Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides A_ed_blank Peptides A_ed_dclpB_blank Peptides A_ed_dclpB_Nva Peptides A_ed_dclpB_Val Peptides A_ed_Nva Peptides A_ed_Val Peptides A_wt_dclpB_blank Peptides A_wt_dclpB_Nva Peptides A_wt_dclpB_Val Peptides B_ed_blank Peptides B_ed_dclpB_blank Peptides B_ed_dclpB_Nva Peptides B_ed_dclpB_Val Peptides B_ed_Nva Peptides B_ed_Val Peptides B_wt_dclpB_blank Peptides B_wt_dclpB_Nva Peptides B_wt_dclpB_Val Peptides C_ed_blank Peptides C_ed_dclpB_blank Peptides C_ed_dclpB_Nva Peptides C_ed_dclpB_Val Peptides C_ed_Nva Peptides C_ed_Val Peptides C_wt_dclpB_blank Peptides C_wt_dclpB_Nva Peptides C_wt_dclpB_Val Peptides D_ed_blank Peptides D_ed_dclpB_blank Peptides D_ed_dclpB_Nva Peptides D_ed_dclpB_Val Peptides D_ed_Nva Peptides D_ed_Val Peptides D_wt_dclpB_blank Peptides D_wt_dclpB_Nva Peptides D_wt_dclpB_Val Razor + unique peptides A_ed_blank Razor + unique peptides A_ed_dclpB_blank Razor + unique peptides A_ed_dclpB_Nva Razor + unique peptides A_ed_dclpB_Val Razor + unique peptides A_ed_Nva Razor + unique peptides A_ed_Val Razor + unique peptides A_wt_dclpB_blank Razor + unique peptides A_wt_dclpB_Nva Razor + unique peptides A_wt_dclpB_Val Razor + unique peptides B_ed_blank Razor + unique peptides B_ed_dclpB_blank Razor + unique peptides B_ed_dclpB_Nva Razor + unique peptides B_ed_dclpB_Val Razor + unique peptides B_ed_Nva Razor + unique peptides B_ed_Val Razor + unique peptides B_wt_dclpB_blank Razor + unique peptides B_wt_dclpB_Nva Razor + unique peptides B_wt_dclpB_Val Razor + unique peptides C_ed_blank Razor + unique peptides C_ed_dclpB_blank Razor + unique peptides C_ed_dclpB_Nva Razor + unique peptides C_ed_dclpB_Val Razor + unique peptides C_ed_Nva Razor + unique peptides C_ed_Val Razor + unique peptides C_wt_dclpB_blank Razor + unique peptides C_wt_dclpB_Nva Razor + unique peptides C_wt_dclpB_Val Razor + unique peptides D_ed_blank Razor + unique peptides D_ed_dclpB_blank Razor + unique peptides D_ed_dclpB_Nva Razor + unique peptides D_ed_dclpB_Val Razor + unique peptides D_ed_Nva Razor + unique peptides D_ed_Val Razor + unique peptides D_wt_dclpB_blank Razor + unique peptides D_wt_dclpB_Nva Razor + unique peptides D_wt_dclpB_Val Unique peptides A_ed_blank Unique peptides A_ed_dclpB_blank Unique peptides A_ed_dclpB_Nva Unique peptides A_ed_dclpB_Val Unique peptides A_ed_Nva Unique peptides A_ed_Val Unique peptides A_wt_dclpB_blank Unique peptides A_wt_dclpB_Nva Unique peptides A_wt_dclpB_Val Unique peptides B_ed_blank Unique peptides B_ed_dclpB_blank Unique peptides B_ed_dclpB_Nva Unique peptides B_ed_dclpB_Val Unique peptides B_ed_Nva Unique peptides B_ed_Val Unique peptides B_wt_dclpB_blank Unique peptides B_wt_dclpB_Nva Unique peptides B_wt_dclpB_Val Unique peptides C_ed_blank Unique peptides C_ed_dclpB_blank Unique peptides C_ed_dclpB_Nva Unique peptides C_ed_dclpB_Val Unique peptides C_ed_Nva Unique peptides C_ed_Val Unique peptides C_wt_dclpB_blank Unique peptides C_wt_dclpB_Nva Unique peptides C_wt_dclpB_Val Unique peptides D_ed_blank Unique peptides D_ed_dclpB_blank Unique peptides D_ed_dclpB_Nva Unique peptides D_ed_dclpB_Val Unique peptides D_ed_Nva Unique peptides D_ed_Val Unique peptides D_wt_dclpB_blank Unique peptides D_wt_dclpB_Nva Unique peptides D_wt_dclpB_Val Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type A_ed_blank Identification type A_ed_dclpB_blank Identification type A_ed_dclpB_Nva Identification type A_ed_dclpB_Val Identification type A_ed_Nva Identification type A_ed_Val Identification type A_wt_dclpB_blank Identification type A_wt_dclpB_Nva Identification type A_wt_dclpB_Val Identification type B_ed_blank Identification type B_ed_dclpB_blank Identification type B_ed_dclpB_Nva Identification type B_ed_dclpB_Val Identification type B_ed_Nva Identification type B_ed_Val Identification type B_wt_dclpB_blank Identification type B_wt_dclpB_Nva Identification type B_wt_dclpB_Val Identification type C_ed_blank Identification type C_ed_dclpB_blank Identification type C_ed_dclpB_Nva Identification type C_ed_dclpB_Val Identification type C_ed_Nva Identification type C_ed_Val Identification type C_wt_dclpB_blank Identification type C_wt_dclpB_Nva Identification type C_wt_dclpB_Val Identification type D_ed_blank Identification type D_ed_dclpB_blank Identification type D_ed_dclpB_Nva Identification type D_ed_dclpB_Val Identification type D_ed_Nva Identification type D_ed_Val Identification type D_wt_dclpB_blank Identification type D_wt_dclpB_Nva Identification type D_wt_dclpB_Val Sequence coverage A_ed_blank [%] Sequence coverage A_ed_dclpB_blank [%] Sequence coverage A_ed_dclpB_Nva [%] Sequence coverage A_ed_dclpB_Val [%] Sequence coverage A_ed_Nva [%] Sequence coverage A_ed_Val [%] Sequence coverage A_wt_dclpB_blank [%] Sequence coverage A_wt_dclpB_Nva [%] Sequence coverage A_wt_dclpB_Val [%] Sequence coverage B_ed_blank [%] Sequence coverage B_ed_dclpB_blank [%] Sequence coverage B_ed_dclpB_Nva [%] Sequence coverage B_ed_dclpB_Val [%] Sequence coverage B_ed_Nva [%] Sequence coverage B_ed_Val [%] Sequence coverage B_wt_dclpB_blank [%] Sequence coverage B_wt_dclpB_Nva [%] Sequence coverage B_wt_dclpB_Val [%] Sequence coverage C_ed_blank [%] Sequence coverage C_ed_dclpB_blank [%] Sequence coverage C_ed_dclpB_Nva [%] Sequence coverage C_ed_dclpB_Val [%] Sequence coverage C_ed_Nva [%] Sequence coverage C_ed_Val [%] Sequence coverage C_wt_dclpB_blank [%] Sequence coverage C_wt_dclpB_Nva [%] Sequence coverage C_wt_dclpB_Val [%] Sequence coverage D_ed_blank [%] Sequence coverage D_ed_dclpB_blank [%] Sequence coverage D_ed_dclpB_Nva [%] Sequence coverage D_ed_dclpB_Val [%] Sequence coverage D_ed_Nva [%] Sequence coverage D_ed_Val [%] Sequence coverage D_wt_dclpB_blank [%] Sequence coverage D_wt_dclpB_Nva [%] Sequence coverage D_wt_dclpB_Val [%] Intensity Intensity A_ed_blank Intensity A_ed_dclpB_blank Intensity A_ed_dclpB_Nva Intensity A_ed_dclpB_Val Intensity A_ed_Nva Intensity A_ed_Val Intensity A_wt_dclpB_blank Intensity A_wt_dclpB_Nva Intensity A_wt_dclpB_Val Intensity B_ed_blank Intensity B_ed_dclpB_blank Intensity B_ed_dclpB_Nva Intensity B_ed_dclpB_Val Intensity B_ed_Nva Intensity B_ed_Val Intensity B_wt_dclpB_blank Intensity B_wt_dclpB_Nva Intensity B_wt_dclpB_Val Intensity C_ed_blank Intensity C_ed_dclpB_blank Intensity C_ed_dclpB_Nva Intensity C_ed_dclpB_Val Intensity C_ed_Nva Intensity C_ed_Val Intensity C_wt_dclpB_blank Intensity C_wt_dclpB_Nva Intensity C_wt_dclpB_Val Intensity D_ed_blank Intensity D_ed_dclpB_blank Intensity D_ed_dclpB_Nva Intensity D_ed_dclpB_Val Intensity D_ed_Nva Intensity D_ed_Val Intensity D_wt_dclpB_blank Intensity D_wt_dclpB_Nva Intensity D_wt_dclpB_Val iBAQ iBAQ A_ed_blank iBAQ A_ed_dclpB_blank iBAQ A_ed_dclpB_Nva iBAQ A_ed_dclpB_Val iBAQ A_ed_Nva iBAQ A_ed_Val iBAQ A_wt_dclpB_blank iBAQ A_wt_dclpB_Nva iBAQ A_wt_dclpB_Val iBAQ B_ed_blank iBAQ B_ed_dclpB_blank iBAQ B_ed_dclpB_Nva iBAQ B_ed_dclpB_Val iBAQ B_ed_Nva iBAQ B_ed_Val iBAQ B_wt_dclpB_blank iBAQ B_wt_dclpB_Nva iBAQ B_wt_dclpB_Val iBAQ C_ed_blank iBAQ C_ed_dclpB_blank iBAQ C_ed_dclpB_Nva iBAQ C_ed_dclpB_Val iBAQ C_ed_Nva iBAQ C_ed_Val iBAQ C_wt_dclpB_blank iBAQ C_wt_dclpB_Nva iBAQ C_wt_dclpB_Val iBAQ D_ed_blank iBAQ D_ed_dclpB_blank iBAQ D_ed_dclpB_Nva iBAQ D_ed_dclpB_Val iBAQ D_ed_Nva iBAQ D_ed_Val iBAQ D_wt_dclpB_blank iBAQ D_wt_dclpB_Nva iBAQ D_wt_dclpB_Val MS/MS count Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Ixx site IDs Oxidation (M) site IDs Ixx site positions Oxidation (M) site positions A0A385XJE6;P0CE58;P0CE57;P0CE56;P0CE55;P0CE54;P0CE52;P0CE51;P0CE50;P0CE49;P76071;P0CE53 A0A385XJE6;P0CE58;P0CE57;P0CE56;P0CE55;P0CE54;P0CE52;P0CE51;P0CE50;P0CE49;P76071;P0CE53 13;13;13;13;13;13;13;13;13;13;12;12 13;13;13;13;13;13;13;13;13;13;12;12 13;13;13;13;13;13;13;13;13;13;12;12 Transposase InsH for insertion sequence element IS5T;Transposase InsH for insertion sequence element IS5R;Transposase InsH for insertion sequence element IS5LO;Transposase InsH for insertion sequence element IS5K;Transposase InsH for insertion sequence element IS5I;Transposase InsH for insertion sequence element IS5F;Transposase InsH for insertion sequence element IS5D;Transposase InsH for insertion sequence element IS5B;Transposase InsH for insertion sequence element IS5A;Transposase InsH for insertion sequence element IS5Y;Transposase InsH for insertion sequence element IS5H insH11;insH10;insH9;insH8;insH7;insH4;insH3;insH2;insH1;insH5;insH6 sp|A0A385XJE6|INH21_ECOLI Transposase InsH for insertion sequence element IS5U OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=insH21 PE=3 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 75.4 77.9 77.9 77.6 74 74 74 70.5 74 74.4 77.9 72 75.1 74 67.3 66.8 62.7 66.8 66.1 73.7 77.9 77.9 70.9 77.9 70.1 67.3 70.1 70.9 68 68.2 68.2 69.4 62.4 64 60.4 71 791770000000 21533000000 75442000000 57141000000 62480000000 18845000000 20315000000 33871000000 11982000000 33626000000 6462800000 26699000000 34967000000 36156000000 4619400000 9853800000 7455900000 3205500000 3681100000 7228000000 19730000000 25125000000 34053000000 4832700000 18239000000 11186000000 3030400000 7824300000 14518000000 43210000000 32516000000 51216000000 12968000000 19510000000 9257700000 1885300000 7105100000 17995000000 489380000 1714600000 1298700000 1420000000 428300000 461710000 769800000 272330000 764230000 146880000 606790000 794710000 821740000 104990000 223950000 169450000 72852000 83661000 164270000 448420000 571010000 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aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2 OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=metL PE=1 SV=3 1 59 59 59 38 43 44 36 56 36 46 51 47 42 37 49 34 46 37 43 46 41 33 35 49 39 49 39 38 42 36 31 33 43 36 48 31 34 37 34 38 43 44 36 56 36 46 51 47 42 37 49 34 46 37 43 46 41 33 35 49 39 49 39 38 42 36 31 33 43 36 48 31 34 37 34 38 43 44 36 56 36 46 51 47 42 37 49 34 46 37 43 46 41 33 35 49 39 49 39 38 42 36 31 33 43 36 48 31 34 37 34 72.2 72.2 72.2 88.887 810 810 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 49.1 55.6 57.2 49.5 71.2 49.6 54.6 57.8 51.2 47.5 44.6 59.5 42.1 47.2 46.7 46.2 50.2 46.8 40.4 44.3 63.6 47 54.1 52.1 45.6 47.8 42.6 39.1 38.6 52.8 46.4 58.3 38.1 39.1 40.9 39 60293000000 702700000 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Phosphoenolpyruvate carboxylase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ppc PE=1 SV=1 1 95 95 95 87 78 73 64 81 68 82 83 83 81 78 71 67 76 71 78 76 82 74 72 72 68 73 68 77 75 75 75 74 70 66 75 66 78 75 78 87 78 73 64 81 68 82 83 83 81 78 71 67 76 71 78 76 82 74 72 72 68 73 68 77 75 75 75 74 70 66 75 66 78 75 78 87 78 73 64 81 68 82 83 83 81 78 71 67 76 71 78 76 82 74 72 72 68 73 68 77 75 75 75 74 70 66 75 66 78 75 78 84.4 84.4 84.4 99.061 883 883 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 76.7 79.8 79.7 75.8 80.4 78.8 80.1 77.1 78.4 75.3 80.1 73.2 75.8 79.7 69.8 66.1 69.5 73.3 78.8 75.9 79.5 75.9 75.7 76 76.9 74.7 71.3 74.5 73.6 74.4 72.8 73.8 67.5 74.2 77 73.4 2242900000000 131440000000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 54.5 58.9 66.4 65 61.3 66.9 66.2 61.5 64.8 50.9 60.1 54 61.1 57 56.1 49.8 34.7 34.7 45.5 60.1 54.7 61.7 59.4 63.2 53.3 47.7 46.9 55.6 54.7 50.5 50.5 52.6 54 44.8 32.6 40.4 91551000000 3616600000 9871900000 5471700000 10685000000 1630600000 4080800000 5499300000 1642000000 3741900000 727390000 2398200000 1995800000 3537500000 387670000 1630700000 780920000 389570000 423490000 868740000 1773400000 1817100000 4681900000 367080000 3058400000 1394100000 377350000 850470000 1699900000 3562400000 2366600000 4396400000 787570000 3018900000 1063700000 202630000 753000000 3156900000 124710000 340410000 188680000 368440000 56228000 140720000 189630000 56621000 129030000 25082000 82698000 68820000 121980000 13368000 56232000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 55.8 58.8 57.1 56 58.3 53.8 60 63.5 62.1 52.3 57.1 51.9 57.1 49.8 56.9 52.7 53.7 52.5 47.1 50.6 58.7 58.7 53.7 58.8 55.4 53.7 50.2 50 53.7 50.6 45 50.4 49.4 46.9 40.8 46 133970000000 2270100000 11181000000 9598700000 11212000000 4486000000 2982500000 7273600000 4081000000 7384900000 425100000 4714300000 5874300000 4509400000 1279900000 2445200000 982500000 1085000000 772980000 534310000 1551400000 7122700000 9700300000 1433300000 2216700000 1212300000 677760000 978690000 900150000 6167500000 3499100000 4470400000 1754600000 7537900000 731440000 253760000 665500000 5581900000 94588000 465850000 399940000 467150000 186920000 124270000 303070000 170040000 307700000 17713000 196430000 244760000 187890000 53329000 101890000 40937000 45207000 32207000 22263000 64641000 296780000 404180000 59719000 92363000 50512000 28240000 40779000 37506000 256980000 145790000 186270000 73110000 314080000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 66.1 67.9 69.7 71.8 66.7 73.9 73.9 73.9 73.9 48.5 60.6 64.5 62.4 71.8 64.5 46.7 46.4 48.5 40.9 48.8 71.8 69.7 53 65.2 48.5 43.3 50.6 41.5 38.2 64.5 62.4 64.5 64.5 40.9 52.7 43.3 62386000000 796740000 3246200000 4725400000 11293000000 3099000000 4643900000 1951700000 1875400000 2506800000 157540000 437160000 3175100000 3455600000 470090000 1273200000 247960000 360990000 291250000 141670000 289760000 1385800000 3140000000 296440000 2406600000 293840000 273820000 325080000 306050000 481580000 1312200000 3720900000 810670000 2447400000 194940000 194340000 358720000 4159100000 53116000 216410000 315020000 752850000 206600000 309590000 130120000 125030000 167120000 10503000 29144000 211670000 230370000 31339000 84877000 16531000 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S6, fully modified isoform;30S ribosomal protein S6, non-modified isoform rpsF sp|P02358|RS6_ECOLI 30S ribosomal protein S6 OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rpsF PE=1 SV=1 1 11 11 11 10 11 11 10 10 10 11 11 11 9 10 11 10 10 10 8 6 7 6 9 10 9 8 9 7 7 7 8 8 10 11 9 10 7 7 7 10 11 11 10 10 10 11 11 11 9 10 11 10 10 10 8 6 7 6 9 10 9 8 9 7 7 7 8 8 10 11 9 10 7 7 7 10 11 11 10 10 10 11 11 11 9 10 11 10 10 10 8 6 7 6 9 10 9 8 9 7 7 7 8 8 10 11 9 10 7 7 7 69.6 69.6 69.6 15.703 135 135 0 240.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 68.1 69.6 69.6 52.6 52.6 52.6 69.6 69.6 69.6 51.9 68.1 69.6 52.6 68.1 68.1 51.9 26.7 43.7 32.6 68.1 68.1 51.1 65.9 68.1 49.6 49.6 49.6 65.9 51.9 68.1 69.6 68.1 68.1 48.9 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KefC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=kefC PE=1 SV=2 1 10 10 10 6 1 0 0 5 0 9 9 8 5 2 1 0 1 0 5 5 5 4 0 1 0 0 1 5 6 6 2 1 0 0 1 0 6 5 5 6 1 0 0 5 0 9 9 8 5 2 1 0 1 0 5 5 5 4 0 1 0 0 1 5 6 6 2 1 0 0 1 0 6 5 5 6 1 0 0 5 0 9 9 8 5 2 1 0 1 0 5 5 5 4 0 1 0 0 1 5 6 6 2 1 0 0 1 0 6 5 5 20.2 20.2 20.2 67.795 620 620 0 41.75 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 11.9 3.5 0 0 11 0 18.4 18.4 17.3 8.2 2.7 3.5 0 1.8 0 7.9 7.9 7.9 6.1 0 3.5 0 0 3.5 7.9 9 10.8 2.6 3.5 0 0 1.3 0 10.8 7.9 8.7 734970000 44090000 24824000 0 0 53472000 0 155530000 70873000 152470000 13773000 7924900 6957200 0 3795100 0 10936000 14328000 15086000 16199000 0 2706900 0 0 4321600 30516000 22924000 24629000 7804200 3292900 0 0 2135700 0 21274000 7649800 17466000 24499000 1469700 827460 0 0 1782400 0 5184200 2362400 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23 23 23 Erythronate-4-phosphate dehydrogenase pdxB sp|P05459|PDXB_ECOLI Erythronate-4-phosphate dehydrogenase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pdxB PE=2 SV=2 1 23 23 23 16 21 21 19 21 21 17 16 20 14 18 21 21 22 20 9 6 8 12 19 23 23 22 21 15 8 17 15 19 18 19 18 18 11 5 11 16 21 21 19 21 21 17 16 20 14 18 21 21 22 20 9 6 8 12 19 23 23 22 21 15 8 17 15 19 18 19 18 18 11 5 11 16 21 21 19 21 21 17 16 20 14 18 21 21 22 20 9 6 8 12 19 23 23 22 21 15 8 17 15 19 18 19 18 18 11 5 11 70.6 70.6 70.6 41.367 378 378 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 56.9 65.1 65.1 60.3 70.4 70.4 58.7 57.7 70.4 49.5 57.4 65.9 65.9 70.6 65.9 29.6 18.8 26.7 42.3 60.1 70.6 70.6 65.9 65.9 47.6 27.2 55.6 47.4 57.7 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 24.4 56.5 52.4 52.4 54.1 56.3 43.8 30.7 43.5 31.3 50.2 51.5 55 51.6 56.5 28.2 22.7 27.6 23.4 50.6 56.7 58.1 53.1 58.1 33.9 25.2 29.9 35.7 47.6 45.8 47.6 51.6 51.6 28.1 13.6 28.7 31885000000 49395000 2745500000 3020600000 4736600000 898820000 2117100000 129950000 68613000 121520000 21860000 578640000 1496400000 2155700000 217820000 684920000 9558000 9163300 12911000 12587000 447670000 1022700000 2323100000 191310000 1700200000 37999000 12498000 25085000 90881000 968830000 973470000 2142200000 593850000 2225900000 21402000 5123800 15401000 1062800000 1646500 91516000 100690000 157890000 29961000 70569000 4331800 2287100 4050800 728680 19288000 49879000 71856000 7260600 22831000 318600 305440 430360 419570 14922000 34091000 77436000 6377100 56674000 1266600 416590 836150 3029400 32294000 32449000 71408000 19795000 74195000 713390 170790 513380 287 141 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 77.6 83.9 83.9 82.5 73.5 73.5 68.6 65.4 68 77.4 84.1 82.5 82.5 70.9 75.6 53 56.6 64.6 69.2 79 83.9 82.5 68.2 68.2 68 66.2 65.2 70.9 83.9 83.9 82.1 67.8 65.6 61.9 51.9 61.9 785030000000 3311400000 119880000000 106250000000 85269000000 9048800000 5043700000 2134600000 488920000 1383000000 936380000 38754000000 51702000000 40720000000 2034100000 3183500000 34621000 63893000 41406000 774570000 24622000000 40747000000 38154000000 1574300000 2488100000 412570000 113280000 220870000 4319900000 63172000000 59193000000 62093000000 6977000000 9540100000 219830000 30402000 100740000 24532000000 103480000 3746300000 3320200000 2664700000 282770000 157620000 66707000 15279000 43218000 29262000 1211100000 1615700000 1272500000 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 45.2 58.3 50.5 47.7 62.6 58.3 62.6 53.6 62.6 42.4 58.3 50.5 52.6 50.8 43.6 49.8 37.1 35.5 39.9 48 49.2 49.2 48.9 50.8 55.1 36.8 51.4 43.3 45.5 44.9 43.3 39.9 43.6 43.6 39.6 46.4 8674300000 163970000 844750000 673350000 978830000 269060000 434120000 443820000 177750000 409980000 27111000 193170000 496910000 520810000 37616000 105750000 28367000 11762000 10956000 17628000 80810000 256030000 529570000 24491000 259620000 45135000 15809000 29471000 68049000 222810000 259770000 618210000 105700000 237200000 37979000 4734500 33257000 481910000 9109600 46930000 37408000 54379000 14948000 24118000 24656000 9874800 22777000 1506100 10731000 27606000 28934000 2089800 5875200 1576000 653440 608660 979350 4489500 14224000 29421000 1360600 14424000 2507500 878280 1637300 3780500 12378000 14431000 34345000 5872300 13178000 2109900 263030 1847600 279 155 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Cystathionine beta-lyase MetC metC sp|P06721|METC_ECOLI Cystathionine beta-lyase MetC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=metC PE=1 SV=1 1 18 18 18 8 14 16 12 15 15 10 14 11 10 14 15 14 15 14 7 10 7 10 14 15 12 13 14 11 9 10 11 12 15 13 15 13 11 6 6 8 14 16 12 15 15 10 14 11 10 14 15 14 15 14 7 10 7 10 14 15 12 13 14 11 9 10 11 12 15 13 15 13 11 6 6 8 14 16 12 15 15 10 14 11 10 14 15 14 15 14 7 10 7 10 14 15 12 13 14 11 9 10 11 12 15 13 15 13 11 6 6 39.7 39.7 39.7 43.212 395 395 0 262.97 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25.3 37.5 37.7 30.4 37.5 39.5 29.9 39 32.2 23.3 37.5 37.7 37.5 37.5 37.5 18 21.5 14.2 25.3 37.5 37.5 32.4 32.7 37.5 31.1 18.5 25.3 30.9 32.4 33.2 32.9 39.5 32.9 31.1 18 13.9 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.8 48.1 37.6 40 29.6 26.9 21.1 24 24 14.3 36.9 44.7 39.8 24.8 32.5 16.7 11.2 8.5 10.7 29.4 42.7 49.5 20.6 29.4 25 33.7 18.2 18.7 41.3 34 38.3 29.1 35 26.9 15.3 18.7 9024600000 31760000 1345200000 574240000 841720000 401660000 460510000 82716000 49049000 117620000 6291800 132350000 697760000 686810000 22172000 74137000 9255300 4319800 4322000 8097400 121620000 571420000 823160000 79953000 176070000 23974000 14177000 18567000 22109000 242260000 558200000 392410000 203110000 195220000 13461000 9008200 9883100 360980000 1270400 53808000 22970000 33669000 16066000 18420000 3308600 1962000 4704900 251670 5293800 27910000 27472000 886870 2965500 370210 172790 172880 323900 4865000 22857000 32927000 3198100 7042700 958960 567090 742690 884360 9690400 22328000 15696000 8124200 7808700 538440 360330 395330 199 164 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.4 12.3 8.9 8.9 8.9 8.9 8.9 12.3 12.3 8.9 12.3 12.3 8.9 8.9 8.9 8.9 12.8 5.4 8.9 9.4 12.8 8.9 8.9 8.9 8.9 12.8 12.8 12.3 12.3 8.9 5.4 12.3 5.4 8.9 12.8 12.8 2987700000 12922000 301250000 289110000 219780000 114640000 104710000 86687000 79017000 187860000 3933200 43694000 176740000 78837000 23149000 39973000 3373400 11531000 4472700 9152900 71900000 166630000 142700000 30743000 84806000 24820000 12357000 38341000 29857000 108770000 136810000 138560000 77302000 96082000 14021000 