.15 750360000 72818000 91951000 86563000 46147000 103550000 30297000 0 146510000 0 26290000 146240000 0 0 11038 4515 10349 97239;97240;97241;97242;97243;97244;97245;97246;97247 123448;123449;123450;123451;123452;123453;123454;123455;123456;123457 123455 10 ELVEPLTPSGEAPNQALLR Unmodified 2033.0793 0.079319539 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.77 106.77 2 6.1607E-08 110173 QUIQUE_C1277_190116_001 129.71 111.57 297800000 19762000 35563000 29628000 0 41104000 0 42594000 0 47036000 0 0 32246000 49867000 11039 1789 10350 97248;97249;97250;97251;97252;97253;97254;97255 123458;123459;123460;123461;123462;123463;123464;123465 123459 8 ELVEPVSR Unmodified 927.50255 0.50254598 2539 P49748;K7EQP4;K7EJW8;J3KS89 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.115 30.115 2 0.007181 24732 QUIQUE_C1368_190116_001 98.997 57.694 1611300000 189320000 0 253320000 145260000 0 177760000 0 0 248920000 0 208590000 169320000 218810000 11040 2539 10351 97256;97257;97258;97259;97260;97261;97262;97263 123466;123467;123468;123469;123470;123471;123472;123473;123474 123467 7 ELVEQDIQPAR Unmodified 1296.6674 0.66737948 4341 Q9NZ94;E7EVK0;A0A087WW27 NLGN3 Neuroligin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.58 48.58 2 0.00044352 46737 QUIQUE_C1438_190116_001 104.17 54.334 296260000 34235000 36322000 39947000 0 35425000 37412000 0 28332000 33061000 18553000 0 32972000 0 11041 4341 10352 97264;97265;97266;97267;97268;97269;97270;97271;97272 123475;123476;123477;123478;123479;123480;123481;123482;123483;123484 123478 6 ELVEVSPLENAIQVVENK Unmodified 2009.0681 0.06808615 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 147.47 147.47 2 1.6642E-17 151499 QUIQUE_C1277_190116_001 135.02 117.85 48345000 25165000 23179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11042 3562 10353 97273;97274 123485;123486 123486 2 ELVFKEDGQEYAQVIK Unmodified 1894.9676 0.96764382 2494 P47813;O14602;A6NJH9 EIF1AX;EIF1AY Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal yes no 0 0 1 1 1 2 86.209 86.209 2;3 1.1045E-05 88620 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.02 99.999 123520000 0 0 0 0 0 0 0 0 27567000 0 0 0 95955000 11043 2494 10354 97275;97276;97277;97278 123487;123488;123489;123490;123491 123487 5 ELVIAMEELK Unmodified 1173.6315 0.63151124 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 102.05 102.05 2 0.032885 105372 QUIQUE_C1218_190116_001 63.227 40.991 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11044 318 10355 97279 123492 123492 1 ELVLALYDYQEK Unmodified 1482.7606 0.76061116 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.31 116.31 2 6.2627E-05 113744 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.56 111.01 6708300000 669230000 692750000 716440000 673070000 672270000 648970000 636870000 223860000 419490000 459070000 267150000 320680000 308460000 11045 267;275;3025 10356 97280;97281;97282;97283;97284;97285;97286;97287;97288;97289;97290;97291;97292;97293 123493;123494;123495;123496;123497;123498;123499;123500;123501;123502;123503;123504;123505;123506;123507;123508;123509;123510;123511;123512;123513;123514;123515 123509 23 ELVLDNCK Unmodified 989.48518 0.48518136 3749 Q92688 ANP32B Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B yes yes 0 0 0 1 1 1 33.342 33.342 2 0.027083 28240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.998 37.528 92668000 0 0 0 0 0 0 0 59810000 0 32857000 0 0 0 11046 3749 10357 97294;97295;97296 123516;123517;123518 123516 3 ELVLDNSR Unmodified 944.49271 0.49270958 1170 H0YN26;P39687;H7BZ09 ANP32A Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A yes no 0 0 0 1 1 1 32.706 32.706 2 0.024002 27731 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.789 36.202 710010000 0 306450000 0 0 0 0 0 0 306340000 97218000 0 0 0 11047 1170 10358 97297;97298;97299 123519;123520;123521 123520 2 ELVLLLLQWMR Unmodified 1412.8214 0.8213777 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 171.94 171.94 2 4.25E-05 175777 QUIQUE_DMIX7_190116_001 163.99 118.85 80345000 0 0 0 0 0 0 0 0 15209000 0 25672000 39465000 0 11048 3117 10359 97300;97301;97302 123522;123523;123524 123524 3 ELVLNGADTAVNK Unmodified 1342.7092 0.70924429 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 57.216 57.216 2 0.0029168 55275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.05 66.697 32570000 0 0 0 0 0 0 0 32570000 0 0 0 0 0 11049 3270 10360 97303 123525 123525 1 ELVLQGADINLQR Unmodified 1467.8045 0.80454166 3607 Q8N6D5;K7EL63 ANKRD29 Ankyrin repeat domain-containing protein 29 yes no 0 0 0 1 1 1 96.294 96.294 2 0.00068419 99115 QUIQUE_C1277_190116_001 85.958 37.162 68092000 0 36690000 31402000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11050 3607 10361 97304;97305;97306 123526;123527;123528 123526 2 ELVNNLAEIYGR Unmodified 1389.7252 0.72522871 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 104.47 104.47 2 6.4439E-08 107554 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.08 113.74 511030000 0 0 0 0 308010000 0 203010000 0 0 0 0 0 0 11051 4352 10362 97307;97308;97309;97310;97311 123529;123530;123531;123532;123533;123534 123534 6 ELVNNLGEIYQK Unmodified 1418.7405 0.74054442 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.066 85.066 2 0.00024465 88053 QUIQUE_C1438_190116_001 117.31 69.028 1021500000 0 0 0 160640000 130950000 0 118170000 105290000 93522000 0 140780000 132560000 139560000 11052 4175 10363 97312;97313;97314;97315;97316;97317;97318;97319 123535;123536;123537;123538;123539;123540;123541;123542 123536 5 ELVPEVPEEQGSK Unmodified 1439.7144 0.71438925 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.864 62.864 2 2.6932E-06 62753 QUIQUE_C1218_190116_001 128.44 86.157 564910000 105610000 99628000 0 101380000 76927000 99651000 0 51073000 0 30642000 0 0 0 11053 921 10364 97320;97321;97322;97323;97324;97325;97326;97327 123543;123544;123545;123546;123547;123548;123549;123550 123543 8 ELVPEVPEEQGSKDR Unmodified 1710.8424 0.84244331 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 1 49.035 49.035 2;3 0.0042299 46289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.46 42.107 227100000 0 0 0 0 0 0 0 127190000 0 0 0 0 99915000 11054 921 10365 97328;97329;97330 123551;123552;123553 123551 3 ELVQVQTLMDNMTLER Unmodified 1918.9492 0.94923334 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 142.22 142.22 2 0.0089094 146934 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.82 84.189 51241000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51241000 0 11055 3108 10366 97331 123554 123554 0 ELVSCSNCTDYQAR Unmodified 1701.7087 0.70866872 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.769 41.769 2 1.5542E-36 37848 QUIQUE_C1563_190116_001 215.56 191.22 1193700000 108310000 145150000 101200000 124510000 126440000 131660000 119970000 39549000 42300000 22437000 84081000 66333000 81800000 11056 2534 10367 97332;97333;97334;97335;97336;97337;97338;97339;97340;97341;97342;97343;97344 123555;123556;123557;123558;123559;123560;123561;123562;123563;123564;123565;123566;123567;123568 123560 14 ELVSDANQHVK Unmodified 1238.6255 0.62551466 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 1 17.66 17.66 2;3 2.6046E-12 9920 QUIQUE_C1277_190116_001 161.02 109.23 8263000000 1203800000 912190000 292610000 418670000 947690000 545790000 504410000 839220000 375020000 362240000 984350000 447430000 429530000 11057 2309 10368 97345;97346;97347;97348;97349;97350;97351;97352;97353;97354;97355;97356;97357;97358;97359;97360;97361;97362;97363 123569;123570;123571;123572;123573;123574;123575;123576;123577;123578;123579;123580;123581;123582;123583;123584;123585;123586;123587;123588 123572 19 ELVSLTDQESEEHYHLTEALK Unmodified 2470.1864 0.18636339 955 E9PKT1;Q8IVF5;E9PMZ8 TIAM2 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 2 yes no 0 0 0 1 87.427 87.427 3 0.0064796 90869 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.808 34.959 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11058 955 10369 97364 123589 123589 1 ELVTGTLWNLSSYEPLK Unmodified 1949.0146 0.014594017 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.26 150.26 2 1.3773E-12 155604 QUIQUE_C1368_190116_001 125.53 96.721 505650000 0 46471000 52384000 56028000 77632000 26408000 53591000 0 60594000 21948000 0 57289000 53306000 11059 730 10370 97365;97366;97367;97368;97369;97370;97371;97372;97373;97374;97375 123590;123591;123592;123593;123594;123595;123596;123597;123598;123599;123600 123591 10 ELVTGVLWNLSSCDALK Unmodified 1903.9713 0.97134899 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 148.08 148.08 2;3 1.8176E-16 151953 QUIQUE_C1277_190116_001 131.26 99.828 685800000 134980000 141830000 0 221510000 0 82016000 0 0 0 46393000 59066000 0 0 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123718;123719;123720;123721;123722;123723;123724;123725;123726;123727;123728;123729;123730;123731;123732;123733;123734;123735;123736;123737;123738;123739;123740;123741;123742;123743;123744;123745 123743 28 ELWFSDDPNVTK Unmodified 1449.6776 0.67760981 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.31 101.31 2 0.016566 105872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.862 45.776 310520000 0 0 0 0 0 0 0 0 99657000 60669000 150190000 0 0 11068 1756 10379 97478;97479;97480;97481 123746;123747;123748;123749 123749 3 ELWLVIHGR Unmodified 1121.6346 0.63456321 1263 J3KNF8;H3BUX2;O43169;D6RFH4;J3QR91 CYB5B Cytochrome b5 type B yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 79.403 79.403 2;3 0.0055954 80725 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.285 70.391 1199400000 41203000 36073000 103980000 90769000 46444000 89462000 127090000 35078000 144910000 46980000 188460000 136860000 112100000 11069 1263 10380 97482;97483;97484;97485;97486;97487;97488;97489;97490;97491;97492;97493;97494;97495;97496;97497;97498;97499;97500;97501;97502;97503 123750;123751;123752;123753;123754;123755;123756;123757;123758;123759;123760;123761;123762;123763;123764;123765;123766;123767;123768;123769;123770;123771;123772 123767 22 ELWTWLEELQK Unmodified 1473.7504 0.75038083 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7;F5H228 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 158.94 158.94 2 0.001374 163890 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.65 73.442 30226000 0 0 16979000 0 0 0 0 0 13247000 0 0 0 0 11070 1674 10381 97504;97505;97506;97507 123773;123774;123775;123776 123776 4 ELWVIDEK Unmodified 1030.5335 0.53351176 3169 Q16134;D6RAD5 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.194 89.194 2 0.015148 92194 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 52.223 244430000 36677000 0 43769000 0 0 0 0 0 0 22125000 55273000 48391000 38190000 11071 3169 10382 97508;97509;97510;97511;97512;97513 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10400 97666;97667;97668;97669;97670;97671 123964;123965;123966;123967;123968;123969 123964 6 EMAHGSQEAEAPGAVAGAAEVPR Oxidation (M) 2250.0335 0.033508333 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 47.366 47.366 3 9.7332E-09 44054 QUIQUE_C1277_190116_001 83.064 79.425 50891000 0 31273000 0 0 0 0 0 0 0 19618000 0 0 0 11092 3532 10401 97672;97673 123970;123971 123970 2682 2 EMAHGSQEAEAPGAVAGAAEVPR Unmodified 2234.0386 0.038593711 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 52.542 52.542 3 7.0331E-06 49851 QUIQUE_C1563_190116_001 57.152 47.889 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11093 3532 10401 97674 123972 123972 1 EMALLATSLPEGIMVK Unmodified 1701.9045 0.90451498 4094 Q9C0C9;K7ES11 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 1 1 140.17 140.17 2 0.00057773 145727 QUIQUE_C1218_190116_001 76.522 61.491 63478000 38888000 0 0 0 0 24590000 0 0 0 0 0 0 0 11094 4094 10402 97675;97676;97677 123973;123974;123975 123973 3 EMANLRPEGR Unmodified 1171.5768 0.57679033 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 20.198 20.198 3 0.032446 12889 QUIQUE_C1277_190116_001 50.292 37.201 32959000 0 32959000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11095 3102 10403 97678 123976 123976 1 EMDEAATAEER Unmodified 1250.5085 0.50849557 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 22.916 22.916 2 0.010536 16242 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.201 50.354 78540000 0 0 0 26152000 0 20435000 0 0 0 0 0 0 31953000 11096 922 10404 97679;97680;97681 123977;123978;123979;123980 123980 4 EMDEQIR Unmodified 919.40693 0.40693104 63;3271;1260 J3KN67;Q5HYB6;A0A087WWU8 TPM3;DKFZp686J1372 no no 0 0 0 1 1 1 1 20.987 20.987 2 0.042144 14479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.381 36.408 560400000 0 0 220340000 0 133300000 0 0 97989000 0 0 0 0 108770000 11097 1260;3271;63 10405 97682;97683;97684;97685 123981;123982;123983;123984 123983 4 EMDPFHYDYQTLR Oxidation (M) 