Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides 55 Peptides 55_2 Peptides 70 Peptides 70_2 Peptides 71 Peptides 71_2 Razor + unique peptides 55 Razor + unique peptides 55_2 Razor + unique peptides 70 Razor + unique peptides 70_2 Razor + unique peptides 71 Razor + unique peptides 71_2 Unique peptides 55 Unique peptides 55_2 Unique peptides 70 Unique peptides 70_2 Unique peptides 71 Unique peptides 71_2 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type 55 Identification type 55_2 Identification type 70 Identification type 70_2 Identification type 71 Identification type 71_2 Sequence coverage 55 [%] Sequence coverage 55_2 [%] Sequence coverage 70 [%] Sequence coverage 70_2 [%] Sequence coverage 71 [%] Sequence coverage 71_2 [%] Intensity Intensity 55 Intensity 55_2 Intensity 70 Intensity 70_2 Intensity 71 Intensity 71_2 iBAQ peptides iBAQ iBAQ 55 iBAQ 55_2 iBAQ 70 iBAQ 70_2 iBAQ 71 iBAQ 71_2 LFQ intensity 55 LFQ intensity 55_2 LFQ intensity 70 LFQ intensity 70_2 LFQ intensity 71 LFQ intensity 71_2 MS/MS count 55 MS/MS count 55_2 MS/MS count 70 MS/MS count 70_2 MS/MS count 71 MS/MS count 71_2 MS/MS count Peptide sequences Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions Taxonomy IDs AT1G02500.2;AT1G02500.1;AT4G01850.2;AT4G01850.1;AT3G17390.1;AT2G36880.2;AT2G36880.1 AT1G02500.2;AT1G02500.1;AT4G01850.2;AT4G01850.1;AT3G17390.1 5;5;4;4;4;2;2 5;5;4;4;4;2;2 5;5;4;4;4;2;2 AT1G02500.2 | Symbols:METK1,SAM-1,AtSAM1,SAM1,MAT1 | S-adenosylmethionine synthetase 1,S-ADENOSYLMETHIONINE SYNTHETASE-1 | S-adenosylmethionine synthetase 1 | Chr1:519037-520218 FORWARD LENGTH=393;AT1G02500.1 | Symbols:METK1,SAM-1,AtSAM1,SAM1,MAT1 | S-a 7 5 5 5 3 5 2 2 1 1 3 5 2 2 1 1 3 5 2 2 1 1 15.3 15.3 15.3 43.158 393 393;393;393;393;393;390;390 0 40.066 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.2 15.3 6.4 6.4 2.5 2.5 34887000 9598100 16870000 3535400 3589200 654820 639170 20 493750 37578 456170 176770 179460 32741 31958 6457200 7375300 3159300 3921700 1878500 2147800 1 2 0 1 0 0 4 AIGFVSDDVGLDADK;FVIGGPHGDAGLTGR;SGAYIVR;TIFHLNPSGR;TNMVMVFGEITTK 0 114;734;1965;2183;2232 True;True;True;True;True 120;770;2073;2297;2348 551;552;4252;4253;4254;4255;10744;11871;11872;11873;11874;11875;11876;12134 327;3215;3216;7959;8863;9062 327;3216;7959;8863;9062 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT1G02780.1 AT1G02780.1 1 1 1 AT1G02780.1 | Symbols:emb2386 | embryo defective 2386 | Ribosomal protein L19e family protein | Chr1:608120-609391 REVERSE LENGTH=214 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 12.1 12.1 12.1 24.606 214 214 0 7.0627 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.1 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Symbols:c-NAD-MDH2 | cytosolic-NAD-dependent malate dehydrogenase 2 | 3 7 7 7 7 6 5 4 3 4 7 6 5 4 3 4 7 6 5 4 3 4 28.3 28.3 28.3 35.571 332 332;332;372 0 52.102 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 28.3 25 20.5 14.5 11.1 14.5 154070000 63289000 53950000 11641000 12866000 6913900 5411800 18 7150700 2574200 2903800 489060 618830 384110 180740 12685000 12931000 8051500 7920100 5271000 3981900 9 5 3 3 0 1 21 EFAPSIPEK;LSVPVSDVK;MELIDAAFPLLK;NGDWSIVQGLPIDEVSR;VLVTGAAGQIGYALVPMIAR;VLVVANPANTNALILK;VQTSSGEKPVR 9 490;1581;1658;1720;2505;2506;2560 True;True;True;True;True;True;True 515;1647;1731;1732;1809;2638;2639;2694 2622;2623;2624;2625;2626;2627;8579;8580;8936;8937;8938;8939;8940;8941;8942;8943;8944;8945;8946;9278;9279;13490;13491;13492;13493;13494;13495;13496;13497;13498;13745;13746;13747;13748 2042;2043;6392;6393;6394;6611;6612;6613;6614;6615;6616;6617;6618;6619;6620;6836;10073;10074;10075;10076;10077;10078;10265;10266;10267 2043;6394;6617;6836;10075;10077;10266 3 56 -1;-1;-1 AT1G04420.1 AT1G04420.1 2 2 2 AT1G04420.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr1:1191634-1193699 FORWARD LENGTH=412 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 5.6 5.6 5.6 46.427 412 412 0 11.481 By MS/MS By MS/MS 5.6 5.6 0 0 0 0 2585100 1266700 1318400 0 0 0 0 23 112400 55074 57323 0 0 0 0 805240 776670 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 AFQDLIVEGK;IVSIQNGYSLLVR 10 68;1231 True;True 72;1289 321;322;6819;6820 190;5071 190;5071 -1 AT3G04400.2;AT2G33370.2;AT3G04400.1;AT2G33370.1;AT1G04480.1 AT3G04400.2;AT2G33370.2;AT3G04400.1;AT2G33370.1;AT1G04480.1 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 AT3G04400.2 | Symbols:emb2171 | embryo defective 2171 | Ribosomal protein L14p/L23e family protein | Chr3:1167611-1168308 FORWARD LENGTH=125;AT2G33370.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L14p/L23e family protein 5 3 3 3 3 3 2 2 0 0 3 3 2 2 0 0 3 3 2 2 0 0 28.8 28.8 28.8 13.406 125 125;125;140;140;140 0 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UDP-glucosyltransferase 75B1 | Chr1:1645674-1647083 REVERSE LENGTH=469;AT1G05560.2 | Symbols:UGT1,UGT75B1 | UDP-GLUCOSE TRANSFERASE 1,UDP-glucosyltransferase 7 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 5.1 5.1 5.1 52.813 469 469;519 0 35.972 By MS/MS By MS/MS 5.1 5.1 0 0 0 0 11915000 5415200 6499600 0 0 0 0 20 595740 270760 324980 0 0 0 0 3874700 4202500 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 4 ALSDFIEATK;SVFELPNLSSLEIR 14 161;2109 True;True 167;2219 757;758;11448;11449 464;8510;8511;8512 464;8512 -1;-1 AT1G06430.3;AT1G06430.2;AT1G06430.1 AT1G06430.3;AT1G06430.2;AT1G06430.1 4;4;4 1;1;1 1;1;1 AT1G06430.3 | Symbols:FTSH8 | FTSH protease 8 | FTSH protease 8 | Chr1:1960214-1962525 REVERSE LENGTH=685;AT1G06430.2 | Symbols:FTSH8 | FTSH protease 8 | FTSH protease 8 | Chr1:1960214-1962525 REVERSE LENGTH=685;AT1G06430.1 | Symbols:FTSH8 | FTSH prot 3 4 1 1 3 3 2 1 4 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 12.4 4.1 4.1 73.198 685 685;685;685 0 8.6486 By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching 9.2 9.2 5.1 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no full name available | NAD(P)-binding Rossmann- 3 4 4 4 4 4 0 0 0 0 4 4 0 0 0 0 4 4 0 0 0 0 22.2 22.2 22.2 35.773 325 325;291;278 0 36.227 By MS/MS By MS/MS 22.2 22.2 0 0 0 0 22400000 11147000 11253000 0 0 0 0 17 945480 434860 510610 0 0 0 0 3465000 3317000 0 0 0 0 3 3 0 0 0 0 6 LGPNDVVDETFFTNPSFAEER;SLGIIEFTPTETSLR;TDPQVELINPAVNGTINVLR;VILTSSMAAVLAPETK 26 1426;2023;2144;2451 True;True;True;True 1488;2131;2256;2583 7843;7844;7845;7846;11055;11056;11619;11620;13257;13258 5815;5816;8195;8196;8631;9909 5816;8196;8631;9909 -1;-1;-1 AT1G09640.1;AT1G09640.2 AT1G09640.1;AT1G09640.2 3;2 1;1 1;1 AT1G09640.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Translation elongation factor EF1B%2C gamma chain | Chr1:3120162-3122152 FORWARD LENGTH=414;AT1G09640.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Translation elongation 2 3 1 1 3 3 2 1 2 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 9.4 4.6 4.6 46.66 414 414;265 0 30.268 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.4 9.4 7.2 4.6 6.8 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 35.4 35.4 35.4 37.6 27.1 27.1 35271000 11909000 12081000 4191300 2599100 2605600 1884400 10 3303500 1190900 1208100 419130 238420 154750 92147 4416600 3980900 2743000 1806100 1725700 1252300 3 4 1 0 2 1 11 DAVLLVFANK;HYFQNTQGLIFVVDSNDR;ILMVGLDAAGK;LGEIVTTIPTIGFNVETVEYK;MLNEDELR;NISFTVWDVGGQDK 29 347;1014;1133;1420;1673;1737 True;True;True;True;True;True 362;1062;1187;1482;1750;1828 1559;1560;1561;1562;1563;1564;5828;5829;5830;6398;6399;6400;6401;7809;7810;7811;7812;7813;7814;9004;9005;9006;9007;9462;9463;9464 987;988;989;4386;4387;4802;4803;5790;6657;6985;6986 987;4387;4802;5790;6657;6986 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT1G10760.3;AT1G10760.2;AT1G10760.1 AT1G10760.3;AT1G10760.2;AT1G10760.1 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT1G10760.3 | Symbols:GWD,GWD1,SOP1,SOP,SEX1 | STARCH EXCESS 1 | Pyruvate phosphate dikinase%2C PEP/pyruvate binding domain-containing protein | Chr1:3581210-3590043 REVERSE LENGTH=1399;AT1G10760.2 | Symbols:GWD,GWD1,SOP1,SOP,SEX1 | STARCH EXCESS 1 | Py 3 3 3 3 2 0 1 1 3 3 2 0 1 1 3 3 2 0 1 1 3 3 4.5 4.5 4.5 156.58 1399 1399;1399;1399 0 58.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.4 0 1.5 1.5 4.5 4.5 14552000 776320 0 1212900 2229500 5421300 4912300 69 18487 6693.2 0 17579 32311 8182.6 3611 585150 0 2171400 4444600 4619400 3930900 0 0 0 0 4 1 5 NNLDSPLVLGYPSKPIGLFIR;NVEPLLEGLLEAR;VRGEEEIPDGAVAVLTPDMPDVLSHVSVR 30 1766;1806;2564 True;True;True 1861;1902;2698 9663;9664;9665;9666;9667;9828;9829;9830;13754;13755 7185;7186;7187;7296;10272 7186;7296;10272 -1;-1;-1 AT1G11860.1;AT1G11860.2;AT1G11860.3 AT1G11860.1;AT1G11860.2;AT1G11860.3 11;11;11 11;11;11 11;11;11 AT1G11860.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glycine cleavage T-protein family | Chr1:4001801-4003245 FORWARD LENGTH=408;AT1G11860.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Glycine cleavage T-protein family | Ch 3 11 11 11 10 11 11 10 9 9 10 11 11 10 9 9 10 11 11 10 9 9 32.6 32.6 32.6 44.444 408 408;408;423 0 184.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 29.4 32.6 32.6 32.4 29.4 28.9 276240000 58711000 66924000 25932000 18444000 50836000 55389000 22 3986600 1397700 1488400 300300 260640 341980 197560 19468000 18663000 8298000 8720100 13103000 12952000 5 5 7 2 23 24 66 AEGGFLGADVILQQLK;GGAIDDSVITK;GGDVSWHIHDER;IGEITSGGFSPNLK;IGEITSGGFSPNLKK;RAEGGFLGADVILQQLK;SHSEVHDESGNK;SLLALQGPLAAPVLQHLTK;TALYDFHVAHGGK;TGYTGEDGFEISVPDEHAVDLAK;VGFFSSGPPAR 31 53;792;793;1067;1068;1876;1984;2031;2134;2172;2418 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 56;828;829;1118;1119;1976;2092;2139;2246;2286;2548 245;246;247;248;249;250;4534;4535;4536;4537;4538;4539;4540;4541;4542;4543;4544;4545;4546;4547;4548;4549;4550;4551;4552;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4563;4564;4565;4566;4567;4568;4569;4570;6087;6088;6089;6090;6091;6092;6093;6094;6095;10300;10301;10302;10303;10304;10807;10808;10809;10810;10811;11090;11091;11092;11093;11094;11095;11574;11575;11576;11577;11578;11579;11580;11581;11582;11583;11804;11805;11806;11807;11808;11809;13109;13110;13111;13112;13113;13114 150;151;152;153;154;155;3396;3397;3398;3399;3400;3401;3402;3403;3404;3405;3406;3407;3408;3409;3410;3411;3412;3413;3414;3415;3416;3417;3418;3419;3420;3421;3422;3423;4583;4584;7663;7664;7665;8008;8009;8010;8011;8215;8216;8217;8218;8219;8220;8221;8604;8605;8606;8607;8608;8609;8610;8611;8612;8613;8614;8615;8616;8784;8785;9819;9820;9821;9822 152;3396;3418;4583;4584;7664;8011;8218;8606;8784;9821 -1;-1;-1 AT1G11910.1;AT1G11910.2;AT1G62290.5;AT1G62290.2;AT1G62290.1 AT1G11910.1;AT1G11910.2 4;4;1;1;1 4;4;1;1;1 4;4;1;1;1 AT1G11910.1 | Symbols:ATAPA1,AtPaspA1,PaspA1,APA1 | aspartic proteinase A1,putative aspartic proteinase A1 | aspartic proteinase A1 | Chr1:4017119-4019874 REVERSE LENGTH=506;AT1G11910.2 | Symbols:ATAPA1,AtPaspA1,PaspA1,APA1 | aspartic proteinase A1,puta 5 4 4 4 4 3 3 3 1 1 4 3 3 3 1 1 4 3 3 3 1 1 14 14 14 54.613 506 506;517;486;513;513 0 32.232 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14 10.9 9.7 9.7 4.2 4.2 34285000 11560000 8552000 5202200 4047700 3433600 1489300 24 637560 289740 129020 114680 104120 143070 62053 4635600 2694900 4026400 3409800 5395500 2741200 3 4 2 1 1 0 11 FDGILGLGFQEISVGK;TVVDQYGQTILDLLLSETQPK;VFDLAPEEYVLK;VGEGPVAQCISGFIALDVAPPR 32 641;2304;2396;2415 True;True;True;True 673;2427;2525;2545 3592;3593;3594;12486;12487;12488;12489;12490;12491;13028;13029;13030;13031;13097;13098 2758;9280;9281;9282;9283;9284;9760;9761;9762;9805;9806 2758;9280;9762;9805 -1;-1;-1;-1;-1 AT1G12010.1 AT1G12010.1 1 1 1 AT1G12010.1 | Symbols:no symbol available | no full name 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ACAULIS 52,ribosomal protein L10,ribosomal protein L10 5 2 2 2 2 2 1 1 1 0 2 2 1 1 1 0 2 2 1 1 1 0 12.5 12.5 12.5 20.545 184 184;220;221;221;126 0 17.702 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.5 12.5 6 6 6.5 0 19425000 7037800 7727800 2063600 1819000 776520 0 10 1942500 703780 772780 206360 181900 77652 0 3791100 3911100 3067600 3011200 1489300 0 1 0 0 0 0 0 1 ENVSSEALEAAR;VAIGQVLLSVR 39 574;2324 True;True 604;2447 3215;3216;3217;12555;12556;12557;12558 2505;9326;9327;9328 2505;9326 -1;-1;-1;-1;-1 AT1G14810.1;AT1G14810.2 AT1G14810.1;AT1G14810.2 4;3 4;3 4;3 AT1G14810.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | semialdehyde dehydrogenase family protein | Chr1:5102684-5104633 REVERSE LENGTH=375;AT1G14810.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | semialdehyde dehydrogenase fami 2 4 4 4 3 4 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 17.9 17.9 17.9 40.745 375 375;306 0 22.728 By MS/MS By MS/MS 15.5 17.9 0 0 0 0 21543000 11094000 10449000 0 0 0 0 16 429140 148290 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photosystem II subunit 6 | Chr1:5446685-5447676 REVERSE LENGTH=258 1 5 5 5 3 3 4 3 5 5 3 3 4 3 5 5 3 3 4 3 5 5 33.3 33.3 33.3 27.522 258 258 0 57.744 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.7 14.7 25.6 14.7 33.3 33.3 145950000 35961000 35131000 15026000 12065000 28609000 19158000 12 10856000 2996700 2927500 1103500 1005400 1666400 1156700 25725000 23386000 12115000 14346000 22708000 17736000 2 4 0 0 5 5 16 DGVYEPDFEK;FFDPLGLAGK;GGGNFLDPEWLDGSLPGDFGFDPLGLGK;TAENFANYTGDQGYPGGR;WVDFFNPDSQSVEWATPWSK 42 368;661;798;2130;2669 True;True;True;True;True 383;694;834;2242;2807 1632;1633;1634;1635;1636;1637;3695;3696;3697;3698;3699;3700;4613;4614;4615;11557;11558;11559;11560;11561;11562;14296;14297;14298;14299 1026;1027;1028;2843;2844;2845;2846;2847;2848;3455;3456;8593;8594;10652;10653;10654 1028;2845;3455;8594;10652 -1 AT1G15930.2;AT1G15930.1 AT1G15930.2;AT1G15930.1 1;1 1;1 1;1 AT1G15930.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein | Chr1:5471702-5472741 FORWARD LENGTH=144;AT1G15930.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein 2 1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 9.7 9.7 9.7 15.377 144 144;144 0 9.5172 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.7 9.7 0 9.7 0 0 3152800 1278400 1410700 0 463720 0 0 9 350310 142040 156740 0 51524 0 0 1278400 1300300 0 827150 0 0 1 1 0 0 0 0 2 DFGEETTALSIVNK 43 360 True 375 1599;1600;1601 1009;1010 1010 -1;-1 AT1G79210.3;AT1G79210.2;AT1G79210.1;AT1G16470.2;AT1G16470.1 AT1G79210.3;AT1G79210.2;AT1G79210.1;AT1G16470.2;AT1G16470.1 2;2;2;2;2 2;2;2;2;2 2;2;2;2;2 AT1G79210.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein | Chr1:29796286-29798240 REVERSE LENGTH=235;AT1G79210.2 | Symbols:no symbol available | no full name availab 5 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 15.3 15.3 15.3 25.733 235 235;235;235;235;235 0 12.79 By MS/MS By MS/MS 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Ribosomal protein L6 family protein | Chr1:6377448-6378548 REVERSE LENGTH=233;AT1G74060.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L6 family protein | 3 2 2 2 1 2 1 1 0 0 1 2 1 1 0 0 1 2 1 1 0 0 10.7 10.7 10.7 26.152 233 233;233;233 0 21.867 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 6.4 10.7 6.4 6.4 0 0 30104000 8356800 18320000 1963500 1464000 0 0 12 2266600 584190 1396800 163630 122000 0 0 8188300 7842000 3604900 2993200 0 0 1 4 1 0 0 0 6 ASITPGTVLIILAGR;IDISGVNTEK 48 224;1038 True;True 234;1088 1026;1027;1028;1029;1030;1031;5943 644;645;646;647;648;4477 644;4477 -1;-1;-1 AT1G19570.1;AT1G19550.1 AT1G19570.1;AT1G19550.1 4;2 4;2 4;2 AT1G19570.1 | Symbols:ATDHAR1,DHAR1,DHAR5 | DEHYDROASCORBATE REDUCTASE 5,dehydroascorbate reductase | dehydroascorbate reductase | Chr1:6773462-6774413 REVERSE LENGTH=213;AT1G19550.1 | Symbols:DHAR | dehydroascorbate reductase | Glutathione S-transferas 2 4 4 4 4 4 3 2 2 2 4 4 3 2 2 2 4 4 3 2 2 2 30 30 30 23.641 213 213;153 0 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protein | Chr1:7912120-7914742 FORWARD LENGTH=527 3 5 5 5 5 4 3 4 0 0 5 4 3 4 0 0 5 4 3 4 0 0 14.2 14.2 14.2 58.326 527 527;347;507 0 104.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.2 11.8 6.6 11.8 0 0 41139000 16776000 14404000 3141800 6816500 0 0 26 603550 243980 198290 90701 70586 0 0 7157900 7163400 4336600 5510400 0 0 7 4 0 2 0 0 13 AFATGGYAAMQR;AYCQSAATLNLLR;LIEILNADNKPGR;TPAASSASAATTTPATLTKPVGVNVGK;TVTFDDLGSR 63 64;317;1443;2240;2301 True;True;True;True;True 67;68;331;1505;2357;2424 304;305;306;307;308;309;1417;7921;7922;7923;7924;12162;12163;12164;12472;12473;12474;12475 179;180;181;182;183;874;5892;5893;9085;9086;9087;9088;9089;9275 180;874;5892;9088;9275 -1;-1;-1 AT4G09800.1;AT1G34030.1;AT1G22780.1 AT4G09800.1;AT1G34030.1;AT1G22780.1 3;3;3 3;3;3 3;3;3 AT4G09800.1 | Symbols:RPS18C | S18 ribosomal protein | S18 ribosomal protein | Chr4:6173818-6174963 FORWARD LENGTH=152;AT1G34030.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S13/S18 family | 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spermidine synthase | Chr1:8420278-8422480 FORWARD LENGTH=327;AT1G23820.1 | Symbols:SPDS1 | spermidine synthase 1 | spermidine synthase | Chr1:8420410-8422724 FORWARD LENGTH=334 2 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 4 4 4 36.506 327 327;334 0.005891 6.1194 By MS/MS By MS/MS 4 4 0 0 0 0 2918300 1116000 1802300 0 0 0 0 20 145910 55798 90115 0 0 0 0 1116000 1661300 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 VNLVIGDGVAFLK 71 2513 True 2647 13533;13534 10113;10114 10114 -1;-1 AT1G24360.1 AT1G24360.1 2 2 2 AT1G24360.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr1:8640820-8643283 FORWARD LENGTH=319 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 10 10 10 33.548 319 319 0 11.659 By MS/MS By MS/MS 10 10 0 0 0 0 7630200 3965200 3665000 0 0 0 0 16 217510 113420 104090 0 0 0 0 2157000 1836700 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 IINISSVVGLIGNIGQANYAAAK;ILGTIPLGR 72 1104;1126 True;True 1156;1180 6264;6265;6371;6372 4712;4713;4791 4713;4791 -1 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LENGTH=183;AT1G27450.2 | Symbols:APT1,ATAPT1 | ARABID 4 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 10.4 10.4 10.4 19.739 183 183;183;243;284 0 26.473 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.4 10.4 10.4 0 10.4 0 5874400 1032300 1640400 1233700 0 1968000 0 10 587440 103230 164040 123370 0 196800 0 1032300 1512000 1976100 0 3190000 0 1 1 0 0 1 0 3 AIIIDDLIATGGTLAAAIR 76 116 True 122 559;560;561;562 331;332;333 333 -1;-1;-1;-1 AT1G29930.1;AT1G29920.1;AT1G29910.1 AT1G29930.1;AT1G29920.1;AT1G29910.1 7;7;7 7;7;7 2;2;2 AT1G29930.1 | Symbols:LHCB1.3,AB140,CAB140,CAB1 | LIGHT-HARVESTING CHLOROPHYLL A/B-PROTEIN 1.3,CHLOROPHYLL A/B PROTEIN 140,chlorophyll A/B binding protein 1 | chlorophyll A/B binding protein 1 | Chr1:10478071-10478874 FORWARD LENGTH=267;AT1G29920.1 | Sy 3 7 7 2 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 7 7 2 2 2 2 2 2 44.9 44.9 27.3 28.241 267 267;267;267 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 44.2 44.2 44.2 44.2 44.9 44.9 794470000 85998000 86425000 94392000 73278000 260320000 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2305;2306;2307;2308;2309;2310;2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320;2321;2322;2323;2324;2325;2326;2327;2328;2329;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;3802;3803;3804;3805;3806;3807;3808;3809;3810;3811;7255;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;10521;10522;10523;10524;10525;10526;10527;10528;10529;10530;10531;10532;10533;10534;10996;10997;10998;10999;11000;11001;11002;11003 2306;2867;3804;7255;9324;10523;11001 13 107 -1;-1;-1 AT2G34480.1;AT1G29965.1;AT2G34480.2;AT1G29970.2;AT3G14600.1 AT2G34480.1;AT1G29965.1;AT2G34480.2;AT1G29970.2;AT3G14600.1 2;2;2;2;1 2;2;2;2;1 2;2;2;2;1 AT2G34480.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L18ae/LX family protein | Chr2:14532916-14534161 REVERSE LENGTH=178;AT1G29965.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L18ae/LX fa 5 2 2 2 2 2 2 1 1 0 2 2 2 1 1 0 2 2 2 1 1 0 14.6 14.6 14.6 21.307 178 178;178;217;312;178 0 27.927 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.6 14.6 14.6 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related to ubiquitin 1,ARABIDOPSIS THALIANA RELATED TO UBIQUITIN 1 | related to ubiq 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 19.5 9.1 9.1 17.15 154 154;156 0 8.8946 By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching 19.5 19.5 10.4 10.4 10.4 10.4 1949200 830970 1118200 0 0 0 0 7 278460 118710 159750 0 0 0 0 830970 1030800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 EIEIDIEPTDTIDR;TITLEVESSDTIDNVK 81 524;2193 True;False 550;2307 2810;2811;11914;11915;11916;11917;11918;11919 2167;8887;8888;8889;8890;8891;8892;8893;8894 2167;8888 -1;-1 AT1G31812.1 AT1G31812.1 1 1 1 AT1G31812.1 | Symbols:ACBP6,ACBP,AtACBP6 | acyl-CoA-binding protein 6,ACYL-COA-BINDING PROTEIN | acyl-CoA-binding protein 6 | Chr1:11411132-11412099 REVERSE LENGTH=92 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 13 13 13 10.386 92 92 0 14.648 By MS/MS 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 SSEEAMNDYITK 82 2085 True 2194 11331 8435 8435 -1 AT1G31840.2;AT1G31840.1 AT1G31840.2;AT1G31840.1 1;1 1;1 1;1 AT1G31840.