5958900 17187000 497950000 2153600 50208000 48186000 36629000 19107000 17452000 14448000 13169000 31310000 655540 7282300 29457000 13139000 3858200 6662100 562240 1921800 745460 1525500 11983000 27772000 23783000 5123800 14134000 4136700 2059500 6390200 4976200 18128000 22801000 23094000 12884000 16014000 2336900 993150 2864500 39 172 20236;21075;21076;27443 True;True;True;True 27392;28733;28734;37199 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methyltransferase A rsmA sp|P06992|RSMA_ECOLI Ribosomal RNA small subunit methyltransferase A OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rsmA PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 3 4 4 4 4 3 4 3 3 4 5 4 5 4 2 3 4 2 3 4 3 2 1 3 2 2 3 3 5 5 4 3 2 2 3 3 3 4 4 4 4 3 4 3 3 4 5 4 5 4 2 3 4 2 3 4 3 2 1 3 2 2 3 3 5 5 4 3 2 2 3 3 3 4 4 4 4 3 4 3 3 4 5 4 5 4 2 3 4 2 3 4 3 2 1 3 2 2 3 3 5 5 4 3 2 2 3 22.7 22.7 22.7 30.42 273 273 0 13.919 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.1 9.5 13.9 13.9 15.4 15.4 9.5 15.4 9.5 9.5 15.4 16.8 13.9 16.8 13.9 6.2 12.5 14.3 6.2 11.7 13.9 10.3 6.2 2.6 12.1 6.6 6.2 12.1 10.3 16.8 16.8 13.9 10.3 6.2 7 12.1 3826100000 17374000 225240000 601620000 540390000 183910000 136600000 114050000 50608000 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 62.1 65.4 71 67.5 66.8 71 71 64.7 71 51.4 55.2 63.6 64.3 57.7 66.8 54.7 47.4 47.7 44.2 50.5 66.8 65.7 66.8 71 53 45.8 50.5 48.3 55.2 55.2 57.9 55.2 58.4 48.3 43.5 46.7 167050000000 1527200000 6172700000 10439000000 25860000000 5371300000 13540000000 2783800000 1399600000 2926100000 392000000 1509500000 6889500000 12033000000 1192600000 5346300000 371680000 331100000 262250000 336640000 1117200000 3525000000 11675000000 1022400000 11089000000 602800000 279040000 527880000 905660000 2435300000 4112700000 14556000000 3153500000 12101000000 555160000 199620000 507490000 6682000000 61088000 246910000 417560000 1034400000 214850000 541610000 111350000 55985000 117040000 15680000 60381000 275580000 481330000 47705000 213850000 14867000 13244000 10490000 13465000 44688000 141000000 467020000 40895000 443540000 24112000 11162000 21115000 36226000 97413000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 37.7 41.6 50.2 61.1 41.6 41.6 41.6 41.6 41.6 41.6 47.5 50.2 50.2 38.9 50.2 38.9 38.9 38.9 33.1 36.6 41.6 41.6 45.1 41.6 36.6 36.6 33.1 33.9 39.7 39.7 38.9 48.2 39.7 33.9 33.9 34.6 10980000000 144460000 572650000 1039700000 1937200000 485730000 778410000 315130000 266100000 316630000 37023000 94222000 555280000 523190000 54574000 248980000 35944000 40763000 27373000 47731000 48827000 273630000 512950000 71409000 424270000 68993000 33392000 47704000 85323000 189860000 187900000 685650000 134810000 573270000 48576000 22799000 49317000 998170000 13133000 52059000 94520000 176110000 44157000 70765000 28648000 24191000 28784000 3365700 8565700 50480000 47563000 4961300 22635000 3267600 3705700 2488500 4339200 4438800 24876000 46632000 6491700 38570000 6272100 3035700 4336700 7756600 17260000 17081000 62332000 12256000 52115000 4416000 2072700 4483400 142 190 1708;3715;11654;12760;13267;14302;18668;23785;23786;27367;30725;35923 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MS/MS 18.4 50.5 46.2 46.2 50.5 46.7 38.7 36.8 50.5 18.4 42.5 50.5 50.5 44.8 44.8 10.8 3.8 22.2 22.2 50.5 48.6 41 27.8 44.8 22.2 22.2 22.2 22.2 44.8 50.5 50.5 44.8 44.8 22.2 0 18.4 2857500000 0 153350000 205540000 731700000 59791000 139400000 40567000 5630700 48530000 0 36908000 104840000 258010000 9269400 69973000 427300 598560 438590 1509100 24229000 63235000 117960000 6303700 63448000 4063500 821130 3185000 7129900 58254000 104210000 320310000 35592000 180550000 1759300 0 0 259780000 0 13941000 18686000 66519000 5435500 12673000 3687900 511880 4411800 0 3355300 9530700 23456000 842670 6361200 38846 54414 39872 137190 2202600 5748600 10724000 573070 5768000 369400 74648 289550 648170 5295800 9473600 29119000 3235600 16413000 159940 0 0 47 209 448;14210;18185;20773;23991;24041;33745;35891 True;True;True;True;True;True;True;True 610;19237;19238;24776;24777;28213;32756;32757;32820;45626;45627;48388 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periplasmic protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=argT PE=1 SV=3 1 16 15 15 4 3 0 0 1 0 14 8 15 4 6 0 0 0 0 6 4 8 5 4 0 1 0 1 12 8 13 9 0 0 1 0 0 10 1 11 3 2 0 0 1 0 13 8 14 3 5 0 0 0 0 5 3 7 4 3 0 1 0 1 11 7 12 8 0 0 1 0 0 9 1 10 3 2 0 0 1 0 13 8 14 3 5 0 0 0 0 5 3 7 4 3 0 1 0 1 11 7 12 8 0 0 1 0 0 9 1 10 71.2 68.5 68.5 27.991 260 260 0 194.94 By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS 19.6 11.2 0 0 5 0 63.1 41.2 63.1 18.5 28.5 0 0 0 0 24.6 16.2 37.3 20.4 17.7 0 5 0 8.1 49.6 40 49.6 41.5 0 0 8.1 0 0 45 3.8 53.1 2977000000 14199000 39404000 0 0 5860800 0 1014800000 73697000 1118700000 2375900 28129000 0 0 0 0 4739400 4203900 14328000 13985000 12453000 0 6855800 0 17227000 204650000 9710200 193860000 56135000 0 0 12845000 0 0 66124000 3476800 59303000 186070000 887440 2462700 0 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 62.7 73.7 72.7 72.7 72.7 72.2 71.2 61.7 71.2 60 71 71.2 69.7 57.8 71 53.8 39.6 46.4 36.7 69.9 70.6 74.8 52.3 71.2 64.6 56.6 62.3 51.7 58.5 48.3 55.5 54.9 56.6 47.5 27.3 44.9 40895000000 212780000 4117800000 3657100000 5636800000 779310000 2394600000 1536200000 225340000 1251400000 49286000 861830000 1520200000 2184000000 117710000 676700000 38070000 39219000 56860000 19411000 612500000 1101800000 2340400000 106190000 1412100000 300650000 45299000 240160000 282230000 1520100000 1498000000 3029400000 416690000 2328100000 145690000 15493000 125410000 1410200000 7337200 141990000 126110000 194370000 26873000 82573000 52971000 7770200 43153000 1699500 29718000 52421000 75311000 4059100 23334000 1312700 1352400 1960700 669340 21121000 37991000 80702000 3661700 48693000 10367000 1562000 8281500 9732100 52418000 51654000 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sp|P09835|UHPB_ECOLI Signal transduction histidine-protein kinase/phosphatase UhpB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=uhpB PE=1 SV=3 1 9 9 9 6 0 0 0 4 0 5 5 5 7 2 3 2 2 1 6 7 7 6 2 0 1 4 1 6 8 5 6 4 2 0 3 1 8 7 7 6 0 0 0 4 0 5 5 5 7 2 3 2 2 1 6 7 7 6 2 0 1 4 1 6 8 5 6 4 2 0 3 1 8 7 7 6 0 0 0 4 0 5 5 5 7 2 3 2 2 1 6 7 7 6 2 0 1 4 1 6 8 5 6 4 2 0 3 1 8 7 7 17.8 17.8 17.8 56.305 500 500 0 31.359 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.2 0 0 0 8.2 0 10.6 10.6 10.6 13.6 3.6 6.4 3.6 4.6 2.8 12.2 14.4 14.2 11.4 4.8 0 2 7 1.6 12.2 16.4 10.6 12 8.2 3.6 0 6.6 2 15.6 14 14 1007500000 64387000 0 0 0 47153000 0 100530000 72327000 103180000 23147000 12718000 69535000 68002000 3007300 2501300 19709000 42793000 28343000 19340000 8946100 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 74 65.1 58.1 51.6 74 65.5 74 69.8 74 58.5 65.1 65.1 60.9 65.1 65.1 51.2 52.3 59.7 42.2 63.6 65.1 60.9 63.6 70.9 65.1 60.5 58.5 65.1 65.1 62 65.1 65.1 65.1 65.1 57.8 65.1 30451000000 563350000 1649400000 1435700000 2822700000 1883400000 1461900000 1564500000 1037900000 1895800000 145140000 373440000 1215200000 1126700000 344750000 646950000 151910000 212010000 140310000 155050000 249450000 797840000 1355400000 279050000 1233400000 394310000 222010000 397470000 442210000 692050000 798140000 1849400000 752950000 1376300000 343900000 123060000 317980000 2175100000 40239000 117810000 102550000 201620000 134530000 104420000 111750000 74137000 135410000 10367000 26674000 86801000 80481000 24625000 46211000 10850000 15143000 10022000 11075000 17818000 56988000 96812000 19932000 88097000 28165000 15858000 28391000 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1-carboxyvinyltransferase aroA sp|P0A6D3|AROA_ECOLI 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=aroA PE=1 SV=1 1 14 14 14 9 11 10 9 12 8 12 11 11 11 12 12 11 13 10 10 7 9 8 11 10 10 10 9 10 8 12 11 10 12 10 11 8 10 4 10 9 11 10 9 12 8 12 11 11 11 12 12 11 13 10 10 7 9 8 11 10 10 10 9 10 8 12 11 10 12 10 11 8 10 4 10 9 11 10 9 12 8 12 11 11 11 12 12 11 13 10 10 7 9 8 11 10 10 10 9 10 8 12 11 10 12 10 11 8 10 4 10 37 37 37 46.095 427 427 0 123.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 23 28.8 27.9 25.3 30.4 20.1 32.6 31.4 30 28.6 31.6 30.4 28.6 34.4 27.6 26.7 19.4 24.4 21.3 29.7 25.8 27.4 29.7 22.7 26.7 21.3 31.6 30.7 25.8 30.4 27.9 30.4 22.7 29.7 11.2 25.8 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25.6 34.4 42.7 42.7 42.7 42.7 29 36.3 39.3 27.9 28.6 34.4 31.7 34.4 34.4 14.9 14.5 25.2 9.5 28.6 31.7 40.1 34.4 42.7 32.8 22.1 30.2 24 34.4 31.7 31.7 34.4 34.4 28.2 17.2 25.2 6414200000 18752000 368750000 692600000 932520000 244710000 419190000 100630000 22363000 115120000 5653800 130560000 284030000 324420000 74008000 165820000 4182000 5800700 7671900 16982000 11090000 179530000 338420000 71805000 333200000 19470000 10724000 23712000 31618000 231290000 241770000 377510000 154810000 425260000 10520000 4047100 15693000 712690000 2083600 40972000 76956000 103610000 27190000 46577000 11181000 2484800 12791000 628200 14507000 31559000 36046000 8223100 18424000 464670 644520 852440 1886800 1232200 19948000 37602000 7978300 37023000 2163300 1191500 2634700 3513100 25699000 26864000 41946000 17201000 47251000 1168800 449680 1743600 71 346 936;5706;7525;11460;13643;14634;30414;32171;32517;35158;35159 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By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.2 21.6 20.5 20.5 11.4 33 21.6 10.2 10.2 10.2 33 21.6 20.5 31.8 11.4 21.6 10.2 21.6 8.5 10.2 10.2 33 14.2 14.2 25.6 8.5 14.2 25.6 21.6 21.6 33 11.4 21.6 25.6 4.5 14.2 2400600000 24454000 147080000 200940000 215310000 59632000 186840000 52131000 22844000 36839000 7148500 71898000 100550000 86605000 22490000 53548000 8235500 7471100 7379100 8727200 25431000 70326000 212880000 14920000 103510000 16678000 4287100 10824000 26645000 53751000 68744000 195160000 145650000 101770000 15661000 2824400 11382000 400100000 4075600 24513000 33490000 35885000 9938700 31140000 8688500 3807300 6139800 1191400 11983000 16759000 14434000 3748400 8924600 1372600 1245200 1229900 1454500 4238500 11721000 35480000 2486700 17252000 2779700 714510 1804000 4440800 8958500 11457000 32526000 24275000 16962000 2610100 470730 1897000 61 356 521;18027;25367;26773;30433;32331 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.2 21.3 28.3 27.2 35.3 35.3 31.4 32.5 32.5 30.8 28.3 26.3 25.5 32.5 35.3 33.3 33.3 33.3 17.4 29.1 25.8 32.5 21.8 26.1 31.9 29.1 31.4 27.2 23.8 26.3 33.3 26.6 23.5 26.9 19 29.4 4534100000 67292000 215890000 269850000 637000000 120040000 235530000 153680000 93555000 190860000 23864000 66617000 146630000 179840000 39125000 104390000 25897000 27295000 22742000 17318000 53275000 117450000 238040000 17835000 155560000 51884000 23258000 33408000 63488000 130100000 157950000 425760000 86768000 251930000 36299000 13941000 39742000 266710000 3958400 12700000 15873000 37471000 7061400 13854000 9039700 5503200 11227000 1403800 3918600 8625200 10579000 2301500 6140400 1523300 1605600 1337800 1018700 3133800 6908800 14002000 1049100 9150500 3052000 1368100 1965200 3734600 7653200 9291100 25044000 5104000 14820000 2135200 820040 2337800 173 393 3165;6721;7562;14612;16274;18152;18954;24952;31183;32847;33931;35327 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sp|P0A8A0|YEBC_ECOLI Probable transcriptional regulatory protein YebC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yebC PE=1 SV=1 1 10 10 10 5 5 5 5 6 3 10 9 10 7 7 3 4 5 4 6 5 7 8 9 3 4 6 7 9 8 8 7 6 4 5 4 5 7 4 7 5 5 5 5 6 3 10 9 10 7 7 3 4 5 4 6 5 7 8 9 3 4 6 7 9 8 8 7 6 4 5 4 5 7 4 7 5 5 5 5 6 3 10 9 10 7 7 3 4 5 4 6 5 7 8 9 3 4 6 7 9 8 8 7 6 4 5 4 5 7 4 7 34.6 34.6 34.6 26.422 246 246 0 60.267 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 21.1 21.1 18.7 21.1 22 13.8 34.6 29.3 34.6 27.2 22.4 13 18.3 19.5 15.9 19.1 16.3 24.8 29.3 34.6 13 15.9 19.5 31.3 34.6 29.3 31.7 22.4 22.4 18.3 21.1 16.3 21.1 22.4 15.9 22.4 4403400000 33581000 234520000 252610000 328590000 58016000 47056000 739260000 140430000 710360000 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MS/MS By MS/MS 68.9 84.9 79.6 83 71.3 66.6 51.7 35.1 41.3 58.9 82.6 79.6 84.9 69.6 67.2 22.6 11.5 15.5 39.6 72.1 79.8 85.1 69.4 66.4 37.2 20.6 22.3 59.6 71.7 72.1 71.7 65.3 66.4 22.3 15.1 16.2 78660000000 442340000 11201000000 6462400000 6891800000 1086100000 771300000 62900000 30014000 63377000 103290000 3188000000 4406000000 3646900000 201260000 408830000 3884300 2935200 2741700 68491000 3680100000 6169900000 7047500000 147070000 496780000 17984000 3575400 14192000 564870000 6241600000 6309500000 6399800000 930960000 1575400000 9791300 1731300 5178400 2383600000 13404000 339430000 195830000 208840000 32912000 23373000 1906100 909510 1920500 3130000 96605000 133520000 110510000 6098900 12389000 117710 88944 83083 2075500 111520000 186970000 213560000 4456600 15054000 544970 108340 430060 17117000 189140000 191200000 193930000 28211000 47738000 296700 52463 156920 426 484 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 26.1 44.7 49.4 41.3 52.8 52.5 46.9 41.3 50 41.3 46.9 44.7 44.7 49.1 41.3 29.2 26.1 29.2 20.8 38.8 41.3 41.3 44.4 49.4 31.1 33.5 38.5 44.4 49.4 49.4 49.4 49.4 41.3 38.8 33.5 38.8 9648100000 115410000 547470000 621090000 586490000 739710000 455030000 592230000 144240000 540320000 27884000 213230000 431140000 405870000 112490000 150050000 23275000 30600000 21877000 29015000 78571000 325680000 439760000 99231000 416630000 56355000 25529000 50612000 125380000 326600000 467230000 732340000 369750000 260600000 40610000 11539000 34235000 742160000 8877800 42113000 47776000 45114000 56901000 35002000 45556000 11096000 41563000 2144900 16402000 33164000 31221000 8652900 11542000 1790300 2353800 1682800 2231900 6043900 25052000 33827000 7633200 32049000 4335000 1963700 3893200 9644900 25123000 35941000 56334000 28442000 20046000 3123800 887650 2633500 201 497 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9 9 Probable Fe(2+)-trafficking protein yggX sp|P0A8P3|FETP_ECOLI Probable Fe(2+)-trafficking protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yggX PE=1 SV=2 1 9 9 9 6 9 6 5 6 5 9 7 9 5 9 6 5 3 3 5 5 5 5 7 7 8 4 2 7 5 7 6 7 6 7 4 4 5 4 4 6 9 6 5 6 5 9 7 9 5 9 6 5 3 3 5 5 5 5 7 7 8 4 2 7 5 7 6 7 6 7 4 4 5 4 4 6 9 6 5 6 5 9 7 9 5 9 6 5 3 3 5 5 5 5 7 7 8 4 2 7 5 7 6 7 6 7 4 4 5 4 4 95.6 95.6 95.6 10.952 91 91 0 78.647 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 69.2 95.6 75.8 67 69.2 61.5 95.6 79.1 95.6 59.3 95.6 76.9 67 40.7 40.7 59.3 59.3 59.3 59.3 86.8 85.7 95.6 49.5 27.5 84.6 60.4 84.6 74.7 85.7 74.7 85.7 49.5 56 64.8 49.5 49.5 7982600000 74856000 764930000 471910000 352760000 88298000 87736000 1244600000 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assembly factor BamE bamE sp|P0A937|BAME_ECOLI Outer membrane protein assembly factor BamE OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=bamE PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.7 48.7 48.7 12.302 113 113 0 64.355 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 48.7 48.7 48.7 17.7 48.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 17.7 1238800000 30451000 96044000 42792000 54217000 40078000 25179000 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MS/MS By MS/MS 32.3 51.7 53.7 53.7 61.1 61.1 61.1 45.8 61.1 27.8 49.3 50 53 53.7 53 44.8 26.8 26.1 25.9 38.4 59.1 52.2 66.5 66.5 44.1 34.7 34.7 34.7 49.3 55.4 50 50 50 41.9 34.7 38.2 59036000000 340590000 4075500000 6044500000 7611100000 3499100000 3925700000 637690000 110690000 678450000 72819000 1170700000 3346900000 2750300000 809980000 1172500000 17013000 20888000 25699000 85620000 1022300000 2792400000 3162500000 824000000 2965500000 153510000 39513000 121240000 317480000 1831800000 2494700000 2609600000 1585100000 2581500000 68778000 12358000 58409000 3689800000 21287000 254720000 377780000 475690000 218690000 245360000 39856000 6918200 42403000 4551200 73167000 209180000 171890000 50623000 73280000 1063300 1305500 1606200 5351300 63893000 174530000 197660000 51500000 185340000 9594100 2469600 7577800 19842000 114490000 155920000 163100000 99071000 161340000 4298600 772350 3650600 205 560 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MS/MS By MS/MS 42.9 59.5 58.8 64.5 69.8 69.8 48.8 48.5 56.1 55.8 59.1 59.1 69.8 69.8 69.8 30.9 24.6 38.2 35.9 50.5 69.8 69.8 64.5 64.5 35.5 17.6 18.3 46.2 59.1 59.1 53.8 53.8 59.1 38.9 23.9 31.6 9375000000 25662000 470320000 1034500000 1253900000 395000000 580950000 124900000 45369000 139510000 4274500 101190000 659360000 658030000 41655000 164370000 3792100 2465400 2940800 3481900 31858000 217850000 724720000 21344000 272550000 3668700 1320300 1044000 14801000 100050000 359620000 1328100000 208080000 371460000 2467400 755660 3486900 585930000 1603900 29395000 64658000 78371000 24688000 36309000 7806000 2835600 8719500 267160 6324200 41210000 41127000 2603400 10273000 237010 154080 183800 217620 1991100 13615000 45295000 1334000 17034000 229300 82516 65250 925070 6253000 22476000 83009000 13005000 23216000 154210 47228 217930 112 592 848;3669;6226;7497;10619;11203;13097;18197;20116;20679;20869;26631;26632;26730;31520 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mismatch-specific DNA glycosylase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=mug PE=1 SV=1 1 14 14 14 10 10 9 11 11 10 11 11 11 10 8 9 10 9 10 10 10 10 9 9 8 10 11 9 9 9 9 11 9 10 11 10 12 11 8 9 10 10 9 11 11 10 11 11 11 10 8 9 10 9 10 10 10 10 9 9 8 10 11 9 9 9 9 11 9 10 11 10 12 11 8 9 10 10 9 11 11 10 11 11 11 10 8 9 10 9 10 10 10 10 9 9 8 10 11 9 9 9 9 11 9 10 11 10 12 11 8 9 86.9 86.9 86.9 18.673 168 168 0 312.55 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 81.5 79.8 64.9 81.5 81.5 81.5 79.8 79.8 79.8 79.8 64.9 64.9 79.8 79.8 79.8 67.3 67.3 67.3 73.2 64.9 64.9 79.8 81.5 64.9 73.2 78 78 64.9 64.9 64.9 70.2 64.9 85.1 64.9 50.6 64.9 32204000000 232300000 1581500000 2352700000 4389500000 1299300000 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126953;316698;830860;868888 P0A9H7 P0A9H7 33 33 33 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase cfa sp|P0A9H7|CFA_ECOLI Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cfa PE=1 SV=2 1 33 33 33 18 25 27 28 25 27 20 19 21 18 26 26 26 22 23 17 14 19 16 23 27 27 24 25 17 17 19 15 24 25 23 22 25 19 14 18 18 25 27 28 25 27 20 19 21 18 26 26 26 22 23 17 14 19 16 23 27 27 24 25 17 17 19 15 24 25 23 22 25 19 14 18 18 25 27 28 25 27 20 19 21 18 26 26 26 22 23 17 14 19 16 23 27 27 24 25 17 17 19 15 24 25 23 22 25 19 14 18 78.8 78.8 78.8 43.909 382 382 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 51 71.7 71.7 74.9 67.3 68.3 58.4 54.7 58.4 50.8 70.9 68.3 65.7 57.3 57.1 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FKBP-type 22 kDa peptidyl-prolyl cis-trans isomerase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=fklB PE=1 SV=2 1 12 12 12 9 10 11 11 6 7 8 9 10 7 10 10 10 6 9 7 10 7 6 10 8 11 8 7 9 9 10 9 9 10 11 9 10 9 5 11 9 10 11 11 6 7 8 9 10 7 10 10 10 6 9 7 10 7 6 10 8 11 8 7 9 9 10 9 9 10 11 9 10 9 5 11 9 10 11 11 6 7 8 9 10 7 10 10 10 6 9 7 10 7 6 10 8 11 8 7 9 9 10 9 9 10 11 9 10 9 5 11 45.6 45.6 45.6 22.216 206 206 0 74.339 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 36.4 44.2 45.6 45.6 31.1 31.1 32 43.2 40.3 32.5 44.7 44.7 44.7 28.6 44.2 35 44.7 35 30.6 44.7 40.8 45.6 32.5 32 33 41.3 39.3 39.3 39.3 44.7 45.6 44.7 44.7 32.5 25.2 44.7 6253500000 105790000 568810000 551230000 891800000 45505000 91937000 377360000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 47.7 47.7 55 55 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 33.9 47.7 47.7 19.3 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 33 47.7 47.7 47.7 47.7 47.7 33.9 47.7 109240000 0 0 42785000 66456000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15606000 0 0 6112100 9493800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 655 6057;10467;13835;18576;20802 True;True;True;True;True 8031;13851;13852;18608;18609;18610;25289;25290;28247;28248;28249 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sp|P0AA39|RLUC_ECOLI Ribosomal large subunit pseudouridine synthase C OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rluC PE=1 SV=1 1 14 14 14 8 7 4 5 10 12 12 11 11 10 11 7 8 9 7 12 11 10 10 10 7 6 9 7 12 12 11 11 9 9 6 9 7 13 12 12 8 7 4 5 10 12 12 11 11 10 11 7 8 9 7 12 11 10 10 10 7 6 9 7 12 12 11 11 9 9 6 9 7 13 12 12 8 7 4 5 10 12 12 11 11 10 11 7 8 9 7 12 11 10 10 10 7 6 9 7 12 12 11 11 9 9 6 9 7 13 12 12 40.1 40.1 40.1 36.026 319 319 0 54.449 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25.7 20.1 11 14.1 29.8 39.2 37.3 33.9 33.9 31.7 33.9 21.3 26 27.6 22.6 37.3 33.9 29.8 29.8 31.3 20.4 17.9 27.6 19.1 37.3 37.3 33.9 35.1 27.6 27.6 21 27.6 20.4 39.2 37.3 35.1 4729000000 88738000 330040000 189610000 239800000 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OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=codB PE=1 SV=1 1 10 10 10 8 8 7 6 10 8 9 9 9 10 10 7 7 8 8 9 9 9 8 9 6 6 8 6 8 8 8 9 8 5 6 8 7 9 8 8 8 8 7 6 10 8 9 9 9 10 10 7 7 8 8 9 9 9 8 9 6 6 8 6 8 8 8 9 8 5 6 8 7 9 8 8 8 8 7 6 10 8 9 9 9 10 10 7 7 8 8 9 9 9 8 9 6 6 8 6 8 8 8 9 8 5 6 8 7 9 8 8 12.6 12.6 12.6 43.649 419 419 0 243.