1729.7406 0.74062078 4122 Q9H0Q3;J3QKN1;E9PJ02;E9PHZ3;A0A0A6YYL5;A0A087WZ82 FXYD6;FXYD6-FXYD2 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 84.256 84.256 2;3 0.0010531 86227 QUIQUE_C1576_190116_001 70.332 61.735 488550000 52695000 67101000 56824000 0 47550000 45382000 86396000 0 34826000 20890000 36606000 0 40281000 11098 4122 10406 97686;97687;97688;97689;97690;97691;97692;97693;97694;97695;97696 123985;123986;123987;123988;123989;123990;123991;123992;123993;123994;123995;123996;123997 123990 2865 13 EMDPFHYDYQTLR Unmodified 1713.7457 0.74570615 4122 Q9H0Q3;J3QKN1;E9PJ02;E9PHZ3;A0A0A6YYL5;A0A087WZ82 FXYD6;FXYD6-FXYD2 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 98.682 98.682 2;3 5.1281E-05 102346 QUIQUE_C1218_190116_001 115.57 109.91 1212500000 155050000 122320000 132520000 104840000 85917000 100910000 205080000 52088000 0 25380000 87064000 60873000 80492000 11099 4122 10406 97697;97698;97699;97700;97701;97702;97703;97704;97705;97706;97707;97708;97709;97710;97711 123998;123999;124000;124001;124002;124003;124004;124005;124006;124007;124008;124009;124010;124011;124012 123998 14 EMDPVTQLYTMTSTLEYK Unmodified 2148.9959 0.99590876 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 159.09 159.09 2 4.5191E-05 166500 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.73 103.57 261870000 0 0 0 69624000 63727000 0 40541000 0 0 0 49929000 38051000 0 11100 3023 10407 97712;97713;97714;97715;97716 124013;124014;124015;124016;124017 124016 3 EMDQTMAANAQK Oxidation (M) 1352.57 0.57004997 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 3 2 1 1 1 1 14 14 2 0.00016908 6086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 90.993 240510000 43884000 11670000 13778000 9240400 8188800 40374000 0 50597000 28351000 6508100 9275200 0 18638000 11101 2306 10408 97717;97718;97719;97720;97721;97722;97723;97724;97725;97726;97727;97728;97729;97730;97731 124018;124019;124020;124021;124022;124023;124024;124025;124026;124027;124028;124029;124030;124031;124032 124027 1690;1691 15 EMDQTMAANAQK Unmodified 1336.5751 0.57513535 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.663 23.663 2 4.132E-20 17198 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.99 122.89 1088300000 126070000 115450000 75640000 100930000 59779000 83909000 80873000 122130000 96947000 32717000 105450000 0 88418000 11102 2306 10408 97732;97733;97734;97735;97736;97737;97738;97739;97740;97741;97742;97743;97744 124033;124034;124035;124036;124037;124038;124039;124040;124041;124042;124043;124044;124045;124046 124042 13 EMDRETLIDVAR Unmodified 1446.7137 0.71367774 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.093 64.093 2;3 0.0050238 63285 QUIQUE_C1368_190116_001 77.674 62.337 718760000 0 0 105560000 96088000 0 52013000 0 144230000 0 22345000 0 148690000 149830000 11103 2424 10409 97745;97746;97747;97748;97749;97750;97751;97752 124047;124048;124049;124050;124051;124052;124053;124054;124055 124047 7 EMDRETLIDVAR Oxidation (M) 1462.7086 0.70859237 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 1 1 1 50.213 50.213 3 0.021799 45140 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.555 30.899 25854000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25854000 0 0 0 11104 2424 10409 97753 124056 124056 1 EMDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNR Unmodified 4233.961 0.96098641 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 1 2 170.51 170.51 3;4 2.2436E-06 172316 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.693 47.166 33040000 0 0 0 0 0 0 0 33040000 0 0 0 0 0 11105 4475 10410 97754;97755 124057;124058 124058 2 EMEAELEDER Unmodified 1249.5132 0.5132466 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 44.858 44.858 2 0.017866 41544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.465 56.678 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11106 2378 10411 97756;97757 124059;124060 124060 2 EMEAELEDERK Unmodified 1377.6082 0.60820962 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 27.36 27.36 2;3 0.0090522 21818 QUIQUE_C1576_190116_001 76.943 34.834 30335000 0 0 30335000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11107 2378 10412 97758;97759;97760 124061;124062;124063 124063 3 EMEAELEDERK Oxidation (M) 1393.6031 0.60312424 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 1 1 1 16.198 16.198 3 0.026798 8380 QUIQUE_C1403_190116_001 41.242 34.806 28772000 0 0 0 28772000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11108 2378 10412 97761 124064 124064 1 EMEEATASAQR Unmodified 1221.5296 0.52956537 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 17.458 17.458 2 0.0023613 9638 QUIQUE_C1277_190116_001 78.816 63.174 99217000 0 22946000 0 0 0 19102000 0 0 0 0 18681000 10596000 27892000 11109 4378 10413 97762;97763;97764;97765;97766 124065;124066;124067;124068;124069 124065 4 EMEELIPLVNR Unmodified 1341.6962 0.69623677 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 111 111 2 0.015314 114931 QUIQUE_C1218_190116_001 76.827 57.04 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11110 840;4528 10414 97767 124070 124070 1 EMEENFAVEAANYQDTIGR Oxidation (M) 2201.9535 0.95352668 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 1 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 106.48 106.48 2;3 0 111184 QUIQUE_C1218_190116_001 291.51 286.66 12321000000 730020000 912970000 1449400000 1283700000 983410000 1158700000 792800000 830620000 886010000 766400000 925100000 853760000 748100000 11111 1952 10415 97768;97769;97770;97771;97772;97773;97774;97775;97776;97777;97778;97779;97780;97781;97782;97783;97784;97785;97786;97787;97788;97789;97790;97791;97792;97793;97794;97795 124071;124072;124073;124074;124075;124076;124077;124078;124079;124080;124081;124082;124083;124084;124085;124086;124087;124088;124089;124090;124091;124092;124093;124094;124095;124096;124097;124098;124099;124100;124101;124102;124103;124104;124105;124106;124107;124108;124109;124110;124111;124112;124113;124114;124115;124116;124117;124118;124119;124120;124121 124072 1197 51 EMEENFAVEAANYQDTIGR Unmodified 2185.9586 0.95861206 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 5 2 6 6 4 5 4 5 6 4 9 6 5 118.34 118.34 2;3 1.81E-195 121418 QUIQUE_C1368_190116_001 323.66 318.16 27573000000 1959500000 748920000 2581000000 3490000000 1802100000 2602800000 703370000 2610300000 2717200000 1246400000 2660400000 2139900000 2310500000 11112 1952 10415 97796;97797;97798;97799;97800;97801;97802;97803;97804;97805;97806;97807;97808;97809;97810;97811;97812;97813;97814;97815;97816;97817;97818;97819;97820;97821;97822;97823;97824;97825;97826;97827;97828;97829;97830;97831;97832;97833;97834;97835;97836;97837;97838;97839;97840;97841;97842;97843;97844;97845;97846;97847;97848;97849;97850;97851;97852;97853;97854;97855;97856;97857;97858;97859;97860;97861;97862 124122;124123;124124;124125;124126;124127;124128;124129;124130;124131;124132;124133;124134;124135;124136;124137;124138;124139;124140;124141;124142;124143;124144;124145;124146;124147;124148;124149;124150;124151;124152;124153;124154;124155;124156;124157;124158;124159;124160;124161;124162;124163;124164;124165;124166;124167;124168;124169;124170;124171;124172;124173;124174;124175;124176;124177;124178;124179;124180;124181;124182;124183;124184;124185;124186;124187;124188;124189;124190;124191;124192;124193;124194;124195;124196;124197;124198;124199;124200;124201;124202;124203;124204;124205;124206;124207;124208;124209;124210;124211;124212;124213;124214;124215;124216;124217;124218;124219;124220;124221;124222;124223;124224;124225;124226;124227;124228;124229;124230;124231;124232;124233;124234;124235;124236;124237;124238;124239;124240;124241;124242;124243;124244;124245;124246;124247;124248;124249;124250;124251;124252 124138 128 EMELELAQTK Unmodified 1190.5853 0.58528933 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 no no 0 0 0 1 1 63.019 63.019 2 0.015727 63543 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.184 37.625 150300000 0 0 0 0 71237000 0 0 0 0 0 79062000 0 0 11113 4596 10416 97863;97864 124253;124254 124254 2 EMELPAK Unmodified 816.40514 0.40514012 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 28.812 28.812 2 0.044362 22595 QUIQUE_C1368_190116_001 79.454 40.235 239400000 0 91153000 92571000 0 0 0 55675000 0 0 0 0 0 0 11114 3117 10417 97865;97866;97867 124255;124256;124257 124256 3 EMENMYIEELK Unmodified 1427.6313 0.63125325 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 95.445 95.445 2 0.0047842 97717 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.552 62.396 198430000 0 0 41543000 0 0 0 0 42080000 0 0 0 50209000 64594000 11115 981;4494 10418 97868;97869;97870;97871;97872;97873 124258;124259;124260;124261;124262;124263 124263 5 EMEQLFSQYGR Unmodified 1386.6238 0.6238001 3073 Q14576 ELAVL3 ELAV-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 92.312 92.312 2 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4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;Q5QPE4 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 0 0 0 1 1 112.15 112.15 2 0.01927 114873 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.616 55.092 45449000 26624000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18825000 0 11119 4636 10422 97889;97890 124280;124281 124281 2 EMFGSGTACVVCPVSDILYK Unmodified 2232.0265 0.026497386 2644 P54687 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.25 137.25 2 2.5769E-09 141537 QUIQUE_C1277_190116_001 143.93 129.36 324040000 40995000 68439000 44459000 38008000 34999000 42644000 0 0 0 0 54498000 0 0 11120 2644 10423 97891;97892;97893;97894;97895;97896;97897;97898 124282;124283;124284;124285;124286;124287;124288;124289;124290 124283 9 EMFNYAR Unmodified 929.40654 0.40653711 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8;H0YJX2 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.547 46.547 2 0.043095 43394 QUIQUE_C1403_190116_001 80.555 49.886 268090000 0 0 0 42748000 0 0 38283000 57954000 0 18667000 58697000 0 51743000 11121 124 10424 97899;97900;97901;97902;97903;97904 124291;124292;124293;124294;124295;124296;124297;124298 124291 8 EMGEAFAADIPR Unmodified 1305.6023 0.60233638 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 92.493 92.493 2 0.027375 95471 QUIQUE_C1218_190116_001 56.043 41.925 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11122 1749 10425 97905;97906 124299;124300 124299 2 EMGGHHIVALCVLK Unmodified 1562.8061 0.80613834 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 53.997 53.997 2;3;4 5.8254E-72 53274 QUIQUE_C1218_190116_001 212.21 170.67 1035600000 79242000 279830000 85750000 64056000 59959000 32489000 79256000 37319000 135570000 0 82835000 63449000 35880000 11123 1787 10426 97907;97908;97909;97910;97911;97912;97913;97914;97915;97916;97917;97918;97919;97920;97921;97922;97923;97924;97925;97926;97927;97928;97929 124301;124302;124303;124304;124305;124306;124307;124308;124309;124310;124311;124312;124313;124314;124315;124316;124317;124318;124319;124320;124321;124322;124323;124324;124325;124326 124303 25 EMGIIPSWGGTTR Unmodified 1403.6867 0.68673471 4294 Q9NTX5;H0Y5L2;H0YCS9 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes no 0 0 0 1 104.95 104.95 2 0.066048 106899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.765 42.67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11124 4294 10427 97930 124327 124327 1 EMGTPLADTPTRPVTR Oxidation (M) 1756.8778 0.87778296 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.451 36.451 3 2.225E-09 32393 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.48 113.99 3211100000 221280000 221440000 190420000 193230000 349770000 162060000 186310000 179260000 371840000 131610000 440500000 317900000 245440000 11125 3984 10428 97931;97932;97933;97934;97935;97936;97937;97938;97939;97940;97941;97942;97943 124328;124329;124330;124331;124332;124333;124334;124335;124336;124337;124338;124339;124340 124336 2822 12 EMGTPLADTPTRPVTR Unmodified 1740.8829 0.88286834 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 48.667 48.667 2;3 7.6104E-19 46369 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.34 135.07 3180600000 370220000 540070000 406560000 72035000 386520000 43531000 74761000 146090000 308250000 63548000 455390000 272380000 41275000 11126 3984 10428 97944;97945;97946;97947;97948;97949;97950;97951;97952;97953;97954;97955;97956;97957;97958;97959;97960;97961;97962;97963;97964 124341;124342;124343;124344;124345;124346;124347;124348;124349;124350;124351;124352;124353;124354;124355;124356;124357;124358;124359;124360;124361;124362;124363;124364 124361 24 EMIDKWEDR Unmodified 1220.5496 0.54957253 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 44.064 44.064 2;3 0.0005855 41627 QUIQUE_C1218_190116_001 144.5 116.63 450850000 201250000 0 0 0 0 