Raw file	Scan number	Scan index	Sequence	Length	Missed cleavages	Modifications	Modified sequence	Oxidation (M) Probabilities	Phospho (STY) Probabilities	Oxidation (M) Score diffs	Phospho (STY) Score diffs	Acetyl (Protein N-term)	Oxidation (M)	Phospho (STY)	Proteins	Gene Names	Protein Names	Charge	Fragmentation	Mass analyzer	Type	Scan event number	Isotope index	m/z	Mass	Mass error [ppm]	Mass error [Da]	Simple mass error [ppm]	Retention time	PEP	Score	Delta score	Score diff	Localization prob	Combinatorics	PIF	Fraction of total spectrum	Base peak fraction	Precursor full scan number	Precursor Intensity	Precursor apex fraction	Precursor apex offset	Precursor apex offset time	Diagnostic peak Phospho (STY) Y	Matches	Intensities	Mass deviations [Da]	Mass deviations [ppm]	Masses	Number of matches	Intensity coverage	Peak coverage	Neutral loss level	ETD identification type	Reverse	All scores	All sequences	All modified sequences	Reporter intensity corrected 1	Reporter intensity corrected 2	Reporter intensity corrected 3	Reporter intensity corrected 4	Reporter intensity corrected 5	Reporter intensity corrected 6	Reporter intensity 1	Reporter intensity 2	Reporter intensity 3	Reporter intensity 4	Reporter intensity 5	Reporter intensity 6	Reporter mass deviation [mDa] 1	Reporter mass deviation [mDa] 2	Reporter mass deviation [mDa] 3	Reporter mass deviation [mDa] 4	Reporter mass deviation [mDa] 5	Reporter mass deviation [mDa] 6	Reporter PIF	Reporter fraction	id	Protein group IDs	Peptide ID	Mod. peptide ID	Evidence ID	Oxidation (M) site IDs	Phospho (STY) site IDs
TMT1_phospho	19162	15820	AAAAAAAGDSDSWDADAFSVEDPVRK	26	1	Acetyl (Protein N-term),Phospho (STY)	_(Acetyl (Protein N-term))AAAAAAAGDS(Phospho (STY))DSWDADAFSVEDPVRK_		AAAAAAAGDS(0.967)DS(0.033)WDADAFSVEDPVRK		AAAAAAAGDS(14.62)DS(-14.62)WDADAFS(-46.87)VEDPVRK	1	0	1	O75822-2;O75822-3;O75822	EIF3J	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J	4	CID	TOF	MULTI-MSMS	5	0	679.54471	2714.1497	84306	57.289	NaN	75.95	3.9646E-09	49.638	40.947	14.621	0.96663	3	0.684343434343434	0.00156063513818963	0.0657144338448776	19157	1801	0.797608503100089	1	-0.058013916015625		y1;y2;y4;y5;y6;y8;y9;y11;y12;y14;y2-NH3;y4-NH3;y5-NH3;y9-NH3;y6(2+);y7(2+);y10(2+);y11(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);b4;b8	35;10;66;10;10;65;5;5;55;20;10;20;10;10;10;10;35;40;40;15;15;10;10;10	0.00891277655358635;0.00705859600907388;-0.00940560674564495;0.0110483226052338;-0.00168076873535483;0.00103905183937059;0.00509829013753915;-6.8308735762912E-05;-0.0110653295687371;0.00190129727457133;-0.000155765773683925;0.00482754220104198;0.0114476888643367;0.0156163860951892;-3.58974433538606E-05;-0.0079272367337353;0.00829242761233218;0.00546846982842908;0.00286259441804759;0.0167213867915734;-0.00424463293347799;-0.00358441017988298;0.0107298462645531;-0.0249378174357844	