Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides C3A_1 Peptides C3A_2 Peptides C3A_3 Peptides SK_1 Peptides SK_2 Peptides SK_3 Peptides SK_4 Razor + unique peptides C3A_1 Razor + unique peptides C3A_2 Razor + unique peptides C3A_3 Razor + unique peptides SK_1 Razor + unique peptides SK_2 Razor + unique peptides SK_3 Razor + unique peptides SK_4 Unique peptides C3A_1 Unique peptides C3A_2 Unique peptides C3A_3 Unique peptides SK_1 Unique peptides SK_2 Unique peptides SK_3 Unique peptides SK_4 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type C3A_1 Identification type C3A_2 Identification type C3A_3 Identification type SK_1 Identification type SK_2 Identification type SK_3 Identification type 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domain-containing protein 1 SMCHD1 sp|A6NHR9|SMHD1_HUMAN Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMCHD1 PE=1 SV=2 1 61 61 61 26 27 39 8 6 13 26 26 27 39 8 6 13 26 26 27 39 8 6 13 26 34.8 34.8 34.8 226.37 2005 2005 0 251.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0807 1.4036 29.545 179 35 Leave out requantified 0.98289 1.5164 1.3846 0.75723 0.72453 0.60412 0.6244 1.5532 1.6925 1.5227 0.99828 0.91892 0.85136 0.8909 23.599 23.107 19.633 18.736 8.0906 37.562 17.19 33 31 57 7 5 16 30 8 3 11 0 2 1 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.5 17.3 24.1 5.3 4.4 7.8 15.8 10914000000 5123800000 5790100000 1520700000 757800000 762880000 2419600000 866610000 1553000000 3076600000 1188100000 1888500000 288200000 163150000 125040000 50936000 30833000 20103000 959420000 592860000 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Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HACD1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 11.8 11.8 11.8 32.387 288 288 0.0014495 2.1857 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.33864 0.35834 51.312 5 1 Median NaN NaN 0.31406 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.34052 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 7.2138 NaN NaN NaN NaN 0 1 2 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 5.2 5.2 0 0 4.2 2.4 1293500000 941450000 352050000 0 0 0 324850000 244810000 80043000 847990000 618510000 229480000 0 0 0 0 0 0 38275000 26013000 12262000 82378000 52113000 30265000 10 129350000 94145000 35205000 0 0 0 32485000 24481000 8004300 84799000 61851000 22948000 0 0 0 0 0 0 3827500 2601300 1226200 8237800 5211300 3026500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MGRLTEAAAAGSGSR;TGMFSIR;VLHGEVIVEKDD 47 58665;82398;90733 True;True;True 60030;84420;92958 402090;402091;402092;548887;611043 597832;814512;814513;908628 597832;814513;908628 5 1 -1 B1AK53 B1AK53 10 10 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Q9C075;CON__Q9C075;CON__Q99PS0 Q9C075;CON__Q9C075 31;31;4 31;31;4 29;29;3 Keratin, type I cytoskeletal 23 KRT23 sp|Q9C075|K1C23_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 23 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT23 PE=1 SV=2; 3 31 31 29 18 18 21 0 0 0 0 18 18 21 0 0 0 0 16 18 21 0 0 0 0 77 77 77 48.131 422 422;422;422 0 277.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.38926 0.45945 27.828 115 40 Leave out requantified 0.36571 0.38205 0.3888 NaN NaN NaN NaN 0.57945 0.43119 0.42816 NaN NaN NaN NaN 30.661 14.378 10.08 NaN NaN NaN NaN 38 28 49 0 0 0 0 13 7 20 0 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Median 47.6 63.5 63.7 0 0 0 0 11047000000 7786600000 3260800000 3074100000 2165600000 908530000 3102100000 2200000000 902040000 4871200000 3420900000 1450200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 120940000 85297000 35639000 64373000 45138000 19235000 18807000 13135000 5672100 37757000 27025000 10732000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 277720000 160920000 270040000 138840000 363500000 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Median Median Leave out requantified 0 2.4 0 1.7 0 0 4.6 427020000 256240000 170790000 0 0 0 129270000 68944000 60325000 0 0 0 41373000 24517000 16856000 0 0 0 0 0 0 256380000 162780000 93604000 50 4288100 2517200 1770900 0 0 0 2585400 1378900 1206500 0 0 0 827450 490330 337120 0 0 0 0 0 0 1702700 1138300 564390 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ALADILSESLHSLATSLPR;LAGSLVTQAPISAR;NQLLPLAHQAWPSLVHR;RWNSDDLNASPK 374 4254;45591;63588;73077 True;True;True;True 4354;46586;65246;74872 29528;29529;311557;311558;435748;489520 43886;43887;464397;464398;464399;647780;726171 43887;464398;647780;726171 -1 O43159 O43159 12 12 12 Ribosomal RNA-processing protein 8 RRP8 sp|O43159|RRP8_HUMAN Ribosomal RNA-processing protein 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP8 PE=1 SV=2 1 12 12 12 5 4 4 2 3 6 7 5 4 4 2 3 6 7 5 4 4 2 3 6 7 32.5 32.5 32.5 50.714 456 456 0 87.729 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66938 0.91991 11.079 44 8 Leave out requantified 0.59359 0.73968 0.97797 0.67895 0.6665 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carnitine/acylcarnitine carrier protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A20 PE=1 SV=1 1 14 14 14 9 6 6 1 1 4 4 9 6 6 1 1 4 4 9 6 6 1 1 4 4 45.2 45.2 45.2 32.943 301 301 0 45.035 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.49628 0.57651 36.605 48 12 Leave out requantified 0.27865 0.47977 0.43552 NaN NaN 0.90566 0.96631 0.44153 0.53751 0.47576 NaN NaN 1.2573 1.347 24.955 19.947 14.082 NaN NaN 71.585 51.105 18 7 9 1 1 6 6 8 1 1 1 0 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Leave out requantified Leave out requantified 28.9 28.9 26.2 3.7 3.7 13.6 12.3 4789200000 3064400000 1724800000 2475700000 1691200000 784560000 531330000 360840000 170490000 947030000 645890000 301140000 75542000 43931000 31611000 34377000 18517000 15860000 236160000 119570000 116590000 489090000 184530000 304560000 17 182320000 109760000 72564000 100500000 65933000 34565000 15660000 10650000 5010500 21005000 14261000 6744400 4443600 2584200 1859500 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iron-sulfur domain-containing protein 3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CISD3 PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 0 2 0 0 0 2 1 0 2 0 0 0 2 1 0 2 0 0 0 2 30.7 30.7 30.7 14.215 127 127 0 6.2957 By matching By MS/MS By MS/MS 1.355 1.4658 24.879 9 2 Leave out requantified NaN NaN 1.4384 NaN NaN NaN 0.70683 NaN NaN 1.5328 NaN NaN NaN 1.0821 NaN NaN 20.515 NaN NaN NaN 38.207 1 0 6 0 0 0 2 0 0 2 0 0 0 0 Median Median Leave out requantified Median Median Median Median 10.2 0 16.5 0 0 0 14.2 645410000 274130000 371280000 62836000 7805400 55030000 0 0 0 347150000 135700000 211450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 235430000 130620000 104800000 8 16105000 5892500 10212000 7854500 975680 6878800 0 0 0 16105000 5892500 10212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29428000 16328000 13100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AEVGSPL;KQPFCDGSHFFQR;MVALCTCK;TPIKVELVAGK 1150 2285;44343;60403;84544 True;True;True;True 2330;45315;61957;86629 14818;302127;302128;302129;302130;302131;414357;414358;564939;564940 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GTP-binding protein Mx1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MX1 PE=1 SV=4 2 12 12 12 0 0 1 2 2 2 9 0 0 1 2 2 2 9 0 0 1 2 2 2 9 23.7 23.7 23.7 75.519 662 662;715 0 87.924 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.32737 0.47827 65.689 14 5 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN 0.52934 0.63257 0.32337 NaN NaN NaN NaN 0.6623 0.87142 0.45639 NaN NaN NaN NaN 6.5445 111.46 42.031 0 0 1 1 2 2 8 0 0 0 1 0 1 3 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 0 0 2.9 4.1 4.1 3.6 17.1 995350000 673630000 321730000 0 0 0 0 0 0 151180000 138890000 12285000 85820000 83023000 2796900 23232000 14595000 8637100 108560000 31114000 77445000 626560000 406000000 220560000 33 16549000 10903000 5646700 0 0 0 0 0 0 4581100 4208800 372260 2600600 2515800 84755 704010 442280 261730 3289700 942850 2346800 13949000 8386700 5562000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25703000 22399000 39585000 24260000 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30 29 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A STT3A sp|P46977|STT3A_HUMAN Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STT3A PE=1 SV=2 1 30 30 29 15 13 14 11 17 15 20 15 13 14 11 17 15 20 14 13 14 10 16 14 19 30.1 30.1 30.1 80.529 705 705 0 302.54 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.76099 0.99494 9.8135 243 41 Leave out requantified 0.60656 0.92904 0.88296 0.78618 0.84907 0.74592 0.72317 0.93402 1.0078 0.99145 1.0267 1.0625 1.0382 1.0308 12.435 15.989 17.296 19.992 18.857 13.288 16.196 45 22 30 21 30 52 43 9 5 4 2 9 5 7 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 18.4 16.5 18.9 15 23.4 18.2 26.1 59983000000 33687000000 26296000000 10558000000 6355000000 4203100000 3010000000 1542700000 1467300000 4730900000 2316900000 2414000000 6971000000 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1956 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requantified Median Median Leave out requantified Leave out requantified 21.7 15.6 19.2 14.2 16.2 19.8 26.9 2317600000 1146300000 1171300000 237090000 139700000 97391000 168340000 93726000 74610000 501400000 215340000 286060000 314220000 122850000 191360000 73219000 19652000 53567000 