Proteins Positions within proteins Leading proteins Protein Fasta headers Localization prob Score diff PEP Score Delta score Score for localization Localization prob 821_JH_EV_Ubi Score diff 821_JH_EV_Ubi PEP 821_JH_EV_Ubi Score 821_JH_EV_Ubi Localization prob 821_JH_MUT_Ubi Score diff 821_JH_MUT_Ubi PEP 821_JH_MUT_Ubi Score 821_JH_MUT_Ubi Localization prob 821_JH_WT_Ubi Score diff 821_JH_WT_Ubi PEP 821_JH_WT_Ubi Score 821_JH_WT_Ubi Localization prob 902_JH_EV_Ubi_2 Score diff 902_JH_EV_Ubi_2 PEP 902_JH_EV_Ubi_2 Score 902_JH_EV_Ubi_2 Localization prob 902_JH_EV_Ubi_3 Score diff 902_JH_EV_Ubi_3 PEP 902_JH_EV_Ubi_3 Score 902_JH_EV_Ubi_3 Localization prob 902_JH_MUT_Ubi_2 Score diff 902_JH_MUT_Ubi_2 PEP 902_JH_MUT_Ubi_2 Score 902_JH_MUT_Ubi_2 Localization prob 902_JH_MUT_Ubi_3 Score diff 902_JH_MUT_Ubi_3 PEP 902_JH_MUT_Ubi_3 Score 902_JH_MUT_Ubi_3 Localization prob 902_JH_WT_Ubi_2 Score diff 902_JH_WT_Ubi_2 PEP 902_JH_WT_Ubi_2 Score 902_JH_WT_Ubi_2 Localization prob 902_JH_WT_Ubi_3 Score diff 902_JH_WT_Ubi_3 PEP 902_JH_WT_Ubi_3 Score 902_JH_WT_Ubi_3 Diagnostic peak Number of Deamidation (NQ) Amino acid Sequence window Modification window Peptide window coverage Deamidation (NQ) Probabilities Deamidation (NQ) Score diffs Position in peptide Charge Mass error [ppm] Intensity Intensity___1 Intensity___2 Intensity___3 Ratio mod/base Intensity 821_JH_EV_Ubi Intensity 821_JH_MUT_Ubi Intensity 821_JH_WT_Ubi Intensity 902_JH_EV_Ubi_2 Intensity 902_JH_EV_Ubi_3 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_2 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_3 Intensity 902_JH_WT_Ubi_2 Intensity 902_JH_WT_Ubi_3 Ratio mod/base 821_JH_EV_Ubi Ratio mod/base 821_JH_MUT_Ubi Ratio mod/base 821_JH_WT_Ubi Ratio mod/base 902_JH_EV_Ubi_2 Ratio mod/base 902_JH_EV_Ubi_3 Ratio mod/base 902_JH_MUT_Ubi_2 Ratio mod/base 902_JH_MUT_Ubi_3 Ratio mod/base 902_JH_WT_Ubi_2 Ratio mod/base 902_JH_WT_Ubi_3 Intensity 821_JH_EV_Ubi___1 Intensity 821_JH_EV_Ubi___2 Intensity 821_JH_EV_Ubi___3 Intensity 821_JH_MUT_Ubi___1 Intensity 821_JH_MUT_Ubi___2 Intensity 821_JH_MUT_Ubi___3 Intensity 821_JH_WT_Ubi___1 Intensity 821_JH_WT_Ubi___2 Intensity 821_JH_WT_Ubi___3 Intensity 902_JH_EV_Ubi_2___1 Intensity 902_JH_EV_Ubi_2___2 Intensity 902_JH_EV_Ubi_2___3 Intensity 902_JH_EV_Ubi_3___1 Intensity 902_JH_EV_Ubi_3___2 Intensity 902_JH_EV_Ubi_3___3 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_2___1 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_2___2 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_2___3 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_3___1 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_3___2 Intensity 902_JH_MUT_Ubi_3___3 Intensity 902_JH_WT_Ubi_2___1 Intensity 902_JH_WT_Ubi_2___2 Intensity 902_JH_WT_Ubi_2___3 Intensity 902_JH_WT_Ubi_3___1 Intensity 902_JH_WT_Ubi_3___2 Intensity 902_JH_WT_Ubi_3___3 Occupancy 821_JH_EV_Ubi Occupancy ratio821_JH_EV_Ubi Occupancy error scale 821_JH_EV_Ubi Occupancy 821_JH_MUT_Ubi Occupancy ratio821_JH_MUT_Ubi Occupancy error scale 821_JH_MUT_Ubi Occupancy 821_JH_WT_Ubi Occupancy ratio821_JH_WT_Ubi Occupancy error scale 821_JH_WT_Ubi Occupancy 902_JH_EV_Ubi_2 Occupancy ratio902_JH_EV_Ubi_2 Occupancy error scale 902_JH_EV_Ubi_2 Occupancy 902_JH_EV_Ubi_3 Occupancy ratio902_JH_EV_Ubi_3 Occupancy error scale 902_JH_EV_Ubi_3 Occupancy 902_JH_MUT_Ubi_2 Occupancy ratio902_JH_MUT_Ubi_2 Occupancy error scale 902_JH_MUT_Ubi_2 Occupancy 902_JH_MUT_Ubi_3 Occupancy ratio902_JH_MUT_Ubi_3 Occupancy error scale 902_JH_MUT_Ubi_3 Occupancy 902_JH_WT_Ubi_2 Occupancy ratio902_JH_WT_Ubi_2 Occupancy error scale 902_JH_WT_Ubi_2 Occupancy 902_JH_WT_Ubi_3 Occupancy ratio902_JH_WT_Ubi_3 Occupancy error scale 902_JH_WT_Ubi_3 Reverse Potential contaminant id Protein group IDs Positions Position Peptide IDs Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best localization evidence ID Best localization MS/MS ID Best localization raw file Best localization scan number Best score evidence ID Best score MS/MS ID Best score raw file Best score scan number Best PEP evidence ID Best PEP MS/MS ID Best PEP raw file Best PEP scan number CON__P00761 74 CON__P00761 CON__P00761 0.786135 5.68418 0.000264362 87.323 44.641 87.323 0.786135 5.68418 0.000264362 87.323 1 N GEHNIDVLEGNEQFINAAKIITHPNFNGNTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LGEHNIDVLEGN(0.002)EQ(0.212)FIN(0.786)AAK LGEHN(-70.6)IDVLEGN(-27.19)EQ(-5.68)FIN(5.68)AAK 17 3 3.3936 5252600 5252600 0 0 0.040377 0 0 5252600 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.089885 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 5252600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 0 1 74 74 2604 2959 8450 8883 8450 8883 20190821_JH_WT_Ubi 10050 8450 8883 20190821_JH_WT_Ubi 10050 8450 8883 20190821_JH_WT_Ubi 10050 sp|P02538|K2C6A_HUMAN;CON__P02538;sp|P48668|K2C6C_HUMAN;CON__P48668;CON__P04259;sp|P04259|K2C6B_HUMAN 324;324;324;324;324;324 sp|P02538|K2C6A_HUMAN sp|P02538|K2C6A_HUMAN sp|P02538|K2C6A_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 6A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT6A PE=1 SV=3;sp|P48668|K2C6C_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 6C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT6C PE=1 SV=3;sp|P04259|K2C6B_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 6B OS=Ho 0.807555 6.22899 1.08094E-11 110.89 43.054 110.89 0.807555 6.22899 1.08094E-11 110.89 1 N MQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKA Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDN(0.808)N(0.192)R ALYDAELSQ(-50.13)MQ(-50.13)THISDTSVVLSMDN(6.23)N(-6.23)R 25 3 0.51764 1299100 1299100 0 0 0.079474 0 0 0 0 0 0 0 0 1299100 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0.3577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1299100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 1 3 324 324 222 253 733 802 733 802 20190902_JH_WT_Ubi_3 11476 733 802 20190902_JH_WT_Ubi_3 11476 733 802 20190902_JH_WT_Ubi_3 11476 sp|P02538|K2C6A_HUMAN;CON__P02538;sp|P12035|K2C3_HUMAN;CON__P12035;CON__Q8VED5 188;188;223;223;164 sp|P02538|K2C6A_HUMAN sp|P02538|K2C6A_HUMAN sp|P02538|K2C6A_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 6A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT6A PE=1 SV=3;sp|P12035|K2C3_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT3 PE=1 SV=3 0.777123 6.33489 1.58279E-05 117.86 55.698 117.86 0.777123 6.33489 1.58279E-05 117.86 1 N KFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGT GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX FLEQ(0.042)Q(0.181)N(0.777)KVLETK FLEQ(-12.66)Q(-6.33)N(6.33)KVLETK 6 3 0.51126 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 2 3 188 188 1239 1401 3946 4151 3946 4151 20190902_JH_EV_Ubi_2 6500 3946 4151 20190902_JH_EV_Ubi_2 6500 3946 4151 20190902_JH_EV_Ubi_2 6500 CON__P08727 79 CON__P08727 CON__P08727 1 40.4534 1.17847E-10 103.57 68.917 40.453 1 54.7324 0.00240144 54.732 1 103.575 1.17847E-10 103.57 1 40.4534 0.0357273 40.453 1 N GYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FVSSSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGN(1)EK FVSSSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGN(40.45)EK 28 3 1.8818 9800700 9800700 0 0 0.06499 0 0 0 0 0 1257800 0 3862800 4680000 NaN 0 NaN NaN 0 0.038821 NaN 0.067378 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1257800 0 0 0 0 0 3862800 0 0 4680000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 3 7 79 79 1335 1515 4219;4220;4221 4437;4438;4439 4221 4439 20190902_JH_WT_Ubi_3 13420 4220 4438 20190902_JH_WT_Ubi_2 13709 4220 4438 20190902_JH_WT_Ubi_2 13709 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 148;148 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 1 85.2904 0.0143543 85.29 16.908 85.29 1 85.2904 0.0143543 85.29 N TIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAAD X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ILGATIEN(1)SR ILGATIEN(85.29)SR 8 2 -4.0632 1516700 1516700 0 0 0.032834 0 0 1516700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1516700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 4 7;477 148;148 148 2192 2497 7231 7606 7231 7606 20190821_JH_WT_Ubi 6511 7231 7606 20190821_JH_WT_Ubi 6511 7231 7606 20190821_JH_WT_Ubi 6511 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 392;392 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.739017 4.68539 4.10892E-29 175.7 116.06 63.374 0.561924 1.29731 4.10892E-29 175.7 0.688237 4.57672 0.0363776 54.953 0.739017 4.68539 0.0176776 63.374 1 N IATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL_______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SLLEGQ(0.01)EDHYN(0.739)N(0.251)LSASK SLLEGQ(-18.81)EDHYN(4.69)N(-4.69)LSASK 11 3 0.8979 128710000 128710000 0 0 0.13726 0 0 0 0 0 0 0 58963000 58722000 0 0 0 0 0 0 0 7.7928 0.25502 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58963000 0 0 58722000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 5 7;477 392;392 392 4027;4028 4574;4576 12758;12759;12770 13381;13382;13393 12759 13382 20190902_JH_WT_Ubi_3 8191 12770 13393 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9571 12770 13393 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9571 CON__P08729;sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN;CON__Q9NSB2;CON__Q6ISB0;CON__Q61726;sp|P78386|KRT85_HUMAN;CON__P78386;sp|O43790|KRT86_HUMAN;CON__O43790;sp|P78385|KRT83_HUMAN;CON__Q6NT21;CON__P78385;sp|Q14533|KRT81_HUMAN;CON__Q14533;sp|P08729|K2C7_HUMAN;CON__Q3KNV1 116;190;190;190;129;148;148;131;131;136;136;136;131;131;116;116 CON__P08729;sp|P78386|KRT85_HUMAN;sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT84 PE=2 SV=2;sp|P78386|KRT85_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT85 PE=1 SV=1;sp|O43790|KRT86_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb6 OS=Homo sap 0.666667 0 0.000361565 138.42 69.671 89.029 0.658277 5.85764 0.000361565 138.42 0.666667 0 0.00887258 89.029 1;2 N KFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKS;RFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKWQFYQNQRC GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX FLEQ(0.667)Q(0.667)N(0.667)KLLETK FLEQ(0)Q(0)N(0)KLLETK 6 2 -3.9253 9226900 9226900 0 0 0.01233 0 0 0 0 0 9226900 0 0 0 0 0 0 0 0 0.070437 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9226900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 6 8;14;19 116;148;116 116 1237 1397;1398 3929;3932 4134;4137 3932 4137 20190902_JH_MUT_Ubi_3 688 3929 4134 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7774 3929 4134 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7774 CON__P08729;sp|P08729|K2C7_HUMAN;CON__Q3KNV1 99;99;99 CON__P08729;sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|P08729|K2C7_HUMAN Keratin, type II cytoskeletal 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT7 PE=1 SV=5 0.959027 14.6371 0.0285835 82.483 31.64 82.483 0.684097 3.45008 0.0301625 55.176 0.959027 14.6371 0.0285835 82.483 1 N LQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX VRQ(0.001)EESEQ(0.001)IKTLN(0.959)N(0.039)K VRQ(-31.27)EESEQ(-34.95)IKTLN(14.64)N(-14.64)K 13 3 -0.21646 2709400 2709400 0 0 0.25748 0 0 1847300 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.54491 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1847300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 7 8;19 99;99 99 5001 5676 16059;16060 16869;16870 16059 16869 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4401 16059 16869 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4401 16059 16869 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4401 CON__P15636 296 CON__P15636 CON__P15636 0.999861 38.5678 2.79126E-43 177.69 142.55 177.69 0.999861 38.5678 2.79126E-43 177.69 0.994086 24.1878 0.000131669 78.451 0.999065 30.3059 6.77165E-10 107.98 1;2 N QNSTCRAPNTPASGANGDGSMSQTQSGSTVK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP APNTPASGAN(1)GDGSMSQTQSGSTVK APN(-38.57)TPASGAN(38.57)GDGSMSQ(-93.53)TQ(-122.7)SGSTVK 10 3 1.0835 14504000 13431000 1072300 0 6.4899 0 0 3907900 0 0 0 0 9453000 1143000 NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3907900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8380600 1072300 0 1143000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 8 10 296 296 243 283;284 824;825;826;827 896;897;898;899;900;901 824 897 20190821_JH_WT_Ubi 4159 824 897 20190821_JH_WT_Ubi 4159 824 897 20190821_JH_WT_Ubi 4159 CON__P15636 427 CON__P15636 CON__P15636 1 83.3755 5.12437E-05 107.65 78.232 107.65 1 83.3755 5.12437E-05 107.65 0.999989 49.5435 0.00189583 77.899 1 N GQLHGGPSSCSATGTNRSDQYGRVFTSWTGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX VLGQLHGGPSSCSATGTN(1)R VLGQ(-83.38)LHGGPSSCSATGTN(83.38)R 18 3 0.27947 14804000 14804000 0 0 0.017899 0 0 0 0 0 0 0 9323400 5481100 0 0 0 0 0 0 0 0.022503 0.053637 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9323400 0 0 5481100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 9 10 427 427 3811;4902 4331;5566 15757;15758 16560;16561 15757 16560 20190902_JH_WT_Ubi_2 6489 15757 16560 20190902_JH_WT_Ubi_2 6489 15757 16560 20190902_JH_WT_Ubi_2 6489 CON__P15636 247 CON__P15636 CON__P15636 0.74643 4.75008 0.000563072 85.469 53.943 85.469 0.74643 4.75008 0.000563072 85.469 1 N AYSKSGTLACTGSLVNNTANDRKMYFLTAHH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SGTLACTGSLVN(0.746)N(0.25)TAN(0.004)DRK SGTLACTGSLVN(4.75)N(-4.75)TAN(-23.23)DRK 12 3 -0.26689 2904500 2904500 0 0 0.37042 0 0 2904500 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2904500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 10 10 247 247 3939 4478 12493 13107 12493 13107 20190821_JH_WT_Ubi 5480 12493 13107 20190821_JH_WT_Ubi 5480 12493 13107 20190821_JH_WT_Ubi 5480 sp|P35527|K1C9_HUMAN;CON__P35527 434;434 sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT9 PE=1 SV=3 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 7.2261 50.425 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 3 N LEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.075)EIECQ(0.975)N(0.975)Q(0.975)EYSLLLSIKMRLEK Q(-15.74)EIECQ(15.74)N(15.74)Q(15.74)EYSLLLSIKMRLEK 7 3 -1.4423 2864800 0 0 2864800 NaN 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 11 13 434 434 3615 4124 11614 12191 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 CON__Q0V8M9 526 CON__Q0V8M9 CON__Q0V8M9 1 44.0888 0.0326486 44.089 9.6939 44.089 1 44.0888 0.0326486 44.089 1 N DMNSFKAAVKGHGAINDLTFTEEVDMKEMEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AAVKGHGAIN(1)DLTFTEEVDMK AAVKGHGAIN(44.09)DLTFTEEVDMK 10 3 0.27841 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 12 17 526 526 41 47 146 161 146 161 20190902_JH_WT_Ubi_3 6232 146 161 20190902_JH_WT_Ubi_3 6232 146 161 20190902_JH_WT_Ubi_3 6232 CON__Q28107 1945 CON__Q28107 CON__Q28107 1 43.4077 0.0220201 43.408 8.1046 43.408 1 43.4077 0.0220201 43.408 3 N GSYNAWIAEKLSTEFNPEPWIQVDMQKEVLL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX LSTEFN(1)PEPWIQ(1)VDMQ(1)K LSTEFN(43.41)PEPWIQ(43.41)VDMQ(43.41)K 6 3 -1.0214 4202700 0 0 4202700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 13 18 1945 1945 2816 3192 9062 9534 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 REV__sp|P61020|RAB5B_HUMAN REV__sp|P61020|RAB5B_HUMAN 1 65.8954 0.0305866 65.895 24.786 65.895 1 65.8954 0.0305866 65.895 1 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXX AN(1)GALAIVISPSAR AN(65.9)GALAIVISPSAR 2 3 -1.1618 4620200 4620200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4620200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4620200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 14 27 83 83 235 272 797 869 797 869 20190902_JH_WT_Ubi_2 12179 797 869 20190902_JH_WT_Ubi_2 12179 797 869 20190902_JH_WT_Ubi_2 12179 REV__sp|P78562|PHEX_HUMAN REV__sp|P78562|PHEX_HUMAN 1 47.2216 0.0372659 47.222 17.415 47.222 1 47.2216 0.0372659 47.222 2 N X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX FIKALDEN(1)VHTDN(1)MIFEPYGK FIKALDEN(47.22)VHTDN(47.22)MIFEPYGK 13 3 -3.9984 2746200 0 2746200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1373100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1373100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 15 28 266 266 1224 1381 3879;3880 4083;4084 3880 4084 20190902_JH_WT_Ubi_3 11186 3880 4084 20190902_JH_WT_Ubi_3 11186 3880 4084 20190902_JH_WT_Ubi_3 11186 REV__sp|Q96BD8-2|SKA1_HUMAN REV__sp|Q96BD8-2|SKA1_HUMAN 1 46.0691 0.0363838 46.069 6.2843 46.069 1 46.0691 0.0363838 46.069 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX TLTPEQ(1)GCRN(1)LSLK TLTPEQ(46.07)GCRN(46.07)LSLK 10 3 0.60467 28369000 0 28369000 0 NaN 0 0 0 28369000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28369000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 16 43 183 183 4512 5122 14393 15131 14393 15131 20190902_JH_EV_Ubi_2 5729 14393 15131 20190902_JH_EV_Ubi_2 5729 14393 15131 20190902_JH_EV_Ubi_2 5729 REV__sp|Q9BW60-2|ELOV1_HUMAN REV__sp|Q9BW60-2|ELOV1_HUMAN 0.877891 13.3381 0.02507 41.621 12.318 41.621 0.877891 13.3381 0.02507 41.621 1 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.878)KAKVAIGPAGN(0.041)Q(0.041)Q(0.041)LR N(13.34)KAKVAIGPAGN(-13.34)Q(-13.34)Q(-13.34)LR 1 3 -0.54972 12147000 12147000 0 0 NaN 0 0 12147000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 12147000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 17 47 1 1 3109 3556 10025 10560 10025 10560 20190821_JH_WT_Ubi 8173 10025 10560 20190821_JH_WT_Ubi 8173 10025 10560 20190821_JH_WT_Ubi 8173 REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN 0.99914 30.5358 0.0276788 56.548 7.0818 56.548 0.99914 30.5358 0.0276788 56.548 3 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX LQ(1)N(0.999)RYQ(0.975)MQ(0.027)ETK LQ(35.76)N(30.54)RYQ(15.82)MQ(-15.82)ETK 3 3 -1.373 1897400 0 0 1897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 18 50 183 183 2787 3163 9001 9471 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 REV__sp|Q9UI42-2|CBPA4_HUMAN REV__sp|Q9UI42-2|CBPA4_HUMAN 0.43249 2.42916 0.0135076 98.676 8.2424 98.676 0.43249 2.42916 0.0135076 98.676 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SWFN(0.003)KLLN(0.432)N(0.034)SN(0.261)VLQ(0.27)SK SWFN(-22.52)KLLN(2.43)N(-11.03)SN(-2.43)VLQ(-2.43)SK 8 3 -2.3326 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 19 60 341 341 4228 4801 13367 14022 20190821_JH_EV_Ubi 14155 13367 14022 20190821_JH_EV_Ubi 14155 13367 14022 20190821_JH_EV_Ubi 14155 REV__sp|Q9ULD9-2|ZN608_HUMAN REV__sp|Q9ULD9-2|ZN608_HUMAN 1 51.1927 0.0325149 51.193 14.746 51.193 1 51.1927 0.0325149 51.193 N X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EILQ(1)HN(1)EMK EILQ(51.19)HN(51.19)EMK 6 3 -0.55018 28027000 0 28027000 0 NaN 0 0 0 0 0 28027000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28027000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 20 62 308 308 940 1061 2952 3105 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN 556 sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN Putative testis-expressed protein 13C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TEX13C PE=5 SV=1 0.544374 0.871933 0.0208277 49.528 10.945 49.528 0.544374 0.871933 0.0208277 49.528 2 N DSRSHSLKKDPVMPQNMIPLEDSNSHSLKKD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX KDPVMPQ(0.462)N(0.544)MIPLEDSN(0.994)SHSLKK KDPVMPQ(-0.87)N(0.87)MIPLEDSN(20.05)SHSLKK 8 3 1.1348 4104900 0 4104900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 4104900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4104900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 21 65 556 556 2326 2646 7650 8047 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN 564 sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN sp|A0A0J9YWL9|TX13C_HUMAN Putative testis-expressed protein 13C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TEX13C PE=5 SV=1 0.993711 20.0515 0.0208277 49.528 10.945 49.528 0.993711 20.0515 0.0208277 49.528 2 N KDPVMPQNMIPLEDSNSHSLKKDPVMPQNMI X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KDPVMPQ(0.462)N(0.544)MIPLEDSN(0.994)SHSLKK KDPVMPQ(-0.87)N(0.87)MIPLEDSN(20.05)SHSLKK 16 3 1.1348 4104900 0 4104900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 4104900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4104900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 22 65 564 564 2326 2646 7650 8047 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 7650 8047 20190902_JH_WT_Ubi_3 11033 sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN 978 sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN Uncharacterized protein SPEM3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEM3 PE=3 SV=1 0.499386 0 0.029396 42.908 9.7207 42.908 0.499386 0 0.029396 42.908 N SEHSQDSNLHKCPGINQDPGPHKDPALVQDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP CPGIN(0.499)Q(0.499)DPGPHKDPALVQ(0.001)DSGLPK CPGIN(0)Q(0)DPGPHKDPALVQ(-26.1)DSGLPK 5 3 1.6595 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 23 67 978 978 357 424 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-3|PI51A_HUMAN;sp|Q99755|PI51A_HUMAN 192;232;233;232;245 sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIPSL PE=5 SV=1;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIP5K1A;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN 0.998468 28.1341 0.0365125 45.014 16.433 45.014 0.998468 28.1341 0.0365125 45.014 N YCVQAGGKNIRIVVMNNLLPRSVKMHIKYDL;YCVQTGGKNIRIVVMNNLLPRSVKMHIKYDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX N(0.003)IRIVVMN(0.998)N(0.998)LLPRSVK N(-28.13)IRIVVMN(28.13)N(28.13)LLPRSVK 8 3 0.32284 1189000 0 1189000 0 NaN 0 1189000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 24 73;1846 192;232 192 3104 3551 10015 10549 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-3|PI51A_HUMAN;sp|Q99755|PI51A_HUMAN 193;233;234;233;246 sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN sp|A2A3N6|PIPSL_HUMAN Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIPSL PE=5 SV=1;sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIP5K1A;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN 0.998468 28.1341 0.0365125 45.014 16.433 45.014 0.998468 28.1341 0.0365125 45.014 N CVQAGGKNIRIVVMNNLLPRSVKMHIKYDLK;CVQTGGKNIRIVVMNNLLPRSVKMHIKYDLK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(0.003)IRIVVMN(0.998)N(0.998)LLPRSVK N(-28.13)IRIVVMN(28.13)N(28.13)LLPRSVK 9 3 0.32284 1189000 0 1189000 0 NaN 0 1189000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 25 73;1846 193;233 193 3104 3551 10015 10549 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 10015 10549 20190821_JH_MUT_Ubi 11989 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN 573 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 162 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC162P PE=2 SV=3 1 107.926 4.97784E-07 146.16 54.202 146.16 1 107.926 4.97784E-07 146.16 0.999981 47.63 0.0180854 60.161 3 N ALFETCLHIKEKLDDNQLNLIQKVCELIGEV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX EKLDDN(1)Q(1)LN(1)LIQK EKLDDN(107.93)Q(102.56)LN(54.85)LIQ(-54.85)K 6 3 1.3632 8070000 0 0 8070000 NaN 3620000 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 26 76 573 573 963 1087 3061;3062 3216;3217 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN 576 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 162 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC162P PE=2 SV=3 0.999997 54.8499 4.97784E-07 146.16 54.202 146.16 0.999997 54.8499 4.97784E-07 146.16 0.998094 27.2288 0.0180854 60.161 3 N ETCLHIKEKLDDNQLNLIQKVCELIGEVRTE X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EKLDDN(1)Q(1)LN(1)LIQK EKLDDN(107.93)Q(102.56)LN(54.85)LIQ(-54.85)K 9 3 1.3632 8070000 0 0 8070000 NaN 3620000 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 27 76 576 576 963 1087 3061;3062 3216;3217 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN;sp|A6NCW7|U17L4_HUMAN 444;444 sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP17L8 PE=3 SV=1;sp|A6NCW7|U17L4_HUMAN Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP17L4 PE 1 44.8471 0.0362234 44.847 6.9075 44.847 1 44.8471 0.0362234 44.847 4 N TEESTLDHWKFPQEQNKMKPEFNVRKVEGTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX FPQ(1)EQ(1)N(1)KMKPEFN(1)VR FPQ(44.85)EQ(44.85)N(44.85)KMKPEFN(44.85)VR 6 2 -4.0932 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 28 83 444 444 1280 1449 4052 4260 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN;sp|A6NCW7|U17L4_HUMAN 451;451 sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN sp|P0C7I0|U17L8_HUMAN Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP17L8 PE=3 SV=1;sp|A6NCW7|U17L4_HUMAN Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP17L4 PE 1 44.8471 0.0362234 44.847 6.9075 44.847 1 44.8471 0.0362234 44.847 4 N HWKFPQEQNKMKPEFNVRKVEGTLPPNVLVI X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FPQ(1)EQ(1)N(1)KMKPEFN(1)VR FPQ(44.85)EQ(44.85)N(44.85)KMKPEFN(44.85)VR 13 2 -4.0932 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 29 83 451 451 1280 1449 4052 4260 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 4052 4260 20190902_JH_WT_Ubi_2 8768 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN 67 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN IgLON family member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLON5 PE=2 SV=4 1 49.3261 0.0140426 49.326 7.6369 49.326 1 49.3261 0.0140426 49.326 3 N LSCFIDEHVTRVAWLNRSNILYAGNDRWTSD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VAWLN(1)RSN(1)ILYAGN(1)DRWTSDPR VAWLN(49.33)RSN(49.33)ILYAGN(49.33)DRWTSDPR 5 3 -0.93235 2170800 0 0 2170800 NaN 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 30 86 67 67 4724 5360 15160 15928 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN 70 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN IgLON family member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLON5 PE=2 SV=4 1 49.3261 0.0140426 49.326 7.6369 49.326 1 49.3261 0.0140426 49.326 3 N FIDEHVTRVAWLNRSNILYAGNDRWTSDPRV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX VAWLN(1)RSN(1)ILYAGN(1)DRWTSDPR VAWLN(49.33)RSN(49.33)ILYAGN(49.33)DRWTSDPR 8 3 -0.93235 2170800 0 0 2170800 NaN 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 31 86 70 70 4724 5360 15160 15928 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN 76 sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN sp|A6NGN9|IGLO5_HUMAN IgLON family member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLON5 PE=2 SV=4 1 49.3261 0.0140426 49.326 7.6369 49.326 1 49.3261 0.0140426 49.326 3 N TRVAWLNRSNILYAGNDRWTSDPRVRLLINT X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX VAWLN(1)RSN(1)ILYAGN(1)DRWTSDPR VAWLN(49.33)RSN(49.33)ILYAGN(49.33)DRWTSDPR 14 3 -0.93235 2170800 0 0 2170800 NaN 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2170800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 32 86 76 76 4724 5360 15160 15928 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 15160 15928 20190821_JH_WT_Ubi 7197 sp|P30046-2|DOPD_HUMAN;sp|P30046|DOPD_HUMAN;sp|A6NHG4|DDTL_HUMAN 39;39;39 sp|P30046-2|DOPD_HUMAN sp|P30046-2|DOPD_HUMAN sp|P30046-2|DOPD_HUMAN Isoform 2 of D-dopachrome decarboxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDT;sp|P30046|DOPD_HUMAN D-dopachrome decarboxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDT PE=1 SV=3;sp|A6NHG4|DDTL_HUMAN D-dopachrome decarboxylase-like protein OS=Homo sapi 0.585216 1.49498 2.17576E-05 66.959 45.034 66.959 0.585216 1.49498 2.17576E-05 66.959 1 N CAAAASILGKPADRVNVTVRPGLAMALSGST X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP VN(0.585)VTVRPGLAMALSGSTEPCAQ(0.415)LSISSIGVVGTAEDNR VN(1.49)VTVRPGLAMALSGSTEPCAQ(-1.49)LSISSIGVVGTAEDN(-51.92)R 2 3 3.9174 599360 599360 0 0 NaN 0 599360 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 599360 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 33 87 39 39 4965 5635 15951 16760 15951 16760 20190821_JH_MUT_Ubi 12097 15951 16760 20190821_JH_MUT_Ubi 12097 15951 16760 20190821_JH_MUT_Ubi 12097 sp|A6NHR9-2|SMHD1_HUMAN;sp|A6NHR9|SMHD1_HUMAN 882;882 sp|A6NHR9-2|SMHD1_HUMAN sp|A6NHR9-2|SMHD1_HUMAN sp|A6NHR9-2|SMHD1_HUMAN Isoform 2 of Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMCHD1;sp|A6NHR9|SMHD1_HUMAN Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 O 1 69.6716 0.0206512 69.672 17.909 69.672 1 69.6716 0.0206512 69.672 1 N ASGLSLHYEEITKGPNCVIRGVTAKGPVNSC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXX GPN(1)CVIRGVTAK GPN(69.67)CVIRGVTAK 3 3 0.51946 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 34 89 882 882 1649 1878 5277 5555 5277 5555 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4517 5277 5555 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4517 5277 5555 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4517 sp|A6NKP2|D42E2_HUMAN 122 sp|A6NKP2|D42E2_HUMAN sp|A6NKP2|D42E2_HUMAN sp|A6NKP2|D42E2_HUMAN Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDR42E2 PE=3 SV=3 0.999963 44.2672 0.0192358 67.385 20.793 67.385 0.999963 44.2672 0.0192358 67.385 N MSGAEKLQKEQIESINVGGTKLVIDVCVRRR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EQIESIN(1)VGGTK EQ(-44.27)IESIN(44.27)VGGTK 7 3 2.776 851570 851570 0 0 NaN 0 851570 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 851570 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 35 90 122 122 1074 1212 3431 3608 3431 3608 20190821_JH_MUT_Ubi 7147 3431 3608 20190821_JH_MUT_Ubi 7147 3431 3608 20190821_JH_MUT_Ubi 7147 sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN;sp|A6NMZ7|CO6A6_HUMAN 198;198 sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN Isoform 2 of Collagen alpha-6(VI) chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COL6A6;sp|A6NMZ7|CO6A6_HUMAN Collagen alpha-6(VI) chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COL6A6 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0277989 48.848 6.4657 48.848 0.5 0 0.0277989 48.848 1 N HFNLRTVRDLSMFSQNMTHIIKDVIKYKEGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DLSMFSQ(0.5)N(0.5)MTHIIKDVIKYK DLSMFSQ(0)N(0)MTHIIKDVIKYK 8 3 3.8281 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 36 92 198 198 597 683 1872 1982 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 sp|A8CG34|P121C_HUMAN 103 sp|A8CG34|P121C_HUMAN sp|A8CG34|P121C_HUMAN sp|A8CG34|P121C_HUMAN Nuclear envelope pore membrane protein POM 121C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POM121C PE=1 SV=3 1 60.0624 0.0232621 60.062 30.722 60.062 1 60.0624 0.0232621 60.062 2 N HRRTLFASPPAKSTANGNLLEPRTLLEGPDP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX TLFASPPAKSTAN(1)GN(1)LLEPR TLFASPPAKSTAN(60.06)GN(60.06)LLEPR 13 3 1.2924 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 37 93 103 103 4465 5063;5064 14166 14871 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 sp|A8CG34|P121C_HUMAN 105 sp|A8CG34|P121C_HUMAN sp|A8CG34|P121C_HUMAN sp|A8CG34|P121C_HUMAN Nuclear envelope pore membrane protein POM 121C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POM121C PE=1 SV=3 1 60.0624 0.0232621 60.062 30.722 60.062 0.573564 1.28728 0.0367516 48.376 1 60.0624 0.0232621 60.062 1;2 N RTLFASPPAKSTANGNLLEPRTLLEGPDPAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TLFASPPAKSTAN(1)GN(1)LLEPR TLFASPPAKSTAN(60.06)GN(60.06)LLEPR 15 3 1.2924 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 38 93 105 105 4465 5063;5064 14165;14166 14870;14871 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 14166 14871 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9360 sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN 158 sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN Putative histone PARylation factor 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 PE=5 SV=1 0.767635 5.85131 0.0299444 41.53 7.0542 41.53 0.767635 5.85131 0.0299444 41.53 2 N YVGINEAKKNCIIVPNGDNVFAAVKLYLMKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.261)CIIVPN(0.768)GDN(0.972)VFAAVKLYLMKK N(-5.85)CIIVPN(5.85)GDN(15.19)VFAAVKLYLMKK 7 3 -2.642 3223800 0 3223800 0 NaN 0 0 0 0 0 3223800 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3223800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 39 97 158 158 3010 3441 9732 10253 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN 161 sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN sp|A8MVJ9|HPF1L_HUMAN Putative histone PARylation factor 1-like OS=Homo sapiens OX=9606 PE=5 SV=1 0.971598 15.1862 0.0299444 41.53 7.0542 41.53 0.971598 15.1862 0.0299444 41.53 2 N INEAKKNCIIVPNGDNVFAAVKLYLMKKLKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.261)CIIVPN(0.768)GDN(0.972)VFAAVKLYLMKK N(-5.85)CIIVPN(5.85)GDN(15.19)VFAAVKLYLMKK 10 3 -2.642 3223800 0 3223800 0 NaN 0 0 0 0 0 3223800 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3223800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 40 97 161 161 3010 3441 9732 10253 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 9732 10253 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14723 sp|C9J3I9|CE058_HUMAN 40 sp|C9J3I9|CE058_HUMAN sp|C9J3I9|CE058_HUMAN sp|C9J3I9|CE058_HUMAN Putative uncharacterized protein C5orf58 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C5orf58 PE=4 SV=1 1 58.2739 0.0340184 58.274 15.189 58.274 1 58.2739 0.0340184 58.274 2 N KRVTDHKLNVDKVIKNINTISSELKKIKELS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)IN(1)TISSELKK N(58.27)IN(58.27)TISSELKK 1 3 -2.862 1035400 0 1035400 0 NaN 0 0 0 0 1035400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1035400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 41 103 40 40 3100 3547 10010 10544 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 sp|C9J3I9|CE058_HUMAN 42 sp|C9J3I9|CE058_HUMAN sp|C9J3I9|CE058_HUMAN sp|C9J3I9|CE058_HUMAN Putative uncharacterized protein C5orf58 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C5orf58 PE=4 SV=1 1 58.2739 0.0340184 58.274 15.189 58.274 1 58.2739 0.0340184 58.274 2 N VTDHKLNVDKVIKNINTISSELKKIKELSQL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX N(1)IN(1)TISSELKK N(58.27)IN(58.27)TISSELKK 3 3 -2.862 1035400 0 1035400 0 NaN 0 0 0 0 1035400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1035400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 42 103 42 42 3100 3547 10010 10544 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 10010 10544 20190902_JH_EV_Ubi_3 6765 sp|O00151|PDLI1_HUMAN 60 sp|O00151|PDLI1_HUMAN sp|O00151|PDLI1_HUMAN sp|O00151|PDLI1_HUMAN PDZ and LIM domain protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDLIM1 PE=1 SV=4 0.514353 1.22489 0.000438887 65.118 37.379 65.118 0.514353 1.22489 0.000438887 65.118 N CIGDVITAIDGENTSNMTHLEAQNRIKGCTD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX AALAN(0.001)LCIGDVITAIDGEN(0.388)TSN(0.514)MTHLEAQ(0.048)N(0.048)R AALAN(-27.69)LCIGDVITAIDGEN(-1.22)TSN(1.22)MTHLEAQ(-10.26)N(-10.26)R 22 3 4.3465 2724500 2724500 0 0 NaN 0 0 2724500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2724500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 43 106 60 60 26 28 89 97 89 97 20190821_JH_WT_Ubi 13531 89 97 20190821_JH_WT_Ubi 13531 89 97 20190821_JH_WT_Ubi 13531 sp|O00154-5|BACH_HUMAN 11 sp|O00154-5|BACH_HUMAN sp|O00154-5|BACH_HUMAN sp|O00154-5|BACH_HUMAN Isoform 5 of Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACOT7 1 72.23 0.0299866 72.23 11.832 72.23 1 72.23 0.0299866 72.23 1 N _____MLLLRRSLSLNVLRKEVDRACFGEKA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SLSLN(1)VLRK SLSLN(72.23)VLRK 5 3 0.72708 1300300 1300300 0 0 NaN 0 1300300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1300300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 44 107 11 11 4052 4600 12838 13462 12838 13462 20190821_JH_MUT_Ubi 3312 12838 13462 20190821_JH_MUT_Ubi 3312 12838 13462 20190821_JH_MUT_Ubi 3312 sp|O00161|SNP23_HUMAN 109 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.388935 0 1.60361E-06 71.338 50.103 56.591 0.388935 0 2.43093E-05 56.591 0.386132 0 1.60361E-06 71.338 N ESGKAYKTTWGDGGENSPCNVVSKQPGPVTN X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TTWGDGGEN(0.389)SPCN(0.389)VVSKQ(0.188)PGPVTN(0.015)GQ(0.01)LQ(0.004)Q(0.004)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(0)SPCN(0)VVSKQ(-3.16)PGPVTN(-14)GQ(-15.87)LQ(-19.53)Q(-19.53)PTTGAASGGYIK 9 4 -0.30145 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 45 109 109 109 4645 5271 14874 15628 20190821_JH_EV_Ubi 9391 14879 15634 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10229 14879 15634 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10229 sp|O00161|SNP23_HUMAN 113 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.388935 0 1.60361E-06 71.338 50.103 56.591 0.388935 0 2.43093E-05 56.591 0.386132 0 1.60361E-06 71.338 N AYKTTWGDGGENSPCNVVSKQPGPVTNGQLQ X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TTWGDGGEN(0.389)SPCN(0.389)VVSKQ(0.188)PGPVTN(0.015)GQ(0.01)LQ(0.004)Q(0.004)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(0)SPCN(0)VVSKQ(-3.16)PGPVTN(-14)GQ(-15.87)LQ(-19.53)Q(-19.53)PTTGAASGGYIK 13 4 -0.30145 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 46 109 113 113 4645 5271 14874 15628 20190821_JH_EV_Ubi 9391 14879 15634 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10229 14879 15634 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10229 sp|O00161|SNP23_HUMAN 124 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.382368 0 0.000788431 57.673 38.742 57.673 0.235838 0 0.000788431 43.302 0.382368 0 0.000809976 57.673 N NSPCNVVSKQPGPVTNGQLQQPTTGAASGGY X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TTWGDGGENSPCN(0.002)VVSKQ(0.007)PGPVTN(0.382)GQ(0.382)LQ(0.125)Q(0.101)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(-32.98)SPCN(-22.45)VVSKQ(-17.54)PGPVTN(0)GQ(0)LQ(-4.86)Q(-5.77)PTTGAASGGYIK 24 3 0.17924 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 47 109 124 124 4645 5271 14880 15635 20190821_JH_WT_Ubi 9090 14880 15635 20190821_JH_WT_Ubi 9090 14878 15633 20190821_JH_MUT_Ubi 8833 sp|O00308|WWP2_HUMAN;sp|O00308-4|WWP2_HUMAN 109;109 sp|O00308|WWP2_HUMAN sp|O00308|WWP2_HUMAN sp|O00308|WWP2_HUMAN NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WWP2 PE=1 SV=2;sp|O00308-4|WWP2_HUMAN Isoform 4 of NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WWP2 0.403314 0 0.0122893 63.374 12.138 63.374 0.403314 0 0.0122893 63.374 N ELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLTLNLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.403)N(0.403)GGKMEN(0.092)MQ(0.097)LTLN(0.001)LQ(0.001)TEN(0.001)K N(0)N(0)GGKMEN(-6.47)MQ(-6.2)LTLN(-25.52)LQ(-25.52)TEN(-24.96)K 1 4 1.5445 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 48 122 109 109 3172 3625 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 sp|O00308|WWP2_HUMAN;sp|O00308-4|WWP2_HUMAN 110;110 sp|O00308|WWP2_HUMAN sp|O00308|WWP2_HUMAN sp|O00308|WWP2_HUMAN NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WWP2 PE=1 SV=2;sp|O00308-4|WWP2_HUMAN Isoform 4 of NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WWP2 0.403314 0 0.0122893 63.374 12.138 63.374 0.403314 0 0.0122893 63.374 N LLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLTLNLQT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N(0.403)N(0.403)GGKMEN(0.092)MQ(0.097)LTLN(0.001)LQ(0.001)TEN(0.001)K N(0)N(0)GGKMEN(-6.47)MQ(-6.2)LTLN(-25.52)LQ(-25.52)TEN(-24.96)K 2 4 1.5445 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 49 122 110 110 3172 3625 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 10206 10745 20190821_JH_WT_Ubi 8996 sp|O00592-2|PODXL_HUMAN;sp|O00592|PODXL_HUMAN 473;505 sp|O00592-2|PODXL_HUMAN sp|O00592-2|PODXL_HUMAN sp|O00592-2|PODXL_HUMAN Isoform 2 of Podocalyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PODXL;sp|O00592|PODXL_HUMAN Podocalyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PODXL PE=1 SV=2 0.736014 4.69105 0.010206 60.382 40.847 60.382 0.736014 4.69105 0.010206 60.382 1 N RKDQQRLTEELQTVENGYHDNPTLEVMETSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LTEELQ(0.006)TVEN(0.736)GYHDN(0.252)PTLEVMETSSEMQ(0.006)EKK LTEELQ(-20.77)TVEN(4.69)GYHDN(-4.69)PTLEVMETSSEMQ(-21.37)EKK 10 4 1.5424 1655700 1655700 0 0 NaN 0 1655700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1655700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 50 135 473 473 2822 3198;3199 9077 9550 9077 9550 20190821_JH_MUT_Ubi 7498 9077 9550 20190821_JH_MUT_Ubi 7498 9077 9550 20190821_JH_MUT_Ubi 7498 sp|O00592-2|PODXL_HUMAN;sp|O00592|PODXL_HUMAN 478;510 sp|O00592-2|PODXL_HUMAN sp|O00592-2|PODXL_HUMAN sp|O00592-2|PODXL_HUMAN Isoform 2 of Podocalyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PODXL;sp|O00592|PODXL_HUMAN Podocalyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PODXL PE=1 SV=2 0.779571 8.5544 0.000720206 74.525 53.791 53.679 0.692126 4.11781 0.000720206 74.525 0.779571 8.5544 0.0234581 53.679 0.541913 1.13157 0.00908108 60.951 1 N RLTEELQTVENGYHDNPTLEVMETSSEMQEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K) XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LTEELQ(0.005)TVEN(0.062)GYHDN(0.78)PTLEVMETSSEMQ(0.153)EKK LTEELQ(-21.41)TVEN(-10.79)GYHDN(8.55)PTLEVMETSSEMQ(-8.55)EKK 15 4 0.94916 7818300 7818300 0 0 NaN 3803200 0 0 1364300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 3803200 0 0 0 0 0 0 0 0 1364300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 51 135 478 478 2822 3198;3199 9074;9075;9076;9078 9547;9548;9549;9551 9078 9551 20190821_JH_MUT_Ubi 8342 9075 9548 20190821_JH_EV_Ubi 8523 9075 9548 20190821_JH_EV_Ubi 8523 sp|O14647|CHD2_HUMAN 1817 sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD2 PE=1 SV=2 0.888906 10.6051 0.036 43.604 15.399 43.604 0.888906 10.6051 0.036 43.604 3 N PLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SLEQ(0.106)KN(0.889)N(0.883)PDYN(0.561)WN(0.561)VR SLEQ(-10.61)KN(10.61)N(6.93)PDYN(0)WN(0)VR 6 2 -3.2011 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 52 146 1817 1817 4005 4551 12687 13307 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 sp|O14647|CHD2_HUMAN 1818 sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD2 PE=1 SV=2 0.883402 6.92594 0.036 43.604 15.399 43.604 0.883402 6.92594 0.036 43.604 3 N LDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT_____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SLEQ(0.106)KN(0.889)N(0.883)PDYN(0.561)WN(0.561)VR SLEQ(-10.61)KN(10.61)N(6.93)PDYN(0)WN(0)VR 7 2 -3.2011 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 53 146 1818 1818 4005 4551 12687 13307 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 sp|O14647|CHD2_HUMAN 1822 sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD2 PE=1 SV=2 0.561062 0 0.036 43.604 15.399 43.604 0.561062 0 0.036 43.604 3 N SPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT_________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SLEQ(0.106)KN(0.889)N(0.883)PDYN(0.561)WN(0.561)VR SLEQ(-10.61)KN(10.61)N(6.93)PDYN(0)WN(0)VR 11 2 -3.2011 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 54 146 1822 1822 4005 4551 12687 13307 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 sp|O14647|CHD2_HUMAN 1824 sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN sp|O14647|CHD2_HUMAN Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHD2 PE=1 SV=2 0.561062 0 0.036 43.604 15.399 43.604 0.561062 0 0.036 43.604 3 N LERSLEQKNNPDYNWNVRKT___________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SLEQ(0.106)KN(0.889)N(0.883)PDYN(0.561)WN(0.561)VR SLEQ(-10.61)KN(10.61)N(6.93)PDYN(0)WN(0)VR 13 2 -3.2011 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 55 146 1824 1824 4005 4551 12687 13307 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 12687 13307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14929 sp|O14668|TMG1_HUMAN 201 sp|O14668|TMG1_HUMAN sp|O14668|TMG1_HUMAN sp|O14668|TMG1_HUMAN Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRRG1 PE=1 SV=1 0.838175 7.14288 0.00134795 48.576 27.109 42.341 0.838175 7.14288 0.00375263 42.341 0.555641 0.970607 0.00134795 48.576 1 N TEPHLDPPPEYEDIVNSNSASAIPMVPVVTT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SETEPHLDPPPEYEDIVN(0.838)SN(0.162)SASAIPMVPVVTTIK SETEPHLDPPPEYEDIVN(7.14)SN(-7.14)SASAIPMVPVVTTIK 18 3 3.8879 2554300 2554300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1217300 1337000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1217300 0 0 1337000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 56 147 201 201 3900 4428 12342;12343 12941;12942 12342 12941 20190902_JH_WT_Ubi_2 14486 12343 12942 20190902_JH_WT_Ubi_3 14021 12343 12942 20190902_JH_WT_Ubi_3 14021 sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN;sp|O14828|SCAM3_HUMAN 56;82 sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN Isoform 2 of Secretory carrier-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP3;sp|O14828|SCAM3_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP3 PE=1 SV=3 1 65.8012 4.88412E-07 108.71 79.752 108.71 0.999686 35.0339 1.08284E-05 94.188 1 65.8012 4.88412E-07 108.71 1 N PSLQPSRKLSPTEPKNYGSYSTQASAAAATA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)YGSYSTQASAAAATAELLKK N(65.8)YGSYSTQ(-65.8)ASAAAATAELLKK 1 3 1.008 17770000 17770000 0 0 0.018103 0 0 9163400 0 0 0 0 0 8606100 0 0 0.050793 0 0 0 0 0 0.053325 0 0 0 0 0 0 9163400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8606100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 57 157 56 56 3273 3738 10519;10521 11066;11068 10521 11068 20190902_JH_WT_Ubi_3 11406 10521 11068 20190902_JH_WT_Ubi_3 11406 10521 11068 20190902_JH_WT_Ubi_3 11406 sp|O14880|MGST3_HUMAN 50 sp|O14880|MGST3_HUMAN sp|O14880|MGST3_HUMAN sp|O14880|MGST3_HUMAN Microsomal glutathione S-transferase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MGST3 PE=1 SV=1 0.976404 18.9569 0.0170759 57.41 36.753 57.41 0.976404 18.9569 0.0170759 57.41 1 N KYKVEYPIMYSTDPENGHIFNCIQRAHQNTL X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VEYPIMYSTDPEN(0.976)GHIFN(0.011)CIQ(0.012)R VEYPIMYSTDPEN(18.96)GHIFN(-19.41)CIQ(-18.96)R 13 3 0.45949 3132900 3132900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3132900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3132900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 58 158 50 50 4806 5453 15428 16204 15428 16204 20190902_JH_WT_Ubi_2 12596 15428 16204 20190902_JH_WT_Ubi_2 12596 15428 16204 20190902_JH_WT_Ubi_2 12596 sp|O14924-5|RGS12_HUMAN;sp|O14924-4|RGS12_HUMAN;sp|O14924|RGS12_HUMAN 596;596;596 sp|O14924-5|RGS12_HUMAN sp|O14924-5|RGS12_HUMAN sp|O14924-5|RGS12_HUMAN Isoform 5 of Regulator of G-protein signaling 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RGS12;sp|O14924-4|RGS12_HUMAN Isoform 4 of Regulator of G-protein signaling 12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RGS12;sp|O14924|RGS12_HUMAN Regulator of G-protein 0.999196 30.9459 0.0053558 98.407 25.876 66.023 0.993174 21.6288 0.0182726 81.709 0.998187 27.4071 0.0308051 74.392 0.994069 22.2426 0.0053558 98.407 0.999196 30.9459 0.0293604 66.023 1 N ADRYRVEGSFAQPPLNAPKREWSRKAFGMQS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX VEGSFAQ(0.001)PPLN(0.999)APK VEGSFAQ(-30.95)PPLN(30.95)APK 11 4 1.7394 148750000 148750000 0 0 NaN 0 14693000 39880000 0 33788000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 14693000 0 0 39880000 0 0 0 0 0 33788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 59 160 596 596 4785 5429 15340;15341;15342;15343 16112;16113;16114;16115 15343 16115 20190902_JH_WT_Ubi_2 6421 15340 16112 20190902_JH_EV_Ubi_3 5077 15340 16112 20190902_JH_EV_Ubi_3 5077 sp|O14936-5|CSKP_HUMAN;sp|O14936-3|CSKP_HUMAN;sp|O14936-4|CSKP_HUMAN;sp|O14936-6|CSKP_HUMAN;sp|O14936-2|CSKP_HUMAN;sp|O14936|CSKP_HUMAN 258;637;643;654;666;666 sp|O14936-5|CSKP_HUMAN sp|O14936-5|CSKP_HUMAN sp|O14936-5|CSKP_HUMAN Isoform 5 of Peripheral plasma membrane protein CASK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CASK;sp|O14936-3|CSKP_HUMAN Isoform 3 of Peripheral plasma membrane protein CASK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CASK;sp|O14936-4|CSKP_HUMAN Isoform 4 of Peri 0.995637 23.583 7.53319E-07 112.53 73.331 112.53 0.965749 14.5109 0.0119105 76.678 0.985547 18.3384 0.00291752 84.975 0.995637 23.583 7.53319E-07 112.53 0.985171 18.2241 2.88702E-05 103.4 1 N KDDHNWWQGKLENSKNGTAGLIPSPELQEWR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LEN(0.004)SKN(0.996)GTAGLIPSPELQEWR LEN(-23.58)SKN(23.58)GTAGLIPSPELQ(-77.44)EWR 6 3 -1.2361 44282000 44282000 0 0 NaN 0 0 24335000 4235900 0 7325900 0 0 8385700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 24335000 0 0 4235900 0 0 0 0 0 7325900 0 0 0 0 0 0 0 0 8385700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 60 161 258 258 2575 2926 8359;8360;8361;8362 8789;8790;8791;8792 8360 8790 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11772 8360 8790 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11772 8360 8790 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11772 sp|O15049|N4BP3_HUMAN 518 sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN NEDD4-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=N4BP3 PE=1 SV=3 1 55.5305 0.031554 55.531 17.803 55.531 1 55.5305 0.031554 55.531 N YQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXX N(1)Q(1)ALEQ(1)ELR N(55.53)Q(55.53)ALEQ(55.53)ELR 1 2 -0.050975 2514500 0 0 2514500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 61 170 518 518 3196 3652 10286 10826 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 sp|O15117|FYB1_HUMAN;sp|O15117-2|FYB1_HUMAN;sp|O15117-3|FYB1_HUMAN 338;338;348 sp|O15117|FYB1_HUMAN sp|O15117|FYB1_HUMAN sp|O15117|FYB1_HUMAN FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYB1 PE=1 SV=2;sp|O15117-2|FYB1_HUMAN Isoform FYB-130 of FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYB1;sp|O15117-3|FYB1_HUMAN Isoform 3 of FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens O 1 52.7843 0.00969986 52.784 29.685 52.784 1 43.6965 0.0246978 43.696 1 52.7843 0.00969986 52.784 2 N GGPWGQSQEKEKGDKNSATPKQKPLPPLFTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)SATPKQ(1)KPLPPLFTLGPPPPK N(52.78)SATPKQ(52.78)KPLPPLFTLGPPPPK 1 4 -0.95268 6774900 0 6774900 0 NaN 4899700 0 0 1875200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 4899700 0 0 0 0 0 0 0 0 1875200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 62 171 338 338 3209 3667 10330;10331 10873;10874 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 319 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.99931 32.9522 3.98934E-11 112.37 68.315 112.37 0.669357 6.08969 0.0094327 70.679 0.99931 32.9522 3.98934E-11 112.37 1 N ATGVMSNKTVQTAAANAASTAASSAAQNAFK X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TVQTAAAN(0.999)AASTAASSAAQ(0.001)NAFKGNQI TVQ(-52.72)TAAAN(32.95)AASTAASSAAQ(-32.95)N(-37.51)AFKGN(-64.17)Q(-69.33)I 8 3 -1.45 7272900 7272900 0 0 0.044987 0 0 0 0 0 3746700 3526200 0 0 0 0 0 0 0 0.71392 0.15121 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3746700 0 0 3526200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 63 173 319 319 4676 5305;5306 14986;14988 15745;15747 14988 15747 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9644 14988 15747 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9644 14988 15747 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9644 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 331 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.953348 13.1837 3.94894E-19 141.69 104.05 141.69 0.764415 4.45758 0.0219312 50.029 0.953348 13.1837 3.94894E-19 141.69 1;2 N AAANAASTAASSAAQNAFKGNQI________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX TVQTAAANAASTAASSAAQ(0.046)N(0.953)AFKGN(0.001)QI TVQ(-117.48)TAAAN(-74.28)AASTAASSAAQ(-13.18)N(13.18)AFKGN(-31.56)Q(-37.12)I 20 3 -0.72096 5457300 5457300 0 0 0.033757 0 0 0 0 0 0 5457300 0 0 0 0 0 0 0 0 0.23402 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5457300 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 64 173 331 331 4676 5305;5306 14989;14991 15748;15751 14989 15748 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9709 14989 15748 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9709 14989 15748 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9709 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 336 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.93295 12.545 1.84603E-12 122.68 93.863 122.68 0.85334 7.8349 0.00154581 80.944 0.93295 12.545 1.84603E-12 122.68 0.49921 0 3.46444E-09 107.88 0.494448 0 0.00178707 79.94 0.804411 6.30711 0.00274484 75.956 0.499554 0 2.8161E-05 88.329 1 N ASTAASSAAQNAFKGNQI_____________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX TVQTAAANAASTAASSAAQ(0.007)N(0.008)AFKGN(0.933)Q(0.052)I TVQ(-107.72)TAAAN(-73.5)AASTAASSAAQ(-21.48)N(-20.41)AFKGN(12.54)Q(-12.54)I 25 3 0.21265 10617000 10617000 0 0 0.065675 2497900 2978400 0 0 0 5141100 0 0 0 0.071635 0.088347 0 0 0 0.97961 0 0 NaN 2497900 0 0 2978400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5141100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 65 173 336 336 4676 5305;5306 14982;14985;14987 15741;15744;15746 14985 15744 20190821_JH_MUT_Ubi 10042 14985 15744 20190821_JH_MUT_Ubi 10042 14985 15744 20190821_JH_MUT_Ubi 10042 sp|O15355|PPM1G_HUMAN 187 sp|O15355|PPM1G_HUMAN sp|O15355|PPM1G_HUMAN sp|O15355|PPM1G_HUMAN Protein phosphatase 1G OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPM1G PE=1 SV=1 0.990962 20.3998 2.87762E-05 80.355 56.442 66.014 0.86521 8.07465 0.000594396 55.691 0.5 0 2.87762E-05 80.355 0.962273 14.0665 0.000826047 65.171 0.990962 20.3998 0.000818368 66.014 0.86952 8.23736 0.000311394 60.382 1 N KSGGGTGEEPGSQGLNGEAGPEDSTRETPSQ GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX GPPHSKSGGGTGEEPGSQ(0.009)GLN(0.991)GEAGPEDSTR GPPHSKSGGGTGEEPGSQ(-20.4)GLN(20.4)GEAGPEDSTR 21 3 0.93409 8881600 8881600 0 0 NaN 0 932410 0 2237900 0 1849100 1494400 1639200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 932410 0 0 0 0 0 2237900 0 0 0 0 0 1849100 0 0 1494400 0 0 1639200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 66 180 187 187 1651 1880 5279;5281;5282;5283;5284;5285;5287 5557;5560;5561;5562;5563;5564;5566 5285 5564 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4771 5279 5557 20190902_JH_EV_Ubi_2 4745 5279 5557 20190902_JH_EV_Ubi_2 4745 sp|O15374-4|MOT5_HUMAN;sp|O15374-2|MOT5_HUMAN;sp|O15374-5|MOT5_HUMAN;sp|O15374|MOT5_HUMAN 154;202;216;264 sp|O15374-4|MOT5_HUMAN sp|O15374-4|MOT5_HUMAN sp|O15374-4|MOT5_HUMAN Isoform 4 of Monocarboxylate transporter 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC16A4;sp|O15374-2|MOT5_HUMAN Isoform 2 of Monocarboxylate transporter 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC16A4;sp|O15374-5|MOT5_HUMAN Isoform 5 of Monocarboxylate tr 0.939078 11.8951 0.00305204 81.808 45.354 81.808 0.939078 11.8951 0.00305204 81.808 1 N SKNLTVSQNQSEEFYNGPNRNRLLLKSDEES X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX AGLPSKNLTVSQNQSEEFYN(0.939)GPN(0.061)R AGLPSKN(-60.24)LTVSQ(-50.88)N(-44.27)Q(-37.23)SEEFYN(11.9)GPN(-11.9)R 20 3 0.13627 3549400 3549400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3549400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3549400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 67 182 154 154 131 149 457 505 457 505 20190902_JH_WT_Ubi_2 9740 457 505 20190902_JH_WT_Ubi_2 9740 457 505 20190902_JH_WT_Ubi_2 9740 sp|O15438|MRP3_HUMAN;sp|O15438-4|MRP3_HUMAN;sp|O15438-2|MRP3_HUMAN;sp|O15438-5|MRP3_HUMAN 279;330;279;279 sp|O15438|MRP3_HUMAN sp|O15438|MRP3_HUMAN sp|O15438|MRP3_HUMAN Canalicular multispecific organic anion transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC3 PE=1 SV=3;sp|O15438-4|MRP3_HUMAN Isoform 4 of Canalicular multispecific organic anion transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC3;sp|O15438-2|MRP 1 85.0461 0.00712823 85.046 47.869 85.046 1 85.0461 0.00712823 85.046 1 N EKQTARHKASAAPGKNASGEDEVLLGARPRP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX ASAAPGKN(1)ASGEDEVLLGAR ASAAPGKN(85.05)ASGEDEVLLGAR 8 3 1.0383 1739600 1739600 0 0 0.003849 0 0 0 0 0 1739600 0 0 0 0 0 0 0 0 0.018178 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1739600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 68 186 279 279 261 309 906 984 906 984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7360 906 984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7360 906 984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7360 sp|O43399|TPD54_HUMAN;sp|O43399-5|TPD54_HUMAN;sp|O43399-7|TPD54_HUMAN;sp|O43399-2|TPD54_HUMAN;sp|O43399-4|TPD54_HUMAN;sp|O43399-3|TPD54_HUMAN;sp|O43399-6|TPD54_HUMAN 184;198;207;164;178;187;141 sp|O43399|TPD54_HUMAN sp|O43399|TPD54_HUMAN sp|O43399|TPD54_HUMAN Tumor protein D54 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPD52L2 PE=1 SV=2;sp|O43399-5|TPD54_HUMAN Isoform 5 of Tumor protein D54 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPD52L2;sp|O43399-7|TPD54_HUMAN Isoform 7 of Tumor protein D54 OS=Homo sapiens OX=9606 GN 0.98777 19.0723 0.0104781 66.76 29.21 66.76 0.98777 19.0723 0.0104781 66.76 1 N DRVGTIKSKVVGDRENGSDNLPSSAGSGDKP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX VVGDREN(0.988)GSDN(0.012)LPSSAGSGDK VVGDREN(19.07)GSDN(-19.07)LPSSAGSGDK 7 3 1.1379 3341900 3341900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3341900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3341900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 69 202 184 184 5052 5739 16298 17129 16298 17129 20190902_JH_WT_Ubi_2 6271 16298 17129 20190902_JH_WT_Ubi_2 6271 16298 17129 20190902_JH_WT_Ubi_2 6271 sp|O43707|ACTN4_HUMAN;sp|O43707-2|ACTN4_HUMAN;sp|P35609-2|ACTN2_HUMAN;sp|P35609|ACTN2_HUMAN;sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN;sp|P12814|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-3|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-4|ACTN1_HUMAN 358;139;346;346;339;339;339;339 sp|O43707|ACTN4_HUMAN;sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN sp|O43707|ACTN4_HUMAN sp|O43707|ACTN4_HUMAN Alpha-actinin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN4 PE=1 SV=2;sp|O43707-2|ACTN4_HUMAN Isoform ACTN4ISO of Alpha-actinin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN4;sp|P35609-2|ACTN2_HUMAN Isoform 2 of Alpha-actinin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AC 0.844615 7.34561 0.00114736 100.69 57.706 100.69 0.844615 7.34561 0.00114736 100.69 2 N KPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFM X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX VQ(0.035)EKCQ(0.955)LEIN(0.164)FN(0.845)TLQ(0.001)TK VQ(-14.47)EKCQ(14.47)LEIN(-7.35)FN(7.35)TLQ(-32.69)TK 12 3 0.25075 12368000 0 12368000 0 2.9854 0 12368000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 12368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 70 214;537 358;339 358 4987 5658 16013 16823 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 sp|O60232|SSA27_HUMAN 4 sp|O60232|SSA27_HUMAN sp|O60232|SSA27_HUMAN sp|O60232|SSA27_HUMAN Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSSCA1 PE=1 SV=1 0.999987 48.9003 0.000126608 77.575 52.419 74.308 0.999987 48.9003 0.000232256 74.308 0.999794 36.8505 0.00237248 59.614 0.999218 31.0669 0.00411149 54.582 0.99987 38.8512 0.000126608 77.575 1 N ____________MALNGAEVDDFSWEPPTEA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP ALN(1)GAEVDDFSWEPPTEAETKVLQAR ALN(48.9)GAEVDDFSWEPPTEAETKVLQ(-48.9)AR 3 3 1.2418 4251200 4251200 0 0 NaN 500860 1455100 0 0 0 0 664050 0 1631100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 500860 0 0 1455100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 664050 0 0 0 0 0 1631100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 71 228 4 4 211 240 700;701;702;703 768;769;770;771;772 700 768 20190821_JH_EV_Ubi 14116 703 772 20190902_JH_WT_Ubi_3 15131 703 772 20190902_JH_WT_Ubi_3 15131 sp|O60248-2|SOX15_HUMAN;sp|O60248|SOX15_HUMAN 76;76 sp|O60248-2|SOX15_HUMAN sp|O60248-2|SOX15_HUMAN sp|O60248-2|SOX15_HUMAN Isoform 2 of Protein SOX-15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOX15;sp|O60248|SOX15_HUMAN Protein SOX-15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOX15 PE=1 SV=1 0.642332 6.66168 0.0338866 48.044 7.3197 48.044 0.642332 6.66168 0.0338866 48.044 1 N SAQRRQMAQQNPKMHNSEISKRLGAQWKLLD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX RQ(0.076)MAQ(0.07)Q(0.07)N(0.141)PKMHN(0.642)SEISK RQ(-12.04)MAQ(-12.04)Q(-12.04)N(-6.66)PKMHN(6.66)SEISK 12 2 -2.5576 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 72 230 76 76 3801 4318 12028 12617 12028 12617 20190821_JH_WT_Ubi 11970 12028 12617 20190821_JH_WT_Ubi 11970 12028 12617 20190821_JH_WT_Ubi 11970 sp|O60260-3|PRKN_HUMAN;sp|O60260-5|PRKN_HUMAN;sp|O60260-8|PRKN_HUMAN;sp|O60260|PRKN_HUMAN 111;190;190;190 sp|O60260-3|PRKN_HUMAN sp|O60260-3|PRKN_HUMAN sp|O60260-3|PRKN_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase parkin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKN;sp|O60260-5|PRKN_HUMAN Isoform 5 of E3 ubiquitin-protein ligase parkin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKN;sp|O60260-8|PRKN_HUMAN Isoform 8 of E3 ubiquitin-p 0.99993 39.2086 0.0336029 43.848 15.018 43.848 0.99993 39.2086 0.0336029 43.848 2 N TLTQGPSCWDDVLIPNRMSGECQSPHCPGTS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(0.583)ATLTLTQ(0.417)GPSCWDDVLIPN(1)R Q(1.45)ATLTLTQ(-1.45)GPSCWDDVLIPN(39.21)R 20 3 4.3768 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 73 232 111 111 3605 4114 11602 12179 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN;sp|O60266|ADCY3_HUMAN 581;994 sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN Isoform 2 of Adenylate cyclase type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADCY3;sp|O60266|ADCY3_HUMAN Adenylate cyclase type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADCY3 PE=1 SV=3 0.672513 3.48274 0.00155522 65.387 42.854 65.387 0.672513 3.48274 0.00155522 65.387 1 N STYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERER X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TIGSTYMAASGVTPDVN(0.013)TN(0.673)GFASSN(0.315)KEDK TIGSTYMAASGVTPDVN(-17.53)TN(3.48)GFASSN(-3.48)KEDK 19 3 0.12583 759580 759580 0 0 NaN 0 0 0 759580 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 759580 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 74 233 581 581 4420 5015 14018 14716 14018 14716 20190902_JH_EV_Ubi_2 8273 14018 14716 20190902_JH_EV_Ubi_2 8273 14018 14716 20190902_JH_EV_Ubi_2 8273 sp|O60281-2|ZN292_HUMAN;sp|O60281|ZN292_HUMAN 1870;2015 sp|O60281-2|ZN292_HUMAN sp|O60281-2|ZN292_HUMAN sp|O60281-2|ZN292_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 292 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF292;sp|O60281|ZN292_HUMAN Zinc finger protein 292 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF292 PE=1 SV=3 0.990555 20.521 0.0339409 43.955 6.3305 43.955 0.990555 20.521 0.0339409 43.955 2 N SRSTQVKKQLAMTEENKKESQPALELRAETQ X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX Q(0.998)LAMTEEN(0.991)KKESQ(0.011)PALELR Q(27.97)LAMTEEN(20.52)KKESQ(-20.52)PALELR 8 3 2.759 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 75 235 1870 1870 3649 4158 11686 12264 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN;sp|O60315|ZEB2_HUMAN 583;607 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2;sp|O60315|ZEB2_HUMAN Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2 PE=1 SV=1 1 51.2649 0.0256586 51.265 26.727 51.265 1 51.2649 0.0256586 51.265 4 N GPIPLHQHERYLCKMNEEIKAVLQPHENIVP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP MN(1)EEIKAVLQ(1)PHEN(1)IVPN(1)K MN(51.26)EEIKAVLQ(51.26)PHEN(51.26)IVPN(51.26)K 2 3 -1.7413 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 76 239 583 583 2950 3355 9498 9998 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN;sp|O60315|ZEB2_HUMAN 595;619 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2;sp|O60315|ZEB2_HUMAN Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2 PE=1 SV=1 1 51.2649 0.0256586 51.265 26.727 51.265 1 51.2649 0.0256586 51.265 4 N CKMNEEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVDNKAL X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX MN(1)EEIKAVLQ(1)PHEN(1)IVPN(1)K MN(51.26)EEIKAVLQ(51.26)PHEN(51.26)IVPN(51.26)K 14 3 -1.7413 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 77 239 595 595 2950 3355 9498 9998 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN;sp|O60315|ZEB2_HUMAN 599;623 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2;sp|O60315|ZEB2_HUMAN Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2 PE=1 SV=1 1 51.2649 0.0256586 51.265 26.727 51.265 1 51.2649 0.0256586 51.265 4 N EEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVDNKALLLSS X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX MN(1)EEIKAVLQ(1)PHEN(1)IVPN(1)K MN(51.26)EEIKAVLQ(51.26)PHEN(51.26)IVPN(51.26)K 18 3 -1.7413 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 78 239 599 599 2950 3355 9498 9998 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN;sp|O60469|DSCAM_HUMAN 366;366 sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN Isoform Short of Down syndrome cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSCAM;sp|O60469|DSCAM_HUMAN Down syndrome cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSCAM PE=1 SV=2 1 46.6804 0.0211905 46.68 19.655 46.68 1 46.6804 0.0211905 46.68 2 N GEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX ITGIN(1)HEN(1)LIMDHMVK ITGIN(46.68)HEN(46.68)LIMDHMVK 5 3 0.7556 6521200 0 6521200 0 NaN 6521200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 6521200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 79 246 366 366 2274 2587 7457 7837 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN;sp|O60469|DSCAM_HUMAN 369;369 sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN sp|O60469-2|DSCAM_HUMAN Isoform Short of Down syndrome cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSCAM;sp|O60469|DSCAM_HUMAN Down syndrome cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSCAM PE=1 SV=2 1 46.6804 0.0211905 46.68 19.655 46.68 1 46.6804 0.0211905 46.68 2 N LNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX ITGIN(1)HEN(1)LIMDHMVK ITGIN(46.68)HEN(46.68)LIMDHMVK 8 3 0.7556 6521200 0 6521200 0 NaN 6521200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 6521200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 80 246 369 369 2274 2587 7457 7837 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 7457 7837 20190821_JH_EV_Ubi 8857 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN;sp|O60522|TDRD6_HUMAN 655;655 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN Isoform 2 of Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6;sp|O60522|TDRD6_HUMAN Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6 PE=2 SV=2 1 46.1543 0.0312893 46.154 19.315 46.154 1 46.1543 0.0312893 46.154 3 N QYVIEILDESRTGEENISKVIAQAGYAKYQE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TGEEN(1)ISKVIAQ(1)AGYAKYQ(1)EFETK TGEEN(46.15)ISKVIAQ(46.15)AGYAKYQ(46.15)EFETK 5 3 0.12197 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 81 253 655 655 4364 4947 13817 14499 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 sp|O60669|MOT2_HUMAN 461 sp|O60669|MOT2_HUMAN sp|O60669|MOT2_HUMAN sp|O60669|MOT2_HUMAN Monocarboxylate transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC16A7 PE=1 SV=2 0.981977 20.3732 0.0178349 61.684 33.401 61.684 0.981977 20.3732 0.0178349 61.684 1 N RESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERET X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX HSEDVN(0.982)VKVSN(0.009)AQ(0.009)SVTSER HSEDVN(20.37)VKVSN(-20.37)AQ(-20.37)SVTSER 6 3 3.9062 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 82 255 461 461 1992 2269 6523 6863 6523 6863 20190902_JH_EV_Ubi_2 5272 6523 6863 20190902_JH_EV_Ubi_2 5272 6523 6863 20190902_JH_EV_Ubi_2 5272 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN 892;886;838;785;791;832;892;785;886;838;832;791;563;569;563;569 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.739732 7.66493 0.0203003 50.827 35.512 50.827 0.739732 7.66493 0.0203003 50.827 2 N QKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTP X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EEIQ(0.134)MSN(0.74)MGSN(0.159)TKSLDN(0.476)N(0.475)YSTPN(0.016)ER EEIQ(-7.66)MSN(7.66)MGSN(-8.37)TKSLDN(-0.8)N(0.8)YSTPN(-18.34)ER 7 3 2.592 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 83 257 892 892 856 969;970;971;972 2729 2871 2729 2871 20190902_JH_EV_Ubi_3 6618 2729 2871 20190902_JH_EV_Ubi_3 6618 2729 2871 20190902_JH_EV_Ubi_3 6618 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN 896;890;842;789;795;836;896;789;890;842;836;795;567;573;567;573 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.686115 8.00415 2.10625E-06 92.518 64.554 64.954 0.603939 1.83493 2.10625E-06 87.748 0.686115 8.00415 0.00622768 64.954 0.409152 0.163582 0.00230797 72.676 0.600103 3.31751 5.64811E-06 92.518 1;2 N KKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERG X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX EEIQ(0.001)MSN(0.091)MGSN(0.686)TKSLDN(0.097)N(0.109)YSTPN(0.016)ER EEIQ(-32.48)MSN(-9.07)MGSN(8)TKSLDN(-8.65)N(-8)YSTPN(-16.84)ER 11 3 -0.75313 2994600 2376900 617740 0 0.059052 0 0 0 617740 0 739980 0 0 1636900 0 0 NaN 0.097432 0 0.12978 0 0 0.67515 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 617740 0 0 0 0 739980 0 0 0 0 0 0 0 0 1636900 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 84 257 896 896 856 969;970;971;972 2718;2721;2723 2859;2860;2863;2865 2721 2863 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7013 2723 2865 20190902_JH_WT_Ubi_3 7615 2718 2859 20190902_JH_EV_Ubi_2 6074 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN 902;896;848;795;801;842;902;795;896;848;842;801;573;579;573;579 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.677908 4.98807 0.000134894 83.059 69.739 72.227 0.427744 0.867221 0.0261294 46.839 0.677908 4.98807 0.00045445 72.227 0.662488 5.37019 0.000134894 83.059 1 N EIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTL X;X;X;Oxidation (M);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX EEIQMSNMGSN(0.002)TKSLDN(0.678)N(0.313)YSTPN(0.007)ER EEIQ(-47.95)MSN(-31.55)MGSN(-24.95)TKSLDN(4.99)N(-4.99)YSTPN(-18.96)ER 17 3 1.6676 1178200 1178200 0 0 0.023233 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 85 257 902 902 856 969;970;971;972 2719;2724 2861;2866 2719 2861 20190902_JH_EV_Ubi_2 6743 2724 2866 20190902_JH_EV_Ubi_3 5767 2724 2866 20190902_JH_EV_Ubi_3 5767 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN 903;897;849;796;802;843;903;796;897;849;843;802;574;580;574;580 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.630106 4.63338 2.10625E-06 87.748 55.981 87.748 0.630106 4.63338 2.10625E-06 87.748 0.547214 0.998394 0.00959754 58.92 1;2 N IQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLD X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX EEIQ(0.001)MSN(0.401)MGSN(0.604)TKSLDN(0.219)N(0.63)YSTPN(0.145)ER EEIQ(-27.23)MSN(-1.83)MGSN(1.83)TKSLDN(-4.63)N(4.63)YSTPN(-6.42)ER 18 3 3.464 617740 0 617740 0 0.012181 0 0 0 617740 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.097432 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 617740 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 86 257 903 903 856 969;970;971;972 2718;2720 2859;2860;2862 2718 2859 20190902_JH_EV_Ubi_2 6074 2718 2859 20190902_JH_EV_Ubi_2 6074 2718 2859 20190902_JH_EV_Ubi_2 6074 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN 908;902;854;801;807;848;908;801;902;854;848;807;579;585;579;585 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.610987 6.82126 2.65461E-06 90.978 70.495 90.978 0.610987 6.82126 2.65461E-06 90.978 0.545472 3.46725 0.000208654 80.702 1 N MGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDL Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX EEIQMSN(0.1)MGSN(0.035)TKSLDN(0.127)N(0.127)YSTPN(0.611)ER EEIQ(-34.26)MSN(-7.86)MGSN(-12.45)TKSLDN(-6.82)N(-6.82)YSTPN(6.82)ER 23 3 0.43699 3818900 3818900 0 0 0.075307 0 0 0 0 0 2473100 1345800 0 0 0 0 NaN 0 0 0.43374 0.2546 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2473100 0 0 1345800 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 87 257 908 908 856 969;970;971;972 2726;2727 2868;2869 2726 2868 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6105 2726 2868 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6105 2726 2868 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6105 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN 185;185;131;84;84;131;185;84;185;131;131;84;185;185;131;131;84;84;185;185;131;131;84;84 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.999979 46.7185 0.000691129 81.878 41.691 81.878 0.999979 46.7185 0.000691129 81.878 0.999013 30.0408 0.00856342 65.085 2 N VSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTA X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP KN(1)GN(1)GGPGPYVGQAGTATLPR KN(46.72)GN(42.05)GGPGPYVGQ(-42.05)AGTATLPR 2 3 -0.12067 2735500 0 2735500 0 NaN 0 0 0 0 0 1201900 1533600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1201900 0 0 1533600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 88 257 185 185 2402 2731 7859;7860 8263;8264 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN 187;187;133;86;86;133;187;86;187;133;133;86;187;187;133;133;86;86;187;187;133;133;86;86 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.999938 42.0528 0.000691129 81.878 41.691 81.878 0.999938 42.0528 0.000691129 81.878 0.997331 25.7209 0.00856342 65.085 2 N NNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATL Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KN(1)GN(1)GGPGPYVGQAGTATLPR KN(46.72)GN(42.05)GGPGPYVGQ(-42.05)AGTATLPR 4 3 -0.12067 2735500 0 2735500 0 NaN 0 0 0 0 0 1201900 1533600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1201900 0 0 1533600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 89 257 187 187 2402 2731 7859;7860 8263;8264 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 7859 8263 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7917 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN 172;172;118;71;71;118;172;71;172;118;118;71;172;172;118;118;71;71;172;172;118;118;71;71 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.33226 0 0.03111 45.042 16.896 45.042 0.33226 0 0.03111 45.042 N AMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGN X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ) PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TVQ(0.003)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0.332)N(0.332)YIQ(0.332)TLGR TVQ(-20.13)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0)N(0)YIQ(0)TLGR 21 3 4.3724 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 90 257 172 172 4674 5302 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN 173;173;119;72;72;119;173;72;173;119;119;72;173;173;119;119;72;72;173;173;119;119;72;72 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.33226 0 0.03111 45.042 16.896 45.042 0.33226 0 0.03111 45.042 N MGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVQ(0.003)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0.332)N(0.332)YIQ(0.332)TLGR TVQ(-20.13)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0)N(0)YIQ(0)TLGR 22 3 4.3724 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 91 257 173 173 4674 5302 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN;sp|O60716-31|CTND1_HUMAN;sp|O60716-32|CTND1_HUMAN;sp|O60716-28|CTND1_HUMAN;sp|O60716-30|CTND1_HUMAN 606;606;552;505;505;552;606;505;606;552;552;505;606;606;552;552;283;505;283;505;283;606;606;283;552;552;505;505;283;283;283;283 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.365172 0 0.0202074 41.296 17.849 41.296 0.365172 0 0.0202074 41.296 N HREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YQ(0.089)EAAPN(0.365)VAN(0.365)N(0.181)TGPHAASCFGAKK YQ(-6.13)EAAPN(0)VAN(0)N(-3.06)TGPHAASCFGAKK 7 4 2.6948 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 92 257 606 606 5192 5910 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-29|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-27|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-26|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-25|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN;sp|O60716-31|CTND1_HUMAN;sp|O60716-32|CTND1_HUMAN;sp|O60716-28|CTND1_HUMAN;sp|O60716-30|CTND1_HUMAN 609;609;555;508;508;555;609;508;609;555;555;508;609;609;555;555;286;508;286;508;286;609;609;286;555;555;508;508;286;286;286;286 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.365172 0 0.0202074 41.296 17.849 41.296 0.365172 0 0.0202074 41.296 N IPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX YQ(0.089)EAAPN(0.365)VAN(0.365)N(0.181)TGPHAASCFGAKK YQ(-6.13)EAAPN(0)VAN(0)N(-3.06)TGPHAASCFGAKK 10 4 2.6948 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 93 257 609 609 5192 5910 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 16761 17619 20190821_JH_MUT_Ubi 4719 sp|O60784-3|TOM1_HUMAN;sp|O60784|TOM1_HUMAN;sp|O60784-2|TOM1_HUMAN;sp|O60784-4|TOM1_HUMAN 289;334;334;301 sp|O60784-3|TOM1_HUMAN sp|O60784-3|TOM1_HUMAN sp|O60784-3|TOM1_HUMAN Isoform 3 of Target of Myb protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1;sp|O60784|TOM1_HUMAN Target of Myb protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1 PE=1 SV=2;sp|O60784-2|TOM1_HUMAN Isoform 2 of Target of Myb protein 1 OS=Homo sapiens O 0.857164 9.95987 2.27836E-06 65.592 49.669 65.592 0.845787 9.61831 0.000137751 48.281 0.857164 9.95987 2.27836E-06 65.592 0.475336 2.38035 1.71035E-05 55.921 1 N AADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSV X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TGQ(0.002)TTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGN(0.857)LSSQ(0.087)LAGMN(0.054)LGSSSVR TGQ(-25.52)TTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGN(9.96)LSSQ(-9.96)LAGMN(-12.01)LGSSSVR 29 3 3.578 735710 735710 0 0 0.010212 735710 0 0 0 0 0 0 0 0 0.14374 0 0 NaN 0 0 0 0 0 735710 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 94 260 289 289 4388 4976;4978;4980 13898;13906 14587;14596 13906 14596 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13893 13906 14596 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13893 13906 14596 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13893 sp|P61567|ENK7_HUMAN;sp|P61566|ENK24_HUMAN;sp|P61570|ENK25_HUMAN;sp|Q9UKH3|ENK9_HUMAN;sp|P61565|ENK21_HUMAN;sp|Q902F9|EN113_HUMAN;sp|Q902F8|ENK8_HUMAN;sp|Q69384|ENK6_HUMAN;sp|O71037|ENK19_HUMAN;sp|P63135|POK7_HUMAN 416;416;527;526;526;527;527;527;527;1287 sp|P61567|ENK7_HUMAN sp|P61567|ENK7_HUMAN sp|P61567|ENK7_HUMAN Endogenous retrovirus group K member 7 Env polyprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERVK-7 PE=2 SV=1;sp|P61566|ENK24_HUMAN Endogenous retrovirus group K member 24 Env polyprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERVK-24 PE=2 SV=1;sp|P61570|ENK 0.675056 3.2203 0.019471 68.243 14.678 68.243 0.675056 3.2203 0.019471 68.243 2 N WNSQSSIDQKLANQINDLRQTVIWMGDRLMS X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LWN(0.001)SQ(0.001)SSIDQ(0.802)KLAN(0.394)Q(0.127)IN(0.675)DLR LWN(-26.73)SQ(-30.39)SSIDQ(5.58)KLAN(-3.22)Q(-8.66)IN(3.22)DLR 17 3 2.0697 70869000 0 70869000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 70869000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70869000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 95 266 416 416 2866 3249 9235 9720 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 sp|O75185|AT2C2_HUMAN;sp|O75185-3|AT2C2_HUMAN;sp|O75185-2|AT2C2_HUMAN 443;443;460 sp|O75185|AT2C2_HUMAN sp|O75185|AT2C2_HUMAN sp|O75185|AT2C2_HUMAN Calcium-transporting ATPase type 2C member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2C2 PE=1 SV=2;sp|O75185-3|AT2C2_HUMAN Isoform 3 of Calcium-transporting ATPase type 2C member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2C2;sp|O75185-2|AT2C2_HUMAN Isofo 0.77917 5.48865 0.0194496 72.801 39.776 72.801 0.77917 5.48865 0.0194496 72.801 1 N SNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTE X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EFSN(0.001)VSVGKLVEAGCVAN(0.779)N(0.22)AVIR EFSN(-30.75)VSVGKLVEAGCVAN(5.49)N(-5.49)AVIR 18 3 1.5038 711560 711560 0 0 0.080871 0 0 0 0 0 711560 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 711560 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 96 274 443 443 887 1004 2830 2978 2830 2978 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11941 2830 2978 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11941 2830 2978 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11941 sp|O75339|CILP1_HUMAN 843 sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN Cartilage intermediate layer protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CILP PE=1 SV=4 0.99738 25.2826 0.0316586 42.789 7.7118 42.789 0.99738 25.2826 0.0316586 42.789 3 N LAGEELQAVESSPKFNPNAIGVPQPYLNKLN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX FN(0.997)PN(0.903)AIGVPQ(0.116)PYLN(0.984)K FN(25.28)PN(9.58)AIGVPQ(-9.58)PYLN(17.47)K 2 3 -0.69479 1853000 0 0 1853000 NaN 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 97 279 843 843 1276 1445 4046 4254 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 sp|O75339|CILP1_HUMAN 845 sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN Cartilage intermediate layer protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CILP PE=1 SV=4 0.902707 9.5849 0.0316586 42.789 7.7118 42.789 0.902707 9.5849 0.0316586 42.789 3 N GEELQAVESSPKFNPNAIGVPQPYLNKLNYR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXX FN(0.997)PN(0.903)AIGVPQ(0.116)PYLN(0.984)K FN(25.28)PN(9.58)AIGVPQ(-9.58)PYLN(17.47)K 4 3 -0.69479 1853000 0 0 1853000 NaN 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 98 279 845 845 1276 1445 4046 4254 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 sp|O75339|CILP1_HUMAN 855 sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN sp|O75339|CILP1_HUMAN Cartilage intermediate layer protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CILP PE=1 SV=4 0.984156 17.4671 0.0316586 42.789 7.7118 42.789 0.984156 17.4671 0.0316586 42.789 3 N PKFNPNAIGVPQPYLNKLNYRRTDHEDPRVK X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX FN(0.997)PN(0.903)AIGVPQ(0.116)PYLN(0.984)K FN(25.28)PN(9.58)AIGVPQ(-9.58)PYLN(17.47)K 14 3 -0.69479 1853000 0 0 1853000 NaN 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1853000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 99 279 855 855 1276 1445 4046 4254 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 4046 4254 20190902_JH_EV_Ubi_3 8069 sp|O75533|SF3B1_HUMAN 185 sp|O75533|SF3B1_HUMAN sp|O75533|SF3B1_HUMAN sp|O75533|SF3B1_HUMAN Splicing factor 3B subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B1 PE=1 SV=3 0.999888 39.4936 0.0136471 76.165 18.991 76.165 0.999888 39.4936 0.0136471 76.165 N QQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX VVN(1)GAAASQPPSK VVN(39.49)GAAASQ(-39.49)PPSK 3 2 -0.50377 1410200 1410200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1410200 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1410200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 100 293 185 185 5061 5751 16327 17160 16327 17160 20190902_JH_WT_Ubi_3 5155 16327 17160 20190902_JH_WT_Ubi_3 5155 16327 17160 20190902_JH_WT_Ubi_3 5155 sp|O75674-2|TM1L1_HUMAN;sp|O75674-3|TM1L1_HUMAN;sp|O75674|TM1L1_HUMAN 305;228;305 sp|O75674-2|TM1L1_HUMAN sp|O75674-2|TM1L1_HUMAN sp|O75674-2|TM1L1_HUMAN Isoform 2 of TOM1-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1L1;sp|O75674-3|TM1L1_HUMAN Isoform 3 of TOM1-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1L1;sp|O75674|TM1L1_HUMAN TOM1-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1L 0.788457 8.82757 0.00249854 76.98 49.426 76.98 0.788457 8.82757 0.00249854 76.98 1 N QQRILEQNKNQKEATNTTSEPSAPSQDLLDL X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.103)Q(0.103)KEATN(0.788)TTSEPSAPSQ(0.005)DLLDLSPSPR N(-8.83)Q(-8.83)KEATN(8.83)TTSEPSAPSQ(-22)DLLDLSPSPR 7 3 1.6634 718830 718830 0 0 0.0092475 0 0 0 0 718830 0 0 0 0 0 0 0 0 0.067112 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 718830 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 101 299 305 305 3200 3657 10301 10844 10301 10844 20190902_JH_EV_Ubi_3 10127 10301 10844 20190902_JH_EV_Ubi_3 10127 10301 10844 20190902_JH_EV_Ubi_3 10127 sp|O75976|CBPD_HUMAN;sp|O75976-2|CBPD_HUMAN 669;422 sp|O75976|CBPD_HUMAN sp|O75976|CBPD_HUMAN sp|O75976|CBPD_HUMAN Carboxypeptidase D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPD PE=1 SV=2;sp|O75976-2|CBPD_HUMAN Isoform 2 of Carboxypeptidase D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPD 0.538424 0.942313 0.00305373 58.861 40.505 58.861 0.538424 0.942313 0.00305373 58.861 1 N AVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SYPFVLSAN(0.538)LHGGSLVVN(0.433)YPFDDDEQ(0.028)GLATYSK SYPFVLSAN(0.94)LHGGSLVVN(-0.94)YPFDDDEQ(-12.81)GLATYSK 9 3 4.2421 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 102 308 669 669 4238 4813 13409 14069 13409 14069 20190821_JH_WT_Ubi 14326 13409 14069 20190821_JH_WT_Ubi 14326 13409 14069 20190821_JH_WT_Ubi 14326 sp|O76082-3|S22A5_HUMAN;sp|O76082|S22A5_HUMAN 328;304 sp|O76082-3|S22A5_HUMAN sp|O76082-3|S22A5_HUMAN sp|O76082-3|S22A5_HUMAN Isoform 3 of Solute carrier family 22 member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC22A5;sp|O76082|S22A5_HUMAN Solute carrier family 22 member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC22A5 PE=1 SV=1 0.999656 34.6339 0.00502584 60.939 33.226 57.009 0.999557 33.5319 0.00502584 60.939 0.999518 33.1719 0.00520029 60.735 0.999656 34.6339 0.00837342 57.009 1 N RFEEAEVIIRKAAKANGIVVPSTIFDPSELQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP AN(1)GIVVPSTIFDPSELQDLSSKK AN(34.63)GIVVPSTIFDPSELQ(-34.63)DLSSKK 2 3 -0.36099 9334900 9334900 0 0 4.4366 0 3262100 5112600 0 0 960230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 3262100 0 0 5112600 0 0 0 0 0 0 0 0 960230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 103 313 328 328 236 274 799;800;801 871;872;873 800 872 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14011 799 871 20190821_JH_MUT_Ubi 13144 799 871 20190821_JH_MUT_Ubi 13144 sp|O95163|ELP1_HUMAN 271 sp|O95163|ELP1_HUMAN sp|O95163|ELP1_HUMAN sp|O95163|ELP1_HUMAN Elongator complex protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELP1 PE=1 SV=3 1 107.529 0.00105752 107.53 52.238 107.53 1 73.9271 0.0104438 73.927 1 98.9421 0.00261517 98.942 1 107.529 0.00105752 107.53 1 N TQDKPNQQDIVFFEKNGLLHGHFTLPFLKDE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXX N(1)GLLHGHFTLPFLK N(107.53)GLLHGHFTLPFLK 1 3 -2.3809 5608800 5608800 0 0 2.4125 0 0 0 0 0 0 948790 4660000 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 948790 0 0 4660000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 104 327 271 271 3069 3511 9915;9916;9917 10446;10447;10448 9917 10448 20190902_JH_WT_Ubi_2 13884 9917 10448 20190902_JH_WT_Ubi_2 13884 9917 10448 20190902_JH_WT_Ubi_2 13884 sp|O95183|VAMP5_HUMAN 52 sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP5 PE=1 SV=1 0.393352 1.48331 0.0106949 63.044 29.913 63.044 0.393352 1.48331 0.0106949 63.044 N LQQRSDQLLDMSSTFNKTTQNLAQKKCWENI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SDQ(0.088)LLDMSSTFN(0.393)KTTQ(0.229)N(0.28)LAQ(0.009)K SDQ(-6.49)LLDMSSTFN(1.48)KTTQ(-2.38)N(-1.48)LAQ(-16.84)K 12 3 3.6937 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 105 329 52 52 3859;3860 4383;4385 12227 12823 20190902_JH_EV_Ubi_3 8252 12227 12823 20190902_JH_EV_Ubi_3 8252 12227 12823 20190902_JH_EV_Ubi_3 8252 sp|O95183|VAMP5_HUMAN 57 sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP5 PE=1 SV=1 0.836356 5.14122 0.00681761 59.975 7.6574 59.975 0.836356 5.14122 0.00681761 59.975 3 N DQLLDMSSTFNKTTQNLAQKKCWENIRYRIC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX SDQ(0.002)LLDMSSTFN(0.467)KTTQ(0.857)N(0.836)LAQ(0.836)KK SDQ(-28.5)LLDMSSTFN(-5.14)KTTQ(5.75)N(5.14)LAQ(5.14)KK 17 3 -3.052 11314000 0 0 11314000 0.21392 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 2.7961 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 106 329 57 57 3859;3860 4383;4385 12234 12830 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 sp|O95239-2|KIF4A_HUMAN;sp|O95239|KIF4A_HUMAN;sp|Q2VIQ3|KIF4B_HUMAN 711;711;711 sp|O95239-2|KIF4A_HUMAN sp|O95239-2|KIF4A_HUMAN sp|O95239-2|KIF4A_HUMAN Isoform 2 of Chromosome-associated kinesin KIF4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4A;sp|O95239|KIF4A_HUMAN Chromosome-associated kinesin KIF4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF4A PE=1 SV=3;sp|Q2VIQ3|KIF4B_HUMAN Chromosome-associated kines 1 52.5786 0.0336166 52.579 8.7708 52.579 1 52.5786 0.0336166 52.579 1 N QSNVLRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVAD X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX RKTEEAAAAN(1)K RKTEEAAAAN(52.58)K 10 2 -3.9972 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 107 333 711 711 3761 4275 11917 12500 11917 12500 20190821_JH_WT_Ubi 13523 11917 12500 20190821_JH_WT_Ubi 13523 11917 12500 20190821_JH_WT_Ubi 13523 sp|O95379|TFIP8_HUMAN 20 sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNFAIP8 PE=1 SV=1 0.819872 6.67415 0.0210772 55.097 11.306 55.097 0.819872 6.67415 0.0210772 55.097 N AEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX EVATDVFN(0.186)SKN(0.82)LAVQ(0.997)AQ(0.997)KK EVATDVFN(-6.67)SKN(6.67)LAVQ(23.3)AQ(23.86)KK 11 3 3.6492 1432500 0 0 1432500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 108 342 20 20 1127 1269 3583 3768 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 sp|O95447|LCA5L_HUMAN 459 sp|O95447|LCA5L_HUMAN sp|O95447|LCA5L_HUMAN sp|O95447|LCA5L_HUMAN Lebercilin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LCA5L PE=1 SV=1 0.976214 16.6796 0.0335267 42.209 14.946 42.209 0.976214 16.6796 0.0335267 42.209 N NTGRQKDKKEDQEKKNIFVKEEQELPPKIIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXX KN(0.976)IFVKEEQ(0.024)ELPPK KN(16.68)IFVKEEQ(-16.68)ELPPK 2 4 0.085603 1624300 1624300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1624300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1624300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 109 344 459 459 2404 2733 7868 8272 7868 8272 20190902_JH_WT_Ubi_2 2305 7868 8272 20190902_JH_WT_Ubi_2 2305 7868 8272 20190902_JH_WT_Ubi_2 2305 sp|O95626|AN32D_HUMAN 89 sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32D PE=2 SV=2 1 45.8792 0.0319488 45.879 19.253 45.879 1 45.8792 0.0319488 45.879 3 N NRASVGLEVLAEKCPNLIHLNLSGNKIKDLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX CPN(1)LIHLN(1)LSGN(1)K CPN(45.88)LIHLN(45.88)LSGN(45.88)K 3 3 1.8466 577280 0 0 577280 NaN 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 110 354 89 89 358 425 1197 1284 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 sp|O95626|AN32D_HUMAN 94 sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32D PE=2 SV=2 1 45.8792 0.0319488 45.879 19.253 45.879 1 45.8792 0.0319488 45.879 3 N GLEVLAEKCPNLIHLNLSGNKIKDLSTIEPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX CPN(1)LIHLN(1)LSGN(1)K CPN(45.88)LIHLN(45.88)LSGN(45.88)K 8 3 1.8466 577280 0 0 577280 NaN 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 111 354 94 94 358 425 1197 1284 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 sp|O95626|AN32D_HUMAN 98 sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN sp|O95626|AN32D_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32D PE=2 SV=2 1 45.8792 0.0319488 45.879 19.253 45.879 1 45.8792 0.0319488 45.879 3 N LAEKCPNLIHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLE X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX CPN(1)LIHLN(1)LSGN(1)K CPN(45.88)LIHLN(45.88)LSGN(45.88)K 12 3 1.8466 577280 0 0 577280 NaN 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 577280 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 112 354 98 98 358 425 1197 1284 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 1197 1284 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7958 sp|O95721|SNP29_HUMAN 135 sp|O95721|SNP29_HUMAN sp|O95721|SNP29_HUMAN sp|O95721|SNP29_HUMAN Synaptosomal-associated protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP29 PE=1 SV=1 0.775334 5.38207 2.32994E-05 104.95 72.17 104.95 0.775334 5.38207 2.32994E-05 104.95 0.715642 4.86655 0.0123417 60.134 1;2 N VNYFKSKPVETPPEQNGTLTSQPNNRLKEAI X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX SKPVETPPEQ(0.225)N(0.775)GTLTSQPNNR SKPVETPPEQ(-5.38)N(5.38)GTLTSQ(-40.75)PN(-43.67)N(-43.67)R 11 3 -1.8792 2202800 1331800 870920 0 NaN 0 0 1331800 0 0 0 0 0 870920 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1331800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 870920 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 113 355 135 135 3990 4535;4536 12651;12652 13269;13270 12651 13269 20190821_JH_WT_Ubi 5112 12651 13269 20190821_JH_WT_Ubi 5112 12651 13269 20190821_JH_WT_Ubi 5112 sp|O95721|SNP29_HUMAN 143 sp|O95721|SNP29_HUMAN sp|O95721|SNP29_HUMAN sp|O95721|SNP29_HUMAN Synaptosomal-associated protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP29 PE=1 SV=1 0.752697 5.62271 0.0123417 60.134 34.262 60.134 0.752697 5.62271 0.0123417 60.134 2 N VETPPEQNGTLTSQPNNRLKEAISTSKEQEA X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX SKPVETPPEQ(0.058)N(0.716)GTLTSQ(0.262)PN(0.753)N(0.211)R SKPVETPPEQ(-11.07)N(4.87)GTLTSQ(-4.87)PN(5.62)N(-5.62)R 19 3 -3.9793 870920 0 870920 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 870920 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 870920 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 114 355 143 143 3990 4535;4536 12652 13270 12652 13270 20190902_JH_WT_Ubi_3 7035 12652 13270 20190902_JH_WT_Ubi_3 7035 12652 13270 20190902_JH_WT_Ubi_3 7035 sp|O95800|GPR75_HUMAN 428 sp|O95800|GPR75_HUMAN sp|O95800|GPR75_HUMAN sp|O95800|GPR75_HUMAN Probable G-protein coupled receptor 75 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPR75 PE=1 SV=1 1 42.0954 0.0349554 42.095 6.5726 42.095 1 42.0954 0.0349554 42.095 2 N GNLEVNRNKSSHHETNSAYMLSPKPQKKFVD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX SSHHETN(1)SAYMLSPKPQ(1)KK SSHHETN(42.1)SAYMLSPKPQ(42.1)KK 7 2 4.1997 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 115 358 428 428 4163 4730 13189 13832 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 sp|O95841|ANGL1_HUMAN 87 sp|O95841|ANGL1_HUMAN sp|O95841|ANGL1_HUMAN sp|O95841|ANGL1_HUMAN Angiopoietin-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANGPTL1 PE=2 SV=1 1 53.001 0.025164 53.001 16.556 53.001 1 53.001 0.025164 53.001 N DASTIKDMITRMDLENLKDVLSRQKREIDVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX MDLEN(1)LKDVLSRQ(1)K MDLEN(53)LKDVLSRQ(53)K 5 3 4.0116 4215700 0 4215700 0 NaN 0 0 4215700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4215700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 116 366 87 87 2883 3272 9284 9770 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 sp|O96001-2|PPR17_HUMAN;sp|O96001|PPR17_HUMAN 55;106 sp|O96001-2|PPR17_HUMAN sp|O96001-2|PPR17_HUMAN sp|O96001-2|PPR17_HUMAN Isoform 2 of Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R17;sp|O96001|PPR17_HUMAN Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R17 PE=1 SV=2 1 46.3186 0.0362352 46.319 15.552 46.319 1 46.3186 0.0362352 46.319 2 N VQERHPKGKMIPVLHNTDLEQKKPRRKDTPA X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX HPKGKMIPVLHN(1)TDLEQ(1)K HPKGKMIPVLHN(46.32)TDLEQ(46.32)K 12 3 -1.5704 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 117 368 55 55 1965 2237 6388 6722 6388 6722 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8409 6388 6722 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8409 6388 6722 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8409 sp|P00338|LDHA_HUMAN;sp|P00338-3|LDHA_HUMAN;sp|P00338-4|LDHA_HUMAN 298;327;240 sp|P00338|LDHA_HUMAN sp|P00338|LDHA_HUMAN sp|P00338|LDHA_HUMAN L-lactate dehydrogenase A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LDHA PE=1 SV=2;sp|P00338-3|LDHA_HUMAN Isoform 3 of L-lactate dehydrogenase A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LDHA;sp|P00338-4|LDHA_HUMAN Isoform 4 of L-lactate dehydrogenase A 0.903755 9.72675 0.0251679 52.432 23.619 52.432 0.903755 9.72675 0.0251679 52.432 1 N IKDDVFLSVPCILGQNGISDLVKVTLTSEEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX DDVFLSVPCILGQ(0.096)N(0.904)GISDLVK DDVFLSVPCILGQ(-9.73)N(9.73)GISDLVK 14 3 0.8467 711980 711980 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 711980 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 711980 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 118 373 298 298 425 499 1375 1466 1375 1466 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14188 1375 1466 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14188 1375 1466 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14188 sp|P00338|LDHA_HUMAN;sp|P00338-3|LDHA_HUMAN;sp|P00338-4|LDHA_HUMAN;sp|P00338-5|LDHA_HUMAN;sp|P00338-2|LDHA_HUMAN 205;234;147;205;205 sp|P00338|LDHA_HUMAN sp|P00338|LDHA_HUMAN sp|P00338|LDHA_HUMAN L-lactate dehydrogenase A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LDHA PE=1 SV=2;sp|P00338-3|LDHA_HUMAN Isoform 3 of L-lactate dehydrogenase A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LDHA;sp|P00338-4|LDHA_HUMAN Isoform 4 of L-lactate dehydrogenase A 1 47.723 0.00542605 47.723 32.204 47.723 1 47.723 0.00542605 47.723 1 N LGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMN(1)VAGVSLK LGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMN(47.72)VAGVSLK 28 3 3.4384 3677700 3677700 0 0 0.0045703 0 0 3677700 0 0 0 0 0 0 0 0 0.007796 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3677700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 119 373 205 205 2630 2991 8538 8979 8538 8979 20190821_JH_WT_Ubi 10809 8538 8979 20190821_JH_WT_Ubi 10809 8538 8979 20190821_JH_WT_Ubi 10809 sp|P00367|DHE3_HUMAN;sp|P49448|DHE4_HUMAN 113;113 sp|P00367|DHE3_HUMAN sp|P00367|DHE3_HUMAN sp|P00367|DHE3_HUMAN Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLUD1 PE=1 SV=2;sp|P49448|DHE4_HUMAN Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLUD2 PE=1 SV=2 1 85.2711 0.0102501 85.271 50.521 85.271 1 85.2711 0.0102501 85.271 1 N KRNRVRGILRIIKPCNHVLSLSFPIRRDDGS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX PCN(1)HVLSLSFPIR PCN(85.27)HVLSLSFPIR 3 3 0.078553 2155800 2155800 0 0 0.013084 0 0 0 0 0 0 0 2155800 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0.060547 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2155800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 120 374 113 113 3312 3785 10633 11191 10633 11191 20190902_JH_WT_Ubi_2 12508 10633 11191 20190902_JH_WT_Ubi_2 12508 10633 11191 20190902_JH_WT_Ubi_2 12508 sp|P00533|EGFR_HUMAN 1053 sp|P00533|EGFR_HUMAN sp|P00533|EGFR_HUMAN sp|P00533|EGFR_HUMAN Epidermal growth factor receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EGFR PE=1 SV=2 0.981715 17.2988 9.67457E-18 166.64 114.54 166.64 0.981715 17.2988 9.67457E-18 166.64 0.940009 11.9505 2.57696E-06 130.47 0.839133 7.17364 4.37353E-12 150.12 0.968418 14.8662 0.000461764 118.52 1 N LSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.982)GLQ(0.018)SCPIKEDSFLQR N(17.3)GLQ(-17.3)SCPIKEDSFLQ(-143.05)R 1 3 0.19701 33480000 33480000 0 0 4.4506 12063000 6025100 0 8080000 0 7311700 0 0 0 3.9577 NaN NaN NaN NaN 2.3818 0 NaN NaN 12063000 0 0 6025100 0 0 0 0 0 8080000 0 0 0 0 0 7311700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 121 382 1053 1053 3070 3514 9922;9923;9925;9926 10453;10454;10456;10457 9922 10453 20190821_JH_EV_Ubi 9388 9922 10453 20190821_JH_EV_Ubi 9388 9922 10453 20190821_JH_EV_Ubi 9388 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN;sp|P00558|PGK1_HUMAN 82;110 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN Isoform 2 of Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1;sp|P00558|PGK1_HUMAN Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1 PE=1 SV=3 0.925209 10.9239 9.10207E-10 125.31 53.143 125.31 0.925209 10.9239 9.10207E-10 125.31 1 N FLKDCVGPEVEKACANPAAGSVILLENLRFH X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX DCVGPEVEKACAN(0.925)PAAGSVILLEN(0.075)LR DCVGPEVEKACAN(10.92)PAAGSVILLEN(-10.92)LR 13 3 2.7641 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 122 383 82 82 407 479 1331 1421 1331 1421 20190902_JH_EV_Ubi_2 11677 1331 1421 20190902_JH_EV_Ubi_2 11677 1331 1421 20190902_JH_EV_Ubi_2 11677 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN;sp|P00558|PGK1_HUMAN 221;249 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN Isoform 2 of Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1;sp|P00558|PGK1_HUMAN Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1 PE=1 SV=3 0.5 0 0.00272882 82.515 26.111 82.515 0.5 0 0.00272882 82.515 N MIIGGGMAFTFLKVLNNMEIGTSLFDEEGAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP VLN(0.5)N(0.5)MEIGTSLFDEEGAK VLN(0)N(0)MEIGTSLFDEEGAK 3 2 -1.4189 1415300 1415300 0 0 0.047902 0 0 0 0 0 0 0 0 1415300 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0.38313 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1415300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 123 383 221 221 4916 5583 15809 16613 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN;sp|P00558|PGK1_HUMAN 222;250 sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN sp|P00558-2|PGK1_HUMAN Isoform 2 of Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1;sp|P00558|PGK1_HUMAN Phosphoglycerate kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGK1 PE=1 SV=3 0.5 0 0.00272882 82.515 26.111 82.515 0.5 0 0.00272882 82.515 N IIGGGMAFTFLKVLNNMEIGTSLFDEEGAKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VLN(0.5)N(0.5)MEIGTSLFDEEGAK VLN(0)N(0)MEIGTSLFDEEGAK 4 2 -1.4189 1415300 1415300 0 0 0.047902 0 0 0 0 0 0 0 0 1415300 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0.38313 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1415300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 124 383 222 222 4916 5583 15809 16613 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 15809 16613 20190902_JH_WT_Ubi_3 13764 sp|P01833|PIGR_HUMAN 596 sp|P01833|PIGR_HUMAN sp|P01833|PIGR_HUMAN sp|P01833|PIGR_HUMAN Polymeric immunoglobulin receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIGR PE=1 SV=4 1 51.9491 0.031999 51.949 14.884 51.949 1 51.9491 0.031999 51.949 N APDEKVLDSGFREIENKAIQDPRLFAEEKAV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX EIEN(1)KAIQ(1)DPR EIEN(51.95)KAIQ(51.95)DPR 4 2 2.7578 356140 0 356140 0 NaN 0 0 0 0 0 356140 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 356140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 125 387 596 596 934 1055 2943 3096 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 sp|P02730-2|B3AT_HUMAN 5 sp|P02730-2|B3AT_HUMAN sp|P02730-2|B3AT_HUMAN sp|P02730-2|B3AT_HUMAN Isoform 2 of Band 3 anion transport protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC4A1 1 44.425 0.0368147 44.425 14.891 44.425 1 44.425 0.0368147 44.425 2 N ___________MDEKNQELRWMEAARWVQLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXX DEKN(1)Q(1)ELRWMEAAR DEKN(44.43)Q(44.43)ELRWMEAAR 4 2 3.9253 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 126 392 5 5 434 508 1394 1485 1394 1485 20190821_JH_WT_Ubi 16463 1394 1485 20190821_JH_WT_Ubi 16463 1394 1485 20190821_JH_WT_Ubi 16463 sp|P02786|TFR1_HUMAN 47 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.770624 6.6484 5.64465E-07 107.85 80.303 107.85 0.770624 6.6484 5.64465E-07 107.85 N DNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRC X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX Q(0.483)VDGDN(0.483)SHVEMKLAVDEEEN(0.771)ADN(0.194)N(0.069)TK Q(0)VDGDN(0)SHVEMKLAVDEEEN(6.65)ADN(-6.65)N(-11.07)TK 20 3 2.3635 4019000 0 4019000 0 0.031296 0 0 0 0 0 0 0 4019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.1518 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4019000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 127 393 47 47 2520;3711 2861;4224;4225 11797 12378 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 sp|P02786|TFR1_HUMAN 50 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.480314 0 0.00274856 68.074 30.385 68.074 0.480314 0 0.00274856 68.074 N HVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGS X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX QVDGDNSHVEMKLAVDEEEN(0.039)ADN(0.48)N(0.48)TK Q(-54.79)VDGDN(-54.79)SHVEMKLAVDEEEN(-10.86)ADN(0)N(0)TK 23 3 -1.3622 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 128 393 50 50 2520;3711 2861;4224;4225 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 sp|P02786|TFR1_HUMAN 51 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.480311 0 0.00274856 68.074 30.385 68.074 0.480311 0 0.00274856 68.074 N VEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX QVDGDNSHVEMKLAVDEEEN(0.039)ADN(0.48)N(0.48)TK Q(-54.79)VDGDN(-54.79)SHVEMKLAVDEEEN(-10.86)ADN(0)N(0)TK 24 3 -1.3622 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 129 393 51 51 2520;3711 2861;4224;4225 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 11796 12377 20190821_JH_WT_Ubi 7260 sp|P02786|TFR1_HUMAN 55 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.365455 0.712481 0.0139583 83.964 51.414 83.964 0.365455 0.712481 0.0139583 83.964 N LAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGT X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LAVDEEEN(0.122)ADN(0.386)N(0.127)TKAN(0.365)VTK LAVDEEEN(-5.74)ADN(-0.71)N(-5.46)TKAN(0.71)VTK 16 3 0.866 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 130 393 55 55 2520 2861 8183 8601 20190902_JH_WT_Ubi_2 6756 8183 8601 20190902_JH_WT_Ubi_2 6756 8183 8601 20190902_JH_WT_Ubi_2 6756 sp|P02786|TFR1_HUMAN 33 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.48309 0 5.64465E-07 107.85 80.303 107.85 0.48309 0 5.64465E-07 107.85 N LSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.483)VDGDN(0.483)SHVEMKLAVDEEEN(0.771)ADN(0.194)N(0.069)TK Q(0)VDGDN(0)SHVEMKLAVDEEEN(6.65)ADN(-6.65)N(-11.07)TK 6 3 2.3635 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 131 393 33 33 3711 4224;4225 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 sp|P04035-2|HMDH_HUMAN;sp|P04035|HMDH_HUMAN;sp|P04035-3|HMDH_HUMAN 445;445;465 sp|P04035-2|HMDH_HUMAN sp|P04035-2|HMDH_HUMAN sp|P04035-2|HMDH_HUMAN Isoform 2 of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGCR;sp|P04035|HMDH_HUMAN 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGCR PE=1 SV=1;sp|P04035-3|HMDH_HUMAN Isof 1 48.0531 0.0363226 48.053 6.1407 48.053 1 48.0531 0.0363226 48.053 N VTQEPEIELPREPRPNEECLQILGNAEKGAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EPRPN(1)EECLQ(1)ILGN(1)AEKGAK EPRPN(48.05)EECLQ(48.05)ILGN(48.05)AEKGAK 5 3 0.063989 1527200 0 0 1527200 NaN 0 0 0 0 1527200 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1527200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 132 397 445 445 1058 1190 3344 3517 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 sp|P04035-2|HMDH_HUMAN;sp|P04035|HMDH_HUMAN;sp|P04035-3|HMDH_HUMAN 454;454;474 sp|P04035-2|HMDH_HUMAN sp|P04035-2|HMDH_HUMAN sp|P04035-2|HMDH_HUMAN Isoform 2 of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGCR;sp|P04035|HMDH_HUMAN 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HMGCR PE=1 SV=1;sp|P04035-3|HMDH_HUMAN Isof 1 48.0531 0.0363226 48.053 6.1407 48.053 1 48.0531 0.0363226 48.053 N PREPRPNEECLQILGNAEKGAKFLSDAEIIQ X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX EPRPN(1)EECLQ(1)ILGN(1)AEKGAK EPRPN(48.05)EECLQ(48.05)ILGN(48.05)AEKGAK 14 3 0.063989 1527200 0 0 1527200 NaN 0 0 0 0 1527200 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1527200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 133 397 454 454 1058 1190 3344 3517 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 3344 3517 20190902_JH_EV_Ubi_3 6111 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN 167;221 sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA 0.838768 7.16189 5.71936E-07 121.72 79.446 121.72 0.838768 7.16189 5.71936E-07 121.72 1 N LKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX IGEHTPSALAIMEN(0.839)AN(0.161)VLAR IGEHTPSALAIMEN(7.16)AN(-7.16)VLAR 14 3 0.92856 5176800 5176800 0 0 0.10144 0 0 0 0 0 0 0 5176800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 0.24496 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5176800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 134 400 167 167 2124 2424 7052 7425 7052 7425 20190902_JH_WT_Ubi_2 11085 7052 7425 20190902_JH_WT_Ubi_2 11085 7052 7425 20190902_JH_WT_Ubi_2 11085 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN 283;337 sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA 0.312519 0 0.0002819 69.71 43.501 69.71 0.312519 0 0.0002819 69.71 N ITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX TVPPAVTGITFLSGGQ(0.062)SEEEASIN(0.313)LN(0.313)AIN(0.313)K TVPPAVTGITFLSGGQ(-6.99)SEEEASIN(0)LN(0)AIN(0)K 24 3 2.2231 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 135 400 283 283 4671 5299 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN 285;339 sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA 0.312519 0 0.0002819 69.71 43.501 69.71 0.312519 0 0.0002819 69.71 N FLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVPPAVTGITFLSGGQ(0.062)SEEEASIN(0.313)LN(0.313)AIN(0.313)K TVPPAVTGITFLSGGQ(-6.99)SEEEASIN(0)LN(0)AIN(0)K 26 3 2.2231 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 136 400 285 285 4671 5299 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN 288;342 sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA 0.312519 0 0.0002819 69.71 43.501 69.71 0.312519 0 0.0002819 69.71 N GGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVPPAVTGITFLSGGQ(0.062)SEEEASIN(0.313)LN(0.313)AIN(0.313)K TVPPAVTGITFLSGGQ(-6.99)SEEEASIN(0)LN(0)AIN(0)K 29 3 2.2231 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 137 400 288 288 4671 5299 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 14966 15725 20190821_JH_WT_Ubi 14513 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN 181;235;181 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA;sp|P09972|ALDOC_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase C 0.957128 12.5886 2.7242E-12 112.88 65.072 99.097 0.742458 6.25438 1.02138E-06 93.712 0.433598 0 0.000391723 81.38 0.376939 0.827707 0.000189929 76.351 0.333333 0 0.00063262 77.693 0.883877 5.80445 2.7242E-12 112.88 0.957128 12.5886 3.07262E-12 111.56 1;2 N ENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGD X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YASICQ(0.222)Q(0.821)N(0.957)GIVPIVEPEILPDGDHDLK YASICQ(-6.38)Q(6.38)N(12.59)GIVPIVEPEILPDGDHDLK 8 3 0.35932 47888000 42202000 5686200 0 26.45 0 4575600 0 0 0 0 0 7356300 35956000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 19.86 0 0 0 4575600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5462600 1893800 0 32164000 3792500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 138 400;498 181;181 181 5104;5105 5802;5803;5805 16461;16464;16465;16466;16467 17299;17302;17303;17304;17305;17306;17307 16467 17307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14227 16464 17302 20190902_JH_WT_Ubi_2 14412 16464 17302 20190902_JH_WT_Ubi_2 14412 sp|P04179-3|SODM_HUMAN;sp|P04179|SODM_HUMAN;sp|P04179-4|SODM_HUMAN;sp|P04179-2|SODM_HUMAN 60;60;14;60 sp|P04179-3|SODM_HUMAN sp|P04179-3|SODM_HUMAN sp|P04179-3|SODM_HUMAN Isoform 3 of Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOD2;sp|P04179|SODM_HUMAN Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SOD2 PE=1 SV=3;sp|P04179-4|SODM_HUMAN Isoform 4 of Superox 0.72422 4.58294 0.0191917 69.258 28.49 69.258 0.72422 4.58294 0.0191917 69.258 1 N QIMQLHHSKHHAAYVNNLNVTEEKYQEALAK X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX HHAAYVN(0.724)N(0.252)LN(0.024)VTEEK HHAAYVN(4.58)N(-4.58)LN(-14.86)VTEEK 7 3 3.4082 4998800 4998800 0 0 0.081085 0 0 0 0 0 0 0 4998800 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.22847 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4998800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 139 405 60 60 1854 2105 5936 6250 5936 6250 20190902_JH_WT_Ubi_2 6543 5936 6250 20190902_JH_WT_Ubi_2 6543 5936 6250 20190902_JH_WT_Ubi_2 6543 sp|P04406|G3P_HUMAN;sp|P04406-2|G3P_HUMAN 304;262 sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH PE=1 SV=3;sp|P04406-2|G3P_HUMAN Isoform 2 of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH 0.999492 33.6552 2.06425E-08 81.386 62.422 55.999 0.999492 33.6552 5.37166E-05 55.999 0.711045 4.2234 4.72244E-05 57.095 0.990291 20.717 2.06425E-08 81.386 1 N DTHSSTFDAGAGIALNDHFVKLISWYDNEFG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX GILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAGIALN(0.999)DHFVK GILGYTEHQ(-41.14)VVSSDFN(-33.66)SDTHSSTFDAGAGIALN(33.66)DHFVK 33 4 -0.97771 34265000 34265000 0 0 0.22887 1811900 4589000 24560000 0 0 0 0 0 0 NaN 0.19111 0.22258 NaN NaN NaN NaN 0 0 1811900 0 0 4589000 0 0 24560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 140 407 304 304 1542 1756 4934;4935;4936;4937 5190;5191;5192;5193 4934 5190 20190821_JH_EV_Ubi 11523 4937 5193 20190821_JH_WT_Ubi 11753 4937 5193 20190821_JH_WT_Ubi 11753 sp|P04406|G3P_HUMAN;sp|P04406-2|G3P_HUMAN 149;107 sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH PE=1 SV=3;sp|P04406-2|G3P_HUMAN Isoform 2 of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH 1 76.3258 1.90404E-14 152 105.41 76.326 0.999981 47.3077 1.90404E-14 152 1 98.9432 0.000330587 104.24 1 76.3258 0.0078486 76.326 1;2 N GVNHEKYDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXX IISN(1)ASCTTN(1)CLAPLAK IISN(76.33)ASCTTN(76.33)CLAPLAK 4 2 -2.655 14970000 10539000 4431000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 12924000 2046100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10539000 2384900 0 0 2046100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 141 407 149 149 2162 2464;2465 7155;7156;7157;7158 7530;7531;7532;7533 7158 7533 20190902_JH_WT_Ubi_3 10980 7155 7530 20190821_JH_WT_Ubi 8580 7155 7530 20190821_JH_WT_Ubi 8580 sp|P04406|G3P_HUMAN;sp|P04406-2|G3P_HUMAN 155;113 sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH PE=1 SV=3;sp|P04406-2|G3P_HUMAN Isoform 2 of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH 1 76.3258 0.000330587 98.943 45.376 76.326 1 98.9432 0.000330587 98.943 1 76.3258 0.0078486 76.326 2 N YDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGI X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX IISN(1)ASCTTN(1)CLAPLAK IISN(76.33)ASCTTN(76.33)CLAPLAK 10 2 -2.655 4431000 0 4431000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2384900 2046100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2384900 0 0 2046100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 142 407 155 155 2162 2464;2465 7157;7158 7532;7533 7158 7533 20190902_JH_WT_Ubi_3 10980 7157 7532 20190902_JH_WT_Ubi_2 11483 7157 7532 20190902_JH_WT_Ubi_2 11483 sp|P04406|G3P_HUMAN;sp|P04406-2|G3P_HUMAN 167;125 sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH PE=1 SV=3;sp|P04406-2|G3P_HUMAN Isoform 2 of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH 0.999345 31.834 2.79243E-06 95.122 72.486 64.318 0.999345 31.834 0.00312735 64.318 0.997216 25.5409 2.79243E-06 95.122 1 N CTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAIT X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VIHDN(0.999)FGIVEGLMTTVHAITATQ(0.001)K VIHDN(31.83)FGIVEGLMTTVHAITATQ(-31.83)K 5 3 1.7727 24863000 24863000 0 0 0.0024286 0 0 3366300 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0010345 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3366300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.11795 0.13373 1.4402 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.73586 2.7858 1.2653 NaN NaN NaN 143 407 167 167 4856 5512;5513 15596;15601 16391;16396 15601 16396 20190821_JH_WT_Ubi 14960 15596 16391 20190902_JH_WT_Ubi_2 13903 15596 16391 20190902_JH_WT_Ubi_2 13903 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN;sp|P04908|H2A1B_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN;sp|Q96KK5|H2A1H_HUMAN;sp|Q9BTM1|H2AJ_HUMAN;sp|Q16777|H2A2C_HUMAN;sp|Q6FI13|H2A2A_HUMAN;sp|P20671|H2A1D_HUMAN;sp|P0C0S8|H2A1_HUMAN 111;111;111;111;111;111;111;111;111;111 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q93077|H2A1C_HUMAN Histone H2A type 1-C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AC PE=1 SV=3;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN Histone H2A type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST3H2A PE=1 SV=3;sp|P04908|H2A1B_HUMAN Histone H2A type 1-B/E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2A 0.984946 18.1622 6.40163E-24 167.35 149.84 140.3 0.984946 18.1622 1.51097E-13 140.3 0.888358 9.03295 1.82888E-23 160.45 0.490292 1.83021 5.4929E-05 99.044 0.918057 10.5141 6.40163E-24 167.35 0.527587 0.907984 0.00703191 76.051 0.97235 17.9018 6.31708E-10 133.96 0.891031 11.0474 2.53355E-13 135.69 1;2 N KLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHK;KLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHK GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VTIAQGGVLPN(0.985)IQ(0.015)AVLLPKK VTIAQ(-48.06)GGVLPN(18.16)IQ(-18.16)AVLLPKK 11 3 2.234 899800000 885610000 14185000 0 0.021344 8518000 60775000 0 0 0 496670000 1199100 14185000 315090000 0.0019176 0.003882 0 0 0 3.4905 0.00080682 0.22675 3.4761 8518000 0 0 60775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 496670000 0 0 1199100 0 0 0 14185000 0 315090000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 144 416;499 111;111 111 5028;5029 5707;5710;5711 16199;16206;16208;16209;16212;16217;16218;16224 17020;17027;17028;17030;17031;17032;17033;17034;17037;17045;17046;17055 16199 17020 20190821_JH_EV_Ubi 12919 16208 17033 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14107 16208 17033 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14107 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN;sp|P05023|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-3|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-2|AT1A1_HUMAN 209;209;178;209 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN Isoform 4 of Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1;sp|P05023|AT1A1_HUMAN Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1;sp|P05023-3|A 0.942962 12.1833 3.85505E-21 155.11 108.62 155.11 0.942962 12.1833 3.85505E-21 155.11 1 N KGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP IISAN(0.943)GCKVDN(0.057)SSLTGESEPQTR IISAN(12.18)GCKVDN(-12.18)SSLTGESEPQ(-106.87)TR 5 3 0.54977 4828500 4828500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4828500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4828500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 145 418 209 209 2160 2462 7152 7527 7152 7527 20190902_JH_WT_Ubi_2 8347 7152 7527 20190902_JH_WT_Ubi_2 8347 7152 7527 20190902_JH_WT_Ubi_2 8347 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN;sp|P05023|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-3|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-2|AT1A1_HUMAN 215;215;184;215 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN Isoform 4 of Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1;sp|P05023|AT1A1_HUMAN Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1;sp|P05023-3|A 0.957025 13.4772 6.25767E-21 152.64 118.38 152.64 0.957025 13.4772 6.25767E-21 152.64 0.746805 4.70016 0.0204713 72.564 0.778422 5.45687 1.09588E-14 139.43 0.583849 1.47051 0.00706182 77.681 0.687254 3.41926 4.01923E-15 144.3 0.593874 1.65522 0.0249913 52.483 1 N PADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX IISAN(0.043)GCKVDN(0.957)SSLTGESEPQTR IISAN(-13.48)GCKVDN(13.48)SSLTGESEPQ(-59.42)TR 11 3 0.59249 15023000 15023000 0 0 NaN 0 0 3365300 3647000 2397900 859290 4753600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3365300 0 0 3647000 0 0 2397900 0 0 859290 0 0 4753600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 146 418 215 215 2160 2462 7147;7148;7149;7150;7151;7153 7521;7522;7523;7524;7525;7526;7528 7151 7526 20190821_JH_WT_Ubi 6289 7151 7526 20190821_JH_WT_Ubi 6289 7151 7526 20190821_JH_WT_Ubi 6289 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN;sp|P05023|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-3|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-2|AT1A1_HUMAN 181;181;150;181 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN Isoform 4 of Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1;sp|P05023|AT1A1_HUMAN Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1;sp|P05023-3|A 0.835866 7.06941 0.0129333 66.644 21.387 66.644 0.789847 5.7505 0.0322211 59.975 0.835866 7.06941 0.0129333 66.644 1 N PQQALVIRNGEKMSINAEEVVVGDLVEVKGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.164)GEKMSIN(0.836)AEEVVVGDLVEVK N(-7.07)GEKMSIN(7.07)AEEVVVGDLVEVK 8 3 -0.25824 2696500 2696500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 1532000 1164500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1532000 0 0 1164500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 147 418 181 181 3064 3502 9882;9883 10413;10414 9883 10414 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12195 9883 10414 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12195 9883 10414 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12195 sp|P05067-10|A4_HUMAN;sp|P05067-3|A4_HUMAN;sp|P05067-4|A4_HUMAN;sp|P05067-5|A4_HUMAN;sp|P05067-6|A4_HUMAN;sp|P05067-7|A4_HUMAN;sp|P05067-11|A4_HUMAN;sp|P05067-8|A4_HUMAN;sp|P05067-9|A4_HUMAN;sp|P05067|A4_HUMAN 624;662;680;681;699;718;731;736;737;755 sp|P05067-10|A4_HUMAN sp|P05067-10|A4_HUMAN sp|P05067-10|A4_HUMAN Isoform APP639 of Amyloid-beta A4 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APP;sp|P05067-3|A4_HUMAN Isoform L-APP677 of Amyloid-beta A4 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APP;sp|P05067-4|A4_HUMAN Isoform APP695 of Amyloid-beta A4 protein OS 0.975844 17.7821 0.00109827 106.3 73.611 97.129 0.847363 8.53339 0.00109827 106.3 0.781704 7.27673 0.0326196 71.031 0.482449 0 0.00695355 91.789 0.952118 15.0431 0.00257283 98.676 0.923758 11.4735 0.00804632 78.069 0.975844 17.7821 0.00317274 97.129 1 N AAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX HLSKMQQ(0.016)N(0.976)GYEN(0.008)PTYK HLSKMQ(-40.28)Q(-17.78)N(17.78)GYEN(-20.97)PTYK 8 3 0.48866 12111000 12111000 0 0 NaN 2911300 1468000 0 0 0 0 385440 4075100 3271000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2911300 0 0 1468000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 385440 0 0 4075100 0 0 3271000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 148 420 624 624 1932 2197;2198 6272;6274;6275;6276;6277;6278 6599;6602;6603;6604;6605;6606 6277 6605 20190902_JH_WT_Ubi_3 5120 6272 6599 20190821_JH_EV_Ubi 3533 6272 6599 20190821_JH_EV_Ubi 3533 sp|P05386|RLA1_HUMAN 62 sp|P05386|RLA1_HUMAN sp|P05386|RLA1_HUMAN sp|P05386|RLA1_HUMAN 60S acidic ribosomal protein P1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPLP1 PE=1 SV=1 0.951549 14.1799 3.63169E-06 60.848 41.473 60.848 0.951549 14.1799 3.63169E-06 60.848 1 N FAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP ALAN(0.012)VN(0.036)IGSLICN(0.952)VGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEK ALAN(-18.95)VN(-14.18)IGSLICN(14.18)VGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEK 13 3 -0.068444 591510 591510 0 0 0.0034319 0 0 0 0 0 0 0 0 591510 0 0 0 0 0 0 0 0 0.019896 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 591510 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 149 426 62 62 193 221 655 720 655 720 20190902_JH_WT_Ubi_3 14591 655 720 20190902_JH_WT_Ubi_3 14591 655 720 20190902_JH_WT_Ubi_3 14591 sp|P05388-2|RLA0_HUMAN;sp|P05388|RLA0_HUMAN 181;243 sp|P05388-2|RLA0_HUMAN sp|P05388-2|RLA0_HUMAN sp|P05388-2|RLA0_HUMAN Isoform 2 of 60S acidic ribosomal protein P0 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPLP0;sp|P05388|RLA0_HUMAN 60S acidic ribosomal protein P0 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPLP0 PE=1 SV=1 0.999935 41.921 5.86991E-12 112.41 84.111 74.876 0.999809 37.1844 5.86991E-12 112.41 0.999801 37.0104 9.28129E-07 95.51 0.999935 41.921 0.000346638 74.876 1 N QIGYPTVASVPHSIINGYKRVLALSVETDYT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX NVASVCLQIGYPTVASVPHSIIN(1)GYK N(-65.54)VASVCLQ(-41.92)IGYPTVASVPHSIIN(41.92)GYK 23 3 0.30919 42886000 42886000 0 0 NaN 0 16388000 24368000 0 0 0 0 0 2129700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 16388000 0 0 24368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2129700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 150 428 181 181 3237 3697 10399;10400;10401 10943;10944;10945 10401 10945 20190902_JH_WT_Ubi_3 13472 10399 10943 20190821_JH_MUT_Ubi 12039 10399 10943 20190821_JH_MUT_Ubi 12039 sp|P05556|ITB1_HUMAN;sp|P05556-2|ITB1_HUMAN;sp|P05556-5|ITB1_HUMAN;sp|P05556-4|ITB1_HUMAN;sp|P05556-3|ITB1_HUMAN 417;417;417;417;417 sp|P05556|ITB1_HUMAN sp|P05556|ITB1_HUMAN sp|P05556|ITB1_HUMAN Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1 PE=1 SV=2;sp|P05556-2|ITB1_HUMAN Isoform 2 of Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1;sp|P05556-5|ITB1_HUMAN Isoform 5 of Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1;sp|P05 0.939673 10.6517 0.0238299 46.35 10.919 46.35 0.939673 10.6517 0.0238299 46.35 N KNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP CSN(0.94)ISIGDEVQ(0.299)FEISITSN(0.761)KCPKK CSN(10.65)ISIGDEVQ(-4.68)FEISITSN(4.68)KCPKK 3 3 2.2952 1654100 0 1654100 0 NaN 0 0 0 0 0 1654100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1654100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 151 429 417 417 363 431 1205 1292 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 sp|P05556|ITB1_HUMAN;sp|P05556-2|ITB1_HUMAN;sp|P05556-5|ITB1_HUMAN;sp|P05556-4|ITB1_HUMAN;sp|P05556-3|ITB1_HUMAN 433;433;433;433;433 sp|P05556|ITB1_HUMAN sp|P05556|ITB1_HUMAN sp|P05556|ITB1_HUMAN Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1 PE=1 SV=2;sp|P05556-2|ITB1_HUMAN Isoform 2 of Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1;sp|P05556-5|ITB1_HUMAN Isoform 5 of Integrin beta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGB1;sp|P05 0.761268 4.6777 0.0238299 46.35 10.919 46.35 0.761268 4.6777 0.0238299 46.35 N ISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX CSN(0.94)ISIGDEVQ(0.299)FEISITSN(0.761)KCPKK CSN(10.65)ISIGDEVQ(-4.68)FEISITSN(4.68)KCPKK 19 3 2.2952 1654100 0 1654100 0 NaN 0 0 0 0 0 1654100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1654100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 152 429 433 433 363 431 1205 1292 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 1205 1292 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10960 sp|P05783|K1C18_HUMAN 339 sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT18 PE=1 SV=2 0.999543 33.4031 2.51982E-45 184.62 113.7 157.01 0.714296 4.96962 0.0210798 52.72 0.967974 15.0418 1.19758E-10 123.12 0.991051 21.9098 4.52266E-06 96.234 0.998669 28.7521 2.51982E-45 184.62 0.988988 19.5691 1.31327E-08 117.35 0.913518 10.5165 0.000408589 81.017 0.999543 33.4031 1.76338E-22 157.01 1 N LREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX YALQMEQLN(1)GILLHLESELAQTR YALQ(-66.13)MEQ(-33.4)LN(33.4)GILLHLESELAQ(-83.34)TR 9 3 -0.34348 27596000 27596000 0 0 17.917 2754400 0 0 0 0 2962700 1454800 9129200 4229200 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2754400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2962700 0 0 1454800 0 0 9129200 0 0 4229200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 153 430 339 339 5101 5797;5799 16449;16450;16451;16453;16454;16456;16457 17286;17287;17288;17290;17291;17293;17294 16454 17291 20190902_JH_WT_Ubi_3 15330 16450 17287 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14837 16450 17287 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14837 sp|P06454-2|PTMA_HUMAN;sp|P06454|PTMA_HUMAN 29;29 sp|P06454-2|PTMA_HUMAN sp|P06454-2|PTMA_HUMAN sp|P06454-2|PTMA_HUMAN Isoform 2 of Prothymosin alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTMA;sp|P06454|PTMA_HUMAN Prothymosin alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTMA PE=1 SV=2 1 76.0998 0.0269483 76.1 34.447 76.1 1 76.0998 0.0269483 76.1 N TKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENG X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX EVVEEAEN(1)GR EVVEEAEN(76.1)GR 8 2 0.40244 7666800 7666800 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7666800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7666800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 154 431 29 29 1151 1298 3672 3866 3672 3866 20190902_JH_WT_Ubi_2 5828 3672 3866 20190902_JH_WT_Ubi_2 5828 3672 3866 20190902_JH_WT_Ubi_2 5828 sp|P06733|ENOA_HUMAN;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN 140;47 sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN Isoform MBP-1 of Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 0.99274 18.9311 9.48107E-05 72.028 35.733 72.028 0.98501 19.4676 0.00554586 47.507 0.99274 18.9311 9.48107E-05 72.028 2 N EKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVING X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP HIADLAGN(0.993)SEVILPVPAFN(0.474)VIN(0.473)GGSHAGN(0.06)K HIADLAGN(18.93)SEVILPVPAFN(0)VIN(0)GGSHAGN(-8.99)K 8 4 -0.18993 10996000 0 10996000 0 0.54314 0 1982700 9013700 0 0 0 0 0 0 0 NaN 3.435 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1982700 0 0 9013700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 155 435 140 140 1864 2118;2119 6009;6011 6329;6331 6011 6331 20190821_JH_WT_Ubi 13431 6011 6331 20190821_JH_WT_Ubi 13431 6011 6331 20190821_JH_WT_Ubi 13431 sp|P06733|ENOA_HUMAN;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN 151;58 sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN Isoform MBP-1 of Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 0.91986 11.9717 2.33451E-07 87.792 46.584 87.792 0.667958 4.55117 7.21757E-05 71.097 0.777291 7.7114 0.000129261 66.36 0.473736 0 1.7099E-05 77.907 0.878513 11.4764 3.57025E-05 74.123 0.438565 0 0.000151129 64.545 0.91986 11.9717 2.33451E-07 87.792 1;2 N DLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQ X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX HIADLAGNSEVILPVPAFN(0.92)VIN(0.058)GGSHAGN(0.022)K HIADLAGN(-58.14)SEVILPVPAFN(11.97)VIN(-11.97)GGSHAGN(-16.27)K 19 4 -0.47648 185830000 183850000 1982700 0 9.1788 83469000 43290000 0 22621000 0 0 0 36453000 0 6.9051 NaN 0 8.668 0 NaN NaN NaN NaN 83469000 0 0 41307000 1982700 0 0 0 0 22621000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36453000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 156 435 151 151 1864 2118;2119 6000;6001;6003;6007;6009 6318;6319;6322;6323;6327;6329 6007 6327 20190902_JH_WT_Ubi_2 14081 6007 6327 20190902_JH_WT_Ubi_2 14081 6007 6327 20190902_JH_WT_Ubi_2 14081 sp|P06733|ENOA_HUMAN;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN 154;61 sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN Isoform MBP-1 of Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 0.643451 5.24095 6.81084E-07 88.708 48.04 88.708 0.621061 1.64427 9.48107E-05 72.028 0.643451 5.24095 6.81084E-07 88.708 0.438565 0 0.000151129 64.545 1;2 N GNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX HIADLAGNSEVILPVPAFN(0.192)VIN(0.643)GGSHAGN(0.164)K HIADLAGN(-59.21)SEVILPVPAFN(-5.24)VIN(5.24)GGSHAGN(-5.94)K 22 3 -1.5641 6349100 2419600 3929600 0 0.3136 0 0 3929600 0 2419600 0 0 0 0 0 NaN 1.4975 0 0.82748 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 3929600 0 0 0 0 2419600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 157 435 154 154 1864 2118;2119 6002;6010 6320;6321;6330 6002 6320 20190902_JH_EV_Ubi_3 11671 6002 6320 20190902_JH_EV_Ubi_3 11671 6002 6320 20190902_JH_EV_Ubi_3 11671 sp|P06733|ENOA_HUMAN;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN 161;68 sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2;sp|P06733-2|ENOA_HUMAN Isoform MBP-1 of Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 0.928013 8.9357 2.01042E-05 76.241 49.741 60.521 0.928013 8.9357 0.000556509 60.521 0.42017 1.61161 2.01042E-05 76.241 0.686419 4.71437 0.000932399 52.192 1;2 N PVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAA X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX HIADLAGN(0.002)SEVILPVPAFN(0.449)VIN(0.621)GGSHAGN(0.928)K HIADLAGN(-25.74)SEVILPVPAFN(-1.64)VIN(1.64)GGSHAGN(8.94)K 29 4 2.6039 63990000 60061000 3929600 0 3.1607 0 0 3929600 0 0 0 0 0 60061000 0 NaN 1.4975 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 3929600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60061000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 158 435 161 161 1864 2118;2119 6008;6010 6328;6330 6010 6330 20190821_JH_WT_Ubi 13074 6004 6324 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13460 6004 6324 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13460 sp|P06744|G6PI_HUMAN;sp|P06744-2|G6PI_HUMAN 249;260 sp|P06744|G6PI_HUMAN sp|P06744|G6PI_HUMAN sp|P06744|G6PI_HUMAN Glucose-6-phosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPI PE=1 SV=4;sp|P06744-2|G6PI_HUMAN Isoform 2 of Glucose-6-phosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPI 1 72.8477 0.0232763 72.848 39.727 72.848 1 65.6266 0.0253529 65.627 1 72.8477 0.0232763 72.848 1 N KDPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX HFVALSTN(1)TTK HFVALSTN(72.85)TTK 8 2 -0.6434 586600 586600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 586600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 586600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 159 437 249 249 1835 2083 5854;5855 6164;6165 5855 6165 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5904 5855 6165 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5904 5855 6165 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5904 sp|P07355|ANXA2_HUMAN;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN 254;272 sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2 PE=1 SV=2;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN Isoform 2 of Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2 0.996993 27.6235 2.15196E-05 96.591 65.231 69.272 0.610802 2.12723 2.15196E-05 96.591 0.548656 5.09773 0.00620971 76.015 0.996993 27.6235 0.0268904 69.272 1 N DMLESIRKEVKGDLENAFLNLVQCIQNKPLY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GDLEN(0.997)AFLN(0.002)LVQ(0.001)CIQNKPLYFADR GDLEN(27.62)AFLN(-27.62)LVQ(-29.9)CIQ(-36.79)N(-42.51)KPLYFADR 5 3 -0.83088 6718000 6718000 0 0 NaN 0 3111500 0 0 0 0 959690 2646800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 3111500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 959690 0 0 2646800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 160 446 254 254 1401 1595 4466;4467;4468 4692;4693;4694 4468 4694 20190902_JH_WT_Ubi_2 16232 4466 4692 20190821_JH_MUT_Ubi 14513 4466 4692 20190821_JH_MUT_Ubi 14513 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 332;332;332;332 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN Tubulin beta-2B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB2B PE=1 SV= 0.977573 17.3712 0.00182631 99.788 46.618 99.788 0.977573 17.3712 0.00182631 99.788 1 N FRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EVDEQ(0.018)MLN(0.978)VQ(0.004)N(0.001)K EVDEQ(-17.37)MLN(17.37)VQ(-24.14)N(-31.16)K 8 2 1.8374 8110400 8110400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 8110400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8110400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 161 448;1099 332;332 332 1128 1270 3584 3769 3584 3769 20190902_JH_WT_Ubi_3 7161 3584 3769 20190902_JH_WT_Ubi_3 7161 3584 3769 20190902_JH_WT_Ubi_3 7161 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 226;226;226;226;226 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV= 1 54.0722 0.000298293 77.689 50.852 54.072 1 47.0495 0.0328098 47.05 1 77.689 0.000298293 77.689 1 55.1771 0.00664636 61.904 1 54.0722 0.00190084 69.071 1 N CFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLR X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LTTPTYGDLN(1)HLVSATMSGVTTCLR LTTPTYGDLN(54.07)HLVSATMSGVTTCLR 10 3 0.21737 24311000 24311000 0 0 0.018059 0 2427300 3626100 0 0 0 0 0 4266000 0 0.0062239 0.009864 0 0 0 0 0 0.030401 0 0 0 2427300 0 0 3626100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4266000 0 0 NaN NaN NaN 0.42921 0.75197 1.8058 0.82469 4.7043 2.1319 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 162 448;1099 226;226 226 2831 3210;3211 9130;9131;9132;9133;9134;9135;9136 9607;9608;9609;9610;9611;9612;9613;9614 9136 9614 20190902_JH_WT_Ubi_3 13539 9135 9613 20190821_JH_WT_Ubi 12570 9135 9613 20190821_JH_WT_Ubi 12570 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 89;89;89;89;89 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV= 0.92856 11.3739 1.27449E-26 154.95 105.33 154.95 0.92856 11.3739 1.27449E-26 154.95 2 N DSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX SGPFGQIFRPDN(0.929)FVFGQ(0.068)SGAGN(0.502)N(0.502)WAK SGPFGQ(-50.72)IFRPDN(11.37)FVFGQ(-11.37)SGAGN(0)N(0)WAK 12 3 3.057 2882100 0 2882100 0 0.014371 0 0 0 0 0 0 0 2882100 0 NaN 0 0 NaN 0 0 0 0.065023 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2882100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 163 448;1099 89;89 89 3932 4465;4466 12460 13071;13072 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 99;99;99;99;99 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV= 0.855044 7.83248 1.27449E-26 156.36 124.06 140.2 0.745585 5.41768 4.08787E-26 156.36 0.855044 7.83248 1.62036E-19 140.2 0.501588 0 1.27449E-26 154.95 0.588951 3.81787 6.46335E-10 108.79 1;2 N IFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVD X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SGPFGQIFRPDNFVFGQ(0.004)SGAGN(0.855)N(0.141)WAK SGPFGQ(-97.53)IFRPDN(-55.18)FVFGQ(-23.18)SGAGN(7.83)N(-7.83)WAK 22 