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr1:11424006-11426528 FORWARD LENGTH=811;AT1G31840.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Tetratricopepti 2 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1.6 1.6 1.6 90.787 811 811;840 0.005848 6.0905 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 0 2937400 262010 352750 590220 879950 852510 0 55 53408 4763.8 6413.6 10731 15999 15500 0 262010 325150 945380 1569600 1381900 0 0 0 1 0 0 0 1 IYEAFGMYGQILK 83 1242 True 1301 6887;6888;6889;6890;6891 5107 5107 -1;-1 AT1G32060.1 AT1G32060.1 12 12 12 AT1G32060.1 | Symbols:PRK | phosphoribulokinase | phosphoribulokinase | Chr1:11532668-11534406 FORWARD LENGTH=395 1 12 12 12 10 11 10 10 12 11 10 11 10 10 12 11 10 11 10 10 12 11 50.6 50.6 50.6 44.463 395 395 0 234.67 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 47.6 47.6 47.6 47.6 50.6 50.6 321570000 44742000 60977000 25456000 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protein 2 | one-helix protein 2 | Chr1:12358151-12358902 REVERSE LENGTH=172 1 3 3 3 3 3 2 2 2 1 3 3 2 2 2 1 3 3 2 2 2 1 21.5 21.5 21.5 18.665 172 172 0 17.662 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 21.5 21.5 16.3 14.5 16.3 9.3 13181000 3710100 4675900 1483300 1717800 1046300 547790 13 633650 210360 269070 56818 73707 23688 42138 1465200 1681000 1659700 1657800 1247600 1238900 1 1 0 0 0 0 2 ILLSNFGILDLE;KLEAAGQGPFFGFQPK;SVTTVEFQR 89 1132;1283;2115 True;True;True 1186;1343;2225 6394;6395;6396;6397;7142;7143;7144;7145;7146;7147;11469;11470;11471 4801;5302;8522 4801;5302;8522 -1 AT1G35720.1 AT1G35720.1 2 2 2 AT1G35720.1 | Symbols:ANNAT1,ATOXY5,OXY5,ANN1,AtANN1 | annexin 1 | annexin 1 | Chr1:13225304-13226939 FORWARD LENGTH=317 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 2 10.4 10.4 10.4 36.203 317 317 0 12.557 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.4 5.7 10.4 5.7 10.4 10.4 31317000 1645800 1003800 2497000 2829600 13046000 10294000 21 1491300 78373 47798 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binding family protein | Chr1:16871768-16873194 FORWARD LENGTH=265;AT1G44575.3 | Symbols:CP22,PSBS,NPQ4 | NONPHOTOCHEMICAL QUENCHING 4,PHOTOSY 3 6 6 6 5 6 5 5 5 5 5 6 5 5 5 5 5 6 5 5 5 5 27.5 27.5 27.5 28.007 265 265;265;205 0 66.047 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.8 27.5 20.8 20.8 20.8 20.8 147600000 53036000 48936000 10687000 6978600 16496000 11462000 13 9930900 3614300 3238600 730640 476080 1093500 777730 16718000 14555000 5324100 4018400 8773100 6793300 3 6 1 2 1 1 14 ANELFVGR;EQGPLFGFTK;FVDDPPTGLEK;SKVEDGIFGTSGGIGFTK;VAMIGFAASLLGEALTGK;VEDGIFGTSGGIGFTK 96 179;576;728;2013;2332;2378 True;True;True;True;True;True 188;606;764;2121;2457;2505 834;835;836;837;838;839;3222;3223;3224;3225;3226;3227;4227;4228;4229;4230;4231;4232;10976;10977;10978;10979;10980;10981;12620;12941;12942;12943;12944;12945;12946 513;514;515;516;517;518;519;520;521;522;2507;3202;8142;8143;9396;9697 515;2507;3202;8142;9396;9697 -1;-1;-1 AT1G45201.1;AT1G45201.3 AT1G45201.1;AT1G45201.3 1;1 1;1 1;1 AT1G45201.1 | Symbols:TLL1,ATTLL1 | ARABIDOPSIS THALIANA TRIACYLGLYCEROL LIPASE-LIKE 1,triacylglycerol lipase-like 1 | triacylglycerol lipase-like 1 | Chr1:17123889-17128462 FORWARD LENGTH=479;AT1G45201.3 | Symbols:TLL1,ATTLL1 | ARABIDOPSIS THALIANA TRI 2 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 4.6 4.6 4.6 54.776 479 479;504 0.0015601 6.3815 By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 4.6 4.6 3722100 0 0 0 0 1681000 2041100 26 143160 0 0 0 0 64655 78503 0 0 0 0 2724800 3875300 0 0 0 0 1 1 2 VVGIVFPGGSNHFPFDYVNSTR 97 2625 True 2761 14065;14066 10461;10462 10461 -1;-1 AT1G47128.1 AT1G47128.1 3 3 3 AT1G47128.1 | Symbols:RD21,RD21A | responsive to dehydration 21A,responsive to dehydration 21 | Granulin repeat cysteine protease family protein | Chr1:17283139-17285609 REVERSE LENGTH=462 1 3 3 3 3 3 3 3 2 1 3 3 3 3 2 1 3 3 3 3 2 1 10.2 10.2 10.2 50.966 462 462 0 20.388 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.2 10.2 10.2 10.2 7.8 4.3 58899000 19358000 22641000 7434400 6698800 1756500 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| Symbols:SDH5 | succinate dehydrogenase 5 | succinate dehydrogenase 5 | Chr1:17395774-17397176 REVERSE LENGTH=257 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 6.2 6.2 6.2 28.106 257 257 0 20.064 By MS/MS By MS/MS 6.2 6.2 0 0 0 0 3942700 1960900 1981800 0 0 0 0 16 246420 122560 123860 0 0 0 0 1960900 1826800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 AAEAVEEFGGILTSIK 100 3 True 3 15;16 10 10 -1 AT1G48030.5;AT1G48030.4;AT1G48030.3;AT1G48030.2;AT1G48030.1 AT1G48030.5;AT1G48030.4;AT1G48030.3;AT1G48030.2;AT1G48030.1 7;7;7;7;7 7;7;7;7;7 5;5;5;5;5 AT1G48030.5 | Symbols:mtLPD1 | mitochondrial lipoamide dehydrogenase 1 | mitochondrial lipoamide dehydrogenase 1 | Chr1:17717432-17719141 REVERSE LENGTH=507;AT1G48030.4 | Symbols:mtLPD1 | mitochondrial lipoamide dehydrogenase 1 | mitochondrial lipoamide 5 7 7 5 6 6 1 1 4 2 6 6 1 1 4 2 4 4 0 0 3 1 19.9 19.9 14.8 53.987 507 507;507;507;507;507 0 103.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.4 17.4 2.2 2.2 13.6 7.1 65625000 24976000 22785000 785710 648200 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Symbols:RABG3c,ATRAB7D,ATRABG3C | RAB GTPase homolog G3C | RAB GTPase homolog G3C | Chr3 5 2 2 2 2 2 2 2 1 0 2 2 2 2 1 0 2 2 2 2 1 0 10.2 10.2 10.2 23.102 206 206;206;206;206;206 0 11.031 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.2 10.2 10.2 10.2 4.9 0 15079000 2432200 2760900 4787600 4211400 887020 0 13 1159900 187090 212380 368280 323960 68233 0 1779600 1793500 5368400 5351100 1472600 0 0 0 1 2 0 0 3 ATIGADFLTK;GNIPYFETSAK 107 248;896 True;True 258;939 1129;1130;1131;1132;1133;5038;5039;5040;5041 707;708;3751 707;3751 -1;-1;-1;-1;-1 AT3G15980.1;AT3G15980.7;AT3G15980.6;AT3G15980.4;AT3G15980.3;AT3G15980.2;AT1G52360.3;AT1G52360.4;AT1G52360.1;AT3G15980.5;AT1G52360.2 AT3G15980.1;AT3G15980.7;AT3G15980.6;AT3G15980.4;AT3G15980.3;AT3G15980.2;AT1G52360.3;AT1G52360.4;AT1G52360.1;AT3G15980.5;AT1G52360.2 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT3G15980.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Coatomer%2C beta subunit | Chr3:5411699-5418313 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Symbols:ZKT | protein containing PDZ domain, a K-box domain, and a TPR region | protein containing PDZ domain%2C a K-box domain%2C and a TPR region | Chr1:20713822-20715351 FORWARD LENGTH=335 1 2 2 2 2 2 1 0 0 0 2 2 1 0 0 0 2 2 1 0 0 0 10.7 10.7 10.7 37.41 335 335 0 17.458 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.7 10.7 4.8 0 0 0 6485700 3037200 2989500 459070 0 0 0 22 294810 138050 135890 20867 0 0 0 1870800 1687300 736000 0 0 0 2 2 0 0 0 0 4 LNQVQAGLSALEEALK;VIATSAVFGTEIWPAAEYGR 117 1516;2437 True;True 1582;2568 8267;8268;8269;13200;13201 6132;6133;9879;9880 6132;9879 -1 AT3G13470.1;AT1G55490.5;AT1G55490.4;AT1G55490.3;AT1G55490.2;AT1G55490.1;AT5G56500.2;AT5G56500.1;AT1G26230.5;AT1G26230.3;AT1G26230.2;AT1G26230.4;AT1G26230.1 AT3G13470.1;AT1G55490.5;AT1G55490.4;AT1G55490.3;AT1G55490.2;AT1G55490.1;AT5G56500.2;AT5G56500.1 13;13;13;13;13;13;10;10;1;1;1;1;1 13;13;13;13;13;13;10;10;1;1;1;1;1 13;13;13;13;13;13;10;10;1;1;1;1;1 AT3G13470.1 | Symbols:Cpn60beta2 | chaperonin-60beta2 | TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | Chr3:4389685-4392624 FORWARD LENGTH=596;AT1G55490.5 | Symbols:Cpn60beta1,LEN1,CPN60B | chaperonin-60beta1,LESION INITIATION 1,chaperonin 60 beta | chaperonin 13 13 13 13 13 13 11 10 7 9 13 13 11 10 7 9 13 13 11 10 7 9 29.5 29.5 29.5 63.341 596 596;600;600;600;600;600;597;597;470;551;551;559;611 0 194.5 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 29.5 29.5 24.3 20.3 15.6 19.5 243470000 83765000 92223000 31769000 18990000 8039800 8681300 34 6190300 2092100 2351100 706580 548720 236470 255330 15368000 15564000 7682100 7788900 3971700 3616400 11 10 6 4 1 1 33 AAVEEGIVVGGGCTLLR;DLVGVLEDAIR;EVELEDPVENIGAK;GVVTLEEGK;GYISPYFVTDSEK;IVNDGVTVAR;LADLVGVTLGPK;NAGVNGSVVSEK;SQYLDDIAILTGATVIR;TNDLAGDGTTTSVVLAQGFIAEGVK;VEDALNATK;VVAAGANPVLITR;YEDLMAAGIIDPTK 118 19;401;602;966;971;1227;1319;1700;2082;2228;2377;2599;2698 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 20;418;633;1012;1017;1285;1379;1788;2191;2344;2504;2735;2837 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Symbols:LOS1 | LOW EXPRESSION OF OSMOTICALLY RESPONSI 5 12 12 12 11 12 6 6 5 3 11 12 6 6 5 3 11 12 6 6 5 3 23.7 23.7 23.7 93.89 843 843;843;843;820;788 0 218.26 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 22.3 23.7 14.4 14.5 11.9 7.8 124930000 47254000 48575000 10190000 6624800 9076400 3211400 44 1613700 693860 733290 84536 47004 41474 13509 11431000 12171000 4723200 3650300 4631800 2561300 12 7 4 2 2 1 28 AYLPVVESFGFSSQLR;DLQDDFMGGAEIIK;EAMTPLSEFEDKL;GFVQFCYEPIK;GGGQVIPTAR;LLEPVYMVEIQAPEGALGGIYSVLNQK;LWGENFFDPATR;PMEEGLAEAIDDGR;STGISLYYEMTDESLK;STLTDSLVAAAGIIAQEVAGDVR;VENLYEGPLDDQYANAIR;VIENANVIMATYEDPLLGDVQVYPEK 119 321;396;474;789;799;1480;1636;1836;2096;2099;2383;2443 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 335;412;499;825;835;1542;1543;1704;1934;2205;2208;2510;2574 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calreticulin 1a | Chr1:21090059-21092630 REVERSE LENGTH=425;AT1G56340.2 | Symbols:AtCRT1a,CRT1,CRT1a | calreticulin 1a,calreticulin 1 | calreticulin 1a | Chr1:21090022-21092630 3 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 5.6 5.6 5.6 48.527 425 425;424;424 0 13.338 By MS/MS By MS/MS 5.6 5.6 0 0 0 0 8366800 4041600 4325200 0 0 0 0 27 309880 149690 160190 0 0 0 0 2134900 2098500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 FYAISAEFPEFSNK;LLSDDVDQTK 122 740;1492 True;True 776;1556 4276;4277;8149;8150 3233;6043 3233;6043 -1;-1;-1 AT1G56590.1 AT1G56590.1 1 1 1 AT1G56590.1 | Symbols:ZIP4,AP3M | ZIG SUPPRESSOR 4,adaptor protein-3 mu-adaptin | Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein | Chr1:21202250-21204697 REVERSE LENGTH=415 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 4.3 4.3 4.3 46.312 415 415 0 7.9769 By MS/MS 0 0 4.3 0 0 0 125430000 0 0 125430000 0 0 0 19 6601600 0 0 6601600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 2 MLQCIFLISDSGEVMLEK 123 1674 True 1751 9008 6658;6659 6658 26 1 -1 AT1G57720.2;AT1G57720.1 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1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 AT3G57490.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S5 family protein | Chr3:21279824-21280887 REVERSE LENGTH=276;AT1G59359.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S5 family protein 6 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 5.4 5.4 5.4 30.116 276 276;284;284;284;284;285 0 23.746 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.4 5.4 5.4 5.4 5.4 0 10652000 2990000 3548500 1389300 1144700 1579100 0 15 710110 199330 236570 92617 76311 105270 0 2990000 3271000 2225200 2041800 2559600 0 1 1 1 0 1 0 4 VLQFAGIDDVFTSSR 125 2497 True 2630 13461;13462;13463;13464;13465 10053;10054;10055;10056 10054 -1;-1;-1;-1;-1;-1 AT1G60680.2;AT1G60750.1;AT1G60730.1;AT1G60710.1;AT1G60680.1;AT1G60730.3;AT1G60690.1 AT1G60680.2;AT1G60750.1;AT1G60730.1;AT1G60710.1;AT1G60680.1;AT1G60730.3;AT1G60690.1 2;2;2;2;2;2;1 2;2;2;2;2;2;1 2;2;2;2;2;2;1 AT1G60680.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | Chr1:22348196-22349236 REVERSE LENGTH=245;AT1G60750.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-linked oxidored 7 2 2 2 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 11 11 11 27.035 245 245;330;345;345;346;365;345 0 11.716 By MS/MS By MS/MS 11 5.3 0 0 0 0 4271600 2711000 1560500 0 0 0 0 13 328580 208540 120040 0 0 0 0 1289100 1867400 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 ELGIGIVAYSPLGR;YIGLSEASASTIR 126 554;2723 True;True 581;2862 2992;14600;14601 2334;10951 2334;10951 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT1G60950.1 AT1G60950.1 1 1 1 AT1G60950.1 | Symbols:ATFD2,FD2,FED A | FERREDOXIN 2 | 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein | Chr1:22444565-22445011 FORWARD LENGTH=148 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 23 23 23 15.539 148 148 0.0058737 6.1066 By MS/MS 23 0 0 0 0 0 468780 468780 0 0 0 0 0 5 93756 93756 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 FITPEGELEVECDDDVYVLDAAEEAGIDLPYSCR 127 688 True 722 3867 2950 2950 -1 AT1G61520.2;AT1G61520.3;AT1G61520.1 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Symbols:no symbol available | no full name available | Vacuolar calcium-binding protein-like protein | Chr1:23128799-23129548 FORWARD LENGTH=152 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 19.7 19.7 19.7 16.628 152 152 0 7.169 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.7 19.7 19.7 0 0 0 6260600 2607800 3116000 536800 0 0 0 10 626060 260780 311600 53680 0 0 0 2607800 2872300 859820 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 AVESEEVTTVSESLPAPVTESQAPVEVTTK 130 284 True 296 1285;1286;1287 796;797 796 -1 AT1G62750.1 AT1G62750.1 2 2 2 AT1G62750.1 | Symbols:ATSCO1/CPEF-G,ATSCO1,SCO1 | SNOWY COTYLEDON 1 | Translation elongation factor EFG/EF2 protein | Chr1:23233622-23236321 REVERSE LENGTH=783 1 2 2 2 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 3.8 3.8 3.8 86.057 783 783 0 16.835 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9 1.9 1.9 0 3.8 1.9 9259300 1737700 1540700 618440 0 3684100 1678300 43 129440 40412 35831 14382 0 38813 39029 2251800 1840300 1283600 0 3173100 2052400 1 1 0 0 2 1 5 PLVLQIPIGAEDVFK;RGQINSFGDKPGGLK 131 1835;1879 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3375;3376;4455;4456;4457;4458;4459;4460;4461;4462;4616;4617;4618;4619;4620;4621;4622;4623;4624;4625;4626;4627;6138;6139;6140;6141;6142 3375;4455;4617;6140 29 17 -1;-1;-1;-1;-1 AT1G64200.3;AT4G11150.1;AT1G64200.2;AT1G64200.1 AT1G64200.3;AT4G11150.1;AT1G64200.2;AT1G64200.1 2;2;2;2 2;2;2;2 2;2;2;2 AT1G64200.3 | Symbols:VHA-E3 | vacuolar H+-ATPase subunit E isoform 3 | vacuolar H+-ATPase subunit E isoform 3 | Chr1:23828914-23830002 REVERSE LENGTH=192;AT4G11150.1 | Symbols:VHA-E1,emb2448,TUF,TUFF | vacuolar ATP synthase subunit E1,embryo defective 4 2 2 2 2 2 0 1 0 0 2 2 0 1 0 0 2 2 0 1 0 0 10.9 10.9 10.9 22.415 192 192;230;237;237 0 11.827 By MS/MS By MS/MS By matching 10.9 10.9 0 4.2 0 0 7403600 3496100 3519200 0 388290 0 0 11 673060 317830 319930 0 35299 0 0 2046000 1894700 0 692690 0 0 0 2 0 0 0 0 2 LQLVEAEK;VLQAQDDIVNAMK 136 1536;2496 True;True 1602;2629 8342;8343;8344;13459;13460 6192;10052 6192;10052 -1;-1;-1;-1 AT1G64550.1 AT1G64550.1 1 1 1 AT1G64550.1 | Symbols:AtABCF3,AtGCN20,SCORD5,GCN3,ATGCN3,GCN20,ABCF3 | general control non-repressible 20,susceptible to coronatine-deficient Pst DC3000 5,general control non-repressible 3,ATP-binding cassette F3 | general control non-repressible 3 | Chr 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2 2 2 79.643 715 715 0.0015723 6.4276 By MS/MS 0 2 0 0 0 0 774910 0 774910 0 0 0 0 33 23482 0 23482 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 TEVASSVVYEVLGR 137 2153 True 2265 11659 8672 8672 -1 AT1G65260.2;AT1G65260.1 AT1G65260.2;AT1G65260.1 1;1 1;1 1;1 AT1G65260.2 | Symbols:PTAC4,VIPP1 | VESICLE-INDUCING PROTEIN IN PLASTIDS 1,plastid transcriptionally active 4 | plastid transcriptionally active 4 | Chr1:24236914-24240428 FORWARD LENGTH=259;AT1G65260.1 | Symbols:PTAC4,VIPP1 | VESICLE-INDUCING PROTEIN I 2 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 4.2 4.2 4.2 28.912 259 259;330 0 6.7989 By MS/MS By matching 4.2 4.2 0 0 0 0 3715300 1563600 2151700 0 0 0 0 16 232200 97724 134480 0 0 0 0 1563600 1983400 0 0 0 0 1 0 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.9 19.9 11.4 11.4 11.4 11.4 128180000 47656000 50738000 11567000 10558000 5213200 2446900 11 9344500 3432400 3682000 831180 782580 433380 183050 35519000 34492000 13429000 14223000 4610100 3706700 2 5 1 1 1 1 11 GNNILVMCDAYTPAGEPIPTNKR;SLLADLVNLDISDNSEK;TLPGPVTDPSK;TLPGPVTDPSKLPK 142 897;2030;2214;2215 True;True;True;True 940;2138;2329;2330 5042;5043;11084;11085;11086;11087;11088;11089;12031;12032;12033;12034;12035;12036;12037;12038;12039;12040;12041 3752;3753;3754;3755;8209;8210;8211;8212;8213;8214;8987;8988 3754;8210;8987;8988 -1;-1;-1 AT1G66970.3;AT1G66970.1;AT1G66970.2 AT1G66970.3;AT1G66970.1;AT1G66970.2 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT1G66970.3 | Symbols:SVL2,GDPDL1 | SHV3-like 2,Glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDPD) like 1 | SHV3-like 2 | Chr1:24992746-24995054 REVERSE LENGTH=569;AT1G66970.1 | Symbols:SVL2,GDPDL1 | SHV3-like 2,Glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDPD 3 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 6.3 6.3 6.3 62.234 569 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Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein | Chr1:25277294-25278529 FORWARD LENGTH=376;AT1G67480.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Galactose oxidase/ke 3 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 2.7 2.7 2.7 41.235 376 376;376;376 0.0044843 6.1599 By MS/MS 0 0 0 0 2.7 0 0 0 0 0 0 0 0 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 WEVMDCLGQK 145 2657 True 2795 14202 10554 10554 -1;-1;-1 AT1G68010.1;AT1G68010.3;AT1G68010.2 AT1G68010.1;AT1G68010.3;AT1G68010.2 10;9;9 10;9;9 10;9;9 AT1G68010.1 | Symbols:HPR,ATHPR1 | hydroxypyruvate reductase | hydroxypyruvate reductase | Chr1:25493418-25495720 FORWARD LENGTH=386;AT1G68010.3 | Symbols:HPR,ATHPR1 | hydroxypyruvate reductase | hydroxypyruvate reductase | Chr1:25493418-25495370 FORWA 3 10 10 10 10 10 8 6 7 5 10 10 8 6 7 5 10 10 8 6 7 5 30.6 30.6 30.6 42.247 386 386;360;387 0 108.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 30.6 30.6 25.6 18.7 23.3 16.1 107810000 40482000 42838000 8379500 3655600 7611100 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PhotoSystem B protein 33 | Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein | Chr1:26936084-26937331 FORWARD LENGTH=287 1 4 4 4 3 4 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 18.5 18.5 18.5 31.727 287 287 0 27.699 By MS/MS By MS/MS 15.3 18.5 0 0 0 0 13766000 6088300 7677800 0 0 0 0 18 764780 338240 426540 0 0 0 0 3054500 2693400 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 AQPGLTATNVNVDEVR;NDVFAIENR;NWVPVVPLSALPK;SPAEGAYSEGLLNAR 151 214;1714;1824;2066 True;True;True;True 224;1803;1922;2174 991;992;9251;9955;9956;11233;11234 622;6815;7396;8358;8359 622;6815;7396;8359 -1 AT1G72370.2;AT1G72370.1;AT3G04770.2;AT3G04770.1 AT1G72370.2;AT1G72370.1 6;6;2;2 6;6;2;2 6;6;2;2 AT1G72370.2 | Symbols:RPSAA,AP40,RP40,P40 | 40s ribosomal protein SA | 40s ribosomal protein SA | Chr1:27243148-27244842 REVERSE LENGTH=294;AT1G72370.1 | Symbols:RPSAA,AP40,RP40,P40 | 40s ribosomal protein SA | 40s ribosomal protein SA | Chr1:27243148- 4 6 6 6 5 6 4 3 3 1 5 6 4 3 3 1 5 6 4 3 3 1 24.8 24.8 24.8 31.981 294 294;298;280;332 0 98.547 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.7 24.8 14.6 10.2 12.6 4.1 44079000 14969000 16725000 5945700 2757400 3054400 626460 14 2291900 718070 902870 362980 142670 165360 44747 4249600 5949100 3234500 3080400 2832400 1302900 1 5 2 2 0 0 10 FAQYTGANAIAGR;HTPGTFTNQMQTSFSEPR;LLILTDPR;RNDGIYIFNLGK;VIVAIENPQDIIVQSAR;VIVAIENPQDIIVQSARPYGQR 152 631;1006;1487;1887;2462;2463 True;True;True;True;True;True 663;1054;1550;1987;2594;2595 3550;3551;3552;5778;5779;8111;8112;8113;8114;8115;10360;10361;10362;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303 2730;4362;4363;6023;7709;9940;9941;9942;9943;9944;9945;9946 2730;4363;6023;7709;9940;9943 -1;-1;-1;-1 AT1G72610.1 AT1G72610.1 1 1 1 AT1G72610.1 | Symbols:GER1,GLP1,ATGER1 | A. THALIANA GERMIN-LIKE PROTEIN 1,GERMIN-LIKE PROTEIN 1,germin-like protein 1 | germin-like protein 1 | Chr1:27339302-27339928 REVERSE LENGTH=208 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.7 7.7 7.7 21.559 208 208 0.0015576 6.3411 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.7 7.7 7.7 7.7 7.7 7.7 14444000 994210 988530 1125600 1770000 8015500 1550500 4 1142900 248550 247130 281390 442500 755280 387630 1145300 1049600 2076800 3636900 8112400 1883900 0 0 0 0 2 0 2 AETPAGYPCIRPIHVK 153 60 True 63 283;284;285;286;287;288;289 171;172 171 -1 AT1G74020.1 AT1G74020.1 2 2 2 AT1G74020.1 | Symbols:SS2 | strictosidine synthase 2 | strictosidine synthase 2 | Chr1:27835289-27837277 REVERSE LENGTH=335 1 2 2 2 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 9 9 9 35.293 335 335 0 12.355 By MS/MS By MS/MS 5.7 9 0 0 0 0 7804700 2320300 5484400 0 0 0 0 14 557480 165730 391740 0 0 0 0 2320300 2821800 0 0 0 0 1 3 0 0 0 0 4 AGSSEDFTNSVSNPDNIKR;ITDSVDGKPFK 154 92;1197 True;True 98;1253 432;433;6683 255;256;257;5002 256;5002 -1 AT1G74470.1 AT1G74470.1 5 5 5 AT1G74470.