250760000 142650000 108110000 772540000 412360000 360180000 27 76599000 37144000 39455000 8781200 5174200 3607100 3026400 1490300 1536100 12542000 4645700 7896300 11638000 4550100 7087500 2711800 727850 1984000 9287400 5283300 4004100 28613000 15273000 13340000 50683000 49549000 42373000 0 40849000 0 27725000 67075000 32152000 0 40826000 58278000 57546000 67520000 DQGGELLSLR;ENFVAEIQK;GLAPEVADR;GMDTPAFELK;IFYIVEQR;IRSVASREEVAIK;ISFDLSLAR;IVDGMFAVCGVPESK;LIAELWDSGIK;QALEGLGDLK;RENFVAEIQK;TTETQVFVATPQK;VPCVGLSIGVER;VRTTETQVFVATPQK;YDGLVGMFDPK;YDLTVPFAR;YGEDSGLMYDLK 1972 13926;19713;28994;29697;36570;39828;39990;40816;49426;65691;70307;85615;91980;92829;96351;96390;96874 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[ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial SUCLG1 sp|P53597|SUCA_HUMAN Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUCLG1 PE=1 SV=4 1 18 18 18 8 14 14 8 7 7 11 8 14 14 8 7 7 11 8 14 14 8 7 7 11 44.8 44.8 44.8 36.249 346 346 0 293.12 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63087 0.68929 21.445 229 37 Leave out requantified 0.36584 0.58776 0.62092 0.77144 0.82229 0.68194 0.68863 0.56787 0.62017 0.64201 1.0457 1.0582 0.99485 1.0122 7.7233 16.372 11.728 18.94 10.923 19.805 6.4271 35 40 60 18 15 23 38 8 4 8 5 5 4 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 26.9 43.9 37.9 31.8 24.9 23.1 39.9 50769000000 30485000000 20284000000 8313900000 5589800000 2724100000 8482500000 5086100000 3396400000 10099000000 5867200000 4231500000 4726600000 2627400000 2099200000 1442400000 765540000 676860000 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48 48 Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase HADHB sp|P55084|ECHB_HUMAN Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB PE=1 SV=3 1 48 48 48 29 37 37 23 24 28 32 29 37 37 23 24 28 32 29 37 37 23 24 28 32 76.4 76.4 76.4 51.294 474 474 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56269 0.67621 29.751 632 99 Leave out requantified 0.37461 0.49779 0.51884 0.85515 0.94554 0.73875 0.72585 0.57623 0.54621 0.55839 1.1735 1.1973 1.0594 1.0327 14.907 32.706 26.925 19.08 19.184 14.634 10.071 137 91 133 32 44 90 105 26 9 15 7 8 12 22 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 55.9 71.9 70.9 53 57.6 54.2 71.3 167880000000 104310000000 63565000000 43898000000 30687000000 13211000000 23985000000 15322000000 8662500000 39240000000 25118000000 14122000000 9622100000 5188900000 4433200000 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epsilon-like protein, mitochondrial ATP5E;ATP5EP2 sp|P56381|ATP5E_HUMAN ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1E PE=1 SV=2;sp|Q5VTU8|AT5EL_HUMAN ATP synthase subunit epsilon-like protein, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5F1EP2 PE=1 SV=1 2 4 4 4 2 2 2 2 3 3 3 2 2 2 2 3 3 3 2 2 2 2 3 3 3 51 51 51 5.7797 51 51;51 0 10.047 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.92237 1.0313 14.103 39 7 Leave out requantified 0.54451 0.899 0.94986 1.0146 0.89544 0.70124 0.68657 0.88793 0.96312 1.0289 1.3516 1.0877 0.98461 1.0502 8.9238 7.7988 3.4833 18.189 15.366 5.3717 19.01 7 3 9 3 5 8 4 3 1 1 0 1 0 1 Median Median Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.4 29.4 37.3 29.4 45.1 45.1 45.1 8883900000 5025600000 3858300000 1782800000 1144500000 638330000 557100000 291490000 265610000 1715600000 898750000 816900000 651360000 301660000 349700000 880360000 453560000 426800000 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Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit DAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DAD1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 4 2 1 3 3 3 3 4 2 1 3 3 3 3 4 2 1 3 3 3 3 35.4 35.4 35.4 12.497 113 113 0 26.152 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.72189 0.99147 7.892 42 12 Leave out requantified 0.5922 0.78676 NaN 0.74873 0.79703 0.76724 0.71699 0.86753 0.83781 NaN 1.0099 0.99173 1.0209 0.99339 9.1535 14.05 NaN 6.9154 11.69 12.667 21.346 9 2 1 6 6 7 11 5 2 0 2 1 0 2 Leave out requantified Median Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 35.4 17.7 10.6 28.3 28.3 28.3 28.3 16002000000 9260100000 6742200000 3263300000 2047900000 1215400000 216150000 116300000 99849000 118310000 66591000 51715000 3455600000 1931800000 1523800000 675360000 369110000 306250000 2902800000 1650100000 1252700000 5370800000 3078300000 2292500000 5 2995400000 1733200000 1262100000 622020000 390890000 231130000 43229000 23260000 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MS/MS By MS/MS 0.92402 1.2224 17.107 266 29 Leave out requantified 0.70668 1.0299 1.0068 0.98531 1.0153 0.9205 0.91722 1.1067 1.1537 1.0675 1.3297 1.2888 1.2867 1.2778 17.935 11.971 28.849 9.1711 8.5197 16.501 11.441 32 24 41 31 37 49 52 3 2 2 3 5 4 10 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 31.8 39.4 48.2 50.9 55 38.8 51.8 101110000000 52228000000 48878000000 6663700000 3917500000 2746200000 5619200000 2725600000 2893600000 8869100000 4343700000 4525400000 19640000000 10001000000 9639000000 7209100000 3518400000 3690700000 27416000000 14422000000 12994000000 25689000000 13300000000 12389000000 13 5465500000 2862600000 2602900000 407570000 241560000 166000000 232140000 115070000 117070000 365180000 180420000 184760000 1069600000 552220000 517390000 410650000 201340000 209310000 1603800000 855170000 748620000 1376600000 716820000 659770000 413220000 457330000 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of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 BLOC1S1 sp|P78537|BL1S1_HUMAN Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BLOC1S1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 1 2 1 0 0 2 3 1 2 1 0 0 2 3 1 2 1 0 0 2 3 19 19 19 17.262 153 153 0 4.8053 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.57276 0.59455 75.984 9 0 Leave out requantified NaN 0.55186 NaN NaN NaN 0.22727 0.72295 NaN 0.58245 NaN NaN NaN 0.26406 1.0652 NaN 2.9083 NaN NaN NaN 212.81 32.725 1 2 1 0 0 2 3 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 4.6 11.8 7.2 0 0 11.8 19 368170000 235260000 132900000 22716000 15479000 7237200 22575000 13240000 9335000 42087000 26417000 15670000 0 0 0 0 0 0 73393000 62311000 11083000 207400000 117820000 89580000 8 46021000 29408000 16613000 2839500 1934800 904650 2821800 1655000 1166900 5260800 3302100 1958700 0 0 0 0 0 0 9174200 7788900 1385300 25924000 14727000 11197000 0 0 13861000 8073600 0 0 0 0 0 0 36128000 9889000 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requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 8.6 7.3 8.1 13.8 20.4 12.6 20 4280800000 2257300000 2023400000 138650000 76883000 61766000 204880000 98463000 106420000 106330000 49338000 56987000 482440000 304120000 178320000 192970000 106360000 86605000 1441300000 550750000 890600000 1714100000 1071400000 642740000 27 76338000 33751000 42587000 5135200 2847500 2287600 7588300 3646800 3941500 1908000 912950 995010 4878900 3084500 1794400 2817700 1696200 1121500 35348000 8637100 26711000 26251000 16573000 9677800 38811000 44975000 0 0 0 0 67960000 128140000 66983000 121460000 84870000 130570000 103440000 116810000 AAGFNVLR;AGVVANDAGDR;DILAVLTMK;FAQVVLQDLDKK;FELLCSPLFNK;FTVLFPSGTPLPAR;FTVLFPSGTPLPARR;HSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSR;LIHEPSAALLAYGIGQDSPTGK;LRYEIDTGEETKFVNPEDVAR;SNILVFK;VLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLASEFQR;VVLCGGSSR;YEIDTGEETK 2665 408;3297;12109;22224;22785;25760;25761;34326;49653;54467;77720;91267;94169;96529 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Cytoskeleton-associated protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CKAP5 PE=1 SV=3 1 79 79 79 18 17 24 23 25 35 61 18 17 24 23 25 35 61 18 17 24 23 25 35 61 43.9 43.9 43.9 225.49 2032 2032 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65089 0.90745 26.44 270 65 Leave out requantified 0.6534 0.88218 0.87601 0.63833 0.65398 0.61391 0.62692 1.0452 0.94151 0.97306 0.86852 0.84704 0.88058 0.87815 31.525 17.571 20.265 41.908 33.496 20.891 21.894 24 20 36 23 26 58 83 0 3 6 5 7 16 28 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 10.6 11.8 17.3 15.5 16.5 19.3 36.1 23245000000 12600000000 10645000000 1012700000 591810000 420940000 1373100000 729710000 643370000 1846200000 953880000 892340000 2258300000 1121400000 1137000000 800380000 458900000 341490000 6005300000 3568500000 2436800000 9949000000 5175500000 4773600000 106 126940000 64742000 62200000 5864800 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2 5 3 6 7 9 58.9 58.9 58.9 21.995 192 192 0 109.