3 1.2838 13967000 11085000 2882100 0 0.069648 0 4177500 0 0 0 0 1416700 2882100 5491100 NaN 0.1183 0 NaN 0 0 0.11941 0.065023 0.24295 0 0 0 4177500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1416700 0 0 0 2882100 0 5491100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.24175 0.31883 2.6363 0.54364 1.1913 2.3512 164 448;1099 99;99 99 3932 4465;4466 12455;12456;12459;12460 13065;13066;13067;13070;13071;13072 12456 13066 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12812 12455 13065 20190821_JH_MUT_Ubi 12943 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 100;100;100;100;100 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV= 0.501588 0 1.27449E-26 154.95 105.33 154.95 0.501588 0 1.27449E-26 154.95 2 N FRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SGPFGQIFRPDN(0.929)FVFGQ(0.068)SGAGN(0.502)N(0.502)WAK SGPFGQ(-50.72)IFRPDN(11.37)FVFGQ(-11.37)SGAGN(0)N(0)WAK 23 3 3.057 2882100 0 2882100 0 0.014371 0 0 0 0 0 0 0 2882100 0 NaN 0 0 NaN 0 0 0 0.065023 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2882100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 165 448;1099 100;100 100 3932 4465;4466 12460 13071;13072 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 12460 13071 20190902_JH_WT_Ubi_2 15119 sp|P07737|PROF1_HUMAN 62 sp|P07737|PROF1_HUMAN sp|P07737|PROF1_HUMAN sp|P07737|PROF1_HUMAN Profilin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFN1 PE=1 SV=2 0.999253 31.2619 0.0070215 87.669 61.195 87.669 0.987524 18.9847 0.0300336 76.158 0.999253 31.2619 0.0070215 87.669 0.924541 10.8821 0.0166379 82.663 1 N EVGVLVGKDRSSFYVNGLTLGGQKCSVIRDS X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX SSFYVN(0.999)GLTLGGQ(0.001)KCSVIR SSFYVN(31.26)GLTLGGQ(-31.26)KCSVIR 6 3 0.51543 20414000 20414000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 10899000 5740500 0 3774500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10899000 0 0 5740500 0 0 0 0 0 3774500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 166 451 62 62 4152 4719 13166;13167;13168 13807;13808;13809 13167 13808 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9923 13167 13808 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9923 13167 13808 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9923 sp|P07900|HS90A_HUMAN;sp|P07900-2|HS90A_HUMAN 637;759 sp|P07900|HS90A_HUMAN sp|P07900|HS90A_HUMAN sp|P07900|HS90A_HUMAN Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AA1 PE=1 SV=5;sp|P07900-2|HS90A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AA1 1 53.2519 0.0328423 53.252 21.409 53.252 1 53.2519 0.0328423 53.252 1 N NSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX HLEIN(1)PDHSIIETLR HLEIN(53.25)PDHSIIETLR 5 2 3.4144 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 167 455 637 637 1896 2157 6138 6462 6138 6462 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9297 6138 6462 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9297 6138 6462 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9297 sp|P07900|HS90A_HUMAN;sp|P07900-2|HS90A_HUMAN 306;428 sp|P07900|HS90A_HUMAN sp|P07900|HS90A_HUMAN sp|P07900|HS90A_HUMAN Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AA1 PE=1 SV=5;sp|P07900-2|HS90A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSP90AA1 1 74.5335 3.32846E-05 120.6 96.752 120.6 0.999833 37.7779 0.000202857 117.79 1 74.5335 3.32846E-05 120.6 1 N NKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWE X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX NPDDITN(1)EEYGEFYK N(-74.53)PDDITN(74.53)EEYGEFYK 7 2 0.13388 1215300 1215300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1215300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1215300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 168 455 306 306 3177 3631 10228;10229 10768;10769 10229 10769 20190902_JH_WT_Ubi_3 10980 10229 10769 20190902_JH_WT_Ubi_3 10980 10229 10769 20190902_JH_WT_Ubi_3 10980 sp|P07954-2|FUMH_HUMAN;sp|P07954|FUMH_HUMAN 318;361 sp|P07954-2|FUMH_HUMAN sp|P07954-2|FUMH_HUMAN sp|P07954-2|FUMH_HUMAN Isoform Cytoplasmic of Fumarate hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FH;sp|P07954|FUMH_HUMAN Fumarate hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FH PE=1 SV=3 1 63.0372 0.0102077 63.037 20.828 63.037 1 63.0372 0.0102077 63.037 1 N GSGPRSGLGELILPENEPGSSIMPGKVNPTQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX SGLGELILPEN(1)EPGSSIMPGK SGLGELILPEN(63.04)EPGSSIMPGK 11 2 -0.551 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 169 460 318 318 3930 4462 12443 13051 12443 13051 20190821_JH_WT_Ubi 13020 12443 13051 20190821_JH_WT_Ubi 13020 12443 13051 20190821_JH_WT_Ubi 13020 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-3|4F2_HUMAN;sp|P08195-4|4F2_HUMAN 116;54;147 sp|P08195|4F2_HUMAN sp|P08195|4F2_HUMAN sp|P08195|4F2_HUMAN 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 PE=1 SV=3;sp|P08195-3|4F2_HUMAN Isoform 3 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2;sp|P08195-4|4F2_HUMAN Isoform 4 of 4F2 cell-surfa 0.813301 6.45251 0.000150092 74.3 48.696 74.3 0.813301 6.45251 0.000150092 74.3 1 N TMSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGA X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EVELN(0.813)ELEPEKQ(0.184)PMN(0.003)AASGAAMSLAGAEK EVELN(6.45)ELEPEKQ(-6.45)PMN(-24.93)AASGAAMSLAGAEK 5 3 0.41777 3292800 3292800 0 0 0.015836 0 0 0 0 0 3292800 0 0 0 0 0 0 0 0 0.097508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3292800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 170 462 116 116 1132;1133 1274;1278;1279;1280 3595 3782 3595 3782 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10214 3595 3782 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10214 3595 3782 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10214 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-3|4F2_HUMAN;sp|P08195-4|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN 126;64;157;25 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195|4F2_HUMAN 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 PE=1 SV=3;sp|P08195-3|4F2_HUMAN Isoform 3 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2;sp|P08195-4|4F2_HUMAN Isoform 4 of 4F2 cell-surfa 0.993402 21.7785 6.87614E-24 151.6 122.94 100.12 0.92571 10.9709 6.87614E-24 151.6 0.967441 14.7354 1.48497E-15 111.27 0.476382 0 0.0301597 54.66 0.993402 21.7785 2.51745E-10 100.12 0.991478 20.6728 0.000150632 87.958 1 N KEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGAEKN GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX EVELNELEPEKQ(0.007)PMN(0.993)AASGAAMSLAGAEK EVELN(-57.83)ELEPEKQ(-21.78)PMN(21.78)AASGAAMSLAGAEK 15 3 -0.3985 66444000 66444000 0 0 0.31954 52040000 1484700 0 0 4723800 0 0 0 8196000 2.3115 0.082094 0 0 0.1359 0 0 0 0.48151 52040000 0 0 1484700 0 0 0 0 0 0 0 0 4723800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8196000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 171 462;463 126;25 25 1132;1133;3683 1274;1278;1279;1280;4193;4194 3590;3591;3593;3594;3596 3776;3777;3778;3780;3781;3783 3593 3780 20190902_JH_EV_Ubi_3 9367 3591 3778 20190821_JH_EV_Ubi 9225 3591 3778 20190821_JH_EV_Ubi 9225 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-3|4F2_HUMAN;sp|P08195-4|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN 141;79;172;40 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195|4F2_HUMAN 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 PE=1 SV=3;sp|P08195-3|4F2_HUMAN Isoform 3 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2;sp|P08195-4|4F2_HUMAN Isoform 4 of 4F2 cell-surfa 1 100.266 6.79338E-10 132.87 109.85 100.27 1 120.077 3.11704E-09 132.87 1 111.628 4.4413E-07 111.63 1 100.266 6.11375E-06 100.27 0.993794 22.5519 1.51978E-05 71.159 1 87.323 0.000288319 87.323 0.999997 58.3433 6.79338E-10 96.913 0.998939 30.8753 6.52287E-05 62.398 1 N NAASGAAMSLAGAEKNGLVKIKVAEDEAEAA Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)GLVKIKVAEDEAEAAAAAK N(100.27)GLVKIKVAEDEAEAAAAAK 1 3 -0.48633 131250000 131250000 0 0 NaN 6820300 2985800 3032600 5031500 6499000 3771000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 6820300 0 0 2985800 0 0 3032600 0 0 5031500 0 0 6499000 0 0 3771000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 172 462;463 141;40 40 1133;3071;3683 1278;1279;1280;3515;4193;4194 3622;3623;3624;3625;3626;3627;3628;3629;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636;3637;9929;9930;9931;9932;9933;11746;11747;11748;11749;11750;11751;11752;11753;11754 3816;3817;3818;3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825;3826;3827;3828;3829;3830;3831;10460;10461;10462;10463;10464;12327;12328;12329;12330;12331;12332;12333;12334;12335 9933 10464 20190821_JH_WT_Ubi 9340 9929 10460 20190821_JH_EV_Ubi 8943 3634 3828 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10262 sp|P08195-2|4F2_HUMAN 15 sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN Isoform 2 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 1 65.8425 4.68242E-10 132.74 102.02 132.74 0.999998 57.4188 8.91959E-10 130.56 1 65.8425 4.68242E-10 132.74 0.813301 6.45251 0.000150092 74.3 1 N _MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SQDTEVDMKEVELN(1)ELEPEK SQ(-65.84)DTEVDMKEVELN(65.84)ELEPEK 14 3 -1.422 7361600 7361600 0 0 0.012844 0 0 0 1459500 2609200 0 0 0 0 0 0 0 0.013189 0.031761 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1459500 0 0 2609200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 173 463 15 15 1132;1133;2971;4116 1274;1278;1279;1280;3388;4672;4674 3595;13016;13017 3782;13648;13649 13017 13649 20190902_JH_EV_Ubi_3 9461 13017 13649 20190902_JH_EV_Ubi_3 9461 13017 13649 20190902_JH_EV_Ubi_3 9461 sp|P08559|ODPA_HUMAN;sp|P08559-4|ODPA_HUMAN;sp|P08559-2|ODPA_HUMAN 159;197;166 sp|P08559|ODPA_HUMAN sp|P08559|ODPA_HUMAN sp|P08559|ODPA_HUMAN Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDHA1 PE=1 SV=3;sp|P08559-4|ODPA_HUMAN Isoform 4 of Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondria 0.92915 11.207 0.00329177 63.639 34.612 63.639 0.92915 11.207 0.00329177 63.639 1 N GCAKGKGGSMHMYAKNFYGGNGIVGAQVPLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.929)FYGGN(0.07)GIVGAQVPLGAGIALACK N(11.21)FYGGN(-11.21)GIVGAQ(-32.86)VPLGAGIALACK 1 3 -0.53984 1099200 1099200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1099200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1099200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 174 467 159 159 3063 3501 9880 10410 9880 10410 20190902_JH_WT_Ubi_2 15504 9880 10410 20190902_JH_WT_Ubi_2 15504 9880 10410 20190902_JH_WT_Ubi_2 15504 sp|P08559|ODPA_HUMAN;sp|P08559-4|ODPA_HUMAN;sp|P08559-2|ODPA_HUMAN 164;202;171 sp|P08559|ODPA_HUMAN sp|P08559|ODPA_HUMAN sp|P08559|ODPA_HUMAN Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDHA1 PE=1 SV=3;sp|P08559-4|ODPA_HUMAN Isoform 4 of Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondria 0.997484 26.3785 1.8902E-16 136.85 97.933 122.83 0.994417 22.5503 1.8902E-16 136.85 0.997484 26.3785 1.17232E-10 122.83 1 N KGGSMHMYAKNFYGGNGIVGAQVPLGAGIAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.002)FYGGN(0.997)GIVGAQVPLGAGIALACK N(-26.38)FYGGN(26.38)GIVGAQ(-36.58)VPLGAGIALACK 6 3 0.15747 5101900 5101900 0 0 NaN 0 0 3162400 0 0 0 0 0 1939400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3162400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1939400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 175 467 164 164 3063 3501 9879;9881 10409;10411;10412 9881 10411 20190902_JH_WT_Ubi_3 15030 9879 10409 20190821_JH_WT_Ubi 14602 9879 10409 20190821_JH_WT_Ubi 14602 sp|P08582|TRFM_HUMAN 665 sp|P08582|TRFM_HUMAN sp|P08582|TRFM_HUMAN sp|P08582|TRFM_HUMAN Melanotransferrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MELTF PE=1 SV=2 0.999738 35.8129 0.0309613 45.115 16.483 45.115 0.999738 35.8129 0.0309613 45.115 1 N GDDHNKNGFKMFDSSNYHGQDLLFKDATVRA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX MFDSSN(1)YHGQDLLFK MFDSSN(35.81)YHGQ(-35.81)DLLFK 6 3 -2.6285 1537500 1537500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1537500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1537500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 176 471 665 665 2910 3305 9379 9872 9379 9872 20190902_JH_WT_Ubi_2 4592 9379 9872 20190902_JH_WT_Ubi_2 4592 9379 9872 20190902_JH_WT_Ubi_2 4592 sp|P08582|TRFM_HUMAN 449 sp|P08582|TRFM_HUMAN sp|P08582|TRFM_HUMAN sp|P08582|TRFM_HUMAN Melanotransferrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MELTF PE=1 SV=2 1 62.6464 0.00106994 62.646 28.981 62.646 1 62.6464 0.00106994 62.646 1 N LVPAAGEHYAPEDSSNSYYVVAVVRRDSSHA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX TYGLVPAAGEHYAPEDSSN(1)SYYVVAVVR TYGLVPAAGEHYAPEDSSN(62.65)SYYVVAVVR 19 3 -0.52597 2623000 2623000 0 0 0.089524 0 0 2623000 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.20833 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 177 471 449 449 4697 5330 15077 15844 15077 15844 20190821_JH_WT_Ubi 11805 15077 15844 20190821_JH_WT_Ubi 11805 15077 15844 20190821_JH_WT_Ubi 11805 sp|P08648|ITA5_HUMAN 507 sp|P08648|ITA5_HUMAN sp|P08648|ITA5_HUMAN sp|P08648|ITA5_HUMAN Integrin alpha-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITGA5 PE=1 SV=2 1 47.9913 0.0297107 47.991 16.173 47.991 1 47.9913 0.0297107 47.991 1 N IVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGNPVAC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX GRPIVSASASLTIFPAMFN(1)PEER GRPIVSASASLTIFPAMFN(47.99)PEER 19 3 3.5799 3299900 3299900 0 0 NaN 0 0 3299900 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3299900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 178 473 507 507 1681 1916 5372 5655 5372 5655 20190821_JH_WT_Ubi 11783 5372 5655 20190821_JH_WT_Ubi 11783 5372 5655 20190821_JH_WT_Ubi 11783 sp|P08684|CP3A4_HUMAN;sp|P24462|CP3A7_HUMAN;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN 280;280;280 sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN Cytochrome P450 3A4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A4 PE=1 SV=4;sp|P24462|CP3A7_HUMAN Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A7 PE=1 SV=2;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN Isoform 2 of Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 0.500131 0 0.00647022 73.9 7.368 73.9 0.500131 0 0.00647022 73.9 2 N QKHRVDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HRVDFLQ(1)LMIDSQ(0.5)N(0.5)SK HRVDFLQ(32.79)LMIDSQ(0)N(0)SK 14 2 -2.2754 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 179 475 280 280 1989 2265 6509 6848 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 sp|P08727|K1C19_HUMAN 79 sp|P08727|K1C19_HUMAN sp|P08727|K1C19_HUMAN sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 1 98.6324 1.1493E-20 125.86 80.509 98.632 1 125.856 1.1493E-20 125.86 1 115.124 6.82584E-16 115.12 1 111.969 9.50242E-16 111.97 1 98.6324 3.82513E-08 98.632 1 N GYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FVSSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGN(1)EK FVSSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGN(98.63)EK 28 3 1.1821 13775000 13775000 0 0 0.032423 0 0 5260900 0 0 1471600 1490300 4702600 0 0 0 0.04056 NaN 0 0.033001 0.044933 0.076395 0 0 0 0 0 0 0 5260900 0 0 0 0 0 0 0 0 1471600 0 0 1490300 0 0 4702600 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 180 477 79 79 1333;1334 1511;1513 4207;4208;4209;4210;4211 4424;4425;4426;4427;4428 4211 4428 20190902_JH_WT_Ubi_2 14030 4210 4427 20190821_JH_WT_Ubi 12573 4210 4427 20190821_JH_WT_Ubi 12573 sp|P08727|K1C19_HUMAN 86 sp|P08727|K1C19_HUMAN sp|P08727|K1C19_HUMAN sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.500668 2.94113 1.97565E-06 79.911 63.29 79.911 0.500668 2.94113 1.97565E-06 79.911 1 N ASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRAL X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FVSSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGN(0.254)EKLTMQ(0.122)N(0.501)LN(0.122)DR FVSSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGN(-2.94)EKLTMQ(-6.11)N(2.94)LN(-6.11)DR 35 3 3.6974 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 181 477 86 86 1334 1513 4213 4430 4213 4430 20190821_JH_MUT_Ubi 11279 4213 4430 20190821_JH_MUT_Ubi 11279 4213 4430 20190821_JH_MUT_Ubi 11279 sp|P09382|LEG1_HUMAN 62 sp|P09382|LEG1_HUMAN sp|P09382|LEG1_HUMAN sp|P09382|LEG1_HUMAN Galectin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LGALS1 PE=1 SV=2 0.893601 9.37137 0.0337523 61.097 24.813 61.097 0.893601 9.37137 0.0337523 61.097 1 N NPRFNAHGDANTIVCNSKDGGAWGTEQREAV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FN(0.103)AHGDAN(0.003)TIVCN(0.894)SK FN(-9.37)AHGDAN(-24.57)TIVCN(9.37)SK 13 3 0.40911 6182400 6182400 0 0 0.43226 0 0 0 0 0 0 0 0 6182400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6182400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 182 486 62 62 1268 1436 4018 4226 4018 4226 20190902_JH_WT_Ubi_3 6376 4018 4226 20190902_JH_WT_Ubi_3 6376 4018 4226 20190902_JH_WT_Ubi_3 6376 sp|P09471-2|GNAO_HUMAN 256 sp|P09471-2|GNAO_HUMAN sp|P09471-2|GNAO_HUMAN sp|P09471-2|GNAO_HUMAN Isoform Alpha-2 of Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAO1 1 47.2879 0.0349952 47.288 15.94 47.288 1 47.2879 0.0349952 47.288 2 N TNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNK X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX MHESLKLFDSICN(1)N(1)K MHESLKLFDSICN(47.29)N(47.29)K 13 2 0.23602 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 183 489 256 256 2922 3318 9407 9901 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 sp|P09471-2|GNAO_HUMAN 257 sp|P09471-2|GNAO_HUMAN sp|P09471-2|GNAO_HUMAN sp|P09471-2|GNAO_HUMAN Isoform Alpha-2 of Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNAO1 1 47.2879 0.0349952 47.288 15.94 47.288 1 47.2879 0.0349952 47.288 2 N NRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKK X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX MHESLKLFDSICN(1)N(1)K MHESLKLFDSICN(47.29)N(47.29)K 14 2 0.23602 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 184 489 257 257 2922 3318 9407 9901 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 9407 9901 20190902_JH_WT_Ubi_2 13800 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN 249;249 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN Isoform A1-A of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L2 PE=2 SV=2 0.360946 0 2.12688E-06 64.065 50.916 64.065 0.360946 0 2.12688E-06 64.065 N GGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GGGGYGGSGDGYN(0.226)GFGN(0.361)DGSN(0.362)FGGGGSYN(0.715)DFGN(0.204)YN(0.071)N(0.031)Q(0.027)SSN(0.002)FGPMK GGGGYGGSGDGYN(-2.09)GFGN(0)DGSN(0)FGGGGSYN(6.01)DFGN(-6.01)YN(-10.79)N(-14.5)Q(-15.39)SSN(-27.4)FGPMK 17 3 3.3153 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 185 492 249 249 1484 1692;1693 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN 253;253 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN Isoform A1-A of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L2 PE=2 SV=2 0.36165 0 2.12688E-06 64.065 50.916 64.065 0.36165 0 2.12688E-06 64.065 N GGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGNYNN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX GGGGYGGSGDGYN(0.226)GFGN(0.361)DGSN(0.362)FGGGGSYN(0.715)DFGN(0.204)YN(0.071)N(0.031)Q(0.027)SSN(0.002)FGPMK GGGGYGGSGDGYN(-2.09)GFGN(0)DGSN(0)FGGGGSYN(6.01)DFGN(-6.01)YN(-10.79)N(-14.5)Q(-15.39)SSN(-27.4)FGPMK 21 3 3.3153 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 186 492 253 253 1484 1692;1693 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN 261;261 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN Isoform A1-A of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L2 PE=2 SV=2 0.715238 6.00641 2.12688E-06 64.065 50.916 64.065 0.715238 6.00641 2.12688E-06 64.065 2 N GFGNDGSNFGGGGSYNDFGNYNNQSSNFGPM X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M) PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GGGGYGGSGDGYN(0.226)GFGN(0.361)DGSN(0.362)FGGGGSYN(0.715)DFGN(0.204)YN(0.071)N(0.031)Q(0.027)SSN(0.002)FGPMK GGGGYGGSGDGYN(-2.09)GFGN(0)DGSN(0)FGGGGSYN(6.01)DFGN(-6.01)YN(-10.79)N(-14.5)Q(-15.39)SSN(-27.4)FGPMK 29 3 3.3153 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 187 492 261 261 1484 1692;1693 4745 4990 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 4745 4990 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12456 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN 267;267 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN Isoform A1-A of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L2 PE=2 SV=2 0.535469 3.40649 6.61696E-06 54.492 41.812 54.492 0.535469 3.40649 6.61696E-06 54.492 1 N SNFGGGGSYNDFGNYNNQSSNFGPMKGGNFG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX GGGGYGGSGDGYN(0.003)GFGN(0.003)DGSN(0.006)FGGGGSYN(0.016)DFGN(0.094)YN(0.535)N(0.244)Q(0.094)SSN(0.004)FGPMK GGGGYGGSGDGYN(-22.81)GFGN(-22.2)DGSN(-19.27)FGGGGSYN(-15.26)DFGN(-7.55)YN(3.41)N(-3.41)Q(-7.55)SSN(-21.59)FGPMK 35 3 1.2576 745840 745840 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 745840 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 745840 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 188 492 267 267 1484 1692;1693 4746 4991 4746 4991 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11405 4746 4991 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11405 4746 4991 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11405 sp|P09693|CD3G_HUMAN 92 sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD3G PE=1 SV=1 0.50089 0 0.00719175 82.85 30.479 61.11 0.50089 0 0.0348554 61.11 0.5 0 0.00719175 82.85 0.500644 0 0.0278647 64.65 2 N NAKDPRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX GSQ(0.501)N(0.501)KSKPLQ(0.998)VYYR GSQ(0)N(0)KSKPLQ(24.48)VYYR 4 3 -0.086754 74910000 0 74910000 0 NaN 0 0 0 0 30770000 22688000 21452000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30770000 0 0 22688000 0 0 21452000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 189 494 92 92 1699 1936 5411;5412;5413 5696;5697;5698 5411 5696 20190902_JH_EV_Ubi_3 8213 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 sp|P09758|TACD2_HUMAN 208 sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN Tumor-associated calcium signal transducer 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACSTD2 PE=1 SV=3 0.766304 8.80073 0.0313109 45.047 13.98 45.047 0.766304 8.80073 0.0313109 45.047 3 N AVHYEQPTIQIELRQNTSQKAAGDVDIGDAA X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FVAAVHYEQ(0.972)PTIQ(0.249)IELRQ(0.247)N(0.766)TSQ(0.766)K FVAAVHYEQ(16.63)PTIQ(-8.8)IELRQ(-8.8)N(8.8)TSQ(8.8)K 19 3 -3.2206 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 190 495 208 208 1318 1493 4161 4373 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 sp|P0CG22|DR4L1_HUMAN 32 sp|P0CG22|DR4L1_HUMAN sp|P0CG22|DR4L1_HUMAN sp|P0CG22|DR4L1_HUMAN Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHRS4L1 PE=5 SV=1 0.999712 35.4108 0.0364877 42.904 18.171 42.904 0.999712 35.4108 0.0364877 42.904 1 N VRLASSGMTRRDPLTNKVALVTASTDWIGFA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DPLTN(1)KVALVTASTDWIGFAVAQR DPLTN(35.41)KVALVTASTDWIGFAVAQ(-35.41)R 5 3 -2.9622 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 191 501 32 32 650 745 2042 2166 2042 2166 20190902_JH_WT_Ubi_2 16193 2042 2166 20190902_JH_WT_Ubi_2 16193 2042 2166 20190902_JH_WT_Ubi_2 16193 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN 417;417;362;419 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1A PE=1 SV=1;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1B PE=1 SV=1;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock 70 kDa protein 1A 0.64635 5.09796 0.00306989 57.347 12.626 57.347 0.64635 5.09796 0.00306989 57.347 2 N GLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.646)STIPTKQ(0.234)TQ(0.201)IFTTYSDN(0.197)Q(0.715)PGVLIQ(0.007)VYEGER N(5.1)STIPTKQ(-5.1)TQ(-6.03)IFTTYSDN(-6.03)Q(6.03)PGVLIQ(-20.65)VYEGER 1 3 2.2154 1823900 0 1823900 0 NaN 0 1823900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1823900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 192 503;766 417;419 417 3218;3775 3677;4289 10358 10901 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 sp|P10321|1C07_HUMAN 352 sp|P10321|1C07_HUMAN sp|P10321|1C07_HUMAN sp|P10321|1C07_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-C PE=1 SV=3 0.997641 26.437 5.68325E-12 113.42 76.312 113.42 0.997641 26.437 5.68325E-12 113.42 1 N SSGGKGGSCSQAACSNSAQGSDESLITCKA_ X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX GGSCSQAACSN(0.998)SAQ(0.002)GSDESLITCKA GGSCSQ(-40.31)AACSN(26.44)SAQ(-26.44)GSDESLITCKA 11 3 0.60546 496900 496900 0 0 0.012459 0 0 0 0 0 0 496900 0 0 0 0 0 0 0 0 0.1228 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 496900 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 193 507 352 352 1500 1712 4810 5060 4810 5060 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7301 4810 5060 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7301 4810 5060 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7301 sp|P10620|MGST1_HUMAN 129 sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN Microsomal glutathione S-transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MGST1 PE=1 SV=1 0.877543 8.55285 0.0145256 69.258 31.465 64.394 0.562419 1.09002 0.0145256 69.258 0.877543 8.55285 0.0206978 64.394 1 N RIYHTIAYLTPLPQPNRALSFFVGYGVTLSM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX IYHTIAYLTPLPQ(0.122)PN(0.878)R IYHTIAYLTPLPQ(-8.55)PN(8.55)R 15 3 0.92022 12402000 12402000 0 0 0.024224 0 0 0 0 0 0 0 6059900 6342500 0 0 0 0 0 0 0 0.10855 0.063154 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6059900 0 0 6342500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 194 512 129 129 2305 2623 7589;7590 7985;7986 7590 7986 20190902_JH_WT_Ubi_3 11076 7589 7985 20190902_JH_WT_Ubi_2 11511 7589 7985 20190902_JH_WT_Ubi_2 11511 sp|P10620|MGST1_HUMAN;sp|P10620-2|MGST1_HUMAN 58;58 sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN Microsomal glutathione S-transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MGST1 PE=1 SV=1;sp|P10620-2|MGST1_HUMAN Isoform 2 of Microsomal glutathione S-transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MGST1 0.999993 52.7838 0.00911282 91.592 58.904 91.592 0.999978 47.0014 0.0134076 86.777 0.999993 52.7838 0.00911282 91.592 1 N VFANPEDCVAFGKGENAKKYLRTDDRVERVR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX VFANPEDCVAFGKGEN(1)AK VFAN(-52.78)PEDCVAFGKGEN(52.78)AK 16 3 0.44393 6758200 6758200 0 0 0.049755 0 0 3042200 0 0 0 0 0 3716000 0 0 0.13154 0 0 0 0 0 0.098837 0 0 0 0 0 0 3042200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3716000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 195 512 58 58 4809 5457 15441;15442 16219;16220 15442 16220 20190902_JH_WT_Ubi_3 9201 15442 16220 20190902_JH_WT_Ubi_3 9201 15442 16220 20190902_JH_WT_Ubi_3 9201 sp|P10809|CH60_HUMAN;sp|P10809-2|CH60_HUMAN 103;103 sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2;sp|P10809-2|CH60_HUMAN Isoform 2 of 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 0.611686 6.46739 6.8377E-07 97.068 58.692 97.068 0.611686 6.46739 6.8377E-07 97.068 1 N DKYKNIGAKLVQDVANNTNEEAGDGTTTATV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LVQ(0.112)DVAN(0.612)N(0.138)TN(0.138)EEAGDGTTTATVLAR LVQ(-7.36)DVAN(6.47)N(-6.47)TN(-6.47)EEAGDGTTTATVLAR 7 3 0.065176 5228700 5228700 0 0 0.035368 0 0 0 0 0 0 0 5228700 0 0 NaN 0 0 0 NaN NaN 0.099532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5228700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 196 515 103 103 2854 3237 9202 9684 9202 9684 20190902_JH_WT_Ubi_2 10669 9202 9684 20190902_JH_WT_Ubi_2 10669 9202 9684 20190902_JH_WT_Ubi_2 10669 sp|P10809|CH60_HUMAN;sp|P10809-2|CH60_HUMAN 104;104 sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2;sp|P10809-2|CH60_HUMAN Isoform 2 of 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 0.365064 0 0.000290592 77.939 50.035 77.939 0.365064 0 0.000290592 77.939 N KYKNIGAKLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LVQ(0.005)DVAN(0.265)N(0.365)TN(0.365)EEAGDGTTTATVLAR LVQ(-18.89)DVAN(-1.39)N(0)TN(0)EEAGDGTTTATVLAR 8 3 -0.014462 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 197 515 104 104 2854 3237 9204 9686 20190902_JH_WT_Ubi_3 10247 9204 9686 20190902_JH_WT_Ubi_3 10247 9204 9686 20190902_JH_WT_Ubi_3 10247 sp|P10809|CH60_HUMAN;sp|P10809-2|CH60_HUMAN 106;106 sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2;sp|P10809-2|CH60_HUMAN Isoform 2 of 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 0.671124 6.17134 0.000290592 77.939 50.035 73.649 0.671124 6.17134 0.000682812 73.649 0.365064 0 0.000290592 77.939 1 N KNIGAKLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLAR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LVQ(0.005)DVAN(0.162)N(0.162)TN(0.671)EEAGDGTTTATVLAR LVQ(-21.49)DVAN(-6.17)N(-6.17)TN(6.17)EEAGDGTTTATVLAR 10 3 -0.17835 7745700 7745700 0 0 0.052392 0 0 0 0 0 0 0 7745700 0 0 NaN 0 0 0 NaN NaN 0.14744 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7745700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 198 515 106 106 2854 3237 9203 9685 9203 9685 20190902_JH_WT_Ubi_2 10757 9204 9686 20190902_JH_WT_Ubi_3 10247 9204 9686 20190902_JH_WT_Ubi_3 10247 sp|P10809|CH60_HUMAN 177 sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2 1 74.5667 2.40627E-49 205.15 140.11 177.41 0.999954 43.3427 2.97442E-14 146.18 0.999961 44.1183 0.00435777 70.555 1 74.5667 1.08828E-30 177.41 0.998848 29.3797 0.0321746 50.916 1 66.0281 2.40627E-49 205.15 1 N VTTPEEIAQVATISANGDKEIGNIISDAMKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX PVTTPEEIAQVATISAN(1)GDK PVTTPEEIAQ(-74.57)VATISAN(74.57)GDK 17 3 0.50256 52379000 52379000 0 0 NaN 4138800 808390 19276000 0 2640000 0 0 0 25516000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 4138800 0 0 808390 0 0 19276000 0 0 0 0 0 2640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25516000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 199 515 177 177 3572 4072 11476;11477;11478;11479;11480 12051;12052;12053;12054;12055 11479 12054 20190821_JH_WT_Ubi 11334 11480 12055 20190902_JH_WT_Ubi_3 12596 11480 12055 20190902_JH_WT_Ubi_3 12596 sp|P11021|BIP_HUMAN 177 sp|P11021|BIP_HUMAN sp|P11021|BIP_HUMAN sp|P11021|BIP_HUMAN Endoplasmic reticulum chaperone BiP OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA5 PE=1 SV=2 0.959739 13.7726 0.00113079 93.424 47.106 93.424 0.553645 0.935506 0.0365876 54.859 0.959739 13.7726 0.00113079 93.424 1 N GKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VTHAVVTVPAYFN(0.96)DAQ(0.04)R VTHAVVTVPAYFN(13.77)DAQ(-13.77)R 13 3 0.12968 13633000 13633000 0 0 0.078374 0 0 0 0 0 0 0 3471800 10161000 NaN NaN 0 0 0 0 0 0.097926 0.2545 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3471800 0 0 10161000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 200 517 177 177 5026 5704 16151;16152 16967;16968 16152 16968 20190902_JH_WT_Ubi_3 10141 16152 16968 20190902_JH_WT_Ubi_3 10141 16152 16968 20190902_JH_WT_Ubi_3 10141 sp|P11142|HSP7C_HUMAN 575 sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN Heat shock cognate 71 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA8 PE=1 SV=1 0.999995 51.9815 2.89205E-24 179.55 111.55 179.55 0.993482 25.418 0.0302511 65.895 0.981541 16.7929 3.21703E-06 129.29 0.999726 33.4423 1.8759E-08 139.58 0.999995 51.9815 2.89205E-24 179.55 0.999942 41.774 3.21703E-06 129.29 0.996785 23.5711 0.029734 90.707 0.99812 26.7601 4.40871E-12 150.05 1 N GKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX CN(1)EIINWLDKNQTAEK CN(51.98)EIIN(-51.98)WLDKN(-94.55)Q(-86.31)TAEK 2 3 -0.21227 37926000 37926000 0 0 NaN 0 780220 0 3416700 2800100 11025000 5360800 6940100 7602400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 780220 0 0 0 0 0 3416700 0 0 2800100 0 0 11025000 0 0 5360800 0 0 6940100 0 0 7602400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 201 519 575 575 351 414 1175;1176;1177;1178;1179;1180;1181 1262;1263;1264;1265;1266;1267;1268 1178 1265 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11722 1178 1265 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11722 1178 1265 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11722 sp|P11142|HSP7C_HUMAN;sp|P11142-2|HSP7C_HUMAN 96;96 sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN Heat shock cognate 71 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA8 PE=1 SV=1;sp|P11142-2|HSP7C_HUMAN Isoform 2 of Heat shock cognate 71 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA8 1 91.8577 0.00203551 101.39 60.811 91.858 1 90.7928 0.00411733 90.793 1 89.1886 0.0102835 89.189 1 60.3012 0.00439246 89.44 1 96.0589 0.00304604 96.059 1 56.9514 0.00203551 101.39 1 91.8577 0.00466496 91.858 1 N AVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGET X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX HWPFMVVN(1)DAGRPK HWPFMVVN(91.86)DAGRPK 8 3 -1.3704 43209000 43209000 0 0 0.11582 0 1993600 0 0 0 2875200 2599400 11302000 13224000 0 0.09203 0 0 0 0.098827 0.081287 0.42286 0.13864 0 0 0 1993600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2875200 0 0 2599400 0 0 11302000 0 0 13224000 0 0 NaN NaN NaN 0.46194 0.85852 1.8506 0.31987 0.47032 1.0943 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.58858 1.4306 1.8178 0.4585 0.84674 1.7231 0.80814 4.2122 1.0937 0.51644 1.068 2.9606 202 519 96 96 2042 2333;2334 6767;6768;6769;6770;6771;6772;6773;6774;6775 7118;7119;7120;7121;7122;7123;7124;7125;7126;7127;7128 6775 7128 20190902_JH_WT_Ubi_3 9970 6770 7122 20190902_JH_WT_Ubi_2 9310 6770 7122 20190902_JH_WT_Ubi_2 9310 sp|P11234|RALB_HUMAN;sp|P11234-3|RALB_HUMAN;sp|P11234-2|RALB_HUMAN 188;209;210 sp|P11234|RALB_HUMAN sp|P11234|RALB_HUMAN sp|P11234|RALB_HUMAN Ras-related protein Ral-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RALB PE=1 SV=1;sp|P11234-3|RALB_HUMAN Isoform 3 of Ras-related protein Ral-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RALB;sp|P11234-2|RALB_HUMAN Isoform 2 of Ras-related protein Ral-B OS=Homo sap 0.983381 17.7212 0.0361354 41.876 7.1553 41.876 0.983381 17.7212 0.0361354 41.876 1 N MREIRTKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERC X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX MSEN(0.017)KDKN(0.983)GK MSEN(-17.72)KDKN(17.72)GK 8 2 1.3641 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 203 524 188 188 2968 3384 9573 10076 9573 10076 20190902_JH_EV_Ubi_2 4916 9573 10076 20190902_JH_EV_Ubi_2 4916 9573 10076 20190902_JH_EV_Ubi_2 4916 sp|P11413|G6PD_HUMAN;sp|P11413-3|G6PD_HUMAN;sp|P11413-2|G6PD_HUMAN 388;418;434 sp|P11413|G6PD_HUMAN sp|P11413|G6PD_HUMAN sp|P11413|G6PD_HUMAN Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=G6PD PE=1 SV=4;sp|P11413-3|G6PD_HUMAN Isoform 3 of Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=G6PD;sp|P11413-2|G6PD_HUMAN Isoform Long of Glucose-6-phos 0.746812 4.86362 0.0269089 56.872 27.886 56.872 0.746812 4.86362 0.0269089 56.872 N FHDVAGDIFHQQCKRNELVIRVQPNEAVYTK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.747)ELVIRVQ(0.009)PN(0.244)EAVYTK N(4.86)ELVIRVQ(-18.96)PN(-4.86)EAVYTK 1 3 2.1138 1516900 1516900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1516900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1516900 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 204 525 388 388 3037 3472 9809 10333 9809 10333 20190902_JH_WT_Ubi_3 9453 9809 10333 20190902_JH_WT_Ubi_3 9453 9809 10333 20190902_JH_WT_Ubi_3 9453 sp|P11586|C1TC_HUMAN 141 sp|P11586|C1TC_HUMAN sp|P11586|C1TC_HUMAN sp|P11586|C1TC_HUMAN C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTHFD1 PE=1 SV=3 1 54.288 0.0266529 54.288 26.588 54.288 1 54.288 0.0266529 54.288 1 N GLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GDLN(1)DCFIPCTPKGCLELIK GDLN(54.29)DCFIPCTPKGCLELIK 4 3 4.4606 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 205 527 141 141 1403 1597 4470 4696 4470 4696 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11261 4470 4696 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11261 4470 4696 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11261 sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN;sp|P12814|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-3|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-4|ACTN1_HUMAN 601;601;601;601 sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN Isoform 2 of Alpha-actinin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN1;sp|P12814|ACTN1_HUMAN Alpha-actinin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN1 PE=1 SV=2;sp|P12814-3|ACTN1_HUMAN Isoform 3 of Alpha-actinin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN1;sp| 0.899585 9.52277 0.00138984 69.435 29.788 69.435 0.899585 9.52277 0.00138984 69.435 1 N MAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQ Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX IVQTYHVNMAGTNPYTTITPQ(0.1)EIN(0.9)GK IVQ(-60.04)TYHVN(-60.2)MAGTN(-51.51)PYTTITPQ(-9.52)EIN(9.52)GK 24 3 -0.24276 974540 974540 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 974540 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 974540 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 206 537 601 601 2295 2612 7546 7936 7546 7936 20190902_JH_WT_Ubi_3 10163 7546 7936 20190902_JH_WT_Ubi_3 10163 7546 7936 20190902_JH_WT_Ubi_3 10163 sp|P14314-2|GLU2B_HUMAN;sp|P14314|GLU2B_HUMAN 72;72 sp|P14314-2|GLU2B_HUMAN sp|P14314-2|GLU2B_HUMAN sp|P14314-2|GLU2B_HUMAN Isoform 2 of Glucosidase 2 subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKCSH;sp|P14314|GLU2B_HUMAN Glucosidase 2 subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKCSH PE=1 SV=2 0.847972 7.46458 0.00617911 60.454 37.124 60.454 0.847972 7.46458 0.00617911 60.454 1 N DCKDGSDEPGTAACPNGSFHCTNTGYKPLYI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX DGSDEPGTAACPN(0.848)GSFHCTN(0.152)TGYK DGSDEPGTAACPN(7.46)GSFHCTN(-7.46)TGYK 13 3 -0.77134 2868600 2868600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2868600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2868600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 207 552 72 72 496 576 1625 1721 1625 1721 20190902_JH_WT_Ubi_3 7612 1625 1721 20190902_JH_WT_Ubi_3 7612 1625 1721 20190902_JH_WT_Ubi_3 7612 sp|P14555|PA2GA_HUMAN 90 sp|P14555|PA2GA_HUMAN sp|P14555|PA2GA_HUMAN sp|P14555|PA2GA_HUMAN Phospholipase A2, membrane associated OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLA2G2A PE=1 SV=2 1 88.5961 0.0125571 100.69 61.507 88.596 1 84.687 0.0344723 84.687 1 100.687 0.0125571 100.69 1 94.3627 0.0199031 94.363 1 98.7542 0.0143163 98.754 1 88.5961 0.0272393 88.596 1 N EKRGCGTKFLSYKFSNSGSRITCAKQDSCRS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FLSYKFSN(1)SGSR FLSYKFSN(88.6)SGSR 8 3 0.49628 63593000 63593000 0 0 NaN 7121500 0 12724000 12306000 8903600 0 0 0 22538000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 7121500 0 0 0 0 0 12724000 0 0 12306000 0 0 8903600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22538000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 208 554 90 90 1257 1422 3993;3994;3995;3996;3997 4201;4202;4203;4204;4205 3997 4205 20190902_JH_WT_Ubi_3 6519 3996 4204 20190821_JH_WT_Ubi 4912 3996 4204 20190821_JH_WT_Ubi 4912 sp|P14618|KPYM_HUMAN;sp|P14618-2|KPYM_HUMAN;sp|P14618-3|KPYM_HUMAN 199;199;184 sp|P14618|KPYM_HUMAN sp|P14618|KPYM_HUMAN sp|P14618|KPYM_HUMAN Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM PE=1 SV=4;sp|P14618-2|KPYM_HUMAN Isoform M1 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM;sp|P14618-3|KPYM_HUMAN Isoform 3 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM 1 131.184 2.47062E-96 251.63 181.53 131.18 1 168.686 5.93512E-66 227.92 1 121.446 1.57162E-23 166.67 1 71.7807 3.93535E-06 114.58 1 50.6533 7.03798E-09 127.88 1 113.14 4.59198E-06 113.14 1 66.7375 5.94039E-14 145.82 1 71.6851 1.28202E-18 157.83 1 52.5691 2.47062E-96 251.63 1 131.184 3.83641E-09 131.18 1 N QVKQKGADFLVTEVENGGSLGSKKGVNLPGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX GADFLVTEVEN(1)GGSLGSKK GADFLVTEVEN(131.18)GGSLGSKK 11 3 -2.3079 171890000 171890000 0 0 26.915 7597100 14986000 22242000 6428600 6742900 18981000 21568000 4264200 35635000 NaN 5.8649 NaN 1.6778 NaN NaN NaN NaN NaN 7597100 0 0 14986000 0 0 22242000 0 0 6428600 0 0 6742900 0 0 18981000 0 0 21568000 0 0 4264200 0 0 35635000 0 0 NaN NaN NaN 0.91527 10.802 5.2782 NaN NaN NaN 0.74112 2.8628 4.5079 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 209 556 199 199 1354;1355 1538;1540 4286;4287;4288;4289;4291;4292;4293;4294;4295;4296;4297;4298;4299;4300;4301;4302;4303;4304 4507;4508;4509;4510;4512;4513;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4526 4304 4526 20190902_JH_WT_Ubi_3 10441 4289 4510 20190902_JH_WT_Ubi_2 13164 4289 4510 20190902_JH_WT_Ubi_2 13164 sp|P14618|KPYM_HUMAN;sp|P14618-2|KPYM_HUMAN;sp|P14618-3|KPYM_HUMAN 523;523;508 sp|P14618|KPYM_HUMAN sp|P14618|KPYM_HUMAN sp|P14618|KPYM_HUMAN Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM PE=1 SV=4;sp|P14618-2|KPYM_HUMAN Isoform M1 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM;sp|P14618-3|KPYM_HUMAN Isoform 3 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKM 1 45.844 0.0112622 60.062 18.004 45.844 1 42.9077 0.0112622 60.062 1 45.844 0.0195031 45.844 1 N VVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP_______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KGDVVIVLTGWRPGSGFTN(1)TMR KGDVVIVLTGWRPGSGFTN(45.84)TMR 19 4 1.3665 22610000 22610000 0 0 0.026928 0 0 4443700 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.01012 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4443700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.6429 1.8004 3.6272 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.84565 5.479 4.2398 210 556 523 523 1416;2349 1614;2671;2672 4515;7738;7739 4742;8139;8140 7739 8140 20190902_JH_WT_Ubi_3 11825 4515 4742 20190821_JH_WT_Ubi 12538 4515 4742 20190821_JH_WT_Ubi 12538 sp|P15121|ALDR_HUMAN 163 sp|P15121|ALDR_HUMAN sp|P15121|ALDR_HUMAN sp|P15121|ALDR_HUMAN Aldose reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1B1 PE=1 SV=3 0.483936 3.86371 0.0306813 55.011 28.391 55.011 0.483936 3.86371 0.0306813 55.011 N LVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX AIGISN(0.118)FN(0.484)HLQ(0.199)VEMILN(0.199)K AIGISN(-6.11)FN(3.86)HLQ(-3.86)VEMILN(-3.86)K 8 3 0.040457 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 211 563 163 163 163 188 558 610 20190821_JH_WT_Ubi 12593 558 610 20190821_JH_WT_Ubi 12593 558 610 20190821_JH_WT_Ubi 12593 sp|P15121|ALDR_HUMAN 53 sp|P15121|ALDR_HUMAN sp|P15121|ALDR_HUMAN sp|P15121|ALDR_HUMAN Aldose reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKR1B1 PE=1 SV=3 0.92589 14.2222 5.04561E-08 113.23 84.484 113.23 0.92589 14.2222 5.04561E-08 113.23 1 N VGYRHIDCAHVYQNENEVGVAIQEKLREQVV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HIDCAHVYQ(0.035)N(0.035)EN(0.926)EVGVAIQ(0.004)EK HIDCAHVYQ(-14.22)N(-14.22)EN(14.22)EVGVAIQ(-23.57)EK 12 3 1.8413 2270200 2270200 0 0 0.027125 0 0 0 0 0 0 0 0 2270200 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0.056578 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2270200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 212 563 53 53 1866 2122 6020 6341 6020 6341 20190902_JH_WT_Ubi_3 8193 6020 6341 20190902_JH_WT_Ubi_3 8193 6020 6341 20190902_JH_WT_Ubi_3 8193 sp|P15941-12|MUC1_HUMAN;sp|P15941-16|MUC1_HUMAN;sp|P15941-9|MUC1_HUMAN;sp|P15941-10|MUC1_HUMAN;sp|P15941-15|MUC1_HUMAN;sp|P15941-6|MUC1_HUMAN;sp|P15941-7|MUC1_HUMAN;sp|P15941-11|MUC1_HUMAN;sp|P15941-8|MUC1_HUMAN;sp|P15941-4|MUC1_HUMAN;sp|P15941-3|MUC1_HUMAN;sp|P15941|MUC1_HUMAN;sp|P15941-2|MUC1_HUMAN 140;147;149;184;205;211;236;245;254;1224;1233;1236;1245 sp|P15941-12|MUC1_HUMAN sp|P15941-12|MUC1_HUMAN sp|P15941-12|MUC1_HUMAN Isoform S2 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-16|MUC1_HUMAN Isoform E2 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-9|MUC1_HUMAN Isoform 9 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-10|MUC1_HUMAN 0.999983 47.7584 1.9035E-14 112.06 74.568 112.06 0.992655 21.317 1.41141E-05 88.433 0.996249 24.2863 1.37537E-05 88.708 0.999952 43.3217 0.00112241 77.646 0.999811 37.2261 1.43162E-05 88.278 0.999854 38.3691 0.000565236 82.479 0.999954 43.3678 8.4367E-10 108.49 0.999983 47.7584 1.9035E-14 112.06 1;2 N PSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SPYEKVSAGN(1)GGSSLSYTNPAVAATSANL SPYEKVSAGN(47.76)GGSSLSYTN(-47.76)PAVAATSAN(-84.64)L 10 3 -0.91708 173380000 172410000 971890 0 NaN 15052000 30488000 7662200 13505000 5797300 30220000 34090000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 15052000 0 0 30488000 0 0 7662200 0 0 13505000 0 0 5797300 0 0 29248000 971890 0 34090000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 213 579 140 140 4113 4667;4668 12992;12993;12994;12995;12996;12997;12998;12999;13000;13001 13623;13624;13625;13626;13627;13628;13629;13630;13631;13632 12999 13630 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11276 12999 13630 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11276 12999 13630 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11276 sp|P15941-12|MUC1_HUMAN;sp|P15941-16|MUC1_HUMAN;sp|P15941-9|MUC1_HUMAN;sp|P15941-10|MUC1_HUMAN;sp|P15941-15|MUC1_HUMAN;sp|P15941-6|MUC1_HUMAN;sp|P15941-7|MUC1_HUMAN;sp|P15941-11|MUC1_HUMAN;sp|P15941-8|MUC1_HUMAN;sp|P15941-4|MUC1_HUMAN;sp|P15941-3|MUC1_HUMAN;sp|P15941|MUC1_HUMAN;sp|P15941-2|MUC1_HUMAN 158;165;167;202;223;229;254;263;272;1242;1251;1254;1263 sp|P15941-12|MUC1_HUMAN sp|P15941-12|MUC1_HUMAN sp|P15941-12|MUC1_HUMAN Isoform S2 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-16|MUC1_HUMAN Isoform E2 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-9|MUC1_HUMAN Isoform 9 of Mucin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MUC1;sp|P15941-10|MUC1_HUMAN 0.981513 17.2488 0.00198314 58.858 31.943 58.858 0.981513 17.2488 0.00198314 58.858 2 N SSLSYTNPAVAATSANL______________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX SPYEKVSAGN(1)GGSSLSYTN(0.019)PAVAATSAN(0.982)L SPYEKVSAGN(34.67)GGSSLSYTN(-17.25)PAVAATSAN(17.25)L 28 3 0.061088 971890 0 971890 0 NaN 0 0 0 0 0 971890 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 971890 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 214 579 158 158 4113 4667;4668 13001 13632 13001 13632 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12112 13001 13632 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12112 13001 13632 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12112 sp|P16070-18|CD44_HUMAN;sp|P16070-12|CD44_HUMAN;sp|P16070-14|CD44_HUMAN;sp|P16070-13|CD44_HUMAN;sp|P16070-11|CD44_HUMAN;sp|P16070-10|CD44_HUMAN;sp|P16070-16|CD44_HUMAN;sp|P16070-8|CD44_HUMAN;sp|P16070-17|CD44_HUMAN;sp|P16070-6|CD44_HUMAN;sp|P16070-4|CD44_HUMAN;sp|P16070-3|CD44_HUMAN;sp|P16070-7|CD44_HUMAN;sp|P16070-5|CD44_HUMAN;sp|P16070|CD44_HUMAN 298;319;354;383;387;451;626;632;649;657;657;669;671;692;700 sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN Isoform 18 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-12|CD44_HUMAN Isoform 12 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-14|CD44_HUMAN Isoform 14 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P160 0.999691 35.883 2.63649E-06 99.343 76.908 65.085 0.917307 12.4056 0.0357415 47.618 0.999507 33.0789 2.63649E-06 99.343 0.987487 19.3311 0.010093 60.09 0.999691 35.883 0.0047156 65.085 0.96244 14.7571 0.0179206 54.74 0.995603 23.5551 1.63053E-05 92.679 1 N NSGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KPSGLN(1)GEASKSQEMVHLVNK KPSGLN(35.88)GEASKSQ(-35.88)EMVHLVN(-47.3)K 6 4 -1.1611 74129000 74129000 0 0 NaN 0 790850 9332600 4518900 2316200 0 0 21197000 20821000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 790850 0 0 9332600 0 0 4518900 0 0 2316200 0 0 0 0 0 0 0 0 21197000 0 0 20821000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 215 580 298 298 2433 2766;2767 7958;7959;7960;7961;7962;7963;7965;7967 8369;8370;8371;8372;8373;8374;8376;8378 7959 8370 20190902_JH_EV_Ubi_3 4806 7961 8372 20190821_JH_WT_Ubi 4327 7961 8372 20190821_JH_WT_Ubi 4327 sp|P16104|H2AX_HUMAN;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN 111;111;111 sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN Histone H2AX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H2AFX PE=1 SV=2;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN Histone H2A type 2-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST2H2AB PE=1 SV=3;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN Histone H2A type 1-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AA PE=1 SV=3 0.969882 15.6255 2.76892E-12 127.37 124.27 95.988 0.767289 5.52827 0.00060952 83.869 0.536424 1.06634 3.09164E-06 90.882 0.753625 5.88197 2.76892E-12 127.37 0.969882 15.6255 1.28734E-06 95.988 1 N KLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX LLGGVTIAQ(0.003)GGVLPN(0.97)IQ(0.027)AVLLPKK LLGGVTIAQ(-24.99)GGVLPN(15.63)IQ(-15.63)AVLLPKK 15 3 1.5667 9768500 9768500 0 0 0.0051482 0 2923100 0 0 0 2483100 1297000 2176800 0 0 0.0039675 0 NaN NaN 0.021552 0.012578 0.037132 0 0 0 0 2923100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2483100 0 0 1297000 0 0 2176800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 216 581 111 111 2693;2694 3063;3065 8760;8762;8763;8765;8766 9211;9213;9214;9215;9216;9219;9220 8765 9219 20190902_JH_WT_Ubi_2 15509 8763 9214 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13364 8763 9214 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13364 sp|P16278-2|BGAL_HUMAN;sp|P16278-3|BGAL_HUMAN;sp|P16278|BGAL_HUMAN 306;407;437 sp|P16278-2|BGAL_HUMAN sp|P16278-2|BGAL_HUMAN sp|P16278-2|BGAL_HUMAN Isoform 2 of Beta-galactosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLB1;sp|P16278-3|BGAL_HUMAN Isoform 3 of Beta-galactosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLB1;sp|P16278|BGAL_HUMAN Beta-galactosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GLB1 PE=1 SV=2 0.86969 9.13341 0.029133 48.641 23.483 48.641 0.86969 9.13341 0.029133 48.641 1 N LPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TTLPQ(0.106)DCSN(0.024)PAPLSSPLN(0.87)GVHDR TTLPQ(-9.13)DCSN(-15.57)PAPLSSPLN(9.13)GVHDR 18 3 -0.21479 3505000 3505000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3505000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3505000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 217 585 306 306 4635 5260 14841 15595 14841 15595 20190902_JH_WT_Ubi_2 10476 14841 15595 20190902_JH_WT_Ubi_2 10476 14841 15595 20190902_JH_WT_Ubi_2 10476 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN;sp|Q08209-2|PP2BA_HUMAN;sp|P48454|PP2BC_HUMAN;sp|P16298-2|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-3|PP2BB_HUMAN;sp|Q08209|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-3|PP2BC_HUMAN;sp|P16298|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-4|PP2BB_HUMAN 259;322;326;322;353;335;326;322;335;335 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN Isoform 5 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP3CA;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN Isoform 2 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform OS=H 1 42.3949 0.0365484 42.395 8.4342 42.395 1 42.3949 0.0365484 42.395 3 N YLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX AAVLKYEN(1)N(1)VMN(1)IR AAVLKYEN(42.39)N(42.39)VMN(42.39)IR 8 2 4.2937 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 218 586 259 259 42 48 147 162 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN;sp|Q08209-2|PP2BA_HUMAN;sp|P48454|PP2BC_HUMAN;sp|P16298-2|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-3|PP2BB_HUMAN;sp|Q08209|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-3|PP2BC_HUMAN;sp|P16298|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-4|PP2BB_HUMAN 260;323;327;323;354;336;327;323;336;336 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN Isoform 5 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP3CA;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN Isoform 2 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform OS=H 1 42.3949 0.0365484 42.395 8.4342 42.395 1 42.3949 0.0365484 42.395 3 N LDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX AAVLKYEN(1)N(1)VMN(1)IR AAVLKYEN(42.39)N(42.39)VMN(42.39)IR 9 2 4.2937 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 219 586 260 260 42 48 147 162 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN;sp|Q08209-2|PP2BA_HUMAN;sp|P48454|PP2BC_HUMAN;sp|P16298-2|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-3|PP2BB_HUMAN;sp|Q08209|PP2BA_HUMAN;sp|P48454-3|PP2BC_HUMAN;sp|P16298|PP2BB_HUMAN;sp|P16298-4|PP2BB_HUMAN 263;326;330;326;357;339;330;326;339;339 sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN sp|Q08209-5|PP2BA_HUMAN Isoform 5 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP3CA;sp|P48454-2|PP2BC_HUMAN Isoform 2 of Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform OS=H 1 42.3949 0.0365484 42.395 8.4342 42.395 1 42.3949 0.0365484 42.395 3 N YNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX AAVLKYEN(1)N(1)VMN(1)IR AAVLKYEN(42.39)N(42.39)VMN(42.39)IR 12 2 4.2937 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 220 586 263 263 42 48 147 162 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 147 162 20190821_JH_MUT_Ubi 11106 sp|P17655|CAN2_HUMAN;sp|P17655-2|CAN2_HUMAN 275;197 sp|P17655|CAN2_HUMAN sp|P17655|CAN2_HUMAN sp|P17655|CAN2_HUMAN Calpain-2 catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAPN2 PE=1 SV=6;sp|P17655-2|CAN2_HUMAN Isoform 2 of Calpain-2 catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAPN2 0.999656 34.6342 8.957E-14 144.3 89.934 144.3 0.999656 34.6342 8.957E-14 144.3 0.586705 1.52159 0.00413064 70.944 0.994259 22.3851 3.03588E-09 130.64 1 N KGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX GHAYSVTGAEEVESN(1)GSLQK GHAYSVTGAEEVESN(34.63)GSLQ(-34.63)K 15 3 0.19335 18313000 18313000 0 0 NaN 0 0 5822500 2329400 0 0 0 10161000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 5822500 0 0 2329400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10161000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 221 602 275 275 1509 1721 4842;4843;4844 5093;5094;5095;5096 4843 5094 20190821_JH_WT_Ubi 5756 4843 5094 20190821_JH_WT_Ubi 5756 4843 5094 20190821_JH_WT_Ubi 5756 sp|P18827|SDC1_HUMAN 295 sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN Syndecan-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDC1 PE=1 SV=3 0.794664 6.28801 0.000464492 106.31 78.244 98.552 0.794664 6.28801 0.00120912 98.552 0.499256 0 0.000464492 106.31 1 N KKDEGSYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEFYA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX DEGSYSLEEPKQ(0.193)AN(0.795)GGAYQ(0.012)K DEGSYSLEEPKQ(-6.29)AN(6.29)GGAYQ(-19.23)K 14 3 1.6825 860170 860170 0 0 NaN 0 860170 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 860170 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 222 614 295 295 431 505 1389 1480 1389 1480 20190821_JH_MUT_Ubi 5622 1390 1481 20190902_JH_WT_Ubi_2 8214 1390 1481 20190902_JH_WT_Ubi_2 8214 sp|P20273-2|CD22_HUMAN;sp|P20273-5|CD22_HUMAN;sp|P20273-4|CD22_HUMAN;sp|P20273-3|CD22_HUMAN;sp|P20273|CD22_HUMAN 237;65;237;237;237 sp|P20273-2|CD22_HUMAN sp|P20273-2|CD22_HUMAN sp|P20273-2|CD22_HUMAN Isoform CD22-alpha of B-cell receptor CD22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD22;sp|P20273-5|CD22_HUMAN Isoform 5 of B-cell receptor CD22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD22;sp|P20273-4|CD22_HUMAN Isoform 4 of B-cell receptor CD22 OS=Homo sapi 0.955741 13.2957 0.0371813 54.722 11.696 54.722 0.955741 13.2957 0.0371813 54.722 N QDADGKFLSNDTVQLNVKHPPKKVTTVIQNP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FLSN(0.055)DTVQ(0.99)LN(0.956)VK FLSN(-13.3)DTVQ(19.57)LN(13.3)VK 10 2 1.5487 1844600 0 1844600 0 NaN 0 0 1844600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1844600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 223 627 237 237 1254 1417 3971 4176 3971 4176 20190821_JH_WT_Ubi 10984 3971 4176 20190821_JH_WT_Ubi 10984 3971 4176 20190821_JH_WT_Ubi 10984 sp|P21333-2|FLNA_HUMAN;sp|P21333|FLNA_HUMAN 1996;2004 sp|P21333-2|FLNA_HUMAN sp|P21333-2|FLNA_HUMAN sp|P21333-2|FLNA_HUMAN Isoform 2 of Filamin-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNA;sp|P21333|FLNA_HUMAN Filamin-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNA PE=1 SV=4 1 150.043 2.98703E-06 150.04 98.607 150.04 1 149.944 3.01969E-06 149.94 1 110.077 0.00272705 110.08 1 138.763 0.000332416 138.76 1 144.55 0.000104853 144.55 1 144.55 0.000104853 144.55 1 144.55 0.000104853 144.55 1 115.004 0.00196958 115 1 144.55 0.000104853 144.55 1 150.043 2.98703E-06 150.04 1 N PPSGREEPCLLKRLRNGHVGISFVPKETGEH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)GHVGISFVPK N(150.04)GHVGISFVPK 1 3 0.59135 173990000 173990000 0 0 21.5 13999000 4989600 20235000 15794000 18464000 10061000 9038800 36435000 25920000 4.0979 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 7.7909 NaN 13999000 0 0 4989600 0 0 20235000 0 0 15794000 0 0 18464000 0 0 10061000 0 0 9038800 0 0 36435000 0 0 25920000 0 0 0.34654 0.53031 3.6375 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.54988 1.2216 3.4946 NaN NaN NaN 224 637 1996 1996 3068 3510 9902;9903;9904;9905;9906;9907;9908;9909;9910;9911;9912;9913;9914 10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439;10440;10441;10442;10443;10444;10445 9914 10445 20190902_JH_WT_Ubi_3 9422 9914 10445 20190902_JH_WT_Ubi_3 9422 9914 10445 20190902_JH_WT_Ubi_3 9422 sp|P21583-3|SCF_HUMAN;sp|P21583-2|SCF_HUMAN;sp|P21583|SCF_HUMAN 223;230;258 sp|P21583-3|SCF_HUMAN sp|P21583-3|SCF_HUMAN sp|P21583-3|SCF_HUMAN Isoform 3 of Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG;sp|P21583-2|SCF_HUMAN Isoform 2 of Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG;sp|P21583|SCF_HUMAN Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG PE=1 SV=1 0.353622 0 0.00555167 71.853 45.866 71.853 0.353622 0 0.00555167 71.853 N SLTRAVENIQINEEDNEISMLQEKEREFQEV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX AVENIQ(0.002)IN(0.291)EEDN(0.354)EISMLQ(0.354)EKER AVEN(-37.59)IQ(-22.29)IN(-0.85)EEDN(0)EISMLQ(0)EKER 12 3 2.0764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 225 639 223 223 323 379 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 sp|P21802-16|FGFR2_HUMAN 321 sp|P21802-16|FGFR2_HUMAN sp|P21802-16|FGFR2_HUMAN sp|P21802-16|FGFR2_HUMAN Isoform 16 of Fibroblast growth factor receptor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FGFR2 1 57.0193 0.0250999 57.019 24.49 57.019 1 57.0193 0.0250999 57.019 N LPYLKVLKVTKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VTKAAGVN(1)TTDK VTKAAGVN(57.02)TTDK 8 3 2.1814 2764400 2764400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2764400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2764400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 226 641 321 321 5030 5712 16227 17058 16227 17058 20190902_JH_WT_Ubi_3 9819 16227 17058 20190902_JH_WT_Ubi_3 9819 16227 17058 20190902_JH_WT_Ubi_3 9819 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN 109;109;109 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN Isoform 3 0.392137 0 0.00163621 54.425 23.57 54.425 0.392137 0 0.00163621 54.425 N DQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRLSLEASTG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DAVEEGDWTATVVDQ(0.051)Q(0.165)DCTLSLQ(0.392)LTTPAN(0.392)APIGLYR DAVEEGDWTATVVDQ(-8.86)Q(-3.76)DCTLSLQ(0)LTTPAN(0)APIGLYR 29 3 3.9721 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 227 645 109 109 396 466 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 sp|P21980|TGM2_HUMAN 531 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2 0.499962 0 0.00714395 68.97 38.461 68.97 0.499962 0 0.00714395 68.97 1 N YNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX TVSYNGILGPECGTKYLLN(0.5)LN(0.5)LEPFSEK TVSYN(-38.94)GILGPECGTKYLLN(0)LN(0)LEPFSEK 19 3 0.2881 745620 745620 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 745620 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 745620 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 228 645 531 531 4680 5310 15000 15760 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 sp|P21980|TGM2_HUMAN 533 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2 0.499961 0 0.00714395 68.97 38.461 68.97 0.499961 0 0.00714395 68.97 1 N GILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILY X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVSYNGILGPECGTKYLLN(0.5)LN(0.5)LEPFSEK TVSYN(-38.94)GILGPECGTKYLLN(0)LN(0)LEPFSEK 21 3 0.2881 745620 745620 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 745620 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 745620 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 229 645 533 533 4680 5310 15000 15760 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 15000 15760 20190902_JH_WT_Ubi_3 15206 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN 497;497 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 0.825598 6.75222 1.88598E-16 120.38 106.98 104.89 0.819894 6.58229 1.88598E-16 120.38 0.825598 6.75222 7.76807E-11 104.89 1 N SMNMGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCAR X;Oxidation (M);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VGQSMNMGSDFDVFAHITN(0.826)N(0.174)TAEEYVCR VGQ(-70.92)SMN(-56.26)MGSDFDVFAHITN(6.75)N(-6.75)TAEEYVCR 19 3 1.276 8235300 8235300 0 0 0.062168 0 0 0 0 0 0 0 5263100 2972200 0 0 0 0 0 NaN NaN 0.20813 0.085563 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5263100 0 0 2972200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.6356 1.7442 3.3609 0.41761 0.71705 3.2875 230 645 497 497 4836 5490 15518;15519 16301;16302 15519 16302 20190902_JH_WT_Ubi_3 12955 15518 16301 20190902_JH_WT_Ubi_2 13433 15518 16301 20190902_JH_WT_Ubi_2 13433 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN 229;229;229 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN Isoform 3 0.538426 1.87593 0.00600199 60.196 30.652 60.196 0.538426 1.87593 0.00600199 60.196 1 N RSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX VVSGMVN(0.538)CN(0.35)DDQ(0.112)GVLLGR VVSGMVN(1.88)CN(-1.88)DDQ(-6.82)GVLLGR 7 2 -3.1732 1060300 1060300 0 0 0.03629 0 0 0 1060300 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1060300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 231 645 229 229 5065 5756 16332 17165 16332 17165 20190902_JH_EV_Ubi_2 8851 16332 17165 20190902_JH_EV_Ubi_2 8851 16332 17165 20190902_JH_EV_Ubi_2 8851 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN 302;302 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 0.748926 6.38961 3.08017E-05 88 57.893 58.479 0.748926 6.38961 3.08017E-05 88 0.540575 5.53058 0.000250956 84.436 1;2 N VLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VVTN(0.06)YN(0.749)SAHDQ(0.268)N(0.679)SN(0.244)LLIEYFR VVTN(-11.32)YN(6.39)SAHDQ(-6.39)N(5.12)SN(-5.12)LLIEYFR 6 3 -0.69553 46872000 43349000 3523300 0 0.076893 0 0 42651000 0 0 2680000 0 0 0 NaN 0 0.17395 NaN NaN 0.12876 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39128000 3523300 0 0 0 0 0 0 0 2680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 232 645 302 302 5069 5762;5763 16355;16356;16359;16364 17189;17190;17193;17198 16364 17198 20190821_JH_WT_Ubi 12790 16359 17193 20190821_JH_WT_Ubi 11904 16359 17193 20190821_JH_WT_Ubi 11904 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN 308;308 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 0.703028 4.59129 7.08916E-06 101.62 71.623 97.621 0.686031 5.15444 0.00677286 60.938 0.592147 4.23354 0.00484071 66.702 0.703028 4.59129 7.08916E-06 97.621 0.466261 0 9.58726E-06 101.62 1;2 N IPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VVTNYN(0.001)SAHDQ(0.051)N(0.703)SN(0.244)LLIEYFR VVTN(-48.53)YN(-27.21)SAHDQ(-11.36)N(4.59)SN(-4.59)LLIEYFR 12 3 -1.03 18120000 14597000 3523300 0 0.029725 0 0 3523300 0 0 0 1511300 13085000 0 NaN 0 0.014369 NaN NaN 0 0.049704 0.098234 0 0 0 0 0 0 0 0 3523300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1511300 0 0 13085000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 233 645 308 308 5069 5762;5763 16357;16360;16362;16364 17191;17194;17196;17198 16362 17196 20190902_JH_WT_Ubi_2 13355 16363 17197 20190902_JH_WT_Ubi_3 12328 16362 17196 20190902_JH_WT_Ubi_2 13355 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN 310;310 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 0.933734 13.8379 0.00609217 63.936 41.623 63.936 0.39187 0 0.00695495 62.966 0.933734 13.8379 0.00609217 63.936 1 N TRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX VVTN(0.001)YN(0.016)SAHDQ(0.011)N(0.039)SN(0.934)LLIEYFR VVTN(-31.38)YN(-17.73)SAHDQ(-19.19)N(-13.84)SN(13.84)LLIEYFR 14 3 -0.3711 7291300 7291300 0 0 0.011961 0 0 0 0 0 0 0 7291300 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0.054737 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7291300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 234 645 310 310 5069 5762;5763 16361 17195 16361 17195 20190902_JH_WT_Ubi_2 12850 16361 17195 20190902_JH_WT_Ubi_2 12850 16361 17195 20190902_JH_WT_Ubi_2 12850 sp|P22087|FBRL_HUMAN 256 sp|P22087|FBRL_HUMAN sp|P22087|FBRL_HUMAN sp|P22087|FBRL_HUMAN rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBL PE=1 SV=2 1 117.706 0.00295755 117.71 68.283 117.71 1 107.455 0.00497432 107.45 1 104.221 0.0064428 104.22 1 117.706 0.00295755 117.71 1 101.381 0.00773289 101.38 1 107.555 0.0049291 107.55 1 102.524 0.00721388 102.52 1 117.706 0.00295755 117.71 1 N DQTRIVALNAHTFLRNGGHFVISIKANCIDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXX N(1)GGHFVISIK N(117.71)GGHFVISIK 1 3 0.98957 40850000 40850000 0 0 4.295 4447900 2656500 10805000 0 4679300 0 2567000 8945300 6750000 NaN NaN 3.086 NaN NaN NaN NaN 3.1435 2.1332 4447900 0 0 2656500 0 0 10805000 0 0 0 0 0 4679300 0 0 0 0 0 2567000 0 0 8945300 0 0 6750000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 235 647 256 256 3066 3504 9885;9886;9887;9888;9889;9890;9891 10416;10417;10418;10419;10420;10421;10422 9891 10422 20190902_JH_WT_Ubi_3 9638 9891 10422 20190902_JH_WT_Ubi_3 9638 9891 10422 20190902_JH_WT_Ubi_3 9638 sp|P22314-2|UBA1_HUMAN;sp|P22314|UBA1_HUMAN 884;924 sp|P22314-2|UBA1_HUMAN sp|P22314-2|UBA1_HUMAN sp|P22314-2|UBA1_HUMAN Isoform 2 of Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1;sp|P22314|UBA1_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1 PE=1 SV=3 0.51807 0.314045 3.4948E-08 116.29 90.784 116.29 0.51807 0.314045 3.4948E-08 116.29 1 N LYKVVQGHRQLDSYKNGFLNLALPFFGFSEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.518)GFLN(0.482)LALPFFGFSEPLAAPR N(0.31)GFLN(-0.31)LALPFFGFSEPLAAPR 1 3 -0.47784 1507500 1507500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1507500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1507500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 236 651 884 884 3065 3503 9884 10415 9884 10415 20190902_JH_WT_Ubi_2 17566 9884 10415 20190902_JH_WT_Ubi_2 17566 9884 10415 20190902_JH_WT_Ubi_2 17566 sp|P22314-2|UBA1_HUMAN;sp|P22314|UBA1_HUMAN 4;44 sp|P22314-2|UBA1_HUMAN sp|P22314-2|UBA1_HUMAN sp|P22314-2|UBA1_HUMAN Isoform 2 of Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1;sp|P22314|UBA1_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1 PE=1 SV=3 1 179.834 1.89315E-18 179.83 133.94 179.83 1 179.834 1.89315E-18 179.83 N ____________MAKNGSEADIDEGLYSRQL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXX N(1)GSEADIDEGLYSR N(179.83)GSEADIDEGLYSR 1 2 2.604 2959000 2959000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2959000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2959000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 237 651 4 4 3074 3518 9937 10468 9937 10468 20190902_JH_WT_Ubi_3 9853 9937 10468 20190902_JH_WT_Ubi_3 9853 9937 10468 20190902_JH_WT_Ubi_3 9853 sp|P23284|PPIB_HUMAN 148 sp|P23284|PPIB_HUMAN sp|P23284|PPIB_HUMAN sp|P23284|PPIB_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIB PE=1 SV=2 0.999979 46.6896 1.79844E-09 174.21 115.58 174.21 0.999979 46.6896 1.79844E-09 174.21 0.873715 8.40019 0.0363376 84.188 1 N YGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTAWLD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX DTN(1)GSQFFITTVK DTN(46.69)GSQ(-46.69)FFITTVK 3 2 -0.032789 15554000 15554000 0 0 NaN 0 0 6529500 0 0 0 0 9024900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 6529500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9024900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 238 660 148 148 714 811 2231;2232 2358;2359 2231 2358 20190821_JH_WT_Ubi 11358 2231 2358 20190821_JH_WT_Ubi 11358 2231 2358 20190821_JH_WT_Ubi 11358 sp|P23528|COF1_HUMAN 138 sp|P23528|COF1_HUMAN sp|P23528|COF1_HUMAN sp|P23528|COF1_HUMAN Cofilin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFL1 PE=1 SV=3 0.999416 32.3319 2.4523E-05 138.89 110.12 72.705 0.999416 32.3319 0.0150875 72.705 0.716356 4.02356 0.0169427 70.41 0.998938 29.7357 2.4523E-05 138.89 1 N AIKKKLTGIKHELQANCYEEVKDRCTLAEKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX HELQ(0.001)AN(0.999)CYEEVK HELQ(-32.33)AN(32.33)CYEEVK 6 3 0.95795 9237600 9237600 0 0 0.047712 0 0 1862500 0 0 0 0 5112900 0 0 0 0.037686 0 0 0 0 0.086051 0 0 0 0 0 0 0 1862500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5112900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 239 667 138 138 1814;1815 2059;2061 5776;5777;5778;5787 6080;6081;6082;6091 5776 6080 20190821_JH_WT_Ubi 4708 5778 6082 20190902_JH_WT_Ubi_2 6529 5778 6082 20190902_JH_WT_Ubi_2 6529 sp|P23743-2|DGKA_HUMAN;sp|P23743-3|DGKA_HUMAN;sp|P23743|DGKA_HUMAN 85;85;85 sp|P23743-2|DGKA_HUMAN sp|P23743-2|DGKA_HUMAN sp|P23743-2|DGKA_HUMAN Isoform 2 of Diacylglycerol kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DGKA;sp|P23743-3|DGKA_HUMAN Isoform 3 of Diacylglycerol kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DGKA;sp|P23743|DGKA_HUMAN Diacylglycerol kinase alpha OS=Homo sapiens 0.530451 2.37387 0.0156336 54.058 23.963 54.058 0.530451 2.37387 0.0156336 54.058 1 N LSLALFQSFETGHCLNETNVTKDVVCLNDVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX HLSLALFQ(0.307)SFETGHCLN(0.53)ETN(0.162)VTK HLSLALFQ(-2.37)SFETGHCLN(2.37)ETN(-5.14)VTK 17 3 3.9282 2360400 2360400 0 0 NaN 0 0 2360400 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2360400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 240 669 85 85 1933 2199 6279 6607 6279 6607 20190821_JH_WT_Ubi 10794 6279 6607 20190821_JH_WT_Ubi 10794 6279 6607 20190821_JH_WT_Ubi 10794 sp|P25705-2|ATPA_HUMAN;sp|P25705|ATPA_HUMAN;sp|P25705-3|ATPA_HUMAN 459;509;487 sp|P25705-2|ATPA_HUMAN sp|P25705-2|ATPA_HUMAN sp|P25705-2|ATPA_HUMAN Isoform 2 of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1A;sp|P25705|ATPA_HUMAN ATP synthase subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1A PE=1 SV=1;sp|P25705-3|ATPA_HUMAN Isoform 3 of 0.793137 6.36634 0.0197682 42.612 23.266 42.612 0.793137 6.36634 0.0197682 42.612 1 N GYLDKLEPSKITKFENAFLSHVVSQHQALLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP FEN(0.793)AFLSHVVSQ(0.183)HQ(0.024)ALLGTIR FEN(6.37)AFLSHVVSQ(-6.37)HQ(-15.24)ALLGTIR 3 4 1.2 37403000 37403000 0 0 0.032401 0 0 37403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.13029 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 241 680 459 459 1188 1341 3777 3974 3777 3974 20190821_JH_WT_Ubi 11409 3777 3974 20190821_JH_WT_Ubi 11409 3777 3974 20190821_JH_WT_Ubi 11409 sp|P26038|MOES_HUMAN 478 sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN Moesin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSN PE=1 SV=3 0.358415 0 0.00320477 43.438 20.878 43.438 0.358415 0 0.00320477 43.438 N LKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASAD X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AELKTAMSTPHVAEPAEN(0.358)EQ(0.358)DEQ(0.093)DEN(0.19)GAEASADLR AELKTAMSTPHVAEPAEN(0)EQ(0)DEQ(-5.86)DEN(-2.75)GAEASADLR 18 4 1.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 242 686 478 478 91;4260 105;4836;4837 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 sp|P26038|MOES_HUMAN 486 sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN Moesin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSN PE=1 SV=3 0.972879 16.9317 5.45336E-73 198.85 171.31 93.505 0.571352 3.94614 3.1037E-05 85.291 0.789484 9.53588 0.000114257 72.578 0.966166 14.585 5.45336E-73 198.85 0.825899 7.30691 9.04097E-11 102.75 0.863623 9.17964 1.03839E-21 133.91 0.860665 8.36041 6.84861E-16 111.5 0.91186 11.9271 8.23982E-32 149.91 0.972879 16.9317 5.52792E-16 113.75 1 N HVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX TAMSTPHVAEPAENEQ(0.007)DEQ(0.02)DEN(0.973)GAEASADLR TAMSTPHVAEPAEN(-38.1)EQ(-21.28)DEQ(-16.93)DEN(16.93)GAEASADLR 22 3 -0.014006 27614000 27614000 0 0 1.7499 1831200 0 4564700 1690000 0 1164300 989150 6856000 0 1.6307 0 1.4183 NaN 0 NaN NaN 1.1618 0 1831200 0 0 0 0 0 4564700 0 0 1690000 0 0 0 0 0 1164300 0 0 989150 0 0 6856000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.97699 42.466 32.544 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.94696 17.855 31.585 243 686 486 486 91;4260 105;4836;4837 13484;13485;13486;13487;13488;13489;13490;13492;13493;13494 14144;14145;14146;14147;14148;14149;14150;14151;14152;14153;14155;14156;14157;14158 13494 14158 20190902_JH_WT_Ubi_3 8689 13488 14150 20190821_JH_WT_Ubi 6196 13488 14150 20190821_JH_WT_Ubi 6196 sp|P26599|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN 161;161;161 sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1 PE=1 SV=1;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN Isoform 2 of Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN Isoform 3 of Polypy 0.715838 4.22794 3.55807E-08 77.627 49.446 77.627 0.715838 4.22794 3.55807E-08 77.627 1 N RAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AQ(0.001)AALQ(0.003)AVN(0.003)SVQ(0.27)SGN(0.716)LALAASAAAVDAGMAMAGQ(0.006)SPVLR AQ(-28.64)AALQ(-23.35)AVN(-23.74)SVQ(-4.23)SGN(4.23)LALAASAAAVDAGMAMAGQ(-20.46)SPVLR 15 3 3.8547 445030 445030 0 0 0.17185 0 0 0 0 0 0 445030 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 445030 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 244 690 161 161 247 289 838 914;915 838 915 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13055 838 915 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13055 838 915 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13055 sp|P26599|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN 220;220;220 sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1 PE=1 SV=1;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN Isoform 2 of Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN Isoform 3 of Polypy 0.45714 0 7.25123E-05 99.813 67.111 99.813 0.45714 0 7.25123E-05 99.813 N SKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.08)N(0.457)Q(0.457)FQ(0.005)ALLQ(0.001)YADPVSAQHAK N(-7.58)N(0)Q(0)FQ(-19.89)ALLQ(-25.86)YADPVSAQ(-74.91)HAK 2 3 -0.58585 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 245 690 220 220 3174 3628 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 sp|P27708|PYR1_HUMAN 973 sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN CAD protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAD PE=1 SV=3 0.494907 0 0.0117414 58.373 39.163 58.373 0.494907 0 0.0117414 58.373 N CIQQLRKMGYKTIMVNYNPETVSTDYDMCDR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MGYKTIMVN(0.495)YN(0.505)PETVSTDYDMCDR MGYKTIMVN(0)YN(0)PETVSTDYDMCDR 9 3 3.3415 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 246 701 973 973 2921 3317 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 sp|P27708|PYR1_HUMAN 975 sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN CAD protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAD PE=1 SV=3 0.505093 0 0.0117414 58.373 39.163 58.373 0.505093 0 0.0117414 58.373 1 N QQLRKMGYKTIMVNYNPETVSTDYDMCDRLY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MGYKTIMVN(0.495)YN(0.505)PETVSTDYDMCDR MGYKTIMVN(0)YN(0)PETVSTDYDMCDR 11 3 3.3415 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 247 701 975 975 2921 3317 9406 9900 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 9406 9900 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9474 sp|P27708|PYR1_HUMAN 466 sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN sp|P27708|PYR1_HUMAN CAD protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAD PE=1 SV=3 0.66346 5.76622 0.0291467 47.807 11.815 47.807 0.66346 5.76622 0.0291467 47.807 1 N YFLPITPHYVTQVIRNERPDGVLLTFGGQTA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.663)ERPDGVLLTFGGQ(0.161)TALN(0.176)CGVELTK N(5.77)ERPDGVLLTFGGQ(-6.16)TALN(-5.77)CGVELTK 1 3 -1.3012 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 248 701 466 466 3041 3476 9813 10337 9813 10337 20190821_JH_MUT_Ubi 11486 9813 10337 20190821_JH_MUT_Ubi 11486 9813 10337 20190821_JH_MUT_Ubi 11486 sp|P27987|IP3KB_HUMAN 630 sp|P27987|IP3KB_HUMAN sp|P27987|IP3KB_HUMAN sp|P27987|IP3KB_HUMAN Inositol-trisphosphate 3-kinase B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITPKB PE=1 SV=5 0.994928 24.2513 0.0333389 53.453 8.1059 53.453 0.994928 24.2513 0.0333389 53.453 1 N SEEDISSDPERTLDPNSAFLHTLDQQKPRVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TLDPN(0.995)SAFLHTLDQ(0.001)Q(0.004)KPRVSK TLDPN(24.25)SAFLHTLDQ(-28.73)Q(-24.25)KPRVSK 5 3 -0.74979 689470 689470 0 0 NaN 0 0 0 689470 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 689470 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 249 705 630 630 4460 5058 14156 14861 14156 14861 20190902_JH_EV_Ubi_2 11890 14156 14861 20190902_JH_EV_Ubi_2 11890 14156 14861 20190902_JH_EV_Ubi_2 11890 sp|P29401|TKT_HUMAN;sp|P29401-2|TKT_HUMAN 482;490 sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT PE=1 SV=3;sp|P29401-2|TKT_HUMAN Isoform 2 of Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT 0.750345 6.16396 4.38504E-08 117.29 58.464 115.38 0.35608 0 4.17885E-07 110.33 0.42874 1.55129 4.38504E-08 117.29 0.750345 6.16396 5.80521E-08 115.38 1 N ICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX TSRPEN(0.02)AIIYN(0.75)N(0.181)N(0.048)EDFQVGQAK TSRPEN(-15.82)AIIYN(6.16)N(-6.16)N(-11.94)EDFQ(-32.53)VGQ(-45.36)AK 11 3 -0.51038 2912300 2912300 0 0 0.036567 0 0 0 0 0 0 0 0 2912300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0.18859 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2912300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 250 715 482 482 4610 5234 14745 15494 14745 15494 20190902_JH_WT_Ubi_3 9236 14742 15491 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8053 14742 15491 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8053 sp|P29401|TKT_HUMAN;sp|P29401-2|TKT_HUMAN 483;491 sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT PE=1 SV=3;sp|P29401-2|TKT_HUMAN Isoform 2 of Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT 0.669146 4.70022 7.71076E-08 112.82 62.771 112.82 0.35608 0 4.17885E-07 110.33 0.316288 1.11783 0.0220596 60.032 0.669146 4.70022 7.71076E-08 112.82 1 N CFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TSRPENAIIYN(0.227)N(0.669)N(0.077)EDFQ(0.027)VGQAK TSRPEN(-58)AIIYN(-4.7)N(4.7)N(-9.37)EDFQ(-14.02)VGQ(-33.13)AK 12 3 -1.7506 3522900 3522900 0 0 0.044234 0 0 0 0 0 0 0 0 3522900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0.22814 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3522900 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 251 715 483 483 4610 5234 14746 15495 14746 15495 20190902_JH_WT_Ubi_3 9499 14746 15495 20190902_JH_WT_Ubi_3 9499 14746 15495 20190902_JH_WT_Ubi_3 9499 sp|P29966|MARCS_HUMAN 61 sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 0.997282 25.6455 1.20632E-06 90.211 64.803 80.17 0.83168 6.90275 0.0124107 55.998 0.997282 25.6455 0.0105598 80.17 0.988343 19.2835 0.000103671 79.016 0.921782 10.7132 1.20632E-06 90.211 1;2 N SPAAAESGAKEELQANGSAPAADKEEPAAAG X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EELQ(0.003)AN(0.997)GSAPAADK EELQ(-25.65)AN(25.65)GSAPAADK 6 2 -1.515 2460600 2460600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 386070 0 1460300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 386070 0 0 0 0 0 1460300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 252 718 61 61 862;863;4951 978;979;5621 2752;2753;2754;15908 2894;2895;2896;16716 2752 2894 20190902_JH_EV_Ubi_2 5030 2754 2896 20190902_JH_WT_Ubi_2 7640 2754 2896 20190902_JH_WT_Ubi_2 7640 sp|P29966|MARCS_HUMAN 32 sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 0.927953 8.32984 1.43743E-20 125.35 85.704 73.109 0.695109 2.77538 5.87815E-06 86.508 0.818161 4.73039 1.03455E-10 105.52 0.672438 0 0.00182054 57.648 0.729758 1.74719 0.00124727 60.218 0.774021 3.42803 0.00185864 57.477 0.927953 8.32984 0.000167922 73.109 0.796647 3.77308 1.43743E-20 125.35 2 N ERPGEAAVASSPSKANGQENGHVKVNGDASP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(0.928)GQ(0.536)EN(0.536)GHVK GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(8.33)GQ(0)EN(0)GHVK 21 4 -0.73125 22249000 0 22249000 0 NaN 1221000 667070 6021100 1350000 3207700 1567400 1591300 6623300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1221000 0 0 667070 0 0 6021100 0 0 1350000 0 0 3207700 0 0 1567400 0 0 1591300 0 0 6623300 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 253 718 32 32 1420 1618 4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529 4750;4751;4752;4753;4754;4755;4756;4757;4758;4759 4527 4757 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4553 4529 4759 20190902_JH_WT_Ubi_2 5519 4529 4759 20190902_JH_WT_Ubi_2 5519 sp|P29966|MARCS_HUMAN 36 sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 0.663781 0 0.000167922 73.109 45.162 57.648 0.656484 0.341532 0.00274042 53.525 0.663781 0 0.00182054 57.648 0.536024 0 0.000167922 73.109 2 N EAAVASSPSKANGQENGHVKVNGDASPAAAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(0.672)GQ(0.664)EN(0.664)GHVK GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(0)GQ(0)EN(0)GHVK 25 4 -0.80796 15007000 0 15007000 0 NaN 0 667070 0 1350000 3207700 1567400 1591300 6623300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 667070 0 0 0 0 0 1350000 0 0 3207700 0 0 1567400 0 0 1591300 0 0 6623300 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 254 718 36 36 1420 1618 4523;4524;4525;4526;4527;4529 4752;4753;4754;4755;4756;4757;4759 4523 4752 20190902_JH_EV_Ubi_2 4484 4527 4757 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4553 4527 4757 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4553 sp|P29966|MARCS_HUMAN 42 sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 0.991182 19.9052 0.0124107 55.998 28.094 55.998 0.991182 19.9052 0.0124107 55.998 2 N SPSKANGQENGHVKVNGDASPAAAESGAKEE X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP VN(0.991)GDASPAAAESGAKEELQ(0.177)AN(0.832)GSAPAADK VN(19.91)GDASPAAAESGAKEELQ(-6.9)AN(6.9)GSAPAADK 2 3 -0.88633 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 255 718 42 42 4951 5621 15908 16716 15908 16716 20190821_JH_WT_Ubi 6703 15908 16716 20190821_JH_WT_Ubi 6703 15908 16716 20190821_JH_WT_Ubi 6703 sp|P30041|PRDX6_HUMAN 90 sp|P30041|PRDX6_HUMAN sp|P30041|PRDX6_HUMAN sp|P30041|PRDX6_HUMAN Peroxiredoxin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX6 PE=1 SV=3 0.775134 5.37454 2.00989E-07 150.51 92.922 150.51 0.775134 5.37454 2.00989E-07 150.51 1 N SVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX DIN(0.225)AYN(0.775)CEEPTEK DIN(-5.37)AYN(5.37)CEEPTEK 6 2 0.60568 1543200 1543200 0 0 NaN 0 0 1543200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1543200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 256 720 90 90 538 621 1727 1832 1727 1832 20190821_JH_WT_Ubi 5887 1727 1832 20190821_JH_WT_Ubi 5887 1727 1832 20190821_JH_WT_Ubi 5887 sp|P30048-2|PRDX3_HUMAN;sp|P30048|PRDX3_HUMAN 139;157 sp|P30048-2|PRDX3_HUMAN sp|P30048-2|PRDX3_HUMAN sp|P30048-2|PRDX3_HUMAN Isoform 2 of Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX3;sp|P30048|PRDX3_HUMAN Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX3 PE=1 SV=3 0.969049 14.9567 0.00018587 108.06 53.112 108.06 0.551508 0.89797 0.034374 55.851 0.843793 7.32534 0.0224704 61.186 0.969049 14.9567 0.00018587 108.06 1 N AWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX N(0.031)GGLGHMN(0.969)IALLSDLTK N(-14.96)GGLGHMN(14.96)IALLSDLTK 8 3 -0.44304 3754800 3754800 0 0 1.3669 0 0 1200000 0 0 596620 0 0 1958200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.92805 0 0 0 0 0 0 1200000 0 0 0 0 0 0 0 0 596620 0 0 0 0 0 0 0 0 1958200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 257 724 139 139 3067 3507 9896;9897;9898 10427;10428;10429 9898 10429 20190902_JH_WT_Ubi_3 14436 9898 10429 20190902_JH_WT_Ubi_3 14436 9898 10429 20190902_JH_WT_Ubi_3 14436 sp|P30101|PDIA3_HUMAN 199 sp|P30101|PDIA3_HUMAN sp|P30101|PDIA3_HUMAN sp|P30101|PDIA3_HUMAN Protein disulfide-isomerase A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDIA3 PE=1 SV=4 0.999485 32.9798 0.000200846 82.267 54.657 82.267 0.718052 4.12939 0.0266324 48.182 0.999485 32.9798 0.000200846 82.267 1 N FAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX FAHTNVESLVN(0.001)EYDDN(0.999)GEGIILFR FAHTN(-49.31)VESLVN(-32.98)EYDDN(32.98)GEGIILFR 16 3 -0.67352 11362000 11362000 0 0 1.7447 0 0 5806900 0 0 0 0 5555000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.85301 NaN 0 0 0 0 0 0 5806900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5555000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 258 730 199 199 1167 1317 3715;3716 3911;3912 3716 3912 20190902_JH_WT_Ubi_2 14766 3716 3912 20190902_JH_WT_Ubi_2 14766 3716 3912 20190902_JH_WT_Ubi_2 14766 sp|P30405|PPIF_HUMAN 148 sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIF PE=1 SV=1 0.346141 0 0.0325253 44.711 13.44 44.711 0.346141 0 0.0325253 44.711 N KHVGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIKTDW X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX HVGPGVLSMAN(0.021)AGPN(0.346)TN(0.346)GSQ(0.287)FFICTIK HVGPGVLSMAN(-12.2)AGPN(0)TN(0)GSQ(-0.82)FFICTIK 15 3 -0.60418 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 259 732 148 148 2023 2307 6657 7003 20190821_JH_WT_Ubi 11425 6657 7003 20190821_JH_WT_Ubi 11425 6657 7003 20190821_JH_WT_Ubi 11425 sp|P30405|PPIF_HUMAN 150 sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIF PE=1 SV=1 0.359455 0 0.00136044 66.372 35.058 66.372 0.346141 0 0.0325253 44.711 0.359455 0 0.00136044 66.372 N VGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIKTDWLD X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX HVGPGVLSMAN(0.002)AGPN(0.279)TN(0.359)GSQ(0.359)FFICTIK HVGPGVLSMAN(-23.27)AGPN(-1.09)TN(0)GSQ(0)FFICTIK 17 3 -0.17943 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 260 732 150 150 2023 2307 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 sp|P31040|SDHA_HUMAN;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN;sp|P31040-3|SDHA_HUMAN 521;473;376 sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDHA PE=1 SV=2;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN Isoform 2 of Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sap 1 44.5871 0.0213415 44.587 6.36 44.587 1 44.5871 0.0213415 44.587 3 N IRTSELRLSMQKSMQNHAAVFRVGSVLQEGC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SMQ(1)N(1)HAAVFRVGSVLQ(1)EGCGK SMQ(44.59)N(44.59)HAAVFRVGSVLQ(44.59)EGCGK 4 3 -1.9201 5897400 0 0 5897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 261 739 521 521 4073 4625 12900 13527 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 sp|P31327|CPSM_HUMAN;sp|P31327-3|CPSM_HUMAN 463;469 sp|P31327|CPSM_HUMAN sp|P31327|CPSM_HUMAN sp|P31327|CPSM_HUMAN Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPS1 PE=1 SV=2;sp|P31327-3|CPSM_HUMAN Isoform 3 of Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPS1 0.782778 7.26699 0.0187661 43.523 11.704 43.523 0.782778 7.26699 0.0187661 43.523 N AVKAMKEENVKTVLMNPNIASVQTNEVGLKQ X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX AMKEEN(0.159)VKTVLMN(0.783)PN(0.038)IASVQ(0.01)TN(0.01)EVGLK AMKEEN(-7.27)VKTVLMN(7.27)PN(-13.5)IASVQ(-19.85)TN(-19.85)EVGLK 13 4 2.8081 2585700 2585700 0 0 NaN 2585700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2585700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 262 741 463 463 229 264 774 844 774 844 20190821_JH_EV_Ubi 11365 774 844 20190821_JH_EV_Ubi 11365 774 844 20190821_JH_EV_Ubi 11365 sp|P31946-2|1433B_HUMAN;sp|P31946|1433B_HUMAN 95;97 sp|P31946-2|1433B_HUMAN sp|P31946-2|1433B_HUMAN sp|P31946-2|1433B_HUMAN Isoform Short of 14-3-3 protein beta/alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAB;sp|P31946|1433B_HUMAN 14-3-3 protein beta/alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAB PE=1 SV=3 0.837647 8.78389 0.00136525 74.525 39.15 74.525 0.837647 8.78389 0.00136525 74.525 1 N KEYREKIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNAT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP IEAELQ(0.016)DICN(0.838)DVLELLDKYLIPN(0.111)ATQ(0.036)PESK IEAELQ(-17.23)DICN(8.78)DVLELLDKYLIPN(-8.78)ATQ(-13.71)PESK 10 3 0.54743 1690400 1690400 0 0 NaN 0 1690400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1690400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 263 749 95 95 2089 2387 6942 7310 6942 7310 20190821_JH_MUT_Ubi 14958 6942 7310 20190821_JH_MUT_Ubi 14958 6942 7310 20190821_JH_MUT_Ubi 14958 sp|P31949|S10AB_HUMAN 70 sp|P31949|S10AB_HUMAN sp|P31949|S10AB_HUMAN sp|P31949|S10AB_HUMAN Protein S100-A11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A11 PE=1 SV=2 0.547873 0.96015 0.0120656 56.366 13.912 56.366 0.547873 0.96015 0.0120656 56.366 1 N KDPGVLDRMMKKLDTNSDGQLDFSEFLNLIG GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KLDTN(0.548)SDGQ(0.439)LDFSEFLN(0.013)LIGGLAMACHDSFLK KLDTN(0.96)SDGQ(-0.96)LDFSEFLN(-16.27)LIGGLAMACHDSFLK 5 4 -0.82643 1139800 1139800 0 0 0.3814 0 0 0 0 0 0 0 1139800 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1139800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 264 751 70 70 2379 2706 7802 8204 7802 8204 20190902_JH_WT_Ubi_2 16695 7802 8204 20190902_JH_WT_Ubi_2 16695 7802 8204 20190902_JH_WT_Ubi_2 16695 sp|P31949|S10AB_HUMAN 44 sp|P31949|S10AB_HUMAN sp|P31949|S10AB_HUMAN sp|P31949|S10AB_HUMAN Protein S100-A11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=S100A11 PE=1 SV=2 1 124.119 1.29594E-07 124.12 77.275 124.12 1 124.119 1.29594E-07 124.12 1 N GYNYTLSKTEFLSFMNTELAAFTKNQKDPGV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TEFLSFMN(1)TELAAFTK TEFLSFMN(124.12)TELAAFTK 8 2 -0.76076 1421300 1421300 0 0 0.47705 0 0 0 0 0 0 0 0 1421300 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.47705 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1421300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 265 751 44 44 4309 4889 13643 14312 13643 14312 20190902_JH_WT_Ubi_3 14824 13643 14312 20190902_JH_WT_Ubi_3 14824 13643 14312 20190902_JH_WT_Ubi_3 14824 sp|P32455|GBP1_HUMAN 289 sp|P32455|GBP1_HUMAN sp|P32455|GBP1_HUMAN sp|P32455|GBP1_HUMAN Guanylate-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GBP1 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0348123 80.522 27.509 80.522 0.5 0 0.0348123 80.522 1 N FSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLTYVNAI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TKTLSGGIQ(0.5)VN(0.5)GPR TKTLSGGIQ(0)VN(0)GPR 11 3 -0.012355 9061300 9061300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 9061300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9061300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 266 755 289 289 4452 5050 14134 14839 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 sp|P32969|RL9_HUMAN 149 sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN 60S ribosomal protein L9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL9 PE=1 SV=1 0.951514 14.3958 0.00817785 56.562 27.408 56.562 0.951514 14.3958 0.00817785 56.562 2 N CSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DELILEGN(0.952)DIELVSN(0.261)SAALIQ(0.333)Q(0.34)ATTVKN(0.115)K DELILEGN(14.4)DIELVSN(-1.14)SAALIQ(0)Q(0)ATTVKN(-5.09)K 8 3 -0.43823 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 267 757 149 149 439 514 1410 1501 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 sp|P32969|RL9_HUMAN 108 sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN 60S ribosomal protein L9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL9 PE=1 SV=1 0.999309 31.6024 1.06175E-06 105.32 55.331 105.32 0.999309 31.6024 1.06175E-06 105.32 0.969332 15.0438 0.000224716 84.113 1 N RSVYAHFPINVVIQENGSLVEIRNFLGEKYI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SVYAHFPINVVIQ(0.001)EN(0.999)GSLVEIR SVYAHFPIN(-65.01)VVIQ(-31.6)EN(31.6)GSLVEIR 15 3 -2.9107 4056700 4056700 0 0 NaN 0 1285900 2770900 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1285900 0 0 2770900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 268 757 108 108 4227 4800 13365;13366 14019;14020;14021 13365 14020 20190821_JH_MUT_Ubi 12947 13365 14020 20190821_JH_MUT_Ubi 12947 13365 14020 20190821_JH_MUT_Ubi 12947 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-9|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 839;898;839;783;898;842;908;783;842 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 0.999788 36.7357 5.8273E-10 140.96 82.145 127.3 0.997482 25.9787 0.00020772 107.63 0.995645 23.5911 1.0275E-09 136.26 0.999788 36.7357 1.71259E-07 127.3 0.994741 22.7683 5.8273E-10 140.96 0.842624 7.28696 1.01962E-09 136.34 0.995099 23.0762 2.48E-07 123.76 0.985562 18.3419 0.0132803 67.685 1 N VTGVSGPGKEAKQMENGMLVTDSAGKQLQRQ X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX EAKQMEN(1)GMLVTDSAGK EAKQ(-36.74)MEN(36.74)GMLVTDSAGK 7 3 -0.42913 32178000 32178000 0 0 NaN 3699800 935460 0 6148200 6543300 2222900 3763800 2183700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 3699800 0 0 935460 0 0 0 0 0 6148200 0 0 6543300 0 0 2222900 0 0 3763800 0 0 2183700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 269 760 839 839 797;3669 902;4178 2499;2500;2501;2502;2503;2504;2505;11724;11725;11726 2631;2632;2633;2634;2635;2636;2637;12303;12304;12305 2500 2632 20190902_JH_EV_Ubi_2 4628 2501 2633 20190902_JH_EV_Ubi_3 4625 2501 2633 20190902_JH_EV_Ubi_3 4625 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-9|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 870;929;870;814;929;873;939;814;873 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 0.998478 28.2309 0.00183859 87.719 42.872 61.423 0.991118 20.4676 0.00183859 87.719 0.998478 28.2309 0.0146394 61.423 1 N LSSSSSYSGDISRHHNSTAELQKAEAKKEET X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXX HHN(0.998)STAELQ(0.002)KAEAK HHN(28.23)STAELQ(-28.23)KAEAK 3 4 0.41325 2842600 2842600 0 0 0.15767 0 0 0 0 0 0 1198600 0 1644000 NaN 0 NaN 0 0 0 1.5038 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1198600 0 0 0 0 0 1644000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 270 760 870 870 1861 2113 5979;5980 6295;6296 5980 6296 20190902_JH_WT_Ubi_3 4107 5979 6295 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3631 5979 6295 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3631 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-9|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 642;642;642;642;642;642;642;642;642 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 1 121.955 6.09911E-48 217.79 169.51 121.95 1 140.771 8.04649E-07 140.77 1 196.974 4.52984E-36 196.97 1 217.785 6.09911E-48 217.79 1 105.171 0.0041605 105.17 1 118.999 0.000421506 119 1 130.015 5.34702E-05 130.02 1 81.346 0.0313077 81.346 1 121.955 0.000209753 121.95 1 N PDSIERRPVKDGGGTNSITVRNATFTWARSD X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX RPVKDGGGTN(1)SITVR RPVKDGGGTN(121.95)SITVR 10 3 -1.7583 74674000 74674000 0 0 0.38204 5937400 6519600 0 10109000 6312500 17896000 14484000 6562600 4852000 0.2131 NaN NaN 0.26912 0.14368 0.33757 1.2998 0.52713 0.51114 5937400 0 0 6519600 0 0 0 0 0 10109000 0 0 6312500 0 0 17896000 0 0 14484000 0 0 6562600 0 0 4852000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 271 760 642 642 3558;3795 4056;4312 11427;12014;12015;12016;12017;12018;12019;12020;12021 12000;12603;12604;12605;12606;12607;12608;12609;12610 12021 12610 20190902_JH_WT_Ubi_3 4927 12015 12604 20190902_JH_EV_Ubi_2 4146 12015 12604 20190902_JH_EV_Ubi_2 4146 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 822;881;822;766;881;825;766;825 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 1 85.0303 2.96133E-120 248.01 213.35 248.01 1 66.7406 4.79007E-53 194.04 0.99873 31.9864 8.1475E-89 220.47 0.994741 22.805 1.1558E-42 176.9 0.99736 25.8276 1.59498E-43 182.19 1 80.588 9.54534E-90 229.71 0.999363 34.8317 1.87526E-52 191.2 0.990254 23.1371 7.40394E-53 193.51 0.99988 39.7181 1.37282E-14 129.52 1 85.0303 2.96133E-120 248.01 1 N LRTYASTEQEQDAEENGVTGVSGPGKEAKQM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Oxidation (M) XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX TYASTEQEQDAEEN(1)GVTGVSGPGKEAK TYASTEQ(-97.53)EQ(-85.03)DAEEN(85.03)GVTGVSGPGKEAK 14 3 0.25308 146370000 146370000 0 0 NaN 15903000 7870200 6356500 18223000 12905000 19052000 11832000 9626300 5548600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 15903000 0 0 7870200 0 0 6356500 0 0 18223000 0 0 12905000 0 0 19052000 0 0 11832000 0 0 9626300 0 0 5548600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 272 760 822 822 4691 5322 15029;15030;15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041;15043;15044;15045 15790;15791;15792;15793;15794;15795;15796;15797;15798;15799;15800;15801;15802;15803;15804;15805;15807;15808;15809 15043 15807 20190902_JH_WT_Ubi_3 6985 15043 15807 20190902_JH_WT_Ubi_3 6985 15043 15807 20190902_JH_WT_Ubi_3 6985 sp|P35398-4|RORA_HUMAN;sp|P35398|RORA_HUMAN;sp|P35398-3|RORA_HUMAN;sp|P35398-1|RORA_HUMAN 295;350;367;383 sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN Isoform 4 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA;sp|P35398|RORA_HUMAN Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA PE=1 SV=2;sp|P35398-3|RORA_HUMAN Isoform 3 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo 1 55.7548 0.017368 55.755 18.518 55.755 1 55.7548 0.017368 55.755 3 N VEFAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGSLEVVF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX RIDGFMELCQ(1)N(1)DQ(1)IVLLK RIDGFMELCQ(55.75)N(55.75)DQ(55.75)IVLLK 11 3 1.8911 889700 0 0 889700 NaN 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 273 774 295 295 3756 4270 11907 12489 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 sp|P35579|MYH9_HUMAN 61 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 1 153.808 5.98016E-13 153.81 105.29 153.81 1 153.808 5.98016E-13 153.81 1 N LKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX EEVGEEAIVELVEN(1)GK EEVGEEAIVELVEN(153.81)GK 14 2 0.11301 650630 650630 0 0 NaN 0 0 0 0 650630 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 650630 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 274 776 61 61 872 988 2777 2921 2777 2921 20190902_JH_EV_Ubi_3 11813 2777 2921 20190902_JH_EV_Ubi_3 11813 2777 2921 20190902_JH_EV_Ubi_3 11813 sp|P35579|MYH9_HUMAN;sp|P35579-2|MYH9_HUMAN 305;169 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4;sp|P35579-2|MYH9_HUMAN Isoform 2 of Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 0.999939 45.1418 0.00718103 80.905 28.561 80.905 0.999939 45.1418 0.00718103 80.905 1 N TDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXX FLSN(1)GHVTIPGQQDK FLSN(45.14)GHVTIPGQ(-45.14)Q(-45.14)DK 4 3 0.94546 1314500 1314500 0 0 NaN 0 0 0 1314500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1314500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 275 776 305 305 1255 1418 3972 4177 3972 4177 20190902_JH_EV_Ubi_2 7941 3972 4177 20190902_JH_EV_Ubi_2 7941 3972 4177 20190902_JH_EV_Ubi_2 7941 sp|P35579|MYH9_HUMAN 1284 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 0.935099 11.5854 0.0224166 51.495 7.9386 51.495 0.935099 11.5854 0.0224166 51.495 2 N TELADKVTKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX LQ(0.065)VELDN(0.935)VTGLLSQ(1)SDSK LQ(-11.59)VELDN(11.59)VTGLLSQ(38.16)SDSK 7 3 2.7375 2239700 0 2239700 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2239700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2239700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 276 776 1284 1284 2797 3173 9026 9497 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 sp|P35613-4|BASI_HUMAN;sp|P35613-2|BASI_HUMAN;sp|P35613|BASI_HUMAN;sp|P35613-3|BASI_HUMAN 193;257;373;164 sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN Isoform 4 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613-2|BASI_HUMAN Isoform 2 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613|BASI_HUMAN Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG PE=1 SV=2;sp|P35613-3|BASI_HUMAN Isoform 3 of 0.887764 11.9955 3.02288E-12 114.19 92.066 114.19 0.308481 0 0.000357098 73.994 0.349165 0 7.45894E-10 103.03 0.887764 11.9955 3.02288E-12 114.19 0.432091 0 7.70463E-07 95.122 1 N DDAGSAPLKSSGQHQNDKGKNVRQRNSS___ X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(0.056)HQ(0.056)N(0.888)DK KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(-12)HQ(-12)N(12)DK 24 4 -0.2015 19876000 19876000 0 0 0.056875 0 0 0 0 0 0 0 19876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.27354 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19876000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 277 778 193 193 2416 2748 7915 8325 7915 8325 20190902_JH_WT_Ubi_2 7140 7915 8325 20190902_JH_WT_Ubi_2 7140 7915 8325 20190902_JH_WT_Ubi_2 7140 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN;sp|P35680|HNF1B_HUMAN 146;116;146;146 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN Isoform C of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN Isoform 4 of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN Isoform B of Hepatocyte nu 0.75 0 0.03186 40.012 6.6588 40.012 0.75 0 0.03186 40.012 N QHNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EVVDVTGLN(0.75)Q(0.75)SHLSQ(0.75)HLN(0.75)KGTPMK EVVDVTGLN(0)Q(0)SHLSQ(0)HLN(0)KGTPMK 9 3 1.0458 5605600 0 0 5605600 NaN 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 278 779 146 146 1149 1296 3668 3862 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN;sp|P35680|HNF1B_HUMAN 155;125;155;155 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN Isoform C of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN Isoform 4 of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN Isoform B of Hepatocyte nu 0.75 0 0.03186 40.012 6.6588 40.012 0.75 0 0.03186 40.012 N VDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX EVVDVTGLN(0.75)Q(0.75)SHLSQ(0.75)HLN(0.75)KGTPMK EVVDVTGLN(0)Q(0)SHLSQ(0)HLN(0)KGTPMK 18 3 1.0458 5605600 0 0 5605600 NaN 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 279 779 155 155 1149 1296 3668 3862 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 sp|P37802|TAGL2_HUMAN;sp|P37802-2|TAGL2_HUMAN 181;202 sp|P37802|TAGL2_HUMAN sp|P37802|TAGL2_HUMAN sp|P37802|TAGL2_HUMAN Transgelin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAGLN2 PE=1 SV=3;sp|P37802-2|TAGL2_HUMAN Isoform 2 of Transgelin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAGLN2 0.499968 0 0.0219184 61.353 23.332 61.353 0.499968 0 0.0219184 61.353 1 N QLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPR X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX NVIGLQ(0.5)MGTN(0.5)R N(-38.88)VIGLQ(0)MGTN(0)R 10 2 1.5445 14896000 14896000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 14896000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14896000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 280 796 181 181 3245 3706 10418 10962 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 sp|P38606-2|VATA_HUMAN;sp|P38606|VATA_HUMAN 126;159 sp|P38606-2|VATA_HUMAN sp|P38606-2|VATA_HUMAN sp|P38606-2|VATA_HUMAN Isoform 2 of V-type proton ATPase catalytic subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1A;sp|P38606|VATA_HUMAN V-type proton ATPase catalytic subunit A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP6V1A PE=1 SV=2 1 63.3021 0.00637904 63.302 15.57 63.302 1 63.3021 0.00637904 63.302 1 N GSHITGGDIYGIVSENSLIKHKIMLPPRNRG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VGSHITGGDIYGIVSEN(1)SLIK VGSHITGGDIYGIVSEN(63.3)SLIK 17 3 0.44365 1839500 1839500 0 0 NaN 1839500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1839500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 281 801 126 126 4839 5493 15526 16309 15526 16309 20190821_JH_EV_Ubi 11142 15526 16309 20190821_JH_EV_Ubi 11142 15526 16309 20190821_JH_EV_Ubi 11142 sp|P39687|AN32A_HUMAN 89 sp|P39687|AN32A_HUMAN sp|P39687|AN32A_HUMAN sp|P39687|AN32A_HUMAN Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANP32A PE=1 SV=1 0.969223 14.982 0.0256067 71.933 21.711 71.933 0.969223 14.982 0.0256067 71.933 1 N NRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX CPN(0.969)LTHLN(0.031)LSGNK CPN(14.98)LTHLN(-14.98)LSGN(-62.88)K 3 3 0.44418 6205500 6205500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6205500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6205500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 282 806 89 89 359 426 1198 1285 1198 1285 20190902_JH_WT_Ubi_3 8679 1198 1285 20190902_JH_WT_Ubi_3 8679 1198 1285 20190902_JH_WT_Ubi_3 8679 sp|P40222|TXLNA_HUMAN 8 sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN Alpha-taxilin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXLNA PE=1 SV=3 1 66.6919 0.0226637 66.692 7.7112 66.692 1 66.6919 0.0226637 66.692 3 N ________MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX KN(1)GAAKQ(1)SN(1)PK KN(66.69)GAAKQ(66.69)SN(66.69)PK 2 2 1.2118 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 283 808 8 8 2401 2730 7858 8262 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 sp|P40222|TXLNA_HUMAN 15 sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN Alpha-taxilin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXLNA PE=1 SV=3 1 66.6919 0.0226637 66.692 7.7112 66.692 1 66.6919 0.0226637 66.692 3 N _MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQPEAGPEGA X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KN(1)GAAKQ(1)SN(1)PK KN(66.69)GAAKQ(66.69)SN(66.69)PK 9 2 1.2118 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 284 808 15 15 2401 2730 7858 8262 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN;sp|P40763|STAT3_HUMAN 189;189;189 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN Isoform 3 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN Isoform Del-701 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P4076 0.993647 22.8393 1.46562E-17 151.28 107.43 151.28 0.396246 1.65946 0.000631488 89.011 0.982404 18.7756 0.017958 56.327 0.993647 22.8393 1.46562E-17 151.28 0.552959 0.492496 5.58003E-05 100.95 1;2;3 N FNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLE X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TLKSQGDMQ(0.005)DLN(0.994)GN(0.001)NQSVTR TLKSQ(-59.35)GDMQ(-22.84)DLN(22.84)GN(-30.54)N(-35.37)Q(-47.55)SVTR 12 3 -1.3659 2255800 1766300 489510 0 NaN 0 0 0 0 1766300 489510 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1766300 0 0 0 489510 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 285 812 189 189 4479 5079;5080;5081 14218;14219;14220;14221 14923;14924;14925;14926 14218 14923 20190902_JH_EV_Ubi_3 4825 14218 14923 20190902_JH_EV_Ubi_3 4825 14218 14923 20190902_JH_EV_Ubi_3 4825 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN;sp|P40763|STAT3_HUMAN 191;191;191 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN Isoform 3 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN Isoform Del-701 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P4076 0.774542 8.51373 5.58003E-05 100.95 59.625 56.327 0.774542 8.51373 0.017958 56.327 0.408556 0 5.58003E-05 100.95 3 N YKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQM X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX TLKSQ(0.874)GDMQ(0.139)DLN(0.982)GN(0.775)N(0.115)Q(0.115)SVTR TLKSQ(8.51)GDMQ(-8.51)DLN(18.78)GN(8.51)N(-8.51)Q(-8.51)SVTR 14 3 3.8285 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 286 812 191 191 4479 5079;5080;5081 14219;14220 14924;14925 14220 14925 20190821_JH_MUT_Ubi 3895 14221 14926 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5248 14221 14926 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5248 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN;sp|P40763|STAT3_HUMAN 192;192;192 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN Isoform 3 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN Isoform Del-701 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P4076 0.408556 0 5.58003E-05 100.95 59.625 100.95 0.408556 0 5.58003E-05 100.95 N KTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQML X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TLKSQGDMQ(0.499)DLN(0.553)GN(0.409)N(0.409)Q(0.131)SVTR TLKSQ(-33.78)GDMQ(-0.49)DLN(0.49)GN(0)N(0)Q(-4.96)SVTR 15 3 -2.0414 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 287 812 192 192 4479 5079;5080;5081 14221 14926 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5248 14221 14926 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5248 14221 14926 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5248 sp|P40939|ECHA_HUMAN 55 sp|P40939|ECHA_HUMAN sp|P40939|ECHA_HUMAN sp|P40939|ECHA_HUMAN Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHA PE=1 SV=2 0.9988 28.4829 0.0235283 55.452 8.1643 55.452 0.9988 28.4829 0.0235283 55.452 2 N HINYGVKGDVAVVRINSPNSKVNTLSKELHS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXX IN(0.999)SPN(0.154)SKVN(0.848)TLSK IN(28.48)SPN(-7.45)SKVN(7.45)TLSK 2 3 -0.9206 1356400 0 1356400 0 NaN 0 1356400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1356400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 288 818 55 55 2218 2527 7305 7683 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 sp|P40939|ECHA_HUMAN 62 sp|P40939|ECHA_HUMAN sp|P40939|ECHA_HUMAN sp|P40939|ECHA_HUMAN Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHA PE=1 SV=2 0.847674 7.44838 0.0235283 55.452 8.1643 55.452 0.847674 7.44838 0.0235283 55.452 2 N GDVAVVRINSPNSKVNTLSKELHSEFSEVMN X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX IN(0.999)SPN(0.154)SKVN(0.848)TLSK IN(28.48)SPN(-7.45)SKVN(7.45)TLSK 9 3 -0.9206 1356400 0 1356400 0 NaN 0 1356400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1356400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 289 818 62 62 2218 2527 7305 7683 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 7305 7683 20190821_JH_MUT_Ubi 5932 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN;sp|P42356|PI4KA_HUMAN 183;1431 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA;sp|P42356|PI4KA_HUMAN Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA PE=1 SV=4 0.666667 0 0.011798 56.488 8.7744 56.488 0.666667 0 0.011798 56.488 2 N SDKKYLTASQLVPPDNQDTRSNLDITVGSRQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FWTAMFSDKKYLTASQ(0.667)LVPPDN(0.667)Q(0.667)DTR FWTAMFSDKKYLTASQ(0)LVPPDN(0)Q(0)DTR 22 3 2.761 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 290 830 183 183 1342 1523 4234 4452 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 sp|P42566-2|EPS15_HUMAN;sp|P42566|EPS15_HUMAN 489;803 sp|P42566-2|EPS15_HUMAN sp|P42566-2|EPS15_HUMAN sp|P42566-2|EPS15_HUMAN Isoform 2 of Epidermal growth factor receptor substrate 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS15;sp|P42566|EPS15_HUMAN Epidermal growth factor receptor substrate 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS15 PE=1 SV=2 0.970303 18.1522 1.79083E-06 118.54 36.508 118.54 0.970303 18.1522 1.79083E-06 118.54 1 N KRSINKLDSPDPFKLNDPFQPFPGNDSPKEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K) XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX LDSPDPFKLN(0.97)DPFQ(0.015)PFPGN(0.015)DSPK LDSPDPFKLN(18.15)DPFQ(-18.15)PFPGN(-18.15)DSPK 10 3 1.5514 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 291 831 489 489 2537 2882 8244 8668 8244 8668 20190821_JH_MUT_Ubi 12272 8244 8668 20190821_JH_MUT_Ubi 12272 8244 8668 20190821_JH_MUT_Ubi 12272 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN;sp|P43003|EAA1_HUMAN 485;530 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN Isoform 2 of Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3;sp|P43003|EAA1_HUMAN Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3 PE=1 SV=1 0.48865 0 8.60391E-06 94.973 68.231 94.973 0.48865 0 8.60391E-06 94.973 N EENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM___ X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX PYQ(0.023)LIAQ(0.489)DN(0.489)ETEKPIDSETKM PYQ(-13.33)LIAQ(0)DN(0)ETEKPIDSETKM 9 3 1.4099 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 292 836 485 485 3593 4100;4101 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 sp|P43007|SATT_HUMAN 5 sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN Neutral amino acid transporter A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A4 PE=1 SV=1 0.795102 5.88929 2.14563E-17 121.62 98.641 84.905 0.614141 2.01952 2.14563E-17 121.62 0.795102 5.88929 2.33307E-06 84.905 0.608253 1.71373 9.95514E-05 101 1;2 N ___________MEKSNETNGYLDSAQAGPAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MEKSN(0.795)ETN(0.205)GYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGR MEKSN(5.89)ETN(-5.89)GYLDSAQ(-45.85)AGPAAGPGAPGTAAGR 5 3 -1.2667 14113000 14113000 0 0 NaN 6785700 0 0 7327000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 6785700 0 0 0 0 0 0 0 0 7327000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 293 837 5 5 2901 3293;3294;3295 9348;9349;9356 9841;9842;9849 9349 9842 20190902_JH_EV_Ubi_2 8448 9348 9841 20190821_JH_EV_Ubi 8393 9348 9841 20190821_JH_EV_Ubi 8393 sp|P43007|SATT_HUMAN 8 sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN Neutral amino acid transporter A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A4 PE=1 SV=1 0.993355 21.7459 2.4347E-61 184.93 159.25 184.93 0.986451 18.6226 2.63744E-40 159.86 0.499264 0 3.51885E-06 83.647 0.993355 21.7459 2.4347E-61 184.93 0.685622 3.38632 5.14571E-50 174.55 0.947962 12.5917 1.36492E-24 138.12 1;2 N ________MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPG X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MEKSN(0.007)ETN(0.993)GYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGR MEKSN(-21.75)ETN(21.75)GYLDSAQ(-71.92)AGPAAGPGAPGTAAGR 8 3 -1.6026 19182000 17295000 1886600 0 NaN 0 4747100 0 0 6820900 6198500 0 0 1415500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 4747100 0 0 0 0 0 0 0 0 6349900 471080 0 6198500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1415500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 294 837 8 8 2901 3293;3294;3295 9351;9352;9353;9354;9355 9844;9845;9846;9847;9848 9351 9844 20190902_JH_EV_Ubi_3 8398 9351 9844 20190902_JH_EV_Ubi_3 8398 9351 9844 20190902_JH_EV_Ubi_3 8398 sp|P43235|CATK_HUMAN 315 sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN Cathepsin K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTSK PE=1 SV=1 0.690308 0.78999 0.0160051 54.09 18.999 54.09 0.690308 0.78999 0.0160051 54.09 3 N ENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM_ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.629)KN(0.69)N(0.826)ACGIAN(0.856)LASFPK N(-0.79)KN(0.79)N(3.28)ACGIAN(4.1)LASFPK 3 3 2.3484 2635100 0 0 2635100 NaN 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 295 840 315 315 3116 3563 10033 10568 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 sp|P43235|CATK_HUMAN 316 sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN Cathepsin K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTSK PE=1 SV=1 0.825607 3.284 0.0160051 54.09 18.999 54.09 0.825607 3.284 0.0160051 54.09 3 N NWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM__ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.629)KN(0.69)N(0.826)ACGIAN(0.856)LASFPK N(-0.79)KN(0.79)N(3.28)ACGIAN(4.1)LASFPK 4 3 2.3484 2635100 0 0 2635100 NaN 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 296 840 316 316 3116 3563 10033 10568 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 sp|P43235|CATK_HUMAN 322 sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN sp|P43235|CATK_HUMAN Cathepsin K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTSK PE=1 SV=1 0.855559 4.10239 0.0160051 54.09 18.999 54.09 0.855559 4.10239 0.0160051 54.09 3 N YILMARNKNNACGIANLASFPKM________ X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX N(0.629)KN(0.69)N(0.826)ACGIAN(0.856)LASFPK N(-0.79)KN(0.79)N(3.28)ACGIAN(4.1)LASFPK 10 3 2.3484 2635100 0 0 2635100 NaN 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2635100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 297 840 322 322 3116 3563 10033 10568 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 10033 10568 20190821_JH_EV_Ubi 6211 sp|P43243|MATR3_HUMAN;sp|P43243-2|MATR3_HUMAN 755;467 sp|P43243|MATR3_HUMAN sp|P43243|MATR3_HUMAN sp|P43243|MATR3_HUMAN Matrin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MATR3 PE=1 SV=2;sp|P43243-2|MATR3_HUMAN Isoform 2 of Matrin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MATR3 0.49886 3.80171 0.00638922 58.626 46.784 58.626 0.49886 3.80171 0.00638922 58.626 N NTEPGAESSENADDPNKDTSENADGQSDENK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP NEENTEPGAESSEN(0.053)ADDPN(0.499)KDTSEN(0.164)ADGQ(0.231)SDEN(0.053)K N(-36.67)EEN(-33.43)TEPGAESSEN(-9.73)ADDPN(3.8)KDTSEN(-4.96)ADGQ(-3.8)SDEN(-12.25)K 19 3 4.2485 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 298 841 755 755 3032 3465 9783 10306 20190902_JH_WT_Ubi_3 5758 9783 10306 20190902_JH_WT_Ubi_3 5758 9783 10306 20190902_JH_WT_Ubi_3 5758 sp|P43243|MATR3_HUMAN;sp|P43243-2|MATR3_HUMAN 761;473 sp|P43243|MATR3_HUMAN sp|P43243|MATR3_HUMAN sp|P43243|MATR3_HUMAN Matrin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MATR3 PE=1 SV=2;sp|P43243-2|MATR3_HUMAN Isoform 2 of Matrin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MATR3 0.48797 3.44203 0.0301556 42.843 25.668 42.843 0.48797 3.44203 0.0301556 42.843 N ESSENADDPNKDTSENADGQSDENKDDYTIP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX N(0.001)EEN(0.001)TEPGAESSEN(0.048)ADDPN(0.222)KDTSEN(0.488)ADGQ(0.157)SDEN(0.084)K N(-29.8)EEN(-25.89)TEPGAESSEN(-10.05)ADDPN(-3.44)KDTSEN(3.44)ADGQ(-5.32)SDEN(-8.58)K 25 3 4.14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 299 841 761 761 3032 3465 9784 10307 20190902_JH_WT_Ubi_3 5765 9784 10307 20190902_JH_WT_Ubi_3 5765 9784 10307 20190902_JH_WT_Ubi_3 5765 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN;sp|P45974|UBP5_HUMAN 364;364 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN Isoform Short of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5;sp|P45974|UBP5_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5 PE=1 SV=2 0.494464 0 3.55382E-05 94.564 56.94 92.136 0.494464 0 5.02959E-05 92.136 0.492468 0 3.55382E-05 94.564 N DFQRKYVDKLEKIFQNAPTDPTQDFSTQVAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LEKIFQ(0.494)N(0.494)APTDPTQ(0.011)DFSTQVAK LEKIFQ(0)N(0)APTDPTQ(-16.52)DFSTQ(-38.88)VAK 7 3 0.98981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 300 849 364 364 2569 2920 8349 8778 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10871 8350 8779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9860 8350 8779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9860 sp|P46013-2|KI67_HUMAN;sp|P46013|KI67_HUMAN 478;838 sp|P46013-2|KI67_HUMAN sp|P46013-2|KI67_HUMAN sp|P46013-2|KI67_HUMAN Isoform Short of Proliferation marker protein Ki-67 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKI67;sp|P46013|KI67_HUMAN Proliferation marker protein Ki-67 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKI67 PE=1 SV=2 0.608343 1.8769 0.0211809 60.364 23.183 60.364 0.608343 1.8769 0.0211809 60.364 N KCSASPPLRRQCIRENGNVAKTPRNTYKMTS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX Q(0.397)CIREN(0.608)GN(0.995)VAKTPR Q(-1.88)CIREN(1.88)GN(20.85)VAKTPR 6 3 3.3289 497220 0 497220 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 497220 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 497220 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 301 850 478 478 3608 4117 11606 12183 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 sp|P46013-2|KI67_HUMAN;sp|P46013|KI67_HUMAN 480;840 sp|P46013-2|KI67_HUMAN sp|P46013-2|KI67_HUMAN sp|P46013-2|KI67_HUMAN Isoform Short of Proliferation marker protein Ki-67 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKI67;sp|P46013|KI67_HUMAN Proliferation marker protein Ki-67 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MKI67 PE=1 SV=2 0.995044 20.8546 0.0211809 60.364 23.183 60.364 0.995044 20.8546 0.0211809 60.364 N SASPPLRRQCIRENGNVAKTPRNTYKMTSLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX Q(0.397)CIREN(0.608)GN(0.995)VAKTPR Q(-1.88)CIREN(1.88)GN(20.85)VAKTPR 8 3 3.3289 497220 0 497220 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 497220 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 497220 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 302 850 480 480 3608 4117 11606 12183 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 11606 12183 20190902_JH_WT_Ubi_2 11988 sp|P46940|IQGA1_HUMAN 699 sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IQGAP1 PE=1 SV=1 0.681984 6.33547 0.0060025 56.57 38.689 56.57 0.681984 6.33547 0.0060025 56.57 1 N KWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GGYYYYHN(0.682)LETQ(0.125)EGGWDEPPN(0.159)FVQ(0.021)N(0.009)SMQ(0.005)LSR GGYYYYHN(6.34)LETQ(-7.38)EGGWDEPPN(-6.34)FVQ(-15.15)N(-18.88)SMQ(-21.18)LSR 8 3 4.4718 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 303 863 699 699 1507 1719 4838 5089 4838 5089 20190821_JH_WT_Ubi 11017 4838 5089 20190821_JH_WT_Ubi 11017 4838 5089 20190821_JH_WT_Ubi 11017 sp|P46940|IQGA1_HUMAN 712 sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IQGAP1 PE=1 SV=1 0.563485 4.34795 3.16835E-07 114.03 92.416 114.03 0.563485 4.34795 3.16835E-07 114.03 1 N YHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQLSREEIQS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX GGYYYYHN(0.049)LETQ(0.131)EGGWDEPPN(0.563)FVQ(0.049)N(0.207)SMQ(0.001)LSR GGYYYYHN(-10.62)LETQ(-6.34)EGGWDEPPN(4.35)FVQ(-10.62)N(-4.35)SMQ(-29.14)LSR 21 3 2.1706 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 304 863 712 712 1507 1719 4839 5090 4839 5090 20190902_JH_WT_Ubi_2 12775 4839 5090 20190902_JH_WT_Ubi_2 12775 4839 5090 20190902_JH_WT_Ubi_2 12775 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 5 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 1 83.8702 4.83983E-19 173.06 119.73 173.06 1 83.8702 4.83983E-19 173.06 2 N ___________MATANGAVENGQPDRKPPAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXX ATAN(1)GAVEN(0.98)GQ(0.02)PDR ATAN(83.87)GAVEN(16.97)GQ(-16.97)PDR 4 2 1.7941 7359900 0 7359900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7359900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7359900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 305 865 5 5 293 343 990 1073 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 10 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 0.980325 16.9745 4.83983E-19 173.06 119.73 173.06 0.980325 16.9745 4.83983E-19 173.06 2 N ______MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX ATAN(1)GAVEN(0.98)GQ(0.02)PDR ATAN(83.87)GAVEN(16.97)GQ(-16.97)PDR 9 2 1.7941 7359900 0 7359900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7359900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7359900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 306 865 10 10 293 343 990 1073 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 990 1073 20190902_JH_WT_Ubi_2 8078 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 251 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 0.885471 6.35584 0.0143417 49.662 24.641 49.662 0.885471 6.35584 0.0143417 49.662 2 N FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX EAGFPPGVVN(0.505)IVPGFGPTVGAAISSHPQ(0.609)IN(0.885)K EAGFPPGVVN(-1.03)IVPGFGPTVGAAISSHPQ(1.03)IN(6.36)K 30 3 2.4641 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 307 865 251 251 790 895 2485 2617 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 sp|P49642|PRI1_HUMAN 61 sp|P49642|PRI1_HUMAN sp|P49642|PRI1_HUMAN sp|P49642|PRI1_HUMAN DNA primase small subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRIM1 PE=1 SV=1 1 41.3995 0.0368127 41.399 21.409 41.399 1 41.3995 0.0368127 41.399 4 N SFTLKDDIYIRYQSFNNQSDLEKEMQKMNPY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX YQ(1)SFN(1)N(1)Q(1)SDLEK YQ(41.4)SFN(41.4)N(41.4)Q(41.4)SDLEK 5 2 -0.26971 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 308 890 61 61 5197 5915 16774 17633 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 sp|P49642|PRI1_HUMAN 62 sp|P49642|PRI1_HUMAN sp|P49642|PRI1_HUMAN sp|P49642|PRI1_HUMAN DNA primase small subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRIM1 PE=1 SV=1 1 41.3995 0.0368127 41.399 21.409 41.399 1 41.3995 0.0368127 41.399 4 N FTLKDDIYIRYQSFNNQSDLEKEMQKMNPYK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX YQ(1)SFN(1)N(1)Q(1)SDLEK YQ(41.4)SFN(41.4)N(41.4)Q(41.4)SDLEK 6 2 -0.26971 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 309 890 62 62 5197 5915 16774 17633 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 16774 17633 20190821_JH_EV_Ubi 3376 sp|P49792|RBP2_HUMAN 1311 sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN E3 SUMO-protein ligase RanBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP2 PE=1 SV=2 1 41.8708 0.0258496 41.871 10.256 41.871 1 41.8708 0.0258496 41.871 3 N CKFEEAQSILKAPGTNVAMASNQAVRIVKEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX APGTN(1)VAMASN(1)Q(1)AVRIVK APGTN(41.87)VAMASN(41.87)Q(41.87)AVRIVK 5 3 0.44952 1204000 0 0 1204000 NaN 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 310 896 1311 1311 240 279 814 886 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 sp|P49792|RBP2_HUMAN 1317 sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN E3 SUMO-protein ligase RanBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP2 PE=1 SV=2 1 41.8708 0.0258496 41.871 10.256 41.871 1 41.8708 0.0258496 41.871 3 N QSILKAPGTNVAMASNQAVRIVKEPTSHDNK X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX APGTN(1)VAMASN(1)Q(1)AVRIVK APGTN(41.87)VAMASN(41.87)Q(41.87)AVRIVK 11 3 0.44952 1204000 0 0 1204000 NaN 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 311 896 1317 1317 240 279 814 886 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 sp|P50443|S26A2_HUMAN 10 sp|P50443|S26A2_HUMAN sp|P50443|S26A2_HUMAN sp|P50443|S26A2_HUMAN Sulfate transporter OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A2 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0195323 90.697 42.129 90.697 0.5 0 0.0195323 90.697 1 N ______MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSYPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SSESKEQ(0.5)HN(0.5)VSPR SSESKEQ(0)HN(0)VSPR 9 3 1.2514 1284000 1284000 0 0 0.018201 0 0 0 1284000 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.052081 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1284000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 312 905 10 10 4151 4718 13165 13806 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 sp|P51114|FXR1_HUMAN;sp|P51114-2|FXR1_HUMAN;sp|P51114-3|FXR1_HUMAN 240;240;155 sp|P51114|FXR1_HUMAN sp|P51114|FXR1_HUMAN sp|P51114|FXR1_HUMAN Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FXR1 PE=1 SV=3;sp|P51114-2|FXR1_HUMAN Isoform 2 of Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FXR1;sp|P51114-3|F 0.999867 38.5047 0.0277032 73.593 11.216 73.593 0.999867 38.5047 0.0277032 73.593 2 N VREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EDLMGLAIGTHGSN(1)IQ(0.946)Q(0.054)AR EDLMGLAIGTHGSN(38.5)IQ(12.41)Q(-12.41)AR 14 3 -1.3226 12422000 0 12422000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12422000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12422000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 313 914 240 240 822 928 2576 2711 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 sp|P51148|RAB5C_HUMAN;sp|P51148-2|RAB5C_HUMAN 11;44 sp|P51148|RAB5C_HUMAN sp|P51148|RAB5C_HUMAN sp|P51148|RAB5C_HUMAN Ras-related protein Rab-5C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB5C PE=1 SV=2;sp|P51148-2|RAB5C_HUMAN Isoform 2 of Ras-related protein Rab-5C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB5C 0.999859 38.5157 0.0242561 79.283 43.845 79.283 0.999859 38.5157 0.0242561 79.283 1 N _____MAGRGGAARPNGPAAGNKICQFKLVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GGAARPN(1)GPAAGNK GGAARPN(38.52)GPAAGN(-38.52)K 7 3 0.88391 1289100 1289100 0 0 NaN 0 1289100 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1289100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 314 915 11 11 1469 1672 4670 4906 4670 4906 20190821_JH_MUT_Ubi 2357 4670 4906 20190821_JH_MUT_Ubi 2357 4670 4906 20190821_JH_MUT_Ubi 2357 sp|P51648|AL3A2_HUMAN;sp|P51648-2|AL3A2_HUMAN 367;367 sp|P51648|AL3A2_HUMAN sp|P51648|AL3A2_HUMAN sp|P51648|AL3A2_HUMAN Fatty aldehyde dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH3A2 PE=1 SV=1;sp|P51648-2|AL3A2_HUMAN Isoform 2 of Fatty aldehyde dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH3A2 1 79.2014 0.0212711 79.201 36.807 79.201 1 79.2014 0.0212711 79.201 1 N INEREKPLALYVFSHNHKLIKRMIDETSSGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX PLALYVFSHN(1)HK PLALYVFSHN(79.2)HK 10 3 -0.043427 3789000 3789000 0 0 0.10155 0 0 0 0 0 0 0 3789000 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.24981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3789000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 315 922 367 367 3409 3891 10920 11484 10920 11484 20190902_JH_WT_Ubi_2 9913 10920 11484 20190902_JH_WT_Ubi_2 9913 10920 11484 20190902_JH_WT_Ubi_2 9913 sp|P51826|AFF3_HUMAN;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN 188;213 sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 PE=1 SV=2;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN Isoform 2 of AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 0.763786 0.34652 0.0347404 41.202 15.694 41.202 0.763786 0.34652 0.0347404 41.202 4 N GDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMA X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX Q(0.744)Q(0.744)PRAKQ(0.744)VCN(0.764)VEVGLQ(0.006)TQ(0.997)ER Q(0)Q(0)PRAKQ(0)VCN(0.35)VEVGLQ(-26.11)TQ(26.43)ER 10 3 1.2386 1900000 0 0 1900000 NaN 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 316 927 188 188 3691 4202 11762 12343 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 sp|P52948-4|NUP98_HUMAN;sp|P52948-3|NUP98_HUMAN;sp|P52948-6|NUP98_HUMAN;sp|P52948-2|NUP98_HUMAN;sp|P52948-5|NUP98_HUMAN;sp|P52948|NUP98_HUMAN 627;644;644;627;627;644 sp|P52948-4|NUP98_HUMAN sp|P52948-4|NUP98_HUMAN sp|P52948-4|NUP98_HUMAN Isoform 4 of Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP98;sp|P52948-3|NUP98_HUMAN Isoform 3 of Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP98;sp|P52948-6|NUP98_HUMAN Isoform 6 0.619507 5.32981 0.00462766 44.365 24.729 44.365 0.619507 5.32981 0.00462766 44.365 1 N ENGERFSFLSKPVDENHQQDGDEDSLVSHFY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FSFLSKPVDEN(0.62)HQ(0.182)Q(0.182)DGDEDSLVSHFYTN(0.017)PIAK FSFLSKPVDEN(5.33)HQ(-5.33)Q(-5.33)DGDEDSLVSHFYTN(-15.96)PIAK 11 4 2.078 2510000 2510000 0 0 NaN 0 0 2510000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 317 943 627 627 1295 1467 4087 4297 4087 4297 20190821_JH_WT_Ubi 10907 4087 4297 20190821_JH_WT_Ubi 10907 4087 4297 20190821_JH_WT_Ubi 10907 sp|P53582|MAP11_HUMAN 185 sp|P53582|MAP11_HUMAN sp|P53582|MAP11_HUMAN sp|P53582|MAP11_HUMAN Methionine aminopeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=METAP1 PE=1 SV=2 0.986575 18.7778 0.029915 56.956 33.124 56.956 0.986575 18.7778 0.029915 56.956 1 N VHLACIARNCYPSPLNYYNFPKSCCTSVNEV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX NCYPSPLN(0.987)YYN(0.013)FPK N(-34.46)CYPSPLN(18.78)YYN(-18.78)FPK 8 3 -2.5368 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 318 947 185 185 3016 3447 9738 10259 9738 10259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11798 9738 10259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11798 9738 10259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11798 sp|P53621|COPA_HUMAN;sp|P53621-2|COPA_HUMAN 304;304 sp|P53621|COPA_HUMAN sp|P53621|COPA_HUMAN sp|P53621|COPA_HUMAN Coatomer subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPA PE=1 SV=2;sp|P53621-2|COPA_HUMAN Isoform 2 of Coatomer subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPA 0.972236 15.4428 4.88548E-06 113.73 68.688 113.73 0.972236 15.4428 4.88548E-06 113.73 1 N RDHDRFWVLAAHPNLNLFAAGHDGGMIVFKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX FWVLAAHPN(0.028)LN(0.972)LFAAGHDGGMIVFK FWVLAAHPN(-15.44)LN(15.44)LFAAGHDGGMIVFK 11 3 3.5205 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 319 950 304 304 1343 1524 4235 4453 4235 4453 20190821_JH_WT_Ubi 13276 4235 4453 20190821_JH_WT_Ubi 13276 4235 4453 20190821_JH_WT_Ubi 13276 sp|P53794|SC5A3_HUMAN 633 sp|P53794|SC5A3_HUMAN sp|P53794|SC5A3_HUMAN sp|P53794|SC5A3_HUMAN Sodium/myo-inositol cotransporter OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC5A3 PE=1 SV=2 0.563308 1.10856 0.0033401 44.477 6.0911 44.477 0.563308 1.10856 0.0033401 44.477 1 N SLGHSEAETPVDAYSNGQAALMGEKERKKET X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX EEGNPVASLGHSEAETPVDAYSN(0.563)GQ(0.436)AALMGEKER EEGN(-32.92)PVASLGHSEAETPVDAYSN(1.11)GQ(-1.11)AALMGEKER 23 4 -1.3932 1149900 1149900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1149900 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1149900 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 320 954 633 633 854 964 2693 2833 2693 2833 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8859 2693 2833 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8859 2693 2833 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8859 sp|P53985|MOT1_HUMAN 475 sp|P53985|MOT1_HUMAN sp|P53985|MOT1_HUMAN sp|P53985|MOT1_HUMAN Monocarboxylate transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC16A1 PE=1 SV=3 1 64.3463 3.85528E-07 98.957 68.305 64.346 0.999978 46.8668 3.85528E-07 98.957 0.997191 25.5931 0.0012932 78.057 1 64.3463 0.035994 64.346 1 89.9924 0.0204021 89.992 1 N ESKEEETSIDVAGKPNEVTKAAESPDQKDTD X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX ESKEEETSIDVAGKPN(1)EVTK ESKEEETSIDVAGKPN(64.35)EVTK 16 3 1.8878 9192000 9192000 0 0 0.0086845 1011300 438360 0 0 0 0 0 0 0 0.0070725 0.012934 0 0 0 0 0 0 0 1011300 0 0 438360 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 321 955 475 475 845;846;1097 954;955;1237 2661;2662;2664;3497 2801;2802;2804;3674 3497 3674 20190902_JH_EV_Ubi_3 5369 2662 2802 20190821_JH_EV_Ubi 5909 2662 2802 20190821_JH_EV_Ubi 5909 sp|P55084-2|ECHB_HUMAN;sp|P55084|ECHB_HUMAN 396;418 sp|P55084-2|ECHB_HUMAN sp|P55084-2|ECHB_HUMAN sp|P55084-2|ECHB_HUMAN Isoform 2 of Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB;sp|P55084|ECHB_HUMAN Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB PE=1 SV=3 0.806464 6.19822 0.000248599 88.319 30.16 88.319 0.806464 6.19822 0.000248599 88.319 1 N MGRKTKVGLPPLEKFNNWGGSLSLGHPFGAT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP FN(0.806)N(0.194)WGGSLSLGHPFGATGCR FN(6.2)N(-6.2)WGGSLSLGHPFGATGCR 2 3 -2.8991 5872800 5872800 0 0 0.076438 0 0 0 0 0 0 0 5872800 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0.56713 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5872800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 322 975 396 396 1275 1444 4044 4252 4044 4252 20190902_JH_WT_Ubi_2 12759 4044 4252 20190902_JH_WT_Ubi_2 12759 4044 4252 20190902_JH_WT_Ubi_2 12759 sp|P55084-2|ECHB_HUMAN;sp|P55084|ECHB_HUMAN 397;419 sp|P55084-2|ECHB_HUMAN sp|P55084-2|ECHB_HUMAN sp|P55084-2|ECHB_HUMAN Isoform 2 of Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB;sp|P55084|ECHB_HUMAN Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB PE=1 SV=3 0.837457 7.11996 0.000169115 93.342 44.443 93.342 0.837457 7.11996 0.000169115 93.342 1 N GRKTKVGLPPLEKFNNWGGSLSLGHPFGATG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP FN(0.163)N(0.837)WGGSLSLGHPFGATGCR FN(-7.12)N(7.12)WGGSLSLGHPFGATGCR 3 3 0.30974 3374700 3374700 0 0 0.043924 0 0 0 0 0 0 0 0 3374700 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0.24162 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3374700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 323 975 397 397 1275 1444 4045 4253 4045 4253 20190902_JH_WT_Ubi_3 12240 4045 4253 20190902_JH_WT_Ubi_3 12240 4045 4253 20190902_JH_WT_Ubi_3 12240 sp|P55157|MTP_HUMAN 319 sp|P55157|MTP_HUMAN sp|P55157|MTP_HUMAN sp|P55157|MTP_HUMAN Microsomal triglyceride transfer protein large subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTTP PE=1 SV=1 1 83.0814 0.0165099 83.081 17.735 83.081 1 83.0814 0.0165099 83.081 2 N LSELWRSTRKYLQPDNLSKAEAVRNFLAFIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX STRKYLQ(1)PDN(1)LSK STRKYLQ(83.08)PDN(83.08)LSK 10 2 2.2017 26108000 0 26108000 0 NaN 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 324 978 319 319 4197 4767 13301 13954 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 sp|P56559|ARL4C_HUMAN;sp|P56559-2|ARL4C_HUMAN 36;36 sp|P56559|ARL4C_HUMAN sp|P56559|ARL4C_HUMAN sp|P56559|ARL4C_HUMAN ADP-ribosylation factor-like protein 4C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARL4C PE=1 SV=1;sp|P56559-2|ARL4C_HUMAN Isoform 2 of ADP-ribosylation factor-like protein 4C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARL4C 0.737215 4.48461 0.0340009 44.468 9.8185 44.468 0.737215 4.48461 0.0340009 44.468 1 N LDSAGKTTVLYRLKFNEFVNTVPTIGFNTEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LKFN(0.737)EFVN(0.263)TVPTIGFNTEKIK