74555000 112690000 0 0 0 62349000 0 0 11127 2851 10429 97965;97966;97967;97968;97969 124365;124366;124367;124368;124369;124370;124371 124366 6 EMIDKWEDR Oxidation (M) 1236.5445 0.54448715 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 29.038 29.038 2;3 0.01673 23107 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 71.257 232060000 75033000 0 0 0 0 0 43688000 0 0 113340000 0 0 0 11128 2851 10429 97970;97971;97972 124372;124373;124374 124374 2292 1 EMIDKWEDRWEWLR Oxidation (M) 2006.9309 0.93088116 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 106.7 106.7 3;4 2.2249E-07 109958 QUIQUE_C1368_190116_001 126.63 118.27 3532200000 28002000 76413000 107650000 98775000 66706000 43472000 197280000 268980000 462130000 33898000 853750000 913420000 381780000 11129 2851 10430 97973;97974;97975;97976;97977;97978;97979;97980;97981;97982;97983;97984;97985;97986;97987;97988 124375;124376;124377;124378;124379;124380;124381;124382;124383;124384;124385;124386;124387;124388;124389;124390;124391;124392;124393;124394;124395;124396;124397;124398;124399 124378 2292 25 EMIDKWEDRWEWLR Unmodified 1990.936 0.93596654 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 117.85 117.85 3;4 5.4502E-05 123055 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.494 89.225 1132000000 0 0 50278000 22912000 0 0 118060000 98642000 158370000 0 267190000 234950000 181610000 11130 2851 10430 97989;97990;97991;97992;97993;97994;97995;97996;97997;97998;97999;98000;98001;98002;98003 124400;124401;124402;124403;124404;124405;124406;124407;124408;124409;124410;124411;124412;124413;124414;124415 124410 15 EMIFEDTNLK Unmodified 1238.5853 0.58528933 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 83.551 83.551 2 0.044328 84620 QUIQUE_C1403_190116_001 49.715 28.018 18500000 0 0 0 18500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11131 2133 10431 98004 124416 124416 1 EMIFEVLAPLAENDAIK Oxidation (M) 1917.9758 0.97576567 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 148.18 148.18 2;3 1.8623E-16 144161 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.47 103.17 504940000 66906000 11524000 49762000 49052000 77650000 38858000 56529000 58188000 0 23082000 73389000 0 0 11132 2605 10432 98005;98006;98007;98008;98009;98010;98011;98012;98013;98014;98015;98016;98017;98018;98019 124417;124418;124419;124420;124421;124422;124423;124424;124425;124426;124427;124428;124429;124430;124431;124432 124430 2062 16 EMIFEVLAPLAENDAIK Unmodified 1901.9809 0.98085105 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 160.02 160.02 2;3 7.2791E-54 162274 QUIQUE_C1563_190116_001 186.17 157.88 5539800000 304090000 456980000 455940000 337620000 499880000 391380000 554620000 344220000 473980000 184040000 528780000 469140000 539170000 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98047;98048;98049;98050;98051;98052;98053;98054;98055;98056 124465;124466;124467;124468;124469;124470;124471;124472;124473;124474;124475;124476 124470 10 EMIPFAVVGSDHEYQVNGK Unmodified 2119.0044 0.004440036 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 100.86 100.86 3 0.00012386 102522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.784 47.917 73035000 0 0 0 0 0 0 0 73035000 0 0 0 0 0 11136 4432 10435 98057 124477 124477 1 EMIQLPGARPILDPVDFLGLQDK Unmodified 2564.3672 0.36724506 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 158.59 158.59 3 2.603E-05 161146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.802 55.078 153940000 0 0 0 0 0 0 0 51705000 32613000 0 0 38076000 31547000 11137 2198 10436 98058;98059;98060;98061 124478;124479;124480;124481 124478 3 EMITLLVAK Unmodified 1016.594 0.59400353 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;A0A0C4DGY2;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 93.126 93.126 2 0.046417 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cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 1 62.876 62.876 2 0.00041402 59945 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.4 104.75 656210000 35423000 46642000 94791000 54435000 0 41304000 0 44083000 51007000 69299000 115950000 40065000 63208000 11150 2857;3307 10447 98130;98131;98132;98133;98134;98135;98136;98137;98138;98139;98140;98141;98142;98143;98144;98145;98146;98147;98148 124579;124580;124581;124582;124583;124584;124585;124586;124587;124588;124589;124590;124591;124592;124593;124594;124595;124596;124597;124598;124599 124594 2326;2327 20 EMNDAAMFYTNR Unmodified 1461.6017 0.60168445 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 78.289 78.289 2 0.00071589 75255 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.548 72.112 651430000 0 0 0 0 0 0 0 213700000 171460000 74757000 0 191510000 0 11151 2857;3307 10447 98149;98150;98151;98152 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42.051 2;3 0.0010778 38333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.804 78.172 159570000 0 0 0 0 0 0 0 159570000 0 0 0 0 0 11158 2201 10451 98204;98205 124665;124666 124665 1558 2 EMNIQQLTNYRK Unmodified 1536.7719 0.77186132 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 0 1 2 1 1 1 64.759 64.759 2;3 6.155E-07 64186 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.84 119.79 413960000 0 0 0 0 0 0 0 321520000 55513000 0 0 36933000 0 11159 2201 10451 98206;98207;98208;98209;98210 124667;124668;124669;124670;124671;124672 124669 6 EMNPALGIDCLHK Unmodified 1496.7116 0.71156925 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 67.73 67.73 2;3 7.6059E-10 67500 QUIQUE_C1277_190116_001 143.24 117.85 2214500000 265470000 333440000 239470000 0 179000000 152160000 257340000 40573000 175620000 66686000 204390000 134620000 165740000 11160 2514 10452 98211;98212;98213;98214;98215;98216;98217;98218;98219;98220;98221;98222;98223;98224;98225;98226;98227;98228;98229 124673;124674;124675;124676;124677;124678;124679;124680;124681;124682;124683;124684;124685;124686;124687;124688;124689;124690;124691;124692;124693 124677 17 EMNPALGIDCLHK Oxidation (M) 1512.7065 0.70648388 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 1 1 54.672 54.672 2;3 0.015903 53211 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.125 27.136 130190000 0 0 0 0 0 0 0 0 65508000 0 64679000 0 0 11161 2514 10452 98230;98231;98232 124694;124695;124696 124695 2 EMQDAFQNAYMELGGLGER Unmodified 2157.9459 0.94593888 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 146.12 146.12 2 1.8997E-16 150340 QUIQUE_C1403_190116_001 155.98 137.84 154700000 0 33337000 50736000 49261000 0 21363000 0 0 0 0 0 0 0 11162 590 10453 98233;98234;98235;98236 124697;124698;124699;124700 124699 4 EMQDVDLAEVKPLVEK Unmodified 1841.9445 0.94446554 3737 Q92597;E5RIR1;E5RGM5;E5RIV1;E5RIM2;E5RI76;E5RH82;E5RK17;E5RJ98 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 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19.099 2 6.0797E-05 12126 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.37 119.37 4207700000 322570000 359310000 451430000 271850000 215480000 346520000 383200000 279790000 323510000 95427000 445510000 341880000 371180000 11166 2337 10456 98244;98245;98246;98247;98248;98249;98250;98251;98252;98253;98254;98255;98256 124708;124709;124710;124711;124712;124713;124714;124715;124716;124717;124718;124719;124720 124715 13 EMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGR Unmodified 3368.5983 0.59832022 1636 O75439;G3V0E4 PMPCB Mitochondrial-processing peptidase subunit beta yes no 0 0 0 1 167.64 167.64 3 1.2822E-19 172772 QUIQUE_C1368_190116_001 90.388 85.176 40275000 0 0 40275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11167 1636 10457 98257 124721 124721 1 EMQNLSFQDCYSSK Oxidation (M) 1751.7131 0.7130854 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.831 60.831 2 5.4425E-58 56939 QUIQUE_DMIX4_190116_001 197.3 180.67 541840000 54252000 46554000 64929000 36038000 28627000 43398000 31894000 20212000 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beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein zeta/delta no no 0 1 0 1 2 1 1 14.413 14.413 2;3 0.0082755 6016 QUIQUE_C1277_190116_001 56.258 48.333 172700000 55594000 69823000 0 0 0 0 0 0 39155000 0 0 8130900 0 11170 2262;2341;2780 10459 98284;98285;98286;98287;98288 124751;124752;124753;124754;124755 124753 1630 5 EMQPTHPIR Unmodified 1107.5495 0.54951295 2780;2341;2262 P27348;P31946;P63104;E7EX29;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAQ;YWHAB;YWHAZ 14-3-3 protein theta;14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein zeta/delta no no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 15.053 15.053 2;3 0.0039205 6620 QUIQUE_C1277_190116_001 59.35 43.147 34096000000 3492600000 6077600000 296790000 4168400000 809130000 5037600000 818180000 3322000000 3641200000 300660000 310920000 4339000000 1481600000 11171 2262;2341;2780 10459 98289;98290;98291;98292;98293;98294;98295;98296;98297;98298;98299;98300;98301;98302;98303;98304;98305;98306;98307;98308;98309;98310 124756;124757;124758;124759;124760;124761;124762;124763;124764;124765;124766;124767;124768;124769;124770;124771;124772;124773;124774;124775;124776;124777;124778;124779;124780 124759 25 EMQYFMQQWTGTNK Unmodified 1790.7756 0.77562607 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.87 112.87 2 9.8374E-133 117375 QUIQUE_C1576_190116_001 250.7 236.88 1792900000 102770000 122220000 154400000 73943000 128340000 98826000 195450000 127300000 140270000 58845000 239700000 165440000 185380000 11172 2483 10460 98311;98312;98313;98314;98315;98316;98317;98318;98319;98320;98321;98322;98323 124781;124782;124783;124784;124785;124786;124787;124788;124789;124790;124791;124792;124793;124794;124795;124796;124797;124798;124799 124789 19 EMQYFMQQWTGTNK Oxidation (M) 1806.7705 0.7705407 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 92.078 92.078 2 3.8396E-170 97504 QUIQUE_DMIX3_190116_001 262.54 252.88 2088500000 0 165340000 169770000 39703000 38860000 92547000 151690000 150430000 378970000 35087000 401720000 115130000 349240000 11173 2483 10460 98324;98325;98326;98327;98328;98329;98330;98331;98332;98333;98334;98335;98336;98337;98338;98339;98340;98341;98342;98343 124800;124801;124802;124803;124804;124805;124806;124807;124808;124809;124810;124811;124812;124813;124814;124815;124816;124817;124818;124819;124820;124821 124815 1909;1910 22 EMQYFMQQWTGTNK 2 Oxidation (M) 1822.7655 0.76545532 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 71.768 71.768 2 0.00036601 71838 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.64 89.378 98867000 0 0 0 0 0 0 0 15325000 33965000 0 0 22211000 27366000 11174 2483 10460 98344;98345;98346;98347 124822;124823;124824;124825 124825 1909;1910 3 EMQYFMQQWTGTNKDK Unmodified 2033.8975 0.89753212 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 92.334 92.334 3 0.0024433 93324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.421 49.891 25791000 0 0 0 0 0 0 0 25791000 0 0 0 0 0 11175 2483 10461 98348 124826 124826 1 EMRDELHVR Unmodified 1183.5768 0.57679033 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 1 1 1 20.033 20.033 3 0.030693 13419 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.161 37.16 75913000 0 0 0 0 0 0 0 28200000 0 0 47714000 0 0 11176 1692 10462 98349;98350 124827;124828 124827 1 EMSCIAEDVIIVTSSLTK Unmodified 1994.9904 0.99042946 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 168.27 168.27 2;3 3.7672E-11 171914 QUIQUE_C1277_190116_001 86.367 81.157 375090000 20883000 55666000 52559000 39660000 68439000 56983000 27014000 25043000 0 8537400 0 0 20311000 11177 4645 10463 98351;98352;98353;98354;98355;98356;98357;98358;98359;98360;98361;98362;98363;98364 124829;124830;124831;124832;124833;124834;124835;124836;124837;124838;124839;124840;124841;124842 124830 14 EMSGDLEEGMLAVVK Unmodified 1606.7582 0.75824468 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 0 0 1 1 125.64 125.64 2 0.0074584 130735 QUIQUE_C1218_190116_001 59.418 46.802 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11178 2574 10464 98365;98366 124843;124844 124843 2 EMSGDLEEGMLAVVK Oxidation (M) 1622.7532 0.7531593 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 1 0 1 1 1 110.64 110.64 2 0.00010084 114284 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.653 75.681 62812000 0 0 0 0 0 0 0 0 22089000 17476000 0 23247000 0 11179 2574 10464 98367;98368;98369 124845;124846;124847 124845 2023 3 EMSGSPASGIPVK Unmodified 1258.6227 0.62273747 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 43.794 43.794 2 0.0034819 40493 QUIQUE_C1277_190116_001 73.499 47.94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11180 290;327;328 10465 98370;98371;98372;98373 124848;124849;124850;124851 124848 4 EMSPLWEMVQDGIDLK Unmodified 1889.8903 0.89032148 4647 Q9Y697 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 