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.8403 1.0738 28.099 58 20 Leave out requantified 0.43697 1.2355 0.70654 0.92268 0.87637 0.82962 0.84775 0.6836 1.3328 0.7872 1.2149 1.1123 1.1448 1.2203 36.856 45.16 6.5895 21.898 7.7216 7.8866 15.441 3 3 11 4 8 15 14 2 0 5 1 1 6 5 Median Plateau Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 20.8 9.9 35.4 19.8 31.8 35.4 41.1 5051100000 2819800000 2231300000 191850000 130400000 61451000 132850000 60862000 71991000 873760000 501500000 372270000 283330000 152590000 130740000 154640000 81249000 73386000 1138500000 698410000 440080000 2276200000 1194800000 1081400000 12 252370000 139520000 112850000 5347000 3569300 1777700 11071000 5071900 5999300 2534100 1381700 1152400 7907900 3677200 4230800 8783900 4733900 4050000 70705000 45292000 25412000 146020000 75797000 70224000 56090000 38343000 45616000 48689000 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sapiens OX=9606 GN=TAF1C PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 3.3 3.3 3.3 95.212 869 869 0.0017693 2.1651 By MS/MS By MS/MS 1.8761 2.0696 42.005 2 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 2.3 1 0 0 0 0 97026000 43453000 53574000 0 0 0 44886000 22527000 22358000 52141000 20925000 31215000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42 1241400 498220 743220 0 0 0 1068700 536370 532340 1241400 498220 743220 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ALLKVPLAPPVWTAPTFTHR;QMLGSTELR 3082 4937;68023 True;True 5052;69753 34456;462022 51010;686364 51010;686364 -1 Q15582 Q15582 4 4 4 Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 TGFBI sp|Q15582|BGH3_HUMAN Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGFBI PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 2 2 0 0 0 0 3 2 2 0 0 0 0 3 2 2 0 0 0 0 8.8 8.8 8.8 74.68 683 683 0 7.2496 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.7162 3.8263 27.965 9 4 Leave out requantified 2.2867 3.5541 1.0897 NaN NaN NaN NaN 3.8046 3.8234 1.3196 NaN NaN NaN NaN 12.629 35.983 135.06 NaN NaN NaN NaN 5 2 2 0 0 0 0 2 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 6 4.5 4.8 0 0 0 0 363640000 125620000 238020000 202970000 66294000 136670000 81011000 18173000 62838000 79658000 41149000 38509000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31 5278600 1502100 3776500 3537600 1104500 2433100 1741000 397570 1343400 2569600 1327400 1242200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 EGVYTVFAPTNEAFR;LTLLAPLNSVFK;STVISYECCPGYEKVPGEK;YLYHGQTLETLGGK 3083 17527;55626;79764;97971 True;True;True;True 17906;56828;81719;100360 115043;380266;380267;380268;531245;531246;662143;662144;662145 170119;565027;565028;565029;565030;788130;788131;985154 170119;565028;788130;985154 -1 Q15599 Q15599 5 5 5 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 SLC9A3R2 sp|Q15599|NHRF2_HUMAN Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 OS=Homo 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Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein TRADD sp|Q15628|TRADD_HUMAN Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRADD PE=1 SV=2 1 9 9 9 0 0 0 5 5 4 8 0 0 0 5 5 4 8 0 0 0 5 5 4 8 38.5 38.5 38.5 34.247 312 312 0 108.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2288 1.6596 34.902 30 12 Leave out requantified NaN NaN NaN 1.1055 0.90108 1.2776 1.1723 NaN NaN NaN 1.4024 1.1166 1.7001 1.6596 NaN NaN NaN 65.446 80.417 3.9739 13.592 0 0 0 6 4 8 12 0 0 0 5 2 2 3 Median Median Median Median Median Leave out requantified Leave out requantified 0 0 0 22.4 21.2 19.2 36.2 4947700000 2659600000 2288200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 846650000 444470000 402180000 269600000 157130000 112470000 1729000000 1113400000 615570000 2102500000 944590000 1158000000 15 190570000 116760000 73818000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30569000 19157000 11412000 4186900 1740700 2446200 82491000 60702000 21790000 73328000 35158000 38170000 0 0 0 0 0 0 120020000 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 5.8 56992000 36421000 20571000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56992000 36421000 20571000 16 3562000 2276300 1285700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3562000 2276300 1285700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 QDAVHAILAYSQSAEELLR 3316 65949 True 67649 450412 669458 669458 -1 Q5JRA6 Q5JRA6 31 31 31 Melanoma inhibitory activity protein 3 MIA3 sp|Q5JRA6|TGO1_HUMAN Transport and Golgi organization protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIA3 PE=1 SV=1 1 31 31 31 12 6 11 3 3 9 16 12 6 11 3 3 9 16 12 6 11 3 3 9 16 23.1 23.1 23.1 213.7 1907 1907 0 108.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6079 0.79586 23.03 71 21 Leave out requantified 0.39445 0.70421 0.63571 0.67238 0.7832 0.55828 0.6557 0.60857 0.77012 0.70998 0.87823 0.99462 0.81422 0.90462 38.71 14.133 30.349 27.289 9.8385 10.67 29.292 17 6 14 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By MS/MS 0.56908 0.82179 38.361 5 1 Median NaN NaN 0.70526 NaN NaN NaN 0.59587 NaN NaN 0.77661 NaN NaN NaN 0.86424 NaN NaN 67.927 NaN NaN NaN 7.1229 0 0 2 0 0 1 2 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 1.9 0 0 0.7 0.7 409630000 225800000 183840000 0 0 0 0 0 0 112710000 55024000 57689000 0 0 0 0 0 0 14488000 10132000 4355800 282430000 160640000 121790000 61 6715300 3701600 3013700 0 0 0 0 0 0 1847800 902030 945730 0 0 0 0 0 0 237500 166100 71407 4630100 2633500 1996600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 VEEENQGALEMIK;VTLEGLK 3333 88134;93567 True;True 90293;95859 590124;630413;630414;630415;630416 876055;937774;937775;937776 876055;937774 -1 Q5MIZ7 Q5MIZ7 14 5 5 Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B SMEK2 sp|Q5MIZ7|P4R3B_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP4R3B PE=1 SV=2 1 14 5 5 4 2 9 3 2 4 4 1 0 4 1 1 0 2 1 0 4 1 1 0 2 17.4 7.1 7.1 97.457 849 849 0 4.7413 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS 1.2605 1.4037 52.003 13 1 Leave out requantified NaN NaN 1.8524 0.80078 NaN NaN 0.91076 NaN NaN 1.8682 1.0686 NaN NaN 1.2435 NaN NaN 52.343 3.1118 NaN NaN 14.826 1 0 4 2 1 0 5 0 0 1 0 0 0 0 Median Median Leave out requantified Median Median Median Leave out requantified 5.3 2.5 12.4 3.8 2.2 4.7 4.9 3048900000 1655500000 1393400000 182170000 128170000 54006000 0 0 0 154110000 61874000 92233000 1948700000 1070400000 878320000 16540000 8016800 8523300 0 0 0 747330000 386980000 360350000 39 76784000 41813000 34971000 4671100 3286300 1384800 0 0 0 2907700 1161600 1746100 49968000 27447000 22521000 424110 205560 218550 0 0 0 18813000 9712200 9101000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AESDGSLLLESK;AGCDEIWEK;EFCAFSQTLQPQNR;FKEVIPITDSELR;ICQVQGK;IIGLKDEFYNR;INPNTAYQK;LALALENEGYIKK;LNSVPSILR;TLIDPENMLATTNK;TTNLPTSVTATK;VEIVSMLQEDEK;VYTLNEDR;VYTLNEDRQWDDR 3334 2208;2764;16816;23847;35448;37291;38981;45664;52713;83564;85738;88288;94876;94877 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repeat domain phosphoinositide-interacting protein 1 WIPI1 sp|Q5MNZ9|WIPI1_HUMAN WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WIPI1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 0 1 1 1 0 0 2 0 1 1 1 0 0 2 0 1 1 1 0 0 2 12.1 12.1 12.1 48.673 446 446 0 39.401 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1149 1.5369 41.445 7 1 Leave out requantified NaN 1.7614 1.5918 NaN NaN NaN 0.95758 NaN 1.8185 1.7225 NaN NaN NaN 1.3755 NaN 50.946 0.74498 NaN NaN NaN 15.686 0 2 2 1 0 0 2 0 1 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 2.9 2.9 4.5 0 0 7.6 315130000 148350000 166780000 0 0 0 90753000 40053000 50700000 65215000 25116000 40099000 47841000 27799000 20042000 0 0 0 0 0 0 111320000 55380000 55942000 19 6831600 3449500 3382100 0 0 0 658650 228760 429890 799300 326670 472630 2517900 1463100 1054800 0 0 0 0 0 0 2855800 1431000 1424800 0 0 15055000 27378000 26585000 44660000 0 0 0 0 0 0 0 0 MFMAATNYLPTQVSDMMHQDR;NICTLSTIQKLPR;PSASSASTVPGYSEDGGALR 3336 58451;61961;65335 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7 Vacuolar protein sorting-associated protein 13D VPS13D sp|Q5THJ4|VP13D_HUMAN Vacuolar protein sorting-associated protein 13D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS13D PE=1 SV=2 1 7 7 7 2 0 1 1 0 1 3 2 0 1 1 0 1 3 2 0 1 1 0 1 3 2.1 2.1 2.1 491.91 4388 4388 0 7.0067 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.62326 0.84413 7.9281 8 0 Leave out requantified 0.58331 NaN NaN NaN NaN NaN 0.67759 0.86941 NaN NaN NaN NaN NaN 0.87616 4.1734 NaN NaN NaN NaN NaN 11.697 2 0 1 1 0 1 3 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 0.6 0 0.3 0.2 0 0.4 0.8 245020000 134320000 110700000 62355000 37425000 24930000 0 0 0 20830000 11890000 8940700 99572000 50236000 49336000 0 0 0 8612000 5360500 3251500 53653000 29411000 24242000 229 594360 313090 281270 32156 19331 12825 0 0 0 90962 51920 39042 434810 219370 215440 0 0 0 37607 23408 14199 89785 50979 38806 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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mitochondrial;Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial ACSM2B;ACSM2A sp|Q68CK6|ACS2B_HUMAN Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACSM2B PE=1 SV=2;sp|Q08AH3|ACS2A_HUMAN Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACSM2A PE=1 SV=2 2 11 11 10 4 4 4 0 0 0 0 4 4 4 0 0 0 0 4 4 3 0 0 0 0 23.6 23.6 21.7 64.271 577 577;577 0 38.002 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.19386 0.20701 35.755 16 8 Leave out requantified 0.20744 0.16931 0.18377 NaN NaN NaN NaN 0.32482 0.18438 0.19355 NaN NaN NaN NaN 129.23 62.643 9.3909 NaN NaN NaN NaN 6 4 6 0 0 0 0 3 3 2 0 0 0 0 Median Median Leave out requantified Median Median Median Median 6.8 8.8 10.7 0 0 0 0 964980000 620570000 344410000 477890000 229070000 248820000 211840000 168420000 43417000 275260000 223080000 52175000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 14339000 7037700 7301200 11934000 4985700 6948200 1312700 1106200 206450 1092300 945760 146490 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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GTPase-activating protein 17 ARHGAP17 sp|Q68EM7|RHG17_HUMAN Rho GTPase-activating protein 17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARHGAP17 PE=1 SV=1 1 24 24 24 9 9 12 2 5 6 14 9 9 12 2 5 6 14 9 9 12 2 5 6 14 33.4 33.4 33.4 95.436 881 881 0 97.531 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.89688 1.1311 27.237 80 10 Leave out requantified 0.59621 1.0119 0.87704 0.96533 1.1702 0.91608 0.98905 0.96782 1.0649 0.95374 1.3905 1.4901 1.2518 1.3666 51.225 15.311 10.148 9.4266 34.822 15.812 12.786 10 12 24 3 4 8 19 1 0 2 0 2 2 3 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Plateau Median Leave out requantified Leave out requantified 13.6 15.1 19.1 4.7 7.2 8.2 23.7 6118600000 3206100000 2912500000 520900000 331140000 189770000 1023100000 508650000 514410000 1844200000 931400000 912830000 276870000 139960000 136910000 78771000 39172000 39599000 662700000 349980000 312720000 1712000000 905780000 806240000 34 72383000 39294000 33089000 10290000 6772500 3517900 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Rho-interacting protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 35 35 34 3 2 7 9 8 12 23 3 2 7 9 8 12 23 3 2 7 9 8 12 22 40.4 40.4 39.5 116.53 1025 1025 0 129.