LKFN(4.48)EFVN(-4.48)TVPTIGFN(-36.78)TEKIK 4 4 2.4183 7118100 7118100 0 0 NaN 0 0 7118100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 7118100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 325 989 36 36 2666 3031 8670 9116 8670 9116 20190821_JH_WT_Ubi 13118 8670 9116 20190821_JH_WT_Ubi 13118 8670 9116 20190821_JH_WT_Ubi 13118 sp|P60174|TPIS_HUMAN;sp|P60174-1|TPIS_HUMAN 109;72 sp|P60174|TPIS_HUMAN sp|P60174|TPIS_HUMAN sp|P60174|TPIS_HUMAN Triosephosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPI1 PE=1 SV=3;sp|P60174-1|TPIS_HUMAN Isoform 2 of Triosephosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPI1 1 101.452 7.96965E-20 144.33 108.34 101.45 0.999675 35.1002 7.96965E-20 144.33 0.99999 50.882 2.90505E-19 136.96 1 101.452 0.0003114 101.45 1 N DPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX VTN(1)GAFTGEISPGMIK VTN(101.45)GAFTGEISPGMIK 3 2 -0.27761 15387000 15387000 0 0 NaN 0 0 3195700 0 0 0 0 2198600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3195700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2198600 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 326 997 109 109 2069;5031 2365;5713 6870;6871;16228 7233;7234;17059 16228 17059 20190902_JH_WT_Ubi_3 10305 6870 7233 20190821_JH_WT_Ubi 9421 6870 7233 20190821_JH_WT_Ubi 9421 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN 280;280 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1 0.957928 15.1327 0.0138746 48.913 32.302 47.546 0.957928 15.1327 0.0184066 47.546 0.883188 9.83427 0.0138746 48.913 1 N SFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX CPEALFQ(0.042)PSFLGMESCGIHETTFN(0.958)SIMK CPEALFQ(-15.13)PSFLGMESCGIHETTFN(15.13)SIMK 24 3 -0.68561 20490000 20490000 0 0 0.62301 0 0 0 0 0 2591100 0 0 17899000 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN 4.117 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2591100 0 0 0 0 0 0 0 0 17899000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 327 1000;1087 280;280 280 356 420;421 1189;1190 1276;1277 1189 1276 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14353 1190 1277 20190902_JH_WT_Ubi_3 14701 1190 1277 20190902_JH_WT_Ubi_3 14701 sp|P60709|ACTB_HUMAN 12 sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1 1 146.787 1.27943E-14 146.79 113.38 146.79 1 146.787 1.27943E-14 146.79 N ____MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX DDDIAALVVDN(1)GSGMCK DDDIAALVVDN(146.79)GSGMCK 11 2 -0.52553 20750000 20750000 0 0 49.897 0 0 0 0 0 0 0 0 20750000 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20750000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 328 1000 12 12 410 483 1336 1426 1336 1426 20190902_JH_WT_Ubi_3 15376 1336 1426 20190902_JH_WT_Ubi_3 15376 1336 1426 20190902_JH_WT_Ubi_3 15376 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN 296;296 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1 1 56.7483 2.04799E-10 127.05 82.623 56.748 1 127.049 2.04799E-10 127.05 1 56.7483 0.0216106 56.748 1 N SIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIAD X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DLYAN(1)TVLSGGTTMYPGIADR DLYAN(56.75)TVLSGGTTMYPGIADR 5 3 0.41824 12805000 12805000 0 0 0.01872 0 0 3569400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.024235 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3569400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.074856 0.080912 13.53 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.14345 0.16748 12.66 NaN NaN NaN 329 1000;1087 296;296 296 608 697;698 1925;1926 2043;2044 1926 2044 20190902_JH_WT_Ubi_2 13900 1925 2043 20190821_JH_WT_Ubi 14067 1925 2043 20190821_JH_WT_Ubi 14067 sp|P60981|DEST_HUMAN;sp|P60981-2|DEST_HUMAN 138;121 sp|P60981|DEST_HUMAN sp|P60981|DEST_HUMAN sp|P60981|DEST_HUMAN Destrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSTN PE=1 SV=3;sp|P60981-2|DEST_HUMAN Isoform 2 of Destrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DSTN 0.999944 42.5565 0.00505604 96.756 70.097 96.756 0.999944 42.5565 0.00505604 96.756 1 N AIKKKFQGIKHECQANGPEDLNRACIAEKLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX HECQAN(1)GPEDLNR HECQ(-42.56)AN(42.56)GPEDLN(-65.05)R 6 3 0.20412 540320 540320 0 0 NaN 0 0 540320 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 540320 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 330 1006 138 138 1805 2048 5744 6048 5744 6048 20190821_JH_WT_Ubi 3806 5744 6048 20190821_JH_WT_Ubi 3806 5744 6048 20190821_JH_WT_Ubi 3806 sp|P61081|UBC12_HUMAN 42 sp|P61081|UBC12_HUMAN sp|P61081|UBC12_HUMAN sp|P61081|UBC12_HUMAN NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBE2M PE=1 SV=1 0.988882 21.6219 0.0027061 69.27 30.337 69.27 0.988882 21.6219 0.0027061 69.27 1 N ASAAQLRIQKDINELNLPKTCDISFSDPDDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DIN(0.007)ELN(0.989)LPKTCDISFSDPDDLLN(0.004)FK DIN(-21.62)ELN(21.62)LPKTCDISFSDPDDLLN(-23.7)FK 6 3 2.0653 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 331 1011 42 42 540 623 1733 1838 1733 1838 20190902_JH_WT_Ubi_3 15271 1733 1838 20190902_JH_WT_Ubi_3 15271 1733 1838 20190902_JH_WT_Ubi_3 15271 sp|P84077|ARF1_HUMAN;sp|P61204|ARF3_HUMAN;sp|P84085|ARF5_HUMAN;sp|P18085|ARF4_HUMAN 84;84;84;84 sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN ADP-ribosylation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF1 PE=1 SV=2;sp|P61204|ARF3_HUMAN ADP-ribosylation factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF3 PE=1 SV=2;sp|P84085|ARF5_HUMAN ADP-ribosylation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF5 0.382427 0 0.000236355 109.04 51.753 109.04 0.382427 0 0.000236355 109.04 0.333333 0 0.000960872 100.04 N GGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRER X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HYFQ(0.382)N(0.382)TQ(0.235)GLIFVVDSNDR HYFQ(0)N(0)TQ(-2.11)GLIFVVDSN(-62.5)DR 5 3 2.554 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 332 1018 84 84 2047;2048 2341;2343 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 sp|P84077|ARF1_HUMAN;sp|P61204|ARF3_HUMAN;sp|P84085|ARF5_HUMAN;sp|P18085|ARF4_HUMAN 95;95;95;95 sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN ADP-ribosylation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF1 PE=1 SV=2;sp|P61204|ARF3_HUMAN ADP-ribosylation factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF3 PE=1 SV=2;sp|P84085|ARF5_HUMAN ADP-ribosylation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF5 1 79.4996 4.9558E-30 171.25 106.67 118.31 1 79.4996 4.9558E-30 171.25 0.998681 33.5633 0.0136096 63.374 0.897183 9.59644 0.000397974 92.474 0.998388 32.6904 1.59022E-06 120.9 1 N HYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX HYFQNTQGLIFVVDSN(1)DR HYFQ(-79.5)N(-79.5)TQ(-79.5)GLIFVVDSN(79.5)DR 16 3 1.1151 18942000 18942000 0 0 0.082487 0 0 3669200 0 0 0 679590 0 2058100 0 0 0.044745 0 0 0 0.046572 0 0.062151 0 0 0 0 0 0 3669200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 679590 0 0 0 0 0 2058100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 333 1018 95 95 2047;2048 2341;2343 6802;6803;6805;6813;6814;6815 7158;7159;7161;7170;7171;7172 6803 7159 20190821_JH_WT_Ubi 11551 6813 7170 20190821_JH_WT_Ubi 9872 6813 7170 20190821_JH_WT_Ubi 9872 sp|P84077|ARF1_HUMAN;sp|P61204|ARF3_HUMAN;sp|P84085|ARF5_HUMAN;sp|P18085|ARF4_HUMAN 52;52;52;52 sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN ADP-ribosylation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF1 PE=1 SV=2;sp|P61204|ARF3_HUMAN ADP-ribosylation factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF3 PE=1 SV=2;sp|P84085|ARF5_HUMAN ADP-ribosylation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF5 1 117.545 1.32825E-07 117.55 86.434 117.55 1 58.4793 0.0147121 58.479 1 117.545 1.32825E-07 117.55 1 N LKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWD X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LGEIVTTIPTIGFN(1)VETVEYK LGEIVTTIPTIGFN(117.55)VETVEYK 14 3 -0.62721 4100800 4100800 0 0 0.2682 2292000 0 0 0 0 1808800 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN 0 2292000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1808800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 334 1018 52 52 2605 2960 8452;8453 8885;8886 8453 8886 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14856 8453 8886 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14856 8453 8886 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14856 sp|P61586|RHOA_HUMAN;sp|P08134|RHOC_HUMAN 109;109 sp|P61586|RHOA_HUMAN sp|P61586|RHOA_HUMAN sp|P61586|RHOA_HUMAN Transforming protein RhoA OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RHOA PE=1 SV=1;sp|P08134|RHOC_HUMAN Rho-related GTP-binding protein RhoC OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RHOC PE=1 SV=1 0.947623 12.5749 0.0075569 90.108 55.722 90.108 0.947623 12.5749 0.0075569 90.108 N NIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRND X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HFCPN(0.948)VPIILVGN(0.052)K HFCPN(12.57)VPIILVGN(-12.57)K 5 2 2.6744 2494000 2494000 0 0 0.0074547 0 2494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.095301 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 335 1025 109 109 1824 2072 5825 6134 5825 6134 20190821_JH_MUT_Ubi 9507 5825 6134 20190821_JH_MUT_Ubi 9507 5825 6134 20190821_JH_MUT_Ubi 9507 sp|P61978-2|HNRPK_HUMAN;sp|P61978|HNRPK_HUMAN;sp|P61978-3|HNRPK_HUMAN 453;453;429 sp|P61978-2|HNRPK_HUMAN sp|P61978-2|HNRPK_HUMAN sp|P61978-2|HNRPK_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPK;sp|P61978|HNRPK_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPK PE=1 SV=1;sp|P61978-3|HNRPK_HUMAN Isoform 3 o 0.848075 7.48702 4.90474E-30 169.77 132.21 123.14 0.760899 5.02809 4.90474E-30 169.77 0.848075 7.48702 8.16731E-11 123.14 1 N TGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX IITITGTQDQIQNAQ(0.001)YLLQ(0.151)N(0.848)SVK IITITGTQ(-62.69)DQ(-62.69)IQ(-58.6)N(-48.08)AQ(-31.18)YLLQ(-7.49)N(7.49)SVK 20 3 0.018086 7006300 7006300 0 0 0.31469 0 0 5353400 0 0 0 0 0 1652800 NaN NaN 0.33095 NaN NaN NaN NaN NaN 0.2715 0 0 0 0 0 0 5353400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1652800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 336 1033 453 453 2166 2470 7166;7167 7541;7542 7167 7542 20190902_JH_WT_Ubi_3 13791 7166 7541 20190821_JH_WT_Ubi 12892 7166 7541 20190821_JH_WT_Ubi 12892 sp|P62314|SMD1_HUMAN 21 sp|P62314|SMD1_HUMAN sp|P62314|SMD1_HUMAN sp|P62314|SMD1_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD1 PE=1 SV=1 0.574152 1.29851 6.11057E-36 173.19 115.22 51.524 0.5 0 6.11057E-36 173.19 0.574152 1.29851 0.0267368 51.524 0.5 0 2.50441E-11 132.52 1 N FLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M) XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.574)GTQ(0.426)VHGTITGVDVSMNTHLK N(1.3)GTQ(-1.3)VHGTITGVDVSMN(-38.73)THLK 1 3 -0.84702 18863000 18863000 0 0 2.0926 6702600 0 0 0 7956600 0 0 0 0 1.8574 NaN NaN 0 3.7587 NaN NaN NaN NaN 6702600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7956600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 337 1048 21 21 3077 3522;3524 9943;9945;9947;9948 10474;10476;10479;10480 9948 10480 20190821_JH_MUT_Ubi 7304 9943 10474 20190821_JH_EV_Ubi 6497 9943 10474 20190821_JH_EV_Ubi 6497 sp|P62714|PP2AB_HUMAN 26 sp|P62714|PP2AB_HUMAN sp|P62714|PP2AB_HUMAN sp|P62714|PP2AB_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP2CB PE=1 SV=1 0.699644 6.73193 4.11206E-07 117.37 75.249 117.37 0.699644 6.73193 4.11206E-07 117.37 1 N DQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX ELDQWVEQLNECKQ(0.005)LN(0.147)EN(0.7)Q(0.148)VR ELDQ(-87.16)WVEQ(-53.17)LN(-39.5)ECKQ(-21.87)LN(-6.77)EN(6.73)Q(-6.73)VR 18 3 1.9361 1517000 1517000 0 0 0.017652 0 0 0 0 0 1517000 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0.17287 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1517000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 338 1054 26 26 981 1109 3146 3305 3146 3305 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11886 3146 3305 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11886 3146 3305 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11886 sp|P62826|RAN_HUMAN 55 sp|P62826|RAN_HUMAN sp|P62826|RAN_HUMAN sp|P62826|RAN_HUMAN GTP-binding nuclear protein Ran OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAN PE=1 SV=3 1 42.8131 0.0226907 42.813 16.378 42.813 1 42.8131 0.0226907 42.813 1 N VATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX YVATLGVEVHPLVFHTN(1)R YVATLGVEVHPLVFHTN(42.81)R 17 4 -3.5198 1243000 1243000 0 0 0.0016476 0 0 0 0 0 0 0 1243000 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 NaN 0.012075 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1243000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 339 1059 55 55 5215 5937 16837 17700 16837 17700 20190902_JH_WT_Ubi_2 11360 16837 17700 20190902_JH_WT_Ubi_2 11360 16837 17700 20190902_JH_WT_Ubi_2 11360 sp|P62829|RL23_HUMAN 107 sp|P62829|RL23_HUMAN sp|P62829|RL23_HUMAN sp|P62829|RL23_HUMAN 60S ribosomal protein L23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL23 PE=1 SV=1 0.898566 8.95349 0.0218574 48.477 6.6169 48.477 0.898566 8.95349 0.0218574 48.477 2 N DGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KDGVFLYFEDN(0.203)AGVIVN(0.899)N(0.899)K KDGVFLYFEDN(-8.95)AGVIVN(8.95)N(8.95)K 17 3 3.4254 917340 0 917340 0 NaN 0 0 0 0 917340 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 917340 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 340 1060 107 107 2322 2641 7630 8027 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 sp|P62829|RL23_HUMAN 108 sp|P62829|RL23_HUMAN sp|P62829|RL23_HUMAN sp|P62829|RL23_HUMAN 60S ribosomal protein L23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL23 PE=1 SV=1 0.898566 8.95349 0.0218574 48.477 6.6169 48.477 0.898566 8.95349 0.0218574 48.477 2 N GVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX KDGVFLYFEDN(0.203)AGVIVN(0.899)N(0.899)K KDGVFLYFEDN(-8.95)AGVIVN(8.95)N(8.95)K 18 3 3.4254 917340 0 917340 0 NaN 0 0 0 0 917340 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 917340 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 341 1060 108 108 2322 2641 7630 8027 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 7630 8027 20190902_JH_EV_Ubi_3 8116 sp|P62834|RAP1A_HUMAN;sp|P61224-3|RAP1B_HUMAN;sp|P61224|RAP1B_HUMAN;sp|A6NIZ1|RP1BL_HUMAN;sp|P61224-4|RAP1B_HUMAN 74;55;74;74;32 sp|P62834|RAP1A_HUMAN sp|P62834|RAP1A_HUMAN sp|P62834|RAP1A_HUMAN Ras-related protein Rap-1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1A PE=1 SV=1;sp|P61224-3|RAP1B_HUMAN Isoform 3 of Ras-related protein Rap-1b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1B;sp|P61224|RAP1B_HUMAN Ras-related protein Rap-1b OS=Homo sapiens OX 0.5 0 0.000737524 101.16 61.148 101.16 0.5 0 0.000737524 101.16 1 N AGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQST X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.5)GQ(0.5)GFALVYSITAQSTFNDLQDLR N(0)GQ(0)GFALVYSITAQ(-65.53)STFN(-85.33)DLQ(-89.39)DLR 1 3 2.1364 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 342 1061 74 74 3073 3517 9936 10467 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 sp|P62888|RL30_HUMAN 77 sp|P62888|RL30_HUMAN sp|P62888|RL30_HUMAN sp|P62888|RL30_HUMAN 60S ribosomal protein L30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL30 PE=1 SV=2 0.952622 13.0335 1.34897E-05 110.74 72.707 102.59 0.913761 10.2513 0.00343154 73.688 0.948572 12.6587 1.34897E-05 110.74 0.952622 13.0335 0.000113295 102.59 1 N YYAMLAKTGVHHYSGNNIELGTACGKYYRVC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TGVHHYSGN(0.953)N(0.047)IELGTACGK TGVHHYSGN(13.03)N(-13.03)IELGTACGK 9 3 1.9713 14124000 14124000 0 0 0.12982 0 0 991790 0 4182900 0 0 0 8949600 0 NaN 0.061468 0 0.79636 0 0 0 0.42777 0 0 0 0 0 0 991790 0 0 0 0 0 4182900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8949600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 343 1068 77 77 4394 4988 13930;13931;13932 14621;14622;14623 13932 14623 20190902_JH_WT_Ubi_3 6339 13930 14621 20190902_JH_EV_Ubi_3 5239 13930 14621 20190902_JH_EV_Ubi_3 5239 sp|P62937|PPIA_HUMAN;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN 102;42 sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA PE=1 SV=2;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN Isoform 2 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA 0.999204 32.0516 4.13201E-10 104.55 79.818 104.55 0.999204 32.0516 4.13201E-10 104.55 2 N NFILKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP HTGPGILSMAN(0.999)AGPN(0.012)TN(0.738)GSQ(0.251)FFICTAK HTGPGILSMAN(32.05)AGPN(-18.03)TN(4.69)GSQ(-4.69)FFICTAK 11 3 2.1961 6077700 0 6077700 0 1.0172 0 0 0 0 0 0 0 0 6077700 NaN NaN 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6077700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 344 1072 102 102 2009 2290;2291;2292 6604 6949 6604 6949 20190902_JH_WT_Ubi_3 12044 6604 6949 20190902_JH_WT_Ubi_3 12044 6604 6949 20190902_JH_WT_Ubi_3 12044 sp|P62937|PPIA_HUMAN;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN 106;46 sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA PE=1 SV=2;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN Isoform 2 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA 0.988957 21.0012 0.00892447 50.14 26.967 50.14 0.988957 21.0012 0.00892447 50.14 2 N KHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTAKTEW X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX HTGPGILSMAN(0.004)AGPN(0.989)TN(0.919)GSQ(0.088)FFICTAK HTGPGILSMAN(-24.51)AGPN(21)TN(10.55)GSQ(-10.55)FFICTAK 15 3 2.1952 1390600 0 1390600 0 0.23274 0 0 0 0 0 0 1390600 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1390600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 345 1072 106 106 2009 2290;2291;2292 6602 6946 6602 6946 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10810 6602 6946 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10810 6602 6946 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10810 sp|P62937|PPIA_HUMAN;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN 108;48 sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA PE=1 SV=2;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN Isoform 2 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA 0.995253 24.0023 1.82727E-76 213.81 162.38 165.01 0.906231 11.5582 5.9652E-34 159.46 0.965828 14.6441 3.64178E-53 186.54 0.967807 15.6639 2.19992E-15 124.85 0.994914 22.9767 4.51011E-64 202.15 0.995253 24.0023 3.1152E-34 165.01 0.969127 15.0729 1.82727E-76 213.81 1;2 N TGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTAKTEWLD X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX HTGPGILSMANAGPN(0.004)TN(0.995)GSQ(0.001)FFICTAK HTGPGILSMAN(-90.73)AGPN(-24)TN(24)GSQ(-31.02)FFICTAK 17 3 -0.31358 250170000 235480000 14686000 0 41.87 0 3938300 33211000 0 0 4991800 4862600 125130000 32653000 NaN NaN 7.541 NaN NaN 3.178 NaN NaN NaN 0 0 0 3938300 0 0 33211000 0 0 0 0 0 0 0 0 4991800 0 0 3472000 1390600 0 117910000 7217900 0 26575000 6077700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 346 1072 108 108 2009 2290;2291;2292 6591;6592;6593;6594;6595;6596;6597;6598;6599;6600;6601;6602;6603;6604 6933;6934;6935;6936;6937;6938;6939;6940;6941;6942;6943;6944;6945;6946;6947;6948;6949 6595 6939 20190902_JH_WT_Ubi_2 12178 6601 6945 20190902_JH_WT_Ubi_3 12580 6601 6945 20190902_JH_WT_Ubi_3 12580 sp|P62979|RS27A_HUMAN;sp|P62987|RL40_HUMAN;sp|P0CG47|UBB_HUMAN;sp|P0CG48|UBC_HUMAN 60;60;60;60 sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27A PE=1 SV=2;sp|P62987|RL40_HUMAN Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA52 PE=1 SV=2;sp|P0CG47|UBB_HUMAN Polyubiquitin-B OS=Homo sapiens O 0.526193 0.45544 0.00578035 62.237 37.643 58.159 0.498717 0 0.0149952 52.93 0.494509 0 0.023298 48.711 0.5 0 0.00578035 62.237 0.526193 0.45544 0.00883129 58.159 1 N FAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRG X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX TLSDYN(0.526)IQ(0.474)KESTLHLVLR TLSDYN(0.46)IQ(-0.46)KESTLHLVLR 6 4 1.5117 1371300000 1371300000 0 0 0.010102 0 0 0 0 0 0 0 847120000 524160000 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.012373 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 847120000 0 0 524160000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 347 1074 60 60 2650;4500 3013;5108 14315;14316 15025;15026;15027 14316 15026 20190902_JH_WT_Ubi_3 10784 14315 15025 20190902_JH_WT_Ubi_2 11326 14315 15025 20190902_JH_WT_Ubi_2 11326 sp|P62979|RS27A_HUMAN;sp|P62987|RL40_HUMAN;sp|P0CG47|UBB_HUMAN;sp|P0CG48|UBC_HUMAN 25;25;25;25 sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27A PE=1 SV=2;sp|P62987|RL40_HUMAN Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA52 PE=1 SV=2;sp|P0CG47|UBB_HUMAN Polyubiquitin-B OS=Homo sapiens O 1 123.829 1.23321E-09 123.83 76.075 123.83 1 99.8459 4.16555E-05 99.846 1 123.829 1.23321E-09 123.83 1 N GKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQ X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX TLTGKTITLEVEPSDTIEN(1)VK TLTGKTITLEVEPSDTIEN(123.83)VK 19 3 3.3791 204380000 204380000 0 0 0.0060714 0 0 0 0 0 0 0 79661000 124720000 0 0 0 0 0 0 0 0.03521 0.030355 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79661000 0 0 124720000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 348 1074 25 25 4509 5118 14384;14385 15121;15122;15123 14385 15122 20190902_JH_WT_Ubi_3 11039 14385 15122 20190902_JH_WT_Ubi_3 11039 14385 15122 20190902_JH_WT_Ubi_3 11039 sp|P63010-2|AP2B1_HUMAN;sp|P63010|AP2B1_HUMAN;sp|P63010-3|AP2B1_HUMAN 435;435;378 sp|P63010-2|AP2B1_HUMAN sp|P63010-2|AP2B1_HUMAN sp|P63010-2|AP2B1_HUMAN Isoform 2 of AP-2 complex subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2B1;sp|P63010|AP2B1_HUMAN AP-2 complex subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2B1 PE=1 SV=1;sp|P63010-3|AP2B1_HUMAN Isoform 3 of AP-2 complex subunit beta OS=Hom 0.999951 43.0996 0.017075 53.355 16.728 53.355 0.999944 42.4794 0.022929 50.827 0.999951 43.0996 0.017075 53.355 1 N KYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIW GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX KYPNKYESIIATLCEN(1)LDSLDEPDAR KYPN(-43.1)KYESIIATLCEN(43.1)LDSLDEPDAR 16 3 1.9328 10707000 10707000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1426600 9280100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1426600 0 0 9280100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 349 1076 435 435 2489 2826 8100;8101 8515;8516 8101 8516 20190902_JH_WT_Ubi_3 10790 8101 8516 20190902_JH_WT_Ubi_3 10790 8101 8516 20190902_JH_WT_Ubi_3 10790 sp|P63104|1433Z_HUMAN 95 sp|P63104|1433Z_HUMAN sp|P63104|1433Z_HUMAN sp|P63104|1433Z_HUMAN 14-3-3 protein zeta/delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAZ PE=1 SV=1 0.999739 38.2074 0.0130794 58.952 18.571 58.952 0.999739 38.2074 0.0130794 58.952 1 N REYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DICN(1)DVLSLLEKFLIPNASQAESK DICN(38.21)DVLSLLEKFLIPN(-38.21)ASQ(-40.55)AESK 4 3 0.18389 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 350 1078 95 95 528 610 1710 1813 1710 1813 20190821_JH_MUT_Ubi 15296 1710 1813 20190821_JH_MUT_Ubi 15296 1710 1813 20190821_JH_MUT_Ubi 15296 sp|P63208|SKP1_HUMAN;sp|P63208-2|SKP1_HUMAN 49;49 sp|P63208|SKP1_HUMAN sp|P63208|SKP1_HUMAN sp|P63208|SKP1_HUMAN S-phase kinase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKP1 PE=1 SV=2;sp|P63208-2|SKP1_HUMAN Isoform 2 of S-phase kinase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKP1 0.607477 3.57844 4.23444E-09 112.37 70.679 112.37 0.5 0 0.0129225 58.332 0.607477 3.57844 4.23444E-09 112.37 1 N LGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTH X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TMLEDLGMDDEGDDDPVPLPN(0.607)VN(0.393)AAILKK TMLEDLGMDDEGDDDPVPLPN(3.58)VN(-3.58)AAILKK 21 3 4.4705 912460 912460 0 0 0.76104 0 0 0 0 0 912460 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 912460 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 351 1082 49 49 4519 5132 14417;14418 15155;15156 14418 15156 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13184 14418 15156 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13184 14418 15156 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13184 sp|P63208|SKP1_HUMAN;sp|P63208-2|SKP1_HUMAN 51;51 sp|P63208|SKP1_HUMAN sp|P63208|SKP1_HUMAN sp|P63208|SKP1_HUMAN S-phase kinase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKP1 PE=1 SV=2;sp|P63208-2|SKP1_HUMAN Isoform 2 of S-phase kinase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKP1 0.5 0 0.0129225 58.332 29.557 58.332 0.5 0 0.0129225 58.332 1 N MDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TMLEDLGMDDEGDDDPVPLPN(0.5)VN(0.5)AAILKK TMLEDLGMDDEGDDDPVPLPN(0)VN(0)AAILKK 23 3 4.3428 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 352 1082 51 51 4519 5132 14417 15155 14417 15155 20190821_JH_MUT_Ubi 11844 14417 15155 20190821_JH_MUT_Ubi 11844 14417 15155 20190821_JH_MUT_Ubi 11844 sp|P63244|RACK1_HUMAN 15 sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 0.994154 22.3063 5.09707E-12 126.97 79.993 126.97 0.499385 0 0.000290664 81.312 0.935159 11.6084 3.84924E-06 93.416 0.793491 6.58655 0.000470427 77.543 0.994154 22.3063 5.09707E-12 126.97 1 N _MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M) XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP GHN(0.994)GWVTQ(0.006)IATTPQFPDMILSASR GHN(22.31)GWVTQ(-22.31)IATTPQ(-72.98)FPDMILSASR 3 3 -0.54276 9541900 9541900 0 0 NaN 0 0 5663000 0 0 0 0 1565300 2313600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 5663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1565300 0 0 2313600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 353 1085 15 15 1517 1729;1730 4867;4868;4869;4870 5119;5120;5121;5122 4869 5121 20190902_JH_WT_Ubi_3 14098 4869 5121 20190902_JH_WT_Ubi_3 14098 4869 5121 20190902_JH_WT_Ubi_3 14098 sp|P63244|RACK1_HUMAN 196 sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 0.711193 3.9138 0.00222025 51.628 17.013 51.628 0.628452 2.28257 0.00937797 43.658 0.711193 3.9138 0.00222025 51.628 1 N NCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TN(0.289)HIGHTGYLN(0.711)TVTVSPDGSLCASGGK TN(-3.91)HIGHTGYLN(3.91)TVTVSPDGSLCASGGK 11 4 -0.54157 6865600 6865600 0 0 0.048004 0 0 0 1544900 0 0 0 0 3939700 0 0 0 0.076955 0 0 0 0 0.10219 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1544900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3939700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 354 1085 196 196 4526 5141 14445;14446;14447 15184;15185;15186 14447 15186 20190902_JH_WT_Ubi_3 8983 14447 15186 20190902_JH_WT_Ubi_3 8983 14447 15186 20190902_JH_WT_Ubi_3 8983 sp|P67809|YBOX1_HUMAN 164 sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN Nuclease-sensitive element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YBX1 PE=1 SV=3 0.656895 6.5622 1.3269E-05 89.079 68.427 89.079 0.638586 5.24158 1.48363E-05 87.881 0.656895 6.5622 1.3269E-05 89.079 1 N PRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.001)YQ(0.001)Q(0.002)N(0.145)YQ(0.145)N(0.657)SESGEKN(0.049)EGSESAPEGQAQQR N(-30.15)YQ(-30.15)Q(-24.37)N(-6.56)YQ(-6.56)N(6.56)SESGEKN(-11.24)EGSESAPEGQ(-37.31)AQ(-50.04)Q(-50.04)R 8 3 -0.12376 1172000 1172000 0 0 0.15106 0 0 0 0 0 608900 563080 0 0 0 NaN NaN NaN 0 0.32905 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 608900 0 0 563080 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 355 1090 164 164 3275 3741 10528;10529 11076;11077;11078 10529 11077 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4880 10529 11077 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4880 10529 11077 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4880 sp|P68104|EF1A1_HUMAN;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN 222;201;222 sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1 PE=1 SV=1;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN Isoform 2 of Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN Putative elongation factor 1-alpha-like 3 1 88.5548 7.35929E-06 88.555 64.049 88.555 1 88.5548 7.35929E-06 88.555 1 N NMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP DGN(1)ASGTTLLEALDCILPPTRPTDK DGN(88.55)ASGTTLLEALDCILPPTRPTDK 3 3 -1.0955 5804400 5804400 0 0 0.027952 0 0 5804400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.061402 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 5804400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 356 1096 222 222 488 568 1599 1693 1599 1693 20190821_JH_WT_Ubi 15574 1599 1693 20190821_JH_WT_Ubi 15574 1599 1693 20190821_JH_WT_Ubi 15574 sp|P68104|EF1A1_HUMAN;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN 197;176;197 sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1 PE=1 SV=1;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN Isoform 2 of Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN Putative elongation factor 1-alpha-like 3 0.917967 10.8399 0.00034268 70.572 52.954 70.572 0.917967 10.8399 0.00034268 70.572 2 N GYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP IGYN(0.023)PDTVAFVPISGWN(0.918)GDN(0.777)MLEPSAN(0.281)MPWFK IGYN(-15.37)PDTVAFVPISGWN(10.84)GDN(5.51)MLEPSAN(-5.51)MPWFK 17 3 2.5035 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 357 1096 197 197 2135 2436 7081 7454 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 sp|P68104|EF1A1_HUMAN;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN 200;179;200 sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN sp|P68104|EF1A1_HUMAN Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1 PE=1 SV=1;sp|P68104-2|EF1A1_HUMAN Isoform 2 of Elongation factor 1-alpha 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF1A1;sp|Q5VTE0|EF1A3_HUMAN Putative elongation factor 1-alpha-like 3 0.777445 5.5129 0.00034268 70.572 52.954 70.572 0.777445 5.5129 0.00034268 70.572 2 N PDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX IGYN(0.023)PDTVAFVPISGWN(0.918)GDN(0.777)MLEPSAN(0.281)MPWFK IGYN(-15.37)PDTVAFVPISGWN(10.84)GDN(5.51)MLEPSAN(-5.51)MPWFK 20 3 2.5035 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 358 1096 200 200 2135 2436 7081 7454 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 7081 7454 20190902_JH_EV_Ubi_3 13385 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN;sp|P68366|TBA4A_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q71U36-2|TBA1A_HUMAN;sp|Q13748|TBA3C_HUMAN;sp|Q13748-2|TBA3C_HUMAN;sp|Q6PEY2|TBA3E_HUMAN 293;177;278;293;293;258;293;293;293 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN sp|P68363|TBA1B_HUMAN sp|P68363|TBA1B_HUMAN Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B PE=1 SV=1;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-4A chain OS=Homo sapie 0.999941 42.2762 1.48367E-16 140.51 106.36 137.87 0.961752 14.0055 1.48367E-16 140.51 0.99878 30.1457 2.63381E-08 110.16 0.999941 42.2762 2.48976E-13 137.87 1 N AEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AYHEQLSVAEITN(1)ACFEPANQMVK AYHEQ(-42.28)LSVAEITN(42.28)ACFEPAN(-67.51)Q(-72.76)MVK 13 3 0.20012 10299000 10299000 0 0 0.048686 0 0 5479600 0 0 0 0 4819800 0 0 0 0.068471 0 0 0 NaN 0.12236 0 0 0 0 0 0 0 5479600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4819800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 359 1097;1098;1515 293;278;293 293 338 400 1149;1150;1151 1236;1237;1238 1151 1238 20190902_JH_WT_Ubi_3 10918 1149 1236 20190821_JH_WT_Ubi 9372 1149 1236 20190821_JH_WT_Ubi 9372 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q71U36-2|TBA1A_HUMAN;sp|Q13748|TBA3C_HUMAN;sp|Q13748-2|TBA3C_HUMAN;sp|Q6PEY2|TBA3E_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN 50;50;50;15;50;50;50;50 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|P68363|TBA1B_HUMAN Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B PE=1 SV=1;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN Tubulin alpha-1A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=T 1 167.286 3.02604E-23 167.29 119.1 167.29 1 74.8155 0.00604885 74.816 1 167.286 3.02604E-23 167.29 1 N QMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRA X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TIGGGDDSFN(1)TFFSETGAGK TIGGGDDSFN(167.29)TFFSETGAGK 10 2 1.0656 1059800 1059800 0 0 0.27307 726130 0 0 333680 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 726130 0 0 0 0 0 0 0 0 333680 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 360 1097;1515;1858 50;50;50 50 4419 5013 14013;14014 14711;14712 14014 14712 20190902_JH_EV_Ubi_2 11716 14014 14712 20190902_JH_EV_Ubi_2 11716 14014 14712 20190902_JH_EV_Ubi_2 11716 sp|P78509-3|RELN_HUMAN;sp|P78509-2|RELN_HUMAN;sp|P78509|RELN_HUMAN 1478;1478;1478 sp|P78509-3|RELN_HUMAN sp|P78509-3|RELN_HUMAN sp|P78509-3|RELN_HUMAN Isoform 3 of Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN;sp|P78509-2|RELN_HUMAN Isoform 2 of Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN;sp|P78509|RELN_HUMAN Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN PE=1 SV=3 0.994242 22.4466 0.00986812 51.645 11.74 51.645 0.994242 22.4466 0.00986812 51.645 2 N YKITGAQVGTGCGTLNDGKSLYFNGPGKREA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX ITGAQ(0.012)VGTGCGTLN(0.994)DGKSLYFN(0.993)GPGK ITGAQ(-21.9)VGTGCGTLN(22.45)DGKSLYFN(21.9)GPGK 14 3 1.3527 2862300 0 2862300 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2862300 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2862300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 361 1106 1478 1478 2273 2586 7456 7836 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 sp|P78509-3|RELN_HUMAN;sp|P78509-2|RELN_HUMAN;sp|P78509|RELN_HUMAN 1486;1486;1486 sp|P78509-3|RELN_HUMAN sp|P78509-3|RELN_HUMAN sp|P78509-3|RELN_HUMAN Isoform 3 of Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN;sp|P78509-2|RELN_HUMAN Isoform 2 of Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN;sp|P78509|RELN_HUMAN Reelin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RELN PE=1 SV=3 0.9934 21.8997 0.00986812 51.645 11.74 51.645 0.9934 21.8997 0.00986812 51.645 2 N GTGCGTLNDGKSLYFNGPGKREARTVPLDTR X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX ITGAQ(0.012)VGTGCGTLN(0.994)DGKSLYFN(0.993)GPGK ITGAQ(-21.9)VGTGCGTLN(22.45)DGKSLYFN(21.9)GPGK 22 3 1.3527 2862300 0 2862300 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2862300 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2862300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 362 1106 1486 1486 2273 2586 7456 7836 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 7456 7836 20190902_JH_WT_Ubi_3 12084 sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN;sp|Q00796|DHSO_HUMAN 8;8 sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN Isoform 2 of Sorbitol dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SORD;sp|Q00796|DHSO_HUMAN Sorbitol dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SORD PE=1 SV=4 0.848098 7.46884 0.00448506 85.976 40.086 85.976 0.848098 7.46884 0.00448506 85.976 1 N ________MAAAAKPNNLSLVVHGPGDLRLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX PN(0.848)N(0.152)LSLVVHGPGDLR PN(7.47)N(-7.47)LSLVVHGPGDLR 2 3 0.66767 934720 934720 0 0 0.0095558 0 0 0 0 0 934720 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 934720 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 363 1127 8 8 3482 3974 11210 11778 11210 11778 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10248 11210 11778 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10248 11210 11778 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10248 sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN;sp|Q00796|DHSO_HUMAN 9;9 sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN sp|Q00796-2|DHSO_HUMAN Isoform 2 of Sorbitol dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SORD;sp|Q00796|DHSO_HUMAN Sorbitol dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SORD PE=1 SV=4 0.867691 8.16777 0.00874989 73.386 33.806 73.386 0.867691 8.16777 0.00874989 73.386 1 N _______MAAAAKPNNLSLVVHGPGDLRLEN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXX PN(0.132)N(0.868)LSLVVHGPGDLR PN(-8.17)N(8.17)LSLVVHGPGDLR 3 3 -0.39793 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 364 1127 9 9 3482 3974 11211 11779 11211 11779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9514 11211 11779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9514 11211 11779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9514 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN 57;57 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU PE=1 SV=6;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU 0.999907 40.3268 1.20389E-05 75.156 52.885 75.156 0.999907 40.3268 1.20389E-05 75.156 0.971976 15.4012 0.002676 50.534 1 N LDDEEAGGRPAMEPGNGSLDLGGDSAGRSGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX LQAALDDEEAGGRPAMEPGN(1)GSLDLGGDSAGR LQ(-40.33)AALDDEEAGGRPAMEPGN(40.33)GSLDLGGDSAGR 20 3 -0.82768 9028800 9028800 0 0 NaN 0 0 2789400 0 0 0 0 6239500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2789400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6239500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 365 1128 57 57 2768 3143 8949;8950 9414;9415 8949 9414 20190821_JH_WT_Ubi 8443 8949 9414 20190821_JH_WT_Ubi 8443 8949 9414 20190821_JH_WT_Ubi 8443 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN 452;433 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU PE=1 SV=6;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU 0.991013 20.4664 7.34298E-05 89.311 64.889 89.311 0.991013 20.4664 7.34298E-05 89.311 0.948193 14.5325 0.0190385 43.955 0.98946 22.5522 0.0109922 50.252 1 N EVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX PLFPHVLCHN(0.991)CAVEFN(0.009)FGQK PLFPHVLCHN(20.47)CAVEFN(-20.47)FGQ(-40.63)K 10 4 -0.66348 16007000 16007000 0 0 0.035738 0 0 10887000 0 0 0 1899300 0 3221100 NaN 0 0.056528 NaN NaN 0 0.048569 0 0.053793 0 0 0 0 0 0 10887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1899300 0 0 0 0 0 3221100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 366 1128 452 452 3420 3904 10958;10959;10960 11522;11523;11524 10959 11523 20190821_JH_WT_Ubi 11056 10959 11523 20190821_JH_WT_Ubi 11056 10959 11523 20190821_JH_WT_Ubi 11056 sp|Q01082|SPTB2_HUMAN;sp|Q01082-2|SPTB2_HUMAN;sp|Q01082-3|SPTB2_HUMAN 2130;2130;2117 sp|Q01082|SPTB2_HUMAN;sp|Q01082-3|SPTB2_HUMAN sp|Q01082|SPTB2_HUMAN sp|Q01082|SPTB2_HUMAN Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTBN1 PE=1 SV=2;sp|Q01082-2|SPTB2_HUMAN Isoform Short of Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTBN1;sp|Q01082-3|SPTB2_HUMAN Isoform 2 o 0.805966 8.5175 3.73698E-11 110.03 92.165 110.03 0.805966 8.5175 3.73698E-11 110.03 0.685158 6.0503 0.00104734 71.608 1 N SQQQWDTSKGEQVSQNGLPAEQGSPRMAETV;SQQQWDTSKGEQVSQNGLPAEQGSPRVSYRS X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX VSEEAESQQQ(0.002)WDTSKGEQ(0.113)VSQ(0.074)N(0.806)GLPAEQ(0.005)GSPR VSEEAESQ(-48.33)Q(-33)Q(-27.08)WDTSKGEQ(-8.52)VSQ(-10.39)N(8.52)GLPAEQ(-22.16)GSPR 22 3 0.78153 2631600 2631600 0 0 NaN 0 1404300 0 0 0 1227300 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1404300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1227300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 367 1129;1130 2130;2117 2130 5007 5682 16075;16076 16885;16886 16075 16885 20190821_JH_MUT_Ubi 6634 16075 16885 20190821_JH_MUT_Ubi 6634 16075 16885 20190821_JH_MUT_Ubi 6634 sp|Q01518|CAP1_HUMAN;sp|Q01518-2|CAP1_HUMAN 129;128 sp|Q01518|CAP1_HUMAN sp|Q01518|CAP1_HUMAN sp|Q01518|CAP1_HUMAN Adenylyl cyclase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAP1 PE=1 SV=5;sp|Q01518-2|CAP1_HUMAN Isoform 2 of Adenylyl cyclase-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAP1 0.999062 30.2724 0.00768015 60.561 19.238 60.561 0.992662 21.3125 0.0361525 46.786 0.999062 30.2724 0.00768015 60.561 1 N EVITFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP LFN(0.999)HLSAVSESIQ(0.001)ALGWVAMAPK LFN(30.27)HLSAVSESIQ(-30.27)ALGWVAMAPK 3 3 2.3119 9336100 9336100 0 0 0.34717 0 0 6615600 0 0 0 0 0 2720500 NaN 0 0.39216 NaN NaN 0 0 0 1.3179 0 0 0 0 0 0 6615600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2720500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 368 1132 129 129 2591 2945 8414;8415 8847;8848 8415 8848 20190902_JH_WT_Ubi_3 13979 8415 8848 20190902_JH_WT_Ubi_3 13979 8415 8848 20190902_JH_WT_Ubi_3 13979 sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668-3|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668-2|CAC1D_HUMAN 789;789;789;809 sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN Isoform 4 of Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACNA1D;sp|Q01668-3|CAC1D_HUMAN Isoform 3 of Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACN 0.861927 9.02514 0.036207 46.706 15.878 46.706 0.861927 9.02514 0.036207 46.706 3 N RKKIARKESLENKKNNKPEVNQIANSDNKVT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX KN(0.129)N(0.862)KPEVN(0.987)Q(0.821)IAN(0.16)SDN(0.041)K KN(-9.03)N(9.03)KPEVN(22.43)Q(7.56)IAN(-7.56)SDN(-14.86)K 3 2 0.37819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 369 1134 789 789 2407 2736 7876 8280 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668-3|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668|CAC1D_HUMAN;sp|Q01668-2|CAC1D_HUMAN 794;794;794;814 sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN sp|Q01668-4|CAC1D_HUMAN Isoform 4 of Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACNA1D;sp|Q01668-3|CAC1D_HUMAN Isoform 3 of Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CACN 0.986992 22.43 0.036207 46.706 15.878 46.706 0.986992 22.43 0.036207 46.706 3 N RKESLENKKNNKPEVNQIANSDNKVTIDDYR X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX KN(0.129)N(0.862)KPEVN(0.987)Q(0.821)IAN(0.16)SDN(0.041)K KN(-9.03)N(9.03)KPEVN(22.43)Q(7.56)IAN(-7.56)SDN(-14.86)K 8 2 0.37819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 370 1134 794 794 2407 2736 7876 8280 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 7876 8280 20190902_JH_EV_Ubi_3 11098 sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN;sp|Q02750|MP2K1_HUMAN 12;12 sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN Isoform 2 of Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K1;sp|Q02750|MP2K1_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K1 PE=1 SV=2 0.71851 4.96703 0.000781413 54.934 22.427 54.934 0.71851 4.96703 0.000781413 54.934 1 N ____MPKKKPTPIQLNPAPDGSAVNGTSSAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KKPTPIQ(0.229)LN(0.719)PAPDGSAVN(0.052)GTSSAETN(0.001)LEALQK KKPTPIQ(-4.97)LN(4.97)PAPDGSAVN(-11.43)GTSSAETN(-29.15)LEALQ(-47.78)K 9 4 0.64473 845490 845490 0 0 NaN 0 0 0 0 845490 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 845490 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 371 1141 12 12 2373 2699 7790 8192 7790 8192 20190902_JH_EV_Ubi_3 8779 7790 8192 20190902_JH_EV_Ubi_3 8779 7790 8192 20190902_JH_EV_Ubi_3 8779 sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN;sp|Q02750|MP2K1_HUMAN 21;21 sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN sp|Q02750-2|MP2K1_HUMAN Isoform 2 of Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K1;sp|Q02750|MP2K1_HUMAN Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP2K1 PE=1 SV=2 0.710931 7.363 0.00085464 53.968 30.227 41.483 0.328213 0.486007 0.00085464 53.968 0.710931 7.363 0.0115232 41.483 1 N PTPIQLNPAPDGSAVNGTSSAETNLEALQKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX KKPTPIQ(0.13)LN(0.13)PAPDGSAVN(0.711)GTSSAETN(0.028)LEALQ(0.001)K KKPTPIQ(-7.36)LN(-7.36)PAPDGSAVN(7.36)GTSSAETN(-14.12)LEALQ(-30.82)K 18 4 -0.28329 4605800 4605800 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4605800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4605800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 372 1141 21 21 2373 2699 7792 8194 7792 8194 20190902_JH_WT_Ubi_2 10460 7791 8193 20190821_JH_WT_Ubi 8377 7791 8193 20190821_JH_WT_Ubi 8377 sp|Q02878|RL6_HUMAN 101 sp|Q02878|RL6_HUMAN sp|Q02878|RL6_HUMAN sp|Q02878|RL6_HUMAN 60S ribosomal protein L6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL6 PE=1 SV=3 1 61.5934 0.035473 61.593 14.512 61.593 1 61.5934 0.035473 61.593 1 N EKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX PVGGDKN(1)GGTR PVGGDKN(61.59)GGTR 7 2 1.5264 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 373 1143 101 101 3547 4044 11393 11966 11393 11966 20190821_JH_WT_Ubi 1533 11393 11966 20190821_JH_WT_Ubi 1533 11393 11966 20190821_JH_WT_Ubi 1533 sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN;sp|Q02978|M2OM_HUMAN 253;304 sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN Isoform 2 of Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A11;sp|Q02978|M2OM_HUMAN Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A11 PE=1 SV=3 1 68.7856 0.0118398 68.786 18.432 68.786 1 68.7856 0.0118398 68.786 2 N LGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG_____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LGPHTVLTFIFLEQ(1)MN(1)K LGPHTVLTFIFLEQ(68.79)MN(68.79)K 16 2 1.8942 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 374 1145 253 253 2625 2984 8520 8961 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 sp|Q03001|DYST_HUMAN;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN 3034;2708 sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST PE=1 SV=4;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN Isoform 4 of Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST 0.499065 0 0.0313569 53.768 19.935 53.768 0.499065 0 0.0313569 53.768 N TSTQKDSPLNDMIQSNDLCSKESISGGGTEI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX STSTQ(0.965)KDSPLN(0.037)DMIQ(0.499)SN(0.499)DLCSK STSTQ(14.42)KDSPLN(-14.42)DMIQ(0)SN(0)DLCSK 17 3 2.8475 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 375 1146 3034 3034 4200 4770 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 sp|Q03135|CAV1_HUMAN 23 sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 PE=1 SV=4 0.940676 11.9812 3.40627E-05 106.31 66.12 106.31 0.940676 11.9812 3.40627E-05 106.31 1 N DSEGHLYTVPIREQGNIYKPNNKAMADELSE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(0.057)GN(0.941)IYKPN(0.001)N(0.002)KAMADELSEK EQ(-11.98)GN(11.98)IYKPN(-30.56)N(-23.6)KAMADELSEK 4 3 4.1348 1812500 1812500 0 0 0.0040257 0 0 0 0 0 0 0 0 1812500 0 0 0 0 0 0 0 0 0.044382 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1812500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 376 1147 23 23 1070 1206;1207;1208 3414 3591 3414 3591 20190902_JH_WT_Ubi_3 6249 3414 3591 20190902_JH_WT_Ubi_3 6249 3414 3591 20190902_JH_WT_Ubi_3 6249 sp|Q03135|CAV1_HUMAN 28 sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 PE=1 SV=4 0.946509 12.5408 5.47349E-07 122.52 91.292 121.51 0.946509 12.5408 5.47349E-07 121.51 0.870741 8.28429 0.00112298 94.547 0.5 0 0.00079485 122.52 0.773078 6.61213 0.000190742 92.236 0.5 0 0.00236026 113.07 0.877306 8.54327 0.00593663 106.54 1;2 N LYTVPIREQGNIYKPNNKAMADELSEKQVYD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX EQGN(0.001)IYKPN(0.947)N(0.053)KAMADELSEK EQ(-51.18)GN(-34.09)IYKPN(12.54)N(-12.54)KAMADELSEK 9 3 -1.0504 58144000 58144000 0 0 0.067418 0 0 3031900 7610600 9789400 0 0 17967000 13809000 0 0 0.048299 0.052269 0.24473 0 0 0.12725 0.14462 0 0 0 0 0 0 3031900 0 0 7610600 0 0 9789400 0 0 0 0 0 0 0 0 17967000 0 0 13809000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 377 1147 28 28 1070;3480 1206;1207;1208;3971 3410;3411;3415;3416;11189;11190;11191;11192;11194 3587;3588;3592;3593;11756;11757;11758;11759;11761 3411 3588 20190821_JH_MUT_Ubi 4339 11189 11756 20190902_JH_EV_Ubi_2 4139 3411 3588 20190821_JH_MUT_Ubi 4339 sp|Q03135|CAV1_HUMAN 29 sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 PE=1 SV=4 0.910653 11.4061 0.00079485 122.52 91.292 45.608 0.727624 4.88339 0.00869975 63.447 0.5 0 0.00079485 122.52 0.910653 11.4061 0.0238344 86.699 0.873711 8.40003 0.00236026 113.07 1;2 N YTVPIREQGNIYKPNNKAMADELSEKQVYDA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX EQ(0.227)GN(0.089)IYKPN(0.773)N(0.911)KAMADELSEK EQ(-6.61)GN(-11.41)IYKPN(6.61)N(11.41)KAMADELSEK 10 3 -2.079 39003000 39003000 0 0 0.045224 0 0 0 7610600 9789400 0 0 17967000 0 0 0 0 0.052269 0.24473 0 0 0.12725 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7610600 0 0 9789400 0 0 0 0 0 0 0 0 17967000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 378 1147 29 29 1070;3480 1206;1207;1208;3971 3412;3415;11189;11190;11192;11193 3589;3592;11756;11757;11759;11760 3415 3592 20190902_JH_EV_Ubi_3 6650 11189 11756 20190902_JH_EV_Ubi_2 4139 11189 11756 20190902_JH_EV_Ubi_2 4139 sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN 568 sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN CCAAT/enhancer-binding protein zeta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEBPZ PE=1 SV=3 1 50.0335 0.0306728 50.034 14.538 50.034 1 50.0335 0.0306728 50.034 N LDPGLMTCSKQAMFLNLVYKSLKADIVLRRV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(1)AMFLN(1)LVYKSLK Q(50.03)AMFLN(50.03)LVYKSLK 6 2 3.223 1600700 0 1600700 0 NaN 0 0 1600700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1600700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 379 1151 568 568 3601 4110 11594 12171 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 sp|Q04446|GLGB_HUMAN 19 sp|Q04446|GLGB_HUMAN sp|Q04446|GLGB_HUMAN sp|Q04446|GLGB_HUMAN 1,4-alpha-glucan-branching enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GBE1 PE=1 SV=3 1 53.262 0.0316875 53.262 27.987 53.262 1 53.262 0.0316875 53.262 1 N PMTPAARPEDYEAALNAALADVPELARLLEI X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AAPMTPAARPEDYEAALN(1)AALADVPELAR AAPMTPAARPEDYEAALN(53.26)AALADVPELAR 18 3 2.2155 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 380 1153 19 19 33 39 124 139 124 139 20190902_JH_WT_Ubi_2 16393 124 139 20190902_JH_WT_Ubi_2 16393 124 139 20190902_JH_WT_Ubi_2 16393 sp|Q04637-6|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-7|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-5|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-4|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-3|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-8|IF4G1_HUMAN;sp|Q04637-9|IF4G1_HUMAN 24;24;56;133;180;220;220;227 sp|Q04637-6|IF4G1_HUMAN sp|Q04637-6|IF4G1_HUMAN sp|Q04637-6|IF4G1_HUMAN Isoform E of Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4G1;sp|Q04637-7|IF4G1_HUMAN Isoform 7 of Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4G1;sp|Q04637-5| 0.697618 3.97176 0.00346257 52.669 24.264 52.669 0.697618 3.97176 0.00346257 52.669 N TPTPPQTGGGLEPQANGETPQVAVIVRPDDR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TASTPTPPQ(0.008)TGGGLEPQ(0.28)AN(0.698)GETPQ(0.015)VAVIVRPDDR TASTPTPPQ(-19.62)TGGGLEPQ(-3.97)AN(3.97)GETPQ(-16.61)VAVIVRPDDR 19 3 -2.1282 1271600 1271600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1271600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1271600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 381 1154 24 24 4263 4840 13498 14162 13498 14162 20190902_JH_WT_Ubi_3 11338 13498 14162 20190902_JH_WT_Ubi_3 11338 13498 14162 20190902_JH_WT_Ubi_3 11338 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN 1059 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOTCH2 PE=1 SV=3 1 48.4048 0.0210823 48.405 17.83 48.405 1 48.4048 0.0210823 48.405 4 N LGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)CQ(1)TLVN(1)LCSRSPCKN(1)K N(48.4)CQ(48.4)TLVN(48.4)LCSRSPCKN(48.4)K 1 3 2.0569 4186100 0 0 4186100 NaN 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 382 1155 1059 1059 3015 3446 9737 10258 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN 1065 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOTCH2 PE=1 SV=3 1 48.4048 0.0210823 48.405 17.83 48.405 1 48.4048 0.0210823 48.405 4 N SCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)CQ(1)TLVN(1)LCSRSPCKN(1)K N(48.4)CQ(48.4)TLVN(48.4)LCSRSPCKN(48.4)K 7 3 2.0569 4186100 0 0 4186100 NaN 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 383 1155 1065 1065 3015 3446 9737 10258 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN 1074 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOTCH2 PE=1 SV=3 1 48.4048 0.0210823 48.405 17.83 48.405 1 48.4048 0.0210823 48.405 4 N NCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLC Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX N(1)CQ(1)TLVN(1)LCSRSPCKN(1)K N(48.4)CQ(48.4)TLVN(48.4)LCSRSPCKN(48.4)K 16 3 2.0569 4186100 0 0 4186100 NaN 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 384 1155 1074 1074 3015 3446 9737 10258 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-3|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-6|APLP2_HUMAN;sp|Q06481|APLP2_HUMAN 506;679;691;735;745;747 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN Isoform 5 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN Isoform 4 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN Isoform 2 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sa 0.576764 2.32821 0.0346465 50.102 22.59 50.102 0.576764 2.32821 0.0346465 50.102 1 N DPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Oxidation (M);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HLN(0.082)KMQ(0.338)N(0.577)HGYEN(0.004)PTYK HLN(-8.48)KMQ(-2.33)N(2.33)HGYEN(-22.16)PTYK 7 3 1.2862 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 385 1168 506 506 1921 2185 6234 6560 6234 6560 20190902_JH_EV_Ubi_2 3922 6234 6560 20190902_JH_EV_Ubi_2 3922 6234 6560 20190902_JH_EV_Ubi_2 3922 sp|Q06730|ZN33A_HUMAN;sp|Q06730-2|ZN33A_HUMAN;sp|Q06730-3|ZN33A_HUMAN 482;483;489 sp|Q06730|ZN33A_HUMAN sp|Q06730|ZN33A_HUMAN sp|Q06730|ZN33A_HUMAN Zinc finger protein 33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF33A PE=1 SV=3;sp|Q06730-2|ZN33A_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF33A;sp|Q06730-3|ZN33A_HUMAN Isoform 3 of Zinc finger protein 33A OS=Homo sa 0.862671 7.9998 0.0266217 60.167 16.748 60.167 0.862671 7.9998 0.0266217 60.167 N PFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXX SN(0.863)LTQ(0.137)HQ(0.001)RIHIGDK SN(8)LTQ(-8)HQ(-31.59)RIHIGDK 2 2 -0.31907 835290 835290 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 835290 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 835290 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 386 1169 482 482 4084 4636 12926 13553 12926 13553 20190902_JH_WT_Ubi_3 14704 12926 13553 20190902_JH_WT_Ubi_3 14704 12926 13553 20190902_JH_WT_Ubi_3 14704 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-7|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-6|SLC31_HUMAN;sp|Q07837|SLC31_HUMAN 135;135;135;135;135 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN Isoform C of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN Isoform E of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837- 1 45.6957 0.027298 45.696 15.96 45.696 1 45.6957 0.027298 45.696 3 N EGPMYQIYPRSFKDSNKDGNGDLKGIQDKLD X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX CLDWWQ(1)EGPMYQ(1)IYPRSFKDSN(1)K CLDWWQ(45.7)EGPMYQ(45.7)IYPRSFKDSN(45.7)K 22 3 0.91032 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 387 1178 135 135 349 412 1173 1260 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN 1358;1358 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 PE=1 SV=2;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 1 56.4136 0.0173109 56.414 26.238 56.414 1 56.4136 0.0173109 56.414 N QKDKFMLQAKVSELKNNMKTLLQQNQQLKLD X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX FMLQ(1)AKVSELKN(1)N(1)MK FMLQ(56.41)AKVSELKN(56.41)N(56.41)MK 12 3 -0.25298 2104900 0 0 2104900 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 388 1185 1358 1358 1264 1431 4012 4220 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN 1359;1359 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 PE=1 SV=2;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 1 56.4136 0.0173109 56.414 26.238 56.414 1 56.4136 0.0173109 56.414 N KDKFMLQAKVSELKNNMKTLLQQNQQLKLDL X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FMLQ(1)AKVSELKN(1)N(1)MK FMLQ(56.41)AKVSELKN(56.41)N(56.41)MK 13 3 -0.25298 2104900 0 0 2104900 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 389 1185 1359 1359 1264 1431 4012 4220 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-8|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-4|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-3|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-2|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-10|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-9|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-6|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-11|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499|PDE4D_HUMAN 100;111;177;197;266;272;280;338;341;402 sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN Isoform 2 of cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE4D;sp|Q08499-8|PDE4D_HUMAN Isoform 6 of cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE4D;sp|Q08499-4|PDE4D_HU 1 59.2522 0.0304921 59.252 12.38 59.252 1 59.2522 0.0304921 59.252 2 N KTEQEDVLAKELEDVNKWGLHVFRIAELSGN X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX FGVKTEQ(1)EDVLAKELEDVN(1)K FGVKTEQ(59.25)EDVLAKELEDVN(59.25)K 19 3 -0.42639 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 390 1188 100 100 1215 1371 3859 4062 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 sp|Q09666|AHNK_HUMAN 2366 sp|Q09666|AHNK_HUMAN sp|Q09666|AHNK_HUMAN sp|Q09666|AHNK_HUMAN Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHNAK PE=1 SV=2 1 53.8608 0.0248742 53.861 26.636 53.861 1 53.8608 0.0248742 53.861 N PKLDADMPEVAVEGPNGKWKTPKFKMPDMHF X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LDADMPEVAVEGPN(1)GKWK LDADMPEVAVEGPN(53.86)GKWK 14 3 -0.20118 517010 517010 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 517010 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 517010 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 391 1190 2366 2366 2525 2869 8213 8635 8213 8635 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8334 8213 8635 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8334 8213 8635 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8334 sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN 2588 sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN Isoform 4 of Dynein heavy chain 14, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH14 1 57.0474 0.0299686 57.047 22.342 57.047 1 57.0474 0.0299686 57.047 N QIISCSLAIYHQVRQNMLPTPTKCHYMFNLR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(1)N(1)MLPTPTK Q(57.05)N(57.05)MLPTPTK 2 2 -1.2362 776910 0 776910 0 NaN 0 0 0 0 776910 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 776910 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 392 1191 2588 2588 3680 4190 11740 12320 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 sp|Q12797-6|ASPH_HUMAN;sp|Q12797-11|ASPH_HUMAN;sp|Q12797-2|ASPH_HUMAN;sp|Q12797|ASPH_HUMAN;sp|Q12797-7|ASPH_HUMAN 12;12;12;12;12 sp|Q12797-6|ASPH_HUMAN sp|Q12797-6|ASPH_HUMAN sp|Q12797-6|ASPH_HUMAN Isoform 6 of Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPH;sp|Q12797-11|ASPH_HUMAN Isoform 11 of Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPH;sp|Q12797-2|ASPH_HUMAN Isoform 2 of Aspart 0.992865 21.4352 3.14087E-09 103.57 82.727 103.57 0.984732 18.0953 0.00350049 73.299 0.992865 21.4352 3.14087E-09 103.57 0.966806 14.6427 0.004708 71.864 0.937029 11.7262 0.000551235 83.755 1 N ____MAQRKNAKSSGNSSSSGSGSGSTSAGS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.007)AKSSGN(0.993)SSSSGSGSGSTSAGSSSPGAR N(-21.44)AKSSGN(21.44)SSSSGSGSGSTSAGSSSPGAR 7 3 0.45336 1095000 1095000 0 0 0.68867 0 128560 365640 228510 372290 0 0 0 0 NaN 0.49844 0.27449 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 128560 0 0 365640 0 0 228510 0 0 372290 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 393 1196 12 12 3001 3430 9705;9706;9707;9708 10222;10223;10224;10225;10226;10227 9708 10227 20190821_JH_WT_Ubi 2647 9708 10227 20190821_JH_WT_Ubi 2647 9708 10227 20190821_JH_WT_Ubi 2647 sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN;sp|Q12802|AKP13_HUMAN;sp|Q12802-2|AKP13_HUMAN 281;281;281 sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP13;sp|Q12802|AKP13_HUMAN A-kinase anchor protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP13 PE=1 SV=2;sp|Q12802-2|AKP13_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 13 O 0.626686 6.9971 0.0255667 49.081 13.731 49.081 0.626686 6.9971 0.0255667 49.081 2 N PFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXX LMN(0.627)IQ(0.624)Q(0.374)Q(0.374)LMKTN(0.002)LK LMN(7)IQ(6.45)Q(-6.45)Q(-6.45)LMKTN(-30.35)LK 3 4 -1.4674 1938500 0 1938500 0 NaN 0 0 0 1938500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1938500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 394 1197 281 281 2721 3094 8820 9277 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 sp|Q13011|ECH1_HUMAN 73 sp|Q13011|ECH1_HUMAN sp|Q13011|ECH1_HUMAN sp|Q13011|ECH1_HUMAN Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECH1 PE=1 SV=2 0.491748 0 0.0278598 58.699 16.616 58.699 0.444608 0 0.033584 45.908 0.491748 0 0.0278598 58.699 N LRVTSAQKHVLHVQLNRPNKRNAMNKVFWRE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX HVLHVQ(0.017)LN(0.492)RPN(0.492)K HVLHVQ(-14.74)LN(0)RPN(0)K 8 4 2.5359 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 395 1208 73 73 2027 2312 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 sp|Q13011|ECH1_HUMAN 76 sp|Q13011|ECH1_HUMAN sp|Q13011|ECH1_HUMAN sp|Q13011|ECH1_HUMAN Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECH1 PE=1 SV=2 0.491748 0 0.0278598 58.699 16.616 58.699 0.444608 0 0.033584 45.908 0.491748 0 0.0278598 58.699 N TSAQKHVLHVQLNRPNKRNAMNKVFWREMVE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HVLHVQ(0.017)LN(0.492)RPN(0.492)K HVLHVQ(-14.74)LN(0)RPN(0)K 11 4 2.5359 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 396 1208 76 76 2027 2312 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 6674 7022 20190902_JH_WT_Ubi_2 5421 sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN;sp|Q13033|STRN3_HUMAN 424;508 sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN Isoform Alpha of Striatin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRN3;sp|Q13033|STRN3_HUMAN Striatin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRN3 PE=1 SV=3 1 76.2278 0.0274162 76.228 20.141 76.228 1 76.2278 0.0274162 76.228 2 N PVLVTASEDHTLKLWNLQKTVPAKKSASLDV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX LWN(1)LQ(1)KTVPAK LWN(76.23)LQ(76.23)KTVPAK 3 3 -1.5197 5035200 0 5035200 0 NaN 0 0 0 0 5035200 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5035200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 397 1209 424 424 2865 3248 9234 9719 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 sp|Q13045-3|FLII_HUMAN;sp|Q13045|FLII_HUMAN 171;182 sp|Q13045-3|FLII_HUMAN sp|Q13045-3|FLII_HUMAN sp|Q13045-3|FLII_HUMAN Isoform 3 of Protein flightless-1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLII;sp|Q13045|FLII_HUMAN Protein flightless-1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLII PE=1 SV=2 0.751143 5.03656 0.000275465 87.157 68.703 87.157 0.751143 5.03656 0.000275465 87.157 1 N PPQMRRLVHLQTLVLNGNPLLHAQLRQLPAM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LVHLQ(0.013)TLVLN(0.751)GN(0.236)PLLHAQLR LVHLQ(-17.64)TLVLN(5.04)GN(-5.04)PLLHAQ(-33.08)LR 10 3 -0.94939 1128500 1128500 0 0 NaN 0 1128500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1128500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 398 1210 171 171 2843 3225 9173 9654 9173 9654 20190821_JH_MUT_Ubi 11125 9173 9654 20190821_JH_MUT_Ubi 11125 9173 9654 20190821_JH_MUT_Ubi 11125 sp|Q13148|TADBP_HUMAN 70 sp|Q13148|TADBP_HUMAN sp|Q13148|TADBP_HUMAN sp|Q13148|TADBP_HUMAN TAR DNA-binding protein 43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TARDBP PE=1 SV=1 0.999893 39.7015 0.00108406 73.448 39.44 73.448 0.999893 39.7015 0.00108406 73.448 1 N RLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX LVEGILHAPDAGWGN(1)LVYVVNYPK LVEGILHAPDAGWGN(39.7)LVYVVN(-39.7)YPK 15 3 4.1201 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 399 1217 70 70 2836 3217 9154 9634 9154 9634 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13152 9154 9634 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13152 9154 9634 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13152 sp|Q13200|PSMD2_HUMAN;sp|Q13200-2|PSMD2_HUMAN;sp|Q13200-3|PSMD2_HUMAN 452;293;322 sp|Q13200|PSMD2_HUMAN sp|Q13200|PSMD2_HUMAN sp|Q13200|PSMD2_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD2 PE=1 SV=3;sp|Q13200-2|PSMD2_HUMAN Isoform 2 of 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD2;sp|Q13200-3|PSMD2_HUMAN Iso 1 73.4585 0.010033 73.459 42.874 73.459 1 73.4585 0.010033 73.459 1 N EDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLS X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX YLYSSEDYIKSGALLACGIVN(1)SGVR YLYSSEDYIKSGALLACGIVN(73.46)SGVR 21 3 1.5493 714300 714300 0 0 0.038443 0 714300 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.19362 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 714300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 400 1224 452 452 5173 5883 16673 17525 16673 17525 20190821_JH_MUT_Ubi 12295 16673 17525 20190821_JH_MUT_Ubi 12295 16673 17525 20190821_JH_MUT_Ubi 12295 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN 613 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN Multimerin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MMRN1 PE=1 SV=3 0.884811 8.29524 0.0310098 41.482 12.591 41.482 0.884811 8.29524 0.0310098 41.482 3 N KCRNDFKFQLKDTEENLHVLNQTLAEVLFPM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DTEEN(0.885)LHVLN(0.222)Q(0.897)TLAEVLFPMDN(0.997)KMDK DTEEN(8.3)LHVLN(-8.3)Q(8.76)TLAEVLFPMDN(23.54)KMDK 5 3 0.44151 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 401 1225 613 613 702 798 2198 2324 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN 630 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN Multimerin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MMRN1 PE=1 SV=3 0.996556 23.5388 0.0310098 41.482 12.591 41.482 0.996556 23.5388 0.0310098 41.482 3 N HVLNQTLAEVLFPMDNKMDKMSEQLNDLTYD X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX DTEEN(0.885)LHVLN(0.222)Q(0.897)TLAEVLFPMDN(0.997)KMDK DTEEN(8.3)LHVLN(-8.3)Q(8.76)TLAEVLFPMDN(23.54)KMDK 22 3 0.44151 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 402 1225 630 630 702 798 2198 2324 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN 742 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAM9 PE=1 SV=1 0.998853 29.4025 9.86816E-13 157.07 128.11 157.07 0.998853 29.4025 9.86816E-13 157.07 1 N YFRKKRSQTYESDGKNQANPSRQPGSVPRHV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SQTYESDGKN(0.999)Q(0.001)ANPSR SQ(-110.37)TYESDGKN(29.4)Q(-29.4)AN(-59.99)PSR 10 3 1.8065 10883000 10883000 0 0 0.040565 0 0 0 0 10883000 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN 0.23989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10883000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 403 1239 742 742 4133 4698 13110 13748 13110 13748 20190902_JH_EV_Ubi_3 3775 13110 13748 20190902_JH_EV_Ubi_3 3775 13110 13748 20190902_JH_EV_Ubi_3 3775 sp|Q13488-2|VPP3_HUMAN;sp|Q13488|VPP3_HUMAN 471;687 sp|Q13488-2|VPP3_HUMAN sp|Q13488-2|VPP3_HUMAN sp|Q13488-2|VPP3_HUMAN Isoform Short of V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCIRG1;sp|Q13488|VPP3_HUMAN V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCIRG1 PE=1 SV=3 0.999998 58.6417 1.08298E-05 96.777 63.146 96.777 0.99999 55.2232 0.00692027 74.627 0.999998 58.6417 1.08298E-05 96.777 1 N EENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDE X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX QEENKAGLLDLPDASVN(1)GWSSDEEK Q(-62.07)EEN(-58.64)KAGLLDLPDASVN(58.64)GWSSDEEK 17 3 0.72866 4129600 4129600 0 0 NaN 1191900 0 2937700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1191900 0 0 0 0 0 2937700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 404 1242 471 471 3613 4122 11611;11612 12188;12189 11612 12189 20190821_JH_WT_Ubi 10763 11612 12189 20190821_JH_WT_Ubi 10763 11612 12189 20190821_JH_WT_Ubi 10763 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN;sp|Q13740|CD166_HUMAN 120;120 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN Isoform 2 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM;sp|Q13740|CD166_HUMAN CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM PE=1 SV=2 1 75.7435 0.00165929 75.743 13.64 75.743 1 75.7435 0.00165929 75.743 1 N ISDEKRFVCMLVTEDNVFEAPTIVKVFKQPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX FVCMLVTEDN(1)VFEAPTIVKVFK FVCMLVTEDN(75.74)VFEAPTIVKVFK 10 3 -2.1929 921200 921200 0 0 NaN 921200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 921200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 405 1260 120 120 1319 1494 4162 4374 4162 4374 20190821_JH_EV_Ubi 12551 4162 4374 20190821_JH_EV_Ubi 12551 4162 4374 20190821_JH_EV_Ubi 12551 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN;sp|Q13740|CD166_HUMAN;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN 554;567;289 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN Isoform 2 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM;sp|Q13740|CD166_HUMAN CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM PE=1 SV=2;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN Isoform 4 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM 0.864229 8.39377 0.0262814 85.672 24.14 85.672 0.864229 8.39377 0.0262814 85.672 1 N KKSKTASKHVNKDLGNMEENKKLEENNHKTE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX HVN(0.011)KDLGN(0.864)MEEN(0.125)K HVN(-19.13)KDLGN(8.39)MEEN(-8.39)K 8 3 4.4545 128870 128870 0 0 0.0043208 0 128870 0 0 0 0 0 0 0 0 0.026748 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 128870 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 406 1260 554 554 2029 2316 6690 7038 6690 7038 20190821_JH_MUT_Ubi 2505 6690 7038 20190821_JH_MUT_Ubi 2505 6690 7038 20190821_JH_MUT_Ubi 2505 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN;sp|Q13740|CD166_HUMAN;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN 564;577;299 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN Isoform 2 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM;sp|Q13740|CD166_HUMAN CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM PE=1 SV=2;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN Isoform 4 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM 0.99603 24.0208 0.0336426 80.455 23.734 80.455 0.99603 24.0208 0.0336426 80.455 1 N NKDLGNMEENKKLEENNHKTEA_________ X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KLEEN(0.996)N(0.004)HK KLEEN(24.02)N(-24.02)HK 5 3 1.4648 382300 382300 0 0 NaN 0 382300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 382300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 407 1260 564 564 2382 2710 7811 8213 7811 8213 20190821_JH_MUT_Ubi 33 7811 8213 20190821_JH_MUT_Ubi 33 7811 8213 20190821_JH_MUT_Ubi 33 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN;sp|Q13740|CD166_HUMAN;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN 361;361;83 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN Isoform 2 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM;sp|Q13740|CD166_HUMAN CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM PE=1 SV=2;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN Isoform 4 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM 1 59.9752 0.0208301 64.65 15.57 59.975 1 64.6504 0.0208301 64.65 1 59.9752 0.0267248 59.975 2 N IGDALPVSCTISASRNATVVWMKDNIRLRSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX N(1)ATVVWMKDN(1)IR N(59.98)ATVVWMKDN(59.98)IR 1 3 2.1811 12569000 0 12569000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4955400 7613700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4955400 0 0 7613700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 408 1260 361 361 3008 3438 9722;9723 10243;10244 9723 10244 20190902_JH_WT_Ubi_3 5927 9722 10243 20190902_JH_WT_Ubi_2 6126 9722 10243 20190902_JH_WT_Ubi_2 6126 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN;sp|Q13740|CD166_HUMAN;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN 370;370;92 sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN sp|Q13740-2|CD166_HUMAN Isoform 2 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM;sp|Q13740|CD166_HUMAN CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM PE=1 SV=2;sp|Q13740-4|CD166_HUMAN Isoform 4 of CD166 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALCAM 1 59.9752 0.0208301 64.65 15.57 59.975 1 64.6504 0.0208301 64.65 1 59.9752 0.0267248 59.975 2 N TISASRNATVVWMKDNIRLRSSPSFSSLHYQ X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX N(1)ATVVWMKDN(1)IR N(59.98)ATVVWMKDN(59.98)IR 10 3 2.1811 12569000 0 12569000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4955400 7613700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4955400 0 0 7613700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 409 1260 370 370 3008 3438 9722;9723 10243;10244 9723 10244 20190902_JH_WT_Ubi_3 5927 9722 10243 20190902_JH_WT_Ubi_2 6126 9722 10243 20190902_JH_WT_Ubi_2 6126 sp|Q14147|DHX34_HUMAN 647 sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX34 PE=1 SV=2 0.906581 9.29242 0.0198629 44.729 13.255 44.729 0.906581 9.29242 0.0198629 44.729 3 N RRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRN X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX PLESDQ(1)GDPFTLFN(0.907)VFN(0.206)AWVQ(0.887)VK PLESDQ(34.61)GDPFTLFN(9.29)VFN(-8.48)AWVQ(8.48)VK 14 3 1.9269 5285300 0 0 5285300 NaN 4383100 0 0 0 0 902190 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 4383100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 902190 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 410 1278 647 647 3414 3896 10930;10931 11494;11495 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 sp|Q14147|DHX34_HUMAN 650 sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX34 PE=1 SV=2 0.541794 0.306002 0.0209304 44.105 8.6837 44.105 0.541794 0.306002 0.0209304 44.105 3 N LESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRK X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX PLESDQ(1)GDPFTLFN(0.508)VFN(0.542)AWVQ(0.95)VK PLESDQ(30.92)GDPFTLFN(-0.31)VFN(0.31)AWVQ(9.95)VK 17 3 2.6166 902190 0 0 902190 NaN 0 0 0 0 0 902190 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 902190 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 411 1278 650 650 3414 3896 10931 11495 10931 11495 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7770 10931 11495 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7770 10931 11495 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7770 sp|Q14151|SAFB2_HUMAN;sp|Q15424-2|SAFB1_HUMAN;sp|Q15424|SAFB1_HUMAN;sp|Q15424-4|SAFB1_HUMAN;sp|Q15424-3|SAFB1_HUMAN 425;355;424;424;424 sp|Q14151|SAFB2_HUMAN;sp|Q15424-2|SAFB1_HUMAN sp|Q15424-2|SAFB1_HUMAN sp|Q14151|SAFB2_HUMAN Scaffold attachment factor B2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAFB2 PE=1 SV=1;sp|Q15424-2|SAFB1_HUMAN Isoform 2 of Scaffold attachment factor B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAFB;sp|Q15424|SAFB1_HUMAN Scaffold attachment factor B1 OS=Homo sa 1 67.8972 0.032919 67.897 23.472 67.897 1 67.8972 0.032919 67.897 N WVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX ATDLKN(1)LFSK ATDLKN(67.9)LFSK 6 2 -0.88277 2703600 2703600 0 0 NaN 0 0 0 0 2703600 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2703600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 412 1279;1348 425;355 355 296 347 996 1079 996 1079 20190902_JH_EV_Ubi_3 4864 996 1079 20190902_JH_EV_Ubi_3 4864 996 1079 20190902_JH_EV_Ubi_3 4864 sp|Q14207|NPAT_HUMAN 268 sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN Protein NPAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPAT PE=1 SV=3 0.926109 9.55798 0.0335932 40.968 10.816 40.968 0.926109 9.55798 0.0335932 40.968 N ILSNKSLQEKLAENINKFLTSDNNIAQVPKQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX LAEN(0.025)IN(0.926)KFLTSDN(0.506)N(0.56)IAQ(0.983)VPK LAEN(-16.94)IN(9.56)KFLTSDN(-0.54)N(0.54)IAQ(16.56)VPK 6 3 -3.721 901850 0 0 901850 NaN 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 413 1285 268 268 2496 2834 8117 8534 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 sp|Q14207|NPAT_HUMAN 276 sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN Protein NPAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPAT PE=1 SV=3 0.559951 0.536013 0.0335932 40.968 10.816 40.968 0.559951 0.536013 0.0335932 40.968 N EKLAENINKFLTSDNNIAQVPKQTDNNPTEP X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LAEN(0.025)IN(0.926)KFLTSDN(0.506)N(0.56)IAQ(0.983)VPK LAEN(-16.94)IN(9.56)KFLTSDN(-0.54)N(0.54)IAQ(16.56)VPK 14 3 -3.721 901850 0 0 901850 NaN 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 414 1285 276 276 2496 2834 8117 8534 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 sp|Q14498-3|RBM39_HUMAN;sp|Q14498-2|RBM39_HUMAN;sp|Q14498|RBM39_HUMAN 467;483;489 sp|Q14498-3|RBM39_HUMAN sp|Q14498-3|RBM39_HUMAN sp|Q14498-3|RBM39_HUMAN Isoform 3 of RNA-binding protein 39 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM39;sp|Q14498-2|RBM39_HUMAN Isoform 2 of RNA-binding protein 39 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM39;sp|Q14498|RBM39_HUMAN RNA-binding protein 39 OS=Homo sapiens OX=9606 G 1 76.0097 0.0047758 76.01 37.336 76.01 1 76.0097 0.0047758 76.01 1 N VYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX CPSIAAAIAAVN(1)ALHGR CPSIAAAIAAVN(76.01)ALHGR 12 3 0.46724 926470 926470 0 0 NaN 0 0 0 0 926470 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 926470 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 415 1294 467 467 360 427 1199 1286 1199 1286 20190902_JH_EV_Ubi_3 11938 1199 1286 20190902_JH_EV_Ubi_3 11938 1199 1286 20190902_JH_EV_Ubi_3 11938 sp|Q14542-3|S29A2_HUMAN;sp|Q14542|S29A2_HUMAN 247;247 sp|Q14542-3|S29A2_HUMAN sp|Q14542-3|S29A2_HUMAN sp|Q14542-3|S29A2_HUMAN Isoform 3 of Equilibrative nucleoside transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC29A2;sp|Q14542|S29A2_HUMAN Equilibrative nucleoside transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC29A2 PE=1 SV=3 0.994095 22.9887 1.18981E-05 90.127 62.036 90.127 0.994095 22.9887 1.18981E-05 90.127 1 N AQELETKAELLQSDENGIPSSPQKVALTLDL X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SSQAQAQELETKAELLQ(0.005)SDEN(0.994)GIPSSPQ(0.001)K SSQ(-64.68)AQ(-64.68)AQ(-60.52)ELETKAELLQ(-22.99)SDEN(22.99)GIPSSPQ(-30.39)K 21 3 -0.89065 469500 469500 0 0 NaN 0 469500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 469500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 416 1295 247 247 4172 4739 13208 13851 13208 13851 20190821_JH_MUT_Ubi 9038 13208 13851 20190821_JH_MUT_Ubi 9038 13208 13851 20190821_JH_MUT_Ubi 9038 sp|Q14764|MVP_HUMAN 886 sp|Q14764|MVP_HUMAN sp|Q14764|MVP_HUMAN sp|Q14764|MVP_HUMAN Major vault protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MVP PE=1 SV=4 0.965236 14.4951 1.43559E-06 85.76 66.023 85.76 0.965236 14.4951 1.43559E-06 85.76 1 N GISPQSAQAPQAPGDNHVVPVLR________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX VASGPSPGEGISPQSAQAPQ(0.034)APGDN(0.965)HVVPVLR VASGPSPGEGISPQ(-39.62)SAQ(-34.14)APQ(-14.5)APGDN(14.5)HVVPVLR 25 3 -0.28522 1893300 1893300 0 0 0.086437 0 0 0 0 0 0 0 0 1893300 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0.19989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1893300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 417 1306 886 886 4715 5350 15135 15902 15135 15902 20190902_JH_WT_Ubi_3 10610 15135 15902 20190902_JH_WT_Ubi_3 10610 15135 15902 20190902_JH_WT_Ubi_3 10610 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN 640 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN Sodium/hydrogen exchanger 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC9A5 PE=1 SV=2 0.666666 0 0.028623 66.692 11.71 66.692 0.666666 0 0.028623 66.692 N SEDAQERQDKEVFQQNMKRRLESFKSTKHNI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX QDKEVFQ(0.667)Q(0.667)N(0.667)MK Q(-55.2)DKEVFQ(0)Q(0)N(0)MK 9 2 1.4399 555140 0 555140 0 NaN 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 418 1310 640 640 3611 4120 11609 12186 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 sp|Q14995|NR1D2_HUMAN 523 sp|Q14995|NR1D2_HUMAN sp|Q14995|NR1D2_HUMAN sp|Q14995|NR1D2_HUMAN Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1D2 PE=1 SV=3 0.993575 21.8923 0.0361446 47.09 15.434 47.09 0.993575 21.8923 0.0361446 47.09 2 N AVVLVSADRSGIENVNSVEALQETLIRALRT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX SGIEN(0.007)VN(0.994)SVEALQ(1)ETLIR SGIEN(-21.89)VN(21.89)SVEALQ(38.3)ETLIR 7 3 0.64195 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 419 1312 523 523 3928 4460 12441 13048 12441 13048 20190821_JH_MUT_Ubi 6906 12441 13048 20190821_JH_MUT_Ubi 6906 12441 13048 20190821_JH_MUT_Ubi 6906 sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8-3|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8-2|RHG19_HUMAN 289;280;289;289 sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN Isoform 7 of Rho GTPase-activating protein 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP19;sp|Q14CB8-3|RHG19_HUMAN Isoform 3 of Rho GTPase-activating protein 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP19;sp|Q14CB8|RHG19_HUMAN Rho GTPase-activating 0.884561 8.24014 0.0277676 60.518 22.432 60.518 0.884561 8.24014 0.0277676 60.518 2 N HVLWPKNVTANDLQENITKLNSGMAFMIKHS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX NVTAN(0.231)DLQ(0.885)EN(0.885)ITK N(-42.25)VTAN(-8.24)DLQ(8.24)EN(8.24)ITK 10 2 -1.9037 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 420 1313 289 289 3264 3728 10474 11019 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 sp|Q15004-2|PAF15_HUMAN;sp|Q15004|PAF15_HUMAN 34;34 sp|Q15004-2|PAF15_HUMAN sp|Q15004-2|PAF15_HUMAN sp|Q15004-2|PAF15_HUMAN Isoform 2 of PCNA-associated factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCLAF;sp|Q15004|PAF15_HUMAN PCNA-associated factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCLAF PE=1 SV=1 1 55.4367 0.0102462 55.437 24.894 55.437 1 51.6838 0.0102462 51.684 1 55.4367 0.0207567 55.437 1 N ARAPRKVLGSSTSATNSTSVSSRKEHVLCNL X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX KVLGSSTSATN(1)STSVSSR KVLGSSTSATN(55.44)STSVSSR 11 3 -0.54293 4767000 4767000 0 0 0.08787 0 1517800 0 0 0 3249100 0 0 0 0 0.20909 0 0 0 0.34277 0 0 0 0 0 0 1517800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3249100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 421 1314 34 34 2479 2815 8079;8080 8492;8493 8080 8493 20190902_JH_MUT_Ubi_2 4826 8080 8493 20190902_JH_MUT_Ubi_2 4826 8079 8492 20190821_JH_MUT_Ubi 3446 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN;sp|Q15043|S39AE_HUMAN 279;279;279 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN Isoform 2 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN Isoform 3 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043|S39AE_HUMAN Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX= 1 42.4683 0.000137083 73.655 54.69 42.468 0.489795 0 0.000171578 63.893 0.947295 15.4916 0.00727481 43.068 0.499413 0 0.000137083 66.545 0.448877 0 0.00759963 42.347 1 42.4683 0.0015671 73.655 1;4 N PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSEL X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KDQ(1)EEGVMEKLQ(1)N(1)GDLDHMIPQ(1)HCSSELDGK KDQ(42.47)EEGVMEKLQ(42.47)N(42.47)GDLDHMIPQ(42.47)HCSSELDGK 13 3 -0.80643 17859000 17859000 0 0 NaN 0 0 6259700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 6259700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 422 1320 279 279 656;2327 751;2647 2060;2062;7651 2184;2186;8048 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 2062 2186 20190902_JH_WT_Ubi_3 8622 2058 2182 20190902_JH_EV_Ubi_3 7453 sp|Q15058|KIF14_HUMAN 1000 sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN Kinesin-like protein KIF14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF14 PE=1 SV=1 0.678557 0 0.0342551 50.607 9.0669 50.607 0.678557 0 0.0342551 50.607 3 N AELREESQRKKMQEINNQKANHKIEELEKAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KKMQ(0.679)EIN(0.679)N(0.679)Q(0.964)K KKMQ(0)EIN(0)N(0)Q(9.58)K 7 2 -0.96644 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 423 1324 1000 1000 2372 2698 7789 8191 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 sp|Q15058|KIF14_HUMAN 1001 sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN Kinesin-like protein KIF14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF14 PE=1 SV=1 0.678557 0 0.0342551 50.607 9.0669 50.607 0.678557 0 0.0342551 50.607 3 N ELREESQRKKMQEINNQKANHKIEELEKAKQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX KKMQ(0.679)EIN(0.679)N(0.679)Q(0.964)K KKMQ(0)EIN(0)N(0)Q(9.58)K 8 2 -0.96644 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 424 1324 1001 1001 2372 2698 7789 8191 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 sp|Q15075|EEA1_HUMAN 475 sp|Q15075|EEA1_HUMAN sp|Q15075|EEA1_HUMAN sp|Q15075|EEA1_HUMAN Early endosome antigen 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEA1 PE=1 SV=2 0.96353 14.5452 0.0297002 48.513 8.6982 48.513 0.96353 14.5452 0.0297002 48.513 N LKLSRLEEQLKEKVTNSTELQHQLDKTKQQH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX VTN(0.964)STELQ(0.034)HQ(0.003)LDK VTN(14.55)STELQ(-14.55)HQ(-25.63)LDK 3 4 0.98658 192290 192290 0 0 NaN 0 192290 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 192290 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 425 1326 475 475 5032 5714 16229 17060 16229 17060 20190821_JH_MUT_Ubi 2359 16229 17060 20190821_JH_MUT_Ubi 2359 16229 17060 20190821_JH_MUT_Ubi 2359 sp|Q15366-7|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-8|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-4|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-5|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-6|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-3|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366|PCBP2_HUMAN;sp|Q15366-2|PCBP2_HUMAN 89;89;89;89;89;89;89;89 sp|Q15366-7|PCBP2_HUMAN sp|Q15366-7|PCBP2_HUMAN sp|Q15366-7|PCBP2_HUMAN Isoform 7 of Poly(rC)-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCBP2;sp|Q15366-8|PCBP2_HUMAN Isoform 8 of Poly(rC)-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCBP2;sp|Q15366-4|PCBP2_HUMAN Isoform 4 of Poly(rC)-binding protein 1 42.6394 0.0324027 42.639 11.956 42.639 1 42.6394 0.0324027 42.639 1 N MIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX LEEDISSSMTN(1)STAASRPPVTLR LEEDISSSMTN(42.64)STAASRPPVTLR 11 3 2.274 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 426 1342 89 89 2553 2901 8297 8722 8297 8722 20190902_JH_WT_Ubi_3 9181 8297 8722 20190902_JH_WT_Ubi_3 9181 8297 8722 20190902_JH_WT_Ubi_3 9181 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN;sp|Q15413|RYR3_HUMAN 2794;2794;2794 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN Isoform 3 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN Isoform 2 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413|RYR3_HUMAN Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3 PE=1 1 41.7598 0.0291025 41.76 15.556 41.76 1 41.7598 0.0291025 41.76 2 N KDREKAQDLFKFLQVNGIIVSRGMKDMELDA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FLQ(1)VN(1)GIIVSRGMKDMELDASSMEK FLQ(41.76)VN(41.76)GIIVSRGMKDMELDASSMEK 5 3 2.3982 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 427 1347 2794 2794 1251 1414 3966 4171 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN;sp|Q15413|RYR3_HUMAN 961;961;961 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN Isoform 3 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN Isoform 2 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413|RYR3_HUMAN Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3 PE=1 0.568787 1.20258 0.035959 43.991 6.3778 43.991 0.568787 1.20258 0.035959 43.991 1 N EDLKKVKLPKNYMMSNGYKPAPLDLSDVKLL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX VKLPKN(0.431)YMMSN(0.569)GYK VKLPKN(-1.2)YMMSN(1.2)GYK 11 3 0.96369 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 428 1347 961 961 4876 5536 15672 16471 15672 16471 20190902_JH_EV_Ubi_2 4217 15672 16471 20190902_JH_EV_Ubi_2 4217 15672 16471 20190902_JH_EV_Ubi_2 4217 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN 234 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBMS2 PE=1 SV=1 0.999999 64.2116 0.00351801 95.741 48.167 95.741 0.999999 64.2116 0.00351801 95.741 N DGGPKKRQNQGKFVQNGRAWPRNADMGVMAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(0.119)N(0.119)Q(0.761)GKFVQ(1)N(1)GR Q(-8.04)N(-8.04)Q(8.04)GKFVQ(40.97)N(64.21)GR 9 2 1.3246 11929000 0 0 11929000 NaN 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 429 1349 234 234 3682 4192 11745 12326 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN;sp|Q15532|SSXT_HUMAN 40;40 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN Isoform 2 of Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18;sp|Q15532|SSXT_HUMAN Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18 PE=1 SV=3 0.499963 0 0.0205461 57.173 24.82 57.173 0.499963 0 0.0205461 57.173 2 N LDDNNHLIQCIMDSQNKGKTSECSQYQQMLH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MLDDN(0.331)N(0.087)HLIQ(0.583)CIMDSQ(0.5)N(0.5)KGK MLDDN(-2.41)N(-8.27)HLIQ(2.41)CIMDSQ(0)N(0)KGK 17 3 3.2784 2014100 0 2014100 0 NaN 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 430 1354 40 40 2933 3334 9460 9958 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 sp|Q15643|TRIPB_HUMAN 484 sp|Q15643|TRIPB_HUMAN sp|Q15643|TRIPB_HUMAN sp|Q15643|TRIPB_HUMAN Thyroid receptor-interacting protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIP11 PE=1 SV=3 0.692191 6.10246 0.0117633 47.814 9.0577 47.814 0.692191 6.10246 0.0117633 47.814 1 N LHDLRLNLEAKEQELNQSISEKETLIAEIEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(0.138)ELN(0.692)Q(0.17)SISEKETLIAEIEELDR EQ(-7)ELN(6.1)Q(-6.1)SISEKETLIAEIEELDR 5 4 -1.2797 1101700 1101700 0 0 NaN 0 0 0 1101700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1101700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 431 1359 484 484 1064 1197 3373 3548 3373 3548 20190902_JH_EV_Ubi_2 5530 3373 3548 20190902_JH_EV_Ubi_2 5530 3373 3548 20190902_JH_EV_Ubi_2 5530 sp|Q15643|TRIPB_HUMAN 587 sp|Q15643|TRIPB_HUMAN sp|Q15643|TRIPB_HUMAN sp|Q15643|TRIPB_HUMAN Thyroid receptor-interacting protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIP11 PE=1 SV=3 0.963942 14.4378 0.0311488 58.815 9.7183 58.815 0.963942 14.4378 0.0311488 58.815 N NDLHLTKQKLEDKVENLVDQLNKSQESNVSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX VEN(0.964)LVDQ(0.035)LN(0.001)K VEN(14.44)LVDQ(-14.44)LN(-28.5)K 3 2 3.8232 8406500 8406500 0 0 NaN 0 0 8406500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 8406500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 432 1359 587 587 4795 5439 15371 16144 15371 16144 20190821_JH_WT_Ubi 10160 15371 16144 20190821_JH_WT_Ubi 10160 15371 16144 20190821_JH_WT_Ubi 10160 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-4|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-5|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-2|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-3|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-6|MYLK_HUMAN;sp|Q15746|MYLK_HUMAN 88;366;366;1219;1288;1219;1288;1288;1288 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN Isoform 7 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN Isoform 9 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN Isoform 5 of M 0.900919 10.7314 0.00485256 53.964 6.361 53.964 0.692535 3.75682 0.00632218 51.044 0.806824 7.22643 0.00557164 52.09 0.900919 10.7314 0.00485256 53.964 0.599587 1.6831 0.0219923 41.45 0.645009 3.54352 0.0206218 42.289 0.817483 5.21929 0.0188402 43.38 2 N KFRKQIQESEHMKVENSENGSKLTILAARQE X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX Q(0.802)IQ(0.218)ESEHMKVEN(0.901)SEN(0.079)GSKLTILAAR Q(6.03)IQ(-6.03)ESEHMKVEN(10.73)SEN(-10.73)GSKLTILAAR 12 4 0.66036 52924000 0 52924000 0 NaN 0 4797500 0 15606000 14891000 7317600 3761300 0 6551100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4797500 0 0 0 0 0 15606000 0 0 14891000 0 0 7317600 0 0 3761300 0 0 0 0 0 6551100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 433 1363 88 88 3640 4149 11669;11670;11671;11672;11673;11674 12247;12248;12249;12250;12251;12252 11670 12248 20190902_JH_EV_Ubi_3 5299 11670 12248 20190902_JH_EV_Ubi_3 5299 11670 12248 20190902_JH_EV_Ubi_3 5299 sp|Q15758-3|AAAT_HUMAN;sp|Q15758-2|AAAT_HUMAN;sp|Q15758|AAAT_HUMAN 290;316;518 sp|Q15758-3|AAAT_HUMAN sp|Q15758-3|AAAT_HUMAN sp|Q15758-3|AAAT_HUMAN Isoform 3 of Neutral amino acid transporter B(0) OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A5;sp|Q15758-2|AAAT_HUMAN Isoform 2 of Neutral amino acid transporter B(0) OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A5;sp|Q15758|AAAT_HUMAN Neutral amino acid tran 0.998975 29.8875 1.12374E-14 113.68 85.584 113.68 0.779762 5.4905 9.75077E-06 88.433 0.998975 29.8875 1.12374E-14 113.68 1 N SELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGDATV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX STEPELIQ(0.001)VKSELPLDPLPVPTEEGN(0.999)PLLK STEPELIQ(-29.89)VKSELPLDPLPVPTEEGN(29.89)PLLK 26 3 1.031 5664600 5664600 0 0 0.009726 0 0 0 0 0 2607400 0 0 3057200 0 0 0 0 0 0.069834 0 0 0.04347 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2607400 0 0 0 0 0 0 0 0 3057200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 434 1364 290 290 4187 4756 13260;13261 13909;13910;13911 13261 13910 20190902_JH_WT_Ubi_3 15157 13261 13910 20190902_JH_WT_Ubi_3 15157 13261 13910 20190902_JH_WT_Ubi_3 15157 sp|Q15842|KCNJ8_HUMAN 402 sp|Q15842|KCNJ8_HUMAN sp|Q15842|KCNJ8_HUMAN sp|Q15842|KCNJ8_HUMAN ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KCNJ8 PE=1 SV=1 0.899969 9.54091 0.0230126 66.351 12.797 66.351 0.899969 9.54091 0.0230126 66.351 N RRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX RN(0.1)N(0.9)SSLMVPK RN(-9.54)N(9.54)SSLMVPK 3 2 -0.63102 844950 844950 0 0 NaN 844950 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 844950 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 435 1368 402 402 3773 4287 11946 12529 11946 12529 20190821_JH_EV_Ubi 2817 11946 12529 20190821_JH_EV_Ubi 2817 11946 12529 20190821_JH_EV_Ubi 2817 sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN;sp|Q15907|RB11B_HUMAN 146;146 sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN Isoform 2 of Ras-related protein Rab-11B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB11B;sp|Q15907|RB11B_HUMAN Ras-related protein Rab-11B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB11B PE=1 SV=4 0.709027 3.87101 0.00108124 84.127 59.491 68.927 0.499999 0 0.00108124 84.127 0.709027 3.87101 0.016917 68.927 1 N LRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AFAEKN(0.709)N(0.291)LSFIETSALDSTNVEEAFK AFAEKN(3.87)N(-3.87)LSFIETSALDSTN(-35.66)VEEAFK 6 3 -0.20477 2082700 2082700 0 0 0.043609 0 1196400 0 0 0 886250 0 0 0 0 0.1359 0 NaN NaN 0.17084 0 NaN 0 0 0 0 1196400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 886250 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 436 1370 146 146 107 122 378;379 418;419 379 419 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14084 378 418 20190821_JH_MUT_Ubi 12934 378 418 20190821_JH_MUT_Ubi 12934 sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN;sp|Q15907|RB11B_HUMAN 147;147 sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN sp|Q15907-2|RB11B_HUMAN Isoform 2 of Ras-related protein Rab-11B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB11B;sp|Q15907|RB11B_HUMAN Ras-related protein Rab-11B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB11B PE=1 SV=4 0.499999 0 0.00108124 84.127 59.491 84.127 0.499999 0 0.00108124 84.127 1 N RAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AFAEKN(0.5)N(0.5)LSFIETSALDSTNVEEAFK AFAEKN(0)N(0)LSFIETSALDSTN(-52.69)VEEAFK 7 3 0.34878 1196400 1196400 0 0 0.025052 0 1196400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.1359 0 NaN NaN 0 0 NaN 0 0 0 0 1196400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 437 1370 147 147 107 122 378 418 378 418 20190821_JH_MUT_Ubi 12934 378 418 20190821_JH_MUT_Ubi 12934 378 418 20190821_JH_MUT_Ubi 12934 sp|Q16181-2|SEPT7_HUMAN;sp|Q16181|SEPT7_HUMAN 257;258 sp|Q16181-2|SEPT7_HUMAN sp|Q16181-2|SEPT7_HUMAN sp|Q16181-2|SEPT7_HUMAN Isoform 2 of Septin-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT7;sp|Q16181|SEPT7_HUMAN Septin-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT7 PE=1 SV=2 0.996256 24.2507 7.98679E-09 132.51 107.59 132.51 0.996256 24.2507 7.98679E-09 132.51 0.993408 21.7814 0.0165915 67.902 1 N RLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX DRLPLAVVGSN(0.004)TIIEVN(0.996)GK DRLPLAVVGSN(-24.25)TIIEVN(24.25)GK 17 3 -0.43759 5923900 5923900 0 0 NaN 0 0 4562600 0 0 0 0 1361300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 4562600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1361300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 438 1373 257 257 673 768 2103;2104 2228;2229 2103 2228 20190821_JH_WT_Ubi 11965 2103 2228 20190821_JH_WT_Ubi 11965 2103 2228 20190821_JH_WT_Ubi 11965 sp|Q16555-2|DPYL2_HUMAN;sp|Q16555|DPYL2_HUMAN 165;201 sp|Q16555-2|DPYL2_HUMAN sp|Q16555-2|DPYL2_HUMAN sp|Q16555-2|DPYL2_HUMAN Isoform 2 of Dihydropyrimidinase-related protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPYSL2;sp|Q16555|DPYL2_HUMAN Dihydropyrimidinase-related protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPYSL2 PE=1 SV=1 0.989306 19.6621 1.24366E-36 179.41 137.88 179.41 0.989306 19.6621 1.24366E-36 179.41 1 N SVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX DIGAIAQ(0.011)VHAEN(0.989)GDIIAEEQQR DIGAIAQ(-19.66)VHAEN(19.66)GDIIAEEQ(-93.55)Q(-100.12)R 12 3 0.99709 6787400 6787400 0 0 NaN 0 0 6787400 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 6787400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 439 1376 165 165 530 612 1712 1815 1712 1815 20190821_JH_WT_Ubi 9850 1712 1815 20190821_JH_WT_Ubi 9850 1712 1815 20190821_JH_WT_Ubi 9850 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN 824;1063 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN Isoform 2 of Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1 PE=1 SV=3 0.578622 0.395302 0.0172781 53.565 9.7037 53.565 0.578622 0.395302 0.0172781 53.565 3 N MAQSGDAVSVKIEEENQDLMHFNLQKKRAKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX IEEEN(0.579)Q(0.982)DLMHFN(0.901)LQ(0.538)KKR IEEEN(0.4)Q(14.03)DLMHFN(6.69)LQ(-0.4)KKR 5 3 -2.3175 2859500 0 0 2859500 NaN 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 440 1398 824 824 2097 2395 6966 7335 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN 831;1070 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN Isoform 2 of Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1 PE=1 SV=3 0.901143 6.69192 0.0172781 53.565 9.7037 53.565 0.901143 6.69192 0.0172781 53.565 3 N VSVKIEEENQDLMHFNLQKKRAKGKGQVKEE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX IEEEN(0.579)Q(0.982)DLMHFN(0.901)LQ(0.538)KKR IEEEN(0.4)Q(14.03)DLMHFN(6.69)LQ(-0.4)KKR 12 3 -2.3175 2859500 0 0 2859500 NaN 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 441 1398 831 831 2097 2395 6966 7335 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN 215 sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPEL1 PE=2 SV=1 0.995051 23.032 0.0228375 53.237 7.8045 53.237 0.995051 23.032 0.0228375 53.237 2 N IMRSEDPRSVINLLRNICSEAAQKRSLDR__ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SVIN(0.005)LLRN(0.995)ICSEAAQ(1)K SVIN(-23.03)LLRN(23.03)ICSEAAQ(34.27)K 8 2 1.5031 592730 0 592730 0 NaN 0 0 0 0 0 592730 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 592730 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 442 1401 215 215 4213 4783 13324 13977 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN;sp|Q32MH5|F214A_HUMAN;sp|Q32MH5-3|F214A_HUMAN 744;744;751 sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN Isoform 2 of Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM214A;sp|Q32MH5|F214A_HUMAN Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM214A PE=1 SV=2;sp|Q32MH5-3|F214A_HUMAN Isoform 3 of Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM21 0.999917 40.1035 0.0366479 42.743 16.624 42.743 0.999917 40.1035 0.0366479 42.743 3 N KDNEGFKCKKSDQLKNEQDKQEDPTNEKSQN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX N(1)EQ(1)DKQ(0.5)EDPTN(0.5)EK N(40.1)EQ(41.9)DKQ(0)EDPTN(0)EK 1 2 0.10472 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 443 1403 744 744 3040 3475 9812 10336 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN;sp|Q32MH5|F214A_HUMAN;sp|Q32MH5-3|F214A_HUMAN 754;754;761 sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN sp|Q32MH5-2|F214A_HUMAN Isoform 2 of Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM214A;sp|Q32MH5|F214A_HUMAN Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM214A PE=1 SV=2;sp|Q32MH5-3|F214A_HUMAN Isoform 3 of Protein FAM214A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM21 0.500071 0 0.0366479 42.743 16.624 42.743 0.500071 0 0.0366479 42.743 3 N SDQLKNEQDKQEDPTNEKSQNYSQRRSIKDC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N(1)EQ(1)DKQ(0.5)EDPTN(0.5)EK N(40.1)EQ(41.9)DKQ(0)EDPTN(0)EK 11 2 0.10472 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 444 1403 754 754 3040 3475 9812 10336 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 9812 10336 20190902_JH_WT_Ubi_3 6854 sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN 154 sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN Isoform 3 of Zinc finger protein 568 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF568 1 56.3592 0.0318112 56.359 6.2714 56.359 1 56.3592 0.0318112 56.359 2 N TKEWCPDWEFGRETKNLSPKENIYEIRSPQQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX N(1)LSPKEN(1)IYEIR N(56.36)LSPKEN(56.36)IYEIR 1 3 -1.9019 1693700 0 1693700 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1693700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1693700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 445 1411 154 154 3149 3599 10128 10665 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN 160 sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN sp|Q3ZCX4-3|ZN568_HUMAN Isoform 3 of Zinc finger protein 568 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF568 1 56.3592 0.0318112 56.359 6.2714 56.359 1 56.3592 0.0318112 56.359 2 N DWEFGRETKNLSPKENIYEIRSPQQEKARVI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX N(1)LSPKEN(1)IYEIR N(56.36)LSPKEN(56.36)IYEIR 7 3 -1.9019 1693700 0 1693700 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1693700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1693700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 446 1411 160 160 3149 3599 10128 10665 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 10128 10665 20190902_JH_WT_Ubi_2 11133 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN 16;16 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152 PE=2 SV=3 0.99802 24.0137 0.019513 48.907 7.5595 48.907 0.99802 24.0137 0.019513 48.907 2 N MDQSSEGCMKKISSVNLDKLINDFSQIEKKM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX ISSVN(0.998)LDKLIN(0.501)DFSQ(0.501)IEKK ISSVN(24.01)LDKLIN(0)DFSQ(0)IEKK 5 3 -3.6429 1145600 0 1145600 0 NaN 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 447 1414 16 16 2264 2577 7421 7800 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN 22;22 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152 PE=2 SV=3 0.50099 0 0.019513 48.907 7.5595 48.907 0.50099 0 0.019513 48.907 2 N GCMKKISSVNLDKLINDFSQIEKKMVETNGK X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX ISSVN(0.998)LDKLIN(0.501)DFSQ(0.501)IEKK ISSVN(24.01)LDKLIN(0)DFSQ(0)IEKK 11 3 -3.6429 1145600 0 1145600 0 NaN 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 448 1414 22 22 2264 2577 7421 7800 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 sp|Q4KMQ2-3|ANO6_HUMAN;sp|Q4KMQ2|ANO6_HUMAN;sp|Q4KMQ2-2|ANO6_HUMAN;sp|Q4KMQ2-4|ANO6_HUMAN 36;54;75;54 sp|Q4KMQ2-3|ANO6_HUMAN sp|Q4KMQ2-3|ANO6_HUMAN sp|Q4KMQ2-3|ANO6_HUMAN Isoform 3 of Anoctamin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANO6;sp|Q4KMQ2|ANO6_HUMAN Anoctamin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANO6 PE=1 SV=2;sp|Q4KMQ2-2|ANO6_HUMAN Isoform 2 of Anoctamin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANO6;sp|Q4KMQ2-4|ANO6_HUMA 0.999872 40.0836 0.0170553 74.698 48.895 74.698 0.999872 40.0836 0.0170553 74.698 1 N LESQHDFRTPEFEEFNGKPDSLFFNDGQRRI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX TPEFEEFN(1)GKPDSLFFNDGQR TPEFEEFN(40.08)GKPDSLFFN(-40.08)DGQ(-45.22)R 8 3 0.79663 855720 855720 0 0 0.45034 0 855720 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.61934 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 855720 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 449 1415 36 36 4546 5164 14490 15231 14490 15231 20190821_JH_MUT_Ubi 11247 14490 15231 20190821_JH_MUT_Ubi 11247 14490 15231 20190821_JH_MUT_Ubi 11247 sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN;sp|Q5CZC0-2|FSIP2_HUMAN 688;688 sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN Fibrous sheath-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSIP2 PE=2 SV=4;sp|Q5CZC0-2|FSIP2_HUMAN Isoform 2 of Fibrous sheath-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSIP2 1 74.8411 0.0102503 74.841 13.68 74.841 1 74.8411 0.0102503 74.841 N SLHCDKTAKAMDEMKNLKNVFVNFKCYLKGE X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX TAKAMDEMKN(1)LK TAKAMDEMKN(74.84)LK 10 2 -1.8732 1222500 1222500 0 0 NaN 0 0 0 1222500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1222500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 450 1424 688 688 4255 4830 13473 14133 13473 14133 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 13473 14133 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 13473 14133 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 sp|Q5FWF5-2|ESCO1_HUMAN;sp|Q5FWF5|ESCO1_HUMAN 581;581 sp|Q5FWF5-2|ESCO1_HUMAN sp|Q5FWF5-2|ESCO1_HUMAN sp|Q5FWF5-2|ESCO1_HUMAN Isoform 2 of N-acetyltransferase ESCO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESCO1;sp|Q5FWF5|ESCO1_HUMAN N-acetyltransferase ESCO1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESCO1 PE=1 SV=3 1 49.2981 0.0304849 49.298 14.8 49.298 1 49.2981 0.0304849 49.298 N SDNRETPRNHSLPKCNSHLEITIPKDLKLKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX CN(1)SHLEITIPKDLKLK CN(49.3)SHLEITIPKDLKLK 2 4 -3.9714 1291300 1291300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1291300 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1291300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 451 1425 581 581 355 418 1185 1272 1185 1272 20190902_JH_WT_Ubi_3 11115 1185 1272 20190902_JH_WT_Ubi_3 11115 1185 1272 20190902_JH_WT_Ubi_3 11115 sp|Q5HYI7-5|MTX3_HUMAN;sp|Q5HYI7|MTX3_HUMAN 211;272 sp|Q5HYI7-5|MTX3_HUMAN sp|Q5HYI7-5|MTX3_HUMAN sp|Q5HYI7-5|MTX3_HUMAN Isoform 4 of Metaxin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTX3;sp|Q5HYI7|MTX3_HUMAN Metaxin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTX3 PE=1 SV=2 0.999995 52.772 0.0311653 61.353 7.2873 61.353 0.999995 52.772 0.0311653 61.353 1 N DANLQKLTQLVNKESNLIEKMDDNLRQSPQL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX ESN(1)LIEKMDDNLR ESN(52.77)LIEKMDDN(-52.77)LR 3 2 3.5616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 452 1426 211 211 1101 1241 3506 3683 3506 3683 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7534 3506 3683 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7534 3506 3683 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7534 sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN;sp|Q5JTV8|TOIP1_HUMAN 304;303 sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN Isoform 3 of Torsin-1A-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOR1AIP1;sp|Q5JTV8|TOIP1_HUMAN Torsin-1A-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOR1AIP1 PE=1 SV=2 0.499992 0 0.00372491 75.064 40.415 75.064 0.499992 0 0.00372491 75.064 1 N QEWAPQTARIRTRMQNDSILKSELGNQSPST X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MQ(0.5)N(0.5)DSILKSELGNQSPSTSSR MQ(0)N(0)DSILKSELGN(-48.6)Q(-47.69)SPSTSSR 3 3 0.066255 883820 883820 0 0 0.069979 883820 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 NaN 883820 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 453 1430 304 304 2960 3369 9542 10042 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN;sp|Q5T0U0-2|CC122_HUMAN 190;190 sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 122 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC122 PE=2 SV=1;sp|Q5T0U0-2|CC122_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 122 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC122 0.998922 28.6978 0.0233658 65.842 8.4934 65.842 0.998922 28.6978 0.0233658 65.842 2 N NPGGNRITQVQEDITNLKDKIITVKESIIEK X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ITQ(0.8)VQ(0.202)EDITN(0.999)LK ITQ(6)VQ(-6)EDITN(28.7)LK 10 3 0.56193 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 454 1438 190 190 2278 2591 7464 7845 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 sp|Q5T848|GP158_HUMAN 736 sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN Probable G-protein coupled receptor 158 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPR158 PE=1 SV=1 0.516771 0 0.0355679 41.448 11.639 41.448 0.516771 0 0.0355679 41.448 2 N LYAQLEIYKRKKMITNNPHLQKKRCSKKGLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KMITN(0.517)N(0.517)PHLQ(0.966)K KMITN(0)N(0)PHLQ(11.64)K 5 2 1.274 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 455 1443 736 736 2398 2727 7855 8259 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 sp|Q5T848|GP158_HUMAN 737 sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN Probable G-protein coupled receptor 158 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPR158 PE=1 SV=1 0.516809 0 0.0355679 41.448 11.639 41.448 0.516809 0 0.0355679 41.448 2 N YAQLEIYKRKKMITNNPHLQKKRCSKKGLGR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX KMITN(0.517)N(0.517)PHLQ(0.966)K KMITN(0)N(0)PHLQ(11.64)K 6 2 1.274 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 456 1443 737 737 2398 2727 7855 8259 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN 25;60;58 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN Isoform 2 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN Isoform 3 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN Acyl 0.984631 17.6006 0.0199924 48.984 15.009 48.984 0.984631 17.6006 0.0199924 48.984 3 N TRFEAAVKVIQSLPKNGSFQPTNEMMLKFYS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX FEAAVKVIQ(1)SLPKN(0.985)GSFQ(0.892)PTN(0.124)EMMLK FEAAVKVIQ(33.09)SLPKN(17.6)GSFQ(9.1)PTN(-9.1)EMMLK 14 3 -2.5073 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 457 1444 25 25 1183 1335 3757 3953 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 sp|Q5T9S5-2|CCD18_HUMAN;sp|Q5T9S5|CCD18_HUMAN 362;362 sp|Q5T9S5-2|CCD18_HUMAN sp|Q5T9S5-2|CCD18_HUMAN sp|Q5T9S5-2|CCD18_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC18;sp|Q5T9S5|CCD18_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC18 PE=1 SV=1 0.917016 10.4338 0.0243751 66.692 11.71 66.692 0.917016 10.4338 0.0243751 66.692 1 N LENKDEILRDKFSLMNENRELKVRVAAQNER X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX FSLMN(0.917)EN(0.083)RELK FSLMN(10.43)EN(-10.43)RELK 5 2 2.8911 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 458 1445 362 362 1301 1475 4111 4322 4111 4322 20190902_JH_WT_Ubi_2 10039 4111 4322 20190902_JH_WT_Ubi_2 10039 4111 4322 20190902_JH_WT_Ubi_2 10039 sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2-2|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2-5|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2|GARL3_HUMAN 182;223;201;223 sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN Isoform 3 of GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GARNL3;sp|Q5VVW2-2|GARL3_HUMAN Isoform 2 of GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GARNL3;sp|Q5VVW2- 0.983765 17.8222 0.00358196 71.376 47.333 71.376 0.983765 17.8222 0.00358196 71.376 2 N LSAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX DGQ(0.017)LTDDEMFSN(0.984)EIGSEPFQ(1)K DGQ(-17.82)LTDDEMFSN(17.82)EIGSEPFQ(32.96)K 12 3 -0.7616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 459 1451 182 182 491 571 1612;1613 1706;1707 1612 1706 20190902_JH_WT_Ubi_3 6991 1612 1706 20190902_JH_WT_Ubi_3 6991 1612 1706 20190902_JH_WT_Ubi_3 6991 sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN 372 sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN Transcription initiation factor TFIID subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAF3 PE=1 SV=1 0.759811 1.99683 0.0368041 41.86 7.8882 41.86 0.759811 1.99683 0.0368041 41.86 N IQVKQIQTPPDAGKLNSENQPKKAVVADKTI X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(0.496)IQ(0.496)TPPDAGKLN(0.76)SEN(0.624)Q(0.624)PKK Q(0)IQ(0)TPPDAGKLN(2)SEN(0)Q(0)PKK 12 3 -4.0866 1796600 0 0 1796600 NaN 0 0 1796600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1796600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 460 1454 372 372 3641 4150 11675 12253 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN 375 sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN sp|Q5VWG9|TAF3_HUMAN Transcription initiation factor TFIID subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAF3 PE=1 SV=1 0.624321 0 0.0368041 41.86 7.8882 41.86 0.624321 0 0.0368041 41.86 N KQIQTPPDAGKLNSENQPKKAVVADKTIEAS X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX Q(0.496)IQ(0.496)TPPDAGKLN(0.76)SEN(0.624)Q(0.624)PKK Q(0)IQ(0)TPPDAGKLN(2)SEN(0)Q(0)PKK 15 3 -4.0866 1796600 0 0 1796600 NaN 0 0 1796600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1796600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 461 1454 375 375 3641 4150 11675 12253 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 11675 12253 20190821_JH_WT_Ubi 8589 sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN;sp|Q5XPI4-2|RN123_HUMAN 538;538 sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RNF123 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF123 PE=1 SV=1;sp|Q5XPI4-2|RN123_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase RNF123 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF123 1 53.4935 0.0355088 53.493 6.8301 53.493 1 53.4935 0.0355088 53.493 2 N SRYIFLTKFRKFLQENASGRGNMPMLCPPEY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FLQ(1)EN(1)ASGR FLQ(53.49)EN(53.49)ASGR 5 2 2.8206 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 462 1456 538 538 1250 1413 3965 4170 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN;sp|Q674R7|ATG9B_HUMAN 387;901 sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN Isoform 2 of Autophagy-related protein 9B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG9B;sp|Q674R7|ATG9B_HUMAN Autophagy-related protein 9B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG9B PE=2 SV=1 0.999927 38.6559 0.034999 51.211 11.186 51.211 0.999927 38.6559 0.034999 51.211 2 N PASSPRQQWGTQKARNLFPGGFQVTTDTQKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPX N(1)LFPGGFQ(0.463)VTTDTQ(0.537)K N(38.66)LFPGGFQ(-0.65)VTTDTQ(0.65)K 1 3 -2.4661 4372000 0 4372000 0 NaN 0 0 4372000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 463 1462 387 387 3127 3574 10064 10600 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 sp|Q6IAA8|LTOR1_HUMAN 34 sp|Q6IAA8|LTOR1_HUMAN sp|Q6IAA8|LTOR1_HUMAN sp|Q6IAA8|LTOR1_HUMAN Ragulator complex protein LAMTOR1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMTOR1 PE=1 SV=2 0.930835 11.2899 0.0108447 43.658 25.563 43.658 0.930835 11.2899 0.0108447 43.658 1 N RKLLLDPSSPPTKALNGAEPNYHSLPSARTD X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX LLLDPSSPPTKALN(0.931)GAEPN(0.069)YHSLPSAR LLLDPSSPPTKALN(11.29)GAEPN(-11.29)YHSLPSAR 14 4 0.55099 8436000 8436000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 8436000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8436000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 464 1471 34 34 2697 3068 8771 9225 8771 9225 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9523 8771 9225 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9523 8771 9225 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9523 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN 2603;2603 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN Isoform 2 of Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL PE=1 SV=2 1 47.8137 0.0264328 47.814 20.883 47.814 1 47.8137 0.0264328 47.814 N FHPKQTLDFLRSDMANSKITEEVKRSIVKQY X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX TGVHFHPKQ(1)TLDFLRSDMAN(1)SK TGVHFHPKQ(47.81)TLDFLRSDMAN(47.81)SK 20 4 -3.2871 1571900 0 1571900 0 NaN 0 0 1571900 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1571900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 465 1474 2603 2603 4393 4986 13920 14610 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN;sp|Q6NZI2-2|CAVN1_HUMAN 50;50 sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1;sp|Q6NZI2-2|CAVN1_HUMAN Isoform 2 of Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 0.999984 47.858 3.06374E-06 128.76 59.043 128.76 0.999984 47.858 3.06374E-06 128.76 N PSGAGSEELIKSDQVNGVLVLSLLDKIIGAV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX SDQVN(1)GVLVLSLLDK SDQ(-47.86)VN(47.86)GVLVLSLLDK 5 2 -0.76753 1365700 1365700 0 0 NaN 0 0 0 0 0 1365700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1365700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 466 1476 50 50 3862 4387 12241 12837 12241 12837 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14997 12241 12837 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14997 12241 12837 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14997 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN 297;297 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN Isoform 2 of Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1 PE=1 SV=1 1 64.5215 0.00204535 64.522 13.564 64.522 1 64.5215 0.00204535 64.522 3 N NTNAETLSTNCIPIKNGSLLMVSDSERTTEG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(1)Q(1)KVK N(64.52)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(64.52)Q(64.52)KVK 1 3 1.94 3113700 0 0 3113700 NaN 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 467 1477 297 297 3075 3519 9938 10469 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN 495 sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN Protein BHLHb9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BHLHB9 PE=1 SV=1 0.999935 44.1078 0.023728 52.599 24.433 52.599 0.999935 44.1078 0.023728 52.599 N DMINMKALAALKLIFNQKEAKANLVSGVAIF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX DMINMKALAALKLIFN(1)Q(1)K DMIN(-44.11)MKALAALKLIFN(44.11)Q(47.06)K 16 4 -0.70872 1065900 0 1065900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1065900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1065900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 468 1485 495 495 619 710 1944 2063 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN;sp|Q6PIW4|FIGL1_HUMAN 554;665 sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN Isoform 2 of Fidgetin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIGNL1;sp|Q6PIW4|FIGL1_HUMAN Fidgetin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIGNL1 PE=1 SV=2 0.4999 0 0.0351978 47.855 19.383 47.855 0.4999 0 0.0351978 47.855 N TVRPSVSPKDLELYENWNKTFGCGK______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX TVRPSVSPKDLELYEN(0.5)WN(0.5)K TVRPSVSPKDLELYEN(0)WN(0)K 16 4 -1.611 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 469 1486 554 554 4677 5307 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN;sp|Q6PIW4|FIGL1_HUMAN 556;667 sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN sp|Q6PIW4-2|FIGL1_HUMAN Isoform 2 of Fidgetin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIGNL1;sp|Q6PIW4|FIGL1_HUMAN Fidgetin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FIGNL1 PE=1 SV=2 0.5001 0 0.0351978 47.855 19.383 47.855 0.5001 0 0.0351978 47.855 N RPSVSPKDLELYENWNKTFGCGK________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVRPSVSPKDLELYEN(0.5)WN(0.5)K TVRPSVSPKDLELYEN(0)WN(0)K 18 4 -1.611 562930 562930 0 0 NaN 0 562930 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 562930 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 470 1486 556 556 4677 5307 14993 15753 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 14993 15753 20190821_JH_MUT_Ubi 11386 sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN 477 sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN Isoform 3 of Coiled-coil domain-containing protein 171 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC171 0.709197 1.57987 0.0355397 45.879 11.111 45.879 0.709197 1.57987 0.0355397 45.879 2 N LTDYQNKLEDASNELNSMNDVKEKACNELDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX LEDASN(0.582)ELN(0.709)SMN(0.709)DVKEK LEDASN(-1.58)ELN(1.58)SMN(1.58)DVKEK 9 2 2.9542 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 471 1491 477 477 2550 2896 8285 8709 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN 480 sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN sp|Q6TFL3-4|CC171_HUMAN Isoform 3 of Coiled-coil domain-containing protein 171 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC171 0.709197 1.57987 0.0355397 45.879 11.111 45.879 0.709197 1.57987 0.0355397 45.879 2 N YQNKLEDASNELNSMNDVKEKACNELDSTKQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LEDASN(0.582)ELN(0.709)SMN(0.709)DVKEK LEDASN(-1.58)ELN(1.58)SMN(1.58)DVKEK 12 2 2.9542 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 472 1491 480 480 2550 2896 8285 8709 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 8285 8709 20190821_JH_EV_Ubi 8156 sp|Q6UY09-4|CEA20_HUMAN;sp|Q6UY09-3|CEA20_HUMAN;sp|Q6UY09-2|CEA20_HUMAN;sp|Q6UY09-5|CEA20_HUMAN;sp|Q6UY09|CEA20_HUMAN 443;455;536;548;548 sp|Q6UY09-4|CEA20_HUMAN sp|Q6UY09-4|CEA20_HUMAN sp|Q6UY09-4|CEA20_HUMAN Isoform 4 of Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEACAM20;sp|Q6UY09-3|CEA20_HUMAN Isoform 3 of Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=C 1 41.4266 0.0364414 41.427 8.3383 41.427 1 41.4266 0.0364414 41.427 N IRVELTKLPSASRRGNSFSPWKPPPKPLMPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX GN(1)SFSPWKPPPK GN(41.43)SFSPWKPPPK 2 2 -2.9437 794190 794190 0 0 NaN 0 0 794190 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 794190 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 473 1495 443 443 1636 1864 5231 5506 5231 5506 20190821_JH_WT_Ubi 9748 5231 5506 20190821_JH_WT_Ubi 9748 5231 5506 20190821_JH_WT_Ubi 9748 sp|Q6V1X1-6|DPP8_HUMAN;sp|Q6V1X1-2|DPP8_HUMAN;sp|Q6V1X1-3|DPP8_HUMAN;sp|Q6V1X1|DPP8_HUMAN 531;704;688;704 sp|Q6V1X1-6|DPP8_HUMAN sp|Q6V1X1-6|DPP8_HUMAN sp|Q6V1X1-6|DPP8_HUMAN Isoform 6 of Dipeptidyl peptidase 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPP8;sp|Q6V1X1-2|DPP8_HUMAN Isoform 2 of Dipeptidyl peptidase 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPP8;sp|Q6V1X1-3|DPP8_HUMAN Isoform 3 of Dipeptidyl peptidase 8 OS=Homo sapiens 0.99998 47.0593 0.0285959 57.989 17.027 56.055 0.999949 42.9192 0.030175 57.496 0.999954 43.4127 0.0285959 57.989 0.99998 47.0593 0.0347841 56.055 1 N LNTLASLGYVVVVIDNRGSCHRGLKFEGAFK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LNTLASLGYVVVVIDN(1)RGSCHR LN(-47.06)TLASLGYVVVVIDN(47.06)RGSCHR 16 3 0.97136 254430000 254430000 0 0 NaN 0 84278000 0 0 0 0 101570000 0 68587000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 84278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101570000 0 0 0 0 0 68587000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 474 1497 531 531 2740 3114 8883;8884;8885 9343;9344;9345 8885 9345 20190902_JH_WT_Ubi_3 10786 8884 9344 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9619 8884 9344 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9619 sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN 754 sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN Protein PPP4R3C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3C PE=2 SV=3 1 80.6884 0.00678804 80.688 32.248 80.688 1 80.6884 0.00678804 80.688 N MPPLEDDDEFMETKRNQEHEGKVDSPKRTSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXX RN(1)Q(1)EHEGKVDSPK RN(80.69)Q(80.69)EHEGKVDSPK 2 2 -3.6555 3985100 0 3985100 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3985100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3985100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 475 1501 754 754 3774 4288 11947 12530 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN 116 sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN Uncharacterized protein FLJ26957 OS=Homo sapiens OX=9606 PE=2 SV=1 0.764762 5.23343 0.0340024 55.335 21.65 55.335 0.764762 5.23343 0.0340024 55.335 2 N HLTWSHTLKEQTNSGNLGKQSEKGKQHKRRS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EQ(0.005)TN(0.23)SGN(0.765)LGKQ(1)SEKGK EQ(-22.07)TN(-5.23)SGN(5.23)LGKQ(39.56)SEKGK 7 3 3.3769 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 476 1503 116 116 1086 1224 3455 3632 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN 95 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN Ras and Rab interactor-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RINL PE=2 SV=2 0.682777 0 0.00390611 53.585 31.986 53.585 0.682777 0 0.00390611 53.585 3 N SQALVLRSGPLPGEVNTYQIQKIPRGVSLES X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX DPSQ(0.952)ALVLRSGPLPGEVN(0.683)TYQ(0.683)IQ(0.683)K DPSQ(8.17)ALVLRSGPLPGEVN(0)TYQ(0)IQ(0)K 18 4 2.4132 69573000 0 0 69573000 NaN 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 477 1505 95 95 653 748 2050 2174 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN;sp|Q6ZS30|NBEL1_HUMAN 2268;2268 sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN Isoform 1 of Neurobeachin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NBEAL1;sp|Q6ZS30|NBEL1_HUMAN Neurobeachin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NBEAL1 PE=2 SV=3 0.740229 4.56828 0.0350216 40.676 12.393 40.676 0.740229 4.56828 0.0350216 40.676 2 N LTDEKERKALEGMINNFGQTPCQLLKITISM X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX KALEGMIN(0.262)N(0.74)FGQ(0.967)TPCQ(0.031)LLK KALEGMIN(-4.57)N(4.57)FGQ(15.35)TPCQ(-15.35)LLK 9 2 -3.6233 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 478 1506 2268 2268 2317 2635 7622 8019 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8|PHLP2_HUMAN 665;598;665 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN Isoform 2 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHLPP2;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN Isoform 3 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=960 1 59.6073 0.012347 59.607 7.1118 59.607 1 57.4251 0.0144499 57.425 1 59.6073 0.012347 59.607 4 N HLANNQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX LN(1)KLEQ(1)LEELN(1)LSGN(1)K LN(59.61)KLEQ(59.61)LEELN(59.61)LSGN(59.61)K 2 4 -0.41413 8072900 0 0 8072900 NaN 3634500 0 0 4438300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3634500 0 0 0 0 0 0 0 0 4438300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 479 1508 665 665 2734 3107 8867;8868 9326;9327 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8|PHLP2_HUMAN 674;607;674 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN Isoform 2 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHLPP2;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN Isoform 3 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=960 1 59.6073 0.012347 59.607 7.1118 59.607 1 57.4251 0.0144499 57.425 1 59.6073 0.012347 59.607 4 N FPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIAN X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LN(1)KLEQ(1)LEELN(1)LSGN(1)K LN(59.61)KLEQ(59.61)LEELN(59.61)LSGN(59.61)K 11 4 -0.41413 8072900 0 0 8072900 NaN 3634500 0 0 4438300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3634500 0 0 0 0 0 0 0 0 4438300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 480 1508 674 674 2734 3107 8867;8868 9326;9327 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8|PHLP2_HUMAN 678;611;678 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN Isoform 2 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHLPP2;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN Isoform 3 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=960 1 59.6073 0.012347 59.607 7.1118 59.607 1 57.4251 0.0144499 57.425 1 59.6073 0.012347 59.607 4 N KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRL X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LN(1)KLEQ(1)LEELN(1)LSGN(1)K LN(59.61)KLEQ(59.61)LEELN(59.61)LSGN(59.61)K 15 4 -0.41413 8072900 0 0 8072900 NaN 3634500 0 0 4438300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3634500 0 0 0 0 0 0 0 0 4438300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 481 1508 678 678 2734 3107 8867;8868 9326;9327 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN 196 sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN sp|Q7KZF4|SND1_HUMAN Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SND1 PE=1 SV=1 1 49.3505 0.0352723 49.35 21.579 49.35 1 49.3505 0.0352723 49.35 1 N ENPRHFVDSHHQKPVNAIIEHVRDGSVVRAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX PVN(1)AIIEHVR PVN(49.35)AIIEHVR 3 3 3.4681 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 482 1518 196 196 3563 4063 11451 12025 11451 12025 20190902_JH_WT_Ubi_3 7923 11451 12025 20190902_JH_WT_Ubi_3 7923 11451 12025 20190902_JH_WT_Ubi_3 7923 sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN 205 sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 70 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC70 PE=2 SV=1 0.576213 1.28216 0.00276887 60.621 25.598 60.621 0.576213 1.28216 0.00276887 60.621 2 N NNILRISESGFQHLENLACLYLGSNNLTKVP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX ISESGFQ(0.431)HLEN(0.576)LACLYLGSN(0.99)N(0.003)LTK ISESGFQ(-1.28)HLEN(1.28)LACLYLGSN(19.01)N(-25.08)LTK 11 3 1.2591 2606000 0 2606000 0 NaN 0 0 0 0 2606000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2606000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 483 1526 205 205 2254 2565 7390 7769 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN 214 sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN sp|Q7Z2Q7|LRR70_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 70 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC70 PE=2 SV=1 0.989673 19.006 0.00276887 60.621 25.598 60.621 0.989673 19.006 0.00276887 60.621 2 N GFQHLENLACLYLGSNNLTKVPSNAFEVLKS X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX ISESGFQ(0.431)HLEN(0.576)LACLYLGSN(0.99)N(0.003)LTK ISESGFQ(-1.28)HLEN(1.28)LACLYLGSN(19.01)N(-25.08)LTK 20 3 1.2591 2606000 0 2606000 0 NaN 0 0 0 0 2606000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2606000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 484 1526 214 214 2254 2565 7390 7769 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 7390 7769 20190902_JH_EV_Ubi_3 13652 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN 485 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DHX29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX29 PE=1 SV=2 0.992702 21.3363 0.0352085 53.751 8.8876 53.751 0.992702 21.3363 0.0352085 53.751 1 N SDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EELN(0.007)KMETN(0.993)KPR EELN(-21.34)KMETN(21.34)KPR 9 2 -0.38334 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 485 1531 485 485 861 977 2751 2893 2751 2893 20190902_JH_WT_Ubi_3 11093 2751 2893 20190902_JH_WT_Ubi_3 11093 2751 2893 20190902_JH_WT_Ubi_3 11093 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN 103 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DHX29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX29 PE=1 SV=2 0.99737 26.7944 0.0370468 45.115 13.887 45.115 0.99737 26.7944 0.0370468 45.115 N VVINNKLEQRIIGVINEHKKQNNDKGMISGR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX IIGVIN(0.997)EHKKQ(0.096)N(0.311)N(0.595)DK IIGVIN(26.79)EHKKQ(-8.1)N(-1.3)N(1.3)DK 6 3 -1.7308 3080000 0 3080000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3080000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 486 1531 103 103 2151 2453 7126 7499 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN 110 sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN sp|Q7Z478|DHX29_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DHX29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX29 PE=1 SV=2 0.594991 1.30258 0.0370468 45.115 13.887 45.115 0.594991 1.30258 0.0370468 45.115 N EQRIIGVINEHKKQNNDKGMISGRLTAKKLQ X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX IIGVIN(0.997)EHKKQ(0.096)N(0.311)N(0.595)DK IIGVIN(26.79)EHKKQ(-8.1)N(-1.3)N(1.3)DK 13 3 -1.7308 3080000 0 3080000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3080000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 487 1531 110 110 2151 2453 7126 7499 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 7126 7499 20190902_JH_WT_Ubi_2 16473 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN 1691;1682;1691 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligas 0.999822 38.0612 0.0283447 53.448 23.512 53.448 0.999822 38.0612 0.0283447 53.448 3 N RPVMLTLLRVPRLNKNSKNSNGQELEKTLEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX N(1)SKN(0.989)SN(0.993)GQ(0.018)ELEK N(38.06)SKN(20.17)SN(21.57)GQ(-20.17)ELEK 1 3 2.9141 3053600 0 0 3053600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 488 1539 1691 1691 3213 3672 10345 10888 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN 1694;1685;1694 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligas 0.989433 20.1747 0.0283447 53.448 23.512 53.448 0.989433 20.1747 0.0283447 53.448 3 N MLTLLRVPRLNKNSKNSNGQELEKTLEESKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXX N(1)SKN(0.989)SN(0.993)GQ(0.018)ELEK N(38.06)SKN(20.17)SN(21.57)GQ(-20.17)ELEK 4 3 2.9141 3053600 0 0 3053600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 489 1539 1694 1694 3213 3672 10345 10888 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN 1696;1687;1696 sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN sp|Q7Z6Z7-2|HUWE1_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7-3|HUWE1_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HUWE1;sp|Q7Z6Z7|HUWE1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligas 0.992926 21.5665 0.0283447 53.448 23.512 53.448 0.992926 21.5665 0.0283447 53.448 3 N TLLRVPRLNKNSKNSNGQELEKTLEESKEMD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX N(1)SKN(0.989)SN(0.993)GQ(0.018)ELEK N(38.06)SKN(20.17)SN(21.57)GQ(-20.17)ELEK 6 3 2.9141 3053600 0 0 3053600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3053600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 490 1539 1696 1696 3213 3672 10345 10888 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 10345 10888 20190902_JH_WT_Ubi_3 7558 sp|Q7Z7A1-2|CNTRL_HUMAN;sp|Q7Z7A1-5|CNTRL_HUMAN;sp|Q7Z7A1|CNTRL_HUMAN 55;607;607 sp|Q7Z7A1-2|CNTRL_HUMAN sp|Q7Z7A1-2|CNTRL_HUMAN sp|Q7Z7A1-2|CNTRL_HUMAN Isoform 2 of Centriolin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNTRL;sp|Q7Z7A1-5|CNTRL_HUMAN Isoform 5 of Centriolin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNTRL;sp|Q7Z7A1|CNTRL_HUMAN Centriolin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNTRL PE=1 SV=2 0.954911 13.2516 0.0359997 45.618 10.268 45.618 0.954911 13.2516 0.0359997 45.618 2 N IKDLEEQLTEGQIAANEALKKDLEGVISGLQ X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX DLEEQ(0.998)LTEGQ(0.047)IAAN(0.955)EALK DLEEQ(27.72)LTEGQ(-13.25)IAAN(13.25)EALK 14 3 2.4755 465670 0 465670 0 NaN 0 0 0 465670 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 465670 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 491 1540 55 55 574 659 1826 1936 1826 1936 20190902_JH_EV_Ubi_2 4552 1826 1936 20190902_JH_EV_Ubi_2 4552 1826 1936 20190902_JH_EV_Ubi_2 4552 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0|KHDC4_HUMAN 81;81;81;81 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN Isoform 4 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN Isoform 3 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN Isoform 2 of 1 50.7217 0.0289355 50.722 17.414 50.722 1 50.7217 0.0289355 50.722 N INAMLMAKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTSN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP PTQ(1)N(1)ASEKLQ(1)APGKGLTSN(1)K PTQ(50.72)N(50.72)ASEKLQ(50.72)APGKGLTSN(50.72)K 4 3 1.8989 6461300 0 0 6461300 NaN 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 492 1541 81 81 3534 4030 11358 11931 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0|KHDC4_HUMAN 96;96;96;96 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN Isoform 4 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN Isoform 3 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN Isoform 2 of 1 50.7217 0.0289355 50.722 17.414 50.722 1 50.7217 0.0289355 50.722 N NASEKLQAPGKGLTSNKSKDDLVVAEVEIND Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX PTQ(1)N(1)ASEKLQ(1)APGKGLTSN(1)K PTQ(50.72)N(50.72)ASEKLQ(50.72)APGKGLTSN(50.72)K 19 3 1.8989 6461300 0 0 6461300 NaN 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 493 1541 96 96 3534 4030 11358 11931 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 sp|Q7Z7G0|TARSH_HUMAN 259 sp|Q7Z7G0|TARSH_HUMAN sp|Q7Z7G0|TARSH_HUMAN sp|Q7Z7G0|TARSH_HUMAN Target of Nesh-SH3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABI3BP PE=1 SV=1 0.92603 10.9773 0.0221974 55.173 38.874 55.173 0.92603 10.9773 0.0221974 55.173 N PRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LIPITIIKQVIQ(0.074)N(0.926)VTHK