164.6 164.6 3 0.006446 172089 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.14 41.636 11609000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11609000 0 0 11181 4647 10466 98374 124852 124852 1 EMSSSTLNLVVAGAPK Unmodified 1602.8287 0.8287075 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 95.59 95.59 2 0.0016185 97928 QUIQUE_C1277_190116_001 65.179 51.021 47441000 0 24618000 0 22823000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11182 3675 10467 98375;98376 124853;124854 124853 2 EMSVYEAYR Unmodified 1146.5016 0.5015597 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.404 57.404 2 0.0042623 56611 QUIQUE_C1218_190116_001 89.401 72.625 2125600000 248060000 238590000 353050000 143790000 148120000 156110000 238250000 46699000 103580000 144260000 142030000 93153000 69964000 11183 3117 10468 98377;98378;98379;98380;98381;98382;98383;98384;98385;98386;98387;98388;98389 124855;124856;124857;124858;124859;124860;124861;124862;124863;124864;124865;124866;124867 124855 9 EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGK Unmodified 3010.3589 0.35894157 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 3 4 5 1 2 2 2 131 131 3;4 4.7521E-24 136407 QUIQUE_C1368_190116_001 98 92.034 1585500000 233740000 267570000 511090000 82485000 159420000 115360000 215820000 0 0 0 0 0 0 11184 1777 10469 98390;98391;98392;98393;98394;98395;98396;98397;98398;98399;98400;98401;98402;98403;98404;98405;98406;98407;98408 124868;124869;124870;124871;124872;124873;124874;124875;124876;124877;124878;124879;124880;124881;124882;124883;124884;124885;124886;124887 124879 13 EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGK Oxidation (M) 3026.3539 0.35385619 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 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EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGR Oxidation (M) 4028.8898 0.88976799 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 105.25 105.25 4;5 2.9893E-99 108586 QUIQUE_C1403_190116_001 153.25 149.09 2146200000 0 0 98762000 317850000 0 0 57855000 0 367610000 0 372130000 583230000 348780000 11187 1777 10470 98434;98435;98436;98437;98438;98439;98440;98441;98442;98443;98444;98445 124920;124921;124922;124923;124924;124925;124926;124927;124928;124929;124930;124931;124932;124933 124922 973 14 EMTADVIELK Unmodified 1147.5795 0.57947567 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 78.013 78.013 2 0.065078 79338 QUIQUE_C1576_190116_001 53.756 30.976 69383000 0 0 0 0 0 0 69383000 0 0 0 0 0 0 11188 4285 10471 98446 124934 124934 1 EMTGIWR Unmodified 891.42727 0.42727255 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 57.425 57.425 2 0.049128 56029 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endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.29 80.29 2 0.0036109 82400 QUIQUE_C1218_190116_001 114.6 82.132 3636600000 329300000 316680000 295690000 314510000 249260000 245440000 299930000 285190000 244930000 114380000 358390000 239850000 343040000 11192 2658 10475 98463;98464;98465;98466;98467;98468;98469;98470;98471;98472;98473;98474;98475 124951;124952;124953;124954;124955;124956;124957;124958;124959;124960;124961;124962;124963;124964;124965;124966;124967;124968;124969;124970;124971;124972;124973 124951 23 EMVELPLR Oxidation (M) 1001.5216 0.52156686 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.136 62.136 2 0.012584 61806 QUIQUE_C1403_190116_001 91.041 72.31 655560000 0 0 76060000 68708000 63456000 56058000 61952000 0 0 41630000 106210000 79582000 101900000 11193 2658 10475 98476;98477;98478;98479;98480;98481;98482;98483;98484 124974;124975;124976;124977;124978;124979;124980;124981;124982;124983;124984 124975 2096 11 EMVIFFGHPR Unmodified 1231.6172 0.61719858 3497 Q86V97;Q8WVZ9 KBTBD6;KBTBD7 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 6;Kelch repeat and BTB domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 76.707 76.707 3 0.033004 77763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.225 25.5 22373000 0 0 0 0 0 0 0 11084000 0 0 0 0 11289000 11194 3497 10476 98485;98486;98487 124985;124986;124987 124985 3 EMVLELIR Unmodified 1001.558 0.55795237 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 3 1 1 1 2 1 1 1 1 1 100.84 100.84 2 0.0036361 107252 QUIQUE_C1277_190116_001 116.88 0 795420000 116680000 151430000 60294000 26169000 65488000 112190000 61732000 32136000 28061000 0 80076000 0 61165000 11195 909 10477 98488;98489;98490;98491;98492;98493;98494;98495;98496;98497;98498;98499;98500;98501;98502 124988;124989;124990;124991;124992;124993;124994;124995;124996;124997;124998;124999;125000;125001;125002;125003;125004;125005 124993 18 EMVQNLMVLR Unmodified 1231.6417 0.64169877 2024 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125011;125012;125013;125014;125015;125016;125017;125018;125019;125020;125021;125022;125023;125024;125025;125026;125027 125015 17 EMYSVEEAEQLMTLISAAR Oxidation (M) 2186.0235 0.023520498 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 1 0 1 1 164.05 164.05 2 0.018623 170594 QUIQUE_C1438_190116_001 43.594 30.614 13585000 0 0 0 0 13585000 0 0 0 0 0 0 0 0 11199 1579 10480 98521;98522 125028;125029 125028 2 EMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAK Unmodified 2852.4459 0.44588931 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 1 3 2 1 168.73 168.73 2;3 1.8957E-19 175818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.57 148.34 1700000000 71652000 88711000 187380000 78046000 114330000 183080000 145320000 119550000 196100000 0 261260000 136550000 118010000 11200 1487 10481 98523;98524;98525;98526;98527;98528;98529;98530;98531;98532;98533;98534;98535;98536;98537;98538;98539;98540;98541;98542 125030;125031;125032;125033;125034;125035;125036;125037;125038;125039;125040;125041;125042;125043;125044;125045;125046;125047;125048;125049;125050;125051;125052;125053;125054 125049 23 EMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAK Oxidation (M) 2868.4408 0.44080393 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 1 0 1 1 166.96 166.96 3 0.00041984 168738 QUIQUE_C1563_190116_001 41.763 35.258 88981000 0 0 0 0 0 61114000 0 0 0 27867000 0 0 0 11201 1487 10481 98543;98544 125055;125056 125055 825 2 ENAAAESGSESSSQEATPEK Unmodified 2007.8505 0.85050139 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7ESQ0 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 18.477 18.477 2 5.2185E-30 11011 QUIQUE_C1218_190116_001 180.62 172.71 12028000 12028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11202 665 10482 98545 125057 125057 1 ENAAAPSPVR Unmodified 1010.5145 0.51450765 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.338 17.338 2 1.7826E-07 9709 QUIQUE_C1368_190116_001 152.38 116.94 3399900000 395230000 303860000 246750000 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1080400000 43340000 0 0 128770000 123520000 133340000 123650000 113590000 251580000 0 123990000 0 38656000 11205 2071 10485 98569;98570;98571;98572;98573;98574;98575;98576;98577;98578;98579;98580;98581;98582;98583;98584;98585;98586;98587;98588;98589 125093;125094;125095;125096;125097;125098;125099;125100;125101;125102;125103;125104;125105;125106;125107;125108;125109;125110;125111;125112;125113;125114;125115 125097 20 ENAEVDGDDDAEEMEAK Unmodified 1865.7109 0.71089637 1883 P05198 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 46.927 46.927 2 2.245E-44 44823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 171.73 169.98 143100000 0 34952000 29712000 0 24578000 0 0 24628000 0 0 29233000 0 0 11206 1883 10486 98590;98591;98592;98593;98594 125116;125117;125118;125119;125120 125120 4 ENALNNLDPNTELNVSR Unmodified 1911.9286 0.92863256 4608 Q9Y4J8;K7ERZ2;K7ESB2;K7EJ84 DTNA Dystrobrevin alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.21 92.21 2 7.9317E-63 94144 QUIQUE_DMIX3_190116_001 226.59 180.71 1188000000 85034000 77787000 97981000 90021000 80074000 0 114970000 93483000 123500000 59795000 135440000 102980000 126940000 11207 4608 10487 98595;98596;98597;98598;98599;98600;98601;98602;98603;98604;98605;98606 125121;125122;125123;125124;125125;125126;125127;125128;125129;125130;125131;125132 125128 10 ENAPAIIFIDEIDAIATK Unmodified 1943.0252 0.025158703 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 3 2 3 1 2 3 2 3 2 1 2 2 2 170.29 170.29 2;3 1.6344E-32 175170 QUIQUE_C1368_190116_001 196.74 174.41 3335100000 279420000 222510000 322320000 251590000 264130000 164360000 218230000 282450000 256650000 46425000 405550000 336690000 284780000 11208 2466 10488 98607;98608;98609;98610;98611;98612;98613;98614;98615;98616;98617;98618;98619;98620;98621;98622;98623;98624;98625;98626;98627;98628;98629;98630;98631;98632;98633;98634 125133;125134;125135;125136;125137;125138;125139;125140;125141;125142;125143;125144;125145;125146;125147;125148;125149;125150;125151;125152;125153;125154;125155;125156;125157;125158;125159;125160;125161;125162;125163 125141 24 ENAPAIIFIDEIDAIATKR Unmodified 2099.1263 0.12626973 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 162.89 162.89 3 2.4772E-05 169974 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.44 77.276 206340000 0 0 0 0 0 0 0 47784000 45783000 0 52051000 44101000 16619000 11209 2466 10489 98635;98636;98637;98638;98639;98640 125164;125165;125166;125167;125168;125169;125170;125171;125172 125170 8 ENASPAPGTTAEEAMSR Unmodified 1717.7577 0.7577274 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 47.389 47.389 2 0.027773 45030 QUIQUE_C1576_190116_001 54.276 46.051 21170000 0 0 0 0 0 0 21170000 0 0 0 0 0 0 11210 7 10490 98641 125173 125173 1 ENAYDLEANLAVLK Unmodified 1561.7988 0.79878758 4404 Q9UBQ5;K7ES31;K7ERF1 EIF3K Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.26 122.26 2 0.0001657 128047 QUIQUE_C1218_190116_001 97.734 79.466 489910000 0 0 141780000 0 0 0 117800000 0 0 0 0 100690000 129650000 11211 4404 10491 98642;98643;98644;98645;98646;98647 125174;125175;125176;125177;125178;125179 125174 6 ENCLILAVSPANSDLANSDALK Unmodified 2314.1475 0.14747546 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 3 2 2 2 3 2 2 1 1 2 3 2 125.36 125.36 2;3 4.1447E-166 129042 QUIQUE_C1277_190116_001 237.4 207.1 4213600000 219060000 304920000 425080000 322180000 471180000 324990000 512540000 227070000 0 72511000 470720000 461430000 401870000 11212 269;2893 10492 98648;98649;98650;98651;98652;98653;98654;98655;98656;98657;98658;98659;98660;98661;98662;98663;98664;98665;98666;98667;98668;98669;98670;98671;98672;98673 125180;125181;125182;125183;125184;125185;125186;125187;125188;125189;125190;125191;125192;125193;125194;125195;125196;125197;125198;125199;125200;125201;125202;125203;125204;125205;125206;125207;125208;125209;125210;125211;125212;125213;125214;125215;125216;125217;125218;125219 125182 40 ENCLILAVTPANTDLANSDALK Unmodified 2342.1788 0.17877559 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.53 129.53 2 3.0909E-36 134090 QUIQUE_DMIX8_190116_001 183.6 165.19 407860000 0 63778000 62579000 67326000 0 40790000 0 0 0 0 70914000 54704000 47768000 11213 840;4528 10493 98674;98675;98676;98677;98678;98679;98680;98681;98682;98683 125220;125221;125222;125223;125224;125225;125226;125227;125228;125229;125230;125231 125231 12 ENCMMHLLR Unmodified 1202.5359 0.53585349 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.683 56.683 2;3 0.012073 54719 QUIQUE_C1368_190116_001 46.891 31.001 134400000 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98696;98697;98698;98699;98700;98701;98702;98703;98704;98705;98706;98707;98708;98709;98710;98711;98712;98713;98714;98715;98716;98717;98718;98719;98720;98721 125244;125245;125246;125247;125248;125249;125250;125251;125252;125253;125254;125255;125256;125257;125258;125259;125260;125261;125262;125263;125264;125265;125266;125267;125268;125269;125270;125271;125272;125273;125274;125275;125276;125277 125245 34 ENDAVWLATQNHSTLVTER Unmodified 2183.0607 0.060709362 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.817 85.817 3 3.5632E-12 87278 QUIQUE_C1403_190116_001 120.11 110.4 841840000 71045000 88966000 75430000 67596000 72007000 59338000 92088000 56982000 66271000 0 69471000 66721000 55927000 11217 245 10497 98722;98723;98724;98725;98726;98727;98728;98729;98730;98731;98732;98733 125278;125279;125280;125281;125282;125283;125284;125285;125286;125287;125288;125289;125290;125291;125292 125281 14 ENDPSGFLQISDALIR Unmodified 1773.8897 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2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.859 52.859 2 0.011743 50943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.55 38.584 1071300000 197480000 128160000 109540000 130480000 76232000 123690000 71238000 0 53926000 67567000 58022000 54995000 0 11222 3800 10502 98780;98781;98782;98783;98784;98785;98786;98787;98788;98789;98790 