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.7514 1.0395 24.286 74 32 Leave out requantified 0.49896 0.76092 0.58755 0.69581 0.75685 0.75853 0.7416 0.79456 0.78996 0.68626 0.91546 0.93365 1.0514 1.0625 14.113 0.63516 18.73 26.394 35.698 11.583 23.178 3 2 7 9 9 17 27 1 0 4 3 3 9 12 Median Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 4.8 3.6 13.4 12 10.1 16.8 26.9 5507100000 3005700000 2501500000 76014000 50095000 25919000 66009000 41018000 24991000 362200000 216270000 145940000 805500000 471580000 333930000 258560000 150500000 108060000 1557000000 589160000 967840000 2381900000 1487100000 894800000 61 54089000 27985000 26104000 213520 123290 90229 128490 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Median 6.8 0 0 0 0 0 0 69185000 46887000 22298000 69185000 46887000 22298000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 11531000 7814600 3716300 11531000 7814600 3716300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MISITEWQK 3654 58894 True 60279 403908;403909 600656;600657;600658 600657 -1 Q6ZVM7 Q6ZVM7 5 5 5 TOM1-like protein 2 TOM1L2 sp|Q6ZVM7|TM1L2_HUMAN TOM1-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1L2 PE=1 SV=1 1 5 5 5 0 0 0 0 0 1 5 0 0 0 0 0 1 5 0 0 0 0 0 1 5 10.7 10.7 10.7 55.556 507 507 0 10.666 By MS/MS By MS/MS 0.78789 1.0734 14.539 8 1 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.78789 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1.0734 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 17.218 0 0 0 0 0 1 7 0 0 0 0 0 0 1 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 0 0 0 0 0 1.4 10.7 1536400000 803290000 733150000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 399160000 221800000 177360000 1137300000 581490000 555790000 21 59788000 31019000 28769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19008000 10562000 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GTP-binding protein A;Ras-related GTP-binding protein B RRAGA;RRAGB sp|Q7L523|RRAGA_HUMAN Ras-related GTP-binding protein A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRAGA PE=1 SV=1;sp|Q5VZM2|RRAGB_HUMAN Ras-related GTP-binding protein B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRAGB PE=1 SV=1 2 9 9 9 3 0 2 1 3 4 8 3 0 2 1 3 4 8 3 0 2 1 3 4 8 35.8 35.8 35.8 36.566 313 313;374 0 152.46 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78579 1.1282 34.543 26 4 Leave out requantified 0.29838 NaN 0.3668 NaN 1.3181 0.74147 0.78579 0.4783 NaN 0.39428 NaN 1.662 1.0459 1.1282 75.546 NaN 39.509 NaN 29.202 13.033 64.9 3 0 2 1 3 5 12 0 0 0 0 1 0 3 Leave out requantified Median Median Median Plateau Leave out requantified Leave out requantified 9.9 0 7.3 6.4 11.2 14.1 29.4 2798000000 1615600000 1182400000 189770000 131570000 58197000 0 0 0 48821000 33166000 15654000 60442000 30692000 29750000 93936000 45912000 48024000 684800000 405820000 278980000 1720300000 968440000 751840000 14 149730000 86264000 63470000 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Median Median Median 2 5.6 5.6 0 0 3.5 4.3 281550000 134210000 147340000 20745000 13360000 7385600 75849000 33700000 42150000 77480000 30752000 46728000 0 0 0 0 0 0 46849000 19193000 27656000 60628000 37207000 23421000 23 3433200 1720500 1712700 901970 580850 321110 3297800 1465200 1832600 3368700 1337000 2031600 0 0 0 0 0 0 2036900 834470 1202400 1396200 885990 510250 0 0 14257000 23069000 11163000 15819000 0 0 0 0 0 0 0 0 AVQESAAQLSMTLK;IQEFIELIR;LAQPLPMAHCANSR;MMVEHLLR 3706 8610;39364;45926;59505 True;True;True;True 8815;40247;46930;60978 59600;265912;314178;314179;314180;314181;408808;408809;408810;408811 88806;396727;396728;468428;468429;607608;607609;607610;607611 88806;396727;468428;607609 -1 Q7L775 Q7L775 2 2 2 EPM2A-interacting protein 1 EPM2AIP1 sp|Q7L775|EPMIP_HUMAN EPM2A-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPM2AIP1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 2 0 0 0 0 1 0 2 0 0 0 0 1 0 2 0 0 0 0 1 0 4.1 4.1 4.1 70.369 607 607 0.00032739 2.5266 By MS/MS By matching 0.60975 0.94809 7.1976 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VKORC1L1 sp|Q8N0U8|VKORL_HUMAN Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VKORC1L1 PE=1 SV=2 1 5 5 5 4 1 1 1 2 5 5 4 1 1 1 2 5 5 4 1 1 1 2 5 5 21.6 21.6 21.6 19.835 176 176 0 8.6863 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.56006 0.81469 15.779 26 15 Leave out requantified 0.49848 NaN NaN NaN 0.68369 0.49088 0.55834 0.77666 NaN NaN NaN 0.89076 0.68122 0.79777 13.199 NaN NaN NaN 8.499 17.281 15.231 7 1 1 1 3 7 6 5 1 1 1 1 4 2 Median Median Median Median Median Leave out requantified Leave out requantified 21.6 5.7 5.7 5.7 11.9 21.6 21.6 2993900000 1874500000 1119500000 687120000 438800000 248320000 274140000 164590000 109550000 201970000 127720000 74248000 216990000 109030000 107960000 107350000 61469000 45881000 890660000 591260000 299390000 615690000 381580000 234110000 7 414400000 258490000 155910000 98160000 62686000 35474000 39162000 23512000 15650000 28853000 18246000 10607000 30998000 15576000 15422000 15336000 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integral membrane protein 20 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMIM20 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 2 0 0 0 1 2 1 2 0 0 0 1 2 1 2 0 0 0 1 34.3 34.3 34.3 7.7019 67 67 0 7.5071 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0.5688 0.64401 8.4604 9 2 Leave out requantified 0.41638 NaN 0.5998 NaN NaN NaN NaN 0.63348 NaN 0.62712 NaN NaN NaN NaN 33.286 NaN 5.4461 NaN NaN NaN NaN 3 1 4 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 0 Median Median Linear Median Median Median Median 34.3 13.4 34.3 0 0 0 20.9 461930000 286870000 175060000 140770000 89575000 51194000 47739000 28350000 19390000 247530000 153190000 94341000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25884000 15753000 10131000 3 70138000 46093000 24045000 37387000 25257000 12131000 15913000 9449800 6463200 24123000 15585000 8537700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8627800 5251000 3376900 30747000 19477000 0 0 47535000 29723000 0 0 0 0 0 0 0 0 AGIVQEDVQPPGLK;VWSDPFGRK 4068 2970;94632 True;True 3036;96952 19820;19821;19822;19823;19824;638555;638556;638557;638558 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6 4 0 1 0 1 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Leave out requantified 14.6 20.7 26.6 1.4 1.1 1.2 8.9 3686800000 1685400000 2001300000 398160000 200300000 197860000 1138900000 529970000 608900000 1566300000 666980000 899280000 44027000 25434000 18593000 10880000 5166900 5712800 17107000 8685600 8421300 511460000 248900000 262560000 67 30621000 14395000 16227000 4240100 2067300 2172800 9514200 4602600 4911600 10819000 4825600 5993900 657130 379620 277510 162380 77118 85266 255330 129640 125690 5885100 2822100 3063000 26344000 39019000 70106000 94761000 85041000 129010000 0 0 0 0 0 0 21590000 20452000 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2 Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 1 PYROXD1 sp|Q8WU10|PYRD1_HUMAN Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYROXD1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 5.6 5.6 5.6 55.792 500 500 0 3.2069 By MS/MS By MS/MS 0.72622 0.88575 119.37 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 3 0 0 0 2.6 64542000 37767000 26775000 0 0 0 0 0 0 29883000 13549000 16334000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34658000 24218000 10441000 17 2038700 1424600 614170 0 0 0 0 0 0 1757800 797020 960810 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2038700 1424600 614170 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 LICEGNPYVLGIR;YNAQGLGSDHELMLR 4306 49462;98083 True;True 50531;100482 338410;662968 504186;986371 504186;986371 -1 Q8WU76 Q8WU76 7 7 7 Sec1 family domain-containing protein 2 SCFD2 sp|Q8WU76|SCFD2_HUMAN Sec1 family 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glutamine/lysine-rich protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SREK1 PE=1 SV=1 1 7 7 7 2 2 2 1 2 2 4 2 2 2 1 2 2 4 2 2 2 1 2 2 4 19.3 19.3 19.3 59.38 508 508 0 101.59 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.87647 1.1991 