LIPITIIKQ(-45.42)VIQ(-10.98)N(10.98)VTHK 13 3 -2.5156 520810 520810 0 0 NaN 520810 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 520810 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 494 1542 259 259 2658 3023 8641 9086 8641 9086 20190821_JH_EV_Ubi 10857 8641 9086 20190821_JH_EV_Ubi 10857 8641 9086 20190821_JH_EV_Ubi 10857 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN 578 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN Retrotransposon-derived protein PEG10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEG10 PE=1 SV=2 0.96747 15.3873 6.00398E-11 124.76 103.7 124.76 0.852576 10.219 1.63861E-05 104.68 0.952958 13.0827 2.27184E-05 102.07 0.586451 4.4629 0.00269002 71.402 0.706113 5.91326 0.0133549 57.52 0.96747 15.3873 6.00398E-11 124.76 0.954151 13.5539 2.91625E-05 99.409 0.923806 12.18 0.000202007 92.289 1;2 N ARNVKDGLITPTIAPNGAQVLQVKRGWKLQV X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX NVKDGLITPTIAPN(0.967)GAQ(0.028)VLQ(0.005)VKR N(-92.27)VKDGLITPTIAPN(15.39)GAQ(-15.39)VLQ(-23.28)VKR 14 3 1.5496 85312000 82309000 3003600 0 NaN 12907000 16654000 0 8810200 1006800 1284900 1718600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 12907000 0 0 16654000 0 0 0 0 0 8810200 0 0 1006800 0 0 0 1284900 0 0 1718600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 495 1546 578 578 486;3249;3250 564;3711;3712;3713 1577;1578;1579;1580;10432;10434;10436;10437;10438;10440 1670;1671;1672;1673;10976;10978;10980;10981;10982;10984 10440 10984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10253 10440 10984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10253 10440 10984 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10253 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN 370 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN cTAGE family member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTAGE6 PE=2 SV=2 0.595248 8.54166 0.0312802 40.142 20.449 40.142 0.595248 8.54166 0.0312802 40.142 5 N HIKNLQTQQESLQSENIYFESENQKLQQKLK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.094)LQ(0.094)TQ(0.102)Q(0.102)ESLQ(0.102)SEN(0.595)IYFESEN(0.975)Q(0.977)KLQ(0.98)Q(0.98)KLK N(-8.97)LQ(-8.97)TQ(-8.54)Q(-8.54)ESLQ(-8.54)SEN(8.54)IYFESEN(31.75)Q(31.75)KLQ(32.17)Q(32.17)KLK 13 3 0.52377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 496 1550 370 370 3146 3596 10118 10655 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN 377 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN cTAGE family member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTAGE6 PE=2 SV=2 0.974776 31.746 0.0312802 40.142 20.449 40.142 0.974776 31.746 0.0312802 40.142 5 N QQESLQSENIYFESENQKLQQKLKIMTEFYQ X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX N(0.094)LQ(0.094)TQ(0.102)Q(0.102)ESLQ(0.102)SEN(0.595)IYFESEN(0.975)Q(0.977)KLQ(0.98)Q(0.98)KLK N(-8.97)LQ(-8.97)TQ(-8.54)Q(-8.54)ESLQ(-8.54)SEN(8.54)IYFESEN(31.75)Q(31.75)KLQ(32.17)Q(32.17)KLK 20 3 0.52377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 497 1550 377 377 3146 3596 10118 10655 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN 327 sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPAT4 PE=1 SV=1 0.5 0 0.0303534 40.756 16.208 40.756 0.5 0 0.0303534 40.756 1 N KSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SKLPILIFPEGTCIN(0.5)N(0.5)TSVMMFKK SKLPILIFPEGTCIN(0)N(0)TSVMMFKK 15 3 2.651 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 498 1551 327 327 3988 4533 12649 13267 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN 328 sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN sp|Q86UL3|GPAT4_HUMAN Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPAT4 PE=1 SV=1 0.5 0 0.0303534 40.756 16.208 40.756 0.5 0 0.0303534 40.756 1 N SKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SKLPILIFPEGTCIN(0.5)N(0.5)TSVMMFKK SKLPILIFPEGTCIN(0)N(0)TSVMMFKK 16 3 2.651 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 499 1551 328 328 3988 4533 12649 13267 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 12649 13267 20190902_JH_EV_Ubi_3 11805 sp|Q86UX6-2|ST32C_HUMAN;sp|Q86UX6|ST32C_HUMAN 20;137 sp|Q86UX6-2|ST32C_HUMAN sp|Q86UX6-2|ST32C_HUMAN sp|Q86UX6-2|ST32C_HUMAN Isoform 2 of Serine/threonine-protein kinase 32C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK32C;sp|Q86UX6|ST32C_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 32C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK32C PE=1 SV=1 0.865776 11.1061 0.0351115 66.19 6.9253 66.19 0.865776 11.1061 0.0351115 66.19 1 N KYMNKQQCIERDEVRNVFRELEILQEIEHVF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX Q(0.067)Q(0.067)CIERDEVRN(0.866)VFR Q(-11.11)Q(-11.11)CIERDEVRN(11.11)VFR 11 2 1.8676 2999600 2999600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 2999600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2999600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 500 1553 20 20 3685 4196 11756 12337 11756 12337 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8025 11756 12337 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8025 11756 12337 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8025 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN 410;410;410 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN Isoform 2 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN Isoform 3 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX= 0.998825 28.6173 0.0362286 43.297 9.4063 43.297 0.998825 28.6173 0.0362286 43.297 3 N PQHKRERLRNREFALNNENYSLSNRQVSSPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EFALN(0.999)N(0.999)EN(0.857)YSLSN(0.146)R EFALN(28.62)N(28.62)EN(7.76)YSLSN(-7.76)R 5 2 -3.6527 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 501 1554 410 410 874 990 2780 2924 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN 411;411;411 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN Isoform 2 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN Isoform 3 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX= 0.998825 28.6173 0.0362286 43.297 9.4063 43.297 0.998825 28.6173 0.0362286 43.297 3 N QHKRERLRNREFALNNENYSLSNRQVSSPSF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX EFALN(0.999)N(0.999)EN(0.857)YSLSN(0.146)R EFALN(28.62)N(28.62)EN(7.76)YSLSN(-7.76)R 6 2 -3.6527 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 502 1554 411 411 874 990 2780 2924 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN 413;413;413 sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN sp|Q86V48-2|LUZP1_HUMAN Isoform 2 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48-3|LUZP1_HUMAN Isoform 3 of Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LUZP1;sp|Q86V48|LUZP1_HUMAN Leucine zipper protein 1 OS=Homo sapiens OX= 0.856742 7.7554 0.0362286 43.297 9.4063 43.297 0.856742 7.7554 0.0362286 43.297 3 N KRERLRNREFALNNENYSLSNRQVSSPSFTN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX EFALN(0.999)N(0.999)EN(0.857)YSLSN(0.146)R EFALN(28.62)N(28.62)EN(7.76)YSLSN(-7.76)R 8 2 -3.6527 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 503 1554 413 413 874 990 2780 2924 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 2780 2924 20190902_JH_WT_Ubi_2 7019 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN 35 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN Interferon epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFNE PE=2 SV=1 1 78.4882 0.0120102 78.488 9.8624 78.488 1 78.4882 0.0120102 78.488 1 66.5599 0.0233692 66.56 4 N FSLDLKLIIFQQRQVNQESLKLLNKLQTLSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXX Q(1)VN(1)Q(1)ESLKLLN(1)K Q(78.49)VN(78.49)Q(78.49)ESLKLLN(78.49)K 3 3 -0.77513 129770000 0 0 129770000 NaN 0 30587000 0 0 99186000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 30587000 0 0 0 0 0 0 0 0 99186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 504 1560 35 35 3716 4230 11803;11804 12384;12385 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN 43 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN Interferon epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFNE PE=2 SV=1 1 78.4882 0.0120102 78.488 9.8624 78.488 1 78.4882 0.0120102 78.488 1 66.5599 0.0233692 66.56 4 N IFQQRQVNQESLKLLNKLQTLSIQQCLPHRK X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(1)VN(1)Q(1)ESLKLLN(1)K Q(78.49)VN(78.49)Q(78.49)ESLKLLN(78.49)K 11 3 -0.77513 129770000 0 0 129770000 NaN 0 30587000 0 0 99186000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 30587000 0 0 0 0 0 0 0 0 99186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 505 1560 43 43 3716 4230 11803;11804 12384;12385 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN 125 sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN Glutamate-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERICH1 PE=1 SV=1 0.703585 1.24556 0.0254784 45.069 21.204 45.069 0.703585 1.24556 0.0254784 45.069 2 N KRRRIRKHKSKKKFKNPNNVLIEQAELEKQQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP FKN(0.704)PN(0.66)N(0.61)VLIEQ(0.015)AELEKQ(0.004)Q(0.004)SLLQ(0.003)EK FKN(1.25)PN(0.63)N(-0.63)VLIEQ(-19.05)AELEKQ(-25.72)Q(-25.72)SLLQ(-25.72)EK 3 3 2.1767 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 506 1562 125 125 1231 1390 3902 4107 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN 127 sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN sp|Q86X53|ERIC1_HUMAN Glutamate-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERICH1 PE=1 SV=1 0.66012 0.627901 0.0254784 45.069 21.204 45.069 0.66012 0.627901 0.0254784 45.069 2 N RRIRKHKSKKKFKNPNNVLIEQAELEKQQSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FKN(0.704)PN(0.66)N(0.61)VLIEQ(0.015)AELEKQ(0.004)Q(0.004)SLLQ(0.003)EK FKN(1.25)PN(0.63)N(-0.63)VLIEQ(-19.05)AELEKQ(-25.72)Q(-25.72)SLLQ(-25.72)EK 5 3 2.1767 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 507 1562 127 127 1231 1390 3902 4107 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 3902 4107 20190902_JH_WT_Ubi_2 13478 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN 13 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase DTX1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTX1 PE=1 SV=1 1 64.2595 0.0205408 64.26 21.552 64.26 1 64.2595 0.0205408 64.26 3 N ___MSRPGHGGLMPVNGLGFPPQNVARVVVW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX SRPGHGGLMPVN(1)GLGFPPQ(1)N(1)VAR SRPGHGGLMPVN(64.26)GLGFPPQ(64.26)N(64.26)VAR 12 3 -4.3995 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 508 1565 13 13 4137 4702 13118 13756 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN 21 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase DTX1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTX1 PE=1 SV=1 1 64.2595 0.0205408 64.26 21.552 64.26 1 64.2595 0.0205408 64.26 3 N HGGLMPVNGLGFPPQNVARVVVWEWLNEHSR X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX SRPGHGGLMPVN(1)GLGFPPQ(1)N(1)VAR SRPGHGGLMPVN(64.26)GLGFPPQ(64.26)N(64.26)VAR 20 3 -4.3995 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 509 1565 21 21 4137 4702 13118 13756 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN 689;708 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1 PE=1 SV=1 0.517155 0 0.0206361 47.499 21.611 47.499 0.517155 0 0.0206361 47.499 2 N RAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AYASPGPLPVPPPQ(0.517)N(0.517)KGSFGKN(0.966)TVK AYASPGPLPVPPPQ(0)N(0)KGSFGKN(11.51)TVK 15 4 1.059 2509600 0 2509600 0 NaN 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 510 1569 689 689 335 395 1133 1220 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN 696;715 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1 PE=1 SV=1 0.96569 11.5068 0.0206361 47.499 21.611 47.499 0.96569 11.5068 0.0206361 47.499 2 N PLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDADGTEGSEIE X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX AYASPGPLPVPPPQ(0.517)N(0.517)KGSFGKN(0.966)TVK AYASPGPLPVPPPQ(0)N(0)KGSFGKN(11.51)TVK 22 4 1.059 2509600 0 2509600 0 NaN 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 511 1569 696 696 335 395 1133 1220 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN 432 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MIB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIB1 PE=1 SV=1 0.837462 7.12246 1.35485E-10 111.57 59.382 111.57 0.837462 7.12246 1.35485E-10 111.57 1 N QLLKKLFETQESGDLNEELVKAAANGDVAKV X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX LFETQESGDLN(0.837)EELVKAAAN(0.162)GDVAK LFETQ(-37.21)ESGDLN(7.12)EELVKAAAN(-7.12)GDVAK 11 3 -0.13596 1841500 1841500 0 0 NaN 1841500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1841500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 512 1570 432 432 2587 2939 8395 8827 8395 8827 20190821_JH_EV_Ubi 10685 8395 8827 20190821_JH_EV_Ubi 10685 8395 8827 20190821_JH_EV_Ubi 10685 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN 441 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MIB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIB1 PE=1 SV=1 0.999981 47.1836 7.39644E-25 154.08 103.67 129.07 0.988797 19.4936 7.39644E-25 154.08 0.908923 10.0171 1.38969E-08 105.38 0.999981 47.1836 4.69381E-14 129.07 0.99985 38.2709 9.27835E-19 143.09 1 N QESGDLNEELVKAAANGDVAKVEDLLKRPDV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LFETQESGDLNEELVKAAAN(1)GDVAK LFETQ(-88.08)ESGDLN(-47.18)EELVKAAAN(47.18)GDVAK 20 3 0.041278 14266000 14266000 0 0 NaN 0 3244300 4566300 0 0 3527200 2928100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 3244300 0 0 4566300 0 0 0 0 0 0 0 0 3527200 0 0 2928100 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 513 1570 441 441 2587 2939 8396;8397;8398;8399 8828;8829;8830;8831;8832 8397 8829 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11563 8396 8828 20190821_JH_MUT_Ubi 10079 8396 8828 20190821_JH_MUT_Ubi 10079 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN 736 sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN sp|Q86YT6|MIB1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MIB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIB1 PE=1 SV=1 0.914005 10.2825 0.0228134 53.779 23.352 53.779 0.914005 10.2825 0.0228134 53.779 1 N MQDVGKVDAAWEPSKNTLIMGLGTQGAEKKS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX VDAAWEPSKN(0.914)TLIMGLGTQ(0.086)GAEK VDAAWEPSKN(10.28)TLIMGLGTQ(-10.28)GAEK 10 3 1.9136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 514 1570 736 736 4728 5366 15167 15935 15167 15935 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10807 15167 15935 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10807 15167 15935 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10807 sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-7|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-2|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-5|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-6|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-4|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50|F219A_HUMAN 39;67;39;50;50;56;67 sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN Isoform 3 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM219A;sp|Q8IW50-7|F219A_HUMAN Isoform 7 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM219A;sp|Q8IW50-2|F219A_HUMAN Isoform 2 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 0.855659 7.87685 0.0296792 55.064 12.589 55.064 0.855659 7.87685 0.0296792 55.064 2 N REEKQRELARKGSLKNGSMGSPVNQQPKKNN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.856)GSMGSPVN(0.14)Q(0.01)Q(0.994)PK N(7.88)GSMGSPVN(-7.88)Q(-22.65)Q(22.65)PK 1 2 -1.0651 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 515 1576 39 39 3076 3520 9939 10470 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN 509 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA processing protein FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 PE=1 SV=2 0.954067 13.1745 0.0155412 57.227 23.538 57.227 0.954067 13.1745 0.0155412 57.227 1 N RLTEVQDDKEEEEEENPLLVPLEEKAVLQEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX LTEVQ(0.046)DDKEEEEEEN(0.954)PLLVPLEEK LTEVQ(-13.17)DDKEEEEEEN(13.17)PLLVPLEEK 15 3 3.5538 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 516 1587 509 509 2824 3201 9085 9560 9085 9560 20190902_JH_WT_Ubi_3 12214 9085 9560 20190902_JH_WT_Ubi_3 12214 9085 9560 20190902_JH_WT_Ubi_3 12214 sp|Q8IYB1|M21D2_HUMAN 9 sp|Q8IYB1|M21D2_HUMAN sp|Q8IYB1|M21D2_HUMAN sp|Q8IYB1|M21D2_HUMAN Protein MB21D2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MB21D2 PE=1 SV=3 1 41.1171 0.0358432 41.117 9.6953 41.117 1 41.1171 0.0358432 41.117 1 N _______MKMAAPTANKAASLGCNNKPAFPE X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX MKMAAPTAN(1)K MKMAAPTAN(41.12)K 9 3 1.5838 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 517 1589 9 9 2928 3325 9424 9919 9424 9919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 808 9424 9919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 808 9424 9919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 808 sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN 178 sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN Ubiquilin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBQLNL PE=2 SV=3 0.469648 0 0.0322309 51.503 12.628 51.503 0.469648 0 0.0322309 51.503 N NLEVSHPECKAQMLENPSIQRLLSNMEFMWQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX VHTQNLEVSHPECKAQ(0.061)MLEN(0.47)PSIQ(0.47)R VHTQ(-41.79)N(-41.79)LEVSHPECKAQ(-8.89)MLEN(0)PSIQ(0)R 20 3 0.5453 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 518 1592 178 178 4851 5505 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 sp|Q8IZ07|AN13A_HUMAN 262 sp|Q8IZ07|AN13A_HUMAN sp|Q8IZ07|AN13A_HUMAN sp|Q8IZ07|AN13A_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 13A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD13A PE=1 SV=3 1 113.987 0.00951848 113.99 77.14 113.99 1 88.8027 0.00951848 88.803 1 113.987 0.0115925 113.99 1 N KSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVNVI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TDKAEVVN(1)GYEAK TDKAEVVN(113.99)GYEAK 8 3 0.79291 2227000 2227000 0 0 NaN 485390 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 485390 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 519 1595 262 262 4290 4868 13583;13584 14249;14250 13584 14250 20190902_JH_EV_Ubi_3 4782 13584 14250 20190902_JH_EV_Ubi_3 4782 13583 14249 20190821_JH_EV_Ubi 4102 sp|Q8IZH2-2|XRN1_HUMAN;sp|Q8IZH2|XRN1_HUMAN 1376;1375 sp|Q8IZH2-2|XRN1_HUMAN sp|Q8IZH2-2|XRN1_HUMAN sp|Q8IZH2-2|XRN1_HUMAN Isoform 2 of 5'-3' exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRN1;sp|Q8IZH2|XRN1_HUMAN 5'-3' exoribonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRN1 PE=1 SV=1 0.997119 25.3922 0.0130799 55.011 8.3897 55.011 0.997119 25.3922 0.0130799 55.011 1 N KEILKIDGSNTVDHKNEIKQIANEIPVSSNR X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EILKIDGSN(0.003)TVDHKN(0.997)EIK EILKIDGSN(-25.39)TVDHKN(25.39)EIK 15 4 2.2731 12012000 12012000 0 0 NaN 12012000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 12012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 520 1597 1376 1376 939 1060 2951 3104 2951 3104 20190821_JH_EV_Ubi 7430 2951 3104 20190821_JH_EV_Ubi 7430 2951 3104 20190821_JH_EV_Ubi 7430 sp|Q8IZT6-2|ASPM_HUMAN;sp|Q8IZT6|ASPM_HUMAN 1128;1128 sp|Q8IZT6-2|ASPM_HUMAN sp|Q8IZT6-2|ASPM_HUMAN sp|Q8IZT6-2|ASPM_HUMAN Isoform 2 of Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPM;sp|Q8IZT6|ASPM_HUMAN Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASPM PE=1 SV=2 0.989166 19.6047 0.0342524 50.088 11.751 50.088 0.989166 19.6047 0.0342524 50.088 1 N IKLLMDWVNAVCAFYNKKVENFTVSFSDGRV X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LLMDWVN(0.011)AVCAFYN(0.989)K LLMDWVN(-19.6)AVCAFYN(19.6)K 14 3 -3.2074 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 521 1599 1128 1128 2701 3072 8782 9237 8782 9237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4665 8782 9237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4665 8782 9237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4665 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN 398 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN Spartin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPART PE=1 SV=1 1 52.7196 0.00503447 52.72 23.084 52.72 1 52.7196 0.00503447 52.72 1 N GKRGKRAKDTSSEEVNLSHIVPCEPVPEEKP X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX AKDTSSEEVN(1)LSHIVPCEPVPEEK AKDTSSEEVN(52.72)LSHIVPCEPVPEEK 10 4 3.7204 2652500 2652500 0 0 0.71675 0 0 0 0 0 0 2652500 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2652500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 522 1603 398 398 180 207 605 662 605 662 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8555 605 662 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8555 605 662 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8555 sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN 500 sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMTR1 PE=1 SV=1 1 61.8154 0.0156919 61.815 18.519 61.815 1 61.8154 0.0156919 61.815 2 N VIKGDHEFTDYMIRSNESHCSLQIKALAKIH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX SN(1)ESHCSLQ(1)IKALAK SN(61.82)ESHCSLQ(61.82)IKALAK 2 2 -1.6734 10356000 0 10356000 0 NaN 0 0 0 10356000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10356000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 523 1607 500 500 4078 4630 12910 13537 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 sp|Q8N302-3|AGGF1_HUMAN 170 sp|Q8N302-3|AGGF1_HUMAN sp|Q8N302-3|AGGF1_HUMAN sp|Q8N302-3|AGGF1_HUMAN Isoform 3 of Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGGF1 0.754543 4.87542 0.0366304 49.3 8.2714 49.3 0.754543 4.87542 0.0366304 49.3 2 N RTENVKYRQVDHFASNSQVIKC_________ X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX Q(1)VDHFASN(0.755)SQ(0.246)VIK Q(34.16)VDHFASN(4.88)SQ(-4.88)VIK 8 2 -0.37283 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 524 1608 170 170 3712 4226 11798 12379 11798 12379 20190821_JH_MUT_Ubi 8231 11798 12379 20190821_JH_MUT_Ubi 8231 11798 12379 20190821_JH_MUT_Ubi 8231 sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN 138 sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN Proline-rich protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRR18 PE=2 SV=2 1 57.8039 0.028103 57.804 18.295 57.804 1 57.8039 0.028103 57.804 2 N SGAGPCPDSAARFCLNLTPEAVLVIQKRHLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXX FCLN(1)LTPEAVLVIQ(1)KR FCLN(57.8)LTPEAVLVIQ(57.8)KR 4 3 -0.17113 4730400 0 4730400 0 NaN 0 4730400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4730400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 525 1616 138 138 1174 1326 3740 3936 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 sp|Q8N4X5-2|AF1L2_HUMAN;sp|Q8N4X5|AF1L2_HUMAN;sp|Q8N4X5-4|AF1L2_HUMAN 338;338;366 sp|Q8N4X5-2|AF1L2_HUMAN sp|Q8N4X5-2|AF1L2_HUMAN sp|Q8N4X5-2|AF1L2_HUMAN Isoform 2 of Actin filament-associated protein 1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFAP1L2;sp|Q8N4X5|AF1L2_HUMAN Actin filament-associated protein 1-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFAP1L2 PE=1 SV=1;sp|Q8N4X5-4|AF1L2_HUMAN Isoform 0.805355 6.16745 0.0362406 43.761 10.569 43.761 0.805355 6.16745 0.0362406 43.761 N VKKKCSAGLKLSNLMNLGRKKSTSLEPVERS X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX CSAGLKLSN(0.195)LMN(0.805)LGR CSAGLKLSN(-6.17)LMN(6.17)LGR 12 3 1.042 798700 798700 0 0 NaN 0 0 0 0 798700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 798700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 526 1619 338 338 361 428 1200 1287 1200 1287 20190902_JH_EV_Ubi_3 9685 1200 1287 20190902_JH_EV_Ubi_3 9685 1200 1287 20190902_JH_EV_Ubi_3 9685 sp|Q8N766-3|EMC1_HUMAN;sp|Q8N766-2|EMC1_HUMAN;sp|Q8N766|EMC1_HUMAN 102;102;102 sp|Q8N766-3|EMC1_HUMAN sp|Q8N766-3|EMC1_HUMAN sp|Q8N766-3|EMC1_HUMAN Isoform 3 of ER membrane protein complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMC1;sp|Q8N766-2|EMC1_HUMAN Isoform 2 of ER membrane protein complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMC1;sp|Q8N766|EMC1_HUMAN ER membrane protein com 0.953131 13.0827 0.00923323 57.188 26.77 57.188 0.953131 13.0827 0.00923323 57.188 1 N VDAMLLHGQDVITVSNGGRIMRSWETNIGGL X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX GTAEGAVDAMLLHGQ(0.047)DVITVSN(0.953)GGR GTAEGAVDAMLLHGQ(-13.08)DVITVSN(13.08)GGR 22 3 2.8092 839380 839380 0 0 NaN 0 839380 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 839380 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 527 1623 102 102 1709 1948 5462 5749 5462 5749 20190821_JH_MUT_Ubi 9329 5462 5749 20190821_JH_MUT_Ubi 9329 5462 5749 20190821_JH_MUT_Ubi 9329 sp|Q8N988|ZN557_HUMAN;sp|Q8N988-2|ZN557_HUMAN 71;78 sp|Q8N988|ZN557_HUMAN sp|Q8N988|ZN557_HUMAN sp|Q8N988|ZN557_HUMAN Zinc finger protein 557 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF557 PE=2 SV=2;sp|Q8N988-2|ZN557_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 557 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF557 0.996551 21.598 0.0361217 66.351 9.4353 66.351 0.996551 21.598 0.0361217 66.351 N AQRTLYRDVMLENCRNLASLGNQVDKPRLIS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX N(0.997)LASLGN(0.502)Q(0.502)VDK N(21.6)LASLGN(0)Q(0)VDK 1 2 -0.59956 2722700 0 2722700 0 NaN 0 0 2722700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2722700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 528 1625 71 71 3121 3568 10051 10586 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 sp|Q8N988|ZN557_HUMAN;sp|Q8N988-2|ZN557_HUMAN 77;84 sp|Q8N988|ZN557_HUMAN sp|Q8N988|ZN557_HUMAN sp|Q8N988|ZN557_HUMAN Zinc finger protein 557 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF557 PE=2 SV=2;sp|Q8N988-2|ZN557_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 557 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF557 0.501724 0 0.0361217 66.351 9.4353 66.351 0.501724 0 0.0361217 66.351 N RDVMLENCRNLASLGNQVDKPRLISQLEQED X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX N(0.997)LASLGN(0.502)Q(0.502)VDK N(21.6)LASLGN(0)Q(0)VDK 7 2 -0.59956 2722700 0 2722700 0 NaN 0 0 2722700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2722700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 529 1625 77 77 3121 3568 10051 10586 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 10051 10586 20190821_JH_WT_Ubi 5268 sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN 295 sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 53 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD53 PE=1 SV=3 0.961832 14.3559 0.0322549 43.383 17.56 43.383 0.961832 14.3559 0.0322549 43.383 2 N TKMKMFKSQLTLMEHNYLIEYQKEHKILREA X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX MKMFKSQ(0.996)LTLMEHN(0.962)YLIEYQ(0.042)K MKMFKSQ(27.87)LTLMEHN(14.36)YLIEYQ(-14.36)K 14 3 -1.9957 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 530 1626 295 295 2929 3326 9425 9920 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN 229;242 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 PE=1 SV=2;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN Isoform 2 of Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 0.996878 24.0616 0.00197834 71.634 41.39 51.469 0.847718 7.02404 0.0122776 43.768 0.996878 24.0616 0.00349604 51.469 0.895979 10.5929 0.00197834 57.985 0.504903 0.767085 0.0157384 40.779 0.98096 17.008 0.0114198 71.634 1 N PYPLPPNYSYGLCPGNGTTKEEKETAEHENR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GHIPYPLPPN(0.003)YSYGLCPGN(0.997)GTTKEEK GHIPYPLPPN(-24.06)YSYGLCPGN(24.06)GTTKEEK 19 4 1.0939 16255000 16255000 0 0 NaN 2699900 0 0 1749500 0 5961200 4596800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2699900 0 0 0 0 0 0 0 0 1749500 0 0 0 0 0 5961200 0 0 4596800 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 531 1630 229 229 1516 1728 4860;4861;4862;4863;4864 5112;5113;5114;5115;5116 4861 5113 20190902_JH_EV_Ubi_2 9192 4864 5116 20190902_JH_WT_Ubi_3 10574 4862 5114 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10046 sp|Q8NBS3-3|S4A11_HUMAN 23 sp|Q8NBS3-3|S4A11_HUMAN sp|Q8NBS3-3|S4A11_HUMAN sp|Q8NBS3-3|S4A11_HUMAN Isoform 3 of Sodium bicarbonate transporter-like protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC4A11 0.645211 3.57569 0.000339046 50.88 12.795 50.88 0.645211 3.57569 0.000339046 50.88 1 N VFHLQPCENSPTMSQNGYFEDSSYYKCDTDD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VFHLQ(0.036)PCEN(0.036)SPTMSQ(0.283)N(0.645)GYFEDSSYYKCDTDDTFEAR VFHLQ(-12.56)PCEN(-12.56)SPTMSQ(-3.58)N(3.58)GYFEDSSYYKCDTDDTFEAR 16 4 0.77731 2431000 2431000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 2431000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 532 1635 23 23 4815 5464 15455 16233 15455 16233 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10885 15455 16233 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10885 15455 16233 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10885 sp|Q8NCW5-2|NNRE_HUMAN;sp|Q8NCW5|NNRE_HUMAN 17;120 sp|Q8NCW5-2|NNRE_HUMAN sp|Q8NCW5-2|NNRE_HUMAN sp|Q8NCW5-2|NNRE_HUMAN Isoform 2 of NAD(P)H-hydrate epimerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAXE;sp|Q8NCW5|NNRE_HUMAN NAD(P)H-hydrate epimerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAXE PE=1 SV=2 0.781419 5.53271 0.0203689 50.956 16.862 50.956 0.781419 5.53271 0.0203689 50.956 1 N SRSPPTVLVICGPGNNGGDGLVCARHLKLFG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SPPTVLVICGPGN(0.219)N(0.781)GGDGLVCAR SPPTVLVICGPGN(-5.53)N(5.53)GGDGLVCAR 14 3 0.40233 1494400 1494400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1494400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1494400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 533 1640 17 17 4107 4661 12971 13600 12971 13600 20190902_JH_WT_Ubi_3 13194 12971 13600 20190902_JH_WT_Ubi_3 13194 12971 13600 20190902_JH_WT_Ubi_3 13194 sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN 4 sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN Isoform 4 of Zinc finger protein 540 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF540 1 44.9254 0.014697 55.724 14.029 44.925 1 55.7239 0.014697 55.724 1 44.9254 0.0274809 44.925 2 N ____________MLPNFKLYNFIEIFFKPLT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXX MLPN(1)FKLYN(1)FIEIFFK MLPN(44.93)FKLYN(44.93)FIEIFFK 4 3 -4.0512 2980500 0 2980500 0 NaN 1295600 1685000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1295600 0 0 1685000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 534 1645 4 4 2940 3342 9478;9479 9978;9979 9479 9979 20190821_JH_MUT_Ubi 9382 9478 9978 20190821_JH_EV_Ubi 10023 9478 9978 20190821_JH_EV_Ubi 10023 sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN 9 sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN sp|Q8NDQ6-4|ZN540_HUMAN Isoform 4 of Zinc finger protein 540 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF540 1 44.9254 0.014697 55.724 14.029 44.925 1 55.7239 0.014697 55.724 1 44.9254 0.0274809 44.925 2 N _______MLPNFKLYNFIEIFFKPLTPSKNR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX MLPN(1)FKLYN(1)FIEIFFK MLPN(44.93)FKLYN(44.93)FIEIFFK 9 3 -4.0512 2980500 0 2980500 0 NaN 1295600 1685000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1295600 0 0 1685000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 535 1645 9 9 2940 3342 9478;9479 9978;9979 9479 9979 20190821_JH_MUT_Ubi 9382 9478 9978 20190821_JH_EV_Ubi 10023 9478 9978 20190821_JH_EV_Ubi 10023 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-7|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-4|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91|SYNE1_HUMAN 620;620;603;620;627;620 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN Isoform 5 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN Isoform 6 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN Isoform 10 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-7|SY 0.500004 0 0.00662238 56.625 27.279 56.625 0.500004 0 0.00662238 56.625 2 N RSMLEEVISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M) XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP YGN(0.5)TVASLQ(0.5)AWLEDAEKMLN(0.333)Q(0.333)SEN(0.333)AKK YGN(0)TVASLQ(0)AWLEDAEKMLN(0)Q(0)SEN(0)AKK 3 3 3.0994 611920 0 611920 0 NaN 0 611920 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 611920 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 536 1652 620 620 5147 5853 16606 17454 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-7|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-4|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91|SYNE1_HUMAN 637;637;620;637;644;637 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN Isoform 5 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN Isoform 6 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN Isoform 10 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-7|SY 0.333343 0 0.00662238 56.625 27.279 56.625 0.333343 0 0.00662238 56.625 N VASLQAWLEDAEKMLNQSENAKKDFFRNLPH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX YGN(0.5)TVASLQ(0.5)AWLEDAEKMLN(0.333)Q(0.333)SEN(0.333)AKK YGN(0)TVASLQ(0)AWLEDAEKMLN(0)Q(0)SEN(0)AKK 20 3 3.0994 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 537 1652 637 637 5147 5853 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-7|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-4|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91|SYNE1_HUMAN 641;641;624;641;648;641 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN Isoform 5 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN Isoform 6 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN Isoform 10 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-7|SY 0.333306 0 0.00662238 56.625 27.279 56.625 0.333306 0 0.00662238 56.625 N QAWLEDAEKMLNQSENAKKDFFRNLPHWIQQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX YGN(0.5)TVASLQ(0.5)AWLEDAEKMLN(0.333)Q(0.333)SEN(0.333)AKK YGN(0)TVASLQ(0)AWLEDAEKMLN(0)Q(0)SEN(0)AKK 24 3 3.0994 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 538 1652 641 641 5147 5853 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN;sp|Q8NFT2-2|STEA2_HUMAN;sp|Q8NFT2|STEA2_HUMAN 20;20;20 sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN Isoform 3 of Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STEAP2;sp|Q8NFT2-2|STEA2_HUMAN Isoform 2 of Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STEAP2;sp|Q8NFT2|STEA2_HUMAN Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9 1 100.681 0.000249692 100.68 65.593 100.68 1 74.3379 0.00415248 74.338 1 100.681 0.000249692 100.68 2 N SMMGSPKSLSETFLPNGINGIKDARKVTVGV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SLSETFLPN(1)GIN(1)GIKDAR SLSETFLPN(100.68)GIN(100.68)GIKDAR 9 3 0.62021 8687800 0 8687800 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4452000 4235800 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4452000 0 0 4235800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 539 1656 20 20 4047 4595 12819;12820 13443;13444 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN;sp|Q8NFT2-2|STEA2_HUMAN;sp|Q8NFT2|STEA2_HUMAN 23;23;23 sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN sp|Q8NFT2-3|STEA2_HUMAN Isoform 3 of Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STEAP2;sp|Q8NFT2-2|STEA2_HUMAN Isoform 2 of Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STEAP2;sp|Q8NFT2|STEA2_HUMAN Metalloreductase STEAP2 OS=Homo sapiens OX=9 1 100.681 0.000249692 100.68 65.593 100.68 1 74.3379 0.00415248 74.338 1 100.681 0.000249692 100.68 2 N GSPKSLSETFLPNGINGIKDARKVTVGVIGS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SLSETFLPN(1)GIN(1)GIKDAR SLSETFLPN(100.68)GIN(100.68)GIKDAR 12 3 0.62021 8687800 0 8687800 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4452000 4235800 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4452000 0 0 4235800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 540 1656 23 23 4047 4595 12819;12820 13443;13444 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 12820 13444 20190902_JH_WT_Ubi_3 11545 sp|Q8NI51-11|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-6|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-5|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-10|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-2|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-3|CTCFL_HUMAN;sp|Q8NI51-7|CTCFL_HUMAN 162;162;219;219;424;424;424;424 sp|Q8NI51-11|CTCFL_HUMAN sp|Q8NI51-11|CTCFL_HUMAN sp|Q8NI51-11|CTCFL_HUMAN Isoform 11 of Transcriptional repressor CTCFL OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTCFL;sp|Q8NI51-6|CTCFL_HUMAN Isoform 6 of Transcriptional repressor CTCFL OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTCFL;sp|Q8NI51-5|CTCFL_HUMAN Isoform 5 of Transcription 0.925706 10.9552 0.0371727 45.915 17.589 45.915 0.925706 10.9552 0.0371727 45.915 1 N QSGTMKIHILQKHGENVPKYQCPHCATIIAR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX IHILQ(0.074)KHGEN(0.926)VPK IHILQ(-10.96)KHGEN(10.96)VPK 10 3 -3.0421 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 541 1661 162 162 2140 2441 7104 7477 7104 7477 20190902_JH_MUT_Ubi_3 1308 7104 7477 20190902_JH_MUT_Ubi_3 1308 7104 7477 20190902_JH_MUT_Ubi_3 1308 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN 167 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN GA-binding protein subunit beta-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GABPB2 PE=1 SV=1 0.653037 4.00806 0.0250094 47.648 12.557 47.648 0.653037 4.00806 0.0250094 47.648 3 N ILVILQEAMQNQVNVNPERANPVTDPVSMAA X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX N(0.099)N(0.099)AEILVILQ(0.781)EAMQ(0.9)N(0.091)Q(0.07)VN(0.307)VN(0.653)PER N(-11.55)N(-11.55)AEILVILQ(11.55)EAMQ(13.46)N(-13.46)Q(-16.18)VN(-4.01)VN(4.01)PER 20 3 -1.8981 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 542 1665 167 167 3166 3619 10190 10729 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 sp|Q8TB69|ZN519_HUMAN 143 sp|Q8TB69|ZN519_HUMAN sp|Q8TB69|ZN519_HUMAN sp|Q8TB69|ZN519_HUMAN Zinc finger protein 519 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF519 PE=2 SV=2 0.990751 20.3066 0.025275 58.577 18.063 58.577 0.990751 20.3066 0.025275 58.577 1 N PQFLSAAPTEPCIPMNKYQHKFLKSVFCNKN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX PQFLSAAPTEPCIPMN(0.991)KYQ(0.009)HK PQ(-47.71)FLSAAPTEPCIPMN(20.31)KYQ(-20.31)HK 16 3 1.4416 2039400 2039400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2039400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2039400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 543 1668 143 143 3491 3983 11229 11797 11229 11797 20190902_JH_WT_Ubi_3 12849 11229 11797 20190902_JH_WT_Ubi_3 12849 11229 11797 20190902_JH_WT_Ubi_3 12849 sp|Q8TBZ0-2|CC110_HUMAN;sp|Q8TBZ0|CC110_HUMAN 417;454 sp|Q8TBZ0-2|CC110_HUMAN sp|Q8TBZ0-2|CC110_HUMAN sp|Q8TBZ0-2|CC110_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 110 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC110;sp|Q8TBZ0|CC110_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 110 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC110 PE=1 SV=1 0.977513 16.445 0.0152166 68.972 18.166 68.972 0.977513 16.445 0.0152166 68.972 1 N VQIQKKVMELESENLNLKSKMKPLIFTTQSL X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX VMELESEN(0.022)LN(0.978)LKSKMK VMELESEN(-16.45)LN(16.45)LKSKMK 10 3 -1.6653 13256000 13256000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 13256000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13256000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 544 1671 417 417 4940 5610 15879 16685 15879 16685 20190902_JH_WT_Ubi_2 10895 15879 16685 20190902_JH_WT_Ubi_2 10895 15879 16685 20190902_JH_WT_Ubi_2 10895 sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN 426 sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN Protein FAM71B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM71B PE=1 SV=2 0.667298 0 0.0359511 42.813 10.632 42.813 0.667298 0 0.0359511 42.813 3 N RDGSQKVSQPSAEVWNENKERREKKDRHPSR X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX DGSQ(0.998)KVSQ(0.667)PSAEVWN(0.667)EN(0.667)K DGSQ(22.45)KVSQ(0)PSAEVWN(0)EN(0)K 15 3 2.5543 1038400 0 0 1038400 NaN 0 1038400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 1038400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 545 1674 426 426 500 580 1629 1725 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN 428 sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN sp|Q8TC56|FA71B_HUMAN Protein FAM71B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM71B PE=1 SV=2 0.667298 0 0.0359511 42.813 10.632 42.813 0.667298 0 0.0359511 42.813 3 N GSQKVSQPSAEVWNENKERREKKDRHPSRKS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DGSQ(0.998)KVSQ(0.667)PSAEVWN(0.667)EN(0.667)K DGSQ(22.45)KVSQ(0)PSAEVWN(0)EN(0)K 17 3 2.5543 1038400 0 0 1038400 NaN 0 1038400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 1038400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 546 1674 428 428 500 580 1629 1725 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 1629 1725 20190821_JH_MUT_Ubi 7657 sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN;sp|Q8TCQ1|MARH1_HUMAN 223;240 sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCH1;sp|Q8TCQ1|MARH1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCH1 PE=1 SV=1 0.5 0 0.0275691 54.776 7.1694 54.776 0.5 0 0.0275691 54.776 1 N LWRRLKAYNRVIFVQNCPDTAKKLEKNFSCN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VIFVQ(0.5)N(0.5)CPDTAKK VIFVQ(0)N(0)CPDTAKK 6 3 -0.55323 9048100 9048100 0 0 NaN 0 0 9048100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 9048100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 547 1675 223 223 4855 5509 15562 16346 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN 246 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN Taste receptor type 1 member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAS1R2 PE=3 SV=2 0.546967 0.582366 0.00672717 48.389 14.177 48.389 0.546967 0.582366 0.00672717 48.389 4 N DICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIV X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX RDICIAFQ(1)ETLPTLQ(0.485)PN(0.547)Q(0.656)N(0.656)MTSEERQ(0.656)R RDICIAFQ(31.03)ETLPTLQ(-0.58)PN(0.58)Q(0)N(0)MTSEERQ(0)R 17 3 2.0476 568230 0 0 568230 NaN 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 548 1683 246 246 3729 4243 11839 12421 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN 248 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN Taste receptor type 1 member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAS1R2 PE=3 SV=2 0.656069 0 0.00672717 48.389 14.177 48.389 0.656069 0 0.00672717 48.389 4 N CIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDK X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX RDICIAFQ(1)ETLPTLQ(0.485)PN(0.547)Q(0.656)N(0.656)MTSEERQ(0.656)R RDICIAFQ(31.03)ETLPTLQ(-0.58)PN(0.58)Q(0)N(0)MTSEERQ(0)R 19 3 2.0476 568230 0 0 568230 NaN 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 549 1683 248 248 3729 4243 11839 12421 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN 1601 sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN Dynein heavy chain 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH5 PE=1 SV=3 0.999978 46.5281 0.0282145 61.679 18.961 61.679 0.999978 46.5281 0.0282145 61.679 N EDSLMLLGSLLSNRYNMPFKAQIQKWVQYLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX YN(1)MPFKAQ(1)IQK YN(46.53)MPFKAQ(37.46)IQ(-37.46)K 2 2 -0.49235 62699000 0 62699000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 62699000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62699000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 550 1684 1601 1601 5185 5901 16729 17586 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 sp|Q8WU90|ZC3HF_HUMAN 163 sp|Q8WU90|ZC3HF_HUMAN sp|Q8WU90|ZC3HF_HUMAN sp|Q8WU90|ZC3HF_HUMAN Zinc finger CCCH domain-containing protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZC3H15 PE=1 SV=1 0.999374 32.0343 0.035355 48.391 20.18 48.391 0.999374 32.0343 0.035355 48.391 1 N DTMDNWDEKKLEEVVNKKHGEAEKKKPKTQI X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX DTMDN(0.001)WDEKKLEEVVN(0.999)K DTMDN(-32.03)WDEKKLEEVVN(32.03)K 16 3 -3.1145 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 551 1691 163 163 713 810 2230 2357 2230 2357 20190821_JH_WT_Ubi 7119 2230 2357 20190821_JH_WT_Ubi 7119 2230 2357 20190821_JH_WT_Ubi 7119 sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN 76 sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN GATA zinc finger domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD1 PE=1 SV=1 1 59.9771 3.00988E-33 124.04 108.28 59.977 0.740781 4.56024 3.92293E-05 50.322 0.888201 9.00072 3.00988E-33 124.04 0.894063 9.2632 3.48413E-26 113.55 1 61.9179 1.84226E-10 80.791 1 59.9771 2.62737E-26 115.91 0.900081 9.54631 5.38265E-20 100.76 0.884122 8.82511 2.88351E-15 97.941 1;2 N GAATFASTSATPPQSNGGGGGKQSKQEIHRR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX GGAGSGGAGSGAAGGTGGSGGGGFGAATFASTSATPPQ(1)SN(1)GGGGGK GGAGSGGAGSGAAGGTGGSGGGGFGAATFASTSATPPQ(59.98)SN(59.98)GGGGGK 40 3 2.4416 22118000 21069000 1049000 0 NaN 1850500 2596200 3799300 0 0 4043600 3683800 2684300 3460100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1850500 0 0 2596200 0 0 3799300 0 0 0 0 0 0 0 0 3432100 611510 0 3246300 437480 0 2684300 0 0 3460100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 552 1694 76 76 1475 1678;1679 4687;4688;4689;4690;4691;4692;4693;4694;4695 4923;4924;4925;4926;4927;4928;4929;4930;4931;4932;4933;4934;4935 4695 4935 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9062 4688 4925 20190821_JH_MUT_Ubi 7828 4688 4925 20190821_JH_MUT_Ubi 7828 sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-3|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-5|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-2|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-4|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-7|MYO3B_HUMAN 885;885;885;885;885;885;894 sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN Isoform 6 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4-3|MYO3B_HUMAN Isoform 3 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4-5|MYO3B_HUMAN Isoform 5 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4- 1 68.6258 0.0260786 68.626 9.2761 68.626 1 68.6258 0.0260786 68.626 N KLLQQLFSIPLTKTGNLAQTRARITVASSSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX TGN(1)LAQ(1)TRAR TGN(68.63)LAQ(68.63)TRAR 3 2 3.788 4446100 0 4446100 0 NaN 0 0 4446100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4446100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 553 1704 885 885 4381 4965 13853 14536 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-3|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-10|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-9|TITIN_HUMAN 11021;11544;11566;11736;12379;12471;12596;12605;14112;5047;5172;5239 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.722722 4.16056 0.0320004 43.349 11.431 43.349 0.722722 4.16056 0.0320004 43.349 1 N KFDIIADGKKHILVINDSQFDDEGVYTAEVE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP HILVIN(0.723)DSQ(0.277)FDDEGVYTAEVEGKK HILVIN(4.16)DSQ(-4.16)FDDEGVYTAEVEGKK 6 3 -2.2034 4012000 4012000 0 0 NaN 0 4012000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 4012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 554 1705 11021 11021 1878 2134 6063 6384 6063 6384 20190821_JH_MUT_Ubi 14995 6063 6384 20190821_JH_MUT_Ubi 14995 6063 6384 20190821_JH_MUT_Ubi 14995 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN 9229;8302;8302;8494;9137;9229;9354;9229;9546 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.84989 6.9704 0.0285387 46.982 8.4051 46.982 0.84989 6.9704 0.0285387 46.982 2 N NIEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.85)N(0.85)TLVLQ(0.286)VRKAGMN(0.014)DAGLYTCK N(6.97)N(6.97)TLVLQ(-6.97)VRKAGMN(-21.4)DAGLYTCK 1 3 -3.4836 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 555 1705 9229 9229 3175 3629 10225 10765 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN 9230;8303;8303;8495;9138;9230;9355;9230;9547 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.84989 6.9704 0.0285387 46.982 8.4051 46.982 0.84989 6.9704 0.0285387 46.982 2 N IEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDAG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.85)N(0.85)TLVLQ(0.286)VRKAGMN(0.014)DAGLYTCK N(6.97)N(6.97)TLVLQ(-6.97)VRKAGMN(-21.4)DAGLYTCK 2 3 -3.4836 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 556 1705 9230 9230 3175 3629 10225 10765 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 10225 10765 20190821_JH_EV_Ubi 12232 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-3|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-10|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-9|TITIN_HUMAN 26723;27246;27268;27438;28081;28173;28298;28307;29814;20749;20874;20941 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.999023 29.4461 0.0113075 51.348 12.111 51.348 0.999023 29.4461 0.0113075 51.348 3 N NLKPGVNYYFRVSAVNCAGQGEPIEMNEPVQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VSAVN(0.999)CAGQ(0.99)GEPIEMN(0.14)EPVQ(0.871)AK VSAVN(29.45)CAGQ(19.43)GEPIEMN(-8.23)EPVQ(8.23)AK 5 3 0.035344 1720700 0 0 1720700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 557 1705 26723 26723 5003 5678 16063 16873 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN 176 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN AP-3 complex subunit sigma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3S1 PE=1 SV=1 0.500004 0 0.0208409 60.209 25.933 60.209 0.500004 0 0.0208409 60.209 2 N AVSAVKNMNLPEIPRNINIGDISIKVPNLPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.5)IN(0.5)IGDISIKVPN(1)LPSFK N(0)IN(0)IGDISIKVPN(50.95)LPSFK 1 3 0.59217 23453000 0 23453000 0 NaN 0 0 23453000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 23453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 558 1711 176 176 3099 3546 10009 10543 10009 10543 20190821_JH_WT_Ubi 12646 10009 10543 20190821_JH_WT_Ubi 12646 10009 10543 20190821_JH_WT_Ubi 12646 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN 178 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN AP-3 complex subunit sigma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3S1 PE=1 SV=1 0.838137 7.14589 0.0151751 62.861 12.782 57.973 0.64561 2.65155 0.0151751 62.861 0.500004 0 0.0208409 60.209 0.838137 7.14589 0.0256201 57.973 2 N SAVKNMNLPEIPRNINIGDISIKVPNLPSFK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.162)IN(0.838)IGDISIKVPN(1)LPSFK N(-7.15)IN(7.15)IGDISIKVPN(44.35)LPSFK 3 3 0.32771 34378000 0 34378000 0 NaN 0 4986700 23453000 0 0 0 5938000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4986700 0 0 23453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5938000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 559 1711 178 178 3099 3546 10007;10008;10009 10541;10542;10543 10008 10542 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12243 10007 10541 20190821_JH_MUT_Ubi 12120 10007 10541 20190821_JH_MUT_Ubi 12120 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN 188 sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN sp|Q92572|AP3S1_HUMAN AP-3 complex subunit sigma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3S1 PE=1 SV=1 0.999995 53.5772 0.0151751 62.861 12.782 62.861 0.999995 53.5772 0.0151751 62.861 0.999992 50.9461 0.0208409 60.209 0.999955 44.3487 0.0256201 57.973 2 N IPRNINIGDISIKVPNLPSFK__________ X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX N(0.354)IN(0.646)IGDISIKVPN(1)LPSFK N(-2.65)IN(2.65)IGDISIKVPN(53.58)LPSFK 13 3 0.34331 34378000 0 34378000 0 NaN 0 4986700 23453000 0 0 0 5938000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4986700 0 0 23453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5938000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 560 1711 188 188 3099 3546 10007;10008;10009 10541;10542;10543 10007 10541 20190821_JH_MUT_Ubi 12120 10007 10541 20190821_JH_MUT_Ubi 12120 10007 10541 20190821_JH_MUT_Ubi 12120 sp|Q92823-3|NRCAM_HUMAN;sp|Q92823-4|NRCAM_HUMAN;sp|Q92823-6|NRCAM_HUMAN;sp|Q92823-2|NRCAM_HUMAN;sp|Q92823|NRCAM_HUMAN;sp|Q92823-5|NRCAM_HUMAN 1069;1072;1081;1193;1193;1193 sp|Q92823-3|NRCAM_HUMAN sp|Q92823-3|NRCAM_HUMAN sp|Q92823-3|NRCAM_HUMAN Isoform 3 of Neuronal cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NRCAM;sp|Q92823-4|NRCAM_HUMAN Isoform 4 of Neuronal cell adhesion molecule OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NRCAM;sp|Q92823-6|NRCAM_HUMAN Isoform 6 of Neuronal cell a 1 71.2957 0.0290935 71.296 35.677 71.296 1 71.2957 0.0290935 71.296 N ALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXX N(1)KGGKYPVK N(71.3)KGGKYPVK 1 2 -3.1278 678270 678270 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 678270 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 678270 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 561 1726 1069 1069 3114 3561 10031 10566 10031 10566 20190902_JH_WT_Ubi_3 12516 10031 10566 20190902_JH_WT_Ubi_3 12516 10031 10566 20190902_JH_WT_Ubi_3 12516 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN;sp|Q92844|TANK_HUMAN 87;87;87 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN Isoform Short of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN Isoform 3 of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844|TANK 0.999998 57.7586 0.0289968 85.963 8.6846 85.963 0.999998 57.7586 0.0289968 85.963 N NYGCVPLLEDSETRKNNLTLDQPQDKVISGI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX KN(1)N(1)LTLDQ(0.999)PQ(0.002)DK KN(57.76)N(41.65)LTLDQ(28.43)PQ(-28.43)DK 2 2 1.9757 1779100 0 0 1779100 NaN 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 562 1730 87 87 2408 2737 7877 8281 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN;sp|Q92844|TANK_HUMAN 88;88;88 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN Isoform Short of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN Isoform 3 of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844|TANK 0.999931 41.6456 0.0289968 85.963 8.6846 85.963 0.999931 41.6456 0.0289968 85.963 N YGCVPLLEDSETRKNNLTLDQPQDKVISGIA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXX KN(1)N(1)LTLDQ(0.999)PQ(0.002)DK KN(57.76)N(41.65)LTLDQ(28.43)PQ(-28.43)DK 3 2 1.9757 1779100 0 0 1779100 NaN 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 563 1730 88 88 2408 2737 7877 8281 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 sp|Q92953|KCNB2_HUMAN 453 sp|Q92953|KCNB2_HUMAN sp|Q92953|KCNB2_HUMAN sp|Q92953|KCNB2_HUMAN Potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KCNB2 PE=2 SV=2 0.999898 39.9342 0.0310293 49.715 12.651 49.715 0.999898 39.9342 0.0310293 49.715 N EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX RNGSIVSMN(1)LK RN(-39.93)GSIVSMN(39.93)LK 9 2 -2.1019 3450200 3450200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3450200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3450200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 564 1734 453 453 3771 4285 11941 12524 11941 12524 20190902_JH_WT_Ubi_2 7041 11941 12524 20190902_JH_WT_Ubi_2 7041 11941 12524 20190902_JH_WT_Ubi_2 7041 sp|Q93084-4|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084-2|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084-3|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084-7|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084-6|AT2A3_HUMAN;sp|Q93084-5|AT2A3_HUMAN 111;111;111;111;111;111;111 sp|Q93084-4|AT2A3_HUMAN sp|Q93084-4|AT2A3_HUMAN sp|Q93084-4|AT2A3_HUMAN Isoform SERCA3G of Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2A3;sp|Q93084-2|AT2A3_HUMAN Isoform SERCA3A of Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2A 1 44.2941 0.035808 44.294 20.283 44.294 1 44.2941 0.035808 44.294 N LILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)AESAIEALKEYEPEMGK N(44.29)AESAIEALKEYEPEMGK 1 4 3.0177 1369500 1369500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1369500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1369500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 565 1742 111 111 2993 3420 9685 10199 9685 10199 20190902_JH_WT_Ubi_2 7629 9685 10199 20190902_JH_WT_Ubi_2 7629 9685 10199 20190902_JH_WT_Ubi_2 7629 sp|Q93100-4|KPBB_HUMAN;sp|Q93100-2|KPBB_HUMAN;sp|Q93100-3|KPBB_HUMAN;sp|Q93100|KPBB_HUMAN 339;339;346;346 sp|Q93100-4|KPBB_HUMAN sp|Q93100-4|KPBB_HUMAN sp|Q93100-4|KPBB_HUMAN Isoform 4 of Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHKB;sp|Q93100-2|KPBB_HUMAN Isoform 2 of Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHKB;sp|Q93100-3|KPBB_HUMAN Iso 1 65.0429 0.0363415 65.043 16.903 65.043 1 65.0429 0.0363415 65.043 1 N KRFLRDGYRTSLEDPNRCYYKPAEIKLFDGI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX FLRDGYRTSLEDPN(1)R FLRDGYRTSLEDPN(65.04)R 14 3 -2.4423 717290 717290 0 0 NaN 0 717290 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 717290 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 566 1743 339 339 1252 1415 3967 4172 3967 4172 20190821_JH_MUT_Ubi 7779 3967 4172 20190821_JH_MUT_Ubi 7779 3967 4172 20190821_JH_MUT_Ubi 7779 sp|Q96A19|C102A_HUMAN 415 sp|Q96A19|C102A_HUMAN sp|Q96A19|C102A_HUMAN sp|Q96A19|C102A_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 102A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC102A PE=1 SV=2 1 49.0599 0.0365994 49.06 17.302 49.06 1 49.0599 0.0365994 49.06 1 N LDCDLRASQAALFEKNKELADLKHVHGKLKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX N(1)KELADLKHVHGK N(49.06)KELADLKHVHGK 1 2 3.682 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 567 1750 415 415 3113 3560 10030 10565 10030 10565 20190902_JH_EV_Ubi_2 11761 10030 10565 20190902_JH_EV_Ubi_2 11761 10030 10565 20190902_JH_EV_Ubi_2 11761 sp|Q96A54|PAQR1_HUMAN 13 sp|Q96A54|PAQR1_HUMAN sp|Q96A54|PAQR1_HUMAN sp|Q96A54|PAQR1_HUMAN Adiponectin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADIPOR1 PE=1 SV=1 0.991508 22.6761 0.00867833 60.669 35.022 60.669 0.991508 22.6761 0.00867833 60.669 0.986015 20.7032 0.0107668 58.672 1 N ___MSSHKGSVVAQGNGAPASNREADTVELA X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SSHKGSVVAQ(0.005)GN(0.992)GAPASN(0.003)R SSHKGSVVAQ(-22.68)GN(22.68)GAPASN(-25)R 12 3 1.5631 1424100 1424100 0 0 NaN 0 0 0 0 1134800 0 289250 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1134800 0 0 0 0 0 289250 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 568 1751 13 13 4164 4731 13190;13191 13833;13834 13190 13833 20190902_JH_EV_Ubi_3 4143 13190 13833 20190902_JH_EV_Ubi_3 4143 13190 13833 20190902_JH_EV_Ubi_3 4143 sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN 21 sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN sp|Q96B26|EXOS8_HUMAN Exosome complex component RRP43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOSC8 PE=1 SV=1 1 50.0403 0.036449 50.04 13.347 50.04 1 50.0403 0.036449 50.04 1 N KTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX FLKEN(1)CRPDGR FLKEN(50.04)CRPDGR 5 2 -1.3072 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 569 1758 21 21 1245 1408 3960 4165 3960 4165 20190821_JH_MUT_Ubi 4332 3960 4165 20190821_JH_MUT_Ubi 4332 3960 4165 20190821_JH_MUT_Ubi 4332 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN 719 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN Deubiquitinating protein VCIP135 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VCPIP1 PE=1 SV=2 0.333112 0 0.0334406 43.03 7.3733 43.03 0.333112 0 0.0334406 43.03 N KEELNMSKTERTIQQNITEQASVMQKRKTEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX TIQ(0.989)Q(0.012)N(0.333)ITEQ(0.333)ASVMQ(0.333)KR TIQ(19.57)Q(-19.57)N(0)ITEQ(0)ASVMQ(0)KR 5 3 -0.19902 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 570 1788 719 719 4432 5027 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN 466 sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN Protocadherin-16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCHS1 PE=1 SV=1 1 61.0151 0.00475453 61.015 7.6197 61.015 1 61.0151 0.00475453 61.015 2 N PLRAEAAFVLHVTDVNDNAPAFDRQLYRPEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX AEAAFVLHVTDVN(1)DN(1)APAFDR AEAAFVLHVTDVN(61.02)DN(61.02)APAFDR 13 3 1.1835 3391900 0 3391900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3391900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3391900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 571 1791 466 466 72 83 255 273 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN 468 sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN sp|Q96JQ0|PCD16_HUMAN Protocadherin-16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCHS1 PE=1 SV=1 1 61.0151 0.00475453 61.015 7.6197 61.015 1 61.0151 0.00475453 61.015 2 N RAEAAFVLHVTDVNDNAPAFDRQLYRPEPLP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX AEAAFVLHVTDVN(1)DN(1)APAFDR AEAAFVLHVTDVN(61.02)DN(61.02)APAFDR 15 3 1.1835 3391900 0 3391900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3391900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3391900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 572 1791 468 468 72 83 255 273 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 255 273 20190902_JH_WT_Ubi_2 15513 sp|Q96K49-2|TM87B_HUMAN;sp|Q96K49|TM87B_HUMAN 496;497 sp|Q96K49-2|TM87B_HUMAN sp|Q96K49-2|TM87B_HUMAN sp|Q96K49-2|TM87B_HUMAN Isoform 2 of Transmembrane protein 87B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM87B;sp|Q96K49|TM87B_HUMAN Transmembrane protein 87B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM87B PE=1 SV=1 0.999447 32.6533 0.00534974 86.189 39.852 86.189 0.999447 32.6533 0.00534974 86.189 1 N NLTEGIKLRASKSVSNGTAKPATSENFDEDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SVSN(0.999)GTAKPATSEN(0.001)FDEDLK SVSN(32.65)GTAKPATSEN(-32.65)FDEDLK 4 3 0.65561 3674100 3674100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3674100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3674100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 573 1792 496 496 4219 4790 13342 13996 13342 13996 20190902_JH_WT_Ubi_3 7981 13342 13996 20190902_JH_WT_Ubi_3 7981 13342 13996 20190902_JH_WT_Ubi_3 7981 sp|Q96KQ4|ASPP1_HUMAN 105 sp|Q96KQ4|ASPP1_HUMAN sp|Q96KQ4|ASPP1_HUMAN sp|Q96KQ4|ASPP1_HUMAN Apoptosis-stimulating of p53 protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R13B PE=1 SV=3 0.982044 17.417 0.0143643 64.507 8.9186 64.507 0.982044 17.417 0.0143643 64.507 1 N SEQGGRQTQEQRTQRNVINVPGEKRTENGVG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.982)VIN(0.018)VPGEKRTENGVGNPR N(17.42)VIN(-17.42)VPGEKRTEN(-38.03)GVGN(-58.69)PR 1 3 1.0597 2606800 2606800 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 2606800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2606800 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 574 1796 105 105 3247 3709 10428 10972 10428 10972 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10313 10428 10972 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10313 10428 10972 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10313 sp|Q96KR7-3|PHAR3_HUMAN;sp|Q96KR7-2|PHAR3_HUMAN;sp|Q96KR7-4|PHAR3_HUMAN;sp|Q96KR7|PHAR3_HUMAN 431;501;539;542 sp|Q96KR7-3|PHAR3_HUMAN sp|Q96KR7-3|PHAR3_HUMAN sp|Q96KR7-3|PHAR3_HUMAN Isoform 3 of Phosphatase and actin regulator 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHACTR3;sp|Q96KR7-2|PHAR3_HUMAN Isoform 2 of Phosphatase and actin regulator 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHACTR3;sp|Q96KR7-4|PHAR3_HUMAN Isoform 4 of Phospha 0.877355 8.54814 0.0340517 46.318 18.982 46.318 0.877355 8.54814 0.0340517 46.318 1 N ADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX ELN(0.123)EYKSN(0.877)EMEVHASSKHLTR ELN(-8.55)EYKSN(8.55)EMEVHASSKHLTR 8 2 -0.59812 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 575 1797 431 431 1008 1137 3217 3381 3217 3381 20190821_JH_WT_Ubi 3531 3217 3381 20190821_JH_WT_Ubi 3531 3217 3381 20190821_JH_WT_Ubi 3531 sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN 2986 sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN Dynein heavy chain domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNHD1 PE=2 SV=2 0.999986 49.2817 0.0198703 86.882 7.3925 86.882 0.999986 49.2817 0.0198703 86.882 2 N TEADLDRIGEHLPRENLGVKQNIKKEMVLQR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX EN(1)LGVKQ(0.999)N(0.001)IKK EN(49.28)LGVKQ(31.8)N(-31.8)IKK 2 3 -0.26071 2573000 0 2573000 0 NaN 0 0 0 2573000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 576 1800 2986 2986 1045 1175 3301 3469 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 sp|Q96N16-7|JKIP1_HUMAN;sp|Q96N16|JKIP1_HUMAN;sp|Q96N16-6|JKIP1_HUMAN 448;613;378 sp|Q96N16-7|JKIP1_HUMAN sp|Q96N16-7|JKIP1_HUMAN sp|Q96N16-7|JKIP1_HUMAN Isoform 7 of Janus kinase and microtubule-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JAKMIP1;sp|Q96N16|JKIP1_HUMAN Janus kinase and microtubule-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JAKMIP1 PE=1 SV=1;sp|Q96N16-6|JKI 1 48.5269 0.0266274 48.527 10.614 48.527 1 48.5269 0.0266274 48.527 N VLELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM__ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX LSN(1)GADILFEPKLKFM LSN(48.53)GADILFEPKLKFM 3 5 1.7631 690300 690300 0 0 NaN 690300 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 690300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 577 1802 448 448 2809 3185 9045 9516 9045 9516 20190821_JH_EV_Ubi 3656 9045 9516 20190821_JH_EV_Ubi 3656 9045 9516 20190821_JH_EV_Ubi 3656 sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-4|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-2|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-6|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-5|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-7|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-3|NED4L_HUMAN 345;365;422;458;466;478;486;382 sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN Isoform 8 of E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEDD4L;sp|Q96PU5-4|NED4L_HUMAN Isoform 4 of E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEDD4L;sp|Q96PU5-2|NED4L_HUMAN Isoform 2 of 0.461982 0 0.0114363 69.986 31.608 69.986 0.461982 0 0.0114363 69.986 N KDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AVKDTLSN(0.02)PQ(0.056)SPQ(0.462)PSPYN(0.462)SPK AVKDTLSN(-13.64)PQ(-9.16)SPQ(0)PSPYN(0)SPK 18 3 -0.0097645 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 578 1808 345 345 327 385 1102 1189 20190821_JH_MUT_Ubi 5344 1102 1189 20190821_JH_MUT_Ubi 5344 1102 1189 20190821_JH_MUT_Ubi 5344 sp|Q96QK8|SIM14_HUMAN 89 sp|Q96QK8|SIM14_HUMAN sp|Q96QK8|SIM14_HUMAN sp|Q96QK8|SIM14_HUMAN Small integral membrane protein 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMIM14 PE=1 SV=1 0.966815 14.644 0.00653294 78.418 50.699 50.956 0.746766 4.69663 0.00653294 78.418 0.966815 14.644 0.027555 50.956 1 N NLRGSSLPGKPTSPHNGQDPPAPPVD_____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX GSSLPGKPTSPHN(0.967)GQ(0.033)DPPAPPVD GSSLPGKPTSPHN(14.64)GQ(-14.64)DPPAPPVD 13 3 -2.2443 3093500 3093500 0 0 0.24237 0 0 3093500 0 0 0 0 0 0 0 0 1.1535 0 NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3093500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 579 1811 89 89 1700 1938 5419;5420 5704;5705 5420 5705 20190902_JH_WT_Ubi_2 8620 5419 5704 20190821_JH_WT_Ubi 6206 5419 5704 20190821_JH_WT_Ubi 6206 sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN 140 sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN Isoform 5 of Fc receptor-like protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FCRL5 0.964659 14.3372 0.0361543 44.543 9.1286 44.543 0.964659 14.3372 0.0361543 44.543 3 N AKAEVTLNNTIYKNDNVLAFLNKRTDFQ___ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.041)DN(0.965)VLAFLN(0.995)KRTDFQ(1) N(-14.34)DN(14.34)VLAFLN(22.67)KRTDFQ(41.32) 3 2 2.1931 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 580 1812 140 140 3023 3454 9758 10279 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN 146 sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN sp|Q96RD9-5|FCRL5_HUMAN Isoform 5 of Fc receptor-like protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FCRL5 0.994812 22.6697 0.0361543 44.543 9.1286 44.543 0.994812 22.6697 0.0361543 44.543 3 N LNNTIYKNDNVLAFLNKRTDFQ_________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX N(0.041)DN(0.965)VLAFLN(0.995)KRTDFQ(1) N(-14.34)DN(14.34)VLAFLN(22.67)KRTDFQ(41.32) 9 2 2.1931 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 581 1812 146 146 3023 3454 9758 10279 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 9758 10279 20190902_JH_EV_Ubi_3 11688 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-4|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1|NR1H4_HUMAN 174;221;225;231;235 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN Isoform 5 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN Isoform 4 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN Isoform 3 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=960 0.999808 37.1487 0.0333245 57.328 38.041 57.328 0.999808 37.1487 0.0333245 57.328 3 N KRLRKNVKQHADQTVNEDSEGRDLRQVTSTT X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX N(0.006)VKQ(0.997)HADQ(0.997)TVN(1)EDSEGR N(-25.18)VKQ(25.18)HADQ(25.18)TVN(37.15)EDSEGR 11 3 -1.1842 5114600 0 0 5114600 NaN 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 582 1814 174 174 3251 3714 10441 10985 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN 476;534;563 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN Isoform 3 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN Isoform 2 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing pro 0.999892 38.2972 0.0219927 52.185 8.8024 52.185 0.999892 38.2972 0.0219927 52.185 N ASLETNDPILGFQATNERLFVLTTKNLFLIK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(0.435)Q(0.435)VASLETN(0.13)DPILGFQ(0.999)ATN(1)ER Q(0)Q(0)VASLETN(-5.26)DPILGFQ(30.91)ATN(38.3)ER 19 3 2.2563 7923900 0 0 7923900 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 7923900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7923900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 583 1815 476 476 3694 4205 11766 12347 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21|SEBP2_HUMAN 245;250;318 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN Isoform 2 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN Isoform 3 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96 0.999239 32.1009 0.0042319 40.328 25.282 40.328 0.999239 32.1009 0.0042319 40.328 3 N VVRQTLSTELSAAPKNVTSMINLKTIASSAD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.999)VTSMIN(0.998)LKTIASSADPKN(0.154)VSIPSSEALSSDPSYN(0.849)K N(32.1)VTSMIN(27.74)LKTIASSADPKN(-8.21)VSIPSSEALSSDPSYN(8.21)K 1 3 -1.9165 657910 0 0 657910 NaN 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 584 1823 245 245 3267 3731 10481 11026 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21|SEBP2_HUMAN 251;256;324 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN Isoform 2 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN Isoform 3 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96 0.998246 27.7385 0.0042319 40.328 25.282 40.328 0.998246 27.7385 0.0042319 40.328 3 N STELSAAPKNVTSMINLKTIASSADPKNVSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.999)VTSMIN(0.998)LKTIASSADPKN(0.154)VSIPSSEALSSDPSYN(0.849)K N(32.1)VTSMIN(27.74)LKTIASSADPKN(-8.21)VSIPSSEALSSDPSYN(8.21)K 7 3 -1.9165 657910 0 0 657910 NaN 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 585 1823 251 251 3267 3731 10481 11026 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN;sp|Q96T21|SEBP2_HUMAN 279;284;352 sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN sp|Q96T21-2|SEBP2_HUMAN Isoform 2 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96T21-3|SEBP2_HUMAN Isoform 3 of Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SECISBP2;sp|Q96 0.848507 8.2107 0.0042319 40.328 25.282 40.328 0.848507 8.2107 0.0042319 40.328 3 N VSIPSSEALSSDPSYNKEKHIIHPTQKSKAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX N(0.999)VTSMIN(0.998)LKTIASSADPKN(0.154)VSIPSSEALSSDPSYN(0.849)K N(32.1)VTSMIN(27.74)LKTIASSADPKN(-8.21)VSIPSSEALSSDPSYN(8.21)K 35 3 -1.9165 657910 0 0 657910 NaN 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 657910 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 586 1823 279 279 3267 3731 10481 11026 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 10481 11026 20190902_JH_EV_Ubi_3 12267 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN 355;463 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN Isoform 2 of RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1 PE=1 SV=2 0.942366 10.6086 0.0202251 47.113 10.867 47.113 0.942366 10.6086 0.0202251 47.113 3 N TLVALRQQLEEVKAINLQMFHKAQNAESSLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP AIN(0.942)LQ(0.829)MFHKAQ(0.362)N(0.774)AESSLQ(0.083)Q(0.01)K AIN(10.61)LQ(5.79)MFHKAQ(-5.79)N(6.31)AESSLQ(-9.94)Q(-19.6)K 3 3 -2.0312 3846600 0 0 3846600 NaN 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 587 1825 355 355 165 190 560 612 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN 364;472 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN Isoform 2 of RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1 PE=1 SV=2 0.774254 6.31454 0.0202251 47.113 10.867 47.113 0.774254 6.31454 0.0202251 47.113 3 N EEVKAINLQMFHKAQNAESSLQQKNEAITSF X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX AIN(0.942)LQ(0.829)MFHKAQ(0.362)N(0.774)AESSLQ(0.083)Q(0.01)K AIN(10.61)LQ(5.79)MFHKAQ(-5.79)N(6.31)AESSLQ(-9.94)Q(-19.6)K 12 3 -2.0312 3846600 0 0 3846600 NaN 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 588 1825 364 364 165 190 560 612 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN 563;574;575 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN Isoform 3 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN Histone- 0.96198 11.5242 0.0280364 40.968 10.926 40.968 0.96198 11.5242 0.0280364 40.968 4 N DITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP CN(0.962)Q(0.796)ATTLDN(0.481)Q(0.876)N(0.876)IKKAIEVQ(0.005)IQ(0.005)K CN(11.52)Q(4.11)ATTLDN(-4.11)Q(6.32)N(6.32)IKKAIEVQ(-29.51)IQ(-29.51)K 2 4 -1.0085 16052000 0 0 16052000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 589 1827 563 563 354 417 1184 1271 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN 572;583;584 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN Isoform 3 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN Histone- 0.875524 6.31853 0.0280364 40.968 10.926 40.968 0.875524 6.31853 0.0280364 40.968 4 N PPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQEG X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX CN(0.962)Q(0.796)ATTLDN(0.481)Q(0.876)N(0.876)IKKAIEVQ(0.005)IQ(0.005)K CN(11.52)Q(4.11)ATTLDN(-4.11)Q(6.32)N(6.32)IKKAIEVQ(-29.51)IQ(-29.51)K 11 4 -1.0085 16052000 0 0 16052000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 590 1827 572 572 354 417 1184 1271 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 sp|Q99707-2|METH_HUMAN;sp|Q99707|METH_HUMAN 964;1015 sp|Q99707-2|METH_HUMAN sp|Q99707-2|METH_HUMAN sp|Q99707-2|METH_HUMAN Isoform 2 of Methionine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTR;sp|Q99707|METH_HUMAN Methionine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTR PE=1 SV=2 0.933257 11.6602 0.0371867 44.925 21.084 44.925 0.933257 11.6602 0.0371867 44.925 1 N KTVGGEARKVYDDAHNMLNTLISQKKLRARG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX VYDDAHN(0.933)MLN(0.064)TLISQ(0.003)KK VYDDAHN(11.66)MLN(-11.66)TLISQ(-24.83)KK 7 3 4.197 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 591 1842 964 964 5082 5776 16393 17227 16393 17227 20190902_JH_WT_Ubi_2 13341 16393 17227 20190902_JH_WT_Ubi_2 13341 16393 17227 20190902_JH_WT_Ubi_2 13341 sp|Q9BPZ2|SPI2B_HUMAN;sp|Q99865|SPI2A_HUMAN 5;5 sp|Q9BPZ2|SPI2B_HUMAN sp|Q9BPZ2|SPI2B_HUMAN sp|Q9BPZ2|SPI2B_HUMAN Spindlin-2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPIN2B PE=1 SV=1;sp|Q99865|SPI2A_HUMAN Spindlin-2A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPIN2A PE=1 SV=3 0.902705 9.69397 0.0222637 51.606 8.5823 51.606 0.902705 9.69397 0.0222637 51.606 1 N ___________MKTPNAQEAEGQQTRAAAGR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KTPN(0.903)AQ(0.097)EAEGQQTRAAAGR KTPN(9.69)AQ(-9.69)EAEGQ(-36.18)Q(-36.18)TRAAAGR 4 3 0.96135 8194500 8194500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 8194500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8194500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 592 1851 5 5 2466 2801 8043 8454 8043 8454 20190902_JH_WT_Ubi_2 5185 8043 8454 20190902_JH_WT_Ubi_2 5185 8043 8454 20190902_JH_WT_Ubi_2 5185 sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN;sp|Q99959|PKP2_HUMAN 283;283 sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN Isoform 1 of Plakophilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKP2;sp|Q99959|PKP2_HUMAN Plakophilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKP2 PE=1 SV=2 0.430996 0 0.00168362 98.76 78.56 98.76 0.430996 0 0.00168362 98.76 N VGQVRPLVPLQPVTQNRASRSSWHQSSFHST X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ENYLTAGLTVGQ(0.044)VRPLVPLQ(0.094)PVTQ(0.431)N(0.431)R EN(-57.77)YLTAGLTVGQ(-9.89)VRPLVPLQ(-6.62)PVTQ(0)N(0)R 25 3 0.98903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 593 1853 283 283 1051 1183 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-6|AKAP9_HUMAN 2235;2215;2223;2235;2227 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN Isoform 5 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 9 O 1 73.0697 0.0297537 94.465 33.775 94.465 1 73.0697 0.0297537 94.465 4 N LEEQLEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPX N(1)EEVQ(1)Q(1)LHMQ(1)LEIQK N(73.07)EEVQ(83.36)Q(79.09)LHMQ(62.21)LEIQ(-62.21)K 1 2 -0.15284 5047600 0 0 5047600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 594 1854 2235 2235 3033 3466 9785 10308 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN;sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN;sp|Q9BRX5-3|PSF3_HUMAN 123;201;240 sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN Isoform 2 of DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3;sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3 PE=1 SV=1;sp|Q9BRX5-3|PSF3_HUMAN Isoform 3 of DNA 0.69798 1.1789 0.0246361 46.319 6.7876 46.319 0.69798 1.1789 0.0246361 46.319 2 N FQCWEKGQASQITASNLVQNYKKRKFTDMED X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GQ(0.601)ASQ(0.693)ITASN(0.698)LVQ(0.004)N(0.004)YKK GQ(-1.18)ASQ(1.18)ITASN(1.18)LVQ(-21.36)N(-21.36)YKK 10 3 4.0621 1611700 0 1611700 0 NaN 0 0 0 0 0 1611700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1611700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 595 1867 123 123 1660 1890 5303 5584 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN 99 sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN sp|Q9BUF5|TBB6_HUMAN Tubulin beta-6 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB6 PE=1 SV=1 0.650737 3.2332 0.00393202 64.845 24.223 64.845 0.650737 3.2332 0.00393202 64.845 1 N LFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SGPFGQLFRPDNFIFGQ(0.309)TGAGN(0.651)N(0.04)WAK SGPFGQ(-35.35)LFRPDN(-34.89)FIFGQ(-3.23)TGAGN(3.23)N(-12.14)WAK 22 3 -0.65259 1030900 1030900 0 0 0.092773 0 0 0 0 0 0 0 1030900 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.26201 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1030900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 596 1878 99 99 3933 4468 12465 13078 12465 13078 20190902_JH_WT_Ubi_2 15620 12465 13078 20190902_JH_WT_Ubi_2 15620 12465 13078 20190902_JH_WT_Ubi_2 15620 sp|Q9BV40|VAMP8_HUMAN 25 sp|Q9BV40|VAMP8_HUMAN sp|Q9BV40|VAMP8_HUMAN sp|Q9BV40|VAMP8_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP8 PE=1 SV=1 0.821274 7.98391 0.0149077 61.52 32.244 61.52 0.821274 7.98391 0.0149077 61.52 1 N NDRVRNLQSEVEGVKNIMTQNVERILARGEN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX NLQSEVEGVKN(0.821)IMTQ(0.131)N(0.047)VER N(-34.68)LQ(-34.19)SEVEGVKN(7.98)IMTQ(-7.98)N(-12.38)VER 11 3 3.2033 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 597 1882 25 25 3145 3595 10117 10654 10117 10654 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8467 10117 10654 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8467 10117 10654 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8467 sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN;sp|Q9BWT3|PAPOG_HUMAN 365;365 sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN Isoform 2 of Poly(A) polymerase gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPOLG;sp|Q9BWT3|PAPOG_HUMAN Poly(A) polymerase gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPOLG PE=1 SV=2 1 74.4644 0.0210413 74.464 23.028 74.464 1 74.4644 0.0210413 74.464 2 N ILQGKSDWSKLLEPPNFFQKYRHYIVLTASA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LLEPPN(1)FFQ(1)K LLEPPN(74.46)FFQ(74.46)K 6 3 -3.98 4989200 0 4989200 0 NaN 4989200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 4989200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 598 1892 365 365 2686 3055 8731 9180 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN 165 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN Synaptonemal complex protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYCP2 PE=2 SV=2 0.999827 34.6051 0.0234642 58.676 18.087 58.676 0.999827 34.6051 0.0234642 58.676 N SFVPRICSLVIDSRVNICIQQEIIKKMNAML X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX VN(1)ICIQ(0.5)Q(0.5)EIIKK VN(34.61)ICIQ(0)Q(0)EIIKK 2 3 1.5561 4115800 0 4115800 0 NaN 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 599 1893 165 165 4954 5624 15912 16720 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN 266 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL11 PE=1 SV=2 0.458018 0 0.0310626 44.5 13.991 44.5 0.458018 0 0.0310626 44.5 N DQDLLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQHAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP ATSMATMN(0.458)CLN(0.505)DCFHILQ(0.106)LQ(0.419)HASHQ(0.512)K ATSMATMN(0)CLN(0)DCFHILQ(-6.26)LQ(-0.89)HASHQ(0.89)K 8 3 -3.4752 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 600 1895 266 266 306 360 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN 269 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL11 PE=1 SV=2 0.504637 0 0.0310626 44.5 13.991 44.5 0.504637 0 0.0310626 44.5 2 N LLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQHASHQK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ATSMATMN(0.458)CLN(0.505)DCFHILQ(0.106)LQ(0.419)HASHQ(0.512)K ATSMATMN(0)CLN(0)DCFHILQ(-6.26)LQ(-0.89)HASHQ(0.89)K 11 3 -3.4752 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 601 1895 269 269 306 360 1037 1121 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN 405;437 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN Isoform 2 of FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L PE=1 SV=2 0.389413 0 0.0333004 45.784 16.337 45.784 0.389413 0 0.0333004 45.784 N IHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVPEKIG X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX TNTSWCIHVNN(0.002)WLQ(0.848)N(0.37)TFAAKHN(0.389)N(0.389)K TN(-33.59)TSWCIHVN(-33.59)N(-25.81)WLQ(7.55)N(-0.39)TFAAKHN(0)N(0)K 22 3 1.6918 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 602 1897 405 405 4534 5150 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN 406;438 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN Isoform 2 of FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L PE=1 SV=2 0.389413 0 0.0333004 45.784 16.337 45.784 0.389413 0 0.0333004 45.784 N HVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVPEKIGV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TNTSWCIHVNN(0.002)WLQ(0.848)N(0.37)TFAAKHN(0.389)N(0.389)K TN(-33.59)TSWCIHVN(-33.59)N(-25.81)WLQ(7.55)N(-0.39)TFAAKHN(0)N(0)K 23 3 1.6918 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 603 1897 406 406 4534 5150 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-2|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-5|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-4|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-3|S26A6_HUMAN 609;645;626;585;623;644 sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-5|S26A6_HUMAN sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN Isoform 7 of Solute carrier family 26 member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A6;sp|Q9BXS9|S26A6_HUMAN Solute carrier family 26 member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A6 PE=1 SV=1;sp|Q9BXS9-2|S26A6_HUMAN Isoform 2 of Solute carri 0.994442 22.5378 4.95842E-21 149.34 111.22 139.81 0.994442 22.5378 5.46141E-15 139.81 0.984509 18.0317 4.95842E-21 149.34 1 N KMMVSSGDKMEDATANGQEDSKAPDGSTLKA;MMQVSSGDKMEDATANGQEDSKAPDGSTLKA Oxidation (M);GlyGly (K);Oxidation (M);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX MEDATAN(0.994)GQ(0.006)EDSKAPDGSTLK MEDATAN(22.54)GQ(-22.54)EDSKAPDGSTLK 7 3 -0.73731 3262000 3262000 0 0 NaN 0 0 0 0 1926300 1335600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1926300 0 0 1335600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 604 1900;1901 609;585 609 2890 3282 9318;9320 9810;9812 9318 9810 20190902_JH_EV_Ubi_3 4924 9320 9812 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5184 9320 9812 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5184 sp|Q9BY42|RTF2_HUMAN 96 sp|Q9BY42|RTF2_HUMAN sp|Q9BY42|RTF2_HUMAN sp|Q9BY42|RTF2_HUMAN Protein RTF2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTFDC1 PE=1 SV=3 1 85.8618 0.0134354 85.862 32.087 85.862 1 85.8618 0.0134354 85.862 N HIKSIKNVTELKLSDNPAWEGDKGNTKGDKH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LSDN(1)PAWEGDK LSDN(85.86)PAWEGDK 4 2 0.44441 259750 259750 0 0 NaN 0 0 0 0 259750 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 259750 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 605 1903 96 96 2802 3178 9037 9508 9037 9508 20190902_JH_EV_Ubi_3 6767 9037 9508 20190902_JH_EV_Ubi_3 6767 9037 9508 20190902_JH_EV_Ubi_3 6767 sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN 143 sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC11C PE=1 SV=3 1 62.5821 0.0287352 62.582 6.5687 62.582 1 62.5821 0.0287352 62.582 N DNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EGQ(1)N(1)WLEKK EGQ(62.58)N(62.58)WLEKK 4 3 -2.632 301960 0 301960 0 NaN 0 0 0 0 0 0 301960 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 301960 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 606 1906 143 143 907 1025 2871 3023 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-3|CADM1_HUMAN 398;426;437;455 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN Isoform 5 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1 PE=1 SV=2;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN Isoform 4 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo s 0.972039 20.4049 3.59919E-12 113.7 79.083 79.942 0.484288 3.31891 3.59919E-12 113.7 0.972039 20.4049 0.0140452 79.942 0.891936 13.5517 0.00452363 100.76 1 N AKGADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX GADDAADADTAIIN(0.972)AEGGQ(0.009)N(0.009)N(0.009)SEEKK GADDAADADTAIIN(20.4)AEGGQ(-20.4)N(-20.4)N(-20.4)SEEKK 14 3 -1.6871 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 607 1907 398 398 1353 1537 4282;4285 4503;4506 4282 4503 20190902_JH_EV_Ubi_2 6503 4283 4504 20190821_JH_MUT_Ubi 6284 4283 4504 20190821_JH_MUT_Ubi 6284 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-3|CADM1_HUMAN 404;432;443;461 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN Isoform 5 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1 PE=1 SV=2;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN Isoform 4 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo s 0.303205 0 0.00560332 60.991 38.055 60.991 0.303205 0 0.00560332 60.991 N AADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI_____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX GADDAADADTAIIN(0.09)AEGGQ(0.303)N(0.303)N(0.303)SEEKK GADDAADADTAIIN(-5.26)AEGGQ(0)N(0)N(0)SEEKK 20 3 2.0905 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 608 1907 404 404 1353 1537 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-3|CADM1_HUMAN 405;433;444;462 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN Isoform 5 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1 PE=1 SV=2;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN Isoform 4 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo s 0.303205 0 0.00560332 60.991 38.055 60.991 0.303205 0 0.00560332 60.991 N ADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX GADDAADADTAIIN(0.09)AEGGQ(0.303)N(0.303)N(0.303)SEEKK GADDAADADTAIIN(-5.26)AEGGQ(0)N(0)N(0)SEEKK 21 3 2.0905 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 609 1907 405 405 1353 1537 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 4281 4502 20190902_JH_EV_Ubi_2 7195 sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-2|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA8-3|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA8-2|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA8-4|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA7-6|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-5|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-4|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-3|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-8|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA8|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA7|PC11X_HUMAN 183;183;204;215;215;183;183;183;183;183;215;183 sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN Isoform 7 of Protocadherin-11 X-linked OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDH11X;sp|Q9BZA7-2|PC11X_HUMAN Isoform 2 of Protocadherin-11 X-linked OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDH11X;sp|Q9BZA8-3|PC11Y_HUMAN Isoform 3 of Protocadherin-11 Y-link 1 46.1561 0.0314962 46.156 13.626 46.156 1 46.1561 0.0314962 46.156 2 N VGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPX SQ(1)N(1)IFGLDVIETPEGDK SQ(46.16)N(46.16)IFGLDVIETPEGDK 3 4 0.044171 2536700 0 2536700 0 NaN 0 2536700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2536700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 610 1910 183 183 4127 4690 13093 13730 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN;sp|Q9C0B2|CFA74_HUMAN 541;541 sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 74 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP74;sp|Q9C0B2|CFA74_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 74 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP74 PE=2 SV=3 1 53.7538 0.0222649 53.754 8.6384 53.754 1 53.7538 0.0222649 53.754 2 N DFDIGKVYKKKITLVNTTYTINYCKLVGVEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX ITLVN(1)TTYTIN(1)YCK ITLVN(53.75)TTYTIN(53.75)YCK 5 3 1.4985 2933000 0 2933000 0 NaN 0 2933000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 611 1913 541 541 2277 2590 7463 7844 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN;sp|Q9C0B2|CFA74_HUMAN 547;547 sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN sp|Q9C0B2-2|CFA74_HUMAN Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 74 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP74;sp|Q9C0B2|CFA74_HUMAN Cilia- and flagella-associated protein 74 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP74 PE=2 SV=3 1 53.7538 0.0222649 53.754 8.6384 53.754 1 53.7538 0.0222649 53.754 2 N VYKKKITLVNTTYTINYCKLVGVEEHLRDFI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX ITLVN(1)TTYTIN(1)YCK ITLVN(53.75)TTYTIN(53.75)YCK 11 3 1.4985 2933000 0 2933000 0 NaN 0 2933000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 612 1913 547 547 2277 2590 7463 7844 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 7463 7844 20190821_JH_MUT_Ubi 5865 sp|Q9C0K1-2|S39A8_HUMAN;sp|Q9C0K1-3|S39A8_HUMAN;sp|Q9C0K1|S39A8_HUMAN 159;226;226 sp|Q9C0K1-2|S39A8_HUMAN sp|Q9C0K1-2|S39A8_HUMAN sp|Q9C0K1-2|S39A8_HUMAN Isoform 2 of Zinc transporter ZIP8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A8;sp|Q9C0K1-3|S39A8_HUMAN Isoform 3 of Zinc transporter ZIP8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A8;sp|Q9C0K1|S39A8_HUMAN Zinc transporter ZIP8 OS=Homo sapiens OX=9606 0.862567 8.10095 8.77319E-25 153.14 112.42 153.14 0.862567 8.10095 8.77319E-25 153.14 1 N FFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TYGQ(0.133)N(0.863)GHTHFGN(0.005)DNFGPQEKTHQPK TYGQ(-8.1)N(8.1)GHTHFGN(-22.66)DN(-52.3)FGPQ(-104.95)EKTHQ(-124.36)PK 5 3 0.24012 2575000 2575000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2575000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2575000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 613 1916 159 159 4698 5331 15078 15845 15078 15845 20190902_JH_WT_Ubi_3 5826 15078 15845 20190902_JH_WT_Ubi_3 5826 15078 15845 20190902_JH_WT_Ubi_3 5826 sp|Q9GZN1|ARP6_HUMAN 182 sp|Q9GZN1|ARP6_HUMAN sp|Q9GZN1|ARP6_HUMAN sp|Q9GZN1|ARP6_HUMAN Actin-related protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTR6 PE=1 SV=1 1 80.8791 0.00227609 81.625 38.649 81.625 1 80.8791 0.00227609 81.625 1 N KEAIIRINVGGKLLTNHLKEIISYRQLHVMD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EAIIRINVGGKLLTN(1)HLK EAIIRIN(-80.88)VGGKLLTN(80.88)HLK 15 2 4.1112 1111600 1111600 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1111600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1111600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 614 1917 182 182 794 899 2492 2624 2492 2624 20190902_JH_WT_Ubi_3 15048 2492 2624 20190902_JH_WT_Ubi_3 15048 2492 2624 20190902_JH_WT_Ubi_3 15048 sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN 128 sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN Protein FAM192A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM192A PE=1 SV=1 1 95.7746 0.00813687 101.46 10.195 95.775 1 101.46 0.00813687 101.46 1 95.7746 0.0135575 95.775 2 N KEYRNNLKKVGISQENKKEVEKKLTVKPIET X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KVGISQ(1)EN(1)KK KVGISQ(95.77)EN(95.77)KK 8 3 -0.9863 44186000 0 44186000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 28181000 16005000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28181000 0 0 16005000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 615 1919 128 128 2477 2812 8063;8064 8476;8477 8064 8477 20190902_JH_WT_Ubi_3 8023 8063 8476 20190902_JH_WT_Ubi_2 8426 8063 8476 20190902_JH_WT_Ubi_2 8426 sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN;sp|Q9H0E2|TOLIP_HUMAN 174;243 sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN Isoform 2 of Toll-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOLLIP;sp|Q9H0E2|TOLIP_HUMAN Toll-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOLLIP PE=1 SV=1 0.726079 4.23354 0.00570478 66.702 21.655 66.702 0.726079 4.23354 0.00570478 66.702 2 N RCSEEDLKAIQDMFPNMDQEVIRSVLEAQRG X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX CSEEDLKAIQ(1)DMFPN(0.726)MDQ(0.274)EVIR CSEEDLKAIQ(49.28)DMFPN(4.23)MDQ(-4.23)EVIR 15 3 0.66343 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 616 1926 174 174 362 429;430 1201 1288 1201 1288 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11807 1201 1288 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11807 1201 1288 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11807 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN;sp|Q9H0E3|SP130_HUMAN 500;970;935 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN Isoform 2 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN Isoform 3 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130;sp|Q9H0E3|SP130_HUMAN Histon 0.993889 22.0854 0.0173412 69.979 15.329 69.979 0.993889 22.0854 0.0173412 69.979 2 N VRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHL X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KAMLQ(0.012)EIAN(0.994)Q(0.994)K KAMLQ(-22.09)EIAN(22.09)Q(22.09)K 9 3 4.4163 2831700 0 2831700 0 0.16738 0 0 0 0 0 0 0 0 2831700 NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2831700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 617 1927 500 500 2318 2637 7624 8021 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN 278 sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN sp|Q9H0G5|NSRP1_HUMAN Nuclear speckle splicing regulatory protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSRP1 PE=1 SV=1 1 64.3739 0.0242316 64.374 40.62 64.374 1 64.3739 0.0242316 64.374 N TRVNCRREKVIETPENDFKHHRSQNHSRSPS X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX REKVIETPEN(1)DFK REKVIETPEN(64.37)DFK 10 2 -0.10779 11459000 11459000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 11459000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11459000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 618 1929 278 278 3739 4253 11866 12448 11866 12448 20190902_JH_WT_Ubi_3 14996 11866 12448 20190902_JH_WT_Ubi_3 14996 11866 12448 20190902_JH_WT_Ubi_3 14996 sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN 6 sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN Isoform 10 of Tumor protein 63 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TP63 0.818614 6.8571 0.0273615 51.591 25.745 51.591 0.818614 6.8571 0.0273615 51.591 2 N __________MLYLENNAQTQFSEYSTELKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX LYLEN(0.819)N(0.26)AQ(0.696)TQ(0.225)FSEYSTELK LYLEN(6.86)N(-6.86)AQ(5.44)TQ(-5.44)FSEYSTELK 5 3 -1.5305 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 619 1943 6 6 2870 3253 9239 9724 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 sp|Q9H3M7-2|TXNIP_HUMAN;sp|Q9H3M7|TXNIP_HUMAN 169;224 sp|Q9H3M7-2|TXNIP_HUMAN sp|Q9H3M7-2|TXNIP_HUMAN sp|Q9H3M7-2|TXNIP_HUMAN Isoform 2 of Thioredoxin-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNIP;sp|Q9H3M7|TXNIP_HUMAN Thioredoxin-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNIP PE=1 SV=1 0.991459 20.6486 0.0347739 94.45 58.343 94.45 0.991459 20.6486 0.0347739 94.45 1 N VVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HTYLAN(0.991)GQ(0.009)TKVLTQK HTYLAN(20.65)GQ(-20.65)TKVLTQ(-68.16)K 6 3 0.85581 3708500 3708500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3708500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3708500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 620 1945 169 169 2016 2299 6622 6967 6622 6967 20190902_JH_WT_Ubi_2 6754 6622 6967 20190902_JH_WT_Ubi_2 6754 6622 6967 20190902_JH_WT_Ubi_2 6754 sp|Q9H4I8|SEHL2_HUMAN 4 sp|Q9H4I8|SEHL2_HUMAN sp|Q9H4I8|SEHL2_HUMAN sp|Q9H4I8|SEHL2_HUMAN Serine hydrolase-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERHL2 PE=2 SV=1 1 69.2288 0.0307832 69.229 9.0618 69.229 1 69.2288 0.0307832 69.229 1 N ____________MSENAAPGLISELKLAVPW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX SEN(1)AAPGLISELK SEN(69.23)AAPGLISELK 3 3 1.8106 34449000 34449000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 34449000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34449000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 621 1954 4 4 3893 4420 12323 12922 12323 12922 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5725 12323 12922 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5725 12323 12922 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5725 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN 451 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN Pseudopodium-enriched atypical kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEAK1 PE=1 SV=4 1 42.7114 0.0256824 42.711 11.738 42.711 1 42.7114 0.0256824 42.711 3 N ESKASTDVAGQAVTINLVPTEEQAKPYRVVN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX ASTDVAGQ(1)AVTIN(1)LVPTEEQ(1)AK ASTDVAGQ(42.71)AVTIN(42.71)LVPTEEQ(42.71)AK 13 3 2.2498 4900300 0 0 4900300 NaN 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 622 1964 451 451 284 334 979 1062 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN 236 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIR PE=1 SV=3 0.496106 0 6.03568E-07 97.388 68.807 97.388 0.496106 0 6.03568E-07 97.388 N AASNRRAQELVRMDSNIQGIENPGFEASPPA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MDSN(0.496)IQ(0.496)GIEN(0.006)PGFEASPPAQ(0.001)GIPEAKVR MDSN(0)IQ(0)GIEN(-18.94)PGFEASPPAQ(-25.34)GIPEAKVR 4 3 0.76782 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 623 1967 236 236 2887 3278;3279 9309 9800 20190902_JH_EV_Ubi_3 9600 9309 9800 20190902_JH_EV_Ubi_3 9600 9309 9800 20190902_JH_EV_Ubi_3 9600 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN 242 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIR PE=1 SV=3 0.871264 9.56987 9.48812E-40 169.8 117.28 169.8 0.871264 9.56987 9.48812E-40 169.8 1 N AQELVRMDSNIQGIENPGFEASPPAQGIPEA X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MDSNIQ(0.096)GIEN(0.871)PGFEASPPAQ(0.032)GIPEAKVR MDSN(-33.43)IQ(-9.57)GIEN(9.57)PGFEASPPAQ(-14.33)GIPEAKVR 10 3 -0.60079 7763400 7763400 0 0 0.038559 0 0 0 0 0 0 0 0 5542600 0 0 0 0 0 0 0 0 0.20244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5542600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 624 1967 242 242 2887 3278;3279 9312;9315 9804;9807 9312 9804 20190902_JH_WT_Ubi_3 11009 9312 9804 20190902_JH_WT_Ubi_3 11009 9312 9804 20190902_JH_WT_Ubi_3 11009 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN 113 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN Putative uncharacterized protein encoded by HEXA-AS1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEXA-AS1 PE=5 SV=1 0.500022 0 0.0357344 43.544 16.757 43.544 0.500022 0 0.0357344 43.544 3 N KDLHFRNTMLSSCIRNQLGGPFLLEVENNER X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.5)Q(0.5)LGGPFLLEVEN(1)N(1)ER N(0)Q(0)LGGPFLLEVEN(43.54)N(43.54)ER 1 2 -0.97377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 625 1970 113 113 3201 3658 10302 10845 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN 125 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN Putative uncharacterized protein encoded by HEXA-AS1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEXA-AS1 PE=5 SV=1 0.999978 43.5437 0.0357344 43.544 16.757 43.544 0.999978 43.5437 0.0357344 43.544 3 N CIRNQLGGPFLLEVENNERLNYRSGEGRQL_ X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX N(0.5)Q(0.5)LGGPFLLEVEN(1)N(1)ER N(0)Q(0)LGGPFLLEVEN(43.54)N(43.54)ER 13 2 -0.97377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 626 1970 125 125 3201 3658 10302 10845 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN 126 sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN sp|Q9H8Q6|HEAS1_HUMAN Putative uncharacterized protein encoded by HEXA-AS1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEXA-AS1 PE=5 SV=1 0.999978 43.5437 0.0357344 43.544 16.757 43.544 0.999978 43.5437 0.0357344 43.544 3 N IRNQLGGPFLLEVENNERLNYRSGEGRQL__ X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX N(0.5)Q(0.5)LGGPFLLEVEN(1)N(1)ER N(0)Q(0)LGGPFLLEVEN(43.54)N(43.54)ER 14 2 -0.97377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 627 1970 126 126 3201 3658 10302 10845 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 10302 10845 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14301 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN 171 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP29 PE=2 SV=1 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 18.495 41.491 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 5 N HVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTNEDILKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX GILEN(0.069)Q(0.935)GGKGQ(0.999)N(0.999)TLSSDVQ(0.999)TN(0.999)EDILK GILEN(-11.57)Q(11.57)GGKGQ(30.07)N(30.07)TLSSDVQ(30.07)TN(29.86)EDILK 12 3 -1.9309 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 628 1981 171 171 1540 1754 4931 5187 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN 180 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP29 PE=2 SV=1 0.999038 29.8595 0.0285376 41.491 18.495 41.491 0.999038 29.8595 0.0285376 41.491 5 N QGGKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNKKY Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX GILEN(0.069)Q(0.935)GGKGQ(0.999)N(0.999)TLSSDVQ(0.999)TN(0.999)EDILK GILEN(-11.57)Q(11.57)GGKGQ(30.07)N(30.07)TLSSDVQ(30.07)TN(29.86)EDILK 21 3 -1.9309 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 629 1981 180 180 1540 1754 4931 5187 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 sp|Q9HC07-2|TM165_HUMAN;sp|Q9HC07|TM165_HUMAN 148;211 sp|Q9HC07-2|TM165_HUMAN sp|Q9HC07-2|TM165_HUMAN sp|Q9HC07-2|TM165_HUMAN Isoform 2 of Transmembrane protein 165 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM165;sp|Q9HC07|TM165_HUMAN Transmembrane protein 165 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM165 PE=1 SV=1 1 73.6486 4.3919E-07 116.98 58.162 116.98 0.996843 24.994 0.0119105 76.678 0.999969 45.0201 0.00357209 84.371 0.999757 36.154 0.030395 72.585 1 73.6486 4.3919E-07 116.98 1 69.4429 0.000138975 96.455 1 N ELKKKDEEFQRTKLLNGPGDVETGTSITVPQ X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TKLLN(1)GPGDVETGTSITVPQK TKLLN(73.65)GPGDVETGTSITVPQ(-73.65)K 5 3 -0.49747 13658000 13658000 0 0 0.13536 3199200 2309200 0 0 2254700 2991100 2903700 0 0 0.13847 0.18308 NaN 0 0.14603 0.17795 0.22879 NaN NaN 3199200 0 0 2309200 0 0 0 0 0 0 0 0 2254700 0 0 2991100 0 0 2903700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 630 1984 148 148 4448 5046 14126;14127;14128;14129;14130 14830;14831;14832;14833;14834 14129 14833 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8981 14129 14833 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8981 14129 14833 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8981 sp|Q9HC35-2|EMAL4_HUMAN;sp|Q9HC35|EMAL4_HUMAN 787;845 sp|Q9HC35-2|EMAL4_HUMAN sp|Q9HC35-2|EMAL4_HUMAN sp|Q9HC35-2|EMAL4_HUMAN Isoform 2 of Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML4;sp|Q9HC35|EMAL4_HUMAN Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML4 PE=1 SV=3 0.999998 57.5755 1.73516E-12 113.08 82.423 107.83 0.9985 28.2334 5.25675E-07 92.551 0.999952 43.2229 5.58365E-07 92.136 0.999998 57.5755 1.30167E-10 107.83 0.999322 31.6875 5.00193E-06 86.707 0.999876 39.0822 1.73516E-12 113.08 0.999949 42.9147 0.000157268 73.831 1 N YSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSII X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX YSAHSSHVTNVSFTHN(1)DSHLISTGGK YSAHSSHVTN(-57.58)VSFTHN(57.58)DSHLISTGGK 16 4 0.069916 17838000 17838000 0 0 0.31872 1579000 431940 4042400 0 0 1693200 0 6102900 3988500 0.33821 0.27998 0.24358 0 NaN NaN NaN 0.36703 0.29962 1579000 0 0 431940 0 0 4042400 0 0 0 0 0 0 0 0 1693200 0 0 0 0 0 6102900 0 0 3988500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 631 1985 787 787 5200 5919 16789;16790;16791;16792;16793;16794 17648;17649;17650;17651;17652;17653 16792 17651 20190821_JH_WT_Ubi 5305 16793 17652 20190902_JH_WT_Ubi_2 7216 16793 17652 20190902_JH_WT_Ubi_2 7216 sp|Q9HCE1-2|MOV10_HUMAN;sp|Q9HCE1|MOV10_HUMAN 731;731 sp|Q9HCE1-2|MOV10_HUMAN sp|Q9HCE1-2|MOV10_HUMAN sp|Q9HCE1-2|MOV10_HUMAN Isoform 2 of Putative helicase MOV-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOV10;sp|Q9HCE1|MOV10_HUMAN Putative helicase MOV-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOV10 PE=1 SV=2 1 59.2612 0.0360184 59.261 7.7657 59.261 1 59.2612 0.0360184 59.261 2 N GPDGYDPQFITKLLRNYRSHPTILDIPNQLY X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX GPDGYDPQ(1)FITKLLRN(1)YR GPDGYDPQ(59.26)FITKLLRN(59.26)YR 16 3 -0.01943 2348500 0 2348500 0 NaN 2348500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 2348500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 632 1987 731 731 1642 1871 5254 5532 5254 5532 20190821_JH_EV_Ubi 9108 5254 5532 20190821_JH_EV_Ubi 9108 5254 5532 20190821_JH_EV_Ubi 9108 sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN 248 sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CWC22 PE=1 SV=3 1 55.1117 0.0292676 55.112 9.9536 55.112 1 55.1117 0.0292676 55.112 N ILKRLILNFRKGYRRNDKQLCLTASKFVAHL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)DKQ(1)LCLTASK N(55.11)DKQ(55.11)LCLTASK 1 2 -2.1169 138950000 0 138950000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 138950000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 138950000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 633 1988 248 248 3021 3452 9756 10277 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-13|SYTL2_HUMAN 84;178;226;226;227 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN Isoform 12 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN Isoform 11 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN Isoform 4 of Synaptotagmin-lik 1 52.5786 0.0274261 52.579 19.316 52.579 1 52.5786 0.0274261 52.579 N IQKLEKSKQTLPGLSNGSQIKAPIPKARKMI X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX Q(1)TLPGLSN(1)GSQ(1)IK Q(52.58)TLPGLSN(52.58)GSQ(52.58)IK 8 2 -2.5824 15781000 0 0 15781000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 634 1989 84 84 3705 4216 11780 12361 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN 1286 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN DBF4-type zinc finger-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZDBF2 PE=1 SV=3 1 47.3971 0.0303246 47.397 6.195 47.397 1 47.3971 0.0303246 47.397 3 N VDLENKIVKPTDSRINFDSHEPLQSVTNKIP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX PTDSRIN(1)FDSHEPLQ(1)SVTN(1)K PTDSRIN(47.4)FDSHEPLQ(47.4)SVTN(47.4)K 7 3 -1.8384 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 635 1990 1286 1286 3529 4025 11346 11919 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN 1298 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN DBF4-type zinc finger-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZDBF2 PE=1 SV=3 1 47.3971 0.0303246 47.397 6.195 47.397 1 47.3971 0.0303246 47.397 3 N SRINFDSHEPLQSVTNKIPGANKEINLLREE X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX PTDSRIN(1)FDSHEPLQ(1)SVTN(1)K PTDSRIN(47.4)FDSHEPLQ(47.4)SVTN(47.4)K 19 3 -1.8384 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 636 1990 1298 1298 3529 4025 11346 11919 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 sp|Q9HCL3|ZFP14_HUMAN 38 sp|Q9HCL3|ZFP14_HUMAN sp|Q9HCL3|ZFP14_HUMAN sp|Q9HCL3|ZFP14_HUMAN Zinc finger protein 14 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZFP14 PE=2 SV=2 0.561517 1.0741 0.0308122 44.238 9.8013 44.238 0.561517 1.0741 0.0308122 44.238 1 N LDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX DLYRDVMWEN(0.562)YSN(0.438)FISLGPSISK DLYRDVMWEN(1.07)YSN(-1.07)FISLGPSISK 10 3 -0.36443 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 637 1991 38 38 613 703 1933 2051 1933 2051 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10675 1933 2051 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10675 1933 2051 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10675 sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN 191 sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN Zinc finger protein 334 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF334 PE=1 SV=2 0.528207 0 0.0358083 41.257 14.939 41.257 0.528207 0 0.0358083 41.257 N LGMKKYRYNPMRKASNQNENLILHQNIQILK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YN(0.16)PMRKASN(0.528)Q(0.528)N(0.528)EN(0.189)LILHQ(0.022)N(0.022)IQ(0.022)ILK YN(-6.64)PMRKASN(0)Q(0)N(0)EN(-5.84)LILHQ(-17.66)N(-17.66)IQ(-17.66)ILK 9 4 1.4133 966060 0 966060 0 NaN 0 0 0 0 966060 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 966060 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 638 1994 191 191 5186 5902 16730 17587 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN 193 sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN sp|Q9HCZ1|ZN334_HUMAN Zinc finger protein 334 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF334 PE=1 SV=2 0.527928 0 0.0358083 41.257 14.939 41.257 0.527928 0 0.0358083 41.257 N MKKYRYNPMRKASNQNENLILHQNIQILKQP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX YN(0.16)PMRKASN(0.528)Q(0.528)N(0.528)EN(0.189)LILHQ(0.022)N(0.022)IQ(0.022)ILK YN(-6.64)PMRKASN(0)Q(0)N(0)EN(-5.84)LILHQ(-17.66)N(-17.66)IQ(-17.66)ILK 11 4 1.4133 966060 0 966060 0 NaN 0 0 0 0 966060 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 966060 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 639 1994 193 193 5186 5902 16730 17587 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 16730 17587 20190902_JH_EV_Ubi_3 11607 sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN;sp|Q9HD67|MYO10_HUMAN 241;884 sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN Isoform Headless of Unconventional myosin-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO10;sp|Q9HD67|MYO10_HUMAN Unconventional myosin-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO10 PE=1 SV=3 0.997167 25.4644 0.03565 51.528 13.806 51.528 0.997167 25.4644 0.03565 51.528 2 N QKEAELTRELEKQKENKQVEEILRLEKEIED X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXX Q(0.003)KEN(0.997)KQ(1)VEEILR Q(-25.46)KEN(25.46)KQ(45.57)VEEILR 4 2 -2.7517 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 640 1995 241 241 3646 4155 11683 12261 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN 184 sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN DnaJ homolog subfamily C member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJC4 PE=1 SV=1 1 52.3906 0.0322887 52.391 6.7376 52.391 1 52.3906 0.0322887 52.391 2 N GLHYIAFRKVKQMHLNFMDEKDRIITAFYNE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX VKQ(1)MHLN(1)FMDEKDR VKQ(52.39)MHLN(52.39)FMDEKDR 7 2 -1.7261 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 641 1997 184 184 4880 5540 15683 16482 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN 250 sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN Solute carrier family 40 member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC40A1 PE=1 SV=1 1 64.3739 0.0316532 64.374 17.146 64.374 1 64.3739 0.0316532 64.374 2 N VKAGLKEEETELKQLNLHKDTEPKPLEGTHL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX Q(1)LN(1)LHKDTEPK Q(64.37)LN(64.37)LHKDTEPK 3 3 1.886 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 642 1998 250 250 3662 4171 11711 12290 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN 199;243 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN Isoform 2 of ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3 PE=1 SV=1 0.822019 6.58409 0.0303959 48.899 20.733 48.899 0.822019 6.58409 0.0303959 48.899 3 N KKGSLGAQKLANTCFNEIEKQAQAADKMKEQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX LAN(0.189)TCFN(0.822)EIEKQ(0.989)AQ(0.999)AADK LAN(-6.58)TCFN(6.58)EIEKQ(18.83)AQ(29.83)AADK 7 3 -2.8819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 643 1999 199 199 2506 2845 8133 8550 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN;sp|Q9NQ76|MEPE_HUMAN;sp|Q9NQ76-2|MEPE_HUMAN 106;219;250 sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN Isoform 3 of Matrix extracellular phosphoglycoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEPE;sp|Q9NQ76|MEPE_HUMAN Matrix extracellular phosphoglycoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEPE PE=1 SV=1;sp|Q9NQ76-2|MEPE_HUMAN Isoform 2 of Matrix 1 49.4658 0.0347121 49.466 9.6175 49.466 1 49.4658 0.0347121 49.466 2 N QKSPVKSKSTHRIQHNIDYLKHLSKVKKIPS X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX SKSTHRIQ(1)HN(1)IDYLK SKSTHRIQ(49.47)HN(49.47)IDYLK 10 2 0.18225 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 644 2003 106 106 3992 4538 12654 13272 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN;sp|Q9NR80-4|ARHG4_HUMAN;sp|Q9NR80|ARHG4_HUMAN 389;460;460 sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN Isoform 3 of Rho guanine nucleotide exchange factor 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF4;sp|Q9NR80-4|ARHG4_HUMAN Isoform 4 of Rho guanine nucleotide exchange factor 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF4;sp|Q9NR80|ARHG4_HUMAN Rho guan 0.99998 46.9615 0.0261355 80.706 7.8583 80.706 0.99998 46.9615 0.0261355 80.706 2 N HRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)VAQ(1)LINERKR N(46.96)VAQ(40.77)LIN(-40.77)ERKR 1 3 -2.3479 3430300 0 3430300 0 NaN 0 0 0 0 0 0 3430300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3430300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 645 2012 389 389 3236 3696 10398 10942 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN 680 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IARS2 PE=1 SV=2 0.333323 0 0.000172702 93.115 43.127 73.057 0.333323 0 0.00289577 73.057 0.331699 0 0.000172702 93.115 N MSKSLGNVIHPDVVVNGGQDQSKEPPYGADV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SLGNVIHPDVVVN(0.333)GGQ(0.333)DQ(0.333)SK SLGN(-40.43)VIHPDVVVN(0)GGQ(0)DQ(0)SK 13 3 -1.1624 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 646 2027 680 680 4014 4560 12706 13328 20190902_JH_WT_Ubi_2 10010 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN;sp|Q9NSI8|SAMN1_HUMAN 8;8 sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN Isoform 2 of SAM domain-containing protein SAMSN-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMSN1;sp|Q9NSI8|SAMN1_HUMAN SAM domain-containing protein SAMSN-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMSN1 PE=1 SV=1 1 44.8635 0.0339837 44.863 10.143 44.863 1 44.8635 0.0339837 44.863 N ________MLKRKPSNVSEKEKHQKPKKGDI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXX PSN(1)VSEKEKHQ(1)K PSN(44.86)VSEKEKHQ(44.86)K 3 2 -3.945 969570 0 969570 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 969570 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 969570 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 647 2028 8 8 3517 4012 11314 11886 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN;sp|Q9NTK5|OLA1_HUMAN 102;102 sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN Isoform 3 of Obg-like ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OLA1;sp|Q9NTK5|OLA1_HUMAN Obg-like ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OLA1 PE=1 SV=2 0.644274 5.2674 3.20368E-05 81.477 52.131 81.477 0.644274 5.2674 3.20368E-05 81.477 1 N FLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISAC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GAHN(0.644)GQ(0.164)GLGN(0.192)AFLSHISACDGIFHLTR GAHN(5.27)GQ(-5.94)GLGN(-5.27)AFLSHISACDGIFHLTR 4 4 -0.40747 4724800 4724800 0 0 NaN 0 0 4724800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 4724800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 648 2031 102 102 1368 1557 4345 4568 4345 4568 20190821_JH_WT_Ubi 11308 4345 4568 20190821_JH_WT_Ubi 11308 4345 4568 20190821_JH_WT_Ubi 11308 sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN;sp|Q9NTK5|OLA1_HUMAN 108;108 sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN sp|Q9NTK5-3|OLA1_HUMAN Isoform 3 of Obg-like ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OLA1;sp|Q9NTK5|OLA1_HUMAN Obg-like ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OLA1 PE=1 SV=2 0.727051 6.96951 0.00034666 66.52 37.187 66.52 0.727051 6.96951 0.00034666 66.52 1 N IAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GAHN(0.127)GQ(0.146)GLGN(0.727)AFLSHISACDGIFHLTR GAHN(-7.58)GQ(-6.97)GLGN(6.97)AFLSHISACDGIFHLTR 10 4 0.15489 12873000 12873000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12873000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12873000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 649 2031 108 108 1368 1557 4346 4569 4346 4569 20190902_JH_WT_Ubi_3 12785 4346 4569 20190902_JH_WT_Ubi_3 12785 4346 4569 20190902_JH_WT_Ubi_3 12785 sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN;sp|Q9NVI1-1|FANCI_HUMAN;sp|Q9NVI1|FANCI_HUMAN 1213;1214;1274 sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN Isoform 2 of Fanconi anemia group I protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCI;sp|Q9NVI1-1|FANCI_HUMAN Isoform 1 of Fanconi anemia group I protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCI;sp|Q9NVI1|FANCI_HUMAN Fanconi anemia group I protein O 1 76.2278 0.0307317 76.228 20.967 76.228 1 76.2278 0.0307317 76.228 2 N QYEKFLIHLSKKSKVNLMQHMKLSTSRDFKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KSKVN(1)LMQ(1)HMK KSKVN(76.23)LMQ(76.23)HMK 5 3 1.8299 7166400 0 7166400 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7166400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7166400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 650 2045 1213 1213 2457 2792 8031 8442 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN;sp|Q9NWK9|BCD1_HUMAN 119;158 sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN Isoform 2 of Box C/D snoRNA protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT6;sp|Q9NWK9|BCD1_HUMAN Box C/D snoRNA protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT6 PE=1 SV=1 0.999995 50.8492 0.00474517 77.068 23.122 75.316 0.999656 34.7538 0.00474517 77.068 0.999995 50.8492 0.00524755 75.316 2 N KEEVMDWSEVKEEKDNLEIKQEEKFVGQCIK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP DN(1)LEIKQ(1)EEKFVGQCIK DN(50.85)LEIKQ(40.23)EEKFVGQ(-40.23)CIK 2 3 2.3911 12510000 0 12510000 0 NaN 0 0 0 2851900 0 0 9658500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2851900 0 0 0 0 0 0 0 0 9658500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 651 2050 119 119 633 725;726 1991;1992 2110;2111 1992 2111 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10081 1991 2110 20190902_JH_EV_Ubi_2 9888 1991 2110 20190902_JH_EV_Ubi_2 9888 sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN 119 sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN BRISC and BRCA1-A complex member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM1 PE=1 SV=1 0.988097 20.8997 0.030124 45.438 7.0622 45.438 0.988097 20.8997 0.030124 45.438 2 N EMSLPKLESFNGSKTNALNVSQKMIEMFVRT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LESFN(0.008)GSKTN(0.988)ALN(0.797)VSQ(0.207)K LESFN(-20.9)GSKTN(20.9)ALN(5.91)VSQ(-5.91)K 10 3 0.9477 4881600 0 4881600 0 NaN 0 0 0 4881600 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4881600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 652 2053 119 119 2580 2932 8373 8803 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN 122 sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN sp|Q9NWV8|BABA1_HUMAN BRISC and BRCA1-A complex member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM1 PE=1 SV=1 0.796511 5.90671 0.030124 45.438 7.0622 45.438 0.796511 5.90671 0.030124 45.438 2 N LPKLESFNGSKTNALNVSQKMIEMFVRTKHK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LESFN(0.008)GSKTN(0.988)ALN(0.797)VSQ(0.207)K LESFN(-20.9)GSKTN(20.9)ALN(5.91)VSQ(-5.91)K 13 3 0.9477 4881600 0 4881600 0 NaN 0 0 0 4881600 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4881600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 653 2053 122 122 2580 2932 8373 8803 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 8373 8803 20190902_JH_EV_Ubi_2 5911 sp|Q9NXL6|SIDT1_HUMAN;sp|Q9NXL6-2|SIDT1_HUMAN 286;286 sp|Q9NXL6|SIDT1_HUMAN sp|Q9NXL6|SIDT1_HUMAN sp|Q9NXL6|SIDT1_HUMAN SID1 transmembrane family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIDT1 PE=2 SV=2;sp|Q9NXL6-2|SIDT1_HUMAN Isoform 2 of SID1 transmembrane family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIDT1 0.912165 12.6115 0.0345419 53.493 9.6857 53.493 0.912165 12.6115 0.0345419 53.493 1 N CGGSFFIQEKENQTWNLQRKKNLEVTIVPSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EN(0.001)Q(0.05)TWN(0.912)LQ(0.037)RK EN(-29.27)Q(-12.61)TWN(12.61)LQ(-13.95)RK 6 2 2.9353 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 654 2060 286 286 1048 1179 3328 3499 3328 3499 20190902_JH_WT_Ubi_2 6661 3328 3499 20190902_JH_WT_Ubi_2 6661 3328 3499 20190902_JH_WT_Ubi_2 6661 sp|Q9NXR7-4|BABA2_HUMAN;sp|Q9NXR7-3|BABA2_HUMAN;sp|Q9NXR7|BABA2_HUMAN;sp|Q9NXR7-1|BABA2_HUMAN 154;154;154;154 sp|Q9NXR7-4|BABA2_HUMAN sp|Q9NXR7-4|BABA2_HUMAN sp|Q9NXR7-4|BABA2_HUMAN Isoform 4 of BRISC and BRCA1-A complex member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM2;sp|Q9NXR7-3|BABA2_HUMAN Isoform 3 of BRISC and BRCA1-A complex member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BABAM2;sp|Q9NXR7|BABA2_HUMAN BRISC and BRCA1-A comp 0.816144 6.60236 0.00545224 62.19 31.98 62.19 0.816144 6.60236 0.00545224 62.19 1 N MFEYQTLLEEPQYGENMEIYAGKKNNWTGEF Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LMFEYQ(0.005)TLLEEPQ(0.178)YGEN(0.816)MEIYAGK LMFEYQ(-21.81)TLLEEPQ(-6.6)YGEN(6.6)MEIYAGK 17 3 -3.7897 1531900 1531900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 1531900 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1531900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 655 2061 154 154 2717 3089 8813 9269 8813 9269 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9029 8813 9269 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9029 8813 9269 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9029 sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN;sp|Q9NZ56|FMN2_HUMAN 208;1612 sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN Isoform 2 of Formin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMN2;sp|Q9NZ56|FMN2_HUMAN Formin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMN2 PE=1 SV=4 0.676871 5.73064 0.0257011 46.353 8.5452 46.353 0.676871 5.73064 0.0257011 46.353 2 N VYQVSSKEHMQPFKENMEQFIIQAKIDQEAE X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VYQ(0.831)VSSKEHMQ(0.333)PFKEN(0.677)MEQ(0.147)FIIQ(0.013)AK VYQ(6.85)VSSKEHMQ(-5.73)PFKEN(5.73)MEQ(-6.85)FIIQ(-19.94)AK 16 3 2.5766 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 656 2069 208 208 5084 5778 16400 17234 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN 3960 sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRP1B PE=1 SV=2 1 54.6078 0.0308071 54.608 20.521 54.608 1 54.6078 0.0308071 54.608 2 N GIFYKRIHGREKRQANSGLICPEFKRPRDIA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXX RQ(1)AN(1)SGLICPEFK RQ(54.61)AN(54.61)SGLICPEFK 4 2 -4.4454 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 657 2075 3960 3960 3796 4313 12022 12611 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN 209 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLRT3 PE=1 SV=1 0.915228 7.32245 0.025786 46.318 11.2 46.318 0.915228 7.32245 0.025786 46.318 2 N SLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LVLDGN(0.915)LLN(0.542)N(0.542)HGLGDK LVLDGN(7.32)LLN(0)N(0)HGLGDK 6 3 -2.6975 5928700 0 5928700 0 NaN 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 658 2077 209 209 2845 3227 9176 9658 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN 212 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLRT3 PE=1 SV=1 0.542386 0 0.025786 46.318 11.2 46.318 0.542386 0 0.025786 46.318 2 N GLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LVLDGN(0.915)LLN(0.542)N(0.542)HGLGDK LVLDGN(7.32)LLN(0)N(0)HGLGDK 9 3 -2.6975 5928700 0 5928700 0 NaN 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 659 2077 212 212 2845 3227 9176 9658 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN 213 sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN sp|Q9NZU0|FLRT3_HUMAN Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLRT3 PE=1 SV=1 0.542386 0 0.025786 46.318 11.2 46.318 0.542386 0 0.025786 46.318 2 N LTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LVLDGN(0.915)LLN(0.542)N(0.542)HGLGDK LVLDGN(7.32)LLN(0)N(0)HGLGDK 10 3 -2.6975 5928700 0 5928700 0 NaN 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 5928700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 660 2077 213 213 2845 3227 9176 9658 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 9176 9658 20190821_JH_WT_Ubi 4548 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN 983 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN Cysteine-rich motor neuron 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRIM1 PE=1 SV=1 0.975085 16.1119 2.31461E-05 122.01 76.286 122.01 0.975085 16.1119 2.31461E-05 122.01 0.954241 13.7845 0.00021612 112.01 1 N PLLCWYRTPTKPSSLNNQLVSVDCKKGTRVQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TPTKPSSLN(0.975)N(0.024)Q(0.001)LVSVDCK TPTKPSSLN(16.11)N(-16.11)Q(-29.7)LVSVDCK 9 3 -0.92063 9490200 9490200 0 0 0.035924 5414200 4076000 0 0 0 0 0 0 0 0.11742 0.15233 0 0 0 0 0 0 0 5414200 0 0 4076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 661 2078 983 983 3524;4566 4020;5185 14560;14562 15304;15306 14560 15304 20190821_JH_EV_Ubi 6893 14560 15304 20190821_JH_EV_Ubi 6893 14560 15304 20190821_JH_EV_Ubi 6893 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN 984 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN Cysteine-rich motor neuron 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRIM1 PE=1 SV=1 0.862173 9.20724 0.0055812 96.447 68.921 96.447 0.333333 0 0.0115135 71.031 0.498808 0 0.0362854 78.228 0.862173 9.20724 0.0055812 96.447 1 N LLCWYRTPTKPSSLNNQLVSVDCKKGTRVQV X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX TPTKPSSLN(0.034)N(0.862)Q(0.103)LVSVDCK TPTKPSSLN(-14)N(9.21)Q(-9.21)LVSVDCK 10 3 -0.23857 7618200 7618200 0 0 0.028838 0 0 0 0 0 1961700 0 0 0 0 0 0 0 0 0.044037 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1961700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 662 2078 984 984 3524;4566 4020;5185 11339;14563 11911;15307 14563 15307 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7538 14563 15307 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7538 11339 11911 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6855 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN 227;250;250 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN Isoform 3 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 PE=1 SV=2;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN Isoform 2 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 0.840924 6.13505 0.000145454 70.391 27.193 70.391 0.840924 6.13505 0.000145454 70.391 3 N QIYQFPTDDDTIAKVNAAMNGQLPFAVVGSM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M) XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP VN(0.841)AAMN(0.347)GQ(0.813)LPFAVVGSMDEVKVGN(1)KMVK VN(6.14)AAMN(-5.43)GQ(5.43)LPFAVVGSMDEVKVGN(31.34)KMVK 2 3 -2.0691 8333600 0 0 8333600 NaN 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 663 2085 227 227 4947 5617 15900 16708 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN 249;272;272 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN Isoform 3 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 PE=1 SV=2;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN Isoform 2 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 0.999519 31.3427 0.000145454 70.391 27.193 70.391 0.999519 31.3427 0.000145454 70.391 3 N LPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQV X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VN(0.841)AAMN(0.347)GQ(0.813)LPFAVVGSMDEVKVGN(1)KMVK VN(6.14)AAMN(-5.43)GQ(5.43)LPFAVVGSMDEVKVGN(31.34)KMVK 24 3 -2.0691 8333600 0 0 8333600 NaN 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 664 2085 249 249 4947 5617 15900 16708 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN 189 sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN Transmembrane protein 181 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM181 PE=1 SV=2 0.382491 0 0.0254719 55.353 11.84 55.353 0.382491 0 0.0254719 55.353 N RGPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQILSNPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX VIQTSAAN(0.235)FSLN(0.382)N(0.382)SK VIQ(-52.13)TSAAN(-2.12)FSLN(0)N(0)SK 12 2 -0.22352 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 665 2088 189 189 4864 5523 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN 190 sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN sp|Q9P2C4|TM181_HUMAN Transmembrane protein 181 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM181 PE=1 SV=2 0.382491 0 0.0254719 55.353 11.84 55.353 0.382491 0 0.0254719 55.353 N GPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQILSNPLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VIQTSAAN(0.235)FSLN(0.382)N(0.382)SK VIQ(-52.13)TSAAN(-2.12)FSLN(0)N(0)SK 13 2 -0.22352 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 666 2088 190 190 4864 5523 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 15640 16436 20190902_JH_WT_Ubi_2 9874 sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN;sp|Q9P2K8-2|E2AK4_HUMAN;sp|Q9P2K8|E2AK4_HUMAN 94;94;94 sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN Isoform 3 of eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK4;sp|Q9P2K8-2|E2AK4_HUMAN Isoform 2 of eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK4;sp|Q9P2K8|E2AK4_HUMAN eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX 0.999997 55.8743 0.00546306 74.78 31.75 74.78 0.999997 55.8743 0.00546306 74.78 0.999908 40.331 0.028718 48.112 2 N CPPTYPDVVPEIELKNAKGLSNESVNLLKSR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXX N(1)AKGLSN(1)ESVNLLK N(55.87)AKGLSN(36.33)ESVN(-36.33)LLK 1 3 -0.062179 8449500 0 8449500 0 NaN 0 0 0 5884200 2565400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5884200 0 0 2565400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 667 2095 94 94 3000 3429 9703;9704 10220;10221 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN;sp|Q9P2K8-2|E2AK4_HUMAN;sp|Q9P2K8|E2AK4_HUMAN 100;100;100 sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN sp|Q9P2K8-3|E2AK4_HUMAN Isoform 3 of eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK4;sp|Q9P2K8-2|E2AK4_HUMAN Isoform 2 of eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK4;sp|Q9P2K8|E2AK4_HUMAN eIF-2-alpha kinase GCN2 OS=Homo sapiens OX 0.999768 36.335 0.00546306 74.78 31.75 74.78 0.999768 36.335 0.00546306 74.78 0.995441 23.3911 0.028718 48.112 2 N DVVPEIELKNAKGLSNESVNLLKSRLEELAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(1)AKGLSN(1)ESVNLLK N(55.87)AKGLSN(36.33)ESVN(-36.33)LLK 7 3 -0.062179 8449500 0 8449500 0 NaN 0 0 0 5884200 2565400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5884200 0 0 2565400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 668 2095 100 100 3000 3429 9703;9704 10220;10221 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 9703 10220 20190902_JH_EV_Ubi_2 6140 sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN;sp|Q9UBK9-2|UXT_HUMAN 150;162 sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN Protein UXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UXT PE=1 SV=1;sp|Q9UBK9-2|UXT_HUMAN Isoform 1 of Protein UXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UXT 0.971997 15.3071 0.0204704 69.65 10.386 69.65 0.971997 15.3071 0.0204704 69.65 N IHMLLEGLRELQGLQNFPEKPHH________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX ELQ(0.978)GLQ(0.05)N(0.972)FPEK ELQ(16.44)GLQ(-15.31)N(15.31)FPEK 7 3 -1.5695 614870 0 614870 0 NaN 0 614870 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 614870 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 669 2103 150 150 1016 1145 3233 3399 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 sp|Q9UFF9-3|CNOT8_HUMAN;sp|Q9UFF9|CNOT8_HUMAN 83;83 sp|Q9UFF9-3|CNOT8_HUMAN sp|Q9UFF9-3|CNOT8_HUMAN sp|Q9UFF9-3|CNOT8_HUMAN Isoform 3 of CCR4-NOT transcription complex subunit 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT8;sp|Q9UFF9|CNOT8_HUMAN CCR4-NOT transcription complex subunit 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT8 PE=1 SV=1 0.949345 12.7281 0.0233222 67.214 26.625 67.214 0.949345 12.7281 0.0233222 67.214 N NVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX IIQ(0.051)LGLTFTN(0.949)EK IIQ(-12.73)LGLTFTN(12.73)EK 10 3 1.5281 1227300 1227300 0 0 NaN 0 0 1227300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1227300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 670 2113 83 83 2158 2460 7138 7511 7138 7511 20190821_JH_WT_Ubi 6288 7138 7511 20190821_JH_WT_Ubi 6288 7138 7511 20190821_JH_WT_Ubi 6288 sp|Q9UGJ1-2|GCP4_HUMAN;sp|Q9UGJ1|GCP4_HUMAN 288;288 sp|Q9UGJ1-2|GCP4_HUMAN sp|Q9UGJ1-2|GCP4_HUMAN sp|Q9UGJ1-2|GCP4_HUMAN Isoform 2 of Gamma-tubulin complex component 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP4;sp|Q9UGJ1|GCP4_HUMAN Gamma-tubulin complex component 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBGCP4 PE=1 SV=1 0.929726 11.4377 0.0320149 46.159 11.884 46.159 0.929726 11.4377 0.0320149 46.159 1 N AEKILFVGESVQMFENQNVNLTRKGSILKNQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX ILFVGESVQ(0.067)MFEN(0.93)Q(0.001)N(0.001)VN(0.001)LTR ILFVGESVQ(-11.44)MFEN(11.44)Q(-29.01)N(-29.01)VN(-29.01)LTR 13 3 -0.25836 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 671 2116 288 288 2190 2495 7229 7604 7229 7604 20190821_JH_MUT_Ubi 12092 7229 7604 20190821_JH_MUT_Ubi 12092 7229 7604 20190821_JH_MUT_Ubi 12092 sp|Q9UHC6-2|CNTP2_HUMAN;sp|Q9UHC6|CNTP2_HUMAN 94;1317 sp|Q9UHC6-2|CNTP2_HUMAN sp|Q9UHC6-2|CNTP2_HUMAN sp|Q9UHC6-2|CNTP2_HUMAN Isoform 2 of Contactin-associated protein-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNTNAP2;sp|Q9UHC6|CNTP2_HUMAN Contactin-associated protein-like 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNTNAP2 PE=1 SV=1 0.516204 2.06875 0.00392911 90.778 60.555 90.778 0.516204 2.06875 0.00392911 90.778 1 N ESAESADAAIMNNDPNFTETIDESKKEWLI_ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX GAESAESADAAIMN(0.321)N(0.163)DPN(0.516)FTETIDESKK GAESAESADAAIMN(-2.07)N(-5)DPN(2.07)FTETIDESKK 18 3 4.2658 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 672 2122 94 94 1360 1548 4327 4550 4327 4550 20190821_JH_MUT_Ubi 8725 4327 4550 20190821_JH_MUT_Ubi 8725 4327 4550 20190821_JH_MUT_Ubi 8725 sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN;sp|Q9UHC9-2|NPCL1_HUMAN;sp|Q9UHC9|NPCL1_HUMAN 939;985;985 sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN Isoform 4 of NPC1-like intracellular cholesterol transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPC1L1;sp|Q9UHC9-2|NPCL1_HUMAN Isoform 2 of NPC1-like intracellular cholesterol transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPC1L1;sp|Q9UHC9|NPCL 0.998915 29.8396 0.0143638 58.49 18.842 58.49 0.998915 29.8396 0.0143638 58.49 2 N YISGPNKDKFCPSTVNSLNCLKNCMSITMGS