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 12.4 12.4 12.2 11.9 12.6 12.4 12.4 12.4 12.4 12.6 12.6 12.2 12.2 12.4 12.4 12.4 12.4 12.4 12.2 12.4 11.9 11.9 12.4 11.9 12.2 12.2 12.2 12.4 12.4 11.7 11.9 12.4 12.2 12.4 12.2 12.2 85373000000 5010400000 8177500000 1425000000 866020000 3106800000 665840000 9306700000 6005400000 10897000000 1866900000 1761300000 794970000 432310000 664420000 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L,D-transpeptidase YafK OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yafK PE=3 SV=1 1 7 7 7 4 4 2 3 1 3 5 4 6 5 4 3 4 3 4 5 4 5 5 4 5 4 2 4 5 5 5 3 5 4 4 4 4 5 4 6 4 4 2 3 1 3 5 4 6 5 4 3 4 3 4 5 4 5 5 4 5 4 2 4 5 5 5 3 5 4 4 4 4 5 4 6 4 4 2 3 1 3 5 4 6 5 4 3 4 3 4 5 4 5 5 4 5 4 2 4 5 5 5 3 5 4 4 4 4 5 4 6 34.1 34.1 34.1 28.021 246 246 0 45.603 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 22 20.3 12.6 17.5 4.9 17.5 26 17.5 29.3 26.8 22.4 16.3 20.3 15.4 20.3 26 17.5 26 26 20.3 26 20.3 6.9 20.3 26 26 26 16.3 25.2 22 20.3 22 20.3 26 20.3 29.3 1649600000 23464000 163050000 49868000 170720000 8858400 43549000 62507000 35003000 80639000 6428200 37471000 38224000 72001000 6167400 21922000 6877400 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 66.1 63.3 63.9 66.1 67 69.1 69.1 69.1 69.1 65.1 57.8 57.8 61.5 69.1 69.1 58.1 46.8 51.7 52.6 62.1 67 65.4 62.1 69.1 62.1 62.1 69.1 58.1 55 55 55 56 55 48 51.1 53.2 63023000000 1139000000 4061600000 2818200000 6425100000 3091200000 3355500000 2665500000 2434600000 3640200000 305010000 1215600000 2914600000 3487300000 637800000 1293000000 256510000 379310000 237700000 241250000 624750000 1564500000 3907300000 444430000 2259700000 607050000 321340000 501140000 539470000 1737400000 1855200000 3493600000 1128100000 2508300000 409440000 156770000 365670000 3317000000 59950000 213770000 148330000 338160000 162690000 176600000 140290000 128130000 191590000 16053000 63979000 153400000 183540000 33568000 68051000 13501000 19964000 12511000 12697000 32881000 82341000 205650000 23391000 118930000 31950000 16912000 26376000 28393000 91444000 97641000 183870000 59373000 132010000 21549000 8251300 19246000 482 691 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.2 5.2 13.9 5.2 5.2 5.2 5.2 5.2 5.2 5.2 13.9 5.2 5.2 13.9 13.9 5.2 13.9 5.2 5.2 5.2 13.9 5.2 5.2 5.2 13.9 5.2 13.9 13.9 13.9 5.2 5.2 13.9 5.2 13.9 5.2 13.9 1296000000 14293000 55213000 270640000 60455000 18570000 27212000 80924000 13803000 62078000 0 24692000 23699000 25977000 6943700 14836000 2042000 3790200 2711800 5227600 59796000 147550000 112220000 6945000 16849000 24756000 3556100 23096000 18848000 47701000 24774000 36249000 17347000 21918000 11226000 0 10034000 185140000 2041900 7887600 38662000 8636400 2652900 3887500 11561000 1971800 8868300 0 3527400 3385600 3711100 991960 2119400 291710 541450 387400 746800 8542300 21078000 16032000 992140 2407000 3536600 508020 3299500 2692500 6814500 3539100 5178400 2478100 3131200 1603800 0 1433400 37 734 18804;26535 True;True 25593;36081 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 30 30 0 9.9 30 23.5 30 23.5 30 29.6 30 26.3 26.3 36.2 23.5 23.5 36.2 36.2 29.6 36.2 23.5 26.3 36.2 13.6 36.2 36.2 36.2 29.6 29.6 23.5 6.6 23.5 23.5 30 19.7 29.6 2021000000 55032000 173680000 0 21636000 85375000 46093000 272670000 61882000 322820000 11300000 87220000 69547000 51524000 20829000 13411000 8688200 20873000 17177000 21121000 54547000 39772000 77141000 17990000 16882000 80213000 29633000 65251000 47506000 45830000 27358000 10892000 21073000 28602000 46795000 14395000 36204000 252620000 6879000 21710000 0 2704500 10672000 5761700 34084000 7735200 40353000 1412500 10902000 8693400 6440500 2603700 1676400 1086000 2609100 2147200 2640200 6818300 4971500 9642600 2248700 2110200 10027000 3704200 8156400 5938300 5728700 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 51.3 68.8 74.9 69.4 57.9 57.9 61.6 57.9 57.9 47.1 51.3 46.5 44.6 53.2 51.3 37.9 37.9 37.9 40.4 63.8 58.2 59.9 51.5 57.9 49.3 42.6 51.5 42.3 49.6 51.5 46.5 46.2 44 44 31.2 33.1 42578000000 147190000 3480700000 4270700000 5390700000 924110000 1306100000 1797700000 303650000 1646000000 36357000 982270000 2338700000 2008300000 273430000 469960000 18122000 29977000 39961000 91096000 1052700000 1830800000 2406000000 240720000 1044700000 387830000 47587000 336840000 290480000 1960600000 2488900000 2436800000 726480000 1447700000 161180000 5340500 158620000 2661200000 9199600 217540000 266920000 336920000 57757000 81634000 112350000 18978000 102880000 2272300 61392000 146170000 125520000 17089000 29373000 1132600 1873600 2497600 5693500 65795000 114430000 150380000 15045000 65292000 24240000 2974200 21053000 18155000 122530000 155560000 152300000 45405000 90484000 10074000 333780 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coli (strain K12) OX=83333 GN=bfr PE=1 SV=1 1 13 13 13 10 12 12 12 13 13 10 11 11 11 11 12 13 13 13 11 7 9 6 12 13 13 13 13 9 5 9 11 10 13 12 13 13 10 8 10 10 12 12 12 13 13 10 11 11 11 11 12 13 13 13 11 7 9 6 12 13 13 13 13 9 5 9 11 10 13 12 13 13 10 8 10 10 12 12 12 13 13 10 11 11 11 11 12 13 13 13 11 7 9 6 12 13 13 13 13 9 5 9 11 10 13 12 13 13 10 8 10 74.7 74.7 74.7 18.495 158 158 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 69.6 74.7 74.7 74.7 74.7 74.7 69.6 74.7 74.7 70.3 74.7 74.7 74.7 74.7 74.7 74.7 55.7 72.8 48.7 74.7 74.7 74.7 74.7 74.7 67.7 46.2 67.7 74.7 65.2 74.7 74.7 74.7 74.7 69.6 67.7 69.6 3884200000 10266000 0 237990000 589780000 206420000 531990000 14384000 4757100 22163000 3997100 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 59.9 69.9 63.6 72.1 63 78.1 78.1 78.1 75.5 54.9 69.9 69.9 67.4 60.8 63.9 58.6 58.6 55.5 43.6 78.1 63.9 72.1 68.3 78.1 71.5 60.2 63.9 60.2 69.9 69.9 69.9 69.9 69.9 65.5 39.5 54.2 34814000000 227320000 2744900000 2908500000 6339200000 694710000 2121800000 1215600000 530580000 1200200000 91642000 716310000 1667300000 1403300000 181320000 465440000 124330000 92407000 60582000 69088000 437450000 840650000 1625000000 186290000 917960000 191270000 96323000 103680000 216220000 790150000 1228600000 2901700000 591320000 1499500000 206210000 31521000 95079000 1832300000 11964000 144470000 153080000 333640000 36564000 111670000 63980000 27925000 63169000 4823300 37700000 87755000 73857000 9543000 24497000 6543600 4863500 3188500 3636200 23024000 44245000 85526000 9804500 48314000 10067000 5069600 5456800 11380000 41587000 64662000 152720000 31122000 78923000 10853000 1659000 5004200 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 11.4 9.7 5.3 3.4 11.4 7.2 11.4 11.4 11.4 11.4 9.7 6.3 3.9 8.9 9.7 11.4 11.4 11.4 11.4 7.2 3.9 7.2 9.7 4.3 11.4 11.4 11.4 8.9 7.2 1.9 6.5 7.2 5.3 11.4 11.4 11.4 2459900000 184590000 253080000 74641000 82049000 110730000 40203000 235940000 142740000 267470000 29258000 45725000 23406000 15059000 15559000 22842000 36180000 30396000 27803000 44042000 22393000 9480400 50769000 12637000 11644000 55981000 32899000 44779000 54081000 55875000 4658800 286290000 25261000 14377000 42617000 14876000 39604000 153750000 11537000 15818000 4665100 5128000 6920500 2512700 14746000 8921100 16717000 1828600 2857800 1462900 941190 972470 1427600 2261300 1899800 1737700 2752600 1399600 592520 3173100 789790 727730 3498800 2056200 2798700 3380100 3492200 291180 17893000 1578800 898540 2663600 929740 2475200 104 774 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synthase A cysK sp|P0ABK5|CYSK_ECOLI Cysteine synthase A OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cysK PE=1 SV=2 1 27 27 27 21 24 25 25 24 24 23 21 23 21 23 24 24 23 23 22 16 21 17 20 23 23 24 25 21 21 22 20 22 23 24 23 23 20 20 21 21 24 25 25 24 24 23 21 23 21 23 24 24 23 23 22 16 21 17 20 23 23 24 25 21 21 22 20 22 23 24 23 23 20 20 21 21 24 25 25 24 24 23 21 23 21 23 24 24 23 23 22 16 21 17 20 23 23 24 25 21 21 22 20 22 23 24 23 23 20 20 21 87.9 87.9 87.9 34.489 323 323 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 84.2 86.4 86.4 86.4 86.4 86.1 86.1 85.4 86.1 85.4 86.1 86.4 86.4 87 86.1 85.4 70.3 85.4 73.7 81.1 86.1 86.1 86.4 86.4 81.1 82 85.4 81.1 85.4 85.8 85.8 85.4 85.4 85.4 84.8 85.4 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protection during starvation protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=dps PE=1 SV=2 1 22 22 22 17 20 20 19 18 19 19 19 19 19 20 20 20 19 19 18 18 18 16 18 19 19 17 18 17 17 18 19 21 20 20 18 19 18 19 19 17 20 20 19 18 19 19 19 19 19 20 20 20 19 19 18 18 18 16 18 19 19 17 18 17 17 18 19 21 20 20 18 19 18 19 19 17 20 20 19 18 19 19 19 19 19 20 20 20 19 19 18 18 18 16 18 19 19 17 18 17 17 18 19 21 20 20 18 19 18 19 19 91.6 91.6 91.6 18.695 167 167 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 89.2 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 85.6 85.6 85.6 83.2 91.6 91.6 91.6 89.2 91.6 89.2 85.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 91.6 85.6 91.6 91.6 124870000000 3136800000 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sp|P0AC33|FUMA_ECOLI Fumarate hydratase class I, aerobic OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=fumA PE=1 SV=2 1 41 41 26 15 19 33 35 38 41 29 21 28 19 20 30 35 34 37 14 17 16 15 18 35 37 34 38 18 16 21 18 17 28 29 29 32 17 11 17 15 19 33 35 38 41 29 21 28 19 20 30 35 34 37 14 17 16 15 18 35 37 34 38 18 16 21 18 17 28 29 29 32 17 11 17 6 10 19 21 23 26 20 13 19 12 13 20 22 20 23 7 10 9 8 10 20 22 19 23 9 8 10 8 9 18 19 19 22 10 5 9 86.5 86.5 55.7 60.298 548 548 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31 46 79.7 81.2 80.7 86.5 73.2 44.9 67.2 41.8 46.4 70.4 78.1 79.2 83.4 27.6 36.1 31.9 30.3 40.5 77.4 80.7 78.6 80.7 37.2 34.3 44.7 40.9 35.4 61.7 67.7 65.9 67.3 36.3 25.4 37.6 60898000000 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Glutaredoxin-like protein NrdH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=nrdH PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 4 4 1 3 1 3 1 2 4 4 3 2 3 1 1 1 1 3 4 4 2 3 1 1 1 2 4 4 4 3 3 1 1 1 2 4 4 4 1 3 1 3 1 2 4 4 3 2 3 1 1 1 1 3 4 4 2 3 1 1 1 2 4 4 4 3 3 1 1 1 2 4 4 4 1 3 1 3 1 2 4 4 3 2 3 1 1 1 1 3 4 4 2 3 1 1 1 2 4 4 4 3 3 1 1 1 64.2 64.2 64.2 9.1394 81 81 0 44.163 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 37 64.2 64.2 64.2 12.3 64.2 12.3 37 12.3 37 64.2 64.2 37 37 64.2 12.3 12.3 12.3 12.3 37 64.2 64.2 39.5 64.2 12.3 12.3 12.3 37 64.2 64.2 64.2 37 64.2 12.3 12.3 12.3 1438500000 14691000 124070000 157770000 146140000 24315000 77279000 11284000 10413000 2986400 3927500 44101000 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MS/MS By MS/MS 36.5 53.4 46.2 53.4 53.4 53.4 45.7 42.3 45.7 36.5 38.5 46.2 53.4 44.2 52.9 28.8 28.8 28.4 25 38 46.2 53.4 45.7 53.4 52.9 36.1 45.7 38 38 38.5 38.5 38 38.5 28.8 28.4 37.5 54166000000 233460000 3795700000 4693300000 9212800000 1922700000 4077300000 370540000 118230000 392530000 49507000 886310000 2543600000 3373700000 371470000 1224700000 16235000 39476000 14977000 47365000 486910000 1689400000 3370000000 327450000 2831100000 85817000 43292000 67915000 221460000 1311700000 2136400000 4290700000 935870000 2904500000 34266000 15202000 30223000 4166600000 17959000 291980000 361020000 708670000 147900000 313640000 28503000 9094600 30194000 3808300 68178000 195660000 259520000 28575000 94207000 1248800 3036600 1152100 3643500 37455000 129960000 259230000 25188000 217780000 6601300 3330100 5224200 17035000 100900000 164340000 330050000 71990000 223420000 2635900 1169400 2324800 195 841 5046;5854;10443;20888;26736;26737;30888;33181;34944;35107;35108;35641 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MS/MS 55 67.1 67.1 67.1 67.1 67.1 61.6 55 60.5 55 55 67.1 67.1 55 64 41.1 42.6 32.2 28.7 67.1 67.1 67.1 61.6 67.1 40.7 31.8 55 61.6 61.6 61.6 61.6 61.6 61.6 45 29.1 45 21813000000 212490000 2583400000 2341100000 3277500000 484960000 932840000 149440000 153840000 161910000 31392000 495440000 909270000 905340000 152670000 339610000 16521000 12027000 10135000 18273000 373350000 936470000 1273900000 78952000 382150000 28041000 8779500 28387000 139220000 967320000 1352700000 1668400000 401180000 927000000 27325000 7587600 24452000 1454200000 14166000 172220000 156080000 218500000 32331000 62189000 9962700 10256000 10794000 2092800 33029000 60618000 60356000 10178000 22640000 1101400 801770 675670 1218200 24890000 62431000 84924000 5263500 25477000 1869400 585300 1892500 9281000 64488000 90179000 111220000 26746000 61800000 1821700 505840 1630200 294 870 7335;7336;11304;12552;14282;16219;17457;18379;20320;20565;20566;24796;26746;28093;31361;35686 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repressor/activator cra sp|P0ACP1|CRA_ECOLI Catabolite repressor/activator OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cra PE=1 SV=1 1 16 16 16 14 11 11 13 14 13 11 14 14 11 11 13 13 10 10 12 12 9 8 10 13 9 10 10 10 8 9 10 12 11 13 15 10 9 6 11 14 11 11 13 14 13 11 14 14 11 11 13 13 10 10 12 12 9 8 10 13 9 10 10 10 8 9 10 12 11 13 15 10 9 6 11 14 11 11 13 14 13 11 14 14 11 11 13 13 10 10 12 12 9 8 10 13 9 10 10 10 8 9 10 12 11 13 15 10 9 6 11 50.3 50.3 50.3 37.999 334 334 0 134.75 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 50.3 42.8 42.8 50.3 50.3 47.9 44.3 50.3 50.3 40.7 43.1 47 41.9 40.7 39.5 44.3 38.6 32.9 27.2 36.5 49.4 33.5 35 31.4 32.9 27.2 27.2 40.7 45.5 43.1 41.9 50.3 40.7 32.6 21.9 39.8 14283000000 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37 37 Pyruvate kinase I pykF sp|P0AD61|KPYK1_ECOLI Pyruvate kinase I OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pykF PE=1 SV=1 1 37 37 37 24 31 32 33 32 35 30 24 29 23 28 33 34 29 32 22 19 19 22 27 33 34 31 32 27 22 25 24 27 29 28 28 29 25 14 24 24 31 32 33 32 35 30 24 29 23 28 33 34 29 32 22 19 19 22 27 33 34 31 32 27 22 25 24 27 29 28 28 29 25 14 24 24 31 32 33 32 35 30 24 29 23 28 33 34 29 32 22 19 19 22 27 33 34 31 32 27 22 25 24 27 29 28 28 29 25 14 24 79.8 79.8 79.8 50.729 470 470 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 61.7 69.8 69.8 73.4 76.6 79.1 74.7 67 74.7 59.8 69.8 70.4 74 69.4 74.3 56.4 45.1 43.4 54 68.7 75.3 74.3 73.4 73.4 63.4 58.7 58.3 61.1 67.7 73.2 68.7 68.7 69.6 62.8 35.7 59.8 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P0ADA1 P0ADA1 9 9 9 Acyl-CoA thioesterase I tesA sp|P0ADA1|TESA_ECOLI Thioesterase 1/protease 1/lysophospholipase L1 OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=tesA PE=1 SV=1 1 9 9 9 0 0 0 2 1 1 6 3 6 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 5 2 4 1 0 1 0 0 0 5 1 3 0 0 0 2 1 1 6 3 6 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 5 2 4 1 0 1 0 0 0 5 1 3 0 0 0 2 1 1 6 3 6 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 5 2 4 1 0 1 0 0 0 5 1 3 51 51 51 23.622 208 208 0 86.825 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0 0 0 11.5 3.8 3.8 37 17.3 37 0 3.8 0 0 0 0 5.8 0 5.3 0 5.8 0 0 0 0 29.3 11.5 24 5.8 0 6.7 0 0 0 29.3 5.3 20.2 266690000 0 0 0 52545000 12903000 0 58892000 11259000 59241000 0 7547700 0 0 0 0 483010 0 1414900 0 1905700 0 0 0 0 17711000 1446000 12881000 1868900 0 14862000 0 0 0 8201300 261970 3265800 17779000 0 0 0 3503000 860170 0 3926100 750610 3949400 0 503180 0 0 0 0 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By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 6.6 36.7 33.2 48 54.6 54.1 11.2 11.2 11.2 11.7 40.8 28.1 30.1 49.5 49.5 0 6.6 4.1 9.2 30.1 48.5 47.4 45.9 54.1 11.2 4.6 4.6 21.4 28.1 40.8 36.7 40.8 40.8 11.2 6.6 11.2 1990100000 0 100020000 76648000 174980000 97005000 144140000 0 0 0 559000 26461000 131730000 79224000 41708000 79392000 0 0 1416800 3404900 16003000 78256000 113440000 37085000 198330000 0 0 0 3830000 42887000 118330000 218810000 77701000 128700000 0 0 0 165840000 0 8334600 6387300 14582000 8083700 12012000 0 0 0 46583 2205100 10978000 6602000 3475600 6616000 0 0 118060 283740 1333600 6521300 9453500 3090500 16527000 0 0 0 319160 3574000 9860900 18234000 6475100 10725000 0 0 0 41 951 3677;6366;13986;14827;14828;17126;21126;26059;26133;28047;31376;32579 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4984;4985;8438;18874;18875;20222;20223;20224;23327;28810;35434;35522;37983;42437;42438;44001 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entB sp|P0ADI4|ENTB_ECOLI Enterobactin synthase component B OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=entB PE=1 SV=1 1 20 20 20 16 19 18 17 17 15 17 17 16 15 19 16 16 12 14 15 12 15 11 15 17 16 15 14 14 13 13 15 18 16 17 14 14 16 14 14 16 19 18 17 17 15 17 17 16 15 19 16 16 12 14 15 12 15 11 15 17 16 15 14 14 13 13 15 18 16 17 14 14 16 14 14 16 19 18 17 17 15 17 17 16 15 19 16 16 12 14 15 12 15 11 15 17 16 15 14 14 13 13 15 18 16 17 14 14 16 14 14 63.5 63.5 63.5 32.554 285 285 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 61.1 63.5 63.5 52.6 61.1 60 62.1 62.1 61.1 52.6 62.1 53.7 53.7 51.6 52.6 52.6 45.3 52.6 40 51.6 62.1 61.1 60 60 60 51.6 51.6 52.6 62.1 53.7 62.1 52.6 52.6 52.6 52.6 52.6 112520000000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching 38.3 34 36.7 55.9 40.4 55.9 40.4 27.7 40.4 14.4 33 40.4 55.9 40.4 54.8 10.6 3.7 5.3 15.4 33 33 34 39.4 54.8 13.8 5.3 8.5 39.4 39.4 40.4 40.4 40.4 39.4 34 9 6.4 9304900000 26693000 531370000 800920000 1585100000 321250000 794880000 69877000 9755800 79635000 5948700 93325000 452770000 612190000 58342000 194150000 1316200 1352800 790770 3037400 78639000 184260000 479410000 50710000 625960000 8449200 979550 6578700 36114000 261480000 484520000 865340000 160950000 412330000 4994200 745690 656740 1033900000 2965900 59041000 88992000 176130000 35695000 88320000 7764100 1084000 8848300 660970 10369000 50308000 68021000 6482400 21573000 146250 150320 87863 337490 8737600 20474000 53268000 5634400 69551000 938800 108840 730970 4012600 29054000 53836000 96149000 17883000 45814000 554910 82854 72971 127 953 2902;9015;20963;25169;29246;31205;32566;33228;33984 True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.6 50.5 53.6 55.5 57.7 60.4 39.9 18.6 45.9 22.7 37.7 53.8 59.3 33.9 52.2 20.2 15.6 15.6 18.6 26.2 48.9 46.4 39.6 45.9 24.3 18.6 24.3 23 37.2 36.3 44.3 33.9 37.4 16.4 13.1 20.5 9737200000 53129000 609860000 839120000 1717600000 388310000 912070000 120150000 36566000 114020000 9504600 85188000 487220000 575190000 69674000 202520000 6430400 3806100 4050800 13859000 61095000 301440000 565680000 71405000 541860000 46601000 6772300 37095000 32799000 226380000 303120000 698260000 184030000 352250000 32912000 2117400 25123000 540960000 2951600 33881000 46618000 95422000 21573000 50670000 6675200 2031400 6334700 528030 4732600 27068000 31955000 3870800 11251000 357240 211450 225050 769960 3394200 16747000 31427000 3966900 30103000 2588900 376240 2060800 1822200 12577000 16840000 38792000 10224000 19570000 1828400 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 46.5 59.5 45.4 61.9 65.9 61 47.6 54 62.1 33.5 50.7 62.1 61.9 50.7 50.9 31.9 33.9 33.3 44.7 47.8 59.7 59.9 54.6 53.1 43.8 40.5 44.1 46.9 40.3 47.1 56.2 52.2 52.2 35.5 32.4 37 40553000000 364430000 2008000000 3387400000 7381000000 1653300000 2768400000 707260000 391030000 757200000 66532000 522740000 1819000000 2626300000 310050000 850580000 52823000 80616000 42844000 56916000 339060000 1363700000 2553900000 240450000 1832300000 105360000 54049000 105320000 177730000 711030000 1429700000 3015700000 776810000 1803500000 103570000 22453000 72193000 1689700000 15185000 83666000 141140000 307540000 68888000 115350000 29469000 16293000 31550000 2772200 21781000 75790000 109430000 12919000 35441000 2201000 3359000 1785100 2371500 14128000 56820000 106410000 10019000 76347000 4389800 2252000 4388400 7405500 29626000 59573000 125650000 32367000 75147000 4315300 935540 3008000 509 970 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 46.8 56 71.6 71.6 76.1 50.5 50.5 50.5 50.5 46.8 55 55 55 55 55 67.9 50.5 50.5 46.8 76.1 55 76.1 71.6 55 46.8 46.8 46.8 76.1 56 72.5 55 71.6 50.5 46.8 55 46.8 10679000000 44757000 893260000 1129300000 1463100000 357910000 819520000 109600000 75885000 132720000 11106000 189260000 496860000 487330000 76189000 215150000 14458000 9343100 8273200 11148000 148240000 355080000 647250000 107130000 480560000 22986000 12787000 26416000 74414000 350220000 459110000 726060000 181630000 504400000 15924000 6970400 14774000 1779900000 7459600 148880000 188220000 243860000 59651000 136590000 18267000 12647000 22120000 1851000 31543000 82809000 81221000 12698000 35858000 2409700 1557200 1378900 1857900 24707000 59180000 107870000 17855000 80094000 3830900 2131200 4402600 12402000 58371000 76519000 121010000 30272000 84066000 2654000 1161700 2462300 102 971 3978;3979;5523;21049;21050;21490;27532;31028;34301 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS 13.7 19.7 