125343;125344;125345;125346;125347;125348;125349;125350;125351;125352;125353 125352 11 ENEGFTVTAEGK Unmodified 1280.5885 0.58846046 1803 P01024;M0QYC8 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 41.303 41.303 2 0.050577 35654 QUIQUE_DMIX4_190116_001 44.543 29.282 26919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26919000 0 0 0 11223 1803 10503 98791 125354 125354 1 ENEITGALLPCLDESR Unmodified 1815.8673 0.86727785 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Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 169.61 169.61 2;3 1.3092E-43 174183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.18 118.52 2080000000 0 59061000 277920000 23953000 83184000 51329000 182780000 148720000 164860000 0 502350000 335780000 250070000 11230 3053 10509 98839;98840;98841;98842;98843;98844;98845;98846;98847;98848;98849;98850;98851;98852;98853;98854;98855;98856;98857 125435;125436;125437;125438;125439;125440;125441;125442;125443;125444;125445;125446;125447;125448;125449;125450;125451;125452;125453;125454 125447 18 ENFLFLTPDCK Unmodified 1382.654 0.6540376 1806 P01042 KNG1 Kininogen-1;Kininogen-1 heavy chain;T-kinin;Bradykinin;Lysyl-bradykinin;Kininogen-1 light chain;Low molecular weight growth-promoting factor yes yes 0 0 0 1 1 115.65 115.65 2 0.011446 120154 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.353 40.483 32313000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32313000 11231 1806 10510 98858;98859 125455;125456 125456 2 ENFMTVDQDGSGTVEHHELR Unmodified 2300.0128 0.012772891 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676;C9JIZ3 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 59.879 59.879 3;4 3.3803E-19 58401 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.11 117.17 1034900000 87430000 120020000 112490000 127390000 92528000 49882000 47824000 94832000 97957000 0 105800000 0 98767000 11232 1210 10511 98860;98861;98862;98863;98864;98865;98866;98867;98868;98869;98870;98871;98872;98873;98874;98875;98876;98877 125457;125458;125459;125460;125461;125462;125463;125464;125465;125466;125467;125468;125469;125470;125471;125472;125473;125474;125475 125474 18 ENFMTVDQDGSGTVEHHELR Oxidation (M) 2316.0077 0.007687513 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676;C9JIZ3 GCA Grancalcin yes no 0 1 0 1 45.554 45.554 4 0.0057485 42658 QUIQUE_C1368_190116_001 40.689 36.037 50039000 0 0 50039000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11233 1210 10511 98878 125476 125476 699 0 ENFQKPGNVK Unmodified 1159.5986 0.59857163 1229 H7C1U8;Q9BUR5;A0A0J9YWW6 APOO Apolipoprotein O yes no 0 0 1 1 1 1 14.456 14.456 2 0.002078 6854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.99 78.592 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125518;125519;125520;125521;125522;125523;125524;125525;125526;125527;125528;125529 125527 12 ENGINGELTSADRETAEEVSAR Unmodified 2347.0888 0.088774606 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 73.437 73.437 3 4.2071E-07 73010 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.287 68.686 30376000 0 0 0 0 0 0 0 30376000 0 0 0 0 0 11239 2009 10517 98915 125530 125530 1 ENGLPLEYQEK Unmodified 1318.6405 0.64049603 1618 O75223;M0QZK8 GGCT Gamma-glutamylcyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 60.711 60.711 2 0.0086663 59812 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.939 52.425 774870000 0 0 113580000 102430000 0 0 0 155650000 138620000 0 131810000 132790000 0 11240 1618 10518 98916;98917;98918;98919;98920;98921;98922 125531;125532;125533;125534;125535;125536;125537 125535 6 ENGTVTAANASTLNDGAAALVLMTADAAK Unmodified 2760.36 0.35998743 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 151.04 151.04 2;3 1.9047E-54 155889 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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62779 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.58 168.6 1568800000 79224000 170810000 168290000 101210000 247720000 88586000 98051000 131540000 81594000 66490000 192120000 71430000 71708000 11243 3958 10521 98946;98947;98948;98949;98950;98951;98952;98953;98954;98955;98956;98957;98958;98959;98960;98961;98962;98963;98964;98965;98966 125566;125567;125568;125569;125570;125571;125572;125573;125574;125575;125576;125577;125578;125579;125580;125581;125582;125583;125584;125585;125586;125587;125588;125589 125580 22 ENGVYLIDVK Unmodified 1148.6077 0.60773933 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 78.679 78.679 2 0.038902 81290 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.528 29.677 68981000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68981000 0 0 11244 2178 10522 98967 125590 125590 1 ENIASVLENYHTESK Unmodified 1732.8268 0.82679325 3373 Q6NVY1;B9A058;F8W8A6 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.809 81.809 2;3 0.0004994 82706 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.46 61.864 1053500000 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125604;125605;125606;125607;125608;125609;125610 125604 5 ENIIAVATTNNLYIFQDK Unmodified 2066.0684 0.068420501 2781 P63151 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes yes 0 0 0 1 143.64 143.64 2 1.0292E-10 139559 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.08 82.557 24791000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24791000 0 0 0 11248 2781 10526 98988 125611 125611 1 ENILEEFSK Unmodified 1107.5448 0.54480473 1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 100 100 2 0.00051641 102747 QUIQUE_C1368_190116_001 112.84 60.987 485130000 53927000 0 56109000 38516000 75177000 41127000 53853000 27237000 42808000 29405000 0 36170000 30797000 11249 1525 10527 98989;98990;98991;98992;98993;98994;98995;98996;98997;98998;98999;99000 125612;125613;125614;125615;125616;125617;125618;125619;125620;125621;125622;125623;125624;125625;125626 125614 14 ENILFGMGNPLLDISAVVDKDFLDK Oxidation (M) 2778.415 0.41498311 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 170.84 170.84 3 4.138E-30 175761 QUIQUE_C1368_190116_001 130.6 123.49 587140000 0 85348000 138300000 0 0 91711000 0 0 0 0 115530000 0 156250000 11250 2663 10528 99001;99002;99003;99004;99005 125627;125628;125629;125630;125631 125628 2110 5 ENILFGMGNPLLDISAVVDKDFLDK Unmodified 2762.4201 0.42006849 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 173.34 173.34 3 2.426E-63 177576 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.71 130.16 341960000 0 0 0 0 14334000 0 16971000 0 44822000 0 121250000 62597000 81994000 11251 2663 10528 99006;99007;99008;99009;99010;99011 125632;125633;125634;125635;125636;125637 125634 4 ENIMVAFK Unmodified 950.48954 0.48953845 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 72.101 72.101 1;2 1.2363E-05 72325 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.03 116 7496100000 142500000 1571800000 118210000 125690000 0 76781000 1086300000 1098100000 1797600000 377370000 0 1101800000 0 11252 2661 10529 99012;99013;99014;99015;99016;99017;99018;99019;99020;99021;99022;99023;99024 125638;125639;125640;125641;125642;125643;125644;125645;125646;125647;125648;125649;125650;125651 125649 7 ENIMVAFK Oxidation (M) 966.48445 0.48445308 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.643 50.643 2 0.020614 48828 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.635 38.916 4011600000 0 352100000 0 0 0 218850000 260970000 510880000 685580000 379310000 594570000 478960000 530330000 11253 2661 10529 99025;99026;99027;99028;99029;99030;99031;99032;99033 125652;125653;125654;125655;125656;125657;125658;125659;125660;125661;125662 125660 11 ENIPTPALEPQTTVIHNPDGNK Unmodified 2384.1972 0.19720284 896 E9PBG7;E9PF82 CAMK2D yes no 0 0 0 1 1 1 1 79.93 79.93 3 0.00023958 81344 QUIQUE_C1218_190116_001 49.076 40.889 960190000 50654000 383640000 0 313690000 0 212210000 0 0 0 0 0 0 0 11254 896 10530 99034;99035;99036;99037 125663;125664;125665;125666 125663 4 ENISEWR Unmodified 932.43519 0.4351947 591 B1ALA9;P60891;A0A2R8Y7H4 PRPS1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.7 40.7 2 0.0030838 36307 QUIQUE_C1368_190116_001 163.84 76.91 1019700000 214960000 169670000 146510000 166890000 0 148990000 172690000 0 0 0 0 0 0 11255 591 10531 99038;99039;99040;99041;99042;99043 125667;125668;125669;125670;125671;125672;125673;125674 125670 8 ENIVEAIIHSPELIR Unmodified 1731.9519 0.95193418 1727 O95373;E9PLB2 IPO7 Importin-7 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 141.82 141.82 2;3 1.2099E-18 146576 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.31 132.97 2068900000 148230000 134100000 225510000 167030000 180660000 140490000 164490000 132020000 179730000 83373000 189810000 156880000 166530000 11256 1727 10532 99044;99045;99046;99047;99048;99049;99050;99051;99052;99053;99054;99055;99056;99057;99058;99059;99060;99061;99062;99063;99064;99065;99066;99067;99068;99069 125675;125676;125677;125678;125679;125680;125681;125682;125683;125684;125685;125686;125687;125688;125689;125690;125691;125692;125693;125694;125695;125696;125697;125698;125699;125700;125701;125702;125703;125704;125705;125706;125707;125708;125709;125710;125711;125712;125713;125714 125703 39 ENIVIQCEAK Unmodified 1202.5965 0.59652272 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43;C9JF43;C9J8B6 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.51 36.51 2 0.00019619 32514 QUIQUE_C1218_190116_001 123.86 86.302 2327800000 335210000 356260000 311920000 302680000 0 0 385440000 209870000 0 104330000 0 322090000 0 11257 756 10533 99070;99071;99072;99073;99074;99075;99076;99077 125715;125716;125717;125718;125719;125720;125721;125722;125723;125724 125715 9 ENIWDGVTTK Unmodified 1161.5666 0.5666028 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.282 75.282 2 0.0080717 74861 QUIQUE_C1563_190116_001 72.243 33.921 250880000 0 0 0 66467000 0 63012000 121400000 0 0 0 0 0 0 11258 1894 10534 99078;99079;99080;99081 125725;125726;125727;125728;125729 125726 4 ENKEFLEFR Unmodified 1210.5982 0.59823728 1622 O75323;H7C333;C9K068;C9J7B1 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 55.513 55.513 2;3 0.0016769 54004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.749 53.006 374720000 0 30538000 0 0 43295000 0 35227000 70745000 0 0 78696000 58781000 57438000 11259 1622 10535 99082;99083;99084;99085;99086;99087;99088;99089 125730;125731;125732;125733;125734;125735;125736;125737;125738;125739;125740 125733 11 ENLATVEGNFASIDER Unmodified 1763.8326 0.83260691 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.77 104.77 2 2.368E-44 109107 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.02 158.16 4550800000 364590000 409060000 0 319270000 374520000 322790000 379760000 374950000 445540000 147010000 578000000 406280000 429040000 11260 3011 10536 99090;99091;99092;99093;99094;99095;99096;99097;99098;99099;99100;99101 125741;125742;125743;125744;125745;125746;125747;125748;125749;125750;125751;125752;125753;125754;125755;125756;125757;125758;125759;125760;125761 125757 20 ENLEEEAIIMK Oxidation (M) 1333.6435 0.64353249 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 64.547 64.547 2 0.00054147 64155 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.4 72.584 408610000 58511000 53376000 88683000 0 0 0 34463000 0 53836000 0 70901000 48843000 0 11261 4364;852 10537 99102;99103;99104;99105;99106;99107;99108;99109;99110 125762;125763;125764;125765;125766;125767;125768;125769;125770;125771;125772;125773 125770 499 11 ENLEEEAIIMK Unmodified 1317.6486 0.64861787 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.781 84.781 2 0.00059478 86060 QUIQUE_C1368_190116_001 113.22 66.328 997850000 208370000 0 179110000 0 88847000 0 155180000 129220000 0 60420000 0 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99144;99145;99146;99147;99148;99149;99150;99151;99152;99153;99154;99155;99156 125809;125810;125811;125812;125813;125814;125815;125816;125817;125818;125819;125820;125821;125822;125823 125821 14 ENLLDFIK Unmodified 990.5386 0.53859714 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L312;I3L398;I3L4M2;I3NI03 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.37 127.37 2 0.0036613 132954 QUIQUE_C1218_190116_001 122.74 70.106 2298400000 239950000 229770000 223480000 206530000 230160000 230340000 206330000 0 124900000 100020000 186810000 139880000 180250000 11271 1917 10545 99157;99158;99159;99160;99161;99162;99163;99164;99165;99166;99167;99168 125824;125825;125826;125827;125828;125829;125830;125831;125832;125833;125834;125835;125836;125837;125838;125839;125840;125841;125842;125843;125844;125845;125846;125847 125825 24 ENLLEEQGSIALR Unmodified 1470.7678 0.7678218 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 5 4 4 4 3 3 4 4 4 3 4 2 3 96.523 96.523 2;3 1.3605E-52 98109 QUIQUE_C1277_190116_001 