X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LYISGPN(0.001)KDKFCPSTVN(0.999)SLN(1)CLK LYISGPN(-29.84)KDKFCPSTVN(29.84)SLN(38.23)CLK 17 3 1.4395 1879600 0 1879600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1879600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1879600 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 673 2123 939 939 2869 3252 9238 9723 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN;sp|Q9UHC9-2|NPCL1_HUMAN;sp|Q9UHC9|NPCL1_HUMAN 942;988;988 sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN sp|Q9UHC9-4|NPCL1_HUMAN Isoform 4 of NPC1-like intracellular cholesterol transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPC1L1;sp|Q9UHC9-2|NPCL1_HUMAN Isoform 2 of NPC1-like intracellular cholesterol transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPC1L1;sp|Q9UHC9|NPCL 0.999797 38.2336 0.0143638 58.49 18.842 58.49 0.999797 38.2336 0.0143638 58.49 2 N GPNKDKFCPSTVNSLNCLKNCMSITMGSVRP X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LYISGPN(0.001)KDKFCPSTVN(0.999)SLN(1)CLK LYISGPN(-29.84)KDKFCPSTVN(29.84)SLN(38.23)CLK 20 3 1.4395 1879600 0 1879600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1879600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1879600 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 674 2123 942 942 2869 3252 9238 9723 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 9238 9723 20190902_JH_WT_Ubi_2 10426 sp|Q9UHD1-2|CHRD1_HUMAN;sp|Q9UHD1|CHRD1_HUMAN 46;65 sp|Q9UHD1-2|CHRD1_HUMAN sp|Q9UHD1-2|CHRD1_HUMAN sp|Q9UHD1-2|CHRD1_HUMAN Isoform 2 of Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHORDC1;sp|Q9UHD1|CHRD1_HUMAN Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHORDC1 PE=1 SV=2 1 82.9999 0.0113675 83 15.847 83 1 82.9999 0.0113675 83 1 N PVFHDALKGCTKGRHNSEKPPEPVKPEVKTT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX HN(1)SEKPPEPVKPEVK HN(83)SEKPPEPVKPEVK 2 2 -1.6457 563600 563600 0 0 NaN 0 563600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 563600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 675 2124 46 46 1960 2232 6376 6710 6376 6710 20190821_JH_MUT_Ubi 9998 6376 6710 20190821_JH_MUT_Ubi 9998 6376 6710 20190821_JH_MUT_Ubi 9998 sp|Q9UHD8-3|SEPT9_HUMAN;sp|Q9UHD8-7|SEPT9_HUMAN;sp|Q9UHD8-2|SEPT9_HUMAN;sp|Q9UHD8-5|SEPT9_HUMAN;sp|Q9UHD8|SEPT9_HUMAN 46;191;192;203;210 sp|Q9UHD8-3|SEPT9_HUMAN sp|Q9UHD8-3|SEPT9_HUMAN sp|Q9UHD8-3|SEPT9_HUMAN Isoform 3 of Septin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT9;sp|Q9UHD8-7|SEPT9_HUMAN Isoform 7 of Septin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT9;sp|Q9UHD8-2|SEPT9_HUMAN Isoform 2 of Septin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT9;sp|Q9UHD8-5|SEPT9_H 0.984753 20.0763 0.00137465 66.017 31.359 66.017 0.984753 20.0763 0.00137465 66.017 1 N PAEAPTAPSPAQTLENSEPAPVSQLQSRLEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX PAEAPTAPSPAQ(0.01)TLEN(0.985)SEPAPVSQ(0.003)LQ(0.003)SR PAEAPTAPSPAQ(-20.08)TLEN(20.08)SEPAPVSQ(-25.48)LQ(-25.48)SR 16 3 0.96386 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 676 2125 46 46 3284 3752 10548 11097 10548 11097 20190902_JH_WT_Ubi_2 11716 10548 11097 20190902_JH_WT_Ubi_2 11716 10548 11097 20190902_JH_WT_Ubi_2 11716 sp|Q9UHX1-4|PUF60_HUMAN;sp|Q9UHX1-6|PUF60_HUMAN;sp|Q9UHX1-2|PUF60_HUMAN 54;68;97 sp|Q9UHX1-4|PUF60_HUMAN sp|Q9UHX1-4|PUF60_HUMAN sp|Q9UHX1-4|PUF60_HUMAN Isoform 4 of Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUF60;sp|Q9UHX1-6|PUF60_HUMAN Isoform 6 of Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUF60;sp|Q9UHX1-2|PUF60_HUMAN Isoform 2 of Pol 0.772485 6.11798 0.0364419 41.422 15.058 41.422 0.772485 6.11798 0.0364419 41.422 3 N VLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAQRQRALAIMC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(0.015)TIAHQ(0.085)Q(0.128)Q(0.384)Q(0.558)LTN(0.772)LQ(0.735)MAAQ(0.323)R Q(-18.77)TIAHQ(-11.01)Q(-7.22)Q(-1.24)Q(1.24)LTN(6.12)LQ(4.97)MAAQ(-4.97)R 12 3 3.0912 4462100 0 0 4462100 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4462100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4462100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 677 2136 54 54 3702 4213 11777 12358 11777 12358 20190902_JH_WT_Ubi_2 11987 11777 12358 20190902_JH_WT_Ubi_2 11987 11777 12358 20190902_JH_WT_Ubi_2 11987 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN 348;348 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN Isoform 2 of Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3 PE=1 SV=2 0.469922 0 0.0121253 57.973 13.582 57.973 0.469922 0 0.0121253 57.973 N NAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIAL X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(0.962)ALQ(0.098)DLLSEYMN(0.47)N(0.47)AGKKER Q(13.93)ALQ(-8.63)DLLSEYMN(0)N(0)AGKKER 12 4 -1.2117 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 678 2140 348 348 3600 4109 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN 349;349 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN Isoform 2 of Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3 PE=1 SV=2 0.469922 0 0.0121253 57.973 13.582 57.973 0.469922 0 0.0121253 57.973 N AIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.962)ALQ(0.098)DLLSEYMN(0.47)N(0.47)AGKKER Q(13.93)ALQ(-8.63)DLLSEYMN(0)N(0)AGKKER 13 4 -1.2117 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 679 2140 349 349 3600 4109 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 sp|Q9UIG8-2|SO3A1_HUMAN 658 sp|Q9UIG8-2|SO3A1_HUMAN sp|Q9UIG8-2|SO3A1_HUMAN sp|Q9UIG8-2|SO3A1_HUMAN Isoform 2 of Solute carrier organic anion transporter family member 3A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLCO3A1 0.999331 31.7399 0.0318665 45.363 16.245 45.363 0.999331 31.7399 0.0318665 45.363 1 N TTWQCLRKNYKRYIKNHEGGLSTSTEYQDIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP RYIKN(0.999)HEGGLSTSTEYQ(0.001)DIETEK RYIKN(31.74)HEGGLSTSTEYQ(-31.74)DIETEK 5 3 2.2328 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 680 2141 658 658 3813 4333 12068 12658 12068 12658 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16641 12068 12658 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16641 12068 12658 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16641 sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN 368 sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN E3 ISG15--protein ligase HERC5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HERC5 PE=1 SV=2 0.5 0 0.029473 51.875 20.485 51.875 0.5 0 0.029473 51.875 1 N ESHTSEKELIMIAGGNQSILLWIKKENSYVN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX ELIMIAGGN(0.5)Q(0.5)SILLWIKK ELIMIAGGN(0)Q(0)SILLWIKK 9 2 -1.3052 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 681 2142 368 368 1001 1130 3198 3361 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 sp|Q9UII6|DS13B_HUMAN;sp|Q9UII6-4|DS13B_HUMAN 173;223 sp|Q9UII6|DS13B_HUMAN sp|Q9UII6|DS13B_HUMAN sp|Q9UII6|DS13B_HUMAN Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUSP13 PE=1 SV=3;sp|Q9UII6-4|DS13B_HUMAN Isoform 4 of Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUSP13 0.982691 17.5414 0.0372007 42.395 6.0773 42.395 0.982691 17.5414 0.0372007 42.395 1 N NMTLVEAIQTVQAHRNICPNSGFLRQLQVLD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXX N(0.983)ICPN(0.017)SGFLR N(17.54)ICPN(-17.54)SGFLR 1 3 -3.3287 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 682 2143 173 173 3084 3531 9972 10504 9972 10504 20190902_JH_WT_Ubi_2 10028 9972 10504 20190902_JH_WT_Ubi_2 10028 9972 10504 20190902_JH_WT_Ubi_2 10028 sp|Q9UJX3-2|APC7_HUMAN;sp|Q9UJX3|APC7_HUMAN 67;67 sp|Q9UJX3-2|APC7_HUMAN sp|Q9UJX3-2|APC7_HUMAN sp|Q9UJX3-2|APC7_HUMAN Isoform 2 of Anaphase-promoting complex subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC7;sp|Q9UJX3|APC7_HUMAN Anaphase-promoting complex subunit 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC7 PE=1 SV=4 0.510598 1.74892 0.0175198 45.347 12.22 45.347 0.510598 1.74892 0.0175198 45.347 1 N NVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPPQKYQLLVY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX LLSSLLLTMSN(0.019)N(0.341)N(0.511)PELFSPPQ(0.129)K LLSSLLLTMSN(-14.38)N(-1.75)N(1.75)PELFSPPQ(-5.96)K 13 3 -0.95668 1947400 1947400 0 0 NaN 0 1947400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1947400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 683 2146 67 67 2707 3078 8793 9248 8793 9248 20190821_JH_MUT_Ubi 10610 8793 9248 20190821_JH_MUT_Ubi 10610 8793 9248 20190821_JH_MUT_Ubi 10610 sp|Q9UJY5-5|GGA1_HUMAN;sp|Q9UJY5-4|GGA1_HUMAN;sp|Q9UJY5-2|GGA1_HUMAN;sp|Q9UJY5|GGA1_HUMAN;sp|Q9UJY5-6|GGA1_HUMAN 31;31;31;31;31 sp|Q9UJY5-5|GGA1_HUMAN sp|Q9UJY5-5|GGA1_HUMAN sp|Q9UJY5-5|GGA1_HUMAN Isoform 5 of ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GGA1;sp|Q9UJY5-4|GGA1_HUMAN Isoform 4 of ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GGA1;sp|Q9UJY5-2|GGA1_HUMAN Isoform 0.943483 13.7915 1.23143E-11 107.98 82.907 107.98 0.943483 13.7915 1.23143E-11 107.98 1 N RATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPL X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP ATN(0.001)PLN(0.006)KELDWASIN(0.943)GFCEQ(0.039)LN(0.01)EDFEGPPLATR ATN(-32.21)PLN(-21.88)KELDWASIN(13.79)GFCEQ(-13.79)LN(-19.57)EDFEGPPLATR 15 3 0.24281 1193700 1193700 0 0 NaN 0 1193700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1193700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 684 2147 31 31 302 355 1021 1105 1021 1105 20190821_JH_MUT_Ubi 13774 1021 1105 20190821_JH_MUT_Ubi 13774 1021 1105 20190821_JH_MUT_Ubi 13774 sp|Q9UK32-2|KS6A6_HUMAN;sp|Q9UK32|KS6A6_HUMAN 203;203 sp|Q9UK32-2|KS6A6_HUMAN sp|Q9UK32-2|KS6A6_HUMAN sp|Q9UK32-2|KS6A6_HUMAN Isoform 2 of Ribosomal protein S6 kinase alpha-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS6KA6;sp|Q9UK32|KS6A6_HUMAN Ribosomal protein S6 kinase alpha-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS6KA6 PE=1 SV=1 1 76.3258 0.0182718 76.326 34.943 76.326 1 76.3258 0.0182718 76.326 1 N HLHQLGIVYRDLKPENILLDEIGHIKLTDFG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX PEN(1)ILLDEIGHIK PEN(76.33)ILLDEIGHIK 3 3 -0.46424 1174000 1174000 0 0 NaN 0 1174000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 685 2148 203 203 3324 3797 10656 11214 10656 11214 20190821_JH_MUT_Ubi 11860 10656 11214 20190821_JH_MUT_Ubi 11860 10656 11214 20190821_JH_MUT_Ubi 11860 sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN;sp|Q9UKC9|FBXL2_HUMAN 5;5 sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN Isoform 2 of F-box/LRR-repeat protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBXL2;sp|Q9UKC9|FBXL2_HUMAN F-box/LRR-repeat protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBXL2 PE=1 SV=3 0.930943 10.9624 0.0349561 40.767 8.3287 40.767 0.930943 10.9624 0.0349561 40.767 2 N ___________MVFSNNDEGLINKKLPKELL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX MVFSN(0.931)N(0.931)DEGLIN(0.138)K MVFSN(10.96)N(10.96)DEGLIN(-10.96)K 5 3 0.26308 4821700 0 4821700 0 NaN 0 0 0 4821700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4821700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 686 2150 5 5 2979 3399 9615 10120 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN;sp|Q9UKC9|FBXL2_HUMAN 6;6 sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN sp|Q9UKC9-2|FBXL2_HUMAN Isoform 2 of F-box/LRR-repeat protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBXL2;sp|Q9UKC9|FBXL2_HUMAN F-box/LRR-repeat protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBXL2 PE=1 SV=3 0.930943 10.9624 0.0349561 40.767 8.3287 40.767 0.930943 10.9624 0.0349561 40.767 2 N __________MVFSNNDEGLINKKLPKELLL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX MVFSN(0.931)N(0.931)DEGLIN(0.138)K MVFSN(10.96)N(10.96)DEGLIN(-10.96)K 6 3 0.26308 4821700 0 4821700 0 NaN 0 0 0 4821700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4821700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 687 2150 6 6 2979 3399 9615 10120 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 9615 10120 20190902_JH_EV_Ubi_2 4923 sp|Q9UKL3|C8AP2_HUMAN 483 sp|Q9UKL3|C8AP2_HUMAN sp|Q9UKL3|C8AP2_HUMAN sp|Q9UKL3|C8AP2_HUMAN CASP8-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CASP8AP2 PE=1 SV=1 0.999999 58.9917 0.0165221 131.09 22.103 131.09 0.999999 58.9917 0.0165221 131.09 N RTEDKRKREQESKEENRHIRNEKRVPTEHLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX EEN(1)RHIRNEK EEN(58.99)RHIRN(-58.99)EK 3 3 -1.0632 3248500 3248500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3248500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3248500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 688 2153 483 483 866 982 2757 2900 2757 2900 20190902_JH_WT_Ubi_2 9445 2757 2900 20190902_JH_WT_Ubi_2 9445 2757 2900 20190902_JH_WT_Ubi_2 9445 sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN 75 sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN Prion-like protein doppel OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRND PE=1 SV=2 1 43.6045 0.033118 43.604 12.807 43.604 1 43.6045 0.033118 43.604 N IKQGRKLDIDFGAEGNRYYEANYWQFPDGIH X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(1)GRKLDIDFGAEGN(1)R Q(43.6)GRKLDIDFGAEGN(43.6)R 14 2 -2.1768 997020 0 997020 0 NaN 0 0 0 0 997020 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 997020 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 689 2156 75 75 3632 4141 11656 12233 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN;sp|Q9ULI0|ATD2B_HUMAN 538;538 sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN Isoform 2 of ATPase family AAA domain-containing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2B;sp|Q9ULI0|ATD2B_HUMAN ATPase family AAA domain-containing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2B PE=1 SV=3 0.996147 22.1405 0.0176271 54.058 8.7008 54.058 0.996147 22.1405 0.0176271 54.058 2 N SSIVSTLLALMDGLDNRGEIVVIGATNRLDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(0.369)DQ(0.635)IHSSIVSTLLALMDGLDN(0.996)R Q(-2.37)DQ(2.37)IHSSIVSTLLALMDGLDN(22.14)R 21 3 2.1077 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 690 2164 538 538 3612 4121 11610 12187 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-6|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-3|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-2|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-4|ODF2L_HUMAN 87;218;218;218;218;218 sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN Isoform 5 of Outer dense fiber protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ODF2L;sp|Q9ULJ1-6|ODF2L_HUMAN Isoform 6 of Outer dense fiber protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ODF2L;sp|Q9ULJ1-3|ODF2L_HUMAN Isoform 3 of Outer dense f 0.5 0 0.0312328 55.806 6.8082 55.806 0.5 0 0.0312328 55.806 1 N LKEYVKSLETKIAKWNLQSRMNKNEAIVMKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SLETKIAKWN(0.5)LQ(0.5)SR SLETKIAKWN(0)LQ(0)SR 10 2 2.1801 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 691 2166 87 87 4008 4554 12694 13314 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 sp|Q9ULL1|PKHG1_HUMAN 1115 sp|Q9ULL1|PKHG1_HUMAN sp|Q9ULL1|PKHG1_HUMAN sp|Q9ULL1|PKHG1_HUMAN Pleckstrin homology domain-containing family G member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEKHG1 PE=1 SV=2 1 63.6941 0.0321574 63.694 12.559 63.694 1 63.6941 0.0321574 63.694 1 N PPEQDLRSRYPTFEINTKSTPRQLSAACSVP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX SRYPTFEIN(1)TK SRYPTFEIN(63.69)TK 9 3 -0.16796 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 692 2167 1115 1115 4139 4704 13123 13761 13123 13761 20190902_JH_WT_Ubi_2 12271 13123 13761 20190902_JH_WT_Ubi_2 12271 13123 13761 20190902_JH_WT_Ubi_2 12271 sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN 403 sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN Pre-mRNA-processing factor 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF19 PE=1 SV=1 0.59276 2.83747 0.000847047 51.242 29.294 51.242 0.59276 2.83747 0.000847047 51.242 1 N FPGHSGPITSIAFSENGYYLATAADDSSVKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX TN(0.099)VAN(0.308)FPGHSGPITSIAFSEN(0.593)GYYLATAADDSSVK TN(-7.78)VAN(-2.84)FPGHSGPITSIAFSEN(2.84)GYYLATAADDSSVK 21 3 0.13691 2673300 2673300 0 0 NaN 0 0 2673300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2673300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 693 2174 403 403 4535 5151 14465 15204 14465 15204 20190821_JH_WT_Ubi 12787 14465 15204 20190821_JH_WT_Ubi 12787 14465 15204 20190821_JH_WT_Ubi 12787 sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN 596 sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAMTS8 PE=2 SV=2 0.997233 28.3216 0.0370477 40.515 19.032 40.515 0.997233 28.3216 0.0370477 40.515 2 N PPDGKSFREQQCEKYNAYNYTDMDGNLLQWV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP YN(0.997)AYN(0.992)YTDMDGN(0.005)LLQ(0.005)WVPK YN(28.32)AYN(25.09)YTDMDGN(-25.09)LLQ(-25.09)WVPK 2 3 2.4105 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 694 2182 596 596 5180 5896 16722 17579 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN 599 sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN sp|Q9UP79|ATS8_HUMAN A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAMTS8 PE=2 SV=2 0.992406 25.093 0.0370477 40.515 19.032 40.515 0.992406 25.093 0.0370477 40.515 2 N GKSFREQQCEKYNAYNYTDMDGNLLQWVPKY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX YN(0.997)AYN(0.992)YTDMDGN(0.005)LLQ(0.005)WVPK YN(28.32)AYN(25.09)YTDMDGN(-25.09)LLQ(-25.09)WVPK 5 3 2.4105 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 695 2182 599 599 5180 5896 16722 17579 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 16722 17579 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5504 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN 160;160;212 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN Isoform 2 of Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1 PE=1 SV=3;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN Isoform 3 of Cytosolic carboxypepti 0.853107 8.30553 0.0119933 64.52 8.9314 64.52 0.853107 8.30553 0.0119933 64.52 3 N KDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX INGALN(0.853)ITLN(0.128)LVKQ(0.05)N(0.656)LQ(0.656)N(0.656)HR IN(-35.65)GALN(8.31)ITLN(-8.31)LVKQ(-15.06)N(0)LQ(0)N(0)HR 6 3 -1.3411 12325000 0 0 12325000 NaN 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 696 2189 160 160 2217 2526 7304 7682 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN 169;169;221 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN Isoform 2 of Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1 PE=1 SV=3;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN Isoform 3 of Cytosolic carboxypepti 0.656215 0 0.0119933 64.52 8.9314 64.52 0.656215 0 0.0119933 64.52 3 N RINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLR X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX INGALN(0.853)ITLN(0.128)LVKQ(0.05)N(0.656)LQ(0.656)N(0.656)HR IN(-35.65)GALN(8.31)ITLN(-8.31)LVKQ(-15.06)N(0)LQ(0)N(0)HR 15 3 -1.3411 12325000 0 0 12325000 NaN 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 697 2189 169 169 2217 2526 7304 7682 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN 172;172;224 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN Isoform 2 of Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1 PE=1 SV=3;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN Isoform 3 of Cytosolic carboxypepti 0.656215 0 0.0119933 64.52 8.9314 64.52 0.656215 0 0.0119933 64.52 3 N GALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX INGALN(0.853)ITLN(0.128)LVKQ(0.05)N(0.656)LQ(0.656)N(0.656)HR IN(-35.65)GALN(8.31)ITLN(-8.31)LVKQ(-15.06)N(0)LQ(0)N(0)HR 18 3 -1.3411 12325000 0 0 12325000 NaN 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 698 2189 172 172 2217 2526 7304 7682 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 sp|Q9UPY5|XCT_HUMAN 21 sp|Q9UPY5|XCT_HUMAN sp|Q9UPY5|XCT_HUMAN sp|Q9UPY5|XCT_HUMAN Cystine/glutamate transporter OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A11 PE=1 SV=1 0.992288 21.3243 2.41907E-08 133.9 107.09 133.9 0.992288 21.3243 2.41907E-08 133.9 0.94424 12.7494 0.0188382 81.594 1 N VVSTISKGGYLQGNVNGRLPSLGNKEPPGQE X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX PVVSTISKGGYLQGN(0.007)VN(0.992)GR PVVSTISKGGYLQ(-33.98)GN(-21.32)VN(21.32)GR 17 3 -0.26944 2732300 2732300 0 0 NaN 1211400 0 0 1520900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1211400 0 0 0 0 0 0 0 0 1520900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 699 2191 21 21 3577 4078 11500;11501 12075;12076 11500 12075 20190821_JH_EV_Ubi 7313 11500 12075 20190821_JH_EV_Ubi 7313 11500 12075 20190821_JH_EV_Ubi 7313 sp|Q9UQE7|SMC3_HUMAN 916 sp|Q9UQE7|SMC3_HUMAN sp|Q9UQE7|SMC3_HUMAN sp|Q9UQE7|SMC3_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC3 PE=1 SV=2 0.998899 29.822 0.0135282 55.33 16.913 55.33 0.998899 29.822 0.0135282 55.33 1 N MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX EHMDAIN(0.999)HDTKELEKMTN(0.001)R EHMDAIN(29.82)HDTKELEKMTN(-29.82)R 7 3 3.6379 2303300 2303300 0 0 NaN 0 2303300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 2303300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 700 2195 916 916 924 1045 2928 3081 2928 3081 20190821_JH_MUT_Ubi 11355 2928 3081 20190821_JH_MUT_Ubi 11355 2928 3081 20190821_JH_MUT_Ubi 11355 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN 207 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN Protein FAM50B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM50B PE=1 SV=1 1 90.1488 0.00771336 90.827 16.942 90.149 1 80.2397 0.0159475 80.24 1 90.827 0.00771336 90.827 1 90.1488 0.00834511 90.149 1 72.434 0.0200016 72.434 1 83.8686 0.00949829 83.869 3 N WDGSGHRRTVRVRKGNTVQQFLKKALQGLRK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX KGN(1)TVQ(1)Q(1)FLKK KGN(90.15)TVQ(90.15)Q(90.15)FLKK 3 3 -0.34831 9179300 0 0 9179300 NaN 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 701 2199 207 207 2356 2682 7757;7758;7759;7760;7761 8158;8159;8160;8161;8162 7761 8162 20190821_JH_WT_Ubi 5774 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 sp|Q9Y2H9|MAST1_HUMAN 372 sp|Q9Y2H9|MAST1_HUMAN sp|Q9Y2H9|MAST1_HUMAN sp|Q9Y2H9|MAST1_HUMAN Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAST1 PE=1 SV=2 1 72.5312 0.0132951 72.531 13.266 72.531 1 72.5312 0.0132951 72.531 N LSEGRSSKAKKPPGENDFDTIKLISNGAYGA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KPPGEN(1)DFDTIK KPPGEN(72.53)DFDTIK 6 3 0.62919 1706100 1706100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1706100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1706100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 702 2206 372 372 2430 2763 7955 8366 7955 8366 20190902_JH_WT_Ubi_3 7299 7955 8366 20190902_JH_WT_Ubi_3 7299 7955 8366 20190902_JH_WT_Ubi_3 7299 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN 245 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN Myosin-15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH15 PE=1 SV=5 0.971441 17.3735 0.0284965 40.369 8.3932 40.369 0.971441 17.3735 0.0284965 40.369 3 N EDQIMQANTILEAFGNAKTLRNDNSSRFGKF X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KKQ(0.965)GALEDQ(0.957)IMQ(0.059)AN(0.047)TILEAFGN(0.971)AK KKQ(17.07)GALEDQ(17.07)IMQ(-17.07)AN(-17.37)TILEAFGN(17.37)AK 22 3 3.1853 1687900 0 0 1687900 NaN 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 703 2208 245 245 2374 2700 7793 8195 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN 112 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN Protocadherin beta-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDHB12 PE=2 SV=1 0.999 32.841 0.0348828 45.395 6.3099 45.395 0.999 32.841 0.0348828 45.395 3 N GSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIELQVRDIN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.999)PTQ(0.999)FLQ(0.668)IELQ(0.14)VRDIN(0.194)DHSPVFLEK N(32.84)PTQ(32.84)FLQ(5.38)IELQ(-6.81)VRDIN(-5.38)DHSPVFLEK 1 3 -1.1674 1007500 0 0 1007500 NaN 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 704 2240 112 112 3194 3650 10284 10824 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN 198;236 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN Isoform 2 of Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11 PE=2 SV=1 1 52.509 0.0240522 52.509 26.032 52.509 1 52.509 0.0240522 52.509 3 N LIVEKDATFQRLLDDNFCNKLSPCIMITGKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX DATFQ(1)RLLDDN(1)FCN(1)KLSPCIMITGK DATFQ(52.51)RLLDDN(52.51)FCN(52.51)KLSPCIMITGK 11 3 1.4 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 705 2241 198 198 393 462 1284 1371 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN 201;239 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN Isoform 2 of Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11 PE=2 SV=1 1 52.509 0.0240522 52.509 26.032 52.509 1 52.509 0.0240522 52.509 3 N EKDATFQRLLDDNFCNKLSPCIMITGKGVPD X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX DATFQ(1)RLLDDN(1)FCN(1)KLSPCIMITGK DATFQ(52.51)RLLDDN(52.51)FCN(52.51)KLSPCIMITGK 14 3 1.4 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 706 2241 201 201 393 462 1284 1371 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN 381 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN Sorting nexin-8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNX8 PE=1 SV=1 0.506622 0 0.0173334 59.116 13.759 59.116 0.506622 0 0.0173334 59.116 N PESVEQLESRIVEQENAIQTMELRNYFSLYC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX IVEQ(0.507)EN(0.507)AIQ(0.987)TMELR IVEQ(0)EN(0)AIQ(15.71)TMELR 6 3 -1.2583 1187200 0 1187200 0 NaN 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 707 2247 381 381 2290 2607 7529 7918 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 sp|Q9Y678|COPG1_HUMAN 80 sp|Q9Y678|COPG1_HUMAN sp|Q9Y678|COPG1_HUMAN sp|Q9Y678|COPG1_HUMAN Coatomer subunit gamma-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPG1 PE=1 SV=1 0.918215 10.5027 0.0356878 51.092 7.7951 51.092 0.918215 10.5027 0.0356878 51.092 N EATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LFQ(0.082)SN(0.918)DPTLRR LFQ(-10.5)SN(10.5)DPTLRR 5 3 -0.2078 4252300000 4252300000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 4252300000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4252300000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 708 2254 80 80 2595 2949 8420 8853 8420 8853 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5764 8420 8853 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5764 8420 8853 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5764 sp|Q9Y6X6-4|MYO16_HUMAN;sp|Q9Y6X6-3|MYO16_HUMAN;sp|Q9Y6X6-2|MYO16_HUMAN;sp|Q9Y6X6|MYO16_HUMAN 710;922;922;922 sp|Q9Y6X6-4|MYO16_HUMAN sp|Q9Y6X6-4|MYO16_HUMAN sp|Q9Y6X6-4|MYO16_HUMAN Isoform 4 of Unconventional myosin-XVI OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO16;sp|Q9Y6X6-3|MYO16_HUMAN Isoform 3 of Unconventional myosin-XVI OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO16;sp|Q9Y6X6-2|MYO16_HUMAN Isoform 2 of Unconventional myosin-XVI O 0.995574 24.6061 0.0288764 63.32 7.2772 63.32 0.995574 24.6061 0.0288764 63.32 1 N YAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKRG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.996)KDSLSQ(0.003)N(0.001)LLFVMK N(24.61)KDSLSQ(-24.61)N(-30.28)LLFVMK 1 2 1.0795 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 709 2265 710 710 3112 3559 10029 10564 10029 10564 20190902_JH_WT_Ubi_3 14393 10029 10564 20190902_JH_WT_Ubi_3 14393 10029 10564 20190902_JH_WT_Ubi_3 14393 CON__P00761 71 CON__P00761 CON__P00761 0.675361 5.77642 0.00098271 87.654 50.726 87.654 0.675361 5.77642 0.00098271 87.654 1 Q VRLGEHNIDVLEGNEQFINAAKIITHPNFNG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LGEHNIDVLEGN(0.146)EQ(0.675)FIN(0.179)AAK LGEHN(-58.48)IDVLEGN(-6.65)EQ(5.78)FIN(-5.78)AAK 14 3 1.3072 2637700 2637700 0 0 0.020276 0 0 0 0 0 0 0 0 2637700 0 NaN 0 NaN 0 NaN NaN 0 0.082258 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2637700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 710 1 71 71 2604 2959 8451 8884 8451 8884 20190902_JH_WT_Ubi_3 11482 8451 8884 20190902_JH_WT_Ubi_3 11482 8451 8884 20190902_JH_WT_Ubi_3 11482 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 135;135 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 1 138.449 3.77383E-05 138.45 95.881 138.45 1 137.158 4.33099E-05 137.16 1 138.449 3.77383E-05 138.45 1 Q GPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX DYSHYYTTIQ(1)DLR DYSHYYTTIQ(138.45)DLR 10 3 0.22139 22534000 22534000 0 0 0.023335 0 0 0 0 0 0 0 10557000 11977000 0 0 0 0 0 0 0 0.051007 0.055546 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10557000 0 0 11977000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 711 7;477 135;135 135 775 879 2435;2436 2564;2565 2436 2565 20190902_JH_WT_Ubi_3 11092 2436 2565 20190902_JH_WT_Ubi_3 11092 2436 2565 20190902_JH_WT_Ubi_3 11092 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 288;288 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.5 0 0.0135463 70.412 18.884 51.252 0.5 0 0.0135463 70.412 0.5 0 0.0277845 51.252 1 Q SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EVAGHTEQ(0.5)LQ(0.5)MSR EVAGHTEQ(0)LQ(0)MSR 8 2 3.6386 1577300 1577300 0 0 0.012072 0 0 0 0 0 0 0 691520 885740 0 0 0 0 0 NaN NaN 0.037912 0.022829 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 691520 0 0 885740 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 712 7;477 288;288 288 1126 1268 3581;3582 3766;3767 3582 3767 20190902_JH_WT_Ubi_3 5081 3581 3766 20190902_JH_WT_Ubi_2 5157 3581 3766 20190902_JH_WT_Ubi_2 5157 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 290;290 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.5 0 0.0135463 70.412 18.884 51.252 0.5 0 0.0135463 70.412 0.5 0 0.0277845 51.252 1 Q TEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX EVAGHTEQ(0.5)LQ(0.5)MSR EVAGHTEQ(0)LQ(0)MSR 10 2 3.6386 1577300 1577300 0 0 0.012072 0 0 0 0 0 0 0 691520 885740 0 0 0 0 0 NaN NaN 0.037912 0.022829 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 691520 0 0 885740 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 713 7;477 290;290 290 1126 1268 3581;3582 3766;3767 3582 3767 20190902_JH_WT_Ubi_3 5081 3581 3766 20190902_JH_WT_Ubi_2 5157 3581 3766 20190902_JH_WT_Ubi_2 5157 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 232;232 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.982056 17.3823 1.88721E-28 160.03 113.04 104.16 0.944054 12.2723 1.88721E-28 160.03 0.982056 17.3823 3.07902E-06 104.16 1 Q NHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GQ(0.018)VGGQ(0.982)VSVEVDSAPGTDLAK GQ(-17.38)VGGQ(17.38)VSVEVDSAPGTDLAK 6 2 2.5967 10081000 10081000 0 0 0.34928 0 0 0 0 3320100 0 0 6760500 0 NaN 0 NaN 0 1.7598 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3320100 0 0 0 0 0 0 0 0 6760500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 714 7;477 232;232 232 1676 1910 5359;5360 5641;5642 5360 5642 20190902_JH_WT_Ubi_2 10740 5359 5641 20190902_JH_EV_Ubi_3 8956 5359 5641 20190902_JH_EV_Ubi_3 8956 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN 387;387 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P08727|K1C19_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT19 PE=1 SV=4 0.959461 14.8806 0.00183902 87.088 46.851 87.088 0.959461 14.8806 0.00183902 87.088 1 Q RLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL__ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX SLLEGQ(0.959)EDHYN(0.031)N(0.009)LSASKVL SLLEGQ(14.88)EDHYN(-14.88)N(-20.11)LSASKVL 6 3 0.55774 14654000 14654000 0 0 0.015627 0 0 0 0 0 14654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.14345 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 715 7;477 387;387 387 4027;4028 4574;4576 12769 13392 12769 13392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10368 12769 13392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10368 12769 13392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10368 CON__P08727;CON__P19001;sp|P13646-2|K1C13_HUMAN;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;CON__P08730-1;CON__A2A4G1;sp|P13646|K1C13_HUMAN;CON__P13646-1;sp|P08727|K1C19_HUMAN 304;307;317;329;329;321;323;329;329;304 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P13646-2|K1C13_HUMAN Isoform 2 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN Isoform 3 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646|K1C13_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 1 0.999976 46.414 1.85018E-09 135.55 78.678 135.55 0.999976 46.414 1.85018E-09 135.55 0.999908 41.0735 0.00011409 110.56 0.960877 14.5889 0.002224 88.311 1 Q LQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAA X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX TLQ(1)GLEIELQSQLSMK TLQ(46.41)GLEIELQ(-46.41)SQ(-59.39)LSMK 3 3 1.2886 7677000 7677000 0 0 0.015049 0 0 0 0 0 3279100 2400100 0 1997800 0 0 0 0 0 0.053324 0.050882 0 0.04324 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3279100 0 0 2400100 0 0 0 0 0 1997800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 716 7;477 304;304 304 4497;4498 5102;5103 14282;14283;14285 14991;14992;14994 14282 14991 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13885 14282 14991 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13885 14282 14991 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13885 CON__P08727;CON__P19001;sp|P13646-2|K1C13_HUMAN;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;CON__P08730-1;CON__A2A4G1;sp|P13646|K1C13_HUMAN;CON__P13646-1;sp|P08727|K1C19_HUMAN 311;314;324;336;336;328;330;336;336;311 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P13646-2|K1C13_HUMAN Isoform 2 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN Isoform 3 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646|K1C13_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 1 0.484212 0 0.0121643 51.978 26.598 51.978 0.484212 0 0.0121643 51.978 Q VTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TLQ(0.032)GLEIELQ(0.484)SQ(0.484)LSMKAALEDTLAETEAR TLQ(-11.86)GLEIELQ(0)SQ(0)LSMKAALEDTLAETEAR 10 3 4.3559 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 717 7;477 311;311 311 4497;4498 5102;5103 14286 14995 20190821_JH_EV_Ubi 13782 14286 14995 20190821_JH_EV_Ubi 13782 14286 14995 20190821_JH_EV_Ubi 13782 CON__P08727;CON__P19001;sp|P13646-2|K1C13_HUMAN;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;CON__P08730-1;CON__A2A4G1;sp|P13646|K1C13_HUMAN;CON__P13646-1;sp|P08727|K1C19_HUMAN 313;316;326;338;338;330;332;338;338;313 CON__P08727;sp|P08727|K1C19_HUMAN CON__P08727 sp|P13646-2|K1C13_HUMAN Isoform 2 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646-3|K1C13_HUMAN Isoform 3 of Keratin, type I cytoskeletal 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT13;sp|P13646|K1C13_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 1 0.763644 5.09363 2.853E-07 127.05 97.416 127.05 0.669597 3.09623 0.000291367 88.278 0.763644 5.09363 2.853E-07 127.05 1 Q DLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TLQGLEIELQ(0.236)SQ(0.764)LSMK TLQ(-45.72)GLEIELQ(-5.09)SQ(5.09)LSMK 12 3 -0.43325 1740600 1740600 0 0 0.003412 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 718 7;477 313;313 313 4497;4498 5102;5103 14284;14287 14993;14996 14284 14993 20190902_JH_WT_Ubi_2 14644 14284 14993 20190902_JH_WT_Ubi_2 14644 14284 14993 20190902_JH_WT_Ubi_2 14644 CON__P08729;sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN;CON__Q9NSB2;CON__Q6ISB0;CON__Q61726;sp|P78386|KRT85_HUMAN;CON__P78386;sp|O43790|KRT86_HUMAN;CON__O43790;sp|P78385|KRT83_HUMAN;CON__Q6NT21;CON__P78385;sp|Q14533|KRT81_HUMAN;CON__Q14533;sp|P08729|K2C7_HUMAN;CON__Q3KNV1 114;188;188;188;127;146;146;129;129;134;134;134;129;129;114;114 CON__P08729;sp|P78386|KRT85_HUMAN;sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT84 PE=2 SV=2;sp|P78386|KRT85_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT85 PE=1 SV=1;sp|O43790|KRT86_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb6 OS=Homo sap 0.666667 0 0.00563898 113.61 69.31 89.029 0.666667 0 0.00563898 113.61 2 Q NNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQ;NSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKWQFYQNQ Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXX FLEQ(0.667)Q(0.667)N(0.667)KLLETK FLEQ(0)Q(0)N(0)KLLETK 4 2 -3.9253 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 719 8;14;19 114;146;114 114 1237 1397;1398 3932 4137 3932 4137 20190902_JH_MUT_Ubi_3 688 3930 4135 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7366 3930 4135 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7366 CON__P08729;sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN;CON__Q9NSB2;CON__Q6ISB0;CON__Q61726;sp|P78386|KRT85_HUMAN;CON__P78386;sp|O43790|KRT86_HUMAN;CON__O43790;sp|P78385|KRT83_HUMAN;CON__Q6NT21;CON__P78385;sp|Q14533|KRT81_HUMAN;CON__Q14533;sp|P08729|K2C7_HUMAN;CON__Q3KNV1 115;189;189;189;128;147;147;130;130;135;135;135;130;130;115;115 CON__P08729;sp|P78386|KRT85_HUMAN;sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|P08729|K2C7_HUMAN sp|Q9NSB2|KRT84_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT84 PE=2 SV=2;sp|P78386|KRT85_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT85 PE=1 SV=1;sp|O43790|KRT86_HUMAN Keratin, type II cuticular Hb6 OS=Homo sap 0.950841 15.8753 8.83554E-05 138.42 87.331 138.42 0.666667 0 0.00563898 113.61 0.950841 15.8753 8.83554E-05 138.42 1;2 Q NKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQK;SRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKWQFYQNQR X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX FLEQ(0.025)Q(0.951)N(0.025)KLLETK FLEQ(-15.88)Q(15.88)N(-15.88)KLLETK 5 3 -0.17545 8145400 8145400 0 0 0.010885 0 0 0 0 0 0 0 0 8145400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.082702 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8145400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 720 8;14;19 115;147;115 115 1237 1397;1398 3931;3932 4136;4137 3931 4136 20190902_JH_WT_Ubi_3 8554 3931 4136 20190902_JH_WT_Ubi_3 8554 3931 4136 20190902_JH_WT_Ubi_3 8554 CON__P15636 303 CON__P15636 CON__P15636 0.845273 7.37978 0.000131669 78.451 47.582 78.451 0.845273 7.37978 0.000131669 78.451 2 Q PNTPASGANGDGSMSQTQSGSTVKATYATSD X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX APN(0.004)TPASGAN(0.994)GDGSMSQ(0.845)TQ(0.156)SGSTVK APN(-24.19)TPASGAN(24.19)GDGSMSQ(7.38)TQ(-7.38)SGSTVK 17 3 1.8056 1072300 0 1072300 0 0.47983 0 0 0 0 0 0 0 1072300 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1072300 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 721 10 303 303 243 283;284 827 900;901 827 900 20190902_JH_WT_Ubi_2 6030 827 900 20190902_JH_WT_Ubi_2 6030 827 900 20190902_JH_WT_Ubi_2 6030 CON__P15636 413 CON__P15636 CON__P15636 0.999997 54.7824 0.00568586 80.585 45.468 80.585 0.999997 54.7824 0.00568586 80.585 0.999747 35.9661 0.00862851 70.615 1 Q SSGSPIYSPEKRVLGQLHGGPSSCSATGTNR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VLGQ(1)LHGGPSSCSATGTNR VLGQ(54.78)LHGGPSSCSATGTN(-54.78)R 4 3 -0.13897 861760 861760 0 0 0.0010419 0 0 0 861760 0 0 0 0 0 0 0 0 0.022638 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 861760 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 722 10 413 413 3811;4902 4331;5566 12059;15756 12649;16559 15756 16559 20190902_JH_EV_Ubi_2 5251 15756 16559 20190902_JH_EV_Ubi_2 5251 15756 16559 20190902_JH_EV_Ubi_2 5251 sp|P35527|K1C9_HUMAN;CON__P35527 433;433 sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT9 PE=1 SV=3 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 7.2261 50.425 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 3 Q NLEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.075)EIECQ(0.975)N(0.975)Q(0.975)EYSLLLSIKMRLEK Q(-15.74)EIECQ(15.74)N(15.74)Q(15.74)EYSLLLSIKMRLEK 6 3 -1.4423 2864800 0 0 2864800 NaN 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 723 13 433 433 3615 4124 11614 12191 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 sp|P35527|K1C9_HUMAN;CON__P35527 435;435 sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN sp|P35527|K1C9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT9 PE=1 SV=3 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 7.2261 50.425 0.974845 15.7358 0.0197969 50.425 3 Q EAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX Q(0.075)EIECQ(0.975)N(0.975)Q(0.975)EYSLLLSIKMRLEK Q(-15.74)EIECQ(15.74)N(15.74)Q(15.74)EYSLLLSIKMRLEK 8 3 -1.4423 2864800 0 0 2864800 NaN 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2864800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 724 13 435 435 3615 4124 11614 12191 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 11614 12191 20190902_JH_EV_Ubi_3 8631 CON__Q28107 1951 CON__Q28107 CON__Q28107 1 43.4077 0.0220201 43.408 8.1046 43.408 1 43.4077 0.0220201 43.408 3 Q IAEKLSTEFNPEPWIQVDMQKEVLLTGIQTQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LSTEFN(1)PEPWIQ(1)VDMQ(1)K LSTEFN(43.41)PEPWIQ(43.41)VDMQ(43.41)K 12 3 -1.0214 4202700 0 0 4202700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 725 18 1951 1951 2816 3192 9062 9534 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 CON__Q28107 1955 CON__Q28107 CON__Q28107 1 43.4077 0.0220201 43.408 8.1046 43.408 1 43.4077 0.0220201 43.408 3 Q LSTEFNPEPWIQVDMQKEVLLTGIQTQGAKH X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LSTEFN(1)PEPWIQ(1)VDMQ(1)K LSTEFN(43.41)PEPWIQ(43.41)VDMQ(43.41)K 16 3 -1.0214 4202700 0 0 4202700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4202700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 726 18 1955 1955 2816 3192 9062 9534 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 9062 9534 20190902_JH_WT_Ubi_2 2646 REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN 1 51.2762 0.0293829 51.276 9.4002 51.276 1 51.2762 0.0293829 51.276 Q X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXX PQ(1)KFPHGGQ(1)EQ(1)AK PQ(51.28)KFPHGGQ(51.28)EQ(51.28)AK 2 2 0.96638 2039300000 0 0 2039300000 NaN 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 727 34 896 896 3493 3985 11233 11801 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN 1 51.2762 0.0293829 51.276 9.4002 51.276 1 51.2762 0.0293829 51.276 Q X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX PQ(1)KFPHGGQ(1)EQ(1)AK PQ(51.28)KFPHGGQ(51.28)EQ(51.28)AK 9 2 0.96638 2039300000 0 0 2039300000 NaN 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 728 34 903 903 3493 3985 11233 11801 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN REV__sp|Q7Z406-5|MYH14_HUMAN 1 51.2762 0.0293829 51.276 9.4002 51.276 1 51.2762 0.0293829 51.276 Q X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX PQ(1)KFPHGGQ(1)EQ(1)AK PQ(51.28)KFPHGGQ(51.28)EQ(51.28)AK 11 2 0.96638 2039300000 0 0 2039300000 NaN 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2039300000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 729 34 905 905 3493 3985 11233 11801 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 11233 11801 20190902_JH_EV_Ubi_2 7635 REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN 0.999742 35.7595 0.0276788 56.548 7.0818 56.548 0.999742 35.7595 0.0276788 56.548 3 Q X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX LQ(1)N(0.999)RYQ(0.975)MQ(0.027)ETK LQ(35.76)N(30.54)RYQ(15.82)MQ(-15.82)ETK 2 3 -1.373 1897400 0 0 1897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 730 50 182 182 2787 3163 9001 9471 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN REV__sp|Q9H2G2-2|SLK_HUMAN 0.974516 15.8202 0.0276788 56.548 7.0818 56.548 0.974516 15.8202 0.0276788 56.548 3 Q X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LQ(1)N(0.999)RYQ(0.975)MQ(0.027)ETK LQ(35.76)N(30.54)RYQ(15.82)MQ(-15.82)ETK 6 3 -1.373 1897400 0 0 1897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1897400 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 731 50 186 186 2787 3163 9001 9471 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 9001 9471 20190902_JH_WT_Ubi_2 4053 REV__sp|Q9ULD9-2|ZN608_HUMAN REV__sp|Q9ULD9-2|ZN608_HUMAN 1 51.1927 0.0325149 51.193 14.746 51.193 1 51.1927 0.0325149 51.193 Q X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EILQ(1)HN(1)EMK EILQ(51.19)HN(51.19)EMK 4 3 -0.55018 28027000 0 28027000 0 NaN 0 0 0 0 0 28027000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28027000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN + 732 62 306 306 940 1061 2952 3105 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 2952 3105 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6861 sp|A0A1B0GTZ2|CC196_HUMAN 74 sp|A0A1B0GTZ2|CC196_HUMAN sp|A0A1B0GTZ2|CC196_HUMAN sp|A0A1B0GTZ2|CC196_HUMAN Putative coiled-coil domain-containing protein 196 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC196 PE=5 SV=1 0.792949 6.88846 0.00461433 59.339 17.889 59.339 0.792949 6.88846 0.00461433 59.339 1 Q MSNLEEKQRSLQIMRQIMAGKGCEESSVMEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SLQ(0.207)IMRQ(0.793)IMAGKGCEESSVMELLK SLQ(-6.89)IMRQ(6.89)IMAGKGCEESSVMELLK 7 3 -0.43731 3566400 3566400 0 0 NaN 3566400 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 3566400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 733 66 74 74 4043 4591 12807 13431 12807 13431 20190821_JH_EV_Ubi 8686 12807 13431 20190821_JH_EV_Ubi 8686 12807 13431 20190821_JH_EV_Ubi 8686 sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN 979 sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN sp|A0A1B0GUW6|SPEM3_HUMAN Uncharacterized protein SPEM3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEM3 PE=3 SV=1 0.499386 0 0.029396 42.908 9.7207 42.908 0.499386 0 0.029396 42.908 Q EHSQDSNLHKCPGINQDPGPHKDPALVQDSG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX CPGIN(0.499)Q(0.499)DPGPHKDPALVQ(0.001)DSGLPK CPGIN(0)Q(0)DPGPHKDPALVQ(-26.1)DSGLPK 6 3 1.6595 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 734 67 979 979 357 424 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 1196 1283 20190902_JH_WT_Ubi_2 8941 sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN 398 sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 18B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD18B PE=1 SV=1 0.373524 0 0.0169109 72.607 8.3831 72.607 0.373524 0 0.0169109 72.607 Q RLNEEMITKKVAQYSQQLNDLKAENARLNSK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KVAQ(0.253)YSQ(0.374)Q(0.374)LNDLK KVAQ(-1.7)YSQ(0)Q(0)LN(-30.42)DLK 7 2 1.7372 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 735 72 398 398 2468 2803 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN 399 sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN sp|A2A2Z9|AN18B_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 18B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD18B PE=1 SV=1 0.373524 0 0.0169109 72.607 8.3831 72.607 0.373524 0 0.0169109 72.607 Q LNEEMITKKVAQYSQQLNDLKAENARLNSKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX KVAQ(0.253)YSQ(0.374)Q(0.374)LNDLK KVAQ(-1.7)YSQ(0)Q(0)LN(-30.42)DLK 8 2 1.7372 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 736 72 399 399 2468 2803 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 8045 8456 20190821_JH_EV_Ubi 10116 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN 574 sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN sp|A2VCL2|CC162_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 162 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC162P PE=2 SV=3 1 102.559 4.97784E-07 146.16 54.202 146.16 1 102.559 4.97784E-07 146.16 0.999977 47.63 0.0180854 60.161 3 Q LFETCLHIKEKLDDNQLNLIQKVCELIGEVR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX EKLDDN(1)Q(1)LN(1)LIQK EKLDDN(107.93)Q(102.56)LN(54.85)LIQ(-54.85)K 7 3 1.3632 8070000 0 0 8070000 NaN 3620000 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4449900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 737 76 574 574 963 1087 3061;3062 3216;3217 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 3061 3216 20190821_JH_EV_Ubi 5246 sp|A3KMH1-2|VWA8_HUMAN;sp|A3KMH1-3|VWA8_HUMAN;sp|A3KMH1|VWA8_HUMAN 365;332;365 sp|A3KMH1-2|VWA8_HUMAN sp|A3KMH1-2|VWA8_HUMAN sp|A3KMH1-2|VWA8_HUMAN Isoform 2 of von Willebrand factor A domain-containing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VWA8;sp|A3KMH1-3|VWA8_HUMAN Isoform 3 of von Willebrand factor A domain-containing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VWA8;sp|A3KMH1|VWA8_H 1 41.4124 0.0351215 41.412 16.262 41.412 1 41.4124 0.0351215 41.412 Q EGKMAVEGVLKRFELQDSGSSLLPKEIVKVE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FELQ(1)DSGSSLLPKEIVKVEK FELQ(41.41)DSGSSLLPKEIVKVEK 4 4 0.71871 934850 934850 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 934850 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 934850 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 738 77 365 365 1187 1339 3764 3960 3764 3960 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6489 3764 3960 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6489 3764 3960 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6489 sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN;sp|A4D0S4|LAMB4_HUMAN 1254;1254 sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN Isoform 3 of Laminin subunit beta-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMB4;sp|A4D0S4|LAMB4_HUMAN Laminin subunit beta-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMB4 PE=2 SV=1 0.642795 5.40382 0.0315103 40.616 9.1543 40.616 0.642795 5.40382 0.0315103 40.616 2 Q GKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP RQ(0.643)IMQ(0.317)LN(0.317)EQ(0.721)LKAVYEFQ(0.003)DLK RQ(5.4)IMQ(-5.4)LN(-5.4)EQ(6.95)LKAVYEFQ(-25.01)DLK 2 4 0.32652 6820600 0 6820600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6820600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6820600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 739 78 1254 1254 3800 4317 12027 12616 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN;sp|A4D0S4|LAMB4_HUMAN 1261;1261 sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN sp|A4D0S4-3|LAMB4_HUMAN Isoform 3 of Laminin subunit beta-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMB4;sp|A4D0S4|LAMB4_HUMAN Laminin subunit beta-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMB4 PE=2 SV=1 0.720541 6.94915 0.0315103 40.616 9.1543 40.616 0.720541 6.94915 0.0315103 40.616 2 Q DYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDTIE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX RQ(0.643)IMQ(0.317)LN(0.317)EQ(0.721)LKAVYEFQ(0.003)DLK RQ(5.4)IMQ(-5.4)LN(-5.4)EQ(6.95)LKAVYEFQ(-25.01)DLK 9 4 0.32652 6820600 0 6820600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6820600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6820600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 740 78 1261 1261 3800 4317 12027 12616 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 12027 12616 20190902_JH_WT_Ubi_3 7166 sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-2|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-4|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-3|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69|EFCB5_HUMAN 71;127;127;127;127 sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN Isoform 5 of EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFCAB5;sp|A4FU69-2|EFCB5_HUMAN Isoform 2 of EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFCAB5;sp|A4FU69- 0.943809 11.8645 0.034653 54.608 6.7013 54.608 0.943809 11.8645 0.034653 54.608 2 Q HTWKKNLFERMEARAQAMQQKIIDKENLKKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX AQ(0.944)AMQ(0.137)Q(0.919)KIIDK AQ(11.86)AMQ(-10.3)Q(10.3)KIIDK 2 2 1.9488 2357600 0 2357600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2357600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2357600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 741 80 71 71 248 290 839 916 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-2|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-4|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69-3|EFCB5_HUMAN;sp|A4FU69|EFCB5_HUMAN 75;131;131;131;131 sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN sp|A4FU69-5|EFCB5_HUMAN Isoform 5 of EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFCAB5;sp|A4FU69-2|EFCB5_HUMAN Isoform 2 of EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFCAB5;sp|A4FU69- 0.919411 10.2985 0.034653 54.608 6.7013 54.608 0.919411 10.2985 0.034653 54.608 2 Q KNLFERMEARAQAMQQKIIDKENLKKELEKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX AQ(0.944)AMQ(0.137)Q(0.919)KIIDK AQ(11.86)AMQ(-10.3)Q(10.3)KIIDK 6 2 1.9488 2357600 0 2357600 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2357600 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2357600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 742 80 75 75 248 290 839 916 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 839 916 20190902_JH_WT_Ubi_3 10845 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN;sp|F8WBI6|GOG8N_HUMAN;sp|A6NCC3|GOG8O_HUMAN 211;212;370;371;371 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8R OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8R;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8O OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8O;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN Golgin subfamily A member 8R OS= 0.746478 8.58481 0.0321055 40.404 14.893 40.404 0.746478 8.58481 0.0321055 40.404 3 Q RLQEQHEKLRQLAKPQSVFEELNNENKSTLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP PQ(0.746)SVFEELN(0.183)N(0.183)EN(0.183)KSTLQ(0.709)LEQ(0.463)Q(0.463)VKELQ(0.07)EK PQ(8.58)SVFEELN(-8.14)N(-8.14)EN(-8.14)KSTLQ(8.14)LEQ(0)Q(0)VKELQ(-8.58)EK 2 3 -4.3227 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 743 82 211 211 3500 3993 11256 11824 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN;sp|F8WBI6|GOG8N_HUMAN;sp|A6NCC3|GOG8O_HUMAN 226;227;385;386;386 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8R OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8R;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8O OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8O;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN Golgin subfamily A member 8R OS= 0.709168 8.13945 0.0321055 40.404 14.893 40.404 0.709168 8.13945 0.0321055 40.404 3 Q QSVFEELNNENKSTLQLEQQVKELQEKLGEV Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX PQ(0.746)SVFEELN(0.183)N(0.183)EN(0.183)KSTLQ(0.709)LEQ(0.463)Q(0.463)VKELQ(0.07)EK PQ(8.58)SVFEELN(-8.14)N(-8.14)EN(-8.14)KSTLQ(8.14)LEQ(0)Q(0)VKELQ(-8.58)EK 17 3 -4.3227 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 744 82 226 226 3500 3993 11256 11824 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN;sp|F8WBI6|GOG8N_HUMAN;sp|A6NCC3|GOG8O_HUMAN 229;230;388;389;389 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8R OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8R;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8O OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8O;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN Golgin subfamily A member 8R OS= 0.46288 0 0.0321055 40.404 14.893 40.404 0.46288 0 0.0321055 40.404 Q FEELNNENKSTLQLEQQVKELQEKLGEVKET X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX PQ(0.746)SVFEELN(0.183)N(0.183)EN(0.183)KSTLQ(0.709)LEQ(0.463)Q(0.463)VKELQ(0.07)EK PQ(8.58)SVFEELN(-8.14)N(-8.14)EN(-8.14)KSTLQ(8.14)LEQ(0)Q(0)VKELQ(-8.58)EK 20 3 -4.3227 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 745 82 229 229 3500 3993 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN;sp|F8WBI6|GOG8N_HUMAN;sp|A6NCC3|GOG8O_HUMAN 230;231;389;390;390 sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN sp|I6L899-2|GOG8R_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8R OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8R;sp|A6NCC3-1|GOG8O_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 8O OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA8O;sp|I6L899|GOG8R_HUMAN Golgin subfamily A member 8R OS= 0.46288 0 0.0321055 40.404 14.893 40.404 0.46288 0 0.0321055 40.404 Q EELNNENKSTLQLEQQVKELQEKLGEVKETE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX PQ(0.746)SVFEELN(0.183)N(0.183)EN(0.183)KSTLQ(0.709)LEQ(0.463)Q(0.463)VKELQ(0.07)EK PQ(8.58)SVFEELN(-8.14)N(-8.14)EN(-8.14)KSTLQ(8.14)LEQ(0)Q(0)VKELQ(-8.58)EK 21 3 -4.3227 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 746 82 230 230 3500 3993 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 11256 11824 20190821_JH_WT_Ubi 11048 sp|A6NM76|O6C76_HUMAN 296 sp|A6NM76|O6C76_HUMAN sp|A6NM76|O6C76_HUMAN sp|A6NM76|O6C76_HUMAN Olfactory receptor 6C76 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OR6C76 PE=3 SV=1 0.549753 1.24583 0.0244746 57.225 27.42 57.225 0.549753 1.24583 0.0244746 57.225 Q MLNPFIYTLRNQQVKQAFKDVLRKISHKKKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(0.017)Q(0.017)Q(0.417)VKQ(0.55)AFKDVLR N(-15.75)Q(-15.75)Q(-1.25)VKQ(1.25)AFKDVLR 6 4 -0.31748 1832600 1832600 0 0 NaN 1832600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1832600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 747 91 296 296 3203 3660 10305 10848 10305 10848 20190821_JH_EV_Ubi 5586 10305 10848 20190821_JH_EV_Ubi 5586 10305 10848 20190821_JH_EV_Ubi 5586 sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN;sp|A6NMZ7|CO6A6_HUMAN 197;197 sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN sp|A6NMZ7-2|CO6A6_HUMAN Isoform 2 of Collagen alpha-6(VI) chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COL6A6;sp|A6NMZ7|CO6A6_HUMAN Collagen alpha-6(VI) chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COL6A6 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0277989 48.848 6.4657 48.848 0.5 0 0.0277989 48.848 1 Q FHFNLRTVRDLSMFSQNMTHIIKDVIKYKEG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX DLSMFSQ(0.5)N(0.5)MTHIIKDVIKYK DLSMFSQ(0)N(0)MTHIIKDVIKYK 7 3 3.8281 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 748 92 197 197 597 683 1872 1982 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 1872 1982 20190902_JH_WT_Ubi_3 14115 sp|A8K979-2|ERI2_HUMAN;sp|A8K979|ERI2_HUMAN 214;307 sp|A8K979-2|ERI2_HUMAN sp|A8K979-2|ERI2_HUMAN sp|A8K979-2|ERI2_HUMAN Isoform 2 of ERI1 exoribonuclease 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI2;sp|A8K979|ERI2_HUMAN ERI1 exoribonuclease 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERI2 PE=2 SV=2 0.873419 9.09194 0.0206347 66.267 23.747 66.267 0.873419 9.09194 0.0206347 66.267 1 Q KVQMKSICANSPIKAQQDQLQVKNNIKASLH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXX AQ(0.873)Q(0.108)DQ(0.016)LQ(0.003)VKNNIK AQ(9.09)Q(-9.09)DQ(-17.32)LQ(-25.05)VKN(-61.36)N(-63.95)IK 2 3 1.6185 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 749 94 214 214 257 304 889 966 889 966 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8939 889 966 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8939 889 966 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8939 sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN;sp|H0YM25|GG6LV_HUMAN 468;416 sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN Golgin subfamily A member 6-like protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA6L6 PE=3 SV=4;sp|H0YM25|GG6LV_HUMAN Golgin subfamily A member 6-like protein 22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA6L22 PE=3 SV=2 1 84.2126 0.00888395 84.213 18.907 84.213 1 84.2126 0.00888395 84.213 Q WRQEEKIREQEEIWRQKEKMHEQEEKIRKQE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX Q(1)KEKMHEQ(1)EEK Q(84.21)KEKMHEQ(84.21)EEK 1 2 -1.246 6957500 0 6957500 0 NaN 0 0 0 0 6957500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6957500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 750 99 468 468 3644 4153 11681 12259 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN;sp|H0YM25|GG6LV_HUMAN 475;423 sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN sp|A8MZA4|GG6L6_HUMAN Golgin subfamily A member 6-like protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA6L6 PE=3 SV=4;sp|H0YM25|GG6LV_HUMAN Golgin subfamily A member 6-like protein 22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA6L22 PE=3 SV=2 1 84.2126 0.00888395 84.213 18.907 84.213 1 84.2126 0.00888395 84.213 Q REQEEIWRQKEKMHEQEEKIRKQEEKVWRQE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX Q(1)KEKMHEQ(1)EEK Q(84.21)KEKMHEQ(84.21)EEK 8 2 -1.246 6957500 0 6957500 0 NaN 0 0 0 0 6957500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6957500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 751 99 475 475 3644 4153 11681 12259 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 11681 12259 20190902_JH_EV_Ubi_3 9473 sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN;sp|B1AJZ9|FHAD1_HUMAN;sp|B1AJZ9-3|FHAD1_HUMAN 908;944;944 sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN Isoform 4 of Forkhead-associated domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHAD1;sp|B1AJZ9|FHAD1_HUMAN Forkhead-associated domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHAD1 PE=2 SV=2;sp|B1AJZ9-3|FHAD1_HUMAN I 1 50.8046 0.0342527 50.805 12.671 50.805 1 50.8046 0.0342527 50.805 2 Q IKQHAQTIVSLEEKLQKVTQHHKKIEGEIAT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX LQ(1)KVTQ(1)HHK LQ(50.8)KVTQ(50.8)HHK 2 3 2.4779 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 752 100 908 908 2781 3157 8993 9463 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN;sp|B1AJZ9|FHAD1_HUMAN;sp|B1AJZ9-3|FHAD1_HUMAN 912;948;948 sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN sp|B1AJZ9-4|FHAD1_HUMAN Isoform 4 of Forkhead-associated domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHAD1;sp|B1AJZ9|FHAD1_HUMAN Forkhead-associated domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHAD1 PE=2 SV=2;sp|B1AJZ9-3|FHAD1_HUMAN I 1 50.8046 0.0342527 50.805 12.671 50.805 1 50.8046 0.0342527 50.805 2 Q AQTIVSLEEKLQKVTQHHKKIEGEIATLKDN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LQ(1)KVTQ(1)HHK LQ(50.8)KVTQ(50.8)HHK 6 3 2.4779 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 753 100 912 912 2781 3157 8993 9463 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 8993 9463 20190902_JH_EV_Ubi_2 7375 sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4-2|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4-4|MYO9A_HUMAN 1265;1482;1501;1501 sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN Isoform 5 of Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO9A;sp|B2RTY4-2|MYO9A_HUMAN Isoform 2 of Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO9A;sp|B2RTY4|MYO9A_HUMAN Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens 0.936871 14.1184 0.012207 72.29 10.003 72.29 0.936871 14.1184 0.012207 72.29 Q VLKKLEKLNTEKEERQKQLQQQNEKEMMEQI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EERQ(0.937)KQ(0.109)LQ(0.109)Q(0.126)Q(0.641)N(0.078)EK EERQ(14.12)KQ(-8.82)LQ(-8.82)Q(-7.11)Q(7.11)N(-9.2)EK 4 3 3.6678 1978700 0 1978700 0 NaN 0 0 0 1978700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1978700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 754 101 1265 1265 869 985 2768 2912 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4-2|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4|MYO9A_HUMAN;sp|B2RTY4-4|MYO9A_HUMAN 1271;1488;1507;1507 sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN sp|B2RTY4-5|MYO9A_HUMAN Isoform 5 of Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO9A;sp|B2RTY4-2|MYO9A_HUMAN Isoform 2 of Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO9A;sp|B2RTY4|MYO9A_HUMAN Unconventional myosin-IXa OS=Homo sapiens 0.640691 7.11125 0.012207 72.29 10.003 72.29 0.640691 7.11125 0.012207 72.29 Q KLNTEKEERQKQLQQQNEKEMMEQIRQQTDI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EERQ(0.937)KQ(0.109)LQ(0.109)Q(0.126)Q(0.641)N(0.078)EK EERQ(14.12)KQ(-8.82)LQ(-8.82)Q(-7.11)Q(7.11)N(-9.2)EK 10 3 3.6678 1978700 0 1978700 0 NaN 0 0 0 1978700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1978700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 755 101 1271 1271 869 985 2768 2912 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 2768 2912 20190902_JH_EV_Ubi_2 5665 sp|O00161|SNP23_HUMAN 118 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.369704 3.14731 4.85126E-12 92.648 65.428 92.648 0.369704 3.14731 4.85126E-12 92.648 Q WGDGGENSPCNVVSKQPGPVTNGQLQQPTTG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TTWGDGGEN(0.132)SPCN(0.132)VVSKQ(0.37)PGPVTN(0.179)GQ(0.179)LQ(0.006)Q(0.001)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(-4.46)SPCN(-4.46)VVSKQ(3.15)PGPVTN(-3.15)GQ(-3.15)LQ(-18.02)Q(-24.56)PTTGAASGGYIK 18 4 0.47161 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 756 109 118 118 4645 5271 14875 15630 20190902_JH_EV_Ubi_2 9288 14875 15630 20190902_JH_EV_Ubi_2 9288 14875 15630 20190902_JH_EV_Ubi_2 9288 sp|O00161|SNP23_HUMAN 126 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.382368 0 0.000788431 57.673 38.742 57.673 0.235842 0 0.000788431 43.302 0.382368 0 0.000809976 57.673 Q PCNVVSKQPGPVTNGQLQQPTTGAASGGYIK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TTWGDGGENSPCN(0.002)VVSKQ(0.007)PGPVTN(0.382)GQ(0.382)LQ(0.125)Q(0.101)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(-32.98)SPCN(-22.45)VVSKQ(-17.54)PGPVTN(0)GQ(0)LQ(-4.86)Q(-5.77)PTTGAASGGYIK 26 3 0.17924 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 757 109 126 126 4645 5271 14880 15635 20190821_JH_WT_Ubi 9090 14880 15635 20190821_JH_WT_Ubi 9090 14878 15633 20190821_JH_MUT_Ubi 8833 sp|O00161|SNP23_HUMAN 128 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.235842 0 0.000788431 43.302 14.825 43.302 0.235842 0 0.000788431 43.302 Q NVVSKQPGPVTNGQLQQPTTGAASGGYIKRI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TTWGDGGEN(0.02)SPCN(0.058)VVSKQ(0.151)PGPVTN(0.236)GQ(0.236)LQ(0.236)Q(0.064)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(-10.72)SPCN(-6.12)VVSKQ(-1.95)PGPVTN(0)GQ(0)LQ(0)Q(-5.65)PTTGAASGGYIK 28 4 0.11493 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 758 109 128 128 4645 5271 14878 15633 20190821_JH_MUT_Ubi 8833 14878 15633 20190821_JH_MUT_Ubi 8833 14878 15633 20190821_JH_MUT_Ubi 8833 sp|O00161|SNP23_HUMAN 129 sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN sp|O00161|SNP23_HUMAN Synaptosomal-associated protein 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNAP23 PE=1 SV=1 0.581357 6.23731 3.17931E-05 66.878 41.655 66.878 0.438761 3.55069 0.000172012 58.628 0.581357 6.23731 3.17931E-05 66.878 1 Q VVSKQPGPVTNGQLQQPTTGAASGGYIKRIT X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX TTWGDGGENSPCNVVSKQ(0.003)PGPVTN(0.138)GQ(0.138)LQ(0.138)Q(0.581)PTTGAASGGYIK TTWGDGGEN(-41.2)SPCN(-31.71)VVSKQ(-22.32)PGPVTN(-6.24)GQ(-6.24)LQ(-6.24)Q(6.24)PTTGAASGGYIK 29 3 0.53112 612500 612500 0 0 NaN 0 0 0 0 612500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 612500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 759 109 129 129 4645 5271 14876 15631 14876 15631 20190902_JH_EV_Ubi_3 9297 14876 15631 20190902_JH_EV_Ubi_3 9297 14876 15631 20190902_JH_EV_Ubi_3 9297 sp|O00571|DDX3X_HUMAN 14 sp|O00571|DDX3X_HUMAN sp|O00571|DDX3X_HUMAN sp|O00571|DDX3X_HUMAN ATP-dependent RNA helicase DDX3X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX3X PE=1 SV=3 0.62953 3.8784 2.40559E-06 88.348 57.806 88.348 0.62953 3.8784 2.40559E-06 88.348 1 Q __MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP SHVAVEN(0.258)ALGLDQ(0.63)Q(0.076)FAGLDLN(0.023)SSDN(0.007)Q(0.007)SGGSTASK SHVAVEN(-3.88)ALGLDQ(3.88)Q(-9.2)FAGLDLN(-14.3)SSDN(-19.64)Q(-19.64)SGGSTASK 13 3 3.1831 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 760 134 14 14 3957 4501 12553 13167 12553 13167 20190821_JH_WT_Ubi 13649 12553 13167 20190821_JH_WT_Ubi 13649 12553 13167 20190821_JH_WT_Ubi 13649 sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN;sp|O14828|SCAM3_HUMAN 63;89 sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN sp|O14828-2|SCAM3_HUMAN Isoform 2 of Secretory carrier-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP3;sp|O14828|SCAM3_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP3 PE=1 SV=3 0.999999 61.2794 1.70266E-15 143.33 111 106.7 0.999999 61.2794 1.94732E-06 106.7 0.999999 58.0749 0.00132066 77.031 0.999988 47.7215 5.0314E-08 116.98 0.999999 60.2487 1.70266E-15 143.33 0.99985 37.1852 0.0215716 59.182 1 Q KLSPTEPKNYGSYSTQASAAAATAELLKKQE X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX NYGSYSTQ(1)ASAAAATAELLKK N(-61.28)YGSYSTQ(61.28)ASAAAATAELLKK 8 3 0.23509 34995000 34995000 0 0 0.035653 0 0 0 4237900 2423000 9972600 9696600 8665100 0 0 0 0 0.06135 0.052395 0.086719 0.113 0.079419 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4237900 0 0 2423000 0 0 9972600 0 0 9696600 0 0 8665100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 761 157 63 63 3273 3738 10515;10516;10517;10518;10520 11062;11063;11064;11065;11067 10515 11062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9577 10518 11065 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9706 10518 11065 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9706 sp|O14964-2|HGS_HUMAN;sp|O14964|HGS_HUMAN 77;77 sp|O14964-2|HGS_HUMAN sp|O14964-2|HGS_HUMAN sp|O14964-2|HGS_HUMAN Isoform 2 of Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HGS;sp|O14964|HGS_HUMAN Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HGS PE=1 SV=1 0.760317 5.3553 0.0266272 50.493 24.882 50.493 0.760317 5.3553 0.0266272 50.493 1 Q LYALEVMESVVKNCGQTVHDEVANKQTMEEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.222)CGQ(0.76)TVHDEVAN(0.017)KQ(0.001)TMEELK N(-5.36)CGQ(5.36)TVHDEVAN(-16.49)KQ(-30.77)TMEELK 4 3 2.4171 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 762 163 77 77 3009 3440 9731 10252 9731 10252 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6058 9731 10252 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6058 9731 10252 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6058 sp|O14965|AURKA_HUMAN 72 sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN Aurora kinase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AURKA PE=1 SV=2 0.977116 17.4285 0.0283061 51.612 19.948 51.612 0.977116 17.4285 0.0283061 51.612 2 Q VPLQAQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LVSSHKPVQ(0.977)N(0.026)Q(0.498)KQ(0.498)K LVSSHKPVQ(17.43)N(-17.43)Q(0)KQ(0)K 9 4 -0.80808 14005000 0 14005000 0 NaN 0 14005000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 14005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 763 164 72 72 2861 3244 9230 9715 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 sp|O14965|AURKA_HUMAN 74 sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN Aurora kinase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AURKA PE=1 SV=2 0.498313 0 0.0283061 51.612 19.948 51.612 0.498313 0 0.0283061 51.612 Q LQAQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LVSSHKPVQ(0.977)N(0.026)Q(0.498)KQ(0.498)K LVSSHKPVQ(17.43)N(-17.43)Q(0)KQ(0)K 11 4 -0.80808 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 764 164 74 74 2861 3244 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 sp|O14965|AURKA_HUMAN 76 sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN sp|O14965|AURKA_HUMAN Aurora kinase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AURKA PE=1 SV=2 0.498313 0 0.0283061 51.612 19.948 51.612 0.498313 0 0.0283061 51.612 Q AQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LVSSHKPVQ(0.977)N(0.026)Q(0.498)KQ(0.498)K LVSSHKPVQ(17.43)N(-17.43)Q(0)KQ(0)K 13 4 -0.80808 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 765 164 76 76 2861 3244 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 9230 9715 20190821_JH_MUT_Ubi 3319 sp|O15049|N4BP3_HUMAN 519 sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN NEDD4-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=N4BP3 PE=1 SV=3 1 55.5305 0.031554 55.531 17.803 55.531 1 55.5305 0.031554 55.531 Q QREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX N(1)Q(1)ALEQ(1)ELR N(55.53)Q(55.53)ALEQ(55.53)ELR 2 2 -0.050975 2514500 0 0 2514500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 766 170 519 519 3196 3652 10286 10826 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 sp|O15049|N4BP3_HUMAN 523 sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN sp|O15049|N4BP3_HUMAN NEDD4-binding protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=N4BP3 PE=1 SV=3 1 55.5305 0.031554 55.531 17.803 55.531 1 55.5305 0.031554 55.531 Q QGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX N(1)Q(1)ALEQ(1)ELR N(55.53)Q(55.53)ALEQ(55.53)ELR 6 2 -0.050975 2514500 0 0 2514500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2514500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 767 170 523 523 3196 3652 10286 10826 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 10286 10826 20190902_JH_WT_Ubi_3 9174 sp|O15117|FYB1_HUMAN;sp|O15117-2|FYB1_HUMAN;sp|O15117-3|FYB1_HUMAN 344;344;354 sp|O15117|FYB1_HUMAN sp|O15117|FYB1_HUMAN sp|O15117|FYB1_HUMAN FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYB1 PE=1 SV=2;sp|O15117-2|FYB1_HUMAN Isoform FYB-130 of FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYB1;sp|O15117-3|FYB1_HUMAN Isoform 3 of FYN-binding protein 1 OS=Homo sapiens O 1 52.7843 0.00969986 52.784 29.685 52.784 1 43.6965 0.0246978 43.696 1 52.7843 0.00969986 52.784 2 Q SQEKEKGDKNSATPKQKPLPPLFTLGPPPPK X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(1)SATPKQ(1)KPLPPLFTLGPPPPK N(52.78)SATPKQ(52.78)KPLPPLFTLGPPPPK 7 4 -0.95268 6774900 0 6774900 0 NaN 4899700 0 0 1875200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 4899700 0 0 0 0 0 0 0 0 1875200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 768 171 344 344 3209 3667 10330;10331 10873;10874 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 10331 10874 20190902_JH_EV_Ubi_2 7867 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 314 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.993708 23.7381 0.0053143 57.152 13.977 57.152 0.993708 23.7381 0.0053143 57.152 Q AQQEFATGVMSNKTVQTAAANAASTAASSAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP TVQ(0.994)TAAAN(0.011)AASTAASSAAQ(0.014)N(0.03)AFKGN(0.476)Q(0.476)I TVQ(23.74)TAAAN(-17.65)AASTAASSAAQ(-16.53)N(-12.41)AFKGN(0)Q(0)I 3 3 3.0061 999820 0 999820 0 0.0061845 0 0 0 0 0 0 999820 0 0 0 0 0 0 0 0 0.042875 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 999820 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 769 173 314 314 4676 5305;5306 14992 15752 14992 15752 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10980 14992 15752 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10980 14992 15752 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10980 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 330 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.802263 5.3189 0.0219312 50.029 22.191 50.029 0.802263 5.3189 0.0219312 50.029 2 Q TAAANAASTAASSAAQNAFKGNQI_______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TVQ(0.004)TAAAN(0.402)AASTAASSAAQ(0.802)N(0.764)AFKGN(0.01)Q(0.018)I TVQ(-24.03)TAAAN(-4.46)AASTAASSAAQ(5.32)N(4.46)AFKGN(-21.09)Q(-16.96)I 19 3 4.0479 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 770 173 330 330 4676 5305;5306 14991 15751 14991 15751 20190821_JH_EV_Ubi 9536 14991 15751 20190821_JH_EV_Ubi 9536 14991 15751 20190821_JH_EV_Ubi 9536 sp|O15126|SCAM1_HUMAN 337 sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN sp|O15126|SCAM1_HUMAN Secretory carrier-associated membrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP1 PE=1 SV=2 0.499554 0 3.46444E-09 107.88 77.783 88.329 0.49921 0 3.46444E-09 107.88 0.494448 0 0.00178707 79.94 0.499554 0 2.8161E-05 88.329 Q STAASSAAQNAFKGNQI______________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVQTAAANAASTAASSAAQN(0.001)AFKGN(0.5)Q(0.5)I TVQ(-78.51)TAAAN(-53.17)AASTAASSAAQ(-33.79)N(-28.65)AFKGN(0)Q(0)I 26 3 0.19475 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 771 173 337 337 4676 5305;5306 14990 15749 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10608 14983 15742 20190902_JH_EV_Ubi_2 10319 14983 15742 20190902_JH_EV_Ubi_2 10319 sp|O15355|PPM1G_HUMAN 184 sp|O15355|PPM1G_HUMAN sp|O15355|PPM1G_HUMAN sp|O15355|PPM1G_HUMAN Protein phosphatase 1G OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPM1G PE=1 SV=1 0.984204 17.9454 2.87762E-05 80.355 56.442 78.978 0.774633 5.36206 0.00583591 50.088 0.5 0 2.87762E-05 80.355 0.984204 17.9454 3.44182E-05 78.978 1 Q PHSKSGGGTGEEPGSQGLNGEAGPEDSTRET X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX GPPHSKSGGGTGEEPGSQ(0.984)GLN(0.016)GEAGPEDSTR GPPHSKSGGGTGEEPGSQ(17.95)GLN(-17.95)GEAGPEDSTR 18 4 0.95797 4408500 4408500 0 0 NaN 0 0 1289300 2237900 881270 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1289300 0 0 2237900 0 0 881270 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 772 180 184 184 1651 1880 5279;5280;5286 5557;5558;5559;5565 5280 5559 20190902_JH_EV_Ubi_3 4761 5279 5557 20190902_JH_EV_Ubi_2 4745 5279 5557 20190902_JH_EV_Ubi_2 4745 sp|O15438|MRP3_HUMAN;sp|O15438-4|MRP3_HUMAN;sp|O15438-2|MRP3_HUMAN 945;996;945 sp|O15438|MRP3_HUMAN sp|O15438|MRP3_HUMAN sp|O15438|MRP3_HUMAN Canalicular multispecific organic anion transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC3 PE=1 SV=3;sp|O15438-4|MRP3_HUMAN Isoform 4 of Canalicular multispecific organic anion transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC3;sp|O15438-2|MRP 0.999999 62.8518 0.00502359 89.877 53.684 89.877 0.999997 55.6983 0.0357234 70.117 0.999999 62.8518 0.00502359 89.877 1 Q EKVQVTEAKADGALTQEEKAAIGTVELSVFW X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX VQVTEAKADGALTQ(1)EEK VQ(-62.85)VTEAKADGALTQ(62.85)EEK 14 3 1.6763 7358800 7358800 0 0 0.033432 0 0 0 4022500 0 3336300 0 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 0.088025 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4022500 0 0 0 0 0 3336300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 773 186 945 945 5000 5673 16047;16048 16857;16858 16048 16858 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6167 16048 16858 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6167 16048 16858 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6167 sp|O15439|MRP4_HUMAN;sp|O15439-2|MRP4_HUMAN 1275;1228 sp|O15439|MRP4_HUMAN sp|O15439|MRP4_HUMAN sp|O15439|MRP4_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC4 PE=1 SV=3;sp|O15439-2|MRP4_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC4 0.792384 5.81677 0.0101564 76.761 38.424 76.761 0.792384 5.81677 0.0101564 76.761 1 Q VLLQNKESLFYKMVQQLGKAEAAALTETAKQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPX MVQ(0.208)Q(0.792)LGKAEAAALTETAK MVQ(-5.82)Q(5.82)LGKAEAAALTETAK 4 3 1.569 2270400 2270400 0 0 0.019644 0 0 0 0 0 0 0 2270400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.11386 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2270400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 774 187 1275 1275 2984 3408 9658 10168 9658 10168 20190902_JH_WT_Ubi_2 9447 9658 10168 20190902_JH_WT_Ubi_2 9447 9658 10168 20190902_JH_WT_Ubi_2 9447 sp|O43506|ADA20_HUMAN 636 sp|O43506|ADA20_HUMAN sp|O43506|ADA20_HUMAN sp|O43506|ADA20_HUMAN Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAM20 PE=2 SV=2 0.963403 14.2038 0.015441 60.196 21.428 60.196 0.963403 14.2038 0.015441 60.196 1 Q IRKKCASMVHLSQACQPKTCNMRGICNNKQH X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KCASMVHLSQ(0.037)ACQ(0.963)PK KCASMVHLSQ(-14.2)ACQ(14.2)PK 13 3 -1.5679 1341700 1341700 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1341700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1341700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 775 207 636 636 2321 2640 7629 8026 7629 8026 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3675 7629 8026 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3675 7629 8026 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3675 sp|O43707|ACTN4_HUMAN;sp|O43707-2|ACTN4_HUMAN;sp|P35609-2|ACTN2_HUMAN;sp|P35609|ACTN2_HUMAN;sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN;sp|P12814|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-3|ACTN1_HUMAN;sp|P12814-4|ACTN1_HUMAN 352;133;340;340;333;333;333;333 sp|O43707|ACTN4_HUMAN;sp|P12814-2|ACTN1_HUMAN sp|O43707|ACTN4_HUMAN sp|O43707|ACTN4_HUMAN Alpha-actinin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN4 PE=1 SV=2;sp|O43707-2|ACTN4_HUMAN Isoform ACTN4ISO of Alpha-actinin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTN4;sp|P35609-2|ACTN2_HUMAN Isoform 2 of Alpha-actinin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AC 0.955219 14.4656 0.00114736 100.69 57.706 100.69 0.955219 14.4656 0.00114736 100.69 2 Q DYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLS;DYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX VQ(0.035)EKCQ(0.955)LEIN(0.164)FN(0.845)TLQ(0.001)TK VQ(-14.47)EKCQ(14.47)LEIN(-7.35)FN(7.35)TLQ(-32.69)TK 6 3 0.25075 12368000 0 12368000 0 2.9854 0 12368000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 12368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 776 214;537 352;333 352 4987 5658 16013 16823 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 16013 16823 20190821_JH_MUT_Ubi 8243 sp|O43711|TLX3_HUMAN 244 sp|O43711|TLX3_HUMAN sp|O43711|TLX3_HUMAN sp|O43711|TLX3_HUMAN T-cell leukemia homeobox protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TLX3 PE=1 SV=3 0.899589 9.44683 0.0351209 54.608 6.4198 54.608 0.899589 9.44683 0.0351209 54.608 2 Q REAERQQASRLMLQLQHDAFQKSLNDSIQPD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LMLQ(0.116)LQ(0.9)HDAFQ(0.984)K LMLQ(-9.45)LQ(9.45)HDAFQ(17.54)K 6 2 2.6669 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 777 216 244 244 2719 3091 8817 9274 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 sp|O43711|TLX3_HUMAN 249 sp|O43711|TLX3_HUMAN sp|O43711|TLX3_HUMAN sp|O43711|TLX3_HUMAN T-cell leukemia homeobox protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TLX3 PE=1 SV=3 0.984435 17.5432 0.0351209 54.608 6.4198 54.608 0.984435 17.5432 0.0351209 54.608 2 Q QQASRLMLQLQHDAFQKSLNDSIQPDPLCLH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LMLQ(0.116)LQ(0.9)HDAFQ(0.984)K LMLQ(-9.45)LQ(9.45)HDAFQ(17.54)K 11 2 2.6669 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 778 216 249 249 2719 3091 8817 9274 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 8817 9274 20190902_JH_EV_Ubi_2 9110 sp|O60260-3|PRKN_HUMAN;sp|O60260-5|PRKN_HUMAN;sp|O60260-8|PRKN_HUMAN;sp|O60260|PRKN_HUMAN 92;171;171;171 sp|O60260-3|PRKN_HUMAN sp|O60260-3|PRKN_HUMAN sp|O60260-3|PRKN_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase parkin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKN;sp|O60260-5|PRKN_HUMAN Isoform 5 of E3 ubiquitin-protein ligase parkin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKN;sp|O60260-8|PRKN_HUMAN Isoform 8 of E3 ubiquitin-p 0.582883 1.45272 0.0336029 43.848 15.018 43.848 0.582883 1.45272 0.0336029 43.848 2 Q RVQPGKLRVQCSTCRQATLTLTQGPSCWDDV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.583)ATLTLTQ(0.417)GPSCWDDVLIPN(1)R Q(1.45)ATLTLTQ(-1.45)GPSCWDDVLIPN(39.21)R 1 3 4.3768 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 779 232 92 92 3605 4114 11602 12179 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 11602 12179 20190902_JH_WT_Ubi_3 8074 sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN;sp|O60266|ADCY3_HUMAN 408;821 sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN sp|O60266-2|ADCY3_HUMAN Isoform 2 of Adenylate cyclase type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADCY3;sp|O60266|ADCY3_HUMAN Adenylate cyclase type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADCY3 PE=1 SV=3 0.870594 9.69984 0.0231121 44.105 16.61 44.105 0.870594 9.69984 0.0231121 44.105 1 Q RFREHDLPMVALEQMQGFNPGLNGTDRLPLV X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX EHDLPMVALEQ(0.093)MQ(0.871)GFN(0.018)PGLN(0.018)GTDR EHDLPMVALEQ(-9.7)MQ(9.7)GFN(-16.83)PGLN(-16.83)GTDR 13 3 -0.86255 1465200 1465200 0 0 NaN 0 1465200 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1465200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 780 233 408 408 917 1037 2910 3063 2910 3063 20190821_JH_MUT_Ubi 6953 2910 3063 20190821_JH_MUT_Ubi 6953 2910 3063 20190821_JH_MUT_Ubi 6953 sp|O60281-2|ZN292_HUMAN;sp|O60281|ZN292_HUMAN 1863;2008 sp|O60281-2|ZN292_HUMAN sp|O60281-2|ZN292_HUMAN sp|O60281-2|ZN292_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 292 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF292;sp|O60281|ZN292_HUMAN Zinc finger protein 292 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF292 PE=1 SV=3 0.998236 27.9703 0.0339409 43.955 6.3305 43.955 0.998236 27.9703 0.0339409 43.955 2 Q QSENVPASRSTQVKKQLAMTEENKKESQPAL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.998)LAMTEEN(0.991)KKESQ(0.011)PALELR Q(27.97)LAMTEEN(20.52)KKESQ(-20.52)PALELR 1 3 2.759 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 781 235 1863 1863 3649 4158 11686 12264 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 11686 12264 20190902_JH_MUT_Ubi_3 13349 sp|O60292|SI1L3_HUMAN 1533 sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIPA1L3 PE=1 SV=3 0.995422 26.4998 0.0307364 41.76 7.6116 41.76 0.995422 26.4998 0.0307364 41.76 2;3 Q IIMDNLGPEQERDTGQSPQKGLQRTLSDESL X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX LIIMDN(0.007)LGPEQ(0.007)ERDTGQ(0.995)SPQ(0.995)KGLQ(0.995)R LIIMDN(-26.29)LGPEQ(-26.29)ERDTGQ(26.5)SPQ(26.29)KGLQ(26.29)R 17 3 1.1954 1576000 0 1576000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 782 237 1533 1533 2656 3020;3021 8637;8638 9082;9083 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 sp|O60292|SI1L3_HUMAN 1536 sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIPA1L3 PE=1 SV=3 0.995205 26.2913 0.0307364 50.851 23.132 41.76 0.995205 26.2913 0.0307364 41.76 0.674935 0.320037 0.0331056 50.851 2;3 Q DNLGPEQERDTGQSPQKGLQRTLSDESLCSG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LIIMDN(0.007)LGPEQ(0.007)ERDTGQ(0.995)SPQ(0.995)KGLQ(0.995)R LIIMDN(-26.29)LGPEQ(-26.29)ERDTGQ(26.5)SPQ(26.29)KGLQ(26.29)R 20 3 1.1954 1576000 0 1576000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 783 237 1536 1536 2656 3020;3021 8637;8638 9082;9083 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 8638 9083 20190902_JH_WT_Ubi_2 11928 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 sp|O60292|SI1L3_HUMAN 1540 sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN sp|O60292|SI1L3_HUMAN Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIPA1L3 PE=1 SV=3 0.995205 26.2913 0.0307364 50.851 23.132 41.76 0.995205 26.2913 0.0307364 41.76 0.674935 0.320037 0.0331056 50.851 2;3 Q PEQERDTGQSPQKGLQRTLSDESLCSGRREP X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LIIMDN(0.007)LGPEQ(0.007)ERDTGQ(0.995)SPQ(0.995)KGLQ(0.995)R LIIMDN(-26.29)LGPEQ(-26.29)ERDTGQ(26.5)SPQ(26.29)KGLQ(26.29)R 24 3 1.1954 1576000 0 1576000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1576000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 784 237 1540 1540 2656 3020;3021 8637;8638 9082;9083 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 8638 9083 20190902_JH_WT_Ubi_2 11928 8637 9082 20190821_JH_WT_Ubi 8691 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN;sp|O60315|ZEB2_HUMAN 591;615 sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN sp|O60315-2|ZEB2_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2;sp|O60315|ZEB2_HUMAN Zinc finger E-box-binding homeobox 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZEB2 PE=1 SV=1 1 51.2649 0.0256586 51.265 26.727 51.265 1 51.2649 0.0256586 51.265 4 Q ERYLCKMNEEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVD X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX MN(1)EEIKAVLQ(1)PHEN(1)IVPN(1)K MN(51.26)EEIKAVLQ(51.26)PHEN(51.26)IVPN(51.26)K 10 3 -1.7413 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 785 239 591 591 2950 3355 9498 9998 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 9498 9998 20190821_JH_MUT_Ubi 6764 sp|O60437|PEPL_HUMAN 744 sp|O60437|PEPL_HUMAN sp|O60437|PEPL_HUMAN sp|O60437|PEPL_HUMAN Periplakin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPL PE=1 SV=4 0.502632 0.599443 0.0126571 51.586 11.703 51.586 0.502632 0.599443 0.0126571 51.586 1 Q KAAYEHFHRGHDHVLQFLVSIPSYEPQETDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GHDHVLQ(0.503)FLVSIPSYEPQ(0.438)ETDSLSQ(0.06)METK GHDHVLQ(0.6)FLVSIPSYEPQ(-0.6)ETDSLSQ(-9.26)METK 7 3 1.3237 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 786 245 744 744 1511 1723 4846 5098 4846 5098 20190821_JH_WT_Ubi 12169 4846 5098 20190821_JH_WT_Ubi 12169 4846 5098 20190821_JH_WT_Ubi 12169 sp|O60437|PEPL_HUMAN 653 sp|O60437|PEPL_HUMAN sp|O60437|PEPL_HUMAN sp|O60437|PEPL_HUMAN Periplakin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPL PE=1 SV=4 0.910924 10.2947 0.0206294 51.979 25.861 51.979 0.910924 10.2947 0.0206294 51.979 1 Q DDTVPESSRVLDSKGQELAAMACELQAQKSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX GQ(0.911)ELAAMACELQ(0.085)AQ(0.004)K GQ(10.29)ELAAMACELQ(-10.29)AQ(-23.62)K 2 2 -3.0246 567480 567480 0 0 NaN 0 0 0 0 0 567480 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 567480 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 787 245 653 653 1663 1893 5311 5592 5311 5592 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7310 5311 5592 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7310 5311 5592 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7310 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN;sp|O60522|TDRD6_HUMAN 662;662 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN Isoform 2 of Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6;sp|O60522|TDRD6_HUMAN Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6 PE=2 SV=2 1 46.1543 0.0312893 46.154 19.315 46.154 1 46.1543 0.0312893 46.154 3 Q DESRTGEENISKVIAQAGYAKYQEFETKENI X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX TGEEN(1)ISKVIAQ(1)AGYAKYQ(1)EFETK TGEEN(46.15)ISKVIAQ(46.15)AGYAKYQ(46.15)EFETK 12 3 0.12197 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 788 253 662 662 4364 4947 13817 14499 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN;sp|O60522|TDRD6_HUMAN 669;669 sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN sp|O60522-2|TDRD6_HUMAN Isoform 2 of Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6;sp|O60522|TDRD6_HUMAN Tudor domain-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TDRD6 PE=2 SV=2 1 46.1543 0.0312893 46.154 19.315 46.154 1 46.1543 0.0312893 46.154 3 Q ENISKVIAQAGYAKYQEFETKENILVNAHSP X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TGEEN(1)ISKVIAQ(1)AGYAKYQ(1)EFETK TGEEN(46.15)ISKVIAQ(46.15)AGYAKYQ(46.15)EFETK 19 3 0.12197 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 789 253 669 669 4364 4947 13817 14499 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 13817 14499 20190821_JH_WT_Ubi 16548 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN;sp|O60716-21|CTND1_HUMAN;sp|O60716-19|CTND1_HUMAN;sp|O60716-13|CTND1_HUMAN;sp|O60716|CTND1_HUMAN;sp|O60716-18|CTND1_HUMAN;sp|O60716-2|CTND1_HUMAN;sp|O60716-9|CTND1_HUMAN;sp|O60716-10|CTND1_HUMAN;sp|O60716-17|CTND1_HUMAN;sp|O60716-7|CTND1_HUMAN;sp|O60716-8|CTND1_HUMAN;sp|O60716-15|CTND1_HUMAN;sp|O60716-16|CTND1_HUMAN;sp|O60716-23|CTND1_HUMAN;sp|O60716-24|CTND1_HUMAN;sp|O60716-4|CTND1_HUMAN;sp|O60716-6|CTND1_HUMAN;sp|O60716-12|CTND1_HUMAN;sp|O60716-14|CTND1_HUMAN;sp|O60716-22|CTND1_HUMAN;sp|O60716-20|CTND1_HUMAN 176;176;122;75;75;122;176;75;176;122;122;75;176;176;122;122;75;75;176;176;122;122;75;75 sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN sp|O60716-3|CTND1_HUMAN Isoform 1AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-5|CTND1_HUMAN Isoform 1A of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNND1;sp|O60716-11|CTND1_HUMAN Isoform 2AC of Catenin delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 0.33226 0 0.03111 45.042 16.896 45.042 0.33226 0 0.03111 45.042 Q DGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TVQ(0.003)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0.332)N(0.332)YIQ(0.332)TLGR TVQ(-20.13)PVAMGPDGLPVDASSVSN(0)N(0)YIQ(0)TLGR 25 3 4.3724 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 790 257 176 176 4674 5302 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 14972 15731 20190821_JH_WT_Ubi 12804 sp|P41567|EIF1_HUMAN;sp|O60739|EIF1B_HUMAN 48;48 sp|P41567|EIF1_HUMAN sp|P41567|EIF1_HUMAN sp|P41567|EIF1_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1 PE=1 SV=1;sp|O60739|EIF1B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 1b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1B PE=1 SV=2 1 76.9272 0.0141754 76.927 45.056 76.927 1 76.9272 0.0141754 76.927 Q IRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX TLTTVQ(1)GIADDYDK TLTTVQ(76.93)GIADDYDK 6 2 2.8352 6626300 6626300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 6626300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6626300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 791 258 48 48 4513 5123 14394 15132 14394 15132 20190902_JH_WT_Ubi_2 10577 14394 15132 20190902_JH_WT_Ubi_2 10577 14394 15132 20190902_JH_WT_Ubi_2 10577 sp|O60880-4|SH21A_HUMAN;sp|O60880|SH21A_HUMAN 92;92 sp|O60880-4|SH21A_HUMAN sp|O60880-4|SH21A_HUMAN sp|O60880-4|SH21A_HUMAN Isoform D of SH2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D1A;sp|O60880|SH21A_HUMAN SH2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D1A PE=1 SV=1 1 50.305 0.0294601 50.305 22.455 50.305 1 50.305 0.0294601 50.305 2 Q FRKIKNLISAFQKPDQGIVIPLQYPVEKKSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX PDQ(1)GIVIPLQ(1)YPVEKK PDQ(50.3)GIVIPLQ(50.3)YPVEKK 3 3 0.47304 668580 0 668580 0 NaN 668580 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 668580 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 792 263 92 92 3318 3791 10645 11203 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 sp|O60880-4|SH21A_HUMAN;sp|O60880|SH21A_HUMAN 99;99 sp|O60880-4|SH21A_HUMAN sp|O60880-4|SH21A_HUMAN sp|O60880-4|SH21A_HUMAN Isoform D of SH2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D1A;sp|O60880|SH21A_HUMAN SH2 domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D1A PE=1 SV=1 1 50.305 0.0294601 50.305 22.455 50.305 1 50.305 0.0294601 50.305 2 Q ISAFQKPDQGIVIPLQYPVEKKSSARSTQGI X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX PDQ(1)GIVIPLQ(1)YPVEKK PDQ(50.3)GIVIPLQ(50.3)YPVEKK 10 3 0.47304 668580 0 668580 0 NaN 668580 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 668580 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 793 263 99 99 3318 3791 10645 11203 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 10645 11203 20190821_JH_EV_Ubi 13906 sp|P61567|ENK7_HUMAN;sp|P61566|ENK24_HUMAN;sp|P61570|ENK25_HUMAN;sp|Q9UKH3|ENK9_HUMAN;sp|P61565|ENK21_HUMAN;sp|Q902F9|EN113_HUMAN;sp|Q902F8|ENK8_HUMAN;sp|Q69384|ENK6_HUMAN;sp|O71037|ENK19_HUMAN;sp|P63135|POK7_HUMAN 409;409;520;519;519;520;520;520;520;1280 sp|P61567|ENK7_HUMAN sp|P61567|ENK7_HUMAN sp|P61567|ENK7_HUMAN Endogenous retrovirus group K member 7 Env polyprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERVK-7 PE=2 SV=1;sp|P61566|ENK24_HUMAN Endogenous retrovirus group K member 24 Env polyprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERVK-24 PE=2 SV=1;sp|P61570|ENK 0.801967 5.58438 0.019471 68.243 14.678 68.243 0.801967 5.58438 0.019471 68.243 2 Q QKNSTRLWNSQSSIDQKLANQINDLRQTVIW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LWN(0.001)SQ(0.001)SSIDQ(0.802)KLAN(0.394)Q(0.127)IN(0.675)DLR LWN(-26.73)SQ(-30.39)SSIDQ(5.58)KLAN(-3.22)Q(-8.66)IN(3.22)DLR 10 3 2.0697 70869000 0 70869000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 70869000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70869000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 794 266 409 409 2866 3249 9235 9720 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 9235 9720 20190902_JH_WT_Ubi_3 11651 sp|O75192-2|PX11A_HUMAN;sp|O75192|PX11A_HUMAN 210;241 sp|O75192-2|PX11A_HUMAN sp|O75192-2|PX11A_HUMAN sp|O75192-2|PX11A_HUMAN Isoform 2 of Peroxisomal membrane protein 11A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEX11A;sp|O75192|PX11A_HUMAN Peroxisomal membrane protein 11A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEX11A PE=1 SV=1 0.728571 4.28816 0.035097 40.519 17.042 40.519 0.728571 4.28816 0.035097 40.519 1 Q GLVSSIAGMITVAYPQMKLKTR_________ X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX SN(0.271)PGIIGLGGLVSSIAGMITVAYPQ(0.729)MK SN(-4.29)PGIIGLGGLVSSIAGMITVAYPQ(4.29)MK 25 3 -3.8966 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 795 275 210 210 4092 4645 12937 13565 12937 13565 20190821_JH_WT_Ubi 15990 12937 13565 20190821_JH_WT_Ubi 15990 12937 13565 20190821_JH_WT_Ubi 15990 sp|O75369-2|FLNB_HUMAN;sp|O75369-9|FLNB_HUMAN;sp|O75369|FLNB_HUMAN;sp|O75369-8|FLNB_HUMAN;sp|O75369-7|FLNB_HUMAN;sp|O75369-6|FLNB_HUMAN;sp|O75369-3|FLNB_HUMAN 2150;2163;2174;2205;1994;2109;2133 sp|O75369-2|FLNB_HUMAN sp|O75369-2|FLNB_HUMAN sp|O75369-2|FLNB_HUMAN Isoform 2 of Filamin-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNB;sp|O75369-9|FLNB_HUMAN Isoform 9 of Filamin-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNB;sp|O75369|FLNB_HUMAN Filamin-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNB PE=1 SV=2;sp|O75369-8|FLNB_HUMAN Isof 0.560252 1.0518 0.0275695 42.309 14.813 42.309 0.560252 1.0518 0.0275695 42.309 Q PQEMGVHTVSVKYRGQHVTGSPFQFTVGPLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP GQ(0.56)HVTGSPFQ(0.44)FTVGPLGEGGAHK GQ(1.05)HVTGSPFQ(-1.05)FTVGPLGEGGAHK 2 4 1.4692 1887300 1887300 0 0 0.018021 0 0 0 0 0 1887300 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1887300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 796 282 2150 2150 1668 1900 5326 5607 5326 5607 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9784 5326 5607 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9784 5326 5607 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9784 sp|O94804|STK10_HUMAN 760 sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK10 PE=1 SV=1 0.997669 24.0186 0.0347783 48.794 9.7723 48.794 0.997669 24.0186 0.0347783 48.794 Q EMEEHQLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX Q(0.998)Q(0.998)LKDQ(0.412)YFLQ(0.593)R Q(24.02)Q(24.02)LKDQ(-1.6)YFLQ(1.6)R 1 2 -0.27092 2134000 0 0 2134000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 797 315 760 760 3690 4201 11761 12342 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 sp|O94804|STK10_HUMAN 761 sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK10 PE=1 SV=1 0.997669 24.0186 0.0347783 48.794 9.7723 48.794 0.997669 24.0186 0.0347783 48.794 Q MEEHQLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXX Q(0.998)Q(0.998)LKDQ(0.412)YFLQ(0.593)R Q(24.02)Q(24.02)LKDQ(-1.6)YFLQ(1.6)R 2 2 -0.27092 2134000 0 0 2134000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 798 315 761 761 3690 4201 11761 12342 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 sp|O94804|STK10_HUMAN 769 sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN sp|O94804|STK10_HUMAN Serine/threonine-protein kinase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK10 PE=1 SV=1 0.592785 1.59644 0.0347783 48.794 9.7723 48.794 0.592785 1.59644 0.0347783 48.794 Q RHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQM X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(0.998)Q(0.998)LKDQ(0.412)YFLQ(0.593)R Q(24.02)Q(24.02)LKDQ(-1.6)YFLQ(1.6)R 10 2 -0.27092 2134000 0 0 2134000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2134000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 799 315 769 769 3690 4201 11761 12342 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 11761 12342 20190902_JH_WT_Ubi_3 14571 sp|O94885|SASH1_HUMAN 974 sp|O94885|SASH1_HUMAN sp|O94885|SASH1_HUMAN sp|O94885|SASH1_HUMAN SAM and SH3 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SASH1 PE=1 SV=3 1 47.6028 0.0328604 47.603 19.778 47.603 1 47.6028 0.0328604 47.603 Q GTHHPLGTKEGVDAEQRMQPKIPSQPPPVPA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EGVDAEQ(1)RMQ(1)PK EGVDAEQ(47.6)RMQ(47.6)PK 7 2 0.12853 2721600 0 2721600 0 NaN 0 0 0 0 2721600 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2721600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 800 318 974 974 912 1032 2885 3038 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 sp|O94885|SASH1_HUMAN 977 sp|O94885|SASH1_HUMAN sp|O94885|SASH1_HUMAN sp|O94885|SASH1_HUMAN SAM and SH3 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SASH1 PE=1 SV=3 1 47.6028 0.0328604 47.603 19.778 47.603 1 47.6028 0.0328604 47.603 Q HPLGTKEGVDAEQRMQPKIPSQPPPVPAKKS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX EGVDAEQ(1)RMQ(1)PK EGVDAEQ(47.6)RMQ(47.6)PK 10 2 0.12853 2721600 0 2721600 0 NaN 0 0 0 0 2721600 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2721600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 801 318 977 977 912 1032 2885 3038 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 2885 3038 20190902_JH_EV_Ubi_3 5845 sp|O94973-3|AP2A2_HUMAN;sp|O94973|AP2A2_HUMAN;sp|O94973-2|AP2A2_HUMAN 199;199;199 sp|O94973-3|AP2A2_HUMAN sp|O94973-3|AP2A2_HUMAN sp|O94973-3|AP2A2_HUMAN Isoform 3 of AP-2 complex subunit alpha-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A2;sp|O94973|AP2A2_HUMAN AP-2 complex subunit alpha-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A2 PE=1 SV=2;sp|O94973-2|AP2A2_HUMAN Isoform 2 of AP-2 complex subunit alpha 0.52162 0.378388 0.0189055 48.867 33.924 48.867 0.52162 0.378388 0.0189055 48.867 1 Q PMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VVHLLN(0.478)DQ(0.522)HLGVVTAATSLITTLAQK VVHLLN(-0.38)DQ(0.38)HLGVVTAATSLITTLAQ(-32.64)K 8 4 -0.037168 9856100 9856100 0 0 0.066734 0 0 9856100 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.12233 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9856100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 802 325 199 199 5056 5746 16319 17152 16319 17152 20190821_JH_WT_Ubi 15153 16319 17152 20190821_JH_WT_Ubi 15153 16319 17152 20190821_JH_WT_Ubi 15153 sp|O95183|VAMP5_HUMAN 56 sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP5 PE=1 SV=1 0.857489 5.7505 0.00681761 59.975 7.6574 59.975 0.857489 5.7505 0.00681761 59.975 3 Q SDQLLDMSSTFNKTTQNLAQKKCWENIRYRI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SDQ(0.002)LLDMSSTFN(0.467)KTTQ(0.857)N(0.836)LAQ(0.836)KK SDQ(-28.5)LLDMSSTFN(-5.14)KTTQ(5.75)N(5.14)LAQ(5.14)KK 16 3 -3.052 11314000 0 0 11314000 0.21392 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 2.7961 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 803 329 56 56 3859;3860 4383;4385 12234 12830 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 sp|O95183|VAMP5_HUMAN 60 sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN sp|O95183|VAMP5_HUMAN Vesicle-associated membrane protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VAMP5 PE=1 SV=1 0.836356 5.14122 0.00681761 59.975 7.6574 59.975 0.836356 5.14122 0.00681761 59.975 3 Q LDMSSTFNKTTQNLAQKKCWENIRYRICVGL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX SDQ(0.002)LLDMSSTFN(0.467)KTTQ(0.857)N(0.836)LAQ(0.836)KK SDQ(-28.5)LLDMSSTFN(-5.14)KTTQ(5.75)N(5.14)LAQ(5.14)KK 20 3 -3.052 11314000 0 0 11314000 0.21392 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 2.7961 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11314000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 804 329 60 60 3859;3860 4383;4385 12234 12830 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 12234 12830 20190902_JH_WT_Ubi_2 9943 sp|O95379|TFIP8_HUMAN 24 sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNFAIP8 PE=1 SV=1 0.996779 23.2966 0.0210772 55.097 11.306 55.097 0.996779 23.2966 0.0210772 55.097 Q KEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EVATDVFN(0.186)SKN(0.82)LAVQ(0.997)AQ(0.997)KK EVATDVFN(-6.67)SKN(6.67)LAVQ(23.3)AQ(23.86)KK 15 3 3.6492 1432500 0 0 1432500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 805 342 24 24 1127 1269 3583 3768 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 sp|O95379|TFIP8_HUMAN 26 sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN sp|O95379|TFIP8_HUMAN Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNFAIP8 PE=1 SV=1 0.997093 23.8641 0.0210772 55.097 11.306 55.097 0.997093 23.8641 0.0210772 55.097 Q VATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATT X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX EVATDVFN(0.186)SKN(0.82)LAVQ(0.997)AQ(0.997)KK EVATDVFN(-6.67)SKN(6.67)LAVQ(23.3)AQ(23.86)KK 17 3 3.6492 1432500 0 0 1432500 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1432500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 806 342 26 26 1127 1269 3583 3768 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 3583 3768 20190902_JH_WT_Ubi_3 14051 sp|O95436|NPT2B_HUMAN;sp|O95436-2|NPT2B_HUMAN 24;24 sp|O95436|NPT2B_HUMAN sp|O95436|NPT2B_HUMAN sp|O95436|NPT2B_HUMAN Sodium-dependent phosphate transport protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC34A2 PE=1 SV=3;sp|O95436-2|NPT2B_HUMAN Isoform 2 of Sodium-dependent phosphate transport protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC34A2 0.767055 5.18525 0.00523629 89.232 54.028 89.232 0.767055 5.18525 0.00523629 89.232 1 Q DAQPNPDKYLEGAAGQQPTAPDKSKETNKTD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX YLEGAAGQ(0.767)Q(0.233)PTAPDKSK YLEGAAGQ(5.19)Q(-5.19)PTAPDKSK 8 3 1.3871 1229700 1229700 0 0 0.032608 0 0 0 0 1229700 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1229700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 807 343 24 24 5166 5875 16651 17501 16651 17501 20190902_JH_EV_Ubi_3 5174 16651 17501 20190902_JH_EV_Ubi_3 5174 16651 17501 20190902_JH_EV_Ubi_3 5174 sp|O95800|GPR75_HUMAN 438 sp|O95800|GPR75_HUMAN sp|O95800|GPR75_HUMAN sp|O95800|GPR75_HUMAN Probable G-protein coupled receptor 75 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPR75 PE=1 SV=1 1 42.0954 0.0349554 42.095 6.5726 42.095 1 42.0954 0.0349554 42.095 2 Q SHHETNSAYMLSPKPQKKFVDQACGPSHSKE X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX SSHHETN(1)SAYMLSPKPQ(1)KK SSHHETN(42.1)SAYMLSPKPQ(42.1)KK 17 2 4.1997 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 808 358 438 438 4163 4730 13189 13832 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 13189 13832 20190902_JH_MUT_Ubi_2 16868 sp|O95841|ANGL1_HUMAN 95 sp|O95841|ANGL1_HUMAN sp|O95841|ANGL1_HUMAN sp|O95841|ANGL1_HUMAN Angiopoietin-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANGPTL1 PE=2 SV=1 1 53.001 0.025164 53.001 16.556 53.001 1 53.001 0.025164 53.001 Q ITRMDLENLKDVLSRQKREIDVLQLVVDVDG X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX MDLEN(1)LKDVLSRQ(1)K MDLEN(53)LKDVLSRQ(53)K 13 3 4.0116 4215700 0 4215700 0 NaN 0 0 4215700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4215700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 809 366 95 95 2883 3272 9284 9770 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 9284 9770 20190821_JH_WT_Ubi 10339 sp|P00533|EGFR_HUMAN 1056 sp|P00533|EGFR_HUMAN sp|P00533|EGFR_HUMAN sp|P00533|EGFR_HUMAN Epidermal growth factor receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EGFR PE=1 SV=2 0.910459 10.0724 1.31378E-06 125.33 78.294 125.33 0.910459 10.0724 1.31378E-06 125.33 0.572596 1.2701 0.00158604 105.53 0.590189 1.58408 0.000216169 114.21 1 Q TSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.09)GLQ(0.91)SCPIKEDSFLQR N(-10.07)GLQ(10.07)SCPIKEDSFLQ(-88.8)R 4 3 0.58917 19756000 19756000 0 0 2.6262 0 0 0 0 6872600 0 5533900 0 7349400 0 NaN NaN NaN NaN 0 3.9393 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6872600 0 0 0 0 0 5533900 0 0 0 0 0 7349400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 810 382 1056 1056 3070 3514 9924;9927;9928 10455;10458;10459 9924 10455 20190902_JH_EV_Ubi_3 9328 9924 10455 20190902_JH_EV_Ubi_3 9328 9924 10455 20190902_JH_EV_Ubi_3 9328 sp|P01270|PTHY_HUMAN 37 sp|P01270|PTHY_HUMAN sp|P01270|PTHY_HUMAN sp|P01270|PTHY_HUMAN Parathyroid hormone OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTH PE=1 SV=1 0.999999 61.5834 0.0315189 87.713 34.923 87.713 0.999999 61.5834 0.0315189 87.713 1 Q KSDGKSVKKRSVSEIQLMHNLGKHLNSMERV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SVSEIQ(1)LMHNLGK SVSEIQ(61.58)LMHN(-61.58)LGK 6 3 -1.1113 1386100 1386100 0 0 NaN 0 1386100 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 1386100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 811 386 37 37 4218 4789 13341 13995 13341 13995 20190821_JH_MUT_Ubi 10569 13341 13995 20190821_JH_MUT_Ubi 10569 13341 13995 20190821_JH_MUT_Ubi 10569 sp|P01833|PIGR_HUMAN 600 sp|P01833|PIGR_HUMAN sp|P01833|PIGR_HUMAN sp|P01833|PIGR_HUMAN Polymeric immunoglobulin receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIGR PE=1 SV=4 1 51.9491 0.031999 51.949 14.884 51.949 1 51.9491 0.031999 51.949 Q KVLDSGFREIENKAIQDPRLFAEEKAVADTR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EIEN(1)KAIQ(1)DPR EIEN(51.95)KAIQ(51.95)DPR 8 2 2.7578 356140 0 356140 0 NaN 0 0 0 0 0 356140 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 356140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 812 387 600 600 934 1055 2943 3096 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 2943 3096 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11140 sp|P02786|TFR1_HUMAN 28 sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN sp|P02786|TFR1_HUMAN Transferrin receptor protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFRC PE=1 SV=2 0.48309 0 5.64465E-07 107.85 80.303 107.85 0.48309 0 5.64465E-07 107.85 Q FGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.483)VDGDN(0.483)SHVEMKLAVDEEEN(0.771)ADN(0.194)N(0.069)TK Q(0)VDGDN(0)SHVEMKLAVDEEEN(6.65)ADN(-6.65)N(-11.07)TK 1 3 2.3635 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 813 393 28 28 3711 4224;4225 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 11797 12378 20190902_JH_WT_Ubi_2 9194 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN 12;66 sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA 0.999623 34.2363 0.00804022 103.08 25.55 103.08 0.999623 34.2363 0.00804022 103.08 1 Q ____MPYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX PYQYPALTPEQ(1)K PYQ(-34.24)YPALTPEQ(34.24)K 11 2 0.78591 7029300 7029300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7029300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7029300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 814 400 12 12 3594 4102 11576 12153 11576 12153 20190902_JH_WT_Ubi_2 9708 11576 12153 20190902_JH_WT_Ubi_2 9708 11576 12153 20190902_JH_WT_Ubi_2 9708 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN 179;233;179 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA;sp|P09972|ALDOC_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase C 0.558061 0 0.00063262 77.693 24.352 77.231 0.333333 0 0.00063262 77.693 0.558061 0 0.00138346 77.231 2 Q ILENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPD;IMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPD X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YASICQ(0.558)Q(0.558)N(0.884)GIVPIVEPEILPDGDHDLK YASICQ(0)Q(0)N(5.8)GIVPIVEPEILPDGDHDLK 6 3 0.52162 1893800 0 1893800 0 1.046 0 0 0 0 0 0 0 1893800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1893800 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 815 400;498 179;179 179 5104;5105 5802;5803;5805 16466 17305;17306 16466 17306 20190902_JH_WT_Ubi_2 14730 16462 17300 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13774 16462 17300 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13774 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN 180;234;180 sp|P04075|ALDOA_HUMAN;sp|P09972|ALDOC_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN sp|P04075|ALDOA_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA PE=1 SV=2;sp|P04075-2|ALDOA_HUMAN Isoform 2 of Fructose-bisphosphate aldolase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDOA;sp|P09972|ALDOC_HUMAN Fructose-bisphosphate aldolase C 0.82097 6.38109 1.87671E-07 99.097 65.647 99.097 0.433598 0 0.000391723 81.38 0.333333 0 0.00063262 77.693 0.558061 0 0.00138346 77.231 0.82097 6.38109 1.87671E-07 99.097 2 Q LENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDG;MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDG Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YASICQ(0.222)Q(0.821)N(0.957)GIVPIVEPEILPDGDHDLK YASICQ(-6.38)Q(6.38)N(12.59)GIVPIVEPEILPDGDHDLK 7 3 0.35932 5686200 0 5686200 0 3.1407 0 0 0 0 0 0 0 1893800 3792500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2.0947 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1893800 0 0 3792500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 816 400;498 180;180 180 5104;5105 5802;5803;5805 16466;16467 17305;17306;17307 16467 17307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14227 16467 17307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14227 16467 17307 20190902_JH_WT_Ubi_3 14227 sp|P04114|APOB_HUMAN 2261 sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN Apolipoprotein B-100 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APOB PE=1 SV=2 0.899529 9.4766 0.00864367 78.903 32.84 60.49 0.89074 9.03904 0.00864367 78.903 0.899529 9.4766 0.0231708 60.49 Q ASWIQNVDTKYQIRIQIQEKLQQLKRHIQNI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX IQ(0.9)IQ(0.109)EKLQ(0.995)Q(0.996)LKR IQ(9.48)IQ(-9.48)EKLQ(22.47)Q(23.64)LKR 2 3 2.4032 574040 0 0 574040 NaN 0 0 0 303920 270120 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 303920 0 0 270120 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 817 403 2261 2261 2242 2552 7357;7358 7736;7737 7358 7737 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 sp|P04114|APOB_HUMAN 2267 sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN Apolipoprotein B-100 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APOB PE=1 SV=2 0.994955 22.4687 0.00864367 78.903 32.84 60.49 0.986932 18.2614 0.00864367 78.903 0.994955 22.4687 0.0231708 60.49 Q VDTKYQIRIQIQEKLQQLKRHIQNIDIQHLA X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX IQ(0.9)IQ(0.109)EKLQ(0.995)Q(0.996)LKR IQ(9.48)IQ(-9.48)EKLQ(22.47)Q(23.64)LKR 8 3 2.4032 574040 0 0 574040 NaN 0 0 0 303920 270120 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 303920 0 0 270120 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 818 403 2267 2267 2242 2552 7357;7358 7736;7737 7358 7737 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 sp|P04114|APOB_HUMAN 2268 sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN sp|P04114|APOB_HUMAN Apolipoprotein B-100 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APOB PE=1 SV=2 0.998045 26.5121 0.00864367 78.903 32.84 78.903 0.998045 26.5121 0.00864367 78.903 0.99615 23.6427 0.0231708 60.49 Q DTKYQIRIQIQEKLQQLKRHIQNIDIQHLAG X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX IQ(0.891)IQ(0.124)EKLQ(0.987)Q(0.998)LKR IQ(9.04)IQ(-9.04)EKLQ(18.26)Q(26.51)LKR 9 3 1.1622 574040 0 0 574040 NaN 0 0 0 303920 270120 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 303920 0 0 270120 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 819 403 2268 2268 2242 2552 7357;7358 7736;7737 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 7357 7736 20190902_JH_EV_Ubi_2 7171 sp|P04406|G3P_HUMAN;sp|P04406-2|G3P_HUMAN 185;143 sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN sp|P04406|G3P_HUMAN Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH PE=1 SV=3;sp|P04406-2|G3P_HUMAN Isoform 2 of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GAPDH 1 151.165 3.10906E-46 185.3 160.41 185.3 1 79.3984 3.40628E-22 134.42 1 98.1627 1.33225E-16 139.04 0.866774 8.13317 0.0171557 54.047 0.960271 13.8329 0.0123275 46.569 1 151.165 3.10906E-46 185.3 1 Q IVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKLWRDGR X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQ(1)K VIHDN(-151.17)FGIVEGLMTTVHAITATQ(151.17)K 23 3 1.6621 250990000 250990000 0 0 0.024517 0 1671600 0 0 4318500 0 0 0 29472000 0 0.00049224 0 0 0.031389 0 0 0 0.085038 0 0 0 1671600 0 0 0 0 0 0 0 0 4318500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29472000 0 0 NaN NaN NaN 0.10071 0.11199 0.70342 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.90999 10.11 2.5042 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.72984 2.7015 0.94129 0.91006 10.119 1.1036 820 407 185 185 4856 5512;5513 15593;15594;15595;15597;15598;15599;15600;15602 16387;16388;16389;16390;16392;16393;16394;16395;16397 15598 16393 20190902_JH_WT_Ubi_3 13453 15598 16393 20190902_JH_WT_Ubi_3 13453 15598 16393 20190902_JH_WT_Ubi_3 13453 sp|P04632|CPNS1_HUMAN 75 sp|P04632|CPNS1_HUMAN sp|P04632|CPNS1_HUMAN sp|P04632|CPNS1_HUMAN Calpain small subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAPNS1 PE=1 SV=1 0.999945 42.6197 1.08301E-12 134.58 106.68 134.58 0.999945 42.6197 1.08301E-12 134.58 1 Q RILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX ILGGVISAISEAAAQ(1)YNPEPPPPR ILGGVISAISEAAAQ(42.62)YN(-42.62)PEPPPPR 15 3 1.5476 385500 385500 0 0 0.0066598 0 0 0 0 0 385500 0 0 0 0 0 0 0 0 0.082706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 385500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 821 410 75 75 2194 2501 7243 7619 7243 7619 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14827 7243 7619 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14827 7243 7619 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14827 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN;sp|P04908|H2A1B_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN;sp|Q96KK5|H2A1H_HUMAN;sp|Q9BTM1|H2AJ_HUMAN;sp|Q16777|H2A2C_HUMAN;sp|Q6FI13|H2A2A_HUMAN;sp|P20671|H2A1D_HUMAN;sp|P0C0S8|H2A1_HUMAN 105;105;105;105;105;105;105;105;105;105 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q93077|H2A1C_HUMAN Histone H2A type 1-C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AC PE=1 SV=3;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN Histone H2A type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST3H2A PE=1 SV=3;sp|P04908|H2A1B_HUMAN Histone H2A type 1-B/E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2A 1 63.5435 6.36627E-48 200.81 188.3 200.81 0.99844 30.2351 7.4677E-05 102.73 0.999987 49.0544 2.13455E-23 165.66 0.999989 51.2313 1.89954E-19 158.92 1 63.5435 6.36627E-48 200.81 0.999976 45.9777 7.77438E-39 183.88 0.99999 50.0074 8.03031E-10 134.4 0.999998 57.3294 7.93601E-24 169.06 1;2 Q NDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKK;NDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKK X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VTIAQ(1)GGVLPNIQAVLLPK VTIAQ(63.54)GGVLPN(-63.54)IQ(-104.38)AVLLPK 5 3 1.1754 1606700000 1542600000 64122000 0 0.038112 0 0 0 39444000 55946000 420880000 409310000 111010000 529960000 0 0 0 0.045078 0.040394 2.9579 0.27542 1.7744 5.8465 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38170000 1273500 0 53283000 2663000 0 420880000 0 0 392060000 17251000 0 111010000 0 0 505220000 24738000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 822 416;499 105;105 105 5028;5029 5707;5710;5711 16164;16165;16166;16167;16200;16202;16207;16210;16214;16216;16219;16220;16221;16222;16223;16225;16226 16980;16981;16982;16983;17021;17023;17029;17035;17041;17042;17044;17047;17048;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17056;17057 16164 16980 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14841 16164 16980 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14841 16164 16980 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14841 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN;sp|P04908|H2A1B_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN;sp|Q96KK5|H2A1H_HUMAN;sp|Q9BTM1|H2AJ_HUMAN;sp|Q16777|H2A2C_HUMAN;sp|Q6FI13|H2A2A_HUMAN;sp|P20671|H2A1D_HUMAN;sp|P0C0S8|H2A1_HUMAN 113;113;113;113;113;113;113;113;113;113 sp|Q93077|H2A1C_HUMAN;sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q99878|H2A1J_HUMAN sp|Q93077|H2A1C_HUMAN Histone H2A type 1-C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AC PE=1 SV=3;sp|Q7L7L0|H2A3_HUMAN Histone H2A type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST3H2A PE=1 SV=3;sp|P04908|H2A1B_HUMAN Histone H2A type 1-B/E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2A 0.999311 31.6021 6.49935E-39 185.71 176.89 133.96 0.695046 4.35966 0.00267922 75.143 0.987253 18.953 2.61143E-09 127.91 0.997008 25.2109 1.15183E-08 124.45 0.938875 11.8849 6.49935E-39 185.71 0.999311 31.6021 6.31708E-10 133.96 0.849817 4.72242 1.97387E-06 111.63 1;2 Q LGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKTK;LGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAK X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX VTIAQ(0.028)GGVLPN(0.972)IQ(0.999)AVLLPKK VTIAQ(-17.9)GGVLPN(17.9)IQ(31.6)AVLLPKK 13 3 1.5252 624520000 546220000 78307000 0 0.014814 0 510470 0 25810000 77055000 0 298010000 146680000 24738000 0 3.2606E-05 0 0.029497 0.055635 0 0.20053 2.3446 0.27291 0 0 0 510470 0 0 0 0 0 24537000 1273500 0 74392000 2663000 0 0 0 0 280760000 17251000 0 132490000 14185000 0 0 24738000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 823 416;499 113;113 113 5028;5029 5707;5710;5711 16201;16203;16204;16205;16211;16215;16220;16221;16222;16223;16224;16225;16226 17022;17024;17025;17026;17036;17043;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057 16224 17055 20190902_JH_WT_Ubi_2 14736 16211 17036 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12637 16211 17036 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12637 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN;sp|P05023|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-3|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-2|AT1A1_HUMAN 528;528;497;528 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN Isoform 4 of Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1;sp|P05023|AT1A1_HUMAN Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1;sp|P05023-3|A 1 73.5933 0.000180897 109.48 52.606 73.593 1 97.7666 0.00117163 97.767 1 109.477 0.000180897 109.48 1 73.5933 0.0158223 73.593 1 Q RILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX CSSILLHGKEQ(1)PLDEELK CSSILLHGKEQ(73.59)PLDEELK 11 3 -0.39448 37289000 37289000 0 0 2.9819 0 5136400 0 0 0 0 0 19396000 12756000 0 1.0144 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 5136400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19396000 0 0 12756000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 824 418 528 528 364 433 1210;1211;1212 1297;1298;1299 1212 1299 20190902_JH_WT_Ubi_3 9386 1211 1298 20190902_JH_WT_Ubi_2 9842 1211 1298 20190902_JH_WT_Ubi_2 9842 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN;sp|P05023|AT1A1_HUMAN;sp|P05023-2|AT1A1_HUMAN 18;18;18 sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN sp|P05023-4|AT1A1_HUMAN Isoform 4 of Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1;sp|P05023|AT1A1_HUMAN Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP1A1 PE=1 SV=1;sp|P05023-2|A 1 75.5888 0.030259 75.589 38.34 75.589 1 75.5888 0.030259 75.589 1 Q FKVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMD X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX YEPAAVSEQ(1)GDKK YEPAAVSEQ(75.59)GDKK 9 3 1.3771 2503200 2503200 0 0 0.010277 0 0 0 0 0 0 0 0 2503200 0 0 0 0 0 0 0 0 0.077657 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2503200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 825 418 18 18 5125 5829 16539 17382 16539 17382 20190902_JH_WT_Ubi_3 5212 16539 17382 20190902_JH_WT_Ubi_3 5212 16539 17382 20190902_JH_WT_Ubi_3 5212 sp|P05067-10|A4_HUMAN;sp|P05067-3|A4_HUMAN;sp|P05067-4|A4_HUMAN;sp|P05067-5|A4_HUMAN;sp|P05067-6|A4_HUMAN;sp|P05067-7|A4_HUMAN;sp|P05067-11|A4_HUMAN;sp|P05067-8|A4_HUMAN;sp|P05067-9|A4_HUMAN;sp|P05067|A4_HUMAN 623;661;679;680;698;717;730;735;736;754 sp|P05067-10|A4_HUMAN sp|P05067-10|A4_HUMAN sp|P05067-10|A4_HUMAN Isoform APP639 of Amyloid-beta A4 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APP;sp|P05067-3|A4_HUMAN Isoform L-APP677 of Amyloid-beta A4 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APP;sp|P05067-4|A4_HUMAN Isoform APP695 of Amyloid-beta A4 protein OS 0.482449 0 0.00695355 91.789 54.144 91.789 0.482449 0 0.00695355 91.789 Q DAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HLSKMQ(0.008)Q(0.482)N(0.482)GYEN(0.027)PTYK HLSKMQ(-17.99)Q(0)N(0)GYEN(-12.45)PTYK 7 3 0.17535 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 826 420 623 623 1932 2197;2198 6273 6600 20190902_JH_EV_Ubi_2 4208 6273 6600 20190902_JH_EV_Ubi_2 4208 6273 6600 20190902_JH_EV_Ubi_2 4208 sp|P05783|K1C18_HUMAN 337 sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT18 PE=1 SV=2 0.435531 0 0.00512375 62.167 35.318 62.167 0.435531 0 0.00512375 62.167 Q NSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YALQ(0.116)MEQ(0.436)LN(0.436)GILLHLESELAQ(0.013)TR YALQ(-5.74)MEQ(0)LN(0)GILLHLESELAQ(-15.33)TR 7 3 -0.37168 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 827 430 337 337 5101 5797;5799 16452 17289 20190821_JH_WT_Ubi 15021 16452 17289 20190821_JH_WT_Ubi 15021 16452 17289 20190821_JH_WT_Ubi 15021 sp|P05783|K1C18_HUMAN 285 sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN sp|P05783|K1C18_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT18 PE=1 SV=2 0.948724 15.6825 0.0061203 62.858 23.469 62.858 0.948724 15.6825 0.0061203 62.858 1 Q YWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP YWSQ(0.026)Q(0.026)IEESTTVVTTQ(0.949)SAEVGAAETTLTELR YWSQ(-15.68)Q(-15.68)IEESTTVVTTQ(15.68)SAEVGAAETTLTELR 16 3 -4.3659 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 828 430 285 285 5221 5945 16860 17726 16860 17726 20190821_JH_MUT_Ubi 13526 16860 17726 20190821_JH_MUT_Ubi 13526 16860 17726 20190821_JH_MUT_Ubi 13526 sp|P06576|ATPB_HUMAN 466 sp|P06576|ATPB_HUMAN sp|P06576|ATPB_HUMAN sp|P06576|ATPB_HUMAN ATP synthase subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1B PE=1 SV=3 0.539328 0.684608 0.0260842 55.782 11.991 55.782 0.539328 0.684608 0.0260842 55.782 1 Q KLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPX FLSQ(0.539)PFQ(0.461)VAEVFTGHMGK FLSQ(0.68)PFQ(-0.68)VAEVFTGHMGK 4 3 -0.18595 2048800 2048800 0 0 0.0077364 0 0 0 0 2048800 0 0 0 0 0 0 0 0 0.15004 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2048800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 829 433 466 466 1256 1421 3989 4197 3989 4197 20190902_JH_EV_Ubi_3 11504 3989 4197 20190902_JH_EV_Ubi_3 11504 3989 4197 20190902_JH_EV_Ubi_3 11504 sp|P06576|ATPB_HUMAN 469 sp|P06576|ATPB_HUMAN sp|P06576|ATPB_HUMAN sp|P06576|ATPB_HUMAN ATP synthase subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1B PE=1 SV=3 0.998639 28.6552 0.000645447 90.259 50.312 66.568 0.995575 23.5213 0.000645447 90.259 0.996076 24.0456 0.00685598 70.167 0.998639 28.6552 0.00968656 66.568 0.979798 16.8574 0.00506259 72.446 1 Q VSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGKLVPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX FLSQ(0.001)PFQ(0.999)VAEVFTGHMGK FLSQ(-28.66)PFQ(28.66)VAEVFTGHMGK 7 3 -0.36251 12553000 12553000 0 0 0.0474 0 0 0 1241600 0 2352200 0 2752300 6206400 0 0 0 0.079068 0 0.53843 0 0.066531 0.31134 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1241600 0 0 0 0 0 2352200 0 0 0 0 0 2752300 0 0 6206400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.69868 2.3187 1.7635 NaN NaN NaN 0.29094 0.41031 1.2804 0.61952 1.6283 2.105 830 433 469 469 1256 1421 3988;3990;3991;3992 4196;4198;4199;4200 3991 4199 20190902_JH_WT_Ubi_2 13833 3988 4196 20190902_JH_EV_Ubi_2 11492 3988 4196 20190902_JH_EV_Ubi_2 11492 sp|P07195|LDHB_HUMAN 31 sp|P07195|LDHB_HUMAN sp|P07195|LDHB_HUMAN sp|P07195|LDHB_HUMAN L-lactate dehydrogenase B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LDHB PE=1 SV=2 1 56.3465 0.00129348 93.237 61.806 56.347 1 93.2373 0.00129348 93.237 1 56.3465 0.0186047 56.347 1 Q EATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX ITVVGVGQ(1)VGMACAISILGK ITVVGVGQ(56.35)VGMACAISILGK 8 3 2.0713 842090 842090 0 0 0.0041002 0 0 0 0 0 842090 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.036087 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 842090 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 831 442 31 31 2284 2601 7514;7515 7901;7902 7515 7902 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12805 7514 7901 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14045 7514 7901 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14045 sp|P07237|PDIA1_HUMAN 243 sp|P07237|PDIA1_HUMAN sp|P07237|PDIA1_HUMAN sp|P07237|PDIA1_HUMAN Protein disulfide-isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P4HB PE=1 SV=3 0.999922 42.0355 0.0262134 80.411 43.473 80.411 0.999922 42.0355 0.0262134 80.411 1 Q FIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHIL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX HNQLPLVIEFTEQ(1)TAPK HN(-48.26)Q(-42.04)LPLVIEFTEQ(42.04)TAPK 13 3 2.4043 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 832 444 243 243 1959 2231 6375 6709 6375 6709 20190902_JH_EV_Ubi_3 11032 6375 6709 20190902_JH_EV_Ubi_3 11032 6375 6709 20190902_JH_EV_Ubi_3 11032 sp|P07355|ANXA2_HUMAN;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN 328;346;328 sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2 PE=1 SV=2;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN Isoform 2 of Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN Putative annexin A2-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2P2 PE=5 SV=2 0.996567 25.7218 0.00245016 101.75 68.129 75.316 0.847925 8.03682 0.00245016 101.75 0.996567 25.7218 0.0234476 75.316 1 Q KSLYYYIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD____ GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX SLYYYIQQ(0.003)DTKGDYQ(0.997)K SLYYYIQ(-38.72)Q(-25.72)DTKGDYQ(25.72)K 15 3 0.57601 14531000 14531000 0 0 0.035542 0 0 0 0 0 0 4805600 0 9725200 0 0 0 0 0 0 0.11248 0 0.22298 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4805600 0 0 0 0 0 9725200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.25677 0.34547 5.2524 NaN NaN NaN 0.40648 0.68485 4.8051 833 446 328 328 4066 4615 12878;12879 13504;13505 12879 13505 20190902_JH_WT_Ubi_3 9589 12878 13504 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8401 12878 13504 20190902_JH_MUT_Ubi_3 8401 sp|P07355|ANXA2_HUMAN;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN 141;159;141 sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2 PE=1 SV=2;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN Isoform 2 of Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN Putative annexin A2-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2P2 PE=5 SV=2 0.982025 19.9125 0.0300811 67.214 25.766 67.214 0.982025 19.9125 0.0300811 67.214 Q DSLIEIICSRTNQELQEINRVYKEMYKTDLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX TN(0.002)Q(0.006)ELQ(0.982)EIN(0.01)R TN(-27.28)Q(-22.06)ELQ(19.91)EIN(-19.91)R 6 2 -1.2582 1382400 1382400 0 0 0.070208 0 0 0 0 0 0 1382400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1382400 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 834 446 141 141 4533 5149 14463 15202 14463 15202 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5689 14463 15202 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5689 14463 15202 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5689 sp|P07355|ANXA2_HUMAN;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN 108;126;108 sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN sp|P07355|ANXA2_HUMAN Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2 PE=1 SV=2;sp|P07355-2|ANXA2_HUMAN Isoform 2 of Annexin A2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2;sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN Putative annexin A2-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANXA2P2 PE=5 SV=2 1 75.5657 0.0247937 75.566 30.585 75.566 1 75.5657 0.0247937 75.566 Q GHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX TPAQ(1)YDASELK TPAQ(75.57)YDASELK 4 2 1.4019 2996300 2996300 0 0 0.13497 0 0 0 0 0 0 2996300 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2996300 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 835 446 108 108 4541 5158 14479 15219 14479 15219 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6226 14479 15219 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6226 14479 15219 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6226 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN;sp|Q9BVA1|TBB2B_HUMAN;sp|Q13885|TBB2A_HUMAN 94;94;94;94;94 sp|P07437|TBB5_HUMAN;sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P07437|TBB5_HUMAN Tubulin beta chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB PE=1 SV=2;sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV= 0.994302 24.7695 3.0374E-33 165.41 131.15 156.41 0.533507 1.22287 3.0374E-33 165.41 0.994302 24.7695 1.14133E-25 156.41 1 Q GPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX SGPFGQIFRPDN(0.002)FVFGQ(0.994)SGAGN(0.003)N(0.001)WAK SGPFGQ(-59.06)IFRPDN(-27.46)FVFGQ(24.77)SGAGN(-24.77)N(-32.21)WAK 17 3 -0.74969 24336000 24336000 0 0 0.12135 0 0 14347000 0 0 0 0 9989400 0 NaN 0 0.19938 NaN 0 0 0 0.22537 0 0 0 0 0 0 0 14347000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9989400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 836 448;1099 94;94 94 3932 4465;4466 12457;12458 13068;13069 12458 13069 20190902_JH_WT_Ubi_2 14705 12457 13068 20190821_JH_WT_Ubi 13588 12457 13068 20190821_JH_WT_Ubi 13588 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-3|4F2_HUMAN;sp|P08195-4|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN 123;61;154;22 sp|P08195|4F2_HUMAN;sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195|4F2_HUMAN 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 PE=1 SV=3;sp|P08195-3|4F2_HUMAN Isoform 3 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2;sp|P08195-4|4F2_HUMAN Isoform 4 of 4F2 cell-surfa 0.476649 0 0.0301597 54.66 35.281 54.66 0.476649 0 0.0301597 54.66 Q VDMKEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGA X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EVELN(0.047)ELEPEKQ(0.477)PMN(0.476)AASGAAMSLAGAEK EVELN(-10.06)ELEPEKQ(0)PMN(0)AASGAAMSLAGAEK 12 3 0.17281 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 837 462;463 123;22 22 1132;1133;3683 1274;1278;1279;1280;4193;4194 3592 3779 20190902_JH_EV_Ubi_2 9507 3592 3779 20190902_JH_EV_Ubi_2 9507 3592 3779 20190902_JH_EV_Ubi_2 9507 sp|P08195-2|4F2_HUMAN 3 sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN sp|P08195-2|4F2_HUMAN Isoform 2 of 4F2 cell-surface antigen heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A2 1 138.08 5.27481E-60 207.16 172.31 174.19 0.960837 13.8998 0.00216926 63.998 0.999996 54.294 2.30109E-05 110.41 0.798268 5.97375 6.13777E-23 162.81 1 115.229 5.27481E-60 207.16 1 138.08 4.52795E-31 174.19 1 Q _____________MSQDTEVDMKEVELNELE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP SQ(1)DTEVDMKEVELNELEPEK SQ(138.08)DTEVDMKEVELN(-138.08)ELEPEK 2 3 2.6983 5247900 5247900 0 0 0.01437 907130 0 0 0 0 1115300 1890700 0 0 0.013245 0 0 0 0 0.038417 0.041441 0 0 907130 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1115300 0 0 1890700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 838 463 3 3 2971;4116 3388;4672;4674 9580;13015;13018;13019;13029;13030 10083;13647;13650;13651;13652;13664;13665 13019 13652 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10242 13018 13650 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11122 13018 13650 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11122 sp|P08684|CP3A4_HUMAN;sp|P24462|CP3A7_HUMAN;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN 273;273;273 sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN Cytochrome P450 3A4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A4 PE=1 SV=4;sp|P24462|CP3A7_HUMAN Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A7 PE=1 SV=2;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN Isoform 2 of Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 0.999737 32.7915 0.00647022 73.9 7.368 73.9 0.999737 32.7915 0.00647022 73.9 2 Q ESRLEDTQKHRVDFLQLMIDSQNSKETESHK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HRVDFLQ(1)LMIDSQ(0.5)N(0.5)SK HRVDFLQ(32.79)LMIDSQ(0)N(0)SK 7 2 -2.2754 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 839 475 273 273 1989 2265 6509 6848 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 sp|P08684|CP3A4_HUMAN;sp|P24462|CP3A7_HUMAN;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN 279;279;279 sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN sp|P08684|CP3A4_HUMAN Cytochrome P450 3A4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A4 PE=1 SV=4;sp|P24462|CP3A7_HUMAN Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYP3A7 PE=1 SV=2;sp|P24462-2|CP3A7_HUMAN Isoform 2 of Cytochrome P450 3A7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 0.500131 0 0.00647022 73.9 7.368 73.9 0.500131 0 0.00647022 73.9 2 Q TQKHRVDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX HRVDFLQ(1)LMIDSQ(0.5)N(0.5)SK HRVDFLQ(32.79)LMIDSQ(0)N(0)SK 13 2 -2.2754 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 840 475 279 279 1989 2265 6509 6848 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 6509 6848 20190821_JH_WT_Ubi 11900 sp|P08708|RS17_HUMAN 118 sp|P08708|RS17_HUMAN sp|P08708|RS17_HUMAN sp|P08708|RS17_HUMAN 40S ribosomal protein S17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS17 PE=1 SV=2 0.7586 4.98856 0.0244332 50.226 24.615 50.226 0.7586 4.98856 0.0244332 50.226 1 Q KEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRG X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX LLDFGSLSN(0.241)LQ(0.759)VTQ(0.001)PTVGMNFK LLDFGSLSN(-4.99)LQ(4.99)VTQ(-30.54)PTVGMN(-35.65)FK 11 3 -1.2798 856060 856060 0 0 0.022265 0 0 0 0 0 0 0 856060 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0.14841 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 856060 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 841 476 118 118 2675 3043 8692 9140 8692 9140 20190902_JH_WT_Ubi_2 15520 8692 9140 20190902_JH_WT_Ubi_2 15520 8692 9140 