29.9 27.8 25.4 29.9 29.9 19.1 29.9 10.7 24.2 29.9 29.9 26.6 37.6 13.4 8.1 5.7 4.5 13.1 29.9 21.8 15.5 27.5 4.5 9.9 9.9 15.5 20.6 28.7 31.9 26.6 28.7 13.1 4.5 17.6 5181100000 45032000 217720000 517850000 720840000 228980000 307920000 134830000 32018000 148920000 10559000 86781000 349360000 337800000 54104000 126270000 5872000 5420300 5142300 795640 29200000 183870000 283200000 31331000 162890000 2674100 4481100 13680000 27490000 86078000 205760000 431970000 123360000 236710000 11581000 949250 9658200 398550000 3464000 16748000 39834000 55449000 17614000 23686000 10372000 2462900 11456000 812230 6675400 26874000 25985000 4161900 9713000 451700 416940 395560 61203 2246200 14144000 21785000 2410100 12530000 205700 344700 1052300 2114600 6621400 15828000 33229000 9489600 18208000 890820 73019 742940 114 981 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582609;602653;677813;825409;892105 P0ADX9 P0ADX9 8 8 8 Ribosomal RNA small subunit methyltransferase D rsmD sp|P0ADX9|RSMD_ECOLI Ribosomal RNA small subunit methyltransferase D OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rsmD PE=1 SV=1 1 8 8 8 4 6 4 4 7 6 6 6 7 5 6 7 6 8 8 5 5 6 4 5 6 6 5 7 4 3 3 3 6 8 4 7 7 4 3 4 4 6 4 4 7 6 6 6 7 5 6 7 6 8 8 5 5 6 4 5 6 6 5 7 4 3 3 3 6 8 4 7 7 4 3 4 4 6 4 4 7 6 6 6 7 5 6 7 6 8 8 5 5 6 4 5 6 6 5 7 4 3 3 3 6 8 4 7 7 4 3 4 39.9 39.9 39.9 21.677 198 198 0 32.924 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.7 32.3 21.7 18.2 39.4 35.4 31.8 35.9 39.4 28.3 35.9 35.9 32.3 39.9 39.9 28.3 28.3 35.9 20.7 28.3 35.9 29.8 24.7 35.9 20.7 18.2 16.7 16.7 32.3 39.9 22.2 35.9 35.9 22.2 14.6 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 57.2 73.3 69.5 69.5 73.3 69.5 69.5 57.2 69.5 61 73.3 69.5 69.5 57.2 69.5 56.1 51.9 57.2 56.1 73.3 73.3 69.5 69.5 69.5 57.2 57.2 57.2 73.3 73.3 73.3 73.3 73.3 69.5 51.9 48.7 57.2 119450000000 706530000 12939000000 12336000000 12135000000 4055600000 4426100000 6123000000 883050000 6112600000 123660000 3009800000 7697900000 5427700000 752140000 935730000 40969000 87887000 74164000 162920000 1955500000 5218000000 5743300000 770070000 2716100000 931270000 170020000 1011900000 586260000 4289000000 6447000000 6925200000 1999100000 2146500000 339020000 15614000 152320000 11945000000 70653000 1293900000 1233600000 1213500000 405560000 442610000 612300000 88305000 611260000 12366000 300980000 769790000 542770000 75214000 93573000 4096900 8788700 7416400 16292000 195550000 521800000 574330000 77007000 271610000 93127000 17002000 101190000 58626000 428900000 644700000 692520000 199910000 214650000 33902000 1561400 15232000 355 996 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coli (strain K12) OX=83333 GN=artQ PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 16.8 16.8 16.8 26.217 238 238 0 66.317 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 13.4 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 16.8 7641900000 238850000 487000000 655990000 658780000 675010000 179580000 320360000 291600000 560580000 37479000 91367000 519100000 281250000 91152000 96757000 37813000 52766000 34688000 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(strain K12) OX=83333 GN=astA PE=2 SV=1 1 5 5 5 2 3 2 2 3 2 2 1 1 3 2 2 3 2 3 2 3 3 2 2 3 4 2 3 2 2 0 2 3 2 3 2 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 2 1 1 3 2 2 3 2 3 2 3 3 2 2 3 4 2 3 2 2 0 2 3 2 3 2 3 2 3 2 2 3 2 2 3 2 2 1 1 3 2 2 3 2 3 2 3 3 2 2 3 4 2 3 2 2 0 2 3 2 3 2 3 2 3 2 19.8 19.8 19.8 38.455 344 344 0 29.975 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching 8.7 13.7 6.1 6.1 12.2 8.7 8.4 3.5 3.5 13.7 8.7 8.7 13.7 8.7 13.7 8.7 13.7 13.7 8.7 8.7 13.7 17.2 8.7 13.7 8.7 8.7 0 8.7 13.7 8.7 12.2 8.7 12.2 8.7 13.7 8.7 822410000 5642600 117480000 54486000 75301000 15929000 30803000 7153500 1938100 3527800 2017400 20125000 23870000 56238000 2870000 16996000 1166100 1334100 1454600 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family protein YtfP ytfP sp|P0AE48|YTFP_ECOLI Gamma-glutamylcyclotransferase family protein YtfP OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ytfP PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 4 3 4 3 4 2 4 1 3 3 2 3 2 1 2 2 1 3 3 2 3 2 1 2 1 2 2 4 3 3 3 2 1 2 2 4 4 3 4 3 4 2 4 1 3 3 2 3 2 1 2 2 1 3 3 2 3 2 1 2 1 2 2 4 3 3 3 2 1 2 2 4 4 3 4 3 4 2 4 1 3 3 2 3 2 1 2 2 1 3 3 2 3 2 1 2 1 2 2 4 3 3 3 2 1 2 49.6 49.6 49.6 12.866 113 113 0 45.474 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 22.1 49.6 49.6 38.1 49.6 38.1 49.6 31 49.6 10.6 42.5 42.5 31 42.5 31 10.6 22.1 22.1 11.5 42.5 42.5 31 42.5 31 10.6 22.1 10.6 31 31 49.6 38.1 42.5 38.1 22.1 11.5 22.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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P0AEE5 21 21 21 D-galactose-binding periplasmic protein mglB sp|P0AEE5|DGAL_ECOLI D-galactose-binding periplasmic protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=mglB PE=1 SV=1 1 21 21 21 2 1 2 1 1 1 17 8 19 2 1 0 0 0 0 1 0 2 4 1 0 1 1 1 18 3 15 7 1 0 1 0 1 11 0 10 2 1 2 1 1 1 17 8 19 2 1 0 0 0 0 1 0 2 4 1 0 1 1 1 18 3 15 7 1 0 1 0 1 11 0 10 2 1 2 1 1 1 17 8 19 2 1 0 0 0 0 1 0 2 4 1 0 1 1 1 18 3 15 7 1 0 1 0 1 11 0 10 65.1 65.1 65.1 35.712 332 332 0 177.6 By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6 2.1 4.5 2.4 2.1 2.1 59.6 28.3 62.3 4.8 2.1 0 0 0 0 2.7 0 6.3 10.5 2.1 0 3.3 2.1 3.6 60.2 8.1 46.1 25.6 2.1 0 2.1 0 2.1 41 0 38.3 1364100000 665490 0 33576000 10751000 0 0 576330000 23347000 467190000 746150 0 0 0 0 0 1174100 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 56.6 67.2 67.2 64.3 67.2 67.2 67.2 64.3 67.2 59.4 67.2 67.2 64.3 64.3 64.3 59.4 49.2 49.2 48.8 67.2 64.3 64.3 67.2 64.3 67.2 56.6 67.2 67.2 67.2 64.3 64.3 64.3 64.3 67.2 34 64.3 237790000 0 0 52382000 0 25009000 11760000 27614000 0 30000000 1551900 17958000 20092000 0 0 0 1220500 0 0 0 4124800 0 0 5278500 0 7072700 0 0 7569700 22293000 0 0 0 0 3859400 0 0 21617000 0 0 4762000 0 2273500 1069100 2510400 0 2727300 141080 1632600 1826500 0 0 0 110950 0 0 0 374980 0 0 479860 0 642980 0 0 688150 2026600 0 0 0 0 350860 0 0 11 1056 643;1130;1157;1406;2091;10510;10727;12999;13929;14613;20902;32760 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 865;1516;1517;1555;1556;1901;1902;2888;13924;13925;13926;14222;14223;14224;14225;17286;17287;18769;18770;18771;18772;19905;19906;28453;28454;28455;28456;44282;44283;44284 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UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=galU PE=1 SV=2 1 15 15 15 10 13 12 13 13 14 14 13 14 10 11 11 11 13 12 11 9 10 10 12 12 15 14 13 11 12 11 10 10 11 12 13 13 11 9 9 10 13 12 13 13 14 14 13 14 10 11 11 11 13 12 11 9 10 10 12 12 15 14 13 11 12 11 10 10 11 12 13 13 11 9 9 10 13 12 13 13 14 14 13 14 10 11 11 11 13 12 11 9 10 10 12 12 15 14 13 11 12 11 10 10 11 12 13 13 11 9 9 64.6 64.6 64.6 32.942 302 302 0 240.11 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 44.4 55 48 55 57 63.9 63.9 55 63.9 34.8 43.7 41.1 41.1 55 48 41.7 30.5 34.8 34.8 48.7 48 64.6 55.6 55 45.7 48.7 41.7 41.7 34.8 41.1 48 48.7 55 41.7 30.5 31.8 32429000000 636880000 2090300000 2168600000 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synthetase/amidase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=gss PE=1 SV=1 1 26 26 26 7 21 20 18 19 20 15 11 15 6 14 19 20 14 18 6 6 8 8 20 22 20 16 23 10 7 9 12 16 18 17 17 17 4 4 8 7 21 20 18 19 20 15 11 15 6 14 19 20 14 18 6 6 8 8 20 22 20 16 23 10 7 9 12 16 18 17 17 17 4 4 8 7 21 20 18 19 20 15 11 15 6 14 19 20 14 18 6 6 8 8 20 22 20 16 23 10 7 9 12 16 18 17 17 17 4 4 8 51.2 51.2 51.2 70.531 619 619 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 14.5 43.8 41.4 40.9 40.1 43.1 33 24.2 32.3 13.1 32.5 42.5 42.8 30.7 39.6 12.8 13.2 16.5 16.2 43.8 47.2 42.6 35.5 48.9 21.2 15 19.2 26 34.9 38.3 37.2 36.8 35.1 9.2 9.4 16.8 5760200000 7478200 551140000 360400000 869120000 159050000 386720000 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Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase ogt sp|P0AFH0|OGT_ECOLI Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ogt PE=1 SV=1 1 9 9 9 3 6 6 5 5 5 1 3 0 3 5 7 5 4 4 2 2 2 1 4 7 5 5 4 3 3 0 2 6 8 5 7 4 1 1 1 3 6 6 5 5 5 1 3 0 3 5 7 5 4 4 2 2 2 1 4 7 5 5 4 3 3 0 2 6 8 5 7 4 1 1 1 3 6 6 5 5 5 1 3 0 3 5 7 5 4 4 2 2 2 1 4 7 5 5 4 3 3 0 2 6 8 5 7 4 1 1 1 60.8 60.8 60.8 19.179 171 171 0 50.872 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS 17 32.7 24.6 31.6 39.2 25.1 7 17 0 17 30.4 39.8 32.7 24 18.7 11.1 12.3 12.3 7 22.8 31.6 30.4 31 18.7 17 19.3 0 12.3 27.5 46.8 33.3 46.8 18.7 7 7 8.2 2879500000 18565000 317040000 287100000 251610000 116170000 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Spermidine/putrescine transport system permease protein PotC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=potC PE=3 SV=1 1 3 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 3 3 3 2 2 2 2 3 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 3 3 3 2 2 2 2 3 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 3 3 1 3 3 1 3 3 3 3 3 2 2 2 2 3 3 3 8.7 8.7 8.7 29.111 264 264 0 30.868 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 4.2 8.7 8.7 4.2 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 8.7 1944700000 122350000 171100000 43557000 76280000 101460000 46234000 198050000 121120000 206630000 26466000 32354000 80046000 27771000 20158000 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sp|P0AFQ7|YCFH_ECOLI Uncharacterized metal-dependent hydrolase YcfH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ycfH PE=1 SV=1 1 14 14 14 9 9 9 10 13 12 12 12 12 8 10 9 11 10 12 7 8 5 7 10 10 11 11 11 8 6 9 10 10 10 8 11 10 8 5 10 9 9 9 10 13 12 12 12 12 8 10 9 11 10 12 7 8 5 7 10 10 11 11 11 8 6 9 10 10 10 8 11 10 8 5 10 9 9 9 10 13 12 12 12 12 8 10 9 11 10 12 7 8 5 7 10 10 11 11 11 8 6 9 10 10 10 8 11 10 8 5 10 69.8 69.8 69.8 29.808 265 265 0 173.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 42.3 39.2 44.5 50.6 66 60 57.4 57.4 54.7 33.6 39.2 40 46 44.9 52.1 36.6 35.5 21.1 33.6 46.4 46.4 54.3 52.5 52.5 34.3 24.5 37.4 46.4 46.4 49.1 34 52.1 46.4 39.6 20.4 46.4 5704600000 70572000 156260000 171130000 714690000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18 14.4 14 14 26.1 10.8 26.1 26.1 26.1 14.4 14.4 22.5 22.1 22.5 14.4 18 10.8 14.4 18 4.1 14.4 10.4 14.4 10.4 14.4 18 18 14.4 10.8 10.4 6.8 22.5 10.8 18 14.4 18 2705100000 57660000 130200000 531370000 356680000 179540000 21004000 202640000 130240000 235330000 18469000 14285000 82211000 62112000 17673000 31629000 47833000 21576000 32260000 41613000 9416400 39505000 16364000 31507000 8422900 38486000 40129000 54662000 30522000 19821000 12747000 0 52997000 18834000 47980000 14543000 54844000 270510000 5766000 13020000 53137000 35668000 17954000 2100400 20264000 13024000 23533000 1846900 1428500 8221100 6211200 1767300 3162900 4783300 2157600 3226000 4161300 941640 3950500 1636400 3150700 842290 3848600 4012900 5466200 3052200 1982100 1274700 0 5299700 1883400 4798000 1454300 5484400 79 1184 201;1536;11175;24093;25877;31795 True;True;True;True;True;True 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OX=83333 GN=btsR PE=1 SV=1 1 12 12 12 7 7 8 5 9 8 8 8 9 8 10 7 7 5 6 8 6 5 7 3 5 6 5 7 5 5 6 6 8 7 7 6 7 8 5 7 7 7 8 5 9 8 8 8 9 8 10 7 7 5 6 8 6 5 7 3 5 6 5 7 5 5 6 6 8 7 7 6 7 8 5 7 7 7 8 5 9 8 8 8 9 8 10 7 7 5 6 8 6 5 7 3 5 6 5 7 5 5 6 6 8 7 7 6 7 8 5 7 51.5 51.5 51.5 27.399 239 239 0 34.851 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31 31.8 36.4 23 40.6 37.2 35.1 36.8 40.6 34.7 42.3 31.8 31.8 23.4 25.9 34.7 23.8 20.1 29.3 13 20.9 26.8 20.5 31 18.4 20.5 26.4 20.1 35.1 31.8 31 26.8 27.6 33.5 21.8 34.3 2659300000 45870000 320400000 248790000 225780000 99664000 126090000 101380000 60494000 98830000 13655000 80994000 133900000 130310000 13448000 34988000 11911000 11367000 6239500 14764000 14389000 59238000 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MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16 11.7 0 5.3 9.6 5.3 5.3 27.1 16 16 16 0 16 9.6 9.6 9.6 9.6 9.6 9.6 27.1 9.6 16 20.7 16 27.1 27.1 31.9 27.1 31.9 16 16 31.9 31.9 20.7 9.6 31.9 936100000 8864500 33722000 0 6801200 11059000 5500500 5741900 29496000 17515000 2395000 14552000 0 15362000 1825600 5317200 1226400 2019700 1232000 6896200 20986000 12719000 33846000 6336000 19835000 45881000 14366000 30195000 28626000 346780000 21353000 46502000 34036000 77319000 7703200 4129500 15964000 117010000 1108100 4215200 0 850150 1382400 687560 717730 3687000 2189300 299370 1819000 0 1920300 228200 664650 153300 252460 154000 862030 2623300 1589800 4230800 792000 2479400 5735200 1795800 3774400 3578300 43347000 2669100 5812800 4254500 9664800 962900 516190 1995500 53 1191 3336;7175;14263;29200;29957;30013 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(strain K12) OX=83333 GN=rfaH PE=1 SV=1 1 7 7 7 7 6 6 6 7 7 6 4 5 6 5 5 5 6 6 6 4 4 6 7 6 6 6 6 5 6 5 5 5 4 4 4 5 5 5 4 7 6 6 6 7 7 6 4 5 6 5 5 5 6 6 6 4 4 6 7 6 6 6 6 5 6 5 5 5 4 4 4 5 5 5 4 7 6 6 6 7 7 6 4 5 6 5 5 5 6 6 6 4 4 6 7 6 6 6 6 5 6 5 5 5 4 4 4 5 5 5 4 46.9 46.9 46.9 18.34 162 162 0 38.407 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 46.9 42.6 42.6 42.6 46.9 46.9 42.6 36.4 36.4 40.7 36.4 34 34 38.3 42.6 40.7 32.1 32.1 40.7 46.9 42.6 42.6 38.9 42.6 40.7 40.7 32.1 32.1 36.4 27.8 27.8 27.8 36.4 36.4 40.7 32.1 1994100000 42141000 42702000 47752000 108160000 595730000 651950000 6385100 0 0 7246000 0 12482000 16541000 115320000 6520900 5642100 18228000 4109300 10971000 13025000 22960000 43639000 108700000 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potassium uptake protein TrkH trkH sp|P0AFZ7|TRKH_ECOLI Trk system potassium uptake protein TrkH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=trkH PE=1 SV=1 1 3 3 3 2 0 0 1 2 0 3 3 3 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 0 0 0 0 0 1 2 2 1 0 0 0 0 1 2 1 2 2 0 0 1 2 0 3 3 3 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 0 0 0 0 0 1 2 2 1 0 0 0 0 1 2 1 2 2 0 0 1 2 0 3 3 3 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 0 0 0 0 0 1 2 2 1 0 0 0 0 1 2 1 2 4.1 4.1 4.1 52.959 483 483 0 3.8663 By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.1 0 0 1.7 3.9 0 4.1 4.1 4.1 4.1 0 0 0 0 0 4.1 3.9 4.1 3.9 0 0 0 0 0 1.7 3.9 3.9 1.7 0 0 0 0 2.5 3.9 1.7 3.9 185060000 16135000 0 0 5519400 8175500 0 30665000 26715000 36466000 4997300 0 0 0 0 0 7821000 5581600 4984800 4759900 0 0 0 0 0 5544000 5188200 6019700 0 0 0 0 0 3679400 5593300 1524200 5686100 26437000 2305000 0 0 788490 1167900 0 4380700 3816500 5209500 713890 0 0 0 0 0 1117300 797370 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Peroxiredoxin OsmC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=osmC PE=1 SV=2 1 8 8 8 6 8 7 7 7 8 8 7 8 6 7 7 7 5 7 6 4 6 5 6 7 7 7 8 8 8 7 5 5 6 6 6 7 6 1 6 6 8 7 7 7 8 8 7 8 6 7 7 7 5 7 6 4 6 5 6 7 7 7 8 8 8 7 5 5 6 6 6 7 6 1 6 6 8 7 7 7 8 8 7 8 6 7 7 7 5 7 6 4 6 5 6 7 7 7 8 8 8 7 5 5 6 6 6 7 6 1 6 58.7 58.7 58.7 15.088 143 143 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 54.5 58.7 58 51.7 55.2 58.7 58.7 58 58.7 48.3 55.2 55.2 55.2 48.3 55.2 44.8 44.8 51.7 47.6 54.5 55.2 55.2 58.7 58.7 58.7 58.7 58 48.3 41.3 48.3 48.3 48.3 51.7 51 13.3 51 12409000000 50723000 1299800000 1139900000 1863600000 165440000 603650000 761740000 73727000 811180000 6742000 201460000 429900000 643680000 21938000 125560000 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 73.3 85.2 80 80 85.2 85.2 77.4 73.3 69.3 73.3 75.5 75.5 75.5 80 77.9 68.8 52.4 56.9 49.3 83.6 86.9 84 77.4 84 61.4 66.7 66.7 63.1 63.1 68.8 63.6 68.8 63.1 63.1 51.2 52.6 382610000000 4669800000 31215000000 34039000000 36437000000 23213000000 20607000000 4071700000 4893700000 3316500000 971500000 8858500000 22200000000 16273000000 7472900000 8024300000 593830000 901330000 323040000 1077200000 6918300000 16922000000 17046000000 5759200000 13168000000 1194800000 1079000000 688170000 4496200000 16310000000 19855000000 20269000000 12830000000 15048000000 795240000 542660000 532850000 22507000000 274690000 1836200000 2002300000 2143300000 1365500000 1212200000 239510000 287870000 195090000 57147000 521090000 1305900000 957240000 439580000 472020000 34931000 53019000 19002000 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translocase subunit SecA secA sp|P10408|SECA_ECOLI Protein translocase subunit SecA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=secA PE=1 SV=2 1 44 44 44 24 26 25 22 30 24 35 31 36 24 31 30 28 26 23 23 28 23 19 31 29 29 28 19 30 25 28 26 27 28 28 26 23 28 20 30 24 26 25 22 30 24 35 31 36 24 31 30 28 26 23 23 28 23 19 31 29 29 28 19 30 25 28 26 27 28 28 26 23 28 20 30 24 26 25 22 30 24 35 31 36 24 31 30 28 26 23 23 28 23 19 31 29 29 28 19 30 25 28 26 27 28 28 26 23 28 20 30 54.7 54.7 54.7 102.02 901 901 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 32.7 32.7 35.6 33.1 41.6 31.7 44.8 40.6 43.4 32 41 39.4 38.4 36.1 33.5 27.6 34.6 27.5 25.1 37.7 37.6 40 34.9 28.2 37.1 32 34.1 33.3 36.1 37.7 38.5 34.2 30.4 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.8 17.5 23.6 23.6 13.5 17.5 17.8 18.2 17.8 12.8 17.8 13.5 17.5 13.5 13.5 13.1 13.5 13.1 9.4 17.8 17.8 23.6 13.5 18.9 17.5 12.8 17.8 17.8 17.8 13.5 15.8 17.8 13.5 13.1 13.1 13.1 4102600000 15642000 351280000 346680000 763470000 96171000 220740000 39893000 56829000 45629000 10114000 110220000 165590000 265290000 26873000 84736000 8148600 24395000 10535000 4790600 53254000 97469000 235250000 18291000 129990000 10276000 12723000 7851100 24999000 138620000 123030000 310420000 65451000 181850000 22800000 8472100 14867000 586090000 2234500 50182000 49525000 109070000 13739000 31534000 5698900 8118500 6518400 1444900 15746000 23655000 37898000 3839000 12105000 1164100 3485000 1504900 684380 7607800 13924000 33608000 2613000 18570000 1468000 1817600 1121600 3571300 19803000 17575000 44345000 9350100 25978000 3257100 1210300 2123900 79 1338 13849;15672;15751;21479;22636;22637;22719;28716;34871;34872 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 32.2 33.3 32.8 49.5 40.3 46 46 40.7 47 32.2 36.5 39.4 36.5 37.9 42.7 26.5 28.9 35.9 30.9 31.9 35.7 44.2 42.7 38.3 40.3 26.9 42.7 37.9 30.9 29.1 37.4 35.4 41.1 37.9 15.1 35 17482000000 61440000 367180000 622210000 3330500000 422170000 1535400000 951800000 181480000 1107600000 17978000 118140000 419150000 959880000 95486000 487960000 14387000 30900000 28612000 30887000 137900000 370010000 1237000000 103030000 1045900000 157140000 35856000 179470000 124440000 207250000 292970000 995110000 241280000 1388900000 93073000 3642300 85977000 699280000 2457600 14687000 24889000 133220000 16887000 61415000 38072000 7259400 44305000 719130 4725700 16766000 38395000 3819400 19519000 575480 1236000 1144500 1235500 5515900 14800000 49479000 4121300 41834000 6285700 1434200 7178700 4977400 8289900 11719000 39804000 9651200 55554000 3722900 145690 3439100 247 1343 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 44.2 68.5 70.5 71.1 71.1 71.1 32.7 50.6 39.9 34.4 69.1 68.2 60.7 71.1 72.5 30.9 30.3 21.1 33.2 68.8 71.1 72.5 69.1 71.1 43.9 41.6 41.3 54.9 64.2 64.2 64.2 70.5 68.2 44.8 25.7 30.3 50142000000 63531000 2370900000 5312900000 6279200000 2415700000 3139500000 75973000 89031000 111820000 9933900 737130000 3595100000 2547600000 432840000 978590000 6828900 13910000 4342600 5125600 381580000 2254600000 3331800000 433570000 2235000000 19368000 9600400 12368000 132030000 1403000000 2782100000 4201700000 2094700000 2619300000 26542000 6374000 8300600 2639000000 3343700 124780000 279620000 330480000 127140000 165240000 3998600 4685800 5885400 522840 38796000 189220000 134080000 22781000 51505000 359420 732090 228560 269770 20083000 118660000 175360000 22820000 117630000 1019400 505280 650930 6948800 73842000 146420000 221140000 110250000 137860000 1397000 335470 436870 428 1363 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K12) OX=83333 GN=selB PE=1 SV=3 1 29 29 29 20 16 13 11 20 11 23 25 25 19 17 16 10 14 14 22 21 18 18 19 13 12 15 14 20 21 22 18 16 16 11 13 12 19 17 18 20 16 13 11 20 11 23 25 25 19 17 16 10 14 14 22 21 18 18 19 13 12 15 14 20 21 22 18 16 16 11 13 12 19 17 18 20 16 13 11 20 11 23 25 25 19 17 16 10 14 14 22 21 18 18 19 13 12 15 14 20 21 22 18 16 16 11 13 12 19 17 18 55.9 55.9 55.9 68.867 614 614 0 281.