23.6873835164375;13.2588215152687;-12.9107904039061;13.0979730691663;-1.72817385412079;0.896764878257902;3.90454763749453;-0.0457894563059629;-7.08023105407811;1.02004103826405;-0.302252132454168;6.78533872453882;13.851021566189;12.1179915802873;-0.0737435671434578;-14.7805331418175;12.0375133490007;7.32647575046288;3.41015218314808;17.9325736368346;-4.34902778309231;-3.46819569227504;19.2872361634166;-30.1732735061322	376.266823535046;532.369788743691;728.507430714646;843.513919817295;972.569242004835;1158.66696451036;1305.73131918826;1491.80054260694;1562.84865341557;1863.94194277423;515.350454003974;711.466648464199;826.486971349536;1288.6942519908;486.787454748793;536.329553046184;688.882111438788;746.398406912572;839.433041197882;932.458838882258;975.995819106933;1033.50863040018;556.318498598835;826.486971349536	24	0.13596837944664	0.0676470588235294	None	Unknown		49.6375053683427;8.69022862912338;8.60052437497365	AAAAAAAGDSDSWDADAFSVEDPVRK;GSTEVPGASGVPGLSMPGEQEQLGVR;NAKMEVIHTDTQNMLFTPR	_(Acetyl (Protein N-term))AAAAAAAGDS(Phospho (STY))DSWDADAFSVEDPVRK_;_GST(Phospho (STY))EVPGAS(Phospho (STY))GVPGLSM(Oxidation (M))PGEQEQLGVR_;_NAKMEVIHT(Phospho (STY))DT(Phospho (STY))QNMLFT(Phospho (STY))PR_	26.531	29.726	24.252	19.773	34.088	46.997	25	30	25	20	35	45	8.0777	0.042414	2.2554	5.4903	4.6488	3.3878			0	92	1	0	0		123
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TMT1_phospho	11681	8808	SSPPEGKLETK	11	1	Acetyl (Protein N-term),Phospho (STY)	_(Acetyl (Protein N-term))S(Phospho (STY))SPPEGKLETK_		S(0.5)S(0.5)PPEGKLETK		S(0)S(0)PPEGKLET(-35.54)K	1	0	1	P51397	DAP	Death-associated protein 1	3	CID	TOF	MULTI-MSMS	6	0	432.2024	1293.5854	353480	152.78	NaN	48.607	0.0087645	46.592	11.908	0	0.49993	3	0.460488088320744	0.0008902276314862	0.0364765477628706	11675	1449	0.207385143838557	-6	0.347000122070313		y1;y2;y3;y4;y5;y6;y8;y8-H2O;y7(2+);y10(2+)	61;61;50;25;15;60;202;25;25;5	-0.0110239393865754;-0.00755850124306789;0.00442745763143648;0.0231497762064237;0.00943938659770538;0.025392132606612;-0.00916254530488914;0.00223934745258703;-0.00173367360514476;-0.00842476783464008	-29.2966443443887;-15.8349272644501;7.30167902184471;32.1780788232072;8.76697269981831;22.3974968261557;-6.73798834283023;1.66889808695884;-2.7436259609113;-10.9063163062024	376.286760250987;477.330973286943;606.361580424268;719.426922086094;1076.6985276344;1133.70403861199;1359.8339502381;1341.81198365905;631.891383827305;772.466852978485	10	0.142319074522464	0.0352112676056338	None	Unknown		46.5921037536858;34.6845349795389;24.3818188142406	SSPPEGKLETK;PQWELSPETK;MLSLILSETK	_(Acetyl (Protein N-term))S(Phospho (STY))SPPEGKLETK_;_PQWELS(Phospho (STY))PETK_;_MLS(Phospho (STY))LILS(Phospho (STY))ETK_	64.834	65.034	48.933	45.356	48.528	79.631	61	66	51	45	51	76	2.5805	1.1059	3.6827	1.1391	0.28718	2.6			2354	331	1644	1745	1907		400;401