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein | Chr1:27991248-27992845 FORWARD LENGTH=467 1 5 5 5 4 4 4 3 2 2 4 4 4 3 2 2 4 4 4 3 2 2 17.3 17.3 17.3 51.837 467 467 0 33.8 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.6 14.6 15 11.6 9 9 62456000 16127000 17119000 5995600 4751100 6133500 12330000 25 731890 321760 361620 32133 16375 195220 58204 12223000 11666000 6006200 5516700 6944100 10927000 3 4 0 0 1 2 10 LAVNTIGSLVR;SGATVINGLFLK;SIDAGDYDYAIAFQER;VAVIGGGPAGGAAAETLAQGGIETILIER;VEAHPIPEHPRPR 155 1360;1964;1987;2345;2376 True;True;True;True;True 1422;2072;2095;2470;2503 7558;7559;10740;10741;10742;10743;10819;10820;10821;12751;12752;12753;12754;12755;12756;12931;12932;12933;12934 5621;5622;5623;7958;8016;8017;9549;9550;9694;9695 5621;7958;8017;9550;9695 -1 AT1G74730.1 AT1G74730.1 1 1 1 AT1G74730.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | transmembrane protein%2C putative (DUF1118) | Chr1:28078995-28079831 FORWARD LENGTH=198 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.6 6.6 6.6 20.735 198 198 0 13.229 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.6 6.6 6.6 6.6 6.6 6.6 7229200 2347300 3060400 428130 347070 695940 350280 5 1445800 469470 612080 85626 69414 139190 70055 2347300 2821000 685750 619080 1128100 665050 1 1 0 0 0 0 2 AEGLGLTLSSLEK 156 54 True 57 251;252;253;254;255;256 156;157 156 -1 AT1G74920.2;AT1G74920.1 AT1G74920.2;AT1G74920.1 2;2 2;2 2;2 AT1G74920.2 | Symbols:ALDH10A8 | aldehyde dehydrogenase 10A8 | aldehyde dehydrogenase 10A8 | Chr1:28139175-28142573 REVERSE LENGTH=496;AT1G74920.1 | Symbols:ALDH10A8 | aldehyde dehydrogenase 10A8 | aldehyde dehydrogenase 10A8 | Chr1:28139175-28142573 R 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 9.9 9.9 9.9 53.977 496 496;501 0 22.009 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.9 9.9 9.9 9.9 9.9 9.9 29415000 1445900 2485200 5064700 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Chr1:28587013-28587657 REVERSE LENGTH=185;AT1G76180.1 | Symbols:ERD14 | EARLY RESPONSE TO DEHYDRATION 14 | Dehydrin family protein | Chr1:28587013-28587657 REVER 2 4 4 4 3 4 3 4 4 4 3 4 3 4 4 4 3 4 3 4 4 4 33 33 33 20.786 185 185;185 0 36.376 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.6 33 27 33 33 33 71232000 15377000 16646000 3460400 2976700 17729000 15043000 11 1462800 644520 589680 44559 56327 60595 67107 13146000 11628000 4874200 5869200 10837000 9724300 2 2 1 0 6 1 12 KKPTTEVEVK;KPEDGSAVAAAPVVVPPPVEEAHPVEK;VATEESSAEVTDR;VHISEPEPEVK 159 1280;1293;2338;2433 True;True;True;True 1340;1353;2463;2564 7126;7127;7128;7129;7130;7199;7200;7201;7202;7203;7204;7205;7206;7207;7208;12642;12643;12644;12645;12646;12647;13188;13189;13190;13191;13192 5292;5293;5294;5295;5296;5342;5343;5344;5345;5346;5347;9411;9412;9872 5294;5346;9412;9872 -1;-1 AT1G76680.1;AT1G76680.2 AT1G76680.1;AT1G76680.2 1;1 1;1 1;1 AT1G76680.1 | Symbols:OPR1,ATOPR1 | 12-oxophytodienoate reductase 1,ARABIDOPSIS 12-OXOPHYTODIENOATE REDUCTASE 1 | 12-oxophytodienoate reductase 1 | Chr1:28776982-28778271 FORWARD LENGTH=372;AT1G76680.2 | Symbols:OPR1,ATOPR1 | 12-oxophytodienoate reducta 2 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 3.5 3.5 3.5 41.167 372 372;397 0.0030534 6.2011 By MS/MS By MS/MS 3.5 3.5 0 0 0 0 2636400 1482100 1154300 0 0 0 0 25 105460 59283 46173 0 0 0 0 1482100 1064000 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 SNGIDEALFTPPR 160 2062 True 2170 11222;11223 8351;8352 8352 -1;-1 AT1G77090.1 AT1G77090.1 1 1 1 AT1G77090.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | thylakoid lumenal protein (Mog1/PsbP/DUF1795-like photosystem II reaction center PsbP family protein) | Chr1:28960576-28961875 REVERSE LENGTH=260 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 3.8 3.8 3.8 28.501 260 260 0.0058824 6.1161 By MS/MS By MS/MS 3.8 3.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 LSVIVAPVLR 161 1579 True 1645 8573;8574 6389;6390 6390 -1 AT1G77490.2;AT1G77490.1 AT1G77490.2;AT1G77490.1 2;2 2;2 2;2 AT1G77490.2 | Symbols:TAPX | thylakoidal ascorbate peroxidase | thylakoidal ascorbate peroxidase | Chr1:29117688-29120649 FORWARD LENGTH=421;AT1G77490.1 | Symbols:TAPX | thylakoidal ascorbate peroxidase | thylakoidal ascorbate peroxidase | Chr1:2911768 2 2 2 2 0 0 0 1 2 1 0 0 0 1 2 1 0 0 0 1 2 1 11.4 11.4 11.4 45.643 421 421;426 0 12.524 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 0 6.7 11.4 4.8 5582000 0 0 0 587370 3738500 1256100 22 181320 0 0 0 26699 124220 57096 0 0 0 2129700 3783700 1949100 0 0 0 0 2 0 2 DDDLLVLPTDAALFEDPSFK;VDVVAPEQCPEEGRLPDAGPPSPADHLR 162 348;2375 True;True 363;2502 1565;1566;12929;12930 990;9693 990;9693 -1;-1 AT1G77510.1 AT1G77510.1 3 2 2 AT1G77510.1 | Symbols:ATPDI6,PDIL1-2,ATPDIL1-2,PDI6 | PDI-like 1-2,PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE 6 | PDI-like 1-2 | Chr1:29126742-29129433 FORWARD LENGTH=508 1 3 2 2 3 3 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 8.3 6.3 6.3 56.364 508 508 0 15.99 By MS/MS By MS/MS 8.3 8.3 0 0 0 0 11370000 5216100 6154200 0 0 0 0 33 90741 44014 46727 0 0 0 0 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THALIANA GLUTATHIONE S-TRANSFERASE TAU 19,glutathione S-transferase TAU 19,GLUTATHIONE TRANSFERASE 8 | glutathione S-transferase TAU 19 | Chr1:29486659-29487819 REVERSE LENGTH=219 3 5 5 5 5 5 3 3 2 2 5 5 3 3 2 2 5 5 3 3 2 2 23.3 23.3 23.3 25.65 219 219;193;220 0 70.542 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 23.3 23.3 12.3 12.3 9.1 7.3 108430000 45961000 54216000 3010300 3162900 998750 1083300 14 5251300 2254300 2681900 97455 118330 71339 27952 17007000 17268000 2903400 3600600 2056100 1601700 4 8 2 1 0 0 15 FANFSIESEVPK;NPILPSDPYLR;SLPDPEKVTEFVSELR;SPLLLQMNPIHK;VTEFVSELR 167 627;1778;2044;2071;2582 True;True;True;True;True 659;1873;2152;2180;2717 3539;3540;9705;9706;9707;9708;9709;11158;11159;11160;11161;11162;11255;11256;13818;13819;13820;13821;13822;13823 2722;2723;7214;7215;7216;7217;8303;8304;8305;8306;8307;8308;8309;8310;8379;8380;10308 2723;7216;8304;8380;10308 -1;-1;-1 AT1G78630.1 AT1G78630.1 2 2 2 AT1G78630.1 | Symbols:emb1473 | embryo defective 1473 | Ribosomal protein L13 family protein | Chr1:29575997-29577406 FORWARD LENGTH=241 1 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 14.9 14.9 14.9 26.788 241 241 0 12.197 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.1 7.1 7.1 7.1 7.1 14.9 78797000 8922700 9429300 16903000 10246000 8792600 24503000 14 156600 637340 673520 1065600 616660 424980 156600 4130500 3510700 7801300 5963700 6309600 15878000 0 1 1 0 3 4 9 ASDHVNTDKPWFVVDATDK;GPDHPHEAQKPLDLPIR 168 219;903 True;True 229;946 1015;5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076;5077;5078;5079;5080;5081;5082;5083;5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093;5094;5095;5096;5097;5098;5099 637;3775;3776;3777;3778;3779;3780;3781;3782;3783;3784 637;3781 -1 AT1G78900.2;AT1G78900.1 AT1G78900.2;AT1G78900.1 8;8 8;8 8;8 AT1G78900.2 | Symbols:VHA-A | vacuolar ATP synthase subunit A | vacuolar ATP synthase subunit A | Chr1:29660463-29664575 FORWARD LENGTH=623;AT1G78900.1 | Symbols:VHA-A | vacuolar ATP synthase subunit A | vacuolar ATP synthase subunit A | Chr1:29660463- 2 8 8 8 7 8 3 4 2 0 7 8 3 4 2 0 7 8 3 4 2 0 20.7 20.7 20.7 68.812 623 623;623 0 61.464 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.3 20.7 5.8 9.6 5.9 0 44993000 17526000 18447000 2137400 2779400 4102800 0 38 836960 317570 339080 56248 48119 75941 0 4398400 4123700 1856700 1931500 2610200 0 8 5 0 0 0 0 13 EDDLNEIVQLVGK;ISGDVYIPR;LAADTPLLTGQR;LEGDSATIQVYEETAGLTVNDPVLR;LYDDLNAGFR;TTLVANTSNMPVAAR;VLDALFPSVLGGTCAIPGAFGCGK;VSGPVVVADGMAGAAMYELVR 169 481;1184;1312;1378;1638;2275;2471;2571 True;True;True;True;True;True;True;True 506;1240;1372;1440;1706;2396;2603;2705 2589;2590;2591;6628;6629;6630;6631;7306;7307;7308;7309;7627;7628;8851;8852;12362;12363;12364;12365;13332;13333;13334;13335;13778 2027;2028;4960;4961;4962;5424;5425;5660;5661;6556;9203;9967;10286 2028;4961;5425;5661;6556;9203;9967;10286 -1;-1 AT1G79550.2;AT1G79550.1 AT1G79550.2;AT1G79550.1 8;8 6;6 6;6 AT1G79550.2 | Symbols:PGK | phosphoglycerate kinase | phosphoglycerate kinase | Chr1:29924347-29926295 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AT2G01140.1 6 4 4 AT2G01140.1 | Symbols:FBA3,AtFBA3,PDE345 | PIGMENT DEFECTIVE 345,fructose-bisphosphate aldolase 3 | Aldolase superfamily protein | Chr2:95006-96491 REVERSE LENGTH=391 1 6 4 4 6 5 3 4 3 2 4 3 1 2 1 0 4 3 1 2 1 0 22.5 18.2 18.2 42.327 391 391 0 25.592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 22.5 18.7 7.7 14.8 11.5 4.3 20723000 10037000 7605300 478200 1276500 1325700 0 21 775290 426270 303920 22771 22327 63131 0 3977100 2954800 923140 1753300 2198600 0 3 2 0 0 1 0 6 ANSLAQLGK;ASPETVADFTLTMLK;EAAWGLAR;LASIGLDNTEDNR;TVVSVPCGPSALAVK;YAAISQDNGLVPIVEPEILLDGDHPIER 173 184;230;463;1343;2306;2674 False;True;False;True;True;True 193;240;488;1405;2429;2812 856;857;858;859;860;861;1058;2496;2497;2498;2499;2500;2501;7478;7479;7480;7481;12498;12499;14314;14315;14316;14317 533;534;535;661;1965;1966;1967;1968;5570;9290;9291;10660;10661 533;661;1965;5570;9291;10660 -1 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Chr2:1531208-1533578 FORWARD LENGTH=402 1 5 5 5 5 5 0 0 0 0 5 5 0 0 0 0 5 5 0 0 0 0 16.4 16.4 16.4 44.577 402 402 0 43.18 By MS/MS By MS/MS 16.4 16.4 0 0 0 0 13777000 7481800 6295700 0 0 0 0 27 510280 277100 233170 0 0 0 0 2419500 2045200 0 0 0 0 2 4 0 0 0 0 6 APLGYSGPFELR;GGAACLSVLTDQK;SLETFEVDISNTK;VLGIEGIELVGINNR;YFQGGFENLEAIR 179 197;790;2021;2484;2709 True;True;True;True;True 207;826;2129;2616;2848 921;922;4526;4527;11049;11050;13402;13403;14513;14514 574;3393;8192;10017;10018;10869 574;3393;8192;10018;10869 -1 AT2G04865.2;AT2G04865.1 AT2G04865.2;AT2G04865.1 1;1 1;1 1;1 AT2G04865.2 | Symbols:MAIL2 | MAIN-LIKE 2 | Aminotransferase-like%2C plant mobile domain family protein | Chr2:1712149-1714599 FORWARD LENGTH=667;AT2G04865.1 | Symbols:MAIL2 | MAIN-LIKE 2 | Aminotransferase-like%2C plant mobile domain family protein | 2 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1.5 1.5 1.5 75.508 667 667;667 0 6.9926 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 1.5 1.5 1.5 1.5 6865000 0 0 2537400 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regulation 5 | proton gradient regulation 5 | Chr2:2081204-2081687 REVERSE LENGTH=133;AT2G05620.1 | Symbols:PGR5,AtPGR5 | proton gradient regulation 5 | proton gradient regulation 5 | Chr2:2081204-208 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.3 8.3 8.3 14.293 133 133;133 0 6.8391 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.3 8.3 8.3 8.3 8.3 8.3 10712000 3585200 4505800 526210 492470 1082600 519930 4 2678000 896300 1126400 131550 123120 270650 129980 3585200 4153300 842850 878440 1754800 987160 1 1 0 0 0 0 2 GLFAPLVVVTR 182 866 True 906 4918;4919;4920;4921;4922;4923 3678;3679 3678 -1;-1 AT2G05710.1 AT2G05710.1 11 11 6 AT2G05710.1 | Symbols:ACO3 | aconitase 3 | aconitase 3 | Chr2:2141591-2146350 FORWARD LENGTH=990 1 11 11 6 10 11 8 5 3 2 10 11 8 5 3 2 5 6 3 1 1 1 17.6 17.6 10.1 108.2 990 990 0 79.417 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.1 17.6 12.5 7 6.6 4.6 81492000 26339000 30772000 7022900 6455200 6670900 4232700 50 1190500 483410 546930 78533 64659 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1 | ATP synthase subunit 1 | ChrM:302166-303689 REVERSE LENGTH=507;AT2G07698.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | ATPase%2C F1 complex%2C alpha subunit protein | Chr2:3 3 6 6 6 4 4 2 1 5 3 4 4 2 1 5 3 4 4 2 1 5 3 18.1 18.1 18.1 55.045 507 507;507;777 0 43.833 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 11.6 11 6.5 4.3 16.2 9.1 28456000 5900600 11233000 1922000 524940 5472700 3402200 27 636850 148760 347980 42221 19442 68418 29471 3682200 4209000 2498900 1099900 4071700 2691400 1 3 2 1 7 3 17 AAELTNLFESR;AVDSLVPIGR;EAFPGDVFYLHSR;EVAAFAQFGSDLDAATQALLNR;GMALNLENENVGIVVFGGDTAIK;NFYANFQVDEIGR 184 5;278;468;593;889;1719 True;True;True;True;True;True 5;289;493;624;930;1808 20;21;22;23;24;1263;2514;2515;2516;3378;3379;3380;3381;3382;3383;5005;9275;9276;9277 13;14;15;782;1975;1976;1977;1978;1979;1980;2616;2617;2618;2619;2620;3728;6834;6835 15;782;1977;2617;3728;6835 -1;-1;-1 AT2G13360.3;AT2G13360.2;AT2G13360.1 AT2G13360.3;AT2G13360.2;AT2G13360.1 10;10;10 10;10;10 10;10;10 AT2G13360.3 | Symbols:SGAT,AGT,AGT1 | ALANINE:GLYOXYLATE AMINOTRANSFERASE 1,alanine:glyoxylate aminotransferase,L-serine:glyoxylate aminotransferase | alanine:glyoxylate aminotransferase | Chr2:5539417-5540902 REVERSE LENGTH=401;AT2G13360.2 | Symbols:SG 3 10 10 10 10 10 8 6 7 5 10 10 8 6 7 5 10 10 8 6 7 5 41.4 41.4 41.4 44.207 401 401;401;401 0 226.2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 41.4 41.4 36.9 26.7 29.4 22.7 520980000 86257000 113300000 96419000 83422000 54571000 87006000 21 5059200 1908300 2420500 203640 214920 228560 83356 11402000 15700000 17151000 21279000 17014000 30172000 13 17 16 15 15 14 90 AALDLIFEEGLENIIAR;ALSLPTGLGIVCASPK;DVGYPVVMGSGVAAASTYLQHHIPLIPSR;HHLFVPGPVNIPEPVIR;HPALLLVDGVSSICALDFR;LAVEAWGLK;MDYMYGPGR;SPAIPALTK;TTSGTPFLFPTTGTGAWESALTNTLSPGDR;YNLSLGLGLNK 185 9;162;447;987;1001;1356;1653;2067;2278;2745 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 9;168;469;470;1034;1049;1418;1725;2175;2399;2885 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1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT2G32060.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein | Chr2:13639228-13640104 REVERSE LENGTH=144;AT2G32060.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protei 3 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 9 9 9 15.329 144 144;144;144 0 10.788 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9 9 9 9 0 0 4764300 1911200 1729600 607280 516290 0 0 9 529370 212350 192180 67475 57366 0 0 1911200 1594300 972690 920920 0 0 1 0 0 0 0 0 1 DFGEETTALNIVK 231 359 True 374 1595;1596;1597;1598 1008 1008 -1;-1;-1 AT2G33040.1 AT2G33040.1 1 1 1 AT2G33040.1 | Symbols:ATP3 | gamma subunit of Mt ATP synthase | gamma subunit of Mt ATP synthase | Chr2:14018978-14021047 REVERSE LENGTH=325 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6.8 6.8 6.8 35.448 325 325 0 7.0351 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.8 6.8 6.8 6.8 6.8 6.8 17307000 535080 2257000 798780 3650400 4902300 5163900 19 910920 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True;True;True;True;True;True;True;True 460;660;916;1213;1713;1714;2266;2267;2278;2347 2363;3541;3542;4961;4962;4963;4964;6509;8876;8877;8878;8879;8880;8881;8882;11660;11661;11662;11663;11664;11665;11666;11667;11756;11757;11758;11759;11760;11761;12128;12129;12130;12131;12132;12133 1865;2724;2725;2726;3700;4883;6577;6578;6579;6580;8673;8674;8675;8676;8677;8678;8757;9058;9059;9060;9061 1865;2724;3700;4883;6578;8673;8757;9058 39;40 118;333 -1 AT2G33210.2;AT2G33210.1 AT2G33210.2;AT2G33210.1 5;5 5;5 2;2 AT2G33210.2 | Symbols:HSP60-2 | heat shock protein 60-2 | heat shock protein 60-2 | Chr2:14075093-14078568 REVERSE LENGTH=580;AT2G33210.1 | Symbols:HSP60-2 | heat shock protein 60-2 | heat shock protein 60-2 | Chr2:14075093-14078568 REVERSE LENGTH=585 2 5 5 2 5 5 2 2 1 1 5 5 2 2 1 1 2 2 0 0 0 0 12.4 12.4 6.7 61.477 580 580;585 0 78.063 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.4 12.4 3.4 3.4 1.6 1.6 33220000 14960000 13434000 2023000 1776900 596060 429920 35 777740 339490 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AT2G34420.1;AT2G34430.1 7;6 2;2 2;2 AT2G34420.1 | Symbols:LHCB1.5,LHB1B2 | PHOTOSYSTEM II LIGHT HARVESTING COMPLEX GENE 1.5,photosystem II light harvesting complex gene B1B2 | photosystem II light harvesting complex protein B1B2 | Chr2:14522716-14523513 REVERSE LENGTH=265;AT2G34430.1 | Sy 2 7 2 2 6 6 6 6 7 7 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 45.3 27.5 27.5 28.054 265 265;266 0 124.98 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 44.5 44.5 44.5 44.5 45.3 45.3 137750000 5933200 7296700 21203000 11124000 45068000 47126000 8 16807000 741650 912090 2650400 1390400 5633500 5478900 5686600 6129400 26470000 17027000 54376000 50988000 3 2 1 3 2 6 17 ELEVIHSR;FGEAVWFK;GPSGSPWYGSDR;NRELEVIHSR;VAGDGPLGEAEDLLYPGGSFDPLGLATDPEAFAELK;WAMLGALGCVFPELLAR;YLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAR 237 551;667;910;1789;2322;2655;2735 False;False;False;False;True;False;True 578;700;953;1884;2445;2792;2793;2874 2976;2977;2978;2979;2980;2981;2982;2983;2984;2985;2986;3724;3725;3726;3727;3728;3729;5126;5127;5128;5129;5130;5131;9762;9763;12543;12544;12545;12546;12547;12548;14174;14175;14176;14177;14178;14179;14180;14181;14182;14183;14660;14661;14662;14663;14664;14665;14666;14667;14668;14669;14670 2305;2306;2307;2308;2309;2310;2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320;2321;2322;2323;2324;2325;2326;2327;2328;2329;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;3802;3803;3804;3805;3806;3807;3808;3809;3810;3811;7255;9318;10521;10522;10523;10524;10525;10526;10527;10528;10529;10530;10531;10532;10533;10534;10980;10981;10982;10983;10984;10985;10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993;10994;10995 2306;2867;3804;7255;9318;10523;10995 13 105 -1;-1 AT2G34460.1 AT2G34460.1 2 2 2 AT2G34460.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | Chr2:14529635-14530732 FORWARD LENGTH=280 1 2 2 2 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 11.8 11.8 11.8 30.471 280 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full name available | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr2:14898341-14899590 FORWARD LENGTH=308 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 7.5 7.5 7.5 33.785 308 308 0 21.862 By MS/MS By MS/MS 7.5 7.5 0 0 0 0 7451000 3361800 4089200 0 0 0 0 18 413940 186760 227180 0 0 0 0 1783500 1993500 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 ELFTAADFNPVSAR;VVFADPEGR 240 552;2622 True;True 579;2758 2987;2988;14052;14053 2330;2331;10452 2331;10452 -1 AT2G35490.1 AT2G35490.1 1 1 1 AT2G35490.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein | Chr2:14912309-14913797 REVERSE LENGTH=376 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 5.9 5.9 5.9 40.505 376 376 0 7.4659 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.9 5.9 5.9 0 5.9 5.9 11132000 3986500 4240400 916180 0 1439700 548980 16 338060 115070 120110 31787 0 53398 17696 2204100 2157900 808780 0 1271200 577690 1 1 0 0 0 0 2 SSVDLPESVGVFGQQISLSLLK 241 2094 True 2203 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Chr2:15321081-15323786 REVERSE LENGTH=444;AT2G36530.2 | Symbols:LOS2,ENO2 | LOW EXPRESSION OF OSMOTICALLY RESPONSIVE GENES 2,ENOLASE 2 | Enolase | 2 13 13 13 12 12 12 11 5 5 12 12 12 11 5 5 12 12 12 11 5 5 43.9 43.9 43.9 47.719 444 444;433 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 41.7 41.7 41.7 38.3 20.3 19.1 363220000 148630000 146980000 27094000 20701000 8983400 10828000 25 10221000 4404100 4321100 686170 483160 254340 72072 30275000 30825000 8803000 9071800 4828000 3243700 9 11 4 2 2 3 31 AGAVVSGIPLYK;ATITVVK;AVGNVNNIIGPALIGK;DGGSDYLGK;IEEELGSEAIYAGVNFR;IVLPVPAFNVINGGSHAGNK;LAMQEFMILPVGAASFK;MGVEVYHHLK;MTTECGTEVQIVGDDLLVTNPK;SCNALLLK;SGETEDTFIADLAVGLSTGQIK;VNQIGSVTESIEAVK;VTAAVPSGASTGIYEALELR 243 73;249;290;366;1047;1225;1340;1664;1693;1914;1968;2518;2580 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 77;259;302;381;1098;1282;1400;1401;1402;1740;1780;2016;2076;2652;2715 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superfamily protein | Chr2:16012723-16014666 REVERSE LENGTH=353 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 10.5 10.5 10.5 39.681 353 353 0 11.844 By MS/MS By MS/MS 10.5 10.5 0 0 0 0 4877400 2596100 2281300 0 0 0 0 17 141130 81841 59293 0 0 0 0 1419800 1145200 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 SVPNALIVNIGDQLQILSNGIYK;YANSPDTYEGYGSR 254 2111;2686 True;True 2221;2824 11456;11457;14366;14367 8516;8517;10715 8516;10715 -1 AT2G38300.1 AT2G38300.1 1 1 1 AT2G38300.