25.08 21 3 Leave out requantified 1.2568 1.3011 0.9356 NaN 0.95179 0.8047 0.74009 1.9205 1.4666 1.0331 NaN 1.2139 1.0973 1.0576 48.415 8.1126 27.488 NaN 19.348 33.508 34.593 4 2 2 1 2 4 6 0 0 0 0 1 1 1 Leave out requantified Median Median Median Median Median Leave out requantified 4.7 9.1 7.7 2 5.1 5.7 14.2 1517300000 787930000 729320000 216720000 110720000 106000000 40406000 16577000 23829000 117060000 55539000 61519000 41122000 22901000 18221000 95886000 49124000 46762000 361870000 185850000 176020000 644190000 347220000 296970000 10 100270000 53373000 46895000 21672000 11072000 10600000 2033700 892560 1141200 11706000 5553900 6151900 4112200 2290100 1822100 9588600 4912400 4676200 33339000 16955000 16384000 29524000 17251000 12272000 0 0 0 0 0 0 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carrier-associated membrane protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAMP4 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 1 2 0 1 1 2 1 1 2 0 1 1 2 1 1 2 0 1 1 2 17.9 17.9 17.9 25.728 229 229 0 57.887 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78168 1.1108 20.76 18 7 Leave out requantified 0.72607 1.0741 1.0396 NaN NaN 0.73012 0.74949 1.182 1.1997 1.0981 NaN NaN 0.98727 1.0383 17.329 14.528 16.841 NaN NaN 11.824 18.953 4 3 5 0 1 2 3 2 0 2 0 1 2 0 Median Median Median Median Median Median Median 4.8 7 7 0 4.8 4.8 15.7 1941800000 1058300000 883490000 617670000 353690000 263980000 194220000 92105000 102120000 328630000 159190000 169440000 0 0 0 99030000 47786000 51244000 130550000 71384000 59169000 571700000 334170000 237530000 5 253640000 139970000 113670000 123530000 70738000 52795000 38844000 18421000 20424000 21653000 9778700 11874000 0 0 0 19806000 9557200 10249000 26111000 14277000 11834000 62537000 35619000 26918000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AQTEWNTGTWR;AQTEWNTGTWRNPPSR;FIPVKPCFYQNFSDEIPVEHQVLVK 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Median Median 0 0 0 15.2 0 0 6.3 487360000 287930000 199430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 220440000 122800000 97640000 0 0 0 0 0 0 266910000 165130000 101790000 7 55947000 34097000 21850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17816000 10507000 7308900 0 0 0 0 0 0 38131000 23589000 14541000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AGAAEDAR;EMASCITQR;WLGGAVEDYFMR 4501 2697;19416;95453 True;True;True 2753;19824;97782 17830;127380;644155;644156;644157 26615;187839;958193;958194;958195 26615;187839;958194 -1 Q969F9 Q969F9 6 6 6 Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein HPS3 sp|Q969F9|HPS3_HUMAN Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HPS3 PE=1 SV=1 1 6 6 6 0 1 0 0 1 2 4 0 1 0 0 1 2 4 0 1 0 0 1 2 4 7.1 7.1 7.1 113.73 1004 1004 0 10.094 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.85049 1.1264 22.029 12 4 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN 0.75605 0.94697 NaN NaN NaN NaN NaN 1.0686 1.3266 NaN NaN NaN NaN NaN 39.514 17.336 0 1 0 0 1 6 4 0 0 0 0 0 4 0 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 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chromatin subfamily E member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCE1 PE=1 SV=2 1 18 17 17 6 5 8 4 7 5 11 5 4 8 3 6 5 11 5 4 8 3 6 5 11 45.7 44 44 46.649 411 411 0 144.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.6674 0.93961 21.662 70 17 Leave out requantified 1.0936 1.1613 1.1216 0.63664 0.67196 0.59869 0.60842 1.6745 1.2568 1.2622 0.85136 0.88124 0.83416 0.88738 20.881 22.86 17.435 26.076 12.996 24.821 11.203 8 5 15 3 6 14 19 2 4 4 1 1 3 2 Leave out requantified Median Leave out requantified Plateau Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 15.3 14.6 28.2 9.2 21.2 15.3 42.6 4759300000 2745900000 2013400000 348080000 194890000 153190000 169120000 75815000 93306000 858910000 393760000 465150000 186190000 120620000 65572000 173990000 95867000 78120000 983010000 630410000 352600000 2040000000 1234600000 805450000 20 118100000 68666000 49435000 12979000 7511900 5467500 8011100 3552600 4458500 13998000 6052000 7946300 6011400 4087200 1924100 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Median Median Median Median Median Median 0 0 0 0 0 2.2 0 94387000 33549000 60838000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94387000 33549000 60838000 0 0 0 13 7260500 2580700 4679800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7260500 2580700 4679800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FSLLPTEQPR 4545 25381 True 25932 165247 243995;243996 243996 -1 Q96AQ6 Q96AQ6 21 21 21 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 PBXIP1 sp|Q96AQ6|PBIP1_HUMAN Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PBXIP1 PE=1 SV=1 1 21 21 21 8 6 8 1 2 3 5 8 6 8 1 2 3 5 8 6 8 1 2 3 5 32.1 32.1 32.1 80.642 731 731 0 135.21 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.32534 0.40792 33.919 42 14 Leave out requantified 0.23283 0.3456 0.33812 NaN 1.0379 1.2335 0.80376 0.36795 0.38014 0.38678 NaN 1.2966 1.6904 1.1552 24.94 17.269 8.2877 NaN 40.585 6.0345 34.188 11 6 14 1 2 2 6 3 2 4 0 1 2 2 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 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SAGA-associated factor 29 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SGF29 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 1 0 1 0 4.4 4.4 4.4 33.238 293 293 0.0079291 1.5641 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71373 1.0656 49.572 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 4.4 0 0 4.4 0 4.4 0 87835000 46954000 40882000 46516000 19171000 27344000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41320000 27782000 13537000 0 0 0 15 5855700 3130200 2725400 3101000 1278100 1823000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2754600 1852200 902480 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 IAELLTELHQLIK 4649 35014 True 35786 232938;232939;232940 345611;345612;345613;345614 345612 -1 Q96EU6;Q9H160 Q96EU6 9;1 9;1 9;1 Ribosomal RNA processing protein 36 homolog RRP36 sp|Q96EU6|RRP36_HUMAN Ribosomal RNA processing protein 36 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP36 PE=1 SV=1 2 9 9 9 1 2 3 2 1 0 4 1 2 3 2 1 0 4 1 2 3 2 1 0 4 33.2 33.2 33.2 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MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.81352 1.0009 40.97 12 3 Leave out requantified NaN NaN 0.8954 NaN NaN 0.76004 0.7178 NaN NaN 0.93471 NaN NaN 1.0849 1.0849 NaN NaN 10.507 NaN NaN 33.311 30.34 1 1 3 0 1 3 3 1 0 1 0 0 1 0 Median Median Median Median Median Plateau Leave out requantified 7.7 9.2 11.6 6.4 12 7.8 13.1 709040000 359040000 350000000 11894000 8470800 3422800 127080000 61835000 65244000 178380000 76506000 101870000 0 0 0 2684500 1728800 955730 189300000 112480000 76823000 199710000 98023000 101680000 68 3796800 2078900 1717900 174910 124570 50336 1868800 909330 959470 1314000 572310 741720 0 0 0 39478 25423 14055 1819600 1119200 700440 1802300 835200 967120 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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Median Plateau Median 4.6 22 11.2 9.3 14.7 7.3 20.8 1290900000 641660000 649290000 76684000 52061000 24624000 323610000 174390000 149220000 312400000 176220000 136170000 194810000 40463000 154350000 67748000 32108000 35641000 91445000 40690000 50754000 224250000 125720000 98526000 13 99304000 49358000 49945000 5898800 4004700 1894100 24893000 13415000 11479000 24030000 13556000 10475000 14986000 3112500 11873000 5211400 2469800 2741600 7034200 3130000 3904200 17250000 9671000 7578900 0 0 60408000 67282000 107160000 101870000 0 0 0 0 0 0 15803000 17301000 AATQCEFSK;FLDLWNK;FRAATQCEFSK;KLEQLYNR;LDVATDNFFQNPELYIR;QEFMDGMTELGCDSIEK;TAVSCLSQNDWK 4692 954;24005;25096;43397;46928;66175;81130 True;True;True;True;True;True;True 969;24511;25641;44352;47949;67882;83115 5959;156194;156195;163433;295498;320893;320894;320895;451551;451552;451553;451554;451555;540245;540246;540247;540248;540249;540250;540251;540252;540253 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-1 Q96I59 Q96I59 11 11 11 Probable asparagine--tRNA ligase, mitochondrial NARS2 sp|Q96I59|SYNM_HUMAN Probable asparagine--tRNA ligase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NARS2 PE=1 SV=3 1 11 11 11 3 1 2 1 3 3 10 3 1 2 1 3 3 10 3 1 2 1 3 3 10 33.8 33.8 33.8 54.089 477 477 0 25.425 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.65807 0.94342 7.5605 33 11 Leave out requantified 0.56388 NaN 0.95688 NaN 0.64953 0.65149 0.61349 0.87423 NaN 0.98793 NaN 0.80476 0.90956 0.88058 2.8315 NaN 15.131 NaN 14.855 63.778 2.4777 7 1 4 1 3 4 13 2 0 1 0 1 0 7 Leave out requantified Median Median Median Median Median Leave out requantified 5.9 1.9 5 1.5 7.5 7.5 32.3 2925800000 1538400000 1387400000 354600000 255670000 98930000 8419000 4059900 4359100 302120000 160640000 141480000 40128000 20216000 19911000 80489000 46332000 34157000 268220000 171970000 96250000 1871800000 879510000 992330000 23 54593000 23081000 31511000 10155000 7939900 2215200 366040 176520 189530 1526900 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Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Leave out requantified Leave out requantified 44.8 44.8 44.8 43.1 43.1 44.8 44.8 14669000000 8304400000 6364200000 4419700000 2630900000 1788900000 1177500000 591630000 