TMT1_phospho	11760	8882	SSPPEGKLETK	11	1	Acetyl (Protein N-term),Phospho (STY)	_(Acetyl (Protein N-term))S(Phospho (STY))SPPEGKLETK_		S(0.5)S(0.5)PPEGKLETK		S(0)S(0)PPEGKLET(-49.86)K	1	0	1	P51397	DAP	Death-associated protein 1	3	CID	TOF	MULTI-MSMS	5	0	432.2024	1293.5854	353480	152.78	NaN	48.894	0.0023469	56.225	21.847	0	0.5	3	0.77953415963116	0.00382610515191421	0.41243286622631	11755	6681	0.956204379562044	-1	0.0580329895019531		y1;y2;y3;y6;y7;y8;y9;y3-H2O;y7-H2O;y8-H2O;b5	146;146;71;136;86;535;30;25;30;60;10	-0.00212349998133732;0.00473955806518234;0.00893581306047508;0.00205652269005441;0.0110315611022997;-0.00241943850255666;0.00202340276814539;0.00534440333080966;0.00566275957771722;-0.0102012320719496;0.0124256131721268	-5.64343589708054;9.9295466763835;14.7368827248717;1.81394816497734;8.7360642035546;-1.77922495583885;1.38886454543296;9.0837128127969;4.54929359969062;-7.60250885859253;14.6296099038979	376.277859811581;477.318675227635;606.357072068839;1133.72737422191;1262.7609922797;1359.8272071313;1456.87552814203;588.350098792269;1244.75579639492;1341.82442423857;849.346855709128	11	0.153985507246377	0.0318840579710145	None	Unknown		56.2250738237618;34.3783633291701;24.7916166735561	SSPPEGKLETK;PQWELSPETK;RCTTSFTITK	_(Acetyl (Protein N-term))S(Phospho (STY))SPPEGKLETK_;_PQWELS(Phospho (STY))PETK_;_RCT(Phospho (STY))TSFTITK_	112.1	189.49	114.69	96.404	89.779	180.79	106	187	121	96	96	172	0.47873	2.8062	4.1948	1.0311	1.4297	0.52523			2355	331	1644	1745	1907		400;401
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TMT1_phospho	11457	8598	SSSPVNVK	8	0	Acetyl (Protein N-term),Phospho (STY)	_(Acetyl (Protein N-term))SSS(Phospho (STY))PVNVK_		S(0.023)S(0.139)S(0.837)PVNVK		S(-15.54)S(-7.79)S(7.79)PVNVK	1	0	1	Q00839-2;Q00839	HNRNPU	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U	2	CID	TOF	MULTI-MSMS	6	0	470.21279	938.41103	243680	114.58	NaN	47.794	0.0071778	68.224	51.297	7.7872	0.83726	3	0.859824083250743	0.0130511307971335	0.963534556560772	11451	41643	0.232286890458181	3	-0.175251007080078		y1;y2;y3;y4;y5;y3-NH3;y4-NH3;y5-NH3;y6*;y7*;y7-H2O	1260;698;1468;377;116;177;81;25;25;111;457	-0.00191539246435468;-0.00399464974123021;0.00100267523248476;-0.000988795889725225;-0.0132064558954426;-0.00543167428054403;-0.000497637135254081;0.00645291087244004;0.00153251551830635;0.00203331449040434;0.00084448771622192	-5.09036998524989;-8.40362960133;1.70121975223992;-1.43625039184651;-16.8123425469679;-9.48986253164431;-0.741160731885804;8.39703145108613;1.79340546309182;2.1595172983772;0.914392731080034	376.277651704064;475.348144877541;589.386074999768;688.45648038709;785.521461899095;572.365960247781;671.429440126835;768.475253430828;854.528186651282;941.55971426221;923.550338402684	11	0.282440949519939	0.0282776349614396	Once	Unknown		68.2235357401295;16.9267936125019	SSSPVNVK;MDIDPYK	_(Acetyl (Protein N-term))SSS(Phospho (STY))PVNVK_;_(Acetyl (Protein N-term))M(Oxidation (M))DIDPYK_	216.82	224.27	157.6	191.89	223.18	219.62	204	227	167	188	229	212	1.1639	2.8645	0.94171	0.97213	1.489	0.46557			2371	402	1654	1755	1917		450