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | myb-like HTH transcriptional regulator family protein | Chr2:16044175-16045679 REVERSE LENGTH=340 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 3.5 3.5 3.5 38.925 340 340 0.0044577 6.1366 By MS/MS 0 0 0 0 3.5 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 IPSMEGGGKTNR 255 1166 True 1222 6540 4911 4911 46 5 -1 AT2G38870.1 AT2G38870.1 1 1 1 AT2G38870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Serine protease inhibitor%2C potato inhibitor I-type family protein | 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activase | Chr2:16570951-16573345 REVERSE LENGTH=474;AT2G39730.3 | Symbols:RCA | rubisco activase | rubisco activase | Chr2:16571174-16573345 REVERSE LENGTH=441;AT2G39730.2 | Symbols:RCA | rubisco 3 17 17 17 17 16 16 15 13 14 17 16 16 15 13 14 17 16 16 15 13 14 54.6 54.6 54.6 51.981 474 474;441;446 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 54.6 49.4 52.5 52.5 45.8 49.4 2136000000 638120000 701390000 229560000 193790000 175160000 198000000 21 59276000 19403000 21292000 7039400 6096100 3299000 2146100 120420000 123270000 70226000 66931000 36130000 33917000 25 24 14 9 13 14 99 EGPPVFEQPEMTYEK;FVESLGVEK;GAQQVNLPVPEGCTDPVAENFDPTAR;GLAYDTSDDQQDITR;GMVDSVFQAPMGTGTHHAVLSSYEYVSQGLR;IKDEDIVTLVDQFPGQSIDFFGALR;KFVESLGVEK;LMEYGNMLVMEQENVKR;MCCLFINDLDAGAGR;MGINPIMMSAGELESGNAGEPAK;NFLTLPNIK;RVQLAETYLSQAALGDANADAIGR;SDDGTCVYNF;SFQCELVMAK;VPIICTGNDFSTLYAPLIR;VPLILGIWGGK;VQLAETYLSQAALGDANADAIGR 259 511;731;755;858;892;1114;1267;1499;1648;1662;1718;1897;1918;1961;2529;2531;2552 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delta1-pyrroline-5-carboxylate synthase 1 | Chr2:16598516-16601976 REVERSE LENGTH=614;AT2G39800.3 | Symbols:P5CS1,ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carboxylate synthase 1 | delta 6 3 3 3 3 3 1 0 1 0 3 3 1 0 1 0 3 3 1 0 1 0 7.2 7.2 7.2 66.758 614 614;714;717;717;622;726 0 17.775 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.2 7.2 2.8 0 2.8 0 9306400 4174400 4081800 421080 0 629170 0 38 244910 109850 107420 11081 0 16557 0 1744800 1438400 861590 0 1302800 0 3 1 0 0 0 0 4 ILLDIADALEANVTTIK;VIPIFNENDAISTR;VITDAIPETVGGK 260 1130;2456;2460 True;True;True 1184;2588;2592 6386;6387;6388;6389;13277;13278;13290;13291 4798;9926;9937;9938 4798;9926;9937 -1;-1;-1;-1;-1;-1 AT2G40100.1;AT2G40100.2 AT2G40100.1;AT2G40100.2 3;2 2;1 2;1 AT2G40100.1 | Symbols:LHCB4.3 | light harvesting complex photosystem II | light harvesting complex photosystem II | Chr2:16745884-16747190 FORWARD LENGTH=276;AT2G40100.2 | Symbols:LHCB4.3 | light harvesting complex photosystem II | light harvesting comp 2 3 2 2 2 1 2 3 3 3 1 0 1 2 2 2 1 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1086;1230;1503 5938;5939;5940;6576;6577;6578;6579;7914;7915;7916;7917;7918 4472;4473;4923;4924;4925;5885;5886;5887;5888;5889;5890 4472;4923;5885 -1;-1;-1;-1 AT2G43820.1 AT2G43820.1 2 2 2 AT2G43820.1 | Symbols:GT,ATSAGT1,SGT1,UGT74F2,SAGT1 | UDP-glucosyltransferase 74F2,Arabidopsis thaliana salicylic acid glucosyltransferase 1,salicylic acid glucosyltransferase 1,UDP-glucose:salicylic acid glucosyltransferase 1 | UDP-glucosyltransferase 74 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 8.2 8.2 8.2 50.771 449 449 0 58.542 By MS/MS By MS/MS 8.2 8.2 0 0 0 0 10182000 4693900 5488300 0 0 0 0 13 432490 196560 235930 0 0 0 0 2594500 2787900 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 ACPVLTIGPTIPSIYLDQR;SLNEGGSTDTNIDTFVSR 272 22;2039 True;True 23;2147 95;96;11135;11136 61;8255 61;8255 -1 AT2G43910.1;AT2G43910.2;AT2G43910.3 AT2G43910.1;AT2G43910.2;AT2G43910.3 3;3;2 3;3;2 3;3;2 AT2G43910.1 | Symbols:ATHOL1,HOL1 | HARMLESS TO OZONE LAYER 1 | HARMLESS TO OZONE LAYER 1 | Chr2:18184658-18186951 REVERSE LENGTH=227;AT2G43910.2 | Symbols:ATHOL1,HOL1 | HARMLESS TO OZONE LAYER 1 | HARMLESS TO OZONE LAYER 1 | Chr2:18184831-18186951 REV 3 3 3 3 3 3 2 2 2 1 3 3 2 2 2 1 3 3 2 2 2 1 21.1 21.1 21.1 25.288 227 227;217;163 0 33.285 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 21.1 21.1 14.1 14.1 15 7.9 14498000 4368000 5963300 815030 1005200 1817700 528950 14 305870 112840 144200 58216 71800 48824 37782 1775600 2260800 785830 1081400 1686200 934360 2 2 0 0 0 0 4 ATPLIVHLVDTSSLPLGR;AVSVEENPHAIPTR;VDVSTFEEVLVPIGFK 273 257;307;2374 True;True;True 267;319;2501 1168;1169;1170;1171;1172;1173;1367;1368;1369;1370;12926;12927;12928 728;844;9691;9692 728;844;9692 -1;-1;-1 AT2G43945.1 AT2G43945.1 1 1 1 AT2G43945.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | hypothetical protein | Chr2:18197995-18199988 REVERSE LENGTH=289 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 6.9 6.9 6.9 32.167 289 289 0.0015699 6.4211 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.9 6.9 0 6.9 6.9 6.9 14887000 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AT2G44350.4 | Symbols:ATCS,CSY4 | CITRATE SYNTHASE 4 | Citrate synthase family protein | Chr2:18316673-18320524 FORWARD LENGTH=473;AT2G44350.1 | Symbols:ATCS,CSY4 | CITRATE SYNTHASE 4 | Citrate synthase family protein | Chr2:18316673-18320524 FORWARD L 4 3 3 3 3 3 1 1 0 0 3 3 1 1 0 0 3 3 1 1 0 0 7 7 7 52.654 473 473;473;474;474 0 19.537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7 7 3 3 0 0 12948000 5545900 5831300 846920 723830 0 0 23 562950 241120 253540 36823 31471 0 0 2443700 2567600 1217400 1158600 0 0 3 3 0 0 0 0 6 GLSIPECQK;LYEVVPPVLTELGK;VPVVAAYVYR 276 876;1640;2545 True;True;True 917;1708;2679 4965;4966;8855;8856;8857;8858;13665;13666 3701;6559;6560;6561;6562;10210 3701;6561;10210 -1;-1;-1;-1 AT2G44380.1 AT2G44380.1 1 1 1 AT2G44380.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein | Chr2:18323590-18324333 REVERSE LENGTH=247 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3.2 3.2 3.2 28.272 247 247 0.0015504 6.3074 By MS/MS 0 0 3.2 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available | no full name available | Tetratricopepti 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 11.2 11.2 11.2 23.778 224 224;210 0 27.605 By MS/MS By MS/MS 11.2 11.2 0 0 0 0 5972800 3055500 2917300 0 0 0 0 15 398190 203700 194490 0 0 0 0 1939700 1685200 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 GADFSLANVTK;VADGVNATTGNATR 279 748;2317 True;True 784;2440 4308;4309;12530;12531 3253;9310 3253;9310 -1;-1 AT2G45470.1 AT2G45470.1 1 1 1 AT2G45470.1 | Symbols:AGP8,FLA8 | ARABINOGALACTAN PROTEIN 8,FASCICLIN-like arabinogalactan protein 8 | FASCICLIN-like arabinogalactan protein 8 | Chr2:18742797-18744059 REVERSE LENGTH=420 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5 5 5 43.074 420 420 0 41.476 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5 5 5 5 5 5 122900000 22467000 17663000 18607000 16894000 18851000 28419000 15 1844900 315950 245570 294400 269880 258620 460450 16868000 12172000 23334000 23671000 22733000 42591000 1 1 1 0 3 3 9 LTQAEVVSLLEYHALAEYKPK 280 1595 True 1662 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no full name available | Ribosomal protein S7e family protein | Chr3:542341-543168 FORWARD LENGTH=191;AT3G02560.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S7e family protein | 4 2 2 2 2 2 1 1 1 0 2 2 1 1 1 0 2 2 1 1 1 0 18.3 18.3 18.3 22.196 191 191;191;191;190 0 16.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.3 18.3 4.7 4.7 13.6 0 9700300 2733300 2880600 466530 413030 3206800 0 8 467510 192170 165400 58316 51628 400860 0 1635100 1530900 1209200 1192200 4087500 0 0 2 0 0 1 0 3 AVVIYVPFR;GVAPTEFEEQVTQALFDLENTNQELK 290 310;944 True;True 322;989 1379;1380;1381;1382;5313;5314;5315 852;853;854;3929 853;3929 -1;-1;-1;-1 AT3G03250.3;AT3G03250.1;AT3G03250.2;AT5G17310.6;AT5G17310.4;AT5G17310.3;AT5G17310.5;AT5G17310.1;AT5G17310.2 AT3G03250.3;AT3G03250.1;AT3G03250.2;AT5G17310.6;AT5G17310.4;AT5G17310.3;AT5G17310.5;AT5G17310.1;AT5G17310.2 3;3;3;2;2;2;2;2;2 3;3;3;2;2;2;2;2;2 3;3;3;2;2;2;2;2;2 AT3G03250.3 | Symbols:AtUGP1,UGP,UGP1 | UDP-glucose 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2 | Chr3:957602-960740 FORWARD LENGTH=765;AT3G03780.1 3 16 2 2 12 12 9 8 8 6 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 25.2 5.6 5.6 84.583 765 765;765;765 0 12.775 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 19.6 19.5 14.9 12 13.6 11 6892000 998650 833780 960120 0 1623700 2475800 39 46986 25606 21379 24619 0 41633 63481 0 0 1537900 0 2631900 4700600 1 0 0 0 2 0 3 AAGASWIQLDEPLFVMDLEGHK;ALAGQTNESFFTANADALSSR;ASHIVGYPR;FALESFWDGK;GGIGVIQIDEAALR;GMLTGPVTILNWSFVR;GNASVPAMEMTK;GVTAFGFDLVR;KLNLPILPTTTIGSFPQTVELR;KYTEVKPALK;LNLPILPTTTIGSFPQTVELR;LNLPILPTTTIGSFPQTVELRR;MLAVLEQNILWVNPDCGLK;YGAGIGPGVYDIHSPR;YLFAGVVDGR;YTEVKPALK 292 6;132;223;624;800;891;895;963;1286;1310;1511;1512;1671;2711;2733;2762 True;True;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False 6;138;233;655;836;932;938;1009;1346;1370;1577;1578;1747;1748;2850;2872;2902 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S3Ae | Chr3:1329751-1331418 F 2 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 5.3 5.3 5.3 29.803 262 262;262 0 8.8087 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.3 0 5.3 5.3 0 0 13962000 6112300 0 4217400 3632000 0 0 16 872610 382020 0 263590 227000 0 0 6112300 0 6755100 6478600 0 0 1 0 1 1 0 0 3 ATQGIYPLQNVFIR 297 258 True 268 1174;1175;1176 729;730;731 729 -1;-1 AT3G04920.2;AT3G04920.1;AT5G28060.1 AT3G04920.2;AT3G04920.1;AT5G28060.1 2;2;1 2;2;1 2;2;1 AT3G04920.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S24e family protein | Chr3:1360989-1361719 FORWARD LENGTH=112;AT3G04920.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S24e family prote 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 24.1 24.1 24.1 12.909 112 112;133;133 0 13.343 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 24.1 24.1 24.1 24.1 24.1 10.7 27464000 7986600 6036100 2712800 2468600 2976600 5283600 5 1517300 585290 557280 161860 128700 84163 1056700 3643600 3899700 2963200 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dehydrogenase | Chr3:1924536-1927701 REVERSE LENGTH=603 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 2 2 65.795 603 603 0.0044978 6.1652 By MS/MS By MS/MS 2 2 0 0 0 0 1047300 596690 450590 0 0 0 0 34 30802 17550 13253 0 0 0 0 596690 415340 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 TVVVIGAGGAGK 302 2308 True 2431 12504;12505 9293;9294 9293 -1 AT3G06580.1 AT3G06580.1 1 1 1 AT3G06580.1 | Symbols:GAL1,GALK | GALACTOSE KINASE 1 | Mevalonate/galactokinase family protein | Chr3:2049141-2051867 REVERSE LENGTH=496 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2.6 2.6 2.6 54.34 496 496 0 7.22 By MS/MS By MS/MS 2.6 2.6 0 0 0 0 1469900 765690 704240 0 0 0 0 24 61247 31904 29343 0 0 0 0 765690 649150 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 TGFAELIDFNPVR 303 2167 True 2281 11769;11770 8762;8763 8762 -1 AT3G06860.1 AT3G06860.1 2 2 2 AT3G06860.1 | Symbols:ATMFP2,MFP2 | MULTIFUNCTIONAL PROTEIN 2,multifunctional protein 2 | multifunctional protein 2 | Chr3:2161926-2166009 FORWARD LENGTH=725 1 2 2 2 2 2 2 0 0 0 2 2 2 0 0 0 2 2 2 0 0 0 6.9 6.9 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.7 8.7 3.1 6.3 6.3 6.3 56226000 16769000 19376000 2807500 2579900 9562100 5131400 22 1929900 762240 880730 127610 48766 82827 27752 11771000 9556400 9331200 3319100 3343000 3311500 2 3 0 0 2 1 8 AVAGAGVLSGYDK;TAAAPIER;TIKDEGFGSLWR;YFPTQALNFAFK 307 267;2123;2187;2708 True;True;True;True 277;2235;2301;2847 1212;1213;1214;11523;11524;11890;11891;11892;11893;14507;14508;14509;14510;14511;14512 755;756;8558;8559;8872;8873;8874;10868 755;8558;8872;10868 -1;-1;-1;-1;-1;-1 AT3G08590.2;AT3G08590.1 AT3G08590.2;AT3G08590.1 1;1 1;1 1;1 AT3G08590.2 | Symbols:iPGAM2 | 2,3-biphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase 2 | Phosphoglycerate mutase%2C 2%2C3-bisphosphoglycerate-independent | Chr3:2608683-2611237 REVERSE LENGTH=560;AT3G08590.1 | Symbols:iPGAM2 | 2,3-biphosphoglycerat 2 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1.8 1.8 1.8 60.763 560 560;560 0.0030441 6.1832 By MS/MS By MS/MS 1.8 1.8 0 0 0 0 4481700 1734300 2747400 0 0 0 0 32 140050 54197 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kinase 1 | adenosine kinase 1 | Chr3:3012122-3014624 FORWARD LENGTH=344;AT5G03300.3 | S 5 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 11.6 11.6 11.6 33.326 302 302;344;292;292;345 0 15.828 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4 11.6 7.6 7.6 7.6 7.6 11678000 2565900 3688800 1157000 636040 1647500 1982500 17 293170 150940 142240 68056 37414 96912 116620 2281800 1388300 2074300 1269900 2989200 4213400 3 1 0 0 1 0 5 AGCYASNVVIQR;LVDTNGAGDAFVGGFLSQLVHGK 316 74;1607 True;True 78;1674 362;363;8708;8709;8710;8711;8712 208;209;210;211;6479 209;6479 -1;-1;-1;-1;-1 AT3G09840.1;AT5G03340.1;AT3G53230.1 AT3G09840.1;AT5G03340.1;AT3G53230.1 7;7;7 7;7;7 7;7;7 AT3G09840.1 | Symbols:ATCDC48,CDC48,AtCDC48A,CDC48A | cell division cycle 48 | cell division cycle 48 | Chr3:3019494-3022832 FORWARD LENGTH=809;AT5G03340.1 | Symbols:AtCDC48C | cell division cycle 48C | ATPase%2C AAA-type%2C CDC48 protein | Chr5:810091 3 7 7 7 7 7 4 2 2 1 7 7 4 2 2 1 7 7 4 2 2 1 10 10 10 89.392 809 809;810;815 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 24 24 24 24 16 16 45231000 16275000 15626000 5870200 5130800 1535900 793410 6 6749900 2417600 2335000 864330 744840 255980 132230 6140400 5070900 3217100 3550800 1348300 854190 3 3 0 1 0 0 7 IEDVTPIPTDSTR;IEDVTPIPTDSTRR;TPGPGAQSALR;VETVTLGPSVR 320 1045;1046;2246;2391 True;True;True;True 1096;1097;2363;2520 5983;5984;5985;5986;5987;5988;5989;5990;5991;5992;12208;12209;12210;12211;12212;12213;13013;13014;13015;13016 4502;4503;9119;9120;9121;9746;9747;9748;9749 4502;4503;9120;9748 -1;-1;-1 AT3G11630.1 AT3G11630.1 7 7 3 AT3G11630.1 | Symbols:2CPA | 2-Cys peroxiredoxin A | Thioredoxin superfamily protein | Chr3:3672189-3673937 FORWARD LENGTH=266 1 7 7 3 6 7 7 6 7 7 6 7 7 6 7 7 3 3 3 3 3 3 46.6 46.6 21.1 29.092 266 266 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 37.6 46.6 46.6 37.6 46.6 46.6 198370000 55236000 66778000 18232000 12118000 29205000 16797000 15 6019800 1980800 2127800 531020 315870 714630 349700 13629000 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-1;-1 AT3G11940.2;AT3G11940.1 AT3G11940.2;AT3G11940.1 3;3 1;1 1;1 AT3G11940.2 | Symbols:ATRPS5A,RPS5A,AML1 | ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1,ribosomal protein 5A | ribosomal protein 5A | Chr3:3778175-3779354 REVERSE LENGTH=207;AT3G11940.1 | Symbols:ATRPS5A,RPS5A,AML1 | ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1,ribosomal protein 5A | riboso 2 3 1 1 3 3 3 3 3 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 21.7 9.2 9.2 22.921 207 207;207 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 21.7 21.7 21.7 21.7 21.7 5.3 37625000 14057000 11708000 5601500 5072600 1186500 0 11 3420500 1277900 1064400 509230 461140 107860 0 14057000 10792000 8972100 9048100 1923200 0 2 1 2 1 1 0 7 ATAADVDAEIQQALTNEVK;HATFVPHTAGR;TIAECLADELINAAK 324 239;980;2176 True;False;False 249;1026;2290 1093;1094;1095;1096;1097;5448;5449;5450;5451;5452;5453;5454;11831;11832;11833;11834;11835 676;677;678;679;680;681;682;4035;4036;4037;4038;4039;4040;4041;4042;4043;4044;4045;4046;4047;4048;4049;8809;8810;8811;8812;8813 677;4041;8810 -1;-1 AT3G12290.1 AT3G12290.1 1 1 1 AT3G12290.1 | Symbols:MTHFD1 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | Amino acid dehydrogenase family protein | Chr3:3919591-3921326 FORWARD LENGTH=299 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 7 7 7 31.589 299 299 0.0015748 6.4439 By matching By MS/MS By MS/MS 0 0 7 0 7 7 12170000 0 0 564280 0 3691300 7914900 20 175090 0 0 28214 0 64092 111000 0 0 923840 0 4204400 10494000 0 0 0 0 1 1 2 VHELNSNPDVHGILVQLPLPK 325 2431 True 2562 13179;13180;13181;13182;13183 9867;9868 9868 -1 AT3G12490.1 AT3G12490.1 1 1 1 AT3G12490.1 | Symbols:ATCYSB,ATCYS6,CYSB | ARABIDOPSIS THALIANA PHYTOCYSTATIN 6,cystatin B | cystatin B | Chr3:3960802-3961777 REVERSE LENGTH=158 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 14.6 14.6 14.6 17.482 158 158 0 11.205 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.6 14.6 14.6 14.6 0 0 9687000 3263900 4229800 1047200 1146200 0 0 9 1076300 362650 469970 116350 127360 0 0 3263900 3898900 1677300 2044500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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modifier 1 | GDSL-like lipase/acylhydrolase superfamily protein | Chr3:4729886-4731562 FORWARD LENGTH=392;AT3G14210.2 | Symbols:ESM1 | epithiospecifier modifier 1 | GDSL-like lipase/acylhydrolase superfamily 2 9 9 9 9 9 9 8 8 6 9 9 9 8 8 6 9 9 9 8 8 6 36 36 36 44.06 392 392;264 0 138.79 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 36 36 36 30.1 30.1 22.4 293940000 62408000 96795000 40496000 37561000 39579000 17102000 18 7977000 2096100 2269200 997260 1027000 952290 635160 22104000 23077000 17870000 20143000 18187000 13618000 7 7 4 9 5 3 35 ANPNADASAQQAFVTNVINR;AQEEMAHLLYGADPDVVQPMTVR;DLPQTYWPYGK;ELIVYPTGETMR;FVVQLLAPLGCLPIVR;GVSFAVADASILGAPVESMTLNQQVVK;IGPMLNEFAK;SYFFFDGR;TGNECYELLNDLAK 330 182;208;395;558;739;956;1080;2118;2168 True;True;True;True;True;True;True;True;True 191;218;411;586;587;775;1001;1002;1132;2229;2282 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Symbols:no symbol available | no full name available | Cyclo 4 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 7.7 7.7 7.7 35.044 326 326;366;466;466 0 35.912 By MS/MS By MS/MS 7.7 7.7 0 0 0 0 5094700 2832800 2261900 0 0 0 0 15 339650 188850 150800 0 0 0 0 1713800 1391100 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 IIQASLEDISYLLR;LVTSGAYDGAK 336 1109;1631 True;True 1161;1699 6278;6279;8821;8822 4725;4726;6543 4725;6543 -1;-1;-1;-1 AT3G15730.1 AT3G15730.1 6 6 6 AT3G15730.1 | Symbols:PLD,PLDALPHA1 | phospholipase D alpha 1 | phospholipase D alpha 1 | Chr3:5330835-5333474 FORWARD LENGTH=810 1 6 6 6 4 3 3 3 5 4 4 3 3 3 5 4 4 3 3 3 5 4 11.5 11.5 11.5 91.847 810 810 0 87.503 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.4 5.6 5.7 5.7 10.1 8.6 136820000 12720000 8522800 16345000 12734000 26144000 60357000 44 166210 69841 83873 99432 101610 12496 341560 3324000 3507700 10279000 9005100 15903000 38137000 3 2 1 1 4 9 20 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17.9 17.9 17.9 17.9 5.4 0 77750000 32935000 33285000 5252900 5080200 1196900 0 9 5257500 2217000 2102500 394010 410970 132990 0 15494000 14697000 4093500 4360500 1250300 0 3 4 2 0 0 0 9 LQEQPTYDKK;LSEEDQAVFK;LSEEDQAVFKK;VVDIVDTFR 340 1534;1549;1550;2607 True;True;True;True 1600;1615;1616;2743 8332;8333;8334;8335;8400;8401;8402;8403;8404;8405;8406;8407;13973;13974;13975;13976;13977 6186;6187;6244;6245;6246;10408;10409;10410;10411;10412;10413 6187;6244;6246;10410 -1 AT3G17240.3;AT3G17240.1 AT3G17240.3;AT3G17240.1 3;3 1;1 1;1 AT3G17240.3 | Symbols:mtLPD2 | lipoamide dehydrogenase 2 | lipoamide dehydrogenase 2 | Chr3:5890278-5892166 REVERSE LENGTH=507;AT3G17240.1 | Symbols:mtLPD2 | lipoamide dehydrogenase 2 | lipoamide dehydrogenase 2 | Chr3:5890278-5892166 REVERSE LENGTH=50 2 3 1 1 3 3 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 10.1 4.9 4.9 53.985 507 507;507 0 8.2659 By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching 10.1 10.1 2.2 2.2 2.2 2.2 4517700 1677900 2839900 0 0 0 0 29 155780 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synthetase 1.3 | Chr3:6097503-6099408 FORWARD LENGTH=354 1 3 1 1 3 3 3 3 3 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8.8 4.8 4.8 38.594 354 354 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.8 8.8 8.8 8.8 8.8 8.8 30966000 14188000 11953000 1963600 1707500 806600 348080 15 2064400 945850 796870 130900 113840 53774 23205 14188000 11018000 3145100 3045800 1307400 660890 1 1 1 1 0 0 4 SLLSDLVNLNLTDATGK;TLPGPVTDPSK;TLPGPVTDPSKLPK 343 2036;2214;2215 True;False;False 2144;2329;2330 11121;11122;11123;11124;11125;11126;12031;12032;12033;12034;12035;12036;12037;12038;12039;12040;12041 8249;8250;8251;8252;8987;8988 8249;8987;8988 -1 AT3G17930.1 AT3G17930.1 1 1 1 AT3G17930.1 | Symbols:DAC | Defective Accumulation of Cytochrome b6/f complex | transmembrane protein | Chr3:6142307-6143246 REVERSE LENGTH=190 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 11.1 11.1 11.1 20.913 190 190 0 43.157 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 11.1 0 11.1 11.1 6849800 0 0 1042000 0 3562000 2245800 9 761090 0 0 115770 0 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| presequence protease 1 | Chr3:6625578-6631874 7 3 3 3 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 3.2 3.2 3.2 119.76 1069 1069;1080;830;932;1080;1080;1080 0 19.122 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.2 0 0 0 1 1 10061000 965990 0 0 0 2295100 6800100 65 14861 14861 0 0 0 35310 104620 0 0 0 0 3720200 12911000 2 0 0 0 0 1 3 DFAQAIDVVR;KREEILTTSLK;TLDIYDGTGDFLR 346 357;1300;2199 True;True;True 372;1360;2313 1592;7246;7247;11935 1005;5374;5375;8903 1005;5375;8903 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT3G19240.1 AT3G19240.1 1 1 1 AT3G19240.