585860000 1488700000 827460000 661220000 1764000000 951910000 812060000 383870000 204240000 179630000 3455400000 1951600000 1503900000 1979400000 1146700000 832710000 3 3681700000 2058700000 1623000000 1124000000 659130000 464880000 127520000 65295000 62225000 216860000 111110000 105760000 587990000 317300000 270690000 127960000 68080000 59877000 952860000 526290000 426570000 544470000 311510000 232970000 545660000 546000000 176910000 190060000 187970000 197850000 225220000 254180000 286660000 262100000 352090000 310190000 190580000 161320000 AGPESDAQYQFTGIK;AGPESDAQYQFTGIKK;KYFNSYTLTGR;YFNSYTLTGR 4736 3116;3117;45131;96761 True;True;True;True 3186;3187;46117;99127 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MS/MS By MS/MS 0.65215 0.87059 16.477 9 5 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN 0.58426 0.55063 NaN NaN NaN NaN NaN 0.82597 0.81556 NaN NaN NaN NaN NaN 11.264 9.8123 1 1 1 0 1 2 3 1 0 0 0 0 2 2 Median Median Median Median Median Median Plateau 4.1 3.5 3.5 0 3.5 6.6 10.7 385250000 246560000 138690000 41861000 33357000 8504400 30598000 18185000 12413000 25371000 10693000 14678000 0 0 0 15138000 8815800 6322000 122360000 76826000 45534000 149920000 98687000 51234000 16 19951000 12697000 7253300 2616300 2084800 531530 1912400 1136500 775820 1585700 668340 917370 0 0 0 946110 550990 395130 7647500 4801600 2845900 5242700 3455200 1787600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 GVPLQFDINSVGK;LLQQSGAQQFR;NIEQYFPVLK;QATFLFR;SNENLDKIDMSLDDIIK 4833 31776;51668;61998;65820;77677 True;True;True;True;True 32481;52772;63615;67518;79587 209009;354814;354815;354816;354817;424959;424960;449541;519234 309207;527884;527885;527886;631804;631805;668220;770271 309207;527886;631804;668220;770271 -1 Q96QE5 Q96QE5 7 7 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Median Median Median Median 0 2.1 0.8 0 0.2 0.2 1.2 342410000 167900000 174510000 0 0 0 195720000 94987000 100730000 21977000 10470000 11506000 0 0 0 9727200 5580200 4147000 39268000 21330000 17938000 75720000 35531000 40189000 152 1346500 627630 718880 0 0 0 682490 307730 374770 144580 68884 75700 0 0 0 63994 36712 27283 258340 140330 118010 197100 73976 123120 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ALVGGAVGGLAGAASK;AVFYTWADPVGSR;CIIEAEPLEIIYDAR;FFNEDGVIRPYR;GVAAMTMDEDYQQK;IDSFHITGLPDNSEKPR;LENIISTLK;LFFILLTPVNHSTADKIPLTK;LPLISLR;MWFLEESNETEK 4846 5418;8290;9601;22991;31485;35752;47528;47939;53021;60662 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5545;8491;9825;23476;32172;36541;48558;48975;54174;62253 38171;57589;65606;149041;206987;238305;324537;327030;363647;363648;416458 56541;56542;85738;97610;219691;306178;353597;483587;487320;540396;540397;618944 56541;85738;97610;219691;306178;353597;483587;487320;540396;618944 -1 Q96RN5 Q96RN5 5 5 5 Mediator of RNA polymerase II transcription 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Leave out requantified Median Median Plateau Leave out requantified 2.4 2.4 23 0 0 9.5 13.5 749460000 400490000 348970000 81579000 49956000 31624000 101200000 55408000 45793000 180360000 89590000 90769000 0 0 0 0 0 0 137080000 70207000 66876000 249240000 135330000 113910000 19 23335000 12739000 10596000 4293600 2629200 1664400 5326400 2916200 2410200 4970300 2741900 2228400 0 0 0 0 0 0 3696400 1922600 1773800 5048300 2528800 2519500 0 0 0 0 18388000 16916000 0 0 0 0 21444000 23041000 23716000 23457000 FALSLSPGAHQK;FITVCDYTNPCTK;LLDAWQGRPGASVGR;LLELLTK;QQQEEAEKPLQVAAVDSSVPR 4963 22156;23764;50590;50864;68553 True;True;True;True;True 22624;24267;51684;51962;70292 143633;143634;143635;143636;143637;154738;347530;349530;349531;349532;349533;349534;349535;349536;349537;464477;464478;464479 211561;211562;211563;211564;211565;211566;227970;517337;520308;520309;520310;520311;520312;520313;520314;520315;520316;520317;520318;689879;689880;689881 211561;227970;517337;520312;689881 -1 Q99848 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requantified Leave out requantified 13.5 13.5 18.4 12 29.8 29.5 53.5 5979200000 3371700000 2607400000 381760000 234330000 147430000 107380000 60118000 47258000 574620000 289140000 285480000 0 0 0 796500000 303870000 492630000 1153500000 701270000 452270000 2965400000 1783000000 1182400000 11 331850000 199520000 132330000 26845000 17004000 9840800 4829400 2476800 2352600 10897000 5734100 5162500 0 0 0 9503600 5431400 4072200 70101000 43474000 26627000 209680000 125400000 84276000 194710000 162690000 47270000 86646000 105840000 165550000 0 0 83117000 137830000 171560000 279940000 261940000 444650000 AHAAQVTCVAASPHK;CWAGSLWLFK;DATWSPLNHSLLTTVGWDHQVVHHVVPTEPLPAPGPASVTE;DSVFLSCSEDNR;ETPPPLVPPAAR;EWNLPPNAPACMER;FCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSK;GILVASDSGAVELWELDENETLIVSK;ILLWDTR;KETPPPLVPPAAR;RKETPPPLVPPAAR;SDGALLLGASSLSGR;VWDLAQQVVLSSYR;YEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSK;YRSDGALLLGASSLSGR 4995 3327;10294;10681;14478;21042;21750;22352;28650;38271;42316;71164;73936;94561;96527;98571 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.1093 1.2882 21.092 46 16 Leave out requantified 0.78914 1.1458 1.1872 1.0589 0.66958 0.99896 0.73702 1.2618 1.2976 1.3223 1.3616 0.86916 1.066 1.007 19.803 29.473 9.5288 27.151 14.096 50.476 102.54 2 9 14 4 2 5 10 0 4 2 0 1 2 7 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Leave out requantified Median 5.2 21.8 27.8 8.8 5.7 8.1 22.9 8041300000 3649600000 4391600000 97735000 51588000 46147000 617480000 257700000 359780000 1094800000 419890000 674900000 451010000 170730000 280270000 65742000 38349000 27392000 4468800000 2169000000 2299800000 1245700000 542380000 703360000 21 72934000 31296000 41639000 1829900 1054700 775230 11624000 5392200 6231300 6040000 2695300 3344700 3905800 2214400 1691400 860980 501810 359170 8987400 4303000 4684500 39687000 15134000 24552000 298640000 376820000 401910000 557960000 401740000 726170000 0 0 0 0 258100000 313570000 514390000 388360000 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transport protein 27 homolog IFT27 sp|Q9BW83|IFT27_HUMAN Intraflagellar transport protein 27 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IFT27 PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 0 2 2 17.7 17.7 17.7 20.48 186 186 0 5.0383 By MS/MS By MS/MS 0.4574 0.66179 41.207 5 4 Median NaN NaN NaN NaN NaN 0.60131 0.69009 NaN NaN NaN NaN NaN 0.85079 0.99053 NaN NaN NaN NaN NaN 35.526 47.664 0 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 0 2 2 Median Median Median Median Median Median Plateau 0 0 0 0 0 9.1 12.9 632910000 432420000 200490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 134740000 78403000 56334000 498180000 354020000 144160000 12 52743000 36035000 16707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11228000 6533600 4694500 41515000 29502000 12013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ELFSEMLDK;SQAPGISLPGVLVGNK;TALAQIFR 5143 18691;78250;80887 True;True;True 19090;80178;82863 122761;522596;538528;538529;538530 181069;775254;798828;798829;798830;798831 181069;775254;798829 -1 Q9BW85 Q9BW85 3 3 3 Coiled-coil domain-containing protein 94 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MS/MS By MS/MS 1.0253 1.5474 54.446 28 1 Leave out requantified 0.82925 1.7162 1.6792 NaN NaN NaN 0.54801 1.284 1.8981 1.7843 NaN NaN NaN 0.79054 17.34 14.844 165.11 NaN NaN NaN 35.523 8 8 8 0 0 1 3 0 0 0 0 0 1 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Median 17 24.1 15.5 0 0 3 8 1823000000 960260000 862770000 359760000 185490000 174270000 544340000 202530000 341810000 669200000 430590000 238600000 0 0 0 0 0 0 47134000 13027000 34108000 202600000 128610000 73982000 21 14880000 6975900 7904500 8685700 4582400 4103300 902710 315900 586810 1169800 434380 735370 0 0 0 0 0 0 2244500 620330 1624200 1877800 1022900 854870 68231000 87608000 81811000 74150000 92052000 56036000 0 0 0 0 0 0 58038000 33811000 DNSNIILLGDSQGDLR;EGYENFFDK;GELIHVFNK;IGYLNDRVDELLEK;IIEMMPEFQK;IKNPTRVEEIICGLIK;MADGVANVEHILK;RCPTCHNIIDNCK;SHGLLVQQALPK;VVSNFMDFDETGVLKGFK 5311 13695;17536;27360;36931;37239;37724;57381;70024;75634;94396 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mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QRSL1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 4.2 4.2 4.2 57.46 528 528 0 2.7845 By MS/MS By MS/MS 4.637 6.55 299.65 2 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 Median Median Median Median Median Median Median 2.1 0 0 0 0 0 2.1 1291700000 53822000 1237900000 34323000 21703000 12620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1257300000 32119000 1225200000 28 46131000 1922200 44209000 1225800 775110 450700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44905000 1147100 43758000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AADLFESEGAK;LLDQGALLMGK 5315 228;50688 True;True 230;51784 1347;348095 1935;518163 1935;518163 -1 Q9H0R8 Q9H0R8 5 5 2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1 GABARAPL1 sp|Q9H0R8|GBRL1_HUMAN Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GABARAPL1 PE=1 SV=1 1 5 5 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 2 2 0 1 1 0 0 1 0 32.5 32.5 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Serine/threonine-protein kinase WNK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WNK1 PE=1 SV=2 1 18 18 15 3 0 2 4 3 5 15 3 0 2 4 3 5 15 2 0 1 4 