199.08 161.6 11732000000 848450000 976780000 768270000 777220000 897100000 834800000 786390000 874020000 1385800000 660760000 906270000 980110000 1035700000 11272 267;275;3025 10546 99169;99170;99171;99172;99173;99174;99175;99176;99177;99178;99179;99180;99181;99182;99183;99184;99185;99186;99187;99188;99189;99190;99191;99192;99193;99194;99195;99196;99197;99198;99199;99200;99201;99202;99203;99204;99205;99206;99207;99208;99209;99210;99211;99212;99213;99214;99215 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126270 3 ENQDYVPGER Unmodified 1205.5313 0.53127993 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 29.502 29.502 2 0.029155 24286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.299 36.132 151240000 0 0 0 0 0 0 50994000 42815000 57427000 0 0 0 0 11307 1510 10580 99505;99506;99507 126271;126272;126273 126272 3 ENQEGAANVNVR Unmodified 1299.6167 0.61674089 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.117 20.117 2 4.1202E-05 12700 QUIQUE_C1563_190116_001 127.3 95.928 1071500000 73934000 85531000 97886000 133370000 101900000 142090000 98922000 0 103860000 38054000 86514000 0 109390000 11308 3565 10581 99508;99509;99510;99511;99512;99513;99514;99515;99516;99517;99518 126274;126275;126276;126277;126278;126279;126280;126281;126282;126283;126284;126285 126279 10 ENQELNAHNQELNNR Unmodified 1821.8354 0.83540087 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 21.255 21.255 3 0.034543 14657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.592 34.429 40693000 0 0 0 0 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alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.842 78.842 2 0.0022308 79835 QUIQUE_C1277_190116_001 91.085 56.683 315800000 55073000 36570000 47156000 0 0 0 34807000 0 35363000 24053000 0 35146000 47636000 11317 1266;3022 10590 99568;99569;99570;99571;99572;99573;99574;99575;99576;99577;99578 126341;126342;126343;126344;126345;126346;126347;126348;126349;126350;126351;126352;126353 126342 13 ENSETVVTGSLDDLVK Unmodified 1704.8418 0.84177461 1171 H0YN81;Q9GZS3;H0YMF9;H0YM76 WDR61 WD repeat-containing protein 61;WD repeat-containing protein 61, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.62 108.62 2 0.00086559 105806 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.18 74.564 734830000 83584000 85268000 90255000 78028000 89711000 0 0 85185000 76422000 33669000 0 0 112700000 11318 1171 10591 99579;99580;99581;99582;99583;99584;99585;99586;99587 126354;126355;126356;126357;126358;126359;126360;126361;126362;126363;126364 126363 11 ENSIEILSSTIKPYNAEDNENFK Unmodified 2654.2712 0.27115565 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.89 114.89 3 2.3534E-74 118696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.7 168.14 1535000000 0 0 153480000 0 181370000 0 0 201820000 274610000 66931000 230430000 200890000 225460000 11319 4315 10592 99588;99589;99590;99591;99592;99593;99594;99595 126365;126366;126367;126368;126369;126370;126371;126372;126373;126374;126375 126369 11 ENSLKTDDYGR Unmodified 1296.5946 0.59460847 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 18.711 18.711 2;3 0.032387 11645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.247 23.6 114700000 0 0 0 0 0 0 0 114700000 0 0 0 0 0 11320 267;275;3025 10593 99596;99597 126376;126377 126376 2 ENSQLDEENLELR Unmodified 1587.7376 0.73764389 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52 CCDC88A Girdin yes no 0 0 0 1 1 1 70.408 70.408 2 5.114E-06 71267 QUIQUE_C1218_190116_001 152.7 117.15 88266000 25331000 0 0 0 32695000 30240000 0 0 0 0 0 0 0 11321 473 10594 99598;99599;99600 126378;126379;126380 126378 2 ENSTLNCASFTAGIVEAVLTHSGFPAK Unmodified 2820.3752 0.37524356 3527 Q8IUR0;M0QZQ8 TRAPPC5 Trafficking protein particle complex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 167.21 167.21 3 6.7507E-55 169155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.04 140.02 298200000 20792000 49111000 0 0 0 0 71044000 92070000 65181000 0 0 0 0 11322 3527 10595 99601;99602;99603;99604;99605 126381;126382;126383;126384;126385 126384 4 ENSVDVYQVAK Unmodified 1250.6143 0.61428128 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 46.026 46.026 2 0.03115 43509 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.908 44.803 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11323 2217 10596 99606 126386 126386 1 ENTEFSELELQEWYK Unmodified 1943.8789 0.8788884 2826 P84074 HPCA Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.62 134.62 2 6.4506E-09 138737 QUIQUE_C1403_190116_001 154.28 139.38 394810000 53285000 41279000 52266000 39553000 23220000 24094000 49939000 0 28184000 0 0 41202000 41789000 11324 2826 10597 99607;99608;99609;99610;99611;99612;99613;99614;99615;99616;99617 126387;126388;126389;126390;126391;126392;126393;126394;126395;126396;126397;126398;126399 126391 11 ENTEFTDHELQEWYK Unmodified 1967.8537 0.85373628 2407 P37235;E9PC71 HPCAL1 Hippocalcin-like protein 1 yes no 0 0 0 3 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 93.95 93.95 2;3 1.1862E-283 97554 QUIQUE_C1218_190116_001 306.07 263.26 1439300000 183780000 219180000 207150000 27500000 0 114980000 221890000 0 102190000 8910800 157010000 38148000 158560000 11325 2407 10598 99618;99619;99620;99621;99622;99623;99624;99625;99626;99627;99628;99629;99630;99631;99632;99633;99634;99635;99636;99637;99638 126400;126401;126402;126403;126404;126405;126406;126407;126408;126409;126410;126411;126412;126413;126414;126415;126416;126417;126418;126419;126420;126421 126401 21 ENTEGEYSGIEHVIVDGVVQSIK Unmodified 2501.2286 0.22856255 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YMU3 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 143.17 143.17 2;3 1.9003E-142 147476 QUIQUE_C1277_190116_001 266.29 238.95 13570000000 1426900000 1228800000 1661700000 894860000 930120000 883060000 1288500000 540730000 1147300000 516590000 1013600000 1082200000 955500000 11326 2558 10599 99639;99640;99641;99642;99643;99644;99645;99646;99647;99648;99649;99650;99651;99652;99653;99654;99655;99656;99657;99658;99659;99660;99661;99662;99663;99664;99665 126422;126423;126424;126425;126426;126427;126428;126429;126430;126431;126432;126433;126434;126435;126436;126437;126438;126439;126440;126441;126442;126443;126444;126445;126446;126447;126448;126449;126450;126451;126452;126453;126454;126455;126456;126457;126458;126459;126460;126461;126462;126463;126464;126465;126466;126467;126468 126428 47 ENTEGEYSSLEHESVAGVVESLK Unmodified 2492.1555 0.15545719 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 118.32 118.32 2;3 4.4382E-127 122415 QUIQUE_C1368_190116_001 205.78 194.34 5972000000 687840000 642890000 488130000 368210000 388530000 362850000 553870000 270010000 481030000 166780000 560320000 537190000 464400000 11327 2582 10600 99666;99667;99668;99669;99670;99671;99672;99673;99674;99675;99676;99677;99678;99679;99680;99681;99682;99683;99684;99685;99686;99687;99688;99689 126469;126470;126471;126472;126473;126474;126475;126476;126477;126478;126479;126480;126481;126482;126483;126484;126485;126486;126487;126488;126489;126490;126491;126492;126493;126494;126495;126496;126497;126498;126499;126500;126501;126502;126503;126504;126505;126506 126478 38 ENTLNQLVGAAFGAAGQR Unmodified 1815.9228 0.92275932 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 141.84 141.84 2;3 9.5356E-182 144468 QUIQUE_C1563_190116_001 253.79 235.17 7361400000 1010400000 530380000 816070000 963720000 708710000 1145700000 466720000 191240000 297350000 374070000 333780000 256440000 266820000 11328 2870 10601 99690;99691;99692;99693;99694;99695;99696;99697;99698;99699;99700;99701;99702;99703;99704;99705;99706;99707;99708 126507;126508;126509;126510;126511;126512;126513;126514;126515;126516;126517;126518;126519;126520;126521;126522;126523;126524;126525;126526;126527;126528;126529;126530;126531;126532 126519 26 ENVFPGTTTR Unmodified 1120.5513 0.55128709 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.899 39.899 2 0.0039331 35853 QUIQUE_C1403_190116_001 82.645 30.242 808940000 126900000 119310000 0 85755000 0 74765000 118110000 0 50658000 41443000 92521000 0 99480000 11329 1877 10602 99709;99710;99711;99712;99713;99714;99715;99716;99717 126533;126534;126535;126536;126537;126538;126539;126540;126541;126542 126536 9 ENVFQEHQTLK Unmodified 1371.6783 0.67827852 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.27 34.27 2 0.00078221 29452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.573 69.635 286020000 0 33763000 0 77386000 40756000 44421000 0 0 0 17187000 26628000 0 45878000 11330 3056 10603 99718;99719;99720;99721;99722;99723;99724 126543;126544;126545;126546;126547;126548;126549 126547 7 ENVIMSQILPCIK Unmodified 1543.8102 0.81022067 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 128.7 128.7 2;3 3.9235E-17 131663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.67 138.32 4076500000 214200000 355320000 296170000 268320000 314760000 246410000 328260000 350150000 355530000 78750000 338410000 433700000 496560000 11331 2309 10604 99725;99726;99727;99728;99729;99730;99731;99732;99733;99734;99735;99736;99737;99738;99739;99740;99741;99742;99743;99744;99745;99746;99747;99748 126550;126551;126552;126553;126554;126555;126556;126557;126558;126559;126560;126561;126562;126563;126564;126565;126566;126567;126568;126569;126570;126571;126572;126573;126574;126575;126576;126577;126578;126579;126580;126581;126582;126583;126584;126585;126586;126587;126588 126572 39 ENVLIGDGAGFK Unmodified 1218.6245 0.62445203 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.589 75.589 2 5.4825E-05 77251 QUIQUE_C1438_190116_001 125.75 76.95 2105100000 141790000 142550000 198530000 163750000 147290000 143900000 173890000 218440000 195690000 47154000 201970000 148940000 181220000 11332 666 10605 99749;99750;99751;99752;99753;99754;99755;99756;99757;99758;99759;99760;99761 126589;126590;126591;126592;126593;126594;126595;126596;126597;126598;126599;126600;126601;126602;126603;126604;126605 126595 15 ENVLVETLNHEMYEAK Oxidation (M) 1933.9091 0.90914267 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 3 2 1 2 2 2 1 4 1 3 2 3 3 86.495 86.495 2;3 4.9875E-80 87945 QUIQUE_C1277_190116_001 212.83 195.66 2774000000 204030000 210650000 145930000 177730000 142670000 152280000 0 429420000 239660000 202770000 305400000 281380000 282120000 11333 2261 10606 99762;99763;99764;99765;99766;99767;99768;99769;99770;99771;99772;99773;99774;99775;99776;99777;99778;99779;99780;99781;99782;99783;99784;99785;99786;99787;99788;99789;99790 126606;126607;126608;126609;126610;126611;126612;126613;126614;126615;126616;126617;126618;126619;126620;126621;126622;126623;126624;126625;126626;126627;126628;126629;126630;126631;126632;126633;126634;126635;126636;126637;126638;126639;126640 126612 1624 33 ENVLVETLNHEMYEAK Unmodified 1917.9142 0.91422805 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 1 1 3 111.28 111.28 2;3 6.6235E-130 114423 QUIQUE_C1403_190116_001 279.56 257.33 8332000000 730490000 871030000 963440000 677700000 637560000 547940000 260730000 525230000 810240000 356510000 576040000 653450000 721680000 11334 2261 10606 99791;99792;99793;99794;99795;99796;99797;99798;99799;99800;99801;99802;99803;99804;99805;99806;99807;99808;99809;99810;99811;99812;99813;99814;99815 126641;126642;126643;126644;126645;126646;126647;126648;126649;126650;126651;126652;126653;126654;126655;126656;126657;126658;126659;126660;126661;126662;126663;126664;126665;126666;126667;126668;126669;126670;126671;126672;126673;126674;126675;126676;126677;126678;126679;126680;126681;126682;126683;126684;126685;126686;126687;126688;126689;126690;126691;126692 126655 51 ENVNATENCISAVGK Unmodified 1604.7464 0.74643444 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 49.125 49.125 2 0.0093755 44067 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.089 54.824 18755000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18755000 0 0 0 11335 1403 10607 99816 126693 126693 1 ENVNLAQIR Unmodified 1055.5724 0.57235688 2506 P48444;B0YIW6;Q6P1Q5 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.674 47.674 2 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67.031 27525000 0 0 0 0 0 0 0 27525000 0 0 0 0 0 11340 1627 10612 99855 126749 126749 1 ENVQDVLPALPNPDDYFLLR Unmodified 2327.1798 0.17976186 1680 O76054;Q9UDX4;F8WEE7;C9JTM4 SEC14L2;SEC14L3 SEC14-like protein 2;SEC14-like protein 3 yes no 0 0 0 1 3 1 2 2 3 1 2 1 2 164.61 164.61 2;3 8.0584E-18 168478 QUIQUE_C1277_190116_001 162.37 141.42 1252600000 67356000 175290000 92713000 182240000 125500000 219120000 86057000 0 0 82012000 0 126980000 95295000 11341 1680 10613 99856;99857;99858;99859;99860;99861;99862;99863;99864;99865;99866;99867;99868;99869;99870;99871;99872;99873 