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Vacuolar import/degradation%2C Vid27-related protein | Chr3:6664383-6666423 FORWARD LENGTH=648 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 2 2 2 72.284 648 648 0.0015456 6.2865 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2 2 2 0 0 0 3191900 1180700 1514200 496990 0 0 0 32 99748 36898 47319 15531 0 0 0 1180700 1395700 796040 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 SPEAPLVVATPLK 347 2068 True 2176 11237;11238;11239 8362;8363 8362 -1 AT3G22200.1;AT3G22200.2 AT3G22200.1;AT3G22200.2 4;4 4;4 4;4 AT3G22200.1 | Symbols:POP2,HER1,GABA-T | GAMMA-AMINOBUTYRATE TRANSAMINASE,POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 2,HEXENAL RESPONSE1 | Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein | Chr3:7835286-7838863 FORWARD LENGTH=504;AT3G22200.2 | Sy 2 4 4 4 3 3 1 2 1 1 3 3 1 2 1 1 3 3 1 2 1 1 16.9 16.9 16.9 55.187 504 504;513 0 22.751 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 11.3 11.3 5.6 8.1 5.6 5.6 16276000 3902900 4397800 1659200 1547400 3011300 1757200 25 131030 69882 61147 66369 61894 120450 70287 3075100 3700500 2009100 1417100 3689900 2522100 1 3 0 0 0 1 5 ALSSAYMPIGAILMSQEVADVINSHSSK;EGPETIGAFIAEPVMGAGGVIPPPATYFEK;GTGLILGTEFVDNK;SEGSYVYDDTGKK 348 164;509;935;1933 True;True;True;True 170;535;979;2039 770;771;772;773;2709;2710;5267;5268;10591;10592;10593 472;2091;3910;3911;7857 472;2091;3911;7857 -1;-1 AT3G22890.1 AT3G22890.1 2 2 2 AT3G22890.1 | Symbols:ATPS1,APS1 | ATP sulfurylase 1 | ATP sulfurylase 1 | Chr3:8112837-8114734 FORWARD LENGTH=463 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 4.5 4.5 4.5 51.458 463 463 0 11.483 By MS/MS By MS/MS 4.5 4.5 0 0 0 0 4463500 2166100 2297400 0 0 0 0 27 165320 80227 85090 0 0 0 0 1495600 1585400 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 LVELIVEEPK;NADAVFAFQLR 349 1609;1697 True;True 1677;1785 8721;8722;9183;9184 6484;6485;6777 6485;6777 -1 AT3G22960.1 AT3G22960.1 1 1 1 AT3G22960.1 | Symbols:PKP1,PKP-ALPHA | PLASTIDIAL PYRUVATE KINASE 1 | Pyruvate kinase family protein | Chr3:8139369-8141771 FORWARD LENGTH=596 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1.8 1.8 1.8 65.13 596 596 0 6.7989 By MS/MS By MS/MS 1.8 1.8 0 0 0 0 1890100 958610 931540 0 0 0 0 28 67505 34236 33269 0 0 0 0 958610 858660 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 AEVADVSEAVR 350 61 True 64 290;291 173;174 173 -1 AT3G23400.1;AT3G23400.4;AT3G23400.3;AT3G23400.2 AT3G23400.1;AT3G23400.4;AT3G23400.3;AT3G23400.2 7;6;5;5 7;6;5;5 7;6;5;5 AT3G23400.1 | Symbols:FIB4 | fibrillin 4 | Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein | Chr3:8376636-8378225 REVERSE LENGTH=284;AT3G23400.4 | Symbols:FIB4 | fibrillin 4 | Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family prote 4 7 7 7 7 7 4 3 2 2 7 7 4 3 2 2 7 7 4 3 2 2 36.3 36.3 36.3 30.454 284 284;221;212;212 0 55.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 36.3 36.3 15.8 12.3 7.7 11.6 84788000 34149000 40195000 4524700 3091300 1392200 1435400 14 3600400 1550600 1580100 198180 133400 99440 38697 8632300 8709000 2798300 2462400 1455700 1230100 7 6 0 1 0 0 14 ELETAGGPVDLTDDLDKLQGK;GLVASVDDLER;LIPVTLGQVFQR;LLSVVSGLNR;LLYSSAFSSR;LPDSFRPSSNPGTGDFEVTYVDDTMR;SLGGSRPGLPTGR 351 550;884;1456;1495;1498;1524;2022 True;True;True;True;True;True;True 577;925;1518;1559;1562;1590;2130 2973;2974;2975;4989;4990;7970;7971;7972;7973;7974;7975;8162;8163;8164;8165;8166;8171;8172;8173;8293;8294;11051;11052;11053;11054 2303;2304;3720;5925;5926;5927;6052;6053;6057;6058;6149;6150;8193;8194 2304;3720;5925;6053;6058;6149;8193 -1;-1;-1;-1 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protein | Chr3:9525474-9526123 FORWARD LENGTH=154;AT3G26060.1 | Symbols:ATPRX Q,PRXQ | peroxiredoxin Q | Thioredoxin superfamily protein | Chr3:9524807-9526123 FORWARD LENGT 3 6 6 6 6 5 5 5 4 4 6 5 5 5 4 4 6 5 5 5 4 4 55.2 55.2 55.2 17.028 154 154;216;217 0 89.493 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 55.2 44.8 42.9 42.9 38.3 32.5 103100000 32872000 34203000 6994900 4835700 11931000 12265000 9 5047800 2112200 2219100 289250 229920 62619 134690 12757000 15169000 3776100 3251800 3881200 3283000 3 2 0 0 5 2 12 AGAEVIGISGDDSASHK;GKPVVLYFYPADETPGCTK;GQAAPDFTLK;HIDETLK;KDWGVPGDLFGALPGR;NGVVQLIYNNQFQPEK 356 71;854;914;988;1257;1725 True;True;True;True;True;True 75;894;957;1035;1316;1814 350;351;352;353;354;355;4864;4865;4866;5157;5158;5159;5160;5161;5614;5615;5616;5617;5618;5619;6950;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;9296;9297;9298;9299 203;3630;3631;3825;3826;3827;4204;4205;5146;5147;5148;5149;5150;5151;6843;6844 203;3631;3826;4204;5146;6844 -1;-1;-1 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symbol available | no full name available | AIG2-like (avirulence induced gene) family protein | Chr3:10968324-10969311 REVERSE LENGTH=169 1 3 3 3 2 3 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 21.3 21.3 21.3 19.465 169 169 0 18.545 By MS/MS By MS/MS 20.7 21.3 0 0 0 0 6086400 2274100 3812300 0 0 0 0 7 300940 202010 98928 0 0 0 0 1676500 1702700 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 5 ILTGLTDSQLENLDMIEGSEYVR;TVEVVLTDTSEK;TVEVVLTDTSEKK 365 1140;2287;2288 True;True;True 1194;2408;2409 6435;6436;12405;12406;12407 4832;4833;9231;9232;9233 4833;9232;9233 -1 AT3G29320.1 AT3G29320.1 1 1 1 AT3G29320.1 | Symbols:PHS1 | alpha-glucan phosphorylase 1 | Glycosyl transferase%2C family 35 | Chr3:11252871-11257587 FORWARD LENGTH=962 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2.7 2.7 2.7 108.58 962 962 0 19.619 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.7 2.7 2.7 2.7 2.7 2.7 7858800 755090 719390 839080 904340 2792400 1848500 49 160380 15410 14681 17124 18456 56987 37725 755090 663110 1344000 1613100 4526200 3509700 0 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14C | Chr3:15406088-15407699 FORWARD LENGTH=240 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 8.3 8.3 8.3 24.767 240 240 0.0015773 6.4559 By MS/MS By MS/MS 8.3 8.3 0 0 0 0 1528700 708690 820050 0 0 0 0 12 127390 59058 68337 0 0 0 0 708690 755900 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 AVEVEPTIDYGGGGGIGGDK 368 286 True 298 1294;1295 800;801 801 -1 AT3G44110.2;AT5G22060.1;AT3G44110.1 AT3G44110.2;AT5G22060.1;AT3G44110.1 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT3G44110.2 | Symbols:ATJ3,ATJ,J3 | DNAJ homologue 3 | DNAJ homologue 3 | Chr3:15869179-15871059 REVERSE LENGTH=343;AT5G22060.1 | Symbols:ATJ2,J2 | DNAJ homologue 2,ARABIDOPSIS THALIANA DNAJ HOMOLOGUE 2 | DNAJ homologue 2 | Chr5:7303798-7305668 REVERSE 3 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 6.4 6.4 6.4 37.674 343 343;419;420 0 11.462 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.4 3.5 6.4 6.4 2.9 2.9 10367000 1507200 1140800 1172600 1004400 2818400 2723700 16 231680 71942 71298 49042 39396 176150 170230 549200 1319100 788240 784400 5104400 5778300 0 1 0 0 3 1 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1138;1139;1140;1141;1142;1143;1443;1444;1445;1446;1447;1448;3868;3869;3870;3871;4751;4752;4753;4754;4755;4756;5204;5205;5206;5207;7770;7771;7772;7773;7774;8182;8183;8184;8185;8186;9681;11420;11421;11422;11423 711;712;888;889;890;891;892;893;2951;3554;3555;3556;3557;3850;3851;3852;3853;5769;5770;5771;5772;6065;6066;7195;8491;8492 712;891;2951;3556;3851;5769;6066;7195;8491 -1 AT3G44310.3;AT3G44310.1;AT3G44310.4;AT3G44310.2 AT3G44310.3;AT3G44310.1;AT3G44310.4;AT3G44310.2 11;11;6;6 11;11;6;6 6;6;2;2 AT3G44310.3 | Symbols:NIT1,ATNIT1,NITI | A. THALIANA NITRILASE 1,nitrilase 1 | nitrilase 1 | Chr3:15986901-15988841 FORWARD LENGTH=346;AT3G44310.1 | Symbols:NIT1,ATNIT1,NITI | A. THALIANA NITRILASE 1,nitrilase 1 | nitrilase 1 | Chr3:15986901-15988841 F 4 11 11 6 11 10 10 10 6 8 11 10 10 10 6 8 6 5 5 5 4 4 43.4 43.4 23.4 38.152 346 346;346;224;224 0 140.04 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 43.4 39.6 39 39 24.3 29.2 348880000 80098000 76190000 48424000 30816000 38126000 75225000 18 11586000 4176400 3878900 1530500 1394800 300740 304930 16570000 20510000 19658000 17017000 16350000 8094000 7 8 5 3 18 10 51 CIWGQGDGSTIPVYDTPIGK;DMSTVQNATPFNGVAPSTTVR;FGLAVGVHNEEGRDEFR;GAELVLFPEGFIGGYPR;GIELYCAPTADGSK;LGAAICWENR;LMPTSLER;PDVLHLTVNEHPR;SVTFVTK;YHASAIHVPGPEVAR;YIVEAASK 371 324;408;670;749;831;1410;1500;1831;2114;2720;2727 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 338;425;704;785;870;1472;1566;1929;2224;2859;2866 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plastid transcriptionally active 16 | Chr3:17228766-17231021 FORWARD LENGTH=510 1 9 9 9 9 8 7 6 7 6 9 8 7 6 7 6 9 8 7 6 7 6 26.1 26.1 26.1 54.358 510 510 0 97.622 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 26.1 24.7 19.2 17.8 23.1 20.8 104140000 35643000 35251000 10805000 9873400 8318700 4249100 28 3125700 1096400 1050000 367060 336270 185560 90424 6979000 7004300 4618600 4751900 2357600 1822200 7 8 2 2 1 1 21 AGVPDLGAAQDLAR;IAQTLLQR;IASLVADIFANTAVAENK;LNAVQSPFQDAESIAK;SLIPVVTNPSTGLVFGNNR;SQPLTISDLIEK;VAQTDVAYTLIK;VQVATVR;VVEVSTDPSAPSRPVDELFSVIPEDGR 378 98;1024;1026;1501;2029;2079;2337;2561;2620 True;True;True;True;True;True;True;True;True 104;1073;1075;1567;2137;2188;2462;2695;2756 452;453;454;455;456;457;5880;5881;5884;5885;5886;5887;5888;5889;5890;5891;5892;5893;8187;8188;8189;8190;8191;8192;11078;11079;11080;11081;11082;11083;11281;11282;11283;11284;11285;11286;12637;12638;12639;12640;12641;13749;13750;14044;14045;14046;14047 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Chr5:8008251-8009330 REVERSE LENGTH=159;AT4G30800.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Nucleic acid-binding%2C OB-fold-like protein | Chr 3 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 8.2 8.2 8.2 17.749 159 159;159;160 0 11.963 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 8.2 8.2 8.2 8.2 8.2 15477000 0 367980 1557500 861110 5474700 7216000 9 1719700 0 40887 173050 95679 608300 801780 0 339200 2494700 1536000 5671400 13701000 0 0 0 0 6 6 12 HSNIPAHVSPCFR 388 1004 True 1052 5769;5770;5771;5772;5773;5774;5775 4349;4350;4351;4352;4353;4354;4355;4356;4357;4358;4359;4360 4357 -1;-1;-1 AT3G48990.1 AT3G48990.1 7 7 7 AT3G48990.1 | Symbols:AAE3 | ACYL-ACTIVATING ENZYME 3 | AMP-dependent synthetase and ligase family protein | Chr3:18159031-18161294 REVERSE LENGTH=514 1 7 7 7 6 6 3 4 0 1 6 6 3 4 0 1 6 6 3 4 0 1 20.2 20.2 20.2 55.544 514 514 0 79.412 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.1 14.8 8.2 9.7 0 2.1 58418000 27526000 23029000 2954300 2707900 0 2200700 22 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PROTEIN,breast basic conserved 1 | brea 9 4 4 4 4 4 4 4 1 0 4 4 4 4 1 0 4 4 4 4 1 0 25 25 25 23.539 204 204;206;206;206;206;206;153;206;206 0 32.024 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25 25 25 25 3.9 0 40563000 15500000 14700000 4977400 4632700 753910 0 10 3239300 1259300 1181400 358820 364330 75391 0 6899600 6662100 3819200 4609200 907920 0 2 3 1 3 0 0 9 AGDSTPEELANATQVQGDYLPIVR;GFTLEELK;SLEGLQTNVQR;TWFNQPAR 390 75;786;2020;2309 True;True;True;True 79;822;2128;2432 364;365;366;367;4507;4508;4509;4510;4511;11044;11045;11046;11047;11048;12506;12507;12508;12509 212;213;214;3387;8187;8188;8189;8190;8191;9295 212;3387;8188;9295 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT3G49120.1;AT3G49110.1;AT4G08780.1;AT4G08770.1;AT3G32980.1 AT3G49120.1 8;2;1;1;1 8;2;1;1;1 8;2;1;1;1 AT3G49120.1 | Symbols:PERX34,ATPERX34,PRX34,ATPCB,PRXCB | ARABIDOPSIS THALIANA PEROXIDASE CB,PEROXIDASE 34,peroxidase CB | peroxidase CB | Chr3:18207819-18210041 FORWARD LENGTH=353 5 8 8 8 7 8 6 5 4 4 7 8 6 5 4 4 7 8 6 5 4 4 32.9 32.9 32.9 38.832 353 353;354;346;346;352 0 201.89 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25.8 32.9 20.4 14.4 17.8 13.6 196760000 74129000 95508000 9264900 7864700 6110500 3887400 18 9010900 3784300 4180000 462400 436930 73899 73397 20285000 22521000 5538600 6415400 3396600 2433000 7 8 1 0 1 0 17 AYADGTQTFFNAFVEAMNR;DAFGNANSAR;MGNITPTTGTQGQIR;NQCQFILDR;NVGLDRPSDLVALSGGHTFGK;SALVDFDLR;TPTVFDNK;TVSCADMLTIAAQQSVTLAGGPSWR 391 316;331;1663;1783;1808;1905;2252;2300 True;True;True;True;True;True;True;True 329;330;345;1739;1878;1904;2006;2369;2423 1411;1412;1413;1414;1415;1416;1485;1486;1487;1488;1489;8976;8977;8978;8979;9727;9728;9729;9730;9844;9845;9846;9847;9848;10431;10432;10433;10434;10435;10436;12231;12232;12233;12234;12235;12236;12470;12471 870;871;872;873;942;943;6637;7222;7223;7224;7300;7301;7302;7303;7304;7755;7756;7757;7758;9131;9132;9273;9274 873;942;6637;7223;7302;7757;9132;9273 78 311 -1;-1;-1;-1;-1 AT3G49360.1 AT3G49360.1 12 12 12 AT3G49360.1 | Symbols:PGL2 | 6-phosphogluconolactonase 2 | 6-phosphogluconolactonase 2 | Chr3:18303189-18304283 REVERSE LENGTH=259 1 12 12 12 12 12 10 10 0 0 12 12 10 10 0 0 12 12 10 10 0 0 57.9 57.9 57.9 28.863 259 259 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 57.9 57.9 57.9 57.9 0 0 660360000 253110000 263070000 74603000 69572000 0 0 14 31867000 12417000 12277000 3745000 3428800 0 0 52731000 52251000 28133000 31341000 0 0 8 9 5 7 0 0 29 ITLTLPVINCASYNVMAVCDK;ITLTLPVINCASYNVMAVCDKEQADSVAAALNHTK;LAYDGFLSK;LLEAPYIDSIEWSK;LTADVEVVWFLDQAAASK;TNNEMAVELAK;VNQNIIR;VPVPAENIYAIDNGLGAEGNAELAAER;VPVPAENIYAIDNGLGAEGNAELAAERYEECLK;WVTSITDSPKPPSK;WVTSITDSPKPPSKR;YTADLSSK 392 1202;1203;1363;1476;1583;2233;2519;2543;2544;2670;2671;2761 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1258;1259;1425;1538;1649;2349;2350;2653;2677;2678;2808;2809;2901 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name available | Tautomerase/MIF superfamily protein | Chr3:19164229-19165076 REVERSE LENGTH=112 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 11.6 11.6 11.6 12.21 112 112 0 9.4794 By MS/MS By MS/MS 11.6 11.6 0 0 0 0 6249700 2656600 3593100 0 0 0 0 7 892810 379520 513290 0 0 0 0 2656600 3312000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 VFDINSLPLPSKL 397 2395 True 2524 13026;13027 9759 9759 -1 AT3G52150.2;AT3G52150.1 AT3G52150.2;AT3G52150.1 2;2 2;2 2;2 AT3G52150.2 | Symbols:PSRP2 | plastid-specific ribosomal protein 2 | RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | Chr3:19342074-19343090 FORWARD LENGTH=253;AT3G52150.1 | Symbols:PSRP2 | plastid-specific ribosomal protein 2 | RNA-binding 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 7.1 7.1 7.1 27.748 253 253;253 0 11.033 By MS/MS By MS/MS 7.1 7.1 0 0 0 0 5076900 2638300 2438600 0 0 0 0 16 317310 164890 152410 0 0 0 0 1859400 1564000 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 EMLENLFSEK;VYIGNIPR 398 569;2651 True;True 599;2787 3201;3202;14153;14154 2497;2498;10509 2498;10509 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aldolase 8 | Aldolase superfamily protein | Chr3:19627383-19628874 REVERSE LENGTH=358 1 15 15 8 15 14 12 10 5 4 15 14 12 10 5 4 8 7 6 4 2 1 49.7 49.7 22.1 38.539 358 358 0 228.27 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 49.7 48.9 43.3 42.5 24.6 20.4 288360000 125270000 116470000 19968000 16198000 6663900 3785600 23 7337400 3382800 3009800 398070 384260 121050 41426 15769000 14930000 4806600 4385100 2668400 1607200 13 11 3 4 2 1 34 AAQEALYVR;ANSEATLGTYK;FADELIANAAYIGTPGK;GILAADESTGTIGK;GILAADESTGTIGKR;GTVELAGTDGETTTQGLDGLGDR;LASINVENVETNR;LASINVENVETNRR;LFVDILK;LGDGAAESLHVK;NLNAMNQLK;TVPAAVPAIVFLSGGQSEEEATR;VDKGTVELAGTDGETTTQGLDGLGDR;VLAACYK;YAVICQENGLVPIVEPEILVDGSHDIQK 400 13;183;622;836;837;942;1346;1347;1407;1416;1750;2296;2364;2467;2689 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 13;192;653;875;876;986;1408;1409;1469;1478;1841;2419;2491;2599;2827 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AHGLAPEIPEDLYHLIK;GLTPSQIGVILR;KGLTPSQIGVILR;LILVESR 418 104;882;1272;1455 True;True;True;True 110;923;1331;1517 481;482;483;484;485;486;487;488;489;490;491;492;493;494;495;496;497;498;499;500;501;502;503;504;505;506;507;508;509;510;511;512;513;514;515;516;4984;4985;4986;4987;7067;7068;7069;7070;7964;7965;7966;7967;7968;7969 288;289;290;291;292;293;294;295;296;297;298;299;300;301;302;303;304;305;306;307;3713;3714;3715;3716;3717;3718;5265;5924 300;3714;5265;5924 -1;-1 AT3G61050.2;AT3G61050.1 AT3G61050.2;AT3G61050.1 2;2 2;2 2;2 AT3G61050.2 | Symbols:AtCLB,NTMC2TYPE4,NTMC2T4 | calcium-dependent lipid-binding protein | Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein | Chr3:22597485-22600932 FORWARD LENGTH=510;AT3G61050.1 | Symbols:AtCLB,NTMC2TYPE4,NTMC2T4 | calcium- 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 7.1 7.1 7.1 55.094 510 510;510 0 14.224 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.1 7.1 7.1 7.1 4.3 4.3 7675300 1512100 1895100 1571900 1355900 666210 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420 1100;1956;2249 True;True;True 1152;2063;2366 6241;6242;10698;10699;10700;10701;12218;12219;12220 4690;4691;7911;9126 4691;7911;9126 -1;-1;-1;-1 AT3G61470.1 AT3G61470.1 2 2 2 AT3G61470.1 | Symbols:LHCA2 | photosystem I light harvesting complex gene 2 | photosystem I light harvesting complex protein | Chr3:22745736-22747032 FORWARD LENGTH=257 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 17.9 17.9 17.9 27.755 257 257 0 16.787 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.1 17.9 10.1 10.1 10.1 10.1 53064000 5167800 4621100 3514900 3904200 20175000 15681000 9 1755100 200680 161150 151920 134660 659080 447650 2729600 2115300 3503800 4113200 15621000 12139000 1 2 2 1 2 2 10 LTGTDVGYPGGLWFDPLGWGSGSPAK;WADIIKPGSVNTDPVFPNNK 421 1590;2653 True;True 1657;2789 8609;8610;8611;8612;8613;8614;8615;8616;8617;8618;8619;8620;8621;8622;8623;8624;8625;8626;14161 6417;6418;6419;6420;6421;6422;6423;6424;6425;10514 6424;10514 -1 AT3G62030.3;AT3G62030.1;AT3G62030.2 AT3G62030.3;AT3G62030.1;AT3G62030.2 6;6;6 6;6;6 6;6;6 AT3G62030.3 | Symbols:ROC4,CYP20-3 | rotamase CYP 4,cyclophilin 20-3 | rotamase CYP 4 | Chr3:22973708-22975139 FORWARD LENGTH=259;AT3G62030.1 | Symbols:ROC4,CYP20-3 | rotamase CYP 4,cyclophilin 20-3 | rotamase CYP 4 | Chr3:22973708-22975139 FORWARD LEN 3 6 6 6 6 6 2 3 2 3 6 6 2 3 2 3 6 6 2 3 2 3 39 39 39 28.079 259 259;260;313 0 70.928 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 39 39 8.1 12.7 8.1 12.7 198520000 75724000 84065000 12339000 11138000 8475600 6775600 18 9939300 3779200 4046000 685500 599270 470870 358430 36470000 38172000 11611000 11607000 8347600 7986800 4 2 1 2 1 0 10 FEDENFTLK;HTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTVK;HVVFGQVIEGMK;IIKDFMIQGGDFTEGNGTGGISIYGAK;IVMGLFGEVVPK;VYFDVEIGGEVAGR 422 647;1005;1011;1099;1226;2650 True;True;True;True;True;True 679;1053;1059;1151;1283;1284;2786 3612;3613;3614;3615;3616;3617;5776;5777;5814;5815;5816;5817;6239;6240;6793;6794;6795;6796;6797;6798;6799;6800;6801;6802;6803;6804;14151;14152 2770;2771;2772;2773;2774;4361;4383;4689;5057;5058;5059;5060;10508 2771;4361;4383;4689;5059;10508 80 112 -1;-1;-1 AT3G63140.1 AT3G63140.1 2 2 2 AT3G63140.1 | Symbols:CSP41A | chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa | chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa | Chr3:23327006-23328620 REVERSE LENGTH=406 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 6.9 6.9 6.9 43.929 406 406 0 11.85 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.9 6.9 2.5 2.5 2.5 2.5 11840000 4933400 5590900 400720 326100 324980 263490 