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 41.5 37.5 30 26.5 39.6 26.7 51 51.5 52.4 41 37.6 35.8 26.4 33.6 35 45.8 42 38.8 37.5 41.9 32.2 28.8 33.6 32.1 41.5 40.7 42.5 38.4 36.8 35.8 27.4 33.6 29 40.4 34.4 38.9 9591700000 283110000 871090000 538000000 560100000 341310000 206540000 849860000 481910000 960490000 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non-specific dipeptidase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pepD PE=1 SV=3 1 22 22 22 15 20 19 18 21 19 19 20 20 15 20 17 18 19 18 13 12 12 14 19 20 18 18 18 15 17 17 17 17 18 16 17 17 14 11 14 15 20 19 18 21 19 19 20 20 15 20 17 18 19 18 13 12 12 14 19 20 18 18 18 15 17 17 17 17 18 16 17 17 14 11 14 15 20 19 18 21 19 19 20 20 15 20 17 18 19 18 13 12 12 14 19 20 18 18 18 15 17 17 17 17 18 16 17 17 14 11 14 51.5 51.5 51.5 52.915 485 485 0 248.78 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 34.4 50.1 48.7 43.9 51.5 50.1 47.6 49.5 49.1 38.4 50.1 41.4 43.9 45.4 45.4 34.6 29.9 31.3 33.8 45.6 50.1 43.9 42.9 43.9 37.9 39.8 38.4 37.5 40.4 40.4 40.4 40.4 41.9 33.6 25.2 33.6 38810000000 175100000 4058200000 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PurH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase purH sp|P15639|PUR9_ECOLI Bifunctional purine biosynthesis protein PurH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=purH PE=1 SV=1 1 35 35 35 24 28 25 28 27 30 28 27 27 19 29 22 27 22 27 13 17 18 19 26 28 32 23 32 25 22 24 19 23 26 22 24 25 21 12 23 24 28 25 28 27 30 28 27 27 19 29 22 27 22 27 13 17 18 19 26 28 32 23 32 25 22 24 19 23 26 22 24 25 21 12 23 24 28 25 28 27 30 28 27 27 19 29 22 27 22 27 13 17 18 19 26 28 32 23 32 25 22 24 19 23 26 22 24 25 21 12 23 73.2 73.2 73.2 57.329 529 529 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 55.2 60.1 52.7 58.6 56.7 64.1 61.8 58.2 64.1 42.9 62.2 51.6 62.6 47.6 60.9 26.8 35.3 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MS/MS By MS/MS 48.8 28.4 22.2 12.7 50 29.6 63.3 65.4 64.5 37.6 42.6 25.1 31.7 42 39.6 47.9 42 40.5 47.9 47.6 28.1 36.1 41.4 29.6 65.4 63.3 60.9 63.9 38.5 45.3 26.9 49.1 36.4 66.3 50.6 59.2 9109500000 85178000 184980000 119020000 129130000 293610000 109360000 1896800000 414860000 2274100000 18709000 105870000 68914000 130150000 54312000 83355000 27683000 37035000 37073000 47696000 137450000 86439000 209840000 43326000 120660000 455430000 75679000 420300000 289230000 117090000 170110000 189940000 135780000 116050000 221010000 30772000 172580000 396070000 3703400 8042600 5174800 5614500 12766000 4754800 82471000 18038000 98872000 813450 4603100 2996300 5658600 2361400 3624100 1203600 1610200 1611900 2073800 5976200 3758200 9123500 1883800 5246000 19801000 3290400 18274000 12575000 5091000 7396200 8258300 5903500 5045800 9609100 1337900 7503400 332 1423 584;4658;6638;8490;8958;9631;10547;10634;17676;17764;17868;18814;18815;22417;23096;24030;25757;29841;30166;30748;33585;36203 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MS/MS By MS/MS 33.8 43.3 38.6 35.3 45.5 44 56.5 43 55.3 28.9 46.6 39.9 37.1 32.3 39.4 23.3 24.6 22.5 14.6 32.2 46.6 37.6 22.2 33.2 49.8 25.6 44.7 38.1 36.6 38.6 36.6 30 39.1 39.1 13.6 33.8 5572800000 54757000 670840000 484020000 545080000 149280000 212150000 646100000 130370000 644650000 13283000 143230000 216140000 185590000 15040000 55174000 4978000 6749600 7192200 8208300 51730000 142630000 190660000 21981000 111820000 72283000 21692000 81379000 24275000 114050000 142360000 206640000 57666000 83454000 25033000 1277100 31097000 199030000 1955600 23959000 17286000 19467000 5331300 7576800 23075000 4656100 23023000 474410 5115200 7719100 6628200 537140 1970500 177780 241060 256860 293150 1847500 5093800 6809200 785020 3993400 2581500 774730 2906400 866950 4073200 5084300 7379900 2059500 2980500 894030 45612 1110600 205 1431 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K12) OX=83333 GN=dmsC PE=1 SV 2 1 1 1 0 1 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 2.5 2.5 2.5 30.523 284 284;287 0.0015009 2.5802 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 2.5 0 0 0 0 2.5 2.5 2.5 0 0 0 0 0 0 2.5 2.5 2.5 2.5 0 0 0 0 0 0 2.5 2.5 0 0 0 0 0 0 2.5 2.5 2.5 253230000 0 50618000 0 0 0 0 0 7367400 147930000 0 0 0 0 0 0 5430800 6641900 5404000 6118700 0 0 0 0 0 0 5692900 6399400 0 0 0 0 0 0 3688100 2742600 5202300 42205000 0 8436300 0 0 0 0 0 1227900 24654000 0 0 0 0 0 0 905140 1107000 900660 1019800 0 0 0 0 0 0 948810 1066600 0 0 0 0 0 0 614680 457110 867050 11 1450 901 True 1195 33836;33837;33838;33839;33840;33841;33842;33843;33844;33845;33846;33847;33848;33849 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molybdenum cofactor assembly chaperone NarW narW sp|P19317|NARW_ECOLI Probable nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarW OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=narW PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 9.5 9.5 9.5 26.16 231 231 0.0091274 1.4534 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0 0 3.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.6 5.6 5.6 5.6 0 0 0 80860000 0 0 9430100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15235000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15226000 20884000 2831300 17254000 0 0 0 5775700 0 0 673580 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1088200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1087600 1491700 202230 1232400 0 0 0 3 1454 5868;24033 True;True 7795;32811 211727;869353;869354;869355;869356;869357 158377;648027;648028;648029 158377;648027 P19318 P19318 5 3 3 Respiratory nitrate reductase 2 beta chain narY sp|P19318|NARY_ECOLI Respiratory nitrate reductase 2 beta chain OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=narY PE=1 SV=2 1 5 3 3 1 3 0 0 2 3 2 3 2 3 2 2 2 3 2 3 4 3 3 2 2 2 2 1 3 3 3 1 2 2 1 3 2 3 2 2 0 1 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 0 2 2 2 0 1 1 1 2 1 2 2 2 0 1 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 0 2 2 2 0 1 1 1 2 1 2 2 2 14 9.7 9.7 58.557 514 514 0 5.3842 By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching 1.9 6.6 0 0 4.3 10.3 4.3 6 4.3 6 4.3 4.3 4.3 10.3 8 6 8 6 5.6 4.3 4.3 4.3 4.3 1.9 5.6 5.6 5.6 1.9 4.3 4.3 6 10.3 8 5.6 3.7 3.7 335870000 0 58777000 0 0 24234000 15762000 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2 2 Uncharacterized protein YdfC ydfC sp|P21418|YDFC_ECOLI Uncharacterized protein YdfC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ydfC PE=4 SV=1 1 2 2 2 2 1 1 0 1 0 2 2 2 2 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 2 1 1 2 0 0 0 0 0 2 1 2 2 1 1 0 1 0 2 2 2 2 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 2 1 1 2 0 0 0 0 0 2 1 2 2 1 1 0 1 0 2 2 2 2 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 2 1 1 2 0 0 0 0 0 2 1 2 34.7 34.7 34.7 8.3504 72 72 0 30.482 By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 34.7 11.1 11.1 0 23.6 0 34.7 34.7 34.7 34.7 11.1 0 0 23.6 23.6 23.6 0 11.1 0 0 0 0 0 0 34.7 23.6 23.6 34.7 0 0 0 0 0 34.7 11.1 34.7 67904000 8385400 0 0 0 4636800 0 5641600 11317000 8145400 1581700 0 0 0 1503400 5230800 2467200 0 0 0 0 0 0 0 0 3188900 2248500 3507100 2150100 0 0 0 0 0 4750700 0 3149300 16976000 2096300 0 0 0 1159200 0 1410400 2829300 2036300 395430 0 0 0 375840 1307700 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 48.2 55.4 59.1 59.1 55.4 56.5 59.1 59.1 59.1 40.4 59.1 59.1 49.2 49.2 59.1 50.3 29 47.7 20.7 34.2 55.4 59.1 39.4 48.2 38.9 20.7 25.9 37.8 49.2 49.2 59.1 49.2 49.2 37.8 26.9 47.7 4238700000 141350000 395570000 346250000 366660000 174750000 170060000 197320000 90403000 191550000 18384000 91768000 218160000 187660000 37780000 97752000 15262000 21778000 16553000 17821000 40587000 121430000 200990000 19039000 118580000 24262000 12965000 13263000 37659000 95190000 141620000 307330000 92809000 168450000 21471000 5820500 20416000 385340000 12850000 35961000 31477000 33333000 15887000 15460000 17939000 8218400 17414000 1671300 8342600 19832000 17060000 3434500 8886500 1387400 1979900 1504800 1620100 3689700 11039000 18272000 1730800 10780000 2205600 1178600 1205700 3423500 8653700 12874000 27939000 8437100 15314000 1951900 529140 1856000 144 1490 5248;7274;9389;10993;12780;13229;16457;21104;26373;27181;31837;36002 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UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase murE sp|P22188|MURE_ECOLI UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=murE PE=1 SV=2 1 18 18 18 8 11 7 10 9 9 12 8 9 7 8 9 6 7 6 5 7 8 6 8 13 11 11 8 10 8 9 9 9 11 9 9 10 9 5 9 8 11 7 10 9 9 12 8 9 7 8 9 6 7 6 5 7 8 6 8 13 11 11 8 10 8 9 9 9 11 9 9 10 9 5 9 8 11 7 10 9 9 12 8 9 7 8 9 6 7 6 5 7 8 6 8 13 11 11 8 10 8 9 9 9 11 9 9 10 9 5 9 43.4 43.4 43.4 53.343 495 495 0 100.34 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 23.4 29.9 18.2 27.7 24.8 23.4 31.7 23.6 24 21.6 19.4 25.7 18.4 19.4 14.5 16.4 21.6 23.8 13.9 21.6 35.4 31.1 28.9 23.6 25.9 21.6 21.8 24.8 25.7 28.3 26.3 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branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=livF PE=1 SV=2 1 15 15 15 11 12 12 12 13 11 10 11 13 11 13 13 11 9 11 7 5 8 7 10 9 11 10 11 10 6 8 9 12 10 11 8 10 6 4 8 11 12 12 12 13 11 10 11 13 11 13 13 11 9 11 7 5 8 7 10 9 11 10 11 10 6 8 9 12 10 11 8 10 6 4 8 11 12 12 12 13 11 10 11 13 11 13 13 11 9 11 7 5 8 7 10 9 11 10 11 10 6 8 9 12 10 11 8 10 6 4 8 73.8 73.8 73.8 26.31 237 237 0 288.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 55.3 68.8 69.2 69.2 65 58.6 49.4 53.2 65 54 62.9 70 51.1 47.3 59.9 23.6 20.7 27 26.2 40.9 39.2 61.2 41.8 66.2 42.6 25.7 36.7 35.9 57.8 52.3 63.7 43 46 21.1 14.3 27 8052100000 135740000 1095400000 542700000 952050000 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MS/MS By MS/MS 27 21.8 18.2 18.4 21.9 6.4 26.5 29.6 25.5 30.5 19.6 21.9 17 20.4 16.5 31.3 24.6 27.7 28.7 21.1 20.3 18.4 20 11.2 22.8 27.8 25.1 24.4 16.6 16.7 16.6 21.3 10.3 28.7 22.5 27.7 8645300000 468230000 743110000 362860000 412440000 243940000 26010000 733890000 543250000 728060000 125590000 145530000 285400000 288840000 53909000 45843000 154730000 127660000 121520000 133390000 111680000 152970000 276370000 45488000 49001000 170650000 138480000 163870000 233750000 265040000 198980000 430810000 105040000 52796000 226330000 63406000 216410000 288180000 15608000 24770000 12095000 13748000 8131200 867000 24463000 18108000 24269000 4186400 4851000 9513300 9627900 1797000 1528100 5157600 4255500 4050500 4446200 3722500 5099100 9212500 1516300 1633400 5688300 4615800 5462400 7791600 8834600 6632800 14360000 3501300 1759900 7544200 2113500 7213700 365 1534 1784;4521;4649;5990;6128;9161;12803;12953;13155;13190;13191;17403;18885;18980;24593;25642;26671;28244;28502;29562;30527;35267 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 32.4 31.6 54.3 69.5 61.4 61.4 53.8 48 49.3 26.4 35.8 58 58 56.9 61.4 30 12.8 17.2 20.9 30.8 54 62.1 49.9 54 35.2 20.4 30.8 35.8 44.1 51.4 42.3 50.7 50.7 28.7 25.3 31.9 23394000000 45349000 537210000 1897200000 3593700000 1527000000 2260400000 202020000 68611000 224450000 5018000 150060000 1010300000 1119100000 338990000 772370000 8198200 2646300 2299800 20469000 154140000 864510000 1426300000 292530000 1728600000 43974000 2027500 51947000 97849000 216120000 726520000 1330700000 741240000 1881500000 23834000 4601400 22007000 1376100000 2667600 31600000 111600000 211390000 89824000 132960000 11884000 4035900 13203000 295180 8826900 59432000 65832000 19941000 45433000 482240 155670 135280 1204100 9067100 50854000 83897000 17208000 101680000 2586700 119260 3055700 5755800 12713000 42737000 78276000 43602000 110680000 1402000 270670 1294500 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Protein YffB yffB sp|P24178|YFFB_ECOLI Protein YffB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yffB PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 2 0 0 1 0 2 1 3 2 1 0 0 1 0 3 3 2 1 1 1 0 0 0 2 1 1 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 2 0 0 1 0 2 1 3 2 1 0 0 1 0 3 3 2 1 1 1 0 0 0 2 1 1 3 0 0 0 0 0 3 2 3 2 2 0 0 1 0 2 1 3 2 1 0 0 1 0 3 3 2 1 1 1 0 0 0 2 1 1 31.4 31.4 31.4 13.6 118 118 0 11.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS 31.4 0 0 0 0 0 31.4 15.3 31.4 22.9 15.3 0 0 6.8 0 22.9 6.8 31.4 22.9 6.8 0 0 6.8 0 31.4 31.4 22.9 6.8 6.8 6.8 0 0 0 15.3 6.8 6.8 210270000 14408000 0 0 0 0 0 63586000 14802000 56357000 1488600 6020000 0 0 870180 0 1305200 1476400 2012600 3553600 3433900 0 0 1227600 0 10854000 3651000 6965700 4464200 3297900 3261800 0 0 0 4514600 473090 2246100 35045000 2401300 0 0 0 0 0 10598000 2467000 9392800 248100 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5 112.96 1015 1015 1 -2 By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 0 0.9 0 0 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 0 0 1.8 0 1.8 1.8 1.8 1.6 0 0 0 1.6 0 0 0 1.6 1.6 0 0.8 0 0 0 3.3 0 1.8 278150000 0 0 0 0 44268000 76530000 44266000 9366000 41020000 1060100 12200000 0 0 1195800 0 1152800 1123000 1325800 4811800 0 0 0 3101100 0 0 0 4357900 13225000 0 8566200 0 0 0 9332800 0 1245300 4635800 0 0 0 0 737800 1275500 737770 156100 683660 17668 203340 0 0 19929 0 19213 18717 22096 80196 0 0 0 51685 0 0 0 72632 220410 0 142770 0 0 0 155550 0 20756 9 + 1562 4088;6932;20258;20997 True;True;True;True 5495;9216;27419;28607 152208;152209;152210;152211;152212;152213;152214;152215;152216;152217;152218;152219;152220;250431;250432;250433;250434;250435;733942;764510 114524;187861;187862;187863;187864;187865;187866;548538;570838 114524;187865;548538;570838 1814 796 P24186 P24186 12 12 12 Bifunctional protein FolD;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase folD sp|P24186|FOLD_ECOLI Bifunctional protein FolD OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=folD PE=1 SV=4 1 12 12 12 8 12 12 12 12 12 9 8 9 8 11 12 12 10 11 6 7 6 7 9 11 11 9 10 8 6 8 6 7 9 9 9 10 6 5 5 8 12 12 12 12 12 9 8 9 8 11 12 12 10 11 6 7 6 7 9 11 11 9 10 8 6 8 6 7 9 9 9 10 6 5 5 8 12 12 12 12 12 9 8 9 8 11 12 12 10 11 6 7 6 7 9 11 11 9 10 8 6 8 6 7 9 9 9 10 6 5 5 43.8 43.8 43.8 31.043 288 288 0 193.83 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 28.1 43.8 43.8 43.8 43.8 43.8 33.7 28.5 33.7 30.6 43.8 43.8 43.8 37.8 43.8 19.4 22.9 19.4 26.4 32.6 43.8 43.8 32.6 38.5 30.6 20.5 30.6 24.7 26.7 37.8 37.8 35.1 40.3 24.7 17 17 19187000000 87436000 1368400000 1840700000 2875100000 909100000 1406600000 166750000 78671000 158560000 27048000 185160000 1058400000 1161100000 186800000 357660000 12907000 12325000 9569000 32667000 137000000 558590000 1213100000 145180000 1007200000 40330000 12250000 48139000 78260000 357710000 702170000 1514600000 419070000 975310000 18887000 8180900 15778000 1744200000 7948800 124400000 167340000 261370000 82645000 127870000 15159000 7151900 14414000 2458900 16833000 96218000 105560000 16982000 32514000 1173400 1120400 869910 2969800 12455000 50781000 110280000 13198000 91561000 3666300 1113600 4376300 7114600 32519000 63833000 137690000 38097000 88665000 1717000 743710 1434400 134 1563 421;2465;5332;6103;10521;12178;12179;12840;19219;23466;30226;34457 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By MS/MS 54.9 54.9 54.9 54.9 71.4 71.4 71.4 54.9 54.9 54.9 54.9 54.9 54.9 69.2 54.9 54.9 54.9 54.9 46.6 51.1 54.9 54.9 51.1 54.9 51.1 51.1 51.1 51.1 54.9 54.9 54.9 54.9 54.9 51.1 54.9 51.1 104020000000 1687200000 8480500000 6213800000 13104000000 4348000000 5323400000 4015600000 2855500000 3887000000 390390000 1989000000 5619700000 5907500000 670970000 1681000000 392200000 460130000 292800000 267530000 833510000 2550500000 5058600000 564680000 3917900000 573460000 358570000 504440000 594320000 2572400000 3742000000 8050800000 1865900000 3991600000 527530000 258330000 469170000 13002000000 210890000 1060100000 776720000 1638000000 543500000 665420000 501950000 356940000 485870000 48799000 248630000 702460000 738440000 83871000 210130000 49025000 57517000 36600000 33441000 104190000 318820000 632330000 70585000 489730000 71683000 44822000 63055000 74290000 321550000 467750000 1006300000 233240000 498950000 65941000 32291000 58647000 577 1580 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1,2-glucosyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rfaJ PE=3 SV=2 1 16 16 16 11 13 9 11 10 12 8 10 11 9 11 13 14 10 13 10 10 11 9 10 13 14 9 13 9 8 9 12 11 10 13 11 13 11 8 9 11 13 9 11 10 12 8 10 11 9 11 13 14 10 13 10 10 11 9 10 13 14 9 13 9 8 9 12 11 10 13 11 13 11 8 9 11 13 9 11 10 12 8 10 11 9 11 13 14 10 13 10 10 11 9 10 13 14 9 13 9 8 9 12 11 10 13 11 13 11 8 9 40.2 40.2 40.2 39.04 338 338 0 72.582 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31.1 37.9 23.1 31.1 33.4 36.7 23.7 32.5 36.7 26 36.7 35.8 39.1 26.3 39.1 27.5 27.5 31.7 26 30.2 37.6 39.1 26.9 37.6 26 23.7 23.4 37.6 31.1 27.8 32.8 34.9 32.5 33.4 21.3 26 7389500000 93975000 647350000 482880000 1155300000 176500000 442270000 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sp|P27242|WAAU_ECOLI Lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=waaU PE=4 SV=2 1 17 17 17 13 16 13 12 15 11 13 16 13 14 13 13 13 12 15 14 14 13 13 13 12 15 13 13 11 13 11 11 11 14 13 14 16 12 12 12 13 16 13 12 15 11 13 16 13 14 13 13 13 12 15 14 14 13 13 13 12 15 13 13 11 13 11 11 11 14 13 14 16 12 12 12 13 16 13 12 15 11 13 16 13 14 13 13 13 12 15 14 14 13 13 13 12 15 13 13 11 13 11 11 11 14 13 14 16 12 12 12 50.1 50.1 50.1 41.729 357 357 0 121.48 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 39.8 48.2 40.3 36.4 45.7 34.5 37.8 47.6 37.8 42 39.2 39.2 37.8 34.7 43.1 39.5 39.5 36.7 35.3 37.5 37.8 45.4 39.2 39.5 30.8 36.1 31.4 32.2 31.7 40.1 39.8 42.6 46.5 34.2 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sp|P27247|PLSX_ECOLI Phosphate acyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=plsX PE=1 SV=2 1 9 9 9 4 5 5 5 5 6 5 5 6 4 7 4 4 4 4 5 5 4 4 5 4 5 3 4 5 5 5 7 7 5 5 5 6 5 5 5 4 5 5 5 5 6 5 5 6 4 7 4 4 4 4 5 5 4 4 5 4 5 3 4 5 5 5 7 7 5 5 5 6 5 5 5 4 5 5 5 5 6 5 5 6 4 7 4 4 4 4 5 5 4 4 5 4 5 3 4 5 5 5 7 7 5 5 5 6 5 5 5 32 32 32 38.214 356 356 0 27.894 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.7 21.6 19.4 17.7 19.4 23.6 19.9 22.5 25.8 15.7 25.6 14.9 14.9 14.9 14.9 19.4 19.4 17.4 14.9 19.1 14.9 19.1 12.9 14.9 19.4 19.4 19.4 28.9 30.1 19.1 19.4 19.9 23.6 19.4 19.4 19.4 2197500000 20783000 272080000 215540000 260450000 62802000 92939000 54569000 26688000 60783000 6681400 73862000 72598000 76943000 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(strain K12) OX=83333 GN=gcvT PE=1 SV=3 1 13 13 13 0 1 1 2 4 3 10 8 8 4 2 5 6 8 4 0 5 4 4 2 2 6 6 2 5 3 6 4 2 2 3 6 5 5 2 5 0 1 1 2 4 3 10 8 8 4 2 5 6 8 4 0 5 4 4 2 2 6 6 2 5 3 6 4 2 2 3 6 5 5 2 5 0 1 1 2 4 3 10 8 8 4 2 5 6 8 4 0 5 4 4 2 2 6 6 2 5 3 6 4 2 2 3 6 5 5 2 5 47 47 47 40.146 364 364 0 62.724 By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS 0 2.5 2.2 4.7 12.9 6.3 38.5 31.6 33 11 4.9 15.9 16.5 21.7 12.4 0 17 9.9 9.6 5.2 4.9 15.7 17 5.2 11 8.8 13.7 11 5.2 6.9 6.6 17 13.7 11 4.4 12.1 1092600000 0 18578000 24818000 33638000 19022000 15502000 213610000 59195000 193610000 2305800 4937200 61355000 52531000 13936000 13690000 0 5570300 4329000 9160700 7831800 23037000 55397000 14882000 20619000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 21.8 25.8 25.8 26.1 38.3 30.6 38 23.9 37 22.3 33.2 30.3 27.9 35.1 31.6 23.1 27.4 20.2 17 25.5 37.5 34.8 30.3 24.2 25.3 18.6 25.3 23.4 34.8 34.8 27.9 35.1 32.2 15.4 9.6 17.8 6026800000 28909000 338510000 432630000 548260000 333970000 320650000 142930000 46435000 157500000 10368000 96283000 454050000 348110000 80629000 124290000 12444000 13067000 9112500 9467400 71316000 259560000 366090000 53961000 192530000 34531000 6882800 26237000 37908000 196010000 297690000 451960000 191120000 295420000 18191000 3291000 16519000 301340000 1445400 16926000 21632000 27413000 16698000 16033000 7146700 2321800 7874800 518410 4814100 22702000 17405000 4031500 6214400 622200 653360 455620 473370 3565800 12978000 18304000 2698000 9626300 1726600 344140 1311800 1895400 9800500 14884000 22598000 9556000 14771000 909570 164550 825930 182 1650 4169;5011;5296;6976;14500;15044;19249;20436;20853;20854;25077;25358;30014;30619;33340 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 29 40.1 45 45.7 41.6 42 28.6 24.9 25.3 33.1 40.1 40.1 40.1 40.9 45.7 28.3 21.9 21.9 24.2 30.9 45 45 41.6 37.9 29 29.7 27.9 33.8 36.8 40.1 40.1 39.4 40.9 33.8 20.8 26.4 7821200000 2056100000 465260000 586470000 879000000 216440000 315520000 38638000 20843000 30551000 8960600 113350000 262740000 264960000 62215000 157240000 7743400 5741600 4856700 7537900 72860000 268230000 339190000 57299000 215200000 13390000 8367200 12441000 35916000 192010000 251460000 394300000 139070000 295170000 9399600 4326500 8382400 558660000 146860000 33233000 41891000 62786000 15460000 22537000 2759900 1488800 2182200 640040 8096400 18767000 18926000 4443900 11232000 553100 410120 346910 538420 5204300 19159000 24228000 4092800 15371000 956410 597660 888640 2565400 13715000 17962000 28164000 9933900 21083000 671400 309040 598740 135 1667 3159;11017;11824;12331;14214;16598;16837;17346;19212;20654;22073;30371;34097 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31 15.5 15.5 19.5 34 12.1 38 38 38 21.9 17.8 15.5 17.8 31.6 24.6 23.9 20.2 20.2 16.5 24.9 15.5 24.9 26.9 15.5 20.2 16.5 20.2 23.6 29 15.5 12.1 24.9 19.5 31.3 14.1 31.3 2160500000 38140000 135490000 158960000 192220000 136440000 31172000 190480000 68216000 176580000 13044000 53318000 107810000 63483000 19922000 27016000 10443000 17094000 11162000 11309000 47978000 57480000 84447000 18973000 30887000 24277000 11114000 32306000 25938000 103990000 74471000 