20190902_JH_WT_Ubi_2 15520 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN;sp|P09651-3|ROA1_HUMAN;sp|P09651|ROA1_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN 96;96;96;96 sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN sp|P09651-2|ROA1_HUMAN Isoform A1-A of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|P09651-3|ROA1_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1;sp|P09651|ROA1_HUMAN Hete 1 87.1843 0.00756267 87.184 22.344 87.184 1 87.1843 0.00756267 87.184 Q GRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EDSQ(1)RPGAHLTVK EDSQ(87.18)RPGAHLTVK 4 2 1.1097 819640 819640 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 819640 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 819640 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 842 492 96 96 831 937 2605 2742 2605 2742 20190902_JH_WT_Ubi_3 4898 2605 2742 20190902_JH_WT_Ubi_3 4898 2605 2742 20190902_JH_WT_Ubi_3 4898 sp|P09693|CD3G_HUMAN 91 sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD3G PE=1 SV=1 0.50089 0 0.00719175 82.85 30.479 61.11 0.50089 0 0.0348554 61.11 0.5 0 0.00719175 82.85 0.500644 0 0.0278647 64.65 2 Q SNAKDPRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXX GSQ(0.501)N(0.501)KSKPLQ(0.998)VYYR GSQ(0)N(0)KSKPLQ(24.48)VYYR 3 3 -0.086754 74910000 0 74910000 0 NaN 0 0 0 0 30770000 22688000 21452000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30770000 0 0 22688000 0 0 21452000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 843 494 91 91 1699 1936 5411;5412;5413 5696;5697;5698 5411 5696 20190902_JH_EV_Ubi_3 8213 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 sp|P09693|CD3G_HUMAN 98 sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN sp|P09693|CD3G_HUMAN T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD3G PE=1 SV=1 0.999999 58.4354 0.00719175 82.85 30.479 82.85 0.998221 24.4791 0.0348554 61.11 0.999999 58.4354 0.00719175 82.85 0.998711 25.8817 0.0278647 64.65 2 Q GMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNCIELNAA X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX GSQ(0.5)N(0.5)KSKPLQ(1)VYYR GSQ(0)N(0)KSKPLQ(58.44)VYYR 10 3 0.08013 74910000 0 74910000 0 NaN 0 0 0 0 30770000 22688000 21452000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30770000 0 0 22688000 0 0 21452000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 844 494 98 98 1699 1936 5411;5412;5413 5696;5697;5698 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 5412 5697 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8786 sp|P09758|TACD2_HUMAN 198 sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN Tumor-associated calcium signal transducer 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACSTD2 PE=1 SV=3 0.971636 16.6345 0.0313109 45.047 13.98 45.047 0.971636 16.6345 0.0313109 45.047 3 Q RYRLHPKFVAAVHYEQPTIQIELRQNTSQKA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX FVAAVHYEQ(0.972)PTIQ(0.249)IELRQ(0.247)N(0.766)TSQ(0.766)K FVAAVHYEQ(16.63)PTIQ(-8.8)IELRQ(-8.8)N(8.8)TSQ(8.8)K 9 3 -3.2206 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 845 495 198 198 1318 1493 4161 4373 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 sp|P09758|TACD2_HUMAN 211 sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN sp|P09758|TACD2_HUMAN Tumor-associated calcium signal transducer 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACSTD2 PE=1 SV=3 0.766304 8.80073 0.0313109 45.047 13.98 45.047 0.766304 8.80073 0.0313109 45.047 3 Q YEQPTIQIELRQNTSQKAAGDVDIGDAAYYF X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX FVAAVHYEQ(0.972)PTIQ(0.249)IELRQ(0.247)N(0.766)TSQ(0.766)K FVAAVHYEQ(16.63)PTIQ(-8.8)IELRQ(-8.8)N(8.8)TSQ(8.8)K 22 3 -3.2206 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 846 495 211 211 1318 1493 4161 4373 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 4161 4373 20190902_JH_EV_Ubi_3 11914 sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN;sp|P0C1Z6|TFPT_HUMAN 105;114 sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN Isoform 2 of TCF3 fusion partner OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFPT;sp|P0C1Z6|TFPT_HUMAN TCF3 fusion partner OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFPT PE=1 SV=1 1 51.5278 0.0331884 51.528 14.546 51.528 1 51.5278 0.0331884 51.528 Q VLNRLHQVQRITRRLQQERRFLMRVLDSYGD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXX LQ(1)Q(1)ERRFLMR LQ(51.53)Q(51.53)ERRFLMR 2 3 -0.98132 11385000 0 11385000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 11385000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11385000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 847 500 105 105 2791 3167 9012 9483 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN;sp|P0C1Z6|TFPT_HUMAN 106;115 sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN sp|P0C1Z6-2|TFPT_HUMAN Isoform 2 of TCF3 fusion partner OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFPT;sp|P0C1Z6|TFPT_HUMAN TCF3 fusion partner OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFPT PE=1 SV=1 1 51.5278 0.0331884 51.528 14.546 51.528 1 51.5278 0.0331884 51.528 Q LNRLHQVQRITRRLQQERRFLMRVLDSYGDD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX LQ(1)Q(1)ERRFLMR LQ(51.53)Q(51.53)ERRFLMR 3 3 -0.98132 11385000 0 11385000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 11385000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11385000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 848 500 106 106 2791 3167 9012 9483 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 9012 9483 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6450 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN 625;625;570 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1A PE=1 SV=1;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1B PE=1 SV=1;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock 70 kDa protein 1A 0.992866 22.0604 1.02009E-09 80.543 52.68 80.543 0.992866 22.0604 1.02009E-09 80.543 0.971416 16.9812 0.00112324 45.051 1 Q LYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP ELEQVCNPIISGLYQ(0.006)GAGGPGPGGFGAQ(0.993)GPKGGSGSGPTIEEVD ELEQ(-33.17)VCN(-33.17)PIISGLYQ(-22.06)GAGGPGPGGFGAQ(22.06)GPKGGSGSGPTIEEVD 28 3 2.2816 1758400 1758400 0 0 0.01082 0 0 0 0 0 912050 846350 0 0 NaN 0 0 NaN NaN 0.058093 0.047861 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 912050 0 0 846350 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 849 503 625 625 988 1117 3163;3164 3325;3326 3163 3325 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14543 3163 3325 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14543 3163 3325 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14543 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN 424;424;369;426 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1A PE=1 SV=1;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1B PE=1 SV=1;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock 70 kDa protein 1A 0.686951 7.54662 0.000595146 52.463 9.0939 52.463 0.686951 7.54662 0.000595146 52.463 2 Q VMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP RN(0.105)STIPTKQ(0.687)TQ(0.687)IFTTYSDN(0.202)Q(0.218)PGVLIQ(0.101)VYEGER RN(-11.26)STIPTKQ(7.55)TQ(7.55)IFTTYSDN(-7.55)Q(-7.55)PGVLIQ(-12.43)VYEGER 9 4 1.7475 4776200 0 4776200 0 NaN 0 0 4776200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4776200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 850 503;766 424;426 424 3218;3775 3677;4289 11948 12531 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN 426;426;371;428 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1A PE=1 SV=1;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1B PE=1 SV=1;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock 70 kDa protein 1A 0.686951 7.54662 0.000595146 52.463 9.0939 52.463 0.686951 7.54662 0.000595146 52.463 2 Q TALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP RN(0.105)STIPTKQ(0.687)TQ(0.687)IFTTYSDN(0.202)Q(0.218)PGVLIQ(0.101)VYEGER RN(-11.26)STIPTKQ(7.55)TQ(7.55)IFTTYSDN(-7.55)Q(-7.55)PGVLIQ(-12.43)VYEGER 11 4 1.7475 4776200 0 4776200 0 NaN 0 0 4776200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4776200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 851 503;766 426;428 426 3218;3775 3677;4289 11948 12531 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 11948 12531 20190821_JH_WT_Ubi 9585 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN 435;435;380;437 sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN;sp|P34931|HS71L_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN sp|P0DMV8|HS71A_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1A PE=1 SV=1;sp|P0DMV9|HS71B_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA1B PE=1 SV=1;sp|P0DMV8-2|HS71A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock 70 kDa protein 1A 0.715021 6.02574 0.00306989 57.347 12.626 57.347 0.715021 6.02574 0.00306989 57.347 2 Q IPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMT X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX N(0.646)STIPTKQ(0.234)TQ(0.201)IFTTYSDN(0.197)Q(0.715)PGVLIQ(0.007)VYEGER N(5.1)STIPTKQ(-5.1)TQ(-6.03)IFTTYSDN(-6.03)Q(6.03)PGVLIQ(-20.65)VYEGER 19 3 2.2154 1823900 0 1823900 0 NaN 0 1823900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1823900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 852 503;766 435;437 435 3218;3775 3677;4289 10358 10901 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 10358 10901 20190821_JH_MUT_Ubi 10634 sp|P0DP25|CALM3_HUMAN;sp|P0DP24|CALM2_HUMAN;sp|P0DP23|CALM1_HUMAN 4;4;4 sp|P0DP25|CALM3_HUMAN sp|P0DP25|CALM3_HUMAN sp|P0DP25|CALM3_HUMAN Calmodulin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALM3 PE=1 SV=1;sp|P0DP24|CALM2_HUMAN Calmodulin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALM2 PE=1 SV=1;sp|P0DP23|CALM1_HUMAN Calmodulin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALM1 PE=1 SV=1 0.800805 6.04249 0.0107629 69.451 28.862 69.451 0.800805 6.04249 0.0107629 69.451 Q ____________MADQLTEEQIAEFKEAFSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX ADQ(0.801)LTEEQ(0.199)IAEFK ADQ(6.04)LTEEQ(-6.04)IAEFK 3 2 0.23484 6474900 6474900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 6474900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6474900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 853 504 4 4 66 77 243 261 243 261 20190902_JH_WT_Ubi_2 14641 243 261 20190902_JH_WT_Ubi_2 14641 243 261 20190902_JH_WT_Ubi_2 14641 sp|P10321|1C07_HUMAN 347 sp|P10321|1C07_HUMAN sp|P10321|1C07_HUMAN sp|P10321|1C07_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-C PE=1 SV=3 0.528713 0.769838 0.0259124 52.927 35.103 52.927 0.528713 0.769838 0.0259124 52.927 1 Q MCRRKSSGGKGGSCSQAACSNSAQGSDESLI X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GGSCSQ(0.529)AACSN(0.443)SAQ(0.028)GSDESLITCKA GGSCSQ(0.77)AACSN(-0.77)SAQ(-12.69)GSDESLITCKA 6 3 4.1504 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 854 507 347 347 1500 1712 4809 5059 4809 5059 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7685 4809 5059 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7685 4809 5059 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7685 sp|P10620|MGST1_HUMAN 127 sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN sp|P10620|MGST1_HUMAN Microsomal glutathione S-transferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MGST1 PE=1 SV=1 0.968994 14.9487 0.0118982 85.837 50.534 85.837 0.968994 14.9487 0.0118982 85.837 1 Q GARIYHTIAYLTPLPQPNRALSFFVGYGVTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX IYHTIAYLTPLPQ(0.969)PN(0.031)R IYHTIAYLTPLPQ(14.95)PN(-14.95)R 13 3 2.7706 2810500 2810500 0 0 0.0054893 0 0 0 0 2810500 0 0 0 0 0 0 0 0 0.033325 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2810500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 855 512 127 127 2305 2623 7588 7984 7588 7984 20190902_JH_EV_Ubi_3 9546 7588 7984 20190902_JH_EV_Ubi_3 9546 7588 7984 20190902_JH_EV_Ubi_3 9546 sp|P10809|CH60_HUMAN 240 sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN sp|P10809|CH60_HUMAN 60 kDa heat shock protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPD1 PE=1 SV=2 1 72.2905 0.0184864 72.29 39.202 72.29 1 72.2905 0.0184864 72.29 Q SPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXX CEFQ(1)DAYVLLSEK CEFQ(72.29)DAYVLLSEK 4 2 0.32988 3710800 3710800 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3710800 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3710800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 856 515 240 240 345 408 1169 1256 1169 1256 20190902_JH_WT_Ubi_2 14624 1169 1256 20190902_JH_WT_Ubi_2 14624 1169 1256 20190902_JH_WT_Ubi_2 14624 sp|P11142|HSP7C_HUMAN 612 sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN sp|P11142|HSP7C_HUMAN Heat shock cognate 71 kDa protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA8 PE=1 SV=1 1 64.0452 2.41064E-05 64.045 38.361 64.045 0.933481 11.9465 0.0129431 41.721 1 64.0452 2.41064E-05 64.045 1 Q KELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPG GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LYQ(1)SAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD LYQ(64.05)SAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD 3 3 2.1522 2235300 2235300 0 0 0.053475 0 0 1150000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0.11709 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1150000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.6955 2.2841 7.2787 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.59119 1.4461 6.8908 NaN NaN NaN 857 519 612 612 2871;4727 3255;5363 9243;15163 9728;15931 9243 9728 20190902_JH_WT_Ubi_2 13638 9243 9728 20190902_JH_WT_Ubi_2 13638 9243 9728 20190902_JH_WT_Ubi_2 13638 sp|P12956-2|XRCC6_HUMAN;sp|P12956|XRCC6_HUMAN 556;597 sp|P12956-2|XRCC6_HUMAN sp|P12956-2|XRCC6_HUMAN sp|P12956-2|XRCC6_HUMAN Isoform 2 of X-ray repair cross-complementing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRCC6;sp|P12956|XRCC6_HUMAN X-ray repair cross-complementing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRCC6 PE=1 SV=2 1 66.6919 0.0254938 67.563 12.581 66.692 1 67.5628 0.0254938 67.563 1 66.6919 0.0261709 66.692 Q KEACRAYGLKSGLKKQELLEALTKHFQD___ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXX KQ(1)ELLEALTK KQ(66.69)ELLEALTK 2 2 2.5235 2739100 2739100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 1471200 0 1267900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1471200 0 0 0 0 0 1267900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 858 541 556 556 2439 2774 7983;7984 8394;8395 7984 8395 20190902_JH_WT_Ubi_2 13538 7983 8394 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12917 7983 8394 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12917 sp|P15529-16|MCP_HUMAN;sp|P15529-7|MCP_HUMAN;sp|P15529-4|MCP_HUMAN;sp|P15529-6|MCP_HUMAN;sp|P15529-3|MCP_HUMAN;sp|P15529-5|MCP_HUMAN;sp|P15529-2|MCP_HUMAN 325;344;358;359;373;374;388 sp|P15529-16|MCP_HUMAN sp|P15529-16|MCP_HUMAN sp|P15529-16|MCP_HUMAN Isoform 3 of Membrane cofactor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD46;sp|P15529-7|MCP_HUMAN Isoform L of Membrane cofactor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD46;sp|P15529-4|MCP_HUMAN Isoform F of Membrane cofactor protein OS=Homo 1 131.217 1.95543E-79 219.85 173.52 219.85 0.99668 24.7739 0.012401 69.361 0.999994 52.471 0.0026784 77.554 0.999937 42.0327 1.88534E-06 109.28 1 131.217 1.95543E-79 219.85 1 Q KKKGKADGGAEYATYQTKSTTPAEQRG____ X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX ADGGAEYATYQ(1)TKSTTPAEQR ADGGAEYATYQ(131.22)TKSTTPAEQ(-131.22)R 11 3 1.2698 16722000 16722000 0 0 0.013492 955620 520000 0 0 0 10302000 4944500 0 0 0.0073436 0.0063556 0 0 0 0.051641 0.041943 NaN 0 955620 0 0 520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10302000 0 0 4944500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 859 572 325 325 57 67 215;217;218;219 233;235;236;237 219 237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5829 219 237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5829 219 237 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5829 sp|P15529-16|MCP_HUMAN;sp|P15529-7|MCP_HUMAN;sp|P15529-4|MCP_HUMAN;sp|P15529-6|MCP_HUMAN;sp|P15529-3|MCP_HUMAN;sp|P15529-5|MCP_HUMAN;sp|P15529-2|MCP_HUMAN 334;353;367;368;382;383;397 sp|P15529-16|MCP_HUMAN sp|P15529-16|MCP_HUMAN sp|P15529-16|MCP_HUMAN Isoform 3 of Membrane cofactor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD46;sp|P15529-7|MCP_HUMAN Isoform L of Membrane cofactor protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD46;sp|P15529-4|MCP_HUMAN Isoform F of Membrane cofactor protein OS=Homo 1 94.1741 9.76574E-36 177.4 132.6 174.72 1 66.5908 3.94372E-21 153.04 1 94.1741 1.44225E-35 174.72 0.999999 61.2693 9.76574E-36 177.4 1 Q AEYATYQTKSTTPAEQRG_____________ X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX ADGGAEYATYQTKSTTPAEQ(1)R ADGGAEYATYQ(-94.17)TKSTTPAEQ(94.17)R 20 3 2.591 46228000 46228000 0 0 0.0373 0 0 0 0 8463500 0 0 20541000 17224000 0 0 0 0 0.075284 0 0 NaN 0.054089 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8463500 0 0 0 0 0 0 0 0 20541000 0 0 17224000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 860 572 334 334 57 67 216;220;221 234;238;239 220 238 20190902_JH_WT_Ubi_2 7024 221 239 20190902_JH_WT_Ubi_3 6716 221 239 20190902_JH_WT_Ubi_3 6716 sp|P16070-18|CD44_HUMAN;sp|P16070-12|CD44_HUMAN;sp|P16070-14|CD44_HUMAN;sp|P16070-13|CD44_HUMAN;sp|P16070-11|CD44_HUMAN;sp|P16070-10|CD44_HUMAN;sp|P16070-16|CD44_HUMAN;sp|P16070-8|CD44_HUMAN;sp|P16070-17|CD44_HUMAN;sp|P16070-6|CD44_HUMAN;sp|P16070-4|CD44_HUMAN;sp|P16070-3|CD44_HUMAN;sp|P16070-7|CD44_HUMAN;sp|P16070-5|CD44_HUMAN;sp|P16070|CD44_HUMAN 305;326;361;390;394;458;633;639;656;664;664;676;678;699;707 sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN Isoform 18 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-12|CD44_HUMAN Isoform 12 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-14|CD44_HUMAN Isoform 14 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P160 0.892609 9.20957 0.000161871 84.895 62.478 80.585 0.811395 6.34295 0.000161871 84.895 0.892609 9.20957 0.000846792 80.585 1 Q EDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKESSETPD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX KPSGLN(0.107)GEASKSQ(0.893)EMVHLVNK KPSGLN(-9.21)GEASKSQ(9.21)EMVHLVN(-48.96)K 13 3 0.5015 8460300 8460300 0 0 0.051005 0 0 0 0 0 0 0 6914700 0 0 0 0 0 0 0 0 0.15321 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6914700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 861 580 305 305 2433;4118 2766;2767;4680 7964;7966 8375;8377 7964 8375 20190902_JH_WT_Ubi_3 5870 7966 8377 20190902_JH_WT_Ubi_2 7482 7966 8377 20190902_JH_WT_Ubi_2 7482 sp|P16070-18|CD44_HUMAN;sp|P16070-12|CD44_HUMAN;sp|P16070-14|CD44_HUMAN;sp|P16070-13|CD44_HUMAN;sp|P16070-11|CD44_HUMAN;sp|P16070-10|CD44_HUMAN;sp|P16070-16|CD44_HUMAN;sp|P16070-8|CD44_HUMAN;sp|P16070-17|CD44_HUMAN;sp|P16070-6|CD44_HUMAN;sp|P16070-4|CD44_HUMAN;sp|P16070-3|CD44_HUMAN;sp|P16070-7|CD44_HUMAN;sp|P16070-5|CD44_HUMAN;sp|P16070|CD44_HUMAN 321;342;377;406;410;474;649;655;672;680;680;692;694;715;723 sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN sp|P16070-18|CD44_HUMAN Isoform 18 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-12|CD44_HUMAN Isoform 12 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P16070-14|CD44_HUMAN Isoform 14 of CD44 antigen OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD44;sp|P160 0.921148 11.159 0.00217177 83.317 43.032 83.317 0.921148 11.159 0.00217177 83.317 1 Q EMVHLVNKESSETPDQFMTADETRNLQNVDM X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SQ(0.008)EMVHLVN(0.071)KESSETPDQ(0.921)FMTADETR SQ(-20.45)EMVHLVN(-11.16)KESSETPDQ(11.16)FMTADETR 18 3 4.3877 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 862 580 321 321 4118 4680 13057 13694 13057 13694 20190902_JH_WT_Ubi_2 8154 13057 13694 20190902_JH_WT_Ubi_2 8154 13057 13694 20190902_JH_WT_Ubi_2 8154 sp|P16104|H2AX_HUMAN;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN 105;105;105 sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN Histone H2AX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H2AFX PE=1 SV=2;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN Histone H2A type 2-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST2H2AB PE=1 SV=3;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN Histone H2A type 1-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AA PE=1 SV=3 0.997041 25.5234 1.57165E-37 180.08 169.24 180.08 0.962556 15.2804 1.69951E-37 179.84 0.996574 24.8576 1.58968E-30 169.6 0.997041 25.5234 1.57165E-37 180.08 1 Q NDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LLGGVTIAQ(0.997)GGVLPN(0.003)IQAVLLPKK LLGGVTIAQ(25.52)GGVLPN(-25.52)IQ(-37.84)AVLLPKK 9 3 -0.28742 11975000 11975000 0 0 0.0063111 0 0 3725800 0 0 3645100 0 0 4604100 0 0 0.0050861 NaN NaN 0.031637 0 0 0.03133 0 0 0 0 0 0 3725800 0 0 0 0 0 0 0 0 3645100 0 0 0 0 0 0 0 0 4604100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 863 581 105 105 2693;2694 3063;3065 8761;8764;8767 9212;9217;9218;9221 8767 9221 20190902_JH_WT_Ubi_3 14908 8767 9221 20190902_JH_WT_Ubi_3 14908 8767 9221 20190902_JH_WT_Ubi_3 14908 sp|P16104|H2AX_HUMAN;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN 113;113;113 sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN sp|P16104|H2AX_HUMAN Histone H2AX OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H2AFX PE=1 SV=2;sp|Q8IUE6|H2A2B_HUMAN Histone H2A type 2-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST2H2AB PE=1 SV=3;sp|Q96QV6|H2A1A_HUMAN Histone H2A type 1-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HIST1H2AA PE=1 SV=3 0.497207 0 0.00060952 83.869 77.974 83.869 0.497207 0 0.00060952 83.869 Q LGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LLGGVTIAQ(0.006)GGVLPN(0.497)IQ(0.497)AVLLPK LLGGVTIAQ(-19.49)GGVLPN(0)IQ(0)AVLLPK 17 2 2.3265 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 864 581 113 113 2693;2694 3063;3065 8752 9202 20190821_JH_MUT_Ubi 14838 8752 9202 20190821_JH_MUT_Ubi 14838 8752 9202 20190821_JH_MUT_Ubi 14838 sp|P16520-2|GBB3_HUMAN;sp|P16520|GBB3_HUMAN 13;13 sp|P16520-2|GBB3_HUMAN sp|P16520-2|GBB3_HUMAN sp|P16520-2|GBB3_HUMAN Isoform 2 of Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNB3;sp|P16520|GBB3_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNB3 PE=1 0.995242 23.4893 0.024732 45.33 19.182 45.33 0.995242 23.4893 0.024732 45.33 1 Q ___MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX MGEMEQLRQ(0.004)EAEQ(0.995)LKK MGEMEQ(-35.19)LRQ(-23.49)EAEQ(23.49)LKK 13 3 -4.3713 2214400 2214400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2214400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2214400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 865 590 13 13 2914 3310 9395 9889 9395 9889 20190902_JH_WT_Ubi_2 10764 9395 9889 20190902_JH_WT_Ubi_2 10764 9395 9889 20190902_JH_WT_Ubi_2 10764 sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN;sp|P17040-2|ZSC20_HUMAN;sp|P17040-3|ZSC20_HUMAN;sp|P17040|ZSC20_HUMAN 161;95;161;161 sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN Isoform 4 of Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZSCAN20;sp|P17040-2|ZSC20_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZSCAN20;sp|P17040-3| 0.484591 0 0.0112631 59.574 12.872 59.574 0.484591 0 0.0112631 59.574 Q EETRPLKTGEEAQSFQLQPVDPWPEGQSQKK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TGEEAQ(0.031)SFQ(0.485)LQ(0.485)PVDPWPEGQSQKK TGEEAQ(-11.97)SFQ(0)LQ(0)PVDPWPEGQ(-43.77)SQ(-43.77)KK 9 3 1.2501 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 866 594 161 161 4363 4946 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN;sp|P17040-2|ZSC20_HUMAN;sp|P17040-3|ZSC20_HUMAN;sp|P17040|ZSC20_HUMAN 163;97;163;163 sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN sp|P17040-4|ZSC20_HUMAN Isoform 4 of Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZSCAN20;sp|P17040-2|ZSC20_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZSCAN20;sp|P17040-3| 0.484591 0 0.0112631 59.574 12.872 59.574 0.484591 0 0.0112631 59.574 Q TRPLKTGEEAQSFQLQPVDPWPEGQSQKKGV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TGEEAQ(0.031)SFQ(0.485)LQ(0.485)PVDPWPEGQSQKK TGEEAQ(-11.97)SFQ(0)LQ(0)PVDPWPEGQ(-43.77)SQ(-43.77)KK 11 3 1.2501 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 867 594 163 163 4363 4946 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 13816 14498 20190902_JH_EV_Ubi_2 7409 sp|P18827|SDC1_HUMAN 293 sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN Syndecan-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDC1 PE=1 SV=3 0.818484 8.56683 0.00541898 75.376 52.723 75.376 0.818484 8.56683 0.00541898 75.376 1 Q MKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX DEGSYSLEEPKQ(0.818)AN(0.115)GGAYQ(0.066)K DEGSYSLEEPKQ(8.57)AN(-8.57)GGAYQ(-10.92)K 12 3 1.5994 1696500 1696500 0 0 NaN 1696500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1696500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 868 614 293 293 431 505 1388 1479 1388 1479 20190821_JH_EV_Ubi 6174 1388 1479 20190821_JH_EV_Ubi 6174 1388 1479 20190821_JH_EV_Ubi 6174 sp|P18827|SDC1_HUMAN 300 sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN sp|P18827|SDC1_HUMAN Syndecan-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDC1 PE=1 SV=3 0.49927 0 0.000464492 106.31 78.244 106.31 0.49927 0 0.000464492 106.31 Q SYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEFYA_____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DEGSYSLEEPKQ(0.001)AN(0.499)GGAYQ(0.499)K DEGSYSLEEPKQ(-25.3)AN(0)GGAYQ(0)K 19 3 0.49043 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 869 614 300 300 431 505 1390 1481 20190902_JH_WT_Ubi_2 8214 1390 1481 20190902_JH_WT_Ubi_2 8214 1390 1481 20190902_JH_WT_Ubi_2 8214 sp|P19623|SPEE_HUMAN 260 sp|P19623|SPEE_HUMAN sp|P19623|SPEE_HUMAN sp|P19623|SPEE_HUMAN Spermidine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRM PE=1 SV=1 0.271203 0 0.00154598 94.463 60.308 94.463 0.271203 0 0.00154598 94.463 Q QIGFMLCSKNPSTNFQEPVQPLTQQQVAQMQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.073)PSTN(0.073)FQ(0.271)EPVQ(0.271)PLTQ(0.266)Q(0.044)Q(0.002)VAQMQLK N(-5.71)PSTN(-5.71)FQ(0)EPVQ(0)PLTQ(-0.08)Q(-7.91)Q(-22.15)VAQ(-44.27)MQ(-52.55)LK 7 3 3.1855 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 870 621 260 260 3192 3648 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 sp|P19623|SPEE_HUMAN 264 sp|P19623|SPEE_HUMAN sp|P19623|SPEE_HUMAN sp|P19623|SPEE_HUMAN Spermidine synthase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRM PE=1 SV=1 0.271203 0 0.00154598 94.463 60.308 94.463 0.271203 0 0.00154598 94.463 Q MLCSKNPSTNFQEPVQPLTQQQVAQMQLKYY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N(0.073)PSTN(0.073)FQ(0.271)EPVQ(0.271)PLTQ(0.266)Q(0.044)Q(0.002)VAQMQLK N(-5.71)PSTN(-5.71)FQ(0)EPVQ(0)PLTQ(-0.08)Q(-7.91)Q(-22.15)VAQ(-44.27)MQ(-52.55)LK 11 3 3.1855 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 871 621 264 264 3192 3648 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 10282 10822 20190902_JH_WT_Ubi_2 11339 sp|P20020|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-4|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-3|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-5|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-2|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-6|AT2B1_HUMAN 334;334;334;334;334;334 sp|P20020|AT2B1_HUMAN sp|P20020|AT2B1_HUMAN sp|P20020|AT2B1_HUMAN Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2B1 PE=1 SV=3;sp|P20020-4|AT2B1_HUMAN Isoform C of Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2B1;sp|P20020-3|AT2B1_HUMAN Iso 0.999941 42.5889 4.36975E-07 101.53 73.5 74.062 0.999941 42.5889 0.000472725 74.062 0.619547 2.11776 4.36975E-07 101.53 1 Q NRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEEGGDGDEKDK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX AQDGAAMEMQ(1)PLKSEEGGDGDEK AQ(-42.59)DGAAMEMQ(42.59)PLKSEEGGDGDEK 10 3 0.97787 3911100 3911100 0 0 0.027116 0 0 0 1862500 0 0 0 2048700 0 0 0 0 0.080404 0 0 0 0.093611 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1862500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2048700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 872 624 334 334 250 294 863;864 940;941 863 940 20190902_JH_EV_Ubi_2 4839 864 941 20190902_JH_WT_Ubi_2 6111 864 941 20190902_JH_WT_Ubi_2 6111 sp|P20020|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-4|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-3|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-5|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-2|AT2B1_HUMAN;sp|P20020-6|AT2B1_HUMAN;sp|Q01814-2|AT2B2_HUMAN;sp|Q01814|AT2B2_HUMAN;sp|Q01814-5|AT2B2_HUMAN;sp|Q16720|AT2B3_HUMAN;sp|Q01814-8|AT2B2_HUMAN;sp|Q16720-4|AT2B3_HUMAN;sp|Q16720-8|AT2B3_HUMAN;sp|Q01814-6|AT2B2_HUMAN;sp|Q16720-7|AT2B3_HUMAN;sp|Q16720-2|AT2B3_HUMAN;sp|Q16720-5|AT2B3_HUMAN;sp|Q01814-7|AT2B2_HUMAN;sp|Q16720-3|AT2B3_HUMAN;sp|Q01814-4|AT2B2_HUMAN;sp|Q16720-6|AT2B3_HUMAN;sp|Q01814-3|AT2B2_HUMAN 752;752;752;752;752;752;775;775;761;749;744;735;735;730;749;749;749;744;735;730;735;761 sp|P20020|AT2B1_HUMAN sp|P20020|AT2B1_HUMAN sp|P20020|AT2B1_HUMAN Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2B1 PE=1 SV=3;sp|P20020-4|AT2B1_HUMAN Isoform C of Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2B1;sp|P20020-3|AT2B1_HUMAN Iso 1 92.6544 0.0107534 113.69 64.186 113.69 1 92.6544 0.0107534 113.69 1 Q KDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLAR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX NEKGEIEQ(1)ER N(-92.65)EKGEIEQ(92.65)ER 8 3 -1.1216 1137200 1137200 0 0 0.012361 0 0 0 0 0 0 0 0 1137200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1137200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 873 624 752 752 3035 3470 9801 10325 9801 10325 20190902_JH_WT_Ubi_3 4290 9801 10325 20190902_JH_WT_Ubi_3 4290 9801 10325 20190902_JH_WT_Ubi_3 4290 sp|P21333-2|FLNA_HUMAN;sp|P21333|FLNA_HUMAN 2211;2219 sp|P21333-2|FLNA_HUMAN sp|P21333-2|FLNA_HUMAN sp|P21333-2|FLNA_HUMAN Isoform 2 of Filamin-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNA;sp|P21333|FLNA_HUMAN Filamin-A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FLNA PE=1 SV=4 0.997486 25.9862 0.00658526 61.862 40.328 61.862 0.997486 25.9862 0.00658526 61.862 1 Q PAEMGTHTVSVKYKGQHVPGSPFQFTVGPLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP GQ(0.997)HVPGSPFQ(0.003)FTVGPLGEGGAHK GQ(25.99)HVPGSPFQ(-25.99)FTVGPLGEGGAHK 2 4 1.6867 5793900 5793900 0 0 0.024382 0 0 0 0 0 0 0 5793900 0 NaN NaN NaN 0 0 0 NaN 0.05688 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5793900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 874 637 2211 2211 1667 1898 5321 5602 5321 5602 20190902_JH_WT_Ubi_2 11207 5321 5602 20190902_JH_WT_Ubi_2 11207 5321 5602 20190902_JH_WT_Ubi_2 11207 sp|P21583-3|SCF_HUMAN;sp|P21583-2|SCF_HUMAN;sp|P21583|SCF_HUMAN 229;236;264 sp|P21583-3|SCF_HUMAN sp|P21583-3|SCF_HUMAN sp|P21583-3|SCF_HUMAN Isoform 3 of Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG;sp|P21583-2|SCF_HUMAN Isoform 2 of Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG;sp|P21583|SCF_HUMAN Kit ligand OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KITLG PE=1 SV=1 0.353622 0 0.00555167 71.853 45.866 71.853 0.353622 0 0.00555167 71.853 Q ENIQINEEDNEISMLQEKEREFQEV______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AVENIQ(0.002)IN(0.291)EEDN(0.354)EISMLQ(0.354)EKER AVEN(-37.59)IQ(-22.29)IN(-0.85)EEDN(0)EISMLQ(0)EKER 18 3 2.0764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 875 639 229 229 323 379 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 1088 1175 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9732 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN 103;103;103 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2;sp|P21980-3|TGM2_HUMAN Isoform 3 0.392137 0 0.00163621 54.425 23.57 54.425 0.392137 0 0.00163621 54.425 Q WTATVVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX DAVEEGDWTATVVDQ(0.051)Q(0.165)DCTLSLQ(0.392)LTTPAN(0.392)APIGLYR DAVEEGDWTATVVDQ(-8.86)Q(-3.76)DCTLSLQ(0)LTTPAN(0)APIGLYR 23 3 3.9721 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 876 645 103 103 396 466 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 1293 1380 20190902_JH_WT_Ubi_2 16400 sp|P21980|TGM2_HUMAN;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN 307;307 sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN sp|P21980|TGM2_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 PE=1 SV=2;sp|P21980-2|TGM2_HUMAN Isoform 2 of Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM2 0.466261 0 9.58726E-06 101.62 71.623 101.62 0.466261 0 9.58726E-06 101.62 Q GIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX VVTN(0.01)YN(0.008)SAHDQ(0.466)N(0.466)SN(0.05)LLIEYFR VVTN(-16.7)YN(-17.69)SAHDQ(0)N(0)SN(-9.73)LLIEYFR 11 3 0.16783 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 877 645 307 307 5069 5762;5763 16363 17197 20190902_JH_WT_Ubi_3 12328 16363 17197 20190902_JH_WT_Ubi_3 12328 16363 17197 20190902_JH_WT_Ubi_3 12328 sp|Q13191-3|CBLB_HUMAN;sp|Q13191-2|CBLB_HUMAN;sp|P22681|CBL_HUMAN;sp|Q13191|CBLB_HUMAN 61;61;71;61 sp|Q13191-3|CBLB_HUMAN sp|Q13191-3|CBLB_HUMAN sp|Q13191-3|CBLB_HUMAN Isoform Truncated 2 of E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CBLB;sp|Q13191-2|CBLB_HUMAN Isoform Truncated 1 of E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CBLB;sp|P22681|CBL_HUMAN E3 ubiquitin 0.993936 22.1457 0.00819672 83.499 36.544 83.499 0.993936 22.1457 0.00819672 83.499 1 Q VEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LMDKVVRLCQ(0.994)N(0.006)PK LMDKVVRLCQ(22.15)N(-22.15)PK 10 2 -0.62479 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 878 654 61 61 2715 3087 8811 9267 8811 9267 20190821_JH_EV_Ubi 13976 8811 9267 20190821_JH_EV_Ubi 13976 8811 9267 20190821_JH_EV_Ubi 13976 sp|P23284|PPIB_HUMAN 103 sp|P23284|PPIB_HUMAN sp|P23284|PPIB_HUMAN sp|P23284|PPIB_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIB PE=1 SV=2 1 62.6328 0.0314552 62.633 22.97 62.633 1 62.6328 0.0314552 62.633 Q YKNSKFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX DFMIQ(1)GGDFTR DFMIQ(62.63)GGDFTR 5 2 0.64896 732130 732130 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 732130 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 732130 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 879 660 103 103 463 538 1470 1563 1470 1563 20190902_JH_WT_Ubi_2 11859 1470 1563 20190902_JH_WT_Ubi_2 11859 1470 1563 20190902_JH_WT_Ubi_2 11859 sp|P23381-2|SYWC_HUMAN;sp|P23381|SYWC_HUMAN 306;347 sp|P23381-2|SYWC_HUMAN sp|P23381-2|SYWC_HUMAN sp|P23381-2|SYWC_HUMAN Isoform 2 of Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WARS;sp|P23381|SYWC_HUMAN Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WARS PE=1 SV=2 0.783843 5.5946 0.0186462 73.279 43.172 73.279 0.783843 5.5946 0.0186462 73.279 1 Q PALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX PALLHSTFFPALQ(0.216)GAQ(0.784)TK PALLHSTFFPALQ(-5.59)GAQ(5.59)TK 16 3 -1.1838 1197000 1197000 0 0 0.010009 0 0 0 0 1197000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.18484 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1197000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 880 661 306 306 3299 3770 10596 11148 10596 11148 20190902_JH_EV_Ubi_3 10467 10596 11148 20190902_JH_EV_Ubi_3 10467 10596 11148 20190902_JH_EV_Ubi_3 10467 sp|P26038|MOES_HUMAN 480 sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN sp|P26038|MOES_HUMAN Moesin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSN PE=1 SV=3 0.358415 0 0.00320477 43.438 20.878 43.438 0.358415 0 0.00320477 43.438 Q TAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AELKTAMSTPHVAEPAEN(0.358)EQ(0.358)DEQ(0.093)DEN(0.19)GAEASADLR AELKTAMSTPHVAEPAEN(0)EQ(0)DEQ(-5.86)DEN(-2.75)GAEASADLR 20 4 1.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 881 686 480 480 91;4260 105;4836;4837 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 338 371 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7149 sp|P26599|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN 221;221;221 sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN sp|P26599|PTBP1_HUMAN Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1 PE=1 SV=1;sp|P26599-2|PTBP1_HUMAN Isoform 2 of Polypyrimidine tract-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PTBP1;sp|P26599-3|PTBP1_HUMAN Isoform 3 of Polypy 0.45714 0 7.25123E-05 99.813 67.111 99.813 0.45714 0 7.25123E-05 99.813 Q KFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N(0.08)N(0.457)Q(0.457)FQ(0.005)ALLQ(0.001)YADPVSAQHAK N(-7.58)N(0)Q(0)FQ(-19.89)ALLQ(-25.86)YADPVSAQ(-74.91)HAK 3 3 -0.58585 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 882 690 221 221 3174 3628 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 10224 10764 20190821_JH_WT_Ubi 13566 sp|P29401|TKT_HUMAN;sp|P29401-2|TKT_HUMAN 488;496 sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN sp|P29401|TKT_HUMAN Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT PE=1 SV=3;sp|P29401-2|TKT_HUMAN Isoform 2 of Transketolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TKT 0.8574 11.0163 7.2695E-06 104.68 73.964 71.842 0.8574 11.0163 0.0129555 71.842 0.829877 7.05485 7.2695E-06 104.68 1 Q SRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TSRPENAIIYN(0.014)N(0.046)N(0.068)EDFQ(0.857)VGQ(0.014)AK TSRPEN(-37.62)AIIYN(-17.72)N(-12.69)N(-11.02)EDFQ(11.02)VGQ(-17.88)AK 17 3 -1.7799 2398400 2398400 0 0 0.030115 0 0 0 942680 0 1455700 0 0 0 0 0 NaN 0.12691 0 0.19349 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 942680 0 0 0 0 0 1455700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 883 715 488 488 4610 5234 14740;14741 15489;15490 14740 15489 20190902_JH_EV_Ubi_2 8047 14741 15490 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8559 14741 15490 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8559 sp|P29590-11|PML_HUMAN;sp|P29590|PML_HUMAN;sp|P29590-14|PML_HUMAN;sp|P29590-10|PML_HUMAN;sp|P29590-4|PML_HUMAN;sp|P29590-12|PML_HUMAN;sp|P29590-2|PML_HUMAN;sp|P29590-5|PML_HUMAN;sp|P29590-9|PML_HUMAN;sp|P29590-13|PML_HUMAN;sp|P29590-3|PML_HUMAN;sp|P29590-8|PML_HUMAN 392;392;392;392;392;392;392;392;392;392;392;392 sp|P29590-11|PML_HUMAN sp|P29590-11|PML_HUMAN sp|P29590-11|PML_HUMAN Isoform PML-11 of Protein PML OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PML;sp|P29590|PML_HUMAN Protein PML OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PML PE=1 SV=3;sp|P29590-14|PML_HUMAN Isoform PML-14 of Protein PML OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PML;sp|P29590-10|PM 0.999999 62.7324 0.00181361 94.01 42.315 90.872 0.999973 45.5172 0.00936411 77.468 0.999999 61.1522 0.00181361 94.01 0.999999 62.7324 0.00234995 90.872 1 Q DEFKVRLQDLSSCITQGKDAAVSKKASPEAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX LQDLSSCITQ(1)GKDAAVSK LQ(-62.73)DLSSCITQ(62.73)GKDAAVSK 10 3 -1.3198 7840200 7840200 0 0 0.031156 0 0 0 0 740520 0 0 3140400 3959300 0 0 0 0 0.075389 0 0 0.058638 0.063995 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 740520 0 0 0 0 0 0 0 0 3140400 0 0 3959300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 884 716 392 392 2772 3148 8970;8971;8972 9437;9438;9439 8972 9439 20190902_JH_WT_Ubi_3 8841 8971 9438 20190902_JH_WT_Ubi_2 9275 8971 9438 20190902_JH_WT_Ubi_2 9275 sp|P29966|MARCS_HUMAN 34 sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN sp|P29966|MARCS_HUMAN Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCKS PE=1 SV=4 0.882293 6.92184 1.43743E-20 125.35 85.704 86.508 0.882293 6.92184 5.87815E-06 86.508 0.690794 0.947996 0.00274042 53.525 0.72099 2.87 1.03455E-10 105.52 0.663781 0 0.00182054 57.648 0.659487 0.589277 0.00124727 60.218 0.697707 2.08375 0.00185864 57.477 0.536024 0 0.000167922 73.109 0.687717 1.90653 1.43743E-20 125.35 2 Q PGEAAVASSPSKANGQENGHVKVNGDASPAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(0.695)GQ(0.882)EN(0.423)GHVK GEAAAERPGEAAVASSPSKAN(2.78)GQ(6.92)EN(-2.78)GHVK 23 4 0.86308 22249000 0 22249000 0 NaN 1221000 667070 6021100 1350000 3207700 1567400 1591300 6623300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1221000 0 0 667070 0 0 6021100 0 0 1350000 0 0 3207700 0 0 1567400 0 0 1591300 0 0 6623300 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 885 718 34 34 1420 1618 4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529 4750;4751;4752;4753;4754;4755;4756;4757;4758;4759 4522 4751 20190821_JH_EV_Ubi 3744 4529 4759 20190902_JH_WT_Ubi_2 5519 4529 4759 20190902_JH_WT_Ubi_2 5519 sp|P30405|PPIF_HUMAN 153 sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN sp|P30405|PPIF_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIF PE=1 SV=1 0.359455 0 0.00136044 66.372 35.058 66.372 0.359455 0 0.00136044 66.372 Q GVLSMANAGPNTNGSQFFICTIKTDWLDGKH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HVGPGVLSMAN(0.002)AGPN(0.279)TN(0.359)GSQ(0.359)FFICTIK HVGPGVLSMAN(-23.27)AGPN(-1.09)TN(0)GSQ(0)FFICTIK 20 3 -0.17943 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 886 732 153 153 2023 2307 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 6658 7004 20190902_JH_WT_Ubi_2 13040 sp|P31040|SDHA_HUMAN;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN;sp|P31040-3|SDHA_HUMAN 520;472;375 sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDHA PE=1 SV=2;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN Isoform 2 of Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sap 1 44.5871 0.0213415 44.587 6.36 44.587 1 44.5871 0.0213415 44.587 3 Q SIRTSELRLSMQKSMQNHAAVFRVGSVLQEG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP SMQ(1)N(1)HAAVFRVGSVLQ(1)EGCGK SMQ(44.59)N(44.59)HAAVFRVGSVLQ(44.59)EGCGK 3 3 -1.9201 5897400 0 0 5897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 887 739 520 520 4073 4625 12900 13527 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 sp|P31040|SDHA_HUMAN;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN;sp|P31040-3|SDHA_HUMAN 533;485;388 sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN sp|P31040|SDHA_HUMAN Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SDHA PE=1 SV=2;sp|P31040-2|SDHA_HUMAN Isoform 2 of Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial OS=Homo sap 1 44.5871 0.0213415 44.587 6.36 44.587 1 44.5871 0.0213415 44.587 3 Q SMQNHAAVFRVGSVLQEGCGKISKLYGDLKH X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX SMQ(1)N(1)HAAVFRVGSVLQ(1)EGCGK SMQ(44.59)N(44.59)HAAVFRVGSVLQ(44.59)EGCGK 16 3 -1.9201 5897400 0 0 5897400 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5897400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 888 739 533 533 4073 4625 12900 13527 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 12900 13527 20190902_JH_WT_Ubi_3 12166 sp|P32455|GBP1_HUMAN 287 sp|P32455|GBP1_HUMAN sp|P32455|GBP1_HUMAN sp|P32455|GBP1_HUMAN Guanylate-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GBP1 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0348123 80.522 27.509 80.522 0.5 0 0.0348123 80.522 1 Q YIFSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLTYVN X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TKTLSGGIQ(0.5)VN(0.5)GPR TKTLSGGIQ(0)VN(0)GPR 9 3 -0.012355 9061300 9061300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 9061300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9061300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 889 755 287 287 4452 5050 14134 14839 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 14134 14839 20190902_JH_WT_Ubi_2 4655 sp|P32969|RL9_HUMAN 162 sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN 60S ribosomal protein L9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL9 PE=1 SV=1 0.332669 0 0.00817785 56.562 27.408 56.562 0.332669 0 0.00817785 56.562 Q EGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLD X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX DELILEGN(0.952)DIELVSN(0.261)SAALIQ(0.333)Q(0.34)ATTVKN(0.115)K DELILEGN(14.4)DIELVSN(-1.14)SAALIQ(0)Q(0)ATTVKN(-5.09)K 21 3 -0.43823 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 890 757 162 162 439 514 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 sp|P32969|RL9_HUMAN 163 sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN sp|P32969|RL9_HUMAN 60S ribosomal protein L9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL9 PE=1 SV=1 0.340099 0 0.00817785 56.562 27.408 56.562 0.340099 0 0.00817785 56.562 Q GNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DELILEGN(0.952)DIELVSN(0.261)SAALIQ(0.333)Q(0.34)ATTVKN(0.115)K DELILEGN(14.4)DIELVSN(-1.14)SAALIQ(0)Q(0)ATTVKN(-5.09)K 22 3 -0.43823 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 891 757 163 163 439 514 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 1410 1501 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14875 sp|P33316-2|DUT_HUMAN;sp|P33316|DUT_HUMAN 146;234 sp|P33316-2|DUT_HUMAN sp|P33316-2|DUT_HUMAN sp|P33316-2|DUT_HUMAN Isoform 2 of Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUT;sp|P33316|DUT_HUMAN Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DUT PE=1 SV=4 1 103.135 0.00239416 103.13 67.489 103.13 1 103.135 0.00239416 103.13 1 Q QLICERIFYPEIEEVQALDDTERGSGGFGST X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX IFYPEIEEVQ(1)ALDDTER IFYPEIEEVQ(103.13)ALDDTER 10 2 4.4503 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 892 759 146 146 2120 2418 7040 7413 7040 7413 20190902_JH_EV_Ubi_2 11814 7040 7413 20190902_JH_EV_Ubi_2 11814 7040 7413 20190902_JH_EV_Ubi_2 11814 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-9|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 836;895;836;780;895;839;905;780;839 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 0.499998 0 0.00169828 74.772 39.469 74.772 0.499998 0 0.00169828 74.772 1 Q ENGVTGVSGPGKEAKQMENGMLVTDSAGKQL X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.5)MEN(0.5)GMLVTDSAGKQLQR Q(0)MEN(0)GMLVTDSAGKQ(-51.21)LQ(-60.81)R 1 3 -1.9888 3271200 3271200 0 0 NaN 3271200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 3271200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 893 760 836 836 797;3669 902;4178 11724 12303 11724 12303 20190821_JH_EV_Ubi 5675 11724 12303 20190821_JH_EV_Ubi 5675 11724 12303 20190821_JH_EV_Ubi 5675 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN;sp|P33527|MRP1_HUMAN;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN;sp|P33527-5|MRP1_HUMAN;sp|P33527-4|MRP1_HUMAN;sp|P33527-3|MRP1_HUMAN;sp|P33527-8|MRP1_HUMAN;sp|P33527-7|MRP1_HUMAN 817;876;817;761;876;820;761;820 sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN sp|P33527-2|MRP1_HUMAN Isoform 2 of Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1;sp|P33527|MRP1_HUMAN Multidrug resistance-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCC1 PE=1 SV=3;sp|P33527-6|MRP1_HUMAN Isoform 6 of Mul 0.611945 4.66583 5.84716E-07 98.299 69.881 98.299 0.611945 4.66583 5.84716E-07 98.299 1 Q AFAEFLRTYASTEQEQDAEENGVTGVSGPGK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TYASTEQ(0.179)EQ(0.612)DAEEN(0.209)GVTGVSGPGKEAK TYASTEQ(-5.58)EQ(4.67)DAEEN(-4.67)GVTGVSGPGKEAK 9 3 0.6879 2404000 2404000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2404000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2404000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 894 760 817 817 4691 5322 15042 15806 15042 15806 20190902_JH_WT_Ubi_2 7337 15042 15806 20190902_JH_WT_Ubi_2 7337 15042 15806 20190902_JH_WT_Ubi_2 7337 sp|P34932|HSP74_HUMAN 534 sp|P34932|HSP74_HUMAN sp|P34932|HSP74_HUMAN sp|P34932|HSP74_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA4 PE=1 SV=4 0.388411 0 2.42836E-11 133.93 96.432 133.93 0.388411 0 2.42836E-11 133.93 Q EEKMQVDQEEPHVEEQQQQTPAENKAESEEM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX MQVDQ(0.001)EEPHVEEQ(0.388)Q(0.388)Q(0.156)Q(0.047)TPAEN(0.019)K MQ(-51.07)VDQ(-24.16)EEPHVEEQ(0)Q(0)Q(-3.95)Q(-9.2)TPAEN(-13.22)K 13 3 1.7653 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 895 767 534 534 2962 3376 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 sp|P34932|HSP74_HUMAN 535 sp|P34932|HSP74_HUMAN sp|P34932|HSP74_HUMAN sp|P34932|HSP74_HUMAN Heat shock 70 kDa protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSPA4 PE=1 SV=4 0.388411 0 2.42836E-11 133.93 96.432 133.93 0.388411 0 2.42836E-11 133.93 Q EKMQVDQEEPHVEEQQQQTPAENKAESEEME X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MQVDQ(0.001)EEPHVEEQ(0.388)Q(0.388)Q(0.156)Q(0.047)TPAEN(0.019)K MQ(-51.07)VDQ(-24.16)EEPHVEEQ(0)Q(0)Q(-3.95)Q(-9.2)TPAEN(-13.22)K 14 3 1.7653 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 896 767 535 535 2962 3376 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 9558 10060 20190821_JH_WT_Ubi 5160 sp|P35232|PHB_HUMAN 269 sp|P35232|PHB_HUMAN sp|P35232|PHB_HUMAN sp|P35232|PHB_HUMAN Prohibitin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHB PE=1 SV=1 0.494418 0 0.0254114 62.528 10.361 62.528 0.494418 0 0.0254114 62.528 Q SRNITYLPAGQSVLLQLPQ____________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX NITYLPAGQ(0.011)SVLLQ(0.494)LPQ(0.494) N(-49.39)ITYLPAGQ(-16.47)SVLLQ(0)LPQ(0) 14 2 1.9731 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 897 771 269 269 3107 3554 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 sp|P35232|PHB_HUMAN 272 sp|P35232|PHB_HUMAN sp|P35232|PHB_HUMAN sp|P35232|PHB_HUMAN Prohibitin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHB PE=1 SV=1 0.494418 0 0.0254114 62.528 10.361 62.528 0.494418 0 0.0254114 62.528 Q ITYLPAGQSVLLQLPQ_______________ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX NITYLPAGQ(0.011)SVLLQ(0.494)LPQ(0.494) N(-49.39)ITYLPAGQ(-16.47)SVLLQ(0)LPQ(0) 17 2 1.9731 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 898 771 272 272 3107 3554 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 10022 10557 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15216 sp|P35398-4|RORA_HUMAN;sp|P35398|RORA_HUMAN;sp|P35398-3|RORA_HUMAN;sp|P35398-1|RORA_HUMAN 294;349;366;382 sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN Isoform 4 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA;sp|P35398|RORA_HUMAN Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA PE=1 SV=2;sp|P35398-3|RORA_HUMAN Isoform 3 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo 1 55.7548 0.017368 55.755 18.518 55.755 1 55.7548 0.017368 55.755 3 Q VVEFAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGSLEVV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX RIDGFMELCQ(1)N(1)DQ(1)IVLLK RIDGFMELCQ(55.75)N(55.75)DQ(55.75)IVLLK 10 3 1.8911 889700 0 0 889700 NaN 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 899 774 294 294 3756 4270 11907 12489 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 sp|P35398-4|RORA_HUMAN;sp|P35398|RORA_HUMAN;sp|P35398-3|RORA_HUMAN;sp|P35398-1|RORA_HUMAN 297;352;369;385 sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN sp|P35398-4|RORA_HUMAN Isoform 4 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA;sp|P35398|RORA_HUMAN Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RORA PE=1 SV=2;sp|P35398-3|RORA_HUMAN Isoform 3 of Nuclear receptor ROR-alpha OS=Homo 1 55.7548 0.017368 55.755 18.518 55.755 1 55.7548 0.017368 55.755 3 Q FAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGSLEVVFIR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX RIDGFMELCQ(1)N(1)DQ(1)IVLLK RIDGFMELCQ(55.75)N(55.75)DQ(55.75)IVLLK 13 3 1.8911 889700 0 0 889700 NaN 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 889700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 900 774 297 297 3756 4270 11907 12489 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 11907 12489 20190902_JH_EV_Ubi_3 11953 sp|P35579|MYH9_HUMAN 1311 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 0.699125 3.2152 0.0256546 50.232 26.505 50.232 0.699125 3.2152 0.0256546 50.232 2 Q SSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX DFSALESQ(0.381)LQ(0.699)DTQ(0.82)ELLQ(0.079)EEN(0.021)R DFSALESQ(-3.22)LQ(3.22)DTQ(7.7)ELLQ(-10.72)EEN(-16.01)R 10 3 2.3833 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 901 776 1311 1311 467 543 1484 1577 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 sp|P35579|MYH9_HUMAN 1314 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 0.819648 7.7026 0.0256546 50.232 26.505 50.232 0.819648 7.7026 0.0256546 50.232 2 Q LTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLST X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX DFSALESQ(0.381)LQ(0.699)DTQ(0.82)ELLQ(0.079)EEN(0.021)R DFSALESQ(-3.22)LQ(3.22)DTQ(7.7)ELLQ(-10.72)EEN(-16.01)R 13 3 2.3833 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 902 776 1314 1314 467 543 1484 1577 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 1484 1577 20190902_JH_WT_Ubi_3 15789 sp|P35579|MYH9_HUMAN 986 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 0.553648 0.957845 0.0170489 68.283 7.8497 68.283 0.553648 0.957845 0.0170489 68.283 1 Q AKLKKLEEEQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KLEEEQ(0.002)IILEDQ(0.554)N(0.444)CK KLEEEQ(-23.84)IILEDQ(0.96)N(-0.96)CK 12 3 -0.876 2921900 2921900 0 0 0.071224 0 0 0 0 0 0 0 2921900 0 0 NaN 0 NaN 0 NaN NaN 0.21976 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2921900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 903 776 986 986 2380 2708 7809 8211 7809 8211 20190902_JH_WT_Ubi_2 9281 7809 8211 20190902_JH_WT_Ubi_2 9281 7809 8211 20190902_JH_WT_Ubi_2 9281 sp|P35579|MYH9_HUMAN 1291 sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN sp|P35579|MYH9_HUMAN Myosin-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH9 PE=1 SV=4 0.999857 38.1621 0.0224166 51.495 7.9386 51.495 0.999857 38.1621 0.0224166 51.495 2 Q TKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSAL X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LQ(0.065)VELDN(0.935)VTGLLSQ(1)SDSK LQ(-11.59)VELDN(11.59)VTGLLSQ(38.16)SDSK 14 3 2.7375 2239700 0 2239700 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2239700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2239700 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 904 776 1291 1291 2797 3173 9026 9497 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 9026 9497 20190902_JH_WT_Ubi_2 13819 sp|P35613-4|BASI_HUMAN;sp|P35613-2|BASI_HUMAN;sp|P35613|BASI_HUMAN;sp|P35613-3|BASI_HUMAN 190;254;370;161 sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN Isoform 4 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613-2|BASI_HUMAN Isoform 2 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613|BASI_HUMAN Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG PE=1 SV=2;sp|P35613-3|BASI_HUMAN Isoform 3 of 0.599166 5.23311 4.75105E-10 106.02 87.519 73.11 0.345759 0 0.000357098 73.994 0.599166 5.23311 4.75105E-10 106.02 0.30167 0 7.45894E-10 103.03 1 Q LDDDDAGSAPLKSSGQHQNDKGKNVRQRNSS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(0.599)HQ(0.239)N(0.162)DK KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(5.23)HQ(-5.23)N(-5.23)DK 21 3 -1.5636 701830 701830 0 0 0.0020082 0 0 0 0 0 701830 0 0 0 0 0 0 0 0 0.02398 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 701830 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 905 778 190 190 2416 2748 7913 8323 7913 8323 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5854 7912 8322 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5794 7912 8322 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5794 sp|P35613-4|BASI_HUMAN;sp|P35613-2|BASI_HUMAN;sp|P35613|BASI_HUMAN;sp|P35613-3|BASI_HUMAN 192;256;372;163 sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN sp|P35613-4|BASI_HUMAN Isoform 4 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613-2|BASI_HUMAN Isoform 2 of Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG;sp|P35613|BASI_HUMAN Basigin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BSG PE=1 SV=2;sp|P35613-3|BASI_HUMAN Isoform 3 of 0.432091 0 4.75105E-10 106.02 87.519 95.122 0.345759 0 0.000357098 73.994 0.420424 0 4.75105E-10 106.02 0.349165 0 7.45894E-10 103.03 0.432091 0 7.70463E-07 95.122 Q DDDAGSAPLKSSGQHQNDKGKNVRQRNSS__ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(0.136)HQ(0.432)N(0.432)DK KPEDVLDDDDAGSAPLKSSGQ(-5.66)HQ(0)N(0)DK 23 4 -1.8707 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 906 778 192 192 2416 2748 7916 8326 20190902_JH_WT_Ubi_3 6638 7912 8322 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5794 7912 8322 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5794 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN;sp|P35680|HNF1B_HUMAN 147;117;147;147 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN Isoform C of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN Isoform 4 of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN Isoform B of Hepatocyte nu 0.75 0 0.03186 40.012 6.6588 40.012 0.75 0 0.03186 40.012 Q HNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX EVVDVTGLN(0.75)Q(0.75)SHLSQ(0.75)HLN(0.75)KGTPMK EVVDVTGLN(0)Q(0)SHLSQ(0)HLN(0)KGTPMK 10 3 1.0458 5605600 0 0 5605600 NaN 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 907 779 147 147 1149 1296 3668 3862 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN;sp|P35680|HNF1B_HUMAN 152;122;152;152 sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN sp|P35680-3|HNF1B_HUMAN Isoform C of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-4|HNF1B_HUMAN Isoform 4 of Hepatocyte nuclear factor 1-beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNF1B;sp|P35680-2|HNF1B_HUMAN Isoform B of Hepatocyte nu 0.75 0 0.03186 40.012 6.6588 40.012 0.75 0 0.03186 40.012 Q REVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EVVDVTGLN(0.75)Q(0.75)SHLSQ(0.75)HLN(0.75)KGTPMK EVVDVTGLN(0)Q(0)SHLSQ(0)HLN(0)KGTPMK 15 3 1.0458 5605600 0 0 5605600 NaN 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5605600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 908 779 152 152 1149 1296 3668 3862 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 3668 3862 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9699 sp|P36871|PGM1_HUMAN 30 sp|P36871|PGM1_HUMAN sp|P36871|PGM1_HUMAN sp|P36871|PGM1_HUMAN Phosphoglucomutase-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PGM1 PE=1 SV=3 0.615219 3.11376 0.00497258 70.994 39.373 70.994 0.615219 3.11376 0.00497258 70.994 1 Q QKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIIS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP VFQ(0.615)SSAN(0.03)YAEN(0.03)FIQ(0.3)SIISTVEPAQ(0.025)R VFQ(3.11)SSAN(-13.19)YAEN(-13.19)FIQ(-3.11)SIISTVEPAQ(-13.84)R 3 3 3.7185 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 909 788 30 30 4817 5466 15457 16235 15457 16235 20190902_JH_WT_Ubi_2 16743 15457 16235 20190902_JH_WT_Ubi_2 16743 15457 16235 20190902_JH_WT_Ubi_2 16743 sp|P37088-3|SCNNA_HUMAN;sp|P37088-4|SCNNA_HUMAN;sp|P37088|SCNNA_HUMAN;sp|P37088-5|SCNNA_HUMAN;sp|P37088-6|SCNNA_HUMAN;sp|P37088-2|SCNNA_HUMAN 15;15;15;15;38;74 sp|P37088-3|SCNNA_HUMAN sp|P37088-3|SCNNA_HUMAN sp|P37088-3|SCNNA_HUMAN Isoform 3 of Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCNN1A;sp|P37088-4|SCNNA_HUMAN Isoform 4 of Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCNN1A;sp|P37088|SCNNA_ 0.992829 22.1131 0.00265281 82.877 49.253 82.877 0.992829 22.1131 0.00265281 82.877 1 Q _MEGNKLEEQDSSPPQSTPGLMKGNKREEQG X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LEEQ(0.006)DSSPPQ(0.993)STPGLMKGN(0.001)K LEEQ(-22.11)DSSPPQ(22.11)STPGLMKGN(-27.44)K 10 3 0.24363 910680 910680 0 0 0.024887 0 0 0 0 910680 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.13339 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 910680 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 910 794 15 15 2558 2908 8314 8739 8314 8739 20190902_JH_EV_Ubi_3 5356 8314 8739 20190902_JH_EV_Ubi_3 5356 8314 8739 20190902_JH_EV_Ubi_3 5356 sp|P37802|TAGL2_HUMAN;sp|P37802-2|TAGL2_HUMAN 177;198 sp|P37802|TAGL2_HUMAN sp|P37802|TAGL2_HUMAN sp|P37802|TAGL2_HUMAN Transgelin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAGLN2 PE=1 SV=3;sp|P37802-2|TAGL2_HUMAN Isoform 2 of Transgelin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAGLN2 0.499968 0 0.0219184 61.353 23.332 61.353 0.499968 0 0.0219184 61.353 1 Q FSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGY X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX NVIGLQ(0.5)MGTN(0.5)R N(-38.88)VIGLQ(0)MGTN(0)R 6 2 1.5445 14896000 14896000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 14896000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14896000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 911 796 177 177 3245 3706 10418 10962 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 10418 10962 20190902_JH_WT_Ubi_3 7666 sp|P40222|TXLNA_HUMAN 13 sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN sp|P40222|TXLNA_HUMAN Alpha-taxilin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXLNA PE=1 SV=3 1 66.6919 0.0226637 66.692 7.7112 66.692 1 66.6919 0.0226637 66.692 3 Q ___MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQPEAGPE X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX KN(1)GAAKQ(1)SN(1)PK KN(66.69)GAAKQ(66.69)SN(66.69)PK 7 2 1.2118 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 912 808 13 13 2401 2730 7858 8262 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 7858 8262 20190821_JH_MUT_Ubi 3386 sp|P40227-2|TCPZ_HUMAN;sp|P40227|TCPZ_HUMAN 137;182 sp|P40227-2|TCPZ_HUMAN sp|P40227-2|TCPZ_HUMAN sp|P40227-2|TCPZ_HUMAN Isoform 2 of T-complex protein 1 subunit zeta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCT6A;sp|P40227|TCPZ_HUMAN T-complex protein 1 subunit zeta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCT6A PE=1 SV=3 1 42.9131 0.0348448 42.913 7.2877 42.913 1 42.9131 0.0348448 42.913 1 Q VLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMIEIMEMK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K) XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP KQ(1)DEPIDLFMIEIMEMKHK KQ(42.91)DEPIDLFMIEIMEMKHK 2 3 -4.2462 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 913 809 137 137 2437 2772 7979 8390 7979 8390 20190821_JH_WT_Ubi 9929 7979 8390 20190821_JH_WT_Ubi 9929 7979 8390 20190821_JH_WT_Ubi 9929 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN;sp|P40763|STAT3_HUMAN 182;182;182 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN Isoform 3 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN Isoform Del-701 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P4076 0.873914 8.51373 0.017958 56.327 30.783 56.327 0.873914 8.51373 0.017958 56.327 3 Q NLQDDFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TLKSQ(0.874)GDMQ(0.139)DLN(0.982)GN(0.775)N(0.115)Q(0.115)SVTR TLKSQ(8.51)GDMQ(-8.51)DLN(18.78)GN(8.51)N(-8.51)Q(-8.51)SVTR 5 3 3.8285 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 914 812 182 182 4479 5079;5080;5081 14220 14925 14220 14925 20190821_JH_MUT_Ubi 3895 14220 14925 20190821_JH_MUT_Ubi 3895 14220 14925 20190821_JH_MUT_Ubi 3895 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN;sp|P40763|STAT3_HUMAN 186;186;186 sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN sp|P40763-3|STAT3_HUMAN Isoform 3 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P40763-2|STAT3_HUMAN Isoform Del-701 of Signal transducer and activator of transcription 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT3;sp|P4076 0.492106 0 0.029084 47.688 17.272 47.688 0.492106 0 0.029084 47.688 Q DFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TLKSQ(0.492)GDMQ(0.492)DLN(0.941)GN(0.655)N(0.21)Q(0.211)SVTR TLKSQ(0)GDMQ(0)DLN(15.38)GN(5.78)N(-5.78)Q(-5.78)SVTR 9 3 3.8285 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 915 812 186 186 4479 5079;5080;5081 14219 14924 20190821_JH_MUT_Ubi 3885 14219 14924 20190821_JH_MUT_Ubi 3885 14219 14924 20190821_JH_MUT_Ubi 3885 sp|P40925-2|MDHC_HUMAN;sp|P40925|MDHC_HUMAN;sp|P40925-3|MDHC_HUMAN 102;191;209 sp|P40925-2|MDHC_HUMAN sp|P40925-2|MDHC_HUMAN sp|P40925-2|MDHC_HUMAN Isoform 2 of Malate dehydrogenase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH1;sp|P40925|MDHC_HUMAN Malate dehydrogenase, cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MDH1 PE=1 SV=4;sp|P40925-3|MDHC_HUMAN Isoform 3 of Malate dehydrogenase, 0.714276 3.98518 0.0179026 69.935 42.664 69.935 0.617966 2.23473 0.0325256 63.337 0.714276 3.98518 0.0179026 69.935 1 Q NDVKNVIIWGNHSSTQYPDVNHAKVKLQGKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX NVIIWGN(0.285)HSSTQ(0.714)YPDVNHAK N(-46.5)VIIWGN(-3.99)HSSTQ(3.99)YPDVN(-32.78)HAK 12 3 1.3356 7972300 7972300 0 0 0.032484 0 0 4881900 0 0 0 0 3090400 0 0 0 0.054881 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4881900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3090400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 916 815 102 102 3246 3708 10426;10427 10970;10971 10427 10971 20190902_JH_WT_Ubi_2 8848 10427 10971 20190902_JH_WT_Ubi_2 8848 10427 10971 20190902_JH_WT_Ubi_2 8848 sp|P40937-2|RFC5_HUMAN;sp|P40937|RFC5_HUMAN 200;221 sp|P40937-2|RFC5_HUMAN sp|P40937-2|RFC5_HUMAN sp|P40937-2|RFC5_HUMAN Isoform 2 of Replication factor C subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RFC5;sp|P40937|RFC5_HUMAN Replication factor C subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RFC5 PE=1 SV=1 0.922417 11.167 0.03067 49.12 9.0074 49.12 0.922417 11.167 0.03067 49.12 1 Q VTLSSGDMRRALNILQSTNMAFGKVTEETVY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX ALN(0.071)ILQ(0.922)STN(0.007)MAFGK ALN(-11.17)ILQ(11.17)STN(-21.15)MAFGK 6 3 -0.35542 2022600 2022600 0 0 NaN 2022600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2022600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 917 817 200 200 212 241 704 773 704 773 20190821_JH_EV_Ubi 4511 704 773 20190821_JH_EV_Ubi 4511 704 773 20190821_JH_EV_Ubi 4511 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN;sp|P42356|PI4KA_HUMAN 177;1425 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA;sp|P42356|PI4KA_HUMAN Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA PE=1 SV=4 0.666667 0 0.011798 56.488 8.7744 56.488 0.666667 0 0.011798 56.488 2 Q FWTAMFSDKKYLTASQLVPPDNQDTRSNLDI X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX FWTAMFSDKKYLTASQ(0.667)LVPPDN(0.667)Q(0.667)DTR FWTAMFSDKKYLTASQ(0)LVPPDN(0)Q(0)DTR 16 3 2.761 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 918 830 177 177 1342 1523 4234 4452 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN;sp|P42356|PI4KA_HUMAN 184;1432 sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN sp|P42356-2|PI4KA_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA;sp|P42356|PI4KA_HUMAN Phosphatidylinositol 4-kinase alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PI4KA PE=1 SV=4 0.666667 0 0.011798 56.488 8.7744 56.488 0.666667 0 0.011798 56.488 2 Q DKKYLTASQLVPPDNQDTRSNLDITVGSRQQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX FWTAMFSDKKYLTASQ(0.667)LVPPDN(0.667)Q(0.667)DTR FWTAMFSDKKYLTASQ(0)LVPPDN(0)Q(0)DTR 23 3 2.761 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 919 830 184 184 1342 1523 4234 4452 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 4234 4452 20190902_JH_EV_Ubi_2 12284 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN;sp|P42684-6|ABL2_HUMAN;sp|P42684|ABL2_HUMAN 3;3;3;3;3 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN Isoform 8 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN Isoform 7 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN Isoform 5 of Abelson tyrosine 0.999957 45.7331 0.0349921 49.537 15.105 49.537 0.999957 45.7331 0.0349921 49.537 3 Q _____________MGQQVGRVGEAPGLQQPQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP MGQ(1)Q(1)VGRVGEAPGLQ(0.03)Q(0.45)PQ(0.52)PR MGQ(45.73)Q(45.73)VGRVGEAPGLQ(-12.38)Q(-0.63)PQ(0.63)PR 3 3 -3.5575 1644100 0 0 1644100 NaN 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 920 832 3 3 2918 3315 9404 9898 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN;sp|P42684-6|ABL2_HUMAN;sp|P42684|ABL2_HUMAN 4;4;4;4;4 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN Isoform 8 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN Isoform 7 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN Isoform 5 of Abelson tyrosine 0.999957 45.7331 0.0349921 49.537 15.105 49.537 0.999957 45.7331 0.0349921 49.537 3 Q ____________MGQQVGRVGEAPGLQQPQP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MGQ(1)Q(1)VGRVGEAPGLQ(0.03)Q(0.45)PQ(0.52)PR MGQ(45.73)Q(45.73)VGRVGEAPGLQ(-12.38)Q(-0.63)PQ(0.63)PR 4 3 -3.5575 1644100 0 0 1644100 NaN 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 921 832 4 4 2918 3315 9404 9898 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN;sp|P42684-6|ABL2_HUMAN;sp|P42684|ABL2_HUMAN 18;18;18;18;18 sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN sp|P42684-8|ABL2_HUMAN Isoform 8 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-7|ABL2_HUMAN Isoform 7 of Abelson tyrosine-protein kinase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABL2;sp|P42684-5|ABL2_HUMAN Isoform 5 of Abelson tyrosine 0.520083 0.629886 0.0349921 49.537 15.105 49.537 0.520083 0.629886 0.0349921 49.537 3 Q QQVGRVGEAPGLQQPQPRGIRGSSAARPSGR Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX MGQ(1)Q(1)VGRVGEAPGLQ(0.03)Q(0.45)PQ(0.52)PR MGQ(45.73)Q(45.73)VGRVGEAPGLQ(-12.38)Q(-0.63)PQ(0.63)PR 18 3 -3.5575 1644100 0 0 1644100 NaN 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1644100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 922 832 18 18 2918 3315 9404 9898 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 9404 9898 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7439 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN;sp|P43003|EAA1_HUMAN 479;524 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN Isoform 2 of Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3;sp|P43003|EAA1_HUMAN Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3 PE=1 SV=1 0.940422 13.3807 4.1504E-05 89.557 50.624 89.557 0.940422 13.3807 4.1504E-05 89.557 1 Q MGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSE Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP PYQ(0.94)LIAQ(0.047)DN(0.013)ETEKPIDSETKM PYQ(13.38)LIAQ(-13.38)DN(-19)ETEKPIDSETKM 3 3 1.6108 1038800 1038800 0 0 0.020323 0 0 0 1038800 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.051874 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1038800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 923 836 479 479 3593 4100;4101 11573 12150 11573 12150 20190902_JH_EV_Ubi_2 7785 11573 12150 20190902_JH_EV_Ubi_2 7785 11573 12150 20190902_JH_EV_Ubi_2 7785 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN;sp|P43003|EAA1_HUMAN 483;528 sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN sp|P43003-2|EAA1_HUMAN Isoform 2 of Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3;sp|P43003|EAA1_HUMAN Excitatory amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A3 PE=1 SV=1 0.48865 0 8.60391E-06 94.973 68.231 94.973 0.48865 0 8.60391E-06 94.973 Q VIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM_ X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX PYQ(0.023)LIAQ(0.489)DN(0.489)ETEKPIDSETKM PYQ(-13.33)LIAQ(0)DN(0)ETEKPIDSETKM 7 3 1.4099 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 924 836 483 483 3593 4100;4101 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 11575 12152 20190902_JH_EV_Ubi_3 7871 sp|P43007|SATT_HUMAN 15 sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN sp|P43007|SATT_HUMAN Neutral amino acid transporter A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC1A4 PE=1 SV=1 0.997159 25.2207 1.36492E-24 138.12 112.97 138.12 0.995483 22.3977 0.013381 58.776 0.973017 13.3329 9.95514E-05 101 0.997159 25.2207 1.36492E-24 138.12 2 Q _MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAG X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MEKSN(0.055)ETN(0.948)GYLDSAQ(0.997)AGPAAGPGAPGTAAGR MEKSN(-12.59)ETN(12.59)GYLDSAQ(25.22)AGPAAGPGAPGTAAGR 15 3 4.1241 1886600 0 1886600 0 NaN 0 0 0 0 471080 0 0 0 1415500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 471080 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1415500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 925 837 15 15 2901 3293;3294;3295 9354;9355;9356 9847;9848;9849 9355 9848 20190902_JH_WT_Ubi_3 9649 9355 9848 20190902_JH_WT_Ubi_3 9649 9355 9848 20190902_JH_WT_Ubi_3 9649 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN;sp|P45974|UBP5_HUMAN 363;363 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN Isoform Short of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5;sp|P45974|UBP5_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5 PE=1 SV=2 0.494464 0 3.55382E-05 94.564 56.94 92.136 0.494464 0 5.02959E-05 92.136 0.492468 0 3.55382E-05 94.564 Q PDFQRKYVDKLEKIFQNAPTDPTQDFSTQVA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LEKIFQ(0.494)N(0.494)APTDPTQ(0.011)DFSTQVAK LEKIFQ(0)N(0)APTDPTQ(-16.52)DFSTQ(-38.88)VAK 6 3 0.98981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 926 849 363 363 2569 2920 8349 8778 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10871 8350 8779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9860 8350 8779 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9860 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN;sp|P45974|UBP5_HUMAN 371;371 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN Isoform Short of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5;sp|P45974|UBP5_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5 PE=1 SV=2 0.999935 41.8508 1.30983E-35 171.83 132.94 171.83 0.548025 5.43938 0.000766101 84.113 0.998049 27.1244 4.8315E-06 103.28 0.999935 41.8508 1.30983E-35 171.83 1 Q DKLEKIFQNAPTDPTQDFSTQVAKLGHGLLS X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX LEKIFQNAPTDPTQ(1)DFSTQVAK LEKIFQ(-77.98)N(-73.07)APTDPTQ(41.85)DFSTQ(-41.85)VAK 14 3 0.033582 21762000 21762000 0 0 0.026341 0 0 0 0 4415200 10920000 0 6426800 0 0 0 0 0 0.090381 0.083978 0 0.063411 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4415200 0 0 10920000 0 0 0 0 0 6426800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 927 849 371 371 2569 2920 8347;8348;8351 8776;8777;8780;8781 8351 8780 20190902_JH_WT_Ubi_2 11542 8351 8780 20190902_JH_WT_Ubi_2 11542 8351 8780 20190902_JH_WT_Ubi_2 11542 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN;sp|P45974|UBP5_HUMAN 376;376 sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN sp|P45974-2|UBP5_HUMAN Isoform Short of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5;sp|P45974|UBP5_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP5 PE=1 SV=2 0.735463 4.49295 0.0302392 56.017 34.418 56.017 0.735463 4.49295 0.0302392 56.017 Q IFQNAPTDPTQDFSTQVAKLGHGLLSGEYSK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LEKIFQ(0.002)N(0.002)APTDPTQ(0.261)DFSTQ(0.735)VAK LEKIFQ(-26.71)N(-26.71)APTDPTQ(-4.49)DFSTQ(4.49)VAK 19 3 -0.17469 6126400 6126400 0 0 0.0074157 0 0 0 0 0 0 0 0 6126400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.090234 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6126400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 928 849 376 376 2569 2920 8352 8782 8352 8782 20190902_JH_WT_Ubi_3 11020 8352 8782 20190902_JH_WT_Ubi_3 11020 8352 8782 20190902_JH_WT_Ubi_3 11020 sp|P46940|IQGA1_HUMAN 439 sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN sp|P46940|IQGA1_HUMAN Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IQGAP1 PE=1 SV=1 0.618329 2.09555 0.0158865 61.524 30.94 61.524 0.618329 2.09555 0.0158865 61.524 1 Q FAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.618)SPEHN(0.382)LTHPELSVAVEMLSSVALINR Q(2.1)SPEHN(-2.1)LTHPELSVAVEMLSSVALIN(-44.55)R 1 3 1.2819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 929 863 439 439 3699 4210 11771 12352 11771 12352 20190902_JH_WT_Ubi_2 14827 11771 12352 20190902_JH_WT_Ubi_2 14827 11771 12352 20190902_JH_WT_Ubi_2 14827 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 249 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 0.609411 1.02781 0.0143417 49.662 24.641 49.662 0.609411 1.02781 0.0143417 49.662 2 Q PGFGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EAGFPPGVVN(0.505)IVPGFGPTVGAAISSHPQ(0.609)IN(0.885)K EAGFPPGVVN(-1.03)IVPGFGPTVGAAISSHPQ(1.03)IN(6.36)K 28 3 2.4641 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 930 865 249 249 790 895 2485 2617 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 2485 2617 20190821_JH_WT_Ubi 14164 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 359 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 0.499994 0 0.0279246 83.204 45.59 83.204 0.499994 0 0.0279246 83.204 1 Q GDPFDVKTEQGPQIDQKQFDKILELIESGKK X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K) XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX TEQGPQIDQ(0.5)KQ(0.5)FDK TEQ(-70.37)GPQ(-46.57)IDQ(0)KQ(0)FDK 9 3 1.2331 4590200 4590200 0 0 0.0058261 0 0 0 0 4590200 0 0 0 0 0 0 0 0 0.063894 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4590200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 931 865 359 359 4320 4902 13684 14355 13684 14355 20190902_JH_EV_Ubi_3 5735 13684 14355 20190902_JH_EV_Ubi_3 5735 13684 14355 20190902_JH_EV_Ubi_3 5735 sp|P47895|AL1A3_HUMAN 361 sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN sp|P47895|AL1A3_HUMAN Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH1A3 PE=1 SV=2 0.647828 2.8245 0.0104952 83.204 45.59 80.469 0.499994 0 0.0279246 83.204 0.647828 2.8245 0.0104952 80.469 1 Q PFDVKTEQGPQIDQKQFDKILELIESGKKEG X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX TEQGPQ(0.014)IDQ(0.339)KQ(0.648)FDK TEQ(-39.95)GPQ(-16.81)IDQ(-2.82)KQ(2.82)FDK 11 2 0.87034 5132900 5132900 0 0 0.0065149 0 0 0 0 4590200 0 0 0 0 0 0 0 0 0.063894 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4590200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 932 865 361 361 4320 4902 13684;13685 14355;14356 13685 14356 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6043 13684 14355 20190902_JH_EV_Ubi_3 5735 13685 14356 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6043 sp|P49454|CENPF_HUMAN 96 sp|P49454|CENPF_HUMAN sp|P49454|CENPF_HUMAN sp|P49454|CENPF_HUMAN Centromere protein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CENPF PE=1 SV=2 0.590092 2.01279 0.0355873 41.257 16.97 41.257 0.590092 2.01279 0.0355873 41.257 1 Q KTKQKISHELQVKESQVNFQEGQLNSGKKQI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP ESQ(0.59)VN(0.371)FQ(0.035)EGQ(0.002)LN(0.002)SGKKQIEK ESQ(2.01)VN(-2.01)FQ(-12.23)EGQ(-25.82)LN(-25.82)SGKKQ(-33.26)IEK 3 3 -4.3991 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 933 887 96 96 1103 1243 3508 3685 3508 3685 20190902_JH_EV_Ubi_3 8865 3508 3685 20190902_JH_EV_Ubi_3 8865 3508 3685 20190902_JH_EV_Ubi_3 8865 sp|P49792|RBP2_HUMAN 1318 sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN sp|P49792|RBP2_HUMAN E3 SUMO-protein ligase RanBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RANBP2 PE=1 SV=2 1 41.8708 0.0258496 41.871 10.256 41.871 1 41.8708 0.0258496 41.871 3 Q SILKAPGTNVAMASNQAVRIVKEPTSHDNKD X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX APGTN(1)VAMASN(1)Q(1)AVRIVK APGTN(41.87)VAMASN(41.87)Q(41.87)AVRIVK 12 3 0.44952 1204000 0 0 1204000 NaN 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 934 896 1318 1318 240 279 814 886 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 814 886 20190902_JH_EV_Ubi_3 9006 sp|P50443|S26A2_HUMAN 8 sp|P50443|S26A2_HUMAN sp|P50443|S26A2_HUMAN sp|P50443|S26A2_HUMAN Sulfate transporter OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A2 PE=1 SV=2 0.5 0 0.0195323 90.697 42.129 90.697 0.5 0 0.0195323 90.697 1 Q ________MSSESKEQHNVSPRDSAEGNDSY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SSESKEQ(0.5)HN(0.5)VSPR SSESKEQ(0)HN(0)VSPR 7 3 1.2514 1284000 1284000 0 0 0.018201 0 0 0 1284000 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.052081 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1284000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 935 905 8 8 4151 4718 13165 13806 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 13165 13806 20190902_JH_EV_Ubi_2 3783 sp|P50750|CDK9_HUMAN;sp|P50750-2|CDK9_HUMAN 348;465 sp|P50750|CDK9_HUMAN sp|P50750|CDK9_HUMAN sp|P50750|CDK9_HUMAN Cyclin-dependent kinase 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK9 PE=1 SV=3;sp|P50750-2|CDK9_HUMAN Isoform 2 of Cyclin-dependent kinase 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDK9 0.991995 23.1028 0.0137889 68.536 25.733 68.536 0.991995 23.1028 0.0137889 68.536 1 Q TSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX RKGSQ(0.992)ITQ(0.001)Q(0.001)STN(0.005)Q(0.001)SR RKGSQ(23.1)ITQ(-29.75)Q(-29.75)STN(-23.1)Q(-29.75)SR 5 2 2.4402 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 936 909 348 348 3759 4273 11915 12498 11915 12498 20190902_JH_WT_Ubi_3 11925 11915 12498 20190902_JH_WT_Ubi_3 11925 11915 12498 20190902_JH_WT_Ubi_3 11925 sp|P51114|FXR1_HUMAN;sp|P51114-2|FXR1_HUMAN;sp|P51114-3|FXR1_HUMAN 242;242;157 sp|P51114|FXR1_HUMAN sp|P51114|FXR1_HUMAN sp|P51114|FXR1_HUMAN Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FXR1 PE=1 SV=3;sp|P51114-2|FXR1_HUMAN Isoform 2 of Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FXR1;sp|P51114-3|F 0.94568 12.4072 0.0277032 73.593 11.216 73.593 0.94568 12.4072 0.0277032 73.593 2 Q EDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX EDLMGLAIGTHGSN(1)IQ(0.946)Q(0.054)AR EDLMGLAIGTHGSN(38.5)IQ(12.41)Q(-12.41)AR 16 3 -1.3226 12422000 0 12422000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12422000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12422000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 937 914 242 242 822 928 2576 2711 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 2576 2711 20190902_JH_WT_Ubi_3 9652 sp|P51148|RAB5C_HUMAN;sp|P51148-2|RAB5C_HUMAN 95;128 sp|P51148|RAB5C_HUMAN sp|P51148|RAB5C_HUMAN sp|P51148|RAB5C_HUMAN Ras-related protein Rab-5C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB5C PE=1 SV=2;sp|P51148-2|RAB5C_HUMAN Isoform 2 of Ras-related protein Rab-5C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB5C 0.985971 18.4685 0.014999 91.401 56.309 91.401 0.985971 18.4685 0.014999 91.401 1 Q QERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP GAQ(0.986)AAIVVYDITN(0.014)TDTFAR GAQ(18.47)AAIVVYDITN(-18.47)TDTFAR 3 3 -1.6484 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 938 915 95 95 1381 1573 4405 4629 4405 4629 20190821_JH_EV_Ubi 12694 4405 4629 20190821_JH_EV_Ubi 12694 4405 4629 20190821_JH_EV_Ubi 12694 sp|P51826|AFF3_HUMAN;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN 179;204 sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 PE=1 SV=2;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN Isoform 2 of AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 0.744296 0 0.0347404 41.202 15.694 41.202 0.744296 0 0.0347404 41.202 4 Q QQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.744)Q(0.744)PRAKQ(0.744)VCN(0.764)VEVGLQ(0.006)TQ(0.997)ER Q(0)Q(0)PRAKQ(0)VCN(0.35)VEVGLQ(-26.11)TQ(26.43)ER 1 3 1.2386 1900000 0 0 1900000 NaN 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 939 927 179 179 3691 4202 11762 12343 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 sp|P51826|AFF3_HUMAN;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN 180;205 sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 PE=1 SV=2;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN Isoform 2 of AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 0.744296 0 0.0347404 41.202 15.694 41.202 0.744296 0 0.0347404 41.202 4 Q QGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.744)Q(0.744)PRAKQ(0.744)VCN(0.764)VEVGLQ(0.006)TQ(0.997)ER Q(0)Q(0)PRAKQ(0)VCN(0.35)VEVGLQ(-26.11)TQ(26.43)ER 2 3 1.2386 1900000 0 0 1900000 NaN 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 940 927 180 180 3691 4202 11762 12343 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 sp|P51826|AFF3_HUMAN;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN 185;210 sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 PE=1 SV=2;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN Isoform 2 of AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 0.744296 0 0.0347404 41.202 15.694 41.202 0.744296 0 0.0347404 41.202 4 Q TLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.744)Q(0.744)PRAKQ(0.744)VCN(0.764)VEVGLQ(0.006)TQ(0.997)ER Q(0)Q(0)PRAKQ(0)VCN(0.35)VEVGLQ(-26.11)TQ(26.43)ER 7 3 1.2386 1900000 0 0 1900000 NaN 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 941 927 185 185 3691 4202 11762 12343 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 sp|P51826|AFF3_HUMAN;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN 196;221 sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN sp|P51826|AFF3_HUMAN AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 PE=1 SV=2;sp|P51826-2|AFF3_HUMAN Isoform 2 of AF4/FMR2 family member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFF3 0.99739 26.4324 0.0347404 41.202 15.694 41.202 0.99739 26.4324 0.0347404 41.202 4 Q PRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGH X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(0.744)Q(0.744)PRAKQ(0.744)VCN(0.764)VEVGLQ(0.006)TQ(0.997)ER Q(0)Q(0)PRAKQ(0)VCN(0.35)VEVGLQ(-26.11)TQ(26.43)ER 18 3 1.2386 1900000 0 0 1900000 NaN 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 942 927 196 196 3691 4202 11762 12343 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 11762 12343 20190821_JH_WT_Ubi 6198 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN;sp|P52630|STAT2_HUMAN 122;126 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN Isoform 2 of Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2;sp|P52630|STAT2_HUMAN Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2 PE=1 SV=1 0.761772 0.768784 0.0220053 40.142 8.3228 40.142 0.761772 0.768784 0.0220053 40.142 Q LLLEEKRILIQAQRAQLEQGEPVLETPVESQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP AQ(0.762)LEQ(0.775)GEPVLETPVESQ(0.716)Q(0.747)HEIESRILDLR AQ(0.77)LEQ(1.02)GEPVLETPVESQ(-0.52)Q(0.52)HEIESRILDLR 2 4 0.13178 676920 0 0 676920 NaN 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 943 938 122 122 254 300 884 961 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN;sp|P52630|STAT2_HUMAN 125;129 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN Isoform 2 of Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2;sp|P52630|STAT2_HUMAN Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2 PE=1 SV=1 0.775133 1.01946 0.0220053 40.142 8.3228 40.142 0.775133 1.01946 0.0220053 40.142 Q EEKRILIQAQRAQLEQGEPVLETPVESQQHE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AQ(0.762)LEQ(0.775)GEPVLETPVESQ(0.716)Q(0.747)HEIESRILDLR AQ(0.77)LEQ(1.02)GEPVLETPVESQ(-0.52)Q(0.52)HEIESRILDLR 5 4 0.13178 676920 0 0 676920 NaN 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 944 938 125 125 254 300 884 961 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN;sp|P52630|STAT2_HUMAN 138;142 sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN sp|P52630-4|STAT2_HUMAN Isoform 2 of Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2;sp|P52630|STAT2_HUMAN Signal transducer and activator of transcription 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STAT2 PE=1 SV=1 0.747456 0.515349 0.0220053 40.142 8.3228 40.142 0.747456 0.515349 0.0220053 40.142 Q LEQGEPVLETPVESQQHEIESRILDLRAMME X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AQ(0.762)LEQ(0.775)GEPVLETPVESQ(0.716)Q(0.747)HEIESRILDLR AQ(0.77)LEQ(1.02)GEPVLETPVESQ(-0.52)Q(0.52)HEIESRILDLR 18 4 0.13178 676920 0 0 676920 NaN 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 676920 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 945 938 138 138 254 300 884 961 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 884 961 20190821_JH_MUT_Ubi 9263 sp|P53794|SC5A3_HUMAN 635 sp|P53794|SC5A3_HUMAN sp|P53794|SC5A3_HUMAN sp|P53794|SC5A3_HUMAN Sodium/myo-inositol cotransporter OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC5A3 PE=1 SV=2 0.69674 3.61865 0.000287192 57.009 30.453 57.009 0.69674 3.61865 0.000287192 57.009 1 Q GHSEAETPVDAYSNGQAALMGEKERKKETDD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX EEGNPVASLGHSEAETPVDAYSN(0.303)GQ(0.697)AALMGEKER EEGN(-32.14)PVASLGHSEAETPVDAYSN(-3.62)GQ(3.62)AALMGEKER 25 4 0.33201 1738700 1738700 0 0 NaN 1738700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1738700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 946 954 635 635 854 964 2692 2832 2692 2832 20190821_JH_EV_Ubi 8716 2692 2832 20190821_JH_EV_Ubi 8716 2692 2832 20190821_JH_EV_Ubi 8716 sp|P53985|MOT1_HUMAN 486 sp|P53985|MOT1_HUMAN sp|P53985|MOT1_HUMAN sp|P53985|MOT1_HUMAN Monocarboxylate transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC16A1 PE=1 SV=3 1 70.9876 2.26441E-33 165.9 125.89 165.9 0.999658 34.7213 3.87548E-09 104.3 0.999992 51.4409 1.12774E-14 128.95 1 70.9876 2.26441E-33 165.9 1 Q AGKPNEVTKAAESPDQKDTDGGPKEEESPV_ X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX EEETSIDVAGKPNEVTKAAESPDQ(1)K EEETSIDVAGKPN(-70.99)EVTKAAESPDQ(70.99)K 24 3 0.94143 4520100 4520100 0 0 0.0368 0 0 0 1405000 0 0 1096500 0 2018700 NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0.016612 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1405000 0 0 0 0 0 0 0 0 1096500 0 0 0 0 0 2018700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 947 955 486 486 846 955 2663;2665;2666 2803;2805;2806 2666 2806 20190902_JH_WT_Ubi_3 7479 2666 2806 20190902_JH_WT_Ubi_3 7479 2666 2806 20190902_JH_WT_Ubi_3 7479 sp|P55036|PSMD4_HUMAN 267 sp|P55036|PSMD4_HUMAN sp|P55036|PSMD4_HUMAN sp|P55036|PSMD4_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD4 PE=1 SV=1 0.601938 1.79602 0.0014668 57.328 38.144 57.328 0.601938 1.79602 0.0014668 57.328 1 Q GTEDSDDALLKMTISQQEFGRTGLPDLSSMT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX AAAASAAEAGIATTGTEDSDDALLKMTISQ(0.602)Q(0.398)EFGR AAAASAAEAGIATTGTEDSDDALLKMTISQ(1.8)Q(-1.8)EFGR 30 3 4.0636 1916500 1916500 0 0 0.024507 0 0 0 0 0 1916500 0 0 0 0 0 0 0 0 0.75735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1916500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 948 971 267 267 3 5 28 32 28 32 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13215 28 32 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13215 28 32 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13215 sp|P55072|TERA_HUMAN 19 sp|P55072|TERA_HUMAN sp|P55072|TERA_HUMAN sp|P55072|TERA_HUMAN Transitional endoplasmic reticulum ATPase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VCP PE=1 SV=4 1 127.868 0.00121519 127.87 63.048 127.87 1 127.868 0.00121519 127.87 1 105.134 0.0190632 105.13 1 88.1551 0.00915025 88.155 1 121.287 0.00265322 121.29 1 127.868 0.00121519 127.87 1 Q GADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINE X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX GDDLSTAILKQ(1)K GDDLSTAILKQ(127.87)K 11 3 0.43162 22399000 22399000 0 0 0.038172 0 0 0 2590500 0 3935400 0 8505800 7366800 0 0 0 0.055935 0 0.094231 0 0.072844 0.065394 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2590500 0 0 0 0 0 3935400 0 0 0 0 0 8505800 0 0 7366800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 949 974 19 19 1394 1588 4443;4444;4445;4446;4447 4668;4669;4670;4671;4672 4447 4672 20190902_JH_WT_Ubi_3 8475 4447 4672 20190902_JH_WT_Ubi_3 8475 4447 4672 20190902_JH_WT_Ubi_3 8475 sp|P55157|MTP_HUMAN 316 sp|P55157|MTP_HUMAN sp|P55157|MTP_HUMAN sp|P55157|MTP_HUMAN Microsomal triglyceride transfer protein large subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTTP PE=1 SV=1 1 83.0814 0.0165099 83.081 17.735 83.081 1 83.0814 0.0165099 83.081 2 Q CPSLSELWRSTRKYLQPDNLSKAEAVRNFLA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX STRKYLQ(1)PDN(1)LSK STRKYLQ(83.08)PDN(83.08)LSK 7 2 2.2017 26108000 0 26108000 0 NaN 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 950 978 316 316 4197 4767 13301 13954 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 13301 13954 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8568 sp|P55196-2|AFAD_HUMAN;sp|P55196-6|AFAD_HUMAN;sp|P55196-3|AFAD_HUMAN;sp|P55196-1|AFAD_HUMAN;sp|P55196|AFAD_HUMAN;sp|P55196-5|AFAD_HUMAN 1525;1541;1524;1524;1541;1540 sp|P55196-2|AFAD_HUMAN sp|P55196-2|AFAD_HUMAN sp|P55196-2|AFAD_HUMAN Isoform 1 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-6|AFAD_HUMAN Isoform 6 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-3|AFAD_HUMAN Isoform 3 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-1|AFAD_HUMAN Isoform 0.377054 0 0.0344339 40.689 14.063 40.689 0.377054 0 0.0344339 40.689 Q KQQQMHIVDMLSKEIQELQSKPDRSAEESDR X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LEKQ(0.082)Q(0.082)Q(0.082)MHIVDMLSKEIQ(0.377)ELQ(0.377)SK LEKQ(-6.68)Q(-6.68)Q(-6.68)MHIVDMLSKEIQ(0)ELQ(0)SK 18 3 -3.2036 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 951 979 1525 1525 2570 2921 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 sp|P55196-2|AFAD_HUMAN;sp|P55196-6|AFAD_HUMAN;sp|P55196-3|AFAD_HUMAN;sp|P55196-1|AFAD_HUMAN;sp|P55196|AFAD_HUMAN;sp|P55196-5|AFAD_HUMAN 1528;1544;1527;1527;1544;1543 sp|P55196-2|AFAD_HUMAN sp|P55196-2|AFAD_HUMAN sp|P55196-2|AFAD_HUMAN Isoform 1 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-6|AFAD_HUMAN Isoform 6 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-3|AFAD_HUMAN Isoform 3 of Afadin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AFDN;sp|P55196-1|AFAD_HUMAN Isoform 0.377054 0 0.0344339 40.689 14.063 40.689 0.377054 0 0.0344339 40.689 Q QMHIVDMLSKEIQELQSKPDRSAEESDRLRK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LEKQ(0.082)Q(0.082)Q(0.082)MHIVDMLSKEIQ(0.377)ELQ(0.377)SK LEKQ(-6.68)Q(-6.68)Q(-6.68)MHIVDMLSKEIQ(0)ELQ(0)SK 21 3 -3.2036 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 952 979 1528 1528 2570 2921 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 8353 8783 20190821_JH_EV_Ubi 8538 sp|P57679|EVC_HUMAN 259 sp|P57679|EVC_HUMAN sp|P57679|EVC_HUMAN sp|P57679|EVC_HUMAN Ellis-van Creveld syndrome protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EVC PE=1 SV=1 1 79.659 0.0313413 79.659 36.816 79.659 1 79.659 0.0313413 79.659 Q LLDLLPKKKSDDELYQKILSKQEKDLEELEK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX SDDELYQ(1)KILSK SDDELYQ(79.66)KILSK 7 3 1.4547 1324300 1324300 0 0 NaN 0 0 1324300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1324300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 953 991 259 259 3846 4368 12188 12782 12188 12782 20190821_JH_WT_Ubi 6383 12188 12782 20190821_JH_WT_Ubi 6383 12188 12782 20190821_JH_WT_Ubi 6383 sp|P58107|EPIPL_HUMAN 5070 sp|P58107|EPIPL_HUMAN sp|P58107|EPIPL_HUMAN sp|P58107|EPIPL_HUMAN Epiplakin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPPK1 PE=1 SV=3 0.99886 29.4245 1.90883E-22 161.26 8.3622 154.81 0.99886 29.4245 2.37827E-17 154.81 0.993395 21.7724 1.90883E-22 161.26 1 Q FDPNTHENLTYLQLLQRATLDPETGLLFLSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX GFFDPNTHENLTYLQ(0.001)LLQ(0.999)R GFFDPN(-108.49)THEN(-86.97)LTYLQ(-29.42)LLQ(29.42)R 18 3 -0.42885 14808000 14808000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 1126500 0 0 13682000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1126500 0 0 0 0 0 0 0 0 13682000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 954 992 5070 5070 1452 1653 4608;4609 4841;4842 4608 4841 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14058 4609 4842 20190902_JH_WT_Ubi_3 14279 4609 4842 20190902_JH_WT_Ubi_3 14279 sp|P60660|MYL6_HUMAN;sp|P60660-2|MYL6_HUMAN 75;75 sp|P60660|MYL6_HUMAN sp|P60660|MYL6_HUMAN sp|P60660|MYL6_HUMAN Myosin light polypeptide 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYL6 PE=1 SV=2;sp|P60660-2|MYL6_HUMAN Isoform Smooth muscle of Myosin light polypeptide 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYL6 1 60.6574 0.0255316 60.657 26.816 60.657 1 55.3353 0.0370838 55.335 1 60.6574 0.0255316 60.657 1 Q MNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VLDFEHFLPMLQ(1)TVAK VLDFEHFLPMLQ(60.66)TVAK 12 3 0.90488 3314700 3314700 0 0 0.025451 0 0 0 0 0 0 0 1373200 1941600 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0.10779 0.11835 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1373200 0 0 1941600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 955 999 75 75 4887 5549 15711;15712 16512;16513 15712 16513 20190902_JH_WT_Ubi_3 14877 15712 16513 20190902_JH_WT_Ubi_3 14877 15712 16513 20190902_JH_WT_Ubi_3 14877 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN 263;263 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1 0.99853 28.3206 0.002595 51.811 32.931 51.811 0.99853 28.3206 0.002595 51.811 0.997479 25.9739 0.00740588 48.204 0.996597 24.6671 0.0179718 41.222 1 Q ITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP CPEALFQ(0.999)PSFLGMESCGIHETTFN(0.001)SIMK CPEALFQ(28.32)PSFLGMESCGIHETTFN(-28.32)SIMK 7 3 0.3276 76195000 76195000 0 0 2.3167 0 0 0 0 0 0 4861600 31593000 39739000 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN 9.1405 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4861600 0 0 31593000 0 0 39739000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 956 1000;1087 263;263 263 356 420;421 1191;1192;1193 1278;1279;1280 1191 1278 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12584 1191 1278 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12584 1191 1278 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12584 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN;sp|P68032|ACTC_HUMAN;sp|P63267|ACTH_HUMAN;sp|P62736|ACTA_HUMAN 49;49;51;51;50;51 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1;sp|P68133|ACTS_HUMAN Actin, alpha skeletal muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTA1 PE=1 0.84204 8.99616 0.0290674 45.659 27.279 45.659 0.84204 8.99616 0.0290674 45.659 1 Q IVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX HQ(0.017)GVMVGMGQ(0.842)KDSYVGDEAQ(0.141)SK HQ(-16.98)GVMVGMGQ(9)KDSYVGDEAQ(-9)SK 10 3 -0.036553 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 957 1000;1087;1094 49;49;51 49 1977 2252 6463 6799 6463 6799 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4837 6463 6799 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4837 6463 6799 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4837 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN 225;225;925 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN POTE ankyrin domain family member E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PO 1 108.276 1.12125E-06 108.28 69.499 108.28 1 108.276 1.12125E-06 108.28 1 Q RDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSY X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX LCYVALDFEQ(1)EMATAASSSSLEK LCYVALDFEQ(108.28)EMATAASSSSLEK 10 3 2.4345 8832900 8832900 0 0 0.014786 0 0 0 0 0 0 0 0 7760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.060222 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7760000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 958 1000;1087;1490 225;225;925 225 2524 2867;2868 8211;8212 8633;8634 8212 8634 20190902_JH_WT_Ubi_3 15236 8212 8634 20190902_JH_WT_Ubi_3 15236 8212 8634 20190902_JH_WT_Ubi_3 15236 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63267-2|ACTH_HUMAN;sp|Q9BYX7|ACTBM_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN;sp|P68032|ACTC_HUMAN;sp|P63267|ACTH_HUMAN;sp|P62736|ACTA_HUMAN;sp|Q562R1|ACTBL_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN;sp|A5A3E0|POTEF_HUMAN 246;204;246;246;248;248;247;248;247;946;946 sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN;sp|Q562R1|ACTBL_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63267-2|ACTH_HUMAN Isoform 2 of Actin, gamma-enteric smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG2;sp|Q9BYX7|ACTBM_HUMAN Putative beta-actin-like protein 3 OS=Homo sap 0.998781 29.133 7.90368E-25 174.95 116.27 174.95 0.998781 29.133 7.90368E-25 174.95 0.630749 2.32535 1.15548E-24 171.21 1 Q AASSSPERSYELPDGQVITIGNERFRCPEAI;ASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEAL;ASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SYELPDGQ(0.999)VITIGN(0.001)ER SYELPDGQ(29.13)VITIGN(-29.13)ER 8 2 2.6629 25724000 25724000 0 0 0.0446 0 0 0 0 0 0 0 11944000 13780000 NaN NaN 0 NaN NaN 0 0 2.0647 1.7974 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11944000 0 0 13780000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 959 1000;1087;1094;1420;1490 246;246;248;247;946 246 4233 4808 13388;13389 14046;14047 13388 14046 20190902_JH_WT_Ubi_2 13145 13388 14046 20190902_JH_WT_Ubi_2 13145 13388 14046 20190902_JH_WT_Ubi_2 13145 sp|P84077|ARF1_HUMAN;sp|P61204|ARF3_HUMAN;sp|P84085|ARF5_HUMAN;sp|P18085|ARF4_HUMAN 83;83;83;83 sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN ADP-ribosylation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF1 PE=1 SV=2;sp|P61204|ARF3_HUMAN ADP-ribosylation factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF3 PE=1 SV=2;sp|P84085|ARF5_HUMAN ADP-ribosylation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF5 0.382427 0 0.000236355 109.04 51.753 109.04 0.382427 0 0.000236355 109.04 0.333333 0 0.000960872 100.04 Q VGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPX HYFQ(0.382)N(0.382)TQ(0.235)GLIFVVDSNDR HYFQ(0)N(0)TQ(-2.11)GLIFVVDSN(-62.5)DR 4 3 2.554 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 960 1018 83 83 2047;2048 2341;2343 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 6801 7157 20190902_JH_MUT_Ubi_2 12187 sp|P84077|ARF1_HUMAN;sp|P61204|ARF3_HUMAN;sp|P84085|ARF5_HUMAN;sp|P18085|ARF4_HUMAN 86;86;86;86 sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN sp|P84077|ARF1_HUMAN ADP-ribosylation factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF1 PE=1 SV=2;sp|P61204|ARF3_HUMAN ADP-ribosylation factor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF3 PE=1 SV=2;sp|P84085|ARF5_HUMAN ADP-ribosylation factor 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARF5 0.333333 0 0.000960872 100.04 57.011 100.04 0.333333 0 0.000960872 100.04 Q QDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HYFQ(0.333)N(0.333)TQ(0.333)GLIFVVDSNDR HYFQ(0)N(0)TQ(0)GLIFVVDSN(-68.74)DR 7 3 1.3673 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 961 1018 86 86 2047;2048 2341;2343 6804 7160 20190902_JH_WT_Ubi_2 12914 6804 7160 20190902_JH_WT_Ubi_2 12914 6804 7160 20190902_JH_WT_Ubi_2 12914 sp|P62258-2|1433E_HUMAN;sp|P62258|1433E_HUMAN 214;236 sp|P62258-2|1433E_HUMAN sp|P62258-2|1433E_HUMAN sp|P62258-2|1433E_HUMAN Isoform SV of 14-3-3 protein epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAE;sp|P62258|1433E_HUMAN 14-3-3 protein epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAE PE=1 SV=1 0.928412 13.8458 0.000480402 73.519 54.913 73.519 0.928412 13.8458 0.000480402 73.519 1 Q MQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DN(0.028)LTLWTSDMQ(0.928)GDGEEQ(0.038)N(0.005)KEALQDVEDENQ DN(-15.16)LTLWTSDMQ(13.85)GDGEEQ(-13.85)N(-22.96)KEALQ(-39.5)DVEDEN(-39.5)Q(-39.5) 11 3 1.7539 1076700 1076700 0 0 0.02498 0 0 0 0 0 1076700 0 0 0 0 0 0 0 0 0.17719 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1076700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 962 1043 214 214 636 731 2010 2134 2010 2134 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13357 2010 2134 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13357 2010 2134 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13357 sp|P62258-2|1433E_HUMAN;sp|P62258|1433E_HUMAN 226;248 sp|P62258-2|1433E_HUMAN sp|P62258-2|1433E_HUMAN sp|P62258-2|1433E_HUMAN Isoform SV of 14-3-3 protein epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAE;sp|P62258|1433E_HUMAN 14-3-3 protein epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAE PE=1 SV=1 0.441411 0.833822 0.00795191 55.394 30.56 55.394 0.441411 0.833822 0.00795191 55.394 Q SDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ________ X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX DNLTLWTSDMQ(0.105)GDGEEQ(0.364)N(0.033)KEALQ(0.441)DVEDEN(0.028)Q(0.028) DN(-45.51)LTLWTSDMQ(-6.25)GDGEEQ(-0.83)N(-11.23)KEALQ(0.83)DVEDEN(-11.94)Q(-11.94) 23 3 0.85002 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 963 1043 226 226 636 731 2011 2135 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12187 2011 2135 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12187 2011 2135 20190902_JH_MUT_Ubi_3 12187 sp|P62314|SMD1_HUMAN 24 sp|P62314|SMD1_HUMAN sp|P62314|SMD1_HUMAN sp|P62314|SMD1_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPD1 PE=1 SV=1 0.773166 5.32706 6.11057E-36 173.19 115.22 65.184 0.5 0 6.11057E-36 173.19 0.772994 5.32139 3.12323E-16 145.88 0.5 0 2.50441E-11 132.52 0.773166 5.32706 0.0209638 65.184 1 Q KLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.227)GTQ(0.773)VHGTITGVDVSMNTHLK N(-5.33)GTQ(5.33)VHGTITGVDVSMN(-40.23)THLK 4 3 -0.41946 22842000 22842000 0 0 2.5341 6702600 0 0 4305200 7956600 0 0 0 0 1.8574 NaN NaN 1.3092 3.7587 NaN NaN NaN NaN 6702600 0 0 0 0 0 0 0 0 4305200 0 0 7956600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 964 1048 24 24 3077 3522;3524 9943;9944;9945;9947;9949 10474;10475;10476;10479;10481 9949 10481 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8564 9943 10474 20190821_JH_EV_Ubi 6497 9943 10474 20190821_JH_EV_Ubi 6497 sp|P62834|RAP1A_HUMAN;sp|P61224-3|RAP1B_HUMAN;sp|P61224|RAP1B_HUMAN;sp|A6NIZ1|RP1BL_HUMAN;sp|P61224-4|RAP1B_HUMAN 76;57;76;76;34 sp|P62834|RAP1A_HUMAN sp|P62834|RAP1A_HUMAN sp|P62834|RAP1A_HUMAN Ras-related protein Rap-1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1A PE=1 SV=1;sp|P61224-3|RAP1B_HUMAN Isoform 3 of Ras-related protein Rap-1b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAP1B;sp|P61224|RAP1B_HUMAN Ras-related protein Rap-1b OS=Homo sapiens OX 0.5 0 0.000737524 101.16 61.148 101.16 0.5 0 0.000737524 101.16 1 Q TEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFN X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N(0.5)GQ(0.5)GFALVYSITAQSTFNDLQDLR N(0)GQ(0)GFALVYSITAQ(-65.53)STFN(-85.33)DLQ(-89.39)DLR 3 3 2.1364 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 965 1061 76 76 3073 3517 9936 10467 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 9936 10467 20190821_JH_WT_Ubi 16268 sp|P62937|PPIA_HUMAN;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN 111;51 sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN sp|P62937|PPIA_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA PE=1 SV=2;sp|P62937-2|PPIA_HUMAN Isoform 2 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIA 0.989476 19.686 1.66041E-26 148.72 120.52 148.72 0.989476 19.686 1.66041E-26 148.72 2 Q GILSMANAGPNTNGSQFFICTAKTEWLDGKH X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX HTGPGILSMANAGPN(0.021)TN(0.989)GSQ(0.989)FFICTAK HTGPGILSMAN(-65.26)AGPN(-19.69)TN(19.69)GSQ(19.69)FFICTAK 20 3 1.5626 7217900 0 7217900 0 1.2081 0 0 0 0 0 0 0 7217900 0 NaN NaN 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7217900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 966 1072 111 111 2009 2290;2291;2292 6603 6947;6948 6603 6948 20190902_JH_WT_Ubi_2 12430 6603 6948 20190902_JH_WT_Ubi_2 12430 6603 6948 20190902_JH_WT_Ubi_2 12430 sp|P62979|RS27A_HUMAN;sp|P62987|RL40_HUMAN;sp|P0CG47|UBB_HUMAN;sp|P0CG48|UBC_HUMAN 49;49;49;49 sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27A PE=1 SV=2;sp|P62987|RL40_HUMAN Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA52 PE=1 SV=2;sp|P0CG47|UBB_HUMAN Polyubiquitin-B OS=Homo sapiens O 1 107.026 0.0032536 119.74 60.479 107.03 1 107.847 0.0107487 107.85 1 96.6404 0.0266375 96.64 1 119.743 0.0032536 119.74 1 100.931 0.019365 100.93 1 105.134 0.0141288 105.13 1 107.026 0.0117711 107.03 1 Q EGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LIFAGKQ(1)LEDGR LIFAGKQ(107.03)LEDGR 7 3 0.40569 566080000 566080000 0 0 0.03026 0 0 0 24436000 28695000 124560000 116690000 139500000 132190000 0 0 0 0.02927 0.02945 0.032106 0.031853 0.042969 0.053136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24436000 0 0 28695000 0 0 124560000 0 0 116690000 0 0 139500000 0 0 132190000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 967 1074 49 49 2649;2650 3011;3013 8600;8601;8602;8603;8604;8605 9043;9044;9045;9046;9047;9048 8605 9048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8924 8602 9045 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8180 8602 9045 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8180 sp|P62979|RS27A_HUMAN;sp|P62987|RL40_HUMAN;sp|P0CG47|UBB_HUMAN;sp|P0CG48|UBC_HUMAN 62;62;62;62 sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN sp|P62979|RS27A_HUMAN Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPS27A PE=1 SV=2;sp|P62987|RL40_HUMAN Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA52 PE=1 SV=2;sp|P0CG47|UBB_HUMAN Polyubiquitin-B OS=Homo sapiens O 0.5 0 0.00578035 62.237 37.643 62.237 0.499043 0 0.0149952 52.93 0.494509 0 0.023298 48.711 0.5 0 0.00578035 62.237 1 Q GKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGA X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TLSDYN(0.5)IQ(0.5)KESTLHLVLR TLSDYN(0)IQ(0)KESTLHLVLR 8 4 1.0515 847120000 847120000 0 0 0.0062403 0 0 0 0 0 0 0 847120000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 847120000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 968 1074 62 62 2650;4500 3013;5108 14315 15025 14315 15025 20190902_JH_WT_Ubi_2 11326 14315 15025 20190902_JH_WT_Ubi_2 11326 14315 15025 20190902_JH_WT_Ubi_2 11326 sp|P63104|1433Z_HUMAN;sp|P63104-2|1433Z_HUMAN 146;71 sp|P63104|1433Z_HUMAN;sp|P63104-2|1433Z_HUMAN sp|P63104|1433Z_HUMAN sp|P63104|1433Z_HUMAN 14-3-3 protein zeta/delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAZ PE=1 SV=1;sp|P63104-2|1433Z_HUMAN Isoform 2 of 14-3-3 protein zeta/delta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YWHAZ 0.868634 11.3766 1.80661E-80 238.02 188.57 238.02 0.868634 11.3766 1.80661E-80 238.02 1 Q EVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQ X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Oxidation (M);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX GIVDQ(0.063)SQ(0.869)Q(0.063)AYQ(0.005)EAFEISK GIVDQ(-11.38)SQ(11.38)Q(-11.38)AYQ(-22.55)EAFEISK 7 2 0.38699 4484200 4484200 0 0 0.27499 0 0 0 0 0 0 0 4484200 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 1.0172 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4484200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 969 1078;1079 146;71 146 1551 1768 4969 5230 4969 5230 20190902_JH_WT_Ubi_2 13581 4969 5230 20190902_JH_WT_Ubi_2 13581 4969 5230 20190902_JH_WT_Ubi_2 13581 sp|P63244|RACK1_HUMAN 20 sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 0.499385 0 0.000290664 81.312 40.361 81.312 0.499385 0 0.000290664 81.312 0.497559 0.00381192 0.0112775 53.964 Q MTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GHN(0.499)GWVTQ(0.499)IATTPQ(0.001)FPDMILSASR GHN(0)GWVTQ(0)IATTPQ(-26.08)FPDMILSASR 8 3 0.053018 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 970 1085 20 20 1517 1729;1730 4865 5117 20190821_JH_MUT_Ubi 12740 4865 5117 20190821_JH_MUT_Ubi 12740 4865 5117 20190821_JH_MUT_Ubi 12740 sp|P67809|YBOX1_HUMAN 267 sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN Nuclease-sensitive element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YBX1 PE=1 SV=3 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 91.062 111.93 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 Q QRQPREDGNEEDKENQGDETQGQQPPQRRYR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX EDGNEEDKEN(0.056)Q(0.295)GDETQ(0.295)GQ(0.295)Q(0.056)PPQ(0.003)R EDGN(-34.57)EEDKEN(-7.25)Q(0)GDETQ(0)GQ(0)Q(-7.25)PPQ(-20.04)R 11 3 0.26214 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 971 1090 267 267 814 920 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 sp|P67809|YBOX1_HUMAN 272 sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN Nuclease-sensitive element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YBX1 PE=1 SV=3 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 91.062 111.93 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 Q EDGNEEDKENQGDETQGQQPPQRRYRRNFNY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX EDGNEEDKEN(0.056)Q(0.295)GDETQ(0.295)GQ(0.295)Q(0.056)PPQ(0.003)R EDGN(-34.57)EEDKEN(-7.25)Q(0)GDETQ(0)GQ(0)Q(-7.25)PPQ(-20.04)R 16 3 0.26214 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 972 1090 272 272 814 920 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 sp|P67809|YBOX1_HUMAN 274 sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN sp|P67809|YBOX1_HUMAN Nuclease-sensitive element-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YBX1 PE=1 SV=3 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 91.062 111.93 0.295256 0 7.07102E-08 111.93 Q GNEEDKENQGDETQGQQPPQRRYRRNFNYRR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX EDGNEEDKEN(0.056)Q(0.295)GDETQ(0.295)GQ(0.295)Q(0.056)PPQ(0.003)R EDGN(-34.57)EEDKEN(-7.25)Q(0)GDETQ(0)GQ(0)Q(-7.25)PPQ(-20.04)R 18 3 0.26214 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 973 1090 274 274 814 920 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 2555 2689 20190902_JH_EV_Ubi_3 4296 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q71U36-2|TBA1A_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN 133;133;98;133 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|P68363|TBA1B_HUMAN Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B PE=1 SV=1;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN Tubulin alpha-1A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1A PE=1 SV=1;sp|Q71U36-2|TBA1A_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-1A chain OS=Homo sapiens OX 0.918169 10.5001 0.00577632 63.033 42.381 63.033 0.918169 10.5001 0.00577632 63.033 1 Q VLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LADQ(0.082)CTGLQ(0.918)GFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMER LADQ(-10.5)CTGLQ(10.5)GFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMER 9 3 -0.59953 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 974 1097;1515;1858 133;133;133 133 2494 2832 8115 8532 8115 8532 20190821_JH_WT_Ubi 15424 8115 8532 20190821_JH_WT_Ubi 15424 8115 8532 20190821_JH_WT_Ubi 15424 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN;sp|P68366|TBA4A_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q71U36-2|TBA1A_HUMAN;sp|Q13748|TBA3C_HUMAN;sp|Q13748-2|TBA3C_HUMAN;sp|Q6PEY2|TBA3E_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN;sp|Q9NY65-2|TBA8_HUMAN;sp|Q9NY65|TBA8_HUMAN 372;256;357;372;372;337;372;372;372;372;306;372 sp|P68363|TBA1B_HUMAN;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN;sp|Q71U36|TBA1A_HUMAN;sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|Q9BQE3|TBA1C_HUMAN sp|P68363|TBA1B_HUMAN Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B PE=1 SV=1;sp|P68363-2|TBA1B_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-1B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBA1B;sp|P68366-2|TBA4A_HUMAN Isoform 2 of Tubulin alpha-4A chain OS=Homo sapie 0.999877 39.3864 0.0153793 67.43 42.638 67.43 0.999877 39.3864 0.0153793 67.43 1 Q YQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEA;YQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX VGINYQPPTVVPGGDLAKVQ(1)R VGIN(-51.03)YQ(-39.39)PPTVVPGGDLAKVQ(39.39)R 20 3 2.8213 3087200 3087200 0 0 0.0076312 0 0 0 0 0 0 0 3087200 0 0 0 0 0 0 0 0 0.059521 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3087200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 975 1097;1098;1515;1858 372;357;372;372 372 4831 5481 15496 16276 15496 16276 20190902_JH_WT_Ubi_2 11659 15496 16276 20190902_JH_WT_Ubi_2 11659 15496 16276 20190902_JH_WT_Ubi_2 11659 sp|P68371|TBB4B_HUMAN;sp|P04350|TBB4A_HUMAN 43;43 sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN sp|P68371|TBB4B_HUMAN Tubulin beta-4B chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4B PE=1 SV=1;sp|P04350|TBB4A_HUMAN Tubulin beta-4A chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB4A PE=1 SV=2 1 79.4548 0.00424521 79.455 39.949 79.455 1 79.4548 0.00424521 79.455 1 Q HGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX FWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQ(1)LER FWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQ(79.45)LER 24 3 2.8936 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 976 1099 43 43 1341 1522 4233 4451 4233 4451 20190902_JH_WT_Ubi_2 12876 4233 4451 20190902_JH_WT_Ubi_2 12876 4233 4451 20190902_JH_WT_Ubi_2 12876 sp|P78527-2|PRKDC_HUMAN;sp|P78527|PRKDC_HUMAN 1471;1471 sp|P78527-2|PRKDC_HUMAN sp|P78527-2|PRKDC_HUMAN sp|P78527-2|PRKDC_HUMAN Isoform 2 of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKDC;sp|P78527|PRKDC_HUMAN DNA-dependent protein kinase catalytic subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKDC PE=1 SV=3 0.99928 31.423 0.00912546 60.104 17.783 60.104 0.99928 31.423 0.00912546 60.104 1 Q KQLHRAGLLHNILPSQSTDLHHSVGTELLSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AGLLHN(0.001)ILPSQ(0.999)STDLHHSVGTELLSLVYK AGLLHN(-31.42)ILPSQ(31.42)STDLHHSVGTELLSLVYK 11 3 3.074 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 977 1107 1471 1471 129 147 455 503 455 503 20190821_JH_WT_Ubi 12746 455 503 20190821_JH_WT_Ubi 12746 455 503 20190821_JH_WT_Ubi 12746 sp|P84090|ERH_HUMAN 9 sp|P84090|ERH_HUMAN sp|P84090|ERH_HUMAN sp|P84090|ERH_HUMAN Enhancer of rudimentary homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ERH PE=1 SV=1 1 70.4379 0.0225047 70.438 45.9 70.438 1 70.4379 0.0225047 70.438 1 Q _______MSHTILLVQPTKRPEGRTYADYES X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX SHTILLVQ(1)PTKRPEGR SHTILLVQ(70.44)PTKRPEGR 8 3 0.10825 1778000 1778000 0 0 0.0036011 0 0 0 0 0 1778000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.016729 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1778000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 978 1112 9 9 3956 4500 12552 13166 12552 13166 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7017 12552 13166 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7017 12552 13166 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7017 sp|P98172|EFNB1_HUMAN;sp|P52799|EFNB2_HUMAN 332;319 sp|P98172|EFNB1_HUMAN sp|P98172|EFNB1_HUMAN sp|P98172|EFNB1_HUMAN Ephrin-B1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFNB1 PE=1 SV=1;sp|P52799|EFNB2_HUMAN Ephrin-B2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EFNB2 PE=1 SV=1 0.898605 9.92988 0.00690582 48.286 14.147 48.286 0.898605 9.92988 0.00690582 48.286 1 Q YEKVSGDYGHPVYIVQEMPPQSPANIYYKV_ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX VSGDYGHPVYIVQ(0.899)EMPPQ(0.091)SPAN(0.01)IYYKV VSGDYGHPVYIVQ(9.93)EMPPQ(-9.93)SPAN(-19.5)IYYKV 13 3 -0.64576 2191600 2191600 0 0 0.029035 0 0 0 0 0 0 0 0 2191600 0 0 0 0 0 0 0 0 0.17164 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2191600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 979 1115 332 332 5011 5688 16101 16917 16101 16917 20190902_JH_WT_Ubi_3 12262 16101 16917 20190902_JH_WT_Ubi_3 12262 16101 16917 20190902_JH_WT_Ubi_3 12262 sp|P98194-2|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-4|AT2C1_HUMAN;sp|P98194|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-3|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-5|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-8|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-9|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-6|AT2C1_HUMAN;sp|P98194-7|AT2C1_HUMAN 592;576;592;576;592;587;592;592;626 sp|P98194-2|AT2C1_HUMAN sp|P98194-2|AT2C1_HUMAN sp|P98194-2|AT2C1_HUMAN Isoform 2 of Calcium-transporting ATPase type 2C member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2C1;sp|P98194-4|AT2C1_HUMAN Isoform 4 of Calcium-transporting ATPase type 2C member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP2C1;sp|P98194|AT2C1_HUMAN Ca 0.732028 5.34325 0.0002554 83.216 56.367 83.216 0.732028 5.34325 0.0002554 83.216 1 Q AVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP LGLYSKTSQ(0.732)SVSGEEIDAMDVQ(0.214)Q(0.054)LSQIVPK LGLYSKTSQ(5.34)SVSGEEIDAMDVQ(-5.34)Q(-11.33)LSQ(-35.04)IVPK 9 3 4.3881 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 980 1117 592 592 2622 2979 8509 8950 8509 8950 20190821_JH_WT_Ubi 11966 8509 8950 20190821_JH_WT_Ubi 11966 8509 8950 20190821_JH_WT_Ubi 11966 sp|P99999|CYC_HUMAN 43 sp|P99999|CYC_HUMAN sp|P99999|CYC_HUMAN sp|P99999|CYC_HUMAN Cytochrome c OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CYCS PE=1 SV=2 1 64.0412 0.0104013 85.672 44.445 85.672 1 64.0412 0.0104013 85.672 1 Q KTGPNLHGLFGRKTGQAPGYSYTAANKNKGI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXX TGQ(1)APGYSYTAANK TGQ(64.04)APGYSYTAAN(-64.04)K 3 2 -2.0651 2892800 2892800 0 0 1.2543 0 0 0 0 0 0 0 2892800 0 NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2892800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 981 1119 43 43 4383 4968 13861 14544 13861 14544 20190902_JH_WT_Ubi_2 6850 13861 14544 20190902_JH_WT_Ubi_2 6850 13861 14544 20190902_JH_WT_Ubi_2 6850 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN;sp|Q00610|CLH1_HUMAN 1199;1199 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN Isoform 2 of Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC;sp|Q00610|CLH1_HUMAN Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC PE=1 SV=5 0.434366 0 0.0214768 58.564 28.136 58.564 0.434366 0 0.0214768 58.564 Q AELEEFINGPNNAHIQQVGDRCYDEKMYDAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LAELEEFIN(0.012)GPN(0.068)N(0.052)AHIQ(0.434)Q(0.434)VGDR LAELEEFIN(-15.58)GPN(-8.07)N(-9.26)AHIQ(0)Q(0)VGDR 17 3 -1.1785 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 982 1123 1199 1199 2495 2833 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN;sp|Q00610|CLH1_HUMAN 1200;1200 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN Isoform 2 of Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC;sp|Q00610|CLH1_HUMAN Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC PE=1 SV=5 0.434366 0 0.0214768 58.564 28.136 58.564 0.434366 0 0.0214768 58.564 Q ELEEFINGPNNAHIQQVGDRCYDEKMYDAAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LAELEEFIN(0.012)GPN(0.068)N(0.052)AHIQ(0.434)Q(0.434)VGDR LAELEEFIN(-15.58)GPN(-8.07)N(-9.26)AHIQ(0)Q(0)VGDR 18 3 -1.1785 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 983 1123 1200 1200 2495 2833 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 8116 8533 20190821_JH_WT_Ubi 10343 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN;sp|Q00610|CLH1_HUMAN 47;47 sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN sp|Q00610-2|CLH1_HUMAN Isoform 2 of Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC;sp|Q00610|CLH1_HUMAN Clathrin heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLTC PE=1 SV=5 0.564999 4.22795 0.0352172 41.513 14.364 41.513 0.564999 4.22795 0.0352172 41.513 1 Q MESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSNPI Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VGEQ(0.565)AQ(0.163)VVIIDMN(0.213)DPSN(0.058)PIR VGEQ(4.23)AQ(-5.39)VVIIDMN(-4.23)DPSN(-9.88)PIR 4 3 4.0618 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 984 1123 47 47 4826 5475 15473 16252 15473 16252 20190902_JH_EV_Ubi_3 10064 15473 16252 20190902_JH_EV_Ubi_3 10064 15473 16252 20190902_JH_EV_Ubi_3 10064 sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN;sp|Q00722-2|PLCB2_HUMAN;sp|Q00722|PLCB2_HUMAN 1090;1101;1105 sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN Isoform 3 of 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLCB2;sp|Q00722-2|PLCB2_HUMAN Isoform 2 of 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2 OS=Homo sapiens OX= 1 45.6139 0.03293 45.614 19.179 45.614 1 45.6139 0.03293 45.614 Q MTENLERHQEKLEEKQAACLEQIREMEKQFQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX LEEKQ(1)AACLEQ(1)IREMEK LEEKQ(45.61)AACLEQ(45.61)IREMEK 5 4 2.5526 3539100 0 3539100 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3539100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3539100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 985 1126 1090 1090 2555 2903 8301 8726 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN;sp|Q00722-2|PLCB2_HUMAN;sp|Q00722|PLCB2_HUMAN 1096;1107;1111 sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN sp|Q00722-3|PLCB2_HUMAN Isoform 3 of 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLCB2;sp|Q00722-2|PLCB2_HUMAN Isoform 2 of 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2 OS=Homo sapiens OX= 1 45.6139 0.03293 45.614 19.179 45.614 1 45.6139 0.03293 45.614 Q RHQEKLEEKQAACLEQIREMEKQFQKEALAE X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LEEKQ(1)AACLEQ(1)IREMEK LEEKQ(45.61)AACLEQ(45.61)IREMEK 11 4 2.5526 3539100 0 3539100 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3539100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3539100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 986 1126 1096 1096 2555 2903 8301 8726 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 8301 8726 20190902_JH_WT_Ubi_3 7015 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN 477;458 sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN sp|Q00839|HNRPU_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU PE=1 SV=6;sp|Q00839-2|HNRPU_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPU 0.736344 4.46042 0.0236003 77.137 48.324 77.137 0.736344 4.46042 0.0236003 77.137 1 Q KEKPYFPIPEEYTFIQNVPLEDRVRGPKGPE X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX PYFPIPEEYTFIQ(0.736)N(0.264)VPLEDR PYFPIPEEYTFIQ(4.46)N(-4.46)VPLEDR 13 3 0.64059 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 987 1128 477 477 3586 4088 11545 12122 11545 12122 20190821_JH_WT_Ubi 15413 11545 12122 20190821_JH_WT_Ubi 15413 11545 12122 20190821_JH_WT_Ubi 15413 sp|Q01650|LAT1_HUMAN 47 sp|Q01650|LAT1_HUMAN sp|Q01650|LAT1_HUMAN sp|Q01650|LAT1_HUMAN Large neutral amino acids transporter small subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A5 PE=1 SV=2 1 73.1266 3.49E-15 137.43 96.738 73.127 1 79.1718 3.28554E-11 131.86 1 74.8731 0.00256812 74.873 1 135.546 4.03235E-15 135.55 1 137.428 3.49E-15 137.43 1 73.1266 0.00440931 73.127 1 Q ADGSAPAGEGEGVTLQRNITLLNGVAIIVGT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX MLAAKSADGSAPAGEGEGVTLQ(1)R MLAAKSADGSAPAGEGEGVTLQ(73.13)R 22 3 1.4592 106020000 106020000 0 0 0.032677 0 0 0 7693900 0 6797600 6078400 0 17083000 0 0 0 0.057139 0 0.027441 0.019041 0 0.02558 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7693900 0 0 0 0 0 6797600 0 0 6078400 0 0 0 0 0 17083000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 988 1133 47 47 965;2931 1091;3330;3331 3088;3089;9449;9450;9451;9452;9453;9454 3244;3245;9947;9948;9949;9950;9951;9952 9454 9952 20190902_JH_WT_Ubi_3 7962 9450 9948 20190902_JH_WT_Ubi_2 7795 9450 9948 20190902_JH_WT_Ubi_2 7795 sp|Q02790|FKBP4_HUMAN 29 sp|Q02790|FKBP4_HUMAN sp|Q02790|FKBP4_HUMAN sp|Q02790|FKBP4_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FKBP4 PE=1 SV=3 0.999999 60.2992 6.63314E-15 111.56 80.293 111.56 0.999999 60.2992 6.63314E-15 111.56 0.99997 44.4536 0.000322395 94.072 1 Q QSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGT X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX ATESGAQSAPLPMEGVDISPKQ(1)DEGVLK ATESGAQ(-60.3)SAPLPMEGVDISPKQ(60.3)DEGVLK 22 3 -0.53859 1013900 1013900 0 0 0.0071283 0 0 0 0 1013900 0 0 0 0 0 0 0 0 0.097687 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1013900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 989 1142 29 29 299 352 1017;1018 1101;1102 1017 1101 20190902_JH_EV_Ubi_3 8983 1017 1101 20190902_JH_EV_Ubi_3 8983 1017 1101 20190902_JH_EV_Ubi_3 8983 sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN;sp|Q02978|M2OM_HUMAN 251;302 sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN sp|Q02978-2|M2OM_HUMAN Isoform 2 of Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A11;sp|Q02978|M2OM_HUMAN Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A11 PE=1 SV=3 1 68.7856 0.0118398 68.786 18.432 68.786 1 68.7856 0.0118398 68.786 2 Q ARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG___ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LGPHTVLTFIFLEQ(1)MN(1)K LGPHTVLTFIFLEQ(68.79)MN(68.79)K 14 2 1.8942 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 990 1145 251 251 2625 2984 8520 8961 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 8520 8961 20190902_JH_WT_Ubi_2 16099 sp|Q03001|DYST_HUMAN;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN 3022;2696 sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST PE=1 SV=4;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN Isoform 4 of Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST 0.964869 14.4169 0.0313569 53.768 19.935 53.768 0.964869 14.4169 0.0313569 53.768 2 Q LQLGVNNTKEKSTSTQKDSPLNDMIQSNDLC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP STSTQ(0.965)KDSPLN(0.037)DMIQ(0.499)SN(0.499)DLCSK STSTQ(14.42)KDSPLN(-14.42)DMIQ(0)SN(0)DLCSK 5 3 2.8475 790980 0 790980 0 NaN 790980 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 790980 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 991 1146 3022 3022 4200 4770 13307 13960 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 sp|Q03001|DYST_HUMAN;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN 3032;2706 sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN sp|Q03001|DYST_HUMAN Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST PE=1 SV=4;sp|Q03001-9|DYST_HUMAN Isoform 4 of Dystonin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DST 0.499065 0 0.0313569 53.768 19.935 53.768 0.499065 0 0.0313569 53.768 Q KSTSTQKDSPLNDMIQSNDLCSKESISGGGT X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX STSTQ(0.965)KDSPLN(0.037)DMIQ(0.499)SN(0.499)DLCSK STSTQ(14.42)KDSPLN(-14.42)DMIQ(0)SN(0)DLCSK 15 3 2.8475 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 992 1146 3032 3032 4200 4770 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 13307 13960 20190821_JH_EV_Ubi 5950 sp|Q03135|CAV1_HUMAN 40 sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 PE=1 SV=4 1 73.296 6.02331E-06 120.32 86.215 73.296 1 73.1684 6.02331E-06 120.32 1 53.2105 0.00021914 102.29 1 90.4534 0.00499603 90.453 1 73.296 0.000418585 96.489 1 Q YKPNNKAMADELSEKQVYDAHTKEIDLVNRD X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX AMADELSEKQ(1)VYDAHTK AMADELSEKQ(73.3)VYDAHTK 10 4 -1.0357 154750000 154750000 0 0 0.041575 0 0 0 33111000 31804000 0 0 47998000 0 0 0 0 0.54381 0.15431 0 0 0.03357 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33111000 0 0 31804000 0 0 0 0 0 0 0 0 47998000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 993 1147 40 40 225 259;260 764;765;766;767;768;769;770 834;835;836;837;838;839;840 770 840 20190902_JH_WT_Ubi_2 7796 764 834 20190902_JH_EV_Ubi_2 5390 764 834 20190902_JH_EV_Ubi_2 5390 sp|Q03135|CAV1_HUMAN 21 sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 PE=1 SV=4 0.608971 2.13885 0.00033143 90.422 49.624 90.422 0.608971 2.13885 0.00033143 90.422 1 Q YVDSEGHLYTVPIREQGNIYKPNNKAMADEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(0.609)GN(0.375)IYKPN(0.008)N(0.008)KAMADELSEK EQ(2.14)GN(-2.14)IYKPN(-21.58)N(-21.58)KAMADELSEK 2 3 3.2926 3649900 3649900 0 0 0.0081068 0 0 0 0 0 0 0 3649900 0 0 0 0 0 0 0 0 0.042107 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3649900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 994 1147 21 21 1070 1206;1207;1208 3413 3590 3413 3590 20190902_JH_WT_Ubi_2 6443 3413 3590 20190902_JH_WT_Ubi_2 6443 3413 3590 20190902_JH_WT_Ubi_2 6443 sp|Q03135-2|CAV1_HUMAN 9 sp|Q03135-2|CAV1_HUMAN sp|Q03135-2|CAV1_HUMAN sp|Q03135-2|CAV1_HUMAN Isoform 2 of Caveolin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAV1 1 131.397 1.7849E-14 160.63 106.68 131.4 1 101.199 0.0037475 101.2 1 158.308 2.43734E-11 158.31 1 131.397 5.23048E-07 135.86 1 116.786 0.000347334 116.79 1 160.63 1.7849E-14 160.63 1 135.856 8.54823E-07 135.86 1 Q _______MADELSEKQVYDAHTKEIDLVNRD X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX MADELSEKQ(1)VYDAHTK MADELSEKQ(131.4)VYDAHTK 9 3 3.9026 206300000 206300000 0 0 0.028839 0 0 3264400 39917000 34834000 15854000 0 64583000 44393000 0 0 0.0043108 0.051977 0.019277 0.040343 0 0.059525 0.055016 0 0 0 0 0 0 3264400 0 0 39917000 0 0 34834000 0 0 15854000 0 0 0 0 0 64583000 0 0 44393000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 995 1148 9 9 55;2875 64;3263 195;196;197;198;199;200;9274 212;213;214;215;216;217;9760 9274 9760 20190902_JH_EV_Ubi_3 5251 199 216 20190902_JH_WT_Ubi_2 8499 199 216 20190902_JH_WT_Ubi_2 8499 sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN 563 sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN sp|Q03701|CEBPZ_HUMAN CCAAT/enhancer-binding protein zeta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEBPZ PE=1 SV=3 1 50.0335 0.0306728 50.034 14.538 50.034 1 50.0335 0.0306728 50.034 Q LYRKMLDPGLMTCSKQAMFLNLVYKSLKADI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX Q(1)AMFLN(1)LVYKSLK Q(50.03)AMFLN(50.03)LVYKSLK 1 2 3.223 1600700 0 1600700 0 NaN 0 0 1600700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1600700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 996 1151 563 563 3601 4110 11594 12171 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 11594 12171 20190821_JH_WT_Ubi 12657 sp|Q04323|UBXN1_HUMAN;sp|Q04323-2|UBXN1_HUMAN 69;69 sp|Q04323|UBXN1_HUMAN sp|Q04323|UBXN1_HUMAN sp|Q04323|UBXN1_HUMAN UBX domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBXN1 PE=1 SV=2;sp|Q04323-2|UBXN1_HUMAN Isoform 2 of UBX domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBXN1 1 61.9755 1.3815E-15 119.87 93.66 61.976 1 73.6545 0.000611826 73.654 1 75.4041 0.000337434 75.404 1 119.87 1.3815E-15 119.87 1 61.9755 0.00358021 61.976 1 Q TPLGHILGREPTSSEQGGLEGSGSAAGEGKP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EPTSSEQ(1)GGLEGSGSAAGEGKPALSEEER EPTSSEQ(61.98)GGLEGSGSAAGEGKPALSEEER 7 3 0.1112 6859300 6859300 0 0 0.024685 0 0 0 1188700 611990 2074300 0 0 2984300 0 0 0 0.047581 0.047322 0.07301 0 0 0.046832 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1188700 0 0 611990 0 0 2074300 0 0 0 0 0 0 0 0 2984300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 997 1152 69 69 1060 1193 3357;3358;3359;3360 3532;3533;3534;3535 3360 3535 20190902_JH_WT_Ubi_3 7591 3359 3534 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6813 3359 3534 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6813 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN 1061 sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN sp|Q04721|NOTC2_HUMAN Neurogenic locus notch homolog protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOTCH2 PE=1 SV=3 1 48.4048 0.0210823 48.405 17.83 48.405 1 48.4048 0.0210823 48.405 4 Q TYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPX N(1)CQ(1)TLVN(1)LCSRSPCKN(1)K N(48.4)CQ(48.4)TLVN(48.4)LCSRSPCKN(48.4)K 3 3 2.0569 4186100 0 0 4186100 NaN 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4186100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 998 1155 1061 1061 3015 3446 9737 10258 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 9737 10258 20190902_JH_EV_Ubi_3 6728 sp|Q05C16|LRC63_HUMAN 251 sp|Q05C16|LRC63_HUMAN sp|Q05C16|LRC63_HUMAN sp|Q05C16|LRC63_HUMAN Leucine-rich repeat-containing protein 63 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRRC63 PE=2 SV=2 0.999995 53.9604 0.0141138 63.76 23.036 63.76 0.999995 53.9604 0.0141138 63.76 1 Q FVSLPTPVLPRKPHRQSVIETLVTENGNIES X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(1)SVIETLVTENGNIESVPK Q(53.96)SVIETLVTEN(-59.19)GN(-53.96)IESVPK 1 2 0.018961 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 999 1162 251 251 3700 4211 11772 12353 11772 12353 20190902_JH_EV_Ubi_3 11219 11772 12353 20190902_JH_EV_Ubi_3 11219 11772 12353 20190902_JH_EV_Ubi_3 11219 sp|Q06136|KDSR_HUMAN 201 sp|Q06136|KDSR_HUMAN sp|Q06136|KDSR_HUMAN sp|Q06136|KDSR_HUMAN 3-ketodihydrosphingosine reductase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KDSR PE=1 SV=1 1 72.8477 0.020377 72.848 39.657 72.848 1 72.8477 0.020377 72.848 Q YSASKFAIRGLAEALQMEVKPYNVYITVAYP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX GLAEALQ(1)MEVK GLAEALQ(72.85)MEVK 7 2 0.72947 2527500 2527500 0 0 2.0607 0 0 0 0 0 0 0 0 2527500 NaN 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2527500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1000 1164 201 201 1571 1791 5038 5304 5038 5304 20190902_JH_WT_Ubi_3 11159 5038 5304 20190902_JH_WT_Ubi_3 11159 5038 5304 20190902_JH_WT_Ubi_3 11159 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-3|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-6|APLP2_HUMAN;sp|Q06481|APLP2_HUMAN 283;456;456;512;522;512 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN Isoform 5 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN Isoform 4 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN Isoform 2 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sa 1 53.7773 0.0243856 53.777 14.429 53.777 1 53.7773 0.0243856 53.777 2 Q VRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPX HYQ(1)HVLAVDPEKAAQ(1)MK HYQ(53.78)HVLAVDPEKAAQ(53.78)MK 3 3 3.0529 806750 0 806750 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 806750 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 806750 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1001 1168 283 283 2051 2346 6819 7176 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-3|APLP2_HUMAN;sp|Q06481-6|APLP2_HUMAN;sp|Q06481|APLP2_HUMAN 295;468;468;524;534;524 sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN sp|Q06481-5|APLP2_HUMAN Isoform 5 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-4|APLP2_HUMAN Isoform 4 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=APLP2;sp|Q06481-2|APLP2_HUMAN Isoform 2 of Amyloid-like protein 2 OS=Homo sa 1 53.7773 0.0243856 53.777 14.429 53.777 1 53.7773 0.0243856 53.777 2 Q RHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEER X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX HYQ(1)HVLAVDPEKAAQ(1)MK HYQ(53.78)HVLAVDPEKAAQ(53.78)MK 