24 229210 87056 87350 16697 13588 13541 10979 2724500 2606400 851240 771440 698610 663490 1 1 0 0 0 0 2 AVPIPGSGLQLTNISHVR;FSEIVSGGGK 423 301;714 True;True 313;750 1342;1343;4040;4041;4042;4043;4044;4045 830;831;3083 831;3083 -1 AT3G63160.1 AT3G63160.1 1 1 1 AT3G63160.1 | Symbols:OEP6 | outer envelope protein 6 | outer envelope membrane protein | Chr3:23333773-23333982 REVERSE LENGTH=69 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13 13 13 7.2563 69 69 0 7.7558 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 13 13 13 13 13 13 28874000 10359000 10523000 2080400 1740600 2262000 1908800 3 9624800 3453100 3507800 693460 580180 753990 636280 10359000 9700300 3332200 3104700 3666400 3624200 0 0 0 0 0 0 0 SGGEVNFPK 424 1974 True 2082 10772;10773;10774;10775;10776;10777 7978;7979;7980 7978 -1 AT3G63190.1 AT3G63190.1 3 3 3 AT3G63190.1 | Symbols:cpRRF,HFP108,AtcpRRF,RRF | chloroplast ribosome recycling factor,Arabidopsis thaliana chloroplast ribosome recycling factor,ribosome recycling factor, chloroplast precursor,HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE AND PALE GREEN MUTANT 108 | 1 3 3 3 3 3 2 2 0 0 3 3 2 2 0 0 3 3 2 2 0 0 17.8 17.8 17.8 30.422 275 275 0 19.181 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.8 17.8 14.2 14.2 0 0 25857000 11724000 12020000 1053800 1059500 0 0 16 1616100 732730 751260 65859 66219 0 0 4351700 4274900 887120 999340 0 0 1 2 0 0 0 0 3 AIVNSDLGVTPNNDGDVIR;LSLPPLTSDR;SIAQISTPDGSSLLLQPYDK 425 128;1563;1985 True;True;True 134;1629;2093 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transducin family protein / WD-40 repeat family protein | Chr3:23431009-23437241 REVERSE LENGTH=1104;AT3G63460.2 | Symbols:SEC31B | | transducin family protein / WD-40 repeat family protein | Chr3:23431009-23437241 RE 3 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 3.3 3.3 3.3 119.87 1104 1104;1102;1094 0 11.107 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.3 3.3 2.1 2.1 2.1 2.1 7013300 1148700 1238700 1154000 706290 1325200 1440300 47 25180 11846 13334 24553 15027 28196 30645 588690 568990 1851200 1261700 2151300 2738800 1 1 0 0 0 1 3 GTSSILSEVFLHSLVTEQSLVSR;LFNETSEALGGAR 427 940;1399 True;True 984;1461 5286;5287;5288;5289;5290;5291;7717;7718 3916;5727;5728 3916;5727 -1;-1;-1 AT3G63490.1;AT3G63490.2 AT3G63490.1;AT3G63490.2 2;1 2;1 2;1 AT3G63490.1 | Symbols:EMB3126,PRPL1 | plastid ribosomal protein L1,EMBRYO DEFECTIVE 3126 | Ribosomal protein L1p/L10e family | Chr3:23444269-23446020 FORWARD LENGTH=346;AT3G63490.2 | Symbols:EMB3126,PRPL1 | plastid ribosomal protein L1,EMBRYO DEFECTIVE 2 2 2 2 2 2 1 0 2 1 2 2 1 0 2 1 2 2 1 0 2 1 9.8 9.8 9.8 37.632 346 346;291 0 11.173 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.8 9.8 4.9 0 9.8 4.9 17229000 7273400 6018700 2037100 0 1510700 388710 17 396460 157280 160890 119830 0 55426 22865 4266900 3361100 3032300 0 1443400 1050700 1 1 0 0 0 0 2 AGTVTANIPQAIEEFKK;SAGADIVGSDDLIEQIK 428 95;1901 True;True 101;2002 440;441;442;443;10417;10418;10419;10420 262;7746 262;7746 -1;-1 AT4G01050.1;AT4G01050.2 AT4G01050.1;AT4G01050.2 1;1 1;1 1;1 AT4G01050.1 | Symbols:TROL | thylakoid rhodanese-like | thylakoid rhodanese-like protein | Chr4:455874-458175 FORWARD LENGTH=466;AT4G01050.2 | Symbols:TROL | thylakoid rhodanese-like | thylakoid rhodanese-like protein | Chr4:455751-458175 FORWARD LENGT 2 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 2.8 2.8 2.8 49.387 466 466;507 0 10.833 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 2.8 2.8 2.8 2.8 2.8 0 9754200 3816700 3912500 0 360380 1664600 0 20 487710 190830 195630 0 18019 83229 0 3816700 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symbol available | no full name available | Ribosomal L5P family protein | Chr4:544166-545480 REVERSE LENGTH=262 1 2 2 2 2 2 2 1 2 0 2 2 2 1 2 0 2 2 2 1 2 0 8 8 8 28.343 262 262 0 12.082 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8 8 8 4.6 8 0 12959000 4878400 5079000 1868500 373220 760200 0 19 682070 256760 267310 98341 19643 40010 0 3090200 2961500 1315900 1141400 581940 0 0 1 0 0 0 0 1 DQGVFPEIR;EGGGGSTGAIVR 431 418;501 True;True 436;526 2133;2134;2135;2136;2668;2669;2670;2671;2672 1660;2063 1660;2063 -1 AT4G01870.1;AT4G01870.2 AT4G01870.1;AT4G01870.2 5;5 5;5 5;5 AT4G01870.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | tolB protein-like protein | Chr4:808473-810431 REVERSE LENGTH=652;AT4G01870.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | tolB protein-like protein | Chr4:808473-810578 R 2 5 5 5 5 4 0 0 0 0 5 4 0 0 0 0 5 4 0 0 0 0 14.4 14.4 14.4 72.814 652 652;701 0 31.511 By MS/MS By MS/MS 14.4 11.7 0 0 0 0 20411000 9253700 11158000 0 0 0 0 30 324980 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Symbols:CYP706A6 | cytochrome P450, family 706, subfamily A, polypeptide 6 | cytochrome P450%2C family 706%2C subfamily A%2C polypeptide 6 | Chr4:7314939-7316647 REVERSE LENGTH=518 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1.9 1.9 1.9 59.028 518 518 0 6.9993 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.9 1.9 1.9 1.9 0 0 9832300 2640000 3090600 2252100 1849700 0 0 30 327740 88000 103020 75070 61656 0 0 2640000 2848800 3607300 3299300 0 0 0 1 0 1 0 0 2 SPLVALPVPR 453 2074 True 2183 11261;11262;11263;11264 8385;8386 8386 -1 AT4G12480.1;AT4G12500.1;AT4G12490.1 AT4G12480.1;AT4G12500.1;AT4G12490.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT4G12480.1 | Symbols:EARLI1,pEARLI 1 | EARLY ARABIDOPSIS ALUMINUM INDUCED 1 | Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein | Chr4:7406371-7406877 REVERSE LENGTH=168;AT4G12500.1 | Symbols:no symbol available 3 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 8.3 8.3 8.3 17.308 168 168;177;182 0 11.852 By MS/MS By MS/MS 0 0 8.3 8.3 0 0 4606700 0 0 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2,glycine-rich RNA-binding protein 2,glycine rich protein 2,RNA-binding glycine-rich protein A5 | glycine-rich RNA-binding protein 2 | Chr4:8021314-8022065 FORWARD LENGTH= 4 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 12.4 12.4 12.4 13.426 129 129;144;153;158 0.0015873 6.4823 By MS/MS 0 12.4 0 0 0 0 1952800 0 1952800 0 0 0 0 6 325460 0 325460 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 LFIGGLSWGTDDASLR 459 1397 True 1459 7712 5721 5721 -1;-1;-1;-1 AT4G13930.1 AT4G13930.1 2 2 2 AT4G13930.1 | Symbols:SHM4 | serine hydroxymethyltransferase 4 | serine hydroxymethyltransferase 4 | Chr4:8048013-8050021 REVERSE LENGTH=471 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 5.5 5.5 5.5 51.717 471 471 0 17.105 By MS/MS By MS/MS 5.5 5.5 0 0 0 0 10476000 4767500 5709000 0 0 0 0 21 498880 227020 271860 0 0 0 0 3622600 3914200 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 AVTLTLDIQK;NAVFGDSSALAPGGVR 460 309;1709 True;True 321;1798 1377;1378;9234;9235 851;6806;6807 851;6807 -1 AT4G13940.1;AT4G13940.3;AT4G13940.4;AT4G13940.2;AT3G23810.1 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48;85;141;241;407;421;1383;1612;1613;1642;1765;2151;2169;2343 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 51;90;147;251;424;439;1445;1680;1681;1710;1860;2263;2283;2468 227;228;229;230;231;407;408;409;410;411;662;663;1104;1105;1106;1107;1854;1855;1856;1857;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;2159;2160;2161;7653;7654;8728;8729;8730;8731;8732;8733;8734;8735;8736;8737;8738;8739;8740;8741;8862;8863;8864;8865;9661;9662;11648;11649;11650;11651;11777;11778;11779;11780;11781;11782;11783;11784;11785;12746;12747;12748;12749 144;145;237;238;239;398;399;689;690;1232;1233;1665;1666;1667;1668;1669;1670;1671;5674;5675;6489;6490;6491;6492;6493;6494;6495;6565;6566;6567;7184;8654;8655;8656;8657;8767;8768;8769;8770;8771;8772;9547 144;238;399;689;1232;1667;5675;6491;6495;6567;7184;8657;8771;9547 -1;-1;-1;-1;-1 AT4G14880.5;AT4G14880.4;AT4G14880.3;AT4G14880.2;AT4G14880.1 AT4G14880.5;AT4G14880.4;AT4G14880.3;AT4G14880.2;AT4G14880.1 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 3;3;3;3;3 AT4G14880.5 | Symbols:OASA1,OLD3,CYTACS1,ATCYS-3A | ONSET OF LEAF DEATH 3,O-acetylserine (thiol) lyase (OAS-TL) isoform A1 | O-acetylserine (thiol) lyase (OAS-TL) isoform A1 | Chr4:8518209-8520050 REVERSE LENGTH=322;AT4G14880.4 | Symbols:OASA1,OLD3,CYTA 5 3 3 3 2 3 1 0 2 1 2 3 1 0 2 1 2 3 1 0 2 1 14.6 14.6 14.6 33.805 322 322;322;322;322;322 0 23.61 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.1 14.6 3.7 0 11.2 3.7 6276300 297950 3710100 0 0 2268300 0 16 152880 18622 134260 0 0 141770 0 1361900 1657600 0 0 2616600 0 1 3 1 0 2 1 8 DVTELIGNTPLVYLNNVAEGCVGR;LFVAIFPSFGER;YLSTVLFDATR 462 452;1406;2740 True;True;True 475;1468;2879 2444;2445;7748;7749;7750;7751;7752;14696;14697 1923;1924;5746;5747;5748;5749;5750;11007;11008 1923;5747;11008 -1;-1;-1;-1;-1 AT4G15000.2;AT4G15000.1;AT3G22230.1;AT2G32220.1 AT4G15000.2;AT4G15000.1;AT3G22230.1;AT2G32220.1 2;2;1;1 2;2;1;1 2;2;1;1 AT4G15000.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal L27e protein family | Chr4:8571896-8572387 FORWARD LENGTH=131;AT4G15000.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal L27e protein family | Chr4:85718 4 2 2 2 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 0 0 14.5 14.5 14.5 15.035 131 131;135;135;135 0 13.021 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.5 14.5 6.1 6.1 0 0 12598000 5692300 5141800 938850 825090 0 0 6 2099700 948710 856960 156480 137510 0 0 2843700 2390400 1527500 1495000 0 0 4 0 0 0 0 0 4 AVILLQGR;EVATLDALQSK 463 294;597 True;True 306;628 1322;1323;1324;1325;3394;3395 817;2631;2632;2633;2634 817;2634 -1;-1;-1;-1 AT4G15530.7;AT4G15530.3;AT4G15530.2;AT4G15530.4;AT4G15530.1;AT4G15530.6;AT4G15530.5 AT4G15530.7;AT4G15530.3;AT4G15530.2;AT4G15530.4;AT4G15530.1;AT4G15530.6;AT4G15530.5 4;4;4;4;4;4;4 4;4;4;4;4;4;4 4;4;4;4;4;4;4 AT4G15530.7 | Symbols:PPDK | pyruvate orthophosphate dikinase | pyruvate orthophosphate dikinase | Chr4:8864828-8869129 REVERSE LENGTH=857;AT4G15530.3 | Symbols:PPDK | pyruvate orthophosphate dikinase | pyruvate orthophosphate dikinase | Chr4:8864828-8 7 4 4 4 4 4 0 0 0 0 4 4 0 0 0 0 4 4 0 0 0 0 6.7 6.7 6.7 93.379 857 857;857;875;956;956;963;963 0 23.197 By MS/MS By MS/MS 6.7 6.7 0 0 0 0 7719100 3890200 3828900 0 0 0 0 45 125990 66150 59844 0 0 0 0 1155700 1044900 0 0 0 0 3 2 0 0 0 0 5 DIGASLADPSKPLLLSVR;IAVDMVGEGLVEK;NDTDLSAADLK;VMANADTPEDAIAAR 464 375;1027;1713;2508 True;True;True;True 391;1076;1802;2642 1669;1670;5894;5895;9249;9250;13519;13520 1063;4434;4435;6814;10105 1063;4435;6814;10105 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT4G15802.1 AT4G15802.1 1 1 1 AT4G15802.1 | Symbols:AtHSBP,HSBP | Arabidopsis thaliana heat shock factor binding protein,heat shock factor binding protein | heat shock factor binding protein | Chr4:8986864-8988339 REVERSE LENGTH=86 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 14 14 14 9.3472 86 86 0 22.058 By MS/MS By MS/MS 14 14 0 0 0 0 3671700 1608200 2063500 0 0 0 0 6 611960 268030 343920 0 0 0 0 1608200 1902100 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 INELEQSINDLR 465 1150 True 1206 6476;6477 4858;4859;4860 4860 -1 AT4G16143.2;AT4G16143.1 AT4G16143.2;AT4G16143.1 2;2 2;2 2;2 AT4G16143.2 | Symbols:IMPA-2 | importin alpha isoform 2 | importin alpha isoform 2 | Chr4:9134450-9137134 REVERSE LENGTH=535;AT4G16143.1 | Symbols:IMPA-2 | importin alpha isoform 2 | importin alpha isoform 2 | Chr4:9134450-9137134 REVERSE LENGTH=535 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 8.2 8.2 8.2 58.906 535 535;535 0 13.544 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.3 4.3 8.2 8.2 3.9 8.2 11059000 843870 770600 2072000 1918500 833430 4620200 25 442340 33755 30824 82880 76738 33337 184810 905990 762600 2456400 2627600 3102900 5955900 0 0 2 2 1 2 7 DLVLGQGALIPLLSQLNEHAK;VVIEHGAVPIFVQLLASQSDDVR 466 403;2628 True;True 420;2764 1844;1845;1846;1847;14077;14078;14079;14080;14081 1226;1227;1228;10470;10471;10472;10473 1228;10473 -1;-1 AT4G17390.1;AT4G16720.1 AT4G17390.1;AT4G16720.1 1;1 1;1 1;1 AT4G17390.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L23/L15e family protein | Chr4:9714407-9715545 REVERSE LENGTH=204;AT4G16720.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L23/L15e fami 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 7.4 7.4 7.4 24.239 204 204;204 0 10.864 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.4 7.4 7.4 7.4 7.4 7.4 41249000 4734700 4364800 7160500 5515400 8080800 11393000 9 1043400 191600 111040 164780 612820 293100 282870 3730200 2923400 8123900 10066000 10197000 15624000 2 1 0 0 1 2 6 YYEIILVDPAHNAVR 467 2769 True 2909 14821;14822;14823;14824;14825;14826;14827;14828;14829;14830;14831 11106;11107;11108;11109;11110;11111;11112 11110 -1;-1 AT4G16760.2;AT4G16760.1;AT2G35690.1 AT4G16760.2;AT4G16760.1 3;3;1 3;3;1 3;3;1 AT4G16760.2 | Symbols:ATACX1,ACX1 | acyl-CoA oxidase 1 | acyl-CoA oxidase 1 | Chr4:9424930-9428689 REVERSE LENGTH=651;AT4G16760.1 | Symbols:ATACX1,ACX1 | acyl-CoA oxidase 1 | acyl-CoA oxidase 1 | Chr4:9424930-9428689 REVERSE LENGTH=664 3 3 3 3 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 7.8 7.8 7.8 72.921 651 651;664;664 0 17.134 By MS/MS By MS/MS 6 4.9 0 0 0 0 11545000 6410700 5133900 0 0 0 0 41 22750 156360 22750 0 0 0 0 3201600 3913300 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 LAASDFATLPEAHACTAGLK;LFPLLASAYAFR;SLEDHSPLPNITVGDIGTK 468 1315;1402;2018 True;True;True 1375;1464;2126 7319;7320;7737;11037 5429;5737;8184 5429;5737;8184 -1;-1;-1 AT5G47200.1;AT4G17530.1;AT1G02130.1;AT5G59840.1;AT5G03520.1;AT3G53610.3;AT3G53610.2;AT3G53610.1;AT3G46060.3;AT3G46060.2;AT3G46060.1;AT3G09900.1 AT5G47200.1;AT4G17530.1;AT1G02130.1;AT5G59840.1;AT5G03520.1;AT3G53610.3;AT3G53610.2;AT3G53610.1;AT3G46060.3;AT3G46060.2;AT3G46060.1;AT3G09900.1 2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT5G47200.1 | Symbols:RAB1A,ATRABD2B,ATRAB1A | ARABIDOPSIS RAB GTPASE HOMOLOG D2B,RAB GTPase homolog 1A | RAB GTPase homolog 1A | Chr5:19167029-19168718 FORWARD LENGTH=202;AT4G17530.1 | Symbols:RAB1C,ATRABD2C,ATRAB1C | RAB GTPase homolog 1C | RAB GTPase 12 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 13.4 13.4 13.4 22.313 202 202;202;203;216;216;216;216;216;216;216;216;218 0 12.624 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.4 13.4 13.4 13.4 7.9 13.4 29228000 6548800 6327100 6558300 6517500 1522000 1754300 16 1826700 409300 395440 409890 407340 95124 109650 3670600 3272800 5697000 6424800 2528600 1868600 2 3 1 1 0 0 7 AFADELGIPFLETSAK;LLLIGDSGVGK 469 63;1488 True;True 66;1551 298;299;300;301;302;303;8116;8117;8118;8119;8120 176;177;178;6024;6025;6026;6027;6028 176;6028 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT5G45930.1;AT4G18480.1 AT5G45930.1;AT4G18480.1 1;1 1;1 1;1 AT5G45930.1 | Symbols:CHLI2,CHL I2,CHLI-2 | magnesium chelatase i2 | magnesium chelatase i2 | Chr5:18628095-18629565 FORWARD LENGTH=418;AT4G18480.1 | Symbols:CHL11,CH-42,LOST1,CH42,CHLI-1,CHLI1 | low temperature with open-stomata 1,CHLORINA 42 | P-loop 2 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 5 5 5 46.097 418 418;424 0 7.053 By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 5 5 3758500 0 0 0 0 1821700 1936800 25 150340 0 0 0 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AT4G20260.5;AT4G20260.9;AT4G20260.8;AT4G20260.7;AT4G20260.3;AT4G20260.2;AT4G20260.10;AT4G20260.1;AT4G20260.4;AT4G20260.6 3;3;3;3;3;3;3;3;3;2 3;3;3;3;3;3;3;3;3;2 3;3;3;3;3;3;3;3;3;2 AT4G20260.5 | Symbols:ATPCAP1,PCAP1,MDP25 | ARABIDOPSIS THALIANA PLASMA-MEMBRANE ASSOCIATED CATION-BINDING PROTEIN 1,microtubule-destabilizing protein 25,plasma-membrane associated cation-binding protein 1 | plasma-membrane associated cation-binding prote 10 3 3 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 2 3 2 3 3 3 2 3 2 28.1 28.1 28.1 18.989 167 167;225;225;225;225;225;225;225;226;166 0 18.468 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 28.1 28.1 28.1 13.8 28.1 13.8 41518000 14254000 16981000 3877300 1751500 3783500 871580 9 3612900 1304800 1530700 207180 194610 278740 96842 5475000 6025700 2140200 2078600 1772200 1086900 3 3 0 0 0 0 6 AVSEASSSFGAGYVAGPVTFIFEK;VSVFLPEEVK;VVETYEATSAEVK 472 303;2579;2618 True;True;True 315;2714;2754 1346;1347;1348;1349;1350;1351;1352;13801;13802;13803;13804;13805;13806;14034;14035;14036;14037;14038;14039 833;834;10300;10301;10446;10447 833;10301;10446 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT4G20360.2;AT4G20360.1 AT4G20360.2;AT4G20360.1 16;16 16;16 16;16 AT4G20360.2 | Symbols:ATRAB8D,ATRABE1B,RABE1b | RAB GTPase homolog E1B | RAB GTPase homolog E1B | Chr4:10990036-10991466 FORWARD LENGTH=476;AT4G20360.1 | Symbols:ATRAB8D,ATRABE1B,RABE1b | RAB GTPase homolog E1B | RAB GTPase homolog E1B | Chr4:10990036- 2 16 16 16 14 16 12 11 12 9 14 16 12 11 12 9 14 16 12 11 12 9 50 50 50 51.63 476 476;476 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 42.6 50 34.2 34.2 34.9 25 540360000 184230000 215350000 53596000 43781000 27503000 15896000 25 17981000 6322400 6565800 1900100 1568000 1044200 580140 42342000 47474000 24438000 22251000 11023000 8264700 17 14 6 5 4 2 48 EDQVDDAELLELVELEVR;EHILLAK;ELLSSYEFNGDDIPIISGSALLAVETLTENPK;FEAIIYVLK;GITINTATVEYETENR;ILDEALAGDNVGLLLR;IVVELIVPVACEQGMR;IYELMDAVDDYIPIPQR;KYDEIDAAPEER;NMITGAAQMDGAILVVSGADGPMPQTK;QVGVPDMVVFLNK;SYTVTGVEMFQK;TTLTAALTMALASIGSSVAK;TVGAGVIGTILE;VGETVDLVGLR;YDEIDAAPEER 473 484;520;560;646;846;1117;1235;1243;1306;1760;1871;2122;2273;2289;2417;2692 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 509;546;589;678;885;1171;1293;1294;1302;1366;1852;1970;2233;2234;2393;2394;2410;2547;2831 2598;2599;2792;2793;2794;2795;2796;2797;3141;3142;3143;3144;3606;3607;3608;3609;3610;3611;4824;4825;4826;4827;4828;4829;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6842;6843;6844;6845;6846;6847;6848;6849;6850;6892;6893;7270;7271;7272;7273;7274;7275;7276;7277;7278;7279;9593;9594;10260;10261;11514;11515;11516;11517;11518;11519;11520;11521;11522;12349;12350;12351;12352;12353;12354;12355;12356;12357;12358;12408;12409;12410;12411;12412;12413;13103;13104;13105;13106;13107;13108;14399;14400;14401 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subfamily B, polypeptide 1 | cytochrome P450%2C family 83%2C subfamily B%2C polypeptide 1 | Chr4:15273677 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 6.2 6.2 6.2 56.846 499 499 0 12.881 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.2 2.2 6.2 6.2 4 4 9168500 847960 877840 1305400 1263400 2985300 1888700 27 119830 31406 32512 29796 26112 110570 69951 1416200 1351400 1129400 1243100 4300800 3187200 1 1 1 0 1 1 5 ELDTYLQELLDETLDPNRPK;LAVISSAELAK 498 544;1357 True;True 571;1419 2945;2946;2947;2948;7546;7547;7548;7549 2288;2289;5614;5615;5616 2289;5615 -1 AT4G31990.4;AT4G31990.2;AT4G31990.1;AT4G31990.3 AT4G31990.4;AT4G31990.2;AT4G31990.1;AT4G31990.3 4;4;4;4 3;3;3;3 3;3;3;3 AT4G31990.4 | Symbols:AAT3,ATAAT1,ASP5 | aspartate aminotransferase 5,ASPARTATE AMINOTRANSFERASE DEFICIENT 3 | aspartate aminotransferase 5 | Chr4:15471074-15473521 REVERSE LENGTH=448;AT4G31990.2 | Symbols:AAT3,ATAAT1,ASP5 | aspartate aminotransferase 5 4 4 3 3 4 4 1 1 0 0 3 3 1 0 0 0 3 3 1 0 0 0 11.2 9.2 9.2 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AT4G33680.1 AT4G33680.1 2 2 2 AT4G33680.1 | Symbols:AGD2 | ABERRANT GROWTH AND DEATH 2 | Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein | Chr4:16171847-16174630 REVERSE LENGTH=461 1 2 2 2 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 5 5 5 50.396 461 461 0 12.436 By MS/MS By MS/MS 5 5 0 0 0 0 5188100 2487400 2700700 0 0 0 0 21 247050 118450 128600 0 0 0 0 1464800 1438900 0 0 0 0 3 2 0 0 0 0 5 EQLTQLVEFAK;LQAGYLFPEIAR 502 582;1532 True;True 613;1598 3262;3263;8328;8329 2526;6181;6182;6183;6184 2526;6184 -1 AT4G34050.2;AT4G34050.1;AT4G34050.3 AT4G34050.2;AT4G34050.1;AT4G34050.3 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT4G34050.2 | Symbols:CCoAOMT1 | caffeoyl coenzyme A O-methyltransferase 1 | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | Chr4:16310844-16311973 FORWARD LENGTH=148;AT4G34050.1 | Symbols:CCoAOMT1 | caffeoyl coenzyme A O-meth 3 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 10.8 10.8 10.8 16.714 148 148;259;286 0.0030581 6.2028 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.8 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dehydrogenase 1,embryo sac development arrest 9 | D-3-phosphoglycerate dehydrogenase | Chr4:16374041-16376561 REVERSE LENGTH=603 2 15 15 14 15 14 10 9 4 1 15 14 10 9 4 1 14 13 10 9 4 1 31.3 31.3 29.5 63.324 603 603;588 0 160.