66704000 37156000 45983000 17015000 2738000 16740000 135030000 2383800 8467900 9934700 12014000 8527700 1948300 11905000 4263500 11036000 815270 3332400 6738200 3967700 1245100 1688500 652660 1068400 697600 706790 2998600 3592500 5277900 1185800 1930500 1517300 694650 2019100 1621100 6499300 4654400 4169000 2322200 2873900 1063500 171130 1046200 105 1686 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MS/MS By MS/MS 51.5 47.6 57.6 62.9 62.9 62.9 52.6 62.9 47.4 42.7 47.4 44.3 57.6 42.4 57.6 26.6 28 21.6 29.4 36.6 47.4 52.4 40.7 51.5 24.4 23.5 24.1 18.3 36.6 39.1 39.1 39.1 39.1 18.3 6.1 10.8 8141800000 79677000 506890000 765030000 1304500000 629640000 691270000 183520000 141590000 162770000 14967000 81149000 520650000 188260000 59190000 173920000 12858000 30679000 20082000 14914000 59315000 207490000 301150000 137810000 812690000 16771000 53895000 15600000 47868000 90352000 173250000 248760000 125960000 246540000 10620000 2600000 9551100 581550000 5691200 36206000 54645000 93178000 44974000 49377000 13109000 10114000 11626000 1069100 5796400 37189000 13447000 4227900 12423000 918420 2191400 1434400 1065300 4236800 14821000 21511000 9843500 58049000 1197900 3849600 1114300 3419100 6453700 12375000 17769000 8996800 17610000 758540 185710 682220 116 1697 855;1376;2951;4948;5647;5648;8143;8491;11730;19839;20600;24416;24584;25000;29398 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MS/MS 8.9 11.7 13.2 12.6 15.9 14.6 11.3 10.5 11.3 8.3 12.6 11.1 16.5 8.9 13 2.9 7.4 7.4 6.2 10.5 12.4 11.1 16.5 13 10.5 2.9 11.3 9.9 12.6 11.1 11.1 14.6 14.6 5.8 2.9 7.6 1902500000 51266000 101590000 175440000 225260000 114290000 146850000 34019000 11304000 36921000 12883000 41159000 60330000 106310000 10786000 32684000 0 1520500 1084600 16329000 28152000 59211000 108950000 12056000 109050000 24576000 0 7239300 17874000 51770000 31552000 125640000 29717000 98744000 16402000 0 1543400 82717000 2228900 4416800 7627900 9793900 4969000 6384700 1479100 491490 1605200 560150 1789500 2623000 4622100 468950 1421100 0 66110 47155 709950 1224000 2574400 4736900 524160 4741300 1068500 0 314750 777140 2250900 1371800 5462500 1292100 4293200 713120 0 67106 75 1760 980;1034;9070;10877;18041;19983;27576;32873;35450 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1290;1370;11964;14428;24580;27078;27079;37375;44482;44483;47813 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OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yciK PE=1 SV=3 1 18 18 18 12 15 12 11 16 15 13 15 13 15 12 11 11 15 15 15 14 15 14 15 12 13 15 13 14 15 16 11 12 11 12 13 10 13 14 15 12 15 12 11 16 15 13 15 13 15 12 11 11 15 15 15 14 15 14 15 12 13 15 13 14 15 16 11 12 11 12 13 10 13 14 15 12 15 12 11 16 15 13 15 13 15 12 11 11 15 15 15 14 15 14 15 12 13 15 13 14 15 16 11 12 11 12 13 10 13 14 15 57.5 57.5 57.5 27.933 252 252 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 52 57.5 43.7 42.1 56 53.2 48.8 52 48.8 53.6 52 44 42.9 53.2 52 52 52 52 48.8 52 45.2 50.4 52 47.6 50.8 52 57.5 43.3 47.2 40.5 42.9 46.8 38.9 43.3 47.2 52.8 16227000000 366160000 1395700000 769710000 1315200000 1155800000 749090000 544830000 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MS/MS 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 0 16.9 0 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 0 0 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9 0 0 0 16.9 16.9 0 16.9 242980000 3973200 24428000 35634000 23775000 5430100 5177300 21659000 6073300 22512000 669210 11877000 13838000 0 324210 0 606650 426960 530500 879020 4852900 6415100 10583000 0 0 2551300 948080 3371900 2000700 24357000 0 0 0 7813700 995980 0 1280500 60746000 993290 6106900 8908400 5943800 1357500 1294300 5414800 1518300 5628100 167300 2969200 3459500 0 81052 0 151660 106740 132630 219760 1213200 1603800 2645700 0 0 637810 237020 842960 500160 6089300 0 0 0 1953400 248990 0 320120 12 1766 208 True 287 9459;9460;9461;9462;9463;9464;9465;9466;9467;9468;9469;9470;9471;9472;9473;9474;9475;9476;9477;9478;9479;9480;9481;9482;9483;9484;9485;9486;9487;9488;9489;9490;9491;9492 7516;7517;7518;7519;7520;7521;7522;7523;7524;7525;7526;7527 7517 P32053 P32053 30 30 30 Prophage CP4-57 integrase intA sp|P32053|INTA_ECOLI Prophage integrase IntA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=intA PE=1 SV=2 1 30 30 30 19 26 24 24 23 25 15 15 12 15 24 25 26 21 26 11 9 10 9 25 25 28 18 24 9 8 9 19 24 24 27 22 24 14 8 12 19 26 24 24 23 25 15 15 12 15 24 25 26 21 26 11 9 10 9 25 25 28 18 24 9 8 9 19 24 24 27 22 24 14 8 12 19 26 24 24 23 25 15 15 12 15 24 25 26 21 26 11 9 10 9 25 25 28 18 24 9 8 9 19 24 24 27 22 24 14 8 12 75.3 75.3 75.3 46.651 413 413 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 53.5 68 62.2 62.2 62.2 64.6 45 46.2 32.7 44.1 66.3 72.6 72.6 54 68.8 34.4 24 26.4 25.2 68 66.8 74.6 48.4 58.4 22.8 22.3 30.3 51.3 66.8 66.8 74.3 58.1 67.6 40 20.8 36.8 22393000000 82969000 1901400000 1951000000 3441600000 532670000 1543400000 45778000 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sp|P32674|PFLD_ECOLI Formate acetyltransferase 2 OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pflD PE=3 SV=1 1 18 18 18 1 3 6 8 12 13 1 1 1 1 4 7 9 8 11 1 1 1 2 3 6 11 6 10 1 2 3 2 8 7 10 10 12 0 1 2 1 3 6 8 12 13 1 1 1 1 4 7 9 8 11 1 1 1 2 3 6 11 6 10 1 2 3 2 8 7 10 10 12 0 1 2 1 3 6 8 12 13 1 1 1 1 4 7 9 8 11 1 1 1 2 3 6 11 6 10 1 2 3 2 8 7 10 10 12 0 1 2 34.4 34.4 34.4 85.959 765 765 0 139.17 By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching 1.2 4.7 10.1 15.6 23.3 25.1 1.2 1.2 1.2 1.2 9.5 15 18.6 16.1 20.7 3.5 1.2 1.2 3 6.3 11 23 11.2 19.6 1.2 4.1 6.5 3 17.3 15 22.1 19.9 24.2 0 1.8 3 2145200000 856870 35703000 95197000 359670000 76290000 243110000 20384000 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By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 44.4 52.3 52.3 38.3 44.4 44.4 35.8 44 37.9 37.9 44 44 42.8 33.3 52.3 37.9 20.6 28.4 20.6 37.9 44 44 25.5 47.7 30 37.9 29.6 44 46.1 44 52.3 46.1 52.3 37.9 7.8 37.9 3958000000 58825000 469040000 402660000 321070000 114770000 228450000 61527000 54793000 75845000 11441000 102480000 136980000 180410000 12672000 70096000 14050000 6984000 11300000 1439600 59644000 136910000 189880000 8629800 129220000 12542000 7426300 13203000 44017000 151360000 163810000 385920000 66664000 214200000 18638000 2499000 18570000 329830000 4902100 39086000 33555000 26756000 9564100 19037000 5127200 4566100 6320400 953450 8540400 11415000 15034000 1056000 5841400 1170800 582000 941650 119970 4970300 11409000 15823000 719150 10769000 1045200 618860 1100300 3668100 12613000 13651000 32160000 5555300 17850000 1553200 208250 1547500 123 1821 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Carbohydrate diacid regulator cdaR sp|P37047|CDAR_ECOLI Carbohydrate diacid regulator OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cdaR PE=1 SV=2 1 13 13 13 8 8 7 5 10 11 6 8 5 6 9 5 3 11 8 6 10 3 5 9 11 7 11 8 4 5 3 5 8 8 8 10 11 2 5 4 8 8 7 5 10 11 6 8 5 6 9 5 3 11 8 6 10 3 5 9 11 7 11 8 4 5 3 5 8 8 8 10 11 2 5 4 8 8 7 5 10 11 6 8 5 6 9 5 3 11 8 6 10 3 5 9 11 7 11 8 4 5 3 5 8 8 8 10 11 2 5 4 33.2 33.2 33.2 43.687 385 385 0 45.828 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching 22.1 19.5 17.1 15.3 24.4 28.6 15.3 20.3 11.2 16.1 22.6 10.4 9.1 27.3 18.4 16.4 23.9 7.8 11.9 26 26.8 15.6 29.4 20 9.6 12.2 7 13.5 20.8 18.2 21.3 25.5 27.3 5.2 11.9 9.6 2696000000 45291000 261780000 207320000 141790000 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1492;1493 332;333 P37128 P37128 8 8 8 GDP-mannose pyrophosphatase NudK nudK sp|P37128|NUDK_ECOLI GDP-mannose pyrophosphatase NudK OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=nudK PE=1 SV=2 1 8 8 8 2 7 8 8 6 6 3 3 5 3 7 7 6 7 7 1 1 1 1 6 7 7 6 7 3 2 2 5 7 7 7 7 7 3 1 3 2 7 8 8 6 6 3 3 5 3 7 7 6 7 7 1 1 1 1 6 7 7 6 7 3 2 2 5 7 7 7 7 7 3 1 3 2 7 8 8 6 6 3 3 5 3 7 7 6 7 7 1 1 1 1 6 7 7 6 7 3 2 2 5 7 7 7 7 7 3 1 3 39.3 39.3 39.3 21.748 191 191 0 64.773 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 14.1 38.7 39.3 39.3 30.9 30.9 22 22 36.1 22 38.7 38.7 30.9 38.7 38.7 4.2 4.2 9.9 4.2 30.9 38.7 38.7 30.9 38.7 21.5 10.5 12 30.4 38.7 38.7 38.7 38.7 38.7 20.9 4.2 24.6 4798400000 0 284580000 401950000 670590000 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ATPase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=zntA PE=1 SV=1 1 35 35 35 28 24 22 18 32 20 34 31 31 29 27 27 24 29 25 30 28 28 30 25 27 24 30 23 28 31 30 29 26 24 23 30 19 28 24 28 28 24 22 18 32 20 34 31 31 29 27 27 24 29 25 30 28 28 30 25 27 24 30 23 28 31 30 29 26 24 23 30 19 28 24 28 28 24 22 18 32 20 34 31 31 29 27 27 24 29 25 30 28 28 30 25 27 24 30 23 28 31 30 29 26 24 23 30 19 28 24 28 57.8 57.8 57.8 76.839 732 732 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 49.3 45.2 43.3 34.7 53.8 39.3 57.8 51.1 53.8 50 45.5 46.6 44.5 48.5 46.9 45.1 44.7 43.6 51.1 46.3 48.5 45.9 50 45.6 49.3 49.6 48.9 48.5 51.1 44.8 44 51.2 35.1 48.5 40.8 43.6 36009000000 1195300000 2725800000 2092700000 569130000 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 48.1 81.6 81.6 81.6 81.6 81.6 50.3 54.6 35.7 48.1 62.7 66.5 67 81.6 69.7 38.4 36.8 34.6 25.9 50.8 81.6 81.6 81.6 81.6 25.9 25.9 27.6 41.1 66.5 69.7 67 69.7 69.7 27.6 30.8 20 21265000000 63433000 1734800000 2371600000 3473200000 1116400000 1969200000 34210000 32226000 28703000 13112000 220220000 927010000 1064500000 139270000 435480000 3506800 4241300 2944600 3555600 31767000 844160000 983380000 98187000 678440000 5178900 1884100 4087200 51146000 438140000 1079900000 1846400000 494660000 1063900000 3992200 1837200 0 1933200000 5766700 157710000 215600000 315750000 101490000 179020000 3110000 2929600 2609400 1192000 20020000 84274000 96776000 12661000 39589000 318800 385570 267690 323240 2887900 76742000 89398000 8926100 61676000 470810 171280 371560 4649700 39831000 98170000 167860000 44969000 96721000 362930 167020 0 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 37.2 44.9 36.7 44.9 31.1 37.2 37.2 37.2 31.1 40.3 37.2 40.3 44.9 23.5 40.3 23.5 23.5 32.1 37.2 40.3 44.9 44.9 19.9 44.9 26.5 29.1 40.3 31.1 40.3 29.1 40.3 31.1 40.3 40.3 31.1 19.9 1417300000 27375000 202320000 34278000 231680000 29939000 67481000 40725000 20135000 32623000 5557100 23955000 47775000 67615000 3874500 9334300 4015400 4539000 1979800 6779600 18189000 38846000 59915000 0 97440000 8715900 592350 6013000 47067000 30254000 8488400 140190000 17028000 69494000 8233800 4850100 0 157480000 3041700 22480000 3808700 25742000 3326600 7497900 4525000 2237200 3624800 617450 2661700 5308300 7512800 430500 1037100 446160 504330 219980 753290 2020900 4316200 6657200 0 10827000 968430 65816 668110 5229700 3361500 943150 15577000 1892000 7721600 914860 538900 0 50 1953 5281;11312;12608;13906;22002;27372;30444;32296 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 45.1 54.1 54.1 47.5 48.4 43 20.6 15 25.3 43.2 53.9 47.5 54.1 43 40.9 8 6.2 7.6 32.9 55.8 55.3 56.6 39.5 41.6 11.7 2.9 11.5 46.9 51.6 51.6 49.4 39.3 36.4 6 1.4 8.4 51661000000 279690000 8449600000 6321300000 4816800000 636980000 405030000 40097000 14368000 11741000 40682000 1843000000 2398100000 2063800000 122230000 205660000 2679200 7105200 6116700 59558000 2750200000 4119200000 3801600000 137120000 181840000 2969700 4098200 1499300 361290000 4591200000 3302100000 3524000000 488180000 661880000 4799500 1650000 2672900 2246100000 12161000 367370000 274840000 209430000 27695000 17610000 1743400 624720 510470 1768800 80132000 104260000 89732000 5314300 8941900 116490 308920 265940 2589500 119580000 179090000 165290000 5961700 7905900 129120 178180 65185 15708000 199620000 143570000 153220000 21225000 28777000 208670 71741 116210 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uncharacterized protein YjhR yjhR sp|P39369|YJHR_ECOLI Putative uncharacterized protein YjhR OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yjhR PE=5 SV=1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 4.7 4.7 4.7 37.997 338 338 0.00369 1.8966 By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching 4.7 4.7 0 0 4.7 0 4.7 4.7 4.7 0 4.7 0 0 0 4.7 0 0 0 4.7 4.7 0 0 0 0 0 0 4.7 4.7 0 0 4.7 4.7 0 4.7 4.7 0 740150000 39703000 43030000 0 0 35549000 0 98140000 141820000 111150000 0 80036000 0 0 0 17362000 0 0 0 12433000 24591000 0 0 0 0 0 0 57157000 21865000 0 0 15166000 12565000 0 25120000 4462700 0 38955000 2089600 2264800 0 0 1871000 0 5165300 7464000 5849900 0 4212400 0 0 0 913800 0 0 0 654390 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N-acetylneuraminate epimerase nanM sp|P39371|NANM_ECOLI N-acetylneuraminate epimerase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=nanM PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 3.8 3.8 3.8 39.572 368 368 0.0029641 2.0539 By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 0 0 0 0 0 0 3.8 0 3.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.8 0 0 3.8 0 0 0 0 0 3.8 0 0 27382000 0 0 0 0 0 0 7588900 0 13254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2801300 0 0 1999300 0 0 0 0 0 1738500 0 0 1521200 0 0 0 0 0 0 421610 0 736350 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 155630 0 0 111070 0 0 0 0 0 96581 0 0 1 2030 22969 True 31414 837469;837470;837471;837472;837473 625005;625006 625006 P39375 P39375 3 3 3 Anti-adapter protein IraD iraD sp|P39375|IRAD_ECOLI Anti-adapter protein IraD OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=iraD PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 1 2 3 1 1 0 0 0 0 1 2 3 1 2 0 0 0 0 0 1 3 0 3 0 0 0 0 2 3 3 1 3 0 0 0 0 1 2 3 1 1 0 0 0 0 1 2 3 1 2 0 0 0 0 0 1 3 0 3 0 0 0 0 2 3 3 1 3 0 0 0 0 1 2 3 1 1 0 0 0 0 1 2 3 1 2 0 0 0 0 0 1 3 0 3 0 0 0 0 2 3 3 1 3 0 0 0 24.6 24.6 24.6 14.747 130 130 0 3.6625 By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 0 6.9 17.7 24.6 6.9 6.9 0 0 0 0 6.9 17.7 24.6 6.9 17.7 0 0 0 0 0 10.8 24.6 0 24.6 0 0 0 0 17.7 24.6 24.6 10.8 24.6 0 0 0 401730000 0 8037700 14944000 68454000 5651100 20051000 0 0 0 0 0 18724000 26171000 0 4609100 0 0 0 0 0 25920000 36710000 0 34056000 0 0 0 0 36627000 21366000 47345000 3229800 29832000 0 0 0 80345000 0 1607500 2988800 13691000 1130200 4010100 0 0 0 0 0 3744700 5234100 0 921810 0 0 0 0 0 5184100 7342000 0 6811300 0 0 0 0 7325300 4273200 9469100 645950 5966300 0 0 0 12 2031 12850;25437;27496 True;True;True 17042;17043;34624;37273 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.6 7.3 13.9 10.6 11.9 15.2 12.9 12.9 8.6 8.6 16.2 15.2 15.2 10.6 16.8 8.6 8.6 8.6 8.6 10.6 20.1 15.2 16.2 13.2 8.6 12.9 8.6 8.6 18.2 11.6 8.3 11.9 16.2 8.6 8.6 6.3 2462500000 32969000 208720000 248320000 365460000 59185000 102330000 75865000 52045000 62354000 9478200 49350000 44669000 131820000 10330000 29215000 9593300 11733000 8621600 10164000 18511000 83031000 94046000 14454000 40871000 15954000 8134400 10865000 20534000 67128000 124750000 169510000 25796000 224340000 9458500 5573300 7354400 164170000 2197900 13915000 16555000 24364000 3945700 6821800 5057600 3469700 4156900 631880 3290000 2977900 8787900 688650 1947600 639550 782220 574770 677610 1234100 5535400 6269700 963590 2724700 1063600 542300 724320 1368900 4475200 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(strain K12) OX=83333 GN=yjiN PE=4 SV=1 1 16 16 16 15 6 5 2 12 3 14 14 16 13 8 7 2 9 4 15 13 13 14 6 5 4 6 3 15 13 11 14 9 5 2 7 5 16 12 14 15 6 5 2 12 3 14 14 16 13 8 7 2 9 4 15 13 13 14 6 5 4 6 3 15 13 11 14 9 5 2 7 5 16 12 14 15 6 5 2 12 3 14 14 16 13 8 7 2 9 4 15 13 13 14 6 5 4 6 3 15 13 11 14 9 5 2 7 5 16 12 14 35.9 35.9 35.9 48.241 426 426 0 92.213 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 32.2 15.3 12 4.2 28.6 7 30.5 29.6 35.9 28.9 16.9 18.1 4.5 22.3 10.3 32.2 25.8 28.9 30.5 13.8 12.4 10.3 14.3 8 34.3 27.9 26.5 32.2 24.9 13.1 5.4 17.6 12.4 35.9 26.8 30.5 3914300000 320540000 175260000 103460000 52583000 276360000 19239000 515490000 327320000 418360000 52835000 52609000 112060000 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By MS/MS By MS/MS 48 48.4 48.4 45.2 48.4 48.4 48.4 37.1 46.4 46 48.4 48.4 48.4 48.4 48.4 41.5 37.1 37.1 29.4 34.7 48.4 45.6 45.6 48.4 37.5 29.4 35.5 37.5 48.4 42.3 41.9 48.4 48.4 35.5 29.4 37.1 29888000000 285990000 1530200000 2897400000 3329500000 1683900000 1632900000 665630000 304260000 770940000 79505000 525820000 2203400000 1631600000 589790000 760840000 59072000 83567000 66097000 113080000 309900000 1465600000 1417900000 391510000 1479100000 183320000 78979000 157280000 183390000 387800000 913180000 591230000 1155300000 1710200000 105700000 38111000 106280000 2988800000 28599000 153020000 289740000 332950000 168390000 163290000 66563000 30426000 77094000 7950500 52582000 220340000 163160000 58979000 76084000 5907200 8356700 6609700 11308000 30990000 146560000 141790000 39151000 147910000 18332000 7897900 15728000 18339000 38780000 91318000 59123000 115530000 171020000 10570000 3811100 10628000 131 2051 3001;3376;4159;8623;10835;18934;22338;24348;26147;29716;34199 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MS/MS By MS/MS 31.7 47.9 43.5 46.8 44.2 43.7 44.8 41.3 42.8 41.1 42.9 44.4 48.6 42.2 41.8 40.1 43.3 43.3 38.3 45.4 43.7 52.1 41 42.2 41.9 42.7 39.1 37.5 43.1 42.7 48.1 36.5 42.9 43.3 31.6 45.1 21794000000 125920000 1365400000 1700100000 2764400000 720300000 642590000 675070000 314140000 683860000 51046000 436960000 1502200000 1218400000 292620000 601680000 53432000 100160000 192430000 80402000 285010000 828980000 1197400000 158860000 566800000 177610000 89092000 126220000 186610000 592370000 660540000 1321500000 535760000 1130800000 121920000 40591000 252820000 506840000 2928400 31755000 39538000 64289000 16751000 14944000 15699000 7305600 15904000 1187100 10162000 34934000 28335000 6805200 13993000 1242600 2329300 4475000 1869800 6628100 19279000 27847000 3694300 13181000 4130400 2071900 2935300 4339800 13776000 15361000 30733000 12460000 26297000 2835500 943980 5879500 606 2127 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.7 36.1 36.4 36.4 36.3 25.6 27.8 26.6 36.4 26.6 35.9 37.5 38 29.2 30.4 22.7 22.7 15.6 18.2 30.6 33.3 39 18.6 23.4 25.6 24.4 30.6 26.3 35.9 34.9 37.5 32.1 28.9 28 16.5 30.4 8858900000 92148000 817280000 953350000 1288200000 320720000 166680000 265460000 153530000 288470000 29782000 162160000 455650000 519020000 44452000 84051000 31815000 44753000 24603000 25787000 123680000 288840000 461760000 31514000 175450000 88063000 44240000 60098000 56017000 330500000 342160000 632790000 122360000 211830000 55499000 19425000 46787000 305480000 3177500 28182000 32874000 44421000 11059000 5747600 9153700 5294000 9947400 1027000 5591700 15712000 17897000 1532800 2898300 1097100 1543200 848390 889220 4265000 9959900 15923000 1086700 6049900 3036600 1525500 2072400 1931600 11396000 11799000 21820000 4219400 7304600 1913800 669820 1613300 304 2200 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MS/MS 9.2 9.2 3.7 3.7 9.2 9.5 9.2 9.2 9.2 5.5 9.2 9.2 9.2 9.2 13.2 9.2 9.2 9.2 9.2 9.2 13.2 9.2 9.2 5.5 9.2 9.2 9.2 9.2 13.2 9.2 3.7 9.2 3.7 9.2 9.2 9.2 3497100000 206370000 375580000 149610000 100200000 239130000 101320000 279600000 237380000 312410000 9733800 62647000 125960000 43061000 38391000 82096000 55126000 55178000 47360000 56768000 41552000 76265000 53138000 35022000 8900900 90009000 55646000 77532000 76926000 116610000 41871000 38350000 50602000 26020000 50124000 26465000 54177000 269010000 15875000 28891000 11508000 7707800 18395000 7794000 21508000 18260000 24032000 748750 4819000 9689300 3312400 2953100 6315100 4240400 4244400 3643100 4366800 3196300 5866600 4087600 2694000 684680 6923800 4280500 5964000 5917400 8970300 3220800 2950000 3892400 2001500 3855700 2035700 4167400 58 2208 2466;16960;27899 True;True;True 3420;23099;37798 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Phosphatidylglycerol--prolipoprotein diacylglyceryl transferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=lgt PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 3 3 3 4 3 4 5 4 4 4 2 3 3 4 4 4 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 2 2 1 4 3 3 3 3 4 3 3 3 3 4 3 4 5 4 4 4 2 3 3 4 4 4 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 2 2 1 4 3 3 3 3 4 3 3 3 3 4 3 4 5 4 4 4 2 3 3 4 4 4 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 2 2 1 4 3 3 3 3 13.1 13.1 13.1 33.108 291 291 0 29.501 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.1 13.1 13.1 9.3 13.1 13.1 13.1 13.1 13.1 13.1 13.1 13.1 9.3 12.7 13.1 13.1 13.1 13.1 9.3 9.3 9.3 13.1 13.1 13.1 12.7 12.7 12.7 12.7 9.3 7.6 5.2 12.7 13.1 12.7 12.7 12.7 7785300000 343930000 362650000 327560000 392690000 563800000 223010000 785070000 519530000 965420000 85205000 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MS/MS By MS/MS 27.8 53.3 53.3 53.3 12.7 0 40.6 40.6 30.2 17.9 30.2 42.9 53.3 17.9 17 32.5 32.5 32.5 0 53.3 53.3 53.3 0 4.2 19.8 19.8 20.3 39.6 40.6 40.6 40.6 12.3 32.5 32.5 32.5 32.5 155650000000 0 14864000000 23174000000 28785000000 0 0 