15 3 3.0529 806750 0 806750 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 806750 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 806750 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1002 1168 295 295 2051 2346 6819 7176 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 6819 7176 20190902_JH_WT_Ubi_2 6634 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-7|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-6|SLC31_HUMAN;sp|Q07837|SLC31_HUMAN 119;119;119;119;119 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN Isoform C of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN Isoform E of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837- 1 45.6957 0.027298 45.696 15.96 45.696 1 45.6957 0.027298 45.696 3 Q TIAIIALSPKCLDWWQEGPMYQIYPRSFKDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP CLDWWQ(1)EGPMYQ(1)IYPRSFKDSN(1)K CLDWWQ(45.7)EGPMYQ(45.7)IYPRSFKDSN(45.7)K 6 3 0.91032 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1003 1178 119 119 349 412 1173 1260 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-7|SLC31_HUMAN;sp|Q07837-6|SLC31_HUMAN;sp|Q07837|SLC31_HUMAN 125;125;125;125;125 sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN sp|Q07837-3|SLC31_HUMAN Isoform C of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837-5|SLC31_HUMAN Isoform E of Neutral and basic amino acid transport protein rBAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC3A1;sp|Q07837- 1 45.6957 0.027298 45.696 15.96 45.696 1 45.6957 0.027298 45.696 3 Q LSPKCLDWWQEGPMYQIYPRSFKDSNKDGNG X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX CLDWWQ(1)EGPMYQ(1)IYPRSFKDSN(1)K CLDWWQ(45.7)EGPMYQ(45.7)IYPRSFKDSN(45.7)K 12 3 0.91032 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1004 1178 125 125 349 412 1173 1260 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 1173 1260 20190821_JH_MUT_Ubi 5520 sp|Q08211|DHX9_HUMAN;sp|Q08211-2|DHX9_HUMAN 1080;45 sp|Q08211|DHX9_HUMAN sp|Q08211|DHX9_HUMAN sp|Q08211|DHX9_HUMAN ATP-dependent RNA helicase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX9 PE=1 SV=4;sp|Q08211-2|DHX9_HUMAN Isoform 2 of ATP-dependent RNA helicase A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX9 0.893596 9.24184 0.0139134 73.466 33.886 73.466 0.893596 9.24184 0.0139134 73.466 1 Q LQLLLFASKKVQSDGQIVLVDDWIKLQISHE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX VQ(0.106)SDGQ(0.894)IVLVDDWIK VQ(-9.24)SDGQ(9.24)IVLVDDWIK 6 2 -0.71465 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1005 1182 1080 1080 4999 5672 16046 16856 16046 16856 20190821_JH_EV_Ubi 13009 16046 16856 20190821_JH_EV_Ubi 13009 16046 16856 20190821_JH_EV_Ubi 13009 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN 1350;1350 sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN sp|Q08378|GOGA3_HUMAN Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 PE=1 SV=2;sp|Q08378-2|GOGA3_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA3 1 56.4136 0.0173109 56.414 26.238 56.414 1 56.4136 0.0173109 56.414 Q AQEDLSMTQKDKFMLQAKVSELKNNMKTLLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXX FMLQ(1)AKVSELKN(1)N(1)MK FMLQ(56.41)AKVSELKN(56.41)N(56.41)MK 4 3 -0.25298 2104900 0 0 2104900 NaN 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2104900 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1006 1185 1350 1350 1264 1431 4012 4220 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 4012 4220 20190902_JH_WT_Ubi_2 15525 sp|Q08379-2|GOGA2_HUMAN;sp|Q08379|GOGA2_HUMAN 171;553 sp|Q08379-2|GOGA2_HUMAN sp|Q08379-2|GOGA2_HUMAN sp|Q08379-2|GOGA2_HUMAN Isoform 2 of Golgin subfamily A member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA2;sp|Q08379|GOGA2_HUMAN Golgin subfamily A member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA2 PE=1 SV=3 0.97617 16.1241 0.032607 47.198 12.39 47.198 0.97617 16.1241 0.032607 47.198 Q ALSQNRELKEQLAELQSGFVKLTNENMEITS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EQ(0.024)LAELQ(0.976)SGFVK EQ(-16.12)LAELQ(16.12)SGFVK 7 2 1.1752 9985900 9985900 0 0 NaN 9985900 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 9985900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1007 1186 171 171 1077 1215 3436 3613 3436 3613 20190821_JH_EV_Ubi 10395 3436 3613 20190821_JH_EV_Ubi 10395 3436 3613 20190821_JH_EV_Ubi 10395 sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-8|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-4|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-3|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-2|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-10|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-9|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-6|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499-11|PDE4D_HUMAN;sp|Q08499|PDE4D_HUMAN 88;99;165;185;254;260;268;326;329;390 sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN sp|Q08499-5|PDE4D_HUMAN Isoform 2 of cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE4D;sp|Q08499-8|PDE4D_HUMAN Isoform 6 of cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE4D;sp|Q08499-4|PDE4D_HU 1 59.2522 0.0304921 59.252 12.38 59.252 1 59.2522 0.0304921 59.252 2 Q SLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVNKWG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX FGVKTEQ(1)EDVLAKELEDVN(1)K FGVKTEQ(59.25)EDVLAKELEDVN(59.25)K 7 3 -0.42639 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1008 1188 88 88 1215 1371 3859 4062 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 3859 4062 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6380 sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN 2587 sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN sp|Q0VDD8-4|DYH14_HUMAN Isoform 4 of Dynein heavy chain 14, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH14 1 57.0474 0.0299686 57.047 22.342 57.047 1 57.0474 0.0299686 57.047 Q DQIISCSLAIYHQVRQNMLPTPTKCHYMFNL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXX Q(1)N(1)MLPTPTK Q(57.05)N(57.05)MLPTPTK 1 2 -1.2362 776910 0 776910 0 NaN 0 0 0 0 776910 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 776910 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1009 1191 2587 2587 3680 4190 11740 12320 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 11740 12320 20190902_JH_EV_Ubi_3 3824 sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN;sp|Q12802|AKP13_HUMAN;sp|Q12802-2|AKP13_HUMAN 283;283;283 sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN sp|Q12802-4|AKP13_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP13;sp|Q12802|AKP13_HUMAN A-kinase anchor protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP13 PE=1 SV=2;sp|Q12802-2|AKP13_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 13 O 0.623859 6.45159 0.0255667 49.081 13.731 49.081 0.623859 6.45159 0.0255667 49.081 2 Q PGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDSLM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX LMN(0.627)IQ(0.624)Q(0.374)Q(0.374)LMKTN(0.002)LK LMN(7)IQ(6.45)Q(-6.45)Q(-6.45)LMKTN(-30.35)LK 5 4 -1.4674 1938500 0 1938500 0 NaN 0 0 0 1938500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1938500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1010 1197 283 283 2721 3094 8820 9277 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 8820 9277 20190902_JH_EV_Ubi_2 7133 sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN;sp|Q13033|STRN3_HUMAN 426;510 sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN sp|Q13033-2|STRN3_HUMAN Isoform Alpha of Striatin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRN3;sp|Q13033|STRN3_HUMAN Striatin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRN3 PE=1 SV=3 1 76.2278 0.0274162 76.228 20.141 76.228 1 76.2278 0.0274162 76.228 2 Q LVTASEDHTLKLWNLQKTVPAKKSASLDVEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LWN(1)LQ(1)KTVPAK LWN(76.23)LQ(76.23)KTVPAK 5 3 -1.5197 5035200 0 5035200 0 NaN 0 0 0 0 5035200 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5035200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1011 1209 426 426 2865 3248 9234 9719 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 9234 9719 20190902_JH_EV_Ubi_3 7145 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN 619 sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN sp|Q13201|MMRN1_HUMAN Multimerin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MMRN1 PE=1 SV=3 0.896551 8.76206 0.0310098 41.482 12.591 41.482 0.896551 8.76206 0.0310098 41.482 3 Q KFQLKDTEENLHVLNQTLAEVLFPMDNKMDK X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DTEEN(0.885)LHVLN(0.222)Q(0.897)TLAEVLFPMDN(0.997)KMDK DTEEN(8.3)LHVLN(-8.3)Q(8.76)TLAEVLFPMDN(23.54)KMDK 11 3 0.44151 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1012 1225 619 619 702 798 2198 2324 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 2198 2324 20190902_JH_EV_Ubi_2 12243 sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439-4|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439-5|GOGA4_HUMAN 1850;1850;1850;1872 sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN Isoform 3 of Golgin subfamily A member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA4;sp|Q13439-4|GOGA4_HUMAN Isoform 4 of Golgin subfamily A member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA4;sp|Q13439|GOGA4_HUMAN Golgin subfamily A member 4 OS=Homo 0.999872 39.142 0.0236095 58.814 25.41 58.814 0.999872 39.142 0.0236095 58.814 2 Q FDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX TLQEKELTCQ(1)ILEQ(1)KIK TLQ(-39.14)EKELTCQ(39.14)ILEQ(49.56)KIK 10 3 0.41283 1109900 0 1109900 0 NaN 0 0 0 0 1109900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1109900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1013 1238 1850 1850 4495 5098 14263 14970 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439-4|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439|GOGA4_HUMAN;sp|Q13439-5|GOGA4_HUMAN 1854;1854;1854;1876 sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN sp|Q13439-3|GOGA4_HUMAN Isoform 3 of Golgin subfamily A member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA4;sp|Q13439-4|GOGA4_HUMAN Isoform 4 of Golgin subfamily A member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA4;sp|Q13439|GOGA4_HUMAN Golgin subfamily A member 4 OS=Homo 0.999986 49.5601 0.0236095 58.814 25.41 58.814 0.999986 49.5601 0.0236095 58.814 2 Q QKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKEV X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX TLQEKELTCQ(1)ILEQ(1)KIK TLQ(-39.14)EKELTCQ(39.14)ILEQ(49.56)KIK 14 3 0.41283 1109900 0 1109900 0 NaN 0 0 0 0 1109900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1109900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1014 1238 1854 1854 4495 5098 14263 14970 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 14263 14970 20190902_JH_EV_Ubi_3 9650 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN 734 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAM9 PE=1 SV=1 0.999996 54.0251 0.00428064 96.707 44.244 96.707 0.999996 54.0251 0.00428064 96.707 1 Q KRDQLWRSYFRKKRSQTYESDGKNQANPSRQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX SQ(1)TYESDGKNQANPSR SQ(54.03)TYESDGKN(-54.03)Q(-66.97)AN(-73.23)PSR 2 3 1.9794 5251700 5251700 0 0 0.019575 0 0 0 0 0 5251700 0 0 0 NaN NaN 0 NaN 0 0.10972 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5251700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1015 1239 734 734 4133 4698 13111 13749 13111 13749 20190902_JH_MUT_Ubi_2 4079 13111 13749 20190902_JH_MUT_Ubi_2 4079 13111 13749 20190902_JH_MUT_Ubi_2 4079 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN 743 sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN sp|Q13443|ADAM9_HUMAN Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAM9 PE=1 SV=1 0.97111 16.193 0.000152319 116.87 80.243 116.87 0.546409 0.829455 0.0185743 79.337 0.97111 16.193 0.000152319 116.87 1 Q FRKKRSQTYESDGKNQANPSRQPGSVPRHVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX SQTYESDGKN(0.006)Q(0.971)AN(0.023)PSR SQ(-84.55)TYESDGKN(-22.42)Q(16.19)AN(-16.19)PSR 11 3 1.6248 9282400 9282400 0 0 0.034598 0 0 1611000 0 0 0 7671300 0 0 NaN NaN 0.027241 NaN 0 0 0.16355 0 0 0 0 0 0 0 0 1611000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7671300 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1016 1239 743 743 4133 4698 13112;13113 13750;13751 13112 13750 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3875 13112 13750 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3875 13112 13750 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3875 sp|Q13501-2|SQSTM_HUMAN;sp|Q13501|SQSTM_HUMAN 221;305 sp|Q13501-2|SQSTM_HUMAN sp|Q13501-2|SQSTM_HUMAN sp|Q13501-2|SQSTM_HUMAN Isoform 2 of Sequestosome-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SQSTM1;sp|Q13501|SQSTM_HUMAN Sequestosome-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SQSTM1 PE=1 SV=1 0.908176 10.8211 0.000135772 75.588 55.685 75.588 0.908176 10.8211 0.000135772 75.588 1 Q CSDPSKPGGNVEGATQSLAEQMRKIALESEG X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SSSQ(0.001)PSSCCSDPSKPGGN(0.075)VEGATQ(0.908)SLAEQ(0.016)MR SSSQ(-30.37)PSSCCSDPSKPGGN(-10.82)VEGATQ(10.82)SLAEQ(-17.59)MR 24 3 3.9727 2231500 2231500 0 0 0.54874 0 0 0 0 0 0 0 0 2231500 NaN NaN NaN 0 0 NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2231500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1017 1246 221 221 4174 4742 13221 13864 13221 13864 20190902_JH_WT_Ubi_3 7543 13221 13864 20190902_JH_WT_Ubi_3 7543 13221 13864 20190902_JH_WT_Ubi_3 7543 sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN;sp|Q13724|MOGS_HUMAN 17;123 sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN Isoform 2 of Mannosyl-oligosaccharide glucosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOGS;sp|Q13724|MOGS_HUMAN Mannosyl-oligosaccharide glucosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOGS PE=1 SV=5 1 58.1583 0.0206963 58.158 20.982 58.158 1 58.1583 0.0206963 58.158 2 Q KTRSPKPLLTGLMWAQQGTTPGTPKLRHTCE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX PLLTGLMWAQ(1)Q(1)GTTPGTPK PLLTGLMWAQ(58.16)Q(58.16)GTTPGTPK 10 3 2.6852 9082700 0 9082700 0 NaN 0 0 9082700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 9082700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1018 1259 17 17 3439 3924 11027 11592 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN;sp|Q13724|MOGS_HUMAN 18;124 sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN sp|Q13724-2|MOGS_HUMAN Isoform 2 of Mannosyl-oligosaccharide glucosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOGS;sp|Q13724|MOGS_HUMAN Mannosyl-oligosaccharide glucosidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOGS PE=1 SV=5 1 58.1583 0.0206963 58.158 20.982 58.158 1 58.1583 0.0206963 58.158 2 Q TRSPKPLLTGLMWAQQGTTPGTPKLRHTCEQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX PLLTGLMWAQ(1)Q(1)GTTPGTPK PLLTGLMWAQ(58.16)Q(58.16)GTTPGTPK 11 3 2.6852 9082700 0 9082700 0 NaN 0 0 9082700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 9082700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1019 1259 18 18 3439 3924 11027 11592 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 11027 11592 20190821_JH_WT_Ubi 11435 sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN;sp|Q13813|SPTN1_HUMAN;sp|Q13813-2|SPTN1_HUMAN 1383;1403;1403 sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN Isoform 3 of Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTAN1;sp|Q13813|SPTN1_HUMAN Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTAN1 PE=1 SV=3;sp|Q13813-2|SPTN1_HUMAN Isoform 2 of 0.499607 0 0.00744308 55.705 31.157 55.705 0.499607 0 0.00744308 55.705 Q IDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX AGTFQAFEQ(0.001)FGQ(0.5)Q(0.5)LLAHGHYASPEIK AGTFQ(-44.18)AFEQ(-28.14)FGQ(0)Q(0)LLAHGHYASPEIK 12 4 0.25308 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1020 1262 1383 1383 139 160 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN;sp|Q13813|SPTN1_HUMAN;sp|Q13813-2|SPTN1_HUMAN 1384;1404;1404 sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN sp|Q13813-3|SPTN1_HUMAN Isoform 3 of Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTAN1;sp|Q13813|SPTN1_HUMAN Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTAN1 PE=1 SV=3;sp|Q13813-2|SPTN1_HUMAN Isoform 2 of 0.499607 0 0.00744308 55.705 31.157 55.705 0.499607 0 0.00744308 55.705 Q DARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AGTFQAFEQ(0.001)FGQ(0.5)Q(0.5)LLAHGHYASPEIK AGTFQ(-44.18)AFEQ(-28.14)FGQ(0)Q(0)LLAHGHYASPEIK 13 4 0.25308 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1021 1262 1384 1384 139 160 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 487 537 20190902_JH_WT_Ubi_2 14645 sp|Q14088|RB33A_HUMAN 216 sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN Ras-related protein Rab-33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB33A PE=1 SV=2 0.515449 0 0.02867 56.147 9.7908 56.147 0.515449 0 0.02867 56.147 2 Q RLKAQKSLLYRDAERQQGKVQKLEFPQEANS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.515)Q(0.515)GKVQ(0.969)KLEFPQEANSK Q(0)Q(0)GKVQ(11.95)KLEFPQ(-46.4)EAN(-46.4)SK 1 3 -3.0979 2985500 0 2985500 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1022 1269 216 216 3687 4198 11758 12339 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 sp|Q14088|RB33A_HUMAN 217 sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN Ras-related protein Rab-33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB33A PE=1 SV=2 0.515449 0 0.02867 56.147 9.7908 56.147 0.515449 0 0.02867 56.147 2 Q LKAQKSLLYRDAERQQGKVQKLEFPQEANSK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.515)Q(0.515)GKVQ(0.969)KLEFPQEANSK Q(0)Q(0)GKVQ(11.95)KLEFPQ(-46.4)EAN(-46.4)SK 2 3 -3.0979 2985500 0 2985500 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1023 1269 217 217 3687 4198 11758 12339 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 sp|Q14088|RB33A_HUMAN 221 sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN sp|Q14088|RB33A_HUMAN Ras-related protein Rab-33A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAB33A PE=1 SV=2 0.968975 11.9512 0.02867 56.147 9.7908 56.147 0.968975 11.9512 0.02867 56.147 2 Q KSLLYRDAERQQGKVQKLEFPQEANSKTSCP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX Q(0.515)Q(0.515)GKVQ(0.969)KLEFPQEANSK Q(0)Q(0)GKVQ(11.95)KLEFPQ(-46.4)EAN(-46.4)SK 6 3 -3.0979 2985500 0 2985500 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2985500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1024 1269 221 221 3687 4198 11758 12339 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 11758 12339 20190902_JH_WT_Ubi_3 7882 sp|Q14123|PDE1C_HUMAN;sp|Q14123-3|PDE1C_HUMAN 700;760 sp|Q14123|PDE1C_HUMAN sp|Q14123|PDE1C_HUMAN sp|Q14123|PDE1C_HUMAN Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDE1C PE=1 SV=1;sp|Q14123-3|PDE1C_HUMAN Isoform 3 of Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C OS=Hom 0.966564 16.3879 0.0186506 103.43 25.789 95.618 0.848113 7.95576 0.0186506 103.43 0.966564 16.3879 0.0333577 95.618 1 Q ARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX MKKIQ(0.967)N(0.022)ISHN(0.011)WNR MKKIQ(16.39)N(-16.39)ISHN(-19.45)WN(-35.54)R 5 3 -2.3526 59741000 59741000 0 0 NaN 30779000 0 0 28961000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 30779000 0 0 0 0 0 0 0 0 28961000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1025 1275 700 700 2926 3323 9421;9422 9916;9917 9422 9917 20190902_JH_EV_Ubi_2 8230 9421 9916 20190821_JH_EV_Ubi 8127 9421 9916 20190821_JH_EV_Ubi 8127 sp|Q14147|DHX34_HUMAN 639 sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX34 PE=1 SV=2 0.999725 34.6095 0.0198629 44.729 13.255 44.729 0.999725 34.6095 0.0198629 44.729 0.999602 30.917 0.0209304 44.105 3 Q SSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP PLESDQ(1)GDPFTLFN(0.907)VFN(0.206)AWVQ(0.887)VK PLESDQ(34.61)GDPFTLFN(9.29)VFN(-8.48)AWVQ(8.48)VK 6 3 1.9269 5285300 0 0 5285300 NaN 4383100 0 0 0 0 902190 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 4383100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 902190 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1026 1278 639 639 3414 3896 10930;10931 11494;11495 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 sp|Q14147|DHX34_HUMAN 654 sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN sp|Q14147|DHX34_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DHX34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX34 PE=1 SV=2 0.95026 9.94953 0.0198629 44.729 13.255 44.105 0.887433 8.48267 0.0198629 44.729 0.95026 9.94953 0.0209304 44.105 3 Q QGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRR Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX PLESDQ(1)GDPFTLFN(0.508)VFN(0.542)AWVQ(0.95)VK PLESDQ(30.92)GDPFTLFN(-0.31)VFN(0.31)AWVQ(9.95)VK 21 3 2.6166 5285300 0 0 5285300 NaN 4383100 0 0 0 0 902190 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 4383100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 902190 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1027 1278 654 654 3414 3896 10930;10931 11494;11495 10931 11495 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7770 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 10930 11494 20190821_JH_EV_Ubi 7086 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN 1973 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNC1H1 PE=1 SV=5 0.300494 0 0.0137586 54.199 12.719 54.199 0.300494 0 0.0137586 54.199 Q DEFNRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNP X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX MLSAVSQ(0.3)Q(0.3)VQ(0.3)CIQ(0.099)EALR MLSAVSQ(0)Q(0)VQ(0)CIQ(-4.84)EALR 7 2 -4.088 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1028 1284 1973 1973 2943 3345 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN 1974 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNC1H1 PE=1 SV=5 0.300494 0 0.0137586 54.199 12.719 54.199 0.300494 0 0.0137586 54.199 Q EFNRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNPN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MLSAVSQ(0.3)Q(0.3)VQ(0.3)CIQ(0.099)EALR MLSAVSQ(0)Q(0)VQ(0)CIQ(-4.84)EALR 8 2 -4.088 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1029 1284 1974 1974 2943 3345 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN 1976 sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN sp|Q14204|DYHC1_HUMAN Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DYNC1H1 PE=1 SV=5 0.300494 0 0.0137586 54.199 12.719 54.199 0.300494 0 0.0137586 54.199 Q NRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNPNYD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX MLSAVSQ(0.3)Q(0.3)VQ(0.3)CIQ(0.099)EALR MLSAVSQ(0)Q(0)VQ(0)CIQ(-4.84)EALR 10 2 -4.088 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1030 1284 1976 1976 2943 3345 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 9482 9982 20190821_JH_MUT_Ubi 10933 sp|Q14207|NPAT_HUMAN 279 sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN sp|Q14207|NPAT_HUMAN Protein NPAT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NPAT PE=1 SV=3 0.983189 16.5605 0.0335932 40.968 10.816 40.968 0.983189 16.5605 0.0335932 40.968 Q AENINKFLTSDNNIAQVPKQTDNNPTEPETS X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LAEN(0.025)IN(0.926)KFLTSDN(0.506)N(0.56)IAQ(0.983)VPK LAEN(-16.94)IN(9.56)KFLTSDN(-0.54)N(0.54)IAQ(16.56)VPK 17 3 -3.721 901850 0 0 901850 NaN 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 901850 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1031 1285 279 279 2496 2834 8117 8534 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 8117 8534 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10640 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN 638 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN Sodium/hydrogen exchanger 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC9A5 PE=1 SV=2 0.666666 0 0.028623 66.692 11.71 66.692 0.666666 0 0.028623 66.692 Q FISEDAQERQDKEVFQQNMKRRLESFKSTKH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX QDKEVFQ(0.667)Q(0.667)N(0.667)MK Q(-55.2)DKEVFQ(0)Q(0)N(0)MK 7 2 1.4399 555140 0 555140 0 NaN 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1032 1310 638 638 3611 4120 11609 12186 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN 639 sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN sp|Q14940|SL9A5_HUMAN Sodium/hydrogen exchanger 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC9A5 PE=1 SV=2 0.666666 0 0.028623 66.692 11.71 66.692 0.666666 0 0.028623 66.692 Q ISEDAQERQDKEVFQQNMKRRLESFKSTKHN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX QDKEVFQ(0.667)Q(0.667)N(0.667)MK Q(-55.2)DKEVFQ(0)Q(0)N(0)MK 8 2 1.4399 555140 0 555140 0 NaN 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 555140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1033 1310 639 639 3611 4120 11609 12186 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 11609 12186 20190902_JH_EV_Ubi_2 7886 sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8-3|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8|RHG19_HUMAN;sp|Q14CB8-2|RHG19_HUMAN 287;278;287;287 sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN sp|Q14CB8-7|RHG19_HUMAN Isoform 7 of Rho GTPase-activating protein 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP19;sp|Q14CB8-3|RHG19_HUMAN Isoform 3 of Rho GTPase-activating protein 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP19;sp|Q14CB8|RHG19_HUMAN Rho GTPase-activating 0.884561 8.24014 0.0277676 60.518 22.432 60.518 0.884561 8.24014 0.0277676 60.518 2 Q APHVLWPKNVTANDLQENITKLNSGMAFMIK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX NVTAN(0.231)DLQ(0.885)EN(0.885)ITK N(-42.25)VTAN(-8.24)DLQ(8.24)EN(8.24)ITK 8 2 -1.9037 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1034 1313 287 287 3264 3728 10474 11019 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 10474 11019 20190902_JH_WT_Ubi_2 8847 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN;sp|Q15043|S39AE_HUMAN 269;269;269 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN Isoform 2 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN Isoform 3 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043|S39AE_HUMAN Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX= 1 42.4683 0.025962 42.468 25.531 42.468 1 42.4683 0.025962 42.468 4 Q GHSHYASESLPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP KDQ(1)EEGVMEKLQ(1)N(1)GDLDHMIPQ(1)HCSSELDGK KDQ(42.47)EEGVMEKLQ(42.47)N(42.47)GDLDHMIPQ(42.47)HCSSELDGK 3 3 -0.80643 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1035 1320 269 269 656;2327 751;2647 7651 8048 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN;sp|Q15043|S39AE_HUMAN 278;278;278 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN Isoform 2 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN Isoform 3 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043|S39AE_HUMAN Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX= 1 42.4683 0.000137083 66.545 48.829 42.468 0.489795 0 0.000171578 63.893 0.499413 0 0.000137083 66.545 0.448877 0 0.00759963 42.347 1 42.4683 0.025962 42.468 4 Q LPSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSE X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KDQ(1)EEGVMEKLQ(1)N(1)GDLDHMIPQ(1)HCSSELDGK KDQ(42.47)EEGVMEKLQ(42.47)N(42.47)GDLDHMIPQ(42.47)HCSSELDGK 12 3 -0.80643 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1036 1320 278 278 656;2327 751;2647 7651 8048 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 2058 2182 20190902_JH_EV_Ubi_3 7453 2058 2182 20190902_JH_EV_Ubi_3 7453 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN;sp|Q15043|S39AE_HUMAN 288;288;288 sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN sp|Q15043-2|S39AE_HUMAN Isoform 2 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043-3|S39AE_HUMAN Isoform 3 of Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC39A14;sp|Q15043|S39AE_HUMAN Zinc transporter ZIP14 OS=Homo sapiens OX= 1 42.4683 0.0012685 51.052 36.006 42.468 0.784374 7.98454 0.0012685 51.052 1 42.4683 0.025962 42.468 1;4 Q VMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKAPMVDE X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX KDQ(1)EEGVMEKLQ(1)N(1)GDLDHMIPQ(1)HCSSELDGK KDQ(42.47)EEGVMEKLQ(42.47)N(42.47)GDLDHMIPQ(42.47)HCSSELDGK 22 3 -0.80643 7832900 7832900 0 0 NaN 0 0 0 7832900 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7832900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1037 1320 288 288 656;2327 751;2647 2057;7651 2181;8048 7651 8048 20190902_JH_WT_Ubi_3 8660 2057 2181 20190902_JH_EV_Ubi_2 7452 2057 2181 20190902_JH_EV_Ubi_2 7452 sp|Q15047-2|SETB1_HUMAN;sp|Q15047-3|SETB1_HUMAN;sp|Q15047|SETB1_HUMAN 55;55;55 sp|Q15047-2|SETB1_HUMAN sp|Q15047-2|SETB1_HUMAN sp|Q15047-2|SETB1_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB1;sp|Q15047-3|SETB1_HUMAN Isoform 3 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB1;sp|Q15047|SETB1_HUMAN Histone- 0.821679 6.63518 0.0091534 91.9 32.919 91.9 0.821679 6.63518 0.0091534 91.9 1 Q LRHFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELETWVIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX MDCVQ(0.822)Q(0.178)RKK MDCVQ(6.64)Q(-6.64)RKK 5 2 -0.78467 1015100 1015100 0 0 NaN 0 0 0 0 1015100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1015100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1038 1322 55 55 2882 3271 9283 9769 9283 9769 20190902_JH_EV_Ubi_3 8599 9283 9769 20190902_JH_EV_Ubi_3 8599 9283 9769 20190902_JH_EV_Ubi_3 8599 sp|Q15058|KIF14_HUMAN 997 sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN Kinesin-like protein KIF14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF14 PE=1 SV=1 0.67854 0 0.0342551 50.607 9.0669 50.607 0.67854 0 0.0342551 50.607 3 Q ALEAELREESQRKKMQEINNQKANHKIEELE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KKMQ(0.679)EIN(0.679)N(0.679)Q(0.964)K KKMQ(0)EIN(0)N(0)Q(9.58)K 4 2 -0.96644 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1039 1324 997 997 2372 2698 7789 8191 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 sp|Q15058|KIF14_HUMAN 1002 sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN sp|Q15058|KIF14_HUMAN Kinesin-like protein KIF14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF14 PE=1 SV=1 0.964346 9.5777 0.0342551 50.607 9.0669 50.607 0.964346 9.5777 0.0342551 50.607 3 Q LREESQRKKMQEINNQKANHKIEELEKAKQH X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX KKMQ(0.679)EIN(0.679)N(0.679)Q(0.964)K KKMQ(0)EIN(0)N(0)Q(9.58)K 9 2 -0.96644 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1040 1324 1002 1002 2372 2698 7789 8191 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 7789 8191 20190902_JH_EV_Ubi_2 6703 sp|Q15084-3|PDIA6_HUMAN;sp|Q15084|PDIA6_HUMAN;sp|Q15084-4|PDIA6_HUMAN;sp|Q15084-5|PDIA6_HUMAN;sp|Q15084-2|PDIA6_HUMAN 93;96;101;144;148 sp|Q15084-3|PDIA6_HUMAN sp|Q15084-3|PDIA6_HUMAN sp|Q15084-3|PDIA6_HUMAN Isoform 3 of Protein disulfide-isomerase A6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDIA6;sp|Q15084|PDIA6_HUMAN Protein disulfide-isomerase A6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDIA6 PE=1 SV=1;sp|Q15084-4|PDIA6_HUMAN Isoform 4 of Protein disulfide-isom 0.976599 16.2049 0.00194047 100.58 57.764 94.454 0.786218 5.65572 0.00194047 100.58 0.976599 16.2049 0.00391109 94.454 0.552078 0.907984 0.0180695 76.051 0.957619 13.5402 0.00287141 97.291 1 Q VDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX HHSLGGQ(0.023)YGVQ(0.977)GFPTIK HHSLGGQ(-16.2)YGVQ(16.2)GFPTIK 11 3 2.911 19261000 19261000 0 0 0.06375 0 0 0 0 3260400 3987700 0 5626800 6385800 0 0 0 0 0.22269 0.12128 0 0.15671 0.14613 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3260400 0 0 3987700 0 0 0 0 0 5626800 0 0 6385800 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1041 1327 93 93 1862 2115 5991;5992;5993;5994 6308;6309;6310;6311 5992 6309 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8010 5991 6308 20190902_JH_EV_Ubi_3 7643 5991 6308 20190902_JH_EV_Ubi_3 7643 sp|Q15149|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-5|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-4|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-6|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-3|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-2|PLEC_HUMAN 639;470;480;488;502;502;506;525;529 sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC PE=1 SV=3;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN Isoform 7 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN Isoform 8 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN Isoform 9 0.499992 0 0.00594862 75.564 48.739 75.564 0.499992 0 0.00594862 75.564 1 Q EYNLRLKAGVAAPATQVAQVTLQSVQRRPEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AGVAAPATQ(0.5)VAQ(0.5)VTLQSVQR AGVAAPATQ(0)VAQ(0)VTLQ(-45.43)SVQ(-56.93)R 9 3 -0.24003 1183400 1183400 0 0 0.017221 0 0 0 0 0 0 0 1183400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0.083804 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1183400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1042 1332 639 639 140 162 496 547 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 sp|Q15149|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-5|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-4|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-6|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-3|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-2|PLEC_HUMAN 642;473;483;491;505;505;509;528;532 sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC PE=1 SV=3;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN Isoform 7 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN Isoform 8 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN Isoform 9 0.499992 0 0.00594862 75.564 48.739 75.564 0.499992 0 0.00594862 75.564 1 Q LRLKAGVAAPATQVAQVTLQSVQRRPELEDS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX AGVAAPATQ(0.5)VAQ(0.5)VTLQSVQR AGVAAPATQ(0)VAQ(0)VTLQ(-45.43)SVQ(-56.93)R 12 3 -0.24003 1183400 1183400 0 0 0.017221 0 0 0 0 0 0 0 1183400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0.083804 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1183400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1043 1332 642 642 140 162 496 547 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 496 547 20190902_JH_WT_Ubi_2 12854 sp|Q15149|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-5|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-4|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-6|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-3|PLEC_HUMAN;sp|Q15149-2|PLEC_HUMAN 1003;834;844;852;866;866;870;889;893 sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN sp|Q15149|PLEC_HUMAN Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC PE=1 SV=3;sp|Q15149-7|PLEC_HUMAN Isoform 7 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-8|PLEC_HUMAN Isoform 8 of Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC;sp|Q15149-9|PLEC_HUMAN Isoform 9 0.638638 5.48343 0.00298736 67.848 28.695 67.848 0.638638 5.48343 0.00298736 67.848 1 Q VPSVCFLVPPPNQEAQEAVTRLEAQHQALVT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX VLSSSGSEAAVPSVCFLVPPPN(0.181)Q(0.181)EAQ(0.639)EAVTR VLSSSGSEAAVPSVCFLVPPPN(-5.48)Q(-5.48)EAQ(5.48)EAVTR 26 3 2.2823 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 NaN NaN NaN 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1044 1332 1003 1003 4932 5602 15860 16666 15860 16666 20190902_JH_EV_Ubi_3 11895 15860 16666 20190902_JH_EV_Ubi_3 11895 15860 16666 20190902_JH_EV_Ubi_3 11895 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN;sp|Q15413|RYR3_HUMAN 2792;2792;2792 sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN sp|Q15413-3|RYR3_HUMAN Isoform 3 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413-2|RYR3_HUMAN Isoform 2 of Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3;sp|Q15413|RYR3_HUMAN Ryanodine receptor 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RYR3 PE=1 1 41.7598 0.0291025 41.76 15.556 41.76 1 41.7598 0.0291025 41.76 2 Q KFKDREKAQDLFKFLQVNGIIVSRGMKDMEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP FLQ(1)VN(1)GIIVSRGMKDMELDASSMEK FLQ(41.76)VN(41.76)GIIVSRGMKDMELDASSMEK 3 3 2.3982 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1045 1347 2792 2792 1251 1414 3966 4171 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 3966 4171 20190821_JH_WT_Ubi 15439 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN 228 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBMS2 PE=1 SV=1 0.761221 8.04496 0.00351801 95.741 48.167 95.741 0.761221 8.04496 0.00351801 95.741 Q LLCKFADGGPKKRQNQGKFVQNGRAWPRNAD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX Q(0.119)N(0.119)Q(0.761)GKFVQ(1)N(1)GR Q(-8.04)N(-8.04)Q(8.04)GKFVQ(40.97)N(64.21)GR 3 2 1.3246 11929000 0 0 11929000 NaN 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1046 1349 228 228 3682 4192 11745 12326 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN 233 sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN sp|Q15434|RBMS2_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBMS2 PE=1 SV=1 0.999866 40.9651 0.00351801 95.741 48.167 95.741 0.999866 40.9651 0.00351801 95.741 Q ADGGPKKRQNQGKFVQNGRAWPRNADMGVMA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX Q(0.119)N(0.119)Q(0.761)GKFVQ(1)N(1)GR Q(-8.04)N(-8.04)Q(8.04)GKFVQ(40.97)N(64.21)GR 8 2 1.3246 11929000 0 0 11929000 NaN 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1047 1349 233 233 3682 4192 11745 12326 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 11745 12326 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7890 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN;sp|Q15532|SSXT_HUMAN 33;33 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN Isoform 2 of Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18;sp|Q15532|SSXT_HUMAN Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18 PE=1 SV=3 0.58263 2.40889 0.0205461 57.173 24.82 57.173 0.58263 2.40889 0.0205461 57.173 2 Q PAAIQKMLDDNNHLIQCIMDSQNKGKTSECS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX MLDDN(0.331)N(0.087)HLIQ(0.583)CIMDSQ(0.5)N(0.5)KGK MLDDN(-2.41)N(-8.27)HLIQ(2.41)CIMDSQ(0)N(0)KGK 10 3 3.2784 2014100 0 2014100 0 NaN 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1048 1354 33 33 2933 3334 9460 9958 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN;sp|Q15532|SSXT_HUMAN 39;39 sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN sp|Q15532-2|SSXT_HUMAN Isoform 2 of Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18;sp|Q15532|SSXT_HUMAN Protein SSXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SS18 PE=1 SV=3 0.499963 0 0.0205461 57.173 24.82 57.173 0.499963 0 0.0205461 57.173 2 Q MLDDNNHLIQCIMDSQNKGKTSECSQYQQML X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX MLDDN(0.331)N(0.087)HLIQ(0.583)CIMDSQ(0.5)N(0.5)KGK MLDDN(-2.41)N(-8.27)HLIQ(2.41)CIMDSQ(0)N(0)KGK 16 3 3.2784 2014100 0 2014100 0 NaN 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2014100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1049 1354 39 39 2933 3334 9460 9958 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 9460 9958 20190902_JH_EV_Ubi_2 5099 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-4|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-5|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-2|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-3|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-6|MYLK_HUMAN;sp|Q15746|MYLK_HUMAN 77;355;355;1208;1277;1208;1277;1277;1277 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN Isoform 7 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN Isoform 9 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN Isoform 5 of M 0.938752 11.8923 0.00485256 53.964 6.361 52.09 0.938752 11.8923 0.00557164 52.09 0.802042 6.03275 0.00485256 53.964 0.933012 9.69164 0.0219923 41.45 0.895899 9.26114 0.0206218 42.289 0.562523 0 0.0188402 43.38 2 Q TGTQPITCTWMKFRKQIQESEHMKVENSENG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.939)IQ(0.099)ESEHMKVEN(0.807)SEN(0.156)GSKLTILAAR Q(11.89)IQ(-11.89)ESEHMKVEN(7.23)SEN(-7.23)GSKLTILAAR 1 4 1.135 48127000 0 48127000 0 NaN 0 0 0 15606000 14891000 7317600 3761300 0 6551100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15606000 0 0 14891000 0 0 7317600 0 0 3761300 0 0 0 0 0 6551100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1050 1363 77 77 3640 4149 11669;11670;11672;11673;11674 12247;12248;12250;12251;12252 11669 12247 20190902_JH_EV_Ubi_2 5291 11670 12248 20190902_JH_EV_Ubi_3 5299 11670 12248 20190902_JH_EV_Ubi_3 5299 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-4|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-5|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-2|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-3|MYLK_HUMAN;sp|Q15746-6|MYLK_HUMAN;sp|Q15746|MYLK_HUMAN 79;357;357;1210;1279;1210;1279;1279;1279 sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN sp|Q15746-9|MYLK_HUMAN Isoform 7 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-11|MYLK_HUMAN Isoform 9 of Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYLK;sp|Q15746-7|MYLK_HUMAN Isoform 5 of M 0.762175 5.13085 0.00632218 51.044 13.16 51.044 0.762175 5.13085 0.00632218 51.044 0.556399 0 0.0188402 43.38 2 Q TQPITCTWMKFRKQIQESEHMKVENSENGSK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.248)IQ(0.762)ESEHMKVEN(0.693)SEN(0.298)GSKLTILAAR Q(-5.13)IQ(5.13)ESEHMKVEN(3.76)SEN(-3.76)GSKLTILAAR 3 4 1.6482 11349000 0 11349000 0 NaN 0 4797500 0 0 0 0 0 0 6551100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4797500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6551100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1051 1363 79 79 3640 4149 11671;11674 12249;12252 11671 12249 20190821_JH_MUT_Ubi 4196 11671 12249 20190821_JH_MUT_Ubi 4196 11671 12249 20190821_JH_MUT_Ubi 4196 sp|Q15942|ZYX_HUMAN;sp|Q15942-2|ZYX_HUMAN 243;86 sp|Q15942|ZYX_HUMAN sp|Q15942|ZYX_HUMAN sp|Q15942|ZYX_HUMAN Zyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZYX PE=1 SV=1;sp|Q15942-2|ZYX_HUMAN Isoform 2 of Zyxin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZYX 0.388241 1.50907 0.0259369 62.274 21.759 62.274 0.388241 1.50907 0.0259369 62.274 Q PQPKPQVQLHVQSQTQPVSLANTQPRGPPAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX PQ(0.03)VQ(0.033)LHVQ(0.274)SQ(0.274)TQ(0.388)PVSLANTQPR PQ(-11.1)VQ(-10.77)LHVQ(-1.51)SQ(-1.51)TQ(1.51)PVSLAN(-30.24)TQ(-33.31)PR 12 3 0.52011 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1052 1372 243 243 3503 3997 11272 11842 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8471 11272 11842 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8471 11272 11842 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8471 sp|Q16602|CALRL_HUMAN 45 sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCRL PE=1 SV=2 0.550349 0.488716 0.0310326 42.661 20.46 42.661 0.550349 0.488716 0.0310326 42.661 3 Q DSIQLGVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.495)KIMTAQ(0.55)YECYQ(0.941)KIMQ(0.53)DPIQ(0.166)Q(0.166)AEGVYCN(0.151)R N(-0.49)KIMTAQ(0.49)YECYQ(13.87)KIMQ(5.29)DPIQ(-5.29)Q(-5.29)AEGVYCN(-5.74)R 7 3 -2.0276 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1053 1378 45 45 3115 3562 10032 10567 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 sp|Q16602|CALRL_HUMAN 50 sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCRL PE=1 SV=2 0.940755 13.8704 0.0310326 42.661 20.46 42.661 0.940755 13.8704 0.0310326 42.661 3 Q GVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQAEGVYC X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.495)KIMTAQ(0.55)YECYQ(0.941)KIMQ(0.53)DPIQ(0.166)Q(0.166)AEGVYCN(0.151)R N(-0.49)KIMTAQ(0.49)YECYQ(13.87)KIMQ(5.29)DPIQ(-5.29)Q(-5.29)AEGVYCN(-5.74)R 12 3 -2.0276 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1054 1378 50 50 3115 3562 10032 10567 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 sp|Q16602|CALRL_HUMAN 54 sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN sp|Q16602|CALRL_HUMAN Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCRL PE=1 SV=2 0.530254 5.29192 0.0310326 42.661 20.46 42.661 0.530254 5.29192 0.0310326 42.661 3 Q NKIMTAQYECYQKIMQDPIQQAEGVYCNRTW X;GlyGly (K);X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.495)KIMTAQ(0.55)YECYQ(0.941)KIMQ(0.53)DPIQ(0.166)Q(0.166)AEGVYCN(0.151)R N(-0.49)KIMTAQ(0.49)YECYQ(13.87)KIMQ(5.29)DPIQ(-5.29)Q(-5.29)AEGVYCN(-5.74)R 16 3 -2.0276 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1055 1378 54 54 3115 3562 10032 10567 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 10032 10567 20190821_JH_MUT_Ubi 9472 sp|Q16718|NDUA5_HUMAN;sp|Q16718-2|NDUA5_HUMAN 50;50 sp|Q16718|NDUA5_HUMAN sp|Q16718|NDUA5_HUMAN sp|Q16718|NDUA5_HUMAN NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDUFA5 PE=1 SV=3;sp|Q16718-2|NDUA5_HUMAN Isoform 2 of NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDUF 0.950472 12.8312 0.0293941 62.546 10.064 62.546 0.950472 12.8312 0.0293941 62.546 Q LEEIPKNAAYRKYTEQITNEKLAMVKAEPDV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX KYTEQ(0.95)ITN(0.05)EK KYTEQ(12.83)ITN(-12.83)EK 5 2 1.1297 10633000 10633000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 10633000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10633000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1056 1384 50 50 2491 2828 8106 8522 8106 8522 20190902_JH_WT_Ubi_3 11451 8106 8522 20190902_JH_WT_Ubi_3 11451 8106 8522 20190902_JH_WT_Ubi_3 11451 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN 825;1064 sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN sp|Q2KHR3-2|QSER1_HUMAN Isoform 2 of Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1;sp|Q2KHR3|QSER1_HUMAN Glutamine and serine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QSER1 PE=1 SV=3 0.981767 14.0335 0.0172781 53.565 9.7037 53.565 0.981767 14.0335 0.0172781 53.565 3 Q AQSGDAVSVKIEEENQDLMHFNLQKKRAKGK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX IEEEN(0.579)Q(0.982)DLMHFN(0.901)LQ(0.538)KKR IEEEN(0.4)Q(14.03)DLMHFN(6.69)LQ(-0.4)KKR 6 3 -2.3175 2859500 0 0 2859500 NaN 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 2859500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1057 1398 825 825 2097 2395 6966 7335 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 6966 7335 20190821_JH_EV_Ubi 7983 sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN 222 sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN sp|Q2QD12|RPEL1_HUMAN Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPEL1 PE=2 SV=1 0.999628 34.2711 0.0228375 53.237 7.8045 53.237 0.999628 34.2711 0.0228375 53.237 2 Q RSVINLLRNICSEAAQKRSLDR_________ X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX SVIN(0.005)LLRN(0.995)ICSEAAQ(1)K SVIN(-23.03)LLRN(23.03)ICSEAAQ(34.27)K 15 2 1.5031 592730 0 592730 0 NaN 0 0 0 0 0 592730 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 592730 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1058 1401 222 222 4213 4783 13324 13977 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 13324 13977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9895 sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN;sp|Q2TAC2|CCD57_HUMAN 464;464 sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC57;sp|Q2TAC2|CCD57_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC57 PE=1 SV=2 0.994683 23.0251 0.0247203 57.328 10.363 57.328 0.994683 23.0251 0.0247203 57.328 2 Q IQGLSMAKSQVAAKLQETEQALQEQEVVLKA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX LQ(0.995)ETEQ(0.993)ALQ(0.011)EQ(0.001)EVVLK LQ(23.03)ETEQ(21.98)ALQ(-21.98)EQ(-34.19)EVVLK 2 3 -2.5511 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1059 1402 464 464 2778 3154 8989 9459 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN;sp|Q2TAC2|CCD57_HUMAN 468;468 sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN sp|Q2TAC2-2|CCD57_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC57;sp|Q2TAC2|CCD57_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 57 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC57 PE=1 SV=2 0.993287 21.978 0.0247203 57.328 10.363 57.328 0.993287 21.978 0.0247203 57.328 2 Q SMAKSQVAAKLQETEQALQEQEVVLKAVTLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LQ(0.995)ETEQ(0.993)ALQ(0.011)EQ(0.001)EVVLK LQ(23.03)ETEQ(21.98)ALQ(-21.98)EQ(-34.19)EVVLK 6 3 -2.5511 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1060 1402 468 468 2778 3154 8989 9459 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 8989 9459 20190821_JH_MUT_Ubi 7296 sp|Q3V6T2-5|GRDN_HUMAN;sp|Q3V6T2-4|GRDN_HUMAN;sp|Q3V6T2-2|GRDN_HUMAN;sp|Q3V6T2-3|GRDN_HUMAN;sp|Q3V6T2|GRDN_HUMAN 759;759;759;759;759 sp|Q3V6T2-5|GRDN_HUMAN sp|Q3V6T2-5|GRDN_HUMAN sp|Q3V6T2-5|GRDN_HUMAN Isoform 5 of Girdin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC88A;sp|Q3V6T2-4|GRDN_HUMAN Isoform 4 of Girdin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC88A;sp|Q3V6T2-2|GRDN_HUMAN Isoform 2 of Girdin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC88A;sp|Q3V6T2-3|GRDN_HUMAN 0.96197 17.0406 0.0249055 55.864 15.685 55.864 0.96197 17.0406 0.0249055 55.864 1 Q LKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLEN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX KTERLEVSYQ(0.962)GLDIEN(0.019)Q(0.019)R KTERLEVSYQ(17.04)GLDIEN(-17.04)Q(-17.04)R 10 4 -3.458 5104300 5104300 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5104300 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5104300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1061 1408 759 759 2462 2797 8039 8450 8039 8450 20190902_JH_WT_Ubi_2 9488 8039 8450 20190902_JH_WT_Ubi_2 9488 8039 8450 20190902_JH_WT_Ubi_2 9488 sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN;sp|Q460N5-1|PAR14_HUMAN;sp|Q460N5|PAR14_HUMAN 28;28;28 sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN Isoform 4 of Poly [ADP-ribose] polymerase 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARP14;sp|Q460N5-1|PAR14_HUMAN Isoform 1 of Poly [ADP-ribose] polymerase 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARP14;sp|Q460N5|PAR14_HUMAN Poly [ADP-ribose] polymerase 1 49.0967 0.0341466 49.097 8.2148 49.097 1 49.0967 0.0341466 49.097 Q GSWGPDPPKNLNTKLQMYFQSPKRSGGGECE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX LQ(1)MYFQ(1)SPK LQ(49.1)MYFQ(49.1)SPK 2 3 -2.0735 21048000 0 21048000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 20360000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20360000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1062 1412 28 28 2785 3161 8998;8999 9468;9469 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN;sp|Q460N5-1|PAR14_HUMAN;sp|Q460N5|PAR14_HUMAN 32;32;32 sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN sp|Q460N5-4|PAR14_HUMAN Isoform 4 of Poly [ADP-ribose] polymerase 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARP14;sp|Q460N5-1|PAR14_HUMAN Isoform 1 of Poly [ADP-ribose] polymerase 14 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARP14;sp|Q460N5|PAR14_HUMAN Poly [ADP-ribose] polymerase 1 49.0967 0.0341466 49.097 8.2148 49.097 1 49.0967 0.0341466 49.097 Q PDPPKNLNTKLQMYFQSPKRSGGGECEVRQD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LQ(1)MYFQ(1)SPK LQ(49.1)MYFQ(49.1)SPK 6 3 -2.0735 21048000 0 21048000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 20360000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20360000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1063 1412 32 32 2785 3161 8998;8999 9468;9469 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 8999 9469 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6696 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN 26;26 sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN sp|Q4G0S7-2|CC152_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152;sp|Q4G0S7|CC152_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 152 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC152 PE=2 SV=3 0.50099 0 0.019513 48.907 7.5595 48.907 0.50099 0 0.019513 48.907 2 Q KISSVNLDKLINDFSQIEKKMVETNGKNNIL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ISSVN(0.998)LDKLIN(0.501)DFSQ(0.501)IEKK ISSVN(24.01)LDKLIN(0)DFSQ(0)IEKK 15 3 -3.6429 1145600 0 1145600 0 NaN 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1145600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1064 1414 26 26 2264 2577 7421 7800 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 7421 7800 20190821_JH_EV_Ubi 9929 sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN 972 sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN Rho GTPase-activating protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP29 PE=1 SV=2 0.888784 9.02514 0.0303331 46.706 7.8314 46.706 0.888784 9.02514 0.0303331 46.706 Q QNALGKCDACLSDKAQLLLDQEAESASQKIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXX AQ(0.889)LLLDQ(0.111)EAESASQ(1)K AQ(9.03)LLLDQ(-9.03)EAESASQ(35.78)K 2 2 -0.70869 556880 0 556880 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 556880 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 556880 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1065 1416 972 972 255 301 885 962 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN 984 sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN sp|Q52LW3|RHG29_HUMAN Rho GTPase-activating protein 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP29 PE=1 SV=2 0.999765 35.7806 0.0303331 46.706 7.8314 46.706 0.999765 35.7806 0.0303331 46.706 Q DKAQLLLDQEAESASQKIEDGKTPKPLSLKS X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX AQ(0.889)LLLDQ(0.111)EAESASQ(1)K AQ(9.03)LLLDQ(-9.03)EAESASQ(35.78)K 14 2 -0.70869 556880 0 556880 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 556880 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 556880 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1066 1416 984 984 255 301 885 962 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 885 962 20190902_JH_WT_Ubi_3 14709 sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN 4852 sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN sp|Q5CZC0|FSIP2_HUMAN Fibrous sheath-interacting protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSIP2 PE=2 SV=4 0.945 15.2469 0.0354215 46.844 14.59 46.844 0.945 15.2469 0.0354215 46.844 Q ISKHEICIIKYGNKKQSMISAKDIQSMVDSI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX YGN(0.055)KKQ(0.945)SMISAK YGN(-15.25)KKQ(15.25)SMISAK 6 3 0.28756 1738900 1738900 0 0 NaN 1738900 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1738900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1067 1424 4852 4852 5146 5852 16605 17453 16605 17453 20190821_JH_EV_Ubi 3135 16605 17453 20190821_JH_EV_Ubi 3135 16605 17453 20190821_JH_EV_Ubi 3135 sp|Q5JRA6-4|TGO1_HUMAN;sp|Q5JRA6-2|TGO1_HUMAN;sp|Q5JRA6|TGO1_HUMAN 132;1254;1254 sp|Q5JRA6-4|TGO1_HUMAN sp|Q5JRA6-4|TGO1_HUMAN sp|Q5JRA6-4|TGO1_HUMAN Isoform 4 of Transport and Golgi organization protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIA3;sp|Q5JRA6-2|TGO1_HUMAN Isoform 2 of Transport and Golgi organization protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIA3;sp|Q5JRA6|TGO1_HUM 0.797961 5.96549 0.0210114 62.088 26.615 62.088 0.797961 5.96549 0.0210114 62.088 Q QKIKESKKHVQETRKQNMILSDEAIKYKDKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXX KQ(0.798)N(0.202)MILSDEAIKYK KQ(5.97)N(-5.97)MILSDEAIKYK 2 3 1.4508 5070400 5070400 0 0 NaN 0 0 0 0 5070400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5070400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1068 1429 132 132 2444 2779 7994 8405 7994 8405 20190902_JH_EV_Ubi_3 4800 7994 8405 20190902_JH_EV_Ubi_3 4800 7994 8405 20190902_JH_EV_Ubi_3 4800 sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN;sp|Q5JTV8|TOIP1_HUMAN 303;302 sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN sp|Q5JTV8-3|TOIP1_HUMAN Isoform 3 of Torsin-1A-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOR1AIP1;sp|Q5JTV8|TOIP1_HUMAN Torsin-1A-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOR1AIP1 PE=1 SV=2 0.499992 0 0.00372491 75.064 40.415 75.064 0.499992 0 0.00372491 75.064 1 Q PQEWAPQTARIRTRMQNDSILKSELGNQSPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP MQ(0.5)N(0.5)DSILKSELGNQSPSTSSR MQ(0)N(0)DSILKSELGN(-48.6)Q(-47.69)SPSTSSR 2 3 0.066255 883820 883820 0 0 0.069979 883820 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 NaN 883820 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1069 1430 303 303 2960 3369 9542 10042 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 9542 10042 20190821_JH_EV_Ubi 7739 sp|Q5SQI0-7|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0-6|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0-5|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0-4|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0-3|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0-2|ATAT_HUMAN;sp|Q5SQI0|ATAT_HUMAN 145;145;145;145;145;133;145 sp|Q5SQI0-7|ATAT_HUMAN sp|Q5SQI0-7|ATAT_HUMAN sp|Q5SQI0-7|ATAT_HUMAN Isoform 7 of Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAT1;sp|Q5SQI0-6|ATAT_HUMAN Isoform 6 of Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAT1;sp|Q5SQI0-5|ATAT_HUMAN Isoform 5 of Alpha-tubu 0.999863 38.627 0.00119236 115.91 20.432 115.91 0.999863 38.627 0.00119236 115.91 0.952309 13.0034 0.019152 74.962 0.768322 5.20659 0.0144155 82.494 1 Q VQRHGHGRELFQYMLQKERVEPHQLAIDRPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX ELFQYMLQ(1)KER ELFQ(-38.63)YMLQ(38.63)KER 8 3 -0.33365 4099900 4099900 0 0 NaN 0 904070 0 0 0 1268400 1927400 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 904070 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1268400 0 0 1927400 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1070 1435 145 145 990 1119 3166;3167;3168 3328;3329;3330 3166 3328 20190821_JH_MUT_Ubi 2339 3166 3328 20190821_JH_MUT_Ubi 2339 3166 3328 20190821_JH_MUT_Ubi 2339 sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN;sp|Q5T0U0-2|CC122_HUMAN 183;183 sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN sp|Q5T0U0|CC122_HUMAN Coiled-coil domain-containing protein 122 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC122 PE=2 SV=1;sp|Q5T0U0-2|CC122_HUMAN Isoform 2 of Coiled-coil domain-containing protein 122 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC122 0.799534 6.0021 0.0233658 65.842 8.4934 65.842 0.799534 6.0021 0.0233658 65.842 2 Q ELMQDLQNPGGNRITQVQEDITNLKDKIITV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXX ITQ(0.8)VQ(0.202)EDITN(0.999)LK ITQ(6)VQ(-6)EDITN(28.7)LK 3 3 0.56193 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1071 1438 183 183 2278 2591 7464 7845 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 7464 7845 20190902_JH_EV_Ubi_2 5634 sp|Q5T7W0-2|ZN618_HUMAN;sp|Q5T7W0-4|ZN618_HUMAN;sp|Q5T7W0|ZN618_HUMAN 632;692;725 sp|Q5T7W0-2|ZN618_HUMAN sp|Q5T7W0-2|ZN618_HUMAN sp|Q5T7W0-2|ZN618_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein 618 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF618;sp|Q5T7W0-4|ZN618_HUMAN Isoform 4 of Zinc finger protein 618 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF618;sp|Q5T7W0|ZN618_HUMAN Zinc finger protein 618 OS=Homo sapiens OX=9 0.742873 4.6274 0.0232328 64.73 6.5973 64.73 0.742873 4.6274 0.0232328 64.73 1 Q QICEFYSRAKKMNLIQSLNKHLLSNLAAILT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX KMN(0.256)LIQ(0.743)SLN(0.001)K KMN(-4.63)LIQ(4.63)SLN(-28.05)K 6 3 -3.9156 142190000 142190000 0 0 NaN 142190000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 142190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1072 1442 632 632 2399 2728 7856 8260 7856 8260 20190821_JH_EV_Ubi 3425 7856 8260 20190821_JH_EV_Ubi 3425 7856 8260 20190821_JH_EV_Ubi 3425 sp|Q5T848|GP158_HUMAN 741 sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN sp|Q5T848|GP158_HUMAN Probable G-protein coupled receptor 158 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPR158 PE=1 SV=1 0.966419 11.6387 0.0355679 41.448 11.639 41.448 0.966419 11.6387 0.0355679 41.448 2 Q EIYKRKKMITNNPHLQKKRCSKKGLGRSIMR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX KMITN(0.517)N(0.517)PHLQ(0.966)K KMITN(0)N(0)PHLQ(11.64)K 10 2 1.274 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1073 1443 741 741 2398 2727 7855 8259 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 7855 8259 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8588 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN 20;55;53 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN Isoform 2 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN Isoform 3 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN Acyl 0.999539 33.0886 0.0199924 48.984 15.009 48.984 0.999539 33.0886 0.0199924 48.984 3 Q RSVHETRFEAAVKVIQSLPKNGSFQPTNEMM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FEAAVKVIQ(1)SLPKN(0.985)GSFQ(0.892)PTN(0.124)EMMLK FEAAVKVIQ(33.09)SLPKN(17.6)GSFQ(9.1)PTN(-9.1)EMMLK 9 3 -2.5073 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1074 1444 20 20 1183 1335 3757 3953 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN 29;64;62 sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN sp|Q5T8D3-2|ACBD5_HUMAN Isoform 2 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3-3|ACBD5_HUMAN Isoform 3 of Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACBD5;sp|Q5T8D3|ACBD5_HUMAN Acyl 0.892104 9.10166 0.0199924 48.984 15.009 48.984 0.892104 9.10166 0.0199924 48.984 3 Q AAVKVIQSLPKNGSFQPTNEMMLKFYSFYKQ X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX FEAAVKVIQ(1)SLPKN(0.985)GSFQ(0.892)PTN(0.124)EMMLK FEAAVKVIQ(33.09)SLPKN(17.6)GSFQ(9.1)PTN(-9.1)EMMLK 18 3 -2.5073 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1075 1444 29 29 1183 1335 3757 3953 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 3757 3953 20190821_JH_EV_Ubi 12209 sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2-2|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2-5|GARL3_HUMAN;sp|Q5VVW2|GARL3_HUMAN 190;231;209;231 sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN sp|Q5VVW2-3|GARL3_HUMAN Isoform 3 of GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GARNL3;sp|Q5VVW2-2|GARL3_HUMAN Isoform 2 of GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GARNL3;sp|Q5VVW2- 0.99992 40.8753 0.00358196 71.376 47.333 57.171 0.99992 40.8753 0.00358196 71.376 2 Q TDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKGW X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX DGQ(0.025)LTDDEMFSN(0.975)EIGSEPFQ(1)K DGQ(-15.86)LTDDEMFSN(15.86)EIGSEPFQ(40.88)K 20 3 -0.7616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1076 1451 190 190 491 571 1612;1613 1706;1707 1613 1707 20190902_JH_WT_Ubi_3 6996 1612 1706 20190902_JH_WT_Ubi_3 6991 1612 1706 20190902_JH_WT_Ubi_3 6991 sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN;sp|Q5XPI4-2|RN123_HUMAN 536;536 sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN sp|Q5XPI4|RN123_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RNF123 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF123 PE=1 SV=1;sp|Q5XPI4-2|RN123_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase RNF123 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF123 1 53.4935 0.0355088 53.493 6.8301 53.493 1 53.4935 0.0355088 53.493 2 Q EASRYIFLTKFRKFLQENASGRGNMPMLCPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXX FLQ(1)EN(1)ASGR FLQ(53.49)EN(53.49)ASGR 3 2 2.8206 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1077 1456 536 536 1250 1413 3965 4170 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 3965 4170 20190902_JH_EV_Ubi_3 5967 sp|Q66K66|TM198_HUMAN 264 sp|Q66K66|TM198_HUMAN sp|Q66K66|TM198_HUMAN sp|Q66K66|TM198_HUMAN Transmembrane protein 198 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM198 PE=1 SV=1 0.998466 28.1352 0.030123 64.439 28.793 64.439 0.998466 28.1352 0.030123 64.439 2 Q VISRQRRRVQLMRIRQQEDRKEKRRKKRPPR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VQ(0.002)LMRIRQ(0.998)Q(1)EDR VQ(-28.14)LMRIRQ(28.14)Q(36.23)EDR 8 3 -1.918 1138400 0 1138400 0 NaN 0 0 0 1138400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1138400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1078 1461 264 264 4994 5666 16031 16841 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 sp|Q66K66|TM198_HUMAN 265 sp|Q66K66|TM198_HUMAN sp|Q66K66|TM198_HUMAN sp|Q66K66|TM198_HUMAN Transmembrane protein 198 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM198 PE=1 SV=1 0.999762 36.233 0.030123 64.439 28.793 64.439 0.999762 36.233 0.030123 64.439 2 Q ISRQRRRVQLMRIRQQEDRKEKRRKKRPPRA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX VQ(0.002)LMRIRQ(0.998)Q(1)EDR VQ(-28.14)LMRIRQ(28.14)Q(36.23)EDR 9 3 -1.918 1138400 0 1138400 0 NaN 0 0 0 1138400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1138400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1079 1461 265 265 4994 5666 16031 16841 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 16031 16841 20190902_JH_EV_Ubi_2 5943 sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN;sp|Q674R7|ATG9B_HUMAN 400;914 sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN sp|Q674R7-2|ATG9B_HUMAN Isoform 2 of Autophagy-related protein 9B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG9B;sp|Q674R7|ATG9B_HUMAN Autophagy-related protein 9B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG9B PE=2 SV=1 0.537291 0.648417 0.034999 51.211 11.186 51.211 0.537291 0.648417 0.034999 51.211 2 Q ARNLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD_____ X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX N(1)LFPGGFQ(0.463)VTTDTQ(0.537)K N(38.66)LFPGGFQ(-0.65)VTTDTQ(0.65)K 14 3 -2.4661 4372000 0 4372000 0 NaN 0 0 4372000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1080 1462 400 400 3127 3574 10064 10600 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 10064 10600 20190821_JH_WT_Ubi 8190 sp|Q68DU8|KCD16_HUMAN 419 sp|Q68DU8|KCD16_HUMAN sp|Q68DU8|KCD16_HUMAN sp|Q68DU8|KCD16_HUMAN BTB/POZ domain-containing protein KCTD16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KCTD16 PE=1 SV=1 1 72.289 0.034876 72.289 15.333 72.289 1 72.289 0.034876 72.289 Q KIKIPDRFPERKHPWQSELLRKYHL______ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX KHPWQ(1)SELLRK KHPWQ(72.29)SELLRK 5 3 -0.067123 1759900 1759900 0 0 NaN 1759900 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1759900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1081 1466 419 419 2366 2692 7777 8178 7777 8178 20190821_JH_EV_Ubi 6984 7777 8178 20190821_JH_EV_Ubi 6984 7777 8178 20190821_JH_EV_Ubi 6984 sp|Q6EMK4|VASN_HUMAN 614 sp|Q6EMK4|VASN_HUMAN sp|Q6EMK4|VASN_HUMAN sp|Q6EMK4|VASN_HUMAN Vasorin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VASN PE=1 SV=1 1 78.3521 0.00120616 78.352 43.176 78.352 1 78.3521 0.00120616 78.352 1 Q VRRGRAMAAAAQDKGQVGPGAGPLELEGVKV X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP GQ(1)VGPGAGPLELEGVKVPLEPGPK GQ(78.35)VGPGAGPLELEGVKVPLEPGPK 2 3 -0.16461 22695000 22695000 0 0 0.22023 0 22695000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 22695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1082 1468 614 614 1677 1912 5366 5649 5366 5649 20190821_JH_MUT_Ubi 10468 5366 5649 20190821_JH_MUT_Ubi 10468 5366 5649 20190821_JH_MUT_Ubi 10468 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN 1380;1380 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN Isoform 2 of Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL PE=1 SV=2 0.999999 59.7488 0.0211554 75.378 29.22 75.378 0.999999 59.7488 0.0211554 75.378 1 Q LLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXX Q(1)RVIVMLYNK Q(59.75)RVIVMLYN(-59.75)K 1 3 0.59137 1592800 1592800 0 0 NaN 0 0 1592800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1592800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1083 1474 1380 1380 3697 4208 11769 12350 11769 12350 20190821_JH_WT_Ubi 9524 11769 12350 20190821_JH_WT_Ubi 9524 11769 12350 20190821_JH_WT_Ubi 9524 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN 2592;2592 sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN sp|Q6KC79-2|NIPBL_HUMAN Isoform 2 of Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL;sp|Q6KC79|NIPBL_HUMAN Nipped-B-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NIPBL PE=1 SV=2 1 47.8137 0.0264328 47.814 20.883 47.814 1 47.8137 0.0264328 47.814 Q DKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKIT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX TGVHFHPKQ(1)TLDFLRSDMAN(1)SK TGVHFHPKQ(47.81)TLDFLRSDMAN(47.81)SK 9 4 -3.2871 1571900 0 1571900 0 NaN 0 0 1571900 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1571900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1084 1474 2592 2592 4393 4986 13920 14610 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 13920 14610 20190821_JH_WT_Ubi 7690 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN 315;315 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN Isoform 2 of Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1 PE=1 SV=1 1 64.5215 0.00204535 64.522 13.564 64.522 1 64.5215 0.00204535 64.522 3 Q LLMVSDSERTTEGTSQQKVKEGNGKTVPGET X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX N(1)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(1)Q(1)KVK N(64.52)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(64.52)Q(64.52)KVK 19 3 1.94 3113700 0 0 3113700 NaN 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1085 1477 315 315 3075 3519 9938 10469 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN 316;316 sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN sp|Q6P0N0-2|M18BP_HUMAN Isoform 2 of Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1;sp|Q6P0N0|M18BP_HUMAN Mis18-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIS18BP1 PE=1 SV=1 1 64.5215 0.00204535 64.522 13.564 64.522 1 64.5215 0.00204535 64.522 3 Q LMVSDSERTTEGTSQQKVKEGNGKTVPGETG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX N(1)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(1)Q(1)KVK N(64.52)GSLLMVSDSERTTEGTSQ(64.52)Q(64.52)KVK 20 3 1.94 3113700 0 0 3113700 NaN 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3113700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1086 1477 316 316 3075 3519 9938 10469 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 9938 10469 20190821_JH_WT_Ubi 8313 sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN 496 sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN sp|Q6PI77|BHLH9_HUMAN Protein BHLHb9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BHLHB9 PE=1 SV=1 0.999961 47.0601 0.023728 52.599 24.433 52.599 0.999961 47.0601 0.023728 52.599 Q MINMKALAALKLIFNQKEAKANLVSGVAIFI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX DMINMKALAALKLIFN(1)Q(1)K DMIN(-44.11)MKALAALKLIFN(44.11)Q(47.06)K 17 4 -0.70872 1065900 0 1065900 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1065900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1065900 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1087 1485 496 496 619 710 1944 2063 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 1944 2063 20190902_JH_WT_Ubi_2 15000 sp|Q6Q4G3-4|AMPQ_HUMAN;sp|Q6Q4G3-3|AMPQ_HUMAN;sp|Q6Q4G3-2|AMPQ_HUMAN;sp|Q6Q4G3|AMPQ_HUMAN 147;147;630;630 sp|Q6Q4G3-4|AMPQ_HUMAN sp|Q6Q4G3-4|AMPQ_HUMAN sp|Q6Q4G3-4|AMPQ_HUMAN Isoform 4 of Aminopeptidase Q OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LVRN;sp|Q6Q4G3-3|AMPQ_HUMAN Isoform 3 of Aminopeptidase Q OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LVRN;sp|Q6Q4G3-2|AMPQ_HUMAN Isoform 2 of Aminopeptidase Q OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LVRN;s 1 64.1518 0.00565511 82.069 16.506 82.069 0.999999 64.7667 0.0087429 72.891 0.999999 63.4707 0.00602831 80.96 0.999999 62.7491 0.00783529 75.589 1 64.1518 0.00565511 82.069 Q LWIKNGTTQPLVWLDQSSKVFPEMQVSDSDH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX NGTTQPLVWLDQ(1)SSK N(-64.15)GTTQ(-70.55)PLVWLDQ(64.15)SSK 12 3 -0.65092 4285100 4285100 0 0 NaN 0 482470 1881900 446700 0 0 0 0 1474100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 482470 0 0 1881900 0 0 446700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1474100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1088 1489 147 147 3078 3525 9950;9951;9952;9953 10482;10483;10484;10485 9953 10485 20190902_JH_WT_Ubi_3 12117 9953 10485 20190902_JH_WT_Ubi_3 12117 9953 10485 20190902_JH_WT_Ubi_3 12117 sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN 755 sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN sp|Q6ZMV5|P4R3C_HUMAN Protein PPP4R3C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3C PE=2 SV=3 1 80.6884 0.00678804 80.688 32.248 80.688 1 80.6884 0.00678804 80.688 Q PPLEDDDEFMETKRNQEHEGKVDSPKRTSSG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXX RN(1)Q(1)EHEGKVDSPK RN(80.69)Q(80.69)EHEGKVDSPK 3 2 -3.6555 3985100 0 3985100 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3985100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3985100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1089 1501 755 755 3774 4288 11947 12530 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 11947 12530 20190902_JH_WT_Ubi_2 13419 sp|Q6ZN16-2|M3K15_HUMAN;sp|Q6ZN16-3|M3K15_HUMAN;sp|Q6ZN16|M3K15_HUMAN 655;695;1220 sp|Q6ZN16-2|M3K15_HUMAN sp|Q6ZN16-2|M3K15_HUMAN sp|Q6ZN16-2|M3K15_HUMAN Isoform 2 of Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K15;sp|Q6ZN16-3|M3K15_HUMAN Isoform 3 of Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP3K15;sp|Q6ZN16|M3 0.966588 15.3886 0.0282879 62.69 14.299 62.69 0.966588 15.3886 0.0282879 62.69 Q LRQTLEQKTQELYHLQLKLKSNCITENPAGP X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(0.001)TLEQ(0.004)KTQ(0.028)ELYHLQ(0.967)LK Q(-28.89)TLEQ(-23.69)KTQ(-15.39)ELYHLQ(15.39)LK 14 3 -2.9737 1900700 1900700 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1900700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1900700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1090 1502 655 655 3704 4215 11779 12360 11779 12360 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11287 11779 12360 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11287 11779 12360 20190902_JH_MUT_Ubi_3 11287 sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN 120 sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN sp|Q6ZNX1|YE028_HUMAN Uncharacterized protein FLJ26957 OS=Homo sapiens OX=9606 PE=2 SV=1 0.999867 39.5563 0.0340024 55.335 21.65 55.335 0.999867 39.5563 0.0340024 55.335 2 Q SHTLKEQTNSGNLGKQSEKGKQHKRRSWSIS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX EQ(0.005)TN(0.23)SGN(0.765)LGKQ(1)SEKGK EQ(-22.07)TN(-5.23)SGN(5.23)LGKQ(39.56)SEKGK 11 3 3.3769 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1091 1503 120 120 1086 1224 3455 3632 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 3455 3632 20190902_JH_MUT_Ubi_3 3862 sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN 133 sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL4 PE=2 SV=2 0.499969 0 0.0139124 63.145 30.581 63.145 0.499969 0 0.0139124 63.145 Q KSTLLKQYENLILEFQQSFGKPTKQEINPLM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX STLLKQYENLILEFQ(0.5)Q(0.5)SFGK STLLKQ(-41.79)YEN(-42.4)LILEFQ(0)Q(0)SFGK 15 4 -0.25857 1874100 1874100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1874100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1874100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1092 1504 133 133 4194 4763 13286 13938 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN 134 sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN sp|Q6ZR62|RTL4_HUMAN Retrotransposon Gag-like protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RTL4 PE=2 SV=2 0.499969 0 0.0139124 63.145 30.581 63.145 0.499969 0 0.0139124 63.145 Q STLLKQYENLILEFQQSFGKPTKQEINPLMN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX STLLKQYENLILEFQ(0.5)Q(0.5)SFGK STLLKQ(-41.79)YEN(-42.4)LILEFQ(0)Q(0)SFGK 16 4 -0.25857 1874100 1874100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1874100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1874100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1093 1504 134 134 4194 4763 13286 13938 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 13286 13938 20190902_JH_WT_Ubi_2 12612 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN 81 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN Ras and Rab interactor-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RINL PE=2 SV=2 0.95167 8.17148 0.00390611 53.585 31.986 53.585 0.95167 8.17148 0.00390611 53.585 3 Q LWPLGSFLVTGRDPSQALVLRSGPLPGEVNT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DPSQ(0.952)ALVLRSGPLPGEVN(0.683)TYQ(0.683)IQ(0.683)K DPSQ(8.17)ALVLRSGPLPGEVN(0)TYQ(0)IQ(0)K 4 4 2.4132 69573000 0 0 69573000 NaN 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1094 1505 81 81 653 748 2050 2174 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN 98 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN Ras and Rab interactor-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RINL PE=2 SV=2 0.682777 0 0.00390611 53.585 31.986 53.585 0.682777 0 0.00390611 53.585 3 Q LVLRSGPLPGEVNTYQIQKIPRGVSLESSNL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX DPSQ(0.952)ALVLRSGPLPGEVN(0.683)TYQ(0.683)IQ(0.683)K DPSQ(8.17)ALVLRSGPLPGEVN(0)TYQ(0)IQ(0)K 21 4 2.4132 69573000 0 0 69573000 NaN 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1095 1505 98 98 653 748 2050 2174 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN 100 sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN sp|Q6ZS11|RINL_HUMAN Ras and Rab interactor-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RINL PE=2 SV=2 0.682777 0 0.00390611 53.585 31.986 53.585 0.682777 0 0.00390611 53.585 3 Q LRSGPLPGEVNTYQIQKIPRGVSLESSNLCM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DPSQ(0.952)ALVLRSGPLPGEVN(0.683)TYQ(0.683)IQ(0.683)K DPSQ(8.17)ALVLRSGPLPGEVN(0)TYQ(0)IQ(0)K 23 4 2.4132 69573000 0 0 69573000 NaN 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1096 1505 100 100 653 748 2050 2174 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 2050 2174 20190902_JH_MUT_Ubi_2 13347 sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN;sp|Q6ZS30|NBEL1_HUMAN 2271;2271 sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN sp|Q6ZS30-1|NBEL1_HUMAN Isoform 1 of Neurobeachin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NBEAL1;sp|Q6ZS30|NBEL1_HUMAN Neurobeachin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NBEAL1 PE=2 SV=3 0.966517 15.348 0.0350216 40.676 12.393 40.676 0.966517 15.348 0.0350216 40.676 2 Q EKERKALEGMINNFGQTPCQLLKITISMNYV X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX KALEGMIN(0.262)N(0.74)FGQ(0.967)TPCQ(0.031)LLK KALEGMIN(-4.57)N(4.57)FGQ(15.35)TPCQ(-15.35)LLK 12 2 -3.6233 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1097 1506 2271 2271 2317 2635 7622 8019 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 7622 8019 20190821_JH_MUT_Ubi 13276 sp|Q6ZTR5-2|CFA47_HUMAN;sp|Q6ZTR5-1|CFA47_HUMAN;sp|Q6ZTR5-6|CFA47_HUMAN;sp|Q6ZTR5|CFA47_HUMAN 488;488;488;488 sp|Q6ZTR5-2|CFA47_HUMAN sp|Q6ZTR5-2|CFA47_HUMAN sp|Q6ZTR5-2|CFA47_HUMAN Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP47;sp|Q6ZTR5-1|CFA47_HUMAN Isoform 1 of Cilia- and flagella-associated protein 47 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CFAP47;sp|Q6ZTR5-6|CFA47_HUMAN Isofor 0.99999 50.1431 0.0117418 62.203 14.474 62.203 0.99999 50.1431 0.0117418 62.203 1 Q MCSFVPHQLGVFKVKQMIEIIGLVAEEDLQS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(1)MIEIIGLVAEEDLQSLSVK Q(50.14)MIEIIGLVAEEDLQ(-50.14)SLSVK 1 3 3.0221 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1098 1507 488 488 3670 4179 11727 12306 11727 12306 20190821_JH_EV_Ubi 9532 11727 12306 20190821_JH_EV_Ubi 9532 11727 12306 20190821_JH_EV_Ubi 9532 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN;sp|Q6ZVD8|PHLP2_HUMAN 669;602;669 sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN sp|Q6ZVD8-2|PHLP2_HUMAN Isoform 2 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHLPP2;sp|Q6ZVD8-3|PHLP2_HUMAN Isoform 3 of PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 2 OS=Homo sapiens OX=960 1 59.6073 0.012347 59.607 7.1118 59.607 1 57.4251 0.0144499 57.425 1 59.6073 0.012347 59.607 4 Q NQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX LN(1)KLEQ(1)LEELN(1)LSGN(1)K LN(59.61)KLEQ(59.61)LEELN(59.61)LSGN(59.61)K 6 4 -0.41413 8072900 0 0 8072900 NaN 3634500 0 0 4438300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 3634500 0 0 0 0 0 0 0 0 4438300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1099 1508 669 669 2734 3107 8867;8868 9326;9327 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 8868 9327 20190902_JH_EV_Ubi_2 5792 sp|Q7L5N1|CSN6_HUMAN 67 sp|Q7L5N1|CSN6_HUMAN sp|Q7L5N1|CSN6_HUMAN sp|Q7L5N1|CSN6_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS6 PE=1 SV=1 1 78.3345 0.0236943 78.334 56.203 78.334 1 78.3345 0.0236943 78.334 1 Q SDHWIRMRSQEGRPVQVIGALIGKQEGRNIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX PVQ(1)VIGALIGK PVQ(78.33)VIGALIGK 3 2 -0.47297 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1100 1523 67 67 3565 4065 11456 12031 11456 12031 20190902_JH_EV_Ubi_2 10634 11456 12031 20190902_JH_EV_Ubi_2 10634 11456 12031 20190902_JH_EV_Ubi_2 10634 sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN;sp|Q7Z569|BRAP_HUMAN 209;388 sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN Isoform 2 of BRCA1-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRAP;sp|Q7Z569|BRAP_HUMAN BRCA1-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRAP PE=1 SV=2 0.999995 52.66 2.42026E-12 136.33 114.52 136.33 0.999995 52.66 2.42026E-12 136.33 1 Q YVHRLVASKTDGKIVQYECEGDTCQEEKIDA X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX TDGKIVQ(1)YECEGDTCQEEK TDGKIVQ(52.66)YECEGDTCQ(-52.66)EEK 7 3 0.026959 1076600 1076600 0 0 0.012965 0 0 0 0 0 1076600 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0.14121 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1076600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1101 1534 209 209 4285 4863 13572 14238 13572 14238 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6161 13572 14238 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6161 13572 14238 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6161 sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN;sp|Q7Z569|BRAP_HUMAN 218;397 sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN sp|Q7Z569-2|BRAP_HUMAN Isoform 2 of BRCA1-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRAP;sp|Q7Z569|BRAP_HUMAN BRCA1-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRAP PE=1 SV=2 0.99865 28.6917 1.73569E-08 131.48 109.05 131.48 0.99865 28.6917 1.73569E-08 131.48 1 Q TDGKIVQYECEGDTCQEEKIDALQLEYSYLL X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX TDGKIVQ(0.001)YECEGDTCQ(0.999)EEK TDGKIVQ(-28.69)YECEGDTCQ(28.69)EEK 16 3 -0.27034 1704800 1704800 0 0 0.020531 0 0 0 0 0 0 0 1704800 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0.11441 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1704800 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1102 1534 218 218 4285 4863 13573 14239 13573 14239 20190902_JH_WT_Ubi_2 7289 13573 14239 20190902_JH_WT_Ubi_2 7289 13573 14239 20190902_JH_WT_Ubi_2 7289 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-5|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-4|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-7|EMSY_HUMAN 461;475;461;462;476;476 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN Isoform 2 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN Isoform 6 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN B 0.665939 0 0.0306453 52.495 6.8975 52.495 0.665939 0 0.0306453 52.495 2 Q PTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTAT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX Q(0.001)ESGVKIITQ(0.666)Q(0.667)VQ(0.667)PSK Q(-31.83)ESGVKIITQ(0)Q(0)VQ(0)PSK 10 2 -2.1616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1103 1535 461 461 3619 4128 11618 12195 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-5|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-4|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-7|EMSY_HUMAN 462;476;462;463;477;477 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN Isoform 2 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN Isoform 6 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN B 0.666643 0 0.0306453 52.495 6.8975 52.495 0.666643 0 0.0306453 52.495 2 Q TIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX Q(0.001)ESGVKIITQ(0.666)Q(0.667)VQ(0.667)PSK Q(-31.83)ESGVKIITQ(0)Q(0)VQ(0)PSK 11 2 -2.1616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1104 1535 462 462 3619 4128 11618 12195 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-5|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-4|EMSY_HUMAN;sp|Q7Z589-7|EMSY_HUMAN 464;478;464;465;479;479 sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN sp|Q7Z589-2|EMSY_HUMAN Isoform 2 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589-6|EMSY_HUMAN Isoform 6 of BRCA2-interacting transcriptional repressor EMSY OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMSY;sp|Q7Z589|EMSY_HUMAN B 0.666643 0 0.0306453 52.495 6.8975 52.495 0.666643 0 0.0306453 52.495 2 Q QIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.001)ESGVKIITQ(0.666)Q(0.667)VQ(0.667)PSK Q(-31.83)ESGVKIITQ(0)Q(0)VQ(0)PSK 13 2 -2.1616 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1105 1535 464 464 3619 4128 11618 12195 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 11618 12195 20190821_JH_EV_Ubi 9534 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0|KHDC4_HUMAN 80;80;80;80 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN Isoform 4 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN Isoform 3 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN Isoform 2 of 1 50.7217 0.0289355 50.722 17.414 50.722 1 50.7217 0.0289355 50.722 Q KINAMLMAKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP PTQ(1)N(1)ASEKLQ(1)APGKGLTSN(1)K PTQ(50.72)N(50.72)ASEKLQ(50.72)APGKGLTSN(50.72)K 3 3 1.8989 6461300 0 0 6461300 NaN 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1106 1541 80 80 3534 4030 11358 11931 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN;sp|Q7Z7F0|KHDC4_HUMAN 87;87;87;87 sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN sp|Q7Z7F0-4|KHDC4_HUMAN Isoform 4 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-3|KHDC4_HUMAN Isoform 3 of KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4;sp|Q7Z7F0-2|KHDC4_HUMAN Isoform 2 of 1 50.7217 0.0289355 50.722 17.414 50.722 1 50.7217 0.0289355 50.722 Q AKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTSNKSKDDL X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX PTQ(1)N(1)ASEKLQ(1)APGKGLTSN(1)K PTQ(50.72)N(50.72)ASEKLQ(50.72)APGKGLTSN(50.72)K 10 3 1.8989 6461300 0 0 6461300 NaN 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 6461300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1107 1541 87 87 3534 4030 11358 11931 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 11358 11931 20190821_JH_WT_Ubi 8435 sp|Q86TA1|MOB3B_HUMAN 7 sp|Q86TA1|MOB3B_HUMAN sp|Q86TA1|MOB3B_HUMAN sp|Q86TA1|MOB3B_HUMAN MOB kinase activator 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MOB3B PE=1 SV=2 0.993544 23.0003 0.0235808 56.205 21.245 50.149 0.993544 23.0003 0.0245581 55.261 0.991509 20.9044 0.0298302 50.207 0.992368 21.2446 0.0235808 56.205 1 Q _________MSIALKQVFNKDKTFRPKRKFE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SIALKQ(0.994)VFN(0.006)KDK SIALKQ(23)VFN(-23)KDK 6 3 -1.3207 22632000 22632000 0 0 NaN 10948000 0 5993400 0 0 0 5070700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 10948000 0 0 0 0 0 5993400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5070700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1108 1544 7 7 3961 4505 12563;12564;12565;12566 13179;13180;13181;13182 12564 13180 20190821_JH_EV_Ubi 4825 12565 13181 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4921 12565 13181 20190902_JH_MUT_Ubi_3 4921 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN 581 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN Retrotransposon-derived protein PEG10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEG10 PE=1 SV=2 0.809638 6.69379 3.34594E-06 105.79 76.83 105.79 0.495408 0 1.63861E-05 104.68 0.682956 5.80537 2.34017E-05 96.561 0.809638 6.69379 3.34594E-06 105.79 0.606644 0.486923 0.0298983 47.32 1;2 Q VKDGLITPTIAPNGAQVLQVKRGWKLQVSYD X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX NVKDGLITPTIAPN(0.173)GAQ(0.81)VLQ(0.017)VK N(-57.73)VKDGLITPTIAPN(-6.69)GAQ(6.69)VLQ(-16.77)VK 17 3 0.63039 11761000 8757300 3003600 0 NaN 0 0 3840900 0 0 6201300 1718600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3840900 0 0 0 0 0 0 0 0 4916400 1284900 0 0 1718600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1109 1546 581 581 486;3249;3250 564;3711;3712;3713 10433;10435;10437;10438 10977;10979;10981;10982 10433 10977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11705 10433 10977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11705 10433 10977 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11705 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN 584 sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN sp|Q86TG7|PEG10_HUMAN Retrotransposon-derived protein PEG10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEG10 PE=1 SV=2 0.747528 7.70517 0.000996073 83.063 57.239 83.063 0.747528 7.70517 0.000996073 83.063 1;2 Q GLITPTIAPNGAQVLQVKRGWKLQVSYDCRA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX NVKDGLITPTIAPN(0.126)GAQ(0.127)VLQ(0.748)VK N(-47.18)VKDGLITPTIAPN(-7.74)GAQ(-7.71)VLQ(7.71)VK 20 3 0.30335 11029000 8025200 3003600 0 NaN 0 0 0 8025200 0 1284900 1718600 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8025200 0 0 0 0 0 0 1284900 0 0 1718600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1110 1546 584 584 486;3249;3250 564;3711;3712;3713 10431;10437;10438 10975;10981;10982 10431 10975 20190902_JH_EV_Ubi_2 10511 10431 10975 20190902_JH_EV_Ubi_2 10511 10431 10975 20190902_JH_EV_Ubi_2 10511 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN 378 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN cTAGE family member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTAGE6 PE=2 SV=2 0.976512 31.746 0.0312802 40.142 20.449 40.142 0.976512 31.746 0.0312802 40.142 5 Q QESLQSENIYFESENQKLQQKLKIMTEFYQE X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(0.094)LQ(0.094)TQ(0.102)Q(0.102)ESLQ(0.102)SEN(0.595)IYFESEN(0.975)Q(0.977)KLQ(0.98)Q(0.98)KLK N(-8.97)LQ(-8.97)TQ(-8.54)Q(-8.54)ESLQ(-8.54)SEN(8.54)IYFESEN(31.75)Q(31.75)KLQ(32.17)Q(32.17)KLK 21 3 0.52377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1111 1550 378 378 3146 3596 10118 10655 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN 381 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN cTAGE family member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTAGE6 PE=2 SV=2 0.979676 32.1727 0.0312802 40.142 20.449 40.142 0.979676 32.1727 0.0312802 40.142 5 Q LQSENIYFESENQKLQQKLKIMTEFYQEDEM X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX N(0.094)LQ(0.094)TQ(0.102)Q(0.102)ESLQ(0.102)SEN(0.595)IYFESEN(0.975)Q(0.977)KLQ(0.98)Q(0.98)KLK N(-8.97)LQ(-8.97)TQ(-8.54)Q(-8.54)ESLQ(-8.54)SEN(8.54)IYFESEN(31.75)Q(31.75)KLQ(32.17)Q(32.17)KLK 24 3 0.52377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1112 1550 381 381 3146 3596 10118 10655 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN 382 sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN sp|Q86UF2|CTGE6_HUMAN cTAGE family member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTAGE6 PE=2 SV=2 0.979676 32.1727 0.0312802 40.142 20.449 40.142 0.979676 32.1727 0.0312802 40.142 5 Q QSENIYFESENQKLQQKLKIMTEFYQEDEMK X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX N(0.094)LQ(0.094)TQ(0.102)Q(0.102)ESLQ(0.102)SEN(0.595)IYFESEN(0.975)Q(0.977)KLQ(0.98)Q(0.98)KLK N(-8.97)LQ(-8.97)TQ(-8.54)Q(-8.54)ESLQ(-8.54)SEN(8.54)IYFESEN(31.75)Q(31.75)KLQ(32.17)Q(32.17)KLK 25 3 0.52377 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1113 1550 382 382 3146 3596 10118 10655 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 10118 10655 20190821_JH_EV_Ubi 14515 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN 33 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN Interferon epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFNE PE=2 SV=1 1 78.4882 0.0120102 78.488 9.8624 78.488 1 78.4882 0.0120102 78.488 1 66.5599 0.0233692 66.56 4 Q TIFSLDLKLIIFQQRQVNQESLKLLNKLQTL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX Q(1)VN(1)Q(1)ESLKLLN(1)K Q(78.49)VN(78.49)Q(78.49)ESLKLLN(78.49)K 1 3 -0.77513 129770000 0 0 129770000 NaN 0 30587000 0 0 99186000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 30587000 0 0 0 0 0 0 0 0 99186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1114 1560 33 33 3716 4230 11803;11804 12384;12385 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN 36 sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN sp|Q86WN2|IFNE_HUMAN Interferon epsilon OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFNE PE=2 SV=1 1 78.4882 0.0120102 78.488 9.8624 78.488 1 78.4882 0.0120102 78.488 1 66.5599 0.0233692 66.56 4 Q SLDLKLIIFQQRQVNQESLKLLNKLQTLSIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXX Q(1)VN(1)Q(1)ESLKLLN(1)K Q(78.49)VN(78.49)Q(78.49)ESLKLLN(78.49)K 4 3 -0.77513 129770000 0 0 129770000 NaN 0 30587000 0 0 99186000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 30587000 0 0 0 0 0 0 0 0 99186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1115 1560 36 36 3716 4230 11803;11804 12384;12385 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 11804 12385 20190821_JH_MUT_Ubi 3115 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN 20 sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN sp|Q86Y01|DTX1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase DTX1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTX1 PE=1 SV=1 1 64.2595 0.0205408 64.26 21.552 64.26 1 64.2595 0.0205408 64.26 3 Q GHGGLMPVNGLGFPPQNVARVVVWEWLNEHS X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SRPGHGGLMPVN(1)GLGFPPQ(1)N(1)VAR SRPGHGGLMPVN(64.26)GLGFPPQ(64.26)N(64.26)VAR 19 3 -4.3995 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1116 1565 20 20 4137 4702 13118 13756 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 13118 13756 20190902_JH_WT_Ubi_3 6602 sp|Q86Y91-2|KI18B_HUMAN;sp|Q86Y91-3|KI18B_HUMAN;sp|Q86Y91|KI18B_HUMAN;sp|Q86Y91-4|KI18B_HUMAN 404;404;404;404 sp|Q86Y91-2|KI18B_HUMAN sp|Q86Y91-2|KI18B_HUMAN sp|Q86Y91-2|KI18B_HUMAN Isoform 2 of Kinesin-like protein KIF18B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF18B;sp|Q86Y91-3|KI18B_HUMAN Isoform 3 of Kinesin-like protein KIF18B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIF18B;sp|Q86Y91|KI18B_HUMAN Kinesin-like protein KIF18B OS=Homo 0.801567 6.27246 0.0100932 63.443 7.5311 63.443 0.801567 6.27246 0.0100932 63.443 1 Q VAALRKKLQVYEGGGQPPPQDLPGSPKSGPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX KLQ(0.009)VYEGGGQ(0.802)PPPQ(0.189)DLPGSPK KLQ(-19.34)VYEGGGQ(6.27)PPPQ(-6.27)DLPGSPK 10 3 2.431 1583400 1583400 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1583400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1583400 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1117 1566 404 404 2393 2721 7844 8247 7844 8247 20190902_JH_WT_Ubi_2 16335 7844 8247 20190902_JH_WT_Ubi_2 16335 7844 8247 20190902_JH_WT_Ubi_2 16335 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN 55 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN Partner and localizer of BRCA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PALB2 PE=1 SV=1 0.909868 10.8655 0.0279551 41.296 10.321 41.296 0.909868 10.8655 0.0279551 41.296 Q RAEKIKHSIKKTVEEQDCLSQQDLSPQLKHS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TVEEQ(0.91)DCLSQ(0.857)Q(0.857)DLSPQ(0.157)LKHSEPKN(0.219)K TVEEQ(10.87)DCLSQ(9.37)Q(9.37)DLSPQ(-12.63)LKHSEPKN(-9.37)K 5 3 -3.6979 2364500 0 0 2364500 NaN 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1118 1567 55 55 4652 5278 14906 15661 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN 60 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN Partner and localizer of BRCA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PALB2 PE=1 SV=1 0.856732 9.37034 0.0279551 41.296 10.321 41.296 0.856732 9.37034 0.0279551 41.296 Q KHSIKKTVEEQDCLSQQDLSPQLKHSEPKNK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP TVEEQ(0.91)DCLSQ(0.857)Q(0.857)DLSPQ(0.157)LKHSEPKN(0.219)K TVEEQ(10.87)DCLSQ(9.37)Q(9.37)DLSPQ(-12.63)LKHSEPKN(-9.37)K 10 3 -3.6979 2364500 0 0 2364500 NaN 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1119 1567 60 60 4652 5278 14906 15661 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN 61 sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN sp|Q86YC2|PALB2_HUMAN Partner and localizer of BRCA2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PALB2 PE=1 SV=1 0.856732 9.37034 0.0279551 41.296 10.321 41.296 0.856732 9.37034 0.0279551 41.296 Q HSIKKTVEEQDCLSQQDLSPQLKHSEPKNKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX TVEEQ(0.91)DCLSQ(0.857)Q(0.857)DLSPQ(0.157)LKHSEPKN(0.219)K TVEEQ(10.87)DCLSQ(9.37)Q(9.37)DLSPQ(-12.63)LKHSEPKN(-9.37)K 11 3 -3.6979 2364500 0 0 2364500 NaN 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 2364500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1120 1567 61 61 4652 5278 14906 15661 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 14906 15661 20190821_JH_WT_Ubi 12137 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN 688;707 sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN sp|Q86YF9-2|DZIP1_HUMAN Isoform 2 of Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1;sp|Q86YF9|DZIP1_HUMAN Zinc finger protein DZIP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DZIP1 PE=1 SV=1 0.517155 0 0.0206361 47.499 21.611 47.499 0.517155 0 0.0206361 47.499 2 Q IRAYASPGPLPVPPPQNKGSFGKNTVKSDAD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX AYASPGPLPVPPPQ(0.517)N(0.517)KGSFGKN(0.966)TVK AYASPGPLPVPPPQ(0)N(0)KGSFGKN(11.51)TVK 14 4 1.059 2509600 0 2509600 0 NaN 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2509600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1121 1569 688 688 335 395 1133 1220 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 1133 1220 20190821_JH_MUT_Ubi 12574 sp|Q8IVF4|DYH10_HUMAN 4202 sp|Q8IVF4|DYH10_HUMAN sp|Q8IVF4|DYH10_HUMAN sp|Q8IVF4|DYH10_HUMAN Dynein heavy chain 10, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH10 PE=1 SV=4 1 69.1978 0.0235941 69.198 6.5393 69.198 1 69.1978 0.0235941 69.198 Q TGESSSGISRDDYIGQVAKEIENKMPKVFDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX DDYIGQ(1)VAK DDYIGQ(69.2)VAK 6 2 0.6381 1015800 1015800 0 0 NaN 1015800 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1015800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1122 1574 4202 4202 426 500 1376 1467 1376 1467 20190821_JH_EV_Ubi 7813 1376 1467 20190821_JH_EV_Ubi 7813 1376 1467 20190821_JH_EV_Ubi 7813 sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-7|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-2|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-5|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-6|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50-4|F219A_HUMAN;sp|Q8IW50|F219A_HUMAN 49;77;49;60;60;66;77 sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN sp|Q8IW50-3|F219A_HUMAN Isoform 3 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM219A;sp|Q8IW50-7|F219A_HUMAN Isoform 7 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM219A;sp|Q8IW50-2|F219A_HUMAN Isoform 2 of Protein FAM219A OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 0.994348 22.649 0.0296792 55.064 12.589 55.064 0.994348 22.649 0.0296792 55.064 2 Q KGSLKNGSMGSPVNQQPKKNNVMARTRLVVP X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX N(0.856)GSMGSPVN(0.14)Q(0.01)Q(0.994)PK N(7.88)GSMGSPVN(-7.88)Q(-22.65)Q(22.65)PK 11 2 -1.0651 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1123 1576 49 49 3076 3520 9939 10470 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 9939 10470 20190821_JH_WT_Ubi 5636 sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN 37 sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN sp|Q8IWJ2|GCC2_HUMAN GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GCC2 PE=1 SV=4 1 68.9431 0.0027858 104.17 35.274 104.17 1 68.9431 0.0027858 104.17 Q LETLPKEDLIKFAKKQMMLIQKAKSRCTELE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX Q(1)MMLIQKAKSR Q(68.94)MMLIQ(-68.94)KAKSR 1 2 0.083572 1812200 1812200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 1812200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1812200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1124 1578 37 37 3674 4184 11732 12312 11732 12312 20190902_JH_WT_Ubi_2 14992 11732 12312 20190902_JH_WT_Ubi_2 14992 11732 12312 20190902_JH_WT_Ubi_2 14992 sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN 64 sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHERP PE=1 SV=3 0.477701 0 0.0335197 54.608 11.865 54.608 0.477701 0 0.0335197 54.608 Q GGEFYSYYKCKLALEQQQLICKQQTPELEPA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LALEQ(0.478)Q(0.478)Q(0.045)LICK LALEQ(0)Q(0)Q(-10.3)LICK 5 3 -4.1085 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1125 1581 64 64 2503 2842 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN 65 sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHERP PE=1 SV=3 0.477701 0 0.0335197 54.608 11.865 54.608 0.477701 0 0.0335197 54.608 Q GEFYSYYKCKLALEQQQLICKQQTPELEPAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LALEQ(0.478)Q(0.478)Q(0.045)LICK LALEQ(0)Q(0)Q(-10.3)LICK 6 3 -4.1085 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1126 1581 65 65 2503 2842 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 8127 8544 20190902_JH_EV_Ubi_2 4353 sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN 410 sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN Protein FAM126B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM126B PE=1 SV=1 0.983511 17.6845 0.00668035 68.567 19.926 68.567 0.983511 17.6845 0.00668035 68.567 2 Q SSESPRDSVVRKQYVQQPTDLSVDSVELTPM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M) XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KQ(0.033)YVQ(0.984)Q(0.984)PTDLSVDSVELTPMKK KQ(-17.68)YVQ(17.68)Q(17.68)PTDLSVDSVELTPMKK 5 3 1.1928 1113500 0 1113500 0 NaN 0 0 1113500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1113500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1127 1582 410 410 2453 2788 8015 8426 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN 411 sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN sp|Q8IXS8|F126B_HUMAN Protein FAM126B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM126B PE=1 SV=1 0.983514 17.6845 0.00668035 68.567 19.926 68.567 0.983514 17.6845 0.00668035 68.567 2 Q SESPRDSVVRKQYVQQPTDLSVDSVELTPMK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K) XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KQ(0.033)YVQ(0.984)Q(0.984)PTDLSVDSVELTPMKK KQ(-17.68)YVQ(17.68)Q(17.68)PTDLSVDSVELTPMKK 6 3 1.1928 1113500 0 1113500 0 NaN 0 0 1113500 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1113500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1128 1582 411 411 2453 2788 8015 8426 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 8015 8426 20190821_JH_WT_Ubi 15946 sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN 182 sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN sp|Q8IYU4|UBQLN_HUMAN Ubiquilin-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBQLNL PE=2 SV=3 0.469648 0 0.0322309 51.503 12.628 51.503 0.469648 0 0.0322309 51.503 Q SHPECKAQMLENPSIQRLLSNMEFMWQFISE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VHTQNLEVSHPECKAQ(0.061)MLEN(0.47)PSIQ(0.47)R VHTQ(-41.79)N(-41.79)LEVSHPECKAQ(-8.89)MLEN(0)PSIQ(0)R 24 3 0.5453 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1129 1592 182 182 4851 5505 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 15553 16336 20190821_JH_MUT_Ubi 13686 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN 360 sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN sp|Q8N0X7|SPART_HUMAN Spartin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPART PE=1 SV=1 1 72.4277 0.0263484 72.428 38.151 72.428 1 72.4277 0.0263484 72.428 1 Q ENEFQIPGRTRPSSDQLKEASGTDVKQLDQG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TRPSSDQ(1)LKEASGTDVK TRPSSDQ(72.43)LKEASGTDVK 7 3 2.8438 1407400 1407400 0 0 0.005519 0 0 0 0 1407400 0 0 0 0 0 0 0 0 0.027103 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1407400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1130 1603 360 360 4593 5215 14682 15427 14682 15427 20190902_JH_EV_Ubi_3 4609 14682 15427 20190902_JH_EV_Ubi_3 4609 14682 15427 20190902_JH_EV_Ubi_3 4609 sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN 92 sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS52 PE=1 SV=1 0.998847 30.8878 0.0143914 70.091 7.4453 70.091 0.998847 30.8878 0.0143914 70.091 2 Q GVDLRHYSKQVELELQQIEQKSIRDYIQESE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX HYSKQ(0.001)VELELQ(0.999)Q(0.073)IEQ(0.928)KSIR HYSKQ(-30.89)VELELQ(30.89)Q(-11.09)IEQ(11.09)KSIR 11 3 2.8136 8313100 0 8313100 0 NaN 0 0 0 0 8313100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8313100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1131 1605 92 92 2053 2348 6823 7182 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN 96 sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN sp|Q8N1B4|VPS52_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS52 PE=1 SV=1 0.927623 11.0884 0.0143914 70.091 7.4453 70.091 0.927623 11.0884 0.0143914 70.091 2 Q RHYSKQVELELQQIEQKSIRDYIQESENIAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX HYSKQ(0.001)VELELQ(0.999)Q(0.073)IEQ(0.928)KSIR HYSKQ(-30.89)VELELQ(30.89)Q(-11.09)IEQ(11.09)KSIR 15 3 2.8136 8313100 0 8313100 0 NaN 0 0 0 0 8313100 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8313100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1132 1605 96 96 2053 2348 6823 7182 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 6823 7182 20190902_JH_EV_Ubi_3 9417 sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN 507 sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN sp|Q8N1G2|CMTR1_HUMAN Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CMTR1 PE=1 SV=1 1 61.8154 0.0156919 61.815 18.519 61.815 1 61.8154 0.0156919 61.815 2 Q FTDYMIRSNESHCSLQIKALAKIHAFVQDTT X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SN(1)ESHCSLQ(1)IKALAK SN(61.82)ESHCSLQ(61.82)IKALAK 9 2 -1.6734 10356000 0 10356000 0 NaN 0 0 0 10356000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10356000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1133 1607 507 507 4078 4630 12910 13537 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 12910 13537 20190902_JH_EV_Ubi_2 7874 sp|Q8N336-3|ELMD1_HUMAN;sp|Q8N336|ELMD1_HUMAN 67;67 sp|Q8N336-3|ELMD1_HUMAN sp|Q8N336-3|ELMD1_HUMAN sp|Q8N336-3|ELMD1_HUMAN Isoform 3 of ELMO domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELMOD1;sp|Q8N336|ELMD1_HUMAN ELMO domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELMOD1 PE=2 SV=3 1 47.0818 0.0308083 47.082 11.23 47.082 1 47.0818 0.0308083 47.082 1 Q MKIETSLRDSKSKLLQTSVSVHPDAIEKTIE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX DSKSKLLQ(1)TSVSVHPDAIEK DSKSKLLQ(47.08)TSVSVHPDAIEK 8 3 -4.051 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1134 1609 67 67 684 780 2148 2273 2148 2273 20190902_JH_EV_Ubi_2 9739 2148 2273 20190902_JH_EV_Ubi_2 9739 2148 2273 20190902_JH_EV_Ubi_2 9739 sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN 148 sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN sp|Q8N4B5|PRR18_HUMAN Proline-rich protein 18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRR18 PE=2 SV=2 1 57.8039 0.028103 57.804 18.295 57.804 1 57.8039 0.028103 57.804 2 Q ARFCLNLTPEAVLVIQKRHLEKQLLARPRRP X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX FCLN(1)LTPEAVLVIQ(1)KR FCLN(57.8)LTPEAVLVIQ(57.8)KR 14 3 -0.17113 4730400 0 4730400 0 NaN 0 4730400 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 4730400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1135 1616 148 148 1174 1326 3740 3936 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 3740 3936 20190821_JH_MUT_Ubi 13572 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN 25 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN Prostaglandin reductase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZADH2 PE=1 SV=1 0.999925 38.2234 0.0112955 56.54 17.716 56.54 0.978305 16.241 0.0372659 43.37 0.999754 33.0734 0.019233 50.425 0.999839 35.2596 0.0278659 47.047 0.999925 38.2234 0.0112955 56.54 2 Q RAIVDMSYARHFLDFQGSAIPQAMQKLVVTR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP HFLDFQ(1)GSAIPQ(0.5)AMQ(0.5)KLVVTR HFLDFQ(38.22)GSAIPQ(0)AMQ(0)KLVVTR 6 3 -1.4011 53685000 0 53685000 0 NaN 0 7886900 0 0 0 11410000 0 15888000 18500000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 7886900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11410000 0 0 0 0 0 15888000 0 0 18500000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1136 1617 25 25 1830 2078 5838;5839;5840;5841 6148;6149;6150;6151 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN 31 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN Prostaglandin reductase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZADH2 PE=1 SV=1 0.539427 0.685053 0.0112955 56.54 17.716 47.047 0.500123 0 0.019233 50.425 0.539427 0.685053 0.0278659 47.047 0.500038 0 0.0112955 56.54 2 Q SYARHFLDFQGSAIPQAMQKLVVTRLSPNFR X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX HFLDFQ(1)GSAIPQ(0.539)AMQ(0.461)KLVVTR HFLDFQ(35.26)GSAIPQ(0.69)AMQ(-0.69)KLVVTR 12 3 -1.2978 45799000 0 45799000 0 NaN 0 0 0 0 0 11410000 0 15888000 18500000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11410000 0 0 0 0 0 15888000 0 0 18500000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1137 1617 31 31 1830 2078 5839;5840;5841 6149;6150;6151 5840 6150 20190902_JH_WT_Ubi_2 16070 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN 34 sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN sp|Q8N4Q0|PTGR3_HUMAN Prostaglandin reductase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZADH2 PE=1 SV=1 0.934659 11.4527 0.0112955 56.54 17.716 43.37 0.934659 11.4527 0.0372659 43.37 0.500123 0 0.019233 50.425 0.500038 0 0.0112955 56.54 2 Q RHFLDFQGSAIPQAMQKLVVTRLSPNFREAV X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX HFLDFQ(0.978)GSAIPQ(0.087)AMQ(0.935)KLVVTR HFLDFQ(16.24)GSAIPQ(-11.45)AMQ(11.45)KLVVTR 15 3 -0.612 37797000 0 37797000 0 NaN 0 7886900 0 0 0 11410000 0 0 18500000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 7886900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11410000 0 0 0 0 0 0 0 0 18500000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1138 1617 34 34 1830 2078 5838;5839;5841 6148;6149;6151 5838 6148 20190821_JH_MUT_Ubi 14304 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 5841 6151 20190902_JH_WT_Ubi_3 15504 sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN 65 sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CISD2 PE=1 SV=1 0.497617 0 0.0103412 77.124 27.641 77.124 0.497617 0 0.0103412 77.124 Q LLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX Q(0.498)Q(0.498)KDSLIN(0.005)LKIQK Q(0)Q(0)KDSLIN(-20.19)LKIQ(-63.72)K 1 3 1.4676 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1139 1620 65 65 3689 4200 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN 66 sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN sp|Q8N5K1|CISD2_HUMAN CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CISD2 PE=1 SV=1 0.497617 0 0.0103412 77.124 27.641 77.124 0.497617 0 0.0103412 77.124 Q LGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.498)Q(0.498)KDSLIN(0.005)LKIQK Q(0)Q(0)KDSLIN(-20.19)LKIQ(-63.72)K 2 3 1.4676 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1140 1620 66 66 3689 4200 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 11760 12341 20190821_JH_EV_Ubi 8127 sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN;sp|Q8N954|GPT11_HUMAN 33;162 sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN Isoform 2 of G patch domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH11;sp|Q8N954|GPT11_HUMAN G patch domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH11 PE=1 SV=4 0.765268 5.13232 0.0226131 61.765 19.574 61.765 0.765268 5.13232 0.0226131 61.765 2 Q EEKLESYRKKIHMKNQAEEKAAEQFRMRLKN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX N(0.235)Q(0.765)AEEKAAEQ(1)FR N(-5.13)Q(5.13)AEEKAAEQ(46.43)FR 2 2 2.8212 1169200 0 1169200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1169200 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1169200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1141 1624 33 33 3195 3651 10285 10825 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN;sp|Q8N954|GPT11_HUMAN 41;170 sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN sp|Q8N954-2|GPT11_HUMAN Isoform 2 of G patch domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH11;sp|Q8N954|GPT11_HUMAN G patch domain-containing protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPATCH11 PE=1 SV=4 0.999983 46.4314 0.0226131 61.765 19.574 61.765 0.999983 46.4314 0.0226131 61.765 2 Q KKIHMKNQAEEKAAEQFRMRLKNKQDEMKLE X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX N(0.235)Q(0.765)AEEKAAEQ(1)FR N(-5.13)Q(5.13)AEEKAAEQ(46.43)FR 10 2 2.8212 1169200 0 1169200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1169200 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1169200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1142 1624 41 41 3195 3651 10285 10825 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 10285 10825 20190902_JH_WT_Ubi_3 6287 sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN 288 sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN sp|Q8N9V6|ANR53_HUMAN Ankyrin repeat domain-containing protein 53 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANKRD53 PE=1 SV=3 0.995813 27.8668 0.0322549 43.383 17.56 43.383 0.995813 27.8668 0.0322549 43.383 2 Q KDFAREMTKMKMFKSQLTLMEHNYLIEYQKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX MKMFKSQ(0.996)LTLMEHN(0.962)YLIEYQ(0.042)K MKMFKSQ(27.87)LTLMEHN(14.36)YLIEYQ(-14.36)K 7 3 -1.9957 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1143 1626 288 288 2929 3326 9425 9920 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 9425 9920 20190902_JH_EV_Ubi_2 9200 sp|Q8NB25-4|F184A_HUMAN;sp|Q8NB25-2|F184A_HUMAN;sp|Q8NB25-3|F184A_HUMAN;sp|Q8NB25|F184A_HUMAN 539;659;659;659 sp|Q8NB25-4|F184A_HUMAN sp|Q8NB25-4|F184A_HUMAN sp|Q8NB25-4|F184A_HUMAN Isoform 4 of Protein FAM184A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM184A;sp|Q8NB25-2|F184A_HUMAN Isoform 2 of Protein FAM184A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM184A;sp|Q8NB25-3|F184A_HUMAN Isoform 3 of Protein FAM184A OS=Homo sapiens OX=9606 GN= 1 55.5671 0.0335134 55.567 11.25 55.567 1 55.5671 0.0335134 55.567 1 Q NLRQECSKLREELRLQHEEDKKSAMSQLLQL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX EELRLQ(1)HEEDKK EELRLQ(55.57)HEEDKK 6 2 -2.8893 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1144 1628 539 539 864 980 2755 2897 2755 2897 20190902_JH_WT_Ubi_3 13970 2755 2897 20190902_JH_WT_Ubi_3 13970 2755 2897 20190902_JH_WT_Ubi_3 13970 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN 263;276 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 PE=1 SV=2;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN Isoform 2 of Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 1 103.975 0.00156001 109.15 52.039 103.97 1 89.6631 0.0114825 89.663 1 109.145 0.00156001 109.15 1 87.4985 0.0128321 87.498 1 103.975 0.00362489 103.97 0.999998 58.8105 0.00467801 82.755 1 Q SKEFLSAKEETPGAGQKQELRSFWSYAFSRR X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX EFLSAKEETPGAGQ(1)K EFLSAKEETPGAGQ(103.97)K 14 3 1.7889 58541000 58541000 0 0 0.033782 0 0 0 19389000 15593000 9439100 12028000 0 0 0 0 0 0.087083 0.087465 0.047752 0.067704 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19389000 0 0 15593000 0 0 9439100 0 0 12028000 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1145 1630 263 263 883;1022 1000;1152 2808;2809;2810;2811;3256 2954;2955;2956;2957;3422 2811 2957 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5766 2809 2955 20190902_JH_EV_Ubi_3 5748 2809 2955 20190902_JH_EV_Ubi_3 5748 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN 247;260 sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN sp|Q8NBI5|S43A3_HUMAN Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 PE=1 SV=2;sp|Q8NBI5-2|S43A3_HUMAN Isoform 2 of Solute carrier family 43 member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC43A3 1 89.9003 0.0134433 89.9 56.812 89.9 1 89.9003 0.0134433 89.9 Q TKEEKETAEHENRELQSKEFLSAKEETPGAG X;GlyGly (K);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX ELQ(1)SKEFLSAK ELQ(89.9)SKEFLSAK 3 3 -0.96562 18325000 18325000 0 0 0.015618 0 0 0 0 0 0 0 18325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0.035047 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18325000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1146 1630 247 247 1021;1022 1150;1152 3246 3412 3246 3412 20190902_JH_WT_Ubi_2 7960 3246 3412 20190902_JH_WT_Ubi_2 7960 3246 3412 20190902_JH_WT_Ubi_2 7960 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN 152 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN Protein FAM83F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM83F PE=1 SV=1 0.997769 26.2631 0.0311499 47.302 12.078 47.302 0.997769 26.2631 0.0311499 47.302 Q LFTHPPKDEKAPHLKQVVRQMIQQAQKVIAV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX Q(0.998)VVRQ(0.96)MIQ(0.392)Q(0.325)AQ(0.325)K Q(26.26)VVRQ(13.43)MIQ(0.95)Q(-0.95)AQ(-0.95)K 1 3 -1.8368 887690 0 0 887690 NaN 0 0 0 0 0 887690 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 887690 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1147 1647 152 152 3721 4235 11811 12392 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN 156 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN Protein FAM83F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM83F PE=1 SV=1 0.960231 13.4318 0.0311499 47.302 12.078 47.302 0.960231 13.4318 0.0311499 47.302 Q PPKDEKAPHLKQVVRQMIQQAQKVIAVVMDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX Q(0.998)VVRQ(0.96)MIQ(0.392)Q(0.325)AQ(0.325)K Q(26.26)VVRQ(13.43)MIQ(0.95)Q(-0.95)AQ(-0.95)K 5 3 -1.8368 887690 0 0 887690 NaN 0 0 0 0 0 887690 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 887690 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1148 1647 156 156 3721 4235 11811 12392 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN 159 sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN sp|Q8NEG4|FA83F_HUMAN Protein FAM83F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM83F PE=1 SV=1 0.391842 0.949744 0.0311499 47.302 12.078 47.302 0.391842 0.949744 0.0311499 47.302 Q DEKAPHLKQVVRQMIQQAQKVIAVVMDLFTD X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX Q(0.998)VVRQ(0.96)MIQ(0.392)Q(0.325)AQ(0.325)K Q(26.26)VVRQ(13.43)MIQ(0.95)Q(-0.95)AQ(-0.95)K 8 3 -1.8368 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1149 1647 159 159 3721 4235 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 11811 12392 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6325 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-7|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-4|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91|SYNE1_HUMAN 626;626;609;626;633;626 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN Isoform 5 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN Isoform 6 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN Isoform 10 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-7|SY 0.500004 0 0.00662238 56.625 27.279 56.625 0.500004 0 0.00662238 56.625 2 Q VISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKMLNQSEN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX YGN(0.5)TVASLQ(0.5)AWLEDAEKMLN(0.333)Q(0.333)SEN(0.333)AKK YGN(0)TVASLQ(0)AWLEDAEKMLN(0)Q(0)SEN(0)AKK 9 3 3.0994 611920 0 611920 0 NaN 0 611920 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 611920 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1150 1652 626 626 5147 5853 16606 17454 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-7|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91-4|SYNE1_HUMAN;sp|Q8NF91|SYNE1_HUMAN 638;638;621;638;645;638 sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN sp|Q8NF91-5|SYNE1_HUMAN Isoform 5 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-6|SYNE1_HUMAN Isoform 6 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-10|SYNE1_HUMAN Isoform 10 of Nesprin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYNE1;sp|Q8NF91-7|SY 0.333343 0 0.00662238 56.625 27.279 56.625 0.333343 0 0.00662238 56.625 Q ASLQAWLEDAEKMLNQSENAKKDFFRNLPHW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX YGN(0.5)TVASLQ(0.5)AWLEDAEKMLN(0.333)Q(0.333)SEN(0.333)AKK YGN(0)TVASLQ(0)AWLEDAEKMLN(0)Q(0)SEN(0)AKK 21 3 3.0994 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1151 1652 638 638 5147 5853 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 16606 17454 20190821_JH_MUT_Ubi 9005 sp|Q8NFJ5|RAI3_HUMAN 287 sp|Q8NFJ5|RAI3_HUMAN sp|Q8NFJ5|RAI3_HUMAN sp|Q8NFJ5|RAI3_HUMAN Retinoic acid-induced protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPRC5A PE=1 SV=2 0.996808 26.0013 0.0206004 59.154 31.659 59.154 0.996808 26.0013 0.0206004 59.154 1 Q RNPMDYPVEDAFCKPQLVKKSYGVENRAYSQ X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX Q(0.002)RN(0.002)PMDYPVEDAFCKPQ(0.997)LVK Q(-26)RN(-26)PMDYPVEDAFCKPQ(26)LVK 17 3 -3.8136 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1152 1655 287 287 3696 4207 11768 12349 11768 12349 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9570 11768 12349 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9570 11768 12349 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9570 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN 157 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN GA-binding protein subunit beta-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GABPB2 PE=1 SV=1 0.780683 11.5521 0.0250094 47.648 12.557 47.648 0.780683 11.5521 0.0250094 47.648 3 Q DIALEKNNAEILVILQEAMQNQVNVNPERAN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.099)N(0.099)AEILVILQ(0.781)EAMQ(0.9)N(0.091)Q(0.07)VN(0.307)VN(0.653)PER N(-11.55)N(-11.55)AEILVILQ(11.55)EAMQ(13.46)N(-13.46)Q(-16.18)VN(-4.01)VN(4.01)PER 10 3 -1.8981 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1153 1665 157 157 3166 3619 10190 10729 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN 161 sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN sp|Q8TAK5|GABP2_HUMAN GA-binding protein subunit beta-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GABPB2 PE=1 SV=1 0.899988 13.4579 0.0250094 47.648 12.557 47.648 0.899988 13.4579 0.0250094 47.648 3 Q EKNNAEILVILQEAMQNQVNVNPERANPVTD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX N(0.099)N(0.099)AEILVILQ(0.781)EAMQ(0.9)N(0.091)Q(0.07)VN(0.307)VN(0.653)PER N(-11.55)N(-11.55)AEILVILQ(11.55)EAMQ(13.46)N(-13.46)Q(-16.18)VN(-4.01)VN(4.01)PER 14 3 -1.8981 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1154 1665 161 161 3166 3619 10190 10729 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 10190 10729 20190902_JH_WT_Ubi_3 9538 sp|Q8TBZ2|MYBPP_HUMAN 568 sp|Q8TBZ2|MYBPP_HUMAN sp|Q8TBZ2|MYBPP_HUMAN sp|Q8TBZ2|MYBPP_HUMAN MYCBP-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYCBPAP PE=1 SV=2 1 65.3744 0.017333 65.374 11.032 65.374 1 65.3744 0.017333 65.374 1 Q KLTAHEAVTVVREVLQELLMGVLTPERTPSP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXX EVLQ(1)ELLMGVLTPER EVLQ(65.37)ELLMGVLTPER 4 3 3.4618 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1155 1672 568 568 1141 1288 3652 3846 3652 3846 20190902_JH_WT_Ubi_2 11448 3652 3846 20190902_JH_WT_Ubi_2 11448 3652 3846 20190902_JH_WT_Ubi_2 11448 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN 333 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN Zinc finger protein 502 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF502 PE=1 SV=1 0.761869 4.95249 0.0317731 48.907 7.705 48.907 0.761869 4.95249 0.0317731 48.907 Q TGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP TFQ(0.762)TKAN(0.255)LSQ(0.983)HQ(0.999)RIHSGEK TFQ(4.95)TKAN(-4.95)LSQ(16.54)HQ(31.67)RIHSGEK 3 3 4.061 7869700 0 0 7869700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1156 1673 333 333 4349 4932 13750 14424 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN 340 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN Zinc finger protein 502 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF502 PE=1 SV=1 0.983482 16.5411 0.0317731 48.907 7.705 48.907 0.983482 16.5411 0.0317731 48.907 Q CDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX TFQ(0.762)TKAN(0.255)LSQ(0.983)HQ(0.999)RIHSGEK TFQ(4.95)TKAN(-4.95)LSQ(16.54)HQ(31.67)RIHSGEK 10 3 4.061 7869700 0 0 7869700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1157 1673 340 340 4349 4932 13750 14424 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN 342 sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN sp|Q8TBZ5|ZN502_HUMAN Zinc finger protein 502 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF502 PE=1 SV=1 0.999492 31.6661 0.0317731 48.907 7.705 48.907 0.999492 31.6661 0.0317731 48.907 Q ECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECG X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX TFQ(0.762)TKAN(0.255)LSQ(0.983)HQ(0.999)RIHSGEK TFQ(4.95)TKAN(-4.95)LSQ(16.54)HQ(31.67)RIHSGEK 12 3 4.061 7869700 0 0 7869700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7869700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1158 1673 342 342 4349 4932 13750 14424 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 13750 14424 20190902_JH_WT_Ubi_3 11217 sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN;sp|Q8TCQ1|MARH1_HUMAN 222;239 sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN sp|Q8TCQ1-2|MARH1_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCH1;sp|Q8TCQ1|MARH1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MARCH1 PE=1 SV=1 0.5 0 0.0275691 54.776 7.1694 54.776 0.5 0 0.0275691 54.776 1 Q QLWRRLKAYNRVIFVQNCPDTAKKLEKNFSC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX VIFVQ(0.5)N(0.5)CPDTAKK VIFVQ(0)N(0)CPDTAKK 5 3 -0.55323 9048100 9048100 0 0 NaN 0 0 9048100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 9048100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1159 1675 222 222 4855 5509 15562 16346 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 15562 16346 20190821_JH_WT_Ubi 8243 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN 237 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN Taste receptor type 1 member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAS1R2 PE=3 SV=2 0.99955 31.0313 0.00672717 48.389 14.177 48.389 0.99955 31.0313 0.00672717 48.389 4 Q LLGERVARRDICIAFQETLPTLQPNQNMTSE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP RDICIAFQ(1)ETLPTLQ(0.485)PN(0.547)Q(0.656)N(0.656)MTSEERQ(0.656)R RDICIAFQ(31.03)ETLPTLQ(-0.58)PN(0.58)Q(0)N(0)MTSEERQ(0)R 8 3 2.0476 568230 0 0 568230 NaN 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1160 1683 237 237 3729 4243 11839 12421 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN 247 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN Taste receptor type 1 member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAS1R2 PE=3 SV=2 0.656069 0 0.00672717 48.389 14.177 48.389 0.656069 0 0.00672717 48.389 4 Q ICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVD X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX RDICIAFQ(1)ETLPTLQ(0.485)PN(0.547)Q(0.656)N(0.656)MTSEERQ(0.656)R RDICIAFQ(31.03)ETLPTLQ(-0.58)PN(0.58)Q(0)N(0)MTSEERQ(0)R 18 3 2.0476 568230 0 0 568230 NaN 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1161 1683 247 247 3729 4243 11839 12421 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN 255 sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN sp|Q8TE23|TS1R2_HUMAN Taste receptor type 1 member 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TAS1R2 PE=3 SV=2 0.656069 0 0.00672717 48.389 14.177 48.389 0.656069 0 0.00672717 48.389 4 Q LPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTAR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX RDICIAFQ(1)ETLPTLQ(0.485)PN(0.547)Q(0.656)N(0.656)MTSEERQ(0.656)R RDICIAFQ(31.03)ETLPTLQ(-0.58)PN(0.58)Q(0)N(0)MTSEERQ(0)R 26 3 2.0476 568230 0 0 568230 NaN 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 568230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1162 1683 255 255 3729 4243 11839 12421 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 11839 12421 20190902_JH_EV_Ubi_3 12868 sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN 1607 sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN sp|Q8TE73|DYH5_HUMAN Dynein heavy chain 5, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH5 PE=1 SV=3 0.99982 37.4572 0.0282145 61.679 18.961 61.679 0.99982 37.4572 0.0282145 61.679 Q LGSLLSNRYNMPFKAQIQKWVQYLSNSTDII X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX YN(1)MPFKAQ(1)IQK YN(46.53)MPFKAQ(37.46)IQ(-37.46)K 8 2 -0.49235 62699000 0 62699000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 62699000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62699000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1163 1684 1607 1607 5185 5901 16729 17586 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 16729 17586 20190902_JH_WT_Ubi_2 6849 sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN;sp|Q8TF46-4|DI3L1_HUMAN;sp|Q8TF46|DI3L1_HUMAN 874;925;1008 sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN Isoform 2 of DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIS3L;sp|Q8TF46-4|DI3L1_HUMAN Isoform 4 of DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIS3L;sp|Q8TF46|DI3L1_HUMAN DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=960 1 88.7814 9.14879E-05 93.812 34.468 88.781 1 93.8124 9.14879E-05 93.812 1 66.2607 0.027989 66.261 1 88.7814 0.000160345 88.781 2 Q KSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SELVKEVTKSVEEAQ(1)LAQ(1)EVK SELVKEVTKSVEEAQ(88.78)LAQ(88.78)EVK 15 3 -0.85355 36497000 0 36497000 0 NaN 10072000 10251000 0 0 0 0 0 16174000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 10072000 0 0 10251000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16174000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1164 1688 874 874 3891 4418 12317;12318;12319 12916;12917;12918 12319 12918 20190902_JH_WT_Ubi_2 12684 12317 12916 20190821_JH_EV_Ubi 11122 12317 12916 20190821_JH_EV_Ubi 11122 sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN;sp|Q8TF46-4|DI3L1_HUMAN;sp|Q8TF46|DI3L1_HUMAN 877;928;1011 sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN sp|Q8TF46-2|DI3L1_HUMAN Isoform 2 of DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIS3L;sp|Q8TF46-4|DI3L1_HUMAN Isoform 4 of DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIS3L;sp|Q8TF46|DI3L1_HUMAN DIS3-like exonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=960 1 88.7814 9.14879E-05 93.812 34.468 88.781 1 93.8124 9.14879E-05 93.812 1 66.2607 0.027989 66.261 1 88.7814 0.000160345 88.781 2 Q LVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX SELVKEVTKSVEEAQ(1)LAQ(1)EVK SELVKEVTKSVEEAQ(88.78)LAQ(88.78)EVK 18 3 -0.85355 36497000 0 36497000 0 NaN 10072000 10251000 0 0 0 0 0 16174000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 10072000 0 0 10251000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16174000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1165 1688 877 877 3891 4418 12317;12318;12319 12916;12917;12918 12319 12918 20190902_JH_WT_Ubi_2 12684 12317 12916 20190821_JH_EV_Ubi 11122 12317 12916 20190821_JH_EV_Ubi 11122 sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN 1099 sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN Probable phospholipid-transporting ATPase IM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP8B4 PE=1 SV=3 1 84.2973 0.00878352 84.297 37.26 84.297 1 76.588 0.0153168 76.588 1 84.2973 0.00878352 84.297 2 Q AFRFLKVDLYPTLSDQIRRWQKAQKKARPPS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX VDLYPTLSDQ(1)IRRWQ(1)K VDLYPTLSDQ(84.3)IRRWQ(84.3)K 10 3 0.95608 9744700 0 9744700 0 NaN 5651000 4093700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 5651000 0 0 4093700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1166 1689 1099 1099 4753 5392 15234;15235 16003;16004 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN 1104 sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN sp|Q8TF62|AT8B4_HUMAN Probable phospholipid-transporting ATPase IM OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP8B4 PE=1 SV=3 1 84.2973 0.00878352 84.297 37.26 84.297 1 76.588 0.0153168 76.588 1 84.2973 0.00878352 84.297 2 Q KVDLYPTLSDQIRRWQKAQKKARPPSSRRPR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX VDLYPTLSDQ(1)IRRWQ(1)K VDLYPTLSDQ(84.3)IRRWQ(84.3)K 15 3 0.95608 9744700 0 9744700 0 NaN 5651000 4093700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 5651000 0 0 4093700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1167 1689 1104 1104 4753 5392 15234;15235 16003;16004 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 15235 16004 20190821_JH_MUT_Ubi 11834 sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN 74 sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN sp|Q8WUU5|GATD1_HUMAN GATA zinc finger domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GATAD1 PE=1 SV=1 1 59.9771 5.88088E-06 61.918 30.538 59.977 1 61.9179 5.88088E-06 61.918 1 59.9771 1.31249E-05 59.977 2 Q GFGAATFASTSATPPQSNGGGGGKQSKQEIH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX GGAGSGGAGSGAAGGTGGSGGGGFGAATFASTSATPPQ(1)SN(1)GGGGGK GGAGSGGAGSGAAGGTGGSGGGGFGAATFASTSATPPQ(59.98)SN(59.98)GGGGGK 38 3 2.4416 1049000 0 1049000 0 NaN 0 0 0 0 0 611510 437480 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 611510 0 0 437480 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1168 1694 74 74 1475 1678;1679 4694;4695 4934;4935 4695 4935 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9062 4694 4934 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9717 4694 4934 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9717 sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-3|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-5|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-2|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-4|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4|MYO3B_HUMAN;sp|Q8WXR4-7|MYO3B_HUMAN 888;888;888;888;888;888;897 sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN sp|Q8WXR4-6|MYO3B_HUMAN Isoform 6 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4-3|MYO3B_HUMAN Isoform 3 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4-5|MYO3B_HUMAN Isoform 5 of Myosin-IIIb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO3B;sp|Q8WXR4- 1 68.6258 0.0260786 68.626 9.2761 68.626 1 68.6258 0.0260786 68.626 Q QQLFSIPLTKTGNLAQTRARITVASSSLPPH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX TGN(1)LAQ(1)TRAR TGN(68.63)LAQ(68.63)TRAR 6 2 3.788 4446100 0 4446100 0 NaN 0 0 4446100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 4446100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1169 1704 888 888 4381 4965 13853 14536 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 13853 14536 20190821_JH_WT_Ubi 7202 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-3|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-10|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-9|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-6|TITIN_HUMAN 2374;2374;2374;2374;2282;2374;2374;2374;2374;2328;2328;2328;2374 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 1 60.5976 0.02966 60.598 17.096 60.598 1 60.5976 0.02966 60.598 1 Q LQGLSDQKVCEGDIVQLEVKVSLESVEGVWM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VCEGDIVQ(1)LEVK VCEGDIVQ(60.6)LEVK 8 3 2.6832 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1170 1705 2374 2374 4726 5362 15162 15930 15162 15930 20190902_JH_EV_Ubi_3 4088 15162 15930 20190902_JH_EV_Ubi_3 4088 15162 15930 20190902_JH_EV_Ubi_3 4088 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-3|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-10|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-9|TITIN_HUMAN 26727;27250;27272;27442;28085;28177;28302;28311;29818;20753;20878;20945 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.990196 19.4304 0.0113075 51.348 12.111 51.348 0.990196 19.4304 0.0113075 51.348 3 Q GVNYYFRVSAVNCAGQGEPIEMNEPVQAKDI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX VSAVN(0.999)CAGQ(0.99)GEPIEMN(0.14)EPVQ(0.871)AK VSAVN(29.45)CAGQ(19.43)GEPIEMN(-8.23)EPVQ(8.23)AK 9 3 0.035344 1720700 0 0 1720700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1171 1705 26727 26727 5003 5678 16063 16873 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-2|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-8|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-13|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-12|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-3|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-10|TITIN_HUMAN;sp|Q8WZ42-9|TITIN_HUMAN 26738;27261;27283;27453;28096;28188;28313;28322;29829;20764;20889;20956 sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN sp|Q8WZ42-5|TITIN_HUMAN