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31.3 30.2 21.9 20.4 12.3 2.8 344510000 148340000 159530000 18301000 12885000 4583400 875470 29 7041800 3105100 3280000 373990 242400 40266 30189 24952000 24793000 5529100 4996400 2243700 338690 12 13 4 3 0 0 32 ALDAGIVAQAALDVFTK;ALDAGIVAQAALDVFTKEPPAK;FASSLSESGEVK;GGVIDEDALVR;GIIEPISDVYVNLVNADFTAK;ILNDETFAK;ISLCDALIVR;ITYASAR;KQAIMAIGVDDIPSK;LAVQLVAGGSGVK;NVAQADASVK;SPLPSAISVAFPSR;TLAVLGFGK;VIAHDPYAPADR;VLLDGSPESPLETITVQLSNVESK 505 136;137;635;814;835;1134;1190;1211;1296;1361;1804;2072;2198;2436;2487 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 142;143;667;851;874;1188;1246;1267;1356;1423;1900;2181;2312;2567;2619 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name available | phosphotransferases/inositol or phosphatidylinositol kinase | Chr4:17059996-17077628 REVERSE LENGTH=3804;AT4G36080.3 | Symbols:no symbol available | no full name available | phosphotra 3 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.5 430 3804 3804;3809;3834 0.0015674 6.418 By MS/MS By MS/MS 0.5 0.5 0 0 0 0 378250000 195300000 182950000 0 0 0 0 221 1007300 541980 465350 0 0 0 0 114150000 100420000 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 LNQAITGQISPEAIGDLR 511 1515 True 1581 8263;8264;8265;8266 6129;6130;6131 6131 -1;-1;-1 AT4G36195.2;AT4G36190.1;AT4G36195.3;AT4G36195.1 AT4G36195.2;AT4G36190.1;AT4G36195.3;AT4G36195.1 1;1;1;1 1;1;1;1 1;1;1;1 AT4G36195.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Serine carboxypeptidase S28 family protein | Chr4:17127202-17129787 FORWARD LENGTH=477;AT4G36190.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Serine carboxypeptidase S28 4 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 2.5 2.5 2.5 53.711 477 477;482;488;488 0.0015361 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.5 17.5 10.6 7.8 2.8 7 59257000 26456000 26788000 2970800 1750200 577780 714090 16 3273300 1431500 1466100 185670 109390 36111 44630 10342000 9724200 1946700 1973300 640700 634860 4 5 1 0 0 0 10 DNSGVLSPFSFTR;FVIDVANTLKPNPNL;IPDNLPLDAAAPLLCAGITVYSPMK;LGADAFLVSR 521 412;733;1159;1411 True;True;True;True 429;769;1215;1473 2110;2111;2112;2113;4247;4248;4249;4250;4251;6514;6515;7775;7776;7777;7778;7779 1640;3213;3214;4886;4887;4888;4889;5773;5774;5775 1640;3214;4887;5773 -1 AT4G38970.1;AT4G38970.2 AT4G38970.1;AT4G38970.2 15;12 15;12 8;7 AT4G38970.1 | Symbols:AtFBA2,FBA2 | fructose-bisphosphate aldolase 2 | fructose-bisphosphate aldolase 2 | Chr4:18163714-18165659 REVERSE LENGTH=398;AT4G38970.2 | Symbols:AtFBA2,FBA2 | fructose-bisphosphate aldolase 2 | fructose-bisphosphate aldolase 2 | 2 15 15 8 15 14 11 11 10 10 15 14 11 11 10 10 8 8 6 6 5 5 53.5 53.5 35.4 42.987 398 398;381 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 53.5 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Symbols:RBGA6,CCR1,ATGRP8,GR-RBP8,GRP8 | cold, circadian rhythm, and RNA binding 1,glycine-rich RNA-binding protein 8,GLYCINE-RICH PROTEIN 8,RNA-binding glycine-rich protein A6 | cold%2C circadian rhythm%2C and RNA binding 1 | Chr4:18274166 4 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 13 13 13 10.23 92 92;105;126;169 0 6.9686 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13 13 13 13 0 0 21527000 9141300 8971800 1695500 1718300 0 0 7 3075300 1305900 1281700 242220 245460 0 0 9141300 8269900 2715800 3064900 0 0 1 1 1 0 0 0 3 TFSQFGDVIDSK 523 2160 True 2274 11742;11743;11744;11745 8743;8744;8745 8744 -1;-1;-1;-1 AT4G39330.2;AT4G39330.1 AT4G39330.2;AT4G39330.1 1;1 1;1 1;1 AT4G39330.2 | Symbols:ATCAD9,CAD9 | cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 | cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 | Chr4:18291268-18292740 FORWARD LENGTH=311;AT4G39330.1 | Symbols:ATCAD9,CAD9 | cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 | cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 | 2 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 7.1 7.1 7.1 33.253 311 311;360 0 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-1;-1 AT4G39980.1 AT4G39980.1 2 2 2 AT4G39980.1 | Symbols:AtDAHP1,DHS1,DAHP1 | 3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE-7-PHOSPHATE 1,3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase 1 | 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase 1 | Chr4:18539654-18541832 FORWARD LENGTH=525 1 2 2 2 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 0 0 4.8 4.8 4.8 57.978 525 525 0 12.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.8 4.8 2.9 2.9 0 0 5297600 2311000 2174900 398200 413550 0 0 30 176590 77032 72497 13273 13785 0 0 1399300 1240900 637380 737170 0 0 1 2 0 0 0 0 3 AFDSILAEVR;TIEAFPPIVFAGEAR 526 66;2180 True;True 70;2294 315;316;11853;11854;11855;11856 186;8845;8846 186;8845 -1 AT5G01530.1 AT5G01530.1 5 3 3 AT5G01530.1 | Symbols:LHCB4.1 | light harvesting complex photosystem II | light harvesting complex photosystem II | Chr5:209084-210243 FORWARD LENGTH=290 1 5 3 3 4 4 5 5 4 4 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 2 2 23.4 11.4 11.4 31.139 290 290 0 40.664 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.8 14.8 23.4 23.4 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Chr5:228149-229594 REVERSE LENGTH=255 1 4 4 4 3 3 2 3 2 2 3 3 2 3 2 2 3 3 2 3 2 2 16.1 16.1 16.1 28.178 255 255 0 28.924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.8 9.8 12.2 15.7 12.5 12.5 31077000 4796100 6599800 741860 871780 9986500 8080700 11 351040 142750 176420 67442 31870 642440 364440 4177400 5132000 846300 883530 6803900 6025000 1 3 0 0 1 3 8 ADLAIPITSHASLAR;ISDYITQLR;KADLAIPITSHASLAR;LHPIVSPISEFEHAEK 528 33;1183;1248;1436 True;True;True;True 34;1239;1307;1498 139;140;141;142;6625;6626;6627;6906;6907;6908;6909;7889;7890;7891;7892;7893;7894 87;88;4959;5116;5117;5859;5860;5861;5862 87;4959;5117;5862 -1 AT5G02450.1;AT3G53740.1;AT3G53740.4;AT3G53740.3;AT3G53740.2 AT5G02450.1;AT3G53740.1;AT3G53740.4;AT3G53740.3;AT3G53740.2 2;1;1;1;1 2;1;1;1;1 2;1;1;1;1 AT5G02450.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L36e family protein | Chr5:533501-534394 FORWARD LENGTH=108;AT3G53740.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein L36e family protein 5 2 2 2 2 2 2 2 0 0 2 2 2 2 0 0 2 2 2 2 0 0 19.4 19.4 19.4 12.189 108 108;103;112;112;112 0 13.725 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.4 19.4 19.4 19.4 0 0 13333000 5233100 5301800 1533800 1264700 0 0 4 3333400 1308300 1325400 383450 316180 0 0 3092600 2881100 1443500 1279400 0 0 3 2 0 0 0 0 5 EVAGQAPYEK;VATGLFVGLNK 529 595;2340 True;True 626;2465 3385;3386;3387;3388;12650;12651;12652;12653 2622;2623;2624;9415;9416 2624;9415 -1;-1;-1;-1;-1 AT5G02500.1;AT5G02500.2 AT5G02500.1;AT5G02500.2 16;14 4;4 2;2 AT5G02500.1 | Symbols:AtHsp70-1,HSP70-1,HSC70-1,HSC70,AT-HSC70-1 | ARABIDOPSIS THALIANA HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN 70-1,heat shock cognate protein 70-1,HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN 70,HEAT SHOCK PROTEIN 70-1 | heat shock cognate protein 70-1 | Chr5:554055- 2 16 4 2 16 15 16 15 14 12 4 4 4 4 4 3 2 2 2 2 2 1 31.6 10.3 6.1 71.357 651 651;521 0 293.87 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31.6 30.6 31.6 31.3 30.3 26.1 81042000 21310000 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| Symbols:GSTL3 | Glutathione transferase L3 | Glutathione S-transferase family protein | Chr5:632877-634858 FORWARD LENGTH=235 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.3 12.3 12.3 27.09 235 235 0 6.9892 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.3 12.3 12.3 12.3 12.3 12.3 5988000 1097700 1650000 662850 475550 1055000 1046800 17 352230 64568 97062 38991 27974 62062 61577 1097700 1521000 1061700 848250 1710100 1987500 0 1 0 0 0 0 1 APSFIFVEDRPAPLDATSDPPSLFDGTTR 531 200 True 210 930;931;932;933;934;935 582 582 -1 AT5G02870.2;AT5G02870.1 AT5G02870.2;AT5G02870.1 4;4 4;4 2;2 AT5G02870.2 | Symbols:RPL4 | ribosomal large subunit 4 | Ribosomal protein L4/L1 family | Chr5:657830-659526 FORWARD LENGTH=406;AT5G02870.1 | Symbols:RPL4 | ribosomal large subunit 4 | Ribosomal protein L4/L1 family | Chr5:657830-659526 FORWARD LENGTH= 2 4 4 2 4 4 2 2 1 0 4 4 2 2 1 0 2 2 1 1 1 0 12.3 12.3 4.7 44.592 406 406;407 0 32.874 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.3 12.3 8.6 6.4 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19;19;4 AT5G04140.1 | Symbols:GLUS,FD-GOGAT,GLS1,GLU1 | FERREDOXIN-DEPENDENT GLUTAMATE SYNTHASE 1,glutamate synthase 1,FERREDOXIN-DEPENDENT GLUTAMATE SYNTHASE | glutamate synthase 1 | Chr5:1130031-1138186 FORWARD LENGTH=1622;AT5G04140.2 | Symbols:GLUS,FD-GOGAT, 3 19 19 19 14 14 9 10 11 8 14 14 9 10 11 8 14 14 9 10 11 8 19.3 19.3 19.3 176.75 1622 1622;1648;1629 0 138.49 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14 12.1 9.5 9.5 11.7 9.6 148390000 34256000 40331000 11199000 8503200 30015000 24082000 82 1001700 351350 451050 54549 51208 77919 15667 12406000 11014000 5055000 5024300 8128600 10389000 12 8 3 0 4 7 34 ETMPNIQQVFVK;FAQVTNPAIDPLR;FCTGGMSLGAISR;FGVTPTFLVNADQLEIK;GNADIIQISGHDGGTGASPISSIK;IGFVPEEATIVGNTCLYGATGGQIFAR;IPTVTIEQAQK;ISGLTFDELAR;LVAEAGIGTVASGVAK;RLENFGFIQFR;SETAYAVYQQHLSNRPVNVLR;SSTVMENEEILR;TPEEALMILVPEAYK;TQHLDLSYLLSSVGTPSLSSTEIR;TSDNFVYVASEVGVVPVDEAK;VEPAVAIVQR;VTAPAGELQLK;WKPLTDVVDGYSPTLPHLK;YLPLFWQLVPPSEEDTPEASAAYVR 534 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TUDOR-SN protein 1,Arabidopsis thaliana TUDOR-SN protein 1 | TUDOR-SN protein 1 | Chr5:2320021-2324892 REVERSE LENGTH=1007;AT5G07350.1 | Symbols:Tudor1,TSN1,AtTudor1 | TUDOR-SN protein 1,Arabidopsis thaliana 3 4 4 4 4 3 1 1 0 0 4 3 1 1 0 0 4 3 1 1 0 0 4.9 4.9 4.9 110.05 1007 1007;991;985 0 24.193 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.9 3.9 1.1 1.1 0 0 10737000 5487600 4668200 307510 273760 0 0 55 195220 99775 84876 5591.1 4977.4 0 0 2131500 1895400 405800 402310 0 0 3 2 0 0 0 0 5 IASIQNQLASLSIK;TNVATVLLEAGLAK;VPGAAEASIR;VVVTEVLGGGR 537 1025;2237;2527;2645 True;True;True;True 1074;2354;2661;2781 5882;5883;12156;12157;13578;14135;14136;14137;14138 4430;9080;10135;10501;10502 4430;9080;10135;10502 -1;-1;-1 AT5G07440.3;AT5G07440.2;AT5G07440.1 AT5G07440.3;AT5G07440.2;AT5G07440.1 2;2;2 2;2;2 2;2;2 AT5G07440.3 | Symbols:GDH2 | glutamate dehydrogenase 2 | glutamate dehydrogenase 2 | Chr5:2356153-2357546 FORWARD LENGTH=309;AT5G07440.2 | Symbols:GDH2 | glutamate dehydrogenase 2 | glutamate 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| no full name available | ATP synthase alpha/beta family pro 3 18 17 17 17 14 15 12 13 7 16 13 14 11 12 6 16 13 14 11 12 6 47.1 45.1 45.1 59.712 556 556;556;559 0 264.86 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 47.1 39.9 42.8 32.6 37.1 21.8 253600000 46749000 55772000 25892000 22709000 50373000 52102000 30 3798700 1108700 1319800 492250 160030 510790 207080 11675000 14690000 8831300 8429600 13669000 33381000 13 13 8 6 15 18 73 DAEGQDVLLFIDNIFR;DAPALVDLATGQEILATGIK;ENINSFQGLLDGK;FTQANSEVSALLGR;GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSR;IGLFGGAGVGK;IMNVLGEPIDER;IPSAVGYQPTLASDLGALQER;KGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSR;KVLNTGAPITVPVGR;LVLEVSHHLGQNVVR;QISELGIYPAVDPLDSTSR;TEHYLPIHR;TIAMDGTEGLVR;TVLIMELINNVAK;VCQVIGAIVDVR;VGLTGLTVAEYFR;VVDLLAPYQR 543 329;345;572;726;927;1078;1146;1165;1275;1303;1615;1848;2152;2177;2293;2354;2422;2610 True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 343;360;602;762;971;1130;1201;1202;1221;1335;1363;1683;1946;2264;2291;2415;2416;2479;2553;2746 1474;1475;1476;1477;1478;1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;3209;3210;3211;3212;4217;4218;4219;4220;4221;5230;6148;6149;6150;6151;6152;6153;6463;6464;6465;6466;6467;6468;6535;6536;6537;6538;6539;7088;7089;7090;7091;7092;7093;7094;7254;7255;7256;7257;8745;8746;8747;8748;8749;8750;8751;8752;8753;8754;8755;8756;8757;8758;8759;8760;8761;8762;8763;10100;10101;11652;11653;11654;11655;11656;11657;11658;11836;12435;12436;12437;12438;12439;12440;12441;12442;12843;12844;12845;12846;12847;13134;13135;13136;13137;13138;13139;13996;13997;13998;13999;14000 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AKDELAGSIQK;ANTFVAEVLGLDPR;EVDVPVVGGHAGVTILPLLSQVKPPSSFTPQEIEYLTNR;LLGVTTLDVAR;QLEDALTGMDLVIIPAGIPR;TGAEEVYQLGPLNEYER;VAILGAAGGIGQSLSLLMK 545 129;186;600;1484;1855;2162;2326 True;True;True;True;True;True;True 135;195;631;1547;1953;1954;2276;2450 610;611;865;866;867;868;869;870;3404;3405;3406;3407;8099;8100;8101;8102;10160;10161;10162;10163;10164;10165;10166;10167;10168;10169;10170;11749;12567;12568;12569;12570 365;537;538;539;2643;2644;6015;6016;6017;7571;7572;7573;7574;7575;7576;7577;8749;9336;9337;9338 365;537;2644;6015;7573;8749;9338 95 90 -1;-1;-1;-1;-1 AT5G09810.1;AT5G59370.2;AT5G59370.1;AT3G46520.2;AT3G46520.1;AT3G12110.1;AT3G53750.2;AT3G53750.1;AT2G37620.4;AT2G37620.3;AT2G37620.2;AT2G37620.1;AT2G42170.4;AT2G42170.2;AT2G42170.3;AT2G42170.1 AT5G09810.1;AT5G59370.2;AT5G59370.1;AT3G46520.2;AT3G46520.1;AT3G12110.1;AT3G53750.2;AT3G53750.1;AT2G37620.4;AT2G37620.3;AT2G37620.2;AT2G37620.1 8;5;5;5;5;5;4;4;4;4;4;4;1;1;1;1 8;5;5;5;5;5;4;4;4;4;4;4;1;1;1;1 4;2;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 AT5G09810.1 | Symbols:AtACT7,ACT7 | actin 7 | actin 7 | Chr5:3052809-3054220 FORWARD LENGTH=377;AT5G59370.2 | Symbols:ACT4 | actin 4 | actin 4 | Chr5:23950109-23951586 FORWARD LENGTH=377;AT5G59370.1 | Symbols:ACT4 | actin 4 | actin 4 | Chr5:23950109- 16 8 8 4 7 7 5 5 6 6 7 7 5 5 6 6 4 4 2 2 2 2 35.3 35.3 17.5 41.735 377 377;377;377;377;377;377;377;377;377;377;377;377;319;319;329;329 0 140.42 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.3 27.3 18.8 18.8 26.8 26.8 169590000 53908000 55312000 20294000 18458000 11351000 10269000 21 5863100 1941000 1957500 722280 685940 336270 220200 14706000 13697000 9308800 9928200 3967800 4423800 5 8 3 2 0 1 19 AGFAGDDAPR;AVFPSIVGRPR;DLYGNIVLSGGSTMFPGIADR;EITALAPSSMK;LAYVALDYEQELETAK;NYELPDGQVITIGAER;TTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILR;VAPEEHPVLLTEAPLNPK 546 79;287;405;530;1365;1826;2270;2334 True;True;True;True;True;True;True;True 84;299;422;556;557;1427;1924;2390;2459 380;381;382;383;384;385;1296;1297;1850;1851;2865;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875;7573;7574;7575;7576;7577;7578;9961;9962;9963;9964;9965;9966;12343;12344;12623;12624;12625;12626;12627;12628 222;223;224;225;802;803;1230;2225;2226;2227;2228;5634;7401;7402;7403;7404;9193;9398;9399;9400;9401;9402;9403;9404;9405 224;803;1230;2228;5634;7404;9193;9401 19 327 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT5G10360.1;AT5G10360.2;AT4G31700.2;AT4G31700.1 AT5G10360.1;AT5G10360.2 3;2;1;1 3;2;1;1 3;2;1;1 AT5G10360.1 | Symbols:RPS6B,EMB3010 | Ribosomal protein small subunit 6b,embryo defective 3010 | Ribosomal protein S6e | Chr5:3258734-3260142 REVERSE LENGTH=249;AT5G10360.2 | Symbols:RPS6B,EMB3010 | Ribosomal protein small subunit 6b,embryo defective 30 4 3 3 3 3 3 3 3 2 1 3 3 3 3 2 1 3 3 3 3 2 1 18.9 18.9 18.9 28.162 249 249;197;188;250 0 34.571 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.9 18.9 18.9 18.9 12.9 6.8 32776000 12810000 11390000 3246400 3525700 1385600 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protein S4 | Chr5:4935124-4936334 REVERSE LENGTH=198;AT5G15200.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Ribosomal protein S4 | Chr5:4935602-4936334 REVERSE 3 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 11.6 11.6 11.6 23.036 198 198;156;197 0 12.025 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 11.6 11.6 11.6 11.6 7.1 7.1 21555000 5999100 5137600 1067500 2860400 3886600 2604000 11 1272600 502420 410470 97044 153770 128630 77359 1078600 1162100 3151000 2822600 7485500 6050400 0 0 1 0 3 1 5 HIDFALTSPFGGGR;IFEGEALLR 559 989;1056 True;True 1036;1107 5620;5621;5622;5623;5624;5625;5626;5627;6026;6027;6028;6029 4206;4207;4208;4209;4528;4529 4209;4528 -1;-1;-1 AT5G15250.2;AT5G15250.1 AT5G15250.2;AT5G15250.1 1;1 1;1 1;1 AT5G15250.2 | Symbols:FTSH6,ATFTSH6 | FTSH protease 6 | FTSH protease 6 | Chr5:4951071-4952777 REVERSE LENGTH=514;AT5G15250.1 | Symbols:FTSH6,ATFTSH6 | FTSH protease 6 | FTSH protease 6 | Chr5:4950411-4952777 REVERSE LENGTH=688 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 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protein (COR6.6) / cold-regulated protein (COR6.6) | Chr5:5211966-5212441 FORWARD LENGTH=66 1 3 3 3 3 3 1 2 0 0 3 3 1 2 0 0 3 3 1 2 0 0 60.6 60.6 60.6 6.5512 66 66 0 47.56 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 60.6 60.6 22.7 43.9 0 0 47859000 21954000 23805000 552110 1548600 0 0 4 11965000 5488400 5951200 138030 387150 0 0 8314500 8563300 839130 1376300 0 0 2 3 0 1 0 0 6 DAAAAAGASAQQAGK;NAFQAGQAAGK;SISDAAVGGVNFVK 562 325;1699;2000 True;True;True 339;1787;2108 1449;1450;1451;1452;9189;9190;10872;10873;10874 894;6786;6787;8054;8055;8056 894;6787;8054 -1 AT5G16050.2;AT5G16050.1 AT5G16050.2;AT5G16050.1 4;4 2;2 2;2 AT5G16050.2 | Symbols:GRF5,GF14 UPSILON | general regulatory factor 5 | general regulatory factor 5 | Chr5:5244008-5245402 REVERSE LENGTH=268;AT5G16050.1 | Symbols:GRF5,GF14 UPSILON | general regulatory factor 5 | general regulatory factor 5 | Chr5:524 2 4 2 2 4 3 2 3 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 19.4 13.1 13.1 30.182 268 268;268 0 69.329 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.4 16.8 11.2 15.7 16.8 13.1 32140000 3351000 3507200 6388700 4621000 7781700 6489900 17 216400 79704 98348 375810 12759 15824 9760.3 5029700 4818500 12672000 6634600 9005600 7800500 1 2 2 1 1 0 7 DSTLIMQLLR;ICDGILNLLEAHLIPAASLAESK;LAEQAER;TVETEELTVEER 563 430;1030;1327;2286 False;True;False;True 448;1079;1387;2407 2202;2203;2204;5904;5905;5906;5907;5908;5909;7363;7364;7365;12400;12401;12402;12403;12404 1704;4447;4448;4449;4450;4451;5456;9229;9230 1704;4449;5456;9229 -1;-1 AT5G16710.1 AT5G16710.1 2 2 2 AT5G16710.1 | Symbols:DHAR3 | dehydroascorbate reductase 1 | dehydroascorbate reductase 1 | Chr5:5483312-5484926 FORWARD LENGTH=258 1 2 2 2 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 8.9 8.9 8.9 28.514 258 258 0 21.535 By MS/MS By MS/MS 8.9 4.7 0 0 0 0 3660000 2159900 1500200 0 0 0 0 18 203340 119990 83344 0 0 0 0 2159900 1382800 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 3 ISAADLSLAPK;NWSVPDSLPFVK 564 1181;1823 True;True 1237;1921 6621;9953;9954 4956;7394;7395 4956;7395 -1 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COBALAMIN-INDEPENDENT METHIONINE SYNTHASE,methionine synthesis 1 | Cobalamin-independent synthase family protein | Chr5:5935771-5939195 FORWARD LENGTH=765;AT5G17920.1 | Symbols:ATCIMS,ATMETS,ATMS1 | COBALAMIN- 4 23 23 9 19 19 16 16 12 11 19 19 16 16 12 11 8 8 8 8 5 6 37.8 37.8 18.2 84.356 765 765;765;812;812 0 302.2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 32.4 32 27.3 26.8 22.1 21.4 394970000 145890000 149650000 27845000 22141000 32933000 16514000 38 6373400 2652900 2447100 436360 328940 317950 190160 17793000 17312000 6843300 6496000 7560400 6128000 19 11 5 8 3 5 51 AAGATWIQLDEPVLVMDLEGQK;ALAGQKDEALFSANAAALASR;ALGVDTVPVLVGPVSYLLLSK;ASHIVGYPR;DEALFSANAAALASR;FALESFWDGK;FIPSNTFAHYDQVLDTTAMLGAVPPR;GGIGVIQIDEAALR;GMLTGPVTILNWSFVR;GNASVPAMEMTK;GVTAFGFDLVR;IPSSEEIADR;KLNLPILPTTTIGSFPQTVELR;KYTEVKPALK;LNLPILPTTTIGSFPQTVELR;LNLPILPTTTIGSFPQTVELRR;MLAVLEQNILWVNPDCGLK;SFELLSLLPK;VVDLQEELDIDVLVHGEPER;VVEVNALAK;YGAGIGPGVYDIHSPR;YLFAGVVDGR;YTEVKPALK 568 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.3 27.3 11.9 6.2 12.7 8.7 38962000 17201000 15584000 1954200 921170 2178900 1122100 26 1223300 598390 461410 48939 35429 65596 13526 4024200 4268500 1593700 1052200 1478300 1174300 5 6 0 1 0 0 12 AADNIAANLYAVK;GFVLGNDGVLLR;GTGITEEFEEVPVQSR;SAEMVTDEGAIYVTSNR;SEEEAWAAGGSGILLR;SIPSAEEEDFNYR;VFLPIDPGVVLLDIAFVPDEPSR 579 2;788;934;1899;1930;1996;2402 True;True;True;True;True;True;True 2;824;978;1999;2036;2104;2532 11;12;13;14;4518;4519;4520;4521;4522;4523;5265;5266;10409;10410;10578;10579;10580;10863;10864;13050;13051;13052;13053;13054 9;3389;3390;3909;7739;7740;7853;7854;8044;8045;8046;9773;9774 9;3389;3909;7740;7853;8045;9774 -1;-1 AT5G23540.2;AT5G23540.1 AT5G23540.2;AT5G23540.1 1;1 1;1 1;1 AT5G23540.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mov34/MPN/PAD-1 family protein | Chr5:7938109-7939339 FORWARD LENGTH=259;AT5G23540.