TMT1_phospho	4650	2222	SSSQPPGR	8	0	Phospho (STY)	_SSS(Phospho (STY))QPPGR_		S(0.028)S(0.129)S(0.843)QPPGR		S(-14.78)S(-8.14)S(8.14)QPPGR	0	0	1	P27987-2;P27987	ITPKB	Inositol-trisphosphate 3-kinase B	2	CID	TOF	MULTI-MSMS	8	0	448.18711	894.35966	255660	114.58	NaN	22.983	0.013156	57.859	29.162	8.1435	0.84272	3	0.353197042192258	0.000475415681340344	0.0141411678654151	4642	1057	0.874276261373036	2	-0.112916946411133		y4;y5;y4-NH3;y5-NH3;y7*;y7-H2O;b2;b4;b3*;b4*;b3-H2O;b4-H2O	18;8;10;8;3;3;8;3;13;15;5;10	-0.00514021176928736;0.00675950822346749;-0.0029212262518854;-0.017082555711454;-0.00203780323693081;-0.0163036155869349;-0.00810083032308739;-0.00677528680705564;0.000917598174794421;0.00292427688214048;-0.00301308588279881;-0.0098832612637807	-12.059117183274;12.1947240122571;-7.13848228596816;-31.7936217093816;-2.86869065046572;-23.5477601701926;-20.03953815648;-9.68869785051621;1.93890934100307;4.86316568720071;-6.61855671561479;-16.9433060298548	426.251083820369;554.297761611777;409.222315733352;537.295054574211;710.360051056737;692.363752182787;404.242366257723;699.297977043907;473.254811552825;601.311382385518;455.248177550583;583.313625237364	12	0.105691056910569	0.0764331210191083	Once	Unknown		57.8585895827441;28.6964884128051;20.2819432048522	SSSQPPGR;GTSSGPGPR;AAYTAYR	_SSS(Phospho (STY))QPPGR_;_GT(Phospho (STY))SSGPGPR_;_AAYT(Phospho (STY))AYR_	10.594	9.6804	14.668	20.816	9.0367	13.6	10	10	15	20	10	13	6.6399	1.7902	2.4222	2.4602	1.6029	1.2628			2372	266	1656	1756	1918		324
TMT1_phospho	9520	6783	SSSQSGSGPSSPDSVLRPR	19	1	Phospho (STY)	_S(Phospho (STY))SSQSGSGPSSPDSVLRPR_		S(0.276)S(0.276)S(0.276)QS(0.086)GS(0.086)GPS(0.001)SPDSVLRPR		S(0)S(0)S(0)QS(-5.07)GS(-5.07)GPS(-24.41)S(-34.91)PDS(-66.39)VLRPR	0	0	1	O75427	LRCH4	Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4	3	CID	TOF	MSMS	10		656.63213	1966.8746	NaN	NaN	NaN	40.778	6.5209E-11	90.084	68.243	0	0.27577	8	NaN	NaN	NaN	9510	1728	0.534984520123839	-2	0.115432739257813		y1;y2;y3;y4;y6;y8;y9;y10;y11;y16;y16-H2O;y1-NH3;y3-NH3;y4-NH3;y6-NH3;y8-NH3;y10-NH3;y11-NH3;y8(2+);y9(2+);y11(2+);y12(2+);y14(2+);b2;b8;b13;b8-H2O;b3*;b4*;b5*;b6*;b7*;b8*;b11*;b13*;b3-H2O;b4-H2O;b5-H2O;b7-H2O;b8-H2O;b11-H2O;b13-H2O	25;45;10;15;20;20;15;10;5;20;20;10;10;15;25;45;20;10;25;15;20;15;81;10;10;5;10;30;20;15;25;20;25;10;10;10;10;15;20;15;5;10	