1072000000 502030000 915470000 0 4924100000 11606000000 10666000000 0 5471900 131780000 134810000 99994000 0 3915000000 9996800000 11586000000 0 5349600 250410000 167190000 198150000 2001000 9375900000 10296000000 12486000000 0 0 199520000 109020000 184870000 19457000000 0 1858000000 2896800000 3598100000 0 0 134000000 62754000 114430000 0 615520000 1450700000 1333200000 0 683990 16472000 16851000 12499000 0 489380000 1249600000 1448300000 0 668700 31301000 20898000 24768000 250130 1172000000 1287000000 1560700000 0 0 24940000 13627000 23109000 102 2220 6278;9420;14898;14899;15542;15543;18456;24324;33188;36332 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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Isoform ClpB-3 of Chaperone protein ClpB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=clpB 1 64 2 2 50 4 2 3 61 59 2 1 3 48 1 5 6 56 55 12 4 4 37 1 3 4 57 57 4 3 2 54 1 2 4 59 57 10 2 9 1 0 0 0 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 2 0 0 0 1 0 0 0 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 2 0 0 0 1 0 0 0 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 2 0 0 0 1 0 0 0 2 2 0 0 0 2 0 0 0 2 2 0 0 0 88.7 2 2 79.869 709 709 0 16.171 By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 70.7 5.2 2 6.1 85 85.5 4.8 1.1 5.1 68 2.1 7.8 8.9 86.9 81.1 21.7 5.2 7.1 59.4 1.8 4.5 8 83.1 83.4 8.6 6.1 2 75.7 2.5 3.9 6.6 82.4 83.4 19.2 3.5 17.3 346650000 4346100 0 0 0 62236000 49065000 0 0 0 2598700 0 0 0 9960600 20757000 0 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YecN yecN sp|P64515|YECN_ECOLI Inner membrane protein YecN OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yecN PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 12.2 12.2 12.2 15.226 131 131 0.0011287 2.6337 By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching 12.2 0 0 0 0 0 12.2 12.2 12.2 0 0 0 0 0 0 0 12.2 0 0 0 0 0 0 0 12.2 0 0 12.2 0 0 0 0 0 0 0 0 17247000 1338900 0 0 0 0 0 4609500 2306900 5849800 0 0 0 0 0 0 0 551010 0 0 0 0 0 0 0 1764400 0 0 826150 0 0 0 0 0 0 0 0 3449300 267770 0 0 0 0 0 921900 461380 1170000 0 0 0 0 0 0 0 110200 0 0 0 0 0 0 0 352870 0 0 165230 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2260 31926 True 43149 1143447;1143448;1143449;1143450;1143451;1143452;1143453 851404;851405 851405 P64517 P64517 3 3 3 Uncharacterized protein YodC yodC sp|P64517|YODC_ECOLI Uncharacterized protein 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Stationary-phase-induced ribosome-associated protein sra sp|P68191|SRA_ECOLI Stationary-phase-induced ribosome-associated protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=sra PE=1 SV=1 1 4 4 4 4 4 4 2 4 4 4 4 4 4 4 4 2 4 3 4 4 4 4 4 2 2 3 3 4 4 4 4 3 4 3 4 3 4 4 4 4 4 4 2 4 4 4 4 4 4 4 4 2 4 3 4 4 4 4 4 2 2 3 3 4 4 4 4 3 4 3 4 3 4 4 4 4 4 4 2 4 4 4 4 4 4 4 4 2 4 3 4 4 4 4 4 2 2 3 3 4 4 4 4 3 4 3 4 3 4 4 4 57.8 57.8 57.8 5.0958 45 45 0 18.084 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 57.8 57.8 57.8 40 57.8 57.8 57.8 57.8 57.8 57.8 57.8 57.8 40 57.8 42.2 57.8 57.8 57.8 57.8 57.8 40 40 42.2 42.2 57.8 57.8 57.8 57.8 55.6 57.8 55.6 57.8 55.6 57.8 57.8 57.8 8513200000 345100000 365930000 331350000 177400000 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Outer membrane lipoprotein RcsF rcsF sp|P69411|RCSF_ECOLI Outer membrane lipoprotein RcsF OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rcsF PE=1 SV=1 1 5 5 5 4 3 2 2 4 2 4 5 3 4 4 3 3 1 2 3 4 4 5 3 3 4 2 2 3 3 2 5 4 3 2 4 3 4 3 5 4 3 2 2 4 2 4 5 3 4 4 3 3 1 2 3 4 4 5 3 3 4 2 2 3 3 2 5 4 3 2 4 3 4 3 5 4 3 2 2 4 2 4 5 3 4 4 3 3 1 2 3 4 4 5 3 3 4 2 2 3 3 2 5 4 3 2 4 3 4 3 5 26.9 26.9 26.9 14.163 134 134 0 54.537 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 26.9 16.4 15.7 15.7 26.9 20.9 26.9 26.9 26.9 26.1 26.9 16.4 26.1 10.4 16.4 20.9 26.9 26.9 26.9 20.9 26.1 26.9 20.9 16.4 20.9 20.9 18.7 26.9 26.9 26.1 15.7 26.9 16.4 26.1 20.9 26.9 1276900000 36937000 87564000 41584000 57703000 55656000 27104000 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P69503 P69503 11 11 11 Adenine phosphoribosyltransferase apt sp|P69503|APT_ECOLI Adenine phosphoribosyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=apt PE=1 SV=1 1 11 11 11 4 7 8 6 6 7 10 6 10 4 7 8 7 8 7 3 3 3 4 7 9 7 8 5 5 4 6 6 6 7 4 8 5 4 3 5 4 7 8 6 6 7 10 6 10 4 7 8 7 8 7 3 3 3 4 7 9 7 8 5 5 4 6 6 6 7 4 8 5 4 3 5 4 7 8 6 6 7 10 6 10 4 7 8 7 8 7 3 3 3 4 7 9 7 8 5 5 4 6 6 6 7 4 8 5 4 3 5 74.3 74.3 74.3 19.859 183 183 0 77.518 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 19.7 47 62.3 36.6 33.9 43.2 72.1 36.6 72.1 19.7 49.7 49.2 50.3 49.2 49.7 19.1 19.1 19.1 19.7 37.2 56.8 47 50.3 32.8 26.2 23 36.6 26.8 26.8 47 25.1 50.3 26.8 23 24 36.1 4056900000 23020000 301840000 403590000 355850000 166530000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 42.6 31.1 63.9 63.9 73.8 63.9 73.8 73.8 73.8 42.6 73.8 42.6 31.1 63.9 63.9 42.6 42.6 42.6 11.5 73.8 73.8 42.6 31.1 63.9 42.6 31.1 31.1 42.6 42.6 42.6 42.6 42.6 31.1 42.6 31.1 42.6 345900000 1981800 0 59385000 49805000 11955000 13599000 37237000 6921900 29808000 462110 7987000 7780000 0 796290 1775700 982370 2104100 730410 0 10548000 23616000 9265200 0 8646800 4745200 0 0 6298100 10480000 9971900 15047000 4467900 0 4975500 0 4525900 172950000 990910 0 29692000 24902000 5977700 6799300 18619000 3460900 14904000 231060 3993500 3890000 0 398140 887870 491180 1052100 365210 0 5273900 11808000 4632600 0 4323400 2372600 0 0 3149000 5240200 4986000 7523700 2233900 0 2487700 0 2262900 17 2355 7819;13679;20994;27218 True;True;True;True 10337;10338;18344;18345;28604;36933 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Putative 2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate aldolase YagE OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yagE PE=1 SV=2 1 8 8 8 1 6 7 6 7 6 0 2 1 2 5 7 6 4 7 1 1 0 2 3 5 6 6 5 0 3 1 1 2 7 6 6 6 1 1 1 1 6 7 6 7 6 0 2 1 2 5 7 6 4 7 1 1 0 2 3 5 6 6 5 0 3 1 1 2 7 6 6 6 1 1 1 1 6 7 6 7 6 0 2 1 2 5 7 6 4 7 1 1 0 2 3 5 6 6 5 0 3 1 1 2 7 6 6 6 1 1 1 23.5 23.5 23.5 32.53 302 302 0 40.232 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 3.3 23.5 23.5 20.9 23.5 20.2 0 5 3.3 5 20.5 23.5 21.2 15.2 23.5 2.6 3.3 0 5.6 8.3 17.5 23.5 20.9 18.5 0 8.3 2.3 2.3 6 23.5 21.2 20.9 20.9 2.6 2.3 2.3 2534900000 682900 208360000 182380000 406200000 125100000 180180000 0 7361400 3666900 1444900 32049000 163560000 156030000 17025000 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hydroxylase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ubiF PE=1 SV=1 1 16 16 16 10 12 14 12 13 13 13 12 13 10 12 14 14 12 12 10 10 10 9 11 11 11 11 10 9 10 10 11 10 11 11 13 12 11 9 11 10 12 14 12 13 13 13 12 13 10 12 14 14 12 12 10 10 10 9 11 11 11 11 10 9 10 10 11 10 11 11 13 12 11 9 11 10 12 14 12 13 13 13 12 13 10 12 14 14 12 12 10 10 10 9 11 11 11 11 10 9 10 10 11 10 11 11 13 12 11 9 11 50.6 50.6 50.6 42.953 391 391 0 290.51 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.1 47.1 47.3 36.6 38.9 36.6 38.9 32.2 32.2 27.1 38.9 47.3 47.3 32.2 40.7 27.1 27.1 27.1 26.3 37.1 33.8 33.8 30.4 33.2 26.6 26.9 26.9 33.5 33.8 40.7 32.2 42.2 42.2 30.4 23.8 30.4 17266000000 177460000 1274500000 2136800000 2279300000 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 30.8 29.2 37.3 34.4 37.3 34.4 30.8 26.3 26.3 26.3 32.8 29.9 34.4 33.8 26.3 19.5 10.7 19.2 31.5 29.9 34.4 34.4 30.8 37.3 26.9 29.9 19.5 29.9 29.9 29.9 28.9 32.8 32.8 29.9 3.9 29.9 4702100000 25447000 329380000 557700000 797830000 175530000 234880000 80476000 30692000 71667000 9805400 74992000 177970000 225360000 27555000 42424000 1547500 8613300 5381400 6286700 71664000 172760000 262920000 29913000 219870000 14171000 8267000 6881500 31994000 132980000 163090000 364640000 98959000 212560000 15115000 1194400 11584000 391840000 2120600 27448000 46475000 66486000 14628000 19573000 6706400 2557700 5972300 817120 6249300 14831000 18780000 2296300 3535400 128960 717770 448450 523890 5972000 14397000 21910000 2492800 18322000 1180900 688920 573460 2666200 11082000 13591000 30387000 8246600 17713000 1259600 99537 965360 163 2377 2122;7452;8567;9208;9928;24329;25657;35271 True;True;True;True;True;True;True;True 2924;9887;11268;12142;12143;13111;33178;34904;47593 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P75800 P75800 30 30 30 Putative cyclic di-GMP phosphodiesterase YliE yliE sp|P75800|PDEI_ECOLI Probable cyclic di-GMP phosphodiesterase PdeI OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pdeI PE=1 SV=1 1 30 30 30 22 12 8 6 21 7 25 29 26 20 15 13 13 11 9 23 23 20 16 15 9 11 11 6 20 24 17 17 13 9 8 11 8 20 20 17 22 12 8 6 21 7 25 29 26 20 15 13 13 11 9 23 23 20 16 15 9 11 11 6 20 24 17 17 13 9 8 11 8 20 20 17 22 12 8 6 21 7 25 29 26 20 15 13 13 11 9 23 23 20 16 15 9 11 11 6 20 24 17 17 13 9 8 11 8 20 20 17 42.5 42.5 42.5 90.048 782 782 0 227.76 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 28.3 16.2 10 6.5 28 9.8 34 39.9 34.9 26.9 18.5 15.1 16.5 14.1 11.6 29.3 29.7 24.4 19.4 20.1 11 13.8 12.9 8.8 26.7 32.2 23.7 24.8 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By MS/MS By MS/MS By MS/MS 30.8 21.7 18.3 9.3 20.8 18.6 26.7 30.8 26.7 26.7 18.6 18.6 18.6 20.8 18.6 28.3 24.2 24.2 20.4 18.3 14 11.8 20.8 13.1 26.7 30.8 26.7 24.2 20.8 14.7 13.1 17 14.7 24.2 17 24.2 3501300000 211040000 359920000 113600000 63170000 225800000 68173000 345870000 302750000 365330000 48918000 55366000 118860000 56046000 38232000 30751000 54790000 41147000 38098000 56841000 28582000 35699000 44965000 30042000 18532000 84411000 63550000 54095000 111370000 109010000 26078000 53556000 42008000 35642000 76172000 27795000 65069000 166730000 10049000 17139000 5409600 3008100 10752000 3246300 16470000 14417000 17397000 2329400 2636500 5659900 2668900 1820600 1464400 2609000 1959400 1814200 2706700 1361100 1699900 2141200 1430600 882480 4019600 3026200 2575900 5303600 5191200 1241800 2550300 2000400 1697200 3627300 1323600 3098500 214 2388 5692;10301;20331;22231;22446;23034;23880;25464;27814;28809;29978;33010;33011 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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ATP-binding/permease protein MacB macB sp|P75831|MACB_ECOLI Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=macB PE=1 SV=1 1 24 24 24 18 7 4 5 16 10 21 20 19 18 11 10 7 10 7 18 16 17 16 8 4 8 10 7 17 18 17 16 8 7 5 10 6 17 17 19 18 7 4 5 16 10 21 20 19 18 11 10 7 10 7 18 16 17 16 8 4 8 10 7 17 18 17 16 8 7 5 10 6 17 17 19 18 7 4 5 16 10 21 20 19 18 11 10 7 10 7 18 16 17 16 8 4 8 10 7 17 18 17 16 8 7 5 10 6 17 17 19 44.9 44.9 44.9 70.702 648 648 0 253.38 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 34.7 15.1 9 9.6 32.1 21.1 39.7 37 35.8 34.1 21.6 19.6 14.4 19.6 15.1 34.4 28.9 30.1 29.2 17.3 8.5 16.7 20.1 15.6 32.9 35.2 30.1 33.6 16.4 15.1 11.6 20.5 13.7 33.6 33.3 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methylthiotransferase accessory factor YcaO ycaO sp|P75838|YCAO_ECOLI Ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ycaO PE=1 SV=2 1 17 17 17 15 10 10 7 13 9 14 17 14 12 10 8 10 9 11 12 10 11 10 9 9 10 10 10 11 11 12 13 10 8 8 10 11 11 8 11 15 10 10 7 13 9 14 17 14 12 10 8 10 9 11 12 10 11 10 9 9 10 10 10 11 11 12 13 10 8 8 10 11 11 8 11 15 10 10 7 13 9 14 17 14 12 10 8 10 9 11 12 10 11 10 9 9 10 10 10 11 11 12 13 10 8 8 10 11 11 8 11 42.5 42.5 42.5 65.651 586 586 0 168.99 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 31.4 22.9 23.7 17.1 28.3 21.3 35.3 42.5 35.3 23.7 23.4 20.5 25.1 23.4 25.1 23.7 20 22 22.9 23 20.3 28.8 24.7 24.7 24.6 24.6 28 29.5 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By MS/MS 63.5 75.3 65.1 57.7 78.2 70.8 70.8 78.2 70.8 42.3 70.8 76 67.3 67.3 67.3 46.2 38.8 46.2 16 56.7 64.7 63.5 53.2 57.1 38.8 34.9 39.1 49.7 54.8 65.1 64.4 47.4 76 53.5 31.1 35.9 23894000000 169230000 1757100000 1945300000 3200800000 848880000 1097700000 335480000 143070000 393570000 35027000 480980000 1427700000 2274900000 87388000 345240000 27481000 24967000 22838000 13683000 209240000 761830000 1397700000 100020000 782760000 55469000 18850000 42425000 130260000 617320000 992020000 2691600000 354910000 1034900000 43732000 5072400 24707000 1257600000 8906700 92479000 102390000 168470000 44678000 57771000 17657000 7530100 20714000 1843500 25315000 75141000 119730000 4599300 18171000 1446400 1314100 1202000 720140 11012000 40096000 73561000 5264300 41198000 2919400 992080 2232900 6855600 32491000 52212000 141660000 18680000 54470000 2301700 266970 1300400 245 2419 3311;9568;11556;14582;16700;18714;18892;27915;29394;29395;30225;31856;31857;33136;34268 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synthase E rluE sp|P75966|RLUE_ECOLI Ribosomal large subunit pseudouridine synthase E OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rluE PE=1 SV=2 1 11 11 11 2 9 8 9 5 6 0 2 1 2 5 8 8 7 9 2 2 2 2 3 9 6 8 10 1 2 3 3 7 9 6 10 8 1 1 2 2 9 8 9 5 6 0 2 1 2 5 8 8 7 9 2 2 2 2 3 9 6 8 10 1 2 3 3 7 9 6 10 8 1 1 2 2 9 8 9 5 6 0 2 1 2 5 8 8 7 9 2 2 2 2 3 9 6 8 10 1 2 3 3 7 9 6 10 8 1 1 2 55.8 55.8 55.8 24.88 217 217 0 129.63 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 9.2 46.5 52.1 55.8 35.5 43.8 0 9.2 6 15.7 31.3 52.5 52.5 42.4 52.1 15.7 9.2 11.5 9.2 12.9 55.8 33.6 36.9 55.8 6 9.2 14.3 18.9 52.1 52.5 52.5 55.8 52.1 6 6 15.7 2065500000 119710000 220720000 263020000 317550000 29602000 64273000 0 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354709;416336;714161 P75974 P75974 5 5 5 Putative lambdoid prophage e14 repressor protein C2 cohE sp|P75974|COHE_ECOLI Prophage repressor CohE OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cohE PE=4 SV=1 1 5 5 5 1 1 1 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 0 3 0 1 1 1 1 2 2 0 1 0 2 2 1 1 1 1 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 0 3 0 1 1 1 1 2 2 0 1 0 2 2 1 1 1 1 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 0 3 0 1 1 1 1 2 2 0 1 0 2 2 1 25.9 25.9 25.9 25.094 224 224 0.0036955 1.9594 By matching By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 4 5.4 5.4 0 0 0 5.4 5.4 8.9 5.4 9.4 5.4 5.4 13.4 8 4.9 5.4 4.9 4 9.4 9.4 0 18.3 0 4 5.4 4.9 4 9.4 9.4 0 5.4 0 9.4 9.4 5.4 467650000 3190800 26264000 31651000 0 0 0 9920300 1975500 9058000 748250 10652000 92725000 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protein YcgX ycgX sp|P75988|YCGX_ECOLI Uncharacterized protein YcgX OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ycgX PE=4 SV=1 1 2 2 2 1 1 0 1 1 2 2 2 1 1 2 0 0 1 1 1 1 1 1 2 0 0 1 0 2 2 0 1 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 2 2 2 1 1 2 0 0 1 1 1 1 1 1 2 0 0 1 0 2 2 0 1 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 2 2 2 1 1 2 0 0 1 1 1 1 1 1 2 0 0 1 0 2 2 0 1 1 0 0 1 1 1 0 1 14.2 14.2 14.2 15.769 134 134 0 5.8016 By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching 9 5.2 0 5.2 9 14.2 14.2 14.2 9 9 14.2 0 0 5.2 5.2 9 9 9 5.2 14.2 0 0 5.2 0 14.2 14.2 0 9 5.2 0 0 5.2 5.2 9 0 9 120040000 1898300 10966000 0 12807000 5449600 23015000 5529000 6258000 5046300 921430 13621000 0 0 1437400 1690500 633560 398590 370370 407050 9977600 0 0 431990 0 1534600 1207100 0 3176600 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sp|P76055|TTCA_ECOLI tRNA-cytidine(32) 2-sulfurtransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ttcA PE=1 SV=1 1 9 9 9 4 5 6 5 5 7 7 4 7 4 4 5 6 4 5 5 3 4 3 6 5 5 6 8 6 6 7 4 5 5 5 5 6 6 3 5 4 5 6 5 5 7 7 4 7 4 4 5 6 4 5 5 3 4 3 6 5 5 6 8 6 6 7 4 5 5 5 5 6 6 3 5 4 5 6 5 5 7 7 4 7 4 4 5 6 4 5 5 3 4 3 6 5 5 6 8 6 6 7 4 5 5 5 5 6 6 3 5 33.8 33.8 33.8 35.561 311 311 0 54.451 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.5 19.9 23.5 20.3 17 24.4 27.7 13.5 27.7 13.5 13.5 19.9 24.8 13.5 19.9 16.4 11.3 14.1 9.3 22.8 19.9 19.9 22.8 30.2 23.8 23.8 27.7 12.5 19.9 19.9 19.9 19.9 24.8 21.2 9.3 17.7 1467600000 6476000 95751000 123490000 245380000 40155000 197670000 40758000 11818000 57675000 1356400 15353000 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OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=mnaT PE=1 SV=1 1 3 3 3 3 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 0 1 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 3 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 0 1 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 3 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 0 1 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 19.2 19.2 19.2 19.247 172 172 0 28.386 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching 19.2 13.4 13.4 13.4 19.2 19.2 9.9 13.4 13.4 13.4 13.4 9.3 13.4 13.4 13.4 0 4.1 0 4.1 4.1 13.4 13.4 4.1 4.1 4.1 4.1 4.1 4.1 13.4 9.3 9.3 13.4 13.4 4.1 4.1 4.1 3262700000 26438000 397610000 588470000 785650000 266310000 236300000 15288000 15642000 14148000 3191200 35842000 106750000 137120000 38114000 77881000 0 2533700 0 4248600 0 78838000 96698000 2505400 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MS/MS 65.9 57.2 44.3 31.1 60.8 54.8 65.3 63.2 63.8 61.4 52.7 61.4 56.9 52.7 46.4 63.8 50 50 52.7 46.4 46.4 65.6 54.2 57.2 65.9 54.2 65.6 63.2 57.2 41.9 57.2 52.7 57.2 65.9 39.2 65.9 10239000000 279640000 601230000 508620000 652050000 232010000 306020000 895450000 314380000 983730000 48648000 150920000 331540000 393450000 66224000 155350000 69610000 73421000 77261000 76886000 101590000 195240000 1133100000 61372000 261530000 182390000 49247000 161300000 154630000 212660000 213680000 497580000 148440000 290330000 159920000 44761000 154720000 731350000 19975000 42945000 36330000 46575000 16572000 21859000 63961000 22456000 70266000 3474800 10780000 23681000 28104000 4730300 11097000 4972100 5244400 5518700 5491800 7256600 13946000 80933000 4383700 18681000 13028000 3517600 11522000 11045000 15190000 15263000 35542000 10603000 20738000 11423000 3197200 11051000 340 2496 1310;1816;3269;14488;16126;18829;19952;19953;21161;22627;23512;24415;25867;26115;32816;34136;36120;36228 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Uncharacterized protein YeaC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yeaC PE=4 SV=2 1 8 8 8 5 8 8 7 8 8 4 4 3 5 8 7 8 4 8 2 3 1 2 7 8 8 6 7 5 4 4 6 7 7 6 4 7 3 3 2 5 8 8 7 8 8 4 4 3 5 8 7 8 4 8 2 3 1 2 7 8 8 6 7 5 4 4 6 7 7 6 4 7 3 3 2 5 8 8 7 8 8 4 4 3 5 8 7 8 4 8 2 3 1 2 7 8 8 6 7 5 4 4 6 7 7 6 4 7 3 3 2 93.3 93.3 93.3 10.338 90 90 0 195.01 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 38.9 93.3 93.3 78.9 93.3 93.3 38.9 38.9 38.9 38.9 93.3 78.9 93.3 38.9 93.3 18.9 25.6 10 18.9 78.9 93.3 93.3 60 74.4 38.9 38.9 38.9 57.8 78.9 78.9 60 44.4 78.9 38.9 25.6 18.9 15286000000 32316000 1713400000 1415800000 3104500000 380000000 1041500000 15058000 9851000 8788200 7294300 361200000 679250000 1087200000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.5 36.3 40.7 47.1 46.3 46.3 25.8 16.6 28.3 17.5 23 41.3 46.3 28.8 36.3 17.7 17.7 17.7 17.5 23 32.4 41 33.8 38.2 17.2 17.5 19.1 18 21.1 24.4 36.3 41.6 43.5 14.4 11.1 14.7 8569300000 57007000 361540000 701320000 1722600000 399190000 919790000 68598000 35630000 82247000 6383600 54874000 415540000 450290000 83741000 242890000 10880000 5110400 4691100 6408100 52787000 191230000 479680000 94807000 475310000 13517000 5087000 9382800 22419000 106170000 219400000 457060000 257520000 536430000 8940000 2626200 8240500 408060000 2714600 17216000 33396000 82026000 19009000 43799000 3266600 1696600 3916500 303980 2613000 19788000 21442000 3987700 11566000 518110 243350 223390 305150 2513700 9106100 22842000 4514600 22634000 643690 242240 446800 1067600 5055700 10448000 21765000 12263000 25544000 425710 125060 392410 192 2513 6031;7098;7763;8232;9335;12845;17028;21130;24507;25125;26049;28623;29948;33247;33534;35151;35152;35153 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ATP-dependent helicase YoaA yoaA sp|P76257|YOAA_ECOLI Probable ATP-dependent DNA helicase YoaA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yoaA PE=1 SV=1 1 26 26 26 5 18 15 18 10 16 2 7 5 10 14 15 17 8 17 6 8 7 7 13 13 17 8 18 4 9 7 12 14 15 16 13 16 6 7 6 5 18 15 18 10 16 2 7 5 10 14 15 17 8 17 6 8 7 7 13 13 17 8 18 4 9 7 12 14 15 16 13 16 6 7 6 5 18 15 18 10 16 2 7 5 10 14 15 17 8 17 6 8 7 7 13 13 17 8 18 4 9 7 12 14 15 16 13 16 6 7 6 43.1 43.1 43.1 70.377 636 636 0 91.696 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS 8.3 31.9 27.5 31.1 16 28.8 2.8 11.3 9.4 17 25.5 29.1 32.7 13.7 29.4 9.7 13.1 12.1 11.6 23.7 24.2 28.5 13.4 29.9 7.2 14.9 11.6 22.5 25.9 28.9 30.5 23.6 28 9.4 11.3 9.7 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Uncharacterized sugar kinase YegV yegV sp|P76419|YEGV_ECOLI Uncharacterized sugar kinase YegV OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yegV PE=3 SV=1 1 5 5 5 4 1 0 0 1 0 5 4 4 4 2 1 1 3 1 3 4 3 3 1 1 0 3 1 4 5 2 3 2 0 0 1 0 5 4 4 4 1 0 0 1 0 5 4 4 4 2 1 1 3 1 3 4 3 3 1 1 0 3 1 4 5 2 3 2 0 0 1 0 5 4 4 4 1 0 0 1 0 5 4 4 4 2 1 1 3 1 3 4 3 3 1 1 0 3 1 4 5 2 3 2 0 0 1 0 5 4 4 14 14 14 34.385 321 321 0 8.4786 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 13.1 2.5 0 0 2.5 0 14 13.1 13.1 13.1 5.9 2.5 2.5 6.9 2.5 9.3 10.3 9.3 9.3 3.7 2.5 0 6.9 2.5 13.1 14 5.9 9.7 3.4 0 0 3.4 0 14 10.3 10.3 405290000 26915000 24888000 0 0 18144000 0 63127000 41894000 61265000 5591300 7877100 11631000 4380300 5985700 2442800 5414000 12029000 7224100 7953200 1801300 5346500 0 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P76506 P76506 6 6 6 Probable phospholipid-binding lipoprotein MlaA mlaA sp|P76506|MLAA_ECOLI Intermembrane phospholipid transport system lipoprotein MlaA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=mlaA PE=1 SV=1 1 6 6 6 5 6 3 4 4 4 6 6 6 6 5 5 5 3 5 5 5 5 3 5 4 5 3 4 5 4 5 4 5 3 4 3 3 6 5 6 5 6 3 4 4 4 6 6 6 6 5 5 5 3 5 5 5 5 3 5 4 5 3 4 5 4 5 4 5 3 4 3 3 6 5 6 5 6 3 4 4 4 6 6 6 6 5 5 5 3 5 5 5 5 3 5 4 5 3 4 5 4 5 4 5 3 4 3 3 6 5 6 29.1 29.1 29.1 28.041 251 251 0 18.719 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 24.7 29.1 11.2 14.3 21.1 15.1 29.1 29.1 29.1 29.1 25.5 24.7 18.7 10.8 25.5 25.5 25.5 25.5 10.8 25.5 15.1 18.7 10.8 15.1 18.7 15.1 18.7 15.1 25.5 10.8 15.1 10.8 11.2 29.1 18.7 29.1 2983800000 62029000 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Uncharacterized protein YfdI OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yfdI PE=4 SV=1 1 11 11 11 10 11 8 6 10 8 10 11 10 10 8 10 9 10 9 10 10 10 8 7 10 9 10 8 9 9 10 9 8 9 9 10 9 9 6 8 10 11 8 6 10 8 10 11 10 10 8 10 9 10 9 10 10 10 8 7 10 9 10 8 9 9 10 9 8 9 9 10 9 9 6 8 10 11 8 6 10 8 10 11 10 10 8 10 9 10 9 10 10 10 8 7 10 9 10 8 9 9 10 9 8 9 9 10 9 9 6 8 25.5 25.5 25.5 51.483 443 443 0 126.67 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 21.4 25.5 19 16 25.3 21.2 25.3 25.5 23.3 21.4 19 23.3 19.2 25.3 23.7 21.4 21.4 21.4 16 16 25.3 21.7 25.3 21.4 21.2 21.2 25.3 23 17.6 21.7 21.7 23.3 19.2 23 14.7 19 19427000000 563770000 1706600000 1185700000 1162600000 1718400000 383570000 1466200000 752570000 1810600000 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536551;623228 P77179 P77179 1 1 1 Electron transport complex subunit RsxE rsxE sp|P77179|RSXE_ECOLI Ion-translocating oxidoreductase complex subunit E OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=rsxE PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 3.9 3.9 3.9 24.459 231 231 0.0022305 2.2224 By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching 3.9 0 0 0 3.9 0 3.9 3.9 3.9 3.9 0 3.9 0 0 0 3.9 3.9 3.9 3.9 0 3.9 0 0 0 3.9 3.9 3.9 3.9 0 0 0 0 0 3.9 3.9 3.9 120510000 13549000 0 0 0 17727000 0 16410000 9645600 18355000 2156400 0 7835700 0 0 0 2793700 2371000 1782900 2384800 0 4360200 0 0 0 3423700 2574500 2684400 4725200 0 0 0 0 0 3075700 1260400 3393000 15064000 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sp|P77293|GTRB_ECOLI Prophage bactoprenol glucosyl transferase homolog OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yfdH PE=1 SV=1 1 11 11 11 7 7 7 8 7 7 9 8 9 9 9 7 7 7 7 7 8 7 7 7 6 6 6 5 9 8 8 8 9 6 7 8 6 7 8 8 7 7 7 8 7 7 9 8 9 9 9 7 7 7 7 7 8 7 7 7 6 6 6 5 9 8 8 8 9 6 7 8 6 7 8 8 7 7 7 8 7 7 9 8 9 9 9 7 7 7 7 7 8 7 7 7 6 6 6 5 9 8 8 8 9 6 7 8 6 7 8 8 39.5 39.5 39.5 34.635 306 306 0 78.