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Mov34/MPN/PAD-1 family protein | Chr5:793 2 1 1 1 1 1 1 1 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.8 21.9 16.4 21.9 29.4 21.9 172980000 15026000 19233000 14856000 17792000 68349000 37723000 24 3130300 599770 543890 270460 216560 1000900 498710 11942000 8366800 11517000 10444000 41229000 22290000 2 2 1 4 17 3 29 DYADLCFELFGDR;GFIFGVASSAYQVEGGR;GIYYVMDYFK;GLNVWDSFTHR;GYALGTDAPGR;IDYLCSHLCFLSK;LFNSGNFEK;LPEFSETEAALVK;TTYGDPLIYVTENGFSTPGDEDFEK;WFLPFDHSQESK 584 455;779;852;874;967;1044;1400;1525;2280;2658 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 478;815;892;915;1013;1095;1462;1591;2401;2796 2450;4466;4467;4468;4469;4470;4471;4862;4958;4959;4960;5402;5403;5404;5405;5977;5978;5979;5980;5981;5982;7719;7720;7721;7722;7723;7724;8295;8296;8297;8298;8299;8300;12379;12380;12381;12382;14203;14204;14205;14206;14207;14208;14209;14210;14211;14212;14213;14214 1929;3356;3357;3628;3699;3993;3994;3995;3996;3997;4500;4501;5729;5730;5731;5732;6151;6152;6153;6154;9218;10555;10556;10557;10558;10559;10560;10561;10562;10563;10564;10565;10566;10567;10568 1929;3356;3628;3699;3996;4501;5731;6152;9218;10559 -1;-1 AT5G26830.1 AT5G26830.1 1 1 1 AT5G26830.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | Threonyl-tRNA synthetase | Chr5:9437351-9441568 FORWARD LENGTH=709 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 2 2 80.935 709 709 0.0058651 6.0938 By MS/MS By MS/MS 2 2 0 0 0 0 2162900 1056700 1106100 0 0 0 0 41 52753 25774 26979 0 0 0 0 1056700 1019600 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 LFEQIQANQLENLK 585 1395 True 1457 7704;7705 5718;5719 5718 -1 AT5G27540.2;AT5G27540.1 AT5G27540.2;AT5G27540.1 1;1 1;1 1;1 AT5G27540.2 | Symbols:MIRO1,emb2473 | MIRO-related GTP-ase 1,embryo defective 2473 | MIRO-related GTP-ase 1 | Chr5:9722816-9727112 FORWARD LENGTH=648;AT5G27540.1 | Symbols:MIRO1,emb2473 | MIRO-related GTP-ase 1,embryo defective 2473 | MIRO-related GTP-a 2 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 3.7 3.7 3.7 72.322 648 648;648 0 10.308 By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 3.7 3.7 4457500 0 0 0 0 2583600 1873900 38 117300 0 0 0 0 67990 49313 0 0 0 0 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AT5G35170.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | adenylate kinase family protein | Chr5:13419278-13423381 FORWARD LENGTH=580;AT5G35170.1 | Symbols:no symbol available | no full name available | adenylate kinase family protein | Chr5 2 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 3.6 3.6 3.6 64.913 580 580;588 0 29.6 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.6 3.6 0 3.6 0 3.6 3540800 645720 529140 0 589030 0 1776900 33 107300 19567 16034 0 17849 0 53845 645720 487740 0 1050700 0 3373700 0 0 0 0 0 1 1 IGTLMELVQALALSFADDGKR 590 1085 True 1137 6181;6182;6183;6184 4652 4652 101 364 -1;-1 AT5G35630.3;AT5G35630.2;AT5G35630.1 AT5G35630.3;AT5G35630.2;AT5G35630.1 9;9;9 9;9;9 9;9;9 AT5G35630.3 | Symbols:GLN2,GS2,ATGSL1 | GLUTAMINE SYNTHETASE 2,glutamine synthetase 2,GLUTAMINE SYNTHETASE LIKE 1 | glutamine synthetase 2 | Chr5:13831220-13833239 FORWARD LENGTH=430;AT5G35630.2 | Symbols:GLN2,GS2,ATGSL1 | GLUTAMINE SYNTHETASE 2,glutami 3 9 9 9 9 9 8 8 6 5 9 9 8 8 6 5 9 9 8 8 6 5 38.8 38.8 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350;351;3488;3489;4050;4051;4668;8847;8848;8849;8850;8851;8852;8853;8854;8855;8856;8857;8858;9739;9740;9741;9742;9743;9744;9745;10281;10282;10283;10284;10285;10626;10627;10628;10631 351;3489;4050;4668;8850;9740;10282;10626;10631 -1;-1;-1 AT5G37600.1;AT5G16570.2;AT5G16570.1 AT5G37600.1;AT5G16570.2;AT5G16570.1 3;2;2 2;1;1 2;1;1 AT5G37600.1 | Symbols:ATGSR1,ATGLN1;1,GLN1;1,GSR 1 | ARABIDOPSIS THALIANA GLUTAMINE SYNTHASE CLONE R1,ARABIDOPSIS GLUTAMINE SYNTHASE 1;1,GLUTAMINE SYNTHASE 1;1,glutamine synthase clone R1 | hypothetical protein | Chr5:14933574-14935656 REVERSE LENGTH=356 3 3 2 2 2 3 1 1 1 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 0 15.2 8.7 8.7 39.115 356 356;249;356 0 23.246 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.4 15.2 3.9 3.9 3.9 0 13086000 2912800 7516600 889300 1330300 436850 0 14 934700 208050 536900 63521 95018 31204 0 2966000 3427300 1450400 2416200 721040 0 1 2 0 1 0 0 4 GNNILVMCDAYTPAGEPIPTNKR;SLVSDLINLNLSDSTDK;TLPGPVTDPSQLPK 592 897;2056;2216 False;True;True 940;2164;2331 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2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133;2134;2135;2136;2137;2138;2139;2140;2141;2142;2143;2144;2145;2146;2147;2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;2159;2645;2646;2647;2648;2649;2696;2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2809;2810;2811;2812;2813;2814;2815;2816;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;5175;5176;5177;5178;5179;5180;5181;5182;5183;5184;5185;5186;5187;5188;5189;5190;5191;5192;5193;5194;5195;5196;5197;5198;5199;5200;5201;5202;5203;5204;5205;5206;5282;6158;6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170;6171;6172;6173;6174;6175;6176;7653;7654;7655;7656;7657;10569;10570;10571;10572;10573;10574;10575;10576;10577;10578;10579;10580;10581;10582;10583;10584;10585;10586;10587;10588;10589;10590;10591;10592;10593;10594;10595;10596;10597;10598;10599;10600;10601;10602;10603;10604;10605;10606;10607;10608;10609;10610;10611;10612;10613;10614;10615;10616;10617;10618;10619;10620 2129;2648;2697;2812;4674;5193;5282;6163;7656;10609 -1;-1;-1;-1 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2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133;2134;2135;2136;2137;2138;2139;2140;2141;2142;2143;2144;2145;2146;2147;2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;2159;2645;2646;2647;2648;2649;2696;2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2826;2827;2828;2829;2830;2831;2832;2833;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;5227;5228;5229;5230;5231;5232;5233;5234;6158;6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170;6171;6172;6173;6174;6175;6176;10569;10570;10571;10572;10573;10574;10575;10576;10577;10578;10579;10580;10581;10582;10583;10584;10585;10586;10587;10588;10589;10590;10591;10592;10593;10594;10595;10596;10597;10598;10599;10600;10601;10602;10603;10604;10605;10606;10607;10608;10609;10610;10611;10612;10613;10614;10615;10616;10617;10618;10619;10620 2129;2648;2697;2830;4674;5231;6163;10609 -1;-1 AT5G38480.3;AT5G38480.2;AT5G38480.1 AT5G38480.3;AT5G38480.2;AT5G38480.1 5;5;5 3;3;3 3;3;3 AT5G38480.3 | Symbols:GRF3,RCI1 | general regulatory factor 3 | general regulatory factor 3 | Chr5:15410277-15411285 FORWARD LENGTH=254;AT5G38480.2 | Symbols:GRF3,RCI1 | general regulatory factor 3 | general regulatory factor 3 | Chr5:15410277-15411285 3 5 3 3 5 4 3 4 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 2 3 2 3 27.2 20.5 20.5 28.491 254 254;254;255 0 22.082 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.2 24.4 16.5 23.2 17.7 20.5 30945000 6770500 9527200 2940600 3842600 4807300 3057300 15 519930 204020 200480 34266 44999 20196 15964 4722800 6592200 3880400 4707400 4107400 1932500 3 3 0 1 1 1 9 DSTLIMQLLR;ICDGILNVLEAHLIPSASPAESK;LAEQAER;SASDIATAELAPTHPIR;TVDVEELSVEER 595 430;1031;1327;1910;2283 False;True;False;True;True 448;1080;1387;2012;2404 2202;2203;2204;5910;5911;5912;5913;5914;5915;7363;7364;7365;10469;10470;10471;10472;12390;12391;12392;12393;12394;12395 1704;4452;4453;4454;5456;7777;7778;9222;9223;9224;9225 1704;4453;5456;7777;9223 -1;-1;-1 AT5G39050.1 AT5G39050.1 2 2 2 AT5G39050.1 | Symbols:PMAT1 | phenolic glucoside malonyltransferase 1 | HXXXD-type acyl-transferase 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DAGVIAGLNVAR;FEELNNDLFR;IINEPTAAAIAYGLDK;IINEPTAAAIAYGLDKK;ITITNEK;ITPSWVGFTDSER;LGSVIGIDLGTTYSCVGVYK;LKEVEAVCNPIITAVYQR;LSQEEIDR;NALETYVYNMK;NQAAVNPER;SQIDEIVLVGGSTR;VEIESLFDGVDLSEPLTR;VFSPEEISAMILTK 600 336;651;1101;1102;1200;1208;1428;1467;1568;1702;1781;2078;2379;2408 True;True;False;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 350;683;1153;1154;1256;1264;1490;1529;1634;1791;1876;2187;2506;2538 1508;1509;1510;1511;1512;3626;3627;3628;6243;6244;6245;6246;6247;6248;6249;6250;6251;6252;6253;6254;6255;6256;6689;6690;6691;6692;6693;6694;6717;6718;6719;6720;6721;7853;7854;7855;8004;8005;8524;8525;8526;8527;8528;8529;9209;9210;9211;9212;9718;9719;9720;11279;11280;12947;12948;12949;13075;13076;13077;13078 953;954;955;2783;2784;4692;4693;4694;4695;4696;4697;4698;4699;4700;4701;4702;4703;4704;4705;4706;4707;5006;5019;5020;5820;5946;6346;6347;6793;6794;7220;8394;8395;8396;9698;9699;9791;9792;9793 953;2784;4694;4705;5006;5020;5820;5946;6347;6793;7220;8394;9698;9791 -1;-1;-1;-1 AT5G42270.1;AT1G50250.1 AT5G42270.1;AT1G50250.1 6;5 6;5 6;5 AT5G42270.1 | Symbols:FTSH5,VAR1 | VARIEGATED 1 | FtsH extracellular protease family | Chr5:16902659-16905102 FORWARD LENGTH=704;AT1G50250.1 | Symbols:FTSH1 | FTSH protease 1 | FTSH protease 1 | Chr1:18614398-18616930 REVERSE LENGTH=716 2 6 6 6 3 4 1 1 3 3 3 4 1 1 3 3 3 4 1 1 3 3 13.9 13.9 13.9 75.231 704 704;716 0 42.761 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.4 8.4 1.6 1.6 7.1 7.1 28859000 4493500 5232700 1079700 1323000 8046100 8683600 29 611430 154950 180440 37230 45620 118140 75059 2516300 2574100 1576400 2151100 6221600 5772300 3 4 0 0 3 2 12 APCIVFIDEIDAVGR;FQEVPETGVTFGDVAGADQAK;GCLLVGPPGTGK;GQAGGLTFFAPSEER;LELQEVVDFLK;LVAYHEAGHALVGALMPEYDPVAK 601 190;710;760;915;1384;1606 True;True;True;True;True;True 200;746;796;958;1446;1673 883;3997;4366;4367;5162;5163;5164;7655;7656;7657;7658;7659;7660;8704;8705;8706;8707 548;3044;3294;3295;3296;3828;3829;5676;5677;6476;6477;6478 548;3044;3295;3829;5677;6476 -1;-1 AT5G42650.1 AT5G42650.1 8 8 8 AT5G42650.1 | Symbols:CYP74A,AOS,DDE2 | allene oxide synthase,DELAYED DEHISCENCE 2,CYTOCHROME P450 74A | allene oxide synthase | Chr5:17097803-17099359 REVERSE LENGTH=518 1 8 8 8 7 7 4 4 5 3 7 7 4 4 5 3 7 7 4 4 5 3 23.9 23.9 23.9 58.196 518 518 0 56.309 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.5 20.5 11 11 14.1 8.3 46925000 16077000 17296000 3743400 2320800 4331800 3155100 31 1146800 374070 394400 96999 56405 123170 101780 4294300 4203500 2344900 1835100 1751600 1869000 5 5 0 0 1 0 11 ADEFVPER;ADFGGSSDGTAFNFLAR;AGEMLYGYQPLATR;DLVIESHDAAFK;IFPEFQATYSELFDSLEK;NIPGNYGLPIVGPIK;VIEEPLIHTFSLPPALVK;VNMPPGAFIAENPQVVALLDGK 602 27;29;78;402;1063;1736;2442;2514 True;True;True;True;True;True;True;True 28;30;82;83;419;1114;1827;2573;2648 113;114;115;116;117;118;125;126;127;128;129;130;374;375;376;377;378;379;1841;1842;1843;6072;6073;9460;9461;13224;13225;13226;13227;13228;13535;13536 73;81;220;221;1225;4579;6982;6983;6984;9891;10115 73;81;220;1225;4579;6983;9891;10115 102 415 -1 AT5G42980.1 AT5G42980.1 5 5 5 AT5G42980.1 | Symbols:ATH3,TRX3,TRXH3,ATTRX3,ATTRXH3 | THIOREDOXIN H3,thioredoxin 3,thioredoxin H-type 3 | thioredoxin 3 | Chr5:17242772-17243718 FORWARD LENGTH=118 1 5 5 5 4 5 5 4 4 4 4 5 5 4 4 4 4 5 5 4 4 4 44.9 44.9 44.9 13.109 118 118 0 102.98 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 38.1 44.9 44.9 38.1 35.6 35.6 79490000 20553000 24584000 10056000 5314800 9559800 9422200 8 9936300 2569200 3073000 1257000 664340 1195000 1177800 16804000 14137000 4755300 5201900 4840000 4922600 1 3 1 1 3 2 11 EEIIANLEK;FIAPVFADLAK;HLDVVFFK;VDVDELNTVAEEFK;VQAMPTFIFMK 603 485;679;991;2373;2548 True;True;True;True;True 510;713;1038;2500;2682 2600;2601;2602;2603;2604;2605;3831;3832;3833;3834;3835;3836;5632;5633;5634;5635;12920;12921;12922;12923;12924;12925;13684;13685;13686;13687 2036;2931;4224;4225;4226;4227;9687;9688;9689;9690;10222;10223;10224 2036;2931;4224;9688;10224 -1 AT5G43940.1;AT5G43940.2 AT5G43940.1;AT5G43940.2 2;1 2;1 2;1 AT5G43940.1 | Symbols:ADH2,HOT5,ATGSNOR1,PAR2,GSNOR | PARAQUAT RESISTANT 2,S-NITROSOGLUTATHIONE REDUCTASE,ALCOHOL DEHYDROGENASE 2,sensitive to hot temperatures 5 | GroES-like zinc-binding dehydrogenase family protein | Chr5:17684265-17686379 FORWARD LENG 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 13.5 13.5 13.5 40.698 379 379;391 0 15.993 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.5 13.5 6.3 6.3 6.3 6.3 35278000 7657700 13012000 2495900 1255700 7884800 2971300 20 477220 84415 99283 53225 24541 154310 61446 3588100 4944100 2798200 1546800 8828200 3932100 1 3 0 1 1 2 8 AAVAYEPNKPLVIEDVQVAPPQAGEVR;VEPGSNVAIFGLGTVGLAVAEGAK 604 18;2386 True;True 19;2513 77;78;12971;12972;12973;12974;12975;12976;12977;12978;12979;12980;12981;12982 56;9721;9722;9723;9724;9725;9726;9727 56;9723 -1;-1 AT5G45390.1 AT5G45390.1 3 3 3 AT5G45390.1 | Symbols:CLPP4,NCLPP4 | NUCLEAR-ENCODED CLP PROTEASE P4,CLP protease P4 | CLP protease P4 | Chr5:18396351-18397586 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Chr5:23569155-23571116 FORWARD LENGTH=408;AT1G45000.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | AAA-type ATPase family protein | 12 2 2 2 2 2 2 2 0 0 2 2 2 2 0 0 2 2 2 2 0 0 7.6 7.6 7.6 45.751 408 408;335;361;398;399;399;403;419;419;419;423;424 0 12.868 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.6 7.6 7.6 7.6 0 0 14879000 4226000 5446200 2695500 2511100 0 0 23 646900 183740 236790 117200 109180 0 0 2727200 3371300 2922200 2914400 0 0 0 1 1 2 0 0 4 ENAPAIIFIDEVDAIATAR;GVLLYGPPGTGK 625 571;950 True;True 601;995 3205;3206;3207;3208;5332;5333;5334;5335 2500;3940;3941;3942 2500;3940 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1 AT5G58330.3;AT5G58330.2;AT5G58330.1 AT5G58330.3;AT5G58330.2;AT5G58330.1 1;1;1 1;1;1 1;1;1 AT5G58330.3 | Symbols:NADP-MDH | NADP-dependent Malate Dehydrogenase | lactate/malate dehydrogenase family protein | Chr5:23580010-23581751 REVERSE LENGTH=334;AT5G58330.2 | Symbols:NADP-MDH | NADP-dependent Malate Dehydrogenase | lactate/malate dehydrog 3 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 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(PSAN) | Chr5:25628724-25629409 REVERSE LENGTH=171;AT5G64040.2 | Symbols:PSAN | | photosystem I reaction center subunit PSI-N%2C 2 4 4 4 4 3 3 3 2 2 4 3 3 3 2 2 4 3 3 3 2 2 28.1 28.1 28.1 18.429 171 171;181 0 39.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 28.1 19.3 19.3 19.3 13.5 13.5 79964000 33429000 31063000 5289700 5688000 2562100 1931700 9 8884900 3714400 3451400 587750 632000 284680 214630 14576000 13728000 4051600 4454300 2702900 2382900 4 4 0 1 0 0 9 AFTVQFGSCK;FPENFTGCQDLAK;LATSGANFAR;VPFISEDIALECEGK 631 69;707;1354;2526 True;True;True;True 73;742;1416;2660 323;324;325;326;3980;3981;3982;3983;3984;3985;7532;7533;7534;7535;7536;7537;13577 191;192;193;3036;3037;3038;5609;5610;10134 192;3037;5609;10134 -1;-1 AT5G64140.1 AT5G64140.1 1 1 1 AT5G64140.1 | Symbols:RPS28 | ribosomal protein S28 | ribosomal protein S28 | Chr5:25667529-25667723 REVERSE LENGTH=64 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 18.8 18.8 18.8 7.3404 64 64 0.0072993 6.0885 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.8 18.8 18.8 18.8 0 0 3003800 1340800 968910 316690 377470 0 0 2 1501900 670380 484450 158350 188730 0 0 1340800 893110 507260 673300 0 0 0 1 0 0 0 0 1 EGDVLTLLESER 632 498 True 523 2654;2655;2656;2657 2059 2059 -1 AT5G66120.2 AT5G66120.2 1 1 1 AT5G66120.2 | Symbols:no symbol available | no full name available | 3-dehydroquinate synthase | Chr5:26431516-26433649 REVERSE LENGTH=442 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 3.4 3.4 3.4 48.064 442 442 0 10.592 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.4 3.4 3.4 3.4 0 0 3179800 1398100 1244900 269980 266880 0 0 26 122300 53771 47880 10384 10264 0 0 1398100 1147500 432430 476030 0 0 1 1 0 0 0 0 2 SISSPTVVEVDLGDR 633 2003 True 2111 10905;10906;10907;10908 8098;8099 8098 -1 AT5G66190.1;AT5G66190.2 AT5G66190.1;AT5G66190.2 7;6 7;6 6;5 AT5G66190.1 | Symbols:LFNR1,ATLFNR1,FNR1 | leaf-type chloroplast-targeted FNR 1,LEAF FNR 1,ferredoxin-NADP(+)-oxidoreductase 1 | ferredoxin-NADP[+]-oxidoreductase 1 | Chr5:26451203-26453012 REVERSE LENGTH=360;AT5G66190.2 | Symbols:LFNR1,ATLFNR1,FNR1 | l 2 7 7 6 5 6 2 2 3 3 5 6 2 2 3 3 4 5 2 2 3 3 25.8 25.8 22.8 40.326 360 360;262 0 81.871 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16.9 22.2 7.2 6.1 10.8 10.8 40865000 12760000 16919000 1633500 1082400 5114000 3356600 21 1862300 550370 805670 55314 47530 243520 159840 3879000 4633800 2194900 1291800 2439400 2086500 4 7 0 0 3 0 14 DNTFVYMCGLK;DPNATIIMLGTGTGIAPFR;GIDDIMVSLAAK;KQEEGIVVNK;LVYTNDGGEIVK;LYSIASSAIGDFGDSK;MAEYAEELWELLK 634 413;415;825;1297;1634;1643;1646 True;True;True;True;True;True;True 430;432;864;1357;1702;1711;1715;1716 2114;2115;2122;4738;4739;7223;7224;7225;7226;7227;7228;7229;7230;7231;8833;8834;8835;8866;8867;8868;8869;8870;8883;8884;8885;8886 1641;1642;1643;1649;3545;3546;5355;5356;6549;6568;6569;6570;6571;6581;6582 1641;1649;3546;5355;6549;6569;6581 107 297 -1;-1 AT5G66570.1 AT5G66570.1 12 3 3 AT5G66570.1 | Symbols:OEE1,PSBO-1,MSP-1,OE33,OEE33,PSBO1 | PS II OXYGEN-EVOLVING COMPLEX 1,OXYGEN EVOLVING COMPLEX 33 KILODALTON PROTEIN,OXYGEN EVOLVING ENHANCER PROTEIN 33,PS II oxygen-evolving complex 1,MANGANESE-STABILIZING PROTEIN 1,33 KDA OXYGEN EVOL 1 12 3 3 12 12 9 9 11 8 3 3 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 41 14.8 14.8 35.142 332 332 0 18.175 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 41 41 33.1 33.1 38.6 27.1 46084000 17415000 19322000 2609300 2374100 2194000 2170300 22 1263100 483060 504860 65492 69314 70963 69398 10236000 10656000 2851700 2785200 2210600 2582400 0 2 0 0 0 0 2 FCFEPTSFTVK;FLVPSYR;GGSTGYDNAVALPAGGR;GGSTGYDNAVALPAGGRGDEEELVK;GTGTANQCPTIDGGSETFSFK;KFCFEPTSFTVK;LTYDEIQSK;NAPPEFQNTK;NTAASVGEITLK;QLDASGKPDSFTGK;RLTYDEIQSK;SKPETGEVIGVFESLQPSDTDLGAK 635 637;704;812;813;936;1261;1599;1704;1797;1852;1885;2012 False;False;False;True;False;False;False;True;False;True;False;False 669;738;849;850;980;1320;1666;1793;1892;1950;1985;2120 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-1;-1;-1 ATCG00020.1 ATCG00020.1 4 4 4 ATCG00020.1 | Symbols:PSBA | photosystem II reaction center protein A | photosystem II reaction center protein A | ChrC:383-1444 REVERSE LENGTH=353 1 4 4 4 4 3 3 3 4 3 4 3 3 3 4 3 4 3 3 3 4 3 15 15 15 38.936 353 353 0 84.805 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15 11.9 11.6 11.6 15 11.6 110280000 13717000 8895900 13522000 8950500 39388000 25810000 10 1924800 582640 680690 117990 74364 341790 127290 11696000 13466000 17646000 12771000 27536000 23699000 2 1 2 0 2 2 9 ANLGMEVMHER;FGQEEETYNIVAAHGYFGR;LIFQYASFNNSR;VINTWADIINR 638 180;672;1447;2454 True;True;True;True 189;706;1509;2586 840;841;842;843;844;3794;3795;3796;3797;3798;3799;3800;3801;7939;7940;7941;13268;13269;13270;13271;13272;13273 523;524;525;526;2913;2914;2915;2916;2917;5908;9920;9921;9922;9923 523;2916;5908;9921 108;109 328;331 -1 ATCG00120.1 ATCG00120.1 15 15 15 ATCG00120.1 | Symbols:ATPA | ATP synthase subunit alpha | ATP synthase subunit alpha | ChrC:9938-11461 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ATCG00350.1 ATCG00350.1 3 3 3 ATCG00350.1 | Symbols:PSAA | | Photosystem I%2C PsaA/PsaB protein | ChrC:39605-41857 REVERSE LENGTH=750 1 3 3 3 3 3 2 2 3 1 3 3 2 2 3 1 3 3 2 2 3 1 3.9 3.9 3.9 83.23 750 750 0 29.685 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.9 3.9 2.7 2.7 3.9 1.6 88866000 10128000 12654000 11944000 8085800 29391000 16663000 18 1763800 336300 355130 215370 109270 622110 125640 5019300 6132500 14090000 10670000 28070000 26534000 6 1 2 5 6 5 25 EIPLPHEFILNR;ILVDRDPIK;YSEFLTFR 647 529;1141;2757 True;True;True 555;1195;2897 2852;2853;2854;2855;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863;2864;6437;6438;6439;14767;14768;14769;14770;14771 2202;2203;2204;2205;2206;2207;2208;2209;2210;2211;2212;2213;2214;2215;2216;2217;2218;2219;2220;2221;2222;2223;2224;4834;4835;11061;11062 2221;4834;11061 -1 ATCG00380.1 ATCG00380.1 3 3 3 ATCG00380.1 | Symbols:RPS4 | chloroplast ribosomal protein S4 | chloroplast ribosomal protein S4 | ChrC:45223-45828 REVERSE LENGTH=201 1 3 3 3 1 3 2 2 1 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707, subfamily A, polypeptide 3 | cytochrome P450%2C family 707%2C subfamily A%2C polypeptide 3 | Chr5:18369121-18370909 REVERSE LENGTH=446;AT5G45340.1 | Symbols:CYP707A3 | cytochrome P450, fam 2 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 50.599 446 446;463 0.0087464 6.0859 By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 28738000 0 0 20126000 8611500 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 0 16119000 15361000 0 0 0 0 1 0 0 0 1 QSLINALIQALK + 693 1863 True 1962 10217;10218;10219 7608 7608 -1;-1