3 4 12 10.3 10.3 9.5 250.79 2382 2382 0 87.763 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.82848 1.1303 18.797 39 11 Leave out requantified 0.74121 NaN 0.94414 0.79751 0.95802 0.67873 0.93781 1.1416 NaN 0.99057 1.0368 1.1823 0.95631 1.2876 14.836 NaN 104.85 9.6282 16.156 12.318 15.562 4 0 2 4 3 9 17 1 0 1 0 1 3 5 Leave out requantified Median Median Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 1.6 0 1.1 2.6 1.8 3 8.4 2064300000 1081100000 983170000 129480000 69788000 59688000 0 0 0 39187000 21112000 18075000 238130000 126910000 111220000 78319000 39738000 38580000 413700000 233790000 179910000 1165400000 589740000 575700000 58 26359000 13574000 12785000 2232300 1203200 1029100 0 0 0 272450 97203 175250 1774900 950540 824340 1113800 559120 554640 6523500 3652600 2870900 14442000 7110800 7331000 10452000 11932000 0 0 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protein 1 EPB41L1 sp|Q9H4G0|E41L1_HUMAN Band 4.1-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPB41L1 PE=1 SV=2 1 9 7 7 4 5 4 2 1 1 1 3 4 3 1 0 0 0 3 4 3 1 0 0 0 13.8 11.7 11.7 98.502 881 881 0 17.492 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching 0.44555 0.53612 120.3 13 4 Leave out requantified 0.26646 0.73604 0.33825 NaN NaN NaN NaN 0.38647 0.87197 0.39549 NaN NaN NaN NaN 82.096 120.32 118.05 NaN NaN NaN NaN 3 4 5 1 0 0 0 2 1 1 0 0 0 0 Median Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Median 5.6 6.7 6 4.1 1.4 1.4 1.4 682970000 348880000 334090000 88299000 54716000 33583000 239450000 150690000 88759000 285990000 105860000 180130000 69231000 37608000 31623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47 1555400 709570 845820 491110 166750 324360 1064300 542820 521460 5196400 1628100 3568300 1473000 800170 672840 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47259000 41209000 55793000 153430000 0 0 0 0 0 0 0 0 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-1 Q9HB40 Q9HB40 8 8 8 Retinoid-inducible serine carboxypeptidase SCPEP1 sp|Q9HB40|RISC_HUMAN Retinoid-inducible serine carboxypeptidase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCPEP1 PE=1 SV=1 1 8 8 8 0 0 1 3 2 4 6 0 0 1 3 2 4 6 0 0 1 3 2 4 6 20.6 20.6 20.6 50.83 452 452 0 28.52 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.0221 1.3711 11.49 20 6 Leave out requantified NaN NaN NaN 1.0084 0.96519 0.89994 0.87087 NaN NaN NaN 1.3773 1.2376 1.2834 1.2811 NaN NaN NaN 50.019 16.51 17.181 9.1456 0 0 1 3 2 6 8 0 0 0 2 1 0 3 Median Median Median Plateau Median Leave out requantified Leave out requantified 0 0 1.8 7.5 5.5 9.7 16.2 2521100000 1293200000 1227900000 0 0 0 0 0 0 17005000 5238800 11767000 686050000 359140000 326910000 113020000 58523000 54493000 648580000 339890000 308690000 1056400000 530440000 525990000 18 137510000 70529000 66977000 0 0 0 0 0 0 944750 291050 653700 38114000 19952000 18162000 6278700 3251300 3027400 36032000 18883000 17150000 57081000 28443000 28638000 0 0 0 0 0 0 81973000 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of RNA polymerase II transcription subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED4 PE=1 SV=1 1 4 4 4 1 0 0 0 1 0 3 1 0 0 0 1 0 3 1 0 0 0 1 0 3 21.9 21.9 21.9 29.745 270 270 0 21.682 By MS/MS By matching By MS/MS 0.74218 1.061 9.1468 6 0 Leave out requantified 0.74218 NaN NaN NaN NaN NaN 0.74791 1.1453 NaN NaN NaN NaN NaN 1.061 0 NaN NaN NaN NaN NaN 10.178 2 0 0 0 1 0 3 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Plateau 7.4 0 0 0 7.4 0 14.8 293200000 169660000 123550000 64434000 28255000 36179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3200600 2426800 773820 0 0 0 225570000 138970000 86592000 15 5890800 3627100 2263700 4295600 1883700 2412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 213370 161790 51588 0 0 0 5890800 3627100 2263700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ISASNAVCAPLTWVPGDPRR;LLQAGEENQVLELLIHR;LLSALEDLEVLSR;RPYPTDLEMR 5603 39888;51569;51739;72144 True;True;True;True 40776;52672;52843;73925 269207;269208;269209;354191;355207;355208;484878 401530;526884;526885;528396;719494 401530;526885;528396;719494 -1 Q9NPL8 Q9NPL8 4 4 4 Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial TIMMDC1 sp|Q9NPL8|TIDC1_HUMAN Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIMMDC1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 1 1 0 1 0 2 1 1 1 0 1 0 2 1 1 1 0 1 0 2 14.4 14.4 14.4 32.177 285 285 0 30.618 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.70655 0.89761 44.538 5 2 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.57729 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.89076 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1.0836 1 1 1 0 0 0 2 0 1 1 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 3.2 7.7 3.2 0 3.5 0 6.7 487140000 287420000 199720000 49116000 28868000 20248000 139620000 76807000 62816000 15690000 5818000 9871800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 282710000 175930000 106780000 16 11646000 7023400 4622800 3069700 1804200 1265500 8726400 4800400 3926000 980620 363630 616990 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7595800 4855500 2740300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FDAVQSAHR;IEALLNLPR;KIEALLNLPR;TAATAGIIGWVYGGIPAFIHAK 5604 22404;35827;42958;80710 True;True;True;True 22878;36617;43909;82684 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Median Median Leave out requantified 0 0 0 0 0 0.9 3.8 1205700000 761590000 444110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24807000 17707000 7100400 1180900000 743890000 437010000 82 13773000 8661400 5111600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 302530 215940 86590 13470000 8445400 5025000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ILSEDIER;LLETQEQEIEDGR;NWLLQGQLDDIKR;TFTMMGPSESDNFSHNLR;TSLLNLVDLAGSER 5684 38473;50939;64683;82166;85332 True;True;True;True;True 39314;52039;66363;84186;87426 259236;350042;442830;547230;569289 386310;521017;658445;811915;844630 386310;521017;658445;811915;844630 -1 Q9NS91 Q9NS91 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase RAD18 RAD18 sp|Q9NS91|RAD18_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RAD18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD18 PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 4.6 4.6 4.6 56.222 495 495 0.0076217 1.5698 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.98338 1.0772 14.866 4 0 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74753 1.0609 27.668 10 5 Leave out requantified NaN NaN NaN 0.89439 NaN 1.1963 0.68325 NaN NaN NaN 1.1675 NaN 1.6611 0.98309 NaN NaN NaN 15.119 NaN 6.8279 28.789 0 1 0 2 1 2 4 0 1 0 1 1 2 0 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 0 4.2 4.2 9.1 5 10.8 18.6 607610000 319770000 287840000 0 0 0 32220000 12513000 19707000 0 0 0 122580000 63288000 59289000 22528000 14097000 8431000 204320000 101020000 103300000 225970000 128850000 97119000 20 14804000 7799000 7004700 0 0 0 1611000 625640 985350 0 0 0 6128800 3164400 2964400 1126400 704850 421550 1023300 387970 635360 4914100 2916100 1998000 0 0 0 0 0 0 40770000 47598000 0 0 51419000 58487000 15690000 15455000 AIINSTVTPNMTFTK;ANTVYGLGFASEQHLTQFAEK;HALTVSYFYDATR;VAELEAQAASEVTPTGEK 5688 3762;5976;32349;86948 True;True;True;True 3851;6128;33062;89078 25900;25901;25902;25903;41899;41900;213232;581276;581277;581278;581279 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mitochondrial SIRT3 sp|Q9NTG7|SIR3_HUMAN NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIRT3 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 2 1 1 0 1 3 1 2 1 1 0 1 3 1 2 1 1 0 1 3 11 11 11 43.573 399 399 0 15.368 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.71908 1.1012 42.964 14 5 Leave out requantified NaN 0.52568 NaN NaN NaN NaN 0.75373 NaN 0.57394 NaN NaN NaN NaN 1.1077 NaN 10.663 NaN NaN NaN NaN 0.82864 1 4 1 1 0 1 6 1 3 0 0 0 0 1 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 2.8 8.3 4 2.8 0 2.8 9.8 1156400000 705650000 450700000 28813000 16954000 11859000 506770000 335420000 171350000 49601000 30416000 19185000 22920000 12431000 10489000 0 0 0 111330000 62265000 49062000 436920000 248170000 188760000 20 13606000 7612900 5993500 1440700 847700 592960 25339000 16771000 8567600 2480100 1520800 959260 1146000 621560 524450 0 0 0 5566300 3113200 2453100 6894000 3878100 3015900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1951;3815;3816;6399;15173;15752;18709;29572;31742;32369;32504;33145;36102;53068;54231;58279;61561;63798;63799;63800;64578;65140;70735;73968;79207;80059;80287;83205;88923;89454;100465 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Putative tRNA (cytidine(32)/guanosine(34)-2-O)-methyltransferase FTSJ1 sp|Q9UET6|TRM7_HUMAN Putative tRNA (cytidine(32)/guanosine(34)-2-O)-methyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 1 0 0 1 0 0 3 1 0 0 1 0 0 3 1 0 0 1 0 0 3 19.8 19.8 19.8 36.079 329 329 0 15.819 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.66009 0.94664 24.98 4 1 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.59491 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.91294 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 11.447 1 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 1 Median Median Median Median Median Median Median 4.9 0 0 5.5 0 0 14.3 183890000 108050000 75839000 17869000 7787400 