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.6 21.9 19.6 25.8 25.2 24.5 35.9 27.1 33.7 25.5 31.7 23.5 23.5 23.5 23.2 19.6 20.9 19.6 19.6 28.8 17.3 17.3 20.9 14.7 33.7 20.9 25.8 27.1 35 17.3 23.5 27.1 21.6 19.6 20.9 20.9 6342700000 421430000 489440000 203900000 462130000 344690000 124350000 735710000 212940000 565440000 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MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.4 13.1 4.4 4.4 12.3 8.7 16.3 16.3 16.3 9.1 4.4 15.5 13.1 4.4 9.1 4.4 4.4 0 4.4 4.8 4.4 10.7 0 4.4 17.5 0 13.1 21.8 13.1 10.7 6.3 13.1 8.7 4.4 4.4 13.1 329340000 1503100 32323000 12329000 17268000 8437500 6189500 28888000 12721000 31207000 850100 3758300 17627000 6364400 1198800 3882900 827370 1640200 0 0 1370200 4155100 23476000 0 3291600 7453600 0 3441600 7975300 14660000 18439000 33864000 6575200 8210800 4486600 1524700 3400300 20584000 93944 2020200 770590 1079200 527340 386850 1805500 795070 1950400 53131 234890 1101700 397770 74923 242680 51711 102510 0 0 85638 259690 1467300 0 205730 465850 0 215100 498460 916280 1152400 2116500 410950 513170 280410 95293 212520 16 2620 5733;7232;15929;23559;26670;30571;31965 True;True;True;True;True;True;True 7630;9607;21805;32189;36248;41375;43201 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24 26 24 24 14 15 16 12 17 21 25 20 29 15 16 12 19 14 20 24 20 25 16 14 14 22 22 23 28 25 30 17 20 20 15 19 24 26 24 24 14 15 16 12 17 21 25 20 29 15 16 12 19 14 20 24 20 25 16 14 14 22 22 23 28 25 30 17 20 20 15 19 24 26 24 24 14 15 16 12 17 21 25 20 29 15 16 12 19 14 20 24 20 25 16 14 14 58.2 58.2 58.2 74.288 660 660 0 319.25 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 37.1 36.4 38.8 46.8 40.9 50 27.6 35 33 25.9 32.3 40.5 45.3 37.6 41.4 23.8 25 25.2 17.6 28.2 34.7 40.8 34.5 46.1 24.4 26.2 17.6 31.4 22.6 33.9 42.3 32.4 43.6 25.8 22 23.3 19228000000 219290000 909460000 1301200000 3005900000 846280000 2054000000 299440000 140610000 367850000 29401000 243390000 661230000 1216200000 158440000 670350000 25015000 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matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching 1 4.1 2.4 4.1 1 2.6 1 1 1 1 1 2.4 2.4 2.4 4.1 1 1 1 1 1 2.4 4.1 1 2.6 1 1 2.6 1 2.4 2.4 2.4 2.4 4.1 1 1 1 749050000 0 122300000 72130000 88681000 0 7066600 0 0 0 0 0 26017000 20095000 1389500 14336000 0 0 0 0 0 83892000 73251000 0 6956100 0 0 1061200 0 76117000 70442000 72848000 5086100 7388000 0 0 0 20245000 0 3305300 1949500 2396800 0 190990 0 0 0 0 0 703160 543120 37555 387460 0 0 0 0 0 2267400 1979800 0 188000 0 0 28682 0 2057200 1903800 1968900 137460 199680 0 0 0 5 + 2647 21048;30685;34113 True;False;True 28691;41511;41512;46109 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Cysteine desulfurase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=sufS PE=1 SV=1 1 15 15 15 10 12 11 13 10 11 12 8 12 8 12 13 14 10 12 9 5 5 7 12 12 13 9 10 8 7 8 13 12 13 12 12 11 9 5 8 10 12 11 13 10 11 12 8 12 8 12 13 14 10 12 9 5 5 7 12 12 13 9 10 8 7 8 13 12 13 12 12 11 9 5 8 10 12 11 13 10 11 12 8 12 8 12 13 14 10 12 9 5 5 7 12 12 13 9 10 8 7 8 13 12 13 12 12 11 9 5 8 52.7 52.7 52.7 44.433 406 406 0 297.44 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 36.2 42.1 40.4 44.8 35.2 42.9 46.1 32 46.1 31.5 39.9 44.3 46.6 34.5 46.3 33.7 15.3 15.3 21.2 39.9 39.9 42.1 31.8 36.7 24.6 24.6 29.6 42.1 39.9 42.1 39.9 39.9 39.9 33.7 12.8 29.8 5750900000 39710000 477930000 393180000 975070000 109940000 126620000 131960000 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K12) OX=83333 GN=cusS PE=1 SV=1 1 27 27 27 25 14 7 7 15 5 19 26 23 22 16 13 8 12 12 21 20 17 19 13 5 9 12 5 22 21 23 19 18 6 8 15 9 21 17 21 25 14 7 7 15 5 19 26 23 22 16 13 8 12 12 21 20 17 19 13 5 9 12 5 22 21 23 19 18 6 8 15 9 21 17 21 25 14 7 7 15 5 19 26 23 22 16 13 8 12 12 21 20 17 19 13 5 9 12 5 22 21 23 19 18 6 8 15 9 21 17 21 55.4 55.4 55.4 53.737 480 480 0 180.41 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 55.2 32.9 16 16.2 31.9 8.8 39.2 54 46.2 46 36.5 28.8 17.9 25 25.6 39.6 35.2 35.4 37.5 28.8 9.8 21.5 24 11 41.5 42.5 46.2 40 39.6 11.7 20 35 19.4 42.1 31.9 42.1 14059000000 732340000 942910000 287950000 253250000 484700000 36460000 1235600000 1331300000 1982100000 207490000 244040000 203670000 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Glutathione S-transferase YfcF OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yfcF PE=1 SV=1 1 11 11 11 10 9 9 9 11 9 10 10 10 9 10 11 11 10 11 8 10 9 7 9 10 10 10 9 9 10 10 10 9 8 8 11 11 7 9 8 10 9 9 9 11 9 10 10 10 9 10 11 11 10 11 8 10 9 7 9 10 10 10 9 9 10 10 10 9 8 8 11 11 7 9 8 10 9 9 9 11 9 10 10 10 9 10 11 11 10 11 8 10 9 7 9 10 10 10 9 9 10 10 10 9 8 8 11 11 7 9 8 51.4 51.4 51.4 24.325 214 214 0 71.298 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 51.4 47.2 47.2 46.3 51.4 48.1 51.4 51.4 51.4 47.7 51.4 51.4 51.4 51.4 51.4 43.5 51.4 47.7 28 48.1 51.4 51.4 51.4 47.2 42.1 51.4 51.4 51.4 46.3 43 40.2 51.4 51.4 40.2 47.7 43.5 6511300000 98666000 133220000 362090000 481780000 579290000 355900000 205990000 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coli (strain K12) OX=83333 GN=ybaY PE=1 SV=1 1 6 6 6 3 4 2 2 4 3 5 6 6 3 4 4 3 3 2 2 1 1 4 4 2 4 2 3 6 3 6 5 3 2 3 4 1 4 2 4 3 4 2 2 4 3 5 6 6 3 4 4 3 3 2 2 1 1 4 4 2 4 2 3 6 3 6 5 3 2 3 4 1 4 2 4 3 4 2 2 4 3 5 6 6 3 4 4 3 3 2 2 1 1 4 4 2 4 2 3 6 3 6 5 3 2 3 4 1 4 2 4 81.1 81.1 81.1 19.431 190 190 0 164.71 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 51.6 51.1 22.1 22.1 64.2 32.6 70.5 81.1 81.1 45.8 56.3 51.1 45.8 45.8 22.1 22.1 9.5 9.5 52.1 56.3 22.1 56.3 33.2 45.8 81.1 45.8 81.1 74.7 45.8 22.1 32.6 56.3 9.5 64.2 22.1 64.2 5049800000 96491000 367690000 84935000 125590000 126860000 90534000 759010000 222380000 1252300000 14009000 145920000 160820000 67724000 20159000 21687000 22298000 26141000 21979000 28635000 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transcriptional regulator YgeV OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ygeV PE=4 SV=1 1 11 11 11 3 4 4 3 1 0 6 5 5 5 8 2 2 2 1 4 5 3 5 5 2 3 1 1 4 5 1 5 8 5 3 1 1 6 5 7 3 4 4 3 1 0 6 5 5 5 8 2 2 2 1 4 5 3 5 5 2 3 1 1 4 5 1 5 8 5 3 1 1 6 5 7 3 4 4 3 1 0 6 5 5 5 8 2 2 2 1 4 5 3 5 5 2 3 1 1 4 5 1 5 8 5 3 1 1 6 5 7 26 26 26 66.095 592 592 0 70.554 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.1 10.1 9.1 5.9 2.9 0 16.2 13.5 14.2 13.2 19.9 5.2 5.2 3.9 2.5 10.1 13.5 7.4 12.8 12.3 3.9 8.3 2.5 2.9 10.5 13.2 2.5 13.3 19.3 12.7 7.8 2.5 3 16.4 12.8 18.6 706160000 9175200 109100000 87570000 43381000 5422500 0 49739000 23553000 33533000 3179200 38966000 13283000 13678000 1604100 1220800 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MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching 12.5 16.7 16.7 0 12.5 12.5 12.5 0 12.5 0 16.7 20.3 16.7 16.7 16.7 0 0 0 0 4.2 16.7 16.7 16.7 4.2 0 0 16.7 0 20.3 20.3 4.2 20.3 20.3 12.5 0 0 557670000 4138300 62730000 54655000 0 17989000 12266000 7531800 0 7852600 0 15887000 32686000 23691000 9870300 11192000 0 0 0 0 4597400 50093000 29007000 4202200 5926600 0 0 1723300 0 73093000 43730000 18481000 36390000 29099000 841830 0 0 55767000 413830 6273000 5465500 0 1798900 1226600 753180 0 785260 0 1588700 3268600 2369100 987030 1119200 0 0 0 0 459740 5009300 2900700 420220 592660 0 0 172330 0 7309300 4373000 1848100 3639000 2909900 84183 0 0 13 2739 13869;13870;35204 True;True;True 18671;18672;47514 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matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 23.6 23.6 16.5 11.5 16.5 11.5 0 11.5 4.9 16.5 16.5 16.5 16.5 16.5 0 0 0 0 16.5 16.5 16.5 16.5 18.7 4.9 0 0 16.5 16.5 16.5 16.5 16.5 16.5 0 0 0 1192900000 0 138190000 148570000 160580000 18783000 71964000 6320300 0 9702600 659860 18290000 60511000 51791000 9255500 26774000 0 0 0 0 25639000 29788000 75900000 8529400 30277000 1514600 0 0 11078000 40067000 53426000 104820000 27270000 63240000 0 0 0 149120000 0 17274000 18571000 20073000 2347900 8995500 790040 0 1212800 82482 2286200 7563900 6473900 1156900 3346700 0 0 0 0 3204900 3723500 9487500 1066200 3784600 189330 0 0 1384800 5008400 6678200 13103000 3408700 7905000 0 0 0 29 2740 17487;21424;26685 True;True;True 23793;29276;36270 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OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yghU PE=1 SV=2 1 15 15 15 8 14 12 14 13 14 12 8 12 11 14 14 14 13 14 7 7 10 9 10 15 14 11 13 10 11 11 9 14 15 15 13 15 9 4 10 8 14 12 14 13 14 12 8 12 11 14 14 14 13 14 7 7 10 9 10 15 14 11 13 10 11 11 9 14 15 15 13 15 9 4 10 8 14 12 14 13 14 12 8 12 11 14 14 14 13 14 7 7 10 9 10 15 14 11 13 10 11 11 9 14 15 15 13 15 9 4 10 52.8 52.8 52.8 32.391 288 288 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 33.3 52.8 47.6 52.8 50.3 52.8 48.6 36.5 50.3 45.5 52.8 52.8 52.8 50.3 52.8 31.9 33 45.5 39.2 41.7 52.8 52.8 44.4 48.6 43.8 45.5 45.5 38.9 52.8 52.8 52.8 50.3 52.8 41.3 19.1 40.6 20624000000 73242000 1810700000 1415700000 3066600000 316680000 933070000 347820000 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system Cascade subunit CasC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=casC PE=1 SV=1 1 9 9 9 5 7 5 5 8 9 4 4 2 6 7 8 7 8 9 4 5 7 3 6 6 7 7 9 4 4 2 7 6 5 7 9 9 3 3 5 5 7 5 5 8 9 4 4 2 6 7 8 7 8 9 4 5 7 3 6 6 7 7 9 4 4 2 7 6 5 7 9 9 3 3 5 5 7 5 5 8 9 4 4 2 6 7 8 7 8 9 4 5 7 3 6 6 7 7 9 4 4 2 7 6 5 7 9 9 3 3 5 31.7 31.7 31.7 40.025 363 363 0 155.07 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching 16.5 22.3 15.4 18.2 29.8 31.7 11.6 11.6 5.5 18.5 22.3 29.8 22.3 29.8 31.7 11.6 13.5 22.3 7.4 18.5 18.5 27.8 25.9 31.7 11.3 9.6 6.1 20.4 20.4 16.5 27.8 31.7 31.7 7.7 7.7 16.5 3215600000 29319000 230920000 169480000 447280000 131150000 308530000 31369000 22618000 17560000 8136300 52713000 127280000 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matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 2.7 0 0 5.1 5.1 0 0 0 0 5.1 2.7 2.7 7.8 7.8 0 0 0 5.1 5.1 7.8 7.8 7.8 7.8 0 0 0 0 5.1 7.8 5.1 7.8 7.8 0 0 0 200530000 0 13823000 0 0 7560500 11349000 0 0 0 0 3931600 5445700 8222200 2195200 7439500 0 0 0 482230 3048400 16262000 30958000 1721800 23892000 0 0 0 0 5783200 13169000 20149000 7941800 17153000 0 0 0 12533000 0 863970 0 0 472530 709300 0 0 0 0 245720 340360 513890 137200 464970 0 0 0 30140 190530 1016400 1934800 107620 1493300 0 0 0 0 361450 823080 1259300 496360 1072100 0 0 0 11 2786 11685;18799 True;True 15498;25587 414798;414799;414800;414801;414802;414803;414804;414805;414806;414807;414808;414809;414810;414811;414812;414813;686014;686015;686016;686017;686018;686019;686020;686021;686022;686023;686024;686025 312120;312121;312122;312123;312124;312125;312126;312127;312128;312129;512695 312123;512695 Q47622 Q47622 6 6 6 Peptide transport periplasmic protein SapA sapA sp|Q47622|SAPA_ECOLI Probable ABC transporter periplasmic-binding protein SapA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=sapA PE=3 SV=1 1 6 6 6 2 1 1 1 3 4 5 4 5 3 1 1 1 2 1 3 2 2 3 2 1 2 1 1 4 2 2 4 2 1 1 1 2 3 2 2 2 1 1 1 3 4 5 4 5 3 1 1 1 2 1 3 2 2 3 2 1 2 1 1 4 2 2 4 2 1 1 1 2 3 2 2 2 1 1 1 3 4 5 4 5 3 1 1 1 2 1 3 2 2 3 2 1 2 1 1 4 2 2 4 2 1 1 1 2 3 2 2 12.4 12.4 12.4 61.564 547 547 0 20.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 3.7 1.6 1.6 1.6 5.7 8.4 10.6 8.4 10.6 5.3 1.6 1.6 1.6 3.5 1.6 5.3 3.5 3.5 5.3 3.5 1.6 4.8 1.6 1.6 7.5 3.7 4.8 7.5 3.5 1.6 1.6 1.6 4.8 5.3 3.7 3.5 769280000 7498300 56449000 58431000 48245000 27733000 168850000 48457000 21937000 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Q47679 9 9 9 Hydrolase YafV yafV sp|Q47679|YAFV_ECOLI Omega-amidase YafV OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yafV PE=3 SV=1 1 9 9 9 5 6 8 6 8 8 7 3 6 4 5 6 8 6 7 3 2 3 3 6 7 8 7 7 3 1 3 4 3 6 5 6 6 3 1 2 5 6 8 6 8 8 7 3 6 4 5 6 8 6 7 3 2 3 3 6 7 8 7 7 3 1 3 4 3 6 5 6 6 3 1 2 5 6 8 6 8 8 7 3 6 4 5 6 8 6 7 3 2 3 3 6 7 8 7 7 3 1 3 4 3 6 5 6 6 3 1 2 44.5 44.5 44.5 28.925 256 256 0 134.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25 30.5 39.5 32 37.5 40.2 34.4 16.8 28.5 21.1 26.2 29.3 37.5 29.3 33.2 16.8 10.9 16.8 18.4 30.1 33.2 40.6 33.2 33.2 18.4 7.4 16.4 21.1 13.7 31.2 24.2 28.5 31.2 16.8 7.4 13.3 4668400000 18731000 370120000 487940000 669800000 194610000 316590000 57365000 10352000 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11 Putative uncharacterized protein YkfC ykfC sp|Q47688|YKFC_ECOLI Protein YkfC OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ykfC PE=4 SV=3 1 11 11 11 3 7 3 4 10 10 1 1 1 4 8 8 7 7 7 1 2 0 1 7 7 7 7 7 1 1 0 4 8 5 6 6 8 1 1 0 3 7 3 4 10 10 1 1 1 4 8 8 7 7 7 1 2 0 1 7 7 7 7 7 1 1 0 4 8 5 6 6 8 1 1 0 3 7 3 4 10 10 1 1 1 4 8 8 7 7 7 1 2 0 1 7 7 7 7 7 1 1 0 4 8 5 6 6 8 1 1 0 30.7 30.7 30.7 43.738 381 381 0 25.746 By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching 6 20.2 11 11.5 30.4 30.4 2.1 2.1 2.1 9.2 21.3 24.9 21.3 23.4 22.8 2.1 5.2 0 2.1 17.6 21.8 21.8 17.6 22.3 2.1 2.1 0 8.9 24.1 13.1 15.2 16 24.9 2.1 3.1 0 1908400000 121960000 206510000 53775000 107260000 109510000 209720000 8150300 4790500 5144200 3106400 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REV__P0A794 1 1 1 sp|P0A794|PDXJ_ECOLI Pyridoxine 5-phosphate synthase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pdxJ PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.384 243 243 1 -2 By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 + + 2816 24915 True 33986 898979;898980;898981;898982;898983 670034;670035;670036 670036 9824 185 REV__P0A7E3 REV__P0A7E3 1 1 1 sp|P0A7E3|PYRE_ECOLI Orotate phosphoribosyltransferase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pyrE PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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metalloprotease FtsH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ftsH PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 0 0 0 70.707 644 644 1 -2 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching By MS/MS By matching 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9868900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7672000 0 0 0 0 0 0 0 0 2196900 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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REV__P0C054 REV__P0C054 1 1 1 sp|P0C054|IBPA_ECOLI Small heat shock protein IbpA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ibpA PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 15.774 137 137 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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REV__P33590;REV__P76128 REV__P33590;REV__P76128 2;1 2;1 2;1 sp|P33590|NIKA_ECOLI Nickel-binding periplasmic protein OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=nikA PE=1 SV=1;sp|P76128|DDPA_ECOLI Probable D,D-dipeptide-binding periplasmic protein DdpA OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ddpA PE=2 SV=1 2 2 2 2 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 58.718 524 524;516 1 -2 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By matching 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 293790000 0 0 0 0 138030000 0 0 155760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2 + + 2870 4866;13770 True;True 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Autoinducer 2-binding protein LsrB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=lsrB PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 36.684 340 340 1 -2 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By matching 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 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NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 + + 2899 27579 True 37379 990313;990314;990315;990316;990317;990318;990319;990320;990321;990322;990323;990324;990325;990326;990327;990328;990329;990330;990331;990332 736507;736508 736508 9896 21 REV__P76639 REV__P76639 2 2 2 sp|P76639|YGEH_ECOLI Uncharacterized protein YgeH OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ygeH PE=4 SV=1 1 2 2 2 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 52.752 458 458 0.004059 1.8763 By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching By MS/MS By matching 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7125600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 936200 4913000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1276400 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 + 2900 2446;18102 True;True 3395;24660;24661 95821;95822;95823;95824;661250;661251;661252;661253;661254;661255 72731;494235;494236;494237 72731;494235 REV__P77239 REV__P77239 1 1 1 sp|P77239|CUSB_ECOLI Cation efflux system protein CusB OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cusB PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44.304 407 407 1 -2 By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 + + 2901 17605 True 23963 641688;641689 478853;478854 478853 9897 213 REV__P77247 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By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 + + 2918 19520 True 26477 709668;709669;709670;709671;709672;709673;709674;709675;709676;709677;709678;709679;709680;709681;709682;709683;709684;709685;709686;709687;709688;709689;709690;709691;709692;709693;709694;709695;709696;709697;709698;709699;709700;709701;709702;709703;709704;709705;709706;709707;709708;709709;709710;709711;709712;709713;709714;709715 530479;530480;530481;530482;530483;530484;530485;530486;530487;530488;530489;530490;530491;530492 530483 9909;9910 27;28 REV__Q59385 REV__Q59385 1 1 1 sp|Q59385|COPA_ECOLI Copper-exporting P-type ATPase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=copA PE=1 SV=4 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 87.872 834 834 1 -2 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0 + + 2919 13114 True 17452 465410;465411;465412 349926;349927;349928 349926 9911 400