126750;126751;126752;126753;126754;126755;126756;126757;126758;126759;126760;126761;126762;126763;126764;126765;126766;126767;126768;126769;126770;126771;126772;126773;126774;126775;126776;126777;126778 126757 25 ENVVQSVTSVAEK Unmodified 1388.7147 0.7147236 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.1 75.1 2 1.4842E-17 76867 QUIQUE_C1218_190116_001 165.66 145.63 2236500000 379120000 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ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 134.7 134.7 2 0.00051982 140086 QUIQUE_C1368_190116_001 95.401 71.652 55824000 0 0 33873000 0 0 0 0 0 0 0 0 21951000 0 11344 1211 10616 99901;99902;99903;99904 126815;126816;126817;126818 126816 4 ENYLFVCSCPK Unmodified 1415.6214 0.62135726 3359 Q6GMV2 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.295 78.295 2 0.0029139 79161 QUIQUE_C1277_190116_001 75.387 57.951 135350000 14608000 22172000 23795000 0 0 23351000 0 29765000 21656000 0 0 0 0 11345 3359 10617 99905;99906;99907;99908;99909;99910;99911 126819;126820;126821;126822;126823;126824;126825 126820 6 ENYPLYIR Unmodified 1066.5447 0.54474515 211 A0A0B4J294;H3BP13;Q9UL33;H3BPN3;A0A0B4J286 TRAPPC2L Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein yes no 0 0 0 1 1 68.148 68.148 2 0.036561 69115 QUIQUE_C1576_190116_001 62.717 0.171 184150000 0 0 0 0 0 0 83236000 0 0 0 0 0 100910000 11346 211 10618 99912;99913 126826;126827 126826 2 ENYTWSQDYTDLEVR Unmodified 1917.8381 0.83808621 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.17 113.17 2 2.4791E-07 115701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.18 138.99 465950000 0 0 43478000 48889000 43412000 40779000 50309000 56223000 26959000 0 54121000 43254000 58522000 11347 3532 10619 99914;99915;99916;99917;99918;99919;99920;99921;99922;99923 126828;126829;126830;126831;126832;126833;126834;126835;126836;126837 126833 7 ENYVWNVLLHR Unmodified 1441.7466 0.74663285 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.27 115.27 3 0.00052869 119375 QUIQUE_C1277_190116_001 82.261 65.144 123240000 0 12792000 16869000 11143000 17749000 0 12275000 0 0 0 19720000 17578000 15115000 11348 3730 10620 99924;99925;99926;99927;99928;99929;99930;99931;99932;99933;99934 126838;126839;126840;126841;126842;126843;126844;126845;126846;126847;126848 126839 10 EPAAAISRPR Unmodified 1066.5883 0.5883413 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 15.108 15.108 2;3 2.8108E-22 6985 QUIQUE_DMIX8_190116_001 189.38 152.98 761530000 18563000 32479000 73860000 40611000 93619000 32285000 48875000 52791000 63355000 0 71494000 59259000 174330000 11349 605;4460 10621 99935;99936;99937;99938;99939;99940;99941;99942;99943;99944;99945;99946;99947;99948;99949;99950 126849;126850;126851;126852;126853;126854;126855;126856;126857;126858;126859;126860;126861;126862;126863;126864;126865;126866 126866 16 EPAAEIEALLGMDLVR Oxidation (M) 1741.892 0.89203604 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 152.71 152.71 2;3 6.5663E-95 157539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 219.42 196.5 7225500000 447810000 478310000 614530000 494510000 515040000 836220000 538560000 319670000 751560000 438180000 590020000 526750000 674300000 11350 2941 10622 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96.778 2;3 4.3426E-36 99768 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.04 155.69 369190000 0 0 0 0 0 0 0 22920000 171870000 0 129920000 0 44479000 11356 166 10626 100069;100070;100071;100072;100073;100074 127034;127035;127036;127037;127038;127039;127040 127037 94;95 7 EPAHLMSLFGGKPMIIYK Unmodified 2031.0686 0.068560618 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 107.39 107.39 2;3;4 9.9992E-21 111990 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.58 121.44 1275100000 0 0 0 0 0 0 0 250500000 204680000 0 212070000 408860000 198950000 11357 166 10626 100075;100076;100077;100078;100079;100080;100081;100082 127041;127042;127043;127044;127045;127046;127047;127048;127049;127050 127047 9 EPANVGVTK Unmodified 913.4869 0.48689592 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 14.775 14.775 2 0.060033 7080 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.96 21.163 11655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11655000 0 0 0 11358 4050 10627 100083 127051 127051 1 EPAPDSGLLGLFQGQNSLLH Unmodified 2092.0589 0.058918448 3799 Q96AB3 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 158.27 158.27 2;3 1.8566E-23 163915 QUIQUE_C1218_190116_001 173.25 160.33 1119500000 192750000 156270000 216880000 105310000 142690000 91548000 0 0 45653000 0 0 0 168360000 11359 3799 10628 100084;100085;100086;100087;100088;100089;100090;100091;100092;100093;100094;100095 127052;127053;127054;127055;127056;127057;127058;127059;127060;127061;127062;127063;127064;127065;127066 127053 14 EPATINYPFEK Unmodified 1307.6398 0.63976774 1387 O00217;E9PPW7;E9PKH6;E9PN51;F8W9K7 NDUFS8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.866 76.866 2 0.00045729 77703 QUIQUE_C1277_190116_001 111.61 97.837 1521700000 282590000 247310000 0 144770000 169230000 195300000 204270000 174410000 0 103800000 0 0 0 11360 1387 10629 100096;100097;100098;100099;100100;100101;100102;100103;100104;100105;100106;100107;100108 127067;127068;127069;127070;127071;127072;127073;127074;127075;127076;127077;127078;127079;127080;127081;127082;127083;127084 127070 18 EPAVGEPAEVTTTVLVR Unmodified 1766.9414 0.94142907 1885 P05362;K7EKL8 ICAM1 Intercellular adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.96 92.96 2 0.00028849 96558 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.075 78.563 190950000 0 20674000 34227000 27326000 0 30450000 0 23923000 38621000 15724000 0 0 0 11361 1885 10630 100109;100110;100111;100112;100113;100114;100115;100116 127085;127086;127087;127088;127089;127090;127091;127092 127092 6 EPAVLELEGK Unmodified 1083.5812 0.58119023 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.276 67.276 2 0.0020582 68174 QUIQUE_C1218_190116_001 92.051 57.665 2052000000 213450000 224490000 287730000 230580000 219800000 164020000 200470000 0 176490000 145090000 0 0 189850000 11362 2857 10631 100117;100118;100119;100120;100121;100122;100123;100124;100125;100126;100127;100128 127093;127094;127095;127096;127097;127098;127099;127100;127101;127102;127103;127104;127105;127106;127107;127108;127109;127110;127111 127093 19 EPAVLELEGKK Unmodified 1211.6762 0.67615325 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 41.38 41.38 2;3 0.0090664 38654 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.207 49.581 229040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105350000 123680000 11363 2857 10632 100129;100130;100131 127112;127113;127114 127112 3 EPCGGQNTVPGVR Unmodified 1369.6408 0.64084715 2006 P10915;D6RBS1 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 29.261 29.261 2 0.00017519 23665 QUIQUE_C1368_190116_001 142.83 119.4 814960000 88033000 112480000 90854000 95877000 69492000 80245000 178650000 0 39620000 16976000 42731000 0 0 11364 2006 10633 100132;100133;100134;100135;100136;100137;100138;100139;100140;100141;100142 127115;127116;127117;127118;127119;127120;127121;127122;127123;127124;127125;127126;127127;127128;127129;127130 127120 16 EPCGTPEYLAPEVVGR Unmodified 1772.8403 0.84033482 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 88.362 88.362 2 5.0278E-05 90584 QUIQUE_C1277_190116_001 124.12 106.75 275990000 71423000 85947000 64749000 0 53867000 0 0 0 0 0 0 0 0 11365 872;3632 10634 100143;100144;100145;100146 127131;127132;127133;127134 127132 3 EPDCFKDIVNMLMHHDR Unmodified 2155.9601 0.96014916 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2 130.73 130.73 3;4 3.5748E-07 135570 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.63 93.843 1686900000 52003000 144330000 126180000 74663000 84613000 54610000 147830000 211780000 144220000 0 238700000 155820000 252190000 11366 2016 10635 100147;100148;100149;100150;100151;100152;100153;100154;100155;100156;100157;100158;100159;100160;100161;100162 127135;127136;127137;127138;127139;127140;127141;127142;127143;127144;127145;127146;127147;127148;127149;127150;127151;127152;127153;127154;127155;127156;127157;127158;127159;127160;127161 127153 27 EPDCFKDIVNMLMHHDR Oxidation (M) 2171.9551 0.95506378 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 1 1 1 2 1 1 115.23 115.23 4 3.8617E-05 120012 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.153 84.222 215610000 0 0 0 0 0 0 0 0 48118000 0 84524000 46633000 36333000 11367 2016 10635 100163;100164;100165;100166;100167 127162;127163;127164;127165;127166 127162 1321;1322 5 EPECIHVMR Unmodified 1169.5321 0.53214833 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ENF6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 26.326 26.326 3 0.064781 20260 QUIQUE_C1576_190116_001 32.32 18.113 73177000 0 0 0 0 0 0 73177000 0 0 0 0 0 0 11368 335;1521 10636 100168 127167 127167 1 EPEEPSQDAPR Unmodified 1253.5524 0.5524093 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.169 19.169 2 0.002565 11949 QUIQUE_C1403_190116_001 100.25 87.889 118580000 0 0 0 42200000 23901000 0 25442000 0 0 0 0 27041000 0 11369 3612 10637 100169;100170;100171;100172;100173;100174;100175 127168;127169;127170;127171;127172;127173;127174 127169 3 EPEKEIRPALELLEPIEQK Unmodified 2260.2315 0.23146308 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 102.63 102.63 4 6.9353E-05 105060 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.007 76.914 288580000 0 0 30396000 0 0 0 0 60567000 49443000 0 76103000 72068000 0 11370 2560 10638 100176;100177;100178;100179;100180 127175;127176;127177;127178;127179 127179 3 EPELAAFVFK Unmodified 1149.607 0.60701105 2958 Q13009;A0A1B0GW57 TIAM1 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.83 121.83 2 0.008683 126589 QUIQUE_C1218_190116_001 83.265 57.528 32556000 13544000 0 0 9442900 0 0 0 0 0 9568400 0 0 0 11371 2958 10639 100181;100182;100183;100184;100185;100186 127180;127181;127182;127183;127184;127185 127180 6 EPELGLEELLR Unmodified 1296.6925 0.6925316 4350 Q9NZL4 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 131.48 131.48 2 0.0035438 136751 QUIQUE_C1218_190116_001 81.338 44.781 158230000 43145000 0 0 41937000 0 30254000 0 0 0 0 0 42896000 0 11372 4350 10640 100187;100188;100189;100190 127186;127187;127188;127189 127186 4 EPESILQVLSQMEK Unmodified 1629.8284 0.82837315 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 153.62 153.62 2;3 1.3162E-36 158340 QUIQUE_C1277_190116_001 226.93 211.62 12362000000 1233900000 1553200000 1245300000 1148600000 899490000 1379300000 947000000 420200000 562530000 406750000 1078400000 613140000 874460000 11373 2120 10641 100191;100192;100193;100194;100195;100196;100197;100198;100199;100200;100201;100202;100203;100204;100205;100206;100207;100208;100209;100210;100211;100212;100213;100214;100215 127190;127191;127192;127193;127194;127195;127196;127197;127198;127199;127200;127201;127202;127203;127204;127205;127206;127207;127208;127209;127210;127211;127212;127213;127214;127215;127216;127217;127218;127219;127220;127221;127222;127223;127224;127225;127226;127227;127228;127229 127196 40 EPESILQVLSQMEK Oxidation (M) 1645.8233 0.82328777 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 2 1 124.74 124.74 2;3 2.4119E-14 122257 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.28 131.69 150790000 0 57513000 0 0 0 0 0 0 0 44952000 48328000 0 0 11374 2120 10641 100216;100217;100218;100219 127230;127231;127232;127233 127232 1447 4 EPETQPVCFFR Unmodified 1408.6445 0.64453555 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 86.414 86.414 2 0.0020474 88037 QUIQUE_C1277_190116_001 93.551 74.457 185470000 65363000 62339000 57773000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11375 4500 10642 100220;100221;100222 127234;127235;127236 127235 3 EPEVLSTMAIIVNK Unmodified 1542.8327 0.83273025 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 126.82 126.82 3 0.0014817 129944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.211 40.577 29035000 0 11022000 0 0 0 0 0 8909200 0 0 0 0 9104500 11376 1470 10643 100223;100224;100225;100226;100227 127237;127238;127239;127240;127241 127239 5 EPFAPSLGSAFHLPDAPPAAAAAALYYSSSTLPAPPR Unmodified 3707.8624 0.86239748 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.12 162.12 3 1.8398E-70 165808 QUIQUE_C1277_190116_001 128.6 122.1 436440000 50493000 72366000 50858000 59369000 45040000 55026000 44767000 0 46730000 11790000 0 0 0 11377 855 10644 100228;100229;100230;100231;100232;100233;100234;100235;100236 127242;127243;127244;127245;127246;127247;127248;127249;127250;127251 127243 9 EPFELEAFYTNLHEVPYPDAR Unmodified 2536.1911 0.19105483 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 142.9 142.9 3 0.00012264 148186 QUIQUE_C1368_190116_001 85.737 