10082000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 166020000 100260000 65757000 12 5695600 3421100 2274500 1489100 648950 840170 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5695600 3421100 2274500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 AVDLCAAPGSWSQVLSQK;IIVPFVTCGDLSSYDSDR;LLQLDKEFQLFQGVTR;SYPLDLEGGSEYK 6017 8149;37596;51635;80560 True;True;True;True 8349;38416;52738;82531 56563;252406;354656;354657;536361 83904;375714;527669;527670;795768 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LAMTOR3 LAMTOR3 sp|Q9UHA4|LTOR3_HUMAN Ragulator complex protein LAMTOR3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMTOR3 PE=1 SV=1 1 5 5 5 2 0 2 2 2 2 5 2 0 2 2 2 2 5 2 0 2 2 2 2 5 49.2 49.2 49.2 13.623 124 124 0 34.661 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.74031 1.0536 5.2412 19 5 Leave out requantified 0.36904 NaN 0.50033 0.42366 0.47028 0.7816 0.74031 0.57104 NaN 0.55472 0.58041 0.61757 1.1052 1.0299 4.3091 NaN 11.842 100.58 99.568 5.6995 4.699 2 0 2 2 2 4 7 1 0 0 1 1 1 1 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 26.6 0 41.1 26.6 26.6 41.1 49.2 2614100000 1516900000 1097200000 121300000 83623000 37674000 0 0 0 372950000 235420000 137530000 264080000 182290000 81783000 67532000 43550000 23982000 626920000 339170000 287750000 1161300000 632890000 528450000 7 42376000 32376000 9999700 12045000 8773500 3271900 0 0 0 53279000 33632000 19647000 24268000 19047000 5220600 5795500 4401100 1394400 6133500 3258400 2875100 267180 154420 112760 117020000 66821000 0 0 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chromatin condensation inducer in the nucleus OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACIN1 PE=1 SV=2 1 45 45 45 21 18 23 17 20 23 22 21 18 23 17 20 23 22 21 18 23 17 20 23 22 36.3 36.3 36.3 151.86 1341 1341 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.78153 1.038 16.878 245 38 Leave out requantified 0.66716 0.91215 0.93471 0.80121 0.74376 0.74462 0.66538 1.0616 0.98575 1.0798 1.0314 0.96846 1.052 0.99448 18.057 19.3 17.632 12.897 29.393 26.445 21.561 46 28 48 18 25 42 38 5 2 9 8 4 5 5 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified 22.5 17.7 20.9 17.2 22.9 26.4 23.2 23626000000 12782000000 10844000000 2661900000 1492600000 1169300000 3156500000 1597700000 1558800000 6024400000 3110400000 2914100000 1767200000 995000000 772250000 816960000 453200000 363760000 3906300000 2021700000 1884600000 5292900000 3111800000 2181100000 68 133030000 73629000 59400000 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matching By matching By MS/MS By MS/MS 0.72219 1.0056 11.757 8 1 Leave out requantified NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.72219 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1.0056 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 7.5414 1 0 1 0 0 1 5 0 0 0 0 0 0 1 Median Median Median Median Median Median Leave out requantified 6.3 2.3 9.3 2.3 2.3 6.3 14 424780000 247080000 177700000 57622000 34139000 23483000 0 0 0 33662000 17201000 16460000 0 0 0 0 0 0 71624000 43560000 28064000 261870000 152180000 109700000 16 8624800 5161400 3463400 3601400 2133700 1467700 0 0 0 2103900 1075100 1028800 0 0 0 0 0 0 4476500 2722500 1754000 546980 305210 241760 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FDDENFILK;HVVFGEVTEGLDVLR;IIPQFMCQGGDFTNHNGTGGK;PVWSDDDWLKK;SDVVPMTAENFR;TDWLDGK 6230 22413;34737;37448;65479;74182;81505 True;True;True;True;True;False 22888;35505;38266;67169;75993;83498 145448;230700;230701;230702;251198;447385;496120;496121;542692;542693;542694;542695;542696;542697;542698;542699;542700;542701;542702;542703;542704;542705;542706;542707;542708;542709 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(hydrolyzing);N-acetylmannosamine kinase GNE sp|Q9Y223|GLCNE_HUMAN Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNE PE=1 SV=1 1 19 19 19 5 4 13 2 0 2 7 5 4 13 2 0 2 7 5 4 13 2 0 2 7 35 35 35 79.274 722 722 0 47.841 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.2166 1.4175 51.761 38 12 Leave out requantified 0.98979 1.3626 1.504 0.35158 NaN 0.67045 0.65031 1.5575 1.516 1.8311 0.4595 NaN 0.93192 0.91007 61.785 13.585 25.651 90.153 NaN 18.573 30.671 6 5 16 2 0 2 7 4 1 6 0 0 0 1 Median Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Leave out requantified 7.6 10.9 28.4 3.5 0 2.9 10.9 2329700000 1121300000 1208400000 432560000 222670000 209890000 354990000 132260000 222730000 867260000 352500000 514760000 100050000 70951000 29101000 0 0 0 71715000 44030000 27685000 503170000 298930000 204240000 36 30379000 16596000 13784000 12015000 6185200 5830200 1751100 602640 1148500 3665900 1419100 2246800 1553300 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.63448 0.73383 12.983 50 10 Leave out requantified 0.4634 0.61617 0.61865 0.66791 1.0946 0.61584 0.65593 0.67075 0.656 0.66531 0.8493 1.4258 0.79695 0.93048 82.896 4.0161 10.643 14.841 70.3 12.619 2.61 6 5 11 4 2 12 10 3 0 2 1 1 1 2 Median Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Leave out requantified Leave out requantified 34 19.8 65.1 45.3 19.8 45.3 45.3 4984400000 2879100000 2105300000 725980000 306970000 419000000 448670000 276590000 172080000 804640000 473210000 331430000 158140000 83142000 74999000 31343000 12790000 18553000 1130000000 726780000 403240000 1685600000 999660000 685950000 5 425950000 225820000 200120000 97473000 30506000 66967000 47826000 28960000 18866000 63950000 36458000 27492000 11043000 6403700 4639400 1504700 822680 681990 62373000 38853000 23520000 141780000 83821000 57958000 125420000 84124000 164810000 164110000 111640000 137100000 16203000 20463000 0 0 75922000 59780000 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monooxygenase COQ6, mitochondrial COQ6 sp|Q9Y2Z9|COQ6_HUMAN Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COQ6 PE=1 SV=2 1 7 7 7 3 3 5 0 0 1 1 3 3 5 0 0 1 1 3 3 5 0 0 1 1 17.7 17.7 17.7 50.869 468 468 0 17.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.64283 0.74393 19.992 17 2 Leave out requantified 0.51279 0.61196 0.70066 NaN NaN 0.65609 NaN 0.80016 0.65841 0.75807 NaN NaN 0.8224 NaN 23.375 11.449 22.856 NaN NaN 10.249 NaN 4 4 6 0 0 2 1 0 1 1 0 0 0 0 Leave out requantified Leave out requantified Leave out requantified Median Median Median Median 9.6 9.8 14.5 0 0 3.6 3.6 818060000 496210000 321850000 142660000 96450000 46210000 428030000 259890000 168130000 135180000 75246000 59930000 0 0 0 0 0 0 45518000 27003000 18515000 66679000 37621000 29057000 17 5005300 2775900 2229400 1305900 813970 491890 1455000 738650 716300 2244500 1223300 1021200 0 0 0 0 0 0 2677500 1588400 1089100 3922300 2213000 1709300 0 0 176800000 116410000 76041000 72425000 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OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRPV2 PE=1 SV=1 1 7 7 7 6 2 2 0 0 0 0 6 2 2 0 0 0 0 6 2 2 0 0 0 0 10.1 10.1 10.1 85.98 764 764 0 20.188 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0.35378 0.5278 11.112 9 0 Leave out requantified 0.31373 0.50697 NaN NaN NaN NaN NaN 0.5018 0.57314 NaN NaN NaN NaN NaN 7.3171 3.6511 NaN NaN NaN NaN NaN 6 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Leave out requantified Median Median Median Median Median Median 8.8 5.5 5.5 0 0 0 0 310550000 208960000 101590000 140670000 103610000 37054000 98699000 62549000 36149000 71178000 42791000 28387000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32 5327100 3786800 1540300 3596200 2657100 939130 1730800 1129700 601180 2224300 1337200 887080 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 DGVNACILPLLQIDR;LCPTVQLEDIR;LETLDGGQEDGSEADR;LETLDGGQEDGSEADRGK;MVVLEPLNK;TSPSSSPVFRLETLDGGQEDGSEADRGK;YLTDSEYTEGSTGK 6487 11779;46309;47719;47720;60620;85407;97908 True;True;True;True;True;True;True 12051;47320;48752;48753;62202;87503;100297 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 GELVYQEEIEK + 6606 27382 True 27974 178926 264205 264205 -1 REV__Q6P474 REV__Q6P474 1 1 1 sp|Q6P474|PDXD2_HUMAN Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDXDC2P PE=5 SV=3 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 51.809 469 469 1 -2 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 72621000 40113000 32509000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72621000 40113000 32509000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 EGVASPTMNPVPVK + + 6607 17498 True 17877 114764 169776 169776 2047 58 -1 REV__Q6PIF6 REV__Q6PIF6 1 1 1 sp|Q6PIF6|MYO7B_HUMAN Unconventional myosin-VIIb OS=Homo sapiens OX=9606 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MS/MS 1.1203 1.3285 0.26106 2 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 2180800000 1045900000 1134900000 0 0 0 0 0 0 976340000 433280000 543060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1204400000 612630000 591800000 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 EDQVSLFSMSMAK + + 6613 16372 True 16736 108305;108306 160518;160519;160520;160521 160520 2050 370 -1 REV__Q8NE71 REV__Q8NE71 1 1 1 sp|Q8NE71|ABCF1_HUMAN ATP-binding cassette sub-family F member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCF1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 95.925 845 845 0.0091388 1.5008 By MS/MS NaN NaN NaN 1 0 Median NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Median Median Median Median Median Median Median 0 0 0 0 0 0 0 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