Isoform 5 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-11|TITIN_HUMAN Isoform 11 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-4|TITIN_HUMAN Isoform 4 of Titin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTN;sp|Q8WZ42-7|TITIN_HUMAN Isoform 0.870679 8.22777 0.0113075 51.348 12.111 51.348 0.870679 8.22777 0.0113075 51.348 3 Q NCAGQGEPIEMNEPVQAKDILEAPEIDLDVA Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX VSAVN(0.999)CAGQ(0.99)GEPIEMN(0.14)EPVQ(0.871)AK VSAVN(29.45)CAGQ(19.43)GEPIEMN(-8.23)EPVQ(8.23)AK 20 3 0.035344 1720700 0 0 1720700 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1720700 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1172 1705 26738 26738 5003 5678 16063 16873 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 16063 16873 20190902_JH_WT_Ubi_3 16053 sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN;sp|Q92576|PHF3_HUMAN 47;135 sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN Isoform 2 of PHD finger protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF3;sp|Q92576|PHF3_HUMAN PHD finger protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF3 PE=1 SV=3 1 69.2755 0.0269403 69.276 16.786 69.276 1 69.2755 0.0269403 69.276 Q ENSVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LMAQ(1)EQ(1)VRSLR LMAQ(69.28)EQ(69.28)VRSLR 4 3 0.43972 157320000 0 157320000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 157320000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 157320000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1173 1713 47 47 2714 3085;3086 8810 9266 8810 9266 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5859 8810 9266 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5859 8810 9266 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5859 sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN;sp|Q92576|PHF3_HUMAN 49;137 sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN sp|Q92576-2|PHF3_HUMAN Isoform 2 of PHD finger protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF3;sp|Q92576|PHF3_HUMAN PHD finger protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF3 PE=1 SV=3 1 69.2755 0.00790044 93.561 23.123 69.276 0.999815 37.3372 0.0112438 87.789 0.999537 33.3416 0.0242507 70.942 0.999535 33.3231 0.0185818 75.566 0.999772 36.4122 0.00790044 93.561 1 69.2755 0.0186159 75.509 1 Q SVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRSNA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LMAQ(1)EQ(1)VRSLR LMAQ(69.28)EQ(69.28)VRSLR 6 3 0.43972 10481000000 10324000000 157320000 0 NaN 0 0 2801800000 1331800000 1702000000 4453000000 192390000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2801800000 0 0 1331800000 0 0 1702000000 0 0 4453000000 0 0 35078000 157320000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1174 1713 49 49 2714 3085;3086 8805;8806;8807;8808;8809;8810 9260;9261;9262;9263;9264;9265;9266 8810 9266 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5859 8807 9262 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5672 8807 9262 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5672 sp|Q92734-4|TFG_HUMAN;sp|Q92734-3|TFG_HUMAN;sp|Q92734-2|TFG_HUMAN;sp|Q92734|TFG_HUMAN 101;101;101;101 sp|Q92734-4|TFG_HUMAN sp|Q92734-4|TFG_HUMAN sp|Q92734-4|TFG_HUMAN Isoform 4 of Protein TFG OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFG;sp|Q92734-3|TFG_HUMAN Isoform 3 of Protein TFG OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFG;sp|Q92734-2|TFG_HUMAN Isoform 2 of Protein TFG OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TFG;sp|Q92734|TFG_HUMAN Pr 1 127.424 0.00359034 127.42 78.911 127.42 1 127.424 0.00359034 127.42 1 Q LTLFVNGQPRPLESSQVKYLRRELIELRNKV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX PLESSQ(1)VKYLR PLESSQ(127.42)VKYLR 6 3 2.3347 1583100 1583100 0 0 0.004997 0 0 0 0 0 1583100 0 0 0 0 0 0 0 0 0.03931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1583100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1175 1720 101 101 3415 3898 10941 11505 10941 11505 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6608 10941 11505 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6608 10941 11505 20190902_JH_MUT_Ubi_2 6608 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN 369 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN Golgin subfamily A member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA1 PE=1 SV=3 0.901618 10.7769 0.0269664 43.592 6.4156 43.592 0.901618 10.7769 0.0269664 43.592 3 Q TRVRELEQTLQASEEQLQQSKGIVAAQETQI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX ELEQ(0.038)TLQ(0.105)ASEEQ(0.902)LQ(0.978)Q(0.978)SK ELEQ(-17.64)TLQ(-10.78)ASEEQ(10.78)LQ(19.13)Q(19.13)SK 12 3 2.8382 854210 0 0 854210 NaN 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1176 1724 369 369 986 1114 3153 3312 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN 371 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN Golgin subfamily A member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA1 PE=1 SV=3 0.977675 19.1252 0.0269664 43.592 6.4156 43.592 0.977675 19.1252 0.0269664 43.592 3 Q VRELEQTLQASEEQLQQSKGIVAAQETQIQE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX ELEQ(0.038)TLQ(0.105)ASEEQ(0.902)LQ(0.978)Q(0.978)SK ELEQ(-17.64)TLQ(-10.78)ASEEQ(10.78)LQ(19.13)Q(19.13)SK 14 3 2.8382 854210 0 0 854210 NaN 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1177 1724 371 371 986 1114 3153 3312 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN 372 sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN sp|Q92805|GOGA1_HUMAN Golgin subfamily A member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOLGA1 PE=1 SV=3 0.977675 19.1252 0.0269664 43.592 6.4156 43.592 0.977675 19.1252 0.0269664 43.592 3 Q RELEQTLQASEEQLQQSKGIVAAQETQIQEL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ELEQ(0.038)TLQ(0.105)ASEEQ(0.902)LQ(0.978)Q(0.978)SK ELEQ(-17.64)TLQ(-10.78)ASEEQ(10.78)LQ(19.13)Q(19.13)SK 15 3 2.8382 854210 0 0 854210 NaN 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 854210 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1178 1724 372 372 986 1114 3153 3312 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 3153 3312 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7851 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN;sp|Q92844|TANK_HUMAN 93;93;93 sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN sp|Q92844-2|TANK_HUMAN Isoform Short of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844-3|TANK_HUMAN Isoform 3 of TRAF family member-associated NF-kappa-B activator OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TANK;sp|Q92844|TANK 0.998567 28.4314 0.0289968 85.963 8.6846 85.963 0.998567 28.4314 0.0289968 85.963 Q LLEDSETRKNNLTLDQPQDKVISGIAREKLP X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX KN(1)N(1)LTLDQ(0.999)PQ(0.002)DK KN(57.76)N(41.65)LTLDQ(28.43)PQ(-28.43)DK 8 2 1.9757 1779100 0 0 1779100 NaN 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1779100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1179 1730 93 93 2408 2737 7877 8281 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 7877 8281 20190821_JH_WT_Ubi 5270 sp|Q969G5|CAVN3_HUMAN 80 sp|Q969G5|CAVN3_HUMAN sp|Q969G5|CAVN3_HUMAN sp|Q969G5|CAVN3_HUMAN Caveolae-associated protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN3 PE=1 SV=3 0.9963 24.3022 0.00176732 94.281 59.849 94.281 0.931262 11.3187 0.0193296 72.421 0.9963 24.3022 0.00176732 94.281 1 Q GALSRSHDTTSNTLAQLLAKAERVSSHANAA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SHDTTSN(0.004)TLAQ(0.996)LLAKAER SHDTTSN(-24.3)TLAQ(24.3)LLAKAER 11 3 -0.46835 4646400 4646400 0 0 0.024392 0 0 0 0 0 0 0 2076700 2569700 0 0 0 NaN NaN 0 0 0.077194 0.059242 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2076700 0 0 2569700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1180 1747 80 80 3945 4487 12520;12521 13134;13135 12521 13135 20190902_JH_WT_Ubi_3 11320 12521 13135 20190902_JH_WT_Ubi_3 11320 12521 13135 20190902_JH_WT_Ubi_3 11320 sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN;sp|Q96AV8-3|E2F7_HUMAN;sp|Q96AV8|E2F7_HUMAN 396;396;396 sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN Isoform 2 of Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=E2F7;sp|Q96AV8-3|E2F7_HUMAN Isoform 3 of Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=E2F7;sp|Q96AV8|E2F7_HUMAN Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=96 1 55.5494 0.0290546 55.549 12.037 55.549 1 55.5494 0.0290546 55.549 Q VSASVLPELKRETYGQIQVCAKQKLARHGSF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX RETYGQ(1)IQ(1)VCAK RETYGQ(55.55)IQ(55.55)VCAK 6 2 -0.57394 9029500 0 9029500 0 NaN 0 0 0 0 0 0 9029500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9029500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1181 1756 396 396 3742 4256 11870 12452 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN;sp|Q96AV8-3|E2F7_HUMAN;sp|Q96AV8|E2F7_HUMAN 398;398;398 sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN sp|Q96AV8-2|E2F7_HUMAN Isoform 2 of Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=E2F7;sp|Q96AV8-3|E2F7_HUMAN Isoform 3 of Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=E2F7;sp|Q96AV8|E2F7_HUMAN Transcription factor E2F7 OS=Homo sapiens OX=96 1 55.5494 0.0290546 55.549 12.037 55.549 1 55.5494 0.0290546 55.549 Q ASVLPELKRETYGQIQVCAKQKLARHGSFNT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX RETYGQ(1)IQ(1)VCAK RETYGQ(55.55)IQ(55.55)VCAK 8 2 -0.57394 9029500 0 9029500 0 NaN 0 0 0 0 0 0 9029500 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9029500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1182 1756 398 398 3742 4256 11870 12452 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 11870 12452 20190902_JH_MUT_Ubi_3 623 sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN 1315 sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN Dynein heavy chain 11, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH11 PE=1 SV=4 1 50.8431 0.0329308 50.843 13.751 50.843 1 50.8431 0.0329308 50.843 2 Q QESTRLFEVALPEYKQMKQCRKEIKLLKGLW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX LFEVALPEYKQ(1)MKQ(1)CR LFEVALPEYKQ(50.84)MKQ(50.84)CR 11 3 0.65145 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1183 1770 1315 1315 2588 2940 8400 8833 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN 1318 sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN sp|Q96DT5|DYH11_HUMAN Dynein heavy chain 11, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH11 PE=1 SV=4 1 50.8431 0.0329308 50.843 13.751 50.843 1 50.8431 0.0329308 50.843 2 Q TRLFEVALPEYKQMKQCRKEIKLLKGLWDVI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX LFEVALPEYKQ(1)MKQ(1)CR LFEVALPEYKQ(50.84)MKQ(50.84)CR 14 3 0.65145 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1184 1770 1318 1318 2588 2940 8400 8833 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 8400 8833 20190821_JH_WT_Ubi 8235 sp|Q96GC6-3|ZN274_HUMAN;sp|Q96GC6-2|ZN274_HUMAN;sp|Q96GC6|ZN274_HUMAN 86;159;191 sp|Q96GC6-3|ZN274_HUMAN sp|Q96GC6-3|ZN274_HUMAN sp|Q96GC6-3|ZN274_HUMAN Isoform 3 of Neurotrophin receptor-interacting factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF274;sp|Q96GC6-2|ZN274_HUMAN Isoform 2 of Neurotrophin receptor-interacting factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNF274;sp|Q96GC6|ZN274_ 0.999799 36.9764 0.0307481 64.841 13.078 64.841 0.999799 36.9764 0.0307481 64.841 Q REALDQLRELCHQWLQPKARSKEQILELLVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ELCHQWLQ(1)PK ELCHQ(-36.98)WLQ(36.98)PK 8 3 3.0608 2304000 2304000 0 0 NaN 0 0 2304000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 2304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1185 1779 86 86 979 1106 3128 3286 3128 3286 20190821_JH_WT_Ubi 11194 3128 3286 20190821_JH_WT_Ubi 11194 3128 3286 20190821_JH_WT_Ubi 11194 sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN;sp|Q96J02-2|ITCH_HUMAN;sp|Q96J02|ITCH_HUMAN 272;382;423 sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITCH;sp|Q96J02-2|ITCH_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITCH;sp|Q96J02|ITCH_HUMAN E3 ubiquitin-pr 0.39454 0.433122 0.012129 52.824 18.331 52.824 0.39454 0.433122 0.012129 52.824 Q QGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FIYGN(0.357)Q(0.395)DLFATSQ(0.248)SKEFDPLGPLPPGWEK FIYGN(-0.43)Q(0.43)DLFATSQ(-2.02)SKEFDPLGPLPPGWEK 6 3 1.1956 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1186 1786 272 272 1228 1387 3897 4102 20190902_JH_WT_Ubi_2 15804 3897 4102 20190902_JH_WT_Ubi_2 15804 3897 4102 20190902_JH_WT_Ubi_2 15804 sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN;sp|Q96J02-2|ITCH_HUMAN;sp|Q96J02|ITCH_HUMAN 279;389;430 sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN sp|Q96J02-3|ITCH_HUMAN Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITCH;sp|Q96J02-2|ITCH_HUMAN Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ITCH;sp|Q96J02|ITCH_HUMAN E3 ubiquitin-pr 0.990162 22.7823 0.00575644 59.646 37.086 59.646 0.990162 22.7823 0.00575644 59.646 1 Q NQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPPGWE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP FIYGN(0.005)Q(0.005)DLFATSQ(0.99)SKEFDPLGPLPPGWEK FIYGN(-23.32)Q(-22.78)DLFATSQ(22.78)SKEFDPLGPLPPGWEK 13 3 -0.36948 934700 934700 0 0 0.0073616 0 0 0 0 0 0 0 0 934700 0 0 0 NaN NaN 0 0 0 0.070889 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 934700 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1187 1786 279 279 1228 1387 3898 4103 3898 4103 20190902_JH_WT_Ubi_3 14870 3898 4103 20190902_JH_WT_Ubi_3 14870 3898 4103 20190902_JH_WT_Ubi_3 14870 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN 717 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN Deubiquitinating protein VCIP135 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VCPIP1 PE=1 SV=2 0.988867 19.5739 0.0334406 43.03 7.3733 43.03 0.988867 19.5739 0.0334406 43.03 Q LHKEELNMSKTERTIQQNITEQASVMQKRKT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXX TIQ(0.989)Q(0.012)N(0.333)ITEQ(0.333)ASVMQ(0.333)KR TIQ(19.57)Q(-19.57)N(0)ITEQ(0)ASVMQ(0)KR 3 3 -0.19902 41374000 0 41374000 0 NaN 0 0 0 41374000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41374000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1188 1788 717 717 4432 5027 14043 14743 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN 723 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN Deubiquitinating protein VCIP135 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VCPIP1 PE=1 SV=2 0.333087 0 0.0334406 43.03 7.3733 43.03 0.333087 0 0.0334406 43.03 Q NMSKTERTIQQNITEQASVMQKRKTEKLKQE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TIQ(0.989)Q(0.012)N(0.333)ITEQ(0.333)ASVMQ(0.333)KR TIQ(19.57)Q(-19.57)N(0)ITEQ(0)ASVMQ(0)KR 9 3 -0.19902 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1189 1788 723 723 4432 5027 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN 728 sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN sp|Q96JH7|VCIP1_HUMAN Deubiquitinating protein VCIP135 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VCPIP1 PE=1 SV=2 0.333087 0 0.0334406 43.03 7.3733 43.03 0.333087 0 0.0334406 43.03 Q ERTIQQNITEQASVMQKRKTEKLKQEQKGQP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TIQ(0.989)Q(0.012)N(0.333)ITEQ(0.333)ASVMQ(0.333)KR TIQ(19.57)Q(-19.57)N(0)ITEQ(0)ASVMQ(0)KR 14 3 -0.19902 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1190 1788 728 728 4432 5027 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 14043 14743 20190902_JH_EV_Ubi_2 6838 sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN 2991 sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN sp|Q96M86|DNHD1_HUMAN Dynein heavy chain domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNHD1 PE=2 SV=2 0.999015 31.7977 0.0198703 86.882 7.3925 86.882 0.999015 31.7977 0.0198703 86.882 2 Q DRIGEHLPRENLGVKQNIKKEMVLQRFHQQV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EN(1)LGVKQ(0.999)N(0.001)IKK EN(49.28)LGVKQ(31.8)N(-31.8)IKK 7 3 -0.26071 2573000 0 2573000 0 NaN 0 0 0 2573000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1191 1800 2991 2991 1045 1175 3301 3469 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 3301 3469 20190902_JH_EV_Ubi_2 12067 sp|Q96PP8|GBP5_HUMAN 541 sp|Q96PP8|GBP5_HUMAN sp|Q96PP8|GBP5_HUMAN sp|Q96PP8|GBP5_HUMAN Guanylate-binding protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GBP5 PE=1 SV=1 0.755957 5.82012 0.0282595 58.32 18.972 58.32 0.755957 5.82012 0.0282595 58.32 Q VRQMEIAKQNWLAEQQKMQEQQMQEQAAQLS X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX Q(0.043)MEIAKQ(0.001)N(0.001)WLAEQ(0.199)Q(0.756)K Q(-12.46)MEIAKQ(-28.98)N(-28.98)WLAEQ(-5.82)Q(5.82)K 14 3 -1.6461 3551200 3551200 0 0 NaN 0 0 3551200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 3551200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1192 1807 541 541 3667 4176 11722 12301 11722 12301 20190821_JH_WT_Ubi 9522 11722 12301 20190821_JH_WT_Ubi 9522 11722 12301 20190821_JH_WT_Ubi 9522 sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-4|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-2|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-6|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-5|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-7|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5|NED4L_HUMAN;sp|Q96PU5-3|NED4L_HUMAN 340;360;417;453;461;473;481;377 sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN sp|Q96PU5-9|NED4L_HUMAN Isoform 8 of E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEDD4L;sp|Q96PU5-4|NED4L_HUMAN Isoform 4 of E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NEDD4L;sp|Q96PU5-2|NED4L_HUMAN Isoform 2 of 0.988977 20.5205 2.42519E-10 126.04 89.234 126.04 0.461982 0 0.0114363 69.986 0.584903 2.34879 1.42251E-05 98.804 0.988977 20.5205 2.42519E-10 126.04 1 Q VRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQ X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX AVKDTLSNPQ(0.002)SPQ(0.989)PSPYN(0.009)SPK AVKDTLSN(-34.15)PQ(-27.23)SPQ(20.52)PSPYN(-20.52)SPK 13 3 0.044752 4897700 4897700 0 0 0.09269 0 0 0 0 0 2899100 1998600 0 0 NaN 0 NaN 0 0 0.29026 0.12228 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2899100 0 0 1998600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1193 1808 340 340 327 385 1103;1104 1190;1191 1104 1191 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6335 1104 1191 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6335 1104 1191 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6335 sp|Q96QD8|S38A2_HUMAN 34 sp|Q96QD8|S38A2_HUMAN sp|Q96QD8|S38A2_HUMAN sp|Q96QD8|S38A2_HUMAN Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC38A2 PE=1 SV=2 0.797311 6.16814 5.6684E-10 100.44 84.925 100.44 0.797311 6.16814 5.6684E-10 100.44 1 Q SYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX FSISPDEDSSSYSSN(0.006)SDFN(0.197)YSYPTKQ(0.797)AALK FSISPDEDSSSYSSN(-21.71)SDFN(-6.17)YSYPTKQ(6.17)AALK 26 3 1.5018 6048300 6048300 0 0 0.026725 0 0 0 0 0 0 6048300 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0.13989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6048300 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1194 1809 34 34 1300 1474 4110 4321 4110 4321 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10271 4110 4321 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10271 4110 4321 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10271 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-4|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1|NR1H4_HUMAN 167;214;218;224;228 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN Isoform 5 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN Isoform 4 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN Isoform 3 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=960 0.996982 25.1754 0.0333245 57.328 38.041 57.328 0.996982 25.1754 0.0333245 57.328 3 Q TEIQCKSKRLRKNVKQHADQTVNEDSEGRDL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXX N(0.006)VKQ(0.997)HADQ(0.997)TVN(1)EDSEGR N(-25.18)VKQ(25.18)HADQ(25.18)TVN(37.15)EDSEGR 4 3 -1.1842 5114600 0 0 5114600 NaN 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1195 1814 167 167 3251 3714 10441 10985 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1-4|NR1H4_HUMAN;sp|Q96RI1|NR1H4_HUMAN 171;218;222;228;232 sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN sp|Q96RI1-5|NR1H4_HUMAN Isoform 5 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-2|NR1H4_HUMAN Isoform 4 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NR1H4;sp|Q96RI1-1|NR1H4_HUMAN Isoform 3 of Bile acid receptor OS=Homo sapiens OX=960 0.996982 25.1754 0.0333245 57.328 38.041 57.328 0.996982 25.1754 0.0333245 57.328 3 Q CKSKRLRKNVKQHADQTVNEDSEGRDLRQVT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX N(0.006)VKQ(0.997)HADQ(0.997)TVN(1)EDSEGR N(-25.18)VKQ(25.18)HADQ(25.18)TVN(37.15)EDSEGR 8 3 -1.1842 5114600 0 0 5114600 NaN 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 5114600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1196 1814 171 171 3251 3714 10441 10985 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 10441 10985 20190821_JH_EV_Ubi 10960 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN 458;516;545 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN Isoform 3 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN Isoform 2 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing pro 0.435459 0 0.0219927 52.185 8.8024 52.185 0.435459 0 0.0219927 52.185 Q LYNRKEGRQVGQVAKQQVASLETNDPILGFQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.435)Q(0.435)VASLETN(0.13)DPILGFQ(0.999)ATN(1)ER Q(0)Q(0)VASLETN(-5.26)DPILGFQ(30.91)ATN(38.3)ER 1 3 2.2563 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1197 1815 458 458 3694 4205 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN 459;517;546 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN Isoform 3 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN Isoform 2 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing pro 0.435459 0 0.0219927 52.185 8.8024 52.185 0.435459 0 0.0219927 52.185 Q YNRKEGRQVGQVAKQQVASLETNDPILGFQA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.435)Q(0.435)VASLETN(0.13)DPILGFQ(0.999)ATN(1)ER Q(0)Q(0)VASLETN(-5.26)DPILGFQ(30.91)ATN(38.3)ER 2 3 2.2563 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1198 1815 459 459 3694 4205 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN 473;531;560 sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN sp|Q96RS6-3|NUDC1_HUMAN Isoform 3 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6-2|NUDC1_HUMAN Isoform 2 of NudC domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUDCD1;sp|Q96RS6|NUDC1_HUMAN NudC domain-containing pro 0.999227 30.9148 0.0219927 52.185 8.8024 52.185 0.999227 30.9148 0.0219927 52.185 Q QQVASLETNDPILGFQATNERLFVLTTKNLF Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX Q(0.435)Q(0.435)VASLETN(0.13)DPILGFQ(0.999)ATN(1)ER Q(0)Q(0)VASLETN(-5.26)DPILGFQ(30.91)ATN(38.3)ER 16 3 2.2563 7923900 0 0 7923900 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 7923900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7923900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1199 1815 473 473 3694 4205 11766 12347 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 11766 12347 20190902_JH_WT_Ubi_3 9654 sp|Q96RY7-2|IF140_HUMAN;sp|Q96RY7|IF140_HUMAN 74;880 sp|Q96RY7-2|IF140_HUMAN sp|Q96RY7-2|IF140_HUMAN sp|Q96RY7-2|IF140_HUMAN Isoform 2 of Intraflagellar transport protein 140 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFT140;sp|Q96RY7|IF140_HUMAN Intraflagellar transport protein 140 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFT140 PE=1 SV=1 0.996436 24.4646 0.0347456 51.436 7.8011 51.436 0.996436 24.4646 0.0347456 51.436 1 Q LYRKCKRHDLLNKFYQAAGRWQEALQVAEHH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX RHDLLN(0.004)KFYQ(0.996)AAGR RHDLLN(-24.46)KFYQ(24.46)AAGR 10 2 -0.91453 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1200 1818 74 74 3754 4268 11905 12487 11905 12487 20190821_JH_WT_Ubi 294 11905 12487 20190821_JH_WT_Ubi 294 11905 12487 20190821_JH_WT_Ubi 294 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN 357;465 sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN sp|Q96T51-2|RUFY1_HUMAN Isoform 2 of RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1;sp|Q96T51|RUFY1_HUMAN RUN and FYVE domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUFY1 PE=1 SV=2 0.828627 5.79007 0.0202251 47.113 10.867 47.113 0.828627 5.79007 0.0202251 47.113 3 Q VALRQQLEEVKAINLQMFHKAQNAESSLQQK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K) XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP AIN(0.942)LQ(0.829)MFHKAQ(0.362)N(0.774)AESSLQ(0.083)Q(0.01)K AIN(10.61)LQ(5.79)MFHKAQ(-5.79)N(6.31)AESSLQ(-9.94)Q(-19.6)K 5 3 -2.0312 3846600 0 0 3846600 NaN 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3846600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1201 1825 357 357 165 190 560 612 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 560 612 20190821_JH_WT_Ubi 6180 sp|Q96T58|MINT_HUMAN 1112 sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN Msx2-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEN PE=1 SV=1 1 46.4609 0.0354271 46.461 7.8839 46.461 1 46.4609 0.0354271 46.461 4 Q ENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPERE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX PIPSKPQ(1)LKQ(1)LQ(1)VLDDQ(1)GPER PIPSKPQ(46.46)LKQ(46.46)LQ(46.46)VLDDQ(46.46)GPER 7 3 2.2784 5080000 0 0 5080000 NaN 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1202 1826 1112 1112 3392 3873 10863 11427 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 sp|Q96T58|MINT_HUMAN 1115 sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN Msx2-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEN PE=1 SV=1 1 46.4609 0.0354271 46.461 7.8839 46.461 1 46.4609 0.0354271 46.461 4 Q EVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPEREDVR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX PIPSKPQ(1)LKQ(1)LQ(1)VLDDQ(1)GPER PIPSKPQ(46.46)LKQ(46.46)LQ(46.46)VLDDQ(46.46)GPER 10 3 2.2784 5080000 0 0 5080000 NaN 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1203 1826 1115 1115 3392 3873 10863 11427 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 sp|Q96T58|MINT_HUMAN 1117 sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN Msx2-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEN PE=1 SV=1 1 46.4609 0.0354271 46.461 7.8839 46.461 1 46.4609 0.0354271 46.461 4 Q QSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPEREDVRKN X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX PIPSKPQ(1)LKQ(1)LQ(1)VLDDQ(1)GPER PIPSKPQ(46.46)LKQ(46.46)LQ(46.46)VLDDQ(46.46)GPER 12 3 2.2784 5080000 0 0 5080000 NaN 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1204 1826 1117 1117 3392 3873 10863 11427 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 sp|Q96T58|MINT_HUMAN 1122 sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN sp|Q96T58|MINT_HUMAN Msx2-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPEN PE=1 SV=1 1 46.4609 0.0354271 46.461 7.8839 46.461 1 46.4609 0.0354271 46.461 4 Q IPSKPQLKQLQVLDDQGPEREDVRKNYCSLR X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX PIPSKPQ(1)LKQ(1)LQ(1)VLDDQ(1)GPER PIPSKPQ(46.46)LKQ(46.46)LQ(46.46)VLDDQ(46.46)GPER 17 3 2.2784 5080000 0 0 5080000 NaN 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1205 1826 1122 1122 3392 3873 10863 11427 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 10863 11427 20190902_JH_EV_Ubi_3 9378 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN 564;575;576 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN Isoform 3 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN Histone- 0.796496 4.11188 0.0280364 40.968 10.926 40.968 0.796496 4.11188 0.0280364 40.968 4 Q ITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP CN(0.962)Q(0.796)ATTLDN(0.481)Q(0.876)N(0.876)IKKAIEVQ(0.005)IQ(0.005)K CN(11.52)Q(4.11)ATTLDN(-4.11)Q(6.32)N(6.32)IKKAIEVQ(-29.51)IQ(-29.51)K 3 4 -1.0085 16052000 0 0 16052000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1206 1827 564 564 354 417 1184 1271 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN 571;582;583 sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN sp|Q96T68-2|SETB2_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68-3|SETB2_HUMAN Isoform 3 of Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SETDB2;sp|Q96T68|SETB2_HUMAN Histone- 0.875524 6.31853 0.0280364 40.968 10.926 40.968 0.875524 6.31853 0.0280364 40.968 4 Q TPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQE X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX CN(0.962)Q(0.796)ATTLDN(0.481)Q(0.876)N(0.876)IKKAIEVQ(0.005)IQ(0.005)K CN(11.52)Q(4.11)ATTLDN(-4.11)Q(6.32)N(6.32)IKKAIEVQ(-29.51)IQ(-29.51)K 10 4 -1.0085 16052000 0 0 16052000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16052000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1207 1827 571 571 354 417 1184 1271 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 1184 1271 20190902_JH_WT_Ubi_2 7742 sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN;sp|Q99471|PFD5_HUMAN 73;118 sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN Isoform 3 of Prefoldin subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN5;sp|Q99471|PFD5_HUMAN Prefoldin subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN5 PE=1 SV=2 0.499496 0 0.0297535 49.28 10.881 49.28 0.499496 0 0.0297535 49.28 Q FKRKIDFLTKQMEKIQPALQEKHAMKQAVME X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX Q(0.001)MEKIQ(0.499)PALQ(0.499)EK Q(-26.95)MEKIQ(0)PALQ(0)EK 6 3 -1.9301 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1208 1834 73 73 3668 4177 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN;sp|Q99471|PFD5_HUMAN 77;122 sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN sp|Q99471-3|PFD5_HUMAN Isoform 3 of Prefoldin subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN5;sp|Q99471|PFD5_HUMAN Prefoldin subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN5 PE=1 SV=2 0.499496 0 0.0297535 49.28 10.881 49.28 0.499496 0 0.0297535 49.28 Q IDFLTKQMEKIQPALQEKHAMKQAVMEMMSQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Q(0.001)MEKIQ(0.499)PALQ(0.499)EK Q(-26.95)MEKIQ(0)PALQ(0)EK 10 3 -1.9301 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1209 1834 77 77 3668 4177 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 11723 12302 20190902_JH_EV_Ubi_3 5667 sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN;sp|Q99755-3|PI51A_HUMAN;sp|Q99755|PI51A_HUMAN 77;78;77;90 sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN sp|Q99755-2|PI51A_HUMAN Isoform 2 of Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIP5K1A;sp|Q99755-4|PI51A_HUMAN Isoform 4 of Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PIP5K1A;sp 1 142.578 1.41484E-17 153.21 104.33 142.58 1 153.212 1.41484E-17 153.21 1 110.26 3.22566E-05 110.26 1 142.578 4.92576E-13 142.58 1 Q TTYKKTTSSALKGAIQLGITHTVGSLSTKPE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GAIQ(1)LGITHTVGSLSTKPER GAIQ(142.58)LGITHTVGSLSTKPER 4 3 0.68876 50988000 50988000 0 0 0.031321 0 0 0 0 0 16173000 8553200 26262000 0 0 0 0 0 0 0.17177 0.096088 0.16169 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16173000 0 0 8553200 0 0 26262000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1210 1846 77 77 1371 1563 4374;4375;4376 4597;4598;4599 4376 4599 20190902_JH_WT_Ubi_2 9765 4374 4597 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8648 4374 4597 20190902_JH_MUT_Ubi_2 8648 sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN;sp|Q99959|PKP2_HUMAN 282;282 sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN sp|Q99959-2|PKP2_HUMAN Isoform 1 of Plakophilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKP2;sp|Q99959|PKP2_HUMAN Plakophilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PKP2 PE=1 SV=2 0.430996 0 0.00168362 98.76 78.56 98.76 0.430996 0 0.00168362 98.76 Q TVGQVRPLVPLQPVTQNRASRSSWHQSSFHS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ENYLTAGLTVGQ(0.044)VRPLVPLQ(0.094)PVTQ(0.431)N(0.431)R EN(-57.77)YLTAGLTVGQ(-9.89)VRPLVPLQ(-6.62)PVTQ(0)N(0)R 24 3 0.98903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN 0 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1211 1853 282 282 1051 1183 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 3335 3508 20190902_JH_EV_Ubi_3 11767 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-6|AKAP9_HUMAN 2239;2219;2227;2239;2231 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN Isoform 5 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 9 O 1 83.3649 0.0297537 94.465 33.775 94.465 1 83.3649 0.0297537 94.465 4 Q LEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX N(1)EEVQ(1)Q(1)LHMQ(1)LEIQK N(73.07)EEVQ(83.36)Q(79.09)LHMQ(62.21)LEIQ(-62.21)K 5 2 -0.15284 5047600 0 0 5047600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1212 1854 2239 2239 3033 3466 9785 10308 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-6|AKAP9_HUMAN 2240;2220;2228;2240;2232 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN Isoform 5 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 9 O 1 79.0932 0.0297537 94.465 33.775 94.465 1 79.0932 0.0297537 94.465 4 Q EQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTTR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX N(1)EEVQ(1)Q(1)LHMQ(1)LEIQK N(73.07)EEVQ(83.36)Q(79.09)LHMQ(62.21)LEIQ(-62.21)K 6 2 -0.15284 5047600 0 0 5047600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1213 1854 2240 2240 3033 3466 9785 10308 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996|AKAP9_HUMAN;sp|Q99996-6|AKAP9_HUMAN 2244;2224;2232;2244;2236 sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN sp|Q99996-5|AKAP9_HUMAN Isoform 5 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-3|AKAP9_HUMAN Isoform 3 of A-kinase anchor protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AKAP9;sp|Q99996-2|AKAP9_HUMAN Isoform 2 of A-kinase anchor protein 9 O 0.999999 62.2114 0.0297537 94.465 33.775 94.465 0.999999 62.2114 0.0297537 94.465 4 Q EELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTTRLQEL X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX N(1)EEVQ(1)Q(1)LHMQ(1)LEIQK N(73.07)EEVQ(83.36)Q(79.09)LHMQ(62.21)LEIQ(-62.21)K 10 2 -0.15284 5047600 0 0 5047600 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5047600 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1214 1854 2244 2244 3033 3466 9785 10308 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 9785 10308 20190902_JH_WT_Ubi_2 11545 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN 87 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN BPI fold-containing family A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BPIFA3 PE=2 SV=3 0.20931 0 0.0178441 48.984 10.11 48.984 0.20931 0 0.0178441 48.984 Q VAPGLVGWLISGRKHQQQQESSINITNIQLD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP HQ(0.209)Q(0.209)Q(0.196)Q(0.196)ESSIN(0.176)ITN(0.045)IQ(0.97)LDCGGIQ(0.998)ISFHK HQ(0)Q(0)Q(-0.3)Q(-0.3)ESSIN(-0.89)ITN(-9.86)IQ(14.55)LDCGGIQ(24.92)ISFHK 2 3 -2.0188 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1215 1862 87 87 1983 2259 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN 88 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN BPI fold-containing family A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BPIFA3 PE=2 SV=3 0.20931 0 0.0178441 48.984 10.11 48.984 0.20931 0 0.0178441 48.984 Q APGLVGWLISGRKHQQQQESSINITNIQLDC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HQ(0.209)Q(0.209)Q(0.196)Q(0.196)ESSIN(0.176)ITN(0.045)IQ(0.97)LDCGGIQ(0.998)ISFHK HQ(0)Q(0)Q(-0.3)Q(-0.3)ESSIN(-0.89)ITN(-9.86)IQ(14.55)LDCGGIQ(24.92)ISFHK 3 3 -2.0188 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1216 1862 88 88 1983 2259 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN 100 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN BPI fold-containing family A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BPIFA3 PE=2 SV=3 0.969882 14.5478 0.0178441 48.984 10.11 48.984 0.969882 14.5478 0.0178441 48.984 3 Q KHQQQQESSINITNIQLDCGGIQISFHKEWF X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX HQ(0.209)Q(0.209)Q(0.196)Q(0.196)ESSIN(0.176)ITN(0.045)IQ(0.97)LDCGGIQ(0.998)ISFHK HQ(0)Q(0)Q(-0.3)Q(-0.3)ESSIN(-0.89)ITN(-9.86)IQ(14.55)LDCGGIQ(24.92)ISFHK 15 3 -2.0188 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1217 1862 100 100 1983 2259 6479 6816 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN 107 sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN sp|Q9BQP9|BPIA3_HUMAN BPI fold-containing family A member 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BPIFA3 PE=2 SV=3 0.997877 24.9159 0.0178441 48.984 10.11 48.984 0.997877 24.9159 0.0178441 48.984 3 Q SSINITNIQLDCGGIQISFHKEWFSANISLE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX HQ(0.209)Q(0.209)Q(0.196)Q(0.196)ESSIN(0.176)ITN(0.045)IQ(0.97)LDCGGIQ(0.998)ISFHK HQ(0)Q(0)Q(-0.3)Q(-0.3)ESSIN(-0.89)ITN(-9.86)IQ(14.55)LDCGGIQ(24.92)ISFHK 22 3 -2.0188 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1218 1862 107 107 1983 2259 6479 6816 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 6479 6816 20190821_JH_EV_Ubi 10231 sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN;sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN;sp|Q9BRX5-3|PSF3_HUMAN 118;196;235 sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN sp|Q9BRX5-2|PSF3_HUMAN Isoform 2 of DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3;sp|Q9BRX5|PSF3_HUMAN DNA replication complex GINS protein PSF3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GINS3 PE=1 SV=1;sp|Q9BRX5-3|PSF3_HUMAN Isoform 3 of DNA 0.693001 1.1789 0.0246361 46.319 6.7876 46.319 0.693001 1.1789 0.0246361 46.319 2 Q KGLNDFQCWEKGQASQITASNLVQNYKKRKF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX GQ(0.601)ASQ(0.693)ITASN(0.698)LVQ(0.004)N(0.004)YKK GQ(-1.18)ASQ(1.18)ITASN(1.18)LVQ(-21.36)N(-21.36)YKK 5 3 4.0621 1611700 0 1611700 0 NaN 0 0 0 0 0 1611700 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1611700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1219 1867 118 118 1660 1890 5303 5584 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 5303 5584 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9383 sp|Q9BW04|SARG_HUMAN;sp|Q9BW04-2|SARG_HUMAN 398;152 sp|Q9BW04|SARG_HUMAN sp|Q9BW04|SARG_HUMAN sp|Q9BW04|SARG_HUMAN Specifically androgen-regulated gene protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SARG PE=1 SV=2;sp|Q9BW04-2|SARG_HUMAN Isoform 2 of Specifically androgen-regulated gene protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SARG 0.939956 14.6336 0.00195917 68.895 34.419 68.895 0.939956 14.6336 0.00195917 68.895 0.695153 3.71299 0.0193501 51.22 1 Q HLSPAPGLAQPAAPAQASAAIPAAGKALAQA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX AQ(0.028)HLSPAPGLAQ(0.032)PAAPAQ(0.94)ASAAIPAAGK AQ(-15.31)HLSPAPGLAQ(-14.63)PAAPAQ(14.63)ASAAIPAAGK 18 3 -0.56162 1713000 1713000 0 0 0.038662 0 0 0 1016600 696360 0 0 0 0 0 0 0 0.15015 0.093468 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1016600 0 0 696360 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1220 1885 398 398 252 298 880;881 957;958 880 957 20190902_JH_EV_Ubi_2 8530 880 957 20190902_JH_EV_Ubi_2 8530 880 957 20190902_JH_EV_Ubi_2 8530 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN 196 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN Kinesin-like protein KIFC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIFC1 PE=1 SV=2 0.826085 7.08052 0.0319931 59.68 26.372 59.68 0.826085 7.08052 0.0319931 59.68 2 Q LGTERTTLEGHLAKVQAQAEQGQQELKNLRA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPX VQ(0.826)AQ(0.163)AEQ(0.026)GQ(0.491)Q(0.491)ELKN(0.002)LR VQ(7.08)AQ(-7.08)AEQ(-15.37)GQ(0)Q(0)ELKN(-24.83)LR 2 3 -0.2039 19955000 0 19955000 0 NaN 0 0 0 19955000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19955000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1221 1886 196 196 4982 5652 16000 16810 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN 203 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN Kinesin-like protein KIFC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIFC1 PE=1 SV=2 0.491472 0 0.0319931 59.68 26.372 59.68 0.491472 0 0.0319931 59.68 Q LEGHLAKVQAQAEQGQQELKNLRACVLELEE X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX VQ(0.826)AQ(0.163)AEQ(0.026)GQ(0.491)Q(0.491)ELKN(0.002)LR VQ(7.08)AQ(-7.08)AEQ(-15.37)GQ(0)Q(0)ELKN(-24.83)LR 9 3 -0.2039 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1222 1886 203 203 4982 5652 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN 204 sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN sp|Q9BW19|KIFC1_HUMAN Kinesin-like protein KIFC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KIFC1 PE=1 SV=2 0.4915 0 0.0319931 59.68 26.372 59.68 0.4915 0 0.0319931 59.68 Q EGHLAKVQAQAEQGQQELKNLRACVLELEER X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VQ(0.826)AQ(0.163)AEQ(0.026)GQ(0.491)Q(0.491)ELKN(0.002)LR VQ(7.08)AQ(-7.08)AEQ(-15.37)GQ(0)Q(0)ELKN(-24.83)LR 10 3 -0.2039 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1223 1886 204 204 4982 5652 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 16000 16810 20190902_JH_EV_Ubi_2 6424 sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN;sp|Q9BWT3|PAPOG_HUMAN 368;368 sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN sp|Q9BWT3-2|PAPOG_HUMAN Isoform 2 of Poly(A) polymerase gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPOLG;sp|Q9BWT3|PAPOG_HUMAN Poly(A) polymerase gamma OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PAPOLG PE=1 SV=2 1 74.4644 0.0210413 74.464 23.028 74.464 1 74.4644 0.0210413 74.464 2 Q GKSDWSKLLEPPNFFQKYRHYIVLTASASTE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX LLEPPN(1)FFQ(1)K LLEPPN(74.46)FFQ(74.46)K 9 3 -3.98 4989200 0 4989200 0 NaN 4989200 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 4989200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1224 1892 368 368 2686 3055 8731 9180 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 8731 9180 20190821_JH_EV_Ubi 6449 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN 169 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN Synaptonemal complex protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYCP2 PE=2 SV=2 0.500087 0 0.0234642 58.676 18.087 58.676 0.500087 0 0.0234642 58.676 Q RICSLVIDSRVNICIQQEIIKKMNAMLDKMP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX VN(1)ICIQ(0.5)Q(0.5)EIIKK VN(34.61)ICIQ(0)Q(0)EIIKK 6 3 1.5561 4115800 0 4115800 0 NaN 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1225 1893 169 169 4954 5624 15912 16720 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN 170 sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN sp|Q9BX26|SYCP2_HUMAN Synaptonemal complex protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYCP2 PE=2 SV=2 0.500087 0 0.0234642 58.676 18.087 58.676 0.500087 0 0.0234642 58.676 Q ICSLVIDSRVNICIQQEIIKKMNAMLDKMPQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX VN(1)ICIQ(0.5)Q(0.5)EIIKK VN(34.61)ICIQ(0)Q(0)EIIKK 7 3 1.5561 4115800 0 4115800 0 NaN 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4115800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1226 1893 170 170 4954 5624 15912 16720 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 15912 16720 20190902_JH_MUT_Ubi_2 5129 sp|Q9BX79-3|STRA6_HUMAN;sp|Q9BX79|STRA6_HUMAN;sp|Q9BX79-6|STRA6_HUMAN;sp|Q9BX79-5|STRA6_HUMAN;sp|Q9BX79-4|STRA6_HUMAN 607;616;631;653;655 sp|Q9BX79-3|STRA6_HUMAN sp|Q9BX79-3|STRA6_HUMAN sp|Q9BX79-3|STRA6_HUMAN Isoform 3 of Receptor for retinol uptake STRA6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRA6;sp|Q9BX79|STRA6_HUMAN Receptor for retinol uptake STRA6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STRA6 PE=1 SV=1;sp|Q9BX79-6|STRA6_HUMAN Isoform 6 of Receptor for ret 0.581774 1.45571 0.00806365 63.563 35.159 63.563 0.581774 1.45571 0.00806365 63.563 1 Q APQDSLRPGEEDEGMQLLQTKDSMAKGARPG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TMAAPQ(0.001)DSLRPGEEDEGMQ(0.582)LLQ(0.417)TKDSMAK TMAAPQ(-29.16)DSLRPGEEDEGMQ(1.46)LLQ(-1.46)TKDSMAK 19 4 -0.24168 22899000 22899000 0 0 0.1649 0 0 0 0 0 0 0 22899000 0 0 0 0 0 NaN 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22899000 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1227 1894 607 607 4518 5130 14415 15153 14415 15153 20190902_JH_WT_Ubi_2 8926 14415 15153 20190902_JH_WT_Ubi_2 8926 14415 15153 20190902_JH_WT_Ubi_2 8926 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN 283 sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN sp|Q9BXB4|OSB11_HUMAN Oxysterol-binding protein-related protein 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OSBPL11 PE=1 SV=2 0.511984 0.888691 0.0310626 44.5 13.991 44.5 0.511984 0.888691 0.0310626 44.5 2 Q LNDCFHILQLQHASHQKGSLPSGTTIEWLEP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX ATSMATMN(0.458)CLN(0.505)DCFHILQ(0.106)LQ(0.419)HASHQ(0.512)K ATSMATMN(0)CLN(0)DCFHILQ(-6.26)LQ(-0.89)HASHQ(0.89)K 25 3 -3.4752 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1228 1895 283 283 306 360 1037 1121 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 1037 1121 20190902_JH_MUT_Ubi_2 15406 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN 397;429 sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN sp|Q9BXM9-2|FSD1L_HUMAN Isoform 2 of FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L;sp|Q9BXM9|FSD1L_HUMAN FSD1-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FSD1L PE=1 SV=2 0.848444 7.54704 0.0333004 45.784 16.337 45.784 0.848444 7.54704 0.0333004 45.784 2 Q GKTNTSWCIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX TNTSWCIHVNN(0.002)WLQ(0.848)N(0.37)TFAAKHN(0.389)N(0.389)K TN(-33.59)TSWCIHVN(-33.59)N(-25.81)WLQ(7.55)N(-0.39)TFAAKHN(0)N(0)K 14 3 1.6918 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1229 1897 397 397 4534 5150 14464 15203 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 14464 15203 20190902_JH_WT_Ubi_2 11556 sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-2|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-5|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-4|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-3|S26A6_HUMAN 611;647;628;587;625;646 sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN;sp|Q9BXS9-5|S26A6_HUMAN sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN sp|Q9BXS9-7|S26A6_HUMAN Isoform 7 of Solute carrier family 26 member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A6;sp|Q9BXS9|S26A6_HUMAN Solute carrier family 26 member 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC26A6 PE=1 SV=1;sp|Q9BXS9-2|S26A6_HUMAN Isoform 2 of Solute carri 0.796187 5.91777 1.32874E-17 147.1 117.98 147.1 0.796187 5.91777 1.32874E-17 147.1 1 Q MVSSGDKMEDATANGQEDSKAPDGSTLKALG;QVSSGDKMEDATANGQEDSKAPDGSTLKALG Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX MEDATAN(0.204)GQ(0.796)EDSKAPDGSTLK MEDATAN(-5.92)GQ(5.92)EDSKAPDGSTLK 9 3 1.6351 715340 715340 0 0 NaN 0 715340 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 715340 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1230 1900;1901 611;587 611 2890 3282 9319 9811 9319 9811 20190821_JH_MUT_Ubi 3802 9319 9811 20190821_JH_MUT_Ubi 3802 9319 9811 20190821_JH_MUT_Ubi 3802 sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN;sp|Q9BXT8-5|RNF17_HUMAN;sp|Q9BXT8|RNF17_HUMAN 1154;1154;1154 sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN Isoform 4 of RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF17;sp|Q9BXT8-5|RNF17_HUMAN Isoform 5 of RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF17;sp|Q9BXT8|RNF17_HUMAN RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 G 1 55.0106 0.0308265 55.011 12.942 55.011 1 55.0106 0.0308265 55.011 2 Q TNFDPDKKTADIISEQKVSEFQEKILEPRTT X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX KTADIISEQ(1)KVSEFQ(1)EK KTADIISEQ(55.01)KVSEFQ(55.01)EK 9 3 -0.31531 1283200 0 1283200 0 NaN 0 1283200 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1283200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1231 1902 1154 1154 2461 2796 8038 8449 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN;sp|Q9BXT8-5|RNF17_HUMAN;sp|Q9BXT8|RNF17_HUMAN 1160;1160;1160 sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN sp|Q9BXT8-4|RNF17_HUMAN Isoform 4 of RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF17;sp|Q9BXT8-5|RNF17_HUMAN Isoform 5 of RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF17;sp|Q9BXT8|RNF17_HUMAN RING finger protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 G 1 55.0106 0.0308265 55.011 12.942 55.011 1 55.0106 0.0308265 55.011 2 Q KKTADIISEQKVSEFQEKILEPRTTRGYKPP X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX KTADIISEQ(1)KVSEFQ(1)EK KTADIISEQ(55.01)KVSEFQ(55.01)EK 15 3 -0.31531 1283200 0 1283200 0 NaN 0 1283200 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 1283200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1232 1902 1160 1160 2461 2796 8038 8449 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 8038 8449 20190821_JH_MUT_Ubi 9019 sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN;sp|Q9BY43-2|CHM4A_HUMAN 45;88 sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN Charged multivesicular body protein 4a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4A PE=1 SV=3;sp|Q9BY43-2|CHM4A_HUMAN Isoform 2 of Charged multivesicular body protein 4a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4A 0.872505 7.97304 0.0341916 63.694 14.158 63.694 0.872505 7.97304 0.0341916 63.694 Q EKILIKKQEFLEQKIQQELQTAKKYGTKNKR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXX IQ(0.873)Q(0.206)ELQ(0.922)TAKK IQ(7.97)Q(-7.97)ELQ(10.1)TAKK 2 3 3.6297 697520 0 697520 0 NaN 0 0 697520 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 697520 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1233 1904 45 45 2246 2556 7364 7743 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN;sp|Q9BY43-2|CHM4A_HUMAN 49;92 sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN sp|Q9BY43|CHM4A_HUMAN Charged multivesicular body protein 4a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4A PE=1 SV=3;sp|Q9BY43-2|CHM4A_HUMAN Isoform 2 of Charged multivesicular body protein 4a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4A 0.921981 10.0972 0.0341916 63.694 14.158 63.694 0.921981 10.0972 0.0341916 63.694 Q IKKQEFLEQKIQQELQTAKKYGTKNKRAALQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX IQ(0.873)Q(0.206)ELQ(0.922)TAKK IQ(7.97)Q(-7.97)ELQ(10.1)TAKK 6 3 3.6297 697520 0 697520 0 NaN 0 0 697520 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 697520 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1234 1904 49 49 2246 2556 7364 7743 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 7364 7743 20190821_JH_WT_Ubi 4065 sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN 142 sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN sp|Q9BY50|SC11C_HUMAN Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC11C PE=1 SV=3 1 62.5821 0.0287352 62.582 6.5687 62.582 1 62.5821 0.0287352 62.582 Q GDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGF X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXX EGQ(1)N(1)WLEKK EGQ(62.58)N(62.58)WLEKK 3 3 -2.632 301960 0 301960 0 NaN 0 0 0 0 0 0 301960 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 301960 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1235 1906 142 142 907 1025 2871 3023 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 2871 3023 20190902_JH_MUT_Ubi_3 2380 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN;sp|Q9BY67-3|CADM1_HUMAN 403;431;442;460 sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN sp|Q9BY67-5|CADM1_HUMAN Isoform 5 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1;sp|Q9BY67|CADM1_HUMAN Cell adhesion molecule 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CADM1 PE=1 SV=2;sp|Q9BY67-4|CADM1_HUMAN Isoform 4 of Cell adhesion molecule 1 OS=Homo s 0.594967 4.53496 1.97839E-09 101 62.625 101 0.303205 0 0.00560332 60.991 0.594967 4.53496 1.97839E-09 101 1 Q DAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GADDAADADTAIINAEGGQ(0.595)N(0.202)N(0.202)SEEKK GADDAADADTAIIN(-40.25)AEGGQ(4.53)N(-4.53)N(-4.53)SEEKK 19 3 1.8427 1321100 1321100 0 0 0.01863 0 0 0 0 0 0 1321100 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0.094428 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1321100 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1236 1907 403 403 1353 1537 4284 4505 4284 4505 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7168 4284 4505 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7168 4284 4505 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7168 sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-2|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA8-3|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA8-2|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA8-4|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA7-6|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-5|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-4|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-3|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA7-8|PC11X_HUMAN;sp|Q9BZA8|PC11Y_HUMAN;sp|Q9BZA7|PC11X_HUMAN 182;182;203;214;214;182;182;182;182;182;214;182 sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN sp|Q9BZA7-7|PC11X_HUMAN Isoform 7 of Protocadherin-11 X-linked OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDH11X;sp|Q9BZA7-2|PC11X_HUMAN Isoform 2 of Protocadherin-11 X-linked OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDH11X;sp|Q9BZA8-3|PC11Y_HUMAN Isoform 3 of Protocadherin-11 Y-link 1 46.1561 0.0314962 46.156 13.626 46.156 1 46.1561 0.0314962 46.156 2 Q DVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP SQ(1)N(1)IFGLDVIETPEGDK SQ(46.16)N(46.16)IFGLDVIETPEGDK 2 4 0.044171 2536700 0 2536700 0 NaN 0 2536700 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 2536700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1237 1910 182 182 4127 4690 13093 13730 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 13093 13730 20190821_JH_MUT_Ubi 3105 sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN 126 sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN sp|Q9GZU8|F192A_HUMAN Protein FAM192A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM192A PE=1 SV=1 1 95.7746 0.00813687 101.46 10.195 95.775 1 101.46 0.00813687 101.46 1 95.7746 0.0135575 95.775 2 Q ELKEYRNNLKKVGISQENKKEVEKKLTVKPI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX KVGISQ(1)EN(1)KK KVGISQ(95.77)EN(95.77)KK 6 3 -0.9863 44186000 0 44186000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 28181000 16005000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28181000 0 0 16005000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1238 1919 126 126 2477 2812 8063;8064 8476;8477 8064 8477 20190902_JH_WT_Ubi_3 8023 8063 8476 20190902_JH_WT_Ubi_2 8426 8063 8476 20190902_JH_WT_Ubi_2 8426 sp|Q9GZY0|NXF2_HUMAN 606 sp|Q9GZY0|NXF2_HUMAN sp|Q9GZY0|NXF2_HUMAN sp|Q9GZY0|NXF2_HUMAN Nuclear RNA export factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NXF2 PE=1 SV=1 0.932563 11.6588 0.0279909 45.88 11.876 45.88 0.932563 11.6588 0.0279909 45.88 1 Q QKCLQDNEWNYTRAGQAFTMLQTEGKIPAEA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP AGQ(0.933)AFTMLQ(0.064)TEGKIPAEAFKQ(0.004)IS AGQ(11.66)AFTMLQ(-11.66)TEGKIPAEAFKQ(-26.48)IS 3 3 -1.9201 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1239 1921 606 606 134 152 462 510 462 510 20190902_JH_WT_Ubi_3 7145 462 510 20190902_JH_WT_Ubi_3 7145 462 510 20190902_JH_WT_Ubi_3 7145 sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN 70 sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN Isoform 4 of Caseinolytic peptidase B protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPB 0.999953 43.2603 0.0259277 64.207 22.098 64.207 0.999953 43.2603 0.0259277 64.207 Q CSPVGSCPCQQYARSQQPQETAKNDAQSRSW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX SQ(1)Q(0.001)PQ(0.999)ETAK SQ(43.26)Q(-29.4)PQ(29.4)ETAK 2 2 -2.0262 8262100 0 8262100 0 NaN 0 0 0 0 0 8262100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8262100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1240 1925 70 70 4131 4695 13102 13739 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN 73 sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN sp|Q9H078-4|CLPB_HUMAN Isoform 4 of Caseinolytic peptidase B protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPB 0.998853 29.3995 0.0259277 64.207 22.098 64.207 0.998853 29.3995 0.0259277 64.207 Q VGSCPCQQYARSQQPQETAKNDAQSRSWAGL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX SQ(1)Q(0.001)PQ(0.999)ETAK SQ(43.26)Q(-29.4)PQ(29.4)ETAK 5 2 -2.0262 8262100 0 8262100 0 NaN 0 0 0 0 0 8262100 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8262100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1241 1925 73 73 4131 4695 13102 13739 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 13102 13739 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7638 sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN;sp|Q9H0E2|TOLIP_HUMAN 169;238 sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN sp|Q9H0E2-2|TOLIP_HUMAN Isoform 2 of Toll-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOLLIP;sp|Q9H0E2|TOLIP_HUMAN Toll-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOLLIP PE=1 SV=1 0.999991 49.2773 3.232E-06 96.561 61.387 66.702 0.999991 49.2773 0.00570478 66.702 0.999907 41.2936 3.232E-06 96.561 0.99807 27.3545 2.67628E-05 86.727 0.991919 21.8481 0.00231853 64.377 1;2 Q VNAQPRCSEEDLKAIQDMFPNMDQEVIRSVL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX CSEEDLKAIQ(1)DMFPN(0.726)MDQ(0.274)EVIR CSEEDLKAIQ(49.28)DMFPN(4.23)MDQ(-4.23)EVIR 10 3 0.66343 4878000 4878000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1754200 1665800 1458000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1754200 0 0 1665800 0 0 1458000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1242 1926 169 169 362 429;430 1201;1202;1203;1204 1288;1289;1290;1291 1201 1288 20190902_JH_MUT_Ubi_2 11807 1202 1289 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10826 1202 1289 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10826 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN;sp|Q9H0E3|SP130_HUMAN 501;971;936 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN Isoform 2 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN Isoform 3 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130;sp|Q9H0E3|SP130_HUMAN Histon 0.993889 22.0854 0.0173412 69.979 15.329 69.979 0.993889 22.0854 0.0173412 69.979 2 Q RVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLC X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX KAMLQ(0.012)EIAN(0.994)Q(0.994)K KAMLQ(-22.09)EIAN(22.09)Q(22.09)K 10 3 4.4163 2831700 0 2831700 0 0.16738 0 0 0 0 0 0 0 0 2831700 NaN NaN NaN NaN NaN 0 NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2831700 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1243 1927 501 501 2318 2637 7624 8021 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 7624 8021 20190902_JH_WT_Ubi_3 7846 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN 220;690 sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN sp|Q9H0E3-2|SP130_HUMAN Isoform 2 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130;sp|Q9H0E3-3|SP130_HUMAN Isoform 3 of Histone deacetylase complex subunit SAP130 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAP130 1 49.1205 0.028242 49.12 27.571 49.12 1 49.1205 0.028242 49.12 1 Q PATDGMAVRKTLIPPQPPDVASPRVESSMRS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX TLIPPQ(1)PPDVASPRVESSMR TLIPPQ(49.12)PPDVASPRVESSMR 6 2 -2.2305 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1244 1927 220 220 4475 5074 14206 14911 14206 14911 20190902_JH_WT_Ubi_2 13782 14206 14911 20190902_JH_WT_Ubi_2 13782 14206 14911 20190902_JH_WT_Ubi_2 13782 sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN 9 sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN sp|Q9H3D4-10|P63_HUMAN Isoform 10 of Tumor protein 63 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TP63 0.695819 5.43523 0.0273615 51.591 25.745 51.591 0.695819 5.43523 0.0273615 51.591 2 Q _______MLYLENNAQTQFSEYSTELKKLYC X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX LYLEN(0.819)N(0.26)AQ(0.696)TQ(0.225)FSEYSTELK LYLEN(6.86)N(-6.86)AQ(5.44)TQ(-5.44)FSEYSTELK 8 3 -1.5305 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1245 1943 9 9 2870 3253 9239 9724 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 9239 9724 20190902_JH_EV_Ubi_2 7880 sp|Q9H444|CHM4B_HUMAN 139 sp|Q9H444|CHM4B_HUMAN sp|Q9H444|CHM4B_HUMAN sp|Q9H444|CHM4B_HUMAN Charged multivesicular body protein 4b OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHMP4B PE=1 SV=1 0.886864 10.689 4.81659E-06 89.043 51.931 89.043 0.886864 10.689 4.81659E-06 89.043 1 Q DIDKVDELMQDIADQQELAEEISTAISKPVG X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX VDELMQ(0.076)DIADQ(0.037)Q(0.887)ELAEEISTAISK VDELMQ(-10.69)DIADQ(-13.74)Q(10.69)ELAEEISTAISK 12 3 1.3301 1331300 1331300 0 0 NaN 0 0 1331300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1331300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1246 1950 139 139 4736 5374 15187 15955 15187 15955 20190821_JH_WT_Ubi 15598 15187 15955 20190821_JH_WT_Ubi 15598 15187 15955 20190821_JH_WT_Ubi 15598 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-4|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-6|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-2|ANTR1_HUMAN 101;101;101;101;101;101 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN Isoform 5 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1 PE=1 SV=2;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN Isoform 3 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo 1 49.1058 0.0187186 49.106 18.895 49.106 1 49.1058 0.0187186 49.106 3 Q STRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(1)IRQ(1)GLEELQ(1)KVLPGGDTYMHEGFER EQ(49.11)IRQ(49.11)GLEELQ(49.11)KVLPGGDTYMHEGFER 2 3 -3.0366 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1247 1961 101 101 1075 1213 3432 3609 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-4|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-6|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-2|ANTR1_HUMAN 104;104;104;104;104;104 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN Isoform 5 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1 PE=1 SV=2;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN Isoform 3 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo 1 49.1058 0.0187186 49.106 18.895 49.106 1 49.1058 0.0187186 49.106 3 Q GTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(1)IRQ(1)GLEELQ(1)KVLPGGDTYMHEGFER EQ(49.11)IRQ(49.11)GLEELQ(49.11)KVLPGGDTYMHEGFER 5 3 -3.0366 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1248 1961 104 104 1075 1213 3432 3609 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-4|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-6|ANTR1_HUMAN;sp|Q9H6X2-2|ANTR1_HUMAN 110;110;110;110;110;110 sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN sp|Q9H6X2-5|ANTR1_HUMAN Isoform 5 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1;sp|Q9H6X2|ANTR1_HUMAN Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANTXR1 PE=1 SV=2;sp|Q9H6X2-3|ANTR1_HUMAN Isoform 3 of Anthrax toxin receptor 1 OS=Homo 1 49.1058 0.0187186 49.106 18.895 49.106 1 49.1058 0.0187186 49.106 3 Q LTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYMHEGFE X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EQ(1)IRQ(1)GLEELQ(1)KVLPGGDTYMHEGFER EQ(49.11)IRQ(49.11)GLEELQ(49.11)KVLPGGDTYMHEGFER 11 3 -3.0366 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1249 1961 110 110 1075 1213 3432 3609 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 3432 3609 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9486 sp|Q9H788-2|SH24A_HUMAN;sp|Q9H788|SH24A_HUMAN 168;213 sp|Q9H788-2|SH24A_HUMAN sp|Q9H788-2|SH24A_HUMAN sp|Q9H788-2|SH24A_HUMAN Isoform 2 of SH2 domain-containing protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D4A;sp|Q9H788|SH24A_HUMAN SH2 domain-containing protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SH2D4A PE=1 SV=1 0.935161 12.3496 0.00208031 97.823 29.649 97.823 0.935161 12.3496 0.00208031 97.823 1 Q QKKESMKKKQDEEINQIEEERTKQICKSWKE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX QDEEIN(0.054)Q(0.935)IEEERTKQ(0.01)ICK Q(-40.04)DEEIN(-12.35)Q(12.35)IEEERTKQ(-19.58)ICK 7 3 -3.983 5206100 5206100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5206100 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5206100 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1250 1963 168 168 3609 4118 11607 12184 11607 12184 20190902_JH_WT_Ubi_2 13005 11607 12184 20190902_JH_WT_Ubi_2 13005 11607 12184 20190902_JH_WT_Ubi_2 13005 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN 446 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN Pseudopodium-enriched atypical kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEAK1 PE=1 SV=4 1 42.7114 0.0256824 42.711 11.738 42.711 1 42.7114 0.0256824 42.711 3 Q QTEKEESKASTDVAGQAVTINLVPTEEQAKP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX ASTDVAGQ(1)AVTIN(1)LVPTEEQ(1)AK ASTDVAGQ(42.71)AVTIN(42.71)LVPTEEQ(42.71)AK 8 3 2.2498 4900300 0 0 4900300 NaN 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1251 1964 446 446 284 334 979 1062 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN 458 sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN sp|Q9H792|PEAK1_HUMAN Pseudopodium-enriched atypical kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEAK1 PE=1 SV=4 1 42.7114 0.0256824 42.711 11.738 42.711 1 42.7114 0.0256824 42.711 3 Q VAGQAVTINLVPTEEQAKPYRVVNLEQPLCK X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ASTDVAGQ(1)AVTIN(1)LVPTEEQ(1)AK ASTDVAGQ(42.71)AVTIN(42.71)LVPTEEQ(42.71)AK 20 3 2.2498 4900300 0 0 4900300 NaN 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4900300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1252 1964 458 458 284 334 979 1062 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 979 1062 20190902_JH_EV_Ubi_2 9482 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN 238 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIR PE=1 SV=3 0.96987 17.7591 8.6643E-20 124.85 92.821 124.85 0.496106 0 6.03568E-07 97.388 0.702032 4.79345 0.0100378 56.986 0.96987 17.7591 8.6643E-20 124.85 1 Q SNRRAQELVRMDSNIQGIENPGFEASPPAQG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP MDSN(0.016)IQ(0.97)GIEN(0.004)PGFEASPPAQ(0.01)GIPEAKVR MDSN(-17.76)IQ(17.76)GIEN(-24.14)PGFEASPPAQ(-19.81)GIPEAKVR 6 3 0.44106 8457700 8457700 0 0 0.042008 0 0 0 0 0 736330 0 2965700 0 0 0 0 0 0 0.031096 0 0.086438 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 736330 0 0 0 0 0 2965700 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1253 1967 238 238 2887 3278;3279 9311;9313;9314 9802;9803;9805;9806 9311 9802 20190902_JH_WT_Ubi_2 11533 9311 9802 20190902_JH_WT_Ubi_2 11533 9311 9802 20190902_JH_WT_Ubi_2 11533 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN 252 sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN sp|Q9H7M9|VISTA_HUMAN V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIR PE=1 SV=3 0.759553 7.54254 0.0126341 55.049 23.009 55.049 0.759553 7.54254 0.0126341 55.049 1 Q IQGIENPGFEASPPAQGIPEAKVRHPLSYVA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX MDSN(0.023)IQ(0.084)GIEN(0.134)PGFEASPPAQ(0.76)GIPEAKVR MDSN(-15.25)IQ(-9.56)GIEN(-7.54)PGFEASPPAQ(7.54)GIPEAKVR 20 3 3.0392 1002500 1002500 0 0 0.0049792 0 0 0 0 0 0 1002500 0 0 0 0 0 0 0 0 0.049355 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1002500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1254 1967 252 252 2887 3278;3279 9310 9801 9310 9801 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9795 9310 9801 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9795 9310 9801 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9795 sp|Q9H9B1-2|EHMT1_HUMAN 49 sp|Q9H9B1-2|EHMT1_HUMAN sp|Q9H9B1-2|EHMT1_HUMAN sp|Q9H9B1-2|EHMT1_HUMAN Isoform 2 of Histone-lysine N-methyltransferase EHMT1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EHMT1 0.831696 7.47677 0.0286335 45.879 14.282 45.879 0.831696 7.47677 0.0286335 45.879 1 Q MGLVKTAMPAVMQMLQSTLRTAQGSTPRMAP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX TAMPAVMQ(0.168)MLQ(0.832)STLR TAMPAVMQ(-7.48)MLQ(7.48)STLR 11 2 3.0917 645530 645530 0 0 NaN 0 645530 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 645530 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1255 1973 49 49 4259 4834 13477 14137 13477 14137 20190821_JH_MUT_Ubi 8381 13477 14137 20190821_JH_MUT_Ubi 8381 13477 14137 20190821_JH_MUT_Ubi 8381 sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN 642 sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN sp|Q9HAV4|XPO5_HUMAN Exportin-5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO5 PE=1 SV=1 0.999763 38.7176 0.0230401 55.291 13.67 55.291 0.999763 38.7176 0.0230401 55.291 1 Q YNHVKQLLSNELLLTQMEKCALMEALVLISN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX QLLSNELLLTQ(1)MEK Q(-39.9)LLSN(-38.72)ELLLTQ(38.72)MEK 11 3 1.2217 1095900 1095900 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 1095900 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1095900 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1256 1977 642 642 3660 4169 11709 12288 11709 12288 20190902_JH_WT_Ubi_3 14166 11709 12288 20190902_JH_WT_Ubi_3 14166 11709 12288 20190902_JH_WT_Ubi_3 14166 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN 165 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP29 PE=2 SV=1 0.935165 11.5736 0.0285376 41.491 18.495 41.491 0.935165 11.5736 0.0285376 41.491 5 Q MSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GILEN(0.069)Q(0.935)GGKGQ(0.999)N(0.999)TLSSDVQ(0.999)TN(0.999)EDILK GILEN(-11.57)Q(11.57)GGKGQ(30.07)N(30.07)TLSSDVQ(30.07)TN(29.86)EDILK 6 3 -1.9309 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1257 1981 165 165 1540 1754 4931 5187 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN 170 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP29 PE=2 SV=1 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 18.495 41.491 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 5 Q THVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTNEDILK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP GILEN(0.069)Q(0.935)GGKGQ(0.999)N(0.999)TLSSDVQ(0.999)TN(0.999)EDILK GILEN(-11.57)Q(11.57)GGKGQ(30.07)N(30.07)TLSSDVQ(30.07)TN(29.86)EDILK 11 3 -1.9309 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1258 1981 170 170 1540 1754 4931 5187 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN 178 sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN sp|Q9HBJ7|UBP29_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP29 PE=2 SV=1 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 18.495 41.491 0.999084 30.0746 0.0285376 41.491 5 Q ENQGGKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNK X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GILEN(0.069)Q(0.935)GGKGQ(0.999)N(0.999)TLSSDVQ(0.999)TN(0.999)EDILK GILEN(-11.57)Q(11.57)GGKGQ(30.07)N(30.07)TLSSDVQ(30.07)TN(29.86)EDILK 19 3 -1.9309 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1259 1981 178 178 1540 1754 4931 5187 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 4931 5187 20190902_JH_EV_Ubi_2 8923 sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN 251 sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN sp|Q9HCG8|CWC22_HUMAN Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CWC22 PE=1 SV=3 1 55.1117 0.0292676 55.112 9.9536 55.112 1 55.1117 0.0292676 55.112 Q RLILNFRKGYRRNDKQLCLTASKFVAHLINQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(1)DKQ(1)LCLTASK N(55.11)DKQ(55.11)LCLTASK 4 2 -2.1169 138950000 0 138950000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 138950000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 138950000 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1260 1988 251 251 3021 3452 9756 10277 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 9756 10277 20190902_JH_WT_Ubi_2 11186 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-13|SYTL2_HUMAN 77;171;219;219;220 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN Isoform 12 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN Isoform 11 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN Isoform 4 of Synaptotagmin-lik 1 52.5786 0.0274261 52.579 19.316 52.579 1 52.5786 0.0274261 52.579 Q STVADTSIQKLEKSKQTLPGLSNGSQIKAPI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXX Q(1)TLPGLSN(1)GSQ(1)IK Q(52.58)TLPGLSN(52.58)GSQ(52.58)IK 1 2 -2.5824 15781000 0 0 15781000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1261 1989 77 77 3705 4216 11780 12361 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5|SYTL2_HUMAN;sp|Q9HCH5-13|SYTL2_HUMAN 87;181;229;229;230 sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN sp|Q9HCH5-15|SYTL2_HUMAN Isoform 12 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-14|SYTL2_HUMAN Isoform 11 of Synaptotagmin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYTL2;sp|Q9HCH5-6|SYTL2_HUMAN Isoform 4 of Synaptotagmin-lik 1 52.5786 0.0274261 52.579 19.316 52.579 1 52.5786 0.0274261 52.579 Q LEKSKQTLPGLSNGSQIKAPIPKARKMIYKS X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(1)TLPGLSN(1)GSQ(1)IK Q(52.58)TLPGLSN(52.58)GSQ(52.58)IK 11 2 -2.5824 15781000 0 0 15781000 NaN 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15781000 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1262 1989 87 87 3705 4216 11780 12361 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 11780 12361 20190902_JH_WT_Ubi_2 8746 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN 1294 sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN sp|Q9HCK1|ZDBF2_HUMAN DBF4-type zinc finger-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZDBF2 PE=1 SV=3 1 47.3971 0.0303246 47.397 6.195 47.397 1 47.3971 0.0303246 47.397 3 Q KPTDSRINFDSHEPLQSVTNKIPGANKEINL X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX PTDSRIN(1)FDSHEPLQ(1)SVTN(1)K PTDSRIN(47.4)FDSHEPLQ(47.4)SVTN(47.4)K 15 3 -1.8384 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1263 1990 1294 1294 3529 4025 11346 11919 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 11346 11919 20190902_JH_MUT_Ubi_3 14120 sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN;sp|Q9HD67|MYO10_HUMAN 243;886 sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN sp|Q9HD67-3|MYO10_HUMAN Isoform Headless of Unconventional myosin-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO10;sp|Q9HD67|MYO10_HUMAN Unconventional myosin-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO10 PE=1 SV=3 0.999972 45.5665 0.03565 51.528 13.806 51.528 0.999972 45.5665 0.03565 51.528 2 Q EAELTRELEKQKENKQVEEILRLEKEIEDLQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX Q(0.003)KEN(0.997)KQ(1)VEEILR Q(-25.46)KEN(25.46)KQ(45.57)VEEILR 6 2 -2.7517 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1264 1995 243 243 3646 4155 11683 12261 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 11683 12261 20190902_JH_WT_Ubi_3 12663 sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN 180 sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN sp|Q9NNZ3|DNJC4_HUMAN DnaJ homolog subfamily C member 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJC4 PE=1 SV=1 1 52.3906 0.0322887 52.391 6.7376 52.391 1 52.3906 0.0322887 52.391 2 Q LAGMGLHYIAFRKVKQMHLNFMDEKDRIITA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXX VKQ(1)MHLN(1)FMDEKDR VKQ(52.39)MHLN(52.39)FMDEKDR 3 2 -1.7261 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1265 1997 180 180 4880 5540 15683 16482 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 15683 16482 20190902_JH_WT_Ubi_3 9137 sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN 248 sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN sp|Q9NP59|S40A1_HUMAN Solute carrier family 40 member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC40A1 PE=1 SV=1 1 64.3739 0.0316532 64.374 17.146 64.374 1 64.3739 0.0316532 64.374 2 Q LAVKAGLKEEETELKQLNLHKDTEPKPLEGT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXX Q(1)LN(1)LHKDTEPK Q(64.37)LN(64.37)LHKDTEPK 1 3 1.886 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1266 1998 248 248 3662 4171 11711 12290 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 11711 12290 20190902_JH_WT_Ubi_3 6797 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN 204;248 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN Isoform 2 of ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3 PE=1 SV=1 0.98938 18.8264 0.0303959 48.899 20.733 48.899 0.98938 18.8264 0.0303959 48.899 3 Q GAQKLANTCFNEIEKQAQAADKMKEQEDLAK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LAN(0.189)TCFN(0.822)EIEKQ(0.989)AQ(0.999)AADK LAN(-6.58)TCFN(6.58)EIEKQ(18.83)AQ(29.83)AADK 12 3 -2.8819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1267 1999 204 204 2506 2845 8133 8550 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN 206;250 sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN sp|Q9NP61-2|ARFG3_HUMAN Isoform 2 of ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3;sp|Q9NP61|ARFG3_HUMAN ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARFGAP3 PE=1 SV=1 0.999157 29.8272 0.0303959 48.899 20.733 48.899 0.999157 29.8272 0.0303959 48.899 3 Q QKLANTCFNEIEKQAQAADKMKEQEDLAKVV X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX LAN(0.189)TCFN(0.822)EIEKQ(0.989)AQ(0.999)AADK LAN(-6.58)TCFN(6.58)EIEKQ(18.83)AQ(29.83)AADK 14 3 -2.8819 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1268 1999 206 206 2506 2845 8133 8550 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 8133 8550 20190902_JH_EV_Ubi_3 12168 sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN;sp|Q9NQ76|MEPE_HUMAN;sp|Q9NQ76-2|MEPE_HUMAN 104;217;248 sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN sp|Q9NQ76-3|MEPE_HUMAN Isoform 3 of Matrix extracellular phosphoglycoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEPE;sp|Q9NQ76|MEPE_HUMAN Matrix extracellular phosphoglycoprotein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MEPE PE=1 SV=1;sp|Q9NQ76-2|MEPE_HUMAN Isoform 2 of Matrix 1 49.4658 0.0347121 49.466 9.6175 49.466 1 49.4658 0.0347121 49.466 2 Q QAQKSPVKSKSTHRIQHNIDYLKHLSKVKKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX SKSTHRIQ(1)HN(1)IDYLK SKSTHRIQ(49.47)HN(49.47)IDYLK 8 2 0.18225 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1269 2003 104 104 3992 4538 12654 13272 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 12654 13272 20190902_JH_WT_Ubi_3 14950 sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN;sp|Q9NR80-4|ARHG4_HUMAN;sp|Q9NR80|ARHG4_HUMAN 392;463;463 sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN sp|Q9NR80-3|ARHG4_HUMAN Isoform 3 of Rho guanine nucleotide exchange factor 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF4;sp|Q9NR80-4|ARHG4_HUMAN Isoform 4 of Rho guanine nucleotide exchange factor 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGEF4;sp|Q9NR80|ARHG4_HUMAN Rho guan 0.999916 40.7691 0.0261355 80.706 7.8583 80.706 0.999916 40.7691 0.0261355 80.706 2 Q FKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXX N(1)VAQ(1)LINERKR N(46.96)VAQ(40.77)LIN(-40.77)ERKR 4 3 -2.3479 3430300 0 3430300 0 NaN 0 0 0 0 0 0 3430300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3430300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1270 2012 392 392 3236 3696 10398 10942 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 10398 10942 20190902_JH_MUT_Ubi_3 5237 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN 107 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOMM22 PE=1 SV=3 0.975726 14.3628 0.0289193 53.237 11.207 53.237 0.975726 14.3628 0.0289193 53.237 3 Q FMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXX LQ(0.976)MEQ(0.508)Q(0.508)Q(0.508)Q(0.417)LQ(0.068)Q(0.014)R LQ(14.36)MEQ(0)Q(0)Q(0)Q(-0.99)LQ(-8.94)Q(-15.91)R 2 3 -0.54775 17439000 0 0 17439000 NaN 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1271 2023 107 107 2784 3160 8997 9467 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN 110 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOMM22 PE=1 SV=3 0.508078 0 0.0289193 53.237 11.207 53.237 0.508078 0 0.0289193 53.237 3 Q LVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX LQ(0.976)MEQ(0.508)Q(0.508)Q(0.508)Q(0.417)LQ(0.068)Q(0.014)R LQ(14.36)MEQ(0)Q(0)Q(0)Q(-0.99)LQ(-8.94)Q(-15.91)R 5 3 -0.54775 17439000 0 0 17439000 NaN 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1272 2023 110 110 2784 3160 8997 9467 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN 111 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOMM22 PE=1 SV=3 0.508078 0 0.0289193 53.237 11.207 53.237 0.508078 0 0.0289193 53.237 3 Q VLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX LQ(0.976)MEQ(0.508)Q(0.508)Q(0.508)Q(0.417)LQ(0.068)Q(0.014)R LQ(14.36)MEQ(0)Q(0)Q(0)Q(-0.99)LQ(-8.94)Q(-15.91)R 6 3 -0.54775 17439000 0 0 17439000 NaN 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1273 2023 111 111 2784 3160 8997 9467 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN 112 sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN sp|Q9NS69|TOM22_HUMAN Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOMM22 PE=1 SV=3 0.508078 0 0.0289193 53.237 11.207 53.237 0.508078 0 0.0289193 53.237 3 Q LPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTGL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX LQ(0.976)MEQ(0.508)Q(0.508)Q(0.508)Q(0.417)LQ(0.068)Q(0.014)R LQ(14.36)MEQ(0)Q(0)Q(0)Q(-0.99)LQ(-8.94)Q(-15.91)R 7 3 -0.54775 17439000 0 0 17439000 NaN 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 17439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1274 2023 112 112 2784 3160 8997 9467 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 8997 9467 20190821_JH_MUT_Ubi 2791 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN 683 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IARS2 PE=1 SV=2 0.333323 0 0.000172702 93.115 43.127 73.057 0.333323 0 0.00289577 73.057 0.331699 0 0.000172702 93.115 Q SLGNVIHPDVVVNGGQDQSKEPPYGADVLRW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SLGNVIHPDVVVN(0.333)GGQ(0.333)DQ(0.333)SK SLGN(-40.43)VIHPDVVVN(0)GGQ(0)DQ(0)SK 16 3 -1.1624 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1275 2027 683 683 4014 4560 12706 13328 20190902_JH_WT_Ubi_2 10010 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN 685 sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN sp|Q9NSE4|SYIM_HUMAN Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IARS2 PE=1 SV=2 0.333323 0 0.000172702 93.115 43.127 73.057 0.333323 0 0.00289577 73.057 0.331699 0 0.000172702 93.115 Q GNVIHPDVVVNGGQDQSKEPPYGADVLRWWV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SLGNVIHPDVVVN(0.333)GGQ(0.333)DQ(0.333)SK SLGN(-40.43)VIHPDVVVN(0)GGQ(0)DQ(0)SK 18 3 -1.1624 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1276 2027 685 685 4014 4560 12706 13328 20190902_JH_WT_Ubi_2 10010 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 12707 13329 20190902_JH_WT_Ubi_3 9543 sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN;sp|Q9NSI8|SAMN1_HUMAN 16;16 sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN sp|Q9NSI8-2|SAMN1_HUMAN Isoform 2 of SAM domain-containing protein SAMSN-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMSN1;sp|Q9NSI8|SAMN1_HUMAN SAM domain-containing protein SAMSN-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SAMSN1 PE=1 SV=1 1 44.8635 0.0339837 44.863 10.143 44.863 1 44.8635 0.0339837 44.863 Q MLKRKPSNVSEKEKHQKPKKGDIIDIICKTP X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX PSN(1)VSEKEKHQ(1)K PSN(44.86)VSEKEKHQ(44.86)K 11 2 -3.945 969570 0 969570 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 969570 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 969570 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1277 2028 16 16 3517 4012 11314 11886 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 11314 11886 20190902_JH_WT_Ubi_3 7482 sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN;sp|Q9NVI1-1|FANCI_HUMAN;sp|Q9NVI1|FANCI_HUMAN 1216;1217;1277 sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN sp|Q9NVI1-2|FANCI_HUMAN Isoform 2 of Fanconi anemia group I protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCI;sp|Q9NVI1-1|FANCI_HUMAN Isoform 1 of Fanconi anemia group I protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCI;sp|Q9NVI1|FANCI_HUMAN Fanconi anemia group I protein O 1 76.2278 0.0307317 76.228 20.967 76.228 1 76.2278 0.0307317 76.228 2 Q KFLIHLSKKSKVNLMQHMKLSTSRDFKIKGN X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;GlyGly (K);X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KSKVN(1)LMQ(1)HMK KSKVN(76.23)LMQ(76.23)HMK 8 3 1.8299 7166400 0 7166400 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 7166400 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7166400 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1278 2045 1216 1216 2457 2792 8031 8442 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 8031 8442 20190902_JH_WT_Ubi_2 8179 sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN;sp|Q9NWK9|BCD1_HUMAN 124;163 sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN sp|Q9NWK9-2|BCD1_HUMAN Isoform 2 of Box C/D snoRNA protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT6;sp|Q9NWK9|BCD1_HUMAN Box C/D snoRNA protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT6 PE=1 SV=1 0.999939 40.225 0.00141705 83.292 28.791 75.316 0.993125 21.6929 0.00141705 81.327 0.999458 33.2773 0.00474517 77.068 0.999939 40.225 0.00524755 83.292 1;2 Q DWSEVKEEKDNLEIKQEEKFVGQCIKEELMH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXX DN(1)LEIKQ(1)EEKFVGQCIK DN(50.85)LEIKQ(40.23)EEKFVGQ(-40.23)CIK 7 3 2.3911 145520000 133010000 12510000 0 NaN 118820000 0 0 2851900 0 0 19306000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 118820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2851900 0 0 0 0 0 0 0 9647500 9658500 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1279 2050 124 124 633 725;726 1988;1989;1990;1991;1992 2107;2108;2109;2110;2111 1992 2111 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10081 1990 2109 20190902_JH_MUT_Ubi_3 9653 1989 2108 20190821_JH_EV_Ubi 9728 sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN;sp|Q9NZ56|FMN2_HUMAN 195;1599 sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN sp|Q9NZ56-2|FMN2_HUMAN Isoform 2 of Formin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMN2;sp|Q9NZ56|FMN2_HUMAN Formin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMN2 PE=1 SV=4 0.830571 6.84548 0.0257011 46.353 8.5452 46.353 0.830571 6.84548 0.0257011 46.353 2 Q KKDLKACEVEAGKVYQVSSKEHMQPFKENME X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Oxidation (M);X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP VYQ(0.831)VSSKEHMQ(0.333)PFKEN(0.677)MEQ(0.147)FIIQ(0.013)AK VYQ(6.85)VSSKEHMQ(-5.73)PFKEN(5.73)MEQ(-6.85)FIIQ(-19.94)AK 3 3 2.5766 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1280 2069 195 195 5084 5778 16400 17234 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 16400 17234 20190821_JH_WT_Ubi 9480 sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN 3958 sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN sp|Q9NZR2|LRP1B_HUMAN Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LRP1B PE=1 SV=2 1 54.6078 0.0308071 54.608 20.521 54.608 1 54.6078 0.0308071 54.608 2 Q PGGIFYKRIHGREKRQANSGLICPEFKRPRD X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXX RQ(1)AN(1)SGLICPEFK RQ(54.61)AN(54.61)SGLICPEFK 2 2 -4.4454 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1281 2075 3958 3958 3796 4313 12022 12611 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 12022 12611 20190902_JH_MUT_Ubi_3 6023 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN 985 sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN sp|Q9NZV1|CRIM1_HUMAN Cysteine-rich motor neuron 1 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CRIM1 PE=1 SV=1 0.498845 0 0.0115135 78.228 35.178 78.228 0.333333 0 0.0115135 71.031 0.498845 0 0.0362854 78.228 Q LCWYRTPTKPSSLNNQLVSVDCKKGTRVQVD X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TPTKPSSLN(0.002)N(0.499)Q(0.499)LVSVDCK TPTKPSSLN(-23.27)N(0)Q(0)LVSVDCK 11 3 0.80381 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1282 2078 985 985 3524;4566 4020;5185 14561 15305 20190902_JH_EV_Ubi_3 6995 14561 15305 20190902_JH_EV_Ubi_3 6995 11338 11910 20190821_JH_MUT_Ubi 5527 sp|Q9P031|TAP26_HUMAN 195 sp|Q9P031|TAP26_HUMAN sp|Q9P031|TAP26_HUMAN sp|Q9P031|TAP26_HUMAN Thyroid transcription factor 1-associated protein 26 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC59 PE=1 SV=2 1 57.0474 0.0303743 57.047 9.9656 57.047 1 57.0474 0.0303743 57.047 Q QAKRAAKKQEFERRKQEREEAQRQYKKKKME X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXX KQ(1)EREEAQ(1)R KQ(57.05)EREEAQ(57.05)R 2 2 -0.37006 50595000 0 50595000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 50595000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50595000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1283 2080 195 195 2441 2776 7988 8399 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 sp|Q9P031|TAP26_HUMAN 201 sp|Q9P031|TAP26_HUMAN sp|Q9P031|TAP26_HUMAN sp|Q9P031|TAP26_HUMAN Thyroid transcription factor 1-associated protein 26 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CCDC59 PE=1 SV=2 1 57.0474 0.0303743 57.047 9.9656 57.047 1 57.0474 0.0303743 57.047 Q KKQEFERRKQEREEAQRQYKKKKMEVFKILN X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXXX KQ(1)EREEAQ(1)R KQ(57.05)EREEAQ(57.05)R 8 2 -0.37006 50595000 0 50595000 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 50595000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50595000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1284 2080 201 201 2441 2776 7988 8399 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 7988 8399 20190902_JH_WT_Ubi_3 6162 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN 233;256;256 sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN sp|Q9P0V9-3|SEP10_HUMAN Isoform 3 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10;sp|Q9P0V9|SEP10_HUMAN Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 PE=1 SV=2;sp|Q9P0V9-2|SEP10_HUMAN Isoform 2 of Septin-10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEPT10 0.812852 5.42926 0.000145454 70.391 27.193 70.391 0.812852 5.42926 0.000145454 70.391 3 Q TDDDTIAKVNAAMNGQLPFAVVGSMDEVKVG X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP VN(0.841)AAMN(0.347)GQ(0.813)LPFAVVGSMDEVKVGN(1)KMVK VN(6.14)AAMN(-5.43)GQ(5.43)LPFAVVGSMDEVKVGN(31.34)KMVK 8 3 -2.0691 8333600 0 0 8333600 NaN 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 8333600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1285 2085 233 233 4947 5617 15900 16708 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 15900 16708 20190821_JH_WT_Ubi 15791 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-3|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2|CACO1_HUMAN 189;222;222;222 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN Isoform 4 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCOCO1;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN Isoform 2 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN 1 41.4823 0.0312289 41.482 17.206 41.482 1 41.4823 0.0312289 41.482 3 Q RSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(1)Q(1)GDHVARILELEDDIQ(1)TISEKVLTK Q(41.48)Q(41.48)GDHVARILELEDDIQ(41.48)TISEKVLTK 1 3 -0.31879 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1286 2086 189 189 3686 4197 11757 12338 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-3|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2|CACO1_HUMAN 190;223;223;223 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN Isoform 4 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCOCO1;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN Isoform 2 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN 1 41.4823 0.0312289 41.482 17.206 41.482 1 41.4823 0.0312289 41.482 3 Q SHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDIQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ) XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(1)Q(1)GDHVARILELEDDIQ(1)TISEKVLTK Q(41.48)Q(41.48)GDHVARILELEDDIQ(41.48)TISEKVLTK 2 3 -0.31879 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1287 2086 190 190 3686 4197 11757 12338 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2-3|CACO1_HUMAN;sp|Q9P1Z2|CACO1_HUMAN 205;238;238;238 sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN sp|Q9P1Z2-4|CACO1_HUMAN Isoform 4 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALCOCO1;sp|Q9P1Z2-2|CACO1_HUMAN Isoform 2 of Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN 1 41.4823 0.0312289 41.482 17.206 41.482 1 41.4823 0.0312289 41.482 3 Q QGDHVARILELEDDIQTISEKVLTKEVELDR Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX Q(1)Q(1)GDHVARILELEDDIQ(1)TISEKVLTK Q(41.48)Q(41.48)GDHVARILELEDDIQ(41.48)TISEKVLTK 17 3 -0.31879 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1288 2086 205 205 3686 4197 11757 12338 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 11757 12338 20190821_JH_MUT_Ubi 13218 sp|Q9P2D7-3|DYH1_HUMAN;sp|Q9P2D7-5|DYH1_HUMAN;sp|Q9P2D7-2|DYH1_HUMAN;sp|Q9P2D7-4|DYH1_HUMAN;sp|Q9P2D7|DYH1_HUMAN 94;94;94;94;94 sp|Q9P2D7-3|DYH1_HUMAN sp|Q9P2D7-3|DYH1_HUMAN sp|Q9P2D7-3|DYH1_HUMAN Isoform 3 of Dynein heavy chain 1, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH1;sp|Q9P2D7-5|DYH1_HUMAN Isoform 5 of Dynein heavy chain 1, axonemal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAH1;sp|Q9P2D7-2|DYH1_HUMAN Isoform 2 of Dynein heavy chain 1 0.999986 48.5834 0.032563 63.488 20.772 63.488 0.999986 48.5834 0.032563 63.488 1 Q KSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(1)RGFYSDILSPGTLDQLGEVCR Q(48.58)RGFYSDILSPGTLDQ(-48.58)LGEVCR 1 3 3.3826 3564200 3564200 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 3564200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3564200 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1289 2090 94 94 3695 4206 11767 12348 11767 12348 20190902_JH_WT_Ubi_2 12516 11767 12348 20190902_JH_WT_Ubi_2 12516 11767 12348 20190902_JH_WT_Ubi_2 12516 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN 341;771;774 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN Isoform 2 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN Isoform 1 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapie 0.509862 0 0.0279874 92.051 10.755 92.051 0.509862 0 0.0279874 92.051 2 Q QARMQASYREHVKEVQQLQGKIRTLQEQLEN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXX EVQ(0.51)Q(0.51)LQ(0.98)GKIR EVQ(0)Q(0)LQ(13.95)GKIR 3 3 1.5358 3013900 0 3013900 0 NaN 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1290 2092 341 341 1143 1290 3655 3849 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN 342;772;775 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN Isoform 2 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN Isoform 1 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapie 0.509862 0 0.0279874 92.051 10.755 92.051 0.509862 0 0.0279874 92.051 2 Q ARMQASYREHVKEVQQLQGKIRTLQEQLENG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX EVQ(0.51)Q(0.51)LQ(0.98)GKIR EVQ(0)Q(0)LQ(13.95)GKIR 4 3 1.5358 3013900 0 3013900 0 NaN 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1291 2092 342 342 1143 1290 3655 3849 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN 344;774;777 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN Isoform 2 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN Isoform 1 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapie 0.980277 13.9535 0.0279874 92.051 10.755 92.051 0.980277 13.9535 0.0279874 92.051 2 Q MQASYREHVKEVQQLQGKIRTLQEQLENGPN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX EVQ(0.51)Q(0.51)LQ(0.98)GKIR EVQ(0)Q(0)LQ(13.95)GKIR 6 3 1.5358 3013900 0 3013900 0 NaN 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 3013900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1292 2092 344 344 1143 1290 3655 3849 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 3655 3849 20190821_JH_MUT_Ubi 3555 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN 852;1282;1285 sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN sp|Q9P2E9-3|RRBP1_HUMAN Isoform 2 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9-2|RRBP1_HUMAN Isoform 1 of Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1;sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapie 0.861254 7.92912 0.000378736 75.297 37.924 75.297 0.861254 7.92912 0.000378736 75.297 1 Q IAGAPASSPEAPPAEQDPVQLKTQLEWTEAI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX SHVEDGDIAGAPASSPEAPPAEQ(0.861)DPVQ(0.139)LK SHVEDGDIAGAPASSPEAPPAEQ(7.93)DPVQ(-7.93)LK 23 3 4.3004 3068000 3068000 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3068000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3068000 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1293 2092 852 852 3958 4502 12554 13168 12554 13168 20190902_JH_WT_Ubi_3 9604 12554 13168 20190902_JH_WT_Ubi_3 9604 12554 13168 20190902_JH_WT_Ubi_3 9604 sp|Q9P2F5-2|STOX2_HUMAN;sp|Q9P2F5|STOX2_HUMAN 169;169 sp|Q9P2F5-2|STOX2_HUMAN sp|Q9P2F5-2|STOX2_HUMAN sp|Q9P2F5-2|STOX2_HUMAN Isoform 2 of Storkhead-box protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STOX2;sp|Q9P2F5|STOX2_HUMAN Storkhead-box protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STOX2 PE=2 SV=2 0.967846 14.7857 0.0325497 55.261 19.609 55.261 0.967846 14.7857 0.0325497 55.261 1 Q NSKWYHLDERIPDRSQCTSPQPGTITPSASG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPP SQ(0.968)CTSPQ(0.032)PGTITPSASGCVR SQ(14.79)CTSPQ(-14.79)PGTITPSASGCVR 2 2 -1.0371 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1294 2093 169 169 4114 4669 13002 13633 13002 13633 20190821_JH_WT_Ubi 10442 13002 13633 20190821_JH_WT_Ubi 10442 13002 13633 20190821_JH_WT_Ubi 10442 sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN 679 sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN StAR-related lipid transfer protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STARD9 PE=1 SV=3 0.98255 14.9821 0.034602 47.915 7.4183 47.915 0.98255 14.9821 0.034602 47.915 Q ILAEEIRAAKELEFDQAWISQQIKENQQCLL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX ELEFDQ(0.983)AWISQ(0.45)Q(0.567)IK ELEFDQ(14.98)AWISQ(-1.04)Q(1.04)IK 6 3 1.3929 1755200 0 1755200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1755200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1755200 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1295 2096 679 679 983 1111 3150 3309 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN 685 sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN sp|Q9P2P6|STAR9_HUMAN StAR-related lipid transfer protein 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STARD9 PE=1 SV=3 0.567002 1.03524 0.034602 47.915 7.4183 47.915 0.567002 1.03524 0.034602 47.915 Q RAAKELEFDQAWISQQIKENQQCLLREETWL X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX ELEFDQ(0.983)AWISQ(0.45)Q(0.567)IK ELEFDQ(14.98)AWISQ(-1.04)Q(1.04)IK 12 3 1.3929 1755200 0 1755200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 1755200 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1755200 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1296 2096 685 685 983 1111 3150 3309 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 3150 3309 20190902_JH_MUT_Ubi_3 7905 sp|Q9UBC2-2|EP15R_HUMAN;sp|Q9UBC2|EP15R_HUMAN 815;815 sp|Q9UBC2-2|EP15R_HUMAN sp|Q9UBC2-2|EP15R_HUMAN sp|Q9UBC2-2|EP15R_HUMAN Isoform 2 of Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS15L1;sp|Q9UBC2|EP15R_HUMAN Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPS15L1 PE=1 SV=1 0.925585 10.9491 0.000564687 60.101 34.826 60.101 0.925585 10.9491 0.000564687 60.101 1 Q SQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPX STPVSQLGSADFPEAPDPFQ(0.926)PLGADSGDPFQ(0.074)SKK STPVSQ(-45.55)LGSADFPEAPDPFQ(10.95)PLGADSGDPFQ(-10.95)SKK 20 3 -1.3047 534330 534330 0 0 0.014124 0 0 0 0 0 534330 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0.11038 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 534330 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1297 2101 815 815 4195 4765 13295 13948 13295 13948 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14070 13295 13948 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14070 13295 13948 20190902_JH_MUT_Ubi_2 14070 sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN;sp|Q9UBK9-2|UXT_HUMAN 146;158 sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN sp|Q9UBK9|UXT_HUMAN Protein UXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UXT PE=1 SV=1;sp|Q9UBK9-2|UXT_HUMAN Isoform 1 of Protein UXT OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UXT 0.978423 16.4393 0.0204704 69.65 10.386 69.65 0.978423 16.4393 0.0204704 69.65 Q IKAHIHMLLEGLRELQGLQNFPEKPHH____ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXX ELQ(0.978)GLQ(0.05)N(0.972)FPEK ELQ(16.44)GLQ(-15.31)N(15.31)FPEK 3 3 -1.5695 614870 0 614870 0 NaN 0 614870 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 614870 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1298 2103 146 146 1016 1145 3233 3399 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 3233 3399 20190821_JH_MUT_Ubi 5061 sp|Q9UGI8-2|TES_HUMAN;sp|Q9UGI8|TES_HUMAN 39;48 sp|Q9UGI8-2|TES_HUMAN sp|Q9UGI8-2|TES_HUMAN sp|Q9UGI8-2|TES_HUMAN Isoform 2 of Testin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TES;sp|Q9UGI8|TES_HUMAN Testin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TES PE=1 SV=1 1 65.2557 0.00907404 76.574 47.762 76.574 1 65.2557 0.00907404 76.574 1 Q ELHFWRKICRNCKCGQEEHDVLLSNEEDRKV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPX CGQ(1)EEHDVLLSNEEDRK CGQ(65.26)EEHDVLLSN(-65.26)EEDRK 3 3 0.57881 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1299 2115 39 39 347 410 1171 1258 1171 1258 20190902_JH_WT_Ubi_3 6685 1171 1258 20190902_JH_WT_Ubi_3 6685 1171 1258 20190902_JH_WT_Ubi_3 6685 sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-3|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-2|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-4|LAT2_HUMAN 514;290;311;409 sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN Large neutral amino acids transporter small subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A8 PE=1 SV=1;sp|Q9UHI5-3|LAT2_HUMAN Isoform 3 of Large neutral amino acids transporter small subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A8;sp|Q9UHI5-2|L 0.484405 0 4.86051E-21 145.14 132.82 145.14 0.484405 0 4.86051E-21 145.14 Q ERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X XXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX GSGTEEANEDMEEQ(0.484)Q(0.484)Q(0.031)PMYQPTPTKDK GSGTEEAN(-35.3)EDMEEQ(0)Q(0)Q(-11.97)PMYQ(-50.18)PTPTKDK 14 3 0.43634 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1300 2129 514 514 1691 1928 5393 5678 20190902_JH_EV_Ubi_2 5332 5393 5678 20190902_JH_EV_Ubi_2 5332 5393 5678 20190902_JH_EV_Ubi_2 5332 sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-3|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-2|LAT2_HUMAN;sp|Q9UHI5-4|LAT2_HUMAN 515;291;312;410 sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN sp|Q9UHI5|LAT2_HUMAN Large neutral amino acids transporter small subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A8 PE=1 SV=1;sp|Q9UHI5-3|LAT2_HUMAN Isoform 3 of Large neutral amino acids transporter small subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A8;sp|Q9UHI5-2|L 0.809532 7.76363 4.86051E-21 145.14 132.82 75.956 0.484405 0 4.86051E-21 145.14 0.809532 7.76363 9.26378E-05 75.956 1 Q RGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDVA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X XPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX GSGTEEAN(0.005)EDMEEQ(0.047)Q(0.81)Q(0.135)PMYQ(0.003)PTPTKDK GSGTEEAN(-21.69)EDMEEQ(-12.4)Q(7.76)Q(-7.76)PMYQ(-24.48)PTPTKDK 15 3 -0.3988 1292800 1292800 0 0 0.088743 0 0 0 0 1292800 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0.29935 NaN 0 NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1292800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1301 2129 515 515 1691 1928 5394 5679 5394 5679 20190902_JH_EV_Ubi_3 5348 5393 5678 20190902_JH_EV_Ubi_2 5332 5393 5678 20190902_JH_EV_Ubi_2 5332 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN 337;337 sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN sp|Q9UI47-2|CTNA3_HUMAN Isoform 2 of Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3;sp|Q9UI47|CTNA3_HUMAN Catenin alpha-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CTNNA3 PE=1 SV=2 0.962001 13.9277 0.0121253 57.973 13.582 57.973 0.962001 13.9277 0.0121253 57.973 2 Q DLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGK X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.962)ALQ(0.098)DLLSEYMN(0.47)N(0.47)AGKKER Q(13.93)ALQ(-8.63)DLLSEYMN(0)N(0)AGKKER 1 4 -1.2117 5156200 0 5156200 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 5156200 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5156200 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1302 2140 337 337 3600 4109 11593 12170 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 11593 12170 20190902_JH_WT_Ubi_2 10105 sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN 369 sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN sp|Q9UII4|HERC5_HUMAN E3 ISG15--protein ligase HERC5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HERC5 PE=1 SV=2 0.5 0 0.029473 51.875 20.485 51.875 0.5 0 0.029473 51.875 1 Q SHTSEKELIMIAGGNQSILLWIKKENSYVNL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ELIMIAGGN(0.5)Q(0.5)SILLWIKK ELIMIAGGN(0)Q(0)SILLWIKK 10 2 -1.3052 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1303 2142 369 369 1001 1130 3198 3361 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 3198 3361 20190902_JH_WT_Ubi_3 15285 sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41-4|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41-3|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41|RABX5_HUMAN 73;87;113;251 sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN Isoform 2 of Rab5 GDP/GTP exchange factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RABGEF1;sp|Q9UJ41-4|RABX5_HUMAN Isoform 4 of Rab5 GDP/GTP exchange factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RABGEF1;sp|Q9UJ41-3|RABX5_HUMAN Isoform 3 of Rab5 GDP/GTP exch 0.98017 16.1377 0.00684395 64.069 38.862 64.069 0.98017 16.1377 0.00684395 64.069 2 Q AERLQREEEEAFASSQSSQGAQSLTFSKFEE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP EEEEAFASSQ(0.98)SSQ(0.767)GAQ(0.253)SLTFSKFEEK EEEEAFASSQ(16.14)SSQ(5.1)GAQ(-5.1)SLTFSKFEEK 10 3 4.4059 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1304 2144 73 73 840 947;948 2634 2772 2634 2772 20190902_JH_EV_Ubi_3 9386 2634 2772 20190902_JH_EV_Ubi_3 9386 2634 2772 20190902_JH_EV_Ubi_3 9386 sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41-4|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41-3|RABX5_HUMAN;sp|Q9UJ41|RABX5_HUMAN 76;90;116;254 sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN sp|Q9UJ41-2|RABX5_HUMAN Isoform 2 of Rab5 GDP/GTP exchange factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RABGEF1;sp|Q9UJ41-4|RABX5_HUMAN Isoform 4 of Rab5 GDP/GTP exchange factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RABGEF1;sp|Q9UJ41-3|RABX5_HUMAN Isoform 3 of Rab5 GDP/GTP exch 0.766702 5.10459 2.45631E-06 96.341 71.61 64.069 0.766702 5.10459 0.00684395 64.069 0.646038 4.77659 2.45631E-06 96.341 1;2 Q LQREEEEAFASSQSSQGAQSLTFSKFEEKKT X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X XXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX EEEEAFASSQ(0.98)SSQ(0.767)GAQ(0.253)SLTFSKFEEK EEEEAFASSQ(16.14)SSQ(5.1)GAQ(-5.1)SLTFSKFEEK 13 3 4.4059 2662800 2662800 0 0 0.020409 0 0 0 0 0 2662800 0 0 0 0 0 0 0 0 0.16563 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2662800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1305 2144 76 76 840 947;948 2634;2635 2772;2773 2634 2772 20190902_JH_EV_Ubi_3 9386 2635 2773 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10362 2635 2773 20190902_JH_MUT_Ubi_2 10362 sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN 62 sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN sp|Q9UKY0|PRND_HUMAN Prion-like protein doppel OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRND PE=1 SV=2 1 43.6045 0.033118 43.604 12.807 43.604 1 43.6045 0.033118 43.604 Q TEAQVAENRPGAFIKQGRKLDIDFGAEGNRY X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPX Q(1)GRKLDIDFGAEGN(1)R Q(43.6)GRKLDIDFGAEGN(43.6)R 1 2 -2.1768 997020 0 997020 0 NaN 0 0 0 0 997020 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 997020 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1306 2156 62 62 3632 4141 11656 12233 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 11656 12233 20190902_JH_EV_Ubi_3 7765 sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN;sp|Q9ULI0|ATD2B_HUMAN 520;520 sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN sp|Q9ULI0-2|ATD2B_HUMAN Isoform 2 of ATPase family AAA domain-containing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2B;sp|Q9ULI0|ATD2B_HUMAN ATPase family AAA domain-containing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2B PE=1 SV=3 0.634542 2.36979 0.0176271 54.058 8.7008 54.058 0.634542 2.36979 0.0176271 54.058 2 Q DEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP Q(0.369)DQ(0.635)IHSSIVSTLLALMDGLDN(0.996)R Q(-2.37)DQ(2.37)IHSSIVSTLLALMDGLDN(22.14)R 3 3 2.1077 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1307 2164 520 520 3612 4121 11610 12187 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 11610 12187 20190902_JH_WT_Ubi_3 10600 sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-6|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-3|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-2|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1|ODF2L_HUMAN;sp|Q9ULJ1-4|ODF2L_HUMAN 89;220;220;220;220;220 sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN sp|Q9ULJ1-5|ODF2L_HUMAN Isoform 5 of Outer dense fiber protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ODF2L;sp|Q9ULJ1-6|ODF2L_HUMAN Isoform 6 of Outer dense fiber protein 2-like OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ODF2L;sp|Q9ULJ1-3|ODF2L_HUMAN Isoform 3 of Outer dense f 0.5 0 0.0312328 55.806 6.8082 55.806 0.5 0 0.0312328 55.806 1 Q EYVKSLETKIAKWNLQSRMNKNEAIVMKEAS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX SLETKIAKWN(0.5)LQ(0.5)SR SLETKIAKWN(0)LQ(0)SR 12 2 2.1801 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1308 2166 89 89 4008 4554 12694 13314 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 12694 13314 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9744 sp|Q9ULT0|TTC7A_HUMAN;sp|Q9ULT0-4|TTC7A_HUMAN 510;510 sp|Q9ULT0|TTC7A_HUMAN sp|Q9ULT0|TTC7A_HUMAN sp|Q9ULT0|TTC7A_HUMAN Tetratricopeptide repeat protein 7A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC7A PE=1 SV=3;sp|Q9ULT0-4|TTC7A_HUMAN Isoform 3 of Tetratricopeptide repeat protein 7A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC7A 0.885346 8.87722 0.0233234 55.721 19.136 55.721 0.885346 8.87722 0.0233234 55.721 1 Q LTYSLQATDATLKSKQDELHRKALQTLERAQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXX Q(0.885)DELHRKALQ(0.115)TLER Q(8.88)DELHRKALQ(-8.88)TLER 1 2 0.13053 573570 573570 0 0 NaN 0 0 0 0 0 573570 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 573570 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1309 2168 510 510 3610 4119 11608 12185 11608 12185 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9536 11608 12185 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9536 11608 12185 20190902_JH_MUT_Ubi_2 9536 sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN 395 sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN Unconventional myosin-Vb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO5B PE=1 SV=3 0.498478 0 0.0342386 51.059 9.6327 51.059 0.498478 0 0.0342386 51.059 Q KLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX TMSLQ(0.498)Q(0.498)VIN(0.003)AR TMSLQ(0)Q(0)VIN(-22.14)AR 5 2 -2.9891 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1310 2169 395 395 4522 5136 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN 396 sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN sp|Q9ULV0|MYO5B_HUMAN Unconventional myosin-Vb OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO5B PE=1 SV=3 0.498478 0 0.0342386 51.059 9.6327 51.059 0.498478 0 0.0342386 51.059 Q LVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX TMSLQ(0.498)Q(0.498)VIN(0.003)AR TMSLQ(0)Q(0)VIN(-22.14)AR 6 2 -2.9891 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1311 2169 396 396 4522 5136 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 14422 15161 20190821_JH_WT_Ubi 6551 sp|Q9UM01|YLAT1_HUMAN 30 sp|Q9UM01|YLAT1_HUMAN sp|Q9UM01|YLAT1_HUMAN sp|Q9UM01|YLAT1_HUMAN Y+L amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC7A7 PE=1 SV=2 0.999681 35.5342 2.70347E-12 108.3 84.111 108.3 0.999452 32.7305 2.42835E-06 82.339 0.705373 3.79146 0.00415496 62.052 0.999681 35.5342 2.70347E-12 108.3 1 Q VETSPLGDGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX VDSTEYEVASQPEVETSPLGDGASPGPEQ(1)VKLK VDSTEYEVASQ(-35.53)PEVETSPLGDGASPGPEQ(35.53)VKLK 29 3 1.8984 2449300 2449300 0 0 0.013094 0 0 0 0 1043600 0 1405700 0 0 0 0 0 0 0.048812 0 0.036586 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1043600 0 0 0 0 0 1405700 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1312 2171 30 30 4758 5400;5401 15261;15262;15263 16032;16033;16034 15262 16033 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10108 15262 16033 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10108 15262 16033 20190902_JH_MUT_Ubi_3 10108 sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN 276 sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN sp|Q9UMS4|PRP19_HUMAN Pre-mRNA-processing factor 19 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF19 PE=1 SV=1 1 81.1435 0.0012449 81.144 36.566 81.144 1 81.1435 0.0012449 81.144 1 Q KGHTKKVTSVVFHPSQDLVFSASPDATIRIW X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX VTSVVFHPSQ(1)DLVFSASPDATIR VTSVVFHPSQ(81.14)DLVFSASPDATIR 10 3 3.0564 2984500 2984500 0 0 0.10484 0 2984500 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 2984500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1313 2174 276 276 5038 5722 16259 17090 16259 17090 20190821_JH_MUT_Ubi 10764 16259 17090 20190821_JH_MUT_Ubi 10764 16259 17090 20190821_JH_MUT_Ubi 10764 sp|Q9UNX4|WDR3_HUMAN 62 sp|Q9UNX4|WDR3_HUMAN sp|Q9UNX4|WDR3_HUMAN sp|Q9UNX4|WDR3_HUMAN WD repeat-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR3 PE=1 SV=1 1 91.7011 0.0112493 107.11 69.52 91.701 1 98.7542 0.0216315 98.754 1 107.114 0.0112493 107.11 1 91.7011 0.0351891 91.701 1 Q VFIWDLRKGEKILILQGLKQEVTCLCPSPDG X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX KGEKILILQ(1)GLK KGEKILILQ(91.7)GLK 9 3 -0.57415 17442000 17442000 0 0 NaN 0 4196600 10224000 0 0 0 0 3021500 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 4196600 0 0 10224000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3021500 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1314 2180 62 62 2351 2676 7745;7746;7747 8146;8147;8148 7747 8148 20190902_JH_WT_Ubi_2 16348 7746 8147 20190821_JH_WT_Ubi 15726 7746 8147 20190821_JH_WT_Ubi 15726 sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN;sp|Q9UPN4-2|CP131_HUMAN;sp|Q9UPN4|CP131_HUMAN 978;1014;1017 sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN Isoform 3 of Centrosomal protein of 131 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP131;sp|Q9UPN4-2|CP131_HUMAN Isoform 2 of Centrosomal protein of 131 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP131;sp|Q9UPN4|CP131_HUMAN Centrosomal protein of 131 kDa 1 91.4691 0.0164824 92.611 33.346 91.469 1 83.0814 0.0282504 83.081 1 92.611 0.0164824 92.611 1 91.4691 0.0175643 91.469 2 Q QEFEDRLAASEEETRQAKAELATLQARQQLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXX Q(1)AKAELATLQ(1)AR Q(91.47)AKAELATLQ(91.47)AR 1 3 0.037744 161460000 0 161460000 0 NaN 0 23368000 0 0 68699000 0 0 0 69394000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 23368000 0 0 0 0 0 0 0 0 68699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69394000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1315 2185 978 978 3599 4108 11590;11591;11592 12167;12168;12169 11592 12169 20190902_JH_WT_Ubi_3 6170 11590 12167 20190902_JH_EV_Ubi_3 5048 11590 12167 20190902_JH_EV_Ubi_3 5048 sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN;sp|Q9UPN4-2|CP131_HUMAN;sp|Q9UPN4|CP131_HUMAN 987;1023;1026 sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN sp|Q9UPN4-3|CP131_HUMAN Isoform 3 of Centrosomal protein of 131 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP131;sp|Q9UPN4-2|CP131_HUMAN Isoform 2 of Centrosomal protein of 131 kDa OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CEP131;sp|Q9UPN4|CP131_HUMAN Centrosomal protein of 131 kDa 1 91.4691 0.0164824 92.611 33.346 91.469 1 83.0814 0.0282504 83.081 1 92.611 0.0164824 92.611 1 91.4691 0.0175643 91.469 2 Q SEEETRQAKAELATLQARQQLELEEVHRRVK X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(1)AKAELATLQ(1)AR Q(91.47)AKAELATLQ(91.47)AR 10 3 0.037744 161460000 0 161460000 0 NaN 0 23368000 0 0 68699000 0 0 0 69394000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 23368000 0 0 0 0 0 0 0 0 68699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69394000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1316 2185 987 987 3599 4108 11590;11591;11592 12167;12168;12169 11592 12169 20190902_JH_WT_Ubi_3 6170 11590 12167 20190902_JH_EV_Ubi_3 5048 11590 12167 20190902_JH_EV_Ubi_3 5048 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN 397;397 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN Isoform Beta of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33 PE=1 SV=3 0.847564 6.39798 0.00113544 80.545 13.293 80.545 0.847564 6.39798 0.00113544 80.545 4 Q QQLENVTKERQMKLLQQQNDITGLSRQVKHV X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXX Q(0.452)MKLLQ(0.848)Q(0.848)Q(0.649)N(0.205)DITGLSRQ(0.999)VK Q(-1.03)MKLLQ(6.4)Q(6.4)Q(1.03)N(-7.38)DITGLSRQ(32.6)VK 6 3 0.42657 9671300 0 0 9671300 NaN 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1317 2186 397 397 3672 4181 11729 12308 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN 398;398 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN Isoform Beta of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33 PE=1 SV=3 0.847569 6.39798 0.00113544 80.545 13.293 80.545 0.847569 6.39798 0.00113544 80.545 4 Q QLENVTKERQMKLLQQQNDITGLSRQVKHVM X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXX Q(0.452)MKLLQ(0.848)Q(0.848)Q(0.649)N(0.205)DITGLSRQ(0.999)VK Q(-1.03)MKLLQ(6.4)Q(6.4)Q(1.03)N(-7.38)DITGLSRQ(32.6)VK 7 3 0.42657 9671300 0 0 9671300 NaN 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1318 2186 398 398 3672 4181 11729 12308 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN 399;399 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN Isoform Beta of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33 PE=1 SV=3 0.649497 1.03101 0.00113544 80.545 13.293 80.545 0.649497 1.03101 0.00113544 80.545 4 Q LENVTKERQMKLLQQQNDITGLSRQVKHVMN X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X XXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXX Q(0.452)MKLLQ(0.848)Q(0.848)Q(0.649)N(0.205)DITGLSRQ(0.999)VK Q(-1.03)MKLLQ(6.4)Q(6.4)Q(1.03)N(-7.38)DITGLSRQ(32.6)VK 8 3 0.42657 9671300 0 0 9671300 NaN 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1319 2186 399 399 3672 4181 11729 12308 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN 408;408 sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN sp|Q9UPN9-2|TRI33_HUMAN Isoform Beta of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33;sp|Q9UPN9|TRI33_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM33 PE=1 SV=3 0.999194 32.6025 0.00113544 80.545 13.293 80.545 0.999194 32.6025 0.00113544 80.545 4 Q MKLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASG X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX Q(0.452)MKLLQ(0.848)Q(0.848)Q(0.649)N(0.205)DITGLSRQ(0.999)VK Q(-1.03)MKLLQ(6.4)Q(6.4)Q(1.03)N(-7.38)DITGLSRQ(32.6)VK 17 3 0.42657 9671300 0 0 9671300 NaN 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 9671300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1320 2186 408 408 3672 4181 11729 12308 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 11729 12308 20190821_JH_MUT_Ubi 8943 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN 171;171;223 sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN sp|Q9UPW5-2|CBPC1_HUMAN Isoform 2 of Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1;sp|Q9UPW5|CBPC1_HUMAN Cytosolic carboxypeptidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AGTPBP1 PE=1 SV=3;sp|Q9UPW5-3|CBPC1_HUMAN Isoform 3 of Cytosolic carboxypepti 0.656215 0 0.0119933 64.52 8.9314 64.52 0.656215 0 0.0119933 64.52 3 Q NGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVY X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX INGALN(0.853)ITLN(0.128)LVKQ(0.05)N(0.656)LQ(0.656)N(0.656)HR IN(-35.65)GALN(8.31)ITLN(-8.31)LVKQ(-15.06)N(0)LQ(0)N(0)HR 17 3 -1.3411 12325000 0 0 12325000 NaN 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 12325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1321 2189 171 171 2217 2526 7304 7682 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 7304 7682 20190821_JH_WT_Ubi 15364 sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN;sp|Q9UPX8|SHAN2_HUMAN;sp|Q9UPX8-3|SHAN2_HUMAN 636;852;1231 sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN Isoform 4 of SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHANK2;sp|Q9UPX8|SHAN2_HUMAN SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHANK2 PE=1 SV=3;sp|Q9UPX8-3|SHAN2_H 1 41.0145 0.0355823 41.014 9.1873 41.014 1 41.0145 0.0355823 41.014 Q LALALSARDRAMKESQQGPKGEAPKADLNKP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXX AMKESQ(1)Q(1)GPKGEAPK AMKESQ(41.01)Q(41.01)GPKGEAPK 6 3 1.1531 2145300 0 2145300 0 NaN 0 0 2145300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2145300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1322 2190 636 636 230 265 775 845 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN;sp|Q9UPX8|SHAN2_HUMAN;sp|Q9UPX8-3|SHAN2_HUMAN 637;853;1232 sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN sp|Q9UPX8-4|SHAN2_HUMAN Isoform 4 of SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHANK2;sp|Q9UPX8|SHAN2_HUMAN SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SHANK2 PE=1 SV=3;sp|Q9UPX8-3|SHAN2_H 1 41.0145 0.0355823 41.014 9.1873 41.014 1 41.0145 0.0355823 41.014 Q ALALSARDRAMKESQQGPKGEAPKADLNKPL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXX AMKESQ(1)Q(1)GPKGEAPK AMKESQ(41.01)Q(41.01)GPKGEAPK 7 3 1.1531 2145300 0 2145300 0 NaN 0 0 2145300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2145300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1323 2190 637 637 230 265 775 845 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 775 845 20190821_JH_WT_Ubi 6573 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN 210 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN Protein FAM50B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM50B PE=1 SV=1 1 90.1488 0.00771336 90.827 16.942 90.149 1 80.2397 0.0159475 80.24 1 90.827 0.00771336 90.827 1 90.1488 0.00834511 90.149 1 72.434 0.0200016 72.434 1 83.8686 0.00949829 83.869 3 Q SGHRRTVRVRKGNTVQQFLKKALQGLRKDFL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX KGN(1)TVQ(1)Q(1)FLKK KGN(90.15)TVQ(90.15)Q(90.15)FLKK 6 3 -0.34831 9179300 0 0 9179300 NaN 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1324 2199 210 210 2356 2682 7757;7758;7759;7760;7761 8158;8159;8160;8161;8162 7761 8162 20190821_JH_WT_Ubi 5774 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN 211 sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN sp|Q9Y247|FA50B_HUMAN Protein FAM50B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM50B PE=1 SV=1 1 90.1488 0.00771336 90.827 16.942 90.149 1 80.2397 0.0159475 80.24 1 90.827 0.00771336 90.827 1 90.1488 0.00834511 90.149 1 72.434 0.0200016 72.434 1 83.8686 0.00949829 83.869 3 Q GHRRTVRVRKGNTVQQFLKKALQGLRKDFLE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX KGN(1)TVQ(1)Q(1)FLKK KGN(90.15)TVQ(90.15)Q(90.15)FLKK 7 3 -0.34831 9179300 0 0 9179300 NaN 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9179300 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1325 2199 211 211 2356 2682 7757;7758;7759;7760;7761 8158;8159;8160;8161;8162 7761 8162 20190821_JH_WT_Ubi 5774 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 7759 8160 20190821_JH_MUT_Ubi 5315 sp|Q9Y279-2|VSIG4_HUMAN;sp|Q9Y279|VSIG4_HUMAN 157;157 sp|Q9Y279-2|VSIG4_HUMAN sp|Q9Y279-2|VSIG4_HUMAN sp|Q9Y279-2|VSIG4_HUMAN Isoform 2 of V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIG4;sp|Q9Y279|VSIG4_HUMAN V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VSIG4 PE=1 SV=1 1 49.3261 0.0166289 49.326 13.353 49.326 1 49.3261 0.0166289 49.326 1 Q KPTVTTGSGYGFTVPQGMRISLQCQARGSPP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX LSVSKPTVTTGSGYGFTVPQ(1)GMR LSVSKPTVTTGSGYGFTVPQ(49.33)GMR 20 3 -4.3593 783250 783250 0 0 NaN 0 0 0 0 783250 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 783250 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1326 2203 157 157 2819 3195 9066 9538 9066 9538 20190902_JH_EV_Ubi_3 7852 9066 9538 20190902_JH_EV_Ubi_3 7852 9066 9538 20190902_JH_EV_Ubi_3 7852 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-4|AMOL2_HUMAN 64;64;64;122 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN Isoform 3 of Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2 PE=1 SV=3;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN Isoform 2 of Angiomotin-like protein 2 OS=H 0.402542 1.29544 0.000943267 67.728 37.143 67.728 0.402542 1.29544 0.000943267 67.728 Q GSPQASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEH X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXX GGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQ(0.403)VLQ(0.299)Q(0.299)ATR GGAGTGGTGSPQ(-44.42)ASLEILAPEDSQ(1.3)VLQ(-1.3)Q(-1.3)ATR 24 3 0.10225 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1327 2207 64 64 1476 1681 4705 4945 20190902_JH_EV_Ubi_3 11763 4705 4945 20190902_JH_EV_Ubi_3 11763 4705 4945 20190902_JH_EV_Ubi_3 11763 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-4|AMOL2_HUMAN 67;67;67;125 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN Isoform 3 of Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2 PE=1 SV=3;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN Isoform 2 of Angiomotin-like protein 2 OS=H 0.478501 0 0.00089239 68.211 33.491 68.211 0.478501 0 0.00089239 68.211 Q QASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX GGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQ(0.043)VLQ(0.479)Q(0.479)ATR GGAGTGGTGSPQ(-44.48)ASLEILAPEDSQ(-10.47)VLQ(0)Q(0)ATR 27 3 0.62743 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1328 2207 67 67 1476 1681 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN;sp|Q9Y2J4-4|AMOL2_HUMAN 68;68;68;126 sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN sp|Q9Y2J4-3|AMOL2_HUMAN Isoform 3 of Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2;sp|Q9Y2J4|AMOL2_HUMAN Angiomotin-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL2 PE=1 SV=3;sp|Q9Y2J4-2|AMOL2_HUMAN Isoform 2 of Angiomotin-like protein 2 OS=H 0.478501 0 0.00089239 68.211 33.491 68.211 0.478501 0 0.00089239 68.211 Q ASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX GGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQ(0.043)VLQ(0.479)Q(0.479)ATR GGAGTGGTGSPQ(-44.48)ASLEILAPEDSQ(-10.47)VLQ(0)Q(0)ATR 28 3 0.62743 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1329 2207 68 68 1476 1681 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 4704 4944 20190902_JH_EV_Ubi_2 11735 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN 226 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN Myosin-15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH15 PE=1 SV=5 0.965258 17.0732 0.0284965 40.369 8.3932 40.369 0.965258 17.0732 0.0284965 40.369 3 Q QYFATIAAMIESRKKQGALEDQIMQANTILE X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPP KKQ(0.965)GALEDQ(0.957)IMQ(0.059)AN(0.047)TILEAFGN(0.971)AK KKQ(17.07)GALEDQ(17.07)IMQ(-17.07)AN(-17.37)TILEAFGN(17.37)AK 3 3 3.1853 1687900 0 0 1687900 NaN 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1330 2208 226 226 2374 2700 7793 8195 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN 232 sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN sp|Q9Y2K3|MYH15_HUMAN Myosin-15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYH15 PE=1 SV=5 0.956765 17.0732 0.0284965 40.369 8.3932 40.369 0.956765 17.0732 0.0284965 40.369 3 Q AAMIESRKKQGALEDQIMQANTILEAFGNAK X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;GlyGly (K) XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP KKQ(0.965)GALEDQ(0.957)IMQ(0.059)AN(0.047)TILEAFGN(0.971)AK KKQ(17.07)GALEDQ(17.07)IMQ(-17.07)AN(-17.37)TILEAFGN(17.37)AK 9 3 3.1853 1687900 0 0 1687900 NaN 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 1687900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1331 2208 232 232 2374 2700 7793 8195 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 7793 8195 20190821_JH_MUT_Ubi 9323 sp|Q9Y5A6|ZSC21_HUMAN 343 sp|Q9Y5A6|ZSC21_HUMAN sp|Q9Y5A6|ZSC21_HUMAN sp|Q9Y5A6|ZSC21_HUMAN Zinc finger and SCAN domain-containing protein 21 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZSCAN21 PE=1 SV=2 1 74.3925 0.0191105 74.392 17.979 74.392 1 74.3925 0.0191105 74.392 Q LVDRPYDCKCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEA X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;GlyGly (K);X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXX CGKAFGQ(1)SSDLLK CGKAFGQ(74.39)SSDLLK 7 3 0.7567 3757500 3757500 0 0 NaN 0 0 0 0 0 3757500 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3757500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1332 2238 343 343 346 409 1170 1257 1170 1257 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7858 1170 1257 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7858 1170 1257 20190902_JH_MUT_Ubi_2 7858 sp|Q9Y5B9|SP16H_HUMAN 673 sp|Q9Y5B9|SP16H_HUMAN sp|Q9Y5B9|SP16H_HUMAN sp|Q9Y5B9|SP16H_HUMAN FACT complex subunit SPT16 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUPT16H PE=1 SV=1 0.999826 37.6004 0.0339152 66.663 11.623 66.663 0.999826 37.6004 0.0339152 66.663 Q SNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXXX DLYIRPNIAQ(1)KR DLYIRPN(-37.6)IAQ(37.6)KR 10 3 -0.53331 3079100 3079100 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 3079100 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3079100 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1333 2239 673 673 610 700 1929 2047 1929 2047 20190902_JH_WT_Ubi_3 14491 1929 2047 20190902_JH_WT_Ubi_3 14491 1929 2047 20190902_JH_WT_Ubi_3 14491 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN 115 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN Protocadherin beta-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDHB12 PE=2 SV=1 0.999 32.841 0.0348828 45.395 6.3099 45.395 0.999 32.841 0.0348828 45.395 3 Q EPCVLYFQVLMKNPTQFLQIELQVRDINDHS X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.999)PTQ(0.999)FLQ(0.668)IELQ(0.14)VRDIN(0.194)DHSPVFLEK N(32.84)PTQ(32.84)FLQ(5.38)IELQ(-6.81)VRDIN(-5.38)DHSPVFLEK 4 3 -1.1674 1007500 0 0 1007500 NaN 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1334 2240 115 115 3194 3650 10284 10824 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN 118 sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN sp|Q9Y5F1|PCDBC_HUMAN Protocadherin beta-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCDHB12 PE=2 SV=1 0.667673 5.38368 0.0348828 45.395 6.3099 45.395 0.667673 5.38368 0.0348828 45.395 3 Q VLYFQVLMKNPTQFLQIELQVRDINDHSPVF X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP N(0.999)PTQ(0.999)FLQ(0.668)IELQ(0.14)VRDIN(0.194)DHSPVFLEK N(32.84)PTQ(32.84)FLQ(5.38)IELQ(-6.81)VRDIN(-5.38)DHSPVFLEK 7 3 -1.1674 1007500 0 0 1007500 NaN 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1007500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1335 2240 118 118 3194 3650 10284 10824 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 10284 10824 20190902_JH_EV_Ubi_3 11629 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN 192;230 sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN sp|Q9Y5K1-2|SPO11_HUMAN Isoform 2 of Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11;sp|Q9Y5K1|SPO11_HUMAN Meiotic recombination protein SPO11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPO11 PE=2 SV=1 1 52.509 0.0240522 52.509 26.032 52.509 1 52.509 0.0240522 52.509 3 Q TDAKFVLIVEKDATFQRLLDDNFCNKLSPCI X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;Deamidation (NQ);GlyGly (K);X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP DATFQ(1)RLLDDN(1)FCN(1)KLSPCIMITGK DATFQ(52.51)RLLDDN(52.51)FCN(52.51)KLSPCIMITGK 5 3 1.4 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1336 2241 192 192 393 462 1284 1371 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 1284 1371 20190821_JH_MUT_Ubi 13537 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN 379 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN Sorting nexin-8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNX8 PE=1 SV=1 0.506622 0 0.0173334 59.116 13.759 59.116 0.506622 0 0.0173334 59.116 Q REPESVEQLESRIVEQENAIQTMELRNYFSL X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXX IVEQ(0.507)EN(0.507)AIQ(0.987)TMELR IVEQ(0)EN(0)AIQ(15.71)TMELR 4 3 -1.2583 1187200 0 1187200 0 NaN 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1337 2247 379 379 2290 2607 7529 7918 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN 384 sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN sp|Q9Y5X2|SNX8_HUMAN Sorting nexin-8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNX8 PE=1 SV=1 0.986756 15.7117 0.0173334 59.116 13.759 59.116 0.986756 15.7117 0.0173334 59.116 Q VEQLESRIVEQENAIQTMELRNYFSLYCLHQ X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPXXXXXXXXXX IVEQ(0.507)EN(0.507)AIQ(0.987)TMELR IVEQ(0)EN(0)AIQ(15.71)TMELR 9 3 -1.2583 1187200 0 1187200 0 NaN 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 1187200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1338 2247 384 384 2290 2607 7529 7918 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 7529 7918 20190821_JH_WT_Ubi 9578 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN 996 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN FH1/FH2 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHOD1 PE=1 SV=3 0.995972 21.0884 0.0234964 80.438 28.183 80.438 0.995972 21.0884 0.0234964 80.438 Q REFALEYRTCRERVLQQQQKQATYRERNKTR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXX ERVLQ(0.996)Q(0.499)Q(0.499)Q(0.006)K ERVLQ(21.09)Q(0)Q(0)Q(-19.53)K 5 2 -0.069998 2122800 0 2122800 0 NaN 0 0 2122800 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 2122800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1339 2250 996 996 1092 1230 3464 3641 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN 997 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN FH1/FH2 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHOD1 PE=1 SV=3 0.499167 0 0.0234964 80.438 28.183 80.438 0.499167 0 0.0234964 80.438 Q EFALEYRTCRERVLQQQQKQATYRERNKTRG X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);Deamidation (NQ);X;X;GlyGly (K);X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXPPPPPPPPPXXXXXXXXXXXX ERVLQ(0.996)Q(0.499)Q(0.499)Q(0.006)K ERVLQ(21.09)Q(0)Q(0)Q(-19.53)K 6 2 -0.069998 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1340 2250 997 997 1092 1230 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN 998 sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN sp|Q9Y613|FHOD1_HUMAN FH1/FH2 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FHOD1 PE=1 SV=3 0.499167 0 0.0234964 80.438 28.183 80.438 0.499167 0 0.0234964 80.438 Q FALEYRTCRERVLQQQQKQATYRERNKTRGR X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ERVLQ(0.996)Q(0.499)Q(0.499)Q(0.006)K ERVLQ(21.09)Q(0)Q(0)Q(-19.53)K 7 2 -0.069998 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1341 2250 998 998 1092 1230 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 3464 3641 20190821_JH_WT_Ubi 10443 sp|Q9Y6N5|SQOR_HUMAN 285 sp|Q9Y6N5|SQOR_HUMAN sp|Q9Y6N5|SQOR_HUMAN sp|Q9Y6N5|SQOR_HUMAN Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SQOR PE=1 SV=1 1 42.8628 0.032949 42.863 16.928 42.863 1 42.8628 0.032949 42.863 1 Q KQEAVFENLDKPGETQVISYEMLHVTPPMSP X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;X;Deamidation (NQ);X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X;X;X;X;X;Oxidation (M);X;X XXXXXXXXXXXPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP PGETQ(1)VISYEMLHVTPPMSPPDVLK PGETQ(42.86)VISYEMLHVTPPMSPPDVLK 5 3 -0.65468 0 0 0 0 NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1342 2263 285 285 3346 3820 10713 11273 10713 11273 20190902_JH_WT_Ubi_2 12676 10713 11273 20190902_JH_WT_Ubi_2 12676 10713 11273 20190902_JH_WT_Ubi_2 12676