-0.00329914393040553;-0.00295113118409063;-0.0113880370831794;-0.00852392781087019;-7.38513657552176E-05;-0.0131210606031118;0.0257133657817121;-0.036203711537155;0.0159025172315523;0.0113555365815046;0.0224918650199015;-0.00251467124121518;0.000363009972204509;0.00894543174513274;-0.00910827040775075;0.00434817372240559;0.0207160181432755;-0.00516002417748496;-0.000957541399145612;-0.00195593308194475;0.005126820269993;0.0115068572597465;-0.00111313901084031;-0.0174817013374877;0.00230420009279442;0.0174465415650502;-0.00100941686901024;-0.00271722977726085;0.0116007200825834;0.000600232425085778;0.00379736964896438;-0.00754183555454802;0.0037538497604146;-0.0113804243546838;-0.019096183147667;0.0177781706893825;0.00972170209797696;-0.0114997425970387;-0.000631294563731899;0.000239917908743337;0.0151025224101886;0.0194710492203285	-18.8390904379372;-10.8427842122074;-26.5899061457791;-15.7452389369081;-0.101519848478205;-13.9652582090844;25.0484946875963;-32.5094279005401;13.135650605643;6.98025588310001;13.9806412418327;-15.9060852618926;0.88270778871803;17.0609702459318;-12.8206066458785;4.71343606274168;18.8919299168405;-4.32295895025748;-2.03613893027261;-3.80687166502396;8.46253708680182;18.140180981625;-1.57586015110638;-36.1029506093707;2.33361322971885;11.8637367488936;-1.0412922505852;-5.74153466893353;19.2926457305786;0.871992655297568;5.09465125991881;-9.06027004930723;4.22057088365964;-9.80606551713797;-13.9120425391452;39.053385680756;16.6668982709787;-17.1549033008408;-0.775174849942369;0.275321346837459;13.2186940145051;14.3741509175612	175.12225132493;272.174667164184;428.284215098183;541.365414969311;727.457407218966;939.550161312203;1026.54335529572;1113.63730078294;1210.63795840617;1626.80806716522;1608.78636615048;158.094917750741;411.245914949628;524.321396508255;710.439892536508;922.506142976378;1096.55383195176;1193.63247184608;470.273115900499;513.790128497132;605.82544187473;634.32979369954;706.369159762561;484.218077537137;987.395881824007;1470.57726703834;969.388630754669;473.258446380777;601.302705942317;688.345734839875;745.364001426251;832.407369041355;889.41753707964;1160.54949202555;1372.63691466835;455.227386294011;583.294020274002;670.347270128597;814.389893814064;871.410486325191;1142.51244439249;1354.58778274968	42	0.174079927748928	0.121037463976945	Once	Unknown		90.0835563828443;21.8407563133589;21.8407563133589	SSSQSGSGPSSPDSVLRPR;QDFMDLSICTREK;NESWLCFTMEVVK	_S(Phospho (STY))SSQSGSGPSSPDSVLRPR_;_QDFM(Oxidation (M))DLS(Phospho (STY))ICTREK_;_NESWLCFT(Phospho (STY))M(Oxidation (M))EVVK_	42.47	50.856	32.532	46.53	38.092	46.883	40	51	35	45	40	45	0.56079	2.0489	4.2774	3.6964	1.3466	1.0073			2373	84	1657	1757	1919		109;110;111
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TMT1_phospho	17297	14073	TQTPPVSPAPQPTEERLPSSPVYEDAASFK	30	1	2 Phospho (STY)	_TQT(Phospho (STY))PPVSPAPQPTEERLPS(Phospho (STY))SPVYEDAASFK_		T(0.204)QT(0.509)PPVS(0.273)PAPQPT(0.102)EERLPS(0.422)S(0.398)PVY(0.09)EDAAS(0.001)FK		T(-4.6)QT(3.14)PPVS(-3.14)PAPQPT(-8.93)EERLPS(0.27)S(-0.27)PVY(-7.1)EDAAS(-27.8)FK	0	0	2	Q14247-3;Q14247-2;Q14247	CTTN	Src substrate cortactin	5	CID	TOF	MULTI-MSMS	6	0	