80.981 771480000 179790000 152860000 186840000 0 0 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3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 104.01 104.01 2;3 1.5402E-12 106708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.91 108.24 3354900000 218680000 271150000 290560000 236400000 232110000 312530000 290490000 227590000 280160000 105130000 330200000 228970000 330970000 11381 3634 10648 100250;100251;100252;100253;100254;100255;100256;100257;100258;100259;100260;100261;100262;100263;100264;100265;100266;100267;100268;100269;100270;100271;100272;100273;100274;100275;100276 127267;127268;127269;127270;127271;127272;127273;127274;127275;127276;127277;127278;127279;127280;127281;127282;127283;127284;127285;127286;127287;127288;127289;127290;127291;127292;127293;127294;127295;127296;127297;127298;127299;127300;127301;127302;127303;127304;127305;127306;127307;127308;127309;127310;127311;127312;127313;127314;127315;127316;127317;127318;127319;127320;127321 127302 55 EPFLQQLK Unmodified 1001.5546 0.55458155 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 2 1 68.021 68.021 2 0.023727 68056 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.039 43.89 24220000 0 0 0 0 0 0 0 0 24220000 0 0 0 0 11382 574 10649 100277;100278;100279 127322;127323;127324 127324 3 EPFLSCCQFAESLR Unmodified 1742.7756 0.77562607 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000007350;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 114.67 114.67 2 2.5245E-05 119920 QUIQUE_C1438_190116_001 119.74 110.74 142090000 0 46944000 0 0 46065000 0 49079000 0 0 0 0 0 0 11383 290;327;328 10650 100280;100281;100282;100283 127325;127326;127327;127328;127329;127330 127328 6 EPFPTIYVDSQK Unmodified 1422.7031 0.70309628 1553 O43776;K7EIU7;K7EPK2;K7EQ35;K7EJ19 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.574 91.574 2 0.010013 92671 QUIQUE_C1403_190116_001 74.533 61.414 377820000 135300000 0 0 115350000 0 71128000 0 0 0 56043000 0 0 0 11384 1553 10651 100284;100285;100286;100287 127331;127332;127333;127334 127332 2 EPFPTIYVDSQKENER Unmodified 1950.9323 0.93232095 1553 O43776;K7EIU7;K7EPK2;K7EQ35;K7EJ19 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 1 73.182 73.182 2;3 9.7671E-06 73915 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.14 74.856 1550800000 0 31579000 106190000 84299000 130900000 0 140970000 166890000 229470000 37721000 189310000 215900000 217560000 11385 1553 10652 100288;100289;100290;100291;100292;100293;100294;100295;100296;100297;100298;100299;100300;100301;100302 127335;127336;127337;127338;127339;127340;127341;127342;127343;127344;127345;127346;127347;127348;127349;127350;127351;127352 127345 17 EPFTFPVK Unmodified 963.50657 0.50656873 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PPB5;E9PIP1;E9PR95;E9PSC3;E9PLC5;E9PLB3 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 82.752 82.752 2 0.054491 79429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.549 44.135 24777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24777000 0 0 0 11386 4127 10653 100303 127353 127353 1 EPFTIAQGK Unmodified 989.5182 0.51819605 2384 P35659;D6RDA2;H0Y8X0;D6R9L5 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 43.433 43.433 2 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Beta-1,4-glucuronyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 85.688 85.688 2 0.010434 87906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.127 28.409 82559000 0 0 0 0 0 24885000 0 0 30215000 0 27460000 0 0 11393 1531 10660 100326;100327;100328 127377;127378;127379;127380 127379 4 EPGLLASCSDDGEVAFWK Unmodified 1979.8935 0.8934926 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 130.59 130.59 2 0.0068226 134131 QUIQUE_C1403_190116_001 91.858 77.848 19711000 0 0 0 19711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11394 1682 10661 100329 127381 127381 0 EPGLQIWR Unmodified 997.53451 0.53451481 166;788;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.701 80.701 2 0.0036608 82082 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.24 68.684 11885000000 1046400000 883450000 1159700000 942790000 1017700000 913520000 1116300000 712240000 876380000 640590000 844430000 635780000 1095900000 + 11395 166;788;3305;311 10662 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Unmodified 2491.2358 0.23583696 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 165.85 165.85 2 1.4666E-27 172999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.46 142.35 414240000 0 17986000 29028000 0 0 0 68247000 0 115820000 0 94732000 88424000 0 11409 2522 10675 100470;100471;100472;100473;100474;100475;100476 127562;127563;127564;127565;127566;127567;127568;127569;127570 127569 8 EPLISGWLFFR Unmodified 1363.7289 0.72885752 2112 P16615;H7C5W9;O14983 ATP2A2;ATP2A1 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 159.49 159.49 2 0.0038272 166945 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.928 53.613 17114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17114000 0 0 11410 2112 10676 100477;100478 127571;127572 127572 2 EPLMEEYSIATQVWK Unmodified 1822.8811 0.881137 2854 Q01433 AMPD2 AMP deaminase 2 yes yes 0 0 0 1 1 138.41 138.41 2 0.0010443 144307 QUIQUE_C1576_190116_001 72.29 60.971 66791000 0 0 0 0 0 0 32819000 0 0 0 0 33973000 0 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0.36830769 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 1 0 1 119.07 119.07 3 0.00077306 115810 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.746 36.242 41179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41179000 0 0 0 11414 2051 10679 100496 127597 127597 1367 1 EPLPSLEAVYLITPSEK Unmodified 1885.0084 0.0084460064 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A0D9SFQ7;A0A0D9SFW6;A0A0D9SEP9;A0A0D9SEH5;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 141.13 141.13 2;3 2.0737E-37 146943 QUIQUE_C1218_190116_001 190.37 168.49 10126000000 1081500000 993950000 663680000 835380000 860480000 642830000 720890000 541580000 566900000 414180000 925890000 1048300000 830290000 11415 273;342 10680 100497;100498;100499;100500;100501;100502;100503;100504;100505;100506;100507;100508;100509;100510;100511;100512 127598;127599;127600;127601;127602;127603;127604;127605;127606;127607;127608;127609;127610;127611;127612;127613;127614;127615;127616;127617;127618;127619;127620;127621;127622;127623;127624;127625;127626;127627 127598 30 EPLPTLPLGR Unmodified 1091.6339 0.63389451 229 A0A0C4DG44;O43464 HTRA2 Serine protease HTRA2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 90.731 90.731 2 0.049357 94513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.598 52.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11416 229 10681 100513 127628 127628 1 EPLTPEEVQSVR Unmodified 1382.7042 0.70415892 1208 H3BV90;Q6FI81;H3BUG4;H3BT65;H3BPG7 CIAPIN1 Anamorsin yes no 0 0 0 1 1 58.529 58.529 2 0.0035491 58299 QUIQUE_C1576_190116_001 101.38 66.994 128000000 0 0 0 0 0 0 91037000 0 0 0 36961000 0 0 11417 1208 10682 100514;100515 127629;127630 127629 0 EPLVDVVDPK Unmodified 1109.5968 0.5968403 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 71.636 71.636 2 0.020435 72748 QUIQUE_C1218_190116_001 70.056 50.27 114820000 71973000 0 0 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 125.03 125.03 2 0.0010631 129488 QUIQUE_C1368_190116_001 90.685 74.487 271460000 27033000 49710000 83237000 0 0 0 37942000 0 0 0 73542000 0 0 11427 288 10691 100543;100544;100545;100546;100547 127660;127661;127662;127663;127664;127665;127666;127667;127668 127664 9 EPPKPEQVESR Unmodified 1294.6517 0.65172941 1586 O60664;K7ERZ3 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.753 14.753 2;3 0.00054757 7321 QUIQUE_C1218_190116_001 94.767 81.367 241450000 39473000 0 0 0 37907000 79931000 45739000 0 38396000 0 0 0 0 11428 1586 10692 100548;100549;100550;100551;100552;100553 127669;127670;127671;127672;127673;127674 127669 6 EPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPR Unmodified 2989.5437 0.5436891 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 166.45 166.45 3;4 5.6013E-24 173719 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.79 94.558 657930000 0 0 0 0 34393000 0 0 103170000 138610000 0 108770000 150300000 122690000 11429 1486 10693 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no 0 0 0 1 97.513 97.513 2 0.034163 100244 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.2 52.866 23521000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23521000 0 11444 3280 10708 100672 127858 127858 0 EPSTASGGGQLNR Unmodified 1272.6058 0.60584185 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 1 1 15.986 15.986 2 0.004591 8329 QUIQUE_C1438_190116_001 70.389 48.941 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11445 426 10709 100673;100674;100675 127859;127860;127861 127860 3 EPTQAVVEEQVLDKEEPLPEEQR Unmodified 2691.3239 0.3239195 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;E9PQD2;E9PRG1;E9PIG0;E9PQN0;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.278 93.278 2;3 7.0274E-53 96514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.77 138.79 2676200000 211660000 243600000 0 469490000 229120000 323890000 197150000 217040000 287310000 176330000 141050000 179560000 0 11446 933;1529 10710 100676;100677;100678;100679;100680;100681;100682;100683;100684;100685;100686;100687 127862;127863;127864;127865;127866;127867;127868;127869;127870;127871;127872;127873;127874;127875;127876;127877;127878;127879;127880;127881;127882 127881 21 EPTSSEQGGLEGSGSAAGEGKPALSEEER Unmodified 2845.285 0.28496781 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 1 47.301 47.301 3 1.8939E-27 44430 QUIQUE_C1403_190116_001 108.75 95.503 82210000 0 0 0 34060000 0 48150000 0 0 0 0 0 0 0 11447 942 10711 100688;100689;100690 127883;127884;127885 127883 3 EPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLK Unmodified 3161.657 0.6570043 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07;C9IZF9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 182.3 182.3 3 5.4384E-28 188605 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.97 97.479 10671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10671000 0 0 11448 3700 10712 100691 127886 127886 1 EPVELGQPNTLICHIDK Unmodified 1961.9881 0.98806169 323 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4 EPVQTLYSQSPALELDKFLEDVR Unmodified 2676.3647 0.3646621 4439 Q9UHY1;F8W6G1 NRBP1 Nuclear receptor-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 156.71 156.71 3 3.0316E-23 161457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.62 118.67 239610000 0 0 0 0 48031000 0 58617000 0 65589000 0 0 67377000 0 11458 4439 10722 100763;100764;100765;100766 127963;127964;127965;127966 127965 4 EPVVTLEGHTK Unmodified 1208.6401 0.6401021 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 25.341 25.341 2;3 0.00080513 18576 QUIQUE_C1368_190116_001 95.09 75.819 1246600000 141120000 149930000 309240000 186330000 0 156850000 0 0 65502000 97586000 0 0 140050000 11459 2327 10723 100767;100768;100769;100770;100771;100772;100773;100774;100775;100776 127967;127968;127969;127970;127971;127972;127973;127974;127975;127976;127977;127978 127971 12 EPVVTLEGHTKR Unmodified 1364.7412 0.74121312 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 1 1 19.101 19.101 3 0.02912 11912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.33 18.118 40086000 0 0 0 0 0 0 0 40086000 0 0 0 0 0 11460 2327 10724 100777 127979 127979 1 EPVVTPQDLEGPGR Unmodified 1492.7522 0.75217174 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 72.622 72.622 2 2.3601E-10 74135 QUIQUE_C1218_190116_001 133.89 98.479 284570000 120410000 0 117800000 0 0 0 0 0 0 0 0 46368000 0 11461 3348 10725 100778;100779;100780;100781 127980;127981;127982;127983;127984;127985 127981 6 EPWLLPSQHNDIIR Unmodified 1716.8948 0.89475365 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 1 1 94.646 94.646 2 0.0023336 98114 QUIQUE_C1576_190116_001 72.2 60.988 137680000 0 0 0 0 25210000 0 31276000 0 0 0 48390000 32806000 0 11462 956;3084 10726 100782;100783;100784;100785 127986;127987;127988;127989 127987 4 EPYNIDVDHR Unmodified 1256.5786 0.57856447 4429 Q9UHC6;A0A0J9YYA0;A0A0J9YWG3;B7Z1Y6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 37.814 37.814 2 0.051455 33563 QUIQUE_C1277_190116_001 66.299 44.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11463 4429 10727 100786 127990 127990 1 EQADFAVEALAK Unmodified 1290.6456 0.6455814 2379;2385 P35749;P35580 MYH11;MYH10 Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 84.902 84.902 2 0.0020514 81732 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.379 60.148 317880000 90926000 91383000 0 0 0 50495000 0 44883000 0 40191000 0 0 0 11464 2385;2379 10728 100787;100788;100789;1007