678.11041	3385.5156	135180	91.667	NaN	69.051	0.00011836	50.665	27.778	3.1436	0.50917	28	0.738865132369192	0.0045160674561513	0.508814814814815	17291	3383	0.936340990866316	-2	0.113967895507813		y1;y2;y3;y4;y5;y6;y9;y10;y13;y15;y5-H2O;y10-H2O;y5-NH3;y14(2+);a2;b2;b3;b6;b21;b2-H2O;b21-H2O;b3*;b4*;b6*;b7*;b8*;b9*;b24*;b7-H2O;b8-H2O;b9-H2O;b8-NH3;b28(2+)	227;152;197;96;45;45;15;15;25;15;25;10;20;25;30;91;40;25;15;20;10;374;75;20;25;25;20;15;45;70;45;30;15	-0.000819082904740753;-0.00766981477852369;-0.00366802724352056;0.00973215958811124;-0.00920199786787634;0.0121237045282214;0.039368938276084;0.0477589040917792;-0.0166239167158437;-0.0179348752510577;-0.00107223469694873;-0.0259388089730237;-0.0205528542064712;-0.012409677278697;8.97688369718708E-05;0.00697139456406148;-0.00582310191043689;0.0142444596433506;-0.0841763047069435;-0.00365025555322518;-0.100808368308208;0.00289685516429472;-1.21571769113871E-05;-0.0134827381107243;-0.0191022502981468;0.0352313608652821;-0.000726002439023432;0.0199275394502365;-0.00130412789815182;0.00643052611724215;0.0203568142810582;0.0112568554310428;0.029371803176673	-2.17681089347167;-14.6551793359574;-6.00941735472149;14.2825194284476;-12.2292250207986;13.9760121458051;31.2796385193917;35.2293500656137;-9.73979117554737;-9.07639654570028;-1.45993323201032;-19.390315170257;-27.9461695920991;-13.6302396145327;0.208144437578633;15.1793112046479;-9.09438636700279;15.2600107551996;-32.5345638275738;-8.27216732240456;-39.2358148968361;5.34168929910197;-0.0190144145495182;-16.1373093108456;-20.7061788516436;34.5562329465327;-0.665684651528892;6.91836714171296;-1.44180548929737;6.42054014168584;18.9793233732525;11.2283969880695;17.6754341643174	376.276555394505;523.351820042579;610.379846664944;681.403560265912;752.459608211168;867.465225540772;1258.61231585772;1355.65668974391;1706.80422364492;1975.99070961195;734.440913761697;1337.71982277067;735.444409966006;910.451879764879;431.281460202163;459.269493198536;640.29629657751;933.450170636157;2587.28855727281;441.269550162353;2569.29462465011;542.310681525736;639.366354390077;835.501002739211;922.538650661298;1019.53708090213;1090.61015205324;2880.38189388465;904.510287852598;1001.55531705058;1072.57850455022;1002.53450630607;1661.73022419827	33	0.213324360699865	0.0825	Once	Unknown		50.665469967784;22.8877946562565;18.8668469413836	TQTPPVSPAPQPTEERLPSSPVYEDAASFK;NSTQIVAMDATVNRYVVDFFSLCMPHFK;DGDSTVLYDILHLLLREGVTEDGHMNAVK	_TQT(Phospho (STY))PPVSPAPQPTEERLPS(Phospho (STY))SPVYEDAASFK_;_NSTQIVAM(Oxidation (M))DATVNRY(Phospho (STY))VVDFFSLCMPHFK_;_DGDSTVLY(Phospho (STY))DILHLLLREGVT(Phospho (STY))EDGHM(Oxidation (M))NAVK_	86.038	100.63	61.738	71.893	107.93	141.9	81	101	66	71	111	136	0.91007	3.749	1.1874	1.2137	0.35799	0.69874			2684	471	1850	1964	2152		574;577;578;1331;1332
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